View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF15985_low_2 (Length: 591)

Name: NF15985_low_2
Description: NF15985
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF15985_low_2
NF15985_low_2
[»] chr5 (95 HSPs)
chr5 (17-510)||(26884710-26885204)
chr5 (215-509)||(38684932-38685227)
chr5 (192-509)||(3301786-3302104)
chr5 (185-509)||(4496317-4496644)
chr5 (187-509)||(12492406-12492732)
chr5 (185-509)||(16347402-16347725)
chr5 (188-509)||(28976881-28977201)
chr5 (185-505)||(24178445-24178766)
chr5 (241-509)||(1287601-1287869)
chr5 (241-509)||(14665706-14665972)
chr5 (185-509)||(10639232-10639562)
chr5 (185-509)||(2075495-2075821)
chr5 (252-509)||(20456776-20457033)
chr5 (185-509)||(1275200-1275524)
chr5 (282-509)||(38501440-38501668)
chr5 (308-509)||(2915518-2915719)
chr5 (342-510)||(14911264-14911433)
chr5 (339-509)||(13561408-13561579)
chr5 (338-507)||(27970-28140)
chr5 (250-493)||(6888994-6889237)
chr5 (241-508)||(34273019-34273272)
chr5 (234-509)||(6859366-6859641)
chr5 (406-509)||(418056-418158)
chr5 (444-510)||(7640528-7640594)
chr5 (278-467)||(17340500-17340690)
chr5 (373-509)||(9235172-9235306)
chr5 (399-507)||(11675680-11675788)
chr5 (268-503)||(29938133-29938364)
chr5 (241-509)||(79505-79773)
chr5 (233-364)||(14749291-14749421)
chr5 (381-509)||(29816513-29816642)
chr5 (275-509)||(7359283-7359516)
chr5 (268-441)||(21952375-21952548)
chr5 (232-385)||(36215481-36215633)
chr5 (421-509)||(5558314-5558401)
chr5 (252-505)||(43475243-43475495)
chr5 (280-353)||(23979976-23980049)
chr5 (241-353)||(43558006-43558117)
chr5 (415-509)||(14667938-14668031)
chr5 (277-379)||(15986890-15986992)
chr5 (270-364)||(21093772-21093866)
chr5 (431-509)||(30213758-30213835)
chr5 (250-364)||(31636088-31636201)
chr5 (358-472)||(14725626-14725741)
chr5 (405-509)||(16913904-16914008)
chr5 (268-357)||(42199304-42199393)
chr5 (268-417)||(1525662-1525813)
chr5 (334-507)||(6788151-6788325)
chr5 (287-387)||(11675547-11675647)
chr5 (429-509)||(32442147-32442226)
chr5 (269-364)||(2712963-2713058)
chr5 (446-509)||(18855804-18855867)
chr5 (399-501)||(2090564-2090665)
chr5 (455-509)||(38132542-38132596)
chr5 (250-327)||(15168793-15168869)
chr5 (268-509)||(30588467-30588707)
chr5 (250-319)||(33667217-33667285)
chr5 (411-509)||(41894229-41894333)
chr5 (415-506)||(683726-683816)
chr5 (234-434)||(15489588-15489789)
chr5 (250-327)||(18351112-18351189)
chr5 (463-509)||(27386554-27386600)
chr5 (460-509)||(408516-408565)
chr5 (287-509)||(7678520-7678737)
chr5 (299-400)||(27799892-27799993)
chr5 (456-509)||(42576217-42576270)
chr5 (445-509)||(28411872-28411936)
chr5 (477-509)||(28985311-28985343)
chr5 (268-465)||(32516574-32516771)
chr5 (458-509)||(3442893-3442944)
chr5 (454-509)||(5860039-5860094)
chr5 (405-504)||(20367050-20367148)
chr5 (477-508)||(36551374-36551405)
chr5 (446-509)||(38830517-38830579)
chr5 (457-508)||(41108752-41108803)
chr5 (446-509)||(43557855-43557918)
chr5 (192-301)||(27836-27944)
chr5 (269-327)||(4026540-4026598)
chr5 (334-400)||(8082086-8082152)
chr5 (250-348)||(10082923-10083020)
chr5 (334-509)||(12576882-12577058)
chr5 (250-400)||(28676596-28676745)
chr5 (454-508)||(39012783-39012837)
chr5 (459-509)||(42272687-42272737)
chr5 (477-510)||(5987744-5987777)
chr5 (304-353)||(9235118-9235167)
chr5 (456-509)||(11069184-11069237)
chr5 (343-465)||(15168864-15168987)
chr5 (185-373)||(31906596-31906784)
chr5 (472-509)||(39322101-39322138)
chr5 (477-509)||(9234114-9234146)
chr5 (454-506)||(28276443-28276495)
chr5 (477-509)||(30639738-30639770)
chr5 (290-350)||(33158013-33158073)
chr5 (445-509)||(41833679-41833743)
[»] chr4 (129 HSPs)
chr4 (185-509)||(31959836-31960161)
chr4 (188-509)||(52569537-52569859)
chr4 (241-509)||(26037527-26037795)
chr4 (185-509)||(4440790-4441113)
chr4 (185-509)||(436164-436489)
chr4 (232-509)||(39708416-39708693)
chr4 (185-509)||(48174115-48174440)
chr4 (185-505)||(1777043-1777362)
chr4 (185-509)||(56375225-56375550)
chr4 (185-510)||(33227144-33227470)
chr4 (189-509)||(48622565-48622884)
chr4 (269-510)||(32479057-32479299)
chr4 (185-509)||(53707729-53708054)
chr4 (241-509)||(27450202-27450469)
chr4 (185-509)||(43433853-43434184)
chr4 (179-509)||(37797781-37798111)
chr4 (193-509)||(39100558-39100872)
chr4 (185-509)||(33190870-33191195)
chr4 (210-508)||(1793420-1793721)
chr4 (185-509)||(23906319-23906648)
chr4 (181-509)||(28236116-28236442)
chr4 (196-499)||(46582857-46583160)
chr4 (281-509)||(53518346-53518571)
chr4 (185-509)||(51421667-51421990)
chr4 (188-509)||(45204862-45205192)
chr4 (192-501)||(27983142-27983445)
chr4 (185-505)||(50286906-50287217)
chr4 (239-509)||(20192023-20192292)
chr4 (185-509)||(47265217-47265549)
chr4 (274-509)||(8286455-8286699)
chr4 (268-509)||(20601674-20601910)
chr4 (336-509)||(35690357-35690531)
chr4 (343-509)||(21236951-21237118)
chr4 (190-505)||(1211418-1211732)
chr4 (253-462)||(7092290-7092498)
chr4 (185-293)||(12494685-12494793)
chr4 (284-466)||(20821073-20821255)
chr4 (250-467)||(41009414-41009631)
chr4 (308-509)||(28351617-28351819)
chr4 (232-400)||(20591437-20591599)
chr4 (250-505)||(37773477-37773732)
chr4 (337-509)||(31459093-31459254)
chr4 (378-509)||(6957726-6957858)
chr4 (190-488)||(16002867-16003165)
chr4 (304-447)||(50679559-50679703)
chr4 (405-509)||(21528445-21528548)
chr4 (400-508)||(31043224-31043331)
chr4 (206-442)||(42639108-42639346)
chr4 (409-509)||(55007907-55008006)
chr4 (241-380)||(35555799-35555937)
chr4 (378-509)||(7947065-7947197)
chr4 (241-359)||(28497482-28497598)
chr4 (185-318)||(31458963-31459098)
chr4 (408-505)||(34208295-34208390)
chr4 (275-508)||(55579057-55579290)
chr4 (426-509)||(19969359-19969441)
chr4 (373-509)||(53540413-53540550)
chr4 (378-509)||(12494791-12494923)
chr4 (448-510)||(40018210-40018272)
chr4 (233-327)||(44047553-44047646)
chr4 (268-349)||(50662405-50662487)
chr4 (420-509)||(19154885-19154973)
chr4 (189-357)||(54470146-54470314)
chr4 (296-509)||(34233046-34233260)
chr4 (268-363)||(2589008-2589103)
chr4 (454-509)||(4548227-4548282)
chr4 (406-509)||(25574982-25575084)
chr4 (458-509)||(49939756-49939807)
chr4 (399-505)||(28550481-28550586)
chr4 (206-358)||(51252635-51252785)
chr4 (287-509)||(13805287-13805510)
chr4 (456-509)||(19061957-19062010)
chr4 (269-358)||(25257755-25257844)
chr4 (280-361)||(38570918-38570999)
chr4 (408-509)||(55388233-55388333)
chr4 (405-509)||(26024872-26024975)
chr4 (410-498)||(28486083-28486170)
chr4 (453-509)||(45209227-45209283)
chr4 (280-364)||(47611757-47611841)
chr4 (410-509)||(28467600-28467698)
chr4 (454-509)||(29399009-29399064)
chr4 (405-491)||(30621241-30621326)
chr4 (399-509)||(37488242-37488351)
chr4 (281-327)||(45176037-45176083)
chr4 (374-445)||(55809075-55809148)
chr4 (456-509)||(7544553-7544605)
chr4 (446-510)||(9977123-9977189)
chr4 (472-509)||(15661894-15661931)
chr4 (456-505)||(25427888-25427937)
chr4 (472-509)||(30634128-30634165)
chr4 (233-349)||(50680723-50680839)
chr4 (449-509)||(1965655-1965715)
chr4 (373-509)||(2557693-2557831)
chr4 (405-509)||(5306453-5306556)
chr4 (469-509)||(15665321-15665361)
chr4 (268-364)||(26356637-26356733)
chr4 (268-509)||(31897450-31897692)
chr4 (296-509)||(31961288-31961502)
chr4 (185-264)||(35690239-35690319)
chr4 (457-509)||(36255544-36255596)
chr4 (268-356)||(45185203-45185291)
chr4 (477-509)||(50862859-50862891)
chr4 (241-364)||(10209026-10209148)
chr4 (446-501)||(12443292-12443347)
chr4 (281-348)||(17666227-17666294)
chr4 (233-327)||(31339521-31339613)
chr4 (458-509)||(32633428-32633479)
chr4 (277-417)||(46372051-46372193)
chr4 (334-509)||(47147457-47147631)
chr4 (478-509)||(50238637-50238668)
chr4 (478-509)||(50238723-50238754)
chr4 (446-509)||(51811301-51811363)
chr4 (405-508)||(56439594-56439696)
chr4 (304-366)||(20131165-20131227)
chr4 (268-358)||(21879327-21879417)
chr4 (443-509)||(36799679-36799745)
chr4 (268-358)||(46715546-46715636)
chr4 (250-327)||(30621409-30621485)
chr4 (448-509)||(40932946-40933007)
chr4 (477-510)||(50967049-50967082)
chr4 (420-509)||(54935321-54935409)
chr4 (445-509)||(6958260-6958324)
chr4 (268-364)||(29398836-29398932)
chr4 (431-487)||(41729494-41729549)
chr4 (481-509)||(46153940-46153968)
chr4 (479-507)||(46236719-46236747)
chr4 (233-309)||(49987412-49987487)
chr4 (449-509)||(51176774-51176834)
chr4 (269-317)||(56225085-56225133)
[»] chr1 (122 HSPs)
chr1 (185-509)||(1210680-1211005)
chr1 (185-505)||(34792375-34792696)
chr1 (185-509)||(30202152-30202477)
chr1 (185-509)||(696204-696530)
chr1 (185-509)||(49347415-49347740)
chr1 (185-507)||(8671855-8672176)
chr1 (185-509)||(32082778-32083092)
chr1 (192-509)||(4001477-4001795)
chr1 (185-509)||(51601993-51602316)
chr1 (192-488)||(32230997-32231294)
chr1 (189-509)||(51440787-51441108)
chr1 (181-509)||(22090025-22090356)
chr1 (265-509)||(25979253-25979498)
chr1 (185-505)||(9592669-9592990)
chr1 (241-509)||(4029114-4029382)
chr1 (185-509)||(15085869-15086182)
chr1 (208-509)||(38807693-38807999)
chr1 (188-507)||(8391710-8392030)
chr1 (188-509)||(9599416-9599738)
chr1 (185-509)||(43240401-43240728)
chr1 (189-509)||(37462898-37463214)
chr1 (188-500)||(9509256-9509569)
chr1 (269-509)||(32404548-32404789)
chr1 (332-499)||(39318211-39318379)
chr1 (188-397)||(27847940-27848148)
chr1 (280-509)||(52561611-52561841)
chr1 (214-509)||(39140484-39140775)
chr1 (334-509)||(37311777-37311953)
chr1 (181-509)||(18469104-18469431)
chr1 (268-442)||(478698-478872)
chr1 (250-507)||(48431423-48431687)
chr1 (241-509)||(2544591-2544853)
chr1 (280-509)||(8796239-8796469)
chr1 (207-509)||(36623907-36624191)
chr1 (370-509)||(52921200-52921340)
chr1 (401-509)||(19936613-19936720)
chr1 (252-509)||(40416374-40416631)
chr1 (399-509)||(41560380-41560489)
chr1 (399-509)||(52532638-52532747)
chr1 (206-356)||(43423675-43423825)
chr1 (252-508)||(5338727-5338972)
chr1 (419-509)||(4707243-4707331)
chr1 (399-508)||(29128934-29129043)
chr1 (268-509)||(38868900-38869142)
chr1 (446-509)||(28090716-28090779)
chr1 (454-509)||(44941798-44941853)
chr1 (443-509)||(40568432-40568498)
chr1 (412-509)||(28511823-28511919)
chr1 (401-509)||(4590554-4590661)
chr1 (234-509)||(35828584-35828847)
chr1 (399-506)||(12930336-12930442)
chr1 (270-430)||(34827204-34827366)
chr1 (446-508)||(21769734-21769796)
chr1 (251-509)||(3818878-3819136)
chr1 (420-509)||(24020289-24020377)
chr1 (399-512)||(27520226-27520338)
chr1 (456-509)||(29577459-29577512)
chr1 (443-508)||(50257764-50257829)
chr1 (454-509)||(2429651-2429706)
chr1 (280-359)||(16272994-16273073)
chr1 (454-509)||(17269011-17269066)
chr1 (446-509)||(22175342-22175405)
chr1 (446-509)||(25715348-25715411)
chr1 (406-509)||(43375620-43375722)
chr1 (408-491)||(52900682-52900764)
chr1 (407-505)||(10200332-10200429)
chr1 (455-509)||(28533673-28533727)
chr1 (447-509)||(45510855-45510917)
chr1 (268-358)||(46388394-46388484)
chr1 (405-510)||(4415506-4415610)
chr1 (456-509)||(27704157-27704210)
chr1 (456-509)||(44751691-44751744)
chr1 (429-509)||(19908057-19908136)
chr1 (446-498)||(27072520-27072572)
chr1 (429-509)||(34444537-34444616)
chr1 (404-508)||(48865730-48865833)
chr1 (241-509)||(1661422-1661679)
chr1 (280-359)||(9002382-9002461)
chr1 (251-350)||(27637815-27637913)
chr1 (419-509)||(32079199-32079286)
chr1 (454-509)||(37294130-37294185)
chr1 (285-509)||(42501143-42501368)
chr1 (416-509)||(46423238-46423327)
chr1 (429-491)||(6084156-6084217)
chr1 (368-467)||(8628148-8628248)
chr1 (250-356)||(13827746-13827851)
chr1 (443-509)||(50846756-50846822)
chr1 (241-338)||(52073656-52073753)
chr1 (446-503)||(1290059-1290116)
chr1 (268-357)||(14226004-14226093)
chr1 (275-324)||(16822230-16822279)
chr1 (472-509)||(26299291-26299328)
chr1 (335-509)||(29577165-29577339)
chr1 (296-442)||(30834065-30834213)
chr1 (456-509)||(42337763-42337816)
chr1 (297-358)||(46394867-46394928)
chr1 (449-509)||(26113461-26113521)
chr1 (250-358)||(37263332-37263439)
chr1 (477-509)||(43481820-43481852)
chr1 (193-264)||(52561878-52561950)
chr1 (399-494)||(52739547-52739642)
chr1 (478-509)||(4318867-4318898)
chr1 (287-358)||(10569241-10569312)
chr1 (456-507)||(32112013-32112064)
chr1 (454-509)||(39123391-39123445)
chr1 (478-509)||(41165511-41165542)
chr1 (254-324)||(13827925-13827994)
chr1 (459-509)||(38877365-38877415)
chr1 (235-353)||(51812511-51812628)
chr1 (298-364)||(52633341-52633407)
chr1 (446-491)||(19822085-19822130)
chr1 (242-307)||(19936507-19936571)
chr1 (481-509)||(7082536-7082564)
chr1 (457-509)||(7133324-7133376)
chr1 (477-509)||(7210949-7210981)
chr1 (445-509)||(29808052-29808116)
chr1 (291-385)||(39894823-39894914)
chr1 (477-509)||(42539234-42539266)
chr1 (276-316)||(44905548-44905588)
chr1 (188-224)||(48065359-48065395)
chr1 (449-509)||(52073070-52073130)
chr1 (445-509)||(52981429-52981493)
[»] chr7 (124 HSPs)
chr7 (188-509)||(12841297-12841619)
chr7 (185-509)||(43281611-43281934)
chr7 (185-509)||(11593895-11594220)
chr7 (185-509)||(35906223-35906548)
chr7 (187-509)||(49029213-49029536)
chr7 (185-509)||(37617879-37618205)
chr7 (181-509)||(39906394-39906721)
chr7 (185-509)||(45836504-45836827)
chr7 (185-509)||(34869355-34869680)
chr7 (190-509)||(44855196-44855514)
chr7 (241-509)||(2885744-2886012)
chr7 (185-508)||(46355879-46356203)
chr7 (185-475)||(13859064-13859355)
chr7 (215-509)||(29650349-29650644)
chr7 (190-509)||(43491248-43491568)
chr7 (185-400)||(31005158-31005373)
chr7 (189-505)||(33349832-33350149)
chr7 (215-509)||(6374833-6375128)
chr7 (250-509)||(31682624-31682883)
chr7 (185-509)||(36651929-36652252)
chr7 (185-509)||(38606940-38607252)
chr7 (252-509)||(22349623-22349880)
chr7 (188-467)||(36136702-36136982)
chr7 (185-400)||(33072889-33073102)
chr7 (179-508)||(8492259-8492586)
chr7 (275-509)||(28627955-28628190)
chr7 (185-447)||(35559076-35559341)
chr7 (268-508)||(15682192-15682433)
chr7 (370-509)||(40979950-40980090)
chr7 (304-509)||(7273154-7273360)
chr7 (306-509)||(1011103-1011306)
chr7 (250-489)||(36869286-36869525)
chr7 (185-397)||(23404353-23404564)
chr7 (188-488)||(47848612-47848912)
chr7 (296-509)||(32631622-32631824)
chr7 (323-509)||(31681042-31681226)
chr7 (190-362)||(7272979-7273151)
chr7 (372-509)||(9210726-9210864)
chr7 (268-509)||(38135235-38135476)
chr7 (209-350)||(46014363-46014503)
chr7 (399-507)||(14057629-14057736)
chr7 (399-507)||(14367657-14367764)
chr7 (405-509)||(27648937-27649040)
chr7 (243-509)||(36101799-36102053)
chr7 (373-509)||(45601599-45601736)
chr7 (304-503)||(1569070-1569270)
chr7 (214-364)||(25579245-25579394)
chr7 (250-508)||(26741917-26742177)
chr7 (273-400)||(6420622-6420749)
chr7 (370-509)||(38900077-38900216)
chr7 (436-509)||(28208350-28208422)
chr7 (405-509)||(28355322-28355426)
chr7 (185-364)||(36514375-36514552)
chr7 (306-447)||(1531444-1531587)
chr7 (308-497)||(24598221-24598411)
chr7 (409-505)||(40415168-40415263)
chr7 (399-509)||(42187592-42187701)
chr7 (401-508)||(27893586-27893692)
chr7 (267-358)||(30144792-30144883)
chr7 (399-494)||(36239833-36239927)
chr7 (190-292)||(32630535-32630636)
chr7 (431-509)||(34035176-34035253)
chr7 (241-357)||(19262609-19262723)
chr7 (189-359)||(39811896-39812066)
chr7 (233-348)||(42187454-42187568)
chr7 (405-506)||(37976392-37976492)
chr7 (420-509)||(42969870-42969958)
chr7 (241-378)||(43282400-43282535)
chr7 (447-507)||(33103124-33103184)
chr7 (426-506)||(47852265-47852344)
chr7 (449-509)||(48515475-48515535)
chr7 (401-505)||(48919265-48919368)
chr7 (280-327)||(9797909-9797956)
chr7 (446-509)||(30814147-30814210)
chr7 (275-354)||(35713720-35713799)
chr7 (285-364)||(48202870-48202949)
chr7 (406-508)||(8519069-8519170)
chr7 (399-509)||(40391845-40391954)
chr7 (241-318)||(27021906-27021982)
chr7 (405-497)||(21078074-21078165)
chr7 (447-507)||(25891086-25891146)
chr7 (446-510)||(34341416-34341480)
chr7 (454-509)||(4604752-4604807)
chr7 (241-316)||(7189442-7189516)
chr7 (269-364)||(18605314-18605409)
chr7 (269-364)||(18637581-18637676)
chr7 (269-364)||(18651015-18651110)
chr7 (458-509)||(31869124-31869175)
chr7 (405-488)||(35922410-35922492)
chr7 (446-497)||(44951352-44951403)
chr7 (252-350)||(12966025-12966122)
chr7 (304-382)||(26925264-26925342)
chr7 (268-358)||(28020982-28021072)
chr7 (399-509)||(34745898-34746007)
chr7 (455-509)||(40149035-40149089)
chr7 (446-507)||(24177651-24177711)
chr7 (472-509)||(28708604-28708641)
chr7 (250-319)||(40169650-40169718)
chr7 (477-509)||(6263487-6263519)
chr7 (461-509)||(27021747-27021795)
chr7 (446-509)||(33732031-33732092)
chr7 (446-506)||(34926547-34926607)
chr7 (399-494)||(44401164-44401256)
chr7 (399-507)||(47796176-47796283)
chr7 (241-364)||(5335912-5336034)
chr7 (454-509)||(24376045-24376100)
chr7 (401-500)||(28541975-28542073)
chr7 (478-509)||(31005434-31005465)
chr7 (397-508)||(40138971-40139081)
chr7 (478-509)||(40630663-40630694)
chr7 (241-356)||(45558354-45558468)
chr7 (446-509)||(47652744-47652807)
chr7 (250-320)||(38920795-38920864)
chr7 (454-504)||(45054330-45054380)
chr7 (469-506)||(17907749-17907786)
chr7 (477-506)||(20525077-20525106)
chr7 (472-509)||(25579125-25579162)
chr7 (448-509)||(48515370-48515431)
chr7 (268-324)||(7220762-7220818)
chr7 (290-357)||(28858084-28858152)
chr7 (477-509)||(32789959-32789991)
chr7 (458-502)||(34029705-34029749)
chr7 (397-505)||(40169804-40169911)
chr7 (481-509)||(41483719-41483747)
[»] chr8 (91 HSPs)
chr8 (185-509)||(36565263-36565588)
chr8 (185-509)||(42854026-42854351)
chr8 (188-509)||(36545085-36545409)
chr8 (216-509)||(11523745-11524040)
chr8 (185-509)||(36394970-36395297)
chr8 (251-509)||(12491160-12491418)
chr8 (185-509)||(45419174-45419495)
chr8 (214-509)||(18125139-18125431)
chr8 (188-509)||(40813260-40813584)
chr8 (185-475)||(39946792-39947083)
chr8 (214-509)||(2796521-2796813)
chr8 (197-509)||(21121105-21121405)
chr8 (241-508)||(8932694-8932962)
chr8 (296-509)||(29520696-29520909)
chr8 (185-505)||(37077700-37078005)
chr8 (334-505)||(42469753-42469925)
chr8 (283-498)||(43904698-43904914)
chr8 (275-491)||(30559718-30559935)
chr8 (296-508)||(35914624-35914837)
chr8 (268-509)||(32930979-32931220)
chr8 (270-500)||(26904938-26905168)
chr8 (405-509)||(490492-490595)
chr8 (286-509)||(42584407-42584618)
chr8 (214-505)||(8879472-8879758)
chr8 (405-509)||(45041338-45041440)
chr8 (185-358)||(32043525-32043698)
chr8 (241-507)||(29700268-29700534)
chr8 (352-509)||(2027632-2027790)
chr8 (281-467)||(9904946-9905132)
chr8 (418-509)||(44529395-44529485)
chr8 (275-499)||(13589511-13589729)
chr8 (399-500)||(14459046-14459146)
chr8 (250-467)||(45512558-45512776)
chr8 (405-509)||(14742104-14742204)
chr8 (241-315)||(18752093-18752165)
chr8 (372-511)||(28169514-28169654)
chr8 (277-492)||(29735834-29736050)
chr8 (206-320)||(12796912-12797024)
chr8 (405-509)||(25473425-25473528)
chr8 (405-509)||(35362672-35362775)
chr8 (421-509)||(44047554-44047641)
chr8 (415-510)||(21425213-21425307)
chr8 (459-509)||(1928609-1928659)
chr8 (240-346)||(6510614-6510719)
chr8 (399-497)||(17491688-17491785)
chr8 (446-508)||(23492231-23492293)
chr8 (455-509)||(27556324-27556378)
chr8 (350-508)||(2216388-2216545)
chr8 (455-508)||(35646953-35647006)
chr8 (251-364)||(36143367-36143479)
chr8 (308-510)||(12025847-12026041)
chr8 (286-350)||(30748493-30748557)
chr8 (268-509)||(35643630-35643865)
chr8 (446-510)||(36069799-36069863)
chr8 (268-356)||(41971954-41972042)
chr8 (457-509)||(44699674-44699726)
chr8 (308-492)||(5908704-5908889)
chr8 (297-356)||(18742198-18742257)
chr8 (297-356)||(18747162-18747221)
chr8 (419-510)||(25300270-25300360)
chr8 (454-509)||(30689940-30689995)
chr8 (189-327)||(2518597-2518734)
chr8 (407-509)||(3802032-3802133)
chr8 (443-509)||(14903755-14903821)
chr8 (446-507)||(2518422-2518483)
chr8 (250-327)||(9695632-9695708)
chr8 (410-507)||(15215436-15215532)
chr8 (189-316)||(13171865-13171992)
chr8 (268-364)||(16917202-16917297)
chr8 (457-509)||(32276893-32276945)
chr8 (443-507)||(36143535-36143599)
chr8 (268-354)||(38689556-38689646)
chr8 (446-509)||(16035749-16035812)
chr8 (455-509)||(1313770-1313824)
chr8 (351-467)||(3464235-3464349)
chr8 (446-496)||(8255568-8255618)
chr8 (296-467)||(10079971-10080143)
chr8 (394-443)||(29717266-29717316)
chr8 (454-509)||(41212066-41212123)
chr8 (452-509)||(5127324-5127381)
chr8 (401-434)||(6483448-6483481)
chr8 (460-509)||(18741843-18741892)
chr8 (460-509)||(18746807-18746856)
chr8 (436-493)||(31716008-31716064)
chr8 (250-311)||(41444547-41444607)
chr8 (477-509)||(1335554-1335586)
chr8 (268-364)||(10824332-10824428)
chr8 (477-509)||(35324001-35324033)
chr8 (477-509)||(41031442-41031474)
chr8 (477-509)||(41031548-41031580)
chr8 (477-509)||(45512466-45512498)
[»] chr3 (101 HSPs)
chr3 (185-509)||(52138735-52139060)
chr3 (185-509)||(22008-22332)
chr3 (185-509)||(54128313-54128639)
chr3 (232-498)||(35033129-35033395)
chr3 (283-509)||(48508268-48508495)
chr3 (185-505)||(54278955-54279276)
chr3 (185-509)||(5168763-5169092)
chr3 (185-508)||(28245372-28245696)
chr3 (185-509)||(47233618-47233943)
chr3 (206-509)||(45289113-45289420)
chr3 (185-509)||(51447739-51448056)
chr3 (185-508)||(53519521-53519839)
chr3 (250-509)||(19676103-19676361)
chr3 (268-499)||(39235156-39235387)
chr3 (250-509)||(50960659-50960914)
chr3 (253-489)||(52678892-52679124)
chr3 (185-509)||(25191314-25191637)
chr3 (251-503)||(38430850-38431107)
chr3 (241-399)||(38060423-38060580)
chr3 (268-504)||(48953446-48953686)
chr3 (188-509)||(19736934-19737243)
chr3 (188-509)||(19757837-19758146)
chr3 (189-509)||(49503590-49503897)
chr3 (185-509)||(48734169-48734480)
chr3 (269-470)||(30294182-30294387)
chr3 (253-506)||(42510041-42510292)
chr3 (189-400)||(33272155-33272371)
chr3 (275-442)||(19162675-19162842)
chr3 (241-507)||(38850112-38850379)
chr3 (197-509)||(39600703-39601016)
chr3 (250-509)||(43694793-43695046)
chr3 (370-509)||(12096727-12096867)
chr3 (399-504)||(49042087-49042192)
chr3 (241-503)||(54365003-54365266)
chr3 (188-467)||(27917510-27917788)
chr3 (188-447)||(3186707-3186967)
chr3 (185-507)||(26490252-26490573)
chr3 (400-509)||(15296059-15296167)
chr3 (211-509)||(54424981-54425292)
chr3 (404-503)||(36304122-36304220)
chr3 (410-509)||(52156106-52156204)
chr3 (431-509)||(38060897-38060974)
chr3 (411-508)||(40991594-40991690)
chr3 (334-511)||(23534590-23534768)
chr3 (405-509)||(53262298-53262401)
chr3 (401-509)||(29601045-29601152)
chr3 (409-509)||(40116360-40116459)
chr3 (454-509)||(46148233-46148288)
chr3 (399-509)||(45486871-45486983)
chr3 (373-502)||(49841741-49841869)
chr3 (417-509)||(311331-311422)
chr3 (296-508)||(33755367-33755578)
chr3 (449-509)||(40273227-40273287)
chr3 (446-509)||(24541354-24541417)
chr3 (426-509)||(47555354-47555436)
chr3 (463-509)||(41529975-41530021)
chr3 (185-400)||(45728081-45728300)
chr3 (443-509)||(50249571-50249637)
chr3 (278-359)||(3870617-3870698)
chr3 (456-505)||(7895906-7895955)
chr3 (268-357)||(21200566-21200655)
chr3 (449-509)||(31566183-31566243)
chr3 (298-358)||(33307176-33307236)
chr3 (185-319)||(36820174-36820306)
chr3 (454-509)||(48532162-48532218)
chr3 (454-509)||(2133634-2133689)
chr3 (458-509)||(24778631-24778682)
chr3 (296-387)||(50249433-50249524)
chr3 (446-509)||(52927870-52927933)
chr3 (241-327)||(3987039-3987124)
chr3 (404-509)||(36049326-36049428)
chr3 (399-509)||(40116490-40116599)
chr3 (188-324)||(344919-345055)
chr3 (446-507)||(4472411-4472472)
chr3 (268-510)||(37351425-37351668)
chr3 (428-509)||(40106642-40106722)
chr3 (268-364)||(11581462-11581558)
chr3 (454-510)||(30797843-30797899)
chr3 (401-465)||(44571580-44571643)
chr3 (478-509)||(7278693-7278724)
chr3 (240-319)||(31453151-31453230)
chr3 (458-509)||(31454247-31454298)
chr3 (477-508)||(32170633-32170664)
chr3 (299-358)||(36304027-36304086)
chr3 (454-509)||(37083314-37083369)
chr3 (446-509)||(39208805-39208868)
chr3 (348-485)||(41482183-41482323)
chr3 (280-359)||(42026709-42026788)
chr3 (479-509)||(659755-659785)
chr3 (478-508)||(21862764-21862794)
chr3 (250-364)||(41842679-41842792)
chr3 (268-358)||(44443378-44443468)
chr3 (459-509)||(45374499-45374549)
chr3 (477-507)||(49888415-49888445)
chr3 (448-509)||(14415282-14415342)
chr3 (446-511)||(41971290-41971355)
chr3 (436-509)||(49045023-49045095)
chr3 (472-509)||(52882684-52882721)
chr3 (405-509)||(29475843-29475946)
chr3 (477-509)||(31146927-31146959)
chr3 (477-509)||(34253688-34253720)
[»] chr2 (103 HSPs)
chr2 (185-508)||(38429819-38430143)
chr2 (190-509)||(12734641-12734960)
chr2 (188-509)||(8180718-8181040)
chr2 (185-507)||(36183386-36183709)
chr2 (185-509)||(41763065-41763388)
chr2 (241-508)||(2610580-2610847)
chr2 (185-510)||(11992129-11992453)
chr2 (241-509)||(25834673-25834938)
chr2 (185-507)||(3866007-3866330)
chr2 (185-509)||(38452708-38453036)
chr2 (192-504)||(41197254-41197568)
chr2 (185-509)||(3243675-3243998)
chr2 (185-509)||(45367647-45367971)
chr2 (271-509)||(451670-451909)
chr2 (296-509)||(7326182-7326396)
chr2 (241-509)||(4807588-4807855)
chr2 (189-509)||(38434890-38435212)
chr2 (185-505)||(23997552-23997858)
chr2 (241-509)||(18424400-18424667)
chr2 (334-509)||(28508762-28508938)
chr2 (268-505)||(24583657-24583896)
chr2 (234-507)||(43751971-43752244)
chr2 (250-509)||(18958908-18959171)
chr2 (250-509)||(12141545-12141804)
chr2 (271-510)||(6237774-6238014)
chr2 (374-509)||(43573152-43573287)
chr2 (354-507)||(31959625-31959779)
chr2 (399-509)||(9496017-9496126)
chr2 (188-509)||(9556391-9556712)
chr2 (307-492)||(39029638-39029824)
chr2 (369-509)||(45543095-45543235)
chr2 (342-509)||(35755267-35755439)
chr2 (321-509)||(12882067-12882251)
chr2 (250-496)||(13149332-13149579)
chr2 (444-509)||(39709223-39709288)
chr2 (190-326)||(16097192-16097332)
chr2 (373-497)||(26670891-26671016)
chr2 (410-509)||(30306194-30306292)
chr2 (419-509)||(227360-227449)
chr2 (270-364)||(3481161-3481255)
chr2 (431-509)||(3635345-3635422)
chr2 (250-507)||(6218968-6219223)
chr2 (447-509)||(12520084-12520146)
chr2 (405-505)||(19336919-19337018)
chr2 (446-509)||(9531622-9531685)
chr2 (399-506)||(9996651-9996757)
chr2 (268-350)||(13240927-13241009)
chr2 (370-509)||(35643068-35643208)
chr2 (245-319)||(43238306-43238379)
chr2 (436-509)||(3720437-3720509)
chr2 (400-509)||(8197563-8197671)
chr2 (400-509)||(8202323-8202431)
chr2 (456-509)||(12474949-12475002)
chr2 (278-387)||(32443693-32443802)
chr2 (285-358)||(43260439-43260512)
chr2 (268-509)||(44437743-44437985)
chr2 (401-507)||(11412861-11412968)
chr2 (446-509)||(33504421-33504484)
chr2 (401-508)||(45077880-45077988)
chr2 (446-507)||(3481351-3481412)
chr2 (449-502)||(23915722-23915775)
chr2 (461-509)||(17670680-17670728)
chr2 (457-509)||(38328392-38328444)
chr2 (281-364)||(7825391-7825474)
chr2 (338-434)||(11744611-11744709)
chr2 (309-509)||(37470155-37470356)
chr2 (289-509)||(42543274-42543495)
chr2 (181-246)||(2610459-2610525)
chr2 (233-358)||(11412705-11412827)
chr2 (290-364)||(13592466-13592540)
chr2 (447-509)||(19863432-19863494)
chr2 (447-509)||(19867764-19867826)
chr2 (447-509)||(19872665-19872727)
chr2 (310-509)||(45436902-45437102)
chr2 (460-509)||(25384680-25384729)
chr2 (275-355)||(12026182-12026262)
chr2 (477-509)||(16521029-16521061)
chr2 (478-510)||(28367352-28367384)
chr2 (304-364)||(45077809-45077869)
chr2 (458-509)||(887087-887138)
chr2 (421-504)||(9394657-9394739)
chr2 (281-324)||(9578911-9578954)
chr2 (446-509)||(13443930-13443993)
chr2 (342-385)||(13444055-13444098)
chr2 (454-509)||(42549859-42549914)
chr2 (241-323)||(4598771-4598852)
chr2 (399-501)||(21834705-21834806)
chr2 (405-511)||(31254445-31254550)
chr2 (268-358)||(42092535-42092625)
chr2 (252-354)||(44411715-44411816)
chr2 (448-509)||(34931631-34931692)
chr2 (268-325)||(41858749-41858806)
chr2 (290-358)||(9647783-9647851)
chr2 (449-509)||(10516771-10516831)
chr2 (268-327)||(14197367-14197427)
chr2 (478-510)||(15775866-15775898)
chr2 (456-508)||(17429257-17429309)
chr2 (479-507)||(19225011-19225039)
chr2 (400-508)||(30743681-30743788)
chr2 (477-509)||(32443864-32443896)
chr2 (429-509)||(36366817-36366896)
chr2 (478-506)||(39592414-39592442)
chr2 (477-509)||(45483007-45483039)
[»] chr6 (56 HSPs)
chr6 (188-509)||(30031194-30031516)
chr6 (185-509)||(28085311-28085636)
chr6 (185-509)||(9593732-9594059)
chr6 (188-509)||(32755857-32756181)
chr6 (187-509)||(608096-608421)
chr6 (185-509)||(20427659-20427983)
chr6 (185-509)||(5258170-5258497)
chr6 (232-509)||(12890567-12890835)
chr6 (214-508)||(21351860-21352153)
chr6 (185-509)||(14030741-14031055)
chr6 (190-509)||(9706716-9707030)
chr6 (188-505)||(28026856-28027169)
chr6 (188-491)||(5631756-5632064)
chr6 (185-505)||(35043467-35043788)
chr6 (185-400)||(10099991-10100204)
chr6 (343-509)||(5095927-5096094)
chr6 (251-488)||(33496963-33497198)
chr6 (185-496)||(6055806-6056117)
chr6 (275-497)||(24665835-24666059)
chr6 (268-381)||(2689658-2689771)
chr6 (275-467)||(26291806-26291995)
chr6 (373-509)||(34527-34664)
chr6 (399-506)||(31818682-31818788)
chr6 (411-509)||(3206481-3206578)
chr6 (340-509)||(8364646-8364816)
chr6 (268-387)||(30679424-30679543)
chr6 (373-505)||(34143791-34143924)
chr6 (373-505)||(34156407-34156540)
chr6 (322-492)||(5080912-5081083)
chr6 (299-400)||(7133795-7133896)
chr6 (299-400)||(7136718-7136819)
chr6 (421-509)||(31819004-31819091)
chr6 (181-319)||(33083989-33084127)
chr6 (419-509)||(34934852-34934941)
chr6 (304-509)||(579472-579678)
chr6 (406-509)||(5897615-5897717)
chr6 (250-358)||(2079341-2079448)
chr6 (454-506)||(7337220-7337272)
chr6 (280-364)||(25494018-25494102)
chr6 (445-509)||(32068616-32068680)
chr6 (449-509)||(32080669-32080729)
chr6 (445-509)||(32097933-32097997)
chr6 (398-509)||(655416-655526)
chr6 (446-509)||(2079478-2079541)
chr6 (410-509)||(7492551-7492649)
chr6 (446-509)||(7513012-7513075)
chr6 (429-508)||(12133925-12134003)
chr6 (289-364)||(14389336-14389411)
chr6 (452-502)||(18130843-18130893)
chr6 (456-509)||(1615245-1615298)
chr6 (268-313)||(8364590-8364635)
chr6 (405-490)||(14389202-14389286)
chr6 (444-509)||(28891472-28891537)
chr6 (446-498)||(3210541-3210593)
chr6 (446-509)||(12119664-12119728)
chr6 (477-509)||(33730193-33730225)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (185-509)||(31403-31728)
scaffold0018 (241-364)||(44036-44158)
[»] scaffold0570 (1 HSPs)
scaffold0570 (207-509)||(970-1271)
[»] scaffold0024 (2 HSPs)
scaffold0024 (190-510)||(82661-82979)
scaffold0024 (446-507)||(48140-48201)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (268-509)||(86631-86873)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (322-509)||(4708-4896)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (185-500)||(4312-4619)
[»] scaffold0157 (2 HSPs)
scaffold0157 (188-293)||(25684-25789)
scaffold0157 (378-509)||(25554-25686)
[»] scaffold0041 (1 HSPs)
scaffold0041 (359-509)||(16687-16838)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (269-509)||(7460-7700)
[»] scaffold0199 (1 HSPs)
scaffold0199 (399-509)||(14734-14843)
[»] scaffold1318 (1 HSPs)
scaffold1318 (456-509)||(538-591)
[»] scaffold0168 (1 HSPs)
scaffold0168 (456-509)||(28911-28964)
[»] scaffold0113 (2 HSPs)
scaffold0113 (185-318)||(11810-11945)
scaffold0113 (298-507)||(11573-11781)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (400-509)||(160346-160454)
[»] scaffold0050 (1 HSPs)
scaffold0050 (373-509)||(58248-58385)
[»] scaffold0491 (2 HSPs)
scaffold0491 (297-356)||(4003-4062)
scaffold0491 (460-509)||(3648-3697)
[»] scaffold0245 (1 HSPs)
scaffold0245 (446-503)||(16464-16521)
[»] scaffold0392 (1 HSPs)
scaffold0392 (446-509)||(6794-6857)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (409-491)||(39480-39561)
[»] scaffold1259 (1 HSPs)
scaffold1259 (399-443)||(1606-1650)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 415; Significance: 0; HSPs: 95)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 415; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 26885204 - 26884710
Alignment:
Q  17 atgaattgtgctatctttgggttctgtcatacatttaaaataagtgagccttatgctccttgtgttggagccgtgtgttatgtcatcattttaccttttt 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26885204 atgaattgtgctatctttgggttctgtcatacatttcaaataagtgagtcttatgctccttgtgttggagccgtgggttatgtcatcattttaccttttt 26885105  T
Q  117 tagctcatctatcgtcaaaagatgatagtagcttttttccttcttctgggatttgtattttgatatgctgcgttggatgagtggtaaagctagacgggat 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26885104 tagctcatctatcgtcaaaagatgattggagcttttttccttcttcagggatttgtagtttgatatgttgcgttggatgagtggtaaaactagacgggat 26885005  T
Q  217 aggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagaga 315  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26885004 aggattaggaataacaccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagata 26884905  T
Q  316 agacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaactaagaaaaactattagg 415  Q
    ||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26884904 agatttgtagatgttgtcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggatgagctaggaaaactaagaaaaactattagg 26884805  T
Q  416 aaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgga 510  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26884804 aaagatttagaggttaatgggtcggatccaaaatatgatttatgatagaacactacgacgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgga 26884710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 215 - 509
Target Start/End: Original strand, 38684932 - 38685227
Alignment:
Q  215 ataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagaga 313  Q
    |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  38684932 ataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtag-aaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagaga 38685030  T
Q  314 gaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaacta--agaaaaactat 411  Q
    ||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||| |||| ||    
T  38685031 gaagacccgtagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccat 38685130  T
Q  412 taggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||| || |||||| |||| |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38685131 tagaaaggatttagaggtcaatgagttggatcc-aaatatggtttatgatagaacaatatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 38685227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 192 - 509
Target Start/End: Original strand, 3301786 - 3302104
Alignment:
Q  192 gatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggct 290  Q
    ||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  3301786 gatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgtcaccattagagagagagtgagggtagcccctatagtag-aaaagttggtagaaaataggct 3301884  T
Q  291 taggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagct 390  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||  | || |||||| |  |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||    
T  3301885 tagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagaatgaatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacct 3301984  T
Q  391 atgaaaac--taagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccat 488  Q
    | ||||||  | ||| |||| ||||  ||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  3301985 aagaaaaccattagagaaaccattataaaagatttagaggtcaatgagttggatcc-aaatatggtttttgatagaacactacggcgtcatttgatccat 3302083  T
Q  489 gtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  3302084 gtagccgaccccacttagtgg 3302104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 185 - 509
Target Start/End: Original strand, 4496317 - 4496644
Alignment:
Q  185 tgcgttggatgagtggtaaagctagacg--ggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtaga 281  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||   |||||||||||||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  4496317 tgcgttggatgagtggtaagactagacacaggataggattaggaatgacacctttagagagagagtgggggtagcacctatagtag-aaaagctggtaga 4496415  T
Q  282 aaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtaga 381  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||    
T  4496416 aaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtaga 4496515  T
Q  382 ggaagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaat 479  Q
    |||||| ||| ||||||||  ||| |||| ||||| || |||||| |||| |||| ||||||||| |||| || | ||||||||||||||| |||   ||    
T  4496516 ggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatcc-aaatttggtgtatgatagaacactatggcatcat 4496614  T
Q  480 ttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4496615 ttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 4496644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 187 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 12492732 - 12492406
Alignment:
Q  187 cgttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcaccta---tagcaggaaaagttggtagaa 282  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||   ||| || ||||||||||||||    
T  12492732 cgttggatgagtggtaagactagacaggataagattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctactatagtag-aaaagttggtagaa 12492634  T
Q  283 aataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagag 382  Q
    |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||    
T  12492633 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtgttaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 12492534  T
Q  383 gaagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatt 480  Q
    ||||| ||| ||||||||  ||| |||| ||||| || |||||| |||| |||| ||||||||| |||| || | ||||||||||||||| ||||  |||    
T  12492533 gaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatcc-aaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatt 12492435  T
Q  481 tgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12492434 tgatgcatgtagccgaccccacttagtgg 12492406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 185 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 16347725 - 16347402
Alignment:
Q  185 tgcgttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaat-aacccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaa 283  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||   ||| |||||  ||| || |||||||| |||||| | ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  16347725 tgcgttggatgagtggtaagactagacaatatatgattaaaaatgaaaccattagagagagagcgggggtagcacctatagtag-aaaagttggtagaaa 16347627  T
Q  284 ataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagagg 383  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||  | | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  16347626 ataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgcctttgcaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagagg 16347527  T
Q  384 aagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaattt 481  Q
    |||| ||| ||||||||  | | |||| ||||| ||||||||| |||| ||||  |||||| | ||||||| ||||||||||||||||  ||||  ||||    
T  16347526 aagacctaggaaaactattaaagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgatttggatac-aaatatggtttatgatagaacact--ggcgtcattt 16347430  T
Q  482 gatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||    
T  16347429 gatccatgtagccgaccctacttagtgg 16347402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 188 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 28977201 - 28976881
Alignment:
Q  188 gttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaata 286  Q
    ||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||| || ||||||||  ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  28977201 gttggatgagtggtaaaactagaaatgataggattaggaatgacaccattaga--gagagtgggggtagcacctatagtag-aaaagttggtagaaaata 28977105  T
Q  287 ggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaag 386  Q
    |||||||  ||||||  ||||||||||||||||  ||| ||||  | |||||||| |||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  28977104 ggcttagatggtttgtgcatgtagagagaagacccgtatatgccgtggtaagaagggtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaag 28977005  T
Q  387 agctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgat 484  Q
    | ||| ||||||||  ||| |||| ||||  || |||||| |||| |||| ||||||||| |||| || | ||||||||||||||| ||||  |||||||    
T  28977004 acctaggaaaactattagagaaaccattataaaggatttagaggtcaatgagttggatcc-aaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgat 28976906  T
Q  485 ccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  28976905 tcatgtagccgaccccacttagtgg 28976881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 185 - 505
Target Start/End: Original strand, 24178445 - 24178766
Alignment:
Q  185 tgcgttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaa 283  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||  |||||||||| |||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  24178445 tgcgttggatgagtggtaagactatacatgataggattaagaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtag-aaaagttggtagaaa 24178543  T
Q  284 ataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagagg 383  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  24178544 ataggcttagatggtttgggcatgtggagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagagg 24178643  T
Q  384 aagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaattt 481  Q
    |||| ||| ||||||||  ||| |||| ||||| || |||||| || | |||| |||||||||||| |  | | ||||||||||||||| |||   ||||    
T  24178644 aagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagagttcaatgagttggatccaaatttag-tgtatgatagaacactatggcatcattt 24178742  T
Q  482 gatccatgtagccgaccccactta 505  Q
    |||| |||||||||||||||||||    
T  24178743 gatctatgtagccgaccccactta 24178766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 241 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 1287869 - 1287601
Alignment:
Q  241 agagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaa 340  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||  | |||||||    
T  1287869 agagagtgggggtagcacctatagtag-aaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacacgtagatgccgtggtaagaa 1287771  T
Q  341 gagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggtt 438  Q
    |||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||| |||| ||||| || |||||| |||| |||| |||    
T  1287770 gagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagtt 1287671  T
Q  439 ggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||||| |||| || | |||||||| |||||| ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1287670 ggatcc-aaatttggtgtatgatagtacactatggcgtcagttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 1287601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 241 - 509
Target Start/End: Original strand, 14665706 - 14665972
Alignment:
Q  241 agagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaa 340  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||    
T  14665706 agagagtgggggtagcacctatagtag-agaagttgatagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgtcgtaagaa 14665804  T
Q  341 gagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggtt 438  Q
    |||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||| |||| ||||||||  ||||| | || |||| |||    
T  14665805 gagtagatcaaatggagcagagtcaggttaaaagaggtagagggagacctaggaaaactattagagaaaccattaggaagaatttagaagtcaatgagtt 14665904  T
Q  439 ggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||| ||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14665905 ggatcc-aaatatggtttatgatagaactct--ggcgtaatttgatctatgtagccgaccccacttagtgg 14665972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 185 - 509
Target Start/End: Original strand, 10639232 - 10639562
Alignment:
Q  185 tgcgttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagc----ag--gaaaagttgg 277  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| | |||||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||||||||||     ||  ||||||||||    
T  10639232 tgcgttggatgagtggtaagactagacagaataggattaggaatgacaccattagagagagagtggggctagcacctatagactatagtagaaaagttgg 10639331  T
Q  278 tagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagagg 377  Q
    ||||||||||||||||  |  |||| |||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| || ||||||  |||||  || ||||||||    
T  10639332 tagaaaataggcttagatgaattgggcatgtagagagaagacctgtagatgccatggtaagaagagtagaacaaatggag--gagtcaagttaaaagagg 10639429  T
Q  378 tagaggaagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcg 475  Q
    |||||||||| ||| ||||||||  ||| |||| ||||| || |||||| |||| |||| ||||||||| |||| || | ||||||||||||||| ||||    
T  10639430 tagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatcc-aaatttggtgtatgatagaacactatggcg 10639528  T
Q  476 caatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
      ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10639529 tcatttgatccatgtagccgaccccactttgtgg 10639562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 185 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 2075821 - 2075495
Alignment:
Q  185 tgcgttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataacc-cattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaa 283  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||  ||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||| ||||| |||||| || || ||||||||||||| |    
T  2075821 tgcgttggatgagttgtaagactagacaagataggattaggaatgacaacattagagagagagtgggggtaacacctacagtag-aaaagttggtagaca 2075723  T
Q  284 ataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagagg 383  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  2075722 ataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagagg 2075623  T
Q  384 aagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaa-gatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatt 480  Q
    |||| ||| || |||||  ||| |||| ||||| ||| |||||| |||| |||| ||||||||| |||| || | |||||||||| |||| ||||  |||    
T  2075622 aagacctaggataactattagagaaaccattagaaaaggatttagaggtcaatgagttggatcc-aaatttggtgtatgatagaatactatggcgtcatt 2075524  T
Q  481 tgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  2075523 tgattcatgtagccaaccccacttagtgg 2075495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 252 - 509
Target Start/End: Original strand, 20456776 - 20457033
Alignment:
Q  252 gtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcag 351  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||  ||||||||  | |||||||||||||||||     
T  20456776 gtagcacctatagtag-aaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgaacatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaa 20456874  T
Q  352 atggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaat 449  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||| |||| ||||| || |||||| |||| |||  |||| || | ||||    
T  20456875 atggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctacgaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaataagttgaat-ctaaat 20456973  T
Q  450 atgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
     |||| |||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20456974 ttgatgtatgatagaacattatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 20457033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 185 - 509
Target Start/End: Original strand, 1275200 - 1275524
Alignment:
Q  185 tgcgttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaa 283  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||  | ||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  1275200 tgcgttggatgagtggtaagactagacatggtaggattaggaatgacaccattagagagagagtg-gggtagcacctatagtag-aaaagttggtagaaa 1275297  T
Q  284 ataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagagg 383  Q
    ||||||||||  ||||||| |||||||||||||||   ||| ||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||  || || || ||||||||    
T  1275298 ataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagatccgtaaatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaacaggggtagagg 1275397  T
Q  384 aagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaattt 481  Q
    |||| |||  |||||||  ||| |||| ||||  || |||||| ||||||||  |||| |||| |||| || | | |||||||||| || | ||  ||||    
T  1275398 aagacctagaaaaactattagagaaaccattataaaggatttagaggttaatcagttgaatcc-aaatttggtgtttgatagaacattatgacgtcattt 1275496  T
Q  482 gatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1275497 gatccatgtagccgaccccacttagtgg 1275524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 282 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 38501668 - 38501440
Alignment:
Q  282 aaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtaga 381  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | ||    
T  38501668 aaataggtttagatggtttggacatgtaaagagaagacttgtagatgccgtcgtaagaagagtagattagatggaggagagtcggatcaaaagagatgga 38501569  T
Q  382 ggaagagctatgaaaac--taagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaat 479  Q
     ||||| ||| || |||  ||| | |||||||||| ||  ||||| |||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  | | |||    
T  38501568 tgaagacctaggagaactataaaagaaactattagaaagtatttagaggtcaataagttggatcc-aaatatgatttatgatagaaaactatagtgtaat 38501470  T
Q  480 ttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
     ||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  38501469 atgatcgatgtagccgatcccacttagtgg 38501440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 308 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 2915719 - 2915518
Alignment:
Q  308 tagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaacta--agaaa 405  Q
    ||||||||||||  ||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||| ||| || |||||  ||| |    
T  2915719 tagagagaagacccgtagatgccttggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggataactattagaga 2915620  T
Q  406 aactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccactta 505  Q
    ||| ||||| || |||||| |||| |||| |||||||||||| |  |  |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2915619 aaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgg--ttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccactta 2915522  T
Q  506 gtgg 509  Q
    ||||    
T  2915521 gtgg 2915518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 342 - 510
Target Start/End: Original strand, 14911264 - 14911433
Alignment:
Q  342 agtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaactaa--gaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttg 439  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| |   || |||| ||||| ||||||||| ||||||||| ||||    
T  14911264 agtagatcaaatgaaggagagtcgggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggttaatgagttg 14911363  T
Q  440 gatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgga 510  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14911364 gatccaaa-tatgatttttgatagaatactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttaatgga 14911433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 339 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 13561579 - 13561408
Alignment:
Q  339 aagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaactaa--gaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatggg 436  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| |||||| |   || |||| ||||| ||||||||| |||| |||| |    
T  13561579 aagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgag 13561480  T
Q  437 ttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||||||  |||| ||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13561479 ttggatccaac-tatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 13561408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 338 - 507
Target Start/End: Original strand, 27970 - 28140
Alignment:
Q  338 gaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgg 435  Q
    |||||||||||||||||   ||||||| | ||||||||||| |||||||| |||  |||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||      
T  27970 gaagagtagatcagatgcgtgagagtcagatcaaaagaggttgaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaagatttagaggttaataa 28069  T
Q  436 gttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagt 507  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||  |||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  28070 gttggatccaaa-tatgatttctgatagaacactatggcataatttgatacatgtagctgaccccatttagt 28140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 250 - 493
Target Start/End: Original strand, 6888994 - 6889237
Alignment:
Q  250 gggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatc 349  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||  | | ||||| | | || ||     
T  6888994 gggtagcacgtatag-aggaaaagatggtggaaaataggcttaagtggtttggacatgtagagagaagacttgtggattatgtggtaaggacaataaatt 6889092  T
Q  350 agatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaac--taagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaa 447  Q
    |||||||||| ||||    ||   |||| ||||||||  |||  |||||  ||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |||||  |||||    
T  6889093 agatggaggatagtcaaaccacttgaggaagaggaaggcctagaaaaactataagagaaactattaggaaagatttagagattaattagttgg-gccaaa 6889191  T
Q  448 atatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagc 493  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||| ||||| |||||||||||    
T  6889192 atatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagc 6889237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 241 - 508
Target Start/End: Original strand, 34273019 - 34273272
Alignment:
Q  241 agagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaa 340  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| || |||||   | |||||||    
T  34273019 agagagtgggggtagcacctataatag-aaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacctgcagatgtcgtggtaagaa 34273117  T
Q  341 gagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggtt 438  Q
    |||              |||||||  || |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||| |||| ||||| || |||||| |||| |||| |||    
T  34273118 gag--------------gagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagtt 34273203  T
Q  439 ggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtg 508  Q
    |||||| |||| || | ||||||||||||||| | ||  ||| ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  34273204 ggatcc-aaatttggtgtatgatagaacactatgacgtcattcgatccatgtagccaacctcacttagtg 34273272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 234 - 509
Target Start/End: Original strand, 6859366 - 6859641
Alignment:
Q  234 attagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatc 333  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||||||  | | ||| |||| ||||| |||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| || |     
T  6859366 attagacagagagttggggtagcacctatagt-gaagaagatggtggaaaacaggcataggtggtttggacacgtagagagaagacttgtggattctgta 6859464  T
Q  334 gtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaac--taagaaaaactattaggaaagatttaaaggtta 431  Q
    |||||  || || || |||||||||| ||||    ||  ||||| ||||||||| |||  |||||  ||||| |||||||||||||||||||| || |||    
T  6859465 gtaaggggaataaattagatggaggatagtcaaaccactagaggaagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaagatttacagatta 6859564  T
Q  432 atgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
     |   ||||  |||||||||| |||||||||||||| || |||  ||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  6859565 gttacttgg-gccaaaatatggtttatgatagaacattatggcataattttatccatgttgctgaccccacttagtgg 6859641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 406 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 418158 - 418056
Alignment:
Q  406 aactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccactta 505  Q
    |||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||| | || |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  418158 aacttttaggaaagatttagagattaatgagttggatccaaa-tgtggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttg 418060  T
Q  506 gtgg 509  Q
    ||||    
T  418059 gtgg 418056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 444 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 7640594 - 7640528
Alignment:
Q  444 caaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgga 510  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7640594 caaaatatggtttatgatagaacactacggcgtaatttgatccatgtagccgatcccacttagtgga 7640528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 278 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 17340690 - 17340500
Alignment:
Q  278 tagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagagg 377  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||| ||| | ||||| | | ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||    
T  17340690 tagaaaataggcttaggtggttttgacatgttaagagaaaactcgcagatgatgtagtatgaagagtagatcagatggaggagagtcaggtcaaaaaggg 17340591  T
Q  378 tagaggaagagctatgaaaactaagaa---aaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaaca 467  Q
    |||| ||||| ||  ||||| | | ||    |||||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  17340590 tagatgaaga-cttagaaaaattataattgtaactattaagaaagatttagaggttaatgagtttgatcc-aaatatggtttatgatataaca 17340500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 373 - 509
Target Start/End: Original strand, 9235172 - 9235306
Alignment:
Q  373 agaggtagaggaagagctatgaaaactaagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacg 472  Q
    ||||| ||||||||| |||  |||||||||| ||||||||| ||||||| || || |||||| | |||||| ||| |||| |||||||||||||| || |    
T  9235172 agaggcagaggaagacctagaaaaactaagagaaactattaagaaagatatagagattaatgagctggatcgaaa-tatggtttatgatagaacattatg 9235270  T
Q  473 gcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9235271 gcataatttgatccatgtagccga-cccacttagtgg 9235306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 399 - 507
Target Start/End: Original strand, 11675680 - 11675788
Alignment:
Q  399 taagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgacc 498  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||| || |||||| |||||||   ||||||| |||||||||||||| || |||| | ||| ||||||||||||||||    
T  11675680 taagagaaactattaggacagatttagagattaatgagttggattttaaatatggtttatgatagaacattatggcgtagtttaatccatgtagccgacc 11675779  T
Q  499 ccacttagt 507  Q
    |||||||||    
T  11675780 ccacttagt 11675788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 268 - 503
Target Start/End: Original strand, 29938133 - 29938364
Alignment:
Q  268 gaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcggg 367  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| |||||   | | |||||||||||| ||||||| |  | ||||| | |||||||  |||| |||| |||| |     
T  29938133 gaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttaagcctatagagagaagacctgtagattcggtggtaaggacagtagattggatgaaggatagtcaga 29938232  T
Q  368 tcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaactaagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaaca 467  Q
    ||| |||||||||||||||| |||  ||||||  || ||||||||||||| ||||||| | |||||| |||||||   |||||||||||||| |||||||    
T  29938233 tcacaagaggtagaggaagacctagaaaaact--gagaaactattaggaatgatttaatgattaatgagttggat-tgaaatatgatttatg-tagaaca 29938328  T
Q  468 ctacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccact 503  Q
     |  || | || ||| ||||||||||||||||||||    
T  29938329 ttttggtgtaagttggtccatgtagccgaccccact 29938364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 241 - 509
Target Start/End: Original strand, 79505 - 79773
Alignment:
Q  241 agagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaa 340  Q
    |||||||  |||||| |||||||| || ||||| |||| ||||| |   ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| || | ||||| |    
T  79505 agagagttggggtagtacctatagtag-aaaagatggtggaaaacataattaggtggtttggacatgtagagagaagacctatagattctgtagtaagga 79603  T
Q  341 gagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggtt 438  Q
    |||| ||||| ||||||||  ||||| ||| ||||||  |||||||| |||  |||||||  ||| ||||||||||||| |||||  |  |||||| | |    
T  79604 gagtcgatcaaatggaggatggtcggatcacaagaggctgaggaagacctagaaaaactatcagataaactattaggaatgatttggaaattaatgagct 79703  T
Q  439 ggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||| || ||||||| |  |||||||| || || ||||  |||| ||||||||||| | |||||||||||||    
T  79704 gga-ccgaaatatggtgcatgatagaccattatggcgtgatttcatccatgtagctggccccacttagtgg 79773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 233 - 364
Target Start/End: Original strand, 14749291 - 14749421
Alignment:
Q  233 cattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctat 332  Q
    ||||||| |||||||  | ||||||||||||| || |||| |||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||| || |    
T  14749291 cattagagagagagttggtgtagcacctatagtagaaaaa-ttggtagaaactagacttagatggtttggacatgtagagagaagacctgtggattctgt 14749389  T
Q  333 cgtaagaagagtagatcagatggaggagagtc 364  Q
     ||||| ||||| ||||||||||||| |||||    
T  14749390 tgtaaggagagtcgatcagatggaggggagtc 14749421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 381 - 509
Target Start/End: Original strand, 29816513 - 29816642
Alignment:
Q  381 aggaagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaa 478  Q
    ||||||| ||| ||||||||  ||| |||| ||||| || |||||| |||| |||| |||||||||||| | || | ||||||||||||||| ||||  |    
T  29816513 aggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatt-tggtgtatgatagaacactatggcgtca 29816611  T
Q  479 tttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29816612 tttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 29816642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 275 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 7359516 - 7359283
Alignment:
Q  275 tggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaag 374  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||||| || | ||||| |||||||||||||||||||| ||||   |||  ||    
T  7359516 tggtggaaaataggtttaggtggtttgg-catgtagagagaagatatgtagattctgtagtaaggagagtagatcagatggaggatagtcatatcactag 7359418  T
Q  375 aggtagaggaagagctatgaaaac--taagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacg 472  Q
    ||| |||||||   |||  |||||  ||||| ||||||||  |||| || || || |||||  ||||||| | ||||||| |||| |||| |||| || |    
T  7359417 aggcagaggaaagcctagaaaaaccataagagaaactatttagaaaaatctagagattaataagttggat-cgaaatatggtttacgata-aacattatg 7359320  T
Q  473 gcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
     || ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7359319 acgtaatttgatccatgtagctgaccccacttagtgg 7359283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 268 - 441
Target Start/End: Original strand, 21952375 - 21952548
Alignment:
Q  268 gaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcggg 367  Q
    |||||| ||| ||||| ||| || ||| |||||||||||||||||||||| | ||| ||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||||       
T  21952375 gaaaagatggcagaaactagactcaggtggtttggacatgtagagagaagtcctgtggattctatagtaaggagaatagatcagatggaggggagtcaaa 21952474  T
Q  368 tcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaactaagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttgga 441  Q
    |||  |||||||| |||||| |||  ||||||| || ||||||||  ||| ||| || || |||||||||||||    
T  21952475 tcactagaggtaggggaagacctagaaaaactatgagaaactattgagaaggatctagagattaatgggttgga 21952548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 232 - 385
Target Start/End: Original strand, 36215481 - 36215633
Alignment:
Q  232 ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgcta 331  Q
    |||||||  ||||||||  ||||||| |||||| || |||||||||||| ||||| ||||||  ||||| | || ||||| |||| ||| ||| |||       
T  36215481 ccattagggagagagtggaggtagcatctatagtag-aaaagttggtaggaaatatgcttagatggtttcggcacgtagaaagaaaactcgtatatgtcg 36215579  T
Q  332 tcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaa 385  Q
    | | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36215580 ttgaaagaagagtagatcggatggaggagagtcaggtcaaaagaggtagaggaa 36215633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 421 - 509
Target Start/End: Original strand, 5558314 - 5558401
Alignment:
Q  421 tttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||| |||| |||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5558314 tttagaggtcaatgagtaggatccaaa-tatggtttatgatagaacactatggcataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 5558401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 252 - 505
Target Start/End: Original strand, 43475243 - 43475495
Alignment:
Q  252 gtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcag 351  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||| |||| |||||||||| |||||||  ||  ||||||||||| |||||||| | | ||||| ||||||||||||    
T  43475243 gtagcacctatagtag-aaaagatggtggaaactaggcttaggtggtttgggtattcagagagaagacctgtagatgttgtagtaaggagagtagatcag 43475341  T
Q  352 atggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaac-taagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaata 450  Q
    |||||||| |||| | |||  | ||| | | | | |  ||  ||||| ||||| ||||||||| |||||||  | || |||||| ||||||| | |||||    
T  43475342 atggaggatagtcagatcactataggaaaaagtaaacatagaaaaacttaagagaaactattaagaaagatccagagattaatgagttggat-cgaaata 43475440  T
Q  451 tgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccactta 505  Q
    ||||||||| ||||||  || || | ||||||||||| |||||| || |||||||    
T  43475441 tgatttatggtagaacgttatggtgtaatttgatccacgtagccaactccactta 43475495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 280 - 353
Target Start/End: Original strand, 23979976 - 23980049
Alignment:
Q  280 gaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagat 353  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  | ||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  23979976 gaaaataggtttaggtggtttggacatgtagagagaaaccctgtagattctatagtaagaagagtagatcagat 23980049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 241 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 43558117 - 43558006
Alignment:
Q  241 agagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaa 340  Q
    ||||||| ||||||||| |||||  || ||||| |||| |||| || ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||   |||||||    
T  43558117 agagagttagggtagcatctataatag-aaaagatggtggaaactaagcttaggtggtttgggcatatagagagaagacttgtagatgctgcagtaagaa 43558019  T
Q  341 gagtagatcagat 353  Q
    |||||||| ||||    
T  43558018 gagtagattagat 43558006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 415 - 509
Target Start/End: Original strand, 14667938 - 14668031
Alignment:
Q  415 gaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||| || || |||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||| || || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14667938 gaaagatctagagattaatgagttggatccaag-tatggtttatgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtaaccgaccccacttagtgg 14668031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 277 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 15986992 - 15986890
Alignment:
Q  277 gtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagag 376  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||  ||||||| |||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||| | ||| |||||    
T  15986992 gtagaaaataggtttaggtggtttgggcgtgtagagagaagatatgtagattctatagtaaggagagtggatcaaatggaggatagtcagatcacaagag 15986893  T
Q  377 gta 379  Q
    |||    
T  15986892 gta 15986890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 270 - 364
Target Start/End: Original strand, 21093772 - 21093866
Alignment:
Q  270 aaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtc 364  Q
    ||||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||| ||||  | | ||||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  21093772 aaagttggtggaaaataggcttaggtagtttgggcatgtagagggaagacttggagattttgtagtaaagagagtagatcagatggaggatagtc 21093866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 431 - 509
Target Start/End: Original strand, 30213758 - 30213835
Alignment:
Q  431 aatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||| |||||||||||| | || | ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30213758 aatgagttggatccaaatt-tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 30213835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 250 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 31636201 - 31636088
Alignment:
Q  250 gggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatc 349  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||  || |||| | | ||||| |||||||||     
T  31636201 gggtagcacctatagtag-aaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggcatgtagagagaagacccgtggatgttgtagtaaggagagtagatt 31636103  T
Q  350 agatggaggagagtc 364  Q
    |||||| || |||||    
T  31636102 agatggtggggagtc 31636088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 358 - 472
Target Start/End: Original strand, 14725626 - 14725741
Alignment:
Q  358 gagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatt 455  Q
    ||||||||| | | |||||||||||||| |||||  |||| ||  ||| |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||    
T  14725626 gagagtcggattagaagaggtagaggaaaagctagaaaaattataagataaactattataaaagatttaaaggttaatgagttggat-caaaatatggtt 14725724  T
Q  456 tatgatagaacactacg 472  Q
    |||||| ||||| ||||    
T  14725725 tatgatcgaacaatacg 14725741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 405 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 16914008 - 16913904
Alignment:
Q  405 aaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccga-ccccact 503  Q
    |||| ||||| || |||||| |||| |||| |||||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  16914008 aaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaa-tatggtttacgatagaacaccatggcgtcatttgatccatgtagccgacccccact 16913910  T
Q  504 tagtgg 509  Q
    ||||||    
T  16913909 tagtgg 16913904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 268 - 357
Target Start/End: Original strand, 42199304 - 42199393
Alignment:
Q  268 gaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggag 357  Q
    |||||| |||| |||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| || | ||||| ||||||||||| ||||||    
T  42199304 gaaaagatggtggaaactagacttaggtggtttgggcatgtagagagaagacatgtagattctgtagtaaggagagtagatcacatggag 42199393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 268 - 417
Target Start/End: Original strand, 1525662 - 1525813
Alignment:
Q  268 gaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcggg 367  Q
    |||||| ||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||||||||||  ||  || ||   || || ||||||||||||||||||||||||| |     
T  1525662 gaaaagatggtagaaactagacttaggtggcttggacatgtagagagaagacccgtgaattctgcagttaggagagtagatcagatggaggagagtcaga 1525761  T
Q  368 tcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaact--aagaaaaactattaggaa 417  Q
    |||  |||||||| || ||| |||  ||||||  |||| |||||||||||||    
T  1525762 tcactagaggtaggggtagacctagaaaaactacaagagaaactattaggaa 1525813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 334 - 507
Target Start/End: Original strand, 6788151 - 6788325
Alignment:
Q  334 gtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaactaagaaa--aactattaggaaagatttaaaggtta 431  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||  ||| | |||  ||||| ||||||||| |||  |||||||  |||  ||||||||||||||| ||  |  |||    
T  6788151 gtaaggagagtcgaccagatggaggatggtcagatcactagaggcagaggaagacctagaaaaactatcaaaggaactattaggaaagacttggaaatta 6788250  T
Q  432 atgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagt 507  Q
    ||| |||||| |  |||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  6788251 atgagttgga-ctgaaatatgatttatgatagaacattatagcgtaatttgattcatgtagccgacctcacttagt 6788325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 287 - 387
Target Start/End: Original strand, 11675547 - 11675647
Alignment:
Q  287 ggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaag 386  Q
    |||||||| ||||||| ||||| |||||||| | ||||||| || | ||||| ||||||||||| | |||||| |||| | |||||||| ||||||||||    
T  11675547 ggcttaggtggtttgggcatgttgagagaaggcctgtagattctgtagtaaggagagtagatcatagggaggatagtcagatcaaaagatgtagaggaag 11675646  T
Q  387 a 387  Q
    |    
T  11675647 a 11675647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 429 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 32442226 - 32442147
Alignment:
Q  429 ttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||||| |||||||||||| |||| |||  ||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32442226 ttaatgagttggatccaaa-tatggttttggatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgactccacttagtgg 32442147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 269 - 364
Target Start/End: Original strand, 2712963 - 2713058
Alignment:
Q  269 aaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtc 364  Q
    ||||| ||||||| | ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| ||| || |   ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2712963 aaaagatggtagagactagacttaggtggtttgggcatgtagagagaagacctgtggattctgtatgaaggagagtagatcagatggaggagagtc 2713058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 446 - 509
Target Start/End: Original strand, 18855804 - 18855867
Alignment:
Q  446 aaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18855804 aaatatggtttatgatagaacattatagcataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 18855867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 399 - 501
Target Start/End: Original strand, 2090564 - 2090665
Alignment:
Q  399 taagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgacc 498  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| | | ||||| ||||||  ||||||||  |||| || |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  2090564 taagagaaaatattaggaaagatttagaggttaatgagcttgatcc-aaatatagtttatgatccaacattatggcgtaatttgatccatgtacccgacc 2090662  T
Q  499 cca 501  Q
    |||    
T  2090663 cca 2090665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 455 - 509
Target Start/End: Original strand, 38132542 - 38132596
Alignment:
Q  455 ttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||||||||| || |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38132542 ttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtggccgaccccacttagtgg 38132596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 250 - 327
Target Start/End: Original strand, 15168793 - 15168869
Alignment:
Q  250 gggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagat 327  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| | ||| |||||||    
T  15168793 gggtagcacctatagtag-aaaagatggtagaaaataggctaaggtggtttggacatgttgagaaatgacctgtagat 15168869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 268 - 509
Target Start/End: Original strand, 30588467 - 30588707
Alignment:
Q  268 gaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcggg 367  Q
    |||||| |||| ||||||||| ||| | ||||||| ||| |   |||||||||||||||| || | ||||| ||||||||| |  ||||||| |||| ||    
T  30588467 gaaaagatggtggaaaataggtttaagtggtttgggcatattcggagaagacttgtagattctgtagtaaggagagtagataa--tggaggatagtcagg 30588564  T
Q  368 tcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaa 465  Q
    |||  ||||  | ||||||| |||  |||||||  ||| ||| | ||| ||||||| || || | |||| |||||||| ||| |||| ||||| ||||||    
T  30588565 tcacgagagacataggaagacctagaaaaactataagagaaattgttaagaaagatctagagatgaatgagttggatcgaaa-tatggtttataatagaa 30588663  T
Q  466 cactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    || || | ||  || ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30588664 cattatgacgtgatatgatccatgtagccgactccacttagtgg 30588707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 250 - 319
Target Start/End: Original strand, 33667217 - 33667285
Alignment:
Q  250 gggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagac 319  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  33667217 gggtagcacctatagtag-aaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggcatgtagagagaagac 33667285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 411 - 509
Target Start/End: Original strand, 41894229 - 41894333
Alignment:
Q  411 ttaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaa------tatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccactt 504  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||       ||||| |||||||| |||| || || | |||||||||||||||||| |||||||||    
T  41894229 ttaggaaagatttagagattaatgagttggatccaaatatggtttatgaattatgatacaacattatggtgtaatttgatccatgtagccaaccccactt 41894328  T
Q  505 agtgg 509  Q
    |||||    
T  41894329 agtgg 41894333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 415 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 683816 - 683726
Alignment:
Q  415 gaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttag 506  Q
    ||||||||||||| |||||  |||| ||| |||||||| |||||||||||||| || |  | | |||||||||||||||| |||||||||||    
T  683816 gaaagatttaaagcttaattagttgtatc-aaaatatggtttatgatagaacattatgttgtagtttgatccatgtagccaaccccacttag 683726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 234 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 15489789 - 15489588
Alignment:
Q  234 attagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatc 333  Q
    |||||| |||||||  |||||| |||||| | || ||||| |||| |||| |  ||||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||  | |     
T  15489789 attagagagagagttggggtagtacctattgtag-aaaagatggttgaaactcagcttagatggtttgggcatgtagagagaagatttgtagattttgta 15489691  T
Q  334 gtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaac--taagaaaaactattaggaaagatttaaaggtta 431  Q
     |||| ||||||||| |||||||||| ||| |  |||  ||||| ||||||||| |||  |||||  ||||| ||||||||| |||||| ||| || |||    
T  15489690 ttaaggagagtagattagatggaggatagttgaatcactagaggcagaggaagacctagaaaaacaataagagaaactattaagaaagacttatagatta 15489591  T
Q  432 atg 434  Q
    |||    
T  15489590 atg 15489588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 250 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 18351189 - 18351112
Alignment:
Q  250 gggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacat-gtagagagaagacttgtagat 327  Q
    ||||||||||||||| || ||||  ||||||||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||    
T  18351189 gggtagcacctatagtag-aaaatatggtagaaactaggcttaggtggtttgggcattgtagagagaagacctgtagat 18351112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 463 - 509
Target Start/End: Original strand, 27386554 - 27386600
Alignment:
Q  463 gaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27386554 gaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 27386600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 460 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 408565 - 408516
Alignment:
Q  460 atagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  408565 atagaatactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 408516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 287 - 509
Target Start/End: Original strand, 7678520 - 7678737
Alignment:
Q  287 ggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaag 386  Q
    ||||||||  |||||| | |||||||| ||||| ||||||| || | ||||| |||||||||     |||||| |||| | |||  ||||| ||||||||    
T  7678520 ggcttaggttgtttgggcttgtagagaaaagacatgtagattctgtagtaaggagagtagat-----ggaggatagtcagatcactagaggcagaggaag 7678614  T
Q  387 agctatgaaaac--taagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgat 484  Q
    | |||  |||||  ||||| ||||||||  ||||||| || || |||||| |||||||| ||| || | ||||| ||| |||| || |  | | ||||||    
T  7678615 atctagtaaaaccataagagaaactatttagaaagatctagagattaatgagttggatcgaaa-tacggtttataata-aacattatgaggtagtttgat 7678712  T
Q  485 ccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  7678713 ccatgtagccgaccccacttagtgg 7678737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 299 - 400
Target Start/End: Original strand, 27799892 - 27799993
Alignment:
Q  299 ttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaac 398  Q
    |||| |||||||||||||||  |||||||| | | ||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||  ||||| |||| |||| |||  |||||    
T  27799892 ttgggcatgtagagagaagagatgtagatgttgtagtaagaagattagatcatatggaggatagtcggatcactagaggcagagtaagacctagaaaaac 27799991  T
Q  399 ta 400  Q
    ||    
T  27799992 ta 27799993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 456 - 509
Target Start/End: Original strand, 42576217 - 42576270
Alignment:
Q  456 tatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  42576217 tatgatagaacataatggcgtaatttgatccatgtagccgacccgacttagtgg 42576270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 445 - 509
Target Start/End: Original strand, 28411872 - 28411936
Alignment:
Q  445 aaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||| ||| ||| ||||||||||||| ||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28411872 aaaacatgttttctgatagaacactatggcgttgtttgattcatgtagccgaccccacttagtgg 28411936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 477 - 509
Target Start/End: Original strand, 28985311 - 28985343
Alignment:
Q  477 aatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28985311 aatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 28985343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 268 - 465
Target Start/End: Original strand, 32516574 - 32516771
Alignment:
Q  268 gaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcggg 367  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||| || || ||||||| || | ||| | |||||||||| |||| |||| | || |     
T  32516574 gaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttagacttgtaaagaaaatacatgtagattctgtagtatggagagtagatcggatgaaggataatcaga 32516673  T
Q  368 tcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaac--taagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaa 465  Q
    | | |||||||||||||||| |||  |||||  ||||| ||||||||||   ||||||| || ||||   ||||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  32516674 ttacaagaggtagaggaagaccta-aaaaactataagagaaactattagagcagatttagagattaacaagttggattc-aaatatggtttatgatagaa 32516771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 458 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 3442944 - 3442893
Alignment:
Q  458 tgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||||||||| ||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3442944 tgatagaacactatggcgtcgtttgattcatgtagccgaccccacttagtgg 3442893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 454 - 509
Target Start/End: Original strand, 5860039 - 5860094
Alignment:
Q  454 tttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||||||| || || |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  5860039 tttatgatagaccattatggcgtaatttgatctatgtagccgaccctacttagtgg 5860094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 405 - 504
Target Start/End: Original strand, 20367050 - 20367148
Alignment:
Q  405 aaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccactt 504  Q
    |||||| |||||| ||| || || |||||| |||||||||||| |||| ||||||| | |||| || | || |||||||||||| ||||| |||||||||    
T  20367050 aaactagtaggaaggatctagagattaatgagttggatccaaa-tatggtttatgacataacattatgacgtaatttgatccatatagccaaccccactt 20367148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 477 - 508
Target Start/End: Original strand, 36551374 - 36551405
Alignment:
Q  477 aatttgatccatgtagccgaccccacttagtg 508  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36551374 aatttgatccatgtagccgaccccacttagtg 36551405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 446 - 509
Target Start/End: Original strand, 38830517 - 38830579
Alignment:
Q  446 aaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||  ||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  38830517 aaatatgatgtatgatagaacattatagcgtaatt-gatccatgtagctgaccccacttagtgg 38830579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 457 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 41108803 - 41108752
Alignment:
Q  457 atgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtg 508  Q
    ||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41108803 atgatagtacattatggcgtaatttgatccatgtagctgaccccacttagtg 41108752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 446 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 43557918 - 43557855
Alignment:
Q  446 aaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||| |||||||||||||| || | |  || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43557918 aaatatggtttatgatagaacattatgacttaagttgatctatgtagccgaccccacttagtgg 43557855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 192 - 301
Target Start/End: Original strand, 27836 - 27944
Alignment:
Q  192 gatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggct 290  Q
    ||||||||||||| ||| ||  |||| ||||| |||| || ||||| |||| ||||| |||||||||||||||| | |||||| || | |||||||||||    
T  27836 gatgagtggtaaaacta-acaagatatgattatgaatgacaccatttgaaaaagagttagggtagcacctatagta-gaaaagatgatggaaaataggct 27933  T
Q  291 taggcggtttg 301  Q
    |||| ||||||    
T  27934 taggtggtttg 27944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 269 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 4026598 - 4026540
Alignment:
Q  269 aaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagat 327  Q
    ||||| |||| |||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  4026598 aaaagatggtggaaactagtcttaggtggtttggacatgtagagaggagacctgtagat 4026540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 334 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 8082152 - 8082086
Alignment:
Q  334 gtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaacta 400  Q
    ||||| ||||||||||||||| | || |||| | |||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  8082152 gtaaggagagtagatcagatgaacgatagtcagatcaaaagaggtagaggaagacctagaaaaacta 8082086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 250 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 10083020 - 10082923
Alignment:
Q  250 gggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagat 348  Q
    ||||| ||||||||| || ||||| ||||||||| ||| |||| | ||||| | |||||||||||||||||||| ||| || | ||||  |||||||||    
T  10083020 gggtatcacctatagtag-aaaagatggtagaaactagacttaagtggtttcggcatgtagagagaagacttgtggattctgtagtaaagagagtagat 10082923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 334 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 12577058 - 12576882
Alignment:
Q  334 gtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaact--aagaaaaactattaggaaagatttaaaggtta 431  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  ||||   |||  ||||| ||||||||| |||  ||||||  |||| ||||||||| ||||||| || || |||    
T  12577058 gtaaggagagtagatcagatggagggtagtcctatcactagaggcagaggaagacctagaaaaactacaagataaactattaagaaagatctagagatta 12576959  T
Q  432 atgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||| |||| ||   ||||||| | ||||||||| || || || |  |||| || |||||||||||||||| |||||||    
T  12576958 atgagttgaat-agaaatatggtatatgatagaccattatggtgtcattttatacatgtagccgaccccaattagtgg 12576882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 250 - 400
Target Start/End: Original strand, 28676596 - 28676745
Alignment:
Q  250 gggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatc 349  Q
    |||||||| |||||| || ||||| |||| |||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||| | || ||  | ||||||| | | || ||     
T  28676596 gggtagcagctatagtag-aaaagatggtggaaaatagtcttaggtggtttcggcatgtagagagaagacctttaaattatgtcgtaaggataatatatt 28676694  T
Q  350 agatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaacta 400  Q
    ||||||||||  ||| | | | |||||||||| ||||| |||| |||||||    
T  28676695 agatggaggattgtcagattacaagaggtagaagaagacctataaaaacta 28676745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 454 - 508
Target Start/End: Original strand, 39012783 - 39012837
Alignment:
Q  454 tttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtg 508  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||||||| |||||||||    
T  39012783 tttatgatagaacactatggtgcaatttgattcatattgccgacctcacttagtg 39012837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 459 - 509
Target Start/End: Original strand, 42272687 - 42272737
Alignment:
Q  459 gatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||||| || ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42272687 gatagaacattatggcgtcatttgatccatgtagctgaccccacttagtgg 42272737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 477 - 510
Target Start/End: Original strand, 5987744 - 5987777
Alignment:
Q  477 aatttgatccatgtagccgaccccacttagtgga 510  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5987744 aatttgatcaatgtagccgaccccacttagtgga 5987777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 304 - 353
Target Start/End: Original strand, 9235118 - 9235167
Alignment:
Q  304 catgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagat 353  Q
    |||||||||||||||||||||||| || | ||||  ||||||||||||||    
T  9235118 catgtagagagaagacttgtagattctgtagtaacgagagtagatcagat 9235167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 456 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 11069237 - 11069184
Alignment:
Q  456 tatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||||||||||| || |||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||||    
T  11069237 tatgatagaacattatggcgtaatttgatccatatagctgaccccacatagtgg 11069184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 465
Target Start/End: Original strand, 15168864 - 15168987
Alignment:
Q  343 gtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaac--taagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttgg 440  Q
    |||||| ||||||||||||||  | | | |||||||||||||  | |||  |||||  ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||  |||||    
T  15168864 gtagattagatggaggagagtgagattagaagaggtagaggacaacctagaaaaactataagagaaactgttaggaaaaatttagaggttaataagttgg 15168963  T
Q  441 atccaaaatatgatttatgatagaa 465  Q
    |||| | ||||| ||||||||||||    
T  15168964 atcc-agatatggtttatgatagaa 15168987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 373
Target Start/End: Original strand, 31906596 - 31906784
Alignment:
Q  185 tgcgttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaa 283  Q
    |||||| |||||  |||||| |||||||| |||||||||||||| ||  ||||||  |||||||||| ||  |||||| |  | ||||||||||| | ||    
T  31906596 tgcgttcgatgaacggtaaaactagacggaataggattaggaatgacatcattagggagagagtgagagtgacacctacaata-gaaaagttggtcggaa 31906694  T
Q  284 ataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaa 373  Q
    |||  |||||   |||| |||||||||| ||||||    ||||||| ||| ||| |||| ||||||||||| | |||| ||| |||||||    
T  31906695 atattcttagatagtttagacatgtagatagaagatacatagatgcaatcataaaaagaatagatcagatgaatgagaatcgagtcaaaa 31906784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 472 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 39322138 - 39322101
Alignment:
Q  472 ggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39322138 ggcgtaatttgatccatgtagccgatcccacttagtgg 39322101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 477 - 509
Target Start/End: Original strand, 9234114 - 9234146
Alignment:
Q  477 aatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9234114 aatttgatccatgtaaccgaccccacttagtgg 9234146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 454 - 506
Target Start/End: Original strand, 28276443 - 28276495
Alignment:
Q  454 tttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttag 506  Q
    |||||||||||| |||| || | |||||||||||||||||| || ||||||||    
T  28276443 tttatgatagaaaactatggtgtaatttgatccatgtagccaactccacttag 28276495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 477 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 30639770 - 30639738
Alignment:
Q  477 aatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30639770 aatttgatccatgtagccgaccccatttagtgg 30639738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 290 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 33158073 - 33158013
Alignment:
Q  290 ttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatca 350  Q
    ||||| |||||| || ||||||||||| || ||||||| || | |||||||||||||||||    
T  33158073 ttaggtggtttgaacgtgtagagagaaaacatgtagattctgtagtaagaagagtagatca 33158013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 445 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 41833743 - 41833679
Alignment:
Q  445 aaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||||||| |||||||||||||| |  || | ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  41833743 aaaatatggtttatgatagaacattttggtgtaatttaatccatgtagctgaccccgcttagtgg 41833679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 161; Significance: 1e-85; HSPs: 129)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 185 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 31960161 - 31959836
Alignment:
Q  185 tgcgttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaa 283  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  31960161 tgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtag-aaaagttggtagaaa 31960063  T
Q  284 ataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagagg 383  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  31960062 ataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagagg 31959963  T
Q  384 aagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaattt 481  Q
    |||| ||| ||||||||  ||| |||||||||| || |||||| |||| |||| ||||||||| |||| || | ||||||||||||||| ||||  ||||    
T  31959962 aagacctaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatcc-aaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 31959864  T
Q  482 gatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31959863 gatccatgtagccgaccccacttagtgg 31959836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 188 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 52569859 - 52569537
Alignment:
Q  188 gttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaata 286  Q
    |||||||||| |||||  |||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  52569859 gttggatgaggggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtag-aaaagttggtagaaaata 52569761  T
Q  287 ggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaag 386  Q
    |||||||  ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  52569760 ggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaag 52569661  T
Q  387 agctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgat 484  Q
    | ||| ||||||||  | | |||| ||||| || |||||| |||| |||| ||||||||| |||| || | ||||||||||||||| ||||  |||||||    
T  52569660 acctacgaaaactattaaagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatcc-aaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgat 52569562  T
Q  485 ccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  52569561 ccatgtagccgaccccacttagtgg 52569537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 241 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 26037795 - 26037527
Alignment:
Q  241 agagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaa 340  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  ||||||    | |||||||||||| |||| ||||  |||||||||    
T  26037795 agagagtgagggtagcacctatagtag-aaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgatattatagagagaagacctgtaaatgccgtcgtaagaa 26037697  T
Q  341 gagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaac--taagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggtt 438  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| | ||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| |||    
T  26037696 gagtagatcagatggaggagagtcaggttaaaagaggcagaggaaaacctaggaaaaccataagagaaactattaggaaagatttagaggtgaatgagtt 26037597  T
Q  439 ggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26037596 ggatcc-aaatatggtttatgatagaacactatggcgtaattggatccatgtagccgaccccacttagtgg 26037527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 185 - 509
Target Start/End: Original strand, 4440790 - 4441113
Alignment:
Q  185 tgcgttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaa 283  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||  | ||||||||  ||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  4440790 tgcgttcgatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatggcaccattaga--gagagtgggggcagcacctatagtag-aaaagttggtagaaa 4440886  T
Q  284 ataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagagg 383  Q
    ||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  4440887 ataggcttagatggtttgggcatctagagagaagacccgtagatgctgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagagg 4440986  T
Q  384 aagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaattt 481  Q
    |||| ||| ||||||||  ||| |||| ||||| || |||||| |||| |||| ||||||||| |||| || | ||||||||||||||| ||||  ||||    
T  4440987 aagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatcc-aaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 4441085  T
Q  482 gatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4441086 gatccatgtagccgaccccacttagtgg 4441113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 185 - 509
Target Start/End: Original strand, 436164 - 436489
Alignment:
Q  185 tgcgttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaa 283  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||  |||||||||| |||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  436164 tgcgttggatgagtcgtaagactagacatgataggattaagaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtag-aaaagttggtagaaa 436262  T
Q  284 ataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagagg 383  Q
    ||||||||||  | ||||| |||||||||||||||| |||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  436263 ataggcttagatgatttgggcatgtagagagaagacctgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagagg 436362  T
Q  384 aagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaattt 481  Q
    |||| ||| ||||||||  ||| |||| | ||| || |||||| |||| |||| |||| |||| |||| || | ||||||||||||||| |||   ||||    
T  436363 aagacctaggaaaactattagagaaaccactagaaaggatttagaggtcaatgagttgaatcc-aaatttggtgtatgatagaacactatggcatcattt 436461  T
Q  482 gatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  436462 gatccatgtagccgaccccacttagtgg 436489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 232 - 509
Target Start/End: Original strand, 39708416 - 39708693
Alignment:
Q  232 ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgcta 331  Q
    |||||||  |||||||||||||||| ||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||| |||||||||   |||||||      
T  39708416 ccattagggagagagtgagggtagctcctgtagtat-aaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgagcatgtatagagaagacacatagatgccg 39708514  T
Q  332 tcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaac--taagaaaaactattaggaaagatttaaaggt 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||| |||| ||||| || |||||| ||||    
T  39708515 tcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcaggtcaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactataagagaaaccattagaaaggatttagaggt 39708614  T
Q  430 taatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
     |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39708615 caatgagttggatcc-aaatatggtttatgatagaacactatgtcgtaatttgatccatgtagtcgaccccacttagtgg 39708693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 185 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 48174440 - 48174115
Alignment:
Q  185 tgcgttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaa 283  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||  |||| |||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||||    
T  48174440 tgcgttggatgagtggtaagactagacatgatatgattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtaacacctatagtag-aaaagttggtagaaa 48174342  T
Q  284 ataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagagg 383  Q
    ||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||  ||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  48174341 ataggcttagatgatttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagagg 48174242  T
Q  384 aagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaattt 481  Q
    |||| ||| ||||||||  ||| |||| ||||| || |||||| |||| |||| ||||||||| |||| || | ||||||| |||| || ||||  ||||    
T  48174241 aagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatcc-aaatttggtgtatgataaaacattatggcgtcattt 48174143  T
Q  482 gatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||    
T  48174142 gatccatgtagcagaccccacttagtgg 48174115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 185 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 1777362 - 1777043
Alignment:
Q  185 tgcgttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaa 283  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||| || ||||||||  |||||||    |||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  1777362 tgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattaga--gagagtggaaatagcacctatagtaa-aaaagttggtagaaa 1777266  T
Q  284 ataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagagg 383  Q
    ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||  |||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  1777265 ataggcttagatggtttggacatctagagagaagactcatagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagagg 1777166  T
Q  384 aagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaattt 481  Q
    |||| ||| ||||||||  ||| |||| ||||| ||||||||| |||| |||| ||||||||| |||| || | |||||||||||| || ||||  ||||    
T  1777165 aagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatcc-aaatttggtgtatgatagaacagtatggcgtcattt 1777067  T
Q  482 gatccatgtagccgaccccactta 505  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  1777066 gatccatgtagccgaccccactta 1777043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 185 - 509
Target Start/End: Original strand, 56375225 - 56375550
Alignment:
Q  185 tgcgttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaa 283  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||  |||| |||||||||| || |||||||| |||||||  ||||||||||||||  || |||||||||||||||    
T  56375225 tgcgttggatgagtggtaagactagacaagataagattaggaatgacaccattagagagagagtaggggtagcacctataatag-aaaagttggtagaaa 56375323  T
Q  284 ataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagagg 383  Q
    | ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||  | ||||||||||||||| | |||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  56375324 acaggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagataaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagagg 56375423  T
Q  384 aagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaattt 481  Q
    |||| ||| ||||||||  ||| |||| ||||| || |||||| |||| |||| ||||||||| |||| || | ||||||||||||||| | ||  ||||    
T  56375424 aagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtgaatgagttggatcc-aaatttggtgtatgatagaacactatgacgtcattt 56375522  T
Q  482 gatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  56375523 gatccatgtagccgacctcacttagtgg 56375550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 185 - 510
Target Start/End: Original strand, 33227144 - 33227470
Alignment:
Q  185 tgcgttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaa 283  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||||  |||||||||| |||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  33227144 tgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtag-aaaagttggtagaaa 33227242  T
Q  284 ataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagagg 383  Q
    ||||||||||   |||||| ||||||||||||||||  ||||||||  |  |||||||||||||||| ||||| |||||||  || |||||||||||| |    
T  33227243 ataggcttagattgtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtgttaagaagagtagatcaaatggaagagagtcaagttaaaagaggtagatg 33227342  T
Q  384 aagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaattt 481  Q
    |||| ||| ||||||||  |||||||| ||||| || |||||| |||| |||| ||||||||| |||| || | ||||||||||||||| | ||  ||||    
T  33227343 aagacctaggaaaactattagaaaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatcc-aaatttggtgtatgatagaacactatgacgtcattt 33227441  T
Q  482 gatccatgtagccgaccccacttagtgga 510  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  33227442 gatccatgtagccgatcccacctagtgga 33227470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 189 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 48622884 - 48622565
Alignment:
Q  189 ttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaatag 287  Q
    |||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||| || ||||||||  ||||||| |||||||||| |||| || |||||||||||||||||||    
T  48622884 ttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattaga--gagagtgggggtagcacccatagtag-aaaagttggtagaaaatag 48622788  T
Q  288 gcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaaga 387  Q
    ||||||  ||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||  | ||||||| || |||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  48622787 gcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgccgtggtaagaaaagaagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaaga 48622688  T
Q  388 gctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatc 485  Q
     ||| ||||||||  ||| |||  ||||| ||||||||| |||| |||| ||| ||||| |||| || | ||||||||||||||| ||||  |||| |||    
T  48622687 cctaggaaaactattagagaaatcattagaaaagatttagaggtcaatgagtttgatcc-aaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttaatc 48622589  T
Q  486 catgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  48622588 catgtagccgaccccacttagtgg 48622565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 269 - 510
Target Start/End: Original strand, 32479057 - 32479299
Alignment:
Q  269 aaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggt 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||  | ||||||||||||||||| ||||||||||| | |||    
T  32479057 aaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagaggagacctgtagaggccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagacaggt 32479156  T
Q  369 caaaagaggtagaggaagagctatgaaaac--taagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaac 466  Q
      ||||||||||||||||| ||| ||||||  |  || |||| ||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  32479157 tgaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggat-caaaatatggtttttgatagaac 32479255  T
Q  467 actacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgga 510  Q
    |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32479256 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgga 32479299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 185 - 509
Target Start/End: Original strand, 53707729 - 53708054
Alignment:
Q  185 tgcgttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaa 283  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||  ||||||| ||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  53707729 tgcgttggatgagtagtaagactagacatgataggactaggaatgacaccattagaaagagagtggaggtagcacctatagtag-aaaagttggtagaaa 53707827  T
Q  284 ataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagagg 383  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||  | |||||||||||| |||| |||||||| ||||  || ||||||||||||||    
T  53707828 ataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtatatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagagg 53707927  T
Q  384 aagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaattt 481  Q
    |||| | | ||||||||  ||| |||| ||||| || |||||| |||| |||| ||||||||| |||| || | ||||||||||||||| | ||  ||||    
T  53707928 aagaccgaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatcc-aaatttggtgtatgatagaacactatgacgtcattt 53708026  T
Q  482 gatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||| ||| ||||  ||||||||||    
T  53708027 gatccatttagtcgacatcacttagtgg 53708054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 241 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 27450469 - 27450202
Alignment:
Q  241 agagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaa 340  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||  | |||||||    
T  27450469 agagagtgggggtagcacctatagtag-aaaagttggtagaaaataggcttagatggttttgacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgtaagaa 27450371  T
Q  341 gagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaa--ctaagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggtt 438  Q
    |||||||||| |||||| ||| || ||| |||||||||| ||||||| ||| |||||   |  || |||| ||| | ||||||||| |||| |||| |||    
T  27450370 gagtagatcaaatggagtagaatcaggttaaaagaggtaaaggaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattggaaaagatttagaggtcaatgagtt 27450271  T
Q  439 ggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27450270 ggatcc-aaatatgattt-tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 27450202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 185 - 509
Target Start/End: Original strand, 43433853 - 43434184
Alignment:
Q  185 tgcgttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgag------ggtagcacctatagcaggaaaagttgg 277  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||  ||||||||||||||| || |||||||| |||||| |||      |||||||||||||| || |||||||||    
T  43433853 tgcgttggatgagtggcaagactagacaagataggattaggaatgacaccattagagagagagagagagtgggggtagcacctatagtag-aaaagttgg 43433951  T
Q  278 tagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagagg 377  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||  | |||||||||||| |||| |||||||||||||  || ||||||||    
T  43433952 tagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtaaatcaaatggaggagagtcaagttaaaagagg 43434051  T
Q  378 tagaggaagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcg 475  Q
    |||||||||| ||| ||||||||  ||| |||| |||   || |||||| |||| |||| || |||||| |||| |||| || |||||||||||||||||    
T  43434052 tagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattgaaaatgatttagaggtcaatgagtcggatcc-aaatttgatgtaggatagaacactacggcg 43434150  T
Q  476 caatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
      ||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  43434151 tcatttgatccatgtagtcgagcccacttagtgg 43434184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 179 - 509
Target Start/End: Original strand, 37797781 - 37798111
Alignment:
Q  179 atatgctgcgttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttgg 277  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||  ||||||  |||| |||||| ||| || |||||||| ||||||||  |||||||||||||| || |||||||||    
T  37797781 atatgttgcgttggatgagtgataagactagacatgataagattagaaatgacaccattagagagagagtggaggtagcacctatagtag-aaaagttgg 37797879  T
Q  278 tagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagagg 377  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||      
T  37797880 tagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagattcgtagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggatgagagtcaggttaaaaga-t 37797978  T
Q  378 tagaggaagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcg 475  Q
    |||||||||| ||| ||||||||  ||| |||  ||||| || |||||| | || |||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||| || | ||    
T  37797979 tagaggaagatctaggaaaactattagagaaatcattagaaaggatttagaagtcaatgagttgaatcc-aaatatggtttatgatagaacaatatgacg 37798077  T
Q  476 caatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
      |||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  37798078 tcatttgatcaatgtagccgactccatttagtgg 37798111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 193 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 39100872 - 39100558
Alignment:
Q  193 atgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggctt 291  Q
    |||||||||||  |||||   ||||||||||||||| || ||||||||  ||||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  39100872 atgagtggtaagactagaaatgataggattaggaatgacaccattaga--gagagtgggggtagcacctatagaag-aaaagttgatagaaaataggctt 39100776  T
Q  292 aggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagcta 391  Q
    ||  |||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | ||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||||||| |||    
T  39100775 agatggtttgaacatgtagagagaagatccgtagatgcgtt-gtaagaagagtagatcagatggaagatagtcaggttaaaagaggtagaggaagaccta 39100677  T
Q  392 tgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatg 489  Q
     ||||||||  ||| |||| ||||| || |||||  |||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||||||| || |||| ||| | |||||||    
T  39100676 ggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttggaggtcaatgagttggatcc-aaatattgtttatcatagaacattatggcgtaatataatccatg 39100578  T
Q  490 tagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  39100577 tagccgaccccacttagtgg 39100558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 185 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 33191195 - 33190870
Alignment:
Q  185 tgcgttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaa 283  Q
    |||| ||||||||||||||   ||||  |||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  33191195 tgcgctggatgagtggtaagattagataggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtag-aaaagttggtagaaa 33191097  T
Q  284 ataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagagg 383  Q
    |||| |||||   |||||| ||||||||||||||||  ||||||||  |  ||||||| |||||||| |||||| ||||||  || ||||||||||||||    
T  33191096 atagacttagattgtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtgttaagaagggtagatcaaatggagaagagtcaagttaaaagaggtagagg 33190997  T
Q  384 aagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaattt 481  Q
    |||| ||| ||||||||  ||| |||| ||||| || |||||| |||| |||| |||| |||| |||| || | ||||||||||||||| | ||  ||||    
T  33190996 aagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttgaatcc-aaatttggtgtatgatagaacactatgacgtcattt 33190898  T
Q  482 gatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||    
T  33190897 gacccatgtagccgaccccacctagtgg 33190870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 210 - 508
Target Start/End: Original strand, 1793420 - 1793721
Alignment:
Q  210 acgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgt 308  Q
    |||||||| |||||||||| || |||||||  |||||| | ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  1793420 acgggataagattaggaatgacaccattagggagagagcgggggtagcacctatagtaa-aaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgt 1793518  T
Q  309 agagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaac--taagaaaa 406  Q
    ||||||||||||||| ||||   ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||| |||| ||   |||||  ||||| ||    
T  1793519 agagagaagacttgttgatgtcgtcgtaagaatagtagatcagatggag--gagtcgtatcaaaagaggtagagaaagacctcgaaaaactataagagaa 1793616  T
Q  407 ac----tattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccac 502  Q
    ||     ||||| ||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||| ||||||||||| | |||    
T  1793617 accattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatcc-aaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcac 1793715  T
Q  503 ttagtg 508  Q
    ||||||    
T  1793716 ttagtg 1793721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 185 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 23906648 - 23906319
Alignment:
Q  185 tgcgttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgag------ggtagcacctatagcaggaaaagttgg 277  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||  ||||||||||||||| || |||||||| |||||| |||      |||||||||||||| || ||||||| |    
T  23906648 tgcgttggatgagtggcaagactagacaagataggattaggaatgacaccattagagagagagagagagtgggggtagcacctatagtag-aaaagtttg 23906550  T
Q  278 tagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagagg 377  Q
    ||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||  ||||||||  | ||||||||||||||| | |||||||||||||  || |||| |||    
T  23906549 tagaaaataggcttagatggtttgagcatgtagagagaagac--gtagatgccgtggtaagaagagtagattaaatggaggagagtcaagttaaaaaagg 23906452  T
Q  378 tagaggaagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcg 475  Q
    || | ||||| |||  |||||||  ||| |||| ||||| || |||||| |||| |||| |||||||||||| | || | ||||||||||||||| ||||    
T  23906451 taaatgaagacctagaaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatt-tggtgtatgatagaacactatggcg 23906353  T
Q  476 caatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
      |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23906352 tcatttgatccatgtagctgaccccacttagtgg 23906319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 181 - 509
Target Start/End: Original strand, 28236116 - 28236442
Alignment:
Q  181 atgctgcgttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggta 279  Q
    ||||||| |||||||| ||||||   ||||   ||||||||||||||| || ||||||||  ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||     
T  28236116 atgctgcattggatgaatggtaagattagatatgataggattaggaatgacaccattaga--gagagtgggggtagcacctatagtag-aaaagttggtg 28236212  T
Q  280 gaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggta 379  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||| |||| ||||| ||  || ||||  ||||    
T  28236213 gaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacttgtagatgtcgtcgtaagaagagttgatcaaatggcggagaatcaagttaaaa-tggta 28236311  T
Q  380 gaggaagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgca 477  Q
    |||||||| ||| ||||||||  ||| |||   |||  || |||||| |||| |||| ||||||||| |||| || |||||||||||| | || || | |    
T  28236312 gaggaagacctaggaaaactattagagaaatctttataaatgatttagaggtcaatgagttggatcc-aaatttggtttatgatagaatattatggtgta 28236410  T
Q  478 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28236411 atttgatctatgtagccgaccccacttagtgg 28236442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 196 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 46583160 - 46582857
Alignment:
Q  196 agtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttagg 294  Q
    ||||||||  |||||| | |||||||||||||| || ||||| || |||||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||     
T  46583160 agtggtaagactagacagcataggattaggaatgacaccattcgagagagagtggggatagcacctatagtag-aaaagttggtagaaaataggcttaga 46583062  T
Q  295 cggtttggacatgtagagagaagactt-gtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatg 393  Q
     || |||| ||||||||||  ||||   |||||||   | ||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||| |||||    
T  46583061 tgggttgggcatgtagaga--agaccccgtagatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctatg 46582964  T
Q  394 aaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgta 491  Q
    |||||||  ||| |||| ||| | || ||||||||||| |||| ||||||||| |||| || | ||||||||||| ||| ||||  ||||||||||||||    
T  46582963 aaaactattagagaaaccattggaaaggatttaaaggtcaatgagttggatcc-aaatttggtgtatgatagaaccctatggcgtcatttgatccatgta 46582865  T
Q  492 gccgaccc 499  Q
    ||| ||||    
T  46582864 gcctaccc 46582857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 281 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 53518571 - 53518346
Alignment:
Q  281 aaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtag 380  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||   ||||   ||| |||||||||    
T  53518571 aaaataggcttaggtggtttgggtatgtagagagaagacctgtggatgctgtagtacgaagagtagatcagatggag---agtcaaatcagaagaggtag 53518475  T
Q  381 aggaagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaa 478  Q
    ||||||  |||  |||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| |||| ||    
T  53518474 aggaaggcctagaaaaactatgagaaaaactaataggaaagatttagaggttaatgagttggatctaaa-tatggtttatgatagaacactatggcgtaa 53518376  T
Q  479 tttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  53518375 tttgatccatgcag-cgaccccacttagtgg 53518346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 185 - 509
Target Start/End: Original strand, 51421667 - 51421990
Alignment:
Q  185 tgcgttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaa 283  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||| |||| || ||||||||  ||| ||  ||||||||| ||||| || |  || || ||||||    
T  51421667 tgcgttggatgagtagtaagactagacgagataggattatgaatgacaccattaga--gagtgttggggtagcacatatagtag-attagatgatagaaa 51421763  T
Q  284 ataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagagg 383  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| || |||||||||  ||||||| | |  || ||||||||||||| |||||||   ||| | ||||||||||||||||    
T  51421764 ataggcttaggtggtttgggcatatacagagaagaccggtagatgttgtaatacgaagagtagatcaaatggaggtttgtcagatcaaaagaggtagagg 51421863  T
Q  384 aagagctatgaaaac--taagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaattt 481  Q
    ||||  ||  |||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||| || | || |||||    
T  51421864 aagatttagaaaaactataagagaaactattaggaaagatttagaggttaatgaattggatccaaaa-atggtttatgatagaacattatgacgtaattt 51421962  T
Q  482 gatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||||||||| | | ||||||||||    
T  51421963 gatccatgtagccaatctcacttagtgg 51421990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 188 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 45205192 - 45204862
Alignment:
Q  188 gttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagt-gagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaat 285  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||   ||||||| | ||||||  ||||||| || ||||| |||||||||||    
T  45205192 gttggatgagtggtaagactagacgggataggattaggaatgacaccattaacgagagagttgggggtagtgcctatagtag-aaaagatggtagaaaat 45205094  T
Q  286 aggctt--aggcggtttggacatgtagagagaagacttgtag-------atgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagag 376  Q
    || |||  ||| ||||||  || ||||||||||||| |||||       ||| | | ||| ||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||    
T  45205093 agacttttaggtggtttgtgcacgtagagagaagacctgtagtctgtagatgatgttgtacgaagagtagatcagatggaggagag-cagatcaaaagag 45204995  T
Q  377 gtagaggaagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggc 474  Q
    || |||||||| |||  |||||||  ||| |||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||    
T  45204994 gtggaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaagatttagagtttaataagttggatcc-aaatatggtttatgatagaacatta-ggc 45204897  T
Q  475 gcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    | ||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  45204896 gtaatttgatctatgtagcccacccaacttagtgg 45204862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 192 - 501
Target Start/End: Original strand, 27983142 - 27983445
Alignment:
Q  192 gatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggct 290  Q
    ||||||||||||  ||| ||  ||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||       |||    
T  27983142 gatgagtggtaagactatacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgagggtagcacctatagtag-aaaagttggtag-------gct 27983233  T
Q  291 taggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagct 390  Q
    |||  |||||| |||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  |    
T  27983234 tagatggtttgaacatgtagagagaagactcgtagatgccgttgtaagaagagtatatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacat 27983333  T
Q  391 atgaaaac--taagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccat 488  Q
    | ||||||  |  || ||||  |||| ||||||||| || | ||||  |||||| |||||||||  || | ||||||||||| | ||  |||||||||||    
T  27983334 aagaaaaccattcgataaacctttagaaaagatttagagttcaatgaattggat-caaaatatggatttttatagaacactatgacgtcatttgatccat 27983432  T
Q  489 gtagccgacccca 501  Q
    |||||||| ||||    
T  27983433 gtagccgatccca 27983445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 185 - 505
Target Start/End: Original strand, 50286906 - 50287217
Alignment:
Q  185 tgcgttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaa 283  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||| || |||||||| ||||     |||    |||||||| || |||||||||||||||    
T  50286906 tgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagag-----ggg----acctatagtag-aaaagttggtagaaa 50286995  T
Q  284 ataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagagg 383  Q
    |||| ||| |  ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||  | ||||||||||||||||  |||||||||||||  || |||||||||||| |    
T  50286996 atagacttggatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcgaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaag 50287095  T
Q  384 aagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaattt 481  Q
    |||| ||||||||||||  |||  ||  ||||  || |||||| |||| |||| ||||||| | |||| |||| ||||||||||||||| || || ||||    
T  50287096 aagacctatgaaaactattagagtaatcattataaaggatttagaggtcaatgagttggat-ctaaatttgatgtatgatagaacactatgg-gccattt 50287193  T
Q  482 gatccatgtagccgaccccactta 505  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    
T  50287194 gatccatgtagtcgaccccactta 50287217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 239 - 509
Target Start/End: Original strand, 20192023 - 20192292
Alignment:
Q  239 aaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaag 338  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||| ||||||   |||||| ||||||||||||||||  ||||||||| | |||||    
T  20192023 aaagagagtgggggtagcacttatagtag-aaaagttgatagaaaataagcttagatagtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgctgtggtaag 20192121  T
Q  339 aagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatggg 436  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||  || ||||||||||| |||||| ||   |||||||  ||| |||| ||||| || |||||| |||| | ||||    
T  20192122 aagagtatatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagtggaagacctgaaaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcagtggg 20192221  T
Q  437 ttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||||||| |||| |||| |||||||||||| || | ||  ||||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  20192222 ttggatcc-aaatttgatgtatgatagaacattatgacgttatttgat-caagtagccgaccctacttagtgg 20192292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 185 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 47265549 - 47265217
Alignment:
Q  185 tgcgttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaa 283  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||||  |||| ||||| |||| || |||||| | |||||||| ||||| ||||||||| || ||||| | |||||||    
T  47265549 tgcgctggatgagtggtaagactagacatgataagattatgaatgacaccattatagagagagtgggggtaacacctatagtag-aaaaggtagtagaaa 47265451  T
Q  284 ataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtag-------atgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagag 376  Q
    ||||| ||||  | ||||| ||||||||||||||||  ||||       ||||  ||||||||||||||||  | |||||||||| ||  || |||||||    
T  47265450 ataggtttagatgatttgggcatgtagagagaagacacgtagtccgtagatgccgtcgtaagaagagtagactaaatggaggagattctagttaaaagag 47265351  T
Q  377 gtagaggaagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggc 474  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||  ||| |||| ||||| ||  ||||| |||| |||| |||||||||||| | |||| |||||||||||||||  |     
T  47265350 gtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaagaatttagaggtcaatgagttggatccaaatt-tgatctatgatagaacactatagt 47265252  T
Q  475 gcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47265251 gtaatttgatccatgtagccgacctcacttagtgg 47265217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 274 - 509
Target Start/End: Original strand, 8286455 - 8286699
Alignment:
Q  274 ttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaa 373  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||  || | ||    
T  8286455 ttggtagaaaataggcttagatggtttaggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtcgtaagaagagtagatgaaatggaggagagtcaagttagaa 8286554  T
Q  374 gagg--------tagaggaagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatag 463  Q
    ||||        |||||||||| ||| ||||||||  ||| |||| ||||| || |||||| |||| |||| |||||||||||| | || ||||||||||    
T  8286555 gaggacaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatt-tggtttatgatag 8286653  T
Q  464 aacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||| | ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8286654 aacactatgacgtcatttgatccatgtagccgcccccacttagtgg 8286699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 268 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 20601910 - 20601674
Alignment:
Q  268 gaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcggg 367  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||  |||||||||||||||| |||||||||  | |||||||||||| || ||||||||||||||| ||    
T  20601910 gaaaagttggtagaaaataggattagatggtttgtgcatgtagagagaagacctgtagatgccgttgtaagaagagtatataagatggaggagagtcagg 20601811  T
Q  368 tcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaac--taagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaa 465  Q
    |||||||||||||| ||||| || |||||||  ||||| |||| |||| |||||      |||| |||| ||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  20601810 tcaaaagaggtagaagaagacct-tgaaaactataagagaaaccatta-gaaag----tcaggtcaatgagttggattc-aaatatgatttatgatagaa 20601718  T
Q  466 cactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    || || | || |||||||| |||||| | || ||||||||||||    
T  20601717 cattatgacgtaatttgattcatgtaactgaacccacttagtgg 20601674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 336 - 509
Target Start/End: Original strand, 35690357 - 35690531
Alignment:
Q  336 aagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaat 433  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||  |||||||  ||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||    
T  35690357 aagaagagtggattagatggaggaaagtcagatcaaaagaggtagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattacgaaaaatttagaggttaat 35690456  T
Q  434 gggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    | ||| |||||||   | | |||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35690457 gagtttgatccaatc-agggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 35690531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 343 - 509
Target Start/End: Original strand, 21236951 - 21237118
Alignment:
Q  343 gtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttgg 440  Q
    |||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||| |||| ||||| || |||||| |||| |||| |||||    
T  21236951 gtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttgg 21237050  T
Q  441 atccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||| |||| || | ||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  21237051 atcc-aaatttggtatatgatagaacactatggcgtcatttgatacatgtagccaaccccacttagtgg 21237118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 190 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 1211732 - 1211418
Alignment:
Q  190 tggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaatag- 287  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||| || ||||| ||  ||||||| | | ||||||||||| |  | |||||||||| |||||      
T  1211732 tggatgagtggtaaaactagacatgatatgattaggaatgacaccattcga--gagagtgggagcagcacctatagtaa-acaagttggtaggaaatata 1211636  T
Q  288 -gcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaag 386  Q
     |||||   |||||||  ||||||||||||||| | |||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  1211635 tgcttaaatggtttgggaatgtagagagaagacctatagatattgtcgtaagaagagtagatcagatggagtagagtcggatcaaaagagatagaggaag 1211536  T
Q  387 agctatgaaaac--taagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcg-caatttga 483  Q
    |  || || |||  ||||| ||| ||||| |||| | ||| |||| |||| |||||||||   || || ||| | ||||||||||| ||||  |||||||    
T  1211535 acataggagaactataagataaattatta-gaaaaaattagaggtcaatgagttggatcc---atttggtttctcatagaacactaaggcgtaaatttga 1211440  T
Q  484 tccatgtagccgaccccactta 505  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  1211439 ttcatgtagccgaccccactta 1211418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 253 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 7092498 - 7092290
Alignment:
Q  253 tagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcaga 352  Q
    |||||||||||| || ||||  || ||||||||||| ||| | ||||||| ||| |||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  7092498 tagcacctatagtag-aaaatatgatagaaaataggtttaagtggtttgggcatatagagagaagacatgtagatgttatagtatgaagagtagatcaga 7092400  T
Q  353 tggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagcta-tgaaaactaagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatat 451  Q
    |||| ||||||| |  || ||||||| |||||||| |||  ||||  ||||  ||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||| | ||||||    
T  7092399 tggatgagagtcagaacataagaggtggaggaagacctagagaaatataagtgaaattattatgaaagatttagaggttaatgcgttagat-ctaaatat 7092301  T
Q  452 gatttatgata 462  Q
    |||||||||||    
T  7092300 gatttatgata 7092290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 185 - 293
Target Start/End: Original strand, 12494685 - 12494793
Alignment:
Q  185 tgcgttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaa 283  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  12494685 tgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagta-gaaaagttggtagaaa 12494783  T
Q  284 ataggcttag 293  Q
    ||||||||||    
T  12494784 ataggcttag 12494793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 284 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 20821255 - 20821073
Alignment:
Q  284 ataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagagg 383  Q
    ||||||||||  ||||| | |||||||||||||||| |||||||||  || ||| || ||||||| |||||||| ||| || | |||||||||||||| |    
T  20821255 ataggcttagatggtttaggcatgtagagagaagacctgtagatgccttcataacaaaagtagattagatggagcagaatcagatcaaaagaggtagatg 20821156  T
Q  384 aagagctatgaaaac--taagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaac 466  Q
    |||| ||| ||||||  ||||| |||| ||||| || ||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  20821155 aagacctaggaaaactataagagaaac-attagaaaggatttaaaggtcaatgagttggattc-aaatatgatttatgatagaac 20821073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 250 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 41009631 - 41009414
Alignment:
Q  250 gggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaa-taggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagat 348  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||| |||| ||| |||||  ||||||  |||||||| ||||||| ||| |||||  ||||||||| | |||||    
T  41009631 gggtagcacctatagtag-aaaagttggtaaaaaaatagacttagatggtttgtgcatgtagaaagaagacatgttgatgcagtcgtaagaaaaatagat 41009533  T
Q  349 cagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaac--taagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaa 446  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||  ||||||  ||||| |||||||||| || |||||| | || |||| | ||||| | |    
T  41009532 cagatggaggagagtcaggtcaaaagtggtagaggaagacct-ggaaaactataagagaaactattagaaatgatttagaagtcaatgagatggattc-a 41009435  T
Q  447 aatatgatttatgatagaaca 467  Q
    |||||| ||||||||| ||||    
T  41009434 aatatggtttatgatataaca 41009414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 308 - 509
Target Start/End: Original strand, 28351617 - 28351819
Alignment:
Q  308 tagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaac--taagaaa 405  Q
    |||||||||||| ||||||  || | ||||| |||||||||||||||||||| |||| | | | ||||||||||| |||| |||  |||||  ||||| |    
T  28351617 tagagagaagacctgtagactctgtagtaaggagagtagatcagatggaggatagtcagattacaagaggtagagaaagacctagaaaaactataagaga 28351716  T
Q  406 aactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccactta 505  Q
    |||||||| |||||||||| || ||| || ||||||||| ||||||  |||||  ||||||  || ||    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28351717 aactattacgaaagatttagagattattgagttggatcc-aaatatagtttatagtagaaccttatggaattatttgatccatgtagccgaccccactta 28351815  T
Q  506 gtgg 509  Q
    ||||    
T  28351816 gtgg 28351819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 232 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 20591599 - 20591437
Alignment:
Q  232 ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgcta 331  Q
    |||||||  |||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| | ||||  ||||||| |||||||||||||||||  |||||| |     
T  20591599 ccattagggagagagtgggggtagcacttatagtag-aaaagttggtagaaaataagattagatggtttgggcatgtagagagaagactcatagatg-tc 20591502  T
Q  332 tcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaacta 400  Q
      |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||    ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  20591501 gtgtaagaagagtatatcagatggaggagagtcaagt----agaggtagaggaagacctaagaaaacta 20591437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 250 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 37773732 - 37773477
Alignment:
Q  250 gggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatc 349  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||| |||  ||| ||    | ||||| ||||||||||    
T  37773732 gggtagcacctatagtag-aaaagtcggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagatagacgacccgtaaatatcgttgtaagtagagtagatc 37773634  T
Q  350 agatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaa 447  Q
    | ||||| |||||||   | |||||||||||| ||| | ||| ||||||||  ||| |||| ||||| || |||||  |||| |||| |||||||||| |    
T  37773633 aaatggatgagagtcaatttaaaagaggtagatgaatacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttggaggtcaatgagttggatccaga 37773534  T
Q  448 atatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccactta 505  Q
     | || ||||||||||||||||| | |  ||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  37773533 tt-tggtttatgatagaacactatgacataatttgatctatatagccgaccccgctta 37773477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 337 - 509
Target Start/End: Original strand, 31459093 - 31459254
Alignment:
Q  337 agaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaactaagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatggg 436  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||          ||||||||||||||||||||||| || |||||| |    
T  31459093 agaagagtagatcatatgtaggagagtcagatcaaaagaggtaaaggaagaccta----------gaaaaactattaggaaagatttagagattaatgag 31459182  T
Q  437 ttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||||  |||||| | | |||| ||||| || |||| || |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31459183 ttggatcc-caatatggtgtgtgattgaacattatggcggaacttgatccatgtacccgaccccacttagtgg 31459254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 378 - 509
Target Start/End: Original strand, 6957726 - 6957858
Alignment:
Q  378 tagaggaagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcg 475  Q
    |||||||||| ||| ||||||||  ||| |||| ||||| || |||||| |||| |||| |||||||||||| | |||| ||||||||||||||| | ||    
T  6957726 tagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatt-tgatgtatgatagaacactatgacg 6957824  T
Q  476 caatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6957825 tcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgg 6957858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 190 - 488
Target Start/End: Original strand, 16002867 - 16003165
Alignment:
Q  190 tggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaatagg 288  Q
    ||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||| || |||||| | || |||||||| | |||||||| | |  |||||||| ||||||||||     
T  16002867 tggatgagtggtaagactagacgaaataggattaggaatgacaccattatagagtgagtgaggatggcacctatggta-taaaagttgatagaaaatagt 16002965  T
Q  289 cttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagag 388  Q
    |||||  || ||| |||| ||||||||||||  ||||||||  || ||||||| ||| |||||||||| || |||   |||||||||  |||||||| |     
T  16002966 cttagatgg-ttgaacatttagagagaagacccgtagatgccgtcataagaagggtaaatcagatggatgaaagttatgtcaaaagaaatagaggaatac 16003064  T
Q  389 ctatgaaaac--taagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatcc 486  Q
    |    |||||  ||||| |||| ||||| ||| ||||| |||| |||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| | || ||||| ||||    
T  16003065 cgtaaaaaactataagagaaaccattagaaaaaatttagaggtcaatgagttggat-ctaaatatgatttatgataaaacactatgacgtaatttaatcc 16003163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 304 - 447
Target Start/End: Original strand, 50679559 - 50679703
Alignment:
Q  304 catgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaacta--a 401  Q
    |||||||| |||||| | |||||||  |||||||||||||||||| | |||||||||||||  || | |||||||||||||||| ||| ||||||||  |    
T  50679559 catgtagaaagaaga-tcgtagatgtcatcgtaagaagagtagattaaatggaggagagtcaagttagaagaggtagaggaagacctaggaaaactatta 50679657  T
Q  402 gaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaa 447  Q
    || |||| ||||| || |||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  50679658 gagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaa 50679703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 405 - 509
Target Start/End: Original strand, 21528445 - 21528548
Alignment:
Q  405 aaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccactt 504  Q
    |||| ||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| |||| |||| ||| ||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  21528445 aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggattcaaa-tatggtttttgatagaacactatggtggcatttgatccatgtagccgaccccactt 21528543  T
Q  505 agtgg 509  Q
    |||||    
T  21528544 agtgg 21528548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 400 - 508
Target Start/End: Original strand, 31043224 - 31043331
Alignment:
Q  400 aagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccc 499  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||  ||  |||||||||| || ||| |||||    
T  31043224 aagagaaactattaggaaagatttagagattaatgagttggatcc-aaatatggtttgtgatagaacactattgcataatttgatccttgcagctgaccc 31043322  T
Q  500 cacttagtg 508  Q
    |||||||||    
T  31043323 cacttagtg 31043331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 206 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 42639346 - 42639108
Alignment:
Q  206 ctagacgggataggattaggaataacc-cattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggac 304  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |  | ||||| ||||||| ||||| |||||||||| || ||||| |||| ||||  ||||||||| |||||||||    
T  42639346 ctagacgggataggattataaatagcaaccttagagagagagttagggttgcacctatagtag-aaaagatggtggaaaccaggcttaggtggtttggac 42639248  T
Q  305 atgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaact--aag 402  Q
    ||||||||||||||||| | ||| || | |||||  | ||| || ||||||||| |||||   |||  ||||||||||||| | |||  ||||||  |||    
T  42639247 atgtagagagaagacttatggattctgtggtaaggggggtaaattagatggaggggagtcaaatcactagaggtagaggaatatctagaaaaactgcaag 42639148  T
Q  403 aaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggat 442  Q
    | ||||||||| ||||||| ||  | |||||| |||||||    
T  42639147 agaaactattaagaaagatctagcgattaatgagttggat 42639108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 409 - 509
Target Start/End: Original strand, 55007907 - 55008006
Alignment:
Q  409 tattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtg 508  Q
    ||||| |||||||||| || |||||| |||||| || ||||||| ||||||||||| || || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55007907 tattaagaaagatttagagattaatgagttgga-ccgaaatatggtttatgatagatcattatgacgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtg 55008005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 241 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 35555937 - 35555799
Alignment:
Q  241 agagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaa 340  Q
    |||||||  ||||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||| ||| || | || || |    
T  35555937 agagagttcgggtagcacctatagtag-aaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggcatttagagagaagacctgtggattctgtagttagga 35555839  T
Q  341 gagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtag 380  Q
    |||||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||||||    
T  35555838 gagtagattagatagaggagagttgggtcactagaggtag 35555799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 378 - 509
Target Start/End: Original strand, 7947065 - 7947197
Alignment:
Q  378 tagaggaagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcg 475  Q
    |||||||||| ||| ||||||||  ||| |||| ||| | || |||||| |||| |||  |||||||||||| | ||||||||||||||||||||    |    
T  7947065 tagaggaagacctaagaaaactattagagaaaccatttgaaaggatttagaggtcaatcagttggatccaaatt-tgatttatgatagaacactatcatg 7947163  T
Q  476 caatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7947164 taatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 7947197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 241 - 359
Target Start/End: Original strand, 28497482 - 28497598
Alignment:
Q  241 agagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaa 340  Q
    |||||||  ||||||||||| ||| || ||||| | || ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  | | ||||| |    
T  28497482 agagagttggggtagcacctttagtag-aaaagattgtggaaaa-aggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacttgtagattatgtagtaagga 28497579  T
Q  341 gagtagatcagatggagga 359  Q
    |||||||||||||||||||    
T  28497580 gagtagatcagatggagga 28497598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 185 - 318
Target Start/End: Original strand, 31458963 - 31459098
Alignment:
Q  185 tgcgttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaaga--gagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtaga 281  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||||  ||||||||||||||| |  |||||||| |||  ||||   |||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  31458963 tgcgttggttgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgataccattagagagacagagtcgaggtagcacctatagtag-aaaagatggtaga 31459061  T
Q  282 aaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaaga 318  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  31459062 aaataggcttaggtggtttgggcatgtaaagagaaga 31459098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 408 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 34208390 - 34208295
Alignment:
Q  408 ctattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccactta 505  Q
    |||||||||||| |||| || |||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||    
T  34208390 ctattaggaaag-tttagagattaatgagttggatccaaa-tatggtttatgatagaacattatggcgcaatttgatccatgtactcgacccccctta 34208295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 275 - 508
Target Start/End: Original strand, 55579057 - 55579290
Alignment:
Q  275 tggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaag 374  Q
    |||||||||||| ||||||| |||| || |||||| ||||||||  | || ||| | | ||| |||||||| ||  ||||||||||||||   |||||||    
T  55579057 tggtagaaaatatgcttaggtggttcgggcatgtaaagagaagatatataaatgttgtagtatgaagagtaaatttgatggaggagagtcaaatcaaaag 55579156  T
Q  375 aggtagaggaagagctatgaaaac--taagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacg 472  Q
    ||||||| ||||| |||  |||||  ||| | ||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||   ||| | | ||||||||| |||| || |    
T  55579157 aggtagaagaagacctagaaaaactataaaataaactattttgaaagatttaaaggttcatgagttggat-ttaaacaaggtttatgata-aacattatg 55579254  T
Q  473 gcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtg 508  Q
        |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  55579255 atataatttgatccatgtagccaaccccacttagtg 55579290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 426 - 509
Target Start/End: Original strand, 19969359 - 19969441
Alignment:
Q  426 aggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||| |||| |||||||||||| | || ||||||||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19969359 aggtcaatgagttggatccaaatt-tggtttatgatagaacgctatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 19969441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 373 - 509
Target Start/End: Original strand, 53540413 - 53540550
Alignment:
Q  373 agaggtagaggaagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacacta 470  Q
    ||||| ||||||||| |||  |||||||  ||| |||||||||||||||| ||  || |||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||| ||    
T  53540413 agaggcagaggaagacctagaaaaactataagataaactattaggaaagacttggagattaatgagttgga-caaaaatatggtttatgatagaacatta 53540511  T
Q  471 cggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
     |||  |||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  53540512 tggcataatttgatccatatagccaaccccactgagtgg 53540550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 378 - 509
Target Start/End: Original strand, 12494791 - 12494923
Alignment:
Q  378 tagaggaagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcg 475  Q
    |||||||||| ||| ||||||||  ||| |||| ||||| || |||||| |||| |||| |||||||||||| | || | ||||||||||||||| | ||    
T  12494791 tagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatt-tggtgtatgatagaacactatgacg 12494889  T
Q  476 caatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
      |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  12494890 tcatttaatccatgtagcggaccccacttagtgg 12494923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 448 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 40018272 - 40018210
Alignment:
Q  448 atatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgga 510  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40018272 atatgatatatgatagaacattacggcgtcgtttgatccatgtagccgaccccacttagtgga 40018210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 233 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 44047646 - 44047553
Alignment:
Q  233 cattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagat 327  Q
    ||||||| |||||||  ||||||||||||||| || ||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  44047646 cattagagagagagttggggtagcacctatagtag-aaaaggtggtagaatctaggcttaggtggtttggacatgtagagttaagacctgtagat 44047553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 268 - 349
Target Start/End: Original strand, 50662405 - 50662487
Alignment:
Q  268 gaaaagttggtagaaaataggcttaggcggttt-ggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatc 349  Q
    |||||| |||| |||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||    
T  50662405 gaaaagatggtggaaagtaggcttaggtggttttgggcatgtagagagaagacttgtagattctattgtaaggagagtagatc 50662487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 420 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 19154973 - 19154885
Alignment:
Q  420 atttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||| |||| |||| |||||||||||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  19154973 atttagaggtcaatgagttggatccaaatt-tggtttatgatagaacactatggcgttatttgatccatgcagctgaccccacttagtgg 19154885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 357
Target Start/End: Original strand, 54470146 - 54470314
Alignment:
Q  189 ttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataacc-cattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaatag 287  Q
    ||||||| |||||||  ||||| |||||| |||| | ||||||  ||||||| |||||||  ||||||||||||||| || ||||| |||| |||| |||    
T  54470146 ttggatgtgtggtaagactagatgggatatgatttgaaataacaacattagagagagagttggggtagcacctatagtag-aaaagatggtggaaactag 54470244  T
Q  288 gcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggag 357  Q
     |||| | ||||||| |||||||||||||||| |||| ||  | | ||||| |||||| |||| ||||||    
T  54470245 acttaagtggtttgggcatgtagagagaagacatgtaaattatgtagtaaggagagtaaatcaaatggag 54470314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 296 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 34233260 - 34233046
Alignment:
Q  296 ggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaa 395  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||||  | | ||||| ||||||||| ||||||||||  ||| | |||  ||||| ||||||| | |||  ||    
T  34233260 ggtttggacatgtagagagagaacatgtagattatgtagtaaggagagtagatgagatggaggatcgtcagatcactagaggcagaggaaaacctagaaa 34233161  T
Q  396 aacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagc 493  Q
    |||||  ||| ||||||||   |||||  || || |||||| ||| |||| |||||| | |||||||||||||| |   ||| |||||||||||||||||    
T  34233160 aactatcagagaaactattcataaagacctagagattaatgagttagatc-aaaataaggtttatgatagaacattgtagcgtaatttgatccatgtagc 34233062  T
Q  494 cgaccccacttagtgg 509  Q
    |||| ||||| |||||    
T  34233061 cgacgccactcagtgg 34233046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 268 - 363
Target Start/End: Original strand, 2589008 - 2589103
Alignment:
Q  268 gaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagt 363  Q
    |||||| ||||||||| ||| |||||| ||||| | ||||||||||||| |||||| ||| || | || || ||||||||||||||||||| ||||    
T  2589008 gaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttaggcatgtagagagaaaacttgtggattctgtagttaggagagtagatcagatggaggggagt 2589103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 454 - 509
Target Start/End: Original strand, 4548227 - 4548282
Alignment:
Q  454 tttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  4548227 tttatgatagaacactaaggcgtaatttgatccatgtagccaacccaacttagtgg 4548282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 406 - 509
Target Start/End: Original strand, 25574982 - 25575084
Alignment:
Q  406 aactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccactta 505  Q
    |||||||| ||||||| || || |||||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||| |  || | ||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  25574982 aactattaagaaagatctagagattaatgagttggatcgaaa-tatggtttatgatagaacattgtggtgtaatttgatccatgtagcagaccccattta 25575080  T
Q  506 gtgg 509  Q
    ||||    
T  25575081 gtgg 25575084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 458 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 49939807 - 49939756
Alignment:
Q  458 tgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49939807 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 49939756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 399 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 28550586 - 28550481
Alignment:
Q  399 taagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgacc 498  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||| ||| ||||||||  ||| |    ||||||||| ||||||| ||||    
T  28550586 taagagaaactattaggaaagatttagaggttaatgagtttgatcc-aaatatggtttttgatagaaagctatgttataatttgatcaatgtagctgacc 28550488  T
Q  499 ccactta 505  Q
    |||||||    
T  28550487 ccactta 28550481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 206 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 51252785 - 51252635
Alignment:
Q  206 ctagacgggataggattaggaataacc-cattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggac 304  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| ||  |||||||  ||||||  ||||||||||| ||| || ||||| |||| |||| |||||||||| ||| ||| |    
T  51252785 ctagacgagataggattagaaatgactacattaga--gagagttggggtagcacctctagtag-aaaagatggtggaaactaggcttaggtggtatgggc 51252689  T
Q  305 atgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggagg 358  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| |||| | ||| ||||||| ||| |||||||    
T  51252688 atgtagagagaagacatgtggattctatggcaaggagagtaggtcaaatggagg 51252635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 287 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 13805510 - 13805287
Alignment:
Q  287 ggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaag 386  Q
    |||||||| |||||||  ||||||||||||||| | |||||  | | | ||| ||| ||||||| ||||||||  ||| | |||  ||||| |||||||     
T  13805510 ggcttaggtggtttgggtatgtagagagaagacctttagattttgtagcaaggagactagatcacatggaggattgtcagatcactagaggcagaggaaa 13805411  T
Q  387 agctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgat 484  Q
    | |||  |||||||  ||| ||||||| | |||||||||  ||  ||||  |||||| |  ||||||| |||||||||||||| || ||   ||||||||    
T  13805410 acctagaaaaactataagagaaactatgaagaaagattttgagagtaataagttgga-cggaaatatggtttatgatagaacattatgggataatttgat 13805312  T
Q  485 ccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||||||||| ||||||||||||||    
T  13805311 ccatgtagccaaccccacttagtgg 13805287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 456 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 19062010 - 19061957
Alignment:
Q  456 tatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19062010 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacctagtgg 19061957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 269 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 25257844 - 25257755
Alignment:
Q  269 aaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggagg 358  Q
    ||||| ||||||||  ||| |||||| ||||||  |||||||||||||||| |||  ||||| | ||||| |||||||||||||||||||    
T  25257844 aaaagatggtagaagctagacttaggtggtttgagcatgtagagagaagacctgtgaatgctgttgtaaggagagtagatcagatggagg 25257755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 280 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 38570999 - 38570918
Alignment:
Q  280 gaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggaga 361  Q
    |||| |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||| ||| | |||||||| | | ||||||||||||||||||    
T  38570999 gaaactaggcttaggtggtttgggcatgtagaaagaagacatgtggattccatcgtaaggacaatagatcagatggaggaga 38570918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 408 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 55388333 - 55388233
Alignment:
Q  408 ctattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagt 507  Q
    |||||| |||||||||  || |||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||||||| |  || | |||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  55388333 ctattaagaaagatttggagattaatgagttagatcgaaa-tatgatttatgatagaacattgtggtgtaatttgatccatgttgtcgaccccacttagt 55388235  T
Q  508 gg 509  Q
    ||    
T  55388234 gg 55388233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 405 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 26024975 - 26024872
Alignment:
Q  405 aaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccactt 504  Q
    ||||||||| ||||||| || || |||||| |||||||| | |  ||| |||||||||||||| || || | ||||| |||||||||||||||| |||||    
T  26024975 aaactattaagaaagatctagagattaatgagttggatcgagac-atggtttatgatagaacattatggtgtaattttatccatgtagccgacctcactt 26024877  T
Q  505 agtgg 509  Q
    |||||    
T  26024876 agtgg 26024872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 410 - 498
Target Start/End: Original strand, 28486083 - 28486170
Alignment:
Q  410 attaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgacc 498  Q
    |||| |||||||||| || |||||| |||||||||||| |||||||||  || ||||| || |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  28486083 attatgaaagatttagagattaatgagttggatccaaa-tatgatttacaattgaacaatatggcgtaatttgatccatgtagctgacc 28486170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 453 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 45209283 - 45209227
Alignment:
Q  453 atttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||||||||| | || |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45209283 atttatgatagaatattatggcgtagtttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 45209227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 280 - 364
Target Start/End: Original strand, 47611757 - 47611841
Alignment:
Q  280 gaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtc 364  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |  ||||  | |  |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  47611757 gaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacctagagattttgtaataaggagagtaaatcagatggaggagagtc 47611841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 410 - 509
Target Start/End: Original strand, 28467600 - 28467698
Alignment:
Q  410 attaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||||||||||||||||  ||| | |||||||| |||| || | ||||  |||||||| || |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  28467600 attaggaaagatttaaaaattagtcggttggattcaaa-tacggtttacaatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagcggaccccgcttagtgg 28467698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 454 - 509
Target Start/End: Original strand, 29399009 - 29399064
Alignment:
Q  454 tttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  29399009 tttatgatagaacattatggcgtaatttgattcatgtagctgaccccacttagtgg 29399064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 405 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 30621326 - 30621241
Alignment:
Q  405 aaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgta 491  Q
    ||||||||| |||||||||| || |||||| |||||| || ||||||| |||||||||||||| || |||  || ||||||||||||    
T  30621326 aaactattaagaaagatttagagattaatgtgttgga-ccgaaatatggtttatgatagaacattatggcttaacttgatccatgta 30621241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 399 - 509
Target Start/End: Original strand, 37488242 - 37488351
Alignment:
Q  399 taagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgacc 498  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| || |  |||||  ||| |||| |||||||| || |||||||| || || |||| ||||||||||||||||||  ||    
T  37488242 taagagaaactattaagaaagatctagaaattaataagtttgatc-aaaatatggttaatgatagagcattatggcgtaatttgatccatgtagccagcc 37488340  T
Q  499 ccacttagtgg 509  Q
    |||||||||||    
T  37488341 ccacttagtgg 37488351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 281 - 327
Target Start/End: Original strand, 45176037 - 45176083
Alignment:
Q  281 aaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagat 327  Q
    ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45176037 aaaattggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacttgtagat 45176083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 374 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 55809148 - 55809075
Alignment:
Q  374 gaggtagaggaagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatcca 445  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||  ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  55809148 gaggtagaggaagacctagaaaaactataagagaaactgttaggaaagatttagaggttaatgagttggatcca 55809075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 456 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 7544605 - 7544553
Alignment:
Q  456 tatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7544605 tatgatagaacattatagcg-aatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 7544553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 446 - 510
Target Start/End: Original strand, 9977123 - 9977189
Alignment:
Q  446 aaatatgatttatgatagaacactacggcgc---aatttgatccatgtagccgaccccacttagtgga 510  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||||    
T  9977123 aaatatgatttatgatagaacactacggcgccataatttaatccatgtaaccg-ccccacttaatgga 9977189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 472 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 15661931 - 15661894
Alignment:
Q  472 ggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15661931 ggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 15661894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 456 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 25427937 - 25427888
Alignment:
Q  456 tatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccactta 505  Q
    |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25427937 tatgattgaacactacggtgtaatttgatccatgtaaccgaccccactta 25427888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 472 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 30634165 - 30634128
Alignment:
Q  472 ggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30634165 ggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 30634128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 233 - 349
Target Start/End: Original strand, 50680723 - 50680839
Alignment:
Q  233 cattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttg-gacatgtagagagaagacttgtagatgcta 331  Q
    ||||||| ||||||| |||| | |||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||| ||||||||| |      
T  50680723 cattagagagagagttagggcaacacctatagttg-aaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttatggcatgtagagagaaggcttgtagattccg 50680821  T
Q  332 tcgtaagaagagtagatc 349  Q
    | ||||| ||||||||||    
T  50680822 tagtaaggagagtagatc 50680839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 449 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 1965715 - 1965655
Alignment:
Q  449 tatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||||||||||||| | || |||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||    
T  1965715 tatgatttatgatagaataatatggcgtaatttgatccacgtagccgatcccatttagtgg 1965655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 373 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 2557831 - 2557693
Alignment:
Q  373 agaggtagaggaagagctatgaaaact--aagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacacta 470  Q
    ||||||||||||||| |||  ||||||  |||| ||||||||| ||| ||| | ||| |||| | |||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||    
T  2557831 agaggtagaggaagatctagaaaaactgtaagagaaactattaagaaggatctgaagattaacgagttggatcgaaa-tatggtttatgatagaacatta 2557733  T
Q  471 c-ggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
      || | |||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  2557732 ttggtgtaatttgatccatgtagccaactccatttagtgg 2557693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 405 - 509
Target Start/End: Original strand, 5306453 - 5306556
Alignment:
Q  405 aaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccactt 504  Q
    |||||| |||||| ||| || || |||||| |||||||||||| |||| ||||||| | |||| || |||| |||||||||||| ||||  |||||||||    
T  5306453 aaactagtaggaaggatctagagattaatgagttggatccaaa-tatggtttatgacataacattatggcgtaatttgatccatatagctaaccccactt 5306551  T
Q  505 agtgg 509  Q
     ||||    
T  5306552 ggtgg 5306556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 469 - 509
Target Start/End: Original strand, 15665321 - 15665361
Alignment:
Q  469 tacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15665321 tacggcgtaatttgatccatgtagctgaccccacttagtgg 15665361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 268 - 364
Target Start/End: Original strand, 26356637 - 26356733
Alignment:
Q  268 gaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtc 364  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| ||  |||||||||||| ||| | |  | | ||||| |||||||||| |||||||| |||||    
T  26356637 gaaaagatggtagaaaatagacttaggtggtttgggcacttagagagaagacatgtgggtattgtagtaaggagagtagatcggatggaggggagtc 26356733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 268 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 31897692 - 31897450
Alignment:
Q  268 gaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcggg 367  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||| || ||||||  ||||||||||| |||| ||| ||| || | || || ||||| ||| ||||||||| ||||| |     
T  31897692 gaaaagatggtagaaactagacttgggtggtttgcgcatgtagagagcagacctgtggattctgtagttaggagagtcgattagatggaggggagtcaga 31897593  T
Q  368 tcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaac--taagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaa 465  Q
    |||  |||||||| || ||| |||  |||||  ||||| ||||||||||||| ||| || || | |||| ||||||   || | ||| ||  ||||||||    
T  31897592 tcactagaggtaggggtagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaggatctagagataaatgagttgga-gaaagacatggttgttgatagaa 31897494  T
Q  466 cactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||| | |||  |||||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  31897493 cactatgacgccgtttgattcatgtagccaacctcacttagtgg 31897450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 296 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 31961502 - 31961288
Alignment:
Q  296 ggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaa 395  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| || | || || ||||| ||| ||||||||  |||||   |||  |||||||| || ||| |||  ||    
T  31961502 ggtttgggcatgtagagagaagacttgtggattctgtagttaggagagtggattagatggagaggagtcaaatcactagaggtaggggtagacctagaaa 31961403  T
Q  396 aac--taagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagc 493  Q
    |||  ||||| ||||||||||||||||| || || | |||| ||||||   || | ||| ||  ||||||||||||| | ||   |||||| ||||||||    
T  31961402 aactataagagaaactattaggaaagatctagagataaatgagttgga-gaaagacatggttgttgatagaacactatgacgtcgtttgattcatgtagc 31961304  T
Q  494 cgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||| ||||||||||    
T  31961303 cgacctcacttagtgg 31961288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 185 - 264
Target Start/End: Original strand, 35690239 - 35690319
Alignment:
Q  185 tgcgttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatag 264  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||| || || ||| | |||||||  |||||||||||||||    
T  35690239 tgcgttggatgagtagtaagactagacgagataggattaggaatgacacctttaaagagagagttggggtagcacctatag 35690319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 457 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 36255596 - 36255544
Alignment:
Q  457 atgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||||||| || || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36255596 atgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtggccgaccccacttagtgg 36255544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 268 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 45185291 - 45185203
Alignment:
Q  268 gaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatgga 356  Q
    |||||| |||| || |||||||||||| | ||||| ||| |||||| |||||||||||||  | | |||||||||||| || |||||||    
T  45185291 gaaaagatggtggataataggcttaggtgatttgggcatatagagacaagacttgtagattttgtagtaagaagagtatatgagatgga 45185203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 477 - 509
Target Start/End: Original strand, 50862859 - 50862891
Alignment:
Q  477 aatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50862859 aatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 50862891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 241 - 364
Target Start/End: Original strand, 10209026 - 10209148
Alignment:
Q  241 agagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaa 340  Q
    |||||||  |||||| |||||||| || ||||| ||| ||||| ||  |||||  ||||||| ||||||| |||||||| |||  ||  | | ||||| |    
T  10209026 agagagttggggtagaacctatagtag-aaaagatggcagaaactaaacttagttggtttgggcatgtagcgagaagacctgtgaattttttagtaagga 10209124  T
Q  341 gagtagatcagatggaggagagtc 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  10209125 gagtagatcagatggaggagagtc 10209148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 446 - 501
Target Start/End: Original strand, 12443292 - 12443347
Alignment:
Q  446 aaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgacccca 501  Q
    ||||||| |||||||||||||| || |||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  12443292 aaatatggtttatgatagaacattatggcataatttgatccatgtagccgatccca 12443347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 281 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 17666294 - 17666227
Alignment:
Q  281 aaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagat 348  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||||  | | |||||||||||||||    
T  17666294 aaaataggtttaggtggtttggacatgtagagggaaaacatgtagattatgtagtaagaagagtagat 17666227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 233 - 327
Target Start/End: Original strand, 31339521 - 31339613
Alignment:
Q  233 cattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagat 327  Q
    ||||||| |||||||  |||||| |||||| | || ||||  |||| |||| || ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  31339521 cattagagagagagttggggtagaacctatggtagaaaaa--tggtcgaaactaagcttaggtggtttgagcatgtagagagaagacttgtagat 31339613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 458 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 32633479 - 32633428
Alignment:
Q  458 tgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  32633479 tgatagaacactatggcgtcatttgatacatgtagccaaccccacttagtgg 32633428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 277 - 417
Target Start/End: Original strand, 46372051 - 46372193
Alignment:
Q  277 gtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagag 376  Q
    ||||||| ||| |||||| ||||||  |||||||||||||||| ||| ||| || |  ||||||||| ||||||||| |||| ||| | | |||  ||||    
T  46372051 gtagaaactagacttaggtggtttgtgcatgtagagagaagacatgtggattctgtactaagaagagcagatcagatagaggggagccagatcactagag 46372150  T
Q  377 gtagaggaagagctatgaaaac--taagaaaaactattaggaa 417  Q
    |||| || ||| |||  |||||  ||||| |||||||||||||    
T  46372151 gtaggggtagacctagaaaaactataagagaaactattaggaa 46372193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 334 - 509
Target Start/End: Original strand, 47147457 - 47147631
Alignment:
Q  334 gtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaacta-agaa-aaactattaggaaagatttaaaggtta 431  Q
    ||||| |||||| |||||||||||   |||||| |||  ||||| ||||||||| |||  ||||||| |||| ||||||||| ||||||| || || |||    
T  47147457 gtaaggagagtaaatcagatggagagtagtcggatcactagaggcagaggaagacctagaaaaactatagaagaaactattaagaaagatctagagatta 47147556  T
Q  432 atgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||| |||||||   | ||||||| |||||||||||| || |||    ||||||||||||| ||  ||||| |||||||    
T  47147557 atgagttggat---agatatgatatatgatagaacattatggcattgtttgatccatgtaaccatccccaattagtgg 47147631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 478 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 50238668 - 50238637
Alignment:
Q  478 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50238668 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 50238637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 478 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 50238754 - 50238723
Alignment:
Q  478 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50238754 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 50238723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 446 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 51811363 - 51811301
Alignment:
Q  446 aaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  51811363 aaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccga-cccacttagtgg 51811301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 405 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 56439696 - 56439594
Alignment:
Q  405 aaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccactt 504  Q
    ||||||||| |||||||||  |  |||||  |||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||  ||| ||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  56439696 aaactattatgaaagatttggaaattaattagttggatcgaaa-tatggtttatgatagaacattatagcgtaatttaatccatatagccaaccccactt 56439598  T
Q  505 agtg 508  Q
    ||||    
T  56439597 agtg 56439594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 304 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 20131227 - 20131165
Alignment:
Q  304 catgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgg 366  Q
    |||||| |||||||||| ||||| |  || ||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20131227 catgtaaagagaagactcgtagaagtcatagtatgaagagtagatcaaatggaggagagtcgg 20131165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 268 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 21879417 - 21879327
Alignment:
Q  268 gaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggagg 358  Q
    |||||| |||| |||| | ||||||||  ||||||||||| | ||||||||| ||||||| || | ||||| ||| ||||| |||||||||    
T  21879417 gaaaagatggtggaaactcggcttaggtagtttggacatgcatagagaagacatgtagattctttagtaaggagaatagattagatggagg 21879327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 443 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 36799745 - 36799679
Alignment:
Q  443 ccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| ||  ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36799745 ccaatatatggtttatgattgaacaatatcgcataatttgatccatgtagacgaccccacttagtgg 36799679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 268 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 46715636 - 46715546
Alignment:
Q  268 gaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggagg 358  Q
    |||||| |||| |||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||| |||  | | | ||| ||||||||||| |||||||    
T  46715636 gaaaagatggtggaaactaggcttaggtggtgtgggcatgtagagagaagacatgtggattatgtagcaaggagagtagatcatatggagg 46715546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 250 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 30621485 - 30621409
Alignment:
Q  250 gggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagat 327  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||| ||||| | ||||| || |||||||||||| ||||||||    
T  30621485 gggtagcacttatagtag-aaaagatggtggaaaataggtttaggtgatttgggcacgtagagagaagatttgtagat 30621409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 448 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 40933007 - 40932946
Alignment:
Q  448 atatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||| |||||||||||| || ||||   |||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  40933007 atatgatatatgatagaacattatggcggcgtttgatgcatgtagccgaccccacttggtgg 40932946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 477 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 50967082 - 50967049
Alignment:
Q  477 aatttgatccatgtagccgaccccacttagtgga 510  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  50967082 aatttgatccatgtagccgacctcacttagtgga 50967049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 420 - 509
Target Start/End: Original strand, 54935321 - 54935409
Alignment:
Q  420 atttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||||||| |||| | |||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||   |  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  54935321 atttaaagattaacgtgttgga-ccaagatatggtttatgatagaacattataacataatttgatccatgtagcctaccccacttggtgg 54935409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 445 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 6958324 - 6958260
Alignment:
Q  445 aaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||||||| |||  |||||||||||| ||||   |||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  6958324 aaaatatggttttggatagaacactatggcgtcgtttgattcatgtagccgaccctacttagtgg 6958260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 268 - 364
Target Start/End: Original strand, 29398836 - 29398932
Alignment:
Q  268 gaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtc 364  Q
    |||||| |||| ||||||| ||||| | ||||||| |||||||||||||||| | ||||| || | || || |||||||| | ||| ||||| ||||    
T  29398836 gaaaagatggtggaaaatatgcttatgtggtttgggcatgtagagagaagacctatagattctgtagtgaggagagtagaccggatagaggatagtc 29398932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 431 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 41729549 - 41729494
Alignment:
Q  431 aatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatcca 487  Q
    |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  41729549 aatgagttggatccaaa-tatggtttatgatagaacactatggcgtagtttgatcca 41729494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 481 - 509
Target Start/End: Original strand, 46153940 - 46153968
Alignment:
Q  481 tgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  46153940 tgatccatgtagccgaccccacttagtgg 46153968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 479 - 507
Target Start/End: Original strand, 46236719 - 46236747
Alignment:
Q  479 tttgatccatgtagccgaccccacttagt 507  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  46236719 tttgatccatgtagccgaccccacttagt 46236747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 233 - 309
Target Start/End: Original strand, 49987412 - 49987487
Alignment:
Q  233 cattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgta 309  Q
    ||||||| |||||||  ||||  ||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  49987412 cattagatagagagtctgggtcacacctatagtag-aaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttggtcatgta 49987487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 449 - 509
Target Start/End: Original strand, 51176774 - 51176834
Alignment:
Q  449 tatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||| |||| ||||||||| || |||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  51176774 tatggtttaggatagaacattatggcataatttgatccatgtagcggaccacacttagtgg 51176834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 269 - 317
Target Start/End: Original strand, 56225085 - 56225133
Alignment:
Q  269 aaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaag 317  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||    
T  56225085 aaaagatggtagaaaataggcttaggtggtttgagtatgtagagagaag 56225133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 157; Significance: 3e-83; HSPs: 122)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 185 - 509
Target Start/End: Original strand, 1210680 - 1211005
Alignment:
Q  185 tgcgttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaa 283  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  1210680 tgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtag-aaaagttggtagaaa 1210778  T
Q  284 ataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagagg 383  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  1210779 ataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagagg 1210878  T
Q  384 aagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaattt 481  Q
    |||| ||| ||||||||  ||| |||| ||||| || |||||| |||| |||| ||||||||| |||| || | ||||||||||||||| ||||  ||||    
T  1210879 aagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatcc-aaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 1210977  T
Q  482 gatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1210978 gatccatgtagccgaccccacttagtgg 1211005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 185 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 34792696 - 34792375
Alignment:
Q  185 tgcgttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaat-aacccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaa 283  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  34792696 tgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgaaaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtag-aaaagttggtagaaa 34792598  T
Q  284 ataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagagg 383  Q
     |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  34792597 gtaggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagagg 34792498  T
Q  384 aagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaattt 481  Q
    |||| ||| ||||||||  ||| |||| ||||| || ||||||||||| |||| ||||||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||  ||||    
T  34792497 aagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttaaaggtcaatgagttggatcc-aaatttggtttatgatagaacactatggcgtcattt 34792399  T
Q  482 gatccatgtagccgaccccactta 505  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  34792398 gatccatgtagccgaccccactta 34792375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 185 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 30202477 - 30202152
Alignment:
Q  185 tgcgttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaa 283  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  30202477 tgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtag-aaaggttggtagaaa 30202379  T
Q  284 ataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagagg 383  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||  | ||||||||||||||||| ||||| |||||||  || ||||||||||||||    
T  30202378 ataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggacgagagtcaagttaaaagaggtagagg 30202279  T
Q  384 aagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaattt 481  Q
    |||| ||| ||||||||  ||| |||| ||||| || |||||| |||| |||| ||||||||| |||| || | ||||||||||||||| ||||  ||||    
T  30202278 aagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatcc-aaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 30202180  T
Q  482 gatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30202179 gatccatgtagccgaccccacttagtgg 30202152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 185 - 509
Target Start/End: Original strand, 696204 - 696530
Alignment:
Q  185 tgcgttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaa 283  Q
    |||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  696204 tgcgctggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtag-aaaagttggtagaaa 696302  T
Q  284 ataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagagg 383  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||||||||  ||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  696303 ataggcttagatggcttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcatatggaggagagtcaggttaaaagaggtagagg 696402  T
Q  384 aagagctatgaaaac--taagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacacta-cggcgcaatt 480  Q
    |||| ||| ||||||  |  || |||| ||||| ||||||||| |||| |||| ||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||  ||||  |||    
T  696403 aagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagtttgatcc-aaatatggtttttgatagaacactattggcgtcatt 696501  T
Q  481 tgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  696502 tgatcaatgtagccgaccccacttagtgg 696530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 185 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 49347740 - 49347415
Alignment:
Q  185 tgcgttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaa 283  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| || ||||| || |||||||  |||||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  49347740 tgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattggagagagagtaggggtagcatctatagtag-aaaagttggtagaaa 49347642  T
Q  284 ataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagagg 383  Q
    ||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||  ||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  49347641 ataggcttagatggtttggtcatgcagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagagg 49347542  T
Q  384 aagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaattt 481  Q
    |||| ||| ||||||||  ||| |||| ||||| || |||||| |||| |||| ||||||||| |||| || | ||||||||||||||| ||||  ||||    
T  49347541 aagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatcc-aaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 49347443  T
Q  482 gatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  49347442 gatccatgtagccgaccccacttagtgg 49347415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 185 - 507
Target Start/End: Original strand, 8671855 - 8672176
Alignment:
Q  185 tgcgttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaa 283  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||| || ||||||||  ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  8671855 tgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattaga--gagagtgggggtagcacctatagtag-aaaagttggtagaaa 8671951  T
Q  284 ataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagagg 383  Q
    ||||||||||  ||||||| |||||||||||||||   ||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  8671952 ataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagatccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagagg 8672051  T
Q  384 aagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaattt 481  Q
    |||| ||| ||||||||  ||| |||| ||||| || |||||| |||| |||| ||||||||| |||| || | |||||||||||||||  |||  ||||    
T  8672052 aagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatcc-aaatttggtgtatgatagaacactatagcgtcattt 8672150  T
Q  482 gatccatgtagccgaccccacttagt 507  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  8672151 gatccatatagccaaccccacttagt 8672176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 185 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 32083092 - 32082778
Alignment:
Q  185 tgcgttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaa 283  Q
    |||| ||||||||||||||  |||||| || ||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  32083092 tgcgctggatgagtggtaagactagacagggtaggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtag-aaaagttggtagaaa 32082994  T
Q  284 ataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagagg 383  Q
    ||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||  ||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  32082993 ataggcttagatggtttggacatgcagagaggagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagagg 32082894  T
Q  384 aagagctatgaaaactaagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggc-gcaatttg 482  Q
    |||| ||| |          ||||| ||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||| |  |||||    
T  32082893 aagacctaag----------aaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggattc-aaatatggtttttgatagaacactacggcagtcatttg 32082805  T
Q  483 atccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  32082804 atccatgtagccgaccccacttagtgg 32082778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 192 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 4001795 - 4001477
Alignment:
Q  192 gatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggct 290  Q
    ||||||||||||  ||||||   |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  4001795 gatgagtggtaagactagacaaaataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtag-aaaagttggtagaaaataggct 4001697  T
Q  291 taggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagct 390  Q
    |||  ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||    
T  4001696 tagatggtttggacatgtagagaggagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacct 4001597  T
Q  391 atgaaaac--taagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccat 488  Q
    | ||||||  |  || |||| ||||  ||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||| | |   |||||||||||    
T  4001596 aagaaaaccattcgagaaaccattaaaaaagatttagaggtcaatgagttggatcc-aaatatggtttttgatagaaccctatgacatcatttgatccat 4001498  T
Q  489 gtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  4001497 gtagccaaccccacttagtgg 4001477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 185 - 509
Target Start/End: Original strand, 51601993 - 51602316
Alignment:
Q  185 tgcgttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaa 283  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||  |||| |||||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  51601993 tgcgttagatgagtggtaagactagacatgatatgattaggaatgacaccattaga--gagagtgagggtagcacctatagtag-aaaagttggtagaaa 51602089  T
Q  284 ataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagagg 383  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||  |||||||   | ||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  51602090 ataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagagg 51602189  T
Q  384 aagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaattt 481  Q
    |||| ||| ||||||||  |||||||| ||||| |  |||||| |||| |||| ||||||||| |||| || | ||||||||||||  | ||||  ||||    
T  51602190 aagacctaggaaaactattagaaaaaccattagaagggatttagaggtcaatgagttggatcc-aaatttggtgtatgatagaacatcatggcgtcattt 51602288  T
Q  482 gatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  51602289 gatccatgtagccaaccccacttagtgg 51602316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 192 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 32231294 - 32230997
Alignment:
Q  192 gatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggct 290  Q
    ||||||||||||   |||||  ||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||    
T  32231294 gatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaaa-ttggtagaaaataggct 32231196  T
Q  291 taggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagct 390  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||| ||    
T  32231195 tagatggtttgggcatgtagagagaagacttgtagatgccgtcataagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacct 32231096  T
Q  391 atgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccat 488  Q
    | ||||||||  ||| |||| ||||| || |||||| |||| |||| |||||||||||| | || | ||||||||||||||| || | ||||||||||||    
T  32231095 aggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaagt-tggtctatgatagaacactatggtgtaatttgatccat 32230997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 189 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 51441108 - 51440787
Alignment:
Q  189 ttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaatag 287  Q
    ||||| |||||||||  ||||||  ||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  51441108 ttggacgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtaacacctatagtag-aaaagttggtagaaaatag 51441010  T
Q  288 gcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaaga 387  Q
    ||||||  ||||||| ||||||||||||||||  | ||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||||  || ||| ||||||||||||||    
T  51441009 gcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccggagatgccgtggtaagaagagtagagcaaatggaggagagtcaagttaaaggaggtagaggaaga 51440910  T
Q  388 gctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatc 485  Q
     ||| ||||||||  ||| |||| ||||| || |||||| |||| |||| ||||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||  |||||||     
T  51440909 cctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttataggtcaatgagttggatcc-aaatttggtgtatgatagaacactacggcgtcatttgatt 51440811  T
Q  486 catgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||||| |||||||||||||||||    
T  51440810 catgtaaccgaccccacttagtgg 51440787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 181 - 509
Target Start/End: Original strand, 22090025 - 22090356
Alignment:
Q  181 atgctgcgttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagag--tgagggtagcacctatagcaggaaaagttgg 277  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| |||| || |||||||| ||||||  || ||||||||||||||| || |||||||||    
T  22090025 atgctgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattatgaatgacaccattagagagagagagtgggggtagcacctatagtag-aaaagttgg 22090123  T
Q  278 tagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagagg 377  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||  | ||||||| ||||||||| |||||||||||||  || ||||| ||    
T  22090124 tagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagggagaagacccgtagatgccgtggtaagaaaagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagggg 22090223  T
Q  378 tagaggaagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcg 475  Q
    |||||||||| ||| ||||||||  ||| |||| ||||| || |||||| |||| |||| ||||||||| |||| || | ||||||||||||||| | ||    
T  22090224 tagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatcc-aaatttggtgtatgatagaacactatgacg 22090322  T
Q  476 caatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
      |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22090323 tcatttgatccatgtagccgaccccactaagtgg 22090356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 265 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 25979498 - 25979253
Alignment:
Q  265 caggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtc 364  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||| ||||||||||  |||||||||||||    
T  25979498 caggaaaagttagtagaaactaggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgctgttgtaaggagagtagatcgaatggaggagagtc 25979399  T
Q  365 gggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgata 462  Q
     ||| |||||||||||||||||| | ||||||||||  ||| |||| ||||| || |||||| |||| |||| ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  25979398 aggttaaaagaggtagaggaagacccatgaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatcc-aaatatggtttatgata 25979300  T
Q  463 gaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25979299 gaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 25979253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 185 - 505
Target Start/End: Original strand, 9592669 - 9592990
Alignment:
Q  185 tgcgttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaa 283  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  9592669 tgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtag-aaaagtttgtagaaa 9592767  T
Q  284 ataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagagg 383  Q
    ||||||||||  || |||| ||||||||||||||||  ||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  9592768 ataggcttagatgggttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagagg 9592867  T
Q  384 aagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaattt 481  Q
    |||| ||| |||| |||  ||| |||| ||||| || |||||| |||| |||| ||| |||   |||| || | |||||||||||||||  |||  ||||    
T  9592868 aagacctaggaaacctattagagaaaccattagaaatgatttagaggtcaatgagttagat-ttaaatttggtgtatgatagaacactatagcgtcattt 9592966  T
Q  482 gatccatgtagccgaccccactta 505  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  9592967 gatccatgtagccgaccccactta 9592990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 241 - 509
Target Start/End: Original strand, 4029114 - 4029382
Alignment:
Q  241 agagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaa 340  Q
    |||||||| |||||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||  | |||||||    
T  4029114 agagagtgggggtagcacctagagtag-acaagttggtagaaaataggcttagaaggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaa 4029212  T
Q  341 gagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggtt 438  Q
    || ||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||| |||| ||||| || ||||||||||| |||| |||    
T  4029213 gaatagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttaaaggtcaatgagtt 4029312  T
Q  439 ggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||||| |||| || | ||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4029313 ggatcc-aaatttggtgtatgatataacactatggcgacatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 4029382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 185 - 509
Target Start/End: Original strand, 15085869 - 15086182
Alignment:
Q  185 tgcgttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaa 283  Q
    |||| |||| |||||||||  |||||  |||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  15085869 tgcgctggacgagtggtaagactagataggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtag-aaaagttggtagaaa 15085967  T
Q  284 ataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagagg 383  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||  | || |||||||||||||| ||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  15085968 ataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagagtagatcaaatggaggagagtcagattaaaagaggtagagg 15086067  T
Q  384 aagagctatgaaaactaagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttga 483  Q
    |||| ||| |          ||||| |||||  | |||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||  ||||||    
T  15086068 aagacctaag----------aaaaccattagataggatttagaggtcaatgagttggatcc-aaatatgatttttgatagaacactatgacgtcatttga 15086156  T
Q  484 tccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  15086157 tccatgtagccaaccccacttagtgg 15086182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 208 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 38807999 - 38807693
Alignment:
Q  208 agacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtga----gggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttgg 302  Q
    ||||||||||| ||||| ||| || |||||||| |||||| ||    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||  ||||| |    
T  38807999 agacgggatagaattagaaatgacaccattagagagagagagaatgggggtagcacctatagtag-aaaagttggtagaaaatagacttagatggtttag 38807901  T
Q  303 acatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaac--ta 400  Q
     |||||| |||||||||   |||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||| ||| ||||||  ||    
T  38807900 gcatgtaaagagaagacccttagatgccgtcgtaagaagagtagaccagatggaggagagtcagatcaaaagagctaggggaagacctaagaaaactata 38807801  T
Q  401 agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgacccc 500  Q
    ||| |||| ||||| || |||||| |||| || | ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  38807800 agagaaaccattagaaaggatttagaggtcaacgagttggatcc-aaatatggtttatgatagaacactatggcgtaatttgttccatgtagccgacccc 38807702  T
Q  501 acttagtgg 509  Q
    |||||||||    
T  38807701 acttagtgg 38807693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 188 - 507
Target Start/End: Original strand, 8391710 - 8392030
Alignment:
Q  188 gttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaata 286  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||  ||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  8391710 gttggatgagtggtaagactacacaagataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtag-aaaagttggtagaaaata 8391808  T
Q  287 ggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaag 386  Q
    || ||||   |||||||||||||||||| ||||  ||||||||  | ||||||||||||||||| ||| |||||||||  || ||| |||||| | ||||    
T  8391809 ggtttagattgtttggacatgtagagaggagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatgaaggagagtcatgttaaaggaggtatatgaag 8391908  T
Q  387 agctatgaaaac--taagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgat 484  Q
    | ||| ||||||  |  || |||  ||||| ||||||||| |||| |||  ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||  |||||||    
T  8391909 acctaagaaaaccattcgagaaatcattagaaaagatttagaggtcaataagttggatcc-aaatatgatttttgatagaatactatggcgtcatttgat 8392007  T
Q  485 ccatgtagccgaccccacttagt 507  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  8392008 ccatgtagccaaccccacttagt 8392030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 188 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 9599738 - 9599416
Alignment:
Q  188 gttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataacc-cattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaata 286  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| ||  ||||||| |||||||  | ||| ||||||||| || ||||| ||||||||||||    
T  9599738 gttggatgagtggtaagactagacgggatatgattaggaatgacatcattagagagagagttggagtaacacctatagtag-aaaagatggtagaaaata 9599640  T
Q  287 ggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaag 386  Q
    |||||||| |||| || ||| || | ||| ||| || ||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  9599639 ggcttaggtggttcgggcatataaatagatgacctgcagatgttatagtacaaagagtagatcagatggaggagagtcagatcataagaggtagaggaag 9599540  T
Q  387 agctatgaaaact--aagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgat 484  Q
    | |||  ||||||  |||| |||||||||||||| ||||| || |||||| ||| ||||| | ||||| |||||||||||||  || |||| ||||||||    
T  9599539 acctagaaaaactacaagagaaactattaggaaatatttagagtttaatgagtttgatcc-agatatggtttatgatagaacgttatggcgtaatttgat 9599441  T
Q  485 ccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||    
T  9599440 ccatgtagctgaccttacttagtgg 9599416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 185 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 43240728 - 43240401
Alignment:
Q  185 tgcgttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagag--tgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtaga 281  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||| |||| || |||||||| ||||||  || ||||||||||||||| || |||| ||| ||||    
T  43240728 tgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattatgaatgacgccattagagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaaa-ttgataga 43240630  T
Q  282 aaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtaga 381  Q
    ||||||||||||   |||||  ||||||||||||||||  ||||||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||||   || |||| |||||||    
T  43240629 aaataggcttagatagtttgagcatgtagagagaagacccgtagatgttgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagttaagttaaaaaaggtaga 43240530  T
Q  382 ggaagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaat 479  Q
    |||||| ||| ||||||||  ||| |||| ||||| || |||||| | || |||| ||||||||| |||| || | ||||||||||||||| ||||  ||    
T  43240529 ggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaatgatttatatgtcaatgagttggatcc-aaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcat 43240431  T
Q  480 ttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  43240430 ttgattcatgtagccgacctcacttagtgg 43240401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 189 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 37463214 - 37462898
Alignment:
Q  189 ttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaatag 287  Q
    |||||||||||||||  |||||| || ||||||||||||| || ||||||||  ||||||  ||||||||||||||| || |||||   |||||||||||    
T  37463214 ttggatgagtggtaagactagacaggttaggattaggaatgacaccattaga--gagagttggggtagcacctatagtag-aaaagacagtagaaaatag 37463118  T
Q  288 gcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaa-gaggtagaggaag 386  Q
    ||||||| ||||||| |   || |||| |||| |||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||      
T  37463117 gcttaggtggtttgggc---tatagagtagacatgtagatgccgtagtacgaagagtagatcagatggaggagagtcggatcaaaaagaggtagaggatt 37463021  T
Q  387 agctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgat 484  Q
    | |||  |||||||  ||| |||| || ||||| |||||| ||||||||| ||| ||||  ||||||| ||||| |||||||| || |||| ||||||||    
T  37463020 acctagaaaaactataagagaaacgatcaggaatgatttagaggttaatgagtttgatc--aaatatggtttatcatagaacattatggcgtaatttgat 37462923  T
Q  485 ccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  37462922 ccatgtagccgaccccacttagtgg 37462898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 188 - 500
Target Start/End: Original strand, 9509256 - 9509569
Alignment:
Q  188 gttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaata 286  Q
    |||||||||||| |||  |||||| ||||| |||||| ||| || |||||||| |||||||  ||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||    
T  9509256 gttggatgagtgataagactagacaggatatgattagaaatgacaccattagagagagagttggggtagcacctatagtag-aaaagatggtaaaaaata 9509354  T
Q  287 ggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaag 386  Q
    ||||||||  |||||| ||||||||||||||||  ||| ||||| | |||   |||||||||||||||||||||||||   | | |||||||||||||||    
T  9509355 ggcttaggtagtttgggcatgtagagagaagaccggtatatgctttagtacttagagtagatcagatggaggagagtcatattagaagaggtagaggaag 9509454  T
Q  387 agctatgaaaac--taagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgat 484  Q
    | |||  |||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||| ||| || || ||||||| |||||||| ||||| || |||| |||| |||    
T  9509455 acctagaaaaactataagataaactattaggaaagatttacagcctaatgagttagagcc-aaatatggtttatgattgaacattatggcgtaattcgat 9509553  T
Q  485 ccatgtagccgacccc 500  Q
    ||||||||||||||||    
T  9509554 ccatgtagccgacccc 9509569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 269 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 32404789 - 32404548
Alignment:
Q  269 aaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggt 368  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||||||||  |||||||||| ||||   |    
T  32404789 aaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttggatatgtagagagaagacctgtagattctatagtaaggagagtagagaagatggaggatagtcatat 32404690  T
Q  369 caaaagaggtagaggaagagctatgaaaac--taagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaac 466  Q
    || |||||||||||||||| |||  |||||  ||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||  |||| ||| ||| ||||||||| |||    
T  32404689 cacaagaggtagaggaagacctacaaaaactataagagaaactattaggaaagatttagagattaatgagttaaatcc-aaacatggtttatgatataac 32404591  T
Q  467 actacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32404590 ataatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 32404548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 332 - 499
Target Start/End: Original strand, 39318211 - 39318379
Alignment:
Q  332 tcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaac--taagaaaaactattaggaaagatttaaaggt 429  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||| |||| ||||| || |||||| ||||    
T  39318211 tcgtaagaagagcagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactataagagaaaccattagaaaggatttagaggt 39318310  T
Q  430 taatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccc 499  Q
     |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  39318311 caatgagttggatcc-aaatatggtttatgatagaacactatggcgtaatttgatccatgtagccgaccc 39318379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 188 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 27848148 - 27847940
Alignment:
Q  188 gttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaata 286  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||   |||||||||| | | || ||||| ||||||||||||    
T  27848148 gttggatgagtggtaagactagacgggataggat-aggaataacaccattagagagagagttgtggtagcacctgtggtag-aaaagatggtagaaaata 27848051  T
Q  287 ggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaag 386  Q
     ||||||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  27848050 agcttaggtggtttgggcatgcagagagaagacctgtagatgctgtagtatgaagagtatatcagatggaggagagtcagctcagaagaggtagaggaag 27847951  T
Q  387 agctatgaaaa 397  Q
    | || ||||||    
T  27847950 acctttgaaaa 27847940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 280 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 52561841 - 52561611
Alignment:
Q  280 gaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggta 379  Q
    ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||   |||||| |   ||| ||||||||||||||||||||||||||  | | | ||||||||    
T  52561841 gaaaataggcttaggtggtttcggcatgtagagagaagaccgatagatgttgcagtacgaagagtagatcagatggaggagagttagattagaagaggta 52561742  T
Q  380 gaggaagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgca 477  Q
    ||||||||  ||  |||||||  ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| |||  | ||||||| || |||| |    
T  52561741 gaggaagacttagaaaaactataagagaaactgttaggaaagatttagaggttaatgagttggatccaaa-tatggtttcgggtagaacattatggcgaa 52561643  T
Q  478 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52561642 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 52561611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 214 - 509
Target Start/End: Original strand, 39140484 - 39140775
Alignment:
Q  214 gataggattaggaat-aacccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagag 312  Q
    ||||||||||||||| || |||||| | |||||||  | ||||||||||||| || ||||| ||| | ||||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  39140484 gataggattaggaatgaaaccattacagagagagttggcgtagcacctatagtag-aaaagatggcaaaaaattggcttaggtggtttgggcatgtagag 39140582  T
Q  313 agaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaactaagaaaaactatt 412  Q
    |||||||   || ||| | | ||| ||||||||||||||||||| ||||||| | | | ||||||||||||||   |||  |||  || || ||||||||    
T  39140583 agaagaccgatacatgttgtagtacgaagagtagatcagatggatgagagtcagattagaagaggtagaggaa---ctaaaaaagttatgagaaactatt 39140679  T
Q  413 aggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||||| ||||| ||||||||  ||||||||| ||||||| |||  ||||||||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39140680 aggaaaaatttagaggttaattagttggatcc-aaatatggtttcagatagaacattatggcgtaatttgattcatgtagccgaccccacttagtgg 39140775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 334 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 37311953 - 37311777
Alignment:
Q  334 gtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaactaa--gaaaaactattaggaaagatttaaaggtta 431  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||| |||||| |   || |||| ||||| ||||||||| |||| |    
T  37311953 gtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggtagacctaggaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtca 37311854  T
Q  432 atgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||| |||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37311853 atgagttggatccaaa-tatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 37311777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 181 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 18469431 - 18469104
Alignment:
Q  181 atgctgcgttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataaccca-ttagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggta 279  Q
    ||||||||||| |||||||||||  ||||||  |||| |||||||||| || || |||||  ||||||  ||||| ||||||||| || | ||| || ||    
T  18469431 atgctgcgttgtatgagtggtaagactagacatgatatgattaggaatgacacaattaga--gagagttggggtaacacctatagtag-agaagatgata 18469335  T
Q  280 gaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggta 379  Q
    ||||||||| |||||  |||||||||| ||| ||||||||| ||||||| | | ||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  18469334 gaaaataggattaggtagtttggacatatagtgagaagactggtagatgttgtagtacgaagagtaaatcagatggagaagagtcggatcaaaagaggta 18469235  T
Q  380 gaggaagagctatgaaaa--ctaagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgca 477  Q
    || |||||  ||  ||||   ||||| ||||| |||||||| ||| | |||| |||| ||||||| | ||||||  |||||||| ||||| || || | |    
T  18469234 gatgaagacttagaaaaattataagagaaacttttaggaaatattaagaggtcaatgagttggatac-aaatatagtttatgatcgaacattatggtgta 18469136  T
Q  478 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||||||||    
T  18469135 atttggttcatgtagacgaccccacttagtgg 18469104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 268 - 442
Target Start/End: Original strand, 478698 - 478872
Alignment:
Q  268 gaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcggg 367  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||  ||    
T  478698 gaaaagttggtagaaaaaag-cttaggtggtttggacattcagatagaa-acttgtagatgctgtcgtaagaagagtagatcagatgaaagagagttagg 478795  T
Q  368 tcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaac--taagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggat 442  Q
    ||||||||| |||||||||| |||  ||| |  ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||    
T  478796 tcaaaagagttagaggaagacctacaaaatctataagagaaactattaggaaagttttagaggttaatgagttggat 478872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 250 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 48431687 - 48431423
Alignment:
Q  250 gggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatc 349  Q
    ||||||| ||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  | | ||||  ||||| ||||    
T  48431687 gggtagcccctatagtag-aaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacttgtagattttgtagtaaagagagttgatc 48431589  T
Q  350 agatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaac--taagaaaaactattaggaaagatttaaaggt-------taatgggttgg 440  Q
    |||||||||| |||||| | | |||||||||||||||| | |  |||||  ||||| ||||||||| |||||||||| || |       ||||| |||||    
T  48431588 agatggaggatagtcggattacaagaggtagaggaagacccaaaaaaactataagagaaactattaagaaagatttagagatttatgaataatgagttgg 48431489  T
Q  441 atccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagt 507  Q
    |||| ||||||| ||| ||||| ||||  | |||  |||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  48431488 atcc-aaatatggtttgtgataaaacatcatggcttaatttgatccttgtagctgaccccacttagt 48431423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 241 - 509
Target Start/End: Original strand, 2544591 - 2544853
Alignment:
Q  241 agagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaa 340  Q
    |||||||  ||||||||||||||| || ||||| |||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||||| |    
T  2544591 agagagttggggtagcacctatagtag-aaaagatggtggaaaacagacttaggtggtttggacatgtagagagaagacctatagattctatagtaagga 2544689  T
Q  341 gagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggtt 438  Q
    ||||||||||||||||||| ||||    ||  ||||||||||||||| |||  |||||||  ||| |||||||     |||||||  |  | |||| |||    
T  2544690 gagtagatcagatggaggatagtc-aaacactagaggtagaggaagacctagaaaaactatcagagaaactat-----aagatttggaaatcaatgagtt 2544783  T
Q  439 ggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||  | ||||||| ||||| |||||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2544784 gga-gcgaaatatggtttataatagaacattatggcataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 2544853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 280 - 509
Target Start/End: Original strand, 8796239 - 8796469
Alignment:
Q  280 gaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggta 379  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| |    | ||||| |||||| ||| ||||||||| |||| | |||  ||||| |    
T  8796239 gaaaataggtttaggtggtttggacatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcggatggaggatagtcagatcactagaggca 8796338  T
Q  380 gaggaagagctatgaaaact--aagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgca 477  Q
    |||||||| | || ||||||  |||| ||||||||| ||||||| || |  ||||||  ||||||  ||| |||| |||||||||||||| || |||| |    
T  8796339 gaggaagaccaataaaaactttaagagaaactattaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaa-tatggtttatgatagaacattatggcgta 8796437  T
Q  478 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8796438 atttaatccatgtagccgaccccacttagtgg 8796469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 207 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 36624191 - 36623907
Alignment:
Q  207 tagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggaca 305  Q
    |||||||||||| ||||||||| || |||||||| |||||||  |||||| || |  || || ||||| | |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  36624191 tagacgggatagaattaggaatgacaccattagagagagagttggggtagtacttgcagtag-aaaagattgtagaaaataggcttaggtggtttgg-ca 36624094  T
Q  306 tgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaactaagaaa 405  Q
    ||| ||||||||||| |||     | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||          ||| |    
T  36624093 tgtcgagagaagactggta-----tgtagtatgaagagtagatcagatggaggagagtcggatcagaagaggtagaggaagacct----------agaga 36624009  T
Q  406 aactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggc-gcaatttgatccatgtagccgaccccactt 504  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||| |||| ||| ||||| || ||| | ||  |||||||||||| |||||| ||||    
T  36624008 aactattagaaaagatttagaggctaatgagttggatcc-aaatatggtttaggatcgaacattatggctgtaa--tgatccatgtagtcgaccctactt 36623912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 370 - 509
Target Start/End: Original strand, 52921200 - 52921340
Alignment:
Q  370 aaaagaggtagaggaagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaaca 467  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||| |||| ||||| || |||||| |||| ||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  52921200 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgaattggatccaaa-tatggtttatgatagaaca 52921298  T
Q  468 ctacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52921299 ctattgcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 52921340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 401 - 509
Target Start/End: Original strand, 19936613 - 19936720
Alignment:
Q  401 agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgacccc 500  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||| |||| || ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  19936613 agaaaaactattaggaaagatttagatgttaatgagttagatccaaa-tatggttaatgatagaacattacggcgtaatttgatccatgtagccgactcc 19936711  T
Q  501 acttagtgg 509  Q
     ||||||||    
T  19936712 gcttagtgg 19936720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 252 - 509
Target Start/End: Original strand, 40416374 - 40416631
Alignment:
Q  252 gtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcag 351  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||| ||||  ||||||||| ||||| | |||||||||||||||  |||||||  | | ||||| ||||||||||||    
T  40416374 gtagcacctatagtag-aaaagatggtggaaacgaggcttaggtggtttaggcatgtagagagaagaactgtagattttgtagtaaggagagtagatcag 40416472  T
Q  352 atggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaat 449  Q
    ||| |||| |||| | |||  | ||  ||| ||||| |||  |||||||  ||| ||||||||| ||||||| || || |||||| |||||||| ||| |    
T  40416473 atgcaggatagtcagatcaccaaagacagaagaagacctagaaaaactataagacaaactattaagaaagatctatagattaatgagttggatcgaaa-t 40416571  T
Q  450 atgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||| |||||||||||||| || || | ||| |||||| | ||||||||||||||||||||    
T  40416572 atggtttatgatagaacattatggtgtaatgtgatccctttagccgaccccacttagtgg 40416631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 399 - 509
Target Start/End: Original strand, 41560380 - 41560489
Alignment:
Q  399 taagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgacc 498  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||| || |||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||    
T  41560380 taagagaaactattaggatacatttagagattaatgagttggatccaaa-tatgggttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgacc 41560478  T
Q  499 ccacttagtgg 509  Q
    |||||||||||    
T  41560479 ccacttagtgg 41560489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 399 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 52532747 - 52532638
Alignment:
Q  399 taagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgacc 498  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |  |||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||||||||    
T  52532747 taagagaaactattaggaaagatttagaaattaatgagttggaac-aaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgattcatgtagccgacc 52532649  T
Q  499 ccacttagtgg 509  Q
    |||||||||||    
T  52532648 ccacttagtgg 52532638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 206 - 356
Target Start/End: Original strand, 43423675 - 43423825
Alignment:
Q  206 ctagacgggataggattaggaataacc-cattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggac 304  Q
    |||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||| |||||||  ||||| ||||||||| || ||||| |||| |||| |||||||||| ||||||| |    
T  43423675 ctagacaggataggattagaaatgaccacattagagagagagttggggtaacacctatagtag-aaaagatggtggaaactaggcttaggtggtttggcc 43423773  T
Q  305 atgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatgga 356  Q
    |||||||||||||||||||||||  | | ||||| ||||||||  |||||||    
T  43423774 atgtagagagaagacttgtagattatgtagtaagtagagtagactagatgga 43423825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 252 - 508
Target Start/End: Original strand, 5338727 - 5338972
Alignment:
Q  252 gtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcag 351  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||| |||| |  ||||||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  5338727 gtagcacctatagtag-aaaagatggtggaaactgagcttaggtggtttgggcatgcagagagaagacctgtagatgctttagtaaggagagtagatcag 5338825  T
Q  352 atggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaactaagaaaaactattag-gaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaata 450  Q
    |||||||| | || | |||  ||||| ||| | ||| ||          ||||||||||| || ||||||| || || |||||| ||||||| | ||||     
T  5338826 atggaggatattcagatcactagaggcagaagtagacct----------agaaaaactataagagaaagatctagagattaatgagttggat-cgaaatg 5338914  T
Q  451 tgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtg 508  Q
    |||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  5338915 tgatttattatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccaacctcacttagtg 5338972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 419 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 4707331 - 4707243
Alignment:
Q  419 gatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4707331 gatttagaggttaatgagttggatccaaatt-tggtttatgatagaacactatggcgtaatttgatc-atgtagccgaccccacttagtgg 4707243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 399 - 508
Target Start/End: Original strand, 29128934 - 29129043
Alignment:
Q  399 taagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgat-ccatgtagccgac 497  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||| ||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||| |||||||||||||    
T  29128934 taagagaaactattaggaaagatttagaggttaacaagttggatcc-aaatatggtttatgatagaacattatggtgtaatatgatcccatgtagccgac 29129032  T
Q  498 cccacttagtg 508  Q
    |||||||||||    
T  29129033 cccacttagtg 29129043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 268 - 509
Target Start/End: Original strand, 38868900 - 38869142
Alignment:
Q  268 gaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcggg 367  Q
    |||||| |||| |||| | |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||| || | |  || ||||||||| |||||||||  ||||       
T  38868900 gaaaagatggtggaaactcggcttaggtggtttgggcatgtagagagaacactagtagattctctagcgaggagagtagattagatggagggtagtcaaa 38868999  T
Q  368 tcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaa 465  Q
    |||  ||||| ||| ||||| |||  |||||||  ||| ||| ||||| ||||||| ||  | ||||||||||||||  | | |||| | ||||||||||    
T  38869000 tcattagaggcagaagaagacctagaaaaactataagagaaattattaagaaagatctagcgattaatgggttggatagata-tatggtatatgatagaa 38869098  T
Q  466 cactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    || || ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38869099 cattatggcgtcgtttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 38869142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 446 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 28090779 - 28090716
Alignment:
Q  446 aaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||| |||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28090779 aaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 28090716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 454 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 44941853 - 44941798
Alignment:
Q  454 tttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44941853 tttatgatagaacactatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 44941798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 443 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 40568498 - 40568432
Alignment:
Q  443 ccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40568498 ccaaaatatggtttatgatagaaaactatggcgtaatttgatccatgtagccaaccccacttagtgg 40568432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 412 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 28511919 - 28511823
Alignment:
Q  412 taggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||||| ||  || |||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28511919 taggaaagacttggagattaatgagttgga-ccaaaacatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatcaatgtagccgaccccacttagtgg 28511823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 401 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 4590661 - 4590554
Alignment:
Q  401 agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgacccc 500  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || || ||| |||||||  | | |||||| | |||||||||| || || | ||||||||||||||||||||||||    
T  4590661 agaaaaactattaagaaagatttatagattgatgagttggatagata-tatgatatgtgatagaacaatatggtgtaatttgatccatgtagccgacccc 4590563  T
Q  501 acttagtgg 509  Q
    |||||||||    
T  4590562 acttagtgg 4590554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 234 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 35828847 - 35828584
Alignment:
Q  234 attagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatc 333  Q
    |||||| |||||||  | ||||||||||| | || ||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| | |||||  | |     
T  35828847 attagagagagagtttgagtagcacctatggtag-aaaagatggtggaaaatagggttaggtggtttggacgtgtagagagaagacctatagattatgta 35828749  T
Q  334 gtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaactaagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaat 433  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||| |||| | ||   ||||| ||||||||| ||           |||||||||||||||||||||| |   |||||    
T  35828748 gtaaggagagaagatcatatggaggatagtcagatccctagaggcagaggaagatct----------ggaaaaactattaggaaagatttgataattaat 35828659  T
Q  434 gggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    | |||||||   ||||||| |||| ||||||||| || |||   |||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  35828658 gagttggat-ggaaatatggtttacgatagaacattatggcaatatttgatccatgtaaccgaccccgcttagtgg 35828584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 399 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 12930442 - 12930336
Alignment:
Q  399 taagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgacc 498  Q
    ||||| ||| ||||| |||| |||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| | || | || |||||||||| ||||||| |||    
T  12930442 taagagaaattattatgaaaaatttaaagattagtgagttggatccaaa-tatgatttatgatagaagattatgacgtaatttgatccgtgtagccaacc 12930344  T
Q  499 ccacttag 506  Q
    ||||||||    
T  12930343 ccacttag 12930336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 270 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 34827366 - 34827204
Alignment:
Q  270 aaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtc 369  Q
    |||| |||||||||||||||||    |||||||||||||| |||||||||   |||||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||     
T  34827366 aaagatggtagaaaataggcttctttggtttggacatgtaaagagaagaccgatagatgctctagtaagaaaagtagattagatggaggagagtaaggtt 34827267  T
Q  370 aaaagaggtagaggaagagctatgaaaac--taagaaaaactattaggaaagatttaaaggtt 430  Q
    | || |  || ||||||| |||  |||||  ||||| |||||||||| ||||||||| |||||    
T  34827266 agaaaaaataaaggaagacctagaaaaactataagagaaactattagaaaagatttagaggtt 34827204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 446 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 21769796 - 21769734
Alignment:
Q  446 aaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtg 508  Q
    ||||||| ||| |||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21769796 aaatatggtttgtgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtg 21769734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 251 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 3819136 - 3818878
Alignment:
Q  251 ggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatca 350  Q
    |||||||||||| | || ||||| |||| | || ||| |||| | ||||||| |||||||| ||||||||||| ||| || | ||||  |||||||||||    
T  3819136 ggtagcacctatggtag-aaaagatggtggtaactagacttaagtggtttgggcatgtagaaagaagacttgtggattctctagtaaagagagtagatca 3819038  T
Q  351 gatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaa 448  Q
    ||||||||  | ||    ||  ||||  ||||||||| ||   |||||||  ||| ||||||||| |||||||||| || |||||| |||| ||  |||     
T  3819037 gatggagggtaatcaaaccactagagaaagaggaagaccttgaaaaactataagagaaactattaagaaagatttagagattaatgagttgaatagaaa- 3818939  T
Q  449 tatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||| |||||||| ||||| || | ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  3818938 tatggtttatgatggaacattatgtcgccatttgatccatgtagccgactgcacttagtgg 3818878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 420 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 24020377 - 24020289
Alignment:
Q  420 atttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||| |||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  24020377 atttagaggtcaatgagttggatccaaatt-tgatttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgcagccaaccccactttgtgg 24020289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 399 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 27520338 - 27520226
Alignment:
Q  399 taagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgacc 498  Q
    ||||| |||||||||| ||| ||||| || |||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||| || |  | |||||||| ||||||| |||||    
T  27520338 taagagaaactattagaaaaaatttagagattaatgagctggatccaaa-tatgatttatgatagaacattatgatgtaatttgattcatgtagtcgacc 27520240  T
Q  499 ccacttagtggatt 512  Q
     |||||| ||||||    
T  27520239 tcacttaatggatt 27520226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 456 - 509
Target Start/End: Original strand, 29577459 - 29577512
Alignment:
Q  456 tatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29577459 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 29577512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 443 - 508
Target Start/End: Original strand, 50257764 - 50257829
Alignment:
Q  443 ccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtg 508  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || || | |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  50257764 ccaaaatatggtttatgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccaaccccacttagtg 50257829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 454 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 2429706 - 2429651
Alignment:
Q  454 tttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||||||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2429706 tttatgatagaacattatggcgtaatttgatccacgtagccgaccccacttagtgg 2429651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 280 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 16273073 - 16272994
Alignment:
Q  280 gaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggagga 359  Q
    ||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||||| || |||||    
T  16273073 gaaaataggtttaggtggtttgtacatttagagagaaaacttgtagattctatagtaagaagagtggatcaaatagagga 16272994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 454 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 17269066 - 17269011
Alignment:
Q  454 tttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17269066 tttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccatttagtgg 17269011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 446 - 509
Target Start/End: Original strand, 22175342 - 22175405
Alignment:
Q  446 aaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||| |||||||||||||| || ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22175342 aaatatggtttatgatagaacattatggtagaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 22175405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 446 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 25715411 - 25715348
Alignment:
Q  446 aaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||| |||||||||||| | || |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25715411 aaatatggtttatgatagaatattatggcgtaatttgatccatgtagccgacctcacttagtgg 25715348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 406 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 43375722 - 43375620
Alignment:
Q  406 aactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccactta 505  Q
    |||||||| |||||||||| || |||||| |||||| || ||||||| || ||||||||||| || | |  |||||||||||||||||| | ||||||||    
T  43375722 aactattaagaaagatttagagattaatgagttgga-ccgaaatatggttcatgatagaacattatgacataatttgatccatgtagccaatcccactta 43375624  T
Q  506 gtgg 509  Q
    ||||    
T  43375623 gtgg 43375620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 408 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 52900764 - 52900682
Alignment:
Q  408 ctattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgta 491  Q
    ||||||||| ||||||| || |||||| |||||| |  ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  52900764 ctattaggacagatttagagattaatgagttgga-ctgaaatatggtttatgatagaacactatggcggaatttgatccatgta 52900682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 407 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 10200429 - 10200332
Alignment:
Q  407 actattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccactta 505  Q
    |||||||| ||||||||| || |  ||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||  | || | |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10200429 actattagaaaagatttagagatcgatgagttggatccaaa-tatggtttatgatagaacatcatggtgtaatttgatccatgtagccgacctcactta 10200332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 455 - 509
Target Start/End: Original strand, 28533673 - 28533727
Alignment:
Q  455 ttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28533673 ttatgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 28533727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 447 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 45510917 - 45510855
Alignment:
Q  447 aatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||||| ||||||||||||||| |  ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  45510917 aatatggtttatgatagaacaccatagcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgg 45510855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 268 - 358
Target Start/End: Original strand, 46388394 - 46388484
Alignment:
Q  268 gaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggagg 358  Q
    |||||| |||| |||| | ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||||| ||||||| |||| ||||||    
T  46388394 gaaaagatggtggaaactcggcttaggtagtttgcacatgtagagagaagacttgtagattctgtagtaaggagagtagctcagttggagg 46388484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 405 - 510
Target Start/End: Original strand, 4415506 - 4415610
Alignment:
Q  405 aaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccactt 504  Q
    |||| ||||| ||||||||| |||| |||| |||||||| ||| |||||||| | |||||||| || |||   |||||||||||||||||||| ||| ||    
T  4415506 aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatctaaa-tatgattttttatagaacattatggcatcatttgatccatgtagccgactccattt 4415604  T
Q  505 agtgga 510  Q
    ||||||    
T  4415605 agtgga 4415610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 456 - 509
Target Start/End: Original strand, 27704157 - 27704210
Alignment:
Q  456 tatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27704157 tatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccgcttagtgg 27704210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 456 - 509
Target Start/End: Original strand, 44751691 - 44751744
Alignment:
Q  456 tatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44751691 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgacctcacttagtgg 44751744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 429 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 19908136 - 19908057
Alignment:
Q  429 ttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||||| ||||||| |||| |||| |||||||| ||||| ||  ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19908136 ttaatgagttggattcaaa-tatggtttatgattgaacattattgcgtaattttatccatgtagccgaccccacttagtgg 19908057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 446 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 27072572 - 27072520
Alignment:
Q  446 aaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgacc 498  Q
    ||||||| |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||    
T  27072572 aaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgacc 27072520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 429 - 509
Target Start/End: Original strand, 34444537 - 34444616
Alignment:
Q  429 ttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||||| |||||||||||| |||| ||||| ||| |||| || || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34444537 ttaatgagttggatccaaa-tatggtttataataaaacattatggtgtaatttgatctatgtagccgaccccacttagtgg 34444616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 404 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 48865833 - 48865730
Alignment:
Q  404 aaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccact 503  Q
    |||||||| | |||||||||| |||||||||  || |||||| | |||| |||||||||||| | || || | |||||||||||||||||| ||||||||    
T  48865833 aaaactatcaagaaagatttagaggttaatgaattagatccaga-tatggtttatgatagaatattatggtgtaatttgatccatgtagccaaccccact 48865735  T
Q  504 tagtg 508  Q
     ||||    
T  48865734 cagtg 48865730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 241 - 509
Target Start/End: Original strand, 1661422 - 1661679
Alignment:
Q  241 agagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaa 340  Q
    |||||||  ||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||| ||  ||||||  |||||||||||||||| | ||||| |||  ||||  |    
T  1661422 agagagttggggtagcacctatagtag-aaaagatggtggaaaataggctcagatggtttgagcatgtagagagaagacctatagattcta--gtaatga 1661518  T
Q  341 gagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaactaagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttgg 440  Q
    |||  |||||||||||||| | |  | |||  ||||||||| ||||| |||       ||||| |||||||||||||||||||| |  |||| | |||||    
T  1661519 gagctgatcagatggaggataattagatcactagaggtagatgaagaccta-------taagagaaactattaggaaagatttagaaattaacgagttgg 1661611  T
Q  441 atccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    | || |||| || ||| |||||||||| |  |||| || ||||||  |||||  |||||||||||||||    
T  1661612 a-ccgaaatgtggtttgtgatagaacattttggcgtaaattgatcactgtagttgaccccacttagtgg 1661679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 280 - 359
Target Start/End: Original strand, 9002382 - 9002461
Alignment:
Q  280 gaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggagga 359  Q
    ||||||||| |||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||  | | ||||||||||||||||| || |||||    
T  9002382 gaaaataggtttaggtagtttggacatgtagagaaaaaacttgtagattttgtagtaagaagagtagatcaaatagagga 9002461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 251 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 27637913 - 27637815
Alignment:
Q  251 ggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatca 350  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||| |||||| | ||||| |||||||||| ||||| ||| |||| | | ||||| |||||||||||    
T  27637913 ggtagcacctatagcag-aaaagatgatagaaactagacttaggtgttttgggcatgtagagaaaagacatgtggatgttgtagtaaggagagtagatca 27637815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 419 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 32079286 - 32079199
Alignment:
Q  419 gatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||||| |||| |||| |||||||||||| | || ||||||||||||||||  ||||  |||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  32079286 gatttagaggtcaatgagttggatccaaa-tctggtttatgatagaacact--ggcgtcatttgatcgatgtagccgaccccacttggtgg 32079199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 454 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 37294185 - 37294130
Alignment:
Q  454 tttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  37294185 tttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagctgaccccatttagtgg 37294130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 285 - 509
Target Start/End: Original strand, 42501143 - 42501368
Alignment:
Q  285 taggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagagga 384  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||  ||||  || ||| || | | ||| ||||||| |||||||||||  ||||   |||  ||||||||||||    
T  42501143 taggcttgggtggtttggacatgtagagaagagacccgtggattctgtagaaaggagagtagttcagatggagggtagtcaaatcattagaggtagagga 42501242  T
Q  385 agagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttg 482  Q
    | | |||  |||||||  ||| ||| ||||| ||||||| || || |||||| |||||||  ||| ||||   |||||||||||| ||| |||   |||     
T  42501243 aaacctagaaaaactataagagaaattattaagaaagatctatagattaatgagttggatagaaa-tatggaatatgatagaacattacagcgtcgttta 42501341  T
Q  483 atccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||    
T  42501342 atccatgtagccgaccctacttagtgg 42501368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 416 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 46423327 - 46423238
Alignment:
Q  416 aaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||||||| |||| ||| |||| |||||    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46423327 aaagatttagaggtcaatgagttggatccaaa-tatggtttttgattgaacat---ggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 46423238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 429 - 491
Target Start/End: Original strand, 6084156 - 6084217
Alignment:
Q  429 ttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgta 491  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||| |||||||||||||||    
T  6084156 ttaatgagttggatc-aaaatatggtttatgatagaacaatatggcgtaatttgatccatgta 6084217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 368 - 467
Target Start/End: Original strand, 8628148 - 8628248
Alignment:
Q  368 tcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaa 465  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||  | | |||||||||||||||||||| |||||||||  || ||| ||||||||  |||| |||||||    
T  8628148 tcaaaagaggtagaggaagacctagaaaaactataacagaaactattaggaaagatttagaggttaatgaatttgat-caaaatatagtttacgatagaa 8628246  T
Q  466 ca 467  Q
    ||    
T  8628247 ca 8628248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 250 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 13827851 - 13827746
Alignment:
Q  250 gggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatc 349  Q
    |||||| |||||||| || |||||  ||| |||| |||| | ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| || | ||||| ||||||||||    
T  13827851 gggtagtacctatagtag-aaaagacggtggaaactagggtaaggtggtttggacatgtagagagaagaagtgtagattctgtagtaaggagagtagatc 13827753  T
Q  350 agatgga 356  Q
    | |||||    
T  13827752 atatgga 13827746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 443 - 509
Target Start/End: Original strand, 50846756 - 50846822
Alignment:
Q  443 ccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||||||||  |||||||||||||| || |||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  50846756 ccaaaatatagtttatgatagaacattatggcataatttgatctatgtagccgacaccacttagtgg 50846822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 241 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 52073753 - 52073656
Alignment:
Q  241 agagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaa-taggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaag 338  Q
    |||||||  ||||||||||||| | || ||||| ||||| |||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||    
T  52073753 agagagttggggtagcacctattgtag-aaaagatggtaaaaaactcggcttaggtggtttggacatgtagagagaagacatatagattctatagtaag 52073656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 446 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 1290116 - 1290059
Alignment:
Q  446 aaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccact 503  Q
    ||||||| |||||||||||||| || |||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  1290116 aaatatggtttatgatagaacattatggcataatttgatccatgtggccgaccccact 1290059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 268 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 14226093 - 14226004
Alignment:
Q  268 gaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggag 357  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |  | |||||||  | | ||||| ||||||||||| ||||||    
T  14226093 gaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagaggattcctgtagattttgtagtaaggagagtagatcacatggag 14226004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 275 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 16822279 - 16822230
Alignment:
Q  275 tggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgta 324  Q
    ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16822279 tggtagaaactcggcttaggtggtttggacatgtagagagaagacctgta 16822230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 472 - 509
Target Start/End: Original strand, 26299291 - 26299328
Alignment:
Q  472 ggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26299291 ggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 26299328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 335 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 29577339 - 29577165
Alignment:
Q  335 taagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaa 432  Q
    |||| ||| ||||||||||||| || |||  | |||  ||||||||||||||| |||  |||||||  | | ||||||||| ||||||| || || ||||    
T  29577339 taaggagattagatcagatggaagatagtaagatcactagaggtagaggaagacctagaaaaactacaacataaactattaagaaagatctagagattaa 29577240  T
Q  433 tgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    || | |||||| |||||||| || ||||||||||| || |||  |||||  | ||||||||| ||||||||||||||    
T  29577239 tgagctggatc-aaaatatggtt-atgatagaacattatggcataatttatttcatgtagccaaccccacttagtgg 29577165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 296 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 30834213 - 30834065
Alignment:
Q  296 ggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaa 395  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||||  |||| ||||||||||||||||| |  ||||   || | ||||| ||||||||| |||  ||    
T  30834213 ggtttggtcgtgtagagagaagacttgcagattctataataaggagagtagatcagatggaaggtagtcaaatcgatagagggagaggaagacctagaaa 30834114  T
Q  396 aac--taagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggat 442  Q
    | |  ||||| ||||||||| ||||||| || || |||||| |||||||    
T  30834113 agctataagagaaactattacgaaagatctagagattaatgagttggat 30834065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 456 - 509
Target Start/End: Original strand, 42337763 - 42337816
Alignment:
Q  456 tatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42337763 tatgatagaacactatggcatcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgg 42337816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 297 - 358
Target Start/End: Original strand, 46394867 - 46394928
Alignment:
Q  297 gtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggagg 358  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||||| ||||||| |||| ||||||    
T  46394867 gtttgcacatgtagagagaagacttgtagattctgtagtaaggagagtagctcagttggagg 46394928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 449 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 26113521 - 26113461
Alignment:
Q  449 tatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||| |||||||||||||| || |||  |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  26113521 tatggtttatgatagaacattatggcttaatttgatccatgtagccgagctcacttagtgg 26113461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 250 - 358
Target Start/End: Original strand, 37263332 - 37263439
Alignment:
Q  250 gggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatc 349  Q
    ||||||||||||||| || ||||| | ||||||| ||| |||  | ||||||| ||||||||||||| |||||| |||| |   ||||| |||||| |||    
T  37263332 gggtagcacctatagtag-aaaagatagtagaaactagacttcagtggtttgggcatgtagagagaaaacttgtggatgttgcggtaaggagagtaaatc 37263430  T
Q  350 agatggagg 358  Q
    |||||||||    
T  37263431 agatggagg 37263439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 477 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 43481852 - 43481820
Alignment:
Q  477 aatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43481852 aatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 43481820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 193 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 52561950 - 52561878
Alignment:
Q  193 atgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatag 264  Q
    |||||||||||  |||||||||||| |||||||||| || |||||||| |||||||  ||||||||||| |||    
T  52561950 atgagtggtaagactagacgggatatgattaggaatgacaccattagagagagagttggggtagcacctttag 52561878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 399 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 52739642 - 52739547
Alignment:
Q  399 taagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttat-gatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagcc 494  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||| |||||| |||||| ||||||||| || | |  |||||||| |||||||||    
T  52739642 taagagaaactattaggaaagatttttaggttaatgagttgaatcc-aaatataatttatggatagaacattatgacttaatttgattcatgtagcc 52739547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 478 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 4318898 - 4318867
Alignment:
Q  478 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4318898 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 4318867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 10569312 - 10569241
Alignment:
Q  287 ggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggagg 358  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| || | ||| | || |||||| |||||||||    
T  10569312 ggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacctgtagattctgtagtacggagggtagattagatggagg 10569241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 456 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 32112064 - 32112013
Alignment:
Q  456 tatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagt 507  Q
    |||||||||||| || |||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  32112064 tatgatagaacattatggcgtaatttgatcaatgtagccgaacccacttagt 32112013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 454 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 39123445 - 39123391
Alignment:
Q  454 tttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||||||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39123445 tttatgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccgacccc-cttagtgg 39123391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 478 - 509
Target Start/End: Original strand, 41165511 - 41165542
Alignment:
Q  478 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41165511 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 41165542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 254 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 13827994 - 13827925
Alignment:
Q  254 agcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgta 324  Q
    ||||||||||| || ||||| |||| |||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  13827994 agcacctatagtag-aaaagatggtggaaactagggttaggtggtttgaacatgtagagagaagacctgta 13827925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 459 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 38877415 - 38877365
Alignment:
Q  459 gatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38877415 gatagaacattatggcgtcatttgatccatgtagccgaacccacttagtgg 38877365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 235 - 353
Target Start/End: Original strand, 51812511 - 51812628
Alignment:
Q  235 ttagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcg 334  Q
    ||||| |||||||  ||||| || |||||| || ||||| |||| |||| |||||||| | | ||||| ||||||||||||| | ||||||||  | | |    
T  51812511 ttagagagagagttggggtaacaactatagtag-aaaagatggtggaaactaggcttatgtgatttgggcatgtagagagaaaaattgtagattttgtag 51812609  T
Q  335 taagaagagtagatcagat 353  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  51812610 taagaaaagtagatcagat 51812628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 298 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 52633407 - 52633341
Alignment:
Q  298 tttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtc 364  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||| |||| |||| || ||||| ||||    
T  52633407 tttggacatgtagagagaaaacttgtagattctatagtacgaatagtatatcaaatagaggatagtc 52633341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 446 - 491
Target Start/End: Original strand, 19822085 - 19822130
Alignment:
Q  446 aaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgta 491  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||| || |||||||||||||||    
T  19822085 aaatatggtttatgatagaacattacgacgtaatttgatccatgta 19822130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 242 - 307
Target Start/End: Original strand, 19936507 - 19936571
Alignment:
Q  242 gagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatg 307  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||| | ||||||| ||||    
T  19936507 gagagttagggtagcacctatagca-aaaaagatggtagaaaataggtttatgtggtttgggcatg 19936571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 481 - 509
Target Start/End: Original strand, 7082536 - 7082564
Alignment:
Q  481 tgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7082536 tgatccatgtagccgaccccacttagtgg 7082564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 457 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 7133376 - 7133324
Alignment:
Q  457 atgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||||||| |  |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7133376 atgatagaacattttggcctaatttgatccatgtagctgaccccacttagtgg 7133324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 477 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 7210981 - 7210949
Alignment:
Q  477 aatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7210981 aatttgatccatgtaaccgaccccacttagtgg 7210949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 445 - 509
Target Start/End: Original strand, 29808052 - 29808116
Alignment:
Q  445 aaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||||||| ||| ||||| ||||||| ||||  ||||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  29808052 aaaatatggtttttgataaaacactatggcgacatttgattcatgtagccgattccacttagtgg 29808116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 291 - 385
Target Start/End: Original strand, 39894823 - 39894914
Alignment:
Q  291 taggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaa 385  Q
    |||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||| | | ||| |||||||| || ||||   |||||||| | |||||||| |||||||||    
T  39894823 taggtggtttgggcatgtacggagaagacttgtagatgttgtggtacgaagagtaaattagat---ggagagtccgatcaaaagatgtagaggaa 39894914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 477 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 42539266 - 42539234
Alignment:
Q  477 aatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42539266 aatttgatccatgtagacgaccccacttagtgg 42539234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 276 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 44905588 - 44905548
Alignment:
Q  276 ggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaa 316  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  44905588 ggtagaaaatatgcttaggtggtttggacatgtaaagagaa 44905548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 188 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 48065395 - 48065359
Alignment:
Q  188 gttggatgagtggtaaagctagacgggataggattag 224  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  48065395 gttggatgagtggtaaaactagacgggataagattag 48065359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 449 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 52073130 - 52073070
Alignment:
Q  449 tatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||||| |||||||||||| || ||||    ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  52073130 tatgatatatgatagaacattatggcggcgattgatccatgtagccgaccccacttggtgg 52073070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #122
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 445 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 52981493 - 52981429
Alignment:
Q  445 aaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||||||| |||||||||||| | || || | |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  52981493 aaaatatggtttatgatagaatattatggtgtaatttgatccttgtagccaaccccacttggtgg 52981429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 150; Significance: 5e-79; HSPs: 124)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 188 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 12841619 - 12841297
Alignment:
Q  188 gttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataaccc-attagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaata 286  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  12841619 gttggatgagtggtaaaactagacatgataggattaggaatgaccccattagagagagagtggaggtagcacctatagtag-aaaagttggtagaaaata 12841521  T
Q  287 ggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaag 386  Q
    |||||||  ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  12841520 ggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaag 12841421  T
Q  387 agctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgat 484  Q
    | ||| ||||||||  ||| |||| ||||| || |||||| |||| |||| |||| |||| |||| || ||||||||||||||||| ||||  |||||||    
T  12841420 acctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttgtatcc-aaatttggtttatgatagaacactatggcgtcatttgat 12841322  T
Q  485 ccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  12841321 ccatgtagccgaccccacttagtgg 12841297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 185 - 509
Target Start/End: Original strand, 43281611 - 43281934
Alignment:
Q  185 tgcgttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaa 283  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||||   |||||||||||||| || ||||||||  ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  43281611 tgcgctggatgagtggtaagactagacaatataggattaggaatgacaccattaga--gagagtgggggtagcacctatagtag-aaaagttggtagaaa 43281707  T
Q  284 ataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagagg 383  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  43281708 ataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagagg 43281807  T
Q  384 aagagctatgaaaac--taagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaattt 481  Q
    |||| ||| ||||||  |  || |||| ||||| ||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||  ||||    
T  43281808 aagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatcc-aaatatggtttttgatagaacactatggcgtcattt 43281906  T
Q  482 gatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43281907 gatccatgtagccgaccccacttagtgg 43281934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 185 - 509
Target Start/End: Original strand, 11593895 - 11594220
Alignment:
Q  185 tgcgttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaa 283  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  11593895 tgcgttggatgagtggtaagactagacaggataagattaggaatgacaccatttgagagagagtgggggtagcacctatagtag-aaaagttggtagaaa 11593993  T
Q  284 ataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagagg 383  Q
    ||| | ||||  ||||||| ||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  11593994 atacggttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccatggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagagg 11594093  T
Q  384 aagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaattt 481  Q
    |||| ||| ||||||||  ||| |||| ||||| || |||||| |||| |||| ||||||||| |||| || | ||||||||||||||| ||||  ||||    
T  11594094 aagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatcc-aaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 11594192  T
Q  482 gatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11594193 gatccatgtagccgaccccacttagtgg 11594220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 185 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 35906548 - 35906223
Alignment:
Q  185 tgcgttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaa 283  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||  |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  35906548 tgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtggaggtagcacctatagtag-aaaagttggtagaaa 35906450  T
Q  284 ataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagagg 383  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||  | |||||||||||| |||| |||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  35906449 ataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtatatcatatggaggagagtcaagttaaaagaggtagagg 35906350  T
Q  384 aagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaattt 481  Q
    |||| ||| ||||||||  ||| |||| ||||| || |||||  |||| |||| ||||||||| |||| || | ||||||||||||||| ||||  ||||    
T  35906349 aagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttcgaggtcaatgagttggatcc-aaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 35906251  T
Q  482 gatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35906250 gatccatgtagccgaccccacttagtgg 35906223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 187 - 509
Target Start/End: Original strand, 49029213 - 49029536
Alignment:
Q  187 cgttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaat 285  Q
    |||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  49029213 cgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtag-aaaagttggtagaaaat 49029311  T
Q  286 aggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaa 385  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||  | |||||| || ||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  49029312 aggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagacgaatagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaa 49029411  T
Q  386 gagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttga 483  Q
    || ||| ||||||||  ||| |||| ||||| || |||||| |||| |||| ||||||||| |||| || | ||||||||||||||| ||||  ||||||    
T  49029412 gacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatcc-aaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttga 49029510  T
Q  484 tccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  49029511 tccatgtagccaaccccacttagtgg 49029536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 185 - 509
Target Start/End: Original strand, 37617879 - 37618205
Alignment:
Q  185 tgcgttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaa 283  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  37617879 tgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtag-aaaagttggtagaaa 37617977  T
Q  284 a-taggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagag 382  Q
    | |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||    
T  37617978 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 37618077  T
Q  383 gaagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatt 480  Q
    ||||| ||| ||||||||  ||| |||| ||||| || |||||| |||| |||  ||||||||| |||| || | ||||||||||||||| || |  |||    
T  37618078 gaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaataagttggatcc-aaatttggtgtatgatagaacactatggtgtcatt 37618176  T
Q  481 tgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37618177 tgatccatgtagccgaccccacttagtgg 37618205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 181 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 39906721 - 39906394
Alignment:
Q  181 atgctgcgttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggta 279  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  39906721 atgctgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgagggtagcacctatagtag-aaaagttggta 39906623  T
Q  280 gaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggta 379  Q
    ||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||   ||||||   | ||||||||||||||||| |||||||||  ||  || ||||||||||    
T  39906622 gaaaataggcttagatgatttgggcatgtagagagaagacccatagatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggag--tcaagttaaaagaggta 39906525  T
Q  380 gaggaagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgca 477  Q
    |||||||| ||| ||||||||  ||| |||| ||||| || |||||| |||| ||||  ||||||||||| | || | ||||||||||||||| ||||      
T  39906524 gaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgacttggatccaaatt-tggtgtatgatagaacactatggcgtc 39906426  T
Q  478 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39906425 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 39906394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 185 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 45836827 - 45836504
Alignment:
Q  185 tgcgttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaa 283  Q
    |||| ||||||||||||||   |||||  ||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  45836827 tgcgctggatgagtggtaagagtagacaagataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtag-aaaagttggtagaaa 45836729  T
Q  284 ataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagagg 383  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||   | ||||||||||    
T  45836728 ataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagttaggt--tatgaggtagagg 45836631  T
Q  384 aagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaattt 481  Q
     ||| ||| || |||||  ||| |||| ||||| || |||||| |||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||    
T  45836630 gagacctaggacaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatcc-aaatatggtttatgatagaacactatggcgtcattt 45836532  T
Q  482 gatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  45836531 gatccatgtagccgaccccacttagtgg 45836504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 185 - 509
Target Start/End: Original strand, 34869355 - 34869680
Alignment:
Q  185 tgcgttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaa 283  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  34869355 tgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtag-aaaagttggtagaaa 34869453  T
Q  284 ataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagagg 383  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||  | ||||||||||||||||  |||| ||||||||  || ||||||||||||||    
T  34869454 ataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgccgtggtaagaagagtagatccaatggtggagagtcaagttaaaagaggtagagg 34869553  T
Q  384 aagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaattt 481  Q
    |||| ||| ||||||||  ||| |||| ||||| || |||||| |||| |||| ||||||||| |||| || | ||||||||||||||| ||||  ||||    
T  34869554 aagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatcc-aaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 34869652  T
Q  482 gatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||    
T  34869653 gatccatgtagccgaccctaattagtgg 34869680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 190 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 44855514 - 44855196
Alignment:
Q  190 tggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaatagg 288  Q
    ||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||| |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  44855514 tggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtggggatagtacctatagtag-aaaagttggtagaaaatagg 44855416  T
Q  289 cttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagag 388  Q
    |||||  ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||| |||||||||||     
T  44855415 cttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtcataagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaagtagaggaagac 44855316  T
Q  389 ctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatcc 486  Q
    ||| ||||||||  ||| |||| ||||| ||||||||| |||| |||| ||||||||| |||| || ||||||||  ||||||| |||| |||||| |||    
T  44855315 ctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatcc-aaatttggtttatgat--aacactatggcgtaatttggtcc 44855219  T
Q  487 atgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  44855218 atgtagccgaccccacttagtgg 44855196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 241 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 2886012 - 2885744
Alignment:
Q  241 agagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaa 340  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||   ||||||||  | ||| |||    
T  2886012 agagagtgggggtagcacctatagtag-aaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagatccgtagatgccgttgtacgaa 2885914  T
Q  341 gagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaac--taagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggtt 438  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||  ||||| |||| ||||| || ||||||  ||| |||| |||    
T  2885913 gagtagatcagatggaggagagtcaggtcaaaagaggtagaagaagacctaggaaaactataagagaaaccattagaaatgatttagtggtcaatgagtt 2885814  T
Q  439 ggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||| || ||||||| ||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2885813 gga-cccaaatatggtttatgatagaacactatggtgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 2885744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 185 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 46356203 - 46355879
Alignment:
Q  185 tgcgttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaa 283  Q
    ||||||| |||||||||||  |||||| |||||||||||||||| || |||| ||| ||||| || ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  46356203 tgcgttgaatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccatcagagagagaatgggggtagcacctatagtag-aaaagttggtagaaa 46356105  T
Q  284 ataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagagg 383  Q
    ||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||  ||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  46356104 ataggtttagatggtttgggcatgtagagagaagacacgtagatgttgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagagg 46356005  T
Q  384 aagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaattt 481  Q
    || | ||| ||||||||  | | |||| ||||| || ||||||||||| |||| ||||||||| |||| || | ||||||||||||||| | |   ||||    
T  46356004 aaaacctaggaaaactattaaagaaaccattagaaaggatttaaaggtcaatgagttggatcc-aaatctggtgtatgatagaacactatgccatcattt 46355906  T
Q  482 gatccatgtagccgaccccacttagtg 508  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  46355905 gatccatgtagccgaccccacttagtg 46355879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 185 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 13859355 - 13859064
Alignment:
Q  185 tgcgttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaa 283  Q
    ||||||||| |||||||||  ||||||  ||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  13859355 tgcgttggacgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtag-aaaagttggtagaaa 13859257  T
Q  284 ataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagagg 383  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||  || | ||||||||||||    
T  13859256 ataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgctgtcgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttagaagaggtagagg 13859157  T
Q  384 aagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcg 475  Q
    |||| ||| ||||||||  ||| |||| ||||| || |||||| |||  |||| ||||||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  13859156 aagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggccaatgagttggatcc-aaatttggtttatgatagaacactatggcg 13859064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 215 - 509
Target Start/End: Original strand, 29650349 - 29650644
Alignment:
Q  215 ataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagaga 313  Q
    |||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||| ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  29650349 ataggattaggaatgacaccattcgagagagagtgggggcagcacctatagtagaaaaa-ttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagaga 29650447  T
Q  314 gaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaac--taagaaaaactat 411  Q
    ||||||  ||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| | ||| ||||||  |  || |||| ||    
T  29650448 gaagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtaaaggaaaacctaagaaaaccattcgagaaaccat 29650547  T
Q  412 taggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||| ||||||||| |||| |||| ||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29650548 tagaaaagatttagaggtcaatgagtttgatcc-aaatatggtttttgatagaacactaaggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 29650644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 190 - 509
Target Start/End: Original strand, 43491248 - 43491568
Alignment:
Q  190 tggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaatagg 288  Q
    |||||||| |||||   |||| |||||| |||||||||| || ||||| |  |||||||  ||||| ||||||||| |  |||| |||||||||||||||    
T  43491248 tggatgagcggtaagattagatgggatatgattaggaatgacaccattggggagagagtaggggtaacacctatagtataaaaa-ttggtagaaaatagg 43491346  T
Q  289 cttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagag 388  Q
    |||||  ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  43491347 cttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtcgtaagaagagttgatcagatggaggagagtcaggtcaaaagaggtagaggaagac 43491446  T
Q  389 ctatgaaaa--ctaagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatcc 486  Q
    ||| |||||   ||||| |||| ||||| ||  ||||| |||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  | ||||| ||||    
T  43491447 ctaggaaaattataagagaaaccattagaaagaatttagaggtcaataagttggatcc-aaatatgatttatgatagaacactatgatgtaatttcatcc 43491545  T
Q  487 atgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  43491546 atgtagccgaccccacttagtgg 43491568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 185 - 400
Target Start/End: Original strand, 31005158 - 31005373
Alignment:
Q  185 tgcgttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaa 283  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  31005158 tgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaataacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtag-aaaagttggtagaaa 31005256  T
Q  284 ataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagagg 383  Q
    ||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  31005257 ataggtttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagagg 31005356  T
Q  384 aagagctatgaaaacta 400  Q
    |||| ||| ||||||||    
T  31005357 aagacctaggaaaacta 31005373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 189 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 33350149 - 33349832
Alignment:
Q  189 ttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaatag 287  Q
    |||||||||||||||  ||||||  |||||||||| |||| || |||||||| |||||||| |||| |||||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  33350149 ttggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacaccattagagagagagtgggggttgcacctatagtag-aaaagttgctagaaaatag 33350051  T
Q  288 gcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaaga 387  Q
    ||||||  ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  33350050 gcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaaga 33349951  T
Q  388 gctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatc 485  Q
     ||| ||||||||  ||| |||| ||||| || |||||| |||| |||| ||||||||| |||| || | |||  ||||||||||  |||  ||||||||    
T  33349950 cctaggaaaactattagagaaaccattagaaatgatttagaggtcaatgagttggatcc-aaatttggtgtatagtagaacactatagcgtcatttgatc 33349852  T
Q  486 catgtagccgaccccactta 505  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  33349851 catgtagccgacctcactta 33349832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 215 - 509
Target Start/End: Original strand, 6374833 - 6375128
Alignment:
Q  215 ataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagaga 313  Q
    |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||    
T  6374833 ataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtag-aaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgagcatgtagaga 6374931  T
Q  314 gaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaacta--agaaaaactat 411  Q
    ||||||  ||||||||| | |||||||| |||||||| ||| |||||| ||  || |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||| |||| ||    
T  6374932 gaagaccagtagatgctgtggtaagaagggtagatcaaatgtaggagaatcaagttaaaagaggtagaggaagatctaggaaaactattagagaaaccat 6375031  T
Q  412 taggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||| ||  ||||| |||| | || |||||||||||| |  | | ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6375032 tagaaagaatttagaggtcagtgagttggatccaaatttag-tgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 6375128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 250 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 31682883 - 31682624
Alignment:
Q  250 gggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatc 349  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||  ||||||||  || |||||||||||||||    
T  31682883 gggtagcacatatagtag-aaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggtatgtagagagaagacccgtagatgccgtcataagaagagtagatc 31682785  T
Q  350 agatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaa 447  Q
    | |||||||||||||  || | |||||||||||||||| ||| ||||||||  ||| |||| ||||| || |||||| |||| ||||  |||||||| |     
T  31682784 aaatggaggagagtcaagttagaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgaattggatcc-at 31682686  T
Q  448 atatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    || || ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31682685 atttggtttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 31682624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 185 - 509
Target Start/End: Original strand, 36651929 - 36652252
Alignment:
Q  185 tgcgttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaa 283  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| || ||||||||  ||| ||  |||| ||| | |||| || |||||||||||||||    
T  36651929 tgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattaga--gagggtaggggtggcatccatagtag-aaaagttggtagaaa 36652025  T
Q  284 ataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagagg 383  Q
    ||||||||||  |||||   ||||||||||||||||  ||||||||  | ||||||||||||||||| || ||||| ||||  || ||||||||||||||    
T  36652026 ataggcttagatggtttcagcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatagaggatagtcaagttaaaagaggtagagg 36652125  T
Q  384 aagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaattt 481  Q
    |||| ||| ||||||||  ||| |||| ||||| || |||| | |||| |||| |||| |||| |||| || | ||||||||||||||| ||||  ||||    
T  36652126 aagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggattcagaggtcaatgagttgaatcc-aaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 36652224  T
Q  482 gatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36652225 gatccatgtagccgaccccacttagtgg 36652252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 185 - 509
Target Start/End: Original strand, 38606940 - 38607252
Alignment:
Q  185 tgcgttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataacc-cattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaa 283  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||| ||  ||||| | |||||||| ||||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  38606940 tgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaacatta-agagagagtgggggtagcacctatagtag-aaaggttggtagaaa 38607037  T
Q  284 ataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagagg 383  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||  | || |||||||||||||| |||||||||||||  || | |||||| |||||    
T  38607038 ataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagagtagatcaaatggaggagagtcacgttagaagagggagagg 38607137  T
Q  384 aagagctatgaaaactaagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttga 483  Q
    |||| ||| |          ||||| ||||| || |||||| |||| |||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||   |||||    
T  38607138 aagacctaag----------aaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatcc-aaatatggtttttgatagaacactatggcgtcgtttga 38607226  T
Q  484 tccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  38607227 tccatgtagccgactccacttagtgg 38607252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 252 - 509
Target Start/End: Original strand, 22349623 - 22349880
Alignment:
Q  252 gtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcag 351  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||||||||||  |||  ||  || |||||||||||||||||     
T  22349623 gtagcacctatagtag-aaaagttggtagaaaataggcttagatggttttggcatgtagagagaagacccgtaattgtcatggtaagaagagtagatcaa 22349721  T
Q  352 atggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaat 449  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||| |||| ||||  || ||||||||||| |||  ||||||||| ||||    
T  22349722 atggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagaactaggaaaactattagagaaaccattaaaaaggatttaaaggtcaataagttggatcc-aaat 22349820  T
Q  450 atgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
     || | |||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22349821 ttggtatatgatagaatactatggcgtcatttgatccatgtagtcgaccccacttagtgg 22349880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 188 - 467
Target Start/End: Original strand, 36136702 - 36136982
Alignment:
Q  188 gttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaata 286  Q
    |||||||| |||||||  ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||  ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||    
T  36136702 gttggatgggtggtaagactagaagggataggtttaggaatgacaccattagagagagagttggggtagcacctatagtag-aaaagatggtagaaaata 36136800  T
Q  287 ggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaag 386  Q
    | ||||||  |||||| ||| ||||||||| || | |||||| | | ||| |||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||| ||||||||||    
T  36136801 gtcttaggttgtttgggcatatagagagaatacctatagatgttgtagtacgaagagcagatcagatggaggagagtcagatcagaagaagtagaggaag 36136900  T
Q  387 agctatgaaaac--taagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaaca 467  Q
    | |||  |||||  ||||| |||||||| ||||||||||| | |||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  36136901 acctagaaaaactataagagaaactatttggaaagatttagatgttaatgaattggatcc-aaatatggtttatgatagaaca 36136982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 185 - 400
Target Start/End: Original strand, 33072889 - 33073102
Alignment:
Q  185 tgcgttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaa 283  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||| || ||||||||  ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  33072889 tgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaggaatgacaccattaga--gagagtgggggtagcacctatagtag-aaaagttggtagaaa 33072985  T
Q  284 ataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagagg 383  Q
    ||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||  |||||||   | ||||||||||||||||| |||||| ||||||  || ||||||||||||||    
T  33072986 ataggcttagatgatttgggcatgtagagagaagacccgtagatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggagaagagtcaagttaaaagaggtagagg 33073085  T
Q  384 aagagctatgaaaacta 400  Q
    |||| ||| ||||||||    
T  33073086 aagacctaggaaaacta 33073102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 179 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 8492586 - 8492259
Alignment:
Q  179 atatgctgcgttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttgg 277  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||| || |||||||  ||||| |  ||||| ||||||||| |  ||| | |||    
T  8492586 atatgctgcgttggatgagtggcaagactagacgggataggattacgaatgacaccattagggagagatttggggtaacacctatagtaa-aaatgatgg 8492488  T
Q  278 tagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagagg 377  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| || |||||||| |||||||||||||| | | |||  |||||||||||||||||||||| ||  | | | ||||||    
T  8492487 tagaaaataggctaaggtggtttgaacttgtagagaaaagacttgtagatgttgtagtacaaagagtagatcagatggaggagggtgagattagaagagg 8492388  T
Q  378 tagaggaagagctatgaaaactaagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgca 477  Q
    ||||| |||| | | ||||| | | || |||| |||||||||||||| ||||||| | ||||||||| | ||||| |||||||||||| |||| |||  |    
T  8492387 tagagaaaga-ccacgaaaaattataataactgttaggaaagatttagaggttaacgagttggatcc-atatatggtttatgatagaaaactatggcata 8492290  T
Q  478 atttgatccatgtagccgaccccacttagtg 508  Q
    |||||||| ||||| |  |||||||||||||    
T  8492289 atttgatcaatgtaactaaccccacttagtg 8492259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 275 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 28628190 - 28627955
Alignment:
Q  275 tggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaag 374  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||| || |||||||  | | ||||| |||||||||| ||||||||| ||||   ||| |||    
T  28628190 tggtggaaaattggcttaggtggtttgggcatgtaaagagaaaacctgtagattatgtagtaaggagagtagatccgatggaggatagtcaaatcacaag 28628091  T
Q  375 aggtagaggaagagctatgaaaac--taagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacg 472  Q
    ||||||||||||| |||  |||||  ||||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| | |||| || |||||||||||||| || |    
T  28628090 aggtagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaagatttagagattaatgagttggatgc-aaatgtggtttatgatagaacattatg 28627992  T
Q  473 gcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28627991 gcgtaatttgatccatgtagccgactccacttagtgg 28627955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 185 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 35559341 - 35559076
Alignment:
Q  185 tgcgttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacct-atagcaggaaaagttggtagaa 282  Q
    |||||||||||||||||||    |||   ||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||||||||    
T  35559341 tgcgttggatgagtggtaagatcagatttgataggattaggaatgacaccatttgagagagagtgggggtagcaccttatagtag-aaaagttggtagaa 35559243  T
Q  283 aataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagag 382  Q
    |||||||||||  | ||||||||| ||| ||||||||   ||||||   | ||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||    
T  35559242 aataggcttagatgatttggacatttagtgagaagacccctagatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 35559143  T
Q  383 gaagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaa 447  Q
    ||||| ||| ||||||||  ||| |||| ||||| ||||||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  35559142 gaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaa 35559076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 268 - 508
Target Start/End: Original strand, 15682192 - 15682433
Alignment:
Q  268 gaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcggg 367  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  ||||| | || ||||||||||||    |||||||  ||||||||||||||||||| || ||||| ||||  |    
T  15682192 gaaaagttggtaggaaataggcttagatggtttaggcaggtagagagaagatccatagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaattgaggaaagtcaag 15682291  T
Q  368 tcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaa 465  Q
    ||||||||||| ||| || | ||| ||||||||  ||| |||  ||||| || |||||| |||| |||  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15682292 tcaaaagaggtggagaaaaacctaggaaaactataagagaaatcattagaaaggatttagaggtcaataagttggatccaaa-tatgatttatgatagaa 15682390  T
Q  466 cactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtg 508  Q
    ||||| |||| | |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15682391 cactatggcgtactttgatccatgtagccaaccccacttagtg 15682433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 370 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 40980090 - 40979950
Alignment:
Q  370 aaaagaggtagaggaagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaaca 467  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||| |||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  40980090 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactataagagaaactattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaa-tatggtttatgatagaaca 40979992  T
Q  468 ctacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40979991 ctatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 40979950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 304 - 509
Target Start/End: Original strand, 7273154 - 7273360
Alignment:
Q  304 catgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaac--taa 401  Q
    |||||||||||||||   |||| |||  ||||| | |||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||    
T  7273154 catgtagagagaagatccgtaggtgccgtcgtatgtagagtagattggatggaggagagtcaggtcaaaagaggtagaggaagacctatgaaaactataa 7273253  T
Q  402 gaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgacccca 501  Q
    || |||| ||||| ||| ||| | |||| |||| ||||||| | ||||||| ||||||||| | ||||| | || |||||||||||||||||||||||||    
T  7273254 gagaaaccattagaaaatattcagaggtcaatgagttggattc-aaatatggtttatgatatagcactatgacgtaatttgatccatgtagccgacccca 7273352  T
Q  502 cttagtgg 509  Q
    ||||||||    
T  7273353 cttagtgg 7273360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 306 - 509
Target Start/End: Original strand, 1011103 - 1011306
Alignment:
Q  306 tgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaacta--aga 403  Q
    |||||||||||||| | |||||| | | ||| ||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||||||||| |||  |||| ||  |||    
T  1011103 tgtagagagaagacatctagatgttgtagtacgaagagtagatcagataaaggagagtcagatcaaaagaggtagaggaagacctagaaaaattatgaga 1011202  T
Q  404 aaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccact 503  Q
     ||| |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||  |||||| |||| ||||||||| || || | ||||||||| |||||||||||||||||    
T  1011203 gaaattattaggaaatatttaaaggttaatgatttggatcc--aatatggtttaggatagaacattatggtgtaatttgatctatgtagccgaccccact 1011300  T
Q  504 tagtgg 509  Q
    ||||||    
T  1011301 tagtgg 1011306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 250 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 36869525 - 36869286
Alignment:
Q  250 gggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatc 349  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  36869525 gggtagcacctatagtag-aaaagttggtagaaaataggtttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgctgtcagaagaagagtagatc 36869427  T
Q  350 agatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaa 447  Q
    | |||||||||||||  || | || ||||||||||||| ||  ||||||||  | | |||| ||||| || |||||| | || |||| ||| ||| | ||    
T  36869426 aaatggaggagagtcaagttagaataggtagaggaagacctgggaaaactattaaagaaaccattagaaaggatttagatgtcaatgagttagattc-aa 36869328  T
Q  448 atatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatg 489  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  36869327 atttgatttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatg 36869286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 185 - 397
Target Start/End: Original strand, 23404353 - 23404564
Alignment:
Q  185 tgcgttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaa 283  Q
    |||| |||||||| |||||  ||| ||  ||||||||||||||| || |||||||  |||||||| ||||| ||| ||||| || ||||||||| |||||    
T  23404353 tgcgctggatgagcggtaagactatacatgataggattaggaatgacaccattagggagagagtgggggtaacacttatagtag-aaaagttgggagaaa 23404451  T
Q  284 ataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagagg 383  Q
    |||||||||| | |||||| ||||||||  ||||||| |||||||   || |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  23404452 ataggcttagacagtttgg-catgtagattgaagactcgtagatgtcgtcataagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggtcaaaagaggtagaag 23404550  T
Q  384 aagagctatgaaaa 397  Q
    |||| ||| |||||    
T  23404551 aagacctaggaaaa 23404564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 188 - 488
Target Start/End: Original strand, 47848612 - 47848912
Alignment:
Q  188 gttggatgagtggtaaagctagacgggataggattagga---ataacccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaa 284  Q
    |||||||| |||||||  |||||||||||||||| || |   |||||  |||||| |||||||  ||||||| ||||||| || ||||| |||| |||||    
T  47848612 gttggatgtgtggtaagactagacgggataggatcagaagtgataac--attagagagagagttggggtagcgcctatagtag-aaaagatggtggaaaa 47848708  T
Q  285 taggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagagga 384  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| || || |  |||| |||||||||||||||||||| |||| | |||  ||||| ||||||    
T  47848709 taggcttaggtggtttgggcatgtcgagagaagacttgtaaattctgtactaaggagagtagatcagatggaggatagtctgatcactagaggcagagga 47848808  T
Q  385 agagctatgaaaac--taagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttg 482  Q
    ||| |||  |||||  ||||| |||||||| ||||||||||   | |||||| | ||||||| ||||||| |||||||||||||| || ||   ||||||    
T  47848809 agaactagaaaaactataagagaaactatt-ggaaagatttggggattaatgagctggatcc-aaatatggtttatgatagaacattatggtttaatttg 47848906  T
Q  483 atccat 488  Q
    ||||||    
T  47848907 atccat 47848912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 296 - 509
Target Start/End: Original strand, 32631622 - 32631824
Alignment:
Q  296 ggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaa 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||| |      
T  32631622 ggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagagtggatcaaatggaggatagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaag-- 32631719  T
Q  396 aactaagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccg 495  Q
            ||||| ||||| ||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||| ||||  |||||||| |||||||||    
T  32631720 --------aaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatcc-aaatatggtttttgatagaacgctatggcgtcatttgatctatgtagccg 32631810  T
Q  496 accccacttagtgg 509  Q
    ||||||||||||||    
T  32631811 accccacttagtgg 32631824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 323 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 31681226 - 31681042
Alignment:
Q  323 tagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaactaagaaaaactattaggaaagatt 422  Q
    |||||||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| | | |||| ||||||||| ||| ||| ||||| || || |||| ||||| || ||||    
T  31681226 tagatgccgtcgtaagaagagttgatcaaatggaagagagtcagtttaaaacaggtagagggagacctaggaaaatta-gagaaaccattagaaaggatt 31681128  T
Q  423 taaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||| ||| |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| |||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31681127 taagggtcaatgagttggatccaaa-tatggcttatgatagaatactatgacgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 31681042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 190 - 362
Target Start/End: Original strand, 7272979 - 7273151
Alignment:
Q  190 tggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaatagg 288  Q
    |||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||| || || ||||  |||||  | | ||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  7272979 tggatgagcggtaagactacacgggataggattaggaatgacacctttagggagagaacgggagtatcacctatagtag-aaaagttggtagaaaatagg 7273077  T
Q  289 cttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagag 362  Q
    |||||  ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7273078 cttagatggtttgggcatgtacagagaagacctgtagatgccgccgtatgaagagtagatcagatggaggagag 7273151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 372 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 9210864 - 9210726
Alignment:
Q  372 aagaggtagaggaagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacact 469  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||||||  ||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| |||| |    
T  9210864 aagaggttgaggaagacctaggaaaactataagagaaacttttaggaaaaatttagaggttaatgagttggatccaaa-tatggtttatgatacaacatt 9210766  T
Q  470 acggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9210765 atggcgtaatttgatccatgtagctgaccccacttagtgg 9210726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 268 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 38135476 - 38135235
Alignment:
Q  268 gaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcggg 367  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  ||||||  | | ||||| ||| |||||||||||||||| |||| |     
T  38135476 gaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttggacatgtagacagaagaccagtagattttgtagtaaggaga-tagatcagatggaggatagtcaga 38135378  T
Q  368 tcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaa--ctaagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaa 465  Q
    |||  ||||| ||| ||||| |||  ||||   ||||| |||||||||  ||||||||| || |||||| |||||| || |||||||  |||||||||||    
T  38135377 tcattagaggcagatgaagacctagaaaaagtataagagaaactattaaaaaagatttagagattaatgagttgga-ccgaaatatgggttatgatagaa 38135279  T
Q  466 cactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
     | || |||| |||||||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  38135278 tattatggcgtaatttgatccatctagctgaccccacttggtgg 38135235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 209 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 46014503 - 46014363
Alignment:
Q  209 gacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatg 307  Q
    ||||||||| |||||| ||| || |||||||| |||||||| |||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  46014503 gacgggataagattagaaatgacaccattagagagagagtgggggttgcacctatagtag-aaaagttggtagaaaataggcttagatggtt-ggacatg 46014406  T
Q  308 tagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatca 350  Q
    ||||||||||||   |||||||  || ||||||||||||||||    
T  46014405 tagagagaagacccatagatgccgtcctaagaagagtagatca 46014363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 399 - 507
Target Start/End: Original strand, 14057629 - 14057736
Alignment:
Q  399 taagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgacc 498  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| |||| |||| |||||||||||||| || || | |||||||||||||||||| |||    
T  14057629 taagagaaactattaggaaagatttagaggttaatgcgttcgattcaaa-tatggtttatgatagaacattatggggtaatttgatccatgtagccaacc 14057727  T
Q  499 ccacttagt 507  Q
    |||||||||    
T  14057728 ccacttagt 14057736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 399 - 507
Target Start/End: Original strand, 14367657 - 14367764
Alignment:
Q  399 taagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgacc 498  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| |||| |||| |||||||||||||| || || | |||||||||||||||||| |||    
T  14367657 taagagaaactattaggaaagatttagaggttaatgcgttcgattcaaa-tatggtttatgatagaacattatggggtaatttgatccatgtagccaacc 14367755  T
Q  499 ccacttagt 507  Q
    |||||||||    
T  14367756 ccacttagt 14367764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 405 - 509
Target Start/End: Original strand, 27648937 - 27649040
Alignment:
Q  405 aaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccactt 504  Q
    |||| ||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||||| | || ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27648937 aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatt-tggtttatgatagaacactgtggcgtaatttgatccatgtagccgaccccactt 27649035  T
Q  505 agtgg 509  Q
    |||||    
T  27649036 agtgg 27649040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 243 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 36102053 - 36101799
Alignment:
Q  243 agagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaaga 342  Q
    ||||||| |||||||||||||  || ||||| || | ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| | |||||  | |   | | |||    
T  36102053 agagtgaaggtagcacctataatag-aaaagatgttggaaaataggcttaggtggtttggggatgtagagagaagacctatagattttgtaacagggaga 36101955  T
Q  343 gtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaactaagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggat 442  Q
    |||||||| |||||| | |||| | |||  ||||| ||||||||| |||          |||||| ||||| |||||||||| || |||||| |||||||    
T  36101954 gtagatcatatggagaatagtcagatcactagaggcagaggaagaccta----------gaaaaattattatgaaagatttatagattaatgagttggat 36101865  T
Q  443 ccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    | |||||||| |||||||||||||| || | || ||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  36101864 c-aaaatatggtttatgatagaacattatgacgtaatttgatccatgtagttgaccccacttagtgg 36101799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 373 - 509
Target Start/End: Original strand, 45601599 - 45601736
Alignment:
Q  373 agaggtagaggaagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacacta 470  Q
    ||||||||||||||| |||  |||||||  ||| |||| |||| ||||||| || || |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  45601599 agaggtagaggaagacctagaaaaactataagagaaaccattaagaaagatctagagattaatgagttggatc-aaaatatgatttatgatagaacacta 45601697  T
Q  471 cggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
     || | ||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  45601698 tggtgtaatttgatccatgtagctgaactcacttagtgg 45601736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 304 - 503
Target Start/End: Original strand, 1569070 - 1569270
Alignment:
Q  304 catgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaacta--a 401  Q
    |||||||||||||| | |||||||| | | | ||| |||||||||||||||||||| |||| | |    ||||| ||||| ||  |||  |||||||  |    
T  1569070 catgtagagagaagtcgtgtagatgttgtagaaaggagagtagatcagatggaggatagtcagattgctagaggcagaggtagtcctagaaaaactataa 1569169  T
Q  402 gaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgacccca 501  Q
    ||  |||||||| ||||||| || || |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  1569170 gagtaactattaagaaagatctagagattaatgagttggatc-aaaatatggtttatgatagaacattacggcgtaatttgatcgatgtagtcgacccca 1569268  T
Q  502 ct 503  Q
    ||    
T  1569269 ct 1569270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 214 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 25579394 - 25579245
Alignment:
Q  214 gataggattaggaataacc-cattagaaagagagtgagg-gtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtaga 311  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||  ||||||| || |||||||| ||||||| |||| | ||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||    
T  25579394 gataggattagaaatgaccacattaga--gagagtggggagtagcacccatagcagaaaaaat-ggtggaaaataggcttaggtggtttggggatgtaga 25579298  T
Q  312 gagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtc 364  Q
    |||||||| ||||||| || | ||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  25579297 gagaagacatgtagattctgtggtaagaagagtagattagatggaggatagtc 25579245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 250 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 26742177 - 26741917
Alignment:
Q  250 gggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatc 349  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| | ||| | |||||  | | ||||| ||||||||||    
T  26742177 gggtagcacctatagtag-aaaagatggtggaaaataggattaggtggtttgaacatgtagagaaacgacctatagattttgtggtaaggagagtagatc 26742079  T
Q  350 agatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaact----aagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatcca 445  Q
    |||| ||| | |||| | |||  ||||| |||||||||  ||  ||||||    |||| |||||||||||||| ||||  |  | |||| |||||| ||     
T  26742078 agatagagaatagtcagatcactagaggcagaggaagacgtagaaaaactatcaaagataaactattaggaaatatttggaaataaatgagttgga-ccg 26741980  T
Q  446 aaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtg 508  Q
    ||||||| |||||||||||||| || |||| ||||||||| ||||| || | |||||||||||    
T  26741979 aaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatcaatgtaaccaatcccacttagtg 26741917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 273 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 6420749 - 6420622
Alignment:
Q  273 gttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaa 372  Q
    |||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||| | || |||| | |||      
T  6420749 gttggtggaaactaggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacttgtagatactgtagtaaggagagtagatcagatgaatgatagtcagatcact 6420650  T
Q  373 agaggtagaggaagagctatgaaaacta 400  Q
    ||||| ||||| ||| |||| |||||||    
T  6420649 agaggcagaggtagacctataaaaacta 6420622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 370 - 509
Target Start/End: Original strand, 38900077 - 38900216
Alignment:
Q  370 aaaagaggtagaggaagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaaca 467  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||| |||| ||||| || |||||| |||| |||| |||||||||||| | || | |||||| |||||    
T  38900077 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatt-tggtgtatgattgaaca 38900175  T
Q  468 ctacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38900176 ctatggcgtcatttgatccatgtagccga-cccacttagtgg 38900216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 436 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 28208422 - 28208350
Alignment:
Q  436 gttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28208422 gttggatccaaa-tatggtttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 28208350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 405 - 509
Target Start/End: Original strand, 28355322 - 28355426
Alignment:
Q  405 aaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtag-ccgaccccact 503  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||| |||| || |||| ||||||||||| |||| | |||||||||    
T  28355322 aaactattaggaaagatttataggttaatgaggtggat-caaaatatggtttatgataaaacattatggcggaatttgatccacgtagtctgaccccact 28355420  T
Q  504 tagtgg 509  Q
    ||||||    
T  28355421 tagtgg 28355426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 185 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 36514552 - 36514375
Alignment:
Q  185 tgcgttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataacc-cattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaa 283  Q
    ||||||||||| |||||||  ||| ||||||||| ||||| ||  ||  |||||||  ||||||  ||||||||||||||| || ||||| |||||||||    
T  36514552 tgcgttggatgtgtggtaagactaaacgggatagaattagaaaggacaacattaga--gagagttggggtagcacctatagtag-aaaagatggtagaaa 36514456  T
Q  284 ataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtc 364  Q
     ||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| ||| || | ||| | |||||||||||||| |||| |||||    
T  36514455 ctagacttaggtggtttgggcatgtagagagacgacttgtggattctgtagtatggagagtagatcagatagaggggagtc 36514375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 306 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 1531587 - 1531444
Alignment:
Q  306 tgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaac--taaga 403  Q
    |||||||||||||| | |||||| | | ||| ||| ||||||||||||  ||||||| | | |||||||||||||||||||| |||  |||||  ||||     
T  1531587 tgtagagagaagacctctagatgttgtagtacgaatagtagatcagataaaggagagccagatcaaaagaggtagaggaagacctaaaaaaactataagc 1531488  T
Q  404 aaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaa 447  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||| |||||    
T  1531487 aaaattattaggaaaaatttagaggttaatgagttggacccaaa 1531444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 308 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 24598411 - 24598221
Alignment:
Q  308 tagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaa--ctaagaaa 405  Q
    ||||||| ||||  ||||||||  | ||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||| |||||   |  || |    
T  24598411 tagagagcagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaatcattcgaga 24598312  T
Q  406 aactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgac 497  Q
    ||| ||||| ||||||||| |||| |||| |||| |||| ||||||||||| |||||||| | |  |||   ||||||||||||||||||||    
T  24598311 aaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttgaatcc-aaatatgatttttgatagaatattttggcatcatttgatccatgtagccgac 24598221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 409 - 505
Target Start/End: Original strand, 40415168 - 40415263
Alignment:
Q  409 tattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccactta 505  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| |||| |||||||| |||| |||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40415168 tattaggaaagatttagaggttaatgagtttgatccaaa-tatgttttatgattgaaccctatagcttaatttgatccatgtagccgaccccactta 40415263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 399 - 509
Target Start/End: Original strand, 42187592 - 42187701
Alignment:
Q  399 taagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacact-acggcgcaatttgatccatgtagccgac 497  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||  |||||||||||| |  | |||||||||||||| | | |||| |||||||||||||||||||||    
T  42187592 taagagaaactattaggaaatatttagagattaattagttggatccaaatt--ggtttatgatagaacatttatggcgtaatttgatccatgtagccgac 42187689  T
Q  498 cccacttagtgg 509  Q
    ||||||||||||    
T  42187690 cccacttagtgg 42187701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 401 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 27893692 - 27893586
Alignment:
Q  401 agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgacccc 500  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || |||||| | |||| || ||||||| |||||||||||||| || |||  |||||||| ||||||||||||||     
T  27893692 agaaaaactattaagaaagatttagagattaatgagctgga-ccgaaatatgttttatgatagaacattatggcataatttgattcatgtagccgaccct 27893594  T
Q  501 acttagtg 508  Q
    ||||||||    
T  27893593 acttagtg 27893586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 267 - 358
Target Start/End: Original strand, 30144792 - 30144883
Alignment:
Q  267 ggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggagg 358  Q
    ||||||| |||||||||   ||||||||  |||||| || ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  30144792 ggaaaagatggtagaaatccggcttaggtagtttgggcaggtagagagaagacttgtagattctatagtacgaagagtagatcagatggagg 30144883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 399 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 36239927 - 36239833
Alignment:
Q  399 taagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagcc 494  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| | |||||||||||| |||| |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  36239927 taagagaaactattaggaaaaatttagagattaacgagttggatccaaa-tatgctttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagcc 36239833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 190 - 292
Target Start/End: Original strand, 32630535 - 32630636
Alignment:
Q  190 tggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataacccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggc 289  Q
    ||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||  |  ||||| || |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  32630535 tggatgagtggtaagactagacatgataggattaggatgataccattggagagagagtgggggtagcacctatagta-gaaaagttggtagaaaataggc 32630633  T
Q  290 tta 292  Q
    |||    
T  32630634 tta 32630636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 431 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 34035253 - 34035176
Alignment:
Q  431 aatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||| |||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34035253 aatgagttggatccaaa-tatggttcatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 34035176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 241 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 19262723 - 19262609
Alignment:
Q  241 agagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaa 340  Q
    |||||||  ||||||||||||| | || ||||| ||||||||| | |||||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||  | | |||||||    
T  19262723 agagagttggggtagcacctattgtag-aaaagatggtagaaacttggcttaggtggtttgagcatgtagagagaagacctgtagat-ttgtagtaagaa 19262626  T
Q  341 gagtagatcagatggag 357  Q
    |||||||||||||||||    
T  19262625 gagtagatcagatggag 19262609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 189 - 359
Target Start/End: Original strand, 39811896 - 39812066
Alignment:
Q  189 ttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataacc-cattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaatag 287  Q
    ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||| |||||||  ||| |||||||||   || |||| | |||  ||| | |    
T  39811896 ttggatgtgtggtaagactagacgtgataggattagaaatgacaacattagagagagagttggggcagcacctatcatagaaaaaat-ggtgaaaactcg 39811994  T
Q  288 gcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggagga 359  Q
    |||||||  |||||| |||||||||||||||  ||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  39811995 gcttaggtagtttgggcatgtagagagaagagatgtagattctatagtaaggagagtagatcagatggagga 39812066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 233 - 348
Target Start/End: Original strand, 42187454 - 42187568
Alignment:
Q  233 cattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctat 332  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||  || ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| | |||||||  | |    
T  42187454 cattagaaagagagtcggggtagcacctataatag-aaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtaaagagaaggcctgtagattatgt 42187552  T
Q  333 cgtaagaagagtagat 348  Q
     ||||| |||||||||    
T  42187553 agtaaggagagtagat 42187568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 405 - 506
Target Start/End: Original strand, 37976392 - 37976492
Alignment:
Q  405 aaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccactt 504  Q
    |||||| || |||||||||| || |||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| || |||  |||| ||||||||||||| ||||| |||    
T  37976392 aaactaatatgaaagatttagagattaatgagttggatccaaa-tatggtttatgatagaacattatggctaaattagatccatgtagccaaccccgctt 37976490  T
Q  505 ag 506  Q
    ||    
T  37976491 ag 37976492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 420 - 509
Target Start/End: Original strand, 42969870 - 42969958
Alignment:
Q  420 atttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||  |   |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42969870 atttagaggttaatgagttggatccaaa-tatggtttatgattgaacattatcgtataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 42969958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 241 - 378
Target Start/End: Original strand, 43282400 - 43282535
Alignment:
Q  241 agagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaa 340  Q
    |||||||  ||||||||||||||| || |||||| ||| |||| |||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||| |||| || | | ||| |    
T  43282400 agagagttggggtagcacctatagtag-aaaagtcggtggaaactaggcttaggtgaattgggcatgtagagagaagacttgcagattctgtaggaagga 43282498  T
Q  341 gagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggt 378  Q
    |||||||| |||||||||| |||| | ||| |||||||    
T  43282499 gagtagat-agatggaggatagtcagatcacaagaggt 43282535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 447 - 507
Target Start/End: Original strand, 33103124 - 33103184
Alignment:
Q  447 aatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagt 507  Q
    |||||| ||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33103124 aatatggtttatgatagaacaccatagcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagt 33103184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 426 - 506
Target Start/End: Original strand, 47852265 - 47852344
Alignment:
Q  426 aggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttag 506  Q
    ||||||||| |||||||||||| | || | ||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47852265 aggttaatgagttggatccaaa-tgtggtgtatcatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttag 47852344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 449 - 509
Target Start/End: Original strand, 48515475 - 48515535
Alignment:
Q  449 tatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||||||||||| |||||| | || |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  48515475 tatgatttatgatagtacactatgacgtaatttgatccgtgtagccgaccccacttagtgg 48515535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 401 - 505
Target Start/End: Original strand, 48919265 - 48919368
Alignment:
Q  401 agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgacccc 500  Q
    |||||||| ||||| || |||||| |||| |||| ||| |||||||| |||| ||||||||| | ||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  48919265 agaaaaaccattagaaatgatttagaggtcaatgagtttgatccaaa-tatggtttatgataaaccactatggcgtcatttgatccatgtagtcgacccc 48919363  T
Q  501 actta 505  Q
    |||||    
T  48919364 actta 48919368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 280 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 9797956 - 9797909
Alignment:
Q  280 gaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagat 327  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9797956 gaaaattggcttaggtggtttggacatgtagagagaagacttgtagat 9797909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 446 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 30814210 - 30814147
Alignment:
Q  446 aaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30814210 aaatatgttttatgatagaacattatcacgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 30814147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 275 - 354
Target Start/End: Original strand, 35713720 - 35713799
Alignment:
Q  275 tggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatg 354  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||  | | ||||| |||||||||| ||||    
T  35713720 tggtggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacttgtacattttgtagtaaggagagtagatctgatg 35713799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 285 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 48202949 - 48202870
Alignment:
Q  285 taggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtc 364  Q
    |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| || | ||||| ||||||||||| |||| ||| ||||    
T  48202949 taggcttaggtggtttgcgcatgtagagagaagacttgtagattctgtagtaaggagagtagatcatatggtggatagtc 48202870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 406 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 8519170 - 8519069
Alignment:
Q  406 aactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccactta 505  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||| | |||||||||| | |||| |||||||||||| |||| |||  ||||||||| ||||| |  ||||||||||    
T  8519170 aactgttaggaaagatttagaggttaacgagttggatccata-tatggtttatgatagaaaactatggcataatttgatcaatgtaactaaccccactta 8519072  T
Q  506 gtg 508  Q
    |||    
T  8519071 gtg 8519069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 399 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 40391954 - 40391845
Alignment:
Q  399 taagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgacc 498  Q
    ||||| |||||| |||||| |||||| |  |||||  |||||| || |||||||  ||||||||||||| || |||| |||||||||||| || ||||||    
T  40391954 taagagaaactagtaggaatgatttagaaattaataagttgga-ccgaaatatggcttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatctaaccgacc 40391856  T
Q  499 ccacttagtgg 509  Q
    |||||||||||    
T  40391855 ccacttagtgg 40391845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 241 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 27021982 - 27021906
Alignment:
Q  241 agagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaaga 318  Q
    |||||||  ||||||||||||||| || ||||||||||  ||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  27021982 agagagttggggtagcacctatagtag-aaaagttggtgaaaactaggcttaggtggtttgggcatgtagagagaaga 27021906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 405 - 497
Target Start/End: Original strand, 21078074 - 21078165
Alignment:
Q  405 aaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgac 497  Q
    |||| ||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||||| | || | |||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||    
T  21078074 aaaccattagtaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatt-tggtgtatgatagaacattatggcgtcatttgatccatgtagccgac 21078165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 447 - 507
Target Start/End: Original strand, 25891086 - 25891146
Alignment:
Q  447 aatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagt 507  Q
    |||||| ||||| |||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25891086 aatatggtttataatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagt 25891146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 446 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 34341480 - 34341416
Alignment:
Q  446 aaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgga 510  Q
    ||||||| |||||||||||||| || |||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||    
T  34341480 aaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgaccaatgtagccgaccccatttagtgga 34341416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 454 - 509
Target Start/End: Original strand, 4604752 - 4604807
Alignment:
Q  454 tttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||||||||||||| || |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4604752 tttatgatagaacattatggcgtactttgatccatgtagccaaccccacttagtgg 4604807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 241 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 7189516 - 7189442
Alignment:
Q  241 agagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaa 316  Q
    |||||||  |||| |||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  7189516 agagagttggggtcgcacctatagtag-aaaagatggtagaaaataagcttaggtggtttgggcatgtagagagaa 7189442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 269 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 18605409 - 18605314
Alignment:
Q  269 aaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtc 364  Q
    ||||| ||||||||| ||  |||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||  ||| || || ||| |||||||||| ||||||||||    
T  18605409 aaaagatggtagaaactaaacttaggtggtttgagcatgtagagagaagacatgtagattatatagttaggagattagatcagatcgaggagagtc 18605314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 269 - 364
Target Start/End: Original strand, 18637581 - 18637676
Alignment:
Q  269 aaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtc 364  Q
    ||||| ||||||||| ||  |||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||  ||| || || ||| |||||||||| ||||||||||    
T  18637581 aaaagatggtagaaactaaacttaggtggtttgagcatgtagagagaagacatgtagattatatagttaggagattagatcagatcgaggagagtc 18637676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 269 - 364
Target Start/End: Original strand, 18651015 - 18651110
Alignment:
Q  269 aaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtc 364  Q
    ||||| ||||||||| ||  |||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||  ||| || || ||| |||||||||| ||||||||||    
T  18651015 aaaagatggtagaaactaaacttaggtggtttgagcatgtagagagaagacatgtagattatatagttaggagattagatcagatcgaggagagtc 18651110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 458 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 31869175 - 31869124
Alignment:
Q  458 tgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31869175 tgatagaacactctggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 31869124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 405 - 488
Target Start/End: Original strand, 35922410 - 35922492
Alignment:
Q  405 aaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccat 488  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||| || | |  ||||||||||||    
T  35922410 aaactattaagaaagatttagaggttaatgagttgaatctaaa-tatgatttatgatagaacattatgacctaatttgatccat 35922492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 446 - 497
Target Start/End: Original strand, 44951352 - 44951403
Alignment:
Q  446 aaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgac 497  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||    
T  44951352 aaatattatttatgatagaacactatgacgtaatttgatccatgtagccgac 44951403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 252 - 350
Target Start/End: Original strand, 12966025 - 12966122
Alignment:
Q  252 gtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatca 350  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||| |||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||| || || | ||||| |||||||||||    
T  12966025 gtagcacctatagaag-aaaagatggtggaaactatgcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaattctgtagtaaggagagtagatca 12966122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 304 - 382
Target Start/End: Original strand, 26925264 - 26925342
Alignment:
Q  304 catgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagag 382  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||| |||| ||||| |||||  | |||||||||||||    
T  26925264 catgcagagagaagactcgtagatgatgtagtaagaagagtagattagatagaggatagtcgaattaaaagaggtagag 26925342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 268 - 358
Target Start/End: Original strand, 28020982 - 28021072
Alignment:
Q  268 gaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggagg 358  Q
    |||||| |||| |||| | |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| | || |  |||| ||||||||| |||||||||    
T  28020982 gaaaagatggtggaaacttggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagatttgtaggttctgtaataaggagagtagattagatggagg 28021072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 399 - 509
Target Start/End: Original strand, 34745898 - 34746007
Alignment:
Q  399 taagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgacc 498  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||| | |||| ||||||   |||| ||| ||| ||||||||| ||| ||||   |||||| |||||||||||||    
T  34745898 taagagaaactattaggaaggatctaaagataaatgagttggaga-aaaacatggtttttgatagaacgctatggcgttgtttgattcatgtagccgacc 34745996  T
Q  499 ccacttagtgg 509  Q
    |||||||||||    
T  34745997 ccacttagtgg 34746007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 455 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 40149089 - 40149035
Alignment:
Q  455 ttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  40149089 ttatgatagaacattatggcgcaatttgatctatgtagccgaatccacttagtgg 40149035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 446 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 24177711 - 24177651
Alignment:
Q  446 aaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagt 507  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  24177711 aaatatggtttatgatagaacactatggcgtcatt-gatccatgtagccaaccccacttagt 24177651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 472 - 509
Target Start/End: Original strand, 28708604 - 28708641
Alignment:
Q  472 ggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28708604 ggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 28708641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 250 - 319
Target Start/End: Original strand, 40169650 - 40169718
Alignment:
Q  250 gggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagac 319  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||    
T  40169650 gggtagcacttatagtag-aaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagataagac 40169718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 477 - 509
Target Start/End: Original strand, 6263487 - 6263519
Alignment:
Q  477 aatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6263487 aatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 6263519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 461 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 27021795 - 27021747
Alignment:
Q  461 tagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||| || ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27021795 tagaacattatggcacaatttgatccatgttgccgaccccacttagtgg 27021747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 446 - 509
Target Start/End: Original strand, 33732031 - 33732092
Alignment:
Q  446 aaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||| |||||||||||||| || |||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  33732031 aaatatggtttatgatagaacattatggc--aatttgatccatgtagccggtcccacttagtgg 33732092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 446 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 34926607 - 34926547
Alignment:
Q  446 aaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttag 506  Q
    ||||||| |||||||||||||   | |||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34926607 aaatatggtttatgatagaacttaatggcgtaatttgatccatgtagccgatcccacttag 34926547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 399 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 44401256 - 44401164
Alignment:
Q  399 taagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagcc 494  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| || |||| | |||  ||| |||||||| |||||||||||||| || | || ||||||||||||||||||    
T  44401256 taagagaaactattaagaaagatttagagattaacgagtt--atc-aaaatatgttttatgatagaacattatgacgtaatttgatccatgtagcc 44401164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 399 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 47796283 - 47796176
Alignment:
Q  399 taagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgacc 498  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| |  |||||  |||||| |  ||||||| |||||||||||| | || |||| ||||||||||||| |||||| |    
T  47796283 taagagaacctattaggaaagatttagaaattaataagttgga-ctgaaatatggtttatgatagaatattatggcgtaatttgatccatgcagccgatc 47796185  T
Q  499 ccacttagt 507  Q
    || ||||||    
T  47796184 ccgcttagt 47796176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 241 - 364
Target Start/End: Original strand, 5335912 - 5336034
Alignment:
Q  241 agagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaa 340  Q
    |||||||  |||||||| |||||| |||||| | |||| |||| ||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||  ||| ||| || | || || |    
T  5335912 agagagttggggtagcatctatagtaggaaa-gatggtcgaaactagacttaggtggtttgggcatatagagagaagaactgtggattctgtagttagga 5336010  T
Q  341 gagtagatcagatggaggagagtc 364  Q
    |||||||| ||||||||| |||||    
T  5336011 gagtagattagatggaggggagtc 5336034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 454 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 24376100 - 24376045
Alignment:
Q  454 tttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  24376100 tttatgatggaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgacctcgcttagtgg 24376045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 401 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 28542073 - 28541975
Alignment:
Q  401 agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgacccc 500  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || |||||| |||||||   || |||| ||||||||||||||  | |||  | |||||||| |||||||||||||    
T  28542073 agaaaaactattaagaaagatttagagattaatgagttggat-tgaactatggtttatgatagaacatcatggcatagtttgatccgtgtagccgacccc 28541975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 478 - 509
Target Start/End: Original strand, 31005434 - 31005465
Alignment:
Q  478 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31005434 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 31005465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 397 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 40139081 - 40138971
Alignment:
Q  397 actaagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccga 496  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| || || |||||| ||| |||  ||| |||||  |||||||||| | || | ||  |||||||||||||||| ||    
T  40139081 actaagagaaactattaagaaagatctagagattaatgcgtttgatagaaa-tatgacatatgatagaatattatgacgtcatttgatccatgtagcaga 40138983  T
Q  497 ccccacttagtg 508  Q
    ||||||||||||    
T  40138982 ccccacttagtg 40138971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 478 - 509
Target Start/End: Original strand, 40630663 - 40630694
Alignment:
Q  478 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40630663 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 40630694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 241 - 356
Target Start/End: Original strand, 45558354 - 45558468
Alignment:
Q  241 agagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaa 340  Q
    |||||||  ||||| ||||||||| || ||||||||||||||| | | |||||| ||||||  || |||||||||| || ||| ||| || | || || |    
T  45558354 agagagttggggtaccacctatagtag-aaaagttggtagaaactcgacttaggtggtttgtgcacgtagagagaatacctgtggattctgtagttagga 45558452  T
Q  341 gagtagatcagatgga 356  Q
    ||||||||||||||||    
T  45558453 gagtagatcagatgga 45558468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 446 - 509
Target Start/End: Original strand, 47652744 - 47652807
Alignment:
Q  446 aaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||| |||  ||||||||| || |||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  47652744 aaatatggtttcggatagaacattatggcgtaacttgatccctgtagccgaccccacttagtgg 47652807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 250 - 320
Target Start/End: Original strand, 38920795 - 38920864
Alignment:
Q  250 gggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagact 320  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||| |||| |||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||    
T  38920795 gggtagcacctatagtag-aaaagatggtggaaactaggcttaagtggtttgggcatgtagagagatgact 38920864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 454 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 45054380 - 45054330
Alignment:
Q  454 tttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccactt 504  Q
    |||||||||||| | || |||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  45054380 tttatgatagaatattatggcgtaatttggtccatgtagccgaccccactt 45054330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 469 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 17907786 - 17907749
Alignment:
Q  469 tacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttag 506  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17907786 tacggcgtaatttgatccatgtagccgaccccatttag 17907749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 477 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 20525106 - 20525077
Alignment:
Q  477 aatttgatccatgtagccgaccccacttag 506  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20525106 aatttgatccatgtagccgaccccacttag 20525077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 472 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 25579162 - 25579125
Alignment:
Q  472 ggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  25579162 ggcgcaatttgatccatgtcgccgaccccactcagtgg 25579125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 448 - 509
Target Start/End: Original strand, 48515370 - 48515431
Alignment:
Q  448 atatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||| ||||| || |||||||||| ||| |||||||||    
T  48515370 atatggtttatgatagaacattatggcgtaattttattcatgtagccgccccaacttagtgg 48515431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 268 - 324
Target Start/End: Original strand, 7220762 - 7220818
Alignment:
Q  268 gaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgta 324  Q
    |||||| || |||||| | |||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  7220762 gaaaagatgatagaaacttggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacgtgta 7220818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 290 - 357
Target Start/End: Original strand, 28858084 - 28858152
Alignment:
Q  290 ttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtaga-tcagatggag 357  Q
    ||||| ||||||| |||||||| ||| ||| ||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  28858084 ttaggtggtttgggcatgtagaaagatgacctgtggattctatagtaagaagagtagattcagatggag 28858152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 477 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 32789991 - 32789959
Alignment:
Q  477 aatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32789991 aatttgatccatgtagctgaccccacttagtgg 32789959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 458 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 34029749 - 34029705
Alignment:
Q  458 tgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccac 502  Q
    |||||||||| || |||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  34029749 tgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccaaccccac 34029705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 397 - 505
Target Start/End: Original strand, 40169804 - 40169911
Alignment:
Q  397 actaagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccga 496  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| | | || ||| |  |||||| |||| ||||| | |||||||||||| ||| ||| || ||||||| |||| ||||    
T  40169804 actaagagaaactattaagaaagactcagagattagttagttgga-ccaacatatggtctatgatagaacattacagcgtaagttgatccgtgtaaccga 40169902  T
Q  497 ccccactta 505  Q
    |||||||||    
T  40169903 ccccactta 40169911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 481 - 509
Target Start/End: Original strand, 41483719 - 41483747
Alignment:
Q  481 tgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41483719 tgatccatgtagccgaccccacttagtgg 41483747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 149; Significance: 2e-78; HSPs: 91)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 185 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 36565588 - 36565263
Alignment:
Q  185 tgcgttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaa 283  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  36565588 tgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtag-aaaagttggtagaaa 36565490  T
Q  284 ataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagagg 383  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||  | |||||||| |||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  36565489 ataggcttagatggtttgggcatgtagagagaatacccgtagatgccgtggtaagaagggtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagagg 36565390  T
Q  384 aagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaattt 481  Q
    |||| ||| ||||||||  ||| |||| ||||| || |||||| |||| |||| ||||||||| |||| || | ||||||||||||||| ||||  ||||    
T  36565389 aagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatcc-aaatttggtgtatgatagaacactatggcgttattt 36565291  T
Q  482 gatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36565290 gatccatgtagccgaccccacttagtgg 36565263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 185 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 42854351 - 42854026
Alignment:
Q  185 tgcgttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaa 283  Q
    |||| ||||| ||||||||  |||||| | |||||||||||||| || |||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||||    
T  42854351 tgcgctggataagtggtaagactagacagaataggattaggaatgacaccatcagagagagagtgggggtaacacctatagcag-agaagttggtagaaa 42854253  T
Q  284 ataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagagg 383  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  42854252 ataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagagg 42854153  T
Q  384 aagagctatgaaaac--taagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaattt 481  Q
    |||| ||| ||||||  |  || |||| ||||| ||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||| ||||  ||||    
T  42854152 aagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatcc-aaatatggtttttgatataacactatggcgtcattt 42854054  T
Q  482 gatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||    
T  42854053 gatccatgtagccgaccccatttagtgg 42854026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 188 - 509
Target Start/End: Original strand, 36545085 - 36545409
Alignment:
Q  188 gttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagag--tgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaa 284  Q
    ||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||| || |||||||| ||||||  || ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||    
T  36545085 gttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagagtgggggtaacacctatagtag-aaaagttggtagaaaa 36545183  T
Q  285 taggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagagga 384  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||| ||||  || |||||| ||||||||    
T  36545184 taggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagacgtagagga 36545283  T
Q  385 agagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttg 482  Q
    ||| ||| ||||||||  ||| |||| ||||| || |||||| |||| |||| ||||||||| |||| || | ||||||||||||||| | ||  |||||    
T  36545284 agacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatcc-aaatttggtgtatgatagaacactatgacgtcatttg 36545382  T
Q  483 atccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  36545383 atccatgtagccgaccccacttagtgg 36545409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 216 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 11524040 - 11523745
Alignment:
Q  216 taggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggctt-aggcggtttggacatgtagaga 313  Q
    ||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||| ||  ||||||| ||||||||||    
T  11524040 taggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtag-aaaagttggtagttaataggctttagatggtttgggcatgtagaga 11523942  T
Q  314 gaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaacta--agaaaaactat 411  Q
    ||||||  ||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||| |||| ||    
T  11523941 gaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccat 11523842  T
Q  412 taggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||| || |||||| |||| |||| ||||||||| |||| || | ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11523841 tagaaaggatttagaggtcaatgagttggatcc-aaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 11523745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 185 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 36395297 - 36394970
Alignment:
Q  185 tgcgttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaa 283  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  36395297 tgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtag-aaaagttggtagaaa 36395199  T
Q  284 ataggctt-aggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagag 382  Q
    |||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||| ||||  || |||||||||| ||    
T  36395198 ataggctttagatggtttgggcatgtagagagaagacctgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggaaagtcaagttaaaagaggtatag 36395099  T
Q  383 gaagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacacta-cggcgcaat 479  Q
    ||||| ||| ||||||||   || ||||  |||| || |||||| |||| |||| ||| ||||| |||| || | |||||||||||||||  |  ||| |    
T  36395098 gaagacctaggaaaactatttgagaaaccgttagaaaggatttagaggtcaatgagttagatcc-aaatttggtgtatgatagaacactattgtggcatt 36395000  T
Q  480 ttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36394999 ttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 36394970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 251 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 12491418 - 12491160
Alignment:
Q  251 ggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatca 350  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||  | |||||||||||||||||    
T  12491418 ggtagcacctatagtag-aaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatca 12491320  T
Q  351 gatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaa 448  Q
     ||| |||||||||  || |||||||||||| ||||| ||||||||||||  ||| |||| ||||| || |||||| |||| |||| ||||||||| |||    
T  12491319 aatgaaggagagtcaagttaaaagaggtagatgaagacctatgaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatcc-aaa 12491221  T
Q  449 tatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    | || | ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12491220 tttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 12491160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 185 - 509
Target Start/End: Original strand, 45419174 - 45419495
Alignment:
Q  185 tgcgttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaa 283  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||| |||||| |||||||||| || ||||||||  |||| |  ||||||||||||||| || ||||| ||||| |||    
T  45419174 tgcgttggattagtggtaagactagaagggataagattaggaatgacaccattaga--gagaattggggtagcacctatagtag-aaaagatggtataaa 45419270  T
Q  284 ataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagagg 383  Q
    |||| |||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||    
T  45419271 atagacttaggtggtttgggcatgtagagataagacctgtagaggcta--gtatgaagagtagatcagatggaggagagtcagatctgaagaggtagagg 45419368  T
Q  384 aagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaattt 481  Q
    |||| |||  |||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||   ||||| ||| |||||||| | || |||||||||||||| || || | |||||    
T  45419369 aagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaaggtttaaatcataatgagtttgatccaaatt-tggtttatgatagaacattatggtgtaattt 45419467  T
Q  482 gatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  45419468 gatccatgtagccgaccccacttagtgg 45419495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 214 - 509
Target Start/End: Original strand, 18125139 - 18125431
Alignment:
Q  214 gataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagag 312  Q
    ||||||||||| ||| || ||||||||  ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  18125139 gataggattagaaatgacaccattaga--gagagtgggggtagcacctatagtag-aaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgaacatgtagag 18125235  T
Q  313 agaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaacta--agaaaaacta 410  Q
    |||||||  ||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||  |||||||  ||| |||| |    
T  18125236 agaagacccgtagatgccgtcgtaagaatagtagatcaaatggaggagagtcgggt-taaagaggtagagggagacctagaaaaactattagagaaacca 18125334  T
Q  411 ttaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||| ||||||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || |  |||||||| |||||| | |||| |||||||||    
T  18125335 ttagaaaagatttaaaagtcaatgagttggatcc-aaatatgatttatgatagaatactatggtg-tatttgatcaatgtagtcaacccgacttagtgg 18125431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 188 - 509
Target Start/End: Original strand, 40813260 - 40813584
Alignment:
Q  188 gttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagag--tgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaa 284  Q
    ||||||||||||||||  ||||||   ||||||||| |||| || |||||||| ||||||  || ||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  40813260 gttggatgagtggtaagactagacataataggattaagaatgacaccattagagagagagagtgggggtagcacctatagtag-aaaagttggtagaaaa 40813358  T
Q  285 taggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagagga 384  Q
    |||| ||||  ||||||| |||||||||||||||  |||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||    
T  40813359 taggtttagatggtttgggcatgtagagagaagatctgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagagga 40813458  T
Q  385 agagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttg 482  Q
    ||| ||| ||||||||  ||| |||| ||||| || |||||| |||| | || ||||||||| |||| || | | ||||||||||||| | |   |||||    
T  40813459 agacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcagtgagttggatcc-aaatttggtgtgtgatagaacactatgacatcatttg 40813557  T
Q  483 atccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||    
T  40813558 atccatgtagccaaccccacttagtgg 40813584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 185 - 475
Target Start/End: Original strand, 39946792 - 39947083
Alignment:
Q  185 tgcgttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaa 283  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||| |||| || |||||| | | |||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  39946792 tgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattatgaatgacaccattatagaaagagtgggggtagcacctatagtag-aaaagttggtagaaa 39946890  T
Q  284 ataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagagg 383  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| ||  || | ||||||||||||    
T  39946891 ataggcttagatggtttggacatgtagaaagaagacctgtagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggaggagactcaagttagaagaggtagagg 39946990  T
Q  384 aagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcg 475  Q
    | || |||  |||||||  ||| |||| ||||| ||||||||| |||| |||| |||| |||| |||| || ||||||||||||| ||| ||||    
T  39946991 acgacctagaaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttgaatcc-aaatttggtttatgatagaacgctatggcg 39947083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 214 - 509
Target Start/End: Original strand, 2796521 - 2796813
Alignment:
Q  214 gataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagag 312  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  2796521 gataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcgcctatagtag-aaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagag 2796619  T
Q  313 agaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaacta--agaaaaacta 410  Q
    |||     ||||||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||| |||| |    
T  2796620 agac----tgtagatgccattgtaagaagagtaaatcaaatggaggagagtcatgttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaactattagagaaacca 2796715  T
Q  411 ttaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||| || |||||| |||| |||  ||| || |  |||| || ||| |||||||||| || |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  2796716 ttagaaaggatttagaggtcaattagtt-gaactcaaatttggtttttgatagaacagtatggcgtaatttgattcatgtagacgaccccacttagtgg 2796813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 197 - 509
Target Start/End: Original strand, 21121105 - 21121405
Alignment:
Q  197 gtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggc 295  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||| |||  | |||||||| |||||||| |||||||||||||||             || |||||||| ||||      
T  21121105 gtggtaagactagacgggataggattagaaatggcaccattagagagagagtgggggtagcacctatag-------------tacaaaataggtttagat 21121191  T
Q  296 ggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaa 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||| |||||||||||||| ||| ||| |||    
T  21121192 ggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggacgagagttaggttaaaagaggtagagggagacctaagaa 21121291  T
Q  396 aacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagc 493  Q
    | |||  ||| |||| ||||| || |||||| | || |||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||    
T  21121292 atctattagagaaaccattagaaaggatttagaagtcaatgagttggatcc-taatatggtttatgatagaacactatggcgtaatttgat-catgtagc 21121389  T
Q  494 cgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||||||||||||    
T  21121390 cgaccccacttagtgg 21121405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 241 - 508
Target Start/End: Original strand, 8932694 - 8932962
Alignment:
Q  241 agagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgt-agatgctatcgtaaga 339  Q
    |||||||| ||||||||| || || || |||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||| ||||||   || | |||| || ||||||    
T  8932694 agagagtgggggtagcacatacagtag-aaaagttggtagaaaatagatttagatggtttggacatgtagaaagaagatccgttaaatgccattgtaaga 8932792  T
Q  340 agagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaac--taagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggt 437  Q
    |||||| |||| ||||| |||||||  || |||||||||||||||||| ||| ||||||  |  || |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  8932793 agagtaaatcaaatggaagagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttaaaggttaatgagt 8932892  T
Q  438 tggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtg 508  Q
    ||||| |||||||||  || ||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8932893 tggat-caaaatatggcttttgataaaacactatggcgtcatttgatccatgtagctgaccccacttagtg 8932962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 296 - 509
Target Start/End: Original strand, 29520696 - 29520909
Alignment:
Q  296 ggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaa 395  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||  | | ||||| |||||||||||||||||||| ||||   ||| |||||||||||||||  |||  ||    
T  29520696 ggtttgggcatgtagagagaagacttgtagattttgtagtaaggagagtagatcagatggaggatagtcaaatcacaagaggtagaggaag-cctagaaa 29520794  T
Q  396 aac--taagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagc 493  Q
    |||  ||||| ||||| ||||||| |||||| || |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||    
T  29520795 aactataagagaaactgttaggaacgatttagagattaatgagttggatcc-aaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagc 29520893  T
Q  494 cgaccccacttagtgg 509  Q
    | |||||| |||||||    
T  29520894 ccaccccatttagtgg 29520909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 185 - 505
Target Start/End: Original strand, 37077700 - 37078005
Alignment:
Q  185 tgcgttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaa 283  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||             |||||||||||||||    
T  37077700 tgcgctggatgagtggtaaaactagacgagataggattaggaatgacaccattcggaagagagtgagggtag-------------aaaagttggtagaaa 37077786  T
Q  284 ataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagagg 383  Q
    |||| |||||  ||||||| |||||||||||  |||   |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  37077787 atagacttagatggtttgggcatgtagagag--gacccatagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcgggtcaaaataggtagatg 37077884  T
Q  384 aagagctatgaaaa--ctaagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaattt 481  Q
    |||| ||| |||||   ||||| |||| ||||| || |||||| |||| |||| ||||||||| |||||   |  | |||||||||||  | || |||||    
T  37077885 aagacctaggaaaattataagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatcc-aaatactttggaagatagaacact--gacgtaattt 37077981  T
Q  482 gatccatgtagccgaccccactta 505  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
T  37077982 gatccatgcagccgaccccactta 37078005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 334 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 42469925 - 42469753
Alignment:
Q  334 gtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaac--taagaaaaactattaggaaagatttaaaggtta 431  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| ||||||  |  || |||| ||||| ||||||||| |||| |    
T  42469925 gtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtca 42469826  T
Q  432 atgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccactta 505  Q
    ||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  42469825 atgagttggatcc-aaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagctgaccccactta 42469753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 283 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 43904914 - 43904698
Alignment:
Q  283 aataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagag 382  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| | | ||||||||| |||||||||||||||| ||||   | | |||||||| ||    
T  43904914 aataagcttaggtggtttggacatgtagagagaagacctatagatgttgtagtaagaagaatagatcagatggaggatagtcaaattacaagaggtacag 43904815  T
Q  383 gaagagctatgaaaac--taagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatt 480  Q
    ||||| |||  || ||  ||||| ||||  ||| || ||||||| || |||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||| || |||| ||||    
T  43904814 gaagacctagaaatactataagagaaacggttatgagagatttagagattaatgagttggat-ctaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatt 43904716  T
Q  481 tgatccatgtagccgacc 498  Q
    ||||||||||||||||||    
T  43904715 tgatccatgtagccgacc 43904698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 275 - 491
Target Start/End: Original strand, 30559718 - 30559935
Alignment:
Q  275 tggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaag 374  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| |||||||  | | ||||| | ||| |||||||||||||| |||||| |||  ||    
T  30559718 tggtcgaaaataggcttaggtggtttgggcatttagagagaagacatgtagattttgtagtaaggacagtggatcagatggaggatagtcggatcactag 30559817  T
Q  375 aggtagaggaagagctatgaaaac--taagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacg 472  Q
    || |||| |||||  ||  |||||  ||||| ||||||| |||||||||||| || |||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||| || |    
T  30559818 agatagatgaagacttaaaaaaactataagagaaactatcaggaaagatttagagattaatgagttggatcc-atatatggtttatgatagaacattatg 30559916  T
Q  473 gcgcaatttgatccatgta 491  Q
     || |||||||||||||||    
T  30559917 acgtaatttgatccatgta 30559935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 296 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 35914837 - 35914624
Alignment:
Q  296 ggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaa 395  Q
    ||||||| || ||||||||||||| | |||||  ||| | ||| ||||||| |||||||||||| |||| | ||   ||||  |||||||||  ||  ||    
T  35914837 ggtttgggcacgtagagagaagacctatagattttatagcaaggagagtaggtcagatggaggatagtcagatccctagagacagaggaagacatagaaa 35914738  T
Q  396 aacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagc 493  Q
    |||||  ||| |||||||||||||||| || ||| |||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||    
T  35914737 aactataagagaaactattaggaaagacttgaagattaatgagttgga-ccaaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagc 35914639  T
Q  494 cgaccccacttagtg 508  Q
     ||||||||||||||    
T  35914638 tgaccccacttagtg 35914624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 268 - 509
Target Start/End: Original strand, 32930979 - 32931220
Alignment:
Q  268 gaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcggg 367  Q
    |||||| ||| |||||| | ||||||| | |||||||||||||| |||| |  | ||||| || | ||||| ||| |||||||||||||||| ||||       
T  32930979 gaaaaggtggcagaaaacatgcttaggtgatttggacatgtagaaagaaaatctatagattctgtagtaaggagactagatcagatggaggatagtcata 32931078  T
Q  368 tcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaa 465  Q
    |||  ||||| ||||||||| |||  |||||||  ||| |||||||||||||||||||  |  |||||| ||||||  | ||||||| | ||||||||||    
T  32931079 tcactagaggcagaggaagacctaaaaaaactatcagagaaactattaggaaagattttgaaattaatgagttgga--cgaaatatggtgtatgatagaa 32931176  T
Q  466 cactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    || || |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32931177 cattatggcataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 32931220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 270 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 26905168 - 26904938
Alignment:
Q  270 aaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtc 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | ||| || |||||||||||| |||  || ||||  | ||||||||||||||||| ||||| ||||||| | |     
T  26905168 aaagttggtagaaaataggcttagatgatttagatatgtagagagaaaactcatacatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaagagagtcagata 26905069  T
Q  370 aaaagaggtagaggaagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaaca 467  Q
    |||||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||| |||| ||||| ||||||||| |||| |||  ||||||  | ||||||  ||||| ||| ||||    
T  26905068 aaaagaggtagagggagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaataagttgga--ccaaatatagtttataataaaaca 26904971  T
Q  468 ctacggcgcaatttgatccatgtagccgacccc 500  Q
    ||| | || |||||||||||| ||| |||||||    
T  26904970 ctatgtcgtaatttgatccatatagtcgacccc 26904938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 405 - 509
Target Start/End: Original strand, 490492 - 490595
Alignment:
Q  405 aaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccactt 504  Q
    ||||||| |||||||||||| || || ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  490492 aaactataaggaaagatttagagattgatgagttggatccaaa-tatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccactt 490590  T
Q  505 agtgg 509  Q
    |||||    
T  490591 agtgg 490595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 286 - 509
Target Start/End: Original strand, 42584407 - 42584618
Alignment:
Q  286 aggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaa 385  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||| || |||||||| | | ||| ||||||||||||||||| |||   ||| | ||||||||||||||  ||    
T  42584407 aggcttaggtggtttgggcatgtagagagaaaacctgtagatgttgtagtacgaagagtagatcagatgaaggtttgtcagatcaaaagaggtagataaa 42584506  T
Q  386 gagctatgaaaactaagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatc 485  Q
    || |||          |||||||||| ||||||||| || |||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||| || | || ||||||||     
T  42584507 gaccta----------gaaaaactataaggaaagatctataggttaatgatttggatcc-aaatatggtttatgatagaacattatgacgtaatttgat- 42584594  T
Q  486 catgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    | ||||||||||||||||||||||    
T  42584595 cttgtagccgaccccacttagtgg 42584618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 214 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 8879758 - 8879472
Alignment:
Q  214 gataggattaggaataaccca-ttagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagag 312  Q
    ||||||||||||||| || || ||||| ||||| || ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||  | |||||  ||||||||    
T  8879758 gataggattaggaatgacacaattagagagagaatgggggaagcacctatagtag-aaaagttggtagaaaatagacttagatgatttgggtatgtagag 8879660  T
Q  313 agaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaac--taagaaaaacta 410  Q
    |||||||  ||    ||  ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| | |||| |||  || ||||||  ||||| |||| |    
T  8879659 agaagacccgt----gccgtcgtaagaagagttgatcagatggaggagggtcgggtccaaagagcttgagggagacgtaggaaaactataagagaaacca 8879564  T
Q  411 ttaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccactta 505  Q
    |||  || |||||| | || |||  |||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||  | || ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  8879563 ttaaaaatgatttagaagtcaataagttgaatcc-aaatatggtttatgatataacact--gacgtaatttaatccatgtagccgactccactta 8879472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 405 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 45041440 - 45041338
Alignment:
Q  405 aaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccactt 504  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||  || || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45041440 aaactattaggaaagatttagaggttaatgagttggatccaa--tatggtttatgatagcgcattatggcgtaatttgatccatgtagctgaccccactt 45041343  T
Q  505 agtgg 509  Q
    |||||    
T  45041342 agtgg 45041338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 185 - 358
Target Start/End: Original strand, 32043525 - 32043698
Alignment:
Q  185 tgcgttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataacc-cattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaa 283  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||| ||| ||  ||||||| |||||||  ||||| ||||||||| |  ||||| |||||||||    
T  32043525 tgcgttggatgtgtggtaagactagacgggatagaattagaaatgacaacattagagagagagttggggtatcacctatagtac-aaaagatggtagaaa 32043623  T
Q  284 ataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggagg 358  Q
     ||| ||| || ||||||| |||||||||||||||| ||| |||| | | ||||| ||| |||||||||||||||    
T  32043624 ctagactttggtggtttggccatgtagagagaagacctgtggatgttgtagtaaggagaatagatcagatggagg 32043698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 241 - 507
Target Start/End: Original strand, 29700268 - 29700534
Alignment:
Q  241 agagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaa 340  Q
    |||||||  ||||||||||||||| || ||||| |||  |||| | |||||||| ||||||| ||| |||||| |||||   | ||| || | ||||| |    
T  29700268 agagagttggggtagcacctatagtag-aaaagatggaggaaagttggcttaggtggtttgggcatatagagaaaagaccattggattctgtagtaagga 29700366  T
Q  341 gagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaactaa--gaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggtt 438  Q
    |||||||| |||||||||| ||||   |||  ||||||||||||||| |||  ||||||||  || |||||| ||||||||| ||  || | |||| ||     
T  29700367 gagtagattagatggaggatagtcatatcactagaggtagaggaagacctagaaaaactaaaagagaaactaataggaaagacttggagataaatgagtc 29700466  T
Q  439 ggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagt 507  Q
    ||| ||||||| |  |||||||||||||| || || | ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29700467 gga-ccaaaattttgtttatgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccgactccacttagt 29700534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 352 - 509
Target Start/End: Original strand, 2027632 - 2027790
Alignment:
Q  352 atggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaat 449  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||| |||| ||||| || |||||| |||| |||| |||  || | ||||    
T  2027632 atggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaatgatttagaggtcaatgagttatattc-aaat 2027730  T
Q  450 atgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccga-ccccacttagtgg 509  Q
    ||| ||||||||||||||||| | ||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  2027731 atggtttatgatagaacactatgacgccatttgatcc-tgtagccaacccccacttagtgg 2027790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 281 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 9905132 - 9904946
Alignment:
Q  281 aaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtag 380  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| || | |||||||   | |||||||||   |||||||||||||    
T  9905132 aaaataggcttaggtggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgttgtagtaa-aaaaatagatcacgggaaggagagtcaaatcaaaagaggtag 9905034  T
Q  381 aggaagagctatgaaaact--aagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaaca 467  Q
    | ||||| |||  ||||||  |||| |||||||||  ||||||||| |  ||||||  |||||| ||||||| | ||||||||| ||||    
T  9905033 atgaagacctagaaaaactacaagagaaactattaataaagatttagaaattaatgatttggat-caaaataaggtttatgataaaaca 9904946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 418 - 509
Target Start/End: Original strand, 44529395 - 44529485
Alignment:
Q  418 agatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||| |||| |||| |||||||||||| | || ||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44529395 agatttagaggtcaatgagttggatccaaatt-tggtttatgatagaacactatggcatcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 44529485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 275 - 499
Target Start/End: Original strand, 13589511 - 13589729
Alignment:
Q  275 tggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaag 374  Q
    |||||||||||| | ||||| |||||| |||||| ||||||||||   |||||| | | ||| ||||||||||| | |||||||| | |        |||    
T  13589511 tggtagaaaatatgattaggtggtttgaacatgttgagagaagaccgatagatgttgtagtacgaagagtagattatatggaggacaatg-------aag 13589603  T
Q  375 aggtagaggaagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacg 472  Q
    ||||||| |||||  ||  |||||||  ||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||| ||| ||||||||||||   |||||||| || |    
T  13589604 aggtagatgaagacttagaaaaactataagagaaactattagaaaagatttaaagattaatgagttgaatc-aaaatatgattttaaatagaacaatatg 13589702  T
Q  473 gcgcaatttgatccatgtagccgaccc 499  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||    
T  13589703 gcgcaatttgatctatgtagccaaccc 13589729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 399 - 500
Target Start/End: Original strand, 14459046 - 14459146
Alignment:
Q  399 taagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgacc 498  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  || |||||| ||| || |||||||||| |||||||| ||||| || || | ||||||||||||||||||||||    
T  14459046 taagagaaactattaggaaagatttggagattaatgagttaga-ccaaaatatggtttatgatggaacattatggtgtaatttgatccatgtagccgacc 14459144  T
Q  499 cc 500  Q
    ||    
T  14459145 cc 14459146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 250 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 45512776 - 45512558
Alignment:
Q  250 gggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatc 349  Q
    ||||||||||||||| || ||||| || | ||||||| ||||||  ||||||| ||| || ||||||||  | ||||| |  | ||||| |||||||||     
T  45512776 gggtagcacctatagtag-aaaagatgatggaaaataagcttagatggtttgggcatataaagagaagatctctagattcggtagtaagcagagtagatt 45512678  T
Q  350 agatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaa 447  Q
    ||||||  || ||||   |||  ||||| ||||||||| |||  |||||||  ||| |||||||||||||||| ||  || |||||| ||| ||||||||    
T  45512677 agatggcagatagtcaaatcactagaggcagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaagacttggagattaatgagttcgatccaaa 45512578  T
Q  448 atatgatttatgatagaaca 467  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  45512577 atatggtttatgatagaaca 45512558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 405 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 14742204 - 14742104
Alignment:
Q  405 aaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccactt 504  Q
    |||| ||||| ||||||||| | || |||| ||||||||||||     |||| ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  14742204 aaaccattagaaaagatttagaagtcaatgagttggatccaaat----atttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccactt 14742109  T
Q  505 agtgg 509  Q
    |||||    
T  14742108 agtgg 14742104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 241 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 18752165 - 18752093
Alignment:
Q  241 agagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagaga 315  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  18752165 agagagtgggggtagcacctatagtag-aaaagttggtagaaaatag-cttagatggtttggacatgtagagaga 18752093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 372 - 511
Target Start/End: Original strand, 28169514 - 28169654
Alignment:
Q  372 aagaggtagaggaagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacact 469  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||||  ||| |||||||||||||||||||  || |||||| ||||||| | ||||||| ||||||||| || | |    
T  28169514 aagaggtagaggaagacctaaaaaaactataagagaaactattaggaaagattttgagattaatgagttggattc-aaatatggtttatgataaaatatt 28169612  T
Q  470 acggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtggat 511  Q
    | || | ||||| |||||| || || ||||||||||||||||    
T  28169613 atggtgtaattttatccatataaccaaccccacttagtggat 28169654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 277 - 492
Target Start/End: Original strand, 29735834 - 29736050
Alignment:
Q  277 gtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagag 376  Q
    |||||||||| | |||||  |||| |||||||| |||||| ||   ||||||||||  || ||||||| |||||||| || ||||||| | ||| |||||    
T  29735834 gtagaaaatatgtttaggtagtttcgacatgtacagagaataccgatagatgctataatacgaagagtggatcagatagacgagagtcagatcagaagag 29735933  T
Q  377 gtagaggaagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggc 474  Q
     |||||||||| |||  |||||||  |||||| ||||||| ||||| |||| | ||||   |||| ||||||| ||||||||||||| ||||  || | |    
T  29735934 atagaggaagatctagaaaaactataagaaaagctattagaaaagacttaatgattaacaagttgaatccaaa-tatgatttatgattgaactttatgac 29736032  T
Q  475 gcaatttgatccatgtag 492  Q
    | |||||||| |||||||    
T  29736033 gtaatttgattcatgtag 29736050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 206 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 12797024 - 12796912
Alignment:
Q  206 ctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggac 304  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||  |||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  | ||| | |    
T  12797024 ctagacggaataagattaggaataacaccattagaaagag--tggaggtaacacctatagaag-aaaagttggtagaaaataggcttagatgatttaggc 12796928  T
Q  305 atgtagagagaagact 320  Q
    ||| ||||||||||||    
T  12796927 atgcagagagaagact 12796912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 405 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 25473528 - 25473425
Alignment:
Q  405 aaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccactt 504  Q
    |||| ||||| || |||||| |||| |||| ||| |||||||| | || | |||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  25473528 aaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagtttgatccaaatt-tggtgtatgatagaacactatagcgtcatttgatccatgtagccgaccccactt 25473430  T
Q  505 agtgg 509  Q
    |||||    
T  25473429 agtgg 25473425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 405 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 35362775 - 35362672
Alignment:
Q  405 aaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccactt 504  Q
    |||||||||||||||||||  |  |||||| |||||| |  ||||||| | |||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||| |||||||||    
T  35362775 aaactattaggaaagatttggaaattaatgagttgga-ctgaaatatggtgtatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgcagccaaccccactt 35362677  T
Q  505 agtgg 509  Q
    |||||    
T  35362676 agtgg 35362672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 421 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 44047641 - 44047554
Alignment:
Q  421 tttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||| |||| |||| |||||||||||| | || ||||||||||||||| | ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44047641 tttagaggtcaatgagttggatccaaatt-tggtttatgatagaacaccatggcgtcatttgatccatgtagctgaccccacttagtgg 44047554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 415 - 510
Target Start/End: Original strand, 21425213 - 21425307
Alignment:
Q  415 gaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgga 510  Q
    ||||||| || || |||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| || || |||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  21425213 gaaagatatagagattaatgagttggatcgaaa-tatgatttatgatagaccattatggcataatttgatccatgtagcagaccctacttagtgga 21425307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 459 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 1928659 - 1928609
Alignment:
Q  459 gatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1928659 gatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 1928609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 240 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 6510719 - 6510614
Alignment:
Q  240 aagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaaga 339  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||  || |||||||||||||||| |   ||||  ||||||| |||||||||||||||  |||||||||  ||||||||    
T  6510719 aagagagagagcgtagcacctataatag-aaaagttggtagaaaacaaatttagatggtttgggcatgtagagagaagatctgtagatgccgtcgtaaga 6510621  T
Q  340 agagtag 346  Q
    |||||||    
T  6510620 agagtag 6510614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 399 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 17491785 - 17491688
Alignment:
Q  399 taagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgac 497  Q
    ||||| ||||||||| |||||| ||  || |||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||| |  ||||||||||||||||||    
T  17491785 taagagaaactattaagaaagacttggagattaatgagttgga-ccaaaatatggtttatgatagaacattatggcgtatgttgatccatgtagccgac 17491688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 446 - 508
Target Start/End: Original strand, 23492231 - 23492293
Alignment:
Q  446 aaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtg 508  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || |  |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23492231 aaatatgatatatgatagaacactatggtgtcatttaatccatgtagccgaccccacttagtg 23492293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 455 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 27556378 - 27556324
Alignment:
Q  455 ttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||||||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27556378 ttatgatagaacattatggcataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 27556324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 350 - 508
Target Start/End: Original strand, 2216388 - 2216545
Alignment:
Q  350 agatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaac--taagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaa 447  Q
    |||||||||| |||| | |||  ||||||||||||||| |||  ||||   ||||| ||||||||| ||| |||||| || | |||| ||||||||| ||    
T  2216388 agatggaggatagtcagatcactagaggtagaggaagacctagaaaaaacataagagaaactattaagaa-gatttagagatcaatgagttggatcctaa 2216486  T
Q  448 atatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtg 508  Q
     |||| |||||||||||||| ||  | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2216487 -tatg-tttatgatagaacattatagtgtaatttgatccatgtagccgaccccactcagtg 2216545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 455 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 35647006 - 35646953
Alignment:
Q  455 ttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtg 508  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35647006 ttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgcagccgaccccacttagtg 35646953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 251 - 364
Target Start/End: Original strand, 36143367 - 36143479
Alignment:
Q  251 ggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatca 350  Q
    ||||||||||||||||| || || |||| |||||||| |||||| ||||||| ||| |||||| ||||| | ||||| || | ||| | |||||||||||    
T  36143367 ggtagcacctatagcag-aatagatggtggaaaatagacttaggtggtttgggcatttagagaaaagacctatagattctgtagtatggagagtagatca 36143465  T
Q  351 gatggaggagagtc 364  Q
     |||||||| ||||    
T  36143466 aatggaggatagtc 36143479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 308 - 510
Target Start/End: Original strand, 12025847 - 12026041
Alignment:
Q  308 tagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaactaagaaaaa 407  Q
    |||||||||||   ||||||||  | ||||||||||||||||| || ||| |||||| ||| |||||||||| | ||||| ||| |||||| |           
T  12025847 tagagagaagatccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatagagaagagtcaggttaaaagaggtaaatgaagacctaagaaaacca------- 12025939  T
Q  408 ctattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacacta---cggcgcaatttgatccatgtagccgaccccactt 504  Q
       |||| ||||||||| |||| |||  |||||||||||| |||| ||| |||||||||||||   || ||  |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  12025940 ---ttagaaaagatttagaggtcaataagttggatccaaa-tatggtttttgatagaacactatgacgtcgtcatttgatccatgtaaccgaccctactt 12026035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 286 - 350
Target Start/End: Original strand, 30748493 - 30748557
Alignment:
Q  286 aggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatca 350  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| | |||||||||    
T  30748493 aggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacctgtagattctatagtaagcaaagtagatca 30748557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 268 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 35643865 - 35643630
Alignment:
Q  268 gaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtag----atcagatggaggagagt 363  Q
    |||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||         ||||| ||| |||    ||||| ||||||| |||    
T  35643865 gaaaagatggtggaaaatatgcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacatgta---------gtaaggagaatagatcaatcagctggaggatagt 35643775  T
Q  364 cgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaac--taagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgat 461  Q
    | | | |  ||||| ||||||||| |||  |||||  ||||| ||| ||||| ||||||| || || |||||| ||||||| | ||||||| ||||||||    
T  35643774 cagattactagaggcagaggaagacctagaaaaactataagagaaattattaagaaagatctagagattaatgagttggat-cgaaatatggtttatgat 35643676  T
Q  462 agaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||||  | |  | |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35643675 agaacact--gccatattttgatccatgtagcctaccccacttagtgg 35643630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 446 - 510
Target Start/End: Original strand, 36069799 - 36069863
Alignment:
Q  446 aaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgga 510  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| | |||||||| ||||    
T  36069799 aaatatggtttatgatagaacattacggcgtaatttgatccatatagccaaacccacttactgga 36069863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 268 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 41972042 - 41971954
Alignment:
Q  268 gaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatgga 356  Q
    |||||| |||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  | | | ||| |||||||||||| ||||    
T  41972042 gaaaagatggtggaaaataagtttaggtggtttggacatgtagagagaagacgtgtagattttctagcaaggagagtagatcaggtgga 41971954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 457 - 509
Target Start/End: Original strand, 44699674 - 44699726
Alignment:
Q  457 atgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  44699674 atgatagaacactatggcgtaatttgatccctgtagcagaccccacttagtgg 44699726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 308 - 492
Target Start/End: Original strand, 5908704 - 5908889
Alignment:
Q  308 tagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaacta--agaaa 405  Q
    |||||||||||| |||||||  | | ||||| |||||||||||| |||||||  ||| | |||  ||||  | ||||||| |||  |||||||  ||| |    
T  5908704 tagagagaagacctgtagattttgtagtaaggagagtagatcaggtggaggatggtcagatcactagagacataggaagacctagaaaaactataagaga 5908803  T
Q  406 aactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtag 492  Q
    ||||||||  ||||||  || | |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||  ||| |||| |||||||||||    
T  5908804 aactattaaaaaagatccaaggattaatgagttggatc-aaaatatgatttatgatagaaccttattgcgtaattggatccatgtag 5908889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 297 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 18742257 - 18742198
Alignment:
Q  297 gtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatgga 356  Q
    |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  18742257 gtttggacttgttgagagaaaacttgtagatgctatagtaaggagagtagataagatgga 18742198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 297 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 18747221 - 18747162
Alignment:
Q  297 gtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatgga 356  Q
    |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  18747221 gtttggacttgttgagagaaaacttgtagatgctatagtaaggagagtagataagatgga 18747162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 419 - 510
Target Start/End: Original strand, 25300270 - 25300360
Alignment:
Q  419 gatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgga 510  Q
    |||||| |||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| | |  ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  25300270 gatttagaggtcaatgagttggatcc-aaatatggtttatgatataacactatgacataatttgatctatgtagctgaccccacctagtgga 25300360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 454 - 509
Target Start/End: Original strand, 30689940 - 30689995
Alignment:
Q  454 tttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||||| |||| || | || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30689940 tttatgatataacattatgacgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 30689995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 189 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 2518734 - 2518597
Alignment:
Q  189 ttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataacccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaatagg 288  Q
    ||||||| |||||||  ||||| | ||||||||||| ||| ||  |||||| ||| | |  |||||||||||  || || ||||| |||| |||||||||    
T  2518734 ttggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaaattagagagaaaattggggtagcacctcaagtag-aaaagatggtggaaaatagg 2518636  T
Q  289 cttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagat 327  Q
     ||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  2518635 tttaggtggtttgattatgtagagagaagacttgtagat 2518597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 407 - 509
Target Start/End: Original strand, 3802032 - 3802133
Alignment:
Q  407 actattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttag 506  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||| | |||||| |||||||| || | ||||||||  |||||| ||| |||| ||||    
T  3802032 actattatgaaagatttaaaggttaatgagttggattc-aaacatggtatatgatcgaacactatggagtaatttgattaatgtagtcgaacccatttag 3802130  T
Q  507 tgg 509  Q
    |||    
T  3802131 tgg 3802133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 443 - 509
Target Start/End: Original strand, 14903755 - 14903821
Alignment:
Q  443 ccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||||||| | |||||||||| ||| || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  14903755 ccaaaataaggtttatgataggacattatggcgtaatttgatccatgtagcttaccccacttagtgg 14903821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 446 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 2518483 - 2518422
Alignment:
Q  446 aaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagt 507  Q
    ||||||||||| |||||||||| || |||  |||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  2518483 aaatatgatttctgatagaacattatggcataatttgatccttgtagctgaccccacttagt 2518422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 250 - 327
Target Start/End: Original strand, 9695632 - 9695708
Alignment:
Q  250 gggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagat 327  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||| |||| | |||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  9695632 gggtagcacctatagtag-aaaagatggtggaaactcggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagtcctgtagat 9695708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 410 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 15215532 - 15215436
Alignment:
Q  410 attaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagt 507  Q
    ||||| ||||||||| || | |||| ||| |||||||| |||| ||| | ||||||||||| | ||  || |||||||||||||||||||||||||||    
T  15215532 attagaaaagatttagagatcaatgagtttgatccaaa-tatggtttttaatagaacactatgacgtcatatgatccatgtagccgaccccacttagt 15215436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 13171992 - 13171865
Alignment:
Q  189 ttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaatag 287  Q
    ||||||| || ||||  ||||||||||||||||||| ||| ||   |||||| |||||||  ||| ||||||||||| | |||||| |||| |||||||     
T  13171992 ttggatgtgtagtaagactagacgggataggattagaaatgacaagattagagagagagttggggaagcacctatagta-gaaaagatggtggaaaatat 13171894  T
Q  288 gcttaggcggtttggacatgtagagagaa 316  Q
    ||||||| ||||||| ||| || ||||||    
T  13171893 gcttaggtggtttgggcatataaagagaa 13171865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 268 - 364
Target Start/End: Original strand, 16917202 - 16917297
Alignment:
Q  268 gaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtc 364  Q
    |||||| ||||  ||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||  | | ||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  16917202 gaaaagatggtgcaaactaggcttaggtggtttgggcatgtaaagagaaggcttgtagatt-tgtagtaaggagagtagatcagattgaggatagtc 16917297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 457 - 509
Target Start/End: Original strand, 32276893 - 32276945
Alignment:
Q  457 atgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||||||| || |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  32276893 atgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagacgaacccacttagtgg 32276945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 443 - 507
Target Start/End: Original strand, 36143535 - 36143599
Alignment:
Q  443 ccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagt 507  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || | ||  || |||||||||||||||||||||| ||||    
T  36143535 ccaaaatatggtttatgatagaacattatgacgtcatctgatccatgtagccgaccccacctagt 36143599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 268 - 354
Target Start/End: Original strand, 38689556 - 38689646
Alignment:
Q  268 gaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtag---atgc-tatcgtaagaagagtagatcagatg 354  Q
    |||||| ||||||||| |  ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||   |||| | | |||||||||||||||||||||    
T  38689556 gaaaagatggtagaaactcagcttaggtggttttgacatctagagagaagacttgtagattatgcatgtagtaagaagagtagatcagatg 38689646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 446 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 16035812 - 16035749
Alignment:
Q  446 aaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||| |||||| ||||||| || | || |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  16035812 aaatatggtttatggtagaacattatgacgtaatttgattcatgtagctgaccccacttagtgg 16035749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 455 - 509
Target Start/End: Original strand, 1313770 - 1313824
Alignment:
Q  455 ttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  1313770 ttatgatagaacattatggcgtaattttatccatgtagttgaccccacttagtgg 1313824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 351 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 3464349 - 3464235
Alignment:
Q  351 gatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaacta-agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaat 449  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||  ||| |||||  || ||||| || ||||||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||| |  ||||    
T  3464349 gatggtggagagtcaggtcaaaatagacagatgaagacataggaaaattatagaaaaattattaggaaagatt-aaaggtcaatgagttggacc--aaat 3464253  T
Q  450 atgatttatgatagaaca 467  Q
    || |||||||||||||||    
T  3464252 ataatttatgatagaaca 3464235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 446 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 8255618 - 8255568
Alignment:
Q  446 aaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccga 496  Q
    ||||||| ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||    
T  8255618 aaatatggtttatgatagaccaatatggcgtaatttgatccatgtagccga 8255568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 296 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 10080143 - 10079971
Alignment:
Q  296 ggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaa 395  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||  |||  | | ||||| ||||||||||| ||| ||| |||||   |||  ||||||||||||||| |||   |    
T  10080143 ggtttgggcatgtagagagaagacctgaggattttgtagtaaggagagtagatcaaatgaaggggagtcaaatcactagaggtagaggaagacctagaga 10080044  T
Q  396 aacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaaca 467  Q
    |||||  ||||||||| ||| ||||||| || || |||||| |||||||   ||||||||| | ||||||||||    
T  10080043 aactataagaaaaactgttaagaaagatctagagattaatgagttggat-agaaatatgatatttgatagaaca 10079971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 394 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 29717316 - 29717266
Alignment:
Q  394 aaaactaagaaaaa-ctattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatc 443  Q
    ||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29717316 aaaactatgaaaaatctattaagaaagatttaaaggttaatgagttggatc 29717266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 454 - 509
Target Start/End: Original strand, 41212066 - 41212123
Alignment:
Q  454 tttatgatagaacactacggcgcaatttgatcca--tgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||||||||||||| || |||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  41212066 tttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatctatagccgaccccacttagtgg 41212123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 452 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 5127381 - 5127324
Alignment:
Q  452 gatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |  ||||||||| ||||    
T  5127381 gatttatgatagaacattacggcgtaatttgacccatgtaactaaccccacttggtgg 5127324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 401 - 434
Target Start/End: Original strand, 6483448 - 6483481
Alignment:
Q  401 agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatg 434  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6483448 agaaaaactattaagaaagatttaaaggttaatg 6483481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 460 - 509
Target Start/End: Original strand, 18741843 - 18741892
Alignment:
Q  460 atagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||||||| || | || ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18741843 atagaacattatgacgtaatttgatccaagtagccgaccccacttagtgg 18741892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 460 - 509
Target Start/End: Original strand, 18746807 - 18746856
Alignment:
Q  460 atagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||||||| || | || ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18746807 atagaacattatgacgtaatttgatccaagtagccgaccccacttagtgg 18746856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 436 - 493
Target Start/End: Original strand, 31716008 - 31716064
Alignment:
Q  436 gttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagc 493  Q
    |||||||||||| |||| |||| ||||||||| || |||| |||||||||||||||||    
T  31716008 gttggatccaaa-tatggtttaagatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagc 31716064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 250 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 41444607 - 41444547
Alignment:
Q  250 gggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtaga 311  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||||    
T  41444607 gggtagcacctatagtag-aaaagatggtggaaactaggtttaggtggtttggacatgtaga 41444547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 477 - 509
Target Start/End: Original strand, 1335554 - 1335586
Alignment:
Q  477 aatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1335554 aatttgattcatgtagccgaccccacttagtgg 1335586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 268 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 10824428 - 10824332
Alignment:
Q  268 gaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtc 364  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| |||||||  || |||||| ||||||  |||||  | | ||| | ||||||||||| |||||||| ||||    
T  10824428 gaaaagatggtcgaaaataggcttaggtggtttgggtatttagagaaaagactcatagattttgtagtatggagagtagatcaaatggaggatagtc 10824332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 477 - 509
Target Start/End: Original strand, 35324001 - 35324033
Alignment:
Q  477 aatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35324001 aatttgatccacgtagccgaccccacttagtgg 35324033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 477 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 41031474 - 41031442
Alignment:
Q  477 aatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41031474 aatttgatccatatagccgaccccacttagtgg 41031442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 477 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 41031580 - 41031548
Alignment:
Q  477 aatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41031580 aatttgatccatatagccgaccccacttagtgg 41031548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 477 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 45512498 - 45512466
Alignment:
Q  477 aatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45512498 aatttgatccatgtagcctaccccacttagtgg 45512466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 145; Significance: 5e-76; HSPs: 101)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 185 - 509
Target Start/End: Original strand, 52138735 - 52139060
Alignment:
Q  185 tgcgttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaa 283  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  52138735 tgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtag-aaaagttggtagaaa 52138833  T
Q  284 ataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagagg 383  Q
    ||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||  | ||||||||| ||||| | |||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  52138834 ataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacctgtagatgccgtggtaagaagaatagattaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagagg 52138933  T
Q  384 aagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaattt 481  Q
    |||| ||| ||||||||  ||| |||| ||||| || |||||| |||| |||| ||||||||| |||| || | ||||||||||||||| | ||  ||||    
T  52138934 aagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatcc-aaatttggtgtatgatagaacactatgacgttattt 52139032  T
Q  482 gatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  52139033 gatccatgtagccgaccccacttagtgg 52139060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 185 - 509
Target Start/End: Original strand, 22008 - 22332
Alignment:
Q  185 tgcgttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaa 283  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||  | |||||||| |||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  22008 tgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgtcaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtag-aaaagttggtagaaa 22106  T
Q  284 ataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagagg 383  Q
     |||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||  | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22107 -taggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagattaaatggaggagagtcgggttaaaagaggtagagg 22205  T
Q  384 aagagctatgaaaac--taagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaattt 481  Q
    ||||  || ||||||  | ||| |||| ||||| || |||||| |||| |||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||  ||||    
T  22206 aagacttaagaaaaccattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatcc-aaatatggtttttgatagaacactatggcgtcattt 22304  T
Q  482 gatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  22305 gatctatgtagccgaccccacttagtgg 22332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 185 - 509
Target Start/End: Original strand, 54128313 - 54128639
Alignment:
Q  185 tgcgttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaa 283  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| || |||||||| |||| ||  ||||||||||||||| || ||||| |||||||||    
T  54128313 tgcgtttgatgagtggtaaaactagacgcgataggattatgaatgacaccattagagagagtgttggggtagcacctatagtag-aaaagatggtagaaa 54128411  T
Q  284 ataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagagg 383  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||| |   ||| | |||||||||||||||||||  |||| | || |||||||||||||    
T  54128412 ataggcttaggtggtttgggcatgtagagaaaagacctgtagatgatgcagtacgtagagtagatcagatggaggttagtcagatcgaaagaggtagagg 54128511  T
Q  384 aagagctatgaaaac---taagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatt 480  Q
    |||| |||  |||||   ||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||| |||||| || ||||||| |||||||||||||| || |||  ||||    
T  54128512 aagacctagaaaaactattaagagaaactataaggaaagatttagaggtcaatgagttgga-cccaaatatggtttatgatagaacattatggcataatt 54128610  T
Q  481 tgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  54128611 tgatccatgtaggcgaccccacttagtgg 54128639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 232 - 498
Target Start/End: Original strand, 35033129 - 35033395
Alignment:
Q  232 ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgcta 331  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |    
T  35033129 ccattagagagagagtgggggtagcacctatagtag-aaaagttggtagaaaataggcttatatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgcca 35033227  T
Q  332 tcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaac--taagaaaaactattaggaaagatttaaaggt 429  Q
    | |||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| ||||||  |  || |||| ||||| ||||||||| ||||    
T  35033228 ttgtaagaagagtaaatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggt 35033327  T
Q  430 taatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgacc 498  Q
     |||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  35033328 caatgagttggatcc-aaatatggtttttgatagaacactatggcgttatttgatccatgtagccgacc 35033395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 283 - 509
Target Start/End: Original strand, 48508268 - 48508495
Alignment:
Q  283 aataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagag 382  Q
    |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  48508268 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgttgtcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcaggtcaaaagaggtagag 48508367  T
Q  383 gaagagctatgaaaac--taagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatt 480  Q
    ||||| ||| ||||||  ||||| |||| ||||| || |||||| |||| |||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||    
T  48508368 gaagacctaggaaaactataagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggattc-aaatatggtttatgatagaacactatggcgtaatt 48508466  T
Q  481 tgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  48508467 tgatccatgtagccgaccccacttagtgg 48508495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 185 - 505
Target Start/End: Original strand, 54278955 - 54279276
Alignment:
Q  185 tgcgttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaa 283  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||||  ||||| ||||||||| || |||||||| |||||||  ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  54278955 tgcgttggataagtggtaagactagacaagatagaattaggaatgacaccattagagagagagtaggggtagcacctatagtag-aaaagttggtagaaa 54279053  T
Q  284 ataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagagg 383  Q
    |||||||||| |||||||| || |||||||||||||  ||||||||  | |||| |||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||| |    
T  54279054 ataggcttagacggtttgggcacgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaaaaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaag 54279153  T
Q  384 aagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaattt 481  Q
    |||| ||| ||||||||  ||| |||| ||||| || |||||| |||| |||| ||||||||| |||| || | ||||||||||||||| ||||  ||||    
T  54279154 aagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatcc-aaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 54279252  T
Q  482 gatccatgtagccgaccccactta 505  Q
    |||| |||||||||| ||||||||    
T  54279253 gatcaatgtagccgatcccactta 54279276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 185 - 509
Target Start/End: Original strand, 5168763 - 5169092
Alignment:
Q  185 tgcgttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccatt----agaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggta 279  Q
    |||| |||||||  |||||  |||||| |||||||||||||||| || |||||    ||| |||||||| ||||||||||||| | | ||||||||||||    
T  5168763 tgcgctggatgataggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagagagtgggggtagcacctatggta-gaaaagttggta 5168861  T
Q  280 gaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggta 379  Q
    ||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||  ||||||||  | || |||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||    
T  5168862 gaaaatacgcttagatggtttgaacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagagtagatcaaatggaggagagtctagttaaaagaggta 5168961  T
Q  380 gaggaagagctatgaaaac--taagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgca 477  Q
    |||||||| ||| ||||||  | ||| |||| ||||| || |||||| |||| |||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||      
T  5168962 gaggaagacctaagaaaaccattagagaaaccattagaaaggatttataggtcaatgagttggatcc-aaatatggtttttgatagaacactatggcgtc 5169060  T
Q  478 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5169061 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 5169092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 185 - 508
Target Start/End: Original strand, 28245372 - 28245696
Alignment:
Q  185 tgcgttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataacc-cattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaa 283  Q
    |||||||||||||||||||  |||| | |||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  28245372 tgcgttggatgagtggtaagactagcctggataggattaggaatgacatcattagagagagagtgggggtagcacctatagtag-aaaagttggtagaaa 28245470  T
Q  284 ataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagagg 383  Q
    |||| |||||  ||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||  | |||||||||||| |||| |||||||||||||  || |||||||||||| |    
T  28245471 atagacttagatggtttgggcatgtagagagaaaacccgtagatgccgtggtaagaagagtatatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagatg 28245570  T
Q  384 aagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaattt 481  Q
    |||| ||| ||||||||  ||| |||| ||||| || |||||| |||| |||| ||||||||| |||| || | ||| ||||||||||| | ||  ||||    
T  28245571 aagacctaggaaaactattagagaaacgattagaaatgatttagaggtcaatgagttggatcc-aaatttggtgtataatagaacactatgacgtcattt 28245669  T
Q  482 gatccatgtagccgaccccacttagtg 508  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    
T  28245670 gatccatgtagccgatcccacttagtg 28245696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 185 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 47233943 - 47233618
Alignment:
Q  185 tgcgttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaa 283  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||  |||| |||||| ||| || |||||||| ||||| ||  |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  47233943 tgcgttggatgagtggtaagactagacatgataagattagaaatgacaccattagagagagaatggaggtagcacctatagtag-aaaagttggtagaaa 47233845  T
Q  284 ataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagagg 383  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||  | || |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| || || |    
T  47233844 ataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagatgttgaag 47233745  T
Q  384 aagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaattt 481  Q
    |||| ||| ||||||||  ||| |||| ||||| || || ||| |||| ||||  || ||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||  ||||    
T  47233744 aagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggaattagaggtcaatgaattagatcc-aaatatggtttttgatagaacactatggcgtcattt 47233646  T
Q  482 gatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||    
T  47233645 gattcatgtagccgaccccagttagtgg 47233618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 206 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 45289420 - 45289113
Alignment:
Q  206 ctagacgggataggattaggaataacccattagaaagagagtga--gggtagcacctatagcag--gaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttg 301  Q
    |||||||||||| |||||| ||| || ||||||| |||||| |   |||||||||||||  |||  |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  45289420 ctagacgggataagattagaaatgacacattagagagagagagttggggtagcacctatt-cagtagaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttg 45289322  T
Q  302 gacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaac--t 399  Q
    | || |||||||||| ||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||||| |||  | | | ||||| |||||||||| ||||||||||  |    
T  45289321 ggcacgtagagagaacacttgtagattttgtagtaagaagagtagatcagatggaggatagttagattacaagagatagaggaagatctatgaaaactat 45289222  T
Q  400 aagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccc 499  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||  ||  |||||||||||||| ||| ||||    
T  45289221 aagagaaactattaggaaagatttagagattaatgagttggatcc-aaatatggtttatgatagaacattatagcataatttgatccatgtcgccaaccc 45289123  T
Q  500 cacttagtgg 509  Q
    ||||||||||    
T  45289122 cacttagtgg 45289113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 185 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 51448056 - 51447739
Alignment:
Q  185 tgcgttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaa 283  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  51448056 tgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagt-agggtagcacctatagtag-aaaagttggtagaaa 51447959  T
Q  284 ataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagagg 383  Q
    ||||||||||   |||||| |||||||||||||||   ||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||       |    
T  51447958 ataggcttagatagtttgggcatgtagagagaagatccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaaga-------g 51447866  T
Q  384 aagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaattt 481  Q
    |||| ||| ||||||||  ||| |||| ||||| || |||||| |||| |||| ||||||||| |||| || | ||||||||||||||| ||||  ||||    
T  51447865 aagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatcc-aaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 51447767  T
Q  482 gatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  51447766 gattcatgtagccggccccatttagtgg 51447739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 185 - 508
Target Start/End: Original strand, 53519521 - 53519839
Alignment:
Q  185 tgcgttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagc---ag--gaaaagttggt 278  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| |||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||     ||  |||||||||||    
T  53519521 tgcgttggatgagtggtaatactagacaggataggattaagaatgacaccattagacagagagtgggggtagcacctatatatatagtagaaaagttggt 53519620  T
Q  279 agaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggt 378  Q
    |||||||||||||||  | |||||||||| | ||||||||   ||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||    
T  53519621 agaaaataggcttagatgttttggacatgaatagagaagaaccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcatgttaaaagaggt 53519720  T
Q  379 agaggaagagctatgaaaactaagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaa 478  Q
    ||||||||| ||| |          ||||| ||||  ||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||| | ||  |    
T  53519721 agaggaagacctaag----------aaaaccattaaaaaagatttagaggtcaatgagttggatcc-aaataaggtttttgatagaacactatgacgtca 53519809  T
Q  479 tttgatccatgtagccgaccccacttagtg 508  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53519810 tttgatccatgtagccgaccccacttagtg 53519839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 250 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 19676361 - 19676103
Alignment:
Q  250 gggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatc 349  Q
    ||||||||||||||| |  ||||| || |||||||| |||||||| ||| | | |||||||||||||||| |||||||||| | |||  ||||| |||||    
T  19676361 gggtagcacctatagtac-aaaagatgatagaaaattggcttaggtggtattggcatgtagagagaagacctgtagatgctgtagtacaaagagaagatc 19676263  T
Q  350 agatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaac--taagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaa 447  Q
    |||| |||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||  |||||  ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| ||    
T  19676262 agatagaggagagtcagatcaaaagaggta-aggaagacctagaaaaactgtaagagaaactattaggaaaaatttagaggttaatgagttggatcc-aa 19676165  T
Q  448 atatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||| | ||||||||| || || ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19676164 atatgctgtatgatagagcattatggcgtgatttgatccatgtagctgaccccacttagtgg 19676103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 268 - 499
Target Start/End: Original strand, 39235156 - 39235387
Alignment:
Q  268 gaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcggg 367  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||| |||| |     
T  39235156 gaaaagatggtagaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacctgtagatgttgtagtacgaagagtagatcagatggaggaaagtcaga 39235255  T
Q  368 tcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaac--taagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaa 465  Q
    |||||||||||||||||||| | |  |||||  || || |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| | ||||||| |||| |||||||    
T  39235256 tcaaaagaggtagaggaagacccaaaaaaactataggataaactattaggaaagatttagaagttaatgagttggat-ctaaatatggtttacgatagaa 39235354  T
Q  466 cactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccc 499  Q
    || || | ||  | ||||||||||||||||||||    
T  39235355 cattatgtcgtga-ttgatccatgtagccgaccc 39235387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 250 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 50960914 - 50960659
Alignment:
Q  250 gggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatc 349  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |    ||| | | | ||||||||||||||    
T  50960914 gggtagcacctatagtag-aaaagatggtagaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacct----atgttgtagaaagaagagtagatc 50960820  T
Q  350 agatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaa--ctaagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaa 447  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| |||  ||||   ||||| ||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||| ||    
T  50960819 agatggaggagagtcggatcgaaagagggagaggaagacctagaaaaaatttaagagaaactattaggaaaggtttagagattaatgagttggatcc-aa 50960721  T
Q  448 atatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||| | ||| ||||| || || || | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  50960720 atatggtgtatcatagaccattatggtgtaatttgatccatttagccaaccccacttagtgg 50960659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 253 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 52679124 - 52678892
Alignment:
Q  253 tagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcaga 352  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||| | |||||| ||    
T  52679124 tagcatctatagcag-aaaagttggaagaaaataggctctggtgatttggacatgtagagagaagacttgtagatgttg--gtaagaaaaatagatcgga 52679028  T
Q  353 tggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaactaagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatg 452  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| || | |||||||    
T  52679027 tggaggagagtcgggttaaaagatgtagaagaagacctaggaaaactaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttgaattc-aaatatg 52678929  T
Q  453 atttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatg 489  Q
    ||| |||||| || | ||  ||| |||||||||||||    
T  52678928 attcatgatataatattatagcgtaatttgatccatg 52678892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 185 - 509
Target Start/End: Original strand, 25191314 - 25191637
Alignment:
Q  185 tgcgttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataacc-cattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaa 283  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||||  |||| ||||| |||| ||  |||||||  |||| || ||||||||||||||| || |||| |||| |||||    
T  25191314 tgcgctggatgagtggtaagactagacatgatatgattaagaatgacatcattaga--gagaatgggggtagcacctatagtagaaaaa-ttggaagaaa 25191410  T
Q  284 ataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagagg 383  Q
    |||| |||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||| |  | |||||||||| |||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  25191411 atagacttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggaggagagcccggttaaaagaggtagagg 25191510  T
Q  384 aagagctatgaaaa--ctaagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaattt 481  Q
    |||| ||| |||||   |  || |||| ||||| ||||||||| |||| ||||  || ||| ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||  ||||    
T  25191511 aagaactaagaaaatcatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgaattagat-caaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcattt 25191609  T
Q  482 gatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||    
T  25191610 gatccatgtagctgatcccacttagtgg 25191637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 251 - 503
Target Start/End: Original strand, 38430850 - 38431107
Alignment:
Q  251 ggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatca 350  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||| ||| || ||||| | | ||| |||||||||||||    
T  38430850 ggtagcacctatagtag-aaaagatggtagaaaataggcttaggttgattgggcatgtagagagacgacctgcagatgttgtagtatgaagagtagatca 38430948  T
Q  351 gatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaact--aagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaa 448  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||  ||  ||||||  |||| ||||||||  | ||| |||| ||||||||| ||||||||| |||    
T  38430949 gatggaggagagtcaaatcaaaagaggtagaggaagacttagaaaaactacaagagaaactattgtggaaggtttagaggttaatgagttggatcc-aaa 38431047  T
Q  449 tatgatttatgatagaaca-----ctacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccact 503  Q
    |||| ||||||||||||||      ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  38431048 tatggtttatgatagaacattacgttacggcgtaatttgatccatgtagtcgaccccact 38431107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 241 - 399
Target Start/End: Original strand, 38060423 - 38060580
Alignment:
Q  241 agagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaa 340  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  38060423 agagagtgggggtagcacctataatag-aaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacctgtagatgccgtcgtaagaa 38060521  T
Q  341 gagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaact 399  Q
    |||||||| | ||||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||| ||| |||||||    
T  38060522 gagtagattaaatggaggagagtcaggttaaaaaaggtagagggagacctaggaaaact 38060580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 268 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 48953686 - 48953446
Alignment:
Q  268 gaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaa-gacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgg 366  Q
    |||||||||||||||||||  |||||  | ||||| |||||| |||||| |||  | ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48953686 gaaaagttggtagaaaataaacttagatgatttgggcatgtaaagagaaagacccgcagatgttgtcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgg 48953587  T
Q  367 gtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaac--taagaaaaactattaggaaaga---tttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgat 461  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||  ||||| |||  ||||  |||||   | ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  48953586 gtcaaaagaagtagaggaagacctaggaaaactataagagaaatcatta-aaaagaacttataaaggtcaatgagttggatcc-aaatatgatttatgat 48953489  T
Q  462 agaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccactt 504  Q
    ||||||||| | || ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  48953488 agaacactatgacgtaatttaatccatgtagccgacgccactt 48953446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 188 - 509
Target Start/End: Original strand, 19736934 - 19737243
Alignment:
Q  188 gttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaat-aacccattagaaagagagt-gagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaat 285  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| | | ||  ||||||| ||||||| | ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  19736934 gttggatgagtggtaagactagacgggatacgattagaagtgaaatcattagagagagagttgggggcagcacctatagtag-aaaagatggtagaaaat 19737032  T
Q  286 aggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaa 385  Q
    ||| ||||| ||||||  |||| ||||||||||| |||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |||| ||||||    
T  19737033 aggtttaggtggtttgagcatgcagagagaagacctgtagatgttgtagtaagaagagtagatcagatggaggagagttagatcaaaa-aggttgaggaa 19737131  T
Q  386 gagctatgaaaactaagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatc 485  Q
    || ||          |||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||| |  |||||| ||||||||| |||| || ||   |||||||||    
T  19737132 gacct----------agaaaaactattaggaaatatttagagattaatgagttggat-ctcaatatggtttatgataaaacattatggtataatttgatc 19737220  T
Q  486 catgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  19737221 catgtag-cgaccccacttagtgg 19737243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 188 - 509
Target Start/End: Original strand, 19757837 - 19758146
Alignment:
Q  188 gttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaat-aacccattagaaagagagt-gagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaat 285  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||| |||| |||||| | | ||  ||||||| ||||||| | ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  19757837 gttggatgagtggtaagactacacgagatacgattagaagtgaaatcattagagagagagttgggggcagcacctatagtag-aaaagatggtagaaaat 19757935  T
Q  286 aggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaa 385  Q
    ||| ||||| ||||||  |||| ||||||||||| |||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||    
T  19757936 aggtttaggtggtttgagcatgcagagagaagacctgtagatgttgtagtaagaagagtagatcagatggaggagagttagatcaaaa-aggtagaggaa 19758034  T
Q  386 gagctatgaaaactaagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatc 485  Q
    || ||          |||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||| |  |||||| |||||||||||||| || ||   |||||||||    
T  19758035 gacct----------agaaaaactattaggaaatatttagagattaatgagttggat-ctcaatatggtttatgatagaacattatggtataatttgatc 19758123  T
Q  486 catgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  19758124 catgtag-cgaccccacttagtgg 19758146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 189 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 49503897 - 49503590
Alignment:
Q  189 ttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaatag 287  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||| || |||||||| |||||||   |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  49503897 ttggatgagtggtaagactagacgagataggattgggaatgacaccattagagagagagttcaggtagcacctatagtag-aaaagatggtagaaaatag 49503799  T
Q  288 gcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaaga 387  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||   |||||| | |  ||  || ||||||||||||||||| ||||| | | | |||| |||||||||||    
T  49503798 gcttaggtggtttgggcatgtagagagaagaccaatagatgttgtaatacaaacagtagatcagatggaggggagtctgattagaagatgtagaggaaga 49503699  T
Q  388 gctatgaaaactaagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatcca 487  Q
     ||            | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||| |||  |||| || | || |||| |||||||||||    
T  49503698 cct------------agaaactattaggaaagatttaacggttaatgagttgggtcc-aaatatggttttggatataatattatggcgtaatttgatcca 49503612  T
Q  488 tgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||||||||||| |||||||||    
T  49503611 tgtagccgaccctacttagtgg 49503590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 185 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 48734480 - 48734169
Alignment:
Q  185 tgcgttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaa 283  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| |||| || ||||||||  ||| ||  ||||||| | ||||| || || || |||||||||    
T  48734480 tgcgttggatgagtggtaaaactaggcgggataagattatgaatgacaccattaga--gagtgttggggtagcgcgtatagtag-aacagatggtagaaa 48734384  T
Q  284 ataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagagg 383  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||   |||  | ||||||||||||||||    
T  48734383 ataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagaactgtagaggctgtagtacgaagagtagatcagatggagattagttagatcaaaagaggtagagg 48734284  T
Q  384 aagagctatgaaaactaagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttga 483  Q
    |||  ||           |||||||||||||  ||||||||||||| || | ||||| ||| ||| ||| |||||||||||||| || |||| || ||||    
T  48734283 aaggcct----------tgaaaaactattagagaagatttaaaggtcaacgagttgggtcc-aaacatggtttatgatagaacattatggcgtaagttga 48734195  T
Q  484 tccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||||||||| |||||||||||||||    
T  48734194 tccatgtagctgaccccacttagtgg 48734169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 269 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 30294387 - 30294182
Alignment:
Q  269 aaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacat---gtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcg 365  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  ||||||  |||   ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| || ||||  ||||||||||    
T  30294387 aaaagttggtagaaaataggtttagatggtttgagcatattgtagagagaagacttgtagatgccaccgtaagaagagtaaattagattaaggagagtcg 30294288  T
Q  366 ggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaac--taagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatag 463  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  | |||  ||||| |||||||||  ||||||||| |||| |||| ||||||| | || ||||||||||||||     
T  30294287 ggtcaaaagaggtagaggaagacctagaagaactataagataaactattaaaaaagatttataggtcaatgagttggat-ctaagtatgatttatgataa 30294189  T
Q  464 aacacta 470  Q
    |||||||    
T  30294188 aacacta 30294182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 253 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 42510292 - 42510041
Alignment:
Q  253 tagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcaga 352  Q
    |||||||||||| || ||||| | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| | |||||  | | ||||| |||||||||||||    
T  42510292 tagcacctatagtag-aaaagatagtggaaaataggcttaggtggtttggacatgtagaga--agacctatagattttgtggtaaggagagtagatcaga 42510196  T
Q  353 tggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaata 450  Q
    ||||||| |||| | |||  ||||| | ||||||| |||  |||||||  ||| |||| ||||||||||||||  |  | |||| |||||| ||||||||    
T  42510195 tggaggatagtcagatcactagaggcaaaggaagacctagaaaaactatcagagaaaccattaggaaagatttggaaataaatgagttgga-ccaaaata 42510097  T
Q  451 tgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttag 506  Q
    || |||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42510096 tggtttatgattgaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttag 42510041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 189 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 33272371 - 33272155
Alignment:
Q  189 ttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagag--tgagggtagcacctatagc-ag--gaaaagttggtagaa 282  Q
    |||||||||||||||  ||||||  |||||||||| |||| || |||||||| ||||||  || ||||||||||||||   ||  |||||||||||||||    
T  33272371 ttggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacaccattagagagagagagtgggggtagcacctatatatagtagaaaagttggtagaa 33272272  T
Q  283 aataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagag 382  Q
    |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||  | |||||||| ||| |||| |||||||||||||  || |||||||||||||    
T  33272271 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac-tgtagatgccgtggtaagaagtgtatatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 33272173  T
Q  383 gaagagctatgaaaacta 400  Q
    ||||| ||| ||||||||    
T  33272172 gaagacctacgaaaacta 33272155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 275 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 19162842 - 19162675
Alignment:
Q  275 tggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaag 374  Q
    |||||||||| || |||||| |||||||||| | ||| |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  19162842 tggtagaaaaaag-cttaggtggtttggacacgcagatagaa-acttgtagatgttgtcgtaagaagagtagatcagatgaaggagagtcaggtcaaaag 19162745  T
Q  375 aggtagaggaagagctatgaaaac--taagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggat 442  Q
    || |||||||||| ||| |||| |  ||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||    
T  19162744 agttagaggaagacctaggaaatctataagagaaactattaggaaagatttagagattaatgagttggat 19162675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 241 - 507
Target Start/End: Original strand, 38850112 - 38850379
Alignment:
Q  241 agagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaa 340  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||   ||||| |   |||||||||    
T  38850112 agagagagagagtagcacatatagtag-aaaagttggtagaaaatagacttagatggtttgggcatgtagagagaagatcagtagaggtcgtcgtaagaa 38850210  T
Q  341 gagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaa-gatttaaaggttaatgggt 437  Q
    |||||||||  |||||||||||||  || | |||||||||||||||| ||| ||||| ||  ||| |||| ||||| ||| ||| || | || ||||  |    
T  38850211 gagtagatcgaatggaggagagtcaagttagaagaggtagaggaagacctaggaaaattattagataaaccattagaaaaggatctagaagtcaatgaat 38850310  T
Q  438 tggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagt 507  Q
    || || | |||| || ||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38850311 tgaattc-aaatttggtttatgatagaacactatgacgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagt 38850379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 197 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 39601016 - 39600703
Alignment:
Q  197 gtggtaaagctagacgggataggattaggaataacc-cattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggc 295  Q
    |||||||  ||||| |||||| |||||| ||| ||  ||||||| |||||||  |||||| |||||||| || ||||| |||| ||||| | |||||||     
T  39601016 gtggtaagactagatgggataagattagaaatgacaacattagagagagagttggggtagtacctatagtag-aaaagatggtggaaaacaagcttaggt 39600918  T
Q  296 ggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaa 395  Q
    ||||| | |||||| ||||||||| ||||||| || | |  || |||||||||||||| ||||| |||| | |   |||||||||||||||| |||  ||    
T  39600917 ggttttggcatgtaaagagaagacctgtagattctgtagcgaggagagtagatcagatcgaggatagtcagattgcaagaggtagaggaagacctagaaa 39600818  T
Q  396 aacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagc 493  Q
    |||||  ||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| || |||| ||||||||| || || | |||||||||||| || |    
T  39600817 aactataagagaaactattaagaaagatttagaggttaatgagttggatcc-aaatctggtttacgatagaacattatggtgtaatttgatccatctaac 39600719  T
Q  494 cgaccccacttagtgg 509  Q
    | ||||||||| ||||    
T  39600718 caaccccactttgtgg 39600703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 250 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 43695046 - 43694793
Alignment:
Q  250 gggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatc 349  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||| ||||||    
T  43695046 gggtagcacctatagtag-aaaagttggtagaaaatttgcttagatggtttgggcatgtagagagaagacctgtagatgtcgtcgtaagaagattagatc 43694948  T
Q  350 agatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaa 447  Q
    | ||| ||||       || |||||||||||||||| | ||| ||||||||  ||| |||| ||||  ||||||||| |||| ||||| ||||||| |||    
T  43694947 aaatgaagga------agttaaaagaggtagaggaaaatctaggaaaactattagagaaaccattaaaaaagatttagaggtcaatggattggatctaaa 43694854  T
Q  448 atatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
     || | |||||||||||||| |||| ||  |||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  43694853 cta-ggtttatgatagaacaatacgacgtcatttgatctatgtagtcgaccccatttagtgg 43694793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 370 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 12096867 - 12096727
Alignment:
Q  370 aaaagaggtagaggaagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaaca 467  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||| ||||| || |||||| |||| |||| |||||||||||| | || | ||||||||||||    
T  12096867 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagaaaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatt-tggtgtatgatagaaca 12096769  T
Q  468 ctacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12096768 ctatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 12096727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 399 - 504
Target Start/End: Original strand, 49042087 - 49042192
Alignment:
Q  399 taagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgattt-atgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgac 497  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  49042087 taagagaaactattaggaaagatttagaggttaatgagttggatccaaa-tatggttttatgatagaacactatggcgtaatttgatccatgtagccgac 49042185  T
Q  498 cccactt 504  Q
    |||||||    
T  49042186 cccactt 49042192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 241 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 54365266 - 54365003
Alignment:
Q  241 agagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagaga--agacttgtagatgctatcgtaag 338  Q
    |||||||  ||||||||||||||| || ||||  |||  |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||  | || ||||||| ||||  ||||    
T  54365266 agagagttggggtagcacctatagtag-aaaatatggcggaaaatag-cttaggtggtttgggcatgtagagagagaatacctgtagattctattataag 54365169  T
Q  339 aagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatggg 436  Q
     ||||||||||| ||| |||| |||| |  ||  ||||| ||||||||| |||  |||||||  ||| |||||||||||||||| ||  || |||||| |    
T  54365168 gagagtagatcaaatgaaggatagtcagaccacgagaggcagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaagacttggagattaatgtg 54365069  T
Q  437 ttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccact 503  Q
    || || |||||||||| ||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||| ||||    
T  54365068 ttaga-ccaaaatatggtttatgatagaacactatgacgtaatttgatccatgtagccgaccacact 54365003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 188 - 467
Target Start/End: Original strand, 27917510 - 27917788
Alignment:
Q  188 gttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataaccc-attagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaata 286  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| |||  |||||||||| |||| ||||||  || |||  ||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||    
T  27917510 gttggatgagtggtaagcctagacgagatttgattaggaatgaccccattaga--gaaagttggggtagcacctatagtag-aaaagatggtaggaaata 27917606  T
Q  287 ggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaag 386  Q
    |||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| | |  ||  |||| ||||||| |||||||| | || | ||| || ||||||| ||||    
T  27917607 ggcttagatggtttggacatgtagaaagaagacttgtagatgttgtattagaaagaatagatcaaatggaggacaatcagatcataataggtagacgaag 27917706  T
Q  387 agctatgaaaac--taagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaaca 467  Q
    | |||| |||||  ||||| | || | ||| |||||||| |||||||||   |||||| | ||||||| |||| |||||||||    
T  27917707 acctataaaaactataagagagacaactagaaaagattttaaggttaattcattggat-ctaaatatggtttacgatagaaca 27917788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 188 - 447
Target Start/End: Original strand, 3186707 - 3186967
Alignment:
Q  188 gttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaata 286  Q
    |||||||||| |||||  || | ||||||| |||||||||| || ||||||   | ||||||  ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  3186707 gttggatgagcggtaagacttggcgggataagattaggaatgacaccattatggaaagagtggtggtagcacctatagtgggaaa-gttggtagaaaata 3186805  T
Q  287 ggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaag 386  Q
    |||| ||  | ||||| ||||||||||||||| |||||||||  || ||||||| | |||||||||| ||| | |||| ||||||||||||| ||| ||     
T  3186806 ggct-agatgatttgggcatgtagagagaagatttgtagatgtcattgtaagaaaaatagatcagattgagaaaagtcaggtcaaaagaggtggagaaat 3186904  T
Q  387 agctatgaaaac--taagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaa 447  Q
    | ||| ||||||  |||||||||  ||||| ||  |||||||||| |||| ||| ||||||||    
T  3186905 acctaagaaaactataagaaaaatcattagaaagaatttaaaggtcaatgagttagatccaaa 3186967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 185 - 507
Target Start/End: Original strand, 26490252 - 26490573
Alignment:
Q  185 tgcgttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaa 283  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||||||| |||||| ||| ||  ||||||| ||||  ||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||    
T  26490252 tgcgttggatgagtggtaagacaagacgggatatgattagcaatgacgtcattagacagag-ttga-ggtagcacctatagta-gaaaagatggtagaaa 26490348  T
Q  284 ataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagagg 383  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| | |||||   | |||| | | ||| |||||||||||||||| ||||||| ||   | | | |||| || ||    
T  26490349 ataggcttaggtggtttggacatgtagataaaagaccgttggatgttgtagtacgaagagtagatcagatagaggagaatcatattagatgaggcagtgg 26490448  T
Q  384 aagagctatgaaaact--aagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaattt 481  Q
    ||||  ||  ||||||  |||| |||||||||| ||||||||| ||  ||||| ||| ||||| |||| ||||||   |||||| | || |||| |||||    
T  26490449 aagatatagaaaaactagaagagaaactattagaaaagatttagagactaatgagtttgatcc-aaatgtgatttcatatagaatattatggcgtaattt 26490547  T
Q  482 gatccatgtagccgaccccacttagt 507  Q
    ||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  26490548 gatccatatagtcgatcccacttagt 26490573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 400 - 509
Target Start/End: Original strand, 15296059 - 15296167
Alignment:
Q  400 aagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccc 499  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||||||  ||||||||| || || | |||||||||||||| ||||||||    
T  15296059 aagagaaactattaggaaagatttagaggttaatgaattggatccaaa-tatgatttcggatagaacattatggtgtaatttgatccatgtggccgaccc 15296157  T
Q  500 cacttagtgg 509  Q
    ||||||||||    
T  15296158 cacttagtgg 15296167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 211 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 54425292 - 54424981
Alignment:
Q  211 cgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgta 309  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||||| |||||||||||| || || |||||  || ||||||| ||||||||||| |||||  | |||| |||||||    
T  54425292 cgggataggattatgaatgacaccattaggaagagagtgagg-tatcatctataatag-aaaagtttgtagaaaatagacttagaagatttgaacatgta 54425195  T
Q  310 gagagaagacttgtagatgctatcgtaagaag-------agtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaac--ta 400  Q
    | |||||||| || ||||||  | ||||| ||       |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| |||| |  ||    
T  54425194 gggagaagacctgcagatgccgttgtaagtaggatttagagtagatcagatggaggagattcaggtcaaaagaggtagaggaagacctaagaaagctata 54425095  T
Q  401 agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggc------gcaatttgatccatgtagcc 494  Q
    |||   || ||||  || |||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| |||| | |       ||||||||||||| ||||     
T  54425094 agagggaccattaaaaaggatttagaggtcaatgggttggatcc-aaatatggtttattatagaaaactatgacataatttcaatttgatccatctagct 54424996  T
Q  495 gaccccacttagtgg 509  Q
    |||||||||||||||    
T  54424995 gaccccacttagtgg 54424981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 404 - 503
Target Start/End: Original strand, 36304122 - 36304220
Alignment:
Q  404 aaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccact 503  Q
    |||||||||| ||||||| || || |||||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36304122 aaaactattaagaaagatctagagattaatgagttggatc-aaaatatggtttatgataggacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccact 36304220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 410 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 52156204 - 52156106
Alignment:
Q  410 attaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||| || |||||| |||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  52156204 attagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaa-tatggtttatgatagaacactatggcgtcatctgatccatgtagccgaccccacttagtgg 52156106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 431 - 509
Target Start/End: Original strand, 38060897 - 38060974
Alignment:
Q  431 aatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38060897 aatgagttggatccaaa-tatggtttatgatagaacaccatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 38060974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 411 - 508
Target Start/End: Original strand, 40991594 - 40991690
Alignment:
Q  411 ttaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtg 508  Q
    |||||||||| || ||| |||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || || | ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40991594 ttaggaaagacttgaagattaatgagttgga-ccaaaatatggtttatgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagctgaccccacttagtg 40991690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 334 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 23534768 - 23534590
Alignment:
Q  334 gtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggtta 431  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || |||  | |||  ||||||||||||||| | |  |||| ||  | | |||||||||||||||| ||| || |||    
T  23534768 gtaaggagagtagatcagatggatgatagttagatcactagaggtagaggaagacccaaaaaaattataacagaaactattaggaaagacttagagatta 23534669  T
Q  432 atgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtggat 511  Q
    ||| |||||| |   ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  23534668 atgagttgga-ctgtaatatgatttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagtcgacctcactttgtggat 23534590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 405 - 509
Target Start/End: Original strand, 53262298 - 53262401
Alignment:
Q  405 aaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccactt 504  Q
    |||| ||||| | ||||||| |||| |||| |||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  53262298 aaaccattagaagagatttagaggtcaatgagttggatccaaa-tatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatctatgtagccgaccccactt 53262396  T
Q  505 agtgg 509  Q
    |||||    
T  53262397 agtgg 53262401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 401 - 509
Target Start/End: Original strand, 29601045 - 29601152
Alignment:
Q  401 agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgacccc 500  Q
    |||||| |||||| |||||||||| || |||||| ||||||| |||| |||  |||||||||||||| || |  | ||||||||||||||||| ||||||    
T  29601045 agaaaagctattaagaaagatttagagattaatgagttggattcaaa-tatagtttatgatagaacattatgatgtaatttgatccatgtagctgacccc 29601143  T
Q  501 acttagtgg 509  Q
    |||||||||    
T  29601144 acttagtgg 29601152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 409 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 40116459 - 40116360
Alignment:
Q  409 tattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtg 508  Q
    |||||||| ||||||| || |||||| |||||| || ||||||| |||||||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  40116459 tattaggatagatttagagattaatgagttgga-ccgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccacgtagccgacctcgcttagtg 40116361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 454 - 509
Target Start/End: Original strand, 46148233 - 46148288
Alignment:
Q  454 tttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46148233 tttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 46148288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 399 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 45486983 - 45486871
Alignment:
Q  399 taagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaa--atatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccga 496  Q
    ||||| ||||||||| |||||| ||  || ||||||  ||||| |||||  ||||| |||||||||||||| || |||  |||||||||||||||||||     
T  45486983 taagagaaactattatgaaagactttgagattaatgacttggaaccaaataatatggtttatgatagaacattatggcataatttgatccatgtagccgg 45486884  T
Q  497 ccccacttagtgg 509  Q
    |||||||||||||    
T  45486883 ccccacttagtgg 45486871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 373 - 502
Target Start/End: Original strand, 49841741 - 49841869
Alignment:
Q  373 agaggtagaggaagagctatgaaaactaagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacg 472  Q
    ||||||||||||||| |    |||| ||||| |||||||||  |||||| ||||| |||||| |||||||| ||| |||| | |||||||||||| || |    
T  49841741 agaggtagaggaagaccagaaaaaaataagagaaactattaacaaagatctaaagattaatgagttggatcgaaa-tatggtatatgatagaacattatg 49841839  T
Q  473 gcgcaatttgatccatgtagccgaccccac 502  Q
    ||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  49841840 gcataatttgatccatgtagctgaccccac 49841869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 417 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 311422 - 311331
Alignment:
Q  417 aagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||||||| |||| |||  |||||||||| | |||| ||| ||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  311422 aagatttagaggtcaattagttggatccaga-tatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatacatgtagccgaccccacttagtgg 311331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 296 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 33755578 - 33755367
Alignment:
Q  296 ggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaa 395  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||||||  | |  | || ||||||||||||||||||||  ||||| |||  ||||| ||||||| | |||  ||    
T  33755578 ggtttggacatgtagagcgaaggcctgtagattttgtacttaggagagtagatcagatggaggatggtcggatcactagaggcagaggaaaacctagaaa 33755479  T
Q  396 aac--taagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagc 493  Q
    |||  ||||| |||||||||||||| | ||| || |||||| |||||| |||| ||||| ||  |||  ||||| || | || ||||||||| |||||||    
T  33755478 aactataagagaaactattaggaaaaacttagagattaatgagttgga-ccaagatatggtt--tgagtgaacattatgacgtaatttgatcgatgtagc 33755382  T
Q  494 cgaccccacttagtg 508  Q
    | |||||||||||||    
T  33755381 caaccccacttagtg 33755367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 449 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 40273287 - 40273227
Alignment:
Q  449 tatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||| ||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40273287 tatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 40273227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 446 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 24541417 - 24541354
Alignment:
Q  446 aaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||| |||| ||||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24541417 aaatatggtttaggatagaacattatggcgtaatttgatccatgtacccgaccccacttagtgg 24541354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 426 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 47555436 - 47555354
Alignment:
Q  426 aggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||| |||| |||||||||||| | || | ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  47555436 aggtcaatgagttggatccaaatt-tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgg 47555354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 463 - 509
Target Start/End: Original strand, 41529975 - 41530021
Alignment:
Q  463 gaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41529975 gaacactatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 41530021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 185 - 400
Target Start/End: Original strand, 45728081 - 45728300
Alignment:
Q  185 tgcgttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac--ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaa 282  Q
    |||| ||||||||||||||  | |||||  |||||||||| ||| ||  |  ||||| |||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  45728081 tgcgctggatgagtggtaagacgagacgaaataggattagaaatgacatcatttagagagagagtgggggtagcacatatagtag-aaaagttggtagaa 45728179  T
Q  283 aataggcttaggcggtttggacatgtagagag-aagacttgtagatgctatcgtaagaagag--tagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggta 379  Q
    | |||| | ||  ||||| ||||||||||||| || ||   ||||||   | ||||||||||  || |||| |||||||||||||  || ||||||| ||    
T  45728180 agtaggatcagatggttttgacatgtagagagaaaaacccatagatgtcgttgtaagaagagtatatatcaaatggaggagagtcatgttaaaagagata 45728279  T
Q  380 gaggaagagctatgaaaacta 400  Q
    |||||||| ||| ||||||||    
T  45728280 gaggaagacctaggaaaacta 45728300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 443 - 509
Target Start/End: Original strand, 50249571 - 50249637
Alignment:
Q  443 ccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | ||||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  50249571 ccaaaatatgatttatgagagaacattgcggcttactttgatccatgtagtcgaccccacttagtgg 50249637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 278 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 3870698 - 3870617
Alignment:
Q  278 tagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggagga 359  Q
    |||||| | |||||||  ||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| || || |||||| |||||||||||||    
T  3870698 tagaaacttggcttagatggttttggcatgtagagagaagacttgtagattctatagttaggagagtaaatcagatggagga 3870617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 456 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 7895955 - 7895906
Alignment:
Q  456 tatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccactta 505  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7895955 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccactta 7895906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 268 - 357
Target Start/End: Original strand, 21200566 - 21200655
Alignment:
Q  268 gaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggag 357  Q
    |||||| |||| |||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||   ||||| ||||||||||| ||||||    
T  21200566 gaaaagatggtggaaactagacttaggtggtttgggcatgtagagagaagacatgtagattctgcagtaaggagagtagatcacatggag 21200655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 449 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 31566243 - 31566183
Alignment:
Q  449 tatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||| ||| ||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31566243 tatggtttttgatagaacactatggtgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 31566183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 298 - 358
Target Start/End: Original strand, 33307176 - 33307236
Alignment:
Q  298 tttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggagg 358  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||| ||||||||||||    
T  33307176 tttgaacatgtagagagaagacatgtagattctataggaagaagagtaaatcagatggagg 33307236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 36820306 - 36820174
Alignment:
Q  185 tgcgttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaa 283  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||  |||||||  ||||||||||||||  | | |||| |||| ||||    
T  36820306 tgcgttggatgtgtggtaagactagacgagataggattagaaatgacgacattag--agagagttggggtagcacctatatta-gcaaagatggtggaaa 36820210  T
Q  284 ataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagac 319  Q
     |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||    
T  36820209 ctaggcttaggtggtttagacatgtaaagagaagac 36820174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 454 - 509
Target Start/End: Original strand, 48532162 - 48532218
Alignment:
Q  454 tttatgatagaacactacggcgcaatttgatcca-tgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  48532162 tttatgatagaacactatggcgtcatttgatccaatgtagccgaccccacttagtgg 48532218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 454 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 2133689 - 2133634
Alignment:
Q  454 tttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  2133689 tttatgatagaacactatggcgtgatttgatccatgtactcgaccccacttagtgg 2133634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 458 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 24778682 - 24778631
Alignment:
Q  458 tgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24778682 tgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 24778631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 296 - 387
Target Start/End: Original strand, 50249433 - 50249524
Alignment:
Q  296 ggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaaga 387  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||||||| || | ||||| |||||||||||||||| ||| ||||   |||  |||||||||||||||    
T  50249433 ggtttgggcatgtagagtgaagacatgtagattctttagtaaggagagtagatcagatgggggatagtcatatcaccagaggtagaggaaga 50249524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 446 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 52927933 - 52927870
Alignment:
Q  446 aaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||| |||| || |||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52927933 aaatatggtttacgacagaacattatggcataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 52927870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 241 - 327
Target Start/End: Original strand, 3987039 - 3987124
Alignment:
Q  241 agagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagat 327  Q
    |||||||  ||||| ||||||||| || ||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  3987039 agagagttggggtatcacctatagtag-aaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggaatgtagagagaagactggtagat 3987124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 404 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 36049428 - 36049326
Alignment:
Q  404 aaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccact 503  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||| |||||||||   ||||||  |||||||  ||| ||||||||  ||||||||| |||||||    
T  36049428 aaaactattaggaaagatttaaaaattaatgaattggat-caaaatatggcctatgattaaacactatagcgtaatttgat--atgtagccggccccact 36049332  T
Q  504 tagtgg 509  Q
    ||||||    
T  36049331 tagtgg 36049326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 399 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 40116599 - 40116490
Alignment:
Q  399 taagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgacc 498  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||| || |||||| |||||| || ||||||| |||||||||||||| |  |||| |||| |||| | |||||| |||    
T  40116599 taagagaaactattaggatagatttagagattaatgagttgga-ccgaaatatggtttatgatagaacattgtggcgtaattcgatctacgtagccaacc 40116501  T
Q  499 ccacttagtgg 509  Q
     | ||||||||    
T  40116500 tcgcttagtgg 40116490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 345055 - 344919
Alignment:
Q  188 gttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataacc-cattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaata 286  Q
    |||||||  |||||||  ||||||| ||||||||||| ||| |   ||||||| |||||||  ||||||||| ||||| || ||||| || |||||||||    
T  345055 gttggatttgtggtaagactagacgagataggattagaaatgatgacattagagagagagttggggtagcacttatagtag-aaaagatgttagaaaata 344957  T
Q  287 ggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgta 324  Q
    |||||| |  |||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  344956 ggcttaagtagtttggtcatgtagagagaggacctgta 344919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 446 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 4472472 - 4472411
Alignment:
Q  446 aaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagt 507  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || | || ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  4472472 aaatatgatttataatagaacactatggtgtaacttgatccatgtagccgactacacttagt 4472411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 268 - 510
Target Start/End: Original strand, 37351425 - 37351668
Alignment:
Q  268 gaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcggg 367  Q
    |||||| ||||||||| ||| |||  | ||||||| ||||| |||||||| | |||  ||||  | ||||| ||||||||||||||||| | ||| |       
T  37351425 gaaaagatggtagaaactagacttgagtggtttgggcatgtggagagaagtcatgtgaatgcggtagtaaggagagtagatcagatggaagggaggcaaa 37351524  T
Q  368 tcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaa 465  Q
    |||  |||||||| |||||| |||  |||||||  ||| |||| || | ||||||| || || |||||| | ||||   || ||||| ||| || |||||    
T  37351525 tcactagaggtaggggaagacctagaaaaactattagagaaacaatcaagaaagatctagagattaatgagatggaga-aagatatggtttttgttagaa 37351623  T
Q  466 cactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgga 510  Q
    ||||||| ||   |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37351624 cactacgacgtcgtttgattcatgtagccgaccccacttagtgga 37351668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 428 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 40106722 - 40106642
Alignment:
Q  428 gttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| || | |  ||||||||| ||||||  |||||||||||||||    
T  40106722 gttaatgagttggatccaaa-tatggtttatgatagaacattatgacataatttgatcaatgtagtggaccccacttagtgg 40106642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 268 - 364
Target Start/End: Original strand, 11581462 - 11581558
Alignment:
Q  268 gaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtc 364  Q
    |||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||  ||||||||||||||| |||  ||  | | |||||||||||| |||||||| ||| |||||    
T  11581462 gaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggtatgtagagagaagacatgtgaattatgtagtaagaagagtacatcagatgtaggtgagtc 11581558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 454 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 30797899 - 30797843
Alignment:
Q  454 tttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgga 510  Q
    |||||||||||||| || | || ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  30797899 tttatgatagaacattatgacgtaatttgatctatgtaaccgaccccacttagtgga 30797843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 401 - 465
Target Start/End: Original strand, 44571580 - 44571643
Alignment:
Q  401 agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaa 465  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| || |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  44571580 agaaaaactataaggaaatatttagagattaatgagttggatcc-aaatatggtttatgatagaa 44571643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 478 - 509
Target Start/End: Original strand, 7278693 - 7278724
Alignment:
Q  478 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7278693 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 7278724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 240 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 31453230 - 31453151
Alignment:
Q  240 aagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagac 319  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||| | |||||| ||||||||| ||| ||||||  |||| | ||||||||||||||||    
T  31453230 aagagagttggggcagcacctatagtaagaaaagatggtagaaactagacttaggttgttttggcatgtagagagaagac 31453151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 458 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 31454298 - 31454247
Alignment:
Q  458 tgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  31454298 tgatagaacactatggcgtcatttgattcatttagccgaccccacttagtgg 31454247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 477 - 508
Target Start/End: Original strand, 32170633 - 32170664
Alignment:
Q  477 aatttgatccatgtagccgaccccacttagtg 508  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32170633 aatttgatccatgtagccgaccccacttagtg 32170664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 299 - 358
Target Start/End: Original strand, 36304027 - 36304086
Alignment:
Q  299 ttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggagg 358  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||||| ||| |||||||||| ||||    
T  36304027 ttgggcatgtagagagaagacctgtagatgctttagtaaggagaatagatcagatagagg 36304086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 454 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 37083369 - 37083314
Alignment:
Q  454 tttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||||||| ||||| || |||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  37083369 tttatgatcgaacattatggcgtaatttggtccttgtagccgaccccacttagtgg 37083314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 446 - 509
Target Start/End: Original strand, 39208805 - 39208868
Alignment:
Q  446 aaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||| |||||||||||||| || | || ||||||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  39208805 aaatatggtttatgatagaacattatgacgtaatttgatccatgtagaggaccccagttagtgg 39208868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 348 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 41482323 - 41482183
Alignment:
Q  348 tcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaact---aagaaaaactattaggaaaga-tttaaaggttaatgggttggatc 443  Q
    |||| ||||||| |||||| |||  ||||| ||||||||| |||  ||||||   |||| |||||||||||||||| |||  || |||||| |||| | |    
T  41482323 tcaggtggaggacagtcggatcactagaggcagaggaagacctagaaaaacttttaagagaaactattaggaaagactttggagattaatgagttgaa-c 41482225  T
Q  444 caaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatc 485  Q
    |||||| || |||||||||||||| || |||| |||||||||    
T  41482224 caaaatctggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatc 41482183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 280 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 42026788 - 42026709
Alignment:
Q  280 gaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggagga 359  Q
    |||| |||||||||| ||||||  | ||||||||||| ||||||||||  | | ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  42026788 gaaactaggcttaggtggtttgagcttgtagagagaaaacttgtagattatttagtaaggagagtagatcagacggagga 42026709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 479 - 509
Target Start/End: Original strand, 659755 - 659785
Alignment:
Q  479 tttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  659755 tttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 659785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 478 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 21862794 - 21862764
Alignment:
Q  478 atttgatccatgtagccgaccccacttagtg 508  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21862794 atttgatccatgtagccgaccccacttagtg 21862764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 250 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 41842792 - 41842679
Alignment:
Q  250 gggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatc 349  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||| ||||  || |||||| |||||||  ||||||||||||||   |||||| || | ||||  ||||||||||    
T  41842792 gggtagcacctatagtag-aaaagatggtggaaaccagtcttaggtggtttgggtatgtagagagaagagcggtagattctgtagtaatgagagtagatc 41842694  T
Q  350 agatggaggagagtc 364  Q
    | |||||||| ||||    
T  41842693 aaatggaggatagtc 41842679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 268 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 44443468 - 44443378
Alignment:
Q  268 gaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggagg 358  Q
    |||||| |||| |||| | |||||| |  ||||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||| ||||||| |||| ||||||    
T  44443468 gaaaagatggtggaaactcggcttaagtagtttgcacatgtagagagaagacttttagattctgtagtaaggagagtagctcagttggagg 44443378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 459 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 45374549 - 45374499
Alignment:
Q  459 gatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||||| || |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  45374549 gatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagctgaccccacttagtgg 45374499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 477 - 507
Target Start/End: Original strand, 49888415 - 49888445
Alignment:
Q  477 aatttgatccatgtagccgaccccacttagt 507  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49888415 aatttgatccatgtagccgaccccacttagt 49888445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 448 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 14415342 - 14415282
Alignment:
Q  448 atatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||| ||||||||| |||| || |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14415342 atatggtttatgatataacattatggcataatttgatc-atgtagccgaccccacttagtgg 14415282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 446 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 41971355 - 41971290
Alignment:
Q  446 aaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtggat 511  Q
    ||||||||| |||||||||||| || | ||   |||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  41971355 aaatatgatatatgatagaacattatgacgttgtttgatccatgtagccaactccacttagtggat 41971290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 436 - 509
Target Start/End: Original strand, 49045023 - 49045095
Alignment:
Q  436 gttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||||||||||| |||  ||||||| |||||| || |||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  49045023 gttggatccaaa-tatagtttatgacagaacattatggccgaatttaatccatgtagccgaccccactcagtgg 49045095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 472 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 52882721 - 52882684
Alignment:
Q  472 ggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  52882721 ggcgtaatttgatccatgtagccaaccccacttagtgg 52882684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 405 - 509
Target Start/End: Original strand, 29475843 - 29475946
Alignment:
Q  405 aaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccactt 504  Q
    ||||||||| ||||||| || || |||||| |||||||  ||| |||  |||||||||||| |||| |||| ||||||| |||| ||||| || ||| ||    
T  29475843 aaactattaagaaagatctagagattaatgagttggattgaaa-tattgtttatgatagaaaactatggcgtaatttgacccatctagccaactccagtt 29475941  T
Q  505 agtgg 509  Q
    |||||    
T  29475942 agtgg 29475946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 477 - 509
Target Start/End: Original strand, 31146927 - 31146959
Alignment:
Q  477 aatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31146927 aatttgatccatgtagccgactccacttagtgg 31146959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 477 - 509
Target Start/End: Original strand, 34253688 - 34253720
Alignment:
Q  477 aatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34253688 aatttgatccatgtagccgaccccatttagtgg 34253720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 144; Significance: 2e-75; HSPs: 103)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 185 - 508
Target Start/End: Original strand, 38429819 - 38430143
Alignment:
Q  185 tgcgttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaa 283  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  38429819 tgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggcagcacctatagtag-aaaagttggtagaaa 38429917  T
Q  284 ataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagagg 383  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||  ||| ||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||    
T  38429918 ataggcttagatggtttggacatgtaaagagaagacccgtatatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaagtagagg 38430017  T
Q  384 aagagctatgaaaac--taagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaattt 481  Q
    |||| ||| ||||||  |  || |||| ||||| ||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||  ||||    
T  38430018 aagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatcc-aaatatggtttttgatagaacactatggcgtcattt 38430116  T
Q  482 gatccatgtagccgaccccacttagtg 508  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  38430117 gatccatgtagccgaccccacttagtg 38430143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 190 - 509
Target Start/End: Original strand, 12734641 - 12734960
Alignment:
Q  190 tggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaatagg 288  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| || ||||||||  ||||||| ||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||    
T  12734641 tggatgagtggtaagactagacgggataggattagaaatgacaccattaga--gagagtgggggtagcacctatagtagaaaaa-ttggtagaaaatagg 12734737  T
Q  289 cttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaaga-ggtagaggaaga 387  Q
    |||||  |||||||||||||| |||||||||  ||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||    
T  12734738 cttagatggtttggacatgtaaagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagagggtagagggaga 12734837  T
Q  388 gctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatc 485  Q
     ||| ||||||||  ||| |||| ||||| || |||||| |||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  12734838 cctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatcc-aaatatggtttatgatagaacactatggtgtaatttgatc 12734936  T
Q  486 catgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  12734937 catgtagtcgaccccacttagtgg 12734960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 188 - 509
Target Start/End: Original strand, 8180718 - 8181040
Alignment:
Q  188 gttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaata 286  Q
    ||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  8180718 gttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtag-aaaagttggtagaaaata 8180816  T
Q  287 ggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaag 386  Q
     ||||||  ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||| |||||||||||    
T  8180817 agcttagatggtttgggcatgtagagagaagacctgtggatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagcggtagaggaag 8180916  T
Q  387 agctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgat 484  Q
    |  || ||||||||  ||| |||| ||||| || |||||| |||| |||| ||||||||| |||| || | |||||||||||||||  | |  |||||||    
T  8180917 acataggaaaactattagataaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatcc-aaatttggtgtatgatagaacactatagtgtcatttgat 8181015  T
Q  485 ccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  8181016 ccatgtagccgaccccacttagtgg 8181040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 185 - 507
Target Start/End: Original strand, 36183386 - 36183709
Alignment:
Q  185 tgcgttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataaccca-ttagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaa 283  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||| || || ||||| |||||||  ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  36183386 tgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacacaattagagagagagtaggggtagcacctatagtag-aaaagttggtagaaa 36183484  T
Q  284 ataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagagg 383  Q
    |||  |||||  ||||| | ||||||||||||||||  ||||||||  | ||||||||||||||| | |||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  36183485 ataatcttagttggtttcggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagataaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagagg 36183584  T
Q  384 aagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaattt 481  Q
    |||| ||| ||||||||  ||| |||| ||||| || |||||| | || |||| ||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| || || ||||    
T  36183585 aagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaagtcaatgagttggatcc-aaatttgatgtatgatagaacactatggtgccattt 36183683  T
Q  482 gatccatgtagccgaccccacttagt 507  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  36183684 gatccatgtagccgaccccacttagt 36183709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 185 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 41763388 - 41763065
Alignment:
Q  185 tgcgttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaa 283  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||||    
T  41763388 tgcgatggatgagtggtaagactagacaagataggattaggaatgacaccattagagagagagtg-gggtaacacctatagtag-aaaagttggtagaaa 41763291  T
Q  284 ataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagagg 383  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||  | ||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||||    
T  41763290 ataggcttaggtggtttggacatgcagagagaagacctgtagatgccgttgtaagaaaagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaaaaggtagagg 41763191  T
Q  384 aagagctatgaaaac--taagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaattt 481  Q
    |||| ||| ||||||  |  || |||| ||||| ||| |||| ||||| |||  ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||   ||||  ||||    
T  41763190 aagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaaaattt-aaggtcaattagttggatcc-aaatatgttttttgatagaacacccgggcgtcattt 41763093  T
Q  482 gatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41763092 gatccatgtagccgaccccacttagtgg 41763065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 241 - 508
Target Start/End: Original strand, 2610580 - 2610847
Alignment:
Q  241 agagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaa 340  Q
    |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||  |||||||   | |||||||    
T  2610580 agagagtgggggtagcacctatagt-ggaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacacgtagatgtcgtggtaagaa 2610678  T
Q  341 gagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggtt 438  Q
    |||||||||| ||||| |||||||  || |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||| ||||| || |||||| |||| |||| |||    
T  2610679 gagtagatcaaatggatgagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctatgaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagtt 2610778  T
Q  439 ggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtg 508  Q
    |||||| |||| || | ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2610779 ggatcc-aaatttggtgtatgatagaacactatggcgttatttgatccatgtaaccgaccccacttagtg 2610847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 185 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 11992453 - 11992129
Alignment:
Q  185 tgcgttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaa 283  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||||  |||| |||||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  11992453 tgcgctggatgagtggtaatactagacatgataagattaggaatgacaccattaga--gagagtgagggtagcacctatagtag-aaaagttggtagaaa 11992357  T
Q  284 ataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagagg 383  Q
    ||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||  | || |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  11992356 ataagcttagatggtttggacatatagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagagtggatcaaatggaggagagtcgggttaaaagaggtaaagg 11992257  T
Q  384 aagagctatgaaaac--taagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaattt 481  Q
    |||| ||| ||||||  | ||  |||  ||||| || |||||| |||| |||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||  ||||    
T  11992256 aagacctaagaaaaccattagggaaatcattagaaaggatttagaggtcaatgagttagatcc-aaatatgatttttgatagaacattatggcgttattt 11992158  T
Q  482 gatccatgtagccgaccccacttagtgga 510  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11992157 gatccatgtagctgaccccacttagtgga 11992129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 241 - 509
Target Start/End: Original strand, 25834673 - 25834938
Alignment:
Q  241 agagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaa 340  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||  | |||||||    
T  25834673 agagagtgggggtagcacctatagtag-aaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacctgtggatgccgttgtaagaa 25834771  T
Q  341 gagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaac-taagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttg 439  Q
    |||||||||| ||||||  ||||  ||| |||||||||||||||||| ||| |||||| | | | |||| ||||| || |||||| |||| |||| ||||    
T  25834772 gagtagatcaaatggag--gagttaggttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactttaaagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttg 25834869  T
Q  440 gatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25834870 gatcc-aaatatggtttatgatagaacactgtggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 25834938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 185 - 507
Target Start/End: Original strand, 3866007 - 3866330
Alignment:
Q  185 tgcgttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaa 283  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  3866007 tgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattggagagagagtgggggtagcacctatagtaa-aaaagttggtagaaa 3866105  T
Q  284 ataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagagg 383  Q
    ||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||  |||||||   | ||||||||||||||||| ||||||||||| |   | ||||||||||||||    
T  3866106 ataggcttagatggtttgtgcatgtagagagaagacccgtagatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagacaaattaaaagaggtagagg 3866205  T
Q  384 aagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaattt 481  Q
    || | ||| ||||||||  ||| |||| ||||| || |||||| |||| |||| ||||||||| |||| || | ||||||||||||||| | |   ||||    
T  3866206 aaaacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatcc-aaatttggtgtatgatagaacactatgacatcattt 3866304  T
Q  482 gatccatgtagccgaccccacttagt 507  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  3866305 gatccatgtagccgaccccacttagt 3866330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 185 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 38453036 - 38452708
Alignment:
Q  185 tgcgttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccatt----agaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggta 279  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||   |||||||||||||| || |||||    ||| |||||||| |||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  38453036 tgcgttggatgagtggtaagactagacatcataggattaggaatgacaccattagagagagagagagtgggggtagcatctatagta-gaaaagttggta 38452938  T
Q  280 gaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggta 379  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||  | ||||||||| ||||||| |||||||| ||||  || ||||||||||    
T  38452937 gaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaaga-tagatcaaatggaggaaagtcaagttaaaagaggta 38452839  T
Q  380 gaggaagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgca 477  Q
    |||||||| ||| ||||||||  ||| |||| ||||| || |||||| |||| |||| ||||||||| |||| || | ||||||| ||||||| || |      
T  38452838 gaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatcc-aaatttggtgtatgataaaacactatggtgtc 38452740  T
Q  478 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38452739 attcgatccatgtagccgaccccacttagtgg 38452708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 192 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 41197568 - 41197254
Alignment:
Q  192 gatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggct 290  Q
    ||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||| || |||||||| | |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||    
T  41197568 gatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagatagagtgagggtagcacctataatag-aaaagttggtagaaaataggct 41197470  T
Q  291 taggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtc-gggtcaaaagaggtagaggaagagc 389  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||   ||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||| |||||||| |||| |    
T  41197469 tagatggtttggacatgtagagagaagatccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaaaaaggtagagaaagacc 41197370  T
Q  390 tatgaaaac--taagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatcca 487  Q
    || ||||||  |  || |||| ||||  ||||||||| |||| || | |||||||||  |||||| ||| |||||||||| || ||||  ||||||||||    
T  41197369 taagaaaaccatttgagaaaccattataaaagatttagaggtcaacgagttggatcc-caatatggtttttgatagaacattatggcgtcatttgatcca 41197271  T
Q  488 tgtagccgaccccactt 504  Q
    ||||| |||||||||||    
T  41197270 tgtagtcgaccccactt 41197254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 185 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 3243998 - 3243675
Alignment:
Q  185 tgcgttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaa 283  Q
    |||||||||||||| ||||  ||| ||  |||||||||| |||| || ||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |  |||||||| | ||||    
T  3243998 tgcgttggatgagtagtaagactacacatgataggattatgaatgacaccattaga--gagagtgggggtagcacctatagtaa-aaaagttgatggaaa 3243902  T
Q  284 ataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagagg 383  Q
    ||||||||||  |||||||  |||||||||||||||  ||||||||  | ||||||||| ||||||| |||||||||||||  || |||||||| |||||    
T  3243901 ataggcttagatggtttgggaatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagaatagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagg 3243802  T
Q  384 aagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaattt 481  Q
    |||| ||| ||||||||  ||| |||| ||||| || |||||| |||| |||| ||||||||| || | || | ||||||||||||||| ||||  ||||    
T  3243801 aagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatcc-aagtttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 3243703  T
Q  482 gatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||    
T  3243702 gatccaggtagccgaccccacttagtgg 3243675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 185 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 45367971 - 45367647
Alignment:
Q  185 tgcgttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaa 283  Q
    |||| ||||||| ||||||  ||||||  |||||||||| |||| || |||||||| |||| | | ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  45367971 tgcgctggatgaatggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtggg-gggtagcacctatagtag-aaaagttggtagaaa 45367874  T
Q  284 ataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagagg 383  Q
    |||  |||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||  | || ||||| |||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  45367873 ataaccttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagggtagatcaaatggaggagagtctagttaaaagaggtagagg 45367774  T
Q  384 aagagctatgaaaac--taagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaattt 481  Q
    ||||   | ||||||  | ||| |||  ||||| || |||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||  ||||    
T  45367773 aagactcaagaaaaccattagagaaatcattagaaaggatttagaggtaaatgagttggatcc-aaatatgatttttgatagaacactatgacgtcattt 45367675  T
Q  482 gatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45367674 gatccatgtcgccgaccccacttagtgg 45367647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 271 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 451909 - 451670
Alignment:
Q  271 aagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtca 370  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| |||||  ||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||  || |    
T  451909 aagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagaaaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagtta 451810  T
Q  371 aaagaggtagaggaagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacac 468  Q
    ||| ||||||||||||| ||| ||||||||  ||| |||| ||||| || |||||| |||| | || |||||||||||| |  | | |||||||||||||    
T  451809 aaaaaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcagtgagttggatccaaatttag-tgtatgatagaacac 451711  T
Q  469 tacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  451710 tatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 451670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 296 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 7326396 - 7326182
Alignment:
Q  296 ggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaa 395  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||  | ||||||||||||||||| ||| |||||||||  || ||||||||||||||||||  || |||    
T  7326396 ggtttgggcatgtagagagaagacctgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatgaaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacataggaa 7326297  T
Q  396 aacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagc 493  Q
    |||||  ||| |||| ||||| || |||||| |||| |||| ||||||||| |||| || | ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  7326296 aactattagagaaaccattagaaatgatttagaggtcaatgagttggatcc-aaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagc 7326198  T
Q  494 cgaccccacttagtgg 509  Q
    | ||||||||||||||    
T  7326197 caaccccacttagtgg 7326182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 241 - 509
Target Start/End: Original strand, 4807588 - 4807855
Alignment:
Q  241 agagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaa 340  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||   |||| | ||| ||||||||||||| |||||||   | |||||||    
T  4807588 agagagtgggggtagcacctatagtag-aaaagttggtagaaa-taggcttagatagtttcggcatatagagagaagactcgtagatgtcgtggtaagaa 4807685  T
Q  341 gagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggtt 438  Q
    |||||||||| ||| |||||||||  || |||||||||||| ||||| ||| ||||||||  ||| |||| ||||| ||  ||||| |||| |||| |||    
T  4807686 gagtagatcaaatgaaggagagtcaagttaaaagaggtagatgaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaagtatttagaggtcaatgagtt 4807785  T
Q  439 ggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||||| |  | | || |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4807786 ggatccaaattcgg-tgtacgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 4807855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 189 - 509
Target Start/End: Original strand, 38434890 - 38435212
Alignment:
Q  189 ttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataacc-cattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaatag 287  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| || | |||||| ||| ||  ||||||| ||||| |  ||||||||||||||| || ||||| |||| |||| |||    
T  38434890 ttggatgcgtggtaaaactagacgagagaagattagaaatgacaacattagagagagaattggggtagcacctatagtag-aaaagatggtggaaactag 38434988  T
Q  288 gcttaggc-ggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaag 386  Q
     ||| ||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||| |||| | |||  ||||| ||||| ||    
T  38434989 actttgggtggtttgggcatgtaaagagaagacttgtagatgctttagtaaggagagtagatcatatggaggatagtcagatcactagaggcagaggtag 38435088  T
Q  387 agctatgaaaact--aagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgat 484  Q
    | |||  ||||||  |||| ||||||||| ||||||| || || |||||| ||||||| | |||| || |||||||| ||||| || |||| ||||||||    
T  38435089 acctagaaaaactacaagagaaactattaagaaagatctagagattaatgtgttggat-cgaaatttggtttatgattgaacattatggcgtaatttgat 38435187  T
Q  485 ccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||||||||||| ||||||||||||    
T  38435188 ccatgtagccgatcccacttagtgg 38435212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 185 - 505
Target Start/End: Original strand, 23997552 - 23997858
Alignment:
Q  185 tgcgttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaa 283  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||||  ||| ||||||||||| || |||||||| | |||||| | |||||||||||||    |||| ||||||||||    
T  23997552 tgcgctggatgagtggtaagactagacatgatcggattaggaatgacaccattagagatagagtgggtgtagcacctatag----aaaatttggtagaaa 23997647  T
Q  284 ataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagagg 383  Q
    |||| |||||  ||||| |||||||||| |||||||  |||||||   | ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| || |    
T  23997648 atagccttagatggttttgacatgtagaaagaagacccgtagatgtcgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtggaag 23997747  T
Q  384 aagagctatgaaaactaagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttga 483  Q
    |||| ||| |          ||||| ||||| ||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||| ||||  ||||||    
T  23997748 aagacctaag----------aaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatcc-aaatatggtttttgataaaacactatggcgttatttga 23997836  T
Q  484 tccatgtagccgaccccactta 505  Q
    | |||||| |||||||||||||    
T  23997837 ttcatgtatccgaccccactta 23997858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 241 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 18424667 - 18424400
Alignment:
Q  241 agagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaa 340  Q
    |||||||| | |||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||  ||||||||   ||||||||    
T  18424667 agagagtgggtgtagcatctatagtag-aaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagacgacccgtagatgccgacgtaagaa 18424569  T
Q  341 gagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggtt 438  Q
    || |||||||  |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||  || ||||||||  ||| |||| ||||  || |||||| || | |||  |||    
T  18424568 gattagatcaattggatgagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacataggaaaactattagagaaaccattataaaggatttagagatcaataagtt 18424469  T
Q  439 ggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
     |||||  |||||| ||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  18424468 tgatcc-gaatatggtttatgatagaacactatgacgtcatttgatccatgta-ccgtccccacttagtgg 18424400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 334 - 509
Target Start/End: Original strand, 28508762 - 28508938
Alignment:
Q  334 gtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggtta 431  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||  || |||||| ||||||||||| ||| ||||||||  ||| |||| ||||| || |||||| |||| |    
T  28508762 gtaataagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagatgtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtca 28508861  T
Q  432 atgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||| |||||||||||| | || ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28508862 atgagttggatccaaatt-tggtttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 28508938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 268 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 24583896 - 24583657
Alignment:
Q  268 gaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcggg 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  24583896 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgctgtcgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 24583797  T
Q  368 tcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaa 465  Q
    | ||||||| |||| |||||   |  |||||||  ||| |||| ||||| || |||||| |||| |||| |||||||| ||  |  | ||| |||||| |    
T  24583796 ttaaaagagatagatgaagacaaaaaaaaactaatagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatcaaatttgagttttgtgatagca 24583697  T
Q  466 cactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccactta 505  Q
    ||||| | || ||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  24583696 cactatgacgtaatttaatcaatgttgccgaccccactta 24583657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 234 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 43752244 - 43751971
Alignment:
Q  234 attagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatc 333  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| | |||||  | |     
T  43752244 attagagagagagttggggtagcacctatagtag-aaaaggtggtagaaaataggcttaggtgatttggacatgtagagagaagacctatagattatgta 43752146  T
Q  334 gtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggtta 431  Q
    ||| | |||||||||||||||||||| | || | |||   |||| | ||||||| |||  |||||||  ||| |||||||||||||||||||  |  |||    
T  43752145 gtagggagagtagatcagatggaggatactcagatcactggaggcataggaagacctagaaaaactatcagagaaactattaggaaagatttggaaatta 43752046  T
Q  432 atgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagt 507  Q
    ||| |||||| || ||| ||| | ||||||||||||||| |  | |||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  43752045 atgagttgga-ccgaaagatggtgtatgatagaacactatgttgtaatttgatccatgtggccgacctcacttagt 43751971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 250 - 509
Target Start/End: Original strand, 18958908 - 18959171
Alignment:
Q  250 gggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttgga----catgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagta 345  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||     |||| ||||||||||| || || |  | | ||||| ||||||    
T  18958908 gggtagcacctatagtag-aaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttggttgggcatgcagagagaagacctgcagcttttgtagtaaggagagta 18959006  T
Q  346 gatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatc 443  Q
    |||||||||||||| |||| | |||  ||||| ||||||||| |||  |||||||  ||| ||||||| |||||||| ||  || |||||| ||||||||    
T  18959007 gatcagatggaggatagtcagatcatcagaggcagaggaagacctagaaaaactacaagagaaactataaggaaagacttggagattaatgagttggatc 18959106  T
Q  444 caaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
     |||||||| | |||||||||||| || |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18959107 -aaaatatggtctatgatagaacattatggcataatttgatccatgtagctgaccccacttagtgg 18959171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 250 - 509
Target Start/End: Original strand, 12141545 - 12141804
Alignment:
Q  250 gggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatc 349  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||| || ||||| ||||||| ||||||| || | ||||| ||||||||||    
T  12141545 gggtagcacctatagtag-aaaagatggtggaaaagaggcttaggtggtttgggcacgtagaaagaagacctgtagattctctagtaaggagagtagatc 12141643  T
Q  350 agatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaac--taagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaa 447  Q
    |||| ||||| ||||   | | |||||||||||||||| |||  ||| |  || || |||||||||||||||| ||| || ||||||  |||||||| ||    
T  12141644 agattgaggatagtcaaattacaagaggtagaggaagacctagaaaagctataggagaaactattaggaaagacttagagattaatgacttggatcc-aa 12141742  T
Q  448 atatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||| | |||||||||||| || |||   |||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  12141743 atatggtatatgatagaacattatggcatgatttgatcgatgtagccaaccccatttagtgg 12141804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 271 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 6238014 - 6237774
Alignment:
Q  271 aagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtca 370  Q
    |||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||| ||||  ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||    
T  6238014 aagttggtagaaaacatgcttagatggtttggacatgtagagagtagacccgtaaacgtcgtcgtaagaagagtagatcagatggaggagagacatgtca 6237915  T
Q  371 aaagaggtagaggaagagctatgaaaact--aagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacac 468  Q
    |||||||||||| |||| |||  ||||||  |||| |||| ||||| || |||||| |||| |||  ||||||| | ||||||  |||||||||||||||    
T  6237914 aaagaggtagagtaagacctagaaaaactagaagataaaccattagaaatgatttagaggtcaatcagttggattc-aaatatagtttatgatagaacac 6237816  T
Q  469 tacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgga 510  Q
    || ||    |||||||| || ||| |||||||||||| ||||    
T  6237815 tatgggatgatttgatctatatagtcgaccccacttaatgga 6237774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 374 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 43573287 - 43573152
Alignment:
Q  374 gaggtagaggaagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactac 471  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||  |||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||  ||     
T  43573287 gaggtagaggaagacctagaaaaactataagaaaaacaactaggaaagatttaa-ggttaatgagttggatccaaa-tatgatttatgatcgaacgttat 43573190  T
Q  472 ggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43573189 ggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 43573152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 354 - 507
Target Start/End: Original strand, 31959625 - 31959779
Alignment:
Q  354 ggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatat 451  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||  ||||| ||| ||||||||  ||| |||| ||||| || |||||| |||| |||| |||||||||||| |||    
T  31959625 ggaggagagtcaggtcaaaagagttaggcgaagacctaggaaaactataagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaa-tat 31959723  T
Q  452 gatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagt 507  Q
    | ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31959724 ggtttatgatagaacactatggcataatttgatccatgtagcagaccccacttagt 31959779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 399 - 509
Target Start/End: Original strand, 9496017 - 9496126
Alignment:
Q  399 taagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgacc 498  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| |||    
T  9496017 taagagaaactattcagaaagatttagaggttaatgagttggatccaaa-tatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccaacc 9496115  T
Q  499 ccacttagtgg 509  Q
    |||||||||||    
T  9496116 ccacttagtgg 9496126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 188 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 9556712 - 9556391
Alignment:
Q  188 gttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataacc-cattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaata 286  Q
    |||||||| |||||||   ||||||||||| |||||| ||| ||  ||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||| || ||||  |||| |||||||    
T  9556712 gttggatgtgtggtaagattagacgggatatgattagaaatgacaacattagagagaaagttggggtaacacttatagtagaaaaa--tggtggaaaata 9556615  T
Q  287 ggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaag 386  Q
    |||||||| ||||| | ||||||||||||||||  |||||| || | ||||||| |||| ||||||||||||| ||||     |  ||||| | ||||||    
T  9556614 ggcttaggtggtttaggcatgtagagagaagacaagtagattctgtagtaagaaaagtatatcagatggaggatagtcaaactactagaggcaaaggaag 9556515  T
Q  387 agctatgaaaac--taagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgat 484  Q
    | ||   |||||  ||||| ||||||||| ||||||| ||  | |||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||| || || | ||||||||    
T  9556514 accttgaaaaactataagataaactattaagaaagatctagtgattaatgagttggat-caagatatggtttatgatagaacattagggtgtaatttgat 9556416  T
Q  485 ccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
     |||||||||||| |||||||||||    
T  9556415 acatgtagccgactccacttagtgg 9556391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 307 - 492
Target Start/End: Original strand, 39029638 - 39029824
Alignment:
Q  307 gtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaa--ctaagaa 404  Q
    |||||||| ||||  ||||||||  | |||||||||||||||||  ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||| |||||   |  ||     
T  39029638 gtagagaggagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaattggaggaaagtcaggtaaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaacattcgag 39029737  T
Q  405 aaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtag 492  Q
    |||| ||||| ||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||||| || ||||  |||||||||||||||    
T  39029738 aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatcc-aaatatggtttttgatagaacattatggcgtcatttgatccatgtag 39029824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 369 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 45543235 - 45543095
Alignment:
Q  369 caaaagaggtagaggaagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaac 466  Q
    ||||||||||||||||||| ||   |||||||  ||| |||||||||| ||||||||| |||| |||| ||| |||||||| |||| |||||||||||||    
T  45543235 caaaagaggtagaggaagacctggaaaaactataagagaaactattagaaaagatttagaggt-aatgagttcgatccaaa-tatggtttatgatagaac 45543138  T
Q  467 actacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    | || |||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45543137 attatggcgtactttgatctatgtagccgaccccacttagtgg 45543095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 342 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 35755439 - 35755267
Alignment:
Q  342 agtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaat----gg 435  Q
    |||| ||||||||||||| ||||   |||||||||| ||||||||  |||  |||||||  | | |||||||||||||||||||| ||||||||    ||    
T  35755439 agtacatcagatggaggaaagtcatatcaaaagagggagaggaaggcctagaaaaactataacagaaactattaggaaagatttagaggttaattaatgg 35755340  T
Q  436 gttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||| |  | || ||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  35755339 gttggatccaaa-tatggtttatgatagaacattgtgccgtaatttgatccatgcagccgaccctacttagtgg 35755267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 321 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 12882251 - 12882067
Alignment:
Q  321 tgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaa 418  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||      | | | || |||||||| |||| ||| |||  ||| |||||| |||||||    
T  12882251 tgtagatgctgtcgttcgaagagtagatcagatggaggagattct-----ataaaagttgaggaagacctataaaagctataagagaaactactaggaaa 12882157  T
Q  419 gatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
     ||||| ||||||||| |||||||||||| |||| ||| |||||||||| |  |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  12882156 tatttagaggttaatgagttggatccaaa-tatggtttgtgatagaacattttggcgtaatttgatccatgtagcctacctcacttagtgg 12882067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 250 - 496
Target Start/End: Original strand, 13149332 - 13149579
Alignment:
Q  250 gggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatc 349  Q
    ||||||||||||||  | |||||| || |||||||||| ||| || ||| ||| |||||||||||||||| |||| ||| | | |   |||||||||||     
T  13149332 gggtagcacctataa-acgaaaagatgatagaaaatagacttcggtggtctggccatgtagagagaagacatgtaaatgatgtagctcgaagagtagata 13149430  T
Q  350 agatggaggagagtcgggtcaaaaga-ggtagaggaagagctatgaaaac--taagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaa 446  Q
    |||||||||| |||| | ||| |||| | ||||||||||  || ||||||  ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| || | |||| |    
T  13149431 agatggaggaaagtcagatcagaagatgttagaggaagacttaggaaaactataagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagtagaatcc-a 13149529  T
Q  447 aatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccga 496  Q
    |||||  || ||||||||||| || | |  |||||||||||| |||||||    
T  13149530 aatatcgttgatgatagaacattatgacataatttgatccatatagccga 13149579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 444 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 39709288 - 39709223
Alignment:
Q  444 caaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39709288 caaaatatggtttatgattgaacactatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 39709223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 190 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 16097332 - 16097192
Alignment:
Q  190 tggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagag----agtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaa 284  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||| |||||| ||| || || ||||| ||||    |||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  16097332 tggatgagtggtaagactagatgggatatgattagaaatgacaccgttagagagagttagagtgggggtagcacctataatag-aaaagttggtagaaaa 16097234  T
Q  285 taggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtaga 326  Q
    |||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16097233 taggcttagatgatttggacatgtagagagaagacctgtaga 16097192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 373 - 497
Target Start/End: Original strand, 26670891 - 26671016
Alignment:
Q  373 agaggtagaggaagagctatgaaaactaagaaa--aactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacacta 470  Q
    ||||||||||||||| |||  |||||||  |||  |||||||| |||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |  |    
T  26670891 agaggtagaggaagacctacaaaaactataaaagaaactattaagaaagatttagagattaatgagttgga-ccaaaatatgatttatgatagaatataa 26670989  T
Q  471 cggcgcaatttgatccatgtagccgac 497  Q
     || | |||||||||||||||||||||    
T  26670990 tggtgtaatttgatccatgtagccgac 26671016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 410 - 509
Target Start/End: Original strand, 30306194 - 30306292
Alignment:
Q  410 attaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||| || |||||| |||| | || |||||||||||| | || ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30306194 attagaaaggatttagaggtcattgagttggatccaaatt-tggtttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 30306292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 419 - 509
Target Start/End: Original strand, 227360 - 227449
Alignment:
Q  419 gatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||||| |||| |||| |||||||||||| | || | ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  227360 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatt-tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 227449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 270 - 364
Target Start/End: Original strand, 3481161 - 3481255
Alignment:
Q  270 aaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtc 364  Q
    |||| |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| || | | ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  3481161 aaagatggtggaaaacaggcttaggtggtttggacatgtagagagaagacctatagattctgtagcaaggagagtagatcagatggaggatagtc 3481255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 431 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 3635422 - 3635345
Alignment:
Q  431 aatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||| |||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3635422 aatgagttggatccaaa-tatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 3635345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 250 - 507
Target Start/End: Original strand, 6218968 - 6219223
Alignment:
Q  250 gggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatc 349  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| | || || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||  | | ||||| ||||  ||||    
T  6218968 gggtagcacttatagtag-aaaagatagtggataataggcttaggtggtttggacatgtagagaggagatatgtagattatgtagtaaggagaggtgatc 6219066  T
Q  350 agatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaac-taagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaa 448  Q
    | |||||||| ||| || |||   |||| |||| |||| ||  ||||   ||| | |||| ||||||||||||||| || ||| || |||||| || |||    
T  6219067 aaatggaggatagtgggatcactggaggcagagaaagaccttagaaactataatataaac-attaggaaagatttagagattagtgagttgga-ccgaaa 6219164  T
Q  449 tatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagt 507  Q
    |||| |||||||||||||| || || | |||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  6219165 tatggtttatgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccaaccccacctagt 6219223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 447 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 12520146 - 12520084
Alignment:
Q  447 aatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12520146 aatatggtttatgataaaacactatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 12520084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 405 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 19337018 - 19336919
Alignment:
Q  405 aaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccactt 504  Q
    ||||||| | |||||||||| || |||||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  19337018 aaactataaagaaagatttagagattaatgagttggatcgaaa-tatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccaatcccactt 19336920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 446 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 9531685 - 9531622
Alignment:
Q  446 aaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||| |||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9531685 aaatatggtttatgatggaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 9531622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 399 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 9996757 - 9996651
Alignment:
Q  399 taagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgacc 498  Q
    ||||| |||| ||||| || |||||| |||| || | |||||||||||| |||| ||||||||  ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  9996757 taagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaacgagttggatccaaa-tatggtttatgattaaacactatggcataatttgatccatgtagccgacc 9996659  T
Q  499 ccacttag 506  Q
    ||||||||    
T  9996658 ccacttag 9996651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 268 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 13241009 - 13240927
Alignment:
Q  268 gaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatca 350  Q
    |||||| |||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| || | ||||| |||||||||||    
T  13241009 gaaaagatggtggaaactaggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacatgtagattctttagtaaggagagtagatca 13240927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 370 - 509
Target Start/End: Original strand, 35643068 - 35643208
Alignment:
Q  370 aaaagaggtagaggaagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaaca 467  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||||||||  ||| |||| ||||| || |||||| |||| |||| |||||||||||| | || | ||||||||||||    
T  35643068 aaaagaggtagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatt-tggtgtatgatagaaca 35643166  T
Q  468 ctacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||| | |   |||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  35643167 ctatgacatcatttaatacatgtagccgaccccacttagtgg 35643208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 245 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 43238379 - 43238306
Alignment:
Q  245 agtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagac 319  Q
    |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||    
T  43238379 agtgggggtagcacctatagtag-aaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtaaagagaagac 43238306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 3720509 - 3720437
Alignment:
Q  436 gttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||||||| |||| ||| |||||||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3720509 gttggatcgaaaa-atggtttatgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 3720437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 400 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 8197671 - 8197563
Alignment:
Q  400 aagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccc 499  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||| |||||||  ||| |||||| |||||||||| | || ||||   |||||||||||||||||||||    
T  8197671 aagagaaactattaagaaagatctaaagattaatgagttggatagaaa-tatgatatatgatagaatattatggcgtcgtttgatccatgtagccgaccc 8197573  T
Q  500 cacttagtgg 509  Q
     |||||||||    
T  8197572 tacttagtgg 8197563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 400 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 8202431 - 8202323
Alignment:
Q  400 aagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccc 499  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||| |||||||  ||| |||||| |||||||||| | || ||||   |||||||||||||||||||||    
T  8202431 aagagaaactattaagaaagatctaaagattaatgagttggatagaaa-tatgatatatgatagaatattatggcgtcgtttgatccatgtagccgaccc 8202333  T
Q  500 cacttagtgg 509  Q
     |||||||||    
T  8202332 tacttagtgg 8202323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 456 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 12475002 - 12474949
Alignment:
Q  456 tatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12475002 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 12474949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 278 - 387
Target Start/End: Original strand, 32443693 - 32443802
Alignment:
Q  278 tagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagagg 377  Q
    ||||||||| |||| || |||||| | |||||||||||| ||||||||||| | | ||| ||||||| ||| |||||||||| |||| | | ||||||||    
T  32443693 tagaaaatatgctttggtggtttgaaaatgtagagagaaaacttgtagatgttgtagtacgaagagtggataagatggaggatagtcagattaaaagagg 32443792  T
Q  378 tagaggaaga 387  Q
    ||| ||||||    
T  32443793 tagtggaaga 32443802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 285 - 358
Target Start/End: Original strand, 43260439 - 43260512
Alignment:
Q  285 taggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggagg 358  Q
    |||||||||| ||||||| |||||  ||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  43260439 taggcttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctatagtaaggagagtagatcagatggagg 43260512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 268 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 44437985 - 44437743
Alignment:
Q  268 gaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcggg 367  Q
    |||||| ||||||||| ||| | |||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||| || |  |||| ||  ||||| ||||||||| ||||| |     
T  44437985 gaaaagatggtagaaactagacataggtggtttcggcatgtagagagaagacttgtggattctgtaataaggagtatagatgagatggaggggagtcaga 44437886  T
Q  368 tcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaactaa--gaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaa 465  Q
    |||  |||||||| || ||| |||  |||||||   || ||||||||| ||| ||| || || | |||| ||||||   |||| ||| ||| ||||||||    
T  44437885 tcactagaggtaggggtagacctagaaaaactatatgagaaactattaagaaggatctagagataaatgagttggaga-aaaacatggtttttgatagaa 44437787  T
Q  466 cactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||| ||||   ||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  44437786 cactatggcgttgtttaattcatgtagccgaccccacttagtgg 44437743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 401 - 507
Target Start/End: Original strand, 11412861 - 11412968
Alignment:
Q  401 agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatag---aacactacggcgcaatttgatccatgtagccgac 497  Q
    |||||||||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||   |||| || || | ||||||||||||||||||||     
T  11412861 agaaaaactattaggaaagatt-agagattaatgagttggatccaaa-tatggtttatgatagtagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccgaa 11412958  T
Q  498 cccacttagt 507  Q
    | ||||||||    
T  11412959 ctcacttagt 11412968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 446 - 509
Target Start/End: Original strand, 33504421 - 33504484
Alignment:
Q  446 aaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||| | |||||||||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33504421 aaatatggtatatgatagaacattatggcgtaatttgatccatctagccgaccccacttagtgg 33504484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 401 - 508
Target Start/End: Original strand, 45077880 - 45077988
Alignment:
Q  401 agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatggg--ttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgacc 498  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || |||||| |  ||||||| ||| |||  ||||||||||||||  | |||  ||||||||||||||| ||||||    
T  45077880 agaaaaactattaagaaagatttagagattaatgagagttggatcgaaa-tatagtttatgatagaacataatggcataatttgatccatgtaaccgacc 45077978  T
Q  499 ccacttagtg 508  Q
    ||||||||||    
T  45077979 ccacttagtg 45077988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 446 - 507
Target Start/End: Original strand, 3481351 - 3481412
Alignment:
Q  446 aaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagt 507  Q
    ||||||| | |||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3481351 aaatatggtctatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagctgaccccacttagt 3481412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 449 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 23915775 - 23915722
Alignment:
Q  449 tatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccac 502  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  23915775 tatggtttatgatagaacactatggcgtaatttgatccatgcagccgaccccac 23915722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 461 - 509
Target Start/End: Original strand, 17670680 - 17670728
Alignment:
Q  461 tagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17670680 tagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 17670728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 457 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 38328444 - 38328392
Alignment:
Q  457 atgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38328444 atgatagaacactatggcttcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 38328392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 281 - 364
Target Start/End: Original strand, 7825391 - 7825474
Alignment:
Q  281 aaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtc 364  Q
    |||||| ||||||  ||||||  |||||||||||||||| ||||||| |||| || || ||||||||| |||||||||| ||||    
T  7825391 aaaataagcttagttggtttgagcatgtagagagaagacatgtagattctatagtcaggagagtagatgagatggaggatagtc 7825474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 338 - 434
Target Start/End: Original strand, 11744611 - 11744709
Alignment:
Q  338 gaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaac--taagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatg 434  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||| |||| |||||||  ||  |||||  ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  11744611 gaagagtagaccagcaggaggagagtcggatcaaaagcggtataggaagacatagaaaaactataaaaaaaactattatgaaaaatttaaaggttaatg 11744709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 309 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 37470356 - 37470155
Alignment:
Q  309 agagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaacta--agaaaa 406  Q
    |||||||||||||||||||  | |  |||| ||||||||| ||||||| |  |||| | |||  || |||||||||||| ||   |||||||  ||| ||    
T  37470356 agagagaagacttgtagattatgtattaaggagagtagattagatggaaggtagtcagatcactagtggtagaggaagacctgaaaaaactataagagaa 37470257  T
Q  407 actattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttag 506  Q
    |||||||||| |||| || || |||||| |||||||| ||| ||||   |||||||||||| || || | | |||||||||||||||  | |||||||||    
T  37470256 actattaggacagatctagagattaatgagttggatcgaaa-tatggcatatgatagaacattatggtgtagtttgatccatgtagctaatcccacttag 37470158  T
Q  507 tgg 509  Q
    |||    
T  37470157 tgg 37470155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 289 - 509
Target Start/End: Original strand, 42543274 - 42543495
Alignment:
Q  289 cttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagag 388  Q
    |||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||| ||| || | || || ||||||||||| ||||||| ||||| | |||  |||||||| || |||     
T  42543274 cttaggtggtttgggcatgtacagagaagacctgtggattctgtagttaggagagtagatcaaatggaggggagtcagatcactagaggtaggggtagac 42543373  T
Q  389 ctatgaaaac--taagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatcc 486  Q
    |||  |||||  ||||| ||||||||||||| ||| || || | |||| ||||||   || |  || ||| ||||||||| ||| ||||   |||||| |    
T  42543374 ctagaaaaactataagagaaactattaggaaggatctagagataaatgagttgga-gaaagacgtgctttttgatagaacgctatggcgttgtttgattc 42543472  T
Q  487 atgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  42543473 atgtagccggccccacttagtgg 42543495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 246
Target Start/End: Original strand, 2610459 - 2610525
Alignment:
Q  181 atgctgcgttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagag 246  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  2610459 atgctgcgttggatgagtggtaagactagacaggacaggattaggaatgacaccattagagagagag 2610525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 358
Target Start/End: Original strand, 11412705 - 11412827
Alignment:
Q  233 cattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctat 332  Q
    ||||||| |||||||  ||||||||||||||| || ||||  |||| |||||||||||||||  |||||| ||| |||||| ||||  ||||||| || |    
T  11412705 cattagagagagagttggggtagcacctatagtag-aaaatatggtggaaaataggcttaggttgtttgggcatttagagataagaactgtagattctgt 11412803  T
Q  333 cgtaagaagagtagatcagatggagg 358  Q
     |||   |||||||||||||||||||    
T  11412804 agta--gagagtagatcagatggagg 11412827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 13592540 - 13592466
Alignment:
Q  290 ttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtc 364  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||| || |||||||  ||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  13592540 ttaggtggtttggacatgtatagagaaaacatgtagatattatagtaagaagagtagatcaaatagaggatagtc 13592466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 447 - 509
Target Start/End: Original strand, 19863432 - 19863494
Alignment:
Q  447 aatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||||| |||||||||||||| || |||   |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19863432 aatatggtttatgatagaacattatggcatgatttgatccatgtagccgtccccacttagtgg 19863494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 447 - 509
Target Start/End: Original strand, 19867764 - 19867826
Alignment:
Q  447 aatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||||| |||||||||||||| || |||   |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19867764 aatatggtttatgatagaacattatggcatgatttgatccatgtagccgtccccacttagtgg 19867826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 447 - 509
Target Start/End: Original strand, 19872665 - 19872727
Alignment:
Q  447 aatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||||| |||||||||||||| || |||   |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19872665 aatatggtttatgatagaacattatggcatgatttgatccatgtagccgtccccacttagtgg 19872727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 310 - 509
Target Start/End: Original strand, 45436902 - 45437102
Alignment:
Q  310 gagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaacta--agaaaaa 407  Q
    |||||||||| |||||||  | |  |||| |||||||||||| | ||||| | || | |||  ||||| ||||||||| |||| |||| ||  ||| ||     
T  45436902 gagagaagacatgtagattttgtattaaggagagtagatcagtttgaggataatcagatcactagaggcagaggaagacctataaaaattataagagaat 45437001  T
Q  408 ctattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagt 507  Q
    |||  |||||||||||| || ||||||  |||||||| ||||||| | | |||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||| ||| |||| |||    
T  45437002 ctagcaggaaagatttagagattaatgcattggatcc-aaatatggtatttgatagaacattacggtgtaatttgatctatgtagccaacctcactcagt 45437100  T
Q  508 gg 509  Q
    ||    
T  45437101 gg 45437102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 460 - 509
Target Start/End: Original strand, 25384680 - 25384729
Alignment:
Q  460 atagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  25384680 atagaacactatggcgtaatttgatccatgtagccaacctcacttagtgg 25384729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 275 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 12026262 - 12026182
Alignment:
Q  275 tggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatgg 355  Q
    |||| |||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||  | |  |||| ||||||||||||||||    
T  12026262 tggtggaaactaggcttaggtggtttgaccatgtagagagaagacctgtagattttgtactaaggagagtagatcagatgg 12026182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 477 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 16521061 - 16521029
Alignment:
Q  477 aatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16521061 aatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 16521029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 478 - 510
Target Start/End: Original strand, 28367352 - 28367384
Alignment:
Q  478 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgga 510  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28367352 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgga 28367384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 304 - 364
Target Start/End: Original strand, 45077809 - 45077869
Alignment:
Q  304 catgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtc 364  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  | | ||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  45077809 catgtagagagaaaacttgtagattttgtagtaaggagagtagatcagatggaggatagtc 45077869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 458 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 887138 - 887087
Alignment:
Q  458 tgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||||||||| || |||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  887138 tgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagctgaccccacttggtgg 887087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 421 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 9394739 - 9394657
Alignment:
Q  421 tttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccactt 504  Q
    |||||||||||||| ||||||||| || |||| ||||| ||||| || || |||  ||||| |||||||||||| |||||||||    
T  9394739 tttaaaggttaatgagttggatccgaa-tatggtttataatagagcattatggcttaattttatccatgtagccaaccccactt 9394657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 281 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 9578954 - 9578911
Alignment:
Q  281 aaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgta 324  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9578954 aaaatagacttaggtggtttggacatgtagagagaagacctgta 9578911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 446 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 13443993 - 13443930
Alignment:
Q  446 aaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||| ||||| |||||||| || ||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  13443993 aaatatggtttattatagaacattatggcgtcatttgatcgatgtagccgaccccatttagtgg 13443930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 13444098 - 13444055
Alignment:
Q  342 agtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaa 385  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  13444098 agtagatcagatggaggagagtcaaatcaaaagaggtagaggaa 13444055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 454 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 42549914 - 42549859
Alignment:
Q  454 tttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||||||||||  | |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  42549914 tttatgatagaacatcatggcgtaatttgattcatgtagccaaccccacttagtgg 42549859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 241 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 4598852 - 4598771
Alignment:
Q  241 agagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgt 323  Q
    |||||||  ||||||||||||||| || ||| | ||||||||| ||| ||| || ||||||||||| |||| |||||||||||    
T  4598852 agagagttggggtagcacctatagtagtaaa-gatggtagaaactagactttggtggtttggacatatagaaagaagacttgt 4598771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 399 - 501
Target Start/End: Original strand, 21834705 - 21834806
Alignment:
Q  399 taagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgacc 498  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||| | |||| || |||||||||||||| || | |  | |||| ||||||||| |||||    
T  21834705 taagataaactattaggaaatatttatagattaatgagttggat-ctaaatttggtttatgatagaacaatatgacatattttggtccatgtagtcgacc 21834803  T
Q  499 cca 501  Q
    |||    
T  21834804 cca 21834806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 405 - 511
Target Start/End: Original strand, 31254445 - 31254550
Alignment:
Q  405 aaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccactt 504  Q
    ||||||||| ||||||| || || |||||| |||| ||  ||| |||||||||||| |||||| || ||| || |||| | ||||||| |||||| ||||    
T  31254445 aaactattaagaaagatctagagattaatgagttgaatagaaa-tatgatttatgacagaacattatggcacagtttggtacatgtagtcgacccaactt 31254543  T
Q  505 agtggat 511  Q
    |||||||    
T  31254544 agtggat 31254550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 268 - 358
Target Start/End: Original strand, 42092535 - 42092625
Alignment:
Q  268 gaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggagg 358  Q
    |||||| ||||||||| || | ||||| | | ||| |||||||||||||| |||||||||  | | ||||| ||||||||| |||||||||    
T  42092535 gaaaagatggtagaaactaagattaggtgatctgggcatgtagagagaaggcttgtagattttgtagtaaggagagtagattagatggagg 42092625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 252 - 354
Target Start/End: Original strand, 44411715 - 44411816
Alignment:
Q  252 gtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcag 351  Q
    ||||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||  | ||||| |||||||  ||||||||||||||| || |   ||||  ||||||||||||    
T  44411715 gtagcacctatagtaggaaa-gatggtggaaaataggcttccgtggttttgacatgtttagagaagacttgtagctgttgcagtaaagagagtagatcag 44411813  T
Q  352 atg 354  Q
    |||    
T  44411814 atg 44411816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 448 - 509
Target Start/End: Original strand, 34931631 - 34931692
Alignment:
Q  448 atatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||  |||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  34931631 atatggtttatgatagaacattatggcataatttgatccatatagccgaccgtacttagtgg 34931692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 268 - 325
Target Start/End: Original strand, 41858749 - 41858806
Alignment:
Q  268 gaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtag 325  Q
    |||||| |||| |||| | |||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41858749 gaaaagatggtggaaactgggcttagatggtttggacatgtagagagaagacatgtag 41858806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 290 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 9647851 - 9647783
Alignment:
Q  290 ttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggagg 358  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||| || | |||  |||||||| |||||||||||    
T  9647851 ttaggtggtttggacatgtaaaaagaagacctgtagattctctagtattaagagtaggtcagatggagg 9647783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 449 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 10516831 - 10516771
Alignment:
Q  449 tatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||||||||||||| || | || |||| ||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  10516831 tatgatttatgataaaatattatggcgtaatttgatccatgtagctgatctcacttagtgg 10516771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 268 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 14197427 - 14197367
Alignment:
Q  268 gaaaagttggtagaaaataggctt-aggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagat 327  Q
    |||||| |||| |||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  14197427 gaaaagatggtggaaactaggctttaggtggtttgggcatgtagagtgaagacttgtagat 14197367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 478 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 15775898 - 15775866
Alignment:
Q  478 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgga 510  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15775898 atttggtccatgtagccgaccccacttagtgga 15775866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 456 - 508
Target Start/End: Original strand, 17429257 - 17429309
Alignment:
Q  456 tatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtg 508  Q
    |||||||||||| || | |  |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17429257 tatgatagaacattatgacataatttgattcatgtagccgaccccacttagtg 17429309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 479 - 507
Target Start/End: Original strand, 19225011 - 19225039
Alignment:
Q  479 tttgatccatgtagccgaccccacttagt 507  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19225011 tttgatccatgtagccgaccccacttagt 19225039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 400 - 508
Target Start/End: Original strand, 30743681 - 30743788
Alignment:
Q  400 aagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccc 499  Q
    ||||||||| ||||| || |||||| |||| |||| |||| ||||||| |||||||||| |||||||| || | |  |||||||||| || || ||| |     
T  30743681 aagaaaaaccattagaaatgatttagaggtcaatgagttgaatccaaa-tatgatttataatagaacaatatgtcataatttgatccttgcagtcgaact 30743779  T
Q  500 cacttagtg 508  Q
    |||||||||    
T  30743780 cacttagtg 30743788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 477 - 509
Target Start/End: Original strand, 32443864 - 32443896
Alignment:
Q  477 aatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32443864 aatttgatccatgtagccgactccacttagtgg 32443896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 429 - 509
Target Start/End: Original strand, 36366817 - 36366896
Alignment:
Q  429 ttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||||| |||||| || ||||||| ||||| |||||||| || || | ||||||||||||||| || |||||| |||||||    
T  36366817 ttaatgagttgga-ccgaaatatggtttataatagaacattatggtgtaatttgatccatgtatccaaccccatttagtgg 36366896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 478 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 39592442 - 39592414
Alignment:
Q  478 atttgatccatgtagccgaccccacttag 506  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39592442 atttgatccatgtagccgaccccacttag 39592414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 477 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 45483039 - 45483007
Alignment:
Q  477 aatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45483039 aatttgatctatgtagccgaccccacttagtgg 45483007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 142; Significance: 3e-74; HSPs: 56)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 188 - 509
Target Start/End: Original strand, 30031194 - 30031516
Alignment:
Q  188 gttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaata 286  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||  | |||||||| || ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  30031194 gttggatgagtggtaagactagacgggataggattagaaatgtcaccattagagagggagtgggggtagcacctatagtag-aaaagttggtagaaaata 30031292  T
Q  287 ggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaag 386  Q
    |||||||  |  |||||||||||||||||||||   |||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  30031293 ggcttagatgagttggacatgtagagagaagacccatagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagagggag 30031392  T
Q  387 agctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgat 484  Q
    | ||| ||||||||  ||| |||| ||||| || |||||| |||| |||| |||||||   ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  30031393 acctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggat-ttaaatatggtttatgatagaacactatggcgtaatttgat 30031491  T
Q  485 ccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||||||||||||| ||||||||||    
T  30031492 ccatgtagccgacctcacttagtgg 30031516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 185 - 509
Target Start/End: Original strand, 28085311 - 28085636
Alignment:
Q  185 tgcgttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaa 283  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||| |||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  28085311 tgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattacgaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtag-aaaagttggtagaaa 28085409  T
Q  284 ataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagagg 383  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||  ||| ||    | ||||||||||||||||| |||||| ||||||  || ||||||||||||||    
T  28085410 ataggcttagatggtttggccatgtagagagaagacccgtaaataaagtggtaagaagagtagatcaaatggagtagagtcaagttaaaagaggtagagg 28085509  T
Q  384 aagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaattt 481  Q
    |||| ||| ||||||||  ||| |||| ||||| || |||||| |||| |||| ||||||||| |||| || | ||||||||||||||| || |  ||||    
T  28085510 aagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatcc-aaatttggtgtatgatagaacactatggtgtcattt 28085608  T
Q  482 gatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28085609 gatccatgtagccgaccccacttagtgg 28085636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 185 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 9594059 - 9593732
Alignment:
Q  185 tgcgttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgag------ggtagcacctatagcaggaaaagttgg 277  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| | |      |||||||||  ||| || ||||| |||    
T  9594059 tgcgttggatgagtggtaagactagacgggataggattaggaatgacaccattagagagagagagggagttggggtagcaccattagtag-aaaagatgg 9593961  T
Q  278 tagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagagg 377  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||   ||  ||||||    
T  9593960 tagaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacatgtagatgctgtagtaagaagagtagatcagatggaggagagtcaaatc--aagagg 9593863  T
Q  378 tagaggaagagctatgaaaa--ctaagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcg 475  Q
    |||||||||| |||  ||||   ||||| |||||||||||||||| ||| || |||||| |||||||||  |||||| |||||||||||||| || |  |    
T  9593862 tagaggaagacctagaaaaattataagagaaactattaggaaagacttagagattaatgagttggatcc-caatatggtttatgatagaacattatg--g 9593766  T
Q  476 caatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
     |||||||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  9593765 taatttgatccatatagctgaccacacttagtgg 9593732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 188 - 509
Target Start/End: Original strand, 32755857 - 32756181
Alignment:
Q  188 gttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagag--tgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaa 284  Q
    ||||||||||||||||  ||||||  ||||  ||||||||| || |||||||| ||||||  || ||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  32755857 gttggatgagtggtaagactagacatgataatattaggaatgacaccattagagagagagagtgggggtagcacctatagtag-aaaagttggtagaaaa 32755955  T
Q  285 taggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagagga 384  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||  | |||||   |  |||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||| |    
T  32755956 taggcttagatggtttggtcatgtagagggaagacccgaagatgtcgtaataagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagagaa 32756055  T
Q  385 agagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttg 482  Q
    ||| ||| ||||||||  ||| |||| ||||| ||||||||| |||| |||| ||||||||| |||| || | ||||||||||||||| ||||  |||||    
T  32756056 agacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatcc-aaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttg 32756154  T
Q  483 atccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||    
T  32756155 atccatgtagccgatcccacttagtgg 32756181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 187 - 509
Target Start/End: Original strand, 608096 - 608421
Alignment:
Q  187 cgttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaat 285  Q
    |||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  608096 cgttggatgagtggtaagactagataggataggattaggaatgacaccattaga--gagagtgagggtatcacctatagtag-aaaagttgatagaaaat 608192  T
Q  286 aggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaa 385  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | ||||||||||| ||||| ||||||||||||| | | ||||||||| || |||    
T  608193 aggcttagatggtttggacatgtagagagaagacctgtagatgcctttgtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcagattaaaagaggttgatgaa 608292  T
Q  386 gagc----tatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaat 479  Q
    || |    || ||||||||   || |||| ||||| ||||||||| || | |||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||| | ||  ||    
T  608293 gacctaattaagaaaactattcgagaaaccattagaaaagatttagagttcaatgagttggatcc-aaatatggtttttgatagaatactatgacgtcat 608391  T
Q  480 ttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  608392 ttgatccatgtagccgaccctacttagtgg 608421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 185 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 20427983 - 20427659
Alignment:
Q  185 tgcgttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaa 283  Q
    |||| |||||||||||||   | |||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  20427983 tgcgctggatgagtggtaggacaagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtag-aaaagttggtagaaa 20427885  T
Q  284 ataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagagg 383  Q
    ||||||||||  |||||| || |||| |||||||||  ||||||||  | |||||||||||| |||| || |||| ||||| ||| | ||||||| ||||    
T  20427884 ataggcttagatggtttgaacgtgtatagagaagacccgtagatgccgttgtaagaagagtaaatcaaatagaggggagtcaggttacaagaggttgagg 20427785  T
Q  384 aagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaattt 481  Q
    |||| ||| ||||||||  ||| |||| |||| |||| ||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| ||| | |||||| |||| ||||  ||||    
T  20427784 aagacctaagaaaactattagagaaaccatta-gaaaaatttagaggttaatgagttggatcc-aaatatggtttttaatagaatactatggcgacattt 20427687  T
Q  482 gatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
     ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  20427686 aatcaatgtagccgacccgacttagtgg 20427659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 185 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 5258497 - 5258170
Alignment:
Q  185 tgcgttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccatt--agaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtaga 281  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||| |||| || || ||  ||| |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  5258497 tgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattatgaatgacaccgttagagagagagagtgggggtagcacctatagta-gaaaagttggtaga 5258399  T
Q  282 aaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtaga 381  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||| |  | ||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||    
T  5258398 aaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagattccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcatgttaaaagaggtaga 5258299  T
Q  382 ggaagagctatgaaaac--taagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaat 479  Q
    | |||| ||| ||||||  |  || |||  |||||  |||||||| |||| |||| | | ||||| ||||||| ||| ||||  ||||||| ||||  ||    
T  5258298 gaaagacctaagaaaaccattcgagaaatcattagacaagatttagaggtcaatgagctagatcc-aaatatggtttttgattaaacactatggcgtcat 5258200  T
Q  480 ttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5258199 ttgatccacgtagccgaccccacttagtgg 5258170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 232 - 509
Target Start/End: Original strand, 12890567 - 12890835
Alignment:
Q  232 ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgcta 331  Q
    |||||||  |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||   |         |||||||      
T  12890567 ccattagggagagagtgggggtagcacctatagtag-aaaagttggtagaaaataggcttacatggtttgggcatgtaccca---------tagatgccg 12890656  T
Q  332 tcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggt 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||  ||| |||| ||||| || |||||| | ||    
T  12890657 tcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtaaggtcaaaagaggtagatgaagacctaggaaaactataagagaaaccattagaaaggatttagacgt 12890756  T
Q  430 taatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
     |||| ||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12890757 caatgagttagatccaaa-tatggtttatgatagaacactatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 12890835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 214 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 21352153 - 21351860
Alignment:
Q  214 gataggattaggaataacc-cattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagag 312  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||  |||||||  |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  21352153 gataggattaggaataacatcgttaga--gagagtggaggtagcacctatagtagaaaaa-ttggtagaaaataggcttagatgatttggacatgtagag 21352057  T
Q  313 agaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaacta--agaaaaacta 410  Q
    ||||||| ||| ||||| || || |||||| |||| || |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| ||| |||||| |  ||| |||| |    
T  21352056 agaagacctgtcgatgccattgttagaagaatagaacaaatggagaagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccaatagagaaacca 21351957  T
Q  411 ttaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtg 508  Q
    |||| ||||||||| |||| |||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||  | ||||||||||||||||||| || ||||||    
T  21351956 ttagaaaagatttagaggtcaatgagctggatcc-aaatatgatttttgatagaacactatgacgttaattgatccatgtagccgacctcagttagtg 21351860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 185 - 509
Target Start/End: Original strand, 14030741 - 14031055
Alignment:
Q  185 tgcgttggatgagtggtaaag-ctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaa 282  Q
    |||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| || |||||||| ||| |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||     
T  14030741 tgcgatggatgagtggttaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagatagtgggggtagcacctatagtag-aaaagttggtagat 14030839  T
Q  283 aataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagag 382  Q
    ||||||||||   |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  | ||||||||||||||||| || | |||||||||| | |||||||||||||    
T  14030840 aataggcttaaatggtttggacatgtatagagaagacatgtaaatgccgttgtaagaagagtagatcaaatagtggagagtcggattaaaagaggtagag 14030939  T
Q  383 gaagagctatgaaaactaagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttg 482  Q
    ||||         | ||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||   ||  |||||    
T  14030940 gaag---------acctaagaaaaac-attagaaaagatttagaggtcaatgggttagatcc-aaatatgatttttgatagaatactataacgtcatttg 14031028  T
Q  483 atccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||||| || ||||||| | |||||||    
T  14031029 atccatataaccgaccctatttagtgg 14031055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 190 - 509
Target Start/End: Original strand, 9706716 - 9707030
Alignment:
Q  190 tggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaatagg 288  Q
    ||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||  |||||||||||| | || ||||||||||||||||||||    
T  9706716 tggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtggaggtagcacctattgtag-aaaagttggtagaaaatagg 9706814  T
Q  289 cttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagag 388  Q
    |||||  ||||||      ||||||||||||   |||| ||  | || |||||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||  ||||| |    
T  9706815 cttagatggtttg------tagagagaagacccatagaagccgttgttagaagagtagatcaaatggagaagagtcaggttaaaagaggtacgggaaggg 9706908  T
Q  389 ctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatcc 486  Q
    ||| | |||| |  ||| ||||  ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||   |||||||||    
T  9706909 ctaagtaaaccattagataaaccgttaggaaggatttagaggttaatgagttggatccaaa-tatggtttttgatagaacactatggcatcatttgatcc 9707007  T
Q  487 atgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  9707008 atgtagccgaccccacttagtgg 9707030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 188 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 28027169 - 28026856
Alignment:
Q  188 gttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataacc-cattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaata 286  Q
    ||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||| ||  | ||||| ||||| || ||||||||||||||| || ||| || |||||||||||    
T  28027169 gttggatgagtggtaagactagatggcataggattaggaatgacgtcgttagatagagaatg-gggtagcacctatagtagaaaatgt-ggtagaaaata 28027072  T
Q  287 ggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaag 386  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| || || |||||||||  | ||| |||||||| |||||||||||||||||| | | | |||||||||||||||    
T  28027071 ggctt-ggtggtttggacatgtagagataacacctgtagatgcggtagtacgaagagtatatcagatggaggagagtcagattagaagaggtagaggaag 28026973  T
Q  387 agctatgaaaac--taagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgat 484  Q
    | |||  |||||  |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||  ||| || | ||||||| ||||||||  |||| ||||||| |||||||     
T  28026972 acctaaaaaaactataagaaaaaccattatgaaagatttacaggttaatgatttgtattc-aaatatggtttatgat--aacattacggcgtaatttga- 28026877  T
Q  485 ccatgtagccgaccccactta 505  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  28026876 caatgtagccgaccccactta 28026856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 188 - 491
Target Start/End: Original strand, 5631756 - 5632064
Alignment:
Q  188 gttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccatt----agaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaa 282  Q
    ||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||| || |||||    ||| |||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||    
T  5631756 gttggatgagtggtaagactagaccggatatgattaggaatgacaccattagagagagagagagtgggggtaacacctatagta-gaaaagttggtagaa 5631854  T
Q  283 aataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagag 382  Q
    |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | | |||||||  | ||    
T  5631855 aatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccttcgtaagaatagtagatcaaatggaggagagtcagattaaaagagacaaag 5631954  T
Q  383 gaagagctatgaaaac--taagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatt 480  Q
    |||||  || ||||||  |  || |||| ||||| ||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||| | ||  |||    
T  5631955 gaagacttaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatcc-aaatatggtttttgatataacactatgacgtcatt 5632053  T
Q  481 tgatccatgta 491  Q
    |||||||||||    
T  5632054 tgatccatgta 5632064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 185 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 35043788 - 35043467
Alignment:
Q  185 tgcgttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaa 283  Q
    |||| ||||||| ||||||   |||||  |||||||||| |||| || ||||||||  |||||||||||||| ||||| || || |||||||||| ||||    
T  35043788 tgcgctggatgattggtaagattagacatgataggattatgaatgacaccattagagggagagtgagggtagtacctaaagtag-aaaagttggttgaaa 35043690  T
Q  284 ataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagagg 383  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||| ||  ||||||||  | ||||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||| ||||| |    
T  35043689 ataggcttagattgtttggacatgtagagagaatacccgtagatgccgttgtaagaaaagtagatcaaatggacgagagtcaggttaaaagaagtagatg 35043590  T
Q  384 aagagctatgaaaac--taagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaattt 481  Q
    |||| ||| ||||||  | ||| |||| ||||| || |||||| |||| |||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| | ||  ||||    
T  35043589 aagacctaagaaaaccattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgtgttggatcc-aaatatggtttttgatagaacactatgacgtcattt 35043491  T
Q  482 gatccatgtagccgaccccactta 505  Q
    |||| ||||||| || ||||||||    
T  35043490 gatcaatgtagctgatcccactta 35043467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 185 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 10100204 - 10099991
Alignment:
Q  185 tgcgttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaa 283  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||   ||| |||||| ||| || ||||||||  ||||||| |||| |||| ||||| || |||||||||||||||    
T  10100204 tgcgttagatgagtggtaagactagacaatatatgattagaaatgacaccattaga--gagagtgggggtcgcacatatagtag-aaaagttggtagaaa 10100108  T
Q  284 ataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagagg 383  Q
    ||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||| ||| ||||||||| | | ||||||||||||||    
T  10100107 ataagcttagatggtttggacatgtagagagaagactcgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatgaaggagagtcagtttaaaagaggtagagg 10100008  T
Q  384 aagagctatgaaaacta 400  Q
    |||| ||| ||||||||    
T  10100007 aagacctaggaaaacta 10099991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 343 - 509
Target Start/End: Original strand, 5095927 - 5096094
Alignment:
Q  343 gtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttgg 440  Q
    |||||||||||||| ||||||  | ||| |||||||||||||||| |||  |||||||  ||| ||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  5095927 gtagatcagatggaagagagttagatcagaagaggtagaggaagacctagaaaaactagaagagaaactcttaggaaagatttagtggttaatgagttgg 5096026  T
Q  441 atccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||| || |||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  5096027 atc-aaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatctatgtagccgatcccacttagtgg 5096094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 251 - 488
Target Start/End: Original strand, 33496963 - 33497198
Alignment:
Q  251 ggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaa-taggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatc 349  Q
    |||||||||||| | || ||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||| | ||| |||||||||||| |||||    
T  33496963 ggtagcacctatggtag-aaaagttagtagaaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagac-cgtaaacgctgtcgtaagaagagaagatc 33497060  T
Q  350 agatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaa 447  Q
    | ||| ||  |||||  || |||||||||||||| ||| |||  |||||||  ||| ||||  |||| || ||||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  33497061 aaatgaag--gagtcaagttaaaagaggtagagggagatctagaaaaactattagagaaacctttagaaaggatttaaaggtcaatgagttggatcc-aa 33497157  T
Q  448 atatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccat 488  Q
    ||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||    
T  33497158 atatgatttatgatataacactatagcgtaatttgatccat 33497198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 185 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 6056117 - 6055806
Alignment:
Q  185 tgcgttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaa 283  Q
    |||||||||||||||||||  |||||  ||||  ||||| |||| || ||||||||  ||||||  ||||| ||||||||| || ||||  |  ||| ||    
T  6056117 tgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattaga--gagagttggggtaacacctatagtagaaaaaaattataggaa 6056020  T
Q  284 ataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagagg 383  Q
    ||||| ||  | ||||||  ||||||||||||||| ||||||||| | | ||   || ||||||||||||||| |||||||   | |||| |||||||||    
T  6056019 ataggttttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtgcaaatagtagatcagatggaagagagtcaaataaaaaaaggtagagg 6055920  T
Q  384 aagagctatgaaaac--taagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaattt 481  Q
    |||| |||| |||||  ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||  | ||| |||||||| |||| || |||||    
T  6055919 aagacctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatcc-aaatatagtgtataatagaacattacgacgtaattt 6055821  T
Q  482 gatccatgtagccga 496  Q
    ||| |||||||||||    
T  6055820 gatgcatgtagccga 6055806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 275 - 497
Target Start/End: Original strand, 24665835 - 24666059
Alignment:
Q  275 tggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtaga-tgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaa 373  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |  | | ||||| ||||||||||||||| || | |||||| |||  |    
T  24665835 tggtagaaaataggcttaggtggtttggacatgtagagagaagacctgtagatttttgtagtaaggagagtagatcagatgaagcatagtcggatcacca 24665934  T
Q  374 gaggtagaggaagagctatgaaaact--aagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactac 471  Q
    |||| ||||||||   ||  | ||||  |||| ||||||||| |||| ||||| |||| |||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||| ||     
T  24665935 gaggcagaggaagtcatagaataactacaagagaaactattaagaaatatttagaggtcaatgagttggat-cgaaatatggtttatgatagaacattat 24666033  T
Q  472 ggcgcaatttgatccatgtagccgac 497  Q
    | |  |||||||||  ||||||||||    
T  24666034 gacttaatttgatctgtgtagccgac 24666059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 268 - 381
Target Start/End: Original strand, 2689658 - 2689771
Alignment:
Q  268 gaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcggg 367  Q
    |||||||| |||||||||||||||||  | ||||  |||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||| ||| ||||||  |    
T  2689658 gaaaagtttgtagaaaataggcttagatgatttgagcatgtagagagaagacatgtagatgccgtcataagaagagtagatcagatagagtagagtcatg 2689757  T
Q  368 tcaaaagaggtaga 381  Q
    ||||||||||||||    
T  2689758 tcaaaagaggtaga 2689771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 275 - 467
Target Start/End: Original strand, 26291806 - 26291995
Alignment:
Q  275 tggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaag 374  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||| |||||| |   |||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||    
T  26291806 tggtagaaaatagacttaggtggtttg--catgtagagagaagacttatagatgttgcagtaagatgagtagatcagatggaggagagtgtgatcaaaag 26291903  T
Q  375 aggtagaggaagagctatgaaaactaagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaaca 467  Q
    | |||||||||||   |  ||||||| || ||| ||||| |||||||||| || || ||| |||| ||  |||||||| ||||||||| ||||    
T  26291904 acgtagaggaagactaaaaaaaactatgagaaattattatgaaagatttagagattcatgagttgaat-aaaaatatggtttatgatataaca 26291995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 373 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 34664 - 34527
Alignment:
Q  373 agaggtagaggaagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacacta 470  Q
    ||||| ||||||||| |||  |||||||  ||| |||| |||| ||||||| ||||| |||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||| ||    
T  34664 agaggcagaggaagacctagaaaaactataagagaaaccattaagaaagatctaaagattaatgagttggattgaaa-tatggtttatgatagaacatta 34566  T
Q  471 cggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
     |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34565 tggcgtaatttgatccatgtagctgaccccacttagtgg 34527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 399 - 506
Target Start/End: Original strand, 31818682 - 31818788
Alignment:
Q  399 taagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgacc 498  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||  || |||||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||| || | || ||||||||||||||||||||||    
T  31818682 taagagaaactattaggaaaggtttggagattaatgagttggatc-aaagtatggtttatgatagaacattatgtcgtaatttgatccatgtagccgacc 31818780  T
Q  499 ccacttag 506  Q
    ||||||||    
T  31818781 ccacttag 31818788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 411 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 3206578 - 3206481
Alignment:
Q  411 ttaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||| ||||||||| |||| |||| |||||||||||| |||| ||| | ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3206578 ttagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaa-tatggtttttaatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 3206481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 340 - 509
Target Start/End: Original strand, 8364646 - 8364816
Alignment:
Q  340 agagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggt 437  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| | |||  ||||| ||| ||||| |||  |||||||  ||| ||||||||| |||||||||| |  |||||  ||    
T  8364646 agagtagatcagatggaggattgtcagatcactagaggaagatgaagacctaaaaaaactataagagaaactattaagaaagatttagaaattaataagt 8364745  T
Q  438 tggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||| |  ||| ||| |||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8364746 tgga-ctgaaacatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccgcttagtgg 8364816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 268 - 387
Target Start/End: Original strand, 30679424 - 30679543
Alignment:
Q  268 gaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcggg 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||| ||||  |||||||   ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||  |    
T  30679424 gaaaagttggtagaaaataggcttagatgatttgggcatgtagagaggagacccgtagatgtcgtcgtaagaatagtagatcaaatggagtagagtcaag 30679523  T
Q  368 tcaaaagaggtagaggaaga 387  Q
    | | |||||||| |||||||    
T  30679524 ttataagaggtataggaaga 30679543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 373 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 34143924 - 34143791
Alignment:
Q  373 agaggtagaggaagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacacta 470  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||  ||| |||| ||||  || |||||| |||| |||| |||||||||||| | || | |||||||||||||||    
T  34143924 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattacaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatt-tggtgtatgatagaacacta 34143826  T
Q  471 cggcgcaatttgatccatgtagccgaccccactta 505  Q
     ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34143825 tggcgtcatttgatccatgtagtcgaccccactta 34143791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 373 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 34156540 - 34156407
Alignment:
Q  373 agaggtagaggaagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacacta 470  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||  ||| |||| ||||  || |||||| |||| |||| |||||||||||| | || | |||||||||||||||    
T  34156540 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattacaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatt-tggtgtatgatagaacacta 34156442  T
Q  471 cggcgcaatttgatccatgtagccgaccccactta 505  Q
     ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34156441 tggcgtcatttgatccatgtagtcgaccccactta 34156407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 322 - 492
Target Start/End: Original strand, 5080912 - 5081083
Alignment:
Q  322 gtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaag 419  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||  || ||||||| |||| ||||| ||| ||||||||  ||| |||  |||   ||      
T  5080912 gtagatgctgtcgtaagaagagtaaatcaaatggaggagagtctcgttaaaagagatagatgaagacctaggaaaactattagagaaatcattcaaaatt 5081011  T
Q  420 atttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtag 492  Q
    ||||| |||| |||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||   ||  |||||||||||||||    
T  5081012 atttagaggtcaatgagttggatac-aaatatgatttatgatagaacactataacgtcatttgatccatgtag 5081083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 299 - 400
Target Start/End: Original strand, 7133795 - 7133896
Alignment:
Q  299 ttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaac 398  Q
    |||| ||||||||||||||||  | ||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||| |||  |||||    
T  7133795 ttgggcatgtagagagaagacccgaagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctagaaaaac 7133894  T
Q  399 ta 400  Q
    ||    
T  7133895 ta 7133896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 299 - 400
Target Start/End: Original strand, 7136718 - 7136819
Alignment:
Q  299 ttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaac 398  Q
    |||| ||||||||||||||||  | ||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||| |||  |||||    
T  7136718 ttgggcatgtagagagaagacccgaagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctagaaaaac 7136817  T
Q  399 ta 400  Q
    ||    
T  7136818 ta 7136819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 421 - 509
Target Start/End: Original strand, 31819004 - 31819091
Alignment:
Q  421 tttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||| |||| |||| |||||||||||| | || | ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31819004 tttagaggtcaatgagttggatccaaatt-tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 31819091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 181 - 319
Target Start/End: Original strand, 33083989 - 33084127
Alignment:
Q  181 atgctgcgttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataaccc-attagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggta 279  Q
    ||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||| ||||| ||| ||   |||||| |||||||  ||||||||||||| | || ||||| |||||    
T  33083989 atgctgcgttggatgtgtggtaagactagatgggatagaattagaaatgacgatattagagagagagttggggtagcacctatggtag-aaaagatggta 33084087  T
Q  280 gaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagac 319  Q
    |||| ||| |||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  33084088 gaaactagacttaggtggtttgggaatgtagagagaagac 33084127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 419 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 34934941 - 34934852
Alignment:
Q  419 gatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||||| |||| |||| |||||||||||| | || | ||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34934941 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatt-tggtgtatgatagaacactatggcctcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 34934852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 304 - 509
Target Start/End: Original strand, 579472 - 579678
Alignment:
Q  304 catgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaac--taa 401  Q
    |||||||||||||| |||||||||  ||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||| | |||  ||||| |||| |||| ||   |||||  |||    
T  579472 catgtagagagaaggcttgtagattatatagtaaggagagttgatcagatggaggatagtctgatcactagaggcagagaaagacctcaaaaaactgtaa 579571  T
Q  402 gaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgacccca 501  Q
    || ||||||||| ||||||| || |  ||| ||  ||| || ||||||||| ||| |||  ||| | || |||| ||||||||| |||||||||| ||||    
T  579572 gagaaactattaagaaagatatagaaattagtgacttgaat-caaaatatggtttctgaaggaaaattatggcgtaatttgatctatgtagccgatccca 579670  T
Q  502 cttagtgg 509  Q
    ||||||||    
T  579671 cttagtgg 579678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 406 - 509
Target Start/End: Original strand, 5897615 - 5897717
Alignment:
Q  406 aactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccactta 505  Q
    ||||||||| ||||||||| |  |||||| |||||||| |||||||| | |||| ||||| | || | || ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  5897615 aactattagaaaagatttagatattaatgtgttggatc-aaaatatggtatatggtagaatattatgacgtaatttgatccatgtagcggatcccactta 5897713  T
Q  506 gtgg 509  Q
    ||||    
T  5897714 gtgg 5897717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 250 - 358
Target Start/End: Original strand, 2079341 - 2079448
Alignment:
Q  250 gggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatc 349  Q
    |||||||| |||||| || ||||| |||| ||||||||||||| | ||||| |  |||||||||||||| ||||||||  | | ||||| |||||| ||     
T  2079341 gggtagcatctatagtag-aaaagatggtggaaaataggcttaagtggtttaggtatgtagagagaagatttgtagattatgtagtaaggagagtaaatt 2079439  T
Q  350 agatggagg 358  Q
    |||||||||    
T  2079440 agatggagg 2079448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 454 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 7337272 - 7337220
Alignment:
Q  454 tttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttag 506  Q
    |||||||||||| | || |||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7337272 tttatgatagaatattatggcgtaatttggtccatgtagccgaccccacttag 7337220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 280 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 25494102 - 25494018
Alignment:
Q  280 gaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtc 364  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||| |||| |||| | |||||||||| || ||||| ||||    
T  25494102 gaaaataagtttaggtggtttggacatgtatagagaaaacatgtagattctatagtaaaacgagtagatcaaatagaggatagtc 25494018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 445 - 509
Target Start/End: Original strand, 32068616 - 32068680
Alignment:
Q  445 aaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||||| ||||||| ||| |||| || |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  32068616 aaaatacgatttataatataacattatggcgtaatttgatacatgtagccgatcccacttagtgg 32068680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 449 - 509
Target Start/End: Original strand, 32080669 - 32080729
Alignment:
Q  449 tatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||||||||||||| |||| || |||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||    
T  32080669 tatgatttatgatataacattatggcgtaatttgatacatgtagtcgatcccacttagtgg 32080729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 445 - 509
Target Start/End: Original strand, 32097933 - 32097997
Alignment:
Q  445 aaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||||||||||||||||| |||| || |||| || ||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  32097933 aaaatatgatttatgatataacattatggcgtaaattgatacatgtagccgattccacttagtgg 32097997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 398 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 655526 - 655416
Alignment:
Q  398 ctaagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgac 497  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||  || ||||||  ||||| || ||||||| ||||||| |||||| |  || ||||||||||||||||||  |||    
T  655526 ctaagagaaactattaggaaaactttcgagattaatgaattgga-ccgaaatatggtttatgacagaacattgtggtgcaatttgatccatgtaggtgac 655428  T
Q  498 cccacttagtgg 509  Q
    | ||||||||||    
T  655427 ctcacttagtgg 655416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 446 - 509
Target Start/End: Original strand, 2079478 - 2079541
Alignment:
Q  446 aaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||||||||||||||| || ||  ||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||||    
T  2079478 aaatatgatttatgatagagcattatagcgtaatttaatccatgtagccgactcgacttagtgg 2079541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 410 - 509
Target Start/End: Original strand, 7492551 - 7492649
Alignment:
Q  410 attaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||  |||| ||||||| |||  ||||||||| ||  |||  |||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  7492551 attaggaaagatttagaggttaatgagttttatcc-aaatatggtttcggatagaacattatagcgttatttgtaccaagtagccgaccccacttagtgg 7492649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 446 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 7513075 - 7513012
Alignment:
Q  446 aaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||| |||||||||||||| || | || ||||||||| ||||||  |||||||||||||||    
T  7513075 aaatatggtttatgatagaacattatgacgtaatttgatctatgtagttgaccccacttagtgg 7513012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 429 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 12134003 - 12133925
Alignment:
Q  429 ttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtg 508  Q
    |||||| |||||||| ||| | ||||| || |||||||| || |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12134003 ttaatgagttggatcgaaa-tgtgattcataatagaacattatggcataatctgatccatgtagccgaccccacttagtg 12133925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 289 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 14389411 - 14389336
Alignment:
Q  289 cttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtc 364  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||   | | ||||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  14389411 cttaggtggtttggacatgtagagagaagacctatagactttgtagtaaggagaatagatcagatggaggatagtc 14389336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 452 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 18130893 - 18130843
Alignment:
Q  452 gatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccac 502  Q
    ||||||| |||||||| || || | ||||||||||||||||||||||||||    
T  18130893 gatttattatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccgaccccac 18130843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 456 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 1615298 - 1615245
Alignment:
Q  456 tatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  1615298 tatgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgacctcatttagtgg 1615245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 268 - 313
Target Start/End: Original strand, 8364590 - 8364635
Alignment:
Q  268 gaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagaga 313  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  8364590 gaaaaggtggttgaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagaga 8364635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 405 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 14389286 - 14389202
Alignment:
Q  405 aaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgt 490  Q
    ||||| ||| |||||||||| || |||||  ||| |||||||| |||| ||||||||| |||| || |||| ||||||||||||||    
T  14389286 aaactcttaagaaagatttagagattaataagttagatccaaa-tatggtttatgatataacattagggcgtaatttgatccatgt 14389202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 444 - 509
Target Start/End: Original strand, 28891472 - 28891537
Alignment:
Q  444 caaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || | ||||| || |||||| |||||||  ||||||||    
T  28891472 caaaatatgatttatgatagaacattatggtgtaatttaatacatgtaaccgacccttcttagtgg 28891537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 446 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 3210593 - 3210541
Alignment:
Q  446 aaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgacc 498  Q
    |||||||| ||||||||||||| || || | ||||||||||||||||| ||||    
T  3210593 aaatatgagttatgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagctgacc 3210541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 446 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 12119728 - 12119664
Alignment:
Q  446 aaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccga-ccccacttagtgg 509  Q
    ||||||||||| | |||||||| || | ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12119728 aaatatgatttttaatagaacattatgacgtcatttgatccatgtagccgacccccacttagtgg 12119664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 477 - 509
Target Start/End: Original strand, 33730193 - 33730225
Alignment:
Q  477 aatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33730193 aatttcatccatgtagccgaccccacttagtgg 33730225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 137; Significance: 3e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 185 - 509
Target Start/End: Original strand, 31403 - 31728
Alignment:
Q  185 tgcgttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaa 283  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  31403 tgcgttggatgagtggtaagactagacaggataagattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtag-aaaagttggtagaaa 31501  T
Q  284 ataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagagg 383  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||| |||||||    
T  31502 ataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccatggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagatgtagagg 31601  T
Q  384 aagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaattt 481  Q
    |||| | | ||||||||  ||| |||| ||||| || |||||| |||| |||| ||||||||| |||| || | ||||||||||||||  |  |  ||||    
T  31602 aagacccaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatcc-aaatttggtgtatgatagaacactgtgaagtcattt 31700  T
Q  482 gatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31701 gatccatgtagccgaccccacttagtgg 31728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 241 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 44158 - 44036
Alignment:
Q  241 agagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaa 340  Q
    |||||||  ||||||||||||||| || ||||| |||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |  |||| || | ||||| |    
T  44158 agagagttggggtagcacctatagtag-aaaagatggcggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagaccttcagattctctagtaagga 44060  T
Q  341 gagtagatcagatggaggagagtc 364  Q
    |||||||  |||||||||| ||||    
T  44059 gagtagactagatggaggatagtc 44036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0570 (Bit Score: 120; Significance: 4e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0570
Description:

Target: scaffold0570; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 207 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 1271 - 970
Alignment:
Q  207 tagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggaca 305  Q
    ||||| ||||||||||| |||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||    
T  1271 tagacaggataggattatgaatgacaccattaga--gagagtgagggtagcacctatagtag-aaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggcca 1175  T
Q  306 tgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaacta--aga 403  Q
    ||||||||||||||  ||||||||  | ||||||||||||||||| |||||| ||||||   | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||    
T  1174 tgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggagaagagtcaaattaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattaga 1075  T
Q  404 aaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccact 503  Q
     |||| ||||  ||||||||| |||| |||| ||||||||| |||| || | ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||| |    
T  1074 gaaaccattaaaaaagatttagaggtcaatgagttggatcc-aaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagctgaccccatt 976  T
Q  504 tagtgg 509  Q
    ||||||    
T  975 tagtgg 970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024 (Bit Score: 120; Significance: 4e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0024
Description:

Target: scaffold0024; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 190 - 510
Target Start/End: Original strand, 82661 - 82979
Alignment:
Q  190 tggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaatagg 288  Q
    ||||||||| ||||  ||||||  |||||||||| |||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||    
T  82661 tggatgagtagtaagactagacatgataggattaagaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtag-aaaagttggtagaaaatggg 82759  T
Q  289 cttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagag 388  Q
    |||||  | ||||||||| |||||||||||    |||||||  |||||||||| ||| |||| ||||||||||||  ||| || |||||||||||||||     
T  82760 cttagatgatttggacatatagagagaagatccatagatgcagtcgtaagaagggtatatcaaatggaggagagt--ggttaagagaggtagaggaagac 82857  T
Q  389 ctatgaaaacta-agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatcca 487  Q
    ||| |||||||| ||| |||| ||||| || |||||| |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||    
T  82858 ctaggaaaactatagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaa-tatgatttatgatagaacactatgacgtcatttgatcca 82956  T
Q  488 tgtagccgaccccacttagtgga 510  Q
    |||||||||||||||||| ||||    
T  82957 tgtagccgaccccacttaatgga 82979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 446 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 48201 - 48140
Alignment:
Q  446 aaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagt 507  Q
    ||||||| | |||||||||| | || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  48201 aaatatggtgtatgatagaatattatggcgtaatttgatccatgtagccgactccacttagt 48140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 89; Significance: 1e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 268 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 86873 - 86631
Alignment:
Q  268 gaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcggg 367  Q
    |||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||| |||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  86873 gaaaagttggtagaaaatagtcttagatagtttggacatgtaaagagaagacccgtagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcagg 86774  T
Q  368 tcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaac--taagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaa 465  Q
    | |||||||||||| | ||| ||| ||||||  | ||| |||| | ||| || |||||| ||||  |  |||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  86773 ttaaaagaggtagatggagacctaggaaaactgttagagaaaccactagaaaggatttagaggtcgacaggttggatcc-aaatatgatgtatgatagaa 86675  T
Q  466 cactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||| | || |||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  86674 cactatgacgtaatttgatccatgtagtcggctccacttagtgg 86631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 322 - 509
Target Start/End: Original strand, 4708 - 4896
Alignment:
Q  322 gtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaac--taagaaaaactattaggaaag 419  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||||| ||||   || ||||||  ||||| |||| ||||| || |    
T  4708 gtagatgccgtcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtaagattaaaagaggtagatgaaggcgtaggaaaaccataagagaaaccattagaaagg 4807  T
Q  420 atttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||| | || |||| |||  ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  4808 atttagacgtcaatgagttaaatccaaa-tatggtttatgatagaacactatggcgtaatttgatccgtgtagccgaccccactttgtgg 4896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 64; Significance: 1e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 185 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 4619 - 4312
Alignment:
Q  185 tgcgttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgaggg-tagcacctatagcaggaaaagttggtagaa 282  Q
    |||||||||||| ||||||  ||||||  ||||||||||  ||| || |||||||| |||||| | ||| | |||||||||| || ||||||||||| ||    
T  4619 tgcgttggatgaatggtaagactagacatgataggattataaatgacaccattagagagagagagtggggtggcacctatagtag-aaaagttggtaaaa 4521  T
Q  283 aataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagag 382  Q
    |||||||||||   |||||| |||||||| |||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||| ||  || |||||||||| ||    
T  4520 aataggcttagatagtttgggcatgtagaaagaagactcgtagaagctgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagaatcaagttaaaagaggtatag 4421  T
Q  383 gaagagctatgaaaactaagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttg 482  Q
    ||| | |||       | ||| |||| ||||| || |||||| |||| |||| ||||||| | |||| || ||||| ||||||||||| | ||  |||||    
T  4420 gaa-aacta-------ttagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggat-ctaaatttggtttataatagaacactatgacgttatttg 4330  T
Q  483 atccatgtagccgacccc 500  Q
    |||||||||| |||||||    
T  4329 atccatgtaggcgacccc 4312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 59; Significance: 1e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 188 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 25789 - 25684
Alignment:
Q  188 gttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaata 286  Q
    ||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  25789 gttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtag-aaaagttggtagaaaata 25691  T
Q  287 ggcttag 293  Q
    |||||||    
T  25690 ggcttag 25684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 378 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 25686 - 25554
Alignment:
Q  378 tagaggaagagctatgaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcg 475  Q
    |||||||||| ||| ||||||||  ||| |||| ||||| || |||||| |||| |||| |||||||||||| | || | ||||||||||||||| | ||    
T  25686 tagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatt-tggtgtatgatagaacactatgacg 25588  T
Q  476 caatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
      |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  25587 tcatttaatccatgtagcggaccccacttagtgg 25554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041 (Bit Score: 58; Significance: 4e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 359 - 509
Target Start/End: Original strand, 16687 - 16838
Alignment:
Q  359 agagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaactaa--gaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgattt 456  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| ||| |||||| |   || |||| ||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||||| |||| |||    
T  16687 agagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaa-tatggttt 16785  T
Q  457 atgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
     ||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  16786 ttgatagaacactatggcgtcatttgatctatgtagccgactccacttagtgg 16838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 52; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 269 - 509
Target Start/End: Original strand, 7460 - 7700
Alignment:
Q  269 aaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggt 368  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||  ||||||| |||||||||||||| | ||||||||   || ||||||||||| |||||||||||||||||   ||    
T  7460 aaaagtttgtagaaaacacgcttagttggtttgggcatgtagagagaaggcatgtagatgtcttcataagaagagtatatcagatggaggagagtgaagt 7559  T
Q  369 caaaagaggtagaggaagagctatgaaaac--taagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaac 466  Q
    ||||||| ||  |  ||||  || ||||||  ||||| |||||||||| ||||||| | |||| | |  ||||||| | ||||||| || | ||||||||    
T  7560 caaaaga-gtgtatcaagacataagaaaactataagataaactattagaaaagattcagaggtcatttagttggattc-aaatatggttcacgatagaac 7657  T
Q  467 actacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||| |||| ||||||||||||| ||||  | |||||||||||    
T  7658 actatggcgtaatttgatccatgcagccatctccacttagtgg 7700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199 (Bit Score: 51; Significance: 6e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0199
Description:

Target: scaffold0199; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 399 - 509
Target Start/End: Original strand, 14734 - 14843
Alignment:
Q  399 taagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgacc 498  Q
    ||||| |||| ||||| || ||||||||||| |||| ||||||| |||| |||| |||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| |||    
T  14734 taagagaaaccattagaaaggatttaaaggtcaatgagttggattcaaa-tatggtttatgattgaacactatggcgtaatttgatccatgtagccaacc 14832  T
Q  499 ccacttagtgg 509  Q
    |||| ||||||    
T  14833 ccacgtagtgg 14843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1318 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1318
Description:

Target: scaffold1318; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 456 - 509
Target Start/End: Original strand, 538 - 591
Alignment:
Q  456 tatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  538 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0168
Description:

Target: scaffold0168; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 456 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 28964 - 28911
Alignment:
Q  456 tatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28964 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 28911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 11945 - 11810
Alignment:
Q  185 tgcgttggatgagtggtaaagctagacgggataggattaggaataac-ccattagaaagaga--gtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtaga 281  Q
    |||| |||||||| |||||  ||||||   |||||||||||||| || |||| ||| |||||  ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  11945 tgcgctggatgagcggtaagactagacataataggattaggaatgacaccatcagagagagatagtgggggtagcacctatagtag-aaaagttggtaga 11847  T
Q  282 aaataggcttaggcggtttggacatgtagagagaaga 318  Q
    ||||||||||||  | ||||| |||||||| ||||||    
T  11846 aaataggcttagatgatttgggcatgtagacagaaga 11810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 298 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 11781 - 11573
Alignment:
Q  298 tttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagagctatgaaaa 397  Q
    ||||| ||||||||| ||||||  ||||||||  || |||||||||||||||| ||||| |||||||  || | |||||||||| ||| | ||| |||||    
T  11781 tttgggcatgtagagcgaagacccgtagatgccgtcataagaagagtagatcaaatggatgagagtcaagttagaagaggtagacgaatacctaggaaaa 11682  T
Q  398 cta--agaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccg 495  Q
    |||  ||| |||   |||| ||  ||||| | || ||| |||||||||| |||| || ||  |||||||  |||| | ||  ||||||||||||||||||    
T  11681 ctattagagaaatcgttagaaagaatttagaagtcaattggttggatcc-aaatttggtt--tgatagagtactatgacgtcatttgatccatgtagccg 11585  T
Q  496 accccacttagt 507  Q
    ||||||||||||    
T  11584 accccacttagt 11573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 400 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 160454 - 160346
Alignment:
Q  400 aagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccc 499  Q
    |||| |||||||||||||||||| | |  |||||| ||| || || ||||||| |||||||||||||| || |||| |||||||  ||||||||| ||||    
T  160454 aagagaaactattaggaaagattaagaaattaatgagttcga-ccgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgaatcatgtagccaaccc 160356  T
Q  500 cacttagtgg 509  Q
    ||||||||||    
T  160355 cacttagtgg 160346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0050 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0050
Description:

Target: scaffold0050; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 373 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 58385 - 58248
Alignment:
Q  373 agaggtagaggaagagctatgaaaac--taagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacacta 470  Q
    ||||| ||||||||| |||  |||||  ||||| ||||| |||||||| | ||  || | |||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  58385 agaggcagaggaagacctagaaaaacgataagagaaactgttaggaaaaacttggagatcaatgagttgga-ccaagatatggtttatgatagaacatta 58287  T
Q  471 cggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
     | || ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  58286 tgtcgtaatttgatccatgtagccgacccaacttagtgg 58248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0491
Description:

Target: scaffold0491; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 297 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 4062 - 4003
Alignment:
Q  297 gtttggacatgtagagagaagacttgtagatgctatcgtaagaagagtagatcagatgga 356  Q
    |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  4062 gtttggacttgttgagagaaaacttgtagatgctatagtaaggagagtagataagatgga 4003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 460 - 509
Target Start/End: Original strand, 3648 - 3697
Alignment:
Q  460 atagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    |||||||| || | || ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3648 atagaacattatgacgtaatttgatccaagtagccgaccccacttagtgg 3697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0245 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0245
Description:

Target: scaffold0245; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 446 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 16521 - 16464
Alignment:
Q  446 aaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccact 503  Q
    ||||||| |||||||||||||| || |||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  16521 aaatatggtttatgatagaacattatggcataatttgatccatgtggccgaccccact 16464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0392 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0392
Description:

Target: scaffold0392; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 446 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 6857 - 6794
Alignment:
Q  446 aaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 509  Q
    ||||||| | ||||||| |||| || |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6857 aaatatggtatatgatataacattatggcataatttgatccatgtagccaaccccacttagtgg 6794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 409 - 491
Target Start/End: Original strand, 39480 - 39561
Alignment:
Q  409 tattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatccaaaatatgatttatgatagaacactacggcgcaatttgatccatgta 491  Q
    |||||||||||||||| | | ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||||||  | |||| ||||| |||||||||    
T  39480 tattaggaaagatttagatggtaatgagttggatcc-aaatgtggtttatgatagaacatgatggcgtaatttaatccatgta 39561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1259 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000008; HSPs: 1)
Name: scaffold1259
Description:

Target: scaffold1259; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 399 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 1650 - 1606
Alignment:
Q  399 taagaaaaactattaggaaagatttaaaggttaatgggttggatc 443  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  1650 taagagaaactattagaaaagatttaaaggttaatgagttagatc 1606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University