View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF15947_high_2 (Length: 379)

Name: NF15947_high_2
Description: NF15947
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF15947_high_2
NF15947_high_2
[»] chr1 (22 HSPs)
chr1 (189-372)||(29103184-29103367)
chr1 (1-161)||(43571026-43571186)
chr1 (1-163)||(5489774-5489936)
chr1 (1-163)||(23989463-23989626)
chr1 (1-159)||(4401329-4401488)
chr1 (1-168)||(48498902-48499069)
chr1 (1-159)||(7447828-7447985)
chr1 (1-161)||(37814778-37814938)
chr1 (9-163)||(24769447-24769601)
chr1 (1-161)||(50448200-50448360)
chr1 (1-162)||(750245-750406)
chr1 (1-159)||(2497502-2497660)
chr1 (9-111)||(4888093-4888195)
chr1 (62-166)||(44112672-44112776)
chr1 (62-161)||(38335918-38336017)
chr1 (62-161)||(48119628-48119727)
chr1 (62-170)||(41065144-41065252)
chr1 (62-162)||(45427746-45427846)
chr1 (62-161)||(35000114-35000213)
chr1 (68-162)||(38113202-38113296)
chr1 (126-163)||(14427345-14427382)
chr1 (1-41)||(44112797-44112837)
[»] chr5 (15 HSPs)
chr5 (1-161)||(41334603-41334763)
chr5 (1-170)||(2614589-2614758)
chr5 (1-166)||(18033977-18034142)
chr5 (1-163)||(7617131-7617293)
chr5 (1-161)||(22512305-22512465)
chr5 (1-159)||(5256997-5257155)
chr5 (9-170)||(33801460-33801621)
chr5 (1-166)||(38470574-38470739)
chr5 (9-162)||(39122381-39122533)
chr5 (1-159)||(25914936-25915085)
chr5 (62-161)||(32473395-32473494)
chr5 (9-74)||(39122304-39122369)
chr5 (62-162)||(17208073-17208173)
chr5 (86-161)||(33855068-33855143)
chr5 (1-41)||(32473334-32473374)
[»] chr6 (18 HSPs)
chr6 (1-163)||(7292745-7292907)
chr6 (1-163)||(26669949-26670111)
chr6 (9-163)||(7273283-7273437)
chr6 (1-168)||(7367542-7367709)
chr6 (1-164)||(30735979-30736142)
chr6 (1-162)||(9698273-9698434)
chr6 (9-161)||(13743169-13743321)
chr6 (9-161)||(13748669-13748821)
chr6 (1-163)||(26466797-26466959)
chr6 (1-163)||(3213398-3213560)
chr6 (1-159)||(24203927-24204085)
chr6 (1-162)||(21293617-21293778)
chr6 (1-161)||(30014343-30014503)
chr6 (9-162)||(21279928-21280081)
chr6 (62-164)||(33242400-33242502)
chr6 (62-159)||(27441544-27441641)
chr6 (62-161)||(33253913-33254012)
chr6 (62-162)||(31109223-31109323)
[»] chr8 (27 HSPs)
chr8 (1-161)||(2165903-2166063)
chr8 (1-163)||(36743423-36743585)
chr8 (1-161)||(11582766-11582926)
chr8 (1-167)||(42197375-42197541)
chr8 (1-168)||(5754896-5755063)
chr8 (1-163)||(30660682-30660844)
chr8 (1-161)||(29705362-29705522)
chr8 (1-159)||(29800890-29801048)
chr8 (3-160)||(45397317-45397474)
chr8 (1-159)||(20148762-20148920)
chr8 (1-159)||(26125637-26125794)
chr8 (9-159)||(42295197-42295346)
chr8 (1-162)||(2546995-2547156)
chr8 (9-168)||(30912510-30912669)
chr8 (3-108)||(9241605-9241710)
chr8 (9-161)||(1375542-1375694)
chr8 (1-100)||(3743832-3743931)
chr8 (9-162)||(31384663-31384816)
chr8 (65-164)||(42699254-42699353)
chr8 (9-162)||(40528582-40528736)
chr8 (68-162)||(16603633-16603727)
chr8 (62-163)||(35181514-35181615)
chr8 (62-165)||(34304784-34304887)
chr8 (62-159)||(33629994-33630091)
chr8 (62-170)||(18066719-18066827)
chr8 (126-163)||(19386635-19386672)
chr8 (124-161)||(28977146-28977183)
[»] scaffold0119 (1 HSPs)
scaffold0119 (1-163)||(683-845)
[»] chr3 (27 HSPs)
chr3 (1-166)||(40808860-40809025)
chr3 (1-163)||(24688342-24688504)
chr3 (11-159)||(27748565-27748713)
chr3 (1-161)||(36150130-36150290)
chr3 (9-163)||(54246096-54246250)
chr3 (1-162)||(25413680-25413841)
chr3 (1-165)||(47190966-47191129)
chr3 (1-160)||(40480750-40480909)
chr3 (9-163)||(46941051-46941205)
chr3 (1-159)||(53581798-53581956)
chr3 (4-161)||(42100688-42100845)
chr3 (1-160)||(54237097-54237256)
chr3 (1-160)||(42394359-42394518)
chr3 (1-161)||(45126868-45127028)
chr3 (11-167)||(53273634-53273790)
chr3 (1-112)||(52629877-52629988)
chr3 (1-159)||(1078229-1078378)
chr3 (62-163)||(4190266-4190367)
chr3 (1-163)||(11064662-11064822)
chr3 (20-146)||(51249323-51249449)
chr3 (62-163)||(10457893-10457994)
chr3 (59-163)||(29558232-29558336)
chr3 (62-163)||(9434122-9434223)
chr3 (73-162)||(25996267-25996356)
chr3 (62-161)||(34791829-34791928)
chr3 (62-168)||(51757586-51757692)
chr3 (1-41)||(9434244-9434284)
[»] chr4 (36 HSPs)
chr4 (1-163)||(1771206-1771368)
chr4 (1-161)||(27550309-27550469)
chr4 (9-164)||(25051690-25051845)
chr4 (9-163)||(23035978-23036132)
chr4 (1-163)||(27864562-27864724)
chr4 (1-163)||(33703139-33703301)
chr4 (1-165)||(28982762-28982926)
chr4 (1-161)||(35017733-35017892)
chr4 (1-159)||(27893782-27893940)
chr4 (1-163)||(55966286-55966448)
chr4 (1-162)||(48463390-48463551)
chr4 (9-159)||(39631102-39631253)
chr4 (9-158)||(23204726-23204875)
chr4 (1-161)||(27316652-27316813)
chr4 (1-161)||(12496956-12497116)
chr4 (1-159)||(31680904-31681062)
chr4 (17-162)||(21687005-21687150)
chr4 (9-160)||(41878407-41878558)
chr4 (9-164)||(43514634-43514789)
chr4 (8-159)||(46412416-46412557)
chr4 (1-159)||(43949741-43949900)
chr4 (1-159)||(43735744-43735902)
chr4 (1-111)||(51512205-51512315)
chr4 (9-161)||(45490261-45490413)
chr4 (20-163)||(28988471-28988614)
chr4 (1-161)||(41847971-41848131)
chr4 (1-159)||(41327483-41327641)
chr4 (62-167)||(17619153-17619258)
chr4 (1-112)||(56215838-56215948)
chr4 (62-163)||(711958-712059)
chr4 (62-161)||(55272377-55272476)
chr4 (81-166)||(960890-960975)
chr4 (62-162)||(48435580-48435680)
chr4 (67-170)||(3756252-3756355)
chr4 (127-168)||(46827772-46827813)
chr4 (62-162)||(32728356-32728456)
[»] chr7 (28 HSPs)
chr7 (1-165)||(41861670-41861836)
chr7 (1-161)||(24000952-24001112)
chr7 (1-161)||(42538371-42538531)
chr7 (1-163)||(5015393-5015555)
chr7 (9-162)||(35069720-35069873)
chr7 (1-158)||(26898342-26898499)
chr7 (1-161)||(42972852-42973012)
chr7 (1-152)||(32029757-32029908)
chr7 (1-159)||(16180297-16180454)
chr7 (1-159)||(44326180-44326338)
chr7 (1-161)||(5810864-5811024)
chr7 (1-164)||(43343564-43343727)
chr7 (1-159)||(44416874-44417032)
chr7 (1-161)||(45326020-45326180)
chr7 (9-159)||(10573751-10573901)
chr7 (1-162)||(9216301-9216461)
chr7 (1-159)||(4638139-4638297)
chr7 (10-167)||(5194180-5194337)
chr7 (1-162)||(43317442-43317603)
chr7 (9-112)||(27393208-27393311)
chr7 (1-111)||(38160519-38160629)
chr7 (1-171)||(24280536-24280707)
chr7 (62-161)||(31513287-31513386)
chr7 (1-81)||(47279664-47279744)
chr7 (73-163)||(40236917-40237007)
chr7 (62-163)||(33384868-33384970)
chr7 (62-163)||(27535232-27535333)
chr7 (129-159)||(1773668-1773698)
[»] chr2 (30 HSPs)
chr2 (1-162)||(30838631-30838792)
chr2 (3-161)||(1750414-1750572)
chr2 (5-164)||(43335707-43335866)
chr2 (1-163)||(4764666-4764828)
chr2 (9-163)||(12302201-12302355)
chr2 (1-159)||(43490341-43490499)
chr2 (1-161)||(16096747-16096908)
chr2 (1-160)||(19047158-19047317)
chr2 (2-161)||(13780676-13780835)
chr2 (1-111)||(42849799-42849908)
chr2 (10-160)||(34817725-34817875)
chr2 (1-112)||(39149233-39149343)
chr2 (20-159)||(8896542-8896681)
chr2 (1-107)||(42026823-42026929)
chr2 (62-168)||(43114550-43114656)
chr2 (67-159)||(33229303-33229396)
chr2 (62-161)||(12415461-12415560)
chr2 (62-161)||(12427521-12427620)
chr2 (62-165)||(16803964-16804067)
chr2 (62-165)||(16843246-16843349)
chr2 (62-159)||(11825655-11825752)
chr2 (62-159)||(41281975-41282072)
chr2 (62-134)||(4451951-4452023)
chr2 (68-162)||(18491704-18491798)
chr2 (79-168)||(14285669-14285758)
chr2 (62-163)||(34895742-34895843)
chr2 (126-165)||(966899-966938)
chr2 (1-41)||(6518434-6518474)
chr2 (1-41)||(16804088-16804128)
chr2 (1-41)||(16843370-16843410)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (1-160)||(112656-112815)
[»] scaffold0187 (2 HSPs)
scaffold0187 (1-162)||(14129-14289)
scaffold0187 (1-162)||(24457-24617)
[»] scaffold0385 (1 HSPs)
scaffold0385 (9-164)||(11248-11403)
[»] scaffold0157 (1 HSPs)
scaffold0157 (1-161)||(23361-23521)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (62-159)||(45720-45817)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (62-161)||(35457-35556)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 180; Significance: 4e-97; HSPs: 22)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 189 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 29103367 - 29103184
Alignment:
Q  189 tcacaaaaatgtgaagccatgtgaaacagtttgcatttataattaagtatatgagaaattagttctaggcatgcagaagcttgatataattttggttttg 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29103367 tcacaaaaatgtgaagccatgtgaaacagtttgcatttataattaagtatatgagaaattagttctaggcatgcagaagcttgatataattttggttttg 29103268  T
Q  289 gatcatttgatgcaaagaataatgtgcattagtaggtgcaccggtatggcatggccaatccacggagttgggtttgagaattat 372  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29103267 gatcatttgatgcaaagaataatgtgcattagtaggtgcaccggtatggcatggccaatccatggagttgggtttgagaattat 29103184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Original strand, 43571026 - 43571186
Alignment:
Q  1 atacaccttttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 100  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43571026 atacaccctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 43571125  T
Q  101 ctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 161  Q
    | |||||||||  ||| || ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43571126 ccctaatacatggggtgtacaatgaggtgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 43571186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 5489936 - 5489774
Alignment:
Q  1 atacaccttttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 100  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5489936 atacaccctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 5489837  T
Q  101 ctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcctt 163  Q
    | |||||||||| ||| || |||| | |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5489836 ccctaatacatagggtgtacaatgggatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcctt 5489774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 23989463 - 23989626
Alignment:
Q  1 atacaccttttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  23989463 atacaccctttacacccacacaagattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagataaatttaccaaaatat 23989562  T
Q  101 ctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaa-ggtgttcatgtaacattttcctt 163  Q
    | |||||||||| |||||| |||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23989563 ccctaatacatagggtatacaattgagtgtatgaataaaagggtgttcatgtaacattttcctt 23989626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 4401488 - 4401329
Alignment:
Q  1 atacaccttttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||   || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4401488 atacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggcatattggaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 4401389  T
Q  101 ctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaag-gtgttcatgtaacatttt 159  Q
    |||||||||||  ||| || ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  4401388 ctctaatacatggggtgtacaatgaagtgtaggaataaaagagtgttcatgtatcatttt 4401329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 48498902 - 48499069
Alignment:
Q  1 atacaccttttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 100  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48498902 atacaccctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 48499001  T
Q  101 ctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttccttaaaaa 168  Q
    | |||||||||  ||| || ||||  |||||  ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  48499002 ccctaatacatgaggtgtacaatggagtgtagaaataaagagtgttcatgtaacattttccttcaaaa 48499069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 7447985 - 7447828
Alignment:
Q  1 atacaccttttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7447985 atacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttatcaaaatat 7447886  T
Q  101 ctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacatttt 159  Q
    || ||||||||  ||| || |||| | |||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  7447885 ctgtaatacat-gggtgtacaatgggatgtaggaataaaggatgttcatgtaacatttt 7447828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 37814938 - 37814778
Alignment:
Q  1 atacaccttttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 100  Q
    ||||||| |||||| ||| | |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  37814938 atacaccctttacatccatataaaattctgacacgtggcaatctggaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgaaatgaatttaccaaaatat 37814839  T
Q  101 ctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 161  Q
    |  ||||||||  ||| || |||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  37814838 ccttaatacatggggtgtacaatgagatgtatgaataaagggtgtttatgtaacattttcc 37814778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 163
Target Start/End: Original strand, 24769447 - 24769601
Alignment:
Q  9 tttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctctaata 108  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||    
T  24769447 tttacatccacacaaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgataagaacttaccaaaatatccctaata 24769546  T
Q  109 catatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcctt 163  Q
    |||  ||| || ||||  |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24769547 catggggtgtacaatggagtgtagaaataaaaggtgttcatgaaacattttcctt 24769601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Original strand, 50448200 - 50448360
Alignment:
Q  1 atacaccttttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  50448200 atacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacatggaacccacaaaaatagaagataaaatgtggttgtaagatgaacttacaaaaatat 50448299  T
Q  101 ctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 161  Q
    | |||||||||| ||| || ||||  |||||  ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  50448300 ccctaatacataaggtgtacaatggagtgtagaaataaagagtgttcatgtaacattttcc 50448360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Original strand, 750245 - 750406
Alignment:
Q  1 atacaccttttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  750245 atacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggtaacatggaccccacacaaatagaagataaagtgtggttttgagatgaatttatcaaaatat 750344  T
Q  101 ctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcct 162  Q
    | || ||||||  ||| || |||| |||||| |||  || |||||||| |||||||||||||    
T  750345 ccctgatacatggggtgtacaatggggtgtaggaaataagggtgttcacgtaacattttcct 750406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Original strand, 2497502 - 2497660
Alignment:
Q  1 atacaccttttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 100  Q
    ||||||| |||| ||||||| |||||||||| ||||| ||| ||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2497502 atacaccctttatacccacataaaattctgacacgtgacaatctggatcccacataaatagatgataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 2497601  T
Q  101 ctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacatttt 159  Q
    |  ||||| ||  ||| || ||||   |||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  2497602 ccttaatatatggggtgtacaatggaatgtatgaataaatggtgtttatgtaacatttt 2497660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 9 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 4888195 - 4888093
Alignment:
Q  9 tttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctctaata 108  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||  || || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  4888195 tttacatccacacaaaattctgatacatggcaatttggacaccacacaaatagaaaataaagtgtggttgtgagataaacttaccaaaatatccctaata 4888096  T
Q  109 cat 111  Q
    |||    
T  4888095 cat 4888093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 62 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 44112776 - 44112672
Alignment:
Q  62 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 161  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| || ||||| |||  ||| || |||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  44112776 aagagaaagtatggttgtgagatgaaattaccaaaatgtccctaatgcatggggtgtacaatagggtgtatgattaaagggtgttcatgtaacattttcc 44112677  T
Q  162 ttaaa 166  Q
    |||||    
T  44112676 ttaaa 44112672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 62 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 38336017 - 38335918
Alignment:
Q  62 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 161  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  |||| |||  | | || ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  38336017 aagagaaagtatggttgtgagatgaatttaccaaaatatccttaatgcatgggatgtacaataaggtgtatgattaaagggtgttcatgtaacattttcc 38335918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 62 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 48119727 - 48119628
Alignment:
Q  62 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 161  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  |||| |||  ||| || |||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  48119727 aagagaaagtatggttgtgagatgaatttaccaaaatatccttaatgcatggggtgtacaatagggtgtatgattaaagggtgttcatgtaacattttcc 48119628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 62 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 41065252 - 41065144
Alignment:
Q  62 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 161  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||  | ||||| |||  ||| || ||   ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  41065252 aagagaaagtatggttgtgagatgaaattaccaaaatgcccctaatgcatggggtgtacaacagggtgtatgattaaagggtgttcatgtaacattttcc 41065153  T
Q  162 ttaaaaata 170  Q
    | |||||||    
T  41065152 taaaaaata 41065144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 62 - 162
Target Start/End: Original strand, 45427746 - 45427846
Alignment:
Q  62 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 161  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| || ||||| |||   || || |||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  45427746 aagagaaagtatggttgtgagatgaaattaccaaaatgtccctaatgcatggagtgtacaatagggtgtatgattaaaaggtattcatgtaacattttcc 45427845  T
Q  162 t 162  Q
    |    
T  45427846 t 45427846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 62 - 161
Target Start/End: Original strand, 35000114 - 35000213
Alignment:
Q  62 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 161  Q
    |||| ||||| |||||||||||| || ||| |||||| || |||||||||   ||||| |||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  35000114 aagagaaagtatggttgtgagataaatttatcaaaatgtccctaatacatgaagtatacaatagagtgtatgattaaaaggtgttcatgtaacattttcc 35000213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 162
Target Start/End: Original strand, 38113202 - 38113296
Alignment:
Q  68 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcct 162  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||  |||| |||  ||| || |||  ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  38113202 aagtatggttgtgagatgaatttaccaaaatgtcattaatgcatggggtgtacaatagggtgtatgattaaagggtgttcatataacattttcct 38113296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 14427382 - 14427345
Alignment:
Q  126 ggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcctt 163  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  14427382 ggtgtatgattaaagggtgttcatgtaacattttcctt 14427345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Complemental strand, 44112837 - 44112797
Alignment:
Q  1 atacaccttttacacccacacaaaattctgatacgtggcaa 41  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  44112837 atacacctcttacacccacacaaaattctgacatgtggcaa 44112797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 125; Significance: 3e-64; HSPs: 15)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Original strand, 41334603 - 41334763
Alignment:
Q  1 atacaccttttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 100  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41334603 atacaccctttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 41334702  T
Q  101 ctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 161  Q
    | |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41334703 ccctaatacatagggtgtataatgaggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcc 41334763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 2614589 - 2614758
Alignment:
Q  1 atacaccttttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 100  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2614589 atacaccctttacacccatacaaaattctgacacgtggcaatctggaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 2614688  T
Q  101 ctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttccttaaaaata 170  Q
    | |||||||||| ||| || |||| | |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||    
T  2614689 ccctaatacatagggtgtacaatgggatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttccatataaata 2614758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 18034142 - 18033977
Alignment:
Q  1 atacaccttttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 100  Q
    ||||||| |||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18034142 atacaccctttacacccatataaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttacaaaaatat 18034043  T
Q  101 ctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttccttaaa 166  Q
    | |||||||||| ||| || ||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18034042 ccctaatacatagggtgtacaatggagtgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttccttaaa 18033977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 7617293 - 7617131
Alignment:
Q  1 atacaccttttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||| |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7617293 atacaccttttacaccaacacaaaattctgacatgtgacaacttagatcccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 7617194  T
Q  101 ctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcctt 163  Q
    | |||||||||  ||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7617193 ccctaatacatggggtgtataatggagtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcctt 7617131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 22512465 - 22512305
Alignment:
Q  1 atacaccttttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 100  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22512465 atacaccctttacatccacacaaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 22512366  T
Q  101 ctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 161  Q
    | |||||||||   || || ||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22512365 ccctaatacatggagtgtacaatggagtgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 22512305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 5257155 - 5256997
Alignment:
Q  1 atacaccttttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 100  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5257155 atacaccctttacacccacataaaattctgacatgtggcaatcttgaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaaattaccaaaatat 5257056  T
Q  101 ctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacatttt 159  Q
    | |||||||||  ||| || |||| | |||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  5257055 ccctaatacatggggtgtacaatgggatgtatgaataaatggtgtttatgtaacatttt 5256997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 9 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 33801621 - 33801460
Alignment:
Q  9 tttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctctaata 108  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  33801621 tttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacttggatcccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaata 33801522  T
Q  109 catatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttccttaaaaata 170  Q
    |||   || || |||| ||||||  |||||| | |||||||||||||||||||||| |||||    
T  33801521 catggagtgtacaatggggtgtagaaataaaggatgttcatgtaacattttccttataaata 33801460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 38470739 - 38470574
Alignment:
Q  1 atacaccttttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 100  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  38470739 atacaccctttacacccacataaaattctgatacgtggtaatctggaccccacataaatagaagataaagtgtgattgtgaaatgaatttaccaaaatat 38470640  T
Q  101 ctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttccttaaa 166  Q
    |  ||||||||  ||| || ||||   |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  38470639 ccttaatacatggggtgtacaatggaatgtatgaataaagggtgtttatgtaacattttccttaaa 38470574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 162
Target Start/End: Original strand, 39122381 - 39122533
Alignment:
Q  9 tttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctctaata 108  Q
    |||||| |||||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||    
T  39122381 tttacatccacacaagattctgacatgtggcaacctaaaccccacacaaatagaagataaagtgtagttgtgagatgaatttaccaaaatattcctaata 39122480  T
Q  109 catatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcct 162  Q
    |||  ||| | |||| || |||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  39122481 cat-gggtgtctaattagatgtatgaataaaaggtgttcatgtaatagtttcct 39122533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Original strand, 25914936 - 25915085
Alignment:
Q  1 atacaccttttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||        || |||||||||| ||| |||||||    
T  25914936 atacaccatttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata--------ttatgagatgaacctacaaaaatat 25915027  T
Q  101 ctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacatttt 159  Q
     ||||||||||  ||| || ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  25915028 -tctaatacattgggtgtacaatgaggtgtaggaataaagggtgttcatgtaacatttt 25915085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 62 - 161
Target Start/End: Original strand, 32473395 - 32473494
Alignment:
Q  62 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 161  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| |||| || ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  32473395 aagagaaagtatggttgtgagatgaaattaccaaaatatccctaatgcatgtggtgtacaataaggtgtatgattaaagggtgttcatgtaacattttcc 32473494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 9 - 74
Target Start/End: Original strand, 39122304 - 39122369
Alignment:
Q  9 tttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtg 74  Q
    |||||| |||||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39122304 tttacatccacacaagattctgacatgtggcaacctaaaccccacacaaatagaagataaagtgtg 39122369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 62 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 17208173 - 17208073
Alignment:
Q  62 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 161  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||  |||| |||  ||| || ||| | |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||    
T  17208173 aagagaaagtatggttgtgagatgaatttaccaaaatgtccttaatgcatggggtgtacaataaagtgtatgattaaagggtgttcacgtaacattttcc 17208074  T
Q  162 t 162  Q
    |    
T  17208073 t 17208073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 86 - 161
Target Start/End: Original strand, 33855068 - 33855143
Alignment:
Q  86 aacttaccaaaatatctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 161  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||  ||| || |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33855068 aacttaccaaaatgttcctaatacatggggtgtacaatggggtgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 33855143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Original strand, 32473334 - 32473374
Alignment:
Q  1 atacaccttttacacccacacaaaattctgatacgtggcaa 41  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  32473334 atacacctcttacacccacacaaaattctgacatgtggcaa 32473374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 18)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 7292907 - 7292745
Alignment:
Q  1 atacaccttttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 100  Q
    ||||||| ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7292907 atacaccctttacacacaaacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 7292808  T
Q  101 ctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcctt 163  Q
    | |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  7292807 ccctaatacatagggtgtataatgaggtgtatgaataaatggtgttcttgtaacattttcctt 7292745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 26669949 - 26670111
Alignment:
Q  1 atacaccttttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26669949 atacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacctggactccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 26670048  T
Q  101 ctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcctt 163  Q
    | |||||||||  ||| || ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26670049 ccctaatacatgaggtgtacaatgaggtgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcctt 26670111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 9 - 163
Target Start/End: Original strand, 7273283 - 7273437
Alignment:
Q  9 tttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctctaata 108  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7273283 tttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacttggaccccacataaatagaagataaagtgtgattgtgagatgaacttaccaaaatatctctaata 7273382  T
Q  109 catatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcctt 163  Q
    |||  ||| || ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7273383 catggggtgtacaataaggtgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcctt 7273437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 7367709 - 7367542
Alignment:
Q  1 atacaccttttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7367709 atacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacctggatcccacataaatagaaaataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 7367610  T
Q  101 ctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttccttaaaaa 168  Q
    | |||||||||  | | || ||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  7367609 ccctaatacatgggatgtacaatgaggtgtatgaataaatgatgttcatataacattttcctttaaaa 7367542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 30736142 - 30735979
Alignment:
Q  1 atacaccttttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 100  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30736142 atacaccctttacatccacacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacataaatagaagataaagtgtgattgtgagatgaacttaccaaaatat 30736043  T
Q  101 ctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcctta 164  Q
    | |||||||||  ||| || |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  30736042 cactaatacatgaggtgtacaatggggtgtaggaataaaaagtgttcatgtaacatttttctta 30735979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Original strand, 9698273 - 9698434
Alignment:
Q  1 atacaccttttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 100  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9698273 atacaccctttacacccatacaaaattctgacacgtggcaatctggaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 9698372  T
Q  101 ctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcct 162  Q
    | |||||||||| ||| || |||| | |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9698373 ccctaatacatagggtgtacaatgggatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcct 9698434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 9 - 161
Target Start/End: Original strand, 13743169 - 13743321
Alignment:
Q  9 tttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctctaata 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13743169 tttacacccacacaagattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaata 13743268  T
Q  109 catatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 161  Q
    |||  ||| || |||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13743269 catggggtgtacaattggatgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 13743321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 9 - 161
Target Start/End: Original strand, 13748669 - 13748821
Alignment:
Q  9 tttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctctaata 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13748669 tttacacccacacaagattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaata 13748768  T
Q  109 catatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 161  Q
    |||  ||| || |||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13748769 catggggtgtacaattggatgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 13748821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 26466959 - 26466797
Alignment:
Q  1 atacaccttttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  26466959 atacaccttttacacccatacaaaatcctgatacgtggcaacctgaaccccaaacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaataa 26466860  T
Q  101 ctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcctt 163  Q
    | |||||||||   || || |||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  26466859 ccctaatacatggagtgtacaatggggtgtaggaataaagggtgtttatgtaacattttcctt 26466797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 3213560 - 3213398
Alignment:
Q  1 atacaccttttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 100  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  3213560 atacaccctttacacccacataaaattctgacacgtggcaatctggaccccacataaatagaagataaagtatggttgtgaaatgaatttaccaaaatat 3213461  T
Q  101 ctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcctt 163  Q
    |  ||||||||  ||| || |||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  3213460 ccttaatacatggggtgtacaatgagatgtatgaataaagggtgtttatgtaacattttcctt 3213398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Original strand, 24203927 - 24204085
Alignment:
Q  1 atacaccttttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 100  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24203927 atacaccctttacatccacacaaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaatataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 24204026  T
Q  101 ctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacatttt 159  Q
    | |||||||||   || || |||  |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  24204027 ccctaatacatggagtgtacaatagggtgtaggaataaatggtgttcatgtaacatttt 24204085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Original strand, 21293617 - 21293778
Alignment:
Q  1 atacaccttttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 100  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  21293617 atacaccctttacacccacataaaattctgacacgtggcaatctggaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgaaatgaatttaccaaaatat 21293716  T
Q  101 ctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcct 162  Q
    |  ||||||||  ||| || | |||  |||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  21293717 ccttaatacatggggtgtacagtgaaatgtatgaataaagggtgtttatgtaacattttcct 21293778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 30014503 - 30014343
Alignment:
Q  1 atacaccttttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 100  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| ||| || |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30014503 atacaccctttacatccacacaaaattctgacacgtggtaacttggaccccatataaatagaagataaagtatggttgtgagatgaacttaccaaaatat 30014404  T
Q  101 ctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 161  Q
      |||||||||  | | ||||||| | |||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30014403 gcctaatacatgggatgtataatgggatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 30014343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 21280081 - 21279928
Alignment:
Q  9 tttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctctaata 108  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  21280081 tttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaatttaccaaaatatccctaata 21279982  T
Q  109 catatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcct 162  Q
    |||  | | |  ||||   ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21279981 catgggatgtgcaatggaatgtagaaataaagggtgttcatgtaacattttcct 21279928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 62 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 33242502 - 33242400
Alignment:
Q  62 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 161  Q
    |||| ||||| || |||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||  ||| || ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  33242502 aagagaaagtatgtttgtgagatgaatttaccaaaatgtccttaatacatggggtgtacaataaggtgtatgattaaatggtgttcatgtaacattttcc 33242403  T
Q  162 tta 164  Q
    |||    
T  33242402 tta 33242400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 62 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 27441641 - 27441544
Alignment:
Q  62 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacatttt 159  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| | | || |||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  27441641 aagagaaagtatggttgtgagatgaatttaccaaaatatccttaatacataggatgtacaatagggtgtatgattaaagggtgttcatgtaacatttt 27441544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 33254012 - 33253913
Alignment:
Q  62 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 161  Q
    |||||||||| || |||||||||||| ||||||| || || ||||| |||  ||| || |||  ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  33254012 aagataaagtatgattgtgagatgaatttaccaatatgtccctaatgcatggggtgtacaatagggtgtgtgattaaatggtgttcatgtaacattttcc 33253913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 162
Target Start/End: Original strand, 31109223 - 31109323
Alignment:
Q  62 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 161  Q
    |||| ||| |||||| || || |||| ||| ||||||||| ||| | |||  ||| ||||||| | ||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  31109223 aagagaaaatgtggtcgtaagttgaatttatcaaaatatccctagtgcatggggtgtataatgggatgtatgattaaagggtgttcatgtaacattttcc 31109322  T
Q  162 t 162  Q
    |    
T  31109323 t 31109323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 27)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Original strand, 2165903 - 2166063
Alignment:
Q  1 atacaccttttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2165903 atacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacctgaaccccacacaaatagaagataaagtgtggttatgagatgaacttaccaaaatat 2166002  T
Q  101 ctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 161  Q
    |||||||||||  |||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  2166003 ctctaatacatggggtatacaatggggtgtaggaataaatggtgttcatgtaatattttcc 2166063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 36743423 - 36743585
Alignment:
Q  1 atacaccttttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 100  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36743423 atacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaatctggaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 36743522  T
Q  101 ctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcctt 163  Q
    | |||||||||| ||| || |||| | |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36743523 ccctaatacatagggtgtacaatgggatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcctt 36743585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 11582926 - 11582766
Alignment:
Q  1 atacaccttttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 100  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11582926 atacaccctttacacccatacaaaattctgacacgtggcaatctggaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 11582827  T
Q  101 ctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 161  Q
    | |||||||||| ||| || |||| | |||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11582826 ccctaatacatagggtgtacaatgggatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 11582766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Original strand, 42197375 - 42197541
Alignment:
Q  1 atacaccttttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42197375 atacaccctttacacccacacaaaattttgacacgtggcaatctggaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 42197474  T
Q  101 ctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttccttaaaa 167  Q
    | ||||||||||  || |  |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  42197475 ccctaatacatagtgtgtgcaatggggtgtaggaataaatggtgttcatgtaacattttcctaaaaa 42197541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 5755063 - 5754896
Alignment:
Q  1 atacaccttttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5755063 atacaccctttacacccacacaaaattctaacacgtggcaacttggatcccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 5754964  T
Q  101 ctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttccttaaaaa 168  Q
    | |||||| ||  | | || |||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5754963 ccctaatatatgggatgtacaatgggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcctttaaaa 5754896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 30660682 - 30660844
Alignment:
Q  1 atacaccttttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 100  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30660682 atacaccctttacatccacataaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtaagatgaacttaccaaaatat 30660781  T
Q  101 ctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcctt 163  Q
    | |||||||||| ||| || |||| | ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30660782 ccctaatacatagggtgtacaatgggatgtagaaataaagggtgttcatgtaacattttcctt 30660844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 29705522 - 29705362
Alignment:
Q  1 atacaccttttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29705522 atacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacttggaccccgcacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttatcaaaatat 29705423  T
Q  101 ctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 161  Q
    | |||||||||  ||| || |||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  29705422 ccctaatacatggggtgtacaatggggtgtagaaataaagggtgttcatgtaacattttcc 29705362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Original strand, 29800890 - 29801048
Alignment:
Q  1 atacaccttttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 100  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29800890 atacaccctttacacccacataaaattctgacatgtggcaatcttgaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 29800989  T
Q  101 ctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacatttt 159  Q
    | |||||||||  ||| || |||| | |||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  29800990 ccctaatacatggggtgtacaatgggatgtatgaataaatggtgtttatgtaacatttt 29801048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 45397474 - 45397317
Alignment:
Q  3 acaccttttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatct 102  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  45397474 acaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaatctggagcccacacaaatagaagataaattgtggttgtgagatgaacttacaaaaatatcc 45397375  T
Q  103 ctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttc 160  Q
    |||||||||| ||| || |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  45397374 ctaatacatagggtgtagaatggggtgtaggaataaagggtgttcacgtaacattttc 45397317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 20148920 - 20148762
Alignment:
Q  1 atacaccttttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 100  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20148920 atacaccctttacacccacataaaattctgacacgtggcaatctggatcccacataaatagatgataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 20148821  T
Q  101 ctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacatttt 159  Q
    | |||||| ||  ||| || |||| | |||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  20148820 ccctaatatatgaggtgtacaatgggatgtatgaataaagggtgtttatgtaacatttt 20148762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 26125794 - 26125637
Alignment:
Q  1 atacaccttttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 100  Q
    ||||||| ||||||||| || |||||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26125794 atacaccctttacacccgcataaaattctgacacgtggcaatctggaccc-acataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 26125696  T
Q  101 ctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacatttt 159  Q
    | |||||||||| ||| || ||||   |||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  26125695 ccctaatacatagggtgtacaatggaatgtatgaataaagggtgtttatgtaacatttt 26125637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 42295346 - 42295197
Alignment:
Q  9 tttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctctaata 108  Q
    |||||| |||||||||||||||| | |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42295346 tttacatccacacaaaattctgacatgtggcaacttggaccc-acataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaata 42295248  T
Q  109 catatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacatttt 159  Q
    |||   || || ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  42295247 catggagtgtacaatgaggtgtaggaataaagggtgttcatgtaacatttt 42295197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 2547156 - 2546995
Alignment:
Q  1 atacaccttttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2547156 atacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacttggatcccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatat 2547057  T
Q  101 ctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcct 162  Q
    | |||||||||  ||| || ||||  |||||  ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  2547056 ccctaatacatgaggtgtacaatggagtgtagaaataaagagtgttcatgtaacattttcct 2546995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 9 - 168
Target Start/End: Original strand, 30912510 - 30912669
Alignment:
Q  9 tttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctctaata 108  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  30912510 tttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacctagaccccacacaaatagaagataaggtgcggttgtgagatgaacttaccaaaatacccctaata 30912609  T
Q  109 catatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttccttaaaaa 168  Q
    |||   || || |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  30912610 catgaagtgtacaatggggtgtaggaataaagggtgttcatgtaacatttttcctaaaaa 30912669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 3 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 9241710 - 9241605
Alignment:
Q  3 acaccttttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatct 102  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  9241710 acaccctttgcacccacacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttacaaaaatatcc 9241611  T
Q  103 ctaata 108  Q
    ||||||    
T  9241610 ctaata 9241605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 1375694 - 1375542
Alignment:
Q  9 tttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctctaata 108  Q
    ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  1375694 tttacacccacacaagattctaacacgtggcaatctgaactccacacaaatagaagataaagtgtagttgtgagataaatttaccaaaatatccctaata 1375595  T
Q  109 catatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 161  Q
     ||  ||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1375594 tatggggtgtacaattgggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaaaattttcc 1375542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 3743931 - 3743832
Alignment:
Q  1 atacaccttttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 100  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3743931 atacaccctttacacccacataaaattctgacacgtggcaatctgaaccctacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttatcaaaatat 3743832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 31384816 - 31384663
Alignment:
Q  9 tttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctctaata 108  Q
    |||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  31384816 tttacatccacataaaattctgacacgtagcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatattcctaata 31384717  T
Q  109 catatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcct 162  Q
    |||  ||| || |||    |||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||    
T  31384716 catggggtgtacaatagaatgtaagaataaagggtgttcatgtaatactttcct 31384663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 65 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 42699353 - 42699254
Alignment:
Q  65 ataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcctta 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| ||| || |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  42699353 ataaagtgtggttgtgagatgaacttacaaaaatatccataatacataaggtgtacaatggggtgtaggaataaagggtgttcatgtaacatttttctta 42699254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 162
Target Start/End: Original strand, 40528582 - 40528736
Alignment:
Q  9 tttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctctaata 108  Q
    |||||| |||||||||||| ||| | ||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||| || ||||||    
T  40528582 tttacatccacacaaaattatgacatgtgacaacttgaaccccacacaaatagaagagaaagtgtggttgtgagataaatttatcaaaatgtccctaata 40528681  T
Q  109 catatggtatataatgaggtgtatgaataaaa-ggtgttcatgtaacattttcct 162  Q
     ||  ||| || |||| ||| | ||||||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  40528682 tatggggtgtacaatggggtttgtgaataaaagggtgttcatgtattattttcct 40528736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 68 - 162
Target Start/End: Original strand, 16603633 - 16603727
Alignment:
Q  68 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcct 162  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| |||  ||| |||||| |||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16603633 aagtatggttgtgagatgaatttaccaaaatgtctttaatgcatggggtgtataataaggtgtatgattaaagggtgtgcatgtaacattttcct 16603727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 62 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 35181615 - 35181514
Alignment:
Q  62 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 161  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| || ||||| |||  ||| || |||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  35181615 aagagaaagtatggttgtgagatgaaattaccaaaatgtccctaatgcatggggtgtacaatagggtgtatgattaaagggtgttcatgtaacattttcc 35181516  T
Q  162 tt 163  Q
    ||    
T  35181515 tt 35181514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 62 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 34304887 - 34304784
Alignment:
Q  62 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 161  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| || ||||| |||  ||| || |||  ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||    
T  34304887 aagagaaagtatggttgtgagatgaaattaccaaaatgtccctaatgcatggggtgtacaatagggtgtatgattaaaggatgttcatgtaacattttcc 34304788  T
Q  162 ttaa 165  Q
    ||||    
T  34304787 ttaa 34304784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 62 - 159
Target Start/End: Original strand, 33629994 - 33630091
Alignment:
Q  62 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacatttt 159  Q
    |||| ||||| | ||||||||||||| |||| ||||| || ||||| |||| ||| || |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||    
T  33629994 aagagaaagtatagttgtgagatgaaattactaaaatgtccctaatgcatagggtgtacaatgaggtgtatgattaaagggtgttcgtgtaacatttt 33630091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 62 - 170
Target Start/End: Original strand, 18066719 - 18066827
Alignment:
Q  62 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 161  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||  | | || |||    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  18066719 aagagaaagtatggttgtgagatgaaattactaaaatatccctaatacatgggatgtacaatagaatgtatgattaaagggtgttcatgtaacattttcc 18066818  T
Q  162 ttaaaaata 170  Q
    | |||||||    
T  18066819 taaaaaata 18066827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 163
Target Start/End: Original strand, 19386635 - 19386672
Alignment:
Q  126 ggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcctt 163  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  19386635 ggtgtatgattaaagggtgttcatgtaacattttcctt 19386672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 124 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 28977183 - 28977146
Alignment:
Q  124 gaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 161  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28977183 gaggtgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 28977146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0119 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0119
Description:

Target: scaffold0119; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 845 - 683
Alignment:
Q  1 atacaccttttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  845 atacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacctggactccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 746  T
Q  101 ctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcctt 163  Q
    | |||||||||  ||| || ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  745 ccctaatacatgaggtgtacaatgaggtgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcctt 683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 27)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 40809025 - 40808860
Alignment:
Q  1 atacaccttttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40809025 atacaccttttacatccacacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 40808926  T
Q  101 ctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttccttaaa 166  Q
    | |||||||||  ||| || |||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  40808925 ccctaatacatggggtgtacaatggggtgtaggaataaatggtgttgatgtaacattttccttaaa 40808860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 24688342 - 24688504
Alignment:
Q  1 atacaccttttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 100  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24688342 atacaccatttacccccacacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 24688441  T
Q  101 ctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcctt 163  Q
    | |||||||||| ||| || ||||  |||||  |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24688442 ccctaatacatagggtgtacaatggagtgtagaaataaagggtgttcatgtaacattttcctt 24688504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 27748713 - 27748565
Alignment:
Q  11 tacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctctaataca 110  Q
    |||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27748713 tacaccgacacaaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtattgttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaataca 27748614  T
Q  111 tatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacatttt 159  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27748613 taaggtgtataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacatttt 27748565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 36150290 - 36150130
Alignment:
Q  1 atacaccttttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 100  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36150290 atacaccctttacatccacacaaaattctgacacgtggcaacctggactccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 36150191  T
Q  101 ctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 161  Q
    | || ||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  36150190 ccctgatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtattcatgtaacattttcc 36150130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 163
Target Start/End: Original strand, 54246096 - 54246250
Alignment:
Q  9 tttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctctaata 108  Q
    |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  54246096 tttacacccacataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttacaaaaatatctctaata 54246195  T
Q  109 catatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcctt 163  Q
    |||| ||| || |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  54246196 catagggtgtacaatggggtgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcctt 54246250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 25413841 - 25413680
Alignment:
Q  1 atacaccttttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25413841 atacaccctttacacccacacaaaactctgacacgtggtaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttacaaaaatat 25413742  T
Q  101 ctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcct 162  Q
    | |||||||||| ||| || |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25413741 ccctaatacataaggtgtacaatggggtgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcct 25413680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 47190966 - 47191129
Alignment:
Q  1 atacaccttttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  47190966 atacaccctttacacccacacaaaattctgacatgtggtaacttggaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttatcaaaatat 47191065  T
Q  101 ctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttccttaa 165  Q
    |||||||||||  ||| || ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47191066 ctctaatacat-gggtgtacaatgaggtgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttccttaa 47191129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 40480909 - 40480750
Alignment:
Q  1 atacaccttttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40480909 atacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacctggaccctacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 40480810  T
Q  101 ctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttc 160  Q
    | |||||||||| | | || |||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40480809 ccctaatacataggatgtacaatggggcatatgaataaagggtgttcatgtaacattttc 40480750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 9 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 46941205 - 46941051
Alignment:
Q  9 tttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctctaata 108  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  46941205 tttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaata 46941106  T
Q  109 catatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcctt 163  Q
    |||  ||| || |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  46941105 catggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcctt 46941051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Original strand, 53581798 - 53581956
Alignment:
Q  1 atacaccttttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  53581798 atacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttatcaaaatat 53581897  T
Q  101 ctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacatttt 159  Q
    | |||||||||| | | || ||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  53581898 ccctaatacataggatgtacaatggagtgtatgaataaagagtgttcatgtaacatttt 53581956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 4 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 42100845 - 42100688
Alignment:
Q  4 caccttttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctc 103  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  42100845 caccctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacctgaactccacacaaataaaagataaaatgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccc 42100746  T
Q  104 taatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 161  Q
    ||||||||  ||| || ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42100745 taatacatggggtgtacaatgaggtgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 42100688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 54237256 - 54237097
Alignment:
Q  1 atacaccttttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 100  Q
    ||||||| |||||||||| |||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54237256 atacaccctttacacccatacaatattctgacacgtggcaatctggaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 54237157  T
Q  101 ctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttc 160  Q
    | |||||||||| ||| || |||| | |||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  54237156 ccctaatacatagggtgtacaatgggatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttc 54237097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 42394359 - 42394518
Alignment:
Q  1 atacaccttttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 100  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42394359 atacaccctttacacccatacaaaattttgacacgtggcaatctggaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 42394458  T
Q  101 ctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttc 160  Q
    | |||||||||| ||| || ||||   |||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42394459 ccctaatacatagggtgtacaatggaatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttc 42394518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Original strand, 45126868 - 45127028
Alignment:
Q  1 atacaccttttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 100  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||  | |||| || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45126868 atacaccctttacacccacataaaattctggcatgtggtaatctggaccccacataaatagaaaataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 45126967  T
Q  101 ctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 161  Q
    | |||||||||  ||| || |||| | |||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  45126968 ccctaatacatggggtgtacaatgggatgtatgaataaagggtgtttatgtaacattttcc 45127028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Original strand, 53273634 - 53273790
Alignment:
Q  11 tacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctctaataca 110  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  53273634 tacacctacacaaaattctgatacgtggtaacctggatcccacataaataaaagataaagtatggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaataca 53273733  T
Q  111 tatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttccttaaaa 167  Q
    |  | | || |||||||| || ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||    
T  53273734 tgggatgtacaatgaggtataggaataaatgatgttcatataacattttccttaaaa 53273790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 52629988 - 52629877
Alignment:
Q  1 atacaccttttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  52629988 atacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtagcaacctggaccctacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttacaaaaatat 52629889  T
Q  101 ctctaatacata 112  Q
    |  |||||||||    
T  52629888 ccttaatacata 52629877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 1078378 - 1078229
Alignment:
Q  1 atacaccttttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 100  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||        ||||||||||||| ||| |||||||    
T  1078378 atacaccctttacatccacacaaaattctgacacgtggcaacctgaactccacacaaatagaagata--------ttgtgagatgaacctacaaaaatat 1078287  T
Q  101 ctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacatttt 159  Q
    | |||||||||  ||| || ||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||    
T  1078286 c-ctaatacattaggtgtacaatgaggtgcaggaataaagggtgttcatgtaacatttt 1078229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 62 - 163
Target Start/End: Original strand, 4190266 - 4190367
Alignment:
Q  62 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 161  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| || |||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  4190266 aagagaaagtatggttgtgagatgaatttaccaaaatatctctaatacataaggtgtacaatagggtgtatgattaaagggtgttcatgtaacattttcc 4190365  T
Q  162 tt 163  Q
    ||    
T  4190366 tt 4190367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 11064662 - 11064822
Alignment:
Q  1 atacaccttttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 100  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| ||| | |||| || ||  |||||||| ||||||||||  ||||||| || ||||||||| | | ||||||||    
T  11064662 atacaccccttacacccacacaaaattttgacatgtggtaatctagaccccacacaaatagaagagtaagtgtgattatgagatgaattaatcaaaatat 11064761  T
Q  101 ctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcctt 163  Q
    ||||||  |||| ||| || ||||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||    
T  11064762 ctctaaagcatagggtgtacaatgaggtgtatgaataaatgatgttca--taacattttcctt 11064822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 20 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 51249449 - 51249323
Alignment:
Q  20 acaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctctaatacatatggtata 119  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| |||  ||| ||    
T  51249449 acaaaattctgacatgtggcaatctggatcccacacaaatagaagagaaagtgtggttgtgagatgaatttaccaaaatatccttaatgcatgaggtgta 51249350  T
Q  120 taatgaggtgtatgaataaaaggtgtt 146  Q
    ||||| | ||  |||||||| ||||||    
T  51249349 taatgggttgggtgaataaagggtgtt 51249323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 62 - 163
Target Start/End: Original strand, 10457893 - 10457994
Alignment:
Q  62 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 161  Q
    |||| ||||| |||||||||||| || |||||||||||||  |||| |||  ||| || |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10457893 aagagaaagtatggttgtgagataaatttaccaaaatatccttaatgcatggggtgtacaatagggtgtatgattaaaaggtgttcatgtaacattttcc 10457992  T
Q  162 tt 163  Q
    ||    
T  10457993 tt 10457994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 59 - 163
Target Start/End: Original strand, 29558232 - 29558336
Alignment:
Q  59 tagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattt 158  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||  |||||| ||| ||| || |||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||     
T  29558232 tagaaaataaaatgtgattgtgagatgaatttaccaatatattcctaatatatagggtgtacaatgagatgtatgaataaagggtgttcatataacattg 29558331  T
Q  159 tcctt 163  Q
    |||||    
T  29558332 tcctt 29558336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 62 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 9434223 - 9434122
Alignment:
Q  62 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 161  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| || ||||| |||  ||| || |||   |||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  9434223 aagagaaagtatggttgtgagatgaaattaccaaaatgtccctaatgcatggggtgtacaatagagtgtatgattaaagggtgttcatgtaacattttcc 9434124  T
Q  162 tt 163  Q
    ||    
T  9434123 tt 9434122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 25996356 - 25996267
Alignment:
Q  73 tggttgtgagatgaacttaccaaaatatctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcct 162  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||| ||  ||| || ||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  25996356 tggttgtgagatgaatttaccaaaatgtccttaatatatggggtgtacaataagatgtatgattaaagggtgttcatgtaacattttcct 25996267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 34791928 - 34791829
Alignment:
Q  62 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 161  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||  ||||| || ||||| |||  ||| || |||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  34791928 aagagaaagtatggttgtgagatgaaattattaaaatgtccctaatgcatgaggtttacaatatggtgtatgattaaagggtgttcatgtaacattttcc 34791829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 51757692 - 51757586
Alignment:
Q  62 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 161  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||  |||| |||  ||| || |||  ||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||    
T  51757692 aagagaaagtatggttgtgagatgaaattactaaaatgtccataatgcatgaggtgtacaatagggtgtatgattaaagggtgtttatgtaatattttcc 51757593  T
Q  162 ttaaaaa 168  Q
     ||||||    
T  51757592 ataaaaa 51757586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Complemental strand, 9434284 - 9434244
Alignment:
Q  1 atacaccttttacacccacacaaaattctgatacgtggcaa 41  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  9434284 atacacctcttacacccacacaaaattctgacatgtggcaa 9434244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 111; Significance: 6e-56; HSPs: 36)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 1771206 - 1771368
Alignment:
Q  1 atacaccttttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1771206 atacaccctttacacccacacaaaattctgagacgtggcaacttggaccccacataaatagaagataaaatgtggttgtgagatgaacttatcaaaatat 1771305  T
Q  101 ctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcctt 163  Q
    |||||||||||  ||| || |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1771306 ctctaatacatggggtgtacaatggggtgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcctt 1771368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 27550469 - 27550309
Alignment:
Q  1 atacaccttttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 100  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27550469 atacaccctttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtaagatgaacttaccaaaatat 27550370  T
Q  101 ctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 161  Q
    | |||||||||  ||| || ||||  |||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  27550369 ccctaatacatgaggtgtacaatggagtgtagaaataaagggtgttcatgtaacattttcc 27550309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 9 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 25051845 - 25051690
Alignment:
Q  9 tttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctctaata 108  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25051845 tttacatccacacaaaattctgacacgtggcaacttggaccccacataaatagaagataaagtgtgattgtgagatgaacttaccaaaatatccctaata 25051746  T
Q  109 catatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcctta 164  Q
    |||| ||| || |||| |||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  25051745 catagggtgtacaatggggtgtaggaataaagtgtgttcatgtgacattttcctta 25051690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 9 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 23036132 - 23035978
Alignment:
Q  9 tttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctctaata 108  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  23036132 tttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttacaaaaatatccctaata 23036033  T
Q  109 catatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcctt 163  Q
     ||| ||| || |||  |||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  23036032 tatagggtgtacaatagggtgtaggaataaaggaggttcatgtaacattttcctt 23035978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 27864724 - 27864562
Alignment:
Q  1 atacaccttttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 100  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27864724 atacaccctttacatccacataaaattctgacatgtggtaatctgaaccccacataaatagaaaataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 27864625  T
Q  101 ctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcctt 163  Q
    | |||||||||  ||| || |||| | |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  27864624 ccctaatacatggggtgtacaatgggatgtatgaataaatggtgtttatgtaacattttcctt 27864562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 33703301 - 33703139
Alignment:
Q  1 atacaccttttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33703301 atacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacttggatcccgcacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 33703202  T
Q  101 ctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcctt 163  Q
    | |||||||||  ||| || ||| || ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33703201 ccctaatacatggggtgtacaataagatgtagaaataaagggtgttcatgtaacattttcctt 33703139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 28982762 - 28982926
Alignment:
Q  1 atacaccttttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28982762 atacaccttttacatccacacaaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataaagtgcggttgtgagatgaacttaccaaaatat 28982861  T
Q  101 ctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttccttaa 165  Q
    | |||||| ||  | | || |||  ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28982862 ccctaatatatgggatgtacaatagggtgtagaaataaagggtgttcatgtaacattttccttaa 28982926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 35017892 - 35017733
Alignment:
Q  1 atacaccttttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 100  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35017892 atacatcttttacatccacacaaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 35017793  T
Q  101 ctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 161  Q
    | || ||||||  ||| || |||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35017792 ccct-atacatggggtgtacaatgagatataggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 35017733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Original strand, 27893782 - 27893940
Alignment:
Q  1 atacaccttttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 100  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27893782 atacaccctttacacccacataaaattctgacatgtggcaatcttgaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaaattaccaaaatat 27893881  T
Q  101 ctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacatttt 159  Q
    | |||||||||  ||| || |||| | |||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  27893882 ccctaatacatggggtgtacaatgggatgtatgaataaatggtgtttatgtaacatttt 27893940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 55966286 - 55966448
Alignment:
Q  1 atacaccttttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 100  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55966286 atacaccctttacacccacataaaattctgacaggtggcaatctagaccccacataaatagaagataaattgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 55966385  T
Q  101 ctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcctt 163  Q
    | |||||||||  | | || |||| | |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  55966386 ccctaatacatgggatgtacaatgggatgtatgaataaagggtgtttatgtaacattttcctt 55966448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Original strand, 48463390 - 48463551
Alignment:
Q  1 atacaccttttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 100  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  48463390 atacaccctttacacccacataaaattctgacatgtggtaatctgaaccccacataaatagaaaataaagtatggttgtgagatgaacttaccaaaatat 48463489  T
Q  101 ctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcct 162  Q
    | |||||||||  | | || |||||  |||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  48463490 ccctaatacatgggatgtacaatgaaatgtatgaataaatggtgtttatgtaacattttcct 48463551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 9 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 39631253 - 39631102
Alignment:
Q  9 tttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctctaata 108  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39631253 tttacacccacacaaaattctgacacgtgacatattgaaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaata 39631154  T
Q  109 catatggtatataatgaggtgtatgaataaaa-ggtgttcatgtaacatttt 159  Q
    |||  ||| || ||||||||||| |||||||| || ||||||||| ||||||    
T  39631153 catgaggtgtacaatgaggtgtaggaataaaagggggttcatgtatcatttt 39631102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 158
Target Start/End: Original strand, 23204726 - 23204875
Alignment:
Q  9 tttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctctaata 108  Q
    |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  23204726 tttacacccacataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgacatgaacttacaaaaatatccctaata 23204825  T
Q  109 catatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattt 158  Q
    |||| | | || |||| | |||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  23204826 cataggatgtacaatgggatgtaggaataaagagtgttcatgtaacattt 23204875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Original strand, 27316652 - 27316813
Alignment:
Q  1 atacaccttttacacccacacaaaa-ttctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaata 99  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27316652 atacaccctttacatccacacaaaaattctgacacgtggcaacttggactccaaataaatagaagataaagtgtggttatgagatgaacttaccaaaata 27316751  T
Q  100 tctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 161  Q
    ||  ||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  27316752 tccttaatacatggggtgtataatgaggtgtaggaataaagggtgttcgtttaacattttcc 27316813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 12497116 - 12496956
Alignment:
Q  1 atacaccttttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  12497116 atacacgttttacacccacacaaaattctaacacgtggcaaattgaacctcacacaaatagaagataaagtgtgattgtaagatgaacttaccaaaatat 12497017  T
Q  101 ctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 161  Q
    |||||||||||  | | || ||||  ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  12497016 ctctaatacatgggatgtacaatggagtgtaggaataaagggtgttcatataacattttcc 12496956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 31681062 - 31680904
Alignment:
Q  1 atacaccttttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 100  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31681062 atacaccctttacacctacataaaattctgacacgtggcaatctaaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 31680963  T
Q  101 ctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacatttt 159  Q
    | |||||| |   ||| || ||||   |||||||||||| |||||| | ||||||||||    
T  31680962 ccctaatatacggggtgtacaatggaatgtatgaataaatggtgtttacgtaacatttt 31680904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 17 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 21687150 - 21687005
Alignment:
Q  17 cacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctctaatacatatggt 116  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | |    
T  21687150 cacacaaaattctgacacgtggcaacctgaactccagacaaatagaagataaagtatggttatgagatgaacttactaaaatatttctaatacataagat 21687051  T
Q  117 atataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcct 162  Q
     ||||||| ||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||    
T  21687050 gtataatggggtgtaaaaataaaggatgttcatgtaacattttcct 21687005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 9 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 41878558 - 41878407
Alignment:
Q  9 tttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctctaata 108  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||| |||||||||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||     
T  41878558 tttacaccaacacaaaattctgacacgtgacaatctggaccccacacaaatagaagagaaggtttggttgtgagatgaacttatcaaaatatccctaatg 41878459  T
Q  109 catatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttc 160  Q
     ||| ||| || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  41878458 gatagggtgtacaatgaggtgtatgaataaagagtgttcatgtaacattttc 41878407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 9 - 164
Target Start/End: Original strand, 43514634 - 43514789
Alignment:
Q  9 tttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctctaata 108  Q
    |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  43514634 tttacatccacaaaaaattctgacacgtggcaacctagaccccacacaaatagaagataaggtgtggttgtgagatgaacttaccaaaataaccctaata 43514733  T
Q  109 catatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcctta 164  Q
    |||   || || ||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  43514734 catgaagtgtacaatggagtgtaggaataaagggtgttcatgtaacatttttctta 43514789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 8 - 159
Target Start/End: Original strand, 46412416 - 46412557
Alignment:
Q  8 ttttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctctaat 107  Q
    ||||||| | |||||||||||||| |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  46412416 ttttacatctacacaaaattctgacacgtggcaatttaaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagaagaacttaccaaaatatctctaat 46412515  T
Q  108 acatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacatttt 159  Q
    |          ||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  46412516 a----------ataatgaagtgtaggaataaaaggtgttcacgtaacatttt 46412557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Original strand, 43949741 - 43949900
Alignment:
Q  1 atacaccttttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 100  Q
    ||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||||   || | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43949741 atacaccctttatacccatacaaaattctgacacgtggcatattggatcccgcacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 43949840  T
Q  101 ctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaa-ggtgttcatgtaacatttt 159  Q
    | |||||||||  ||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||    
T  43949841 ccctaatacatggggtgtacaatgaggtgcaggaataaaagggtgttcatgtatcatttt 43949900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 43735902 - 43735744
Alignment:
Q  1 atacaccttttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 100  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||| |||| || | |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  43735902 atacaccctttacatccacataaaattctgacacgtgacaacttggatcccacacaaatagaagataaagtgtgattgtgagatgaacttatcaaaatat 43735803  T
Q  101 ctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacatttt 159  Q
    |||||||||||    | ||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||| |||||    
T  43735802 ctctaatacatggaatgtataatgagatgtaggaataaaggatgttcatgtaatatttt 43735744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 111
Target Start/End: Original strand, 51512205 - 51512315
Alignment:
Q  1 atacaccttttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 100  Q
    ||||| |||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  51512205 atacatctttaatacccacacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaataaaagataaagtgtggttataagatgaacttaccaaaatat 51512304  T
Q  101 ctctaatacat 111  Q
    |||||||||||    
T  51512305 ctctaatacat 51512315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 9 - 161
Target Start/End: Original strand, 45490261 - 45490413
Alignment:
Q  9 tttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctctaata 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| ||||||    
T  45490261 tttacacccacacaagattctgacacgtggcaacctggatcccgtacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaatttactaaagtatccctaata 45490360  T
Q  109 catatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 161  Q
    |||  ||| || |||  | ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45490361 catgaggtgtacaattggatgtataaataaaatgtgttcatgtaacattttcc 45490413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 20 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 28988614 - 28988471
Alignment:
Q  20 acaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctctaatacatatggtata 119  Q
    |||||||||||| |  |||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||||| || ||| | |||  ||| ||    
T  28988614 acaaaattctgacatatggcaacctggaccccacacaaatagaagagaaagtgtggttatgagatgaatttatcaaaatgtccctagtgcatggggtgta 28988515  T
Q  120 taatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcctt 163  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28988514 caatgaggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcctt 28988471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 41848131 - 41847971
Alignment:
Q  1 atacaccttttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 100  Q
    |||||||  ||||| |||| ||||||||||| | ||| ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||| |    
T  41848131 atacaccccttacatccacgcaaaattctgacatgtgacaatctgaaccccacacaaatagaagagaaagtgtggttgtgcgatgaatttgccaaaatgt 41848032  T
Q  101 ctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 161  Q
    ||||||| |||  ||| || |||||||||| |||| ||| | ||||| |||||||||||||    
T  41848031 ctctaatgcatggggtgtacaatgaggtgtgtgaaaaaaggatgttcttgtaacattttcc 41847971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Original strand, 41327483 - 41327641
Alignment:
Q  1 atacaccttttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 100  Q
    |||||||  |||||| |||| |||||||| | | ||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |    
T  41327483 atacaccccttacactcacaaaaaattctaacatgtggcaacctggaccccacacaaattgaagagaaagtgtggatgtgagatgaatttaccaaaatgt 41327582  T
Q  101 ctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacatttt 159  Q
    |  || | |||| ||| || |||| ||||| |||||||| |||||  ||||||||||||    
T  41327583 ccgtagtgcataaggtgtacaatggggtgtgtgaataaagggtgtctatgtaacatttt 41327641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 62 - 167
Target Start/End: Original strand, 17619153 - 17619258
Alignment:
Q  62 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 161  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  |||| |||  ||| || |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17619153 aagagaaagtatggttgtgagatgaatttaccaaaatatccttaatgcatggggtgtacaatagggtgtatgattaaaaggtgttcatgtaacattttcc 17619252  T
Q  162 ttaaaa 167  Q
     |||||    
T  17619253 ataaaa 17619258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Original strand, 56215838 - 56215948
Alignment:
Q  1 atacaccttttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |  | |||||||  |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  56215838 atacacctcttacacccacacaaaattctgacatatagcaacctagaccccacacaaatag-agagaaagtgtggttgtgagataaattttccaaaatat 56215936  T
Q  101 ctctaatacata 112  Q
    | ||||| ||||    
T  56215937 cgctaatgcata 56215948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 62 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 712059 - 711958
Alignment:
Q  62 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 161  Q
    |||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||||  |||| |||| ||| || |||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  712059 aagagaaagtatgtttgtgagatgaatttaccaaaatatccttaatgcatagggtgtacaatagggtgtatgattaaagggtgttcatgtaacattttcc 711960  T
Q  162 tt 163  Q
    ||    
T  711959 tt 711958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 161
Target Start/End: Original strand, 55272377 - 55272476
Alignment:
Q  62 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 161  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  |||| |||  ||| || |||   |||||||| |||| | |||||||||||||||||||    
T  55272377 aagagaaagtatggttgtgagatgaatttaccaaaatatccttaatgcatggggtgtacaatagagtgtatgattaaaggatgttcatgtaacattttcc 55272476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 81 - 166
Target Start/End: Original strand, 960890 - 960975
Alignment:
Q  81 agatgaacttaccaaaatatctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttccttaaa 166  Q
    ||||||| |||||||||| || |||||  ||| ||| || |||   |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  960890 agatgaatttaccaaaatgtccctaatgtatagggtgtacaatagagtgtatgattaaagggtgttcatgtaacattttccttaaa 960975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 162
Target Start/End: Original strand, 48435580 - 48435680
Alignment:
Q  62 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 161  Q
    |||||||||| || |||||||||||| ||||||| || || ||||| |||  ||| || |||  ||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||||    
T  48435580 aagataaagtatgattgtgagatgaatttaccaatatgtccctaatgcatggggtgtacaatagggtgtgtgattaaatggtgttcatgtaacactttcc 48435679  T
Q  162 t 162  Q
    |    
T  48435680 t 48435680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 67 - 170
Target Start/End: Original strand, 3756252 - 3756355
Alignment:
Q  67 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttccttaaa 166  Q
    ||||| || ||||||||| || |||| ||||||||  |||| |||  ||| || |||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || |||    
T  3756252 aaagtatgattgtgagataaatttactaaaatatccttaatgcatggggtgtacaatagggtgtatgattaaagggtgttcatgtaacatttttctaaaa 3756351  T
Q  167 aata 170  Q
    ||||    
T  3756352 aata 3756355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 127 - 168
Target Start/End: Original strand, 46827772 - 46827813
Alignment:
Q  127 gtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttccttaaaaa 168  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  46827772 gtgtatgattaaagggtgttcatgtaacattttcctttaaaa 46827813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 62 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 32728456 - 32728356
Alignment:
Q  62 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 161  Q
    |||| ||||| || |||||||||||| |||| ||||| ||  |||| |||  ||| || |||  ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||    
T  32728456 aagagaaagtatgattgtgagatgaatttactaaaatgtccttaatgcatggggtgtacaatagggtgtatgattaaaggatgttcatgtaacattttcc 32728357  T
Q  162 t 162  Q
    |    
T  32728356 t 32728356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 108; Significance: 4e-54; HSPs: 28)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 41861836 - 41861670
Alignment:
Q  1 atacaccttttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 100  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41861836 atacaccctttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccatacaaatagaagataaagtgtggttgtgagataaacttaccaaaatat 41861737  T
Q  101 ctc--taatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttccttaa 165  Q
    |||  ||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41861736 ctctataatacatagggtgtataattgggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttccttaa 41861670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Original strand, 24000952 - 24001112
Alignment:
Q  1 atacaccttttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 100  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24000952 atacaccctttacacccatacaaaattctgacacgtggcaatctggaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 24001051  T
Q  101 ctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 161  Q
    | |||||||||| ||| || |||| | |||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24001052 ccctaatacatagggtgtacaatgggatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 24001112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Original strand, 42538371 - 42538531
Alignment:
Q  1 atacaccttttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 100  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42538371 atacaccctttacacccatacaaaattctgacacgtggcaatctggaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 42538470  T
Q  101 ctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 161  Q
    | |||||||||| ||| || |||| | |||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42538471 ccctaatacatagggtgtacaatgggatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 42538531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 5015555 - 5015393
Alignment:
Q  1 atacaccttttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5015555 atacaccttttacactcacacaaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 5015456  T
Q  101 ctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcctt 163  Q
    | |||||||||  ||| || ||||  |||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  5015455 ccctaatacatgaggtgtacaatggagtgtagaaataaagagtgttcatgtaacattttcctt 5015393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 9 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 35069873 - 35069720
Alignment:
Q  9 tttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctctaata 108  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35069873 tttacatctacacaaaattctgacacgtggcaacttggacctcacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaata 35069774  T
Q  109 catatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcct 162  Q
    |||  ||| || ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  35069773 catgaggtgtacaatgaggtgtaggaataaagagtgttcatgtaacattttcct 35069720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 26898342 - 26898499
Alignment:
Q  1 atacaccttttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26898342 atacaccttttacacccacataaaattctgacacgtggtaacctggaccccacacaaatagaatataaagtgtggttgtaagatgaacttaccaaaatat 26898441  T
Q  101 ctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattt 158  Q
    | |||||||||    | || |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26898442 ccctaatacatggaatgtacaattgggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattt 26898499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 42973012 - 42972852
Alignment:
Q  1 atacaccttttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42973012 atacaccatttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataaaatgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 42972913  T
Q  101 ctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 161  Q
    | |||||||||  ||| || ||||  ||||| ||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  42972912 ccctaatacatgaggtgtacaatggagtgtaggaataaaggatgttcaggtaacattttcc 42972852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 32029757 - 32029908
Alignment:
Q  1 atacaccttttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  32029757 atacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacttggaccccacataaatagaagataaagtgtggttgttagatgaatttaccaaaatat 32029856  T
Q  101 ctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgta 152  Q
    | |||||||||  ||| || |||| |||||| |||||||| ||||| |||||    
T  32029857 ccctaatacatggggtgtacaatggggtgtaggaataaaaagtgtttatgta 32029908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Original strand, 16180297 - 16180454
Alignment:
Q  1 atacaccttttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16180297 atacaccttttacatccacacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaatttaccaaaatat 16180396  T
Q  101 ctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacatttt 159  Q
     | |||||| |  ||| || |||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  16180397 ttataatacgtggggtgtacaatg-ggtgtaggaataaatggtgttgatgtaacatttt 16180454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 44326338 - 44326180
Alignment:
Q  1 atacaccttttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 100  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44326338 atacaccctttacacccacataaaattctgacacgtggcaatctggatcccacataaatagatgataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 44326239  T
Q  101 ctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacatttt 159  Q
    | |||||| ||  ||| || |||| | |||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  44326238 ccctaatatatgaggtgtacaatgggatgtatgaataaagggtgtttatgtaacatttt 44326180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Original strand, 5810864 - 5811024
Alignment:
Q  1 atacaccttttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 100  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||| ||| | |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5810864 atacaccctttacacccatacaaaattttgacatgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttatcaaaatat 5810963  T
Q  101 ctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 161  Q
    | |||||| ||| ||| || |||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  5810964 ccctaatatatagggtgtacaatggggtgtaggaataaagggtggtcatgtaacattttcc 5811024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Original strand, 43343564 - 43343727
Alignment:
Q  1 atacaccttttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43343564 atacaccttttacatccacacaaatttctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttatcaaaatat 43343663  T
Q  101 ctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcctta 164  Q
    | |||||||||  ||| || |||  ||||||  |||||| | ||||||||||||||||| ||||    
T  43343664 ccctaatacatggggtgtacaatagggtgtagaaataaatgatgttcatgtaacatttttctta 43343727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Original strand, 44416874 - 44417032
Alignment:
Q  1 atacaccttttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44416874 atacaccttttacatccacacaaatttctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttatcaaaatat 44416973  T
Q  101 ctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacatttt 159  Q
    | |||||||||  ||| || |||  ||||||  |||||| | |||||||||||||||||    
T  44416974 ccctaatacatggggtgtacaatagggtgtagaaataaatgatgttcatgtaacatttt 44417032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 45326180 - 45326020
Alignment:
Q  1 atacaccttttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 100  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||| | |||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  45326180 atacaccatttacacccacataaaattctgacaggtggtagtctggaccccacataaatagaagataaagtgtgattgtgagatgaacttaccaaaatat 45326081  T
Q  101 ctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 161  Q
    | |||||| ||  ||| || |||| | ||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  45326080 ccctaatatatggggtgtacaatgtgatgtatgaataaaaggtgtttatgtaacactttcc 45326020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 9 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 10573901 - 10573751
Alignment:
Q  9 tttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctctaata 108  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||    
T  10573901 tttacacccacataaaattctgatatgtggcaatcttgaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaatttaccaaaatattcctaata 10573802  T
Q  109 catatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacatttt 159  Q
    |||  ||| || |||  | |||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  10573801 catggggtgtacaataggatgtatgaataaagggtgtttatgtaacatttt 10573751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 9216461 - 9216301
Alignment:
Q  1 atacaccttttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| | | |||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9216461 atacaccttttacatccacacaaaattctgacatgcggcaacttaaaccccacacaaatagaagataaaatgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 9216362  T
Q  101 ctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcct 162  Q
    ||||||| |||  ||| || |||  | | || ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9216361 ctctaatgcat-gggtgtacaataggatataggaataaagggtgttcatgtaacattttcct 9216301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Original strand, 4638139 - 4638297
Alignment:
Q  1 atacaccttttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 100  Q
    ||||||| |||||| ||| |||| ||||||| |||||| |||||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4638139 atacaccctttacatccatacaagattctgacacgtggtaacctagaccccacacaaatagaagataaagtatggttgtgagatgaacttaccaaaatat 4638238  T
Q  101 ctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacatttt 159  Q
    |  ||||| ||  ||| || |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4638239 ccataatatatggggtgtacaattgagtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacatttt 4638297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Original strand, 5194180 - 5194337
Alignment:
Q  10 ttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctctaatac 109  Q
    |||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||  |||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||  ||| ||    
T  5194180 ttacacccacacaaaattttgacatgtggcaatctagaccccacacaaatagaagagtaagtgtgattgtgagatgaatttatcaaaatatccttaaaac 5194279  T
Q  110 atatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttccttaaaa 167  Q
    ||| ||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  5194280 atagggtgtacaatgaggtgtatgaataaatggtgttcatgtaacattttcctaaaaa 5194337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 43317603 - 43317442
Alignment:
Q  1 atacaccttttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 100  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||  |||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  43317603 atacaccccttacacccacacaaaattctgacatgtggcaatctagaccccacacaaatagaagagtaagtgtgattgtgagatgaatttatcaaaatat 43317504  T
Q  101 ctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcct 162  Q
    | ||||  |||| | | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43317503 ccctaaagcataggatgtacaatgaggtgtatgaataaatggtgttcatgtaacattttcct 43317442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 9 - 112
Target Start/End: Original strand, 27393208 - 27393311
Alignment:
Q  9 tttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctctaata 108  Q
    |||||||||||| |||||||||| | | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  27393208 tttacacccacataaaattctgacatgaggcaacctggaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttacaaaaatatccctaata 27393307  T
Q  109 cata 112  Q
    ||||    
T  27393308 cata 27393311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 111
Target Start/End: Original strand, 38160519 - 38160629
Alignment:
Q  1 atacaccttttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 100  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||    
T  38160519 atacaccccttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacttggaccccacataaatagaagataaagtgtagttgtgagatgaagttactaaaatat 38160618  T
Q  101 ctctaatacat 111  Q
    | |||||||||    
T  38160619 ccctaatacat 38160629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Original strand, 24280536 - 24280707
Alignment:
Q  1 atacaccttttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 100  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||  ||||||| || |||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  24280536 atacacctcttacactcgcacaaaattctgatatatggcaacttggaccccacacaaatagaagagaaagtgtgattgtgagatgaatttaccaaaatat 24280635  T
Q  101 ctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcct-taaaaatag 171  Q
     |||| | |||  | | || |||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  24280636 ttctagtgcatgggatgtagaatagggtgtatgaataaagggtgttcacgtaacattttcctataaaaatag 24280707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 62 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 31513386 - 31513287
Alignment:
Q  62 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 161  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  |||| |||  |||||| |||  ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  31513386 aagagaaagtatggttgtgagatgaatttaccaaaatatccttaatgcatggggtatacaatagggtgtatgattaaagagtgttcatgtaacattttcc 31513287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Original strand, 47279664 - 47279744
Alignment:
Q  1 atacaccttttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtga 81  Q
    ||||||| |||| ||||||| |||||||||||| |||| || ||| | || | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47279664 atacaccctttatacccacataaaattctgatatgtggtaatctggatcctatataaatagaagataaagtgtggttgtga 47279744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 73 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 40237007 - 40236917
Alignment:
Q  73 tggttgtgagatgaacttaccaaaatatctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcctt 163  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| || ||||| |||  ||| || |||  | ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  40237007 tggttgtgagatgaaattaccaaaatgtccctaatgcatggggtgtacaataggatgtatgattaaagggtgttcatgtaacattttcctt 40236917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 62 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 33384970 - 33384868
Alignment:
Q  62 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctctaatacatatggtatataat-gaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttc 160  Q
    |||| ||||| || |||||||||||| |||||||||| || ||||| |||   ||||| ||| | ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||    
T  33384970 aagagaaagtatgtttgtgagatgaatttaccaaaatgtccctaatgcatggagtatacaataggggtgtatgattaaatgatgttcatgtaacattttc 33384871  T
Q  161 ctt 163  Q
    |||    
T  33384870 ctt 33384868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 62 - 163
Target Start/End: Original strand, 27535232 - 27535333
Alignment:
Q  62 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 161  Q
    |||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||   || || |||   |||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  27535232 aagagaaagtatagttgtgagatgaaattaccaaaatgtctttaacacatggagtgtacaatagagtgtatgattaaagggtgttcatgtaacattttcc 27535331  T
Q  162 tt 163  Q
    ||    
T  27535332 tt 27535333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 129 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 1773698 - 1773668
Alignment:
Q  129 gtatgaataaaaggtgttcatgtaacatttt 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1773698 gtatgaataaaaggtgttcatgtaacatttt 1773668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 106; Significance: 6e-53; HSPs: 30)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 30838792 - 30838631
Alignment:
Q  1 atacaccttttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30838792 atacaccttttacacctacacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 30838693  T
Q  101 ctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcct 162  Q
    | |||||||||  ||| || ||| || ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30838692 ccctaatacatggggtgtacaataagatgtagaaataaagggtgttcatgtaacattttcct 30838631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 3 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 1750572 - 1750414
Alignment:
Q  3 acaccttttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatct 102  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  1750572 acaccctttacactcacacaaaattctgacacgtggcaatctggaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttacaaaaatatcc 1750473  T
Q  103 ctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 161  Q
    |||||||||| ||| || |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1750472 ctaatacatagggtgtacaatggggtgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 1750414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 5 - 164
Target Start/End: Original strand, 43335707 - 43335866
Alignment:
Q  5 accttttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctct 104  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  43335707 accttttacatccacacaaaattctgacacgtggcaacctggatcccacataaatagaagataaagtgtagttgtgagatgaacttaccaaaatatccct 43335806  T
Q  105 aatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcctta 164  Q
    |||||||  | | || ||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  43335807 aatacatgggatgtacaatgaggtgtaggaataaatgatgttcatataacattttcctta 43335866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 4764666 - 4764828
Alignment:
Q  1 atacaccttttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4764666 atacaccttttacatccacacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaatttaccaaaatat 4764765  T
Q  101 ctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcctt 163  Q
     | ||||||||  ||| || |||  |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  4764766 ttataatacatggggtgtacaatagggtgtaggaataaatggtgttgatgtaacattttcctt 4764828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 9 - 163
Target Start/End: Original strand, 12302201 - 12302355
Alignment:
Q  9 tttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctctaata 108  Q
    |||||| |||||||||||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  12302201 tttacatccacacaaaattctgacacatggtaacctggaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttacaaaaatatccctaata 12302300  T
Q  109 catatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcctt 163  Q
    |||| ||| || |||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12302301 catagggtgtacaatggggtgtagaaataaagggtgttcatgtaacattttcctt 12302355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Original strand, 43490341 - 43490499
Alignment:
Q  1 atacaccttttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 100  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43490341 atacaccctttacacccatacaaaattctgacacgtggcaatctggaccccacataaatagaagataaagtgtggttatgagatgaacttaccaaaatat 43490440  T
Q  101 ctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacatttt 159  Q
    | ||||||||||  || || |||| | |||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  43490441 ccctaatacatagagtgtacaatgggatgtaggaataaagggtgttcatgtaacatttt 43490499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 16096908 - 16096747
Alignment:
Q  1 atacaccttttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacct-gaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaata 99  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  16096908 atacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacttagacccccacataagtagaagataaagtgtggttgtgagattaactcaccaaaata 16096809  T
Q  100 tctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 161  Q
    || |||||||||  ||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16096808 tccctaatacatggggtgtataatggggtgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 16096747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 19047317 - 19047158
Alignment:
Q  1 atacaccttttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 100  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19047317 atacaccctttacacccatacaaaattttgacacgtggcaatctggaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 19047218  T
Q  101 ctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttc 160  Q
    | |||||||||| ||| || ||||   |||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19047217 ccctaatacatagggtgtacaatggaatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttc 19047158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 161
Target Start/End: Original strand, 13780676 - 13780835
Alignment:
Q  2 tacaccttttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 101  Q
    |||||| |||||||| | |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  13780676 tacaccctttacacctatacaaaattctgacatgtggcaacctggaccccacataaatagaagagaaagtgtggttgtgagatgaatttatcaaaatatc 13780775  T
Q  102 tctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 161  Q
     |||||  ||  ||| || |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  13780776 cctaatgtatggggtgtacaatgaggtgtgtgaataaaatgtgttgatgtaacattttcc 13780835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 111
Target Start/End: Original strand, 42849799 - 42849908
Alignment:
Q  1 atacaccttttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42849799 atacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaa-ataaagtgtggttgtgagatgaacttatcaaaatat 42849897  T
Q  101 ctctaatacat 111  Q
    | |||||||||    
T  42849898 ccctaatacat 42849908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 160
Target Start/End: Original strand, 34817725 - 34817875
Alignment:
Q  10 ttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctctaatac 109  Q
    ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| | |||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |   || | |    
T  34817725 ttacacccatacaaaattctgacatgtggcaacctggatcccgtacaaatagaagagaaagtgtggttgtgagatgaatttaccaaaatgtgcgtagtgc 34817824  T
Q  110 atatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttc 160  Q
    ||  ||| || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34817825 atggggtgtacaatgaggtgtgtgaataaagggtgttcatgtaacattttc 34817875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Original strand, 39149233 - 39149343
Alignment:
Q  1 atacaccttttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||  | |  |||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  39149233 atacaccttttacacccacacaaaattatgagacgtggtaa-tttagacccacacaaataaaagataaagtgtagttgtgggatgaacttaccaaaatat 39149331  T
Q  101 ctctaatacata 112  Q
    ||||||||||||    
T  39149332 ctctaatacata 39149343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 20 - 159
Target Start/End: Original strand, 8896542 - 8896681
Alignment:
Q  20 acaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctctaatacatatggtata 119  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||| |  ||| ||| ||    
T  8896542 acaaaattctgacatgtggcaacctgaacctcacacaaatagaaaagaaagtgtgattgtgagatgaatttaccaaaatattcctattgtatagggtgta 8896641  T
Q  120 taatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacatttt 159  Q
     ||||   ||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  8896642 caatggaatgtgtgaataaagggtgttcatgtaacatttt 8896681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 42026929 - 42026823
Alignment:
Q  1 atacaccttttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 100  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| |  | |||||||  |||||||| |||||||| | ||||||| ||||||||||||| || |||||||||    
T  42026929 atacaccccttacacccacacaaaattctgacatcttgcaacctagaccccacacaaatagaaaagaaagtgtagttgtgagatgaatttgccaaaatat 42026830  T
Q  101 ctctaat 107  Q
    | |||||    
T  42026829 ccctaat 42026823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 62 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 43114656 - 43114550
Alignment:
Q  62 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 161  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| || ||||| |||  ||| || |||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  43114656 aagagaaagtatggttgtgagatgaaattaccaaaatgtccctaatgcatggggtgtacaatagggtgtatgattaaagggtgttcatgtaacattttcc 43114557  T
Q  162 ttaaaaa 168  Q
    || ||||    
T  43114556 tttaaaa 43114550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 67 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 33229396 - 33229303
Alignment:
Q  67 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaa-ggtgttcatgtaacatttt 159  Q
    |||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||  ||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||    
T  33229396 aaagtgtgattgtatgatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgaggtgtaggaataaaagggtgttcatgtatcatttt 33229303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 62 - 161
Target Start/End: Original strand, 12415461 - 12415560
Alignment:
Q  62 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 161  Q
    |||| ||||| |||||||||||| || |||||||||| || ||||| |||  ||| || ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  12415461 aagagaaagtatggttgtgagataaaattaccaaaatgtccctaatgcatggggtgtacaataaggtgtatgattaaagggtgttcatgtaacattttcc 12415560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 62 - 161
Target Start/End: Original strand, 12427521 - 12427620
Alignment:
Q  62 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 161  Q
    |||| ||||| |||||||||||| || |||||||||| || ||||| |||  ||| || ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  12427521 aagagaaagtatggttgtgagataaaattaccaaaatgtccctaatgcatggggtgtacaataaggtgtatgattaaagggtgttcatgtaacattttcc 12427620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 62 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 16804067 - 16803964
Alignment:
Q  62 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 161  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||| || ||||| |||  | | || |||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  16804067 aagagaaagtatggttgtgagatgaaattatcaaaatgtccctaatgcatgggatgtacaatagggtgtatgattaaagggtgttcatgtaacattttcc 16803968  T
Q  162 ttaa 165  Q
    ||||    
T  16803967 ttaa 16803964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 62 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 16843349 - 16843246
Alignment:
Q  62 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 161  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||| || ||||| |||  | | || |||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  16843349 aagagaaagtatggttgtgagatgaaattatcaaaatgtccctaatgcatgggatgtacaatagggtgtatgattaaagggtgttcatgtaacattttcc 16843250  T
Q  162 ttaa 165  Q
    ||||    
T  16843249 ttaa 16843246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 159
Target Start/End: Original strand, 11825655 - 11825752
Alignment:
Q  62 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacatttt 159  Q
    |||| ||||| || |||||||||||| |||||||||| || ||||| |||  ||| || |||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  11825655 aagagaaagtatgattgtgagatgaaattaccaaaatgtccctaatgcatggggtgtacaatagggtgtatgattaaagggtgttcatgtaacatttt 11825752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 159
Target Start/End: Original strand, 41281975 - 41282072
Alignment:
Q  62 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacatttt 159  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||| || ||||| |||  ||| || |||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  41281975 aagagaaagtatggttgtgagatgaaattatcaaaatgtccctaatgcatggggtgtacaatagggtgtatgattaaagggtgttcatgtaacatttt 41282072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 62 - 134
Target Start/End: Original strand, 4451951 - 4452023
Alignment:
Q  62 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctctaatacatatggtatataatgaggtgtatga 134  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| || |||||||    
T  4451951 aagagaaagtatggttgtgagatgaatttaccaaaatatccctaatgcatatggtgtacaataagatgtatga 4452023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 18491798 - 18491704
Alignment:
Q  68 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcct 162  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||| |   |||| |||  ||| || |||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  18491798 aagtatggttgtgagatgaatttaccaaaatgttcttaatgcatgaggtgtacaatagggtgtatgattaaagggtgttcatgtaacattttcct 18491704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 79 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 14285758 - 14285669
Alignment:
Q  79 tgagatgaacttaccaaaatatctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttccttaaaaa 168  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||| || |||  ||||||||| |||| ||||||  ||||| |||||||| |||||    
T  14285758 tgagatgaatttaccaaaatatctttaatatatagggtgtacaatagggtgtatgattaaagggtgtttgtgtaatattttcctaaaaaa 14285669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 62 - 163
Target Start/End: Original strand, 34895742 - 34895843
Alignment:
Q  62 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 161  Q
    |||||||||| || |||||||||||| ||||||| || || ||||| |||  ||| || |||  ||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||||    
T  34895742 aagataaagtatgattgtgagatgaatttaccaatatgtccctaatgcatggggtgtacaatagggtgtgtgattaaatggtgttcatgtaacactttcc 34895841  T
Q  162 tt 163  Q
    ||    
T  34895842 tt 34895843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 126 - 165
Target Start/End: Original strand, 966899 - 966938
Alignment:
Q  126 ggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttccttaa 165  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  966899 ggtgtatgattaaagggtgttcatgtaacattttccttaa 966938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Original strand, 6518434 - 6518474
Alignment:
Q  1 atacaccttttacacccacacaaaattctgatacgtggcaa 41  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  6518434 atacaccttttacacccacacaaaatcctgacatgtggcaa 6518474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Complemental strand, 16804128 - 16804088
Alignment:
Q  1 atacaccttttacacccacacaaaattctgatacgtggcaa 41  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  16804128 atacacctcttacacccacacaaaattctgacatgtggcaa 16804088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Complemental strand, 16843410 - 16843370
Alignment:
Q  1 atacaccttttacacccacacaaaattctgatacgtggcaa 41  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  16843410 atacacctcttacacccacacaaaattctgacatgtggcaa 16843370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 96; Significance: 5e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 112815 - 112656
Alignment:
Q  1 atacaccttttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 100  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  112815 atacaccctttacacccatacaaaattttgacacgtggcaatctggaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 112716  T
Q  101 ctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttc 160  Q
    | |||||||||| ||| || ||||   |||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  112715 ccctaatacatagggtgtacaatggaatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttc 112656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0187 (Bit Score: 94; Significance: 8e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0187
Description:

Target: scaffold0187; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Original strand, 14129 - 14289
Alignment:
Q  1 atacaccttttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 100  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14129 atacaccctttacatccacacaaaattctgacacgtggcaacctggaccc-acacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttacaaaaatat 14227  T
Q  101 ctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcct 162  Q
    | |||||||||| | | || |||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14228 ccctaatacataggatgtacaatggggtgtagaaataaagggtgttcatgtaacattttcct 14289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0187; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Original strand, 24457 - 24617
Alignment:
Q  1 atacaccttttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 100  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24457 atacaccctttacatccacacaaaattctgacacgtggcaacctggaccc-acacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttacaaaaatat 24555  T
Q  101 ctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcct 162  Q
    | |||||||||| | | || |||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24556 ccctaatacataggatgtacaatggggtgtagaaataaagggtgttcatgtaacattttcct 24617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0385 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0385
Description:

Target: scaffold0385; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 11403 - 11248
Alignment:
Q  9 tttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctctaata 108  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11403 tttacacctacacaaaattctgacacgtagcaacttggaccccacatcaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaata 11304  T
Q  109 catatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcctta 164  Q
     ||  ||| || |||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  11303 tatggggtgtacaatggggtgtatgaataaagtgtgttcatgtgacattttcctta 11248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Original strand, 23361 - 23521
Alignment:
Q  1 atacaccttttacacccacacaaaattctgatacgtggcaacctgaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  23361 atacacgttttacacccacacaaaattctaacacgtggcaaattgaacctcacacaaatagaagataaagtgtgattgtaagatgaacttaccaaaatat 23460  T
Q  101 ctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 161  Q
    |||||||||||  | | || ||||  ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  23461 ctctaatacatgggatgtacaatggagtgtaggaataaagggtgttcatataacattttcc 23521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 62 - 159
Target Start/End: Original strand, 45720 - 45817
Alignment:
Q  62 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacatttt 159  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| | | || |||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  45720 aagagaaagtatggttgtgagatgaatttaccaaaatatccttaatacataggatgtacaatagggtgtatgattaaagggtgttcatgtaacatttt 45817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 161
Target Start/End: Original strand, 35457 - 35556
Alignment:
Q  62 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctctaatacatatggtatataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 161  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| || || ||||| |||  ||| || |||  ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||    
T  35457 aagagaaagtatggttgtgagatgaatttaccaatatgtccctaatgcatggggtgtacaatatggtgtatgattaaatggtgtttatgtaacattttcc 35556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University