View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF15956_high_4 (Length: 346)

Name: NF15956_high_4
Description: NF15956
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF15956_high_4
NF15956_high_4
[»] chr8 (50 HSPs)
chr8 (1-326)||(20394604-20394929)
chr8 (1-334)||(22375924-22376257)
chr8 (1-334)||(23887001-23887338)
chr8 (1-326)||(22246904-22247229)
chr8 (102-326)||(22988715-22988939)
chr8 (1-325)||(22422363-22422687)
chr8 (1-325)||(18858563-18858887)
chr8 (1-326)||(23652026-23652351)
chr8 (1-334)||(21920219-21920552)
chr8 (1-325)||(22118646-22118970)
chr8 (1-325)||(22127430-22127754)
chr8 (11-325)||(20016744-20017058)
chr8 (1-325)||(30311615-30311939)
chr8 (1-334)||(23656904-23657237)
chr8 (1-321)||(17672494-17672814)
chr8 (1-325)||(22131512-22131836)
chr8 (9-334)||(22052840-22053165)
chr8 (74-334)||(21252921-21253181)
chr8 (9-334)||(21927404-21927730)
chr8 (88-334)||(29301984-29302230)
chr8 (74-327)||(21392405-21392658)
chr8 (74-327)||(21782964-21783217)
chr8 (74-327)||(21786899-21787152)
chr8 (74-334)||(19864637-19864898)
chr8 (9-334)||(20008400-20008725)
chr8 (92-326)||(32602129-32602364)
chr8 (107-325)||(19979953-19980171)
chr8 (92-325)||(15535369-15535602)
chr8 (9-334)||(21323758-21324082)
chr8 (170-325)||(19114676-19114831)
chr8 (9-326)||(19861420-19861737)
chr8 (1-321)||(19482535-19482855)
chr8 (118-334)||(20390076-20390292)
chr8 (1-325)||(21165009-21165333)
chr8 (9-309)||(31414948-31415248)
chr8 (92-322)||(16875657-16875887)
chr8 (92-322)||(21848899-21849129)
chr8 (107-325)||(22041813-22042031)
chr8 (9-334)||(16269703-16270028)
chr8 (9-334)||(6605635-6605960)
chr8 (9-325)||(31569321-31569637)
chr8 (9-334)||(27356513-27356838)
chr8 (9-140)||(28983082-28983213)
chr8 (9-140)||(28988301-28988432)
chr8 (92-334)||(22372908-22373150)
chr8 (4-138)||(22522719-22522853)
chr8 (9-334)||(4984019-4984344)
chr8 (9-334)||(14567119-14567444)
chr8 (9-67)||(19984424-19984482)
chr8 (1-66)||(20390331-20390396)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (1-334)||(22217-22549)
[»] chr7 (47 HSPs)
chr7 (1-326)||(15626433-15626758)
chr7 (2-334)||(48813290-48813621)
chr7 (1-334)||(14041595-14041928)
chr7 (1-334)||(14351625-14351958)
chr7 (1-326)||(15146921-15147247)
chr7 (1-325)||(11235250-11235574)
chr7 (153-334)||(11770430-11770611)
chr7 (1-325)||(15159094-15159418)
chr7 (11-325)||(8709514-8709828)
chr7 (9-334)||(11386452-11386777)
chr7 (92-325)||(14334305-14334538)
chr7 (92-325)||(14956463-14956696)
chr7 (1-325)||(11551139-11551463)
chr7 (9-334)||(13675353-13675678)
chr7 (17-321)||(44789404-44789708)
chr7 (9-334)||(12204823-12205148)
chr7 (9-334)||(15342332-15342657)
chr7 (9-334)||(19149112-19149436)
chr7 (107-325)||(12689411-12689629)
chr7 (9-334)||(15100626-15100951)
chr7 (9-334)||(20748511-20748835)
chr7 (9-334)||(14262268-14262592)
chr7 (9-334)||(16948495-16948820)
chr7 (1-325)||(10872599-10872923)
chr7 (9-325)||(14139589-14139905)
chr7 (107-325)||(15493-15711)
chr7 (92-322)||(7825812-7826042)
chr7 (9-334)||(16070320-16070643)
chr7 (92-322)||(27105902-27106132)
chr7 (92-322)||(27172193-27172423)
chr7 (9-334)||(26092821-26093146)
chr7 (9-334)||(13023258-13023583)
chr7 (9-334)||(19614576-19614901)
chr7 (9-334)||(49154202-49154527)
chr7 (1-324)||(18179655-18179978)
chr7 (9-334)||(11301236-11301561)
chr7 (1-254)||(13688021-13688274)
chr7 (9-334)||(13966691-13967016)
chr7 (9-334)||(14284399-14284724)
chr7 (9-334)||(26116613-26116938)
chr7 (9-325)||(18051976-18052292)
chr7 (9-325)||(23503893-23504209)
chr7 (230-325)||(14213583-14213678)
chr7 (92-230)||(18588299-18588437)
chr7 (9-334)||(12458541-12458866)
chr7 (244-325)||(8200537-8200618)
chr7 (276-325)||(13687973-13688022)
[»] scaffold0647 (2 HSPs)
scaffold0647 (1-326)||(2849-3174)
scaffold0647 (1-334)||(7690-8023)
[»] scaffold0083 (1 HSPs)
scaffold0083 (20-334)||(9084-9398)
[»] chr5 (47 HSPs)
chr5 (1-334)||(20466309-20466642)
chr5 (2-334)||(23473070-23473402)
chr5 (1-326)||(26736937-26737262)
chr5 (9-334)||(21408980-21409302)
chr5 (1-329)||(21337504-21337832)
chr5 (1-325)||(37289706-37290030)
chr5 (1-325)||(14997949-14998273)
chr5 (1-325)||(19771812-19772136)
chr5 (1-325)||(22331097-22331421)
chr5 (1-325)||(22136520-22136844)
chr5 (74-334)||(25428276-25428536)
chr5 (1-325)||(27612206-27612530)
chr5 (17-321)||(40710636-40710940)
chr5 (1-325)||(41772694-41773018)
chr5 (1-325)||(27520258-27520582)
chr5 (92-325)||(16358354-16358587)
chr5 (92-321)||(27666791-27667020)
chr5 (92-325)||(34568346-34568579)
chr5 (1-325)||(29474283-29474607)
chr5 (1-325)||(22349771-22350095)
chr5 (1-325)||(27683610-27683934)
chr5 (1-325)||(18780966-18781290)
chr5 (1-326)||(28893152-28893477)
chr5 (1-326)||(28921978-28922303)
chr5 (92-322)||(21935489-21935719)
chr5 (92-322)||(23507521-23507751)
chr5 (13-334)||(22234142-22234463)
chr5 (9-334)||(25849900-25850225)
chr5 (2-326)||(20777746-20778070)
chr5 (92-325)||(20801249-20801482)
chr5 (9-334)||(22504504-22504829)
chr5 (18-326)||(28914640-28914948)
chr5 (18-326)||(28929908-28930216)
chr5 (2-325)||(22463785-22464108)
chr5 (1-267)||(21562234-21562500)
chr5 (9-326)||(20344115-20344432)
chr5 (225-334)||(21679212-21679321)
chr5 (9-334)||(24796615-24796940)
chr5 (9-334)||(37541599-37541924)
chr5 (2-326)||(20823286-20823610)
chr5 (92-322)||(24583047-24583277)
chr5 (9-325)||(17267552-17267868)
chr5 (11-334)||(14885211-14885534)
chr5 (196-334)||(24618700-24618838)
chr5 (196-334)||(24714931-24715069)
chr5 (196-334)||(24747959-24748097)
chr5 (281-325)||(23442060-23442104)
[»] scaffold0445 (1 HSPs)
scaffold0445 (21-334)||(1900-2213)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (1-334)||(494959-495293)
scaffold0001 (9-334)||(453252-453577)
scaffold0001 (9-334)||(515392-515717)
[»] scaffold0074 (2 HSPs)
scaffold0074 (1-334)||(5054-5386)
scaffold0074 (9-201)||(11196-11388)
[»] scaffold0018 (3 HSPs)
scaffold0018 (1-329)||(10772-11100)
scaffold0018 (1-329)||(16964-17292)
scaffold0018 (20-326)||(24348-24654)
[»] chr2 (41 HSPs)
chr2 (1-329)||(24818798-24819126)
chr2 (1-334)||(30010752-30011085)
chr2 (9-334)||(30209493-30209819)
chr2 (9-334)||(23098594-23098919)
chr2 (1-325)||(27372820-27373144)
chr2 (1-334)||(23073405-23073738)
chr2 (9-334)||(23112278-23112603)
chr2 (1-325)||(24711585-24711909)
chr2 (1-334)||(23106296-23106629)
chr2 (1-322)||(41606953-41607274)
chr2 (14-334)||(22734355-22734675)
chr2 (1-321)||(10870405-10870725)
chr2 (1-325)||(24263921-24264245)
chr2 (1-325)||(24875318-24875642)
chr2 (92-325)||(21143700-21143933)
chr2 (17-321)||(16926915-16927219)
chr2 (17-321)||(17000555-17000859)
chr2 (92-325)||(9485767-9486000)
chr2 (92-321)||(27219571-27219800)
chr2 (1-321)||(44384138-44384458)
chr2 (158-325)||(22323581-22323748)
chr2 (207-334)||(45534482-45534609)
chr2 (20-334)||(23278318-23278632)
chr2 (107-325)||(24706156-24706374)
chr2 (9-334)||(19650626-19650951)
chr2 (14-323)||(21323847-21324156)
chr2 (161-334)||(25264596-25264769)
chr2 (1-325)||(23189470-23189793)
chr2 (9-325)||(12575904-12576220)
chr2 (1-325)||(24677040-24677364)
chr2 (9-325)||(27789291-27789607)
chr2 (11-334)||(24950132-24950455)
chr2 (92-322)||(24829847-24830077)
chr2 (9-334)||(1065293-1065618)
chr2 (9-334)||(31832200-31832525)
chr2 (92-249)||(9337209-9337366)
chr2 (152-334)||(23295477-23295659)
chr2 (9-334)||(19717593-19717918)
chr2 (102-322)||(22279659-22279879)
chr2 (240-329)||(27208979-27209068)
chr2 (9-141)||(25255654-25255786)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (1-334)||(14510-14843)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (1-326)||(14418-14743)
[»] scaffold0010 (4 HSPs)
scaffold0010 (1-334)||(3856-4189)
scaffold0010 (9-334)||(40372-40697)
scaffold0010 (196-334)||(45626-45763)
scaffold0010 (9-171)||(45466-45628)
[»] scaffold0379 (1 HSPs)
scaffold0379 (1-326)||(5920-6245)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (1-334)||(22647-22980)
scaffold0042 (1-325)||(37851-38175)
[»] scaffold0011 (3 HSPs)
scaffold0011 (1-334)||(24564-24897)
scaffold0011 (9-334)||(150511-150836)
scaffold0011 (240-334)||(193974-194068)
[»] chr4 (37 HSPs)
chr4 (14-334)||(14849147-14849467)
chr4 (2-334)||(14696024-14696356)
chr4 (14-334)||(8707822-8708142)
chr4 (1-325)||(23957667-23957991)
chr4 (1-325)||(8051391-8051715)
chr4 (1-325)||(27713256-27713580)
chr4 (1-325)||(40474960-40475284)
chr4 (15-334)||(14161381-14161700)
chr4 (92-325)||(12478520-12478753)
chr4 (92-325)||(19776652-19776885)
chr4 (1-325)||(14301747-14302071)
chr4 (107-325)||(14682487-14682705)
chr4 (92-334)||(15323128-15323370)
chr4 (17-321)||(8388336-8388640)
chr4 (1-325)||(15145653-15145977)
chr4 (1-334)||(18225214-18225547)
chr4 (9-334)||(15072270-15072595)
chr4 (9-334)||(16149622-16149947)
chr4 (9-334)||(16153768-16154093)
chr4 (9-334)||(3262830-3263155)
chr4 (9-334)||(15001401-15001725)
chr4 (9-334)||(44659902-44660227)
chr4 (2-334)||(27902297-27902629)
chr4 (9-325)||(51604828-51605144)
chr4 (158-325)||(18613749-18613916)
chr4 (107-249)||(16234866-16235008)
chr4 (2-334)||(1647306-1647638)
chr4 (215-334)||(1640322-1640441)
chr4 (9-334)||(15357156-15357481)
chr4 (9-334)||(29451573-29451898)
chr4 (17-249)||(17092933-17093165)
chr4 (92-322)||(15291277-15291507)
chr4 (1-152)||(16218323-16218474)
chr4 (1-152)||(16221643-16221794)
chr4 (9-177)||(11205268-11205436)
chr4 (257-325)||(29037428-29037496)
chr4 (9-183)||(15257990-15258164)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (1-334)||(16819-17151)
scaffold0040 (257-334)||(111775-111852)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (1-334)||(15252-15585)
[»] scaffold0058 (2 HSPs)
scaffold0058 (5-334)||(27283-27611)
scaffold0058 (2-334)||(21062-21394)
[»] chr3 (63 HSPs)
chr3 (1-326)||(15261168-15261493)
chr3 (9-322)||(15014031-15014344)
chr3 (1-334)||(17491380-17491713)
chr3 (1-325)||(15723201-15723525)
chr3 (92-265)||(11889638-11889811)
chr3 (1-325)||(10007139-10007463)
chr3 (17-325)||(48426986-48427294)
chr3 (11-321)||(15346522-15346832)
chr3 (92-325)||(13254229-13254462)
chr3 (1-325)||(10907749-10908073)
chr3 (9-329)||(11950172-11950492)
chr3 (1-325)||(20060321-20060645)
chr3 (9-334)||(17187914-17188239)
chr3 (1-321)||(5108878-5109198)
chr3 (1-321)||(5423197-5423517)
chr3 (2-325)||(15400785-15401108)
chr3 (17-334)||(15229143-15229460)
chr3 (17-334)||(15235011-15235328)
chr3 (92-325)||(15340808-15341041)
chr3 (92-325)||(16637312-16637545)
chr3 (1-322)||(16805214-16805535)
chr3 (9-334)||(12358791-12359116)
chr3 (92-321)||(16755059-16755288)
chr3 (1-321)||(3687486-3687806)
chr3 (92-324)||(6602276-6602508)
chr3 (1-321)||(12888252-12888572)
chr3 (1-325)||(15587659-15587983)
chr3 (92-325)||(12499787-12500020)
chr3 (92-321)||(53383376-53383605)
chr3 (74-325)||(14874839-14875090)
chr3 (92-325)||(16693703-16693936)
chr3 (9-334)||(28755858-28756183)
chr3 (92-322)||(30139358-30139588)
chr3 (92-322)||(30148909-30149139)
chr3 (9-334)||(31693449-31693774)
chr3 (11-334)||(11959435-11959758)
chr3 (9-334)||(13970384-13970709)
chr3 (9-334)||(14088213-14088538)
chr3 (92-322)||(8272757-8272987)
chr3 (9-334)||(18132610-18132935)
chr3 (9-334)||(47125484-47125809)
chr3 (92-322)||(13965710-13965941)
chr3 (9-334)||(31940443-31940768)
chr3 (2-326)||(10418302-10418626)
chr3 (190-334)||(12179878-12180022)
chr3 (9-325)||(41179071-41179387)
chr3 (92-322)||(15611655-15611885)
chr3 (9-325)||(16379192-16379508)
chr3 (9-325)||(16834774-16835090)
chr3 (9-329)||(16327924-16328244)
chr3 (9-140)||(13943758-13943889)
chr3 (9-140)||(44778981-44779112)
chr3 (92-300)||(15948828-15949036)
chr3 (9-334)||(13318766-13319091)
chr3 (116-334)||(10385211-10385429)
chr3 (9-122)||(10407720-10407833)
chr3 (9-63)||(12510747-12510801)
chr3 (9-66)||(8745654-8745711)
chr3 (9-66)||(24189112-24189169)
chr3 (1-81)||(11888621-11888701)
chr3 (9-204)||(12269880-12270075)
chr3 (9-51)||(12180167-12180209)
chr3 (9-50)||(14291796-14291837)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (1-334)||(217451-217784)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (9-334)||(84558-84883)
scaffold0007 (2-326)||(268558-268882)
[»] chr6 (49 HSPs)
chr6 (132-326)||(18965599-18965793)
chr6 (1-267)||(23085944-23086210)
chr6 (18-334)||(23080244-23080560)
chr6 (119-326)||(18196024-18196231)
chr6 (88-334)||(25608121-25608367)
chr6 (14-334)||(20634126-20634446)
chr6 (27-326)||(18450286-18450585)
chr6 (88-334)||(18406204-18406450)
chr6 (1-334)||(22760628-22760961)
chr6 (1-322)||(24293955-24294276)
chr6 (32-328)||(19487486-19487772)
chr6 (92-325)||(22828619-22828852)
chr6 (1-321)||(2872976-2873296)
chr6 (107-326)||(16961761-16961980)
chr6 (9-328)||(14378097-14378416)
chr6 (9-328)||(14379647-14379966)
chr6 (1-326)||(5837392-5837717)
chr6 (92-321)||(28261461-28261690)
chr6 (92-321)||(28284226-28284455)
chr6 (92-321)||(28340210-28340439)
chr6 (9-329)||(19454804-19455124)
chr6 (92-326)||(16925902-16926136)
chr6 (107-321)||(25114340-25114554)
chr6 (107-325)||(27564112-27564330)
chr6 (9-334)||(18796465-18796790)
chr6 (1-136)||(18963261-18963396)
chr6 (14-321)||(27189224-27189531)
chr6 (14-321)||(27259709-27260016)
chr6 (92-322)||(16380637-16380867)
chr6 (9-334)||(19881073-19881398)
chr6 (9-334)||(25769619-25769944)
chr6 (9-334)||(19436777-19437102)
chr6 (92-325)||(19866471-19866704)
chr6 (104-325)||(22435653-22435874)
chr6 (104-325)||(22444051-22444272)
chr6 (92-322)||(16648233-16648463)
chr6 (1-334)||(21473376-21473708)
chr6 (9-334)||(24366187-24366512)
chr6 (74-325)||(25763474-25763725)
chr6 (2-326)||(15461119-15461443)
chr6 (92-322)||(23998035-23998265)
chr6 (9-334)||(10467030-10467355)
chr6 (225-334)||(34643983-34644092)
chr6 (9-140)||(28280994-28281125)
chr6 (92-322)||(1647078-1647308)
chr6 (9-334)||(21568172-21568497)
chr6 (1-124)||(18183540-18183663)
chr6 (9-66)||(24516589-24516646)
chr6 (195-326)||(5295573-5295704)
[»] scaffold1602 (1 HSPs)
scaffold1602 (1-334)||(98-431)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (29-334)||(939-1244)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (1-334)||(201499-201832)
scaffold0004 (9-334)||(324646-324971)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (2-324)||(3533-3855)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (20-326)||(16028-16333)
[»] scaffold0120 (1 HSPs)
scaffold0120 (1-334)||(7962-8295)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (1-334)||(103175-103508)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (27-334)||(42164-42471)
scaffold0035 (9-334)||(4691-5016)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (160-329)||(115171-115340)
scaffold0037 (1-95)||(115069-115163)
[»] scaffold0023 (3 HSPs)
scaffold0023 (9-334)||(86711-87035)
scaffold0023 (2-334)||(2537-2869)
scaffold0023 (104-334)||(151052-151282)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (1-329)||(7118-7446)
[»] scaffold0270 (2 HSPs)
scaffold0270 (1-322)||(5825-6146)
scaffold0270 (1-322)||(12955-13276)
[»] scaffold2004 (1 HSPs)
scaffold2004 (1-324)||(840-1163)
[»] scaffold0621 (1 HSPs)
scaffold0621 (1-334)||(3374-3707)
[»] scaffold0022 (4 HSPs)
scaffold0022 (1-334)||(55697-56030)
scaffold0022 (1-334)||(40574-40907)
scaffold0022 (1-334)||(74294-74627)
scaffold0022 (92-322)||(8948-9178)
[»] chr1 (40 HSPs)
chr1 (1-334)||(50618498-50618831)
chr1 (1-324)||(21750876-21751199)
chr1 (89-334)||(20140009-20140254)
chr1 (17-322)||(51331609-51331914)
chr1 (74-334)||(430289-430549)
chr1 (1-321)||(33389129-33389449)
chr1 (1-334)||(22360344-22360677)
chr1 (1-325)||(21832237-21832561)
chr1 (1-325)||(21838885-21839209)
chr1 (1-320)||(21862473-21862792)
chr1 (1-325)||(17043115-17043439)
chr1 (9-334)||(20834008-20834333)
chr1 (92-321)||(16348787-16349016)
chr1 (92-325)||(19108303-19108536)
chr1 (9-334)||(21743660-21743985)
chr1 (107-325)||(21233937-21234155)
chr1 (1-205)||(16378150-16378354)
chr1 (1-325)||(20854860-20855184)
chr1 (1-321)||(41351762-41352082)
chr1 (92-322)||(20829583-20829813)
chr1 (9-334)||(19661244-19661569)
chr1 (9-334)||(31538105-31538430)
chr1 (9-334)||(48424830-48425155)
chr1 (9-334)||(52987698-52988023)
chr1 (1-325)||(24792716-24793040)
chr1 (158-334)||(41308599-41308775)
chr1 (9-334)||(20938171-20938496)
chr1 (9-334)||(38910934-38911259)
chr1 (9-334)||(24097711-24098036)
chr1 (158-325)||(21026108-21026275)
chr1 (9-334)||(19856231-19856556)
chr1 (9-334)||(20296338-20296663)
chr1 (92-313)||(22503480-22503701)
chr1 (9-334)||(37679006-37679331)
chr1 (246-326)||(16378076-16378156)
chr1 (9-325)||(21952844-21953160)
chr1 (92-309)||(20927005-20927222)
chr1 (225-334)||(23196573-23196682)
chr1 (293-334)||(22116839-22116880)
chr1 (9-51)||(41310766-41310808)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (92-334)||(38070-38312)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (1-334)||(176375-176708)
[»] scaffold0509 (1 HSPs)
scaffold0509 (1-334)||(10770-11103)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (1-334)||(810-1140)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (1-334)||(85261-85594)
scaffold0008 (1-318)||(85827-86144)
[»] scaffold0312 (1 HSPs)
scaffold0312 (74-334)||(1-261)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (88-334)||(7163-7409)
[»] scaffold0333 (1 HSPs)
scaffold0333 (1-334)||(17596-17924)
[»] scaffold0309 (2 HSPs)
scaffold0309 (9-334)||(11735-12060)
scaffold0309 (1-334)||(16583-16916)
[»] scaffold0228 (1 HSPs)
scaffold0228 (1-334)||(20180-20513)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (1-334)||(30887-31220)
scaffold0026 (9-327)||(50759-51077)
[»] scaffold1423 (1 HSPs)
scaffold1423 (74-334)||(1486-1746)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (1-325)||(8889-9213)
[»] scaffold0319 (1 HSPs)
scaffold0319 (88-334)||(708-954)
[»] scaffold0028 (4 HSPs)
scaffold0028 (11-321)||(45106-45416)
scaffold0028 (92-322)||(10428-10658)
scaffold0028 (1-322)||(16890-17211)
scaffold0028 (9-334)||(48553-48878)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (1-334)||(24976-25309)
[»] scaffold0067 (4 HSPs)
scaffold0067 (9-326)||(50219-50536)
scaffold0067 (9-326)||(59253-59570)
scaffold0067 (9-326)||(65641-65958)
scaffold0067 (9-334)||(28564-28889)
[»] scaffold0053 (2 HSPs)
scaffold0053 (9-334)||(55886-56211)
scaffold0053 (9-334)||(47073-47398)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (9-334)||(99601-99926)
[»] scaffold0079 (2 HSPs)
scaffold0079 (10-334)||(2658-2982)
scaffold0079 (1-325)||(35446-35771)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (75-334)||(6436-6695)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (1-334)||(4118-4454)
[»] scaffold0523 (1 HSPs)
scaffold0523 (9-334)||(1811-2136)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (1-334)||(6692-7025)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (9-334)||(33276-33601)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (9-334)||(49914-50239)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (9-334)||(2992-3317)
scaffold0034 (2-334)||(69312-69644)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (9-334)||(262166-262491)
[»] scaffold0080 (5 HSPs)
scaffold0080 (1-325)||(11270-11594)
scaffold0080 (107-334)||(50032-50259)
scaffold0080 (74-276)||(53635-53837)
scaffold0080 (74-325)||(30833-31084)
scaffold0080 (74-325)||(36298-36550)
[»] scaffold0298 (1 HSPs)
scaffold0298 (9-334)||(10096-10421)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (9-334)||(52987-53312)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (92-321)||(16113-16342)
scaffold0044 (92-321)||(2375-2605)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (9-328)||(5128-5447)
[»] scaffold0358 (2 HSPs)
scaffold0358 (74-334)||(7991-8251)
scaffold0358 (74-334)||(17187-17447)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (74-334)||(393-652)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (1-325)||(40104-40428)
scaffold0109 (107-325)||(14261-14480)
[»] scaffold0029 (3 HSPs)
scaffold0029 (92-324)||(107933-108165)
scaffold0029 (9-334)||(114501-114826)
scaffold0029 (1-66)||(94925-94990)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (92-323)||(9319-9550)
[»] scaffold0081 (2 HSPs)
scaffold0081 (74-325)||(20553-20804)
scaffold0081 (74-325)||(35977-36228)
[»] scaffold0017 (3 HSPs)
scaffold0017 (14-325)||(195531-195842)
scaffold0017 (1-325)||(57966-58290)
scaffold0017 (225-325)||(18321-18422)
[»] scaffold0865 (1 HSPs)
scaffold0865 (9-334)||(2311-2636)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (9-334)||(16054-16379)
scaffold0266 (92-322)||(7983-8213)
[»] scaffold0261 (2 HSPs)
scaffold0261 (9-334)||(21554-21879)
scaffold0261 (9-334)||(13375-13700)
[»] scaffold0244 (2 HSPs)
scaffold0244 (9-326)||(19302-19619)
scaffold0244 (225-322)||(25032-25129)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (9-334)||(29324-29649)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (9-334)||(49046-49371)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (9-334)||(24156-24481)
scaffold0104 (9-334)||(44456-44781)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (9-334)||(109572-109897)
scaffold0031 (1-325)||(55022-55346)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (74-334)||(8314-8574)
[»] scaffold0130 (2 HSPs)
scaffold0130 (173-325)||(44846-44998)
scaffold0130 (38-334)||(8876-9172)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (104-326)||(13345-13567)
[»] scaffold0256 (1 HSPs)
scaffold0256 (74-324)||(23178-23428)
[»] scaffold1477 (1 HSPs)
scaffold1477 (9-334)||(169-493)
[»] scaffold0304 (1 HSPs)
scaffold0304 (9-334)||(1524-1849)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (9-326)||(31358-31675)
[»] scaffold1288 (1 HSPs)
scaffold1288 (9-329)||(893-1213)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (9-334)||(9500-9821)
scaffold0235 (9-334)||(19714-20035)
[»] scaffold0149 (2 HSPs)
scaffold0149 (107-334)||(5487-5714)
scaffold0149 (107-334)||(9918-10145)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (92-322)||(25348-25578)
[»] scaffold0162 (2 HSPs)
scaffold0162 (92-322)||(14862-15092)
scaffold0162 (92-309)||(11296-11513)
[»] scaffold1373 (1 HSPs)
scaffold1373 (9-334)||(873-1198)
[»] scaffold0054 (2 HSPs)
scaffold0054 (101-322)||(64639-64860)
scaffold0054 (9-66)||(64558-64615)
[»] scaffold0114 (1 HSPs)
scaffold0114 (74-334)||(18445-18705)
[»] scaffold1985 (1 HSPs)
scaffold1985 (74-325)||(444-695)
[»] scaffold1830 (1 HSPs)
scaffold1830 (101-334)||(936-1169)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (1-238)||(2637-2874)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (9-334)||(28467-28792)
[»] scaffold0076 (4 HSPs)
scaffold0076 (9-334)||(31716-32041)
scaffold0076 (101-322)||(42212-42433)
scaffold0076 (9-66)||(54450-54507)
scaffold0076 (219-334)||(55149-55264)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (9-334)||(250562-250887)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (225-334)||(195182-195291)
[»] scaffold0501 (1 HSPs)
scaffold0501 (107-325)||(4145-4363)
[»] scaffold0302 (2 HSPs)
scaffold0302 (92-322)||(7107-7337)
scaffold0302 (92-322)||(165-395)
[»] scaffold0180 (3 HSPs)
scaffold0180 (128-334)||(33911-34117)
scaffold0180 (240-334)||(510-604)
scaffold0180 (240-334)||(4830-4924)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (116-325)||(7839-8048)
[»] scaffold0102 (2 HSPs)
scaffold0102 (9-334)||(41639-41963)
scaffold0102 (14-249)||(51389-51624)
[»] scaffold2111 (1 HSPs)
scaffold2111 (2-334)||(619-951)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (173-325)||(3556-3708)
[»] scaffold0476 (2 HSPs)
scaffold0476 (219-334)||(1794-1909)
scaffold0476 (1-135)||(10307-10441)
[»] scaffold0730 (1 HSPs)
scaffold0730 (9-334)||(40-365)
[»] scaffold0420 (2 HSPs)
scaffold0420 (9-334)||(588-912)
scaffold0420 (9-66)||(7824-7881)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (9-326)||(10825-11142)
[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (169-325)||(28770-28926)
scaffold0215 (93-249)||(28586-28742)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (225-334)||(36055-36164)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (9-334)||(37590-37915)
[»] scaffold0046 (1 HSPs)
scaffold0046 (9-326)||(79870-80187)
[»] scaffold0124 (3 HSPs)
scaffold0124 (190-334)||(14142-14286)
scaffold0124 (131-322)||(5969-6160)
scaffold0124 (9-51)||(14431-14473)
[»] scaffold0206 (1 HSPs)
scaffold0206 (2-329)||(25060-25387)
[»] scaffold0739 (1 HSPs)
scaffold0739 (167-325)||(1003-1161)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (244-334)||(20791-20881)
scaffold0090 (244-334)||(24953-25043)
[»] scaffold0089 (2 HSPs)
scaffold0089 (240-334)||(546-640)
scaffold0089 (43-334)||(14786-15077)
[»] scaffold0222 (2 HSPs)
scaffold0222 (9-334)||(9003-9328)
scaffold0222 (11-66)||(1530-1585)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (9-334)||(42859-43183)
[»] scaffold0993 (1 HSPs)
scaffold0993 (1-153)||(3-155)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (230-334)||(23339-23443)
[»] scaffold0682 (1 HSPs)
scaffold0682 (240-334)||(1825-1919)
[»] scaffold0203 (1 HSPs)
scaffold0203 (20-326)||(12349-12655)
[»] scaffold0170 (1 HSPs)
scaffold0170 (92-322)||(34039-34269)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (251-329)||(5974-6052)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (9-270)||(19673-19934)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (2-325)||(7965-8288)
[»] scaffold0348 (3 HSPs)
scaffold0348 (9-140)||(9913-10044)
scaffold0348 (240-326)||(10159-10245)
scaffold0348 (9-66)||(18522-18579)
[»] scaffold0249 (1 HSPs)
scaffold0249 (240-326)||(243-329)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (92-309)||(2074-2291)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (251-334)||(16430-16513)
[»] scaffold0055 (1 HSPs)
scaffold0055 (92-223)||(21298-21429)
[»] scaffold0894 (1 HSPs)
scaffold0894 (213-334)||(3868-3989)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (9-334)||(28875-29199)
[»] scaffold1488 (1 HSPs)
scaffold1488 (110-309)||(943-1141)
[»] scaffold0467 (1 HSPs)
scaffold0467 (92-237)||(1743-1888)
[»] scaffold0405 (1 HSPs)
scaffold0405 (9-204)||(572-767)
[»] scaffold0269 (1 HSPs)
scaffold0269 (252-322)||(2218-2288)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (240-326)||(4606-4692)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (230-326)||(44733-44829)
[»] scaffold1646 (1 HSPs)
scaffold1646 (240-326)||(1274-1360)
[»] scaffold0285 (1 HSPs)
scaffold0285 (213-286)||(9215-9288)
[»] scaffold0708 (2 HSPs)
scaffold0708 (10-66)||(6185-6241)
scaffold0708 (240-328)||(6415-6503)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 290; Significance: 1e-163; HSPs: 50)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 326
Target Start/End: Original strand, 20394604 - 20394929
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  20394604 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcaatgatgccttttagtgctacaaatgcaccg 20394703  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20394704 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgctttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 20394803  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20394804 aagaacatgccgagcatttgaagattgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaataaggtgag 20394903  T
Q  301 ttttcttggccatattatttctggta 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  20394904 ttttcttggccatattatttctggta 20394929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 22375924 - 22376257
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||   || |||||||||||    ||||||||||||     
T  22375924 gattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacggcttttagaacacgttatggacattattaatataaagtgatgcctttcagcattacaaatgcacca 22376023  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||    
T  22376024 ggtgtgtttatggagtacatgaatcgtatttttcatgcatttttggatcgttttgtggttgtgttcatcgacgatatttttatatactccaagactgaag 22376123  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | | |||||||||||||  || ||||    
T  22376124 aagaacatgctgagcatttgaagattgttttgcaagtgctgaaagagaagaagttatatgctaaattgtcaaactataaattctggttgaaatagatgag 22376223  T
Q  301 ttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  22376224 ttttcttggccatgttatttctggtagtggtatt 22376257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 23887338 - 23887001
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| |||| || || |||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||  || ||| ||||| ||     
T  23887338 gattaaagtgaaagacgaggatatgcataagacggcctttaggacacgttatggacattacgagtattcagtgatgcctttcggtgttactaatgcgcca 23887239  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    | ||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||    
T  23887238 gatgtgtttatggagtacatgaatcatatttttcatgcttatttagatcgcttcgtggttgtgttcatcgatgatattttgatatactctaagtctaaag 23887139  T
Q  201 aagaa----aatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgagg 296  Q
    |||||     |||   ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23887138 aagaacatgtatgttgagcatttgaagattgttttgcaagtgctgaaggagaagaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctagttgaatgagg 23887039  T
Q  297 tgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    ||||||||||||||||| |||||| | |||||| ||||    
T  23887038 tgagttttcttggccatgttatttttcgtagtggtatt 23887001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 326
Target Start/End: Original strand, 22246904 - 22247229
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||| |||||||| |||||   || ||||||||||  || ||||||||| ||     
T  22246904 gattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagaccgcttttagaacaagttatggacattatgaatataaagtgatgcctttcggtgttacaaatgcgcca 22247003  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  22247004 ggtgtgtttatggagtacatgaatcgtatttttcctgcgtttttggatcgtttcatggttgtgttcatcgacgatattttgatatactccaagattgaag 22247103  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
     |||| |||   |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  22247104 gagaacatgttgagcatttgtagattgttttgcaagtgctgaaagagaagaagttatatgctaaattttcaaagtgtgaattctggttgaaagaggcgag 22247203  T
Q  301 ttttcttggccatattatttctggta 326  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  22247204 ttttcatggccatgttatttctggta 22247229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 102 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 22988939 - 22988715
Alignment:
Q  102 gtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaaga 201  Q
    |||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||| |||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| || ||| |||||||    
T  22988939 gtgtgtttatggaatacatgaatcacatttttcatgcatttttggatcgtttcgtggttgtgttcatcgatgatattttgatatattccaagactgaaga 22988840  T
Q  202 agaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagt 301  Q
    |||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22988839 agaacatgctgagcatttgaagattgttttgcaagtgctgaaagagaagaagctttatgctaaattgtcaaagtgtgaattctggttgaaagaggtgagt 22988740  T
Q  302 tttcttggccatattatttctggta 326  Q
    |||||||||||| ||||||||||||    
T  22988739 tttcttggccatgttatttctggta 22988715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 22422363 - 22422687
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| ||||||  || || || || ||||| |||||||| |||||   || ||||||||||  || ||||||||| ||     
T  22422363 gattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagatagcattcagaacgcgttatggacattatgaatataaagtgatgcctttcggtgttacaaatgcgcca 22422462  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  22422463 ggtgtgtttatggagtacatgaatcgcatttttcatgcatttttggatcgtttcgtggttgtattcattgatgatattttgatttactccaagtccgaag 22422562  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||| |||   | ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  22422563 aagaacatgttgaacatttgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatcaaagtgtgaattatggttgaaagaggtgag 22422662  T
Q  301 ttttcttggccatattatttctggt 325  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||    
T  22422663 tttccttggccatgttatttctggt 22422687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 18858887 - 18858563
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||||||||     
T  18858887 gattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacggctttcaggacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacct 18858788  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||| ||||||    
T  18858787 ggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgacattttgatttactccaagactgaag 18858688  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  18858687 aagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgag 18858588  T
Q  301 ttttcttggccatattatttctggt 325  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    
T  18858587 ttttcttggccatgttatttctggt 18858563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 23652351 - 23652026
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| | || |||||||||||| ||||||| | ||| || || ||||| |||||||| || ||   ||  ||||||||   || ||||||||||||     
T  23652351 gattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacaggtttcagaacgcgttatggacattatgagtacaaagttatgccttttggtgttacaaatgcacct 23652252  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| ||||| || || ||||| |||||||| |||| |||||| ||||| ||| ||||||    
T  23652251 ggtgtgtttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgttttcattgatgatactttgatttactccaagactgaag 23652152  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    | ||| ||||  ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  23652151 aggaacatgctgagcatttgaagattgttttacaagtgttgaaagagaagaagctatatgctaaattgtctaagtgtgaattttggttgaaagaggtaag 23652052  T
Q  301 ttttcttggccatattatttctggta 326  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||    
T  23652051 ttttcttggccatgtcatttctggta 23652026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 21920219 - 21920552
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||| |||||||| || ||    | |||| | |||  || |||||||||||      
T  21920219 gattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagcttttagaacgcgttatggacattatgagtataaggtgatgtcgttcggtgttacaaatgcacat 21920318  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    || ||||||||||| ||||||||| |||| ||||| || | ||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||  ||| ||||||    
T  21920319 ggagtatttatggagtacatgaattgtatctttcaagcatttttggatcggttcgtggttgtttttattgatgatattttgatttacttcaagactgaag 21920418  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||    
T  21920419 aagaatatgctgagcatttgaagttagttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgcgaaattgtctaagtgtgagttctggttgaaagaagtgag 21920518  T
Q  301 ttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
     |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  21920519 ctttcttggacatgttatttctggtagtggtatt 21920552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 22118646 - 22118970
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || || |  |||||   ||  ||||||||   || ||| ||||||||     
T  22118646 gattaaagtaaaggatgaagatatgtagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactttgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacct 22118745  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  22118746 ggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaag 22118845  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    |||||  |||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  22118846 aagaacgtgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggtcgaaagaggtgag 22118945  T
Q  301 ttttcttggccatattatttctggt 325  Q
    |||||| |||||| |||||||||||    
T  22118946 ttttctaggccatgttatttctggt 22118970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 22127430 - 22127754
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || || |  |||||   ||  ||||||||   || ||| ||||||||     
T  22127430 gattaaagtaaaggatgaagatatgtagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactttgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacct 22127529  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  22127530 ggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaag 22127629  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    |||||  |||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  22127630 aagaacgtgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggtcgaaagaggtgag 22127729  T
Q  301 ttttcttggccatattatttctggt 325  Q
    |||||| |||||| |||||||||||    
T  22127730 ttttctaggccatgttatttctggt 22127754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 11 - 325
Target Start/End: Original strand, 20016744 - 20017058
Alignment:
Q  11 aaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtattta 110  Q
    |||||||| |||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || |||||||| || || ||||    
T  20016744 aaggatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgttta 20016843  T
Q  111 tggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgc 210  Q
    |||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  20016844 tggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgc 20016943  T
Q  211 caagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggc 310  Q
      ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||  | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  20016944 tgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagttttctaggc 20017043  T
Q  311 catattatttctggt 325  Q
    ||| |||||||||||    
T  20017044 catgttatttctggt 20017058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 30311615 - 30311939
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||||||||     
T  30311615 gattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacct 30311714  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||| ||||||    
T  30311715 ggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgttgttgtgtttattgacgatattttaatttactccaagactgaag 30311814  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || || ||    
T  30311815 aagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtaag 30311914  T
Q  301 ttttcttggccatattatttctggt 325  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    
T  30311915 ttttcttggccatgttatttctggt 30311939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 23657237 - 23656904
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||| ||     
T  23657237 gattaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcct 23657138  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    || || |||||||| || ||||| || ||||| ||||||| | | |||   ||| | ||||| || ||||| |||||| | ||||| |||||| ||||||    
T  23657137 ggcgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttatggttgtatttattgatgatattctaatatattctaagactgaag 23657038  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||  ||||  | ||| ||||| |||| ||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||| || ||    
T  23657037 aagagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgccaagttgtcaaagtgtgagttatggttaagtgaagtaag 23656938  T
Q  301 ttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  23656937 ttttcttggccatattatttatggtagtggtatt 23656904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 321
Target Start/End: Original strand, 17672494 - 17672814
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| | || |||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||||||||     
T  17672494 gattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacct 17672593  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  17672594 ggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaag 17672693  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  17672694 aagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgag 17672793  T
Q  301 ttttcttggccatattatttc 321  Q
    |||||| |||||| |||||||    
T  17672794 ttttctaggccatgttatttc 17672814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 22131512 - 22131836
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||| || || | |||||| || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||||||||     
T  22131512 gattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttaagaacgcattacggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacct 22131611  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||  |||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  22131612 ggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcctttttggatcgattctttgttgtgtttatcgatgatattttgatctactccaagactgaag 22131711  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||| ||||  ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || || ||    
T  22131712 aagaacatgctgagcatttgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaag 22131811  T
Q  301 ttttcttggccatattatttctggt 325  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    
T  22131812 ttttcttggccatgttatttctggt 22131836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 22053165 - 22052840
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  22053165 tgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgaataccaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 22053066  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
     ||||| || ||||| || ||||||||||| | | | |||   ||||| | ||| |||||||| |||||  | || || |||||| ||||||| ||  ||    
T  22053065 catggagtatatgaaccgaatttttcatgcctttctggataagtttgtgggtgtattcattgatgatatcctaatttattctaagactgaagaggagcat 22052966  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  | ||| ||| | |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||  || |||||||||||||| | ||| |||||||||||||    
T  22052965 gcagaacatctgaggattgtattgcaagtactgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgttgaaatgtgaattctggttaagtgaagtgagttttcttg 22052866  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||    
T  22052865 gccacattatttctggtagtggtatt 22052840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 74 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 21253181 - 21252921
Alignment:
Q  74 atgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacg 173  Q
    |||||||||  || ||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| ||||| || |  ||||| || || || |    
T  21253181 atgcctttcggtgttacgaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggttcgaggttgtttttatcgatg 21253082  T
Q  174 atattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaa 273  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||| | ||| |||||||  |||||||||| ||| | ||||| || ||||| ||    
T  21253081 atattttgatttactccaagtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagctggttctgcaagtattgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaa 21252982  T
Q  274 gtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    ||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  21252981 gtgagaattctggttgaaagaagtgagctttcttggacatgttatttctggtagtggtatt 21252921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 21927730 - 21927404
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||| | |||||||||||||| || || || |||||    | ||||||||||| || ||| ||||| || ||||| ||    
T  21927730 tgaaggatgagcatatgcagaagacgacctttaggacacgttatggtcactatgaatataaggtgatgcctttcagtgttactaatgcgcctggtgtgtt 21927631  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
    |||||| || |||||  | ||||| ||||||||| | |||   ||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||| ||||||||||  ||    
T  21927630 tatggagtatatgaacagaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttaatttattctaagactgaagaagagcat 21927531  T
Q  209 gcca-agcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttctt 307  Q
      || ||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| || || ||||||    
T  21927530 tgcagagcatctgaagattgtattgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgaattctggttaagtgaagtaagatttctt 21927431  T
Q  308 ggccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||    
T  21927430 ggccatattatttctggtagtggtatt 21927404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 88 - 334
Target Start/End: Original strand, 29301984 - 29302230
Alignment:
Q  88 tacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatac 187  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||  | ||||||||||| |  |||||||  |||||||| || || ||||| || ||| |||| |||    
T  29301984 tacaaatgcacctggggtatttatggagtacatgaacagaatttttcatgcattcttagatcagtttgttgtggtatttattgatgacattctgatttac 29302083  T
Q  188 tctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggt 287  Q
    |||||| | |||||| || ||||  | || |||||| |||| || |||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29302084 tctaagaccgaagaataacatgcagaacacttgaagattgtgttacaagtgttgaaagagaggaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgaattctggt 29302183  T
Q  288 tgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    ||| ||| || ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||    
T  29302184 tgagtgaagtaagttttcttggccacgttatttctggtagtggtatt 29302230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 74 - 327
Target Start/End: Original strand, 21392405 - 21392658
Alignment:
Q  74 atgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacg 173  Q
    |||||||||  || ||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| ||| | || || ||||| || || || |    
T  21392405 atgcctttcggtgttacgaatgcacctggagtatttatggattacatgaatcgcatctttcatgcatttttggattggttcgtggttgtttttatcgatg 21392504  T
Q  174 atattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaa 273  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||   ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| ||    
T  21392505 atatattgatttactccaagtctgaagaagaacatgttgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcaaaattgtctaa 21392604  T
Q  274 gtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtag 327  Q
    ||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| ||| |||||||||||||    
T  21392605 gtgcgaattctggttgaaagaagtgagctttcttggacatgttatttctggtag 21392658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 74 - 327
Target Start/End: Original strand, 21782964 - 21783217
Alignment:
Q  74 atgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacg 173  Q
    |||||||||  || ||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| ||| | || || ||||| || || || |    
T  21782964 atgcctttcggtgttacgaatgcacctggagtatttatggattacatgaatcgcatctttcatgcatttttggattggttcgtggttgtttttatcgatg 21783063  T
Q  174 atattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaa 273  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||   ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| ||    
T  21783064 atatattgatttactccaagtctgaagaagaacatgttgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaa 21783163  T
Q  274 gtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtag 327  Q
    ||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| ||| |||||||||||||    
T  21783164 gtgcgaattctggttgaaagaagtgagctttcttggacatgttatttctggtag 21783217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 74 - 327
Target Start/End: Original strand, 21786899 - 21787152
Alignment:
Q  74 atgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacg 173  Q
    |||||||||  || ||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| ||| | || || ||||| || || || |    
T  21786899 atgcctttcggtgttacgaatgcacctggagtatttatggattacatgaatcgcatctttcatgcatttttggattggttcgtggttgtttttatcgatg 21786998  T
Q  174 atattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaa 273  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||   ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| ||    
T  21786999 atatattgatttactccaagtctgaagaagaacatgttgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcaaaattgtctaa 21787098  T
Q  274 gtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtag 327  Q
    ||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| ||| |||||||||||||    
T  21787099 gtgcgaattctggttgaaagaagtgagctttcttggacatgttatttctggtag 21787152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 74 - 334
Target Start/End: Original strand, 19864637 - 19864898
Alignment:
Q  74 atgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacg 173  Q
    |||||||||  || ||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||  || |||||||| | ||| ||| | ||  | ||||| |||||||| |    
T  19864637 atgcctttcggtgttacgaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatctcatctttcatgcatttttggattggttcatggttgttttcattgatg 19864736  T
Q  174 atattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttg-caagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaa 272  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    ||||||||||  | |||||  |||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| |    
T  19864737 atattttgatttactctaagtctgaagaagaacatattgagcatttgaaactggtttttacaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtcta 19864836  T
Q  273 agtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    |||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  19864837 agtgcgaattctggttgaaagaagtgagttttcttggacatgttatttctggtagtggtatt 19864898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Original strand, 20008400 - 20008725
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  20008400 tgaaagatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 20008499  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
    |||||| || |||||  | ||||| ||||||||| | |||   ||||| |||||||| | ||| |||||  | || || ||||||  |||||||||  ||    
T  20008500 tatggagtatatgaacagaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttagtgatgatatcctaatttattctaagaatgaagaagagcat 20008599  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  ||||| ||||| |||| |||||| || ||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| | ||| || ||||||||||    
T  20008600 gcagagcatatgaagattgtgttgcaactgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtccaaatgtgaattttggttaagtgaagtaagttttcttg 20008699  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||    
T  20008700 gccatattatttctggtagtggtatt 20008725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 92 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 32602364 - 32602129
Alignment:
Q  92 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 191  Q
    |||||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |    
T  32602364 aatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcctttttggatcggttcgttgttgtgtttatcgatgatattttgatttactcca 32602265  T
Q  192 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattc-tggttga 290  Q
    || ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || |||||||||||||||||| |||||||    
T  32602264 agactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtcaaagtgtgaattcttggttga 32602165  T
Q  291 atgaggtgagttttcttggccatattatttctggta 326  Q
    | || || |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  32602164 aagaagtaagtttttttggccatgttatttctggta 32602129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 107 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 19980171 - 19979953
Alignment:
Q  107 tttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaa 206  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| ||||| || || ||||| || || |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||     
T  19980171 tttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgtttttatcgacgatattttgatttactccaagactgaagaagaac 19980072  T
Q  207 atgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttct 306  Q
    ||||  || || ||||| |||| ||||||||| |||||||||| || || ||||| || || || |||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  19980071 atgctgagaatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaattttatgctaaattatctaagtatgatttctggttgaaagaggtaagttttct 19979972  T
Q  307 tggccatattatttctggt 325  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  19979971 tggccatgttatttctggt 19979953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 92 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 15535602 - 15535369
Alignment:
Q  92 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 191  Q
    |||||||| || || |||||||| || |||||||  || || ||||| | ||| ||||| || || |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |    
T  15535602 aatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcacatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttatcgacgacattttgatttactcca 15535503  T
Q  192 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 291  Q
    || ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  15535502 agactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaa 15535403  T
Q  292 tgaggtgagttttcttggccatattatttctggt 325  Q
     || || ||||||||||||||| |||||||||||    
T  15535402 agaagtaagttttcttggccatgttatttctggt 15535369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Original strand, 21323758 - 21324082
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  21323758 tgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattacgagtacaatgtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 21323857  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
     ||||| || ||||| || ||||| ||||||||  | |||   || || |||||||| || || || ||| |||| || || ||| ||||||||||  ||    
T  21323858 catggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctggataaattcgtggttgtgtttatcgatgacattctgatctattcaaagactgaagaagagcat 21323957  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  | ||| ||||| |||| |||||| |  |||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||    
T  21323958 gcagaacatctgaagattgtgttgcaaattttgaaagagaaaa-gttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaagtgagttttcttg 21324056  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||    
T  21324057 gccacattatttctggtagtggtatt 21324082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 170 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 19114831 - 19114676
Alignment:
Q  170 gacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgt 269  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||    
T  19114831 gacgatattttgatttactccaagaccgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgt 19114732  T
Q  270 caaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggt 325  Q
    | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  19114731 ctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctggt 19114676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 19861737 - 19861420
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||    |  ||||| |||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  19861737 tgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattatgagtataaggtaatgcccttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 19861638  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
    |||| | || |||||  | ||||| ||||||||| | |||   ||||| |||||||| ||||| |||||  | || || ||||||  |||||||||| ||    
T  19861637 tatgaagtatatgaacagaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgatatcctaatttattctaagaatgaagaagaacat 19861538  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  ||||| ||||| |||  ||||||||| ||||| | || ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| | ||| || ||||||||||    
T  19861537 gcagagcatctgaagattgagttgcaagtgttgaaataaaagaagttgtatgccaagttgtccaaatgtgaattttggttaagtgaagtaagttttcttg 19861438  T
Q  309 gccatattatttctggta 326  Q
    ||||||||||||||||||    
T  19861437 gccatattatttctggta 19861420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 321
Target Start/End: Original strand, 19482535 - 19482855
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| | |||||||| |||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||||||||     
T  19482535 gattaaagtaaaggatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatacaaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacct 19482634  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    || || |||||||  || |||||||| || || ||||| | ||| ||||  || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  19482635 ggagtgtttatggggtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcagttcgtggttgtgttcatcgacgatattttgatttactccaagactgaag 19482734  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||| ||||  | ||| ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  19482735 aagaacatgcagaacatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgag 19482834  T
Q  301 ttttcttggccatattatttc 321  Q
    ||||||||| ||| |||||||    
T  19482835 ttttcttggtcatgttatttc 19482855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 118 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 20390292 - 20390076
Alignment:
Q  118 catgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcat 217  Q
    ||||||| | ||||| |||||||  || ||||| ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || |||||| ||||||||||  ||||  |||||    
T  20390292 catgaatagaattttccatgctttcttggatcggtttgtggttgtgtttattgatgacatcttgatttattctaagactgaagaagagcatgcggagcat 20390193  T
Q  218 ttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatatta 317  Q
    || ||| |||| ||||||||| |||| || |||||||| |||||||||||||| || | |||||||| ||| | ||| |  |||||||||||||||||||    
T  20390192 ttaaagattgtgttgcaagtgttgaaggaaaaaaagttgtatgccaagttgtccaaatttgaattctagttaagtgaagcaagttttcttggccatatta 20390093  T
Q  318 tttctggtagtgatatt 334  Q
    ||| |||||||| ||||    
T  20390092 tttatggtagtggtatt 20390076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 21165009 - 21165333
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| | || |||||||||||| ||||||| ||||| || || || || || || || |||||   ||  |||||||||  || ||| ||||||||     
T  21165009 gattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcggtatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgttacgaatgcacct 21165108  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    || || |||||||| ||||||||||| || |||||||| |  || ||||| || || ||||| || ||  | |||||||| || ||||| ||| ||||||    
T  21165109 ggagtgtttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcattcttggatcgattcgtggttgtttttatctatgatattttaatttactccaagactgaag 21165208  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| | |||||||| ||  | ||||| || || || |||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  21165209 aagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttaaaagagaagaaactttatgctaaattatccaagtgtgagttctggttgaaagaggtaag 21165308  T
Q  301 ttttcttggccatattatttctggt 325  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    
T  21165309 ttttcttggccatgttatttctggt 21165333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 309
Target Start/End: Original strand, 31414948 - 31415248
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || || || ||    
T  31414948 tgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggggtgtt 31415047  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
     ||||| || ||||| || ||||| ||||||| | | |||   ||||| |||||||| ||||| |||||| |||| || |||||| | ||||| ||  ||    
T  31415048 catggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggttgtgtttattgatgatattctgatttattctaagaccgaagaggagcat 31415147  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  ||||| ||||| |||| ||||||||| | ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||| | ||| |||| ||||||||    
T  31415148 gcagagcatctgaagattgtattgcaagtgttaaaagaaaagaagttgtatgctaagttgtcaaagtgtaagttctggttaagtgaagtgaattttcttg 31415247  T
Q  309 g 309  Q
    |    
T  31415248 g 31415248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 92 - 322
Target Start/End: Original strand, 16875657 - 16875887
Alignment:
Q  92 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 191  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||| | || |||||| ||||| | || |||||||| || |||||||| || ||||||||| | || || |    
T  16875657 aatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaa 16875756  T
Q  192 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 291  Q
    ||||||| |||||  ||||  ||||||||| | |||| ||||||||  ||||||||||  |||| | |||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  16875757 agtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaa 16875856  T
Q  292 tgaggtgagttttcttggccatattatttct 322  Q
     || |||||||| ||||| ||| | ||||||    
T  16875857 ggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 16875887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 92 - 322
Target Start/End: Original strand, 21848899 - 21849129
Alignment:
Q  92 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 191  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||| | || |||||| ||||| | || |||||||| || |||||||| || ||||||||| | || || |    
T  21848899 aatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaa 21848998  T
Q  192 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 291  Q
    ||||||| |||||  ||||  ||||||||| | |||| ||||||||  ||||||||||  |||| | |||||||||||| ||||| || || ||||||||    
T  21848999 agtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgggagttttggttgaa 21849098  T
Q  292 tgaggtgagttttcttggccatattatttct 322  Q
     || |||||||||||||| ||| | ||||||    
T  21849099 ggaagtgagttttcttggtcatgtgatttct 21849129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 107 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 22042031 - 22041813
Alignment:
Q  107 tttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaa 206  Q
    |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||     
T  22042031 tttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtggttgtgtttatcgacgatattttgatgtactccaagactgaagaagaac 22041932  T
Q  207 atgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttct 306  Q
    ||||  ||||| ||||| |||| ||||||| | |||||||||| ||  | ||||| || || || ||||| |||||||||||||| ||  | ||||||||    
T  22041931 atgctgagcatctgaagattgtcttgcaagcgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatctaagtgagaattctggttgaaagaaataagttttct 22041832  T
Q  307 tggccatattatttctggt 325  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  22041831 tggccatgttatttctggt 22041813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Original strand, 16269703 - 16270028
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| || |  || ||||| ||    
T  16269703 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgggcctggtgtgtt 16269802  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
    |||||| |||||||| || ||||| ||||||| | | |||   |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || |||  |||||| ||  ||    
T  16269803 tatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgttcattgatgatatcttgatttattccaagaatgaagaggagcat 16269902  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  ||||  |||   |||| ||||||||| |||| || || | ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| |    
T  16269903 gcagagcacctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgcaaagttgtcaaaatgtgagttctggttaagtgaagtgagctttctgg 16270002  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    | || |||||||||||||||| ||||    
T  16270003 gtcacattatttctggtagtggtatt 16270028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 6605960 - 6605635
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  6605960 tgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtttt 6605861  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
    |||||| |||||||| || ||||| ||||||| | | |||   |||||||| || || ||||| |||||||| || || || |||  ||| || ||  ||    
T  6605860 tatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtatttattgatgatattttaatctattccaagaatgaggaggagcat 6605761  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  ||||| |||   |||| ||||| ||| |||| || || | ||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| |    
T  6605760 gcagagcatctgagaattgtattgcaggtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttatcaaaatgtgagttctggttaagtgaagtgagctttctgg 6605661  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    | || |||||||||||||||| ||||    
T  6605660 gtcacattatttctggtagtggtatt 6605635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 9 - 325
Target Start/End: Original strand, 31569321 - 31569637
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||   || ||||||||||  || ||| || || || ||||| ||    
T  31569321 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcccggtgtgtt 31569420  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
     ||||| || |||||||| ||||||||||||| | | |||   || || || || || ||||| |||||| |||| || || ||| ||||||||||  ||    
T  31569421 catggagtatatgaatcgaatttttcatgcttttctggataaattcgtggtggtatttattgatgatattctgatttattcgaagactgaagaagagcat 31569520  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  | ||| |||   ||||  |||||||  |||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||| | | ||| |||||||| ||||    
T  31569521 gcagaacatctgagaattgtgctgcaagttttgaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcgaaatgtgagttttggctaagtgaagtgagtttccttg 31569620  T
Q  309 gccatattatttctggt 325  Q
    | |||||||||||||||    
T  31569621 gtcatattatttctggt 31569637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 27356838 - 27356513
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  27356838 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 27356739  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
    |||||| |||||||| || || || ||||||| | | |||   |||||||| ||||| ||||| ||||| || || || || |||  |||||| ||  ||    
T  27356738 tatggagtacatgaaccgaatcttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatcttaatttattccaagaatgaagaggagcat 27356639  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  ||||| |||   |||| ||||||||  | |||||||| | ||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| |    
T  27356638 gcagagcatctgagaattgtattgcaagttttaaaagagaagaggttgtatgcgaagttgtcgaaatgtgagttctggttaagtgaagtgagctttctgg 27356539  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    | |||||||||| |||||||| ||||    
T  27356538 gtcatattatttttggtagtggtatt 27356513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 28983213 - 28983082
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  28983213 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtttt 28983114  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgctt 140  Q
    |||||| |||||||| || ||||| |||||||    
T  28983113 tatggagtacatgaaccgaattttccatgctt 28983082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 28988432 - 28988301
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  28988432 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtttt 28988333  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgctt 140  Q
    |||||| |||||||| || ||||| |||||||    
T  28988332 tatggagtacatgaaccgaattttccatgctt 28988301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 92 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 22373150 - 22372908
Alignment:
Q  92 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 191  Q
    ||||| || ||||| || ||||| ||||||||| | ||||| ||||||||| | |||   ||||| |||||||| | ||| |||||  | || || ||||    
T  22373150 aatgcgcctggtgtgttcatggagtacatgaattgaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttactgatgatatcctaatttattcta 22373051  T
Q  192 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 291  Q
    ||  |||||||||  ||||  ||||| | ||| |||| ||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||| ||| || |||||||| |||||       
T  22373050 agaatgaagaagaccatgcagagcatcttaagattgtgttgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagtggtccaaatgtgaattatggttacg 22372951  T
Q  292 tgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    ||| || ||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||    
T  22372950 tgaagtaagttttcttggtcacattatttttggtagtggtatt 22372908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 22522853 - 22522719
Alignment:
Q  4 taaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggt 103  Q
    |||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||  ||||||| || ||   || ||||||||||  || ||||||||| || ||     
T  22522853 taaagtgaaagatgaagatatgcagaaaacggcttttagaacacgttatcgacattatgagtataaagtgatgcctttcggtgttacaaatgcgccagga 22522754  T
Q  104 gtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgc 138  Q
    || |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  22522753 gtgtttatggagtacatgaatcgcatttttcatgc 22522719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 4984344 - 4984019
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  ||  || || || || ||||| ||    
T  4984344 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgtaactaaagcgcctggtgtttt 4984245  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
    |||||| ||||||||||| || || ||||||| | |||||   |||||||| ||||||||| | ||||  ||||| || || |||   || |||||  ||    
T  4984244 tatggagtacatgaatcgaatcttccatgcttttctagataagtttgttgtggtgttcattaatgataccttgatttattccaagaacgaggaagagcat 4984145  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  ||||| |||   | || ||||||||| | || |||||    || ||||  ||||||||||| ||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| |    
T  4984144 gcagagcatctgagaatagtattgcaagtgttaaaggagaagcgattgtatgttaagttgtcaaaatgtgagttctggttaagtgaagtgagctttctgg 4984045  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    | || |||||||||||||||| ||||    
T  4984044 gtcacattatttctggtagtggtatt 4984019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 14567444 - 14567119
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||||||||| ||| || | |||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| || || || ||||| ||    
T  14567444 tgaaggatgaggatttgcaaaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaaggcgcctggtgtttt 14567345  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
    |||||| |||||||| || ||||| ||||||| | | |||   |||||||| ||||| ||||| ||||| || || || || |||  ||| || ||  ||    
T  14567344 tatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatcttaatttattccaagaatgaggaggagcat 14567245  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    || |||||  | ||  | || ||||||||| |||| || || |  || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| |    
T  14567244 gcaaagcacctaaaaatagtgttgcaagtgttgaaggaaaagagattgtatgcaaagttgtcgaaatgtgagttctggttaagtgaagtgagctttctgg 14567145  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    | || |||||||||||||||| ||||    
T  14567144 gtcacattatttctggtagtggtatt 14567119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 19984482 - 19984424
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataa 67  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||    
T  19984482 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattatgaataa 19984424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 20390396 - 20390331
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaata 66  Q
    ||||||| | || |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  20390396 gattaaagtaaaagatgaagatatgcagaaaacggcctttaggacacgatatggacattacaaata 20390331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 22217 - 22549
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||  || ||| |||||||||    
T  22217 gattaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttacggacattacaaatattcagtgatgcctttcg-tgttactaatgcaccg 22315  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22316 ggtgtatttacggaatacatgaattgcatttctcatgcttatttagatcgcattgttgttgtgttcattgatgatattttgatatactctaagtctgaag 22415  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22416 aagaacacgccaagcatttgaagattgttttgcaagtgctgcaagagaaaacgttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 22515  T
Q  301 ttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22516 tttttttggccatattatttctggtagtggtatt 22549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 47)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 15626758 - 15626433
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||||||| || ||| ||||||||     
T  15626758 gattaaactgaaagatgaagatacgaagaagacggcttttaggacacgttacagacattacgaatattcggtgatgcctttcagtgttactaatgcacca 15626659  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||| |||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  15626658 ggtgtatttatggagtacatgaaccgtatttttcatgcttatttagatcgcttcgtggttgcgttcatcgatgatattttaatatactataagtctgaag 15626559  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||| ||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15626558 aagaacatgtcgagtatttgaagattgttttgcaagtgctgaaagagaagaagttatatgctaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 15626459  T
Q  301 ttttcttggccatattatttctggta 326  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||    
T  15626458 tttccttggccatattatttctggta 15626433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 2 - 334
Target Start/End: Original strand, 48813290 - 48813621
Alignment:
Q  2 attaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgg 101  Q
    |||||| |||| || || |||||| |||||||  | |||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||  || ||| ||||| ||      
T  48813290 attaaagtgaaagacgaggatatgcagaagacaacctttaggacacgttatggacattacgaatattcagtgatgcctttcggtgttactaatgcgccaa 48813389  T
Q  102 gtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaaga 201  Q
    |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  48813390 gtgtgtttatggagtacatgaattgtatttttcatgcttatttagatcgcttcgtggttgtgttcattgatgatattttgatatactctaagtctgaaga 48813489  T
Q  202 agaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagt 301  Q
    |||| ||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48813490 agaacatgctgagcatttgaagattgtgttgcaagtgctgaaggagaagaagttatatgccaa-ttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagt 48813588  T
Q  302 tttcttggccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  48813589 tttcttggccatgttatttctggtagtggtatt 48813621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 14041928 - 14041595
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||| |||||||| || ||   || ||||||||||  || ||||||||||||     
T  14041928 gattaaagtgaaagatgaagatatggagaagacagcttttagaacgcgttatggacattatgagtacaaagtgatgcctttcggtgttacaaatgcacct 14041829  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    | ||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||| | ||| |||||||| || ||| | |||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||| |    
T  14041828 gatgtgtttatggagtacatgaatcacatttttcatgcatttttggatcgtttcgtagttattttcattgatgatattttgatttactccaagactgagg 14041729  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||| |||   ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || || |||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  14041728 aagaacatgatgagcatttgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaataaactttatgctaaattatcaaagtgtgaattctagttgaaagaggtgag 14041629  T
Q  301 ttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    ||||||||| ||| ||| | ||||||||| ||||    
T  14041628 ttttcttggacatgttactactggtagtggtatt 14041595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 14351958 - 14351625
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||| |||||||| || ||   || ||||||||||  || ||||||||||||     
T  14351958 gattaaagtgaaagatgaagatatggagaagacagcttttagaacgcgttatggacattatgagtacaaagtgatgcctttcggtgttacaaatgcacct 14351859  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    | ||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||| | ||| |||||||| || ||| | |||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||| |    
T  14351858 gatgtgtttatggagtacatgaatcacatttttcatgcatttttggatcgtttcgtagttattttcattgatgatattttgatttactccaagactgagg 14351759  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||| |||   ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || || |||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  14351758 aagaacatgatgagcatttgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaataaactttatgctaaattatcaaagtgtgaattctagttgaaagaggtgag 14351659  T
Q  301 ttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    ||||||||| ||| ||| | ||||||||| ||||    
T  14351658 ttttcttggacatgttactactggtagtggtatt 14351625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 326
Target Start/End: Original strand, 15146921 - 15147247
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||  || || || ||||||||||| ||   ||  ||||||||   || ||||||||||||     
T  15146921 gattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacggcttttaaaacgcgatatggacattacgagtataaagttatgccttttggtgttacaaatgcacct 15147020  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgc-ttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaa 199  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||| ||||| || || ||| | |||||||| |||||||| || ||||| ||| |||||    
T  15147021 ggtgtgtttatggagtacatgaatcgcattttccatgcattttttggatcggttcgtggtttttttcattgatgatatttttatctactccaagactgaa 15147120  T
Q  200 gaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtga 299  Q
    |||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  15147121 gaagaacatgctgagcatttgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgcaaaattgtctaagtgtgagttctggttgaaagaggtaa 15147220  T
Q  300 gttttcttggccatattatttctggta 326  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||    
T  15147221 gttttcttggccatgttatttctggta 15147247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 11235250 - 11235574
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| | || |||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||||||||     
T  11235250 gattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacacgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacct 11235349  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  11235350 ggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaag 11235449  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  11235450 aagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgag 11235549  T
Q  301 ttttcttggccatattatttctggt 325  Q
    |||||| |||||| |||||||||||    
T  11235550 ttttctaggccatgttatttctggt 11235574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 153 - 334
Target Start/End: Original strand, 11770430 - 11770611
Alignment:
Q  153 ttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaa 252  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| | |||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||    
T  11770430 ttgtggttgtgttcatcgatgatattttgatatactccaagtctgagggagaacatgctgagcatttgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaa 11770529  T
Q  253 gttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    ||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  11770530 gttatatgttaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaggtaagttttcttggccatgttatttctggtagtggtatt 11770611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 15159094 - 15159418
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||||||||     
T  15159094 gattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacct 15159193  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||| |||| |    
T  15159194 ggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgacg 15159293  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  15159294 aagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgag 15159393  T
Q  301 ttttcttggccatattatttctggt 325  Q
    |||||| |||||| |||||||||||    
T  15159394 ttttctaggccatgttatttctggt 15159418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 11 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 8709828 - 8709514
Alignment:
Q  11 aaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtattta 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| |||||||| || || ||||    
T  8709828 aaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgttta 8709729  T
Q  111 tggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgc 210  Q
    |||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||| | |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  8709728 tggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttatggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgc 8709629  T
Q  211 caagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggc 310  Q
      ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  8709628 tgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagttttctaggc 8709529  T
Q  311 catattatttctggt 325  Q
    ||| |||||||||||    
T  8709528 catgttatttctggt 8709514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Original strand, 11386452 - 11386777
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||  || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||||||    
T  11386452 tgaaggatgaagatatgcagaagacggactttaggacacgttgtggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgccaggtgtatt 11386551  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
    |||||| || | |||  | ||||||||||||| | | ||| | || || || ||||| ||||| |||||||| || || |||||| ||||||||||  ||    
T  11386552 tatggagtataagaacagaatttttcatgcttttctggatagattcgtggtggtgtttattgatgatattttaatttattctaagactgaagaagagcat 11386651  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||| ||||| ||| | |||| || || || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| | ||| ||||||||||| |    
T  11386652 gccgagcatctgaggattgtattacaggttctgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaaatgtgaattctggttaagtgaagtgagttttctcg 11386751  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||    
T  11386752 gccacattatttctggtagtggtatt 11386777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 92 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 14334538 - 14334305
Alignment:
Q  92 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 191  Q
    |||||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| |    
T  14334538 aatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactcca 14334439  T
Q  192 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 291  Q
    || ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||  | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  14334438 agactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgaattctggttgaa 14334339  T
Q  292 tgaggtgagttttcttggccatattatttctggt 325  Q
     || ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  14334338 agaagtgagttttctaggccatgttatttctggt 14334305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 92 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 14956696 - 14956463
Alignment:
Q  92 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 191  Q
    |||||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| ||||| |    
T  14956696 aatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactcca 14956597  T
Q  192 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 291  Q
    || ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  14956596 agactgaagaagaagatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgaattctggttgaa 14956497  T
Q  292 tgaggtgagttttcttggccatattatttctggt 325  Q
     || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14956496 agaagtgagttttcttggccatgttatttctggt 14956463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 11551139 - 11551463
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| | || |||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||||||||     
T  11551139 gattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagcttttagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacct 11551238  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| || || ||| ||||||    
T  11551239 ggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttattccaagactgaag 11551338  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||| |||   ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  11551339 aagaacatgttgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgag 11551438  T
Q  301 ttttcttggccatattatttctggt 325  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    
T  11551439 ttttcttggccatgttatttctggt 11551463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 13675678 - 13675353
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  13675678 tgaaggatgaggatatggagaagacggcctttaggacacgatatggacattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 13675579  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
     ||||| || ||||| || ||||| ||||||||  | |||   ||||| ||||| || ||||| || ||| |||| || || ||| ||||||||||  ||    
T  13675578 catggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctggataaatttgtggttgtatttattgatgacattctgatttattcaaagactgaagaagagcat 13675479  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  ||||| ||||| |||| ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||||| |||||    
T  13675478 gcagagcatctgaagattgtattgcaagtattgaatgagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaagtgagttatcttg 13675379  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||    
T  13675378 gccacattatttctggtagtggtatt 13675353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 17 - 321
Target Start/End: Original strand, 44789404 - 44789708
Alignment:
Q  17 gaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaat 116  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || |||||||| || || |||||||| |    
T  44789404 gaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagt 44789503  T
Q  117 acatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagca 216  Q
    | |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| ||| |||| || |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||  ||||    
T  44789504 atatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttatgtttatcgacgatattttgatctactccaagactgaagaagaacatgctgagca 44789603  T
Q  217 tttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatatt 316  Q
    | ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||    
T  44789604 tctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaggtgagtttccttggccatgtt 44789703  T
Q  317 atttc 321  Q
    |||||    
T  44789704 atttc 44789708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Original strand, 12204823 - 12205148
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    ||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||||| ||| || |||||||| |||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  12204823 tgaagtatgaagatatgcagaaaacggcctttaggatacgatatggacattatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 12204922  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
    |||||| ||||||||| | ||||| ||||||||| | |||   | ||| || ||||| ||||| ||||| || || || | |||| ||||||||||  ||    
T  12204923 tatggagtacatgaatagaattttccatgcttatctggataaatctgtggtcgtgtttattgatgatatcttaatttattttaagactgaagaagagcat 12205022  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  ||||| ||||  |||| ||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || ||||||||||    
T  12205023 gcagagcatctgaaaattgtgttgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtccaaatgtgaattctggttaagtgaagtaagttttcttg 12205122  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||    
T  12205123 gccacattatttctggtagtggtatt 12205148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 15342657 - 15342332
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  15342657 tgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 15342558  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
     ||||| || |||||  | ||||| ||||  | | | |||   ||||| ||||| ||||||||||||||  | || || |||||| || |||| ||  ||    
T  15342557 catggagtatatgaactgaattttccatgtctttctggataagtttgtggttgtattcattgacgatatcctaatttattctaagactaaagaggagcat 15342458  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  | ||| ||| | |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| | ||| |||||||||||||    
T  15342457 gcagaacatctgaggattgtattgcaagtactgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaaatgtgaattctggttaagtgaagtgagttttcttg 15342358  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||    
T  15342357 gccacattatttctggtagtggtatt 15342332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 19149436 - 19149112
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  19149436 tgaaggatgaggat-tgcagaagacggcctttaggacacgttacggtcactatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 19149338  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
    |||||| || |||||| | ||||| ||||||||| | |||   ||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||| |||| |||||  ||    
T  19149337 tatggagtatatgaattgaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttaatttattctaagactgatgaagagcat 19149238  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  ||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||| || ||||| | || ||||||||| || |||||||||||||| | ||| || ||||||||||    
T  19149237 gcagagcatctgaagattgtgttgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtgtgtcaagttgtccaaatgtgaattctggttaagtgaagtaagttttcttg 19149138  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||    
T  19149137 gccatattatttctggtagtggtatt 19149112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 107 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 12689629 - 12689411
Alignment:
Q  107 tttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaa 206  Q
    |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||     
T  12689629 tttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtattcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaac 12689530  T
Q  207 atgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttct 306  Q
    ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  12689529 atgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgagttctggttgaaagaagtgagttttct 12689430  T
Q  307 tggccatattatttctggt 325  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  12689429 tggccatgttatttctggt 12689411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Original strand, 15100626 - 15100951
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| | ||||||||||| || || |||||| ||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  15100626 tgaaggatgaggatatgcagaagacgacctttaggacacgatatggtcattacaaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 15100725  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||||||  | |||   || || |||||||| ||||| || || ||||| || |||||| ||||||||||  ||    
T  15100726 tatggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctggataaattcgtggttgtgtttattgatgacatcttgatttattctaagactgaagaagagcat 15100825  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  | ||| ||||| | || ||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||| || ||||||||||    
T  15100826 gcagaacatctgaagatcgtcttgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgagttctggttaagtgaagtaagttttcttg 15100925  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||    
T  15100926 gccacattatttctggtagtggtatt 15100951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 20748835 - 20748511
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  20748835 tgaaggatgaggat-tgcagaagacggcctttaggacacgttacggtcactatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 20748737  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
    |||||| || |||||  | ||||| ||||||||| | |||   ||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||| |||| |||||  ||    
T  20748736 tatggagtatatgaacagaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttaatttattctaagactgatgaagagcat 20748637  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  ||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||| || ||||| | || ||||||||| || |||||||||||||| | ||| || ||||||||||    
T  20748636 gcagagcatctgaagattgtgttgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtgtgtcaagttgtccaaatgtgaattctggttaagtgaagtaagttttcttg 20748537  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||    
T  20748536 gccatattatttctggtagtggtatt 20748511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Original strand, 14262268 - 14262592
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||  || || ||||| |||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  14262268 tgaaggatgaggatatgcagaagatggcctttaggacacaatatggtcattatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 14262367  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
    |||||| || |||||| | ||||| ||||||||| | |||   ||||| |||||||| ||||| || || || || || |||| | ||||||||||  ||    
T  14262368 tatggagtatatgaatagaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttaatttattcta-gactgaagaagagcat 14262466  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  ||||| ||||| || | ||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||| || ||||||||||    
T  14262467 gcagagcatctgaagattatgttgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgaattttggttaagtgaagtaagttttcttg 14262566  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||    
T  14262567 gccatattatttctagtagtggtatt 14262592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Original strand, 16948495 - 16948820
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||   | ||||||||||  || ||| ||||| || || || ||    
T  16948495 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattacgaataaaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggcgtgtt 16948594  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||||| | | |||   ||||| |||||||| ||||| |||||| |||| || |||||    ||||| ||  |     
T  16948595 tatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggttgtgtttattgatgatattctgatttattctaaaatcgaagaggagcac 16948694  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  ||||| ||||| |||| ||||||||  ||||||| || ||||| ||||| ||| ||||||||||||| || ||||| | ||| ||||||||||| |    
T  16948695 gcagagcatctgaagattgtgttgcaagtcttgaaagaaaagaagttgtatgctaagctgtcaaagtgtgagttttggttaagtgaagtgagttttctgg 16948794  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||    
T  16948795 gccacattatttctggtagtggtatt 16948820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 10872923 - 10872599
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| | || |||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||||||||     
T  10872923 gattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacct 10872824  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | | | ||||| ||||| || ||||| || |||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  10872823 ggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttctggatcggtttgtggtcgtgtttatcgacgatattttgatctactccaagactgaag 10872724  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||| ||||  ||||| ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||  | ||| | || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  10872723 aagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatcctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgag 10872624  T
Q  301 ttttcttggccatattatttctggt 325  Q
    |||||| |||||| |||||||||||    
T  10872623 ttttctaggccatgttatttctggt 10872599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 9 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 14139905 - 14139589
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||   || ||||||||||  || ||| || || || ||||| ||    
T  14139905 tgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctggtgtgtt 14139806  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
     ||||| || |||||||| ||||||||||||| | | |||   || || || || || ||||| ||||||||||| || |||||| ||||||||||  ||    
T  14139805 catggagtatatgaatcgaatttttcatgcttttctggataaattcgtggtggtatttattgatgatattttgatttattctaagactgaagaagagcat 14139706  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  | ||| |||   |||| ||||||||  ||||||| || ||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||| | | ||| || ||||| ||||    
T  14139705 gcagaacatctgagaattgtgttgcaagtattgaaagaaaagaagttgtatgccaaattgtcaaaatgtgagttttggctaagtgaagtaagtttccttg 14139606  T
Q  309 gccatattatttctggt 325  Q
    | |||||||||||||||    
T  14139605 gtcatattatttctggt 14139589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 107 - 325
Target Start/End: Original strand, 15493 - 15711
Alignment:
Q  107 tttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaa 206  Q
    |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || |||| ||| || |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||     
T  15493 tttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcctttttggatcggttcgtagttgcgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaagaagaac 15592  T
Q  207 atgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttct 306  Q
    ||||  ||||| ||| | |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  15593 atgctgagcatctgatgattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttct 15692  T
Q  307 tggccatattatttctggt 325  Q
    ||||||| |||||| ||||    
T  15693 tggccatgttatttttggt 15711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 92 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 7826042 - 7825812
Alignment:
Q  92 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 191  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||| | || |||||| ||||| | || |||||||| || |||||||| || ||||||||| | || || |    
T  7826042 aatgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaa 7825943  T
Q  192 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 291  Q
    ||||||| |||||  ||||  ||||||||| | |||| ||||||||  ||||||||||  |||| | |||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  7825942 agtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaa 7825843  T
Q  292 tgaggtgagttttcttggccatattatttct 322  Q
     || |||||||| ||||| ||| | ||||||    
T  7825842 ggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 7825812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Original strand, 16070320 - 16070643
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||    | ||||||||||  || ||| ||||| ||  ||||  |    
T  16070320 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctagtgt--t 16070417  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
    |||||| || |||||  | ||||| ||||  ||| | |||   ||||| |||||||| ||||| |||||| | || || |||||| ||||||||||  ||    
T  16070418 tatggagtatatgaacagaattttccatgtctatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgatattctcatttattctaagactgaagaagagcat 16070517  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  || || ||||| |||| ||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| | ||| || |||||||| |    
T  16070518 gcagagtatctgaagattgtattgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtccaaatgtgagttctggttaagtgaagtaagttttctgg 16070617  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||    
T  16070618 gtcatattatttctggtagtggtatt 16070643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 92 - 322
Target Start/End: Original strand, 27105902 - 27106132
Alignment:
Q  92 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 191  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||| | || |||||| ||||| | || |||||||| || |||||||| || ||||||||| | || || |    
T  27105902 aatgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaa 27106001  T
Q  192 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 291  Q
    ||||||| |||||  ||||  ||||||||| | |||| ||||||||  ||||||||||  |||| | |||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  27106002 agtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaa 27106101  T
Q  292 tgaggtgagttttcttggccatattatttct 322  Q
     || |||||||| ||||| ||| | ||||||    
T  27106102 ggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 27106132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 92 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 27172423 - 27172193
Alignment:
Q  92 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 191  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||| | || |||||| ||||| | || |||||||| || |||||||| || ||||||||| | || || |    
T  27172423 aatgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaa 27172324  T
Q  192 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 291  Q
    ||||||| |||||  ||||  ||||||||| | |||| ||||||||  ||||||||||  |||| | |||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  27172323 agtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaa 27172224  T
Q  292 tgaggtgagttttcttggccatattatttct 322  Q
     || |||||||| ||||| ||| | ||||||    
T  27172223 ggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 27172193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Original strand, 26092821 - 26093146
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  26092821 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtttt 26092920  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
    |||||| |||||||| || ||||| ||||||| | | |||   |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || || |||  ||| || ||  ||    
T  26092921 tatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatattttaatctattccaagaatgaggaggagcat 26093020  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  ||||| |||   |||| ||||||||| |||| || || | ||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||| |    
T  26093021 gcagagcatctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttatcaaaatgtgagttctggttaaatgaagtaagttttctgg 26093120  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    | || |||||||||||||||| ||||    
T  26093121 gtcacattatttctggtagtggtatt 26093146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 13023583 - 13023258
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  13023583 tgaatgatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtttt 13023484  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
    |||| | || ||||| || ||||| ||||||| | | |||   ||||| || ||||| ||||| |||| |||||| || |||||| ||||||| ||  ||    
T  13023483 tatgtattatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggtggtgtttattgatgataatttgatttattctaagactgaagaggagcat 13023384  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  | ||| |||   |||| ||||||||  ||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| | ||| ||||||||||| |    
T  13023383 gcagaacatctgagaattgtattgcaagttttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgagttgtggttaagtgaagtgagttttctgg 13023284  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    | || |||||||||||||||| ||||    
T  13023283 gtcacattatttctggtagtggtatt 13023258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 19614901 - 19614576
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||| ||||| || ||| ||||||| || ||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  19614901 tgaaagatgaggacatgcagaagactgcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 19614802  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
     ||||| || |||||  | ||||||||||||||  | |||   ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || || |   |||| |||||  ||    
T  19614801 catggagtatatgaacagaatttttcatgcttacctggataaatttgtggttgtattcattgatgacattttgatctattcgagaactgaggaagagcat 19614702  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  | ||| ||| | |||| ||||||||  |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||| | ||| |||||||||||||    
T  19614701 gcagaacatctgaggattgtattgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcaaagtgcgagttttggttaagtgaagtgagttttcttg 19614602  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||    
T  19614601 gccatattatttctggtagtggtatt 19614576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 49154527 - 49154202
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  49154527 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtttt 49154428  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
    |||||  |||||||| || ||||| ||||||| | | |||   |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || || |||  ||| || ||  ||    
T  49154427 tatggggtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatattttaatctattccaagaatgaggaggagcat 49154328  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  ||||| |||   |||| ||||||||| |||| || || | ||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||| |    
T  49154327 gcagagcatctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttatcaaaatgtgagttctggttaaatgaagtaagttttctgg 49154228  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    | || |||||||||||||||| ||||    
T  49154227 gtcacattatttctggtagtggtatt 49154202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 18179978 - 18179655
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| | |||||||| |||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||   ||  |||||||||  ||  || ||||||||     
T  18179978 gattaaagtaaaggatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggccactacgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacct 18179879  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
     | || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||| | || ||  ||||||| || ||| |||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  18179878 agagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggattggttcgtaattgtgtttatcgaccatattttgatttactccaagactgaag 18179779  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaa--aaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtg 298  Q
    ||||| ||||| ||||| | ||| |||| || |||||| |||| |||||  | | || |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  18179778 aagaacatgccgagcatctcaagattgtcttacaagtgttgaa-gagaangacactt-tatgccaaattgtctaagtatgaattctggttgaaagaggtg 18179681  T
Q  299 agttttcttggccatattatttctgg 324  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||    
T  18179680 agttttcttggccatgttatttctgg 18179655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Original strand, 11301236 - 11301561
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  11301236 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtttt 11301335  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
    |||||| |||||||| || ||||| ||||||| | | |||   |||||||| ||||| ||||| ||||| || || || || |||  ||| || ||  ||    
T  11301336 tatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatcttaatttattccaagaatgaggaggagcat 11301435  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  ||||| |||   | || ||||||||| |||| || || | ||| ||||| ||||||||||| |||||  ||||||| ||||| || |||||||| |    
T  11301436 gcagagcatctgagaatagtgttgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttgtcaaaatgtgagatctggttaaatgaagtaagttttctgg 11301535  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    | || |||||||||||||||| ||||    
T  11301536 gtcacattatttctggtagtggtatt 11301561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 13688274 - 13688021
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || |  || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||||||||     
T  13688274 gattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtccctatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacct 13688175  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||| |||| |    
T  13688174 ggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgacg 13688075  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagt 254  Q
    ||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  13688074 aagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagt 13688021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Original strand, 13966691 - 13967016
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| | |||||||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| || || || ||||| ||    
T  13966691 tgaaggatgaggatatgcagaagacgacctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctggtgtgtt 13966790  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
    |||||| |||||||| || || || ||||||| | | |||   |||||||| ||||| ||||| ||||| || || || || |||  |||||| ||  ||    
T  13966791 tatggagtacatgaaccgaatcttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatcttaatttattccaagaatgaagaggagcat 13966890  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  ||||| |||   |||| ||||||||  |||||||||| | ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| |    
T  13966891 gcagagcatctgagaattgtcttgcaagttttgaaagagaagaggttgtatgctaagttgtcaaaatgtgagttctggttaagtgaagtgagctttctgg 13966990  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    | || |||||||||||||||| ||||    
T  13966991 gtcacattatttctggtagtggtatt 13967016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Original strand, 14284399 - 14284724
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || || || ||    
T  14284399 tgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttattgtcattacgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggcgtgtt 14284498  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
     ||||| || || ||  | |||||||||||||   | |||   ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || |||||| ||||||| ||  ||    
T  14284499 catggagtatataaacaggatttttcatgctttcctggataagtttgtggttgtattcattgatgacattttgatttattctaagactgaagaggagcat 14284598  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
     |  | ||| ||| | || | ||||||||  |||||||||| ||| | ||||| |||||||| || ||||| |||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  14284599 acagaacatctgaggattatattgcaagtattgaaagagaagaagctgtatgctaagttgtcgaaatgtgagttctagttaagtgaagtgagttttcttg 14284698  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||    
T  14284699 gccacattatttctggtagtggtatt 14284724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Original strand, 26116613 - 26116938
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| || || || ||||| ||    
T  26116613 tgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacattatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctggtgtttt 26116712  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
    |||||| ||||||||||| || || ||||||| | | |||   ||| |||| ||||| |||||||||||||| || || || |||  ||| || ||  ||    
T  26116713 tatggagtacatgaatcgaatcttccatgcttttctggataagtttcttgtggtgtttattgacgatattttaatctattccaagaatgaggaggagcat 26116812  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  ||||| |||   |||| ||||||||| |||| || || | ||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| |    
T  26116813 gcagagcatctgagaattgtgttgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgcaaagttgtcgaaatgtgagttctggttaagtgaagtgagctttctgg 26116912  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    | || ||||||| |||||||||||||    
T  26116913 gtcacattatttttggtagtgatatt 26116938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 325
Target Start/End: Original strand, 18051976 - 18052292
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||   || ||||||||||  || ||| || || || ||||||||    
T  18051976 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcccggtgtatt 18052075  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
     ||||| || |||||||| ||||||||||||| | | |||   || || || || || ||||| || ||| |||| || || ||| ||||||||||  ||    
T  18052076 catggagtatatgaatcgaatttttcatgcttttctggataaattcgtggtggtatttattgatgacattctgatttattcgaagactgaagaagagcat 18052175  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  | ||| |||   |||| ||||||||  ||||||| |  ||||| ||||||||  |||| || ||||| || ||| | | ||| |||||||| ||||    
T  18052176 gcagaacatctgagaattgtgttgcaagttttgaaagaaaggaagttgtatgccaaactgtcgaaatgtgagttttggctaagtgaagtgagtttccttg 18052275  T
Q  309 gccatattatttctggt 325  Q
    | |||||||||||||||    
T  18052276 gtcatattatttctggt 18052292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 325
Target Start/End: Original strand, 23503893 - 23504209
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||   || ||||||||||  || ||| || || || ||||| ||    
T  23503893 tgaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcccggtgtgtt 23503992  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
     ||||| || |||||||| ||||||||||||| | | |||   || || || || || ||||| |||||| |||| || || ||| ||||||||||  ||    
T  23503993 catggagtatatgaatcgaatttttcatgcttttctggataaattcgtggtggtatttattgatgatattctgatttattcgaagactgaagaagagcat 23504092  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  | ||| |||   |||| ||||||||  ||||||| |  ||||| ||||||||  |||| || ||||| || ||| | | ||| |||||||| ||||    
T  23504093 gcagaacatctgagaattgtgttgcaagttttgaaagaaaggaagttgtatgccaaactgtcgaaatgtgagttttggctaagtgaagtgagtttccttg 23504192  T
Q  309 gccatattatttctggt 325  Q
    | |||||||||||||||    
T  23504193 gtcatattatttctggt 23504209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 230 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 14213678 - 14213583
Alignment:
Q  230 ttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggt 325  Q
    ||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||||||    
T  14213678 ttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtcaaagtgtgaattctggttgaaagaagtaagttttcttggccatgttatttctggt 14213583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 92 - 230
Target Start/End: Original strand, 18588299 - 18588437
Alignment:
Q  92 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 191  Q
    |||||||| || || |||||||| || |||||| | || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| |    
T  18588299 aatgcacctggagtgtttatggagtatatgaattgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactcca 18588398  T
Q  192 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttt 230  Q
    || ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||    
T  18588399 agactgaagaagaacatgctgagcatttgaagattgttt 18588437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 12458866 - 12458541
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||| ||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||   || ||||||||||  || ||| || || || ||||| ||    
T  12458866 tgaaagatgaggatatgcagaagacggcctttagaacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctggtgtgtt 12458767  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
     ||||| ||  ||||    || || ||||||| | | |||  ||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || || |||  |||||| ||  ||    
T  12458766 catggagtatttgaacataatcttccatgcttttctggataatttcgttgttgtgtttattgatgatattttaatctattccaagaatgaagaggagcat 12458667  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  ||||| |||   |||| ||||||||  ||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| |    
T  12458666 gcagagcatctgagaattgtattgcaagttttgaaagaaaagaagttgtatgcaaagttgtcaaaatgtgagttctggttaagtgaagtgagatttctgg 12458567  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    | || |||||||||||||||| ||||    
T  12458566 gacacattatttctggtagtggtatt 12458541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 244 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 8200618 - 8200537
Alignment:
Q  244 agagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggt 325  Q
    |||||| ||| | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  8200618 agagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctggt 8200537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 276 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 13688022 - 13687973
Alignment:
Q  276 gtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggt 325  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  13688022 gtgaattctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctggt 13687973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 2)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 3174 - 2849
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| |||| ||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||  || ||| |||||||||    
T  3174 gattaaagtgaaagatgaggatatgcagaagatggcctttaggacacgttacggacattacaaatattcagtgatgcctttcggtgttactaatgcaccg 3075  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||    
T  3074 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttggatcgtttcgtggttgtgttcatcgatgatattttgatataatctaagtctgaag 2975  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||| ||||  | ||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2974 aagaacatgctgaacatttgaagattattttgcaagtgctgaaagagaagaagttatatgctcaattgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 2875  T
Q  301 ttttcttggccatattatttctggta 326  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||    
T  2874 tttccgtggccatattatttctggta 2849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 7690 - 8023
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||| || ||  |||| |||||||| || ||   ||  |||||||||  || ||||||||||||     
T  7690 gattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagactgctttcagaacgggttatggacattatgagtacaaagttatgcctttcggtgttacaaatgcacct 7789  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| ||||| ||  | ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  7790 ggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggttcatagttgtttttattgatgatattttgatttactccaagtctgaag 7889  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||| |||   ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| |||| ||||||||||||||| |  |||||    
T  7890 aagaacatgttgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaagtatgaattctggttgaaaggagtgag 7989  T
Q  301 ttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
     |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  7990 ctttcttggacatgttatttctggtagtggtatt 8023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 20 - 334
Target Start/End: Original strand, 9084 - 9398
Alignment:
Q  20 gatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaataca 119  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||  || ||||||||| || ||||| |||||||| ||||    
T  9084 gatatggagaagacggcttttaggacacgttatggacattatgaatattcagtgatgcctttcggtgttacaaatgcgccaggtgtgtttatggagtaca 9183  T
Q  120 tgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcattt 219  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||    
T  9184 tgaatcgtatttttcatgcgtatttagatcgtttcgtggttgtgttcatggatgatattttgatatactctaagtctgaagaagaacatgttgagcattt 9283  T
Q  220 gaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatt 319  Q
    || | ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9284 gaggattgttttgcaagtgctgaaggagaagaagttatatgccaagctgtcaaagtgtgaattctggttggatgaggtgagttttcttggccatgttatt 9383  T
Q  320 tctggtagtgatatt 334  Q
    |||||||||| ||||    
T  9384 tctggtagtggtatt 9398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 47)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 20466309 - 20466642
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| |||| || || |||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||   || ||| |||||||||    
T  20466309 gattaaagtgaaagacgaggatatgcaaaagacggcctttaggacacgttatggacattacgaatattcagtgatgccttttggtgttactaatgcaccg 20466408  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    ||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20466409 ggtgtgtttatgaagtacatgaatcgtatttttcatgcgtatttagatcgcttcgtggttgtgatcatcgatgatattttgatatactctaagtctgaag 20466508  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||| |||   ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20466509 aagaacatgttgagcatttgaagattgttttgcaagtgctgaaggagaagaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgagttctggttgaatgaggtgag 20466608  T
Q  301 ttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  20466609 ttttcttggccatgttatttctggtagtggtatt 20466642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 2 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 23473402 - 23473070
Alignment:
Q  2 attaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgg 101  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||   || ||||||||||  || ||||||||| || |    
T  23473402 attaaagtgaaagatgaagatatgtagaagacggcttttagaacacgttatggacattatgaatataaagtgatgcctttcggtgttacaaatgcgccag 23473303  T
Q  102 gtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaaga 201  Q
    |||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  23473302 gtgtgtctatggagtacatgaatcgtatttttcatgcatttttggatcgtttcgtggttgtgttcatcgacgatattttgatgtactcaaagtctgaaga 23473203  T
Q  202 agaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagt 301  Q
    |||| ||||  ||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  23473202 agaacatgctgagcgtttaaaagttgttttgcaagtgctgaaagagaagaagttatatgctaaattgtcaaagtgtgagttctagttgaatgaggtgagt 23473103  T
Q  302 tttcttggccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||    
T  23473102 tttcttggccatgttatttctggtggtggtatt 23473070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 326
Target Start/End: Original strand, 26736937 - 26737262
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||| ||||| || |||||   || ||||||||||  || ||||||||||||     
T  26736937 gattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaacttttagaacacgttatggacaatatgaatataaagtgatgcctttcggtgttacaaatgcacct 26737036  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  26737037 ggtgtgtttatggagtacatgaatcaaatttttcatgcatttttagatcgtttcgtggttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagtccgaag 26737136  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||| ||||  | ||||||||| || ||||||||||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  26737137 aagaacatgctgaacatttgaagattattttgcaagtgctgaaagataagaagttatatgctaaattatcaaagtgtgaattctggttgaaagaggtaag 26737236  T
Q  301 ttttcttggccatattatttctggta 326  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||    
T  26737237 ttttcttggccatgttatttctggta 26737262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 21409302 - 21408980
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||| ||||| |||||  |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| || | ||||||||||  || ||  ||||| || || |||||    
T  21409302 tgaaagatgaggatattcagaagacggcctttaggacacattacggacataacgaatattctgtgatgcctttcggtgttattaatgcgccaggagtatt 21409203  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||| ||| ||||||||||||||| || ||| ||    
T  21409202 tatggaatatatgaattgtatttttcatacttatctagatcgttttgttgttgtgtttatagatgatattctgaaatactctaagtctgaggaggaacat 21409103  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||| |||||||||   ||||||||||||||||||   |||| || |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  21409102 gccgagcatttgagaattgttttgcaagtgctga---agaagaatttatatgccaagttatcgaagtgcgaattctggttgaacgaagtgagttttcttg 21409006  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||    
T  21409005 gtcatattatttctggtagtggtatt 21408980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 329
Target Start/End: Original strand, 21337504 - 21337832
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| |||| || |||||||| |||||||| ||| |||| |||||   || ||||||||||  || ||| ||||| ||     
T  21337504 gattaaagtgaaagatgaagatatgcagaatacagcttttagaacacgttatggatattatgaatataaagtgatgcctttcggtgttacgaatgcgcca 21337603  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| | || || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||    
T  21337604 ggtgtgtttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcgtttttggatagcttagtggttgtattcatcgacgatattttgatttactccaagtttgaag 21337703  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||| ||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21337704 aagaacatgctgagcacttgaagattgttttgcaagtgctgaaagagaagaaactttatgctaaattatcaaagtgtgaattctggttgaaagaggtgag 21337803  T
Q  301 ttttcttggccatattatttctggtagtg 329  Q
    |||||| |||||  |||||||||||||||    
T  21337804 ttttctcggccacgttatttctggtagtg 21337832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 37289706 - 37290030
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || ||||| |||||   ||  ||||||||   || ||| ||||||||     
T  37289706 gattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcattatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacct 37289805  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  37289806 ggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaag 37289905  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  37289906 aagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgag 37290005  T
Q  301 ttttcttggccatattatttctggt 325  Q
    |||||| |||||| |||||||||||    
T  37290006 ttttctaggccatgttatttctggt 37290030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 14997949 - 14998273
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||||||||     
T  14997949 gattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacct 14998048  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  14998049 ggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaag 14998148  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    | ||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  14998149 aggaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgag 14998248  T
Q  301 ttttcttggccatattatttctggt 325  Q
    |||||| |||||| |||||||||||    
T  14998249 ttttctaggccatgttatttctggt 14998273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 19772136 - 19771812
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| | || |||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||||||||     
T  19772136 gattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacct 19772037  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||| ||||||    
T  19772036 ggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgttcatcgacgatatcttgatttactccaagactgaag 19771937  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  19771936 aagaacatgccgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgag 19771837  T
Q  301 ttttcttggccatattatttctggt 325  Q
    |||||| |||||| |||||| ||||    
T  19771836 ttttctaggccatgttatttttggt 19771812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 22331097 - 22331421
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||||||||     
T  22331097 gattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacct 22331196  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  22331197 ggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaag 22331296  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  22331297 aagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgag 22331396  T
Q  301 ttttcttggccatattatttctggt 325  Q
    |||||| ||| || |||||||||||    
T  22331397 ttttctaggctatgttatttctggt 22331421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 22136844 - 22136520
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||||||||     
T  22136844 gattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacggctttcaggacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttactaatgcacct 22136745  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    || || |||||||  || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||| ||||||    
T  22136744 ggagtgtttatggggtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgacattttgatttactccaagactgaag 22136645  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||  | | ||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  22136644 aagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttttgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgag 22136545  T
Q  301 ttttcttggccatattatttctggt 325  Q
    |||||| |||||| |||||||||||    
T  22136544 ttttctaggccatgttatttctggt 22136520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 74 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 25428536 - 25428276
Alignment:
Q  74 atgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacg 173  Q
    |||||||||  || |||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| || || || || ||||| || ||||| |    
T  25428536 atgcctttcggtgttacaaatgcacctggactatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggaccgattcgtggttgtttttattgatg 25428437  T
Q  174 atattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaa 273  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||  | |||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| ||    
T  25428436 atattttgatttactccaagtctgaagaagaacatgctgagcatttgaatctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaa 25428337  T
Q  274 gtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    ||||||||||| |||||| || ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  25428336 gtgtgaattctagttgaaagaagtgagctttcttggacatgttatttctggtagtggtatt 25428276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 27612530 - 27612206
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||    | ||| ||||||||     
T  27612530 gattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggagttaccaatgcacct 27612431  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  27612430 ggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaag 27612331  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  27612330 aagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgag 27612231  T
Q  301 ttttcttggccatattatttctggt 325  Q
    |||||| |||||| |||||||||||    
T  27612230 ttttctaggccatgttatttctggt 27612206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 17 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 40710940 - 40710636
Alignment:
Q  17 gaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaat 116  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || |||||||| || || |||||||| |    
T  40710940 gaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagt 40710841  T
Q  117 acatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagca 216  Q
    | |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||  ||||    
T  40710840 atatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatctactccaagactgaagaagaacatgctgagca 40710741  T
Q  217 tttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatatt 316  Q
    | ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||    
T  40710740 tctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaggtgagtttccttggccatgtt 40710641  T
Q  317 atttc 321  Q
    |||||    
T  40710640 atttc 40710636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 41773018 - 41772694
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| | || |||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||||||||     
T  41773018 gattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacct 41772919  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
     | || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||| ||||||    
T  41772918 agagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatatcttgatttactccaagactgaag 41772819  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| || || ||||| || ||||| || ||||||||||||||||| || |||||    
T  41772818 aagaacatgccgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaatttttatgctaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagaagtgag 41772719  T
Q  301 ttttcttggccatattatttctggt 325  Q
    |||||| |||||| |||||||||||    
T  41772718 ttttctaggccatgttatttctggt 41772694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 27520582 - 27520258
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||||||||     
T  27520582 gattaaagtaaaggatgaggatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacct 27520483  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| ||| ||||||    
T  27520482 ggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttaatttactccaagactgaag 27520383  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||| ||||  ||||| ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  27520382 aagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgag 27520283  T
Q  301 ttttcttggccatattatttctggt 325  Q
    |||||| |||||| |||||||||||    
T  27520282 ttttctaggccatgttatttctggt 27520258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 92 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 16358587 - 16358354
Alignment:
Q  92 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 191  Q
    |||||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || |||||||| || |||||||||||||| ||||| |    
T  16358587 aatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttatcgacgatattttgatctactcca 16358488  T
Q  192 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 291  Q
    || ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  16358487 agactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaa 16358388  T
Q  292 tgaggtgagttttcttggccatattatttctggt 325  Q
     || ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  16358387 agaagtgagttttctaggccatgttatttctggt 16358354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 92 - 321
Target Start/End: Original strand, 27666791 - 27667020
Alignment:
Q  92 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 191  Q
    |||||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |    
T  27666791 aatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtggttgtgttcatcgacgatatcttgatttactcca 27666890  T
Q  192 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 291  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  27666891 agactgaagaagaacatgccgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaa 27666990  T
Q  292 tgaggtgagttttcttggccatattatttc 321  Q
    ||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  27666991 tgaagtgagtttccttggccatgttatttc 27667020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 92 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 34568579 - 34568346
Alignment:
Q  92 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 191  Q
    |||||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || |||||||| || |||||||||||||| ||||| |    
T  34568579 aatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttatcgacgatattttgatctactcca 34568480  T
Q  192 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 291  Q
    || ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  34568479 agactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaa 34568380  T
Q  292 tgaggtgagttttcttggccatattatttctggt 325  Q
     || ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  34568379 agaagtgagttttctaggccatgttatttctggt 34568346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 29474283 - 29474607
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| | ||||||| ||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||||||||     
T  29474283 gattaaagtaaaggatggagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacct 29474382  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    || || |||||||| || |||||||| || |||||||| | ||| ||||  ||||| |||||||| || || ||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  29474383 ggagtgtttatggagtatatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcagtttgtggttgtgtttatcgatgatattttgatttactccaagactgaag 29474482  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||  | ||||  || || || |||||||||||||||||||| || |||||    
T  29474483 aagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgataaattatcgaagtgtgaattctggttgaaagaagtgag 29474582  T
Q  301 ttttcttggccatattatttctggt 325  Q
    |||||| |||||| |||||||||||    
T  29474583 ttttctaggccatgttatttctggt 29474607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 22350095 - 22349771
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| | || ||||| |||||| ||||||||||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||||||||     
T  22350095 gattaaagtaaaagatgaggatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacct 22349996  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    || || |||||||| || |||||||  || || ||||| | ||| ||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  22349995 ggagtgtttatggagtatatgaatcacatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtattcatcgatgatattttgatttactccaagactgaag 22349896  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||    
T  22349895 aagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgagttctggttgaaagaagtgag 22349796  T
Q  301 ttttcttggccatattatttctggt 325  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||    
T  22349795 ttttcttggccatgttatttatggt 22349771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 27683610 - 27683934
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||||||||     
T  27683610 gattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacct 27683709  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    || || | |||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || ||| |||||||||| ||||| ||| |||| |    
T  27683710 ggagtgtctatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacaatattttgatttactccaagactgacg 27683809  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||| ||| | ||||| || ||||| ||||||||||||||||| || || |||||    
T  27683810 aagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgagagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttcaaagaagtgag 27683909  T
Q  301 ttttcttggccatattatttctggt 325  Q
    |||||| |||||| |||| ||||||    
T  27683910 ttttctaggccatgttatctctggt 27683934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 18781290 - 18780966
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || || |||||     
T  18781290 gattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaacgcacct 18781191  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||| ||||||    
T  18781190 ggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcctttttggatcggttcgtagttgtgtttatcgacgacattttgatttactccaagactgaag 18781091  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | | ||| || ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||    
T  18781090 aagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttttgcgaaattgtctaagtgtgaattctgattgaaggaagtaag 18780991  T
Q  301 ttttcttggccatattatttctggt 325  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    
T  18780990 ttttcttggccatgttatttctggt 18780966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 326
Target Start/End: Original strand, 28893152 - 28893477
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||   || ||||||||||  || ||| || || |||    
T  28893152 gattaaagtgaaggatgaagatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgccg 28893251  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    ||||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||| | | |||   ||||| || || || || || ||||| ||||| || |||||  ||||||    
T  28893252 ggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggtggtatttatagatgatatattgatctattctaaaactgaag 28893351  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    | ||| | ||| | ||  ||||| |||| |||||  |  ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| | ||| |||||    
T  28893352 aggaacacgccgaacacctgaagattgtgttgcagattttgaaagagagaaagttgtatgccaagttgtcgaagtgcgagttctggttaagtgaagtgag 28893451  T
Q  301 ttttcttggccatattatttctggta 326  Q
    |||||| |||||| | ||||||||||    
T  28893452 ttttctaggccatgtcatttctggta 28893477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 326
Target Start/End: Original strand, 28921978 - 28922303
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||   || ||||||||||  || ||| || || |||    
T  28921978 gattaaagtgaaggatgaagatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgccg 28922077  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    ||||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||| | | |||   ||||| || || || || || ||||| ||||| || |||||  ||||||    
T  28922078 ggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggtggtatttatagatgatatattgatctattctaaaactgaag 28922177  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    | ||| | ||| | ||  ||||| |||| |||||  |  ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| | ||| |||||    
T  28922178 aggaacacgccgaacacctgaagattgtgttgcagattttgaaagagagaaagttgtatgccaagttgtcgaagtgcgagttctggttaagtgaagtgag 28922277  T
Q  301 ttttcttggccatattatttctggta 326  Q
    |||||| |||||| | ||||||||||    
T  28922278 ttttctaggccatgtcatttctggta 28922303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 92 - 322
Target Start/End: Original strand, 21935489 - 21935719
Alignment:
Q  92 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 191  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||| | || |||||| ||||| | || |||||||| || |||||||| || ||||||||| | || || |    
T  21935489 aatgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaa 21935588  T
Q  192 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 291  Q
    ||||||| |||||  ||||  ||||||||| | |||| ||||||||  ||||||||||  |||| | |||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  21935589 agtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaa 21935688  T
Q  292 tgaggtgagttttcttggccatattatttct 322  Q
     || |||||||| ||||| ||| | ||||||    
T  21935689 ggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 21935719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 92 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 23507751 - 23507521
Alignment:
Q  92 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 191  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||| | || |||||| ||||| | || |||||||| || |||||||| || ||||||||| | || || |    
T  23507751 aatgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcga 23507652  T
Q  192 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 291  Q
    ||||||| |||||  ||||  ||||||||| | |||| ||||||||  ||||||||||  ||| || ||| |||||||| |||||||| || ||||||||    
T  23507651 agtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtattgaaagagaaccagtgatgtgcaaagttgtctaagtgtgagttttggttgaa 23507552  T
Q  292 tgaggtgagttttcttggccatattatttct 322  Q
     || |||||||| ||||| ||| | ||||||    
T  23507551 ggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 23507521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 334
Target Start/End: Original strand, 22234142 - 22234463
Alignment:
Q  13 ggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatg 112  Q
    |||||| ||||||  ||||||||| ||||||||| |||| || || || |||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||| ||    
T  22234142 ggatgaggatatgccgaagacggcctttaggacatgttatggtcactatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttgtg 22234241  T
Q  113 gaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgcca 212  Q
    || || |||||    ||||| ||||||||| | |||   ||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||| ||||||||||  ||||      
T  22234242 gagtatatgaacaaaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttaatttattctaagactgaagaagagcatgcag 22234341  T
Q  213 agcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggcca 312  Q
    | ||| ||||| |||| ||||||||| ||||||| || ||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||    
T  22234342 atcatctgaagattgtattgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgtcaagttatcaaaatgtgaattctggttaagtgaagtaagttttcttggcca 22234441  T
Q  313 tattatttctggtagtgatatt 334  Q
    |||||||||| |||||| ||||    
T  22234442 tattatttctagtagtggtatt 22234463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 25850225 - 25849900
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| || || || ||||||||    
T  25850225 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctggtgtatt 25850126  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
    |||||| |||||||| |  || || ||||||| | | |||   |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || |||  |||||| ||  ||    
T  25850125 tatggagtacatgaaccaaatcttccatgcttttctggataagtttgttgtagtgttcattgatgatatcttgatttattcgaagaatgaagaggagcat 25850026  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  ||||| |||   | || ||||||||| |||| || || | ||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| | ||| ||||||||||| |    
T  25850025 gcagagcatctgagaatagtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgcaaagttgtcgaaatgtgagttctggttaagtgaagtgagttttctgg 25849926  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    | || |||||||||||||||| ||||    
T  25849925 gtcacattatttctggtagtggtatt 25849900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 2 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 20778070 - 20777746
Alignment:
Q  2 attaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgg 101  Q
    |||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||   || ||||||||||  || ||| || || || |    
T  20778070 attaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttagaacacgatatggacattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctg 20777971  T
Q  102 gtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaaga 201  Q
    ||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||||| | | |||   ||||| || ||||| || || ||||||||||| || |||||   ||||||    
T  20777970 gtgtattcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggtggtgtttatagatgatattttgatctattctaaaattgaaga 20777871  T
Q  202 agaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagt 301  Q
     ||| | ||||| ||  | ||| |||| |||||  |  ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| | ||| ||||||    
T  20777870 ggaacacgccaaacacctaaagattgtgttgcagattttgaaagagagaaagttgtatgccaagttgtcgaagtgcgagttctggttaagtgaagtgagt 20777771  T
Q  302 tttcttggccatattatttctggta 326  Q
    || || |||||| ||| ||||||||    
T  20777770 ttcctaggccatgttacttctggta 20777746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 92 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 20801482 - 20801249
Alignment:
Q  92 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 191  Q
    |||||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||| | || || || |||||||| || ||||| |    
T  20801482 aatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttttctttatcgatgatattttaatttactcca 20801383  T
Q  192 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 291  Q
    || ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||  | ||||| || || || |||||||| |||||||||||    
T  20801382 agactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgctgaaagagaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgagttctggttgaa 20801283  T
Q  292 tgaggtgagttttcttggccatattatttctggt 325  Q
     ||||| ||||| ||||||||| | |||||||||    
T  20801282 agaggtaagtttccttggccatgtcatttctggt 20801249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 22504829 - 22504504
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||| || || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| || |  || ||||| ||    
T  22504829 tgaaggatgaggatatgcagaagatggcctttaggacacgatatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgagcctggtgtgtt 22504730  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
    |||||| |||||||| || ||||| ||||||| | | |||   |||||||| ||||| ||||| ||||| || || || ||||||   ||||| ||  ||    
T  22504729 tatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatcttaatttattctaagaacgaagaggagcat 22504630  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  ||||| |||   |||| ||||||||  |||||||||| | ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| | ||| ||||||||||| |    
T  22504629 gcagagcatctgagaattgtattgcaagttttgaaagagaagaggttgtatgcaaagttgtcaaaatgtgagttctggttaagtgaagtgagttttctgg 22504530  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    | || |||||||||||||||| ||||    
T  22504529 gtcacattatttctggtagtggtatt 22504504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 18 - 326
Target Start/End: Original strand, 28914640 - 28914948
Alignment:
Q  18 aagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaata 117  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||   || ||||||||||  || ||| || || |||||||| || ||||| ||    
T  28914640 aagatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgccgggtgtgttcatggagta 28914739  T
Q  118 catgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcat 217  Q
     ||||| || ||||| ||||||| | | |||   ||||| || || || || || ||||| ||||| || |||||  ||||||| ||| | ||| | ||     
T  28914740 tatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggtggtatttatagatgatatattgatctattctaaaactgaagaggaacacgccgaacac 28914839  T
Q  218 ttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatatta 317  Q
     ||||| |||| |||||  |  ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| | ||| ||||||||||| |||||| | |    
T  28914840 ctgaagattgtgttgcagattttgaaagagagaaagttgtatgccaagttgtcgaagtgcgagttctggttaagtgaagtgagttttctaggccatgtca 28914939  T
Q  318 tttctggta 326  Q
    |||||||||    
T  28914940 tttctggta 28914948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 18 - 326
Target Start/End: Original strand, 28929908 - 28930216
Alignment:
Q  18 aagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaata 117  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||   || ||||||||||  || ||| || || |||||||| || ||||| ||    
T  28929908 aagatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgccgggtgtgttcatggagta 28930007  T
Q  118 catgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcat 217  Q
     ||||| || ||||| ||||||| | | |||   ||||| || || || || || ||||| ||||| || |||||  ||||||| ||| | ||| | ||     
T  28930008 tatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggtggtatttatagatgatatattgatctattctaaaactgaagaggaacacgccgaacac 28930107  T
Q  218 ttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatatta 317  Q
     ||||| |||| |||||  |  ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| | ||| ||||||||||| |||||| | |    
T  28930108 ctgaagattgtgttgcagattttgaaagagagaaagttgtatgccaagttgtcgaagtgcgagttctggttaagtgaagtgagttttctaggccatgtca 28930207  T
Q  318 tttctggta 326  Q
    |||||||||    
T  28930208 tttctggta 28930216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 22464108 - 22463785
Alignment:
Q  2 attaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgg 101  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||   || ||||||||||  || ||| || || || |    
T  22464108 attaaagtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctg 22464009  T
Q  102 gtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaaga 201  Q
    || | || ||||| || ||||| || ||||| ||||||| | | |||   ||||| || || || || || ||||||||||| || |||||  |||||||    
T  22464008 gtatgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggtggtatttatagatgatattttgatttattctaaaactgaaga 22463909  T
Q  202 agaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagt 301  Q
     ||  ||||  | || |||||| |||| |||||  |  |||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||  || |||||||| | ||| ||||||    
T  22463908 ggagcatgcagaacacttgaagattgtgttgcagattttgaaggagagaaagttgtatgccaagttgtcgaagtacgagttctggttaagtgaagtgagt 22463809  T
Q  302 tttcttggccatattatttctggt 325  Q
    ||||| |||||| |||||||||||    
T  22463808 tttctaggccatgttatttctggt 22463785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 267
Target Start/End: Original strand, 21562234 - 21562500
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| || |||||||| |||||   || |||| |||||  || ||| |||||  |     
T  21562234 gattaaagtgaaagatgaagatatgcagaaaacggcctttaggacacgatatggacattatgaatataaagtgatgtctttcggtgttactaatgcgtct 21562333  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| | ||||| ||||| ||||||||| | ||||| |||||||| || || || ||  |||| || |||||| ||||||    
T  21562334 ggtgtgtttatggagtacatgaatagaattttccatgcctatttagattggtttgtagttgtgtttatagatgacatcctgatttattctaagactgaag 21562433  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagtt 267  Q
    ||||  ||||  ||||||| ||  |||| || |||||| |||| || |||||| | |||||||||||    
T  21562434 aagagcatgcagagcatttaaaaattgtgtttcaagtgttgaaggaaaaaaagctgtatgccaagtt 21562500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 20344432 - 20344115
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| || |  || ||||| ||    
T  20344432 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgtgcctggtgtgtt 20344333  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
    |||||| |||||||| || || || ||||||| | | |||   |||||||| ||||| ||||| ||||| || || || || |||  |||||| ||  ||    
T  20344332 tatggagtacatgaaccgaatcttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatcttaatttattccaagaatgaagaggagcat 20344233  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  ||||| |||   |||| ||||||||  |||||||||| | ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| |    
T  20344232 gcagagcatctgagaattgtcttgcaagttttgaaagagaagaggttgtatgctaagttgtcaaaatgtgagttctggttaagtgaagtgagctttctgg 20344133  T
Q  309 gccatattatttctggta 326  Q
    | || |||||||||||||    
T  20344132 gtcacattatttctggta 20344115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 225 - 334
Target Start/End: Original strand, 21679212 - 21679321
Alignment:
Q  225 ttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctgg 324  Q
    |||| ||||||||  |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21679212 ttgtattgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcaaagtgcgagttttggttaagtgaagtgagttttcttggccatattatttctgg 21679311  T
Q  325 tagtgatatt 334  Q
    ||||| ||||    
T  21679312 tagtggtatt 21679321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Original strand, 24796615 - 24796940
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  24796615 tgaaagatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtttt 24796714  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
    |||||| |||||||| || ||||| ||||||| | | |||   |||||||| ||||| ||||| |||||| | || || || |||  ||| || ||  ||    
T  24796715 tatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatattctaatttattccaagaatgaggaggagcat 24796814  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  ||||| |||   | || ||||||||| |||| || || | ||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  |||| || |||||||| |    
T  24796815 gcagagcatctgagaatagtgttgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttatcaaaatgtgaattctggttacatgaagtaagttttctgg 24796914  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    | || |||||||||||||||| ||||    
T  24796915 gtcacattatttctggtagtggtatt 24796940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Original strand, 37541599 - 37541924
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  37541599 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtttt 37541698  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| | | | |||   |||||||| || || ||||| |||||| | || || || |||  ||| || ||| |     
T  37541699 tatggaatacatgaatcgaattttccatgcctttctggataagtttgttgtggtatttattgatgatattctaatctattccaagaatgaggaggaacac 37541798  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  ||||| |||   | || ||||||||| |||| || || | ||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||| |    
T  37541799 gcagagcatctgagaatagtgttgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttatcaaaatgtgagttctggttaaatgaagtaagttttctgg 37541898  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    | || ||||||| |||||||| ||||    
T  37541899 gtcacattatttatggtagtggtatt 37541924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 2 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 20823610 - 20823286
Alignment:
Q  2 attaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgg 101  Q
    |||||| |||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||   || ||||||||||  || ||| || || || |    
T  20823610 attaaagtgaaagacgaagatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctg 20823511  T
Q  102 gtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaaga 201  Q
    |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||| | | |||   ||||| || ||||| || || ||||| ||||| || || ||  |||||||    
T  20823510 gtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggtggtgtttatagatgatatattgatctattcaaaaactgaaga 20823411  T
Q  202 agaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagt 301  Q
     ||| | ||| | ||  ||||| |||| |||||  |  ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| | ||| ||||||    
T  20823410 ggaacacgccgaacacctgaagattgtgttgcagattttgaaagagagaaagttgtatgccaagttgtcgaagtgcgagttctggttaagtgaagtgagt 20823311  T
Q  302 tttcttggccatattatttctggta 326  Q
    || || |||||  ||||||||||||    
T  20823310 ttcctcggccacgttatttctggta 20823286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 92 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 24583277 - 24583047
Alignment:
Q  92 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 191  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||| | || |||||| ||||| | || |||||||| || |||||||| || ||||||||| | || || |    
T  24583277 aatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaa 24583178  T
Q  192 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 291  Q
    ||| ||| |||||  ||||  |||||||||   |||| ||||||||  ||||||||||  |||| |  ||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  24583177 agtttgaggaagagcatgctgagcatttgagaattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgcgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaa 24583078  T
Q  292 tgaggtgagttttcttggccatattatttct 322  Q
     || |||||||| ||||| ||| | ||||||    
T  24583077 ggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 24583047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 325
Target Start/End: Original strand, 17267552 - 17267868
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||   || ||||||||||  || ||| || || || ||||| ||    
T  17267552 tgaaagatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcccggtgtgtt 17267651  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
     ||||| || |||||||| ||||||||||| | | | |||   ||||| || || || ||||| |||||| |||| || || ||| ||||||||||  ||    
T  17267652 catggagtatatgaatcgaatttttcatgcctttctggataaatttgtggtggtatttattgatgatattctgatttattcaaagactgaagaagagcat 17267751  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  | ||  |||   |||| ||||||||| ||||||| || ||||| |||||||| ||||| || ||| | || ||| | | ||| |||||||| ||||    
T  17267752 gcagaacacctgagaattgtgttgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaaattgtcgaaatgtaagttttggctaagtgaagtgagtttccttg 17267851  T
Q  309 gccatattatttctggt 325  Q
    | |||||||||||||||    
T  17267852 gtcatattatttctggt 17267868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 334
Target Start/End: Original strand, 14885211 - 14885534
Alignment:
Q  11 aaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtattta 110  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||||    
T  14885211 aaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgttttta 14885310  T
Q  111 tggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgc 210  Q
    |||| |||||||| || ||||| ||||||| | | |||   ||||| || || || ||||| ||||| || || || || |||  ||| || ||| | ||    
T  14885311 tggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgtggtggtatttattgatgatatcttaatttattccaagaatgaggaggaacacgc 14885410  T
Q  211 caagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggc 310  Q
      ||||| |||   | || ||||||||| |||| || || | ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||     
T  14885411 agagcatctgagaatagtgttgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttgtcaaaatgtgagttctggttaaatgaagtaagtttcctgggt 14885510  T
Q  311 catattatttctggtagtgatatt 334  Q
    || |||||||||||||||| ||||    
T  14885511 cacattatttctggtagtggtatt 14885534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 196 - 334
Target Start/End: Original strand, 24618700 - 24618838
Alignment:
Q  196 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 295  Q
    |||||||||  ||||  ||||| ||||  |||| ||||||||| ||||||| || | ||| |||||||||||||| || || || |||||||| | |||     
T  24618700 tgaagaagagcatgcagagcatctgaaaattgtgttgcaagtgttgaaagaaaagaggttgtatgccaagttgtccaaatgcgagttctggttaagtgaa 24618799  T
Q  296 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    || |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  24618800 gtaagttttctgggccatattattcctggtagtggtatt 24618838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 196 - 334
Target Start/End: Original strand, 24714931 - 24715069
Alignment:
Q  196 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 295  Q
    |||||||||  ||||  ||||| ||||  |||| ||||||||| ||||||| || | ||| |||||||||||||| || || || |||||||| | |||     
T  24714931 tgaagaagagcatgcagagcatctgaaaattgtgttgcaagtgttgaaagaaaagaggttgtatgccaagttgtccaaatgcgagttctggttaagtgaa 24715030  T
Q  296 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    || |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  24715031 gtaagttttctgggccatattattcctggtagtggtatt 24715069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 196 - 334
Target Start/End: Original strand, 24747959 - 24748097
Alignment:
Q  196 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 295  Q
    |||||||||  ||||  ||||| ||||  |||| ||||||||| ||||||| || | ||| |||||||||||||| || || || |||||||| | |||     
T  24747959 tgaagaagagcatgcagagcatctgaaaattgtgttgcaagtgttgaaagaaaagaggttgtatgccaagttgtccaaatgcgagttctggttaagtgaa 24748058  T
Q  296 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    || |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  24748059 gtaagttttctgggccatattattcctggtagtggtatt 24748097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 281 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 23442104 - 23442060
Alignment:
Q  281 ttctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggt 325  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||| | |||||||||    
T  23442104 ttctggttgaaagaagtgagttttcttggccatgtcatttctggt 23442060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0445 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0445
Description:

Target: scaffold0445; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 21 - 334
Target Start/End: Original strand, 1900 - 2213
Alignment:
Q  21 atatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacat 120  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||| |||| |||||  || ||| ||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  1900 atatgcagaagacggcctttaggacacgttatggacattacgaatatgcagtgatggctttcggtgttactaatgcgccgggtgtgtttatggagtacat 1999  T
Q  121 gaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttg 220  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   ||||||||    
T  2000 gaatcgtatttttcatgcgtatttagatcgcttcatggttgtgttcattgatgatattttgatatactctaagtctcaagaagaacatgttgagcatttg 2099  T
Q  221 aagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattattt 320  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  2100 aagattgttttgcaagtgctgaaggagaagaagttaaatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggtcatgttattt 2199  T
Q  321 ctggtagtgatatt 334  Q
    ||||||||| ||||    
T  2200 ctggtagtggtatt 2213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 495293 - 494959
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||   || ||||||||||  || ||||||||| ||     
T  495293 gattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacggcttttagaacacgttatggacattatgaatataaagtgatgcctttcggtgttacaaatgcgcca 495194  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  495193 ggtgtgtttattgagtacatgaatcgtatttttcatgcgtttttggatcgttttgtggttgtgttcatcgacgatattttgatatactcgaagtctgaag 495094  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||| ||||  || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  495093 aagaacatgctgagtatttgaagattgttttgcaagtgctgaaagagaagaagctatatgctaaattgtcaaagtctgagttctggttgaatgaggtgag 494994  T
Q  301 ttttcttggccat-attatttctggtagtgatatt 334  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||    
T  494993 ttttcttggccatgtttatttctggtagtggtatt 494959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Original strand, 453252 - 453577
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||| || ||||| || |||||   || ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  453252 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaagacacgatatggacactatgaatataaagtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 453351  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||| | |||   ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || |  ||| ||||||||||  ||    
T  453352 tatggaatatatgaaccgaattttccatgcctatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttgatttatttgaagactgaagaagagcat 453451  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  | ||| ||||| |||| || |||||  |||||||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||| | ||| || || |||||||    
T  453452 gcagaacatctgaagattgtattacaagtattgaaagagaagaagttgtatgtcaagttgtcaaaatgtgagttctggttaagtgaagtaagatttcttg 453551  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||    
T  453552 gccacattatttctggtagtggtatt 453577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Original strand, 515392 - 515717
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| || || || ||||||||    
T  515392 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgattacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctggtgtatt 515491  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
    |||||| |||||||| || ||||| ||||||| | | |||   ||||| |||||||| ||||| ||||| || || || || |||  |||||| ||| |     
T  515492 tatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgtcgttgtgtttattgatgatatcttaatttattccaagaatgaagaggaacac 515591  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  ||||| |||   |||| ||||||||| |||||||||| | ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| | ||| ||||||||||| |    
T  515592 gcagagcatctgagaattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaggttgtatgcaaagttgtcaaaatgtgagttctggttaagtgaagtgagttttctgg 515691  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    | || |||||||||||||||| ||||    
T  515692 gtcacattatttctggtagtggtatt 515717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 178; Significance: 6e-96; HSPs: 2)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 5386 - 5054
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| | || |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| || | ||| ||||| |||| ||||||||||  || ||| ||||| ||     
T  5386 gattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacggcctttagaacacgttatgggctttatgaatattcagtgatgcctttcggtgttacgaatgcgcca 5287  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    ||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  5286 ggtgtgttcatg-agtacatgaatcgtatttttcatgcgtatttggatcgctttgtggttgtgttcattgacgatattttgatatactccaagactgaag 5188  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5187 aagaacatgctgagcatttgaagattgttttgcaagtgctgaaagagaagaagttatatgcaaagttgtcaaagtgtgagttctggttgaatgaggtgag 5088  T
Q  301 ttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  5087 ttttcttggccatgttatttctgctagtggtatt 5054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 11388 - 11196
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    | ||||||||||  || ||| |||||||| ||||| ||    
T  11388 tgaaggattaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcacctggtgtgtt 11289  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaaga 201  Q
     ||||| || ||||| || ||||| ||||||| ||| |||   ||||| |||||||| ||||| |||||| | || || |||||| |||||||    
T  11288 catggagtatatgaaccgaattttccatgcttctttggataaatttgtggttgtgtttattgatgatattctaatttattctaagactgaaga 11196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 3)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 329
Target Start/End: Original strand, 10772 - 11100
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| | || |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||  || ||||||||| ||     
T  10772 gattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggacattacgaatattcagtgatgcctttcggtgttacaaatgcgcca 10871  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10872 ggtgtgtttatggagtacttgaatcgtatttttcatgcgtatttagatcgcttcatggttgtgttcattgatgatattttgatatactctaagactgaag 10971  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||| ||||  ||||||||| | |||| |||||||||||||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||    
T  10972 aagaacatgctgagcatttgaggattgtcttgcaagtgctgaaggagaagaagctttatgctaagttgtcaaagtgtgaactctggttgaatgaagtaag 11071  T
Q  301 ttttcttggccatattatttctggtagtg 329  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11072 ttttcttggccatgttatttctggtagtg 11100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 329
Target Start/End: Original strand, 16964 - 17292
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| | || |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||  || ||||||||| ||     
T  16964 gattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggacattacgaatattcagtgatgcctttcggtgttacaaatgcgcca 17063  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17064 ggtgtgtttatggagtacttgaatcgtatttttcatgcgtatttagatcgcttcatggttgtgttcattgatgatattttgatatactctaagactgaag 17163  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||| ||||  ||||||||| | |||| |||||||||||||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||    
T  17164 aagaacatgctgagcatttgaggattgtcttgcaagtgctgaaggagaagaagctttatgctaagttgtcaaagtgtgaactctggttgaatgaagtaag 17263  T
Q  301 ttttcttggccatattatttctggtagtg 329  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17264 ttttcttggccatgttatttctggtagtg 17292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #3
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 20 - 326
Target Start/End: Original strand, 24348 - 24654
Alignment:
Q  20 gatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaataca 119  Q
    |||||| |||||||  ||||||| ||||||||  |||| ||  |||| |||| ||||||||||  || |||||| || ||  |||| |||||||| ||||    
T  24348 gatatgcagaagacaacttttagaacacgttattgacactataaatattcagtgatgcctttcggtgttacaaacgcgccaagtgtgtttatggagtaca 24447  T
Q  120 tgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcattt 219  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||    ||||||    
T  24448 tgaatcgcatttttcatgcgtatctagatcgtttcgtggttgtgttcatcgacgacattttgatatactctaagactgaagaagaacttgttgcgcattt 24547  T
Q  220 gaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatt 319  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  24548 gaagattgttttgcaagtgctgaaagagaagaagttatatgctaagttgtcaaaatgtgaattctggttgaatgaggtgagttttctaggccatgttatt 24647  T
Q  320 tctggta 326  Q
    |||||||    
T  24648 tctggta 24654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 41)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 329
Target Start/End: Original strand, 24818798 - 24819126
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| | || |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||  || ||||||||| ||     
T  24818798 gattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggacattacgaatattcagtgatgcctttcggtgttacaaatgcgcca 24818897  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24818898 ggtgtgtttatggagtacttgaatcgtatttttcatgcgtatttagatcgcttcatggttgtgttcattgatgatattttgatatactctaagactgaag 24818997  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||| ||||  ||||||||| | |||| |||||||||||||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||    
T  24818998 aagaacatgctgagcatttgaggattgtcttgcaagtgctgaaggagaagaagctttatgctaagttgtcaaagtgtgaactctggttgaatgaagtaag 24819097  T
Q  301 ttttcttggccatattatttctggtagtg 329  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24819098 ttttcttggccatgttatttctggtagtg 24819126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 30010752 - 30011085
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| |||| ||||| |||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| || ||| ||||| ||     
T  30010752 gattaaagtgaaagatgaggatattcagaagacgacctttaggacacgttacggacattacgaatattctgtgatgcctttcagtgttactaatgcgcca 30010851  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    || || |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||| ||||| || |    
T  30010852 ggagtgtttatgaaatatatgaatcgtatttttcatacttatctggatcgttttgttgtcgtgtttatagatgatattttgatatactccaagtccgagg 30010951  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    | ||| ||| | |||||||||   ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||| || |||||    
T  30010952 aggaacatgtcgagcatttgagaattgttttgcaagtgctgcaagagaagaagttatatgccaagttatcgatgtgcgaattctggttgaacgaagtgag 30011051  T
Q  301 ttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  30011052 ttttctcggtcatattatttctggtagtgatatt 30011085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Original strand, 30209493 - 30209819
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||| ||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| |  | ||||||||||  || ||| ||||| | ||| || ||    
T  30209493 tgaaagatgaggatattcagaagacggcctttaggacacgttacagacattacaaatattttgtgatgcctttcggtgttactaatgcgctgggagtgtt 30209592  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| || || ||| ||    
T  30209593 tatggaatatatgaatcatatttttcatacttatctggatcgttttgttgttgtgtttatagatgatattttgatatactccaagtccgaggaggaacat 30209692  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    | | | |||||||   ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |    
T  30209693 gtcgaacatttgagaattgtttttcaagtgctgaaagagaagaagttatctgccaagttatcgaagtgcgaattctggttgaacgaagtgagttttctcg 30209792  T
Q  309 gccatatta-tttctggtagtgatatt 334  Q
      ||||||| |||||||||||| ||||    
T  30209793 atcatattattttctggtagtgttatt 30209819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Original strand, 23098594 - 23098919
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||||||    
T  23098594 tgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgaatagaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtatt 23098693  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
    |||||| || |||||| | ||||||||||||| | | ||| | || || || ||||| ||||| |||||||| || || |||||| ||||||||||  ||    
T  23098694 tatggagtatatgaataggatttttcatgcttttctggatagattcgtggtggtgtttattgatgatattttaatttattctaagactgaagaagagcat 23098793  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||| ||||| ||| | |||| || || || ||||||||||||| ||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| | ||| ||||||||||| |    
T  23098794 gccgagcatctgaggattgtattacaggttctgaaagagaaaatgttgtatgctaagttgtcgaaatgtgaattctggttaagtgaagtgagttttctcg 23098893  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||    
T  23098894 gccacattatttctggtagtggtatt 23098919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 27373144 - 27372820
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||||||||     
T  27373144 gattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacct 27373045  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    || || ||||||||||| |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  27373044 ggagtgtttatggaatatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaag 27372945  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  27372944 aagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgag 27372845  T
Q  301 ttttcttggccatattatttctggt 325  Q
    |||||| |||||| |||||||||||    
T  27372844 ttttctaggccatgttatttctggt 27372820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 23073738 - 23073405
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| | || |||||||||||| ||||||| ||||| || || || || || ||||| |||||   ||  |||||||||  || ||||||||||||     
T  23073738 gattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgatatggccattatgaatacaaagttatgcctttcggtgttacaaatgcacct 23073639  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    || ||||||||||| |||||||| || || |||||||| | ||| ||  |||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  23073638 ggagtatttatggagtacatgaaccgcatctttcatgcatttttggaatgtttcgtggttgttttcattgatgatattttgatttactccaagtctgaag 23073539  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||| || | |  ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  23073538 aagaacatactagccatttgaagttggttttccaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgag 23073439  T
Q  301 ttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
     |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  23073438 ctttcttggacatgttatttctggtagtggtatt 23073405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 23112603 - 23112278
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||| |||||   || |||| |||||  || ||| ||||| ||  |||| ||    
T  23112603 tgaaagatgaagatatgtagaaaacggcctttaggacgcgatatggacattatgaatataaagtgatgtctttcggtgttactaatgcgcctagtgtgtt 23112504  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
    |||||| ||||||||| | ||||| ||||||||| | ||||  ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||| ||||||||||  ||    
T  23112503 tatggagtacatgaatagaattttccatgcttatctggatcagtttgtagttgtgtttattgatgatatcttgatttattctaagactgaagaagagcat 23112404  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  ||||||| ||| |||| ||||||||| |||| || || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || ||||||||||    
T  23112403 gcagagcatttaaagattgtgttgcaagtgttgaaggaaaagaagttgtatgccaagttgtccaaatgtgaattctggttaagtgaagtaagttttcttg 23112304  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||    
T  23112303 gccatattatttctagtagtggtatt 23112278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 24711909 - 24711585
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| | |||||||| |||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||||||||     
T  24711909 gattaaagtaaaggatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacct 24711810  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    || || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  24711809 ggagtgtttatggagtatatgaatcgcattttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaag 24711710  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  24711709 aagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgag 24711610  T
Q  301 ttttcttggccatattatttctggt 325  Q
    |||||| |||||| |||||||||||    
T  24711609 ttttctaggccatgttatttctggt 24711585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 23106296 - 23106629
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| | || |||||||||||| ||||||| |||||||| || || || || || || || ||   ||  |||||||||  || ||| ||||||||     
T  23106296 gattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagcttttagaacgcggtatggtcactatgagtacaaagttatgcctttcggtgttacgaatgcacct 23106395  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||  || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  23106396 ggagtatttatggagtacatgaatcgcatttttcatgcatttttggatcagttcgtggttgttttcattgatgatattttgatttactccaagtctgaag 23106495  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||| ||||  ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||    
T  23106496 aagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaagtgcgaattatggttaaaagaagtgag 23106595  T
Q  301 ttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
     |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  23106596 ctttcttggacatgttatttctggtagtggtatt 23106629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Original strand, 41606953 - 41607274
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||||||||     
T  41606953 gattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacct 41607052  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    || || |||||||| || |||||||  || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  41607053 ggagtgtttatggagtatatgaatcacatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaag 41607152  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  41607153 aagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgag 41607252  T
Q  301 ttttcttggccatattatttct 322  Q
    |||||| |||||| ||||||||    
T  41607253 ttttctaggccatgttatttct 41607274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 334
Target Start/End: Original strand, 22734355 - 22734675
Alignment:
Q  14 gatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatgg 113  Q
    |||||||||||| |||||||  |||| || || ||||| |||||||| || ||   ||  |||||||||  || || ||||||||| || |||||||||     
T  22734355 gatgaagatatgcagaagacaactttcagaacgcgttatggacattatgagtacaaagttatgcctttcggtgttataaatgcacctggagtatttatgt 22734454  T
Q  114 aatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaa 213  Q
    | ||||||||||| || |||||||  | ||| ||||| || || ||||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||  |    
T  22734455 agtacatgaatcgcatctttcatgaatttttggatcggttcgtggttgtttttattgatgatattttaatttactccaagtctgaagaagaacatgctga 22734554  T
Q  214 gcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccat 313  Q
    |||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||| |||    
T  22734555 gcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaagtgtaaattctggttgaaagaagtgagctttcttggacat 22734654  T
Q  314 attatttctggtagtgatatt 334  Q
     ||||||||||||||| ||||    
T  22734655 gttatttctggtagtggtatt 22734675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 10870725 - 10870405
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||||||||     
T  10870725 gattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacct 10870626  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  10870625 ggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatctactccaagactgaag 10870526  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||| ||||  ||||| ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  10870525 aagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgcgaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgag 10870426  T
Q  301 ttttcttggccatattatttc 321  Q
    |||||| |||||| |||||||    
T  10870425 ttttctaggccatgttatttc 10870405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 24264245 - 24263921
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||||||||     
T  24264245 gattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacct 24264146  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||| | ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  24264145 ggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggattggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaag 24264046  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    | ||| |||   ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  24264045 aggaacatgttgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgag 24263946  T
Q  301 ttttcttggccatattatttctggt 325  Q
    |||||| |||||| |||||||||||    
T  24263945 ttttctaggccatgttatttctggt 24263921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 24875318 - 24875642
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| | || ||||| |||||| ||||||||||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||||||||     
T  24875318 gattaaagtaaaagatgaggatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacct 24875417  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  24875418 ggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtattcattgatgatattttgatttactccaagactgaag 24875517  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||    
T  24875518 aagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgagttctggttgaaagaagtgag 24875617  T
Q  301 ttttcttggccatattatttctggt 325  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    
T  24875618 ttttcttggccatgttatttctggt 24875642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 92 - 325
Target Start/End: Original strand, 21143700 - 21143933
Alignment:
Q  92 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 191  Q
    |||||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| ||||| |    
T  21143700 aatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactcca 21143799  T
Q  192 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 291  Q
    || ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  21143800 agactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgagttctggttgaa 21143899  T
Q  292 tgaggtgagttttcttggccatattatttctggt 325  Q
     || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21143900 agaagtgagttttcttggccatgttatttctggt 21143933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 17 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 16927219 - 16926915
Alignment:
Q  17 gaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaat 116  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || |||||||| || || |||||||| |    
T  16927219 gaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagt 16927120  T
Q  117 acatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagca 216  Q
    | |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||  ||||    
T  16927119 atatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttatcgacgatattttgatctactccaagactgaagaagaacatgctgagca 16927020  T
Q  217 tttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatatt 316  Q
    | ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||    
T  16927019 tctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaggtgagtttccttggccatgtt 16926920  T
Q  317 atttc 321  Q
    |||||    
T  16926919 atttc 16926915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 17 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 17000859 - 17000555
Alignment:
Q  17 gaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaat 116  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || |||||||| || || |||||||| |    
T  17000859 gaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagt 17000760  T
Q  117 acatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagca 216  Q
    | |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||  ||||    
T  17000759 atatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttatcgacgatattttgatctactccaagactgaagaagaacatgctgagca 17000660  T
Q  217 tttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatatt 316  Q
    | ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||    
T  17000659 tctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaggtgagtttccttggccatgtt 17000560  T
Q  317 atttc 321  Q
    |||||    
T  17000559 atttc 17000555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 92 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 9486000 - 9485767
Alignment:
Q  92 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 191  Q
    |||||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || |||||||| || |||||||||||||| ||||| |    
T  9486000 aatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttatcgacgatattttgatctactcca 9485901  T
Q  192 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 291  Q
    || ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  9485900 agactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaa 9485801  T
Q  292 tgaggtgagttttcttggccatattatttctggt 325  Q
     || ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  9485800 agaagtgagttttctaggccatgttatttctggt 9485767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 92 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 27219800 - 27219571
Alignment:
Q  92 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 191  Q
    |||||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| |    
T  27219800 aatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatctactcca 27219701  T
Q  192 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 291  Q
    || ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  27219700 agactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaa 27219601  T
Q  292 tgaggtgagttttcttggccatattatttc 321  Q
     || ||||||||||| |||||| |||||||    
T  27219600 agaagtgagttttctaggccatgttatttc 27219571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 321
Target Start/End: Original strand, 44384138 - 44384458
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| | || |||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||||||||     
T  44384138 gattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacct 44384237  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  44384238 ggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgacgatattttgatctactccaagactgaag 44384337  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||| ||||  ||||| ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  44384338 aagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgag 44384437  T
Q  301 ttttcttggccatattatttc 321  Q
    |||||| |||||| |||||||    
T  44384438 ttttctaggccatgttatttc 44384458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 158 - 325
Target Start/End: Original strand, 22323581 - 22323748
Alignment:
Q  158 gttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttat 257  Q
    |||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| | |    
T  22323581 gttgtgtttatcgacgatatcttgatttactccaagactgaagaagaacatgccgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagcttt 22323680  T
Q  258 atgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggt 325  Q
    |||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  22323681 atgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttgtttctggt 22323748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 207 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 45534609 - 45534482
Alignment:
Q  207 atgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttct 306  Q
    ||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||    
T  45534609 atgccgagcatttgagaattgttttgcaagtgctgaaagagaagaagttatatgccaagttatcgaagtgcgaattctggttgaacgaagtgagttttct 45534510  T
Q  307 tggccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
     || ||||||||||||||||||| ||||    
T  45534509 cggtcatattatttctggtagtggtatt 45534482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 20 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 23278632 - 23278318
Alignment:
Q  20 gatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaataca 119  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||||| || ||||||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| || ||||| || |    
T  23278632 gatatgcagaagacgacctttaggacacgatatggacattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtata 23278533  T
Q  120 tgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcattt 219  Q
    |||| || ||||| ||||||||| | |||  ||| || ||||| || ||||| || ||| |||| || |||||| ||||||||||  ||||  | ||| |    
T  23278532 tgaaccgaattttccatgcttatctggataatttcgtggttgtttttattgatgacattctgatttattctaagactgaagaagagcatgcagaacatct 23278433  T
Q  220 gaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatt 319  Q
    |||| |||| |||||| |  |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||| | ||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  23278432 gaagattgtgttgcaaatattgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaagtgcgagttctggttaagtgaagtgagttttctaggccacattatt 23278333  T
Q  320 tctggtagtgatatt 334  Q
    | |||||||| ||||    
T  23278332 tttggtagtggtatt 23278318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 107 - 325
Target Start/End: Original strand, 24706156 - 24706374
Alignment:
Q  107 tttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaa 206  Q
    |||||||| |||||||||| ||| ||||| || | ||| ||||| || || | ||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||     
T  24706156 tttatggagtacatgaatcatatctttcacgcatttttggatcggttcgtggctgttttcattgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaac 24706255  T
Q  207 atgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttct 306  Q
    ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || || || || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  24706256 atgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatctaaatgtgagttctggttgaaagaggtaagttttct 24706355  T
Q  307 tggccatattatttctggt 325  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  24706356 tggccatgttatttctggt 24706374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Original strand, 19650626 - 19650951
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| || || |||||||| ||    | ||||||||||  ||  || || || || ||||| ||    
T  19650626 tgaaggatgaagatatgcagaagacgacctttaggacacgatatggtcattacgagtacaaggtgatgcctttcggtgtcactaacgcgcctggtgtgtt 19650725  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
     ||||| || ||||| |  ||||| ||||||| ||| |||   ||||| |||||||| ||||| |||||| | || || |||||| | ||||| ||  ||    
T  19650726 catggagtatatgaaccaaattttccatgcttttttggataaatttgtggttgtgtttattgatgatattctaatttattctaagaccgaagaggagcat 19650825  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  ||||| ||||| |||| ||||||||  ||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||| ||| | ||| || ||||||||||    
T  19650826 gcagagcatctgaagattgtattgcaagttttgaaagaaaagaagttgtatgctaagttgtcaaaatgtgagttctagttaagtgaagtaagttttcttg 19650925  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||    
T  19650926 gccacattatttctggtagtggtatt 19650951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 323
Target Start/End: Original strand, 21323847 - 21324156
Alignment:
Q  14 gatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatgg 113  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||| || || || || ||   ||  ||||||||   || ||| ||| |||| || ||||||||||    
T  21323847 gatgaagatatgcagaagacagctttcagaacacgttatggccactatgagtataaagttatgccttttggtgttaccaatacacctggagtatttatgg 21323946  T
Q  114 aatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaa 213  Q
    | || |||||||| || || ||||| | ||| ||| | || || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||  |    
T  21323947 agtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggattggttcgtagttgttttcatcgacgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctga 21324046  T
Q  214 gcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccat 313  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||  | ||||| ||  | || |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  21324047 gcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaggagaagaaactttatgctaaactatctaagtgtgagttctggttgaaagaggtaagttttcttggccat 21324146  T
Q  314 attatttctg 323  Q
     | |||||||    
T  21324147 gtcatttctg 21324156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 161 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 25264769 - 25264596
Alignment:
Q  161 gtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatg 260  Q
    ||||| ||||| || || ||||| || |||||| ||||||||||  ||||  | ||| ||||| |||| ||||||||| ||||||| || ||||| ||||    
T  25264769 gtgtttattgatgacatcttgatttattctaagactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatg 25264670  T
Q  261 ccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| | ||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  25264669 ccaagttgtcaaaatgtgagttctggttaagtgaagtaagttttcttggccacattatttctggtagtggtatt 25264596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 23189793 - 23189470
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| | || |||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||||||||     
T  23189793 gattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacct 23189694  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||| |||| |    
T  23189693 ggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttatagacgatattttgatttactccaagactgagg 23189594  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||| ||||  ||||| ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||  | || ||    
T  23189593 aagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtg-attctggttgaagaaagtaag 23189495  T
Q  301 ttttcttggccatattatttctggt 325  Q
    |||||| |||||| |||||||||||    
T  23189494 ttttctgggccatgttatttctggt 23189470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 9 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 12576220 - 12575904
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||   || ||||||||||  || ||| || || || ||||||||    
T  12576220 tgaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcccggtgtatt 12576121  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
     ||||| || |||||||| ||||||||||||| ||| |||   || || || || || ||||| || ||| |||| || || ||| ||||||||||  ||    
T  12576120 catggagtatatgaatcgaatttttcatgcttttttggataaattcgtggtggtatttattgatgacattctgatttattcgaagactgaagaagagcat 12576021  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  | ||| |||   |||| ||||||||  ||||||| |  ||||| ||||||||  |||| || |||||||| ||| | | ||| |||||||| ||||    
T  12576020 gcagaacatctgagaattgtgttgcaagttttgaaagaaaggaagttgtatgccaaactgtcgaaatgtgaattttggctaagtgaagtgagtttccttg 12575921  T
Q  309 gccatattatttctggt 325  Q
    | |||||||||||||||    
T  12575920 gtcatattatttctggt 12575904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 24677364 - 24677040
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| | || |||||||||||| ||||||  ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  || ||| ||||||||     
T  24677364 gattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagatagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatacaaagttatgcctttcggtgttacgaatgcacct 24677265  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    |  || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||| | ||||| || |||||||| || ||||| ||| ||||||    
T  24677264 gtagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtggtttttttcatcgatgatattttaatttactccaagactgaag 24677165  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| | |||||||| ||  | ||||| || || || |||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  24677164 aagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttaaaagagaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgagttctggttgaaagaggtaag 24677065  T
Q  301 ttttcttggccatattatttctggt 325  Q
    |||||| |||||| |||||||||||    
T  24677064 ttttctgggccatgttatttctggt 24677040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 9 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 27789607 - 27789291
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||   || ||||||||||  || ||| || || || ||||| ||    
T  27789607 tgaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcccggtgtgtt 27789508  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
     ||||| || |||||||| ||||||||||||| | | |||   || || || || || ||||| |||||| |||| || || ||| ||||||||||  ||    
T  27789507 catggagtatatgaatcgaatttttcatgcttttctggataaattcgtggtggtatttattgatgatattctgatttattcgaagactgaagaagagcat 27789408  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  | ||| |||   ||||  |||||||  |||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||| | | ||| |||||||| ||||    
T  27789407 gcagaacatctgagaattgtgctgcaagttttgaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcgaaatgtgagttttggctaagtgaagtgagtttccttg 27789308  T
Q  309 gccatattatttctggt 325  Q
    | |||||||||||||||    
T  27789307 gtcatattatttctggt 27789291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 24950455 - 24950132
Alignment:
Q  11 aaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtattta 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| || || || ||||| || |    
T  24950455 aaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctggtgtgttca 24950356  T
Q  111 tggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgc 210  Q
    |||| || ||||| || ||||| ||||||||  | |||   ||||  ||||| ||  |||| |||||| |||| || || ||| ||||||||||  ||||    
T  24950355 tggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctggataaatttgcggttgtatttgttgatgatattctgatttattcaaagactgaagaagagcatgc 24950256  T
Q  211 caagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggc 310  Q
      | ||| ||||| |||| |||||| |  |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||| | ||| |||||| ||||||||    
T  24950255 agaacatctgaagattgtgttgcaaatattgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttatggttaagtgaagtgagtcttcttggc 24950156  T
Q  311 catattatttctggtagtgatatt 334  Q
    ||  ||| |||| |||||| ||||    
T  24950155 caccttacttctcgtagtggtatt 24950132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 92 - 322
Target Start/End: Original strand, 24829847 - 24830077
Alignment:
Q  92 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 191  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||| | || |||||| ||||| | || |||||||| || |||||||| || ||||||||| | || || |    
T  24829847 aatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaa 24829946  T
Q  192 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 291  Q
    ||||||| |||||  ||||  ||||||||| | |||| |||||| |  ||||||||||  |||| | |||||||||||| |||||||| || ||||| ||    
T  24829947 agtctgaggaagagcatgcggagcatttgaggattgtgttgcaattcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttcaa 24830046  T
Q  292 tgaggtgagttttcttggccatattatttct 322  Q
     || |||||||| ||||| ||| | ||||||    
T  24830047 ggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 24830077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 1065618 - 1065293
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  1065618 tgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtttt 1065519  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
    |||||| ||||||||||| || || ||||||| | | |||   ||||| || || || ||||| |||||||| || || || |||  ||| || ||  ||    
T  1065518 tatggagtacatgaatcgaatcttccatgcttttctggataagtttgtggtggtatttattgatgatattttaatctattccaagaatgaggaggagcat 1065419  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  ||||| |||   | || ||||||||| |||| || || | ||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| || |||||||| |    
T  1065418 gcagagcatctgagaatagtgttgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttatcaaaatgtgagttctgattaaatgaagtaagttttctgg 1065319  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    | || |||||||||||||||| ||||    
T  1065318 gtcacattatttctggtagtggtatt 1065293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 31832525 - 31832200
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  31832525 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtttt 31832426  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
    |||||| |||||||| || ||||| ||||||| | | |||   |||||||| ||||| ||||| ||||| || || || || |||  ||| || ||  ||    
T  31832425 tatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatcttaatttattccaagaatgaggaggagcat 31832326  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  ||||| |||   |||| ||||||||| |||| || || | ||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| | ||| || |||||||| |    
T  31832325 gcagagcatctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgcaaagttgtcgaaatgtgagttctggttaagtgaagtaagttttctgg 31832226  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    | || |||||||||||||||| ||||    
T  31832225 gtcacattatttctggtagtggtatt 31832200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 92 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 9337366 - 9337209
Alignment:
Q  92 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 191  Q
    |||||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| |    
T  9337366 aatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatctactcca 9337267  T
Q  192 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaa 249  Q
    || ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| || |||||| ||||||||||    
T  9337266 agactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaa 9337209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 152 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 23295659 - 23295477
Alignment:
Q  152 tttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaa 251  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||  |||| || || ||| ||||||||||  ||||  | ||| ||||| |||| || |||||  ||||||||||||    
T  23295659 tttgtggttgtgtttattgatgacatcctgatttattcaaagactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtgttacaagttttgaaagagaaaa 23295560  T
Q  252 agttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||||||||| ||||| |||||||  ||||||| ||||    
T  23295559 agttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggttaattgaagtgagttttctgggccacattattttgggtagtggtatt 23295477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Original strand, 19717593 - 19717918
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| || || || ||||| ||    
T  19717593 tgaaggatgaggatatgcacaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaaagcgcctggtgtgtt 19717692  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
     ||||| || ||||| || ||||| ||||||| | | |||   |||   |||||||| ||||| |||||| | || || |||||| |||||||  |  ||    
T  19717693 catggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaattttgggttgtgtttattgatgatattctaatttattctaagactgaagatcagcat 19717792  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  | ||| ||||| |||| ||||||||  ||||||| || ||| | ||||| |||||||| |||||||| |||||||| | ||| || || ||||| |    
T  19717793 gcagaacatctgaagattgtattgcaagttttgaaagaaaagaagctgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaagtaagatttctag 19717892  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||    
T  19717893 gccacattatttctggtagtggtatt 19717918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 102 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 22279879 - 22279659
Alignment:
Q  102 gtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaaga 201  Q
    |||| |||||||||||||||||| | || ||| || ||||| | || |||||||| || |||||||| || ||||||||| | || || || ||  | ||    
T  22279879 gtgtctttatggaatacatgaatagaatattttatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcgaaatcgaagga 22279780  T
Q  202 agaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagt 301  Q
     ||  ||||  ||||||||| | |||| ||||||||  ||||||||||  |||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||    
T  22279779 ggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtattgaaagagaaccagttatgtgcaaagttgtctaagtgtgaattttggttgaaggaagtgagt 22279680  T
Q  302 tttcttggccatattatttct 322  Q
    || ||||| ||| | ||||||    
T  22279679 ttccttggtcatgtgatttct 22279659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 240 - 329
Target Start/End: Original strand, 27208979 - 27209068
Alignment:
Q  240 tgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtg 329  Q
    ||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| | ||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  27208979 tgaaagagagaaagttgtatgccaacttgtcgaagtgcgagttctggttaagtgaagtgagttttctaggccacgttatttctggtagtg 27209068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 9 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 25255786 - 25255654
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||| |  ||||| ||    
T  25255786 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcttggtgtgtt 25255687  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgctta 141  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||||||    
T  25255686 tatggagtatatgaaccgaattttccatgctta 25255654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 14510 - 14843
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||   || ||||||||||  || ||||||||| ||     
T  14510 gattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagactgcttttagaacacgttatggacattatgaatataaagtgatgcctttcggtgttacaaatgcgcca 14609  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||| |||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  14610 ggtgtgtttatggagtacatgaatcgtatttttcatgcatttttggatagtttcgtggttgtgttcatcgacgatattttgatatactccaagattgaag 14709  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||| |||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  14710 aagaacatgttgagcatttgaagattgttttgcaagtgctgaaagagaagaagttatatgctaaattgtcaaagtgtgaattctagttgaaagaggtgag 14809  T
Q  301 ttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  14810 ttttcttggccatgttatttctggtagtggtatt 14843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 170; Significance: 3e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 14743 - 14418
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||   || |||||||||| ||| |||||| |||||     
T  14743 gattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacgacttttagaacacgttatggacattatgaatataaagtgatgcctttcgatgttacaaaggcacct 14644  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  14643 ggtgtgtttatggaatacatgaatcgaatttttcatgcgtttttggatcgtttcgtggttgtgttcatcgacgatattttgatatactcgaagtccgaag 14544  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||  ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  14543 aagagcatgctgagcatttgaagattgttttgcaagtgctgaaagagaagaagctatattctaaattgtcaaagtgtgagttctggttgaatgaggttag 14444  T
Q  301 ttttcttggccatattatttctggta 326  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  14443 ttttcttggccatgttatttcgggta 14418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 170; Significance: 3e-91; HSPs: 4)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 4189 - 3856
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||   || |||| |||||  || ||||||| | ||     
T  4189 gattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacggcttttagaacacgttatagacattatgaatataaagtgatgtctttcggtgttacaaatacgcca 4090  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  4089 ggtgtgtttatggagtacatgaatcgtatttttcatgcatttttggatcgtttcgtggttgtgttcatcgacgatattttgatatactccaagactgaag 3990  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||| ||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3989 aagaacatgctgagcatttgaagattgtattgcaagtgctgaaagagaagaagctatatgctaaattgtcaaagtgtgaattctggttgaaagaggtgag 3890  T
Q  301 ttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||| ||||    
T  3889 ttttcttggcaatgttatttctggtagtggtatt 3856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Original strand, 40372 - 40697
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  40372 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtttt 40471  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
    |||||| |||||||| || ||||| ||||||| | | |||   |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || || |||  ||| || ||  ||    
T  40472 tatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatattttaatctattccaagaatgaggaggagcat 40571  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  ||||| |||   |||| ||||||||| |||| || || | ||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||| |    
T  40572 gcagagcatctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttatcaaaatgtgagttctggttaaatgaagtaagttttctgg 40671  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    | || |||||||||||||||| ||||    
T  40672 gtcacattatttctggtagtggtatt 40697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 196 - 334
Target Start/End: Original strand, 45626 - 45763
Alignment:
Q  196 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 295  Q
    |||||||||  |||| || ||| ||||| |||| || |||||  |||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||| | |||     
T  45626 tgaagaagagcatgcaaaacatctgaagattgtgttacaagttttgaaagagaagaagttgtatgctaa-ttgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaa 45724  T
Q  296 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  45725 gtaagttttcttggccacattatttctggttgtggtatt 45763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 171
Target Start/End: Original strand, 45466 - 45628
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||| || || ||||| ||||||   | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  45466 tgaaggatgaggatatgcagaagatggcctttaggacacgatatggtcattaagaataaaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 45565  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattga 171  Q
     ||||| || ||||| |  ||||| |||||||| || |||   ||||| |||||||| |||||    
T  45566 catggagtatatgaaccaaattttccatgcttacttggataaatttgtggttgtgtttattga 45628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 166; Significance: 8e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 326
Target Start/End: Original strand, 5920 - 6245
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| ||||||| ||  ||||| | |||||||||||||| |||||  | |||||||| ||||| || | ||||||||||  || |||||| || ||     
T  5920 gattaaagtgaaggacgacaatatgcaaaagacggcttttagaacacgacatggacattaggaatattcggtgatgcctttcggtgttacaaacgcgcca 6019  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6020 ggtgtgtttatggagtacatgaatcgtattttccatgcatatctagatcgtttcgtggttgtgttcatcgacgatattttgatatactctaaggctgaag 6119  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||| ||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  6120 aagaacatgctgagcaattgaagattgttttgcaagtgctgaaagagaagaagttatatgctaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtcat 6219  T
Q  301 ttttcttggccatattatttctggta 326  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  6220 ttttcttggtcatgttatttctggta 6245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 166; Significance: 8e-89; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 22980 - 22647
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| |||| || || |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||||||  || ||||| ||| ||     
T  22980 gattaaagtgaaagacgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggacattacgaatattcggtgatgcctttcgttgttacaactgcgcca 22881  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  || || |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22880 ggtgtgtttatggagtacatgaatcgtatttttcatgcgtatttggatcacttcgtggttgtgttcatcaatgatattttgatatactctaagtctgaag 22781  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||| |  |  ||||||||||| ||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  22780 aagaacacactgagcatttgaagattgttttgcaagtgccgaaggaaaagaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgagttctggttgaatgaggtaag 22681  T
Q  301 ttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||    
T  22680 ttttcttggccatgttatttttggtagtggtatt 22647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 37851 - 38175
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| | || |||||||||||| ||||||| ||||| || || || || || || || |||||   ||  |||||||||  || ||| ||||||||     
T  37851 gattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcggtatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgttacgaatgcacct 37950  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    || || |||||||| || || ||||| || || ||||| | ||| ||||| || |  ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  37951 ggagtgtttatggagtatataaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgcggttgttttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaag 38050  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || || || |||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  38051 aagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgagttctggttgaaagaggtaag 38150  T
Q  301 ttttcttggccatattatttctggt 325  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    
T  38151 ttttcttggccatgttatttctggt 38175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 166; Significance: 8e-89; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 24564 - 24897
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||   || ||||||||||  || ||||||||| ||     
T  24564 gattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacggcttttagaacgcgttatggacattatgaatataaagtgatgcctttcggtgttacaaatgcgcca 24663  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  24664 ggtgtgtttatggagtacatgaatcgtatttttcatgcatttttggaacgtttcgtggttgtgttcatcgatgatattttgatatactcgaagactgaag 24763  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  24764 aagaacatgctgagcatttgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagttatatgctaaattatcaaagtgtgaattctggttgaaagaggtaag 24863  T
Q  301 ttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  24864 ttttcttggccatgttatttctagtagtggtatt 24897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 150836 - 150511
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| | || ||||| || |||||   || ||||||||||  || ||| ||||| ||  |||| ||    
T  150836 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacatgatatggacactatgaatataaagtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctagtgtgtt 150737  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
     ||||| || ||||| || ||||| ||||||||  | |||   ||  | ||||  || ||||| || |||||||| || |||||| ||||||||||  ||    
T  150736 catggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctggataaattcatggttgaatttattgatgacattttgatttattctaagactgaagaagagcat 150637  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  | ||| ||||| |||| ||||||||  ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||    
T  150636 gcagaacatctgaagattgtattgcaagtattgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttaagtgaggtaagttttcttg 150537  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||    
T  150536 gccacattatttctggaagtggtatt 150511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 240 - 334
Target Start/End: Original strand, 193974 - 194068
Alignment:
Q  240 tgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    ||||||| || ||||  ||||| |||||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  193974 tgaaagaaaagaagtcgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaagtgagttttcttggccacattatttctggtagtggtatt 194068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 165; Significance: 3e-88; HSPs: 37)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 334
Target Start/End: Original strand, 14849147 - 14849467
Alignment:
Q  14 gatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatgg 113  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||   || ||||||||||  || ||||||||| || ||||| |||||||    
T  14849147 gatgaagatatgcagaagacggcttttagaacgcgttatggacattatgaatataaagagatgcctttcggtgttacaaatgcgccaggtgtgtttatgg 14849246  T
Q  114 aatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaa 213  Q
    | ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| || || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||   |    
T  14849247 agtacatgaatcgtatttttcatgcatttttggatcgcttcgtggttgtgttcatcgacgatattttgatatactccaagtccgaagaagaacatgttga 14849346  T
Q  214 gcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccat 313  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  14849347 gcatttgaagattgttttgcaagtgctgaaggagaagaagttatatgctaaattgtcaaagtgtgaattctggttgaaagaggtaagttttcttggccaa 14849446  T
Q  314 attatttctggtagtgatatt 334  Q
     ||||||||||||||| ||||    
T  14849447 gttatttctggtagtggtatt 14849467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 2 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 14696356 - 14696024
Alignment:
Q  2 attaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgg 101  Q
    |||||| |||| ||| | |||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||||||  |||| |||| |||||||||   || ||||||||| || |    
T  14696356 attaaagtgaaagataaggatatgcagaagacggcctttagaacgcgttatggacattattaatattcagtgatgccttttggtgttacaaatgcgccag 14696257  T
Q  102 gtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaaga 201  Q
    |||| |||||||| ||||||||   |||||||||||| ||||| ||| | || || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  14696256 gtgtgtttatggagtacatgaactctatttttcatgcgtatttggattgcttcgtggttgtgttcattgatgatattttgatatactcgaagtccgaaga 14696157  T
Q  202 agaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagt 301  Q
    |||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14696156 agaacatgctgagcatttgaagattgttttgcaagtgctgaaagagaagaatttatatgctaagttgtcaaagtgtgagttctggttgaatgaggtgagt 14696057  T
Q  302 tttcttggccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  14696056 tttcttggccatgttatttctagtagtggtatt 14696024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 8708142 - 8707822
Alignment:
Q  14 gatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatgg 113  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||  || ||| || || | |||||| |||||||    
T  8708142 gatgaagatatgtagaaaacggcctttagcacacgatatggacattacgaatattcagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcggggtgtgtttatgg 8708043  T
Q  114 aatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaa 213  Q
    | ||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || |||||||||||||||||  ||||  |    
T  8708042 agtacatgaatagaattttccatgcttatttggatcggtttgtggttgtgtttattgatgacatcttgatttattctaagtctgaagaagagcatgcaga 8707943  T
Q  214 gcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccat 313  Q
    ||||| |||  |||| ||||||||| |||| || || ||| | |||||||||||||| || |||||||| ||||| | ||| || |||||| ||||||||    
T  8707942 gcattagaaagttgtgttgcaagtgttgaaggaaaagaagatgtatgccaagttgtccaaatgtgaattttggttaagtgaagtaagttttattggccat 8707843  T
Q  314 attatttctggtagtgatatt 334  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  8707842 attatttctggtagtggtatt 8707822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 23957991 - 23957667
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||||||||     
T  23957991 gattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacct 23957892  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  23957891 ggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaag 23957792  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  23957791 aagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgag 23957692  T
Q  301 ttttcttggccatattatttctggt 325  Q
    |||||| |||||| |||||||||||    
T  23957691 ttttctaggccatgttatttctggt 23957667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 8051391 - 8051715
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| | |||||||| |||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||||||||     
T  8051391 gattaaagtaaaggatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacct 8051490  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  8051491 ggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaag 8051590  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||  | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  8051591 aagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgag 8051690  T
Q  301 ttttcttggccatattatttctggt 325  Q
    |||||| |||||| |||||||||||    
T  8051691 ttttctaggccatgttatttctggt 8051715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 27713580 - 27713256
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||||||||     
T  27713580 gattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacct 27713481  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  27713480 ggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaag 27713381  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| ||||||||||||| |||||| || |||||    
T  27713380 aagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctagttgaaagaagtgag 27713281  T
Q  301 ttttcttggccatattatttctggt 325  Q
    |||||| |||||| |||||||||||    
T  27713280 ttttctaggccatgttatttctggt 27713256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 40475284 - 40474960
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| | ||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||||||||     
T  40475284 gattaaagtaaaggatgaagatatgcataagacagctttcagaacccgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacct 40475185  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    || || |||||||| || |||||||| || |||||||| | ||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  40475184 ggagtgtttatggagtatatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggtttgtggttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaag 40475085  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  40475084 aagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtcgaagtgtgaattctggttgaaagaagtgag 40474985  T
Q  301 ttttcttggccatattatttctggt 325  Q
    |||||| |||||| |||||||||||    
T  40474984 ttttctaggccatgttatttctggt 40474960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 14161700 - 14161381
Alignment:
Q  15 atgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatgga 114  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  |||| ||||||||||  || | | |||||||| || |||||||||||    
T  14161700 atgaagatatacagaagacggcttttaggacacgttacagacattatgaattttcagtgatgcctttcggtgtttctaatgcacctggagtatttatgga 14161601  T
Q  115 atacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaag 214  Q
     || |||||  | ||||||||||||||| | |||   || || ||||| || ||||| |||||  | || || ||| || | ||||||||| ||||  ||    
T  14161600 gtatatgaacagaatttttcatgcttatctggataagttcgtagttgtatttattgatgatatcctaatttattctgagacagaagaagaacatgctgag 14161501  T
Q  215 catttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccata 314  Q
    ||||||||| ||||| | || ||| |||| || |  ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14161500 catttgaagattgttctacaggtgttgaaggaaagtaagttgtatgccaagttgtcgaaatgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccaca 14161401  T
Q  315 ttatttctggtagtgatatt 334  Q
    |||| |||||||||| ||||    
T  14161400 ttatctctggtagtggtatt 14161381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 92 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 12478753 - 12478520
Alignment:
Q  92 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 191  Q
    |||||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  12478753 aatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgacgatattttgatttactcca 12478654  T
Q  192 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 291  Q
    || | ||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||  | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  12478653 agaccgaagaagaacatgccgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgaattctggttgaa 12478554  T
Q  292 tgaggtgagttttcttggccatattatttctggt 325  Q
     || ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  12478553 agaagtgagttttctaggccatgttatttctggt 12478520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 92 - 325
Target Start/End: Original strand, 19776652 - 19776885
Alignment:
Q  92 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 191  Q
    |||||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  19776652 aatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgacgatattttgatttactcca 19776751  T
Q  192 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 291  Q
    || | ||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||  | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  19776752 agaccgaagaagaacatgccgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgaattctggttgaa 19776851  T
Q  292 tgaggtgagttttcttggccatattatttctggt 325  Q
     || ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  19776852 agaagtgagttttctaggccatgttatttctggt 19776885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 14301747 - 14302071
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| |||||||  |||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||||||||     
T  14301747 gattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaactttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacct 14301846  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  14301847 ggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgatgatattttgatttactccaagactgaag 14301946  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  14301947 aagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgag 14302046  T
Q  301 ttttcttggccatattatttctggt 325  Q
    |||||| |||||| |||||||||||    
T  14302047 ttttctaggccatgttatttctggt 14302071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 107 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 14682705 - 14682487
Alignment:
Q  107 tttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaa 206  Q
    |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||| ||||| |||||     
T  14682705 tttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaaaaagaac 14682606  T
Q  207 atgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttct 306  Q
    ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  14682605 atgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagttttct 14682506  T
Q  307 tggccatattatttctggt 325  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  14682505 tggccatgttatttctggt 14682487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 92 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 15323370 - 15323128
Alignment:
Q  92 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 191  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| | |||   ||||| |||||||| ||||| |||||| | || || ||||    
T  15323370 aatgcgcctggtgtgtttatggaatacatgaatagaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgatattgtaatttattcta 15323271  T
Q  192 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 291  Q
    ||  |||||||||  ||||  ||||| ||||  |||| ||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |     
T  15323270 agagtgaagaagagcatgcagagcatctgaaaattgtgttgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtccaaatgtgaattctggttaag 15323171  T
Q  292 tgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15323170 tgaagtaagttttcttggccatattatttctggtagtggtatt 15323128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 8388640 - 8388336
Alignment:
Q  17 gaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaat 116  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || |||||||| || || |||||||| |    
T  8388640 gaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagt 8388541  T
Q  117 acatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagca 216  Q
    | |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || |||||||| || ||||||||||| || ||||| ||| ||||||||||| ||||  ||||    
T  8388540 atatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttatcgacgatattttaatttactccaagactgaagaagaacatgctgagca 8388441  T
Q  217 tttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatatt 316  Q
    | ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  8388440 tctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagtttccttggccatgtt 8388341  T
Q  317 atttc 321  Q
    |||||    
T  8388340 atttc 8388336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 15145653 - 15145977
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| | || |||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  || ||| ||||||||     
T  15145653 gattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgttaccaatgcacct 15145752  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    || || |||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||| ||||| || || ||||| || || || ||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  15145753 ggagtgtttatggagtacatgaatcgtatctttcatgcatttttggatcgattcgtggttgtctttatcgatgatattttgatttactccaagactgaag 15145852  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||| ||||  ||||| ||||  |||| ||||||||| |||||||||  ||  | ||||| || || || |||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  15145853 aagaacatgctgagcatctgaacattgtcttgcaagtgttgaaagagaggaaactttatgctaaattatctaagtgtgagttctggttgaaagaggtaag 15145952  T
Q  301 ttttcttggccatattatttctggt 325  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    
T  15145953 ttttcttggccatgttatttctggt 15145977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 18225214 - 18225547
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||||||||     
T  18225214 gattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacct 18225313  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    ||  | |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || |||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||    
T  18225314 ggactgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcctttttggatcggttcgtagttgtgtttattgacgacattttgatttactccaagactgaag 18225413  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||       
T  18225414 aagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtacc 18225513  T
Q  301 ttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  18225514 ttttcttggccatgttatttctggtgatgatatt 18225547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 15072595 - 15072270
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    ||||||||||||||| | | || ||||| ||||||||||| || |||||||| |||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  15072595 tgaaggatgaagatacgcaaaaaacggcctttaggacacgatatggacattatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 15072496  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||||||||| | |||   ||||| |||||||| ||||| |||||  | || || ||||||  |||| ||||  ||    
T  15072495 tatggagtacatgaatagagttttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgatatcctaatttattctaagaatgaataagagcat 15072396  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  ||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||| || | ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || ||||||||||    
T  15072395 gcagagcatctgaagattgtgttgcaagtgttgaaagaaaagaggttgtatgccaagttgtccaaatgtgaattctggttaagtgaagtaagttttcttg 15072296  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    | || ||||||||| |||||| ||||    
T  15072295 gtcacattatttcttgtagtggtatt 15072270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 16149947 - 16149622
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| |||||||| ||||| ||    
T  16149947 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcacctggtgtgtt 16149848  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
     ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||  | |||   ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || || | | ||||||||||  ||    
T  16149847 catggagtatatgaaccgaattttccatgcctacctggataaatttgtggttgtgtttattgacgatattctgatttattcaatgactgaagaagagcat 16149748  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  | ||| ||||| |||| |||||| |  ||||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||||| | ||| || |||||||||     
T  16149747 gcagaacatctgaagattgtattgcaaatattgaaagaaaagaagttgtatgctaagttatcgaagtgtgagttctggttaagtgaagtaagttttcttt 16149648  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||    
T  16149647 gccacattatttctggtagtggtatt 16149622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 16154093 - 16153768
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| |||||||| ||||| ||    
T  16154093 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcacctggtgtgtt 16153994  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
     ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||  | |||   ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || || | | ||||||||||  ||    
T  16153993 catggagtatatgaaccgaattttccatgcctacctggataaatttgtggttgtgtttattgacgatattctgatttattcaatgactgaagaagagcat 16153894  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  | ||| ||||| |||| |||||| |  ||||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||||| | ||| || |||||||||     
T  16153893 gcagaacatctgaagattgtattgcaaatattgaaagaaaagaagttgtatgctaagttatcgaagtgtgagttctggttaagtgaagtaagttttctta 16153794  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||    
T  16153793 gccacattatttctggtagtggtatt 16153768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Original strand, 3262830 - 3263155
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  3262830 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtttt 3262929  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
    |||||| |||||||| || ||||| ||||||| | | |||   |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || || |||  ||| || ||  ||    
T  3262930 tatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatattttaatctattccaagaatgaggaggagcat 3263029  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  ||||| |||   |||| ||||||||| |||| || || | ||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||| |    
T  3263030 gcagagcatctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttatcaaaatgtgagttctggttaaatgaagtaagttttctgg 3263129  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    | || |||||||||||||||| ||||    
T  3263130 gtcacattatttctggtagtggtatt 3263155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Original strand, 15001401 - 15001725
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||| || || || |||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || | ||| ||    
T  15001401 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacatgttatggtcactatgaatataaggtgatgcctttcggtgatactaatgcgcctgttgtgtt 15001500  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||||||| | |||   ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||||  |||||||||  ||    
T  15001501 tatggagtatatgaaccgaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttgatttattctaagattgaagaagagcat 15001600  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  | ||| ||| | |||| ||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||  || ||||| | |||||| | ||| || ||||||||||    
T  15001601 gcagaacatctgaggattgtgttgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtttaaatgtgagt-ctggttaagtgaagtaagttttcttg 15001699  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||    
T  15001700 gccacattatttctggtagtggtatt 15001725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Original strand, 44659902 - 44660227
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| || || || ||||||||    
T  44659902 tgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctggtgtatt 44660001  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
    |||||| ||||||||||| || || ||||||| | | |||   |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||  ||| || ||  ||    
T  44660002 tatggagtacatgaatcgaatcttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgacgatattttaatctattccaagaatgaggaggagcat 44660101  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  ||||| |||   |||| ||||||||| |||| || || | ||| ||||| |||||||| || ||||| |||||| | | ||| ||||| ||||| |    
T  44660102 gcagagcatctgagaattgtgttgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgcaaagttgtcgaaatgtgagttctggctaagtgaagtgagctttctgg 44660201  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
      || |||||||||||||||| ||||    
T  44660202 atcacattatttctggtagtggtatt 44660227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 2 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 27902629 - 27902297
Alignment:
Q  2 attaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgg 101  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||   || ||||||||||  || ||| || || || |    
T  27902629 attaaagtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaaagcgcctg 27902530  T
Q  102 gtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaaga 201  Q
    | || || ||||| || ||||| || ||||| |||||||   | |||   || || || || || |||||  |||||||||| || |||||| |||||||    
T  27902529 gagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgctttcctggataaattcgtggtggtatttattgatcatattttgatttattctaagactgaaga 27902430  T
Q  202 agaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagt 301  Q
     ||  ||||  | ||  ||||| |||| |||||  |  ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || |||| ||| ||||| ||||||    
T  27902429 ggagcatgcagaacacatgaagattgtgttgcagattttgaaagagagaaagttgtatgccaagttgtcgaagtgcgagttctagttaaatgaagtgagt 27902330  T
Q  302 tttcttggccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  27902329 tttctaggccacattatttctggtagtggtatt 27902297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 9 - 325
Target Start/End: Original strand, 51604828 - 51605144
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||   || ||||||||||  || ||| || || || ||||| ||    
T  51604828 tgaaagatgaagatatgcagaagacggcttttaggacacgatacggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcccggtgtgtt 51604927  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
     ||||| || |||||||| ||||||||||||| | | |||   || || || || || ||||| |||||| |||| || || ||| ||||||||||  ||    
T  51604928 catggagtatatgaatcgaatttttcatgcttttctggataaattcgtggtggtatttattgatgatattctgatttattcgaagactgaagaagagcat 51605027  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  | ||| |||   ||||  |||||||  |||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||| | | ||| |||||||| ||||    
T  51605028 gcagaacatctgagaattgtgctgcaagttttgaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcgaaatgtgagttttggctaagtgaagtgagtttccttg 51605127  T
Q  309 gccatattatttctggt 325  Q
    | |||||||||||||||    
T  51605128 gtcatattatttctggt 51605144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 158 - 325
Target Start/End: Original strand, 18613749 - 18613916
Alignment:
Q  158 gttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttat 257  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | |    
T  18613749 gttgtgtttattgacgacattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaacttt 18613848  T
Q  258 atgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggt 325  Q
    |||| || ||||| ||||||||||||||||||||  | || |||||||| |||||| |||| ||||||    
T  18613849 atgcaaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaaaaagtaagttttctaggccatgttatatctggt 18613916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 107 - 249
Target Start/End: Original strand, 16234866 - 16235008
Alignment:
Q  107 tttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaa 206  Q
    |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||     
T  16234866 tttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgacgatattttgatttactccaagactgaagaagaac 16234965  T
Q  207 atgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaa 249  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  16234966 atgccgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaa 16235008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 2 - 334
Target Start/End: Original strand, 1647306 - 1647638
Alignment:
Q  2 attaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgg 101  Q
    |||||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| || || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || |    
T  1647306 attaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggactcgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctg 1647405  T
Q  102 gtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaaga 201  Q
    |||| |||||||| || |||||| | ||||| ||||||| | | |||   || || || || |||||||| ||||||||||| || |||||| |||||||    
T  1647406 gtgtgtttatggagtatatgaataggattttccatgcttttctggataaattcgtggtggtattcattgatgatattttgatttattctaagactgaaga 1647505  T
Q  202 agaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagt 301  Q
     ||  ||||  | ||  ||||| |||| ||||   | |||||||| | |||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||| | ||| ||||||    
T  1647506 ggagcatgcagaacacctgaagattgtgttgcggattctgaaagaaagaaagttgtatgctaagttgtcgaagtgcgagttctggttaagtgaagtgagt 1647605  T
Q  302 tttcttggccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    ||| |||||||  | ||||||||||||| ||||    
T  1647606 tttgttggccacgtgatttctggtagtggtatt 1647638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 215 - 334
Target Start/End: Original strand, 1640322 - 1640441
Alignment:
Q  215 catttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccata 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||     
T  1640322 catttgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattttcaaagtgtgaattctggttgaaagaggtaagttttcttagccatg 1640421  T
Q  315 ttatttctggtagtgatatt 334  Q
    |||||||||||  |||||||    
T  1640422 ttatttctggtgatgatatt 1640441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Original strand, 15357156 - 15357481
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || || || |||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  15357156 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcactatgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 15357255  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
     ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||  | |||   || |  ||||| || ||||| || ||| |||| || |||||| ||||||||||  ||    
T  15357256 catggagtatatgaaccgaattttccatgcctacctggataagttcgcggttgtatttattgatgacattctgatttattctaagactgaagaagagcat 15357355  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  | ||| ||||| |||| || |||||  ||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| | |||  | ||||||||||    
T  15357356 gcagaacatctgaagattgtattacaagtattgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtcgaaatgtgagttctggttaagtgaattaagttttcttg 15357455  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||    
T  15357456 gccacattatttctggtagtggtatt 15357481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Original strand, 29451573 - 29451898
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  29451573 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtttt 29451672  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
    |||||| |||||||| || ||||| ||||||| | | |||   |||||||| || || ||||| |||||||| || || || |||  ||| || ||  ||    
T  29451673 tatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtatttattgatgatattttaatctattccaagaatgaggaggagcat 29451772  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  | ||| |||   |||| ||||||||| |||| || || |  || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| |    
T  29451773 gcagatcatctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagagattgtatgcaaagttgtcgaaatgtgagttctggttaagtgaagtgagctttctgg 29451872  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||    
T  29451873 gtcatattatttctggtagtggtatt 29451898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 17 - 249
Target Start/End: Original strand, 17092933 - 17093165
Alignment:
Q  17 gaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaat 116  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || |||||||| || || |||||||| |    
T  17092933 gaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagt 17093032  T
Q  117 acatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagca 216  Q
    | |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||  ||||    
T  17093033 atatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatctactccaagactgaagaagaacatgctgagca 17093132  T
Q  217 tttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaa 249  Q
    | ||||| |||| || |||||| ||||||||||    
T  17093133 tctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaa 17093165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 92 - 322
Target Start/End: Original strand, 15291277 - 15291507
Alignment:
Q  92 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 191  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||||||||   || |||||| ||||| | || | |||||| || |||||||| || ||||||||| | || || |    
T  15291277 aatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaataaaatatttcatccttatctggaccattttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaa 15291376  T
Q  192 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 291  Q
    ||||||| |||||  ||||  ||||||||| | |||| ||||||||  ||||||||||  |||| |  ||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  15291377 agtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgcgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaa 15291476  T
Q  292 tgaggtgagttttcttggccatattatttct 322  Q
     || |||||||| ||||| ||| | ||||||    
T  15291477 ggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 15291507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 16218474 - 16218323
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| |||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||   || |||||| |||  || ||||||||   |     
T  16218474 gattaaagtgaaagatgaggatatgcagaagacagcttttagaacacgttatggacattatgaatataaagtgatgcccttcggtgttacaaatgtgtca 16218375  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgtt 152  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||    
T  16218374 ggtgtgtttatggagtacatgaatcgcatttttcatgcatttttggatcgtt 16218323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 16221794 - 16221643
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| |||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||   || |||||| |||  || ||||||||   |     
T  16221794 gattaaagtgaaagatgaggatatgcagaagacagcttttagaacacgttatggacattatgaatataaagtgatgcccttcggtgttacaaatgtgtca 16221695  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgtt 152  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||    
T  16221694 ggtgtgtttatggagtacatgaatcgcatttttcatgcatttttggatcgtt 16221643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 177
Target Start/End: Original strand, 11205268 - 11205436
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| || || || ||||| ||    
T  11205268 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctggtgtgtt 11205367  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatat 177  Q
    |||||| |||||||| || || || ||||||| | | |||   |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  11205368 tatggagtacatgaaccgaatcttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatat 11205436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 257 - 325
Target Start/End: Original strand, 29037428 - 29037496
Alignment:
Q  257 tatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggt 325  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  29037428 tatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctggt 29037496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 15258164 - 15257990
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  15258164 tgaaggatgagaatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 15258065  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgat 183  Q
     |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||| |  ||   ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  15258064 catggaatatatgaaccgaattttccatgcctatctgaataaatttgtggttgtgtttattgatgatatcttgat 15257990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 17151 - 16819
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| |||| || || |||||| |||||||  ||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| ||| ||||||  || ||| ||||| ||     
T  17151 gattaaagtgaaagacgaggatatgcagaagacaacttttagaacacgttatggacattatgaatattcagtgat-cctttcggtgttaccaatgcgcca 17053  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  17052 ggtgtgtttatggagtacatgaatcgtatttttcatgcgtatttagatcgcttcgtggttgtgttcatcgacgatattttgatatactccaagactgaag 16953  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  16952 aagaacatgctgagcatttgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagttatatgccaaattgtcaaagtgtcaattctgattgaaagaggtgag 16853  T
Q  301 ttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    | || ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  16852 tgtttttggcaatgttatttctggtagtgatatt 16819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 257 - 334
Target Start/End: Original strand, 111775 - 111852
Alignment:
Q  257 tatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  111775 tatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaggtgagttttcttggccatattatttctggtggtggtatt 111852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 158; Significance: 5e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 15252 - 15585
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||  ||||||| |||||   || ||| ||||||  || ||||||||| ||     
T  15252 gattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacggcttttagaacttgttatagacattatgaatataaagtgattcctttcggtgttacaaatgcgcca 15351  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  15352 ggtatctttatggagtacatgaatcgtatttttcatgcatttttggatcgtttcgtgattgtgttcatcgacgatattttgatatactccaagactgaag 15451  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||| | ||  ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  15452 aagaacaagctgagcatttgaagattgttttgcaagtgctaaaagagaaaaagttatatgctaaattgtcaaagtgtgaattctagttgaaagaggtgag 15551  T
Q  301 ttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  15552 ttttcttggccatgtaatttctggtagtggtatt 15585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 2)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 5 - 334
Target Start/End: Original strand, 27283 - 27611
Alignment:
Q  5 aaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtg 104  Q
    |||||||| ||||| || ||  |||||| ||  ||||||| |||||||||| |||| ||||| || | ||||||||||  || ||| ||||| ||||| |    
T  27283 aaactgaaagatgaggacattcagaagatggactttaggatacgttacggaaattatgaatattctgtgatgcctttcggtgttactaatgcgccgggag 27382  T
Q  105 tatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaaga 204  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||  ||||||||||||||||||| || ||    
T  27383 tatttgtggaatatatgaatcgtatttttcatacttatctagatcgttttgttgttgtgtttatagatgatatcctgatatactctaagtctgaggagga 27482  T
Q  205 aaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagtttt 304  Q
    | ||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  27483 acatgccgagcatttgagaattgttttgcaagtgctgaaagagaagaagttatatgccaagttatcaaagtgagaattctggttgaacga-gtgagtttt 27581  T
Q  305 cttggccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  27582 cttggtcatattatttctggtagtggtatt 27611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 2 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 21394 - 21062
Alignment:
Q  2 attaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgg 101  Q
    |||||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||  |||| ||||| |||||    | ||| ||||||  || ||| ||||| || |    
T  21394 attaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgacacggtcattatgaatagaaggtgatacctttcggtgttactaatgcgcctg 21295  T
Q  102 gtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaaga 201  Q
    ||||||| ||||| || ||||| || ||||||||||||| | | |||   ||||| ||||| ||  |||| |||||| | || || |||||| |||||||    
T  21294 gtgtattcatggagtatatgaaccgaatttttcatgcttttctggataaatttgtagttgtatttcttgatgatattctaatttattctaagactgaaga 21195  T
Q  202 agaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagt 301  Q
     ||  ||||  | ||| ||||| |||| ||||||||  ||||||| || ||||| ||||| || ||||  || ||| | || ||||| | | | || |||    
T  21194 ggagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaagttttgaaagaaaataagttgtatgctaaattgttgaaatgttagttttggttaagtaaagtaagt 21095  T
Q  302 tttcttggccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    |||||||| || |||||||||||||||| ||||    
T  21094 tttcttggtcacattatttctggtagtggtatt 21062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 63)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 15261493 - 15261168
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||   || ||||||||||  || || |||||| ||     
T  15261493 gattaaactgaaagatgaagatatgcagaagatggcttttagaacacgttatggacattatgaatataaagtgatgcctttcggtgttagaaatgcgcca 15261394  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||| || ||| ||||||    
T  15261393 ggtgtgtttatggagtacatgaatcgtatctttcatgcgtttttggatcgtttcgtggttgtattcatcgatgatattttgatatattccaagactgaag 15261294  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15261293 aagaacatgctgagcatttgaagattgttttgcaagtgctgaaggagaagaagctttatgctaaattgtaaaagtgtgaattctggttgaaagaggtgag 15261194  T
Q  301 ttttcttggccatattatttctggta 326  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||    
T  15261193 ttttcttggccatgttatttctggta 15261168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 9 - 322
Target Start/End: Original strand, 15014031 - 15014344
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||| ||||| |||||  |||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||| || | ||||||||||  || ||| || || || || || ||    
T  15014031 tgaaagatgaggatattcagaagacgacctttaggacatgttatggacattacgaatattcggtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctggagtgtt 15014130  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||| | |||||||||||| | || || ||| ||    
T  15014131 tatggaatatatgaatcgtatttttcatgcttatttggatcgatttgttgttgtgtttatagatgatattctaatatactctaagaccgaggaggaacat 15014230  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||| ||||||  |   ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  15014231 gccgagcattgtagaattgttttgcaagtgctgaaggagaagaagttatatgccaagttatcgaagtgcgaattctggttgaacgaagtgagttttcttg 15014330  T
Q  309 gccatattatttct 322  Q
    ||||||||||||||    
T  15014331 gccatattatttct 15014344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 17491713 - 17491380
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| |||| || ||||| || || ||||| |||||||| || ||   ||  |||||||||| || ||||||||||||     
T  17491713 gattaaagtgaaagatgaagatatgcagaaaacagctttcagaacgcgttatggacattatgagtacaaagttatgcctttcagtgttacaaatgcacct 17491614  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    || ||||||||| | ||||||||||| || |||||| | | ||| ||||| || || ||||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||    
T  17491613 ggagtatttatgaagtacatgaatcgcatctttcattcatttttggatcggttcgtggttgtttttattgatgatattttaatttactccaagtctgaag 17491514  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||| ||||  ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  17491513 aagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgag 17491414  T
Q  301 ttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
     |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  17491413 ctttcttggacatgttatttctggtagtggtatt 17491380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 15723201 - 15723525
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||||||||     
T  15723201 gattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacacgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacct 15723300  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    || || |||||||| || |||||||| || |||||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  15723301 ggagtgtttatggagtatatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgatgatattttgatttactccaagactgaag 15723400  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  15723401 aagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtcgaagtgtgaattctggttgaaagaagtgag 15723500  T
Q  301 ttttcttggccatattatttctggt 325  Q
    |||||| |||||| |||||||||||    
T  15723501 ttttctaggccatgttatttctggt 15723525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 92 - 265
Target Start/End: Original strand, 11889638 - 11889811
Alignment:
Q  92 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 191  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11889638 aatgcgccaggtgtgttcatggaatacatgaatcgtatttttcatgcgtatttagatcgcttcgtggttgtgttcattgatgatattttgatatactcta 11889737  T
Q  192 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaag 265  Q
    ||| | | |||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  11889738 agtttaaggaagaacatgctgagcatttgaagattgttttgcaagtgctgaaggagaagaagttatatgccaag 11889811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 10007463 - 10007139
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||    | ||| ||||||||     
T  10007463 gattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggagttaccaatgcacct 10007364  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  10007363 ggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgacgatattttgatttactccaagactgaag 10007264  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||| || |  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  10007263 aagaacattctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgag 10007164  T
Q  301 ttttcttggccatattatttctggt 325  Q
    |||||| |||||| |||||||||||    
T  10007163 ttttctaggccatgttatttctggt 10007139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 17 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 48427294 - 48426986
Alignment:
Q  17 gaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaat 116  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || |||||||| || || |||||||| |    
T  48427294 gaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagt 48427195  T
Q  117 acatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagca 216  Q
    | |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  48427194 atatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttatcgacgatattttgatctactccaagactgaagaagaacatgccgagca 48427095  T
Q  217 tttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatatt 316  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||    
T  48427094 tctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgtt 48426995  T
Q  317 atttctggt 325  Q
    |||||||||    
T  48426994 atttctggt 48426986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 11 - 321
Target Start/End: Original strand, 15346522 - 15346832
Alignment:
Q  11 aaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtattta 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || |||||||| || || ||||    
T  15346522 aaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgttta 15346621  T
Q  111 tggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgc 210  Q
    |||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  15346622 tggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgc 15346721  T
Q  211 caagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggc 310  Q
      ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  15346722 tgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagttttctaggc 15346821  T
Q  311 catattatttc 321  Q
    ||| |||||||    
T  15346822 catgttatttc 15346832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 92 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 13254462 - 13254229
Alignment:
Q  92 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 191  Q
    |||||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| |    
T  13254462 aatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatctactcca 13254363  T
Q  192 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 291  Q
    || ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  13254362 agactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaa 13254263  T
Q  292 tgaggtgagttttcttggccatattatttctggt 325  Q
     || ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  13254262 agaagtgagttttctaggccatgttatttctggt 13254229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 10908073 - 10907749
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||    | ||| ||||||||     
T  10908073 gattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggagttaccaatgcacct 10907974  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  10907973 ggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgacgatattttgatttactccaagactgaag 10907874  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||| ||    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  10907873 aagaacattttgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgag 10907774  T
Q  301 ttttcttggccatattatttctggt 325  Q
    |||||| |||||| |||||||||||    
T  10907773 ttttctaggccatgttatttctggt 10907749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 329
Target Start/End: Original strand, 11950172 - 11950492
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  11950172 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggggatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 11950271  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
     ||||| || ||||| || ||||| ||||||||  | |||   || || |||||||| ||||| |||||| |||| || |||||| ||||||||||  ||    
T  11950272 catggagtagatgaaccgaattttccatgcttacctggataaattcgtggttgtgtttattgatgatattctgatttattctaagactgaagaagagcat 11950371  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  | ||||||||| |||| ||||||||  |||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||    
T  11950372 gcagaacatttgaagattgtgttgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaagtgagttttcttg 11950471  T
Q  309 gccatattatttctggtagtg 329  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  11950472 gccacattatttctggtagtg 11950492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 20060321 - 20060645
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||    | ||| ||||||||     
T  20060321 gattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggagttaccaatgcacct 20060420  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | | | ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  20060421 ggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttctggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaag 20060520  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||  | |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||    
T  20060521 aagaacatgccgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgaattttggttgaaagaagtgag 20060620  T
Q  301 ttttcttggccatattatttctggt 325  Q
    |||||| |||||| |||||||||||    
T  20060621 ttttctaggccatgttatttctggt 20060645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 17188239 - 17187914
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||   || ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  17188239 tgaaggatgaggatatgcagaagactgcctttaggacacgatacggtcattacgaatataaagtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 17188140  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
     ||||| || |||||  | ||||||||||| ||||| |||   ||||| ||||| |||||||| || ||| |||| || || | | |||| |||||  ||    
T  17188139 catggagtatatgaacagaatttttcatgcctatttggataaatttgtggttgtattcattgatgacattctgatttattcaaggactgaggaagagcat 17188040  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  | ||| ||||  |||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||    
T  17188039 gcagaacatctgaaaattgtattgcaagtattgaaagagaaaaagttgtatgccaaattgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaagtgagttttcttg 17187940  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||    
T  17187939 gccacattatttctggtagtggtatt 17187914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 321
Target Start/End: Original strand, 5108878 - 5109198
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| | || |||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||||||||     
T  5108878 gattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacct 5108977  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||| ||||||    
T  5108978 ggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgacgatatcttgatttactccaagactgaag 5109077  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| || ||| | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  5109078 aagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagaaaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgag 5109177  T
Q  301 ttttcttggccatattatttc 321  Q
    |||||| |||||| |||||||    
T  5109178 ttttctaggccatgttatttc 5109198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 321
Target Start/End: Original strand, 5423197 - 5423517
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| | || |||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||||||||     
T  5423197 gattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagcttttagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacct 5423296  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  5423297 ggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttatgttcatcgacgatatcttgatttactctaagactgaag 5423396  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  5423397 aagaacatgccgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattcttgttgaatgaagtgag 5423496  T
Q  301 ttttcttggccatattatttc 321  Q
    ||| ||||||||| |||||||    
T  5423497 tttccttggccatgttatttc 5423517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 325
Target Start/End: Original strand, 15400785 - 15401108
Alignment:
Q  2 attaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgg 101  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| |||||||  |    
T  15400785 attaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacttg 15400884  T
Q  102 gtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaaga 201  Q
    | || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  15400885 gagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgatgatattttgatttactccaagactgaaga 15400984  T
Q  202 agaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagt 301  Q
    |||| ||||  ||||| ||||| |||| |||| |||| |||||||||| ||  | |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  15400985 agaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcgagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgagttctggttgaaagaagtgagt 15401084  T
Q  302 tttcttggccatattatttctggt 325  Q
    |||||||||||| |||||||||||    
T  15401085 tttcttggccatgttatttctggt 15401108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 15229460 - 15229143
Alignment:
Q  17 gaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaat 116  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| |||||    | ||||||||||   | ||| ||||| ||  |||| ||||||||||    
T  15229460 gaagatatgtagaaaacggcctttaggacacgatatggacattatgaatataaggtgatgcctttcggcgttactaatgcgcctagtgtgtttatggaat 15229361  T
Q  117 acatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagca 216  Q
    |||||||| | | ||| ||||||||| |||||   ||||| |||||||| ||||| ||||| || || || |||||| ||||||||||  ||||  ||||    
T  15229360 acatgaatagaactttccatgcttatctagataaatttgtggttgtgtttattgatgatatcttaatttattctaagactgaagaagagcatgcagagca 15229261  T
Q  217 tttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatatt 316  Q
    | ||||  || | ||||||||| ||||||| || ||||| ||||||| |||||| || ||||||||| |||| | ||| || |||||||||||||| |||    
T  15229260 tctgaaaattatgttgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccatgttgtccaaatgtgaattcgggttaagtgaagtaagttttcttggccacatt 15229161  T
Q  317 atttctggtagtgatatt 334  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  15229160 atttctggtagtggtatt 15229143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 15235328 - 15235011
Alignment:
Q  17 gaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaat 116  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| |||||    | ||||||||||   | ||| ||||| ||  |||| ||||||||||    
T  15235328 gaagatatgtagaaaacggcctttaggacacgatatggacattatgaatataaggtgatgcctttcggcgttactaatgcgcctagtgtgtttatggaat 15235229  T
Q  117 acatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagca 216  Q
    |||||||| | | ||| ||||||||| |||||   ||||| |||||||| ||||| ||||| || || || |||||| ||||||||||  ||||  ||||    
T  15235228 acatgaatagaactttccatgcttatctagataaatttgtggttgtgtttattgatgatatcttaatttattctaagactgaagaagagcatgcagagca 15235129  T
Q  217 tttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatatt 316  Q
    | ||||  || | ||||||||| ||||||| || ||||| ||||||| |||||| || ||||||||| |||| | ||| || |||||||||||||| |||    
T  15235128 tctgaaaattatgttgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccatgttgtccaaatgtgaattcgggttaagtgaagtaagttttcttggccacatt 15235029  T
Q  317 atttctggtagtgatatt 334  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  15235028 atttctggtagtggtatt 15235011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 92 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 15341041 - 15340808
Alignment:
Q  92 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 191  Q
    |||||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||||||||| ||||| |    
T  15341041 aatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgatgatattttgatttactcca 15340942  T
Q  192 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 291  Q
    || ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| |||| |||| |||||||||| ||  | |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  15340941 agactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcgagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgagttctggttgaa 15340842  T
Q  292 tgaggtgagttttcttggccatattatttctggt 325  Q
     || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15340841 agaagtgagttttcttggccatgttatttctggt 15340808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 92 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 16637545 - 16637312
Alignment:
Q  92 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 191  Q
    |||||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || |||||||| || |||||||||||||| ||||| |    
T  16637545 aatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttatcgacgatattttgatctactcca 16637446  T
Q  192 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 291  Q
    || ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  16637445 agactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaa 16637346  T
Q  292 tgaggtgagttttcttggccatattatttctggt 325  Q
     || ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  16637345 agaagtgagttttctaggccatgttatttctggt 16637312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Original strand, 16805214 - 16805535
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||||||||     
T  16805214 gattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagcacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacct 16805313  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    || || |||||||| ||||||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||| ||||||    
T  16805314 ggagtgtttatggagtacatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttatcgacgacattttgatttactccaagactgaag 16805413  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
     |||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || || ||    
T  16805414 gagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtaag 16805513  T
Q  301 ttttcttggccatattatttct 322  Q
    ||||||||||||| ||||||||    
T  16805514 ttttcttggccatgttatttct 16805535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Original strand, 12358791 - 12359116
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||    | ||||||||||  || ||| || || || ||||| ||    
T  12358791 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaagacacgatatggacattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaaagcgcctggtgtgtt 12358890  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
     ||||| || ||||| || ||||| ||||||||  | |||   || || ||||| || ||||| || ||| |||| || || ||| ||||||||||  ||    
T  12358891 catggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctggataaattagtggttgtatttattgatgacattctgatttattcaaagactgaagaagagcat 12358990  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  | ||| ||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||    
T  12358991 gcagaacatctgaagattgtattgcaagtattgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaagtgagttttcttg 12359090  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||    
T  12359091 gccacattatttctggtagtggtatt 12359116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 92 - 321
Target Start/End: Original strand, 16755059 - 16755288
Alignment:
Q  92 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 191  Q
    |||||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |    
T  16755059 aatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttattgacgatattttgatttactcca 16755158  T
Q  192 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 291  Q
    || ||||||||||| ||||  | ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||    ||||||||||||||||||    
T  16755159 agactgaagaagaacatgcggaacatttgaagattgttttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtttgtgtgtgaattctggttgaa 16755258  T
Q  292 tgaggtgagttttcttggccatattatttc 321  Q
    ||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  16755259 tgaagtgagtttccttggccatgttatttc 16755288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 3687806 - 3687486
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||    | ||| ||||||||     
T  3687806 gattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggagttaccaatgcacct 3687707  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  3687706 ggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgacgatattttgatttactccaagactgaag 3687607  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||| ||||  ||||| ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||  | ||||| || || || |||||||||||||||||||| || |||||    
T  3687606 aagaacatgcagagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgag 3687507  T
Q  301 ttttcttggccatattatttc 321  Q
    |||||| || ||| |||||||    
T  3687506 ttttctaggtcatgttatttc 3687486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 92 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 6602508 - 6602276
Alignment:
Q  92 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 191  Q
    |||||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  6602508 aatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgacgatattttgatttactcca 6602409  T
Q  192 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 291  Q
    || | ||||||||| ||||  ||||| ||| | |||| || |||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  6602408 agaccgaagaagaacatgctgagcatctgacgattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaa 6602309  T
Q  292 tgaggtgagttttcttggccatattatttctgg 324  Q
    ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  6602308 tgaagtgagtttccttggccatgttatttctgg 6602276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 12888572 - 12888252
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||||||||     
T  12888572 gattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacct 12888473  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || || |||||||| || ||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  12888472 ggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtagtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaag 12888373  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||| ||||| ||||  ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  12888372 aagaacatgccgagcacctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgcaaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgag 12888273  T
Q  301 ttttcttggccatattatttc 321  Q
    ||| ||||||||| |||||||    
T  12888272 tttacttggccatgttatttc 12888252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 15587659 - 15587983
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||| || || || || || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||||||||     
T  15587659 gattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgatatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacct 15587758  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | | | ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  15587759 ggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttctggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatctactccaagactgaag 15587858  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||| |||   ||||| ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  15587859 aagaacatgttgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgag 15587958  T
Q  301 ttttcttggccatattatttctggt 325  Q
    |||||| |||||| |||||||||||    
T  15587959 ttttctaggccatgttatttctggt 15587983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 92 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 12500020 - 12499787
Alignment:
Q  92 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 191  Q
    |||||||| || || |||||||| ||||||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||||| || || |||||||||||||| ||||| |    
T  12500020 aatgcacctggagtgtttatggagtacatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtggttgtttttatcgacgatattttgatttactcca 12499921  T
Q  192 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 291  Q
    || ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||| ||  | ||||| || || || |||||||| |||||||||||    
T  12499920 agactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgatagagaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgagttctggttgaa 12499821  T
Q  292 tgaggtgagttttcttggccatattatttctggt 325  Q
     ||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  12499820 agaggtaagttttcttggccatgttatttctggt 12499787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 92 - 321
Target Start/End: Original strand, 53383376 - 53383605
Alignment:
Q  92 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 191  Q
    |||||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  53383376 aatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtggttgtgttcatcgacgatattttgatttactcca 53383475  T
Q  192 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 291  Q
    || ||||||||||| ||||  | ||| ||||| |||| || || ||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  53383476 agactgaagaagaacatgcggaacatctgaagattgtcttacaggtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaa 53383575  T
Q  292 tgaggtgagttttcttggccatattatttc 321  Q
    ||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  53383576 tgaagtgagtttccttggccatgttatttc 53383605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 74 - 325
Target Start/End: Original strand, 14874839 - 14875090
Alignment:
Q  74 atgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacg 173  Q
    |||||||||  || ||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| ||||| || || ||||| || || || |    
T  14874839 atgcctttcggtgttacgaatgcacctggagtattcatggagtacatgaatcgcatctttcatgcctttttggatcgattcgtggttgtttttatcgatg 14874938  T
Q  174 atattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaa 273  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || || || ||    
T  14874939 atattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatctaa 14875038  T
Q  274 gtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggt 325  Q
    |||||| ||||||||||| || || ||||||||||||| | |||||||||||    
T  14875039 gtgtgagttctggttgaaagaagtaagttttcttggccttgttatttctggt 14875090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 92 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 16693936 - 16693703
Alignment:
Q  92 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 191  Q
    |||||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || |||||||| || ||||| |||||||||||||| |    
T  16693936 aatgcacctggagtgtttatggagtaaatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttagtagttgtgtttatagacgaaattttgatatactcca 16693837  T
Q  192 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 291  Q
    || ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||    
T  16693836 agactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgagttctggttgaa 16693737  T
Q  292 tgaggtgagttttcttggccatattatttctggt 325  Q
     || || ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  16693736 agaagtaagttttcttggtcatgttatttctggt 16693703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 28756183 - 28755858
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||   || ||||||||||  || ||| ||||| |||||||| ||    
T  28756183 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaatgcgccgggtgtttt 28756084  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
    |||||| |||||||| || ||||| ||||||| | | |||   |||||||| ||||| ||||| ||||| || || || || |||  ||| || ||  ||    
T  28756083 tatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatcttaatttattccaagaatgaggaggagcat 28755984  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  ||||| |||   |||| ||||||||| |||| || || | ||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||| |    
T  28755983 gcagagcatctgagaattgtgttgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttatcaaaatgtgagttctggttaaatgaagtaagttttctgg 28755884  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    | || |||||||||||||||| ||||    
T  28755883 gtcacattatttctggtagtggtatt 28755858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 92 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 30139588 - 30139358
Alignment:
Q  92 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 191  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||| | || |||||| ||||| | || |||||||| || |||||||| || ||||||||| | || || |    
T  30139588 aatgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaa 30139489  T
Q  192 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 291  Q
    ||||||| |||||  ||||  ||||||||| | |||| ||||||||  ||||||||||  |||| | |||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  30139488 agtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaa 30139389  T
Q  292 tgaggtgagttttcttggccatattatttct 322  Q
     || |||||||| ||||| ||| | ||||||    
T  30139388 ggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 30139358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 92 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 30149139 - 30148909
Alignment:
Q  92 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 191  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||| | || |||||| ||||| | || |||||||| || |||||||| || ||||||||| | || || |    
T  30149139 aatgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaa 30149040  T
Q  192 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 291  Q
    ||||||| |||||  ||||  ||||||||| | |||| ||||||||  ||||||||||  |||| | |||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  30149039 agtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaa 30148940  T
Q  292 tgaggtgagttttcttggccatattatttct 322  Q
     || |||||||| ||||| ||| | ||||||    
T  30148939 ggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 30148909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Original strand, 31693449 - 31693774
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  31693449 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggacattatgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 31693548  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
    |||||| || |||||  | ||||| ||||||||| | |||   || || ||||| || ||||| || ||  |||| || |  ||| ||||||||||  ||    
T  31693549 tatggagtatatgaactgaattttccatgcttatctggataaattcgtggttgtatttattgatgacatactgatttatttaaagactgaagaagagcat 31693648  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  | ||| ||||| |||| ||||||||  ||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| | ||| || ||||||||||    
T  31693649 gcagaacatctgaagattgtattgcaagttttgaaagaaaagaagttgtatgctaagttgtcaaaatgtgagttctggttaagtgaagtaagttttcttg 31693748  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    |||| ||||||| |||||||| ||||    
T  31693749 gccacattatttatggtagtggtatt 31693774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 334
Target Start/End: Original strand, 11959435 - 11959758
Alignment:
Q  11 aaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtattta 110  Q
    |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||||    
T  11959435 aaggatgaggatatgcagaagacgacttttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgttta 11959534  T
Q  111 tggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgc 210  Q
    ||||||| |||||| | ||||| ||||||| | | |||   ||| | |||||||| ||||| |||||||| || || || |||  |||||| ||  ||||    
T  11959535 tggaatatatgaataggattttccatgcttttctggataaatttctagttgtgtttattgatgatattttaatctattccaagaatgaagaggagcatgc 11959634  T
Q  211 caagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggc 310  Q
      ||||| |||   |||| ||||||||  ||||||| || | ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||     
T  11959635 agagcatctgagaattgtattgcaagttttgaaagaaaagaggttgtatgcaaagttgtcaaaatgtgaattctggttaagtgaagtgagttttctgggt 11959734  T
Q  311 catattatttctggtagtgatatt 334  Q
    || ||||||| |||||||| ||||    
T  11959735 cacattatttgtggtagtggtatt 11959758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Original strand, 13970384 - 13970709
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||| ||||| || ||| ||||||| || ||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  13970384 tgaaagatgaggacatgcagaagactgcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 13970483  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
     ||||| || |||||  | ||||||||||||||  | |||   ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || || |   |||| |||||  ||    
T  13970484 catggagtatatgaacagaatttttcatgcttacctggataaatttgtggttgtattcattgatgacattttgatctattcgagaactgaggaagagcat 13970583  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  | ||| ||| | |||| ||||||||  |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||| | ||| |||||||||||||    
T  13970584 gcagaacatctgagggttgtattgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcaaagtgcgagttttggttaagtgaagtgagttttcttg 13970683  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||    
T  13970684 gccatattatttctggtagtggtatt 13970709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 14088538 - 14088213
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||| ||||| || ||| ||||||| || ||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  14088538 tgaaagatgaggacatgcagaagactgcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 14088439  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
     ||||| || |||||  | ||||||||||||||  | |||   ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || || |   |||| |||||  ||    
T  14088438 catggagtatatgaacagaatttttcatgcttacctggataaatttgtggttgtattcattgatgacattttgatctattcgagaactgaggaagagcat 14088339  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  | ||| ||| | |||| ||||||||  |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||| | ||| |||||||||||||    
T  14088338 gcagaacatctgaggattgtattgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcaaagtgcgagttttggttaagtgaagtgagttttcttg 14088239  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||    
T  14088238 gccatattatttctggtagtggtatt 14088213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 92 - 322
Target Start/End: Original strand, 8272757 - 8272987
Alignment:
Q  92 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 191  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||| | || |||||| ||||| | || |||||||| || |||||||| || ||||||||| | || || |    
T  8272757 aatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaa 8272856  T
Q  192 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 291  Q
    ||||||| |||||  ||||  ||||||||| | |||| ||||||||  ||||||||||  |||| |  ||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  8272857 agtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgcgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaa 8272956  T
Q  292 tgaggtgagttttcttggccatattatttct 322  Q
     || |||||||| ||||| ||| | ||||||    
T  8272957 ggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 8272987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Original strand, 18132610 - 18132935
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  18132610 tgaaggatgaggatatgcaaaagacggcctttaggacacgatacggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 18132709  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
     ||||| || ||||| || ||||||||||||||  | |||   ||||| |||||||| |||||||||||  | || || || ||| ||||||| ||   |    
T  18132710 catggagtatatgaaccgaatttttcatgcttacctggataaatttgtggttgtgtttattgacgatatcctaatttattcaaagactgaagaggagctt 18132809  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
     |  | ||| ||| | || | ||||||||| ||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| || | ||| |||| ||||||||    
T  18132810 acggaacatctgaggattatgttgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgctaagttgtcgaagtgcgagttctgattaagtgaagtgacttttcttg 18132909  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||    
T  18132910 gccacattatttctggtagtggtatt 18132935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 47125809 - 47125484
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  47125809 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtttt 47125710  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
    |||||| |||||||| || ||||| ||||||| | | |||   |||||||| ||||| ||||| |||||| | || || || |||  ||| || ||  ||    
T  47125709 tatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatattctaatctattccaagaatgaggaggagcat 47125610  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  ||||| |||   | || ||||||||| |||| || || | ||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  |||| || |||||||| |    
T  47125609 gcagagcatctgagaatagtgttgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttatcaaaatgtgaattctggttacatgaagtaagttttctgg 47125510  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    | || |||||||||||||||| ||||    
T  47125509 gtcacattatttctggtagtggtatt 47125484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 92 - 322
Target Start/End: Original strand, 13965710 - 13965941
Alignment:
Q  92 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 191  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||| | || |||||| ||||| | || |||||||| || |||||||| || ||||||||| | || || |    
T  13965710 aatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcga 13965809  T
Q  192 agtctgaagaagaa-aatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttga 290  Q
    ||||||| ||||||  ||||  ||||||||| | |||| |||||||   ||||||||||  |||| | |||||| ||||| |||||||| || |||||||    
T  13965810 agtctgaggaagaagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagacttgaaagagaaccagttgtctgccaatttgtctaagtgtgagttttggttga 13965909  T
Q  291 atgaggtgagttttcttggccatattatttct 322  Q
    | || |||||||||||||| ||| | ||||||    
T  13965910 aggaagtgagttttcttggtcatgtgatttct 13965941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 31940768 - 31940443
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||||||||| |||||| | ||||| || ||||||||||| || | |||||| |||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  31940768 tgaaggatgaggatatgcataagacagcctttaggacacgatatgcacattatgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 31940669  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||||||| | |||   || || ||||| || ||||| || ||  |||| || || ||| |||||||| |  ||    
T  31940668 tatggagtatatgaaccgaattttccatgcttatctggataaattcgtggttgtatttattgatgacatactgatttattcaaagactgaagaatagcat 31940569  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  | ||| ||||| |||| ||||||||  ||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| | ||| || ||||||||||    
T  31940568 gcagaacatctgaagattgtattgcaagttttgaaagaaaagaagttgtatgctaagttgtcaaaatgtgagttctggttaagtgaagtaagttttcttg 31940469  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    |||| ||||||| |||||||| ||||    
T  31940468 gccacattatttatggtagtggtatt 31940443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 2 - 326
Target Start/End: Original strand, 10418302 - 10418626
Alignment:
Q  2 attaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgg 101  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| || || || |    
T  10418302 attaaagtgaaggacgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctg 10418401  T
Q  102 gtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaaga 201  Q
    |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||| | | |||   ||||| || || || || || ||||| ||||| || || ||  |||||||    
T  10418402 gtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggtggtatttatagatgatatcttgatctattcaaaaactgaaga 10418501  T
Q  202 agaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagt 301  Q
     ||| | ||| | ||  ||||| |||| |||||| |  |||||||||  ||||| ||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||    
T  10418502 ggaacacgccgaacacctgaagattgtgttgcaaatattgaaagagaggaagttgtatgccaagctgtcgaagtgcgagttctggttaaatgaagtgagt 10418601  T
Q  302 tttcttggccatattatttctggta 326  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||    
T  10418602 tttctaggccacgttatttctggta 10418626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 190 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 12180022 - 12179878
Alignment:
Q  190 taagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttg 289  Q
    |||| ||||||||||  ||||  ||||| ||||| |||| |||||| |  ||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||     
T  12180022 taagactgaagaagagcatgcagagcatctgaagattgtgttgcaaatattgaaagaaaagaagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggtta 12179923  T
Q  290 aatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  12179922 attgaagtgagttttcttggccacattatttctggtagtggtatt 12179878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 41179387 - 41179071
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| || ||||| ||||| ||    
T  41179387 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcacccggtgtgtt 41179288  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
     ||||| || |||||||| ||||||||||||| | | |||   || || || || || ||||| |||||| |||| || || ||| ||||||||||  ||    
T  41179287 catggagtatatgaatcgaatttttcatgcttttctggataaattcgtggtggtatttattgatgatattctgatttattcgaagactgaagaagagcat 41179188  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
     |  | ||| |||   ||||  |||||||  |||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||| | | ||| |||||||| ||||    
T  41179187 tcagaacatctgagaattgtgctgcaagttttgaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcgaaatgtgagttttggctaagtgaagtgagtttccttg 41179088  T
Q  309 gccatattatttctggt 325  Q
    | |||||||||||||||    
T  41179087 gtcatattatttctggt 41179071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 92 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 15611885 - 15611655
Alignment:
Q  92 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 191  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| |||||| | || |||||| ||||| | || |||||||| || |||||||| || ||||||||| | || || |    
T  15611885 aatgcaccaggtgtctttatggaatatatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcga 15611786  T
Q  192 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 291  Q
    ||||||| |||||  ||||  ||||||||| | |||| ||||||||  ||||||| ||   ||| | |||||||||||| ||| |||| || ||||||||    
T  15611785 agtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtcttgcaagttttgaaagataaccggttgtgtgccaagttgtctaagcgtgagttttggttgaa 15611686  T
Q  292 tgaggtgagttttcttggccatattatttct 322  Q
     || |||||||| ||||| ||| | ||||||    
T  15611685 ggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 15611655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 325
Target Start/End: Original strand, 16379192 - 16379508
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||   || ||||||||||  || ||| || || || ||||| ||    
T  16379192 tgaatgatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcccggtgtgtt 16379291  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
     ||||| || |||||||| ||||||||||| | | | |||   ||  | || || || ||||| |||||| |||| || |||||| || |||||||  ||    
T  16379292 catggagtatatgaatcgaatttttcatgcctttctggataaattcctggtggtatttattgatgatattctgatttattctaagacttaagaagagcat 16379391  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  | ||| |||   |||| ||||||||  ||||||| || ||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||| | | ||| || ||||| ||||    
T  16379392 gcagaacatctgagaattgtgttgcaagtattgaaagaaaagaagttgtatgccaaattgtcaaaatgtgagttttggctaagtgaagtaagtttccttg 16379491  T
Q  309 gccatattatttctggt 325  Q
    | |||||||||||||||    
T  16379492 gtcatattatttctggt 16379508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 325
Target Start/End: Original strand, 16834774 - 16835090
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||||| |||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  16834774 tgaaggatggagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgtatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 16834873  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
     ||||| || ||||| || ||||||||||| | | | |||   ||||| ||||| || ||||| || ||  | || || |||||| |||| || ||  ||    
T  16834874 catggagtatatgaaccgaatttttcatgcatttctggataagtttgtggttgtatttattgatgacatcctaatttattctaagactgacgaggagcat 16834973  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  | ||| ||| | |||| ||||||||  ||||||| || ||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||| | | ||| |||||||| ||||    
T  16834974 gcagaacatctgaggattgtattgcaagtattgaaagaaaagaagttgtatgccaaattgtcaaaatgtgagttttggctaagtgaagtgagtttccttg 16835073  T
Q  309 gccatattatttctggt 325  Q
    |||||||||||||||||    
T  16835074 gccatattatttctggt 16835090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 329
Target Start/End: Original strand, 16327924 - 16328244
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    ||||| |||| |||||| |||| ||| ||||||||||||| || || |||||||| ||    | ||||||||||  || ||| ||  | || ||||| ||    
T  16327924 tgaagaatgaggatatgcagaaaacgacttttaggacacgatatggtcattacgagtacaaggtgatgcctttcggtgttactaacacgcctggtgtgtt 16328023  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
    |||||| |||||||| || ||||| ||||| | |   |||   |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||||  |||||| ||  ||    
T  16328024 tatggagtacatgaaccgaattttccatgcctttccggataagtttgttgtggtgtttattgatgatattttaatctattctaagaatgaagaggagcat 16328123  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  ||||| |||   |||| |||||||   |||||||||| | ||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| | ||| ||||||||||| |    
T  16328124 gcagagcatctgagaattgtattgcaagatttgaaagagaagaggttgtatgcaaagttgtcaaaatgtgagttatggttaagtgaagtgagttttctgg 16328223  T
Q  309 gccatattatttctggtagtg 329  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  16328224 gtcatattatttctggtagtg 16328244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 13943889 - 13943758
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||   || ||||||||||  || ||| || || || ||||| ||    
T  13943889 tgaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcccggtgtgtt 13943790  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgctt 140  Q
     ||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  13943789 catggagtatatgaatcgaatttttcatgctt 13943758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 44779112 - 44778981
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||   || ||||||||||  || ||| || || || ||||||||    
T  44779112 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcccggtgtatt 44779013  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgctt 140  Q
     ||||| |  |||||||| |||||||||||||    
T  44779012 catggagtttatgaatcgaatttttcatgctt 44778981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 92 - 300
Target Start/End: Original strand, 15948828 - 15949036
Alignment:
Q  92 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 191  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| |||||| | || |||||| ||||||| || || ||||| || || ||||| || ||||||||| | || || |    
T  15948828 aatgcgccaggtgtctttatggaatatatgaatagaatatttcatccttatttggaccgatttgtggtggttttcatagatgatattttggtgtattcga 15948927  T
Q  192 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 291  Q
    ||||||| |||||  |||   ||||| ||| | |||| ||||||||  ||||||||||  |||| |  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  15948928 agtctgaggaagagcatgttgagcatctgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgagccaagttgtctaagtgtgaattttggttgaa 15949027  T
Q  292 tgaggtgag 300  Q
     || |||||    
T  15949028 ggaagtgag 15949036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Original strand, 13318766 - 13319091
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||  || || |||||||||||    | |||||| |||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  13318766 tgaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacaatatggtcattacgaatacaaggtgatgccattcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 13318865  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
     ||||| || ||||| || ||||||||||||| | | |||   ||||| || || || ||||| |||||||| || || || ||| || |||| ||  ||    
T  13318866 catggagtatatgaaccgaatttttcatgcttttctggataaatttgtggtggtatttattgatgatattttaatttattccaagactaaagaggagcat 13318965  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  | ||| ||||| || | |||||| |  ||||||||| ||| || ||||| || ||||| ||||| || |||||||| | ||| ||||||||||| |    
T  13318966 gcagaacatctgaagattatgttgcaaattttgaaagagagaaatttgtatgctaaattgtcgaagtgcgagttctggttaagtgaagtgagttttctag 13319065  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    || |  ||||||||||||||| ||||    
T  13319066 gctacgttatttctggtagtggtatt 13319091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 116 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 10385429 - 10385211
Alignment:
Q  116 tacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagc 215  Q
    ||||||||||| || || ||||||| | |||||   |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || |||   || |||||  ||||   ||    
T  10385429 tacatgaatcgaatcttccatgcttttctagataagtttgttgtggtgttcattgatgatatcttgatttattccaagaacgaggaagagcatgcagggc 10385330  T
Q  216 atttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatat 315  Q
    || |||   |||| ||||||||| |||| || || | ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| || || ||    
T  10385329 atctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttgtcaaaatgtgagttctggttaagtgaagtgagctttctgggtcacat 10385230  T
Q  316 tatttctggtagtgatatt 334  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  10385229 tatttctggtagtggtatt 10385211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 10407833 - 10407720
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||   ||  |||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  10407833 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtaatgcctttctgtgttactaatgcgcctggtgtttt 10407734  T
Q  109 tatggaatacatga 122  Q
    |||||| |||||||    
T  10407733 tatggagtacatga 10407720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 63
Target Start/End: Original strand, 12510747 - 12510801
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacga 63  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  12510747 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcatttaggacacgttatggtcattacga 12510801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 66
Target Start/End: Original strand, 8745654 - 8745711
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaata 66  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  8745654 tgaaggatgaggatatgcagaagacgccctttaggacacgatacggtcattacgaata 8745711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 24189169 - 24189112
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaata 66  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  24189169 tgaaggatgaggatatgcagaagactgcctttaggacacgatacggtcattacgaata 24189112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Original strand, 11888621 - 11888701
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgccttt 81  Q
    ||||||| |||| || || |||||| ||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| || | |||||||||    
T  11888621 gattaaagtgaaagacgaggatatgcagaagacagcctttaggacacgttatggacattatgaatattcggtgatgccttt 11888701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 9 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 12270075 - 12269880
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||| || |||||    | ||||||||||  || ||| ||||  || | ||| ||    
T  12270075 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacactatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgttcctgatgtgtt 12269976  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaaga 204  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||||||| | |||   ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || || |||  |||||||||    
T  12269975 tatggagtatatgaaccgaattttccatgcttatcttgataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttgatttattcaaagattgaagaaga 12269880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 12180209 - 12180167
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgtta 51  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  12180209 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgtta 12180167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 50
Target Start/End: Original strand, 14291796 - 14291837
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgtt 50  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  14291796 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgtt 14291837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 146; Significance: 7e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 217451 - 217784
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| |||| || || |||||| |||||||| | ||||| |||||||| |||||||| |||||   || ||||||||||  || ||||||||| ||     
T  217451 gattaaagtgaaagacgaggatatgcagaagacgtcctttagaacacgttatggacattatgaatataaagtgatgcctttcggtgttacaaatgcccca 217550  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| | ||| |||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||    
T  217551 ggtgtgtttatggagtacatgaatcatatttttcatgcgttttttgatcgtttcgtggttgtgatcattgatgatattttgatatactcgaagttcgaag 217650  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||| |||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  || |||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  217651 aagaacatgttgagcatttgaagattgttttgcaagtgctgaaagagaagaagctatatgttaaattgtcaaagtgtgagttctagttgaatgaggtgag 217750  T
Q  301 ttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||    
T  217751 ttttcttggccacgttatttctggtagtggtatt 217784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 138; Significance: 4e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Original strand, 84558 - 84883
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||| ||||| |||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||  || ||| ||||| | | | |||||    
T  84558 tgaaagatgaggatattcagaagacgacctttaggacacgttacggacattacgaatattttgtgatgcctttcggtgttactaatgcgctgagagtatt 84657  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||| |  | || ||  ||    
T  84658 tatggaatatatgaatcgtatttttcatacttatctagatcgttttgttgttgtgtttatagatgatattatgatatactctaagaccaaggaggagcat 84757  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  | |||||||| ||||    
T  84758 gccgagcatttgagaattgttttgcaagtgctgaaagagaagaagttatatgccaagttatcaaagtgcgaattctggttgaacaaagtgagtttccttg 84857  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    | ||||||||||| | ||||| ||||    
T  84858 gtcatattatttcagttagtggtatt 84883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 2 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 268882 - 268558
Alignment:
Q  2 attaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgg 101  Q
    |||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| |  || |||||||||||   || ||||||||||  || ||| || || || |    
T  268882 attaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatgtggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctg 268783  T
Q  102 gtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaaga 201  Q
    |||| || ||||| || ||||| |  ||||| ||||||| | | |||   || || || ||||| || || ||||||||||| || |||||  |||||||    
T  268782 gtgtgttcatggagtatatgaaccagattttccatgcttttctggataaattcgtggtggtgtttatagatgatattttgatttattctaaaactgaaga 268683  T
Q  202 agaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagt 301  Q
     ||| | ||| | ||  ||||| |||| |||||  |  ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| | ||| ||||||    
T  268682 ggaacacgccgaacacctgaagattgtgttgcagattttgaaagagagaaagttgtatgccaagttgtcgaagtgcgagttctggttaagtgaagtgagt 268583  T
Q  302 tttcttggccatattatttctggta 326  Q
    || || |||||| ||||||||||||    
T  268582 ttcctaggccatgttatttctggta 268558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 49)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 132 - 326
Target Start/End: Original strand, 18965599 - 18965793
Alignment:
Q  132 ttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgtttt 231  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| || |  ||||||||||| |||||||    
T  18965599 ttcatgcttatttagatcgctttgttgttttgttcattgatgatattttgatatatgctaagtctgaagaagaacattctgagcatttgaagattgtttt 18965698  T
Q  232 gcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggta 326  Q
     |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18965699 tcaagtgatgaaagagaagaagttatatgctaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagtttccttggccatattatttctggta 18965793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 267
Target Start/End: Original strand, 23085944 - 23086210
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| | || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||  || ||||||||| |||    
T  23085944 gattaaagtaaaagatgaagatatctagaagacggcctttaggacacgttatggacattatgaatattcagtgatgcctttcggtgttacaaatgcgccg 23086043  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||    
T  23086044 ggtgtgtttatggagtacatgaatcgtatttttcatgcgtatttggatcgcttcgtggttgtgttcatcgatgatattttgatatactctaagtatgaag 23086143  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagtt 267  Q
    ||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||| | ||||| |||||    
T  23086144 aagaacatgctgagcatttgaagattgttttgcaagtgctggaggagaagaagctttatgctaagtt 23086210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 18 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 23080560 - 23080244
Alignment:
Q  18 aagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaata 117  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| || ||||| |||||||| |||||   || |||| |||||  || |||||||||||| || || |||||||| ||    
T  23080560 aagatatgcagaagacggattttagaacgcgttatggacattatgaatataaagtgatgtctttcggtgttacaaatgcacctggagtgtttatggagta 23080461  T
Q  118 catgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcat 217  Q
    ||||||||| ||||||||||| | | |||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||  |||||    
T  23080460 catgaatcgcatttttcatgcatttctagatcgtttcgtggttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagtctgaggaagaacatgctgagcat 23080361  T
Q  218 ttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatatta 317  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||| || || ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||    
T  23080360 ttgaagattgttttgcaagtgctgaaagagaagaaactttatgctaaattatcaaagtttgaattctggttgaaagaggtgagtttccttggccatgtta 23080261  T
Q  318 tttctggtagtgatatt 334  Q
    ||| |||||||| ||||    
T  23080260 tttttggtagtggtatt 23080244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 119 - 326
Target Start/End: Original strand, 18196024 - 18196231
Alignment:
Q  119 atgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatt 218  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||| |||||||    
T  18196024 atgaatcgtatttttcatgcgtttttggatcgttttgtggttgtgttcatttatgatattttgatatactccaagtccgaagaagagcatgctaagcatt 18196123  T
Q  219 tgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattat 318  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||| |||||| |||||||| || |||| ||||||||||||| ||||    
T  18196124 tgaagattgttttgcaagtgctgaaagagaagaagctatatgctaaattgtcaaagtatgaattttggttgaaagatgtgaattttcttggccatgttat 18196223  T
Q  319 ttctggta 326  Q
    ||||||||    
T  18196224 ttctggta 18196231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 88 - 334
Target Start/End: Original strand, 25608121 - 25608367
Alignment:
Q  88 tacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatac 187  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| | || |||||||| | ||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||||||||| |||    
T  25608121 tacaaatgcacctggagtatttatggagtacatgaattgcatctttcatgcatttttggatcgattcgtagttgtttttattgatgatattttgatttac 25608220  T
Q  188 tctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggt 287  Q
    || ||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  25608221 tccaagtctgaagaagaagatgctgagcatttgaagattgttttacaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtcaaagtgtgaattctggt 25608320  T
Q  288 tgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  25608321 tgaaagaggtaagttttcttggccatgttatttctggtagtggtatt 25608367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 334
Target Start/End: Original strand, 20634126 - 20634446
Alignment:
Q  14 gatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatgg 113  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| |||||||| || ||   ||  |||||||||  || |||||||||||| || ||||||||||    
T  20634126 gatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggacattatgagtacaaagttatgcctttcggtgttacaaatgcacctggagtatttatgg 20634225  T
Q  114 aatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaa 213  Q
    | ||||||||||| || |||||||| | ||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||  |    
T  20634226 agtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgtttttattgatgatattttgatttactccaagtctaaagaagaacatgctga 20634325  T
Q  214 gcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccat 313  Q
    |||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||    
T  20634326 gcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagctttcttggacat 20634425  T
Q  314 attatttctggtagtgatatt 334  Q
     ||||||||||||||| ||||    
T  20634426 gttatttctggtagtggtatt 20634446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 27 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 18450585 - 18450286
Alignment:
Q  27 agaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcg 126  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| || |||||||||| |  | ||||||||||  || ||| ||||| | ||| |||||||||||||| || || ||    
T  18450585 agaagacgacctttaggacacgttacagaaattacgaatattttgtgatgcctttcggtgttactaatgcgctgggagtatttatggaatatattaaccg 18450486  T
Q  127 tatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagttt 226  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||| |   | || ||| ||| | |||||||||   ||    
T  18450485 tatttttcatacttatctagatcgttttgttgttgtgtttatagatgatattctgatatactctaaattcaaggaggaacatgtcgagcatttgagaatt 18450386  T
Q  227 gttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggta 326  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18450385 gttttgcaagtgctgaaggggaagaagttatatgccaagttatcgaagtgcgaattctggttgaacgaagggagttttcttggtcatattatttctggta 18450286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 88 - 334
Target Start/End: Original strand, 18406204 - 18406450
Alignment:
Q  88 tacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatac 187  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  18406204 tacaaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcgttttgtggttgttttcattgatgatattttgatttac 18406303  T
Q  188 tctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggt 287  Q
    || ||| ||||||||||| ||||  ||||||||||  | |||||||||||| |||||||||| ||  ||||||| || ||||  ||||||||||||||||    
T  18406304 tccaagactgaagaagaacatgctgagcatttgaaactggttttgcaagtgttgaaagagaagaaactatatgctaaattgtttaagtgtgaattctggt 18406403  T
Q  288 tgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    |||| || ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  18406404 tgaaagaagtgagctttcttggacatgttatttctggtagtggtatt 18406450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 22760628 - 22760961
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| | || |||||||||||| | ||||| ||||| || || ||||| |||||||| || ||   ||  |||||||||  || ||||||||||||     
T  22760628 gattaaagtaaaagatgaagatatgcacaagacagctttcagaacgcgttatggacattatgagtataaagttatgcctttcggtgttacaaatgcacct 22760727  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| ||||| || || ||||| || ||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  22760728 ggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgtttttattaatgatattttgatttactccaagtctgaag 22760827  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||  ||||  ||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  22760828 aagagcatgctgagcatttgaagctggttttgtaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgag 22760927  T
Q  301 ttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
     |||||||| ||| |||||| |||||||| ||||    
T  22760928 ctttcttggacatgttatttgtggtagtggtatt 22760961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Original strand, 24293955 - 24294276
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||  |||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||||||||     
T  24293955 gattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgtgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacct 24294054  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  24294055 ggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaag 24294154  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  24294155 aagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgag 24294254  T
Q  301 ttttcttggccatattatttct 322  Q
    |||||| |||||| ||||||||    
T  24294255 ttttctaggccatgttatttct 24294276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 32 - 328
Target Start/End: Original strand, 19487486 - 19487772
Alignment:
Q  32 acggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtattt 131  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||||           
T  19487486 acggcctttaggacacgatatggacattacgaatattcagtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatggagtacatgaat------- 19487578  T
Q  132 ttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgtttt 231  Q
       |||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| || || ||||| || |||||||||||||||||  ||||  ||||||| ||| |||| ||    
T  19487579 ---atgcttatttggatcggtttgtggttgtttttattgatgacatcttgatttattctaagtctgaagaagagcatgcagagcatttaaagattgtgtt 19487675  T
Q  232 gcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagt 328  Q
    ||||||| |||| |  || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19487676 gcaagtgttgaaggtaaagaagttgtatgccaagttgtccaaatgtgaattctggttaagtgaagtaagttttcttggccatattatttctggtagt 19487772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 92 - 325
Target Start/End: Original strand, 22828619 - 22828852
Alignment:
Q  92 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 191  Q
    |||||||| || || |||||||| || ||||||||||| || ||||| | ||| ||||| || || |||| |||||| || ||||||||||| ||||| |    
T  22828619 aatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgtatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgcgttcatcgatgatattttgatttactcca 22828718  T
Q  192 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 291  Q
    || ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  22828719 agactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgagttctggttgaa 22828818  T
Q  292 tgaggtgagttttcttggccatattatttctggt 325  Q
     || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22828819 agaagtgagttttcttggccatgttatttctggt 22828852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 321
Target Start/End: Original strand, 2872976 - 2873296
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||||||||     
T  2872976 gattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacct 2873075  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| ||| |||| || |||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  2873076 ggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttatgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaag 2873175  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||| | ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||    
T  2873176 aagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaggagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattttggttgaaagaagtgag 2873275  T
Q  301 ttttcttggccatattatttc 321  Q
    ||| ||||||||| |||||||    
T  2873276 tttccttggccatgttatttc 2873296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 107 - 326
Target Start/End: Original strand, 16961761 - 16961980
Alignment:
Q  107 tttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaa 206  Q
    |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||     
T  16961761 tttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtggttgttttcattgacgatattttgatttactccaagactgaagaagaac 16961860  T
Q  207 atgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttct 306  Q
    ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  16961861 atgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaagtcatctaagtgtgaattctggttgaaagaggtaagttttct 16961960  T
Q  307 tggccatattatttctggta 326  Q
    ||||||| | ||||||||||    
T  16961961 tggccatgtcatttctggta 16961980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 9 - 328
Target Start/End: Original strand, 14378097 - 14378416
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  14378097 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 14378196  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
     ||||| || ||||| || ||||| ||||||| | | |||   ||||| ||||| || ||||| |||| | |||| || |||||| ||||||| ||  ||    
T  14378197 catggagtatatgaaccgaattttacatgcttttctggataaatttgtggttgtatttattgatgatagtctgatttattctaagactgaagaggagcat 14378296  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  ||||| ||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||| | ||| || ||||||||||    
T  14378297 gcagagcatctgaagattgtattgcaagtcttgaaagagaaaaagttgtatgccaagttgtcgaaatgtgagttttggttaagtgaagtaagttttcttg 14378396  T
Q  309 gccatattatttctggtagt 328  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  14378397 gccacattatttctggtagt 14378416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 9 - 328
Target Start/End: Original strand, 14379647 - 14379966
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  14379647 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 14379746  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
     ||||| || ||||| || ||||| ||||||| | | |||   ||||| ||||| || ||||| |||| | |||| || |||||| ||||||| ||  ||    
T  14379747 catggagtatatgaaccgaattttacatgcttttctggataaatttgtggttgtatttattgatgatagtctgatttattctaagactgaagaggagcat 14379846  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  ||||| ||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||| | ||| || ||||||||||    
T  14379847 gcagagcatctgaagattgtattgcaagtcttgaaagagaaaaagttgtatgccaagttgtcgaaatgtgagttttggttaagtgaagtaagttttcttg 14379946  T
Q  309 gccatattatttctggtagt 328  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  14379947 gccacattatttctggtagt 14379966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 326
Target Start/End: Original strand, 5837392 - 5837717
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || || ||   ||  ||||||||   || ||| ||||||||     
T  5837392 gattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagaccgctttcagaacgcgttatggtcactatgagtacaaagttatgccttttggtgttaccaatgcacct 5837491  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||| |||| || || ||| |||| |    
T  5837492 ggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgctttgtggttgtcttcattgacgacattctgatttattccaagactgagg 5837591  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||| |||   ||||| |||||  ||||||||||||| ||||||| || ||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  5837592 aagaacatgttgagcatctgaagactgttttgcaagtgttgaaagaaaagaagctttatgccaagttgtctaagtgtgagttctggttgaaagaggtaag 5837691  T
Q  301 ttttcttggccatattatttctggta 326  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||    
T  5837692 ttttcttggccacgttatttctggta 5837717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 92 - 321
Target Start/End: Original strand, 28261461 - 28261690
Alignment:
Q  92 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 191  Q
    |||||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  28261461 aatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgacgatattttgatttactcca 28261560  T
Q  192 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 291  Q
    || ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||  | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  28261561 agactgaagaagaacatgcagagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgaattctggttgaa 28261660  T
Q  292 tgaggtgagttttcttggccatattatttc 321  Q
     || |||||||| | ||||||| |||||||    
T  28261661 agaagtgagtttccctggccatgttatttc 28261690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 92 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 28284455 - 28284226
Alignment:
Q  92 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 191  Q
    |||||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  28284455 aatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgacgatattttgatttactcca 28284356  T
Q  192 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 291  Q
    || ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||  | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  28284355 agactgaagaagaacatgcagagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgaattctggttgaa 28284256  T
Q  292 tgaggtgagttttcttggccatattatttc 321  Q
     || |||||||| | ||||||| |||||||    
T  28284255 agaagtgagtttccctggccatgttatttc 28284226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 92 - 321
Target Start/End: Original strand, 28340210 - 28340439
Alignment:
Q  92 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 191  Q
    |||||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  28340210 aatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgacgatattttgatttactcca 28340309  T
Q  192 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 291  Q
    || ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||  | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  28340310 agactgaagaagaacatgcagagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgaattctggttgaa 28340409  T
Q  292 tgaggtgagttttcttggccatattatttc 321  Q
     || |||||||| | ||||||| |||||||    
T  28340410 agaagtgagtttccctggccatgttatttc 28340439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 19455124 - 19454804
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||    | |||| |||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  19455124 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgtctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 19455025  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
     ||||| || ||||| || ||||| ||||| || || |||   ||||| ||||| || ||||| || || ||||| || || ||| || |||||||  ||    
T  19455024 catggagtatatgaaccgaattttccatgcctacttggataaatttgtggttgtatttattgatgacatcttgatttattcaaagactaaagaagagcat 19454925  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  ||||| ||||| | || ||||||||  ||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||    
T  19454924 gcagagcatctgaagatagtattgcaagttttgaaagaaaagaagttgtatgctaagttgtcaaagtgtgagttctggttaagtgaagtgagttttcttg 19454825  T
Q  309 gccatattatttctggtagtg 329  Q
    |||| ||||||| ||||||||    
T  19454824 gccacattatttttggtagtg 19454804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 92 - 326
Target Start/End: Original strand, 16925902 - 16926136
Alignment:
Q  92 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 191  Q
    |||||||| || || ||| |||| || ||||| || || || ||||| | ||| ||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |    
T  16925902 aatgcacctggagtgtttttggagtatatgaagcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtggttgttttcatcgatgatattttgatttactcca 16926001  T
Q  192 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 291  Q
    || ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  16926002 agactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaagttatctaagtgtgaattctggttgaa 16926101  T
Q  292 tgaggtgagttttcttggccatattatttctggta 326  Q
     ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||    
T  16926102 agaggtaagttttcttggccatgtcatttctggta 16926136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 107 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 25114554 - 25114340
Alignment:
Q  107 tttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaa 206  Q
    |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||| ||||||| || ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||     
T  25114554 tttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttttgttcatcgatgatattttgatctactccaagactgaagaagaac 25114455  T
Q  207 atgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttct 306  Q
    ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | |||| ||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25114454 atgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgtcaaattatctaagtgtgaattctggttgaaagaggtgagttttct 25114355  T
Q  307 tggccatattatttc 321  Q
    ||||||| |||||||    
T  25114354 tggccatgttatttc 25114340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 107 - 325
Target Start/End: Original strand, 27564112 - 27564330
Alignment:
Q  107 tttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaa 206  Q
    |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||| ||||| ||| |||||||||||     
T  27564112 tttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttagatcggttcgtggttgtgttcatcgatgaaattttgatttactccaagactgaagaagaac 27564211  T
Q  207 atgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttct 306  Q
    ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || || || |||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  27564212 atgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgaattctggttgaaagaagtaagttttct 27564311  T
Q  307 tggccatattatttctggt 325  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  27564312 tggccatgttatttctggt 27564330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 18796790 - 18796465
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||| || ||| ||||  || ||||| ||    
T  18796790 tgaaggatgaggatatgcagaagactgcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctttcagtgttactaatgtgcctggtgtgtt 18796691  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
     ||||| || |||||  | ||||| ||||| ||| | |||   ||||| ||||| ||||||||  | |||||||| || ||||   ||||||||||  ||    
T  18796690 catggagtatatgaacagaattttccatgcctatctggataaatttgtggttgtattcattgataacattttgatctattctagaactgaagaagagcat 18796591  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  | ||| ||||| |||| ||||||||  |||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||| ||    
T  18796590 gcagaacatctgaagattgtgttgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcgaagtgtgagttctggttaaatgaagtgagttttcatg 18796491  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||    
T  18796490 gccacattatttctggtagtggtatt 18796465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 18963261 - 18963396
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| |||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||  || ||| ||||||||     
T  18963261 gattaaagtgaaagatgacgatatgcagaagacgacttttaggacacgttatggacattacgaatattcagtgatgcctttcggtgttactaatgcacca 18963360  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  18963361 ggtgtatttatggagtacatgaatcatatttttcat 18963396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 27189531 - 27189224
Alignment:
Q  14 gatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatgg 113  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||   ||  |||||||||  ||  || |||||||| || || |||||||    
T  27189531 gatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactacgaatacaaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatgg 27189432  T
Q  114 aatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaa 213  Q
    | || |||||||| || || ||||| | ||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||  |    
T  27189431 agtatatgaatcgcatcttccatgcatttttagatcggttcgtggttgtattcatcgacgatatcttgatttactccaagactgaagaagaacatgcgga 27189332  T
Q  214 gcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccat 313  Q
     ||| ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  27189331 acatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtccaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagtttccttggccat 27189232  T
Q  314 attatttc 321  Q
     |||||||    
T  27189231 gttatttc 27189224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 321
Target Start/End: Original strand, 27259709 - 27260016
Alignment:
Q  14 gatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatgg 113  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||   ||  |||||||||  ||  || |||||||| || || |||||||    
T  27259709 gatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactacgaatacaaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatgg 27259808  T
Q  114 aatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaa 213  Q
    | || |||||||| || || ||||| | ||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||  |    
T  27259809 agtatatgaatcgcatcttccatgcatttttagatcggttcgtggttgtattcatcgacgatatcttgatttactccaagactgaagaagaacatgcgga 27259908  T
Q  214 gcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccat 313  Q
     ||| ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  27259909 acatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtccaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagtttccttggccat 27260008  T
Q  314 attatttc 321  Q
     |||||||    
T  27260009 gttatttc 27260016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 92 - 322
Target Start/End: Original strand, 16380637 - 16380867
Alignment:
Q  92 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 191  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||| | || |||||| ||||| | || |||||||| || |||||||| || ||||||||| | || || |    
T  16380637 aatgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaa 16380736  T
Q  192 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 291  Q
    ||||||| |||||  ||||  ||||||||| | |||| ||||||||  ||||||||||  |||| | |||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  16380737 agtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaa 16380836  T
Q  292 tgaggtgagttttcttggccatattatttct 322  Q
     || |||||||| ||||| ||| | ||||||    
T  16380837 ggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 16380867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 19881398 - 19881073
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||| |||||||| ||| ||||||| || ||||||||||| || || |||||| ||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  19881398 tgaaagatgaagacatgcagaagactgcctttaggacacgatatggtcattacaaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 19881299  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
     ||||| || |||||| | ||||||||||||||  | |||   ||||| |||||||||||||| || |||||||| || || |   |||| |||||  ||    
T  19881298 catggagtatatgaataggatttttcatgcttacctggataaatttgtggttgtgttcattgatgacattttgatctattcgagaactgaggaagagcat 19881199  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  | ||| ||| | |||| ||||||||  |||||||||| ||  | |||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| |||||||||||||    
T  19881198 gcagaacatctgaggattgtattgcaagtattgaaagagaagaaactgtatgccaaattgtcaaagtgcgagttctggttaagtgaagtgagttttcttg 19881099  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||    
T  19881098 gccatattatttctggtagtggtatt 19881073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 25769944 - 25769619
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||| ||||| |||||| |||| | ||| ||||||||||| || |||||||| || ||    | |||| |||||  || ||| ||||| || ||||||||    
T  25769944 tgaatgatgaggatatgcagaaaatggcctttaggacacgatatggacattatgagtataaggtgatgtctttcggtgttactaatgcgcctggtgtatt 25769845  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
    |||||| || ||||| || ||||| |||||||||   |||   ||||| |||||||| ||||| |||||  | || || ||||||| |||||||||  ||    
T  25769844 tatggagtatatgaaccgaattttccatgcttatccggataaatttgtggttgtgtttattgatgatatcctaatttattctaagtatgaagaagagcat 25769745  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  ||||| ||||| |||| ||||||||| ||||| | |  ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| | ||| || ||||||||||    
T  25769744 gcagagcatctgaagattgtgttgcaagtgttgaaataaatgaagttgtatgctaagttgtccaaatgtgaattctggttaagtgaagtaagttttcttg 25769645  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||    
T  25769644 gccacattatttctggtagtggtatt 25769619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 19437102 - 19436777
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||| ||  |||| ||    
T  19437102 tgaaggatgaggatatgcagaagacagcctttaggacacgatatggacattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctagtgtgtt 19437003  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
     ||||| || ||||| |  ||||| ||||| ||| | |||   ||||| |||||||| ||||| || ||| |||| || ||||   ||||||||||  ||    
T  19437002 catggagtatatgaaccaaattttccatgcctatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacattctgatctattctagaactgaagaagagcat 19436903  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  | ||| ||||| |||| |||||| | || ||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || | ||| ||||||||||| |    
T  19436902 gcagaacatctgaagattgtgttgcaaattctaaaagagaaagagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctgcttaagtgaagtgagttttctgg 19436803  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||    
T  19436802 gccacattatttctggtagtggtatt 19436777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 92 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 19866704 - 19866471
Alignment:
Q  92 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 191  Q
    |||||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| ||||| || || || ||||||||||| ||||| |    
T  19866704 aatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgctttgtggttgtttttatcgatgatattttgatttactcca 19866605  T
Q  192 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 291  Q
    || ||||| ||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||||| ||  | || ||| |||| |||||||||||    
T  19866604 agactgaaaaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaactatctaagcgtgagttctggttgaa 19866505  T
Q  292 tgaggtgagttttcttggccatattatttctggt 325  Q
     ||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  19866504 agaggtaagttttcttggccatgttatttctggt 19866471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 104 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 22435874 - 22435653
Alignment:
Q  104 gtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaag 203  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| ||||| || || ||||| || || || |||||||| || ||||| ||| || ||||||    
T  22435874 gtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgtttttatcgatgatattttaatttactccaagactaaagaag 22435775  T
Q  204 aaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttt 303  Q
    || |||   ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||| | || || || |||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  22435774 aacatgttgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatcctaaattatctaagtgtgagttctggttgaaagaggtaagttt 22435675  T
Q  304 tcttggccatattatttctggt 325  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  22435674 tcttggccatgttatttctggt 22435653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 104 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 22444272 - 22444051
Alignment:
Q  104 gtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaag 203  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| ||||| || || ||||| || || || |||||||| || ||||| ||| || ||||||    
T  22444272 gtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgtttttatcgatgatattttaatttactccaagactaaagaag 22444173  T
Q  204 aaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttt 303  Q
    || |||   ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||| | || || || |||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  22444172 aacatgttgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatcctaaattatctaagtgtgagttctggttgaaagaggtaagttt 22444073  T
Q  304 tcttggccatattatttctggt 325  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  22444072 tcttggccatgttatttctggt 22444051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 92 - 322
Target Start/End: Original strand, 16648233 - 16648463
Alignment:
Q  92 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 191  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||| | || |||||| ||||| | || |||||||| || |||||||| || ||||||||| | || || |    
T  16648233 aatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaa 16648332  T
Q  192 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 291  Q
    ||||||| |||||  ||||  ||||||||| | |||| ||||||||  ||||||||||  |||| |  ||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  16648333 agtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgcgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaa 16648432  T
Q  292 tgaggtgagttttcttggccatattatttct 322  Q
     || |||||||| ||||| ||| | ||||||    
T  16648433 ggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 16648463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 21473708 - 21473376
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||| || |||||||| || ||    | |||| ||||| ||| ||| ||||| | |    
T  21473708 gattaaagtgaaggatgaggatatgcagaaaacggcctttaggacacgatatggacattatgagtataaggtgatgtctttcgatgttactaatgcgctg 21473609  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    | ||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||| | |||   ||||| |||||||| ||| | |||||  | || || ||||||  |||||    
T  21473608 g-tgtgtttatggagtatatgaaccgaatttttcatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttatttatgatatcctaatttattctaagaatgaag 21473510  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    | ||  ||||  | ||| ||||| |||| ||||||||| ||||||| |  ||||| |||| ||||||||| || |||||||||||||| | ||| || ||    
T  21473509 aggagcatgcagaacatctgaagattgtgttgcaagtgttgaaagaaaggaagttgtatgtcaagttgtccaaatgtgaattctggttaagtgaagtaag 21473410  T
Q  301 ttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    |||||||||||| | ||||| |||||||| ||||    
T  21473409 ttttcttggccacaatatttttggtagtggtatt 21473376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 24366512 - 24366187
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| ||||  || ||||||||    
T  24366512 tgaaggatgaggatatgcaaaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaatgtgccaggtgtatt 24366413  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
    |||||| |||||||| || ||||| ||||||| | | |||   |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || || |||  ||| || ||  ||    
T  24366412 tatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatattttaatctattccaagaatgaggaggagcat 24366313  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  ||||  |||   |||| ||||||||| |||| || || | ||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| |    
T  24366312 gcagagcacctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgcaaagttgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaagtgagctttctgg 24366213  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    | || |||||||||||||||| ||||    
T  24366212 gtcacattatttctggtagtggtatt 24366187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 74 - 325
Target Start/End: Original strand, 25763474 - 25763725
Alignment:
Q  74 atgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacg 173  Q
    |||||||||  || |||||||||||| ||  | |||||||| || |||||||| || || | ||| | ||| ||||| ||| | ||||| || ||||| |    
T  25763474 atgcctttcggtgttacaaatgcacctggactgtttatggagtatatgaatcgcatcttccttgcatttttggatcgctttatggttgtctttattgatg 25763573  T
Q  174 atattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaa 273  Q
    | ||||| || ||||| ||| |||||| |||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||| |||  | ||||| || || || ||    
T  25763574 acattttaatttactccaagactgaaggagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagataaaaatgtatgctaaattatctaa 25763673  T
Q  274 gtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggt 325  Q
     ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||||    
T  25763674 ttgtgaattctggttgaaagaggtaagttttcttggccatgtcatttctggt 25763725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 2 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 15461443 - 15461119
Alignment:
Q  2 attaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgg 101  Q
    |||||| |||| || ||||||||| | |||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||   || ||||||||||  || ||| || || || |    
T  15461443 attaaagtgaaagacgaagatatgcaaaagacggcctttagaacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctg 15461344  T
Q  102 gtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaaga 201  Q
    |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||| | | |||||   ||||| || ||||| || || |||||| |||| || |||||  |||||||    
T  15461343 gtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcctttctagataaatttgtggtggtgtttatagatgatattctgatttattctaaaactgaaga 15461244  T
Q  202 agaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagt 301  Q
     ||| | ||| | || |||||| |||| |||||  |  ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| | ||| ||||||    
T  15461243 ggaacacgccgaacacttgaagattgtgttgcagattttgaaagagagaaagttgtatgccaagttgtcgaagtgcgatttctggttaagtgaagtgagt 15461144  T
Q  302 tttcttggccatattatttctggta 326  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||    
T  15461143 tttctaggccacgttatttctggta 15461119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 92 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 23998265 - 23998035
Alignment:
Q  92 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 191  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||| | || |||||| ||||| | || |||||||| || |||||||| || ||||||||| | || |  |    
T  23998265 aatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattgaa 23998166  T
Q  192 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 291  Q
    |||| || |||||  ||||  | ||||||| | |||| ||| ||||  ||||||||||  |||||| |||||||||||| |||||||| || |||||| |    
T  23998165 agtccgaggaagagcatgctgaacatttgaggattgtgttgtaagtcttgaaagagaaccagttatgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgga 23998066  T
Q  292 tgaggtgagttttcttggccatattatttct 322  Q
     || |||||||| ||||| ||| | ||||||    
T  23998065 ggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 23998035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Original strand, 10467030 - 10467355
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| ||  | |||||||||||   || ||||||||||  || ||| || || || ||||| ||    
T  10467030 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgataaagtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctggtgtgtt 10467129  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
     ||||| || ||||| || ||||| ||||||| | | |||   |||||||| ||||| ||||| |||||| | || || || |||  |||||| ||  ||    
T  10467130 catggagtatatgaaccgaattttccatgcttttatggataagtttgttgtggtgtttattgatgatattctaatctattccaagaatgaagaggagcat 10467229  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  ||||| |||   |||| ||||||||  ||||||| || | ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |  || ||||||||||| |    
T  10467230 gcagagcatctgagaattgtattgcaagttttgaaagaaaagaggttgtatgcaaagttgtcaaaatgtgagttctggttaagcgaagtgagttttctgg 10467329  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    | || |||||||||| ||||| ||||    
T  10467330 gtcacattatttctgatagtggtatt 10467355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 225 - 334
Target Start/End: Original strand, 34643983 - 34644092
Alignment:
Q  225 ttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctgg 324  Q
    |||| ||||||||  |||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  34643983 ttgtgttgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaagtaagtttccttggccatattatttctgg 34644082  T
Q  325 tagtgatatt 334  Q
     |||| ||||    
T  34644083 aagtggtatt 34644092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 140
Target Start/End: Original strand, 28280994 - 28281125
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||   || ||||||||||  || ||| || || |||||||| ||    
T  28280994 tgaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgccgggtgtgtt 28281093  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgctt 140  Q
     ||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  28281094 catggagtatatgaatcgaatttttcatgctt 28281125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 92 - 322
Target Start/End: Original strand, 1647078 - 1647308
Alignment:
Q  92 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 191  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| |||||| | || |||||| ||||| | || |||||||| || |||||||| || || |||||| | || || |    
T  1647078 aatgcgccaggtgtctttatggaatatatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgacattttggtgtattcga 1647177  T
Q  192 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 291  Q
    ||| ||| |||||  ||||  ||||||||| | |||| ||||||||  ||||||| ||   ||| | |||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  1647178 agtttgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagataaccggttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaa 1647277  T
Q  292 tgaggtgagttttcttggccatattatttct 322  Q
     || |||||||| ||||| ||| | ||||||    
T  1647278 ggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 1647308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Original strand, 21568172 - 21568497
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| || |||||||||||   || |||| |||||  || ||| || || || ||||| ||    
T  21568172 tgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacactttatggtcattacgaatacaaagtgatgtctttcggtgttactaacgcgcctggtgtgtt 21568271  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
     ||||| || ||||| || ||||||||||||| | | |||   ||| | ||||| || ||||| |||||| |||| || |||||| | ||||| ||  ||    
T  21568272 catggagtatatgaaccgaatttttcatgcttttctggataaatttatggttgtatttattgatgatattctgatttattctaagaccgaagaggagcat 21568371  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    |   | ||| ||| | |||  ||  | ||  ||||||| || ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||| | | ||| || |||||||| |    
T  21568372 gtagaacatctgaggattgaattataggttttgaaagaaaagaagttgtatgctaagttgtcgaaatgtgaattctggctaattgaagtaagttttctcg 21568471  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||    
T  21568472 gccacattatttctggtagtggtatt 21568497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 18183540 - 18183663
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||| |||||||| |||||   || ||||||||||  || ||||||||| ||     
T  18183540 gattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacgtcttttagcacgcgttatggacattatgaatataaagtgatgcctttcggtgttacaaatgcgcct 18183639  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaat 124  Q
    ||||| |||||||  |||||||||    
T  18183640 ggtgtgtttatggtgtacatgaat 18183663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 9 - 66
Target Start/End: Original strand, 24516589 - 24516646
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaata 66  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  24516589 tgaaggatgaagatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcattacgaata 24516646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 326
Target Start/End: Original strand, 5295573 - 5295704
Alignment:
Q  195 ctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatga 294  Q
    ||||||||||  ||||  ||||| ||||  |||| ||||||||| ||||||| || | ||| |||||||||||||| || || |  |||||||| | |||    
T  5295573 ctgaagaagagcatgcagagcatctgaaaattgtgttgcaagtgttgaaagaaaagaggttgtatgccaagttgtccaaatgcgtgttctggttaagtga 5295672  T
Q  295 ggtgagttttcttggccatattatttctggta 326  Q
     || |||||||||||||| |||||||||||||    
T  5295673 agtaagttttcttggccacattatttctggta 5295704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1602 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold1602
Description:

Target: scaffold1602; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 98 - 431
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||||||| ||  |||| |||||||| || ||    | |||||| |||  || ||||||||||||     
T  98 gattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagcttttagaacgtgttatggacattatgagtataacgtgatgccgttcggtgttacaaatgcacct 197  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||| || ||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||| |||| |    
T  198 ggtgtgttgatggagtacatgaatcgcatttttcatgcatttttggatcgtttcgtggttgttttcattgatgacattttgatttactccaagactgagg 297  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||| ||||  |||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  298 aagaacatgctgagcatttgaagactgtgttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 397  T
Q  301 ttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  398 ttttcttggccatgttatttctggtagtggtatt 431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 29 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 1244 - 939
Alignment:
Q  29 aagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgta 128  Q
    ||||| || ||||||||||||||| |||||||| |||| || | ||||||||||  || ||| || || ||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  1244 aagacagcctttaggacacgttacagacattacaaatattcggtgatgcctttcggtgttactaacgcgccgggagtgtttatggaatatatgaatcgta 1145  T
Q  129 tttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgt 228  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||| | ||||| ||| ||||  |||||||||   ||||    
T  1144 tttttcatgcttatttggatcagtttgttgttgtgtttatagatgatattatgatatactctaagaccgaagaggaacatgcggagcatttgagaattgt 1045  T
Q  229 tttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagt 328  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1044 tttgcaagtactgaaggagaagaagttatatgccaaattatcgaagtgtgaattctggttgaacgaagtgacttttcttggccatatcatttctggtagt 945  T
Q  329 gatatt 334  Q
    | ||||    
T  944 ggtatt 939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 201499 - 201832
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| | || |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||  || ||| ||  | |||    
T  201499 gattaaagtaaaagatgaagatatgcagaaaacggcctttaggacacgatatggacattacgaatattcagtgatgcctttcggtgttactaacacgccg 201598  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  201599 ggtgtgtttatggagtacatgaatagaattttccatgcttatttggatcggtttgtggttgtgtttattgatgatattttgatatactctaagactgaag 201698  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||| ||||  | ||||||||| |||| ||||||||| |||| || || ||| | |||||||| | ||| || |||||||||||||| | ||| || |     
T  201699 aagaacatgcagaacatttgaaggttgtgttgcaagtgttgaaggaaaagaagctgtatgccaaatggtccaaatgtgaattctggttaagtgaagtaaa 201798  T
Q  301 ttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  201799 ttttcttggccatattatttctggtagtggtatt 201832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 324971 - 324646
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  324971 tgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 324872  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
     ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||| | |||   || || ||||| || ||||| || ||| |||| || || | | ||||||||||  ||    
T  324871 catggagtatatgaaccgaattttccatgcctatctggataaattcgtggttgtatttattgatgacattctgatctattcaaggactgaagaagagcat 324772  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    |   | ||| ||||| |||| |||||| |  |||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||    
T  324771 gtagaacatctgaagattgtattgcaaattttgaaagagaaaaagttgtatgctaagtcgtcgaagtgtgaattctggttaagtgaagtaagttttcttg 324672  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||    
T  324671 gccacattatttctggtagtggtatt 324646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 2 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 3855 - 3533
Alignment:
Q  2 attaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgg 101  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||| ||||| || |||||   || ||||||||||  || |||||||||||| |    
T  3855 attaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagcttttagaacgcgttatggacactatgaatataaagtgatgcctttcggtgttacaaatgcacctg 3756  T
Q  102 gtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaaga 201  Q
     ||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||| | ||| |||||||| || ||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||| |||| ||    
T  3755 ctgtgtttatggagtacgtgaatcgcatttttcatgcatttttggatcgtttcgtggttgttttcattgatgacattttgatttactccaagactgagga 3656  T
Q  202 agaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagt 301  Q
    |||| ||||  |||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  3655 agaacatgctgagcatttgaagactgttttggaagtgttgaaagagaaaaagttttatgctaaattgtcaaagtgtgaattatggttgaaagaggtgagt 3556  T
Q  302 tttcttggccatattatttctgg 324  Q
    |||||| | ||| ||||||||||    
T  3555 tttcttagacatgttatttctgg 3533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 20 - 326
Target Start/End: Original strand, 16028 - 16333
Alignment:
Q  20 gatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaataca 119  Q
    |||||| |||||| ||||||||| | |||||| |||||||| || || |||| |||||||||   || |||||| || || ||||| |||||| | ||||    
T  16028 gatatgcagaagatggcttttagaaaacgttatggacattatgagtattcagtgatgcctttgggtgttacaaacgcgccaggtgtgtttatgtagtaca 16127  T
Q  120 tgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcattt 219  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| || ||| | ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||  |||||||    
T  16128 tgaatcgcatttttcatgcgtatctagatcgtttcgtggttatattcatcgatgatattttgatatactctaagactgaagaggaatatgctgagcattt 16227  T
Q  220 gaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatt 319  Q
    |||| || ||||||||||| | || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||    
T  16228 gaagatt-ttttgcaagtgttcaaggagaagaagttatatgctaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtaagttttcttgaccgtgttatt 16326  T
Q  320 tctggta 326  Q
    |||||||    
T  16327 tctggta 16333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 126; Significance: 6e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 8295 - 7962
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| ||||||| | ||| || || ||||| ||| |||| || ||    | |||||| |||  || ||||||||||||     
T  8295 gattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagttttcagaacgcgttatggagattatgagtataaggtgatgccgttcggtgttacaaatgcacct 8196  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  8195 ggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcgttttgtggttgttttcattgatgatattttgatttactccatgtctgaag 8096  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  8095 aagaacatgctaagcatttgaagctagttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgag 7996  T
Q  301 ttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
     |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  7995 ctttcttggacatgttatttctggtagtggtatt 7962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 126; Significance: 6e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 103508 - 103175
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| |||||| || |||||| || ||||| ||||| || || ||   || ||||||||||  || | ||||||| ||     
T  103508 gattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagatggattttagaacgcgttatggacactatgagtataaagtgatgcctttcggtgttgcaaatgcgcca 103409  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    ||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||| || || || ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  103408 ggtgtgtttatggagtgcatgaatcgcatttttcatgcatttttggatcgtttcgtggtagtattcatcgatgatattttgatttactccaagtctgagg 103309  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||| ||||| | |||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  103308 aagaacatgccgaacatttgaagactgttttgcaagtgctgaaagagaagaagctttatgctaaattatcaaagtgtgaattctgattgaaagaggtgag 103209  T
Q  301 ttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  103208 ttttcttggccatgttatttctggtagtggtatt 103175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 27 - 334
Target Start/End: Original strand, 42164 - 42471
Alignment:
Q  27 agaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcg 126  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| || | ||||||||||  || ||| || || |  || || ||||||||||| |||||||     
T  42164 agaagacggcctttaggacacattacgaacattacgaatattcggtgatgcctttcggtgttactaacgcgcaaggagtgtttatggaatatatgaatca 42263  T
Q  127 tatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagttt 226  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| || || |||||| |||||||||| ||| | || || ||| ||||| |||||||||  |||    
T  42264 tatttttcatgcttatttggatcgatttgtttttgtgtttatagatgatattctgatatactccaagaccgaggaggaacatgccgagcatttgagattt 42363  T
Q  227 gttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggta 326  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  || || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  42364 gttttgcaagtgctgaaggagaagaagttatatgccagtttatcgaagtgcgaattctggttgaacgaagtgagttttcttggtcatattatttccggta 42463  T
Q  327 gtgatatt 334  Q
    ||| ||||    
T  42464 gtggtatt 42471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 5016 - 4691
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||| |||||| ||||||| ||  | || |||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  5016 tgaaggatgaggatatgccgaagacggcctttaggtcacgttatggttactatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 4917  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
     ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||  | |||   || || |||||||| ||||| || ||| |||| || |||||| ||||||||||  ||    
T  4916 catggagtatatgaaccgaattttccatgcctacctggataaattcgtagttgtgtttattgatgacattctgatttattctaagactgaagaagagcat 4817  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  | ||| ||||| |||| || |||||  ||||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| | ||| || ||||||||||    
T  4816 gcagaacatctgaagattgtattacaagtattgaaagaaaagaagttgtatgctaagttgtcgaattgtgagttctggttaagtgaagtcagttttcttg 4717  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||    
T  4716 gccacattatttctggtagtggtatt 4691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 160 - 329
Target Start/End: Original strand, 115171 - 115340
Alignment:
Q  160 tgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatat 259  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  115171 tgtgttcatcgatgatattttgatatactctaagtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagattgttttgcaagtgctgaaggagaagtagttatat 115270  T
Q  260 gccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtg 329  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  115271 gccaagttgtcaaagtgtgaattttggttgaaagaggtgagttttcttggccatgttatttctggtagtg 115340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 115069 - 115163
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 95  Q
    ||||||| |||| || || |||||  |||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| | || ||||||||||  || ||||||||    
T  115069 gattaaagtgaaagacgaggatatccagaagatggcctttaggacacgttatggacattacgaatattgagtgatgcctttcggtgttacaaatg 115163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 3)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 87035 - 86711
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||| ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||   ||||||||||  || ||| || || || || || ||    
T  87035 tgaaagatgaggatattcagaagacggcctttaggacacgttacggacattacaaatattcgatgatgcctttcggtgttactaacgcccctggagtgtt 86936  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||| || || || ||| | |||||||||||| | || || ||| ||    
T  86935 tatggaatatatgaatcatatttttcatgcttatttgaatcgatttgttgttatgtttatagatgagattctaatatactctaagaccgaggaggaacat 86836  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||| ||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||    
T  86835 gccgagcattt-aagaatgttttgcaagtgctgaaggagaataagttatatgcctagttatcgaagtgcgaattctggttgaacgaagtaagttttcttg 86737  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||    
T  86736 gccatattatttctggtagtggtatt 86711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 2 - 334
Target Start/End: Original strand, 2537 - 2869
Alignment:
Q  2 attaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgg 101  Q
    |||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||| || ||   || ||||||||    || |||||| || |  |    
T  2537 attaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacggcttttagaacgcgttatggacattatgagtataaagtgatgccttctggtgttacaaacgcgcttg 2636  T
Q  102 gtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaaga 201  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||    
T  2637 gtgtgtttatggagtacatgaatcgcatttttcatgcatttttggatcgtttcgtggttgtattcattgatgatattttgatttactccaagtctgagga 2736  T
Q  202 agaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagt 301  Q
    |||| ||||  |||||||||||  |  |||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  2737 agaacatgctgagcatttgaagactagtttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatcaaagtgtgaattctggttgaaagagatgagt 2836  T
Q  302 tttcttggccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  2837 tttcttggccatgttatttctagtagtggtatt 2869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 104 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 151282 - 151052
Alignment:
Q  104 gtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaag 203  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| ||||| || || ||||| || || ||  ||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  151282 gtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgtttttatcgataatattttaatttactccaagtctgaagaag 151183  T
Q  204 aaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttt 303  Q
    || ||||  ||||||||||| | || ||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||    
T  151182 aacatgctgagcatttgaagctggtgttgcaagtgttgaaagagaataagctttatgcgaaattgtctaagtgcgaattctggttgaaagaagtgagctt 151083  T
Q  304 tcttggccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    ||| || ||| | ||||||||||||| ||||    
T  151082 tctaggacatgtaatttctggtagtggtatt 151052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 121; Significance: 6e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 329
Target Start/End: Original strand, 7118 - 7446
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| |||| |||| ||||||| |||||||  ||||||| || ||||| |||||||| || ||   || |||| | |||  || ||||||||||||     
T  7118 gattaaagtgaaagatggagatatgcagaagacaacttttagaacgcgttatggacattatgagtataaagtgatgtcgttcggtgttacaaatgcacct 7217  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| ||||||||  | ||||| ||||| || || |||||| | ||||| ||| ||||||    
T  7218 ggtgtgtttatggagtacatgaatcgaatctttcatgcatttttggatcgtttcatggttgtattcatcgatgacattttggtttactccaagactgaag 7317  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||| ||||  |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7318 aagaacatgctgagcatttgaagactgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 7417  T
Q  301 ttttcttggccatattatttctggtagtg 329  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7418 ttttcttggccatgttatttctggtagtg 7446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270 (Bit Score: 118; Significance: 4e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0270
Description:

Target: scaffold0270; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 6146 - 5825
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| |||| ||| | |||||| |||||||| ||||||| |  ||||| |||||||| |||||   || |||| |||||  || ||||||||| ||     
T  6146 gattaaagtgaaagatcaggatatgcagaagacgacttttagaatgcgttatggacattatgaatataaagtgatgtctttcggtgttacaaatgcgcca 6047  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || | ||| ||||| || || ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  6046 ggtgtgtttatggaatacatgaatcgtattattcaagcattttttgatcgcttcgtggttgtgttcatcgatgatattttgatatactcgaagtccgaag 5947  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||| ||||  ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||| ||  ||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||    
T  5946 aagaacatgctgagcatttgaagattgttttacaagtgttgaaagagaagaagctatatgctaaactgttaaagtgtaaattctggttgaaagaggtaag 5847  T
Q  301 ttttcttggccatattatttct 322  Q
    ||||||||||||  ||||||||    
T  5846 ttttcttggccacgttatttct 5825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 13276 - 12955
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| |||| ||| | |||||| |||||||| ||||||| |  ||||| |||||||| |||||   || |||| |||||  || ||||||||| ||     
T  13276 gattaaagtgaaagatcaggatatgcagaagacgacttttagaatgcgttatggacattatgaatataaagtgatgtctttcggtgttacaaatgcgcca 13177  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || | ||| ||||| || || ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  13176 ggtgtgtttatggaatacatgaatcgtattattcaagcattttttgatcgcttcgtggttgtgttcatcgatgatattttgatatactcgaagtccgaag 13077  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||| ||||  ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||| ||  ||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||    
T  13076 aagaacatgctgagcatttgaagattgttttacaagtgttgaaagagaagaagctatatgctaaactgttaaagtgtaaattctggttgaaagaggtaag 12977  T
Q  301 ttttcttggccatattatttct 322  Q
    ||||||||||||  ||||||||    
T  12976 ttttcttggccacgttatttct 12955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2004 (Bit Score: 116; Significance: 6e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold2004
Description:

Target: scaffold2004; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Original strand, 840 - 1163
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||||||| || || || || || || |||||   || ||||||||||  || ||||||||||||     
T  840 gattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagcttttagaacgcggtatggtcactatgaatataaagtgatgcctttcggtgttacaaatgcacct 939  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    || || |||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| ||||  ||||| ||||| ||||| || | ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  940 ggagtgtttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcagtttgtggttgttttcatagatggtattttgatttactccaagtctgaag 1039  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||| ||||  ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || || || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1040 aagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattatctaagtgtgaattctggttgaaagaggtgag 1139  T
Q  301 ttttcttggccatattatttctgg 324  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||    
T  1140 ttttcttggacatgttatttctgg 1163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 114; Significance: 9e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 3707 - 3374
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||| || || |  || |||||||| || ||   ||  |||||||||  || ||| ||| ||||     
T  3707 gattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcagtatggacattatgagtataaagttatgcctttcggtgttactaattcacct 3608  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  3607 ggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcgttttgtggttgttttcattgatgatattttgatttactccaactctgaag 3508  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||| ||||  ||||||||||| | ||||||||| || |||||||||| ||  | ||||| || || || |||||||||||||||||||| || |||||    
T  3507 aagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaattgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgag 3408  T
Q  301 ttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  3407 ttttcttggccatgttatttctggtagtggtatt 3374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 114; Significance: 9e-58; HSPs: 4)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 56030 - 55697
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| |||||||  ||||||| || || || |||||||| || ||   || ||||||||||  || ||||||||| ||     
T  56030 gattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaacttttagaacgcgatatggacattatgagtataaagtgatgcctttcggtgttacaaatgcccct 55931  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    || || |||||||| ||||||||||  ||||||||||| | ||| |||||||| || ||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||| |||| |    
T  55930 ggagtgtttatggagtacatgaatcacatttttcatgcattttttgatcgtttcgtggttgttttcattgatgacattttgatttactccaagactgagg 55831  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||| |||   |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  55830 aagaacatgttgagcatttgaagactgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatcaaagtgtgaattctggttgaaagaggtgag 55731  T
Q  301 ttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  55730 ttttcttggacatgttatttctggtagtggtatt 55697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 40907 - 40574
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||| ||||||| |||||||| |  || || |||||||| || ||   || ||||||||||  || ||||||||||||     
T  40907 gattaaagtgaaagataaagatatgcagaagacagcttttagaatgcgatatggacattatgagtataaagtgatgcctttcggtgttacaaatgcacct 40808  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||| || ||| | |||||||| || ||||| || ||||| ||| | || |    
T  40807 ggagtatttatggagtacatgaatcgcatttttcatgcatttttggatcgtttcgtggtttttttcattgatgacattttaatttactccaagaccgagg 40708  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||  ||||  |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || || || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40707 aagatcatgctgagcatttgaagactgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgaattctggttgaaagaggtgag 40608  T
Q  301 ttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||    
T  40607 ttttcttggccatgttatttatggtagtggtatt 40574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 74627 - 74294
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||| ||||||| |||||||| |  || || |||||||| || ||   || ||||||||||  || ||||||||||||     
T  74627 gattaaagtgaaagataaagatatgcagaagacagcttttagaatgcgatatggacattatgagtataaagtgatgcctttcggtgttacaaatgcacct 74528  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||| || ||| | |||||||| || ||||| || ||||| ||| | || |    
T  74527 ggagtatttatggagtacatgaatcgcatttttcatgcatttttggatcgtttcgtggtttttttcattgatgacattttaatttactccaagaccgagg 74428  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||  ||||  |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || || || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  74427 aagatcatgctgagcatttgaagactgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgaattctggttgaaagaggtgag 74328  T
Q  301 ttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||    
T  74327 ttttcttggccatgttatttatggtagtggtatt 74294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 92 - 322
Target Start/End: Original strand, 8948 - 9178
Alignment:
Q  92 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 191  Q
    |||||||| ||||| ||||||| |||||||||| | || |||||| ||||| | |||||||||||  | |||||||| || ||||||||| | || || |    
T  8948 aatgcaccaggtgtctttatgggatacatgaatagaatatttcatccttatctggatcgttttgtgatggtgttcatagatgatattttggtgtattcaa 9047  T
Q  192 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 291  Q
    ||||||| |||||  ||||  ||||||||| | |||| ||||||||  ||||||||||  |||||| ||  ||||| || |||||||| || ||||||||    
T  9048 agtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtattgaaagagaactagttatgtgttaagttatctaagtgtgagttttggttgaa 9147  T
Q  292 tgaggtgagttttcttggccatattatttct 322  Q
     || |||||||| ||||| ||| | ||||||    
T  9148 ggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 9178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 114; Significance: 9e-58; HSPs: 40)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 50618498 - 50618831
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| |||||||  ||||||| || || || |||||||| || ||   || ||||||||||  || ||||||||| ||     
T  50618498 gattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaacttttagaacgcgatatggacattatgagtataaagtgatgcctttcggtgttacaaatgcccct 50618597  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    || || |||||||| ||||||||||  ||||||||||| | ||| |||||||| || ||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||| |||| |    
T  50618598 ggagtgtttatggagtacatgaatcacatttttcatgcattttttgatcgtttcgtggttgttttcattgatgacattttgatttactccaagactgagg 50618697  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||| |||   |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  50618698 aagaacatgttgagcatttgaagactgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatcaaagtgtgaattctggttgaaagaggtgag 50618797  T
Q  301 ttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  50618798 ttttcttggacatgttatttctggtagtggtatt 50618831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 21751199 - 21750876
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| || || |||||||| || ||   ||  ||||||||   || ||| ||||| |      
T  21751199 gattaaagtgaaagatgaagatatgtagaagacaacttttaggacgcggtatggacattatgagtataaagttatgccttttggtgttactaatgctctt 21751100  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||    
T  21751099 ggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcgtttcgtggttgttttcattgatgatattttaatttactccaagtctgaag 21751000  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||| | ||||| || ||||| ||||||||||||||||| || || || |     
T  21750999 aagaacatgctgagcatttgaagttggttttgcaagtgttgaaaaagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttaaaagaagtaat 21750900  T
Q  301 ttttcttggccatattatttctgg 324  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||    
T  21750899 ttttcttggacatgttatttctgg 21750876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 89 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 20140254 - 20140009
Alignment:
Q  89 acaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatact 188  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| ||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  20140254 acaaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcgttttttggttgttttcattgatgatattttgatttact 20140155  T
Q  189 ctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggtt 288  Q
    | ||| ||||||||||| ||||  | || |||||| |||||||||||||| ||||||| || ||| | ||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  20140154 ccaagactgaagaagaacatgctgatcacttgaagattgttttgcaagtgttgaaagaaaagaagctctatgctaaattgtctaagtgtgaattctggtt 20140055  T
Q  289 gaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    |||  | ||||| |||||||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  20140054 gaaaaaagtgagctttcttggccatgttatttctcgtagtggtatt 20140009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 17 - 322
Target Start/End: Original strand, 51331609 - 51331914
Alignment:
Q  17 gaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaat 116  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || |||||||| || || |||||||| |    
T  51331609 gaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagt 51331708  T
Q  117 acatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagca 216  Q
    | |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||  ||||    
T  51331709 atatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgcggagca 51331808  T
Q  217 tttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatatt 316  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||    
T  51331809 tctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagttttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgtt 51331908  T
Q  317 atttct 322  Q
    ||||||    
T  51331909 atttct 51331914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 74 - 334
Target Start/End: Original strand, 430289 - 430549
Alignment:
Q  74 atgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacg 173  Q
    |||||||||  || ||| |||||||| || ||||||||||| ||||||| ||| || |||||||| | ||| ||||| || || ||||| |||||||| |    
T  430289 atgcctttcggtgttacgaatgcacctggagtatttatggagtacatgattcgcatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgttttcattgatg 430388  T
Q  174 atattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaa 273  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || || || ||    
T  430389 atattttgatttactccaagtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattatctaa 430488  T
Q  274 gtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    ||||||||||||||| || || ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  430489 gtgtgaattctggttaaaagaagtgagctttcttgggcatgttatttctggtagtggtatt 430549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 321
Target Start/End: Original strand, 33389129 - 33389449
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||||||||     
T  33389129 gattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacct 33389228  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  33389229 ggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaag 33389328  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  33389329 aagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgag 33389428  T
Q  301 ttttcttggccatattatttc 321  Q
    |||||| |||||| |||||||    
T  33389429 ttttctaggccatgttatttc 33389449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 22360344 - 22360677
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| | || |||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| |||||||| || ||   ||  |||||||||  || ||||||||||||     
T  22360344 gattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggacattatgagtacaaagttatgcctttcggtgttacaaatgcacct 22360443  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
     | ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||  ||||| || || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  22360444 tgagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcattttaggatcggttcgtcgttgtttttattgatgatattttgatttactccaagtctgaag 22360543  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    |||||  |||  ||||||||||  | |||||||| ||| |||||||||| | | | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  22360544 aagaacctgctgagcatttgaaactggttttgcaggtgttgaaagagaagatgatttatgcgaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtgag 22360643  T
Q  301 ttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
     | |||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  22360644 ctatcttggacatgttatttctggtagtggtatt 22360677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 21832561 - 21832237
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||| |  || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || |||||||      
T  21832561 gattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcaaaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacat 21832462  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  21832461 ggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaag 21832362  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  21832361 aagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgag 21832262  T
Q  301 ttttcttggccatattatttctggt 325  Q
    |||||| |||||| |||||||||||    
T  21832261 ttttctaggccatgttatttctggt 21832237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 21839209 - 21838885
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| |||||||  |||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||||||||     
T  21839209 gattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaactttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacct 21839110  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  21839109 ggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgatgatattttgatttactccaagactgaag 21839010  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  21839009 aagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgag 21838910  T
Q  301 ttttcttggccatattatttctggt 325  Q
    |||||| |||||| |||||||||||    
T  21838909 ttttctaggccatgttatttctggt 21838885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Original strand, 21862473 - 21862792
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||||||| || || || | |||||| || ||   ||  |||||||||  || ||||||||||||     
T  21862473 gattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagcttttagaacgcggtatgcacattatgagtataaagttatgcctttcggtgttacaaatgcacct 21862572  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
     |||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||| | ||| || ||||| || ||||| || ||||| || ||||| || ||||| ||| |||| |    
T  21862573 agtgtgtttatggagcacatgaatcgcatttttcatgcatttttggaccgtttcgtggttgtttttattgatgacattttaatttactccaagactgagg 21862672  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||| ||||  ||||||||||| | |||||||||||| | |||||||| ||| | ||||| || || || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21862673 aagaacatgctgagcatttgaagatggttttgcaagtgttcaaagagaagaagctttatgctaaattatctaagtgtgaattctggttgaaagaggtgag 21862772  T
Q  301 ttttcttggccatattattt 320  Q
    ||||||||| ||| ||||||    
T  21862773 ttttcttggacatgttattt 21862792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 17043115 - 17043439
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| |||||||  |||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||||||||     
T  17043115 gattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacatctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacct 17043214  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||| || |||    
T  17043215 ggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcctttttggatcggttcgttgttgtgtttatcgatgatattttgatttactccaagactaaag 17043314  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||  |||||||||| ||  | ||||| || |||||||||||||||||||||||||| || || ||    
T  17043315 aagaacatgctgagcatatgaagattgtcttgcaagtattgaaagagaagaaactttatgctaaattgtcaaagtgtgaattctggttgaaagaagtaag 17043414  T
Q  301 ttttcttggccatattatttctggt 325  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    
T  17043415 ttttcttggccatgttatttctggt 17043439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Original strand, 20834008 - 20834333
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||    | |||||||||   || ||| ||||| |  ||||| ||    
T  20834008 tgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttaggtgttactaatgcgcgtggtgtgtt 20834107  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
     ||||| || ||||| || ||||| ||||||||  | |||   || || |||||||| ||||| |||||| |||| || || ||| ||||||||||| ||    
T  20834108 catggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctggataaattcgtggttgtgtttattgatgatattctgatttattcaaagactgaagaagaacat 20834207  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  | ||||||||| |||| |||||| |  |||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||   ||| | |||||||||||    
T  20834208 gcagaacatttgaagattgtgttgcaaattttgaaagagaaaaggttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggttatgtgaagcgagttttcttg 20834307  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||    
T  20834308 gccacattatttctggtagtggtatt 20834333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 92 - 321
Target Start/End: Original strand, 16348787 - 16349016
Alignment:
Q  92 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 191  Q
    |||||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  16348787 aatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgacgatattttgatttactcca 16348886  T
Q  192 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 291  Q
    || ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  16348887 agactgaagaagaacatgcagagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaa 16348986  T
Q  292 tgaggtgagttttcttggccatattatttc 321  Q
     || ||||||||||| || ||| |||||||    
T  16348987 agaagtgagttttctaggtcatgttatttc 16349016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 92 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 19108536 - 19108303
Alignment:
Q  92 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 191  Q
    |||||||| || || |||||||| || |||||||| || || || || | ||| ||||| || || |||||||| || || ||||||||||| |||||||    
T  19108536 aatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccacgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttatcgatgatattttgatttactcta 19108437  T
Q  192 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 291  Q
    || ||||| ||||| ||||  ||||| ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||  | |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  19108436 agactgaaaaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttccaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgagttctggttgaa 19108337  T
Q  292 tgaggtgagttttcttggccatattatttctggt 325  Q
     || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19108336 agaagtgagttttcttggccatgttatttctggt 19108303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Original strand, 21743660 - 21743985
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || || || |||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  21743660 tgaagaatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcactatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 21743759  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
    |||||| || |||||  | ||||| ||||||||| | |||   ||||| |||||||| |||||  | || || || || |||||| ||||||||||  ||    
T  21743760 tatggagtatatgaacagaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatcacatcttaatttattctaagactgaagaagagcat 21743859  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  ||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| | ||| || ||| ||||||    
T  21743860 gcagagcatctgaagattgtattgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtccaaatgtgagttctggttaagtgaagtaagtcttcttg 21743959  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||    
T  21743960 gccacattatttctggtagtggtatt 21743985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 107 - 325
Target Start/End: Original strand, 21233937 - 21234155
Alignment:
Q  107 tttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaa 206  Q
    |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||     
T  21233937 tttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttatcgacgacattttgatttactccaagactgaagaagaac 21234036  T
Q  207 atgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttct 306  Q
    ||||  | ||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  21234037 atgctgaacatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtaagttttct 21234136  T
Q  307 tggccatattatttctggt 325  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  21234137 tggccatgttatttctggt 21234155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 16378354 - 16378150
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||   || ||||||||||  || ||||||||| ||     
T  16378354 gattaaagtgaaagatgaggatatgcagaagacggcttttagaacgcgttatggacattatgaatataaagtgatgcctttcggtgttacaaatgcgcct 16378255  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||  | ||| |||||||| || |||||||| ||||| || |||||||||||||  ||||| ||||    
T  16378254 ggtgtgttcatggagtacatgaatcgaatttttcatgtgtttttggatcgtttcgtggttgtgtttattgatgacattttgatatacttcaagtccgaag 16378155  T
Q  201 aagaa 205  Q
    |||||    
T  16378154 aagaa 16378150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 20854860 - 20855184
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||   || ||||||||||  || ||| || || ||     
T  20854860 gattaaagtgaaggatgaagatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcct 20854959  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    ||||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||| | | |||   ||||| || || || || || ||||||||||| || |||||  ||||||    
T  20854960 ggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggtggtatttatagatgatattttgatttattctaaaactgaag 20855059  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    | ||  ||||  | || |||||| |||| |||||  |  |||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| | ||| |||||    
T  20855060 aggagcatgcagaacacttgaagattgtgttgcagattttgaaggagagaaagttgtatgccaagttgtcgaagtgcgagttctggttaagtgaagtgag 20855159  T
Q  301 ttttcttggccatattatttctggt 325  Q
    |||||| |||||| |||||||||||    
T  20855160 ttttctaggccatgttatttctggt 20855184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 321
Target Start/End: Original strand, 41351762 - 41352082
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| | |||||||| |||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||||||||     
T  41351762 gattaaagtaaaggatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatacaaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacct 41351861  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    || || |||||||  || |||||||| || || ||||| | ||| ||||  || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  41351862 ggagtgtttatggggtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcagttcgtggttgtgttcatcgacgatattttgatttactccaagactgaag 41351961  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||| ||||  | ||| ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  41351962 aagaacatgcagaacatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgag 41352061  T
Q  301 ttttcttggccatattatttc 321  Q
    ||||||||| ||| |||||||    
T  41352062 ttttcttggtcatgttatttc 41352082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 92 - 322
Target Start/End: Original strand, 20829583 - 20829813
Alignment:
Q  92 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 191  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||| | || |||||| ||||| | || |||||||| || |||||||| || ||||||||| | || || |    
T  20829583 aatgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaa 20829682  T
Q  192 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 291  Q
    ||||||| |||||  ||||  ||||||||| | |||| ||||||||  ||||||||||  |||| | |||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  20829683 agtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaa 20829782  T
Q  292 tgaggtgagttttcttggccatattatttct 322  Q
     || |||||||| ||||| ||| | ||||||    
T  20829783 ggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 20829813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Original strand, 19661244 - 19661569
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| | |||||||||||| || || || |||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  19661244 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctctaggacacgttatggtcactatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 19661343  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||| ||  |||||   || || |||||||| ||||| || || ||||| || || | | ||||||||||  ||    
T  19661344 tatggagtatatgaaccgaattttccatgcctacctagataaattcgtggttgtgtttattgatgacatcttgatttattcaaggactgaagaagagcat 19661443  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  ||||| ||||| |||| ||| ||||| | ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| | ||| |||||||||| ||    
T  19661444 gcatagcatctgaagattgtattgtaagtgttaaaagaaaagaagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaagtgagttttcctg 19661543  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||    
T  19661544 gccacattatttctggtagtggtatt 19661569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Original strand, 31538105 - 31538430
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  31538105 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtttt 31538204  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
    |||||| |||||||| || ||||| ||||||| | | |||   |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || || |||  ||| || ||  ||    
T  31538205 tatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatattttaatctattccaagaatgaggaggagcat 31538304  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  ||||| |||   |||| ||||||||| |||| || || | ||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||| |    
T  31538305 gcagagcatctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttatcaaaatgtgagttctggttaaatgaagtaagttttctgg 31538404  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    | || |||||||||||||||| ||||    
T  31538405 gtcacattatttctggtagtggtatt 31538430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 48425155 - 48424830
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  48425155 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtttt 48425056  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
    |||||| |||||||| || ||||| ||||||| | | |||   |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || || |||  ||| || ||  ||    
T  48425055 tatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatattttaatctattccaagaatgaggaggagcat 48424956  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  ||||| |||   |||| ||||||||| |||| || || | ||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||| |    
T  48424955 gcagagcatctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttatcaaaatgtgagttctggttaaatgaagtaagttttctgg 48424856  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    | || |||||||||||||||| ||||    
T  48424855 gtcacattatttctggtagtggtatt 48424830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 52988023 - 52987698
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  52988023 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtttt 52987924  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
    |||||| |||||||| || ||||| ||||||| | | |||   |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || || |||  ||| || ||  ||    
T  52987923 tatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatattttaatctattccaagaatgaggaggagcat 52987824  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  ||||| |||   |||| ||||||||| |||| || || | ||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||| |    
T  52987823 gcagagcatctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttatcaaaatgtgagttctggttaaatgaagtaagttttctgg 52987724  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    | || |||||||||||||||| ||||    
T  52987723 gtcacattatttctggtagtggtatt 52987698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 24792716 - 24793040
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   ||  || ||||||||     
T  24792716 gattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaaggtatgccttttggtgtgaccaatgcacct 24792815  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  24792816 ggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtggttgtttttattgatgatattttgatttactccaagactgaag 24792915  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||| |||   ||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||| || ||  | ||||| || || || |||||||| ||||||||||| || || ||    
T  24792916 aagaacatgttgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagaaaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgagttctggttgaaagaagtaag 24793015  T
Q  301 ttttcttggccatattatttctggt 325  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    
T  24793016 ttttcttggccatgttatttctggt 24793040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 158 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 41308775 - 41308599
Alignment:
Q  158 gttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttat 257  Q
    |||||||| ||||| || || || || || |||||| ||||||||||  ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||| || ||||| |    
T  41308775 gttgtgtttattgatgacatcttaatttattctaagactgaagaagagcatgcagagcatctgaagattgtattgcaagtgttgaaagaaaagaagttgt 41308676  T
Q  258 atgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    ||||||||||||| || |||||||| ||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41308675 atgccaagttgtccaaatgtgaattttggttaagtgaagtaagttttcttggccatattatttctggtagtggtatt 41308599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Original strand, 20938171 - 20938496
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| || || || ||||| ||    
T  20938171 tgaaggatgaggatatgcagaaaacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctggtgtgtt 20938270  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
     ||||| || ||||| || ||||| |||||||| || |||   || || |||||||| ||||| || | | |||| || || ||| ||||||||||  ||    
T  20938271 catggagtatatgaaccgaattttccatgcttacttggataaattcgtggttgtgtttattgatgacagtctgatttattcgaagactgaagaagagcat 20938370  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    |   ||||| |||   | || || |||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| | ||| || ||||||||||    
T  20938371 gtagagcatctgagaatagtattacaagtattgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggttaattgaagtaagttttcttg 20938470  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||    
T  20938471 gccacattatttctggtagtggtatt 20938496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Original strand, 38910934 - 38911259
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  38910934 tgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggacattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtttt 38911033  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
    |||||| |||||||| |  ||||| |||||||   | |||   |||||||| || || ||||| |||||||| || || || |||  ||| || ||  ||    
T  38911034 tatggagtacatgaaccaaattttccatgctttcctggataagtttgttgtggtatttattgatgatattttaatctattccaagaatgaggaggagcat 38911133  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  ||||| |||   |||| ||||||||| |||| || || | ||| ||||| ||| |||| || ||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| |    
T  38911134 gcagagcatctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagctgtcgaaatgtgagttctggttaagtgaagtgagctttctgg 38911233  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||    
T  38911234 gtcatattatttctggtagtggtatt 38911259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Original strand, 24097711 - 24098036
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || | ||||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  24097711 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatgaacattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 24097810  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
     ||||| || ||||| |  ||||| ||||||| | | |||   || || || || || ||||| || ||| |||| || |||||| ||||||| ||  ||    
T  24097811 catggagtatatgaaccaaattttccatgcttttctggataaattcgtggtggtatttattgatgacattctgatctattctaagactgaagaggagcat 24097910  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  |  || ||||| |||| ||| ||||  ||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||| |    
T  24097911 gcagaaaatctgaagattgtattgtaagtcttgaaagaaaagaagttgtatgctaagttgtcaaagtgtgagttctggttaagtgaagtgagttttctgg 24098010  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    | || |||||||||||||||| ||||    
T  24098011 gtcacattatttctggtagtggtatt 24098036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 158 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 21026275 - 21026108
Alignment:
Q  158 gttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttat 257  Q
    ||||| ||||| || |||||||| || ||||| ||| ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | |    
T  21026275 gttgttttcatcgatgatattttaatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaacttt 21026176  T
Q  258 atgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggt 325  Q
    |||| ||  | || |||||||| ||||||||||| || ||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  21026175 atgctaaaatatctaagtgtgagttctggttgaaagaagtgagtttttttggccatgttatttctggt 21026108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 19856556 - 19856231
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||  | || |||||    | ||||||||||  || |||  |||| || ||||| ||    
T  19856556 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggttactatgaatataaggtgatgcctttcgttgttactcatgcgcctggtgtgtt 19856457  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||| ||  | |||   || || |||||||| ||||  || |||||||| || |||||| ||||||||||  ||    
T  19856456 tatggagtatatgaaccgaattttccatgcctacctggataaattcgtggttgtgtttattggtgacattttgatttattctaagactgaagaagagcat 19856357  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    |   | ||| ||||| | || |||||| |  | ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||| | ||| |||||||| ||||    
T  19856356 gaagaacatctgaagatagtattgcaaatattaaaagaaaagaagttgtatgctaagttgtcaaagtgtgagttctagttaagtgaagtgagtttccttg 19856257  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||    
T  19856256 gccacattatttctggtagtggtatt 19856231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 20296663 - 20296338
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| || || || ||||| ||    
T  20296663 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctggtgtgtt 20296564  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
     ||||| |||||||| || || || ||||||| | | |||   |||||||| ||||| ||||| ||||| || || || ||||||  |||||| ||  ||    
T  20296563 catggagtacatgaaccgaatcttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatcttaatttattctaagaatgaagaggagcat 20296464  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  ||||| | |   |||| ||||||||| |||| || || |  || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| |    
T  20296463 gcagagcatctaagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagagattgtatgcaaagttgtcaaaatgtgagttctggttaagtgaagtgagctttctgg 20296364  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    | || |||||||||||||||| ||||    
T  20296363 gtcacattatttctggtagtggtatt 20296338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 92 - 313
Target Start/End: Original strand, 22503480 - 22503701
Alignment:
Q  92 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 191  Q
    |||||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || |  ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |    
T  22503480 aatgcacctggagtgtttatggagtaaatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcggggttgttttcatcgatgatattttgatttactcca 22503579  T
Q  192 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 291  Q
    || ||||||||||| |||   ||||| ||||| |||| ||||||||| | |||||||| ||  | ||||| ||  | || |||||||| |||||||||||    
T  22503580 agactgaagaagaacatgttgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttaaaagagaagaaactttatgctaaaatatctaagtgtgagttctggttgaa 22503679  T
Q  292 tgaggtgagttttcttggccat 313  Q
     ||||| |||||||||||||||    
T  22503680 agaggtaagttttcttggccat 22503701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 37679331 - 37679006
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  37679331 tgaaagatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtttt 37679232  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
    |||||| ||||||||||| || || ||||||| | | |||   |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || || |||  ||| ||  |  ||    
T  37679231 tatggagtacatgaatcgaatcttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatattttaatctattccaagaatgaggagaagcat 37679132  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  ||||| |||   |||| ||||||||| |||| || || | ||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||   ||| || |||||| | |    
T  37679131 gcagagcatctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttatcaaaatgtgaattctggttaggtgaagtaagttttttgg 37679032  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    | || |||||||||||||||| ||||    
T  37679031 gtcacattatttctggtagtggtatt 37679006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 246 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 16378156 - 16378076
Alignment:
Q  246 agaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggta 326  Q
    |||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16378156 agaagaagctatatgctaaattgtcaaagtgtgaattctggttgaaagaggttagttttcttggccatgttatttctggta 16378076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 21953160 - 21952844
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| || || || ||||| ||    
T  21953160 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctggtgtgtt 21953061  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
    |||||| |||||||| || ||||| ||||||| | | |||   |||||||| ||||| ||||| ||||| || || || || |||   ||||| ||  ||    
T  21953060 tatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatcttaatttattccaagaacgaagaggagcat 21952961  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  ||||| |||   |||| ||||||||  ||||||| || | ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |  || ||||| ||||| |    
T  21952960 gcagagcatctgagaattgtattgcaagttttgaaagaaaagaggttgtatgcgaagttgtcaaaatgtgagttctggttaagcgaagtgagctttctgg 21952861  T
Q  309 gccatattatttctggt 325  Q
    | || ||||||| ||||    
T  21952860 gtcacattatttatggt 21952844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 92 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 20927222 - 20927005
Alignment:
Q  92 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 191  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||| | || |||||| ||||| | ||  ||||||| || |||||||| || ||||||||| | || || |    
T  20927222 aatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggacagttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcga 20927123  T
Q  192 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 291  Q
    ||||||| |||||  |||   ||||||||| | |||| ||||||||  |||| |||||  |||||| ||| ||||| || |||||||| || ||||||||    
T  20927122 agtctgaggaagagcatgatgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaggagaatcagttatgtgctaagttatctaagtgtgagttttggttgaa 20927023  T
Q  292 tgaggtgagttttcttgg 309  Q
     || |||| ||| |||||    
T  20927022 ggaagtgattttccttgg 20927005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 225 - 334
Target Start/End: Original strand, 23196573 - 23196682
Alignment:
Q  225 ttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctgg 324  Q
    |||| ||||||||| ||||||| || | ||| |||||||||||||| || || || |||||||| | ||| || |||||||||||||| ||||||| |||    
T  23196573 ttgtgttgcaagtgttgaaagaaaagaggttgtatgccaagttgtccaaatgcgagttctggttaagtgaagtaagttttcttggccacattatttatgg 23196672  T
Q  325 tagtgatatt 334  Q
    ||||| ||||    
T  23196673 tagtggtatt 23196682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 293 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 22116880 - 22116839
Alignment:
Q  293 gaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  22116880 gaggtgagttttcttggccatgttatttctggtagtggtatt 22116839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 41310808 - 41310766
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgtta 51  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  41310808 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgtta 41310766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 111; Significance: 6e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 92 - 334
Target Start/End: Original strand, 38070 - 38312
Alignment:
Q  92 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 191  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||  |    
T  38070 aatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcgtttcgtggttgttttcattgatgatattttgatttactaca 38169  T
Q  192 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 291  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  38170 agtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaa 38269  T
Q  292 tgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
     || ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  38270 agaagtgagctttcttggacatgttatttctggtagtggtatt 38312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 176375 - 176708
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| | || |||||||||||| | || ||| | ||||||||||| || |||||||||||||| |||| |||  |||||  || ||| ||||| ||     
T  176375 gattaaagtaaaagatgaagatatgcataaaacgacctttaggacacgatatggacattacgaatattcagtgatatctttcggtgttactaatgcgcct 176474  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| || |||||||||||||    
T  176475 ggtgtgtttatggagtacatgaatagaattttccatgcttatttggatcggtttgttgttgtatttattgatgacatcttgatttattctaagtctgaag 176574  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||  ||||  ||||||| ||| |||| ||| ||||| |||| || || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || |     
T  176575 aagagcatgcagagcatttaaagattgtgttgtaagtgttgaatgaaaagaagttgtatgccaagttgtccaaatgtgaattctggttaagtgaagtaaa 176674  T
Q  301 ttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  176675 ttttcttggccatattatttatggtagtggtatt 176708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0509 (Bit Score: 106; Significance: 5e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0509
Description:

Target: scaffold0509; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 11103 - 10770
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| |||| ||  |||||||| |||| ||||| |||| |||||| ||||| ||||| |||||   || ||||||||||  || ||| ||||| ||     
T  11103 gattaaagtgaaagaaaaagatatgcagaaaacggcctttaagacacgatacgggcattatgaatataaagtgatgcctttcggtgttaccaatgcgcct 11004  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||  ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || |||||| ||||||    
T  11003 ggtgtgtttatggagtacatgaatagaattttccatgcttatttggatcaatttgtagttgtgtttattgatgacatcttgatttattctaagactgaag 10904  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||  || |  ||||||| ||| |||| ||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || ||    
T  10903 aagagcatacagagcatttaaagattgtattgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtccaaatgtgaattctggttaagtgaagtaag 10804  T
Q  301 ttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  10803 ttttcttggccatatcatttctggtagtggtatt 10770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 104; Significance: 8e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 810 - 1140
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| |||||||| || ||    | |||||| |||  || ||||||||||||     
T  810 gattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggacattatgagtataaggtgatgccgttcggtgttacaaatgcacct 909  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
     | ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  910 agagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcgtttcgtggttgttttcattgatgatattttgatttactccaagtctgaag 1009  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    || |   |||  ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||  || |||||    
T  1010 aaca---tgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaagtgtgaattctggttgagagaagtgag 1106  T
Q  301 ttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
     |||||||| ||| |||||| |||||||| ||||    
T  1107 ctttcttggacatgttatttttggtagtggtatt 1140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 85261 - 85594
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| | || |||||||||||| ||||||| ||||| || ||||| || || || || || ||   ||  |||||||||  || ||| ||||||||     
T  85261 gattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacacggtatggtcactatgagtacaaagttatgcctttcggtgttacgaatgcacct 85360  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||||||||| || || ||||| || ||||| |||||||| || | ||| ||||||||||    
T  85361 ggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttagatcggttcgtggttgtttttattgatgatattttaatttcctccaagtctgaag 85460  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || |||||    
T  85461 aagaacatgctgagcatttgaagcttgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaagtgcgaattctggttgaaagaagtgag 85560  T
Q  301 ttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
     |||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||    
T  85561 ctttcttggacatgttatttcaggtagtggtatt 85594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Original strand, 85827 - 86144
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| | || |||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||||||||     
T  85827 gattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacct 85926  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    || || ||||| || || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||| ||||||    
T  85927 ggagtgtttatagagtaaatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgttttcatcgatgacattttgatttactccaagactgaag 86026  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||| ||    ||||| ||||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||  | ||||| || || || |||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  86027 aagaacatattgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaggagaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgaattctggttgaaagaggtaag 86126  T
Q  301 ttttcttggccatattat 318  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  86127 ttttcttggccatgttat 86144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0312 (Bit Score: 101; Significance: 5e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0312
Description:

Target: scaffold0312; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 74 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 261 - 1
Alignment:
Q  74 atgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacg 173  Q
    |||||||||  || ||| |||||||| || ||||||||||| ||||||| ||| || |||||||| | ||| ||||| || || ||||| |||||||| |    
T  261 atgcctttcggtgttacgaatgcacctggagtatttatggagtacatgattcgcatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgttttcattgatg 162  T
Q  174 atattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaa 273  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || || || ||    
T  161 atattttgatttactccaagtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattatctaa 62  T
Q  274 gtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    ||||||||||||||| || || ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  61 gtgtgaattctggttaaaagaagtgagctttcttgggcatgttatttctggtagtggtatt 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 88 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 7409 - 7163
Alignment:
Q  88 tacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatac 187  Q
    ||||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||| || || ||||| || ||||| ||||||||||| |||    
T  7409 tacaaatgcacctagagtgtttatggagtacatgaatcgtatctttcatgcatttttagatcggttcgtggttgtttttattgatgatattttgatttac 7310  T
Q  188 tctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggt 287  Q
    || ||| | || |||||| |||   ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  7309 tccaagaccgaggaagaacatgttgagcatttgaagttggttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgcgaaattgtctaagtgtgaattctggt 7210  T
Q  288 tgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    | || || |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  7209 taaaagaagtgagttttcttggacatgttatttctggtagtggtatt 7163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 94; Significance: 8e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 17924 - 17596
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| |||||||  ||||||| || || || |||||||| || ||    | ||||||||||  || ||||||||||||     
T  17924 gattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaacttttagaacgcggtatggacattatgagtataaggtgatgcctttcggtgttacaaatgcacct 17825  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| |||||||| || ||||| |||| ||| |||     ||| ||||  ||  ||||||    
T  17824 ggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcgtttcgtggttgttttcaatgatgat-----gatttacttcaatactgaag 17730  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||| ||||  ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || || || |||||||||||||||||||| || |||||    
T  17729 aagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaatctttatgctaaattatctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgag 17630  T
Q  301 ttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  17629 ttttcttggccatgttatttctggtagtggtatt 17596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 94; Significance: 8e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 12060 - 11735
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || || || |||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  12060 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcactatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 11961  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
    |||||| || |||||  | ||||||||||| ||| | |||   ||||| |||||||| ||||| |||||  | || || ||||||  |||||||||  ||    
T  11960 tatggagtatatgaacagaatttttcatgcctatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgatatcctaatttattctaagaatgaagaagagcat 11861  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  ||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| |||  | ||||||||||    
T  11860 gcagagcatctgaagattgtattgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtccaaatgtgaattctggttgagtgaattaagttttcttg 11761  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||    
T  11760 gccatattatttctggtagtggtatt 11735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 16916 - 16583
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| |||| | |||||||||| ||||||| ||||| || || || || || ||||| || ||   ||  |||||||||  || ||||||||||||     
T  16916 gattaaagtgaaaggtgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcggtatggtcattatgagtacaaagttatgcctttcggtgttacaaatgcacca 16817  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||   ||| ||||| || || || || || || || ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  16816 ggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcacttttggatcggttcgtggtggtttttatcgatgatattttgatttactccaagtctgaag 16717  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||| ||||  ||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| || || |||||||||||||| || |||||    
T  16716 aagaacatgctgagcatttgaagctggttttgtaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaattgcgaattctggttgaaagaagtgag 16617  T
Q  301 ttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
     |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  16616 ctttcttggacatgttatttctggtagtggtatt 16583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 94; Significance: 8e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 20513 - 20180
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| |||||||  |||| || || || || |||||||| || ||    | |||||| |||  || ||||||||||||     
T  20513 gattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaactttcagaacgcggtatggacattatgagtataaggtgatgccgttcggtgttacaaatgcacct 20414  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
     | || |||||||| |||||||||| ||| |||||||| | ||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  20413 agagtgtttatggagtacatgaatcatatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgtttttattgatgatattttgatttactccaagactgaag 20314  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||    
T  20313 aagaacatgctgagcatttgaagttggttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaattgag 20214  T
Q  301 ttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
     |||||||| |||  |||||||||||||| ||||    
T  20213 ctttcttggacatgctatttctggtagtggtatt 20180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 94; Significance: 8e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 31220 - 30887
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||| || || || || || || || |||||   ||  |||||||||  || ||||||||||||     
T  31220 gattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcggtatggccactatgaatataaagttatgcctttcggtgttacaaatgcacct 31121  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
     | ||||||||||| | ||||||||| || |||||||| | ||| ||||| ||  | ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||     
T  31120 agagtatttatggagtgcatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggttcatggttgtttttattgatgatattttgatttactccaagtcttaat 31021  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||| ||||  ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||| | ||||  || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  31020 aagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgttaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgag 30921  T
Q  301 ttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
     |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  30920 ctttcttggacatgttatttctggtagtggtatt 30887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 9 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 51077 - 50759
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||| || || ||||| |||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  51077 tgaaggatgaggatatgccgaagacggcctttaggacacgatatggtcattatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 50978  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
    |||||| || |||||| | ||||||||||| ||| | |||   ||| | |||||||| ||||| || || || || || |||| | ||||||||||  ||    
T  50977 tatggagtatatgaatagaatttttcatgcctatctggataaatttttggttgtgtttattgatgacatcttaatttattctatgactgaagaagagcat 50878  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  ||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||| || ||||||||||    
T  50877 gcagagcatctgaagattgtattgcaagtgttgaaagataagaagttgtatgccaagttgtccaaatgtgaattcttgttaagtgaagtaagttttcttg 50778  T
Q  309 gccatattatttctggtag 327  Q
    |||||||||||||||||||    
T  50777 gccatattatttctggtag 50759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1423 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold1423
Description:

Target: scaffold1423; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 74 - 334
Target Start/End: Original strand, 1486 - 1746
Alignment:
Q  74 atgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacg 173  Q
    |||||||||  || ||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||  || |||||||| | ||| ||| | ||  | ||||| |||||||| |    
T  1486 atgcctttcggtgttacgaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcacatctttcatgcatttttggattggttcatggttgttttcattgatg 1585  T
Q  174 atattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaa 273  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||   ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| ||    
T  1586 atattttgatttactccaagtctgaagaagaacatgttgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaa 1685  T
Q  274 gtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| |||||||  ||| ||||||||||||||| ||||    
T  1686 gtgtgaattctggttgaaagaagtgagctttcttgtacatgttatttctggtagtggtatt 1746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 9213 - 8889
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| |||||||  |||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||||||||     
T  9213 gattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaactttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacct 9114  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  9113 ggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgatgatattttgatttactccaagactgaag 9014  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  9013 aagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgag 8914  T
Q  301 ttttcttggccatattatttctggt 325  Q
    |||||| |||||| |||||||||||    
T  8913 ttttctaggccatgttatttctggt 8889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0319 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0319
Description:

Target: scaffold0319; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 88 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 954 - 708
Alignment:
Q  88 tacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatac 187  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| ||||| || || ||||| || || || ||||||||||| |||    
T  954 tacaaatgcgcctggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgtttttatcgatgatattttgatttac 855  T
Q  188 tctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggt 287  Q
    |  ||||||||||||||| ||||  ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| ||| ||||||||||||    
T  854 ttcaagtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaacctttatgcgaaattgtctaagggtgaattctggt 755  T
Q  288 tgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    |||| || ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  754 tgaaagaagtgagctttcttggacatgttatttctggtagtggtatt 708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 4)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 11 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 45416 - 45106
Alignment:
Q  11 aaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtattta 110  Q
    |||||||| |||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||||||||  | |||||||    
T  45416 aaggatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctagagtattta 45317  T
Q  111 tggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgc 210  Q
    |||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  45316 tggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgc 45217  T
Q  211 caagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggc 310  Q
      | ||| ||||| |||| ||||||||  |||||||||||||  | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45216 tgatcatctgaagattgtcttgcaagtattgaaagagaaaaaactttatgccaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaggtgagttttcttggc 45117  T
Q  311 catattatttc 321  Q
    ||| |||||||    
T  45116 catgttatttc 45106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 92 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 10658 - 10428
Alignment:
Q  92 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 191  Q
    |||||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |    
T  10658 aatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtattcatcgatgatattttgatttactcca 10559  T
Q  192 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 291  Q
    || ||||| ||||| ||||  ||||| | ||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||     
T  10558 agactgaaaaagaacatgctgagcatctaaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgagttctggttgag 10459  T
Q  292 tgaggtgagttttcttggccatattatttct 322  Q
     || |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  10458 agaagtgagtttccttggccatgttatttct 10428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 17211 - 16890
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| | || ||||| |||||| ||||||||||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||||||||     
T  17211 gattaaagtaaaagatgaggatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacct 17112  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    || || |||||||| || |||||||  || || ||||| | ||| ||| | || || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||| |||||     
T  17111 ggagtgtttatggagtatatgaatcacatcttccatgcatttttggattggttcgtagttgtattcatcgatgatattttgatttactccaagactgaaa 17012  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||  || |||||    
T  17011 aagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgagttctggttgagagaagtgag 16912  T
Q  301 ttttcttggccatattatttct 322  Q
    ||| ||||||||| ||||||||    
T  16911 tttccttggccatgttatttct 16890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Original strand, 48553 - 48878
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||| ||||| || ||| ||||||| || ||||| ||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  48553 tgaaagatgaggacatgcagaagactgcctttagcacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 48652  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
     ||||| || |||||  | ||||||||||||||  | |||   ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || || |   |||| |||||  ||    
T  48653 catggagtatatgaacagaatttttcatgcttacctggataaatttgtggttgtattcattgatgacattttgatctattcgagaactgaggaagagcat 48752  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  | ||| ||| | |||| ||||||||  |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||| | ||| |||||||||||||    
T  48753 gcagaacatctgaggattgtattgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcaaagtgcgagttttggttaagtgaagtgagttttcttg 48852  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||    
T  48853 gccatattatttctggtagtggtatt 48878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 24976 - 25309
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| |||| ||||| |||||| ||||||| ||||| || || ||||| ||||| || |||||   || ||||||||||  || ||||||||||||     
T  24976 gattaaagtgaaagatgatgatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggacaatatgaatataaagtgatgcctttcggtgttacaaatgcacct 25075  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    |  || |||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| |||||||| || ||| | || ||||||||||||||||| ||||| |||  ||| |    
T  25076 gaagtgtttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcgtttcgtggttctttttattgacgatattttgatttactccaagattgagg 25175  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||| ||||  ||||||||||| | |||||||||||| ||||||| || ||  | ||||| || || || |||||||||||||||||||| ||  ||||    
T  25176 aagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagataagaaactttatgctaaattatctaagtgtgaattctggttgaaagaattgag 25275  T
Q  301 ttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    |||||||||  || ||||||||| ||||| ||||    
T  25276 ttttcttggatatgttatttctgttagtggtatt 25309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 4)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 9 - 326
Target Start/End: Original strand, 50219 - 50536
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||   || ||||||||||  || ||| ||  | || ||||| ||    
T  50219 tgaaggatgaagatatgcagaagacggcatttaggacacgatatggacattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacacgcccggtgtgtt 50318  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
     ||||| || ||||| || ||||||||||||| ||| |||   || || ||||| |||||||| |||||||| || || |||||| | ||||||||  ||    
T  50319 catggagtatatgaaccgaatttttcatgcttttttggataaattcgtggttgtattcattgatgatattttaatttattctaagacggaagaagagcat 50418  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  | ||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || |||| ||| | ||| || || |||||||    
T  50419 gcggaacatctgaagattgtgttgcaagtgttgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaagtgcgagttctagttaagtgaagttagctttcttg 50518  T
Q  309 gccatattatttctggta 326  Q
    |||||||||||| |||||    
T  50519 gccatattatttttggta 50536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 9 - 326
Target Start/End: Original strand, 59253 - 59570
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||   || ||||||||||  || ||| ||  | || ||||| ||    
T  59253 tgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacacgcccggtgtgtt 59352  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
     ||||| || ||||| || ||||||||||||| ||| |||   || || ||||| |||||||| |||||||| || || |||||| | ||||||||  ||    
T  59353 catggagtatatgaaccgaatttttcatgcttttttggataaattcgtggttgtattcattgatgatattttaatttattctaagacggaagaagagcat 59452  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  | ||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || |||| ||| | ||| || || |||||||    
T  59453 gcggaacatctgaagattgtgttgcaagtgttgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaagtgcgagttctagttaagtgaagttagctttcttg 59552  T
Q  309 gccatattatttctggta 326  Q
    |||||||||||| |||||    
T  59553 gccatattatttttggta 59570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 9 - 326
Target Start/End: Original strand, 65641 - 65958
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||   || ||||||||||  || ||| ||  | || ||||| ||    
T  65641 tgaaggatgaagatatgcagaagacggcatttaggacacgatatggacattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacacgcccggtgtgtt 65740  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
     ||||| || ||||| || ||||||||||||| ||| |||   || || ||||| |||||||| |||||||| || || |||||| | ||||||||  ||    
T  65741 catggagtatatgaaccgaatttttcatgcttttttggataaattcgtggttgtattcattgatgatattttaatttattctaagacggaagaagagcat 65840  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  | ||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || |||| ||| | ||| || || |||||||    
T  65841 gcggaacatctgaagattgtgttgcaagtgttgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaagtgcgagttctagttaagtgaagttagctttcttg 65940  T
Q  309 gccatattatttctggta 326  Q
    |||||||||||| |||||    
T  65941 gccatattatttttggta 65958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #4
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 28889 - 28564
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || |||||  |    
T  28889 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgct 28790  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||||||  | |||   ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || |||||| ||||||||||  ||    
T  28789 tatggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttgatttattctaagactgaagaagagcat 28690  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  | ||| ||||| | || ||| ||||| ||||||| || ||||| | ||| ||||||||||| ||||| ||||||||  |||| || |||||| |||    
T  28689 gcagaacatctgaagatcgtcttgaaagtgttgaaagaaaagaagttgtctgcgaagttgtcaaaatgtgagttctggttagatgaagtaagttttgttg 28590  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    |||| ||||||| |||||||| ||||    
T  28589 gccacattatttatggtagtggtatt 28564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Original strand, 55886 - 56211
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| || |||||||||||   |  ||||||||||  || ||| ||||| || ||||||||    
T  55886 tgaaggatgaagatatgcagaagacgacctttaggacacgttatggtcattacgaatacaaattgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtatt 55985  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
     ||||| || ||||| |||||||||||||||| | | |||   ||| | ||||| |||||||| || ||  | || || || ||| ||||||| ||  ||    
T  55986 catggagtatatgaaccgtatttttcatgcttttctggataagtttatggttgtattcattgatgacatcctaatttattccaagactgaagaggagcat 56085  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  | ||| ||| | |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| | ||| ||||||||||||     
T  56086 gcagaacatctgaggattgtattgcaagtactgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaaatgtgaattctggttaagtgaagtgagttttctta 56185  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||    
T  56186 gccacattatttctggtagtggtatt 56211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Original strand, 47073 - 47398
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||| || ||||| |||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  47073 tgaaggatgaggatatgcagaagatggcctttaggacacgttatggtcattatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 47172  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
    |||| | || ||||| |  ||||| ||||| ||| |||||   ||||| |||||||| ||||| |||||  | || || | ||||  |||||| ||  ||    
T  47173 tatgaagtatatgaaccaaattttccatgcctatctagataaatttgtggttgtgtttattgatgatatcctaatttattttaagaatgaagatgagcat 47272  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  ||||| || || |||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||| | ||||||||| |||||||| ||||| | ||| ||  |||||||||    
T  47273 gcagagcatctgcagattgtattgcaagtgttgaaagaaaaaaagttgtatgcgacgttgtcaaaatgtgaattttggttaagtgaagtaggttttcttg 47372  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||    
T  47373 gccatattatttctggtagtggtatt 47398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Original strand, 99601 - 99926
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  99601 tgaaggatgaggatatgcagaagacagcctttaggacacgatatggacattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 99700  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
     ||||| || |||||||| ||||| ||||| ||| | |||   ||||| |||||||| ||||| || ||| |||| || ||||   ||||||||||  ||    
T  99701 catggagtatatgaatcgaattttccatgcctatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacattctgatctattctagaactgaagaagagcat 99800  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  | ||| ||||| |||| |||||| | || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||||||||| |    
T  99801 gcagaacatctgaagattgtgttgcaaattctaaaagagaaaaagttatatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaagtgagttttctgg 99900  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||    
T  99901 gccacattatttctggtagtggtatt 99926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 89; Significance: 7e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 2982 - 2658
Alignment:
Q  10 gaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtattt 109  Q
    ||||||||| |||||| |||||||| | ||||||||| | || ||||||||||||||   || ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| |||    
T  2982 gaaggatgaggatatgcagaagacgacctttaggacatgatatggacattacgaatataaagtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgttt 2883  T
Q  110 atggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatg 209  Q
    ||||| || ||||| || ||||| ||||||||  | |||   || || |||||||| ||||| || || ||||| || || ||| ||||||||||  |||    
T  2882 atggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctggataaattcgtggttgtgtttattgatgacatcttgatttattcaaagactgaagaagagcatg 2783  T
Q  210 ccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttgg 309  Q
    |  | ||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| | ||| || |||||||||||    
T  2782 cagaacatctgaagattgtattgcaagtgttgaaagagaagaagttgtatgccaagttgtctaaatgtgagttctggttaagtgaagtaagttttcttgg 2683  T
Q  310 ccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||    
T  2682 ccacattatttctggtagtggtatt 2658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 35771 - 35446
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| | || |||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||||||||     
T  35771 gattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacct 35672  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || |||||  |||| || |||||||| || ||||| ||| | ||||    
T  35671 ggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtggttgttctcatcgatgatattttaatttactccaagaccgaag 35572  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtga- 299  Q
    ||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || || || |||||||| ||||||||||| ||||| |     
T  35571 aagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgagttctggttgaaagaggtaag 35472  T
Q  300 gttttcttggccatattatttctggt 325  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||    
T  35471 gttttgttggccatgttatttctggt 35446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 75 - 334
Target Start/End: Original strand, 6436 - 6695
Alignment:
Q  75 tgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacga 174  Q
    ||||||||  || ||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| ||||| || || ||||| || || || ||    
T  6436 tgcctttcggtgttacgaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcgtttttggatcggttcgtggttgtttttatcgatga 6535  T
Q  175 tattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaag 274  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| |||    
T  6536 tattttgatttactccaagtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaag 6635  T
Q  275 tgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    || |||||||||||||| || ||| | |||||||| ||| ||||| || |||||| ||||    
T  6636 tgcgaattctggttgaaagaagtgtgctttcttggacatgttattgctagtagtggtatt 6695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 86; Significance: 5e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 4454 - 4118
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaata--atcagc-gatgcctttcaatgctacaaatgca 97  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||  || ||  ||||||||||  || ||| |||||     
T  4454 gattaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattatgaatataataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcg 4355  T
Q  98 ccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctg 197  Q
    || ||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||| ||| | |||   ||||| |||||||| |||||  | || ||||| || | |||| |||    
T  4354 cctggtgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcctatctggataaatttgtggttgtgtttattgatcacatcttgatttattataagactg 4255  T
Q  198 aagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggt 297  Q
    |||||||  ||||  | ||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||| ||    
T  4254 aagaagagcatgcataacatctgaagattgtattgcaagtgttgaaagagaagaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgaattttggttaagtgaagt 4155  T
Q  298 gagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
     |||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||    
T  4154 aagttttctgggccatatcatttatggtagtggtatt 4118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 86; Significance: 5e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 2136 - 1811
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || || || |||||    | ||||||||||  |||||| ||||| ||  |||| ||    
T  2136 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcactatgaatataaggtgatgcctttcggtgctactaatgcgcctagtgtgtt 2037  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
    |||||| || |||||  | ||||| ||||||||| | |||    |||| |||||||| ||||| || || || || || |||||| ||||||||||  ||    
T  2036 tatggagtatatgaacagaattttccatgcttatctggataaaattgtggttgtgtttattgatgacatcttaatttattctaagactgaagaagagcat 1937  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  ||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| | ||| || ||||||||||    
T  1936 gcagagcatctgaagattgtattgcaagtgttgaaagaaaataagttgtatgccaagttgtccaaatgtgaattttggttaagtgaagtaagttttcttg 1837  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
     |||||||||||||||||||| ||||    
T  1836 accatattatttctggtagtggtatt 1811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 86; Significance: 5e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 7025 - 6692
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||| ||     
T  7025 gattaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcct 6926  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    | ||| ||||| || || ||||| || ||||||||||||| | |   |   ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || |||||| |||| |    
T  6925 gatgtgtttatagagtatatgaaccgaatttttcatgcttttctgattaaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttgatttattctaagactgagg 6826  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||  |||   | ||| ||||| |||| ||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||| |||||    
T  6825 aagagcatgtagaacatctgaagattgtattgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgagttctggttaagtgaagtgag 6726  T
Q  301 ttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  6725 ttttcttggccacattatttctggtagtggtatt 6692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 86; Significance: 5e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 33601 - 33276
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  33601 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattacgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 33502  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
    |||||| || ||||| |  ||||| ||||| ||||| |||   || || |||||||||||||| || || ||||| || |||||| ||||||||||  ||    
T  33501 tatggagtatatgaaccaaattttccatgcctatttggataaattcgtggttgtgttcattgatgacatcttgatttattctaagactgaagaagagcat 33402  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  | ||| | ||| |||| || || ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||| ||| | ||| || ||||||||||    
T  33401 gcagaacatctaaagattgtattacaggtgttgaaagagaagaagttgtatgccaagttgttaaaatgtgagttctagttaagtgaagtaagttttcttg 33302  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||    
T  33301 gccacattatttctggtagtggtatt 33276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 86; Significance: 5e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Original strand, 49914 - 50239
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||| ||||| |||||| |||| ||| | ||||||||||| || || ||||| |||||    | |||||||||| ||| ||| ||||| || ||||| ||    
T  49914 tgaatgatgaggatatgcagaatacgccctttaggacacgatatggtcattatgaatataaggtgatgcctttcgatgttactaatgcgcctggtgtgtt 50013  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||| ||| | |||   ||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||| ||||||||||  ||    
T  50014 tatggagtatatgaaccgaattttccatgcctatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttaatttattctaagactgaagaagagcat 50113  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  ||||| ||||| |||| || |||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||| || ||||||||||    
T  50114 gcagagcatctgaagattgtgtttcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgaattcttgttaagtgaagtaagttttcttg 50213  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||    
T  50214 gccatattatttctggtagtggtatt 50239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 86; Significance: 5e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Original strand, 2992 - 3317
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  2992 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggacattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 3091  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
     ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||| | |||   || || |||||||| ||||| || ||  | || || || ||| ||||||||||  ||    
T  3092 catggagtatatgaaccgaattttccatgcctatctggataaattcgtggttgtgtttattgatgacatcctaatttattcaaagactgaagaagagcat 3191  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  ||||| ||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| | ||| ||  |||||||||    
T  3192 gcagagcatctgaagattgtattgcaagtattgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggtttagtgaagtttgttttcttg 3291  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||    
T  3292 gccacattatttctggtagtggtatt 3317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 2 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 69644 - 69312
Alignment:
Q  2 attaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgg 101  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| || || || |    
T  69644 attaaagtgaaggatgaagatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctg 69545  T
Q  102 gtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaaga 201  Q
    |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||| | | |||   || || || || || ||||| ||||||||||| || |||||| |||||||    
T  69544 gtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaattcgtggtggtatttattgatgatattttgatttattctaagactgaaga 69445  T
Q  202 agaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagt 301  Q
     ||  ||||  | |  |||||| |||| |||||  |  ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || |||| ||| | ||| ||||||    
T  69444 ggagcatgcagaacgcttgaagattgtgttgcagattttgaaagagagaaagttgtatgccaagttgtcgaagtgcgagttcttgttaagtgaagtgagt 69345  T
Q  302 tttcttggccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||| ||||    
T  69344 tttctaggccacgttatttctggtagtggtatt 69312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 86; Significance: 5e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 262491 - 262166
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  262491 tgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 262392  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
     ||||| || |||||  | ||||| ||||  | | | |||   ||||| ||||| ||||||||||||||  | || || |||||| || |||| ||  ||    
T  262391 catggagtatatgaactgaattttccatgtctttctggataagtttgtggttgtattcattgacgatatcctaatttattctaagactaaagaggagcat 262292  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  | ||| ||| | |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| | ||| |||||||||||||    
T  262291 gcagaacatctgaggattgtattgcaagtactgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaaatgtgaattctggttaagtgaagtgagttttcttg 262192  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||    
T  262191 gccacattatttctggtagtggtatt 262166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 5)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 11270 - 11594
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| |||||||  |||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||||||||     
T  11270 gattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaactttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacct 11369  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || || ||||| || || ||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  11370 ggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcctttttggatcggttcgtggtggtgtttatcgatgatattttgatttactccaagactgaag 11469  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| || || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || || ||    
T  11470 aagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaattttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaag 11569  T
Q  301 ttttcttggccatattatttctggt 325  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    
T  11570 ttttcttggccatgttatttctggt 11594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 107 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 50259 - 50032
Alignment:
Q  107 tttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaa 206  Q
    |||||||| ||||||||||  || |||||||| | ||| ||||| || || ||||| |||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||     
T  50259 tttatggagtacatgaatcacatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgttttcaatgatgatattttgatttactccaagtctgaagaagaac 50160  T
Q  207 atgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttct 306  Q
    |||   ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||| | |||||    
T  50159 atgttgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaagtgcgaattttggttgaaagaagtgggctttct 50060  T
Q  307 tggccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    ||| ||| |||||||| |||||| ||||    
T  50059 tggacatgttatttctcgtagtggtatt 50032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 74 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 53837 - 53635
Alignment:
Q  74 atgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacg 173  Q
    |||||||||  || ||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||  || |||||||| | ||| ||||| || || ||||| |||| ||| |    
T  53837 atgcctttcggtgttacgaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcacatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgttttcaatgatg 53738  T
Q  174 atattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaa 273  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| ||    
T  53737 atattttgatttactccaagtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaa 53638  T
Q  274 gtg 276  Q
    |||    
T  53637 gtg 53635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #4
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 74 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 31084 - 30833
Alignment:
Q  74 atgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacg 173  Q
    ||||||||| ||| ||  |||||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||  || || ||||| ||||| || |    
T  31084 atgcctttcgatgttatgaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcagttcgtggttgttttcatcgaag 30985  T
Q  174 atattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaa 273  Q
    ||||||| || ||||| ||| ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||| ||| | ||||| || ||  | ||||| || || || ||    
T  30984 atattttaatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaggtgttaaaagaaaagaaactttatgctaaattatctaa 30885  T
Q  274 gtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggt 325  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  30884 gtgtgagttctggttgaaagaggtcagttttcttggccatgttatttctggt 30833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #5
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 74 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 36550 - 36298
Alignment:
Q  74 atgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacg 173  Q
    ||||||||| ||| ||  |||||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| |||| |||||| ||||| || ||||| |    
T  36550 atgcctttcgatgttatgaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatctttttgtggttgtttttattgatg 36451  T
Q  174 atattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaa 273  Q
    ||||||| || ||||| ||| ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||| ||| | ||||| || ||  | ||||| || || || ||    
T  36450 atatttttatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaggtgttaaaagaaaagaaactttatgctaaattatctaa 36351  T
Q  274 gtgtgaattctggttgaatgaggtga-gttttcttggccatattatttctggt 325  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||| |||||||||||    
T  36350 gtgtgagttctggttgaaagaggtaaggttttgttggccatgttatttctggt 36298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Original strand, 10096 - 10421
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||| ||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||| ||  |||| ||    
T  10096 tgaaagatgaggatatgcagaagacggcctttgggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctagtgtgtt 10195  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||||||  |||||   || || |||||||| ||||| || || ||||| || || ||| ||||||||||  ||    
T  10196 tatggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctagataaattcgtggttgtgtttattgatgacatcttgatttattcaaagactgaagaagagcat 10295  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  | ||| ||||| |||| ||||||||  ||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||||||||    
T  10296 gcagaacatctgaagattgtattgcaagtattgaaagaaaagaagttgtatgtcaagttgtcaaagtgtgagttctggttaagtgaagtaagttttcttg 10395  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||    
T  10396 gccatattatttctggtagtggtatt 10421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 53312 - 52987
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||    | ||| |||||| ||| ||| ||||  || ||| | ||    
T  53312 tgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattacgagtacaaggtgatacctttcgatgttactaatgtgcctggtttgtt 53213  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
     ||||| || ||||| || ||||| ||||||||  | |||   ||||| ||||| || ||||| |||||| |||| || |||||| ||||||||||  ||    
T  53212 catggagtatatgaaccggattttccatgcttacctggataaatttgtggttgtatttattgatgatattctgatttattctaagactgaagaagagcat 53113  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  | ||| ||||| |||| |||||| |  |||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||||||||| |    
T  53112 gcagaacatctgaagattgtgttgcaaatattgaaagagaaaaagttgtatgttaagttgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaagtgagttttctgg 53013  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||    
T  53012 gccacattatttctggtagtggtatt 52987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 92 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 16342 - 16113
Alignment:
Q  92 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 191  Q
    |||||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |    
T  16342 aatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttattgacgatattttgatttactcca 16243  T
Q  192 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 291  Q
    || ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  16242 agactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaaatttatgctaacttgtctaagtgtgaattctggttgaa 16143  T
Q  292 tgaggtgagttttcttggccatattatttc 321  Q
     ||  | ||||||||||||||| |||||||    
T  16142 agaattaagttttcttggccatgttatttc 16113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 92 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 2605 - 2375
Alignment:
Q  92 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 191  Q
    |||||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || |||||||| || |||||||||||||| ||||| |    
T  2605 aatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactcca 2506  T
Q  192 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagtt-gtcaaagtgtgaattctggttga 290  Q
    || ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || || ||| |||||||||||||||||||    
T  2505 agactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaataacctttatgctaacttggtctaagtgtgaattctggttga 2406  T
Q  291 atgaggtgagttttcttggccatattatttc 321  Q
    | ||  | ||||||||||||||| |||||||    
T  2405 aagaattaagttttcttggccatgttatttc 2375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 328
Target Start/End: Original strand, 5128 - 5447
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagc-gatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtat 107  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| || |||||||| || || | ||  |||| |||||  || ||| ||||| || ||||| |    
T  5128 tgaaggatgaagatatgcagaaaacggcctttaggacacgatatggacattatgagta-taagatgatgtctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgt 5226  T
Q  108 ttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaa 207  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||| | |||   ||||| |||||||| ||||| |||||  | || || ||||||  |||||||||  |    
T  5227 ttatggagtacatgaatagaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgatatcctaatttattctaagaatgaagaagagca 5326  T
Q  208 tgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttctt 307  Q
    |||  ||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| | ||  || |||||||||    
T  5327 tgcagagcatctgaagattgtgttgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtccaaatgtgaattttggttaagtggagtaagttttctt 5426  T
Q  308 ggccatattatttctggtagt 328  Q
    ||||||||||||| |||||||    
T  5427 ggccatattatttatggtagt 5447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 74 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 8251 - 7991
Alignment:
Q  74 atgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacg 173  Q
    |||||||||  || ||| |||||||| || ||||||||||| || |||||||  || |||||||| | ||| ||||| || ||  |||| |||||||| |    
T  8251 atgcctttcggtgttacgaatgcacctggagtatttatggagtatatgaatcacatctttcatgcatttttggatcggttcgtgcttgttttcattgatg 8152  T
Q  174 atattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaa 273  Q
    |||||||||| ||||| |||| ||| |||||| |||   ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| ||    
T  8151 atattttgatttactccaagtttgaggaagaatatgttgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaa 8052  T
Q  274 gtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    ||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||  || ||||||||||||||| ||||    
T  8051 gtgcgaattctggttgaaagaagtgagctttcttggatatgttatttctggtagtggtatt 7991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 74 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 17447 - 17187
Alignment:
Q  74 atgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacg 173  Q
    |||||||||  || ||| |||||||| || ||||||||||| || |||||||  || |||||||| | ||| ||||| ||  |  |||| |||||||| |    
T  17447 atgcctttcggtgttacgaatgcacctggagtatttatggagtatatgaatcacatctttcatgcatttttggatcggttcttgcttgttttcattgatg 17348  T
Q  174 atattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaa 273  Q
    |||||||||| ||||| |||| ||| |||||| ||    ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| ||    
T  17347 atattttgatttactccaagtttgatgaagaatattttgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaa 17248  T
Q  274 gtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    ||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||  || ||||||||||||||| ||||    
T  17247 gtgcgaattctggttgaaagaagtgagctttcttggatatgttatttctggtagtggtatt 17187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 74 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 652 - 393
Alignment:
Q  74 atgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacg 173  Q
    |||||||||| |  ||| |||||||| || ||||||||||| || |||||||| || |||||||| | ||| ||||  || || ||||| || ||| | |    
T  652 atgcctttcagttttactaatgcacctggagtatttatggagtatatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcagttcgtagttgtttttatttatg 553  T
Q  174 atattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaa 273  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||   | |||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||  | ||||| ||||| || ||    
T  552 atattttgatttactctaagtctgaagaagaacatatga-gcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgcgaagttatctaa 454  T
Q  274 gtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
     |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  453 ctgtgaattttggttgaaagaggtaagttttcttggccatgttatttcttgtagtggtatt 393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 40428 - 40104
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||| |  || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||||||||     
T  40428 gattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcaaaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacct 40329  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || |||||||| || || || |||||||| ||||| ||| ||||||    
T  40328 ggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttatcgatgacattttgatttactccaagactgaag 40229  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || || ||    
T  40228 aagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtaag 40129  T
Q  301 ttttcttggccatattatttctggt 325  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    
T  40128 ttttcttggccatgttatttctggt 40104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 107 - 325
Target Start/End: Original strand, 14261 - 14480
Alignment:
Q  107 tttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttg-atatactctaagtctgaagaagaa 205  Q
    |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || || ||||| || || ||||||||  || ||||| | | |||||||||||    
T  14261 tttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcctttttggatcggttcgtggtggtgtttatcgatgatattttttatttactccatgactgaagaagaa 14360  T
Q  206 aatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttc 305  Q
     ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || || || |||||||||||||| ||||| || || |||||||    
T  14361 tatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattttctaagtgtgaattctgtttgaaggaagtaagttttc 14460  T
Q  306 ttggccatattatttctggt 325  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  14461 ttggccatgttatttctggt 14480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 3)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 92 - 324
Target Start/End: Original strand, 107933 - 108165
Alignment:
Q  92 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 191  Q
    |||||||| || || |||||||| || |||| ||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| ||||| |    
T  107933 aatgcacctggagtgtttatggagtatatgagtcgcatcttccatgcgtttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactcca 108032  T
Q  192 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 291  Q
    ||  |||||| ||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  108033 agattgaagaggaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgaattctggttgaa 108132  T
Q  292 tgaggtgagttttcttggccatattatttctgg 324  Q
     ||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  108133 agaggtaagttttcttggccatgttatttctgg 108165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 114826 - 114501
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||| |||||||| ||| ||||||| || ||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  114826 tgaaagatgaagacatgcagaagactgcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 114727  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
     |||||||| |||||| | ||||||||||||||  | |||   ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || || |   |||| |||||  ||    
T  114726 catggaatatatgaatagaatttttcatgcttacctggataaatttgtggttgtattcattgatgacattttgatctattcaagaactgaggaagagcat 114627  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  | ||| ||| | |||| ||||||||  |||||||||| || || |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  114626 gcagaacatctgatgattgtattgcaagtattgaaagagaagaaattgtatgccaaattgtcgaagtgcgagttctggttaaatgaagtgagttttcttg 114527  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||    
T  114526 gccatattatttctggtagtggtatt 114501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 66
Target Start/End: Original strand, 94925 - 94990
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaata 66  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || || ||||||||    
T  94925 gattaaagtgaaggatgaagatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcactacgaata 94990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 92 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 9550 - 9319
Alignment:
Q  92 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 191  Q
    |||||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || ||||| |    
T  9550 aatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtattcatcgatgatatttttatttactcca 9451  T
Q  192 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 291  Q
    || ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  9450 agactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgagttctggttgaa 9351  T
Q  292 tgaggtgagttttcttggccatattatttctg 323  Q
     || |||||||||||||||||| |||||||||    
T  9350 agaagtgagttttcttggccatgttatttctg 9319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 74 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 20804 - 20553
Alignment:
Q  74 atgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacg 173  Q
    |||||||||  || ||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||  || |||||||| | ||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |    
T  20804 atgcctttcggtgttacgaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcacatctttcatgcatttttggatcgatttgtggttgttttcattgatg 20705  T
Q  174 atattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaa 273  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| | | |||||| ||  | ||||| || || || ||    
T  20704 atattttaatttactctaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttaagagagaagaaactttatgctaaattatctaa 20605  T
Q  274 gtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggt 325  Q
    |||||| |||||| |||| || || ||||||||||||||| |||||||||||    
T  20604 gtgtgagttctggatgaaagaagtaagttttcttggccatgttatttctggt 20553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 74 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 36228 - 35977
Alignment:
Q  74 atgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacg 173  Q
    |||||||||  || ||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||  || |||||||| | ||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |    
T  36228 atgcctttcggtgttacgaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcacatctttcatgcatttttggatcgatttgtggttgttttcattgatg 36129  T
Q  174 atattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaa 273  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| | | |||||| ||  | ||||| || || || ||    
T  36128 atattttaatttactctaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttaatagagaagaaactttatgctaaattatctaa 36029  T
Q  274 gtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggt 325  Q
    |||||| |||||| |||| || || ||||||||||||||| |||||||||||    
T  36028 gtgtgagttctggatgaaagaagtaagttttcttggccatgttatttctggt 35977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 3)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 325
Target Start/End: Original strand, 195531 - 195842
Alignment:
Q  14 gatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatgg 113  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| |||||||| |  ||||||||||    
T  195531 gatgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcaccagaagtatttatgg 195630  T
Q  114 aatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaa 213  Q
    | || |||||||| || || ||||| | | | ||||||||||| ||||| || || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||  |    
T  195631 agtatatgaatcgcatcttccatgcatttctggatcgttttgtggttgtctttatcgatgatattttgatttactccaagtctgaagaagaacatgctga 195730  T
Q  214 gcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccat 313  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||||| ||  | || |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  195731 gcatctgaaggttgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaactatctaagtgtgagttctggttgaaagaggtaagttttcttggccat 195830  T
Q  314 attatttctggt 325  Q
     | |||||||||    
T  195831 gtcatttctggt 195842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 58290 - 57966
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||| || || || || || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||||||||     
T  58290 gattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcggtatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacct 58191  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||  || || |||||||| || || || |||||||| ||||| ||| ||||||    
T  58190 ggagtgtttatggattatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcagttcgtagttgtgtttatcgatgacattttgatttactccaagactgaag 58091  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||| ||||   |||| ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  58090 aagaacatgctgtgcatctgaagattgtcttccaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaggtaag 57991  T
Q  301 ttttcttggccatattatttctggt 325  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    
T  57990 ttttcttggccatgttatttctggt 57966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 225 - 325
Target Start/End: Original strand, 18321 - 18422
Alignment:
Q  225 ttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtga-gttttcttggccatattatttctg 323  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || || || |||||||| ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||| |||||||||    
T  18321 ttgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgagttctggttgaaagaggtaaggttttgttggccatgttatttctg 18420  T
Q  324 gt 325  Q
    ||    
T  18421 gt 18422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0865 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0865
Description:

Target: scaffold0865; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Original strand, 2311 - 2636
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||| | ||||||||||| || |||||||| |||||   ||  |||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  2311 tgaaggatgaggatatgcagaaaacgacctttaggacacgatatggacattatgaatataaagtaatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 2410  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
     ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| |||   ||||| |||||||| ||||| |||||| | || || ||||||  |||||||||  ||    
T  2411 catggagtatatgaaccgaattttccatgcttatttggataaatttgtggttgtgtttattgatgatattctaatttattctaagaatgaagaagagcat 2510  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  ||||| ||||| || | ||||||||| | ||||| |  ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || ||||||||||    
T  2511 gcagagcatctgaagattttgttgcaagtgtttaaagaaaggaagttgtatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttaagtgaagtaagttttcttg 2610  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    |||| ||||||| |||||||| ||||    
T  2611 gccacattatttatggtagtggtatt 2636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 16379 - 16054
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||||| || || || |||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  16379 tgaaggatgaggatttgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcactatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 16280  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
    |||||| || |||||  | ||||| ||||||||| | |||   ||||| |||||||| ||||| || || || || || |||| | ||||||||||  ||    
T  16279 tatggagtatatgaacggaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttaatttattctacgactgaagaagagcat 16180  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||| || || | ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||| || ||||||||||    
T  16179 gcagagcatctgaagattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgccaagttgtcaaaatgtgaattttggttaagtgaagtaagttttcttg 16080  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||    
T  16079 gccatattatttatggtagtggtatt 16054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 322
Target Start/End: Original strand, 7983 - 8213
Alignment:
Q  92 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 191  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||| | || |||||| ||||| | || |||||| | || ||||| || || ||||||||  | || || |    
T  7983 aatgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttttggtggtgtttatagatgatattttagtgtattcga 8082  T
Q  192 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 291  Q
    |||| || |||||  |||   ||||| ||| | |||| ||||||||  ||||||||||  |||||| ||| |||||||| |||||||  || ||||||||    
T  8083 agtcggaggaagagcatgttgagcatctgaggattgtgttgcaagttttgaaagagaaccagttatgtgctaagttgtctaagtgtgtgttttggttgaa 8182  T
Q  292 tgaggtgagttttcttggccatattatttct 322  Q
     || |||||||| ||||| ||| | ||||||    
T  8183 ggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 8213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Original strand, 21554 - 21879
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||    | ||||||||||  |  ||| ||||| || ||||| ||    
T  21554 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacatgatatggacattacgaatataaggtgatgcctttcggtcttactaatgcgcctggtgtgtt 21653  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
    |||||| || ||||| || ||||| || || ||| | |||   ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || || ||| | ||||||||  ||    
T  21654 tatggagtatatgaaccgaattttccacgcctatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttgatttattcgaagacagaagaagagcat 21753  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  | ||| ||||| |||| ||||||||  |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| | ||| || ||||||||||    
T  21754 gcagaacatctgaagattgtattgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgcgaagttgtcaaaatgtgagttctggttaagtgaagtaagttttcttg 21853  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||    
T  21854 gccacattatttctggtagtggtatt 21879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Original strand, 13375 - 13700
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||    | ||||||||||  |  ||| ||||| || ||||| ||    
T  13375 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacatgatatggacattacgaatataaggtgatgcctttcggtcttactaatgcgcctggtgtgtt 13474  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
    |||||| || ||||| || ||||| || || ||| | |||   ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || || ||| | ||||||||  ||    
T  13475 tatggagtatatgaaccgaattttccacgcctatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttgatttattcgaagacagaagaagagcat 13574  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  | ||| ||||| |||| ||||||||  |||||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||| | ||| || ||||||||||    
T  13575 gcagaacatctgaagattgtattgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgcaaaattgtcaaaatgtgagttctggttaagtgaagtaagttttcttg 13674  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||    
T  13675 gccacattatttctggtagtggtatt 13700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 19619 - 19302
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || || || |||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  19619 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcactatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 19520  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
    |||||| || || ||    ||||| ||||||||| |||||   ||||| ||| |||| ||||| || || || || || |||||| | ||||| ||  ||    
T  19519 tatggagtatataaacaaaattttccatgcttatctagataaatttgtggttatgtttattgatgacatcttaatttattctaagaccgaagaggagcat 19420  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  ||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| || ||||||||||    
T  19419 gcagagcatctgaagattgtattgcaagtgttgaaagataagaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgaattctggttaagtgaagtaagttttcttg 19320  T
Q  309 gccatattatttctggta 326  Q
    |||| |||||||||||||    
T  19319 gccacattatttctggta 19302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 322
Target Start/End: Original strand, 25032 - 25129
Alignment:
Q  225 ttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttct 322  Q
    |||| ||||||||  |||| |||||  |||||| ||| ||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||| | ||||||    
T  25032 ttgtgttgcaagtcttgaaggagaaccagttatgtgcaaagttatctaagtgtgaattttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 25129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Original strand, 29324 - 29649
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||| | ||||||||||| || |||||||| |||||   ||  |||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  29324 tgaaggatgaggatatgcagaaaacgacctttaggacacgatatggacattatgaatataaagtaatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 29423  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
     ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| |||   ||||| |||||||| ||||| |||||| | || || ||||||  |||||||||  ||    
T  29424 catggagtatatgaaccgaattttccatgcttatttggataaatttgtggttgtgtttattgatgatattctaatttattctaagaatgaagaagagcat 29523  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  ||||| ||||| || | ||||||||| | ||||| |  ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || ||||||||||    
T  29524 gcagagcatctgaagattttgttgcaagtgtttaaagaaaggaagttgtatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttaagtgaagtaagttttcttg 29623  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    |||| ||||||| |||||||| ||||    
T  29624 gccacattatttatggtagtggtatt 29649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 49371 - 49046
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || || || |||||    | ||||||||||   | ||| ||||| || ||||| ||    
T  49371 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcactatgaatataaggtgatgcctttcggcgttactaatgcgcctggtgtgtt 49272  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
    |||||| || |||||    ||||| ||||||||| | |||   ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || |||||| ||||||||||  ||    
T  49271 tatggagtatatgaacaaaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttgatttattctaagactgaagaagagcat 49172  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  | ||| ||||| |||| ||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | | | || ||||||||||    
T  49171 gcagaacatctgaagattgtattgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgagttctggttaagtcaagtaagttttcttg 49072  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    ||||||| |||| |||||||| ||||    
T  49071 gccatatcatttatggtagtggtatt 49046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 24481 - 24156
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || || || ||    
T  24481 tgaaggatgacgatatgcagaagacagcctttaggacacgatatggacattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggggtgtt 24382  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||||| | | |||   ||||| |||||||| ||||| |||||| |||| || |||||| ||||||| ||  ||    
T  24381 tatggagtatatgaaccgaattttccatgcttctctggataaatttgtggttgtgtttattgatgatattctgatttattctaagactgaagaggagcat 24282  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  | ||| ||||| |||| ||||||||  | ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| | ||| || ||||||||||    
T  24281 gcagaacatctgaagattgtgttgcaagtattaaaagaaaagaagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaagtaagttttcttg 24182  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||    
T  24181 gccacattatttctggttgtggtatt 24156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Original strand, 44456 - 44781
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || || || |||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  44456 tgaaggatgaggatatggagaagacggcctttaggacacgttatggtcactatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 44555  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
    |||||| || |||||    ||||| ||||| ||| | |||   ||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||| || |||||||  ||    
T  44556 tatggagtatatgaaaaaaattttccatgcatatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttaatttattctaagactaaagaagagcat 44655  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
     | || ||| ||||| |||| ||||||||  ||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||| || ||||||||||    
T  44656 acaaaacatctgaagattgtattgcaagtattgaaagaaaataagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgaattttggttaagtgaagtaagttttcttg 44755  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    |||  |||||||||||||||| ||||    
T  44756 gccccattatttctggtagtggtatt 44781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 109897 - 109572
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||    | ||||||||||  || ||| ||||  ||  |||| ||    
T  109897 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcattatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgtgcctagtgtgtt 109798  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
    |||||| |  ||||| || ||||| ||||| ||| |||||   ||||| |||||||| ||||| || ||  |||| || |||||| ||||||||||  ||    
T  109797 tatggagtctatgaaccgaattttccatgcctatctagataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcgtgatttattctaagactgaagaagagcat 109698  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  | ||| ||||| |||| ||||||||  |||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || |||||||| | ||| || ||||||||||    
T  109697 gcagaacatctgaagattgtattgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcaaaatgcgagttctggttaagtgaagtaagttttcttg 109598  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||    
T  109597 gccatattatttcttgtagtggtatt 109572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 55022 - 55346
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| | || |||||||||||| ||||||| ||||| || ||||| || || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||||||||     
T  55022 gattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacacgatatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacct 55121  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    || || |||||||| ||  ||||||| || || ||||| | ||| ||||  ||||| ||||| ||  | || |||||||| || ||||| ||  ||||||    
T  55122 ggagtgtttatggagtaattgaatcgcatcttccatgcatttttggatccctttgtggttgtttttctggatgatatttttatttactccaatactgaag 55221  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| | |||||||| ||  | ||||| || || || |||||||| |||||||||||  |||| ||    
T  55222 aagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtttaaagagaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgagttctggttgaaaaaggtaag 55321  T
Q  301 ttttcttggccatattatttctggt 325  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    
T  55322 ttttcttggccatgttatttctggt 55346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 74 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 8574 - 8314
Alignment:
Q  74 atgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacg 173  Q
    |||||||||  || ||| |||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| |||||||| || ||||| || || || |    
T  8574 atgcctttcggtgttacgaatgcacctgtagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcgtttcgtggttgtttttatcgatg 8475  T
Q  174 atattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaa 273  Q
    |||||||||| ||||| |||||| | |||||| || |  ||||||||||| | |||||||||||| ||||||| || |||   ||||| || ||||| ||    
T  8474 atattttgatttactccaagtctaaggaagaacattctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagaaaagaagcattatgcgaaattgtctaa 8375  T
Q  274 gtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    ||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| ||| |||||||| |||||| ||||    
T  8374 gtgcgaattctggttgaaagaagtgagctttcttggacatgttatttctagtagtggtatt 8314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 173 - 325
Target Start/End: Original strand, 44846 - 44998
Alignment:
Q  173 gatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaa 272  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| |||||| || |||||||||| ||  | |||||||| ||||| |    
T  44846 gatattttgatatactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaaatgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtcta 44945  T
Q  273 agtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggt 325  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  44946 agtgtgacttctggttgaaagaggtgagttttcttggccatgttatttctggt 44998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 38 - 334
Target Start/End: Original strand, 8876 - 9172
Alignment:
Q  38 tttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatg 137  Q
    ||||||||||| || |||||||| |||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| |||||| | ||||||||    ||||| ||||    
T  8876 tttaggacacgatatggacattatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatgaagtacatgaacttaattttccatg 8975  T
Q  138 cttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagt 237  Q
    ||||| | |||   ||||| || ||||| ||||| ||||| || || || |||||| ||||||||||  ||||  ||||| ||||  || | ||||||||    
T  8976 cttatctggataaatttgtggtcgtgtttattgatgatatctttatttattctaagactgaagaagagcatgcagagcatctgaaaattatgttgcaagt 9075  T
Q  238 gctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    | ||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||   ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  9076 gttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtccaaatgtgaattctggttatgtgaagtgtgttttcttcgccatattatttctggtagtggtatt 9172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 104 - 326
Target Start/End: Original strand, 13345 - 13567
Alignment:
Q  104 gtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaag 203  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| ||||| || || ||||  || |  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  13345 gtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgatttaaaagatgatattttgatttactccaagtctgaagaag 13444  T
Q  204 aaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttt 303  Q
    || |||   ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||    
T  13445 aacatgatgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaagtgcgaattctggttaaaagaagtgagctt 13544  T
Q  304 tcttggccatattatttctggta 326  Q
    |||||| ||| ||||||||||||    
T  13545 tcttggacatgttatttctggta 13567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 74 - 324
Target Start/End: Original strand, 23178 - 23428
Alignment:
Q  74 atgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacg 173  Q
    |||||||||  || ||| |||||||| || || |||||||| || |||||||  || || ||||| | ||| ||||| || || |||||||| || ||||    
T  23178 atgcctttcggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcacatcttccatgcatttttggatcggttagtagttgtgtttatcgacg 23277  T
Q  174 atattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaa 273  Q
    | |||||||| ||||| ||  ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||  | ||||||||  |||| ||    
T  23278 acattttgatttactccaaaactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaactgtctaa 23377  T
Q  274 gtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctgg 324  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23378 gtgtgaattctggttgaaagaagtgagttttcttggccatgttatttctgg 23428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1477 (Bit Score: 74; Significance: 7e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold1477
Description:

Target: scaffold1477; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 493 - 169
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||   || ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  493 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattaagaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 394  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
    |||| | || ||||| || ||||| ||||| ||| | |||   ||  | ||||| || ||||| || |||||||| || | || | ||||||||||  ||    
T  393 tatgaagtatatgaaccgaattttccatgcctatctggataaattcatggttgtatttattgatgacattttgat-tattttaggactgaagaagagcat 295  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  | ||| ||||| |||| ||||||||  ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||||||||    
T  294 gcagaacatctgaagattgtattgcaagtattgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtcaaagtgtgatttctggttaagtgatgttagttttcttg 195  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    |||| ||||||||| |||||| ||||    
T  194 gccacattatttcttgtagtggtatt 169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0304 (Bit Score: 74; Significance: 7e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0304
Description:

Target: scaffold0304; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Original strand, 1524 - 1849
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||||| || | ||| || |||||    | |||  |||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  1524 tgaaggatgaggatatgcagaagacggtctttaggacacgatatgaacactatgaatataaggtgatatctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 1623  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
    |||||| || || || || ||||| ||||| ||| | |||   ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || |||||| ||||||||||  ||    
T  1624 tatggagtatataaaccgaattttccatgcctatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttgatttattctaagactgaagaagagcat 1723  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  |  || ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||    
T  1724 gcagaagatctgaagattgtattgcaagtgttgaaagagaagaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgagttctggttaaatgaagttagttttcttg 1823  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    |||| ||||||| |||||||| ||||    
T  1824 gccacattatttatggtagtggtatt 1849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 74; Significance: 7e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 326
Target Start/End: Original strand, 31358 - 31675
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||      ||||||||||| || ||| ||||| || || |||||    
T  31358 tgaaagatgaggatatgcagaagacggcctttaggagacgatatggacattacgaatacaagttgatgcctttcagtgttactaatgcgcctggggtatt 31457  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||||| | | | |   ||||| || ||||| ||||| |||||| |||| || |||||| ||||||| ||  ||    
T  31458 tatggaatatatgaaccgaattttccatgcttttctggttaaatttgtggtggtgtttattgatgatattctgatttattctaagactgaagaggagcat 31557  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  ||||| ||||| || | ||||||||  ||||||| || ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||| |    
T  31558 gcagagcatctgaagattatattgcaagtcttgaaagaaaagaagttgtatgcaaagctgtcaaagtgtgagttctggttaagtgaagtgagttttctgg 31657  T
Q  309 gccatattatttctggta 326  Q
    | || |||||||||||||    
T  31658 gtcacattatttctggta 31675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1288 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold1288
Description:

Target: scaffold1288; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 9 - 329
Target Start/End: Original strand, 893 - 1213
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| | ||||||||||| || ||||||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || || || ||    
T  893 tgaaggatgaggatatgcagaagacgacctttaggacacgatatggacattacgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggcgtgtt 992  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||| ||  | |||   || || |||| ||| ||||| || || ||||| || ||||||  ||||||||| |||    
T  993 tatggagtatatgaaccgaattttccatgcctacctggataaattcgtggttgagtttattgatgacatcttgatttattctaagaatgaagaagagaat 1092  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  | ||| ||||| |||| ||||||||  | || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||    
T  1093 gcagaacatctgaagattgtattgcaagtattaaaggagaagaagttgtatgccaagttgtcgaagtgtgaattttggttaagtgaagtgagttttcttg 1192  T
Q  309 gccatattatttctggtagtg 329  Q
    |||| ||||||||||| ||||    
T  1193 gccacattatttctggaagtg 1213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Original strand, 9500 - 9821
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| || || || ||||| ||    
T  9500 tgaaggatgaagatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctggtgtgtt 9599  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
     ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||  || ||    |||| |||||||| ||||| |||||| |||| ||  ||| | ||||||| ||  ||    
T  9600 catggagtatatgaaccgaattttccatgcctacctaaat----ttgtggttgtgtttattgatgatattctgatttaagctaggactgaagaggagcat 9695  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
     |  | ||||||||| |||| |||||| |  |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| | ||| || || |||||||    
T  9696 acagaacatttgaagattgtgttgcaaattttgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaagtaagatttcttg 9795  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||    
T  9796 gccacattatttctggtagtggtatt 9821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Original strand, 19714 - 20035
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| || || || ||||| ||    
T  19714 tgaaggatgaagatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctggtgtgtt 19813  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
     ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||  || ||    |||| |||||||| ||||| |||||| |||| ||  ||| | ||||||| ||  ||    
T  19814 catggagtatatgaaccgaattttccatgcctacctaaat----ttgtggttgtgtttattgatgatattctgatttaagctaggactgaagaggagcat 19909  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
     |  | ||||||||| |||| |||||| |  |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| | ||| || || |||||||    
T  19910 acagaacatttgaagattgtgttgcaaattttgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaagtaagctttcttg 20009  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||    
T  20010 gccacattatttctggtagtggtatt 20035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 107 - 334
Target Start/End: Original strand, 5487 - 5714
Alignment:
Q  107 tttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaa 206  Q
    |||||||| || ||||| || ||||| ||||||||| | |||   ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || || ||| ||||||||||      
T  5487 tttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttgatttattcaaagactgaagaagagc 5586  T
Q  207 atgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttct 306  Q
    ||||  | ||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||| || ||||||||    
T  5587 atgcagaacatctgaagattgtgttgcaagtgttgaaagagaagaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgagttctggttaagtgaagtaagttttct 5686  T
Q  307 tggccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    |||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  5687 tggccacattagttctggtagtggtatt 5714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 107 - 334
Target Start/End: Original strand, 9918 - 10145
Alignment:
Q  107 tttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaa 206  Q
    |||||||| || ||||| || ||||| ||||||||| | |||   ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || || ||| ||||||||||      
T  9918 tttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttgatttattcaaagactgaagaagagc 10017  T
Q  207 atgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttct 306  Q
    ||||  | ||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||| || ||||||||    
T  10018 atgcagaacatctgaagattgtgttgcaagtgttgaaagagaagaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgagttctggttaagtgaagtaagttttct 10117  T
Q  307 tggccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    |||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  10118 tggccacattagttctggtagtggtatt 10145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 92 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 25578 - 25348
Alignment:
Q  92 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 191  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||| | || |||||| ||||| | || |||||||| || |||||||| || ||||||||| | || || |    
T  25578 aatgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaa 25479  T
Q  192 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 291  Q
    ||||||| |||||  ||||  ||||||||| | |||| ||||||||  ||||||||||  |||| | |||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  25478 agtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaa 25379  T
Q  292 tgaggtgagttttcttggccatattatttct 322  Q
     || |||||||| ||||| ||| | ||||||    
T  25378 ggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 25348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 92 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 15092 - 14862
Alignment:
Q  92 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 191  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||| | || |||||| ||||| | || |||||||| || |||||||| || ||||||||| | || || |    
T  15092 aatgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaa 14993  T
Q  192 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 291  Q
    ||||||| |||||  ||||  ||||||||| | |||| ||||||||  ||||||||||  |||| | |||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  14992 agtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaa 14893  T
Q  292 tgaggtgagttttcttggccatattatttct 322  Q
     || |||||||| ||||| ||| | ||||||    
T  14892 ggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 14862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 92 - 309
Target Start/End: Original strand, 11296 - 11513
Alignment:
Q  92 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 191  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||| | || |||||| ||||| | || |||||||| || |||||||| || ||||||||| | || || |    
T  11296 aatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcga 11395  T
Q  192 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 291  Q
    ||||||| |||||  ||    ||||||||| | |||| ||||||||  ||||||||||  |||||| ||| ||||| |  |||||||| || ||||||||    
T  11396 agtctgaggaagagcataatgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttatgtgcaaagttatataagtgtgagttttggttgaa 11495  T
Q  292 tgaggtgagttttcttgg 309  Q
     || |||||||| |||||    
T  11496 ggaagtgagtttccttgg 11513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1373 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold1373
Description:

Target: scaffold1373; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Original strand, 873 - 1198
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| || || || ||||| ||    
T  873 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctggtgtgtt 972  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
    |||||| || ||||| |  ||||| |||| || | | |||   ||||||||||| ||||||||||||||||| || || || |||  |||||| ||  ||    
T  973 tatggagtatatgaaccaaattttccatgattttctggataaatttgttgttgtattcattgacgatattttaatctattccaagaatgaagaggagcat 1072  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  ||||| |||   |||| ||||||||  ||||||| || | ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| | ||| ||||||||||| |    
T  1073 gcagagcatctgagaattgtgttgcaagttttgaaagaaaagaggttgtatgcaaagttgtcaaaatgtgagttctggttaagtgaagtgagttttctgg 1172  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||    
T  1173 gtcatattatttctggtagtggtatt 1198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 101 - 322
Target Start/End: Original strand, 64639 - 64860
Alignment:
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    ||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||||||| | |||   ||||| |||||||| ||||| || || || || || || ||| ||||||    
T  64639 ggtgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttaatttattcaaagactgaag 64738  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||  ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| || ||    
T  64739 aagagcatgcagagcatctgaagattgtgttgcaagtgttgaaaaagaagaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgaattctggttaagtgaagtaag 64838  T
Q  301 ttttcttggccatattatttct 322  Q
    |||||||||||| |||||||||    
T  64839 ttttcttggccacattatttct 64860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 66
Target Start/End: Original strand, 64558 - 64615
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaata 66  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| | ||||||||||| || || |||||||||||    
T  64558 tgaaggatgaggatatgcagaagacgtcctttaggacacgatatggtcattacgaata 64615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 74 - 334
Target Start/End: Original strand, 18445 - 18705
Alignment:
Q  74 atgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacg 173  Q
    |||||||||  || ||| ||||||||  | ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| ||||  || || ||||| || || || |    
T  18445 atgcctttcggtgttacgaatgcacctagagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcagttcgtggttgtttttatcgatg 18544  T
Q  174 atattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaa 273  Q
    |||||||||| ||| | |||| |||||||||| |||   ||||||||||| | |||||||||||| | |||||||  ||| | ||||| || ||||| ||    
T  18545 atattttgatttaccccaagtttgaagaagaacatgatgagcatttgaagctggttttgcaagtgttaaaagagatgaagctttatgcgaaattgtctaa 18644  T
Q  274 gtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    ||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| ||| |||||| |||||||| ||||    
T  18645 gtgcgaattctggttgaaagaagtgagctttcttggacatgttatttatggtagtggtatt 18705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1985 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold1985
Description:

Target: scaffold1985; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 74 - 325
Target Start/End: Original strand, 444 - 695
Alignment:
Q  74 atgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacg 173  Q
    |||||||||  || ||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||  | ||||||||||| || |    
T  444 atgcctttcggtgttacgaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcttagttgtgttcatcgatg 543  T
Q  174 atattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaa 273  Q
    ||| ||||||  |||| ||| || |||||||| ||||  ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||| ||  | ||||| || || |||||    
T  544 ataatttgattgactccaagactaaagaagaacatgctgagcatttgaagattgtcctgcaagtgttaaaagagaagaaactttatgctaaattatcaaa 643  T
Q  274 gtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggt 325  Q
    |||||| |||||| |||| || || ||||||||||||||| |||||||||||    
T  644 gtgtgagttctggctgaaagaagtaagttttcttggccatgttatttctggt 695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1830 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold1830
Description:

Target: scaffold1830; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 101 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 1169 - 936
Alignment:
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    ||||| |||||||| || |||||  | ||||| ||||||||| | |||   ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || || ||| ||||||    
T  1169 ggtgtgtttatggagtatatgaacagaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttgatttattcaaagactgaag 1070  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||  ||||  | ||| ||||  |||| ||||||||  ||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||| || ||    
T  1069 aagagcatgcagaacatctgaatattgtattgcaagtattgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgagttctagttaaatgaagtaag 970  T
Q  301 ttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  969 ttttcttggccatattatttctggtagtggtatt 936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 2874 - 2637
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| |||| |||||||||||  |||||||  ||||||| || || || ||||| || ||||||  || |||||| |||| || ||||||||||||     
T  2874 gattaaagtgaaagatgaagatatccagaagacaccttttagaacgcgatatggacactatgaataaaaagtgatgccgttcagtgttacaaatgcacct 2775  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
     | || |||||||| ||||||||||| || |||||||| | |||  ||| ||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  2774 cgagtgtttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttgaatcatttcgtggttgtttttattgatgatattttgatttactgcaagtctgaag 2675  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtg 238  Q
    ||||| ||||  ||||||||||| | ||||||||||||    
T  2674 aagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtg 2637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 28792 - 28467
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||| | ||||||||||| || |||||||| || ||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||||||    
T  28792 tgaaggatgaggatatgcagaaaacgacctttaggacacgatatggacattatgagtataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtatt 28693  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
    |||||| || |||||  | ||||| ||||| ||| | |||   ||||| |||||||| ||||| |||||  | || || |||| |  ||||||| |  ||    
T  28692 tatggagtatatgaacagaattttccatgcctatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgatatcctaatttattctaggaatgaagaaaagcat 28593  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  ||||| ||| | |||| ||||||||| ||||||| || || || |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || ||||||||||    
T  28592 gcagagcatctgatgattgtgttgcaagtgttgaaagaaaagaaattgtatgccaagttgtccaaatgtgaattctggttaagtgaagtaagttttcttg 28493  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||    
T  28492 gccatattatttatggtagtggtatt 28467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 4)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Original strand, 31716 - 32041
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||| ||||| || ||| ||||||| || ||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  31716 tgaaagatgaggacatgcagaagactgcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 31815  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
     ||||| || |||||  | ||||||||||||||  | |||   ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || || |   |||| |||||  ||    
T  31816 catggagtatatgaacagaatttttcatgcttacctggataaatttgtggttgtattcattgatgacattttgatctattcgagaactgaggaagagcat 31915  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  | ||| ||| | |||| ||||||||  |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||| | ||| |||||||||||||    
T  31916 gcagaacatctgaggattgtattgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcaaagtgcgagttttggttaagtgaagtgagttttcttg 32015  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||    
T  32016 gccatattatttctggtagtggtatt 32041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 101 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 42433 - 42212
Alignment:
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | || |||||| ||||| | || |||||||| || |||||||| || ||||||||| | || || |||||||| |    
T  42433 ggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgagg 42334  T
Q  201 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 300  Q
    ||||  ||||  ||||||||| | |||| ||||||||  ||||||||||  |||| | |||||||||||| |||||||| || |||||||| || |||||    
T  42333 aagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgag 42234  T
Q  301 ttttcttggccatattatttct 322  Q
    ||| ||||| ||| | ||||||    
T  42233 tttccttggtcatgtgatttct 42212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 66
Target Start/End: Original strand, 54450 - 54507
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaata 66  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  54450 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattacgaata 54507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 219 - 334
Target Start/End: Original strand, 55149 - 55264
Alignment:
Q  219 tgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattat 318  Q
    ||||| |||| ||||||||  ||||||| || ||||| ||||| |||||||| || |  || || ||||| | ||| || |||||||||||||| |||||    
T  55149 tgaagattgtattgcaagttttgaaagaaaagaagttgtatgctaagttgtcgaaataagagttttggttaagtgaagtaagttttcttggccacattat 55248  T
Q  319 ttctggtagtgatatt 334  Q
    ||||||||||| ||||    
T  55249 ttctggtagtggtatt 55264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 250887 - 250562
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || || || ||    
T  250887 tgaaggatgagaatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggagtgtt 250788  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
     ||||| || ||||| || ||||| ||||||| | | |||   |||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||| ||||||| ||  ||    
T  250787 catggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgatgacatcttgatttattctaagactgaagaggagcat 250688  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||| || || | ||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| | ||| ||||||||||| |    
T  250687 gcagagcatctgaagattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttgtcgaaatgtgagttctggttaagtgaagtgagttttctgg 250588  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    | || ||||||||||| |||| ||||    
T  250587 gtcacattatttctggcagtggtatt 250562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 225 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 195291 - 195182
Alignment:
Q  225 ttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctgg 324  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  195291 ttgtattgcaagtactgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaaatgtgaattctggttaagtgaagtgagttttcttggccacattatttctgg 195192  T
Q  325 tagtgatatt 334  Q
    ||||| ||||    
T  195191 tagtggtatt 195182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0501 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0501
Description:

Target: scaffold0501; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 107 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 4363 - 4145
Alignment:
Q  107 tttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaa 206  Q
    |||||||| || ||||||||||| || ||||| | ||| ||| | ||||| ||||| || ||||| |||||| |||| ||||  |||  ||||||||||     
T  4363 tttatggagtatatgaatcgtatcttccatgcatttttggatggctttgtggttgtttttattgatgatattctgatttacttcaagaatgaagaagaac 4264  T
Q  207 atgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttct 306  Q
    ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || || || |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  4263 atgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgagttctggttgaaagaggtaagttttct 4164  T
Q  307 tggccatattatttctggt 325  Q
    ||||||| |||||| ||||    
T  4163 tggccatgttatttttggt 4145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 92 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 7337 - 7107
Alignment:
Q  92 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 191  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||| | || |||||| ||||| | || |||||||| || ||||| || || ||||||||| | || || |    
T  7337 aatgcgccaggtgtttttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgtttatagatgatattttggtgtattcga 7238  T
Q  192 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 291  Q
    ||||||| |||||  ||||  ||||||||| | |||| ||||||||  ||||||||||  |||||| ||| |||||||| |||||||| || ||||||||    
T  7237 agtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttatgtgctaagttgtctaagtgtgagttttggttgaa 7138  T
Q  292 tgaggtgagttttcttggccatattatttct 322  Q
     || |||||||| ||||| ||| | ||||||    
T  7137 ggaagtgagtttccttggtcatttgatttct 7107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 92 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 395 - 165
Alignment:
Q  92 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 191  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||| | || |||||| ||||| | || |||||||| || ||||| || || ||||||||| | || || |    
T  395 aatgcgccaggtgtttttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgtttatagatgatattttggtgtattcga 296  T
Q  192 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 291  Q
    ||||||| |||||  ||||  ||||||||| | |||| ||||||||  ||||||||||  |||||| ||| ||||| || |||||||| || ||||||||    
T  295 agtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagttttgaaagagaaccagttatgtgctaagttttctaagtgtgagttttggttgaa 196  T
Q  292 tgaggtgagttttcttggccatattatttct 322  Q
     || |||||||| ||||| ||| | ||||||    
T  195 ggaagtgagtttccttggtcatttgatttct 165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 3)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 128 - 334
Target Start/End: Original strand, 33911 - 34117
Alignment:
Q  128 atttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttg 227  Q
    ||||| ||||||||||| ||| | || || ||||| || ||||| || |||||||| || |||| ||||||||||||  ||||  ||||||| ||| ||     
T  33911 attttccatgcttatttggattggttcgtggttgtatttattgatgacattttgatttattctaggtctgaagaagagcatgcagagcatttaaagatta 34010  T
Q  228 ttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtag 327  Q
    | ||||||||| | || || || ||| | |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  34011 tgttgcaagtgttaaaggaaaagaagatgtatgccaagttgtccaaatgtgaattctggttaagtgaagtaagttttcttggccatattatttctgatag 34110  T
Q  328 tgatatt 334  Q
    || ||||    
T  34111 tggtatt 34117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 240 - 334
Target Start/End: Original strand, 510 - 604
Alignment:
Q  240 tgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  510 tgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaagtgagttttcttggccacattatttatggtagtggtatt 604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 240 - 334
Target Start/End: Original strand, 4830 - 4924
Alignment:
Q  240 tgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  4830 tgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaagtgagttttcttggccacattatttatggtagtggtatt 4924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 116 - 325
Target Start/End: Original strand, 7839 - 8048
Alignment:
Q  116 tacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagc 215  Q
    |||| |||||| || |||||||| | ||| ||||| || || ||||| ||  | |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||  |||    
T  7839 tacacgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgtttttgtcgacgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagc 7938  T
Q  216 atttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatat 315  Q
    || ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||||| ||  | || |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||| |    
T  7939 atctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaactatctaagtgtgagttctggttgaaagaggtaagttttcttgcccatgt 8038  T
Q  316 tatttctggt 325  Q
    ||||||||||    
T  8039 tatttctggt 8048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 41963 - 41639
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    | ||||||||||   | ||| ||||| || ||||| ||    
T  41963 tgaaggatgaggatatgcagaatacggcctttaggacacgttatggtcactatgaatataaggtgatgcctttcggagttactaatgcgcctggtgtgtt 41864  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
    |||||| || |||||  | ||||| ||||||||| | |||   ||||| |||||||| ||||| || || || || || ||||||  |||||||||  ||    
T  41863 tatggagtatatgaacagaattttgcatgcttatatggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttaatttattctaagaatgaagaagagcat 41764  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||| || || ||||| |||| |||| |||| |||||||||||||||||    || || ||||||||||    
T  41763 gcagagcatctgaagattgtgttgcaagtgttgaa-gaaaagaagttgtatgacaagctgtccaagtgtgaattctggttacgcgaagtaagttttcttg 41665  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||    
T  41664 gccatattatatctggtagtggtatt 41639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 51389 - 51624
Alignment:
Q  14 gatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatgg 113  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||||||||  | ||||||||||    
T  51389 gatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatacaaagtcatgccttttggtgttaccaatgcacctcgagtatttatgg 51488  T
Q  114 aatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaa 213  Q
    | || |||||||| || ||||||||   ||| ||||  ||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||  |    
T  51489 agtatatgaatcgcatctttcatgcacttttggatcactttgtggttgttttcatcgatgacattttgatttactccaagactgaagaagaagatgctga 51588  T
Q  214 gcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaa 249  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  51589 gcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaa 51624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2111 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold2111
Description:

Target: scaffold2111; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 2 - 334
Target Start/End: Original strand, 619 - 951
Alignment:
Q  2 attaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgg 101  Q
    |||||| |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| |||||||| |    
T  619 attaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcacctg 718  T
Q  102 gtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaaga 201  Q
    |||| || ||||| || |||||| | ||||||||||||||  |||||   ||||| ||||| |||||||| || ||||| || || || |   | || ||    
T  719 gtgtgttcatggagtatatgaatagaatttttcatgcttacctagataaatttgtggttgtattcattgatgacatttttatctattcaagaaccgagga 818  T
Q  202 agaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagt 301  Q
    |||  | ||  | ||   |||| |||| |||||  |  |||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |  |||||||| |  || |||| |    
T  819 agagcacgcagaacaccagaagattgtgttgcagattttgaaagagaaaaagttgtatgccaagttttcgaagtgcgggttctggttaagggaagtgaat 918  T
Q  302 tttcttggccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  919 tttcttggccatattatttctggtagtggtatt 951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 173 - 325
Target Start/End: Original strand, 3556 - 3708
Alignment:
Q  173 gatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaa 272  Q
    ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||  ||||| ||||| || | ||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || || || |    
T  3556 gatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattatcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatcta 3655  T
Q  273 agtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggt 325  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  3656 agtgtgagttctggttgaaagaggtaagttttcttggccatgttatttctggt 3708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 219 - 334
Target Start/End: Original strand, 1794 - 1909
Alignment:
Q  219 tgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattat 318  Q
    ||||| |||| ||||||||  |||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  1794 tgaagattgtattgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaagtgagttttcttggccacattat 1893  T
Q  319 ttctggtagtgatatt 334  Q
    ||||||||||| ||||    
T  1894 ttctggtagtggtatt 1909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 10441 - 10307
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||||||| || ||  | || ||||| || ||    | ||||||||||  || ||||||||||||     
T  10441 gattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagcttttagaacgcgggatggtcattatgagtataaggtgatgcctttcggtgttacaaatgcacct 10342  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttca 135  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  10341 ggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttca 10307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0730 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0730
Description:

Target: scaffold0730; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Original strand, 40 - 365
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||| |||||||| ||| ||||||| || ||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  40 tgaaagatgaagacatgcagaagactgcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 139  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
     ||||| || |||||| | ||||||||||||||| | |||   ||||| || |||| |||||| || |||||||| || || |   | || |||||  ||    
T  140 catggagtatatgaatagaatttttcatgcttatctggataaatttgtggtagtgtacattgatgacattttgatctattcgacaacggaggaagagcat 239  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  | ||| |||   |||| ||||||||  |||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||    
T  240 gcagaacatctgagaattgtgttgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaagtaagtttccttg 339  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||    
T  340 gccatattatttctggaagtggtatt 365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 912 - 588
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||| |||||||| ||    
T  912 tgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgccgggtgtgtt 813  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
     ||| | || ||||| || ||||| ||||||| | | |||   ||||| || ||||| ||||| || ||| | || || |||||| ||||||| ||  ||    
T  812 catgtagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggtggtgtttattgatgacattctaatttattctaagactgaagaggagcat 713  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  | ||| ||||| |||| ||||||||| ||||||| || ||||| ||||| || ||||| || ||||| || ||| | | ||| || |||||||| |    
T  712 gcagaacatctgaagattgtattgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgctaaattgtcgaaatgtgagttttgg-taagtgaagtaagttttctgg 614  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||    
T  613 gccacattatttctggtagtggtatt 588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 7881 - 7824
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaata 66  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||    
T  7881 tgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaata 7824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 326
Target Start/End: Original strand, 10825 - 11142
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||   || ||||||||||  || ||| || || || ||||| ||    
T  10825 tgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctggtgtgtt 10924  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
     ||||| || ||||| || |||||||||||||   | |||   || || || || || ||||| |||||||| || || |||||| ||||||| ||  ||    
T  10925 catggagtatatgaaccgaatttttcatgctttcctggataaattcgtagtggtatttattgatgatattttaatttattctaagactgaagaggagcat 11024  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  | ||| ||| | |||| ||||||||  | |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||| | | ||| || ||||| ||||    
T  11025 gcagaacatctgaggattgtattgcaagtatttaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcaaaatgtgagttttggctaagtgaagtaagtttccttg 11124  T
Q  309 gccatattatttctggta 326  Q
    | ||||||||||||||||    
T  11125 gtcatattatttctggta 11142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 169 - 325
Target Start/End: Original strand, 28770 - 28926
Alignment:
Q  169 tgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttg 268  Q
    ||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||     
T  28770 tgangatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaatta 28869  T
Q  269 tcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggt 325  Q
    || |||||| | || |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  28870 tctaagtgtaagttatggttgaaagaggtaagttttcttggccatgttatttctggt 28926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 93 - 249
Target Start/End: Original strand, 28586 - 28742
Alignment:
Q  93 atgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaa 192  Q
    ||||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| |||||||| || ||||| || || |||||||||||||| ||||| ||    
T  28586 atgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgtttcgtggttgtttttatcgacgatattttgatttactccaa 28685  T
Q  193 gtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaa 249  Q
    | ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  28686 gactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaa 28742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 225 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 36164 - 36055
Alignment:
Q  225 ttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctgg 324  Q
    |||| ||||||||  ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || |||||||||||||||||||||| |||    
T  36164 ttgtattgcaagtattgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtcaaagtgtgagttctggttaagtgaagtaagttttcttggccatattatttatgg 36065  T
Q  325 tagtgatatt 334  Q
    ||||| ||||    
T  36064 tagtggtatt 36055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 37915 - 37590
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||    | |||||||| |  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  37915 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttagaacacgttatggtcattacgaatacaaggtgatgccttacggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 37816  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
     ||||| || ||||| || ||||| ||||||||  | |||   ||||| ||||  || ||||| || ||| |||| || || ||| ||||||||||  ||    
T  37815 catggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctggataaatttgtggttgaatttattgatgacattctgatttattcaaagactgaagaagagcat 37716  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  | ||| ||||| |||| ||  ||||  ||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| | | | |||||||||||||    
T  37715 gcagaacatctgaagattgtattagaagtattgaaagaaaagaagttgtatgctaagttgtcaaagtgtgagttttggttaagtaaagtgagttttcttg 37616  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    |||| ||||||| |||||||| ||||    
T  37615 gccacattatttatggtagtggtatt 37590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 326
Target Start/End: Original strand, 79870 - 80187
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||   || ||||||||||  || ||| ||||| |  ||||| ||    
T  79870 tgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaatgcgcttggtgtgtt 79969  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
     ||||| || |||||  | |||||||||||||   | |||   ||||| || || |||||||| |||||||| || || |||||| ||||||| ||  ||    
T  79970 catggagtatatgaacaggatttttcatgctttcctggataagtttgtggtagtattcattgatgatattttaatttattctaagactgaagaggagcat 80069  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    || |||||| ||| | |||| || || ||  ||||||| || ||||| ||||| || |||||||| || || || ||||| | ||| || ||||| ||||    
T  80070 gcaaagcatctgaggattgtattacaggttttgaaagaaaagaagttgtatgctaaattgtcaaaatgcgagttttggttaagtgaagtaagtttccttg 80169  T
Q  309 gccatattatttctggta 326  Q
    |||||||||||| |||||    
T  80170 gccatattatttttggta 80187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 57; Significance: 9e-24; HSPs: 3)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 190 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 14286 - 14142
Alignment:
Q  190 taagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttg 289  Q
    |||| ||||||||||  ||||  ||||| ||||| |||| |||||| |  ||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||     
T  14286 taagactgaagaagagcatgcagagcatctgaagattgtgttgcaaatattgaaagaaaagaagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggtta 14187  T
Q  290 aatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  14186 attgaagtgagttttcttggccacattatttctggtagtggtatt 14142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 131 - 322
Target Start/End: Original strand, 5969 - 6160
Alignment:
Q  131 tttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttt 230  Q
    |||||| ||||| | || |||||||| || |||||||| || ||||||||| | || || |||||||| |||||  ||||  ||||||||| | |||| |    
T  5969 tttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcgaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgt 6068  T
Q  231 tgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttct 322  Q
    |||||||  ||||||||||  |||| | |||||||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||| | ||||||    
T  6069 tgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 6160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 14473 - 14431
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgtta 51  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  14473 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgtta 14431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0206 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0206
Description:

Target: scaffold0206; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 2 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 25387 - 25060
Alignment:
Q  2 attaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgg 101  Q
    |||||| |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||  || || |||||||||||   || ||||||||||  || ||  || || || |    
T  25387 attaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacaatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttattaacgcgcctg 25288  T
Q  102 gtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaaga 201  Q
    | || || ||||| || ||||| || ||||| ||||| | | | |||   || || || || || || || ||||||||||| || |||||| |||||||    
T  25287 gcgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcctttctggataaattcgtggtggtatttatagatgatattttgatttattctaagactgaaga 25188  T
Q  202 agaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagt 301  Q
     ||  ||||  |||| |||||| |||| |||||  |  ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| | ||| ||||||    
T  25187 ggagcatgcagagcacttgaagattgtgttgcagattttgaaagagagaaagttgtatgccaagttgtcgaagtgggagttctggttaactgaagtgagt 25088  T
Q  302 tttcttggccatattatttctggtagtg 329  Q
    ||||| |||||  |||||||||||||||    
T  25087 tttctaggccacgttatttctggtagtg 25060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0739 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0739
Description:

Target: scaffold0739; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 167 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 1161 - 1003
Alignment:
Q  167 attgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagt 266  Q
    ||||| |||||| |||| ||||| ||| ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||| || ||  | ||||| ||      
T  1161 attgatgatattctgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagaaaagaaactttatgctaaac 1062  T
Q  267 tgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggt 325  Q
    | || |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  1061 tatctaagtgtgagttctggttgaaagaggtaagttttcttggccatgttatttctggt 1003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 244 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 20881 - 20791
Alignment:
Q  244 agagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20881 agagaagaagttgtatgccaaattgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaagtgagttttcttggccatattatttctggtagtggtatt 20791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 244 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 25043 - 24953
Alignment:
Q  244 agagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25043 agagaagaagttgtatgccaaattgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaagtgagttttcttggccatattatttctggtagtggtatt 24953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 240 - 334
Target Start/End: Original strand, 546 - 640
Alignment:
Q  240 tgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  546 tgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaagtgagttttcttggccacattatttatggtagtggtatt 640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 43 - 334
Target Start/End: Original strand, 14786 - 15077
Alignment:
Q  43 gacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttat 142  Q
    ||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| || || || ||||| |||||||| ||||||||||  || || ||||||| |    
T  14786 gacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctggtgtttttatggagtacatgaatctaatcttccatgctttt 14885  T
Q  143 ttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctga 242  Q
     | |||   |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || || |||  ||| || ||  ||||  ||||| |||   |||| ||||||||| |||    
T  14886 ctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatattttaatctattccaagaatgaggaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagtgttga 14985  T
Q  243 aagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    | || || | ||| ||||| |||||||| || ||||| |||| ||| | ||| ||||| ||||| || || |||||||||||||||| ||||    
T  14986 aggaaaagaggttgtatgcaaagttgtcgaaatgtgagttctagttaagtgaagtgagctttctgggtcacattatttctggtagtggtatt 15077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 9328 - 9003
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    ||||||| || |||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||    | |||| |||||  || ||| || || || ||||| ||    
T  9328 tgaaggacgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgtctttcggtgttactaacgcgcctggtgtgtt 9229  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
     ||||| || ||||| |  ||||| ||||| ||| | |||   ||||| ||||| || ||||| || || || || || || ||| ||||||||||  ||    
T  9228 catggagtatatgaaccaaattttccatgcctatctggataaatttgtggttgtatttattgatgacatcttaatttattcaaagactgaagaagagcat 9129  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  | ||| ||||| |||| || |||||  |||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||| |||| ||| | ||| ||||||||||| |    
T  9128 gcagaacatctgaagattgtgttacaagttttgaaagagaaaaagttgtgtgctaagttgtcgaagtgtgagttctagttaagtgaagtgagttttctgg 9029  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||    
T  9028 gccacattatttctggtagtggtatt 9003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 66
Target Start/End: Original strand, 1530 - 1585
Alignment:
Q  11 aaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaata 66  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||    
T  1530 aaggatgaggatatgaagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaata 1585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 43183 - 42859
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||||||||| | |||| |||||| ||| ||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  43183 tgaaggatgagggtatgcagaagagggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 43084  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
     || || || ||||| || |||| | |||||||  | |||   ||||| |||||||| ||||| |||||| |||| || || ||| ||||||||||  ||    
T  43083 catcgagtatatgaaccgaatttct-atgcttacctggataaatttgtggttgtgtttattgatgatattctgatctattcaaagactgaagaagagcat 42985  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  | ||| ||||  |||| |||||| |  |||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| | ||| || || |||||||    
T  42984 gcagaacatctgaaaattgtgttgcaaatattgaaagagaagaagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaagtaagctttcttg 42885  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    |||| || ||||||||||||| ||||    
T  42884 gccacatcatttctggtagtggtatt 42859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0993 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0993
Description:

Target: scaffold0993; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 155 - 3
Alignment:
Q  1 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || || || |||||||| || ||   ||   ||||| ||| || ||||||||||||     
T  155 gattaaagtgaaggatgaagatatgcagaagacggcttttagaacgcggtatggacattatgagtataaagttttgcctctcagtgttacaaatgcacct 56  T
Q  101 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttt 153  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| ||||||||    
T  55 ggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcgttt 3  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 230 - 334
Target Start/End: Original strand, 23339 - 23443
Alignment:
Q  230 ttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtg 329  Q
    ||||||||| |||| || || ||| | |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23339 ttgcaagtgttgaaggaaaagaaggtgtatgccaagttgtccaaatgtgaattctggttaagtgaagtaagttttcttggccatattatttctggtagtg 23438  T
Q  330 atatt 334  Q
     ||||    
T  23439 gtatt 23443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0682 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0682
Description:

Target: scaffold0682; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 240 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 1919 - 1825
Alignment:
Q  240 tgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| | ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  1919 tgaaagagagaaagttgtatgccaagttgtcgaagtgcgagttctggttaagtgaagtgagttttctaggccacattatttctggtagtggtatt 1825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 20 - 326
Target Start/End: Original strand, 12349 - 12655
Alignment:
Q  20 gatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaataca 119  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||  || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| || ||||| || |    
T  12349 gatatgcagaagacggcctttaggacacaatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtata 12448  T
Q  120 tgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcattt 219  Q
     ||| || ||||| |||||||| || ||    ||||| ||||| || |||||  ||||| |||| || || ||| ||||||||||  ||||  | ||| |    
T  12449 cgaaccgaattttccatgcttacttggaaaaatttgtggttgtatttattgataatattctgatctattcaaagactgaagaagagcatgcagaacatct 12548  T
Q  220 gaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatt 319  Q
    |||| |||| |||||| |  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||  | ||| ||||||||||| ||||| || |||    
T  12549 gaagattgtgttgcaattattgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcaaagtgtaagttctggtaaagtgaagtgagttttctgggccacatcatt 12648  T
Q  320 tctggta 326  Q
    | |||||    
T  12649 tttggta 12655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0170 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0170
Description:

Target: scaffold0170; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 92 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 34269 - 34039
Alignment:
Q  92 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 191  Q
    ||||| || ||||| || ||||| || |||||| | || |||||| ||||| | || |||||||| || |||||||| || ||||||||| | || || |    
T  34269 aatgcgccaggtgtcttcatggagtatatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcga 34170  T
Q  192 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 291  Q
    ||||||| |||||  ||||  ||||||||| | |||| ||||||||  ||||||||||  |||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||| |    
T  34169 agtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttatgtgcaaagttgtctaagtgtgaattttggttgga 34070  T
Q  292 tgaggtgagttttcttggccatattatttct 322  Q
     || || ||||| ||||| ||| | ||||||    
T  34069 ggaagtaagtttccttggtcatgtgatttct 34039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 251 - 329
Target Start/End: Original strand, 5974 - 6052
Alignment:
Q  251 aagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtg 329  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5974 aagttgtatgccaagttgtcgaagtgcgagttctggttaagtgaagtgagttttcttggccatattatttctggtagtg 6052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 270
Target Start/End: Original strand, 19673 - 19934
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    | ||||||||||| || ||| |||||  | |  || ||    
T  19673 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattacgaatataaggtgatgcctttcagtgttactaatgcgtctgacgtgtt 19772  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||| || || |||   || || |||||||| ||||| || || ||||| || ||||||  |||||||||  ||    
T  19773 tatggagtatatgaaccgaattttccatgcctacttggataaattcgtggttgtgtttattgatgacatcttgatttattctaagaatgaagaagagcat 19872  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtc 270  Q
    ||  | ||| ||||| |||| ||||||||  | |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  19873 gcagaacatctgaagattgtattgcaagtattcaaagagaataagttgtatgccaagttgtc 19934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 2 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 8288 - 7965
Alignment:
Q  2 attaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgg 101  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |  | ||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || |||||||| |    
T  8288 attaaagtgaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgctttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctg 8189  T
Q  102 gtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaaga 201  Q
    | || |||||||| || |||||||  || || ||||| | ||| ||||| ||  |||||||||| || |||||||||||||| ||||  ||  |||| ||    
T  8188 gagtgtttatggagtatatgaatcacatcttccatgcctttttggatcggttcattgttgtgtttatcgacgatattttgatttacttcaaaactgagga 8089  T
Q  202 agaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagt 301  Q
     ||| ||||  | ||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || || || || ||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  8088 ggaacatgctgaacatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatctaaatgtgagttctggttgaaagaggtaagt 7989  T
Q  302 tttcttggccatattatttctggt 325  Q
    ||| | |||||| |||||||||||    
T  7988 tttatgggccatgttatttctggt 7965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 3)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 140
Target Start/End: Original strand, 9913 - 10044
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||   || ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  9913 tgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaatgcgccaggtgtgtt 10012  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgctt 140  Q
     ||||| || ||||| || |||||||||||||    
T  10013 catggagtatatgaaccgaatttttcatgctt 10044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 240 - 326
Target Start/End: Original strand, 10159 - 10245
Alignment:
Q  240 tgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggta 326  Q
    ||||||| || ||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| | ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10159 tgaaagaaaagaagttgtatgccaaattgtcaaaatgtgagttttggttaagtgaagtaagtttccttggccatattatttctggta 10245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 66
Target Start/End: Original strand, 18522 - 18579
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaata 66  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||    
T  18522 tgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttagaacacgatatggtcattacgaata 18579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 47; Significance: 9e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 240 - 326
Target Start/End: Original strand, 243 - 329
Alignment:
Q  240 tgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggta 326  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  243 tgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtccaaatgtgaattttggttaagtgaagtaagttttcttggccatattatttctggta 329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 92 - 309
Target Start/End: Original strand, 2074 - 2291
Alignment:
Q  92 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 191  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| |||||| | || |||||| ||||| | || | |||||| || ||||| || || ||||||||| | || || |    
T  2074 aatgcaccaggtgtctttatggaataaatgaatagaatatttcatccttatctggaccattttgtggtggtgttaatagatgatattttggtgtattcaa 2173  T
Q  192 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 291  Q
    ||||||| |||||  ||||  ||||||||| | || | ||||| ||  ||||||||||  |||||| ||| |||||||| |||||||| || |||||| |    
T  2174 agtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattatgttgcaggtcttgaaagagaaccagttatgtgctaagttgtctaagtgtgagttttggttgga 2273  T
Q  292 tgaggtgagttttcttgg 309  Q
     || |||||||| |||||    
T  2274 ggaagtgagtttccttgg 2291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 251 - 334
Target Start/End: Original strand, 16430 - 16513
Alignment:
Q  251 aagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| | ||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  16430 aagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaagtaagttttcttggccacattatttctggtagtggtatt 16513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0055 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0055
Description:

Target: scaffold0055; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 92 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 21429 - 21298
Alignment:
Q  92 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 191  Q
    |||||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| |    
T  21429 aatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactcca 21330  T
Q  192 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaag 223  Q
    || ||||||||||| ||||  ||||| |||||    
T  21329 agactgaagaagaacatgctgagcatctgaag 21298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0894 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0894
Description:

Target: scaffold0894; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 213 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 3989 - 3868
Alignment:
Q  213 agcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggcca 312  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| | ||||||||||||||| || || || ||||||||| | ||    
T  3989 agcatttgaaggtgattttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctatgtgtgaattctggttaaaagaagtaagttttcttagaca 3890  T
Q  313 tattatttctggtagtgatatt 334  Q
    | |||||| |||||||| ||||    
T  3889 tgttatttttggtagtggtatt 3868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 29199 - 28875
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||| || || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| || || || ||||| ||    
T  29199 tgaaggatgaggatatgcagaagatggcctttaggacacgatatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctggtgtgtt 29100  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 208  Q
    |||| | || ||||| |  ||||| ||||||| | | |||   |||||||| ||||| ||||| ||||| || || || ||||||  |||||| ||  ||    
T  29099 tatgtagtatatgaacctaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatcttaatctattctaagaatgaaga-gagcat 29001  T
Q  209 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 308  Q
    ||  ||||  |||   |||| ||||||||  ||||||| || | ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| |    
T  29000 gcagagcacctgagaattgtgttgcaagttttgaaagaaaagaggttgtatgcgaagttgtcaaaatgtgagttctggttaagtgaagtgagctttctgg 28901  T
Q  309 gccatattatttctggtagtgatatt 334  Q
    | || |||||||||||||||| ||||    
T  28900 gtcacattatttctggtagtggtatt 28875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1488 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1488
Description:

Target: scaffold1488; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 309
Target Start/End: Original strand, 943 - 1141
Alignment:
Q  110 atggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatg 209  Q
    |||||||| |||||| | || |||||| ||||||| || | |||||| || ||||| || || ||||||| | | || || |||||||| || ||  |||    
T  943 atggaatatatgaatagaatatttcatccttatttggaccattttgtggtggtgtttatagatgatatttgg-tgtattcgaagtctgaggaggagcatg 1041  T
Q  210 ccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttgg 309  Q
    |  ||||||||| | |||| ||||||||  ||||||||||  |||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||| | || |||||||| |||||    
T  1042 ctgagcatttgaggattgtgttgcaagttttgaaagagaaccagttatgtgctaagttgtcgaagtgtgaattttggttgcaggaagtgagtttccttgg 1141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 237
Target Start/End: Original strand, 1743 - 1888
Alignment:
Q  92 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 191  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||| | || |||||| ||||| | || |||||||| || ||||| || || ||||||||| | || || |    
T  1743 aatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgtttatagatgatattttggtgtattcga 1842  T
Q  192 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagt 237  Q
    ||||||| |||||  ||||  ||||||||| | |||| ||||||||    
T  1843 agtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagt 1888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0405 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0405
Description:

Target: scaffold0405; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 767 - 572
Alignment:
Q  9 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 108  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||| || || ||||| |||||    | |||||| |||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  767 tgaaggatgaggatatgcagaagacagcctttaggacacgatatggtcattatgaatataaggtgatgccattcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 668  T
Q  109 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaaga 204  Q
    |||||| || |||||  | ||||| ||||||||| |||||   ||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||| ||||||||||    
T  667 tatggagtatatgaacagaattttccatgcttatctagataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttaatttattctaagactgaagaaga 572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 252 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 2288 - 2218
Alignment:
Q  252 agttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttct 322  Q
    |||||| ||| |||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  2288 agttatgtgctaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagttttcttggtcatgttatttct 2218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 240 - 326
Target Start/End: Original strand, 4606 - 4692
Alignment:
Q  240 tgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggta 326  Q
    ||||||| || ||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| | ||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  4606 tgaaagaaaagaagttgtatgccaaattgtcaaaatgtgagttttggttaagtgaagtaagtttccttggtcatattatttctggta 4692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 230 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 44829 - 44733
Alignment:
Q  230 ttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggta 326  Q
    ||||||||| |||| || || | ||| ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||| | ||| ||||||||||| || || |||||||||||||    
T  44829 ttgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagctgtcaaaatgtgagttctggttaagtgaagtgagttttctaggtcacattatttctggta 44733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1646 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1646
Description:

Target: scaffold1646; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 240 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 1360 - 1274
Alignment:
Q  240 tgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggta 326  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || |||||||| || || || ||||| | ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1360 tgaaagaaaagaagttgtatgctaaattgtcaaaatgcgagttttggttaagtgaagtaagtttccttggccatattatttctggta 1274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0285 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0285
Description:

Target: scaffold0285; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 213 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 9288 - 9215
Alignment:
Q  213 agcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctgg 286  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  9288 agcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctgg 9215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0708 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0708
Description:

Target: scaffold0708; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 66
Target Start/End: Original strand, 6185 - 6241
Alignment:
Q  10 gaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaata 66  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||  | || |||||||||||    
T  6185 gaaggatgaagacatgcagaagacggcctttaggacacgaaatggtcattacgaata 6241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0708; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 240 - 328
Target Start/End: Original strand, 6415 - 6503
Alignment:
Q  240 tgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagt 328  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||||| ||| ||||| || ||||| | ||| ||||||||||| ||  | |||||||||||||||    
T  6415 tgaaagaaaagaagttgtatgcaaagttgttaaaatgtgagttatggttaagtgaagtgagttttctgggttacattatttctggtagt 6503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University