View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF15968_low_2 (Length: 620)

Name: NF15968_low_2
Description: NF15968
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF15968_low_2
NF15968_low_2
[»] chr7 (15 HSPs)
chr7 (1-608)||(4652462-4653069)
chr7 (1-606)||(4665877-4666482)
chr7 (2-606)||(4629852-4630456)
chr7 (5-602)||(4642650-4643247)
chr7 (5-603)||(4671586-4672184)
chr7 (2-606)||(4660744-4661351)
chr7 (5-605)||(4635803-4636403)
chr7 (1-611)||(4784399-4785009)
chr7 (1-611)||(4816828-4817438)
chr7 (35-611)||(4862865-4863441)
chr7 (35-611)||(4697754-4698330)
chr7 (38-564)||(4712677-4713203)
chr7 (36-606)||(4846590-4847160)
chr7 (5-54)||(4676951-4677000)
chr7 (119-189)||(27539508-27539578)
[»] chr4 (3 HSPs)
chr4 (2-606)||(18926308-18926912)
chr4 (119-189)||(46271746-46271816)
chr4 (111-192)||(45191495-45191576)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 596; Significance: 0; HSPs: 15)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 596; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 608
Target Start/End: Original strand, 4652462 - 4653069
Alignment:
Q  1 atcagattttagagttagcctttggagcatataatattctggatccaaataccctaggctacccttcaccatcgtgctaacatgggttgtagacatccct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4652462 atcagattttagagttagcctttggagcatataatattctggatccaaataccctaggctacccttcaccatcgtgctaacatgggttgtagacatcctt 4652561  T
Q  101 gtcggtcccactttcgataatccaaaatcagaaaccttagccacccatttctcatccaacaatatgttggtgctcttcacgtcacggtgtattatcttgt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4652562 gtcggtcccactttcgataatccaaaatcagaaaccttagccacccatttctcatccaacaatatgttggtgctcttcacgtcacggtgtattatcttgt 4652661  T
Q  201 gtttcacctcagcatgaagataattcagccctctcgcggaacccaatagaatctcaagcctcttcttccacggtaagggctggttattagaaccataaag 300  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4652662 gtttcacctctgcatgaagataattcagccctctcgcggaacccaatagaatctcaagcctcttcttccacggtaagggctggttattagaaccataaag 4652761  T
Q  301 atactcacacagagtaccgtgttgcatgaactcataaaccaaaatcatttctgtgtcatcattgcaatatcccacgagggataccaagtgaatgtggcga 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4652762 atactcacacagagtaccgtgttgcatgaactcataaaccaaaatcatttctgtgtcatcattgcaatatcccacgagggataccaagtgaatgtggcga 4652861  T
Q  401 agctgggagagtaacttgatctcattcatgaactcgttggcaccttgttgagagccagatttgaggcgttttatcgcaacaggcatggatccatcgatgc 500  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4652862 agctgggagagtaactcgatctcattcatgaactcgttggcaccttgttgagagccagatttgaggcgttttatcgcaacaggcatggatccatcgatgc 4652961  T
Q  501 aacctttgtacacgttgccaaatcctccaacaccgatgatgaaaacatcatcgaagttatttgtggctgctttgatctctgcgattgtgaaggagcgaca 600  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4652962 aacctttgtacacgttgccaaatcctccaacaccgatgatgaaaacatcatcgaagttatttgtggctgctttgatctctgcgattgtgaaggagcgaca 4653061  T
Q  601 caaatgtg 608  Q
    ||||||||    
T  4653062 caaatgtg 4653069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 382; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 606
Target Start/End: Original strand, 4665877 - 4666482
Alignment:
Q  1 atcagattttagagttagcctttggagcatataatattctggatccaaataccctaggctacccttcaccatcgtgctaacatgggttgtagacatccct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||    
T  4665877 atcagattttagagttagcctttggagcatataatattcgggatccaaatatccgaggctccccttcaccatcgtgctgacatgggtagttgatatccct 4665976  T
Q  101 gtcggtcccactttcgataatccaaaatcagaaaccttagccacccatttctcatccaacaatatgttggtgctcttcacgtcacggtgtattatcttgt 200  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4665977 gtcggtcccaccttggataacccaaagtcggaaacctttgccatccatttttcatccaacaatatgttggtgctcttcacgtcacggtgtattatcttct 4666076  T
Q  201 gtttcacctcagcatgaagataattcagccctctcgcggaacccaatagaatctcaagcctcttcttccacggtaagggctggttattagaaccataaag 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  4666077 gtttcacctcagtatgaagataattcagccctctcgctgcacccaaaagaatctcaagcctctgcttccatgataggggctggttattagaaccataaag 4666176  T
Q  301 atactcacacagagtaccgtgttgcatgaactcataaaccaaaatcatttctgtgtcatcattgcaatatcccacgagggataccaagtgaatgtggcga 400  Q
    |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4666177 atactcgcaaagagtaccgtgctgcatgaactcataaaccagaatcatctctgtgtcgtcattgcaatatcccacaagggataccaagtgaatgtggcga 4666276  T
Q  401 agctgggagagtaacttgatctcattcatgaactcgttggcaccttgttgagagccagatttgaggcgttttatcgcaacaggcatggatccatcgatgc 500  Q
    ||||| ||||| || | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||  |    
T  4666277 agctgagagagcaattcgatttcgttcatgaactcgttggcaccttgttgagagcctgatttgaggcgttttatggcaacaagtgtggatccatcgacac 4666376  T
Q  501 aacctttgtacacgttgccaaatcctccaacaccgatgatgaaaacatcatcgaagttatttgtggctgctttgatctctgcgattgtgaaggagcgaca 600  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| || ||    
T  4666377 aacctttgtacacgttgccaaaccctccaactccgatgatgaaatcatcgtcaaagttgtttgtggctgctctgatctctgcaattgtaaaggaccggca 4666476  T
Q  601 caaatg 606  Q
    ||||||    
T  4666477 caaatg 4666482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2 - 606
Target Start/End: Original strand, 4629852 - 4630456
Alignment:
Q  2 tcagattttagagttagcctttggagcatataatattctggatccaaataccctaggctacccttcaccatcgtgctaacatgggttgtagacatccctg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |  || ||||    
T  4629852 tcagattttagagttagcctttggagcatatagtattcgggatccaaatatccaaggctccccttcaccatcgtgctgacatgggtagtcgttattcctg 4629951  T
Q  102 tcggtcccactttcgataatccaaaatcagaaaccttagccacccatttctcatccaacaatatgttggtgctcttcacgtcacggtgtattatcttgtg 201  Q
    | |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  4629952 taggtcccaccttggataacccgaaatcagaaaccttagctacccatttctcatccaacagtatgttggtgctctttacgtcacgatgtattatcttgtg 4630051  T
Q  202 tttcacctcagcatgaagataattcagccctctcgcggaacccaatagaatctcaagcctcttcttccacggtaagggctggttattagaaccataaaga 301  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||| |||||||| |||    
T  4630052 cttcacctcagaatgaagataattcagccctctcgctgcacccaataggatctcaagcctctgcttccatggtaggggctgattattggaaccatacaga 4630151  T
Q  302 tactcacacagagtaccgtgttgcatgaactcataaaccaaaatcatttctgtgtcatcattgcaatatcccacgagggataccaagtgaatgtggcgaa 401  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  4630152 tactcgcagagagtaccgtgctgcatgaactcataaaccagaatcatctctgtgttgtcattgcaatatcctacaagggacaccaagtgaatgtggcgaa 4630251  T
Q  402 gctgggagagtaacttgatctcattcatgaactcgttggcaccttgttgagagccagatttgaggcgttttatcgcaacaggcatggatccatcgatgca 501  Q
    |||||||||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||    
T  4630252 gctgggagagcaactcgatttcgttcatgaactcgttggcaccttgttgagagcctgatttgaggcgttttatcgcaacaggtgtggatccatcgacaca 4630351  T
Q  502 acctttgtacacgttgccaaatcctccaacaccgatgatgaaaacatcatcgaagttatttgtggctgctttgatctctgcgattgtgaaggagcgacac 601  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||| |||  || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||    
T  4630352 acctttgtacacgttcccaaaccctccaaatccgatgatgaaatcattgtcaaagttgtttgtggctgctttgatctccgcgattgtaaagtagcgacac 4630451  T
Q  602 aaatg 606  Q
    |||||    
T  4630452 aaatg 4630456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 602
Target Start/End: Original strand, 4642650 - 4643247
Alignment:
Q  5 gattttagagttagcctttggagcatataatattctggatccaaataccctaggctacccttcaccatcgtgctaacatgggttgtagacatccctgtcg 104  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| |  ||||| || || |||||||| |    
T  4642650 gattttagagttagcctttggaacatatagtactcaggatctaaatacccaaggcttcctttcaccattgtgctgatgtgggtagtcgatatccctgtag 4642749  T
Q  105 gtcccactttcgataatccaaaatcagaaaccttagccacccatttctcatccaacaatatgttggtgctcttcacgtcacggtgtattatcttgtgttt 204  Q
    ||||||| || ||||| || || || ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  4642750 gtcccaccttggataacccgaagtcggaaaccttagctatccatttttcatccaacaatatgttggtgctcttcacgtcacgatgtattattttgtgctt 4642849  T
Q  205 cacctcagcatgaagataattcagccctctcgcggaacccaatagaatctcaagcctcttcttccacggtaagggctggttattagaaccataaagatac 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||| | |||| ||||  |||| ||||||||||||||||||||||    
T  4642850 cacctcagcatgaagataattcagccctcttgcggcacctaatagaatttcaagcctctgcctccaaggtagtggctcgttattagaaccataaagatac 4642949  T
Q  305 tcacacagagtaccgtgttgcatgaactcataaaccaaaatcatttctgtgtcatcattgcaatatcccacgagggataccaagtgaatgtggcgaagct 404  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4642950 tcacaaagagtaccgtgctgcatgaactcataaaccaaaatcatctctgtgtcatcgttgcaatatcccacgagggacaccaagtgaatgtggcgaagct 4643049  T
Q  405 gggagagtaacttgatctcattcatgaactcgttggcaccttgttgagagccagatttgaggcgttttatcgcaacaggcatggatccatcgatgcaacc 504  Q
    ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||| |  |||||||||| |  |||||    
T  4643050 gggagagcaactcgatttcattcatgaactcgttggcaccttgttgagagcccgatttgaggcgcttaaccgcaacaagtgtggatccatcaacacaacc 4643149  T
Q  505 tttgtacacgttgccaaatcctccaacaccgatgatgaaaacatcatcgaagttatttgtggctgctttgatctctgcgattgtgaaggagcgacaca 602  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  4643150 tttgtacacgttgccaaaccctccaactccgatgataaaagcatcatcgaagttgtttgtagctgctttgatctctgcgattgtaaaggagcggcaca 4643247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 5 - 603
Target Start/End: Original strand, 4671586 - 4672184
Alignment:
Q  5 gattttagagttagcctttggagcatataatattctggatccaaataccctaggctacccttcaccatcgtgctaacatgggttgtagacatccctgtcg 104  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| || ||||| || |  ||||| || |    
T  4671586 gattttagagttagcctttggaacatatagtactcaggatctaaatacccaaggcttcctttcaccattgtgctgacgtgggtagttgttatccccgtgg 4671685  T
Q  105 gtcccactttcgataatccaaaatcagaaaccttagccacccatttctcatccaacaatatgttggtgctcttcacgtcacggtgtattatcttgtgttt 204  Q
    ||||||| || ||||| || || || ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  4671686 gtcccaccttggataacccgaagtcggaaaccttagctatccatttctcatccaacaatatgttggtgctcttcacgtcacgatgtattattttgtgctt 4671785  T
Q  205 cacctcagcatgaagataattcagccctctcgcggaacccaatagaatctcaagcctcttcttccacggtaagggctggttattagaaccataaagatac 304  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||  |||| ||||||||||||||||||||||    
T  4671786 cacctcagcatgaagataatttagccctctcgcagcacccaatagaatctcaagcctctgcctccaaggtagtggctcgttattagaaccataaagatac 4671885  T
Q  305 tcacacagagtaccgtgttgcatgaactcataaaccaaaatcatttctgtgtcatcattgcaatatcccacgagggataccaagtgaatgtggcgaagct 404  Q
    || || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4671886 tcgcaaagagtaccgtgctgcataaactcgtaaaccaaaatcatctatgtgtcatcgtcgcaatatccaacgagggataccaagtgaatgtggcgaagtt 4671985  T
Q  405 gggagagtaacttgatctcattcatgaactcgttggcaccttgttgagagccagatttgaggcgttttatcgcaacaggcatggatccatcgatgcaacc 504  Q
    | |||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||| |  ||||||||||||  |||||    
T  4671986 gagagagtaactcgatttcgttcatgaactcgttggcaccttgctgagagcccgatttgagccgttttatggcaacaagtgtggatccatcgacacaacc 4672085  T
Q  505 tttgtacacgttgccaaatcctccaacaccgatgatgaaaacatcatcgaagttatttgtggctgctttgatctctgcgattgtgaaggagcgacacaa 603  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  4672086 tttgtacaggtttccaaaccctccaactccgatgatagaagcatcatcgaagttgtttgtggctgctttgatctctgcgattgtaaaggaacggcacaa 4672184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 2 - 606
Target Start/End: Original strand, 4660744 - 4661351
Alignment:
Q  2 tcagattttagagttagcctttggagcatataatattctggatccaaataccctaggctacccttcaccatcgtgctaac---atgggttgtagacatcc 98  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||   ||| || || || ||||    
T  4660744 tcagattttagagttaacctttggagcatatagtattggggatccaaatacccaaggctccccttcaccattgtgctgacgtgatgagtagtcgatatcc 4660843  T
Q  99 ctgtcggtcccactttcgataatccaaaatcagaaaccttagccacccatttctcatccaacaatatgttggtgctcttcacgtcacggtgtattatctt 198  Q
    ||||||||||||| || ||||| || || || ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  4660844 ctgtcggtcccaccttggataacccgaagtcggaaaccttagctacccatttgtgatccaacaatatgttggtgctctttacgtcgcggtgtattatttt 4660943  T
Q  199 gtgtttcacctcagcatgaagataattcagccctctcgcggaacccaatagaatctcaagcctcttcttccacggtaagggctggttattagaaccataa 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||| || ||||||||||| ||||||||||| | | |||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  4660944 gtgtttcacctcagcatgaagataatgcaaccctcttgctgaacccaataggatctcaagcctttgcctccaaggtaggggctggttattagaaccataa 4661043  T
Q  299 agatactcacacagagtaccgtgttgcatgaactcataaaccaaaatcatttctgtgtcatcattgcaatatcccacgagggataccaagtgaatgtggc 398  Q
    |||| ||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||| | |||||  ||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  4661044 agatgctcgcagagagtaccgcgctgcatgaattcataaaccagaatcatctatgtgttgtcattacaatatcccatgagggacaccaaatgaatgtggc 4661143  T
Q  399 gaagctgggagagtaacttgatctcattcatgaactcgttggcaccttgttgagagccagatttgaggcgttttatcgcaacaggcatggatccatcgat 498  Q
    ||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |  | |||||||| |     
T  4661144 gaagctgggagagcaactcgatttcgttcatgaactcgttgacaccttgttgagagcccgatttgaggcgtttaatcgcaacaagtgttgatccatcaac 4661243  T
Q  499 gcaacctttgtacacgttgccaaatcctccaacaccgatgatgaaaacatcatcgaagttatttgtggctgctttgatctctgcgattgtgaaggagcga 598  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||     
T  4661244 acaacctttgtacacgttgccaaaccctccaactccaatgatgaaatcatcatcaaagttttttgtggctgctctgatctctgcaattgtaaagtagcgg 4661343  T
Q  599 cacaaatg 606  Q
    ||||||||    
T  4661344 cacaaatg 4661351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 297; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 5 - 605
Target Start/End: Original strand, 4635803 - 4636403
Alignment:
Q  5 gattttagagttagcctttggagcatataatattctggatccaaataccctaggctacccttcaccatcgtgctaacatgggttgtagacatccctgtcg 104  Q
    ||||| ||||| |||||||||| |||||| || || ||||| |||||||| | ||| ||||| || || ||||| || ||||| || || || |||||||    
T  4635803 gatttaagagtaagcctttggaacatatagtactcaggatctaaataccccaagcttcccttaacaattgtgctgacgtgggtagtcgatatacctgtcg 4635902  T
Q  105 gtcccactttcgataatccaaaatcagaaaccttagccacccatttctcatccaacaatatgttggtgctcttcacgtcacggtgtattatcttgtgttt 204  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||    
T  4635903 gtcccacctttgataacccaaaatcagaaaccttagctatccatttctcatccaacaatatgttggtgctctttacgtcacgatgtattatcttgttttt 4636002  T
Q  205 cacctcagcatgaagataattcagccctctcgcggaacccaatagaatctcaagcctcttcttccacggtaagggctggttattagaaccataaagatac 304  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||| |||||||||| |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4636003 aacctcagtatgaagataattcagccctctagctgcacccaaaagaatttcaagcctctgcttccatggtaggggttggttattagaaccataaagatac 4636102  T
Q  305 tcacacagagtaccgtgttgcatgaactcataaaccaaaatcatttctgtgtcatcattgcaatatcccacgagggataccaagtgaatgtggcgaagct 404  Q
    || || ||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| ||||| |  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4636103 tcgcagagagtaccgtgctgcatgaactcatagaccagaatcatctctgtcttgtcgttgcaatatcccacaagggataccaagtgaatgtggcgaagct 4636202  T
Q  405 gggagagtaacttgatctcattcatgaactcgttggcaccttgttgagagccagatttgaggcgttttatcgcaacaggcatggatccatcgatgcaacc 504  Q
    ||||||| |||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||| ||||    
T  4636203 gggagagcaactcgatctcgttcatgaactcatttgcaccttgttgagagcccgacctgaggcgttttatcgcaacgggtgtggatccatcaatgaaacc 4636302  T
Q  505 tttgtacacgttgccaaatcctccaacaccgatgatgaaaacatcatcgaagttatttgtggctgctttgatctctgcgattgtgaaggagcgacacaaa 604  Q
    ||||||||| || ||||| || ||||||||||| |||    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||||    
T  4636303 tttgtacacattcccaaaccccccaacaccgataatgttttcatcatcgaagttttttgtggctgctctgatctctgcgattgtaaagtagcggcacaaa 4636402  T
Q  605 t 605  Q
    |    
T  4636403 t 4636403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 611
Target Start/End: Complemental strand, 4785009 - 4784399
Alignment:
Q  1 atcagattttagagttagcctttggagcatataatattctggatccaaataccctaggctacccttcaccatcgtgctaacatgggttgtagacatccct 100  Q
    |||||| |||||||| | ||||||  |||| || |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||  | |||||||||    
T  4785009 atcagactttagagtcaacctttgtcgcatgtagtattctggatccaaatacccgagactacctttcaccatagtgctgacatgggtcatcgacatccct 4784910  T
Q  101 gtcggtcccactttcgataatccaaaatcagaaaccttagccacccatttctcatccaacaatatgttggtgctcttcacgtcacggtgtattatcttgt 200  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||    
T  4784909 gtaggtcccacttttgataacccaaaatcagaaaccttagccacccatttttcatccaacaatatgtttgtactcttcacgtcacggtgtatgatattgt 4784810  T
Q  201 gtttcacctcagcatgaagataattcagccctctcgcggaacccaatagaatctcaagcctcttcttccacggtaag-ggctggttattagaaccataaa 299  Q
    | ||| |  | ||||| ||||||| || ||| | ||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||| || | |||||  || |||||||    
T  4784809 gcttcgcacctgcatgcagataatgcaacccccgcgcggcacctaatagaatctcaagcctctgcttcca-ggtaagaggtttgttatctgatccataaa 4784711  T
Q  300 gatactcacacagagtaccgtgttgcatgaactcataaaccaaaatcatttctgtgtcatcattgcaatatcccacgagggataccaagtgaatgtggcg 399  Q
    |||| ||||| ||| | ||  |||||||||| |||||||| | |||||| |||    | |||||||||||||| |  || || ||||||||||| || ||    
T  4784710 gatattcacatagactgccacgttgcatgaagtcataaacgagaatcatctctacaccttcattgcaatatccaataagtgaaaccaagtgaatatgacg 4784611  T
Q  400 aagctgggagagtaacttgatctcattcatgaactcgttggcaccttgttgagagccagatttgaggcgttttatcgcaacaggcatggatccatcgatg 499  Q
    |||||| ||||| ||||  |||||||||| |||||||||  ||||||||||||| || | ||| || |||||||||||||| ||  |   |||||| ||     
T  4784610 aagctgagagagcaactcaatctcattcaagaactcgttcacaccttgttgagaacctggtttaagacgttttatcgcaactggtgtaactccatcaata 4784511  T
Q  500 caacctttgtacacgttgccaaatcctccaacaccgatgatgaaaacatcatcgaagttatttgtggctgctttgatctctgcgattgtgaaggagcgac 599  Q
     ||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| |||| ||| |||||||| ||||| |||||||| || || || ||||| ||  |||| |    
T  4784510 taacctttgtacacattgccgaaccctccaaccccgatgataaaaatatcttcgaagttgtttgtagctgcttttatttccgctattgtaaaatagcggc 4784411  T
Q  600 acaaatgtgatg 611  Q
    ||||||| ||||    
T  4784410 acaaatgggatg 4784399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 180; E-Value: 7e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 611
Target Start/End: Complemental strand, 4817438 - 4816828
Alignment:
Q  1 atcagattttagagttagcctttggagcatataatattctggatccaaataccctaggctacccttcaccatcgtgctaacatgggttgtagacatccct 100  Q
    |||||| |||||||| |  |||||  |||| || |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||  | |||||||||    
T  4817438 atcagactttagagtcaatctttgtcgcatgtagtattctggatccaaatacccgagactacctttcaccatagtgctgacatgggtcatcgacatccct 4817339  T
Q  101 gtcggtcccactttcgataatccaaaatcagaaaccttagccacccatttctcatccaacaatatgttggtgctcttcacgtcacggtgtattatcttgt 200  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || ||||    
T  4817338 gtaggtcccacttttgataacccaaaatcagaaaccttagccacccatttttcatccaacaatatgtttgtactcttcacatcacggtgtatgatattgt 4817239  T
Q  201 gtttcacctcagcatgaagataattcagccctctcgcggaacccaatagaatctcaagcctcttcttccacggtaag-ggctggttattagaaccataaa 299  Q
    | ||| |  | ||||| | ||||| || ||| | ||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||| || | |||||  || |||||||    
T  4817238 gcttcgcacctgcatgcaaataatgcaacccccgcgcggcacctaatagaatctcaagcctctgcttcca-ggtaagaggtttgttatctgatccataaa 4817140  T
Q  300 gatactcacacagagtaccgtgttgcatgaactcataaaccaaaatcatttctgtgtcatcattgcaatatcccacgagggataccaagtgaatgtggcg 399  Q
    |||| ||||| ||| | ||  |||||||||| |||||||| | |||||| |||    | |||||||||||||| |  || || ||||||||||| || ||    
T  4817139 gatattcacatagactgccacgttgcatgaagtcataaacgagaatcatctctacaccttcattgcaatatccaataagtgaaaccaagtgaatatgacg 4817040  T
Q  400 aagctgggagagtaacttgatctcattcatgaactcgttggcaccttgttgagagccagatttgaggcgttttatcgcaacaggcatggatccatcgatg 499  Q
    |||||| ||||| ||||  |||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||| ||| || |||||||||||||| ||  |   |||||| ||     
T  4817039 aagctgagagagcaactcaatctcattcaagaactcgttaacaccttgttgagaaccaggtttaagacgttttatcgcaactggtgtaactccatcaata 4816940  T
Q  500 caacctttgtacacgttgccaaatcctccaacaccgatgatgaaaacatcatcgaagttatttgtggctgctttgatctctgcgattgtgaaggagcgac 599  Q
     ||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| |||| ||| |||||||| ||||| |||||||| || || || ||||| ||  |||| |    
T  4816939 taacctttgtacacattgccgaaccctccaaccccgatgataaaaatatcttcgaagttgtttgtagctgcttttatttccgctattgtaaaatagcggc 4816840  T
Q  600 acaaatgtgatg 611  Q
    ||||||| ||||    
T  4816839 acaaatgggatg 4816828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 35 - 611
Target Start/End: Original strand, 4862865 - 4863441
Alignment:
Q  35 tattctggatccaaataccctaggctacccttcaccatcgtgctaacatgggttgtagacatccctgtcggtcccactttcgataatccaaaatcagaaa 134  Q
    ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||  ||||| || || ||  ||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| |    
T  4862865 tattctggatctaaatatccaagactacccttcaccacggtgctgacgtgagtgatagacattcctgttggtcccacttttgataacccgaaatcagaca 4862964  T
Q  135 ccttagccacccatttctcatccaacaatatgttggtgctcttcacgtcacggtgtattatcttgtgtttcacctcagcatgaagataattcagccctct 234  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| || ||  |||||||||||||||  | ||| ||    
T  4862965 ccttagccacccatttttcatccaacaatatgttggtactcttcacgtcacggtgtatgatattgtgctttacaccagcatgaagataatgtaaccccct 4863064  T
Q  235 cgcggaacccaatagaatctcaagcctcttcttccacggtaag-ggctggttattagaaccataaagatactcacacagagtaccgtgttgcatgaactc 333  Q
     || |  ||||| ||||||||||| |||||||||||  ||||| || |  ||||  |||||||||||||| ||||  ||||| ||  |||||||||| ||    
T  4863065 tgctgcccccaacagaatctcaagtctcttcttcca-agtaagaggttcattatccgaaccataaagatattcacggagagtgccacgttgcatgaagtc 4863163  T
Q  334 ataaaccaaaatcatttctgtgtcatcattgcaatatcccacgagggataccaagtgaatgtggcgaagctgggagagtaacttgatctcattcatgaac 433  Q
    |||||| | |||||| ||     | || ||||||||||| | ||| || ||||||||||| || |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||    
T  4863164 ataaacgagaatcatctcctcaccttcgttgcaatatccaatgagagaaaccaagtgaatatgacgaagctgagagagtaattcgatctcattcatgaac 4863263  T
Q  434 tcgttggcaccttgttgagagccagatttgaggcgttttatcgcaacaggcatggatccatcgatgcaacctttgtacacgttgccaaatcctccaacac 533  Q
    || ||   |||||||||||| || | ||| || ||||||||||||||||| |||  |||||| ||  ||||||||||||||||||| || |||||||| |    
T  4863264 tcatttataccttgttgagaacctggtttaagacgttttatcgcaacaggtatgtctccatcaatataacctttgtacacgttgccgaaccctccaactc 4863363  T
Q  534 cgatgatgaaaacatcatcgaagttatttgtggctgctttgatctctgcgattgtgaaggagcgacacaaatgtgatg 611  Q
    | |||||||||| ||| || ||||| ||||| || ||| | |||||||  ||||| ||  |||| |||||||| ||||    
T  4863364 caatgatgaaaatatcgtcaaagttgtttgtagcagctcttatctctgttattgtaaaatagcggcacaaatgggatg 4863441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 35 - 611
Target Start/End: Complemental strand, 4698330 - 4697754
Alignment:
Q  35 tattctggatccaaataccctaggctacccttcaccatcgtgctaacatgggttgtagacatccctgtcggtcccactttcgataatccaaaatcagaaa 134  Q
    ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||| | ||||| || |||||  | ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||    
T  4698330 tattcgggatctaaatacccgagactacccttcaccttagtgctgacgtgggtcatcgacattcctgttggtcccacttttgataacccgaaatcagaaa 4698231  T
Q  135 ccttagccacccatttctcatccaacaatatgttggtgctcttcacgtcacggtgtattatcttgtgtttcacctcagcatgaagataattcagccctct 234  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| ||| |  | |||||||||||||  || |||||    
T  4698230 ccttagccacccatttatcatctaacaatatgttggtactcttcacatcacggtgtatgatattgtgcttcgcacctgcatgaagataatgtaggcctct 4698131  T
Q  235 cgcggaacccaatagaatctcaagcctcttcttccacggtaag-ggctggttattagaaccataaagatactcacacagagtaccgtgttgcatgaactc 333  Q
     || |  |||||||||||||| || |||||||||||  ||||| || | |||||  |||||||| ||||| ||||  ||||| ||  ||| |||||| ||    
T  4698130 tgctgcccccaatagaatctcgagtctcttcttcca-agtaagaggttcgttatccgaaccatagagatattcacgaagagtgccacgttccatgaagtc 4698032  T
Q  334 ataaaccaaaatcatttctgtgtcatcattgcaatatcccacgagggataccaagtgaatgtggcgaagctgggagagtaacttgatctcattcatgaac 433  Q
     ||||| | |||||| ||||   | || ||||||||||| | ||| || |||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  4698031 gtaaacgagaatcatctctgcaccttcgttgcaatatccaatgagagaaaccaagtgaatgtgacgaagttgagagagcaactcgatttcattcatgaac 4697932  T
Q  434 tcgttggcaccttgttgagagccagatttgaggcgttttatcgcaacaggcatggatccatcgatgcaacctttgtacacgttgccaaatcctccaacac 533  Q
    |||||  ||||||||||||| || | ||| |  |||||||| || |||||  |   | |||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||| |    
T  4697931 tcgtttacaccttgttgagaacccggtttcaaacgttttattgctacaggtgtaccttcatcgatgtaacctttgaacacgttaccaaaccctccaactc 4697832  T
Q  534 cgatgatgaaaacatcatcgaagttatttgtggctgctttgatctctgcgattgtgaaggagcgacacaaatgtgatg 611  Q
    | ||||| |||| ||| |||||||| ||||| || ||| | ||||| || ||||| ||  |||| |||||||| ||||    
T  4697831 caatgataaaaatatcttcgaagttgtttgtagcggctcttatctccgctattgtaaaatagcggcacaaatgggatg 4697754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 38 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 4713203 - 4712677
Alignment:
Q  38 tctggatccaaataccctaggctacccttcaccatcgtgctaacatgggttgtagacatccctgtcggtcccactttcgataatccaaaatcagaaacct 137  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||| ||  | || |||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  4713203 tctggatccaaatatcctatactacccttcaccatagtgctgacatgagtcattgatatccctgttggtcccacttttgataaaccgaaatcagaaacct 4713104  T
Q  138 tagccacccatttctcatccaacaatatgttggtgctcttcacgtcacggtgtattatcttgtgtttcacctcagcatgaagataattcagccctctcgc 237  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| || || || ||| |  |  |||||||||||| ||  || || ||    
T  4713103 tagccacccatttttcatccaacaatatatttgtactcttaacgtcacggtgtatgatattatgcttcgcaccttcatgaagataatgcaatccccttgc 4713004  T
Q  238 ggaacccaatagaatctcaagcctcttcttccacggtaag-ggctggttattagaaccataaagatactcacacagagtaccgtgttgcatgaactcata 336  Q
     | ||  |||||||| | ||| || |  ||||||  |||| || | |||||  |||||||| ||||  ||||  ||||| || |||| ||| || |||||    
T  4713003 tgcacataatagaatattaagtctttgattccacc-taagaggttcgttatccgaaccatagagatgttcacggagagtgccatgttccataaagtcata 4712905  T
Q  337 aaccaaaatcatttctgtgtcatcattgcaatatcccacgagggataccaagtgaatgtggcgaagctgggagagtaacttgatctcattcatgaactcg 436  Q
    ||| | |||||| ||||  || |||||||||||||| | |||||| || |||||||| || |||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||| ||     
T  4712904 aacaagaatcatctctgcatcttcattgcaatatccaatgagggaaactaagtgaatatgacgaagctgagagagcaactcgatttcattcatgaattca 4712805  T
Q  437 ttggcaccttgttgagagccagatttgaggcgttttatcgcaacaggcatggatccatcgatgcaacctttgtacacgttgccaaatcctccaacaccga 536  Q
    ||   ||||||| |||| ||  ||||  | ||||||||||||||||| |||  |||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  4712804 tttagaccttgtcgagaacccaatttacgacgttttatcgcaacaggtatgagtccatcaatgtaacctttgtacacgttgccgaatcctccaaccccga 4712705  T
Q  537 tgatgaaaacatcatcgaagttatttgt 564  Q
    |||| |||| ||| |||||||| |||||    
T  4712704 tgataaaaatatcttcgaagttgtttgt 4712677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 36 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 4847160 - 4846590
Alignment:
Q  36 attctggatccaaataccctaggctacccttcaccatcgtgctaacatgggttgtagacatccctgtcggtcccactttcgataatccaaaatcagaaac 135  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||| ||  | || ||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  4847160 attctggatccaaatatcctatactacccttcaccatagtgcttacatgagtcattgatatcccggttggtcccacttttgataacccgaaatcagaaac 4847061  T
Q  136 cttagccacccatttctcatccaacaatatgttggtgctcttcacgtcacggtgtattatcttgtgtttcacctcagcatgaagataattcagccctctc 235  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||| |  |  ||||||||||||||| ||| ||     
T  4847060 cttagccacccatttttcatccaacaatatgtttgtactcttaacgtcacgatgtatgatattgtgcttcgcaccttcatgaagataattcaaccccctt 4846961  T
Q  236 gcggaacccaatagaatctcaagcctcttcttccacggtaag-ggctggttattagaaccataaagatactcacacagagtaccgtgttgcatgaactca 334  Q
    || | ||| ||||||||||| || || |  ||||||  |||| || |  ||||  |||||||| ||||  ||||  ||||||||  |||||||||| |||    
T  4846960 gctgcacctaatagaatctcgagtctttgattccac-ctaagaggttcattatccgaaccatagagatgttcactgagagtaccacgttgcatgaagtca 4846862  T
Q  335 taaaccaaaatcatttctgtgtcatcattgcaatatcccacgagggataccaagtgaatgtggcgaagctgggagagtaacttgatctcattcatgaact 434  Q
    ||||| | |||||| ||||  || || ||||||||||| | |||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| | || ||| ||||||||||| |    
T  4846861 taaactagaatcatctctgcatcttcgttgcaatatccaatgagggaaaccaagtgaatatgacgaagctgagagagcatctcgatttcattcatgaatt 4846762  T
Q  435 cgttggcaccttgttgagagccagatttgaggcgttttatcgcaacaggcatggatccatcgatgcaacctttgtacacgttgccaaatcctccaacacc 534  Q
    | ||   ||||| | |||| || | |||  | |||||||||||||||||  ||  ||||| |||| ||||||||||||||||||| || |||||| | ||    
T  4846761 catttagaccttatcgagaacccggtttacgacgttttatcgcaacaggtgtgagtccattgatgtaacctttgtacacgttgccgaaccctccagctcc 4846662  T
Q  535 gatgatgaaaacatcatcgaagttatttgtggctgctttgatctctgcgattgtgaaggagcgacacaaatg 606  Q
     ||||| |||| ||| |||||||| ||||| ||| || | ||||| || ||||| ||  |||| ||||||||    
T  4846661 aatgataaaaatatcttcgaagttgtttgtagcttctcttatctccgctattgtaaaatagcggcacaaatg 4846590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 54
Target Start/End: Original strand, 4676951 - 4677000
Alignment:
Q  5 gattttagagttagcctttggagcatataatattctggatccaaataccc 54  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  4676951 gattttagagttagcctttggagcatgtaatattcaggatccaaataccc 4677000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 119 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 27539578 - 27539508
Alignment:
Q  119 aatccaaaatcagaaaccttagccacccatttctcatccaacaatatgttggtgctcttcacgtcacggtg 189  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |  || ||||| ||  ||||||| ||||||||    
T  27539578 aatccaaaatcagaaaccttggccacccacttctcatctagtaaaatgtttgtagtcttcacatcacggtg 27539508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 289; Significance: 1e-162; HSPs: 3)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 2 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 18926912 - 18926308
Alignment:
Q  2 tcagattttagagttagcctttggagcatataatattctggatccaaataccctaggctacccttcaccatcgtgctaacatgggttgtagacatccctg 101  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||| |    
T  18926912 tcagattttagggtaagcctttggagcatatagtactcaggatctaaatacccaagactccccttcaccattgtgctgacatgggtagttgatatccccg 18926813  T
Q  102 tcggtcccactttcgataatccaaaatcagaaaccttagccacccatttctcatccaacaatatgttggtgctcttcacgtcacggtgtattatcttgtg 201  Q
    | |||||||| || ||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  18926812 ttggtcccaccttggataacccgaagtcggaaaccttagccacccatttctcatccaataatatgttggtgcttttcacatcacgatgtattatcttgtg 18926713  T
Q  202 tttcacctcagcatgaagataattcagccctctcgcggaacccaatagaatctcaagcctcttcttccacggtaagggctggttattagaaccataaaga 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| | ||||||  ||| ||| |||||||| |||||||| |||    
T  18926712 tttcacctcagcatgaagataattcagccctcttgcggcacccaatacaatctcaagcctttgcttccaaagtaggggttggttattggaaccatataga 18926613  T
Q  302 tactcacacagagtaccgtgttgcatgaactcataaaccaaaatcatttctgtgtcatcattgcaatatcccacgagggataccaagtgaatgtggcgaa 401  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| || |||||| ||| |||   | ||||| || || |||||||||||||  |||||||||||||    
T  18926612 tactcacaaagagtaccacgttgcatgaactcataaatcagaatcatctctttgttgccgttgcagtacccgacgagggataccagatgaatgtggcgaa 18926513  T
Q  402 gctgggagagtaacttgatctcattcatgaactcgttggcaccttgttgagagccagatttgaggcgttttatcgcaacaggcatggatccatcgatgca 501  Q
    | || ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| |||||||| ||||| ||  |||||  ||||||| |    
T  18926512 gttgagagagcaactcgatctcattcatgaactcgttggccccttgttgagagcctggtttgagacgttttattgcaacgggtgtggatttatcgatgaa 18926413  T
Q  502 acctttgtacacgttgccaaatcctccaacaccgatgatgaaaacatcatcgaagttatttgtggctgctttgatctctgcgattgtgaaggagcgacac 601  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||| |||    
T  18926412 acctttatacacgttgccaaaccctccaactccgatgattaaatcatcatcaaagttatttgtggctgcttttatctctgcaattgtaaagtagcggcac 18926313  T
Q  602 aaatg 606  Q
    |||||    
T  18926312 aaatg 18926308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 119 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 46271816 - 46271746
Alignment:
Q  119 aatccaaaatcagaaaccttagccacccatttctcatccaacaatatgttggtgctcttcacgtcacggtg 189  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |  || ||||| ||  ||||||| ||||||||    
T  46271816 aatccaaaatcagaaaccttggccacccacttctcatctagtaaaatgtttgtagtcttcacatcacggtg 46271746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 45191576 - 45191495
Alignment:
Q  111 ctttcgataatccaaaatcagaaaccttagccacccatttctcatccaacaatatgttggtgctcttcacgtcacggtgtat 192  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| || ||  | ||||||||||| | ||| || ||  |||||||||||||||||||    
T  45191576 ctttagataaaccaaaatcagaaaccttggcaacataattctcatccaagagtatatttgttgtcttcacgtcacggtgtat 45191495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University