View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF15943_high_2 (Length: 397)

Name: NF15943_high_2
Description: NF15943
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF15943_high_2
NF15943_high_2
[»] chr6 (132 HSPs)
chr6 (14-303)||(2870221-2870510)
chr6 (14-303)||(2876836-2877125)
chr6 (14-303)||(8796923-8797212)
chr6 (20-303)||(26130199-26130481)
chr6 (14-303)||(30694094-30694382)
chr6 (14-303)||(20801489-20801777)
chr6 (14-303)||(27328142-27328431)
chr6 (14-303)||(27388882-27389171)
chr6 (14-290)||(20060394-20060670)
chr6 (21-303)||(20649884-20650165)
chr6 (21-303)||(6980392-6980673)
chr6 (14-303)||(12762435-12762723)
chr6 (14-303)||(27430369-27430658)
chr6 (14-303)||(30596958-30597239)
chr6 (14-303)||(28287087-28287377)
chr6 (69-303)||(8228598-8228832)
chr6 (69-290)||(18930800-18931021)
chr6 (69-290)||(29587841-29588062)
chr6 (69-290)||(29593982-29594203)
chr6 (14-303)||(28258539-28258829)
chr6 (14-303)||(28265163-28265453)
chr6 (14-303)||(28337288-28337578)
chr6 (14-303)||(28343912-28344202)
chr6 (24-266)||(3708592-3708834)
chr6 (24-266)||(24291156-24291398)
chr6 (24-266)||(31317196-31317438)
chr6 (69-290)||(30638291-30638512)
chr6 (72-303)||(28314285-28314516)
chr6 (26-291)||(1545154-1545419)
chr6 (24-266)||(24315184-24315426)
chr6 (24-266)||(25110594-25110836)
chr6 (24-266)||(25117197-25117439)
chr6 (72-303)||(27185424-27185655)
chr6 (72-303)||(27207260-27207491)
chr6 (72-303)||(27241737-27241968)
chr6 (72-303)||(27263585-27263816)
chr6 (26-303)||(1539055-1539332)
chr6 (24-266)||(4167676-4167920)
chr6 (24-266)||(4208356-4208600)
chr6 (24-266)||(34832407-34832652)
chr6 (26-276)||(19808269-19808520)
chr6 (26-263)||(25928051-25928289)
chr6 (26-266)||(22758604-22758844)
chr6 (26-248)||(17037444-17037666)
chr6 (26-266)||(34370086-34370327)
chr6 (26-276)||(34298734-34298979)
chr6 (21-262)||(20176697-20176941)
chr6 (69-303)||(32565394-32565629)
chr6 (69-303)||(16552172-16552407)
chr6 (69-303)||(16576546-16576781)
chr6 (69-303)||(16618599-16618834)
chr6 (69-303)||(16628728-16628963)
chr6 (14-159)||(4233584-4233729)
chr6 (21-262)||(5834591-5834835)
chr6 (21-262)||(22159050-22159294)
chr6 (69-303)||(17017074-17017309)
chr6 (154-303)||(14053784-14053933)
chr6 (135-303)||(14098317-14098485)
chr6 (165-303)||(4233708-4233846)
chr6 (24-236)||(11566411-11566627)
chr6 (24-236)||(12619183-12619399)
chr6 (24-236)||(19870139-19870355)
chr6 (24-236)||(23394617-23394833)
chr6 (24-236)||(8243382-8243598)
chr6 (24-236)||(23989469-23989685)
chr6 (38-236)||(16759818-16760011)
chr6 (24-236)||(22862495-22862711)
chr6 (25-260)||(31478326-31478565)
chr6 (60-264)||(1587859-1588056)
chr6 (109-263)||(25135847-25135996)
chr6 (38-264)||(5616920-5617140)
chr6 (93-260)||(22948608-22948769)
chr6 (93-260)||(22952564-22952725)
chr6 (38-260)||(23414430-23414646)
chr6 (93-260)||(23871052-23871213)
chr6 (93-260)||(23875008-23875169)
chr6 (38-236)||(27416292-27416483)
chr6 (136-260)||(1644035-1644157)
chr6 (136-260)||(14471738-14471860)
chr6 (136-260)||(16623879-16624001)
chr6 (60-235)||(9482421-9482588)
chr6 (24-186)||(14098461-14098624)
chr6 (38-260)||(12496094-12496309)
chr6 (60-264)||(20803682-20803879)
chr6 (60-264)||(21702068-21702265)
chr6 (109-260)||(27556188-27556333)
chr6 (38-236)||(16741017-16741206)
chr6 (38-260)||(12706475-12706689)
chr6 (38-260)||(19662556-19662769)
chr6 (165-260)||(18917895-18917990)
chr6 (38-260)||(2685424-2685637)
chr6 (24-133)||(25595462-25595571)
chr6 (292-361)||(12762312-12762381)
chr6 (292-356)||(4233900-4233964)
chr6 (292-356)||(6980274-6980338)
chr6 (292-356)||(30596839-30596903)
chr6 (292-356)||(30638580-30638644)
chr6 (25-186)||(1644134-1644298)
chr6 (292-354)||(20650220-20650282)
chr6 (69-263)||(27325765-27325950)
chr6 (292-356)||(2870564-2870628)
chr6 (292-356)||(2877179-2877243)
chr6 (292-356)||(14053987-14054051)
chr6 (292-356)||(20060263-20060327)
chr6 (293-356)||(8796805-8796868)
chr6 (294-356)||(25471654-25471716)
chr6 (294-356)||(27185306-27185368)
chr6 (294-356)||(27207142-27207204)
chr6 (294-356)||(27242024-27242086)
chr6 (294-356)||(27263872-27263934)
chr6 (292-356)||(8228481-8228543)
chr6 (93-186)||(14471837-14471924)
chr6 (292-356)||(18930671-18930733)
chr6 (167-236)||(22430255-22430326)
chr6 (292-354)||(27430712-27430774)
chr6 (292-356)||(29588129-29588191)
chr6 (292-356)||(29594270-29594332)
chr6 (292-356)||(20801371-20801435)
chr6 (69-260)||(17803971-17804156)
chr6 (292-351)||(28258883-28258942)
chr6 (292-351)||(28265507-28265566)
chr6 (292-351)||(28286974-28287033)
chr6 (292-351)||(28337632-28337691)
chr6 (292-351)||(28344256-28344315)
chr6 (25-133)||(16624025-16624142)
chr6 (14-73)||(14059702-14059761)
chr6 (24-159)||(18917775-18917916)
chr6 (292-353)||(1539386-1539447)
chr6 (292-353)||(1545485-1545546)
chr6 (292-356)||(26130081-26130145)
chr6 (292-356)||(18194584-18194648)
chr6 (292-356)||(30693976-30694040)
[»] chr5 (142 HSPs)
chr5 (14-303)||(37286867-37287155)
chr5 (14-303)||(37293570-37293858)
chr5 (14-303)||(23583870-23584159)
chr5 (14-303)||(19991615-19991902)
chr5 (21-303)||(41098314-41098596)
chr5 (14-303)||(22328249-22328537)
chr5 (21-303)||(22264676-22264958)
chr5 (14-312)||(22341688-22341985)
chr5 (21-303)||(27663881-27664163)
chr5 (14-361)||(22062967-22063323)
chr5 (21-303)||(34294644-34294926)
chr5 (14-303)||(33725589-33725878)
chr5 (21-303)||(17707022-17707303)
chr5 (21-303)||(24472339-24472620)
chr5 (21-303)||(27608471-27608752)
chr5 (21-303)||(27670521-27670802)
chr5 (21-303)||(27615077-27615358)
chr5 (14-303)||(18038753-18039042)
chr5 (14-303)||(15001765-15002054)
chr5 (21-266)||(23249707-23249951)
chr5 (21-266)||(41769011-41769256)
chr5 (21-266)||(41775585-41775830)
chr5 (19-303)||(22139421-22139705)
chr5 (19-303)||(25406156-25406440)
chr5 (14-303)||(37543771-37544060)
chr5 (19-303)||(29471448-29471733)
chr5 (14-303)||(41294520-41294808)
chr5 (19-303)||(17283799-17284083)
chr5 (19-303)||(22132729-22133013)
chr5 (19-303)||(22587827-22588111)
chr5 (14-303)||(1692522-1692811)
chr5 (34-303)||(14995141-14995411)
chr5 (19-303)||(29478043-29478328)
chr5 (14-303)||(27687414-27687703)
chr5 (14-303)||(40706853-40707142)
chr5 (14-303)||(40713495-40713784)
chr5 (14-290)||(27516496-27516772)
chr5 (14-290)||(27523133-27523409)
chr5 (69-290)||(16354568-16354789)
chr5 (69-290)||(16361227-16361448)
chr5 (69-290)||(34564561-34564782)
chr5 (69-290)||(34571216-34571437)
chr5 (69-290)||(25106507-25106728)
chr5 (69-290)||(25165600-25165821)
chr5 (24-266)||(19768101-19768343)
chr5 (24-266)||(19774697-19774939)
chr5 (24-266)||(24020037-24020279)
chr5 (69-303)||(20775598-20775833)
chr5 (69-303)||(22410751-22410985)
chr5 (24-266)||(22343248-22343493)
chr5 (24-266)||(22352648-22352893)
chr5 (24-266)||(22326038-22326282)
chr5 (26-276)||(15442068-15442319)
chr5 (26-276)||(14359931-14360182)
chr5 (26-276)||(21295374-21295619)
chr5 (26-276)||(25534738-25534983)
chr5 (26-302)||(23337402-23337682)
chr5 (69-302)||(21667958-21668192)
chr5 (26-263)||(24554294-24554529)
chr5 (69-303)||(29316137-29316372)
chr5 (14-159)||(23609778-23609923)
chr5 (14-159)||(23841174-23841319)
chr5 (69-303)||(22258633-22258868)
chr5 (154-303)||(27680912-27681061)
chr5 (24-260)||(15237176-15237416)
chr5 (24-260)||(19473059-19473299)
chr5 (24-236)||(20295396-20295612)
chr5 (165-303)||(23609661-23609799)
chr5 (165-303)||(23841057-23841195)
chr5 (25-260)||(10752715-10752954)
chr5 (38-236)||(40723977-40724173)
chr5 (38-236)||(33409037-33409229)
chr5 (38-260)||(11230646-11230862)
chr5 (56-263)||(17730531-17730731)
chr5 (109-236)||(11220272-11220393)
chr5 (60-264)||(25229534-25229731)
chr5 (60-264)||(25293690-25293887)
chr5 (93-264)||(4035999-4036164)
chr5 (93-260)||(21885349-21885510)
chr5 (109-260)||(11226667-11226812)
chr5 (109-236)||(11224858-11224979)
chr5 (109-236)||(11228681-11228802)
chr5 (38-260)||(16673938-16674153)
chr5 (38-236)||(21340872-21341063)
chr5 (109-260)||(26172249-26172394)
chr5 (136-260)||(20911394-20911515)
chr5 (38-260)||(18355742-18355958)
chr5 (38-263)||(26742852-26743068)
chr5 (38-260)||(42805207-42805420)
chr5 (38-260)||(18773990-18774203)
chr5 (38-260)||(18783833-18784046)
chr5 (38-260)||(20232338-20232551)
chr5 (38-260)||(26666236-26666449)
chr5 (38-260)||(26937833-26938046)
chr5 (292-356)||(17707357-17707421)
chr5 (292-356)||(23609542-23609606)
chr5 (292-356)||(23840938-23841002)
chr5 (292-356)||(24472675-24472739)
chr5 (292-356)||(27608353-27608417)
chr5 (292-356)||(27614959-27615023)
chr5 (292-356)||(34294981-34295045)
chr5 (292-356)||(41098651-41098715)
chr5 (292-361)||(40706729-40706798)
chr5 (292-361)||(40713371-40713440)
chr5 (292-356)||(27664218-27664282)
chr5 (292-356)||(27670857-27670921)
chr5 (93-236)||(24533208-24533342)
chr5 (164-260)||(24767786-24767882)
chr5 (292-356)||(23583752-23583816)
chr5 (292-356)||(16354439-16354501)
chr5 (292-356)||(16361098-16361160)
chr5 (292-356)||(27516367-27516429)
chr5 (292-356)||(27523004-27523066)
chr5 (292-356)||(34564432-34564494)
chr5 (292-356)||(34571087-34571149)
chr5 (292-356)||(20775480-20775544)
chr5 (292-356)||(37543653-37543717)
chr5 (167-236)||(23535791-23535859)
chr5 (292-356)||(25106378-25106440)
chr5 (292-356)||(25165471-25165533)
chr5 (292-356)||(41294862-41294926)
chr5 (292-356)||(22132611-22132675)
chr5 (292-356)||(22139303-22139367)
chr5 (292-356)||(22587709-22587773)
chr5 (292-356)||(37287209-37287273)
chr5 (292-356)||(37293912-37293976)
chr5 (292-356)||(22264564-22264621)
chr5 (38-159)||(20911275-20911393)
chr5 (292-356)||(14995465-14995529)
chr5 (292-356)||(15002108-15002172)
chr5 (292-356)||(17283681-17283745)
chr5 (292-356)||(19991497-19991561)
chr5 (292-356)||(22328591-22328655)
chr5 (206-236)||(17410279-17410309)
chr5 (302-356)||(18039106-18039160)
chr5 (303-356)||(1692875-1692928)
chr5 (303-356)||(27681125-27681178)
chr5 (303-356)||(27687767-27687820)
chr5 (292-356)||(22342022-22342086)
chr5 (292-356)||(25406038-25406102)
chr5 (292-356)||(29471787-29471851)
chr5 (292-356)||(29478382-29478446)
[»] chr3 (182 HSPs)
chr3 (14-313)||(10153819-10154118)
chr3 (14-293)||(53380435-53380714)
chr3 (14-293)||(53387087-53387366)
chr3 (21-303)||(31422644-31422926)
chr3 (14-303)||(5106968-5107257)
chr3 (14-303)||(10846368-10846657)
chr3 (14-303)||(16758655-16758944)
chr3 (21-303)||(37615125-37615407)
chr3 (14-303)||(6598451-6598740)
chr3 (14-303)||(6605131-6605420)
chr3 (14-303)||(10010015-10010304)
chr3 (14-303)||(16624139-16624428)
chr3 (14-303)||(16747923-16748212)
chr3 (14-303)||(10003368-10003657)
chr3 (21-303)||(26889188-26889469)
chr3 (14-303)||(10903958-10904247)
chr3 (14-303)||(10910630-10910919)
chr3 (14-303)||(5221137-5221425)
chr3 (19-294)||(23704856-23705131)
chr3 (19-294)||(23723312-23723587)
chr3 (19-294)||(23741768-23742043)
chr3 (14-303)||(20057489-20057778)
chr3 (19-294)||(41201886-41202161)
chr3 (14-303)||(3690351-3690640)
chr3 (14-303)||(20064127-20064416)
chr3 (21-266)||(26794486-26794731)
chr3 (14-303)||(417732-418021)
chr3 (19-303)||(15727020-15727304)
chr3 (14-303)||(14673285-14673574)
chr3 (14-303)||(16489755-16490038)
chr3 (14-303)||(13250451-13250740)
chr3 (14-303)||(13257097-13257386)
chr3 (24-266)||(13316294-13316536)
chr3 (26-303)||(5150078-5150355)
chr3 (24-266)||(19808781-19809023)
chr3 (26-303)||(41092456-41092733)
chr3 (69-290)||(16633575-16633796)
chr3 (69-290)||(16640185-16640406)
chr3 (69-290)||(43160850-43161071)
chr3 (69-290)||(43167087-43167308)
chr3 (69-303)||(48423079-48423313)
chr3 (69-290)||(1333221-1333442)
chr3 (69-303)||(48429857-48430091)
chr3 (25-266)||(10236503-10236744)
chr3 (24-266)||(410861-411103)
chr3 (24-266)||(1145662-1145904)
chr3 (24-266)||(8721266-8721508)
chr3 (24-266)||(9073153-9073395)
chr3 (24-266)||(15825419-15825661)
chr3 (24-266)||(17710701-17710943)
chr3 (25-266)||(15992212-15992453)
chr3 (24-266)||(15343715-15343957)
chr3 (24-266)||(15350359-15350601)
chr3 (24-266)||(15404605-15404847)
chr3 (24-266)||(15367040-15367282)
chr3 (72-303)||(6608192-6608424)
chr3 (24-266)||(4710054-4710296)
chr3 (24-266)||(30777335-30777578)
chr3 (69-303)||(15584872-15585106)
chr3 (69-303)||(15591530-15591764)
chr3 (24-266)||(12891155-12891400)
chr3 (24-266)||(17253168-17253413)
chr3 (24-266)||(13320726-13320970)
chr3 (19-224)||(15692366-15692571)
chr3 (26-266)||(7985458-7985699)
chr3 (26-266)||(10325604-10325844)
chr3 (26-276)||(55148728-55148973)
chr3 (69-303)||(5200946-5201181)
chr3 (69-303)||(12482148-12482383)
chr3 (26-276)||(24187527-24187772)
chr3 (26-256)||(16332934-16333165)
chr3 (69-303)||(5426864-5427099)
chr3 (26-256)||(20722771-20722996)
chr3 (69-303)||(5420457-5420692)
chr3 (26-276)||(838996-839242)
chr3 (24-260)||(30065475-30065716)
chr3 (24-236)||(7109248-7109464)
chr3 (24-236)||(7113183-7113399)
chr3 (165-293)||(22643539-22643667)
chr3 (24-236)||(27409985-27410201)
chr3 (24-236)||(55022417-55022633)
chr3 (21-159)||(26788896-26789034)
chr3 (24-236)||(4107740-4107956)
chr3 (24-236)||(4111592-4111808)
chr3 (24-236)||(11069620-11069836)
chr3 (24-236)||(11165870-11166086)
chr3 (24-236)||(14498877-14499093)
chr3 (24-236)||(15616926-15617142)
chr3 (24-236)||(22321216-22321432)
chr3 (24-236)||(22336271-22336487)
chr3 (24-236)||(28949274-28949490)
chr3 (25-236)||(16750684-16750898)
chr3 (24-159)||(22643426-22643560)
chr3 (141-255)||(15360482-15360596)
chr3 (141-266)||(15337213-15337338)
chr3 (144-276)||(28368673-28368806)
chr3 (144-276)||(28376491-28376624)
chr3 (144-276)||(28384313-28384446)
chr3 (38-260)||(38814169-38814385)
chr3 (24-159)||(15398014-15398149)
chr3 (38-260)||(1598584-1598800)
chr3 (38-260)||(3833459-3833675)
chr3 (93-260)||(15964472-15964633)
chr3 (93-260)||(15968396-15968557)
chr3 (93-260)||(15972320-15972481)
chr3 (141-266)||(15398104-15398229)
chr3 (165-266)||(26789013-26789114)
chr3 (38-236)||(15942009-15942201)
chr3 (24-159)||(15360551-15360686)
chr3 (60-264)||(16696566-16696763)
chr3 (172-266)||(29695943-29696037)
chr3 (38-236)||(5222874-5223065)
chr3 (60-263)||(16809009-16809203)
chr3 (136-260)||(19775095-19775217)
chr3 (138-236)||(15464651-15464746)
chr3 (24-159)||(15337293-15337428)
chr3 (138-236)||(12339252-12339347)
chr3 (141-260)||(4589378-4589494)
chr3 (165-260)||(37440123-37440218)
chr3 (38-260)||(17241759-17241972)
chr3 (141-260)||(8489652-8489768)
chr3 (220-303)||(15711579-15711662)
chr3 (60-223)||(16798182-16798336)
chr3 (292-356)||(31422981-31423045)
chr3 (167-260)||(15482448-15482542)
chr3 (26-147)||(28351277-28351398)
chr3 (164-260)||(31097779-31097875)
chr3 (292-361)||(48422955-48423024)
chr3 (292-361)||(48429733-48429802)
chr3 (296-356)||(6596872-6596932)
chr3 (296-356)||(6598333-6598393)
chr3 (296-356)||(6605013-6605073)
chr3 (292-356)||(10846711-10846775)
chr3 (38-186)||(11300871-11301017)
chr3 (292-356)||(26889069-26889133)
chr3 (292-356)||(37615006-37615070)
chr3 (293-356)||(20057832-20057895)
chr3 (293-356)||(20064470-20064533)
chr3 (25-186)||(19775194-19775358)
chr3 (292-353)||(417618-417679)
chr3 (292-361)||(13250327-13250396)
chr3 (292-361)||(13256973-13257042)
chr3 (292-353)||(14673627-14673688)
chr3 (292-356)||(5107312-5107376)
chr3 (25-159)||(4589289-4589420)
chr3 (292-356)||(1333509-1333571)
chr3 (292-356)||(16633446-16633508)
chr3 (292-356)||(16640056-16640118)
chr3 (292-356)||(43160721-43160783)
chr3 (292-356)||(43166958-43167020)
chr3 (292-356)||(10154211-10154275)
chr3 (207-266)||(4290920-4290979)
chr3 (93-185)||(11854328-11854417)
chr3 (69-260)||(20461647-20461832)
chr3 (167-260)||(7793586-7793682)
chr3 (38-190)||(12339322-12339467)
chr3 (38-190)||(15464721-15464866)
chr3 (167-260)||(327401-327497)
chr3 (167-260)||(14668334-14668430)
chr3 (292-356)||(3690233-3690297)
chr3 (292-356)||(16624482-16624545)
chr3 (316-356)||(26196011-26196051)
chr3 (191-260)||(14665178-14665247)
chr3 (167-260)||(2898058-2898155)
chr3 (137-187)||(11854266-11854313)
chr3 (191-236)||(14572386-14572431)
chr3 (293-353)||(16748269-16748330)
chr3 (293-353)||(16759000-16759061)
chr3 (292-353)||(22643731-22643792)
chr3 (93-159)||(37440081-37440144)
chr3 (292-356)||(15711830-15711894)
chr3 (292-356)||(15727472-15727536)
chr3 (292-356)||(23705194-23705258)
chr3 (292-356)||(23723650-23723714)
chr3 (292-356)||(23742106-23742170)
chr3 (193-236)||(14577112-14577155)
chr3 (190-236)||(49668364-49668410)
chr3 (191-236)||(9512707-9512752)
chr3 (191-236)||(9520682-9520727)
chr3 (191-236)||(16103567-16103612)
chr3 (292-356)||(5150409-5150472)
chr3 (292-356)||(41202224-41202288)
[»] scaffold0052 (6 HSPs)
scaffold0052 (14-303)||(1139-1428)
scaffold0052 (69-290)||(10082-10303)
scaffold0052 (69-290)||(56504-56725)
scaffold0052 (292-356)||(9953-10015)
scaffold0052 (292-356)||(56375-56437)
scaffold0052 (292-356)||(1482-1546)
[»] chr4 (132 HSPs)
chr4 (14-303)||(14298915-14299203)
chr4 (21-303)||(23953879-23954161)
chr4 (21-303)||(23960541-23960823)
chr4 (21-290)||(19780381-19780650)
chr4 (14-303)||(14268541-14268829)
chr4 (14-290)||(15148201-15148477)
chr4 (14-290)||(15361876-15362152)
chr4 (14-290)||(16231928-16232204)
chr4 (14-290)||(22194363-22194639)
chr4 (14-303)||(36884821-36885110)
chr4 (14-303)||(15383579-15383867)
chr4 (21-266)||(4771865-4772109)
chr4 (19-303)||(386421-386705)
chr4 (19-303)||(40477880-40478164)
chr4 (19-303)||(6873468-6873752)
chr4 (21-266)||(8048589-8048833)
chr4 (21-266)||(8055202-8055446)
chr4 (14-303)||(12474750-12475039)
chr4 (14-303)||(12481380-12481669)
chr4 (14-303)||(18070899-18071188)
chr4 (14-303)||(18024514-18024803)
chr4 (19-303)||(26284998-26285283)
chr4 (14-303)||(18295356-18295645)
chr4 (69-290)||(8384557-8384778)
chr4 (69-290)||(14073553-14073774)
chr4 (69-290)||(15256331-15256552)
chr4 (69-290)||(17090140-17090361)
chr4 (69-290)||(29041061-29041282)
chr4 (26-303)||(7901283-7901560)
chr4 (69-290)||(8391212-8391433)
chr4 (24-266)||(23081341-23081583)
chr4 (24-266)||(27709498-27709740)
chr4 (69-290)||(17808136-17808357)
chr4 (55-303)||(40453651-40453899)
chr4 (19-303)||(51493909-51494183)
chr4 (24-266)||(9272267-9272509)
chr4 (26-303)||(15322205-15322482)
chr4 (24-266)||(19942265-19942507)
chr4 (24-266)||(16956762-16957004)
chr4 (24-266)||(53433126-53433371)
chr4 (26-266)||(12521835-12522076)
chr4 (69-303)||(55795168-55795403)
chr4 (26-276)||(23838183-23838428)
chr4 (24-236)||(14757763-14757984)
chr4 (26-263)||(41385856-41386088)
chr4 (24-236)||(4561675-4561882)
chr4 (24-236)||(5757280-5757487)
chr4 (69-303)||(12349726-12349961)
chr4 (26-263)||(14678726-14678957)
chr4 (69-303)||(12300050-12300285)
chr4 (69-303)||(17962486-17962721)
chr4 (165-303)||(14305662-14305800)
chr4 (26-263)||(14684934-14685165)
chr4 (24-236)||(9556079-9556295)
chr4 (24-236)||(17809823-17810039)
chr4 (24-236)||(33741929-33742145)
chr4 (14-159)||(14305539-14305683)
chr4 (14-169)||(20115007-20115162)
chr4 (25-260)||(15224567-15224805)
chr4 (60-263)||(14708762-14708959)
chr4 (38-236)||(12487234-12487427)
chr4 (38-236)||(45937958-45938149)
chr4 (38-236)||(2014588-2014779)
chr4 (93-260)||(14954612-14954773)
chr4 (38-235)||(19757706-19757896)
chr4 (38-235)||(19781910-19782100)
chr4 (165-276)||(35170397-35170508)
chr4 (38-260)||(26243770-26243985)
chr4 (60-263)||(18602859-18603055)
chr4 (60-263)||(42997578-42997775)
chr4 (165-263)||(35613722-35613820)
chr4 (137-260)||(23139057-23139177)
chr4 (60-263)||(3412580-3412776)
chr4 (38-236)||(9530244-9530435)
chr4 (60-263)||(18609431-18609627)
chr4 (26-162)||(35170484-35170621)
chr4 (39-263)||(18236674-18236891)
chr4 (38-237)||(16243505-16243697)
chr4 (37-162)||(35613796-35613921)
chr4 (165-260)||(25689394-25689489)
chr4 (165-260)||(28569646-28569741)
chr4 (93-260)||(18222539-18222697)
chr4 (138-234)||(27533528-27533621)
chr4 (38-234)||(1951867-1952054)
chr4 (165-260)||(10712380-10712475)
chr4 (165-260)||(10926150-10926245)
chr4 (24-133)||(20682038-20682147)
chr4 (292-356)||(17962776-17962840)
chr4 (60-260)||(18228982-18229172)
chr4 (292-356)||(19780718-19780782)
chr4 (60-263)||(17152615-17152808)
chr4 (292-361)||(18295232-18295301)
chr4 (292-356)||(15148070-15148134)
chr4 (292-353)||(12474636-12474697)
chr4 (292-353)||(12481266-12481327)
chr4 (292-353)||(18024856-18024917)
chr4 (292-356)||(22194232-22194296)
chr4 (292-356)||(23953760-23953824)
chr4 (292-356)||(23960422-23960486)
chr4 (206-266)||(30235277-30235337)
chr4 (292-356)||(36885164-36885227)
chr4 (208-263)||(21339968-21340023)
chr4 (292-361)||(14073419-14073486)
chr4 (292-356)||(8384428-8384490)
chr4 (292-356)||(8391083-8391145)
chr4 (292-356)||(15256202-15256264)
chr4 (292-356)||(17090428-17090490)
chr4 (292-356)||(17808007-17808069)
chr4 (292-356)||(29041349-29041411)
chr4 (292-356)||(15361745-15361809)
chr4 (292-356)||(16232271-16232335)
chr4 (292-354)||(18070783-18070845)
chr4 (168-236)||(36134176-36134246)
chr4 (167-236)||(20157680-20157751)
chr4 (167-264)||(22634626-22634726)
chr4 (19-61)||(40471449-40471491)
chr4 (217-266)||(13020537-13020586)
chr4 (38-184)||(27533602-27533742)
chr4 (292-353)||(15322536-15322597)
chr4 (292-356)||(386759-386823)
chr4 (292-356)||(51494237-51494301)
chr4 (93-159)||(10712454-10712517)
chr4 (93-159)||(10926224-10926287)
chr4 (93-159)||(25689468-25689531)
chr4 (292-356)||(6873806-6873870)
chr4 (292-356)||(7901615-7901678)
chr4 (292-356)||(14299257-14299321)
chr4 (292-356)||(14305854-14305918)
chr4 (292-356)||(26285337-26285401)
chr4 (292-356)||(40453476-40453540)
chr4 (292-356)||(40477705-40477769)
chr4 (292-350)||(9272599-9272657)
[»] scaffold0155 (2 HSPs)
scaffold0155 (21-303)||(9908-10190)
scaffold0155 (292-356)||(10244-10308)
[»] chr8 (74 HSPs)
chr8 (21-303)||(5534531-5534813)
chr8 (21-290)||(17669662-17669931)
chr8 (14-303)||(8354851-8355140)
chr8 (21-290)||(17676314-17676583)
chr8 (14-290)||(22083575-22083851)
chr8 (14-303)||(22123471-22123760)
chr8 (21-303)||(21915662-21915943)
chr8 (19-303)||(16883262-16883546)
chr8 (14-303)||(19496120-19496409)
chr8 (14-303)||(19498168-19498457)
chr8 (21-266)||(20013956-20014200)
chr8 (21-266)||(20020033-20020277)
chr8 (14-303)||(22047676-22047965)
chr8 (14-294)||(22115806-22116087)
chr8 (14-294)||(22124614-22124895)
chr8 (19-303)||(29122818-29123102)
chr8 (19-303)||(18865061-18865345)
chr8 (14-303)||(19110958-19111246)
chr8 (14-303)||(19117249-19117537)
chr8 (69-303)||(28454481-28454715)
chr8 (24-266)||(23845873-23846115)
chr8 (24-266)||(20024039-20024281)
chr8 (26-263)||(19905252-19905490)
chr8 (24-266)||(26935288-26935533)
chr8 (26-276)||(20527199-20527444)
chr8 (24-266)||(3216014-3216259)
chr8 (141-303)||(18854693-18854855)
chr8 (69-303)||(18065049-18065285)
chr8 (24-236)||(22111480-22111696)
chr8 (24-236)||(43251360-43251576)
chr8 (24-236)||(21972922-21973138)
chr8 (24-236)||(21977013-21977229)
chr8 (38-260)||(15531674-15531890)
chr8 (19-159)||(18854810-18854950)
chr8 (38-236)||(24445611-24445803)
chr8 (38-260)||(23847120-23847335)
chr8 (38-260)||(15538233-15538449)
chr8 (93-260)||(21410450-21410611)
chr8 (93-260)||(21804942-21805103)
chr8 (93-260)||(18863090-18863251)
chr8 (93-260)||(21828459-21828620)
chr8 (93-260)||(30940522-30940683)
chr8 (109-264)||(32598459-32598608)
chr8 (109-264)||(32604991-32605140)
chr8 (38-260)||(17828687-17828903)
chr8 (93-263)||(30308913-30309076)
chr8 (93-263)||(17055539-17055703)
chr8 (38-260)||(22044670-22044884)
chr8 (178-266)||(20705896-20705984)
chr8 (38-260)||(16231581-16231794)
chr8 (60-260)||(21386858-21387051)
chr8 (60-236)||(14398236-14398405)
chr8 (38-260)||(23833959-23834172)
chr8 (165-260)||(15440370-15440465)
chr8 (292-356)||(5534867-5534931)
chr8 (292-356)||(17669999-17670063)
chr8 (292-356)||(17676651-17676715)
chr8 (292-356)||(21915997-21916061)
chr8 (165-237)||(19278748-19278822)
chr8 (292-361)||(19110834-19110903)
chr8 (292-361)||(19117125-19117194)
chr8 (24-157)||(19278628-19278767)
chr8 (293-356)||(19498051-19498114)
chr8 (293-356)||(22047559-22047622)
chr8 (292-356)||(22083444-22083508)
chr8 (293-356)||(19496003-19496066)
chr8 (292-356)||(8355194-8355258)
chr8 (292-356)||(28454363-28454427)
chr8 (292-356)||(18854575-18854639)
chr8 (292-356)||(18864943-18865007)
chr8 (292-353)||(22124960-22125021)
chr8 (292-356)||(16883600-16883664)
chr8 (292-353)||(22116150-22116211)
chr8 (292-356)||(29122700-29122764)
[»] chr7 (129 HSPs)
chr7 (21-303)||(18164765-18165047)
chr7 (14-303)||(18175836-18176125)
chr7 (21-303)||(9511104-9511385)
chr7 (14-303)||(18182508-18182797)
chr7 (21-290)||(40523453-40523722)
chr7 (14-290)||(60762-61038)
chr7 (21-303)||(12703501-12703782)
chr7 (21-290)||(49051116-49051384)
chr7 (14-303)||(16407380-16407669)
chr7 (19-303)||(20703080-20703364)
chr7 (25-303)||(15162917-15163195)
chr7 (14-303)||(11365928-11366219)
chr7 (19-303)||(32767407-32767691)
chr7 (25-303)||(15156266-15156544)
chr7 (14-303)||(13690824-13691113)
chr7 (21-266)||(14330555-14330799)
chr7 (21-266)||(14337139-14337383)
chr7 (33-303)||(11232402-11232672)
chr7 (14-303)||(13684193-13684482)
chr7 (33-303)||(11239089-11239359)
chr7 (14-303)||(44786560-44786849)
chr7 (14-303)||(44793201-44793490)
chr7 (69-290)||(15021852-15022073)
chr7 (33-303)||(1347225-1347495)
chr7 (14-303)||(14655502-14655791)
chr7 (69-290)||(21405-21626)
chr7 (69-290)||(8202236-8202457)
chr7 (24-266)||(20205-20448)
chr7 (24-255)||(13569656-13569887)
chr7 (24-266)||(9409698-9409942)
chr7 (26-303)||(4318655-4318933)
chr7 (24-266)||(6017283-6017528)
chr7 (24-266)||(18530998-18531241)
chr7 (26-276)||(14958913-14959158)
chr7 (26-255)||(7535947-7536177)
chr7 (26-276)||(11262078-11262323)
chr7 (69-303)||(8705714-8705949)
chr7 (26-276)||(12692245-12692490)
chr7 (26-276)||(26419749-26419994)
chr7 (26-276)||(11548377-11548623)
chr7 (26-276)||(11554973-11555219)
chr7 (69-303)||(18553684-18553919)
chr7 (69-303)||(23520115-23520350)
chr7 (24-260)||(12705000-12705240)
chr7 (24-236)||(32658-32874)
chr7 (24-236)||(71108-71324)
chr7 (24-236)||(75217-75433)
chr7 (24-236)||(12718217-12718433)
chr7 (24-236)||(16113790-16114006)
chr7 (24-236)||(16116943-16117159)
chr7 (24-236)||(12723128-12723344)
chr7 (24-236)||(18282915-18283131)
chr7 (24-236)||(18278952-18279168)
chr7 (118-303)||(8712385-8712571)
chr7 (38-260)||(15083696-15083912)
chr7 (38-264)||(18556752-18556973)
chr7 (38-260)||(13148940-13149155)
chr7 (60-264)||(15728105-15728302)
chr7 (109-264)||(14216705-14216854)
chr7 (164-276)||(14952974-14953086)
chr7 (141-303)||(10869184-10869347)
chr7 (141-303)||(10875264-10875427)
chr7 (195-294)||(20871301-20871400)
chr7 (164-263)||(44408554-44408653)
chr7 (93-236)||(1859245-1859381)
chr7 (38-260)||(39721766-39721982)
chr7 (93-260)||(45170451-45170612)
chr7 (141-303)||(18585497-18585660)
chr7 (136-260)||(18425185-18425307)
chr7 (136-260)||(26291897-26292019)
chr7 (93-263)||(8917209-8917372)
chr7 (172-276)||(15380567-15380671)
chr7 (141-260)||(12714413-12714530)
chr7 (141-236)||(7519531-7519622)
chr7 (60-263)||(13461542-13461738)
chr7 (38-260)||(25927607-25927822)
chr7 (109-260)||(16724806-16724951)
chr7 (109-260)||(17701820-17701965)
chr7 (138-233)||(2530616-2530708)
chr7 (38-260)||(9593132-9593345)
chr7 (165-236)||(13918981-13919052)
chr7 (38-263)||(16457463-16457679)
chr7 (168-264)||(35151421-35151517)
chr7 (141-236)||(16907675-16907768)
chr7 (38-260)||(6800998-6801211)
chr7 (165-236)||(16275324-16275395)
chr7 (112-236)||(14932954-14933071)
chr7 (112-236)||(15356389-15356506)
chr7 (112-236)||(15360503-15360620)
chr7 (26-162)||(14953061-14953192)
chr7 (26-162)||(44408448-44408579)
chr7 (292-356)||(9511439-9511503)
chr7 (292-356)||(12703836-12703900)
chr7 (292-356)||(18165102-18165166)
chr7 (292-356)||(40523790-40523854)
chr7 (24-186)||(26291996-26292162)
chr7 (110-260)||(2832636-2832778)
chr7 (24-159)||(16907576-16907718)
chr7 (292-361)||(44786904-44786973)
chr7 (292-361)||(44793545-44793614)
chr7 (292-356)||(16407723-16407787)
chr7 (292-356)||(49050985-49051049)
chr7 (69-159)||(10869301-10869392)
chr7 (69-159)||(10875381-10875472)
chr7 (69-260)||(16583040-16583224)
chr7 (69-159)||(18585452-18585543)
chr7 (25-186)||(18425284-18425448)
chr7 (164-260)||(20578-20673)
chr7 (292-356)||(21276-21338)
chr7 (292-356)||(8202524-8202586)
chr7 (24-159)||(12714487-12714629)
chr7 (292-356)||(15021723-15021785)
chr7 (69-260)||(14152140-14152325)
chr7 (167-260)||(12317910-12318006)
chr7 (167-236)||(9751984-9752055)
chr7 (167-219)||(13635696-13635747)
chr7 (167-260)||(15605497-15605594)
chr7 (38-159)||(2530496-2530614)
chr7 (292-361)||(14655845-14655914)
chr7 (69-122)||(8719312-8719365)
chr7 (38-159)||(13918884-13919002)
chr7 (292-356)||(1347107-1347171)
chr7 (292-356)||(11365810-11365874)
chr7 (292-356)||(20703418-20703482)
chr7 (292-356)||(20871463-20871527)
chr7 (292-356)||(32767289-32767353)
chr7 (26-64)||(14148524-14148562)
chr7 (141-190)||(26292016-26292063)
chr7 (114-159)||(8712502-8712547)
[»] chr2 (96 HSPs)
chr2 (21-303)||(22321078-22321360)
chr2 (21-303)||(22327231-22327513)
chr2 (21-303)||(1842814-1843095)
chr2 (14-303)||(27598995-27599283)
chr2 (21-290)||(27617042-27617310)
chr2 (14-303)||(29233261-29233549)
chr2 (14-303)||(29346560-29346848)
chr2 (19-303)||(24914056-24914340)
chr2 (69-356)||(19490086-19490381)
chr2 (14-303)||(23170769-23171058)
chr2 (14-303)||(23582026-23582315)
chr2 (21-290)||(26877660-26877928)
chr2 (19-303)||(12828803-12829087)
chr2 (14-290)||(10873282-10873558)
chr2 (14-303)||(16928087-16928376)
chr2 (14-303)||(16996781-16997070)
chr2 (14-303)||(17003414-17003703)
chr2 (69-290)||(9340006-9340227)
chr2 (69-290)||(9488640-9488861)
chr2 (69-290)||(9607901-9608122)
chr2 (69-290)||(16922255-16922476)
chr2 (69-290)||(28432074-28432295)
chr2 (69-303)||(13306751-13306985)
chr2 (69-303)||(16985654-16985888)
chr2 (69-290)||(27215789-27216010)
chr2 (45-290)||(10865917-10866162)
chr2 (24-266)||(13970480-13970722)
chr2 (24-266)||(24714465-24714707)
chr2 (26-266)||(37318029-37318269)
chr2 (24-266)||(41604843-41605085)
chr2 (24-266)||(41610740-41610982)
chr2 (24-266)||(45057536-45057778)
chr2 (24-266)||(30971091-30971336)
chr2 (26-266)||(11677200-11677441)
chr2 (26-266)||(24641075-24641316)
chr2 (26-276)||(24502860-24503105)
chr2 (26-262)||(21147404-21147638)
chr2 (69-303)||(27369021-27369256)
chr2 (69-303)||(44381353-44381588)
chr2 (69-303)||(27375531-27375766)
chr2 (69-303)||(44388023-44388258)
chr2 (24-260)||(12901857-12902097)
chr2 (24-236)||(10101994-10102210)
chr2 (24-236)||(24628820-24629036)
chr2 (24-236)||(24648904-24649120)
chr2 (24-236)||(27601341-27601557)
chr2 (24-236)||(27379773-27379989)
chr2 (24-236)||(27383819-27384035)
chr2 (38-236)||(19928607-19928798)
chr2 (38-260)||(30345381-30345597)
chr2 (38-263)||(18855564-18855782)
chr2 (24-164)||(24872519-24872660)
chr2 (24-164)||(24880404-24880545)
chr2 (38-264)||(60598-60817)
chr2 (141-266)||(24872609-24872736)
chr2 (141-266)||(24880494-24880621)
chr2 (93-235)||(41666759-41666895)
chr2 (60-263)||(23186858-23187053)
chr2 (60-263)||(23598121-23598316)
chr2 (93-260)||(31344662-31344823)
chr2 (136-263)||(26124966-26125090)
chr2 (165-263)||(27195507-27195605)
chr2 (14-142)||(10866263-10866391)
chr2 (165-260)||(1282913-1283008)
chr2 (165-260)||(41531491-41531586)
chr2 (38-260)||(22461295-22461508)
chr2 (292-356)||(26877995-26878059)
chr2 (292-356)||(27616911-27616975)
chr2 (292-356)||(28432362-28432426)
chr2 (292-361)||(16985530-16985599)
chr2 (292-361)||(17003290-17003359)
chr2 (201-266)||(30657567-30657632)
chr2 (292-356)||(22321415-22321479)
chr2 (292-356)||(22327568-22327632)
chr2 (292-350)||(27215664-27215722)
chr2 (292-361)||(13307040-13307109)
chr2 (292-361)||(16927963-16928032)
chr2 (292-361)||(16996657-16996726)
chr2 (293-356)||(10865787-10865850)
chr2 (293-356)||(10873152-10873215)
chr2 (93-162)||(27195581-27195650)
chr2 (292-356)||(9339877-9339939)
chr2 (292-356)||(9488511-9488573)
chr2 (292-356)||(9607772-9607834)
chr2 (292-356)||(16922126-16922188)
chr2 (69-260)||(24735177-24735362)
chr2 (93-159)||(1282987-1283050)
chr2 (93-159)||(41531449-41531512)
chr2 (292-356)||(1842695-1842759)
chr2 (292-356)||(12828685-12828749)
chr2 (292-356)||(23170651-23170715)
chr2 (292-356)||(23581908-23581972)
chr2 (292-356)||(27598877-27598941)
chr2 (208-260)||(19691914-19691967)
chr2 (191-236)||(22134501-22134546)
chr2 (292-356)||(24914394-24914459)
[»] chr1 (70 HSPs)
chr1 (14-303)||(47658945-47659234)
chr1 (21-303)||(20216020-20216301)
chr1 (14-303)||(18600191-18600480)
chr1 (14-303)||(41348937-41349226)
chr1 (14-303)||(41478663-41478952)
chr1 (14-290)||(44844969-44845245)
chr1 (14-303)||(41356374-41356663)
chr1 (14-303)||(16345860-16346149)
chr1 (14-303)||(21828445-21828734)
chr1 (14-303)||(16352508-16352798)
chr1 (14-303)||(51328764-51329053)
chr1 (14-303)||(51335398-51335687)
chr1 (69-290)||(43078163-43078384)
chr1 (69-290)||(46157482-46157703)
chr1 (24-266)||(21807311-21807553)
chr1 (24-266)||(21835119-21835361)
chr1 (24-266)||(33386334-33386576)
chr1 (24-266)||(33392979-33393221)
chr1 (24-266)||(50887864-50888109)
chr1 (26-276)||(19111151-19111402)
chr1 (26-263)||(19104507-19104745)
chr1 (26-266)||(20525328-20525569)
chr1 (24-266)||(8304894-8305138)
chr1 (26-276)||(23762961-23763206)
chr1 (69-303)||(27898811-27899046)
chr1 (69-303)||(43063428-43063663)
chr1 (69-303)||(49334291-49334526)
chr1 (69-296)||(44755831-44756059)
chr1 (69-303)||(18626436-18626671)
chr1 (70-303)||(33384789-33385023)
chr1 (24-236)||(1010272-1010488)
chr1 (24-236)||(52639090-52639306)
chr1 (24-260)||(21406881-21407120)
chr1 (24-236)||(16375798-16376015)
chr1 (182-303)||(21844019-21844140)
chr1 (38-260)||(1925519-1925735)
chr1 (38-260)||(20924533-20924749)
chr1 (136-236)||(41388478-41388576)
chr1 (38-260)||(20137869-20138083)
chr1 (136-237)||(20229466-20229565)
chr1 (137-260)||(39244380-39244500)
chr1 (137-260)||(39247935-39248055)
chr1 (138-236)||(33797068-33797163)
chr1 (38-260)||(19211654-19211867)
chr1 (14-121)||(21844140-21844247)
chr1 (165-260)||(46975276-46975371)
chr1 (38-260)||(12646657-12646870)
chr1 (292-356)||(20216355-20216419)
chr1 (25-164)||(39244237-39244382)
chr1 (25-164)||(39247792-39247937)
chr1 (164-260)||(18882177-18882273)
chr1 (292-361)||(51329108-51329177)
chr1 (292-361)||(51335742-51335811)
chr1 (292-356)||(44845312-44845376)
chr1 (167-260)||(36819536-36819629)
chr1 (25-186)||(41388337-41388501)
chr1 (293-356)||(41349280-41349343)
chr1 (33-186)||(20229333-20229489)
chr1 (26-130)||(21437686-21437789)
chr1 (292-356)||(43078034-43078096)
chr1 (292-356)||(46157770-46157832)
chr1 (69-260)||(21312902-21313087)
chr1 (167-260)||(21172786-21172882)
chr1 (293-356)||(41356717-41356780)
chr1 (167-236)||(16080645-16080711)
chr1 (38-159)||(46975350-46975468)
chr1 (292-356)||(16346203-16346267)
chr1 (292-356)||(16352852-16352916)
chr1 (292-356)||(21828327-21828391)
chr1 (292-356)||(21843901-21843965)
[»] scaffold0029 (7 HSPs)
scaffold0029 (23-303)||(105980-106260)
scaffold0029 (23-303)||(126215-126494)
scaffold0029 (25-236)||(80091-80305)
scaffold0029 (24-260)||(61951-62189)
scaffold0029 (24-260)||(65867-66105)
scaffold0029 (292-353)||(126548-126609)
scaffold0029 (292-353)||(106314-106375)
[»] scaffold0028 (9 HSPs)
scaffold0028 (21-303)||(67241-67522)
scaffold0028 (26-353)||(56704-57039)
scaffold0028 (26-353)||(41197-41532)
scaffold0028 (24-266)||(6759-7001)
scaffold0028 (24-266)||(13284-13526)
scaffold0028 (24-266)||(22812-23054)
scaffold0028 (24-236)||(59060-59276)
scaffold0028 (292-356)||(67122-67186)
scaffold0028 (191-236)||(132483-132528)
[»] scaffold0061 (3 HSPs)
scaffold0061 (14-290)||(59546-59822)
scaffold0061 (24-236)||(67642-67858)
scaffold0061 (292-356)||(59889-59953)
[»] scaffold0017 (2 HSPs)
scaffold0017 (14-290)||(138811-139087)
scaffold0017 (292-356)||(138680-138744)
[»] scaffold0044 (8 HSPs)
scaffold0044 (21-290)||(30271-30541)
scaffold0044 (19-303)||(7792-8076)
scaffold0044 (22-266)||(72991-73235)
scaffold0044 (93-264)||(62041-62207)
scaffold0044 (292-356)||(30139-30203)
scaffold0044 (69-236)||(18999-19156)
scaffold0044 (69-260)||(12689-12872)
scaffold0044 (292-356)||(7674-7738)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (19-303)||(306829-307113)
scaffold0005 (292-356)||(306711-306775)
[»] scaffold0141 (3 HSPs)
scaffold0141 (14-303)||(37772-38062)
scaffold0141 (109-260)||(14548-14693)
scaffold0141 (293-356)||(37655-37718)
[»] scaffold0049 (2 HSPs)
scaffold0049 (14-303)||(76750-77040)
scaffold0049 (293-356)||(77094-77157)
[»] scaffold0003 (5 HSPs)
scaffold0003 (14-303)||(56705-56994)
scaffold0003 (38-260)||(70854-71069)
scaffold0003 (38-260)||(139497-139712)
scaffold0003 (110-263)||(100854-100998)
scaffold0003 (292-354)||(56589-56651)
[»] scaffold0109 (9 HSPs)
scaffold0109 (26-303)||(26358-26636)
scaffold0109 (93-236)||(38978-39116)
scaffold0109 (135-262)||(43015-43144)
scaffold0109 (109-236)||(6770-6890)
scaffold0109 (93-263)||(11461-11626)
scaffold0109 (138-260)||(36451-36570)
scaffold0109 (24-189)||(43145-43311)
scaffold0109 (38-159)||(36330-36449)
scaffold0109 (135-189)||(43117-43172)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (24-266)||(12199-12441)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (24-266)||(77969-78211)
scaffold0004 (26-159)||(60878-61006)
[»] scaffold0140 (2 HSPs)
scaffold0140 (69-290)||(38427-38648)
scaffold0140 (292-356)||(38295-38359)
[»] scaffold0055 (2 HSPs)
scaffold0055 (69-290)||(25093-25314)
scaffold0055 (292-356)||(24964-25026)
[»] scaffold0572 (1 HSPs)
scaffold0572 (24-266)||(9607-9849)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (24-266)||(73749-73991)
scaffold0009 (167-260)||(228598-228691)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (26-303)||(19688-19967)
[»] scaffold0744 (1 HSPs)
scaffold0744 (24-266)||(3782-4024)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (24-266)||(8963-9206)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (72-303)||(32473-32696)
[»] scaffold0013 (4 HSPs)
scaffold0013 (26-266)||(9092-9332)
scaffold0013 (178-260)||(73818-73900)
scaffold0013 (167-260)||(2899-2992)
scaffold0013 (183-260)||(81468-81544)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (24-266)||(15101-15345)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (26-276)||(241807-242052)
scaffold0010 (38-260)||(23003-23216)
[»] scaffold0525 (1 HSPs)
scaffold0525 (24-260)||(4214-4450)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (69-303)||(4230-4465)
[»] scaffold0233 (1 HSPs)
scaffold0233 (26-291)||(14651-14912)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (26-276)||(9918-10169)
[»] scaffold0553 (1 HSPs)
scaffold0553 (69-303)||(8508-8743)
[»] scaffold0242 (3 HSPs)
scaffold0242 (26-276)||(19325-19570)
scaffold0242 (114-276)||(25472-25634)
scaffold0242 (26-190)||(25585-25744)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (69-303)||(21923-22158)
[»] scaffold0372 (1 HSPs)
scaffold0372 (24-236)||(5440-5656)
[»] scaffold0349 (1 HSPs)
scaffold0349 (24-236)||(11971-12187)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (24-234)||(1-215)
[»] scaffold0256 (1 HSPs)
scaffold0256 (26-276)||(25087-25332)
[»] scaffold0231 (2 HSPs)
scaffold0231 (117-266)||(1-150)
scaffold0231 (114-159)||(25-70)
[»] scaffold0229 (3 HSPs)
scaffold0229 (165-303)||(11988-12127)
scaffold0229 (292-356)||(12181-12245)
scaffold0229 (38-162)||(11891-12012)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (38-264)||(9684-9904)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (93-264)||(16823-16989)
[»] scaffold0157 (1 HSPs)
scaffold0157 (38-236)||(33050-33243)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (38-260)||(9206-9421)
[»] scaffold0371 (1 HSPs)
scaffold0371 (60-264)||(15117-15315)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (93-263)||(9118-9282)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (93-260)||(36531-36692)
scaffold0031 (69-260)||(53339-53524)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (38-260)||(189767-189983)
scaffold0012 (38-260)||(25075-25290)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (38-263)||(36090-36307)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (93-263)||(77331-77495)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (93-263)||(1658-1822)
[»] scaffold0656 (1 HSPs)
scaffold0656 (165-276)||(1102-1213)
[»] scaffold0299 (1 HSPs)
scaffold0299 (38-236)||(6490-6681)
[»] scaffold0111 (2 HSPs)
scaffold0111 (93-262)||(8283-8445)
scaffold0111 (136-262)||(15403-15525)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (171-262)||(14752-14843)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (60-260)||(20592-20785)
[»] scaffold0284 (1 HSPs)
scaffold0284 (38-236)||(18164-18355)
[»] scaffold0130 (2 HSPs)
scaffold0130 (60-236)||(6128-6297)
scaffold0130 (165-236)||(8225-8296)
[»] scaffold0546 (2 HSPs)
scaffold0546 (109-263)||(6417-6564)
scaffold0546 (93-263)||(1681-1846)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (38-260)||(63640-63855)
[»] scaffold1552 (1 HSPs)
scaffold1552 (60-263)||(150-346)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (136-260)||(208073-208194)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (113-260)||(29337-29477)
[»] scaffold1852 (1 HSPs)
scaffold1852 (165-260)||(2-97)
[»] scaffold0486 (1 HSPs)
scaffold0486 (165-260)||(9377-9472)
[»] scaffold0780 (1 HSPs)
scaffold0780 (24-133)||(3-112)
[»] scaffold0200 (1 HSPs)
scaffold0200 (165-260)||(11495-11591)
[»] scaffold0235 (1 HSPs)
scaffold0235 (60-236)||(16488-16654)
[»] scaffold0405 (1 HSPs)
scaffold0405 (164-236)||(9889-9960)
[»] scaffold0379 (1 HSPs)
scaffold0379 (292-356)||(11962-12026)
[»] scaffold0228 (1 HSPs)
scaffold0228 (167-260)||(18859-18953)
[»] scaffold0051 (2 HSPs)
scaffold0051 (165-228)||(30725-30788)
scaffold0051 (38-159)||(30767-30885)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (25-186)||(80871-81026)
[»] scaffold0560 (1 HSPs)
scaffold0560 (24-143)||(5907-6026)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (38-246)||(173093-173292)
[»] scaffold0166 (1 HSPs)
scaffold0166 (164-260)||(10283-10379)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (165-246)||(28867-28947)
[»] scaffold0120 (1 HSPs)
scaffold0120 (38-233)||(20122-20307)
[»] scaffold0156 (2 HSPs)
scaffold0156 (26-132)||(2699-2804)
scaffold0156 (205-248)||(2651-2694)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (69-260)||(66562-66747)
[»] scaffold0697 (1 HSPs)
scaffold0697 (26-114)||(6522-6610)
[»] scaffold0146 (1 HSPs)
scaffold0146 (203-236)||(5-38)
[»] scaffold0628 (1 HSPs)
scaffold0628 (191-236)||(3397-3442)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 132)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 14 - 303
Target Start/End: Original strand, 2870221 - 2870510
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2870221 gcataagtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatattgataagttgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcatt 2870320  T
Q  114 gagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2870321 gagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga 2870420  T
Q  214 cgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  2870421 cgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgaatgaatacgtgat 2870510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 14 - 303
Target Start/End: Original strand, 2876836 - 2877125
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2876836 gcataagtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatattgataagttgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcatt 2876935  T
Q  114 gagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2876936 gagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga 2877035  T
Q  214 cgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  2877036 cgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgaatgaatacgtgat 2877125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 14 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 8797212 - 8796923
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8797212 gcataagtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcatt 8797113  T
Q  114 gagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8797112 gagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga 8797013  T
Q  214 cgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  8797012 cgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgat 8796923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 20 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 26130481 - 26130199
Alignment:
Q  20 gtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagctt 119  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26130481 gtatatgatgaagtt-agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccatgcatagcatctcattgagctt 26130383  T
Q  120 agtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattg 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26130382 agtcctcaccacgaatattaggagctttgtcccccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattg 26130283  T
Q  220 gtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26130282 gtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 26130199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 14 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 30694382 - 30694094
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcatt 113  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  30694382 gcataagtatatgatgaagtt-agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgactacgatgttttgttcataagtgtccatgcatagaatctcatt 30694284  T
Q  114 gagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30694283 gagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga 30694184  T
Q  214 cgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30694183 cgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 30694094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 14 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 20801777 - 20801489
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  20801777 gcataagtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagt-gattacgaagttttgtccatatgtgtccatgcatagcatatcatt 20801679  T
Q  114 gagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga 213  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20801678 gagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga 20801579  T
Q  214 cgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  20801578 cgattggtaccacatgcatataatgagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatgattgattatgtgat 20801489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 14 - 303
Target Start/End: Original strand, 27328142 - 27328431
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcatt 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27328142 gcataagtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgctgattacgatgttttgttcataagtgtccatgcatagcatctcatt 27328241  T
Q  114 gagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga 213  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27328242 gagcttagtcctcaccacgattattaggagttttgtcctccgcacattttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga 27328341  T
Q  214 cgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  27328342 cgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatgattgaatacgtgat 27328431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 14 - 303
Target Start/End: Original strand, 27388882 - 27389171
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcatt 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27388882 gcataagtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgctgattacgatgttttgttcataagtgtccatgcatagcatctcatt 27388981  T
Q  114 gagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga 213  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27388982 gagcttagtcctcaccacgattattaggagttttgtcctccgcacattttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga 27389081  T
Q  214 cgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  27389082 cgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatgattgaatacgtgat 27389171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 14 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 20060670 - 20060394
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20060670 gcataagtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcatt 20060571  T
Q  114 gagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga 213  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20060570 gagctttgtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga 20060471  T
Q  214 cgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatga 290  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20060470 cgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatga 20060394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 21 - 303
Target Start/End: Original strand, 20649884 - 20650165
Alignment:
Q  21 tatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagctta 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20649884 tatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagt-gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagctta 20649982  T
Q  121 gtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20649983 gtcctcaccacgaatattaggagttttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 20650082  T
Q  221 taccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || |||||    
T  20650083 taccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttggtaatgaatgaatatgtgat 20650165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 21 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 6980673 - 6980392
Alignment:
Q  21 tatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagctta 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6980673 tatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagt-gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagctta 6980575  T
Q  121 gtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6980574 gtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 6980475  T
Q  221 taccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    |||||||||||||| | ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| || |||||    
T  6980474 taccacatgcatatgaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgcctcgttgatgatgaatgaatatgtgat 6980392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 14 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 12762723 - 12762435
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12762723 gcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcatt 12762624  T
Q  114 gagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga 213  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12762623 gagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacg-tttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga 12762525  T
Q  214 cgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||    
T  12762524 cgattggtaccacatgcataaaaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgaatgaatatgtgat 12762435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 14 - 303
Target Start/End: Original strand, 27430369 - 27430658
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataa-gtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcat 112  Q
    ||||| || |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  27430369 gcatatgtttatgataaggtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttttgttcataagtgtccatgcatagcatatcat 27430467  T
Q  113 tgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg 212  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27430468 tgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg 27430567  T
Q  213 acgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  27430568 acgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatgattggttatgtgat 27430658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 14 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 30597239 - 30596958
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcatt 113  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||| |||||    
T  30597239 gcataagtatatgatgaagttaagctccaaattattggatgcatgtcgataagttgattacgatgttttgt--------gtccatgcatagcatatcatt 30597148  T
Q  114 gagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30597147 gagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga 30597048  T
Q  214 cgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||    
T  30597047 cgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcacgattaagatgtcttgttgataatgaatgaatatgtgat 30596958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 14 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 28287377 - 28287087
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcat-gttgataa-gtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctca 111  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| |||||| | |  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||    
T  28287377 gcatatgtatatgataaggtttagctccaaattattggacgcattgttgattacgatgattacg-tgttttgttcataagtgtccatgcattacatatca 28287279  T
Q  112 ttgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgat 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28287278 ttgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgat 28287179  T
Q  212 gacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  28287178 gacgattggtaccacatgcatatatggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgat 28287087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 69 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 8228832 - 8228598
Alignment:
Q  69 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttatagg 168  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8228832 gattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttatagg 8228733  T
Q  169 agctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgat 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  8228732 agctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgat 8228633  T
Q  269 taagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || |||||    
T  8228632 taagatgccttgttgataatgaatgaatatgtgat 8228598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 69 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 18931021 - 18930800
Alignment:
Q  69 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttatagg 168  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18931021 gattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttatagg 18930922  T
Q  169 agctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgat 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  18930921 agctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgat 18930822  T
Q  269 taagatgccttgttgataatga 290  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  18930821 taagatgccttgttgataatga 18930800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 69 - 290
Target Start/End: Original strand, 29587841 - 29588062
Alignment:
Q  69 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttatagg 168  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29587841 gattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttatagg 29587940  T
Q  169 agctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgat 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  29587941 agctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgat 29588040  T
Q  269 taagatgccttgttgataatga 290  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  29588041 taagatgccttgttgataatga 29588062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 69 - 290
Target Start/End: Original strand, 29593982 - 29594203
Alignment:
Q  69 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttatagg 168  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29593982 gattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttatagg 29594081  T
Q  169 agctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgat 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  29594082 agctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgat 29594181  T
Q  269 taagatgccttgttgataatga 290  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  29594182 taagatgccttgttgataatga 29594203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 14 - 303
Target Start/End: Original strand, 28258539 - 28258829
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcat-gttgataa-gtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctca 111  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| |||||| | |  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||    
T  28258539 gcatatgtatatgataaggtttagctccaaattattggacgcattgttgattacgatgattacg-tgttttgttcataagtgtccatgcattacatatca 28258637  T
Q  112 ttgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgat 211  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28258638 ttgagcttagtcttcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgat 28258737  T
Q  212 gacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  28258738 gacgattggtaccacatgcatatatggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgat 28258829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 14 - 303
Target Start/End: Original strand, 28265163 - 28265453
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcat-gttgataa-gtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctca 111  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| |||||| | |  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||    
T  28265163 gcatatgtatatgataaggtttagctccaaattattggacgcattgttgattacgatgattacg-tgttttgttcataagtgtccatgcattacatatca 28265261  T
Q  112 ttgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgat 211  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28265262 ttgagcttagtcttcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgat 28265361  T
Q  212 gacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  28265362 gacgattggtaccacatgcatatatggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgat 28265453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 14 - 303
Target Start/End: Original strand, 28337288 - 28337578
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcat-gttgataa-gtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctca 111  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| |||||| | |  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||    
T  28337288 gcatatgtatatgataaggtttagctccaaattattggacgcattgttgattacgatgattacg-tgttttgttcataagtgtccatgcattacatatca 28337386  T
Q  112 ttgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgat 211  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28337387 ttgagcttagtcttcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgat 28337486  T
Q  212 gacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  28337487 gacgattggtaccacatgcatatatggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgat 28337578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 14 - 303
Target Start/End: Original strand, 28343912 - 28344202
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcat-gttgataa-gtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctca 111  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| |||||| | |  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||    
T  28343912 gcatatgtatatgataaggtttagctccaaattattggacgcattgttgattacgatgattacg-tgttttgttcataagtgtccatgcattacatatca 28344010  T
Q  112 ttgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgat 211  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28344011 ttgagcttagtcttcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgat 28344110  T
Q  212 gacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  28344111 gacgattggtaccacatgcatatatggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgat 28344202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 24 - 266
Target Start/End: Original strand, 3708592 - 3708834
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 123  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3708592 atgatgatgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgttgattacggtgatttgttcataagagtccatgcatagcatttcattgagcttagtc 3708691  T
Q  124 ctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 223  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3708692 ctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttatcggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 3708791  T
Q  224 cacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 266  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3708792 cacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 3708834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 24 - 266
Target Start/End: Original strand, 24291156 - 24291398
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 123  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24291156 atgatgatgtttagctccaaattgttggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 24291255  T
Q  124 ctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 223  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24291256 ctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 24291355  T
Q  224 cacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 266  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24291356 cacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 24291398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 24 - 266
Target Start/End: Original strand, 31317196 - 31317438
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 123  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31317196 atgatgatgtttagctccaaattgttggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 31317295  T
Q  124 ctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 223  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31317296 ctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 31317395  T
Q  224 cacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 266  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31317396 cacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 31317438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 69 - 290
Target Start/End: Original strand, 30638291 - 30638512
Alignment:
Q  69 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttatagg 168  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30638291 gattatgatgttttgttcatctgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttatagg 30638390  T
Q  169 agctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgat 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  30638391 agctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgat 30638490  T
Q  269 taagatgccttgttgataatga 290  Q
    ||||||||||||||||| ||||    
T  30638491 taagatgccttgttgatgatga 30638512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 72 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 28314516 - 28314285
Alignment:
Q  72 tacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagc 171  Q
    ||||||||||||||  || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28314516 tacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagc 28314417  T
Q  172 tttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaa 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  28314416 tttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatatggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaa 28314317  T
Q  272 gatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  28314316 gatgccttgttgataatgattgaatatgtgat 28314285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 26 - 291
Target Start/End: Original strand, 1545154 - 1545419
Alignment:
Q  26 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataa-gtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcc 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1545154 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcc 1545252  T
Q  125 tcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 224  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1545253 tcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgtttattaggagctttgtcctccgcacgaataaagtatatttatacttatgatgacgattggtacc 1545352  T
Q  225 acatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgat 291  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1545353 acatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgat 1545419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 24 - 266
Target Start/End: Original strand, 24315184 - 24315426
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 123  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24315184 atgatgatgtttagctccaaattgttggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcataacatctcattgagcttagtc 24315283  T
Q  124 ctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 223  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24315284 ctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 24315383  T
Q  224 cacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 266  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24315384 cacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 24315426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 24 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 25110836 - 25110594
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  25110836 atgatgaagtttagctccaaattattagatgcatgttgatatgatgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatttcattaagtttagtc 25110737  T
Q  124 ctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 223  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25110736 ctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcatgattaaagtatattaatacttatgatgatgattggtac 25110637  T
Q  224 cacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 266  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25110636 cacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 25110594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 24 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 25117439 - 25117197
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  25117439 atgatgaagtttagctccaaattattagatgcatgttgatatgatgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatttcattaagtttagtc 25117340  T
Q  124 ctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 223  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25117339 ctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcatgattaaagtatattaatacttatgatgatgattggtac 25117240  T
Q  224 cacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 266  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25117239 cacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 25117197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 72 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 27185655 - 27185424
Alignment:
Q  72 tacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagc 171  Q
    ||||||||||||||  |  | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27185655 tacgatgttttgttgttgagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagc 27185556  T
Q  172 tttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaa 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  27185555 tttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaa 27185456  T
Q  272 gatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  27185455 gatgccttgttgataatgattgaatatgtgat 27185424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 72 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 27207491 - 27207260
Alignment:
Q  72 tacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagc 171  Q
    ||||||||||||||  |  | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27207491 tacgatgttttgttgttgagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagc 27207392  T
Q  172 tttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaa 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  27207391 tttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaa 27207292  T
Q  272 gatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  27207291 gatgccttgttgataatgattgaatatgtgat 27207260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 72 - 303
Target Start/End: Original strand, 27241737 - 27241968
Alignment:
Q  72 tacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagc 171  Q
    ||||||||||||||  |  | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27241737 tacgatgttttgttgttgagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagc 27241836  T
Q  172 tttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaa 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  27241837 tttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaa 27241936  T
Q  272 gatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  27241937 gatgccttgttgataatgattgaatatgtgat 27241968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 72 - 303
Target Start/End: Original strand, 27263585 - 27263816
Alignment:
Q  72 tacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagc 171  Q
    ||||||||||||||  |  | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27263585 tacgatgttttgttgttgagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagc 27263684  T
Q  172 tttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaa 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  27263685 tttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaa 27263784  T
Q  272 gatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  27263785 gatgccttgttgataatgattgaatatgtgat 27263816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 26 - 303
Target Start/End: Original strand, 1539055 - 1539332
Alignment:
Q  26 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataa-gtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcc 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||| |||||||||  || | ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  1539055 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttttgttgttaagagtccaggcatagcatatcattgagcttagtcc 1539153  T
Q  125 tcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 224  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1539154 tcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgtttattaggagttttgtcctccgcacgaataaagtatatttatacttatgatgacgattggtacc 1539253  T
Q  225 acatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  1539254 acatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgat 1539332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 24 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 4167920 - 4167676
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagt 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  4167920 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcattagcatttcattgagcttagt 4167821  T
Q  123 cctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggt 221  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4167820 cctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggt 4167721  T
Q  222 accacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 266  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  4167720 accacatgcatataaggattctaagagcattgtcacattgtcatg 4167676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 24 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 4208600 - 4208356
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagt 122  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  4208600 atgatgacgtttagctccaaattattagatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcattagcatttcattgagcttagt 4208501  T
Q  123 cctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggt 221  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4208500 cctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggt 4208401  T
Q  222 accacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 266  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4208400 accacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 4208356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 24 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 34832652 - 34832407
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagt 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||| | |||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  34832652 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgatttgttcataagagtccatgcattagcatttcattaagcttagt 34832553  T
Q  123 cctcaccacgaat-attaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 220  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34832552 cctcaccacgatttattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacaattgg 34832453  T
Q  221 taccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 266  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34832452 taccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 34832407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 26 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 19808520 - 19808269
Alignment:
Q  26 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcc 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||| || |||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  19808520 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 19808422  T
Q  125 tcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 223  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19808421 tcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 19808322  T
Q  224 cacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgc 276  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  19808321 cacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcgtgtctaagatgc 19808269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 26 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 25928289 - 25928051
Alignment:
Q  26 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcc 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||| || |||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  25928289 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 25928191  T
Q  125 tcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 223  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25928190 tcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 25928091  T
Q  224 cacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtc 263  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25928090 cacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtc 25928051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 26 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 22758844 - 22758604
Alignment:
Q  26 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcc 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||| || |||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  22758844 gatgacgtttagctccaaattattggatgcttattgatatgttgattacggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 22758746  T
Q  125 tcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 223  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22758745 tcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacg-ttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 22758647  T
Q  224 cacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 266  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22758646 cacatgcatataaggagtctaagagaattgtcgcattgtcatg 22758604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 26 - 248
Target Start/End: Original strand, 17037444 - 17037666
Alignment:
Q  26 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcct 125  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |  ||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17037444 gatgacgtttagctccaaattattggatgcacattgatatgatgattacggtgttttgttgataagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcct 17037543  T
Q  126 caccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacca 225  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17037544 caccacaattattaggagctttgtcctccgcacgtttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatatttatacttatgatgacgattggtacca 17037643  T
Q  226 catgcatataaagagtctaagag 248  Q
    ||||||||||| |||||||||||    
T  17037644 catgcatataaggagtctaagag 17037666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 26 - 266
Target Start/End: Original strand, 34370086 - 34370327
Alignment:
Q  26 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcc 124  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |  ||||||| || |||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  34370086 gatgacgtttagcttcaaattattggatgcatattgatatgatgattacggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 34370184  T
Q  125 tcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 223  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  34370185 tcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgttttaagtatattaatacttatgatgacgattgttac 34370284  T
Q  224 cacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 266  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34370285 cacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 34370327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 26 - 276
Target Start/End: Original strand, 34298734 - 34298979
Alignment:
Q  26 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcc 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  34298734 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacgatgttttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 34298831  T
Q  125 tcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 224  Q
    |||||| ||    |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34298832 tcaccatga----taggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 34298927  T
Q  225 acatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgc 276  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  34298928 acatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcgtgtctaagatgc 34298979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 21 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 20176941 - 20176697
Alignment:
Q  21 tatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgtttt-gttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagctt 119  Q
    |||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||| |||||| |||  || | |||||||||||||||||||||||||||    
T  20176941 tatatgatgacggttatctccaaattattggatgcacgttgatgtgttgattacggtgtttttgttgttaagagtccatgcatagcatctcattgagctt 20176842  T
Q  120 agtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacg-attaaagtatattaatactt-atgatgacgat 217  Q
    ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20176841 agtcctcaccaagatttttaggagctttgtcctccgcacgaattataggagctttgtcctccgcacgttttaaagtatattaatacttaatgatgacgat 20176742  T
Q  218 tggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgt 262  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  20176741 tggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgt 20176697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 69 - 303
Target Start/End: Original strand, 32565394 - 32565629
Alignment:
Q  69 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat-attaggagctttgtcctccgcacgttttatag 167  Q
    |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  32565394 gattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattattag 32565493  T
Q  168 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatga 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||     
T  32565494 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacggagtctaggagcattgtcacattgtcatgt 32565593  T
Q  268 ttaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
     ||  |||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  32565594 ctattatgctttgttgatgatgattgattatgtgat 32565629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 69 - 303
Target Start/End: Original strand, 16552172 - 16552407
Alignment:
Q  69 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat-attaggagctttgtcctccgcacgttttatag 167  Q
    |||||| ||||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  16552172 gattacaatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattattag 16552271  T
Q  168 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatga 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||     
T  16552272 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacggagtctaggagcattgtcacattgtcatgt 16552371  T
Q  268 ttaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
     ||  |||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  16552372 ctattatgctttgttgatgatgattgattatgtgat 16552407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 69 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 16576781 - 16576546
Alignment:
Q  69 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat-attaggagctttgtcctccgcacgttttatag 167  Q
    |||||| ||||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  16576781 gattacaatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattattag 16576682  T
Q  168 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatga 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||     
T  16576681 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacggagtctaggagcattgtcacattgtcatgt 16576582  T
Q  268 ttaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
     ||  |||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  16576581 ctattatgctttgttgatgatgattgattatgtgat 16576546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 69 - 303
Target Start/End: Original strand, 16618599 - 16618834
Alignment:
Q  69 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat-attaggagctttgtcctccgcacgttttatag 167  Q
    |||||| ||||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  16618599 gattacaatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattattag 16618698  T
Q  168 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatga 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||     
T  16618699 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacggagtctaggagcattgtcacattgtcatgt 16618798  T
Q  268 ttaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
     ||  |||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  16618799 ctattatgctttgttgatgatgattgattatgtgat 16618834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 69 - 303
Target Start/End: Original strand, 16628728 - 16628963
Alignment:
Q  69 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat-attaggagctttgtcctccgcacgttttatag 167  Q
    |||||| ||||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  16628728 gattacaatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattattag 16628827  T
Q  168 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatga 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||     
T  16628828 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacggagtctaggagcattgtcacattgtcatgt 16628927  T
Q  268 ttaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
     ||  |||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  16628928 ctattatgctttgttgatgatgattgattatgtgat 16628963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 14 - 159
Target Start/End: Original strand, 4233584 - 4233729
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4233584 gcataagtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcatt 4233683  T
Q  114 gagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacg 159  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4233684 gagcttagtcctcaccacaaatattaggagctttgtcctccgcacg 4233729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 262
Target Start/End: Original strand, 5834591 - 5834835
Alignment:
Q  21 tatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgtttt-gttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagctt 119  Q
    |||||||||| | ||| |||||||||||||||||||  |||||  || ||||||| |||||| |||  || | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  5834591 tatatgatgacggttatctccaaattattggatgcactttgatgtgttgattacggtgtttttgttgttaagagtccatgcatagtatctcattgagctt 5834690  T
Q  120 agtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacg-attaaagtatattaatactt-atgatgacgat 217  Q
    ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5834691 agtcctcaccatgatttttaggagctttgtcctccgcacgaattataggagctttgtcctccgcacgttttaaagtatattaatacttaatgatgacgat 5834790  T
Q  218 tggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgt 262  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  5834791 tggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgt 5834835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 262
Target Start/End: Original strand, 22159050 - 22159294
Alignment:
Q  21 tatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgtttt-gttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagctt 119  Q
    |||||||||| | ||| |||||||||||||||||||  |||||  || ||||||| |||||| |||  || | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  22159050 tatatgatgacggttaactccaaattattggatgcacattgatgtgttgattacggtgtttttgttgttaagagtccatgcatagaatctcattgagctt 22159149  T
Q  120 agtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacg-attaaagtatattaatactt-atgatgacgat 217  Q
    ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22159150 agtcctcaccaagatttttaggagctttgtcctccgcacgaattataggagctttgtcctccgcacgttttaaagtatattaatacttaatgatgacgat 22159249  T
Q  218 tggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgt 262  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  22159250 tggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgt 22159294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 69 - 303
Target Start/End: Original strand, 17017074 - 17017309
Alignment:
Q  69 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat-attaggagctttgtcctccgcacgttttatag 167  Q
    |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  17017074 gattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattattag 17017173  T
Q  168 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatga 267  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||     
T  17017174 gagctttgtcctccgcacgactaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatatggagtctaggagcattgtcacattgtcatgt 17017273  T
Q  268 ttaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
     ||  ||||  ||||||| ||||||||||| |||||    
T  17017274 ctattatgctatgttgatgatgattgattatgtgat 17017309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 154 - 303
Target Start/End: Original strand, 14053784 - 14053933
Alignment:
Q  154 cgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattg 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  14053784 cgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattg 14053883  T
Q  254 tcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  14053884 tcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgat 14053933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 135 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 14098485 - 14098317
Alignment:
Q  135 tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14098485 tattaggagctttgtcctccgcacgtttattaggagctttgtcctcctcacgattaaagtatatttatacttctgatgacgattggtaccacatgcatat 14098386  T
Q  235 aaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  14098385 aaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgtctaagatgctttgttgataatgattgaatacgtgat 14098317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 165 - 303
Target Start/End: Original strand, 4233708 - 4233846
Alignment:
Q  165 taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtca 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  4233708 taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtca 4233807  T
Q  265 tgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  4233808 tgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgat 4233846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 24 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 11566627 - 11566411
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  11566627 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 11566528  T
Q  115 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 214  Q
    ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11566527 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgac 11566433  T
Q  215 gattggtaccacatgcatataa 236  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  11566432 gattggtaccacatgcatataa 11566411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 24 - 236
Target Start/End: Original strand, 12619183 - 12619399
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  12619183 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 12619282  T
Q  115 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 214  Q
    ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12619283 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgac 12619377  T
Q  215 gattggtaccacatgcatataa 236  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  12619378 gattggtaccacatgcatataa 12619399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 24 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 19870355 - 19870139
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  19870355 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattatggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 19870256  T
Q  115 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 214  Q
    ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19870255 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgac 19870161  T
Q  215 gattggtaccacatgcatataa 236  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  19870160 gattggtaccacatgcatataa 19870139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 24 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 23394833 - 23394617
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  23394833 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 23394734  T
Q  115 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 214  Q
    ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23394733 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgac 23394639  T
Q  215 gattggtaccacatgcatataa 236  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  23394638 gattggtaccacatgcatataa 23394617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 24 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 8243598 - 8243382
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  8243598 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 8243499  T
Q  115 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 214  Q
    ||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8243498 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttca--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgac 8243404  T
Q  215 gattggtaccacatgcatataa 236  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  8243403 gattggtaccacatgcatataa 8243382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 24 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 23989685 - 23989469
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttt---------tgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||         ||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  23989685 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtggtttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 23989586  T
Q  115 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 214  Q
    ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23989585 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgac 23989491  T
Q  215 gattggtaccacatgcatataa 236  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  23989490 gattggtaccacatgcatataa 23989469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 38 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 16760011 - 16759818
Alignment:
Q  38 ctccaaattattggatgcatgt-tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaata 136  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||| ||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||       
T  16760011 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga--- 16759915  T
Q  137 ttaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa 236  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16759914 ttaggagctttgtcctccgcacgatt---aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa 16759818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 24 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 22862711 - 22862495
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||| ||| ||||||    
T  22862711 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcataacatttcattg 22862612  T
Q  115 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 214  Q
    || || |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22862611 agttttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgac 22862517  T
Q  215 gattggtaccacatgcatataa 236  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  22862516 gattggtaccacatgcatataa 22862495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 25 - 260
Target Start/End: Original strand, 31478326 - 31478565
Alignment:
Q  25 tgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattga 115  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| |||||||    
T  31478326 tgatgacgtttagcttcaaattattggatgcatgataatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattga 31478425  T
Q  116 gcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacg 215  Q
    |||| ||||||||||||    |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31478426 gctttgtcctcaccacgt---ttaggagctttgtccttcgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacg 31478520  T
Q  216 attggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    |||||||||| |||||||| ||| |||||||  |||||||||||||    
T  31478521 attggtaccaaatgcatat-aagtgtctaagttgcattgtcgcatt 31478565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 60 - 264
Target Start/End: Original strand, 1587859 - 1588056
Alignment:
Q  60 tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcac 158  Q
    |||||||| ||||| | |||||||||  || | |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||    ||||||||||||||||| |||    
T  1587859 tgataagttgattaaggtgttttgttgtta-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccatga----taggagctttgtcctccacac 1587952  T
Q  159 gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgc 257  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||    
T  1587953 gtttta--ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat-aagtgtctaagttgcattgtcgc 1588049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 109 - 263
Target Start/End: Original strand, 25135847 - 25135996
Alignment:
Q  109 tcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttat 208  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25135847 tcattgagctttgtcctcaccatga---ttaggagctttgtcctccgcacgattta--ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttat 25135941  T
Q  209 gatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgcattgtc 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  25135942 gatgacgattggtaccacatgcatat-aagtgtctaagttgcattgtcgcattgtc 25135996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 38 - 264
Target Start/End: Original strand, 5616920 - 5617140
Alignment:
Q  38 ctccaaattattggatgcatgt-tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat 135  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||| ||||| | |||||||||  || | |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||      
T  5616920 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaaggtgttttgttgtta-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccatga-- 5617015  T
Q  136 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 235  Q
      ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5617016 --taggagctttgtcctccacacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat- 5617110  T
Q  236 aagagtctaag-agcattgtcgcattgtca 264  Q
    ||| |||||||  || ||||||||||||||    
T  5617111 aagtgtctaagttgccttgtcgcattgtca 5617140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 93 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 22948769 - 22948608
Alignment:
Q  93 gtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaa 191  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  22948769 gtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgatt---aggagctttgtcctccgcacgattaa 22948677  T
Q  192 agtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||    
T  22948676 agtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat-aagtgtctaagttgcattgtcgcatt 22948608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 93 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 22952725 - 22952564
Alignment:
Q  93 gtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaa 191  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  22952725 gtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgatt---aggagctttgtcctccgcacgattaa 22952633  T
Q  192 agtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||    
T  22952632 agtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat-aagtgtctaagttgcattgtcgcatt 22952564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 38 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 23414646 - 23414430
Alignment:
Q  38 ctccaaattattggatgcatgt-tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat 135  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||| ||||| | ||| ||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||      
T  23414646 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaaggtgtcttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccatga-- 23414551  T
Q  136 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 235  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23414550 -ttaggagctttgtcctccgcacgatt---aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat- 23414456  T
Q  236 aagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    ||| |||||||  |||||||||||||    
T  23414455 aagtgtctaagttgcattgtcgcatt 23414430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 93 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 23871213 - 23871052
Alignment:
Q  93 gtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaa 191  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  23871213 gtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgatt---aggagctttgtcctccgcacgattaa 23871121  T
Q  192 agtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||    
T  23871120 agtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat-aagtgtctaagttgcattgtcgcatt 23871052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 93 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 23875169 - 23875008
Alignment:
Q  93 gtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaa 191  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  23875169 gtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgatt---aggagctttgtcctccgcacgattaa 23875077  T
Q  192 agtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||    
T  23875076 agtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat-aagtgtctaagttgcattgtcgcatt 23875008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 38 - 236
Target Start/End: Original strand, 27416292 - 27416483
Alignment:
Q  38 ctccaaattattggatgcatgt-tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat 135  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||| ||||| | ||| ||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||      
T  27416292 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaaggtgtcttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccatga-- 27416387  T
Q  136 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 235  Q
     |||||||||||||||||||||||    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27416388 -ttaggagctttgtcctccgcacg----ataggagttttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 27416482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 136 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 1644157 - 1644035
Alignment:
Q  136 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  1644157 attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat- 1644061  T
Q  236 aagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    ||| |||||||  |||||||||||||    
T  1644060 aagtgtctaagttgcattgtcgcatt 1644035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 136 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 14471860 - 14471738
Alignment:
Q  136 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14471860 attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat- 14471764  T
Q  236 aagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    ||| |||||||  |||||||||||||    
T  14471763 aagtgtctaagttgcattgtcgcatt 14471738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 136 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 16624001 - 16623879
Alignment:
Q  136 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16624001 attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat- 16623905  T
Q  236 aagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    ||| |||||||  |||||||||||||    
T  16623904 aagtgtctaagttgcattgtcgcatt 16623879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 60 - 235
Target Start/End: Original strand, 9482421 - 9482588
Alignment:
Q  60 tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcac 158  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||  || | |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||    |||||||||| ||||||||||    
T  9482421 tgataagttgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccatga----taggagctttctcctccgcac 9482514  T
Q  159 gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 235  Q
    ||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9482515 gttt---aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 9482588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 14098624 - 14098461
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataa-gtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagt 122  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14098624 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgattacggtgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagt 14098526  T
Q  123 cctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgtttta-taggagctttgtcctccgcacg 186  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  14098525 cctcaccacgtttattaagagctttgtcctctgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacg 14098461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 38 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 12496309 - 12496094
Alignment:
Q  38 ctccaaattattggatgcatgt-tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat 135  Q
    ||||||||||||||||| ||   || ||||| ||||| |||||||||||  || | |||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||| |       
T  12496309 ctccaaattattggatgtataagtgttaagttgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattagcat-tcactgagctttgtcctcaccatg--- 12496215  T
Q  136 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 235  Q
     ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12496214 -ttaggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtccttcgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat- 12496120  T
Q  236 aagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    ||| |||||||  |||||||||||||    
T  12496119 aagtgtctaagttgcattgtcgcatt 12496094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 60 - 264
Target Start/End: Original strand, 20803682 - 20803879
Alignment:
Q  60 tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcac 158  Q
    |||||||||||||  | |||||||||  || | |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||    ||||||||||||||||  |||    
T  20803682 tgataagtcgattgaggtgttttgttgtta-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccatga----taggagctttgtcctctacac 20803775  T
Q  159 gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgc 257  Q
    ||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||| ||    
T  20803776 gtttta--ggagctttgtcctccgcatgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat-aagtgtctaagttgcattgttgc 20803872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 60 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 21702265 - 21702068
Alignment:
Q  60 tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcac 158  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |  ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||| ||    || ||| |||||||||| |||    
T  21702265 tgataagtcgattaaggtgttttgttgtta-gaatccatgcattagcat-tcattgagctttgtccttaccatga----taagagatttgtcctccacac 21702172  T
Q  159 gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgc 257  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||    
T  21702171 gtttta--ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat-aagtgtctaagttgcattgtcgc 21702075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 109 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 27556333 - 27556188
Alignment:
Q  109 tcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttat 208  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||   |||||||||||||||||| || | |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27556333 tcattgagctttgtcctcaccatga---ttaggagctttgtcctccacatgat---taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttat 27556240  T
Q  209 gatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||    
T  27556239 gatgacgattggtaccacatgcatat-aagtgtctaagttgcattgtcgcatt 27556188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 38 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 16741206 - 16741017
Alignment:
Q  38 ctccaaattattggatgcatgt-tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat 135  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||| ||||| ||||||||||| ||| | |||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||      
T  16741206 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaagatgttttgttgata-gagtccatgcattagcata-cattgagctttgtcctcaccacga-- 16741111  T
Q  136 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 235  Q
      | ||||||||||||||| ||||    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16741110 --tcggagctttgtcctccacacg----ataggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatac-tatgatgacgattggtaccacatgcatata 16741018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 38 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 12706689 - 12706475
Alignment:
Q  38 ctccaaattattggatgcatgt-tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat 135  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||| ||||| ||||||||||| ||| | |||||||||| |||||  |||||||||  |||||| ||||||      
T  12706689 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaagatgttttgttgata-gagtccatgcattagcata-cattgagctctgtcctcgccacgatc 12706592  T
Q  136 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 235  Q
    |    |||||||||||||| ||||    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12706591 a----gagctttgtcctccacacg----ataggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat- 12706501  T
Q  236 aagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    ||| |||||||  |||||||||||||    
T  12706500 aagtgtctaagttgcattgtcgcatt 12706475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 38 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 19662769 - 19662556
Alignment:
Q  38 ctccaaattattggatgcatgt-tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat 135  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||| ||||| |||||||||||  | |  |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| |       
T  19662769 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaagatgttttgttgtt-taagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccatg--- 19662675  T
Q  136 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 235  Q
     || ||||||||||||||| ||||    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  19662674 -ttcggagctttgtcctccacacg----ataggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatac-tatgatgacgattggtaccacatgcatat- 19662582  T
Q  236 aagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    ||| |||||||  |||||||||||||    
T  19662581 aagtgtctaagttgcattgtcgcatt 19662556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 165 - 260
Target Start/End: Original strand, 18917895 - 18917990
Alignment:
Q  165 taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||    
T  18917895 taggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat-aagtgtctaagttgcattgtcgcatt 18917990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 38 - 260
Target Start/End: Original strand, 2685424 - 2685637
Alignment:
Q  38 ctccaaattattggatgcatgt-tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat 135  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||| ||||| |||||||||||  | |  |||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||| |       
T  2685424 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaagatgttttgttgtt-taagtccatgcattagcat-tcattgacctttgtcctcaccatg--- 2685518  T
Q  136 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 235  Q
     || ||||||||||||||| ||||    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  2685519 -ttcggagctttgtcctccacacg----ataggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatac-tatgatgacgattggtaccacatgcatat- 2685611  T
Q  236 aagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    ||| |||||||  |||||||||||||    
T  2685612 aagtgtctaagttgcattgtcgcatt 2685637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 24 - 133
Target Start/End: Original strand, 25595462 - 25595571
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgca-tagcatctcattgagcttagt 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  25595462 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgatttgttcataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagt 25595560  T
Q  123 cctcaccacga 133  Q
    |||||||||||    
T  25595561 cctcaccacga 25595571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 292 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 12762381 - 12762312
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattttgatt 361  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12762381 tgattacgtgataactgtttagcatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattatgatt 12762312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Original strand, 4233900 - 4233964
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4233900 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttattaatggaatgattatgatgttaattt 4233964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 6980338 - 6980274
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6980338 tgattacgtgataactgtttagcatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 6980274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 30596903 - 30596839
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30596903 tgattacgtgataactgtttagcatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 30596839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Original strand, 30638580 - 30638644
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30638580 tgattacgtgataactgtttagcatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 30638644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 25 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 1644298 - 1644134
Alignment:
Q  25 tgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattga 115  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| |||||||    
T  1644298 tgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgataatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattga 1644199  T
Q  116 gcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacg 186  Q
    |||| ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||    
T  1644198 gctttgtcctcaccacg---tttaggagctttgtcctccgcacgat---taggagctttgtcctccgcacg 1644134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 292 - 354
Target Start/End: Original strand, 20650220 - 20650282
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaat 354  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20650220 tgattacgtgataactgtttagcatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaat 20650282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 69 - 263
Target Start/End: Original strand, 27325765 - 27325950
Alignment:
Q  69 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttatag 167  Q
    ||||| ||||||||||| ||| | |||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||| |     |||||||||||||  ||||    || |    
T  27325765 gattaagatgttttgttgata-gagtccatgcattagcata-cattgagctttgtcctcaccacgattt----gagctttgtcctcaccacg----atcg 27325854  T
Q  168 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgcattgtc 263  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||  ||||||||||||||||    
T  27325855 gagctttgttctccacacgattaaagtatattaatac-tatgatgacgattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgcattgtc 27325950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Original strand, 2870564 - 2870628
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2870564 tgattatgtgataactgtttagcatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 2870628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Original strand, 2877179 - 2877243
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2877179 tgattatgtgataactgtttagcatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 2877243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Original strand, 14053987 - 14054051
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14053987 tgattacgtgataactgtttagcatttatgcaaagttaataaaggaatgattatgatgttaattt 14054051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 20060327 - 20060263
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20060327 tgattacgtgacaactgtttagcatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 20060263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #105
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 293 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 8796868 - 8796805
Alignment:
Q  293 gattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8796868 gattacgtggtaactgtttagcaattatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 8796805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #106
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 294 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 25471716 - 25471654
Alignment:
Q  294 attacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    |||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25471716 attacgtggtaactgtttagcaattatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 25471654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #107
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 294 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 27185368 - 27185306
Alignment:
Q  294 attacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    |||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27185368 attacgtggtaactgtttagcaattatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 27185306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #108
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 294 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 27207204 - 27207142
Alignment:
Q  294 attacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    |||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27207204 attacgtggtaactgtttagcaattatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 27207142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #109
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 294 - 356
Target Start/End: Original strand, 27242024 - 27242086
Alignment:
Q  294 attacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    |||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27242024 attacgtggtaactgtttagcaattatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 27242086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #110
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 294 - 356
Target Start/End: Original strand, 27263872 - 27263934
Alignment:
Q  294 attacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    |||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27263872 attacgtggtaactgtttagcaattatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 27263934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #111
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 8228543 - 8228481
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  8228543 tgattacgtgataactgtttagcatttatgcaaagttaataatggaatgat--tgatgttaattt 8228481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #112
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 93 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 14471924 - 14471837
Alignment:
Q  93 gtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacg 186  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||    
T  14471924 gtccatgcatagcatatcattgagctttgtcctcaccacg---tttaggagctttgtcctccgcacgat---taggagctttgtcctccgcacg 14471837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #113
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 18930733 - 18930671
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  18930733 tgattacgtgataactgtttagcatttatgcaaagttaataatggaatgat--tgatgttaattt 18930671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #114
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 167 - 236
Target Start/End: Original strand, 22430255 - 22430326
Alignment:
Q  167 ggagctttgtcctccgcacgat---taaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa 236  Q
    ||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22430255 ggagctttgtcctccccacgatgcttaaagtatattaatact-atgatgacgattggtaccacatgcatataa 22430326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #115
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 292 - 354
Target Start/End: Original strand, 27430712 - 27430774
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaat 354  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  27430712 tgattacgtgataactgtttagcaattatgcaaagttagtaatggaatgaatatgatgttaat 27430774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #116
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Original strand, 29588129 - 29588191
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  29588129 tgattacgtgataactgtttagcatttatgcaaagttaatgatggaatgat--tgatgttaattt 29588191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #117
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Original strand, 29594270 - 29594332
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  29594270 tgattacgtgataactgtttagcatttatgcaaagttaatgatggaatgat--tgatgttaattt 29594332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #118
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 20801435 - 20801371
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  20801435 tgattacgtgttaactgtttagcaattatgcaaagttagtaatggaatgaatatgatgttaattt 20801371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #119
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 69 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 17804156 - 17803971
Alignment:
Q  69 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttatag 167  Q
    ||||| ||||||||||| ||| | |||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||| |     |||||||||||||  |||| ||    |    
T  17804156 gattaagatgttttgttgata-gagtccatgcattagcata-cattgagctttgtcctcaccacgattt----gagctttgtcctcaccacgatt----g 17804067  T
Q  168 gagctttgtcctccgcacgat--ta-aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    |||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||  |||||||||||||    
T  17804066 gagctttgtcctccccacgatgctataagtatattaatactt-tgatgacgattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgcatt 17803971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #120
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 292 - 351
Target Start/End: Original strand, 28258883 - 28258942
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgtt 351  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  28258883 tgattacgtgataactgcttagcatttatgcaaagttaataatgtaatgactatgatgtt 28258942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #121
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 292 - 351
Target Start/End: Original strand, 28265507 - 28265566
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgtt 351  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  28265507 tgattacgtgataactgcttagcatttatgcaaagttaataatgtaatgactatgatgtt 28265566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #122
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 292 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 28287033 - 28286974
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgtt 351  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  28287033 tgattacgtgataactgcttagcatttatgcaaagttaataatgtaatgactatgatgtt 28286974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #123
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 292 - 351
Target Start/End: Original strand, 28337632 - 28337691
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgtt 351  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  28337632 tgattacgtgataactgcttagcatttatgcaaagttaataatgtaatgactatgatgtt 28337691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #124
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 292 - 351
Target Start/End: Original strand, 28344256 - 28344315
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgtt 351  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  28344256 tgattacgtgataactgcttagcatttatgcaaagttaataatgtaatgactatgatgtt 28344315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #125
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 16624142 - 16624025
Alignment:
Q  25 tgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacga---------tgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattga 115  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||         |||||||||  || | ||||||||||||||| |||||||    
T  16624142 tgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgataatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattga 16624043  T
Q  116 gcttagtcctcaccacga 133  Q
    |||| |||||||||||||    
T  16624042 gctttgtcctcaccacga 16624025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #126
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 73
Target Start/End: Original strand, 14059702 - 14059761
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgatta 73  Q
    ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  14059702 gcataagtatatggtaaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgatta 14059761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #127
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 159
Target Start/End: Original strand, 18917775 - 18917916
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacga---------tgttttgttcatatgtgtccatgca-tagcatctcatt 113  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||         || |||||| ||| | ||||||||| |||||| |||||    
T  18917775 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcatt 18917873  T
Q  114 gagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacg 159  Q
    |||||| |||||||||| |    |||||||||||||||||||||||    
T  18917874 gagctttgtcctcaccatg---tttaggagctttgtcctccgcacg 18917916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #128
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 292 - 353
Target Start/End: Original strand, 1539386 - 1539447
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaa 353  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  1539386 tgattacgtgataactgtttagcaattatgcaaagttgttaaagaaatgattatgatgttaa 1539447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #129
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 292 - 353
Target Start/End: Original strand, 1545485 - 1545546
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaa 353  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  1545485 tgattacgtgataactgtttaacaattattcaaagttgttaaagaaatgattatgatgttaa 1545546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #130
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 26130145 - 26130081
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    |||||| || ||||||||||| || |||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  26130145 tgattatgttataactgtttagcaattatgcaatgttatttaaggaatgattatgatgttaattt 26130081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #131
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Original strand, 18194584 - 18194648
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    |||||| ||||||||||||||  | | |||||| |||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  18194584 tgattatgtgataactgtttagtaatgatgcaatgttgttaatgaaatgattatgatgttaattt 18194648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #132
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 30694040 - 30693976
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    |||||| || ||||||||||| || |||||||| |||| | | | ||||||||||||||||||||    
T  30694040 tgattatgttataactgtttagcaattatgcaatgttatttaagaaatgattatgatgttaattt 30693976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 142)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 14 - 303
Target Start/End: Original strand, 37286867 - 37287155
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcatt 113  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37286867 gcataagtatatgatgaagtt-agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccatgcatagcatctcatt 37286965  T
Q  114 gagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37286966 gagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga 37287065  T
Q  214 cgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37287066 cgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 37287155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 14 - 303
Target Start/End: Original strand, 37293570 - 37293858
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcatt 113  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37293570 gcataagtatatgatgaagtt-agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccatgcatagcatctcatt 37293668  T
Q  114 gagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37293669 gagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga 37293768  T
Q  214 cgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37293769 cgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 37293858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 14 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 23584159 - 23583870
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23584159 gcataagtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcatt 23584060  T
Q  114 gagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23584059 gagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccacacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga 23583960  T
Q  214 cgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  23583959 cgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgat 23583870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 14 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 19991902 - 19991615
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcatt 113  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19991902 gcataagtatatgatgaagtt-agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccatgcatagcatctcatt 19991804  T
Q  114 gagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga 213  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19991803 gagcttagtcctcgccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga 19991704  T
Q  214 cgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19991703 cgattggtaccacatgcatat-aagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 19991615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 21 - 303
Target Start/End: Original strand, 41098314 - 41098596
Alignment:
Q  21 tatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagctta 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41098314 tatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagctta 41098413  T
Q  121 gtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41098414 gtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 41098513  T
Q  221 taccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||    
T  41098514 taccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgaatgaatatgtgat 41098596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 14 - 303
Target Start/End: Original strand, 22328249 - 22328537
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcatt 113  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22328249 gcataagtatatgatgaagtt-agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccatgcatagcatctcatt 22328347  T
Q  114 gagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22328348 gagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga 22328447  T
Q  214 cgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  22328448 cgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagataccttattgataatgattgattacgtgat 22328537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 21 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 22264958 - 22264676
Alignment:
Q  21 tatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagctta 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22264958 tatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgactacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagctta 22264859  T
Q  121 gtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22264858 gtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 22264759  T
Q  221 taccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||    
T  22264758 taccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgaatgaatatgtgat 22264676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 14 - 312
Target Start/End: Original strand, 22341688 - 22341985
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcatt 113  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  22341688 gcataagtatatgatgaagtt-agctccaaattatttgatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgcccatgcatagcatctcatt 22341786  T
Q  114 gagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga 213  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22341787 gagcatagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga 22341886  T
Q  214 cgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgataactgttta 312  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  22341887 cgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttcttgataatgattgattatgtgataagtgttta 22341985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 21 - 303
Target Start/End: Original strand, 27663881 - 27664163
Alignment:
Q  21 tatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagctta 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27663881 tatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagctta 27663980  T
Q  121 gtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27663981 gtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtccttcgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 27664080  T
Q  221 taccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||    
T  27664081 taccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgaatgaatatgtgat 27664163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 14 - 361
Target Start/End: Original strand, 22062967 - 22063323
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataa-gtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcat 112  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||    
T  22062967 gcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcat 22063065  T
Q  113 tgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg 212  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22063066 tgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg 22063165  T
Q  213 acgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatga---------ttgattacgtgat 303  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||    
T  22063166 acgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgaattggatatatgattacgtgat 22063265  T
Q  304 aactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattttgatt 361  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22063266 aactgtttagcatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattatgatt 22063323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 21 - 303
Target Start/End: Original strand, 34294644 - 34294926
Alignment:
Q  21 tatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagctta 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34294644 tatatgatgaagtttagctccaaattattggatacatgttgataagttgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagctta 34294743  T
Q  121 gtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34294744 gtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagttttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 34294843  T
Q  221 taccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||    
T  34294844 taccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgaatgaatatgtgat 34294926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 14 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 33725878 - 33725589
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  33725878 gcataagtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttgttttgttcatatgtgtccatgcatagcataacatt 33725779  T
Q  114 gagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga 213  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33725778 gagctttgtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga 33725679  T
Q  214 cgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  33725678 cgattggtaccacatgcatatatggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgat 33725589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 21 - 303
Target Start/End: Original strand, 17707022 - 17707303
Alignment:
Q  21 tatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagctta 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17707022 tatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagt-gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagctta 17707120  T
Q  121 gtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17707121 gtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 17707220  T
Q  221 taccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||    
T  17707221 taccacttgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatgaatgaatatgtgat 17707303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 21 - 303
Target Start/End: Original strand, 24472339 - 24472620
Alignment:
Q  21 tatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagctta 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24472339 tatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagctta 24472438  T
Q  121 gtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24472439 gtcctcaccacgaatattaggagctt-gtcctccgcacgttttataagagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 24472537  T
Q  221 taccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||    
T  24472538 taccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgaatgaatatgtgat 24472620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 21 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 27608752 - 27608471
Alignment:
Q  21 tatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagctta 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27608752 tatatgatgaagtttagctccaagttattggatgcatgttgataagt-gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagctta 27608654  T
Q  121 gtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27608653 gtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 27608554  T
Q  221 taccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||    
T  27608553 taccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatgaatgaatatgtgat 27608471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 21 - 303
Target Start/End: Original strand, 27670521 - 27670802
Alignment:
Q  21 tatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagctta 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27670521 tatatgatgaagtttagctccaagttattggatgcatgttgataagt-gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagctta 27670619  T
Q  121 gtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27670620 gtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 27670719  T
Q  221 taccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || |||||    
T  27670720 taccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgaatgaatatgtgat 27670802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 21 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 27615358 - 27615077
Alignment:
Q  21 tatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagctta 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27615358 tatatgatgaagtttagctccaagttattggatgcatgttgataagt-gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagctta 27615260  T
Q  121 gtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27615259 gtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagttttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 27615160  T
Q  221 taccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||    
T  27615159 taccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatgaatgaatatgtgat 27615077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 14 - 303
Target Start/End: Original strand, 18038753 - 18039042
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgtttt-gttcatatgtgtccatgcatagcatctcat 112  Q
    ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18038753 gcataagtttatgatgaagtt-agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgtttttgttcataagtgtccatgcatagcatctcat 18038851  T
Q  113 tgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg 212  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18038852 tgagcttagtcctcaccacgaataataggagctttgtcctccgcacgttttatatgagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg 18038951  T
Q  213 acgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18038952 acgattggtaccacatgcatatagggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatacgtgat 18039042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 14 - 303
Target Start/End: Original strand, 15001765 - 15002054
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgtttt-gttcatatgtgtccatgcatagcatctcat 112  Q
    ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15001765 gcataagtttatgatgaagtt-agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgtttttgttcataagtgtccatgcatagcatctcat 15001863  T
Q  113 tgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg 212  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15001864 tgagcttagtcctcaccacgaataataggagctttgtcctccgcacgttttataggagcttcgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg 15001963  T
Q  213 acgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  15001964 acgattggtaccacatgcatatagggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatgattgaatacgtgat 15002054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 21 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 23249951 - 23249707
Alignment:
Q  21 tatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagctta 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23249951 tatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagt-gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagctta 23249853  T
Q  121 gtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23249852 gtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 23249753  T
Q  221 taccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 266  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23249752 taccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 23249707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 21 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 41769256 - 41769011
Alignment:
Q  21 tatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagctta 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41769256 tatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagctta 41769157  T
Q  121 gtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41769156 gtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 41769057  T
Q  221 taccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 266  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  41769056 taccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 41769011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 21 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 41775830 - 41775585
Alignment:
Q  21 tatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagctta 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41775830 tatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagctta 41775731  T
Q  121 gtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41775730 gtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 41775631  T
Q  221 taccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 266  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  41775630 taccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 41775585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 19 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 22139705 - 22139421
Alignment:
Q  19 ggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagct 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||  || | ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  22139705 ggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgttttgttgttaagagtctatgcatagcatatcattgagct 22139606  T
Q  119 tagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgatt 218  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22139605 tagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgatt 22139506  T
Q  219 ggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  22139505 ggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgat 22139421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 19 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 25406440 - 25406156
Alignment:
Q  19 ggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagct 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||    
T  25406440 ggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagct 25406341  T
Q  119 tagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgatt 218  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25406340 tagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagttttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgatt 25406241  T
Q  219 ggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  25406240 ggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgat 25406156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 14 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 37544060 - 37543771
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataa-gtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcat 112  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  37544060 gcatatgtatatgataaggtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttttgttcataagtgtccatgcatagcatatcat 37543962  T
Q  113 tgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37543961 tgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg 37543862  T
Q  213 acgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  37543861 acgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacagtgtcatgattaagatgccttgttgatgatgattgattatgtgat 37543771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 19 - 303
Target Start/End: Original strand, 29471448 - 29471733
Alignment:
Q  19 ggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcga-ttacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagc 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||  || | ||||||||||||||| |||||||||    
T  29471448 ggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgaattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagc 29471547  T
Q  118 ttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgat 217  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29471548 ttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgat 29471647  T
Q  218 tggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  29471648 tggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgat 29471733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 14 - 303
Target Start/End: Original strand, 41294520 - 41294808
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| | |||| | |||||||||||||||||||||    
T  41294520 gcataagtatatgatgaagtttagctccaaattactggatgcatgttgatatgttgattacgatgtttt-tccataagagtccatgcatagcatctcatt 41294618  T
Q  114 gagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga 213  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41294619 gagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatga 41294718  T
Q  214 cgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||    
T  41294719 cgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgttgatgactgaatacgtgat 41294808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 19 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 17284083 - 17283799
Alignment:
Q  19 ggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagct 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||  || | ||||||| ||||||| ||||||||||    
T  17284083 ggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgttttgttgttaagagtccatgtatagcatatcattgagct 17283984  T
Q  119 tagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgatt 218  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17283983 tagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatatttatgatgacgatt 17283884  T
Q  219 ggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  17283883 ggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgat 17283799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 19 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 22133013 - 22132729
Alignment:
Q  19 ggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagct 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||    
T  22133013 ggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatattgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagct 22132914  T
Q  119 tagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgatt 218  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22132913 tagtcctcaccacgtttattaggagctttgtccttcgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgatt 22132814  T
Q  219 ggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  22132813 ggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgat 22132729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 19 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 22588111 - 22587827
Alignment:
Q  19 ggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagct 118  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||    
T  22588111 ggtatatgatgaagtttatctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagct 22588012  T
Q  119 tagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgatt 218  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22588011 tagtcctcaccatgtttattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgatt 22587912  T
Q  219 ggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  22587911 ggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgat 22587827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 14 - 303
Target Start/End: Original strand, 1692522 - 1692811
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgtttt-gttcatatgtgtccatgcatagcatctcat 112  Q
    ||||| || |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  1692522 gcataagtttatgatgaagtt-agctccaatttaatggatgcatgttgatatgttgattacgatgtttttgttcataagtgtccatgcatagcatcttat 1692620  T
Q  113 tgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg 212  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1692621 tgagcttagtcctcaccacgaataataggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg 1692720  T
Q  213 acgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  1692721 acgattggtaccacatgcatatagggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatgattgaatacgtgat 1692811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 34 - 303
Target Start/End: Original strand, 14995141 - 14995411
Alignment:
Q  34 ttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgtttt-gttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacg 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14995141 ttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgtttttgttcataagtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacg 14995240  T
Q  133 aatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcat 232  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14995241 aataataggagctttgtcctccgcacgttttataggaccttcgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcat 14995340  T
Q  233 ataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
     ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  14995341 gtagggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatgattgaatacgtgat 14995411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 19 - 303
Target Start/End: Original strand, 29478043 - 29478328
Alignment:
Q  19 ggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcga-ttacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagc 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||  || | ||||||||||| ||| |||||||||    
T  29478043 ggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgaattacggtgttttgttgttaagagtccatgcataacatatcattgagc 29478142  T
Q  118 ttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgat 217  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29478143 ttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgat 29478242  T
Q  218 tggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  29478243 tggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattggcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgat 29478328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 14 - 303
Target Start/End: Original strand, 27687414 - 27687703
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgtttt-gttcatatgtgtccatgcatagcatctcat 112  Q
    ||||| || |||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27687414 gcataagtttatgatgaagtt-agctccaatttaatggatgcgtgttgatatgttgattacgatgtttttgttcataagtgtccatgcatagcatctcat 27687512  T
Q  113 tgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg 212  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27687513 tgagcttagtcctcaccacgaataataggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcatccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg 27687612  T
Q  213 acgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  27687613 acgattggtaccacatgcatatagggagtctaagagcattgtcacgttgtcatgattaagatgccttgttgatgatgattgaatacgtgat 27687703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 14 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 40707142 - 40706853
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataa-gtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcat 112  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||    
T  40707142 gcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcat 40707044  T
Q  113 tgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg 212  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40707043 tgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgatttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg 40706944  T
Q  213 acgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||    
T  40706943 acgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgaatgaatatgtgat 40706853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 14 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 40713784 - 40713495
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataa-gtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcat 112  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||    
T  40713784 gcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcat 40713686  T
Q  113 tgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg 212  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40713685 tgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgatttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg 40713586  T
Q  213 acgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||    
T  40713585 acgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgaatgaatatgtgat 40713495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 14 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 27516772 - 27516496
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataa-gtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcat 112  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||    
T  27516772 gcataagtatatgatagagtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcat 27516674  T
Q  113 tgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg 212  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27516673 tgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg 27516574  T
Q  213 acgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatga 290  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27516573 acgactggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatga 27516496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 14 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 27523409 - 27523133
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataa-gtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcat 112  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||    
T  27523409 gcataagtatatgatagagtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcat 27523311  T
Q  113 tgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg 212  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27523310 tgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg 27523211  T
Q  213 acgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatga 290  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27523210 acgactggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatga 27523133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 69 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 16354789 - 16354568
Alignment:
Q  69 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttatagg 168  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16354789 gattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttatagg 16354690  T
Q  169 agctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgat 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  16354689 agctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgat 16354590  T
Q  269 taagatgccttgttgataatga 290  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  16354589 taagatgccttgttgataatga 16354568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 69 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 16361448 - 16361227
Alignment:
Q  69 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttatagg 168  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16361448 gattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttatagg 16361349  T
Q  169 agctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgat 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  16361348 agctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgat 16361249  T
Q  269 taagatgccttgttgataatga 290  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  16361248 taagatgccttgttgataatga 16361227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 69 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 34564782 - 34564561
Alignment:
Q  69 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttatagg 168  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34564782 gattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttatagg 34564683  T
Q  169 agctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgat 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  34564682 agctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgat 34564583  T
Q  269 taagatgccttgttgataatga 290  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  34564582 taagatgccttgttgataatga 34564561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 69 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 34571437 - 34571216
Alignment:
Q  69 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttatagg 168  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34571437 gattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttatagg 34571338  T
Q  169 agctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgat 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  34571337 agctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgat 34571238  T
Q  269 taagatgccttgttgataatga 290  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  34571237 taagatgccttgttgataatga 34571216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 69 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 25106728 - 25106507
Alignment:
Q  69 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttatagg 168  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25106728 gattatgatgttttgttcatctgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttatagg 25106629  T
Q  169 agctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgat 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  25106628 agctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgat 25106529  T
Q  269 taagatgccttgttgataatga 290  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  25106528 taagatgtcttgttgataatga 25106507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 69 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 25165821 - 25165600
Alignment:
Q  69 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttatagg 168  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25165821 gattatgatgttttgttcatctgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttatagg 25165722  T
Q  169 agctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgat 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  25165721 agctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgat 25165622  T
Q  269 taagatgccttgttgataatga 290  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  25165621 taagatgtcttgttgataatga 25165600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 24 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 19768343 - 19768101
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 123  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19768343 atgatgacgtttagctccaaattgttggatgcatgatgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 19768244  T
Q  124 ctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 223  Q
    |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19768243 ctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 19768144  T
Q  224 cacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 266  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19768143 cacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 19768101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 24 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 19774939 - 19774697
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 123  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19774939 atgatgacgtttagctccaaattgttggatgcatgatgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 19774840  T
Q  124 ctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 223  Q
     ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19774839 ttcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 19774740  T
Q  224 cacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 266  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19774739 cacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 19774697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 24 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 24020279 - 24020037
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 123  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |  |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  24020279 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgatttgttcataagaatccatgcataacatttcattgagcttagtc 24020180  T
Q  124 ctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 223  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24020179 ctcaccacgattattaggagctttgtactccgtacgatttataggagctttgtcctccgcacgattaaaatatattaatacttatgatgacgattggtac 24020080  T
Q  224 cacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24020079 cacatgcatataaagagtctaagagcattgtcacattgtcatg 24020037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 69 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 20775833 - 20775598
Alignment:
Q  69 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat-attaggagctttgtcctccgcacgttttatag 167  Q
    |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||  |  |||    
T  20775833 gattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgaatattag 20775734  T
Q  168 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatga 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||    
T  20775733 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgccacattgtcatga 20775634  T
Q  268 ttaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  20775633 ttaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgat 20775598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 69 - 303
Target Start/End: Original strand, 22410751 - 22410985
Alignment:
Q  69 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttatagg 168  Q
    |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22410751 gattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttatagg 22410850  T
Q  169 agctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgat 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||      
T  22410851 agctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacggagtctaggagcattgtcacattgtcatgtc 22410950  T
Q  269 taagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    ||  ||||  ||||||| ||||||||||| |||||    
T  22410951 tattatgctatgttgatgatgattgattatgtgat 22410985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 24 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 22343493 - 22343248
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 123  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22343493 atgatgacgtttagctccaaattattagatgcatgttgatatgttgattacggtgatttgttcataagagtccatgcatagcatttcattgagcttagtc 22343394  T
Q  124 ctcaccacga-atattaggagctttgtcctccgcacgtttta-taggagctttgtcctccgcacg-attaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 220  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22343393 ctcaccacgatttattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgttttaaagtatattaatacttatgatgatgattgg 22343294  T
Q  221 taccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 266  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22343293 taccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 22343248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 24 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 22352893 - 22352648
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 123  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22352893 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgatttgttcataagagtccatgcatagcatttcattgagcttagtc 22352794  T
Q  124 ctcaccacga-atattaggagctttgtcctccgcacgtttta-taggagctttgtcctccgcacg-attaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 220  Q
     |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22352793 ttcaccacgatttattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctctgcacgttttaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 22352694  T
Q  221 taccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 266  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22352693 taccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 22352648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 24 - 266
Target Start/End: Original strand, 22326038 - 22326282
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagt 122  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| || |||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  22326038 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgttgattacggtgatttgttcataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagt 22326136  T
Q  123 cctcaccacgaat-attaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 220  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22326137 cctcaccacgatttattaggagctttgtcctccgcacgatttattaagagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 22326236  T
Q  221 taccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 266  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22326237 taccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 22326282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 26 - 276
Target Start/End: Original strand, 15442068 - 15442319
Alignment:
Q  26 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcc 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||  ||  ||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  15442068 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacagtgaattgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 15442166  T
Q  125 tcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 223  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15442167 tcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 15442266  T
Q  224 cacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgc 276  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  15442267 cacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcgtgtctaagatgc 15442319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 26 - 276
Target Start/End: Original strand, 14359931 - 14360182
Alignment:
Q  26 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcc 124  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||| |  ||||||| || |||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  14359931 gatgacgtttagctccaaactattggatgcatattgatatgatgattacggtggtttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 14360029  T
Q  125 tcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 223  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14360030 tcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattatgagttttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 14360129  T
Q  224 cacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgc 276  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  14360130 cacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcgtgtctaagatgc 14360182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 26 - 276
Target Start/End: Original strand, 21295374 - 21295619
Alignment:
Q  26 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcc 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  21295374 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacgatgttttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 21295471  T
Q  125 tcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 224  Q
    |||||| ||    |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21295472 tcaccatga----taggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 21295567  T
Q  225 acatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgc 276  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  21295568 acatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcgtgtctaagatgc 21295619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 26 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 25534983 - 25534738
Alignment:
Q  26 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcc 124  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  25534983 gatgacgtttaactccaaattattggatgcatattgatatgatgattacgatgttttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 25534886  T
Q  125 tcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 224  Q
    |||||| ||    |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25534885 tcaccatga----taggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 25534790  T
Q  225 acatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgc 276  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  25534789 acatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcgtgtctaagatgc 25534738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 26 - 302
Target Start/End: Original strand, 23337402 - 23337682
Alignment:
Q  26 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcc 124  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||  || |||||| ||| | |||||||||| ||||| |||||||||| |||||    
T  23337402 gatgacgtttggctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacagtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagctcagtcc 23337500  T
Q  125 tcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 223  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23337501 tcaccgcgattattaggagctttgtactccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgtttggtac 23337600  T
Q  224 cacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgc---cttgttgataatgattgattacgtga 302  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||    |||||||| |||||||| |||||||    
T  23337601 cacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatgatgattgaatacgtga 23337682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 69 - 302
Target Start/End: Original strand, 21667958 - 21668192
Alignment:
Q  69 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat-attaggagctttgtcctccgcacgttttatag 167  Q
    |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  21667958 gattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattattag 21668057  T
Q  168 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatga 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||     
T  21668058 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacggagtctaggagcattgtcacattgtcatgt 21668157  T
Q  268 ttaagatgccttgttgataatgattgattacgtga 302  Q
     ||  |||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  21668158 ctattatgctttgttgatgatgattgattatgtga 21668192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 26 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 24554529 - 24554294
Alignment:
Q  26 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcc 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  24554529 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacgatgttttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 24554432  T
Q  125 tcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttt---tataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggt 221  Q
    |||||||||    |||||||||||||||||||||| ||   | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24554431 tcaccacga----taggagctttgtcctccgcacgattatttttaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggt 24554336  T
Q  222 accacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtc 263  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  24554335 accacatgcatataaggaatctaagagcattgtcgcattgtc 24554294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 69 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 29316372 - 29316137
Alignment:
Q  69 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat-attaggagctttgtcctccgcacgttttatag 167  Q
    |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||  ||  |||    
T  29316372 gattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacaattattag 29316273  T
Q  168 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatga 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||     
T  29316272 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacggagtctaggagcattgtcacattgtcatgt 29316173  T
Q  268 ttaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
     ||  |||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  29316172 ctattatgctttgttgatgatgattgattatgtgat 29316137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 14 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 23609923 - 23609778
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23609923 gcataagtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcatt 23609824  T
Q  114 gagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23609823 gagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacg 23609778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 14 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 23841319 - 23841174
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23841319 gcataagtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcatt 23841220  T
Q  114 gagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23841219 gagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacg 23841174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 69 - 303
Target Start/End: Original strand, 22258633 - 22258868
Alignment:
Q  69 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat-attaggagctttgtcctccgcacgttttatag 167  Q
    |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  22258633 gattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattattag 22258732  T
Q  168 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatga 267  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||     
T  22258733 gagctttgtcctccgcacgaataaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacggagtctaggagcattgtcacattgtcatgt 22258832  T
Q  268 ttaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
     ||  ||||  ||||||| ||||||||||| |||||    
T  22258833 ctattatgctatgttgatgatgattgattatgtgat 22258868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 154 - 303
Target Start/End: Original strand, 27680912 - 27681061
Alignment:
Q  154 cgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattg 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  27680912 cgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatagggagtctaagagcattg 27681011  T
Q  254 tcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  27681012 tcacgttgtcatgattaagatgccttgttgatgatgattgaatacgtgat 27681061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 24 - 260
Target Start/End: Original strand, 15237176 - 15237416
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  15237176 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 15237275  T
Q  115 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 214  Q
    ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15237276 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgac 15237370  T
Q  215 gattggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||    
T  15237371 gattggtaccacatgcatat-aagtgtctaagttgcattgtcgcatt 15237416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 24 - 260
Target Start/End: Original strand, 19473059 - 19473299
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  19473059 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 19473158  T
Q  115 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 214  Q
    ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19473159 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgac 19473253  T
Q  215 gattggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||    
T  19473254 gattggtaccacatgcatat-aagtgtctaagttgcattgtcgcatt 19473299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 24 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 20295612 - 20295396
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  20295612 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 20295513  T
Q  115 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 214  Q
    ||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20295512 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctcctcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgac 20295418  T
Q  215 gattggtaccacatgcatataa 236  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  20295417 gattggtaccacatgcatataa 20295396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 165 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 23609799 - 23609661
Alignment:
Q  165 taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtca 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  23609799 taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtca 23609700  T
Q  265 tgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||| || |||||    
T  23609699 tggttaagatgccttgttgataatgaatgaatatgtgat 23609661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 165 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 23841195 - 23841057
Alignment:
Q  165 taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtca 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  23841195 taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtca 23841096  T
Q  265 tgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||| || |||||    
T  23841095 tggttaagatgccttgttgataatgaatgaatatgtgat 23841057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 25 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 10752954 - 10752715
Alignment:
Q  25 tgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattga 115  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||| ||| ||||||     
T  10752954 tgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgataatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcataacatttcattgg 10752855  T
Q  116 gcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacg 215  Q
    |||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  10752854 gctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgatgaaaatatattaatacttatgatgacg 10752760  T
Q  216 attggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||    
T  10752759 attggtaccacatgcatat-aagtgtctaagttgcattgtcgcatt 10752715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 38 - 236
Target Start/End: Original strand, 40723977 - 40724173
Alignment:
Q  38 ctccaaattattggatgcatgt-tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat 135  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||| ||||| | ||| ||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |    
T  40723977 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaaggtgtcttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcttcaccacgatt 40724074  T
Q  136 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40724075 attaggagctttgtcctccgcacgttttaga--agctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 40724172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 38 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 33409229 - 33409037
Alignment:
Q  38 ctccaaattattggatgcatgt-tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat 135  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||||| ||| | |||||||||||  || | |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||      
T  33409229 ctccaaattattggatgtatatgtgataagttgatcaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccacga-- 33409134  T
Q  136 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 235  Q
     ||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33409133 -ttaggagctttgtcctccgcacgttt---aggagttttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 33409038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 38 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 11230862 - 11230646
Alignment:
Q  38 ctccaaattattggatgcatgt-tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat 135  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||| |||||  |||| ||||| ||| | |||||||||| | ||| ||||||||||| ||||| |||||||      
T  11230862 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaaaatgtcttgttgata-gagtccatgcattaacat-tcattgagctttgtcctgaccacga-- 11230767  T
Q  136 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 235  Q
     ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  11230766 -ttaggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat- 11230672  T
Q  236 aagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    ||| |||||||  |||||||||||||    
T  11230671 aagtgtctaagttgcattgtcgcatt 11230646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 56 - 263
Target Start/End: Original strand, 17730531 - 17730731
Alignment:
Q  56 atgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctcc 154  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||||||  || | |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||    |||||||||||||||||    
T  17730531 atgttgataagttgattaaggtgttttgttgtta-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccatga----taggagctttgtcctcc 17730624  T
Q  155 gcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattg 253  Q
     |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||    
T  17730625 acacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgtttggtaccacatgcatat-aagtgtctaagttgcattg 17730721  T
Q  254 tcgcattgtc 263  Q
    ||||||||||    
T  17730722 tcgcattgtc 17730731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 109 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 11220393 - 11220272
Alignment:
Q  109 tcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttat 208  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11220393 tcattgagctttgtcctgaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttat 11220300  T
Q  209 gatgacgattggtaccacatgcatataa 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11220299 gatgacgattggtaccacatgcatataa 11220272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 60 - 264
Target Start/End: Original strand, 25229534 - 25229731
Alignment:
Q  60 tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcac 158  Q
    |||||||| ||||| | |||||||||  || | |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| | ||    ||||||||||||||||| |||    
T  25229534 tgataagttgattaaggtgttttgttgtta-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcactatga----taggagctttgtcctccacac 25229627  T
Q  159 gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgc 257  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||    
T  25229628 gtttta--ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat-aagtgtctaagttgcattgtcgc 25229724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 60 - 264
Target Start/End: Original strand, 25293690 - 25293887
Alignment:
Q  60 tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcac 158  Q
    |||||||| ||||| | |||||||||  || | |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| | ||    ||||||||||||||||| |||    
T  25293690 tgataagttgattaaggtgttttgttgtta-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcactatga----taggagctttgtcctccacac 25293783  T
Q  159 gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgc 257  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||    
T  25293784 gtttta--ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat-aagtgtctaagttgcattgtcgc 25293880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 93 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 4036164 - 4035999
Alignment:
Q  93 gtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaa 191  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||    ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  4036164 gtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccatga----taggagctttgtcctccacacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgattaa 4036072  T
Q  192 agtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgcattgtca 264  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  4036071 agtatattaatacttatgatgatgattggtaccacatgcatat-aagtgtctaagttgcattgtcgcattgtca 4035999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 93 - 260
Target Start/End: Original strand, 21885349 - 21885510
Alignment:
Q  93 gtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaa 191  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||    
T  21885349 gtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccatga---ttaggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtcctccgcacgatgaa 21885441  T
Q  192 agtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  21885442 agtatattaatacttatgataacgattggtaccacatgcatat-aagagtctaagttgcattgtcgcatt 21885510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 109 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 11226812 - 11226667
Alignment:
Q  109 tcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttat 208  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||   ||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11226812 tcattgagctttgtcctgaccacga---ttaagagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttat 11226719  T
Q  209 gatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||    
T  11226718 gatgacgattggtaccacatgcatat-aagtgtctaagttgcattgtcgcatt 11226667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 109 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 11224979 - 11224858
Alignment:
Q  109 tcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttat 208  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11224979 tcattgagctttgtcctgaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttat 11224886  T
Q  209 gatgacgattggtaccacatgcatataa 236  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||    
T  11224885 gatgacaattggtaccacatgcatataa 11224858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 109 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 11228802 - 11228681
Alignment:
Q  109 tcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttat 208  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |   ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11228802 tcattgagctttgtcctgaccacaa---ttaggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttat 11228709  T
Q  209 gatgacgattggtaccacatgcatataa 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11228708 gatgacgattggtaccacatgcatataa 11228681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 38 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 16674153 - 16673938
Alignment:
Q  38 ctccaaattattggatgcatgt-tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat 135  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||||| |||||  ||||||||||  || | |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||      
T  16674153 ctccaaattattggatgtatatgtgataagttgattaaaatgttttgttgtta-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccatga-- 16674058  T
Q  136 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 235  Q
      |||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  16674057 --taggagctttgtcctctgcacgttt---aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatacatat- 16673964  T
Q  236 aagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    ||| |||||||  |||||||||||||    
T  16673963 aagtgtctaagttgcattgtcgcatt 16673938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 38 - 236
Target Start/End: Original strand, 21340872 - 21341063
Alignment:
Q  38 ctccaaattattggatgcatgt-tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat 135  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||| ||||| ||| |||||||  || | |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||      
T  21340872 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaagatattttgttgtta-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccatga-- 21340967  T
Q  136 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 235  Q
      ||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21340968 --taggagctttgtcctccgcactttt---aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 21341062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 109 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 26172394 - 26172249
Alignment:
Q  109 tcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttat 208  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26172394 tcattgagctttgtcctcaccatga---ttaggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctctgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttat 26172301  T
Q  209 gatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  26172300 gataacgattggtaccacatgcatat-aagagtctaagttgcattgtcgcatt 26172249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 136 - 260
Target Start/End: Original strand, 20911394 - 20911515
Alignment:
Q  136 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20911394 attaggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat- 20911489  T
Q  236 aagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    ||| |||||||  |||||||||||||    
T  20911490 aagtgtctaagttgcattgtcgcatt 20911515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 38 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 18355958 - 18355742
Alignment:
Q  38 ctccaaattattggatgcatgt-tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat 135  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||| ||||| | ||| ||||| ||| | | |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||      
T  18355958 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaaggtgtcttgttgata-gaggccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccatga-- 18355863  T
Q  136 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 235  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  18355862 -ttaggagctttgtcctccgcacgatt---aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgaagattggtaccacatgcatat- 18355768  T
Q  236 aagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    ||| |||||||  |||||||||||||    
T  18355767 aagtgtctaagttgcattgtcgcatt 18355742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 38 - 263
Target Start/End: Original strand, 26742852 - 26743068
Alignment:
Q  38 ctccaaattattggatgcatgt-tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat 135  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||| ||||| |||||||||||  || | |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||      
T  26742852 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccatga-- 26742947  T
Q  136 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 235  Q
      | ||||||||||||||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||     
T  26742948 --tcggagctttgtcctccacacg----ataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatac-tatgatgacgattgataccacatgcatat- 26743039  T
Q  236 aagagtctaag-agcattgtcgcattgtc 263  Q
    ||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  26743040 aagtgtctaagttgcattgtcgcattgtc 26743068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 38 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 42805420 - 42805207
Alignment:
Q  38 ctccaaattattggatgcatgt-tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat 135  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||| ||||| |||||||||||  || | |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||      
T  42805420 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccatga-- 42805325  T
Q  136 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 235  Q
      | ||||||||||||||| ||||    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||     
T  42805324 --tcggagctttgtcctccacacg----ataggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatac-aatgatgacgattggtaccacatgcatat- 42805233  T
Q  236 aagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    ||| |||||||  |||||||||||||    
T  42805232 aagtgtctaagttgcattgtcgcatt 42805207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 38 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 18774203 - 18773990
Alignment:
Q  38 ctccaaattattggatgcatgt-tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat 135  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||| ||||| | ||||| ||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||      
T  18774203 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaaggtgtttcgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccatga-- 18774108  T
Q  136 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 235  Q
      | ||||||||||||| | ||||    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  18774107 --tcggagctttgtccttcacacg----ataggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatac-tatgatgacgattggtaccacatgcatat- 18774016  T
Q  236 aagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    ||| |||||||  |||||||||||||    
T  18774015 aagtgtctaagttgcattgtcgcatt 18773990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 38 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 18784046 - 18783833
Alignment:
Q  38 ctccaaattattggatgcatgt-tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat 135  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||| ||||| | ||||| ||| ||| | |||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||| ||      
T  18784046 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaaggtgtttcgttgata-gagtccatgcattagcata-cattgagctttgtcctcaccatga-- 18783951  T
Q  136 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 235  Q
      | ||||||||||||||| ||||    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  18783950 --tcggagctttgtcctccacacg----ataggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatac-tatgatgacgattggtaccacatgcatat- 18783859  T
Q  236 aagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    ||| |||||||  |||||||||||||    
T  18783858 aagtgtctaagttgcattgtcgcatt 18783833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 38 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 20232551 - 20232338
Alignment:
Q  38 ctccaaattattggatgcatgt-tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat 135  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||| ||||| |||||||||||  | |  |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| |       
T  20232551 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaagatgttttgttgtt-taagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccatg--- 20232457  T
Q  136 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 235  Q
     || ||||||||||||||| ||||    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||     
T  20232456 -ttcggagctttgtcctccacacg----ataggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatac-tatgatgacgattggtatcacatgcatat- 20232364  T
Q  236 aagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    ||| |||||||  |||||||||||||    
T  20232363 aagtgtctaagttgcattgtcgcatt 20232338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 38 - 260
Target Start/End: Original strand, 26666236 - 26666449
Alignment:
Q  38 ctccaaattattggatgcatgt-tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat 135  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||| ||||| |||||||||||  | |  |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| |       
T  26666236 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaagatgttttgttgtt-taagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccatg--- 26666330  T
Q  136 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 235  Q
     || |||||||| |||||| ||||    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||     
T  26666331 -ttcggagctttatcctccacacg----ataggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatac-tatgatgacgattggtactacatgcatat- 26666423  T
Q  236 aagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    ||| |||||||  |||||||||||||    
T  26666424 aagtgtctaagttgcattgtcgcatt 26666449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 38 - 260
Target Start/End: Original strand, 26937833 - 26938046
Alignment:
Q  38 ctccaaattattggatgcatgt-tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat 135  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||| ||||| |||||||||||  | |  |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| |       
T  26937833 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaagatgttttgttgtt-taagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccatg--- 26937927  T
Q  136 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 235  Q
     || |||||||| |||||| ||||    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||     
T  26937928 -ttcggagctttatcctccacacg----ataggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatac-tatgatgacgattggtactacatgcatat- 26938020  T
Q  236 aagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    ||| |||||||  |||||||||||||    
T  26938021 aagtgtctaagttgcattgtcgcatt 26938046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Original strand, 17707357 - 17707421
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17707357 tgattacgtgataactgtttagcatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 17707421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 23609606 - 23609542
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23609606 tgattacgtgataactgtttagcatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 23609542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 23841002 - 23840938
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23841002 tgattacgtgataactgtttagcatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 23840938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Original strand, 24472675 - 24472739
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24472675 tgattacgtgataactgtttagcatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 24472739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 27608417 - 27608353
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27608417 tgattacgtgataactgtttagcatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 27608353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 27615023 - 27614959
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27615023 tgattacgtgataactgtttagcatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 27614959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Original strand, 34294981 - 34295045
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34294981 tgattacgtgataactgtttagcatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 34295045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Original strand, 41098651 - 41098715
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41098651 tgattacgtgataactgtttagcatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 41098715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 292 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 40706798 - 40706729
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattttgatt 361  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  40706798 tgattacgtgataactgtttagcatttatgcaaagttaataatggaatgtttatgatgttaattatgatt 40706729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 292 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 40713440 - 40713371
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattttgatt 361  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  40713440 tgattacgtgataactgtttagcatttatgcaaagttaataatggaatgtttatgatgttaattatgatt 40713371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Original strand, 27664218 - 27664282
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27664218 tgattacgtgataactgtttagcatttatgcaaagttaataatagaatgattatgatgttaattt 27664282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Original strand, 27670857 - 27670921
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27670857 tgattacgtgataactgtttagcatttatgcaaagttaataatagaatgattatgatgttaattt 27670921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 93 - 236
Target Start/End: Original strand, 24533208 - 24533342
Alignment:
Q  93 gtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaa 191  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| |    || |||||||||||||||  |||    |||||||||||||||||| |||||||||    
T  24533208 gtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccatg----tttggagctttgtcctccatacg----ataggagctttgtcctccacacgattaa 24533298  T
Q  192 agtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa 236  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24533299 aatatattaatac-tatgatgacgattgataccacatgcatataa 24533342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Original strand, 24767786 - 24767882
Alignment:
Q  164 ataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||   |||||||  |||||||||||||    
T  24767786 ataggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatac-tatgatgaagattgataccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgcatt 24767882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 23583816 - 23583752
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  23583816 tgattacgtgataactgtttagcatttatgcaaagttaataaaggaacgattatgatgttaattt 23583752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 16354501 - 16354439
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  16354501 tgattacgtgataactgtttagcatttatgcaaagttaataatggaatgat--tgatgttaattt 16354439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 16361160 - 16361098
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  16361160 tgattacgtgataactgtttagcatttatgcaaagttaataatggaatgat--tgatgttaattt 16361098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 27516429 - 27516367
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  27516429 tgattacgtgataactgtttagcatttatgcaaagttaataatggaatgat--tgatgttaattt 27516367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 27523066 - 27523004
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  27523066 tgattacgtgataactgtttagcatttatgcaaagttaataatggaatgat--tgatgttaattt 27523004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 34564494 - 34564432
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  34564494 tgattacgtgataactgtttagcatttatgcaaagttaataatggaatgat--tgatgttaattt 34564432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 34571149 - 34571087
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  34571149 tgattacgtgataactgtttagcatttatgcaaagttaataatggaatgat--tgatgttaattt 34571087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 20775544 - 20775480
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20775544 tgattacgtaataactgcttagcatttatgcaaagttaataatggaatgattataatgttaattt 20775480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 37543717 - 37543653
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  37543717 tgattacgtgataactgtttagcaattatgcaaagttagtaatggaatgaatatgatgttaattt 37543653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 167 - 236
Target Start/End: Original strand, 23535791 - 23535859
Alignment:
Q  167 ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa 236  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  23535791 ggagcttcgtcctccccacgattaaagtatattaatac-tatgatcacgattgataccacatgcatataa 23535859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #119
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 25106440 - 25106378
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  25106440 tgattacgtgataactgtttagcatttatgcaaagttaatagtggaatgat--tgatgttaattt 25106378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #120
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 25165533 - 25165471
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  25165533 tgattacgtgataactgtttagcatttatgcaaagttaatagtggaatgat--tgatgttaattt 25165471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #121
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Original strand, 41294862 - 41294926
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | |||||||||| |||||||||||    
T  41294862 tgattacgtgataactgtttagcatttatgcaaagttgatgaaggaatgattaggatgttaattt 41294926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #122
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 22132675 - 22132611
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||  ||| | ||||||||||||||||||||    
T  22132675 tgattacgcgataactgtttagcatttatgcaatgttgttaaagaaatgattatgatgttaattt 22132611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #123
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 22139367 - 22139303
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||  ||| | ||||||||||||||||||||    
T  22139367 tgattacgcgataactgtttagcatttatgcaatgttgttaaagaaatgattatgatgttaattt 22139303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #124
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 22587773 - 22587709
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||  ||| | ||||||||||||||||||||    
T  22587773 tgattacgtgataactgtttagcaattatgcaatgttgttaaagtaatgattatgatgttaattt 22587709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #125
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Original strand, 37287209 - 37287273
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    |||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  37287209 tgattatgttataactgtttagcatttatgcaatgttatttaaggaatgattatgatgttaattt 37287273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #126
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Original strand, 37293912 - 37293976
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    |||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  37293912 tgattatgttataactgtttagcatttatgcaatgttatttaaggaatgattatgatgttaattt 37293976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #127
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 22264621 - 22264564
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||       |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22264621 tgattacgtgataactgtttagcatttat-------taataatggaatgattatgatgttaattt 22264564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #128
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 38 - 159
Target Start/End: Original strand, 20911275 - 20911393
Alignment:
Q  38 ctccaaattattggatgcatgt-tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat 135  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||| ||||| | ||| ||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||      
T  20911275 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaaggtgtcttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccatga-- 20911370  T
Q  136 attaggagctttgtcctccgcacg 159  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  20911371 -ttaggagctttgtcctccgcacg 20911393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #129
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Original strand, 14995465 - 14995529
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    |||||| || ||||||||||| ||  ||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  14995465 tgattatgttataactgtttagcaaatatgcaatgttaattaaggaatgattatgatgttaattt 14995529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #130
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Original strand, 15002108 - 15002172
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    |||||| || ||||||||||| ||  ||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  15002108 tgattatgttataactgtttagcaaatatgcaatgttaattaaggaatgattatgatgttaattt 15002172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #131
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 17283745 - 17283681
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    |||||||| |||||||||||| || |||||||| |||  ||| | ||||||||||||||||||||    
T  17283745 tgattacgcgataactgtttagcaattatgcaatgttgttaaagaaatgattatgatgttaattt 17283681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #132
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 19991561 - 19991497
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    |||||| || ||||||||||| || |||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  19991561 tgattatgttataactgtttagcaattatgcaatgttatttaaggaatgattatgatgttaattt 19991497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #133
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Original strand, 22328591 - 22328655
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    |||||| || ||||||||||| || |||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  22328591 tgattatgttataactgtttagcaattatgcaatgttatttaaggaatgattatgatgttaattt 22328655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #134
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 206 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 17410309 - 17410279
Alignment:
Q  206 tatgatgacgattggtaccacatgcatataa 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17410309 tatgatgacgattggtaccacatgcatataa 17410279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #135
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 302 - 356
Target Start/End: Original strand, 18039106 - 18039160
Alignment:
Q  302 ataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||||| || |||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  18039106 ataactgtttagcaattatgcaatgttatttaaggaatgattatgatgttaattt 18039160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #136
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 303 - 356
Target Start/End: Original strand, 1692875 - 1692928
Alignment:
Q  303 taactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    |||||||||| || |||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  1692875 taactgtttagcaattatgcaatgttatttaaggaatgattatgatgttaattt 1692928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #137
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 303 - 356
Target Start/End: Original strand, 27681125 - 27681178
Alignment:
Q  303 taactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    |||||||||| || |||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  27681125 taactgtttagcaattatgcaatgttatttaaggaatgattatgatgttaattt 27681178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #138
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 303 - 356
Target Start/End: Original strand, 27687767 - 27687820
Alignment:
Q  303 taactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    |||||||||| || |||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  27687767 taactgtttagcaattatgcaatgttatttaaggaatgattatgatgttaattt 27687820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #139
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Original strand, 22342022 - 22342086
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    |||||| || ||| ||||||| || |||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  22342022 tgattatgttatagctgtttagcaattatgcaatgttatttaaggaatgattatgatgttaattt 22342086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #140
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 25406102 - 25406038
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||||||||| ||||| || ||||||||  ||  ||| | ||||||||||||||||||||    
T  25406102 tgattacgtgataaccgtttagcaattatgcaattttgttaaggaaatgattatgatgttaattt 25406038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #141
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Original strand, 29471787 - 29471851
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||  ||||||||||| || |||||||| |||  ||| | ||||||||||||||||||||    
T  29471787 tgattacgcaataactgtttagcaattatgcaatgttgttaaagaaatgattatgatgttaattt 29471851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #142
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Original strand, 29478382 - 29478446
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||  ||||||||||| || |||||||| |||  ||| | ||||||||||||||||||||    
T  29478382 tgattacgcaataactgtttagcaattatgcaatgttgttaaagaaatgattatgatgttaattt 29478446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 260; Significance: 1e-145; HSPs: 182)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 14 - 313
Target Start/End: Original strand, 10153819 - 10154118
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcatt 113  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10153819 gcataagtataagatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcatt 10153918  T
Q  114 gagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga 213  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10153919 gagcttagtcctcaccatgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga 10154018  T
Q  214 cgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgataactgtttaa 313  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  10154019 cgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgataagtgtttaa 10154118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 14 - 293
Target Start/End: Original strand, 53380435 - 53380714
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcatt 113  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53380435 gcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcatt 53380534  T
Q  114 gagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53380535 gagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga 53380634  T
Q  214 cgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattg 293  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53380635 cgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattg 53380714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 14 - 293
Target Start/End: Original strand, 53387087 - 53387366
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcatt 113  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53387087 gcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcatt 53387186  T
Q  114 gagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53387187 gagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga 53387286  T
Q  214 cgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattg 293  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53387287 cgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattg 53387366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 21 - 303
Target Start/End: Original strand, 31422644 - 31422926
Alignment:
Q  21 tatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagctta 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31422644 tatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagctta 31422743  T
Q  121 gtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31422744 gtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 31422843  T
Q  221 taccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||    
T  31422844 taccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgaatgaatatgtgat 31422926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 14 - 303
Target Start/End: Original strand, 5106968 - 5107257
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5106968 gcatatgtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcatt 5107067  T
Q  114 gagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga 213  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5107068 gagcttagtcctcacaacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga 5107167  T
Q  214 cgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||    
T  5107168 cgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgaatgaatatgtgat 5107257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 14 - 303
Target Start/End: Original strand, 10846368 - 10846657
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10846368 gcataagtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatattgataagtttattacaatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcatt 10846467  T
Q  114 gagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10846468 gagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacaattaaagtatattaatacttatgatga 10846567  T
Q  214 cgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  10846568 cgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgaatgaatacgtgat 10846657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 14 - 303
Target Start/End: Original strand, 16758655 - 16758944
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||    
T  16758655 gcataagtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattaggttgttttgttcatacgtgttcatgcatagcatatcatt 16758754  T
Q  114 gagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16758755 gagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga 16758854  T
Q  214 cgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  16758855 cgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgat 16758944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 21 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 37615407 - 37615125
Alignment:
Q  21 tatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagctta 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37615407 tatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagctta 37615308  T
Q  121 gtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37615307 gtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcatgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 37615208  T
Q  221 taccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||    
T  37615207 taccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgaatgaatatgtgat 37615125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 14 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 6598740 - 6598451
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcatt 113  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  6598740 gcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttgtttcgttcatgtgtgtccatgcatagcatatcatt 6598641  T
Q  114 gagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6598640 gagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatga 6598541  T
Q  214 cgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  6598540 cgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgat 6598451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 14 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 6605420 - 6605131
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcatt 113  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  6605420 gcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttgtttcgttcatgtgtgtccatgcatagcatatcatt 6605321  T
Q  114 gagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6605320 gagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatga 6605221  T
Q  214 cgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  6605220 cgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgat 6605131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 14 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 10010304 - 10010015
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  10010304 gcataagtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttgttttgttcatatgtgtccatgcatagcataacatt 10010205  T
Q  114 gagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga 213  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10010204 gagctttgtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga 10010105  T
Q  214 cgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  10010104 cgattggtaccacatgcatatatggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgat 10010015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 14 - 303
Target Start/End: Original strand, 16624139 - 16624428
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  16624139 gcataagtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttgttttgttcatgtgtgtccatgcatagcatatcatt 16624238  T
Q  114 gagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga 213  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16624239 gagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcatgttttataggagccttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga 16624338  T
Q  214 cgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  16624339 cgattggtaccacatgcatgtaaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattggttatgtgat 16624428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 14 - 303
Target Start/End: Original strand, 16747923 - 16748212
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcatt 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  16747923 gcataagtatatgatgaagtttagctctaaattattggatgcatgttgataagtcgattaggctgttttgttcatacgtgtccatgcatagcatatcatt 16748022  T
Q  114 gagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga 213  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16748023 gagtttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacattttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga 16748122  T
Q  214 cgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  16748123 cgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgataatgattgattatgtgat 16748212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 14 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 10003657 - 10003368
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  10003657 gcataagtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttgttttgttcatatgtgtccatgcatagcataacatt 10003558  T
Q  114 gagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga 213  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10003557 gagctttgtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga 10003458  T
Q  214 cgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  10003457 cgattggtaccacatgcatatatggagtctaggagcattgtcacattatcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgat 10003368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 21 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 26889469 - 26889188
Alignment:
Q  21 tatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagctta 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26889469 tatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagt-gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagctta 26889371  T
Q  121 gtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 220  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26889370 gtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 26889271  T
Q  221 taccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||    
T  26889270 taccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatgaatggatacgtgat 26889188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 14 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 10904247 - 10903958
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  10904247 gcataagtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttgttttgttcatatgtgtccatgcatagcataacatt 10904148  T
Q  114 gagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga 213  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10904147 gagctttgtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacggttaaagtatattaatacttatgatga 10904048  T
Q  214 cgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  10904047 cgattggtaccacatgcatatacggagtctaggaacattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgat 10903958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 14 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 10910919 - 10910630
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  10910919 gcataagtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttgttttgttcatatgtgtccatgcatagcataacatt 10910820  T
Q  114 gagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga 213  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10910819 gagctttgtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacggttaaagtatattaatacttatgatga 10910720  T
Q  214 cgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  10910719 cgattggtaccacatgcatatacggagtctaggaacattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgat 10910630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 14 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 5221425 - 5221137
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcatt 113  Q
    ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||||| || || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5221425 gcataagtatatgatgaagttaa-ctccaaattattggacacatgttgttatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccatgcatagcatctcatt 5221327  T
Q  114 gagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga 213  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5221326 gagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga 5221227  T
Q  214 cgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  5221226 cgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcgtgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgat 5221137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 19 - 294
Target Start/End: Original strand, 23704856 - 23705131
Alignment:
Q  19 ggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagct 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||    
T  23704856 ggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagct 23704955  T
Q  119 tagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgatt 218  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23704956 tagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgatt 23705055  T
Q  219 ggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattga 294  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23705056 ggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattga 23705131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 19 - 294
Target Start/End: Original strand, 23723312 - 23723587
Alignment:
Q  19 ggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagct 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||    
T  23723312 ggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagct 23723411  T
Q  119 tagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgatt 218  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23723412 tagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgatt 23723511  T
Q  219 ggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattga 294  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23723512 ggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattga 23723587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 19 - 294
Target Start/End: Original strand, 23741768 - 23742043
Alignment:
Q  19 ggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagct 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||    
T  23741768 ggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagct 23741867  T
Q  119 tagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgatt 218  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23741868 tagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgatt 23741967  T
Q  219 ggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattga 294  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23741968 ggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattga 23742043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 14 - 303
Target Start/End: Original strand, 20057489 - 20057778
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataa-gtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcat 112  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  20057489 gcatatgtatatgataaggtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttttgttcataagtgtccatgcatagcatatcat 20057587  T
Q  113 tgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20057588 tgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg 20057687  T
Q  213 acgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  20057688 acgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgat 20057778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 19 - 294
Target Start/End: Original strand, 41201886 - 41202161
Alignment:
Q  19 ggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagct 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||    
T  41201886 ggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagct 41201985  T
Q  119 tagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgatt 218  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41201986 tagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgatt 41202085  T
Q  219 ggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattga 294  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41202086 ggtaccacatgcatataaggagtttaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattga 41202161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 14 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 3690640 - 3690351
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataa-gtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcat 112  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  3690640 gcatatgtatatgataaggtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttttgttcataagtgtccatgcatagcatatcat 3690542  T
Q  113 tgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg 212  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3690541 tgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg 3690442  T
Q  213 acgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  3690441 acgattggtaccacatgcatataagaagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatgattgattatgtgat 3690351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 14 - 303
Target Start/End: Original strand, 20064127 - 20064416
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataa-gtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcat 112  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  20064127 gcatatgtatatgataaggtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttttgttcataagtgtccatgcatagcatatcat 20064225  T
Q  113 tgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20064226 tgagcttagtcctcaccacgaatatgaggagctttgtcctctgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg 20064325  T
Q  213 acgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  20064326 acgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgat 20064416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 21 - 266
Target Start/End: Original strand, 26794486 - 26794731
Alignment:
Q  21 tatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagctta 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26794486 tatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcatttgtgtccatgcatagcatatcattgagctta 26794585  T
Q  121 gtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26794586 gtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 26794685  T
Q  221 taccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 266  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||| | ||||||||||    
T  26794686 taccacatgcatataaggagtctaggagcattgccacattgtcatg 26794731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 14 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 418021 - 417732
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataa-gtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcat 112  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||    
T  418021 gcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcat 417923  T
Q  113 tgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg 212  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  417922 tgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg 417823  T
Q  213 acgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  417822 acgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgat 417732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 19 - 303
Target Start/End: Original strand, 15727020 - 15727304
Alignment:
Q  19 ggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagct 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || ||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||    
T  15727020 ggtatatgatgaagtttagctccaaattattgtatgcatgttgacatgttgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagct 15727119  T
Q  119 tagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgatt 218  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15727120 tagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacattttataggagctttgtcctccgcacaattaaagtatattaatacttatgatgacgatt 15727219  T
Q  219 ggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  15727220 ggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgat 15727304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 14 - 303
Target Start/End: Original strand, 14673285 - 14673574
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataa-gtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcat 112  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| |||||||||  || | |||||| |||||||| ||||    
T  14673285 gcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatacatagcatatcat 14673383  T
Q  113 tgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg 212  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14673384 tgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg 14673483  T
Q  213 acgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  14673484 acgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgat 14673574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 14 - 303
Target Start/End: Original strand, 16489755 - 16490038
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcatt 113  Q
    ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16489755 gcataagtttatgatgaagtt-agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgtttttgtcataagtgtccatgcatagcatctcatt 16489853  T
Q  114 gagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga 213  Q
         |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16489854 -----tagtcctcaccacgaataataggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga 16489948  T
Q  214 cgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16489949 cgattggtaccacatgcatatagggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaaaatgccttgttgataatgattgaatacgtgat 16490038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 14 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 13250740 - 13250451
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataa-gtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcat 112  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||    
T  13250740 gcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcat 13250642  T
Q  113 tgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg 212  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13250641 tgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg 13250542  T
Q  213 acgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||    
T  13250541 acgattggtaccacatgcatatacggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgaatgaatatgtgat 13250451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 14 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 13257386 - 13257097
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataa-gtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcat 112  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||    
T  13257386 gcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcat 13257288  T
Q  113 tgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg 212  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13257287 tgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg 13257188  T
Q  213 acgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||    
T  13257187 acgattggtaccacatgcatatacggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgaatgaatatgtgat 13257097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 24 - 266
Target Start/End: Original strand, 13316294 - 13316536
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 123  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13316294 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatttcattgagcttagtc 13316393  T
Q  124 ctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 223  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13316394 ctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 13316493  T
Q  224 cacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 266  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13316494 cacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 13316536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 26 - 303
Target Start/End: Original strand, 5150078 - 5150355
Alignment:
Q  26 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataa-gtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcc 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5150078 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgacgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcc 5150176  T
Q  125 tcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 224  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5150177 tcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgtttattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtacc 5150276  T
Q  225 acatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  5150277 acatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgat 5150355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 24 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 19809023 - 19808781
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19809023 atgataaagtttagctccaaattattgaatgcatgttgatatgtcgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatttcattgagcttagtc 19808924  T
Q  124 ctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 223  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19808923 ctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatgcttatgatgacgattggtac 19808824  T
Q  224 cacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 266  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  19808823 cacatgcatataaggagtctaagagcatcgtcacattgtcatg 19808781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 26 - 303
Target Start/End: Original strand, 41092456 - 41092733
Alignment:
Q  26 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataa-gtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcc 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41092456 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcc 41092554  T
Q  125 tcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 224  Q
    ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41092555 tcaccacgtttattaggagccttgtcctccgcacgtttattaggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 41092654  T
Q  225 acatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41092655 acatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 41092733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 69 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 16633796 - 16633575
Alignment:
Q  69 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttatagg 168  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16633796 gattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttatagg 16633697  T
Q  169 agctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgat 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  16633696 agctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgat 16633597  T
Q  269 taagatgccttgttgataatga 290  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  16633596 taagatgccttgttgataatga 16633575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 69 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 16640406 - 16640185
Alignment:
Q  69 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttatagg 168  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16640406 gattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttatagg 16640307  T
Q  169 agctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgat 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  16640306 agctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgat 16640207  T
Q  269 taagatgccttgttgataatga 290  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  16640206 taagatgccttgttgataatga 16640185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 69 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 43161071 - 43160850
Alignment:
Q  69 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttatagg 168  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43161071 gattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttatagg 43160972  T
Q  169 agctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgat 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  43160971 agctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgat 43160872  T
Q  269 taagatgccttgttgataatga 290  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  43160871 taagatgccttgttgataatga 43160850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 69 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 43167308 - 43167087
Alignment:
Q  69 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttatagg 168  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43167308 gattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttatagg 43167209  T
Q  169 agctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgat 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  43167208 agctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgat 43167109  T
Q  269 taagatgccttgttgataatga 290  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  43167108 taagatgccttgttgataatga 43167087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 69 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 48423313 - 48423079
Alignment:
Q  69 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttatagg 168  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48423313 gattatgatgttttgttcatctgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttatagg 48423214  T
Q  169 agctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgat 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  48423213 agctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgat 48423114  T
Q  269 taagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || |||||    
T  48423113 taagatgccttgttgataatgaatgaatatgtgat 48423079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 69 - 290
Target Start/End: Original strand, 1333221 - 1333442
Alignment:
Q  69 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttatagg 168  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1333221 gattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcataacattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttatagg 1333320  T
Q  169 agctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgat 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  1333321 agctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgat 1333420  T
Q  269 taagatgccttgttgataatga 290  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  1333421 taagatgccttgttgataatga 1333442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 69 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 48430091 - 48429857
Alignment:
Q  69 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttatagg 168  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48430091 gattatgatgttttgttcatctgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacggaaattaggagctttgtcctccgcacgttttatagg 48429992  T
Q  169 agctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgat 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  48429991 agctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgat 48429892  T
Q  269 taagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || |||||    
T  48429891 taagatgccttgttgataatgaatgaatatgtgat 48429857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 25 - 266
Target Start/End: Original strand, 10236503 - 10236744
Alignment:
Q  25 tgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcc 124  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10236503 tgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgatttgttcataagagtccatgcatagcatttcattgagcttagtcc 10236602  T
Q  125 tcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 224  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10236603 tcaccacgattattaggagctttgtcctgcgcacgatttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 10236702  T
Q  225 acatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 266  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10236703 acatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 10236744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 24 - 266
Target Start/End: Original strand, 410861 - 411103
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 123  Q
    ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  410861 atgatgacgtttagctccaagttgttggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 410960  T
Q  124 ctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 223  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  410961 ctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 411060  T
Q  224 cacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 266  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  411061 cacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 411103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 24 - 266
Target Start/End: Original strand, 1145662 - 1145904
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 123  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1145662 atgatgacgtttagctccaaattgttggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 1145761  T
Q  124 ctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 223  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1145762 ctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 1145861  T
Q  224 cacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 266  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  1145862 cacatgcatataaggagtttaagagcattgtcacattgtcatg 1145904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 24 - 266
Target Start/End: Original strand, 8721266 - 8721508
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 123  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8721266 atgatgacgtttagctccaaattgttggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 8721365  T
Q  124 ctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 223  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8721366 ctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 8721465  T
Q  224 cacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 266  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8721466 cacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 8721508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 24 - 266
Target Start/End: Original strand, 9073153 - 9073395
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 123  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9073153 atgatgacgtttagctccaaattgttggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 9073252  T
Q  124 ctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 223  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9073253 ctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 9073352  T
Q  224 cacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 266  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9073353 cacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 9073395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 24 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 15825661 - 15825419
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 123  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15825661 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgatttgttcataagagtccatgcatagcatttcattgagcttagtc 15825562  T
Q  124 ctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 223  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15825561 ctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttataggagctttgtcctccacatgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 15825462  T
Q  224 cacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 266  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15825461 cacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 15825419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 24 - 266
Target Start/End: Original strand, 17710701 - 17710943
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 123  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  17710701 atgatgacatttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgatttgttcatatgagtccatgcatagcattccattgagcttagtc 17710800  T
Q  124 ctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 223  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17710801 ctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttataggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 17710900  T
Q  224 cacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 266  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  17710901 cacatgcatataaagtgtctaagagcattgtcacattgtcatg 17710943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 25 - 266
Target Start/End: Original strand, 15992212 - 15992453
Alignment:
Q  25 tgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcc 124  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  15992212 tgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgatttgttcataagagtccatgcatagcatttcattgagtttagtcc 15992311  T
Q  125 tcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15992312 tcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 15992411  T
Q  225 acatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 266  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  15992412 acatgcatataaggagtctaagtgcattgtcacattgtcatg 15992453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 24 - 266
Target Start/End: Original strand, 15343715 - 15343957
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 123  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15343715 atgatgacgtttagctccaaattgttggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 15343814  T
Q  124 ctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 223  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15343815 ctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctctgcatgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 15343914  T
Q  224 cacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 266  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15343915 cacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 15343957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 24 - 266
Target Start/End: Original strand, 15350359 - 15350601
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 123  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15350359 atgatgacgtttagctccaaattgttggatgcatgttgatatgttgattacgatgtttttttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 15350458  T
Q  124 ctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 223  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15350459 ctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 15350558  T
Q  224 cacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 266  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  15350559 cacatgcatataaggagtctaatagcattgtcacattgtcatg 15350601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 24 - 266
Target Start/End: Original strand, 15404605 - 15404847
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 123  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15404605 atgatgacgtttagctccaaatttttggatgcatgtcgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 15404704  T
Q  124 ctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 223  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15404705 ctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgatttttaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 15404804  T
Q  224 cacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 266  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  15404805 cacatgaatataaggagtctaagagcattgtcatattgtcatg 15404847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 24 - 266
Target Start/End: Original strand, 15367040 - 15367282
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 123  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15367040 atgatgacgtttagctccaaattgtaggatgcatgttgatatgttgattacgattttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 15367139  T
Q  124 ctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 223  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15367140 ctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattagtac 15367239  T
Q  224 cacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 266  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15367240 cacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 15367282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 72 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 6608424 - 6608192
Alignment:
Q  72 tacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaa-tattaggagctttgtcctccgcacgttttataggag 170  Q
    ||||||||||||||   | | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6608424 tacgatgttttgttataaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggag 6608325  T
Q  171 ctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgatta 270  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6608324 ctttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatatggagtctaggagcattgtcgcattgtcatgatta 6608225  T
Q  271 agatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  6608224 agatgccttgttgataatgattgaatatgtgat 6608192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 24 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 4710296 - 4710054
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 123  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4710296 atgatgacgtttagctccaaattgttggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatttcattgagcttagtc 4710197  T
Q  124 ctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 223  Q
     ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4710196 ttcaccacgtttattaggagctttgtcctctgcacgattattaggagttttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 4710097  T
Q  224 cacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  4710096 cacatgcatataaagagtctaagagcattgcaacattgtcatg 4710054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 24 - 266
Target Start/End: Original strand, 30777335 - 30777578
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcga-ttacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagt 122  Q
    ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30777335 atgatgacgtttagctccaagttgttggatgcatgttgatatgttgaattacgatgttttgttcatgagagtccatgcatagcatttcattgagcttagt 30777434  T
Q  123 cctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 222  Q
    ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30777435 cctcaccacgtttattagaagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 30777534  T
Q  223 ccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 266  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  30777535 ccacatgcatataaagtgtctaagagcattgtcacattgtcatg 30777578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 69 - 303
Target Start/End: Original strand, 15584872 - 15585106
Alignment:
Q  69 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttatagg 168  Q
    |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15584872 gattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttatagg 15584971  T
Q  169 agctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgat 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||      
T  15584972 agctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacggagtctaggagcattgtcacattgtcatgtc 15585071  T
Q  269 taagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    ||  ||||  ||||||| ||||||||||| |||||    
T  15585072 tattatgctatgttgatgatgattgattatgtgat 15585106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 69 - 303
Target Start/End: Original strand, 15591530 - 15591764
Alignment:
Q  69 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttatagg 168  Q
    |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15591530 gattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttatagg 15591629  T
Q  169 agctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgat 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||      
T  15591630 agctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacggagtctaggagcattgtcacattgtcatgtc 15591729  T
Q  269 taagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    ||  ||||  ||||||| ||||||||||| |||||    
T  15591730 tattatgctatgttgatgatgattgattatgtgat 15591764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 24 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 12891400 - 12891155
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagt 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  12891400 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgatttgttcataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagt 12891302  T
Q  123 cctcaccacgaat-attaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgatt-aaagtatattaatacttatgatgacgattg 219  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12891301 cctcaccacgatttattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgttttaaagtatattaatacttatgatgacgattg 12891202  T
Q  220 gtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 266  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12891201 gtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 12891155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 24 - 266
Target Start/End: Original strand, 17253168 - 17253413
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagt 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  17253168 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgatttgttcataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagt 17253266  T
Q  123 cctcaccacgaat-attaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgatt-aaagtatattaatacttatgatgacgattg 219  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17253267 cctcaccacgatttattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgttttaaagtatattaatacttatgatgacgattg 17253366  T
Q  220 gtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 266  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17253367 gtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 17253413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 24 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 13320970 - 13320726
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagt 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  13320970 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgatttgttcataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagt 13320872  T
Q  123 cctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgatt-aaagtatattaatacttatgatgacgattgg 220  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13320871 cctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacaacttattaggagctttgtcctccgcacgttttaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 13320772  T
Q  221 taccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 266  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13320771 taccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 13320726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 19 - 224
Target Start/End: Original strand, 15692366 - 15692571
Alignment:
Q  19 ggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagct 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || ||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||    
T  15692366 ggtatatgatgaagtttagctccaaattattgtatgcatgttgacatgttgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagct 15692465  T
Q  119 tagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgatt 218  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15692466 tagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgatt 15692565  T
Q  219 ggtacc 224  Q
    ||||||    
T  15692566 ggtacc 15692571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 26 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 7985699 - 7985458
Alignment:
Q  26 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcc 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||| ||  ||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  7985699 gatgacgtttagctccaaattattgggtgcatgttgatatgatgattacggtgaattgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 7985601  T
Q  125 tcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 223  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7985600 tcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttttgatgacgattggtac 7985501  T
Q  224 cacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 266  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7985500 cacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 7985458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 26 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 10325844 - 10325604
Alignment:
Q  26 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcc 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |  ||||||||| ||||||| ||| | || ||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  10325844 gatgacgtttagctccaaattattggatgcttattgatatgatgattacgattttttgttgata-gagttcatgcattagcat-tcattgagtttagtcc 10325747  T
Q  125 tcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 223  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10325746 tcaccacgattattaggagctttgtcctccacacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 10325647  T
Q  224 cacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 266  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10325646 cacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 10325604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 26 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 55148973 - 55148728
Alignment:
Q  26 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcc 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  55148973 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacgatgttttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 55148876  T
Q  125 tcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 224  Q
    |||||| ||    |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55148875 tcaccatga----taggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 55148780  T
Q  225 acatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgc 276  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  55148779 atatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcgtgtctaagatgc 55148728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 69 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 5201181 - 5200946
Alignment:
Q  69 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat-attaggagctttgtcctccgcacgttttatag 167  Q
    |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  5201181 gattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattattag 5201082  T
Q  168 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatga 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||     
T  5201081 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatgtttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacagagtctaggagcattgtcacattgtcatgt 5200982  T
Q  268 ttaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
     ||  |||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  5200981 ctattatgctttgttgatgatgattgattatgtgat 5200946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 69 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 12482383 - 12482148
Alignment:
Q  69 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat-attaggagctttgtcctccgcacgttttatag 167  Q
    |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  12482383 gattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattattag 12482284  T
Q  168 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatga 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||     
T  12482283 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacggagtctaggagcattgtcacattgtcatgt 12482184  T
Q  268 ttaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
     ||  |||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  12482183 ctattatgctttgttgatgatgattgattatgtgat 12482148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 26 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 24187772 - 24187527
Alignment:
Q  26 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcc 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  24187772 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacgatgttttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 24187675  T
Q  125 tcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 224  Q
    |||||| ||    |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24187674 tcaccatga----taggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcaagtttaaagtatattaacacttatgatgacgattggtacc 24187579  T
Q  225 acatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgc 276  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  24187578 acatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcgtgtctaagatgc 24187527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 26 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 16333165 - 16332934
Alignment:
Q  26 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcc 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||| ||  ||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16333165 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacggtgaattgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 16333067  T
Q  125 tcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 223  Q
    ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16333066 tcaccacgattatcaggagttttgtcctccgcatgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 16332967  T
Q  224 cacatgcatataaagagtctaagagcattgtcg 256  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16332966 cacatgcatataaggagtctaagagcattgtcg 16332934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 69 - 303
Target Start/End: Original strand, 5426864 - 5427099
Alignment:
Q  69 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat-attaggagctttgtcctccgcacgttttatag 167  Q
    |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  5426864 gattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattattag 5426963  T
Q  168 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatga 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| || |||||||     
T  5426964 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacggagtctaggagcattgtcacactgtcatgt 5427063  T
Q  268 ttaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
     ||  ||||  ||||||| ||||||||||| |||||    
T  5427064 ctactatgctatgttgatgatgattgattatgtgat 5427099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 26 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 20722996 - 20722771
Alignment:
Q  26 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcc 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  20722996 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacgatgttttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 20722899  T
Q  125 tcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 224  Q
    |||||| ||    |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20722898 tcaccatga----taggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccacacatttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 20722803  T
Q  225 acatgcatataaagagtctaagagcattgtcg 256  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20722802 acatgcatataaggagtctaagagcattgtcg 20722771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 69 - 303
Target Start/End: Original strand, 5420457 - 5420692
Alignment:
Q  69 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccac-gaatattaggagctttgtcctccgcacgttttatag 167  Q
    |||||||||||||||||  || | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  5420457 gattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatatcatatcattgagcttagtcctcaccacattttattaggagctttgtcctccgcacgattattag 5420556  T
Q  168 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatga 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| || |||||||     
T  5420557 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacggagtctaggagcattgtcacactgtcatgt 5420656  T
Q  268 ttaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
     ||  ||||  ||||||| ||||||||||| |||||    
T  5420657 ctactatgctatgttgatgatgattgattatgtgat 5420692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 26 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 839242 - 838996
Alignment:
Q  26 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcc 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |  ||||||| || |||||| ||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  839242 gatgacgtttagctccaaattattggatgcacattgatatgatgattacggtgatttgttgataagagtccatgcattagca-ctcattgagcttagtcc 839144  T
Q  125 tcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 224  Q
    |||||||||    |||||| ||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  839143 tcaccacga----taggagttttgtcctccgtacgattattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattgatacc 839048  T
Q  225 acatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgc 276  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  839047 acatgcatataagaattctaagagcattgtcgcattgtcgtgtctaagatgc 838996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 24 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 30065716 - 30065475
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttt---------tgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||         ||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  30065716 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgtcttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 30065617  T
Q  115 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 214  Q
    ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30065616 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagttttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgac 30065522  T
Q  215 gattggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||    
T  30065521 gattggtaccacatgcatataaagtgtctaagttgcattgtcgcatt 30065475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 24 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 7109464 - 7109248
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  7109464 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 7109365  T
Q  115 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 214  Q
    ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7109364 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgac 7109270  T
Q  215 gattggtaccacatgcatataa 236  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  7109269 gattggtaccacatgcatataa 7109248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 24 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 7113399 - 7113183
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  7113399 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 7113300  T
Q  115 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 214  Q
    ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7113299 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgac 7113205  T
Q  215 gattggtaccacatgcatataa 236  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  7113204 gattggtaccacatgcatataa 7113183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 165 - 293
Target Start/End: Original strand, 22643539 - 22643667
Alignment:
Q  165 taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtca 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22643539 taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcgtataaggagtctaagagcattgtcgcattgtca 22643638  T
Q  265 tgattaagatgccttgttgataatgattg 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22643639 tgattaagatgccttgttgataatgattg 22643667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 24 - 236
Target Start/End: Original strand, 27409985 - 27410201
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  27409985 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 27410084  T
Q  115 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 214  Q
    ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27410085 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgac 27410179  T
Q  215 gattggtaccacatgcatataa 236  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  27410180 gattggtaccacatgcatataa 27410201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 24 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 55022633 - 55022417
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  55022633 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 55022534  T
Q  115 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 214  Q
    ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  55022533 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgac 55022439  T
Q  215 gattggtaccacatgcatataa 236  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  55022438 gattggtaccacatgcatataa 55022417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 159
Target Start/End: Original strand, 26788896 - 26789034
Alignment:
Q  21 tatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagctta 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  26788896 tatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatattattgagctta 26788995  T
Q  121 gtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacg 159  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26788996 gttctcaccacgtatattaggagctttgtcctccgcacg 26789034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 24 - 236
Target Start/End: Original strand, 4107740 - 4107956
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  4107740 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatattgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 4107839  T
Q  115 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 214  Q
    ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4107840 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgac 4107934  T
Q  215 gattggtaccacatgcatataa 236  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  4107935 gattggtaccacatgcatataa 4107956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 24 - 236
Target Start/End: Original strand, 4111592 - 4111808
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  4111592 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatattgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 4111691  T
Q  115 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 214  Q
    ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4111692 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgac 4111786  T
Q  215 gattggtaccacatgcatataa 236  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  4111787 gattggtaccacatgcatataa 4111808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 24 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 11069836 - 11069620
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  11069836 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 11069737  T
Q  115 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 214  Q
    ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  11069736 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacctatgatgac 11069642  T
Q  215 gattggtaccacatgcatataa 236  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  11069641 gattggtaccacatgcatataa 11069620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 24 - 236
Target Start/End: Original strand, 11165870 - 11166086
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  11165870 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 11165969  T
Q  115 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 214  Q
    ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11165970 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcatccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgac 11166064  T
Q  215 gattggtaccacatgcatataa 236  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  11166065 gattggtaccacatgcatataa 11166086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 24 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 14499093 - 14498877
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  14499093 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattatgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 14498994  T
Q  115 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 214  Q
    ||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14498993 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacatttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgac 14498899  T
Q  215 gattggtaccacatgcatataa 236  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  14498898 gattggtaccacatgcatataa 14498877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 24 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 15617142 - 15616926
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 114  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  15617142 atgatgacatttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 15617043  T
Q  115 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 214  Q
    ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15617042 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacggttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgac 15616948  T
Q  215 gattggtaccacatgcatataa 236  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  15616947 gattggtaccacatgcatataa 15616926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 24 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 22321432 - 22321216
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  22321432 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 22321333  T
Q  115 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 214  Q
    ||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  22321332 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgttttg--ggagctttgtcctccgcacgataaaaatatattaatacttatgatgac 22321238  T
Q  215 gattggtaccacatgcatataa 236  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  22321237 gattggtaccacatgcatataa 22321216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 24 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 22336487 - 22336271
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  22336487 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 22336388  T
Q  115 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 214  Q
    ||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  22336387 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgttttg--ggagctttgtcctccgcacgataaaaatatattaatacttatgatgac 22336293  T
Q  215 gattggtaccacatgcatataa 236  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  22336292 gattggtaccacatgcatataa 22336271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 24 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 28949490 - 28949274
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  28949490 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 28949391  T
Q  115 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 214  Q
    ||||| |||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  28949390 agctttgtcctcaccatga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgaaaaaagtatattaatacttatgatgac 28949296  T
Q  215 gattggtaccacatgcatataa 236  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  28949295 gattggtaccacatgcatataa 28949274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 25 - 236
Target Start/End: Original strand, 16750684 - 16750898
Alignment:
Q  25 tgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattga 115  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| |||||||    
T  16750684 tgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgataatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattga 16750783  T
Q  116 gcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacg 215  Q
    |||| ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16750784 gctttgtcctcaccacgt---ttaggagctttgtcctccgcacgatt---aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacg 16750877  T
Q  216 attggtaccacatgcatataa 236  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  16750878 attggtaccacatgcatataa 16750898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 24 - 159
Target Start/End: Original strand, 22643426 - 22643560
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 123  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22643426 atgatgaagtt-agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcatacgagtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 22643524  T
Q  124 ctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacg 159  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22643525 ctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacg 22643560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 141 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 15360596 - 15360482
Alignment:
Q  141 gagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagag 240  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15360596 gagctttgtcctccgcacgatttttaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggag 15360497  T
Q  241 tctaagagcattgtc 255  Q
    |||||||||||||||    
T  15360496 tctaagagcattgtc 15360482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 141 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 15337338 - 15337213
Alignment:
Q  141 gagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagag 240  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15337338 gagctttgtcctccgcacgatttttaggagttttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggag 15337239  T
Q  241 tctaagagcattgtcgcattgtcatg 266  Q
    |||||||||||||||  |||||||||    
T  15337238 tctaagagcattgtcatattgtcatg 15337213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 144 - 276
Target Start/End: Original strand, 28368673 - 28368806
Alignment:
Q  144 ctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtc 242  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28368673 ctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtc 28368772  T
Q  243 taagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgc 276  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  28368773 taagagcattgtcgcattgtcgtgtctaagatgc 28368806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 144 - 276
Target Start/End: Original strand, 28376491 - 28376624
Alignment:
Q  144 ctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtc 242  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28376491 ctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtc 28376590  T
Q  243 taagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgc 276  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  28376591 taagagcattgtcgcattgtcgtgtctaagatgc 28376624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 144 - 276
Target Start/End: Original strand, 28384313 - 28384446
Alignment:
Q  144 ctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtc 242  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28384313 ctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtc 28384412  T
Q  243 taagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgc 276  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  28384413 taagagcattgtcgcattgtcgtgtctaagatgc 28384446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 38 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 38814385 - 38814169
Alignment:
Q  38 ctccaaattattggatgcatgt-tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat 135  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||||| ||||| |||||||||||  || | |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||      
T  38814385 ctccaaattattggatgtatatgtgataagttgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccacga-- 38814290  T
Q  136 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 235  Q
     ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  38814289 -ttaggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtcctccgcatgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat- 38814195  T
Q  236 aagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    ||| |||||||  |||||||||||||    
T  38814194 aagtgtctaagttgcattgtcgcatt 38814169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 24 - 159
Target Start/End: Original strand, 15398014 - 15398149
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 123  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15398014 atgatgacgtttagctccaaattgttggatgcatgtcgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 15398113  T
Q  124 ctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacg 159  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  15398114 ctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacg 15398149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 38 - 260
Target Start/End: Original strand, 1598584 - 1598800
Alignment:
Q  38 ctccaaattattggatgcatgt-tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat 135  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||||| ||||| |||||||| ||  || | |||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||      
T  1598584 ctccaaattattggatgtatatgtgataagttgattaagatgttttattgtta-gagtccatgcattagcgt-tcattgagctttgtcctcaccacga-- 1598679  T
Q  136 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 235  Q
     |||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  1598680 -ttaggagctttgtcctcctcacgttt---aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat- 1598774  T
Q  236 aagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    ||| |||||||  |||||||||||||    
T  1598775 aagtgtctaagttgcattgtcgcatt 1598800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 38 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 3833675 - 3833459
Alignment:
Q  38 ctccaaattattggatgcatgt-tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat 135  Q
    ||||||||||||||||| || | ||||| || ||||| |||||||||||  || | |||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||| ||      
T  3833675 ctccaaattattggatgtatatgtgataggttgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattaacat-tcattgagctttgtcctcaccatga-- 3833580  T
Q  136 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 235  Q
     ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  3833579 -ttaggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat- 3833485  T
Q  236 aagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    ||| |||||||  |||||||||||||    
T  3833484 aagtgtctaagttgcattgtcgcatt 3833459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 93 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 15964633 - 15964472
Alignment:
Q  93 gtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaa 191  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  15964633 gtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgatt---aggagctttgtcctccgcacgattaa 15964541  T
Q  192 agtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||    
T  15964540 agtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat-aagtgtctaagttgcattgtcgcatt 15964472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 93 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 15968557 - 15968396
Alignment:
Q  93 gtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaa 191  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  15968557 gtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgatt---aggagctttgtcctccgcacgattaa 15968465  T
Q  192 agtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||    
T  15968464 agtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat-aagtgtctaagttgcattgtcgcatt 15968396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 93 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 15972481 - 15972320
Alignment:
Q  93 gtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaa 191  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  15972481 gtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgatt---aggagctttgtcctccgcacgattaa 15972389  T
Q  192 agtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||    
T  15972388 agtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat-aagtgtctaagttgcattgtcgcatt 15972320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 141 - 266
Target Start/End: Original strand, 15398104 - 15398229
Alignment:
Q  141 gagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagag 240  Q
    |||||| ||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  15398104 gagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacaattggtaccacatgcatataaggag 15398203  T
Q  241 tctaagagcattgtcgcattgtcatg 266  Q
    |||||||||||||||  |||||||||    
T  15398204 tctaagagcattgtcatattgtcatg 15398229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 165 - 266
Target Start/End: Original strand, 26789013 - 26789114
Alignment:
Q  165 taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtca 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  26789013 taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtca 26789112  T
Q  265 tg 266  Q
    ||    
T  26789113 tg 26789114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 38 - 236
Target Start/End: Original strand, 15942009 - 15942201
Alignment:
Q  38 ctccaaattattggatgcatgt-tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat 135  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| | ||||||| |  || | || ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||      
T  15942009 ctccaaattattggatgtatgtgtgataagttgattaagttgttttgctgtta-gagttcatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccacga-- 15942104  T
Q  136 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 235  Q
     ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  15942105 -ttaggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgataaagattggtaccacatgcatata 15942200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 24 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 15360686 - 15360551
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 123  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15360686 atgatgacgtttagctccaaattgttggatgcatgtcgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagctttgtc 15360587  T
Q  124 ctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacg 159  Q
    |||  ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  15360586 ctccgcacgatttttaggagctttgtcctccgcacg 15360551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 60 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 16696763 - 16696566
Alignment:
Q  60 tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcac 158  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||  || | |||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||| |    ||||||||||||||||||||||    
T  16696763 tgataagttgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattagcat-tcattgacctttgtcctcaccatgt---ttaggagctttgtcctccgcac 16696669  T
Q  159 gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgc 257  Q
    ||||   |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||    
T  16696668 gttt---aggagctttgtcctccacacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat-aagtgtctaagttgcattgtcgc 16696573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 172 - 266
Target Start/End: Original strand, 29695943 - 29696037
Alignment:
Q  172 tttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29695943 tttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 29696037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 38 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 5223065 - 5222874
Alignment:
Q  38 ctccaaattattggatgcatgt-tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat 135  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||| ||||| | ||| ||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||      
T  5223065 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaaggtgtcttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccatga-- 5222970  T
Q  136 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 235  Q
     |||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5222969 -ttaggagctttgtcctccgcacg----ataggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgatgattggtaccacatgcatata 5222875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 60 - 263
Target Start/End: Original strand, 16809009 - 16809203
Alignment:
Q  60 tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcac 158  Q
    |||||||| ||||| | ||| ||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||    ||||||||||||||||| |||    
T  16809009 tgataagttgattaaggtgtcttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccatga----taggagctttgtcctccacac 16809102  T
Q  159 gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgc 257  Q
    ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||    
T  16809103 gttt---aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatac-tatgatgacgattggtaccacatgcatat-aagtgtctaagttgcattgtcgc 16809197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 136 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 19775217 - 19775095
Alignment:
Q  136 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  19775217 attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacaatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat- 19775121  T
Q  236 aagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    ||| |||||||  |||||||||||||    
T  19775120 aagtgtctaagttgcattgtcgcatt 19775095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 138 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 15464746 - 15464651
Alignment:
Q  138 taggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa 236  Q
    |||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15464746 taggagctttgtcctccgcacgatt---aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa 15464651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 24 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 15337428 - 15337293
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 123  Q
    |||||||  |||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15337428 atgatgacatttagctccaaattgttggatgcatgtcgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagctttgtc 15337329  T
Q  124 ctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacg 159  Q
    |||  ||||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  15337328 ctccgcacgatttttaggagttttgtcctccgcacg 15337293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 138 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 12339347 - 12339252
Alignment:
Q  138 taggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa 236  Q
    |||||||||||||||||||||| ||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12339347 taggagctttgtcctccgcacgatt---agcagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa 12339252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 141 - 260
Target Start/End: Original strand, 4589378 - 4589494
Alignment:
Q  141 gagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagag 240  Q
    |||||||||||||| |||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  4589378 gagctttgtcctccccacgatt---aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat-aagtg 4589473  T
Q  241 tctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    ||||||  |||||||||||||    
T  4589474 tctaagttgcattgtcgcatt 4589494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 165 - 260
Target Start/End: Original strand, 37440123 - 37440218
Alignment:
Q  165 taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||    
T  37440123 taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat-aagtgtctaagttgcattgtcgcatt 37440218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 38 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 17241972 - 17241759
Alignment:
Q  38 ctccaaattattggatgcatgt-tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat 135  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||| ||||| |||||||||||  | |  |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| |       
T  17241972 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaagatgttttgttgtt-taagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccatg--- 17241878  T
Q  136 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 235  Q
     || ||||||||||||||| ||||    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  17241877 -ttcggagctttgtcctccacacg----ataggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatac-tatgatgacgattggtaccacatgcatat- 17241785  T
Q  236 aagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    ||| |||||||  |||||||||||||    
T  17241784 aagtgtctaagttgcattgtcgcatt 17241759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 141 - 260
Target Start/End: Original strand, 8489652 - 8489768
Alignment:
Q  141 gagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagag 240  Q
    ||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |    
T  8489652 gagctttgtcctccgcacgatt---aggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattgataccacatgcatat-aagtg 8489747  T
Q  241 tctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    ||||||  |||||||||||||    
T  8489748 tctaagttgcattgtcgcatt 8489768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 220 - 303
Target Start/End: Original strand, 15711579 - 15711662
Alignment:
Q  220 gtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  15711579 gtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgat 15711662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 60 - 223
Target Start/End: Original strand, 16798182 - 16798336
Alignment:
Q  60 tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcac 158  Q
    |||||||| ||||| | ||| ||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||    ||||||||||||||||| |||    
T  16798182 tgataagttgattaaggtgtcttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccatga----taggagctttgtcctccacac 16798275  T
Q  159 gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 223  Q
    ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16798276 gttt---aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatac-tatgatgacgattggtac 16798336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Original strand, 31422981 - 31423045
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31422981 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaacgattatgatgttaattt 31423045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 167 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 15482542 - 15482448
Alignment:
Q  167 ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa-agagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  |||||||||||||    
T  15482542 ggagctttgtcctccccacgattaaagtatattaatac-tatgatgacgattggtaccacatgcatataagagtgtctaagttgcattgtcgcatt 15482448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 26 - 147
Target Start/End: Original strand, 28351277 - 28351398
Alignment:
Q  26 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcc 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||| ||  ||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  28351277 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacggtgaattgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 28351375  T
Q  125 tcaccacgaatattaggagcttt 147  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  28351376 tcaccacgattattaggagcttt 28351398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Original strand, 31097779 - 31097875
Alignment:
Q  164 ataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||  |||||||||||||    
T  31097779 ataggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatac-tatgatgaagattggtaccacatgcataaagagtgtctaagttgcattgtcgcatt 31097875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 292 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 48423024 - 48422955
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattttgatt 361  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  48423024 tgattacgtgataactgtttagcatttatgcaaagttaataatggaatgtttatgatgttaattatgatt 48422955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 292 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 48429802 - 48429733
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattttgatt 361  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  48429802 tgattacgtgataactgtttagcatttatgcaaagttaataatggaatgtttatgatgttaattatgatt 48429733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 296 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 6596932 - 6596872
Alignment:
Q  296 tacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6596932 tacgtgataactgtttagcatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 6596872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 296 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 6598393 - 6598333
Alignment:
Q  296 tacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6598393 tacgtgataactgtttagcatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 6598333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 296 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 6605073 - 6605013
Alignment:
Q  296 tacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6605073 tacgtgataactgtttagcatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 6605013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Original strand, 10846711 - 10846775
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10846711 tgattatgtgataactgtttagcatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 10846775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 38 - 186
Target Start/End: Original strand, 11300871 - 11301017
Alignment:
Q  38 ctccaaattattggatgcatgt-tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat 135  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||| ||||| | ||| ||||| ||| | |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| |    
T  11300871 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaaggtgtcttgttgataagagtccatgcattagcat-tcactgagcttagtcctcaccacgatt 11300969  T
Q  136 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacg 186  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||    
T  11300970 attaggagttttgtcctccgcacgat---taggagctttgtcctccgcacg 11301017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 26889133 - 26889069
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26889133 tgattacgtgataactgtttagcatttatgcaaagttaataatagaatgattatgatgttaattt 26889069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 37615070 - 37615006
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37615070 tgattacgtgataactgtttagcatttacgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 37615006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 293 - 356
Target Start/End: Original strand, 20057832 - 20057895
Alignment:
Q  293 gattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20057832 gattacgtgataactgtttagcaattatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 20057895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 293 - 356
Target Start/End: Original strand, 20064470 - 20064533
Alignment:
Q  293 gattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20064470 gattacgtgataactgtttagcaattatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 20064533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 25 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 19775358 - 19775194
Alignment:
Q  25 tgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattga 115  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| |||||||    
T  19775358 tgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgataatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattga 19775259  T
Q  116 gcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacg 186  Q
    |||| ||||||||||||    |||| |||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||    
T  19775258 gctttgtcctcaccacg---tttagaagctttgtcctccgcacgat---taggagctttgtcctccgcacg 19775194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 292 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 417679 - 417618
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaa 353  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  417679 tgattacgcgataactgtttagcatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaa 417618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 292 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 13250396 - 13250327
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattttgatt 361  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  13250396 tgattgcgtgataactgtttagcatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgtaaattatgatt 13250327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 292 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 13257042 - 13256973
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattttgatt 361  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  13257042 tgattgcgtgataactgtttagcatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgtaaattatgatt 13256973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 292 - 353
Target Start/End: Original strand, 14673627 - 14673688
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaa 353  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14673627 tgattacgcgataactgtttagcatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaa 14673688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Original strand, 5107312 - 5107376
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5107312 tgattacgtgataactgtttagcctttatgcaaagctaataatggaatgattatgatgttaattt 5107376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 25 - 159
Target Start/End: Original strand, 4589289 - 4589420
Alignment:
Q  25 tgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacga-tgttttgttcatatgtgtccatgca-tagcatctcattgagcttagt 122  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |  || ||||| ||||||||| ||| | ||||||||| |||||| ||||||||||| ||    
T  4589289 tgatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgaatacgattgttttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgt 4589386  T
Q  123 cctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacg 159  Q
    |||| |||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  4589387 cctccccacg---attaggagctttgtcctccgcacg 4589420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Original strand, 1333509 - 1333571
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  1333509 tgattacgtgataactgtttagcatttatgcaaagttaataatggaatgat--tgatgttaattt 1333571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 16633508 - 16633446
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  16633508 tgattacgtgataactgtttagcatttatgcaaagttaataatggaatgat--tgatgttaattt 16633446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 16640118 - 16640056
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  16640118 tgattacgtgataactgtttagcatttatgcaaagttaataatggaatgat--tgatgttaattt 16640056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 43160783 - 43160721
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  43160783 tgattacgtgataactgtttagcatttatgcaaagttaataatggaatgat--tgatgttaattt 43160721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 43167020 - 43166958
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  43167020 tgattacgtgataactgtttagcatttatgcaaagttaataatggaatgat--tgatgttaattt 43166958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Original strand, 10154211 - 10154275
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||    
T  10154211 tgattacgtgataactgtttagcatttatgcaaagttgataaaggaatgattaagatgttaattt 10154275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 207 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 4290979 - 4290920
Alignment:
Q  207 atgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 266  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  4290979 atgatgacgattggcaccacatgcatataaagtgtctaagagcattgtcacattgtcatg 4290920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 93 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 11854417 - 11854328
Alignment:
Q  93 gtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcac 185  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  11854417 gtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgacgattagcagctttatcctccgcacgtt---taggagctttgtcctccgcac 11854328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 69 - 260
Target Start/End: Original strand, 20461647 - 20461832
Alignment:
Q  69 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttatag 167  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |||||||||| |||||  |||||||||| |||||| |||||| |     |||||||||||||  |||| ||    |    
T  20461647 gattacgatgttttgttgata-gagtccatgcattagcata-cattgagctttgtcctcgccacgattt----gagctttgtcctcaccacgatt----g 20461736  T
Q  168 gagctttgtcctccgcacgat---taaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    |||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||  |||||||||||||    
T  20461737 gagctttgtcctccccacgatgcgtaaagtatattaatact-atgatgacgattgataccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgcatt 20461832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 167 - 260
Target Start/End: Original strand, 7793586 - 7793682
Alignment:
Q  167 ggagctttgtcctccgcacgat---taaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    ||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||  |||||||||||||    
T  7793586 ggagctttgtcctccccacgatgcttaaagtatattaatact-atgataacgattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgcatt 7793682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 38 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 12339467 - 12339322
Alignment:
Q  38 ctccaaattattggatgcatgt-tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat 135  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||| ||||| | ||| ||||| ||| | | |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||      
T  12339467 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaaggtgtcttgttgata-gaggccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccatga-- 12339372  T
Q  136 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgatta 190  Q
     |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||    
T  12339371 -ttaggagctttgtcctccgcacg----ataggagctttgtcctccgcacgatta 12339322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 38 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 15464866 - 15464721
Alignment:
Q  38 ctccaaattattggatgcatgt-tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat 135  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||| ||||| | ||| ||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||      
T  15464866 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaaggtgtcttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccatga-- 15464771  T
Q  136 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgatta 190  Q
     ||||||| |||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||    
T  15464770 -ttaggagttttgtcctccgcacg----ataggagctttgtcctccgcacgatta 15464721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 260
Target Start/End: Original strand, 327401 - 327497
Alignment:
Q  167 ggagctttgtcctccgcacgat--ta-aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    ||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||  |||||||||||||    
T  327401 ggagctttgtcctccccacgatgctataagtatattaatactt-tgatgacgattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgcatt 327497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 14668430 - 14668334
Alignment:
Q  167 ggagctttgtcctccgcacgat--ta-aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    ||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||  |||||||||||||    
T  14668430 ggagctttgtcctccccacgatgctataagtatattaatactt-tgatgacgattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgcatt 14668334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 3690297 - 3690233
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||    
T  3690297 tgattacgtgataactgtttagcaattatgcaaagttagaaatagaatgaatatgatgttaattt 3690233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Original strand, 16624482 - 16624545
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  16624482 tgattatgtgataactgtttagcatt-atgcaaagttaataatgggatgaatatgatgttaattt 16624545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #162
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 316 - 356
Target Start/End: Original strand, 26196011 - 26196051
Alignment:
Q  316 tttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26196011 tttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 26196051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #163
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 191 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 14665247 - 14665178
Alignment:
Q  191 aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||  |||||||||||||    
T  14665247 aagtatattaatactt-tgatgacgattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgcatt 14665178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #164
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 167 - 260
Target Start/End: Original strand, 2898058 - 2898155
Alignment:
Q  167 ggagctttgtcctccgcacgat---taaagtatattaatacttatgatgacg-attggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    ||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||   |||||||  |||||||||||||    
T  2898058 ggagctttgtcctccccacgatgcttaaagtatattaatact-atgatgaagtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgcatt 2898155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #165
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 137 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 11854313 - 11854266
Alignment:
Q  137 ttaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacga 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  11854313 ttaggagctttgtcctccgcacgtt---taggagctttgtcctccgcacga 11854266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #166
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 191 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 14572431 - 14572386
Alignment:
Q  191 aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa 236  Q
    |||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||    
T  14572431 aagtatattaatacttattacgatgattggtaccacatgcatataa 14572386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #167
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 293 - 353
Target Start/End: Original strand, 16748269 - 16748330
Alignment:
Q  293 gattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagtt-aataatggaatgattatgatgttaa 353  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||    
T  16748269 gattatgtgataactgtttagtatttatgcaaagttaaatagtggaatgattatgttgttaa 16748330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #168
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 293 - 353
Target Start/End: Original strand, 16759000 - 16759061
Alignment:
Q  293 gattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagtt-aataatggaatgattatgatgttaa 353  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||    
T  16759000 gattatgtgataactgtttagtatttatgcaaagttaaatagtggaatgattatgttgttaa 16759061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #169
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 292 - 353
Target Start/End: Original strand, 22643731 - 22643792
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaa 353  Q
    ||||||||||||||||||||| || || |||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  22643731 tgattacgtgataactgtttagcaattttgcaaagttgttaaagaaatgattatgatgttaa 22643792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #170
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 93 - 159
Target Start/End: Original strand, 37440081 - 37440144
Alignment:
Q  93 gtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacg 159  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  37440081 gtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacg 37440144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #171
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Original strand, 15711830 - 15711894
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    |||||||| |||||||||||| || |||||||| |||  ||| | ||||||||||||||||||||    
T  15711830 tgattacgcgataactgtttagcaattatgcaatgttgttaaagaaatgattatgatgttaattt 15711894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #172
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Original strand, 15727472 - 15727536
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    |||||||| |||||||||||| || |||||||| |||  ||| | ||||||||||||||||||||    
T  15727472 tgattacgcgataactgtttagcaattatgcaatgttgttaaagaaatgattatgatgttaattt 15727536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #173
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Original strand, 23705194 - 23705258
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    |||||||| |||||||||||| || |||||||| |||  ||| | ||||||||||||||||||||    
T  23705194 tgattacgcgataactgtttatcaattatgcaatgttgttaaagaaatgattatgatgttaattt 23705258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #174
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Original strand, 23723650 - 23723714
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    |||||||| |||||||||||| || |||||||| |||  ||| | ||||||||||||||||||||    
T  23723650 tgattacgcgataactgtttatcaattatgcaatgttgttaaagaaatgattatgatgttaattt 23723714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #175
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Original strand, 23742106 - 23742170
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    |||||||| |||||||||||| || |||||||| |||  ||| | ||||||||||||||||||||    
T  23742106 tgattacgcgataactgtttatcaattatgcaatgttgttaaagaaatgattatgatgttaattt 23742170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #176
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 193 - 236
Target Start/End: Original strand, 14577112 - 14577155
Alignment:
Q  193 gtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa 236  Q
    |||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||    
T  14577112 gtatattaatacttattacgatgattggtaccacatgcatataa 14577155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #177
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 190 - 236
Target Start/End: Original strand, 49668364 - 49668410
Alignment:
Q  190 aaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa 236  Q
    ||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||    
T  49668364 aaagtatattaatacttattacgttgattggtaccacatgcatataa 49668410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #178
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 9512752 - 9512707
Alignment:
Q  191 aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa 236  Q
    |||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||    
T  9512752 aagtatattaatacttattacgttgattggtaccacatgcatataa 9512707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #179
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 9520727 - 9520682
Alignment:
Q  191 aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa 236  Q
    |||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||    
T  9520727 aagtatattaatacttattacgttgattggtaccacatgcatataa 9520682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #180
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 16103612 - 16103567
Alignment:
Q  191 aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa 236  Q
    |||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||    
T  16103612 aagtatattaatacttattacgttgattggtaccacatgcatataa 16103567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #181
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Original strand, 5150409 - 5150472
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||  ||| | |||||||||||| |||||||    
T  5150409 tgattacgtgatgactgtttagcaattatgcaaagttgttaa-gaaatgattatgattttaattt 5150472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #182
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Original strand, 41202224 - 41202288
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||  ||||||||||| || |||||||| |||  ||| | ||||||||||||||||||||    
T  41202224 tgattacgcaataactgtttagcaattatgcaatgttgttaaagaaatgattatgatgttaattt 41202288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0052 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 6)
Name: scaffold0052
Description:

Target: scaffold0052; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 14 - 303
Target Start/End: Original strand, 1139 - 1428
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcatt 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1139 gcataagtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccatgcatagcatctcatt 1238  T
Q  114 gagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga 213  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1239 gagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga 1338  T
Q  214 cgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  1339 cgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgat 1428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0052; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 69 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 10303 - 10082
Alignment:
Q  69 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttatagg 168  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10303 gattatgatgttttgttcatctgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttatagg 10204  T
Q  169 agctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgat 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  10203 agctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgat 10104  T
Q  269 taagatgccttgttgataatga 290  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  10103 taagatgccttgttgataatga 10082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0052; HSP #3
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 69 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 56725 - 56504
Alignment:
Q  69 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttatagg 168  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  56725 gattatgatgttttgttcatctgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagttttgtcctccgcacgttttatagg 56626  T
Q  169 agctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgat 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  56625 agctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgat 56526  T
Q  269 taagatgccttgttgataatga 290  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  56525 taagatgccttgttgataatga 56504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0052; HSP #4
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 10015 - 9953
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  10015 tgattacgtgataactgtttagcatttatgcaaagttaataatggaatgat--tgatgttaattt 9953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0052; HSP #5
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 56437 - 56375
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  56437 tgattacgtgataactgtttagcatttatgcaaagttaataatggaatgat--tgatgttaattt 56375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0052; HSP #6
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Original strand, 1482 - 1546
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||    
T  1482 tgattacgtgataactgtttagcaattatgcaaagttgataaagaaatgattatgatgttaattt 1546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 132)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 14 - 303
Target Start/End: Original strand, 14298915 - 14299203
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcatt 113  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14298915 gcataagtatatgatgaagtt-agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccatgcatagcatctcatt 14299013  T
Q  114 gagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga 213  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14299014 gagcttagtcctcgccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga 14299113  T
Q  214 cgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14299114 cgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgatgatgattgattacgtgat 14299203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 21 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 23954161 - 23953879
Alignment:
Q  21 tatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagctta 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23954161 tatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagctta 23954062  T
Q  121 gtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23954061 gtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 23953962  T
Q  221 taccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||    
T  23953961 taccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgaatgaatatgtgat 23953879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 21 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 23960823 - 23960541
Alignment:
Q  21 tatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagctta 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23960823 tatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagctta 23960724  T
Q  121 gtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23960723 gtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 23960624  T
Q  221 taccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||    
T  23960623 taccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgaatgaatatgtgat 23960541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 21 - 290
Target Start/End: Original strand, 19780381 - 19780650
Alignment:
Q  21 tatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagctta 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19780381 tatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagctta 19780480  T
Q  121 gtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19780481 gtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 19780580  T
Q  221 taccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatga 290  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19780581 taccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatga 19780650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 14 - 303
Target Start/End: Original strand, 14268541 - 14268829
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcatt 113  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14268541 gcataagtatatgatgaagtt-agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccatgcatagcatctcatt 14268639  T
Q  114 gagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga 213  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14268640 gagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga 14268739  T
Q  214 cgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  14268740 cgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatgattgaatacgtgat 14268829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 14 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 15148477 - 15148201
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15148477 gcataagtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcatt 15148378  T
Q  114 gagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga 213  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15148377 gagctttgtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga 15148278  T
Q  214 cgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatga 290  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15148277 cgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatga 15148201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 14 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 15362152 - 15361876
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15362152 gcataagtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcatt 15362053  T
Q  114 gagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga 213  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15362052 gagctttgtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga 15361953  T
Q  214 cgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatga 290  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15361952 cgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatga 15361876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 14 - 290
Target Start/End: Original strand, 16231928 - 16232204
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16231928 gcataagtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcatt 16232027  T
Q  114 gagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga 213  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16232028 gagctttgtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga 16232127  T
Q  214 cgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatga 290  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16232128 cgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatga 16232204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 14 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 22194639 - 22194363
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22194639 gcataagtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcatt 22194540  T
Q  114 gagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga 213  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22194539 gagctttgtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga 22194440  T
Q  214 cgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatga 290  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22194439 cgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatga 22194363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 14 - 303
Target Start/End: Original strand, 36884821 - 36885110
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36884821 gcataagtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcatt 36884920  T
Q  114 gagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga 213  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36884921 gagctttgtcctcaccacgaaaattaggagcgttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga 36885020  T
Q  214 cgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||    
T  36885021 cgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatgaatgaatatgtgat 36885110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 14 - 303
Target Start/End: Original strand, 15383579 - 15383867
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcatt 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  15383579 gcataagtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatacgttgattacg-tgttttgttgttatgtgtccatgcatagcatatcatt 15383677  T
Q  114 gagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga 213  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15383678 gagctttgtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga 15383777  T
Q  214 cgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  15383778 cgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgat 15383867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 21 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 4772109 - 4771865
Alignment:
Q  21 tatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagctta 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4772109 tatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagt-gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagctta 4772011  T
Q  121 gtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4772010 gtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 4771911  T
Q  221 taccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 266  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4771910 taccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 4771865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 19 - 303
Target Start/End: Original strand, 386421 - 386705
Alignment:
Q  19 ggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagct 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||    
T  386421 ggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagct 386520  T
Q  119 tagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgatt 218  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  386521 tagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcatgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgatt 386620  T
Q  219 ggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  386621 ggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgat 386705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 19 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 40478164 - 40477880
Alignment:
Q  19 ggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagct 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||    
T  40478164 ggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagct 40478065  T
Q  119 tagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgatt 218  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40478064 tagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagttttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgatt 40477965  T
Q  219 ggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  40477964 ggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgat 40477880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 19 - 303
Target Start/End: Original strand, 6873468 - 6873752
Alignment:
Q  19 ggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagct 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||    
T  6873468 ggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagct 6873567  T
Q  119 tagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgatt 218  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6873568 tagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgtttattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgatt 6873667  T
Q  219 ggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  6873668 ggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgat 6873752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 21 - 266
Target Start/End: Original strand, 8048589 - 8048833
Alignment:
Q  21 tatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagctta 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8048589 tatatgatgaagtttagctccaagttattggatgcatgttgataagt-gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagctta 8048687  T
Q  121 gtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 220  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8048688 gtcctcaccacgaatattaggagccttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 8048787  T
Q  221 taccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 266  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8048788 taccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 8048833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 21 - 266
Target Start/End: Original strand, 8055202 - 8055446
Alignment:
Q  21 tatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagctta 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8055202 tatatgatgaagtttagctccaagttattggatgcatgttgataagt-gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagctta 8055300  T
Q  121 gtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 220  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8055301 gtcctcaccacgaatattaggagccttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 8055400  T
Q  221 taccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 266  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8055401 taccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 8055446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 14 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 12475039 - 12474750
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataa-gtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcat 112  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||    
T  12475039 gcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcat 12474941  T
Q  113 tgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg 212  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12474940 tgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg 12474841  T
Q  213 acgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  12474840 acgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgat 12474750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 14 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 12481669 - 12481380
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataa-gtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcat 112  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||    
T  12481669 gcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcat 12481571  T
Q  113 tgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg 212  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12481570 tgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg 12481471  T
Q  213 acgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  12481470 acgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgat 12481380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 14 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 18071188 - 18070899
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataa-gtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcat 112  Q
    ||||| || |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  18071188 gcatatgtttatgataaggtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttttgttcataagtgtccatgcatagcatatcat 18071090  T
Q  113 tgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg 212  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18071089 tgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg 18070990  T
Q  213 acgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  18070989 acgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatgattgaatatgtgat 18070899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 14 - 303
Target Start/End: Original strand, 18024514 - 18024803
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataa-gtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcat 112  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| |||||||||  || | |||||| |||||||| ||||    
T  18024514 gcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatacatagcatatcat 18024612  T
Q  113 tgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg 212  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18024613 tgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg 18024712  T
Q  213 acgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  18024713 acgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgat 18024803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 19 - 303
Target Start/End: Original strand, 26284998 - 26285283
Alignment:
Q  19 ggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcga-ttacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagc 117  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||  || | ||||||||||||||| |||||||||    
T  26284998 ggtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgaattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagc 26285097  T
Q  118 ttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgat 217  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26285098 ttagtcctcaccacgtttattaggagccttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgaggat 26285197  T
Q  218 tggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  26285198 tggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgat 26285283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 14 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 18295645 - 18295356
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataa-gtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcat 112  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||    
T  18295645 gcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcat 18295547  T
Q  113 tgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg 212  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18295546 tgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgatttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg 18295447  T
Q  213 acgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||    
T  18295446 acgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgaatgaatatgtgat 18295356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 69 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 8384778 - 8384557
Alignment:
Q  69 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttatagg 168  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8384778 gattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttatagg 8384679  T
Q  169 agctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgat 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  8384678 agctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgat 8384579  T
Q  269 taagatgccttgttgataatga 290  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  8384578 taagatgccttgttgataatga 8384557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 69 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 14073774 - 14073553
Alignment:
Q  69 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttatagg 168  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14073774 gattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttatagg 14073675  T
Q  169 agctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgat 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  14073674 agctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgat 14073575  T
Q  269 taagatgccttgttgataatga 290  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  14073574 taagatgccttgttgataatga 14073553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 69 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 15256552 - 15256331
Alignment:
Q  69 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttatagg 168  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15256552 gattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttatagg 15256453  T
Q  169 agctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgat 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  15256452 agctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgat 15256353  T
Q  269 taagatgccttgttgataatga 290  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  15256352 taagatgccttgttgataatga 15256331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 69 - 290
Target Start/End: Original strand, 17090140 - 17090361
Alignment:
Q  69 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttatagg 168  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17090140 gattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttatagg 17090239  T
Q  169 agctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgat 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  17090240 agctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgat 17090339  T
Q  269 taagatgccttgttgataatga 290  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  17090340 taagatgccttgttgataatga 17090361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 69 - 290
Target Start/End: Original strand, 29041061 - 29041282
Alignment:
Q  69 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttatagg 168  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29041061 gattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttatagg 29041160  T
Q  169 agctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgat 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  29041161 agctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgat 29041260  T
Q  269 taagatgccttgttgataatga 290  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  29041261 taagatgccttgttgataatga 29041282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 26 - 303
Target Start/End: Original strand, 7901283 - 7901560
Alignment:
Q  26 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataa-gtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcc 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7901283 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgattatgatgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcc 7901381  T
Q  125 tcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 224  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7901382 tcaccacgtttattaggagctttgttctctgcacgtttattaggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 7901481  T
Q  225 acatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7901482 acatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 7901560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 69 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 8391433 - 8391212
Alignment:
Q  69 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttatagg 168  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8391433 gattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttatagg 8391334  T
Q  169 agctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgat 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  8391333 agctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatagggagtctaggagcattgtcacattgtcatgat 8391234  T
Q  269 taagatgccttgttgataatga 290  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  8391233 taagatgccttgttgataatga 8391212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 24 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 23081583 - 23081341
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 123  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23081583 atgatgacgtttagctccaaattgttggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 23081484  T
Q  124 ctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 223  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23081483 ctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 23081384  T
Q  224 cacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 266  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23081383 cacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 23081341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 24 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 27709740 - 27709498
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 123  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27709740 atgatgacgtttagctccaaattgttggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 27709641  T
Q  124 ctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 223  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27709640 ctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 27709541  T
Q  224 cacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 266  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27709540 cacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 27709498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 69 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 17808357 - 17808136
Alignment:
Q  69 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttatagg 168  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17808357 gattatgatgttttgttcatctgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttatagg 17808258  T
Q  169 agctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgat 268  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  17808257 agctttgtcctccgcacgattgaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgat 17808158  T
Q  269 taagatgccttgttgataatga 290  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  17808157 taagatgccttgttgataatga 17808136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 55 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 40453899 - 40453651
Alignment:
Q  55 catgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctcc 154  Q
    |||||||||| || ||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  40453899 catgttgatatgttgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctcc 40453800  T
Q  155 gcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgt 254  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40453799 gcacgttttataggagttttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgt 40453700  T
Q  255 cgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  40453699 cacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgat 40453651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 19 - 303
Target Start/End: Original strand, 51493909 - 51494183
Alignment:
Q  19 ggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagct 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  |||||| |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||    
T  51493909 ggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcat--tgatatgtttattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagct 51494006  T
Q  119 tagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgatt 218  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51494007 tagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgatt 51494106  T
Q  219 ggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  51494107 ggtaccacatgcatataaggagtctaaga--------gcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgat 51494183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 24 - 266
Target Start/End: Original strand, 9272267 - 9272509
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 123  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||| || |||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9272267 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgaatacggtgatttgttcataagagtccatgcatagcatttcattgagcttagtc 9272366  T
Q  124 ctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 223  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9272367 ctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacaattggtac 9272466  T
Q  224 cacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 266  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9272467 cacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 9272509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 26 - 303
Target Start/End: Original strand, 15322205 - 15322482
Alignment:
Q  26 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataa-gtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcc 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||| |||||| ||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15322205 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttttattgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcc 15322303  T
Q  125 tcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 224  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15322304 tcaccacgtttattacgagctttgtcctccgcacgtttattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtacc 15322403  T
Q  225 acatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  15322404 acatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgat 15322482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 24 - 266
Target Start/End: Original strand, 19942265 - 19942507
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 123  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19942265 atgatgacgtttagctccaaattgttggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 19942364  T
Q  124 ctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 223  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19942365 ctcaccacgtttattatgagctttgtcctctgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 19942464  T
Q  224 cacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 266  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19942465 cacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 19942507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 24 - 266
Target Start/End: Original strand, 16956762 - 16957004
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 123  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16956762 atgatgacgtttagctccaaattgttggatgcatgttgatatgttgattacgatgttatgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 16956861  T
Q  124 ctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 223  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16956862 ctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagttttttcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 16956961  T
Q  224 cacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 266  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  16956962 cacatgcatataaagtgtctaagagcattgtcacattgtcatg 16957004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 24 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 53433371 - 53433126
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagt 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  53433371 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgatttgttcataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagt 53433273  T
Q  123 cctcaccacgaat-attaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgatt-aaagtatattaatacttatgatgacgattg 219  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53433272 cctcaccacgatttattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgttttaaagtatattaatacttatgatgacgattg 53433173  T
Q  220 gtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 266  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  53433172 gtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 53433126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 26 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 12522076 - 12521835
Alignment:
Q  26 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcc 124  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||| || |||||| ||| | |||||||||| ||||| |||||||||| |||||    
T  12522076 gatgacgtttggctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagctcagtcc 12521978  T
Q  125 tcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 223  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12521977 tcaccacgattattaggagctttgtcctccgcatgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 12521878  T
Q  224 cacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 266  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12521877 cacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 12521835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 69 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 55795403 - 55795168
Alignment:
Q  69 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat-attaggagctttgtcctccgcacgttttatag 167  Q
    |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  55795403 gattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattattag 55795304  T
Q  168 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatga 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||     
T  55795303 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacggagtctaggagcattgtcgcattgtcatgt 55795204  T
Q  268 ttaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
     ||  |||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  55795203 ctattatgctttgttgatgatgattgattatgtgat 55795168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 26 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 23838428 - 23838183
Alignment:
Q  26 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcc 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||| |||||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  23838428 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacgacgttttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgaacttagtcc 23838331  T
Q  125 tcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 224  Q
    |||||| ||    |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23838330 tcaccatga----taggagctttgtcctccgcacgatatttaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 23838235  T
Q  225 acatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgc 276  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  23838234 acatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcgtgtctaagatgc 23838183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 24 - 236
Target Start/End: Original strand, 14757763 - 14757984
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  14757763 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattg 14757862  T
Q  115 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 214  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14757863 agcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgatttataggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgac 14757962  T
Q  215 gattggtaccacatgcatataa 236  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  14757963 gattggtaccacatgcatataa 14757984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 26 - 263
Target Start/End: Original strand, 41385856 - 41386088
Alignment:
Q  26 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcc 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  41385856 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacgatgttttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 41385953  T
Q  125 tcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 224  Q
    |||||| ||    ||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41385954 tcaccatga----taggagctttgtcttccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 41386049  T
Q  225 acatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtc 263  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41386050 acatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtc 41386088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 24 - 236
Target Start/End: Original strand, 4561675 - 4561882
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 123  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  4561675 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtc 4561774  T
Q  124 ctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 223  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4561775 ctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 4561869  T
Q  224 cacatgcatataa 236  Q
    |||||||||||||    
T  4561870 cacatgcatataa 4561882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 24 - 236
Target Start/End: Original strand, 5757280 - 5757487
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 123  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  5757280 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtc 5757379  T
Q  124 ctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 223  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5757380 ctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 5757474  T
Q  224 cacatgcatataa 236  Q
    |||||||||||||    
T  5757475 cacatgcatataa 5757487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 69 - 303
Target Start/End: Original strand, 12349726 - 12349961
Alignment:
Q  69 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat-attaggagctttgtcctccgcacgttttatag 167  Q
    |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  12349726 gattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattattag 12349825  T
Q  168 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatga 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||     
T  12349826 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacggagtctaggagcattgtcacattgtcatgt 12349925  T
Q  268 ttaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
     ||  |||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  12349926 ctattatgctttgttgatgatgattgattatgtgat 12349961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 26 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 14678957 - 14678726
Alignment:
Q  26 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcc 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||  ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  14678957 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacgatgttttgtg-ata-gagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 14678861  T
Q  125 tcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 224  Q
    |||||| ||    |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14678860 tcaccatga----taggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacatttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 14678765  T
Q  225 acatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtc 263  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14678764 acatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtc 14678726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 69 - 303
Target Start/End: Original strand, 12300050 - 12300285
Alignment:
Q  69 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat-attaggagctttgtcctccgcacgttttatag 167  Q
    |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  12300050 gattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattattag 12300149  T
Q  168 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatga 267  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||     
T  12300150 gagctttgtcctccgcacgactaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacggagtctaggagcattgtcacattgtcatgt 12300249  T
Q  268 ttaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
     ||  ||||  ||||||| ||||||||||| |||||    
T  12300250 ctattatgctatgttgatgatgattgattatgtgat 12300285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 69 - 303
Target Start/End: Original strand, 17962486 - 17962721
Alignment:
Q  69 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat-attaggagctttgtcctccgcacgttttatag 167  Q
    ||||| |||||||||||  || |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  17962486 gattaagatgttttgttgttaagaatccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattattag 17962585  T
Q  168 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatga 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||     
T  17962586 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacggagtctaggagcattgtcacattgtcatgt 17962685  T
Q  268 ttaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
     ||  |||||||||||||||||| ||| || |||||    
T  17962686 ctattatgccttgttgataatgaatgaatatgtgat 17962721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 165 - 303
Target Start/End: Original strand, 14305662 - 14305800
Alignment:
Q  165 taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtca 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14305662 taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtca 14305761  T
Q  265 tgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14305762 tgattaagatgccttgttgatgatgattgattacgtgat 14305800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 26 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 14685165 - 14684934
Alignment:
Q  26 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcc 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| |  ||||||||||||||||  ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  14685165 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatattaatatgatgattacgatgttttgtg-ata-gagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 14685069  T
Q  125 tcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 224  Q
    |||||| ||    |||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14685068 tcaccatga----taggagctttgtcctccgtacgattattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgatttgtacc 14684973  T
Q  225 acatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtc 263  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14684972 acatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtc 14684934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 24 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 9556295 - 9556079
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  9556295 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 9556196  T
Q  115 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 214  Q
    ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9556195 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgac 9556101  T
Q  215 gattggtaccacatgcatataa 236  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  9556100 gattggtaccacatgcatataa 9556079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 24 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 17810039 - 17809823
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  17810039 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 17809940  T
Q  115 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 214  Q
    ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17809939 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac 17809845  T
Q  215 gattggtaccacatgcatataa 236  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  17809844 gattggtaccacatgcatataa 17809823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 24 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 33742145 - 33741929
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  33742145 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 33742046  T
Q  115 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 214  Q
    ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33742045 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgac 33741951  T
Q  215 gattggtaccacatgcatataa 236  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  33741950 gattggtaccacatgcatataa 33741929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 14 - 159
Target Start/End: Original strand, 14305539 - 14305683
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcatt 113  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14305539 gcataagtatatgatgaagtt-agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccatgcatagcatctcatt 14305637  T
Q  114 gagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacg 159  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14305638 gagcttagtcctcgccacgaatattaggagctttgtcctccgcacg 14305683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 14 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 20115162 - 20115007
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgtttt-gttcatatgtgtccatgcatagcatctcat 112  Q
    ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20115162 gcataagtttatgatgaagtt-agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgtttttgttcataagtgtccatgcatagcatctcat 20115064  T
Q  113 tgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttatagga 169  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20115063 tgagcttagtcctcaccacgaataataggagttttgtcctccgcacgttttatagga 20115007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 25 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 15224805 - 15224567
Alignment:
Q  25 tgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattga 115  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| |||||||    
T  15224805 tgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgataatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattga 15224706  T
Q  116 gcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacg 215  Q
    |||| ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15224705 gctttgtcctcaccacgt---ttaggagctttgtcctccgcacgatt---aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacg 15224612  T
Q  216 attggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||    
T  15224611 attggtaccacatgcatat-aagtgtctaagttgcattgtcgcatt 15224567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 60 - 263
Target Start/End: Original strand, 14708762 - 14708959
Alignment:
Q  60 tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcac 158  Q
    |||||||| ||||| | |||||||||  || | |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||    
T  14708762 tgataagttgattaaggtgttttgttgtta-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccatga---ttaggagctttgtcctccgcac 14708856  T
Q  159 gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgc 257  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||    
T  14708857 gtttta--ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat-aagtgtctaagttgcattgtcgc 14708953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 38 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 12487427 - 12487234
Alignment:
Q  38 ctccaaattattggatgcatgt-tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat 135  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||| ||||| | ||| ||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||      
T  12487427 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaaggtgtcttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccacga-- 12487332  T
Q  136 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 235  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12487331 -ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 12487235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 38 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 45938149 - 45937958
Alignment:
Q  38 ctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaata 136  Q
    ||||||||||||||||| |   |||||||| ||||| |||||||||||  || | |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||       
T  45938149 ctccaaattattggatgtaatgtgataagttgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccatga--- 45938055  T
Q  137 ttaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45938054 ttaggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgataacgattggtaccacatgcatataa 45937958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 38 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 2014779 - 2014588
Alignment:
Q  38 ctccaaattattggatgcatgt-tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat 135  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||| ||||| |||||||||||  || | |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||      
T  2014779 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccatga-- 2014684  T
Q  136 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 235  Q
      |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2014683 --taggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 2014589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 93 - 260
Target Start/End: Original strand, 14954612 - 14954773
Alignment:
Q  93 gtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaa 191  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  14954612 gtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgatt---aggagctttgtcctccgcacgattaa 14954704  T
Q  192 agtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||    
T  14954705 agtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat-aagtgtctaagttgcattgtcgcatt 14954773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Original strand, 19757706 - 19757896
Alignment:
Q  38 ctccaaattattggatgcatgt-tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat 135  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||||| ||||| |||||||||||  || | |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| || |    
T  19757706 ctccaaattattggatgtatatgtgataagttgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccatgatt 19757803  T
Q  136 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 235  Q
        |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19757804 ----ggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 19757896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 19782100 - 19781910
Alignment:
Q  38 ctccaaattattggatgcatgt-tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat 135  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||||| ||||| |||||||||||  || | |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| || |    
T  19782100 ctccaaattattggatgtatatgtgataagttgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccatgatt 19782003  T
Q  136 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 235  Q
        |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19782002 ----ggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 19781910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 165 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 35170508 - 35170397
Alignment:
Q  165 taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtca 264  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  35170508 taggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcg 35170409  T
Q  265 tgattaagatgc 276  Q
    ||  ||||||||    
T  35170408 tgtctaagatgc 35170397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 38 - 260
Target Start/End: Original strand, 26243770 - 26243985
Alignment:
Q  38 ctccaaattattggatgcatgt-tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat 135  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||| ||||| |||||||||||  || | |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| |       
T  26243770 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccatg--- 26243864  T
Q  136 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 235  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  26243865 -ttaggagctttgtcctccgcacgtttaa---gagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat- 26243959  T
Q  236 aagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    ||| |||||||  |||||||||||||    
T  26243960 aagtgtctaagttgcattgtcgcatt 26243985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 60 - 263
Target Start/End: Original strand, 18602859 - 18603055
Alignment:
Q  60 tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcac 158  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || | |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||    |||||| |||||||||| |||    
T  18602859 tgataagtcgattaaggtgttttgttgtta-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccatga----taggagatttgtcctccacac 18602952  T
Q  159 gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgc 257  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||    
T  18602953 gtttta--ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgtttggtaccacatgcatat-aagtgtctaagttgcattgtcgc 18603049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 60 - 263
Target Start/End: Original strand, 42997578 - 42997775
Alignment:
Q  60 tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcac 158  Q
    |||||||| ||||| | |||||||||  || | |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||    
T  42997578 tgataagttgattaaggtgttttgttgtta-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccatga---ttaggagctttgtcctccgcac 42997672  T
Q  159 gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgc 257  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||  ||||||||||    
T  42997673 gtttta--ggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtatcacgtgcatat-aagtgtctaagtcgcattgtcgc 42997769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 165 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 35613820 - 35613722
Alignment:
Q  165 taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtc 263  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  35613820 taggagctttgtcctccgcacgtttaaattatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtc 35613722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 137 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 23139177 - 23139057
Alignment:
Q  137 ttaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23139177 ttaggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat-a 23139082  T
Q  237 agagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    || |||||||  |||||||||||||    
T  23139081 agtgtctaagttgcattgtcgcatt 23139057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 60 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 3412776 - 3412580
Alignment:
Q  60 tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcac 158  Q
    |||||||| ||||| | |||||||||  || | |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||    ||||||||||||||||| ||     
T  3412776 tgataagttgattaaggtgttttgttgtta-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccatga----taggagctttgtcctccacat 3412683  T
Q  159 gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgc 257  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||    
T  3412682 gtttta--ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgtttggtagcacatgcatat-aagtgtctaagttgcattgtcgc 3412586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 38 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 9530435 - 9530244
Alignment:
Q  38 ctccaaattattggatgcatgt-tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat 135  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||| ||||| |||||||||||  ||   |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||      
T  9530435 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaagatgttttgttgttaaa-gtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccatga-- 9530340  T
Q  136 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 235  Q
      |||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9530339 --taggagctttgtcctccgcacgttt---aggatctttgtcctccacacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 9530245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 60 - 263
Target Start/End: Original strand, 18609431 - 18609627
Alignment:
Q  60 tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcac 158  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || | |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||| ||    || |||||||||||||| |||    
T  18609431 tgataagtcgattaaggtgttttgttgtta-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtccttaccatga----taagagctttgtcctccacac 18609524  T
Q  159 gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgc 257  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||    
T  18609525 gtttta--ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgtttagtaccacatgcatat-aagtgtctaagttgcattgtcgc 18609621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 26 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 35170621 - 35170484
Alignment:
Q  26 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcc 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||| || |||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  35170621 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacggtgatttgttgataagagtccatgcattagcatttcattgagcttagtcc 35170522  T
Q  125 tcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttt 162  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35170521 tcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgttt 35170484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 39 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 18236891 - 18236674
Alignment:
Q  39 tccaaattattggatgcatgt-tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaata 136  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||| ||||| | || |||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||       
T  18236891 tccaaattattggatgtataagtgataagttgattaaggtgatttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccatga--- 18236797  T
Q  137 ttaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa 236  Q
     ||||||||||||||||| |||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  18236796 -taggagctttgtcctccacacgttt---aggatctttgtcctccgcacgattaaagtatattaataattatgacgacgattggtaccacatgcatat-a 18236702  T
Q  237 agagtctaag-agcattgtcgcattgtc 263  Q
    || |||||||  ||||||||||||||||    
T  18236701 agtgtctaagttgcattgtcgcattgtc 18236674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 38 - 237
Target Start/End: Original strand, 16243505 - 16243697
Alignment:
Q  38 ctccaaattattggatgcatgt-tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat 135  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||| ||||| |||||||||||  || | |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||      
T  16243505 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccatga-- 16243600  T
Q  136 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 235  Q
      ||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16243601 --taggagcttagtcctccgcacgttt---aggagctttgtcctctgcacgatgaaattatattaatacttacgatgacgattggtaccacatgcatata 16243695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 37 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 35613921 - 35613796
Alignment:
Q  37 gctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat 135  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||| ||| | ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  35613921 gctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacgatgttttgttgataagagtccatgtattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgatt 35613823  T
Q  136 attaggagctttgtcctccgcacgttt 162  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  35613822 attaggagctttgtcctccgcacgttt 35613796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 165 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 25689489 - 25689394
Alignment:
Q  165 taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||    
T  25689489 taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat-aagtgtctaagttgcattgtcgcatt 25689394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 165 - 260
Target Start/End: Original strand, 28569646 - 28569741
Alignment:
Q  165 taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  28569646 taggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat-aagagtctaagttgcattgtcgcatt 28569741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 93 - 260
Target Start/End: Original strand, 18222539 - 18222697
Alignment:
Q  93 gtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaa 191  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||    | ||||||||||||||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18222539 gtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccatga----tcggagctttgtcctccacacg----ataggagctttgtcctccgcacgattaa 18222629  T
Q  192 agtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||    
T  18222630 agtatattaatac-tatgatgacgattggtaccacatgcatat-aagtgtctaagttgcattgtcgcatt 18222697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 138 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 27533621 - 27533528
Alignment:
Q  138 taggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 234  Q
    |||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27533621 taggagctttgtcctccgcatgttt---aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgataacgattggtaccacatgcatat 27533528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 38 - 234
Target Start/End: Original strand, 1951867 - 1952054
Alignment:
Q  38 ctccaaattattggatgcatgt-tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat 135  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||| ||||| ||||||||||| ||| | || ||||||| |||||  |||||||||| ||||| |||||||      
T  1951867 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaagatgttttgttgata-gagttcatgcattagcata-cattgagctttgtcctgaccacga-- 1951962  T
Q  136 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 234  Q
      | ||||||||||||||| ||||    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1951963 --tcggagctttgtcctccacacg----ataggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatac-tatgatgacgattggtaccacatgcatat 1952054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 165 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 10712475 - 10712380
Alignment:
Q  165 taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||    
T  10712475 taggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat-aagtgtctaagttgcattgtcgcatt 10712380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 165 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 10926245 - 10926150
Alignment:
Q  165 taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||    
T  10926245 taggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat-aagtgtctaagttgcattgtcgcatt 10926150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 24 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 20682147 - 20682038
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgca-tagcatctcattgagcttagt 122  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| || |||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  20682147 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgttgattacggtgatttgttcataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagt 20682049  T
Q  123 cctcaccacga 133  Q
    |||||||||||    
T  20682048 cctcaccacga 20682038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Original strand, 17962776 - 17962840
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17962776 tgattacgtgataactgtttagcatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 17962840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 60 - 260
Target Start/End: Original strand, 18228982 - 18229172
Alignment:
Q  60 tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcac 158  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||  || | |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||    | ||||||||||||||| |||    
T  18228982 tgataagttgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccatga----tcggagctttgtcctccacac 18229075  T
Q  159 gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgc 257  Q
         |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| ||| |||||||  ||||||||||    
T  18229076 a----ataggagctttgtcttccgcacgattaaagtatattaatac-tatgatgacaattggtaccatatgcatat-aagtgtctaagttgcattgtcgc 18229169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Original strand, 19780718 - 19780782
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19780718 tgattacgtgataactgtttagcatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 19780782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 60 - 263
Target Start/End: Original strand, 17152615 - 17152808
Alignment:
Q  60 tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcac 158  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||  || | |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||    | |||||||||| |||| |||    
T  17152615 tgataagttgattaagatgttttgttttta-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccatga----tcggagctttgtgctccacac 17152708  T
Q  159 gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgc 257  Q
    |    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||  ||||||||||    
T  17152709 g----ataggagctttgttctccacacgattaaagtatattaatac-tacgatgacgattggtactacatgcatat-aagtgtctaagttgcattgtcgc 17152802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 292 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 18295301 - 18295232
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattttgatt 361  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  18295301 tgattacgtgataactgtttagcatttatgcaaagttaataatggaatgtttatgatgttaattatgatt 18295232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 15148134 - 15148070
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15148134 tgattacgtgacaactgtttagcatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 15148070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 292 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 12474697 - 12474636
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaa 353  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12474697 tgattacgcgataactgtttaccatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaa 12474636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 292 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 12481327 - 12481266
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaa 353  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12481327 tgattacgcgataactgtttaccatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaa 12481266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 292 - 353
Target Start/End: Original strand, 18024856 - 18024917
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaa 353  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18024856 tgattacgcgataactgtttagcatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaa 18024917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 22194296 - 22194232
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22194296 tgattacgtgacaactgtttagcatttatgcaaagttaataatgggatgattatgatgttaattt 22194232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 23953824 - 23953760
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23953824 tgattacgtgataattgtttagcatttatgcaaagttagtaatggaatgattatgatgttaattt 23953760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 23960486 - 23960422
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23960486 tgattacgtgataattgtttagcatttatgcaaagttagtaatggaatgattatgatgttaattt 23960422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 206 - 266
Target Start/End: Original strand, 30235277 - 30235337
Alignment:
Q  206 tatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30235277 tatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 30235337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Original strand, 36885164 - 36885227
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36885164 tgattacgtga-aactgtttagcatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 36885227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 208 - 263
Target Start/End: Original strand, 21339968 - 21340023
Alignment:
Q  208 tgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtc 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21339968 tgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtc 21340023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 292 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 14073486 - 14073419
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattttgatt 361  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  14073486 tgattacgtgataactgtttagcatttatgcaaagttaataatggaatgat--tgatgttaattatgatt 14073419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 8384490 - 8384428
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  8384490 tgattacgtgataactgtttagcatttatgcaaagttaataatggaatgat--tgatgttaattt 8384428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 8391145 - 8391083
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  8391145 tgattacgtgataactgtttagcatttatgcaaagttaataatggaatgat--tgatgttaattt 8391083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 15256264 - 15256202
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  15256264 tgattacgtgataactgtttagcatttatgcaaagttaataatggaatgat--tgatgttaattt 15256202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Original strand, 17090428 - 17090490
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  17090428 tgattacgtgataactgtttagcatttatgcaaagttaataatggaatgat--tgatgttaattt 17090490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 17808069 - 17808007
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  17808069 tgattacgtgataactgtttagcatttatgcaaagttaataatggaatgat--tgatgttaattt 17808007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Original strand, 29041349 - 29041411
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  29041349 tgattacgtgataactgtttagcatttatgcaaagttaataatggaatgat--tgatgttaattt 29041411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 15361809 - 15361745
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  15361809 tgattacgtgataactgtttagcatttatgcaaagttaataaagaaatgattataatgttaattt 15361745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Original strand, 16232271 - 16232335
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  16232271 tgattacgtgataactgtttagcatttatgcaaagttaataaagaaatgattataatgttaattt 16232335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 292 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 18070845 - 18070783
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaat 354  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  18070845 tgattacgtgataactgtttagcaattatgcaaagttagtaatggaatgaatatgatgttaat 18070783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 168 - 236
Target Start/End: Original strand, 36134176 - 36134246
Alignment:
Q  168 gagctttgtcctccgcacgat---taaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa 236  Q
    |||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36134176 gagctttgtcctccccacgatgcttaaagtatattaatact-atgatgacgattggtaccacatgcatataa 36134246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 236
Target Start/End: Original strand, 20157680 - 20157751
Alignment:
Q  167 ggagctttgtcctccgcacgatt---aaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa 236  Q
    ||||||||||||||| ||||||    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20157680 ggagctttgtcctccccacgatgctgaaagtatattaatact-atgatgacgattggtaccacatgcatataa 20157751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 264
Target Start/End: Original strand, 22634626 - 22634726
Alignment:
Q  167 ggagctttgtcctccgcacgat--ta-aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgcattgt 262  Q
    ||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||  |||||||||||| ||    
T  22634626 ggagctttgtcctccccacgatgctataagtatattaatactt-tgatgacgattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgcatagt 22634724  T
Q  263 ca 264  Q
    ||    
T  22634725 ca 22634726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 40471491 - 40471449
Alignment:
Q  19 ggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttg 61  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40471491 ggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttg 40471449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 217 - 266
Target Start/End: Original strand, 13020537 - 13020586
Alignment:
Q  217 ttggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 266  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13020537 ttggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 13020586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 27533742 - 27533602
Alignment:
Q  38 ctccaaattattggatgcatgt-tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat 135  Q
    ||||||||||||||||| ||   ||||| || ||||||| || |||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||       
T  27533742 ctccaaattattggatgtataagtgatacgttgattacggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccacgt-- 27533646  T
Q  136 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgca 184  Q
     ||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||    
T  27533645 -ttaggagctttgtcctccgcac----aataggagctttgtcctccgca 27533602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 292 - 353
Target Start/End: Original strand, 15322536 - 15322597
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaa 353  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  15322536 tgattacgtgataactgtttagcaattatgcaaagttgttaaagaaatgattatgatgttaa 15322597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Original strand, 386759 - 386823
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||  ||| | ||||||||||||||||||||    
T  386759 tgattacgtgataactgtttagcaattatgcaatgttgttaaagaaatgattatgatgttaattt 386823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Original strand, 51494237 - 51494301
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||  ||| | ||||||||||||||||||||    
T  51494237 tgattacgtgataactgtttagcaattatgcaatgttgttaaagaaatgattatgatgttaattt 51494301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 93 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 10712517 - 10712454
Alignment:
Q  93 gtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacg 159  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  10712517 gtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacg 10712454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 93 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 10926287 - 10926224
Alignment:
Q  93 gtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacg 159  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  10926287 gtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacg 10926224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 93 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 25689531 - 25689468
Alignment:
Q  93 gtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacg 159  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  25689531 gtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacg 25689468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Original strand, 6873806 - 6873870
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||  |||  ||| | ||||||||||||||||||||    
T  6873806 tgattacgtgataactgtttagcaattatgcagtgttgttaaagaaatgattatgatgttaattt 6873870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Original strand, 7901615 - 7901678
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||  ||| | ||||||||||||||||||||    
T  7901615 tgattacgtgataactgtttagcaattatgaaaagttgttaa-gaaatgattatgatgttaattt 7901678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Original strand, 14299257 - 14299321
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    |||||| || ||||||||||| || |||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  14299257 tgattatgttataactgtttagcaattatgcaatgttatttaaggaatgattatgatgttaattt 14299321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Original strand, 14305854 - 14305918
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    |||||| || ||||||||||| || |||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  14305854 tgattatgttataactgtttagcaattatgcaatgttatttaaggaatgattatgatgttaattt 14305918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Original strand, 26285337 - 26285401
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    |||||||| |||||||||||| || |||||||| |||  ||| | ||||||||||||||||||||    
T  26285337 tgattacgcgataactgtttagcaattatgcaatgttgttaaagaaatgattatgatgttaattt 26285401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 40453540 - 40453476
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    |||||||| |||||||||||| || |||||||| |||  ||| | ||||||||||||||||||||    
T  40453540 tgattacgcgataactgtttagcaattatgcaatgttgttaaagaaatgattatgatgttaattt 40453476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 40477769 - 40477705
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    |||||||| |||||||||||| || |||||||| |||  ||| | ||||||||||||||||||||    
T  40477769 tgattacgcgataactgtttagcaattatgcaatgttgttaaagaaatgattatgatgttaattt 40477705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 292 - 350
Target Start/End: Original strand, 9272599 - 9272657
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgt 350  Q
    ||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||  ||| | ||||||||||||||    
T  9272599 tgattacgtgatatctgtttagcaattatgcaaagttgttaaagaaatgattatgatgt 9272657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 251; Significance: 1e-139; HSPs: 2)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 21 - 303
Target Start/End: Original strand, 9908 - 10190
Alignment:
Q  21 tatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagctta 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9908 tatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagctta 10007  T
Q  121 gtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10008 gtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 10107  T
Q  221 taccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  10108 taccacatgcatataaggagtctaggagcattgccacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgat 10190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Original strand, 10244 - 10308
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||||||| ||||||| || |||||||| |||  ||| | || |||||||||||||||||    
T  10244 tgattacgtgatatctgtttagcaattatgcaatgttgttaaagaaacgattatgatgttaattt 10308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 251; Significance: 1e-139; HSPs: 74)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 21 - 303
Target Start/End: Original strand, 5534531 - 5534813
Alignment:
Q  21 tatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagctta 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  5534531 tatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatattttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgaactta 5534630  T
Q  121 gtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5534631 gtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 5534730  T
Q  221 taccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  5534731 taccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgaatgaatacgtgat 5534813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 21 - 290
Target Start/End: Original strand, 17669662 - 17669931
Alignment:
Q  21 tatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagctta 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17669662 tatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagctta 17669761  T
Q  121 gtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17669762 gtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 17669861  T
Q  221 taccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatga 290  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17669862 taccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccctgttgataatga 17669931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 14 - 303
Target Start/End: Original strand, 8354851 - 8355140
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcatt 113  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8354851 gcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcatt 8354950  T
Q  114 gagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga 213  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8354951 gagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga 8355050  T
Q  214 cgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  8355051 cgattggcaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgat 8355140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 21 - 290
Target Start/End: Original strand, 17676314 - 17676583
Alignment:
Q  21 tatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagctta 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17676314 tatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagctta 17676413  T
Q  121 gtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17676414 gtcctcaccacgaatattaggagttttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 17676513  T
Q  221 taccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatga 290  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17676514 taccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccctgttgataatga 17676583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 14 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 22083851 - 22083575
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22083851 gcataagtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcatt 22083752  T
Q  114 gagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga 213  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22083751 gagctttgtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga 22083652  T
Q  214 cgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatga 290  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22083651 cgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatga 22083575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 14 - 303
Target Start/End: Original strand, 22123471 - 22123760
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgtttt-gttcatatgtgtccatgcatagcatctcat 112  Q
    ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22123471 gcataagtttatgatgaagtt-agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgtttttgttcataagtgtccatgcatagcatctcat 22123569  T
Q  113 tgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg 212  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22123570 tgagctcagtcctcaccacgaataataggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcaggattaaagtatattaatacttatgatg 22123669  T
Q  213 acgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22123670 acgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 22123760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 21 - 303
Target Start/End: Original strand, 21915662 - 21915943
Alignment:
Q  21 tatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagctta 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  21915662 tatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagt-gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcataccattgagctta 21915760  T
Q  121 gtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 220  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21915761 gtcctcaccatgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 21915860  T
Q  221 taccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||    
T  21915861 taccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatgaatgaatatgtgat 21915943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 19 - 303
Target Start/End: Original strand, 16883262 - 16883546
Alignment:
Q  19 ggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagct 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||    
T  16883262 ggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagct 16883361  T
Q  119 tagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgatt 218  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16883362 tagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgatt 16883461  T
Q  219 ggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  16883462 ggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgat 16883546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 14 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 19496409 - 19496120
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataa-gtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcat 112  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| | |  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  19496409 gcatatgtatatgataaggtttagcttcaaattattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttttgttcataagtgtccatgcatagcatatcat 19496311  T
Q  113 tgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19496310 tgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg 19496211  T
Q  213 acgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  19496210 acgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgat 19496120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 14 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 19498457 - 19498168
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataa-gtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcat 112  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| | |  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  19498457 gcatatgtatatgataaggtttagcttcaaattattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttttgttcataagtgtccatgcatagcatatcat 19498359  T
Q  113 tgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19498358 tgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg 19498259  T
Q  213 acgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  19498258 acgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgat 19498168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 21 - 266
Target Start/End: Original strand, 20013956 - 20014200
Alignment:
Q  21 tatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagctta 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20013956 tatatgatgaagtttagctccaagttattggatgcatgttgataagt-gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagctta 20014054  T
Q  121 gtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20014055 gtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 20014154  T
Q  221 taccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 266  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20014155 taccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 20014200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 21 - 266
Target Start/End: Original strand, 20020033 - 20020277
Alignment:
Q  21 tatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagctta 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20020033 tatatgatgaagtttagctccaagttattggatgcatgttgataagt-gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagctta 20020131  T
Q  121 gtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20020132 gtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 20020231  T
Q  221 taccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 266  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20020232 taccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 20020277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 14 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 22047965 - 22047676
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataa-gtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcat 112  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  22047965 gcatatgtatatgataatgtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttctgttcataagtgtccatgcatagcatatcat 22047867  T
Q  113 tgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22047866 tgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg 22047767  T
Q  213 acgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  22047766 acgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatgattgaatatgtgat 22047676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 14 - 294
Target Start/End: Original strand, 22115806 - 22116087
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgtttt-gttcatatgtgtccatgcatagcatctcat 112  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||||    
T  22115806 gcataagtatatgattaagtttagctccaaattactggatgcatgttgatatgttgattacgatgtttttgtccataagagtccatgcatagcatctcat 22115905  T
Q  113 tgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg 212  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22115906 tgagcttggtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg 22116005  T
Q  213 acgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattga 294  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22116006 acgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacactgtcatgattaagatgccttgttgatgatgattga 22116087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 14 - 294
Target Start/End: Original strand, 22124614 - 22124895
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgtttt-gttcatatgtgtccatgcatagcatctcat 112  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||||    
T  22124614 gcataagtatatgatgaagtttagctccaaattactggatgcatgttgatatgttgattacgatgtttttgtccataagagtccatgcatagcatctcat 22124713  T
Q  113 tgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg 212  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22124714 tgagcttagtcctcaccacgattattaggagatttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcatgattaaagtatattaatacttatgatg 22124813  T
Q  213 acgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattga 294  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22124814 acgattggtaccacgtgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatgattga 22124895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 19 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 29123102 - 29122818
Alignment:
Q  19 ggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagct 118  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||    
T  29123102 ggtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacagtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagct 29123003  T
Q  119 tagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgatt 218  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29123002 tagtcctcaccacatttattaggagctttgtcctccgcacgttttatagtagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgatt 29122903  T
Q  219 ggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  29122902 ggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgat 29122818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 19 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 18865345 - 18865061
Alignment:
Q  19 ggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagct 118  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||    
T  18865345 ggtatatgatcaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagct 18865246  T
Q  119 tagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgatt 218  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18865245 tagtcctcaccacgtttattaggagctttgtccttcgcacgtttattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgatt 18865146  T
Q  219 ggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||    
T  18865145 ggtaccacatgcacataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgaatgaatatgtgat 18865061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 14 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 19111246 - 19110958
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataa-gtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcat 112  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||    
T  19111246 gcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcat 19111148  T
Q  113 tgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg 212  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19111147 tgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgatttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg 19111048  T
Q  213 acgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||    
T  19111047 acgattggtaccacatgcatat-aagagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgaatgaatatgtgat 19110958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 14 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 19117537 - 19117249
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataa-gtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcat 112  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||    
T  19117537 gcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcat 19117439  T
Q  113 tgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg 212  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19117438 tgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgatttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg 19117339  T
Q  213 acgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||    
T  19117338 acgattggtaccacatgcatat-aagagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgaatgaatatgtgat 19117249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 69 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 28454715 - 28454481
Alignment:
Q  69 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttatagg 168  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28454715 gattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttatagg 28454616  T
Q  169 agctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgat 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28454615 agctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagaagtctaagagcattgtcacattgtcatgat 28454516  T
Q  269 taagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  28454515 taagatgccttgttgatgatgattgattatgtgat 28454481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 24 - 266
Target Start/End: Original strand, 23845873 - 23846115
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 123  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23845873 atgatgacgtttagctccaaattgttggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 23845972  T
Q  124 ctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 223  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23845973 ctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 23846072  T
Q  224 cacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 266  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  23846073 cacatgcatataaggagtctatgagcattgtcacattgtcatg 23846115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 24 - 266
Target Start/End: Original strand, 20024039 - 20024281
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 123  Q
    ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20024039 atgatgacgtttagctccaagttgttggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 20024138  T
Q  124 ctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 223  Q
    |||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20024139 ctcaccacgtttattaggagttttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 20024238  T
Q  224 cacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 266  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20024239 cacattcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 20024281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 26 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 19905490 - 19905252
Alignment:
Q  26 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcc 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||| || |||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  19905490 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 19905392  T
Q  125 tcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 223  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19905391 tcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 19905292  T
Q  224 cacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtc 263  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19905291 cacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtc 19905252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 24 - 266
Target Start/End: Original strand, 26935288 - 26935533
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagt 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  26935288 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgatttgttcataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagt 26935386  T
Q  123 cctcaccacgaat-attaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgatt-aaagtatattaatacttatgatgacgattg 219  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26935387 cctcaccacgatttattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgttttaaagtatattaatacttatgatgacgattg 26935486  T
Q  220 gtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 266  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26935487 gtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 26935533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 26 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 20527444 - 20527199
Alignment:
Q  26 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcc 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  20527444 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacgatgttttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 20527347  T
Q  125 tcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 224  Q
    |||||| ||    |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20527346 tcaccatga----taggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 20527251  T
Q  225 acatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgc 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  20527250 acatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaagatgc 20527199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 24 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 3216259 - 3216014
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagt 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  || |||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  3216259 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacagtgatttgttcataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagt 3216161  T
Q  123 cctcaccacgaat-attaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgatt-aaagtatattaatacttatgatgacgattg 219  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3216160 cctcaccacgatttattaggagctttgtcctccgcacgacttattaggagctttgtcctccgcacgttttaaagtatattaatacttatgatgacgattg 3216061  T
Q  220 gtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 266  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3216060 gtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 3216014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 141 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 18854855 - 18854693
Alignment:
Q  141 gagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagag 240  Q
    |||||| ||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18854855 gagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggag 18854756  T
Q  241 tctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||    
T  18854755 tctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgaatgaatatgtgat 18854693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 69 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 18065285 - 18065049
Alignment:
Q  69 gattacgatgttttgttcat-atgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat-attaggagctttgtcctccgcacgttttata 166  Q
    ||||||||||||||| | || | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  18065285 gattacgatgttttggttattaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattatta 18065186  T
Q  167 ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 266  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  18065185 ggagatttgtcctccgcacgattaaagtatatttatatttatgatgacgattggtaccacatgcatgtacggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 18065086  T
Q  267 attaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
      ||  |||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  18065085 tctattatgctttgttgatgatgattgattatgtgat 18065049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 24 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 22111696 - 22111480
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  22111696 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 22111597  T
Q  115 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 214  Q
    ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22111596 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgac 22111502  T
Q  215 gattggtaccacatgcatataa 236  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  22111501 gattggtaccacatgcatataa 22111480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 24 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 43251576 - 43251360
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  43251576 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 43251477  T
Q  115 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 214  Q
    ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43251476 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgac 43251382  T
Q  215 gattggtaccacatgcatataa 236  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  43251381 gattggtaccacatgcatataa 43251360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 24 - 236
Target Start/End: Original strand, 21972922 - 21973138
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| |||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  21972922 atgatgatgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattgcgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 21973021  T
Q  115 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 214  Q
    ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  21973022 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtttattaatacttatgatgac 21973116  T
Q  215 gattggtaccacatgcatataa 236  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  21973117 gattggtaccacatgcatataa 21973138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 24 - 236
Target Start/End: Original strand, 21977013 - 21977229
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| |||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  21977013 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattgcgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 21977112  T
Q  115 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 214  Q
    || || |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21977113 agttttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgac 21977207  T
Q  215 gattggtaccacatgcatataa 236  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  21977208 gattggtaccacatgcatataa 21977229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 38 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 15531890 - 15531674
Alignment:
Q  38 ctccaaattattggatgcatgt-tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat 135  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||||| ||||| |||||||||||  || | |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||      
T  15531890 ctccaaattattggatgtatatgtgataagttgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccacga-- 15531795  T
Q  136 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 235  Q
     ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15531794 -ttaggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat- 15531700  T
Q  236 aagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    ||| |||||||  |||||||||||||    
T  15531699 aagtgtctaagttgcattgtcgcatt 15531674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 19 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 18854950 - 18854810
Alignment:
Q  19 ggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagct 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||    
T  18854950 ggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagct 18854851  T
Q  119 tagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacg 159  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  18854850 tagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacg 18854810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 38 - 236
Target Start/End: Original strand, 24445611 - 24445803
Alignment:
Q  38 ctccaaattattggatgcatgt-tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat 135  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||| | ||||| |||||||||||  || | |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||      
T  24445611 ctccaaattattggatgtatatgtgataaattgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccacga-- 24445706  T
Q  136 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 235  Q
     ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24445707 -ttaggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 24445802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 38 - 260
Target Start/End: Original strand, 23847120 - 23847335
Alignment:
Q  38 ctccaaattattggatgcatgt-tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat 135  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||||| ||||| |||||||||||  || | |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||      
T  23847120 ctccaaattattggatgtatatgtgataagttgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccatga-- 23847215  T
Q  136 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 235  Q
      |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23847216 --taggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat- 23847309  T
Q  236 aagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    ||| |||||||  |||||||||||||    
T  23847310 aagtgtctaagttgcattgtcgcatt 23847335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 38 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 15538449 - 15538233
Alignment:
Q  38 ctccaaattattggatgcatgt-tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat 135  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||||| ||||| ||| |||||||  || | |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |      
T  15538449 ctccaaattattggatgtatatgtgataagttgattaagatattttgttgtta-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccacaa-- 15538354  T
Q  136 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 235  Q
     ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15538353 -ttaggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat- 15538259  T
Q  236 aagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    ||| |||||||  |||||||||||||    
T  15538258 aagtgtctaagttgcattgtcgcatt 15538233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 93 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 21410611 - 21410450
Alignment:
Q  93 gtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaa 191  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  21410611 gtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtcctccgcacgattaa 21410519  T
Q  192 agtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||    
T  21410518 agtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat-aagtgtctaagttgcattgtcgcatt 21410450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 93 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 21805103 - 21804942
Alignment:
Q  93 gtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaa 191  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  21805103 gtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtcctccgcacgattaa 21805011  T
Q  192 agtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||    
T  21805010 agtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat-aagtgtctaagttgcattgtcgcatt 21804942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 93 - 260
Target Start/End: Original strand, 18863090 - 18863251
Alignment:
Q  93 gtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaa 191  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  18863090 gtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgatt---aggagctttgtcctccgcacgattaa 18863182  T
Q  192 agtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||    
T  18863183 agtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat-aagtgtctaagttgcattgtcgcatt 18863251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 93 - 260
Target Start/End: Original strand, 21828459 - 21828620
Alignment:
Q  93 gtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaa 191  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  21828459 gtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgatt---aggagctttgtcctccgcacgattaa 21828551  T
Q  192 agtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||    
T  21828552 agtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat-aagtgtctaagttgcattgtcgcatt 21828620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 93 - 260
Target Start/End: Original strand, 30940522 - 30940683
Alignment:
Q  93 gtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaa 191  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  30940522 gtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgatt---aggagctttgtcctccgcacgattaa 30940614  T
Q  192 agtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||    
T  30940615 agtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat-aagtgtctaagttgcattgtcgcatt 30940683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 109 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 32598608 - 32598459
Alignment:
Q  109 tcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttat 208  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||    ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32598608 tcattgagctttgtcctcaccatga----taggagctttgtcctccacacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttat 32598515  T
Q  209 gatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgcattgtca 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  32598514 gatgacgattggtaccacatgcatat-aagtgtctaagttgcattgtcgcattgtca 32598459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 109 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 32605140 - 32604991
Alignment:
Q  109 tcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttat 208  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||    ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32605140 tcattgagctttgtcctcaccatga----taggagctttgtcctccacacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttat 32605047  T
Q  209 gatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgcattgtca 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  32605046 gatgacgattggtaccacatgcatat-aagtgtctaagttgcattgtcgcattgtca 32604991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 38 - 260
Target Start/End: Original strand, 17828687 - 17828903
Alignment:
Q  38 ctccaaattattggatgcatgt-tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat 135  Q
    ||||||||||||||||| || | ||||| || ||||| |||||||||||  || | |||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||| ||      
T  17828687 ctccaaattattggatgtatatgtgataggttgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattaacat-tcattgagctttgtcctcaccatga-- 17828782  T
Q  136 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 235  Q
     ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17828783 -ttaggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtcctccgcacaatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat- 17828877  T
Q  236 aagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    ||| |||||||  |||||||||||||    
T  17828878 aagtgtctaagttgcattgtcgcatt 17828903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 93 - 263
Target Start/End: Original strand, 30308913 - 30309076
Alignment:
Q  93 gtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaa 191  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||    ||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  30308913 gtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccatga----taggagctttgtcctccacacgttt---aggagctttgtcctccgcacgattaa 30309004  T
Q  192 agtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgcattgtc 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  30309005 agtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat-aagtgtctaagttgcattgtcgcattgtc 30309076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 93 - 263
Target Start/End: Original strand, 17055539 - 17055703
Alignment:
Q  93 gtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaa 191  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||    
T  17055539 gtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccatga---ttaggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtcctccgcacgatgaa 17055631  T
Q  192 agtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgcattgtc 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||  ||||||||||||||||    
T  17055632 agtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcata-caggagtctaagttgcattgtcgcattgtc 17055703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 38 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 22044884 - 22044670
Alignment:
Q  38 ctccaaattattggatgcatgt-tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat 135  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||| ||||| ||||||||||| ||| | |||||||||| |||||  |||||||||| ||| |||||||||      
T  22044884 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaagatgttttgttgata-gagtccatgcattagcata-cattgagctttgtcgtcaccacga-- 22044789  T
Q  136 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 235  Q
      | ||||||||||||||| ||||    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22044788 --tcggagctttgtcctccacacg----ataggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat- 22044696  T
Q  236 aagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    ||| |||||||  |||||||||||||    
T  22044695 aagtgtctaagttgcattgtcgcatt 22044670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 178 - 266
Target Start/End: Original strand, 20705896 - 20705984
Alignment:
Q  178 ctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20705896 ctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 20705984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 38 - 260
Target Start/End: Original strand, 16231581 - 16231794
Alignment:
Q  38 ctccaaattattggatgcatgt-tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat 135  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||| ||||| ||||||||||| ||| | |||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||      
T  16231581 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaagatgttttgttgata-gagtccatgcattagcata-cattgagctttgtcctcaccacga-- 16231676  T
Q  136 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 235  Q
      | ||||||||||||||| ||||    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  16231677 --tcggagctttgtcctccacacg----ataggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatac-tatgatgacgattggtaccacatgcatat- 16231768  T
Q  236 aagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    ||| |||||||  |||||||||||||    
T  16231769 aagtgtctaagttgcattgtcgcatt 16231794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 60 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 21387051 - 21386858
Alignment:
Q  60 tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcac 158  Q
    |||||||| ||||| | ||| ||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||| | |||||||    
T  21387051 tgataagttgattaaggtgtcttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgccatccgcac 21386957  T
Q  159 gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgc 257  Q
    ||||   |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||    
T  21386956 gttt---aggaactttgtcctccgcacaatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat-aagtgtctaagttgcattgtcgc 21386861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 60 - 236
Target Start/End: Original strand, 14398236 - 14398405
Alignment:
Q  60 tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcac 158  Q
    |||||||| ||||| | ||| ||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| || ||   |||||||||||||||||| |||    
T  14398236 tgataagttgattaaggtgtcttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaacaaga---ttaggagctttgtcctccacac 14398330  T
Q  159 gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa 236  Q
    | ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14398331 gatt---aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacatatgatgacgattggtaccacatgcatataa 14398405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 38 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 23834172 - 23833959
Alignment:
Q  38 ctccaaattattggatgcatgt-tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat 135  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||| ||||| | ||||||||| ||| | |||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||| ||      
T  23834172 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaaggtgttttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttttcctcaccatga-- 23834077  T
Q  136 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 235  Q
      | ||||||||||||||| ||||    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  23834076 --tcggagctttgtcctccacacg----ataggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatac-tatgatgacgattggtaccacatgcatat- 23833985  T
Q  236 aagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    ||| |||||||  |||||||||||||    
T  23833984 aagtgtctaagttgcattgtcgcatt 23833959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 165 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 15440465 - 15440370
Alignment:
Q  165 taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||    
T  15440465 taggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat-aagtgtctaagttgcattgtcgcatt 15440370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Original strand, 5534867 - 5534931
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5534867 tgattacgtgataactgtttagcatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 5534931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Original strand, 17669999 - 17670063
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17669999 tgattacgtgataactgttaagcatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 17670063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Original strand, 17676651 - 17676715
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17676651 tgattacgtgataactgttaagcatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 17676715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Original strand, 21915997 - 21916061
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21915997 tgattacgtgataactgtttagaatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 21916061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 165 - 237
Target Start/End: Original strand, 19278748 - 19278822
Alignment:
Q  165 taggagctttgtcctccgca-cgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccac-atgcatataaa 237  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19278748 taggagctttgtcctccgcaacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacaatgcatataaa 19278822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 292 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 19110903 - 19110834
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattttgatt 361  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  19110903 tgattacgtgatgactgtttagcatttatgcaaagttaataatggaatgtttatgatgttaattatgatt 19110834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 292 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 19117194 - 19117125
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattttgatt 361  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  19117194 tgattacgtgatgactgtttagcatttatgcaaagttaataatggaatgtttatgatgttaattatgatt 19117125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 24 - 157
Target Start/End: Original strand, 19278628 - 19278767
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  19278628 atgatgacgtttagctccaaattattgaatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 19278727  T
Q  115 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgca 157  Q
    ||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  19278728 agctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcctccgca 19278767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 293 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 19498114 - 19498051
Alignment:
Q  293 gattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19498114 gattacgtgataactgtttagcaattatgcaaagttaataatggaatgattatgttgttaattt 19498051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 293 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 22047622 - 22047559
Alignment:
Q  293 gattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22047622 gattacgtgataactgtttagcaattatgcaaagttaataatggaatgattatgttgttaattt 22047559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 22083508 - 22083444
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  22083508 tgattacgtgataactgtttagcatttatgcaaagttaataaagaaatgattataatgttaattt 22083444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 293 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 19496066 - 19496003
Alignment:
Q  293 gattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  19496066 gattacgtgataactgtttagcaattatgcaaagttaataatggaatgattatgttattaattt 19496003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Original strand, 8355194 - 8355258
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||    
T  8355194 tgattacgtgataactctttagcatttatgcaaagttgataaaggaatgattaagatgttaattt 8355258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 28454427 - 28454363
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||    
T  28454427 tgattacgtgataactgtttagcaattatgcaaagttagaaatagaatgaatatgatgttaattt 28454363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 18854639 - 18854575
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||  ||| | ||||||||||||||||||||    
T  18854639 tgattacgtgataactgtttagcaattatgcaatgttgttaaagaaatgattatgatgttaattt 18854575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 18865007 - 18864943
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||  ||| | ||||||||||||||||||||    
T  18865007 tgattacgtgataactgtttagcaattatgcaatgttgttaaagaaatgattatgatgttaattt 18864943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 292 - 353
Target Start/End: Original strand, 22124960 - 22125021
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaa 353  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||| |||| |||| ||| | |||||||||||||||||    
T  22124960 tgattacgtgataactgtttagcaattacgcaatgttattaaagaaatgattatgatgttaa 22125021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Original strand, 16883600 - 16883664
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||  ||| | ||||| ||||||||||||||    
T  16883600 tgattacgtgataactgtttagcaattatgcaatgttgttaaagaaatgaatatgatgttaattt 16883664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 292 - 353
Target Start/End: Original strand, 22116150 - 22116211
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaa 353  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||| |||| |||  ||| | |||||||||||||||||    
T  22116150 tgattacgtgataactgtttagcaattacgcaatgttgttaaagaaatgattatgatgttaa 22116211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 29122764 - 29122700
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||  ||||||||||| || |||||||| |||  ||| | ||||||||||||||||||||    
T  29122764 tgattacgcaataactgtttagcaattatgcaatgttgttaaagaaatgattatgatgttaattt 29122700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 251; Significance: 1e-139; HSPs: 129)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 21 - 303
Target Start/End: Original strand, 18164765 - 18165047
Alignment:
Q  21 tatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagctta 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18164765 tatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagctta 18164864  T
Q  121 gtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18164865 gtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 18164964  T
Q  221 taccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||    
T  18164965 taccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgaatgaatatgtgat 18165047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 14 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 18176125 - 18175836
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcatt 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18176125 gcataagtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccatgcatagcatctcatt 18176026  T
Q  114 gagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga 213  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18176025 gagcttagtcctcaccacaattattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga 18175926  T
Q  214 cgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||    
T  18175925 cgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgtcttgttgataatgattgaatatgtgat 18175836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 21 - 303
Target Start/End: Original strand, 9511104 - 9511385
Alignment:
Q  21 tatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagctta 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9511104 tatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagt-gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagctta 9511202  T
Q  121 gtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9511203 gtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 9511302  T
Q  221 taccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||    
T  9511303 taccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatgaatgaatatgtgat 9511385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 14 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 18182797 - 18182508
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcatt 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18182797 gcataagtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttattcataagtgtccatgcatagcatctcatt 18182698  T
Q  114 gagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga 213  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18182697 gagcttagtcctcaccacaattattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga 18182598  T
Q  214 cgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||    
T  18182597 cgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgtcttgttgataatgattgaatatgtgat 18182508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 21 - 290
Target Start/End: Original strand, 40523453 - 40523722
Alignment:
Q  21 tatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagctta 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  40523453 tatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcagagcatatcattgagctta 40523552  T
Q  121 gtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40523553 gtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 40523652  T
Q  221 taccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatga 290  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40523653 taccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccctgttgataatga 40523722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 14 - 290
Target Start/End: Original strand, 60762 - 61038
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  60762 gcataagtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcatt 60861  T
Q  114 gagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga 213  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  60862 gagctttgtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga 60961  T
Q  214 cgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatga 290  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  60962 cgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatga 61038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 21 - 303
Target Start/End: Original strand, 12703501 - 12703782
Alignment:
Q  21 tatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagctta 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12703501 tatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagt-gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagctta 12703599  T
Q  121 gtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12703600 gtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 12703699  T
Q  221 taccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||    
T  12703700 taccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcataattaagatgccttgttgatgatgaatgaatatgtgat 12703782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 21 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 49051384 - 49051116
Alignment:
Q  21 tatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagctta 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  49051384 tatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagt-gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagctta 49051286  T
Q  121 gtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 220  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49051285 gtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 49051186  T
Q  221 taccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatga 290  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  49051185 taccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgccatgattaagatgccttgttgatgatga 49051116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 14 - 303
Target Start/End: Original strand, 16407380 - 16407669
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttg-ttcatatgtgtccatgcatagcatctcat 112  Q
    ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16407380 gcataagtttatgatgaagtt-agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgtttttattcataagtgtccatgcatagcatctcat 16407478  T
Q  113 tgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg 212  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16407479 tgagcttagtcctcaccacgaataataggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg 16407578  T
Q  213 acgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  16407579 acgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgat 16407669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 19 - 303
Target Start/End: Original strand, 20703080 - 20703364
Alignment:
Q  19 ggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagct 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||    
T  20703080 ggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagct 20703179  T
Q  119 tagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgatt 218  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20703180 tagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgatt 20703279  T
Q  219 ggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  20703280 ggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgat 20703364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 25 - 303
Target Start/End: Original strand, 15162917 - 15163195
Alignment:
Q  25 tgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgtttt-gttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 123  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15162917 tgatgaagtt-agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgtttttgttcataagtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 15163015  T
Q  124 ctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 223  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15163016 ctcaccacgaataataggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 15163115  T
Q  224 cacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15163116 cacatgcatatagggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaaaatgccttgttgataatgattgaatacgtgat 15163195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 14 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 11366219 - 11365928
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgtttt---gttcatatgtgtccatgcatagcatctc 110  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11366219 gcataagtatatgatgaagtt-agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgtttttgtgttcataagtgtccatgcatagcatctc 11366121  T
Q  111 attgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatga 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11366120 attgagcttagtcctcaccacgaataataggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatga 11366021  T
Q  211 tgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||    
T  11366020 tgacgattggtaccacatgcatatagggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccgtgttgatgatgattgaatacgtgat 11365928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 19 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 32767691 - 32767407
Alignment:
Q  19 ggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagct 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||    
T  32767691 ggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagct 32767592  T
Q  119 tagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgatt 218  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32767591 tagtcctcaccacgtttattaggagttttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgatt 32767492  T
Q  219 ggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  32767491 ggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgat 32767407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 25 - 303
Target Start/End: Original strand, 15156266 - 15156544
Alignment:
Q  25 tgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgtttt-gttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 123  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15156266 tgatgaagtt-agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgtttttgttcataagtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 15156364  T
Q  124 ctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 223  Q
    ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15156365 ctcaccatgaataatagaagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 15156464  T
Q  224 cacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15156465 cacatgcatatagggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaaaatgccttgttgataatgattgaatacgtgat 15156544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 14 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 13691113 - 13690824
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgtttt-gttcatatgtgtccatgcatagcatctcat 112  Q
    ||||| || |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13691113 gcataagtttatgatgaagtt-agctccaatttaatggatgcatgttgatatgttgattacgatgtttttgttcataagtgtccatgcatagcatctcat 13691015  T
Q  113 tgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg 212  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13691014 tgagcttagtcctcaccacgaataataggagctttgtcctccgcacattttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg 13690915  T
Q  213 acgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  13690914 acgattggtaccacatgcatatagggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatgattgaatacgtgat 13690824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 21 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 14330799 - 14330555
Alignment:
Q  21 tatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagctta 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14330799 tatatgatgaagtttagctccaagttattggatgcatattgataagt-gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagctta 14330701  T
Q  121 gtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14330700 gtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 14330601  T
Q  221 taccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 266  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14330600 taccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 14330555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 21 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 14337383 - 14337139
Alignment:
Q  21 tatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagctta 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14337383 tatatgatgaagtttagctccaagttattggatgcatattgataagt-gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagctta 14337285  T
Q  121 gtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14337284 gtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 14337185  T
Q  221 taccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 266  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14337184 taccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 14337139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 33 - 303
Target Start/End: Original strand, 11232402 - 11232672
Alignment:
Q  33 tttagctccaaattattggatgcatgttgataa-gtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccac 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11232402 tttagctccaaattattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccac 11232500  T
Q  132 gaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgca 231  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11232501 gtttattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgca 11232600  T
Q  232 tataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11232601 tataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 11232672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 14 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 13684482 - 13684193
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgtttt-gttcatatgtgtccatgcatagcatctcat 112  Q
    ||||| || |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  13684482 gcataagtttatgatgaagtt-agctccaatttaatggatgcatgttgatatgttgattacgatgtttttgttcacaagtgtccatgcatagcatctcat 13684384  T
Q  113 tgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg 212  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  13684383 tgagcttagtcctcaccacgaataataggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaaacatattaatacttatgatg 13684284  T
Q  213 acgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  13684283 acgattggtaccacatgcatatagggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatgattgaatacgtgat 13684193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 33 - 303
Target Start/End: Original strand, 11239089 - 11239359
Alignment:
Q  33 tttagctccaaattattggatgcatgttgataa-gtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccac 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11239089 tttagctccaaattattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccac 11239187  T
Q  132 gaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgca 231  Q
    |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11239188 gtttattaggagctttgtcctccacacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgca 11239287  T
Q  232 tataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11239288 tataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 11239359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 14 - 303
Target Start/End: Original strand, 44786560 - 44786849
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataa-gtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcat 112  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||    
T  44786560 gcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcat 44786658  T
Q  113 tgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg 212  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44786659 tgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgatttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg 44786758  T
Q  213 acgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||    
T  44786759 acgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgaatgaatatgtgat 44786849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 14 - 303
Target Start/End: Original strand, 44793201 - 44793490
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataa-gtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcat 112  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||    
T  44793201 gcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcat 44793299  T
Q  113 tgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg 212  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44793300 tgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgatttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg 44793399  T
Q  213 acgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||    
T  44793400 acgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgaatgaatatgtgat 44793490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 69 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 15022073 - 15021852
Alignment:
Q  69 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttatagg 168  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15022073 gattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttatagg 15021974  T
Q  169 agctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgat 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  15021973 agctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgat 15021874  T
Q  269 taagatgccttgttgataatga 290  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  15021873 taagatgccttgttgataatga 15021852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 33 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 1347495 - 1347225
Alignment:
Q  33 tttagctccaaattattggatgcatgttgataa-gtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccac 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||| |||||||||  || | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1347495 tttagctccaaattattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttttgttgttaagagttcatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccac 1347397  T
Q  132 gaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgca 231  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1347396 gtttattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgca 1347297  T
Q  232 tataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  1347296 tataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatgattgaatacgtgat 1347225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 14 - 303
Target Start/End: Original strand, 14655502 - 14655791
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataa-gtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcat 112  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||    
T  14655502 gcataagtatatgataaggtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcat 14655600  T
Q  113 tgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg 212  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14655601 tgagcttagtcctcaccacgattactaggagctttgtcctccgcacgttatataggagctttgtcctccgaacgattaaagtatattaatacttatgatg 14655700  T
Q  213 acgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  14655701 acgattggtaccacatgcatttaaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgat 14655791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 69 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 21626 - 21405
Alignment:
Q  69 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttatagg 168  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21626 gattatgatgttttgttcatctgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttatagg 21527  T
Q  169 agctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgat 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  21526 agctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgat 21427  T
Q  269 taagatgccttgttgataatga 290  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  21426 taagatgccttgttgataatga 21405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 69 - 290
Target Start/End: Original strand, 8202236 - 8202457
Alignment:
Q  69 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttatagg 168  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8202236 gattatgatgttttgttcatctgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttatagg 8202335  T
Q  169 agctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgat 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  8202336 agctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgat 8202435  T
Q  269 taagatgccttgttgataatga 290  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  8202436 taagatgccttgttgataatga 8202457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 24 - 266
Target Start/End: Original strand, 20205 - 20448
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagt 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  20205 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgatttgttcataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagt 20303  T
Q  123 cctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggt 221  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20304 cctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggt 20403  T
Q  222 accacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 266  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20404 accacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 20448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 24 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 13569887 - 13569656
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 123  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13569887 atgatgacgtttagctccaaatttttggatgcatgtcgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgtatagcatctcattgagcttagtc 13569788  T
Q  124 ctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 223  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13569787 ctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgatttttaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 13569688  T
Q  224 cacatgcatataaagagtctaagagcattgtc 255  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  13569687 cacatgcataaaaggagtctaagagcattgtc 13569656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 24 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 9409942 - 9409698
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagt 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  9409942 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcattagcatttcattgagcttagt 9409843  T
Q  123 cctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttata-ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggt 221  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9409842 cttcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttatttggagctttgtcctccgtacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggt 9409743  T
Q  222 accacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 266  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9409742 accacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 9409698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 26 - 303
Target Start/End: Original strand, 4318655 - 4318933
Alignment:
Q  26 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcc 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||| | || ||||||  || | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  4318655 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattatggtgatttgttgttaagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 4318753  T
Q  125 tcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 223  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4318754 tcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatatttatacttatgatgacgattggtac 4318853  T
Q  224 cacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  4318854 cacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaagatgctttgttgataatgattgaatatgtgat 4318933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 24 - 266
Target Start/End: Original strand, 6017283 - 6017528
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagt 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  6017283 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgatttgttcataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagt 6017381  T
Q  123 cctcaccacgaat-attaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgatt-aaagtatattaatacttatgatgacgattg 219  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6017382 cctcaccacgatttattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgttttaaagtatattaatacttatgatgacgattg 6017481  T
Q  220 gtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 266  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6017482 gtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 6017528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 24 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 18531241 - 18530998
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagt 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||| || ||||||| || |||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  18531241 atgatgacgtttagctccaaattattggatgctcattgatatgttgattacggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagt 18531143  T
Q  123 cctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggt 221  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18531142 tctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggt 18531043  T
Q  222 accacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 266  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18531042 accacatgcatataaggagtctaagagcattgttgcattgtcatg 18530998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 26 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 14959158 - 14958913
Alignment:
Q  26 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcc 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  14959158 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacgatgttttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 14959061  T
Q  125 tcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 224  Q
    |||||| ||    |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14959060 tcaccatga----taggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 14958965  T
Q  225 acatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgc 276  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  14958964 acatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcgtgtctaagatgc 14958913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 26 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 7536177 - 7535947
Alignment:
Q  26 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcc 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||| || |||||| ||| | || ||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  7536177 gatgacgtttagctccaaattattggatgcttattgatatgttgattacggtgatttgttgataagagttcatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 7536079  T
Q  125 tcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 223  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7536078 tcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattgatac 7535979  T
Q  224 cacatgcatataaagagtctaagagcattgtc 255  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7535978 cacatgcatataaggagtctaagagcattgtc 7535947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 26 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 11262323 - 11262078
Alignment:
Q  26 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcc 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  11262323 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacgatgttttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 11262226  T
Q  125 tcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 224  Q
    |||||| ||    |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11262225 tcaccatga----taggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattgatacc 11262130  T
Q  225 acatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgc 276  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  11262129 acatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcgtgtctaagatgc 11262078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 69 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 8705949 - 8705714
Alignment:
Q  69 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat-attaggagctttgtcctccgcacgttttatag 167  Q
    |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  8705949 gattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattattag 8705850  T
Q  168 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatga 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||     
T  8705849 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacggagtctaggagcattgtcacattgtcatgt 8705750  T
Q  268 ttaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
     ||  |||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  8705749 ctattatgctttgttgatgatgattgattatgtgat 8705714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 26 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 12692490 - 12692245
Alignment:
Q  26 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcc 124  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  12692490 gatgacgtctagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacgatgatttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 12692393  T
Q  125 tcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 224  Q
    |||||||||    |||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12692392 tcaccacga----taggagctttgtcctctgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 12692297  T
Q  225 acatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgc 276  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  12692296 acatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcgtgtctaagatgc 12692245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 26 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 26419994 - 26419749
Alignment:
Q  26 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcc 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  26419994 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacgatgttttgttgata-gcgtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 26419897  T
Q  125 tcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 224  Q
    |||||| ||    ||||||||||||||||| |||| ||  |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26419896 tcaccatga----taggagctttgtcctccacacgattattaggagttttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 26419801  T
Q  225 acatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgc 276  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  26419800 acatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcgtgtctaagatgc 26419749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 26 - 276
Target Start/End: Original strand, 11548377 - 11548623
Alignment:
Q  26 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgca-tagcatctcattgagcttagtcc 124  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  11548377 gatgacgtttagctccaaattgttggatgcatattgatatgaagattacgatgttttgttgata-gagtccatgcagtagcat-tcattgagcttagtcc 11548474  T
Q  125 tcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgatt-aaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 223  Q
    |||||| ||    |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11548475 tcaccatga----taggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgttttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 11548570  T
Q  224 cacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgc 276  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  11548571 cacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcgtgtctaagatgc 11548623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 26 - 276
Target Start/End: Original strand, 11554973 - 11555219
Alignment:
Q  26 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgca-tagcatctcattgagcttagtcc 124  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  11554973 gatgacgtttagctccaaattgttggatgcatattgatatgaagattacgatgttttgttgata-gagtccatgcagtagcat-tcattgagcttagtcc 11555070  T
Q  125 tcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgatt-aaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 223  Q
    |||||| ||    |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11555071 tcaccatga----taggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgttttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 11555166  T
Q  224 cacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgc 276  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  11555167 cacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcgtgtctaagatgc 11555219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 69 - 303
Target Start/End: Original strand, 18553684 - 18553919
Alignment:
Q  69 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat-attaggagctttgtcctccgcacgttttatag 167  Q
    |||||||||||||||||  || | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  18553684 gattacgatgttttgttgttaagagtacatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattattag 18553783  T
Q  168 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatga 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||     
T  18553784 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacggagtctaggagcattgtcacattgtcatgt 18553883  T
Q  268 ttaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    |||  ||||  ||||||| ||| ||||||| |||||    
T  18553884 ttattatgctatgttgatgatgtttgattatgtgat 18553919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 69 - 303
Target Start/End: Original strand, 23520115 - 23520350
Alignment:
Q  69 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat-attaggagctttgtcctccgcacgttttatag 167  Q
    |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||| ||  |||    
T  23520115 gattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggatctttgtcctccgcacgattattag 23520214  T
Q  168 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatga 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||     
T  23520215 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacggagtctaggagcattgtcacattgtcatgt 23520314  T
Q  268 ttaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
     ||  ||||  ||||||| |||||| |||| |||||    
T  23520315 ctattatgctatgttgatgatgattaattatgtgat 23520350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 24 - 260
Target Start/End: Original strand, 12705000 - 12705240
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  12705000 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 12705099  T
Q  115 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 214  Q
    ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12705100 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgac 12705194  T
Q  215 gattggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||    
T  12705195 gattggtaccacatgcatat-aagtgtctaagttgcattgtcgcatt 12705240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 24 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 32874 - 32658
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  32874 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 32775  T
Q  115 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 214  Q
    ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32774 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgac 32680  T
Q  215 gattggtaccacatgcatataa 236  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  32679 gattggtaccacatgcatataa 32658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 24 - 236
Target Start/End: Original strand, 71108 - 71324
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  71108 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 71207  T
Q  115 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 214  Q
    ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  71208 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagccttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgac 71302  T
Q  215 gattggtaccacatgcatataa 236  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  71303 gattggtaccacatgcatataa 71324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 24 - 236
Target Start/End: Original strand, 75217 - 75433
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  75217 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 75316  T
Q  115 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 214  Q
    ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  75317 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagccttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgac 75411  T
Q  215 gattggtaccacatgcatataa 236  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  75412 gattggtaccacatgcatataa 75433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 24 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 12718433 - 12718217
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  12718433 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 12718334  T
Q  115 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 214  Q
    || || |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12718333 agttttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgac 12718239  T
Q  215 gattggtaccacatgcatataa 236  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  12718238 gattggtaccacatgcatataa 12718217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 24 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 16114006 - 16113790
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 114  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  16114006 atgatgacgtttagctccaagttattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 16113907  T
Q  115 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 214  Q
    ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16113906 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgac 16113812  T
Q  215 gattggtaccacatgcatataa 236  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  16113811 gattggtaccacatgcatataa 16113790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 24 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 16117159 - 16116943
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 114  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  16117159 atgatgacgtttagctccaagttattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 16117060  T
Q  115 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 214  Q
    ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16117059 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgac 16116965  T
Q  215 gattggtaccacatgcatataa 236  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  16116964 gattggtaccacatgcatataa 16116943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 24 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 12723344 - 12723128
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  12723344 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgctgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 12723245  T
Q  115 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 214  Q
    ||||| |||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12723244 agctttgtcctcaccatga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgac 12723150  T
Q  215 gattggtaccacatgcatataa 236  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  12723149 gattggtaccacatgcatataa 12723128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 24 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 18283131 - 18282915
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 114  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  18283131 atgatgacgtttaactccaaattattgaatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 18283032  T
Q  115 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 214  Q
    ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18283031 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgac 18282937  T
Q  215 gattggtaccacatgcatataa 236  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  18282936 gattggtaccacatgcatataa 18282915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 24 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 18279168 - 18278952
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 114  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  18279168 atgatgacgtttaactccaaattattgaatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 18279069  T
Q  115 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 214  Q
    ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18279068 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagttttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgac 18278974  T
Q  215 gattggtaccacatgcatataa 236  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  18278973 gattggtaccacatgcatataa 18278952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 118 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 8712571 - 8712385
Alignment:
Q  118 ttagtcctcaccacgaat-attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacga 216  Q
    |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8712571 ttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacga 8712472  T
Q  217 ttggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||  ||||||||   ||  |||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  8712471 ttggtaccacatgcatatacggagtctaggagcattgtcaaattgtcatttctattatgctttgttgatgatgattgattatgtgat 8712385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 38 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 15083912 - 15083696
Alignment:
Q  38 ctccaaattattggatgcatgt-tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat 135  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||| ||||| | ||| ||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||      
T  15083912 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaaggtgtcttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccacga-- 15083817  T
Q  136 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 235  Q
     ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15083816 -ttaggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat- 15083722  T
Q  236 aagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    ||| |||||||  |||||||||||||    
T  15083721 aagtgtctaagttgcattgtcgcatt 15083696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 38 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 18556973 - 18556752
Alignment:
Q  38 ctccaaattattggatgcatgt-tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat 135  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||||| ||||| |||||||||||  |  | |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||      
T  18556973 ctccaaattattggatgtatatgtgataagttgattaagatgttttgttgtttagcgtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccacga-- 18556877  T
Q  136 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 235  Q
     ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||     
T  18556876 -ttaggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgataaagattggtaccacatgcatat- 18556782  T
Q  236 aagagtctaag-agcattgtcgcattgtca 264  Q
    ||| |||||||  |||||||| ||||||||    
T  18556781 aagtgtctaagttgcattgtcacattgtca 18556752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 38 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 13149155 - 13148940
Alignment:
Q  38 ctccaaattattggatgcatgt-tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat 135  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||| ||||| |||||||||||  || | |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||      
T  13149155 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccatga-- 13149060  T
Q  136 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 235  Q
      |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13149059 --taggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat- 13148966  T
Q  236 aagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    ||| |||||||  |||||||||||||    
T  13148965 aagtgtctaagttgcattgtcgcatt 13148940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 60 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 15728302 - 15728105
Alignment:
Q  60 tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcac 158  Q
    |||||||| ||||| | |||||||||  || | |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||    ||||||||||||||||| |||    
T  15728302 tgataagttgattaaggtgttttgttgtta-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccatga----taggagctttgtcctccacac 15728209  T
Q  159 gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgc 257  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||    
T  15728208 gtttta--ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat-aagtgtctaagttgcattgtcgc 15728112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 109 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 14216854 - 14216705
Alignment:
Q  109 tcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttat 208  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||    ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14216854 tcattgagctttgtcctcaccatga----taggagctttgtcctccacacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttat 14216761  T
Q  209 gatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgcattgtca 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  14216760 gatgacgattggtaccacatgcatat-aagtgtctaagttgcattgtcgcattgtca 14216705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 164 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 14953086 - 14952974
Alignment:
Q  164 ataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtc 263  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14953086 ataggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtc 14952987  T
Q  264 atgattaagatgc 276  Q
     ||  ||||||||    
T  14952986 gtgtctaagatgc 14952974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 141 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 10869347 - 10869184
Alignment:
Q  141 gagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaaga 239  Q
    |||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  10869347 gagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacgga 10869248  T
Q  240 gtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||  ||  ||||  ||||||| ||||||||||| |||||    
T  10869247 gtctaggagcattgtcacattgtcatgtctattatgctatgttgatgatgattgattatgtgat 10869184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 141 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 10875427 - 10875264
Alignment:
Q  141 gagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaaga 239  Q
    |||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  10875427 gagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacgga 10875328  T
Q  240 gtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||  ||  ||||  ||||||| ||||||||||| |||||    
T  10875327 gtctaggagcattgtcacattgtcatgtctattatgctatgttgatgatgattgattatgtgat 10875264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 195 - 294
Target Start/End: Original strand, 20871301 - 20871400
Alignment:
Q  195 atattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattga 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20871301 atattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattga 20871400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 164 - 263
Target Start/End: Original strand, 44408554 - 44408653
Alignment:
Q  164 ataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtc 263  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44408554 ataggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtc 44408653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 93 - 236
Target Start/End: Original strand, 1859245 - 1859381
Alignment:
Q  93 gtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaa 191  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1859245 gtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccatga---ttaggagctttgtcctccgcacg----ataggagctttgtcctccgcacgattaa 1859336  T
Q  192 agtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1859337 agtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa 1859381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 38 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 39721982 - 39721766
Alignment:
Q  38 ctccaaattattggatgcatgt-tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat 135  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||| ||||| | ||| ||||| ||| | ||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||      
T  39721982 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaaggtgtcttgttgata-gagtcaatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcactacga-- 39721887  T
Q  136 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 235  Q
     ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  39721886 -ttaggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgttctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat- 39721792  T
Q  236 aagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    ||| |||||||  |||||||||||||    
T  39721791 aagtgtctaagttgcattgtcgcatt 39721766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 93 - 260
Target Start/End: Original strand, 45170451 - 45170612
Alignment:
Q  93 gtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaa 191  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  45170451 gtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgatt---aggagctttgtcctccgcacgattaa 45170543  T
Q  192 agtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||  |||||||||||||    
T  45170544 agtatattaatacttatgatgacgattggtaccacaagcatat-aagtgtctaagttgcattgtcgcatt 45170612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 141 - 303
Target Start/End: Original strand, 18585497 - 18585660
Alignment:
Q  141 gagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaaga 239  Q
    |||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||    
T  18585497 gagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgatgattggtaccacatgcatatacgga 18585596  T
Q  240 gtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| |||  ||||  ||||||| ||| ||||||| |||||    
T  18585597 gtctaggagcattgtcacattgtcatgtttattatgctatgttgatgatgtttgattatgtgat 18585660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 136 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 18425307 - 18425185
Alignment:
Q  136 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18425307 attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat- 18425211  T
Q  236 aagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    ||| |||||||  |||||||||||||    
T  18425210 aagtgtctaagttgcattgtcgcatt 18425185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 136 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 26292019 - 26291897
Alignment:
Q  136 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  26292019 attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat- 26291923  T
Q  236 aagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    ||| |||||||  |||||||||||||    
T  26291922 aagtgtctaagttgcattgtcgcatt 26291897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 93 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 8917372 - 8917209
Alignment:
Q  93 gtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaa 191  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||    ||||||||| ||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  8917372 gtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccatga----taggagcttagtcctccacacgttt---aggagctttgtcctccgcacgattaa 8917281  T
Q  192 agtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgcattgtc 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  8917280 agtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat-aagtgtctaagttgcattgtcgcattgtc 8917209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 172 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 15380671 - 15380567
Alignment:
Q  172 tttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaa 271  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  15380671 tttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcgtgtctaa 15380572  T
Q  272 gatgc 276  Q
    |||||    
T  15380571 gatgc 15380567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 141 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 12714530 - 12714413
Alignment:
Q  141 gagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagag 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  12714530 gagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat-aagtg 12714434  T
Q  241 tctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    ||||||  |||||||||||||    
T  12714433 tctaagttgcattgtcgcatt 12714413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 141 - 236
Target Start/End: Original strand, 7519531 - 7519622
Alignment:
Q  141 gagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa 236  Q
    |||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7519531 gagctttgtcctccgcacg----ataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa 7519622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 60 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 13461738 - 13461542
Alignment:
Q  60 tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcac 158  Q
    |||||||| ||||| | || |||||| ||  | |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||  ||    ||||||||||||||||| |||    
T  13461738 tgataagttgattaaggtgatttgttgattagagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccttga----taggagctttgtcctccacac 13461644  T
Q  159 gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgc 257  Q
    ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||    
T  13461643 gttt---aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgttttgtaccacatgcatat-aagtgtctaagttgcattgtcgc 13461548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 38 - 260
Target Start/End: Original strand, 25927607 - 25927822
Alignment:
Q  38 ctccaaattattggatgcatgt-tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat 135  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||| ||||| | ||| ||||| ||| | || ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||      
T  25927607 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaaggtgtcttgttgata-gagttcatgcattagcat-tcattgagctt-gtcctcaccatga-- 25927701  T
Q  136 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 235  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25927702 -ttaggagctttgtcctccacacgatt---agaagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat- 25927796  T
Q  236 aagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    ||| |||||||  |||||||||||||    
T  25927797 aagtgtctaagttgcattgtcgcatt 25927822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 109 - 260
Target Start/End: Original strand, 16724806 - 16724951
Alignment:
Q  109 tcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttat 208  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||    ||||||| ||||||||| || |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16724806 tcattgagctttgtcctcaccatga----taggagccttgtcctccacaggttttc--ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttat 16724899  T
Q  209 gatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||    
T  16724900 gatgacgattggtaccacatgcatat-aagtgtctaagttgcattgtcgcatt 16724951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 109 - 260
Target Start/End: Original strand, 17701820 - 17701965
Alignment:
Q  109 tcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttat 208  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||    ||||||| ||||||||| || |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17701820 tcattgagctttgtcctcaccatga----taggagccttgtcctccacaggttttc--ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttat 17701913  T
Q  209 gatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||    
T  17701914 gatgacgattggtaccacatgcatat-aagtgtctaagttgcattgtcgcatt 17701965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 138 - 233
Target Start/End: Original strand, 2530616 - 2530708
Alignment:
Q  138 taggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcata 233  Q
    ||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2530616 taggagctttgtcctccacacgttt---aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcata 2530708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 38 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 9593345 - 9593132
Alignment:
Q  38 ctccaaattattggatgcatgt-tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat 135  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||| ||||| ||||||||||| ||| | |||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||      
T  9593345 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaagatgttttgttgata-gagtccatgcattagcata-cattgagctttgtcctcaccacga-- 9593250  T
Q  136 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 235  Q
      | ||||||||||||||| ||||    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||     
T  9593249 --tcggagctttgtcctccacacg----ataggagctttgtcctcccaacgattaaagtatattaatac-tatgatgatgattggtaccacatgcatat- 9593158  T
Q  236 aagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    ||| |||||||  |||||||||||||    
T  9593157 aagtgtctaagttgcattgtcgcatt 9593132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 165 - 236
Target Start/End: Original strand, 13918981 - 13919052
Alignment:
Q  165 taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13918981 taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa 13919052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 38 - 263
Target Start/End: Original strand, 16457463 - 16457679
Alignment:
Q  38 ctccaaattattggatgcatgt-tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat 135  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||| ||||| |||||||||||  || | | |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| |       
T  16457463 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaagatgttttgttgtta-gagcccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccatg--- 16457557  T
Q  136 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 235  Q
     || ||||||||||||||| ||||    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16457558 -ttcggagctttgtcctccacacg----ataggagctttgacctccgcacgattaaagtatattaatact-atgatgacgattggtaccacatgcatata 16457651  T
Q  236 aagagtctaaga-gcattgtcgcattgtc 263  Q
    |   |||||||  ||||||||||||||||    
T  16457652 att-gtctaagttgcattgtcgcattgtc 16457679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 168 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 35151517 - 35151421
Alignment:
Q  168 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgcattgtca 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  35151517 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgatgattggtaccacatgcatat-aagtgtctaagttgcattgtcgcattgtca 35151421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 141 - 236
Target Start/End: Original strand, 16907675 - 16907768
Alignment:
Q  141 gagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa 236  Q
    |||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16907675 gagctttgtcctcaccacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatataaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa 16907768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 38 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 6801211 - 6800998
Alignment:
Q  38 ctccaaattattggatgcatgt-tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat 135  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||| ||||| |||||||||||  | |  |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| |       
T  6801211 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaagatgttttgttgtt-taagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccatg--- 6801117  T
Q  136 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 235  Q
     || ||||||||||||||| || |    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |     
T  6801116 -ttcggagctttgtcctccacatg----ataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatac-tatgatgacgattggtaccacatgcat-tt 6801024  T
Q  236 aagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    ||| |||||||  |||||||||||||    
T  6801023 aagtgtctaagttgcattgtcgcatt 6800998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 165 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 16275395 - 16275324
Alignment:
Q  165 taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa 236  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16275395 taggagctttgtcctctgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa 16275324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 112 - 236
Target Start/End: Original strand, 14932954 - 14933071
Alignment:
Q  112 ttgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgat 211  Q
    |||||||| |||||||||||||    |||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14932954 ttgagctttgtcctcaccacga----taggagctttgtcctccgcacgatt---aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatac-tatgat 14933045  T
Q  212 ga-cgattggtaccacatgcatataa 236  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||    
T  14933046 gagagattggtaccacatgcatataa 14933071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 112 - 236
Target Start/End: Original strand, 15356389 - 15356506
Alignment:
Q  112 ttgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgat 211  Q
    |||||||| |||||||||||||    |||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15356389 ttgagctttgtcctcaccacga----taggagctttgtcctccgcacgatt---aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatac-tatgat 15356480  T
Q  212 ga-cgattggtaccacatgcatataa 236  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||    
T  15356481 gagagattggtaccacatgcatataa 15356506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 112 - 236
Target Start/End: Original strand, 15360503 - 15360620
Alignment:
Q  112 ttgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgat 211  Q
    |||||||| |||||||||||||    |||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15360503 ttgagctttgtcctcaccacga----taggagctttgtcctccgcacgatt---aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatac-tatgat 15360594  T
Q  212 ga-cgattggtaccacatgcatataa 236  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||    
T  15360595 gagagattggtaccacatgcatataa 15360620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 26 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 14953192 - 14953061
Alignment:
Q  26 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgca-tagcatctcattgagcttagtcc 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  14953192 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacgatgttttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 14953095  T
Q  125 tcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttt 162  Q
    |||||| ||    |||||||||||||||||||||||||    
T  14953094 tcaccatga----taggagctttgtcctccgcacgttt 14953061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 26 - 162
Target Start/End: Original strand, 44408448 - 44408579
Alignment:
Q  26 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgca-tagcatctcattgagcttagtcc 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  44408448 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacgatgttttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 44408545  T
Q  125 tcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttt 162  Q
    |||||| ||    |||||||||||||||||||||||||    
T  44408546 tcaccatga----taggagctttgtcctccgcacgttt 44408579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Original strand, 9511439 - 9511503
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9511439 tgattacgtgataactgtttagcatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 9511503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Original strand, 12703836 - 12703900
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12703836 tgattacgtgataactgtttagcatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 12703900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Original strand, 18165102 - 18165166
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18165102 tgattacgtgataactgtttagcatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 18165166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Original strand, 40523790 - 40523854
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40523790 tgattacgtgataactgtttagcatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 40523854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 26292162 - 26291996
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttt---------tgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||         ||||  || | ||| ||||||||||| ||||||    
T  26292162 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacgatgtcttgttgttaagagtcaatgcatagcatttcattg 26292063  T
Q  115 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacg 186  Q
    ||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||    
T  26292062 agctttgtcctcaccacg--ttttaggagctttgtcctccgcacgat---taggagctttgtcctccgcacg 26291996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 110 - 260
Target Start/End: Original strand, 2832636 - 2832778
Alignment:
Q  110 cattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatg 209  Q
    |||||||||| |||||||||||||    | ||||| ||||||||| ||||    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  2832636 cattgagctttgtcctcaccacga----tcggagccttgtcctccacacg----ataggagccttgtcctccacacgattaaagtatattaatac-tatg 2832726  T
Q  210 atgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | || |||||||  |||||||||||||    
T  2832727 atgaagattggtaccacatgcataaagagtgtctaagttgcattgtcgcatt 2832778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 24 - 159
Target Start/End: Original strand, 16907576 - 16907718
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  16907576 atgatgatgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 16907675  T
Q  115 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacg 159  Q
    ||||| ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  16907676 agctttgtcctcaccacg--ttttaggagctttgtcctccgcacg 16907718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 292 - 361
Target Start/End: Original strand, 44786904 - 44786973
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattttgatt 361  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  44786904 tgattacgtgataactgtttagcatttatgcaaagttaataatggaatgtttatgatgttaattatgatt 44786973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 292 - 361
Target Start/End: Original strand, 44793545 - 44793614
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattttgatt 361  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  44793545 tgattacgtgataactgtttagcatttatgcaaagttaataatggaatgtttatgatgttaattatgatt 44793614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Original strand, 16407723 - 16407787
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16407723 tgattacgtgataactgtttagtatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 16407787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 49051049 - 49050985
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  49051049 tgattacgtgataactgtttagcatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatattaattt 49050985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 69 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 10869392 - 10869301
Alignment:
Q  69 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacg-aatattaggagctttgtcctccgcacg 159  Q
    |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  10869392 gattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacg 10869301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 69 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 10875472 - 10875381
Alignment:
Q  69 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacg-aatattaggagctttgtcctccgcacg 159  Q
    |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  10875472 gattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacg 10875381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 69 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 16583224 - 16583040
Alignment:
Q  69 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttatag 167  Q
    ||||| ||||||||||| ||| | |||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||| | |   |||||||||||||  ||||    || |    
T  16583224 gattaagatgttttgttgata-gagtccatgcattagcata-cattgagctttgtcctcaccacgatttt---gagctttgtcctcaccacg----atcg 16583134  T
Q  168 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa-agagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||||  |||||||||||||    
T  16583133 gagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatac-tatgatgacaattggtaccacatgcatgtaagagtgtctaagttgcattgtcgcatt 16583040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 69 - 159
Target Start/End: Original strand, 18585452 - 18585543
Alignment:
Q  69 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacg-aatattaggagctttgtcctccgcacg 159  Q
    |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  18585452 gattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacg 18585543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 25 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 18425448 - 18425284
Alignment:
Q  25 tgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttt---------tgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattga 115  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| || |||||||||| ||         ||||  || | ||||||||||||||| |||||||    
T  18425448 tgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgataatatgttgattacgatgattatggtgtcttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattga 18425349  T
Q  116 gcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacg 186  Q
    |||| ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||    
T  18425348 gctttgtcctcaccacg---tttaggagctttgtcctccgcacgat---taggagctttgtcctccgcacg 18425284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Original strand, 20578 - 20673
Alignment:
Q  164 ataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||| |||||||  |||||||||||||    
T  20578 ataggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatac-tatgatgatgattggtaccaaatgcatat-aagtgtctaagttgcattgtcgcatt 20673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 21338 - 21276
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  21338 tgattacgtgataactgtttagcatttatgcaaagttaataatggaatgat--tgatgttaattt 21276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Original strand, 8202524 - 8202586
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  8202524 tgattacgtgataactgtttagcatttatgcaaagttaataatggaatgat--tgatgttaattt 8202586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 24 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 12714629 - 12714487
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  12714629 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 12714530  T
Q  115 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacg 159  Q
    ||||| ||||||  ||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  12714529 agctttgtcctccgcacg--ttttaggagctttgtcctccgcacg 12714487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 15021785 - 15021723
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  15021785 tgattacgtgataactgtttagcatttatgcaaagttaataatggaatgat--tgatgttaattt 15021723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 69 - 260
Target Start/End: Original strand, 14152140 - 14152325
Alignment:
Q  69 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttatag 167  Q
    ||||| ||||||||||| ||| | |||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||| |     |||||||||||||  |||    ||| |    
T  14152140 gattaagatgttttgttgata-gagtccatgcattagcata-cattgagctttgtcctcaccacgattt----gagctttgtcctcaccac----tattg 14152229  T
Q  168 gagctttgtcctccgcacgat---taaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    |||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||    
T  14152230 gagctttgtcctccccacgatgcttaaagtatattaatact-atgatgacaattggtaccacatgcatataaaaggtctaagttgcattgtcgcatt 14152325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 167 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 12318006 - 12317910
Alignment:
Q  167 ggagctttgtcctccgcacgat---taaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    ||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||  |||||||||||||    
T  12318006 ggagctttgtcctccccacgatgcttaaagtatattaatact-atgatgacgattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgcatt 12317910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 236
Target Start/End: Original strand, 9751984 - 9752055
Alignment:
Q  167 ggagctttgtcctccgcacgat---taaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa 236  Q
    ||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9751984 ggagctttgtcctccccacgatgcttaaagtatattaatact-atgatgacgattgataccacatgcatataa 9752055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 167 - 219
Target Start/End: Original strand, 13635696 - 13635747
Alignment:
Q  167 ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattg 219  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13635696 ggagctttgtcctccccacgattaaagtatattaatac-tatgatgacgattg 13635747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 167 - 260
Target Start/End: Original strand, 15605497 - 15605594
Alignment:
Q  167 ggagctttgtcctccgcacgat---taaagtatattaatacttatgatgacg-attggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    ||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||  |||||||||||||    
T  15605497 ggagctttgtcctccccacgatgcttaaagtatattaatact-atgatgacgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgcatt 15605594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 159
Target Start/End: Original strand, 2530496 - 2530614
Alignment:
Q  38 ctccaaattattggatgcatgt-tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat 135  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||||||||| | ||| ||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||       
T  2530496 ctccaaattattggatgtataagtgataagtcgattaaggtgtcttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccacgt-- 2530591  T
Q  136 attaggagctttgtcctccgcacg 159  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  2530592 -ttaggagctttgtcctccgcacg 2530614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 292 - 361
Target Start/End: Original strand, 14655845 - 14655914
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattttgatt 361  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||| | ||||||| ||||||||||| |||||    
T  14655845 tgattacgtgataactgtttagcaattatgcaatgttgataaagaaatgattgtgatgttaattatgatt 14655914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 69 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 8719365 - 8719312
Alignment:
Q  69 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagt 122  Q
    |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8719365 gattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagt 8719312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 38 - 159
Target Start/End: Original strand, 13918884 - 13919002
Alignment:
Q  38 ctccaaattattggatgcatgt-tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat 135  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||| ||||| | ||| ||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||      
T  13918884 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaaggtgtcttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccatga-- 13918979  T
Q  136 attaggagctttgtcctccgcacg 159  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  13918980 -ttaggagctttgtcctccgcacg 13919002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 1347171 - 1347107
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    |||||| || ||||||||||| || |||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  1347171 tgattatgttataactgtttagcaattatgcaatgttatttaaggaatgattatgatgttaattt 1347107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 11365874 - 11365810
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    |||||| || ||||||||||| || |||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  11365874 tgattatgttataactgtttagcaattatgcaatgttatttaaggaatgattatgatgttaattt 11365810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Original strand, 20703418 - 20703482
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    |||||||| |||||||||||| || |||||||| |||  ||| | ||||||||||||||||||||    
T  20703418 tgattacgcgataactgtttagcaattatgcaatgttgttaaagaaatgattatgatgttaattt 20703482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Original strand, 20871463 - 20871527
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||   ||| | ||||||||||||||||||||    
T  20871463 tgattacgtgataactgtttagcaattatgcaatgtcgttaaagaaatgattatgatgttaattt 20871527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 32767353 - 32767289
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    |||||||| |||||||||||| || |||||||| |||  ||| | ||||||||||||||||||||    
T  32767353 tgattacgcgataactgtttagcaattatgcaatgttgttaaagaaatgattatgatgttaattt 32767289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 26 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 14148562 - 14148524
Alignment:
Q  26 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgata 64  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14148562 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgata 14148524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 141 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 26292063 - 26292016
Alignment:
Q  141 gagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgatta 190  Q
    |||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  26292063 gagctttgtcctcaccacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgatta 26292016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 8712547 - 8712502
Alignment:
Q  114 gagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacg 159  Q
    |||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8712547 gagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacg 8712502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 251; Significance: 1e-139; HSPs: 96)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 21 - 303
Target Start/End: Original strand, 22321078 - 22321360
Alignment:
Q  21 tatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagctta 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22321078 tatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagctta 22321177  T
Q  121 gtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22321178 gtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 22321277  T
Q  221 taccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||    
T  22321278 taccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgaatgaatatgtgat 22321360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 21 - 303
Target Start/End: Original strand, 22327231 - 22327513
Alignment:
Q  21 tatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagctta 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22327231 tatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagctta 22327330  T
Q  121 gtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22327331 gtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 22327430  T
Q  221 taccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||    
T  22327431 taccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgaatgaatatgtgat 22327513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 21 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 1843095 - 1842814
Alignment:
Q  21 tatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagctta 120  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1843095 tatatgatgaagtt-agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccatgcatagcatctcattgagctta 1842997  T
Q  121 gtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1842996 gtcctcgccacgaatattaggagctttgtcctccgcacattttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 1842897  T
Q  221 taccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1842896 taccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccgtgttgataatgattgattacgtgat 1842814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 14 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 27599283 - 27598995
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcatt 113  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27599283 gcataagtatatgatgaagtt-agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccatgcatagcatctcatt 27599185  T
Q  114 gagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga 213  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27599184 gagcttagtcctcaccatgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga 27599085  T
Q  214 cgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  27599084 cgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagaggccttgttgatgatgattgaatacgtgat 27598995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 21 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 27617310 - 27617042
Alignment:
Q  21 tatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagctta 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27617310 tatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagt-gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagctta 27617212  T
Q  121 gtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 220  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27617211 gtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 27617112  T
Q  221 taccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatga 290  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27617111 taccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatga 27617042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 14 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 29233549 - 29233261
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcatt 113  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29233549 gcataagtatatgatgaagtt-agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccatgcatagcatctcatt 29233451  T
Q  114 gagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga 213  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29233450 gagcttagtcctcaccgcgattattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaattatattaatacttatgatga 29233351  T
Q  214 cgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  29233350 cgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatgattgaatacgtgat 29233261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 14 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 29346848 - 29346560
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcatt 113  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29346848 gcataagtatatgatgaagtt-agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccatgcatagcatctcatt 29346750  T
Q  114 gagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga 213  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29346749 gagcttagtcctcaccgcgattattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaattatattaatacttatgatga 29346650  T
Q  214 cgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  29346649 cgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatgattgaatacgtgat 29346560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 19 - 303
Target Start/End: Original strand, 24914056 - 24914340
Alignment:
Q  19 ggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagct 118  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  24914056 ggtatacgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagct 24914155  T
Q  119 tagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgatt 218  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24914156 tagtcctcaccacgatgattaggagttttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgatt 24914255  T
Q  219 ggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  24914256 ggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgat 24914340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 69 - 356
Target Start/End: Original strand, 19490086 - 19490381
Alignment:
Q  69 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttatagg 168  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19490086 gattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttatagg 19490185  T
Q  169 agctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgat 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  19490186 agctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgat 19490285  T
Q  269 taagatgccttgttgataatga--------ttgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19490286 taagatgccttgttgataatgaatgaatatatgattacgtgataactgtttagcatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 19490381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 14 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 23171058 - 23170769
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||    
T  23171058 gcataagtatatgatgaagtttagctccaaattactggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgtccataagagtccatgcatagcatctcatt 23170959  T
Q  114 gagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga 213  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23170958 gagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga 23170859  T
Q  214 cgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  23170858 cgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatgattgaatatgtgat 23170769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 14 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 23582315 - 23582026
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||    
T  23582315 gcataagtatatgatgaagtttagctccaaattactggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgtccataagagtccatgcatagcatctcatt 23582216  T
Q  114 gagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga 213  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23582215 gagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga 23582116  T
Q  214 cgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  23582115 cgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatgattgaatatgtgat 23582026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 21 - 290
Target Start/End: Original strand, 26877660 - 26877928
Alignment:
Q  21 tatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagctta 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  26877660 tatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagt-gattacgttgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagttta 26877758  T
Q  121 gtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 220  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26877759 gtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcatgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 26877858  T
Q  221 taccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatga 290  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26877859 taccacatgcatataaggagtctaggagaattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatga 26877928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 19 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 12829087 - 12828803
Alignment:
Q  19 ggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagct 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||    
T  12829087 ggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagct 12828988  T
Q  119 tagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgatt 218  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12828987 tagtcctcaccacgtttattaggagttttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatactaatacttatgatgacgatt 12828888  T
Q  219 ggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  12828887 ggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgat 12828803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 14 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 10873558 - 10873282
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataa-gtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcat 112  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  10873558 gcatatgtatatgataatgtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttctgttcataagtgtccatgcatagcatatcat 10873460  T
Q  113 tgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg 212  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10873459 tgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg 10873360  T
Q  213 acgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatga 290  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10873359 acgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatga 10873282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 14 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 16928376 - 16928087
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataa-gtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcat 112  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||    
T  16928376 gcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcat 16928278  T
Q  113 tgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg 212  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16928277 tgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgatttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg 16928178  T
Q  213 acgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||    
T  16928177 acgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgaatgaatatgtgat 16928087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 14 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 16997070 - 16996781
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataa-gtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcat 112  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||    
T  16997070 gcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcat 16996972  T
Q  113 tgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg 212  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16996971 tgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgatttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg 16996872  T
Q  213 acgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||    
T  16996871 acgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgaatgaatatgtgat 16996781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 14 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 17003703 - 17003414
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataa-gtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcat 112  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||    
T  17003703 gcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcat 17003605  T
Q  113 tgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg 212  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17003604 tgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgatttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg 17003505  T
Q  213 acgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||    
T  17003504 acgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgaatgaatatgtgat 17003414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 69 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 9340227 - 9340006
Alignment:
Q  69 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttatagg 168  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9340227 gattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttatagg 9340128  T
Q  169 agctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgat 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  9340127 agctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgat 9340028  T
Q  269 taagatgccttgttgataatga 290  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  9340027 taagatgccttgttgataatga 9340006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 69 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 9488861 - 9488640
Alignment:
Q  69 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttatagg 168  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9488861 gattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttatagg 9488762  T
Q  169 agctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgat 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  9488761 agctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgat 9488662  T
Q  269 taagatgccttgttgataatga 290  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  9488661 taagatgccttgttgataatga 9488640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 69 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 9608122 - 9607901
Alignment:
Q  69 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttatagg 168  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9608122 gattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttatagg 9608023  T
Q  169 agctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgat 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  9608022 agctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgat 9607923  T
Q  269 taagatgccttgttgataatga 290  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  9607922 taagatgccttgttgataatga 9607901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 69 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 16922476 - 16922255
Alignment:
Q  69 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttatagg 168  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16922476 gattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttatagg 16922377  T
Q  169 agctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgat 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  16922376 agctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgat 16922277  T
Q  269 taagatgccttgttgataatga 290  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  16922276 taagatgccttgttgataatga 16922255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 69 - 290
Target Start/End: Original strand, 28432074 - 28432295
Alignment:
Q  69 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttatagg 168  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28432074 gattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttatagg 28432173  T
Q  169 agctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgat 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  28432174 agctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgat 28432273  T
Q  269 taagatgccttgttgataatga 290  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  28432274 taagatgccttgttgataatga 28432295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 69 - 303
Target Start/End: Original strand, 13306751 - 13306985
Alignment:
Q  69 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttatagg 168  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13306751 gattatgatgttctgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttatagg 13306850  T
Q  169 agctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgat 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  13306851 agctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgat 13306950  T
Q  269 taagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || |||||    
T  13306951 taagatgccttgttgataatgaatgaatatgtgat 13306985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 69 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 16985888 - 16985654
Alignment:
Q  69 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttatagg 168  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16985888 gattatgatgttctgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttatagg 16985789  T
Q  169 agctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgat 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  16985788 agctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgat 16985689  T
Q  269 taagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || |||||    
T  16985688 taagatgccttgttgataatgaatgaatatgtgat 16985654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 69 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 27216010 - 27215789
Alignment:
Q  69 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttatagg 168  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27216010 gattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttatagg 27215911  T
Q  169 agctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgat 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  27215910 agctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgat 27215811  T
Q  269 taagatgccttgttgataatga 290  Q
    ||||||||||||||||| ||||    
T  27215810 taagatgccttgttgatgatga 27215789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 45 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 10866162 - 10865917
Alignment:
Q  45 ttattggatgcatgttgataa-gtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggag 143  Q
    ||||||||||||||||||| | |  ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10866162 ttattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttctgttcataagtgtccatgcataacatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggag 10866064  T
Q  144 ctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtct 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10866063 ctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtct 10865964  T
Q  244 aagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatga 290  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10865963 aagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatga 10865917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 24 - 266
Target Start/End: Original strand, 13970480 - 13970722
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 123  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13970480 atgatgacgtttagctccaaattgttggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 13970579  T
Q  124 ctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 223  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13970580 ctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 13970679  T
Q  224 cacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 266  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13970680 cacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 13970722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 24 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 24714707 - 24714465
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 123  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24714707 atgatgacgtttagctccaaattgttggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 24714608  T
Q  124 ctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 223  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24714607 ctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 24714508  T
Q  224 cacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 266  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24714507 cacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 24714465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 26 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 37318269 - 37318029
Alignment:
Q  26 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcct 125  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37318269 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgatttgtgcatatgagtccatgcatagcatttcattgagcttagtcct 37318170  T
Q  126 caccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacca 225  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37318169 caccacgattattaggagctttgtcctccgcatgatttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttttgatgacgattggtacca 37318070  T
Q  226 catgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 266  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37318069 catgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 37318029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 24 - 266
Target Start/End: Original strand, 41604843 - 41605085
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 123  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41604843 atgatgacgtttagctccaaattgttggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcataacatctcattgagcttagtc 41604942  T
Q  124 ctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 223  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41604943 ctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 41605042  T
Q  224 cacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 266  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||    
T  41605043 cacatgcatataaggagtctaagagcattttcacattgtcatg 41605085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 24 - 266
Target Start/End: Original strand, 41610740 - 41610982
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 123  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41610740 atgatgacgtttagctccaaattgttggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcataacatctcattgagcttagtc 41610839  T
Q  124 ctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 223  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41610840 ctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgattattagaagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 41610939  T
Q  224 cacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 266  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41610940 cacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 41610982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 24 - 266
Target Start/End: Original strand, 45057536 - 45057778
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 123  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45057536 atgatgacgtttagctccaaattgttggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagattccatgcatagcatctcattgagcttagtc 45057635  T
Q  124 ctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 223  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45057636 ctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgatgattggtac 45057735  T
Q  224 cacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 266  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45057736 cacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 45057778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 24 - 266
Target Start/End: Original strand, 30971091 - 30971336
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagt 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  30971091 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgatttgttcataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagt 30971189  T
Q  123 cctcaccacgaat-attaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgatt-aaagtatattaatacttatgatgacgattg 219  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30971190 cctcaccacgatttattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgttttaaagtatattaatacttatgatgacgattg 30971289  T
Q  220 gtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 266  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30971290 gtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 30971336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 26 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 11677441 - 11677200
Alignment:
Q  26 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcc 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |  | |||| ||| |||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  11677441 gatgacgtttagctccaaattattggatgcacattgatatgatggttacaatgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 11677343  T
Q  125 tcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 223  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11677342 tcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 11677243  T
Q  224 cacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 266  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11677242 cacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 11677200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 26 - 266
Target Start/End: Original strand, 24641075 - 24641316
Alignment:
Q  26 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcc 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||| || ||||||| || |||||| ||| | || ||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  24641075 gatgacgtttagctccaaattattggatgtttattgatatgttgattacggtgatttgttgataagagtgcatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 24641173  T
Q  125 tcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 223  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24641174 tcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgttctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 24641273  T
Q  224 cacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 266  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24641274 cacatgcatataaggagtctaagagcattatcgcattgtcatg 24641316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 26 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 24503105 - 24502860
Alignment:
Q  26 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcc 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    ||||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  24503105 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatataatgattacgatgttttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 24503008  T
Q  125 tcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 224  Q
    |||||||||    |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24503007 tcaccacga----taggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 24502912  T
Q  225 acatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgc 276  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  24502911 atatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgtctaagatgc 24502860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 26 - 262
Target Start/End: Original strand, 21147404 - 21147638
Alignment:
Q  26 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcc 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||| || |||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  21147404 gatgacgtttagctccaaattattggatgcttattgatatgttgattacggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 21147502  T
Q  125 tcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 223  Q
    ||||||||| ||||||   |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21147503 tcaccacgattattag---ctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 21147599  T
Q  224 cacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgt 262  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  21147600 cacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgt 21147638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 69 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 27369256 - 27369021
Alignment:
Q  69 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat-attaggagctttgtcctccgcacgttttatag 167  Q
    |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  27369256 gattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattattag 27369157  T
Q  168 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatga 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||     
T  27369156 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacggagtctaggagcattgtcacattgtcatgt 27369057  T
Q  268 ttaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
     ||  |||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  27369056 ctattatgctttgttgatgatgattgattatgtgat 27369021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 69 - 303
Target Start/End: Original strand, 44381353 - 44381588
Alignment:
Q  69 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat-attaggagctttgtcctccgcacgttttatag 167  Q
    |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  44381353 gattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattattag 44381452  T
Q  168 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatga 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||     
T  44381453 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacggagtctaggagcattgtcacattgtcatgt 44381552  T
Q  268 ttaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
     ||  |||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  44381553 ctattatgctttgttgatgatgattgattatgtgat 44381588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 69 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 27375766 - 27375531
Alignment:
Q  69 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat-attaggagctttgtcctccgcacgttttatag 167  Q
    |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  27375766 gattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctaaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattattag 27375667  T
Q  168 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatga 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||| |||||||||| ||||||||||     
T  27375666 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacggattctaggagcattgtcacattgtcatgt 27375567  T
Q  268 ttaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
     ||  |||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  27375566 ctattatgctttgttgatgatgattgattatgtgat 27375531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 69 - 303
Target Start/End: Original strand, 44388023 - 44388258
Alignment:
Q  69 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat-attaggagctttgtcctccgcacgttttatag 167  Q
    |||||||||||||||||  || | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  44388023 gattacgatgttttgttgttaagagtccatgcataacatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattattag 44388122  T
Q  168 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatga 267  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||| ||||||||||     
T  44388123 gagctttatcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacgaagtctaggagcattgtcacattgtcatgt 44388222  T
Q  268 ttaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
     ||  |||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  44388223 ctattatgctttgttgatgatgattgattatgtgat 44388258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 24 - 260
Target Start/End: Original strand, 12901857 - 12902097
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  12901857 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 12901956  T
Q  115 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 214  Q
    ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12901957 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgac 12902051  T
Q  215 gattggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||    
T  12902052 gattggtaccacatgcatat-aagtgtctaagttgcattgtcgcatt 12902097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 24 - 236
Target Start/End: Original strand, 10101994 - 10102210
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  10101994 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 10102093  T
Q  115 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 214  Q
    ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10102094 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgac 10102188  T
Q  215 gattggtaccacatgcatataa 236  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  10102189 gattggtaccacatgcatataa 10102210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 24 - 236
Target Start/End: Original strand, 24628820 - 24629036
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  24628820 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 24628919  T
Q  115 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 214  Q
    ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24628920 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgac 24629014  T
Q  215 gattggtaccacatgcatataa 236  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  24629015 gattggtaccacatgcatataa 24629036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 24 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 24649120 - 24648904
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  24649120 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 24649021  T
Q  115 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 214  Q
    ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24649020 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgac 24648926  T
Q  215 gattggtaccacatgcatataa 236  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  24648925 gattggtaccacatgcatataa 24648904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 24 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 27601557 - 27601341
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  27601557 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 27601458  T
Q  115 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 214  Q
    ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27601457 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgac 27601363  T
Q  215 gattggtaccacatgcatataa 236  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  27601362 gattggtaccacatgcatataa 27601341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 24 - 236
Target Start/End: Original strand, 27379773 - 27379989
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  27379773 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 27379872  T
Q  115 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 214  Q
    ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  27379873 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttttgatgac 27379967  T
Q  215 gattggtaccacatgcatataa 236  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  27379968 gattggtaccacatgcatataa 27379989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 24 - 236
Target Start/End: Original strand, 27383819 - 27384035
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  27383819 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 27383918  T
Q  115 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 214  Q
    ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  27383919 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttttgatgac 27384013  T
Q  215 gattggtaccacatgcatataa 236  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  27384014 gattggtaccacatgcatataa 27384035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 38 - 236
Target Start/End: Original strand, 19928607 - 19928798
Alignment:
Q  38 ctccaaattattggatgcatgt-tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat 135  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||||| ||||| |||||||||||  || | |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||      
T  19928607 ctccaaattattggatgtatatgtgataagttgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccatga-- 19928702  T
Q  136 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 235  Q
      |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19928703 --taggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 19928797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 38 - 260
Target Start/End: Original strand, 30345381 - 30345597
Alignment:
Q  38 ctccaaattattggatgcatgt-tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat 135  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||| ||||| | ||| ||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||      
T  30345381 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaaggtgtcttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccacga-- 30345476  T
Q  136 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 235  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  30345477 -ttaggagctttgtcctccgcacgatt---aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat- 30345571  T
Q  236 aagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    ||| |||||||  |||||||||||||    
T  30345572 aagtgtctaagttgcattgtcgcatt 30345597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 38 - 263
Target Start/End: Original strand, 18855564 - 18855782
Alignment:
Q  38 ctccaaattattggatgcatgt-tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat 135  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||| ||||| |||||||||||  || | |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| |       
T  18855564 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccatg--- 18855658  T
Q  136 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 235  Q
     ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18855659 -ttaggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtcttccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat- 18855753  T
Q  236 aagagtctaag-agcattgtcgcattgtc 263  Q
    ||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  18855754 aagtgtctaagttgcattgtcgcattgtc 18855782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 24 - 164
Target Start/End: Original strand, 24872519 - 24872660
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgca-tagcatctcattgagcttagt 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| |||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  24872519 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacaatgatttgttcataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagt 24872617  T
Q  123 cctcaccacga-atattaggagctttgtcctccgcacgtttta 164  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24872618 cctcaccacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttta 24872660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 24 - 164
Target Start/End: Original strand, 24880404 - 24880545
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgca-tagcatctcattgagcttagt 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| |||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  24880404 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacaatgatttgttcataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagt 24880502  T
Q  123 cctcaccacga-atattaggagctttgtcctccgcacgtttta 164  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24880503 cctcaccacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttta 24880545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 38 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 60817 - 60598
Alignment:
Q  38 ctccaaattattggatgcatgt-tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat 135  Q
    ||||||||||||||| ||||   |||||||| ||||| | |||||||||  || | |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||      
T  60817 ctccaaattattggaagcataagtgataagttgattaaggtgttttgttgtta-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccatga-- 60722  T
Q  136 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 235  Q
      |||||  |||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  60721 --taggaa-tttgtcctccacacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat- 60628  T
Q  236 aagagtctaag-agcattgtcgcattgtca 264  Q
    ||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  60627 aagtgtctaagttgcattgtcgcattgtca 60598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 141 - 266
Target Start/End: Original strand, 24872609 - 24872736
Alignment:
Q  141 gagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgatt-aaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaag 238  Q
    |||||| ||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24872609 gagcttagtcctcaccacgatttattaggagctttgtcctccgcacgttttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagg 24872708  T
Q  239 agtctaagagcattgtcgcattgtcatg 266  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24872709 agtctaagagcattgtcacattgtcatg 24872736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 141 - 266
Target Start/End: Original strand, 24880494 - 24880621
Alignment:
Q  141 gagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgatt-aaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaag 238  Q
    |||||| ||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24880494 gagcttagtcctcaccacgatttattaggagctttgtcctccgcacgttttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagg 24880593  T
Q  239 agtctaagagcattgtcgcattgtcatg 266  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24880594 agtctaagagcattgtcacattgtcatg 24880621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 93 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 41666895 - 41666759
Alignment:
Q  93 gtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaa 191  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||    
T  41666895 gtccatgcattagcat-tcattgagttttgtcctcaccatga---ttaggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtcctccgcacgatgaa 41666803  T
Q  192 agtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41666802 agtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 41666759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 60 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 23187053 - 23186858
Alignment:
Q  60 tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcac 158  Q
    |||||||| ||||| | |||||||||  || | |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||    ||||||||||||||||| |||    
T  23187053 tgataagttgattaaggtgttttgttgtta-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccatga----taggagctttgtcctccacac 23186960  T
Q  159 gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgc 257  Q
    |||    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||    
T  23186959 gttg---aggagctttgtcgtccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat-aagtgtctaagttgcattgtcgc 23186864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 60 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 23598316 - 23598121
Alignment:
Q  60 tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcac 158  Q
    |||||||| ||||| | |||||||||  || | |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||    ||||||||||||||||| |||    
T  23598316 tgataagtagattaaggtgttttgttgtta-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccatga----taggagctttgtcctccacac 23598223  T
Q  159 gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgc 257  Q
    |||    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||    
T  23598222 gttg---aggagctttgtcgtccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat-aagtgtctaagttgcattgtcgc 23598127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 93 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 31344823 - 31344662
Alignment:
Q  93 gtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaa 191  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||   |||| |||||||||||||||||| ||   || |||||||||||||||||||||||    
T  31344823 gtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccatga---ttagaagctttgtcctccgcacgatt---agaagctttgtcctccgcacgattaa 31344731  T
Q  192 agtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||    
T  31344730 agtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat-aagtgtctaagttgcattgtcgcatt 31344662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 136 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 26125090 - 26124966
Alignment:
Q  136 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  26125090 attaggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtcctccgcacgacgaaagtatattaatacttgtgatgacgattggtaccacatgcatat- 26124995  T
Q  236 aagagtctaag-agcattgtcgcattgtc 263  Q
    ||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  26124994 aagtgtctaagttgcattgtcgcattgtc 26124966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 165 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 27195605 - 27195507
Alignment:
Q  165 taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtc 263  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  27195605 taggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacctatgatgacgattggtaccacaagcatataaggagtctaagagcaatgtcgcattgtc 27195507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 10866391 - 10866263
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataa-gtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcat 112  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  10866391 gcatatgtatatgataatgtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttctgttcataagtgtccatgcatagcatatcat 10866293  T
Q  113 tgagcttagtcctcaccacgaatattagga 142  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10866292 tgagcttagtcctcaccacgaaaattagga 10866263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 165 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 1283008 - 1282913
Alignment:
Q  165 taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||    
T  1283008 taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat-aagtgtctaagttgcattgtcgcatt 1282913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 165 - 260
Target Start/End: Original strand, 41531491 - 41531586
Alignment:
Q  165 taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||    
T  41531491 taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat-aagtgtctaagttgcattgtcgcatt 41531586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 38 - 260
Target Start/End: Original strand, 22461295 - 22461508
Alignment:
Q  38 ctccaaattattggatgcatgt-tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat 135  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||| ||||| |||||||||||  | |  |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| |       
T  22461295 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaagatgttttgttgtt-taagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccatg--- 22461389  T
Q  136 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 235  Q
     || ||||||||||||||| ||||    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  22461390 -ttcggagctttgtcctccacacg----atatgagctttgtcctccacacgattaaagtatattaaaact-atgatgacgattggtaccacatgcatat- 22461482  T
Q  236 aagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    ||| |||||||  |||||||||||||    
T  22461483 aagtgtctaagttgcattgtcgcatt 22461508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Original strand, 26877995 - 26878059
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26877995 tgattacgtgataactgtttagcatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 26878059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 27616975 - 27616911
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27616975 tgattacgtgataactgtttagcatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 27616911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Original strand, 28432362 - 28432426
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28432362 tgattacgtgataactgtttagcatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 28432426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 292 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 16985599 - 16985530
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattttgatt 361  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  16985599 tgattacgtgataactgtttagcatttatgcaaagttaataatggaatgtttatgatgttaattatgatt 16985530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 292 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 17003359 - 17003290
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattttgatt 361  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  17003359 tgattacgtgataactgtttagcatttatgcaaagttaataatggaatgtttatgatgttaattatgatt 17003290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 201 - 266
Target Start/End: Original strand, 30657567 - 30657632
Alignment:
Q  201 atacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30657567 atacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 30657632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Original strand, 22321415 - 22321479
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22321415 tgattacgtgataattgtttagcatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 22321479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Original strand, 22327568 - 22327632
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22327568 tgattacgtgataattgtttagcatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 22327632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 292 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 27215722 - 27215664
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgt 350  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27215722 tgattacgtgataactgtttagcatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgt 27215664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 292 - 361
Target Start/End: Original strand, 13307040 - 13307109
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattttgatt 361  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  13307040 tgattacgtgataactgtttagcatttatgcaaagctaataatggaatgtttatgatgttaattatgatt 13307109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 292 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 16928032 - 16927963
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattttgatt 361  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  16928032 tgattacgtgataactatttagcatttatgcaaagttaataatggaatgtttatgatgttaattatgatt 16927963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 292 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 16996726 - 16996657
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattttgatt 361  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  16996726 tgattacgtgataactatttagcatttatgcaaagttaataatggaatgtttatgatgttaattatgatt 16996657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 293 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 10865850 - 10865787
Alignment:
Q  293 gattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10865850 gattacgtgataactgtttagcaattatgcaaagttaataatggaatgattatgttgttaattt 10865787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 293 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 10873215 - 10873152
Alignment:
Q  293 gattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10873215 gattacgtgataactgtttagcaattatgcaaagttaataatggaatgattatgttgttaattt 10873152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 93 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 27195650 - 27195581
Alignment:
Q  93 gtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttt 162  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27195650 gtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgttt 27195581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 9339939 - 9339877
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  9339939 tgattacgtgataactgtttagcatttatgcaaagttaataatggaatgat--tgatgttaattt 9339877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 9488573 - 9488511
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  9488573 tgattacgtgataactgtttagcatttatgcaaagttaataatggaatgat--tgatgttaattt 9488511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 9607834 - 9607772
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  9607834 tgattacgtgataactgtttagcatttatgcaaagttaataatggaatgat--tgatgttaattt 9607772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 16922188 - 16922126
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  16922188 tgattacgtgataactgtttagcatttatgcaaagttaataatggaatgat--tgatgttaattt 16922126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 69 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 24735362 - 24735177
Alignment:
Q  69 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttatag 167  Q
    ||||| ||||||||||| ||| | |||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||| |     |||||||||||||  |||| ||    |    
T  24735362 gattaagatgttttgttgata-gagtccatgcattagcata-cattgagctttgtcctcaccacgattt----gagctttgtcctcaccacgatt----g 24735273  T
Q  168 gagctttgtcctccgcacgat---taaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    |||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||  |||||||||||||    
T  24735272 gagctttgtcctccccacgatgcttaaagtatattaatact-atgatgacgattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgcatt 24735177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 93 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 1283050 - 1282987
Alignment:
Q  93 gtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacg 159  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  1283050 gtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacg 1282987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 93 - 159
Target Start/End: Original strand, 41531449 - 41531512
Alignment:
Q  93 gtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacg 159  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  41531449 gtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacg 41531512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 1842759 - 1842695
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    |||||| || ||||||||||| || |||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  1842759 tgattatgttataactgtttagcaattatgcaatgttatttaaggaatgattatgatgttaattt 1842695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 12828749 - 12828685
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||||||||||| ||| || |||||||| |||  ||| | ||||||||||||||||||||    
T  12828749 tgattacgtgataactgcttagcaattatgcaatgttgttaaagaaatgattatgatgttaattt 12828685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 23170715 - 23170651
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||| |||| |||  ||| | ||||||||||||||||||||    
T  23170715 tgattacgtgataactgtttagcaattacgcaatgttgttaaagaaatgattatgatgttaattt 23170651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 23581972 - 23581908
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||| |||| |||  ||| | ||||||||||||||||||||    
T  23581972 tgattacgtgataactgtttagcaattacgcaatgttgttaaagaaatgattatgatgttaattt 23581908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 27598941 - 27598877
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    |||||| || ||||||||||| || |||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  27598941 tgattatgttataactgtttagcaattatgcaatgttatttaaggaatgattatgatgttaattt 27598877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 208 - 260
Target Start/End: Original strand, 19691914 - 19691967
Alignment:
Q  208 tgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||  |||||||||||||    
T  19691914 tgatgacgattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgcatt 19691967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 236
Target Start/End: Original strand, 22134501 - 22134546
Alignment:
Q  191 aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa 236  Q
    |||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||    
T  22134501 aagtatattaatacttattacgttgattggtaccacatgcatataa 22134546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Original strand, 24914394 - 24914459
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatga-tgttaattt 356  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||  ||| | ||||||||||| |||||||||    
T  24914394 tgattacgtgataactgtttagcaattatgcaatgttgttaaagaaatgattatgattgttaattt 24914459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 250; Significance: 1e-139; HSPs: 70)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 14 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 47659234 - 47658945
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  47659234 gcataagtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttgttttgttcatatgtgtccatgcatagcataacatt 47659135  T
Q  114 gagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga 213  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47659134 gagctttgtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga 47659035  T
Q  214 cgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  47659034 cgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgat 47658945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 21 - 303
Target Start/End: Original strand, 20216020 - 20216301
Alignment:
Q  21 tatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagctta 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20216020 tatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagt-gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagctta 20216118  T
Q  121 gtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20216119 gtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 20216218  T
Q  221 taccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||    
T  20216219 taccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatgaatgaatatgtgat 20216301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 14 - 303
Target Start/End: Original strand, 18600191 - 18600480
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgtttt-gttcatatgtgtccatgcatagcatctcat 112  Q
    ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18600191 gcataagtttatgatgaagtt-agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgtttttgttcataagtgtccatgcatagcatctcat 18600289  T
Q  113 tgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg 212  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18600290 tgagcttagtcctcaccacgaataataggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg 18600389  T
Q  213 acgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  18600390 acgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatacatgat 18600480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 14 - 303
Target Start/End: Original strand, 41348937 - 41349226
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataa-gtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcat 112  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  41348937 gcatatgtatatgataaggtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttttgttcataagtgtccatgcatagcatatcat 41349035  T
Q  113 tgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41349036 tgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg 41349135  T
Q  213 acgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  41349136 acgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgat 41349226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 14 - 303
Target Start/End: Original strand, 41478663 - 41478952
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgtttt-gttcatatgtgtccatgcatagcatctcat 112  Q
    ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41478663 gcataagtttatgatgaagtt-agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgtttttgttcataagtgtccatgcatagcatctcat 41478761  T
Q  113 tgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg 212  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41478762 tgagcttagtcctcaccacgaataataggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg 41478861  T
Q  213 acgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||    
T  41478862 acgattggtaccacatgcatatagggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgtcttgttgatgatgattgaatacgtgat 41478952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 14 - 290
Target Start/End: Original strand, 44844969 - 44845245
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcatt 113  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  44844969 gcataagtctatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttgttttgttcatatgtgtccgtgcatagcatatcatt 44845068  T
Q  114 gagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga 213  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44845069 gagctttgtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttacaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga 44845168  T
Q  214 cgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatga 290  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  44845169 cgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagataccttgttgatgatga 44845245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 14 - 303
Target Start/End: Original strand, 41356374 - 41356663
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataa-gtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcat 112  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| | |  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  41356374 gcatatgtatatgataaggtttagcttcaaattattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttttgttcataagtgtccatgcatagcatatcat 41356472  T
Q  113 tgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41356473 tgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg 41356572  T
Q  213 acgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  41356573 acgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgat 41356663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 14 - 303
Target Start/End: Original strand, 16345860 - 16346149
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataa-gtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcat 112  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  16345860 gcatatgtatatgataaggtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttttgttcataagtgtccatgcatagcatatcat 16345958  T
Q  113 tgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg 212  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16345959 tgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg 16346058  T
Q  213 acgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  16346059 acgattggtaccacatgcatataagaagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatgattgattatgtgat 16346149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 14 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 21828734 - 21828445
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcatt 113  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||  || | ||||||||||| ||| |||||    
T  21828734 gcatatgtatatgatgaattttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggcgttttgttgttaagagtccatgcataacatatcatt 21828635  T
Q  114 gagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga 213  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21828634 gagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga 21828535  T
Q  214 cgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  21828534 cgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgat 21828445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 14 - 303
Target Start/End: Original strand, 16352508 - 16352798
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataa-gtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcat 112  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  16352508 gcatatgtatatgataaggtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttttgttcataagtgtccatgcatagcatatcat 16352606  T
Q  113 tgagcttagtcctcaccacgaatatta-ggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgat 211  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16352607 tgagcttagtcctcaccacgaaaattaaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgat 16352706  T
Q  212 gacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  16352707 gacgattggtaccacatgcatataagaagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatgattgattatgtgat 16352798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 14 - 303
Target Start/End: Original strand, 51328764 - 51329053
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataa-gtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcat 112  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||    
T  51328764 gcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcat 51328862  T
Q  113 tgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg 212  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51328863 tgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgatttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg 51328962  T
Q  213 acgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||    
T  51328963 acgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgaatgaatatgtgat 51329053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 14 - 303
Target Start/End: Original strand, 51335398 - 51335687
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataa-gtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcat 112  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||    
T  51335398 gcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcat 51335496  T
Q  113 tgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg 212  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51335497 tgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgatttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg 51335596  T
Q  213 acgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||    
T  51335597 acgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgaatgaatatgtgat 51335687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 69 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 43078384 - 43078163
Alignment:
Q  69 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttatagg 168  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43078384 gattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttatagg 43078285  T
Q  169 agctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgat 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  43078284 agctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgat 43078185  T
Q  269 taagatgccttgttgataatga 290  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  43078184 taagatgccttgttgataatga 43078163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 69 - 290
Target Start/End: Original strand, 46157482 - 46157703
Alignment:
Q  69 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttatagg 168  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46157482 gattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttatagg 46157581  T
Q  169 agctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgat 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  46157582 agctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgat 46157681  T
Q  269 taagatgccttgttgataatga 290  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  46157682 taagatgccttgttgataatga 46157703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 24 - 266
Target Start/End: Original strand, 21807311 - 21807553
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 123  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21807311 atgatgatgtttagctccaaattgttggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 21807410  T
Q  124 ctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 223  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21807411 ctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 21807510  T
Q  224 cacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 266  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21807511 cacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 21807553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 24 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 21835361 - 21835119
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 123  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21835361 atgatgatgtttagctccaaattgttggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 21835262  T
Q  124 ctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 223  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21835261 ctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 21835162  T
Q  224 cacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 266  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21835161 cacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 21835119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 24 - 266
Target Start/End: Original strand, 33386334 - 33386576
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 123  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33386334 atgatgacgtttagctccaaattgttggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 33386433  T
Q  124 ctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 223  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33386434 ctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 33386533  T
Q  224 cacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 266  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33386534 cacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 33386576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 24 - 266
Target Start/End: Original strand, 33392979 - 33393221
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 123  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33392979 atgatgacgtttagctccaaattgttggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 33393078  T
Q  124 ctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 223  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33393079 ctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 33393178  T
Q  224 cacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 266  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33393179 cacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 33393221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 24 - 266
Target Start/End: Original strand, 50887864 - 50888109
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagt 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  50887864 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgatttgttcataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagt 50887962  T
Q  123 cctcaccacgaat-attaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgatt-aaagtatattaatacttatgatgacgattg 219  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50887963 cctcaccacgatttattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgttttaaagtatattaatacttatgatgacgattg 50888062  T
Q  220 gtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 266  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  50888063 gtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 50888109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 26 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 19111402 - 19111151
Alignment:
Q  26 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcc 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||| || |||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  19111402 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 19111304  T
Q  125 tcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 223  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19111303 tcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 19111204  T
Q  224 cacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgc 276  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||    
T  19111203 cacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgtattgtcgtgtctaagatgc 19111151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 26 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 19104745 - 19104507
Alignment:
Q  26 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcc 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||| || |||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  19104745 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 19104647  T
Q  125 tcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 223  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19104646 tcaccacggttattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 19104547  T
Q  224 cacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtc 263  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19104546 cacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtc 19104507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 26 - 266
Target Start/End: Original strand, 20525328 - 20525569
Alignment:
Q  26 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcc 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||   |||||||||  ||   |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  20525328 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattattgtgttttgttgttaatagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 20525426  T
Q  125 tcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 223  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20525427 tcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 20525526  T
Q  224 cacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 266  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20525527 cacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 20525569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 24 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 8305138 - 8304894
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagt 122  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| || |||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  8305138 atgatgacgtttaggtccaaattattggatgcatattgatatgttgattacggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagt 8305040  T
Q  123 cctcaccacgaat-attaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 220  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8305039 cctcaccacgatttattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagttttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 8304940  T
Q  221 taccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 266  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8304939 taccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcgcattgtcatg 8304894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 26 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 23763206 - 23762961
Alignment:
Q  26 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcc 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  23763206 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacgatgttttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 23763109  T
Q  125 tcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 224  Q
    |||||| ||    |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23763108 tcaccatga----taggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 23763013  T
Q  225 acatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgc 276  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  23763012 acatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcgtgtctaagatgc 23762961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 69 - 303
Target Start/End: Original strand, 27898811 - 27899046
Alignment:
Q  69 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat-attaggagctttgtcctccgcacgttttatag 167  Q
    |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  27898811 gattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattattag 27898910  T
Q  168 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatga 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||     
T  27898911 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacggagtctaggagcattgtcacattgtcatgt 27899010  T
Q  268 ttaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
     ||  |||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  27899011 ctattatgctttgttgatgatgattgattatgtgat 27899046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 69 - 303
Target Start/End: Original strand, 43063428 - 43063663
Alignment:
Q  69 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat-attaggagctttgtcctccgcacgttttatag 167  Q
    |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  43063428 gattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattattag 43063527  T
Q  168 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatga 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||     
T  43063528 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacggagtctaggagcattgtcacattgtcatgt 43063627  T
Q  268 ttaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
     ||  |||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  43063628 ctattatgctttgttgatgatgattgattatgtgat 43063663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 69 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 49334526 - 49334291
Alignment:
Q  69 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat-attaggagctttgtcctccgcacgttttatag 167  Q
    |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  49334526 gattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattattag 49334427  T
Q  168 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatga 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||     
T  49334426 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacggagtctaggagcattgtcacattgtcatgt 49334327  T
Q  268 ttaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
     ||  |||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  49334326 ctattatgctttgttgatgatgattgattatgtgat 49334291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 69 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 44756059 - 44755831
Alignment:
Q  69 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat-attaggagctttgtcctccgcacgttttatag 167  Q
    |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  44756059 gattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattattag 44755960  T
Q  168 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatga 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||     
T  44755959 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacggagtctaggagcattgtcacattgtcatgt 44755860  T
Q  268 ttaagatgccttgttgataatgattgatt 296  Q
     ||  |||| |||||||| ||||||||||    
T  44755859 ctattatgctttgttgatgatgattgatt 44755831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 69 - 303
Target Start/End: Original strand, 18626436 - 18626671
Alignment:
Q  69 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat-attaggagctttgtcctccgcacgttttatag 167  Q
    |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  18626436 gattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattattag 18626535  T
Q  168 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatga 267  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||     
T  18626536 gagctttgtcctccgcatgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacggagtctaggagcattgtcacattgtcatgt 18626635  T
Q  268 ttaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
     ||  |||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  18626636 ctattatgctttgttgatgatgattgattatgtgat 18626671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 70 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 33385023 - 33384789
Alignment:
Q  70 attacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat-attaggagctttgtcctccgcacgttttatagg 168  Q
    ||||||||||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||  ||||    
T  33385023 attacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattattagg 33384924  T
Q  169 agctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgat 268  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||      
T  33384923 agctttatcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacggagtctaggagcattgtcacattgtcatgtc 33384824  T
Q  269 taagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    ||  |||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  33384823 tattatgctttgttgatgatgattgattatgtgat 33384789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 24 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 1010488 - 1010272
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  1010488 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 1010389  T
Q  115 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 214  Q
    ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1010388 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgac 1010294  T
Q  215 gattggtaccacatgcatataa 236  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  1010293 gattggtaccacatgcatataa 1010272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 24 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 52639306 - 52639090
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  52639306 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 52639207  T
Q  115 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 214  Q
    ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  52639206 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgac 52639112  T
Q  215 gattggtaccacatgcatataa 236  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  52639111 gattggtaccacatgcatataa 52639090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 24 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 21407120 - 21406881
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  21407120 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 21407021  T
Q  115 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 214  Q
    ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21407020 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgatt---aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 21406927  T
Q  215 gattggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||    
T  21406926 gattggtaccacatgcatat-aagtgtctaagttgcattgtcgcatt 21406881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 24 - 236
Target Start/End: Original strand, 16375798 - 16376015
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagc-atctcatt 113  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||| || |||||    
T  16375798 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagctatttcatt 16375897  T
Q  114 gagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga 213  Q
    |||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16375898 gagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatga 16375992  T
Q  214 cgattggtaccacatgcatataa 236  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  16375993 cgattggtaccacatgcatataa 16376015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 182 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 21844140 - 21844019
Alignment:
Q  182 gcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgt 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21844140 gcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgt 21844041  T
Q  282 tgataatgattgattacgtgat 303  Q
    ||||||||||||| || |||||    
T  21844040 tgataatgattgaatatgtgat 21844019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 38 - 260
Target Start/End: Original strand, 1925519 - 1925735
Alignment:
Q  38 ctccaaattattggatgcatgt-tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat 135  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||| ||||| | ||| ||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||      
T  1925519 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaaggtgtcttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccacga-- 1925614  T
Q  136 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 235  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  1925615 -ttaggagctttgtcctccgcacgatt---aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat- 1925709  T
Q  236 aagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    ||| |||||||  |||||||||||||    
T  1925710 aagtgtctaagttgcattgtcgcatt 1925735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 38 - 260
Target Start/End: Original strand, 20924533 - 20924749
Alignment:
Q  38 ctccaaattattggatgcatgt-tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat 135  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||| ||||| | ||| ||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||      
T  20924533 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaaggtgtcttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccacga-- 20924628  T
Q  136 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 235  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20924629 -ttaggagctttgtcctccgcacgatt---aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat- 20924723  T
Q  236 aagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    ||| |||||||  |||||||||||||    
T  20924724 aagtgtctaagttgcattgtcgcatt 20924749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 136 - 236
Target Start/End: Original strand, 41388478 - 41388576
Alignment:
Q  136 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41388478 attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 41388575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 38 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 20138083 - 20137869
Alignment:
Q  38 ctccaaattattggatgcatgt-tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat 135  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||| ||||| |||||||||||  || | |||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||| ||      
T  20138083 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttg-cctcaccatga-- 20137989  T
Q  136 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 235  Q
      ||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20137988 --taggagctttgtcctccacacgttt---aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat- 20137895  T
Q  236 aagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    ||| |||||||  |||||||||||||    
T  20137894 aagtgtctaagttgcattgtcgcatt 20137869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 136 - 237
Target Start/End: Original strand, 20229466 - 20229565
Alignment:
Q  136 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20229466 attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatatcaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 20229563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 137 - 260
Target Start/End: Original strand, 39244380 - 39244500
Alignment:
Q  137 ttaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa 236  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  39244380 ttaggagctttgtcctccgcacgatt---aggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat-a 39244475  T
Q  237 agagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    || |||||||  |||||||||||||    
T  39244476 agtgtctaagttgcattgtcgcatt 39244500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 137 - 260
Target Start/End: Original strand, 39247935 - 39248055
Alignment:
Q  137 ttaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa 236  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  39247935 ttaggagctttgtcctccgcacgatt---aggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat-a 39248030  T
Q  237 agagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    || |||||||  |||||||||||||    
T  39248031 agtgtctaagttgcattgtcgcatt 39248055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 138 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 33797163 - 33797068
Alignment:
Q  138 taggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33797163 taggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgaagattggtaccacatgcatataa 33797068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 38 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 19211867 - 19211654
Alignment:
Q  38 ctccaaattattggatgcatgt-tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat 135  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||| ||||| ||||||| ||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||| ||      
T  19211867 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaagatgtttcgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgagctatgtcctcaccatga-- 19211772  T
Q  136 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 235  Q
      | ||||||||||||||| ||||    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  19211771 --tcggagctttgtcctccacacg----ataggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatac-tatgatgacgattggtaccacatgcatat- 19211680  T
Q  236 aagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    ||| |||||||  |||||||||||||    
T  19211679 aagtgtctaagttgcattgtcgcatt 19211654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 21844247 - 21844140
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcatt 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||  || | ||||||||||||||| |||||    
T  21844247 gcatatgtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggcgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcatt 21844148  T
Q  114 gagcttag 121  Q
    ||||||||    
T  21844147 gagcttag 21844140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 165 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 46975371 - 46975276
Alignment:
Q  165 taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||    
T  46975371 taggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattcatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat-aagtgtctaagttgcattgtcgcatt 46975276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 38 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 12646870 - 12646657
Alignment:
Q  38 ctccaaattattggatgcatgt-tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat 135  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||| ||||| |||||||||||  | |  |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| |       
T  12646870 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaagatgttttgttgtt-taagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccatg--- 12646776  T
Q  136 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 235  Q
     || ||||||||||||||| ||||    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||     
T  12646775 -ttcggagctttgtcctccacacg----ataggagctttttcctccacacgattaaagtatattaatac-tatgatgacgattggaaccacatgcatat- 12646683  T
Q  236 aagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    ||| |||||||  |||||||||||||    
T  12646682 aagtgtctaagttgcattgtcgcatt 12646657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Original strand, 20216355 - 20216419
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20216355 tgattacgtgataactgtttagcatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 20216419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 25 - 164
Target Start/End: Original strand, 39244237 - 39244382
Alignment:
Q  25 tgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattga 115  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| |||||||    
T  39244237 tgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgataatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattga 39244336  T
Q  116 gcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgtttta 164  Q
    |||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39244337 gctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcctccgcacgtttta 39244382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 25 - 164
Target Start/End: Original strand, 39247792 - 39247937
Alignment:
Q  25 tgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattga 115  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| |||||||    
T  39247792 tgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgataatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattga 39247891  T
Q  116 gcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgtttta 164  Q
    |||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39247892 gctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcctccgcacgtttta 39247937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 18882273 - 18882177
Alignment:
Q  164 ataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||    
T  18882273 ataggagctttgtcctccgcacgatgaaagtgtattaatacttttgatgacgattggtactacatgcatat-aagtgtctaagttgcattgtcgcatt 18882177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 292 - 361
Target Start/End: Original strand, 51329108 - 51329177
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattttgatt 361  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  51329108 tgattacgtgataactgtttagcatttatgcaaagttaataatggaatgtttatgatgttaattatgatt 51329177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 292 - 361
Target Start/End: Original strand, 51335742 - 51335811
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattttgatt 361  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  51335742 tgattacgtgataactgtttagcatttatgcaaagttaataatggaatgtttatgatgttaattatgatt 51335811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Original strand, 44845312 - 44845376
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44845312 tgattacgtgacaactgtttagcatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 44845376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 167 - 260
Target Start/End: Original strand, 36819536 - 36819629
Alignment:
Q  167 ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||  |||||||||||||    
T  36819536 ggagctttgtcctccccacgattaaagtatattaatac-tatgatgacgattgataccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgcatt 36819629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 25 - 186
Target Start/End: Original strand, 41388337 - 41388501
Alignment:
Q  25 tgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattga 115  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| |||||||    
T  41388337 tgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgataatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattga 41388436  T
Q  116 gcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacg 186  Q
    |||| ||||||||||||    |||||||||||||| |||||||| |   ||||||||||||||||||||||    
T  41388437 gctttgtcctcaccacg---tttaggagctttgtcatccgcacgat---taggagctttgtcctccgcacg 41388501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 293 - 356
Target Start/End: Original strand, 41349280 - 41349343
Alignment:
Q  293 gattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41349280 gattacgtgataactgtttagcaattatgcaaagttaataatggaatgattatgttgttaattt 41349343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 33 - 186
Target Start/End: Original strand, 20229333 - 20229489
Alignment:
Q  33 tttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||         |||||||  || | |||||||| |||||| ||||||||||| |||    
T  20229333 tttagctccaaattattggatgcatgataatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcttagcatttcattgagctttgtc 20229432  T
Q  124 ctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacg 186  Q
    |||||||||    ||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||    
T  20229433 ctcaccacg---tttaggagctttgtcctccgcacgat---taggagctttgtcctccgcacg 20229489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 26 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 21437789 - 21437686
Alignment:
Q  26 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgca-tagcatctcattgagcttagtcc 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||| ||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  21437789 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacgatgatttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 21437692  T
Q  125 tcacca 130  Q
    ||||||    
T  21437691 tcacca 21437686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 43078096 - 43078034
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  43078096 tgattacgtgataactgtttagcatttatgcaaagttaataatggaatgat--tgatgttaattt 43078034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Original strand, 46157770 - 46157832
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  46157770 tgattacgtgataactgtttagcatttatgcaaagttaataatggaatgat--tgatgttaattt 46157832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 69 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 21313087 - 21312902
Alignment:
Q  69 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttatag 167  Q
    ||||| ||||||||||| ||| | |||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||| |     |||||||||||||  |||| ||    |    
T  21313087 gattaagatgttttgttgata-gagtccatgcattagcata-cattgagctttgtcctcaccacgattt----gagctttgtcctcaccacgatt----g 21312998  T
Q  168 gagctttgtcctccgcacgat---taaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    |||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||  |||||||||||||    
T  21312997 gagctttgtcctccccacgatgcttaaagtatattaatact-atgatgacgattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgcatt 21312902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 167 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 21172882 - 21172786
Alignment:
Q  167 ggagctttgtcctccgcacgat---taaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    ||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||  |||||||||||||    
T  21172882 ggagctttgtcctccccacgatgcttaaagtatattaatact-atgatgacgattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgcatt 21172786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 293 - 356
Target Start/End: Original strand, 41356717 - 41356780
Alignment:
Q  293 gattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  41356717 gattacgtgataactgtttagcaattatgcaaagttaataatggaatgattatgttattaattt 41356780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 167 - 236
Target Start/End: Original strand, 16080645 - 16080711
Alignment:
Q  167 ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa 236  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16080645 ggagctttgtcctcc-cacgat-aaagtatattaatact-atgatgacgattggtaccacatgcatataa 16080711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 38 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 46975468 - 46975350
Alignment:
Q  38 ctccaaattattggatgcatgt-tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat 135  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||||| ||||| |||||||||||  || | |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||      
T  46975468 ctccaaattattggatgtatatgtgataagttgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccacga-- 46975373  T
Q  136 attaggagctttgtcctccgcacg 159  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  46975372 -ttaggagctttgtcctccgcacg 46975350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Original strand, 16346203 - 16346267
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||    
T  16346203 tgattacgtgataactgtttagcaattatgcaaagttagaaatagaatgaatatgatgttaattt 16346267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Original strand, 16352852 - 16352916
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||    
T  16352852 tgattacgtgataactgtttagcaattatgcaaagttagaaatagaatgaatatgatgttaattt 16352916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 21828391 - 21828327
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||  ||| | ||||||||||||||||||||    
T  21828391 tgattacgtgataaccgtttagcaattatgcaatgttgttaaagaaatgattatgatgttaattt 21828327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 21843965 - 21843901
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||  ||| | ||||||||||||||||||||    
T  21843965 tgattacgtgataaccgtttagcaattatgcaatgttgttaaagaaatgattatgatgttaattt 21843901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 7)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 23 - 303
Target Start/End: Original strand, 105980 - 106260
Alignment:
Q  23 tatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagt 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  105980 tatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagt 106079  T
Q  123 cctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  106080 cctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggaa 106179  T
Q  223 ccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  106180 ctacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgcgttgttgataatgattgaataagtgat 106260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 23 - 303
Target Start/End: Original strand, 126215 - 126494
Alignment:
Q  23 tatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagt 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  126215 tatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagaccatgcatagcatctcattgagcttagt 126314  T
Q  123 cctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 222  Q
    ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  126315 ccttaccac-attattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 126413  T
Q  223 ccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  126414 ccgcatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgat 126494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 25 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 80305 - 80091
Alignment:
Q  25 tgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattga 115  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| |||||||    
T  80305 tgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgataatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattga 80206  T
Q  116 gcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacg 215  Q
    |||| ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  80205 gctttgtcctcaccacgt---ttaggagctttgtcctccgcacgatt---aggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacg 80112  T
Q  216 attggtaccacatgcatataa 236  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  80111 attggtaccacatgcatataa 80091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #4
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 24 - 260
Target Start/End: Original strand, 61951 - 62189
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttt---------tgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcatt 113  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||         |||| ||| | |||||||||| ||||| |||||    
T  61951 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgtcttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcatt 62048  T
Q  114 gagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga 213  Q
    |||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||| | ||   |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  62049 gagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcatgatt---aggagcattgtcctccgcacgattaaattatattaatacttatgatga 62142  T
Q  214 cgattggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||  |||||||||||||    
T  62143 cgattggtaccacatgcata-aaagtgtctaagttgcattgtcgcatt 62189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #5
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 24 - 260
Target Start/End: Original strand, 65867 - 66105
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttt---------tgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcatt 113  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||         |||| ||| | |||||||||| ||||| |||||    
T  65867 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgtcttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcatt 65964  T
Q  114 gagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga 213  Q
    |||||| ||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||| ||   |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  65965 gagctttgtcctcaccacaa---ttaggagctttgtcctccgcacgatt---aggagcattgtctcccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga 66058  T
Q  214 cgattggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||    
T  66059 cgattggtaccacatgcatat-aagtgtctaagttgcattgtcgcatt 66105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #6
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 292 - 353
Target Start/End: Original strand, 126548 - 126609
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaa 353  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  126548 tgattacgtgataactgtttagcaattatgcaaagttgttaaagaaatgattatgatgttaa 126609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #7
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 292 - 353
Target Start/End: Original strand, 106314 - 106375
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaa 353  Q
    |||| |||||||||||||||| || ||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  106314 tgatgacgtgataactgtttagcaattatgcaaagttgttaaagaaatgattatgatgttaa 106375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 9)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 21 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 67522 - 67241
Alignment:
Q  21 tatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagctta 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  67522 tatatgacgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgt-catatgtgtccatgcatagcatatcattgagctta 67424  T
Q  121 gtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  67423 gtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 67324  T
Q  221 taccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||    
T  67323 taccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgaatgaatatgtgat 67241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 26 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 57039 - 56704
Alignment:
Q  26 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataa-gtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcc 124  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  57039 gatgacgtttaactccaaattattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcc 56941  T
Q  125 tcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 224  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  56940 tcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcatgtttattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtacc 56841  T
Q  225 acatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgat--------tgattacgtgataactgtttaacat 316  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||| ||||||||| ||     
T  56840 acatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgattacgtgagaactgtttagcaa 56741  T
Q  317 ttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaa 353  Q
    ||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  56740 ttatgcaaagttgttaaagaaatgattatgatgttaa 56704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 26 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 41532 - 41197
Alignment:
Q  26 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtc-gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcc 124  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||| |||||||||  |  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41532 gatgacgtttaactccaaattattggatgcatgttgattaggatgattacg-tgttttgttgtttagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcc 41434  T
Q  125 tcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 224  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41433 tcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcatgtttattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtacc 41334  T
Q  225 acatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgat--------tgattacgtgataactgtttaacat 316  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||| ||||||||| ||     
T  41333 acatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgattacgtgagaactgtttagcaa 41234  T
Q  317 ttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaa 353  Q
    ||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  41233 ttatgcaaagttgttaaagaaatgattatgatgttaa 41197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 24 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 7001 - 6759
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 123  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  7001 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgatttgttcataagagtccatgcataacatttcattgagcttagtc 6902  T
Q  124 ctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 223  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6901 ctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttataggagccttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 6802  T
Q  224 cacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 266  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  6801 cacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattatcatg 6759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 24 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 13526 - 13284
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 123  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13526 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgatttgttcataagagtccatgcatagcatttcattgagcttagtc 13427  T
Q  124 ctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 223  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13426 ctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttataggagccttgtcctctgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 13327  T
Q  224 cacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 266  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  13326 cacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattatcatg 13284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 24 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 23054 - 22812
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 123  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||| |||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23054 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgatttgtccataagagtccatgcatagcatttcattgagcttagtc 22955  T
Q  124 ctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 223  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22954 ctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttataggagccttgtcctctgcacgattaaagtatattaatatttatgatgacgattggtac 22855  T
Q  224 cacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 266  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  22854 cacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattatcatg 22812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 24 - 236
Target Start/End: Original strand, 59060 - 59276
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||| | ||||||    
T  59060 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcttttcattg 59159  T
Q  115 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 214  Q
    ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  59160 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaaatatattaatacttatgatgac 59254  T
Q  215 gattggtaccacatgcatataa 236  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  59255 gattggtatcacatgcatataa 59276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #8
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 67186 - 67122
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  67186 tgattacatgataactgtttagcatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 67122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #9
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 132528 - 132483
Alignment:
Q  191 aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa 236  Q
    |||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||    
T  132528 aagtatattaatacttattacgttgattggtaccacatgcatataa 132483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 3)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 14 - 290
Target Start/End: Original strand, 59546 - 59822
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcatt 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  59546 gcataagtatatgatgaagtttaactccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttgttttgttcctatgtgtccatgcatagcatatcatt 59645  T
Q  114 gagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga 213  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  59646 gagctttgtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga 59745  T
Q  214 cgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatga 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  59746 cgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgtcttgttgatgatga 59822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 24 - 236
Target Start/End: Original strand, 67642 - 67858
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  67642 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 67741  T
Q  115 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 214  Q
    ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  67742 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgac 67836  T
Q  215 gattggtaccacatgcatataa 236  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  67837 gattggtaccacatgcatataa 67858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061; HSP #3
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Original strand, 59889 - 59953
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  59889 tgattacgtgataactgtttagcatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 59953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 2)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 14 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 139087 - 138811
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcatt 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  139087 gcataagtatatgatgaagtttaactccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttgttttgttcctatgtgtccatgcatagcatatcatt 138988  T
Q  114 gagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga 213  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  138987 gagctttgtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga 138888  T
Q  214 cgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatga 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  138887 cgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgtcttgttgatgatga 138811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 138744 - 138680
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  138744 tgattacgtgataactgtttagcatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 138680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 8)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 21 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 30541 - 30271
Alignment:
Q  21 tatatgatgaagtttagctccaaa-ttattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagctt 119  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30541 tatatgatgaagtttagctccaaaattattggatgcatgttgataagttgatcacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagctt 30442  T
Q  120 agtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattg 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30441 agtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattg 30342  T
Q  220 gtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatga 290  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30341 gtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccctgttgataatga 30271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 19 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 8076 - 7792
Alignment:
Q  19 ggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagct 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||    
T  8076 ggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagct 7977  T
Q  119 tagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgatt 218  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7976 tagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgatt 7877  T
Q  219 ggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  7876 ggtaccacatgcatataagaagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgat 7792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #3
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 22 - 266
Target Start/End: Original strand, 72991 - 73235
Alignment:
Q  22 atatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttag 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  72991 atatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttag 73090  T
Q  122 tcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggt 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  73091 tcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggt 73190  T
Q  222 accacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 266  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  73191 accacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 73235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #4
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 93 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 62207 - 62041
Alignment:
Q  93 gtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaa 191  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||   |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  62207 gtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccatga---ttaggagctttgtcctccacacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgattaa 62114  T
Q  192 agtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgcattgtca 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  62113 agtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat-aagtgtctaagttgcattgtcgcattgtca 62041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #5
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 30203 - 30139
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30203 tgattacgtgataactgtttagcatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 30139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #6
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 69 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 19156 - 18999
Alignment:
Q  69 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttatag 167  Q
    ||||| ||||||||||| ||| | |||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||| |     |||||||||||||  |||| ||    |    
T  19156 gattaagatgttttgttgata-gagtccatgcattagcata-cattgagctttgtcctcaccacgattt----gagctttgtcctcaccacgatt----g 19067  T
Q  168 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa 236  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19066 gagctttgtcctccccacgattaaagtatattaatac-tatgatgatgattggtaccacatgcatataa 18999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #7
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 69 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 12872 - 12689
Alignment:
Q  69 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttatag 167  Q
    ||||| ||||||||||| ||| | |||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||| |     |||||||||||||  |||| ||    |    
T  12872 gattaagatgttttgttgata-gagtccatgcattagcata-cattgagctttgtcctcaccacgattt----gagctttgtcctcaccacgatt----g 12783  T
Q  168 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa-agagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||  |||||||||||||    
T  12782 gagttttgtcctccccacgattaaagtatattaatac-tatgatgatgattggtaccacatgcatataagagtgtctaagttgcattgtcgcatt 12689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #8
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 7738 - 7674
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    |||||||| |||||||||||| || |||||||| |||  ||| | ||||||||||||||||||||    
T  7738 tgattacgcgataactgtttagcaattatgcaatgttgttaaagaaatgattatgatgttaattt 7674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 19 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 307113 - 306829
Alignment:
Q  19 ggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagct 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||    
T  307113 ggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagct 307014  T
Q  119 tagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgatt 218  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  307013 tagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgatt 306914  T
Q  219 ggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  306913 ggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgat 306829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 306775 - 306711
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||  ||||||||||| || |||||||| |||  ||| | ||||||||||||||||||||    
T  306775 tgattacgcaataactgtttagcaattatgcaatgttgttaaagaaatgattatgatgttaattt 306711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 3)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 14 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 38062 - 37772
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataa-gtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcat 112  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  38062 gcatatgtatatgataatgtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttctgttcataagtgtccatgcatagcatatcat 37964  T
Q  113 tgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcc-tccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgat 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37963 tgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtccctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgat 37864  T
Q  212 gacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  37863 gacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgat 37772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 109 - 260
Target Start/End: Original strand, 14548 - 14693
Alignment:
Q  109 tcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttat 208  Q
    ||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14548 tcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgatt---aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttat 14641  T
Q  209 gatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||    
T  14642 gatgacgattggtaccacatgcatat-aagtgtctaagttgcattgtcgcatt 14693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 293 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 37718 - 37655
Alignment:
Q  293 gattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37718 gattacgtgataactgtttagcaattatgcaaagttaataatggaatgattatgttgttaattt 37655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 2)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 14 - 303
Target Start/End: Original strand, 76750 - 77040
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataa-gtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcat 112  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  76750 gcatatgtatatgataatgtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttctgttcataagtgtccatgcatagcatatcat 76848  T
Q  113 tgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcc-tccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgat 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  76849 tgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtccctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgat 76948  T
Q  212 gacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  76949 gacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgat 77040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 293 - 356
Target Start/End: Original strand, 77094 - 77157
Alignment:
Q  293 gattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  77094 gattacgtgataactgtttagcaattatgcaaagttaataatggaatgattatgttgttaattt 77157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 5)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 14 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 56994 - 56705
Alignment:
Q  14 gcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataa-gtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcat 112  Q
    ||||| || |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  56994 gcatatgtttatgataaggtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttttgttcataagtgtccatgcatagcatatcat 56896  T
Q  113 tgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg 212  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56895 tgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg 56796  T
Q  213 acgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  56795 acgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatgattggttatgtgat 56705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 38 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 71069 - 70854
Alignment:
Q  38 ctccaaattattggatgcatgt-tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat 135  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||| ||||| | ||| ||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||      
T  71069 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaaggtgtcttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccatga-- 70974  T
Q  136 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 235  Q
     |||||||||||||||||||||||    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  70973 -ttaggagctttgtcctccgcacg----ataggagttttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat- 70880  T
Q  236 aagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    ||| |||||||  |||||||||||||    
T  70879 aagtgtctaagttgcattgtcgcatt 70854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 38 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 139712 - 139497
Alignment:
Q  38 ctccaaattattggatgcatgt-tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat 135  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||| ||||| |||||||||||  || | |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| |       
T  139712 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccatg--- 139618  T
Q  136 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 235  Q
     || |||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  139617 -tttggagctttgtcctccgcacgttt---aggtgctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat- 139523  T
Q  236 aagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    ||| |||||||  |||||||||||||    
T  139522 aagtgtctaagttgcattgtcgcatt 139497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #4
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 110 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 100998 - 100854
Alignment:
Q  110 cattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatg 209  Q
    |||||||||| |||||||||||||    | ||||||||||||||| ||||    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||     
T  100998 cattgagctttgtcctcaccacga----tcggagctttgtcctccacacg----ataggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatac-tatt 100908  T
Q  210 atgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgcattgtc 263  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  100907 atgatgattggtaccacatgcatat-aagtgtctaagttgcattgtcgcattgtc 100854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #5
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 292 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 56651 - 56589
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaat 354  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  56651 tgattacgtgataactgtttagcaattatgcaaagttagtaatggaatgaatatgatgttaat 56589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 9)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 26 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 26636 - 26358
Alignment:
Q  26 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttga-taagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcc 124  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |  || |||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26636 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgaatatgatgactacgatgttttgttcataagattccatgcatagcatctcattgagcttagtcc 26537  T
Q  125 tcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 224  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  26536 tcaccacgatttttaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatatttatgataacgattggtacc 26437  T
Q  225 acatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  26436 acatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgaatatgtgat 26358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 93 - 236
Target Start/End: Original strand, 38978 - 39116
Alignment:
Q  93 gtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaa 191  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  38978 gtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccatga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccacacgattaa 39071  T
Q  192 agtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39072 agtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa 39116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #3
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 135 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 43144 - 43015
Alignment:
Q  135 tattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgatt-aaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcat 232  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43144 tattaggagctttgtcctctgcacgatttattaggagctttgtcctccgaacgttttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcat 43045  T
Q  233 ataaagagtctaagagcattgtcgcattgt 262  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  43044 ataacgagtctaagagcattgtcacattgt 43015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #4
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 109 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 6890 - 6770
Alignment:
Q  109 tcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttat 208  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||    ||||||||||||||||| ||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6890 tcattgagctttgtcctcaccatga----taggagctttgtcctccacacgtttca---gagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttat 6798  T
Q  209 gatgacgattggtaccacatgcatataa 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6797 gatgacgattggtaccacatgcatataa 6770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #5
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 93 - 263
Target Start/End: Original strand, 11461 - 11626
Alignment:
Q  93 gtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaa 191  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||   |||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||| ||||||||| ||||||    
T  11461 gtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccatga---ttaggagctttgtcctccacacgtttta--ggagttttatcctccgcaggattaa 11554  T
Q  192 agtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgcattgtc 263  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  11555 agtatattaatacttatgatgatgattggtaccacatgcatat-aagtgtctaagttgcattgtcgcattgtc 11626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #6
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 138 - 260
Target Start/End: Original strand, 36451 - 36570
Alignment:
Q  138 taggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaa 237  Q
    |||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  36451 taggagctttgtcctctgcacgttt---aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat-aa 36546  T
Q  238 gagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    | |||||||  |||||||||||||    
T  36547 gtgtctaagttgcattgtcgcatt 36570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #7
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 24 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 43311 - 43145
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgca-tagcatctcattgagcttagt 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||| ||  ||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  43311 atgatgacgtttagctccaaattattggaagcatgttgatatgttgatcacggtg-attgttcataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagt 43214  T
Q  123 cctcaccacga-atattaggagctttgtcctccgcacgtttta-taggagctttgtcctccgcacgatt 189  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  43213 cctcaccacgatttattaggagctttgtcctctgcacgatttattaggagctttgtcctctgcacgatt 43145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #8
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 159
Target Start/End: Original strand, 36330 - 36449
Alignment:
Q  38 ctccaaattattggatgcatgt-tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat 135  Q
    ||||||||||||||||| ||   ||||| || ||||||| || |||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||       
T  36330 ctccaaattattggatgtataagtgatatgttgattacggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccacgt-- 36426  T
Q  136 attaggagctttgtcctccgcacg 159  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  36427 -ttaggagctttgtcctccgcacg 36449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #9
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 135 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 43172 - 43117
Alignment:
Q  135 tattaggagctttgtcctccgcacgtttta-taggagctttgtcctccgcacgatt 189  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  43172 tattaggagctttgtcctctgcacgatttattaggagctttgtcctctgcacgatt 43117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 24 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 12441 - 12199
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 123  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12441 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgatttgttcataagagtccatgcatagcatttcattgagcttagtc 12342  T
Q  124 ctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 223  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12341 ctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 12242  T
Q  224 cacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 266  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12241 cacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 12199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 24 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 78211 - 77969
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 123  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  78211 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgatttgttcataagagtccatgcatagcatttcattgagcttagtc 78112  T
Q  124 ctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 223  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  78111 ctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 78012  T
Q  224 cacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 266  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  78011 cacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 77969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 26 - 159
Target Start/End: Original strand, 60878 - 61006
Alignment:
Q  26 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgca-tagcatctcattgagcttagtcc 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  60878 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacgatgttttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 60975  T
Q  125 tcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacg 159  Q
    |||||| ||    ||||||||||||||||||||||    
T  60976 tcaccatga----taggagctttgtcctccgcacg 61006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 2)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 69 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 38648 - 38427
Alignment:
Q  69 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttatagg 168  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38648 gattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttatagg 38549  T
Q  169 agctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgat 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  38548 agctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgat 38449  T
Q  269 taagatgccttgttgataatga 290  Q
    |||||||||  |||||||||||    
T  38448 taagatgccccgttgataatga 38427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 38359 - 38295
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38359 tgattacgtgataactgtttagcatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 38295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0055 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 2)
Name: scaffold0055
Description:

Target: scaffold0055; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 69 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 25314 - 25093
Alignment:
Q  69 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttatagg 168  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25314 gattatgatgttttgttcatctgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttatagg 25215  T
Q  169 agctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgat 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  25214 agctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgat 25115  T
Q  269 taagatgccttgttgataatga 290  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  25114 taagatgccttgttgataatga 25093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0055; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 25026 - 24964
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  25026 tgattacgtgataactgtttagcatttatgcaaagttaataatggaatgat--tgatgttaattt 24964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0572 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0572
Description:

Target: scaffold0572; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 24 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 9849 - 9607
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 123  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  9849 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgatttgttcataagagtccatgcataacatttcattgagcttagtc 9750  T
Q  124 ctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 223  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9749 ctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttataggagctttgtcctccgcacaattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 9650  T
Q  224 cacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9649 cacatgcatataaagagtctaagagcattgtcacattgtcatg 9607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 24 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 73991 - 73749
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 123  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  73991 atgatgacgtttagctccaaattgttggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 73892  T
Q  124 ctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 223  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  73891 ctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 73792  T
Q  224 cacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 266  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  73791 cacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 73749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 167 - 260
Target Start/End: Original strand, 228598 - 228691
Alignment:
Q  167 ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||  |||||||||||||    
T  228598 ggagctttgtcctctacacgattaaagtatattaatac-tatgatgacgattggtaccacatgcataaagagtgtctaagttgcattgtcgcatt 228691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 26 - 303
Target Start/End: Original strand, 19688 - 19967
Alignment:
Q  26 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttga-taagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcc 124  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19688 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgaatacgatgattacggtgttgtgttgatatgagtccatgcatagcatttcattgagcttagtcc 19787  T
Q  125 tcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 223  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19788 tcaccacgattattaggagctttatcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 19887  T
Q  224 cacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  19888 cacatgcatataaggagtctaaaagcattgtcgcattgtcatgtctaagatgctttgttgataatgattgaatatgtgat 19967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0744 (Bit Score: 179; Significance: 2e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0744
Description:

Target: scaffold0744; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 24 - 266
Target Start/End: Original strand, 3782 - 4024
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 123  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3782 atgatgacgtttagctccaaattgttggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatttcattgagcttagtc 3881  T
Q  124 ctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 223  Q
    ||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3882 ctcaccacatttattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgtacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 3981  T
Q  224 cacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 266  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  3982 cacatgcatataaagtgtctaagagcattgtcacattgtcatg 4024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 161; Significance: 9e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 24 - 266
Target Start/End: Original strand, 8963 - 9206
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagt 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||| || ||||||| || |||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  8963 atgatgacgtttagctccaaattattggatgctcattgatatgttgattacggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagt 9061  T
Q  123 cctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggt 221  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9062 cctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggt 9161  T
Q  222 accacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 266  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9162 accacatgcatataaggagtctaagagcattgttgcattgtcatg 9206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 155; Significance: 4e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 72 - 303
Target Start/End: Original strand, 32473 - 32696
Alignment:
Q  72 tacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagc 171  Q
    ||||||||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32473 tacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagttttgtcctccgcacgttttataggagc 32572  T
Q  172 tttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaa 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||        ||||||||||||||||    
T  32573 tttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacggagtctagga--------gcattgtcatgattaa 32664  T
Q  272 gatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    |||||||||||| |||||||||| || |||||    
T  32665 gatgccttgttgttaatgattgaatatgtgat 32696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 155; Significance: 4e-82; HSPs: 4)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 26 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 9332 - 9092
Alignment:
Q  26 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcc 124  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| ||||| | |||||| |  ||||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  9332 gatgacgtttagatccaaattattagatgcttattgatatgatgattacgatgttttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 9235  T
Q  125 tcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 223  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9234 tcaccacgattaataggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 9135  T
Q  224 cacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9134 cacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 9092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 178 - 260
Target Start/End: Original strand, 73818 - 73900
Alignment:
Q  178 ctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||    
T  73818 ctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat-aagtgtctaagttgcattgtcgcatt 73900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 167 - 260
Target Start/End: Original strand, 2899 - 2992
Alignment:
Q  167 ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||  |||||||||||||    
T  2899 ggagctttgtcctccccacgattaaagtatattaata-ttatgatgacgattgataccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgcatt 2992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 260
Target Start/End: Original strand, 81468 - 81544
Alignment:
Q  183 cacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||    
T  81468 cacgattaaagtatattaatact-atgatgaagattggtaccacatgcatat-aagtgtctaagttgcattgtcgcatt 81544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 24 - 266
Target Start/End: Original strand, 15101 - 15345
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagt 122  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| | || |||||||||| | || ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  15101 atgatgatgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgttgattatggtgatttgttcataagagttcatgcattagcat-tcattgagcttagt 15199  T
Q  123 cctcaccacgaat-attaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 220  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15200 cctcaccacgatttattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 15299  T
Q  221 taccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 266  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15300 taccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 15345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 26 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 242052 - 241807
Alignment:
Q  26 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcc 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  242052 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacgatgttttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 241955  T
Q  125 tcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 224  Q
    |||||| ||    |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  241954 tcaccatga----taggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 241859  T
Q  225 acatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgc 276  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  241858 acatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcgtgtctaagatgc 241807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 38 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 23216 - 23003
Alignment:
Q  38 ctccaaattattggatgcatgt-tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat 135  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||| ||||| | ||||||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||      
T  23216 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaaggtgttttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccatga-- 23121  T
Q  136 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 235  Q
      | ||||||||||||||| ||||     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||     
T  23120 --tcggagctttgtcctccacacg----gtaggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaattc-tatgatgacgattggcaccacatgcatat- 23029  T
Q  236 aagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    ||| |||||||  |||||||||||||    
T  23028 aagtgtctaagttgcattgtcgcatt 23003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525 (Bit Score: 141; Significance: 8e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0525
Description:

Target: scaffold0525; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 24 - 260
Target Start/End: Original strand, 4214 - 4450
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttga-taagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagt 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4214 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgaatacgatgattacggtgttttgttgataagagtccatgcatagcatatcattgagcttagt 4313  T
Q  123 cctcaccacgaatatt-aggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggt 221  Q
    ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4314 cctcaccacgattttttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggt 4411  T
Q  222 accacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||    
T  4412 accacatgcatat-aagtgtctaagttgcattgtcgcatt 4450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 140; Significance: 3e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 69 - 303
Target Start/End: Original strand, 4230 - 4465
Alignment:
Q  69 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat-attaggagctttgtcctccgcacgttttatag 167  Q
    |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  4230 gattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattattag 4329  T
Q  168 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatga 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||     
T  4330 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacggagtctaggagcattgtcacattgtcatgt 4429  T
Q  268 ttaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
     ||  |||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  4430 ctattatgctttgttgatgatgattgattatgtgat 4465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0233 (Bit Score: 138; Significance: 5e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0233
Description:

Target: scaffold0233; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 26 - 291
Target Start/End: Original strand, 14651 - 14912
Alignment:
Q  26 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcc 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |  ||||||| || |||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  14651 gatgacgtttagctccaaattattggatgcacattgatatgatgattacggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 14749  T
Q  125 tcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 224  Q
    | |||||||    ||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14750 ttaccacga----taggagctttgtcatccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 14845  T
Q  225 acatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgataatgat 291  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||| |||||    
T  14846 acatgcatataagaagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaagatgctatgttgatgatgat 14912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 26 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 10169 - 9918
Alignment:
Q  26 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcc 124  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||| ||  ||||| ||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||||     
T  10169 gatgacgtttatctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacggtgaattgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtct 10071  T
Q  125 tcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 223  Q
    |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10070 tcacgacgattattacgagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 9971  T
Q  224 cacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgc 276  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||    
T  9970 cacatgcatataaggagtctaagagcattttcgcattgtcgtgtctaagatgc 9918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0553 (Bit Score: 136; Significance: 8e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0553
Description:

Target: scaffold0553; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 69 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 8743 - 8508
Alignment:
Q  69 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat-attaggagctttgtcctccgcacgttttatag 167  Q
    |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  8743 gattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattattag 8644  T
Q  168 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatga 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||     
T  8643 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtacctcatgcatatacggagtctaggagcattgtcacattgtcatgt 8544  T
Q  268 ttaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
     ||  |||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  8543 ctattatgctttgttgatgatgattgattatgtgat 8508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0242 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 3)
Name: scaffold0242
Description:

Target: scaffold0242; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 26 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 19570 - 19325
Alignment:
Q  26 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcc 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  19570 gatgatgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacgatgttttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 19473  T
Q  125 tcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 224  Q
    |||||| ||    |||||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19472 tcaccatga----taggagctttgtcctccgcacgattattaggagcattgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgatgattggtacc 19377  T
Q  225 acatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgc 276  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||    
T  19376 acatgcatataaggagtctaagagcattgtctcattgtcgtgtctaagatgc 19325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0242; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 114 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 25634 - 25472
Alignment:
Q  114 gagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga 213  Q
    |||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25634 gagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatga 25535  T
Q  214 cgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgc 276  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||    
T  25534 tgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtctcattgtcgtgtctaagatgc 25472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0242; HSP #3
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 26 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 25744 - 25585
Alignment:
Q  26 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcc 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  25744 gatgatgtttagctccaaattattggatgcattttgatatgatgattacgatgttttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 25647  T
Q  125 tcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgatta 190  Q
    |||||| ||    |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  25646 tcaccatga----taggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgatta 25585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 69 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 22158 - 21923
Alignment:
Q  69 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat-attaggagctttgtcctccgcacgttttatag 167  Q
    |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  22158 gattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattattag 22059  T
Q  168 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatga 267  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||     
T  22058 gagctttgtcctccgcacgactaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatatggagtctaggagcattgtcacattgtcatgt 21959  T
Q  268 ttaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
     ||  ||||  ||||||| ||||||||||| |||||    
T  21958 ctattatgctatgttgatgatgattgattatgtgat 21923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0372 (Bit Score: 121; Significance: 7e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0372
Description:

Target: scaffold0372; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 24 - 236
Target Start/End: Original strand, 5440 - 5656
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  5440 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 5539  T
Q  115 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 214  Q
    ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5540 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgac 5634  T
Q  215 gattggtaccacatgcatataa 236  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  5635 gattggtaccacatgcatataa 5656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 121; Significance: 7e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 24 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 12187 - 11971
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  12187 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 12088  T
Q  115 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 214  Q
    ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12087 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgac 11993  T
Q  215 gattggtaccacatgcatataa 236  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  11992 gattggtaccacatgcatataa 11971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 24 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 215 - 1
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  215 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 116  T
Q  115 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 214  Q
    ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  115 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgac 21  T
Q  215 gattggtaccacatgcatat 234  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  20 gattggtaccacatgcatat 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 26 - 276
Target Start/End: Original strand, 25087 - 25332
Alignment:
Q  26 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcc 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |  |||||| |||||||||| ||| | |||||||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  25087 gatgacgtttagctccaaattattggatgcacattgatatgatgattacaatgttttgttgata-gagtccatgcattagcgt-tcattgagcttagtcc 25184  T
Q  125 tcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 224  Q
    |||||| ||    ||| ||||||||||||| |||| ||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25185 tcaccatga----tagaagctttgtcctccacacgattattaggagatttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgaagacgattggtacc 25280  T
Q  225 acatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgc 276  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  25281 acatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcgtgtctaagatgc 25332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 110; Significance: 3e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 117 - 266
Target Start/End: Original strand, 1 - 150
Alignment:
Q  117 cttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacga 216  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1 cttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacga 100  T
Q  217 ttggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 266  Q
    |||||||||||||||||||| |||   |||||||||||| ||||||||||    
T  101 ttggtaccacatgcatataaggagataaagagcattgtcacattgtcatg 150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 159
Target Start/End: Original strand, 25 - 70
Alignment:
Q  114 gagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacg 159  Q
    |||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25 gagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacg 70  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0229 (Bit Score: 108; Significance: 4e-54; HSPs: 3)
Name: scaffold0229
Description:

Target: scaffold0229; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 165 - 303
Target Start/End: Original strand, 11988 - 12127
Alignment:
Q  165 taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaa-gagcattgtcgcattgtc 263  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| || ||||    
T  11988 taggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaaggagcattgtcacagtgtc 12087  T
Q  264 atgattaagatgccttgttgataatgattgattacgtgat 303  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  12088 atgattaagatgccttgttgatgatgattgattatgtgat 12127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0229; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Original strand, 12181 - 12245
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  12181 tgattacgtgataactgtttagcaattatgcaaagttagtaatggaatgaatatgatgttaattt 12245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0229; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 162
Target Start/End: Original strand, 11891 - 12012
Alignment:
Q  38 ctccaaattattggatgcatgt-tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat 135  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||| ||||| | ||| ||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||      
T  11891 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaaggtgtcttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccacga-- 11986  T
Q  136 attaggagctttgtcctccgcacgttt 162  Q
     ||||||||||||||||||||||||||    
T  11987 -ttaggagctttgtcctccgcacgttt 12012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 38 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 9904 - 9684
Alignment:
Q  38 ctccaaattattggatgcatgt-tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat 135  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||| ||||| |||||||||||  || | |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||      
T  9904 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccatga-- 9809  T
Q  136 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 235  Q
     ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  9808 -ttaggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat- 9714  T
Q  236 aagagtctaag-agcattgtcgcattgtca 264  Q
    ||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  9713 aagtgtctaagttgcattgtcgcattgtca 9684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 101; Significance: 6e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 93 - 264
Target Start/End: Original strand, 16823 - 16989
Alignment:
Q  93 gtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaa 191  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  16823 gtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagttttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgattaa 16916  T
Q  192 agtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgcattgtca 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  16917 agtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat-aagtgtctaagttgcattgtcgcattgtca 16989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 38 - 236
Target Start/End: Original strand, 33050 - 33243
Alignment:
Q  38 ctccaaattattggatgcatgt-tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat 135  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||| ||||| | ||| ||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||      
T  33050 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaaggtgtcttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccacga-- 33145  T
Q  136 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 235  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33146 -ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 33242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 99; Significance: 9e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 38 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 9421 - 9206
Alignment:
Q  38 ctccaaattattggatgcatgt-tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat 135  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||||| ||||| |||||||||||  || | |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||      
T  9421 ctccaaattattggatgtatatgtgataagttgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccatga-- 9326  T
Q  136 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 235  Q
      |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  9325 --taggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat- 9232  T
Q  236 aagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    ||| |||||||  |||||||||||||    
T  9231 aagtgtctaagttgcattgtcgcatt 9206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371 (Bit Score: 98; Significance: 4e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0371
Description:

Target: scaffold0371; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 60 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 15315 - 15117
Alignment:
Q  60 tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcac 158  Q
    |||||||| ||||| | |||||||||  || | |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||    
T  15315 tgataagttgattaaggtgttttgttgtta-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccatga---ttaggagctttgtcctccgcac 15221  T
Q  159 gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgc 257  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||    
T  15220 gtttta--ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatgttaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat-aagtgtctaagttgcattgtcgc 15124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 93 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 9282 - 9118
Alignment:
Q  93 gtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaa 191  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||    
T  9282 gtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtcctccgcacgatgaa 9190  T
Q  192 agtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgcattgtc 263  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  9189 agtattttaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat-aagagtctaagttgcattgtcgcattgtc 9118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 94; Significance: 9e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 93 - 260
Target Start/End: Original strand, 36531 - 36692
Alignment:
Q  93 gtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaa 191  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  36531 gtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgatt---aggagctttgtcctccgcacgattaa 36623  T
Q  192 agtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||    
T  36624 agtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat-aagtgtctaagttgcattgtcgcatt 36692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 69 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 53524 - 53339
Alignment:
Q  69 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttatag 167  Q
    ||||| ||||||||||| ||| | |||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||| |     |||||||||||||  |||| ||    |    
T  53524 gattaagatgttttgttgata-gagtccatgcattagcata-cattgagctttgtcctcaccacgattt----gagctttgtcctcaccacgatt----g 53435  T
Q  168 gagctttgtcctccgcacgat---taaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    |||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||  |||||||||||||    
T  53434 gagctttgtcctccccacgatgcttaaagtatattaatact-atgatgacgattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgcatt 53339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 94; Significance: 9e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 38 - 260
Target Start/End: Original strand, 189767 - 189983
Alignment:
Q  38 ctccaaattattggatgcatgt-tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat 135  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||| ||||| | ||| ||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||      
T  189767 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaaggtgtcttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccacga-- 189862  T
Q  136 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 235  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  189863 -ttaggagctttgtcctccgcacgatt---aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat- 189957  T
Q  236 aagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    ||| |||||||  |||||||||||||    
T  189958 aagtgtctaagttgcattgtcgcatt 189983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 38 - 260
Target Start/End: Original strand, 25075 - 25290
Alignment:
Q  38 ctccaaattattggatgcatgt-tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat 135  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||| ||||| ||||||||||| ||| | |||||||||| |||||  |||||||||| || ||||||||||      
T  25075 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaagatgttttgttgata-gagtccatgcattagcata-cattgagctttgttctcaccacga-- 25170  T
Q  136 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 235  Q
      |||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25171 --taggagctttgtcctccgcacgatt---aggagctttgtcctcagcacgattaaagtatattaatac-tatgatgaagattggtaccacatgcatata 25264  T
Q  236 aagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    |   |||||||  |||||||||||||    
T  25265 agatgtctaagttgcattgtcgcatt 25290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 93; Significance: 4e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 38 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 36307 - 36090
Alignment:
Q  38 ctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaata 136  Q
    ||||||||||||||||| |   |||||||| ||||| |||||||||||  || | |||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||| ||| |        
T  36307 ctccaaattattggatgtaaagtgataagttgattaagatgttttgttgtta-gagtccatacattagcat-tcattgagctttgtcctcgccatg---- 36214  T
Q  137 ttaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  36213 ttaggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat-a 36118  T
Q  237 agagtctaag-agcattgtcgcattgtc 263  Q
    || |||||||  ||||||||||||||||    
T  36117 agtgtctaagttgcattgtcgcattgtc 36090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 93; Significance: 4e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 93 - 263
Target Start/End: Original strand, 77331 - 77495
Alignment:
Q  93 gtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaa 191  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||    
T  77331 gtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccatga---ttaggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtcctccgcacgatgaa 77423  T
Q  192 agtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgcattgtc 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  77424 agtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat-aagagtctaagttgcattgttgcattgtc 77495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 93; Significance: 4e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 93 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 1822 - 1658
Alignment:
Q  93 gtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaa 191  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||| ||    
T  1822 gtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccatga---ttaggagctttgtcctccgcacgttt---aggagccttgtcctccgcacgatgaa 1730  T
Q  192 agtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgcattgtc 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  1729 agtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat-aagagtctaagttgcattgtcgcattgtc 1658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0656 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0656
Description:

Target: scaffold0656; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 165 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 1213 - 1102
Alignment:
Q  165 taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtca 264  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  1213 taggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcg 1114  T
Q  265 tgattaagatgc 276  Q
    ||  ||||||||    
T  1113 tgtctaagatgc 1102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0299 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0299
Description:

Target: scaffold0299; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 38 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 6681 - 6490
Alignment:
Q  38 ctccaaattattggatgcatg-ttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat 135  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||| |||| ||||| |||||| |||| ||| | |||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||      
T  6681 ctccaaattattggatgtataattgaaaagttgattaagatgttctgttgata-gagtccatgcattagcata-cattgagctttgtcctcaccacga-- 6586  T
Q  136 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 235  Q
      |||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6585 --taggagctttgtcctccgcacgatt---aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacaattggtaccacatgcatata 6491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 93 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 8445 - 8283
Alignment:
Q  93 gtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaa 191  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||    
T  8445 gtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccatga---ttaggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtcctccgcacgatgaa 8353  T
Q  192 agtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgcattgt 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||    
T  8352 agtatattaatacttatgatgacgattgatagcacatgcatataa--agtctaagttgcattgtcgcattgt 8283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 136 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 15525 - 15403
Alignment:
Q  136 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  15525 attaggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattgatagcacatgcatata 15429  T
Q  236 aagagtctaag-agcattgtcgcattgt 262  Q
    |  ||||||||  |||||||||||||||    
T  15428 a--agtctaagttgcattgtcgcattgt 15403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 84; Significance: 8e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 171 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 14843 - 14752
Alignment:
Q  171 ctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgt 262  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14843 ctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgt 14752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 60 - 260
Target Start/End: Original strand, 20592 - 20785
Alignment:
Q  60 tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcac 158  Q
    |||||||| ||||| | ||| ||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||| ||   |||||||||||||||||| |||    
T  20592 tgataagttgattaaggtgtcttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcatcaccatga---ttaggagctttgtcctccacac 20686  T
Q  159 gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgc 257  Q
    | ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||    
T  20687 gatt---aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat-aagtgtctaagttgcattgtcgc 20782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0284 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0284
Description:

Target: scaffold0284; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 38 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 18355 - 18164
Alignment:
Q  38 ctccaaattattggatgcatgt-tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat 135  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||  ||||| |||||||||||  || | |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||      
T  18355 ctccaaattattggatgtattagtgataagctgattaagatgttttgttgcta-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccatga-- 18260  T
Q  136 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 235  Q
      |||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18259 --taggagctttgtcctccgcacgttt---agtagctttttcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 18165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 60 - 236
Target Start/End: Original strand, 6128 - 6297
Alignment:
Q  60 tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcac 158  Q
    |||||||| ||||| | |||||||||  || | |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||    ||||||||||||||||  ||     
T  6128 tgataagttgattaaggtgttttgttgtta-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccatga----taggagctttgtcctctacaa 6221  T
Q  159 gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa 236  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6222 gtttta--ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa 6297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 165 - 236
Target Start/End: Original strand, 8225 - 8296
Alignment:
Q  165 taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8225 taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa 8296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 81; Significance: 5e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 109 - 263
Target Start/End: Original strand, 6417 - 6564
Alignment:
Q  109 tcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttat 208  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||    ||||||||||||||||| ||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6417 tcattgagctttgtcctcaccatga----taggagctttgtcctccacacgtttca---gagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttat 6509  T
Q  209 gatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaaga-gcattgtcgcattgtc 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||  ||||||||||||||||    
T  6510 gatgacgattggtaccacatgcatataa-gtgtccaagttgcattgtcgcattgtc 6564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 93 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 1846 - 1681
Alignment:
Q  93 gtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaa 191  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||   |||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||| ||||||||| ||||||    
T  1846 gtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccatga---ttaggagctttgtcctccacacgtttta--ggagttttatcctccgcaggattaa 1753  T
Q  192 agtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgcattgtc 263  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  1752 agtatattaatacttatgatgatgattggtaccacatgcatat-aagtgtctaagttgcattgtcgcattgtc 1681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 79; Significance: 8e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 38 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 63855 - 63640
Alignment:
Q  38 ctccaaattattggatgcatgt-tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat 135  Q
    ||||||||||||||||| ||   ||||||||  |||| |||||||||||  || | |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||      
T  63855 ctccaaattattggatgtataaatgataagttcattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccatga-- 63760  T
Q  136 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 235  Q
      ||||||||||||||||||||| |||   ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  63759 --taggagctttgtcctccgcacattt---aggagctttttcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgatgattggtaccacatgcatat- 63666  T
Q  236 aagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    ||| |||||||  |||||||||||||    
T  63665 aagtgtctaagttgcattgtcgcatt 63640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1552 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold1552
Description:

Target: scaffold1552; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 60 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 346 - 150
Alignment:
Q  60 tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcac 158  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || | |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||    ||| ||||||||||||| |||    
T  346 tgataagtcgattaaggtgttttgttgtta-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccatga----tagtagctttgtcctccacac 253  T
Q  159 gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgc 257  Q
    ||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||    
T  252 gtttta--ggagctttgtcctccactcgattaaagtatattaatatttatgatgacgtttggtaccacatgcatat-aagtgtctaagttgcattgtcgc 156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 76; Significance: 5e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 136 - 260
Target Start/End: Original strand, 208073 - 208194
Alignment:
Q  136 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 235  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  208073 attaagagctttgtcctccgcgcgttt---aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat- 208168  T
Q  236 aagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    ||| |||||||  |||||||||||||    
T  208169 aagtgtctaagttgcattgtcgcatt 208194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 74; Significance: 8e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 113 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 29477 - 29337
Alignment:
Q  113 tgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg 212  Q
    ||||||| |||||||||||||    |||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29477 tgagctttgtcctcaccacga----taggagctttgtcctccgcacgatt---aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatac-tatgatg 29386  T
Q  213 acgattggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    | ||||||||||||||||||||||   |||||||  |||||||||||||    
T  29385 aagattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgcatt 29337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1852 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold1852
Description:

Target: scaffold1852; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 165 - 260
Target Start/End: Original strand, 2 - 97
Alignment:
Q  165 taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||    
T  2 taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat-aagtgtctaagttgcattgtcgcatt 97  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0486 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0486
Description:

Target: scaffold0486; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 165 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 9472 - 9377
Alignment:
Q  165 taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||    
T  9472 taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat-aagtgtctaagttgcattgtcgcatt 9377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0780 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0780
Description:

Target: scaffold0780; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 24 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 112 - 3
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgca-tagcatctcattgagcttagt 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  112 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgatttgttcataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagt 14  T
Q  123 cctcaccacga 133  Q
    |||||||||||    
T  13 cctcaccacga 3  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0200 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0200
Description:

Target: scaffold0200; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 165 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 11591 - 11495
Alignment:
Q  165 taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||  |||||||||||||    
T  11591 taggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgaagattggtaccacatgcataaagagtgtctaagttgcattgtcgcatt 11495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 64; Significance: 7e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 60 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 16654 - 16488
Alignment:
Q  60 tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcac 158  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||  || | |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| |    || ||||||||||||||| |||    
T  16654 tgataagttgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccatg----ttcggagctttgtcctccacac 16561  T
Q  159 gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa 236  Q
    |    ||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16560 g----ataggagctttttcctccacacgattacagtatattaatact-atgatgacgattggtaccacatgcatataa 16488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0405 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0405
Description:

Target: scaffold0405; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 164 - 236
Target Start/End: Original strand, 9889 - 9960
Alignment:
Q  164 ataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa 236  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9889 ataggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatac-tatgatgacgattggtaccacatgcatataa 9960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 12026 - 11962
Alignment:
Q  292 tgattacgtgataactgtttaacatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 356  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12026 tgattacgtgataactgtttagcatttatgcaaagttaataatggaatgattatgatgttaattt 11962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 167 - 260
Target Start/End: Original strand, 18859 - 18953
Alignment:
Q  167 ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa-agagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  |||||||||||||    
T  18859 ggagctttgtcctccccacgattaaagtatattaatac-tatgatgacgattggtaccacatgcatataagagtgtctaagttgcattgtcgcatt 18953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 165 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 30788 - 30725
Alignment:
Q  165 taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 228  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30788 taggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 30725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 38 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 30885 - 30767
Alignment:
Q  38 ctccaaattattggatgcatgt-tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat 135  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||||||||| | ||| ||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||  ||    
T  30885 ctccaaattattggatgtataagtgataagtcgattaaggtgtcttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccac--at 30790  T
Q  136 attaggagctttgtcctccgcacg 159  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  30789 -ttaggagctttgtcctccgcacg 30767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 25 - 186
Target Start/End: Original strand, 80871 - 81026
Alignment:
Q  25 tgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacga-tgttttgttcatatgtgtccatgca-tagcatctcattgagcttagt 122  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |  || ||||| ||||||||| ||| | ||||||||| |||||| ||||||||||| ||    
T  80871 tgatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgaatacgattgttttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgt 80968  T
Q  123 cctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacg 186  Q
    |||||||| |   |||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||    
T  80969 cctcaccatg---attaggagctttgtcctccgcacgat---taggagctttgtcctccgcacg 81026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0560 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0560
Description:

Target: scaffold0560; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 24 - 143
Target Start/End: Original strand, 5907 - 6026
Alignment:
Q  24 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgca-tagcatctcattgagcttagt 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||| || ||||||| || |||||| ||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  5907 atgatgacgtttagctccaaattattggatgctcattgatatgttgattacggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagt 6005  T
Q  123 cctcaccacgaatattaggag 143  Q
    ||||||||||| |||||||||    
T  6006 cctcaccacgattattaggag 6026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 38 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 173292 - 173093
Alignment:
Q  38 ctccaaattattggatgcatgt-tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat 135  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||| ||||| ||||||||||| ||| | |||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||| |    
T  173292 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaagatgttttgttgata-gagtccatgcattagcata-cattgagctttgtcctcaccacgatt 173195  T
Q  136 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 235  Q
         ||||| |||||||  ||||    || ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  173194 t----gagctatgtcctcaccacg----atcggagctttgtcctgcacacgattaaagtatattaatac-tatgatgacgattggtaccacatgcataaa 173104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0166 (Bit Score: 54; Significance: 7e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0166
Description:

Target: scaffold0166; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Original strand, 10283 - 10379
Alignment:
Q  164 ataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||   |||||||  |||||||||||||    
T  10283 ataggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatac-tatgatgaagattgataccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgcatt 10379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 54; Significance: 7e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 165 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 28947 - 28867
Alignment:
Q  165 taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaag 246  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||    
T  28947 taggagctttgtcctctgcacgattaaagtatattaatac-tatgatgaagattggtaccacatgcataaagagtgtctaag 28867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 38 - 233
Target Start/End: Original strand, 20122 - 20307
Alignment:
Q  38 ctccaaattattggatgcatgt-tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat 135  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||| ||||| ||||||||||| ||| | |||||||||| |||||  |||| ||||| ||||||||||||| |    
T  20122 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaagatgttttgttgata-gagtccatgcattagcata-cattaagctttgtcctcaccacgatt 20219  T
Q  136 attaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcata 233  Q
         |||||||||||||  ||||    || ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20220 t----gagctttgtcctcaccacg----atcggagctttgtcctca-cacgattaaagtatattaatact-atgatgacgattggtaccacatgcata 20307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 26 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 2804 - 2699
Alignment:
Q  26 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgca-tagcatctcattgagcttagtcc 124  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||| |  ||||||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  2804 gatgacgtttggctccaaattattggatgcatatcgatatgatgattacgatgttttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 2707  T
Q  125 tcaccacg 132  Q
    ||||||||    
T  2706 tcaccacg 2699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 205 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 2694 - 2651
Alignment:
Q  205 ttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagag 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2694 ttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagag 2651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 69 - 260
Target Start/End: Original strand, 66562 - 66747
Alignment:
Q  69 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttatag 167  Q
    ||||| ||||||||||| ||| | |||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||| |     |||||||||||||  |||| ||    |    
T  66562 gattaagatgttttgttgata-gagtccatgcattagcata-cattgagctttgtcctcaccacgattt----gagctttgtcctcaccacgatt----g 66651  T
Q  168 gagctttgtcctccgcacgat--ta-aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgcatt 260  Q
    |||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||  |||||||||||||    
T  66652 gagctttgtcctccccacgatgctataagtatattaatactt-tgatgacgattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgcatt 66747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0697 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0697
Description:

Target: scaffold0697; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 6610 - 6522
Alignment:
Q  26 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgca-tagcatctcattg 114  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||| |||||||| ||| | ||||||||| |||||| ||||||    
T  6610 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacgacgttttgttgata-gagtccatgcattagcatttcattg 6522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 203 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 38 - 5
Alignment:
Q  203 acttatgatgacgattggtaccacatgcatataa 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38 acttatgatgacgattggtaccacatgcatataa 5  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 236
Target Start/End: Original strand, 3397 - 3442
Alignment:
Q  191 aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa 236  Q
    |||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||    
T  3397 aagtatattaatacttattacgttgattggtaccacatgcatataa 3442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University