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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF1596_low_95 (Length: 250)
Name: NF1596_low_95
Description: NF1596
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF1596_low_95 |
 | |
|
Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 2)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Original strand, 14087887 - 14088078
Alignment:
| Q |
1 |
aacattttatagtaatgtacatgctaaaaattgagtgaacaatacttcaaacaattataaacctctcatgtactctccatcctattattactcttatcct |
100 |
Q |
| |
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| T |
14087887 |
aacattttatagtaatgtacatgctaaaaattgagtgaacaataattcaaacaattataaacctctcatgtactctccatcctattattactcttatcct |
14087986 |
T |
|
| Q |
101 |
agagtaaacattcctttgcattattctttgcactttccatctttagattattccatatttagtaaacactaaatatttcacttattctcaca |
192 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14087987 |
agagtaaacattcctttgcattattctttgcactttccatctttagattattccatatttagtaaacactaaatatttcacttattctcaca |
14088078 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 14092419 - 14092611
Alignment:
| Q |
1 |
aacattttatagtaatgtacatgctaaaaattgagtgaacaatacttcaaacaattataaacctctcatgtactctccatcctattattactcttatcct |
100 |
Q |
| |
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||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
14092419 |
aacattttataataatgtacatgctaaaaattgagtgaacaatacttcaaacaattataaacctctcatgtactctccatcctattattactcttatcct |
14092518 |
T |
|
| Q |
101 |
agagtaaacattcctttgcattattctttgcactttccatctttagattattccatatttagtaaacactaaatatttcacttattctcacag |
193 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14092519 |
agagtaaacattcctttgcattattctttgcattttccatctttagattattccatatttagtaaacactaaatatttcacttattctcacag |
14092611 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 2)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 33698809 - 33698617
Alignment:
| Q |
1 |
aacattttatagtaatgtacatgctaaaaa-ttgagtgaacaatacttcaaacaattataaacctctcatgtactctccatcctattattactcttatcc |
99 |
Q |
| |
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|
|
| T |
33698809 |
aacattttatagtaatgtacatgctaaaaaattgagtgaacaatacttcaaacaattataaacctctcatgtactctccatcctattattactcttatcc |
33698710 |
T |
|
| Q |
100 |
tagagtaaacattcctttgcattattctttgcactttccatctttagattattccatatttagtaaacactaaatatttcacttattctcaca |
192 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
33698709 |
tagagtaaacattcctttgcattattctttgcactttccatctttagattattccatatttagtaaacactaaatatttcacttattctcaca |
33698617 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 33681752 - 33681560
Alignment:
| Q |
1 |
aacattttatagtaatgtacatgctaaaaa-ttgagtgaacaatacttcaaacaattataaacctctcatgtactctccatcctattattactcttatcc |
99 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33681752 |
aacattttatagtaatgtacatgctaaaaaattgagtgaacaatacttcaaacaattataaacctctcatgtactctccatcctattattactcttatcc |
33681653 |
T |
|
| Q |
100 |
tagagtaaacattcctttgcattattctttgcactttccatctttagattattccatatttagtaaacactaaatatttcacttattctcaca |
192 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33681652 |
tagagtaaacattccttttcattattctttgcactttccatctttagattattccatatttagtaaacactaaatatttcacttattctcaca |
33681560 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1 (Bit Score: 180; Significance: 3e-97; HSPs: 2)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 46461468 - 46461277
Alignment:
| Q |
1 |
aacattttatagtaatgtacatgctaaaaattgagtgaacaatacttcaaacaattataaacctctcatgtactctccatcctattattactcttatcct |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46461468 |
aacattttatagtaacctacatgctaaaaattgagtgaacaatacctcaaacaattataaacctctcatgtactctccatcctattattactcttatcct |
46461369 |
T |
|
| Q |
101 |
agagtaaacattcctttgcattattctttgcactttccatctttagattattccatatttagtaaacactaaatatttcacttattctcaca |
192 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46461368 |
agagtaaacattcctttgcattattctttgcactttccatctttagattattccatatttagtaaacactaaatatttcacttattctcaca |
46461277 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 46454067 - 46453879
Alignment:
| Q |
1 |
aacattttatagtaatgtacatgctaaaaattgagtgaacaatacttcaaacaattataaacctctcatgtactctccatcctattattactcttatcct |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46454067 |
aacattttataataatgtacatgctaaaaattgagtgaacaatacttcaaacaattataaacctctcatgtactctccatcctattattactcttatcct |
46453968 |
T |
|
| Q |
101 |
agagtaaacattcctttgcattattctttgcactttccatctttagattattccatatttagtaaacactaaatatttcacttattctc |
189 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46453967 |
agagtaaacattcctttgcattattctttgctctttctatctttagattattccatatttagtaaacactaaatatttcacttattctc |
46453879 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 4)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 9950280 - 9950086
Alignment:
| Q |
1 |
aacattttatagtaatgtacatgctaaaaa-ttgagtgaacaatacttcaaacaattataaacctctcatgtactctccatcctattattactcttatcc |
99 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9950280 |
aacattttatagtaatgtacatgctaaaaaattgagtgaacaatacttcaaacaattataaacctctcatgtactctccatcctattattactcttatcc |
9950181 |
T |
|
| Q |
100 |
tagagtaaacattcctttgcattattctttgcactttccatctttagattattccatatttagtaaacactaaatatttcacttattctcacaga |
194 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9950180 |
tagagtaaacattcctttacattattctttgcactttccatctttagattattccatatttaataaacactaaatatttcacttattctcacaga |
9950086 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 9955268 - 9955077
Alignment:
| Q |
1 |
aacattttatagtaatgtacatgctaaaaattgagtgaacaatacttcaaacaattataaacctctcatgtactctccatcctattattactcttatcct |
100 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
9955268 |
aacattttatagtaatgtacatgctaaaaattgagtgaacaatatttcaaacaattataaacctctcatgtactctccatcctattattactcctatcct |
9955169 |
T |
|
| Q |
101 |
agagtaaacattcctttgcattattctttgcactttccatctttagattattccatatttagtaaacactaaatatttcacttattctcaca |
192 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9955168 |
agagtaaacattcatttacattattctttgcactttccatctttaaattattccatatttactaaacactaaatatttcacttattctcaca |
9955077 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Original strand, 32213683 - 32213868
Alignment:
| Q |
1 |
aacattttatagtaatgtacatgctaaaaattgagtgaacaatacttcaaacaattataaacctctcatgtactctccatcctattattactcttatcct |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
32213683 |
aacattttatagtaacgtacattctaaaaattgagtgaacaatacttcaaacaattataaatctctgatgtactctccttcctattattactcttattcc |
32213782 |
T |
|
| Q |
101 |
agagtaaacattcctttgcattattctttgcactttccatctttagattattccatatttagtaaacactaaatatttcacttattctcaca |
192 |
Q |
| |
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|||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32213783 |
agagta------cctttgcattattctttacactttccatctttaaattattccatatttagtaaacactaaatatttcacttattctcaca |
32213868 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 32213256 - 32213147
Alignment:
| Q |
1 |
aacattttatagtaatgtacatgctaaaaattgagtgaacaatacttcaaacaattataaacctctcatgtactctccatcctattattactcttatcct |
100 |
Q |
| |
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||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| |||| |||||||||||||||||| | |
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|
| T |
32213256 |
aacattttatagtaacgtacatcctaaaaattgagtgaacaatacttcaaacaattataatcctatgatgtaccctccttcctattattactcttattcc |
32213157 |
T |
|
| Q |
101 |
agagtaaaca |
110 |
Q |
| |
|
|| ||||||| |
|
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| T |
32213156 |
agggtaaaca |
32213147 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 2)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 24876647 - 24876826
Alignment:
| Q |
1 |
aacattttatagtaatgtacatgctaaaaattgagtgaacaatacttcaaacaattataaacctctcatgtactctccatcctattattactcttatcct |
100 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24876647 |
aacattttatagtaatgtatatgctaaaaattgagtgaacaatacttcaaacaattataaacctctcatgtactctccatcctattattactcttatcct |
24876746 |
T |
|
| Q |
101 |
agagtaaacattcctttgcattattctttgcactttccatctttagattattccatatttagtaaacactaaatatttca |
180 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24876747 |
agagtaaacattcctttgcattattctttgcattttccatctttagattattccatatttagtaaacactaaatatttca |
24876826 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 9 - 192
Target Start/End: Original strand, 24881140 - 24881323
Alignment:
| Q |
9 |
atagtaatgtacatgctaaaaattgagtgaacaatacttcaaacaattataaacctctcatgtactctccatcctattattactcttatcctagagtaaa |
108 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24881140 |
atagtaatgtacatgctaaaaattgagtgaacaatacttcaaacaattataaacctctcatatactttccatcctattattactcttatcctagagtaaa |
24881239 |
T |
|
| Q |
109 |
cattcctttgcattattctttgcactttccatctttagattattccatatttagtaaacactaaatatttcacttattctcaca |
192 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24881240 |
cattcctttgcgttattctttgcactttccatctttagattattccatatttagtaaacactaaatatttcacttattctcaca |
24881323 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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