View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF15945_low_27 (Length: 289)

Name: NF15945_low_27
Description: NF15945
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF15945_low_27
NF15945_low_27
[»] chr3 (60 HSPs)
chr3 (11-289)||(12497799-12498077)
chr3 (11-289)||(14876800-14877078)
chr3 (11-289)||(17489401-17489679)
chr3 (11-289)||(9522270-9522548)
chr3 (11-289)||(16370964-16371242)
chr3 (11-289)||(16492482-16492760)
chr3 (11-288)||(16807228-16807505)
chr3 (11-288)||(16691711-16691988)
chr3 (23-289)||(10905773-10906039)
chr3 (11-289)||(15348546-15348824)
chr3 (11-289)||(15725234-15725512)
chr3 (23-289)||(10005163-10005429)
chr3 (23-289)||(13252253-13252519)
chr3 (23-289)||(48425010-48425276)
chr3 (23-289)||(15589693-15589959)
chr3 (23-289)||(16635336-16635602)
chr3 (23-289)||(43162660-43162926)
chr3 (11-288)||(15208442-15208719)
chr3 (11-289)||(15338820-15339098)
chr3 (11-289)||(15402811-15403089)
chr3 (11-289)||(16412583-16412861)
chr3 (23-289)||(20062355-20062621)
chr3 (11-289)||(5425231-5425508)
chr3 (11-289)||(53385319-53385597)
chr3 (18-289)||(26792700-26792971)
chr3 (11-289)||(6600298-6600576)
chr3 (11-288)||(16756887-16757164)
chr3 (38-288)||(15247725-15247975)
chr3 (29-288)||(15227228-15227487)
chr3 (38-288)||(13972411-13972661)
chr3 (12-288)||(47123506-47123782)
chr3 (11-288)||(14571409-14571686)
chr3 (12-288)||(10383531-10383807)
chr3 (29-288)||(13322943-13323202)
chr3 (29-288)||(18134637-18134896)
chr3 (47-289)||(15953258-15953500)
chr3 (77-288)||(12850570-12850781)
chr3 (150-289)||(15016045-15016184)
chr3 (26-288)||(16329950-16330212)
chr3 (11-289)||(10420335-10420613)
chr3 (38-288)||(14086261-14086511)
chr3 (11-212)||(11304140-11304341)
chr3 (29-288)||(12360833-12361092)
chr3 (47-288)||(8759373-8759614)
chr3 (47-288)||(13941621-13941862)
chr3 (47-288)||(41177119-41177360)
chr3 (26-288)||(11961325-11961587)
chr3 (11-153)||(31689049-31689191)
chr3 (11-155)||(31945033-31945177)
chr3 (47-212)||(16381294-16381459)
chr3 (170-288)||(8274701-8274819)
chr3 (11-225)||(44776808-44777022)
chr3 (148-285)||(16836804-16836941)
chr3 (170-288)||(6153141-6153259)
chr3 (170-288)||(16743005-16743123)
chr3 (8-64)||(320781-320836)
chr3 (170-288)||(13975347-13975465)
chr3 (170-288)||(15576470-15576588)
chr3 (186-288)||(21686681-21686783)
chr3 (11-72)||(12854365-12854426)
[»] chr2 (48 HSPs)
chr2 (11-289)||(24675052-24675330)
chr2 (11-289)||(22757065-22757343)
chr2 (11-289)||(21325868-21326146)
chr2 (11-282)||(24708091-24708362)
chr2 (11-289)||(23188571-23188849)
chr2 (11-289)||(23138600-23138878)
chr2 (11-289)||(23550390-23550668)
chr2 (11-261)||(27377101-27377351)
chr2 (35-289)||(23063664-23063918)
chr2 (23-289)||(16924835-16925101)
chr2 (23-289)||(16998575-16998841)
chr2 (11-289)||(44386171-44386449)
chr2 (23-289)||(16981727-16981993)
chr2 (23-289)||(17063292-17063558)
chr2 (17-289)||(21145632-21145904)
chr2 (23-289)||(9609711-9609977)
chr2 (11-289)||(22325458-22325736)
chr2 (11-289)||(24709596-24709874)
chr2 (23-289)||(27217591-27217857)
chr2 (11-289)||(24261933-24262211)
chr2 (11-289)||(24878597-24878875)
chr2 (11-289)||(27370832-27371110)
chr2 (23-289)||(10868425-10868691)
chr2 (23-289)||(17066953-17067216)
chr2 (11-288)||(23087013-23087290)
chr2 (26-289)||(30211519-30211782)
chr2 (113-286)||(24825887-24826060)
chr2 (12-288)||(31830222-31830498)
chr2 (38-288)||(27365682-27365932)
chr2 (11-188)||(41609047-41609224)
chr2 (31-289)||(45529100-45529352)
chr2 (26-288)||(11358477-11358739)
chr2 (12-288)||(20832549-20832825)
chr2 (29-288)||(23293539-23293798)
chr2 (12-288)||(1063315-1063591)
chr2 (49-288)||(24653946-24654185)
chr2 (11-288)||(23276339-23276616)
chr2 (26-104)||(24833360-24833438)
chr2 (47-288)||(27787340-27787581)
chr2 (47-212)||(24944966-24945131)
chr2 (11-55)||(45676685-45676729)
chr2 (47-212)||(12573952-12574117)
chr2 (11-54)||(23599834-23599877)
chr2 (170-288)||(22276001-22276119)
chr2 (188-234)||(25128387-25128433)
chr2 (32-72)||(17967577-17967617)
chr2 (186-234)||(23817750-23817798)
chr2 (186-234)||(28144701-28144749)
[»] chr5 (60 HSPs)
chr5 (11-289)||(23516405-23516683)
chr5 (11-289)||(23573606-23573884)
chr5 (11-289)||(23440089-23440367)
chr5 (11-289)||(18775641-18775919)
chr5 (11-285)||(21984553-21984827)
chr5 (11-289)||(22333131-22333409)
chr5 (11-289)||(25423053-25423331)
chr5 (46-289)||(20798659-20798902)
chr5 (25-289)||(26738949-26739213)
chr5 (11-289)||(14999983-15000261)
chr5 (11-289)||(23471093-23471371)
chr5 (11-289)||(19769824-19770102)
chr5 (11-289)||(27610218-27610496)
chr5 (23-289)||(40708656-40708922)
chr5 (11-289)||(27668734-27669012)
chr5 (11-289)||(27685644-27685922)
chr5 (23-289)||(34566370-34566636)
chr5 (11-289)||(41770706-41770984)
chr5 (23-289)||(16356378-16356644)
chr5 (11-289)||(22134532-22134810)
chr5 (11-289)||(27518271-27518549)
chr5 (11-289)||(29476317-29476595)
chr5 (11-289)||(37291740-37292018)
chr5 (11-288)||(20468341-20468618)
chr5 (23-225)||(21343666-21343868)
chr5 (36-289)||(22348314-22348565)
chr5 (11-252)||(20573385-20573626)
chr5 (90-289)||(21498280-21498479)
chr5 (48-288)||(21564211-21564451)
chr5 (38-288)||(23442538-23442788)
chr5 (29-288)||(21891004-21891263)
chr5 (12-288)||(25847922-25848198)
chr5 (11-273)||(21662300-21662561)
chr5 (12-288)||(14887236-14887512)
chr5 (29-288)||(24735856-24736115)
chr5 (29-288)||(24737030-24737289)
chr5 (29-288)||(24749799-24750058)
chr5 (11-289)||(28924012-28924290)
chr5 (12-285)||(37545744-37546018)
chr5 (29-289)||(22461816-22462076)
chr5 (26-288)||(24798642-24798904)
chr5 (11-289)||(28895186-28895464)
chr5 (12-288)||(20342129-20342405)
chr5 (26-234)||(21404715-21404923)
chr5 (8-288)||(22236165-22236445)
chr5 (47-273)||(21665761-21665986)
chr5 (26-288)||(22381060-22381322)
chr5 (26-288)||(22502540-22502802)
chr5 (26-288)||(23080334-23080596)
chr5 (11-289)||(20773606-20773884)
chr5 (29-289)||(20821317-20821577)
chr5 (47-288)||(17269578-17269819)
chr5 (170-288)||(11210939-11211057)
chr5 (223-289)||(21339530-21339596)
chr5 (11-99)||(21625382-21625470)
chr5 (170-288)||(27011089-27011207)
chr5 (170-288)||(21937433-21937551)
chr5 (170-288)||(24581216-24581334)
chr5 (190-287)||(25244598-25244695)
chr5 (190-287)||(25308750-25308847)
[»] chr8 (54 HSPs)
chr8 (11-289)||(21167042-21167320)
chr8 (11-289)||(30313649-30313927)
chr8 (11-289)||(19977965-19978243)
chr8 (11-288)||(15533378-15533655)
chr8 (11-289)||(21250940-21251218)
chr8 (11-289)||(16408550-16408828)
chr8 (11-289)||(22164696-22164974)
chr8 (11-288)||(32600142-32600419)
chr8 (11-289)||(21922240-21922518)
chr8 (11-289)||(22133546-22133824)
chr8 (11-289)||(21394370-21394648)
chr8 (11-289)||(21788863-21789141)
chr8 (11-289)||(22046372-22046649)
chr8 (11-289)||(22032030-22032308)
chr8 (11-289)||(23650039-23650317)
chr8 (11-289)||(17674528-17674806)
chr8 (23-289)||(19112700-19112966)
chr8 (11-252)||(15441179-15441420)
chr8 (11-289)||(20018255-20018533)
chr8 (11-289)||(19485375-19485653)
chr8 (11-289)||(22987199-22987477)
chr8 (11-286)||(23948887-23949162)
chr8 (11-289)||(22120679-22120957)
chr8 (26-289)||(20396630-20396893)
chr8 (47-288)||(20388133-20388374)
chr8 (11-288)||(21681976-21682253)
chr8 (29-288)||(20010406-20010665)
chr8 (158-289)||(22377958-22378089)
chr8 (158-289)||(22384133-22384264)
chr8 (12-288)||(6679110-6679386)
chr8 (12-285)||(804182-804455)
chr8 (11-288)||(23654925-23655202)
chr8 (29-289)||(1266255-1266515)
chr8 (29-288)||(19851427-19851686)
chr8 (29-288)||(19857463-19857722)
chr8 (11-288)||(22061939-22062216)
chr8 (11-285)||(16265127-16265401)
chr8 (12-285)||(14565141-14565414)
chr8 (29-289)||(21324914-21325175)
chr8 (29-289)||(20007866-20008126)
chr8 (11-258)||(21840415-21840662)
chr8 (12-288)||(6603657-6603933)
chr8 (12-288)||(28982356-28982632)
chr8 (12-288)||(28987576-28987852)
chr8 (29-288)||(31416980-31417239)
chr8 (12-223)||(27347225-27347436)
chr8 (26-289)||(29303931-29304194)
chr8 (47-288)||(31571348-31571589)
chr8 (26-288)||(12304771-12305033)
chr8 (170-288)||(20652839-20652957)
chr8 (170-286)||(21197010-21197126)
chr8 (170-288)||(22982593-22982711)
chr8 (168-285)||(22051018-22051135)
chr8 (11-43)||(22179309-22179341)
[»] scaffold0005 (4 HSPs)
scaffold0005 (13-289)||(278895-279171)
scaffold0005 (11-289)||(164774-165052)
scaffold0005 (11-289)||(308622-308900)
scaffold0005 (11-285)||(260271-260545)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (11-289)||(65369-65646)
scaffold0042 (11-219)||(39924-40132)
[»] chr4 (52 HSPs)
chr4 (11-283)||(16355253-16355525)
chr4 (11-289)||(16252247-16252525)
chr4 (11-289)||(12523608-12523886)
chr4 (11-289)||(7090365-7090642)
chr4 (44-289)||(15149808-15150053)
chr4 (11-289)||(14680499-14680777)
chr4 (11-289)||(18227248-18227526)
chr4 (11-289)||(14652240-14652518)
chr4 (11-288)||(14159424-14159701)
chr4 (11-289)||(14303780-14304057)
chr4 (23-289)||(18297149-18297415)
chr4 (11-289)||(19778595-19778873)
chr4 (23-289)||(23955691-23955957)
chr4 (23-289)||(8386356-8386622)
chr4 (23-289)||(12476544-12476810)
chr4 (11-289)||(14851168-14851446)
chr4 (11-289)||(27711268-27711546)
chr4 (11-289)||(14266701-14266979)
chr4 (23-289)||(29039206-29039472)
chr4 (11-289)||(40472972-40473250)
chr4 (23-276)||(15364330-15364583)
chr4 (11-289)||(8053425-8053703)
chr4 (11-199)||(14927151-14927339)
chr4 (29-289)||(15003426-15003686)
chr4 (12-288)||(3264857-3265133)
chr4 (12-288)||(11207294-11207570)
chr4 (29-288)||(16145862-16146121)
chr4 (12-288)||(29453600-29453876)
chr4 (26-288)||(15070360-15070622)
chr4 (11-98)||(18607823-18607910)
chr4 (26-288)||(33222865-33223127)
chr4 (29-225)||(1649403-1649599)
chr4 (11-257)||(15245856-15246102)
chr4 (26-288)||(20890930-20891191)
chr4 (26-288)||(44661929-44662191)
chr4 (179-289)||(15415088-15415198)
chr4 (47-212)||(42702871-42703036)
chr4 (47-212)||(51606320-51606485)
chr4 (66-208)||(18164332-18164474)
chr4 (216-289)||(16676505-16676578)
chr4 (140-288)||(15359153-15359301)
chr4 (29-104)||(15415226-15415301)
chr4 (186-288)||(12132472-12132574)
chr4 (170-288)||(13247736-13247854)
chr4 (148-213)||(9849616-9849681)
chr4 (172-288)||(55375421-55375537)
chr4 (223-289)||(1640227-1640293)
chr4 (170-288)||(14997407-14997525)
chr4 (151-285)||(16752665-16752799)
chr4 (11-43)||(15351934-15351966)
chr4 (170-288)||(16445275-16445393)
chr4 (29-82)||(15359326-15359379)
[»] chr6 (61 HSPs)
chr6 (11-289)||(19864483-19864761)
chr6 (13-289)||(12497824-12498100)
chr6 (13-289)||(12510801-12511077)
chr6 (11-289)||(21833188-21833466)
chr6 (11-288)||(25765498-25765774)
chr6 (13-289)||(12505153-12505429)
chr6 (11-289)||(16963574-16963852)
chr6 (11-289)||(16927847-16928125)
chr6 (11-289)||(27331640-27331918)
chr6 (11-289)||(27392380-27392658)
chr6 (11-289)||(22078895-22079173)
chr6 (11-289)||(25610068-25610346)
chr6 (11-285)||(18408154-18408428)
chr6 (11-288)||(5839427-5839704)
chr6 (11-289)||(23078265-23078543)
chr6 (11-289)||(16626924-16627202)
chr6 (11-289)||(28263404-28263682)
chr6 (11-289)||(28342153-28342431)
chr6 (17-289)||(1543291-1543563)
chr6 (11-289)||(24313375-24313653)
chr6 (11-289)||(25112348-25112626)
chr6 (23-289)||(29592127-29592393)
chr6 (11-289)||(2875010-2875288)
chr6 (11-289)||(27187232-27187510)
chr6 (11-289)||(27261730-27262008)
chr6 (11-235)||(17032358-17032582)
chr6 (11-287)||(22762664-22762940)
chr6 (11-289)||(28292579-28292857)
chr6 (11-288)||(25750605-25750882)
chr6 (26-288)||(21471412-21471674)
chr6 (11-146)||(22433793-22433928)
chr6 (37-289)||(18197754-18198006)
chr6 (47-288)||(25768023-25768264)
chr6 (38-289)||(14131386-14131637)
chr6 (26-288)||(10469057-10469319)
chr6 (11-288)||(22796840-22797117)
chr6 (29-289)||(15459150-15459410)
chr6 (29-288)||(19879112-19879371)
chr6 (65-288)||(34645794-34646017)
chr6 (38-288)||(21564340-21564590)
chr6 (26-288)||(24364223-24364485)
chr6 (29-288)||(18794504-18794763)
chr6 (29-201)||(8766443-8766615)
chr6 (169-288)||(25750900-25751019)
chr6 (40-288)||(11287806-11288054)
chr6 (221-289)||(11291818-11291886)
chr6 (94-288)||(17415365-17415559)
chr6 (47-288)||(27560825-27561066)
chr6 (40-288)||(11280713-11280961)
chr6 (158-288)||(1640715-1640845)
chr6 (29-104)||(1640613-1640688)
chr6 (29-95)||(18787702-18787768)
chr6 (170-288)||(16098005-16098123)
chr6 (170-288)||(25743295-25743413)
chr6 (122-288)||(14381675-14381841)
chr6 (170-288)||(16382581-16382699)
chr6 (186-288)||(18571622-18571724)
chr6 (170-288)||(18838116-18838234)
chr6 (186-288)||(1648992-1649094)
chr6 (170-288)||(23996203-23996321)
chr6 (140-289)||(18800867-18801016)
[»] scaffold1355 (1 HSPs)
scaffold1355 (11-289)||(639-917)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (11-289)||(64096-64374)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (11-289)||(5977-6255)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (11-289)||(33638-33916)
scaffold0109 (11-289)||(8559-8837)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (11-289)||(14323-14601)
scaffold0044 (11-289)||(583-861)
[»] chr7 (63 HSPs)
chr7 (11-289)||(15154723-15155001)
chr7 (11-285)||(17391-17665)
chr7 (11-289)||(11553173-11553451)
chr7 (11-289)||(11237284-11237562)
chr7 (11-289)||(12687422-12687700)
chr7 (11-289)||(14954541-14954819)
chr7 (23-289)||(8198561-8198827)
chr7 (11-289)||(8707526-8707804)
chr7 (11-289)||(10870916-10871194)
chr7 (11-289)||(14037728-14038006)
chr7 (11-289)||(14332318-14332596)
chr7 (11-289)||(14347758-14348036)
chr7 (11-289)||(15161128-15161406)
chr7 (11-289)||(23516840-23517118)
chr7 (11-289)||(15203800-15204078)
chr7 (11-289)||(18177663-18177941)
chr7 (11-289)||(18551829-18552107)
chr7 (23-289)||(44791422-44791688)
chr7 (11-289)||(13685984-13686263)
chr7 (77-288)||(15624539-15624750)
chr7 (29-289)||(12206849-12207109)
chr7 (29-288)||(19147151-19147410)
chr7 (29-288)||(20746550-20746809)
chr7 (11-289)||(15102650-15102928)
chr7 (29-288)||(8212178-8212437)
chr7 (11-288)||(14264294-14264571)
chr7 (12-288)||(11306313-11306589)
chr7 (12-288)||(49152224-49152500)
chr7 (29-288)||(16072344-16072603)
chr7 (29-288)||(11388478-11388736)
chr7 (26-289)||(21661900-21662160)
chr7 (29-288)||(13665493-13665747)
chr7 (47-288)||(16950521-16950762)
chr7 (194-289)||(35964921-35965016)
chr7 (11-72)||(12254326-12254387)
chr7 (26-199)||(13021294-13021467)
chr7 (47-288)||(14286426-14286667)
chr7 (47-288)||(18054003-18054244)
chr7 (47-288)||(23199793-23200034)
chr7 (47-288)||(23505920-23506161)
chr7 (8-288)||(6413430-6413710)
chr7 (11-206)||(14129795-14129990)
chr7 (11-206)||(14433613-14433808)
chr7 (26-288)||(12455640-12455901)
chr7 (47-212)||(26288162-26288327)
chr7 (47-212)||(1533-1698)
chr7 (47-162)||(15340454-15340569)
chr7 (243-289)||(11772312-11772358)
chr7 (186-288)||(14936443-14936545)
chr7 (26-104)||(26118818-26118896)
chr7 (133-288)||(26118655-26118810)
chr7 (170-288)||(7823980-7824098)
chr7 (170-288)||(12368648-12368766)
chr7 (186-288)||(15364036-15364138)
chr7 (170-288)||(27107846-27107964)
chr7 (179-288)||(41218-41327)
chr7 (29-138)||(15479338-15479447)
chr7 (170-288)||(4440008-4440126)
chr7 (170-288)||(21674605-21674723)
chr7 (186-288)||(45146652-45146753)
chr7 (186-214)||(13353247-13353275)
chr7 (11-43)||(13634038-13634070)
chr7 (185-285)||(20466877-20466977)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (11-288)||(127265-127542)
[»] scaffold0180 (1 HSPs)
scaffold0180 (11-289)||(32817-33095)
[»] chr1 (36 HSPs)
chr1 (11-289)||(17045149-17045427)
chr1 (11-289)||(20249797-20250075)
chr1 (11-289)||(50620378-50620656)
chr1 (11-289)||(19106314-19106592)
chr1 (11-289)||(20136725-20137003)
chr1 (11-246)||(16078810-16079045)
chr1 (11-289)||(16350733-16351011)
chr1 (11-289)||(21747482-21747759)
chr1 (11-289)||(19761000-19761278)
chr1 (11-289)||(33391163-33391441)
chr1 (11-289)||(21830250-21830528)
chr1 (11-289)||(51333627-51333905)
chr1 (11-289)||(21836897-21837175)
chr1 (34-289)||(16369267-16369522)
chr1 (11-237)||(50612602-50612828)
chr1 (11-289)||(41354603-41354881)
chr1 (11-165)||(21163227-21163381)
chr1 (29-288)||(19665011-19665270)
chr1 (47-288)||(20940198-20940439)
chr1 (12-288)||(37677027-37677304)
chr1 (26-288)||(31550316-31550578)
chr1 (29-288)||(19854279-19854538)
chr1 (29-289)||(20856895-20857155)
chr1 (26-288)||(20294374-20294636)
chr1 (26-288)||(20075194-20075456)
chr1 (11-212)||(22433327-22433528)
chr1 (12-222)||(20395194-20395404)
chr1 (148-288)||(11382678-11382818)
chr1 (47-288)||(20244183-20244424)
chr1 (143-288)||(41307904-41308049)
chr1 (11-104)||(24476927-24477020)
chr1 (77-183)||(20836131-20836237)
chr1 (170-288)||(20831527-20831645)
chr1 (170-232)||(22142232-22142294)
chr1 (170-288)||(46518827-46518945)
chr1 (170-288)||(20914316-20914434)
[»] scaffold0546 (1 HSPs)
scaffold0546 (11-289)||(4470-4748)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (11-289)||(27930-28208)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (11-289)||(180180-180458)
[»] scaffold0012 (3 HSPs)
scaffold0012 (11-289)||(219482-219760)
scaffold0012 (11-289)||(229006-229284)
scaffold0012 (170-288)||(33061-33179)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (11-289)||(888-1165)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (11-289)||(47-325)
[»] scaffold0120 (3 HSPs)
scaffold0120 (11-289)||(5986-6264)
scaffold0120 (47-288)||(1590-1831)
scaffold0120 (170-288)||(22816-22934)
[»] scaffold0001 (5 HSPs)
scaffold0001 (11-289)||(162076-162354)
scaffold0001 (11-288)||(448022-448299)
scaffold0001 (47-288)||(90998-91239)
scaffold0001 (170-288)||(78695-78813)
scaffold0001 (137-212)||(175352-175427)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (11-289)||(6335-6613)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (11-289)||(16950-17228)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (11-289)||(759-1036)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (11-289)||(9306-9584)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (11-286)||(14840-15115)
[»] scaffold0894 (1 HSPs)
scaffold0894 (11-285)||(1102-1376)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (11-289)||(5184-5462)
[»] scaffold0029 (3 HSPs)
scaffold0029 (17-288)||(109877-110148)
scaffold0029 (29-288)||(112540-112799)
scaffold0029 (11-289)||(96067-96345)
[»] scaffold0004 (5 HSPs)
scaffold0004 (11-289)||(111984-112262)
scaffold0004 (11-288)||(203534-203811)
scaffold0004 (12-288)||(117532-117808)
scaffold0004 (47-288)||(322703-322944)
scaffold0004 (26-288)||(385797-386059)
[»] scaffold0459 (1 HSPs)
scaffold0459 (11-289)||(377-655)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (11-289)||(968-1246)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (11-289)||(15144-15422)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (11-233)||(16920-17142)
[»] scaffold0028 (5 HSPs)
scaffold0028 (17-289)||(43123-43395)
scaffold0028 (11-289)||(8448-8726)
scaffold0028 (216-289)||(13834-13907)
scaffold0028 (38-273)||(50595-50830)
scaffold0028 (170-288)||(106639-106757)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (11-289)||(7340-7618)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (11-289)||(3995-4273)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (11-289)||(15456-15733)
scaffold0333 (225-289)||(15832-15896)
[»] scaffold0106 (2 HSPs)
scaffold0106 (11-289)||(14002-14280)
scaffold0106 (11-285)||(31373-31647)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (11-289)||(16530-16808)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (23-289)||(3115-3381)
[»] scaffold0877 (1 HSPs)
scaffold0877 (24-279)||(335-590)
[»] scaffold0011 (5 HSPs)
scaffold0011 (23-289)||(26598-26864)
scaffold0011 (29-227)||(148551-148749)
scaffold0011 (11-212)||(68582-68783)
scaffold0011 (11-288)||(195769-196045)
scaffold0011 (170-288)||(122016-122134)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (11-289)||(6900-7180)
[»] scaffold0037 (3 HSPs)
scaffold0037 (26-289)||(116970-117233)
scaffold0037 (170-288)||(98137-98255)
scaffold0037 (170-234)||(23586-23650)
[»] scaffold0739 (1 HSPs)
scaffold0739 (47-289)||(1-243)
[»] scaffold0081 (1 HSPs)
scaffold0081 (61-289)||(49506-49734)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (26-289)||(886-1149)
[»] scaffold0379 (1 HSPs)
scaffold0379 (11-289)||(13042-13320)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (11-289)||(16481-16759)
[»] scaffold0284 (1 HSPs)
scaffold0284 (113-289)||(21932-22108)
[»] scaffold0091 (1 HSPs)
scaffold0091 (113-288)||(7855-8030)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (26-289)||(25784-26047)
[»] scaffold0730 (1 HSPs)
scaffold0730 (26-289)||(5656-5918)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (26-288)||(25137-25399)
[»] scaffold0507 (3 HSPs)
scaffold0507 (125-289)||(9047-9211)
scaffold0507 (11-104)||(6940-7033)
scaffold0507 (170-288)||(399-517)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (29-289)||(10804-11064)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (26-289)||(86569-86832)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (38-288)||(26132-26382)
[»] scaffold0064 (2 HSPs)
scaffold0064 (47-288)||(28835-29076)
scaffold0064 (47-288)||(40826-41067)
[»] scaffold0600 (1 HSPs)
scaffold0600 (47-288)||(3874-4115)
[»] scaffold0023 (4 HSPs)
scaffold0023 (62-212)||(4567-4717)
scaffold0023 (11-126)||(36974-37089)
scaffold0023 (47-99)||(18993-19045)
scaffold0023 (248-289)||(4519-4560)
[»] scaffold0058 (4 HSPs)
scaffold0058 (92-289)||(58471-58668)
scaffold0058 (48-288)||(19120-19360)
scaffold0058 (26-84)||(59042-59100)
scaffold0058 (186-288)||(74038-74140)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (29-288)||(79-338)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (38-288)||(7102-7352)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (11-289)||(13966-14244)
scaffold0034 (83-288)||(5019-5224)
[»] scaffold0326 (2 HSPs)
scaffold0326 (11-288)||(18603-18880)
scaffold0326 (11-72)||(3637-3698)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (47-288)||(47123-47364)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (173-286)||(7522-7635)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (47-288)||(51929-52170)
[»] scaffold0298 (3 HSPs)
scaffold0298 (38-289)||(19973-20224)
scaffold0298 (11-288)||(13427-13704)
scaffold0298 (11-212)||(17273-17474)
[»] scaffold0165 (2 HSPs)
scaffold0165 (38-256)||(1167-1385)
scaffold0165 (11-72)||(26203-26264)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (11-256)||(9761-10006)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (47-284)||(2750-2987)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (149-289)||(845-985)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (29-288)||(27500-27759)
scaffold0139 (11-285)||(1218-1491)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (38-288)||(1235-1485)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (11-288)||(14049-14325)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (29-289)||(10148-10408)
[»] scaffold0924 (1 HSPs)
scaffold0924 (29-288)||(3872-4131)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (47-289)||(5979-6220)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (29-207)||(27207-27385)
[»] scaffold0010 (3 HSPs)
scaffold0010 (11-288)||(42399-42676)
scaffold0010 (11-288)||(47465-47742)
scaffold0010 (150-228)||(2252-2330)
[»] scaffold0113 (2 HSPs)
scaffold0113 (29-288)||(25931-26190)
scaffold0113 (26-288)||(16654-16916)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (29-288)||(18830-19089)
scaffold0090 (133-288)||(23096-23251)
[»] scaffold0235 (1 HSPs)
scaffold0235 (38-288)||(21737-21987)
[»] scaffold0249 (1 HSPs)
scaffold0249 (47-288)||(5068-5309)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (11-288)||(39702-39979)
[»] scaffold0053 (2 HSPs)
scaffold0053 (11-288)||(49099-49376)
scaffold0053 (11-285)||(57885-58159)
[»] scaffold0682 (1 HSPs)
scaffold0682 (29-289)||(172-432)
[»] scaffold0069 (1 HSPs)
scaffold0069 (12-288)||(38953-39229)
[»] scaffold0574 (1 HSPs)
scaffold0574 (11-258)||(4235-4482)
[»] scaffold0203 (2 HSPs)
scaffold0203 (29-288)||(14317-14576)
scaffold0203 (29-192)||(9039-9202)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (29-288)||(509-768)
[»] scaffold0071 (1 HSPs)
scaffold0071 (29-288)||(49273-49532)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (26-288)||(16779-17041)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (47-288)||(37201-37442)
scaffold0026 (143-288)||(27403-27548)
scaffold0026 (143-288)||(38240-38385)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (11-207)||(136082-136278)
[»] scaffold1032 (1 HSPs)
scaffold1032 (47-197)||(2023-2173)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (58-288)||(4760-4990)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (47-285)||(12850-13088)
[»] scaffold0124 (3 HSPs)
scaffold0124 (11-212)||(10851-11052)
scaffold0124 (38-212)||(541-715)
scaffold0124 (170-288)||(7876-7994)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (13-104)||(6238-6329)
[»] scaffold0114 (4 HSPs)
scaffold0114 (29-288)||(20103-20362)
scaffold0114 (14-288)||(43471-43745)
scaffold0114 (14-288)||(44483-44757)
scaffold0114 (29-212)||(36036-36219)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (26-288)||(26239-26501)
[»] scaffold0076 (2 HSPs)
scaffold0076 (38-288)||(33743-33993)
scaffold0076 (170-288)||(40380-40498)
[»] scaffold0348 (1 HSPs)
scaffold0348 (29-289)||(6164-6425)
[»] scaffold0067 (3 HSPs)
scaffold0067 (11-288)||(61279-61556)
scaffold0067 (11-288)||(52245-52522)
scaffold0067 (47-288)||(67667-67908)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (47-227)||(13380-13560)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (11-72)||(7498-7559)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (47-227)||(248612-248792)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (49-222)||(42784-42957)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (47-207)||(7385-7543)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (170-289)||(1916-2035)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (153-288)||(28332-28467)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (38-146)||(45835-45943)
[»] scaffold1710 (1 HSPs)
scaffold1710 (170-288)||(976-1094)
[»] scaffold0357 (1 HSPs)
scaffold0357 (186-288)||(14661-14763)
[»] scaffold0523 (1 HSPs)
scaffold0523 (179-288)||(1-110)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (172-288)||(23518-23634)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (170-285)||(14779-14894)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (170-289)||(46276-46395)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (170-288)||(3941-4059)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (170-288)||(24002-24120)
[»] scaffold0742 (1 HSPs)
scaffold0742 (148-285)||(5313-5450)
[»] scaffold0222 (1 HSPs)
scaffold0222 (11-104)||(3518-3611)
[»] scaffold1508 (1 HSPs)
scaffold1508 (29-104)||(887-962)
[»] scaffold0513 (1 HSPs)
scaffold0513 (11-98)||(9182-9269)
[»] scaffold0551 (1 HSPs)
scaffold0551 (170-288)||(8217-8335)
[»] scaffold0447 (2 HSPs)
scaffold0447 (186-288)||(10493-10595)
scaffold0447 (186-288)||(5879-5981)
[»] scaffold0310 (1 HSPs)
scaffold0310 (170-288)||(14803-14921)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (170-288)||(13030-13148)
[»] scaffold0554 (1 HSPs)
scaffold0554 (170-288)||(3281-3399)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (186-288)||(8488-8590)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (186-288)||(4010-4112)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 60)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Original strand, 12497799 - 12498077
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12497799 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 12497898  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12497899 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 12497998  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12497999 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttt 12498077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 14877078 - 14876800
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  14877078 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcagtggtaatc 14876979  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14876978 caactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 14876879  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14876878 cacaggagtaactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttt 14876800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Original strand, 17489401 - 17489679
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||    
T  17489401 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggtacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 17489500  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17489501 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 17489600  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17489601 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttt 17489679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Original strand, 9522270 - 9522548
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |    
T  9522270 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcaaaagatgcggtggtaaac 9522369  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9522370 ccactcggtacgccaccgttccaactctttttgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagt 9522469  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9522470 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaagtcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttt 9522548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Original strand, 16370964 - 16371242
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16370964 acatcatcactctggatcacatgagatggatctagaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacgacatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 16371063  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | ||||  ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16371064 ccactcaatacgccaccgtcccaactctttctgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacatccaacaccagt 16371163  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16371164 cacaggagtgactctcaaaaacacgtagtcttcttcttgaaattcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttt 16371242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 16492760 - 16492482
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  16492760 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggtacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgaaaattcgaaagatgcggtggtaatc 16492661  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | ||||| ||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16492660 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccaatatctgatacagaccaataaatctcggagtcaacttctttgactttaaagctcgtccaacaccagt 16492561  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16492560 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttt 16492482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 11 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 16807505 - 16807228
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||    
T  16807505 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacataattccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaagttcgaaagatgcggtggtaatc 16807406  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | ||||| ||||||||||||| || | |||  |||| |||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16807405 ccactcgatacgccaccgttccaaattttttcgatatctgatacggaccgaaaaatctcagagtcaacttctttgacttcaaagcacatccaacaccagt 16807306  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  16807305 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcctttctgcgcttatcatgataattctt 16807228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 11 - 288
Target Start/End: Original strand, 16691711 - 16691988
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  16691711 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 16691810  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | || || || |||||||||| ||| ||||| ||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16691811 ccacacgatatgccaccgttccaaccctttccgatatttgatacgacccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 16691910  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||    
T  16691911 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatccttcttgcgcttatcatgataactctt 16691988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 23 - 289
Target Start/End: Original strand, 10905773 - 10906039
Alignment:
Q  23 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 122  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| |    
T  10905773 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtaag 10905872  T
Q  123 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 222  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  10905873 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 10905972  T
Q  223 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10905973 tctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 10906039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 15348824 - 15348546
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||| | ||| |    
T  15348824 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaac 15348725  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15348724 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 15348625  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15348624 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 15348546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 15725512 - 15725234
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  15725512 acatcgtcactttggatcacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 15725413  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  15725412 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacacccgt 15725313  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    || | |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15725312 cataggagtgactctaaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 15725234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 23 - 289
Target Start/End: Original strand, 10005163 - 10005429
Alignment:
Q  23 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 122  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||| |    
T  10005163 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaacccactcggtaag 10005262  T
Q  123 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 222  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  10005263 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 10005362  T
Q  223 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10005363 tctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 10005429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 23 - 289
Target Start/End: Original strand, 13252253 - 13252519
Alignment:
Q  23 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 122  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||| |    
T  13252253 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaacccactcggtaag 13252352  T
Q  123 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 222  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  13252353 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 13252452  T
Q  223 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13252453 tctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 13252519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 23 - 289
Target Start/End: Original strand, 48425010 - 48425276
Alignment:
Q  23 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 122  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| || |||||||| |    
T  48425010 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 48425109  T
Q  123 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 222  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  48425110 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 48425209  T
Q  223 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48425210 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 48425276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 23 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 15589959 - 15589693
Alignment:
Q  23 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 122  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||| | ||| || |||||||| |    
T  15589959 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 15589860  T
Q  123 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 222  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  15589859 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 15589760  T
Q  223 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15589759 tctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 15589693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 23 - 289
Target Start/End: Original strand, 16635336 - 16635602
Alignment:
Q  23 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 122  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||| || | ||| || |||||||| |    
T  16635336 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaag 16635435  T
Q  123 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 222  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||    
T  16635436 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgac 16635535  T
Q  223 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16635536 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 16635602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 23 - 289
Target Start/End: Original strand, 43162660 - 43162926
Alignment:
Q  23 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 122  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||| || | ||| || |||||||| |    
T  43162660 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaag 43162759  T
Q  123 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 222  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||    
T  43162760 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgac 43162859  T
Q  223 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43162860 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 43162926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 288
Target Start/End: Original strand, 15208442 - 15208719
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||  ||| |    
T  15208442 acatcatctctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgaaaattcgaaagatgcggttgtaaac 15208541  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | ||||| ||| ||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  15208542 ccactcgatactccaccgttccaattctttctgatatctgattcggaccaataaacctcggagtcaacttcttttacttcaatgcgcgtccaacaccagt 15208641  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    |||| |||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  15208642 cacaggagtgactctcaaaaatacatgatctccttcttgaaactcaatgtttttcctacgcttatcatgataactctt 15208719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Original strand, 15338820 - 15339098
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| || | ||| |    
T  15338820 acatcgtcactctggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaac 15338919  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | |||||||| || ||||||| || ||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  15338920 ccactcggtaagctaccgttccaattctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacgccagt 15339019  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15339020 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctaaaactcaagatcttttctacgcttatcgtgataactcttt 15339098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 15403089 - 15402811
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| || | ||| |    
T  15403089 acatcgtcactctggattacatgagatggatctggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaac 15402990  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | |||||||| |||||||||| || ||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  15402989 ccactcggtaagccaccgttccaattctttccaatatctgatacggaccaatgaacatcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacgccagt 15402890  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15402889 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaaaatcttttctacgcttatcgtgataactcttt 15402811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 16412861 - 16412583
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |  | |||||||||||||||||| | ||| |    
T  16412861 acatcgtcactctggattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaaaacgttgtccaaattcgaaagatgcggcggtaaac 16412762  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16412761 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 16412662  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    || | |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||    
T  16412661 cataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcatgaaactcaaggtcattcctacgcttatcatgataactcttt 16412583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 23 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 20062621 - 20062355
Alignment:
Q  23 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 122  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||| | ||| || |||||||| |    
T  20062621 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 20062522  T
Q  123 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 222  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| | |||||||    
T  20062521 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacgccagtcataggagtgac 20062422  T
Q  223 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20062421 tctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 20062355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 5425508 - 5425231
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  5425508 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 5425409  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5425408 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 5425309  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    || | ||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5425308 cataggagtgactctc-aaagcacgtggtctccttcctgaaattcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttt 5425231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 53385597 - 53385319
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  53385597 acatcgtcgctctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 53385498  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | |||||||| |||||||| | |||||||||  | | |||||| |||||||| ||  |||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  53385497 ccactcggtaagccaccgtcccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaactttttcgacttcaaagcacgtcctacaccagt 53385398  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53385397 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 53385319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 26792971 - 26792700
Alignment:
Q  18 cactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcg 117  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | |||  | |||||    
T  26792971 cactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaatccactcg 26792872  T
Q  118 gtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatga 217  Q
    ||| |||| ||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||    
T  26792871 gtaagccatcgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacactagtcatagga 26792772  T
Q  218 gtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26792771 gtgactcttaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttt 26792700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Original strand, 6600298 - 6600576
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  6600298 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 6600397  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | |||||||| |||||||| | |||| ||||  | | |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6600398 ccactcggtaagccaccgtcccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 6600497  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6600498 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttccttgaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 6600576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 16757164 - 16756887
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  16757164 acatcgtcactctgaatgacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 16757065  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | |||||||| |||||||| | |||||||||  | |  ||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  16757064 ccactcggtaagccaccgtcccaactctttccaaaatatgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacaccagt 16756965  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    || | |||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16756964 cataggagtgactctcaaaaacatgtggtctccttccttaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 16756887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 38 - 288
Target Start/End: Original strand, 15247725 - 15247975
Alignment:
Q  38 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactc 137  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||  ||| || ||||| ||||||||||||| || ||    
T  15247725 ggatccagaacatatttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggttgtaaacccactcgatacgccaccgttccaattc 15247824  T
Q  138 tttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtg 237  Q
    |||| |||| || ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||    
T  15247825 tttccgatatctaatacggaccaatacacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcgcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacatg 15247924  T
Q  238 gtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
     ||| ||||||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  15247925 atctccttcttgaaactcattgtttttcctacgcttatcatgataactctt 15247975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 29 - 288
Target Start/End: Original strand, 15227228 - 15227487
Alignment:
Q  29 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 128  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || || ||||  || ||||| |    
T  15227228 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccactg 15227327  T
Q  129 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 228  Q
    ||| |||||| || |||| ||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  15227328 ttccaactctctcagatatctggtacggaccaataaacttcggcgtcaacttcttcgatttcaaggcacgaccaacacctgtcacaggagtgactctcaa 15227427  T
Q  229 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  15227428 aaacacatggtctccttcttgaaactcaagatcctttctacgcttgtcatgataactctt 15227487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 38 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 13972661 - 13972411
Alignment:
Q  38 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactc 137  Q
    |||||||| ||||||||||| |  || |||||||| || || |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||| |||| |||||    
T  13972661 ggatccggtacatacttccgcaactgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatccaactctatacgccacagttccaactc 13972562  T
Q  138 tttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtg 237  Q
    ||||||| | |||||| |||||||||||  |||||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| | ||||||||||||| ||||| ||    
T  13972561 tttctgaaatctgataaggaccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatg 13972462  T
Q  238 gtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
     ||| | |||||||||||||| || || |||||||| |||||||| |||||    
T  13972461 atctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctctt 13972411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 12 - 288
Target Start/End: Original strand, 47123506 - 47123782
Alignment:
Q  12 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatcc 111  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| || || ||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||    
T  47123506 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacctccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacc 47123605  T
Q  112 aactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 211  Q
    |||||  || ||||| || | |||||| ||||| | ||||||||||||||||||  | |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||    
T  47123606 aactctatatgccacagtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcccgtccaacacccgtc 47123705  T
Q  212 acatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    | | |||||||||||| ||| || || ||  | || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  47123706 aaaggagtgactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactctt 47123782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 11 - 288
Target Start/End: Original strand, 14571409 - 14571686
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    |||||||| ||| |||| ||||| || |||||||  || |||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||  || |    
T  14571409 acatcatctctcgggataacatgcgaaggatccgctacgtacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatatggtggcaagc 14571508  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | ||||  || ||||| |||| ||| || || |||| |||||| |||||||||||  | |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  14571509 ccactctatatgccactgttccaaccctctcagatatctgataaggaccaataaacttaggagtcaaattcttagacttcaatgcacgtcctacacccgt 14571608  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    || | |||| |||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||  | || |||||||| ||| | ||||||||    
T  14571609 cataggagtaactctcaaaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcacggtaactctt 14571686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 12 - 288
Target Start/End: Original strand, 10383531 - 10383807
Alignment:
Q  12 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatcc 111  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||||  || ||    
T  10383531 catcatccctcgggatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaaggtgtggtggcaaacc 10383630  T
Q  112 aactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 211  Q
    |||||  || ||||| || | |||||| ||||| | ||||||||||||||| ||| | |||||||||||  | |||||||||||||| || ||||| |||    
T  10383631 aactctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaatttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgaccgacacccgtc 10383730  T
Q  212 acatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    | | ||||||| |||| ||| || || ||  | || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  10383731 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactctt 10383807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 29 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 13323202 - 13322943
Alignment:
Q  29 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 128  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||  || ||||  |  || ||||| |    
T  13323202 acatgcgacggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatggaatacaccatgcaaattcgaaagatgtggtggaaaaccaatcctatatgccactg 13323103  T
Q  129 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 228  Q
    ||| ||  || ||  ||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| || || |||| | |||| |||||||     
T  13323102 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacccccgtcataggagtaactctcag 13323003  T
Q  229 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    |||||| |||||| | || |||||| |||||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  13323002 aaacacatggtctccctcctgaaacccaagatctttcctacgcttgtcatgatagctctt 13322943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 29 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 18134896 - 18134637
Alignment:
Q  29 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 128  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |    
T  18134896 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagtttgaaagatgtggtggcaaaccaactctataagccactg 18134797  T
Q  129 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 228  Q
    ||| ||| || ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||| | |||| |||||||     
T  18134796 ttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagtaactctcag 18134697  T
Q  229 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    ||| ||  | ||  | || |||||||||||  | || |||||||| ||||||||||||||    
T  18134696 aaatacaagatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactctt 18134637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 15953500 - 15953258
Alignment:
Q  47 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || || |||  ||| ||||| |||| ||| || || ||||    
T  15953500 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactgttccaaccctctcagata 15953401  T
Q  147 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 246  Q
     |||||||| |||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| |||| | |||| | ||||| ||| || || ||| | ||    
T  15953400 tctgatacgaaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcgtacacccgtcataggagtaaatctcagaaatacatgatctccctc 15953301  T
Q  247 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    ||||||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||||    
T  15953300 ttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttt 15953258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 77 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 12850781 - 12850570
Alignment:
Q  77 acatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtca 176  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||  || || |||| ||| ||||| |||| |||||| || |||| ||| || |||||||||||  |||||||||    
T  12850781 acatcatgcaaattccaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaactctctcagatatctggtatggaccaataaacttcggagtca 12850682  T
Q  177 acttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatc 276  Q
    ||||||| |||||||| ||||| || | ||| |||||| |||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||  | ||| | ||||| ||    
T  12850681 acttcttagacttcaacgcacgacctatacccgtcacaggagtgactctcagaaacacatgatcttcctcttgaaactcaagggcctttattcgcttgtc 12850582  T
Q  277 atgataactctt 288  Q
    ||| ||||||||    
T  12850581 atggtaactctt 12850570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 150 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 15016184 - 15016045
Alignment:
Q  150 gatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttg 249  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| |  ||||| ||||| |  || | ||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  15016184 gatacggagcaataaacctcggagttagtttcttcgactttagtgctcatccaacaccggtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttg 15016085  T
Q  250 aaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  15016084 aaactcaagatccttcctacgcttatcatgataactcttt 15016045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 26 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 16330212 - 16329950
Alignment:
Q  26 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 125  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||    
T  16330212 atcacatgcgaaggatccgccacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 16330113  T
Q  126 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 225  Q
    | |||| |||||| ||||| | |||||||||||| || ||  | |||||||||| | | |||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| ||    
T  16330112 ctgttccaactctctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaactacctcgacttcaatgcacgtccaacacctgtcaaaggagtgaccct 16330013  T
Q  226 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    || ||| || || ||  | || |||||||||||| | |||||  |||| ||||| ||||||||    
T  16330012 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttctttgcttgtcatggtaactctt 16329950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 10420613 - 10420335
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || ||||| || ||||||||||| |  || |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||  || |    
T  10420613 acatcatctctcggaataacatgtgaaggatcaggtacatacttccgcaactgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaac 10420514  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    ||| ||  |||||||| ||||  ||||||||||| | |||||| |||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  10420513 caattctatacgccacagttccgactctttctgaaatctgataaggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacctgt 10420414  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    || | |||| || |||| ||| || || ||  |||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||    
T  10420413 cataggagtaaccctcagaaaaacatgatcaccttcctgaaattcaaggtctttcctacgcttgtcatggtagctcttt 10420335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 38 - 288
Target Start/End: Original strand, 14086261 - 14086511
Alignment:
Q  38 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactc 137  Q
    |||||||| ||||||||||| |  |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || |  || || || |  || ||||| || |  ||||    
T  14086261 ggatccggtacatacttccgcaactgcgacacgtggaacacgtcatgcaaattcgaaagatgagggggcaaacccaccctataagccactgtcccgactc 14086360  T
Q  138 tttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtg 237  Q
    | || |||| |||||| || ||||||||  |||||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| | ||||||||||||| ||||| ||    
T  14086361 tctcagatatctgatatgggccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatg 14086460  T
Q  238 gtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
     ||| | |||||||||||||| || || |||||||| |||||||| |||||    
T  14086461 atctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctctt 14086511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 11304341 - 11304140
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    |||||||||||  | || ||||| || |||||||  ||||||||| |||||||||||||| | || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |    
T  11304341 acatcatcactaggaataacatgcgaaggatccgctacatacttctgaagttgcgacacaagaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 11304242  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    ||||||  || |||||  ||| ||| || ||||||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  11304241 caactctatatgccactattccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacctgt 11304142  T
Q  211 ca 212  Q
    ||    
T  11304141 ca 11304140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 29 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 12361092 - 12360833
Alignment:
Q  29 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 128  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |    
T  12361092 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactg 12360993  T
Q  129 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 228  Q
    ||| |||  | ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||  |||| |  ||| |||||||     
T  12360992 ttccaaccttctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgatttcaatgcacgtcctacacatgtcatagaagtaactctcag 12360893  T
Q  229 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    ||| || || ||  | || |||||||||||  | || |||||||| ||||||||||||||    
T  12360892 aaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactctt 12360833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 47 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 8759614 - 8759373
Alignment:
Q  47 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 146  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||  || |||||||  || ||||||||||  | ||| ||||| |    
T  8759614 acatacttccgcagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccgattctctctgaaa 8759515  T
Q  147 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 246  Q
     ||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||   |||| ||||| | ||| || || ||  | ||    
T  8759514 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctc 8759415  T
Q  247 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    ||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  8759414 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactctt 8759373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 47 - 288
Target Start/End: Original strand, 13941621 - 13941862
Alignment:
Q  47 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 146  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||  || |||||||  || ||||||||||  | ||| ||||| |    
T  13941621 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccgattctctctgaaa 13941720  T
Q  147 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 246  Q
     ||||||||||||||| ||  |||||||||||||  | || |||||||||||||| ||||| ||||   |||| ||||| | ||| || || ||  | ||    
T  13941721 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctc 13941820  T
Q  247 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    ||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  13941821 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactctt 13941862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 47 - 288
Target Start/End: Original strand, 41177119 - 41177360
Alignment:
Q  47 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 146  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||  || |||||||  || ||||||||||  | ||| ||||| |    
T  41177119 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccgattctctctgaaa 41177218  T
Q  147 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 246  Q
     ||||||||||||||| ||  |||||||||||||  | || |||||||||||||| ||||| ||||   |||| ||||| | ||| || || ||  | ||    
T  41177219 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctc 41177318  T
Q  247 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    ||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  41177319 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactctt 41177360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 26 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 11961587 - 11961325
Alignment:
Q  26 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 125  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || |  ||  ||||||  || ||||    
T  11961587 atcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtgggggcaaatcaactctataagcca 11961488  T
Q  126 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 225  Q
    |  ||| |||||| ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||| ||| | |||||||| |||||||  ||||  |||| | ||||||| ||    
T  11961487 ctattccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaatttcctcgacttcaatgcacgtcgtacactcgtcaaaggagtgaccct 11961388  T
Q  226 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    || ||| || || ||  | || |||||||||||| | || || ||||| ||||| ||||||||    
T  11961387 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagccttccttcgcttgtcatggtaactctt 11961325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 31689191 - 31689049
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |    
T  31689191 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtgtcaaac 31689092  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgata 153  Q
    ||||||  || ||||| |||| ||| |||||||||| ||||||    
T  31689091 caactctatatgccactgttccaaccctttctgatatctgata 31689049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 155
Target Start/End: Original strand, 31945033 - 31945177
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |    
T  31945033 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 31945132  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacg 155  Q
    |||||   || ||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||    
T  31945133 caactttatatgccactgttccaaccctttctgatatctgatacg 31945177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 47 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 16381459 - 16381294
Alignment:
Q  47 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 146  Q
    ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||  || |||||||  || |||||||| | ||  || ||||| |    
T  16381459 acatatttccgaagctgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgtcccaatcctctctgaaa 16381360  T
Q  147 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtca 212  Q
     ||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||    
T  16381359 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtca 16381294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 170 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 8274819 - 8274701
Alignment:
Q  170 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 269  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || |||||| || | || ||||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  8274819 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 8274720  T
Q  270 gcttatcatgataactctt 288  Q
     ||||||||||||||||||    
T  8274719 tcttatcatgataactctt 8274701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Original strand, 44776808 - 44777022
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||||||||| |  || ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||  || |    
T  44776808 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagc 44776907  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    ||||||  || ||||||||||  |  || ||||| | ||||||||| ||||| ||  ||||||| |||||| | || |||||||||||||| ||||| ||    
T  44776908 caactctatatgccaccgttccgatcctctctgaaatctgatacgggccaatgaacttcggagttaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacctgt 44777007  T
Q  211 cacatgagtgactct 225  Q
    ||   ||||||||||    
T  44777008 catcggagtgactct 44777022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 16836941 - 16836804
Alignment:
Q  148 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttct 247  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||   |||| ||||||||||| || || ||  | ||     
T  16836941 ctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactctcaaaaatacatgatcaccctcc 16836842  T
Q  248 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 285  Q
    |||||||||||  | || || ||||||||||| |||||    
T  16836841 tgaaactcaagggccttcctccgcttatcatggtaact 16836804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 170 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 6153259 - 6153141
Alignment:
Q  170 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 269  Q
    |||||||||||  |  ||||||||||||| || ||||| ||||||||| | ||||||| |||||| || ||  |  ||||||||| || ||| ||||| |    
T  6153259 ggagtcaactttctgcacttcaaagcacgaccgacaccggtcacatgattcactctcagaaacacatgatcaccaacttgaaacttaatatcctttctcc 6153160  T
Q  270 gcttatcatgataactctt 288  Q
     ||||||||||||||||||    
T  6153159 tcttatcatgataactctt 6153141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 170 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 16743123 - 16743005
Alignment:
Q  170 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 269  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || |||||| || | || ||||||||||| || ||  |  ||||| |||||| ||| ||||| |    
T  16743123 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgacactcaatatcctttctcc 16743024  T
Q  270 gcttatcatgataactctt 288  Q
     ||||||||||||||||||    
T  16743023 tcttatcatgataactctt 16743005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 64
Target Start/End: Original strand, 320781 - 320836
Alignment:
Q  8 tggacatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgc 64  Q
    ||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  320781 tggacatcatctctttggatcacg-gagatggatccggagcatacttccgaagttgc 320836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 170 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 13975465 - 13975347
Alignment:
Q  170 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 269  Q
    |||||||||||| |  |||||||| |||| ||||| || |||||| || | || ||||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  13975465 ggagtcaacttcctacacttcaaaacacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 13975366  T
Q  270 gcttatcatgataactctt 288  Q
     |||||||||||| |||||    
T  13975365 tcttatcatgatagctctt 13975347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 170 - 288
Target Start/End: Original strand, 15576470 - 15576588
Alignment:
Q  170 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 269  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || |||||| || | || ||||||||||| || ||  |  | |||||||||| ||| ||||| |    
T  15576470 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcc 15576569  T
Q  270 gcttatcatgataactctt 288  Q
     |||||||||||| |||||    
T  15576570 tcttatcatgatagctctt 15576588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 186 - 288
Target Start/End: Original strand, 21686681 - 21686783
Alignment:
Q  186 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 285  Q
    |||||||||||||||||||| | || |||||| | ||||| ||||| || || ||  |  ||||||||| || ||||||||| | ||||| |||||||||    
T  21686681 acttcaaagcacgtccaacatcggttacatgattcactctaaaaaatacatgatcaccaacttgaaactgaatatcttttctcctcttataatgataact 21686780  T
Q  286 ctt 288  Q
    |||    
T  21686781 ctt 21686783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 12854426 - 12854365
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatg 72  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  12854426 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatg 12854365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 48)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Original strand, 24675052 - 24675330
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  24675052 acatcatcactctggatcacatgagatggatctggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 24675151  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24675152 caactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 24675251  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24675252 cacaggggtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 24675330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 22757343 - 22757065
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22757343 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 22757244  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22757243 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgatttcaaagcacgtccaacaccagt 22757144  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  22757143 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctctttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttt 22757065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 21326146 - 21325868
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21326146 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttctgaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 21326047  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | ||||| ||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21326046 ccactcgatacgccaccgtcccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagt 21325947  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  21325946 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttt 21325868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 24708362 - 24708091
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24708362 acatcatcactgtggatcacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgtcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 24708263  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24708262 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaaaaaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 24708163  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgata 282  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  24708162 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgata 24708091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Original strand, 23188571 - 23188849
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  23188571 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 23188670  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
      ||||| ||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23188671 tcactcgatacgccatcgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatcttggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 23188770  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  23188771 cacaggagtgactctcaaaaacatgtggtctccttcctgacactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttt 23188849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Original strand, 23138600 - 23138878
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  23138600 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacaccatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 23138699  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | ||||| || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23138700 ctactcgatatgccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagt 23138799  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    |||| |||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  23138800 cacaagagtgactctcaaaaatacctggtctccttcttgaaactcgaggtctttcgtacgcttatcatgataactcttt 23138878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Original strand, 23550390 - 23550668
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  23550390 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacaccatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 23550489  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | ||||| || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23550490 ctactcgatatgccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagt 23550589  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    |||| |||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  23550590 cacaagagtgactctcaaaaatacctggtctccttcttgaaactcgaggtctttcgtacgcttatcatgataactcttt 23550668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 11 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 27377351 - 27377101
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  27377351 acatcatcactttggatcacatgagatggatccagaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 27377252  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    |||| || ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27377251 caacccgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 27377152  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatc 261  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  27377151 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatc 27377101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 35 - 289
Target Start/End: Original strand, 23063664 - 23063918
Alignment:
Q  35 gatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaa 134  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||    
T  23063664 gatggatctggtacatacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaa 23063763  T
Q  135 ctctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacac 234  Q
    ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||    
T  23063764 ctctttcagatatctgaaacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaaaac 23063863  T
Q  235 gtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  23063864 gtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatggtaactcttt 23063918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 23 - 289
Target Start/End: Original strand, 16924835 - 16925101
Alignment:
Q  23 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 122  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| || |||||||| |    
T  16924835 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 16924934  T
Q  123 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 222  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  16924935 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 16925034  T
Q  223 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16925035 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 16925101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 23 - 289
Target Start/End: Original strand, 16998575 - 16998841
Alignment:
Q  23 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 122  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| || |||||||| |    
T  16998575 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 16998674  T
Q  123 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 222  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  16998675 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 16998774  T
Q  223 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16998775 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 16998841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 44386449 - 44386171
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||||| ||| |    
T  44386449 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaac 44386350  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44386349 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaatttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 44386250  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44386249 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttt 44386171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 23 - 289
Target Start/End: Original strand, 16981727 - 16981993
Alignment:
Q  23 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 122  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| || |||||||| |    
T  16981727 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 16981826  T
Q  123 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 222  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  16981827 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 16981926  T
Q  223 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16981927 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 16981993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 23 - 289
Target Start/End: Original strand, 17063292 - 17063558
Alignment:
Q  23 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 122  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| || |||||||| |    
T  17063292 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 17063391  T
Q  123 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 222  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  17063392 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 17063491  T
Q  223 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17063492 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 17063558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 17 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 21145904 - 21145632
Alignment:
Q  17 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactc 116  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||| ||| || ||||    
T  21145904 tcactctggattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactc 21145805  T
Q  117 ggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatg 216  Q
    | || |||| ||||| |||||||||  ||| ||||||| || |||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| | |    
T  21145804 gataagccatcgttccaactctttccaatatctgatacagatcaataaacttcggggtcaacttctttgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatagg 21145705  T
Q  217 agtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21145704 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 21145632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 23 - 289
Target Start/End: Original strand, 9609711 - 9609977
Alignment:
Q  23 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 122  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||| || | ||| || |||||||| |    
T  9609711 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaag 9609810  T
Q  123 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 222  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||    
T  9609811 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgac 9609910  T
Q  223 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9609911 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 9609977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 22325736 - 22325458
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||| | ||| |    
T  22325736 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaac 22325637  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22325636 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttgtttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 22325537  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22325536 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 22325458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Original strand, 24709596 - 24709874
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  | |||||||| ||||||||| | ||| |    
T  24709596 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtacaaattcgcaagatgcggcggtaaac 24709695  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| || |||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24709696 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctaatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 24709795  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24709796 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 24709874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 23 - 289
Target Start/End: Original strand, 27217591 - 27217857
Alignment:
Q  23 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 122  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| || |||||||| |    
T  27217591 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 27217690  T
Q  123 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 222  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | |||||||    
T  27217691 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagtgac 27217790  T
Q  223 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27217791 tctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 27217857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Original strand, 24261933 - 24262211
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||| || | ||| |    
T  24261933 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaac 24262032  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  |||  |||||| ||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24262033 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatatgatacagaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 24262132  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24262133 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttt 24262211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 24878875 - 24878597
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| || |  |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  24878875 acatcgtcactctggattacttgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacagatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 24878776  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | ||| |||| |||||||||| |||||||||  ||| |||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  24878775 ccacttggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagt 24878676  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    || | |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24878675 cataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 24878597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Original strand, 27370832 - 27371110
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||| | |||      
T  27370832 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaat 27370931  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  27370932 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacatcctacaccagt 27371031  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27371032 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgatagctcttt 27371110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 23 - 289
Target Start/End: Original strand, 10868425 - 10868691
Alignment:
Q  23 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 122  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| || |||||||| |    
T  10868425 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 10868524  T
Q  123 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 222  Q
    |||| |||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  10868525 ccactgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 10868624  T
Q  223 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  10868625 tctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatctttcctacgcttatcatgatagctcttt 10868691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 23 - 289
Target Start/End: Original strand, 17066953 - 17067216
Alignment:
Q  23 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 122  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| || || |  ||||| |||||||||||||| | ||| || |||||  | |    
T  17066953 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagt-gcgacacatgaaaaacgtg-tgcaa-ttcgaaagatgcggcggtaaacccactcgtaaag 17067049  T
Q  123 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 222  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  17067050 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 17067149  T
Q  223 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17067150 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 17067216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 288
Target Start/End: Original strand, 23087013 - 23087290
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    |||||||| ||  |||| ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || |    
T  23087013 acatcatctcttgggataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 23087112  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
      ||||  |||||||| |||| |||||| || |||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||    
T  23087113 acactctatacgccactgttccaactctctcagatatctgatatggaccaataaacctcggcgtcaacttcttcgatttcaaggcacgaccaacacctgt 23087212  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  | ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  23087213 cacaagagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaaggacctttctacacttgtcatgataactctt 23087290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 26 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 30211782 - 30211519
Alignment:
Q  26 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 125  Q
    |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||||||||||| ||| || |||   ||||| |    
T  30211782 atcacatgagattgatccaaaacatacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcatgtaagttcgaaagatgcggtggtaaacccactttatacgcaa 30211683  T
Q  126 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 225  Q
    ||   | |||| |||| || | ||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||| || |  || ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  30211682 ccaccccaactttttccgaaatctgatacgggccaataaacctcggagtcagtttctttgattttagcgcccgtccaacaccggtcacatgggtgactct 30211583  T
Q  226 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
     |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||| | |||||||||    
T  30211582 aaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaagatccttcctacgcttatcacggtaactcttt 30211519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 113 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 24826060 - 24825887
Alignment:
Q  113 actcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtca 212  Q
    ||||| ||||||||||| | || ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  24826060 actcgatacgccaccgtcccaattctttctgatatctgatacgaaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcgcgtccaacaccagtca 24825961  T
Q  213 catgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactc 286  Q
    || |||||||||| ||||| || |  ||| |||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  24825960 caggagtgactcttaaaaatacattatctccttcctaaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactc 24825887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 12 - 288
Target Start/End: Original strand, 31830222 - 31830498
Alignment:
Q  12 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatcc 111  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||    
T  31830222 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacc 31830321  T
Q  112 aactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 211  Q
    |||||  || ||||| || | |||||| ||||| | ||||||||||||||||||  | |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||    
T  31830322 aactctatatgccacagtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcccgtccaacacccgtc 31830421  T
Q  212 acatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    | | |||||||||||| ||| || || ||  | || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  31830422 aaaggagtgactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactctt 31830498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 38 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 27365932 - 27365682
Alignment:
Q  38 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactc 137  Q
    |||| ||| ||||||||||| |  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||| |||| |||||    
T  27365932 ggattcggtacatacttccgcaactgcgacacatggaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatccaactctatacgccacagttccaactc 27365833  T
Q  138 tttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtg 237  Q
    ||||||| | |||||| |||||||| ||  | |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| | ||||||| ||||| ||||| ||    
T  27365832 tttctgaaatctgataaggaccaatgaactttggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgaccctcaagaacacatg 27365733  T
Q  238 gtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
     ||| | |||||||||||||| || || |||||||| |||||||| |||||    
T  27365732 atctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctctt 27365682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 11 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 41609224 - 41609047
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||   ||| |    
T  41609224 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacgtggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggctgtaaac 41609125  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgact 188  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  | | ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||    
T  41609124 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaaaatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgact 41609047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 31 - 289
Target Start/End: Original strand, 45529100 - 45529352
Alignment:
Q  31 atgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgtt 130  Q
    |||||| ||||| | ||||| |||||||||||| |||||||| || |||||| | || ||| |||||||| ||| ||| || ||||  ||||| |||||     
T  45529100 atgagagggatctgaaacatgcttccgaagttgtgacacatgaaacacatcacgtaagttcaaaagatgcagtggtaaacccactctatacgcaaccgtc 45529199  T
Q  131 cgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaa 230  Q
    | ||||||||| || | |||||| ||  ||||||| ||||||||||  |||||||| || |  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  45529200 ccaactctttccgaaatctgatatgggtcaataaacctcggagtcagtttctttgattttagcgcacgtccaacaccagtcacaagagtgactctcataa 45529299  T
Q  231 acacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    |||| ||||||||      |||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||    
T  45529300 acacatggtcttc------aaactcaagatccttcctaggcttatcatgataactcttt 45529352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 11358739 - 11358477
Alignment:
Q  26 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 125  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||    
T  11358739 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 11358640  T
Q  126 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 225  Q
    | || | |||| | ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||  | |||||||||||||| |||||||| |||| | ||||||||||    
T  11358639 ctgtaccaactttctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgaccaacacccgtcaaaggagtgactct 11358540  T
Q  226 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    || ||| || || ||  | || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  11358539 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttctccgcttgtcatggtaactctt 11358477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 288
Target Start/End: Original strand, 20832549 - 20832825
Alignment:
Q  12 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatcc 111  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || ||    
T  20832549 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 20832648  T
Q  112 aactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 211  Q
    |||||  || ||||| || | |||||| ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||  | ||||||||||| || |||||||| |||    
T  20832649 aactctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgtc 20832748  T
Q  212 acatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    | | ||||||| |||| ||| || || ||  | || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  20832749 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactctt 20832825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 29 - 288
Target Start/End: Original strand, 23293539 - 23293798
Alignment:
Q  29 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 128  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |    
T  23293539 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttagaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactg 23293638  T
Q  129 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 228  Q
    ||| ||| || ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| |||||||     
T  23293639 ttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 23293738  T
Q  229 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    ||| || || ||  | || |||||||||||  | || |||||||| ||||||||||||||    
T  23293739 aaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactctt 23293798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 288
Target Start/End: Original strand, 1063315 - 1063591
Alignment:
Q  12 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatcc 111  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  ||  |    
T  1063315 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaagc 1063414  T
Q  112 aactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 211  Q
    |||||  || ||||| || | || ||| ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||  | ||||||||||| || |||||||| |||    
T  1063415 aactctatatgccacagtaccaattctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgtc 1063514  T
Q  212 acatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    | | ||||||| |||| ||| || || ||  | || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  1063515 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactctt 1063591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 49 - 288
Target Start/End: Original strand, 24653946 - 24654185
Alignment:
Q  49 atacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataac 148  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |||| |||  |  |||| | |    
T  24653946 atacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccttcactgaaatc 24654045  T
Q  149 tgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttctt 248  Q
    |||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| ||| |||| ||||| |||| | |||| || |||| ||| || || ||  | || |    
T  24654046 tgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcaagtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcct 24654145  T
Q  249 gaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    ||||||||||  | || |||||||||||||||||||||||    
T  24654146 gaaactcaagggccttcctacgcttatcatgataactctt 24654185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 288
Target Start/End: Original strand, 23276339 - 23276616
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |    
T  23276339 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatactttcgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 23276438  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    ||||||  || ||||| |||| ||| || || |||| ||||||||||||||| ||  | |||||| ||||  | |||||||| |||||||| |||||  |    
T  23276439 caactctatatgccactgttccaaccctctccgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcgacttactcgacttcaatgcacgtcccacacccat 23276538  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    || | |||| | ||||| ||| || || ||  | || |||||||||||  | || |||||||| ||||||||||||||    
T  23276539 cataggagtaaatctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactctt 23276616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 26 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 24833438 - 24833360
Alignment:
Q  26 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtg 104  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24833438 atcacatgagatggatccgaaacatacttccgaagttgcaacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtg 24833360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 47 - 288
Target Start/End: Original strand, 27787340 - 27787581
Alignment:
Q  47 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 146  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||  || |||||||  || ||||||||||  | ||| ||||| |    
T  27787340 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccgattctctctgaaa 27787439  T
Q  147 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 246  Q
     ||||||||||||||| ||  |||||||||||||  | || |||||||||||||| ||||| ||||   |||| ||||| | ||| || || ||  | ||    
T  27787440 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctc 27787539  T
Q  247 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    ||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  27787540 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactctt 27787581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 47 - 212
Target Start/End: Original strand, 24944966 - 24945131
Alignment:
Q  47 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 146  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||  |||| ||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |||| ||| || | ||| |    
T  24944966 acatacttccgaagctgcgacacatgaaacccatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctttgaaa 24945065  T
Q  147 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtca 212  Q
     ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  24945066 tctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttccttgacttcaatgcacgtcctacacccgtca 24945131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 45676729 - 45676685
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttc 55  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45676729 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttc 45676685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 47 - 212
Target Start/End: Original strand, 12573952 - 12574117
Alignment:
Q  47 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 146  Q
    ||||||||||| |  || ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||  || |||||||  || |||||||| | ||  || ||||| |    
T  12573952 acatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgtcccaatcctctctgaaa 12574051  T
Q  147 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtca 212  Q
     ||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||    
T  12574052 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtca 12574117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 54
Target Start/End: Original strand, 23599834 - 23599877
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatactt 54  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23599834 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatactt 23599877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 170 - 288
Target Start/End: Original strand, 22276001 - 22276119
Alignment:
Q  170 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 269  Q
    |||||||||||| |   |||||||||||| |||||||| |||||| || | |||||||||||||| || ||  |  | |||||||||| ||| ||||| |    
T  22276001 ggagtcaacttcctacccttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcc 22276100  T
Q  270 gcttatcatgataactctt 288  Q
     ||||||||||||||||||    
T  22276101 tcttatcatgataactctt 22276119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 234
Target Start/End: Original strand, 25128387 - 25128433
Alignment:
Q  188 ttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacac 234  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  25128387 ttcaaagcgcgtccaacaccagtcacatggttcactctcaaaaacac 25128433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 32 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 17967617 - 17967577
Alignment:
Q  32 tgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatg 72  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  17967617 tgagatggatcgggaacatactttcgaagttgggacacatg 17967577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 186 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 23817798 - 23817750
Alignment:
Q  186 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacac 234  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||| || | ||||||||||||||    
T  23817798 acttcaaagcacgaccaacaccggtcacaagattcactctcaaaaacac 23817750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 186 - 234
Target Start/End: Original strand, 28144701 - 28144749
Alignment:
Q  186 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacac 234  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||| || | ||||||||||||||    
T  28144701 acttcaaagcacgtccaacaccggttacaagattcactctcaaaaacac 28144749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 60)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Original strand, 23516405 - 23516683
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  23516405 acatcatcactctggatcacatgagatggatccgggaaatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcttgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 23516504  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    ||||||| || |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23516505 caactcgatatgccaccgttccaactctttctgatatctaatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 23516604  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23516605 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttt 23516683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Original strand, 23573606 - 23573884
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  23573606 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 23573705  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23573706 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 23573805  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  23573806 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttt 23573884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Original strand, 23440089 - 23440367
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||| |||||    
T  23440089 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaatacttcttgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 23440188  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    |  |||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23440189 cctctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttcattgacttcaaagcacgtccaacaccagt 23440288  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  23440289 cacaagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaacttaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttt 23440367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Original strand, 18775641 - 18775919
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  18775641 acatcatcactctggatcacatgagatggatctggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 18775740  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | ||||| |||  |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  18775741 ccactcgatacatcaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcagggcacgtccaacaccagt 18775840  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  18775841 cacaggagtgactctcaaaaagacgtggtctccctcctgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttt 18775919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 21984827 - 21984553
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| || |||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  21984827 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggtacatacctctgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaaggtgcggtggtaatc 21984728  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | ||||| ||||||||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21984727 ccactcgatacgccaccgttccagctctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccaat 21984628  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 285  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21984627 cacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccctcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataact 21984553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 22333409 - 22333131
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  22333409 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 22333310  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22333309 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 22333210  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22333209 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 22333131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Original strand, 25423053 - 25423331
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  25423053 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggtacatagttccgaagttgcaacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 25423152  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | ||  | ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  25423153 ccacctgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacgggccaataaatctcggagtcaacttctttcacttcaacgcacgtccaacaccagt 25423252  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  25423253 cacaagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatggtaactcttt 25423331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 46 - 289
Target Start/End: Original strand, 20798659 - 20798902
Alignment:
Q  46 aacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgat 145  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| || ||||||| || |||||||||||||    
T  20798659 aacatatttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccaatcgatatgccaccggtccaactctttctgat 20798758  T
Q  146 aactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttctt 245  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20798759 atttgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccggtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctcctt 20798858  T
Q  246 cttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  20798859 cttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttt 20798902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 25 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 26739213 - 26738949
Alignment:
Q  25 gatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcc 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| || ||| || ||||| ||||||    
T  26739213 gatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcttgcaaattcgaaagatgcgttggtaaacccactcgatacgcc 26739114  T
Q  125 accgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactc 224  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| |    
T  26739113 accgttccaattctttctgatatctgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacatccaacaccagtcacaggagtgaccc 26739014  T
Q  225 tcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    ||||||| |  || |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26739013 tcaaaaatatatgatctctttcttgaaactcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttt 26738949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 15000261 - 14999983
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  15000261 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 15000162  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15000161 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 15000062  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15000061 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacacttatcatgataactcttt 14999983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Original strand, 23471093 - 23471371
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| || ||| |    
T  23471093 acatcatctctttggatcacatgtgatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcgttggtaaac 23471192  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | ||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23471193 ccactcgatacgccaccgttccaattctttctgatacctgatacggaccaataaacctccaagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 23471292  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    ||| ||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  23471293 cacttgagtgactctcaaaaatacatgatctccttcttgaaactcaaggtcttgcctacgcttatcatgattactcttt 23471371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Original strand, 19769824 - 19770102
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||| | ||| |    
T  19769824 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaac 19769923  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | |||||||| ||||||||||  ||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19769924 ccactcggtaagccaccgttccgactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 19770023  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19770024 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 19770102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Original strand, 27610218 - 27610496
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||| ||| ||||||| ||| |    
T  27610218 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagttgcggtggtaaac 27610317  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27610318 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 27610417  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27610418 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 27610496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 23 - 289
Target Start/End: Original strand, 40708656 - 40708922
Alignment:
Q  23 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 122  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| || |||||||| |    
T  40708656 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 40708755  T
Q  123 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 222  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  40708756 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 40708855  T
Q  223 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40708856 tctcaaaaacacgcggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 40708922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 27669012 - 27668734
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  27669012 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacgtggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 27668913  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  | | |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27668912 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 27668813  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27668812 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 27668734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 27685922 - 27685644
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  27685922 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacgtggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 27685823  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  27685822 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggt 27685723  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27685722 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttt 27685644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 23 - 289
Target Start/End: Original strand, 34566370 - 34566636
Alignment:
Q  23 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 122  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||| || | ||| || |||||||| |    
T  34566370 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaag 34566469  T
Q  123 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 222  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||    
T  34566470 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgac 34566569  T
Q  223 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34566570 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 34566636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Original strand, 41770706 - 41770984
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||| | ||| |    
T  41770706 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaac 41770805  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  | | ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41770806 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaaaatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 41770905  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41770906 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 41770984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 23 - 289
Target Start/End: Original strand, 16356378 - 16356644
Alignment:
Q  23 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 122  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  || |  ||||||||||||||||| || | ||| || |||||||| |    
T  16356378 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggagaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaag 16356477  T
Q  123 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 222  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||    
T  16356478 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgac 16356577  T
Q  223 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16356578 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 16356644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Original strand, 22134532 - 22134810
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  22134532 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 22134631  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | |||||||| ||||| |||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  22134632 ccactcggtaagccactgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagt 22134731  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    || | |||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  22134732 cataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctgcgcttatcatggtaactcttt 22134810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Original strand, 27518271 - 27518549
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||| | ||| |    
T  27518271 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgtgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaac 27518370  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27518371 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 27518470  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    || | |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27518471 cataggagtgactctcaaaaacacgaggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 27518549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 29476595 - 29476317
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  29476595 acatcgtcactttggattacatgagatggatccgaaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 29476496  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| |||||| |||||||| ||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||    
T  29476495 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatacctgatatggaccaatgaacttcgtggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacatccgt 29476396  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29476395 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 29476317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 37292018 - 37291740
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  37292018 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacttactttcgaagttgagacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 37291919  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  37291918 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttttttgacttcaaggcacgtcctacaccagt 37291819  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  37291818 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacacttatcatgataactcttt 37291740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 11 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 20468618 - 20468341
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |    
T  20468618 acatcatctcttgggatcacatgagacggatccgaaacatacttccgaagttgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggtaaac 20468519  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | ||||  |||||||| |||   | ||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20468518 ccactcaatacgccactgtttctattctttctaatatctgacacggaccaataaacctcagagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 20468419  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    |||| |||||||||||||||| || |||||| |||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  20468418 cacaggagtgactctcaaaaatacatggtctccttcctgaaattcaaggtctttcctacgtttatcatgataactctt 20468341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 23 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 21343868 - 21343666
Alignment:
Q  23 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 122  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||||    
T  21343868 tggatcacatgggatggatccggaacatacttccgaagttgcaacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacg 21343769  T
Q  123 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 222  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||    
T  21343768 ccaccgttccaactctttctgatatcttatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgctcgtccaacaccagtcacaggagtgac 21343669  T
Q  223 tct 225  Q
    |||    
T  21343668 tct 21343666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 36 - 289
Target Start/End: Original strand, 22348314 - 22348565
Alignment:
Q  36 atggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaac 135  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| |||||||||| |||    
T  22348314 atggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtaggccaccgttccaac 22348413  T
Q  136 tctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacg 235  Q
    ||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| |||    
T  22348414 tctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacg 22348513  T
Q  236 tggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    |||||| ||||  |||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22348514 tggtctccttcccgaaactcaaga--ttttctacgcttatcgtgataactcttt 22348565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 11 - 252
Target Start/End: Original strand, 20573385 - 20573626
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  20573385 acatcatctctttggatcacatgagatggatctggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 20573484  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | ||||| ||||||||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||||| || | |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  20573485 ccactcgatacgccaccgttccaattctttccgatatctgatacggaccaataaaccttgaagtcaacttccttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 20573584  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaa 252  Q
    ||   |||||||||||||||| || || ||| ||||||||||    
T  20573585 cagtggagtgactctcaaaaatacatgatctccttcttgaaa 20573626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 90 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 21498479 - 21498280
Alignment:
Q  90 tcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgactt 189  Q
    ||||||||||||||| ||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21498479 tcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacaccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgactt 21498380  T
Q  190 caaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    |||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  || || ||| | ||||||||||| |  ||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  21498379 caattcacgtccaacaccggtcacaagagtgactctcaaaactacatgatctccctcttgaaactcgatgtctatcctacgcttatcatggtaactcttt 21498280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 48 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 21564451 - 21564211
Alignment:
Q  48 catacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataa 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || || ||||  || ||||| || | |||||| || ||||     
T  21564451 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccactgtccaaactctatcagatat 21564352  T
Q  148 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttct 247  Q
    |||||| ||||||||||| |  |||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||    
T  21564351 ctgatatggaccaataaaccgtggagtcaaattcttagacttcaaagcacgactaacacgtgtcacatgagtgactctcagaaacacatggtctccttct 21564252  T
Q  248 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  21564251 tgaaactcaaggtcctttcttcgcttgtcatgataactctt 21564211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 38 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 23442788 - 23442538
Alignment:
Q  38 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactc 137  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  ||  | |||  ||| ||||| |||| ||| |    
T  23442788 ggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaaccactttgtatgccactgttccaaccc 23442689  T
Q  138 tttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtg 237  Q
    | || |||||||||||||||||||| ||  | ||||||||| |||| ||||||||  ||||||| ||||| |||| | ||||||||||||||||||| ||    
T  23442688 tctcagataactgatacggaccaatgaactttggagtcaacatcttagacttcaacacacgtcctacacccgtcataggagtgactctcaaaaacacatg 23442589  T
Q  238 gtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
     ||| | ||||||||||||||| | || |||||||| ||||| ||||||||    
T  23442588 atctccctcttgaaactcaagagccttcctacgcttgtcatggtaactctt 23442538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 29 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 21891263 - 21891004
Alignment:
Q  29 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 128  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||  || || |||| ||| ||||| |    
T  21891263 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacatatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactg 21891164  T
Q  129 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 228  Q
    ||| ||| || || |||| ||||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||| | | || |||||||     
T  21891163 ttccaaccctctcagatatctgatacggaccaataaactttggagtcaacttcttagacttcaacgcacatcctacaccagtcataggtgtaactctcag 21891064  T
Q  229 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    |||||| || ||| | ||||||||||||||  | || |||||||| ||||| ||||||||    
T  21891063 aaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactctt 21891004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 12 - 288
Target Start/End: Original strand, 25847922 - 25848198
Alignment:
Q  12 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatcc 111  Q
    ||||||| ||| | |||||||| || ||||||| |||||||||| |||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || ||    
T  25847922 catcatccctcggaatcacatgtgaaggatccgcaacatacttctgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgaggtggcaaacc 25848021  T
Q  112 aactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 211  Q
    ||||| ||| ||||| |||| |||||| ||||| | ||||||||||||||| ||| | |||||||||||  | || |||||||||||||||||||| |||    
T  25848022 aactctgtatgccacagttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaatttaggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtccaacacccgtc 25848121  T
Q  212 acatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    | | |||||||||||||||| || || ||  | || |||||||||||||| ||| | ||||| ||||| ||||||||    
T  25848122 aaaggagtgactctcaaaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttttccgcttgtcatggtaactctt 25848198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 11 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 21662561 - 21662300
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||||  || |    
T  21662561 acatcatccctcggaatcacatgcgatggatccgatacatatttccgaagttgcgacacttgaaatacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggcaaac 21662462  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | ||||  |||| ||  |||| ||||||||| |||| |||||||  ||||||||| |||| |||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||  |    
T  21662461 ccactctatacgtcattgttccaactctttccgatatctgatac-aaccaataaacctcgaagtcaacttcttcgatttcaaggcacgaccaacacctat 21662363  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgctt 273  Q
    || | |||||||||| | |||||| || ||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  21662362 cataggagtgactcttagaaacacatgatctgcttcttgaaattcaaggtctttcctacgctt 21662300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 14887512 - 14887236
Alignment:
Q  12 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatcc 111  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || ||    
T  14887512 catcatctctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 14887413  T
Q  112 aactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 211  Q
    |||||  || ||||| || | || ||| ||||| | ||||||||||||||||||  | |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||    
T  14887412 aactctatatgccactgtaccaattctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtc 14887313  T
Q  212 acatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    | | ||||||| |||| ||| || || ||  | || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  14887312 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactctt 14887236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 29 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 24736115 - 24735856
Alignment:
Q  29 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 128  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| | |||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||  || || ||||  || ||||| |    
T  24736115 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaattgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatatgccactg 24736016  T
Q  129 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 228  Q
    ||| ||| || || |||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| | |||||||||||||    
T  24736015 ttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacccgtcataggagtgactctcaa 24735916  T
Q  229 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
     ||||| || ||| | |||||||||||||| || || |||||||| |||||||| |||||    
T  24735915 gaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctctt 24735856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 29 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 24737289 - 24737030
Alignment:
Q  29 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 128  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| | |||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||  || || ||||  || ||||| |    
T  24737289 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaattgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatatgccactg 24737190  T
Q  129 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 228  Q
    ||| ||| || || |||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| | |||||||||||||    
T  24737189 ttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacccgtcataggagtgactctcaa 24737090  T
Q  229 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
     ||||| || ||| | |||||||||||||| || || |||||||| |||||||| |||||    
T  24737089 gaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctctt 24737030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 29 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 24750058 - 24749799
Alignment:
Q  29 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 128  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| | |||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||  || || ||||  || ||||| |    
T  24750058 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaattgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatatgccactg 24749959  T
Q  129 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 228  Q
    ||| ||| || || |||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| | |||||||||||||    
T  24749958 ttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacccgtcataggagtgactctcaa 24749859  T
Q  229 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
     ||||| || ||| | |||||||||||||| || || |||||||| |||||||| |||||    
T  24749858 gaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctctt 24749799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 28924290 - 28924012
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || ||||| || ||||||||||| |  || |||||||| || || |||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  28924290 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatcaggtacatacttccgcaactgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatc 28924191  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    ||||||  |||||||| |||| |||||||||||| | |||||| ||||| || ||  | |||||||||||  | |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  28924190 caactctatacgccacagttccaactctttctgaaatctgataaggaccgatgaactttggagtcaactttctcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 28924091  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    || | |||| ||||||| ||| || |||||  |||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  28924090 cataggagtaactctcagaaaaacatggtcaccttcctgaaattcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttt 28924012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 12 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 37546018 - 37545744
Alignment:
Q  12 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatcc 111  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || ||    
T  37546018 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 37545919  T
Q  112 aactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 211  Q
    |||||  || ||||| || | |||||| || || | ||||||||||||||||||  | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||    
T  37545918 aactctatatgccacagtaccaactctctcagaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtc 37545819  T
Q  212 acatgagtgactctca-aaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 285  Q
    | | ||||||| |||| |||| || || ||  | || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  37545818 aaaggagtgaccctcagaaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaact 37545744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 29 - 289
Target Start/End: Original strand, 22461816 - 22462076
Alignment:
Q  29 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 128  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||| | |||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||  || |||||||  |||||||| |    
T  22461816 acatgcgaaggatctggtacatacttccgcaattgcgacacatgaaatacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatacgccacag 22461915  T
Q  129 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 228  Q
    ||| |||||||||||| | ||| || |||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| || ||||     
T  22461916 ttccaactctttctgaaatctggtaaggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcccacacccgtcataggagtaaccctcag 22462015  T
Q  229 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    ||| || |||||  |||| ||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||||    
T  22462016 aaaaacatggtcaccttcctgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttt 22462076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 24798904 - 24798642
Alignment:
Q  26 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 125  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||    
T  24798904 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 24798805  T
Q  126 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 225  Q
    | || | |||||| ||||| | ||||||||| ||||||||  | |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  24798804 cagtaccaactctctctgaaatctgatacggtccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcccgtccaacacccgtcaaaggagtgactct 24798705  T
Q  226 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    || ||| || || ||  | ||  ||||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||    
T  24798704 cagaaaaacatgatcaccctccagaaactcaagatccttccttcgcttgtcatggtaactctt 24798642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 28895464 - 28895186
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || ||||| || ||||||||||| |  || |||||||| || || |||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  28895464 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatcaggtacatacttccgcaactgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatc 28895365  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    ||||||  |||||||  |||| |||||||||||| | |||||| ||||| || ||  | |||||||||||  | |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  28895364 caactctatacgccagagttccaactctttctgaaatctgataaggaccgatgaactttggagtcaactttctcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 28895265  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    || | |||| ||||||| ||| || |||||  |||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  28895264 cataggagtaactctcagaaaaacatggtcaccttcctgaaattcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttt 28895186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 288
Target Start/End: Original strand, 20342129 - 20342405
Alignment:
Q  12 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatcc 111  Q
    ||||||| ||| | |||||||| || ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || ||    
T  20342129 catcatccctcggaatcacatgtgaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgaggtggcaaacc 20342228  T
Q  112 aactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 211  Q
    |||||  || ||||| || | |||||| ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||    
T  20342229 aactctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgtccaacacctgtc 20342328  T
Q  212 acatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    | | | |||||||||| ||| || || ||    || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  20342329 aaaggggtgactctcagaaaaacatgatcacgctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactctt 20342405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 26 - 234
Target Start/End: Original strand, 21404715 - 21404923
Alignment:
Q  26 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 125  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| || ||||||||||| |||| ||| || ||||  ||||| |    
T  21404715 atcacatgagatggatctgaaacatacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcatgtaagttcgaaagatgtggtggtaaacccactctatacgcaa 21404814  T
Q  126 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 225  Q
    | || | ||||||||| || | ||||||||  |||||||| | ||||||||  |||||||| || |  |||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  21404815 ctgtcccaactctttccgaaatctgatacgagccaataaaccacggagtcagtttctttgattttagcgcacgtccaacaccggtcacaagagtgactct 21404914  T
Q  226 caaaaacac 234  Q
     ||||||||    
T  21404915 aaaaaacac 21404923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 8 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 22236445 - 22236165
Alignment:
Q  8 tggacatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgata 107  Q
    ||||||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  |    
T  22236445 tggacatcatccctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggca 22236346  T
Q  108 atccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacacc 207  Q
    | |||||||  || | ||| |||| ||| || ||||||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||    
T  22236345 aaccaactctatatgacactgttccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacc 22236246  T
Q  208 agtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
     |||| | |||| || |||| ||| || || ||  | || |||||||||||  | || |||||||| ||||||||||||||    
T  22236245 cgtcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactctt 22236165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 21665986 - 21665761
Alignment:
Q  47 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 146  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||||  || || ||||  |||| ||  |||| ||||||||| ||||    
T  21665986 acatatttccgaagttgcgacacttgaaatacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggcaaacccactctatacgtcattgttccaactctttccgata 21665887  T
Q  147 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 246  Q
     |||||||  ||||||||| |||| |||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||  ||| | |||||||||| | |||||| || ||| ||||    
T  21665886 tctgataca-accaataaacctcgaagtcaacttcttcgatttcaaggcacgaccaacacctatcataggagtgactcttagaaacacatgatctgcttc 21665788  T
Q  247 ttgaaactcaagatcttttctacgctt 273  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  21665787 ttgaaattcaaggtctttcctacgctt 21665761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 26 - 288
Target Start/End: Original strand, 22381060 - 22381322
Alignment:
Q  26 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 125  Q
    |||||||| || ||||| |  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||    
T  22381060 atcacatgtgacggatctgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataagcca 22381159  T
Q  126 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 225  Q
    |||||| ||| || ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| ||||   ||||||| ||    
T  22381160 ccgttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcatcggagtgaccct 22381259  T
Q  226 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    || ||| || || ||  | || |||||||||||| | ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  22381260 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactctt 22381322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 26 - 288
Target Start/End: Original strand, 22502540 - 22502802
Alignment:
Q  26 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 125  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||    
T  22502540 atcacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 22502639  T
Q  126 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 225  Q
    | |||| |||||| ||||| | |||||||||||| || ||  | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||    
T  22502640 ctgttccaactctctctgaaatctgatacggaccgatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccct 22502739  T
Q  226 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    || ||| || || ||  | || |||||||||||| | ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  22502740 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactctt 22502802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 26 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 23080596 - 23080334
Alignment:
Q  26 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 125  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||  || ||||    
T  23080596 atcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgcaacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggtaaaccaactctataagcca 23080497  T
Q  126 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 225  Q
    | |||| ||| || ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| |||| | ||||||| ||    
T  23080496 ctgttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcttacacccgtcataggagtgaccct 23080397  T
Q  226 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    || ||| || || ||  | || |||||||  ||  | ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  23080396 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactatagggcctttctccgcttgtcatgataactctt 23080334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Original strand, 20773606 - 20773884
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || ||||| || ||||||||||| |  || |||||||| || || |||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  20773606 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatctggtacatacttccgcaactgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatc 20773705  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    ||||||  |||||||| |||| |||||||||||| | |||||| ||||| || ||  | |||||||||||  | |||||||| |||||||| || || ||    
T  20773706 caactctatacgccacagttccaactctttctgaaatctgataaggaccgatgaactttggagtcaactttctcgacttcaatgcacgtcctacgcccgt 20773805  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    || | |||| || |||| ||| || ||| |  |||| ||||||| ||| ||||| | |||||| |||||||| ||||||    
T  20773806 cataggagtaaccctcagaaaaacatggcccccttcctgaaactgaagctctttccgacgcttgtcatgatagctcttt 20773884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 29 - 289
Target Start/End: Original strand, 20821317 - 20821577
Alignment:
Q  29 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 128  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||| |  || |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||  || |||| ||  |||||||| |    
T  20821317 acatgcgaaggatcaggtacatacttccgcaactgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaattctatacgccacag 20821416  T
Q  129 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 228  Q
    ||| ||| |||||||| | |||||| |||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| || ||||     
T  20821417 ttccaaccctttctgaaatctgataaggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcag 20821516  T
Q  229 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    ||| || || ||  |||| ||||| ||||| |||||  ||||||| ||||| || ||||||    
T  20821517 aaaaacatgatcaccttcctgaaattcaaggtctttcttacgcttgtcatggtagctcttt 20821577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 47 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 17269819 - 17269578
Alignment:
Q  47 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 146  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||  || |||||||  || |||||||| |  |  || ||||| |    
T  17269819 acatacttccggagttgtgacacgtgaaatacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgtcccgatcctctctgaaa 17269720  T
Q  147 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 246  Q
     ||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||   |||| ||||| | ||| || || ||  | ||    
T  17269719 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctc 17269620  T
Q  247 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    ||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  17269619 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactctt 17269578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 11211057 - 11210939
Alignment:
Q  170 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 269  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| |||||| || | || ||||||||||| || ||  |  |||||||||||| |||||| || |    
T  11211057 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatctttcctcc 11210958  T
Q  270 gcttatcatgataactctt 288  Q
     ||||||||||||||||||    
T  11210957 tcttatcatgataactctt 11210939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 223 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 21339596 - 21339530
Alignment:
Q  223 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    ||||||||| || ||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21339596 tctcaaaaatacttggtctcgttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttt 21339530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 99
Target Start/End: Original strand, 21625382 - 21625470
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatg 99  Q
    |||||||| ||| | |||||||| || ||||||   |||||||| | ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  21625382 acatcatctctcggaatcacatgcgaaggatccactacatactttcaaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatg 21625470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 170 - 288
Target Start/End: Original strand, 27011089 - 27011207
Alignment:
Q  170 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 269  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || ||||||||| | || ||||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| || || |    
T  27011089 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacatgattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctcc 27011188  T
Q  270 gcttatcatgataactctt 288  Q
     ||||||||||||||||||    
T  27011189 tcttatcatgataactctt 27011207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 170 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 21937551 - 21937433
Alignment:
Q  170 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 269  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || |||||| || | || || |||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  21937551 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcacccttaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 21937452  T
Q  270 gcttatcatgataactctt 288  Q
     ||||||||||||||||||    
T  21937451 tcttatcatgataactctt 21937433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 170 - 288
Target Start/End: Original strand, 24581216 - 24581334
Alignment:
Q  170 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 269  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || |||||| || | || || | ||||||||| ||  |  |||||||||||| ||| || || |    
T  24581216 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcacccttacaaacacgtgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctcc 24581315  T
Q  270 gcttatcatgataactctt 288  Q
     ||||||||||||||||||    
T  24581316 tcttatcatgataactctt 24581334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 190 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 25244695 - 25244598
Alignment:
Q  190 caaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactct 287  Q
    ||||||||||||||||||    |||||| | |||||||||||||| || ||| |  |||||||||||| ||||||  | | ||||| |||||||||||    
T  25244695 caaagcacgtccaacaccgactacatgattcactctcaaaaacacatgatctccaacttgaaactcaatatctttcatcctcttatgatgataactct 25244598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 190 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 25308847 - 25308750
Alignment:
Q  190 caaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactct 287  Q
    ||||||||||||||||||    |||||| | |||||||||||||| || ||| |  |||||||||||| ||||||  | | ||||| |||||||||||    
T  25308847 caaagcacgtccaacaccgactacatgattcactctcaaaaacacatgatctccaacttgaaactcaatatctttcatcctcttatgatgataactct 25308750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 54)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 21167320 - 21167042
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  21167320 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatattttcgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaacc 21167221  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    ||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21167220 caactcgatacgccactgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 21167121  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21167120 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 21167042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 30313927 - 30313649
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||    
T  30313927 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaatttgaaagatgcggtggtaatc 30313828  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30313827 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 30313728  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  30313727 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttt 30313649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Original strand, 19977965 - 19978243
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||    
T  19977965 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggtacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 19978064  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | ||||| ||||||||||||| |||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19978065 ccactcgttacgccaccgttccaactatttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 19978164  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19978165 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcctttctacgcttatcatgataactcttt 19978243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 11 - 288
Target Start/End: Original strand, 15533378 - 15533655
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  15533378 acatcatcactttggatcacatgagatggatccgaaacatacttccgaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 15533477  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  15533478 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagc 15533577  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15533578 cacaggagtgactctcaaaaacatgtggtcaccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactctt 15533655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Original strand, 21250940 - 21251218
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  21250940 acatcatcactttggatcacatgggatggatctggtacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 21251039  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21251040 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagt 21251139  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21251140 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttattgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttt 21251218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 16408828 - 16408550
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  16408828 acatcatcactctggatcacatgagatagatccgggacacacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 16408729  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16408728 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 16408629  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  16408628 cacaagagtgactctcaacaatacgtggtctccttcttggaacttaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttt 16408550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 22164974 - 22164696
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  22164974 acatcatcactttggatcacatgtgatggatccgggacatacttccgaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 22164875  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | ||||| | ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22164874 ccactcgatgcgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttatttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 22164775  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    ||||||||||||| ||||||||||   |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22164774 cacatgagtgactttcaaaaacacaatgtctccttcctgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttt 22164696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 11 - 288
Target Start/End: Original strand, 32600142 - 32600419
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| | |||| |||||    
T  32600142 acatcatcactttggatcacatgagatagatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaacacgtcgtgcaaattcgaaagacgtggtggtaatc 32600241  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32600242 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggggtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 32600341  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  32600342 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactctt 32600419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 21922518 - 21922240
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||| |||||||| ||| |    
T  21922518 acatcatcgctttggatcacatgggatggatccagtacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacgtcgtgcaaattcgaaatatgcggtggtaaac 21922419  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  21922418 ccactcggtacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaatatatctcggagtcaacttcttcgacttcaaagcttgtccaacaccagt 21922319  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21922318 cacatgagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 21922240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 22133824 - 22133546
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || ||    
T  22133824 acatcatcactttggatcacatgtgatggattcgggacatacttccgaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtattc 22133725  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22133724 cgactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 22133625  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    |||||||||| |||||||||||||   |||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  22133624 cacatgagtgtctctcaaaaacacaatgtctccttcctgaaactcaagatctttcctacacttatcatgataactcttt 22133546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 21394648 - 21394370
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | || ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||    
T  21394648 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggtacatacttctgaagttgcgacacaggaaacacatcgtgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 21394549  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | ||||||||||||||||||   |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21394548 ccactcggtacgccaccgttacgactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagaacgtccaacaccagt 21394449  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  21394448 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcatgcgcttatcatgataactcttt 21394370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 21789141 - 21788863
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | || ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||    
T  21789141 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggtacatacttctgaagttgcgacacaggaaacacatcgtgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 21789042  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | ||||||||||||||||||   |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21789041 ccactcggtacgccaccgttacgactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagaacgtccaacaccagt 21788942  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  21788941 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcatgcgcttatcatgataactcttt 21788863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Original strand, 22046372 - 22046649
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  22046372 acatcatcactttg-atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 22046470  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22046471 ctactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacgaaccaataaacctcggagtcaatttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 22046570  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| || || || ||||||||||||||||||    
T  22046571 cactggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctaaaactcaagatccttcctgcgtttatcatgataactcttt 22046649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Original strand, 22032030 - 22032308
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  22032030 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgaaacatggaaaacatcgtgtaaattcgaaagatgcggtggtaatc 22032129  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | ||||| ||||||| ||||  ||||||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22032130 ctactcgatacgccaacgtttcaactctttccgatatctgatacaaaccaataaatctcggagtcaatttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 22032229  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| | || | |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  22032230 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccatcctaaaactcaagatccttcctacgtttatcatgataactcttt 22032308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Original strand, 23650039 - 23650317
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    |||| |||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  23650039 acattatcactttggatcacatgggatggatccagtacatacttccgaagttgcaacacaagaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 23650138  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  23650139 caactcgataagccaccgttccaactcttttcgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagt 23650238  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23650239 cacaggagtgactctcaaaaacatgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttt 23650317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 17674806 - 17674528
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  17674806 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 17674707  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17674706 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 17674607  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17674606 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 17674528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 23 - 289
Target Start/End: Original strand, 19112700 - 19112966
Alignment:
Q  23 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 122  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| || |||||||| |    
T  19112700 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 19112799  T
Q  123 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 222  Q
    |||| |||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  19112800 ccactgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 19112899  T
Q  223 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19112900 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 19112966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 252
Target Start/End: Original strand, 15441179 - 15441420
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||    
T  15441179 acatcatcactttggatcacatgagatggatccaaaacatacttacgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgaggtggtaatc 15441278  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
     ||| || ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  15441279 aaacacgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagc 15441378  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaa 252  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  15441379 cacaggagtgactctcaaaaacatgtggtcaccttcttgaaa 15441420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 20018533 - 20018255
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||| | ||| |    
T  20018533 acatcgtcactttggatcacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaac 20018434  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||   || ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20018433 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccagtatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 20018334  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20018333 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctcaaattcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttt 20018255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 19485653 - 19485375
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  19485653 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 19485554  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | |||||||| |||||||| | |||||||||  | | |||||| |||||||| ||  |||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  19485553 ccactcggtaagccaccgtcccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcgaggtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacaccagt 19485454  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19485453 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 19485375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Original strand, 22987199 - 22987477
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || || |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  22987199 acatcatctctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgtattacttcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 22987298  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | ||||| ||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||    
T  22987299 ccactcgatacgccaccgttccaattctttatgatatctgatacggaccaataaacttcagagtcaacttctttgacttcaatgcatgtccaacatcagt 22987398  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    |||  |||||||||| ||||| || || ||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22987399 cactggagtgactctaaaaaatacatgatctccttcttgaaaatcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttt 22987477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 286
Target Start/End: Original strand, 23948887 - 23949162
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||| ||| |    
T  23948887 acatcatctcttgggatcacatgagactgatccgaaacatacttccaaagttgcgacacatgaaacacatcgtgaaaattcgaaagatgcggtggtaaac 23948986  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | ||||| ||||||||||| | || ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  23948987 ccactcgctacgccaccgtactaattctttctgatatctgatacggaccaacaaacctcggagtcaacttctttgatttcaaagcacgtctaaaaccagt 23949086  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactc 286  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||    
T  23949087 cacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaaggtccttcctacgcttatcataataactc 23949162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 22120957 - 22120679
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |  | |||||| ||||||||||||| ||| |    
T  22120957 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaaaacgttgttcaaatttgaaagatgcggtggtaaac 22120858  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| |||||| |||||||| ||  |||  ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||    
T  22120857 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatatggaccaatgaacttcgaggtcaacttccttgacttcaatgcacgtcccacaccagt 22120758  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    || | |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22120757 cataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 22120679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 26 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 20396893 - 20396630
Alignment:
Q  26 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 125  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||| |||||||    
T  20396893 atcacatgagatggatccgaaacacacttccgaagttgttacacatgaaatgcatcatgcaaattcgaaagatgcggtagtaaacccactcgatacgcca 20396794  T
Q  126 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 225  Q
    |  ||  || ||||||||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||  ||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  20396793 ctatttcaattctttctgatatctgatacagaccaataaatcttagagtcagtttccttgacttcaatgcacgtcctacaccggtcacaggagtgactct 20396694  T
Q  226 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
     ||||| || |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20396693 aaaaaatacatggtctccttcctgaaactcaaggtcttttctacgcttatcatgataacacttt 20396630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 47 - 288
Target Start/End: Original strand, 20388133 - 20388374
Alignment:
Q  47 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 146  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||| |||||||||||| ||||  || || ||||  || | ||| || | |||||| || ||||    
T  20388133 acatacttccgaaattgcgacacattaaacacatcatgcacattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgtcactgtcccaactctctcagata 20388232  T
Q  147 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 246  Q
     || ||| ||||||||||| |  || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||| |||||| |||||| ||||    
T  20388233 tctaatatggaccaataaaccgtggggtcaacttcttagacttcaaagcacgaccaacacctgtcactagagtgactctcagaaacacatggtctccttc 20388332  T
Q  247 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  20388333 ttgaaactcaaggtcctttctacgcttgtcatgataactctt 20388374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 21682253 - 21681976
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||   ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||  || |    
T  21682253 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgtttcatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcattcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 21682154  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | ||||  || ||||| |||| ||| || || |||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  21682153 ccactctatatgccactgttccaaccctctcagatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgt 21682054  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    || | |||| ||||||| |||||| || ||| | ||||||||||||||  | || |||||||| ||||||||||||||    
T  21682053 cataggagtaactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactctt 21681976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 29 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 20010665 - 20010406
Alignment:
Q  29 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 128  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||  || || |||| ||| ||||| |    
T  20010665 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacgtgaaatacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactg 20010566  T
Q  129 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 228  Q
    ||| ||| || || |||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||   ||||||||||||     
T  20010565 ttccaaccctctcagatatctggtacggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacccacacccgtcatcggagtgactctcag 20010466  T
Q  229 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    |||||| || ||| | ||||||||||||||  | ||  ||||||| ||||| ||||||||    
T  20010465 aaacacatgatctccctcttgaaactcaagcgccttcttacgcttgtcatggtaactctt 20010406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 158 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 22378089 - 22377958
Alignment:
Q  158 ccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaa 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| || || ||| |||| ||||||||||    
T  22378089 ccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcactggagtgaccctcaaaaatacatgatctgcttcctgaaactcaa 22377990  T
Q  258 gatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22377989 tatctttcctacgcttatcatgataactcttt 22377958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 158 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 22384264 - 22384133
Alignment:
Q  158 ccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaa 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| || || ||| |||| ||||||||||    
T  22384264 ccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcactggagtgaccctcaaaaatacatgatctgcttcctgaaactcaa 22384165  T
Q  258 gatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22384164 tatctttcctacgcttatcatgataactcttt 22384133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 288
Target Start/End: Original strand, 6679110 - 6679386
Alignment:
Q  12 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatcc 111  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || ||    
T  6679110 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 6679209  T
Q  112 aactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 211  Q
    |||||  || ||||| || | |||||| ||||| | ||||||||||||||||||  | |||||||||||  | |||||||||||||| |||||||| |||    
T  6679210 aactctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgaccaacacccgtc 6679309  T
Q  212 acatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    | | ||||||| |||| ||| || || ||  | || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  6679310 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactctt 6679386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 12 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 804455 - 804182
Alignment:
Q  12 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatcc 111  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || ||    
T  804455 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 804356  T
Q  112 aactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 211  Q
    |||||  || ||||| || | || ||| ||||| | ||||||||||||||||||  | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||    
T  804355 aactctatatgccactgtaccaattctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtc 804256  T
Q  212 acatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 285  Q
    | | ||||||| |||| ||| || || ||  | || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  804255 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactccagatcctttcttcgcttgtcatggtaact 804182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 11 - 288
Target Start/End: Original strand, 23654925 - 23655202
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || |    
T  23654925 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 23655024  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | | |   ||  |||| |||| ||| || ||||||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  23655025 ccaatatatataccactgttcaaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgt 23655124  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    || | |||| ||||||| |||||  || ||| | ||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  23655125 cataggagtaactctcagaaacaaatgatctccgtcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactctt 23655202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 29 - 289
Target Start/End: Original strand, 1266255 - 1266515
Alignment:
Q  29 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 128  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |    
T  1266255 acatgcgaaggatccgttacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactg 1266354  T
Q  129 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 228  Q
    ||| ||| || ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||   |||| |||||||     
T  1266355 ttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcatcggagtaactctcag 1266454  T
Q  229 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    ||| || || ||  | || |||||||||||  | ||||| ||||| || ||||||||||||    
T  1266455 aaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcgtgataactcttt 1266515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 29 - 288
Target Start/End: Original strand, 19851427 - 19851686
Alignment:
Q  29 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 128  Q
    ||||| || |||||||  || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || || |||  ||| ||||| |    
T  19851427 acatgcgaaggatccgctacgtactttcgaagttgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 19851526  T
Q  129 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 228  Q
    ||| ||| || || |||| ||| || |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||| | ||||   ||||||||||||     
T  19851527 ttccaaccctctcagatatctggtatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacaaccgtcaacggagtgactctcag 19851626  T
Q  229 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    |||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||||||||||  |||| ||||||||    
T  19851627 aaacacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgccatggtaactctt 19851686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 29 - 288
Target Start/End: Original strand, 19857463 - 19857722
Alignment:
Q  29 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 128  Q
    ||||| || |||||||  || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || || |||  ||| ||||| |    
T  19857463 acatgcgaaggatccgctacgtactttcgaagttgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 19857562  T
Q  129 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 228  Q
    ||| ||| || || |||| ||| || |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||| | ||||   ||||||||||||     
T  19857563 ttccaaccctctcagatatctggtatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacaaccgtcaacggagtgactctcag 19857662  T
Q  229 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    |||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||||||||||  |||| ||||||||    
T  19857663 aaacacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgccatggtaactctt 19857722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 22062216 - 22061939
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |    
T  22062216 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 22062117  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    ||||||  || ||||| |||| ||| || |||||||  |||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| ||| |||| ||||| ||    
T  22062116 caactctatatgccacagttccaaccctctctgatatttgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcatgtcctacacccgt 22062017  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    || | |||| || |||| |||||| || ||  | || |||||||||||| | ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  22062016 cataggagtaaccctcagaaacacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttctccgcttgtcatggtaactctt 22061939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 11 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 16265401 - 16265127
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    |||||||| || || |||||||| || |||||||  |||||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || |    
T  16265401 acatcatccctttgaatcacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 16265302  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    ||||||  || ||||| |||| ||| || ||||| | |||||||||||| || ||  | |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| ||    
T  16265301 caactctatatgccactgttccaaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacatccaacacccgt 16265202  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 285  Q
    || | ||||||| |||| ||| || || ||  | || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  16265201 caaaggagtgaccctcagaaagacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaact 16265127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 12 - 285
Target Start/End: Original strand, 14565141 - 14565414
Alignment:
Q  12 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatcc 111  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || | ||| ||||| ||||||||||| ||||  || ||    
T  14565141 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacaaatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 14565240  T
Q  112 aactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 211  Q
    |||||  || ||||| || | |||||| ||||| | |||||| |||||||| ||  | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||    
T  14565241 aactctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatatggaccaatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtc 14565340  T
Q  212 acatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 285  Q
    | | ||||||| |||| ||| || || ||  | || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  14565341 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactccagatcctttcttcgcttgtcatggtaact 14565414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 29 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 21325175 - 21324914
Alignment:
Q  29 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaa-gatgcggtgataatccaactcggtacgccacc 127  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||| ||||  || |||||||  || |||||     
T  21325175 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaatgatgtggtggcaaaccaactctatatgccact 21325076  T
Q  128 gttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctca 227  Q
    |||| ||| || | ||||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| || ||||    
T  21325075 gttccaaccctctatgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctca 21324976  T
Q  228 aaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
     ||| || || ||  | || |||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||    
T  21324975 gaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatgataactcttt 21324914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 29 - 289
Target Start/End: Original strand, 20007866 - 20008126
Alignment:
Q  29 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 128  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||   || || ||||  || ||||| |    
T  20007866 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtagcaaacccactctatatgccactg 20007965  T
Q  129 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 228  Q
    ||| ||| || || |||| |||||| |||||||| ||  | ||||||| ||| || |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| |||||||     
T  20007966 ttccaaccctctcagatatctgatatggaccaatgaactttggagtcaccttgttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 20008065  T
Q  229 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    |||||| || ||| | ||||| ||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||||    
T  20008066 aaacacatgatctccctcttggaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttt 20008126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 258
Target Start/End: Original strand, 21840415 - 21840662
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||  || |    
T  21840415 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacgtggaatacatcatgcaaatttgaaagatgtggtggcaaac 21840514  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
      |||| ||| ||||| |||| ||| || || |||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||  |||| ||| ||||| ||    
T  21840515 tcactctgtatgccactgttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcagtgcacctcctacacctgt 21840614  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaag 258  Q
     | | |||| ||||| | |||||| || ||| | ||||||||||||||    
T  21840615 tataggagtaactcttagaaacacatgatctccctcttgaaactcaag 21840662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 288
Target Start/End: Original strand, 6603657 - 6603933
Alignment:
Q  12 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatcc 111  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || ||    
T  6603657 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 6603756  T
Q  112 aactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 211  Q
    |||||  || ||||| || | || ||| ||||| |  |||||||||||||| ||  | |||||||||||  | ||||||||||| || |||||||| |||    
T  6603757 aactctatatgccactgtaccaattctctctgaaatttgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgtc 6603856  T
Q  212 acatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    | | ||||||| |||| ||| || || ||  | || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  6603857 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactctt 6603933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 288
Target Start/End: Original strand, 28982356 - 28982632
Alignment:
Q  12 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatcc 111  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| || || ||||| || || || ||||| ||||||||||| ||||  || ||    
T  28982356 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatatttccgaagctgagaaacatgaaacacgtcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 28982455  T
Q  112 aactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 211  Q
    |||||  || ||||| || | || ||| ||||| | ||||||||| ||||||||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||    
T  28982456 aactctatatgccactgtaccaattctctctgaaatctgatacggtccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaggcacgtccaacacccgtc 28982555  T
Q  212 acatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    |   ||||||| |||| ||| || || ||  | || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  28982556 aacggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactctt 28982632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 288
Target Start/End: Original strand, 28987576 - 28987852
Alignment:
Q  12 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatcc 111  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| || || ||||| || || || ||||| ||||||||||| ||||  || ||    
T  28987576 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatatttccgaagctgagaaacatgaaacacgtcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 28987675  T
Q  112 aactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 211  Q
    |||||  || ||||| || | || ||| ||||| | ||||||||| ||||||||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||    
T  28987676 aactctatatgccactgtaccaattctctctgaaatctgatacggtccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaggcacgtccaacacccgtc 28987775  T
Q  212 acatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    |   ||||||| |||| ||| || || ||  | || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  28987776 aacggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactctt 28987852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 29 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 31417239 - 31416980
Alignment:
Q  29 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 128  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  ||  ||||||  || ||||| |    
T  31417239 acatgcgaaggatccgctacatacttccgtagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaagcaactctatatgccactg 31417140  T
Q  129 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 228  Q
    ||| ||| |||||||| | || |||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| |||||||     
T  31417139 ttccaaccctttctgaaatctaatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataagagtaactctcag 31417040  T
Q  229 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    ||| || || ||  | || |||||||||||  | ||| | ||||||||||| ||||||||    
T  31417039 aaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttatccgcttatcatggtaactctt 31416980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 223
Target Start/End: Original strand, 27347225 - 27347436
Alignment:
Q  12 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatcc 111  Q
    ||||||| ||| | |||||||| || |||||||  |||||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || ||    
T  27347225 catcatccctcggaatcacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtgccaaacc 27347324  T
Q  112 aactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 211  Q
    ||||   || ||||| || | ||| || ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||    
T  27347325 aactttatatgccactgtcccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtc 27347424  T
Q  212 acatgagtgact 223  Q
    | | ||||||||    
T  27347425 aaaggagtgact 27347436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 26 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 29304194 - 29303931
Alignment:
Q  26 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 125  Q
    |||||||| || ||||||   |||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||    
T  29304194 atcacatgtgaaggatcctctacatacttcctaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataagcca 29304095  T
Q  126 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 225  Q
    | |||| || ||| ||||| | |||||||||||| || |   | |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||   ||||||| ||    
T  29304094 ctgttccaattctctctgaaatctgatacggacctatgatctttggagtcaacttccttgacttcaatgcacgtcctacacccgtcattggagtgaccct 29303995  T
Q  226 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    || ||| || || ||  | || |||||||||||| | ||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  29303994 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttt 29303931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 47 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 31571589 - 31571348
Alignment:
Q  47 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 146  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||  || |||||||  || ||||||||||  | ||| ||||| |    
T  31571589 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttcctattctctctgaaa 31571490  T
Q  147 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 246  Q
     ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||  | || |||||||||||||| ||||| ||||   |||| ||||||| ||| || || ||  | ||    
T  31571489 tctgatacgggccaatgaatttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactctcagaaatacatgatcaccctc 31571390  T
Q  247 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    ||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  31571389 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactctt 31571348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 26 - 288
Target Start/End: Original strand, 12304771 - 12305033
Alignment:
Q  26 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 125  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||    
T  12304771 atcacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 12304870  T
Q  126 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 225  Q
    | |||  ||| || ||||| | |||||||||||| || ||  | |||||||||||  | |||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| ||    
T  12304871 ctgtttcaaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaggcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccct 12304970  T
Q  226 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
     | ||| || || ||  | || |||||||||||| | ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  12304971 aagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactctt 12305033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 170 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 20652957 - 20652839
Alignment:
Q  170 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 269  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||||||| || || ||  |  |||||||||| | ||| ||||| |    
T  20652957 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacatgattcactctcaaaaatacatgatcaccaacttgaaactctatatcctttctcc 20652858  T
Q  270 gcttatcatgataactctt 288  Q
     ||||| ||||||||||||    
T  20652857 tcttataatgataactctt 20652839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 170 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 21197126 - 21197010
Alignment:
Q  170 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 269  Q
    |||||||||||| |  ||||||||| ||| ||||| ||||| ||| || | |||||||||||||| || ||  || | |||||||||| ||| ||||| |    
T  21197126 ggagtcaacttcctacacttcaaagtacgaccaactccagttacaggattcactctcaaaaacacatgatcacctacctgaaactcaatatcctttctcc 21197027  T
Q  270 gcttatcatgataactc 286  Q
     ||||||||||||||||    
T  21197026 tcttatcatgataactc 21197010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 170 - 288
Target Start/End: Original strand, 22982593 - 22982711
Alignment:
Q  170 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 269  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||| |||||| | || ||  |  | |||||||||| ||||||||  |    
T  22982593 ggagtcaacttctgacacttcaaagcacgaccaacaccaatcacatgattcactctaaaaaacgcatgatcaccaacctgaaactcaatatcttttcacc 22982692  T
Q  270 gcttatcatgataactctt 288  Q
      |||||||||||||||||    
T  22982693 ttttatcatgataactctt 22982711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 168 - 285
Target Start/End: Original strand, 22051018 - 22051135
Alignment:
Q  168 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttct 267  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||   |||| ||| ||||||| || || ||  | ||||||||||||||  | || ||    
T  22051018 tcggagtcaacttccttgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactttcaaaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggccttcct 22051117  T
Q  268 acgcttatcatgataact 285  Q
     ||||||||||| |||||    
T  22051118 ccgcttatcatggtaact 22051135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 22179341 - 22179309
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatcc 43  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22179341 acatcatcactttggatcacatgagatggatcc 22179309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 4)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 13 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 279171 - 278895
Alignment:
Q  13 atcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatcca 112  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  279171 atcatcactctgaatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccc 279072  T
Q  113 actcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtca 212  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  279071 actcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggacctataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcttgtcccacaccagtca 278972  T
Q  213 catgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  278971 caggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 278895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 165052 - 164774
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||  |||||||||||||||||||||| | | |    
T  165052 acatcatctctttgaatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacatatgaaacacattgtgcaaattcgaaagatgcggtggtgaac 164953  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | ||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  164952 ccactcgatacgccaccgttccaattctttctgatatctgatacggaccaataaacctcgaagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 164853  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  164852 cacatgagtgactctcaaaaatacgtgatctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttt 164774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Original strand, 308622 - 308900
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  308622 acatcgtcactttggattacatgagatggatccagaacatactttcgaagttacgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 308721  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||  | || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  308722 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaataaactttggggttaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 308821  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  308822 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 308900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #4
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 285
Target Start/End: Original strand, 260271 - 260545
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||||||  ||||  || |    
T  260271 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatatggtggcaaac 260370  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
     |||||  || |||||||||| ||  || ||||| | ||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | || || ||||||||||| ||||| ||    
T  260371 aaactctatatgccaccgttctaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgattttaaagcacgtcctacacccgt 260470  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 285  Q
    ||   |||| ||||||||||| || || ||  | || |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||    
T  260471 catcggagtaactctcaaaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttatcatggtaact 260545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Original strand, 65369 - 65646
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  65369 acatcatcact-tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 65467  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | ||||| || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  65468 ccactcgataagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacgccagt 65567  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  65568 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttt 65646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 40132 - 39924
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  40132 acatcatcactctggatcacatgagatggatccgaaacatacttccgaagttgtgacacatgaaagacatcatgcaagttcgaaagatgcggtggtaatc 40033  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    ||||||  ||||||||||||| |||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40032 caactcaatacgccaccgttccaactctttcccatatccgatacggaccaataaatctcggagtcaaattctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 39933  T
Q  211 cacatgagt 219  Q
    |||| ||||    
T  39932 cacaggagt 39924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 52)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 16355525 - 16355253
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16355525 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 16355426  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | ||||| ||||||||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16355425 ccactcgatacgccaccgttccaagtctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 16355326  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataa 283  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  16355325 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtttccttcttgaaattcaagatctttcctgcgcttatcatgataa 16355253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 16252525 - 16252247
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||    
T  16252525 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttctgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgtggtggtaatc 16252426  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16252425 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 16252326  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  16252325 cacaagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttt 16252247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Original strand, 12523608 - 12523886
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||    
T  12523608 acatcgtcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaatttgaaagatgcggtggtaatc 12523707  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  12523708 caactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagt 12523807  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  12523808 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacggttatcatgataactcttt 12523886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Original strand, 7090365 - 7090642
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  7090365 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggtacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 7090464  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  7090465 ccactcggtacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacg-agcaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagctcatccaacaccagt 7090563  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7090564 cacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttt 7090642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 44 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 15150053 - 15149808
Alignment:
Q  44 ggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctg 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||||| ||||||||| |    
T  15150053 ggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgtcaccgttccaactctttccg 15149954  T
Q  144 ataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttc 243  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  15149953 atatctgatacggaccaataaatctcagagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctcc 15149854  T
Q  244 ttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  15149853 ttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttt 15149808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Original strand, 14680499 - 14680777
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||| |||||    
T  14680499 acatcgtcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaacacgtcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 14680598  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  14680599 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggggtcaacttatttgacttcaatgcacgtcctacaccagt 14680698  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  14680699 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctcgttcctgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttt 14680777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 18227526 - 18227248
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  18227526 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatacggtggtaatc 18227427  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | ||||| |||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18227426 ccactcgatacgccactgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcagagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 18227327  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  || || |||||||||||||||||||||    
T  18227326 cacaggagtgactctcaaaaacacgtgctctccttcctgaaactcaagattcttcctgcgcttatcatgataactcttt 18227248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Original strand, 14652240 - 14652518
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||  |||||||||||||||||||||| | | |    
T  14652240 acatcatctctttgaatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacatatgaaacacattgtgcaaattcgaaagatgcggtggtgaac 14652339  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | ||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14652340 ccactcgatacgccaccgttccaattctttctgatatctgatacggaccaataaacctcgaagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 14652439  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14652440 cacatgagtgactctcaaaaatacgtgatctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttt 14652518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 11 - 288
Target Start/End: Original strand, 14159424 - 14159701
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  14159424 acatcatcactctgaatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttccgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 14159523  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | |||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14159524 ccactcggtaagccaccgttccaattctttctgatatctgatatggaccaataaacctcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 14159623  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    ||   |||| |||||||  ||||| || ||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14159624 catgggagtaactctcaggaacacatgatctcctccttgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 14159701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 14304057 - 14303780
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  14304057 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 14303958  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  14303957 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcgg-gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggt 14303859  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14303858 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 14303780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 23 - 289
Target Start/End: Original strand, 18297149 - 18297415
Alignment:
Q  23 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 122  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| || |||||||| |    
T  18297149 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 18297248  T
Q  123 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 222  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  18297249 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 18297348  T
Q  223 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18297349 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 18297415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 19778873 - 19778595
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  19778873 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 19778774  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | ||||| || |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19778773 ccactcgataagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 19778674  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19778673 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 19778595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 23 - 289
Target Start/End: Original strand, 23955691 - 23955957
Alignment:
Q  23 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 122  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||| | ||| || |||||||| |    
T  23955691 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttatgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 23955790  T
Q  123 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 222  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  23955791 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 23955890  T
Q  223 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23955891 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 23955957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 23 - 289
Target Start/End: Original strand, 8386356 - 8386622
Alignment:
Q  23 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 122  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| || |||||||| |    
T  8386356 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 8386455  T
Q  123 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 222  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  8386456 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 8386555  T
Q  223 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8386556 tctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 8386622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 23 - 289
Target Start/End: Original strand, 12476544 - 12476810
Alignment:
Q  23 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 122  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |  |||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||| |    
T  12476544 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgatacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaacccactcggtaag 12476643  T
Q  123 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 222  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  12476644 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 12476743  T
Q  223 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12476744 tctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttt 12476810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 14851446 - 14851168
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    |||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  14851446 acatcatctcttgggagcacatgagatggatccggaacatacttccgaatttgcgacacatgaaatacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 14851347  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | ||||| ||||||||||||| || ||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  14851346 ccactcgatacgccaccgttccaattctttcctatatctgatacggaccaataaacctcggagttaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccggt 14851247  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    ||||||||||||||| ||||| || || ||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14851246 cacatgagtgactctaaaaaatacatgatctccttcttgaaactcaaggtttttcctacgcttatcatgataactcttt 14851168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Original strand, 27711268 - 27711546
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||| | ||| |    
T  27711268 acatcgtcactttgaattacatgagatggatccggaacatacttttgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaac 27711367  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27711368 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 27711467  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27711468 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 27711546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 14266979 - 14266701
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  14266979 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccgaaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 14266880  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  14266879 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcatacaccagt 14266780  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    || | | |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14266779 cataggggtgactctcaaaaacatgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 14266701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 23 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 29039472 - 29039206
Alignment:
Q  23 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 122  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||| || | ||| || |||||||| |    
T  29039472 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaag 29039373  T
Q  123 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 222  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||    
T  29039372 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgac 29039273  T
Q  223 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29039272 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 29039206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Original strand, 40472972 - 40473250
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  40472972 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 40473071  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | |||||||| |||| ||||| |||||||||  ||| ||||||| ||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40473072 ccactcggtaagccatcgttccaactctttccaatatctgatacagaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 40473171  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    || | |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40473172 cataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcgtgataactcttt 40473250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 23 - 276
Target Start/End: Original strand, 15364330 - 15364583
Alignment:
Q  23 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 122  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| || |||||||| |    
T  15364330 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacatatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 15364429  T
Q  123 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 222  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  15364430 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 15364529  T
Q  223 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatc 276  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15364530 tctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatc 15364583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 8053703 - 8053425
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||| | ||| |    
T  8053703 acatcgtcactttggatcacatgagatggatccgaaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaac 8053604  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | || ||||| |||| ||||| |||||||||   || ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8053603 ccacacggtaagccatcgttccaactctttccagtatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 8053504  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  8053503 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatctcttctacgcttatcgtgataactcttt 8053425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 14927339 - 14927151
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  14927339 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 14927240  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgt 199  Q
    | |||| ||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  14927239 ccactcagtacgccactgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctaggagtcaaattctttgacttcaatgcacgt 14927151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 29 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 15003686 - 15003426
Alignment:
Q  29 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 128  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || || ||||  || ||||| |    
T  15003686 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccactg 15003587  T
Q  129 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 228  Q
    ||| |||||| || |||| |||||| ||| |||||||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| ||||||||    
T  15003586 ttccaactctctcagatatctgatatggatcaataaacttaggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacctgtcataggagtaactctcaa 15003487  T
Q  229 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    |||||| || ||| | ||||||||||||||   |||||||||||| ||||| |||||||||    
T  15003486 aaacacatgatctccctcttgaaactcaagggattttctacgcttgtcatggtaactcttt 15003426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 12 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 3265133 - 3264857
Alignment:
Q  12 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatcc 111  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || ||    
T  3265133 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 3265034  T
Q  112 aactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 211  Q
    |||||  || ||||| || | |||||| ||||| | ||||||||||||||||||  | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||    
T  3265033 aactctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtc 3264934  T
Q  212 acatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    | | ||||||| |||| ||| || || ||  | || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  3264933 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactctt 3264857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 11207570 - 11207294
Alignment:
Q  12 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatcc 111  Q
    ||||||| ||| | |||||||| || ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || ||    
T  11207570 catcatccctcggtatcacatgtgaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgaggtggcaaacc 11207471  T
Q  112 aactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 211  Q
    |||||  || ||||| || | |||||| ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||    
T  11207470 aactctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtc 11207371  T
Q  212 acatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    | | |||||||||||| ||| || || ||  | || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  11207370 aaaggagtgactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactctt 11207294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 29 - 288
Target Start/End: Original strand, 16145862 - 16146121
Alignment:
Q  29 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 128  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |    
T  16145862 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgtaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccacag 16145961  T
Q  129 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 228  Q
    ||| |||||| ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| |||||||     
T  16145962 ttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 16146061  T
Q  229 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    ||| || || || || || |||||||||||  | || |||||||| ||||||||||||||    
T  16146062 aaatacatgatcatcctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactctt 16146121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 29453876 - 29453600
Alignment:
Q  12 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatcc 111  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || ||    
T  29453876 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 29453777  T
Q  112 aactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 211  Q
    |||||  || ||||| || | |||||| ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||  | ||||||||||| || |||||||| |||    
T  29453776 aactctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgtc 29453677  T
Q  212 acatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    | | ||||||| |||| ||| || || ||  | || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  29453676 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactctt 29453600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 26 - 288
Target Start/End: Original strand, 15070360 - 15070622
Alignment:
Q  26 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 125  Q
    |||||||| || |||||||   ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || || || | ||| ||||    
T  15070360 atcacatgcgaaggatccgctgcatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccaccctgtatgcca 15070459  T
Q  126 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 225  Q
    | |||| |||||| ||  ||| ||| || |||||||||||  ||| |||||||||| |  |||||||  |||| || ||||| |||| | ||||||||||    
T  15070460 ctgttccaactctctcaaatatctggtatggaccaataaacttcgtagtcaacttcataaacttcaacacacgacctacacccgtcataggagtgactct 15070559  T
Q  226 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    || |||||| || ||| | ||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  15070560 cagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttcttcgcttgtcatggtaactctt 15070622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 18607910 - 18607823
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagat 98  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  18607910 acatcttcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagat 18607823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 26 - 288
Target Start/End: Original strand, 33222865 - 33223127
Alignment:
Q  26 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 125  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||    
T  33222865 atcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcatgttcgaaagatggggtggcaaaccaactctatatgcca 33222964  T
Q  126 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 225  Q
    | |||| |||||| | ||| | ||||||||||||||| ||  | || ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| | ||||||| ||    
T  33222965 ctgttccaactctctttgaaatctgatacggaccaatgaactttggtgtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcaaaggagtgaccct 33223064  T
Q  226 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    || ||| || || ||  | || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  33223065 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagttcctttcttcgcttgtcatggtaactctt 33223127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 29 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 1649599 - 1649403
Alignment:
Q  29 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 128  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |    
T  1649599 acatgtgaaggatccgctacatacttccgtagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaacccaactctatatgccacag 1649500  T
Q  129 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 225  Q
    ||| ||  || ||||||| ||||||||||||||| ||  | | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| | |||| |||||    
T  1649499 ttccaatcctctctgatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacacccgtcataggagtaactct 1649403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 257
Target Start/End: Original strand, 15245856 - 15246102
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||||||| |||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||  || |    
T  15245856 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttctgaagttgcgacacatgaaacacataatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 15245955  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
      |||| ||| ||||| |||| ||| || |||| || ||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  15245956 gcactctgtatgccactgttccaaccctctctgttatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgt 15246055  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaa 257  Q
    || | | || ||||||| ||| || || ||| | || ||||||||||    
T  15246056 cataggggtaactctcagaaatacatgatctccctcctgaaactcaa 15246102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 26 - 288
Target Start/End: Original strand, 20890930 - 20891191
Alignment:
Q  26 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 125  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| | ||  || ||| | |  || ||||    
T  20890930 atcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtgttggaaacccatc-ctatatgcca 20891028  T
Q  126 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 225  Q
    | |||| ||| || ||||| | |||||||| |||||||||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| ||    
T  20891029 ctgttccaaccctctctgaaatctgatacgaaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccct 20891128  T
Q  226 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    || ||| || || ||  | || |||||||||||| | ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  20891129 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactctt 20891191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 26 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 44662191 - 44661929
Alignment:
Q  26 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 125  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||    
T  44662191 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 44662092  T
Q  126 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 225  Q
    | |||| |||||| ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||  | |||||||  ||||| |||||||| |||| | |||| || ||    
T  44662091 ctgttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcagcgcacgaccaacacccgtcaaaggagtaaccct 44661992  T
Q  226 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    || ||| || || ||  | || |||||||||||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||    
T  44661991 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttctccgcttgtcacggtaactctt 44661929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 179 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 15415198 - 15415088
Alignment:
Q  179 ttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcat 278  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  15415198 ttcttcgatttcaaggcacgaccaacacctatcacaagagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaattcaaggtctttcctacgcttatcat 15415099  T
Q  279 gataactcttt 289  Q
    |||||||||||    
T  15415098 gataactcttt 15415088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 47 - 212
Target Start/End: Original strand, 42702871 - 42703036
Alignment:
Q  47 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 146  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||  || |||||||  || ||||||||||  | ||| ||||| |    
T  42702871 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccgattctctctgaaa 42702970  T
Q  147 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtca 212  Q
     ||||||||||||||| ||  |||||||||||||  | || |||||||||||||| ||||| ||||    
T  42702971 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtca 42703036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 47 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 51606485 - 51606320
Alignment:
Q  47 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 146  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||  || |||||||  || ||||||||||  | ||| ||||| |    
T  51606485 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccgattctctctgaaa 51606386  T
Q  147 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtca 212  Q
     ||||||||||||||| ||  |||||||||||||  | || |||||||||||||| ||||| ||||    
T  51606385 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtca 51606320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 66 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 18164474 - 18164332
Alignment:
Q  66 acacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaa 165  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || || |||| ||| ||||| |||| ||| || ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  18164474 acacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaa 18164375  T
Q  166 tctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacacca 208  Q
      | ||||||| |||||| |||||||| |||| ||| ||||||    
T  18164374 ctttggagtcagcttcttagacttcaatgcacatcctacacca 18164332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 216 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 16676578 - 16676505
Alignment:
Q  216 gagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  16676578 gagtgactctcaaaaacacgtggtctccttgctgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttt 16676505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 140 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 15359301 - 15359153
Alignment:
Q  140 tctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggt 239  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||| | |||| ||||||  ||| || || |    
T  15359301 tctgatatctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttcgatttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcggaaatacatgat 15359202  T
Q  240 cttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    || | ||||||||||||||  | ||||||||||| |||||| |||||||    
T  15359201 ctccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatgaaaactctt 15359153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 15415301 - 15415226
Alignment:
Q  29 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtg 104  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  15415301 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaggatgtggtg 15415226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 186 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 12132574 - 12132472
Alignment:
Q  186 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||| || ||  |  ||||||||||||  || || || | |||||||||| ||||    
T  12132574 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatgtccttcctcctcttatcatgacaact 12132475  T
Q  286 ctt 288  Q
    |||    
T  12132474 ctt 12132472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 170 - 288
Target Start/End: Original strand, 13247736 - 13247854
Alignment:
Q  170 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 269  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||| | ||||||||  |||||||| | || |||||||| || || ||  |  |||||||||||| ||||||||| |    
T  13247736 ggagtcaacttcctacacttcaaagcaagaccaacaccgatcacatgattcaccctcaaaaatacatgatcaccaacttgaaactcaatatcttttctcc 13247835  T
Q  270 gcttatcatgataactctt 288  Q
     ||||||||||||||||||    
T  13247836 tcttatcatgataactctt 13247854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 9849681 - 9849616
Alignment:
Q  148 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 213  Q
    |||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  9849681 ctgataaggaccaataaaacacggtgtcaacttcttggacttcaaagcacgaccaacaccggtcac 9849616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 172 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 55375537 - 55375421
Alignment:
Q  172 agtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgc 271  Q
    |||||||||| |  |||||||||| || ||||||||||| ||| || | || ||||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| | |    
T  55375537 agtcaacttcatacacttcaaagctcgaccaacaccagttacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctc 55375438  T
Q  272 ttatcatgataactctt 288  Q
    |||||||||||||||||    
T  55375437 ttatcatgataactctt 55375421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 223 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 1640293 - 1640227
Alignment:
Q  223 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    ||||||||| || || ||| ||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  1640293 tctcaaaaatacatgatctccttcttggaactcaaggtctttcctatgcttatcatgataactcttt 1640227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 170 - 288
Target Start/End: Original strand, 14997407 - 14997525
Alignment:
Q  170 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 269  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || |||||| || | || ||||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  14997407 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaagattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 14997506  T
Q  270 gcttatcatgataactctt 288  Q
     ||||||||||| ||||||    
T  14997507 tcttatcatgatgactctt 14997525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 285
Target Start/End: Original strand, 16752665 - 16752799
Alignment:
Q  151 atacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttga 250  Q
    |||||||||||| ||  ||||||| |||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||   |||| ||||||||||| || || ||  | || |||    
T  16752665 atacggaccaatgaacttcggagttaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactctcaaaaatacatgatcaccctcctga 16752764  T
Q  251 aactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 285  Q
    ||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||    
T  16752765 aactcaagggcctttctccgcttatcatggtaact 16752799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 15351966 - 15351934
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatcc 43  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15351966 acatcatcactctggatcacatgagatggatcc 15351934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 170 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 16445393 - 16445275
Alignment:
Q  170 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 269  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| || || ||||||||| || | || || |||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| || || |    
T  16445393 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgacccactccagtcacaggattcaccctaaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctcc 16445294  T
Q  270 gcttatcatgataactctt 288  Q
     ||||||||||||||||||    
T  16445293 tcttatcatgataactctt 16445275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 15359379 - 15359326
Alignment:
Q  29 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatca 82  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  15359379 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatca 15359326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 61)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Original strand, 19864483 - 19864761
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  19864483 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttctgaagttgcgacacatgaaagacatcatacaaattcgaaagatgcggtggtaatc 19864582  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | ||||| ||||||||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19864583 ccactcgatacgccaccgttccaaatctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacatccaacaccagt 19864682  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  19864683 cacaggagtgactctaaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctgcacttatcatgataactcttt 19864761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 13 - 289
Target Start/End: Original strand, 12497824 - 12498100
Alignment:
Q  13 atcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatcca 112  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  12497824 atcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccc 12497923  T
Q  113 actcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtca 212  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  12497924 actcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgttacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgaattcaaggcacgtccaacaccggtca 12498023  T
Q  213 catgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  12498024 caagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttt 12498100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 13 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 12511077 - 12510801
Alignment:
Q  13 atcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatcca 112  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  12511077 atcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccc 12510978  T
Q  113 actcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtca 212  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  12510977 actcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgttacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgaattcaaggcacgtccaacaccggtca 12510878  T
Q  213 catgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  12510877 caagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttt 12510801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 21833466 - 21833188
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21833466 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 21833367  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | ||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21833366 ccactcgatacgccaccattccaactctttccgatatctgatacggacctataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacctccaacaccagt 21833267  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  21833266 cacaggagtgactctcaaaaacatgtggtttccttcttgaaattcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttt 21833188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 11 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 25765774 - 25765498
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||    
T  25765774 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttacgacacatggaacacatcgtgcaagttcgaaagatgcggtggtaatc 25765675  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | ||||| ||| ||||||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25765674 ccactcgatacaccaccgttccaactctttccgatatctgatacagaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 25765575  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    |||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25765574 caca-gcgtgactctcaaaagcacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 25765498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 13 - 289
Target Start/End: Original strand, 12505153 - 12505429
Alignment:
Q  13 atcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatcca 112  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||     
T  12505153 atcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgaaaaatcgaaagatgcggtggtaatccc 12505252  T
Q  113 actcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtca 212  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  12505253 actcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgttacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgaattcaaggcacgtccaacaccggtca 12505352  T
Q  213 catgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  12505353 caagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttt 12505429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 16963852 - 16963574
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  16963852 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggtacatactttcgaagttgcgacacatgtaatacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 16963753  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    |||| || ||||||| ||||| |||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16963752 caacacgatacgccatcgttccaactatttccgatatctgatatggaccaataaatctcggagtcaacttcttttacttcaaagcacgtccaacaccagt 16963653  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  16963652 cacaggagtgactctcaaaaacacttggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttt 16963574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 16928125 - 16927847
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || | ||| ||| |||||||||||||||||| |||||    
T  16928125 acatcatcactctgtatcacatgagatggatccggtacatactttcgaagttgcgacacatgtaatatatcgtgcgaattcgaaagatgcggtggtaatc 16928026  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    |||  || ||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16928025 caagacgatacgccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacactagt 16927926  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  16927925 cacaagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttt 16927847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 27331918 - 27331640
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  27331918 acatcatcactttggatcacatgggatggatccagaacatacttccgaagttgcgacacatcaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 27331819  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||    
T  27331818 ccactcggtacgccaccgttccaactctttctgatatctgatatggaccaataaatctcggagtcaacttcctttacttcaatgcacgtccaacaccagt 27331719  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27331718 cacaggagtgactctcaaaaatacgtgatccccttcttgaaactcaaggtcttttctacgcttatcatggtaactcttt 27331640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 27392658 - 27392380
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  27392658 acatcatcactttggatcacatgggatggatccagaacatacttccgaagttgcgacacatcaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 27392559  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||    
T  27392558 ccactcggtacgccaccgttccaactctttctgatatctgatatggaccaataaatctcggagtcaacttcctttacttcaatgcacgtccaacaccagt 27392459  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27392458 cacaggagtgactctcaaaaatacgtgatccccttcttgaaactcaaggtcttttctacgcttatcatggtaactcttt 27392380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 22079173 - 22078895
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  22079173 acatcatcactttggatcacatgggatggatcaggaacatacttccgaagttgctacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 22079074  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | ||||| ||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  22079073 ccactcgatacgccaccgtaccaactctttccgatatctgatacggacgaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccaat 22078974  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  22078973 cacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctaagcttatcatgataactcttt 22078895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 25610346 - 25610068
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||| ||| |    
T  25610346 acatcatcactttggatcacatgggatggatccgatacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgcgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 25610247  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    |||| || ||||||||||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25610246 caacacgatacgccaccgttccaactctttccgatatctaatacggaccaataaatctcggaatcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccggt 25610147  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    |||| | |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  25610146 cacaggtgtgactctcaaaaacatgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatggtaactcttt 25610068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 11 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 18408428 - 18408154
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||| ||||||| |||||    
T  18408428 acatcatcactttggatcacatgggatgaatccggtgcatactttcgaagttgcgacacatgaaacacatagtgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 18408329  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | || || ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18408328 ccacccgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 18408229  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 285  Q
    |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  18408228 cacacgagttactctcaaaaatacgtggtcttcttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatggtaact 18408154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 11 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 5839704 - 5839427
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  5839704 acatcatcactctggatcacatgggatggatccggtacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgtaaattcgaaagatgcggtggtaaac 5839605  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    ||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  5839604 caactcgatacgccactgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaacttcgaagtcaacttcttagacttcaacgcacgtcctacacctgt 5839505  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    || | |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  5839504 cataggagtgactctcaaaaacgtgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactctt 5839427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Original strand, 23078265 - 23078543
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  23078265 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgatacatgtaatacttcttgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 23078364  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | ||||| ||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  23078365 ccactcgatacgccaccgtttaaactctttccgatatctgatacgaacaaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcgcgcccaacaccagt 23078464  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23078465 cacaggagtgactctcaaaaatacgtgatctccctcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttt 23078543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 16627202 - 16626924
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||| | ||| |    
T  16627202 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaac 16627103  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16627102 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 16627003  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16627002 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 16626924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 28263682 - 28263404
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  28263682 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 28263583  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | |||||||| |||||||| | |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28263582 ccactcggtaagccaccgtcccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 28263483  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28263482 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 28263404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 28342431 - 28342153
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  28342431 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 28342332  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | |||||||| |||||||| | |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28342331 ccactcggtaagccaccgtcccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 28342232  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28342231 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 28342153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 17 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 1543563 - 1543291
Alignment:
Q  17 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactc 116  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||| || ||||    
T  1543563 tcactctggattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactc 1543464  T
Q  117 ggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatg 216  Q
    |||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||| ||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | |    
T  1543463 ggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacagaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgccctacaccagtcatagg 1543364  T
Q  217 agtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  1543363 agtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctgcgcttatcatggtaactcttt 1543291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 24313653 - 24313375
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  24313653 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 24313554  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24313553 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 24313454  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  24313453 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctatgcttatcatgataactcttt 24313375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Original strand, 25112348 - 25112626
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  25112348 acatcgtcactctggattacatgagatggatccggaacatacttctgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 25112447  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | |||||||| ||||||||||  ||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25112448 ccactcggtaagccaccgttccgactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcagcttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 25112547  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    || | |||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25112548 cataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataagtcttt 25112626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 23 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 29592393 - 29592127
Alignment:
Q  23 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 122  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||| || | ||| || |||||||| |    
T  29592393 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaag 29592294  T
Q  123 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 222  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  29592293 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 29592194  T
Q  223 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29592193 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 29592127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 2875288 - 2875010
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  2875288 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 2875189  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | |||||||| ||||| |||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2875188 ccactcggtaagccactgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttatttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 2875089  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    || | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2875088 cataggagtgactctcaaaaactcgtggtctccttcttgaaactcaaaatcttttctacgcttatcatgataactcttt 2875010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Original strand, 27187232 - 27187510
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| | | ||| |    
T  27187232 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgctgcggtaaac 27187331  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  | | |||||| |||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  27187332 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaatttcggggtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacaccagt 27187431  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27187432 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttcttcgcttatcatgataactcttt 27187510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 27262008 - 27261730
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| | | ||| |    
T  27262008 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgctgcggtaaac 27261909  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  | | |||||| |||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  27261908 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaatttcggggtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacaccagt 27261809  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27261808 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttcttcgcttatcatgataactcttt 27261730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 17032358 - 17032582
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  17032358 acatcgtcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 17032457  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | |||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  17032458 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaacgcacgtcccacaccagt 17032557  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacg 235  Q
    || | ||||||||||||||||||||    
T  17032558 cataggagtgactctcaaaaacacg 17032582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 22762940 - 22762664
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||   |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  22762940 acatcatcactttggatcacatgggagggatccgatacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacaaagtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 22762841  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | ||| | ||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22762840 ccacttgatacgccatcgttccaactctttccgatatctgattcggaccaataaatctcggggtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagt 22762741  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactct 287  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||||    
T  22762740 cacaggagtgactctcacaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatctgtcctacgcttatcattgtaactct 22762664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 28292857 - 28292579
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  28292857 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 28292758  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | |||||||| |||||||| | |||||||||  | | |||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  28292757 ccactcggtaagccaccgtcccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttaacttcaaagcacgtcctacaccagt 28292658  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28292657 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttctacacttatcatgataactcttt 28292579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 11 - 288
Target Start/End: Original strand, 25750605 - 25750882
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||  || |    
T  25750605 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagatgcgacacatgaaacatatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 25750704  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | |||| ||| ||||| |||| |||||| || |||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| ||    
T  25750705 ccactctgtatgccactgttccaactctctcagatatctggtacggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgtcttacacccgt 25750804  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    |||| |||||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  25750805 cacaagagtgactctcagaaacacatgatctccttcttgaaactcaagatcctttctacgcttgtcatggtaactctt 25750882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 26 - 288
Target Start/End: Original strand, 21471412 - 21471674
Alignment:
Q  26 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 125  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || || |||| ||| ||||    
T  21471412 atcacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgcca 21471511  T
Q  126 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 225  Q
    | |||| |||||| || |||| ||| |||||| |||||||  |||||||||||||||| || ||||| |||||||| || || |||| | ||||||||||    
T  21471512 ctgttccaactctctcagatatctggtacggatcaataaacttcggagtcaacttcttagatttcaacgcacgtcctacccccgtcataggagtgactct 21471611  T
Q  226 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    || |||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  21471612 cagaaacacatgatctccttcttgaaactcaagatcctttctacgcttgtcatggtaactctt 21471674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 11 - 146
Target Start/End: Original strand, 22433793 - 22433928
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22433793 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 22433892  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 146  Q
    | ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  22433893 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 22433928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 37 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 18198006 - 18197754
Alignment:
Q  37 tggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaact 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  || || ||||| |||||||| |||  || |    
T  18198006 tggatccagaacatacttccgaagttgcgaaacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggcaaacccactcgatacgccactgtttaaatt 18197907  T
Q  137 ctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgt 236  Q
    ||||| |||| || |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||  |||||| |||||||| ||| ||| || |    
T  18197906 ctttccgatatcttatacagaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaattcgcgtcctacacttgtcacaagagtgactttcagaaatacat 18197807  T
Q  237 ggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    | | | | |||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  18197806 gatatccctcttgaaacttaaggtctttccgacgcttatcatgataactcttt 18197754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 47 - 288
Target Start/End: Original strand, 25768023 - 25768264
Alignment:
Q  47 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 146  Q
    |||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||||  || || |||| ||| ||||| |||| |||||| || ||||    
T  25768023 acatacttccgaagctgcgacacgtgaaacacatcatgcaaattggaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaactctctcagata 25768122  T
Q  147 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 246  Q
     ||| ||||||||||||||  | | |||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||||||||||| |||||| || ||| ||||    
T  25768123 tctggtacggaccaataaactttgaagtcaatttcttagacttcaacgcacgtcctacacccgtcataagagtgactctcagaaacacatgatctccttc 25768222  T
Q  247 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||    
T  25768223 ttgaaactcaagatccttcctacgcttgtcatggtaactctt 25768264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 38 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 14131637 - 14131386
Alignment:
Q  38 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactc 137  Q
    |||||||  ||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||  || || ||||  || ||||| |||| |||||    
T  14131637 ggatccgttacatacttccgtaactgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgttgtggcaaacccactctatatgccactgttccaactc 14131538  T
Q  138 tttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtg 237  Q
    | || |||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||| | ||||||| |||| |||||| ||    
T  14131537 tctcagatatctgatacggaccaataaacttcgaagtcaacttcttagacttcaatgcacgacctacacctgtcataggagtgaccctcagaaacacatg 14131438  T
Q  238 gtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
     ||| |||| |||||||| || || || |||||||| |||||||| ||||||    
T  14131437 atctccttcctgaaactccaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttt 14131386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 26 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 10469319 - 10469057
Alignment:
Q  26 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 125  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||    
T  10469319 atcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaggttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 10469220  T
Q  126 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 225  Q
    | |||| ||| || ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| ||    
T  10469219 cagttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccct 10469120  T
Q  226 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    || ||| || || ||  | || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  10469119 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactctt 10469057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 11 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 22797117 - 22796840
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||   ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || |    
T  22797117 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctgcatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 22797018  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | ||||  || ||||| |||| ||| || || ||||  |||||| ||||||||||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  22797017 ccactctatatgccactgttccaaccctctcagatatatgatacagaccaataaacttaggagtcaacttcctagacttcaatgcacgtcctacacccgt 22796918  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    || | |||| ||||||| |||||| || ||| | ||||||||||||||  | || |||||||| ||||| ||||||||    
T  22796917 cataggagtaactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactctt 22796840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 29 - 289
Target Start/End: Original strand, 15459150 - 15459410
Alignment:
Q  29 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 128  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||| |  || || ||||| || || |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||  |||||||| |    
T  15459150 acatgcgaaggatcaggtacatacttccgcaactgtgatacatgaaatacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatcccactctatacgccacag 15459249  T
Q  129 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 228  Q
    ||| |||||||||||| | |||||| |||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| || ||||     
T  15459250 ttccaactctttctgaaatctgataaggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacctgtcataggagtaaccctcag 15459349  T
Q  229 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    ||| || |||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||    
T  15459350 aaaaacatggtcaccttcctgaaactcaagatctttcctacgcttgtcatggtagctcttt 15459410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 29 - 288
Target Start/End: Original strand, 19879112 - 19879371
Alignment:
Q  29 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 128  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| |  || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| || | ||| || || |  || ||||| |    
T  19879112 acatgcgaaggatccggtacatacttccgcaactgtgacacatggaacacgtcatgcaaattcgaaagatgagggggtaaacccaccctataagccactg 19879211  T
Q  129 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 228  Q
    ||| |||||| || |||| |||||| || ||||||||  | |||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| | || | |||||||||||||    
T  19879212 ttccaactctctcagatatctgatatgggccaataaactttggagtcaacttcttagatttcaatgcacggcctacacctgccataggagtgactctcaa 19879311  T
Q  229 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
     ||||| || ||| | |||||||||||||| || || |||||||| |||||||| |||||    
T  19879312 gaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctctt 19879371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 65 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 34646017 - 34645794
Alignment:
Q  65 gacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataa 164  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||  |||||||| |||| |||||| || |||| |||||| || |||||||    
T  34646017 gacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatccaattctatacgccacagttccaactctctcagatatctgatatgggccaataa 34645918  T
Q  165 atctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttt 264  Q
    |  | |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| | ||||||| ||||| ||||| || ||| | |||||||||||||| || ||    
T  34645917 actttggagtcaacttcttagattttaatgcacgacccacacctgtcataggagtgaccctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtcctt 34645818  T
Q  265 tctacgcttatcatgataactctt 288  Q
     |||||||| |||||||| |||||    
T  34645817 cctacgcttgtcatgatagctctt 34645794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 38 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 21564590 - 21564340
Alignment:
Q  38 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactc 137  Q
    |||||||| ||||||||||| | ||| |||||||| || || |||||||||||| ||||||| || |  || || ||||  |||||||| |||| ||| |    
T  21564590 ggatccggtacatacttccgtaattgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattctaaagatgaggcggcaaacccactctatacgccactgttccaaccc 21564491  T
Q  138 tttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtg 237  Q
    | || |||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| | ||||||||||||| ||||| ||    
T  21564490 tctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcaaaggagtgactctcaagaacacatg 21564391  T
Q  238 gtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
     ||| | |||||||||||||| || || ||||| || |||||||| |||||    
T  21564390 atctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgtttgtcatgatagctctt 21564340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 26 - 288
Target Start/End: Original strand, 24364223 - 24364485
Alignment:
Q  26 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 125  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||    
T  24364223 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 24364322  T
Q  126 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 225  Q
    | || | |||||| ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||  | |||||||  ||||| |||||||| |||| | ||||||| ||    
T  24364323 ctgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcagcgcacgaccaacacccgtcaaaggagtgaccct 24364422  T
Q  226 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    || ||| || || ||  | || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  24364423 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttctccgcttgtcatggtaactctt 24364485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 29 - 288
Target Start/End: Original strand, 18794504 - 18794763
Alignment:
Q  29 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 128  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || | ||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||  || || ||||| || ||||| |    
T  18794504 acatgcgacggatccggtacatactttcgtaattgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactcgatatgccactg 18794603  T
Q  129 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 228  Q
    ||| ||| || |  |||| |||||| || ||||||||  |||||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| | |||||||||||||    
T  18794604 ttccaaccctcttagatatctgatatgggccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaaggcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaa 18794703  T
Q  229 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
     ||||| || ||| | |||||||||| ||| ||||| ||||| || |||||||| |||||    
T  18794704 gaacacatgatctccctcttgaaactgaaggtctttcctacgattgtcatgatagctctt 18794763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 29 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 8766615 - 8766443
Alignment:
Q  29 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 128  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || || |||| ||| ||||| |    
T  8766615 acatgcgaaggatccgctacatactttcgaagttgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtaagccactg 8766516  T
Q  129 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtcc 201  Q
    ||| ||| || ||||| | |||||||||||| || ||  | |||||||||||| | |||||||| ||||||||    
T  8766515 ttccaaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcc 8766443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 169 - 288
Target Start/End: Original strand, 25750900 - 25751019
Alignment:
Q  169 cggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttcta 268  Q
    ||||||| ||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  25750900 cggagtccacttcttagatttcaacgcacgtcctacacccgtcacaggagtgactctcagaaacacatgatctccttcttgaaactcaagatcctttcta 25750999  T
Q  269 cgcttatcatgataactctt 288  Q
    ||||| ||||| ||||||||    
T  25751000 cgcttgtcatggtaactctt 25751019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 40 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 11288054 - 11287806
Alignment:
Q  40 atccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctt 139  Q
    |||||| ||||| ||||| |  || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || | ||| || || |  || ||||| |||| ||||||     
T  11288054 atccggtacatagttccgcaactgtgacacatggaacacgtcatgcaaatttgaaagatgagggggtaaacccaccctataagccactgttccaactctc 11287955  T
Q  140 tctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggt 239  Q
    || |||| |||||| || ||||||||  | |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| | | ||||||||||| ||||| || |    
T  11287954 tcagatatctgatatgggccaataaactttggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacccgtcataggggtgactctcaagaacacatgat 11287855  T
Q  240 cttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    || | |||||||||||||| || || |||||||| |||||||| |||||    
T  11287854 ctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctctt 11287806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 221 - 289
Target Start/End: Original strand, 11291818 - 11291886
Alignment:
Q  221 actctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11291818 actctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacacttatcatgataactcttt 11291886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 94 - 288
Target Start/End: Original strand, 17415365 - 17415559
Alignment:
Q  94 aagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaa 193  Q
    |||||||||||  || || ||||  || ||||| |||| ||| || || |||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| ||||||||     
T  17415365 aagatgcggtggcaaacccactctatatgccactgttccaaccctctcagatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaat 17415464  T
Q  194 gcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    |||||||| ||||| |||| | |||| ||||||| |||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||||||||||  |||| ||||||||    
T  17415465 gcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcataaacacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgccatggtaactctt 17415559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 47 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 27561066 - 27560825
Alignment:
Q  47 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 146  Q
    ||||||||||| |  || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||  || |||||||  || |||||||||| ||  || ||||| |    
T  27561066 acatacttccgcaactgtgacacgtggaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccaatcctctctgaaa 27560967  T
Q  147 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 246  Q
     ||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||   |||| ||||| | ||| || || ||  | ||    
T  27560966 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctc 27560867  T
Q  247 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    ||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  27560866 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactctt 27560825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 40 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 11280961 - 11280713
Alignment:
Q  40 atccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctt 139  Q
    |||||| ||||| ||||| |  || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || | ||| || || |  || ||||| |||| ||||||     
T  11280961 atccggtacatagttccgcaactgtgacacatggaacacgtcatgcaaatttgaaagatgagggggtaaacccaccctataagccactgttccaactctc 11280862  T
Q  140 tctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggt 239  Q
    || |||| |||||| || ||||||||  | |||||||||||||| || || || ||| |||| ||||| |||| | | |||| |||||| ||||| || |    
T  11280861 tcagatatctgatatgggccaataaactttggagtcaacttcttagattttaatgcatgtcctacacctgtcataggtgtgattctcaagaacacatgat 11280762  T
Q  240 cttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    || | |||||||||||||| || || |||||||| |||||||| |||||    
T  11280761 ctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctctt 11280713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 158 - 288
Target Start/End: Original strand, 1640715 - 1640845
Alignment:
Q  158 ccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaa 257  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||| | |||||||| | |||||| || ||| |||| | ||| ||||    
T  1640715 ccaataaacctcggggtcaacttcttcgatttcaaggcacgaccaacacctgtcacaggggtgactcttagaaacacatgatctccttcctaaaattcaa 1640814  T
Q  258 gatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    | || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  1640815 ggtcctttctacgcttgtcatgataactctt 1640845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 29 - 104
Target Start/End: Original strand, 1640613 - 1640688
Alignment:
Q  29 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtg 104  Q
    ||||| || |||||||  || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1640613 acatgtgaaggatccgctacgtacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtg 1640688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 95
Target Start/End: Original strand, 18787702 - 18787768
Alignment:
Q  29 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaa 95  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18787702 acatgcgaaggatccgctacatactttcgaagttgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaa 18787768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 170 - 288
Target Start/End: Original strand, 16098005 - 16098123
Alignment:
Q  170 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 269  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||||||||||||| || ||  |  | |||||||||| ||| ||||| |    
T  16098005 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggtttcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcc 16098104  T
Q  270 gcttatcatgataactctt 288  Q
     ||||||||||||||||||    
T  16098105 tcttatcatgataactctt 16098123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 170 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 25743413 - 25743295
Alignment:
Q  170 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 269  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| |||||| || |  | ||||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  25743413 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaagattctccctcaaaaacacttgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 25743314  T
Q  270 gcttatcatgataactctt 288  Q
     ||||||||||||||||||    
T  25743313 tcttatcatgataactctt 25743295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 14381841 - 14381675
Alignment:
Q  122 gccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtga 221  Q
    ||||| |||| ||| || || |||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| |    
T  14381841 gccactgttccaaccctctccgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaa 14381742  T
Q  222 ctctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    | |||| ||| || || ||  | || |||||||||||  | ||||| ||||| || |||||||||||    
T  14381741 ccctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcgtgataactctt 14381675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 170 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 16382699 - 16382581
Alignment:
Q  170 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 269  Q
    |||||||||||| |  |||| |||||||| ||||| || |||||| || | || ||||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  16382699 ggagtcaacttcctacactttaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 16382600  T
Q  270 gcttatcatgataactctt 288  Q
     ||||||||||||||||||    
T  16382599 tcttatcatgataactctt 16382581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 288
Target Start/End: Original strand, 18571622 - 18571724
Alignment:
Q  186 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 285  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||||||| | || |||||||| || || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||    
T  18571622 acttcaaagcacgaccaacatcggtcacatgattcaccctcaaaaatacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataact 18571721  T
Q  286 ctt 288  Q
    |||    
T  18571722 ctt 18571724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 170 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 18838234 - 18838116
Alignment:
Q  170 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 269  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||| | |||||||| |||||| || | || | ||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  18838234 ggagtcaacttcctacacttcaaagcatgaccaacaccggtcacaggattcacccacaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 18838135  T
Q  270 gcttatcatgataactctt 288  Q
     ||||||||||||||||||    
T  18838134 tcttatcatgataactctt 18838116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 186 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 1649094 - 1648992
Alignment:
Q  186 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 285  Q
    ||||||||||||| ||||| || |||||| || | || ||||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||| ||    
T  1649094 acttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgatagct 1648995  T
Q  286 ctt 288  Q
    |||    
T  1648994 ctt 1648992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 170 - 288
Target Start/End: Original strand, 23996203 - 23996321
Alignment:
Q  170 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 269  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || |||| | || | || || ||||||||||| ||  |  |||||||||||| ||| || || |    
T  23996203 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcataggattcacccttaaaaacacgtgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctcc 23996302  T
Q  270 gcttatcatgataactctt 288  Q
     ||||||||||||||||||    
T  23996303 tcttatcatgataactctt 23996321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 289
Target Start/End: Original strand, 18800867 - 18801016
Alignment:
Q  140 tctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggt 239  Q
    ||||||| |||||| |||||||| ||  | | |||||||| ||| ||||||||  ||||||  ||||| |||| | |||| ||||||| ||| || || |    
T  18800867 tctgatatctgatatggaccaatgaactttgaagtcaactgcttcgacttcaattcacgtcttacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgat 18800966  T
Q  240 cttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    |  | ||||||||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||||    
T  18800967 ccccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttt 18801016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1355 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 1)
Name: scaffold1355
Description:

Target: scaffold1355; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Original strand, 639 - 917
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  639 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaagc 738  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    |||| || ||||||||| ||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  739 caacacgatacgccaccattccaaccctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 838  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  839 cacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctatgcttatcatgataactcttt 917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 64374 - 64096
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  64374 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 64275  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  64274 ccactcgatacgccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaatgaatctcacagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaactccagc 64175  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  64174 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataattcttt 64096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Original strand, 5977 - 6255
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  5977 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcgaaagctgcggtggtaatc 6076  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    ||||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6077 caactcgatacgccaccattccaactctttctaatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtcaaacaccagt 6176  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |  || ||||||| |||||||||||||    
T  6177 cacaggagtgactcttaaaaacacgtggtctccctcttgaaactcaagatcctgcctgcgcttattatgataactcttt 6255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 33916 - 33638
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  |||||    
T  33916 acatcatcactctggatcacatgggatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtagtaatc 33817  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | ||||| |||||||| |||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33816 ccactcgatacgccactgttccaactcttttcgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 33717  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33716 cacatgagtgactttcaataacacgtggtctccttcctgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttt 33638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Original strand, 8559 - 8837
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||| |||||    
T  8559 acatcatcactttggatcacatgagatggatccagaacatacttccaaagttgcgacacatggaaaacttcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 8658  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | ||||| |||||||| |||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8659 ccactcgatacgccactgttccaactcttttcgatatctgatacggaccaataaatctcggagttaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 8758  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    |||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8759 cacaagagtgactttcaataacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttt 8837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Original strand, 14323 - 14601
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  14323 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagtttcgacacatggaagacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 14422  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | || || ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14423 ccacccgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 14522  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  14523 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtatccttcctgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttt 14601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Original strand, 583 - 861
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  583 acatcgtcactttggattacatgagatggatccgaaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 682  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | ||| |||| |||||||||| |||||||||  |||  ||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  683 ccacttggtaagccaccgttccaactctttccaatatttgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 782  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  783 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatggtgataactcttt 861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 63)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 15155001 - 15154723
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |    
T  15155001 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacgtgaaatacatcgtgcaaattcgaaagatgcagtggtaaac 15154902  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15154901 ccactcggtaagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 15154802  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    || | |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15154801 cataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 15154723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 11 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 17665 - 17391
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  17665 acatcatcagtttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 17566  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17565 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacgggccaataaatctcagagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 17466  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 285  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  17465 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataact 17391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 11553451 - 11553173
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||| ||| |    
T  11553451 acatcgtcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacgtcgtgcaaattcgaaagatgtggtggtaaac 11553352  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | ||||| || |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  11553351 ccactcgataagccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagt 11553252  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  11553251 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcctttctgcgcttatcatgataactcttt 11553173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 11237562 - 11237284
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  11237562 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 11237463  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11237462 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 11237363  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11237362 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 11237284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Original strand, 12687422 - 12687700
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||| ||| |    
T  12687422 acatcgtcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacgtcgtgcaaatttgaaagatgcggtggtaaac 12687521  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | ||||| || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  12687522 ccactcgataagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagt 12687621  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    || | ||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  12687622 cataggagtgactcgcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttt 12687700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Original strand, 14954541 - 14954819
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  14954541 acatcgtcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgatacatggaaaacgtcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 14954640  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
      ||||| || |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  14954641 tcactcgataagccaccgttccaactctttctgatatcttatacggaccaataaactttggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagt 14954740  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  14954741 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcctttctgcgcttatcatgataactcttt 14954819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 23 - 289
Target Start/End: Original strand, 8198561 - 8198827
Alignment:
Q  23 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 122  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| | ||| || |||||||| |    
T  8198561 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 8198660  T
Q  123 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 222  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  8198661 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 8198760  T
Q  223 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8198761 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 8198827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Original strand, 8707526 - 8707804
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  8707526 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 8707625  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8707626 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 8707725  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8707726 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttt 8707804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Original strand, 10870916 - 10871194
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||||| ||| |    
T  10870916 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaac 10871015  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10871016 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacctcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 10871115  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10871116 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttt 10871194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Original strand, 14037728 - 14038006
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  14037728 acatcatcactttggatcacatgagatggatctggaacatacttccgaagttgcgatacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 14037827  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | ||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||| |||||| | |||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  14037828 ccactcgatacgccaccattcaaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatcttggtgtcaacttctttgacttcaatgcacgcccaacaccagt 14037927  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    || | |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14037928 cataggagtgactctcaaaaatacgtgatctccttcttggaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttt 14038006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Original strand, 14332318 - 14332596
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||||| ||| |    
T  14332318 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaac 14332417  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||   || ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14332418 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccagtatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 14332517  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14332518 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcgtgataactcttt 14332596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Original strand, 14347758 - 14348036
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  14347758 acatcatcactttggatcacatgagatggatctggaacatacttccgaagttgcgatacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 14347857  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | ||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||| |||||| | |||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  14347858 ccactcgatacgccaccattcaaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatcttggtgtcaacttctttgacttcaatgcacgcccaacaccagt 14347957  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    || | |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14347958 cataggagtgactctcaaaaatacgtgatctccttcttggaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttt 14348036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 15161406 - 15161128
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  15161406 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 15161307  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15161306 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 15161207  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15161206 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttt 15161128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 23517118 - 23516840
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  23517118 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaatatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 23517019  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  | | |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23517018 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 23516919  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23516918 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 23516840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Original strand, 15203800 - 15204078
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    |||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  15203800 acatcatctctttcgatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 15203899  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | ||||| ||| | ||||||| || ||||||||  | ||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||    
T  15203900 ccactcgatactctaccgttccaattctttctgtaatctgatacagaccaataaacctcggagtcaacttatttgacttcaatgcgcggccaacaccagt 15203999  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    ||||  ||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15204000 cacaaaagtgactctaaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttt 15204078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Original strand, 18177663 - 18177941
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  18177663 acatcgtcactctgaattacatgagatggatctggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 18177762  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  18177763 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgttctacaccagt 18177862  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
     | | ||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18177863 tataggagtgactctcaagaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 18177941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 18552107 - 18551829
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||| | ||| |    
T  18552107 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaac 18552008  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18552007 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcagcttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 18551908  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18551907 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttt 18551829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 23 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 44791688 - 44791422
Alignment:
Q  23 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 122  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||| | ||| || |||||||| |    
T  44791688 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 44791589  T
Q  123 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 222  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  44791588 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaatttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 44791489  T
Q  223 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44791488 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 44791422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Original strand, 13685984 - 13686263
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaga-catcatgcaaattcgaaagatgcggtgataat 109  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | |  |||||||||||||||||||  | |||     
T  13685984 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcgacggtaaa 13686083  T
Q  110 ccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccag 209  Q
    || |||||||| |||||||||| |||||||||  |||  |||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13686084 cccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatttgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccag 13686183  T
Q  210 tcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13686184 tcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttt 13686263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 77 - 288
Target Start/End: Original strand, 15624539 - 15624750
Alignment:
Q  77 acatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtca 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  15624539 acatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacgccaccgttccaattctttctgatatctgatatgaaccaataaacctcggagtca 15624638  T
Q  177 acttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatc 276  Q
    | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  15624639 atttccttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaatacatggtctccttcctgaaactcaaggtctttcctaagcttatc 15624738  T
Q  277 atgataactctt 288  Q
    ||||||||||||    
T  15624739 atgataactctt 15624750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 29 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 12207109 - 12206849
Alignment:
Q  29 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 128  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || || ||||  || ||||| |    
T  12207109 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccactg 12207010  T
Q  129 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 228  Q
    ||  |||||| || |||| ||| |||| |||||||||  |||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  12207009 ttgcaactctctcagatatctggtacgaaccaataaacttcggcgtcaacttctttgatttcaaggcacgaccaacacctgtcacaggagtgactctcaa 12206910  T
Q  229 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    |||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  12206909 aaacacatggtctccttcttgaaacttaagatcctttctacacttgtcatgataactcttt 12206849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 29 - 288
Target Start/End: Original strand, 19147151 - 19147410
Alignment:
Q  29 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 128  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||  || |  |||| ||| ||||| |    
T  19147151 acatgtgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacattatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaactcactctgtatgccactg 19147250  T
Q  129 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 228  Q
    ||| ||| || || |||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | ||||||||||||     
T  19147251 ttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacctgtcataggagtgactctcag 19147350  T
Q  229 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    |||||| || ||| | ||||||||||||||  |||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  19147351 aaacacatgatctccctcttgaaactcaagggctttcctacgcttgtcatggtaactctt 19147410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 29 - 288
Target Start/End: Original strand, 20746550 - 20746809
Alignment:
Q  29 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 128  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||  || |  |||| ||| ||||| |    
T  20746550 acatgtgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacattatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaactcactctgtatgccactg 20746649  T
Q  129 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 228  Q
    ||| ||| || || |||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | ||||||||||||     
T  20746650 ttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacctgtcataggagtgactctcag 20746749  T
Q  229 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    |||||| || ||| | ||||||||||||||  |||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  20746750 aaacacatgatctccctcttgaaactcaagggctttcctacgcttgtcatggtaactctt 20746809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 15102928 - 15102650
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || |    
T  15102928 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 15102829  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | ||||  || ||||| |||| ||| || || |||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  15102828 ccactctatatgccactgttccaaccctctcagatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgt 15102729  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    || | |||| |||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||||    
T  15102728 cataggagtaactctcaaaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttt 15102650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 29 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 8212437 - 8212178
Alignment:
Q  29 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 128  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || ||||||| ||| ||||| |    
T  8212437 acatgagaaggatccgcaacatacttccgaagttgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctgtatgccactg 8212338  T
Q  129 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 228  Q
    | | |||||| ||||| | ||||||||||||||||||  | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||     
T  8212337 taccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcag 8212238  T
Q  229 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    ||| || || ||  | || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  8212237 aaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactctt 8212178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 11 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 14264571 - 14264294
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||| ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||  || |    
T  14264571 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccaaagttgcgacacatgaaacacatcaggcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 14264472  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | ||||  || ||||| |||| ||| ||||| |||| |||||| |||||||||||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  14264471 ccactctatatgccactgttccaaccctttcagatatctgatatggaccaataaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgt 14264372  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    || | |||||||||||| |||||| || ||| | ||||||||||||||  | || |||||||| ||||| ||||||||    
T  14264371 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagcgccttcctacgcttgtcatggtaactctt 14264294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 12 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 11306589 - 11306313
Alignment:
Q  12 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatcc 111  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || ||    
T  11306589 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagagacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 11306490  T
Q  112 aactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 211  Q
    |||||  || ||||| || | |||||| ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||    
T  11306489 aactctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtc 11306390  T
Q  212 acatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    | | ||||||| |||| ||| || || ||  | || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  11306389 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactctt 11306313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 288
Target Start/End: Original strand, 49152224 - 49152500
Alignment:
Q  12 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatcc 111  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || ||    
T  49152224 catcatctctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 49152323  T
Q  112 aactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 211  Q
    |||||  || ||||| || | |||||| ||||| | ||||||||||||||||||  | |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||    
T  49152324 aactctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcccgtccaacacccgtc 49152423  T
Q  212 acatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    | | ||||||| |||| ||| || || ||  | || |||||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||    
T  49152424 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatccttccttcgcttgtcatggtaactctt 49152500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 29 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 16072603 - 16072344
Alignment:
Q  29 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 128  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||  || || |||  | | ||||| |    
T  16072603 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacatatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgcatgccactg 16072504  T
Q  129 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 228  Q
    ||| ||| || || |||| |||||| |||||||||||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| |||||||     
T  16072503 ttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 16072404  T
Q  229 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    |||||| || ||| | ||||||||||||||  | || || ||||| ||||| ||||||||    
T  16072403 aaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttccttcgcttgtcatggtaactctt 16072344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 29 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 11388736 - 11388478
Alignment:
Q  29 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 128  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| | |||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||  || || ||||  || ||||| |    
T  11388736 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaattgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatatgccactg 11388637  T
Q  129 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 228  Q
    ||| ||| || || |||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| | |||||||||||||    
T  11388636 ttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaa 11388537  T
Q  229 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
     ||||| || || || |||||||||||| | || || |||||||| |||||||| |||||    
T  11388536 gaacacatgatc-tcctcttgaaactcatggtccttcctacgcttgtcatgatagctctt 11388478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 26 - 289
Target Start/End: Original strand, 21661900 - 21662160
Alignment:
Q  26 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 125  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||||  | ||||| |||||||| || |||||||| || |||||||||||||||| ||| || ||    ||||| |    
T  21661900 atcacatgagatggatatgaaacatacttttgtagttgtgacacatgaaacacatcatgtaagttcgaaagatgcggtggtaaacccacgttatacgcaa 21661999  T
Q  126 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 225  Q
    |||  | ||||||||  || | ||||||||| |||||||| |||||||| |  |||||||| || |  || ||||||||||| || | | | ||||||||    
T  21662000 ccgccccaactctttgcgaaatctgatacgggccaataaacctcggagttagtttctttgattttagtgcccgtccaacaccggtaagaggggtgactct 21662099  T
Q  226 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    ||||||||| |||||| |||   ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  21662100 caaaaacacatggtctcctt---gaaactcaagatccttcctacgcttatcatgataactcttt 21662160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 29 - 288
Target Start/End: Original strand, 13665493 - 13665747
Alignment:
Q  29 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 128  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |    
T  13665493 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactg 13665592  T
Q  129 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 228  Q
    ||| ||| |||||||| | |||||||||     | ||  | |||||||||||||| |||||||| || || || ||||| |||| | |||| |||||||     
T  13665593 ttccaaccctttctgaaatctgatacgg-----tgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcccgacctacacccgtcataggagtaactctcag 13665687  T
Q  229 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    ||| || || ||||| ||||||||||||||  | || |||||||| | ||||||||||||    
T  13665688 aaatacatgatcttcctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtgatgataactctt 13665747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 47 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 16950762 - 16950521
Alignment:
Q  47 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 146  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |||| ||| |||||||| |    
T  16950762 acatacttccgaagctgcgacacataaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtgccaaaccaactctatatgccactgttccaaccctttctgaaa 16950663  T
Q  147 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 246  Q
     ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| ||||||| ||| || || ||  | ||    
T  16950662 tctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctc 16950563  T
Q  247 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
     ||||||||| |  | ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  16950562 ctgaaactcatgggcctttctccgcttgtcatggtaactctt 16950521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 194 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 35965016 - 35964921
Alignment:
Q  194 gcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    |||||||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  35965016 gcacgtcatacactagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtccccttcttgaaactcaagatccttcctacgcttatcatgataactcttt 35964921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 12254387 - 12254326
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatg 72  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12254387 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatg 12254326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 26 - 199
Target Start/End: Original strand, 13021294 - 13021467
Alignment:
Q  26 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 125  Q
    |||||||| ||  ||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||    
T  13021294 atcacatgtgaaagatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggaaaaccaactctataagcca 13021393  T
Q  126 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgt 199  Q
    | |||| ||| || ||||| | ||||||||||||||||||  | |||||| ||||| | |||||||| ||||||    
T  13021394 ctgttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaataaactttggagtccacttcctcgacttcaatgcacgt 13021467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 47 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 14286667 - 14286426
Alignment:
Q  47 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |||| ||  || | ||| |    
T  14286667 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaatcctatatgaaa 14286568  T
Q  147 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 246  Q
     ||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||| ||||   |||| ||||||||||| || || ||  | ||    
T  14286567 tctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacatcctacacctgtcatcggagtaactctcaaaaatacatgatcaccctc 14286468  T
Q  247 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
     |||||||||||    ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  14286467 ctgaaactcaagggtctttctccgcttgtcatggtaactctt 14286426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 47 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 18054244 - 18054003
Alignment:
Q  47 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 146  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||  || |||||||  || ||||||||||  | ||| ||||| |    
T  18054244 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttcctattctctctgaaa 18054145  T
Q  147 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 246  Q
     ||||||||| ||||| ||  |||||||||||||  | || |||||||||||||| ||||| ||||   |||| ||||||| ||| || || ||  | ||    
T  18054144 tctgatacgggccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactctcagaaatacatgatcaccctc 18054045  T
Q  247 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    ||||||||||||  | || || ||||| ||||| ||||||||    
T  18054044 ttgaaactcaagggccttcctccgcttgtcatggtaactctt 18054003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 47 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 23200034 - 23199793
Alignment:
Q  47 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 146  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||  || |||||||  || | || |||||  |  || ||||| |    
T  23200034 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgtcatcgttccgatcctctctgaaa 23199935  T
Q  147 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 246  Q
     ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||   |||| ||||| | ||| || || ||  | ||    
T  23199934 tctgatacggaccaatgaatttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctc 23199835  T
Q  247 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    ||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  23199834 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactctt 23199793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 47 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 23506161 - 23505920
Alignment:
Q  47 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 146  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||  || |||||||  || | || |||||  |  || ||||| |    
T  23506161 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgtcatcgttccgatcctctctgaaa 23506062  T
Q  147 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 246  Q
     ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||   |||| ||||| | ||| || || ||  | ||    
T  23506061 tctgatacggaccaatgaatttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctc 23505962  T
Q  247 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    ||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  23505961 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactctt 23505920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 8 - 288
Target Start/End: Original strand, 6413430 - 6413710
Alignment:
Q  8 tggacatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgata 107  Q
    ||||||||||| ||| | || ||||| || ||||||   ||||||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  |    
T  6413430 tggacatcatctctcggaataacatgcgaaggatccactacatacttctgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggca 6413529  T
Q  108 atccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacacc 207  Q
    | |||||||  || ||||| |||| ||| || ||||| | ||||| || |||||| ||  | |||||||||||  | |||||||| |||||||| |||||    
T  6413530 aaccaactctatatgccactgttccaaccctctctgaaatctgattcgaaccaatgaactttggagtcaactttctcgacttcaatgcacgtcctacacc 6413629  T
Q  208 agtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
     |||| | |||| || |||| |||||| || ||  | || ||||||||||   | ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  6413630 cgtcataggagtaaccctcagaaacacatgatcaccctcctgaaactcaaaggcctttctccgcttgtcatggtaactctt 6413710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 206
Target Start/End: Original strand, 14129795 - 14129990
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||  || |    
T  14129795 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagc 14129894  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacac 206  Q
    ||||||  || |||| ||||| ||  || ||| | | ||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||    
T  14129895 caactctatatgccatcgttccaatcctctctaaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacac 14129990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 206
Target Start/End: Original strand, 14433613 - 14433808
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||  || |    
T  14433613 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagc 14433712  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacac 206  Q
    ||||||  || |||| ||||| ||  || ||| | | ||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||    
T  14433713 caactctatatgccatcgttccaatcctctctaaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacac 14433808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 26 - 288
Target Start/End: Original strand, 12455640 - 12455901
Alignment:
Q  26 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 125  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||  ||||||||||| ||||  || |||| ||  || ||||    
T  12455640 atcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgc-acacatgaaacacatcatgcaggttcgaaagatgtggtggcaaaccaattctataagcca 12455738  T
Q  126 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 225  Q
    | |||| |||||| ||||| | ||||||| ||||||| ||  | ||| |||||||| | |||||||| |||| ||||||||| |||| | ||||||| ||    
T  12455739 ctgttctaactctctctgaaatctgataccgaccaatgaactttggattcaacttcctcgacttcaatgcacatccaacacccgtcaaaggagtgaccct 12455838  T
Q  226 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    || ||| || || ||  | || |||||||| ||  | ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  12455839 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactctagggcctttctccgcttgtcatggtaactctt 12455901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 47 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 26288327 - 26288162
Alignment:
Q  47 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 146  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |||| ||| |||||||| |    
T  26288327 acatattttcgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagtttgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttcaaaccctttctgaaa 26288228  T
Q  147 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtca 212  Q
     |||||||| |||||| ||| | |||||||||||| | |||||||| || ||||| ||||| ||||    
T  26288227 tctgatacgtaccaatgaattttggagtcaacttcctcgacttcaatgcgcgtcctacacccgtca 26288162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 47 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 1698 - 1533
Alignment:
Q  47 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 146  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||  |||| ||| |||||| | |    
T  1698 acatccttccgaagctgagacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccagtgttccaaccctttcttaaa 1599  T
Q  147 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtca 212  Q
     ||||||| ||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  1598 tctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtca 1533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 47 - 162
Target Start/End: Original strand, 15340454 - 15340569
Alignment:
Q  47 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 146  Q
    |||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || |||||||||| ||  || ||||| |    
T  15340454 acatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccaccgttccaatcctctctgaaa 15340553  T
Q  147 actgatacggaccaat 162  Q
     |||||||||||||||    
T  15340554 tctgatacggaccaat 15340569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 243 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 11772358 - 11772312
Alignment:
Q  243 cttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11772358 cttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttt 11772312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 186 - 288
Target Start/End: Original strand, 14936443 - 14936545
Alignment:
Q  186 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 285  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||| || ||  |  | ||||||||||  || ||||| | |||||||||||||||    
T  14936443 acttcaaagcacgaccaacaccagtcacaagattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatgtcctttctcctcttatcatgataact 14936542  T
Q  286 ctt 288  Q
    |||    
T  14936543 ctt 14936545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 26 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 26118896 - 26118818
Alignment:
Q  26 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtg 104  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  26118896 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtg 26118818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 133 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 26118810 - 26118655
Alignment:
Q  133 aactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaac 232  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||  | ||||||| |||||| |||||||| |||| | ||||||| |||| |||     
T  26118810 aactctatctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcagagcacgaccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaa 26118711  T
Q  233 acgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    || || ||  | || ||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||    
T  26118710 acatgatcaccctcctgaaactcaagctccttccttcgcttgtcatggtaactctt 26118655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 170 - 288
Target Start/End: Original strand, 7823980 - 7824098
Alignment:
Q  170 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 269  Q
    |||||||||||| |  |||| |||||||| ||||| || |||||| || | || ||||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  7823980 ggagtcaacttcctacactttaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 7824079  T
Q  270 gcttatcatgataactctt 288  Q
     ||||||||||||||||||    
T  7824080 tcttatcatgataactctt 7824098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 170 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 12368766 - 12368648
Alignment:
Q  170 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 269  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||| | |||||||  |||||| || | ||||||||||||||||| ||  |  | ||||| |||| ||| ||||| |    
T  12368766 ggagtcaacttcctacacttcaaagcatgaccaacactggtcacaagattcactctcaaaaacacgtgatcaccaacctgaaagtcaatatcctttctcc 12368667  T
Q  270 gcttatcatgataactctt 288  Q
     ||||||||||||||||||    
T  12368666 tcttatcatgataactctt 12368648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 288
Target Start/End: Original strand, 15364036 - 15364138
Alignment:
Q  186 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 285  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||| || | |||||||||||||| || ||  |  | ||||||||||  || ||||| | |||||||||||||||    
T  15364036 acttcaaagcacgaccaacaccggtcacaagattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatgtcctttctcctcttatcatgataact 15364135  T
Q  286 ctt 288  Q
    |||    
T  15364136 ctt 15364138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 170 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 27107964 - 27107846
Alignment:
Q  170 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 269  Q
    |||||||||||| |  |||| |||||||| ||||| || |||||| || | || ||||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  27107964 ggagtcaacttcctacactttaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 27107865  T
Q  270 gcttatcatgataactctt 288  Q
     ||||||||||||||||||    
T  27107864 tcttatcatgataactctt 27107846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 179 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 41327 - 41218
Alignment:
Q  179 ttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcat 278  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||| ||||| || || ||  |||| |||||||| |  | |||||| || |||||||    
T  41327 ttcttagacttcaaagcacgtccaacgcccgtcaccggagtgactcttaaaaatacatgatccccttcctgaaactccaattattttcttcgtttatcat 41228  T
Q  279 gataactctt 288  Q
    |||| |||||    
T  41227 gatagctctt 41218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 29 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 15479447 - 15479338
Alignment:
Q  29 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 128  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||| |  || |||||||| || |  |||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||  |||||||| |    
T  15479447 acatgcgaaggatcaggtacatacttccgcaactgtgacacatgaaacatgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatccaattctatacgccacag 15479348  T
Q  129 ttcgaactct 138  Q
    ||| ||||||    
T  15479347 ttccaactct 15479338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 170 - 288
Target Start/End: Original strand, 4440008 - 4440126
Alignment:
Q  170 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 269  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||| | |  | |||||||||||||| || ||  |  | ||||||||||  || || || |    
T  4440008 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagggttcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatgtccttcctcc 4440107  T
Q  270 gcttatcatgataactctt 288  Q
     ||||||||||||||||||    
T  4440108 tcttatcatgataactctt 4440126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 170 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 21674723 - 21674605
Alignment:
Q  170 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 269  Q
    |||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||| ||||| |  | |||||||||||||| || ||  |  ||||||| ||||  || || || |    
T  21674723 ggagtcaatttcttacacttcaaagcacgtccaataccaatcacaaggttcactctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaattcaatgtccttcctcc 21674624  T
Q  270 gcttatcatgataactctt 288  Q
     ||||||||||||||||||    
T  21674623 tcttatcatgataactctt 21674605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 186 - 288
Target Start/End: Original strand, 45146652 - 45146753
Alignment:
Q  186 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| | | |||||||||||| || ||  |  |||||||| |||  || || |||| ||||| |||||||||    
T  45146652 acttcaaagcacgtccaacaccagtc-catgattcattctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaacacaatgtccttcctactcttataatgataact 45146750  T
Q  286 ctt 288  Q
    |||    
T  45146751 ctt 45146753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 186 - 214
Target Start/End: Original strand, 13353247 - 13353275
Alignment:
Q  186 acttcaaagcacgtccaacaccagtcaca 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13353247 acttcaaagcacgtccaacaccagtcaca 13353275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 13634070 - 13634038
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatcc 43  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13634070 acatcatcactttggatcacatgagatggatcc 13634038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 185 - 285
Target Start/End: Original strand, 20466877 - 20466977
Alignment:
Q  185 gacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataac 284  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||  |  | ||||| |||||||| |  |||||  || ||||||||| ||| || || ||||||||||||||||    
T  20466877 gacttcaaagcacgaccaacaccggtcacggggttaactctaaaaaacacattatcttcaactagaaactcaatatccttcctccgcttatcatgataac 20466976  T
Q  285 t 285  Q
    |    
T  20466977 t 20466977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 11 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 127542 - 127265
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  127542 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgatacatgaaacacatcatgtaaattcgaaagatgcggtggtaaac 127443  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  127442 ccactcgatacgccaccattccaactctttctgatatctgatacggatcaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 127343  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  127342 cacatgagtgactctcaaaaacacgtgatctccttcttggaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactctt 127265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 33095 - 32817
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  33095 acatcatcactttggatcacatgagatggatccgtaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 32996  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  32995 ccactcggtacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttaacttcaatgcaagtccaacaccagt 32896  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32895 cacaagagtgactctcaaaaatacgtgatctccttcttaaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttt 32817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 36)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 17045427 - 17045149
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||| |||||    
T  17045427 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaacacgtcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 17045328  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  17045327 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggggtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccggt 17045228  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  17045227 cacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcctgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttt 17045149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Original strand, 20249797 - 20250075
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |    
T  20249797 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaaggtgcggtggtaaac 20249896  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  20249897 ccactcggtacgccaccgttccaactctttctgatatcttatacggaacaataaatttcggagtcaacttctttgacttcaacgctcgtccaacaccagt 20249996  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20249997 cacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttt 20250075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 50620656 - 50620378
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| ||| |    
T  50620656 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttacgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatacggtggtaaac 50620557  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | ||||| || |||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  50620556 ccactcgatatgccaccattccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 50620457  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  50620456 cacaggagtgactctcaaaaatacgtgatcttcctcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttt 50620378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Original strand, 19106314 - 19106592
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||  |||||    
T  19106314 acatcgtcactctagatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggtagtaatc 19106413  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  19106414 caactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatatggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaacgcacgtcctacaccagt 19106513  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19106514 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctccgcttatcatgataactcttt 19106592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Original strand, 20136725 - 20137003
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |    
T  20136725 acatcatcactttggatcacatgagatggatcaaaaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgccgtggtaaac 20136824  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    |||| || |||||||| || | ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20136825 caacacgatacgccactgtcccaactctttccgatatctgatacagaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 20136924  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  20136925 cacaggagtgactctcaaaaacacgaggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatggtaactcttt 20137003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 11 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 16079045 - 16078810
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  16079045 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgtagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 16078946  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | ||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16078945 ccactcgatacgccaccattccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 16078846  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 246  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16078845 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 16078810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 16351011 - 16350733
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  16351011 acatcgtcattctgaattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 16350912  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16350911 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 16350812  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16350811 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 16350733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Original strand, 21747482 - 21747759
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |    
T  21747482 acatcatcactttggattacatgggatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgtggtggtaaac 21747581  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21747582 ccactcggtacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacgaaccaataaatctcggattcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 21747681  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    |||| |||||||||||||| | | ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  21747682 cacaggagtgactctcaaacatatgtggtctccttctagaaactcaagatc-tttctacgcttattatggtaactcttt 21747759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 19761278 - 19761000
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||| ||||||| ||| |    
T  19761278 acatcatctcttgggatcacatgagacggatccgaaacatactaccgaagttgcgatacatgaaacatatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaaac 19761179  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | ||||| ||||||||||||| || |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  19761178 ccactcgatacgccaccgttccaattctttcggatatctgatacggtccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccaat 19761079  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19761078 cacaagagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttt 19761000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 33391441 - 33391163
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||| | ||| |    
T  33391441 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaac 33391342  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33391341 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 33391242  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33391241 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 33391163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Original strand, 21830250 - 21830528
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  21830250 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 21830349  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21830350 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 21830449  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  21830450 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttccacgcttatcgtgataactcttt 21830528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 51333905 - 51333627
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  51333905 acatcgtcactttggatcacatgagatggatccagaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 51333806  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  |||  |||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  51333805 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatatgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 51333706  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51333705 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttattggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 51333627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Original strand, 21836897 - 21837175
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||| | ||| |    
T  21836897 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatacttttgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaac 21836996  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21836997 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 21837096  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21837097 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgctgatcatgataactcttt 21837175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 34 - 289
Target Start/End: Original strand, 16369267 - 16369522
Alignment:
Q  34 agatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcga 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| |    
T  16369267 agatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaaccaacacggtacgccaccgttcca 16369366  T
Q  134 actctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaaca 233  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |    
T  16369367 actctttctgatatctgatatagaccaataaacctcgaagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacacttgtcacaggagtgactctcaaaaata 16369466  T
Q  234 cgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    | || ||| ||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  16369467 catgatctccttcttggaattcaaggtctttcctacgcttatcatgataacccttt 16369522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 50612828 - 50612602
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| ||| |    
T  50612828 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttacgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatacggtggtaaac 50612729  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | ||||| || |||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  50612728 ccactcgatatgccaccattccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 50612629  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtg 237  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||    
T  50612628 cacaggagtgactctcaaaaatacgtg 50612602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 41354881 - 41354603
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  41354881 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 41354782  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | |||||||| |||||||| | |||||||||  | | |||||| |||||||| ||  |||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  41354781 ccactcggtaagccaccgtcccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcgaggtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacaccagt 41354682  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41354681 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 41354603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 165
Target Start/End: Original strand, 21163227 - 21163381
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||| |||||||| ||| |    
T  21163227 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaatgtcgtgcaaattcgaaatatgcggtggtaaac 21163326  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaa 165  Q
    | |||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  21163327 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaa 21163381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 29 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 19665270 - 19665011
Alignment:
Q  29 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 128  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |    
T  19665270 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaatacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactg 19665171  T
Q  129 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 228  Q
    ||| ||| || ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| || || |||| | |||| |||||||     
T  19665170 ttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacccccgtcataggagtaactctcag 19665071  T
Q  229 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    ||| || || ||| | ||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  19665070 aaatacatgatctccctcttgaaactcaagggctttcctacgcttgtcatgataactctt 19665011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 47 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 20940439 - 20940198
Alignment:
Q  47 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |||| ||| || |||||||    
T  20940439 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctctgata 20940340  T
Q  147 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 246  Q
     ||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| ||||||| ||| || || ||  | ||    
T  20940339 tctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatcaccctc 20940240  T
Q  247 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
     |||||||||||  | || |||||||||||||||||||||||    
T  20940239 ctgaaactcaagggccttcctacgcttatcatgataactctt 20940198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 12 - 288
Target Start/End: Original strand, 37677027 - 37677304
Alignment:
Q  12 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatcc 111  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || ||    
T  37677027 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagagacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 37677126  T
Q  112 aactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 211  Q
    ||||| ||| ||||| || | |||||| ||||| | ||||||||||||||||||  | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||    
T  37677127 aactctgtatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtc 37677226  T
Q  212 acatgagtgactctcaa-aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    | | ||||||| ||||| ||| || || ||  | || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  37677227 aaaggagtgaccctcaagaaaaacatgatcaccctcctgaaactccagatcctttcttcgcttgtcatggtaactctt 37677304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 26 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 31550578 - 31550316
Alignment:
Q  26 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 125  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||||| ||| ||||    
T  31550578 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctgtatgcca 31550479  T
Q  126 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 225  Q
    | || | |||||| ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||  | ||||||||||| || |||||||| |||| | ||||||| ||    
T  31550478 ctgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgtcaaaggagtgaccct 31550379  T
Q  226 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    || ||| || || ||  | || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  31550378 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactctt 31550316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 29 - 288
Target Start/End: Original strand, 19854279 - 19854538
Alignment:
Q  29 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 128  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||  || |||||||  || ||||| |    
T  19854279 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatttggtggcaaaccaactctatatgccactg 19854378  T
Q  129 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 228  Q
    ||| ||| || ||||| | ||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| || || || ||||| |||| | |||| |||||||     
T  19854379 ttccaaccctctctgaaatctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcccgacctacacccgtcataggagtaactctcag 19854478  T
Q  229 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    ||| || || ||| | ||||||||||||||  | || |||||||| ||||||||||||||    
T  19854479 aaatacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactctt 19854538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 29 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 20857155 - 20856895
Alignment:
Q  29 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 128  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||| | |||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||  || |||||||  |||||||| |    
T  20857155 acatgcgaaggatctggtacatacttccgcaattgcgacacatgaaatacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatacgccacag 20857056  T
Q  129 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 228  Q
    ||| |||||||||||| | ||| || |||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| || ||||     
T  20857055 ttccaactctttctgaaatctggtaaggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcccacacccgtcataggagtaaccctcag 20856956  T
Q  229 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    ||| || |||||  |||| |||||| |||| || || |||||||| || ||||| ||||||    
T  20856955 aaaaacatggtcaccttcctgaaacgcaaggtccttcctacgcttgtcgtgatagctcttt 20856895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 26 - 288
Target Start/End: Original strand, 20294374 - 20294636
Alignment:
Q  26 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 125  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||    
T  20294374 atcacatgcgaaggatccgccacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 20294473  T
Q  126 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 225  Q
    | || | |||||| ||||| | |||||| |||||||| ||  | |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||    
T  20294474 ctgtaccaactctctctgaaatctgatatggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccct 20294573  T
Q  226 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    || ||| || || ||  | ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||    
T  20294574 cagaaaaacatgatcaccctcttgaaactcaagatccttccttcgcttgtcatggtaactctt 20294636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 26 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 20075456 - 20075194
Alignment:
Q  26 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 125  Q
    |||||||| || ||||| |  |||||||||||||| || || ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || ||||||   || ||||    
T  20075456 atcacatgcgaaggatctgctacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactttatatgcca 20075357  T
Q  126 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 225  Q
    | ||||  ||||| ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||    
T  20075356 ctgttcccactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccct 20075257  T
Q  226 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
     | ||| || || ||  | || |||||||||||| | ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  20075256 tagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttctccgcttgtcatggtaactctt 20075194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 22433528 - 22433327
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||  || |    
T  22433528 acatcatctctcggaataacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcatattcgaaagatgtggtggcaaac 22433429  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    ||||||  || ||||| |||  ||| || ||||| | |||||||| ||| || ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  22433428 caactctataggccacagttgcaaccctctctgaaatctgatacgaaccgatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcccacacccgt 22433329  T
Q  211 ca 212  Q
    ||    
T  22433328 ca 22433327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 20395404 - 20395194
Alignment:
Q  12 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatcc 111  Q
    ||||||| ||| | |||||||| || |||||||  |||||||||||||| || || | ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||    
T  20395404 catcatccctcggaatcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgagaaatatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacc 20395305  T
Q  112 aactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 211  Q
    |||||  || |||||  ||| |||||| ||||| | |||||||||||| || ||  | |||||||| ||| | |||||||||||||| || ||||| |||    
T  20395304 aactctatatgccactattccaactctctctgaaatctgatacggaccgatgaacttaggagtcaaattcctcgacttcaaagcacgaccgacacccgtc 20395205  T
Q  212 acatgagtgac 222  Q
    | | |||||||    
T  20395204 aaaggagtgac 20395194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 148 - 288
Target Start/End: Original strand, 11382678 - 11382818
Alignment:
Q  148 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttct 247  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||| || || ||  | ||     
T  11382678 ctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaggcacgtccaacacccgtcaaaggagtgactctcagaaaaacatgatcaccctcc 11382777  T
Q  248 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    |||||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||    
T  11382778 tgaaactcaagatccttccttcgcttgtcatggtaactctt 11382818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 47 - 288
Target Start/End: Original strand, 20244183 - 20244424
Alignment:
Q  47 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 146  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |||| ||| || ||||| |    
T  20244183 acatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggaaaaccaactctataggccactgttccaaccctctctgaaa 20244282  T
Q  147 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 246  Q
     |||||| ||||| || ||  | |||||||||||  | |||||||| ||| |||| ||||| |||| | |||| || |||| ||| || || ||  | ||    
T  20244283 tctgatatggaccgatgaactttggagtcaactttctcgacttcaatgcatgtcccacacccgtcataggagtaaccctcagaaagacatgatcaccctc 20244382  T
Q  247 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
     |||||||||||  | ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  20244383 ctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactctt 20244424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 143 - 288
Target Start/End: Original strand, 41307904 - 41308049
Alignment:
Q  143 gataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtctt 242  Q
    |||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||| || |||||||| |||||||  ||||| |||| | |||| || |||| |||||| ||||||     
T  41307904 gatatctgatacggaccaataaacttaggagtcaactttttagacttcaatgcacgtcatacacccgtcataggagtaaccctcagaaacacatggtctc 41308003  T
Q  243 cttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    | ||||||||||||||    ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  41308004 cctcttgaaactcaaggggctttctacgcttgtcatggtaactctt 41308049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 104
Target Start/End: Original strand, 24476927 - 24477020
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtg 104  Q
    |||||||| ||| | |||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  24476927 acatcatctctcggaatcacatgcgagggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgaaaattcgagagatgtggtg 24477020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 77 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 20836237 - 20836131
Alignment:
Q  77 acatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtca 176  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |||| |||||| ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||    
T  20836237 acatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccacagttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtca 20836138  T
Q  177 acttctt 183  Q
    |||||||    
T  20836137 acttctt 20836131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 170 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 20831645 - 20831527
Alignment:
Q  170 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 269  Q
    |||||||||||| |  |||| |||||||| ||||| || |||||| || | || ||||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  20831645 ggagtcaacttcctacactttaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 20831546  T
Q  270 gcttatcatgataactctt 288  Q
     ||||||||||||||||||    
T  20831545 tcttatcatgataactctt 20831527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 170 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 22142294 - 22142232
Alignment:
Q  170 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaac 232  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||| || | ||||||||||||    
T  22142294 ggagtcaacttcttacacttcaaagcacgaccaacaccagttacaggattcactctcaaaaac 22142232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 170 - 288
Target Start/End: Original strand, 46518827 - 46518945
Alignment:
Q  170 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 269  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| |||||| || | || ||||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| || || |    
T  46518827 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctcc 46518926  T
Q  270 gcttatcatgataactctt 288  Q
     |||||||||||| |||||    
T  46518927 tcttatcatgatagctctt 46518945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 170 - 288
Target Start/End: Original strand, 20914316 - 20914434
Alignment:
Q  170 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 269  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| |||||| || | || |||||||| || || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  20914316 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 20914415  T
Q  270 gcttatcatgataactctt 288  Q
      |||| ||||||||||||    
T  20914416 atttataatgataactctt 20914434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 4748 - 4470
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||| |||||    
T  4748 acatcatcactttggatcacatgagatggatccagaacatacttccaaagttgcgacacatggaaaacttcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 4649  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | ||||| |||||||| |||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4648 ccactcgatacgccactgttccaactcttttcgatatctgatacggaccaataaatctcggagttaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 4549  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    |||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4548 cacaagagtgactttcaataacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttt 4470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Original strand, 27930 - 28208
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  27930 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 28029  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    ||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28030 caactcgatacgccactgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctaggattcaacttctttgacttcacagcacgtccaacaccagt 28129  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    |||  |||| |||||||||||||| || ||  | |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28130 caccggagtaactctcaaaaacacatgatcaccctcttgaaattcaagatcctttctacgcttatcatgataactcttt 28208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Original strand, 180180 - 180458
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  180180 acatcaacactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacttgaaagacatcatgaaaattcgaaagatgcggtggtaagc 180279  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  180280 caactcgatacgccactgttctaactctttctgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcaggtccaacaccagt 180379  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    |||  |||| |||||||||||||| || ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  180380 caccggagtaactctcaaaaacacatgatcaccctcttgaaactcaagatcctttctacgcttatcatgataactcttt 180458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 3)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 219760 - 219482
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  219760 acatcatctctttggatcacatgagatggatctggaacatacttccgaagttgcgatacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtgttaatc 219661  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | ||| | ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  219660 ccacttgatacgccaccgttccaattctttctgatatctgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaacgcacgtccaacaccagt 219561  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  219560 cacaggagtgactctcaaaaatacgtgatcttcttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttt 219482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Original strand, 229006 - 229284
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| |||| ||||||||||||||||| ||| |    
T  229006 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacatatcgtgcatattcgaaagatgcggtggtaacc 229105  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | | ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  229106 ctattcggtacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaacaaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtcccacaccagt 229205  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
     | | |||||||||||||||| || || ||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  229206 aataggagtgactctcaaaaatacatgatctccttcttgaaattcaaggtcttttctacgtttatcatggtaactcttt 229284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 33179 - 33061
Alignment:
Q  170 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 269  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||| |  | || ||||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  33179 ggagtcaacttcttacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggtttcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 33080  T
Q  270 gcttatcatgataactctt 288  Q
     ||||||||||||||||||    
T  33079 tcttatcatgataactctt 33061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 191; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 1165 - 888
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||    
T  1165 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgtaatacatcatgcaatttcgaaagttgctgtggtaatc 1066  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    ||||||| ||  ||||| ||| | || ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1065 caactcgatattccacctttccatctttttcttatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagt 966  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  965 cacaggagtgactctcaaaaa-acgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttttcatgataactcttt 888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 325 - 47
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  325 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgatacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 226  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
      ||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  225 tcactcgatacgccaccgttccaacactttccgatatctgatacggaccaataaatctcagagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 126  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    ||||||||||||||| ||||| || || ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  125 cacatgagtgactctaaaaaatacatgatctccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataattcttt 47  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 3)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Original strand, 5986 - 6264
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  5986 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacaagaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 6085  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | ||||| ||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6086 ccactcgatacgccaccgtcccaactctttccgatatctgatacgggccaataaatcttggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagt 6185  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    |||| | |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  6186 cacaggtgtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatggtaactcttt 6264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 47 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 1831 - 1590
Alignment:
Q  47 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |||| ||| ||||||||||    
T  1831 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtgggaaaccaactctatatgccactgttccaaccctttctgata 1732  T
Q  147 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 246  Q
     ||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| ||||||  ||| || || |||||  |    
T  1731 tctgatacggactaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctccgaaatacatgatcttccac 1632  T
Q  247 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
     |||||||||||  | || |||| ||| ||||||||||||||    
T  1631 ctgaaactcaagggccttcctacacttgtcatgataactctt 1590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 170 - 288
Target Start/End: Original strand, 22816 - 22934
Alignment:
Q  170 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 269  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||  |||||||| ||||||||| | |||||||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  22816 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacaaccaacaccggtcacatgattcactctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 22915  T
Q  270 gcttatcatgataactctt 288  Q
     ||||||||||||||||||    
T  22916 tcttatcatgataactctt 22934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 5)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Original strand, 162076 - 162354
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  162076 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggaacatacttctgaagttgcgaaacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 162175  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  162176 ccactcggtacgccaccgttccaactctttctgatatctgatacgggccaataaatctcggagtcaagttctttgacttcgacgctcgtccaacaccagt 162275  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    || | |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  162276 cataggagtgactctcaaaaatacgtggtctacttcttgaaacacaagatcttttttacgcttatcatgataactcttt 162354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 11 - 288
Target Start/End: Original strand, 448022 - 448299
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  448022 acatcatctctttggatcacatgagatggatccggaaaatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 448121  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | ||| | | ||||||||||| || |||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  |||    
T  448122 ccacttgatgcgccaccgttccaattctttccgatatttgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgctcgtccaacaatagt 448221  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
     ||| |||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  448222 tacaggagtgactctaaaaaatacgtgatctccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgatagctctt 448299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 91239 - 90998
Alignment:
Q  47 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 146  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || || |||| ||| ||||| |||| ||| || || ||||    
T  91239 acatacttccgcagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacctactctgtatgccactgttccaaccctctcagata 91140  T
Q  147 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 246  Q
     || ||| |||| ||||||  | | |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||  | |||| ||||||| |||||| || ||| | ||    
T  91139 tctaatatggactaataaactttgaagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcgtaggagtaactctcagaaacacatgatctccctc 91040  T
Q  247 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    ||||||||||||  | || |||||||| ||||| ||||||||    
T  91039 ttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactctt 90998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 170 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 78813 - 78695
Alignment:
Q  170 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 269  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || ||||||||| | |||||||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  78813 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactcctgtcacatgattcactctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 78714  T
Q  270 gcttatcatgataactctt 288  Q
     ||||||||||||||||||    
T  78713 tcttatcatgataactctt 78695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #5
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 212
Target Start/End: Original strand, 175352 - 175427
Alignment:
Q  137 ctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtca 212  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  175352 ctttccgatatctgatacggaccaataaacttcgggatcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacacccgtca 175427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 183; Significance: 5e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Original strand, 6335 - 6613
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||||||||   |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  6335 acatcatcacctaggatcacatgggatggatccagtacatacttccgaagttgcgacacatgaaacatatcgtgcaaattcgaaagatgcggtgttaatc 6434  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | ||||| ||  ||||| | | |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6435 ccactcgatataccaccatcccaactctttccaatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 6534  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  6535 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgtttatcatggtaactcttt 6613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 183; Significance: 5e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Original strand, 16950 - 17228
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    |||||||| || |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  16950 acatcatctctttggatcacatgagatgcatccagaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 17049  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | ||| | ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |    
T  17050 ccacttgatacgccaccgttccaattctttctgatatctgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacacaaat 17149  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17150 cacatgagtgactctcaaaaatacgtgatctccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttt 17228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 183; Significance: 5e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 1036 - 759
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  1036 acatcaccactttggatcacatgggatggatccggtacatacttccgaagttgctccacatgaaacacatcctgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 937  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | || || ||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  936 ccacacgatacgccaccgttccaactcttttcgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 837  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  836 cacacgagggactctc-aaaacacgtggtctccttcttgaaacttaagatctttcctacgcttatcatgataactcttt 759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Original strand, 9306 - 9584
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  9306 acatcatcactttggatcacatgggatggatctagaacatactttcgaagttgcgacacatgaaacacatagtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 9405  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9406 ccactcggtacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacagaccaataaatctaggagtcaccttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagt 9505  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9506 cacaggagtgactctcaacaatacgtggtctccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttt 9584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 176; Significance: 7e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 11 - 286
Target Start/End: Original strand, 14840 - 15115
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||| ||| |    
T  14840 acatcatctctctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgcggtggtaagc 14939  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | ||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  14940 ccactcggtacgccaccgttccaattctttctgatatttgatacggaccaataaacctcggagtcaacttatttgacttcaatgcgcgtccaacaccagt 15039  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactc 286  Q
    |||| |||||||| ||||||| || || ||| |||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||    
T  15040 cacaggagtgactatcaaaaatacatgatctccttcatgaaactcaaggtctttcctaagcttatcatgataactc 15115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0894 (Bit Score: 175; Significance: 3e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0894
Description:

Target: scaffold0894; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 11 - 285
Target Start/End: Original strand, 1102 - 1376
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||| |||      
T  1102 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggtacatacttccgaagttgcaacacataaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaat 1201  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  1202 ccactcggtacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaacaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtcgaacaccagt 1301  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 285  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  1302 cacaggagtgactctaaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacacttatcatggtaact 1376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 175; Significance: 3e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Original strand, 5184 - 5462
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  5184 acatcatcactttggatcacatgagatggatccagaacataattacgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcagtggtaatc 5283  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5284 ccactcgatacgccaccgttccaactctttctgatatctgatacagaccaataaatctcggagtcgacttccttgacttcaaagctcgtccaacaccagt 5383  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    |||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||    
T  5384 cacaggagtgactctcaaaaatatgtggtctccttctttaaactcaagatctttcctgcgtttaccatgataactcttt 5462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 3)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 17 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 110148 - 109877
Alignment:
Q  17 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactc 116  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | ||| || ||||    
T  110148 tcactctgaattacatgagagggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactc 110049  T
Q  117 ggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatg 216  Q
    |||| |||||||||| |||||||||  ||| |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |    
T  110048 ggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagg 109949  T
Q  217 agtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  109948 agtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 109877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 29 - 288
Target Start/End: Original strand, 112540 - 112799
Alignment:
Q  29 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 128  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || | ||| || || |  || ||||| |    
T  112540 acatgcgaaggatccggtacatacttccgcaactgcgacacatggaacacgtcatgcaaattcgaaagatgagggggtaaacccaccctataagccactg 112639  T
Q  129 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 228  Q
    ||| |||||| || |||| |||||| || ||||||||  | |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| | |||||||||||||    
T  112640 ttccaactctctcagatatctgatatgggccaataaactttggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaa 112739  T
Q  229 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
     ||||| || ||| | ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||    
T  112740 gaacacatgatctccctcttgaaactcaagatccttcctacgcttgtcatgatagctctt 112799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 96345 - 96067
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || ||||| || ||||||||||| |  || |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||  || |    
T  96345 acatcatctctcggaataacatgtgaaggatcaggtacatacttccgcaactgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaac 96246  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    ||| ||  |||||||| |||| |||||||||||| | |||||| ||||| || ||  | |||||||||||  | |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  96245 caattctatacgccacagttccaactctttctgaaatctgataaggaccgatgaactttggagtcaactttctcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 96146  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    || | |||| || |||||||| || |||||  |||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  96145 cataggagtaaccctcaaaaaaacatggtcaccttcctgaaattcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttt 96067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 171; Significance: 7e-92; HSPs: 5)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Original strand, 111984 - 112262
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  111984 acatcatctcttgggatcacatgagatggatccgaaacatacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 112083  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | ||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  112084 ccactcgatacgccaccgttccaattctttctgatatctgatacggaccaataaacctgggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 112183  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    |||| |||||||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||| || ||  |||||||||||||||| ||||||    
T  112184 cacaggagtgactctcaaaaatacatggtctccttcctgaaactcaaggtccttcttacgcttatcatgatatctcttt 112262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 203811 - 203534
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    |||||||| ||| | |||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || |    
T  203811 acatcatccctcggaatcacatgcgatggatccaatacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 203712  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | ||||  || ||||| |||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| ||    
T  203711 ccactctatatgccactgttccaactcttttagatatctgatacggaccaataaacctcggcgtcaacttctttggcttcaaagcacggccagcacctgt 203612  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    |||| |||||||||| | |||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||| ||||    
T  203611 cacaagagtgactcttagaaacacatggtctccttcttgaaattcaaggtctttcctgcgcttatcgtgataaatctt 203534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 288
Target Start/End: Original strand, 117532 - 117808
Alignment:
Q  12 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatcc 111  Q
    ||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||    
T  117532 catcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacc 117631  T
Q  112 aactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 211  Q
    |||||  || ||||| |||| ||| || || |||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||  |||    
T  117632 aactctatatgccactgttccaaccctctccgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcccacactcgtc 117731  T
Q  212 acatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    | | |||| || |||| ||| || || ||  | || |||||||||||  | || |||||||| ||||||||||||||    
T  117732 ataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactctt 117808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 288
Target Start/End: Original strand, 322703 - 322944
Alignment:
Q  47 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||  |||| ||| || |||||||    
T  322703 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccattgttccaaccctctctgata 322802  T
Q  147 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 246  Q
     |||||| |||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| ||||||| ||| || || ||  | ||    
T  322803 tctgatatggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatcaccctc 322902  T
Q  247 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
     |||||||||||  | || |||||||| ||||||||||||||    
T  322903 ctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactctt 322944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #5
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 26 - 288
Target Start/End: Original strand, 385797 - 386059
Alignment:
Q  26 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 125  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || || |||| ||| ||||    
T  385797 atcacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgcca 385896  T
Q  126 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 225  Q
    | |||| |||||| || |||| ||| || | ||| |||||  ||||||||||||||||  ||||||| ||||  || ||||| |||  | ||||||||||    
T  385897 ctgttccaactctctcagatatctggtatgaacctataaacttcggagtcaacttcttatacttcaacgcacaacctacacccgtcgtaggagtgactct 385996  T
Q  226 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    || ||| |  || ||| | ||||||||||||||    ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  385997 cagaaatagatgatctccctcttgaaactcaagggtctttcttcgcttgtcatggtaactctt 386059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0459 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0459
Description:

Target: scaffold0459; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Original strand, 377 - 655
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||||| ||| |    
T  377 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaac 476  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | |||||||| ||||| |||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  477 ccactcggtaagccactgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaatttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 576  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  577 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttt 655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Original strand, 968 - 1246
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  968 acatcatcaccttggatcacataagatggatccagaacatactttcgaagttgcgttacatgaaagacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 1067  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1068 ccactcggtacgccaacgttccaactctttccgatatccgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 1167  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    |||| | ||||||||||| || || || ||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1168 cacaggggtgactctcaagaatacatgatctccttctttgaactcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttt 1246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 15422 - 15144
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    |||||||| ||  |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  15422 acatcatctcttgggatgacatgagatggatccgaaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 15323  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | ||||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||| || ||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15322 ccactcgatacgccaccgttccaattctttctgatatctgatacagaccaattaaccttagagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 15223  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    ||||||||||||||||||| | || || ||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15222 cacatgagtgactctcaaagatacatgatctccttcctgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttt 15144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Original strand, 16920 - 17142
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  16920 acatcatcactctggatcacatgaaatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 17019  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    ||||||  ||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17020 caactcaatacgccaccgttaaaactctttccgatatctgatacgaacaaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 17119  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaaca 233  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  17120 cacatgagtgactctcaaaaaca 17142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 165; Significance: 3e-88; HSPs: 5)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 17 - 289
Target Start/End: Original strand, 43123 - 43395
Alignment:
Q  17 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactc 116  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||| || ||||    
T  43123 tcactctggattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactc 43222  T
Q  117 ggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatg 216  Q
     ||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | |    
T  43223 agtatgccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgccctacaccagtcatagg 43322  T
Q  217 agtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  43323 agtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctgcacttatcatggtaactcttt 43395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Original strand, 8448 - 8726
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||| |||| ||| |    
T  8448 acatcgtcactctagatttcatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgaggtggtaaac 8547  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | |||||||| |||||| ||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  8548 ccactcggtaagccacccttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagt 8647  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    || | |||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  8648 cataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctaaaactcaagatcttttctacgtttatcgtgataactcttt 8726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 216 - 289
Target Start/End: Original strand, 13834 - 13907
Alignment:
Q  216 gagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  13834 gagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctaaaactcaagatcttttctacgtttatcgtgataactcttt 13907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 38 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 50830 - 50595
Alignment:
Q  38 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactc 137  Q
    |||||||| ||||||||||| |  | |||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || |  || || || |  || ||||| || |  ||||    
T  50830 ggatccggtacatacttccgcaactacgacacgtggaacacgtcatgcaaattcgaaagatgagggggcaaacccaccctataagccactgtcccgactc 50731  T
Q  138 tttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtg 237  Q
    | || |||| |||||| || ||||||||  | |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| | ||||||||||||| ||||| ||    
T  50730 tctcagatatctgatatgggccaataaactttggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatg 50631  T
Q  238 gtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgctt 273  Q
     ||| | |||||||||||||| || || ||||||||    
T  50630 atctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgctt 50595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 170 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 106757 - 106639
Alignment:
Q  170 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 269  Q
    |||||||||||| |  |||| |||||| | |||||||| |||||| || | || ||||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  106757 ggagtcaacttcctacactttaaagcaggaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 106658  T
Q  270 gcttatcatgataactctt 288  Q
     ||||||||||||| ||||    
T  106657 tcttatcatgataaatctt 106639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 163; Significance: 4e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Original strand, 7340 - 7618
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||| |||| ||| |    
T  7340 acatcgtcactctggattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgaggtggtaaac 7439  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | ||||| || |||||||||| |||||| ||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7440 ccactcgctaagccaccgttccaactctctccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 7539  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    || | |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  7540 cataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgtttatcgtgataactcttt 7618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 163; Significance: 4e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Original strand, 3995 - 4273
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||  ||| |    
T  3995 acatcatctctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacaaatcatgcaaattcgaaagatgcggtagtaaac 4094  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | ||| | ||||||||||||| ||  |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  4095 ccacttgatacgccaccgttccaatcctttctgatatctgatatggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcgcgtccaacaccagt 4194  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    |||| |||||||||||||||| || || ||| |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||    
T  4195 cacaggagtgactctcaaaaatacatgatctccttcttaaaactcaaggtctttcctacgcttatcatagtaactcttt 4273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 163; Significance: 4e-87; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Original strand, 15456 - 15733
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||| ||| |||| ||| |    
T  15456 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggaacatacttccgaagttgcgacccatgaaacacatcgtgcaaattcgaaa-atgtggtggtaaac 15554  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | ||||| || |||||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15555 ctactcgatatgccaccgttccaactctttccgatatctgatacgaaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 15654  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    |||| || ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||| || | ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  15655 cacaagaatgactgtcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcgaggtatttcctacgcttatcatggtaactcttt 15733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 225 - 289
Target Start/End: Original strand, 15832 - 15896
Alignment:
Q  225 tcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||| || | ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  15832 tcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcgaggtatttcctacgcttatcatggtaactcttt 15896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 163; Significance: 4e-87; HSPs: 2)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Original strand, 14002 - 14280
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||||||| | |||||||||||  |||||| | | ||||||||| |||||||||||||||| || ||||  | |||||||||||||||||||| |||||    
T  14002 acatcatcagtttggatcacatggaatggattctgtacatacttcggaagttgcgacacatgaaacacatagttcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 14101  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
      ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14102 tcactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctcatacagaccaataaatctcggagtcaactactttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 14201  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    |||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  14202 cacaggagtgactatcaaaaacatgtggtctccttcttgaaactcaagatctctcctacgcttatcatgataactcttt 14280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 11 - 285
Target Start/End: Original strand, 31373 - 31647
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||| ||||  || |    
T  31373 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacaaaaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 31472  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    ||||||  || ||||| |||| ||  || || |||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  31473 caactctatatgccactgttccaaacctatcagatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgt 31572  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 285  Q
    || |  ||| ||||||| |||||| || | | | ||||||||||||||  | || |||||||| ||||| |||||    
T  31573 catagaagtaactctcagaaacacatgatatccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaact 31647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 16808 - 16530
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  16808 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttctgaagttttaatacatggaacatatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 16709  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | ||||| ||||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  16708 ccactcgatacgccaccgttccaactcttttcgatatctgatacggaccagtaaacctctgagtcaacttctttgacttcaatgtgcgtccaacaccagt 16609  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  16608 cacaggagtgactctcaaaaatacgtgatctccctcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatggtaactcttt 16530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 23 - 289
Target Start/End: Original strand, 3115 - 3381
Alignment:
Q  23 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 122  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||| ||||    
T  3115 tggatcacgtaagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggtaaacccactcgatacg 3214  T
Q  123 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 222  Q
    ||||||||| || ||||||  ||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||    
T  3215 ccaccgttccaattctttcaaatatctgatacgaaccaataaacctcgaagtcaacttctttgacttcaatgcgcgtccaacaccagtcacaggagtgac 3314  T
Q  223 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    ||||||||| || || ||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3315 tctcaaaaatacatgatctccttcttgaaacttaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttt 3381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0877 (Bit Score: 156; Significance: 6e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0877
Description:

Target: scaffold0877; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 24 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 590 - 335
Alignment:
Q  24 ggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgc 123  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||    
T  590 ggatcacatgagatggatccataacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgc 491  T
Q  124 caccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgact 223  Q
    |||| ||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||| || |||||    
T  490 caccattccaatcctttctgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtccaacaccggttacaggattgact 391  T
Q  224 ctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatg 279  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  390 ctcaaaaacacatggtccccttcttgaaactcaatgtctttcctacgcttatcatg 335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 155; Significance: 3e-82; HSPs: 5)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 23 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 26864 - 26598
Alignment:
Q  23 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||||    
T  26864 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatcaaacacatcatggaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacg 26765  T
Q  123 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 222  Q
    ||||||||  ||  |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||    
T  26764 ccaccgtttcaatcctttctgatatctgatacgggccaataaacctcggagtcaacttctttcacttcaatgcgcgtccaacaccagtcacaggagtaac 26665  T
Q  223 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  26664 tctcaaaaatacgtgatctccttcctggaactcaaggtctttcctacgcttatcatggtaactcttt 26598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 29 - 227
Target Start/End: Original strand, 148551 - 148749
Alignment:
Q  29 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 128  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || || |||| ||| ||||| |    
T  148551 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacctactctgtatgccactg 148650  T
Q  129 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctca 227  Q
    ||| ||| || ||| ||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| |||||||    
T  148651 ttccaaccctctctcatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctca 148749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 68783 - 68582
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || |    
T  68783 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 68684  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | |||| ||| ||||| |||| ||| || || |||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  68683 ccactctgtatgccactgttccaaccctctcagatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgt 68584  T
Q  211 ca 212  Q
    ||    
T  68583 ca 68582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 196045 - 195769
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || |    
T  196045 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 195946  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    ||||||  || ||||| |||| |||  | ||||||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  195945 caactctatatgccactgttccaaccttctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctagacttcaatgcacgtcctacacccgt 195846  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    || | |||| || |||| ||| || || ||  | || |||||||||||  | || |||||||| ||||||||||||||    
T  195845 cataggagtaaccctcagaaa-acatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactctt 195769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 170 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 122134 - 122016
Alignment:
Q  170 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 269  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| |||||| || | || |||||||| || || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  122134 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 122035  T
Q  270 gcttatcatgataactctt 288  Q
     ||||||||||||||||||    
T  122034 tcttatcatgataactctt 122016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 153; Significance: 4e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Original strand, 6900 - 7180
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaaga-tgcggtgataat 109  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||| ||||| | |||     
T  6900 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagaatgcggcggtaaa 6999  T
Q  110 ccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccag 209  Q
    || |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7000 cccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccag 7099  T
Q  210 tcacatgagtgactctc-aaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    ||| | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  7100 tcataggagtgactctcaaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttccacgcttatcgtgataactcttt 7180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 148; Significance: 4e-78; HSPs: 3)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 26 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 117233 - 116970
Alignment:
Q  26 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 125  Q
    |||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| || ||||| ||| || ||||| |||||||    
T  117233 atcacatgagatagatctgaaacatacttccgaagttacgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaatatacggtggtaaacccactcgatacgcca 117134  T
Q  126 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 225  Q
    |||||  || |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  117133 ccgttacaattctttctgatatttgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacactattcacatgagtgactct 117034  T
Q  226 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    |||||| || || |||  ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  117033 caaaaatacttgttctctttcttgaaactcaaggtctttcctacgtttatcatgataactcttt 116970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 170 - 288
Target Start/End: Original strand, 98137 - 98255
Alignment:
Q  170 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 269  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || |||| | || | || || ||||||||||| ||  |  |||||||||||| ||| || || |    
T  98137 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcataggattcacccttaaaaacacgtgatcaccaacttgaaactcaatatccttactcc 98236  T
Q  270 gcttatcatgataactctt 288  Q
     ||||||||||||||||||    
T  98237 tcttatcatgataactctt 98255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 170 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 23650 - 23586
Alignment:
Q  170 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacac 234  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| |||||| || | || |||||||||||    
T  23650 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacac 23586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0739 (Bit Score: 143; Significance: 4e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0739
Description:

Target: scaffold0739; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 47 - 289
Target Start/End: Original strand, 1 - 243
Alignment:
Q  47 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||| || |||||  ||| ||||||||| ||||    
T  1 acatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgaaaatttgaaagatgcggtggtaaaccaactcgatatgccactattccaactctttccgata 100  T
Q  147 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 246  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| || |   | ||    
T  101 tctgatacggaccaataaatctcggagtcaactttttttacttcaaagcacgtccaacaccagtcaccggattgactctcaaaaacacatgataaccctc 200  T
Q  247 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  201 ttgaaactcaagatcctttctacggttatcatgataactcttt 243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 141; Significance: 6e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 61 - 289
Target Start/End: Original strand, 49506 - 49734
Alignment:
Q  61 ttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggacca 160  Q
    |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||    
T  49506 ttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacgggcca 49605  T
Q  161 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagat 260  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||| ||||| | ||||||| |||||||||||||||| |    
T  49606 ataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaacaatcacaggagtgactctaaaaaatatgtggtctccttcttgaaactcaaggt 49705  T
Q  261 cttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  49706 ctttcctacgcttatcatgataaatcttt 49734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 26 - 289
Target Start/End: Original strand, 886 - 1149
Alignment:
Q  26 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 125  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || || |||||||||| ||||||||||||||||| ||| || | ||| || ||||    
T  886 atcacatgagatggatccgaaacatacttccaaagttgcgacacgtgaaacacatcatgcatattcgaaagatgcggtggtaaacccaatcgatatgcca 985  T
Q  126 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 225  Q
    | |||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  986 ctgttccaattctttctgatatctgatatggaccaataaacctcggattcaatttctttcatttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 1085  T
Q  226 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
     ||||| || |||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1086 aaaaaatacatggtctccttcctgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttt 1149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 13320 - 13042
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    |||||||| ||  |||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||| |||| || |||| ||| |    
T  13320 acatcatctcttaggatcatatgagatggatccgaaaaatacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcatgtaaattcaaaagttgtggtggtaaac 13221  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | ||||  ||||| ||| |||  | ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  13220 ccactccatacgctaccattcccattctttctgatatctgatacgaactaataaatctcgaagtcaatttcttagacttcaatgcacgtccaacaccagt 13121  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13120 cacaggagtgactctcaataacacatggtctccttcttgaaattcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttt 13042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 16759 - 16481
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||| ||| |    
T  16759 acatcatctctttggatcacatgagatggatcccgaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtacaaattcgaaagatgcggtggtaaac 16660  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | ||  | ||||||||| ||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |    
T  16659 ctacatgatacgccaccattccaattctttctgatatcttatacggaccaataaatctcggtgtcaacttcttcgacttcaatgcacgtccaacaccaat 16560  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    |||  ||||||| || ||||| || || ||| ||||||||||   |||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  16559 cactggagtgaccctaaaaaatacatgatctccttcttgaaatataagatcctccctacgcttatcatgataactcttt 16481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0284 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0284
Description:

Target: scaffold0284; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 113 - 289
Target Start/End: Original strand, 21932 - 22108
Alignment:
Q  113 actcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtca 212  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21932 actcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcg 22031  T
Q  213 catgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||||||||    
T  22032 caggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatccttcctgcacttatcatgataactcttt 22108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 113 - 288
Target Start/End: Original strand, 7855 - 8030
Alignment:
Q  113 actcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtca 212  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  7855 actcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccggtca 7954  T
Q  213 catgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    |   ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7955 ccgaagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactctt 8030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 124; Significance: 8e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 26 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 26047 - 25784
Alignment:
Q  26 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 125  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||    
T  26047 atcacatgagatggatccgaaacatacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgcca 25948  T
Q  126 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 225  Q
    | |||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||| |  ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  25947 cggttccaattctttctgatatctgatacggaccaataaacatccgagttagtttccttgacttcaatgcacgtccaaccccagtcataggagtgactct 25848  T
Q  226 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
     ||||| || |||| | |||| ||||||||||  || || |||||||||||||||||| |||||    
T  25847 aaaaaatacatggtttccttcctgaaactcaaagtccttcctacgcttatcatgataattcttt 25784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0730 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0730
Description:

Target: scaffold0730; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 26 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 5918 - 5656
Alignment:
Q  26 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |  ||||  ||||| |    
T  5918 atcacatgagatggatccggaacatacttccgatgttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggtaaactcactctatacgcaa 5819  T
Q  126 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 225  Q
    | || | |||||||| ||| |  ||||||| |||| |||| ||||||| ||  ||||| ||||| |  || ||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  5818 ctgtcccaactctttatgaaatatgatacgaaccattaaacctcggagacagtttcttcgactttagtgctcgtccaacaccggtcacaggagtgactct 5719  T
Q  226 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    |||||| || |||||| ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||    
T  5718 caaaaatacatggtctccttcttgaaactcaagatccttt-tgcgcttatcatgataactcttt 5656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 111; Significance: 5e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 26 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 25399 - 25137
Alignment:
Q  26 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 125  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || || ||||  || ||||    
T  25399 atcacatgtgatggatccgatacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgcca 25300  T
Q  126 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 225  Q
    | |||| ||||||||| |||| ||||||||  |||||||| ||| | ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||    
T  25299 ctgttccaactctttccgatatctgatacgagccaataaacctcagcgtcaacttcttcgatttcaaagcacgaccaacacctgtcacaggagtgactct 25200  T
Q  226 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
     | |||||| |||||| || ||||||| ||||||||||| ||||| || || |||||| ||||    
T  25199 tagaaacacatggtctcctgcttgaaattcaagatctttcctacgtttgtcgtgataagtctt 25137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 3)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 125 - 289
Target Start/End: Original strand, 9047 - 9211
Alignment:
Q  125 accgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactc 224  Q
    ||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  9047 accgttccaattctttctgatatctgatacagaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaacgcacgtccaacaccggtcacaggagtgactc 9146  T
Q  225 tcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    ||||||| || || ||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  9147 tcaaaaatacatgatccccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatggtaactcttt 9211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 104
Target Start/End: Original strand, 6940 - 7033
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtg 104  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6940 acatcatctctttggatcacatgagatggatccggaacatactttctaagttgtgacacttgaaacacatcatgcaaattcgaaacatgcggtg 7033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 170 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 517 - 399
Alignment:
Q  170 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 269  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||| ||| ||| || | |||||||| ||||| || ||  |  | |||||||||| ||| || || |    
T  517 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacactagttacaggattcactctcaagaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatccttcctcc 418  T
Q  270 gcttatcatgataactctt 288  Q
     ||||||||||||||||||    
T  417 tcttatcatgataactctt 399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 29 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 11064 - 10804
Alignment:
Q  29 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 128  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||  ||  | ||||  || ||||| |    
T  11064 acatgtgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacattatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaatccactctatatgccactg 10965  T
Q  129 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 228  Q
    ||| |||| | || |||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| || | ||| |||||| |||||||||||||    
T  10964 ttccaactttctcagatatctgatatggaccaataaacctcggtgtcaacttcttcgatttcaaggcacgacctatacctgtcacaggagtgactctcaa 10865  T
Q  229 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  10864 aaacacatggtctccttcttgtaactcaagatcctttctacacttgtcatgataactcttt 10804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 104; Significance: 7e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 26 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 86832 - 86569
Alignment:
Q  26 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 125  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |  |||||||| ||||||| ||| || ||||  ||||| |    
T  86832 atcacatgagatggatctgaaacatacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcatgtaggttcgaaagttgcggtggtaaacccactctatacgcaa 86733  T
Q  126 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 225  Q
    |||  | ||||||||| || |  |||||||| |||||||| |||| |||||  |||||||| || |  |||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  86732 ccgacccaactctttccgaaatttgatacgggccaataaacctcgaagtcagtttctttgattttagtgcacgtccaacaccggtcacaagagtgactct 86633  T
Q  226 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
     |||||||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  86632 aaaaaacacatggtatccttcttgaaactcaagatccttcctacgattatcatgataactcttt 86569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 38 - 288
Target Start/End: Original strand, 26132 - 26382
Alignment:
Q  38 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactc 137  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| ||||  || || |||| ||| ||||| |||| |||||    
T  26132 ggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaacacgtcatgcaaattcaaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaactc 26231  T
Q  138 tttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtg 237  Q
    | || |||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||| | ||||||||||||||||||| ||    
T  26232 tctcagatatctggtacggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacggcctacacccgtcataggagtgactctcaaaaacacatg 26331  T
Q  238 gtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
     ||| | ||||||||||||||  | ||||||||||| | ||| ||||||||    
T  26332 atctccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgtaatggtaactctt 26382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 47 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 29076 - 28835
Alignment:
Q  47 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 146  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||| | ||   | || ||||  || ||||| || | |||||| || || |    
T  29076 acatacttctgaagttgcgacacatgaagcacatcatgcaaattcgagagatgtgatgggtaacccactctatatgccactgtcccaactctctcagaga 28977  T
Q  147 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 246  Q
     |||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  28976 tctgatatggaccaataaaccgtggagtcaacttctttgacttcaaagcacgacagacacctgtcacatgagtgactctcaaaaacacatggtctccttc 28877  T
Q  247 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  28876 ttgaaactcaaggtcctttctacgcttgtcatgataactctt 28835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 47 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 41067 - 40826
Alignment:
Q  47 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 146  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||| | ||   | || ||||  || ||||| || | |||||| || || |    
T  41067 acatacttctgaagttgcgacacatgaagcacatcatgcaaattcgagagatgtgatgggtaacccactctatatgccactgtcccaactctctcagaga 40968  T
Q  147 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 246  Q
     |||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  40967 tctgatatggaccaataaaccgtggagtcaacttctttgacttcaaagcacgacagacacctgtcacatgagtgactctcaaaaacacatggtctccttc 40868  T
Q  247 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  40867 ttgaaactcaaggtcctttctacgcttgtcatgataactctt 40826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0600 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0600
Description:

Target: scaffold0600; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 47 - 288
Target Start/End: Original strand, 3874 - 4115
Alignment:
Q  47 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || || |||| ||| ||||| |||| ||| || || ||||    
T  3874 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtaagccactgttccaacactctcagata 3973  T
Q  147 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 246  Q
     |||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||| | |||||||| ||| |||||| || ||| | ||    
T  3974 tctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacacctgtcataggagtgactatcagaaacacatgatctccctc 4073  T
Q  247 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    ||||||||||||  |||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  4074 ttgaaactcaaggactttcctacgcttgtcatggtaactctt 4115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 4)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 62 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 4717 - 4567
Alignment:
Q  62 tgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaa 161  Q
    ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||| || ||| || ||||| ||||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||    
T  4717 tgcgacagatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcgatggtaaacccactcgatacgccaccgttccaattctttccgatacctgatacggaccaa 4618  T
Q  162 taaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtca 212  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4617 taaatctcggagtaaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtca 4567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 37089 - 36974
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||    
T  37089 acatcatcattctggatcacatcagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcgtaagaggcggtggtaatc 36990  T
Q  111 caactcggtacgccac 126  Q
    ||||| | ||||||||    
T  36989 caactagatacgccac 36974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 47 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 19045 - 18993
Alignment:
Q  47 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatg 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  19045 acatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatg 18993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 4560 - 4519
Alignment:
Q  248 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  4560 tgaaactcgagatctttcctacgcttatcatggtaactcttt 4519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 94; Significance: 6e-46; HSPs: 4)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 92 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 58668 - 58471
Alignment:
Q  92 gaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttca 191  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||  ||||| ||||| | || ||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||| ||||    
T  58668 gaaagatgcggtggtaaacccactctatacgcaaccgtcccaattctttctgaaatctgatacgggccaataaacctcggagtcagtttctttgatttca 58569  T
Q  192 aagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
      ||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||    
T  58568 gtgcatgtccaacaccggtcacatgagtggctctcaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaagatccttcctatgcttatcatgataactcttt 58471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 48 - 288
Target Start/End: Original strand, 19120 - 19360
Alignment:
Q  48 catacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataa 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |||| ||| || || ||||     
T  19120 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacaacatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctccgatat 19219  T
Q  148 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttct 247  Q
    |||||||| |||||| ||| | |||||||||||| | |||||||| ||| |||| ||||| |||| | |||| || |||| ||| || || ||  | ||     
T  19220 ctgatacgaaccaatgaattttggagtcaacttcctcgacttcaatgcatgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccatcc 19319  T
Q  248 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  19320 tgaaactcaaggtcctttctccgcttgtcatggtaactctt 19360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 26 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 59100 - 59042
Alignment:
Q  26 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatg 84  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  59100 atcacatgagatggatccgaaacatacatccgaagttgtgacacatgaaacacatcatg 59042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 288
Target Start/End: Original strand, 74038 - 74140
Alignment:
Q  186 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 285  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||| || | ||||||| |||||| || || ||  | |||||||||| |||||| || | |||||||||||| ||    
T  74038 acttcaaagcacgtccaacaccggttacaggattcactctcagaaacacatgatcatcaacctgaaactcaatatctttcctgctcttatcatgatagct 74137  T
Q  286 ctt 288  Q
    |||    
T  74138 ctt 74140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 29 - 288
Target Start/End: Original strand, 79 - 338
Alignment:
Q  29 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 128  Q
    ||||| || |||||||  ||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||| ||| || |||| ||| ||||| |    
T  79 acatgcgaaggatccgctacatatttccgaagttgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgtggtggtaaacccactctgtatgccactg 178  T
Q  129 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 228  Q
    ||| ||| || ||||||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||     
T  179 ttccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaaagcacgtcatacacccgtcataggagtaactctcag 278  T
Q  229 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    ||| || || ||| | ||||||||||||||  |  |||||||||| ||||| ||||||||    
T  279 aaatacatgatctccctcttgaaactcaagggcccttctacgcttgtcatggtaactctt 338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 91; Significance: 4e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 38 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 7352 - 7102
Alignment:
Q  38 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactc 137  Q
    |||||||  ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || || |||| ||| ||||| |||| |||||    
T  7352 ggatccgctacatacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtaagccactgttccaactc 7253  T
Q  138 tttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtg 237  Q
    | || |||| ||| || |||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||| | |||| || |||| |||||| ||    
T  7252 tctcagatatctggtatggaccaatgaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacacctgtcataggagtaaccctcagaaacacatg 7153  T
Q  238 gtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
     ||| | |||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7152 atctccctcttgacactcaagggcttttctacgcttgtcatgataactctt 7102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 91; Significance: 4e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 14244 - 13966
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |    
T  14244 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaacc 14145  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    ||||||  || ||||| |||| ||  |||||||||| ||||||||||||||| ||  | |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  14144 caactctatatgccactgttccaatcctttctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaatttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 14045  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    || | |||| ||||| |||||||| || ||  | ||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  14044 cataggagtaactcttaaaaacacatgatccccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttt 13966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 83 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 5224 - 5019
Alignment:
Q  83 tgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttct 182  Q
    ||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |||| ||| || ||||||| ||||||||||||||| ||  | ||||||||||||     
T  5224 tgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 5125  T
Q  183 ttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgata 282  Q
    | |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| ||||||| ||| || || || || || |||||||||||  | || |||||||| ||||||||    
T  5124 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatcatcctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgata 5025  T
Q  283 actctt 288  Q
    ||||||    
T  5024 actctt 5019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0326
Description:

Target: scaffold0326; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 18880 - 18603
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||  || |    
T  18880 acatcatctctccgaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcaaaagatgtggtggaaaac 18781  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | |||| ||| ||||| |||| ||| || ||||||| |||||||  |||||||||  | |||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||| ||    
T  18780 ccactctgtatgccactgttctaaccctctctgatatctgatacaaaccaataaacttaggagtcaacttcttagacttcaatgcacatcctacacccgt 18681  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    || | |||| ||||||| |||||| || ||| | ||||||||||||||  | || |||||||| ||||| ||||||||    
T  18680 cataggagtaactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactctt 18603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 3698 - 3637
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatg 72  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  3698 acatcatctctccgaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatg 3637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 47 - 288
Target Start/End: Original strand, 47123 - 47364
Alignment:
Q  47 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || || |||| ||| ||||| |||| ||| || || ||||    
T  47123 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctcagata 47222  T
Q  147 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 246  Q
     ||||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || | | |||| || |||| |||||| || ||| | ||    
T  47223 tctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgttataggagtaaccctcagaaacacatgatctccctc 47322  T
Q  247 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    ||||||||||||  | || |||||||| ||||| ||||||||    
T  47323 ttgaaactcaagggccttcctacgcttttcatggtaactctt 47364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 173 - 286
Target Start/End: Original strand, 7522 - 7635
Alignment:
Q  173 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgct 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7522 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 7621  T
Q  273 tatcatgataactc 286  Q
    ||||||||||||||    
T  7622 tatcatgataactc 7635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 47 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 52170 - 51929
Alignment:
Q  47 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 146  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || || |||| ||| ||||| |||| ||| ||||| ||||    
T  52170 acatacttccgaagttgcaacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctttcagata 52071  T
Q  147 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 246  Q
     |||||| |||||| ||||  | |||||||||||||| |||||||| ||| |||| ||||| |||| | |||||||||||| |||||| || ||| | ||    
T  52070 tctgatatggaccactaaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcatgtcctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctc 51971  T
Q  247 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    ||||||||||||  | || |||||||| ||||| ||||||||    
T  51970 ttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactctt 51929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 3)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 38 - 289
Target Start/End: Original strand, 19973 - 20224
Alignment:
Q  38 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactc 137  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||| ||||  || || |||| ||| ||||| |||| |||      
T  19973 ggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacgccatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaacct 20072  T
Q  138 tttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtg 237  Q
    | ||||||| ||||||||||||||| ||  | ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| ||||||| ||| || ||    
T  20073 tctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtaaacttcttcgacttcaacgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatg 20172  T
Q  238 gtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
     ||| | ||||||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||    
T  20173 atctccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatgataactcttt 20224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 13704 - 13427
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| ||||  || |    
T  13704 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttctaaagatgtggtggcaaac 13605  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    ||||||  || ||||| |||| ||| || || |||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  13604 caactctatatgccactgttccaaccctctccgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcgtcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 13505  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    || | |||| ||||| | ||| || || ||  | || |||||||||||  | || ||||| || ||||||||||||||    
T  13504 cataggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgtttgtcatgataactctt 13427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #3
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 11 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 17474 - 17273
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| ||||  || |    
T  17474 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttctaaagatgtggtggcaaac 17375  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    ||||||  || ||||| |||| ||| || || |||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  17374 caactctatatgccactgttccaaccctctccgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcgtcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 17275  T
Q  211 ca 212  Q
    ||    
T  17274 ca 17273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 38 - 256
Target Start/End: Original strand, 1167 - 1385
Alignment:
Q  38 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactc 137  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || || |||| ||| ||||| |||| ||| |    
T  1167 ggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccc 1266  T
Q  138 tttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtg 237  Q
    | |  |||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||| | |||||||||||| |||||| ||    
T  1267 tctaagatatctgatacagaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacacctgtcataggagtgactctcagaaacacatg 1366  T
Q  238 gtcttcttcttgaaactca 256  Q
     ||| | ||||||||||||    
T  1367 atctccctcttgaaactca 1385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 26264 - 26203
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatg 72  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  26264 acatcatcactttggatcacatgagatggatccagaacatacttccgaagttacgatacatg 26203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 86; Significance: 4e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 11 - 256
Target Start/End: Original strand, 9761 - 10006
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||  || |    
T  9761 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcaaaagatgtggtggcaaac 9860  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | |||| ||| ||||| |||| ||| || || |||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |     
T  9861 ccactctgtatgccactgttccaaccctctcagatatctgataaggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgtcctacacccgc 9960  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactca 256  Q
    || | |||| ||||||| |||||| || ||| | ||||||||||||    
T  9961 cataggagtaactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactca 10006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 86; Significance: 4e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 47 - 284
Target Start/End: Original strand, 2750 - 2987
Alignment:
Q  47 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || || |||| ||| ||||| |||| ||| || |||||||    
T  2750 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctctgata 2849  T
Q  147 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 246  Q
     ||||||||||||||| ||  | |||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| ||||||| ||| || || | | | ||    
T  2850 tctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttctcagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcataaatacatgatatccctc 2949  T
Q  247 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataac 284  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||| ||||| ||||    
T  2950 ttgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatggtaac 2987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 149 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 985 - 845
Alignment:
Q  149 tgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttctt 248  Q
    |||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||| |||| |    
T  985 tgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcagtgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctaaaaaatacgtggtctccttcct 886  T
Q  249 gaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  885 taaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 84; Significance: 6e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 29 - 288
Target Start/End: Original strand, 27500 - 27759
Alignment:
Q  29 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 128  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |    
T  27500 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcaacacatgaaacacatcatgcaaattcaaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactg 27599  T
Q  129 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 228  Q
    ||| ||| || ||||||| || |||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||| |||| | |||| |||||||     
T  27600 ttccaaccctctctgatatcttatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcgatgcacgtcctacacctgtcataggagtaactctcag 27699  T
Q  229 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    |||||| || ||| | || |||||||||||  | || |||||||| ||||||||||||||    
T  27700 aaacacatgatctccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactctt 27759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 11 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 1491 - 1218
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| |||   || |    
T  1491 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaatacatcattcaaattcgaaagatgtggtttcaaac 1392  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | |||   || ||||| |||| ||| || || |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||    
T  1391 ctactttttatgccactgttccaaccctctcagatatctgatacggaccaataact-tcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacacccgt 1293  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 285  Q
    || | || ||| ||||| |||||| || ||| | ||||||||||||||  | || |||||||| ||||| |||||    
T  1292 cataggaatgattctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaact 1218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 38 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 1485 - 1235
Alignment:
Q  38 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactc 137  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || || | |   || ||||| |||| ||| |    
T  1485 ggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaatttcgaaagatgtggtggcaaacctattttttatgccactgttccaaccc 1386  T
Q  138 tttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtg 237  Q
    | ||||||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| ||||||| |||||| ||    
T  1385 tctctgatatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaacacatg 1286  T
Q  238 gtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
     ||| | ||||||||||||||  | || |||||||| ||||| ||||||||    
T  1285 atctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactctt 1235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 82; Significance: 9e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 11 - 288
Target Start/End: Original strand, 14049 - 14325
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || |    
T  14049 acatcatccctcggaataacatgtgaaggatccgctacatacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 14148  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | |||  ||| ||||| |||| ||| ||||| |||| ||  |||| ||| |||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||    
T  14149 ccactttgtatgccactgttccaac-ctttcagatatctagtacgaaccgataaacttcggagtcaacttcttcgacttcaacgcacgacctacacccgt 14247  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    || | |||||||||||| |||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||||| |||| ||||| ||||||||    
T  14248 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttctatgcttgtcatggtaactctt 14325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 29 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 10408 - 10148
Alignment:
Q  29 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 128  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| | |||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |    
T  10408 acatgcgaaggatccggtacatacttccgcaattgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 10309  T
Q  129 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 228  Q
    ||| ||||||||||||   |||||| |||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| || ||||     
T  10308 ttccaactctttctgaactctgatatggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcag 10209  T
Q  229 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    ||| || || ||  | || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  10208 aaatacatgatcaccctcctgaaactcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttt 10148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0924 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0924
Description:

Target: scaffold0924; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 29 - 288
Target Start/End: Original strand, 3872 - 4131
Alignment:
Q  29 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 128  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| || |  ||  |||||  ||| ||||| |    
T  3872 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacataatgcaaattcgaaagatgtggaggcaaaacaactatgtatgccactg 3971  T
Q  129 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 228  Q
    ||| ||| || || |||| ||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| |||||||     
T  3972 ttccaaccctctcagatatctgatacagaccaatgaacttaggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 4071  T
Q  229 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    |||||| || ||| | ||||||||||||||  | || |||||||| ||||| ||||||||    
T  4072 aaacacatgatctccatcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactctt 4131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 79; Significance: 6e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 47 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 6220 - 5979
Alignment:
Q  47 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||  || || ||||  || ||||| |||| |||||| || ||||    
T  6220 acatacttccgaagttgcgacacatgaaa-acatcaagcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccacagttccaactctctcagata 6122  T
Q  147 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 246  Q
     ||| || |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||| | |||| || |||| |||||| ||  || | ||    
T  6121 tctggtatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaatgcacgacctacacccgtcataggagtaaccctcagaaacacatgagctccctc 6022  T
Q  247 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  6021 ttgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatggtaactcttt 5979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 79; Significance: 6e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 29 - 207
Target Start/End: Original strand, 27207 - 27385
Alignment:
Q  29 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 128  Q
    ||||| || |||||||  ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||| ||| ||||| |    
T  27207 acatgcgaaggatccgctacatatttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaatcccactctgtatgccacgg 27306  T
Q  129 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacacc 207  Q
    ||| ||| || ||||||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  27307 ttccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacc 27385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 3)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 42676 - 42399
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||  || |    
T  42676 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaacacatcaagcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 42577  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    ||||||  || ||||| |||| |||||| ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||| ||| ||||| ||    
T  42576 caactctatatgccacagttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacttcctacacccgt 42477  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    || | |||| || |||| ||| || || ||  | || |||||||||||  | || |||||||| ||||||||||||||    
T  42476 cataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactctt 42399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 11 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 47742 - 47465
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||  || |    
T  47742 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaacacatcaagcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 47643  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    ||||||  || ||||| |||| |||||| ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||  ||| ||||| ||    
T  47642 caactctatatgccacagttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcatttcctacacccgt 47543  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    || | |||| || |||| ||| || || ||  | || |||||||||||  | || |||||||| ||||||||||||||    
T  47542 cataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactctt 47465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 150 - 228
Target Start/End: Original strand, 2252 - 2330
Alignment:
Q  150 gatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 228  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||  |||||||||||||    
T  2252 gatacggaccaataaacctcagagtcaacttctttgatttcaatgcacgtccaacacctatcactagagtgactctcaa 2330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 29 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 26190 - 25931
Alignment:
Q  29 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 128  Q
    ||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||||| |||| || ||||||||||| || |||||||| ||||  || || |||| ||| ||||| |    
T  26190 acatgcgaaggatccgctacatatttccgaagttgcgacgcatgaaacacatcatgcaagtttgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactg 26091  T
Q  129 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 228  Q
    ||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||| |||| | |||| |||||||     
T  26090 ttccaaccctttttgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacatcctacacccgtcataggagtaactctcag 25991  T
Q  229 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    ||| || || ||  | ||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  25990 aaatacatgatccccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatggtaactctt 25931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 26 - 288
Target Start/End: Original strand, 16654 - 16916
Alignment:
Q  26 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 125  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || ||||| |  || ||||    
T  16654 atcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaacactatatgcca 16753  T
Q  126 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 225  Q
    |  ||| ||| || ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| ||    
T  16754 ctattccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccct 16853  T
Q  226 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    || ||| || || ||  | || |||||||||||| | ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  16854 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactctt 16916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 29 - 288
Target Start/End: Original strand, 18830 - 19089
Alignment:
Q  29 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 128  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||  | ||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||  || || ||||  |||||||| |    
T  18830 acatgcgaaggatccggtacatacttccacaattgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatacgccactg 18929  T
Q  129 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 228  Q
    | | |||||| || |||| |||||| || ||||||||  |||||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| | |||||||||||||    
T  18930 tcccaactctctcagatatctgatatgggccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacgacctacacctgtcataggagtgactctcaa 19029  T
Q  229 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
     ||||| |||||| | |||||||||||||| || ||  ||||||| |||||||| |||||    
T  19030 gaacacatggtctccctcttgaaactcaaggtccttcatacgcttgtcatgatagctctt 19089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 133 - 288
Target Start/End: Original strand, 23096 - 23251
Alignment:
Q  133 aactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaac 232  Q
    |||||| || |||| |||||| || ||||||||  |||||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| | ||||||||||||| |||    
T  23096 aactctctcagatatctgatatgggccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacgacctacacctgtcataggagtgactctcaagaac 23195  T
Q  233 acgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    || |||||| | |||||||||||||| || ||  ||||||| |||||||| |||||    
T  23196 acatggtctccctcttgaaactcaaggtccttcatacgcttgtcatgatagctctt 23251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 38 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 21987 - 21737
Alignment:
Q  38 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactc 137  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |||| ||| |    
T  21987 ggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccc 21888  T
Q  138 tttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtg 237  Q
    | || |||| || |||||||||||| ||  ||||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| || |||| ||| || ||    
T  21887 tctccgatatcttatacggaccaatgaacttcggaatcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaatacatg 21788  T
Q  238 gtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    ||   | ||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  21787 gttaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactctt 21737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 5309 - 5068
Alignment:
Q  47 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||  || || |||  ||| ||||  |||| ||| || |  ||||    
T  5309 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcattcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactatgtatgccagtgttccaaccctcttagata 5210  T
Q  147 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 246  Q
     |||||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||  |||  || ||||| |||| | |||||| ||||| |||||| || ||| | ||    
T  5209 tctgatacgaaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacacacaacctacacccgtcataggagtgattctcagaaacacatgatctccctc 5110  T
Q  247 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  5109 ttgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatggtaactctt 5068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 11 - 288
Target Start/End: Original strand, 39702 - 39979
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    |||||||| ||| | || |||||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||  || |    
T  39702 acatcatctctcggaataacatgagaaggatccgctacatacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcatgcaaattcgagagatgtggtggcaaac 39801  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | |||| ||| ||||| |||| ||| || || |||| | ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| ||||| |  || ||||| ||||| ||    
T  39802 ccactctgtatgccactgttccaaccctctcagatatcggatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttgagtgcgcgtcctacacccgt 39901  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    || | |||| ||||||| ||| || || ||| | || ||||||||||| || ||||||||||| ||||  ||||||||    
T  39902 cataggagtaactctcagaaatacatgatctccctcctgaaactcaaggtcctttctacgcttgtcatagtaactctt 39979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 11 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 49376 - 49099
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||| ||||  || |    
T  49376 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacattatgaaaattcgaaagatgtggtggcaaac 49277  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | |||  ||| ||| | |||| ||| || || |||| ||||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||| ||    
T  49276 ccactttgtatgccgctgttccaaccctctcagatatctgatacggaccaataaactttggagtcaacttcttagacttcaacgcacttcctacacctgt 49177  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    || | | || ||||||| |||||| || | | | ||||||||||||||  | || |||||||| ||||| ||||||||    
T  49176 cataggtgttactctcagaaacacatgatttccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactctt 49099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 11 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 58159 - 57885
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |    
T  58159 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 58060  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    ||||||  || |||||||||| ||  || ||||| | ||||||| ||||||| ||  |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||    
T  58059 caactctatatgccaccgttccaatcctctctgaaatctgatacagaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgt 57960  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 285  Q
    ||   |||| ||||||||||| || || ||  | |  |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||    
T  57959 catcggagtaactctcaaaaatacatgatcacccttctgaaactcaagggcctttctccgcttatcatggtaact 57885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0682 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0682
Description:

Target: scaffold0682; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 29 - 289
Target Start/End: Original strand, 172 - 432
Alignment:
Q  29 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 128  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||| | |||||||||||| || || |||||||||||||||||||| || |  || |||||||  || ||||| |    
T  172 acatgcgaaggatctggtacatacttccgcaattgcgacacatgaaatacgtcatgcaaattcgaaagatgaggaggcaaaccaactctatatgccacag 271  T
Q  129 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 228  Q
    ||| |||||||||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||| |||||  ||||||| |||||||| | ||| |||| | |||| || ||||     
T  272 ttccaactctttctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaagttcttcaacttcaacgcacgtcctatacccgtcataggagtaaccctcag 371  T
Q  229 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
    ||| || |||||  | || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  372 aaaaacatggtcaccctcctgaaactcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttt 432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 39229 - 38953
Alignment:
Q  12 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatcc 111  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || || || ||||| ||| ||||||| ||||  || ||    
T  39229 catcatccctctgaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacttcgtgcaagttctaaagatgtggtggcaaacc 39130  T
Q  112 aactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 211  Q
    |||||  || ||||| | || |||||| ||||| | |||||||||||| || ||  | |||||||||||| | |||||||| ||||| || ||||| |||    
T  39129 aactctatatgccactgctccaactctctctgaaatctgatacggaccgatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaggcacgaccgacacccgtc 39030  T
Q  212 acatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    | | |||||||||||| ||| || || ||  | || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  39029 aaaggagtgactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttcttcgcttgtcatgataactctt 38953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 72; Significance: 9e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 4482 - 4235
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |    
T  4482 acatcatctctcggaataacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 4383  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    ||||||  || ||||| |||| ||| || | ||| | |||||||||||| || ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  4382 caactctatatgccacagttccaaccctctttgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 4283  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaag 258  Q
    || | |||| ||||| |||||||| || ||  | ||||||||||||||    
T  4282 cataggagtaactcttaaaaacacatgatccccctcttgaaactcaag 4235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 72; Significance: 9e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 29 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 14576 - 14317
Alignment:
Q  29 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 128  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || ||||||   || ||||| |    
T  14576 acatgcgaaggatccggtacatacttccgaagttgcgacacctgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactttatatgccactg 14477  T
Q  129 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 228  Q
    ||| ||| || ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| || ||||     
T  14476 ttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcag 14377  T
Q  229 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    ||| || || ||  | || | |||||||||  | || |||||||||||||||||||||||    
T  14376 aaatacatgatcaccctcctaaaactcaagggccttcctacgcttatcatgataactctt 14317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 29 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 9202 - 9039
Alignment:
Q  29 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 128  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || ||||||   || ||||| |    
T  9202 acatgcgaaggatccggtacatacttccgaagttgcgacacctgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactttatatgccactg 9103  T
Q  129 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaa 192  Q
    ||| ||| || ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | ||||||||    
T  9102 ttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaa 9039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 72; Significance: 9e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 29 - 288
Target Start/End: Original strand, 509 - 768
Alignment:
Q  29 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 128  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||  |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || || |||| ||| ||||| |    
T  509 acatgtgaaggatccgctacatactttggaagttccgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtaagccactg 608  T
Q  129 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 228  Q
    ||| ||| || ||||| |  ||||||||||| |||||  |||||||||||||||| || || || ||||  || ||||| |||| | |||| ||||||||    
T  609 ttccaaccctctctgaaatttgatacggaccgataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcactgcctacacctgtcataggagtaactctcaa 708  T
Q  229 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
     ||||| || ||| | |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||| |||||    
T  709 gaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcacgatagctctt 768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 72; Significance: 9e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 29 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 49532 - 49273
Alignment:
Q  29 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 128  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |    
T  49532 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgatacatgtaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataggccacag 49433  T
Q  129 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 228  Q
    ||| ||| || ||||| | |||||||||||| || ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | || |||| ||||     
T  49432 ttccaaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcccacacccgtcataggaatgaccctcag 49333  T
Q  229 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    |||||| || ||  | ||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  49332 aaacacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactctt 49273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 26 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 17041 - 16779
Alignment:
Q  26 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 125  Q
    |||||||| || ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||    
T  17041 atcacatgtgaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgcca 16942  T
Q  126 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 225  Q
    | |||| |||||| ||||| | || |||||||||||| ||  | |||||||||||  | |||||||||||||| || ||||| |||| | ||||||| ||    
T  16941 ctgttccaactctctctgaaatctaatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgaccgacacccgtcaaaggagtgaccct 16842  T
Q  226 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    || ||| || || ||  | || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  16841 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactctt 16779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 288
Target Start/End: Original strand, 37201 - 37442
Alignment:
Q  47 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 146  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||  || || |||| ||| ||||| |||| ||| ||||| ||||    
T  37201 acatacttccgaagttgcgagacatgtaacacatcatgcaaatttgaaagatgaggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctttcagata 37300  T
Q  147 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 246  Q
     ||||||  ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||| | | |||||||| | |||||| || |||    |    
T  37301 tctgatatagaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacacctgtcataggggtgactctaagaaacacatgatctctccc 37400  T
Q  247 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    |||||||||||   | || |||||||| ||||| ||||||||    
T  37401 ttgaaactcaatggccttcctacgcttgtcatggtaactctt 37442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 143 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 27548 - 27403
Alignment:
Q  143 gataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtctt 242  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| ||||||| ||| || || |||     
T  27548 gatatctgatacggaccaattaatttttgagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatctc 27449  T
Q  243 cttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    | ||||||||||||||  | || |||||||| || || ||||||||    
T  27448 cctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcgtggtaactctt 27403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 143 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 38385 - 38240
Alignment:
Q  143 gataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtctt 242  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| ||||||| ||| || || |||     
T  38385 gatatctgatacggaccaattaatttttgagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatctc 38286  T
Q  243 cttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    | ||||||||||||||  | || |||||||| || || ||||||||    
T  38285 cctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcttggtaactctt 38240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 207
Target Start/End: Original strand, 136082 - 136278
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    |||||||| ||| |||| ||||  || |||||||  ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |    
T  136082 acatcatctctcgggataacatccgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggaaaac 136181  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacacc 207  Q
    ||||||  || ||||| |||| |||||| ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||    
T  136182 caactctatatgccacagttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacc 136278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1032 (Bit Score: 67; Significance: 8e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold1032
Description:

Target: scaffold1032; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 47 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 2173 - 2023
Alignment:
Q  47 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || || |||| ||| ||||| |||| ||| || || ||||    
T  2173 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtgtaaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctccgata 2074  T
Q  147 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcac 197  Q
     ||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  2073 tctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcac 2023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 67; Significance: 8e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 58 - 288
Target Start/End: Original strand, 4760 - 4990
Alignment:
Q  58 aagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacgga 157  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||  || || |||| ||| ||||| |||| ||| || || |||| || |||||||    
T  4760 aagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaatttgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctcagatatcttatacgga 4859  T
Q  158 ccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaa 257  Q
    ||||| ||  | |||||||| ||||| |||||||| |||| ||| ||||| |||| | |||| ||||||| ||| || || ||| | |||||||||||||    
T  4860 ccaatgaactttggagtcaatttcttagacttcaatgcacatcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatctccctcttgaaactcaa 4959  T
Q  258 gatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    |  | ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  4960 gggcctttctacgcttgtcatggtaactctt 4990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 67; Significance: 8e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 47 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 13088 - 12850
Alignment:
Q  47 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 146  Q
    |||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || ||||||| ||| |||||||||| ||  || ||||| |    
T  13088 acatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaagccaactctgtatgccaccgttccaatcctctctgaaa 12989  T
Q  147 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 246  Q
     || |||||||||||| ||  ||||||| |||||| |||| |||||||||||| | ||||| ||||   |||| ||||||||||| || || ||  | ||    
T  12988 tctaatacggaccaatgaacttcggagttaacttccttgatttcaaagcacgttctacacccgtcatcggagtaactctcaaaaatacatgatcaccctc 12889  T
Q  247 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 285  Q
     |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||    
T  12888 ctgaaactcaagggcctttctccgcttatcatggtaact 12850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 3)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 11 - 212
Target Start/End: Original strand, 10851 - 11052
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| ||||  || |    
T  10851 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttctaaagatgtggtggcaaac 10950  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    ||||||  || ||||| |||| ||| || || |||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  10951 caactctatatgccactgttccaaccctctccgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcgtcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 11050  T
Q  211 ca 212  Q
    ||    
T  11051 ca 11052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 38 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 715 - 541
Alignment:
Q  38 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactc 137  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |||| ||| |    
T  715 ggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacgccatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccc 616  T
Q  138 tttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtca 212  Q
    | ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  615 tctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcgtcgacttcaatgcacgtcctacacccgtca 541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 170 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 7994 - 7876
Alignment:
Q  170 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 269  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || |||||| || | |||||||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| || || |    
T  7994 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcactctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctcc 7895  T
Q  270 gcttatcatgataactctt 288  Q
     |||||||||||| |||||    
T  7894 tcttatcatgatagctctt 7876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 104
Target Start/End: Original strand, 6238 - 6329
Alignment:
Q  13 atcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtg 104  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6238 atcatcactttggatcacatgggatggatccggtacatacttccaaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtg 6329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 4)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 29 - 288
Target Start/End: Original strand, 20103 - 20362
Alignment:
Q  29 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 128  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || |||||      
T  20103 acatgcgaaggatccgctacatacttctgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataggccacaa 20202  T
Q  129 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 228  Q
    ||| ||| || ||||| | |||||||||||| || ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| || ||||     
T  20203 ttccaacactctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcccacacccgtcataagagtaaccctcag 20302  T
Q  229 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    |||||| || ||  | || |||||||||||  | ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  20303 aaacacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactctt 20362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 288
Target Start/End: Original strand, 43471 - 43745
Alignment:
Q  14 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 113  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || ||||    
T  43471 tcatctctctgaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggaaaaccaa 43570  T
Q  114 ctcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 213  Q
    |||  || ||||| |||| ||| || ||||| | |||||||||||| || ||  | |||||||||||| | || ||||| |||||||| || || ||||     
T  43571 ctctataggccacagttccaaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcctcgaattcaatgcacgtcctaccccggtcat 43670  T
Q  214 atgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    | |||| || |||| |||||| || ||  | || |||||||||||  | ||||| ||||| |||||  |||||||    
T  43671 aggagtaaccctcagaaacacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggcaactctt 43745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #3
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 288
Target Start/End: Original strand, 44483 - 44757
Alignment:
Q  14 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 113  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || ||||    
T  44483 tcatctctctgaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggaaaaccaa 44582  T
Q  114 ctcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 213  Q
    |||  || ||||| |||| ||| || ||||| | |||||||||||| || ||  | |||||||||||| | || ||||| |||||||| || || ||||     
T  44583 ctctataggccacagttccaaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcctcgaattcaatgcacgtcctaccccggtcat 44682  T
Q  214 atgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    | |||| || |||| |||||| || ||  | || |||||||||||  | ||||| ||||| |||||  |||||||    
T  44683 aggagtaaccctcagaaacacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggcaactctt 44757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #4
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 29 - 212
Target Start/End: Original strand, 36036 - 36219
Alignment:
Q  29 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 128  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || |||||      
T  36036 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcttgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataggccacaa 36135  T
Q  129 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtca 212  Q
    ||| ||| || ||||| | |||||||||||| || ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  36136 ttccaacactctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcccacacccgtca 36219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 26 - 288
Target Start/End: Original strand, 26239 - 26501
Alignment:
Q  26 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 125  Q
    |||||||| ||  ||||||  |||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || ||| |||  || ||||    
T  26239 atcacatgcgaaagatccgccacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccagctctataagcca 26338  T
Q  126 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 225  Q
    | ||||  || || ||||| | |||||||||||| || ||  | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||    
T  26339 ctgttcccaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccct 26438  T
Q  226 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    || ||| || || ||  | || |||||||||||| | ||||| | ||| ||||| ||||||||    
T  26439 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttcacttgtcatggtaactctt 26501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 38 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 33993 - 33743
Alignment:
Q  38 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactc 137  Q
    |||||||| ||||||||||| |  |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || |  || || || |  || ||||| || |  ||||    
T  33993 ggatccggtacatacttccgcaactgcgacacgtggaacacgtcatgcaaattcgaaagatgagggggcaaacccaccctataagccactgtcccgactc 33894  T
Q  138 tttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtg 237  Q
    | || |||| |||||| || ||||||||  |||||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| | ||||||||||||| ||||| ||    
T  33893 tctcagatatctgatatgggccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatg 33794  T
Q  238 gtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
     ||| | |||||||||||||| || || |||||||| |||||||| |||||    
T  33793 atctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctctt 33743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 170 - 288
Target Start/End: Original strand, 40380 - 40498
Alignment:
Q  170 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 269  Q
    |||||||||||| |  |||| |||||||| ||||| || |||||| || | || ||||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  40380 ggagtcaacttcctacactttaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 40479  T
Q  270 gcttatcatgataactctt 288  Q
     ||||||||||||||||||    
T  40480 tcttatcatgataactctt 40498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 62; Significance: 8e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 29 - 289
Target Start/End: Original strand, 6164 - 6425
Alignment:
Q  29 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 128  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||| | |||||||||||| || || |||||||||||||||||| | | ||  || |||| ||  || ||||| |    
T  6164 acatgcgaaggatctggtacatacttccgcaattgcgacacatgaaatacgtcatgcaaattcgaaagaagagatggcaaaccaaatctatatgccacag 6263  T
Q  129 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctca- 227  Q
    ||| || ||||||||| | |||||| |||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| || ||||     
T  6264 ttccaaatctttctgaaatctgataaggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcag 6363  T
Q  228 aaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 289  Q
     ||| || |||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  6364 gaaaaacatggtcaccttcctgaaactcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttt 6425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 62; Significance: 8e-27; HSPs: 3)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 61556 - 61279
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||  || |    
T  61556 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaac 61457  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | ||||  || ||||| |||| ||| ||||  |||| ||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||  |    
T  61456 ccactctatatgccactgttccaacccttttagatatctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccat 61357  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    || | |||| || |||| ||| || || ||  | || |||||||||||  | ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  61356 cataggagtaaccctcagaaatacatgatcgccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactctt 61279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 52522 - 52245
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 110  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||| ||||  || |    
T  52522 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacgtcatgcaatttcgaaagatgaggtggcaaac 52423  T
Q  111 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 210  Q
    | ||||  || ||||| |||| ||| ||||  |||| ||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||  |    
T  52422 ccactctatatgccactgttccaacccttttagatatctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccat 52323  T
Q  211 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    || | |||| || |||| ||| || || ||  | || |||||||||||  | ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  52322 cataggagtaaccctcagaaatacatgatcgccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactctt 52245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 47 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 67908 - 67667
Alignment:
Q  47 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 146  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||  || || ||||  || ||||| |||| ||| ||||  ||||    
T  67908 acatacttccgaagctgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatatgccactgttccaacccttttagata 67809  T
Q  147 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 246  Q
     ||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||  ||| | |||| || |||| ||| || || ||  | ||    
T  67808 tctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccatcataggagtaaccctcagaaatacatgatcgccctc 67709  T
Q  247 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
     |||||||||||  | ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  67708 ctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactctt 67667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 47 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 13560 - 13380
Alignment:
Q  47 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || || |||| ||| | ||| |||| ||| || || ||||    
T  13560 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgtcactgttccaaccctctcagata 13461  T
Q  147 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctca 227  Q
     |||||||  |||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| ||| |||| ||||| |||| | |||| |||||||    
T  13460 tctgatacttaccaattaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcatgtcctacacccgtcataggagtaactctca 13380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 7559 - 7498
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatg 72  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7559 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacaaacttccgaagttgcgacacatg 7498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 47 - 227
Target Start/End: Original strand, 248612 - 248792
Alignment:
Q  47 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 146  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || |||||  ||| |||| | ||||| |    
T  248612 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataagccacttttccaactttctctgaaa 248711  T
Q  147 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctca 227  Q
     ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| | ||||||| ||||    
T  248712 tctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtgaccctca 248792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 49 - 222
Target Start/End: Original strand, 42784 - 42957
Alignment:
Q  49 atacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataac 148  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |||| |||  | ||||| | |    
T  42784 atacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcaaaagatgtggtggcaaaccaactctataagccactgttccaaccttctctgaaatc 42883  T
Q  149 tgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 222  Q
    |||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||||||    
T  42884 tgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtgac 42957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 47 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 7543 - 7385
Alignment:
Q  47 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 146  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||| ||| ||||  || |||||||  || ||||| |||| ||  | |||||| |    
T  7543 acatacttccgaagttgcaacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaatatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaa--ccttctgaaa 7446  T
Q  147 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacacc 207  Q
     ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||    
T  7445 tctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacc 7385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 170 - 289
Target Start/End: Original strand, 1916 - 2035
Alignment:
Q  170 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 269  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||||||||||| |||||| || ||| | ||||||||||||||  | || |||     
T  1916 ggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacctgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctat 2015  T
Q  270 gcttatcatgataactcttt 289  Q
    |||| ||||| |||||||||    
T  2016 gcttgtcatggtaactcttt 2035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 153 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 28467 - 28332
Alignment:
Q  153 acggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaa 252  Q
    |||| |||| |||||  |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| ||||||||| | || ||||||||||| || ||  || |||| ||    
T  28467 acggtccaacaaatcgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacatgattcaccctcaaaaacacatgatcacctacttgtaa 28368  T
Q  253 ctcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 288  Q
    ||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||    
T  28367 ctcaatatcctttctcctcttatcatgataactctt 28332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 38 - 146
Target Start/End: Original strand, 45835 - 45943
Alignment:
Q  38 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactc 137  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||  || |||||||  || ||||| |||| ||| |    
T  45835 ggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaatgatgtggtggaaaaccaactctatatgccactgttccaaccc 45934  T
Q  138 tttctgata 146  Q
    | |||||||    
T  45935 tctctgata 45943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1710 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1710
Description:

Target: scaffold1710; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 1094 - 976
Alignment:
Q  170 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 269  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| |||||| || | || ||||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  1094 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 995  T
Q  270 gcttatcatgataactctt 288  Q
     ||||||||||||||||||    
T  994 tcttatcatgataactctt 976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 288
Target Start/End: Original strand, 14661 - 14763
Alignment:
Q  186 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || ||  |  | ||||||||||  || || || | |||||||||||||||    
T  14661 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgattcactctcaaaaacacatgatccccaacctgaaactcaatgtccttcctcctcttatcatgataact 14760  T
Q  286 ctt 288  Q
    |||    
T  14761 ctt 14763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 179 - 288
Target Start/End: Original strand, 1 - 110
Alignment:
Q  179 ttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcat 278  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||||||||||| |||||| || ||| | ||||||||||||||  | || |||||||| ||||    
T  1 ttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcat 100  T
Q  279 gataactctt 288  Q
    | ||||||||    
T  101 ggtaactctt 110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 172 - 288
Target Start/End: Original strand, 23518 - 23634
Alignment:
Q  172 agtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgc 271  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || ||||||||| | || |||||||||||||| ||     |||||||||||| ||| ||||| | |    
T  23518 agtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacatgattcaccctcaaaaacacgtgatcactaacttgaaactcaatatcctttctcctc 23617  T
Q  272 ttatcatgataactctt 288  Q
    |||||||||||||||||    
T  23618 ttatcatgataactctt 23634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 170 - 285
Target Start/End: Original strand, 14779 - 14894
Alignment:
Q  170 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 269  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||| || | || || |||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  14779 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccagtcacaggattcaccctaaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 14878  T
Q  270 gcttatcatgataact 285  Q
     |||||||||||||||    
T  14879 tcttatcatgataact 14894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 170 - 289
Target Start/End: Original strand, 46276 - 46395
Alignment:
Q  170 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 269  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| || ||| || | || ||||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  46276 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggttacaggatttaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 46375  T
Q  270 gcttatcatgataactcttt 289  Q
     |||||||||||||||||||    
T  46376 tcttatcatgataactcttt 46395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 170 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 4059 - 3941
Alignment:
Q  170 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 269  Q
    |||||||||||| |  |||| |||||||| |||||||| |||||| || | ||||| |||||||| || || ||  | |||||||||| ||| ||||| |    
T  4059 ggagtcaacttcctacactttaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcactcttaaaaacacatgatcatcaacctgaaactcaatatcctttctcc 3960  T
Q  270 gcttatcatgataactctt 288  Q
     ||||||||||||||||||    
T  3959 tcttatcatgataactctt 3941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 170 - 288
Target Start/End: Original strand, 24002 - 24120
Alignment:
Q  170 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 269  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||  || | ||||| |||||||| || ||  |  | |||||||||| ||| ||||| |    
T  24002 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccagtcaccggattaactctaaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcc 24101  T
Q  270 gcttatcatgataactctt 288  Q
     ||||||||||||||||||    
T  24102 tcttatcatgataactctt 24120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0742 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0742
Description:

Target: scaffold0742; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 285
Target Start/End: Original strand, 5313 - 5450
Alignment:
Q  148 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttct 247  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||   |||| ||||||||||| || || ||  | ||     
T  5313 ctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactctcaaaaatacatgatcaccctcc 5412  T
Q  248 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 285  Q
    |||||||||||  | || || ||||||||||| |||||    
T  5413 tgaaactcaagggccttcctccgcttatcatggtaact 5450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 3611 - 3518
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtg 104  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  3611 acatcatctctcggaataacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagtagcgacacatgatacacatcatgcaagttcgaaagatgaggtg 3518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1508 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1508
Description:

Target: scaffold1508; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 962 - 887
Alignment:
Q  29 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtg 104  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  962 acatgtgaaggatccgctacatacttctgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtg 887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0513
Description:

Target: scaffold0513; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 98
Target Start/End: Original strand, 9182 - 9269
Alignment:
Q  11 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagat 98  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||||||| |||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  9182 acatcatctctcggaataacatgtgaaggatccgctacatacttctgaagttgcgacatatgaaccacatcatgcaaattcgaaagat 9269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0551 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0551
Description:

Target: scaffold0551; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 170 - 288
Target Start/End: Original strand, 8217 - 8335
Alignment:
Q  170 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 269  Q
    |||||||||||| |  || |||||||||| |||||||| ||||||||| | || |||||||| || || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  8217 ggagtcaacttcctacacatcaaagcacgaccaacaccggtcacatgattcaccctcaaaaatacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 8316  T
Q  270 gcttatcatgataactctt 288  Q
     ||||||||||||| ||||    
T  8317 tcttatcatgataagtctt 8335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 288
Target Start/End: Original strand, 10493 - 10595
Alignment:
Q  186 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 285  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| | || | || ||||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||    
T  10493 acttcaaagcacgaccaacaccggtcaaaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataact 10592  T
Q  286 ctt 288  Q
    |||    
T  10593 ctt 10595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 186 - 288
Target Start/End: Original strand, 5879 - 5981
Alignment:
Q  186 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 285  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| | || | || ||||||||||| || ||  |  ||||| |||||| ||| ||||| | |||||||||||||||    
T  5879 acttcaaagcacgaccaacaccggtcataggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgatactcaatatcctttctcctcttatcatgataact 5978  T
Q  286 ctt 288  Q
    |||    
T  5979 ctt 5981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 170 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 14921 - 14803
Alignment:
Q  170 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 269  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||  ||||||||| | || ||||||||||| || ||  |  | ||||| |||| ||| ||||| |    
T  14921 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacactggtcacatgattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaattcaatatcctttctcc 14822  T
Q  270 gcttatcatgataactctt 288  Q
     ||||||||||||||||||    
T  14821 tcttatcatgataactctt 14803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 170 - 288
Target Start/End: Original strand, 13030 - 13148
Alignment:
Q  170 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 269  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||||||| ||||| || ||  |  | |||||||||| ||| ||||| |    
T  13030 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacagggttcactctcaacaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcc 13129  T
Q  270 gcttatcatgataactctt 288  Q
     ||||||||||||||||||    
T  13130 tcttatcatgataactctt 13148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0554 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0554
Description:

Target: scaffold0554; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 170 - 288
Target Start/End: Original strand, 3281 - 3399
Alignment:
Q  170 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 269  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||| ||| |||||| || | |||||||||||||| || ||  |  | |||||||| |  || ||||| |    
T  3281 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaataccggtcacaggattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcgatgtcctttctcc 3380  T
Q  270 gcttatcatgataactctt 288  Q
     ||||||||||||||||||    
T  3381 tcttatcatgataactctt 3399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 186 - 288
Target Start/End: Original strand, 8488 - 8590
Alignment:
Q  186 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 285  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| | || | || ||||||||||| || ||  |  ||||| |||||| ||| ||||| | |||||||||||||||    
T  8488 acttcaaagcacgaccaacaccggtcataggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgatactcaatatcctttctcctcttatcatgataact 8587  T
Q  286 ctt 288  Q
    |||    
T  8588 ctt 8590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 186 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 4112 - 4010
Alignment:
Q  186 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 285  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||   | | |||||||||||||| || ||  |  | |||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||    
T  4112 acttcaaagcacgaccaacaccggtcaccaaattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataact 4013  T
Q  286 ctt 288  Q
    |||    
T  4012 ctt 4010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University