View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF15948_low_9 (Length: 316)

Name: NF15948_low_9
Description: NF15948
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF15948_low_9
NF15948_low_9
[»] scaffold0234 (2 HSPs)
scaffold0234 (1-303)||(2041-2343)
scaffold0234 (1-303)||(10932-11234)
[»] chr6 (41 HSPs)
chr6 (1-303)||(17684189-17684491)
chr6 (1-303)||(27380972-27381274)
chr6 (1-303)||(27471355-27471657)
chr6 (1-303)||(17691160-17691462)
chr6 (1-303)||(11651908-11652210)
chr6 (1-303)||(29309075-29309377)
chr6 (1-303)||(29316035-29316336)
chr6 (1-303)||(188697-188999)
chr6 (64-303)||(27296877-27297116)
chr6 (30-303)||(16394165-16394438)
chr6 (62-299)||(25536915-25537152)
chr6 (81-302)||(16559193-16559414)
chr6 (15-286)||(13359010-13359277)
chr6 (3-303)||(27508347-27508642)
chr6 (1-303)||(16789076-16789373)
chr6 (1-303)||(22859888-22860185)
chr6 (1-303)||(1586108-1586405)
chr6 (3-289)||(27527947-27528228)
chr6 (17-293)||(2669494-2669768)
chr6 (1-86)||(16566257-16566342)
chr6 (64-281)||(10359073-10359285)
chr6 (1-303)||(14074485-14074782)
chr6 (1-259)||(18019885-18020138)
chr6 (64-303)||(8612982-8613221)
chr6 (1-169)||(27925939-27926103)
chr6 (15-225)||(28172755-28172963)
chr6 (66-218)||(20736413-20736562)
chr6 (1-200)||(17850321-17850517)
chr6 (49-234)||(8510155-8510338)
chr6 (64-303)||(17120505-17120740)
chr6 (64-206)||(21994655-21994794)
chr6 (3-120)||(20553492-20553607)
chr6 (190-303)||(33317055-33317167)
chr6 (71-218)||(5758565-5758709)
chr6 (17-131)||(19347092-19347205)
chr6 (64-175)||(22560311-22560419)
chr6 (147-286)||(28756145-28756283)
chr6 (1-206)||(19218434-19218630)
chr6 (73-206)||(4073652-4073781)
chr6 (1-91)||(13995151-13995240)
chr6 (1-34)||(25537148-25537181)
[»] chr5 (35 HSPs)
chr5 (1-303)||(24695186-24695488)
chr5 (1-303)||(19714218-19714520)
chr5 (1-303)||(18569581-18569885)
chr5 (1-303)||(19706939-19707240)
chr5 (24-303)||(17298621-17298898)
chr5 (1-181)||(39538773-39538953)
chr5 (15-303)||(17285470-17285756)
chr5 (129-307)||(27347252-27347428)
chr5 (1-216)||(18806843-18807056)
chr5 (196-303)||(24701950-24702057)
chr5 (1-303)||(20941032-20941329)
chr5 (1-303)||(25805385-25805682)
chr5 (64-303)||(22941317-22941552)
chr5 (1-303)||(31904-32201)
chr5 (1-303)||(12789663-12789960)
chr5 (1-303)||(23545927-23546224)
chr5 (1-170)||(22546872-22547038)
chr5 (1-303)||(24933306-24933603)
chr5 (1-291)||(20100255-20100540)
chr5 (1-303)||(31096821-31097118)
chr5 (1-303)||(12764990-12765291)
chr5 (1-303)||(5097656-5097953)
chr5 (64-303)||(7865430-7865669)
chr5 (78-216)||(18806483-18806619)
chr5 (78-216)||(18806663-18806799)
chr5 (71-303)||(9811733-9811965)
chr5 (71-303)||(12703874-12704106)
chr5 (54-303)||(18829281-18829530)
chr5 (64-307)||(26129689-26129928)
chr5 (218-307)||(28719471-28719558)
chr5 (64-303)||(26245169-26245404)
chr5 (18-76)||(27347425-27347483)
chr5 (222-303)||(39538954-39539035)
chr5 (1-128)||(33477193-33477319)
chr5 (74-170)||(31651917-31652009)
[»] chr4 (52 HSPs)
chr4 (1-303)||(18262397-18262699)
chr4 (1-303)||(18269258-18269560)
chr4 (1-303)||(55612868-55613170)
chr4 (1-303)||(26963825-26964127)
chr4 (1-303)||(26970648-26970950)
chr4 (1-303)||(868782-869084)
chr4 (1-303)||(19926480-19926782)
chr4 (1-303)||(5707505-5707807)
chr4 (1-303)||(5714133-5714435)
chr4 (1-303)||(8858352-8858654)
chr4 (1-303)||(10621053-10621355)
chr4 (1-303)||(10628132-10628434)
chr4 (1-303)||(28392854-28393156)
chr4 (1-303)||(8845388-8845690)
chr4 (1-303)||(4426336-4426626)
chr4 (26-303)||(5667849-5668124)
chr4 (1-303)||(35223745-35224047)
chr4 (71-303)||(10677303-10677534)
chr4 (71-303)||(10890943-10891174)
chr4 (17-307)||(20311493-20311781)
chr4 (1-303)||(15461502-15461799)
chr4 (1-303)||(34975556-34975853)
chr4 (1-303)||(2677018-2677315)
chr4 (1-303)||(15815026-15815323)
chr4 (1-303)||(18111043-18111340)
chr4 (1-303)||(3369023-3369320)
chr4 (1-303)||(17299959-17300256)
chr4 (1-303)||(18163167-18163464)
chr4 (1-303)||(20243942-20244239)
chr4 (1-303)||(26531618-26531915)
chr4 (52-202)||(21453961-21454110)
chr4 (1-303)||(4675983-4676280)
chr4 (64-287)||(19365586-19365806)
chr4 (64-303)||(1941791-1942026)
chr4 (1-303)||(5870423-5870720)
chr4 (17-303)||(32646523-32646807)
chr4 (1-128)||(56516241-56516368)
chr4 (64-286)||(19362477-19362695)
chr4 (71-287)||(5616469-5616681)
chr4 (71-303)||(9487625-9487853)
chr4 (83-303)||(30040489-30040705)
chr4 (64-287)||(5528495-5528714)
chr4 (65-201)||(32636552-32636685)
chr4 (71-287)||(9538033-9538244)
chr4 (64-218)||(4546147-4546298)
chr4 (86-303)||(11421096-11421309)
chr4 (1-78)||(24700214-24700291)
chr4 (52-206)||(33888594-33888743)
chr4 (43-170)||(34777850-34777975)
chr4 (175-225)||(24701361-24701411)
chr4 (194-275)||(9937745-9937826)
chr4 (73-164)||(9937830-9937923)
[»] chr3 (45 HSPs)
chr3 (1-303)||(6110249-6110551)
chr3 (1-303)||(16482203-16482505)
chr3 (2-303)||(8490681-8490982)
chr3 (1-303)||(10579075-10579377)
chr3 (1-303)||(15600604-15600906)
chr3 (1-303)||(15607149-15607451)
chr3 (1-303)||(10572312-10572614)
chr3 (1-303)||(15357306-15357608)
chr3 (1-303)||(18520160-18520462)
chr3 (1-299)||(18522848-18523146)
chr3 (1-303)||(15341939-15342241)
chr3 (1-303)||(17780838-17781140)
chr3 (1-303)||(13211487-13211789)
chr3 (1-303)||(13248792-13249094)
chr3 (1-303)||(32056619-32056922)
chr3 (1-307)||(17199900-17200206)
chr3 (1-303)||(13516996-13517294)
chr3 (1-303)||(1647241-1647543)
chr3 (1-303)||(17136544-17136840)
chr3 (18-303)||(29925173-29925458)
chr3 (18-303)||(29974326-29974611)
chr3 (15-303)||(16200629-16200917)
chr3 (1-303)||(21034243-21034540)
chr3 (1-303)||(15846536-15846833)
chr3 (1-303)||(20147554-20147851)
chr3 (52-303)||(21398847-21399094)
chr3 (1-303)||(14890396-14890693)
chr3 (1-303)||(55427026-55427323)
chr3 (65-303)||(12299978-12300212)
chr3 (64-303)||(25978728-25978963)
chr3 (1-285)||(24253130-24253410)
chr3 (71-269)||(15526827-15527021)
chr3 (1-205)||(14147026-14147226)
chr3 (64-303)||(11787654-11787889)
chr3 (64-303)||(15317176-15317408)
chr3 (118-303)||(28088227-28088408)
chr3 (37-229)||(32280313-32280507)
chr3 (35-164)||(28953965-28954093)
chr3 (150-265)||(30464147-30464261)
chr3 (15-107)||(8251933-8252025)
chr3 (1-81)||(9504468-9504548)
chr3 (15-55)||(16200323-16200363)
chr3 (142-206)||(36138033-36138097)
chr3 (1-34)||(19089734-19089767)
chr3 (142-206)||(36142816-36142880)
[»] chr1 (37 HSPs)
chr1 (1-303)||(18252215-18252517)
chr1 (1-303)||(18532234-18532536)
chr1 (1-303)||(27131130-27131431)
chr1 (1-303)||(27310297-27310599)
chr1 (1-303)||(16358755-16359057)
chr1 (1-303)||(3855639-3855941)
chr1 (1-303)||(36816354-36816655)
chr1 (22-303)||(22641594-22641871)
chr1 (1-303)||(27277278-27277579)
chr1 (1-175)||(21171081-21171255)
chr1 (1-303)||(19706439-19706736)
chr1 (1-303)||(43802365-43802662)
chr1 (15-303)||(23507099-23507385)
chr1 (2-303)||(28134723-28135019)
chr1 (111-303)||(9916497-9916688)
chr1 (1-303)||(9456121-9456418)
chr1 (1-303)||(20391239-20391536)
chr1 (1-303)||(20779645-20779942)
chr1 (1-303)||(22670257-22670554)
chr1 (1-303)||(42816989-42817286)
chr1 (2-225)||(12014084-12014305)
chr1 (15-136)||(22657108-22657229)
chr1 (52-303)||(22612547-22612794)
chr1 (64-283)||(634001-634216)
chr1 (71-303)||(8727741-8727969)
chr1 (17-105)||(9917837-9917924)
chr1 (1-303)||(47667485-47667771)
chr1 (64-287)||(29096789-29097008)
chr1 (71-203)||(21881475-21881604)
chr1 (15-236)||(12006332-12006547)
chr1 (190-303)||(28145723-28145835)
chr1 (64-128)||(35930649-35930713)
chr1 (71-206)||(51997353-51997485)
chr1 (51-216)||(24301691-24301855)
chr1 (4-130)||(26923553-26923678)
chr1 (142-201)||(10852402-10852461)
chr1 (85-164)||(31236402-31236478)
[»] chr8 (42 HSPs)
chr8 (1-302)||(21940850-21941151)
chr8 (1-303)||(22171672-22171974)
chr8 (17-303)||(6094324-6094610)
chr8 (1-303)||(24642834-24643135)
chr8 (40-303)||(15326422-15326685)
chr8 (40-303)||(15506791-15507054)
chr8 (162-303)||(28548393-28548534)
chr8 (1-236)||(14983710-14983942)
chr8 (1-303)||(21969338-21969635)
chr8 (52-188)||(24797224-24797359)
chr8 (1-303)||(8371253-8371550)
chr8 (1-303)||(12562128-12562425)
chr8 (1-303)||(27007517-27007814)
chr8 (1-303)||(27014660-27014957)
chr8 (1-303)||(27880487-27880784)
chr8 (1-303)||(28020668-28020965)
chr8 (52-303)||(25611250-25611497)
chr8 (1-287)||(38232115-38232399)
chr8 (1-303)||(22130609-22130906)
chr8 (64-303)||(22659494-22659729)
chr8 (1-303)||(21916681-21916978)
chr8 (1-303)||(45534273-45534570)
chr8 (64-303)||(26240551-26240786)
chr8 (64-303)||(6430953-6431188)
chr8 (72-218)||(8781959-8782102)
chr8 (1-206)||(18835355-18835556)
chr8 (19-194)||(2375214-2375386)
chr8 (64-303)||(2962932-2963171)
chr8 (196-293)||(24796731-24796826)
chr8 (100-287)||(20535226-20535409)
chr8 (27-123)||(32872741-32872837)
chr8 (1-93)||(29645539-29645631)
chr8 (190-308)||(36970439-36970556)
chr8 (190-307)||(2375411-2375528)
chr8 (154-276)||(29645675-29645797)
chr8 (43-95)||(10920427-10920479)
chr8 (15-70)||(24535514-24535569)
chr8 (70-129)||(34659059-34659118)
chr8 (64-103)||(36970332-36970371)
chr8 (242-303)||(8968015-8968076)
chr8 (243-291)||(41368106-41368154)
chr8 (243-291)||(41375077-41375125)
[»] scaffold0433 (1 HSPs)
scaffold0433 (1-303)||(7292-7594)
[»] scaffold0390 (2 HSPs)
scaffold0390 (1-303)||(6654-6956)
scaffold0390 (1-303)||(13670-13972)
[»] scaffold0186 (1 HSPs)
scaffold0186 (1-307)||(25706-26012)
[»] chr7 (47 HSPs)
chr7 (1-299)||(15152628-15152926)
chr7 (1-303)||(29327969-29328271)
chr7 (1-303)||(11535782-11536084)
chr7 (1-303)||(11542700-11543002)
chr7 (1-303)||(12751011-12751313)
chr7 (1-303)||(12738721-12739023)
chr7 (1-303)||(18561192-18561485)
chr7 (18-303)||(13392352-13392637)
chr7 (17-309)||(18257559-18257848)
chr7 (1-303)||(2204557-2204854)
chr7 (1-303)||(8465004-8465301)
chr7 (1-303)||(18400109-18400406)
chr7 (1-303)||(18407093-18407390)
chr7 (1-303)||(48808496-48808793)
chr7 (63-303)||(2365169-2365407)
chr7 (1-303)||(15729756-15730053)
chr7 (1-303)||(18139338-18139635)
chr7 (1-303)||(19230893-19231190)
chr7 (1-291)||(30254143-30254428)
chr7 (64-303)||(41680968-41681203)
chr7 (11-301)||(10235357-10235644)
chr7 (1-303)||(10668901-10669199)
chr7 (64-291)||(47166871-47167094)
chr7 (1-281)||(24443349-24443624)
chr7 (71-303)||(34128647-34128875)
chr7 (64-303)||(28130628-28130863)
chr7 (64-303)||(18259124-18259359)
chr7 (75-281)||(25845498-25845700)
chr7 (75-281)||(25845917-25846119)
chr7 (64-265)||(19393462-19393659)
chr7 (71-218)||(19388626-19388774)
chr7 (71-303)||(14591924-14592153)
chr7 (71-303)||(16011515-16011744)
chr7 (78-217)||(31190524-31190660)
chr7 (1-119)||(7662569-7662686)
chr7 (71-203)||(22969024-22969153)
chr7 (155-292)||(39112138-39112275)
chr7 (1-105)||(47833875-47833979)
chr7 (115-303)||(15169290-15169474)
chr7 (14-74)||(7396390-7396450)
chr7 (1-96)||(19859127-19859221)
chr7 (154-229)||(22948499-22948574)
chr7 (15-129)||(3132873-3132986)
chr7 (1-37)||(15148327-15148363)
chr7 (30-85)||(29983179-29983234)
chr7 (61-103)||(7396469-7396511)
chr7 (149-213)||(29984308-29984372)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (1-303)||(18473-18774)
[»] chr2 (27 HSPs)
chr2 (1-303)||(21329968-21330270)
chr2 (1-303)||(18796691-18796993)
chr2 (1-309)||(18619989-18620296)
chr2 (1-303)||(36270351-36270650)
chr2 (32-303)||(20978091-20978360)
chr2 (1-289)||(6991847-6992136)
chr2 (15-291)||(18822282-18822556)
chr2 (17-303)||(22183206-22183489)
chr2 (1-303)||(30174382-30174679)
chr2 (1-303)||(24250032-24250329)
chr2 (1-303)||(24229215-24229512)
chr2 (64-291)||(15342014-15342237)
chr2 (71-305)||(29800545-29800775)
chr2 (1-126)||(18851956-18852081)
chr2 (19-128)||(19279491-19279600)
chr2 (140-303)||(17241034-17241196)
chr2 (71-218)||(19616509-19616653)
chr2 (2-105)||(36801899-36802003)
chr2 (71-205)||(40301034-40301164)
chr2 (73-278)||(41316305-41316506)
chr2 (71-206)||(21626824-21626955)
chr2 (156-236)||(36799745-36799826)
chr2 (236-303)||(41661694-41661761)
chr2 (142-218)||(28740910-28740986)
chr2 (1-105)||(28741220-28741323)
chr2 (67-130)||(28718943-28719006)
chr2 (64-105)||(24763751-24763792)
[»] scaffold0657 (1 HSPs)
scaffold0657 (1-284)||(1178-1461)
[»] scaffold0063 (1 HSPs)
scaffold0063 (1-307)||(5714-6013)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (47-303)||(230111-230367)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (1-303)||(188-485)
[»] scaffold0264 (1 HSPs)
scaffold0264 (1-303)||(3675-3972)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (1-303)||(119735-120032)
[»] scaffold0466 (1 HSPs)
scaffold0466 (64-291)||(12961-13184)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (64-303)||(67374-67609)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (1-265)||(130262-130521)
[»] scaffold0111 (1 HSPs)
scaffold0111 (64-303)||(26609-26844)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (1-303)||(39988-40285)
[»] scaffold0378 (1 HSPs)
scaffold0378 (1-206)||(8310-8511)
[»] scaffold0136 (1 HSPs)
scaffold0136 (73-275)||(8807-9005)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (113-303)||(102-288)
[»] scaffold0376 (1 HSPs)
scaffold0376 (71-303)||(11526-11758)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (4-119)||(90019-90135)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (71-206)||(83111-83243)
[»] scaffold0086 (1 HSPs)
scaffold0086 (64-303)||(53832-54066)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (35-126)||(45956-46051)
[»] scaffold0496 (1 HSPs)
scaffold0496 (83-179)||(11328-11421)


Alignment Details
Target: scaffold0234 (Bit Score: 299; Significance: 1e-168; HSPs: 2)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 2343 - 2041
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2343 tattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 2244  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2243 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 2144  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2143 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 2044  T
Q  301 atg 303  Q
    |||    
T  2043 atg 2041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #2
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 11234 - 10932
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11234 tattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 11135  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11134 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 11035  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11034 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 10935  T
Q  301 atg 303  Q
    |||    
T  10934 atg 10932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 299; Significance: 1e-168; HSPs: 41)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 17684491 - 17684189
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17684491 tattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 17684392  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17684391 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 17684292  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17684291 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 17684192  T
Q  301 atg 303  Q
    |||    
T  17684191 atg 17684189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 27381274 - 27380972
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27381274 tattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 27381175  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27381174 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 27381075  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27381074 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 27380975  T
Q  301 atg 303  Q
    |||    
T  27380974 atg 27380972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 27471657 - 27471355
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471657 tattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 27471558  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471557 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 27471458  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471457 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 27471358  T
Q  301 atg 303  Q
    |||    
T  27471357 atg 27471355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 295; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 17691462 - 17691160
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17691462 tattatgtaggtagactgatgatcacatctcacatatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 17691363  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17691362 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 17691263  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17691262 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 17691163  T
Q  301 atg 303  Q
    |||    
T  17691162 atg 17691160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 11651908 - 11652210
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11651908 tattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 11652007  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11652008 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcataatgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 11652107  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11652108 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 11652207  T
Q  301 atg 303  Q
    |||    
T  11652208 atg 11652210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 29309075 - 29309377
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29309075 tattatgtaggtagactgatgatcacatctcacatatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 29309174  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29309175 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 29309274  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29309275 actatgtaccctagatgttggagtcaggtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 29309374  T
Q  301 atg 303  Q
    |||    
T  29309375 atg 29309377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 29316035 - 29316336
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29316035 tattatgtaggtagactgatgatcacatctcacatatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 29316134  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29316135 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 29316234  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29316235 actatgtaccctagatgttggagtc-agtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 29316333  T
Q  301 atg 303  Q
    |||    
T  29316334 atg 29316336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 188999 - 188697
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  188999 tattatgtgggtagactgatgatcacatctcacatatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 188900  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  188899 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 188800  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  188799 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgttatcattcaaatattgtctgtaacagaatgactataaagttgattgatggatactccataaatc 188700  T
Q  301 atg 303  Q
    |||    
T  188699 atg 188697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 64 - 303
Target Start/End: Original strand, 27296877 - 27297116
Alignment:
Q  64 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 163  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27296877 acattgatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 27296976  T
Q  164 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27296977 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 27297076  T
Q  264 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27297077 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 27297116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 30 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 16394438 - 16394165
Alignment:
Q  30 tcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagt 129  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||    
T  16394438 tcacatatcatggataaacagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccatgagaatactacgtagt 16394339  T
Q  130 aaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16394338 aaaagttatgaaaagtgtcataagatattcttatagtgatagtggtgtattccaccctttgacttgaaaccactatgtaccctagatgttggaatcgagt 16394239  T
Q  230 gctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16394238 gctttgtcaccattcaaacgttgtctgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 16394165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 62 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 25537152 - 25536915
Alignment:
Q  62 tcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctc 161  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25537152 tcacatagatataaatattaggtgtcatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctc 25537053  T
Q  162 atagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaaca 261  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25537052 atagtgacagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatttaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaaca 25536953  T
Q  262 ggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaat 299  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25536952 ggatgattataaagttggttgatgggtactccatgaat 25536915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 81 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 16559414 - 16559193
Alignment:
Q  81 aggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtatt 180  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16559414 aggagtaatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtatt 16559315  T
Q  181 ccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggt 280  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16559314 ccacccttcgacctgaaaccgctatgtaccgtagatgttggagtcgagtgttttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggt 16559215  T
Q  281 tgatgggtactccatgaatcat 302  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  16559214 tgatgggtactccatgaatcat 16559193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 15 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 13359277 - 13359010
Alignment:
Q  15 actgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatg 114  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||   | |||||    
T  13359277 actgatgatcacatctcgcaaatcatggataaaaagttatcaaatcttcacttagatataagtattagaagtagtatttatattgaattgtctcaccatg 13359178  T
Q  115 agaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata-gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtacccta 213  Q
    |  ||||||||| | |||  ||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13359177 a--atactacattgaaaa--ttatgtaaa-tgtcataaattattctcatagtgataagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtacctta 13359083  T
Q  214 gatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 286  Q
    ||||| ||||||||||  |||||  || | ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13359082 gatgtaggagtcgagtattttgttgccgtacaaacatcgtccgtaacaggatgactataaagtcggttgatgg 13359010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 27508642 - 27508347
Alignment:
Q  3 ttatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggat 102  Q
    ||||||| ||| |||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27508642 ttatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttgtattggat 27508544  T
Q  103 tgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccac 202  Q
    ||| || |  |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||    
T  27508543 tgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccac 27508447  T
Q  203 tatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcat 302  Q
    ||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  |||||||||    
T  27508446 tatgatctctagatg-tggattcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataaaaataacgttggttgatgggtacttgatgaatcat 27508348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 16789076 - 16789373
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||| ||| |||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16789076 tattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 16789174  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||    
T  16789175 attgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaacc 16789271  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    ||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||   ||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  |||||||    
T  16789272 actatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatc 16789370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 22860185 - 22859888
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||| ||| |||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22860185 tattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 22860087  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||    
T  22860086 attgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaacc 22859990  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    ||||||  | ||||||| |||| || |||| |||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  |||||||    
T  22859989 actatgatctctagatg-tggactcaagtgttttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatc 22859891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 1586405 - 1586108
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||| ||| |||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1586405 tattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacatagatataaatattagaagtaatatttatattgg 1586307  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||    | ||| |||||||||||    
T  1586306 attgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattgctcttagacctgaaacc 1586210  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    ||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  1586209 actatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgatgaatc 1586111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 27528228 - 27527947
Alignment:
Q  3 ttatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggat 102  Q
    ||||||| ||| |||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27528228 ttatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttgtattggat 27528130  T
Q  103 tgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccac 202  Q
    ||| || |  |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||    
T  27528129 tgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccac 27528033  T
Q  203 tatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggta 289  Q
    ||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||    
T  27528032 tatgatctctagatg-tggattcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataaaaataacgttggttgatgggta 27527947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 17 - 293
Target Start/End: Original strand, 2669494 - 2669768
Alignment:
Q  17 tgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgag 116  Q
    ||||||||||||||||   ||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |  |||||     
T  2669494 tgatgatcacatctcatgaatcattgattaagagttatcatgtattcacatagatataaatattaggagtaatatttatatttgattgacacatcatgaa 2669593  T
Q  117 aatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtga-tagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 215  Q
    ||||||||||||  || ||| |   |||| ||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||  || ||||||||| || ||||||| |||||    
T  2669594 aatactacatag--aatgttgt-ttaagtatcataagttattctcatagtgacaagttgtgtattccactatttgacctgaaatcattatgtactctaga 2669690  T
Q  216 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactcc 293  Q
    ||| ||||||  || ||||||   | |||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  2669691 tgtaggagtccggtactttgttgtcgttcaaatgttatctataacaggatgactataaagtcagttgattggtactcc 2669768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 16566342 - 16566257
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 86  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16566342 tattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 16566257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 64 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 10359285 - 10359073
Alignment:
Q  64 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 163  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||| || || || ||| ||||||||||||||   ||||||||  |||||||||||||||||||     
T  10359285 acatagatataaatattataggtaatatttatactggatcgacccaccgtgaaaatactacatagtat--gttatgaa--gtgtcataagatattctcac 10359190  T
Q  164 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 263  Q
    | ||||| |||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||  ||||||||| |||| ||| ||||||| |   ||||||||| ||||||||||||||    
T  10359189 aatgataatggtgtataccactcttagacttgaaaccactatgatccctagatg-tggactcgtgtgctttattgtcattcaaacattgtccgtaacagg 10359091  T
Q  264 atgactataaagttggtt 281  Q
    || || || |||||||||    
T  10359090 ataaccattaagttggtt 10359073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 14074485 - 14074782
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||| ||| |||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  14074485 tattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattgggagtaatatttataatgg 14074583  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||| ||| | |||||   ||||||    | ||| |||||||||||    
T  14074584 attgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattttcacaatgataaaagtgtatattgctcttagacctgaaacc 14074680  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    ||||||  ||||||||| | || || ||||||||||  || ||| ||| ||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  14074681 actatgatccctagatg-tagactcaagtgctttgttgcctttctaacattgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatc 14074779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 18020138 - 18019885
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||| ||| |||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18020138 tattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 18020040  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||||| |    
T  18020039 attgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaatc 18019943  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaa 259  Q
    ||||||  | ||||||| | || || ||| ||||||  |||||| ||||||||| ||||    
T  18019942 actatgatctctagatg-tcgactcaagtactttgttgccattctaacgttgtctgtaa 18019885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 64 - 303
Target Start/End: Original strand, 8612982 - 8613221
Alignment:
Q  64 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatga---aaagtgtcataagatattct 160  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||  | |||||||    || ||||||||||||||||    
T  8612982 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggatagacccaccgtgagaatactacatagt--acgttatgagattaattgtcataagatattct 8613079  T
Q  161 catagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaac 260  Q
    || | ||||| | ||||||  | | ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || |||  |||||  || ||| ||||||||| ||||     
T  8613080 cacaatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtattttgtttcccttctaacgttgtctgtaaa 8613178  T
Q  261 aggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 303  Q
    ||||| || ||||  ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  8613179 aggataaccataacattggttgatgggtacttgatgaatcatg 8613221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Original strand, 27925939 - 27926103
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    |||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||     
T  27925939 tattatgtggataaactgatgatctcatctcacggatcatggataaagatttatgaagttttcacatagatattaa-attaggaataatatttatattga 27926037  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat 169  Q
    |||||  |||||||| ||||||||| ||  ||| ||||| ||| ||||||| | |||| ||||||||||    
T  27926038 attgactcgccatgataatactacacag--aaaattatgtaaa-tgtcataggttattatcatagtgat 27926103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 15 - 225
Target Start/End: Original strand, 28172755 - 28172963
Alignment:
Q  15 actgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatg 114  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||| || |||||    
T  28172755 actgatgatcacatcttacagatcattgttaaaaagttatcaagtctttacatagatataaatattaagggtagtgtttatattggattgaccctccatg 28172854  T
Q  115 agaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata-gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtacccta 213  Q
    |||||  ||||||   ||  |||||  ||   ||| | |  ||  | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  28172855 agaatgttacatat--aactttatgtgaaac-tcacacgtcatctttatagtgataagtggtgtattccacccttcgaccggaaaccagtatgtacccta 28172951  T
Q  214 gatgttggagtc 225  Q
    ||| | ||||||    
T  28172952 gatataggagtc 28172963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 66 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 20736562 - 20736413
Alignment:
Q  66 atagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatag 165  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||| |  | | |||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  20736562 ataggtataaatattaggagtaatatttatactggattgatccatcgtgagaatactacatatt--atgctatgaaaa-tgtcataagatattctcacag 20736466  T
Q  166 tgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgt 218  Q
    ||||| | ||||||  ||| ||| ||||| |||| ||||||  ||||||||||    
T  20736465 tgataatagtgtatatcactcttagacctaaaactactatgatccctagatgt 20736413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 17850517 - 17850321
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    |||||| | |||| ||||||||||| |||| | ||||||| || || ||||||||  || ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  17850517 tattatatgggtagactgatgatcatatcttatagatcattgacaacgagttatcgtgtattcacataggtataaatattatgagtaatatatatattgg 17850418  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||| || || | ||||||||||||  |     |||||  |||| ||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  17850417 attgaccctccttaagaatactacat--tgggttttatg-taagtatcataagttattcttatagtgatagtgatgtataccaccctttgacctgaaacc 17850321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 49 - 234
Target Start/End: Original strand, 8510155 - 8510338
Alignment:
Q  49 agttatcaagtcttcacatagatataaa-tattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgt 147  Q
    ||||||||  |||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| |||||| |  | |||| ||||||||||||  || |||||| || ||||    
T  8510155 agttatcatttcttcatatagataaaaaatattagaagtaatatttatatttgattgacctacaatgataatactacatag--aatgttatgtaa-gtgt 8510251  T
Q  148 cataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgcttt 234  Q
    ||| || || |||||||||||| |||||| ||| ||  ||||| |||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||    
T  8510252 cattagttactctcatagtgatggtggtgcattacatgcttcggcctggaaccactatgtaccttagatgtaggagtcgagtacttt 8510338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 64 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 17120740 - 17120505
Alignment:
Q  64 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 163  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||| || |  ||||||| ||| ||||||   |||||||||  ||||||||||||||||||     
T  17120740 acataggtataaatactaggagtagtatttatactggattgacccactgtgagaatgctaaatagtat--gttatgaaat-tgtcataagatattctcac 17120644  T
Q  164 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 263  Q
    | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||||||  ||||| |||| ||| || ||||||||||   ||||| ||||||||| || | |||    
T  17120643 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctatatgt-ggactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtcaaagg 17120545  T
Q  264 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 303  Q
    || || |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  17120544 ataaccataacgttggttgatgggtgcttgatgaatcatg 17120505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 64 - 206
Target Start/End: Original strand, 21994655 - 21994794
Alignment:
Q  64 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 163  Q
    |||||| |||||| |||| |||||||||||||| |||| ||| || |||||||||||||| |||||  | |||||||||| |||||||||||||| |||     
T  21994655 acatagctataaacattacgagtaatatttatactggaatgacccaccatgagaatactaaatagt--atgttatgaaaa-tgtcataagatattttcac 21994751  T
Q  164 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatg 206  Q
    | ||||| ||||||||  ||| ||| |||||||||| ||||||    
T  21994752 aatgataatggtgtatatcactcttagacctgaaacgactatg 21994794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 3 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 20553607 - 20553492
Alignment:
Q  3 ttatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggat 102  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||   ||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| |||    
T  20553607 ttatgttggtagactgatgatcacatctcacatatcatcgataaagaaatatcaaacattcacatagatat-aatattaagaataatatttatatt-gat 20553510  T
Q  103 tgatccgccatgagaata 120  Q
    ||| ||  ||||||||||    
T  20553509 tgacccatcatgagaata 20553492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 190 - 303
Target Start/End: Original strand, 33317055 - 33317167
Alignment:
Q  190 gacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggta 289  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| ||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||    
T  33317055 gacctgaaaccactatgatccctagatgt-ggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggta 33317153  T
Q  290 ctccatgaatcatg 303  Q
    ||  ||||||||||    
T  33317154 cttgatgaatcatg 33317167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 71 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 5758709 - 5758565
Alignment:
Q  71 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||  | |||||| | | || ||||||||||||||| | | |||    
T  5758709 tataaatattaggagtaatatttatactggatagatccactgtgagaatactacatagt--acgttatg-agattgccataagatattctcacaattata 5758613  T
Q  171 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgt 218  Q
     | ||||||  | | ||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  5758612 atagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatgt 5758565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 19347205 - 19347092
Alignment:
Q  17 tgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgag 116  Q
    |||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||| || ||||||||  |||||| ||||| | |||||||| || |||||||| | ||||| ||    
T  19347205 tgatgaccatatctcacatatcattgataaagagttgtcatgttttcacataagtataaacattagaa-taatatttgtaatggattgaactgccattag 19347107  T
Q  117 aatactacatagtaa 131  Q
    |||||||||||||||    
T  19347106 aatactacatagtaa 19347092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 22560419 - 22560311
Alignment:
Q  64 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 163  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||| || ||||| |  | ||||||| ||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||     
T  22560419 acataggtttaaatattaggagtaatatttatactgtattgacctactatgagaacactacatagt--atgttatgaaaa-tgtcataagatattctcac 22560323  T
Q  164 agtgatagtggt 175  Q
    | ||||| ||||    
T  22560322 aatgataatggt 22560311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 147 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 28756283 - 28756145
Alignment:
Q  147 tcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaa 246  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || | |||  || |||  |||||||||||||| |||||| || |||| ||||||  || |||| |||||| ||||    
T  28756283 tcataaaatattctcatagtgataatgatttatctcatcctatgacctgaaaccactgtgtaccatatatgtaggagtcatgtactttatcacca-tcaa 28756185  T
Q  247 acgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 286  Q
    | |||||  |||||| |||| ||||||||| |||||||||    
T  28756184 atgttgtatgtaacaagatgcctataaagtcggttgatgg 28756145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 19218434 - 19218630
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||| ||| |||||||| |||| ||||  | ||||| |||  ||| ||| ||||||  |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||     
T  19218434 tattatgtatgtagactgatgaccacacctcatgggtcatgaatat-gagatattaagtctatacatatgtataaatattaggagtaaaatttatattg- 19218531  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
        | || || ||||||||||||||||||   |||||||||| | |||||||||||||||| | ||||| || | ||| | || ||| |||||||||||    
T  19218532 ----acccaccgtgagaatactacatagtat--gttatgaaaatt-tcataagatattctcagaatgataatgatatatactactcttagacctgaaacc 19218624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 73 - 206
Target Start/End: Original strand, 4073652 - 4073781
Alignment:
Q  73 taaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagt 172  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| |||||| |  || |||||||||||||||  | | ||||||||||   |||||||||||||||||| |||||      
T  4073652 taaatattagaggtaatatttatatttgattgacctaccgtgagaatactacata--atatgttatgaaaa--ttcataagatattctcataatgataac 4073747  T
Q  173 ggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatg 206  Q
    | ||||| |||  ||| ||||| |||||||||||    
T  4073748 gatgtataccaatcttagacctaaaaccactatg 4073781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 13995240 - 13995151
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatat 91  Q
    ||||||||| ||| |||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13995240 tattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatat 13995151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 34
Target Start/End: Complemental strand, 25537181 - 25537148
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcaca 34  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25537181 tattatgtaggtagactgatgatcacatctcaca 25537148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 299; Significance: 1e-168; HSPs: 35)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 24695488 - 24695186
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24695488 tattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 24695389  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24695388 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 24695289  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24695288 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 24695189  T
Q  301 atg 303  Q
    |||    
T  24695188 atg 24695186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 19714520 - 19714218
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19714520 tattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 19714421  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19714420 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagttgtgtattccacccttcgacctgaaacc 19714321  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19714320 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaactttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactacatgaatc 19714221  T
Q  301 atg 303  Q
    |||    
T  19714220 atg 19714218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 18569885 - 18569581
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggata--aagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatatt 98  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18569885 tattatgttggtagactgatgatcacatctcacatatcatggatataaagagatatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatatt 18569786  T
Q  99 ggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaa 198  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18569785 ggattgacccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattatcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaa 18569686  T
Q  199 ccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaa 298  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  18569685 ccactatgtaccctacatgttggagtcgagtgctttatcaccattcaaatgttgtccgtaacaggatgactataaaattggttgatgggtacttcatgaa 18569586  T
Q  299 tcatg 303  Q
    |||||    
T  18569585 tcatg 18569581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 19707240 - 19706939
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19707240 tattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaaatcttcacatagatataaatactaggagtaatatttatattgg 19707141  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||      
T  19707140 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagattttctcatagtgataattgtgtattccacccttcgacctg-aata 19707042  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19707041 actatgtaccctagatattggagtcgagtgctctgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 19706942  T
Q  301 atg 303  Q
    |||    
T  19706941 atg 19706939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 24 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 17298898 - 17298621
Alignment:
Q  24 cacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatacta 123  Q
    ||||| |||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  17298898 cacatatcacgggtcatggataaagagttattaaatcttcacatagatataaatattaagagtaatatttatattggattgacccaccatgagaatacta 17298799  T
Q  124 catagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata-gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttgga 222  Q
    | |||  ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | | |||    
T  17298798 cgtag--aaagttatgtaaa-tgtcataagttattctcatagtgataagtggcgtattccacccttcaacctgaaaccaatatgtaccctaggtttagga 17298702  T
Q  223 gtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 303  Q
    ||||||| ||||||  || | |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||    
T  17298701 gtcgagtactttgtttccgtacaaacgttgtccgtaataggatgactataaaatcggttgatgggtgctccatgattcatg 17298621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Original strand, 39538773 - 39538953
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    |||||||| |||| ||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39538773 tattatgtgggtagactgatggtcatatttcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 39538872  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 181  Q
    ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  39538873 attgacccaccatgaaaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataaaatattctcatagtgatagtggtatattc 39538953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 15 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 17285756 - 17285470
Alignment:
Q  15 actgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatg 114  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | |||    
T  17285756 actgatgatcacatatcacaggtcatggataaagagttatcaagtctttacatagatataaatattaagagtaatatttatattggattgacccacaatg 17285657  T
Q  115 agaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtacccta 213  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| | | | ||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||||||||    
T  17285656 agaatactacatag--aaagttatgtata-tatcataagttattatcatagtgataagtggtatattccactcttcgacctgaaatcaatatgtacccta 17285560  T
Q  214 gatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 303  Q
    | | | ||| |||||| ||||||  || | ||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||    
T  17285559 ggtttaggattcgagtactttgtttccgtacaaactttgtccgtaataggatgactataaaatcggttgatgggtgctccatgattcatg 17285470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 129 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 27347428 - 27347252
Alignment:
Q  129 taaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgag 228  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27347428 taaaagttatgaaa-gtgtcataagatattctcatagtgatagttgtgtattccaccctttgacacgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgag 27347330  T
Q  229 tgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgatga 307  Q
    || |||||||||||||||| ||| ||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27347329 tgttttgtcaccattcaaatgttatctttaacaagatgac-ataaagttggttgatgggtactccacgaatcatgatga 27347252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 18807056 - 18806843
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    |||||||  |||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  18807056 tattatgcgggtagactgatgatcacatttcatatatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattagaagtaatgtttatattgg 18806957  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaac 199  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||||  |||||| ||  || ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  18806956 attgatccaccatgagaatgatacatag--aaagttttg-taactgtcataagttattctcatagtgataagtgatgtattccacccttcaacctgaaac 18806860  T
Q  200 cactatgtaccctagat 216  Q
    |||||||||| ||||||    
T  18806859 cactatgtacactagat 18806843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 196 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 24702057 - 24701950
Alignment:
Q  196 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24702057 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 24701958  T
Q  296 gaatcatg 303  Q
    ||||||||    
T  24701957 gaatcatg 24701950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 20941032 - 20941329
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||| ||| |||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20941032 tattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 20941130  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||    
T  20941131 attgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaacc 20941227  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    ||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||   ||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  20941228 actatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatc 20941326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 25805682 - 25805385
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||| ||| |||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25805682 tattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 25805584  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |||  ||||||||||    
T  25805583 attgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttacacctgaaacc 25805487  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    ||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  25805486 actatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatc 25805388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 64 - 303
Target Start/End: Original strand, 22941317 - 22941552
Alignment:
Q  64 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  22941317 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 22941413  T
Q  164 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 263  Q
    | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| |||    
T  22941414 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 22941512  T
Q  264 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 303  Q
    || |  |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  22941513 ataatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 22941552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 31904 - 32201
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||| ||| |||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31904 tattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 32002  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||    
T  32003 attgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaacc 32099  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    ||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  |||||||    
T  32100 actatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatc 32198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 12789960 - 12789663
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||| ||| |||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12789960 tattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattagaagtaatatttatattgg 12789862  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  ||||| |  | ||| |||||||||||    
T  12789861 attgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatactgctcttagacctgaaacc 12789765  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    ||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  12789764 actatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgatgaatc 12789666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 23545927 - 23546224
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||| ||| |||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23545927 tattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 23546025  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||    
T  23546026 attgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaacc 23546122  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    ||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  |||||||    
T  23546123 actatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatc 23546221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 22547038 - 22546872
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    |||||||| | || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22547038 tattatgtggatagaccgatgatcacatctcacaaatcatggataaagagttatcaagttttcatatagatataaatattatgagtaatatttatattgg 22546939  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 170  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||| ||| | ||||||| |||| ||||| |||||    
T  22546938 attgaccagccatgagaatactacata--aaaagttatgtaaa-tatcataagttattttcataatgata 22546872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 24933603 - 24933306
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||| ||| |||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24933603 tattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacatagatataaatattagaagtaatatttatattgg 24933505  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||    | ||| |||||||||||    
T  24933504 attgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattgctcttagacctgaaacc 24933408  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    ||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  24933407 actatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgatgaatc 24933309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 20100540 - 20100255
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||  | ||||| |||  ||| ||| ||||||  | |||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||    
T  20100540 tattatgtatgtagactgatgatcacatctcatgggtcatgaatat-gagatattaagtctatagataggtatcaatattaggagtaatacttatactgg 20100442  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
     |||| ||  | |||||| |||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||| ||| ||| |||||||    
T  20100441 cttgacccaacgtgagaaaactacatagtat--gttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgataatggtgtataccactcttagacatgaaacc 20100345  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtact 291  Q
    ||||||  ||| ||||| |||| || |||||||| |  |||||||||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||    
T  20100344 actatgatcccaagatg-tggactcaagtgctttattgccattcaaacgttgtctgtaaaaggataaccataatgttggttgatgggtact 20100255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 31096821 - 31097118
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||| ||| |||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  31096821 tattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaattataggagtaatatttatattgg 31096919  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||    
T  31096920 attgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaacc 31097016  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    | ||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  31097017 attatgatccctagatg-tggaatcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatc 31097115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 12765291 - 12764990
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||| ||| |||||||| |||||||||  | | || ||||  ||| ||| ||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12765291 tattatgtatgtagactgatgaccacatctcatgggttatagatat-gagatattaagtctatacatatgtataaatattaggagtaatatttatattgg 12765193  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaa---agtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaa 197  Q
    || || || || |||||||||||||||||||  ||||||| |   | |||||||||| ||||||| | ||||| | ||||||  | | ||| ||||||||    
T  12765192 atagacccaccgtgagaatactacatagtaa--gttatgagattaattgtcataagacattctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaa 12765095  T
Q  198 accactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatga 297  Q
    |||||||||  | || ||||| ||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| || || || |||| |||||||||||||||||  ||||    
T  12765094 accactatgatctcttgatgt-ggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgtaaaagaataaccataacgttggttgatgggtacttgatga 12764996  T
Q  298 atcatg 303  Q
    ||||||    
T  12764995 atcatg 12764990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 5097656 - 5097953
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||| ||| ||||||||  ||||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5097656 tattatgtatgtagactgatgactacatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacataagtataaatattatgagtaatatttatattgg 5097754  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||| | || || |||||||||||||||||  | |||||| ||| ||||||||| |||||||| | ||||| | ||||||  | | ||| |||||||||||    
T  5097755 attaacccaccgtgagaatactacatagt--atgttatg-aaattgtcataagttattctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaacc 5097851  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    ||||||  ||| ||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||  |||| ||||| || |||| ||| ||||||||||||   |||||||    
T  5097852 actatgatcccgagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtatgtaaaaggataaccataacgtttgttgatgggtacatgatgaatc 5097950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 64 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 7865669 - 7865430
Alignment:
Q  64 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaa---agtgtcataagatattct 160  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||||||||   ||||||| |   | ||||||||||||||||    
T  7865669 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggatagacccaccgtgagaatactacatagtac--gttatgagattaattgtcataagatattct 7865572  T
Q  161 catagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaac 260  Q
    || | ||||| | ||||||  | | ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || |||  |||||  || ||| ||||||||| ||||     
T  7865571 cacaatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtattttgtttcccttctaacgttgtctgtaaa 7865473  T
Q  261 aggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 303  Q
    ||||| || ||||  ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  7865472 aggataaccataacattggttgatgggtacttgatgaatcatg 7865430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 78 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 18806619 - 18806483
Alignment:
Q  78 attaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata-gtggtg 176  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||  |||||| || ||  ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||    
T  18806619 attagaagtaatgtttatattggattgatccaccatgagaatgatacatag--aaagttttgtaac-tgtcataagttattctcatagtgataagtgatg 18806523  T
Q  177 tattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagat 216  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  18806522 tattccacccttcaacctgaaaccactatgtacactagat 18806483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 78 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 18806799 - 18806663
Alignment:
Q  78 attaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata-gtggtg 176  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||  |||||| || ||  ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||    
T  18806799 attagaagtaatgtttatattggattgatccaccatgagaatgatacatag--aaagttttgtaac-tgtcataagttattctcatagtgataagtgatg 18806703  T
Q  177 tattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagat 216  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  18806702 tattccacccttcaacctgaaaccactatgtacactagat 18806663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 71 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 9811965 - 9811733
Alignment:
Q  71 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatga---aaagtgtcataagatattctcatagtg 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||  | |||||||    || ||||||||||| |||||| | ||    
T  9811965 tataaatattaggagtaatatttatattggatagacccaccgtgagaatactacatagt--acgttatgagattaattgtcataagattttctcacaatg 9811868  T
Q  168 atagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatga 267  Q
    ||| | ||||||  | | ||| |||||||||||||||||  | || |||| |||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| || || |    
T  9811867 ataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctcttgatg-tggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgtaaaagaataa 9811769  T
Q  268 ctataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 303  Q
    | |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  9811768 ccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 9811733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 71 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 12704106 - 12703874
Alignment:
Q  71 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatga---aaagtgtcataagatattctcatagtg 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||  | |||||||    || ||||||||||| |||||| | ||    
T  12704106 tataaatattaggagtaatatttatattggatagacccaccgtgagaatactacatagt--acgttatgagattaattgtcataagattttctcacaatg 12704009  T
Q  168 atagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatga 267  Q
    ||| | ||||||  | | ||| |||||||||||||||||  | || |||| |||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| || || |    
T  12704008 ataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctcttgatg-tggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgtaaaagaataa 12703910  T
Q  268 ctataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 303  Q
    | |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  12703909 ccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 12703874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 54 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 18829530 - 18829281
Alignment:
Q  54 tcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataag 153  Q
    |||||| ||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||  |||||||||  ||||  ||||||    
T  18829530 tcaagtgttctcatatatataaatattaggaccaatatttatattggattgacccaccatgagaatgatacatag--aaagttatg-taagttccataag 18829434  T
Q  154 atattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttg 252  Q
     |||||||||| |||| |||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||| || |||||  |||||| || ||||||   | | |||| ||      
T  18829433 ttattctcataatgataagtggtgtattccatcatttgacctaaaaccactatgtacact-gatgtgagagtcgtgtactttgttgtcgtacaaatgtca 18829335  T
Q  253 tccgtaacaggatgactataaagttgg---ttgatgggtactccatgaatcatg 303  Q
    ||  ||| | |||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||    
T  18829334 tctataaaatgatgactataaagttggttattgatgggtactccatggatcatg 18829281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 64 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 26129928 - 26129689
Alignment:
Q  64 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 163  Q
    ||||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||| ||||| |||||||  | |||||||||| ||| ||||||||||||||     
T  26129928 acatatatacaaatattatgagtaatatttatactggattgacccaccgtgaaaataccacatagt--atgttatgaaaa-tgtaataagatattctcac 26129832  T
Q  164 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 263  Q
    | ||||| ||||||||  ||| ||| ||| |||||||||||||  | ||||||| |||| || |||||||| |  |||||| ||| |||||  ||| | |    
T  26129831 attgataatggtgtatatcactcttagacatgaaaccactatgatcactagatg-tggactcaagtgctttattgccattctaacattgtctataaaaag 26129733  T
Q  264 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgatga 307  Q
    || || |||| ||||| | |||||||||  ||||||||||||||    
T  26129732 ataaccataacgttggctaatgggtacttaatgaatcatgatga 26129689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 218 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 28719558 - 28719471
Alignment:
Q  218 ttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgatga 307  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28719558 ttggagtcgagtgctttatcaccgt-caaacgttgtctgtaacaagatgac-ataaagttggttgatgggtactccacgaatcatgatga 28719471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 64 - 303
Target Start/End: Original strand, 26245169 - 26245404
Alignment:
Q  64 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 163  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |  | |||||||| ||||||  | |||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  26245169 acataggtataaatattaggagtaatatttatacttgattgatccactgtcagaatactgcatagt--atgttatg-aaattgtcataagatattctcac 26245265  T
Q  164 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 263  Q
    | || || | ||||||  | | ||| |||||||||||| ||||  | ||||||  |||| |  ||||||||||   ||||| ||||||||| |||| |||    
T  26245266 aatgttaatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccattatgatctctagat-atggacttaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaagg 26245364  T
Q  264 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 303  Q
    || || |||  |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  26245365 ataaccatagcgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 26245404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 18 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 27347483 - 27347425
Alignment:
Q  18 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaa 76  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  27347483 gatgatcacatctcacagatcatagataaagagttatcatgtcttcacataggtataaa 27347425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 222 - 303
Target Start/End: Original strand, 39538954 - 39539035
Alignment:
Q  222 agtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 303  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||  | || ||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  39538954 agtcgagtgctttatcaccattcaaatgttgtttggaataggatgattataaagttggttggtaggtactccacgaatcatg 39539035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 33477319 - 33477193
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||| ||| || |||||||||  ||  |||||| ||| || ||| |||| ||||||| ||||||||||||||        
T  33477319 tattatgtgagtaaactgataatcacatatcaaaggtcatggatat-gaaatatcaaatctacaaataaatattaatattaagagtaatatttatacata 33477221  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatag 128  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  33477220 attgatctgccataagaatactacatag 33477193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 74 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 31652009 - 31651917
Alignment:
Q  74 aaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 170  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| |||||||| |  | ||||||||| |||||||||   ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  31652009 aaatattaggagtaacattaataatggattgacctactatgagaatattacatagtat--gttatgaa--gtatcataagatattctcatagtgata 31651917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 299; Significance: 1e-168; HSPs: 52)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 18262397 - 18262699
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18262397 tattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 18262496  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18262497 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 18262596  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18262597 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 18262696  T
Q  301 atg 303  Q
    |||    
T  18262697 atg 18262699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 18269258 - 18269560
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18269258 tattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 18269357  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18269358 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 18269457  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18269458 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 18269557  T
Q  301 atg 303  Q
    |||    
T  18269558 atg 18269560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 55612868 - 55613170
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55612868 tattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 55612967  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55612968 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 55613067  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55613068 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 55613167  T
Q  301 atg 303  Q
    |||    
T  55613168 atg 55613170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 295; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 26963825 - 26964127
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26963825 tattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattagcagtaatatttatattgg 26963924  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26963925 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 26964024  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26964025 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 26964124  T
Q  301 atg 303  Q
    |||    
T  26964125 atg 26964127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 295; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 26970648 - 26970950
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26970648 tattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattagcagtaatatttatattgg 26970747  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26970748 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 26970847  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26970848 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 26970947  T
Q  301 atg 303  Q
    |||    
T  26970948 atg 26970950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 868782 - 869084
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  868782 tattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaaaagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 868881  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  868882 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataatggtgtattccacccttcgacctgaaacc 868981  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  868982 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 869081  T
Q  301 atg 303  Q
    |||    
T  869082 atg 869084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 19926782 - 19926480
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19926782 tattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcaaatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 19926683  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19926682 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaaatgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 19926583  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19926582 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 19926483  T
Q  301 atg 303  Q
    |||    
T  19926482 atg 19926480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 5707505 - 5707807
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5707505 tattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattgg 5707604  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5707605 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccatccttcgacctgaaacc 5707704  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5707705 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaactttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 5707804  T
Q  301 atg 303  Q
    |||    
T  5707805 atg 5707807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 5714133 - 5714435
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5714133 tattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattgg 5714232  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5714233 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccatccttcgacctgaaacc 5714332  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5714333 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaactttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 5714432  T
Q  301 atg 303  Q
    |||    
T  5714433 atg 5714435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 8858352 - 8858654
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8858352 tattatgtgggtaggctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcatatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 8858451  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8858452 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 8858551  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8858552 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 8858651  T
Q  301 atg 303  Q
    |||    
T  8858652 atg 8858654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 10621355 - 10621053
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10621355 tattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaattttaggagtaatatttatattgg 10621256  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10621255 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgttttccacccttcgacctgaaacc 10621156  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621155 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaactttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 10621056  T
Q  301 atg 303  Q
    |||    
T  10621055 atg 10621053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 10628434 - 10628132
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10628434 tattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 10628335  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10628334 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataatggtgttttccacccttcgacctgaaacc 10628235  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10628234 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaactttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 10628135  T
Q  301 atg 303  Q
    |||    
T  10628134 atg 10628132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 28393156 - 28392854
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28393156 tattatgtgggtagactgatgatcacatctcacatatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattagaagtaatatttatattgg 28393057  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28393056 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcaacctgaaacc 28392957  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28392956 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgagtactccatgaatc 28392857  T
Q  301 atg 303  Q
    |||    
T  28392856 atg 28392854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 8845388 - 8845690
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8845388 tattatgtgggtaggctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaattctttatatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 8845487  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8845488 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataatatattctcatagtgatagtggtgtattccatccttcgacctgaaacc 8845587  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8845588 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaatttggttgatgggtactccatgaatc 8845687  T
Q  301 atg 303  Q
    |||    
T  8845688 atg 8845690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 4426626 - 4426336
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4426626 tattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 4426527  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4426526 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaatctatgaaaagt------------tctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 4426439  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4426438 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgttaccattcaaacattgtccgtaataggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 4426339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 26 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 5668124 - 5667849
Alignment:
Q  26 catctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactaca 125  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||    
T  5668124 catctcacggatcatagataaagagttatcatatcttcacgtaggtataaatattaggagtaatatttatactggattgactcaccatgagaatactaca 5668025  T
Q  126 tagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtc 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  5668024 tagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttagacctgaaaccactatgtaccctagatgttg--gtc 5667927  T
Q  226 gagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5667926 gagtgctttgtcaccattcaaacgttgtctgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtactccacgaatcatg 5667849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 35223745 - 35224047
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    |||||||| |||| || |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  35223745 tattatgtgggtagacggatgatcacatctcacggatcatagataaagagttatcatgtctttacatatgtataaatattaggagtaatatttatactgg 35223844  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  35223845 attgaaccaccatgagaatactatatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtgttgtattccaccctttgacctgaaacc 35223944  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  35223945 acgatgtaccttagatgttggagtcgagtgctttatcaacattcaaacgttgtctgtaacaagatgactataaagttggttgatgtgtactccacgaatc 35224044  T
Q  301 atg 303  Q
    |||    
T  35224045 atg 35224047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 71 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 10677534 - 10677303
Alignment:
Q  71 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10677534 tataaatattaggagtaatatttatactggattgacccactatgagaatactacatagtaaatgttatgaaaaatgtcataagatattctcatagtgata 10677435  T
Q  171 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgacta 270  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||| |||||||||  |||| | |||||| |    
T  10677434 gtggtgtatttcaccctttgacttgaaaccactatgtatcctagatgtaggagtcgagtgctttaccaccatttaaacgttgtttgtaataagatgac-a 10677336  T
Q  271 taaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 303  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  10677335 taaagttggtagatgggtactccatgaaccatg 10677303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 71 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 10891174 - 10890943
Alignment:
Q  71 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10891174 tataaatattaggagtaatatttatactggattgacccactatgagaatactacatagtaaatgttatgaaaaatgtcataagatattctcatagtgata 10891075  T
Q  171 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgacta 270  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||| |||||||||  |||| | |||||| |    
T  10891074 gtggtgtatttcaccctttgacttgaaaccactatgtatcctagatgtaggagtcgagtgctttaccaccatttaaacgttgtttgtaataagatgac-a 10890976  T
Q  271 taaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 303  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  10890975 taaagttggtagatgggtactccatgaaccatg 10890943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 17 - 307
Target Start/End: Original strand, 20311493 - 20311781
Alignment:
Q  17 tgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgag 116  Q
    |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | ||||||    
T  20311493 tgatgatcacatatcatggatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatgtaaatattaggagtaatttttatattggattgacctgtcatgag 20311592  T
Q  117 aatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata-gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 215  Q
    ||||||||||||  | ||||||| ||  | |||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||    
T  20311593 aatactacatag--acagttatgtaac-tatcatacattattctcatagtgataagtggtgtattccacccttctacttgaaaccactatttaccctaga 20311689  T
Q  216 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgatga 307  Q
    ||| ||| |||||| ||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||||| ||||||||||||    
T  20311690 tgtaggattcgagtactttgttcccgtacaaacgttgtccgtagcaggatgactataaagtcggttaatcggtactccacgaatcatgatga 20311781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 15461502 - 15461799
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||| ||| |||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15461502 tattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 15461600  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||    
T  15461601 attgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaacc 15461697  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    ||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  15461698 actatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatc 15461796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 34975556 - 34975853
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||| ||| |||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34975556 tattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 34975654  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||    
T  34975655 attgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaacc 34975751  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    ||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  34975752 actatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgtttccattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatc 34975850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 2677018 - 2677315
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||| ||| |||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2677018 tattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 2677116  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||    
T  2677117 attgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaacc 2677213  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    ||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  |||||||    
T  2677214 actatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatc 2677312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 15815026 - 15815323
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||| ||| |||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15815026 tattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 15815124  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||    
T  15815125 attgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaacc 15815221  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    ||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  |||||||    
T  15815222 actatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatc 15815320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 18111340 - 18111043
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||| ||| |||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18111340 tattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 18111242  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||    
T  18111241 attgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaacc 18111145  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    ||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  |||||||    
T  18111144 actatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatc 18111046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 3369320 - 3369023
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||| ||| |||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3369320 tattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttgtattgg 3369222  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||    
T  3369221 attgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaacc 3369125  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    ||||||  | || |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  3369124 actatgatctcttgatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgatgaatc 3369026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 17300256 - 17299959
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||| ||| |||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17300256 tattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 17300158  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||    
T  17300157 attgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaacc 17300061  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    ||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||| | |||  |||||||    
T  17300060 actatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgagcacttgatgaatc 17299962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 18163167 - 18163464
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18163167 tattatgtatgtagactgatgatcgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacatagatataaatattagaagtaatatttatattgg 18163265  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||| | || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||    | ||| |||||||||||    
T  18163266 attcacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattgctcttagacctgaaacc 18163362  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    ||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  18163363 actatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgatgaatc 18163461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 20243942 - 20244239
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||| ||| |||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20243942 tattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacatagatataaatattagaagtaatatttatattgg 20244040  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||    | ||| |||||||||||    
T  20244041 attgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattgctcttagacctgaaacc 20244137  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    ||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  20244138 actatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgatgaatc 20244236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 26531618 - 26531915
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||| ||| |||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26531618 tattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaaggctatacataaatataaatattaggagtaatatttatattgg 26531716  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||    
T  26531717 attgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaacc 26531813  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    ||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  |||||||    
T  26531814 actatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatc 26531912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 52 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 21454110 - 21453961
Alignment:
Q  52 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 151  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||  ||||||| ||| | |||||    
T  21454110 tatcaagttttcacatacatataaatattaggagtaatatttatattgaattgacccaccatgagaatactacata-tatgagttatgtaaaatatcata 21454012  T
Q  152 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccac 202  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  21454011 agatattttcattgtgatagtggtgtatgtcacccttcgacctgaaaccac 21453961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 4676280 - 4675983
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||| ||| |||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4676280 tattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacatagatataaatattagaagtaatatttatattgg 4676182  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||    | ||| |||||||||||    
T  4676181 attgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattgctcttagacctgaaacc 4676085  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    ||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||  ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  4676084 actatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattataacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgatgaatc 4675986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 64 - 287
Target Start/End: Original strand, 19365586 - 19365806
Alignment:
Q  64 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctca- 162  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| |||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||     
T  19365586 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggattgacccaccgtgagagtactacatagt--atgttatg-aaagtgtcataagatattctcac 19365682  T
Q  163 tagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacag 262  Q
     | ||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||| ||||  ||||||||| |||| || |||||||| |   ||||||||||||||| |||||||    
T  19365683 caatgataatggtgtataccactcttagacctgaaaccattatgatccctagatg-tggactcaagtgctttattgtcattcaaacgttgtctgtaacag 19365781  T
Q  263 gatgactataaagttggttgatggg 287  Q
    |||||| |||| ||| ||| |||||    
T  19365782 gatgaccataacgttagttaatggg 19365806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 64 - 303
Target Start/End: Original strand, 1941791 - 1942026
Alignment:
Q  64 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 163  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || || |||||||||||||||||  |||||||| | | |||||| |||||||||||     
T  1941791 acataggtataaatattaggagtaatatttatattggattaacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-agattgtcatgagatattctcac 1941887  T
Q  164 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 263  Q
    | ||||| | ||||||  | | ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||| ||||||  |||||| || |||||| |||| |||    
T  1941888 aatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtactttgttgccattctaatgttgtctgtaaaagg 1941986  T
Q  264 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 303  Q
    || || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  1941987 ataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 1942026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 5870423 - 5870720
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||| ||| |||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5870423 tattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 5870521  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||| |||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||    
T  5870522 attgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcatatgatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaacc 5870618  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    ||||||  | ||||||| |||| || |||| |||||   ||||| |||||||||  ||| ||||| || |||| ||||||||||| |||||  |||||||    
T  5870619 actatgatctctagatg-tggactcaagtgttttgttgtcattctaacgttgtctataataggataacaataacgttggttgatgagtacttgatgaatc 5870717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 17 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 32646807 - 32646523
Alignment:
Q  17 tgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgag 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |  |||| ||    
T  32646807 tgatgatcacatctcacggatcattgataaaggaatatcgagtcttcacatagatataaatattaggaataatatttacattggattgacctaccataag 32646708  T
Q  117 aatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 215  Q
    ||| |||||||  ||| |||||| | |  |||| | || |||| | ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||| ||| ||    
T  32646707 aatgctacata--aaaggttatgtata-agtcacatgacattcccgtagtgataagtggtgtattttacccttcgacctgaaacaactctgtatcctgga 32646611  T
Q  216 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 303  Q
    |||  |||||| || ||||||   | | |||||||  ||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||   ||||||||||    
T  32646610 tgtatgagtcgggtactttgttgtcgtacaaacgtcatccataacaggatgattatgaagtcggttgatgggtaccggatgaatcatg 32646523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 56516241 - 56516368
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  56516241 tattatgtaggtagattaatgatcaaatctcacagataatggataaagagttatcaagtcttcacatacgtataaatatcatgagtaatatttatattgg 56516340  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatag 128  Q
    |||||  ||| ||||||| |||||||||    
T  56516341 attgactcgctatgagaacactacatag 56516368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 64 - 286
Target Start/End: Original strand, 19362477 - 19362695
Alignment:
Q  64 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 163  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||  | ||||| |||||||||||  | |||||  ||||||||||||||||||||||     
T  19362477 acataggtattaatattaggagtaatatttatactggattgacccatcgtgagagtactacatagt--atgttat-caaagtgtcataagatattctcac 19362573  T
Q  164 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 263  Q
    | ||||| |||||||| |||| |||  ||||||||||||||||  || |||||| |||| |  | |||||| |   ||||||||||||||| ||||||||    
T  19362574 aatgataatggtgtataccactcttaaacctgaaaccactatgatccttagatg-tggacttaaatgctttattgtcattcaaacgttgtctgtaacagg 19362672  T
Q  264 atgactataaagttggttgatgg 286  Q
    ||||| |||| | ||||| ||||    
T  19362673 atgaccataacggtggttaatgg 19362695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 71 - 287
Target Start/End: Original strand, 5616469 - 5616681
Alignment:
Q  71 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 170  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |  || ||||||||||||| |||  |  ||||| |||||||||||||||||||| | | |||||    
T  5616469 tataaatattagaagtaatatttatactggattgaccaaccgtgagaatactacagagttta--ttatg-aaagtgtcataagatattcttacaatgata 5616565  T
Q  171 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgacta 270  Q
     |||||||| |||  ||| || ||||||||||||||  ||||||||| |||| || |||||||| |  |||||||||||||||  |||||| ||| |||     
T  5616566 atggtgtataccaatcttagatctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttattgccattcaaacgttgtttgtaacaagataactg 5616664  T
Q  271 taaagttggttgatggg 287  Q
    ||| ||||||| |||||    
T  5616665 taacgttggttaatggg 5616681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 71 - 303
Target Start/End: Original strand, 9487625 - 9487853
Alignment:
Q  71 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||  | |||||||||||||||||  |||||||| | | |||||||||||||||||| | |||||    
T  9487625 tataaatattaggagtaatatttatactggatagacccatcgtgagaatactacatagt--aagttatg-agattgtcataagatattctcacaatgata 9487721  T
Q  171 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgacta 270  Q
     | ||||||  | | ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || |||  |||||   ||||  ||||||||| |||| ||||| || |    
T  9487722 atagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtattttgttgtcattataacgttgtctgtaataggataacca 9487820  T
Q  271 taaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 303  Q
    |||  ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  9487821 taacattggttgatgggtacttgatgaatcatg 9487853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 83 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 30040705 - 30040489
Alignment:
Q  83 gagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattcc 182  Q
    |||||||||||||| | |||||| || |||||||| ||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||  |    
T  30040705 gagtaatatttatactagattgacccaccatgagagtactacatagtat--gttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatc 30040609  T
Q  183 acccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttg 282  Q
    || ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||   ||||| || |||||  |||| ||||| || |||| |||||||     
T  30040608 actcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaatgttgtttgtaaaaggataaccataacgttggtta 30040510  T
Q  283 atgggtactccatgaatcatg 303  Q
    ||| |||||  ||||||||||    
T  30040509 atgagtacttgatgaatcatg 30040489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 64 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 5528714 - 5528495
Alignment:
Q  64 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 163  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||  | ||||||||| || ||||| |  ||||||||| || ||||||||||||||||    
T  5528714 acataggtataaatattaggagtgatatttatattgtattaacccaacgtgagaataccacgtagtata--ttatgaaaa-tgccataagatattctcat 5528618  T
Q  164 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 263  Q
    | ||||| ||||||||  ||| |||  |||||||||  |||||  ||||||||| |||| || |||||||| |  ||||||||||||| || ||||||||    
T  5528617 aatgataatggtgtataacactcttatacctgaaactgctatgatccctagatg-tggactcaagtgctttatttccattcaaacgttatctgtaacagg 5528519  T
Q  264 atgactataaagttggttgatggg 287  Q
    || || |||| ||||||| |||||    
T  5528518 ataaccataatgttggttaatggg 5528495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 65 - 201
Target Start/End: Original strand, 32636552 - 32636685
Alignment:
Q  65 catagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcata 164  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| |    
T  32636552 cataggtataaatattatgagtaatatttatattggattgacccaatgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcaca 32636648  T
Q  165 gtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacca 201  Q
     ||||| |||||||| |||| || |||| ||||||||    
T  32636649 atgataatggtgtataccactctccgacgtgaaacca 32636685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 71 - 287
Target Start/End: Original strand, 9538033 - 9538244
Alignment:
Q  71 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 170  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||  | ||||||||||||||||   | |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||    
T  9538033 tataaatgttaggagtaatatttatactggattgacccagcgtgagaatactacatag--catgttatg-aaagtgtcataagatattctcacaatgata 9538129  T
Q  171 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgacta 270  Q
     ||| ||  ||||  ||| ||||| ||||||| |||  || | |||| |||| || |||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||| || |    
T  9538130 atggcgt-gtccagtcttagacctcaaaccaccatgatccttggatg-tggactcaagtgctttattgccattcaaacattgtccgtaacaggataacca 9538227  T
Q  271 taaagttggttgatggg 287  Q
    ||| ||||||| |||||    
T  9538228 taacgttggttaatggg 9538244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 64 - 218
Target Start/End: Original strand, 4546147 - 4546298
Alignment:
Q  64 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 163  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  || || || |||||||||||||||||  |||||||| | | ||||||||||||||||||     
T  4546147 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggacagacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-agattgtcataagatattctcac 4546243  T
Q  164 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgt 218  Q
    | ||||| | ||||||  | | ||| ||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  4546244 aatgataatagtgtatatcgctctttgacctaaaaccactatgatccctagatgt 4546298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 86 - 303
Target Start/End: Original strand, 11421096 - 11421309
Alignment:
Q  86 taatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacc 185  Q
    |||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||| ||| || |||| |  |||||  |||     
T  11421096 taatatttatattggattgacccaccgttagaatactacatagt--atgttatgaaaa-tgtcataagatattatcacagggataataatgtatatcact 11421192  T
Q  186 cttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatg 285  Q
    | | |||||||||||||||||  || |||||| || | || |||||||| |   ||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||| | |||    
T  11421193 catagacctgaaaccactatgatccgtagatg-tgtactcaagtgctttattgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataatgttggctaatg 11421291  T
Q  286 ggtactccatgaatcatg 303  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  11421292 ggtactcgatgaatcatg 11421309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Original strand, 24700214 - 24700291
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaata 78  Q
    |||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  24700214 tattatgtgggtagactgataatcacatcttacagatcttggataaagagatattaagtcttcacatagatataaata 24700291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 52 - 206
Target Start/End: Original strand, 33888594 - 33888743
Alignment:
Q  52 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 151  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||   || ||||| || |||||| ||||| |||||  |  | ||||| ||||||| |||    
T  33888594 tatcaagttttcacatagatataaatattatgtgtaatattta---tgaattgacccaccatgataataccacata--atgatttatgtaaagtgtgata 33888688  T
Q  152 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatg 206  Q
    ||||| | ||||| ||| |||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||    
T  33888689 agataatatcatattgacagtggtgtatgccacatttcgacctgaaatcactatg 33888743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 43 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 34777975 - 34777850
Alignment:
Q  43 ataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaa 142  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||| | ||||||| ||| |||| |||||| || |||||||||||||||| | |   | ||||| ||    
T  34777975 ataaaaagttatcaagtcttcaaatatgtataaatataatgagtaatttttgtattagattgaccctccatgagaatactacacatt--gacttatgtaa 34777878  T
Q  143 agtgtcataagatattctcatagtgata 170  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||    
T  34777877 agtgtcataagatattttgatagtgata 34777850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 175 - 225
Target Start/End: Original strand, 24701361 - 24701411
Alignment:
Q  175 tgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtc 225  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  24701361 tgtattccacccttcgacctaaaaccactgtgtaccctagatgtaggagtc 24701411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 194 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 9937826 - 9937745
Alignment:
Q  194 tgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaag 275  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  ||||||| | |||| ||  | ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||    
T  9937826 tgaaatcactatgtaccctagatgtaagagtcgaatactttatcgtcgttcaaacattgttcgtaaaaggatgactataaag 9937745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 73 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 9937923 - 9937830
Alignment:
Q  73 taaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactaca---tagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcata 164  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||    |||||  | |||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  9937923 taaataatagaagtaatatttatattgcagtga-ccgtcatgagaatactactacttagtatgaattatgaaatgtgccataagatattctcata 9937830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 299; Significance: 1e-168; HSPs: 45)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 6110249 - 6110551
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6110249 tattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 6110348  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6110349 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 6110448  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6110449 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 6110548  T
Q  301 atg 303  Q
    |||    
T  6110549 atg 6110551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 16482505 - 16482203
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16482505 tattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 16482406  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16482405 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 16482306  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16482305 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 16482206  T
Q  301 atg 303  Q
    |||    
T  16482205 atg 16482203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 2 - 303
Target Start/End: Original strand, 8490681 - 8490982
Alignment:
Q  2 attatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgga 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490681 attatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgga 8490780  T
Q  102 ttgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacca 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490781 ttgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacca 8490880  T
Q  202 ctatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490881 ctatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 8490980  T
Q  302 tg 303  Q
    ||    
T  8490981 tg 8490982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 295; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 10579377 - 10579075
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10579377 tattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 10579278  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10579277 attgatccgccatgagaatactacataataaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 10579178  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10579177 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 10579078  T
Q  301 atg 303  Q
    |||    
T  10579077 atg 10579075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 295; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 15600906 - 15600604
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15600906 tattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 15600807  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15600806 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 15600707  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15600706 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtaccccatgaatc 15600607  T
Q  301 atg 303  Q
    |||    
T  15600606 atg 15600604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 295; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 15607451 - 15607149
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15607451 tattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 15607352  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15607351 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 15607252  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15607251 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtaccccatgaatc 15607152  T
Q  301 atg 303  Q
    |||    
T  15607151 atg 15607149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 10572614 - 10572312
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10572614 tattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 10572515  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10572514 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaactgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 10572415  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10572414 actatgtaccgtagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 10572315  T
Q  301 atg 303  Q
    |||    
T  10572314 atg 10572312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 15357608 - 15357306
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15357608 tattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaaaattaggagtaatatttatattgg 15357509  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15357508 gttgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 15357409  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15357408 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 15357309  T
Q  301 atg 303  Q
    |||    
T  15357308 atg 15357306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 18520160 - 18520462
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18520160 tattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatatttg 18520259  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18520260 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgaactgaaacc 18520359  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18520360 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccataacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 18520459  T
Q  301 atg 303  Q
    |||    
T  18520460 atg 18520462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Original strand, 18522848 - 18523146
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18522848 tattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 18522947  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18522948 attgatccgccatgaaaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtatttcacccttcgacctgaaacc 18523047  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18523048 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaat 18523146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 15342241 - 15341939
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15342241 tattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaaaattaggagtaatatttatattgg 15342142  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15342141 attgatccgtcatgagaatactacatagtaaaaattatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 15342042  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15342041 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 15341942  T
Q  301 atg 303  Q
    |||    
T  15341941 atg 15341939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 17781140 - 17780838
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17781140 tattatgtaggtagactgatgatcacatctcacaaatcatagataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 17781041  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17781040 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaaattatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 17780941  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17780940 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaataggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 17780841  T
Q  301 atg 303  Q
    |||    
T  17780840 atg 17780838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 13211487 - 13211789
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13211487 tattatgtaggtagactgatgatcacaactcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 13211586  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13211587 attgatccgccatgagaatattacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataatatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 13211686  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13211687 attatgtaacctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 13211786  T
Q  301 atg 303  Q
    |||    
T  13211787 atg 13211789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 13248792 - 13249094
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13248792 tattatgtaggtagactgatgatcacaactcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 13248891  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13248892 attgattcgccatgagaatattacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataatatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 13248991  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13248992 actatgtaacctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 13249091  T
Q  301 atg 303  Q
    |||    
T  13249092 atg 13249094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 32056922 - 32056619
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaa-tattaggagtaatatttatattg 99  Q
    |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  32056922 tattatgtgggtagactaatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaaatattatgagtaatatttatattg 32056823  T
Q  100 gattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaac 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32056822 gattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcaacctgaaac 32056723  T
Q  200 cactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaat 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32056722 cactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggatactccatgaat 32056623  T
Q  300 catg 303  Q
    ||||    
T  32056622 catg 32056619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 17200206 - 17199900
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  17200206 tattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagatcgtggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtagtatttgtattgg 17200107  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17200106 attgacccgctatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 17200007  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17200006 actatgtaccttagatgttggagtcgagtgttttgtcaccattcaaatgttgttcgtatcaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 17199907  T
Q  301 atgatga 307  Q
    |||||||    
T  17199906 atgatga 17199900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 13516996 - 13517294
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13516996 tattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 13517095  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||    
T  13517096 attgatcctccatgagaatactaaatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtgg----ccccacccttcgacctgaaacc 13517191  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13517192 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttatcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtagatgggtactccatgaatc 13517291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 1647543 - 1647241
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  1647543 tattatgtggatagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtctacacatagatataaatattaggagtaatgtttatatttg 1647444  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    |||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1647443 attgactcgccatgagaatactacataataaaagttatgaaaagtgtcatacgatattcccatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctaaaacc 1647344  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  1647343 actatataccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaatttggttgatgagtactccatgaatc 1647244  T
Q  301 atg 303  Q
    |||    
T  1647243 atg 1647241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 17136544 - 17136840
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||    
T  17136544 tattatgtgggtagactgatgatcacatttcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatat------taggagtaatatttatattgg 17136637  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17136638 attgacccaccatgagaatactacatagtaaaagttattgaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacttgaaacc 17136737  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17136738 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgcttagtaaacattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggatactccatgaatc 17136837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 18 - 303
Target Start/End: Original strand, 29925173 - 29925458
Alignment:
Q  18 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 117  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||    
T  29925173 gatgatcacatctcatagatcatggataaagagtcattaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccacctagaga 29925272  T
Q  118 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatg 217  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| |    
T  29925273 atactgcatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccatttgacctgaaaccattatgtaccctagacg 29925372  T
Q  218 ttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 303  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  29925373 ttggagttgagtgctttgtcaccaatcaaacgttgtctgtaacaagatgattataaagttggttgatggatactccacgaatcatg 29925458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 18 - 303
Target Start/End: Original strand, 29974326 - 29974611
Alignment:
Q  18 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 117  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||    
T  29974326 gatgatcacatctcatagatcatggataaagagtcattaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccacctagaga 29974425  T
Q  118 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatg 217  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| |    
T  29974426 atactgcatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccatttgacctgaaaccattatgtaccctagacg 29974525  T
Q  218 ttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 303  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  29974526 ttggagttgagtgctttgtcaccaatcaaacgttgtctgtaacaagatgattataaagttggttgatggatactccacgaatcatg 29974611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 15 - 303
Target Start/End: Original strand, 16200629 - 16200917
Alignment:
Q  15 actgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatg 114  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| || |||||    
T  16200629 actgatgatcatatcttacagatcatggataaagaattatcaagtattcatatagatacaaatattaggtgtaatattcatattggattgacccaccatg 16200728  T
Q  115 agaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctag 214  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16200729 agaatactacatagtcaaaattatgtaaagtatcataagatattctcatagtgatagtggtgtattcaaccctttgacctgaaaccactatgtaccctag 16200828  T
Q  215 atgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 303  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  16200829 atgttgaagtcgagtgctttgtcaccattcaaatgttgtctgtaacaagatgactataaagttggttgatggatactccacgaatcatg 16200917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 21034243 - 21034540
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||| ||| |||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21034243 tattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 21034341  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||    
T  21034342 attgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaacc 21034438  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    ||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  21034439 actatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgatgaatc 21034537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 15846833 - 15846536
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||| ||| |||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15846833 tattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 15846735  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||    
T  15846734 attgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaacc 15846638  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    ||||||  ||||||||| |||| || |||| |||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  15846637 actatgatccctagatg-tggactcaagtgttttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatc 15846539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 20147851 - 20147554
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||| ||| |||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20147851 tattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 20147753  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||    
T  20147752 attgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaacc 20147656  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    ||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  |||||||    
T  20147655 actatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatc 20147557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 52 - 303
Target Start/End: Original strand, 21398847 - 21399094
Alignment:
Q  52 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 151  Q
    ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  21398847 tatcaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcata 21398943  T
Q  152 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 251  Q
    ||||||||| | | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||    
T  21398944 agatattcttacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 21399042  T
Q  252 gtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 303  Q
    ||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  21399043 gtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 21399094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 14890396 - 14890693
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||| ||| |||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14890396 tattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 14890494  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||    | ||| ||||||||| |    
T  14890495 attgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattgctcttagacctgaaagc 14890591  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    ||| ||  | ||||||| |||| || ||||||||||   ||||| ||||||||| |||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  14890592 actgtgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataattataacgttggttgatgggtacttgatgaatc 14890690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 55427026 - 55427323
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||| ||| |||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  55427026 tattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacatagatataaatattagaagtaatatttatattgg 55427124  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||    | ||| |||||||||||    
T  55427125 attgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattgctcttagacctgaaacc 55427221  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    ||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  55427222 actatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgatgaatc 55427320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 65 - 303
Target Start/End: Original strand, 12299978 - 12300212
Alignment:
Q  65 catagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcata 164  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| |    
T  12299978 catagatataaatgttaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcaca 12300074  T
Q  165 gtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagga 264  Q
     ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || |||| |||||  |||||| ||||||||| |||| ||||    
T  12300075 atgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgatttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagga 12300173  T
Q  265 tgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 303  Q
    | || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  12300174 taacaataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 12300212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 64 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 25978963 - 25978728
Alignment:
Q  64 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 163  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||  |||||||| | | ||||||||||||||||||     
T  25978963 acataggtataattattaggagtaatatttatactggatagacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-agattgtcataagatattctcac 25978867  T
Q  164 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 263  Q
    | ||||| | ||||||  | | ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| |||    
T  25978866 aatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtactttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 25978768  T
Q  264 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 303  Q
    || || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  25978767 ataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 25978728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 24253410 - 24253130
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    |||||||| |||| ||| ||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |||| |||| |||||||||||||    
T  24253410 tattatgtcggtagactaatgatcatatctcacgaattatggataaagagttatcaagttttcacatacttataaacattaagagttatatttatattgg 24253311  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
     |||| || ||||||||||| | |||||  || |||||   |||  ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||| |||||    
T  24253310 tttgaccctccatgagaataatgcatag--aatgttat-ttaaggatcataagttattctcatagtgataacggtgtattcca-cattcgacctaaaacc 24253215  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatg 285  Q
    |||||||||| |||||||  || |||||| ||||||   | ||||||| |||||  | ||||  |||| |||||||| |||||||    
T  24253214 actatgtaccttagatgtatgactcgagtactttgttgtcgttcaaacattgtcaattacagagtgaccataaagttagttgatg 24253130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 71 - 269
Target Start/End: Original strand, 15526827 - 15527021
Alignment:
Q  71 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 170  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||  | ||||| ||||| ||||||   | |||||||| |||||||||||||||| | | || ||    
T  15526827 tataaatcttaggagtaatatttatactggattgacccatcgtgagagtactaaatagtat--gctatgaaaa-tgtcataagatattcttacaatgtta 15526923  T
Q  171 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgact 269  Q
     |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||  || || ||| |||| || |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  15526924 atggtgtataccactcttagacctgaaaccactatgatccatacatg-tggactcaagtgctttataaccattcaaacgttgtctgtaacagcatgact 15527021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 14147026 - 14147226
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    |||||| || ||| |||||||| |||||||||  | |||||||||  ||| ||| ||||||  |||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  14147026 tattatatatgtagactgatgaccacatctcatgggtcatggatat-gagatattaagtctatacatatgtataaatattaggaggaatatttatactgg 14147124  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||| | ||| ||||||| |||||||||  | |||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||  |||||||  ||| ||| |||||||||||    
T  14147125 attgacctgccgtgagaatgctacatagt--atgttatgaaaa-tgtcgtaagatattctcacattgataaaggtgtatatcactcttagacctgaaacc 14147221  T
Q  201 actat 205  Q
    |||||    
T  14147222 actat 14147226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 64 - 303
Target Start/End: Original strand, 11787654 - 11787889
Alignment:
Q  64 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 163  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||  ||||||| |  | ||||||||||||||||     
T  11787654 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggatagacccaccgtgagaatactacatagtaa--gttatgatattt-tcataagatattctcac 11787750  T
Q  164 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 263  Q
    | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||| ||||  ||||||||  |  | || ||| ||||||  |||||| ||||||||| ||||  ||    
T  11787751 aatgataatattgtatatcgctcttagacctgaaaccattatgatccctagat-ctataatcaagtactttgttgccattctaacgttgtctgtaaatgg 11787849  T
Q  264 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 303  Q
    || || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  11787850 ataaccataacgttggttgatgggtacttaatgaatcatg 11787889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 64 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 15317408 - 15317176
Alignment:
Q  64 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 163  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| || || || |||||||||||||||||  | |||||| | | ||||||||||||||||||     
T  15317408 acataggtataaatattaggagtaatatttatactagatagacccaccgtgagaatactacatagt--acgttatg-agattgtcataagatattctcac 15317312  T
Q  164 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 263  Q
    | ||||| | |||||   | | ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||| ||||||   ||||| ||||||||| ||||  ||    
T  15317311 aatgataatagtgtaaatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtactttgt---cattctaacgttgtctgtaaacgg 15317216  T
Q  264 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 303  Q
    || |  |||| ||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  15317215 ataatcataacgttggttgacgggtacttgatgaatcatg 15317176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 118 - 303
Target Start/End: Original strand, 28088227 - 28088408
Alignment:
Q  118 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatg 217  Q
    ||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||  | | ||| |||||||||||||||||  |||||||||    
T  28088227 atactacatagtaa--gttatgaaat-tgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg 28088323  T
Q  218 ttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 303  Q
     |||| || || |||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  28088324 -tggactcaagggctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatggatacttgatgaatcatg 28088408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 37 - 229
Target Start/End: Original strand, 32280313 - 32280507
Alignment:
Q  37 tcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagtt 136  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||||| |||||  |||| || ||||||||| | | | |||| || | ||||||||| |||||||| |  ||     
T  32280313 tcatggataaagagttatttaatcttcacataggtataatcattacgaataatatttacactcggttgacccacaatgagaataatacatagtga--gtc 32280410  T
Q  137 atgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccac----tatgtaccctagatgttggagtcgagt 229  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||  ||| ||  || |||||||||    |||||||||||||||| ||||||||||    
T  32280411 atgtaaagtgtcataagatattctcatagtgataatgatttattttaccttttcacttgaaaccactatatatgtaccctagatgtaggagtcgagt 32280507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 35 - 164
Target Start/End: Original strand, 28953965 - 28954093
Alignment:
Q  35 gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatattt-atattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaa 133  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||  | ||||||| | ||  |||||||||||||||||  | ||    
T  28953965 gatcattgataaagagttacaaagtcttcacatatgtatacacattaggagtaatatttgttgttggattaacccatcatgagaatactacata--ataa 28954062  T
Q  134 gttatgaaaagtgtcataagatattctcata 164  Q
    |||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  28954063 gttatttaaagtgtcatatgatattctcata 28954093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 265
Target Start/End: Original strand, 30464147 - 30464261
Alignment:
Q  150 taagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacg 249  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || |||| ||| |   ||||||||||    
T  30464147 taagatattctcataatgataatggtctataccactcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgttttattgacattcaaacg 30464245  T
Q  250 ttgtccgtaacaggat 265  Q
    ||||| |||| |||||    
T  30464246 ttgtctgtaaaaggat 30464261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 15 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 8252025 - 8251933
Alignment:
Q  15 actgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatc 107  Q
    ||||| |||||||||| || ||||||| |||||  |||||||| |||| ||||| || || |||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  8252025 actgaagatcacatcttacggatcatgaataaaatgttatcaaatctttacataaatttacatatttcgagtaatatttatatttgattgatc 8251933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Original strand, 9504468 - 9504548
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 81  Q
    |||||||| |||| |||||| |||  ||||||| | |||||||||| |||||||||||| || ||||| ||| ||||||||    
T  9504468 tattatgtgggtagactgataatcttatctcacgggtcatggataaggagttatcaagtattaacatacataaaaatatta 9504548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 55
Target Start/End: Original strand, 16200323 - 16200363
Alignment:
Q  15 actgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatc 55  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16200323 actgatgatcatatcttacagatcatggataaagagttatc 16200363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 36138097 - 36138033
Alignment:
Q  142 aagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatg 206  Q
    ||||| |||||||||||  || ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| |||||||    
T  36138097 aagtgccataagatatttccaaagtgataatggtgtataccacccttcaacctgaaatcactatg 36138033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 34
Target Start/End: Complemental strand, 19089767 - 19089734
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcaca 34  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19089767 tattatgtaggtagactgatgatcacatctcaca 19089734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 142 - 206
Target Start/End: Original strand, 36142816 - 36142880
Alignment:
Q  142 aagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatg 206  Q
    ||||| |||||||||||  || ||||||| || |||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  36142816 aagtgccataagatatttccaaagtgataatgatgtatgtcacccttcaacctgaaaccactatg 36142880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 299; Significance: 1e-168; HSPs: 37)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 18252215 - 18252517
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18252215 tattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 18252314  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18252315 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 18252414  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18252415 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 18252514  T
Q  301 atg 303  Q
    |||    
T  18252515 atg 18252517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 295; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 18532536 - 18532234
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18532536 tattatgtagatagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 18532437  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18532436 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 18532337  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18532336 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 18532237  T
Q  301 atg 303  Q
    |||    
T  18532236 atg 18532234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 27131431 - 27131130
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27131431 tattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 27131332  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27131331 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 27131232  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27131231 actatgta-cctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 27131133  T
Q  301 atg 303  Q
    |||    
T  27131132 atg 27131130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 27310599 - 27310297
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27310599 tattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagattatggataaagagttatcaagtcttcacataaatataaatattaggagtaatatttatattgg 27310500  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27310499 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattcttatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 27310400  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27310399 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtctgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 27310300  T
Q  301 atg 303  Q
    |||    
T  27310299 atg 27310297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 16359057 - 16358755
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16359057 tattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagataatggataaagagttatcaagccttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattgg 16358958  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  16358957 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgagaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgtcttgaaacc 16358858  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16358857 accatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactttaaagttggttgatgggtactccatgaatc 16358758  T
Q  301 atg 303  Q
    |||    
T  16358757 atg 16358755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 3855941 - 3855639
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||| || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3855941 tattacgtgggtagactgatgatcacatctcacaaatcatggataaagagttataaagtcttcacataggtataaatattaggagtaatatttatattgg 3855842  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  3855841 attgacccgcaatgagaatactacatagtaaaggttatgaaaagtgtcataagatattctcacagtgatagtggtgtattccaccattcgacccgaaacc 3855742  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  3855741 actatgtaccctagatgttggagttgagcgctttgtcaccattcaagcgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgaccggtactccatgaatc 3855642  T
Q  301 atg 303  Q
    |||    
T  3855641 atg 3855639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 36816655 - 36816354
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36816655 tattatgtggatagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtctacacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 36816556  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||    
T  36816555 attgacccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataa-aaattatcatagtgatggtggtgtattccaccctttgaactgaaacc 36816457  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||||    
T  36816456 actatgtaccctagatgttggagtcgagcgttttgtcaccattcaaacgttgtctgtaacaagataactataaagttggttgataggtactccacaaatc 36816357  T
Q  301 atg 303  Q
    |||    
T  36816356 atg 36816354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 22 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 22641871 - 22641594
Alignment:
Q  22 atcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatac 121  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||   |||||| ||||||||||| | |||||| || ||||||||| ||    
T  22641871 atcacatctcatagatcatggataaagagttattaagtgttcacatagatataa---ttaggaataatatttatactagattgacccaccatgagaa-ac 22641776  T
Q  122 tacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttgg 221  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22641775 tacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcacagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccgtagatgttgg 22641676  T
Q  222 agtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  22641675 agtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtctgtaacaagatgactataaagttggtcgatgggtactccacgaatcatg 22641594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 27277579 - 27277278
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    |||||||| |||| || |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |    
T  27277579 tattatgtgggtagaccgatgatcacatctcacggatcatagataaagagttatcatgttttcacataggtataaatattaggagtaatatttatactag 27277480  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||| || |||| |||||| | |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27277479 attgacccaccataagaatattgcatagtaaaagtcatgaaa-gtgccataagatattcttatagtgatagtggtgtattccaccctttgacctgaaacc 27277381  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  27277380 actatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttatcataattcaaacattgtttgtaacaagatgaccataaagttggttgaagggtactccataaatc 27277281  T
Q  301 atg 303  Q
    |||    
T  27277280 atg 27277278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 21171255 - 21171081
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21171255 tattatgtgggtagactgatgataacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 21171156  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggt 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21171155 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggt 21171081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 19706736 - 19706439
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||| ||| |||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19706736 tattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 19706638  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||    
T  19706637 attgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaacc 19706541  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    ||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  19706540 actatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatc 19706442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 43802662 - 43802365
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||| ||| |||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43802662 tattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 43802564  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||    
T  43802563 attgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaacc 43802467  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    ||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  43802466 actatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatc 43802368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 303
Target Start/End: Original strand, 23507099 - 23507385
Alignment:
Q  15 actgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatg 114  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||     
T  23507099 actgatgatcacatctcacggatcatggataaggagttatcaagttttcacatagatataaataataggagtaatatttatattggattaacccaccatt 23507198  T
Q  115 agaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtacccta 213  Q
    ||||| ||||| ||  || ||| || |||  | |||||| ||||||||||||||| ||||| ||||  || ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23507199 agaatgctacagag--aacgttgtgtaaaaag-cataagttattctcatagtgataagtggagtatgtcatccttcgacctgaaaccactgtgtacccta 23507295  T
Q  214 gatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 303  Q
    |||||  || | |||| |||||| | ||| ||||    ||| |||| |||||||||||||| | | || ||||||||||||| |||||||    
T  23507296 gatgtaagatttgagtactttgttatcatacaaataccgtctgtaataggatgactataaattcgatttatgggtactccataaatcatg 23507385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 28135019 - 28134723
Alignment:
Q  2 attatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgga 101  Q
    |||||||| ||| |||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28135019 attatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattgga 28134921  T
Q  102 ttgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacca 201  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||||||||    
T  28134920 ttgatccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaacca 28134824  T
Q  202 ctatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 301  Q
    |||||  ||||| ||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  28134823 ctatgatccctaaatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatca 28134725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 111 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 9916688 - 9916497
Alignment:
Q  111 catgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata-gtggtgtattccacccttcgacctgaaa-ccactatgta 208  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9916688 catgagaatactacatag--aaagttatgtaaa-tgtcataaattattctcatagtgataagtggtgtattccacccttcgacctgaaaaccactatgta 9916592  T
Q  209 ccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 303  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||| || ||||| ||||||||    
T  9916591 ccctagatgtaggagtcgagtactttgttaccgtccaaacgttgtccgtaacaaggtgactataaagttagtttatgagttctccacgaatcatg 9916497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 9456121 - 9456418
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||| ||| |||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9456121 tattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 9456219  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||    
T  9456220 attgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaacc 9456316  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    ||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  |||||||    
T  9456317 actatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatc 9456415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 20391536 - 20391239
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||| ||| |||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20391536 tattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatgttaggagtaatatttatattgg 20391438  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| | |||||||||||||||| | ||||| |  ||||| || | ||| |||||||||||    
T  20391437 attgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattttcataagatattctcacaatgataataatgtataccgctcttagacctgaaacc 20391341  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    ||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  20391340 actatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgatgaatc 20391242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 20779942 - 20779645
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||| ||| |||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20779942 tattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 20779844  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||    
T  20779843 attgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaacc 20779747  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    ||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  |||||||    
T  20779746 actatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatc 20779648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 22670554 - 22670257
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||| ||| |||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22670554 tattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 22670456  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||    
T  22670455 attgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaacc 22670359  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    ||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  |||||||    
T  22670358 actatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatc 22670260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 42817286 - 42816989
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||| ||| |||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42817286 tattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 42817188  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||    
T  42817187 attgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaacc 42817091  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    ||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  |||||||    
T  42817090 actatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatc 42816992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 12014305 - 12014084
Alignment:
Q  2 attatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgga 101  Q
    ||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  12014305 attatgtgggtagaatgatgatcacatctcacggatcattgataaggagttatcaagtcttcacataaatataaatattaagagtaatattaatattgga 12014206  T
Q  102 ttgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    |||| ||| |||||||||  ||||||| | ||  | | ||||   ||| |||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||| |    
T  12014205 ttgacccggcatgagaatgttacatagaacaatatgtaaaaa---tcacaagtcattctcatagtgataagtggtgtatttcacccttcaacctaaaatc 12014109  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtc 225  Q
    ||| ||||| |||||||| ||||||    
T  12014108 actgtgtactctagatgtaggagtc 12014084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 22657229 - 22657108
Alignment:
Q  15 actgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatg 114  Q
    |||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || |||||    
T  22657229 actgatgatcacatctcatagctcatagataaagagttattaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattagattgacccaccatg 22657130  T
Q  115 agaatactacatagtaaaagtt 136  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  22657129 tgaatactacatagtaaaagtt 22657108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 52 - 303
Target Start/End: Original strand, 22612547 - 22612794
Alignment:
Q  52 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 151  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  22612547 tatcaagtctatacatagatataaatattgggagtaatatttttattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcata 22612643  T
Q  152 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 251  Q
    ||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||    
T  22612644 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatcactagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 22612742  T
Q  252 gtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 303  Q
    |||  ||| ||||| |  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  22612743 gtctataaaaggataatcataacgttggttgatggctacttgatgaatcatg 22612794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 64 - 283
Target Start/End: Original strand, 634001 - 634216
Alignment:
Q  64 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 163  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | || || |||||||||||||||||  |||||||| | | ||||||||||||||||||     
T  634001 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggattaacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-agattgtcataagatattctcac 634097  T
Q  164 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 263  Q
    | ||||| | ||||||  | | ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| |||    
T  634098 aatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 634196  T
Q  264 atgactataaagttggttga 283  Q
    || || |||| |||||||||    
T  634197 ataaccataacgttggttga 634216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 71 - 303
Target Start/End: Original strand, 8727741 - 8727969
Alignment:
Q  71 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 170  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||  | |||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||    
T  8727741 tataaatattagaagtaatatttatactggattgatccaccgtgagaatactacatagt--atgttatgaaaa-taccataagatattctcttagtgata 8727837  T
Q  171 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgacta 270  Q
       ||||||  ||| ||| |||||| ||||||||||  |||||||||  ||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |    
T  8727838 agagtgtatatcactcttagacctggaaccactatgatccctagatg-cggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacca 8727936  T
Q  271 taaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 303  Q
    |||  |||| | |||||||||  ||||||||||    
T  8727937 taacattggctaatgggtacttgatgaatcatg 8727969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 9917924 - 9917837
Alignment:
Q  17 tgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattga 105  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  9917924 tgatgatcacatctcgtggatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatt-tgagtaatatttatattggattga 9917837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 47667771 - 47667485
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||| ||| |||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  47667771 tattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattatgagtaatatttatattgg 47667673  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||| || || |||           |||||  |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||    
T  47667672 attgacccaccgtga-----------agtaa--gttatgaaat-tgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaacc 47667587  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    ||||||  | |||||||| ||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  47667586 actatgatctctagatgt-ggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatc 47667488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 64 - 287
Target Start/End: Original strand, 29096789 - 29097008
Alignment:
Q  64 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 163  Q
    |||||| |||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||| || || |||||||||||||   | |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29096789 acataggtatacatattaggaataatatttatactagattgatccaccgtgtgaatactacatag--catgttatgaaaa-tgtcataagatattctcat 29096885  T
Q  164 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 263  Q
    | ||||| |||||| |  ||| ||| ||| |||||||||||||  ||||||||  |||| || |||| ||| |  | ||||||||||| || |||| |||    
T  29096886 aatgataatggtgtttcacactcttagacatgaaaccactatgatccctagat-atggactcaagtgttttatttcgattcaaacgttatctgtaatagg 29096984  T
Q  264 atgactataaagttggttgatggg 287  Q
    || || |||| ||||||| |||||    
T  29096985 ataaccataacgttggttaatggg 29097008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 71 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 21881604 - 21881475
Alignment:
Q  71 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 170  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||   |||||| || || |||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||    
T  21881604 tataaatattaggagtaatgtttatacaagattgacccaccgtgagaatactacatagt--atgttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgata 21881508  T
Q  171 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccact 203  Q
      ||||||| |||| ||| |||||||| |||||    
T  21881507 acggtgtataccactcttagacctgaagccact 21881475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 12006547 - 12006332
Alignment:
Q  15 actgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatg 114  Q
    ||||||||||||| || ||  ||||| ||||| |||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||    || ||||||||    
T  12006547 actgatgatcacaacttacgaatcattgataaggagttatcaagtgttcgcacagatataaatattaagagtaatatttatactg----gacccgccatg 12006452  T
Q  115 agaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtacccta 213  Q
    |||||  || | ||  |  |||||| |||  |||| |||  ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||| |||    
T  12006451 agaatgttagagag--agcgttatgtaaa-agtcacaagtcattctcatactgataagtggtgttttccacccttcgacctgaaatcattgtgtactcta 12006355  T
Q  214 gatgttggagtcgagtgctttgt 236  Q
    ||||| | |||| ||| ||||||    
T  12006354 gatgtagaagtcaagtactttgt 12006332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 190 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 28145835 - 28145723
Alignment:
Q  190 gacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggta 289  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| ||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||    
T  28145835 gacctgaaaccactatgatccctagatgt-ggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggta 28145737  T
Q  290 ctccatgaatcatg 303  Q
    ||  ||||||||||    
T  28145736 cttgatgaatcatg 28145723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 64 - 128
Target Start/End: Original strand, 35930649 - 35930713
Alignment:
Q  64 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatag 128  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||    
T  35930649 acataggtataaatattaggagtaatatttatattggattgacctaccgtgagaatactacatag 35930713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 71 - 206
Target Start/End: Original strand, 51997353 - 51997485
Alignment:
Q  71 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| ||  |||  ||||| || || ||||||| |||||||||| |||||    
T  51997353 tataaatattaggagtaatatttatattagattgacccaccatgagaatactacgta--aaatattatg-aatgtatcataagttattctcatattgata 51997449  T
Q  171 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatg 206  Q
     || | ||| |||| ||| |||| ||||| ||||||    
T  51997450 atgatatataccacgcttagaccagaaactactatg 51997485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 24301855 - 24301691
Alignment:
Q  51 ttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatattta-tattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtca 149  Q
    ||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||| ||   | ||  || |||||||| ||||||| |  ||||||  |||| |||    
T  24301855 ttatcaagatttcacataggtatacatattaggagtaatatttgctattagaaatacccatcacgagaataccacatagtga--gttatgttaagtatca 24301758  T
Q  150 taagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagat 216  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||| || ||||  ||||||||    
T  24301757 taagacattctcatagtgatagtggtgtatacaaccctttgacctaaaatcattatgatccctagat 24301691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 26923678 - 26923553
Alignment:
Q  4 tatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggatt 103  Q
    |||||| ||| |||||||| |||||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||| | ||| |||||||||||||||||||||| || |||    
T  26923678 tatgtatgtagactgatgaccacatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacattggtatgaatattaggagtaatatttatactgaatt 26923580  T
Q  104 gatccgccatgagaatactacatagta 130  Q
    || || || ||||||||||||||||||    
T  26923579 gacccaccgtgagaatactacatagta 26923553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 142 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 10852461 - 10852402
Alignment:
Q  142 aagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacca 201  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  10852461 aagtgtcataagatatttttaaagtgataatggtgtatgtcacccttcaacctgaaacca 10852402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 85 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 31236478 - 31236402
Alignment:
Q  85 gtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcata 164  Q
    |||||| ||||| || |||||||   |||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  31236478 gtaatacttatactgaattgatctatcatgagaatactacatagtata--ttatg-aaagtgtcgtaagatattctcata 31236402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 298; Significance: 1e-167; HSPs: 42)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Original strand, 21940850 - 21941151
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21940850 tattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 21940949  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21940950 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 21941049  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21941050 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 21941149  T
Q  301 at 302  Q
    ||    
T  21941150 at 21941151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 22171672 - 22171974
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22171672 tattatgtaggtagactgatgatcacatctcatagatcatggataaagagttatcaagtcttcacataaatataaatattatgagtaatatttatattgg 22171771  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22171772 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 22171871  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22171872 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 22171971  T
Q  301 atg 303  Q
    |||    
T  22171972 atg 22171974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 17 - 303
Target Start/End: Original strand, 6094324 - 6094610
Alignment:
Q  17 tgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgag 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6094324 tgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgag 6094423  T
Q  117 aatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagat 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6094424 aatactatatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgaccagaaaccactatgtaccctagat 6094523  T
Q  217 gttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6094524 gttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgttcgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 6094610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 24642834 - 24643135
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24642834 tattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 24642933  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24642934 attgatcctccatgagaatactacatagtaaaa-ttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataatggtgtattccacccttcgaactgaaacc 24643032  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24643033 actatgtaccctagatgttggagtcaagtgttttgtcaccattcaaacgtggtctgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 24643132  T
Q  301 atg 303  Q
    |||    
T  24643133 atg 24643135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 40 - 303
Target Start/End: Original strand, 15326422 - 15326685
Alignment:
Q  40 tggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatg 139  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15326422 tggagaaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatg 15326521  T
Q  140 aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcac 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15326522 aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcac 15326621  T
Q  240 cattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 303  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15326622 cattcaaatgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 15326685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 40 - 303
Target Start/End: Original strand, 15506791 - 15507054
Alignment:
Q  40 tggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatg 139  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15506791 tggagaaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatg 15506890  T
Q  140 aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcac 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15506891 aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcac 15506990  T
Q  240 cattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 303  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15506991 cattcaaatgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 15507054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 162 - 303
Target Start/End: Original strand, 28548393 - 28548534
Alignment:
Q  162 atagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaaca 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28548393 atagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaaca 28548492  T
Q  262 ggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 303  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28548493 gggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 28548534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 14983942 - 14983710
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    |||||||| |||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |    
T  14983942 tattatgtgggtagactaatgatcatatctcacggatcatggaaaaagtgttatcaagtcttcacatagatgtagatattaggagtaata-ttatattag 14983844  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaac 199  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||     
T  14983843 aatgacccgccatgagaatactacatag--aaagttatgtaaa-tgtcataagttattctcatagtgataagtggtgtattccgtccttcgacctgaaat 14983747  T
Q  200 cactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgt 236  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  14983746 cactatgtaccctagatgtaagagtcgagtactttgt 14983710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 21969338 - 21969635
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||| ||| |||||||| | |||||||  |||||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21969338 tattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatggatcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 21969436  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||    
T  21969437 attgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaacc 21969533  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    ||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  21969534 actatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatc 21969632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 52 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 24797359 - 24797224
Alignment:
Q  52 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 151  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24797359 tatcatgtcttcacgtaggtataaatattatgagtaaaatttatactggattgacccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 24797260  T
Q  152 agatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 188  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24797259 agatattctcatagtgat-gtggtgtattccaccctt 24797224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 8371550 - 8371253
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||| ||| |||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8371550 tattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacataggtataaatattaagagtaatatttatattgg 8371452  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||    
T  8371451 attgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaacc 8371355  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    ||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| |||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  8371354 actatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggatgatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatc 8371256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 12562128 - 12562425
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||| ||| |||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12562128 tattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 12562226  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||    
T  12562227 attgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaacc 12562323  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    ||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||   ||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  12562324 actatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatc 12562422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 27007814 - 27007517
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||| ||| |||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27007814 tattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 27007716  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||    
T  27007715 attgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaacc 27007619  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    ||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  |||||||    
T  27007618 actatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatc 27007520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 27014957 - 27014660
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||| ||| |||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27014957 tattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 27014859  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||    
T  27014858 attgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaacc 27014762  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    ||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  |||||||    
T  27014761 actatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatc 27014663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 27880784 - 27880487
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||| ||| |||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27880784 tattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 27880686  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||    
T  27880685 attgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaacc 27880589  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    ||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  |||||||    
T  27880588 actatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatc 27880490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 28020965 - 28020668
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||| ||| |||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28020965 tattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 28020867  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||    
T  28020866 attgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaacc 28020770  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    ||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  |||||||    
T  28020769 actatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatc 28020671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 52 - 303
Target Start/End: Original strand, 25611250 - 25611497
Alignment:
Q  52 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 151  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  25611250 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaactgtcata 25611346  T
Q  152 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 251  Q
    ||||||||||| | ||||| |  |||||  ||| ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||    
T  25611347 agatattctcacaatgataataatgtatatcactcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 25611445  T
Q  252 gtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 303  Q
    ||| |||| ||||| |  |||  ||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  25611446 gtctgtaaaaggataatcatagtgttggttgatgggcacttgatgaatcatg 25611497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 38232399 - 38232115
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    |||| ||| |||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| | |||||| | ||||||||||||||||    
T  38232399 tattttgtgggtagactgataatcacatctcacggatcatggataaagagtgatccagtcttgacatagatacacatattatgggtaatatttatattgg 38232300  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaac 199  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||| ||| ||||| | | ||||| |||| |||| |||||||||||||| |||  ||| |||||     
T  38232299 attgatccgccgtgagaatgctacatag--aaagttatgtaaa-tgtcacaggttattcgcataatgataagtggtgtattccatcctcagacttgaaat 38232203  T
Q  200 cactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 287  Q
       | |||||||| ||||| | |||||||| ||||||   | | |||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  38232202 tgatgtgtacccttgatgtagaagtcgagtactttgttgtcgtacaaacgttgtccgtgacatgatggttataaagttggttgatggg 38232115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 22130906 - 22130609
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||| ||| |||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22130906 tattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 22130808  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||    
T  22130807 attgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttggacctgaaacc 22130711  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    ||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| |||||||||  ||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  |||||||    
T  22130710 actatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctataaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatc 22130612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 64 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 22659729 - 22659494
Alignment:
Q  64 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 163  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  22659729 acataggtataaatattaggagtaatatgtatactggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 22659633  T
Q  164 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 263  Q
    | ||||| | ||||||  | | ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||| ||||| |||| |||    
T  22659632 aatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacattgtctgtaaaagg 22659534  T
Q  264 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 303  Q
    || || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  22659533 ataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 22659494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 21916681 - 21916978
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||| ||| |||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21916681 tattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatgcatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 21916779  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||| || |  |||||||||||||| ||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||    
T  21916780 attgacccactgtgagaatactacattgt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaacc 21916876  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    ||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || ||||  |||||||||||| |||  |||||||    
T  21916877 actatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataactttggttgatgggcacttgatgaatc 21916975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 45534570 - 45534273
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||| ||| |||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45534570 tattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacatagatataaatattagaagtaatatttatattgg 45534472  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||    | ||| |||||||||||    
T  45534471 attgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattgctcttagacctgaaacc 45534375  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    ||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| |||||||||  ||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  45534374 actatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctataaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgatgaatc 45534276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 64 - 303
Target Start/End: Original strand, 26240551 - 26240786
Alignment:
Q  64 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 163  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  26240551 acataggtataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 26240647  T
Q  164 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 263  Q
    | ||||  |  |||||  | | ||| ||||| |||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||   ||||| ||||||||  |||| |||    
T  26240648 aatgattataatgtatatcgctcttagacctaaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtttgtaaaagg 26240746  T
Q  264 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 303  Q
    || |  |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  26240747 ataatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 26240786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 64 - 303
Target Start/End: Original strand, 6430953 - 6431188
Alignment:
Q  64 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 163  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| || || || |||||||||||||||||  |||||||| | | ||||||||||||||||||     
T  6430953 acataggtataaatattaggagtaatatttatactagatagacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-agattgtcataagatattctcac 6431049  T
Q  164 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 263  Q
    | ||||| | ||||||  | | ||  ||||||||| |||||||  ||||||||| |||| || ||| ||||||   ||||| ||||||||| |||| |||    
T  6431050 aatgataatagtgtatatcgctctaagacctgaaatcactatgatccctagatg-tggactcaagtactttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaagg 6431148  T
Q  264 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 303  Q
    || || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  6431149 ataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 6431188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 72 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 8782102 - 8781959
Alignment:
Q  72 ataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatag 171  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||    |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||     
T  8782102 ataaatattaggactaatatttatacttgattgatccaccgtgagaatactacatagtct--gttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgataa 8782006  T
Q  172 tggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgt 218  Q
    |||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  8782005 tggtgtataccactcttagacttgaaaccactatgatccctagatgt 8781959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 18835355 - 18835556
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||| ||| |||||| | |||||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18835355 tattatgtatgtagactgattaccacatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacataagtataaatattaggagtaatatttatactgg 18835453  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||| || || |||||||||||||||||  | ||| | |||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||  ||| ||| |||||||||||    
T  18835454 attgacccaccgtgagaatactacatagt--atgtt-ttaaaaatgtcataagatattcacacagtgataatggtgtatatcactcttagacctgaaacc 18835550  T
Q  201 actatg 206  Q
    | ||||    
T  18835551 attatg 18835556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 19 - 194
Target Start/End: Original strand, 2375214 - 2375386
Alignment:
Q  19 atgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaa 118  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||| | ||    
T  2375214 atgatcacatcacacgtatcatggataatgagttatcaaattttcacataaatataaatattatgagtaatatgtatattggattgaccctccattataa 2375313  T
Q  119 tactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacct 194  Q
    | |||||||  |||||||||| |||   |||| || ||||||||||||||| |||||||||||| ||| || |||||    
T  2375314 ttctacata--aaaagttatgtaaa-actcat-agttattctcatagtgataagtggtgtattcaaccatttgacct 2375386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 64 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 2963171 - 2962932
Alignment:
Q  64 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaa---agtgtcataagatattct 160  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |  ||  ||||||||||||||||| |  |||||| |   | ||||||||||||||||    
T  2963171 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggatagacctaccgcgagaatactacatagtaca--ttatgagattaattgtcataagatattct 2963074  T
Q  161 catagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaac 260  Q
    || | ||||| | | ||||  | | ||| |||||||||||||||||  ||||||| || ||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| | ||     
T  2963073 cacaatgataatagcgtatatccctcttagacctgaaaccactatgatccctagacgt-ggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgcaaa 2962975  T
Q  261 aggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 303  Q
    ||||| || |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  2962974 aggataaccataacgttggttgatggttacttgatgaatcatg 2962932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 196 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 24796826 - 24796731
Alignment:
Q  196 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactcc 293  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  || |||| |  ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  24796826 aaaccactatataccctagatgttggagtcgagtgctttatcaccattcaatcgt--tctgtaatataatggctataaaattggttgatgggtactcc 24796731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 100 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 20535409 - 20535226
Alignment:
Q  100 gattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaac 199  Q
    |||||| || ||||||||||| | |||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||| ||| |||||| |||    
T  20535409 gattgacccaccatgagaatattgcatagtat--gttatgaaa-gtgtcataagatattctcacaatgataatggtgtataccactcttagacctggaac 20535313  T
Q  200 cactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 287  Q
    |||||||  || || ||  |||| || |||||||| |  ||||||||||||||||  ||||||||| || |||| ||||||| |||||    
T  20535312 cactatgatccttaaat-atggactcaagtgctttattgccattcaaacgttgtctataacaggataaccataatgttggttaatggg 20535226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 27 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 32872837 - 32872741
Alignment:
Q  27 atctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatacta 123  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| |  |||| |||||| | |||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  32872837 atctcacagatcatgaataaagaggtatcaagtctttacatcggcataagtattagtaataatatttatattgaattgatctgtcatgagaatacta 32872741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 29645539 - 29645631
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatattt 93  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||||||||  | ||||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||||||||    
T  29645539 tattacgtgggtaaactgatgaccacatctcatggttcatgcataaagatttatcaactcttcacatatatataaacattaagagtaatattt 29645631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 190 - 308
Target Start/End: Original strand, 36970439 - 36970556
Alignment:
Q  190 gacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggta 289  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| ||| || ||||||||||  |||||| |||||| |  |||| ||| | || |||| |||||||||||||||    
T  36970439 gacctgaaaccactatgatccctagatgt-ggactcaagtgctttgttgccattctaacgttatatgtaaaagggtaacaataacgttggttgatgggta 36970537  T
Q  290 ctccatgaatcatgatgat 308  Q
    ||  |||||||||| ||||    
T  36970538 cttgatgaatcatgctgat 36970556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 190 - 307
Target Start/End: Original strand, 2375411 - 2375528
Alignment:
Q  190 gacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggta 289  Q
    |||||||||| | ||| |||| ||||||| |||||||||| ||||||  | || ||||| |  |||| ||  |||| |||||||||| |||||||||||     
T  2375411 gacctgaaactattatttaccatagatgtaggagtcgagtactttgttgctatacaaacatcatccgcaattggataactataaagtcggttgatgggtg 2375510  T
Q  290 ctccatgaatcatgatga 307  Q
    |||||||||| |||||||    
T  2375511 ctccatgaattatgatga 2375528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 276
Target Start/End: Original strand, 29645675 - 29645797
Alignment:
Q  154 atattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgt 253  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | |||| |||||||||||||  ||| ||| ||||||| | ||| || | | ||||||   | |||||| |||||    
T  29645675 atattctcatagtgatagtgatgtacttcaccattcgacctgaaacttctacgtatcctagatataggattcaatttctttgtagacgttcaaatgttgt 29645774  T
Q  254 ccgtaacaggatgactataaagt 276  Q
      |||| ||||||||||||||||    
T  29645775 ttgtaaaaggatgactataaagt 29645797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 95
Target Start/End: Original strand, 10920427 - 10920479
Alignment:
Q  43 ataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 95  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  10920427 ataaagagttatcaaatattcacatatgtataaatattatgagtaatatttat 10920479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 15 - 70
Target Start/End: Original strand, 24535514 - 24535569
Alignment:
Q  15 actgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacataga 70  Q
    ||||||||||| |||| || ||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  24535514 actgatgatcatatcttacggatcatgaataatgagttatcaagttttcacataga 24535569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 70 - 129
Target Start/End: Original strand, 34659059 - 34659118
Alignment:
Q  70 atataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagt 129  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||    
T  34659059 atatatatattaggactaatatttatattggatttatccaccatgcaaatactaaatagt 34659118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 64 - 103
Target Start/End: Original strand, 36970332 - 36970371
Alignment:
Q  64 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggatt 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36970332 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggatt 36970371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 242 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 8968076 - 8968015
Alignment:
Q  242 ttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 303  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||| |||||||| |  ||||||||||||||| |||||||    
T  8968076 ttcaaacgttgtccataaaaagatgattataaagtcgactgatgggtactccataaatcatg 8968015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 243 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 41368154 - 41368106
Alignment:
Q  243 tcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtact 291  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| || ||||||    
T  41368154 tcaaacgttgtctgtaacatgataactataaagttggttaataggtact 41368106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 243 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 41375125 - 41375077
Alignment:
Q  243 tcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtact 291  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| || ||||||    
T  41375125 tcaaacgttgtctgtaacatgataactataaagttggttaataggtact 41375077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0433 (Bit Score: 295; Significance: 1e-166; HSPs: 1)
Name: scaffold0433
Description:

Target: scaffold0433; HSP #1
Raw Score: 295; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 7292 - 7594
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7292 tattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 7391  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  7392 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaca 7491  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7492 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 7591  T
Q  301 atg 303  Q
    |||    
T  7592 atg 7594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390 (Bit Score: 295; Significance: 1e-166; HSPs: 2)
Name: scaffold0390
Description:

Target: scaffold0390; HSP #1
Raw Score: 295; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 6956 - 6654
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6956 tattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 6857  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6856 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 6757  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6756 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccataacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 6657  T
Q  301 atg 303  Q
    |||    
T  6656 atg 6654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390; HSP #2
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 13972 - 13670
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13972 tattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacaaagatataaatattaggagtaatatttatattgg 13873  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13872 attgatccgccatgagaatactacataataaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 13773  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13772 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggttactccatgaatc 13673  T
Q  301 atg 303  Q
    |||    
T  13672 atg 13670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0186 (Bit Score: 295; Significance: 1e-166; HSPs: 1)
Name: scaffold0186
Description:

Target: scaffold0186; HSP #1
Raw Score: 295; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 26012 - 25706
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26012 tattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagacttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 25913  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25912 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 25813  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25812 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccataaatc 25713  T
Q  301 atgatga 307  Q
    |||||||    
T  25712 atgatga 25706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 295; Significance: 1e-166; HSPs: 47)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 295; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Original strand, 15152628 - 15152926
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15152628 tattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 15152727  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15152728 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 15152827  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15152828 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaat 15152926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 295; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 29327969 - 29328271
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29327969 tattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 29328068  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29328069 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 29328168  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29328169 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttgcttgatgggtactccatgaatc 29328268  T
Q  301 atg 303  Q
    |||    
T  29328269 atg 29328271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 11536084 - 11535782
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11536084 tattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacaaagatataaatattaggagtaatatttatattgg 11535985  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||    
T  11535984 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtgatgtattccaacattcgacctgaaacc 11535885  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11535884 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 11535785  T
Q  301 atg 303  Q
    |||    
T  11535784 atg 11535782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 11543002 - 11542700
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11543002 tattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 11542903  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11542902 attgatccgccatgagaatactacatagtaaatgttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtgatgtattccacccttcgacctgaaacc 11542803  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11542802 actatgtaccctagatgctggagtcgagtgatttgtcaccattcaaacgttgtctgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 11542703  T
Q  301 atg 303  Q
    |||    
T  11542702 atg 11542700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 12751011 - 12751313
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12751011 tattatgtggatagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaattcttctcatagatataaatattatgagtaatatttatattgg 12751110  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12751111 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 12751210  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12751211 actaggtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggatactccatgaatc 12751310  T
Q  301 atg 303  Q
    |||    
T  12751311 atg 12751313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 12738721 - 12739023
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||    
T  12738721 tattatgtgggtagactgaagatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattactcataatatttatattgg 12738820  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  12738821 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccgttcgacctgaaact 12738920  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12738921 actatgtaccctagatgttgtagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtttgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 12739020  T
Q  301 atg 303  Q
    |||    
T  12739021 atg 12739023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 18561192 - 18561485
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18561192 tattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 18561291  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18561292 attgaccctctatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataa---------atagtgatagtggtgtattccacccttcgacttgaaacc 18561382  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| || |||||    
T  18561383 actatgtaccctagatgttggagttgagtgatttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttgattgataggtactgcacgaatc 18561482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 18 - 303
Target Start/End: Original strand, 13392352 - 13392637
Alignment:
Q  18 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 117  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| |||||||| || ||||| ||    
T  13392352 gatgatcacatctcacggatcatagataaagagttatcctgtcttcacataggaataaatattaggagaaatatttatactggattgacccaccatgcga 13392451  T
Q  118 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatg 217  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  13392452 atattacatagtaaaatttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctttgacctaaaatcactatgtaccatagatg 13392551  T
Q  218 ttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 303  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13392552 ttggagtcaggtgctttgtcaccatacaaacgttgtttgtaacaagatgactataaaattggttgatgggtactccatgaatcatg 13392637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 18257848 - 18257559
Alignment:
Q  17 tgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgag 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || || | ||    
T  18257848 tgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattaacccaccgtcag 18257749  T
Q  117 aatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagat 216  Q
    |||| ||||||||  | || ||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  18257748 aatattacatagt--atgtcatgaaaaatgtcataagatattctcacaatgataatggtgtatatcactcttagacctgaaaccactatgatccctagat 18257651  T
Q  217 gttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgatgatg 309  Q
    | |||| || ||||||||||  |||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||    
T  18257650 g-tggactcaagtgctttgttgccattcaaacgttgtgtgtaacaagataactataaagttggttgatgggtacttgaagaatcatgttgatg 18257559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 2204557 - 2204854
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||| ||| |||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2204557 tattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 2204655  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||    
T  2204656 attgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaacc 2204752  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    ||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  |||||||    
T  2204753 actatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatc 2204851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 8465004 - 8465301
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||| ||| |||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8465004 tattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 8465102  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||    
T  8465103 attgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaacc 8465199  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    ||||||  || |||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||| ||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  8465200 actatgatccttagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacattgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatc 8465298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 18400109 - 18400406
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||| ||| |||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18400109 tattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 18400207  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||    
T  18400208 attgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttggacctgaaacc 18400304  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    ||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  |||||||    
T  18400305 actatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatc 18400403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 18407093 - 18407390
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||| ||| |||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18407093 tattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 18407191  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||    
T  18407192 attgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttggacctgaaacc 18407288  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    ||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  |||||||    
T  18407289 actatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatc 18407387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 48808793 - 48808496
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||| ||| |||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48808793 tattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 48808695  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||    
T  48808694 attgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaacc 48808598  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    ||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  |||||||    
T  48808597 actatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatc 48808499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 63 - 303
Target Start/End: Original strand, 2365169 - 2365407
Alignment:
Q  63 cacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctca 162  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| ||| ||||||||   |||||||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  2365169 cacatagatatcaatattaggagtaatatttacattggattgacccaccatgaaaatgctacatag--gaagttatgtaaa-tgtcataagttattctca 2365265  T
Q  163 tagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaaca 261  Q
    | ||||| ||||||||||| |||| |||||||| || |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||   | | ||||||| ||||||||||    
T  2365266 ttgtgataagtggtgtatttcaccattcgacctaaagccactatgtaccctagaccttggagtcaagtactttgttgtcgtacaaacgtcgtccgtaaca 2365365  T
Q  262 ggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 303  Q
    |  |||||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||    
T  2365366 gattgactataaagtcggttgatgagtgctcaacgaatcatg 2365407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 15729756 - 15730053
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||| ||| |||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15729756 tattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacatagatataaatattagaagtaatatttatattgg 15729854  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||    | ||| |||||||||||    
T  15729855 attgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattgctcttagacctgaaacc 15729951  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    ||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  15729952 actatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgatgaatc 15730050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 18139635 - 18139338
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||| ||| |||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18139635 tattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaggtctatacatagatataaatattaggagtaatatttgtattgg 18139537  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||    
T  18139536 attgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaacc 18139440  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    ||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  18139439 actatgatctctagatg-tggattcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataataataacgttggttgatgggtacttgatgaatc 18139341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 19230893 - 19231190
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||| ||| |||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19230893 tattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatactgg 19230991  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||| || || |||||||||||||||  | |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||    
T  19230992 attgacccaccgtgagaatactacata--ataagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaacc 19231088  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    ||||||  ||||| ||| |||| || |||| |||||  |||||| ||||||||  |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  19231089 actatgatccctaaatg-tggactcaagtgttttgttgccattctaacgttgtttgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatc 19231187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 291
Target Start/End: Original strand, 30254143 - 30254428
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||| ||| |||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30254143 tattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttgtattgg 30254241  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||   || ||| ||| |||||||    
T  30254242 attgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattactcttagacttgaaacc 30254338  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtact 291  Q
    ||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||    
T  30254339 actatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtact 30254428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 64 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 41681203 - 41680968
Alignment:
Q  64 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 163  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  41681203 acataggtataaatattatgagtaatatttatactggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 41681107  T
Q  164 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 263  Q
    | ||||| | ||||||  | | ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||| ||||| |||| |||    
T  41681106 aatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacattgtctgtaaaagg 41681008  T
Q  264 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 303  Q
    || || |||| |||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  41681007 ataaccataacgttggttgattggtacttgatgaatcatg 41680968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 301
Target Start/End: Original strand, 10235357 - 10235644
Alignment:
Q  11 gtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgc 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||||  | |    
T  10235357 gtaaactgatgatcacatctcacagatcattgataaagagttatcaggtgttcccatatgtataaatattaggaataatatttatatcggattgactcac 10235456  T
Q  111 catgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttc-gacctgaaaccactatgtac 209  Q
    |||||||||  |||||||  |  ||||||  ||| |||||||| |||| |  || ||||| || || ||  || ||||| ||| ||||||||||||  ||    
T  10235457 catgagaattatacatag--agtgttatg-taagagtcataagttattattgtaatgataatgatgcatatcatccttctgacatgaaaccactatcgac 10235553  T
Q  210 cctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 301  Q
    ||||||||| || ||||||  || |||  ||||| ||   |||| |||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  10235554 cctagatgtagg-gtcgagaactgtgttgccatttaattattgttcgtagcaggatgaccataaactcggttgatgggtactccataaatca 10235644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 10669199 - 10668901
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||| ||| |||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| | |    
T  10669199 tattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttatactag 10669101  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctc-atagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaac 199  Q
    ||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||   | ||||| | ||||||  | | ||| ||||||||||    
T  10669100 attgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcgcaattgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaac 10669004  T
Q  200 cactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaat 299  Q
    |||||||  || || ||| |||| || | ||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||||||    
T  10669003 cactatgatccgtaaatg-tggactcaaatgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataaaaataacgttggttgatgggtacttgatgaat 10668905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 64 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 47167094 - 47166871
Alignment:
Q  64 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 163  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||| || || || |||||||||||||||||  |||||||| | | ||||||||||||||||||     
T  47167094 acataggtataaatattatgagtaatatttatactagatagacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-agattgtcataagatattctcac 47166998  T
Q  164 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 263  Q
    | ||||| | ||||||  | | ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||| ||||||   ||||| ||||||||| |||| |||    
T  47166997 aatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtactttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaagg 47166899  T
Q  264 atgactataaagttggttgatgggtact 291  Q
    || || |||| |||||||||||||||||    
T  47166898 ataaccataacgttggttgatgggtact 47166871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 24443624 - 24443349
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||| ||| |||||||| |||||||||  | ||||| ||| | || ||| |||| |  |||||| ||| |||||||||||||||||||||| | |    
T  24443624 tattatgtatgtagactgatgaccacatctcatgggtcatgaatata-agatattaagtttatacataggtatgaatattaggagtaatatttatactag 24443526  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||| | || || ||||| |||||||||||  | |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||  ||| ||| ||| |||||||    
T  24443525 attaacccaccgtgagagtactacatagt--atgttatgaaaa-tgtcataagttattctcacagtgataatggtgtataacactcttagacttgaaacc 24443429  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 281  Q
    | ||||  ||||||||| |||| || |||||||| |    |||||||||||||  ||||||||||||| |||| |||||||    
T  24443428 attatgatccctagatg-tggactcaagtgctttattgttattcaaacgttgtgtgtaacaggatgaccataacgttggtt 24443349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 71 - 303
Target Start/End: Original strand, 34128647 - 34128875
Alignment:
Q  71 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    ||||||||||||||||||   ||||||| |  |||||||||||||||||| | | |||    
T  34128647 tataaatattaggagtaatatttatactggatagatccattgtgagaatactacatagtac--gttatgagat-tgtcataagatattctcacaattata 34128743  T
Q  171 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgacta 270  Q
     | ||||||  | | ||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||| || ||| ||||||   ||||| ||||||||| |||| ||||| || |    
T  34128744 atagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatgt-ggactcaagtactttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataacca 34128842  T
Q  271 taaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 303  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  34128843 taacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 34128875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 64 - 303
Target Start/End: Original strand, 28130628 - 28130863
Alignment:
Q  64 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 163  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| || |  |||||||| ||||||||  | |||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  28130628 acataggtataaatatcaggagtaatatttatactggattgacccactgtgagaatattacatagt--atgttatg-aaattgtcataagatattctcac 28130724  T
Q  164 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 263  Q
    | | ||| | ||||||  ||  ||| ||||||||| |||||||  || |||||| |||| || ||||||||||   ||||| ||||||||| |||| |||    
T  28130725 aataataatagtgtatatcattcttagacctgaaatcactatgatccgtagatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaagg 28130823  T
Q  264 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 303  Q
    || || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  28130824 ataaccataacgttggttgatgggtacttaatgaatcatg 28130863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 64 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 18259359 - 18259124
Alignment:
Q  64 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 163  Q
    |||||| ||||||||||   ||||||||||||| ||||| || || || |||||||||| ||||||||  ||||||| |  ||||||||||||||||||     
T  18259359 acataggtataaatattgaaagtaatatttatactggatagacccaccgtgagaatactgcatagtaa--gttatgagat-tgtcataagatattctcac 18259263  T
Q  164 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 263  Q
    | ||||| | ||||||  | | ||| |||||||||||  ||||  |||||||||| ||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| |||    
T  18259262 aatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaacccttatgatccctagatgt-ggactcaagtactttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 18259164  T
Q  264 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 303  Q
    || || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  18259163 ataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 18259124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 75 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 25845700 - 25845498
Alignment:
Q  75 aatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtgg 174  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  | || |||||||||||||||||  | |||||||||| | |||||||||||||||| | | ||| ||     
T  25845700 aatattaggagtaatatttatactggattgacacaccgtgagaatactacatagt--atgttatgaaaa-tatcataagatattctcaaaataataatga 25845604  T
Q  175 tgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaa 274  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||| ||||  ||||||||| |||| || |||||||| |  |||||||||| || || |||| | ||| |||||||     
T  25845603 tgtataccactcttagacctgaaaccattatgatccctagatg-tggactcaagtgctttatttccattcaaaccttatctgtaaaaagataactataac 25845505  T
Q  275 gttggtt 281  Q
    |||||||    
T  25845504 gttggtt 25845498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 75 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 25846119 - 25845917
Alignment:
Q  75 aatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtgg 174  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  | || |||||||||||||||||  | |||||||||| | |||||||||||||||| | | ||| ||     
T  25846119 aatattaggagtaatatttatactggattgacacaccgtgagaatactacatagt--atgttatgaaaa-tatcataagatattctcaaaataataatga 25846023  T
Q  175 tgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaa 274  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||| ||||  ||||||||| |||| || |||||||| |  |||||||||| || || |||| | ||| |||||||     
T  25846022 tgtataccactcttagacctgaaaccattatgatccctagatg-tggactcaagtgctttatttccattcaaaccttatctgtaaaaagataactataac 25845924  T
Q  275 gttggtt 281  Q
    |||||||    
T  25845923 gttggtt 25845917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 64 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 19393659 - 19393462
Alignment:
Q  64 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 163  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||| |  || |||||||||||||||||  | |||||||||| | ||||||||||||||||     
T  19393659 acataggtataaatattaggagtaatatttatactagattgaccgaccgtgagaatactacatagt--atgttatgaaaa-tctcataagatattctcac 19393563  T
Q  164 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 263  Q
    | ||||| | ||||||  ||| ||| |||||||| ||| ||||  ||||||||||| || || |||||||||| ||| ||| || |||||| |||| |||    
T  19393562 aatgataatagtgtatatcactcttagacctgaatccagtatgatccctagatgtt-gactcaagtgctttgttacctttctaatgttgtctgtaaaagg 19393464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 71 - 218
Target Start/End: Original strand, 19388626 - 19388774
Alignment:
Q  71 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaa--aagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtga 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||  |   |||||||||||||||||   |  | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  19388626 tataaatattaggagtaatatttatactggattgcccaatcatgagaatactacatatatagtatgttatgaaa-gtgtcataagatattctcatagtgg 19388724  T
Q  169 tagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgt 218  Q
    || | |||||| |||| ||| |||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  19388725 taatagtgtataccactcttagacctgaaaccattatgagccctagatgt 19388774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 71 - 303
Target Start/End: Original strand, 14591924 - 14592153
Alignment:
Q  71 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||| |||    |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||    
T  14591924 tataaatattaggagtaatatttatactggattgacccaccgtgagaatactacacagt--ttgttatgaaaa-tgtcataagatattctcagattgata 14592020  T
Q  171 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgacta 270  Q
     | ||||||  ||| ||| ||| |||||||||||||  ||||| |||| |   |  | | |||| |  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |    
T  14592021 atagtgtatatcactcttagacttgaaaccactatgatccctatatgtggacttacatttctttattgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacca 14592120  T
Q  271 taaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 303  Q
    ||| ||||| | |||||||||  ||||||||||    
T  14592121 taacgttggctaatgggtacttgatgaatcatg 14592153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 71 - 303
Target Start/End: Original strand, 16011515 - 16011744
Alignment:
Q  71 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| | |||    |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||    
T  16011515 tataaatattaggagtaatatttatactggattgacccaccatgagaatactatacagt--ttgttatgaaaa-tgtcataagatattctcacattgata 16011611  T
Q  171 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgacta 270  Q
     |  |||||  ||| ||| |||||||||||||||||  ||||| |||| |   |  | | |||| |  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |    
T  16011612 ataatgtatatcactcttagacctgaaaccactatgatccctatatgtggacttacatttctttattgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacca 16011711  T
Q  271 taaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 303  Q
    ||| ||||| | |||||||||  ||||||||||    
T  16011712 taatgttggctaatgggtacttgatgaatcatg 16011744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 78 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 31190660 - 31190524
Alignment:
Q  78 attaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgt 177  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||   |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31190660 attaggagcaatatttatactggattgacccaccatgagaatactacattgtat--gttatgaata-tgtcttaagatattctcatagtgataatggtgt 31190564  T
Q  178 attccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatg 217  Q
    ||  |||  || ||||||||||||||| |  |||||||||    
T  31190563 atatcactgttagacctgaaaccactaagatccctagatg 31190524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 7662686 - 7662569
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    |||||||| | || ||||||||||| |||| ||  |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||| |    
T  7662686 tattatgtggatacactgatgatcatatcttacgaatcatgtataaaaacttatcaagtcttcacatagatataaa-attataagtaatatttttattag 7662588  T
Q  101 attgatccgccatgagaat 119  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  7662587 attgacccgccatgagaat 7662569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 71 - 203
Target Start/End: Original strand, 22969024 - 22969153
Alignment:
Q  71 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 170  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||   |||||| || || |||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||    
T  22969024 tataaatattaggagtaatgtttatacaagattgacccaccgtgagaatactacatagt--atgttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgata 22969120  T
Q  171 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccact 203  Q
      ||||||| |||| ||| |||||||| |||||    
T  22969121 acggtgtataccactcttagacctgaagccact 22969153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 155 - 292
Target Start/End: Original strand, 39112138 - 39112275
Alignment:
Q  155 tattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtc 254  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||   ||| || ||||| |||||||||| |||||||| ||| || |||  |||||   | |||||||||||||    
T  39112138 tattctcttagtgatagtggtgtattccattattcaacatgaaatcactatgtactctagatgtaggaatcaagtattttgttgtcgttcaaacgttgtc 39112237  T
Q  255 cgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactc 292  Q
     |||| | | |||||||||||||||||||| |||||||    
T  39112238 tgtaataaggtgactataaagttggttgataggtactc 39112275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 47833979 - 47833875
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||| |||||||  ||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||    ||||||||||||| |    
T  47833979 tattacgtaggtaggctggtgatcagatctcaccgatcatgaataaagagttaccaagttttcacataggtataaatattactcataatatttatatttg 47833880  T
Q  101 attga 105  Q
    |||||    
T  47833879 attga 47833875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 115 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 15169474 - 15169290
Alignment:
Q  115 agaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctag 214  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||| | || ||| | ||| |||||||||||  ||| ||    
T  15169474 agaatactacatagtat--gttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgataatggtgtatgctactcttagtcctaaaaccactatgatcccaag 15169378  T
Q  215 atgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 303  Q
    ||| |||| |  | |||||| |  ||||||||||||| ||  ||||||||| || |||| |||||||||| || |||  ||||||||||    
T  15169377 atg-tggacttaaatgctttattgccattcaaacgttatctataacaggataaccataacgttggttgataggcacttgatgaatcatg 15169290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 74
Target Start/End: Original strand, 7396390 - 7396450
Alignment:
Q  14 aactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatata 74  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  7396390 aactgatgatcacatctcacatatcatgaataaagaattatcaagtattcacataaatata 7396450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 96
Target Start/End: Original strand, 19859127 - 19859221
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttata 96  Q
    ||||||||| ||| |||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19859127 tattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttata 19859221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 22948574 - 22948499
Alignment:
Q  154 atattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagt 229  Q
    |||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  22948574 atattctcgtagtaatagtcgtgtatgccacccttcgacatgaaaccgctatgtaccttagatgtaggagttgagt 22948499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 15 - 129
Target Start/End: Original strand, 3132873 - 3132986
Alignment:
Q  15 actgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatg 114  Q
    |||||||||||||||||| |||| |  ||  | ||| |||||||||||||||||  ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||| | | |||     
T  3132873 actgatgatcacatctcatagataaatgaatatgagatatcaagtcttcacatatgtataattattatgt-taatatttatattggattgacctgtcata 3132971  T
Q  115 agaatactacatagt 129  Q
    |||||||||||||||    
T  3132972 agaatactacatagt 3132986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Original strand, 15148327 - 15148363
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagat 37  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15148327 tattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagat 15148363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 30 - 85
Target Start/End: Original strand, 29983179 - 29983234
Alignment:
Q  30 tcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggag 85  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||  |||||||||||||||    
T  29983179 tcacggatcatggataaagagttaacaaattttcacatatgtataaatattaggag 29983234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 61 - 103
Target Start/End: Original strand, 7396469 - 7396511
Alignment:
Q  61 ttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggatt 103  Q
    |||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  7396469 ttcacataaatataaatattatgggtaatatttatattggatt 7396511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 149 - 213
Target Start/End: Original strand, 29984308 - 29984372
Alignment:
Q  149 ataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtacccta 213  Q
    |||||||||||||||||||  |||| || ||  |||||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  29984308 ataagatattctcatagtggaagtgatgcatatcacccttcaacttgaaaccaccatgtacccta 29984372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 291; Significance: 1e-163; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 18473 - 18774
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18473 tattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 18572  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18573 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 18672  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18673 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgat-ggtactccatgaatc 18771  T
Q  301 atg 303  Q
    |||    
T  18772 atg 18774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 283; Significance: 1e-158; HSPs: 27)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 21330270 - 21329968
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21330270 tattatgtaggtggactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattgg 21330171  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21330170 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 21330071  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  21330070 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagtaggttgatggggactccatgaatc 21329971  T
Q  301 atg 303  Q
    |||    
T  21329970 atg 21329968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 18796691 - 18796993
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18796691 tattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 18796790  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18796791 attgatcctctatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatggtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 18796890  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  18796891 actatgtaccctaaatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtacgtaacaggatgactataaagtttgttgatgggtacaccatgaatc 18796990  T
Q  301 atg 303  Q
    |||    
T  18796991 atg 18796993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Original strand, 18619989 - 18620296
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    |||||||| ||||  | |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |    
T  18619989 tattatgtgggtaggccgatgatcacatctcacggatcatagataaagagttatcatgtcttcacataggtataaatattaggagtaatatttatactag 18620088  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  18620089 attgacccaccatgagaatactacatagtaaaagttatg-aaagtgtcataagatattctcatggtgatattggtgtatcccaccctttgacctgaaacc 18620187  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |   |||  |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  18620188 actatgtaccctaaatgttggagtcgagtgctttatcaccattcacattatgtatgtaacaagatgaccataaagttggttgatgggtactccactaatc 18620287  T
Q  301 atgatgatg 309  Q
    ||| |||||    
T  18620288 atgctgatg 18620296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 36270351 - 36270650
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    |||| ||| |||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36270351 tattgtgtgggtagactgatgatcacatctcacgagtcatagagaaagagttatcaagttttcacttcgatttaaatattaggagtaatatttatattgg 36270450  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaac 199  Q
    |||||  ||||||||||||  |||||||  ||| ||||| |||| |||| |||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  36270451 attgactcgccatgagaatgttacatag--aaaattatgtaaag-gtcacaagtcattctcatagtgataagtggtgtatt-cacccttcgacctaaaac 36270546  T
Q  200 cactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaat 299  Q
    ||| ||| |||||||||||  ||||||| | ||||||  || | |||| || || |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  36270547 caccatgcaccctagatgtatgagtcgaatactttgttgccgtacaaaagtcgttcgtaacaggatgactataaagtcggttgttgggtactcaatgaat 36270646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 32 - 303
Target Start/End: Original strand, 20978091 - 20978360
Alignment:
Q  32 acagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaa 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || || |  |    
T  20978091 acagatcatggataaagagttatcaagtcttcaccgagatataattattatgagtaatatttatattggattgacccgccatgagaattttatatgg--a 20978188  T
Q  132 aagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 230  Q
    || ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||| || |||||||||||||||||| ||| ||||||     
T  20978189 aaattatgaaaa-tgtcataagttattctcgtagtgataagtggtgtattccactctttgacatgacactactatgtaccctagatgtaggattcgagta 20978287  T
Q  231 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 303  Q
    |||||    |||  |||||| |||||||||| ||| |||||||||| | ||||||| |||||||  |||||||    
T  20978288 ctttgatgtcatataaacgtagtccgtaacatgataactataaagtcgattgatggatactccacaaatcatg 20978360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 6992136 - 6991847
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagt--cttcacatagatataaatattaggagtaatatttatatt 98  Q
    |||||| | |||| ||| ||||||| ||||||||||| ||  ||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  6992136 tattatatgggtagactaatgatcatatctcacagattataaataaagatttatcaagtatcttcacataggtataaatctcaggagtaatatttatatt 6992037  T
Q  99 ggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata-gtggtgtattccacccttcgacctgaa 197  Q
    |||||||||| |||| ||||  |||||||| |||  ||||| || ||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  6992036 ggattgatcctccataagaacgctacatagaaaa--ttatgtaa-gtgacataaactattctcatagtgataagtggtgtattccacccttcggcctgaa 6991940  T
Q  198 accactatgtaccctagatgttggagtcgagtgc-tttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggta 289  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||  |  || ||||||||||  | ||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  6991939 atcactatgttccctagatgtaggagtcgagtacttttgtttctgtttaaacgttgtctatgacacgatgactataaagtcggttgatgggta 6991847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 291
Target Start/End: Original strand, 18822282 - 18822556
Alignment:
Q  15 actgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatg 114  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18822282 actgatgatcacatatcacggatcattgataaggagttatcaacttttcacatagatataaatattaatggtaatatttatattggattgatctgccatg 18822381  T
Q  115 agaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtacccta 213  Q
    ||| |  ||||||  ||| |||||| ||||  ||  |||  |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18822382 agattgttacata--aaacgttatgtaaag-atctcaagtcattctcatatagataagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactgtgtacccta 18822478  T
Q  214 gatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtact 291  Q
    ||||| |||||| ||| |||| |   |||  ||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||    
T  18822479 gatgtaggagtcaagtacttttttgtcatataaacgtcatccgtaacacaatgactataaagttggttaatgggtact 18822556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 17 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 22183489 - 22183206
Alignment:
Q  17 tgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgag 116  Q
    ||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||     
T  22183489 tgatgatcaaatctcacagatctttgataaggagttatcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgac 22183391  T
Q  117 aatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 215  Q
    |||  ||||||   || |||||| |||  |||| | |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||| || ||    
T  22183390 aatgttacata--taatgttatgtaaa-agtcacaggtcattctcatagtgataagtggtgtattccaccctttgacctgaaaccaacgtgtactcttga 22183294  T
Q  216 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 303  Q
    ||| |||||||||| ||||||     | ||||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||||||| |  ||||||||||    
T  22183293 tgtaggagtcgagtactttgttgttgtacaaacgttgtttgtaacaggatgactataaagtcgattgatgggtatttgatgaatcatg 22183206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 30174382 - 30174679
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||| ||| |||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30174382 tattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 30174480  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||    
T  30174481 attgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaacc 30174577  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    ||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  |||||||    
T  30174578 actatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatc 30174676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 24250329 - 24250032
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||| ||| |||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24250329 tattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 24250231  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||    
T  24250230 attgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaacc 24250134  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    ||||||  | ||||||| |||| || |||| |||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  |||||||    
T  24250133 actatgatctctagatg-tggactcaagtgttttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatc 24250035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 24229512 - 24229215
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||| ||| |||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24229512 tattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatggttcatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttatactgg 24229414  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||  | | ||| | | |||||||    
T  24229413 attgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagccttgaaacc 24229317  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    ||||||  ||||||||| | || || ||||||||||   ||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||| |||||||  |||||||    
T  24229316 actatgatccctagatg-tagactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgaagggtacttgatgaatc 24229218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 64 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 15342237 - 15342014
Alignment:
Q  64 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 163  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | || || ||| ||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||| |||||     
T  15342237 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggattaacccaccgtgaaaatactacatagtat--gttatgaaa-gtgtcataagatagtctcac 15342141  T
Q  164 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 263  Q
    | |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||| || | || | |||||| |  | |||||||  ||||  ||||||||    
T  15342140 aatgatagtggtgtatgccactcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tgaactcaaatgctttattgcaattcaaaaattgtttgtaacagg 15342042  T
Q  264 atgactataaagttggttgatgggtact 291  Q
    ||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  15342041 atgaccataacgttggttaatgggtact 15342014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 71 - 305
Target Start/End: Original strand, 29800545 - 29800775
Alignment:
Q  71 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||  | ||||| |||||||| | | |||||||||| |  ||||    
T  29800545 tataaatattaggagtaatatttatactggattgacccaccgtgagaatactacatagt--atgttat-aaaagtgtaacatgatattctcacaaggata 29800641  T
Q  171 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgacta 270  Q
     |||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||  ||||||||| |||| || |||||||| |   ||||||||| ||||| |||||||||| |  |    
T  29800642 atggtgtataccactcttagacttgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttattgtcattcaaacattgtctgtaacaggataatca 29800740  T
Q  271 taaagttggttgatgggtactccatgaatcatgat 305  Q
    ||| ||||||| ||||| |||  | ||||||||||    
T  29800741 taatgttggttaatgggcacttgacgaatcatgat 29800775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 18852081 - 18851956
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    |||||||| |||| ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18852081 tattatgtcggtagactaatgatcccatctcacggatcatgaataaagagttatcaagtcttcaaatatgtataaatattaagagtaatatttatattgg 18851982  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacat 126  Q
    |||||  ||| || |||||| |||||    
T  18851981 attgactcgctataagaatattacat 18851956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 19 - 128
Target Start/End: Original strand, 19279491 - 19279600
Alignment:
Q  19 atgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaa 118  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  19279491 atgatcacatctcacgtatcatggataaaaagttatcaagttttcagatagatatagatatttggagtaatatttatattggattgacacgtcatgagaa 19279590  T
Q  119 tactacatag 128  Q
    ||| ||||||    
T  19279591 taccacatag 19279600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 140 - 303
Target Start/End: Original strand, 17241034 - 17241196
Alignment:
Q  140 aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcac 239  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||| ||| |||| ||||    
T  17241034 aaaagtgtaataagatattctcatagtgataatggtgtatttcacc-ttcgacctaaaaccactatgtactgtagatgtaggagtcaagtactttatcac 17241132  T
Q  240 cattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 303  Q
    |  |||||||||||  |||||| || | ||||||| | ||| |||  ||||| |||||| ||||    
T  17241133 cgctcaaacgttgtgtgtaacatgaagcctataaaatcggtagatatgtacttcatgaaacatg 17241196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 71 - 218
Target Start/End: Original strand, 19616509 - 19616653
Alignment:
Q  71 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 170  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  || ||||| || || ||||||||||||||||||    ||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  19616509 tataaatattaggagtaacatttattctgaattgacccaccgtgagaatactacatagtatt--ttatgaaaa-tgtcatatgatattctcacagtgata 19616605  T
Q  171 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgt 218  Q
     | ||||||  ||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  19616606 atagtgtatatcactcttagacctgaaaccactatgatccctagatgt 19616653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 2 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 36802003 - 36801899
Alignment:
Q  2 attatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacat-agatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    |||||||  ||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||||||| | |||||||||||||||     
T  36802003 attatgtgagtagactgatgatcacacctcacaaatcattgataatgagttatcaagtcttcgcataaaatataaatattaagggtaatatttatattga 36801904  T
Q  101 attga 105  Q
    |||||    
T  36801903 attga 36801899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 71 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 40301164 - 40301034
Alignment:
Q  71 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 170  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||   |||||| || ||||||||||||||||||  | | ||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40301164 tatacatattagaagtaatatttataccagattgacccaccatgagaatactacata--acatgttatg--aagtgtcataagatagtctcatagtgata 40301069  T
Q  171 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactat 205  Q
     || ||||| |||| ||| ||| ||||||||||||    
T  40301068 atgatgtataccactcttagacatgaaaccactat 40301034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 73 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 41316506 - 41316305
Alignment:
Q  73 taaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagt 172  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |  || || || ||||||||||| || ||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||      
T  41316506 taaatattatgagtaatatttatacttaatcgacccaccatgagaatattatatagtat--gttatgaaa-gtgtcataagatattctcatactgataac 41316410  T
Q  173 ggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactata 272  Q
    || | || |||  ||| |||||||| ||||||||  ||||||||| |||| |  || ||||| |   |||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  41316409 ggagaataccattcttagacctgaatccactatgatccctagatg-tggacttaagggctttattgtcattcaaacgttatctgtaacaggataactata 41316311  T
Q  273 aagttg 278  Q
    ||||||    
T  41316310 aagttg 41316305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 71 - 206
Target Start/End: Original strand, 21626824 - 21626955
Alignment:
Q  71 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 170  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||   ||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21626824 tataaataatatgagtaatatttatattgaattga-ccaccatgagaatactacacgctat--gttatgaaa-gtgtcataagatattctcatagtgata 21626919  T
Q  171 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatg 206  Q
     | |||| | ||||  || ||||||||| |||||||    
T  21626920 atagtgtctaccactgttagacctgaaatcactatg 21626955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 156 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 36799826 - 36799745
Alignment:
Q  156 attctcatagtgata-gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgt 236  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  36799826 attctcatagtgataagtggtgtattctaccgtttgacctgaaaccactatgcgccctagatgtaggagtcaagtactttgt 36799745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 236 - 303
Target Start/End: Original strand, 41661694 - 41661761
Alignment:
Q  236 tcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 303  Q
    |||||||||||||||||||  ||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41661694 tcaccattcaaacgttgtctataataagatgatcataaagttggttgatgggtactccatgaaacatg 41661761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 142 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 28740986 - 28740910
Alignment:
Q  142 aagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgt 218  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||  ||| || ||||||||||||||  ||||||||||    
T  28740986 aagtgtcataagacattctcataatgataatggtgtataccattcttagatctgaaaccactatgatccctagatgt 28740910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 28741323 - 28741220
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||    ||||| |||  ||| ||| |||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  28741323 tattatgtatgtagactgatgatcacatctcatgcgtcatgaatat-gagatattaagtatgtacataggtataaatattaggagtaatatttataccgg 28741225  T
Q  101 attga 105  Q
    |||||    
T  28741224 attga 28741220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 67 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 28719006 - 28718943
Alignment:
Q  67 tagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  |  | ||||||||||||| ||||    
T  28719006 tagatataaatattaggagtaatatttatacttgattgactcatcgtgagaatactacacagta 28718943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 24763792 - 24763751
Alignment:
Q  64 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattga 105  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  24763792 acataggtataaatattatgagtaatatttatactggattga 24763751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0657 (Bit Score: 248; Significance: 1e-138; HSPs: 1)
Name: scaffold0657
Description:

Target: scaffold0657; HSP #1
Raw Score: 248; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 1178 - 1461
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1178 tattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaaaagttatcaagtcttgccatagatataaatattaagagtaatatttatattgg 1277  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1278 attgatctgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtatcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 1377  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgat 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  1378 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggataaatataaagttggttgat 1461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 1)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Original strand, 5714 - 6013
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5714 tattatgtgggtagactgatgatcacatctcacaggtcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 5813  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatg-aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattcca-cccttcgacctgaaa 198  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||         ||| |||||| || |||||| |||||    
T  5814 attgatccgccatgtgaatactacatagtaaaagttatgaaaaagtgtcataagatattctcata---------gtgcattccatcctttcgacatgaaa 5904  T
Q  199 ccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaa 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5905 ccactatgtaccctagatgttggagtcaagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatcaa 6004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 47 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 230367 - 230111
Alignment:
Q  47 agagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtg 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  230367 agagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatctgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtg 230268  T
Q  147 tcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaa 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  230267 tcataagatattctcatagtgatagtggtgtattctacccttcgacctgaaaccattatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcactattcaa 230168  T
Q  247 acgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 303  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  230167 acgttgtctgtaacaagatgacaataaagttggttggtggatacaccatgaatcatg 230111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 188 - 485
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||| ||  |||||||| |||||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  188 tattatgtatgtcgactgatgaccacatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 286  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||    
T  287 attgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaacc 383  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    ||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  384 actatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatc 482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0264 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0264
Description:

Target: scaffold0264; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 3972 - 3675
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||| ||| |||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3972 tattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 3874  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||    
T  3873 attgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaacc 3777  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    ||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  |||||||    
T  3776 actatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatc 3678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 119735 - 120032
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||| ||| |||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  119735 tattatgtacgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 119833  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||    
T  119834 attgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaacc 119930  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    ||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  |||||||    
T  119931 actatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatc 120029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0466 (Bit Score: 89; Significance: 7e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0466
Description:

Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 64 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 13184 - 12961
Alignment:
Q  64 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 163  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || || |||||||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  13184 acataggtataaatattaggagtaatatttataccggattgacccaccgtgagaatactacatagt--atgttatg-aaattgtcataagatattctcat 13088  T
Q  164 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 263  Q
    | ||||| | ||||||  ||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || | ||||||||  |||||| ||||||||  |||| |||    
T  13087 aatgataatagtgtatatcactcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaattgctttgttgccattctaacgttgtttgtaaaagg 12989  T
Q  264 atgactataaagttggttgatgggtact 291  Q
    || || ||||||||||||||||||||||    
T  12988 ataaccataaagttggttgatgggtact 12961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 89; Significance: 7e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 64 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 67609 - 67374
Alignment:
Q  64 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 163  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| | | |||||| |||||||||||     
T  67609 acataggtataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-agattgtcatgagatattctcac 67513  T
Q  164 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 263  Q
    | ||||| | ||||||  | | ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| |||    
T  67512 aatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgtaaaagg 67414  T
Q  264 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 303  Q
    || || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  67413 ataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 67374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 86; Significance: 4e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 130521 - 130262
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||| ||| |||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  130521 tattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 130423  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||    
T  130422 attgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaacc 130326  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggat 265  Q
    ||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| |||||    
T  130325 actatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggat 130262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 64 - 303
Target Start/End: Original strand, 26609 - 26844
Alignment:
Q  64 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 163  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||| |||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||     
T  26609 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggattgacccaccttgagaatactatatagt--atgttatgaaaa-tgtcataagatattctcac 26705  T
Q  164 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 263  Q
    ||||||| | ||||||  ||| ||| |||||||||||||||||  ||||| ||| |||| ||||||||||| |   ||||  || |||||| |||| |||    
T  26706 agtgataatagtgtatatcactcttagacctgaaaccactatgatccctatatg-tggactcgagtgctttattgtcattttaatgttgtctgtaaaagg 26804  T
Q  264 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 303  Q
    || || |||| ||||| | |||||||||| ||||||||||    
T  26805 ataaccataacgttggataatgggtactcgatgaatcatg 26844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 40285 - 39988
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||| ||| |||||||  |||||||||  | |||||||||  ||| ||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  40285 tattatgtatgtagactgatggccacatctcatgggtcatggatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttataccgg 40187  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||| || |  |||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||   || ||| ||| |||||||    
T  40186 attgacccactgtgagaatactacatagt--atgttatgaaaa-tgtcataagatattctcacagtgataatggtgtatataactcttagacttgaaacc 40090  T
Q  201 actatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatc 300  Q
    ||||||  ||||| ||  |||| || |||||||| |  |||||| ||||||||  |||| ||||| || |||||||||| | |||| ||||  |||||||    
T  40089 actatgatccctaaat-atggactcaagtgctttatttccattctaacgttgtttgtaaaaggataaccataaagttggctaatggttacttgatgaatc 39991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0378 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0378
Description:

Target: scaffold0378; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 8310 - 8511
Alignment:
Q  1 tattatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 100  Q
    ||||||||| ||| |||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8310 tattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 8408  T
Q  101 attgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 200  Q
    ||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||    
T  8409 attgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaacc 8505  T
Q  201 actatg 206  Q
    ||||||    
T  8506 actatg 8511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0136 (Bit Score: 64; Significance: 6e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0136
Description:

Target: scaffold0136; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 73 - 275
Target Start/End: Original strand, 8807 - 9005
Alignment:
Q  73 taaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagt 172  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||| || | ||||||||||||| |||||   |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |    
T  8807 taaatattaggagtaatatttatactagattgacccccaatgagaatactacttagtat--gttatgaaga-tgtcataagatattctcatagtgataat 8903  T
Q  173 ggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactata 272  Q
    ||||||| |||| | | ||||||||||||| |||  || || ||| ||||||| |||| ||| |   |||||||||||| || |||||| ||| ||||||    
T  8904 ggtgtataccactcctagacctgaaaccacaatgatccttaaatg-tggagtcaagtgttttattgtcattcaaacgttctctgtaacatgataactata 9002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 113 - 303
Target Start/End: Original strand, 102 - 288
Alignment:
Q  113 tgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccct 212  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||  ||| ||| |||||||||||||| ||  ||||    
T  102 tgagaatactacatagtaa--gttatgaaat-tgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcactcttagacctgaaaccactctgatccct 198  T
Q  213 agatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 303  Q
    ||||| |||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||  |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  199 agatg-tggactcaagtactttgttgccattctaacgttgtatgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0376 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0376
Description:

Target: scaffold0376; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 71 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 11758 - 11526
Alignment:
Q  71 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaa---agtgtcataagatattctcatagtg 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||||   ||||||  |   | |||||||||||||||||| | ||    
T  11758 tataaatattaggagtaatatttatactggatagacccactgtgagaatactacatagtac--gttatgtgattaattgtcataagatattctcacaatg 11661  T
Q  168 atagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatga 267  Q
    |||   |||||   | | ||| |||||||||||||| ||  |||||||||| ||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |    
T  11660 ataacagtgtacatcgctcttagacctgaaaccactttgatccctagatgt-ggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgtaaaaggataa 11562  T
Q  268 ctataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 303  Q
    | |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  11561 ccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 11526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 90135 - 90019
Alignment:
Q  4 tatgtaggtaaactgatgatcacatctcacagatcatggataaa-gagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggat 102  Q
    ||||||| || |||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||    
T  90135 tatgtagatagactgataatcacatctcacggatcatgggtaaaagagttatcaacacttcacatagatataaatattacgtataacatttatattggat 90036  T
Q  103 tgatccgccatgagaat 119  Q
    |||  ||| ||||||||    
T  90035 tgacacgcgatgagaat 90019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 71 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 83243 - 83111
Alignment:
Q  71 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 170  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||  | |||| | || ||||||||||||||| ||||||| |||    
T  83243 tataaatatcagaagtaatatttatactggattgacccacaatgagaatactacatagt--atgttacg-aaggtgtcataagatattatcatagtcata 83147  T
Q  171 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatg 206  Q
     ||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  83146 ttggtgtactccactcttagacctgaaaccagtatg 83111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0086 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0086
Description:

Target: scaffold0086; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 64 - 303
Target Start/End: Original strand, 53832 - 54066
Alignment:
Q  64 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 163  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||| | | ||| |||| || || |||||||||||||||||  | |||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  53832 acataggtataaatattaagagtaatattcacactgggttgacccaccgtgagaatactacatagt--atgttatg-aaattgtcataagatattctcaa 53928  T
Q  164 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 263  Q
      || || | || |||    | ||| |||||||||||||||||  |||||| || |||| || |||||||| |  |||||| ||||||||  |||| |||    
T  53929 catgttaatagtttatattgctcttagacctgaaaccactatgatccctaggtg-tggactcaagtgctttat-gccattctaacgttgtatgtaaaagg 54026  T
Q  264 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 303  Q
    || || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  54027 ataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 54066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 126
Target Start/End: Original strand, 45956 - 46051
Alignment:
Q  35 gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatat----taggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 126  Q
    ||||||||||||| |||| |||| | |||| ||||||||||||||    || ||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||| ||||||    
T  45956 gatcatggataaaaagttgtcaaatattcatatagatataaatatatattatgagtaatatttatattgaattgacccaccattagaatgctacat 46051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0496 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0496
Description:

Target: scaffold0496; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 83 - 179
Target Start/End: Original strand, 11328 - 11421
Alignment:
Q  83 gagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtat 179  Q
    |||||||||||||  |||||| | || ||||||||||||||||||||  | |||||||| | ||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||||    
T  11328 gagtaatatttatgatggatttacccaccatgagaatactacatagt--atgttatgaaga-tgttataagttattctaatagtgataatggtgtat 11421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University