View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF15982_low_53 (Length: 246)

Name: NF15982_low_53
Description: NF15982
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF15982_low_53
NF15982_low_53
[»] chr1 (61 HSPs)
chr1 (9-224)||(42571777-42571992)
chr1 (9-228)||(17697036-17697255)
chr1 (9-225)||(35586929-35587145)
chr1 (9-228)||(14173755-14173974)
chr1 (10-228)||(36909552-36909770)
chr1 (9-228)||(17686358-17686577)
chr1 (9-228)||(18170015-18170234)
chr1 (9-217)||(24270371-24270579)
chr1 (9-228)||(6435762-6435981)
chr1 (9-228)||(38046431-38046650)
chr1 (11-225)||(35576331-35576545)
chr1 (12-225)||(48568404-48568617)
chr1 (9-225)||(12791273-12791489)
chr1 (17-225)||(47488037-47488245)
chr1 (11-230)||(13283697-13283916)
chr1 (9-228)||(13972914-13973133)
chr1 (11-229)||(5765198-5765416)
chr1 (11-229)||(18842431-18842649)
chr1 (9-230)||(50068254-50068475)
chr1 (21-229)||(3658475-3658683)
chr1 (9-225)||(39224197-39224413)
chr1 (9-225)||(44337319-44337535)
chr1 (9-228)||(49926377-49926595)
chr1 (11-225)||(39856906-39857120)
chr1 (12-225)||(13635297-13635510)
chr1 (9-225)||(27035318-27035534)
chr1 (9-225)||(29435963-29436179)
chr1 (10-217)||(29762229-29762436)
chr1 (12-228)||(23342634-23342850)
chr1 (12-227)||(35184963-35185179)
chr1 (9-225)||(44597691-44597907)
chr1 (12-228)||(49396697-49396913)
chr1 (9-225)||(49427377-49427593)
chr1 (9-225)||(51269792-51270008)
chr1 (22-229)||(24363796-24364003)
chr1 (12-229)||(21484639-21484856)
chr1 (9-225)||(27486690-27486906)
chr1 (12-225)||(45689114-45689325)
chr1 (12-225)||(41874884-41875097)
chr1 (12-225)||(48215191-48215404)
chr1 (9-225)||(19160307-19160523)
chr1 (41-225)||(46180280-46180465)
chr1 (49-228)||(37778109-37778288)
chr1 (9-179)||(49598921-49599090)
chr1 (11-196)||(49263017-49263202)
chr1 (9-228)||(41780683-41780902)
chr1 (11-213)||(35526189-35526391)
chr1 (9-228)||(17372717-17372936)
chr1 (12-225)||(30309832-30310039)
chr1 (11-228)||(16532087-16532304)
chr1 (28-229)||(16081294-16081495)
chr1 (65-150)||(13148365-13148450)
chr1 (135-228)||(40533283-40533376)
chr1 (11-79)||(16098078-16098146)
chr1 (121-229)||(19262409-19262517)
chr1 (145-219)||(29707547-29707621)
chr1 (165-229)||(14772528-14772592)
chr1 (11-104)||(14772662-14772755)
chr1 (11-213)||(15471510-15471721)
chr1 (11-53)||(48707090-48707132)
chr1 (9-46)||(46181731-46181768)
[»] chr2 (50 HSPs)
chr2 (9-228)||(35491629-35491848)
chr2 (9-225)||(12968298-12968514)
chr2 (9-229)||(10364629-10364849)
chr2 (9-228)||(19471627-19471846)
chr2 (12-229)||(33404012-33404229)
chr2 (17-225)||(42120014-42120222)
chr2 (11-228)||(27130502-27130719)
chr2 (11-228)||(37312488-37312705)
chr2 (17-217)||(29906584-29906784)
chr2 (14-225)||(10360195-10360406)
chr2 (9-228)||(41499087-41499306)
chr2 (9-225)||(22493265-22493481)
chr2 (9-228)||(2919358-2919577)
chr2 (11-229)||(6901962-6902180)
chr2 (9-225)||(3941731-3941947)
chr2 (9-228)||(34521677-34521896)
chr2 (12-213)||(29111155-29111356)
chr2 (9-228)||(6976832-6977049)
chr2 (9-225)||(32734641-32734857)
chr2 (11-225)||(5420465-5420679)
chr2 (11-229)||(20148114-20148332)
chr2 (9-225)||(42241095-42241311)
chr2 (9-225)||(3937060-3937276)
chr2 (9-225)||(39393885-39394101)
chr2 (9-225)||(43982850-43983066)
chr2 (10-225)||(17424784-17424999)
chr2 (12-225)||(29067726-29067939)
chr2 (11-229)||(17796099-17796314)
chr2 (9-217)||(16581816-16582026)
chr2 (9-225)||(22001828-22002044)
chr2 (12-161)||(39799902-39800051)
chr2 (14-157)||(18392032-18392179)
chr2 (69-228)||(40677368-40677527)
chr2 (9-143)||(34638960-34639093)
chr2 (121-229)||(27650419-27650527)
chr2 (13-133)||(16253474-16253594)
chr2 (160-229)||(16253600-16253669)
chr2 (163-229)||(31991928-31991994)
chr2 (12-79)||(31770360-31770427)
chr2 (165-228)||(43491600-43491663)
chr2 (163-229)||(15891639-15891705)
chr2 (9-73)||(40678763-40678827)
chr2 (163-229)||(18036154-18036220)
chr2 (152-225)||(18393486-18393559)
chr2 (11-225)||(11679084-11679308)
chr2 (11-205)||(11718741-11718945)
chr2 (9-54)||(26617652-26617697)
chr2 (118-170)||(17112399-17112451)
chr2 (130-213)||(26617485-26617568)
chr2 (163-229)||(18878652-18878718)
[»] chr3 (69 HSPs)
chr3 (12-228)||(51015284-51015500)
chr3 (12-225)||(39416947-39417160)
chr3 (11-225)||(44927469-44927683)
chr3 (12-228)||(34472072-34472288)
chr3 (9-225)||(42382275-42382491)
chr3 (12-228)||(45100461-45100677)
chr3 (9-225)||(47065691-47065907)
chr3 (12-224)||(48087552-48087764)
chr3 (9-228)||(46414330-46414549)
chr3 (9-228)||(51013274-51013493)
chr3 (9-234)||(2428491-2428716)
chr3 (9-225)||(42383055-42383271)
chr3 (9-225)||(53826695-53826911)
chr3 (13-224)||(6464345-6464556)
chr3 (10-225)||(13895869-13896084)
chr3 (9-224)||(25576592-25576806)
chr3 (9-228)||(30192542-30192761)
chr3 (17-228)||(41577918-41578129)
chr3 (9-228)||(55206880-55207099)
chr3 (11-229)||(6754210-6754428)
chr3 (11-228)||(34647263-34647480)
chr3 (9-225)||(42950019-42950235)
chr3 (9-228)||(41803906-41804125)
chr3 (9-219)||(43569914-43570124)
chr3 (11-228)||(8633355-8633572)
chr3 (9-228)||(47759887-47760106)
chr3 (10-225)||(49218735-49218950)
chr3 (11-225)||(34693289-34693503)
chr3 (12-225)||(24702271-24702483)
chr3 (9-225)||(2646875-2647091)
chr3 (10-228)||(10053271-10053485)
chr3 (12-228)||(37281459-37281675)
chr3 (9-224)||(43477061-43477276)
chr3 (9-225)||(3495028-3495244)
chr3 (9-217)||(19453236-19453444)
chr3 (9-229)||(27186952-27187172)
chr3 (9-225)||(49610493-49610709)
chr3 (9-228)||(14631449-14631668)
chr3 (9-227)||(52569406-52569623)
chr3 (9-225)||(46403007-46403223)
chr3 (9-225)||(49140053-49140269)
chr3 (9-217)||(51695613-51695821)
chr3 (9-225)||(54390446-54390662)
chr3 (11-229)||(774333-774551)
chr3 (11-228)||(7954209-7954427)
chr3 (12-225)||(2268493-2268706)
chr3 (9-230)||(4004081-4004302)
chr3 (10-227)||(49273404-49273621)
chr3 (12-228)||(7246101-7246317)
chr3 (9-225)||(34049731-34049947)
chr3 (10-230)||(36135013-36135232)
chr3 (10-225)||(44835486-44835701)
chr3 (12-229)||(33449146-33449351)
chr3 (12-228)||(36721385-36721601)
chr3 (9-228)||(50458687-50458906)
chr3 (16-229)||(20375877-20376090)
chr3 (48-228)||(42323385-42323565)
chr3 (70-225)||(50997453-50997608)
chr3 (9-229)||(14265412-14265629)
chr3 (104-216)||(46346620-46346732)
chr3 (133-230)||(18440873-18440970)
chr3 (133-230)||(19485947-19486044)
chr3 (38-224)||(25887611-25887796)
chr3 (12-99)||(15637031-15637118)
chr3 (11-62)||(11378906-11378957)
chr3 (140-229)||(7954774-7954863)
chr3 (10-59)||(46346745-46346794)
chr3 (9-52)||(42328288-42328331)
chr3 (121-213)||(17267306-17267398)
[»] chr4 (60 HSPs)
chr4 (9-228)||(43889497-43889716)
chr4 (9-228)||(22436901-22437120)
chr4 (9-225)||(242417-242633)
chr4 (10-225)||(14330695-14330910)
chr4 (11-225)||(25762590-25762804)
chr4 (17-225)||(31824630-31824838)
chr4 (9-225)||(33163545-33163761)
chr4 (9-225)||(51027768-51027984)
chr4 (9-225)||(51428193-51428409)
chr4 (9-228)||(26591683-26591902)
chr4 (11-229)||(17211258-17211476)
chr4 (10-228)||(49817642-49817860)
chr4 (9-228)||(4785420-4785639)
chr4 (9-224)||(34153288-34153503)
chr4 (11-229)||(3393296-3393514)
chr4 (9-225)||(1226150-1226365)
chr4 (9-225)||(21017178-21017394)
chr4 (9-225)||(40353774-40353990)
chr4 (9-228)||(34529794-34530013)
chr4 (9-228)||(49791934-49792153)
chr4 (10-228)||(2773000-2773218)
chr4 (14-229)||(20778866-20779081)
chr4 (9-228)||(47657353-47657572)
chr4 (11-229)||(24606744-24606962)
chr4 (11-228)||(957453-957670)
chr4 (12-225)||(6282324-6282537)
chr4 (9-225)||(49063969-49064185)
chr4 (14-225)||(55796738-55796949)
chr4 (11-229)||(18412587-18412805)
chr4 (12-225)||(32937903-32938116)
chr4 (9-225)||(46816526-46816740)
chr4 (9-225)||(41794563-41794779)
chr4 (12-225)||(1042744-1042955)
chr4 (12-229)||(11288288-11288504)
chr4 (9-225)||(37866396-37866613)
chr4 (9-225)||(6177316-6177532)
chr4 (9-225)||(56138900-56139116)
chr4 (11-229)||(10312264-10312482)
chr4 (11-228)||(42886255-42886475)
chr4 (9-225)||(49094735-49094951)
chr4 (9-228)||(21169441-21169660)
chr4 (38-225)||(21711549-21711736)
chr4 (12-225)||(20901669-20901882)
chr4 (12-225)||(39588922-39589135)
chr4 (12-225)||(45939518-45939731)
chr4 (12-228)||(36776517-36776733)
chr4 (66-225)||(27759374-27759533)
chr4 (9-228)||(44560178-44560397)
chr4 (9-225)||(28082228-28082444)
chr4 (12-228)||(49423756-49423972)
chr4 (11-225)||(9489671-9489884)
chr4 (9-229)||(13850739-13850959)
chr4 (9-229)||(13866253-13866473)
chr4 (12-229)||(31324167-31324384)
chr4 (140-229)||(49817194-49817283)
chr4 (163-229)||(17292106-17292172)
chr4 (11-104)||(21412647-21412740)
chr4 (121-229)||(23124522-23124630)
chr4 (121-229)||(20759132-20759240)
chr4 (121-229)||(20765523-20765631)
[»] chr5 (45 HSPs)
chr5 (11-229)||(33370645-33370863)
chr5 (11-228)||(1400301-1400518)
chr5 (10-225)||(40009518-40009733)
chr5 (9-228)||(4724073-4724292)
chr5 (11-213)||(1971356-1971558)
chr5 (9-225)||(7231-7447)
chr5 (9-225)||(8537943-8538159)
chr5 (9-216)||(18308249-18308456)
chr5 (9-225)||(541637-541853)
chr5 (9-225)||(8576143-8576359)
chr5 (9-225)||(11346698-11346914)
chr5 (9-225)||(19400352-19400568)
chr5 (9-227)||(35565261-35565478)
chr5 (9-230)||(3601330-3601551)
chr5 (9-225)||(19036676-19036892)
chr5 (12-225)||(11027769-11027982)
chr5 (9-225)||(28880980-28881196)
chr5 (16-225)||(30709594-30709803)
chr5 (12-225)||(38854150-38854363)
chr5 (9-225)||(27661379-27661595)
chr5 (9-228)||(36350313-36350523)
chr5 (9-228)||(6793385-6793604)
chr5 (12-225)||(17366738-17366950)
chr5 (11-194)||(35927470-35927653)
chr5 (9-183)||(3169593-3169766)
chr5 (11-197)||(2599210-2599396)
chr5 (91-228)||(1694860-1694997)
chr5 (12-125)||(3458828-3458941)
chr5 (135-225)||(7082336-7082426)
chr5 (121-229)||(18920835-18920943)
chr5 (166-229)||(12742818-12742881)
chr5 (163-229)||(17195357-17195423)
chr5 (21-94)||(1693382-1693455)
chr5 (9-63)||(7082281-7082335)
chr5 (11-125)||(12742706-12742820)
chr5 (11-125)||(12805524-12805638)
chr5 (12-229)||(19748051-19748276)
chr5 (121-230)||(25360580-25360690)
chr5 (166-229)||(12805636-12805699)
chr5 (121-229)||(15798078-15798186)
chr5 (163-230)||(13131075-13131142)
chr5 (163-229)||(36311943-36312009)
chr5 (121-229)||(23228668-23228776)
chr5 (191-230)||(2599426-2599465)
chr5 (128-216)||(16418111-16418199)
[»] chr8 (31 HSPs)
chr8 (17-225)||(33799549-33799757)
chr8 (9-228)||(41856969-41857188)
chr8 (9-228)||(44943076-44943295)
chr8 (17-225)||(43638675-43638883)
chr8 (9-225)||(15032322-15032538)
chr8 (9-225)||(26452325-26452541)
chr8 (9-225)||(40415257-40415473)
chr8 (9-225)||(43693137-43693353)
chr8 (11-225)||(34614955-34615169)
chr8 (11-225)||(41363658-41363872)
chr8 (11-225)||(42168958-42169172)
chr8 (12-225)||(38033923-38034136)
chr8 (9-225)||(28706140-28706356)
chr8 (9-228)||(18440290-18440509)
chr8 (9-225)||(40414610-40414826)
chr8 (9-225)||(41275394-41275610)
chr8 (9-228)||(42603454-42603673)
chr8 (10-228)||(19242157-19242375)
chr8 (10-228)||(19315341-19315559)
chr8 (12-189)||(26484580-26484757)
chr8 (11-229)||(3589260-3589478)
chr8 (9-225)||(2416915-2417131)
chr8 (10-225)||(24861344-24861559)
chr8 (9-225)||(485256-485472)
chr8 (11-228)||(31171811-31172028)
chr8 (9-218)||(40702360-40702569)
chr8 (12-168)||(16575695-16575851)
chr8 (9-126)||(22548263-22548380)
chr8 (163-225)||(22549236-22549295)
chr8 (9-51)||(12504896-12504938)
chr8 (14-104)||(22843442-22843532)
[»] chr7 (48 HSPs)
chr7 (9-225)||(18237556-18237772)
chr7 (12-225)||(41217609-41217822)
chr7 (9-228)||(15337901-15338120)
chr7 (9-228)||(48270640-48270859)
chr7 (10-228)||(41048776-41048994)
chr7 (9-224)||(47268891-47269105)
chr7 (9-228)||(21187295-21187514)
chr7 (11-229)||(1642582-1642800)
chr7 (9-230)||(20378697-20378918)
chr7 (12-228)||(36393820-36394036)
chr7 (10-225)||(40588542-40588757)
chr7 (9-228)||(43351096-43351314)
chr7 (9-228)||(46862190-46862409)
chr7 (11-229)||(21614755-21614973)
chr7 (9-225)||(39477239-39477455)
chr7 (10-225)||(34140858-34141073)
chr7 (9-228)||(48315176-48315395)
chr7 (11-217)||(21650518-21650724)
chr7 (12-225)||(30360512-30360724)
chr7 (10-217)||(17183205-17183412)
chr7 (17-225)||(48220743-48220949)
chr7 (9-225)||(20564751-20564967)
chr7 (9-228)||(42735255-42735473)
chr7 (9-210)||(17839315-17839516)
chr7 (27-228)||(30354811-30355012)
chr7 (10-229)||(2356282-2356501)
chr7 (12-186)||(28979060-28979234)
chr7 (9-228)||(28114389-28114608)
chr7 (9-161)||(26603268-26603420)
chr7 (10-225)||(10523061-10523277)
chr7 (9-225)||(45363251-45363458)
chr7 (117-225)||(2206036-2206144)
chr7 (101-225)||(9367119-9367243)
chr7 (9-133)||(13916825-13916949)
chr7 (9-112)||(42682948-42683051)
chr7 (121-228)||(28066359-28066466)
chr7 (163-229)||(11824839-11824905)
chr7 (128-229)||(18149638-18149739)
chr7 (121-229)||(150192-150300)
chr7 (121-229)||(7414196-7414304)
chr7 (171-229)||(3380669-3380727)
chr7 (163-225)||(26601777-26601839)
chr7 (142-225)||(13920431-13920514)
chr7 (12-61)||(8726381-8726430)
chr7 (128-229)||(12083042-12083143)
chr7 (128-227)||(31267188-31267286)
chr7 (10-50)||(3924805-3924845)
chr7 (11-54)||(18146953-18146996)
[»] scaffold0589 (1 HSPs)
scaffold0589 (11-225)||(2261-2475)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (17-225)||(17916-18123)
[»] chr6 (31 HSPs)
chr6 (9-225)||(801160-801375)
chr6 (11-229)||(14115033-14115251)
chr6 (9-228)||(13402527-13402746)
chr6 (9-228)||(32027624-32027843)
chr6 (9-228)||(32037683-32037902)
chr6 (9-225)||(29066547-29066763)
chr6 (9-225)||(29075560-29075776)
chr6 (9-225)||(29108134-29108350)
chr6 (9-228)||(34802892-34803111)
chr6 (10-225)||(11692446-11692661)
chr6 (27-225)||(35058734-35058932)
chr6 (9-225)||(29110531-29110748)
chr6 (9-228)||(12396770-12396989)
chr6 (9-225)||(6205478-6205694)
chr6 (9-225)||(27640174-27640390)
chr6 (12-194)||(22305793-22305975)
chr6 (74-228)||(30257575-30257729)
chr6 (144-236)||(17465323-17465415)
chr6 (145-194)||(3765818-3765867)
chr6 (165-229)||(34134801-34134865)
chr6 (121-198)||(2402306-2402383)
chr6 (11-230)||(28051354-28051583)
chr6 (128-216)||(18743985-18744073)
chr6 (153-225)||(24021096-24021168)
chr6 (163-226)||(20192466-20192529)
chr6 (163-226)||(20242125-20242188)
chr6 (163-226)||(22136109-22136172)
chr6 (163-226)||(22143462-22143525)
chr6 (177-224)||(35021237-35021284)
chr6 (11-65)||(18744144-18744198)
chr6 (153-225)||(2192535-2192607)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (10-225)||(1783-1998)
[»] scaffold0181 (1 HSPs)
scaffold0181 (11-229)||(24899-25116)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (9-137)||(63968-64095)
scaffold0004 (166-229)||(64098-64161)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (121-229)||(5453-5561)
[»] scaffold0027 (2 HSPs)
scaffold0027 (128-213)||(36775-36860)
scaffold0027 (11-104)||(36649-36742)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 180; Significance: 3e-97; HSPs: 61)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 9 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 42571992 - 42571777
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42571992 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaatgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 42571893  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||    
T  42571892 gtgaagagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgc 42571793  T
Q  209 cagaagatcgtgatta 224  Q
    ||||||||||| ||||    
T  42571792 cagaagatcgtcatta 42571777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 9 - 228
Target Start/End: Original strand, 17697036 - 17697255
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17697036 cagagacataaggagggtggaacacgtttggtataaacgtccaatgctcgacaagggtagggtatcattcacttgggtggagttaaagtacgacgaaaac 17697135  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  17697136 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatattatcaagagtctgattccgc 17697235  T
Q  209 cagaagatcgtgattaggta 228  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  17697236 cagaagatcgtgattaggta 17697255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 9 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 35587145 - 35586929
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  35587145 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaac 35587046  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  35587045 gtgacgaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaccttgctgagatcaattgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 35586946  T
Q  209 cagaagatcgtgattag 225  Q
    ||||||||||| |||||    
T  35586945 cagaagatcgtcattag 35586929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 9 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 14173974 - 14173755
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  14173974 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgatgaggggagaatatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 14173875  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  14173874 gtgacgagcatgttttgggaggacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 14173775  T
Q  209 cagaagatcgtgattaggta 228  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  14173774 cagaagatcgtcattaggta 14173755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Original strand, 36909552 - 36909770
Alignment:
Q  10 agagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacg 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  36909552 agagacataaggagggtggaatacgttcggtgtaaacgtccaacgctcgacgagggaagagcatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacg 36909651  T
Q  110 tgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcc 209  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  36909652 tgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcc 36909751  T
Q  210 agaagatcgtgattaggta 228  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  36909752 agaagatcgtcattaggta 36909770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 9 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 17686577 - 17686358
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||    
T  17686577 cagagacacaaggagggtagaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggttgaattaacgaatgacgaaaac 17686478  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  17686477 gtgaagagcatgttttgggagcacaacatcttccagtggatcgatatgcgggtgacgtagctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 17686378  T
Q  209 cagaagatcgtgattaggta 228  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  17686377 cagaagatcgtcattaggta 17686358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 9 - 228
Target Start/End: Original strand, 18170015 - 18170234
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18170015 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgttcaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 18170114  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||  || |||||||||    
T  18170115 gtgacgagcatgttttgggagcacatcatgttccagtagatcgatatgcgggtgacattgctgagctcaactgaagatatcatcaaaggtttgattccgc 18170214  T
Q  209 cagaagatcgtgattaggta 228  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  18170215 cagaagatcgtcattaggta 18170234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 9 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 24270579 - 24270371
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  24270579 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacactcgatgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 24270480  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  24270479 gtgacgagcatgttttaggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 24270380  T
Q  209 cagaagatc 217  Q
    |||||||||    
T  24270379 cagaagatc 24270371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 9 - 228
Target Start/End: Original strand, 6435762 - 6435981
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  6435762 cagagacacaaggagggtggaaaacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 6435861  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  6435862 gtgacgagcaagttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgtgagtgacgttgttgagatcaagtgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 6435961  T
Q  209 cagaagatcgtgattaggta 228  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  6435962 cagaagatcgtcattaggta 6435981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 9 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 38046650 - 38046431
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  38046650 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 38046551  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |    
T  38046550 gtgacaagcatgttttgggagcacaacatgttccagtcgatcaatatgccggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccac 38046451  T
Q  209 cagaagatcgtgattaggta 228  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  38046450 cagaagatcgtcattaggta 38046431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Original strand, 35576331 - 35576545
Alignment:
Q  11 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgt 110  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  35576331 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgatgaggggagaatatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgt 35576430  T
Q  111 gaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcca 210  Q
    || || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  35576431 gacgagcatgttttgggagcacagcatgttccggtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcca 35576530  T
Q  211 gaagatcgtgattag 225  Q
    ||||||||| |||||    
T  35576531 gaagatcgtcattag 35576545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 48568617 - 48568404
Alignment:
Q  12 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 111  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  48568617 agacacaaggagggtggaattagttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcacttgggtggagttaaagaatgatgaaaacgtg 48568518  T
Q  112 aagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccag 211  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||| ||||||    
T  48568517 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgatttcgccag 48568418  T
Q  212 aagatcgtgattag 225  Q
    ||||| || |||||    
T  48568417 aagattgtcattag 48568404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 9 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 12791489 - 12791273
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  12791489 cagagacacaagtagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 12791390  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| || ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  12791389 gtgacgagcatttttttggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgtttttgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 12791290  T
Q  209 cagaagatcgtgattag 225  Q
    ||||||||||| |||||    
T  12791289 cagaagatcgtcattag 12791273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 47488245 - 47488037
Alignment:
Q  17 caaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaa 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  47488245 caaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgag 47488146  T
Q  117 catgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagat 216  Q
    |||||||||||||||||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||| |||||||||||    
T  47488145 catgttttgggagcacaatattttctagttgatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatgtcatcaacagcttgatttcgccagaagat 47488046  T
Q  217 cgtgattag 225  Q
    ||| |||||    
T  47488045 cgtcattag 47488037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 230
Target Start/End: Original strand, 13283697 - 13283916
Alignment:
Q  11 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgt 110  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| | |||| |||||| |||||| |    
T  13283697 gagacacgaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcatttagttgggtgaaattaacgaacgatgaaaacat 13283796  T
Q  111 gaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcca 210  Q
    || || |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  13283797 gacgagcatgttttgggagcgcagcatgttctagtggatcgatatgcaggtaacgttgctgagatcaactgaatatattatcaacagtctgattccgcca 13283896  T
Q  211 gaagatcgtgattaggtaga 230  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  13283897 gaagatcgtgattaggtaga 13283916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 9 - 228
Target Start/End: Original strand, 13972914 - 13973133
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  13972914 cagagacgcaaggagggtggaatacgttcagtataaacgtccaacactcgactaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 13973013  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  13973014 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcaatatgcgggtgacattgctgagatcaattgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 13973113  T
Q  209 cagaagatcgtgattaggta 228  Q
    || |||||||| ||||||||    
T  13973114 cataagatcgtcattaggta 13973133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 229
Target Start/End: Original strand, 5765198 - 5765416
Alignment:
Q  11 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgt 110  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||| |    
T  5765198 gagatacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatggaagaatatcattcagttgggtggaattaacgaacgacaaaaactt 5765297  T
Q  111 gaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcca 210  Q
    || || ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||    
T  5765298 gatgagcatgttttgggagcagaacatgttctagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaaatgaagatattatcaaccgtctgattccgcca 5765397  T
Q  211 gaagatcgtgattaggtag 229  Q
    |||||||||||||||||||    
T  5765398 gaagatcgtgattaggtag 5765416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 229
Target Start/End: Original strand, 18842431 - 18842649
Alignment:
Q  11 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  18842431 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgatgagggaagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgt 18842530  T
Q  111 gaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcca 210  Q
    || || ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| ||||||    
T  18842531 gacgagcatgttttgggagcacggcatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattgtcaagagtctgatcccgcca 18842630  T
Q  211 gaagatcgtgattaggtag 229  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  18842631 gaagatcgggattaggtag 18842649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 9 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 50068475 - 50068254
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  50068475 cagagacgcaaggagggtggaatatgttcggtatgaaggtccaacactcgacgagtggagagtatcattcacttgggtggatttaaagaacgacaaaaat 50068376  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||    
T  50068375 gtgacgaacatgttttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcgtcaacagcttgattccgc 50068276  T
Q  209 cagaagatcgtgattaggtaga 230  Q
    ||||||||||| ||||| ||||    
T  50068275 cagaagatcgtcattagttaga 50068254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 21 - 229
Target Start/End: Original strand, 3658475 - 3658683
Alignment:
Q  21 gagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatg 120  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| |||| ||    
T  3658475 gagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggagagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacaaaaacgtgacgaacgtg 3658574  T
Q  121 ttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtg 220  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||     
T  3658575 ttttgggagcacaacatgttctagtggatcgatatgcaagtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtc 3658674  T
Q  221 attaggtag 229  Q
    |||||||||    
T  3658675 attaggtag 3658683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 9 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 39224413 - 39224197
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  39224413 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtctaacgctcaacgaggggagggtatcattcacttgggtggaattaaagaatgacgaaaac 39224314  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||| |||||||   |||||||||    
T  39224313 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactaaatatatcatcaacaacttgattccgc 39224214  T
Q  209 cagaagatcgtgattag 225  Q
    ||||||||||| |||||    
T  39224213 cagaagatcgtcattag 39224197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 9 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 44337535 - 44337319
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || |  ||||||||||||    
T  44337535 cagagacacaaggatggtggaacaccttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattcacaaacgacgaaaac 44337436  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  44337435 gtgacgagcatgttttgggtgcacaacatgtttcagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaatatgattccgc 44337336  T
Q  209 cagaagatcgtgattag 225  Q
    ||||||||||| |||||    
T  44337335 cagaagatcgtcattag 44337319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 9 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 49926595 - 49926377
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||| |||| |||||||||||||    
T  49926595 cagagacagaagg-gggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtgtcattcacttgtgcggaattaacgaacgacgaaaac 49926497  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  49926496 gtgaggagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcaggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 49926397  T
Q  209 cagaagatcgtgattaggta 228  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  49926396 cagaagatcgtcattaggta 49926377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 39857120 - 39856906
Alignment:
Q  11 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgt 110  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  39857120 gagacacaagaagggtggaacatgttcggtataaacgtccaatgctcgacgaggggagagtatcatccacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgt 39857021  T
Q  111 gaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcca 210  Q
    || || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||    
T  39857020 gacgatcatgttttgggagcacgacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattctgcca 39856921  T
Q  211 gaagatcgtgattag 225  Q
    ||||||||| |||||    
T  39856920 gaagatcgtcattag 39856906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 13635510 - 13635297
Alignment:
Q  12 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 111  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||     
T  13635510 agacacaaggatggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtc 13635411  T
Q  112 aagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccag 211  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  13635410 acgaccatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttggttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 13635311  T
Q  212 aagatcgtgattag 225  Q
    |||||||| |||||    
T  13635310 aagatcgtcattag 13635297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 9 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 27035534 - 27035318
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27035534 cagagacacaaggagggtggaatacgtccggtataaacgtccaacgctcgacgagggaagggtatcattcacttgggtggagttaaagaatgacgaaaac 27035435  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| ||  |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||   ||||||| |    
T  27035434 gtgacgagtatgttttgggagaacaccatattccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaacttaagatatcatcaacaacttgattccac 27035335  T
Q  209 cagaagatcgtgattag 225  Q
    ||||||||||| |||||    
T  27035334 cagaagatcgtcattag 27035318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 9 - 225
Target Start/End: Original strand, 29435963 - 29436179
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  29435963 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 29436062  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||  ||    
T  29436063 gtgacgagcatgttttgggagtacagcatgttccagtggatcgatacgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattaagc 29436162  T
Q  209 cagaagatcgtgattag 225  Q
    ||||||||||| |||||    
T  29436163 cagaagatcgtcattag 29436179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 10 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 29762436 - 29762229
Alignment:
Q  10 agagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacg 109  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  29762436 agagacacaaggagggtggaacaccttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacg 29762337  T
Q  110 tgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcc 209  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| |||| |||||||   ||||||||||    
T  29762336 tgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatacgggtgacgttgatgagatcaactgaaaatatcatcaacaacttgattccgcc 29762237  T
Q  210 agaagatc 217  Q
    ||||||||    
T  29762236 agaagatc 29762229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Original strand, 23342634 - 23342850
Alignment:
Q  12 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 111  Q
    ||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||    
T  23342634 agacacaaggaaggtgaaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggttgaattaacgaacgacgaaaacgtg 23342733  T
Q  112 aagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccag 211  Q
    | || |||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||    
T  23342734 acgagcatgtttttggagcacattatgttcgagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagataaactgaagatatcatcaaaagtttgattcctccag 23342833  T
Q  212 aagatcgtgattaggta 228  Q
    |||||||| ||||||||    
T  23342834 aagatcgtcattaggta 23342850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 12 - 227
Target Start/End: Original strand, 35184963 - 35185179
Alignment:
Q  12 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 111  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||||||    
T  35184963 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcactttgatggaattaacgaacgacgaaaacgtg 35185062  T
Q  112 aagaacatgtttt-gggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcca 210  Q
    | ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  35185063 acgaacatgttttggggagcacggcatgttccagtggatcgatatgcaggtgacgttgctgaaatcaattgaagatatcatcaaaagtttgattccgcca 35185162  T
Q  211 gaagatcgtgattaggt 227  Q
    ||||||||| |||||||    
T  35185163 gaagatcgtcattaggt 35185179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 9 - 225
Target Start/End: Original strand, 44597691 - 44597907
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  44597691 cagagacacaaggagggtggaacaccttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 44597790  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||    
T  44597791 gtgatgagtatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgtgggtgacgttgatgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgc 44597890  T
Q  209 cagaagatcgtgattag 225  Q
    | ||||||||| |||||    
T  44597891 cggaagatcgtcattag 44597907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Original strand, 49396697 - 49396913
Alignment:
Q  12 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 111  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||||||||||    
T  49396697 agacataaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgatttacgaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaacaacgaaaacgtg 49396796  T
Q  112 aagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccag 211  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||    
T  49396797 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggattgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcaacaaaagtttgattccgccag 49396896  T
Q  212 aagatcgtgattaggta 228  Q
    |||||||| ||||||||    
T  49396897 aagatcgtcattaggta 49396913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 9 - 225
Target Start/End: Original strand, 49427377 - 49427593
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||| ||||||| ||||  | |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  49427377 cagagatacaaggatggtgttacacgttcggtataaatgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggcggaattaacgaacgacgaaaac 49427476  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  49427477 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 49427576  T
Q  209 cagaagatcgtgattag 225  Q
    ||||||||||| |||||    
T  49427577 cagaagatcgtcattag 49427593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 9 - 225
Target Start/End: Original strand, 51269792 - 51270008
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  51269792 cagagacacaaggagggtggaacaccttctgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcagttgggtggaattaacaaacgacgaaaac 51269891  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||   |||||||||    
T  51269892 gtgacgagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgggatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgc 51269991  T
Q  209 cagaagatcgtgattag 225  Q
    ||||||||||| |||||    
T  51269992 cagaagatcgtcattag 51270008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 22 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 24364003 - 24363796
Alignment:
Q  22 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24364003 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcaatcacttgggtagaattaatgaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 24363904  T
Q  122 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 221  Q
    |||||| |||||  |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||    
T  24363903 tttgggggcacagtatgttctagtggatcgatatgcggttaacgttgttgagagcaactgaagatattatcaagagtttgattccgttagaagatcgtga 24363804  T
Q  222 ttaggtag 229  Q
    ||||||||    
T  24363803 ttaggtag 24363796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 12 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 21484856 - 21484639
Alignment:
Q  12 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 111  Q
    |||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||    
T  21484856 agacacaaggagggtgaaacttgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaatgtg 21484757  T
Q  112 aagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccag 211  Q
    | || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| | ||||    
T  21484756 acgagcatgtttttggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgagtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgatttcaccag 21484657  T
Q  212 aagatcgtgattaggtag 229  Q
    |||||||| |||||||||    
T  21484656 aagatcgtcattaggtag 21484639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 9 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 27486906 - 27486690
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||||||||||||| ||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  27486906 cagagacacaaggagggtagatcaccttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttaattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaac 27486807  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||    
T  27486806 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccattggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgc 27486707  T
Q  209 cagaagatcgtgattag 225  Q
    | ||||||||| |||||    
T  27486706 ctgaagatcgtcattag 27486690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Original strand, 45689114 - 45689325
Alignment:
Q  12 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 111  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||   |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  45689114 agacacaaggagggtggaatatgtttggtt--aacgtccaacgctcgacggggggagaatatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 45689211  T
Q  112 aagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccag 211  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||     
T  45689212 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatggatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccgccat 45689311  T
Q  212 aagatcgtgattag 225  Q
    |||||||| |||||    
T  45689312 aagatcgtcattag 45689325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 41875097 - 41874884
Alignment:
Q  12 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 111  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  41875097 agacacaaggagggtggaattagttcggtatcaacgtccaatgctcgaagaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaataacgacgaaaatgtg 41874998  T
Q  112 aagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccag 211  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || | ||   ||||||||||||    
T  41874997 acgagcatgttttgggagcacaacatgttctagtggatcgatatgcgggtaatgttgctgagatcaactaaagatatcattagcaacttgattccgccag 41874898  T
Q  212 aagatcgtgattag 225  Q
    |||||||| |||||    
T  41874897 aagatcgttattag 41874884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Original strand, 48215191 - 48215404
Alignment:
Q  12 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 111  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||    
T  48215191 agacacaaggatggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaacgacgaaaacatg 48215290  T
Q  112 aagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccag 211  Q
    | || ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  48215291 acgagcatatttttggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 48215390  T
Q  212 aagatcgtgattag 225  Q
    ||||| || |||||    
T  48215391 aagatagtcattag 48215404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 9 - 225
Target Start/End: Original strand, 19160307 - 19160523
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    ||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  19160307 cagagacacgaggatggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgcttgacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 19160406  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| ||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  19160407 gtgacgactatgttttgggaacacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaattgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 19160506  T
Q  209 cagaagatcgtgattag 225  Q
    |||||||| || |||||    
T  19160507 cagaagattgtcattag 19160523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 41 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 46180465 - 46180280
Alignment:
Q  41 ataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcact-tgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgttttgggagcacaacatgt 139  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  46180465 ataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcactctgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacagcatgt 46180366  T
Q  140 tccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattag 225  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||| |||||    
T  46180365 tccagtggatcgatatgtgggtaacgttgttgagatcaattgaagatatcatcaacagcttgattctgccagaagatcgtcattag 46180280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 49 - 228
Target Start/End: Original strand, 37778109 - 37778288
Alignment:
Q  49 ccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtgga 148  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  37778109 ccaacgcttgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaaaggacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagaacaacatgttccagttga 37778208  T
Q  149 tcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggta 228  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37778209 tcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggta 37778288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 49599090 - 49598921
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  49599090 cagagacgcaaggagggtggaatacgttcggtataaacgttcaacactcgacgaggggagagtatcattcacttgagtggagttaaagaatgacg-aaac 49598992  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaac 179  Q
    ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49598991 gtgacaagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaac 49598921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 49263202 - 49263017
Alignment:
Q  11 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgt 110  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| ||||  || |||||||||||    
T  49263202 gagacacaagtagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcaacgaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacaaaagacgaaaacgt 49263103  T
Q  111 gaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaaca 196  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  49263102 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatctatatgctggtaacgttgttgagatcaactgaagatatcatcaaca 49263017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 9 - 228
Target Start/End: Original strand, 41780683 - 41780902
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  41780683 cagagacacaagaagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgagaggataatatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 41780782  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||| ||||| |||    
T  41780783 gtgacgaatatattttgggagcacagcatgttccagtagatagatatgcaggtgacgttgctaagatcaactgaatatatcatcaaaagtttgatttcgc 41780882  T
Q  209 cagaagatcgtgattaggta 228  Q
    |||||| |||| ||||||||    
T  41780883 cagaagttcgtcattaggta 41780902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 11 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 35526391 - 35526189
Alignment:
Q  11 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgt 110  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||     
T  35526391 gagacacagggagggtggaacgcgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggagagagtatcattcacctgggtggaattaacgaacgtcgaaaacga 35526292  T
Q  111 gaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcca 210  Q
    || || |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |    
T  35526291 gacgaccatgttttgggagcacagaatgttgcagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcta 35526192  T
Q  211 gaa 213  Q
    |||    
T  35526191 gaa 35526189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 9 - 228
Target Start/End: Original strand, 17372717 - 17372936
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || ||||| |||||| |||  ||||||||||||     
T  17372717 cagagacgcaaagagggtgaaatatgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatataatccacttaggtggaattagcgaacgacgaaaat 17372816  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | ||| | ||| |||    
T  17372817 gtgaagaacatgttttgggagcacaccatattccagtggatcgatatacgtgtaacgttgatgagatcaactgaagatatcatcgaaagtttaatttcgc 17372916  T
Q  209 cagaagatcgtgattaggta 228  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  17372917 cagaagatcgtcattaggta 17372936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 30310039 - 30309832
Alignment:
Q  12 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 111  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30310039 agacataaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacactcgacggggggagggtatcattcacttgggtggaattaaagaacgacgaaaacgtg 30309940  T
Q  112 aagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccag 211  Q
    | || |||||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||| ||      ||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||    
T  30309939 acgagcatgttttgggagcacaggacgtttcagtggatcgatatgcgggtgac------gagatcaactgaatatatcatcaacagcttgattccgccag 30309846  T
Q  212 aagatcgtgattag 225  Q
    |||||||| |||||    
T  30309845 aagatcgtcattag 30309832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16532304 - 16532087
Alignment:
Q  11 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgt 110  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||| |||| ||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||| ||    
T  16532304 gagacacaaggaggatggaatacgttcgatataaacgtacaacgctcgatgaggagagaatatcattaagttgggtggaattaacgaacgacgaaaatgt 16532205  T
Q  111 gaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcca 210  Q
    || || ||| || |||||||| | |||| || | ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| |    
T  16532204 gatgagcatattatgggagcagagcatgctctaatggattgatatgcgtgtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaatagtctgatttcgcta 16532105  T
Q  211 gaagatcgtgattaggta 228  Q
    ||||||||||||||||||    
T  16532104 gaagatcgtgattaggta 16532087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 28 - 229
Target Start/End: Original strand, 16081294 - 16081495
Alignment:
Q  28 gaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgttttggg 127  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||| || |||||| |||| ||||||||| ||| ||| || |||||||| ||    
T  16081294 gaatacgttcggtataaacgttcaacgctcgacgaggggaggatatcattcagttaggtggaattaacgaacgacgataacatgaggagcatgtttttgg 16081393  T
Q  128 agcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggt 227  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||  ||||  | || ||| | |||| ||| |||||||||||||||||    
T  16081394 agcacaacatgttctagttgatcgatatgcgtgtaacgttgctgcaatcaactgagaatatactgaagagtttaattctgccggaagatcgtgattaggt 16081493  T
Q  228 ag 229  Q
    ||    
T  16081494 ag 16081495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 65 - 150
Target Start/End: Original strand, 13148365 - 13148450
Alignment:
Q  65 ggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatc 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13148365 ggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagaacatgttttgagagcacaacatgttccagtggatc 13148450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 135 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 40533376 - 40533283
Alignment:
Q  135 catgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggta 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||    
T  40533376 catgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgccgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttaattccgccagaagatcgtcattaggta 40533283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 16098146 - 16098078
Alignment:
Q  11 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattca 79  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||    
T  16098146 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattca 16098078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 121 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 19262517 - 19262409
Alignment:
Q  121 ttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtg 220  Q
    |||||| |||||| |||||||| | ||||| |||||   || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||  ||    
T  19262517 ttttggcagcacatcatgttcccgaggatcaatatgtttgtcacgttgctgagatcaactgaagatattctcaacagtttgattccgcctgaagattatg 19262418  T
Q  221 attaggtag 229  Q
    |||||||||    
T  19262417 attaggtag 19262409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 145 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 29707621 - 29707547
Alignment:
Q  145 tggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgt 219  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||    
T  29707621 tggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagtttgattccgctagaagatcgt 29707547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 14772592 - 14772528
Alignment:
Q  165 gttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtag 229  Q
    ||||| |||||||| ||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14772592 gttgcagagatcaattgaagatgttctcaacagtttgattctgccagaagatcgtgattaggtag 14772528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 14772755 - 14772662
Alignment:
Q  11 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacga 104  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| | ||||| |||||| |||| |||| | || | || ||||||||||||||    
T  14772755 gagacacaaggagggtgaaatacatttggtatgaacgtccaacgttggacaacgggagaatatcgttcagtcggctagaattaaagaacgacga 14772662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 213
Target Start/End: Original strand, 15471510 - 15471721
Alignment:
Q  11 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgt 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||| || | |||| |  |  |||||||| |||| ||||  | ||    
T  15471510 gagacacaaggagtgtggaatacgtttggtatgaacatccaacgttcgacgaggggagaataacgttcagtcagccggagttaacgaacaacgacgatgt 15471609  T
Q  111 gaagaacatg---------ttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatg 201  Q
    || |||||||         |||||  ||||||||||||||| |||||| ||| ||   || ||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||| ||    
T  15471610 gaggaacatgttcttgattttttgtcagcacaacatgttcccgtggattgatgtgtttgtcacgttgctgagatcgcctgaagatattctcaagagtttg 15471709  T
Q  202 attccgccagaa 213  Q
    |||  |||||||    
T  15471710 attatgccagaa 15471721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 11 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 48707132 - 48707090
Alignment:
Q  11 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaac 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  48707132 gagacacaaggagggtggaatacgtttggtatgaacgtccaac 48707090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 9 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 46181768 - 46181731
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaac 46  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  46181768 cagagacgcaaggaaggtggaatacgttcggtataaac 46181731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 176; Significance: 6e-95; HSPs: 50)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 9 - 228
Target Start/End: Original strand, 35491629 - 35491848
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  35491629 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 35491728  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  35491729 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 35491828  T
Q  209 cagaagatcgtgattaggta 228  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  35491829 cagaagatcgtcattaggta 35491848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 9 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 12968514 - 12968298
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12968514 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaatgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 12968415  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    || | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||| |    
T  12968414 gttacgagcatgttttgggagcacaacatgttccattggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattcctc 12968315  T
Q  209 cagaagatcgtgattag 225  Q
    ||||||||||| |||||    
T  12968314 cagaagatcgtcattag 12968298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 9 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 10364849 - 10364629
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  10364849 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 10364750  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  10364749 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaattgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 10364650  T
Q  209 cagaagatcgtgattaggtag 229  Q
    ||||||||||| |||| ||||    
T  10364649 cagaagatcgtcattacgtag 10364629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 9 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 19471846 - 19471627
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  19471846 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 19471747  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  19471746 gtgacgagcatgttttgggagcacagcatgttccagtgtatcgatatgcgggtgacgttgctaagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 19471647  T
Q  209 cagaagatcgtgattaggta 228  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  19471646 cagaagatcgtcattaggta 19471627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 12 - 229
Target Start/End: Original strand, 33404012 - 33404229
Alignment:
Q  12 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 111  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  33404012 agacacaaagagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgagggaatagtatcattcagttgtgtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 33404111  T
Q  112 aagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccag 211  Q
    | || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||    
T  33404112 acgagcatgttttgggagcacaagatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgatgtcgccag 33404211  T
Q  212 aagatcgtgattaggtag 229  Q
    ||||||||||||||||||    
T  33404212 aagatcgtgattaggtag 33404229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 17 - 225
Target Start/End: Original strand, 42120014 - 42120222
Alignment:
Q  17 caaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||     
T  42120014 caaggagggtggaatacgttcggtataaatgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggcggagttaaagaacgacgaaaatgtgacgag 42120113  T
Q  117 catgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagat 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  42120114 catgttttgggagcacaacatgttccagtggattgatatgtgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccgccagaagat 42120213  T
Q  217 cgtgattag 225  Q
    ||| |||||    
T  42120214 cgtcattag 42120222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 27130719 - 27130502
Alignment:
Q  11 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgt 110  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  27130719 gagacacaaggagggtggaacacattcggtataaacgtccaacgctcaacgaggggagaatatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgt 27130620  T
Q  111 gaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcca 210  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  27130619 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcca 27130520  T
Q  211 gaagatcgtgattaggta 228  Q
    |||||| || ||||||||    
T  27130519 gaagatagtcattaggta 27130502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 37312705 - 37312488
Alignment:
Q  11 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgt 110  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  37312705 gagacacaaggaggatggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagattatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgt 37312606  T
Q  111 gaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcca 210  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||    
T  37312605 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattctgcca 37312506  T
Q  211 gaagatcgtgattaggta 228  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  37312505 gaagatcgtcattaggta 37312488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 17 - 217
Target Start/End: Original strand, 29906584 - 29906784
Alignment:
Q  17 caaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||    
T  29906584 caaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgtggggagagtatcattcacttgggtgaagttaaagaacgacgaaaacgtgacaaa 29906683  T
Q  117 catgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagat 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||   |||||| ||||||||||    
T  29906684 catgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaaaatatcatcaacaacttgattctgccagaagat 29906783  T
Q  217 c 217  Q
    |    
T  29906784 c 29906784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 10360406 - 10360195
Alignment:
Q  14 acacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaa 113  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||     
T  10360406 acacaaggagggtggaacacgttctgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgatgaaaacgtgac 10360307  T
Q  114 gaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaa 213  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||    
T  10360306 gagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaatgttgctgagatcaactgaagatttcatcaacagcttgattccgccagaa 10360207  T
Q  214 gatcgtgattag 225  Q
    |||||| |||||    
T  10360206 gatcgtcattag 10360195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 9 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 41499306 - 41499087
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||    
T  41499306 cagagacagaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattaacctgggtggaattaacgaacgacgaaaac 41499207  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  41499206 gtgacgagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgagggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 41499107  T
Q  209 cagaagatcgtgattaggta 228  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  41499106 cagaagatcgtcattaggta 41499087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 9 - 225
Target Start/End: Original strand, 22493265 - 22493481
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22493265 cagagacgcaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacggcgaaaac 22493364  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| || ||||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||   |||||||||    
T  22493365 gtgacgagcatgttttgggagtacagaatgttccagtggattgatatgcgggtaacgttcctgagatcaactaaagatatcatcaacaacttgattccgc 22493464  T
Q  209 cagaagatcgtgattag 225  Q
    ||||||||||| |||||    
T  22493465 cagaagatcgtcattag 22493481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 9 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 2919577 - 2919358
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  2919577 cagagacacaaggagggtggaacacgttctgtataaacgtccaacgctcgatgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 2919478  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||    
T  2919477 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttacagtagatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcattaaaagtttgattccgc 2919378  T
Q  209 cagaagatcgtgattaggta 228  Q
    || |||||||| ||||||||    
T  2919377 caaaagatcgtcattaggta 2919358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 229
Target Start/End: Original strand, 6901962 - 6902180
Alignment:
Q  11 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgt 110  Q
    |||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  6901962 gagacacaaggagggttgaacacattcggcataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgt 6902061  T
Q  111 gaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcca 210  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  6902062 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtgaatcgatatgcgagtaacgttgttgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattccgcga 6902161  T
Q  211 gaagatcgtgattaggtag 229  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  6902162 gaagatcatgattaggtag 6902180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 9 - 225
Target Start/End: Original strand, 3941731 - 3941947
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  3941731 cagagacacaaggagggtggaacaccttcagtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 3941830  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||    
T  3941831 gtgacgagcatgttttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgatgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgc 3941930  T
Q  209 cagaagatcgtgattag 225  Q
    ||||||||||| |||||    
T  3941931 cagaagatcgtcattag 3941947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 9 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 34521896 - 34521677
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  34521896 cagagacacaaggagggtgaaacacgttcggtataaacgtcaaacgctcaacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 34521797  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||      
T  34521796 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgttgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccct 34521697  T
Q  209 cagaagatcgtgattaggta 228  Q
    || |||||||| ||||||||    
T  34521696 cataagatcgtcattaggta 34521677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 12 - 213
Target Start/End: Original strand, 29111155 - 29111356
Alignment:
Q  12 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 111  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  29111155 agacacaaggagggtggaacacgttcagtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 29111254  T
Q  112 aagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccag 211  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | | | ||||||||||    
T  29111255 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaaccgaagatatcatcaaaaatttaattccgccag 29111354  T
Q  212 aa 213  Q
    ||    
T  29111355 aa 29111356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 9 - 228
Target Start/End: Original strand, 6976832 - 6977049
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||    
T  6976832 cagagacacaaggagggtggaacatgttcggtataaacgtccaacgctcgacgagg--agtgtatcattcacttgggtgaaattaacgaacgacgaaaac 6976929  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  6976930 gtgacgagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 6977029  T
Q  209 cagaagatcgtgattaggta 228  Q
     |||||||||| ||||||||    
T  6977030 gagaagatcgtcattaggta 6977049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 9 - 225
Target Start/End: Original strand, 32734641 - 32734857
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  32734641 cagagacacaaggagggtggaatacgtttggtataaacgttcaacgctcgacgaggggagggtatcattcacttgggtggagttaaagaactacgaaaat 32734740  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    ||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||    
T  32734741 gtgacaagcatgttttgggagcacaacatgttacagtggatcgatatgcgggtaacgttgttgatatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccgc 32734840  T
Q  209 cagaagatcgtgattag 225  Q
    || ||||| || |||||    
T  32734841 caaaagatagtcattag 32734857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Original strand, 5420465 - 5420679
Alignment:
Q  11 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgt 110  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||    
T  5420465 gagacacaaggagggtggaacacgttcgatataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaacgacgaaaacgt 5420564  T
Q  111 gaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcca 210  Q
    || |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||     
T  5420565 gacgaacatgttttgtgagcacagcatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgatatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccacct 5420664  T
Q  211 gaagatcgtgattag 225  Q
    ||||||||| |||||    
T  5420665 gaagatcgtcattag 5420679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 11 - 229
Target Start/End: Original strand, 20148114 - 20148332
Alignment:
Q  11 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgt 110  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| | ||||| ||| |||||||||||||||||| |    
T  20148114 gagacacaaggagggtgaaatatgttcggtataaacgtccaacgctcaacgaggggagaatatcatttagttggggggaattaaagaacgacgaaaacat 20148213  T
Q  111 gaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcca 210  Q
    ||  | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  20148214 gactagcatgttttaggagcacaacatgttccagtagatcgatatgcgggtaacgttgctgagattagctgaagatattttcaacagtctgattccgcca 20148313  T
Q  211 gaagatcgtgattaggtag 229  Q
    |||||||||||||||||||    
T  20148314 gaagatcgtgattaggtag 20148332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 9 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 42241311 - 42241095
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  42241311 cagagacacaaggagggtgaaacacattcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagggtatcattcacttgggtggaattaaagaacaacgaaaac 42241212  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| |||||| ||    
T  42241211 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgtttcagttgatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcaccaaaagtttgattctgc 42241112  T
Q  209 cagaagatcgtgattag 225  Q
    || |||||||| |||||    
T  42241111 cataagatcgtcattag 42241095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 9 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 3937276 - 3937060
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  3937276 cagagacacaaggatggtggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 3937177  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  3937176 gtgacgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 3937077  T
Q  209 cagaagatcgtgattag 225  Q
    || |||||||| |||||    
T  3937076 cacaagatcgtcattag 3937060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 9 - 225
Target Start/End: Original strand, 39393885 - 39394101
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||    
T  39393885 cagagacacaaggagggtgtaacaccttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaatcaacaaacgacgaaaac 39393984  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||   ||||||||     
T  39393985 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttctagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcattaacaacttgattccgt 39394084  T
Q  209 cagaagatcgtgattag 225  Q
    ||||||||||| |||||    
T  39394085 cagaagatcgtcattag 39394101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 9 - 225
Target Start/End: Original strand, 43982850 - 43983066
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  43982850 cagagacacaaggatggtggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 43982949  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  43982950 gtgacgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 43983049  T
Q  209 cagaagatcgtgattag 225  Q
    || |||||||| |||||    
T  43983050 cacaagatcgtcattag 43983066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 10 - 225
Target Start/End: Original strand, 17424784 - 17424999
Alignment:
Q  10 agagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacg 109  Q
    ||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  17424784 agagacacaaggatggtggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacg 17424883  T
Q  110 tgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcc 209  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  17424884 tgacgaccatgttttgggagcacaacatgttctagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcc 17424983  T
Q  210 agaagatcgtgattag 225  Q
    | |||||||| |||||    
T  17424984 acaagatcgtcattag 17424999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Original strand, 29067726 - 29067939
Alignment:
Q  12 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 111  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | |||| ||| |||||||| |||    
T  29067726 agacacaaggatggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcacttgggtgcaattaacgaatgacgaaaatgtg 29067825  T
Q  112 aagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccag 211  Q
    | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  29067826 acgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 29067925  T
Q  212 aagatcgtgattag 225  Q
    |||||||| |||||    
T  29067926 aagatcgtcattag 29067939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 17796314 - 17796099
Alignment:
Q  11 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgt 110  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  17796314 gagacacagggagggtggaacacgttaagtataaacatccaacgctcgacgagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgt 17796215  T
Q  111 gaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcca 210  Q
    ||||| ||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || ||||| ||    
T  17796214 gaagagcatgttttgggagc---acatgttctagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttggttccgtca 17796118  T
Q  211 gaagatcgtgattaggtag 229  Q
    |||| |||| |||||||||    
T  17796117 gaagctcgtcattaggtag 17796099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 9 - 217
Target Start/End: Original strand, 16581816 - 16582026
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||     
T  16581816 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaatgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgagcgacgaaaat 16581915  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatc--gatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattcc 206  Q
    |||  || ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||    
T  16581916 gtgtcgagcatgttttgggagcacatcatgttccattggatcgagatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagcttgattcc 16582015  T
Q  207 gccagaagatc 217  Q
    || ||||||||    
T  16582016 gctagaagatc 16582026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 9 - 225
Target Start/End: Original strand, 22001828 - 22002044
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  22001828 cagagacacaaggatggtagaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcacttgggaggaattaacgaacgacgaaaac 22001927  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| || |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  22001928 gtgacgaccatgttttgggagctcagcatgttccaatggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaacttaagatatcatcaaaagtttgattccgc 22002027  T
Q  209 cagaagatcgtgattag 225  Q
    |||||||| || |||||    
T  22002028 cagaagattgtcattag 22002044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 39800051 - 39799902
Alignment:
Q  12 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 111  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||     
T  39800051 agacacaaggatggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtc 39799952  T
Q  112 aagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggt 161  Q
    | || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39799951 acgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggt 39799902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 157
Target Start/End: Original strand, 18392032 - 18392179
Alignment:
Q  14 acacaaggagggtggaatacgtt----cggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18392032 acacaaggagggtggaatacgttcgttcggtataaacgtccaacgcttgacgaggggagagtatcatttacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacg 18392131  T
Q  110 tgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgc 157  Q
    ||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18392132 tgacgagcatgttttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgc 18392179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 69 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 40677527 - 40677368
Alignment:
Q  69 agtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttg 168  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  40677527 agtatcatccacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttctgggagcacgacatgttctagtggatcgatatgcgggtgacgttg 40677428  T
Q  169 ctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggta 228  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  40677427 ctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgctagaagatcgtcattaggta 40677368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 9 - 143
Target Start/End: Original strand, 34638960 - 34639093
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  34638960 cagagacacaaggagg-tggaacaccttcggtataaacgtccaacgctcaacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaac 34639058  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttcca 143  Q
    |||| || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  34639059 gtgacgagcatgttttgggagcacagcatgttcca 34639093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 121 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 27650527 - 27650419
Alignment:
Q  121 ttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtg 220  Q
    |||||| | ||||||||||| | |||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27650527 ttttggcaacacaacatgttaccgtggatcgatatgtttgtcacgttgctgagatcaactgaagatattctcaacagtttgattccgccagaagatcgtg 27650428  T
Q  221 attaggtag 229  Q
    |||||||||    
T  27650427 attaggtag 27650419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Original strand, 16253474 - 16253594
Alignment:
Q  13 gacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  || | |||||| ||||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  16253474 gacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgcccaacacttaacgatgggagaatatcattaagttgggtggaattaaagaacgacgataacgtga 16253573  T
Q  113 agaacatgttttgggagcaca 133  Q
      | |||||||||||||||||    
T  16253574 gcagcatgttttgggagcaca 16253594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 160 - 229
Target Start/End: Original strand, 16253600 - 16253669
Alignment:
Q  160 gtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtag 229  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16253600 gtaacgttgctgagatcaactaaagatattatcgacagtttgattccaccagaagatcgtgattaggtag 16253669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 163 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 31991994 - 31991928
Alignment:
Q  163 acgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtag 229  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31991994 acgttgcagagatcaactgaagatattctcaacaatttgattccgccagaagatcgtgattaggtag 31991928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 12 - 79
Target Start/End: Original strand, 31770360 - 31770427
Alignment:
Q  12 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattca 79  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  31770360 agacacaaggaggatgtaatatgttcggtataaacgtccaacgttcgacgaggggagagtatcattca 31770427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 165 - 228
Target Start/End: Original strand, 43491600 - 43491663
Alignment:
Q  165 gttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggta 228  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43491600 gttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggta 43491663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 163 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 15891705 - 15891639
Alignment:
Q  163 acgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtag 229  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  15891705 acgttgcggagatcaactgaagatattctcaacagtttgattccgctagaatatcgtgattaggtag 15891639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 9 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 40678827 - 40678763
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtat 73  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||    
T  40678827 cagagacacaaggagggtggaacgcgttcggtataaacgtccaacactcgacgaagggagagtat 40678763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 18036220 - 18036154
Alignment:
Q  163 acgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtag 229  Q
    ||||||| |||||||||| || ||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18036220 acgttgcagagatcaactaaaaatattctcaacaatttgattccgccagaagatcgtgattaggtag 18036154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 152 - 225
Target Start/End: Original strand, 18393486 - 18393559
Alignment:
Q  152 atatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattag 225  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||   |||||| ||||||||||||| |||||    
T  18393486 atatgcgtgtaacgttgctgagatcaactgaagatatcataaacaacttgattctgccagaagatcgtcattag 18393559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 11679308 - 11679084
Alignment:
Q  11 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgt 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| | ||| | |||||| || | || | |  | | || ||||||||||||||  ||||    
T  11679308 gagacacaaggagggtggaatacatttggtatgaacgtccaacgttggacgatgggagaataacgtttaatcagctagaattaaagaacgacgacgacgt 11679209  T
Q  111 gaagaacatgtt----------ttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtat 200  Q
    || |||||||||          || | | |||| |||||||| |||||||||||||    | ||||| || |||||||||||||||||| |||||||| |    
T  11679208 gatgaacatgttctcgattttttttgcaccacatcatgttcccgtggatcgatatgtttctcacgttacttagatcaactgaagatattctcaacagttt 11679109  T
Q  201 gattccgccagaagatcgtgattag 225  Q
    ||||| |||| |||||  |||||||    
T  11679108 gattctgccataagattatgattag 11679084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 205
Target Start/End: Original strand, 11718741 - 11718945
Alignment:
Q  11 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgt 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || | ||| | |||||| || | || | | || | || ||||||||||||||  ||||    
T  11718741 gagacacaaggagggtggaatacatttggtatgaacgtccagcgttggacgatgggagaataacgtttaatcggctagaattaaagaacgacgacgacgt 11718840  T
Q  111 gaagaacatgtt----------ttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtat 200  Q
    || |||||||||          || | | |||| |||||||| |||||||||||||    | ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  11718841 gatgaacatgttctcgattttttttgcaccacatcatgttcccgtggatcgatatgtttctcacgttactgagatcaactgaagatattctcaacagttt 11718940  T
Q  201 gattc 205  Q
    |||||    
T  11718941 gattc 11718945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 26617697 - 26617652
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacg 54  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  26617697 cagagacacaaggagggtggaatacgtttggtatgaacgtccaacg 26617652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 170
Target Start/End: Original strand, 17112399 - 17112451
Alignment:
Q  118 atgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgct 170  Q
    ||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  17112399 atgttttgggagcacaatatgttctaatggattgatatgcgggtgacgttgct 17112451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 130 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 26617568 - 26617485
Alignment:
Q  130 cacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaa 213  Q
    |||||||||| || |||||||||||||   || ||||||||||||||  ||||||||||| | || ||| ||||||||| ||||    
T  26617568 cacaacatgtccccgtggatcgatatgtttgtcacgttgctgagatcgcctgaagatattcttaagagtttgattccgctagaa 26617485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 229
Target Start/End: Original strand, 18878652 - 18878718
Alignment:
Q  163 acgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtag 229  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||  | |||||||||    
T  18878652 acgttgctgagatcgcctgaagatattctcaacaatttgattccgacagaagattatcattaggtag 18878718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 173; Significance: 4e-93; HSPs: 69)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Original strand, 51015284 - 51015500
Alignment:
Q  12 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 111  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  51015284 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagtgtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 51015383  T
Q  112 aagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccag 211  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  51015384 acgaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggaaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 51015483  T
Q  212 aagatcgtgattaggta 228  Q
    |||||||| ||||||||    
T  51015484 aagatcgtcattaggta 51015500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 39417160 - 39416947
Alignment:
Q  12 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 111  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39417160 agacacaaggagggtggaattagttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 39417061  T
Q  112 aagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccag 211  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||| ||||||    
T  39417060 atgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaatagcttgatttcgccag 39416961  T
Q  212 aagatcgtgattag 225  Q
    |||||||| |||||    
T  39416960 aagatcgtcattag 39416947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Original strand, 44927469 - 44927683
Alignment:
Q  11 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgt 110  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  44927469 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgt 44927568  T
Q  111 gaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcca 210  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  44927569 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgttgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcca 44927668  T
Q  211 gaagatcgtgattag 225  Q
    ||||||||| |||||    
T  44927669 gaagatcgtcattag 44927683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 34472288 - 34472072
Alignment:
Q  12 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 111  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  34472288 agacacaaggagggtggaacacattcggtataaacgtccaacgctctacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 34472189  T
Q  112 aagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccag 211  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||    
T  34472188 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagttttattccgccag 34472089  T
Q  212 aagatcgtgattaggta 228  Q
    |||||||| ||||||||    
T  34472088 aagatcgtcattaggta 34472072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 9 - 225
Target Start/End: Original strand, 42382275 - 42382491
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42382275 cagagacgtaaggagggtggactacgttcagtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 42382374  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||    
T  42382375 gtgacgagcatgttttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaagttgattccgc 42382474  T
Q  209 cagaagatcgtgattag 225  Q
    ||||||||||| |||||    
T  42382475 cagaagatcgtcattag 42382491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 45100677 - 45100461
Alignment:
Q  12 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 111  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  45100677 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaagggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacaaaaatgtg 45100578  T
Q  112 aagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccag 211  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||     
T  45100577 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccat 45100478  T
Q  212 aagatcgtgattaggta 228  Q
    || ||||| ||||||||    
T  45100477 aatatcgtcattaggta 45100461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 9 - 225
Target Start/End: Original strand, 47065691 - 47065907
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  47065691 cagagacacaaggagggtggaatacgttcagtataaacgtccaacgcttgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgaggaaaat 47065790  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||   |||||||||    
T  47065791 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttctagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcattaacaacttgattccgc 47065890  T
Q  209 cagaagatcgtgattag 225  Q
    ||||||||||| |||||    
T  47065891 cagaagatcgtcattag 47065907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 48087764 - 48087552
Alignment:
Q  12 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 111  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48087764 agacacaaggatggtggaattagttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacctgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 48087665  T
Q  112 aagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccag 211  Q
    | || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||    
T  48087664 acgagcatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccaccag 48087565  T
Q  212 aagatcgtgatta 224  Q
    |||||||| ||||    
T  48087564 aagatcgtcatta 48087552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 9 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 46414549 - 46414330
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  46414549 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacatccaacgctcgacgagtggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 46414450  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  46414449 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttctagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaacttaagatatcatcaaaagtttgattccgc 46414350  T
Q  209 cagaagatcgtgattaggta 228  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  46414349 cagaagatcgtcattaggta 46414330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 9 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 51013493 - 51013274
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  51013493 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcaacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 51013394  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  51013393 gtgacgagcatgttttgggaacacaacatgttccagtgtatcgatatgcgggtgacgttgctaagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 51013294  T
Q  209 cagaagatcgtgattaggta 228  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  51013293 cagaagatcgtcattaggta 51013274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Original strand, 2428491 - 2428716
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  2428491 cagagacagaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggataatatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 2428590  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  2428591 gtgacgaacatgttttgggagcacaacattttctagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 2428690  T
Q  209 cagaagatcgtgattaggtagataat 234  Q
     |||||||||| |||||||| |||||    
T  2428691 tagaagatcgtcattaggtacataat 2428716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 9 - 225
Target Start/End: Original strand, 42383055 - 42383271
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42383055 cagagacgtaaggagggtggactacgttcagtataaacttccaacactcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 42383154  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||    
T  42383155 gtgacgagcatgttttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaagttgattccgc 42383254  T
Q  209 cagaagatcgtgattag 225  Q
    ||||||||||| |||||    
T  42383255 cagaagatcgtcattag 42383271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 9 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 53826911 - 53826695
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  53826911 cagagacgcaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaatgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtagagttaaagaacgacgaaaat 53826812  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||    
T  53826811 gtgatgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcatgtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgc 53826712  T
Q  209 cagaagatcgtgattag 225  Q
    ||||||||||| |||||    
T  53826711 cagaagatcgtcattag 53826695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 6464556 - 6464345
Alignment:
Q  13 gacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtga 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  6464556 gacacaaagagggtggaatacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcagttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtga 6464457  T
Q  113 agaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccaga 212  Q
      | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||    
T  6464456 caatcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgtgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgcaaga 6464357  T
Q  213 agatcgtgatta 224  Q
    ||||||||||||    
T  6464356 agatcgtgatta 6464345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 10 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 13896084 - 13895869
Alignment:
Q  10 agagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacg 109  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||    
T  13896084 agagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgagcgacgaaaacg 13895985  T
Q  110 tgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcc 209  Q
    ||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||     
T  13895984 tgacgagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagcttgattccgct 13895885  T
Q  210 agaagatcgtgattag 225  Q
    |||||||||| |||||    
T  13895884 agaagatcgtcattag 13895869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 9 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 25576806 - 25576592
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25576806 cagagacgcaaggagggtggaatacgttcggtataaacatccaacgctcgacgaggggagattatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 25576707  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| || ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||     
T  25576706 gtgacgagcatgttttgggagcacagcatgttcca-tggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaatagcttgattccgt 25576608  T
Q  209 cagaagatcgtgatta 224  Q
    ||||||||||| ||||    
T  25576607 cagaagatcgtcatta 25576592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 9 - 228
Target Start/End: Original strand, 30192542 - 30192761
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  30192542 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 30192641  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||   | ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  30192642 gtgtctagcatgttttgggagtacatcatgttctagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 30192741  T
Q  209 cagaagatcgtgattaggta 228  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  30192742 cagaagatcgtcattaggta 30192761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 17 - 228
Target Start/End: Original strand, 41577918 - 41578129
Alignment:
Q  17 caaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaa 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||     
T  41577918 caaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgag 41578017  T
Q  117 catgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagat 216  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||    
T  41578018 catgttttgggagcacagcatgttccagtggatcaatatgcgagtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagat 41578117  T
Q  217 cgtgattaggta 228  Q
    | | ||||||||    
T  41578118 catcattaggta 41578129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 9 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 55207099 - 55206880
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||     
T  55207099 cagagacagaaggagggtgaaacacgttcggtataaacgtccaatgctcgacgaggtgagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaat 55207000  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  55206999 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 55206900  T
Q  209 cagaagatcgtgattaggta 228  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  55206899 cagaagatcgtcattaggta 55206880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 229
Target Start/End: Original strand, 6754210 - 6754428
Alignment:
Q  11 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgt 110  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  6754210 gagacacaaagagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattaagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgt 6754309  T
Q  111 gaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcca 210  Q
    || || ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |    
T  6754310 gacgatcatgttttgggagtacaacatgttctagttgatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgcta 6754409  T
Q  211 gaagatcgtgattaggtag 229  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  6754410 gaagatcgtgattatgtag 6754428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 34647480 - 34647263
Alignment:
Q  11 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgt 110  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  34647480 gagacacaaggagggtggaacacgttcagtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgt 34647381  T
Q  111 gaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcca 210  Q
    || || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||| |    
T  34647380 gacgagcatgtttcgggagcacaacatgttccagtggattgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattacgcta 34647281  T
Q  211 gaagatcgtgattaggta 228  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  34647280 gaagatcgtcattaggta 34647263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 9 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 42950235 - 42950019
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  42950235 cagagacgcaagaagggtggaatacgttcggtataaatgtccaacgctcgacgagggaagagtatcattcacttggatggagttaaagaatgacgaaaac 42950136  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||    
T  42950135 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcggtttacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgc 42950036  T
Q  209 cagaagatcgtgattag 225  Q
    ||||||||||| |||||    
T  42950035 cagaagatcgtcattag 42950019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 9 - 228
Target Start/End: Original strand, 41803906 - 41804125
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  41803906 cagagacaaaaggagggtggaacacgttcggtataaacgttcaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 41804005  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  41804006 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgagagtgacgttgatgagatcaaatgaagatataatcaaaagtttgattccgc 41804105  T
Q  209 cagaagatcgtgattaggta 228  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  41804106 cagaagatcgtcattaggta 41804125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 9 - 219
Target Start/End: Original strand, 43569914 - 43570124
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  43569914 cagagacagaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcatttacttgggtggaactaacgaacgacgaaaac 43570013  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||| |||    
T  43570014 gtgacgagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaattgaagatatcatcaaaagtttgatttcgc 43570113  T
Q  209 cagaagatcgt 219  Q
    |||||||||||    
T  43570114 cagaagatcgt 43570124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 11 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 8633572 - 8633355
Alignment:
Q  11 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  8633572 gagacacaaggagggtggaatacgtttggtataaacatccaacgctcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgt 8633473  T
Q  111 gaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcca 210  Q
    || ||| || ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8633472 gacgaatattttttgggatgacaacgtgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgttgcgatcatctgaagatattatcaacagtctgattccgcca 8633373  T
Q  211 gaagatcgtgattaggta 228  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  8633372 gaagatcgtcattaggta 8633355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 9 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 47760106 - 47759887
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||    
T  47760106 cagagacacaaggagggtggaacacgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacctgggtggaattaacgaacgacgaaaac 47760007  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    ||||  |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  47760006 gtgacaaacatgttttgggaacacagcatgttccagtggatcgatgtacgggtgacgttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagtttgattccgc 47759907  T
Q  209 cagaagatcgtgattaggta 228  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  47759906 cagaagatcgtcattaggta 47759887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 10 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 49218950 - 49218735
Alignment:
Q  10 agagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacg 109  Q
    ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||    
T  49218950 agagacacaaggagggtggaacacctttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcacttgggtggaattaacaaacggcgaaaacg 49218851  T
Q  110 tgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcc 209  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  49218850 tgacgaacatgttttgggagcgcaacatgttccagtggatcgatatgcgagtgacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacaacttgattccgcc 49218751  T
Q  210 agaagatcgtgattag 225  Q
    |||||||||| |||||    
T  49218750 agaagatcgtcattag 49218735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 34693503 - 34693289
Alignment:
Q  11 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgt 110  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  34693503 gagacacaaggagggtggaacaccttcagtataaacgtccaacgctcgacgagggttgagtatcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaacgt 34693404  T
Q  111 gaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcca 210  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | | |||||||||||    
T  34693403 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaactttgattccgcca 34693304  T
Q  211 gaagatcgtgattag 225  Q
    ||||||||| |||||    
T  34693303 gaagatcgtcattag 34693289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 24702483 - 24702271
Alignment:
Q  12 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 111  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  24702483 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcacttgggtggaattac-gaacgacgaaaacgtg 24702385  T
Q  112 aagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccag 211  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||    
T  24702384 acggacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcaggtgacgttgttgagatcaactgaagatatcatcaaaagcttgattccgccag 24702285  T
Q  212 aagatcgtgattag 225  Q
    |||||||| |||||    
T  24702284 aagatcgtcattag 24702271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 9 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 2647091 - 2646875
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  2647091 cagagacacaaggatggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 2646992  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  2646991 gtgacgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 2646892  T
Q  209 cagaagatcgtgattag 225  Q
     |||||||||| |||||    
T  2646891 tagaagatcgtcattag 2646875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 10053485 - 10053271
Alignment:
Q  10 agagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  10053485 agagacacaaggagggtggaatacattcggtataaatgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcaattgggtggaattaacgaacgacgaaaacg 10053386  T
Q  110 tgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcc 209  Q
    ||| || ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||    
T  10053385 tgatgagcatgttttgggagc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaa-atatcatcaaaagtttgattccgcc 10053290  T
Q  210 agaagatcgtgattaggta 228  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  10053289 agaagatcgtcattaggta 10053271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Original strand, 37281459 - 37281675
Alignment:
Q  12 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 111  Q
    ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37281459 agacacaaggatgatggaacacgttcggtataaacgtccaacactcgacgagggtagggtatcattcacttgggtggaattaaagaacgacgaaaacgtg 37281558  T
Q  112 aagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccag 211  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| | ||||||||||    
T  37281559 acgagcatgttttgggagcacaacatgtttcagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaacggaagatatcatcaaaagtttaattccgccag 37281658  T
Q  212 aagatcgtgattaggta 228  Q
    |||||||| ||||||||    
T  37281659 aagatcgtcattaggta 37281675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 9 - 224
Target Start/End: Original strand, 43477061 - 43477276
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  43477061 cagagacacaaggagggtggaacacctttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 43477160  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||||   |||||||||    
T  43477161 gtgacgaacatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcaggtgacgttgatgagatcaaccgaagatatcatcaacaacttgattccgc 43477260  T
Q  209 cagaagatcgtgatta 224  Q
    ||||||||||| ||||    
T  43477261 cagaagatcgtcatta 43477276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 9 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 3495244 - 3495028
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  3495244 cagagacacaaggatggtggaacacgtttgatataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 3495145  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| ||    
T  3495144 gtgacgaccatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgtttagatcaacttaagatatcatcaaaagtttgattctgc 3495045  T
Q  209 cagaagatcgtgattag 225  Q
    ||||||||||| |||||    
T  3495044 cagaagatcgtcattag 3495028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 9 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 19453444 - 19453236
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  19453444 cagagatagaaggagggtggaacacgttcgatataaacgtccaatgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 19453345  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||| |    
T  19453344 gtgacgagcatgttatgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagtttgattccac 19453245  T
Q  209 cagaagatc 217  Q
    |||||||||    
T  19453244 cagaagatc 19453236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 9 - 229
Target Start/End: Original strand, 27186952 - 27187172
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||   |||||||| ||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  27186952 cagagacacaaggagggtggaatacgtttagtataaatgtccaatgctcgtagaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 27187051  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||    
T  27187052 atgacgaacatgttttgggagcacaacatgttccattggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactaaagatattatcaacaatctgattccgc 27187151  T
Q  209 cagaagatcgtgattaggtag 229  Q
    || || |||||||||||||||    
T  27187152 cataatatcgtgattaggtag 27187172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 9 - 225
Target Start/End: Original strand, 49610493 - 49610709
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  49610493 cagagacacaaggagggtggaacaccttcgatataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaac 49610592  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| || |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||    
T  49610593 gtgacgagcatgttttgggagcacagtatgttccagtgggtcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgc 49610692  T
Q  209 cagaagatcgtgattag 225  Q
    ||||||||||| |||||    
T  49610693 cagaagatcgtcattag 49610709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 9 - 228
Target Start/End: Original strand, 14631449 - 14631668
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  14631449 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgagtaaagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacaacgaaaac 14631548  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| ||    
T  14631549 gtgacgagcatgttttgggagcaaaacatgttccagtggattgatatgcgggtgacgttgttgagatcaactaaagatatcatcaaaagtttgattctgc 14631648  T
Q  209 cagaagatcgtgattaggta 228  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  14631649 cagaagatcgtcattaggta 14631668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 9 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 52569623 - 52569406
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||| ||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||     
T  52569623 cagagacaaaaggatggtggaacacattcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcgcttgggtggaattaacgaacgacgaaaa- 52569525  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  52569524 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccggtgaatcgatatgcgggtgacattgctgagatcaactgaagatatcatcaagagtttgattccgc 52569425  T
Q  209 cagaagatcgtgattaggt 227  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  52569424 cagaagatcgtcattaggt 52569406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 9 - 225
Target Start/End: Original strand, 46403007 - 46403223
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  46403007 cagagacacaaggatggtggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 46403106  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  46403107 gtgacgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 46403206  T
Q  209 cagaagatcgtgattag 225  Q
    || |||||||| |||||    
T  46403207 cacaagatcgtcattag 46403223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 9 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 49140269 - 49140053
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  49140269 cagagacacaaggatggtggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 49140170  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  49140169 gtgacgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 49140070  T
Q  209 cagaagatcgtgattag 225  Q
    || |||||||| |||||    
T  49140069 cacaagatcgtcattag 49140053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 9 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 51695821 - 51695613
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||    
T  51695821 cagagacacaaggagggtggaacaccttcggtataaacgtccaacgctcgacgagggaaaagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaatac 51695722  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||    
T  51695721 gtgacgagcatgttttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgc 51695622  T
Q  209 cagaagatc 217  Q
    |||||||||    
T  51695621 cagaagatc 51695613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 9 - 225
Target Start/End: Original strand, 54390446 - 54390662
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  54390446 cagagacacaaggatggtggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 54390545  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  54390546 gtgacgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 54390645  T
Q  209 cagaagatcgtgattag 225  Q
    || |||||||| |||||    
T  54390646 cacaagatcgtcattag 54390662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 774551 - 774333
Alignment:
Q  11 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgt 110  Q
    ||||||| ||||| |||||||  ||| | ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||| |||| |||| |||||| ||||||||    
T  774551 gagacacgaggagagtggaatgtgtttgctataaacgtccaacgctcgacgacgggagaatatcattcagttggatggaattaacgaacgatgaaaacgt 774452  T
Q  111 gaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcca 210  Q
    |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||    
T  774451 gaagaacatgttttcggagcactgcatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaagagtctgattccacca 774352  T
Q  211 gaagatcgtgattaggtag 229  Q
    |||||||||||||||||||    
T  774351 gaagatcgtgattaggtag 774333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 228
Target Start/End: Original strand, 7954209 - 7954427
Alignment:
Q  11 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaagggg-agagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||||| || |||||||| | ||||||||| ||||  ||||||||||| |    
T  7954209 gagacacaaggagggtggaatacgttcggcataaacgtccaacactcgatgagggggagggtatcatttagttgggtggaattaacaaacgacgaaaatg 7954308  T
Q  110 tgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcc 209  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||     
T  7954309 tgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaaagttgctaagatcaactgaagatattatcaacaatctgattccgct 7954408  T
Q  210 agaagatcgtgattaggta 228  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  7954409 agaagatcgtcattaggta 7954427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 2268706 - 2268493
Alignment:
Q  12 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 111  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||    
T  2268706 agacacaaggatggtggaacaagtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttggatggaattaacgaacgacgaaaacgtg 2268607  T
Q  112 aagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccag 211  Q
    | |  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  2268606 acgggcatgttttgggagcacatcatgttccagtagatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 2268507  T
Q  212 aagatcgtgattag 225  Q
    |||||||| |||||    
T  2268506 aagatcgtcattag 2268493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 9 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 4004302 - 4004081
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||    
T  4004302 cagagacacaaggatggtggaacacgtttggtataaacattcaacgctcgacgaggggagagtatcattcacgtgggtggaattaacgaacgacaaaaac 4004203  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||    
T  4004202 gtgacgagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattctgc 4004103  T
Q  209 cagaagatcgtgattaggtaga 230  Q
    ||||||||||| ||||| ||||    
T  4004102 cagaagatcgtcattagttaga 4004081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 10 - 227
Target Start/End: Original strand, 49273404 - 49273621
Alignment:
Q  10 agagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacg 109  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  49273404 agagacacaaggagggtggaacacattcggtataaacgtccaacgctcgacgagggcagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacg 49273503  T
Q  110 tgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcc 209  Q
    ||| || |||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||  ||    
T  49273504 tgacgagcatgttctgggagcacaacatgttccagttgatcaatatgtgggtgacgttgctgagatcaactgaatatatcatcaaaagtttgattcttcc 49273603  T
Q  210 agaagatcgtgattaggt 227  Q
    |||| ||||| |||||||    
T  49273604 agaatatcgtcattaggt 49273621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Original strand, 7246101 - 7246317
Alignment:
Q  12 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 111  Q
    ||||||||| || |||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  7246101 agacacaagaagagtggaacacattcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattgacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 7246200  T
Q  112 aagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccag 211  Q
    | || ||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  7246201 acgagcatgttttgggattataacatgttccagtgtatcgatatgcgggtgacgttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 7246300  T
Q  212 aagatcgtgattaggta 228  Q
    |||||||| ||||||||    
T  7246301 aagatcgtcattaggta 7246317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 9 - 225
Target Start/End: Original strand, 34049731 - 34049947
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  34049731 cagagacacaaggatggtggaacacatttggtataaacgttcaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 34049830  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  34049831 gtgacgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 34049930  T
Q  209 cagaagatcgtgattag 225  Q
    || |||||||| |||||    
T  34049931 cacaagatcgtcattag 34049947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 10 - 230
Target Start/End: Original strand, 36135013 - 36135232
Alignment:
Q  10 agagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacg 109  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  36135013 agagacacaaggatggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgagggga-agtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacg 36135111  T
Q  110 tgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcc 209  Q
    ||| || ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  36135112 tgacgagcatgttttgggagcacatcatgtttcagtagatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcc 36135211  T
Q  210 agaagatcgtgattaggtaga 230  Q
    ||||||| || ||||| ||||    
T  36135212 agaagattgtcattagttaga 36135232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 10 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 44835701 - 44835486
Alignment:
Q  10 agagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacg 109  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44835701 agagacgcaaggagggtggaatacgttcgatataaacattcaacgttcgacgaggggagagtatcattcatttgggtggagttaaagaacgacgaaaacg 44835602  T
Q  110 tgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcc 209  Q
    ||| || ||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||| |    
T  44835601 tgacgagcatgttttgggagcatagaatgttccagtggatggatatgcgggtaaggttgttgagatcaactgaaaatatcatcaacagcttgattccgtc 44835502  T
Q  210 agaagatcgtgattag 225  Q
    |||||||||| |||||    
T  44835501 agaagatcgtcattag 44835486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 12 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 33449351 - 33449146
Alignment:
Q  12 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 111  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  33449351 agacacaaggagggtgaaatacgttcgatataaacgtcaaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 33449252  T
Q  112 aagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccag 211  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||            |||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||    
T  33449251 aagaacatgttttgggagcacatcatgttccagtggatcgata------------tgctgagatcaactgaagatatcatccaaagtttgattccgccag 33449164  T
Q  212 aagatcgtgattaggtag 229  Q
    |||||||| |||||||||    
T  33449163 aagatcgtaattaggtag 33449146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 36721601 - 36721385
Alignment:
Q  12 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 111  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||  |||| | || ||||||||||||||||    
T  36721601 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaatgtccaacgctcgacgagaggagagtatcattcacttgattggaataaacgaacgacgaaaacgtg 36721502  T
Q  112 aagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccag 211  Q
    | || ||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  36721501 acgagcaatgtttgggagcacaacatgttctagtggatcgatatgctggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 36721402  T
Q  212 aagatcgtgattaggta 228  Q
    |||||||| ||| ||||    
T  36721401 aagatcgtcatttggta 36721385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 9 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 50458906 - 50458687
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| ||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||||| |  | |||||||||||||    
T  50458906 cagagacacaaggagggtgggacacggtcgatataagtgtccaacgctcgacgaggggagagtatcgtttaattgggtggaatctacgaacgacgaaaac 50458807  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
     ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  50458806 ttgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatagatatgcgggtgacgttgttgagataaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 50458707  T
Q  209 cagaagatcgtgattaggta 228  Q
    | ||||||||| ||||||||    
T  50458706 ctgaagatcgtcattaggta 50458687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 16 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 20376090 - 20375877
Alignment:
Q  16 acaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaaga 115  Q
    ||||||| | ||||||| |||||||||||||||| || ||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||    
T  20376090 acaaggaagatggaatatgttcggtataaacgtctaatgctcgacgatgggagaatatcattcagttgggtggaattaaagaacgacgataacgtgagga 20375991  T
Q  116 acatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaaga 215  Q
      |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| || |||| || ||||||||||| || |    
T  20375990 gtatgttttgagagcacaacatgttcaagtagatcgatatgcgtgtaacgttgctgagatcaatttaagataataacaactgtttgattccgccaaaata 20375891  T
Q  216 tcgtgattaggtag 229  Q
    ||||||||||||||    
T  20375890 tcgtgattaggtag 20375877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 48 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 42323565 - 42323385
Alignment:
Q  48 tccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtgg 147  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||| ||||||    
T  42323565 tccaacgcttgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagctcaaaatgtttcagtgg 42323466  T
Q  148 atcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggta 228  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |  ||||||||| ||||||||    
T  42323465 atcgatatgctggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccactggaagatcgtcattaggta 42323385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 70 - 225
Target Start/End: Original strand, 50997453 - 50997608
Alignment:
Q  70 gtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgc 169  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||    
T  50997453 gtatcattcacttgagtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagttgatcgatatgcgggtgaagttgc 50997552  T
Q  170 tgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattag 225  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  50997553 ttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 50997608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 9 - 229
Target Start/End: Original strand, 14265412 - 14265629
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||| || ||||||||| |||| || | |||| |||||||||   |    
T  14265412 cagagacacaaggaaggtggaatacgttcggtataaacatccaacgttcgacgatgggtgaatatcattcagttggatgaaattaaggaacgacga---c 14265508  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| || | |||||||| ||||||| |||| |||||||| || | ||| |||||||||    
T  14265509 gtgacgaacatgttttgggaccacaacatgttaccgtggatcgatttgtgtgtaacgttactgagattaactaaagatattctccagagtttgattccgc 14265608  T
Q  209 cagaagatcgtgattaggtag 229  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  14265609 ctgaagatcgtgattaggtag 14265629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 104 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 46346732 - 46346620
Alignment:
Q  104 aaaacgtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgat 203  Q
    ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  46346732 aaaacgtgacgagcatgttctgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgat 46346633  T
Q  204 tccgccagaagat 216  Q
    |||||||||||||    
T  46346632 tccgccagaagat 46346620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 133 - 230
Target Start/End: Original strand, 18440873 - 18440970
Alignment:
Q  133 aacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtaga 230  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18440873 aacatgttccagtggatcgatatgtgtgtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtttgattccaccagaagatcgtgattaggtaga 18440970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 133 - 230
Target Start/End: Original strand, 19485947 - 19486044
Alignment:
Q  133 aacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtaga 230  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19485947 aacatgttccagtggatcgatatgtgtgtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtttgattccaccagaagatcgtgattaggtaga 19486044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 38 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 25887796 - 25887611
Alignment:
Q  38 ggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgttttgggagcacaacat 137  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | |||||| ||||| ||| ||||||||| ||||  ||||||||  | |||| || |||||||||||||||||||||    
T  25887796 ggtataaacgtccaacgttcgacgatgggagaatatcactcagttgggtggaattaacaaacgacgaggatgtgaggaccatgttttgggagcacaacat 25887697  T
Q  138 gttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgatta 224  Q
    ||||  ||||||| ||||| | | ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||| ||||||||||    
T  25887696 gttctcgtggatc-atatgtgtggaacgttgttgagatcaactgaagatattctccacagtttgattccgctagaatatcgtgatta 25887611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 12 - 99
Target Start/End: Original strand, 15637031 - 15637118
Alignment:
Q  12 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaac 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| ||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  15637031 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacactcgacgatgggagaatatcattcagttgggtggaattaatgaac 15637118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 11378957 - 11378906
Alignment:
Q  11 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaa 62  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11378957 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaa 11378906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 140 - 229
Target Start/End: Original strand, 7954774 - 7954863
Alignment:
Q  140 tccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtag 229  Q
    |||||| ||||||||| || ||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  7954774 tccagttgatcgatatacgtgtaactttgatgagatcaactaaagattttatcaacagtcttatttcgccagaagatcgtgattaagtag 7954863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 10 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 46346794 - 46346745
Alignment:
Q  10 agagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcga 59  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  46346794 agagacacaaggagggtggaacacgttccgtataaacgtccaacgctcga 46346745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 9 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 42328331 - 42328288
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaa 52  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42328331 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaa 42328288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 17267398 - 17267306
Alignment:
Q  121 ttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaa 213  Q
    |||||| |||||| |||||||| |||||||||||||   || |||||||||||||   || |||||||| |||| ||| |||||| |||||||    
T  17267398 ttttggcagcacatcatgttcccgtggatcgatatgtaagttacgttgctgagattgcctaaagatattctcaagagtttgattctgccagaa 17267306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 60)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 9 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 43889716 - 43889497
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  43889716 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 43889617  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  43889616 gtgacgaacatgttttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgttgagatcaactgaagatataatcaaaagtttgattccgc 43889517  T
Q  209 cagaagatcgtgattaggta 228  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  43889516 cagaagatcgtcattaggta 43889497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 9 - 228
Target Start/End: Original strand, 22436901 - 22437120
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||    
T  22436901 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgatgaaaac 22437000  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  22437001 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 22437100  T
Q  209 cagaagatcgtgattaggta 228  Q
    | ||||||||| ||||||||    
T  22437101 cggaagatcgtcattaggta 22437120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 9 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 242633 - 242417
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  242633 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagcatcattcacttaggtggagttaaagaacgatgaaaac 242534  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||    
T  242533 gtgacgagcatgttttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccgc 242434  T
Q  209 cagaagatcgtgattag 225  Q
    ||||||||||| |||||    
T  242433 cagaagatcgtcattag 242417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 10 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 14330910 - 14330695
Alignment:
Q  10 agagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacg 109  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14330910 agagacacaaggagggtggaacactttcggtataaacgtccaacactcgacgaggggagggtatcattcacttgggtggaattaaagaacgacgaaaacg 14330811  T
Q  110 tgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcc 209  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  14330810 tgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcc 14330711  T
Q  210 agaagatcgtgattag 225  Q
    |||||||||| |||||    
T  14330710 agaagatcgtcattag 14330695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Original strand, 25762590 - 25762804
Alignment:
Q  11 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgt 110  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  25762590 gagacacaaggagggtggaacacattcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgt 25762689  T
Q  111 gaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcca 210  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||    
T  25762690 gacgaacatgttttgggagcacaacatgttctggtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgcca 25762789  T
Q  211 gaagatcgtgattag 225  Q
    ||||||||| |||||    
T  25762790 gaagatcgtcattag 25762804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 17 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 31824838 - 31824630
Alignment:
Q  17 caaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaa 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  31824838 caaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgag 31824739  T
Q  117 catgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagat 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||    
T  31824738 catgttttgggagcacaacatgttctagtggatcaatatgcgggtaacgttgcttagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccgctagaagat 31824639  T
Q  217 cgtgattag 225  Q
    ||| |||||    
T  31824638 cgtcattag 31824630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 9 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 33163761 - 33163545
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  33163761 cagagacgcaatgagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacgaggggagagtaacattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaat 33163662  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||    
T  33163661 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgtgggtaacgttgttgagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccgc 33163562  T
Q  209 cagaagatcgtgattag 225  Q
    ||||||||||| |||||    
T  33163561 cagaagatcgtcattag 33163545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 9 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 51027984 - 51027768
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  51027984 cagagacacaaggagagtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 51027885  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||   ||||||| |    
T  51027884 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgttgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccac 51027785  T
Q  209 cagaagatcgtgattag 225  Q
    || |||||||| |||||    
T  51027784 cataagatcgtcattag 51027768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 9 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 51428409 - 51428193
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  51428409 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgttcaacgctcaacgaggggagagtatcattcacttgtgtggagttaacgaacgacgaaaac 51428310  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||    
T  51428309 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgttgagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccgc 51428210  T
Q  209 cagaagatcgtgattag 225  Q
     |||||||||| |||||    
T  51428209 aagaagatcgtcattag 51428193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 9 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 26591902 - 26591683
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||    
T  26591902 cagagacacaaggagggtggaacacgttcgatataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacgaacgacaaaaac 26591803  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||   |||||||||    
T  26591802 gtgacgaacatattttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctaagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgc 26591703  T
Q  209 cagaagatcgtgattaggta 228  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  26591702 cagaagatcgtcattaggta 26591683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 11 - 229
Target Start/End: Original strand, 17211258 - 17211476
Alignment:
Q  11 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||| ||| || || |||| ||||||  |||||||    
T  17211258 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgttcgacgagggaagaatatcattcatttgagtcgaattaacgaacgataaaaacgt 17211357  T
Q  111 gaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcca 210  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17211358 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactaaagatattatcaacagtctgattccgcca 17211457  T
Q  211 gaagatcgtgattaggtag 229  Q
    |||||||||||||||||||    
T  17211458 gaagatcgtgattaggtag 17211476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 49817860 - 49817642
Alignment:
Q  10 agagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacg 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  49817860 agagacacaaggagggtggaacacgttcagtataaacgtccaacgctctacgaggggagagtaacattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacg 49817761  T
Q  110 tgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcc 209  Q
    | | || ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  49817760 ttacgagcatgttttgggagcacatcatgttctagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattccgcc 49817661  T
Q  210 agaagatcgtgattaggta 228  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  49817660 agaagatcgtcattaggta 49817642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 9 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 4785639 - 4785420
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||| |||||    
T  4785639 cagagacacaaggagggtggaacacattcggtataaacgtcaaacccttgacgaggggagagcatcattcactttggtggaattaacgaacgacaaaaac 4785540  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4785539 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcggggaacgttgctgatatcaactgaagatattatcaacagtttgattccgc 4785440  T
Q  209 cagaagatcgtgattaggta 228  Q
    || |||||||| ||||||||    
T  4785439 cacaagatcgtcattaggta 4785420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 9 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 34153503 - 34153288
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  34153503 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 34153404  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||    
T  34153403 gtgacgatcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcaatatgcggatgacgttggtgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattctgc 34153304  T
Q  209 cagaagatcgtgatta 224  Q
    ||||||||||| ||||    
T  34153303 cagaagatcgtcatta 34153288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 229
Target Start/End: Original strand, 3393296 - 3393514
Alignment:
Q  11 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  3393296 gagacacaaggagggtggaatacgttcgatataaacgtccaacgctcgaggatgggagattatcatttagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgt 3393395  T
Q  111 gaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcca 210  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3393396 gaggagcatgttttgggagcacaacatgttctagtggatcgatatgcatgtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattccgcca 3393495  T
Q  211 gaagatcgtgattaggtag 229  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  3393496 gaagatcatgattaggtag 3393514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 9 - 225
Target Start/End: Original strand, 1226150 - 1226365
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  1226150 cagagacaca-ggagggtggaatacgtttgctataaacgtccaacgctcgacgaggggagggtatcattcacttgtgtggaattaaagaacgacgaaaat 1226248  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  1226249 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttctagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 1226348  T
Q  209 cagaagatcgtgattag 225  Q
    ||||||||||| |||||    
T  1226349 cagaagatcgtcattag 1226365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 9 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 21017394 - 21017178
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  21017394 cagagacacaaggatggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 21017295  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  21017294 gtgacgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 21017195  T
Q  209 cagaagatcgtgattag 225  Q
    ||||||||||| |||||    
T  21017194 cagaagatcgtcattag 21017178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 9 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 40353990 - 40353774
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  40353990 cagagacacaaggatggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 40353891  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  40353890 gtgacgaccatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 40353791  T
Q  209 cagaagatcgtgattag 225  Q
    |||||||| || |||||    
T  40353790 cagaagattgtcattag 40353774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 9 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 34530013 - 34529794
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||     
T  34530013 cagagacacaagaagggtggaacaccttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaat 34529914  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  34529913 gtgacgagcattttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcaggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 34529814  T
Q  209 cagaagatcgtgattaggta 228  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  34529813 cagaagatcgtcattaggta 34529794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 9 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 49792153 - 49791934
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||    
T  49792153 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagagtattattcacttgggtggaattaacgaatgacgaaaac 49792054  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||    
T  49792053 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcaggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgc 49791954  T
Q  209 cagaagatcgtgattaggta 228  Q
    || |||||| | ||||||||    
T  49791953 caaaagatcatcattaggta 49791934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Original strand, 2773000 - 2773218
Alignment:
Q  10 agagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacg 109  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  2773000 agagacacaaggatggtggaacacgttcgttataaacgtccaacgctctacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacg 2773099  T
Q  110 tgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcc 209  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||   ||||||||||    
T  2773100 tgacgaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttattgagatcaactgaagataccatcaacaacttgattccgcc 2773199  T
Q  210 agaagatcgtgattaggta 228  Q
    |||||||||| || |||||    
T  2773200 agaagatcgtcatcaggta 2773218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 20779081 - 20778866
Alignment:
Q  14 acacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaa 113  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||     
T  20779081 acacaagaagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctctacgaggggagagtatcattcatttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgac 20778982  T
Q  114 gaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaa 213  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||    
T  20778981 gagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtttcgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccaaaa 20778882  T
Q  214 gatcgtgattaggtag 229  Q
    |||||| |||||||||    
T  20778881 gatcgtcattaggtag 20778866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 9 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 47657572 - 47657353
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||    
T  47657572 cagagacacaaggtgggtggaacacgttcggtataaacatccaacgctcgacgatgggagagtatcattcacttggatggaattaacgaacgaccaaaac 47657473  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |    
T  47657472 gtgacgagcatattttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccac 47657373  T
Q  209 cagaagatcgtgattaggta 228  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  47657372 cagaagatcgtcattaggta 47657353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 229
Target Start/End: Original strand, 24606744 - 24606962
Alignment:
Q  11 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgt 110  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| || |||| |||||||||||||||    
T  24606744 gagacacaaggagggtggaacacgttcgatataaatgtccaacgctcgacaagcggagagtattattcagttgggtagaattaacgaacgacgaaaacgt 24606843  T
Q  111 gaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcca 210  Q
    || || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  24606844 gacgagcatgtattgggagcacatcatgttcccgtggattgatatgtgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaagagtctgattccgcca 24606943  T
Q  211 gaagatcgtgattaggtag 229  Q
    |||||||||||||||||||    
T  24606944 gaagatcgtgattaggtag 24606962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 957670 - 957453
Alignment:
Q  11 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgt 110  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  957670 gagacataaggagggtggaatatgttctgtataaatgtccaacgctcgacgaggggagcgtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgt 957571  T
Q  111 gaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcca 210  Q
    || || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  957570 gacgagcatgttttaggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagtttgattccgcca 957471  T
Q  211 gaagatcgtgattaggta 228  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  957470 gaagatcgtcattaggta 957453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 6282537 - 6282324
Alignment:
Q  12 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 111  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  6282537 agacagaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacactcgacaaggagagagtatcattcacttgggtggaattaacgaatgacgaaaacgtg 6282438  T
Q  112 aagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccag 211  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||    
T  6282437 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgctaagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattctgccag 6282338  T
Q  212 aagatcgtgattag 225  Q
    |||||||| |||||    
T  6282337 aagatcgtcattag 6282324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 9 - 225
Target Start/End: Original strand, 49063969 - 49064185
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  49063969 cagagacacaaggagagtggaacacgttcggtataaacgtccaacactcgacgaggggagggtgtcattcacttgggtggaattaaagaacgacgaaaac 49064068  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  49064069 gtgacgagcatgtttttggagcacaacatgtttccgtggatcgatatgcgggtgacgttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 49064168  T
Q  209 cagaagatcgtgattag 225  Q
    ||||||||||| |||||    
T  49064169 cagaagatcgtcattag 49064185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 14 - 225
Target Start/End: Original strand, 55796738 - 55796949
Alignment:
Q  14 acacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaa 113  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||     
T  55796738 acacaaggatggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgac 55796837  T
Q  114 gaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaa 213  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||    
T  55796838 gaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccacaa 55796937  T
Q  214 gatcgtgattag 225  Q
    |||||| |||||    
T  55796938 gatcgtcattag 55796949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 11 - 229
Target Start/End: Original strand, 18412587 - 18412805
Alignment:
Q  11 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgt 110  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||| || |||||| |||| ||||||||| |||||    
T  18412587 gagacacaagaagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatggaagaatatcattcagttcggtggaattaatgaacgacgataacgt 18412686  T
Q  111 gaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcca 210  Q
    || || ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| ||||    
T  18412687 gaggagcatgttttgggagcacaccatgtttcagtggatcgatatgcgtgtaacgttgctgagatcaactgaatatattatcaacaatttgattctgcca 18412786  T
Q  211 gaagatcgtgattaggtag 229  Q
    |||||||||||||||||||    
T  18412787 gaagatcgtgattaggtag 18412805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 32938116 - 32937903
Alignment:
Q  12 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 111  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| ||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  32938116 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacactcgacgaagggagaatatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 32938017  T
Q  112 aagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccag 211  Q
    | || ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||||||    
T  32938016 acgagcatgtttcgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgttgagatcaactgaagatatcatcaaaaatttgattccgccag 32937917  T
Q  212 aagatcgtgattag 225  Q
    |||||||| |||||    
T  32937916 aagatcgtcattag 32937903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 9 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 46816740 - 46816526
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  46816740 cagagacgcaaggagggtggaatacgttcagtatacacgtccaatgctcgacgaggggagggtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacaaaaac 46816641  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||| ||  |||||||||    
T  46816640 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcaggtaacgttgttgagatca--tgaagatatcatcaatagcttgattccgc 46816543  T
Q  209 cagaagatcgtgattag 225  Q
    ||||||||||| |||||    
T  46816542 cagaagatcgtcattag 46816526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 9 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 41794779 - 41794563
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  41794779 cagagacacaaggatggtggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 41794680  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  41794679 gtgacgaccatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 41794580  T
Q  209 cagaagatcgtgattag 225  Q
    || |||||||| |||||    
T  41794579 cacaagatcgtcattag 41794563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Original strand, 1042744 - 1042955
Alignment:
Q  12 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 111  Q
    |||||||||||||||||||  | ||  |||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  1042744 agacacaaggagggtggaacgcctt--gtataaacgtccaacgctagacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 1042841  T
Q  112 aagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccag 211  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||    
T  1042842 acgaacatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatataatcaacaacttgattccgccag 1042941  T
Q  212 aagatcgtgattag 225  Q
    |||||||| |||||    
T  1042942 aagatcgtcattag 1042955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 12 - 229
Target Start/End: Original strand, 11288288 - 11288504
Alignment:
Q  12 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  11288288 agacacaaggagggtggaatacgttccgtataaacgtccaacggtcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 11288387  T
Q  112 aagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccag 211  Q
    | || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| |  ||    
T  11288388 acgagcatgttttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatc-acaatttgattctgttag 11288486  T
Q  212 aagatcgtgattaggtag 229  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  11288487 aagatcgtgattaagtag 11288504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 9 - 225
Target Start/End: Original strand, 37866396 - 37866613
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||    
T  37866396 cagagacacaagaagggtggaacacattcggtataaacatccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgagcgacgaaaac 37866495  T
Q  109 gtgaagaacatgtttt-gggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccg 207  Q
    |||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |   ||||||||    
T  37866496 gtgatgagcatgttttcgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaatatcttgattccg 37866595  T
Q  208 ccagaagatcgtgattag 225  Q
    | |||||||||| |||||    
T  37866596 ctagaagatcgtcattag 37866613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 9 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 6177532 - 6177316
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  6177532 cagagacacaaggatggtggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 6177433  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  6177432 gtgacgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 6177333  T
Q  209 cagaagatcgtgattag 225  Q
    || |||||||| |||||    
T  6177332 cacaagatcgtcattag 6177316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 9 - 225
Target Start/End: Original strand, 56138900 - 56139116
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  56138900 cagagacacaaggatggtggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 56138999  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  56139000 gtgacgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 56139099  T
Q  209 cagaagatcgtgattag 225  Q
    || |||||||| |||||    
T  56139100 cacaagatcgtcattag 56139116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 229
Target Start/End: Original strand, 10312264 - 10312482
Alignment:
Q  11 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgt 110  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| | |||||| ||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  10312264 gagacacaaggagtgtggaatatgttcggtataaacatacaacactcgacgatgggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgt 10312363  T
Q  111 gaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcca 210  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | | |||||||      
T  10312364 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgttaagatcaactgaagatattatcaacaatctaattccgctg 10312463  T
Q  211 gaagatcgtgattaggtag 229  Q
    |||||||||||||||||||    
T  10312464 gaagatcgtgattaggtag 10312482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 228
Target Start/End: Original strand, 42886255 - 42886475
Alignment:
Q  11 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagta---tcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaa 107  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  42886255 gagacacaaggagggtggaacacgttcgttataaacttccaacgctcgacgaggggagagtactatcattcacttgggtggaattaaccaacgacgaaaa 42886354  T
Q  108 cgtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccg 207  Q
    | ||| || |||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42886355 catgacgagcatgctttgagagcacaacattttctagtggatcgatacgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattccg 42886454  T
Q  208 ccagaagatcgtgattaggta 228  Q
    |||||||||| | ||||||||    
T  42886455 ccagaagatcatcattaggta 42886475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 9 - 225
Target Start/End: Original strand, 49094735 - 49094951
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||    
T  49094735 cagagacacaaggatggtggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacaaaaac 49094834  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||    
T  49094835 gtgacgaccatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcgtcaaaagtttgattccgc 49094934  T
Q  209 cagaagatcgtgattag 225  Q
    || |||||||| |||||    
T  49094935 cacaagatcgtcattag 49094951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 9 - 228
Target Start/End: Original strand, 21169441 - 21169660
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| | |||| ||| ||    
T  21169441 cagagacacaaggagggtggaacacgttcgatataaacatccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtcgaattaacggacgatgaatac 21169540  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    | || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | | |||||||||    
T  21169541 gcgacgagcatgttttgggagcacagcatgtaccagtggatcgatatgcaggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaaatttgattccgc 21169640  T
Q  209 cagaagatcgtgattaggta 228  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  21169641 cagaagatcgtcattaggta 21169660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 38 - 225
Target Start/End: Original strand, 21711549 - 21711736
Alignment:
Q  38 ggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgttttgggagcacaacat 137  Q
    ||||||||| || |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  21711549 ggtataaacatctaacgctcgacgaggggagggtatcattcacttgggtggaattaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacat 21711648  T
Q  138 gttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||   |||||||||||||||||||| |||||    
T  21711649 gttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactaaagatatcatcaacaacttgattccgccagaagatcgtcattag 21711736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 20901882 - 20901669
Alignment:
Q  12 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 111  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  20901882 agacacaaggagggtagaacacgttcggtataaacgtccaacgttcgacgagtggagaatatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 20901783  T
Q  112 aagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccag 211  Q
    | || ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||| || |    
T  20901782 acgagcatgttttgggagcacagcatgttctagtggatcgatatgcgggtaacactgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccacctg 20901683  T
Q  212 aagatcgtgattag 225  Q
    |||||||| |||||    
T  20901682 aagatcgtcattag 20901669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Original strand, 39588922 - 39589135
Alignment:
Q  12 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 111  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||    
T  39588922 agacacaaggagggtggaacaccttcagtataaacgtccaacgctcgacggggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaatgtg 39589021  T
Q  112 aagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccag 211  Q
    | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||| ||    
T  39589022 acgagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcggatgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgctag 39589121  T
Q  212 aagatcgtgattag 225  Q
    |||||||| |||||    
T  39589122 aagatcgtcattag 39589135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Original strand, 45939518 - 45939731
Alignment:
Q  12 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 111  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||    
T  45939518 agacacaaggagggtggaacacgttcgatataaacgttcaacgctcgacgagaggagattatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgataatgtg 45939617  T
Q  112 aagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccag 211  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||  |||     
T  45939618 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattcttccat 45939717  T
Q  212 aagatcgtgattag 225  Q
    |||||||| |||||    
T  45939718 aagatcgtcattag 45939731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 36776733 - 36776517
Alignment:
Q  12 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 111  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || |||| ||||||||||||||||    
T  36776733 agacacaaggagggtggaacacgttaggtataaatgtccaacgctcgacgaggggagagtattattcacttgggtagaattaacgaacgacgaaaacgtg 36776634  T
Q  112 aagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccag 211  Q
    | || |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||       
T  36776633 acgagcatggtttgggagcacggcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgttgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgctga 36776534  T
Q  212 aagatcgtgattaggta 228  Q
    |||||||| ||||||||    
T  36776533 aagatcgtcattaggta 36776517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 66 - 225
Target Start/End: Original strand, 27759374 - 27759533
Alignment:
Q  66 gagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacg 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27759374 gagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacg 27759473  T
Q  166 ttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattag 225  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  27759474 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccgccagaagatcgtcattag 27759533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 9 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 44560397 - 44560178
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||    
T  44560397 cagagacacaaggagggtggaacacgttcagtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcacttggatggaattaacgaacgacgaaaac 44560298  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    ||||  | ||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| | |    
T  44560297 gtgacaagcatgttttgggagcaaagcatgttccagtgtattgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgatttctc 44560198  T
Q  209 cagaagatcgtgattaggta 228  Q
    |  |||||||| ||||||||    
T  44560197 cttaagatcgtcattaggta 44560178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 9 - 225
Target Start/End: Original strand, 28082228 - 28082444
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  28082228 cagagacacaaggatggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgatgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 28082327  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
     ||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | ||| || ||||||||||||||||| ||||| | | |||||||||    
T  28082328 atgacgagcatgttttgggagcacatcatgtttcagtggatcaatatgcaggtgaagttacttagatcaactgaagatatcatcaaaaatttgattccgc 28082427  T
Q  209 cagaagatcgtgattag 225  Q
    ||||||||||| |||||    
T  28082428 cagaagatcgtcattag 28082444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 49423972 - 49423756
Alignment:
Q  12 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 111  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||    
T  49423972 agacacaaggagggtggaacatgttcggtataaatgtccagcgctcgacgaggggagattatcattcacttggatggaattaacgaacgacgaaaacgtg 49423873  T
Q  112 aagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccag 211  Q
    | || |||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| ||||     
T  49423872 acgagcatgttctgggagcacggcatgttcaagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagaaatcatcaaaagtttgattctgccat 49423773  T
Q  212 aagatcgtgattaggta 228  Q
    |||||||| ||||||||    
T  49423772 aagatcgtcattaggta 49423756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Original strand, 9489671 - 9489884
Alignment:
Q  11 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgt 110  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||    
T  9489671 gagacacaaggagggtggaacaccttcagtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaatgt 9489770  T
Q  111 gaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcca 210  Q
    || || |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||    
T  9489771 gacgagcatgtttt-ggagcacagcatgttccagtggattgatatgcgggtgacgttattgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgcca 9489869  T
Q  211 gaagatcgtgattag 225  Q
    ||||||||| |||||    
T  9489870 gaagatcgtcattag 9489884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 9 - 229
Target Start/End: Original strand, 13850739 - 13850959
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| | |||||| ||||||||| |||| || | ||||  ||||||||  ||    
T  13850739 cagagacacaaggagggtggaatacgtttggtataaacgtccaacgtttgacgatgggagaatatcattcagttggatgaaattaacaaacgacgacgac 13850838  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||    
T  13850839 gtgacgaacatgttttgggagcacaacatgttaccgtggatcgatatgtatgtaacattgctgagatcaactaaagatattctcaacagtttgattccgc 13850938  T
Q  209 cagaagatcgtgattaggtag 229  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  13850939 cagaagaccgtgattaggtag 13850959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 9 - 229
Target Start/End: Original strand, 13866253 - 13866473
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  | ||| | |||||| ||||||||| |||| |||| ||||  ||||||||  ||    
T  13866253 cagagacacaaggagggtggaatgcgtttggtataaacgtccaacatttgacgatgggagaatatcattcagttggatggaattaacaaacgacgacgac 13866352  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  13866353 gtgacgaacatgttttgggagcacaacatgttaccgtggattgatatgtatgtaacgttgctgagatcaactgaagatattctcaacagtttgattccgc 13866452  T
Q  209 cagaagatcgtgattaggtag 229  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  13866453 cagaagaccgtgattaggtag 13866473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 12 - 229
Target Start/End: Original strand, 31324167 - 31324384
Alignment:
Q  12 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 111  Q
    |||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| | |||||| ||| ||||| ||||||||| |||| ||||||| |  |||||    
T  31324167 agacacaatgaggatggaataggttcagtataaacgtccaacgttcgacgatgggagaatattattcagttgggtggaattaacgaacgacaatgacgtg 31324266  T
Q  112 aagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccag 211  Q
    | || |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||    
T  31324267 acgagcatgtttttggagcacaacatgttaccgtggatcgatatgtgtgtaaagttgctgagatcaactgaagacattctcaacagtttgattccgctag 31324366  T
Q  212 aagatcgtgattaggtag 229  Q
    |||||| |||||||||||    
T  31324367 aagatcatgattaggtag 31324384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 140 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 49817283 - 49817194
Alignment:
Q  140 tccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtag 229  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  49817283 tccagtggatcgatatgcgtgtaacgttgatgagatcaaatgaagatattatcaacagtctgattctgccaaaagatcgtgattaggtag 49817194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 163 - 229
Target Start/End: Original strand, 17292106 - 17292172
Alignment:
Q  163 acgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtag 229  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17292106 acgttgcagagatcaactgaagatattctcaacagtttgattccgccagaagatcgtgattatgtag 17292172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 21412740 - 21412647
Alignment:
Q  11 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacga 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || || |||||||| ||||||| | |||| |||| |||| |||||||||    
T  21412740 gagacacaaggagggtggaatacgtccggtataaacgtccaatgttcaacgaggggagaatatcatttagttggatggaattaacgaacgacga 21412647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 121 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 23124630 - 23124522
Alignment:
Q  121 ttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtg 220  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||   || ||||||||||||||   | |||||||| |||||| | ||||| ||||||||||| |||    
T  23124630 ttttggtagcacaacatgttctcgtggatcgatatgtttgtcacgttgctgagatcgcttaaagatattctcaacaatttgatttcgccagaagattgtg 23124531  T
Q  221 attaggtag 229  Q
    |||||||||    
T  23124530 attaggtag 23124522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 121 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 20759240 - 20759132
Alignment:
Q  121 ttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtg 220  Q
    |||||| |||| |||||||||  |||||||||||||   || |||||||||| |||  ||||||||||| |||||| | ||||||| |||||||||  ||    
T  20759240 ttttggcagcataacatgttcgcgtggatcgatatgtttgtcacgttgctgatatcgcctgaagatattctcaacaatttgattccaccagaagattatg 20759141  T
Q  221 attaggtag 229  Q
    |||||||||    
T  20759140 attaggtag 20759132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 121 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 20765631 - 20765523
Alignment:
Q  121 ttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtg 220  Q
    |||||| |||| |||||||||  |||||||||||||   || |||||||||| |||  ||||||||||| |||||| | ||||||| |||||||||  ||    
T  20765631 ttttggcagcataacatgttcgcgtggatcgatatgtttgtcacgttgctgatatcgcctgaagatattctcaacaatttgattccaccagaagattatg 20765532  T
Q  221 attaggtag 229  Q
    |||||||||    
T  20765531 attaggtag 20765523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 171; Significance: 6e-92; HSPs: 45)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 229
Target Start/End: Original strand, 33370645 - 33370863
Alignment:
Q  11 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  33370645 gagacacaaggagggtggaatacgttcgatataaacgttcaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgt 33370744  T
Q  111 gaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcca 210  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33370745 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattccgcca 33370844  T
Q  211 gaagatcgtgattaggtag 229  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  33370845 gaagatcatgattaggtag 33370863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 1400518 - 1400301
Alignment:
Q  11 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgt 110  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  1400518 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgt 1400419  T
Q  111 gaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcca 210  Q
    || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  1400418 gacgaccatgttttgggagcacatcatgttccagtggatccatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcca 1400319  T
Q  211 gaagatcgtgattaggta 228  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  1400318 gaagatcgtcattaggta 1400301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 10 - 225
Target Start/End: Original strand, 40009518 - 40009733
Alignment:
Q  10 agagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacg 109  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40009518 agagacgcaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacg 40009617  T
Q  110 tgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcc 209  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||  ||||||| |     
T  40009618 tgacgagcatgttttgggagcacaacatgttacagtggatcgatatgtgggtaacgttgttgagatcaactgaagacatcatcaacagcttgattccaca 40009717  T
Q  210 agaagatcgtgattag 225  Q
    |||||||||| |||||    
T  40009718 agaagatcgtcattag 40009733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 9 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 4724292 - 4724073
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    ||||||||||||||  |||||| || |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||    
T  4724292 cagagacacaaggaaagtggaacacattcggtataaacgtccaacgctcgatgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacaaaaac 4724193  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  4724192 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 4724093  T
Q  209 cagaagatcgtgattaggta 228  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  4724092 cagaagatcgtcattaggta 4724073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 213
Target Start/End: Original strand, 1971356 - 1971558
Alignment:
Q  11 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgt 110  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||    
T  1971356 gagacacaaggagggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttcggtggaattaacgaacgacgaaaacgt 1971455  T
Q  111 gaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcca 210  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  1971456 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcaatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccgcca 1971555  T
Q  211 gaa 213  Q
    |||    
T  1971556 gaa 1971558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 9 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 7447 - 7231
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  7447 cagagacacaaggatggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 7348  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  7347 gtgacgagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 7248  T
Q  209 cagaagatcgtgattag 225  Q
    ||||||||||| |||||    
T  7247 cagaagatcgtcattag 7231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 9 - 225
Target Start/End: Original strand, 8537943 - 8538159
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  8537943 cagagacacaaggatggtggaacacgttcggtataaacgttcaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 8538042  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
     ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  8538043 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 8538142  T
Q  209 cagaagatcgtgattag 225  Q
    ||||||||||| |||||    
T  8538143 cagaagatcgtcattag 8538159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 9 - 216
Target Start/End: Original strand, 18308249 - 18308456
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  18308249 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 18308348  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
     ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| | | |||||||||    
T  18308349 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaaatttgattccgc 18308448  T
Q  209 cagaagat 216  Q
    ||| ||||    
T  18308449 cagtagat 18308456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 9 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 541853 - 541637
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  541853 cagagacacaaggagggtggaacaccttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 541754  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    | || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||   ||||| |||    
T  541753 gggacgagcatgttttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactggagatatcatcaacaacttgatttcgc 541654  T
Q  209 cagaagatcgtgattag 225  Q
    ||||||||||| |||||    
T  541653 cagaagatcgtcattag 541637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 9 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 8576359 - 8576143
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||    
T  8576359 cagagacacaaggatggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgaagaaaac 8576260  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  8576259 gtgacgaccatgttttgggagcacaacatgttccggtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 8576160  T
Q  209 cagaagatcgtgattag 225  Q
    |||||||| || |||||    
T  8576159 cagaagattgtcattag 8576143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 9 - 225
Target Start/End: Original strand, 11346698 - 11346914
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||    
T  11346698 cagagacacaaggatggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtgaaattaatgaacgacgaaaac 11346797  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  11346798 gtgacgagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgagtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 11346897  T
Q  209 cagaagatcgtgattag 225  Q
    ||||||||||| |||||    
T  11346898 cagaagatcgtcattag 11346914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 9 - 225
Target Start/End: Original strand, 19400352 - 19400568
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||     
T  19400352 cagagacacaaggatggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgatgaggggagagtgtcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaat 19400451  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||    
T  19400452 gtgacgagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttggtgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgc 19400551  T
Q  209 cagaagatcgtgattag 225  Q
    ||||| ||||| |||||    
T  19400552 cagaatatcgtcattag 19400568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 9 - 227
Target Start/End: Original strand, 35565261 - 35565478
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||| |    
T  35565261 cagagacataaggagggtggaacacgttcggtataaacgtctaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgatgaaa-c 35565359  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||| |||||||||    
T  35565360 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttctagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactaaagatatcatcagaagtttgattccgc 35565459  T
Q  209 cagaagatcgtgattaggt 227  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  35565460 cagaagatcgtcattaggt 35565478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 9 - 230
Target Start/End: Original strand, 3601330 - 3601551
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  3601330 cagagacacaaggagggtagaacatattcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 3601429  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||     
T  3601430 gtgacgagcatgttttaagagcacaacatgttccagtgtttcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgt 3601529  T
Q  209 cagaagatcgtgattaggtaga 230  Q
    ||||||||||| ||||| ||||    
T  3601530 cagaagatcgtcattagttaga 3601551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 9 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 19036892 - 19036676
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  19036892 cagagacacaaggatggtggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 19036793  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  19036792 gtgacgaccatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 19036693  T
Q  209 cagaagatcgtgattag 225  Q
    || |||||||| |||||    
T  19036692 cacaagatcgtcattag 19036676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Original strand, 11027769 - 11027982
Alignment:
Q  12 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 111  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||     
T  11027769 agacacaaggatggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtc 11027868  T
Q  112 aagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccag 211  Q
    | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||    
T  11027869 acgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttggttagatcaactgaagatatcatcgaaagtttgattccgccag 11027968  T
Q  212 aagatcgtgattag 225  Q
    |||||||| |||||    
T  11027969 aagatcgtcattag 11027982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 9 - 225
Target Start/End: Original strand, 28880980 - 28881196
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||||||||| ||||||| || || |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  28880980 cagagacacaaggatggtggaaaacatttggtacaaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 28881079  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  28881080 gtgacgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 28881179  T
Q  209 cagaagatcgtgattag 225  Q
    || |||||||| |||||    
T  28881180 cacaagatcgtcattag 28881196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 16 - 225
Target Start/End: Original strand, 30709594 - 30709803
Alignment:
Q  16 acaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaaga 115  Q
    ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||    
T  30709594 acaaggatggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaatgacgaaaacgtgacga 30709693  T
Q  116 acatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaaga 215  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| |||||    
T  30709694 ccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttggttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccggaaga 30709793  T
Q  216 tcgtgattag 225  Q
    |||| |||||    
T  30709794 tcgtcattag 30709803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Original strand, 38854150 - 38854363
Alignment:
Q  12 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 111  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||     
T  38854150 agacacaaggatggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcaattgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtc 38854249  T
Q  112 aagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccag 211  Q
    | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  38854250 acgaccatgttttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttggttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 38854349  T
Q  212 aagatcgtgattag 225  Q
    |||| ||| |||||    
T  38854350 aagaccgtcattag 38854363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 9 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 27661595 - 27661379
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  27661595 cagagacacaaggatggtggaacacgtttagtataaacttccattgctcgacgaggggagagtatcatttacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 27661496  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  27661495 gtgacgaccatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactaaagatatcatcaaaagtttgattccgc 27661396  T
Q  209 cagaagatcgtgattag 225  Q
    |||||||| || |||||    
T  27661395 cagaagattgtcattag 27661379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 9 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 36350523 - 36350313
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  36350523 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgttcaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaac 36350424  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| || |||         ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |    
T  36350423 gtgacgagcat---------gcacaacatgttccagtggatcgatatgtaggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccac 36350333  T
Q  209 cagaagatcgtgattaggta 228  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  36350332 cagaagatcgtcattaggta 36350313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 9 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 6793604 - 6793385
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| | |||||||||| ||| | |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||     
T  6793604 cagagacacaaggaggatggaacacattcggtataaacgcctaacgctcgacgaggagtgagtatcattcacttgagtggaattaacgaacgacgaaaat 6793505  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | | |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||| ||    
T  6793504 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttctagtgaatcgatatgcggatgaggttgctgagatcaattgaagatatcatcaaaagtttgattcagc 6793405  T
Q  209 cagaagatcgtgattaggta 228  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  6793404 cagaagatcgtcattaggta 6793385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 17366950 - 17366738
Alignment:
Q  12 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 111  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||  |||| ||| ||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||| |||    
T  17366950 agacacaaggagggtggaata-gttcgatataaacgtccaaccctcgatgagggaagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgacgaaaatgtg 17366852  T
Q  112 aagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccag 211  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  17366851 acaaacatgttttgggagcacaacatgttctagtggattgatatgcgggtaccgttgttgagatcaactaaagatattatcaagagtctgattctgccag 17366752  T
Q  212 aagatcgtgattag 225  Q
    || |||||||||||    
T  17366751 aatatcgtgattag 17366738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 11 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 35927653 - 35927470
Alignment:
Q  11 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgt 110  Q
    |||||||||  |||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  35927653 gagacacaattagggtgtaacacgttcgttataaacgtccaatgctcgacgagggaagagtatcatttagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgt 35927554  T
Q  111 gaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaa 194  Q
    || |||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  35927553 gacgaacatgttttgggagcacatcatctttcagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactaaagatatcatcaa 35927470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 9 - 183
Target Start/End: Original strand, 3169593 - 3169766
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  3169593 cagagacataaagagggtggaacacgttcggtataaacgtctaacgctcgacgaggg-agagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 3169691  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaa 183  Q
    |||| || ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  3169692 gtgacgagcatattttaagagcacaacatgttccagtggatcggtatgcgggtgacgttgctgagatcagctgaa 3169766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 11 - 197
Target Start/End: Original strand, 2599210 - 2599396
Alignment:
Q  11 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | | |||| ||||||||| ||||||||| |||  |||| |||   || |    
T  2599210 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacattcgacgatgagagaatatcattcagttgggtggaattagcgaacaacggcgacat 2599309  T
Q  111 gaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacag 197  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||    
T  2599310 gaagagcatgttttgggagcacaacatgttaccgtggatcgatatgtgtgtaacgttgctgagattaactgatgatattctcaacag 2599396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 91 - 228
Target Start/End: Original strand, 1694860 - 1694997
Alignment:
Q  91 ttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatta 190  Q
    |||| |||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |    
T  1694860 ttaacgaacaacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacagcatgtttcactggaacgatatgcgggtgacgttgttgagatcaactgaagatatca 1694959  T
Q  191 tcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggta 228  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1694960 tcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggta 1694997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 12 - 125
Target Start/End: Original strand, 3458828 - 3458941
Alignment:
Q  12 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 111  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3458828 agacgcaaggagggtggaatacgttcggtataaatgtccaacgcttgacgaggggagagtatcattcacttgggttgagttaaagaacgacgaaaacgtg 3458927  T
Q  112 aagaacatgttttg 125  Q
    | ||  ||||||||    
T  3458928 acgagtatgttttg 3458941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 135 - 225
Target Start/End: Original strand, 7082336 - 7082426
Alignment:
Q  135 catgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattag 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||| |||||    
T  7082336 catgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgccagaagatcgtcattag 7082426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 121 - 229
Target Start/End: Original strand, 18920835 - 18920943
Alignment:
Q  121 ttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtg 220  Q
    |||||| ||||||||||| | | |  ||||||||||   || ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18920835 ttttggcagcacaacatggttccgatgatcgatatgtttgtcacgttgcagagatcaactgaagatattctcaacagtttgattccgccagaagatcgtg 18920934  T
Q  221 attaggtag 229  Q
    |||||||||    
T  18920935 attaggtag 18920943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 166 - 229
Target Start/End: Original strand, 12742818 - 12742881
Alignment:
Q  166 ttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtag 229  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12742818 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaacagtctgattccgccagaagatcgtgattaggtag 12742881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 163 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 17195423 - 17195357
Alignment:
Q  163 acgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtag 229  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17195423 acgttgctgagatcaactaaagatattatcaacaatttgattccgccagaagatcgtgattaggtag 17195357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 94
Target Start/End: Original strand, 1693382 - 1693455
Alignment:
Q  21 gagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaa 94  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  1693382 gagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgagaggagagtatcactcacttgggtggaattaa 1693455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 9 - 63
Target Start/End: Original strand, 7082281 - 7082335
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaag 63  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7082281 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaag 7082335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 125
Target Start/End: Original strand, 12742706 - 12742820
Alignment:
Q  11 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgt 110  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | || | ||||||||| || |||||| |||| ||||||||| |||      
T  12742706 gagacacaagaagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacgatgagataatatcattcagttaggtggaattaacgaacgacgataacag 12742805  T
Q  111 gaagaacatgttttg 125  Q
    |  ||||||||||||    
T  12742806 gtggaacatgttttg 12742820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 125
Target Start/End: Original strand, 12805524 - 12805638
Alignment:
Q  11 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgt 110  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | | || | ||||||||| || |||||| |||| ||||||||| ||||     
T  12805524 gagacacaagaagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaatgatgagataatatcattcagttaggtggaattaacgaacgacgataacgg 12805623  T
Q  111 gaagaacatgttttg 125  Q
    |  ||||||||||||    
T  12805624 gtggaacatgttttg 12805638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 12 - 229
Target Start/End: Original strand, 19748051 - 19748276
Alignment:
Q  12 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 111  Q
    ||||||||| |||||||||||| || | ||| ||||||||||| | ||||| |||||| || | |||| |  | | || |||| |||||||||  |||||    
T  19748051 agacacaagaagggtggaatacatttgatatgaacgtccaacgttggacaacgggagaataacgttcagtcagctagaattaacgaacgacgacgacgtg 19748150  T
Q  112 aagaacatgtt---------ttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatga 202  Q
    |||||||||||         |||| ||||||||||||| | |||||||||||||   ||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||| | |||    
T  19748151 aagaacatgttctccattttttggcagcacaacatgtttccgtggatcgatatgtttgta-cgttgctgagatcgcctgaagatattctcaacaatttga 19748249  T
Q  203 ttccgccagaagatcgtgattaggtag 229  Q
    |||||||| |||||  |||||||||||    
T  19748250 ttccgccataagattatgattaggtag 19748276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 121 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 25360690 - 25360580
Alignment:
Q  121 ttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtt-gctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgt 219  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||   || ||||| |||||||||  |||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  25360690 ttttggcagcacaacatgttctcgtggatcgatatgtttgtcacgtttgctgagatcgcctgaagatgttttcaacagtttgattccgtcagaagatcgt 25360591  T
Q  220 gattaggtaga 230  Q
    |||||||||||    
T  25360590 gattaggtaga 25360580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 166 - 229
Target Start/End: Original strand, 12805636 - 12805699
Alignment:
Q  166 ttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtag 229  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  12805636 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaacagtctgattatgccagaagatcgtgattaggtag 12805699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 121 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 15798186 - 15798078
Alignment:
Q  121 ttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtg 220  Q
    |||||| ||||||||||||| | |||||| ||||||   || |||||| ||||||   ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||  ||    
T  15798186 ttttggcagcacaacatgtttccgtggattgatatgtttgtcacgttgatgagattgcctgaagatattctcaacagtttgattccgccaaaagattatg 15798087  T
Q  221 attaggtag 229  Q
    |||||||||    
T  15798086 attaggtag 15798078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 13131142 - 13131075
Alignment:
Q  163 acgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtaga 230  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | |||||  || |||||||||||||||| ||||    
T  13131142 acgttgcagagatcaactgaagatattctcaacattttgattttgctagaagatcgtgattagctaga 13131075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 163 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 36312009 - 36311943
Alignment:
Q  163 acgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtag 229  Q
    ||||||||||||||  |||||||| || |||| ||| | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  36312009 acgttgctgagatcgcctgaagatcttctcaatagtttaattctgccagaagatcgtgattaggtag 36311943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 23228776 - 23228668
Alignment:
Q  121 ttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtg 220  Q
    |||||| |||||  |||||||| ||| |||||||||   || |||||| ||||||||  |||||||||| | |||||| ||||||||| |||| ||  ||    
T  23228776 ttttggcagcaccgcatgttcccgtgaatcgatatgtttgtcacgttgttgagatcacttgaagatattctgaacagtttgattccgctagaaaattatg 23228677  T
Q  221 attaggtag 229  Q
    |||||||||    
T  23228676 attaggtag 23228668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 191 - 230
Target Start/End: Original strand, 2599426 - 2599465
Alignment:
Q  191 tcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtaga 230  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2599426 tcaacagtttgattccgtcagaagatcgtgattaggtaga 2599465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 128 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 16418199 - 16418111
Alignment:
Q  128 agcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagat 216  Q
    ||||||||||||||| | |||| || |||   || || |||||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||| || ||||||||||    
T  16418199 agcacaacatgttcccgaggattgagatggatgttacattgctgagatcacctgaagatattctcaagagtttgactctgccagaagat 16418111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 165; Significance: 2e-88; HSPs: 31)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 17 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 33799757 - 33799549
Alignment:
Q  17 caaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaa 116  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  33799757 caaggagggtggaatatgttcgttataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgag 33799658  T
Q  117 catgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagat 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  33799657 catgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcggataacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgccagaagat 33799558  T
Q  217 cgtgattag 225  Q
    ||| |||||    
T  33799557 cgtcattag 33799549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 9 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 41857188 - 41856969
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||     
T  41857188 cagagacagaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattaacttgggtggaattaacgaacgacgaaaat 41857089  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  41857088 gtgacgagcatattttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 41856989  T
Q  209 cagaagatcgtgattaggta 228  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  41856988 cagaagatcgtcattaggta 41856969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 9 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 44943295 - 44943076
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||||||||| |||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  44943295 cagagacacaaggatggtgtaacacgttcgatataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 44943196  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  44943195 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 44943096  T
Q  209 cagaagatcgtgattaggta 228  Q
    |||||||| || ||||||||    
T  44943095 cagaagattgtcattaggta 44943076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 17 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 43638883 - 43638675
Alignment:
Q  17 caaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaa 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||     
T  43638883 caaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatccttcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaatgtgacgag 43638784  T
Q  117 catgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagat 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||| |||||||||||    
T  43638783 catgttttgggagcacaacatgttccagtgcatcgatatgcgcgtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgatttcgccagaagat 43638684  T
Q  217 cgtgattag 225  Q
    ||| |||||    
T  43638683 cgtcattag 43638675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 9 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 15032538 - 15032322
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  15032538 cagagacacaagtatggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 15032439  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  15032438 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 15032339  T
Q  209 cagaagatcgtgattag 225  Q
    ||||||||||| |||||    
T  15032338 cagaagatcgtcattag 15032322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 9 - 225
Target Start/End: Original strand, 26452325 - 26452541
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  26452325 cagagacacaaggagggtggaacaccttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaac 26452424  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||    
T  26452425 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgc 26452524  T
Q  209 cagaagatcgtgattag 225  Q
     |||||||||| |||||    
T  26452525 tagaagatcgtcattag 26452541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 9 - 225
Target Start/End: Original strand, 40415257 - 40415473
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40415257 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagggtatcattcacttgggtggaattaaagaacgacgaaaac 40415356  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||     
T  40415357 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttcccgtggatcgatatgcaggtgacgttgttgagatcaacttaagatatcatcaacagcttgattccgt 40415456  T
Q  209 cagaagatcgtgattag 225  Q
    ||||||||||| |||||    
T  40415457 cagaagatcgtcattag 40415473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 9 - 225
Target Start/End: Original strand, 43693137 - 43693353
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43693137 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcggcgaggggaggatatcattcatttgggtggaattaaagaacgacgaaaac 43693236  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||| |    
T  43693237 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattcctc 43693336  T
Q  209 cagaagatcgtgattag 225  Q
    ||||||||||| |||||    
T  43693337 cagaagatcgtcattag 43693353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Original strand, 34614955 - 34615169
Alignment:
Q  11 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgt 110  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||    
T  34614955 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggaaagtatcattcacttgggtgaaattaacgaacgacgaaaacgt 34615054  T
Q  111 gaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcca 210  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||| |||    
T  34615055 gacgaacatgttttgggagcacaacatgatccagtggattgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccacca 34615154  T
Q  211 gaagatcgtgattag 225  Q
    |||||| || |||||    
T  34615155 gaagatagtaattag 34615169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Original strand, 41363658 - 41363872
Alignment:
Q  11 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgt 110  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||    
T  41363658 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtatacacgtctaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaatgt 41363757  T
Q  111 gaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcca 210  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||| |||    
T  41363758 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggttacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattcctcca 41363857  T
Q  211 gaagatcgtgattag 225  Q
    ||||||||| |||||    
T  41363858 gaagatcgtcattag 41363872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 42169172 - 42168958
Alignment:
Q  11 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgt 110  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  42169172 gagacacgaggagggtggaacgcgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggaaagtatcattcccttgggtggaattaacgaacaacgaaaacgt 42169073  T
Q  111 gaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcca 210  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  42169072 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgcagagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccgcca 42168973  T
Q  211 gaagatcgtgattag 225  Q
    ||||||||| |||||    
T  42168972 gaagatcgtcattag 42168958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 38034136 - 38033923
Alignment:
Q  12 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 111  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  38034136 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgttcaacgctctacgaggggagagtatcattcacctgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 38034037  T
Q  112 aagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccag 211  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||| |    
T  38034036 acgagcatgttttgggagcacaacatgttctagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaatagcttgattccgccgg 38033937  T
Q  212 aagatcgtgattag 225  Q
    |||||||| |||||    
T  38033936 aagatcgtcattag 38033923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 9 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 28706356 - 28706140
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  28706356 cagagacgcaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcacttgagtggagttaaagaacaacgaaaac 28706257  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  28706256 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttttagtggatcgatatgcgtgtaacgttgttgagatcaactgaagatatcatcaaccgcttgattccgc 28706157  T
Q  209 cagaagatcgtgattag 225  Q
    |||||||| || |||||    
T  28706156 cagaagattgtcattag 28706140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 9 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 18440509 - 18440290
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| ||||||    
T  18440509 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtagaattaacgaacgatgaaaac 18440410  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||| |||    
T  18440409 gtgacgagcatgttttaggagcacaacatgttccagtggatcgatatgagggtgacgttgctgagataaactgaagatatcatcaaaagtttgattacgc 18440310  T
Q  209 cagaagatcgtgattaggta 228  Q
     |||||||||| ||||||||    
T  18440309 gagaagatcgtcattaggta 18440290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 9 - 225
Target Start/End: Original strand, 40414610 - 40414826
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40414610 cagagacacaaggaaggtggaacacgttcggtataaacgtctaacactcgacgaggggagggtatcattcacttgggtggaattaaagaacgacgaaaac 40414709  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| |    
T  40414710 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgtttcagttgattgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccac 40414809  T
Q  209 cagaagatcgtgattag 225  Q
    ||||||||||| |||||    
T  40414810 cagaagatcgtcattag 40414826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 9 - 225
Target Start/End: Original strand, 41275394 - 41275610
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  41275394 cagagacacaaggagggtggaacaccttcggtataaacgtcaaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaac 41275493  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||    
T  41275494 gtgacgagcatgttttgagagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgc 41275593  T
Q  209 cagaagatcgtgattag 225  Q
    ||||||||||| |||||    
T  41275594 cagaagatcgtcattag 41275610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 9 - 228
Target Start/End: Original strand, 42603454 - 42603673
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  42603454 cagagacagaaggagggcggaacacgttcggtataaacgtccaatgctcgacgaggggagggtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 42603553  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| |||| ||||| ||| |||||||||    
T  42603554 gtgacgagcatgttttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgaaatcaaccgaatatatcatcaaaagtttgattccgc 42603653  T
Q  209 cagaagatcgtgattaggta 228  Q
    || |||||||| ||||||||    
T  42603654 caaaagatcgtcattaggta 42603673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 19242375 - 19242157
Alignment:
Q  10 agagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacg 109  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||    
T  19242375 agagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtgtaattaaggaacgacaaaaacg 19242276  T
Q  110 tgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcc 209  Q
    ||| || ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||  |     
T  19242275 tgacgagcatgttttgggaatacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctaagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattctacg 19242176  T
Q  210 agaagatcgtgattaggta 228  Q
    ||||||| || ||||||||    
T  19242175 agaagattgtcattaggta 19242157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 19315559 - 19315341
Alignment:
Q  10 agagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacg 109  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||    
T  19315559 agagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtgtaattaaggaacgacaaaaacg 19315460  T
Q  110 tgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcc 209  Q
    ||| || ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||  |     
T  19315459 tgacgagcatgttttgggaatacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctaagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattctacg 19315360  T
Q  210 agaagatcgtgattaggta 228  Q
    ||||||| || ||||||||    
T  19315359 agaagattgtcattaggta 19315341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 12 - 189
Target Start/End: Original strand, 26484580 - 26484757
Alignment:
Q  12 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 111  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  26484580 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 26484679  T
Q  112 aagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatt 189  Q
    | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26484680 acgagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgcataacattgctgagatcaactgaagatatt 26484757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 3589478 - 3589260
Alignment:
Q  11 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgt 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | | | |||||| ||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  3589478 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtcaaacgattgtctatgggagaatatcattcagttgggtggaattaatgaacgacgataacgt 3589379  T
Q  111 gaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcca 210  Q
    || |  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  3589378 gatgggcatgttttgggagcacaggatgttccagtggatcgatatgcgtgtaacattgttgagatcaactgaagacattatcaacagtttgattccgcca 3589279  T
Q  211 gaagatcgtgattaggtag 229  Q
    |||||||||||||||||||    
T  3589278 gaagatcgtgattaggtag 3589260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 9 - 225
Target Start/End: Original strand, 2416915 - 2417131
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  2416915 cagaaacacaaggagggtggaacaccttcggtataaacgtccaacattcgacaaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 2417014  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||||   ||||||| |    
T  2417015 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagttgatcgatatgcaggtgacgttgatgagatcaaccgaagatatcatcaacaacttgattccac 2417114  T
Q  209 cagaagatcgtgattag 225  Q
    ||||||||||| |||||    
T  2417115 cagaagatcgtcattag 2417131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 10 - 225
Target Start/End: Original strand, 24861344 - 24861559
Alignment:
Q  10 agagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacg 109  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |    
T  24861344 agagacacaaggagggtggaacaccttcggtataaacgtccaacgctcgacggggggagagtatcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaatg 24861443  T
Q  110 tgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcc 209  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||| |||    
T  24861444 tgacgagcatgttttgggagcacaacatgttcaattggattgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattctgcc 24861543  T
Q  210 agaagatcgtgattag 225  Q
    |||||||||| |||||    
T  24861544 agaagatcgtcattag 24861559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 9 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 485472 - 485256
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  485472 cagagacacaaggatggtggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 485373  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  485372 gtgacgaccatgttttgggagcacagcatgttctagtggatcgatatgcggatgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 485273  T
Q  209 cagaagatcgtgattag 225  Q
    || |||||||| |||||    
T  485272 cacaagatcgtcattag 485256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 31172028 - 31171811
Alignment:
Q  11 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||||||||  || |    
T  31172028 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgttcgacgatgggagaatatcattcagttgggtggaattaatgaacgacgacgacat 31171929  T
Q  111 gaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcca 210  Q
    ||  ||||| |||  | |||||| |||||| | ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  31171928 gacaaacatttttcagaagcacagcatgttaccgtggatcgatatgtgggtgacgttgctgagatcaactgaaaatattatcaacagtttgattccgcca 31171829  T
Q  211 gaagatcgtgattaggta 228  Q
    ||||||||||||||||||    
T  31171828 gaagatcgtgattaggta 31171811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 218
Target Start/End: Original strand, 40702360 - 40702569
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||| |||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  40702360 cagagacagaaggagagtggaacacgttcagtataaacgtccaacgttcgacgaagggagaatatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 40702459  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| || |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| |||||||||    
T  40702460 gtgacgagcatgttttgggaacaaaacatgttccagtggatcgatatgcggatgacgttgctgagatcaactgaatatatcatcaaaagtttgattccgc 40702559  T
Q  209 cagaagatcg 218  Q
    || |||||||    
T  40702560 caaaagatcg 40702569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 12 - 168
Target Start/End: Original strand, 16575695 - 16575851
Alignment:
Q  12 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||||| |    
T  16575695 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgagaggagagtttcattcagttgggtggaattaacgaacaacgaaaacggg 16575794  T
Q  112 aagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttg 168  Q
    | || |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||    
T  16575795 atgagcatgttttgggaccacaacatgttccagtgcatcgatacgcgcgtaatgttg 16575851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 126
Target Start/End: Original strand, 22548263 - 22548380
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || |||||||||    
T  22548263 cagagacacaaggagggtggaacacattcgatataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaatgacgaaaac 22548362  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgg 126  Q
    |||| || ||||||||||    
T  22548363 gtgacgagcatgttttgg 22548380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 225
Target Start/End: Original strand, 22549236 - 22549295
Alignment:
Q  163 acgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattag 225  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||    |||||||||||||||||||| |||||    
T  22549236 acgttgctgacatcaactgaagatatcatcaac---ttgattccgccagaagatcgtcattag 22549295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 12504938 - 12504896
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtcca 51  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  12504938 cagagacacaaggagggtggaatacgtttggtatgaatgtcca 12504896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 22843532 - 22843442
Alignment:
Q  14 acacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacga 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || | ||| | |||||| || | |||| |||  ||||||||| ||| |||||    
T  22843532 acacaaggagggtggaatacgtttggtatgaacgtccatcgtttgacgatgggagaataacgttcagttgattggagttaacgaaggacga 22843442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 165; Significance: 2e-88; HSPs: 48)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 9 - 225
Target Start/End: Original strand, 18237556 - 18237772
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18237556 cagagacgcaaggatggtggaatacgttcggtataaacgtctaacgctcgacaaggggagaggatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 18237655  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
     ||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  18237656 atgacgagcatattttgggagcacatcatgttccagtggatcggtatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacagtttgattccgc 18237755  T
Q  209 cagaagatcgtgattag 225  Q
    ||||||||||| |||||    
T  18237756 cagaagatcgtcattag 18237772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Original strand, 41217609 - 41217822
Alignment:
Q  12 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 111  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  41217609 agacacaaggagggtggaattagttcggtataaaaattcaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaaagtg 41217708  T
Q  112 aagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccag 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||| ||||    
T  41217709 aagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccaccag 41217808  T
Q  212 aagatcgtgattag 225  Q
    |||||||| |||||    
T  41217809 aagatcgtcattag 41217822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 9 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 15338120 - 15337901
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  15338120 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaatgttcaacgctcaacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacaaacgacgaaaac 15338021  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  15338020 gtgatgagcatgttttgggagcacaacatgtttcagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattataaacagtctgattccgc 15337921  T
Q  209 cagaagatcgtgattaggta 228  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  15337920 cagaagatcgtcattaggta 15337901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 9 - 228
Target Start/End: Original strand, 48270640 - 48270859
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||    
T  48270640 cagagacaaaaggagggtggaacacgttcggtatagacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaacgacgaaaac 48270739  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  48270740 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 48270839  T
Q  209 cagaagatcgtgattaggta 228  Q
    |||||||||||  |||||||    
T  48270840 cagaagatcgtcgttaggta 48270859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Original strand, 41048776 - 41048994
Alignment:
Q  10 agagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacg 109  Q
    ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  41048776 agagacagaaggaggatggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggtgagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacg 41048875  T
Q  110 tgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcc 209  Q
     || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  41048876 cgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcc 41048975  T
Q  210 agaagatcgtgattaggta 228  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  41048976 agaagatcgtcattaggta 41048994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 9 - 224
Target Start/End: Original strand, 47268891 - 47269105
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47268891 cagagacgcaaggagggtggaatacgttcg-tataaacgtccagcgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 47268989  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| ||||||| | |||||||||    
T  47268990 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagattaactaaaaatatcatcaacaatttgattccgc 47269089  T
Q  209 cagaagatcgtgatta 224  Q
    || |||||||| ||||    
T  47269090 caaaagatcgtcatta 47269105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 9 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 21187514 - 21187295
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||  |||||||||    
T  21187514 cagagacacaaggagggtgaaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtagaattaacgattgacgaaaac 21187415  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||     
T  21187414 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttctagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgt 21187315  T
Q  209 cagaagatcgtgattaggta 228  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  21187314 cagaagatcgtcattaggta 21187295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 1642800 - 1642582
Alignment:
Q  11 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||| | ||||||||| |||| |||||| ||||||||    
T  1642800 gagacacaaggagggtggaatacgtttgatataaacgttcaacactcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgatgaaaacgt 1642701  T
Q  111 gaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcca 210  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1642700 gaggagcatgttttgggagcacaacatgttcaagtggatcgatatgcgtgtaacgttgttgagatcaactgaagatattatcaacagtttgattccgcca 1642601  T
Q  211 gaagatcgtgattaggtag 229  Q
    |||||||||||||||||||    
T  1642600 gaagatcgtgattaggtag 1642582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 9 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 20378918 - 20378697
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20378918 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaatgcacaacgaggggagggtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 20378819  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || ||||   |||||||||    
T  20378818 gtgacgaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggacagatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatataattaacaacttgattccgc 20378719  T
Q  209 cagaagatcgtgattaggtaga 230  Q
    ||||||||| | ||||| ||||    
T  20378718 cagaagatcatcattagttaga 20378697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 36394036 - 36393820
Alignment:
Q  12 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 111  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  36394036 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacactcgacgaggggagaatatcattcacttgtgtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 36393937  T
Q  112 aagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccag 211  Q
    | || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||     
T  36393936 acgagcatgttttgggagcacaatatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccat 36393837  T
Q  212 aagatcgtgattaggta 228  Q
    |||||| | ||||||||    
T  36393836 aagatcttcattaggta 36393820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 10 - 225
Target Start/End: Original strand, 40588542 - 40588757
Alignment:
Q  10 agagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacg 109  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||     
T  40588542 agagacacaaggagggtggaacaccttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcgcttgggtggaattaacgaacgacgaaaaca 40588641  T
Q  110 tgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcc 209  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||   |||||| |||    
T  40588642 tgatgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgttgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattcggcc 40588741  T
Q  210 agaagatcgtgattag 225  Q
    |||||||||| |||||    
T  40588742 agaagatcgtcattag 40588757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 9 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 43351314 - 43351096
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  43351314 cagagacacaaggagggtggaacacgttcagtataaacgtccaacgctcgatgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 43351215  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
     ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||| |    
T  43351214 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatg-gggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaatgtctgattccac 43351116  T
Q  209 cagaagatcgtgattaggta 228  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  43351115 cagaagatcgtcattaggta 43351096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 9 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 46862409 - 46862190
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||    
T  46862409 cagagacagaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttggatggaattaacgaacgacgaaaac 46862310  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  46862309 gtgacgagcttgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgagtgacgttgctgagattaactgaagatatgatcaaaagtttgattccgc 46862210  T
Q  209 cagaagatcgtgattaggta 228  Q
    ||||||||||| || |||||    
T  46862209 cagaagatcgtcataaggta 46862190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 21614973 - 21614755
Alignment:
Q  11 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgt 110  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||     
T  21614973 gagacacaaggagggtggaacacgttcgatataaacgttcaacgctcgacgagggaagagtatcattcatttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgc 21614874  T
Q  111 gaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcca 210  Q
    || || ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | |||||||||||    
T  21614873 gacgagcatgttttgggagcacatcatgttctagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaattttgattccgcca 21614774  T
Q  211 gaagatcgtgattaggtag 229  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  21614773 gaagttcgtgattaggtag 21614755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 9 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 39477455 - 39477239
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39477455 cagatacacaaggagggtggaacacgttcagtataaacgtccaacgctcgacgaggggaggatatcattcacttgggtggaattaaagaacgacgaaaac 39477356  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
     ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||   |||||||||    
T  39477355 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactaaagatatcattaacaacttgattccgc 39477256  T
Q  209 cagaagatcgtgattag 225  Q
    ||||||||||| |||||    
T  39477255 cagaagatcgtcattag 39477239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 10 - 225
Target Start/End: Original strand, 34140858 - 34141073
Alignment:
Q  10 agagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacg 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  34140858 agagacacaaggagggtggaacaatttcggtataaacatccaacgctcgacgaggggagagtatcattcatttgggtggaattaacaaacgacgaaaacg 34140957  T
Q  110 tgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcc 209  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||    
T  34140958 tgacggacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgatttcgcc 34141057  T
Q  210 agaagatcgtgattag 225  Q
    | |||||||| |||||    
T  34141058 ataagatcgtcattag 34141073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 9 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 48315395 - 48315176
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||| | ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  48315395 cagagatagaaggagggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcaacgagaggagagcatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 48315296  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  48315295 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtagatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 48315196  T
Q  209 cagaagatcgtgattaggta 228  Q
    || |||||||| ||||||||    
T  48315195 cataagatcgtcattaggta 48315176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Original strand, 21650518 - 21650724
Alignment:
Q  11 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgt 110  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||| ||    
T  21650518 gagacacaaggagggtggaacacgttcattataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcagttgggaggaattaacgaacgacgaaaatgt 21650617  T
Q  111 gaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcca 210  Q
    || || |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21650618 gacgagcatgttatgggatcacaacatgttccagtggatcgatatgtgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattccgcca 21650717  T
Q  211 gaagatc 217  Q
     ||||||    
T  21650718 taagatc 21650724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Original strand, 30360512 - 30360724
Alignment:
Q  12 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  30360512 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaatgtacaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaaaaaacgacgaaaacgta 30360611  T
Q  112 aagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccag 211  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || || ||| ||||||||||||    
T  30360612 acgagcatgttttgggagcacaacatgttctagtggattgatatgcgggt-gcgttgctgagatcaactgaagatatcataaaaagtttgattccgccag 30360710  T
Q  212 aagatcgtgattag 225  Q
    |||||||| |||||    
T  30360711 aagatcgtcattag 30360724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 10 - 217
Target Start/End: Original strand, 17183205 - 17183412
Alignment:
Q  10 agagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacg 109  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  17183205 agagacacaaggagggtgtaacacgtttggtataaacgtccaacactcgacgagggaagaatatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacg 17183304  T
Q  110 tgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcc 209  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| |||    
T  17183305 tgacgaacatgttttggaagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattctgcc 17183404  T
Q  210 agaagatc 217  Q
    ||||||||    
T  17183405 agaagatc 17183412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 17 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 48220949 - 48220743
Alignment:
Q  17 caaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaa 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  48220949 caaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcactttggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgag 48220850  T
Q  117 catgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagat 216  Q
    ||||  ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||| |||||    
T  48220849 catg--ttgggagcacagcatgttccagtggatcaatatgcaggtgacggtgctgagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccaccataagat 48220752  T
Q  217 cgtgattag 225  Q
    ||| |||||    
T  48220751 cgtcattag 48220743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 9 - 225
Target Start/End: Original strand, 20564751 - 20564967
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  20564751 cagagacacaaggatggtggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 20564850  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  20564851 gtgacgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 20564950  T
Q  209 cagaagatcgtgattag 225  Q
    || |||||||| |||||    
T  20564951 cacaagatcgtcattag 20564967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 9 - 228
Target Start/End: Original strand, 42735255 - 42735473
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  42735255 cagagacagaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgatg-gggaagattatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 42735353  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  42735354 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatattctagtgaatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 42735453  T
Q  209 cagaagatcgtgattaggta 228  Q
     |||||||||| ||||||||    
T  42735454 aagaagatcgtcattaggta 42735473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 9 - 210
Target Start/End: Original strand, 17839315 - 17839516
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  17839315 cagagacacaaggatggtggaagacgtttggaataaacgtccaacgctcgatgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 17839414  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  17839415 gtgacgagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaattgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 17839514  T
Q  209 ca 210  Q
    ||    
T  17839515 ca 17839516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 27 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 30355012 - 30354811
Alignment:
Q  27 ggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgttttgg 126  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  30355012 ggaacacgttcggtataaacgtccaacgttcgacgaggggagcgtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 30354913  T
Q  127 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattagg 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||| |||| |||||||| ||||||    
T  30354912 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgtggatgacgttgctgagatcagctgaagatatcatcaaaagtttgattctgccaaaagatcgtcattagg 30354813  T
Q  227 ta 228  Q
    ||    
T  30354812 ta 30354811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 10 - 229
Target Start/End: Original strand, 2356282 - 2356501
Alignment:
Q  10 agagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacg 109  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||| |    
T  2356282 agagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacatccaacgctcgaagaggggagagtatcattcacttggatggaattaacgaacgacaaaaatg 2356381  T
Q  110 tgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcc 209  Q
    ||| || ||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | | |||||||||     
T  2356382 tgacgagcatgttttgggagaacagcatgttccaatggatcgatatgcgagtaacgttgttgagatcaactgaagatatcatcaaaaatttgattccgct 2356481  T
Q  210 agaagatcgtgattaggtag 229  Q
    | |||| |||||||||||||    
T  2356482 ataagaccgtgattaggtag 2356501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 12 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 28979234 - 28979060
Alignment:
Q  12 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 111  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||| || |||| ||||||||    
T  28979234 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgagaggagagtatcattcacttgggtgaaattaacgagcgacaaaaacgtg 28979135  T
Q  112 aagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagat 186  Q
    | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28979134 acgagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagat 28979060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 9 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 28114608 - 28114389
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  28114608 cagagaaacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgcccgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 28114509  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
     ||| || |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | | |||||| |     
T  28114508 atgacgagcatgttttaggagcacaacatgttccaatggatcgaaatgtgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaaatttgattctgt 28114409  T
Q  209 cagaagatcgtgattaggta 228  Q
    || ||||| || ||||||||    
T  28114408 caaaagattgtcattaggta 28114389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 9 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 26603420 - 26603268
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  26603420 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaagggagggtatcattcacttgggtggaattaaagagcgacgaaaac 26603321  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggt 161  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26603320 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgtgggt 26603268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 10 - 225
Target Start/End: Original strand, 10523061 - 10523277
Alignment:
Q  10 agagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacg 109  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||||    
T  10523061 agagacacaaggatggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcactttgttggaattaacgaacgacgaaaacg 10523160  T
Q  110 tgaagaacatgttttgggagcacaacatg-ttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    ||| || |||||||||||||||| ||||| |||  |||||||||||||||||| | ||| || |||||||||||| |||| ||||| ||| |||||||||    
T  10523161 tgacgagcatgttttgggagcaccacatgtttcttgtggatcgatatgcgggtgaagtttcttagatcaactgaatatatcatcaaaagtttgattccgc 10523260  T
Q  209 cagaagatcgtgattag 225  Q
    | ||| ||||| |||||    
T  10523261 ctgaaaatcgtcattag 10523277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 9 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 45363458 - 45363251
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||||||||| ||||  || |||||||||    
T  45363458 cagagacacaaggagggtggaacaccttcagtataaacgtccaacgctcgacgagcagagagtttcattcacttgggtggaattaacaaatgacgaaaac 45363359  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||    
T  45363358 gtgacgagcatgttttgggagcacatcatgttccagtggatcgat---------acgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgc 45363268  T
Q  209 cagaagatcgtgattag 225  Q
    ||||||||||| |||||    
T  45363267 cagaagatcgtcattag 45363251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 117 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 2206144 - 2206036
Alignment:
Q  117 catgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagat 216  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  2206144 catgttttgggagcacaatatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccgccagaagat 2206045  T
Q  217 cgtgattag 225  Q
    ||| |||||    
T  2206044 cgtcattag 2206036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 101 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 9367243 - 9367119
Alignment:
Q  101 acgaaaacgtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtat 200  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |    
T  9367243 acgaaaacgtgacgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagttt 9367144  T
Q  201 gattccgccagaagatcgtgattag 225  Q
    |||||||||| |||||||| |||||    
T  9367143 gattccgccacaagatcgtcattag 9367119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 9 - 133
Target Start/End: Original strand, 13916825 - 13916949
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||| ||||     
T  13916825 cagagacacaaggatggtggaacacatttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggttgaattaacgaatgacaaaaat 13916924  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcaca 133  Q
    |||| || |||||||||||||||||    
T  13916925 gtgatgaccatgttttgggagcaca 13916949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 9 - 112
Target Start/End: Original strand, 42682948 - 42683051
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||    
T  42682948 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgaacgacgaggggagaatatcattcactttggtggaattaacgaacaacgaaaac 42683047  T
Q  109 gtga 112  Q
    ||||    
T  42683048 gtga 42683051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 121 - 228
Target Start/End: Original strand, 28066359 - 28066466
Alignment:
Q  121 ttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtg 220  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||   || ||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||    
T  28066359 ttttggcagcacaacatgttcctgtggatcgatatgtttgtcacgttgctgagatcgtctgaagatattctcaaaagtttgattccgccagaacatcgtg 28066458  T
Q  221 attaggta 228  Q
    ||||||||    
T  28066459 attaggta 28066466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 163 - 229
Target Start/End: Original strand, 11824839 - 11824905
Alignment:
Q  163 acgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtag 229  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11824839 acgttgcagagatcaactgaagatattttcaacagtttgattccgctagaagatcgtgattaggtag 11824905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 128 - 229
Target Start/End: Original strand, 18149638 - 18149739
Alignment:
Q  128 agcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggt 227  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||    | | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||    
T  18149638 agcacaacatgttcccgtggatcgatttgtttttcaagttgcagagatcaactgaagatattctcaacagtttgattgcgccagaagatcgtatttaggt 18149737  T
Q  228 ag 229  Q
    ||    
T  18149738 ag 18149739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 121 - 229
Target Start/End: Original strand, 150192 - 150300
Alignment:
Q  121 ttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtg 220  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||    || |||||| |||||||  ||||||||||| |||||| | |||||| || |||||||||||    
T  150192 ttttggcagcacatcatgttcccgtggatcgatatatttgtcacgttgttgagatcgcctgaagatattctcaacaatttgattctgctagaagatcgtg 150291  T
Q  221 attaggtag 229  Q
    |||||||||    
T  150292 attaggtag 150300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 121 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 7414304 - 7414196
Alignment:
Q  121 ttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtg 220  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||   || ||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||  ||    
T  7414304 ttttggcagcacaacatgttctcgtggatctatatgtttgtcacgttgctgagatcgcctgaaaatattctcaacagtttgatttcgccagaagattatg 7414205  T
Q  221 attaggtag 229  Q
    |||||||||    
T  7414204 attaggtag 7414196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 3380727 - 3380669
Alignment:
Q  171 gagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtag 229  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3380727 gagatcaactgaagatattctcaacaatttgattctgccagaagatcgtgattaggtag 3380669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 26601839 - 26601777
Alignment:
Q  163 acgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattag 225  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  26601839 acgttgttgagatcaactgaagatatcatcaatagtttgattccgccagaagatcgtcattag 26601777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 142 - 225
Target Start/End: Original strand, 13920431 - 13920514
Alignment:
Q  142 cagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattag 225  Q
    |||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| | | ||||| ||||| |||||||| |||||    
T  13920431 cagtggatcgatatgcaggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaaatttgatttcgccataagatcgtcattag 13920514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 8726430 - 8726381
Alignment:
Q  12 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgaca 61  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||    
T  8726430 agacacaaggagggtggaataagttcggtataaacgtccatcgttcgaca 8726381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 128 - 229
Target Start/End: Original strand, 12083042 - 12083143
Alignment:
Q  128 agcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggt 227  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||   || || |||||||||||  ||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||  |||||||||    
T  12083042 agcacaacatgttcccatggatggatatgtttgtcacattgctgagatcgcctgaagatattctcaacagtttggttccgcctgaagattatgattaggt 12083141  T
Q  228 ag 229  Q
    ||    
T  12083142 ag 12083143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 227
Target Start/End: Original strand, 31267188 - 31267286
Alignment:
Q  128 agcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggt 227  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||   || |||||||| |||||  ||||||||||| | |||||| |||||| || |||||||  |||||||||    
T  31267188 agcacaacatgttcccgtggatcgatatgtttgtcacgttgctaagatcgcctgaagatattct-aacagtttgattcagctagaagattatgattaggt 31267286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 50
Target Start/End: Original strand, 3924805 - 3924845
Alignment:
Q  10 agagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtcc 50  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  3924805 agagacacaaggagggtggaatacgtttgatataaacgtcc 3924845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 54
Target Start/End: Original strand, 18146953 - 18146996
Alignment:
Q  11 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacg 54  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  18146953 gagacacaaggagggtggaatacttttggtatgaacgtccaacg 18146996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 159; Significance: 9e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Original strand, 2261 - 2475
Alignment:
Q  11 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgt 110  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  2261 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcaacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgt 2360  T
Q  111 gaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcca 210  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  2361 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgatgagatcaattgaagatatcatcaacagcttgattccgcca 2460  T
Q  211 gaagatcgtgattag 225  Q
     |||||||| |||||    
T  2461 aaagatcgtcattag 2475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 157; Significance: 1e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 17 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 18123 - 17916
Alignment:
Q  17 caaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  18123 caaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacactcgacgaggg-agagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgatgag 18025  T
Q  117 catgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagat 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  18024 catgttttgggagcacaacatgttatagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccgccagaagat 17925  T
Q  217 cgtgattag 225  Q
    ||| |||||    
T  17924 cgtcattag 17916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 157; Significance: 1e-83; HSPs: 31)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 9 - 225
Target Start/End: Original strand, 801160 - 801375
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  801160 cagagacacaaggagggtggaatacgtttggtataaacgtccaaagctcgacgaggggag-gtgtcattcacttgggtagagttaaagaacgacgaaaac 801258  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  801259 gtgacgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 801358  T
Q  209 cagaagatcgtgattag 225  Q
    ||||||||||| |||||    
T  801359 cagaagatcgtcattag 801375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 229
Target Start/End: Original strand, 14115033 - 14115251
Alignment:
Q  11 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgt 110  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  14115033 gagacacaaggagggtgcaaaacgttcagtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaagtaaagaacgacgaaaacgt 14115132  T
Q  111 gaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcca 210  Q
    || || |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||    
T  14115133 gacgagcatgttctgggagcacaacatgttccagtggatcaatatgcgggtaacgttgttgagatcaactgaagatatcatcaagagtctgattctgcca 14115232  T
Q  211 gaagatcgtgattaggtag 229  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  14115233 gaagatagtgattaggtag 14115251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 9 - 228
Target Start/End: Original strand, 13402527 - 13402746
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||    
T  13402527 cagagacacaaggagggtggaacacgttctgtataaatgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgagtggaattaacgaacgacgaaaac 13402626  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | | |||||||||    
T  13402627 gtgacgagcatgttttgggagcccaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaaatttgattccgc 13402726  T
Q  209 cagaagatcgtgattaggta 228  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  13402727 cagaagatcgtcattaggta 13402746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 9 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 32027843 - 32027624
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||    
T  32027843 cagagacacaaggagggttgaacacgttcggtataaacgtccaacattcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaatgacgaaaac 32027744  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  32027743 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttctagtggattgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 32027644  T
Q  209 cagaagatcgtgattaggta 228  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  32027643 cagaagatcgtcattaggta 32027624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 9 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 32037902 - 32037683
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||    
T  32037902 cagagacacaaggagggttgaacacgttcggtataaacgtccaacattcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaatgacgaaaac 32037803  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  32037802 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttctagtggattgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 32037703  T
Q  209 cagaagatcgtgattaggta 228  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  32037702 cagaagatcgtcattaggta 32037683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 9 - 225
Target Start/End: Original strand, 29066547 - 29066763
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  29066547 cagagacacaaggagggtggaacaccttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaac 29066646  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||    
T  29066647 gtgaagagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatgatcaacaacttgattccgc 29066746  T
Q  209 cagaagatcgtgattag 225  Q
    ||| ||||||| |||||    
T  29066747 cagtagatcgtcattag 29066763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 9 - 225
Target Start/End: Original strand, 29075560 - 29075776
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  29075560 cagagacacaaggagggtggaacaccttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaac 29075659  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||    
T  29075660 gtgaagagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatgatcaacaacttgattccgc 29075759  T
Q  209 cagaagatcgtgattag 225  Q
    ||| ||||||| |||||    
T  29075760 cagcagatcgtcattag 29075776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 9 - 225
Target Start/End: Original strand, 29108134 - 29108350
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  29108134 cagagacacaaggagggtggaacacctgtggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaac 29108233  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||    
T  29108234 gtgaagagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatgatcaacaacttgattccgc 29108333  T
Q  209 cagaagatcgtgattag 225  Q
    ||||||||||| |||||    
T  29108334 cagaagatcgtcattag 29108350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 9 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 34803111 - 34802892
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  34803111 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattgacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 34803012  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| || ||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| |||    
T  34803011 gtgatgagcatgttcagggagcacaacatgttccagtaaatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgatttcgc 34802912  T
Q  209 cagaagatcgtgattaggta 228  Q
    || |||||||| ||||||||    
T  34802911 caaaagatcgtcattaggta 34802892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 10 - 225
Target Start/End: Original strand, 11692446 - 11692661
Alignment:
Q  10 agagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacg 109  Q
    ||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  11692446 agagacacaaggatggtggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacaaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacg 11692545  T
Q  110 tgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcc 209  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  11692546 tgacgaacatgttttggaagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcc 11692645  T
Q  210 agaagatcgtgattag 225  Q
    | |||||||| |||||    
T  11692646 acaagatcgtcattag 11692661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 27 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 35058932 - 35058734
Alignment:
Q  27 ggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgttttgg 126  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||    
T  35058932 ggaatacgttcgttataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgttacgagcatgttttgg 35058833  T
Q  127 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||   | ||||| | |||||||||| |||||    
T  35058832 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactaaagatatcatcaacatcttaattccacaagaagatcgtcattag 35058734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 9 - 225
Target Start/End: Original strand, 29110531 - 29110748
Alignment:
Q  9 cagagacacaagga-gggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaa 107  Q
    |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  29110531 cagagacacaaggatgggtggaacaccttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaa 29110630  T
Q  108 cgtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccg 207  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||    
T  29110631 cgtgaagagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatgatcaacaacttgattccg 29110730  T
Q  208 ccagaagatcgtgattag 225  Q
    |||| ||||||| |||||    
T  29110731 ccagcagatcgtcattag 29110748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 9 - 228
Target Start/End: Original strand, 12396770 - 12396989
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  12396770 cagagacataaggagggtggagcacgttcggtataaacgtctaacactcgacgaggggagagtatcattcaattgggtggaattaacgaacgacgaaaac 12396869  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
     ||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||   |||||||||    
T  12396870 atgacgagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatctactgaagatatcatcaacaacttgattccgc 12396969  T
Q  209 cagaagatcgtgattaggta 228  Q
    || |||||||| ||||||||    
T  12396970 caaaagatcgtcattaggta 12396989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 9 - 225
Target Start/End: Original strand, 6205478 - 6205694
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  6205478 cagagacacaaggatggtggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 6205577  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  6205578 gtgacgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 6205677  T
Q  209 cagaagatcgtgattag 225  Q
    || |||||||| |||||    
T  6205678 cacaagatcgtcattag 6205694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 9 - 225
Target Start/End: Original strand, 27640174 - 27640390
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  27640174 cagagacacaaggatggtggaacacatttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 27640273  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 208  Q
    |||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  27640274 gtgacgaccatgttttggaagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 27640373  T
Q  209 cagaagatcgtgattag 225  Q
    || |||||||| |||||    
T  27640374 cacaagatcgtcattag 27640390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 12 - 194
Target Start/End: Original strand, 22305793 - 22305975
Alignment:
Q  12 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 111  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||     
T  22305793 agacacaaggatggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtc 22305892  T
Q  112 aagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaa 194  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  22305893 acgaccatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttggttagatcaactgaagatatcatcaa 22305975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 74 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 30257729 - 30257575
Alignment:
Q  74 cattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgag 173  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  30257729 cattcagttgggtggaattaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacatcatgttctagtggatcgatatgtgggtgacgttgctgag 30257630  T
Q  174 atcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggta 228  Q
    ||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  30257629 atcaattgaagatatcatcaaaagtttgattccgctagaagatcgtcattaggta 30257575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 144 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 17465415 - 17465323
Alignment:
Q  144 gtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtagataatac 236  Q
    |||||||||||||   || ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  17465415 gtggatcgatatgtttgtcacgttgcagagatcaactgaagatattctcaacagtttgattccgccaaaagatcgtgattaggtagagaatac 17465323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 145 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 3765867 - 3765818
Alignment:
Q  145 tggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaa 194  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3765867 tggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaa 3765818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 229
Target Start/End: Original strand, 34134801 - 34134865
Alignment:
Q  165 gttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtag 229  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  34134801 gttgcagagatcaactgaagaaattctcaacagtttgattccgctaaaagatcgtgattaggtag 34134865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 198
Target Start/End: Original strand, 2402306 - 2402383
Alignment:
Q  121 ttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagt 198  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||   || ||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||    
T  2402306 ttttggcagcacaacatgttcctgtggatcgatatgtttgtcacgttgctgagatcgcctgaagataatctcaacagt 2402383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 230
Target Start/End: Original strand, 28051354 - 28051583
Alignment:
Q  11 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgt 110  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| | ||| | |||||| || | |||| | || | || |||||||||||||| |||||    
T  28051354 gagacacaaggagggtgaaatacatttggtatgaacgtccaacgttggacgacgggagaataacgttcagtcggctagaattaaagaacgacgacaacgt 28051453  T
Q  111 gaagaacatgtt---------ttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatta-tcaacagtat 200  Q
     | || ||||||         |||| |||||| |||| | | |  ||||||||||   || ||||||| ||||||||||| |||||||  |||| ||| |    
T  28051454 caggagcatgttctcgattttttggcagcacagcatggttctggtgatcgatatgtttgtcacgttgcagagatcaactggagatatttctcaatagttt 28051553  T
Q  201 gattccgccagaagatcgtgattaggtaga 230  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  28051554 gattccgctagaagatcgtgattacgtaga 28051583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 128 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 18744073 - 18743985
Alignment:
Q  128 agcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagat 216  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||   || | ||||||||||||  ||||||||||| || ||||| ||||||| ||| |||||    
T  18744073 agcacaacatgttctcgtggatcgatatgtttgtcatgttgctgagatcgtctgaagatattctcgacagtttgattcctccataagat 18743985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 153 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 24021168 - 24021096
Alignment:
Q  153 tatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattag 225  Q
    ||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||| || ||||| |||||    
T  24021168 tatgcgggtgaagttgcttagatcaacttaagatatcatcaaaagtttgattccgccataaaatcgtcattag 24021096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 163 - 226
Target Start/End: Original strand, 20192466 - 20192529
Alignment:
Q  163 acgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattagg 226  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || ||| | |||||||  |||||||||    
T  20192466 acgttgcagagatcaactgaagatattctcaacagtgtggttctggcagaagaatgtgattagg 20192529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 163 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 20242188 - 20242125
Alignment:
Q  163 acgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattagg 226  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || ||| | |||||||  |||||||||    
T  20242188 acgttgcagagatcaactgaagatattctcaacagtgtggttctggcagaagaatgtgattagg 20242125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 163 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 22136172 - 22136109
Alignment:
Q  163 acgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattagg 226  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || ||| | |||||||  |||||||||    
T  22136172 acgttgcagagatcaactgaagatattctcaacagtgtggttctggcagaagaatgtgattagg 22136109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 163 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 22143525 - 22143462
Alignment:
Q  163 acgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattagg 226  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || ||| | |||||||  |||||||||    
T  22143525 acgttgcagagatcaactgaagatattctcaacagtgtggttctggcagaagaatgtgattagg 22143462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 177 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 35021284 - 35021237
Alignment:
Q  177 aactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgatta 224  Q
    |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  35021284 aactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcatta 35021237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 18744198 - 18744144
Alignment:
Q  11 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggg 65  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||| | ||||||||||    
T  18744198 gagacacaaggagggtggaatacatttggtacgaacgtccaaagttcgacaaggg 18744144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 153 - 225
Target Start/End: Original strand, 2192535 - 2192607
Alignment:
Q  153 tatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattag 225  Q
    ||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||| ||||| | | ||||||||||| || ||||| |||||    
T  2192535 tatgcgggtgaagttgcttagatcaacttaagatatcatcaaaattttgattccgccataaaatcgtcattag 2192607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 144; Significance: 8e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 10 - 225
Target Start/End: Original strand, 1783 - 1998
Alignment:
Q  10 agagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacg 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  1783 agagacacaaggagggtggaacaatttcggtataaacatccaacgctcgacgaggggagagtatcattcatttgggtggaattaacaaacgacgaaaacg 1882  T
Q  110 tgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcc 209  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||    
T  1883 tgacggacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgatttcgcc 1982  T
Q  210 agaagatcgtgattag 225  Q
    | |||||||| |||||    
T  1983 ataagatcgtcattag 1998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0181 (Bit Score: 119; Significance: 6e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0181
Description:

Target: scaffold0181; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 11 - 229
Target Start/End: Original strand, 24899 - 25116
Alignment:
Q  11 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgt 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| ||    
T  24899 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtatagacgtacaacgctcgaggaggggagagtagcattcagttgggtggaattaacgaacaacgaaaatgt 24998  T
Q  111 gaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcca 210  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||    
T  24999 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttctagtggatctatttgcggataacattgctaagatcaactgaagatatta-caagagtctgattgcgcca 25097  T
Q  211 gaagatcgtgattaggtag 229  Q
      |||||||||||||||||    
T  25098 atagatcgtgattaggtag 25116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 137
Target Start/End: Original strand, 63968 - 64095
Alignment:
Q  9 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 108  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| | || |||||||||||||    
T  63968 cagagacacaaggagggtggagcacgttcggtataaatgtccaacgctcgacaaggg-agagtatcattcagttgagtggaatcaatgaacgacgaaaac 64066  T
Q  109 gtgaagaacatgttttgggagcacaacat 137  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||    
T  64067 gtgacgagcatgttttgggagcacaacat 64095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 166 - 229
Target Start/End: Original strand, 64098 - 64161
Alignment:
Q  166 ttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtag 229  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  64098 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccaccagaagatcgtcattaggtag 64161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 121 - 229
Target Start/End: Original strand, 5453 - 5561
Alignment:
Q  121 ttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtg 220  Q
    |||||| |||||||||||||||  |||||| |||||   || |||||| |||||||  ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |    
T  5453 ttttggcagcacaacatgttcccatggatcaatatgtttgtcacgttgttgagatcgcctgaagatattctcaacagtttgatttcgccagaagatcgag 5552  T
Q  221 attaggtag 229  Q
    |||||||||    
T  5553 attaggtag 5561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 128 - 213
Target Start/End: Original strand, 36775 - 36860
Alignment:
Q  128 agcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaa 213  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||  || |||||| |||||||  ||||||||||| |||| ||| | ||||||| ||||    
T  36775 agcacatcatgttcccgtggatcgatatgcttgtcacgttgttgagatcgcctgaagatattctcaagagtttaattccgctagaa 36860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 104
Target Start/End: Original strand, 36649 - 36742
Alignment:
Q  11 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacga 104  Q
    |||||||| |||  |||||||||||| ||||| ||||||| ||| | ||  |||||||| || |||||| ||||  |||||||| |||||||||    
T  36649 gagacacatggaacgtggaatacgtttggtatgaacgtcccacgtttgatgaggggagaataacattcagttggccggagttaacgaacgacga 36742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University