View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF15993_low_4 (Length: 436)

Name: NF15993_low_4
Description: NF15993
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF15993_low_4
NF15993_low_4
[»] chr8 (50 HSPs)
chr8 (1-416)||(23854262-23854680)
chr8 (1-347)||(37970350-37970698)
chr8 (1-359)||(43643426-43643786)
chr8 (1-300)||(1149463-1149762)
chr8 (1-359)||(1204926-1205286)
chr8 (30-360)||(10555062-10555394)
chr8 (1-361)||(6098344-6098711)
chr8 (2-359)||(16446707-16447066)
chr8 (3-359)||(27082671-27083029)
chr8 (33-359)||(36694829-36695157)
chr8 (1-359)||(16222862-16223222)
chr8 (1-357)||(7890788-7891137)
chr8 (1-345)||(11727037-11727383)
chr8 (9-359)||(30654421-30654774)
chr8 (3-360)||(5299779-5300138)
chr8 (1-346)||(31933717-31934064)
chr8 (1-328)||(9864180-9864507)
chr8 (1-359)||(38643977-38644337)
chr8 (1-359)||(34894966-34895321)
chr8 (1-328)||(8803647-8803968)
chr8 (33-360)||(12876107-12876437)
chr8 (1-272)||(35459542-35459813)
chr8 (1-322)||(40862457-40862779)
chr8 (1-357)||(465843-466191)
chr8 (27-256)||(33906316-33906545)
chr8 (46-360)||(13307621-13307936)
chr8 (3-235)||(4132519-4132750)
chr8 (155-359)||(1150090-1150296)
chr8 (29-288)||(39098978-39099237)
chr8 (1-261)||(1953819-1954081)
chr8 (1-280)||(44869577-44869856)
chr8 (6-166)||(1149756-1149912)
chr8 (103-360)||(41910921-41911180)
chr8 (1-178)||(24823225-24823394)
chr8 (103-322)||(43025740-43025959)
chr8 (1-130)||(12587812-12587941)
chr8 (1-134)||(35859160-35859293)
chr8 (1-198)||(18259245-18259438)
chr8 (1-133)||(34951888-34952020)
chr8 (168-359)||(41362517-41362707)
chr8 (167-319)||(34952028-34952180)
chr8 (1-95)||(33198067-33198161)
chr8 (238-363)||(4133078-4133203)
chr8 (39-130)||(34463704-34463792)
chr8 (84-160)||(7998478-7998554)
chr8 (123-178)||(12585298-12585353)
chr8 (296-360)||(15009240-15009306)
chr8 (3-59)||(41362723-41362779)
chr8 (167-253)||(7998401-7998488)
chr8 (247-277)||(34463671-34463701)
[»] chr7 (55 HSPs)
chr7 (1-359)||(18797304-18797662)
chr7 (1-359)||(7334769-7335128)
chr7 (1-359)||(30055501-30055862)
chr7 (27-360)||(27283718-27284053)
chr7 (1-359)||(31578890-31579255)
chr7 (1-360)||(37109846-37110209)
chr7 (1-359)||(32820879-32821239)
chr7 (1-359)||(17842410-17842772)
chr7 (1-359)||(9355652-9356012)
chr7 (1-358)||(24211717-24212077)
chr7 (7-321)||(10481619-10481934)
chr7 (1-360)||(37346996-37347356)
chr7 (65-358)||(38258521-38258816)
chr7 (3-361)||(5657309-5657669)
chr7 (1-360)||(15612585-15612945)
chr7 (1-359)||(21991611-21991962)
chr7 (1-359)||(32432432-32432787)
chr7 (4-347)||(41764907-41765252)
chr7 (1-357)||(11071182-11071538)
chr7 (1-347)||(23111177-23111527)
chr7 (1-361)||(8861258-8861620)
chr7 (3-360)||(4582893-4583252)
chr7 (46-359)||(43686016-43686330)
chr7 (2-343)||(48928124-48928466)
chr7 (1-360)||(6546493-6546854)
chr7 (1-345)||(22687228-22687566)
chr7 (1-361)||(10359040-10359402)
chr7 (30-358)||(33688117-33688446)
chr7 (1-359)||(31520567-31520909)
chr7 (1-357)||(25691370-25691729)
chr7 (5-360)||(12165726-12166074)
chr7 (2-322)||(35353122-35353442)
chr7 (3-228)||(37703326-37703551)
chr7 (3-243)||(15672587-15672830)
chr7 (1-322)||(29173554-29173857)
chr7 (4-359)||(12390478-12390816)
chr7 (1-271)||(43925167-43925430)
chr7 (80-358)||(48928469-48928748)
chr7 (27-261)||(44598741-44598973)
chr7 (108-363)||(27421313-27421569)
chr7 (7-228)||(46480961-46481182)
chr7 (1-217)||(26587918-26588126)
chr7 (46-328)||(38053494-38053751)
chr7 (106-328)||(37704175-37704387)
chr7 (1-322)||(26980337-26980641)
chr7 (147-357)||(44413351-44413564)
chr7 (9-160)||(32593040-32593191)
chr7 (3-144)||(44411368-44411509)
chr7 (1-131)||(37704387-37704517)
chr7 (1-120)||(34362004-34362123)
chr7 (212-359)||(26524364-26524513)
chr7 (231-361)||(34362205-34362336)
chr7 (29-93)||(27421219-27421283)
chr7 (180-314)||(32593194-32593327)
chr7 (1-48)||(38258867-38258914)
[»] chr5 (64 HSPs)
chr5 (1-359)||(22973897-22974257)
chr5 (1-358)||(31705427-31705785)
chr5 (1-359)||(38528052-38528411)
chr5 (1-357)||(699152-699510)
chr5 (1-359)||(24886102-24886447)
chr5 (4-360)||(5829896-5830249)
chr5 (1-359)||(12910350-12910715)
chr5 (1-328)||(22255214-22255542)
chr5 (1-358)||(22980794-22981153)
chr5 (1-359)||(17157846-17158208)
chr5 (1-347)||(27318303-27318650)
chr5 (1-359)||(35826301-35826658)
chr5 (1-347)||(43308475-43308815)
chr5 (1-357)||(7208679-7209037)
chr5 (1-363)||(31786461-31786825)
chr5 (1-347)||(33908245-33908592)
chr5 (1-359)||(19119859-19120219)
chr5 (3-360)||(36866761-36867120)
chr5 (1-345)||(30969139-30969485)
chr5 (1-359)||(8741700-8742062)
chr5 (1-359)||(27330306-27330664)
chr5 (3-361)||(40133383-40133743)
chr5 (1-359)||(14919354-14919704)
chr5 (3-346)||(8436979-8437323)
chr5 (1-359)||(36860423-36860784)
chr5 (1-357)||(5837557-5837915)
chr5 (1-361)||(35511297-35511654)
chr5 (1-299)||(35504427-35504725)
chr5 (1-361)||(23116045-23116399)
chr5 (1-359)||(39572819-39573171)
chr5 (1-357)||(25500741-25501099)
chr5 (1-280)||(15992355-15992634)
chr5 (1-358)||(32563150-32563500)
chr5 (1-360)||(7693229-7693581)
chr5 (1-359)||(9200233-9200584)
chr5 (1-362)||(15724487-15724848)
chr5 (1-360)||(21088584-21088942)
chr5 (5-359)||(35933902-35934252)
chr5 (2-361)||(14409157-14409503)
chr5 (103-346)||(26268087-26268332)
chr5 (27-347)||(1429003-1429308)
chr5 (1-360)||(22019631-22019983)
chr5 (14-236)||(13956190-13956412)
chr5 (1-213)||(2888260-2888472)
chr5 (1-319)||(42342775-42343081)
chr5 (27-300)||(23954636-23954904)
chr5 (34-304)||(6824329-6824599)
chr5 (122-359)||(5112250-5112488)
chr5 (1-210)||(25669737-25669936)
chr5 (3-147)||(25889584-25889728)
chr5 (149-358)||(28416490-28416696)
chr5 (1-359)||(8466745-8467086)
chr5 (1-95)||(28416366-28416460)
chr5 (206-322)||(25668689-25668804)
chr5 (4-95)||(26269075-26269166)
chr5 (1-62)||(43254154-43254215)
chr5 (224-357)||(11898004-11898139)
chr5 (277-360)||(26317775-26317860)
chr5 (276-321)||(22255615-22255660)
chr5 (266-359)||(13956425-13956520)
chr5 (116-167)||(11898148-11898199)
chr5 (284-363)||(16004474-16004556)
chr5 (277-318)||(5748478-5748519)
chr5 (323-359)||(12164928-12164964)
[»] chr4 (61 HSPs)
chr4 (1-359)||(55477742-55478106)
chr4 (1-359)||(879399-879759)
chr4 (1-359)||(25184113-25184473)
chr4 (1-359)||(37663592-37663950)
chr4 (1-359)||(19089304-19089664)
chr4 (1-362)||(19440499-19440863)
chr4 (1-356)||(6864038-6864395)
chr4 (2-361)||(28002838-28003199)
chr4 (1-359)||(32912430-32912791)
chr4 (1-357)||(47253751-47254100)
chr4 (1-359)||(50697242-50697602)
chr4 (1-357)||(36493540-36493897)
chr4 (1-359)||(34361342-34361702)
chr4 (1-362)||(34947946-34948311)
chr4 (1-321)||(17167753-17168073)
chr4 (1-321)||(17173330-17173650)
chr4 (1-359)||(35020882-35021246)
chr4 (1-347)||(42199741-42200091)
chr4 (1-361)||(55240956-55241317)
chr4 (1-359)||(25700907-25701268)
chr4 (1-359)||(29584051-29584409)
chr4 (1-346)||(33341408-33341758)
chr4 (1-359)||(3042611-3042979)
chr4 (1-360)||(7703516-7703869)
chr4 (1-342)||(23761089-23761431)
chr4 (3-361)||(49375964-49376325)
chr4 (2-345)||(5047818-5048162)
chr4 (1-358)||(37775670-37776018)
chr4 (1-253)||(1815409-1815661)
chr4 (46-359)||(38011854-38012169)
chr4 (1-321)||(46888009-46888328)
chr4 (1-357)||(27396618-27396974)
chr4 (1-345)||(50764746-50765080)
chr4 (1-359)||(32579444-32579806)
chr4 (1-359)||(37287733-37288088)
chr4 (2-343)||(33816368-33816728)
chr4 (1-358)||(4597994-4598342)
chr4 (1-347)||(30002492-30002823)
chr4 (1-262)||(17272067-17272324)
chr4 (27-359)||(9139247-9139563)
chr4 (1-356)||(32592096-32592444)
chr4 (84-300)||(4934136-4934353)
chr4 (84-359)||(35025530-35025799)
chr4 (1-219)||(46883965-46884177)
chr4 (1-164)||(7152055-7152218)
chr4 (106-322)||(54499193-54499411)
chr4 (2-163)||(26896285-26896447)
chr4 (1-95)||(35025417-35025511)
chr4 (155-361)||(39397916-39398115)
chr4 (1-129)||(4205216-4205344)
chr4 (1-133)||(39400236-39400368)
chr4 (1-90)||(23431826-23431915)
chr4 (277-360)||(53124286-53124371)
chr4 (256-359)||(4205116-4205221)
chr4 (57-120)||(56050171-56050234)
chr4 (277-359)||(4396326-4396410)
chr4 (2-55)||(38012568-38012621)
chr4 (303-357)||(52516599-52516655)
chr4 (324-362)||(38811810-38811848)
chr4 (297-359)||(17272011-17272075)
chr4 (247-320)||(23518400-23518473)
[»] chr1 (57 HSPs)
chr1 (1-358)||(10922724-10923083)
chr1 (1-359)||(32267030-32267390)
chr1 (4-359)||(15382929-15383286)
chr1 (1-359)||(2959744-2960104)
chr1 (1-328)||(51128888-51129215)
chr1 (4-360)||(30326775-30327133)
chr1 (4-364)||(8222122-8222480)
chr1 (1-347)||(37451294-37451641)
chr1 (1-359)||(30254420-30254779)
chr1 (27-359)||(18422647-18422981)
chr1 (1-359)||(19899588-19899949)
chr1 (1-347)||(28564603-28564949)
chr1 (3-363)||(15752021-15752383)
chr1 (1-360)||(23999342-23999704)
chr1 (1-322)||(32216090-32216411)
chr1 (1-359)||(16415641-16416002)
chr1 (1-347)||(47279197-47279545)
chr1 (1-328)||(28769682-28770009)
chr1 (1-357)||(27763130-27763487)
chr1 (3-361)||(27227307-27227659)
chr1 (1-359)||(10181827-10182188)
chr1 (4-274)||(25160715-25160985)
chr1 (1-340)||(9902874-9903215)
chr1 (1-328)||(238333-238659)
chr1 (2-358)||(14758038-14758387)
chr1 (1-328)||(46931440-46931766)
chr1 (1-362)||(42721032-42721392)
chr1 (3-360)||(47682316-47682674)
chr1 (1-360)||(7078883-7079255)
chr1 (3-346)||(27267022-27267364)
chr1 (4-360)||(38823209-38823567)
chr1 (9-322)||(27532809-27533121)
chr1 (1-314)||(4330323-4330637)
chr1 (2-359)||(15168085-15168451)
chr1 (1-357)||(27563725-27564084)
chr1 (1-359)||(34012202-34012557)
chr1 (2-322)||(40884848-40885168)
chr1 (9-359)||(37618729-37619076)
chr1 (29-357)||(41926161-41926484)
chr1 (2-360)||(31621369-31621734)
chr1 (1-361)||(3309142-3309509)
chr1 (1-322)||(3534967-3535279)
chr1 (1-359)||(1547283-1547627)
chr1 (3-359)||(39393379-39393738)
chr1 (1-359)||(11742188-11742530)
chr1 (53-357)||(33725472-33725778)
chr1 (1-262)||(22170806-22171067)
chr1 (1-165)||(1359755-1359919)
chr1 (103-324)||(48620670-48620882)
chr1 (44-275)||(38759611-38759846)
chr1 (1-165)||(48353735-48353898)
chr1 (1-143)||(21289817-21289956)
chr1 (28-122)||(31962851-31962945)
chr1 (213-346)||(21289674-21289816)
chr1 (262-359)||(30254854-30254952)
chr1 (231-321)||(1359933-1360022)
chr1 (277-359)||(25160366-25160449)
[»] scaffold0291 (1 HSPs)
scaffold0291 (1-357)||(7889-8247)
[»] chr3 (63 HSPs)
chr3 (1-359)||(48354932-48355292)
chr3 (1-359)||(26941085-26941445)
chr3 (1-315)||(42505900-42506214)
chr3 (1-359)||(40552084-40552444)
chr3 (1-359)||(4761473-4761836)
chr3 (5-359)||(46994490-46994835)
chr3 (1-357)||(46297587-46297945)
chr3 (1-359)||(21009626-21009990)
chr3 (1-359)||(47481513-47481874)
chr3 (7-359)||(3655031-3655387)
chr3 (1-328)||(34132959-34133286)
chr3 (1-347)||(52040747-52041096)
chr3 (2-359)||(22450959-22451318)
chr3 (1-357)||(53228977-53229336)
chr3 (1-362)||(4015448-4015810)
chr3 (1-360)||(37203057-37203419)
chr3 (1-360)||(37157698-37158059)
chr3 (27-357)||(54828552-54828883)
chr3 (1-359)||(39282644-39283003)
chr3 (1-359)||(7327307-7327668)
chr3 (1-343)||(33378610-33378951)
chr3 (1-347)||(24488787-24489135)
chr3 (1-359)||(54505799-54506159)
chr3 (1-363)||(44891494-44891848)
chr3 (1-357)||(24707940-24708295)
chr3 (1-328)||(3362277-3362606)
chr3 (2-357)||(43975718-43976068)
chr3 (27-328)||(2007957-2008257)
chr3 (1-344)||(11357206-11357535)
chr3 (1-236)||(22622543-22622778)
chr3 (1-347)||(29099358-29099697)
chr3 (27-359)||(11466815-11467142)
chr3 (4-358)||(25579731-25580087)
chr3 (1-236)||(33698269-33698504)
chr3 (1-359)||(21193597-21193958)
chr3 (1-356)||(22445890-22446247)
chr3 (2-361)||(27480184-27480566)
chr3 (9-345)||(32373477-32373813)
chr3 (37-360)||(45174493-45174821)
chr3 (1-319)||(38591727-38592049)
chr3 (150-360)||(51212955-51213167)
chr3 (1-359)||(44186342-44186686)
chr3 (1-239)||(1089806-1090044)
chr3 (27-258)||(29163912-29164134)
chr3 (1-346)||(40935995-40936324)
chr3 (103-359)||(35844317-35844575)
chr3 (4-148)||(51212599-51212743)
chr3 (1-290)||(14586505-14586784)
chr3 (180-361)||(20373300-20373483)
chr3 (46-290)||(43348320-43348563)
chr3 (1-245)||(36012244-36012490)
chr3 (122-321)||(53176086-53176284)
chr3 (68-195)||(20373136-20373263)
chr3 (37-250)||(11835494-11835702)
chr3 (26-142)||(50475021-50475137)
chr3 (2-166)||(11356984-11357140)
chr3 (39-147)||(53811597-53811701)
chr3 (277-360)||(33698182-33698263)
chr3 (1-53)||(20373088-20373140)
chr3 (307-358)||(11835737-11835790)
chr3 (277-318)||(41585408-41585449)
chr3 (304-358)||(29163839-29163895)
chr3 (324-357)||(53818522-53818555)
[»] chr2 (47 HSPs)
chr2 (3-321)||(19289168-19289486)
chr2 (1-328)||(43648088-43648415)
chr2 (4-360)||(37905708-37906067)
chr2 (36-363)||(33550865-33551193)
chr2 (1-359)||(11366223-11366584)
chr2 (33-321)||(3176979-3177267)
chr2 (1-360)||(26357576-26357937)
chr2 (1-359)||(2325221-2325573)
chr2 (3-359)||(4166922-4167280)
chr2 (1-360)||(44913661-44914027)
chr2 (67-359)||(17071646-17071940)
chr2 (1-359)||(19424485-19424831)
chr2 (1-322)||(33709075-33709396)
chr2 (1-262)||(41960939-41961200)
chr2 (8-359)||(4263926-4264280)
chr2 (1-360)||(4763627-4763991)
chr2 (1-359)||(29241988-29242341)
chr2 (1-362)||(35958906-35959252)
chr2 (1-359)||(27349791-27350142)
chr2 (67-359)||(17054005-17054299)
chr2 (1-359)||(31570577-31570937)
chr2 (9-329)||(4478401-4478717)
chr2 (1-357)||(43770691-43771039)
chr2 (3-359)||(39167214-39167566)
chr2 (1-265)||(31861948-31862212)
chr2 (27-357)||(44285951-44286283)
chr2 (1-357)||(33660220-33660569)
chr2 (27-361)||(19313850-19314181)
chr2 (2-360)||(41465508-41465860)
chr2 (1-263)||(18494124-18494385)
chr2 (56-280)||(45327801-45328025)
chr2 (56-357)||(36641988-36642293)
chr2 (1-358)||(13711465-13711819)
chr2 (1-290)||(5881610-5881889)
chr2 (1-290)||(7006781-7007053)
chr2 (108-361)||(33902066-33902319)
chr2 (103-357)||(41463795-41464051)
chr2 (1-166)||(19500758-19500923)
chr2 (85-219)||(18258214-18258348)
chr2 (1-95)||(41051143-41051237)
chr2 (1-80)||(41463433-41463512)
chr2 (27-73)||(18257407-18257453)
chr2 (216-261)||(41051263-41051308)
chr2 (324-359)||(19093413-19093448)
chr2 (277-347)||(18494387-18494459)
chr2 (323-359)||(7007057-7007093)
chr2 (297-359)||(41960883-41960947)
[»] chr6 (18 HSPs)
chr6 (1-359)||(1945833-1946195)
chr6 (1-359)||(5627391-5627752)
chr6 (1-359)||(3879763-3880123)
chr6 (27-363)||(7234885-7235222)
chr6 (1-346)||(6091006-6091353)
chr6 (1-359)||(4318646-4319007)
chr6 (3-358)||(20768087-20768440)
chr6 (1-360)||(33892836-33893187)
chr6 (1-357)||(29182165-29182521)
chr6 (1-357)||(21016942-21017294)
chr6 (27-359)||(8513233-8513562)
chr6 (103-359)||(7055141-7055399)
chr6 (29-361)||(33618832-33619162)
chr6 (27-357)||(6088910-6089237)
chr6 (75-357)||(30353256-30353540)
chr6 (103-322)||(15491654-15491873)
chr6 (1-108)||(7054596-7054704)
chr6 (230-346)||(18498446-18498565)
[»] scaffold0002 (4 HSPs)
scaffold0002 (1-307)||(408254-408559)
scaffold0002 (1-359)||(134-488)
scaffold0002 (124-321)||(94331-94528)
scaffold0002 (9-132)||(93933-94056)
[»] scaffold0061 (1 HSPs)
scaffold0061 (3-328)||(43990-44314)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (3-328)||(154473-154797)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (3-357)||(145842-146199)
[»] scaffold0318 (1 HSPs)
scaffold0318 (7-357)||(11908-12263)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (44-359)||(267282-267602)
[»] scaffold0009 (3 HSPs)
scaffold0009 (277-359)||(42348-42432)
scaffold0009 (296-359)||(100821-100886)
scaffold0009 (27-140)||(100948-101047)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 292; Significance: 1e-164; HSPs: 50)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 416
Target Start/End: Original strand, 23854262 - 23854680
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23854262 tgattcatttttaaattgttgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttattgtcg 23854361  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  23854362 gaatctttaacatgcaagcagagttgatgatattatgtgattgtcttaagtgttacactttatgcggtgttacacttataactaggtaagataaaattag 23854461  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    ||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||||||||||||||    
T  23854462 attaattgtagtattgttaatctaatgagttgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgcacaaacagttgggtgttactcattacattttt 23854561  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttccataaggattgacagg-caacaaaataggaattttcttac 397  Q
     |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  23854562 tatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcatgacttcaccgtagacttttccataaggattaacaggccaagaaaataggaattttcttac 23854661  T
Q  398 ttaccattcccttcttctc 416  Q
    |||||||||||||||||||    
T  23854662 ttaccattcccttcttctc 23854680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 37970350 - 37970698
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||      
T  37970350 tgattcatttttaaattgttgatttctgattaatgatcaacagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttattgtaa 37970449  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  37970450 ggatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattag 37970549  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  37970550 attaagtgtagtcttgttaatcatatgaattgatgatactatgagggctgaacttttgatggcattgtacaaacagtggggtgttactcattacattttt 37970649  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcacc 347  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  37970650 gatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcatgacttcacc 37970698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 43643426 - 43643786
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43643426 tgattcatttttaaattgtcgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 43643525  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |    
T  43643526 gaatttttaacatgcaaacagagttgataatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattag 43643625  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||    
T  43643626 atcaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaagattgaactttggatgtcattgtacaaacagtagagtgttactcattacattttt 43643725  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcc 359  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  43643726 gatgttatagtgttaacttcaccaaaatagtcattctcatgacttcaccatagaattttcc 43643786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Original strand, 1149463 - 1149762
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  1149463 tgattcatttttaaattgttgattaccgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 1149562  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  1149563 gaatctttaacatgcaaacaaagttgataatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattag 1149662  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  1149663 attaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaggacagaacttttgatgtcattgtacaaacagtgggttgttactcattacattttt 1149762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 1205286 - 1204926
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||      
T  1205286 tgattcatttttaaattgctgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatacttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgtta 1205187  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |    
T  1205186 aaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaacaaggtaagataaaattag 1205087  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||| |||||||||    
T  1205086 attaagtgtaatcttgttaatatgatgaactgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtgatgtgttactcactacattttt 1204987  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcc 359  Q
     |||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1204986 tatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccgtaaaattttcc 1204926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 30 - 360
Target Start/End: Original strand, 10555062 - 10555394
Alignment:
Q  30 ttaatgatcaatagt--aattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttga 127  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10555062 ttaatgatcaatagtgtaattcatctagtaatgcttgcaatatcttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacaaagttga 10555161  T
Q  128 tgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattggattaagtgtagtcttgttattctgatg 227  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||  |||||| |||||| | |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  10555162 tgatattatgtgatagtc--aagtgttacgttttgtgaggtgttgcgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatg 10555259  T
Q  228 agttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcac--aaa 325  Q
    | ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||    
T  10555260 aattgatgatactatgaggattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggagtgttactcattacattttttatgttatagtgttaacttcaccaaaa 10555359  T
Q  326 aaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcca 360  Q
    || ||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  10555360 aagtcattctcatgacttcaccgtagaattttcca 10555394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 361
Target Start/End: Original strand, 6098344 - 6098711
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtc- 99  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||      
T  6098344 tgattcatttttaaattgttgattactaattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtactattgtattgtat 6098443  T
Q  100 ----ggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaa 195  Q
        || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||    
T  6098444 cgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaagataggataaa 6098543  T
Q  196 attggattaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattaca 295  Q
    ||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| || |    
T  6098544 attagattaaatgtagtcttgttaatctgatgaattgacgatactatggggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactcactata 6098643  T
Q  296 tttttgatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttccat 361  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||  ||||| | ||| ||||||||||||| || ||||||||||    
T  6098644 tttttgatgctatagtattaacttcaccaaaaaagttattttcatgacttcaccatagaattttccat 6098711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 2 - 359
Target Start/End: Original strand, 16446707 - 16447066
Alignment:
Q  2 gattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcgg 101  Q
    ||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||    
T  16446707 gattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcattgg 16446806  T
Q  102 aatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgga 201  Q
     |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||  |    
T  16446807 catctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacgctttgtggggtgttacacttgaaacaaggtaggataaaattaaa 16446906  T
Q  202 ttaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttttg 301  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||| ||||||||| |||| |||||    
T  16446907 ttaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatagtatggggactaaacttttgatgccattatacaaacagtggggtgttactcactacaattttg 16447006  T
Q  302 atgttatagtgttaacttca-ca-aaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcc 359  Q
    |||||||||||||||||| | || |||| ||||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  16447007 atgttatagtgttaactttatcagaaaagtcattttcatgacttcaccatagaattttcc 16447066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 3 - 359
Target Start/End: Original strand, 27082671 - 27083029
Alignment:
Q  3 attcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcgga 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |      
T  27082671 attcatttttaaattgttgattattgattaatgataagtagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgac 27082770  T
Q  103 atctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattggat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| |||    
T  27082771 atctttaacatgcaaacatagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgcggggtgttagacttaaaacatggtaagataaaattagat 27082870  T
Q  203 taagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttttga 302  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| || || ||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||    
T  27082871 taagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttaatgccactgcacaaacagtggggtgttactcactacacttttga 27082970  T
Q  303 tgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcc 359  Q
    || |||||||||||||||||   |||| ||| ||| ||||||||||| || ||||||||    
T  27082971 tgctatagtgttaacttcaccagaaaagtcagtctgatgacttcaccatagaattttcc 27083029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 33 - 359
Target Start/End: Original strand, 36694829 - 36695157
Alignment:
Q  33 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgata 132  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36694829 atgataaatagtaattcatctagtgatgcttgcaacatcttggatttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgata 36694928  T
Q  133 ttatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattggattaagtgtagtcttgttattctgatgagttg 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||| |||    
T  36694929 ttatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgtattcttcttagtctgatgaattg 36695028  T
Q  233 atgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttca-ca-aaaaatc 330  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||    
T  36695029 atgatactatggggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcacaacatttttgatattatagtgttaacttcatcagaaaagtc 36695128  T
Q  331 attctcatgacttcaccctaaaattttcc 359  Q
    ||| || |||||||||| || ||||||||    
T  36695129 attttcctgacttcaccatagaattttcc 36695157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 16223222 - 16222862
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |    
T  16223222 tgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcattg 16223123  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||| | ||||||||| |    
T  16223122 gaatctttaaaatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatactcttaagtgttacactttttggggtgttacgtttaaaacaaggaaggataaaattag 16223023  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    |||||| || ||||||    
T  16223022 attaagtgtagtcttgttaatcggatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaactgtggggaactactcactatattttt 16222923  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcc 359  Q
     ||||||||||||||| |||||   |||| |||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  16222922 tatgttatagtgttaaattcaccagaaaagtcattctcatgatttcaccgtagaattttcc 16222862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Original strand, 7890788 - 7891137
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || |    
T  7890788 tgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacattttagacttacatgtactattttatcgttg 7890887  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | |    
T  7890888 gaatctttaacatgcaaccagagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacacgttgtggggtgttacgcttataacaaagtaagataaaactag 7890987  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |||  ||||         ||||||    
T  7890988 attgagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatattatgaggaccgaacttttgatgccattgtacaaacggtggagtgtt---------attttt 7891078  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttcacaaaaaa--tcattctcatgacttcaccctaaaatttt 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||    
T  7891079 gatgttatagtgttaacttcacaaaaaaagtcattctcatgacttcaccatagaatttt 7891137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 11727383 - 11727037
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |    
T  11727383 tgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatatactattttatcgttg 11727284  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
    | ||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| |    
T  11727283 gcatctttaacattcaaacaaagttgttgatatcatgtgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattag 11727184  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    ||||| |||| |||||||| | |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| || | |||||| | |||| ||||||| |  ||| ||||    
T  11727183 attaaatgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattatgaggactgaacttttgatgccactatacaaatagtggggtgttacttacaacactttt 11727084  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttca 345  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  11727083 gatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcattctcataacttca 11727037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 9 - 359
Target Start/End: Original strand, 30654421 - 30654774
Alignment:
Q  9 tttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctt 107  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||| ||    
T  30654421 ttttaaattgttaattactgattaatgatcaataatatattcatttagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatttt 30654520  T
Q  108 taacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattggattaagt 207  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||| | |||||||  |||||||    
T  30654521 taacatgcaaatagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaatgtatggtaaaattaaattaagt 30654620  T
Q  208 gtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttttgatgtta 307  Q
    ||||||||||||  |||||||  |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  30654621 gtagtcttgttaacctgatgaagtgatgatactatgaaggctgaacttttgatgtcattcaacaaacagtggggtgttactcattacattttttatgtta 30654720  T
Q  308 tagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcc 359  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  30654721 tagtgttaacttcaccaaaaaaatcactcttatgacttcaccataaaattttcc 30654774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 3 - 360
Target Start/End: Original strand, 5299779 - 5300138
Alignment:
Q  3 attcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcgga 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |      
T  5299779 attcatttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgtt 5299878  T
Q  103 atctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattggat 202  Q
    |||||||||||||||||| | ||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||    
T  5299879 atctttaacatgcaaacaaaattgctgatatcatttgataatcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggttggataaaattagat 5299978  T
Q  203 taagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttttga 302  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| | |  || |||| |  ||| ||||||    
T  5299979 taagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtagagtgctacttacaacacttttga 5300078  T
Q  303 tgttatagtgttaacttca--caaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcca 360  Q
    || ||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  5300079 tgctatagtgttaacttcattaaaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcca 5300138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 346
Target Start/End: Original strand, 31933717 - 31934064
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| |    
T  31933717 tgattcatttttaaatcgttgattactgattaatgatcaataataattcatctagtaatgtctgcaatatcttagacttacaagtactattttattgttg 31933816  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||| ||||||||| |    
T  31933817 gaatccttaacatgcaaacagacttgatgatattatgtgataattttaagtgttacactttgtgcggtattatgcttataacaaggtatgataaaattag 31933916  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| | |||| |||||||||||| ||||||    
T  31933917 attaagtgtagtcttgttaatcggatgaattgatgatactataatgactgaacttttgatgtcattgtataaagagtggggtgttactcattatattttt 31934016  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcac 346  Q
    ||| | ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  31934017 gatatcatagtgttaacttcaccaaaaaaatcattctcataacttcac 31934064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 9864507 - 9864180
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||   |||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || |    
T  9864507 tgattcatttttaaattgttgattaccgattcatgattactagttattcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttacaggtactattttatcgttg 9864408  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
    | |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||      
T  9864407 gcatctttaacatgcaaacaaaattgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattat 9864308  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    |||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||    
T  9864307 attaagtgtattcttattagtctgatgaattgatgatattatggggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcacaacattttt 9864208  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttcacaaaaaa 328  Q
    |||  ||||||||||| ||||| |||||    
T  9864207 gatactatagtgttaatttcaccaaaaa 9864180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 38644337 - 38643977
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    ||||| |||||| |||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |    
T  38644337 tgatttatttttaaatttttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcattg 38644238  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
      ||||||||| |||||||| ||||| |||||| || |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| |    
T  38644237 acatctttaacttgcaaacagagttgctgatatcatatgatagtcttgagtgttacactttatggagtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattag 38644138  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||| || |  ||||||| |||| |||||||||  ||| ||||    
T  38644137 attaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggagactgaacttttgatgccactagacaaacagtggggtgttactcacaacactttt 38644038  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcc 359  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  38644037 gatgttatagtgttaacttgaccaaaaaagtcattctcatgatttcaccatagaattttcc 38643977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 34895321 - 34894966
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || |    
T  34895321 tgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatatagtaatgcttgcaacatcttgaacttacatgtactattttttcgttg 34895222  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
    | |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||     |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||| |    
T  34895221 gcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagt-----gtgttacattttgtggggtgttacacttgaaacaaggttggataaaattag 34895127  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||| || | |||||||| |||  ||||||||| |||| | ||    
T  34895126 attaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatagtatgatgactgaacttttgatgccactttacaaacagtggagtgttactcactacagtgtt 34895027  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttca-ca-aaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcc 359  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  34895026 gatgttatagtgttaacttcatcagaaaagtcattttcatgacttcaccatagaattttcc 34894966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 8803647 - 8803968
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtc 99  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  8803647 tgattcatttttaaattgttcattactgattaatgatcaatagtatattcatctggtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgtt 8803746  T
Q  100 ggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattg 199  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||     
T  8803747 ggaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtattaagtgttacactttttagggtgttacgcttagaacaaggtatgataaaatta 8803846  T
Q  200 gattaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttt 299  Q
     |||||||||||||||||||  ||||| | ||||||| |       | ||||||||||||||||||| |||||| | |||  ||||||||||||||||||    
T  8803847 tattaagtgtagtcttgttaacctgataaattgatgata-------ggctgaacttttgatgtcattctacaaatagtggagtgttactcattacatttt 8803939  T
Q  300 tgatgttatagtgttaacttcacaaaaaa 328  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8803940 tgatgttatagtgttaacttcaccaaaaa 8803968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 33 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 12876437 - 12876107
Alignment:
Q  33 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgata 132  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12876437 atgataaatagtaattcatctagtaatgcctgtaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgata 12876338  T
Q  133 ttatgtgatagtctt-aagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattggattaagtgtagtcttgttattctgatgagtt 231  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||| |||||||||||  ||| ||| |||||||| ||    
T  12876337 ttatgtgatagtctttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtatccttcttaatctgatgaatt 12876238  T
Q  232 gatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttca-ca-aaaaat 329  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||  |||||||| || ||||||||||||||||| || |||| |    
T  12876237 gatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagttgggtgttactcacaacattttttatattatagtgttaacttcatcagaaaagt 12876138  T
Q  330 cattctcatgacttcaccctaaaattttcca 360  Q
    |||| || |||||| ||| || |||||||||    
T  12876137 cattttcgtgacttaaccatagaattttcca 12876107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 272
Target Start/End: Original strand, 35459542 - 35459813
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  35459542 tgattcatttttaaattgttgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacattttggacttacagatactattttattgtcg 35459641  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
     |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||| | | |||||| ||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |    
T  35459642 aaatctttaacatacaaacagaattgatgatattatgtaatagtcttaagtgttataatctgtgggatgttacatttataacaaagtaggataaaattag 35459741  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaa 272  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35459742 attaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatattatgaggactgaacttttaatgtcattgtacaa 35459813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 40862779 - 40862457
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaa-ttgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtc 99  Q
    ||||||||||||||| ||||  |||  ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  40862779 tgattcattttttaaattgtcgattactgatttatgacaaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgtt 40862680  T
Q  100 ggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattg 199  Q
    |  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||     
T  40862679 gacatctttaacatacaaacatagttgataatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggagtgttacacttagaacaaagtaggataaaatta 40862580  T
Q  200 gattaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattaca-ttt 298  Q
    ||||||||||| | |||||| | |||  | ||||||| || |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||  ||| |||    
T  40862579 gattaagtgtatttttgttagtatgaaaaattgatgataccatga-gactgaacttttgatgccattgtacaaacagtggggtgttactcacaacatttt 40862481  T
Q  299 ttgatgttatagtgttaacttcac 322  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  40862480 ttgatattatagtgttaacttcac 40862457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 466191 - 465843
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||  | |    
T  466191 tgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaggtattattttatcattg 466092  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
    | |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||         ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |    
T  466091 gcatctttaacatgcaaacagagttgctgatat-atgtga---------gtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaatgtaagataaaattag 466002  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||| | |||||||| |||||||| || |||||||||| |||| |||||||||  ||| ||||    
T  466001 attaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaatttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacactttt 465902  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaatttt 357  Q
    |||||||| |||||||||||||   |||| ||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  465901 gatgttatcgtgttaacttcaccacaaaagtcattttaatgacttcaccataaaatttt 465843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 27 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 33906545 - 33906316
Alignment:
Q  27 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttg 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||||    
T  33906545 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttg 33906446  T
Q  127 atgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattggattaagtgtagtcttgttattctgat 226  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  33906445 atgatattatgcgatagtcttaagtgttacactttttggaatgttacccttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgat 33906346  T
Q  227 gagttgatgaaactatgaggactgaacttt 256  Q
    || ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  33906345 gaattgatgatactatgaagactgaacttt 33906316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 46 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 13307936 - 13307621
Alignment:
Q  46 attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtc 145  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| || |  || ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  13307936 attcatcttgtaatgcttgcaacatcttgaacttacgggtactattttatcgttgacat-tttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtc 13307838  T
Q  146 ttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattggattaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgag 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || || ||| ||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| | |||||| |    
T  13307837 ttaagtgttacactttgtggggtgttacatttaaaataaagtaggataaaattagattaagtgtattcttgctaatctgatgaattgataatactatggg 13307738  T
Q  246 gactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgactt 343  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| | || | |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  13307737 gactgaacttttgatgtcactgtacaaatagtgaggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctcatgactt 13307638  T
Q  344 caccctaaaattttcca 360  Q
    |||| || |||||||||    
T  13307637 caccatagaattttcca 13307621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 3 - 235
Target Start/End: Original strand, 4132519 - 4132750
Alignment:
Q  3 attcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcgga 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||     
T  4132519 attcatttttaaattgttgattacaaattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggc 4132618  T
Q  103 atctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattggat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| |||    
T  4132619 atctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttatgtgttacactttgtggggtgttacactta-aacaaggtagaataaaattagat 4132717  T
Q  203 taagtgtagtcttgttattctgatgagttgatg 235  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| ||||||    
T  4132718 taagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatg 4132750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 155 - 359
Target Start/End: Original strand, 1150090 - 1150296
Alignment:
Q  155 acactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattggattaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaact 254  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  1150090 acactttgtggggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgatgactgaact 1150189  T
Q  255 tttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaa 352  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||| || |    
T  1150190 tttgatgtcgttgtacaaacagtgggatgttactcattacatttttgatgttatagcgttaacttcaccaaaaaagtcattcttatgacttcaccataga 1150289  T
Q  353 attttcc 359  Q
    |||||||    
T  1150290 attttcc 1150296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 29 - 288
Target Start/End: Original strand, 39098978 - 39099237
Alignment:
Q  29 attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgat 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |  || ||||||||||||||| ||||| |    
T  39098978 attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacattttggacttacatatactattttatcgttgacatatttaacatgcaaacagagttgct 39099077  T
Q  129 gatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattggattaagtgtagtcttgttattctgatga 228  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  39099078 gatatcatgcgatagtcttaagtgtgatactttgtgggatgttacacttaaaacagggtaagataaaattagattaagtgtatttttgttaatctgatga 39099177  T
Q  229 gttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttact 288  Q
     |||| || ||||||||||||||||||||||||  | |||||||| | |||| |||||||    
T  39099178 attgacgatactatgaggactgaacttttgatgctagtgtacaaagagtggggtgttact 39099237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 261
Target Start/End: Original strand, 1953819 - 1954081
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||  ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| || |    
T  1953819 tgattcattttaaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggatttacaggtactattttatcgttg 1953918  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgggg-tgttacacttataacaaggtaagataaaattg 199  Q
      | |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||     
T  1953919 acaactttaacatgcaaacagagttgatgatgttatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggatgttacacttaaaacaaggtatgataaaatta 1954018  T
Q  200 gattaagtgtagtcttgttattctgatgagttgat-gaaactatgaggactgaacttttgatg 261  Q
    |||| ||||||||| | ||| |||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  1954019 gatttagtgtagtcatattaatctgatgaattgatagatactatgagggctgaacttttgatg 1954081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 44869856 - 44869577
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| |||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||| || |    
T  44869856 tgattcatttttaaattgttggttactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaatatcttggacttatcggtactattttatcgttg 44869757  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagat-aaaattg 199  Q
      |||||||||||| ||||| ||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||| ||||||||| ||| ||||||     
T  44869756 acatctttaacatggaaacaaagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacactttgtgggg-acaacacttaaaacaaggtaggataaaaatta 44869658  T
Q  200 gattaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatggg 280  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||| | ||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  44869657 gattaagtgtattattgttaatctgataaattgatgatactatgacgattgaacttttgatgtcattgtgcaaacagtggg 44869577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 6 - 166
Target Start/End: Original strand, 1149756 - 1149912
Alignment:
Q  6 cattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatc 105  Q
    ||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  1149756 catttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaagtactattttatcgttggaatc 1149855  T
Q  106 tttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggg 166  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  1149856 tttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgt----gtcttaagtgttacactttgtggg 1149912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 103 - 360
Target Start/End: Original strand, 41910921 - 41911180
Alignment:
Q  103 atctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattggat 202  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||    
T  41910921 atctttaacatgcaaacagagttggtgatatcatgtgatagtattaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagat 41911020  T
Q  203 taagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaat-gggatgttactcattacatttttg 301  Q
    ||| |||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||||  ||||||| ||||||||  | |||   || | | ||| |||||||||  ||| |||||    
T  41911021 taaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgttgactgaatttttgatgctactgttataatagtgggggtgttactcacgacacttttg 41911120  T
Q  302 atgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcca 360  Q
    ||| |||||| ||||||||||  ||||||||| | ||||||||||| | || |||||||||    
T  41911121 atgatatagtattaacttcaccaaaaaaatca-tatcatgacttcatcgtagaattttcca 41911180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 24823225 - 24823394
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  24823225 tgatttatttttaaattgttgattactgattaatgaacaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttg 24823324  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacactta 178  Q
    | ||||||        |||| ||||| |||||| |||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  24823325 gcatcttt--------aacagagttgttgatatcatgtgataatcttgagtattatactttgtggggtgttacactta 24823394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 103 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 43025959 - 43025740
Alignment:
Q  103 atctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattggat 202  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||| |||    
T  43025959 atctttaacatgcaatcagagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacattttgtggggtgttacagttaaaataaggtaggataaaattagat 43025860  T
Q  203 taagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttttga 302  Q
    ||| |||| |||| ||| |||||||| ||||||| | |||  | ||||||||||| ||  ||||||||||| | |||| | ||| |||  ||| ||||||    
T  43025859 taaatgtattcttcttagtctgatgaattgatgatattatatgaactgaacttttaataccattgtacaaagagtggggtattaatcacaacacttttga 43025760  T
Q  303 tgttatagtgttaacttcac 322  Q
    |  ||||  |||||||||||    
T  43025759 tactatatcgttaacttcac 43025740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 12587941 - 12587812
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| || |    
T  12587941 tgattcatttttaaattgttaattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaaaatctttgacttacaggtactattttatcgttg 12587842  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatga 130  Q
      |||||||||||||||| | |||||||||    
T  12587841 acatctttaacatgcaaatagagttgatga 12587812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 35859293 - 35859160
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| || |    
T  35859293 tgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaacatctcgaacttacaagtactattttatcgttg 35859194  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatatt 134  Q
    | |||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  35859193 gcatctttaacatgcaaacagatttgatgatatt 35859160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 18259438 - 18259245
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  | |||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |    
T  18259438 tgattcatttttaaattgttgattactcattactgatcaacaataattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttg 18259339  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaatt 198  Q
      || |||||||||||||   | ||| ||||||  |||||    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  18259338 acatttttaacatgcaaattaaattgctgatatcttgtga----cttaggtgttacactttgtgggatgttacacttaaaataaggtatgataaaatt 18259245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 34951888 - 34952020
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |    
T  34951888 tgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatgtagtaagacttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttg 34951987  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatat 133  Q
      |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  34951988 acatctttaacatgcaaacagagttgctgatat 34952020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 168 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 41362707 - 41362517
Alignment:
Q  168 tgttacacttataacaaggtaagataaaattggattaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattg 267  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||  || |||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |     
T  41362707 tgttacacttaaaacaaggtatgataaaattatatcaagtttagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggtctgaacttttgatgtcacta 41362608  T
Q  268 tacaaacaatgggatgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcc 359  Q
    |||||| | |||| ||||||||| ||||||||| |||   |||||||||||||||  ||||| ||||| |||| |||||||| || ||||||||    
T  41362607 tacaaatagtggggtgttactcactacattttt-atg--ctagtgttaacttcaccaaaaaagtcattttcataacttcaccatagaattttcc 41362517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 167 - 319
Target Start/End: Original strand, 34952028 - 34952180
Alignment:
Q  167 gtgttacacttataacaaggtaagataaaattggattaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcatt 266  Q
    |||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||| | |||||| ||||||| ||||   |||||||||||||||||||| |    
T  34952028 gtgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaagtgtattcttattaatttgatgaattgatgatactaaagggactgaacttttgatgtcact 34952127  T
Q  267 gtacaaacaatgggatgttactcattacatttttgatgttatagtgttaactt 319  Q
    ||||||||| |||| |||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||    
T  34952128 gtacaaacagtgggctgttactcacaacacttttgatgatatagtgttaactt 34952180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 33198161 - 33198067
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttat 95  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  33198161 tgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtgatgcttgcaacattttagacttacatgtactattttat 33198067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 238 - 363
Target Start/End: Original strand, 4133078 - 4133203
Alignment:
Q  238 actatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacaaaaaa--tcattct 335  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |  | | ||||||| ||  ||||| ||| ||  ||||||||||||| |||||  |||||||    
T  4133078 actatgaggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtcaggtattactcactatcttttttatgcta--gtgttaacttcaccaaaaaagtcattct 4133175  T
Q  336 catgacttcaccctaaaattttccataa 363  Q
     ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  4133176 gatgacttgaccataaaattttccataa 4133203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 34463792 - 34463704
Alignment:
Q  39 aatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatga 130  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||| | ||| |||||||| || |  |||||||||||||||||| |||||||||    
T  34463792 aatagtaattcatttagtaatgcttgcaaca---tggacttataggtattattttatcgttgacatctttaacatgcaaacaaagttgatga 34463704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 84 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 7998554 - 7998478
Alignment:
Q  84 gtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 160  Q
    |||||||||||| || || |||||||| ||  ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7998554 gtactattttatcgttggcatctttaatatagaaacagagttgttgatattatgtgatagtattaagtgttacactt 7998478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 12585353 - 12585298
Alignment:
Q  123 gttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacactta 178  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  12585353 gttgatgatgttatgtgatagtattaagtgttagattttgtggggtgttacactta 12585298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 296 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 15009306 - 15009240
Alignment:
Q  296 tttttgatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcca 360  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  15009306 tttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattcttatgacttcaccatagaattttcca 15009240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 41362779 - 41362723
Alignment:
Q  3 attcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 59  Q
    |||||||||| ||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41362779 attcatttttaaattgttgattactggttaatgatcaatagtaattcatctagtaat 41362723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 167 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 7998488 - 7998401
Alignment:
Q  167 gtgttacacttataacaaggtaagataaaa-ttggattaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaac 253  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||| | |||| |||| ||||    
T  7998488 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgtattgatgatattatggggaccgaac 7998401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 247 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 34463701 - 34463671
Alignment:
Q  247 actgaacttttgatgtcattgtacaaacaat 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34463701 actgaacttttgatgtcattgtacaaacaat 34463671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 267; Significance: 1e-149; HSPs: 55)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 18797662 - 18797304
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18797662 tgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttattgtcg 18797563  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  18797562 gaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacacttataacaaggtaggataaaattag 18797463  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  18797462 attaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaggattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacattttt 18797363  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcc 359  Q
     ||||  |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  18797362 tatgt--tagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcc 18797304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 7335128 - 7334769
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| |||| || |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  7335128 tgattcatttttaaattattgatttctgattaatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttattgtcg 7335029  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  7335028 gaatctttaacattcaaac-tagttgatgatattatctgataatcttaagtgttacactctgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattag 7334930  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||    
T  7334929 attaagtgtagtcttgttaagctgatgagttgatgatactatgagaactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatattt 7334830  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttca-caaaaaa-tcattctcatgacttcaccctaaaattttcc 359  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  7334829 tatgttatagtgttaacttcatcaaaaaagtcattctcacgacttcaccgtagaattttcc 7334769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 30055862 - 30055501
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  30055862 tgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 30055763  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |    
T  30055762 gaatctttaacatgcgaacaacgttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttatagcaaggtaggataaaattag 30055663  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  30055662 attaagtgtagtcttgttaatctgatgaattaatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacaatttt 30055563  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttca-caaaaaa--tcattctcatgacttcaccctaaaattttcc 359  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  30055562 gatattatagtgttaacttcatcaaaaaaagtcattcttatgacttcaccatagaattttcc 30055501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 27 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 27284053 - 27283718
Alignment:
Q  27 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttg 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  27284053 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttg 27283954  T
Q  127 atgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattggattaagtgtagtcttgttattctgat 226  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  27283953 ataatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattagattaagtatagtcttgttaatctgat 27283854  T
Q  227 gagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcac--aa 324  Q
     | ||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  27283853 aaattgataatactatgaggactgaacttttgatttcattgtacaaacggtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaa 27283754  T
Q  325 aaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcca 360  Q
    ||||||||| | || |||||||| || |||||||||    
T  27283753 aaaatcatttttataacttcaccatagaattttcca 27283718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 31578890 - 31579255
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| |||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |    
T  31578890 tgattcatttttaaattattgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtattattttatcgttg 31578989  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |    
T  31578990 gaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttatagggtgttatacttataacaaggtaggataaaattag 31579089  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgta-----caaacaatgggatgttactcattaca 295  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||      ||||| |||| ||||||||||||||    
T  31579090 attaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgtcattgtataaattaaacagtggggtgttactcattaca 31579189  T
Q  296 tttttgatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcc 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  31579190 tttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaattattcttatgacttcaccatagaattttcc 31579255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 37110209 - 37109846
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  37110209 tgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttg 37110110  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaagg--taagataaaatt 198  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || |||||||||    
T  37110109 aaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtggtagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtataggataaaatt 37110010  T
Q  199 ggattaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattt 298  Q
      ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  37110009 atattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatattataatgactgaacttttgatgtcattgtacaaacggtggggtgttactcattacattt 37109910  T
Q  299 ttgatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcca 360  Q
    || |||||||||||||||||||||  ||||| ||||| | ||||||||||| || |||||||||    
T  37109909 tttatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcatttttatgacttcaccatagaattttcca 37109846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 32820879 - 32821239
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |    
T  32820879 tgattcatttttaaattgttgattattgatgaatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttg 32820978  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| |      
T  32820979 gaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacactttatggggtgttacgcttaaaacaaggtaggataaaactaa 32821078  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||    
T  32821079 attaactgtagtcttgttaatctaatgaattgatgatactacgaggactgaacttttgatgccattgtacaaacagtggtgtgttactcactacattttt 32821178  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcc 359  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  32821179 gatgttatattgttaacttcaccaaaaaaatcattttcatgacttcaccatagaattttcc 32821239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 17842410 - 17842772
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  17842410 tgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttg 17842509  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaagg--taagataaaatt 198  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  || |||||||||    
T  17842510 aaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtggtagtcttaagtgttacactttgtgggatgttacgcttataacaaggtataggataaaatt 17842609  T
Q  199 ggattaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattt 298  Q
      ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  17842610 atattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatattataatgactgagcttttgatgtcattgtacaaacggtggggtgttactcattacattt 17842709  T
Q  299 ttgatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcc 359  Q
    || |||||||||||||||||||||  ||||| ||||| | ||||||||||| || ||||||||    
T  17842710 tttatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcatttttatgacttcaccatagaattttcc 17842772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 9355652 - 9356012
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  9355652 tgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagcaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtactattttatcgttg 9355751  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |    
T  9355752 gcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggatgaaattag 9355851  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| || | || | |||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||| | || |||| |||||||||    
T  9355852 attaagtgtagtcttgttaatctgatgaattaacgataatatgagaactaaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtattgctcactacattttt 9355951  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttcacaaaaa--atcattctcatgacttcaccctaaaattttcc 359  Q
     ||| ||||||||||| ||||| ||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9355952 tatgctatagtgttaaattcaccaaaatggtcattctcatgacttcaccataaaattttcc 9356012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 24212077 - 24211717
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtc 99  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||     
T  24212077 tgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttataggtactattttatcgtt 24211978  T
Q  100 ggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattg 199  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||||     
T  24211977 ggaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaggtgttacactttgtaggatgttacacttagaacaaggtatgataaaatta 24211878  T
Q  200 gattaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttt 299  Q
     |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| || ||||| | || ||||||||||||||||||    
T  24211877 tattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatactatgagggctgaacttttgatgccattctataaacagtagggtgttactcattacatttt 24211778  T
Q  300 tgatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttc 358  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  24211777 tgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattcttatgacttcaccatagaattttc 24211717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 7 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 10481934 - 10481619
Alignment:
Q  7 attttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatct 106  Q
    |||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||    
T  10481934 atttttaaattgttaattactgattaacgatcaatagtaattcatctagtaatacttgcaacatcttggacttacggatactattttattgttggaatct 10481835  T
Q  107 ttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattggattaag 206  Q
    || ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10481834 ttgacatgcaaagagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattagattaag 10481735  T
Q  207 tgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaat-gggatgttactcattacatttttgatgt 305  Q
     |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  10481734 cgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactataaagactgaatttttgatgtcattgtacaaacagtgggggtgttactcattatattttttatgt 10481635  T
Q  306 tatagtgttaacttca 321  Q
    ||||||||||||||||    
T  10481634 tatagtgttaacttca 10481619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 37347356 - 37346996
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||  | |    
T  37347356 tgattcatttttaaattgttaattacggattaatgatcaatagtaattcatcgagtaatgcttgcaatatcttggacttacagatactattttatcattg 37347257  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| ||| ||||||||| |    
T  37347256 gcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtggtagtcttaagtgttacactttgtggagt-ttacacttaaaacaatgtatgataaaattag 37347158  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    ||||||||||||| ||||| | | || | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  37347157 attaagtgtagtcctgttaatttaataaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcactgtacaaacaatggggtgttactcattatattttt 37347058  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcca 360  Q
    |||| |||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  37347057 gatggtatagtattaacttcaccaaaaaaatcattttcatgacttcaccataaaattttcca 37346996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 65 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 38258816 - 38258521
Alignment:
Q  65 caacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtg 164  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38258816 caacatcttggacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtg 38258717  T
Q  165 gggtgttacacttataacaaggtaagataaaattggattaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtca 264  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  38258716 gggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggattgaacttttgatgtca 38258617  T
Q  265 ttgtacaaacaatgggatgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttc 358  Q
    ||||||||||  || | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||| || |||||||    
T  38258616 ttgtacaaacggtgtggtgttactcattacattttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcatttttatgacttcaccgtagaattttc 38258521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 3 - 361
Target Start/End: Original strand, 5657309 - 5657669
Alignment:
Q  3 attcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcgga 102  Q
    |||||||||| |||| || |||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||     
T  5657309 attcatttttaaatttttgattactcattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttggc 5657408  T
Q  103 atctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattggat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||||  ||    
T  5657409 atctttaacatgcaaacatagttgctgatatcatgcgatagtcttaagtattacactttgtgggctgttacacttaaaacaaagtaggataaaattaaat 5657508  T
Q  203 taagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttttga 302  Q
    |||||||| | |||||| | |||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||||||  ||| ||||||    
T  5657509 taagtgtatttttgttaatatgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttga 5657608  T
Q  303 tgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttccat 361  Q
    ||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  5657609 tgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttccat 5657669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Original strand, 15612585 - 15612945
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  | |    
T  15612585 tgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaacaataattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaggtactattttatcattg 15612684  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
    | |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||      
T  15612685 gcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattaa 15612784  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| | |||  ||||||||||||||||| || | |||||||| |||| |||||||||| |||  |||    
T  15612785 attaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatattatagggactgaacttttgatgccactctacaaacactggggtgttactcataaca-cttt 15612883  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttcacaaaaaa--tcattctcatgacttcaccctaaaattttcca 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  15612884 gatgttatagtgttaacttcacaagaaacgttattctcatgacttcaccatagaattttcca 15612945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 21991962 - 21991611
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| |||||    |||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  21991962 tgattcatttttaaattgttgattaatgat----gatcaatagtaattcatct-----tgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 21991872  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
      |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |    
T  21991871 acatctttaacatgcaaacaaagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattag 21991772  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||||||   ||| ||||    
T  21991771 attaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgacactgtacaaacagtggggtgttactcgcaacaatttt 21991672  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcc 359  Q
    |||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21991671 gatgctatagtgttaacttcaccataaaaatcattctcatgacttcaccctagaattttcc 21991611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 32432787 - 32432432
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |    
T  32432787 tgattcatttttaaattgttgattattgattcatgattaataataattcatctagtaatgcttgcaacaccttggacttacatgtactattttatcgttg 32432688  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
    | |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||      
T  32432687 gcatctttaatatgcaaacagtgttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattat 32432588  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    ||||| |||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||    
T  32432587 attaactgtattcttgttagtctgatgaattgatgatactatggagactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatggggtgttactcacaacattttt 32432488  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcc 359  Q
    |     ||||||||||||||||   |||||||||| || |||||||||| || ||||||||    
T  32432487 g-----atagtgttaacttcaccagaaaaatcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 32432432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 4 - 347
Target Start/End: Original strand, 41764907 - 41765252
Alignment:
Q  4 ttcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaa 103  Q
    ||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || || |    
T  41764907 ttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaataataattcatccagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatgtactatttcatcgttggca 41765006  T
Q  104 tctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattggatt 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||   ||||||| ||||    
T  41765007 tctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttctggggtgttacacttaaaacaaggtagagtaaaattagatt 41765106  T
Q  204 aagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttttgat 303  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||| |||| || |||||| |||| |||||||    
T  41765107 aagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactggacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgctactcactacacttttgat 41765206  T
Q  304 gttatagtgttaacttca-ca-aaaaatcattctcatgacttcacc 347  Q
    | |||||| || |||| | || |||| |||||||||||||||||||    
T  41765207 gctatagtattgactttatcagaaaagtcattctcatgacttcacc 41765252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 11071538 - 11071182
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |    
T  11071538 tgattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg 11071439  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
       |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| |    
T  11071438 ---tctttaacatgcgaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggtaggataaaattag 11071342  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||  || ||||||    
T  11071341 attaagcgtagtgttgttaatctgatgaattgatgatactatgagaactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggagtgttactcgctatattttt 11071242  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttcac--aaaaaat-cattctcatgacttcaccctaaaatttt 357  Q
    |||| ||||||  |||||| ||  ||||||| |||| ||||||||||||| || ||||||    
T  11071241 gatgatatagtactaactttaccaaaaaaatacattttcatgacttcaccatagaatttt 11071182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 23111527 - 23111177
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| || |    
T  23111527 tgattcatttttaaattgttgattactgatttatgatcaatagtaattcttctagtaatgctttcaacatctttgatttacatgtactattttatcgttg 23111428  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggta--agataaaatt 198  Q
      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||  | ||||||||    
T  23111427 ttatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaacaaagtatgatataaaatt 23111328  T
Q  199 ggattaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattt 298  Q
     |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| |||| || |  ||||||||||||| ||||||||||| | |||  |||||||||  | ||||    
T  23111327 agattaagtgtagtcttgttaatctaatgaattgatgatactacgatggttgaacttttgatgccattgtacaaatagtggtgtgttactcacaatattt 23111228  T
Q  299 ttgatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcacc 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||    
T  23111227 ttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattttcatgacttcacc 23111177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 8861620 - 8861258
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |    
T  8861620 tgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatttcatctagtaatgcatgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttg 8861521  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
    | |||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||| ||||||||| |    
T  8861520 gtatctttaacatgcaaagagagttgctgatatcatgtgatggtcttgagtgttacactttgcggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattag 8861421  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    ||||| |||| | |||||| |||||| | ||||||| |||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||| |||| ||||| |||| ||| ||||    
T  8861420 attaaatgtattgttgttaatctgattaattgatgatactatggggacttaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttattcataacactttt 8861321  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttccat 361  Q
    |||| ||||||||||||||| |   |||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  8861320 gatgctatagtgttaacttcgcgagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttccat 8861258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 3 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 4583252 - 4582893
Alignment:
Q  3 attcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcgga 102  Q
    |||||||||| ||||||| ||   ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||| || || |      
T  4583252 attcatttttaaattgttgatgactgattcatgattaatagtaattcatccagtaatgcttgcaacatcttgaacttacaaatattatttgatcgttgac 4583153  T
Q  103 atctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattggat 202  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||    
T  4583152 atctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagat 4583053  T
Q  203 taagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttttga 302  Q
    ||| |||| |||||||| |||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||  ||||||||||    
T  4583052 taaatgtattcttgttagtctgatgaattgttgatactatggggactgaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacatttttga 4582953  T
Q  303 tgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcca 360  Q
    |  |||||| ||||||||||   |||| ||||| || |||||||||| || |||||||||    
T  4582952 tactatagtattaacttcaccagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcca 4582893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 46 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 43686330 - 43686016
Alignment:
Q  46 attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtc 145  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| || |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  43686330 attcatccagtaatgcttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagtt 43686231  T
Q  146 ttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattggattaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgag 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| |||| |||||||| |||||||| ||| ||| |||||  |    
T  43686230 ttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttgatactatagg 43686131  T
Q  246 gactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttca--caaaaaatcattctcatgactt 343  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||| || ||||||    
T  43686130 gactgaacttttgatgccattgtacaaacagtggg-tgttactcacaacatttttgatattatagtgttaacttcacccaaaaagtcattttcgtgactt 43686032  T
Q  344 caccctaaaattttcc 359  Q
    |||| || ||||||||    
T  43686031 caccatagaattttcc 43686016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 2 - 343
Target Start/End: Original strand, 48928124 - 48928466
Alignment:
Q  2 gattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcgg 101  Q
    |||| |||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||    
T  48928124 gatttatttttaaattgttgattgttgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactatttcatcgttgg 48928223  T
Q  102 aatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgga 201  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||    
T  48928224 catttttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagcattacactttctgaggtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattaga 48928323  T
Q  202 ttaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttttg 301  Q
    ||||||| | |||||||| |||||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||| | |||| || |||||| |||| |||||    
T  48928324 ttaagtgcaatcttgttaatctgatgaattgataatactatg-ggactgaacttttgatggcaccgtacaaatagtggggtgctactcactacacttttg 48928422  T
Q  302 atgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgactt 343  Q
    ||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||||||||    
T  48928423 atgttatagtgttgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 48928466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 6546854 - 6546493
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||| || |    
T  6546854 tgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcctcatcttagacttacaggtactattttatcgttg 6546755  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
    | ||||||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |    
T  6546754 gcatctttaacatacaaacagagttgctgatatcatgtgataatattaagtgttatactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattag 6546655  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    ||||| |||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||||   | | |||||||||||| | |||||||| | |||| ||||||||   ||| ||||    
T  6546654 attaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggatagtaaacttttgatgttactgtacaaatagtggggtgttactcgcaacactttt 6546555  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcca 360  Q
    |||| |||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  6546554 gatgctatagtgttaacttcactagaaaaatcattcttatgacttcaccatagaattttcca 6546493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 22687566 - 22687228
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  22687566 tgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctattaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttg 22687467  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
    | ||| ||||||         ||||| |||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |    
T  22687466 gcatccttaacag--------agttgttgatatcatgagatagtcttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattag 22687375  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    |||||||||| | |||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||  || || ||||||| |||  |||||||||  ||||||||    
T  22687374 attaagtgtattattgttaatctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgataccactgcacaaacagtggagtgttactcacaacattttt 22687275  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttca-ca-aaaaatcattctcatgacttca 345  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||    
T  22687274 gatgttatagtgttaacttcatcagaaaagtcattctcatgacttca 22687228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 361
Target Start/End: Original strand, 10359040 - 10359402
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| || |    
T  10359040 tgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaaatcatttagtaatgcttgcaaaatcttggacttacaagtactaatttatcgttg 10359139  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
      |||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |    
T  10359140 acatctttaacatgcaaacagagttgatgttgttatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtatgataaaattag 10359239  T
Q  201 a-ttaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttt 299  Q
    | |||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| |||| ||| | | |||||||||||| |||| |||    
T  10359240 atttaagtgtagtcttgttgatctgatgaattgatgatactatca-gactgaacttttgatgtcactgtataaatagtaggatgttactcactacacttt 10359338  T
Q  300 tgatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttccat 361  Q
    ||||| ||||   |||| || ||   |||| ||||| ||||||||||||| || ||||||||||    
T  10359339 tgatgctataagattaattttaccagaaaagtcattatcatgacttcaccatagaattttccat 10359402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 30 - 358
Target Start/End: Original strand, 33688117 - 33688446
Alignment:
Q  30 ttaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatg 129  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |  ||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  33688117 ttaatgatcaatagcaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcattgacatctttaacttgcaaacagagttgctg 33688216  T
Q  130 atattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattggattaagtgtagtcttgttattctgatgag 229  Q
    |||| || |||||||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||     
T  33688217 atatcatatgatagtcttgaatgttacactttatggagtgttacacttaaaacaaagtatgataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaa 33688316  T
Q  230 ttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcaca-aaaaa 328  Q
    ||||||| |||||   |||||||||||||||| || || ||||||| | ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  || ||||     
T  33688317 ttgatgatactatagagactgaacttttgatgccactggacaaacagtaggatgttactcataacacttttgatgttatagtgttaacttaccagaaaag 33688416  T
Q  329 tcattctcatgacttcaccctaaaattttc 358  Q
    |||||||||| |||||||| || |||||||    
T  33688417 tcattctcataacttcaccatataattttc 33688446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 31520567 - 31520909
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || |    
T  31520567 tgattcatttttaaattgttaattacggattaatgatcaatagtaattcatcgagtaatgcttgcaacatcttggacttacagatactattttatcgttg 31520666  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
    | |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||                 |||||||||||| ||||||||| ||||||||| |    
T  31520667 gcatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaa-----------------gtgttacacttaaaacaaggtatgataaaattag 31520749  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    ||||||||||||||||||| | | |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| || ||||||    
T  31520750 attaagtgtagtcttgttaatttaatgaattgatgatactatg-ggactgaacttttgatgtcactgtacaaacaatggagtgttactcactatattttt 31520848  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcc 359  Q
    |||| |||||| ||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||    
T  31520849 gatggtatagtattaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcatcataaaattttcc 31520909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Original strand, 25691370 - 25691729
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||  |||||||| ||      
T  25691370 tgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacattttgaacttacatgtgttattttatcgtta 25691469  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
      ||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| |    
T  25691470 acatctttaacgtgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgtgacactttgtggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattag 25691569  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatg-ggatgttactcattacatttt 299  Q
    ||||| |||| | |||||| | |||||| ||||| | ||||| || |||||||| |||||| || |||||||||| || ||   |||||||  | | |||    
T  25691570 attaaatgtatttttgttaatatgatgaattgataatactataagaactgaactgttgatgccactgtacaaacagtgaggtaattactcacaatacttt 25691669  T
Q  300 tgatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaatttt 357  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25691670 tgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattctcatgacttcaccataaaatttt 25691729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 5 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 12166074 - 12165726
Alignment:
Q  5 tcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaat 104  Q
    |||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| || |  ||    
T  12166074 tcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacagatactattttatcgttgtcat 12165975  T
Q  105 ctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattggatta 204  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| |||||    
T  12165974 ctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtga---------gtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagatta 12165884  T
Q  205 agtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttttgatg 304  Q
    |||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||    ||||| ||||||||||| || |||||||||| |||| |||||||||  ||| ||| ||||    
T  12165883 agtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatacttaagggacttaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacactttggatg 12165784  T
Q  305 ttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcca 360  Q
     |||||||||||||||||   |||| ||||| | | ||||||||| || |||||||||    
T  12165783 ctatagtgttaacttcaccagaaaagtcattttaacgacttcaccgtagaattttcca 12165726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 2 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 35353442 - 35353122
Alignment:
Q  2 gattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcgg 101  Q
    ||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |     
T  35353442 gattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtgattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaaatgtactattttatcgttga 35353343  T
Q  102 aatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgga 201  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||    |  |  |    
T  35353342 catctttaacatgcaaatatagttgatgatattatgagatagtcttaagtgttacattttctggggtgttacacttaaaacaaggtaagtgttacatcta 35353243  T
Q  202 ttaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactg-aacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
     ||| || |||||||||| |||||||| ||| ||| |||||| |||| | ||||||||||  ||| |||||||||||||| || |||||| |||| ||||    
T  35353242 gtaa-tgcagtcttgttaatctgatgaattggtgatactatggggacagaaacttttgattccatcgtacaaacaatggggtgctactcactacactttt 35353144  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttcac 322  Q
    |||| ||||||||| |||||||    
T  35353143 gatgctatagtgttgacttcac 35353122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 3 - 228
Target Start/End: Original strand, 37703326 - 37703551
Alignment:
Q  3 attcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcgga 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| || |      
T  37703326 attcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacagatactattttatcgttgac 37703425  T
Q  103 atctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattggat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||| || ||||||||| |||    
T  37703426 atctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtggtacactttgtgggatgttacacttaaaataagatatgataaaattagat 37703525  T
Q  203 taagtgtagtcttgttattctgatga 228  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||    
T  37703526 taagtgtagtcttattaatctgatga 37703551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 3 - 243
Target Start/End: Original strand, 15672587 - 15672830
Alignment:
Q  3 attcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactatt---ttattgtc 99  Q
    |||||||||| ||||||| |||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||   |||| ||     
T  15672587 attcatttttaaattgttgattattgatgcatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattattttatcgtt 15672686  T
Q  100 ggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattg 199  Q
    || ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||     
T  15672687 ggcatctttaacattcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggagtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatta 15672786  T
Q  200 gattaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatg 243  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  15672787 gattaagtgtattcttgttagtctgatgaattgatgatactatg 15672830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 29173857 - 29173554
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || |    
T  29173857 tgattcatttttaaattgttgattactgattcatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacagatactattttatcgttg 29173758  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
    | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||                 |||| ||||||| ||||||||| ||||||||| |    
T  29173757 gcat-tttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaa-----------------gtgtaacacttaaaacaaggtaggataaaattag 29173676  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    |||||||||| |||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||  ||| ||||    
T  29173675 attaagtgtattcttgttagtttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggagtgttactcacaacactttt 29173576  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttcac 322  Q
    |||  || ||||||||||||||    
T  29173575 gatactacagtgttaacttcac 29173554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 4 - 359
Target Start/End: Original strand, 12390478 - 12390816
Alignment:
Q  4 ttcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaa 103  Q
    ||||||||| |||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || |    
T  12390478 ttcatttttaaattgtcaattactgattaatgataaatagtaattcatctagtaatggttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcattggca 12390577  T
Q  104 tctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattggatt 203  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||  |||||||||||                 |||||||| || ||||||  |||||||| ||||    
T  12390578 tctttaacatgcaagctgagttgatgatattatgtga--gtcttaagtgt-----------------tacacttaaaagaaggtagaataaaattagatt 12390658  T
Q  204 aagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttttgat 303  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||| ||||  |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  12390659 aagtgtagtcttgttaatctgatgaattgataatactatggggacataacttttgatgtcactgcacaaacagtgggatgttactcattacacttttgat 12390758  T
Q  304 gttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcc 359  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| ||  ||| ||||||||||| || ||||||||    
T  12390759 gttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcgatctgatgacttcaccatagaattttcc 12390816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 43925430 - 43925167
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||| |||||||| || |    
T  43925430 tgattcatttttaaattgttgattagtgattcatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggac------gtattattttatcgttg 43925337  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||| || ||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||||||| |    
T  43925336 gcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgattgtattaagtattaaacgttgtgaggtgttgcacttaaaacaaggtatgataaaattag 43925237  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtaca 271  Q
    |||||||||| | |||||| |||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  43925236 attaagtgtattattgttagtctgat-agttgatgatactatgtagactgaacttttgatgtcattgtaca 43925167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 80 - 358
Target Start/End: Original strand, 48928469 - 48928748
Alignment:
Q  80 acatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttat 179  Q
    |||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||     
T  48928469 acatgtactattttatcgttggcatttttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagcattacactttctgaggtgttacacttaa 48928568  T
Q  180 aacaaggtaagataaaattggattaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgg 279  Q
    || || ||| ||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||| | |||    
T  48928569 aataatgtaggataaaattagattaagtgcaatcttgttaatctgatgaattgataatactatg-ggactgaacttttgatggcaccgtacaaatagtgg 48928667  T
Q  280 gatgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttc 358  Q
    | || |||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||   |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  48928668 ggtgctactcactacacttttgatgttatagtgttgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccataaaattttc 48928748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 27 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 44598973 - 44598741
Alignment:
Q  27 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttg 126  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||||||| |||||    
T  44598973 tgattaatgatcaatagt--ttcatctagtaatgcttgtaacatcttagacttacatgtattattttatcgttgtcatctttaacatgcaaacagagttg 44598876  T
Q  127 atgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattggattaagtgtagtcttgttattctgat 226  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||    
T  44598875 ttgatatcatgtgatagtcttaggtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaaatgtattcttgttaatctgat 44598776  T
Q  227 gagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatg 261  Q
    || || |||| |||||| ||| |||| ||||||||    
T  44598775 gaatttatgatactatggggattgaatttttgatg 44598741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 108 - 363
Target Start/End: Original strand, 27421313 - 27421569
Alignment:
Q  108 taacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattggattaagt 207  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||||    
T  27421313 taacatgcaaacagagttgctgatatcatacgatagtcttaagtgttacactttgtgggatgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaagt 27421412  T
Q  208 gtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttttgatgtta 307  Q
    ||| |||||||| |||||| | || |||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||  ||| |||||||||||    
T  27421413 gtattcttgttaatctgataaatttatgatattat-aggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggagtgttactcacaacacttttgatgtta 27421511  T
Q  308 tagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttccataa 363  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||| || |||||| |||||    
T  27421512 tagtgttaacttcaccaaaaaaatcattatcacgacttcaccatagaatttttcataa 27421569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 7 - 228
Target Start/End: Original strand, 46480961 - 46481182
Alignment:
Q  7 attttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatct 106  Q
    |||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |  ||||    
T  46480961 atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttgacatct 46481060  T
Q  107 ttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattggattaag 206  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||| |||  ||||||||  || |||    
T  46481061 ttaacatgcaaacaaagttaatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttatgagatgttacacttaaaacaatgtagaataaaattacatcaag 46481160  T
Q  207 tgtagtcttgttattctgatga 228  Q
    | ||||||||||| ||||||||    
T  46481161 tatagtcttgttaatctgatga 46481182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 26587918 - 26588126
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| || |    
T  26587918 tgatttatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcctgcaacatcttggacttacatgtattattttatcgttg 26588017  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
    | ||||||        |||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |    
T  26588018 gcatcttt--------aacagagttgttgatatcatgtgatagtcttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattag 26588109  T
Q  201 attaagtgtagtcttgt 217  Q
    |||||||||| ||||||    
T  26588110 attaagtgtattcttgt 26588126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 46 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 38053751 - 38053494
Alignment:
Q  46 attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtc 145  Q
    ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  38053751 attcatcaaataatgtttgcaacatcttggacttacaggtactattttattgttggaatctttaacatccaaatagagttgatgatattatgtgatagtc 38053652  T
Q  146 ttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattggattaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgag 245  Q
    |||||||||||                 ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||        | ||||||| ||||||||    
T  38053651 ttaagtgttac-----------------acttataacaaagtatgataaaattagattaagtgtagtcttgtta--------atttgatgacactatgag 38053577  T
Q  246 gactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacaaaaaa 328  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| | || | ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||    
T  38053576 aactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtagggttttactcattacattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaa 38053494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 106 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 37704387 - 37704175
Alignment:
Q  106 tttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattggattaa 205  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||||    
T  37704387 tttaacatgcaaacagagttgatgatattatatgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattaaattaa 37704288  T
Q  206 gtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattaca-tttttgatg 304  Q
    |||||||||||||| |||||| | ||||||| |||||| ||||||||         ||  ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||    
T  37704287 gtgtagtcttgttaatctgataaattgatgatactatggggactgaa---------tc--tgtacaaacaatggggtgttactcactacatttttttatg 37704199  T
Q  305 ttatagtgttaacttcacaaaaaa 328  Q
     |||||||||||||||| ||||||    
T  37704198 ctatagtgttaacttcataaaaaa 37704175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 26980641 - 26980337
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||   ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| || |    
T  26980641 tgattcatttttaaattgttgattaccgattaatgatcaacaataattcatctagtaatacttgcaacatcttagacttacagatactattttatcgttg 26980542  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
      |||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||                 ||||| |||||||||  |||||||| |    
T  26980541 acatctttaacatgcaaatagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttac-----------------acttaaaacaaggtagaataaaattag 26980459  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    |||||||||| |||||||| | |||||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||| || |||||||||  |||| |||||||||  ||| ||||    
T  26980458 attaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattatggggactgaacttttgatgccactgtacaaaccgtggggtgttactcacaacactttt 26980359  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttcac 322  Q
    |||| |||| ||||||||||||    
T  26980358 gatgctataatgttaacttcac 26980337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 147 - 357
Target Start/End: Original strand, 44413351 - 44413564
Alignment:
Q  147 taagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattggattaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgagg 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||||| |||| || ||||||  |    
T  44413351 taagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtagccttgttaatttgatgaattgaagatactatggag 44413450  T
Q  247 actgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttc---acaaaaaatcattctcatgactt 343  Q
    || ||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||   | ||||| ||||| |||||||||    
T  44413451 accgaacttttgatttcagtgtacaaacattggggtgttactcactatatttttgatgttatagtgttaacttcattaaaaaaagtcattttcatgactt 44413550  T
Q  344 caccctaaaatttt 357  Q
     ||| || ||||||    
T  44413551 taccatagaatttt 44413564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 160
Target Start/End: Original strand, 32593040 - 32593191
Alignment:
Q  9 tttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatcttt 108  Q
    |||| ||||||| |||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||  || |  ||||||    
T  32593040 ttttaaattgttgattgctgattaatgatccatagtaatttatctagtaatatttgtaacatcttggacttacatgtactattttaacgttgacatcttt 32593139  T
Q  109 aacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32593140 aacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacactt 32593191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 3 - 144
Target Start/End: Original strand, 44411368 - 44411509
Alignment:
Q  3 attcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcgga 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| || ||     
T  44411368 attcatttttaaattgttgattactgattaatggtcaatattaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacagataatattttatcgttggc 44411467  T
Q  103 atctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagt 144  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44411468 atctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagt 44411509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 37704517 - 37704387
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||| | ||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || |    
T  37704517 tgattcatttgtaaattgttgattactaattaatgatcaatagtaattcatctggtaatgcttgcaacatcttggacttacagatactattttatcgttg 37704418  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgat 131  Q
    | |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  37704417 gcatctttaacatgcaaatagagttgatgat 37704387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Original strand, 34362004 - 34362123
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||| || |    
T  34362004 tgattcatttttaaattgttaatgactgattaatgatcaaaagtaattcatctagtaatgtttgcaatatcttggacttacagatactattttatcgttg 34362103  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaaca 120  Q
      || |||||||||||||||    
T  34362104 atatttttaacatgcaaaca 34362123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 212 - 359
Target Start/End: Original strand, 26524364 - 26524513
Alignment:
Q  212 tcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttttgatgttatagt 311  Q
    |||||||| | |||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||  ||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  26524364 tcttgttaatatgataaattgatgatactatgaggactggacttttgatgccactgcacaaacaatggagtgttagtcacaacatttttgatgttatagt 26524463  T
Q  312 gttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcc 359  Q
    |||||| ||||   |||| ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  26524464 gttaacatcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcc 26524513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 361
Target Start/End: Original strand, 34362205 - 34362336
Alignment:
Q  231 tgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttttgatgttatagtgttaactt--cacaaaaaa 328  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| |||| || |||||||||| |||| |||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||  |   ||||     
T  34362205 tgatgatactatgagaactgaacttt-gatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgctatagtgttaactttcctagaaaag 34362303  T
Q  329 tcattctcatgacttcaccctaaaattttccat 361  Q
    |||||||||| | |||||| || ||||||||||    
T  34362304 tcattctcataatttcaccatagaattttccat 34362336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 29 - 93
Target Start/End: Original strand, 27421219 - 27421283
Alignment:
Q  29 attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactatttt 93  Q
    |||||||||||||| || ||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27421219 attaatgatcaatattatttcatcttgtaacatttgcaacatcttggacttacatgtactatttt 27421283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 314
Target Start/End: Original strand, 32593194 - 32593327
Alignment:
Q  180 aacaaggtaagataaaattggattaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgg 279  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||| || ||| ||| || |||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||||  ||   || ||||| |||    
T  32593194 aacaaggtatgataaaattagattaaatgcagttttgataatctgatgaattgatgatactgtga-gactgaacttttgataccaccatataaacagtgg 32593292  T
Q  280 gatgttactcattacatttttgatgttatagtgtt 314  Q
    | || |||||| |||| |||| ||| |||||||||    
T  32593293 ggtgctactcactacacttttaatgctatagtgtt 32593327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 38258914 - 38258867
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaatt 48  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  38258914 tgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaatt 38258867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 64)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 22973897 - 22974257
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22973897 tgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 22973996  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||| |    
T  22973997 aaatctttaacatgcaaacagagttgataatattatgtaatagtcttaagtgttacattttgtgaggtgttacgcttataacaagataggataaaattag 22974096  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  22974097 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgataatatgagaattgaacttttgatgttattgtacaaacagtgggatgttactcattactttttt 22974196  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcc 359  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  22974197 gatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcattctcataacttcaccatagaattttcc 22974257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 358
Target Start/End: Original strand, 31705427 - 31705785
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |    
T  31705427 tgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatatgtactattttatctttg 31705526  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||| |    
T  31705527 gaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatggtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattag 31705626  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  | || |||||||| ||||||||||    
T  31705627 attaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatacta-gaggactggacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttacattttt 31705725  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttc 358  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||| || |||||||    
T  31705726 gatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcatttttatgacttcaccatagaattttc 31705785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 38528052 - 38528411
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  38528052 tgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtactattttatcgttg 38528151  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
      |||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |    
T  38528152 atatctttaacatgtaaatagatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttgaaacaaggtaagataaaattag 38528251  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  38528252 attaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatga-gactgaacttttgatgtcactgtataaacaatggggtgttactcattacaatttt 38528350  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttca-ca-aaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcc 359  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  38528351 gatgttatagtgttaacttcatcagaaaaaccattttcatgacttcaccatagaattttcc 38528411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 699510 - 699152
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || |    
T  699510 tgattcatttttaaattgttaattactgattaataatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacagatactattttatcgttg 699411  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || |||||| ||||||||| |    
T  699410 gcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtattacactttgtggagtgttacacttaaaataaggtatgataaaattag 699311  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| || ||||||    
T  699310 attaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatattatgatgactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactcactagattttt 699211  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttca-ca-aaaaatcattctcatgacttcaccctaaaatttt 357  Q
     ||| |||||||||||||||| || |||| |||||||||| |||||||| |||||||||    
T  699210 tatgctatagtgttaacttcatcagaaaagtcattctcataacttcaccataaaatttt 699152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 24886447 - 24886102
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24886447 tgattcatttttaaattgttgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgttg 24886348  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||                 |||||||| |||||| ||||||||| |    
T  24886347 gaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac-----------------acttataataaggtaggataaaattag 24886265  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  24886264 attaagtgtagtcttgttaatatgatgagttgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacattttt 24886165  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttcac----aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcc 359  Q
    ||||||||||| ||||||||||    ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  24886164 gatgttatagtattaacttcaccaaaaaaaagtcattctcatgatttcaccataaaattttcc 24886102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 4 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 5830249 - 5829896
Alignment:
Q  4 ttcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaa 103  Q
    ||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  5830249 ttcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggaa 5830150  T
Q  104 tctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattggatt 203  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||    
T  5830149 tctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtaagataaaatgagatt 5830050  T
Q  204 aagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttttgat 303  Q
    |||||||||||||||         | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||| ||    
T  5830049 aagtgtagtcttgtt---------aattgatgatactatgaggactaaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcattacattttttat 5829959  T
Q  304 g----ttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcca 360  Q
    |    ||||| ||||||||||||  ||||||||||| | | |||||||||||| |||||||||    
T  5829958 gttaattataatgttaacttcaccaaaaaaatcatttttacgacttcaccctagaattttcca 5829896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 12910715 - 12910350
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |    
T  12910715 tgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgttcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtattattgtattgttg 12910616  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
    | ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |    
T  12910615 gcatctttaacatacaaccagagttgatgatattatgtgatagtcttaggtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattag 12910516  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtc-----attgtacaaacaatgggatgttactcattaca 295  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||     | |||||||||| |||| |||||| || || |    
T  12910515 attaagtgtagtcatgttaatctgatgaattgacgatactatgaggactgaacttttgatgtcactgtactgtacaaacagtggggtgttacgcactata 12910416  T
Q  296 tttttgatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcc 359  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  12910415 tttttgatgttatagttttaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaattttcc 12910350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 22255542 - 22255214
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  22255542 tgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaaggcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 22255443  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  || | ||||||| |    
T  22255442 gaatatttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatagttttaagtgttacactttgtgtggtgttacgcttataacaaaataggctaaaattag 22255343  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacat-ttt 299  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||    
T  22255342 attaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgataatatgagaactgaacttttgatgccattgtacaaacggtggggtgttactcattacattttt 22255243  T
Q  300 tgatgttatagtgttaacttcacaaaaaa 328  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||    
T  22255242 tgatgttataatgttaacttcaccaaaaa 22255214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 22981153 - 22980794
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |    
T  22981153 tgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaataataattcatctagtaatgattgcaacatcttggacttacatatactattttatcgttg 22981054  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
    | |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |    
T  22981053 gcatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgaggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattag 22980954  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| |||| | ||||||| |  ||||||    
T  22980953 attaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtcattgctcaaacagtggggtattactcactgtattttt 22980854  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttc 358  Q
    |||  |||||||||||||||||   |||| |||||||||| |||||| | ||||||||||    
T  22980853 gatactatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcataacttcatcataaaattttc 22980794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 17157846 - 17158208
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || |    
T  17157846 tgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaataataattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaaaagtactattttatcgttg 17157945  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
     |||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||      
T  17157946 aaatctttatcatgcaaacagagttgataatattatgtgatggtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataataaggtaagatacaattat 17158045  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||    
T  17158046 actaagtgtagtcttgttaatctgatgaattaatgatactataatgac-gaacttttgatgtcattgtacaaacggtggagtgttactcattacattttt 17158144  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttcacaaaa-----aatcattctcatgacttcaccctaaaattttcc 359  Q
     |||||||||||||||||||||||||     ||||||| | ||||||||||| || ||||||||    
T  17158145 tatgttatagtgttaacttcacaaaaaaaaaaatcatttttatgacttcaccatagaattttcc 17158208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 27318303 - 27318650
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaa-ttgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtc 99  Q
    |||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  |||||  ||||||||||||| ||     
T  27318303 tgattcatttttaaaattgttgatttttgattaatgatcaatagtaattcatatagtaatgtttgcaacatcttaaactta--tgtactattttatcgtt 27318400  T
Q  100 ggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattg 199  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||||||     
T  27318401 gaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaataaggtaggataaaatta 27318500  T
Q  200 gattaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttt 299  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||    
T  27318501 gattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactgtgagaactaaacttttgatgtcattgtacaaacagtggtgtgttactcactacatttt 27318600  T
Q  300 tgatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcacc 347  Q
    | ||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  27318601 ttatgttttagtgttaacttcaccagaaaaatcattctcatgacttcacc 27318650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 35826301 - 35826658
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  35826301 tgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttg 35826400  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||  |||||||| |    
T  35826401 aaatctttaacatgcaaacagagttgatgatatta--tgataatcttaagggttacactttgtggagtgttacgcttaaaacaatgtagaataaaattag 35826498  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    ||||| ||| || |||||| ||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||| |||||||||    
T  35826499 attaaatgtggtattgttaatct-atgaactgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcactgtacaaacaatgaagtgttactcagtacattttt 35826597  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttcacaaaaaa--tcattctcatgacttcaccctaaaattttcc 359  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  35826598 gatgttatagtattaacttcacaaaaaaagtcattatcatgacttcaccatagaattttcc 35826658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 43308475 - 43308815
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  43308475 tgattcgtttttaaattgttgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttcgacttacaggtactattttattgtcg 43308574  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||||||||        ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  43308575 gaatctttaacatgcaagaagagttgatgatat--------agtcttaagtgttacacttttcagggtgttacacttataacaaggtaagataaaattag 43308666  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    ||||||| |||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| ||||| |||||||||||||    
T  43308667 attaagtatagttttgttaagctgatgagttgatgatactatgaggactgaacttttgatgccattgtacgaacagtggg-tgttattcattacattttt 43308765  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttcac---aaaaaatcattctcatgacttcacc 347  Q
    ||||||||| ||||||||| ||   ||||| |||||||||||||||||||    
T  43308766 gatgttataatgttaactttactaaaaaaagtcattctcatgacttcacc 43308815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Original strand, 7208679 - 7209037
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |    
T  7208679 tgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaataataattcatctagtaatacttgcaacatcttgaacttacatgtactattttatcgttg 7208778  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |    
T  7208779 gaatctttaacatgcaaacagagttgaaaatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacgtttataacaaggtaggataaaattag 7208878  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  | || |||||||| || |||||||    
T  7208879 attaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatacta-gaggactgaacttttgatgtcaatgtacaaacggtagggtgttactcgttgcattttt 7208977  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttcac---aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaatttt 357  Q
     |||||| | ||||||||||||   ||||| ||||| | ||||||||||| || ||||||    
T  7208978 tatgttacaatgttaacttcaccaaaaaaagtcatttttatgacttcaccgtagaatttt 7209037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 363
Target Start/End: Original strand, 31786461 - 31786825
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || |    
T  31786461 tgattcatttttaaattgttgattactgattaatgaacaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttg 31786560  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
    | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||| |    
T  31786561 gcatctttaacatgcaatcagagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtagggtgttacacttaaaacaagataggataaaattag 31786660  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||||    | |||| |||||||||    
T  31786661 attaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggcagtgctcactacattttt 31786760  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttccataa 363  Q
     ||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||||  |||||||  || ||||||||||||    
T  31786761 catgctatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcactacttcactatagaattttccataa 31786825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 33908592 - 33908245
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  33908592 tgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtaatt-atctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttg 33908494  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| |    
T  33908493 gcatctttaacatacaaacatagttgacgatattatgcgatagtcttaagtgttacactttctggggtgttacatttaaaacaaggtatgataaaattag 33908394  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    |||||||| |||||||||| |||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||  || |||||| |||| ||||    
T  33908393 attaagtgcagtcttgttaatctgaataattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggagtgctactcactacactttt 33908294  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttcacaaaaaa--tcattctcatgacttcacc 347  Q
    |||| ||||||||| ||||||| | |||  |||||||||||||||||||    
T  33908293 gatgatatagtgttgacttcaccagaaagttcattctcatgacttcacc 33908245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 19120219 - 19119859
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||| || |    
T  19120219 tgattcatttttaaattgttgatcactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagactttgaggtactattttatcgttg 19120120  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
    | |||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| |    
T  19120119 gcatctttaacatgcaaacggagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttatacttaaaacaaggtaggataaaattag 19120020  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    | ||||| || |||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||    ||| ||||    
T  19120019 agtaagtttattcttgttaatctgatgaattgatgacactatggggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactagcaacactttt 19119920  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcc 359  Q
    |||| |||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  19119919 gatgctatagtgttaacttcaccacaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcc 19119859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 3 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 36867120 - 36866761
Alignment:
Q  3 attcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcgga 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||  ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||| || |      
T  36867120 attcatttttaaattgttgattactgattcatgattaatagtaattcatccagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttgac 36867021  T
Q  103 atctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattggat 202  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||    
T  36867020 atctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagat 36866921  T
Q  203 taagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttttga 302  Q
    ||| |||| |||||||| |||||||| ||| ||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||  | ||||||||    
T  36866920 taaatgtattcttgttagtctgatgaattgttgatactatcgggactgaacttttgatgccattgtacaaacagtggggtgttactcacaatatttttga 36866821  T
Q  303 tgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcca 360  Q
    | ||||||||||||||||||   |||||||||| || |||||||||| || |||||||||    
T  36866820 tattatagtgttaacttcaccagaaaaatcattttcgtgacttcaccatagaattttcca 36866761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 30969139 - 30969485
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||  |||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |  |||||||||||||| |    
T  30969139 tgattcatttttaaattgtggattactgattaatgattaatagtaactcatctagtaatacttgcagcatcttgaacttatagatactattttattgttg 30969238  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
      |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |    
T  30969239 acatctttaacatgcaaacaaagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacacttaaaacaaagtaggataaaattag 30969338  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| |||||||||  ||| ||||    
T  30969339 attaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtataaatagtggggtgttactcacaacactttt 30969438  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttca 345  Q
    ||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||    
T  30969439 gatgttatagtgttaacttcaccagataaatcattctcatgacttca 30969485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 8741700 - 8742062
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |    
T  8741700 tgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatttcatctagtgatgcttgcaacattttggacttacatgtactattttatcgttg 8741799  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatatt-atgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattg 199  Q
      |||||||||||||||||| ||||| | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||||     
T  8741800 acatctttaacatgcaaacagagttgctcataatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacacttaaaacaaggtatgacaaaatta 8741899  T
Q  200 gattaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaat-gggatgttactcattacattt 298  Q
    |||||| |||| |||||||| | |||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||| ||    
T  8741900 gattaattgtattcttgttaatttgatgaattgatgatactatggagactgaacttttgatgccattgtacaaacaatgggggtgttactcacaacactt 8741999  T
Q  299 ttgatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcc 359  Q
    |||||| |||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  8742000 ttgatgctatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcc 8742062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 27330664 - 27330306
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  27330664 tgattcatttttaaatcgttcattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtaccattttattgttg 27330565  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
     ||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||||  |||||||| |    
T  27330564 aaatctttaacatgcaaatagagttgctgatatcatgcgatagtcttaagtgtgacacttcatggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattag 27330465  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    |||||||||| |||  ||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |  | |||||||||  ||| ||||    
T  27330464 attaagtgtattctcattaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccattgtacaaacagtaaggtgttactca--acactttt 27330367  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcc 359  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||| |||||| || ||||||||| || ||||||||    
T  27330366 gatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcattcccacgacttcaccatagaattttcc 27330306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 3 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 40133743 - 40133383
Alignment:
Q  3 attcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcgga 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| || |      
T  40133743 attcatttttaaattgttgattactgattcatgattaatagtaattcatccagtaatgcttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttgac 40133644  T
Q  103 atctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattggat 202  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||    
T  40133643 atctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagat 40133544  T
Q  203 taagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttttga 302  Q
    ||| |||| |||||||| |||||||| ||| ||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| |||||||||  ||||||||||    
T  40133543 taaatgtattcttgttagtctgatgaattgttgatattatggggactgaacttttgatgccattgtacaaatagtggggtgttactcacaacatttttga 40133444  T
Q  303 tgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttccat 361  Q
    |  |||| ||||||||||||   |||| ||||| || |||||||||| || ||||||||||    
T  40133443 tactataatgttaacttcaccacaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttccat 40133383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 14919354 - 14919704
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| |||| |  |||| ||||||||||||||| |||||||||||      | |||||| ||||||||||||    ||| |||||||||| |    
T  14919354 tgattcatttttaaattttagatttctgattaatgatcaat-gtaattcatct------gattgcaatatcttggactta----tacaattttattgttg 14919442  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |    
T  14919443 gaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtattacaatttgtgaggtgttacacttataataaggtaggataaaattag 14919542  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    |||||||||||| |||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||||||||    
T  14919543 attaagtgtagttttgttaatatgatgagttgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattatataaacagtgaggtgttactcattacattttt 14919642  T
Q  301 gatgttatagtgttaact---tcacaaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcc 359  Q
    ||||||||| ||||||||   ||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  14919643 gatgttataatgttaacttcatcaaaaaaaataattctcatgacttcaccatataattttcc 14919704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 3 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 8437323 - 8436979
Alignment:
Q  3 attcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcgga 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||| || ||     
T  8437323 attcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggc 8437224  T
Q  103 atctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattggat 202  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||   ||||| ||||||| | ||||||||| |||    
T  8437223 atctttaacattcaaacagagttgatcatattatgtgataatcttaagtgttacacattgtggggtgtataacttaaaacaaggcaggataaaattagat 8437124  T
Q  203 taagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttttga 302  Q
    ||||  |||| |||| | ||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||    
T  8437123 taagcatagttttgtaaatctgatg-gttgatgatataatgaggactgaacttttgatgtcactgtacaaacaatgggatgttactcactacactttgga 8437025  T
Q  303 tgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcac 346  Q
     | ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  8437024 agctatagtgttaatttcaccaaaaaaatcattctcatgacttcac 8436979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 36860784 - 36860423
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  | ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| || |    
T  36860784 tgattcatttttaaattgttgattactaattcatgattaatagtaattcatttagtaatgcttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttg 36860685  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacactt-ataacaaggtaagataaaattg 199  Q
      ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| |||||||||     
T  36860684 acatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaaaaaaggtaggataaaatta 36860585  T
Q  200 gattaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttt 299  Q
    |||||| |||| |||||||| | |||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||    
T  36860584 gattaaatgtactcttgttagtatgatgaattgttgatactatggggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcacaacatttt 36860485  T
Q  300 tgatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcc 359  Q
    | ||  |||||||||||||||||   |||||||||| || |||||||||| || ||||||||    
T  36860484 ttatactatagtgttaacttcaccagaaaaatcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 36860423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 5837915 - 5837557
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | || |    
T  5837915 tgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaacagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttgcaggtactattttgtcgttg 5837816  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
      |||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| ||| ||||| |    
T  5837815 tcatctttaacatgcaaagagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaatgtaggattaaattag 5837716  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    |||||||||| |||||||| | |||||| ||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||  ||| ||||    
T  5837715 attaagtgtattcttgttaatatgatgaattgatgatactatggagactgaaattttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactcacaacactttt 5837616  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaatttt 357  Q
    |||| |||||||||| ||||||   |||| |||||||||||| |||||| || ||||||    
T  5837615 gatgctatagtgttaccttcaccagaaaagtcattctcatgaattcaccgtagaatttt 5837557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 361
Target Start/End: Original strand, 35511297 - 35511654
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |    
T  35511297 tgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatatagtaatgcttgcaacatcttgaacttacatgtactattttatcgttg 35511396  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
    | |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||     |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||| |    
T  35511397 gcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagt-----gtgttacattttgtggggtgttacacttgaaacaaggttggataaaattag 35511491  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| | ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| |||  ||||||||| |||| | ||    
T  35511492 attaagtgtagtcttgttaatctgatgaattggtgatagtatgatgactgaacttttgatgtcactttacaaacagtggagtgttactcactacagtgtt 35511591  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttcacaaaaaa--tcattctcatgacttcaccctaaaattttccat 361  Q
    ||||||||| |||||||||||  | |||  ||||| ||||||||||||| ||  |||||||||    
T  35511592 gatgttataatgttaacttcatcagaaacgtcattttcatgacttcaccataggattttccat 35511654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 35504725 - 35504427
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  35504725 tgattcatttttaaattgttgattactgattaataatcaatagtaattcatctagtaatacttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttg 35504626  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
     ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| |||||||||      
T  35504625 aaatctttaacatgcaaacagatttgataatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataatatggtaggataaaattat 35504526  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttt 299  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||| | || |||||||||||||||||  |||||||  || | ||||||||||||||||||    
T  35504525 attaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactataatgattgaacttttgatgtcatcatacaaacggtgaggtgttactcattacatttt 35504427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 361
Target Start/End: Original strand, 23116045 - 23116399
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||| |        |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  23116045 tgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtca--------gtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 23116136  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
      |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |    
T  23116137 acatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttgaaacaaggtaggataaaattag 23116236  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    |||||||||| | |||||| |||||||| ||||||| ||||||   ||||||||||||||  || |||||||||| |||| || |||||| |||| ||||    
T  23116237 attaagtgtaatattgttaatctgatgaattgatgatactatgtaaactgaacttttgattccactgtacaaacagtggggtgctactcactacagtttt 23116336  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttcacaaaaaa--tcattctcatgacttcaccctaaaattttccat 361  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||| ||||||| ||||| || ||||||||||    
T  23116337 gatgttataatgttaacttcataaaaaaagtcattttcatgacgtcaccatagaattttccat 23116399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 39573171 - 39572819
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |    
T  39573171 tgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcattg 39573072  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
    | ||||||||||         ||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| |    
T  39573071 gcatctttaacag--------agttgttgatatcatgtgatagtctcgagtgttacactttgtgggatgttacacttaaaacaaggtaggataaaattag 39572980  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| || |||| |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| |||  |||||||||  ||||||||    
T  39572979 attaagtgtattcttgttaatctgatgaatttatgatactatgagaactgaacttttgatgtcactgcacaaacagtggagtgttactcacaacattttt 39572880  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcc 359  Q
     || ||||||| ||||||| ||   |||| ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  39572879 tatattatagtattaacttaactagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcc 39572819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Original strand, 25500741 - 25501099
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || |    
T  25500741 tgattcatttttaaattgttaattactgattaatgatcaacagtatttcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaggtactattttatcgttg 25500840  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
    | |||||||||||  ||| | ||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||      
T  25500841 gcatctttaacatctaaagaaagttgctgatatcatgtgatgatcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattaa 25500940  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||| ||||||| |||||  ||||| ||||||||||| || |||||||||| || | ||||| |||  ||| ||||    
T  25500941 attaagtttattcttgttaatctgatgaattgatgatactatagggacttaacttttgatggcagtgtacaaacagtgaggtgttattcacaacactttt 25501040  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaatttt 357  Q
    |||| |||||||||||||| ||   |||| ||||||||||||||||||| || ||||||    
T  25501041 gatgctatagtgttaactttaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaatttt 25501099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 15992355 - 15992634
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || |    
T  15992355 tgattcatttttaaattgttaattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaccggtactattttatcgttg 15992454  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
    | |||||||||||||||||| ||||  |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | | |||||||  |||||||| |    
T  15992455 gcatctttaacatgcaaacagagttcctgatatcatgcgatagtcttaagtgtgacactttgtggggtgttgcactcaaatcaaggtagaataaaattag 15992554  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatggg 280  Q
    || ||||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  15992555 atcaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggg 15992634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 32563500 - 32563150
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |    
T  32563500 tgattcatttttaaattgttaattgctgattaatgatcaataataatttatctagtaattcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttg 32563401  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
    | |||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||         ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| |    
T  32563400 gcatctataacatgcaaacagagttgctgatatcatgtga---------gtgttacactttgtgggctgttacacttaaaacaaggtaggataaaattag 32563310  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| | || | |||||||||||||||||||| |||||| ||| |||  |||||||||  ||| ||||    
T  32563309 attaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatattaaggggactgaacttttgatgtcactgtacagacagtggagtgttactcacaacactttt 32563210  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttca-ca-aaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttc 358  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||| || |||||||    
T  32563209 gatgttatagtgttaacttcatcagaaaaatcattttaatgacttcaccatagaattttc 32563150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 7693581 - 7693229
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| || |    
T  7693581 tgattcatttttaaattgttgattactgattaatgaacaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaagtattattttatcgttg 7693482  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
      |||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||         ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  7693481 acatctttaacatgcaaacagagttgctaatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaagataaaattag 7693391  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    |||||| ||| || ||||| ||| |||| ||||||| |||| ||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||  ||| ||||    
T  7693390 attaagcgtattcatgttaatctaatgaattgatgatactaagaggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtgggatgttactcacaacactttt 7693291  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcca 360  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||| ||||| | ||||||||||| || |||||||||    
T  7693290 gatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcattttaatgacttcaccatagaattttcca 7693229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 9200584 - 9200233
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||| || |    
T  9200584 tgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttatagatactattttatcgttg 9200485  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
    | |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||         ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| ||||||||| |    
T  9200484 gcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggaatgttacacttaaaacaaggtaggataaaattag 9200394  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    ||||| |||| |||||||| | |||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||| |||||||||  ||| ||||    
T  9200393 attaaatgtattcttgttaatatgatgaattgatgatactaagaggactaaacttttgatgtcactgtacaaactgtggggtgttactcacaacactttt 9200294  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcc 359  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||| | ||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  9200293 gatgttatagtgttaacttcaccagaaaagttattttaatgacttcaccataaaattttcc 9200233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 15724848 - 15724487
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||||||||||| || |    
T  15724848 tgattcatttttaaattgttgattattgattaatgattaatagtaattcatctagtaatgcttacaatattttggacttacaagtactattttatagttg 15724749  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
      |||||||||||| ||||| ||||| |||||| || |||||||||||| || ||||||||| || |||||| ||||| || ||||||  ||||||||      
T  15724748 acatctttaacatgtaaacaaagttgttgatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaa 15724649  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    |||||||||| |||||||| | |||||| ||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||  | | ||||    
T  15724648 attaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaactttt 15724551  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttccata 362  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  15724550 gatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcataacttcaccatagaattttccata 15724487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Original strand, 21088584 - 21088942
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||| | ||||||   | ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  |  |||||||| || |    
T  21088584 tgattcatttttaaattgattatttat---tcatgattaatagtaattcatctagtaatgcttacaacatcttggatttacagatgttattttatcgttg 21088680  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| || |    
T  21088681 gcatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactttgtgggatgttacacttaaaacaaggtaggataaagttag 21088780  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    ||||| |||| |||||||| | |||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||  ||||||||    
T  21088781 attaaatgtattcttgttagtatgatgaattgttgatactatggggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgtcactcacaacattttt 21088880  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttcac---aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcca 360  Q
     ||  || ||| ||||||||||   ||||| ||||| || |||||||| | || |||||||||    
T  21088881 tatactacagt-ttaacttcaccaaaaaaagtcattttcgtgacttcatcgtagaattttcca 21088942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 5 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 35934252 - 35933902
Alignment:
Q  5 tcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaat 104  Q
    |||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |  ||    
T  35934252 tcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaataataattcaactagtaatgcttgcaacatcttggacttaccggtactattttattgttgacat 35934153  T
Q  105 ctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagat-aaaattggatt 203  Q
    |||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| |||| | ||||    
T  35934152 ctttaacatggaaacaaagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaactagatt 35934053  T
Q  204 aagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttttgat 303  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||||  ||||| |||||||||| || |        | || | |||||||||  ||| |||||||    
T  35934052 aagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggtgactggacttttgatgccact-------aagtgaggtgttactcacaacacttttgat 35933960  T
Q  304 gttatagtgttaacttca--caaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcc 359  Q
      ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  35933959 tctatagtgttaacttcatcaaaaaaatcattctcatgacttcaccatacaattttcc 35933902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 2 - 361
Target Start/End: Original strand, 14409157 - 14409503
Alignment:
Q  2 gattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcgg 101  Q
    ||||||||||| ||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |     
T  14409157 gattcatttttaaattgttgattgctgaataatgatcaatagtaattcatttagtaatgtttgcaacatcttggacttacaagtactattttatcgttga 14409256  T
Q  102 aatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgga 201  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||               |||||||||| |||||||||  |||||||| ||    
T  14409257 catctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagagt--------------agttacacttaaaacaaggtagaataaaattaga 14409342  T
Q  202 ttaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttttg 301  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||  |||  || | |||| || |||||| ||||||||||    
T  14409343 ttaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatga-gactgaacttttgatgccaccgtattaagagtggggtgctactcactacatttttg 14409441  T
Q  302 atgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttccat 361  Q
    ||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  14409442 atgttatagtgttgacttcaccagaaaaatcattctcatgacttcaccatagaattttccat 14409503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 103 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 26268332 - 26268087
Alignment:
Q  103 atctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattggat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||    
T  26268332 atctttaacatgcaaacatagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgcggtgttacacttaaaacaaggtatgataaaatttgat 26268233  T
Q  203 taagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttttga 302  Q
    ||| |||| |||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||  ||| ||||||    
T  26268232 taattgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactaaacttttgatgtcaccgtacaaacagtggggtgttactcaaaacacttttga 26268133  T
Q  303 tgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcac 346  Q
    || |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  26268132 tgctatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctcatgacttcac 26268087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 27 - 347
Target Start/End: Original strand, 1429003 - 1429308
Alignment:
Q  27 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttg 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||| | ||||     
T  1429003 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaataaagttt 1429102  T
Q  127 atgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattggattaagtgtagtcttgttattctgat 226  Q
    |||||||||||||||||||||||                 |||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| | ||||    
T  1429103 atgatattatgtgatagtcttaa-----------------gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtagtcttgttaatttgat 1429185  T
Q  227 gagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcac--aa 324  Q
    || ||||||| ||||||  ||||||| |||||||| || |||||||||| |||| ||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||  ||    
T  1429186 gaattgatgatactatggagactgaatttttgatgccagtgtacaaacagtggggtgttactcactatatttttgatgctatagtgttaacttcaccaaa 1429285  T
Q  325 aaaatcattctcatgacttcacc 347  Q
    | | ||||| |||||||||||||    
T  1429286 agagtcattttcatgacttcacc 1429308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 22019983 - 22019631
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||| || |    
T  22019983 tgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaacatcttagacttacaagtattattttatcgttg 22019884  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
    | |||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||         |||||| |||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| |    
T  22019883 gcatctttaacatgcaaatagagttgctgatatcatgtga---------gtgttatactttgtggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattag 22019793  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||||  |||||| |||| | ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||  ||| ||||    
T  22019792 attaagtgtattcttgttaatatgatgaagtgatgatactaaggggacttaacttttgatgtcactatacaaacaatggggtgttactcacaacactttt 22019693  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcca 360  Q
    |||  |||||| ||||||||||   |||| ||||||| || |||||||| || || ||||||    
T  22019692 gattctatagttttaacttcaccagaaaagtcattctaataacttcaccatagaaatttcca 22019631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Original strand, 13956190 - 13956412
Alignment:
Q  14 aattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacat 113  Q
    ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || || |||||||||||    
T  13956190 aattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggactaacaggtactattttatcgttggcatctttaacat 13956289  T
Q  114 gcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattggattaagtgtagtc 213  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||| ||| |||||||| ||||||||| |||     
T  13956290 gcaaacaaatttgatgatattatatgatagtcttaagtgttacgctttgtagggtgttacacttgaaacaagataaaataaaattagattaagtgaagtt 13956389  T
Q  214 ttgttattctgatgagttgatga 236  Q
    |||||| |||||||| |||||||    
T  13956390 ttgttaatctgatgaattgatga 13956412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 2888260 - 2888472
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  2888260 tgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgtaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 2888359  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
      |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||  |||||||||| |||||||| |    
T  2888360 acatctttaacatgcaaacatatttgatgatattatctgatagtcttaagtgttacactttatggaatgttaaacttgaaacaaggtaaaataaaattag 2888459  T
Q  201 attaagtgtagtc 213  Q
    |||||||||||||    
T  2888460 attaagtgtagtc 2888472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 42343081 - 42342775
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |    
T  42343081 tgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatggtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtcctattttatcgttg 42342982  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
      |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||         ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| ||||||||||||| |    
T  42342981 acatctttaacatgcaaacagagttgatgatatcatgtg---------agtgttacactttgtggtgtattacacttaaaacaa-gtaagataaaattag 42342892  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||| | |||   |  ||||||||||| |||| ||||| |||| | |||||||  ||||||||    
T  42342891 attaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaagggga--aattttttgatgtcactgtataaacagtggggtattactcacaacattttt 42342794  T
Q  301 gatgttatagtgttaactt 319  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  42342793 gatgttatagtattaactt 42342775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 27 - 300
Target Start/End: Original strand, 23954636 - 23954904
Alignment:
Q  27 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttg 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |     ||||||| |||||||  || |||||||| || || || ||||||||||||||| |||||    
T  23954636 tgattaatgatcaatagtaattcatcaagtaatgtt-----catcttgcacttacaaatattattttatcgttggcat-tttaacatgcaaacagagttg 23954729  T
Q  127 atgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattggattaagtgtagtcttgttattctgat 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||    
T  23954730 atgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgaggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgat 23954829  T
Q  227 gagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtca-ttgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    || ||||||| ||||||   ||||||||||||||| || | ||| ||||| |||| ||||||||| || ||||||    
T  23954830 gaattgatgatactatggaaactgaacttttgatgccactagtaaaaacagtggggtgttactcactatattttt 23954904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 34 - 304
Target Start/End: Original strand, 6824329 - 6824599
Alignment:
Q  34 tgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatat 133  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||  | |  |||||||||||||||||| ||||| | ||||    
T  6824329 tgatcaatagtatctcatctagtgatgcttgcaacatcttagacttacatgtattgttttatctt-gacatctttaacatgcaaacagagttgct-atat 6824426  T
Q  134 tatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattggattaagtgtagtcttgttattctgatgagttga 233  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| | ||||    
T  6824427 cttgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacatttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgataaattga 6824526  T
Q  234 tgaaactatgaggactga--acttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttttgatg 304  Q
    ||| ||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||  ||| ||||||||    
T  6824527 tgatactatgaagactgaacacttttgatgtcactgtacaaacagtggagtgttactcacaacacttttgatg 6824599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 122 - 359
Target Start/End: Original strand, 5112250 - 5112488
Alignment:
Q  122 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattggattaagtgtagtcttgttatt 221  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| |    
T  5112250 agttgatgatattatgtgaaagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacatggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaat 5112348  T
Q  222 ctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttca 321  Q
     | |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||||||| || |||||| |||||||||| |||||||||    
T  5112349 ttaatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttca 5112448  T
Q  322 c--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcc 359  Q
    |  ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  5112449 ccaaaaaagtcattttcatgacttcaccataaaattttcc 5112488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 25669936 - 25669737
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || |    
T  25669936 tgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacattttagacttacatgtactattttatcgttg 25669837  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
      |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||         |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |    
T  25669836 acatctttaacatgcaaacagagttgatgatatcatgtg---------agtgttacac-ttgtggagtgttacacttaaaacaaagtaggataaaattag 25669747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 25889728 - 25889584
Alignment:
Q  3 attcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcgga 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||     
T  25889728 attcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctttcaacatcttggatttacaggtactattttattgttggt 25889629  T
Q  103 atctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtctt 147  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||    
T  25889628 atctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtcataatctt 25889584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 149 - 358
Target Start/End: Original strand, 28416490 - 28416696
Alignment:
Q  149 agtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattggattaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggac 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |  |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| | || |  ||     
T  28416490 agtgttacactttgtggggtgttacacttaaaataaggcagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatattaaggagat 28416589  T
Q  249 tgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacaaaaaatcattctcatgacttcaccc 348  Q
    ||||||||||||  || |||||||||| ||||||||||||||  | | ||||||| ||||||||||||||||||    ||||||||| |||||||||||     
T  28416590 tgaacttttgattccactgtacaaacagtgggatgttactcacaatacttttgatattatagtgttaacttcac---taatcattctaatgacttcacca 28416686  T
Q  349 taaaattttc 358  Q
    || |||||||    
T  28416687 tagaattttc 28416696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 8467086 - 8466745
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| || |||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||| ||      
T  8467086 tgattcatttttaaactgttgattactaattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacattttggacttacaaataatattttatcgtta 8466987  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
     |  |||||| ||| ||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||||||| ||                 | |||||||||  ||||||||      
T  8466986 cac-ctttaatatgtaaacagagttggtgatatcatatgatagtcttaagtgttacattt-----------------aaaacaaggtagaataaaattaa 8466905  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    |||||||||| |||||||| | |||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||  || ||||||||  | ||| ||||| |||  ||| ||||    
T  8466904 attaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatactatggggattgaacttttgataccactgtacaaa-gagggggtgttattcacaacactttt 8466806  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcc 359  Q
    ||||||| ||||||||||||||   |||| ||||||||||||| ||| | || ||||||||    
T  8466805 gatgttacagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacctcatcatagaattttcc 8466745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 28416366 - 28416460
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttat 95  Q
    |||||| ||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  28416366 tgattcttttttaaattgttgattgttgattaatgatcaatagtaattcatcaagtaatgcttgcaacatcttggacttaaaagtactattttat 28416460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 206 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 25668804 - 25668689
Alignment:
Q  206 gtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttttgatgt 305  Q
    ||||| |||||||| ||| |||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||| || ||| |||||| |||| |||||||||  ||| |||||||||    
T  25668804 gtgtattcttgttaatctaatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgttcaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgt 25668705  T
Q  306 tatagtgttaacttcac 322  Q
    || ||||||||||||||    
T  25668704 ta-agtgttaacttcac 25668689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 26269166 - 26269075
Alignment:
Q  4 ttcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttat 95  Q
    ||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  26269166 ttcatttttaaattgttgattactgattaatgatcagtagtaatttatctagtattgcttacaacatcttaaacttacaggtactattttat 26269075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 43254215 - 43254154
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgct 62  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43254215 tgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgct 43254154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 224 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 11898139 - 11898004
Alignment:
Q  224 gatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcac- 322  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||  | | || ||||||||| | || |||||||| |||| | ||||||| ||     
T  11898139 gatgaattgatgatactatgaggactaaacttttgatgtcactgtacaactagtagggtgttactcagtgcacttttgatgctataatattaactttacc 11898040  T
Q  323 -aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaatttt 357  Q
      |||| | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  11898039 agaaaagttattatcatgacttcaccctaaaatttt 11898004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 277 - 360
Target Start/End: Original strand, 26317775 - 26317860
Alignment:
Q  277 tgggatgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcca 360  Q
    |||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||| | || |||||||||    
T  26317775 tggggtgttactcgttatatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcatcatagaattttcca 26317860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 276 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 22255660 - 22255615
Alignment:
Q  276 atgggatgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttca 321  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22255660 atggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttca 22255615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 266 - 359
Target Start/End: Original strand, 13956425 - 13956520
Alignment:
Q  266 tgtacaaacaatgggatgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttca--caaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcc 359  Q
    |||||||||| || | ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    |||| ||||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  13956425 tgtacaaacagtgaggtgttactcactacagttttgatgttatagtgttaacttcatgagaaaagtcattttcatgacttcaccgtagaattttcc 13956520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 116 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 11898199 - 11898148
Alignment:
Q  116 aaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgggg 167  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  11898199 aaacagagttgatgatgttatgtgatattcttaagggttacactttgtgggg 11898148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 284 - 363
Target Start/End: Original strand, 16004474 - 16004556
Alignment:
Q  284 ttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatc-attctcatgacttcaccctaaaattttccataa 363  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||   |||| || ||||||||||||| ||| || ||||||||||||    
T  16004474 ttactcacaacatttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcaattctcatgactttaccatagaattttccataa 16004556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 277 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 5748519 - 5748478
Alignment:
Q  277 tgggatgttactcattacatttttgatgttatagtgttaact 318  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  5748519 tggggtgttactcattatatttttgacgttatagtgttaact 5748478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 323 - 359
Target Start/End: Original strand, 12164928 - 12164964
Alignment:
Q  323 aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcc 359  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12164928 aaaaagtcattctcatgacttcaccgtaaaattttcc 12164964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 61)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 55477742 - 55478106
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |    
T  55477742 tgattcatttttaaattgttaattactgattaatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaaatgtactattttatcgttg 55477841  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |    
T  55477842 gaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttcagtgttacacgttgtggggtgttacacttataacaagttaggataaaattag 55477941  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaa----tgggatgttactcattacat 296  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||  |||||||| ||||||    
T  55477942 attaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaaacagtggagtgttactcgttacat 55478041  T
Q  297 ttttgatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcc 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  55478042 ttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcattctcatgacttcaccatagaattttcc 55478106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 879399 - 879759
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  879399 tgattcatttttaaattgttgattacttattaatgatcaataataattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttattgtca 879498  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |    
T  879499 gaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaaatgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattag 879598  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  879599 attatgtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaagattaaacttttgatgtcattgtacaaacaatgaggtgttactcattacattttt 879698  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcc 359  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  879699 gatgttatagtgtttacttcaccaaaaaaattattctcatgacttcaccttaaaattttcc 879759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 25184473 - 25184113
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25184473 tgattcatttttaaattgtcgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 25184374  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |    
T  25184373 gaatttttaacatgcaaacagagttgataatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattag 25184274  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||    
T  25184273 atcaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaagattgaactttggatgtcattgtacaaacagtagagtgttactcattacattttt 25184174  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcc 359  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  25184173 gatgttatagtgttaacttcaccaaaatagtcattctcatgacttcaccatagaattttcc 25184113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 37663592 - 37663950
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  37663592 tgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 37663691  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |    
T  37663692 gaatctttaacatgcgaacaacgttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttatagcaaggtaggataaaattag 37663791  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  37663792 attaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacagtttt 37663891  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttca-caaaaaa-tcattctcatgacttcaccctaaaattttcc 359  Q
     ||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  37663892 aatgt--tagtgttaacttcatcaaaaaagtcattcttatgacttcaccatagaattttcc 37663950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 19089304 - 19089664
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  19089304 tgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 19089403  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
     |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| ||||||| ||||||||| |    
T  19089404 aaatctttaacatgcgaacaacgttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcatatagcaaggtaggataaaattag 19089503  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  19089504 attaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattatacaaacagtggggtgttactcattacaatttt 19089603  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttca-caaaaaa-tcattctcatgacttcaccctaaaattttcc 359  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  19089604 gatattatagtgttaacttcatcaaaaaagttattcttatgacttcaccatagaattttcc 19089664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 362
Target Start/End: Original strand, 19440499 - 19440863
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    ||||| |||||| |||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |    
T  19440499 tgattaatttttaaattattgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcattg 19440598  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |    
T  19440599 gaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgttataaacttaagggttacacgttgtggggtgttacgcttataacaagctaagataaaattag 19440698  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||  ||||| |||||||||||||    
T  19440699 attaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatattatgaggactgaacttttgatgccattgtacaaacggtggagtgttaatcattacattttt 19440798  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgac-ttcaccctaaaattttccata 362  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||| |||||| || |||||||||||    
T  19440799 gatgttatagtgttaacatcaccaaaaaagtcattctcatgactttcaccatagaattttccata 19440863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 6864395 - 6864038
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||| || |    
T  6864395 tgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttacaaatattattttatcgttg 6864296  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||      
T  6864295 taatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtattacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtatgataaaattaa 6864196  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| | | |||||||| |||||| ||||||    
T  6864195 attaaatgtagtcttgttaatctgataaattgatgatactatgaggactggacttttgatgctattgtacaaaaagttggatgttattcattaaattttt 6864096  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattt 356  Q
    |||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||| || |||||    
T  6864095 gatgttatagtgataacttcaccaaaaaagtcattctcatgacatcaccatacaattt 6864038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 2 - 361
Target Start/End: Original strand, 28002838 - 28003199
Alignment:
Q  2 gattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcgg 101  Q
    ||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| || |     
T  28002838 gattcatttttaaattgttgattgttgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttagcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttga 28002937  T
Q  102 aatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgga 201  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||    
T  28002938 catctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttctggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattaga 28003037  T
Q  202 ttaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttttg 301  Q
    ||||||| |||||||||| || ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |  |||| | |||| |||||    
T  28003038 ttaagtgcagtcttgttaatccgatgaattgatgatactatgatgactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggagtactactgactacacttttg 28003137  T
Q  302 atgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttccat 361  Q
    ||| ||||||||| |||||||   |||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  28003138 atgctatagtgttgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttccat 28003199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 32912430 - 32912791
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtc 99  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||     
T  32912430 tgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgtt 32912529  T
Q  100 ggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattg 199  Q
    | |||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||     
T  32912530 gaaatctttaacatacaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttagaacaaggtatgataaaatta 32912629  T
Q  200 gattaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttt 299  Q
     |||||||||||||||||||  ||||| | ||||||| | ||||||  ||||||||||||| ||||| |||||| | | || ||||||||||||||||||    
T  32912630 tattaagtgtagtcttgttaacctgataaattgatgatattatgagtgctgaacttttgatatcattctacaaatactagggtgttactcattacatttt 32912729  T
Q  300 tgatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcc 359  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  32912730 tgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattcttatgacttcaccatagaattttcc 32912791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 47254100 - 47253751
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |    
T  47254100 tgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttgcatgtactattttattgttg 47254001  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
    | |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||      
T  47254000 gcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattaa 47253901  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    |||||||||| |||||||| ||        |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||    
T  47253900 attaagtgtattcttgttaatc--------tgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcactgtataaacaatggg-tgttactcacaacactttt 47253810  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaatttt 357  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||    
T  47253809 gatgatatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcatgacttcaccatagaatttt 47253751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 50697602 - 50697242
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| || |    
T  50697602 tgattcatttttaaattgttgattactaattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaacatcttggaattacaggtactattttatcgttg 50697503  T
Q  101 gaatctttaacat-gcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattg 199  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||     
T  50697502 gaatctttaacattgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttgcactttgtgtggtgttacgcttataacaaggtaggataaaatta 50697403  T
Q  200 gattaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttt 299  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||  | || |||||||| ||| |||||    
T  50697402 tattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatacta-gagaattgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttatatttt 50697304  T
Q  300 tgatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcc 359  Q
    | ||||||||||||| |||||||  ||||||||||| | ||||||||||| || ||||||||    
T  50697303 ttatgttatagtgtttacttcactaaaaaaatcatttttatgacttcaccgtagaattttcc 50697242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Original strand, 36493540 - 36493897
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||| || |    
T  36493540 tgattcatttttaaattgttaattacggattaatgatcaatagtaattcatcgagtaatgcttgcaatatcttagacttacagatactattttatcgttg 36493639  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| ||| ||||||||| |    
T  36493640 gcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtggtagtcttaagtgttacactttgtggagt-ttacacttaaaacaatgtatgataaaattag 36493738  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    ||||||||||||||||||| | | |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||    
T  36493739 attaagtgtagtcttgttaatttaatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtcactgtacaaacaatggggtgttactcactatattttt 36493838  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaatttt 357  Q
    |||| |||||| ||||||||||  ||||| | ||| ||||||||||||| || ||||||    
T  36493839 gatggtatagtattaacttcaccaaaaaagttattttcatgacttcaccatagaatttt 36493897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 34361342 - 34361702
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtc 99  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||     
T  34361342 tgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttataggtactattttatcgtt 34361441  T
Q  100 ggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattg 199  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||     
T  34361442 ggaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagctttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttagaacaaggtatgataaaatta 34361541  T
Q  200 gattaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttt 299  Q
     |||||||||| | ||||||  | ||||| ||||||| | ||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  34361542 tattaagtgtaattttgttaaccggatgaattgatgatattatgagg-ctgaacttttaatgtcattctacaaacagtggggtgttactcattacatttt 34361640  T
Q  300 tgatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcc 359  Q
    | |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  34361641 ttatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattcttatgacttcaccatagaattttcc 34361702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 362
Target Start/End: Original strand, 34947946 - 34948311
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |    
T  34947946 tgattcatttttaaattgttgattactgattaacgatcaatagtatttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtattattttatcgttg 34948045  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagt--gttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaatt 198  Q
    | |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||  |||||| || |||||||||    
T  34948046 gcatctttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtcttaagtacgttacactttgtggggtgttgcactttaaacaagataggataaaatt 34948145  T
Q  199 ggattaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattt 298  Q
     ||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||| |||||||||  ||| ||    
T  34948146 agattaagtgtattcttgttaatatgatgaattgatgatattatgaggactgaacttttgatgccactttacaaacagtggggtgttactcacaacactt 34948245  T
Q  299 ttgatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttccata 362  Q
    |||||||||||||||||||||| |   |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  34948246 ttgatgttatagtgttaacttcgccagaaaagtcattctcatgacttcaccataaaattttacata 34948311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 17168073 - 17167753
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| |||| || |||  | ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |    
T  17168073 tgattcatttttaaattattgattactaattaatgataaatagtaattcatctagtgatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttg 17167974  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
    | |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |    
T  17167973 gcatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattag 17167874  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    |||||||||| |||| ||| |||||||| || |||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||    
T  17167873 attaagtgtattcttcttagtctgatgaattaatgatactatggagaatgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcacaacattttt 17167774  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttca 321  Q
    ||| ||||| |||||||||||    
T  17167773 gatattataatgttaacttca 17167753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 17173650 - 17173330
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| |||| || |||  | ||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |    
T  17173650 tgattcatttttaaattattgattacttattcatgataaatagtaattcatctagtgatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttg 17173551  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |    
T  17173550 gcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattag 17173451  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    |||||||||| |||| ||| |||||||| || |||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||    
T  17173450 attaagtgtattcttcttagtctgatgaattaatgatactatggagattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcacaacattttt 17173351  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttca 321  Q
    ||| ||||| |||||||||||    
T  17173350 gatattataatgttaacttca 17173330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 35020882 - 35021246
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaata----gtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatt 96  Q
    |||||||||||| ||||||| |||   |||||||||||||||    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||     
T  35020882 tgattcatttttaaattgttgattaccgattaatgatcaatatatagtaattcatctagtaatgtttgcaatatcttggacttacagatactattttatc 35020981  T
Q  97 gtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaa 196  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||    
T  35020982 gttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaacaaggtaggataaaa 35021081  T
Q  197 ttggattaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacat 296  Q
    || ||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||| |||| ||||||  ||||||||| | || |||||||||| |||  ||||||||| |||||    
T  35021082 ttagattaagtgtagttttgttaatctaatgaattgatgatactacgaggacgaaacttttgacgccaatgtacaaacagtggtgtgttactcactacat 35021181  T
Q  297 ttttgatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcc 359  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||   |||| ||||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  35021182 ttttgatgttataatgttaacttcaccagaaaagtcattttcatgacttcaccatagaattttcc 35021246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 42200091 - 42199741
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatg-tactattttattgt 98  Q
    ||||| |||||| |||| || |||  |||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| ||    
T  42200091 tgattaatttttaaattattgattactgattaatgaacagtagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaaggtattattttatcgt 42199992  T
Q  99 cggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaatt 198  Q
     ||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||| |||||||||    
T  42199991 tggaatctttaacatgcaaatagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttatgcttagaacaaggtatgataaaatt 42199892  T
Q  199 ggattaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattt 298  Q
      ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| |||||| | |||||||||||||||    
T  42199891 atattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagggctgaactttttatgtcattctacaaataatggggtattactcattacattt 42199792  T
Q  299 ttgatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcacc 347  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||    
T  42199791 ttgatgttatagtattaacttcaccaaaaaaatcattcttatgatttcacc 42199741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 361
Target Start/End: Original strand, 55240956 - 55241317
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  55240956 tgattcatttttaaattgttgattattgattaatgattaatagtaatttatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttg 55241055  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
    | |||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |    
T  55241056 gcatctttaacatgcaaacagagttgctgacatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacacttaaaacaaggtatgataaaattag 55241155  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    |||||||||| |||| ||| |||||| | ||||||| |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||||||   ||| ||||    
T  55241156 attaagtgtattcttctta-tctgataaattgatgatactatggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcgcaacaatttt 55241254  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttccat 361  Q
    |||  |||||| ||||||||||   |||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  55241255 gataatatagtattaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttccat 55241317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 25700907 - 25701268
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| || ||||   ||||||||||| || |    
T  25700907 tgattcatttttaaattgtacattattgattaatgatcaatagtaattcatctaacaatgcttgcaaaatcttagatttacggatactattttatcgttg 25701006  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgggg-tgttacacttataacaaggtaagataaaattg 199  Q
       ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||     
T  25701007 acttctttaacatgcaaacaaagttgatgatgttatgtgataatcttaagtgttacactttgtggggatgttacacttaaaacaaggtaggataaaatta 25701106  T
Q  200 gattaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttt 299  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || ||||||||| |||| |||    
T  25701107 gatttagtgtagtcctgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtagggtgttactcactacacttt 25701206  T
Q  300 tgatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcc 359  Q
    |||||||||| ||||||||| ||  ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  25701207 tgatgttataatgttaactttaccaaaaaagtcattatcatgacttcaccataaaattttcc 25701268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 29584051 - 29584409
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  29584051 tgattcatttttaaatcgttcattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtaccattttattgttg 29584150  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
     ||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||| |||||||||  |||||||| |    
T  29584151 aaatctttaacatgcaaatagagttgctgatatcatgcgatagtcttaagtgtgacacttcatggggtgtaacacttaaaacaaggtagaataaaattag 29584250  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    |||||||||| |||  ||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||  ||| ||||    
T  29584251 attaagtgtattctcattaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccattgtacaaacagtgaggtgttactca--acactttt 29584348  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcc 359  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||| |||||| || ||||||||| || ||||||||    
T  29584349 gatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcattcccacgacttcaccatagaattttcc 29584409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 33341758 - 33341408
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  33341758 tgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaacatcttggacttacatgtactattttatcgttg 33341659  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
      |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||      
T  33341658 acatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattat 33341559  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcatta----cat 296  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| |||| |||| |||   |    ||     
T  33341558 attaagtatattcttgttaatctgatgaattgatgatactatg-ggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttcctcgcaacaatcaa 33341460  T
Q  297 ttttgatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcac 346  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||    
T  33341459 ttttgatgatatagtgttaatttcaccagaaaaatcattctcatgacttcac 33341408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 3042979 - 3042611
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |    
T  3042979 tgattcatttttaaattgttgattactgattaataatcaatactaattcatctagtaatgcttgcaacatgttggacttacatgtactattttatcgttg 3042880  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
     ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||      
T  3042879 aaatctttaacaagcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataataaggtatgataaaattat 3042780  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttga--------tgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcatt 292  Q
    |||||||||| |||||||| | |||||| ||||        ||| ||| | | ||||||| |||||||||||||||| ||||  |||| | |||||||||    
T  3042779 attaagtgtaatcttgttaatatgatgaattgatgatacattgatactctaatgactgaatttttgatgtcattgtataaacggtggggtattactcatt 3042680  T
Q  293 acatttttgatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcc 359  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||| |||||| || ||||||||    
T  3042679 acattttgtatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcatttttatgatttcaccatagaattttcc 3042611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 7703869 - 7703516
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || |    
T  7703869 tgattcatttttaaattgttgattactgattaatgataaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttcgacttacaggtactattttatcgttg 7703770  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
    | ||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||| |    
T  7703769 gcatctttaacgtgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgtgacactttgtggagtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattag 7703670  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    |||||||||| |||||||| ||        |||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||| |  ||| ||||    
T  7703669 attaagtgtattcttgttaatc--------tgatgatactatggggactgaacttttgatgtcaccgtacaaacagtggggtgttactgacaacactttt 7703578  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcca 360  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||| | | || |||||||||    
T  7703577 gatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgactttaacatagaattttcca 7703516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 23761431 - 23761089
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| |||| || |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| || |    
T  23761431 tgattcatttttaaattattgattactgattaatgatcaataataattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttataggtacaattttatcgttg 23761332  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
    | ||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||| |||||||| |||||||||| |    
T  23761331 gtatctttaacgtgcaaacagagttgctgatatcatgcgatagtcttaaatgtgacactttatgaggtgttacacttaaaacaaggt-agataaaattag 23761233  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| | |||||||| || | |||||||||  ||| ||||    
T  23761232 attaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtcactatacaaacagtgaggtgttactcacaacactttt 23761133  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttcaca--aaaaatcattctcatgact 342  Q
    ||||||||||||||||||| |||  || | ||||||||||||||    
T  23761132 gatgttatagtgttaactttacaagaatagtcattctcatgact 23761089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 3 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 49376325 - 49375964
Alignment:
Q  3 attcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcgga 102  Q
    |||||||||| |||| || |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || |      
T  49376325 attcatttttaaattcttgattactgattaatgatcaatagtaattcatttagtaatgctttcaacttcttggacttacatgtactattttatcgttgac 49376226  T
Q  103 atctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattggat 202  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||   ||||| | ||||| |  |||||||| |||    
T  49376225 atctttaacatccaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacacattgtggggtgtataacttaaatcaaggcagaataaaattagat 49376126  T
Q  203 taagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttttga 302  Q
     ||| ||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||| || ||||||| || |||| |||||||||  ||| ||||||    
T  49376125 caagcgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaagcagtggggtgttactcacgacacttttga 49376026  T
Q  303 tgttatagtgttaacttcac---aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttccat 361  Q
    || |||| ||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  49376025 tgctataatgttaacttcaccagaaaaagtcattctcatgacttcaccgtagaattttccat 49375964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 5047818 - 5048162
Alignment:
Q  2 gattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcgg 101  Q
    ||||||||||| ||||||| |||  |||||| ||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5047818 gattcatttttaaattgtttattgttgattactgatcaataataatttatctagtaaaacttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgttgg 5047917  T
Q  102 aatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgga 201  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||    
T  5047918 catctttaacatgcaaacatagtttatgatatcatgtgatagtcttaagtgttacattttg-cgggtattacacttaaaacaaggtaggataaaattaga 5048016  T
Q  202 ttaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttttg 301  Q
    |||| || |||||||||| ||| |||| ||||||| |||||| | |||||||||||||| |||| ||||||||| || | |  |||||| |||| |||||    
T  5048017 ttaaatgcagtcttgttaatctcatgaattgatgatactatgggaactgaacttttgatatcatcgtacaaacagtgtggtcctactcactacacttttg 5048116  T
Q  302 atgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttca 345  Q
    ||||||||| ||| |||||||   ||||||||||||||| ||||||    
T  5048117 atgttatagagttgacttcaccagaaaaatcattctcataacttca 5048162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 37776018 - 37775670
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |    
T  37776018 tgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttg 37775919  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
    | |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||         |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| |    
T  37775918 gtatctttaacatgcaaacaaagttgctgatatcatgtg---------agtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattag 37775828  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||  |||   |||||||||||| || |||||||||| |||| |||||||||  ||||||||    
T  37775827 attaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatacta--aggggggaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacattttt 37775730  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttc 358  Q
     || |||||||| |||||||||  ||||||||||| | ||||||||||| || |||||||    
T  37775729 aatattatagtgctaacttcaccaaaaaaatcattttaatgacttcaccgtagaattttc 37775670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 1815661 - 1815409
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || |    
T  1815661 tgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaattgtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttg 1815562  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| |    
T  1815561 gaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacccttaaaacaaggtaggataaaattag 1815462  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaac 253  Q
    | ||| ||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  1815461 agtaaatgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatgaggactgaac 1815409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 46 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 38012169 - 38011854
Alignment:
Q  46 attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtc 145  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38012169 attcatctagtaatatttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgttggcatttttaacgtgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtc 38012070  T
Q  146 ttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattggattaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgag 245  Q
    ||||| |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | | |||| |    
T  38012069 ttaagcgttacactttctgggatgttacacttaaaacaaggtataataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgataatattatggg 38011970  T
Q  246 gactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgactt 343  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||||| |||| || || ||| |||| |||||||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||||| ||    
T  38011969 gactgaacttttgatggcaccgtacaaacagtggggtgctattcactacacttttgatgttatagtgttgacttcaccagaaaagtcattctcatgattt 38011870  T
Q  344 caccctaaaattttcc 359  Q
    |||| || ||||||||    
T  38011869 caccatagaattttcc 38011854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 321
Target Start/End: Original strand, 46888009 - 46888328
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| || |    
T  46888009 tgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgtaacatcttggatttacaggtactattttatcgttg 46888108  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
    | |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |    
T  46888109 gcatctttaacatgcaaaccgatttgatgatattatgtgatagtc-taagtgttacgttttgtggggtgttacacttgaaacaaggtaggataaaattag 46888207  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||| || | || | |||| ||||||||||||||||| |  |||||||| | |||| | ||||||| |||| ||||    
T  46888208 attaagtgtagttttgttaatctgatgaattaacgatagtatggggactgaacttttgatgccgctgtacaaatagtggggtattactcactacaatttt 46888307  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttca 321  Q
    ||||||||||| |||||||||    
T  46888308 gatgttatagtattaacttca 46888328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 27396974 - 27396618
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| | ||||| || |    
T  27396974 tgattcatttttaaattgttgattac--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacattttggacttataggtaccactttatcgttg 27396877  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
      ||||||||||||||||||  |||| |||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||      
T  27396876 acatctttaacatgcaaacagcgttgctgatatcatgcgatggtcttaagtgtgacactttatgggatgttacacttaaaacaaggtagaataaaattaa 27396777  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| ||| ||||    
T  27396776 attaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggacgaaacttttgatgtcattgtacaaacagtagggtgttactcataacactttt 27396677  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaatttt 357  Q
     ||| |||| ||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||| || ||||||    
T  27396676 aatgctataatgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaatttt 27396618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 50765080 - 50764746
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |    
T  50765080 tgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttg 50764981  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
      ||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| | || |||||| ||||||||||||||||||||          ||| ||||||||| |    
T  50764980 acatctttaacttgcaaacatagttgctgatatcatgtgataatattgagtgtttcactttgtggggtgttacac----------gtaggataaaattag 50764891  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    ||||| |||| |||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||  ||| ||||    
T  50764890 attaaatgtattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaggattgaacttttgatgtcaccgtacaaacagtggggtgttactcacaacactttt 50764791  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttca-caaaaaa-tcattctcatgacttca 345  Q
    |||||  |||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||    
T  50764790 gatgt--tagtgttaacttcatcaaaaaagttattctcatgacttca 50764746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 32579806 - 32579444
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  32579806 tgatttatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttg 32579707  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
      || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| || ||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| |    
T  32579706 acatttttaacatgcaaacatagttgatgatattataagatagtcttaagagttacactttctgaggtcttacacttaaaacaaggtaggataaaattag 32579607  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgt---acaaacaatgggatgttactcattacatt 297  Q
    |||||||  |||| ||||| ||||||||  |||| | ||||||| |||| ||||||||||| ||  ||   ||||||| |||| || |||||| | || |    
T  32579606 attaagtacagtcatgttaatctgatgaactgataatactatga-gactaaacttttgatggcaccgtacaacaaacactggggtgctactcactgcact 32579508  T
Q  298 tttgatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcc 359  Q
    |||||||||||| |||| |||||||   |||| |||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  32579507 tttgatgttataatgttgacttcaccagaaaagtcattctcagaacttcaccataaaattttcc 32579444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 37288088 - 37287733
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| |||| || |||  ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  37288088 tgattcatttttaaattattgattactgattaatgctcaatagtaattcatctaataatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttg 37287989  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt-ggggtgttacacttataacaaggtaagat-aaaatt 198  Q
    | ||||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| ||||| ||| | | ||||||    
T  37287988 gcatcttcaacatgcaaacaaagttgctgatatcatgtgctagtcttaagtgttacattttgtgggggcgttacacttaaaacaaagtaggttaaaaatt 37287889  T
Q  199 ggattaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattt 298  Q
     ||||||||||| |||||||| ||        | |||| | |||||||| ||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||||||  ||| ||    
T  37287888 agattaagtgtattcttgttaatc--------ttatgatattatgaggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacactt 37287797  T
Q  299 ttgatgttatagtgttaactt---cacaaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcc 359  Q
    |||||||||||||||||||||   || ||||| |||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  37287796 ttgatgttatagtgttaactttaccaaaaaaagtcattctcattacttcaccatagaattttcc 37287733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 343
Target Start/End: Original strand, 33816368 - 33816728
Alignment:
Q  2 gattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcgg 101  Q
    ||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |     
T  33816368 gattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgaactattttatcgttga 33816467  T
Q  102 aatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttg-----------------tggggtgttacacttataacaa 184  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||                 |||||||||||||||| |||||    
T  33816468 catctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacactttgtggggtattacactttctggggtgttacacttaaaacaa 33816567  T
Q  185 ggtaagataaaattggattaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgt 284  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||| | ||||||| ||||||  |||||||||||||||| ||  ||| ||| | || | ||     
T  33816568 ggtaggataaaattagattaagtgcaatcttgttaatctgataaattgatgatactatggagactgaacttttgatgccaccgtataaatagtgaggtgc 33816667  T
Q  285 tactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgactt 343  Q
    |||||| |||| |||||||| || | |||| |||||||   ||||||||||||||||||||    
T  33816668 tactcactacacttttgatgctacaatgttgacttcaccagaaaaatcattctcatgactt 33816728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 4598342 - 4597994
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| || |    
T  4598342 tgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtaattaatctaataatgcttgcaacatcttggatttaaatgtattattttatcgttg 4598243  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
    | |||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||         ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||      
T  4598242 gcatctttaacatgaaaacagagttgctgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaagc-aggataaaattaa 4598153  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    |||||||||| |||||||| | |||||| |||||||  ||| | ||||||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||||||  |||  |||    
T  4598152 attaagtgtattcttgttaatatgatgaattgatgagtctaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaaca-cttt 4598054  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttc 358  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  4598053 gatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctaatgacttcaccataaaattttc 4597994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 30002492 - 30002823
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || |    
T  30002492 tgattcatttttaaattgtttattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttaaatgtactattttatcgttg 30002591  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
      |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||         |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| |    
T  30002592 acatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtg---------agtgttacactttgtggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattag 30002682  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    |||||||||| |||||||| ||        |||||| |||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||||||  ||| ||||    
T  30002683 attaagtgtattcttgttaatc--------tgatgatactaagaagactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtgaggtgttactcacaacactttt 30002774  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcacc 347  Q
    |||| || ||||||||||||||   |||||||||| | |||||||||||    
T  30002775 gatgctacagtgttaacttcaccagaaaaatcattttaatgacttcacc 30002823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 17272324 - 17272067
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17272324 tgattcatttttaaatcgttcattaccgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgttg 17272225  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
     ||||||||| ||||||| | ||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||||  |||||||| |    
T  17272224 aaatctttaatatgcaaatagagttgctgatatcatgcgatagtcttaagtgtgacacttcatggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattag 17272125  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgt 262  Q
    |||||||||| |||  ||| |||||||| ||||||| ||||    |||||||||||||||||    
T  17272124 attaagtgtattctcattaatctgatgaattgatgatacta----gactgaacttttgatgt 17272067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 27 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 9139563 - 9139247
Alignment:
Q  27 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttg 126  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || || |||||||||||||||||| ||||     
T  9139563 tgattaatgatcaatagtaattcgtctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactacgttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttt 9139464  T
Q  127 atgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattggattaagtgtagtcttgttattctgat 226  Q
    ||                ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  9139463 at----------------cttaagtgttacactttgtagggtgttacagttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgat 9139380  T
Q  227 gagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcac--aa 324  Q
    |||||||||| |||||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||  |||| ||||||||| |  |||||| ||| ||||  |||||||||||  ||    
T  9139379 gagttgatgatactatggggattgaactttttatgtcactgtacaaacggtggggtgttactcact--attttttatgctataacgttaacttcaccaaa 9139282  T
Q  325 aaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcc 359  Q
    ||| ||| | ||||||||||||| || ||||||||    
T  9139281 aaagtcaatttcatgacttcaccatagaattttcc 9139247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 32592444 - 32592096
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| || |    
T  32592444 tgattcatttttaaattgttgattattgattaacgatcaatagtaattcatttagtaatgctttcaacatcttgaacttacaggtactattttatcgtag 32592345  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
      |||||||||||||||||| ||||| ||| || || |||         ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||      
T  32592344 acatctttaacatgcaaacaaagttgctgaaatcatatga---------gtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattaa 32592254  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    ||||| |||| |||||||| |||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||| | |||||||| |||  ||||||||   ||| ||||    
T  32592253 attaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgtcactatacaaacagtggagtgttactctcaacactttt 32592154  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttca-caaaaaa-tcattctcatgacttcaccctaaaattt 356  Q
    |||  | |||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||  ||||||||    
T  32592153 gatactgtagtgttaacttcatcaaaaaagtcattataatgacttcacaataaaattt 32592096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 84 - 300
Target Start/End: Original strand, 4934136 - 4934353
Alignment:
Q  84 gtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataaca 183  Q
    |||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||    
T  4934136 gtactattttatcgttgtcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatatgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttggacttaaaaca 4934235  T
Q  184 aggtaagataaaattggattaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaat-gggat 282  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||| |    
T  4934236 aggtagaataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaaatgatgatactatgaggattgaacttttgatgccagtgtacaaacaatgggggt 4934335  T
Q  283 gttactcattacattttt 300  Q
    |||||||| |||||||||    
T  4934336 gttactcactacattttt 4934353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 84 - 359
Target Start/End: Original strand, 35025530 - 35025799
Alignment:
Q  84 gtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataaca 183  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  35025530 gtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacactttctggggtgtgacacttaaaaca 35025629  T
Q  184 aggtaagataaaattggattaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatg 283  Q
    || || |||||||||  ||||| || |||||||||| ||        |||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||||| |||| ||    
T  35025630 agataggataaaattatattaaatgcagtcttgttaatc--------tgatgatactacgaggactgaacttttgatgtcaacgtataaacagtggggtg 35025721  T
Q  284 ttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcc 359  Q
     |||||| |||| |||||||| ||||||||| |||||||   |||||||||| ||||||||||| | || ||||||||    
T  35025722 ctactcactacacttttgatgctatagtgttgacttcaccagaaaaatcattttcatgacttcagcatagaattttcc 35025799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 46883965 - 46884177
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||  | |    
T  46883965 tgatttatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatc--ggacttaca--tactattttatctttg 46884060  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
    |||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | |||||  ||||||||||| || ||||||||| |    
T  46884061 gaatttttaacatgcaaacaaaatttatgatattatgtgatagt-ttaagtgttacattttgtgagatgtta-gcttataacaagatatgataaaattag 46884158  T
Q  201 attaagtgtagtcttgtta 219  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  46884159 attaagtgtagtctcgtta 46884177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Original strand, 7152055 - 7152218
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  7152055 tgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacaggtactattttatcgttg 7152154  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtg 164  Q
      || ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  7152155 acatatttaacatgcaaacagagttgatgatgttatgtgatagtattaagtgttatactttgtg 7152218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 106 - 322
Target Start/End: Original strand, 54499193 - 54499411
Alignment:
Q  106 tttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagat-aaaattggatta 204  Q
    ||||||||| ||||| ||||  | |||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||    
T  54499193 tttaacatggaaacagagttactaatatcatgtgatagtcttaaaagttacactttgtagggtgttacacttaaaacaaggtatgataaaaattagatta 54499292  T
Q  205 agtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcatt-gtacaaacaatgggatgttactcattacatttttgat 303  Q
    ||| || |||||||| | |||||| ||||||| |||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||  ||| |||||||    
T  54499293 agtatattcttgttaatatgatgaattgatgatactatagagactgaacttttgatgtcattagtacaaacggtggggtgttactcacaacacttttgat 54499392  T
Q  304 gttatagtgttaacttcac 322  Q
    | |||||||||||||||||    
T  54499393 gctatagtgttaacttcac 54499411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 26896447 - 26896285
Alignment:
Q  2 gattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatctt-ggacttacatgtactattttattgtc 99  Q
    ||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| |||||||||||| ||     
T  26896447 gattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgtttgcaacattttcggacttacaagtactattttatcgtt 26896348  T
Q  100 ggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt 163  Q
    | ||| ||||||||||||| | | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26896347 gaaat-tttaacatgcaaatagacttgatcatattatgcgatagtcttaagtgttacactttgt 26896285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 35025417 - 35025511
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttat 95  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35025417 tgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttat 35025511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 155 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 39398115 - 39397916
Alignment:
Q  155 acactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattggattaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaact 254  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||| |         |||||| |||  || |||||||||    
T  39398115 acactttgtggggtgttacacttaaaataaggcaggataaaattagattaagtgtattcttgttaat---------tgatgatactgagaagactgaact 39398025  T
Q  255 tttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaa 352  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||   |||| ||||||| ||||||||||| || |    
T  39398024 tttgatgtcactgtacaaacaatggggtgttactcacaacacttttaatgttatagtgttaacttcaccataaaagtcattctaatgacttcaccataga 39397925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 4205344 - 4205216
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| |||| || |||  | ||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  4205344 tgattcatttttaaattattgattacttattcatgataaatagtaattcatctagtgatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttg 4205245  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatg 129  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||    
T  4205244 gcatctttaacatgcaaacagagttgatg 4205216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 39400368 - 39400236
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||| || |    
T  39400368 tgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtcattcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttaaaggtaccattttatcgttg 39400269  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatat 133  Q
    | |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  39400268 gcatctttaacatgcaaacagagttgctgatat 39400236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 23431915 - 23431826
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactat 90  Q
    |||| ||||||| ||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23431915 tgatgcatttttaaattgttgattactaattaatgatcaatagtaattcatctactaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactat 23431826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 277 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 53124371 - 53124286
Alignment:
Q  277 tgggatgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcca 360  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||| | || |||||||||    
T  53124371 tggggtgttactcattatatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcattttaatgacttcatcatataattttcca 53124286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 256 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 4205221 - 4205116
Alignment:
Q  256 ttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttca-ca-aaaaatcattctcatgacttcaccctaaaa 353  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||| || |||||||||| || ||    
T  4205221 ttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttattcagaacatttttgatattatagtgttaacttcatcagaaaagtcattttcctgacttcaccatagaa 4205122  T
Q  354 ttttcc 359  Q
    ||||||    
T  4205121 ttttcc 4205116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 57 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 56050234 - 56050171
Alignment:
Q  57 aatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaaca 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | | |||||||||||||||||    
T  56050234 aatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaagtctttaacatgcaaaca 56050171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 277 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 4396410 - 4396326
Alignment:
Q  277 tgggatgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcc 359  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||||| | ||||||||||  || ||||||||    
T  4396410 tggggtgttactcattacattttttatgttatagtgttaacttcactaaaaaagtcatttttatgacttcactatagaattttcc 4396326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 2 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 38012621 - 38012568
Alignment:
Q  2 gattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctag 55  Q
    |||| |||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38012621 gatttatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtaattcatctag 38012568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 303 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 52516655 - 52516599
Alignment:
Q  303 tgttatagtgttaacttcacaaaaaa--tcattctcatgacttcaccctaaaatttt 357  Q
    |||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  52516655 tgttatagtgttaacttcaccataaaagtcattctcatgacttcaccataaaatttt 52516599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 324 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 38811848 - 38811810
Alignment:
Q  324 aaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttccata 362  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  38811848 aaaaatcattctcatgacttcaccatagaattttccata 38811810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 17272075 - 17272011
Alignment:
Q  297 ttttgatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcc 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   |||| |||||| || ||||||||| || ||||||||    
T  17272075 ttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcattcccacgacttcaccatagaattttcc 17272011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 247 - 320
Target Start/End: Original strand, 23518400 - 23518473
Alignment:
Q  247 actgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttc 320  Q
    |||||| |||||||| || ||||  |||| |||| ||||| ||| |||| |||| |||||||||||||||||||    
T  23518400 actgaatttttgatgccactgtattaacagtggggtgttagtcactacagttttaatgttatagtgttaacttc 23518473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 57)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 10923083 - 10922724
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||     
T  10923083 tgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacattttggacttacagatactattttattgtca 10922984  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||  |    
T  10922983 gaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgacagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacccttataacaaggtatgataaaataag 10922884  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||    
T  10922883 attaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaggattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtcttactcattacattttt 10922784  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttc 358  Q
     |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  10922783 tatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcattctcatgatttcaccataaaattttc 10922724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 32267390 - 32267030
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || |    
T  32267390 tgattcatttttaaattgttgattactgattaatgttcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacctacaggtactattttatagttg 32267291  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| |    
T  32267290 gaatatttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttgagtgttacactttgtggagtgttacgcttataacaaggtaggataaaattag 32267191  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  32267190 attaagtgtaatcttgttaatctgatgggttgatgataatatgaggagtgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacattttt 32267091  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttcacaaaaaa--tcattctcatgacttcaccctaaaattttcc 359  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  32267090 gatgttatattgttaacttcacaaaaaaagtcattcttatgacttcaccataaaattttcc 32267030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 4 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 15383286 - 15382929
Alignment:
Q  4 ttcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaa 103  Q
    ||||||||| ||||||| |||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || ||||    
T  15383286 ttcatttttaaattgttgattgctgattaataatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttggaa 15383187  T
Q  104 tctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattggatt 203  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  15383186 tctttaacatgcatacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagatt 15383087  T
Q  204 aagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttttgat 303  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| || |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  15383086 aagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactacgatgactgaacttttgatgacattgtacaaacggtgggatgttactcattacatttttgat 15382987  T
Q  304 gttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcc 359  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||| ||||| | || |||||||| || ||||||||    
T  15382986 gttatagtgttaatttcaccaaaaaagtcatttttataacttcaccatagaattttcc 15382929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 2960104 - 2959744
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || |    
T  2960104 tgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacagatactattttatcgttg 2960005  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||| |    
T  2960004 gcatctttaacatgcaaacatatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacaatttgtgggatgttacacttgaaacaaggtaggataaaattag 2959905  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| | |||| ||||    
T  2959904 attaagtgtggtcttgttaatctgatgaattgatgacactatgaggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtgggatgttacttactacagtttt 2959805  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttca-ca-aaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcc 359  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  2959804 gatgttatagtgttaacttcatcagaaaagtcattttcatgacttcaccatagaattttcc 2959744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 51129215 - 51128888
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  51129215 tgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttg 51129116  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||      
T  51129115 aaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagttttaattgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtatgataaaattat 51129016  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||    
T  51129015 attaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactataatgactgaacttttgatgtcattgtacaaacggtggagtgttactcattacattttt 51128916  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttcacaaaaaa 328  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||    
T  51128915 tatgttatagtgttaacttcactaaaaa 51128888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 4 - 360
Target Start/End: Original strand, 30326775 - 30327133
Alignment:
Q  4 ttcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaa 103  Q
    ||||||||| ||||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||    
T  30326775 ttcatttttaaattgttgattactgattgatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaaatgtattattttatcgttggaa 30326874  T
Q  104 tctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattggatt 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||    
T  30326875 tctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtaggataaaatgagatt 30326974  T
Q  204 aagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttttgat 303  Q
    ||||||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||  | || | ||||||||||||||||||||    
T  30326975 aagtgtagttttgttaatctgatgaattgatgatactatgatgactgaacttttgatgctattgtacaaacggttgggtattactcattacatttttgat 30327074  T
Q  304 gttatagtgttaacttcacaaaaaa--tcattctcatgacttcaccctaaaattttcca 360  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  ||||| | ||||||||||  || |||||||||    
T  30327075 gttatagtgttaaattcacaaaaaaagtcatttttatgacttcactatagaattttcca 30327133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 4 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 8222480 - 8222122
Alignment:
Q  4 ttcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaa 103  Q
    ||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  8222480 ttcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaata-taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggaa 8222382  T
Q  104 tctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattggatt 203  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||    
T  8222381 tctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtaggataaaatgagatt 8222282  T
Q  204 aagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttttgat 303  Q
    |||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||   |||  || | ||||||||||||||||||||||    
T  8222281 aagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatgagaactgaacttttgatgccattgt---aacggtgtggtgttactcattacatttttgat 8222185  T
Q  304 gttatagtgttaacttcacaaaaaa--tcattctcatgacttcaccctaaaattttccataag 364  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  ||||| | ||||||||||| || |||||||| ||||    
T  8222184 gttatagtgttaacttcactaaaaaggtcatttttatgacttcaccgtagaattttccttaag 8222122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 37451641 - 37451294
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| || |    
T  37451641 tgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacagatactattttatcgttg 37451542  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  37451541 gaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttttgaggtgttacacttataacaaggtcagataaaattag 37451442  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| | ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  | || ||||||| |||||||||||    
T  37451441 attaagtgtagtcttgttaatatgataaattgatgatacta-gaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttacttattacattttt 37451343  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcacc 347  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||| | |||||||||||    
T  37451342 gatgttatagtgttaactttaccaaaaaagtcatttttatgacttcacc 37451294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 30254779 - 30254420
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |    
T  30254779 tgattcatttttaaattgttgattattgattaataatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtattattttatcgttg 30254680  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||| ||||||||| |    
T  30254679 gaatctttaacatgcaaacagagttgatgttattatgtgacagtcttaagtgttacactttatagggtgttatgcttataacaaggtaggataaaattag 30254580  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||||    
T  30254579 attaagtctagtcttgttaatctgatgaattgatgatactttgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtgtg-tattactcattacattttt 30254481  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttc-acaaaaaa-tcattctcatgacttcaccctaaaattttcc 359  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| || |||||||| || ||||||||    
T  30254480 gatgttatattgttaacttcaacaaaaaagtcattcttataacttcaccatagaattttcc 30254420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 27 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 18422981 - 18422647
Alignment:
Q  27 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttg 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || ||||||||||||||||||||  || ||    
T  18422981 tgattaatgatcaatagtaattcatctagcaatgcttgcaacatcttggacttacatgtgcttttttatcgttggaatctttaacatgcaaacggaggtg 18422882  T
Q  127 atgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattggattaagtgtagtcttgttattctgat 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  18422881 atgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcatataacaaggtaggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgat 18422782  T
Q  227 gagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcac--aa 324  Q
    || ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  18422781 gaattgatgatattatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacggtggggtgttactcgttatatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaa 18422682  T
Q  325 aaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcc 359  Q
    ||| ||||| | ||||||||||| || ||||||||    
T  18422681 aaagtcatttttatgacttcaccatagaattttcc 18422647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 19899588 - 19899949
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtc 99  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  19899588 tgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgtt 19899687  T
Q  100 ggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattg 199  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||| |||||||||     
T  19899688 ggaatctttaacatgcaaatagagttggtgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttagaacaatgtatgataaaatta 19899787  T
Q  200 gattaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttt 299  Q
     |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||| |||||||| || | |||||||| |||||||||    
T  19899788 tattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatactatgagggttgaacttttgatgccattctacaaacagtgaggtgttactcgttacatttt 19899887  T
Q  300 tgatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcc 359  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||| || ||||||||    
T  19899888 tgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcattattatgacttcaccatagaattttcc 19899949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 28564603 - 28564949
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |    
T  28564603 tgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtattattttatcgttg 28564702  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||| | ||||||||| |    
T  28564703 aaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagt--taagtgttacactttacggggtgttatgcttataacaaggcatgataaaattag 28564800  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||    
T  28564801 attaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtaaggtgttactcattacattttt 28564900  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttca--caaaaaatcattctcatgacttcacc 347  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||| ||||||||    
T  28564901 gatgttatagtgttaacttcatcaaaaaaatcattttcataacttcacc 28564949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 3 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 15752383 - 15752021
Alignment:
Q  3 attcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcgga 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||| |||||| | || |||    
T  15752383 attcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaaaaattgcaacttcttggacttacatgtattattttgtcgttgga 15752284  T
Q  103 atctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattggat 202  Q
    || ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| |||    
T  15752283 atttttaacatgcaaacagagttaatgatattatgtgatactcttaagtgttacactttatggggtgttacgcttaaaacaaggtaggataaaattagat 15752184  T
Q  203 taagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttttga 302  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||||| || |||||| |    
T  15752183 taagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccattgtacaaacagtgaggtgttactcactatatttttta 15752084  T
Q  303 tgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttccataa 363  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  15752083 tgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcatgacttcaccatagaatttttcataa 15752021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 23999704 - 23999342
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtc 99  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||     
T  23999704 tgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgtt 23999605  T
Q  100 ggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattg 199  Q
    | ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||| |||||||||     
T  23999604 gaaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttatgcttagaacaaggtatgataaaatta 23999505  T
Q  200 gattaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttt 299  Q
     |||||||||||||||||||  ||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||| ||| |||||    
T  23999504 tattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgataatactatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaatagtggggtgttactcgttatatttt 23999405  T
Q  300 tgatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcca 360  Q
    | ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  23999404 ttatgttgtagtgttaacttcaccaaaaaaatcattcttatgacttcaccataaaattttcca 23999342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 32216411 - 32216090
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| || |    
T  32216411 tgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttg 32216312  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |    
T  32216311 gaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatttg 32216212  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    ||||||| |||| |||||| ||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||    
T  32216211 attaagtttagttttgttaatctaatgaattgatgatactacgaggactgaacttttgacgccattgtacaaacagtggtgtgttactcactacattttt 32216112  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttcac 322  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  32216111 gatgttatagtgttaacttcac 32216090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 16416002 - 16415641
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  16416002 tgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttg 16415903  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| |    
T  16415902 gcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtattacaatatgtggggtattacacttaaaacaaggtaggataaaattag 16415803  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaaca-atgggatgttactcattacatttt 299  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||| | |||||||||||||| || ||||||||||  | || ||||||||| |||| |||    
T  16415802 attaagtgtagtcttgttaatctaatgaattgatgatactatgatggctgaacttttgatgccactgtacaaacatttagggtgttactcactacacttt 16415703  T
Q  300 tgatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcc 359  Q
    ||||| |||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  16415702 tgatgctatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccttagaattttcc 16415641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 47279545 - 47279197
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |    
T  47279545 tgattcatttttaaattgttgattactaattaatgatcaatagtaattcatctaataatgtttgcaacatcttggacttacagatactattttattgttg 47279446  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||||| |    
T  47279445 gcatctttaacatgcaaacatagttgttgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttatgggatgttacaattaaaacaaggtaggataaaattag 47279346  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||| |||| |||||||||  ||| ||||    
T  47279345 attaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaactttcgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacactttt 47279246  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcacc 347  Q
    |||  |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  47279245 gatagtataatgttaacttcaccaaaaaaatcattctcatgacttcacc 47279197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 28770009 - 28769682
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  28770009 tgattcatttttaaattgttgattattaattaatgatcaatagtaattcatctagcaatgtttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 28769910  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt-ggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattg 199  Q
     ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||     
T  28769909 aaatctttaacatgcaaacagaggtgatgatattatgtgatagtcttaagcgttacactttgtgggggtgttacgtttataacaaggtatgataaaatta 28769810  T
Q  200 gattaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttt 299  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  28769809 gattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatgaggaccgaacctttgatgccattgtacaaacggtggg-tgttactcattacatttt 28769711  T
Q  300 tgatgttatagtgttaacttcacaaaaaa 328  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28769710 tgatgtcatagtgttaacttcacaaaaaa 28769682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Original strand, 27763130 - 27763487
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtc 99  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||     
T  27763130 tgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatatttatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttacagatactattttatcgtt 27763229  T
Q  100 ggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattg 199  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||| |||||||||     
T  27763230 ggaatctttaacatgcaaatagagttgattatattatgtgatagtcttaagtattacactttgtagggtgttacgcttagaactaggtatgataaaatta 27763329  T
Q  200 gattaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttt 299  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  27763330 gattaagtgtagtcttgttaacctgataaattgatgatactatgagggctggacttttgatgtcattctacaaactatggg-tgttactcattacatttt 27763428  T
Q  300 tgatgttatagtgttaacttcac-aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaatttt 357  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||| |||| ||||    
T  27763429 tgatgttatagtgttaacttcacaaaaaaatcattcttataactttaccataaattttt 27763487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 3 - 361
Target Start/End: Original strand, 27227307 - 27227659
Alignment:
Q  3 attcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcgga 102  Q
    |||||||||| ||| ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || |      
T  27227307 attcatttttaaatggttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacagatactattttatcgttgac 27227406  T
Q  103 atctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattggat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||    
T  27227407 atctttaacatgcaaacatagttgatgatatcatgtgatagtcttaagtgttgcactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagat 27227506  T
Q  203 taagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttttga 302  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| || | ||      | ||||||||| |    
T  27227507 taagtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtgaggtg------agtacatttttta 27227600  T
Q  303 tgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttccat 361  Q
    ||   |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  27227601 tg--ctagtgttaacttcaccaaaaaaatcattctcatgacttcaccatagaattttccat 27227659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 10181827 - 10182188
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatg-tactattttattgtc 99  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||||     
T  10181827 tgattcatttttaaattgttgattgttgattaatgttcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacattttggacttacaaggtactattgtattgtt 10181926  T
Q  100 ggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattg 199  Q
    |  ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||     
T  10181927 gtcatctttaacatacaaccagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatta 10182026  T
Q  200 gattaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttt 299  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||  |||||| || || |||||    
T  10182027 gattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgacgatactatgaggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggcgtgttacgcactatatttt 10182126  T
Q  300 tgatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcc 359  Q
    | |||||| ||| ||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  10182127 ttatgttacagttttaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaattttcc 10182188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 4 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 25160985 - 25160715
Alignment:
Q  4 ttcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaa 103  Q
    ||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  25160985 ttcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatatagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggaa 25160886  T
Q  104 tctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattggatt 203  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||    
T  25160885 tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaatgagatt 25160786  T
Q  204 aagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaac 274  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25160785 aagtgtagtcttattaatctaatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccattgtacaaac 25160715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 9902874 - 9903215
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| || |    
T  9902874 tgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtagtgcttgcagcatcttggacttactggtactattttatcgttg 9902973  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
      |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |    
T  9902974 tcatctttaacatgcaaacaaatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacacttgaaacaatgtaagataaaattag 9903073  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| | |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||| |||| ||||    
T  9903074 attaagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatagtatgtggattgaacttttgatgtcactgtacaaacagcggggtgttactcactacagtttt 9903173  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttca-caaaaaa-tcattctcatga 340  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  9903174 gatgttatagtgttaacttcatcaaaaaagtcattttcatga 9903215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 238333 - 238659
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||  |||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| || |    
T  238333 tgattcatttttaaattgtggattactgattcatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacagatattattttatcgttg 238432  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| |    
T  238433 gcatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattag 238532  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    |||||||||| |||||||| |||||| | ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||    
T  238533 attaagtgtattcttgttagtctgattaattgttgatactatggggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagt-ggatgttactcacaacattttt 238631  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttcacaaaaaa 328  Q
     ||  ||||||||||||||||| |||||    
T  238632 aatactatagtgttaacttcaccaaaaa 238659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 2 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 14758387 - 14758038
Alignment:
Q  2 gattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcgg 101  Q
    ||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  14758387 gattcatttttaaattgttgattgttgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgg 14758288  T
Q  102 aatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgga 201  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||         ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||    
T  14758287 catctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaa---------tttctggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattaga 14758197  T
Q  202 ttaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttttg 301  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||| | |  || |||||| |||| |||||    
T  14758196 ttaagtgcagtcttgttaatctaatgaattgatgaaactatggggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagttgtgtgctactcactacacttttg 14758097  T
Q  302 atgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttc 358  Q
    ||||||||||||| |||||||   |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14758096 atgttatagtgttgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccgtaaaattttc 14758038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 46931766 - 46931440
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtc 99  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||     
T  46931766 tgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaataatatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgtt 46931667  T
Q  100 ggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattg 199  Q
    | ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||   ||||||||| |||||||||     
T  46931666 gaaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgct--gaacaaggtatgataaaatta 46931569  T
Q  200 gattaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttt 299  Q
     |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| | ||||||| ||||| |||||||| | || |||||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  46931568 tattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatattatgagggctgaatttttgatgccgttctacaaacagtggggtattactcattacatttt 46931469  T
Q  300 tgatgttatagtgttaacttcacaaaaaa 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  46931468 tgatgttatagtgttaacttcacaaaaaa 46931440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 42721392 - 42721032
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| |||| || |||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |    
T  42721392 tgattcatttttaaattattgattactcattaatgatcaatagtaattaatctagtaataattgcaacatcttggacttacatgtaatattttatcgttg 42721293  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
       ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| |    
T  42721292 ---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattacgtgataatcttaagtgttatactttgtggggtattacacttaaaacaaggtaggataaaattag 42721196  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||||| | |||||||||| |||| ||||||||| || ||||||    
T  42721195 attaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggattgaacttttgatgttactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttt 42721096  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttccata 362  Q
     ||| ||||| | |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||    
T  42721095 tatgatatagggctaacttcaccaaaaaaatcattttcatgacttcaccatagaattttccata 42721032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 3 - 360
Target Start/End: Original strand, 47682316 - 47682674
Alignment:
Q  3 attcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcgga 102  Q
    |||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || |      
T  47682316 attcttttttaaattgttaattactgattaatgatcaatagtaattcatttagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttgac 47682415  T
Q  103 atctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattggat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |  |||||||| | |    
T  47682416 atctttaacatgcaaacatagttgatgatattatatgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacacttaaaacaaggcagaataaaattagtt 47682515  T
Q  203 taagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatggga-tgttactcattacatttttg 301  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||  || ||||||| || ||||| |||||||||  ||||||||     
T  47682516 taaatgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggaatgaacttttgataccactgtacaagcagtgggagtgttactcacaacatttttt 47682615  T
Q  302 atgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcca 360  Q
    |||   |||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  47682616 atg--ctagtgttaacttcaccaaaaaagtcactctcatgacttcaccataaaattttcca 47682674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Original strand, 7078883 - 7079255
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| || |    
T  7078883 tgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaatatcttagacttacatatactattttatcgttg 7078982  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
    | |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |    
T  7078983 gcatctttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtcttaagtcttatactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattag 7079082  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaac-----------aatgggatgttactc 289  Q
    |||||||||| |||||||| | |||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||           | |||| ||||||||    
T  7079083 attaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatactatgatgactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtgaggtgttagtggggtgttactc 7079182  T
Q  290 attacatttttgatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcca 360  Q
    |  ||| ||||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  7079183 acaacacttttgatattatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattatcatgactttaccataaaattttcca 7079255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 3 - 346
Target Start/End: Original strand, 27267022 - 27267364
Alignment:
Q  3 attcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcgga 102  Q
    |||||||||| |||| || |||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| || |      
T  27267022 attcatttttaaattattgattattgattaattatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacagatactattttatcgttgac 27267121  T
Q  103 atctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattggat 202  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||| |||    
T  27267122 atctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttgcactttgtggggtgttacactcaaaacaaggt-agattaaattagat 27267220  T
Q  203 taagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttttga 302  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||  |||||||||||| ||| || |||||||||| |||| ||| ||||| ||||||||| |    
T  27267221 taagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggagactgaacttttaatgccactgtacaaacagtggggtgtcactcactacatttttta 27267320  T
Q  303 tgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcac 346  Q
    ||   |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  27267321 tg--ctagtgttaacttcaccaaaaaaatcattctcatgacttcac 27267364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 4 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 38823567 - 38823209
Alignment:
Q  4 ttcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaa 103  Q
    ||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||||| || || |    
T  38823567 ttcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacattttagacttacaggtattattttatcgttggca 38823468  T
Q  104 tctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattggatt 203  Q
    ||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||| ||||||||| ||||    
T  38823467 tctctaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgttgggtgttacacttaaaataaagtaggataaaattagatt 38823368  T
Q  204 aagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttttgat 303  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||| || |||||||| | |||| ||||||||   ||| |||||||    
T  38823367 aagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggattgaacttttgatgacactgtacaaatagtggggtgttactcgcaacaattttgat 38823268  T
Q  304 gttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcca 360  Q
    | |||||||||||||| ||   |||| ||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  38823267 gctatagtgttaacttaaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcca 38823209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 9 - 322
Target Start/End: Original strand, 27532809 - 27533121
Alignment:
Q  9 tttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatcttt 108  Q
    |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||    
T  27532809 tttttaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatcttt 27532908  T
Q  109 aacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattggattaagtg 208  Q
    ||| |||||||| | ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  27532909 aacttgcaaacagaattgctgatatcatgtgatagtcttgagtgttacactttgtgaggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatt-gattaagtg 27533007  T
Q  209 tagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttttgatgttat 308  Q
    || |||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||| || |||||||| | |||| |||||| ||  | | |||||||| |||    
T  27533008 tattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaagagtgggttgttacccacaatacttttgatgctat 27533107  T
Q  309 agtgttaacttcac 322  Q
    ||||||||||||||    
T  27533108 agtgttaacttcac 27533121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 4330637 - 4330323
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    ||||||||||||  |||||| |||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  | |    
T  4330637 tgattcatttttatattgttgattactgattaatgatcaattgtaattcatctagtaatgcttgcaacatattggacttacaagtactattttatctttg 4330538  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
      |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |    
T  4330537 acatctttaacatgcaaaaagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattag 4330438  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaat-gggatgttactcattacatttt 299  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| | ||||||| ||||||| |||||||||||||||  || |||||||||| | ||| ||||||||| |||| |||    
T  4330437 attaagtgcagtcttgttaatctgataaattgatgatactatgatgactgaacttttgatcccactgtacaaacattgggggtgttactcactacacttt 4330338  T
Q  300 tgatgttatagtgtt 314  Q
    ||||| |||||||||    
T  4330337 tgatgctatagtgtt 4330323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 2 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 15168451 - 15168085
Alignment:
Q  2 gattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcgg 101  Q
    ||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |     
T  15168451 gattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaacatcttgtacttacatgtactattttatcgttga 15168352  T
Q  102 aatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgga 201  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||    
T  15168351 catctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagccttaagtgttacactttctgaggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattaga 15168252  T
Q  202 ttaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatg-------tcattgtacaaacaatgggatgttactcattac 294  Q
    |||| || |||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||        ||  ||||||||| |||| || |||||| |||    
T  15168251 ttaactgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgccaccgtacaacgtacaaacagtggggtgctactcactac 15168152  T
Q  295 atttttgatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcc 359  Q
    | |||||||| ||||||||| |||||||   ||||| ||||||||| |||||||  || ||||||||    
T  15168151 acttttgatgctatagtgttgacttcaccagaaaaagcattctcatcacttcacgatagaattttcc 15168085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Original strand, 27563725 - 27564084
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||| ||||| ||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||      
T  27563725 tgattcttttttaaattgttgattactgattaatgatcaatattaattcatctagtaatacttgcaacatcttggacttacatatactattttatcgttt 27563824  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||| |    
T  27563825 gcatctttaacatgcaaacagagttgatgaaattatatgatagtcttaagtgttcctctttgtggggtattatacttaaaacaaggtaggataaaattag 27563924  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | | |||  | |||||||||||||||||| | |||||||| |||  ||||||||| || ||||||    
T  27563925 attaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgataatattatcggaactgaacttttgatgtcactatacaaacagtggagtgttactcactatattttt 27564024  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttcac---aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaatttt 357  Q
     | |||||||||||||||||||   ||||||||||| |||| |||||||| || ||||||    
T  27564025 aaagttatagtgttaacttcactaaaaaaaatcattttcataacttcaccgtagaatttt 27564084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 34012202 - 34012557
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |    
T  34012202 tgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatatagtaatgcttgcaacatcttgaacttacatatactattttatcgttg 34012301  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
    | |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||     |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||| |    
T  34012302 gcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagt-----gtgttacattttgtggggtgttacacttgaaacaaggttggataaaattag 34012396  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||| || | |||||||| |||  ||||||||| |||| | ||    
T  34012397 attaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatagtatgatgactgaacttttgatgccactttacaaacagtggagtgttactcactacagtgtt 34012496  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttcacaaaaaa--tcattctcatgacttcaccctaaaattttcc 359  Q
    |||||||||||||||||||||  | |||  ||||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  34012497 gatgttatagtgttaacttcatcataaacgtcattttcatgacttcaccatagaattttcc 34012557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 2 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 40885168 - 40884848
Alignment:
Q  2 gattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcgg 101  Q
    ||||||||||| |||| || |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  40885168 gattcatttttgaattattgattgctaattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcatcgg 40885069  T
Q  102 aatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgga 201  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||| |||||| || ||||||| | ||    
T  40885068 catctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacacttttcggaatgttacacttaaaacaagataggataaaactaga 40884969  T
Q  202 ttaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttttg 301  Q
    ||||||| | |||||||| |||||||| |||| || |||||  ||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||| || |||||| |||| |||||    
T  40884968 ttaagtgcaatcttgttaatctgatgaattgaagatactatagggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgctactcactacacttttg 40884869  T
Q  302 atgttatagtgttaacttcac 322  Q
    ||||||| ||||| |||||||    
T  40884868 atgttatggtgttgacttcac 40884848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 9 - 359
Target Start/End: Original strand, 37618729 - 37619076
Alignment:
Q  9 tttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatcttt 108  Q
    |||| ||||||| |||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||    
T  37618729 ttttaaattgttgattattgattaatggtcaatactaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtattattttatcgttggaatcttt 37618828  T
Q  109 aacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattggattaagtg 208  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||         |||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  37618829 aacatgcaaacagagttgatgatattatatga---------gtgttacactttatgggatgttatgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtg 37618919  T
Q  209 tagtcttgttattctgatgagttgatg--aaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatg--ttactcattacatttttgatg 304  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||  | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||  |||||||||| ||||||||||    
T  37618920 tagtattgttaatctgatgaattgatgatatactatgagaactgaacttttgatgtcattttacaaacagtggggtgttttactcattaaatttttgatg 37619019  T
Q  305 ttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcc 359  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||||||| || |||||||| || ||||||||    
T  37619020 ttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattcttataacttcaccatagaattttcc 37619076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 29 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 41926484 - 41926161
Alignment:
Q  29 attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgat 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||    
T  41926484 attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttg-aatatcttggacttacaagtactattttattgttggcatctttaacatgcaaacagagttgat 41926386  T
Q  129 gatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattggattaagtgtagtcttgttattctgatga 228  Q
    |||||||| | |||      ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  41926385 gatattatttaata------agtgttacactttgtggagtgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatga 41926292  T
Q  229 gttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttca--caaaa 326  Q
     ||||||| |||||  ||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||   ||||    
T  41926291 attgatgatactatagggactgaacttgtgatgccactgtacaaacagtgggatattactcactatatttttgatgttatagtattaacttcatcaaaaa 41926192  T
Q  327 aatcattctcatgacttcaccctaaaatttt 357  Q
    ||||||| |||| |||||||| || ||||||    
T  41926191 aatcattttcataacttcaccatagaatttt 41926161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 2 - 360
Target Start/End: Original strand, 31621369 - 31621734
Alignment:
Q  2 gattcattttttaa-ttgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || |    
T  31621369 gattcattttttaaattgttgattgatgattaatgatcaatagtagttcatctactaatgcttgcaacatattgaacttacatgtactattttatcgttg 31621468  T
Q  101 gaatct-----ttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaa 195  Q
    | ||||     |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| || |||||| || |||||| ||||||||| ||||||    
T  31621469 gcatctttaacttaacatgcaaacatagttgttgatattatgcgatagtcttaagtgtcacac-ttctggggtattgcacttaaaacaaggtaggataaa 31621567  T
Q  196 attggattaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattaca 295  Q
    ||| ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||  ||||||| |  ||| || |||||| ||||    
T  31621568 attagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactgaatttttgatgccaccgtacaaatagcggggtgctactcaataca 31621667  T
Q  296 tttttgatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcca 360  Q
      ||||||||||||||||| |||||||   |||| ||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  31621668 cctttgatgttatagtgttgacttcactagaaaagtcattctcatgacttcaccgtagaattttcca 31621734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 3309509 - 3309142
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| || |    
T  3309509 tgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaatatcttggacttacgggtactattttatcgttg 3309410  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact-----ttgtggggtgttacacttataacaaggtaagat-aa 194  Q
    | ||||||||||| |||||| ||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||     | ||| ||||||||| ||| ||||| ||| | | ||    
T  3309409 gcatctttaacatacaaacagagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacacttagtgtagtgaggtgttacatttaaaacaaagtaggttaaa 3309310  T
Q  195 aattggattaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattac 294  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||||  || |||||||||| |||| |||||||||  ||    
T  3309309 aattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagattgaacttttgataccactgtacaaacagtggg-tgttactcacaac 3309211  T
Q  295 atttttgatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttccat 361  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||   |||| ||||||||||||||| ||| || ||||||||||    
T  3309210 acttttgatgttatagtgttaactttaccagaaaagtcattctcatgactttaccatagaattttccat 3309142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 3535279 - 3534967
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || |    
T  3535279 tgattcatttttaaattgttgattgttgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaaaggtactattttatcgttg 3535180  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
    | |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||         |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |    
T  3535179 gcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatg---------taagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggcaggataaaattag 3535089  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    ||||| |||| |||||||| |||||||| ||||| | | || | |||||||||||||||||||| || ||||||| |  | |||||||||  ||| ||||    
T  3535088 attaaatgtattcttgttaatctgatgaattgataatattaaggggactgaacttttgatgtcactgcacaaacagtaaggtgttactcacaacactttt 3534989  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttcac 322  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  3534988 gatgttatagtgttaacttcac 3534967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 1547627 - 1547283
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  1547627 tgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatggtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttg 1547528  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
    | ||||||        |||| ||||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |    
T  1547527 gtatcttt--------aacagagttgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaagtaggataaaattag 1547436  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    |||||||||| | |||||| ||        |||||| |||||||| ||||||||||||||| || || ||||||| |||  |||||||||  ||||||||    
T  1547435 attaagtgtatttttgttaatc--------tgatgatactatgagaactgaacttttgatgccactgcacaaacagtggagtgttactcacaacattttt 1547344  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcc 359  Q
     |||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  1547343 tatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcc 1547283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 3 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 39393738 - 39393379
Alignment:
Q  3 attcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcgga 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||  | ||     
T  39393738 attcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggatttaccggtactattttatcattggc 39393639  T
Q  103 atctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagat-aaaattgga 201  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| | |||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||    
T  39393638 atctttaacatggaaacagagttgctaatatcatatgatagtcttaagtgttacactttgtaggatgttacacttaaaacaaggtaggataaaaattaga 39393539  T
Q  202 ttaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttttg 301  Q
    | ||||||| |||||||| |||||||| || |||| |||||| ||| | ||||||||||| || |||||||||||||   | |||||||  ||| |||||    
T  39393538 tgaagtgtattcttgttaatctgatgaatttatgatactatggggattaaacttttgatgccactgtacaaacaatgaagtattactcacaacacttttg 39393439  T
Q  302 atgttatagtgttaacttca--caaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcc 359  Q
    ||| ||||||||||||||||    |||| |||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  39393438 atgctatagtgttaacttcattagaaaagtcattctcataacttcaccgtagaattttcc 39393379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 11742188 - 11742530
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  11742188 tgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttg 11742287  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
      ||||||||||| |||| | ||||| |||||| |||||||||||||||                  ||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  11742288 acatctttaacatacaaagagagttgctgatatcatgtgatagtcttaa-----------------ttgttacacttaaaacaaggtaagataaaattag 11742370  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    |||||||||| |||||||| || ||||| ||||||| | |||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| |  ||| ||||    
T  11742371 attaagtgtattcttgttaatccgatgaattgatgatattatg-ggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttacttacaacactttt 11742469  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcc 359  Q
    |||  |||||||||||||||||   |||| |||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  11742470 gataatatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcataacttcacgataaaattttcc 11742530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 53 - 357
Target Start/End: Original strand, 33725472 - 33725778
Alignment:
Q  53 tagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg 152  Q
    |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  33725472 tagtaatgtttgcaacattttggtcttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaaatg 33725571  T
Q  153 ttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattggattaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaa 252  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||| |||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  33725572 ttacactttctggggtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatgaggactgaa 33725671  T
Q  253 cttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcacccta 350  Q
    ||||||||| ||    | ||| | |||| || |||||| |||| |||||||| ||||| ||| |||||||   |||| |||||||| |||||| ||| ||    
T  33725672 cttttgatgccaccaaagaaatagtgggctgctactcaatacacttttgatgatatagcgttgacttcactagaaaagtcattctcttgactttaccata 33725771  T
Q  351 aaatttt 357  Q
     ||||||    
T  33725772 gaatttt 33725778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 22171067 - 22170806
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||  | |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| |||||||| | | |||||||| || |    
T  22171067 tgatttatttttaaattgttgattactaattaatgatcaatagtaatttatctaataatgtttgcaacatcttagacttacaagaattattttatcgttg 22170968  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
      |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| ||||| |    
T  22170967 acatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacatttgaaacaaggtaggatgaaattag 22170868  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgt 262  Q
    |||||||||||| || ||| ||| |||| ||||||| | ||||  |||||||||||||||||    
T  22170867 attaagtgtagtgttattaatctaatgaattgatgatattatgtagactgaacttttgatgt 22170806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 1359755 - 1359919
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| || |    
T  1359755 tgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcgatagtaattcatccagtaatgcttgcaacattttgaacttacaggtactattttatcgttg 1359854  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgg 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1359855 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatatgataatcttaagtgttacactttgtgg 1359919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 103 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 48620882 - 48620670
Alignment:
Q  103 atctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattggat 202  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||         ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||    
T  48620882 atctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagat 48620792  T
Q  203 taagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttttga 302  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||  ||| ||||||    
T  48620791 taagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttga 48620692  T
Q  303 tgttatagtgttaacttcacaa 324  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  48620691 tgttatattgttaacttcacaa 48620670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 44 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 38759846 - 38759611
Alignment:
Q  44 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatag 143  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| || |  | |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  38759846 taattaatctagtaatgcttgcaacatcttggagttacatatattattttatagttgacacctttaacatgcaaacatagttggtgatattatctgatag 38759747  T
Q  144 tcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattggattaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatg 243  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || |||||||||  ||||| |||||| || ||| | |||||| ||||||| | || |    
T  38759746 tctcaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaataagatatgataaaattaaattaaatgtagttttattaatatgatgaattgatgatattacg 38759647  T
Q  244 agga----ctgaacttttgatgtcattgtacaaaca 275  Q
    | ||    ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38759646 aagactggctgaacttttgatgtcactgtacaaaca 38759611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 48353898 - 48353735
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| || |    
T  48353898 tgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaataataattcatctagtaatgcttgcaatatcttggacttacagatactattttatcgttg 48353799  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgg 165  Q
      |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  48353798 acatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtctt-agtgttacactttgtgg 48353735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 21289956 - 21289817
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||  |||||||| || |    
T  21289956 tgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaataataattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttataagtgttattttatcgttg 21289857  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatag 143  Q
    | |||||||| ||||||||| |||   ||||||||||||||||    
T  21289856 gcatctttaatatgcaaacagagt---tgatattatgtgatag 21289817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 28 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 31962945 - 31962851
Alignment:
Q  28 gattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacata 122  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| || |||||||| || |   |||||||||||||||||||    
T  31962945 gattaatgatcaatagtagttcatctaataatgcttgcaacatcttaaacttacatatattattttatcgttgatttctttaacatgcaaacata 31962851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 213 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 21289816 - 21289674
Alignment:
Q  213 cttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattt-------ttgatgt 305  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||||||| |||||||       || |||     
T  21289816 cttgttaatctgatgaattgatgatactatagggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactacattttttattatttatga 21289717  T
Q  306 tatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcac 346  Q
    |||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||    
T  21289716 tatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcac 21289674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 262 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 30254952 - 30254854
Alignment:
Q  262 tcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttca-caaaaaa-tcattctcatgacttcaccctaaaattttcc 359  Q
    |||||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||| || ||||||||    
T  30254952 tcattgtacaaacagtggg-tgttatccattacatttttgatgttatagtgttaacttcatcaaaaaagtcattattatgacttcaccatagaattttcc 30254854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 231 - 321
Target Start/End: Original strand, 1359933 - 1360022
Alignment:
Q  231 tgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttca 321  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  || ||| ||| || |||||| |||||||||| |||||||||    
T  1359933 tgatgatactacgaggactgaacttttgatgtcattatacaaacactgaaatatta-tcactatatttttaatgttatagtattaacttca 1360022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 277 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 25160449 - 25160366
Alignment:
Q  277 tgggatgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttca-caaaaa-atcattctcatgacttcaccctaaaattttcc 359  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| |||||| |||||| | ||||||||| | || ||||||||    
T  25160449 tgggatattactcattacattttttatgttata-tgttaatttcatcaaaaatatcatttttatgacttcatcgtagaattttcc 25160366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0291 (Bit Score: 247; Significance: 1e-137; HSPs: 1)
Name: scaffold0291
Description:

Target: scaffold0291; HSP #1
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 8247 - 7889
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  8247 tgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttg 8148  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || ||||||||| |    
T  8147 gaatctttaacatgcgaacaacgttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttatagcaagttaggataaaattag 8048  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  8047 attaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacaatttt 7948  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttca-caaaaaa-tcattctcatgacttcaccctaaaatttt 357  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||||||| || ||||||    
T  7947 gatgttatagtgttaacttcatcaaaaaagtcattcttataacttcaccatagaatttt 7889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 63)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 48355292 - 48354932
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| |||||||  ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  48355292 tgattcatttttaaattgttgcttactgattaatgatcaataataattcatctagtaatacttgcaacatcttggacttacagatactattttattgtcg 48355193  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |    
T  48355192 gaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggtatgttacatttataacaaggtaggataaaattag 48355093  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  48355092 actaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgagaactgaacttttgatgccattgtacaaacaatggggtgttactcattacattttt 48354993  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcc 359  Q
     || ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  48354992 aatattatagtgttaacttcaccataaaaatcattctcatgacttcaccatagaattttcc 48354932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 26941085 - 26941445
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  26941085 tgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttg 26941184  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || ||| |||| |||||||||||||| ||||||||| |    
T  26941185 gaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatatgatagttttaagtgttacactttatgaggtattacgcttataacaaggtaggataaaattag 26941284  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| || |||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| | ||||    
T  26941285 attaagtgtagtcttgttaatctgatgaattaatgataccatgaggactgaacttttgatgtcattatacaaacagtggggtgttactcattataatttt 26941384  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcc 359  Q
    ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  26941385 gattttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcattcttatgacttcaccatagaattttcc 26941445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Original strand, 42505900 - 42506214
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  42505900 tgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 42505999  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |    
T  42506000 gaatctttaacatgcgaacaacgttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttatagcaaggtaggataaaattag 42506099  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||    
T  42506100 attaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtattactcattacaatttt 42506199  T
Q  301 gatgttatagtgtta 315  Q
    |||||||||||||||    
T  42506200 gatgttatagtgtta 42506214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 40552084 - 40552444
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |    
T  40552084 tgattcatttttaaattgttgattactgattaataatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcatggacttacatgtactattttatcgttg 40552183  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||      
T  40552184 gaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgacaatcctaagtgttacacgttgtgggatgttacgcttataacaagctaagataaaattaa 40552283  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||    
T  40552284 attaagtgtagtgttgttaatctgatgaattgatgatattatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacggtggagtgttactcattacattttt 40552383  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcc 359  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  40552384 gatgttatagtgttaacttctccaaaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcc 40552444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 4761473 - 4761836
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||    
T  4761473 tgattcattttcaaattgttgatttctgattaatgattaatagtaattcatctggtaatgtttgcaacattttggacttataggtactattttattgtcg 4761572  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt-ggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattg 199  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||     
T  4761573 gaatctttaacatgcaaatatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttatactttgtgggggtgttatacttataacaaggtaggataaaatta 4761672  T
Q  200 gattaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttt 299  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||    
T  4761673 gattaagtgtagtcttgttaatcagatgagttgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtgaagtgttactcattacatttt 4761772  T
Q  300 tgatgttatagtgttaacttcac----aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcc 359  Q
    |||| ||||||| ||||||||||    ||||| ||| |||||||| |||||| || ||||||||    
T  4761773 tgatattatagtattaacttcaccaaaaaaaagtcaatctcatgaattcaccatagaattttcc 4761836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 5 - 359
Target Start/End: Original strand, 46994490 - 46994835
Alignment:
Q  5 tcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaat 104  Q
    |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  46994490 tcatttttaaattgttgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaatatcttggacttacaggtactattttattgtcggaat 46994589  T
Q  105 ctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattggatta 204  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  46994590 ctttagcatgcaaacataattgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtggggcgttacacttataacaaggtaggataaaattagatta 46994689  T
Q  205 agtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttttgatg 304  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||       |||   |||||||||||||| ||||||||    
T  46994690 agtgtagtcttgttaatcatatgagttgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgt-------atg---tgttactcattaca-ttttgatg 46994778  T
Q  305 ttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcc 359  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||| || ||||||||    
T  46994779 ttatagtattaacttcaccaaaaaaatcattcttacgacttcaccgtagaattttcc 46994835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Original strand, 46297587 - 46297945
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || |    
T  46297587 tgattcatttttaaattgttgattactaattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaaatactattttatcgttg 46297686  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || |    
T  46297687 gaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaagtttg 46297786  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    |||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||  ||||||||| || ||||||    
T  46297787 attaagtgtagttttgttaatctaatgaattgatgatactacggggactgaacttttgacgccattgtacaaacagtggtgtgttactcactatattttt 46297886  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaatttt 357  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||| ||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  46297887 gatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatttt 46297945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 21009626 - 21009990
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtc 99  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||     
T  21009626 tgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaggtactattttatcgtt 21009725  T
Q  100 ggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattg 199  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||| |||||| || |||||||||     
T  21009726 ggaatctttaacatgcaaatattgttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagagtgttatgcttagaacaagttatgataaaatta 21009825  T
Q  200 gattaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttt 299  Q
     |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  21009826 tattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgataatatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaatagtggggtgttactcattacatttt 21009925  T
Q  300 tgatgttatagtgttaacttcac-----aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcc 359  Q
    |||||||||||||| || |||||     ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  21009926 tgatgttatagtgtcaaattcacaaaaaaaaaaatcattcttataacttcaccataaaattttcc 21009990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 47481874 - 47481513
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtc 99  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||     
T  47481874 tgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttacaagtactattttatcgtt 47481775  T
Q  100 ggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattg 199  Q
    | ||||||||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| || ||||||  ||||||||     
T  47481774 gaaatctttaatatgcaaatagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttatgcttagaataaggtataataaaatta 47481675  T
Q  200 gattaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttt 299  Q
     |||||||||||||||||||   |||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  47481674 tattaagtgtagtcttgttaacatgatgaattgatgatactatgagggctaaacttttgatgtcattctacaaacagtggggtgttactcattacatttt 47481575  T
Q  300 tgatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcc 359  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  47481574 tgatgttatagtgttaacttcaccaaaaacatcattcctatgacttcaccataaaattttcc 47481513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 7 - 359
Target Start/End: Original strand, 3655031 - 3655387
Alignment:
Q  7 attttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcat--ctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaat 104  Q
    |||||| ||||||| |||  |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |  |||||    
T  3655031 atttttaaattgttgattactgattaataatcaatagtaattcatatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatatgtgttattttatcgatggaat 3655130  T
Q  105 ctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattggatta 204  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||    
T  3655131 ctttaacatgcaaacagagctgatgatatcatgtgatagttttaagtgttacattttgtggtgtgttacgcttctaacaaggtaggataaaattagatta 3655230  T
Q  205 agtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttttgatg 304  Q
    |||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| |||    
T  3655231 agtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacggtggggtgttactcattacattttttatg 3655330  T
Q  305 ttatagtgttaacttca-caaaaaa-tcattctcatgacttcaccctaaaattttcc 359  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  3655331 ttatagtgttaactttatcaaaaaagtcatttttatgacttcaccataaaattttcc 3655387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 34133286 - 34132959
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||   |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  34133286 tgattcatttttaaattgttgattaccgattcatgattactagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 34133187  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
    | |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||      
T  34133186 gcatctttaacatgcaaacaaaattgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattat 34133087  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    |||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||    
T  34133086 attaagtgtattcttattagtctgatgaattgatgatattatggggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcacaacattttt 34132987  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttcacaaaaaa 328  Q
    |||  ||||||||||| ||||| |||||    
T  34132986 gatactatagtgttaatttcaccaaaaa 34132959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 52040747 - 52041096
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  | |||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  52040747 tgattcatttttaaattgttgattactcattaatgatcaataatcattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttg 52040846  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| |    
T  52040847 acatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactatgtggggtattacacttaaaacaaggtaggataaaattag 52040946  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaaca-atgggatgttactcattacatttt 299  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||  ||||  |||||||| |||| |||    
T  52040947 attaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatactatgatgactgaacttttgatgccactatacaaacatttggggagttactcactacacttt 52041046  T
Q  300 tgatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcacc 347  Q
    |||||||||||| ||||||||||   |||| |||||||||||||||||||    
T  52041047 tgatgttatagtattaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcacc 52041096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 2 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 22451318 - 22450959
Alignment:
Q  2 gattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcgg 101  Q
    ||||||||||| |||| || |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  22451318 gattcatttttaaatttttgattgctgattaatgatcaataataattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgttga 22451219  T
Q  102 aatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgga 201  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||    
T  22451218 catctttaacatgcaaacatagttgatgatattatacgatagtgttaaatgttacacttactggggtgttacacttaaaacaaggtaaggtaaaattaga 22451119  T
Q  202 ttaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttttg 301  Q
    ||||||| |||||||||| | |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||   |||||||| || | || |||||| |||| |||||    
T  22451118 ttaagtgcagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgccaccatacaaacagtgaggtgctactcactacacttttg 22451019  T
Q  302 atgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcc 359  Q
    ||| ||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  22451018 atgctatagtgttgacttcaccagaaaaatcattctcatgacttcaccatagaattttcc 22450959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Original strand, 53228977 - 53229336
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |    
T  53228977 tgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatactaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttacatgtattattttatcgttg 53229076  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| ||||||||| |    
T  53229077 gcatctttaacatgcaaacaaagttgatgatactatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggagttacacttaaaataaggtaggataaaattag 53229176  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatg-ggatgttactcattacatttt 299  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||  | |||||||||| || || |||| |||| |||| |||    
T  53229177 attaactgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatattatgatgactgaacttttgatgcaactgtacaaacattgagggtgttgctcactacacttt 53229276  T
Q  300 tgatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaatttt 357  Q
    ||||| ||||||||||| |||||   |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  53229277 tgatgctatagtgttaatttcaccagaaaaataattttcatgacttcaccttaaaatttt 53229336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 4015810 - 4015448
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |    
T  4015810 tgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttaccgttg 4015711  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
    | |||||||||||||||||| ||||| |||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |    
T  4015710 gcatctttaacatgcaaaca-agttgttgatacaatgcgatagtcttaagtgtgacactttgtggggtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattag 4015612  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    | ||| | || |||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | || |||||||||  ||| ||||    
T  4015611 actaattatattcttgttaatatgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcactctacaaacagttgggtgttactcacaacactttt 4015512  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttca-ca-aaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttccata 362  Q
    |||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  4015511 gatgctatagtgttaacttcatcagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttccata 4015448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 37203419 - 37203057
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||| ||||||||||||  | |    
T  37203419 tgattcatttttaaattgttgattactcattaatgatcaatggtaattcatctagtaatgcttgcgatatattggacttacaggtactattttatcattg 37203320  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaaca-tagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattg 199  Q
      ||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||||| |||||||||     
T  37203319 acatctttaacatacaaacaatatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgatacactaaaaataaggtaggataaaatta 37203220  T
Q  200 gattaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttt 299  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||||||| |||| |||    
T  37203219 gattaagtgtagtcttgttaatcttatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactacaattt 37203120  T
Q  300 tgatgttatagtgttaacttca--caaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcca 360  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||||||||||| | ||||||||||| || |||||||||    
T  37203119 tgatgttatagtgttaacttcatcaaaaaaatcatttttatgacttcaccatagaattttcca 37203057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 37158059 - 37157698
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  | |    
T  37158059 tgattcatttttaaattgttgattactcattaatgatcaatggtaattcatctagtaatgcttgcgacatattggacttacatgtactattttatcattg 37157960  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaaca-tagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattg 199  Q
    | ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| |||||||||     
T  37157959 gcatctttaacatacaaacaatatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttgaaataaggtaggataaaatta 37157860  T
Q  200 gattaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttt 299  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || | ||||||| ||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||| |||| ||||||||| |||| |||    
T  37157859 gattaagtgtagtcttgttaatcttataaattgatgatactatgatgactgaacttttgatgccactgtac-aacagtggggtgttactcactacaattt 37157761  T
Q  300 tgatgttatagtgttaacttca-caaaaaa-tcattctcatgacttcaccctaaaattttcca 360  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||||||||| || |||||||||    
T  37157760 tgatgttatagtgttaacttcatcaaaaaagccattttcatgacttcaccatagaattttcca 37157698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 27 - 357
Target Start/End: Original strand, 54828552 - 54828883
Alignment:
Q  27 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttg 126  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  54828552 tgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatagttggaatttttaacatacaaacatagttg 54828651  T
Q  127 atgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattggattaagtgtagtcttgttattctgat 226  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  | ||||    
T  54828652 atgatattatttgatagttttaagtgttacactttgtgggatgttacacttataataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttcatatgat 54828751  T
Q  227 gagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcac--aa 324  Q
    || |||||||  |||||| || |||| |||||||||| ||||  ||||  |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||    
T  54828752 gaattgatgatgctatgaagaatgaatttttgatgtcgttgtttaaacggtggggtgttactcattacattttt-atgttatagtgttaactttaccaaa 54828850  T
Q  325 aaaatcattctcatgacttcaccctaaaatttt 357  Q
    ||||| ||| | ||||||||||| |||||||||    
T  54828851 aaaattatttttatgacttcaccataaaatttt 54828883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 39283003 - 39282644
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||| |    
T  39283003 tgattcatttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacattttggatttacagatactattttattgttg 39282904  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
      |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |    
T  39282903 acatctttaacaggcaaacatatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttgaaacaaggtaggataaaattag 39282804  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| | |||||| ||||||||||||||| || |||| ||||| |||| | |||||||  ||| ||||    
T  39282803 attaagtgtagtcttgttaatctgatgaatggatgataatatgagaactgaacttttgatgccactgtataaacagtggggtattactca-cacagtttt 39282705  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttca-ca-aaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcc 359  Q
    |||||||||||||||| || | || |||||||||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  39282704 gatgttatagtgttaattttatcagaaaaatcattttcatgacttcaccatagaattttcc 39282644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 7327307 - 7327668
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || |    
T  7327307 tgattcatttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaagtactattttatcgttg 7327406  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
    | |||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||| |      
T  7327407 gcatctttaacatgcaaatagagttgttgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacactagaaagaaggtaggataaaaataa 7327506  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    |||||||||| |||||||| || ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||  ||| ||||    
T  7327507 attaagtgtattcttgttaatccgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtcactgtacaaataatggagtgttactcacaacactttt 7327606  T
Q  301 gatgttatagtg-ttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcc 359  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  7327607 gatgttatagtgtttaacttcactaaaaaagtcattctcataacttcaccatagaattttcc 7327668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Original strand, 33378610 - 33378951
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |    
T  33378610 tgattcatttttaaatcgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttgaacttacatgtactattttatcgttg 33378709  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |    
T  33378710 acatctttaacatgcaaacatagttgatgagattatgcgatagtcttaagtattacacttcttggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattag 33378809  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| | |||| |  |||||| |||| ||||    
T  33378810 attaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgataatactatggggactgaacttttgatgtcaccgtacaaatattggggtactactcactacactttt 33378909  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttcacaaaaaatcattctcatgactt 343  Q
    |||  ||||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  33378910 gatactatagtgttgacttcac-aaaagtcattctcataactt 33378951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 24488787 - 24489135
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| |||| || |||  ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    ||||||||||||| |    
T  24488787 tgattcatttttaaattattgattattgattcatgattaatagtaatgcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttactgacactattttattgttg 24488886  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
    | |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |    
T  24488887 gcatctttaacatgcaaatagagttgatgatattgtgtgatagtcttaagtgttacaccttgtgaggtgttacacttaaaacaatgtaagataaaattag 24488986  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||  ||||||||    
T  24488987 attaagtgtattcttgttagtctgatgaattgatgataatatggggactgaacttttgatgtcattgtgcaaacagtggaatgttactcacaacattttt 24489086  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcacc 347  Q
     ||  |||||| ||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||    
T  24489087 aatactatagtcttaacttcacaaaaaaaatcattttcgtgacttcacc 24489135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 54506159 - 54505799
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtc 99  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||||| ||     
T  54506159 tgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacattttggacttataaatactattttatcgtt 54506060  T
Q  100 ggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattg 199  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||| ||||||||| |||||||||     
T  54506059 ggaatctttaacatgcaaataaagtagatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagagtgttatgcttagaacaaggtatgataaaatta 54505960  T
Q  200 gattaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttt 299  Q
     |||||||||||||||||||  | ||||  || |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  54505959 tattaagtgtagtcttgttaacccgatgtatttatgatactatgagg-ctgaatttttgatgtcattctataaataatggggtgttactcattacatttt 54505861  T
Q  300 tgatgttatagtgttaacttc-acaaaaaa-tcattctcatgacttcaccctaaaattttcc 359  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||   ||||||| | |||||||||||    
T  54505860 tgatgttatagtgttaacttcaacaaaaaagtcattcttgcgacttcatcataaaattttcc 54505799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 44891848 - 44891494
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||| || |    
T  44891848 tgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaacagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttgtaggtactattttatcgttg 44891749  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
      ||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| |    
T  44891748 acatctttaacatacaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggagtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattag 44891649  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    |||||||||| |||||||| |||||| | ||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |         ||| ||||||||||||||  ||| ||||    
T  44891648 attaagtgtattcttgttaatctgattaattgatgatactatgtggactaaacttttgatgcc---------acagtgggatgttactcacaacactttt 44891558  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttca-caaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttccataa 363  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| || ||||||||||||    
T  44891557 gatgttatagtgttaacttcaccaaaaagtcattttcatgacttcaccgtataattttccataa 44891494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Original strand, 24707940 - 24708295
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |    
T  24707940 tgattcatttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtaatttatctaataatgcttgcaacttcttggacttacatgtactattttatcgttg 24708039  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
    | |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |    
T  24708040 gcatctttaacatgcaaacaaatttgatgatattatgtgattgttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttgaaacaaggtaggataaaattag 24708139  T
Q  201 at--taagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattt 298  Q
    ||   |||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||| || | ||||||||| | || ||    
T  24708140 atcaaaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgtcactgtac--acagtgaggtgttactcactgcagtt 24708237  T
Q  299 ttgatgttatagtgttaacttcacaaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaatttt 357  Q
    |||||||||  |||||||| ||| ||||| ||||| | || |||||||| |||||||||    
T  24708238 ttgatgtta-cgtgttaacatcaaaaaaagtcattttgataacttcaccataaaatttt 24708295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 3362606 - 3362277
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  | |||| ||||||| || |    
T  3362606 tgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatccagtaatgcttgcaacatattggacttctaagtacaattttatcgttg 3362507  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
      |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||| ||||||||| |    
T  3362506 acatctttaacatgcaaacagagttgatgatgttatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgtttcacttaaaataaggtaggataaaattag 3362407  T
Q  201 atta--agtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattt 298  Q
    ||||  |||||||||||||||   |||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||| || |||||||| | |||||||||||||| || ||||    
T  3362406 attaatagtgtagtcttgttaacatgatgaattgatgataccatgaggagtgaacttttgatgccactgtacaaatagtgggatgttactcactatattt 3362307  T
Q  299 ttgatgttatagtgttaacttcacaaaaaa 328  Q
     ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  3362306 ctgatgctatagtgttaacttcaccaaaaa 3362277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 2 - 357
Target Start/End: Original strand, 43975718 - 43976068
Alignment:
Q  2 gattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcgg 101  Q
    ||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || ||    
T  43975718 gattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacaagtactattttatcgttgg 43975817  T
Q  102 aatctttaacatgcaaaca---tagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaatt 198  Q
     |||||||||||| |||||   ||||||||||||||||| ||||||       |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  43975818 catctttaacatgtaaacaacatagttgatgatattatgcgatagt-------gttacactttctggggtgttacacttaaaacaagataagataaaatt 43975910  T
Q  199 ggattaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattt 298  Q
     ||||||||| | | |||||| |||||||| ||||||| | |||||||| | ||||||||||||||| ||||||| | |||  || |||||| |||| ||    
T  43975911 agattaagtgcaattttgttaatctgatgaattgatgatattatgaggattaaacttttgatgtcatcgtacaaatagtggagtgctactcactacactt 43976010  T
Q  299 ttgatgttatagtgttaacttcacaaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaatttt 357  Q
    |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43976011 ttgatgctatagtgttgacttca-aaaaagtcattctcatgacttcaccataaaatttt 43976068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 27 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 2008257 - 2007957
Alignment:
Q  27 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttg 126  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |  |||||||||||||||||| |||||    
T  2008257 tgattaatgatcaatattatttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtactattttatcgttgtcatctttaacatgcaaacagagttg 2008158  T
Q  127 atgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattggattaagtgtagtcttgttattctgat 226  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||    
T  2008157 ctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggagtg-tacacttaaaacgaggtaggataaaattagattaagtatattcttgttaatctgat 2008059  T
Q  227 gagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacaaaa 326  Q
    || |||||||  ||||| ||| ||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||||||  ||| |||| | | |||||||||||||||| ||||    
T  2008058 gaattgatgatgctatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttaacgctatagtgttaacttcaaaaaa 2007959  T
Q  327 aa 328  Q
    ||    
T  2007958 aa 2007957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 11357206 - 11357535
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  11357206 tgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtactattttatcgttg 11357305  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||                 |||||||||||| || |||||| ||||||||| |    
T  11357306 gtatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaa-----------------gtgttacacttaaaataaggtaggataaaattag 11357388  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaat-gggatgttactcattacatttt 299  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||| | ||| ||||||||| || | |||    
T  11357389 attaaatgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgatgactgaacttttgatgcaactgtacaaacagtgggggtgttactcactatacttt 11357488  T
Q  300 tgatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttc 344  Q
    ||||| |||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||    
T  11357489 tgatgctatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttc 11357535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 22622543 - 22622778
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  22622543 tgattcatttttaaatagttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttg 22622642  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
      ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |    
T  22622643 acatctttaacatccaaacagatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacgctttgtggggtgttacacttgaaacaaggtatgataaaattag 22622742  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatga 236  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  22622743 attaagtgtagttttgttaatctgatgaattgatga 22622778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 29099697 - 29099358
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||      
T  29099697 tgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatggtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaaaggtactattttatcgtta 29099598  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
    | |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||         ||||||||||||||||||||||||| || |||| | |||||||||      
T  29099597 gcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgaaagt---------tacactttgtggggtgttacacttaaaataaggcacgataaaattaa 29099507  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    |||||||||| |||||||| | |||||| ||||||| |||| | |||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||  ||||||||    
T  29099506 attaagtgtattcttgttaatatgatgaattgatgatactaaggggactgaactttagatgtcactgtacaaacagtggggtgttactcacgacattttt 29099407  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcacc 347  Q
     |||||||||||||||||||||   |||| ||||||| |||||||||||    
T  29099406 tatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctaatgacttcacc 29099358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 27 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 11467142 - 11466815
Alignment:
Q  27 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttg 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||| ||||| || |||||||||| | || || ||||| |||||||||||| |||||    
T  11467142 tgattaatgatcaatagtaattcatcta-------ttgcaacatcttagacttgcaggtactattttgtcgttggtatcttaaacatgcaaacagagttg 11467050  T
Q  127 atgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattggattaagtgtagtcttgttattctgat 226  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  11467049 ttgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgat 11466950  T
Q  227 gagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttca-ca-a 324  Q
    || ||||||| |||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||| |||| |||||||||  ||| ||  ||||||||||| ||||||||| || |    
T  11466949 gaattgatgatactatggggactaaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttgcgatgttatagtcttaacttcatcaga 11466850  T
Q  325 aaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcc 359  Q
    ||| ||||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  11466849 aaagtcattctcaagacttcaccatagaattttcc 11466815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 4 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 25580087 - 25579731
Alignment:
Q  4 ttcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaa 103  Q
    ||||||||| ||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| | ||||  |||||| || || |    
T  25580087 ttcatttttaaattgttgattgcggattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaatatcttagatttataggtacagttttatcgttggca 25579988  T
Q  104 tctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattggatt 203  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||    
T  25579987 tctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtaatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacactaaaaacaaggtaggataaaattagatt 25579888  T
Q  204 aagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttttgat 303  Q
    ||||||| | |||||| ||| || |  |||||| | |||| |||||||||||||||||||| |||| ||| | | | |||||| |||  ||| |||||||    
T  25579887 aagtgtatttttgttaatctaataaactgatgataatatggggactgaacttttgatgtcactgtataaatagtagaatgttattcacaacacttttgat 25579788  T
Q  304 gttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttc 358  Q
    | |||||| ||||||||||   ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  25579787 gctatagtattaacttcaccagaaaaatcattctcataacttaaccataaaattttc 25579731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 33698504 - 33698269
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| || |    
T  33698504 tgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaatatcttagacttacaggtactattttatcgttg 33698405  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
    | |||||||||||||||||| |||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |    
T  33698404 gcatctttaacatgcaaacagagttgccgatatcatgcgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattag 33698305  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatga 236  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  33698304 attaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatga 33698269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 21193958 - 21193597
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  |||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||   ||||||||||| ||      
T  21193958 tgattcatttttaaattgttgattactgattaataatcaatagtaattcatttagtaatggttgcaacatcttgaacttacggctactattttatcgtga 21193859  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtc-ttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattg 199  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||| || |||||||| ||||||||||  |||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||     
T  21193858 gaatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatatgatagtctttaagtgttatcctttatggagtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatta 21193759  T
Q  200 gattaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttt 299  Q
    |||||| |||| |||||||| |||||||| || |||| || ||| |||||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||  ||| |||    
T  21193758 gattaaatgtattcttgttaatctgatgaattaatgataccatggggactgaacttttgatgtcactctacaaacagtggggtgttactcacaacacttt 21193659  T
Q  300 tgatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcc 359  Q
    ||||   | ||||||||||||||   |||| ||||||||||||||| ||| || ||||||||    
T  21193658 tgattcaacagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgactttaccatagaattttcc 21193597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 356
Target Start/End: Original strand, 22445890 - 22446247
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||| || |    
T  22445890 tgattcatatttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatccagtaatacttgcaacattttggacttaaaggtactattttatcgttg 22445989  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
    | |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| || |||| | |||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |    
T  22445990 gtatctttaatatgcaaaaatagttgatgatattatatgatagtcttgagtgttatacattgt-gagtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattag 22446088  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatga-ggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttt 299  Q
    ||||||||||||||| ||  | |||||| ||||||| ||||||| ||  ||||||||||||| || |||||||| | |||| ||||||||| || |||||    
T  22446089 attaagtgtagtcttatttatatgatgaattgatgatactatgagggtttgaacttttgatgccactgtacaaa-agtggggtgttactcactatatttt 22446187  T
Q  300 tgatgttatagtgttaacttcac---aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattt 356  Q
    ||||| |||| ||||||||||||   ||||| ||||| ||||||||||||| || |||||    
T  22446188 tgatgatataatgttaacttcaccaaaaaaagtcattttcatgacttcaccgtagaattt 22446247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 2 - 361
Target Start/End: Original strand, 27480184 - 27480566
Alignment:
Q  2 gattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa----catcttggacttacatgtactattttattg 97  Q
    ||||||||||| ||||||| ||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||    ||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  27480184 gattcatttttaaattgttgatcgctgattaataatcaatagtaattcatctagtaatgtttgtaattaacattttggacttacatgtactattttatcg 27480283  T
Q  98 tcggaatctttaacatgcaaacata----gttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacacttt---gtg----------gggtgttacacttata 180  Q
    | || ||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    |||          |||||||||||||| |    
T  27480284 ttggcatctttaacatgcaaacatatatagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacacttctgggtgttacacttctgggtgttacacttaaa 27480383  T
Q  181 acaaggtaagataaaattggattaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatggg 280  Q
    |||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| | |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||    
T  27480384 acaatgtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtcaccgtacaaacaattgg 27480483  T
Q  281 atgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttccat 361  Q
    ||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |||| ||  |||| |||||||||||||||||| | || ||||||||||    
T  27480484 atgctactcattatacttttgatgttatagtgttgactttaccaaaaatatcattctcatgacttcatcatagaattttccat 27480566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 9 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 32373813 - 32373477
Alignment:
Q  9 tttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatcttt 108  Q
    |||| ||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || |  ||||||    
T  32373813 ttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagaaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaagtactattttatcgttgacatcttt 32373714  T
Q  109 aacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattggattaagtg 208  Q
    || ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  32373713 aatatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgtcacactttgtgggatgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtg 32373614  T
Q  209 tagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttttgatgttat 308  Q
    || |||||||| | |||||| ||||||| || ||  ||   |||||||||||| || |||||||||| |||   ||||||||  ||| |||||||| |||    
T  32373613 tattcttgttaatatgatgaattgatgataccattggggtggaacttttgatgccactgtacaaacagtgg--agttactcacaacacttttgatgctat 32373516  T
Q  309 agtgttaacttca--caaaaaatcattctcatgacttca 345  Q
    ||||||||||| |    |||| |||||||||||||||||    
T  32373515 agtgttaactttattggaaaagtcattctcatgacttca 32373477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 37 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 45174821 - 45174493
Alignment:
Q  37 tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattat 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| || || |||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||    
T  45174821 tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaccgttactattttatcgttggcatctttaacatggaaacagagttgctgatatcat 45174722  T
Q  137 gtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagat-aaaattggattaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatg 235  Q
     | |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||  ||||| |||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  45174721 attatagtcttaagtgttacactttgtagagtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaattaaattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatg 45174622  T
Q  236 aaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttact--cattacatttttgatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatca 331  Q
    | |||||| |||||||||||||||||  | |||||||||| ||   |||||||  ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |    
T  45174621 atactatggggactgaacttttgatgctactgtacaaacagtgaagtgttactcacacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtta 45174522  T
Q  332 ttctcatgacttcaccctaaaattttcca 360  Q
    ||||||  |||||||| ||||||||||||    
T  45174521 ttctcacaacttcaccataaaattttcca 45174493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 38592049 - 38591727
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||| |||||  |||| |||||| || |    
T  38592049 tgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaatttgtttaataatgcttgcaacatcttggatttacaaatacttttttatcgttg 38591950  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
      |||||| ||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||  |||||| || ||||||||| |    
T  38591949 tcatctttgacatgcaaatagatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgtcacgttttgtggggtattacacttgaaacaagataggataaaattag 38591850  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaa----acaatgggatgttactcattacat 296  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||    |||||| ||||||||||  || |     
T  38591849 attaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgataataatatgtggacttaacttttgatgccattgtacaacaatacaatgagatgttactccctataa 38591750  T
Q  297 ttttgatgttatagtgttaactt 319  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  38591749 ttttgatgttatagtgttaactt 38591727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 150 - 360
Target Start/End: Original strand, 51212955 - 51213167
Alignment:
Q  150 gtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattggattaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggact 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  51212955 gtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattatattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaggact 51213054  T
Q  250 gaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcacc 347  Q
     ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  51213055 caacttttgatgccattgtacaaacagtggggtgttgctcattacattttttatgttacagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcatgacttcacc 51213154  T
Q  348 ctaaaattttcca 360  Q
     || |||||||||    
T  51213155 atagaattttcca 51213167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 44186342 - 44186686
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||  | |    
T  44186342 tgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttagacttagaggtactattttatcattg 44186441  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
    | |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||                |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| |    
T  44186442 gcatctttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagt----------------tgtggggtgttacatttaaaacaaggtaggataaaattag 44186525  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    |||||||||| | |||||| | |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||  ||| |||||||||  ||| ||||    
T  44186526 attaagtgtatttttgttaatttgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtcactgtataaacagcggggtgttactcacaacactttt 44186625  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcc 359  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||| | || ||||||||    
T  44186626 gatgctatagtgttaacttcaccaaaaaaatcattctctcgacttcatcatagaattttcc 44186686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 1090044 - 1089806
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| || |    
T  1090044 tgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggattta-atgtactattttatcgttg 1089946  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgggg-tgttacacttataacaaggtaagataaaattg 199  Q
    | |||||||||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||     
T  1089945 gcatctttaacatgcaaatagagttgttgatgttatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggatgttacacttaaaacaaggtaggataaaatta 1089846  T
Q  200 gattaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaac 239  Q
    |||| | ||||||| ||||  |||||| | ||||| ||||    
T  1089845 gatttaatgtagtcctgttgatctgataaattgataaaac 1089806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 27 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 29164134 - 29163912
Alignment:
Q  27 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttg 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| ||  | |||||||||||||||||| |||||    
T  29164134 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgtaacatcttagacttacaagtactattttatcgttagcatctttaacatgcaaacagagttg 29164035  T
Q  127 atgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattggattaagtgtagtcttgttattctgat 226  Q
     |||||| ||||||         ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||    
T  29164034 ctgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttattaatctgat 29163944  T
Q  227 gagttgatgaaactatgaggactgaacttttg 258  Q
    || ||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  29163943 gaattgatgatactaagaggactgaacttttg 29163912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 40936324 - 40935995
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || |    
T  40936324 tgatttatttttaaattgttgattaccgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttagacttgcatgtactattttatcgttg 40936225  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
    | |||||||||||||||||  ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||                   || || ||  |||||||||      
T  40936224 gcatctttaacatgcaaacggagttgctaatatcatgtgatagtcttaagtgttacactt------------------aaaaaaagttggataaaattat 40936143  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||   ||| ||||    
T  40936142 attaagtgtattcttgttaatctgatgaatagatgatactatgaggactgaacttttgatgtcactgtataaacaatgaggtgttactcgcaacactttt 40936043  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcac 346  Q
    |||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  40936042 gatgctatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctcatgacttcac 40935995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 103 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 35844575 - 35844317
Alignment:
Q  103 atctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaa-ttgga 201  Q
    |||||||||||| ||||| ||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||||| || ||    
T  35844575 atctttaacatggaaacaaagttactgatatcatgtgata-tcttaagtgttacactttgtagggtgttacacttaaaactaggtaggataaaaattaga 35844477  T
Q  202 ttaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttttg 301  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| || | |||||||||  |||||||||    
T  35844476 ttaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactaaacttttgatgtcactgtacaaacagtgaggtgttactcacaacatttttg 35844377  T
Q  302 atgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcc 359  Q
     ||||||||||||||||||||   |||| ||||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  35844376 ttgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcattatcatgacttcaccatagaattttcc 35844317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 4 - 148
Target Start/End: Original strand, 51212599 - 51212743
Alignment:
Q  4 ttcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaa 103  Q
    ||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  51212599 ttcatttttaaattgttgatttttaattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttattgtcggaa 51212698  T
Q  104 tctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtctta 148  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  51212699 tctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagcctta 51212743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 290
Target Start/End: Original strand, 14586505 - 14586784
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || |    
T  14586505 tgatttatttttaaattgttgattactgattaatgatcagtagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggacttac-cgtactattttatcgttg 14586603  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||  |         |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || |    
T  14586604 gcatctttaacatgcaaacatagttgttgatatcatacg---------agtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaagttag 14586694  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactca 290  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||| | ||||  |||||||||| ||| |||| ||| | || | |||||||||    
T  14586695 attaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggacaaaacttttgatatcactgtataaatagtgaggtgttactca 14586784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 180 - 361
Target Start/End: Original strand, 20373300 - 20373483
Alignment:
Q  180 aacaaggtaagataaaattggattaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgg 279  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20373300 aacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgataccatgagaactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtgg 20373399  T
Q  280 gatgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttccat 361  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||    
T  20373400 ggtgttactcgttacatttttgatgttatagtattaacttcaccaaaaaaatcattcttatgacttcactataaaattttccat 20373483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 46 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 43348563 - 43348320
Alignment:
Q  46 attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtc 145  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| || |  |||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||||    
T  43348563 attcatttagtaatgcttgcaacatcttaaacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaatagagttgttgatatcatgtgatagtc 43348464  T
Q  146 ttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattggattaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgag 245  Q
    |||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||  |     
T  43348463 ttaagtgtcacactttatgggatgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatacta-aaa 43348365  T
Q  246 gactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactca 290  Q
    |||||||||||||||| || |  ||||||| |||| |||| ||||    
T  43348364 gactgaacttttgatgccactaaacaaacagtggggtgttgctca 43348320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 36012490 - 36012244
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||   |||||||||||| || |    
T  36012490 tgatttatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcagcattttggacttatcggtactattttatcgttg 36012391  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaac-atagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagat-aaaatt 198  Q
    | |||||||||||| |||| | ||||| |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||||| ||| ||||||    
T  36012390 gcatctttaacatggaaacaagagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacattttgtgggatgttacactgaaaacaaggtaggataaaaatt 36012291  T
Q  199 ggattaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgag 245  Q
     ||||| ||||| |||||||  |||||||| ||||||| | ||||||    
T  36012290 agattaggtgtattcttgttcatctgatgaattgatgatattatgag 36012244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 122 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 53176284 - 53176086
Alignment:
Q  122 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattggattaagtgtagtcttgttatt 221  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||  ||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||| |    
T  53176284 agttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggagtgttatatttaaaatgaggttggataaaattagattaagtgtaatcttgttaat 53176185  T
Q  222 ctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttca 321  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||  ||||| |  ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  53176184 ctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgttattgtacaaacagt-ggacattacttacaacatttttgatgttatgatgttaacttca 53176086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 68 - 195
Target Start/End: Original strand, 20373136 - 20373263
Alignment:
Q  68 catcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgggg 167  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||     
T  20373136 catcttggacttatatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttatggga 20373235  T
Q  168 tgttacacttataacaaggtaagataaa 195  Q
    | |||| |||||||||||||| ||||||    
T  20373236 tattacgcttataacaaggtaggataaa 20373263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 37 - 250
Target Start/End: Original strand, 11835494 - 11835702
Alignment:
Q  37 tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattat 136  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||    |||      ||||||| | |||||||||||| ||    
T  11835494 tcaatagtaattcatttagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatactattttatcgttaacatc------atgcaaatagagttgatgatatcat 11835587  T
Q  137 gtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaa-attggattaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatg 235  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||||| | |||||| | |||| | ||||||    
T  11835588 gtgatagtcttaattgttacactttgtaggttgttacacttaaaacaaggtaggataaatattagattaagtgtatttttgttaatatgataaattgatg 11835687  T
Q  236 aaactatgaggactg 250  Q
    | |||||| ||||||    
T  11835688 atactatggggactg 11835702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 26 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 50475137 - 50475021
Alignment:
Q  26 atgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagtt 125  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  | |  |||||||| ||||||||| | ||    
T  50475137 atgattaatgatcaatactaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtattattttatccttgacatctttaatatgcaaacagattt 50475038  T
Q  126 gatgatattatgtgata 142  Q
    ||||||||||| |||||    
T  50475037 gatgatattatatgata 50475021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 2 - 166
Target Start/End: Original strand, 11356984 - 11357140
Alignment:
Q  2 gattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcgg 101  Q
    ||||||||||| ||||||| |||  | ||||||||| ||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  | ||    
T  11356984 gattcatttttaaattgttgattactaattaatgatgaatagtaatt--------aatgcttgcaacatcttggacttacaaatactattttatcattgg 11357075  T
Q  102 aatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggg 166  Q
     || |||||||| ||| || ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11357076 catatttaacatacaaccagagttgatgatattatatgatagtcttgagtgttacactttgtggg 11357140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 39 - 147
Target Start/End: Original strand, 53811597 - 53811701
Alignment:
Q  39 aatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgt 138  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||| |||||||| || || |||||||||||||||    |||||||||||||||||    
T  53811597 aatagtaattcatctaggaatgcctgcaacatcttggacttacgagtattattttatcgttggtatctttaacatgcaa----agttgatgatattatgt 53811692  T
Q  139 gatagtctt 147  Q
    |||||||||    
T  53811693 gatagtctt 53811701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 277 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 33698263 - 33698182
Alignment:
Q  277 tgggatgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacaaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcca 360  Q
    |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| | | |  ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  33698263 tggggtgttactcacaacatttttgatgttatagtgttaacttcactagaga--attctcatgacttcaccatagaattttcca 33698182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 20373088 - 20373140
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatct 53  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  20373088 tgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatct 20373140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 307 - 358
Target Start/End: Original strand, 11835737 - 11835790
Alignment:
Q  307 atagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttc 358  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  11835737 atagtgttaacttcaccaaaaaaatcattctcatgacttcaccatagaattttc 11835790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 277 - 318
Target Start/End: Original strand, 41585408 - 41585449
Alignment:
Q  277 tgggatgttactcattacatttttgatgttatagtgttaact 318  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41585408 tggggtgttactcattatatttttgatgttatagtgttaact 41585449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 304 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 29163895 - 29163839
Alignment:
Q  304 gttatagtgttaacttcacaa--aaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttc 358  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||    
T  29163895 gttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattttaatgacttcaccataaaattttc 29163839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 324 - 357
Target Start/End: Original strand, 53818522 - 53818555
Alignment:
Q  324 aaaaatcattctcatgacttcaccctaaaatttt 357  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  53818522 aaaaatcattctcatgacttcaccataaaatttt 53818555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 47)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 3 - 321
Target Start/End: Original strand, 19289168 - 19289486
Alignment:
Q  3 attcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcgga 102  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  19289168 attcatttttaaattgttaatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaatatcttggacttacaggtattattttattgtcgga 19289267  T
Q  103 atctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattggat 202  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||    
T  19289268 atctttaacatgcacacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgggatgttacatttataacaatgtaggataaaattagat 19289367  T
Q  203 taagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttttga 302  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  19289368 taagtgtagtcttattaatctgatgagttgatgatactgtgagaacttaacttttgatgtcattgtacaaacaatggggtgttactcattatatttttga 19289467  T
Q  303 tgttatagtgttaacttca 321  Q
    |||||||||||||||||||    
T  19289468 tgttatagtgttaacttca 19289486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 43648088 - 43648415
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| || ||||||||| || |    
T  43648088 tgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcgacatcttggacttacaagtgctattttatcgttg 43648187  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
     ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  43648188 aaatctttaacatggaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttatactttgtgtggtgttacacttataacaaggtatgataaaattag 43648287  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || | |||||||||||||||||||    
T  43648288 attaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgatgactgaacttttgatgtcattatacaaacagtgaggtgttactcattacattttt 43648387  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttcacaaaaaa 328  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||    
T  43648388 gatgttatagtgttaacttcaccaaaaa 43648415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 4 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 37906067 - 37905708
Alignment:
Q  4 ttcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaa 103  Q
    ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||  | ||||    
T  37906067 ttcatttttaaattgttaattactgattaatgatcaatagtaattcatccagtaattcttgcaacatcttggacttacatgtgttattttatcattggaa 37905968  T
Q  104 tctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgggg--tgttacacttataacaaggtaagataaaattgga 201  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||    
T  37905967 tctttaacatgcaaacagagttaatgatattatgcgatagttttaagtgttacactttgtggggggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattaga 37905868  T
Q  202 ttaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttttg 301  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||     
T  37905867 ttaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacggtggggtgttactcgttacatttttt 37905768  T
Q  302 atgttatagtgttaacttca-caaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcca 360  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||| || |||||||||    
T  37905767 atgttatagtgttaacttcaccaaaaaatcatttttataacttcaccatagaattttcca 37905708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 36 - 363
Target Start/End: Original strand, 33550865 - 33551193
Alignment:
Q  36 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatatta 135  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33550865 atcaatagttattcatctagtaatgcttgcaacatattggactttcaagtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacatagttgatgatatta 33550964  T
Q  136 tgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattggattaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatg 235  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  33550965 tacg-tagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaacaacgtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 33551063  T
Q  236 aaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcatt 333  Q
    | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  33551064 atactatgaagaccgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcactacatttttgatgttatagtgttaacttcactaaaaaagtcatt 33551163  T
Q  334 ctcatgacttcaccctaaaattttccataa 363  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||    
T  33551164 ctcatgacttcaccgtagaattttccataa 33551193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 11366223 - 11366584
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtc 99  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||     
T  11366223 tgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgtt 11366322  T
Q  100 ggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattg 199  Q
    | ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||| |||||| || |||||||||     
T  11366323 gaaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttatgtttagaacaagatatgataaaatta 11366422  T
Q  200 gattaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttt 299  Q
     ||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||||    
T  11366423 tattaaatgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatactatgagggctgaacttttgatgtcattatacaaatagtgagatgttactcattacatttt 11366522  T
Q  300 tgatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcc 359  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||||| ||||||| |||| |||||| || ||||||||    
T  11366523 tgatgttatagtgttaatttcaccaaaaaagtcattcttatgatttcaccatagaattttcc 11366584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 33 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 3177267 - 3176979
Alignment:
Q  33 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgata 132  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3177267 atgataaatagtaattcatctagtaatgcttgtaatatcttggacttacatgtactattttatagttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgata 3177168  T
Q  133 ttatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattggattaagtgtagtcttgttattctgatgagttg 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||| |||    
T  3177167 ttatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaagataaaattagattaagtgtattcttcttagtctgatgaattg 3177068  T
Q  233 atgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttca 321  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  3177067 atgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagttgcgtgttactcaaaacatttttgatattatagtattaacttca 3176979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 26357937 - 26357576
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| || |    
T  26357937 tgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaaaaatactattttatcgttg 26357838  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
    | |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||| |    
T  26357837 gcatctttaacatgcaaacacatttgataatattatgtgatagttttaagtgttacaatttgtgggatgttacacttgaaacaaggtaggataaaattag 26357738  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    |||||||||  |||||||| | |||||| ||||| |  |||| || |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  26357737 attaagtgtgatcttgttaatatgatgaattgataactctataagaactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtgggatgttactcactacagtttt 26357638  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttca-ca-aaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcca 360  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  26357637 gatgttatagtgttaacttcatcagaaaagtcattttcatgacttcaccataaaattttcca 26357576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 2325221 - 2325573
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || |    
T  2325221 tgatttatttttaaattgttgattactgattaataatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttg 2325320  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
     ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||| |    
T  2325321 taatctttaacatgcaaacaaatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaataaggtaggataaaattag 2325420  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    |||||||||||||||||||        | ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |    
T  2325421 attaagtgtagtcttgtta--------atttgatgatactatgaggactgaacttttgatgccagtgtacaaacaatggggtgttactcaatacatttat 2325512  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcc 359  Q
    ||||||||| ||||||||||||   |||| |||||| ||| |||||||| || ||||||||    
T  2325513 gatgttatattgttaacttcacgagaaaagtcattcacataacttcaccatagaattttcc 2325573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 3 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 4167280 - 4166922
Alignment:
Q  3 attcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcgga 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| || |      
T  4167280 attcatttttaaattgttgattactgattcatgattaatagtaattcatccagtaatgcttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttgac 4167181  T
Q  103 atctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattggat 202  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||    
T  4167180 atctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagat 4167081  T
Q  203 taagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttttga 302  Q
    ||| |||| |||||||| |||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||  | ||||||||    
T  4167080 taaatgtattcttgttagtctgatgaattgttgatactatggggactgaacttttgatgccattgtacaaacagtggggtgttactcacaatatttttga 4166981  T
Q  303 tgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcc 359  Q
    |  |||| ||||||||||||   |||| ||||| || |||||||||| || ||||||||    
T  4166980 tactataatgttaacttcaccagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 4166922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 44914027 - 44913661
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcat---ctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattg 97  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  ||||| ||||| |||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  44914027 tgattcatttttaaattgttgattactgattcatgattaatagtaattcattttctaataatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcg 44913928  T
Q  98 tcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt-ggggtgttacacttataacaaggtaagataaaa 196  Q
    | || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  44913927 ttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgggggtgttacacttaaaacaatgtatgataaaa 44913828  T
Q  197 ttggattaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactat-gaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaa-tgggatgttactcattac 294  Q
    || ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||| | ||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || | |||||||||  ||    
T  44913827 ttagattaagtgtattcttgttagtctgatgaattgatgatactatgggggattgaactttttatgtcattttacaaacaagtgaggtgttactcacaac 44913728  T
Q  295 atttttgatgttatagtgttaacttcaca-aaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcca 360  Q
    |||||||||  || ||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||| || |||||||||    
T  44913727 atttttgatactacagtgttaacttcacataaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcca 44913661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 67 - 359
Target Start/End: Original strand, 17071646 - 17071940
Alignment:
Q  67 acatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggg 166  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17071646 acatcttggatttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggg 17071745  T
Q  167 gtgttacacttataacaaggtaagataaaattggattaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcatt 266  Q
    ||||||| |||| || |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||  || |||||||||||||||||    
T  17071746 gtgttacgcttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaataccgaacttttgatgtcatt 17071845  T
Q  267 gtacaaacaatgggatgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcc 359  Q
    ||||||| |||| ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  17071846 gtacaaataatgagatgttacttactacatttttgttgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattcgcatgacttcaccatagaattttcc 17071940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 19424485 - 19424831
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||              
T  19424485 tgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttgcaggtactat---------- 19424574  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
        |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  19424575 ----ctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaagataaaattag 19424670  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    |||||| ||| |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| || | || |||||||||| |||||||||  ||| ||||    
T  19424671 attaagcgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactaaacttttgatgccactatataaacaatggggtgttactcacaacactttt 19424770  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcc 359  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19424771 gatgttatagtgttaacttcaccagaaaagccattctcatgacttcaccataaaattttcc 19424831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Original strand, 33709075 - 33709396
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||  | |    
T  33709075 tgattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaagtactattttatcattg 33709174  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
      |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |    
T  33709175 acatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgcgatagtcttaagtgtgacactttgtagggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattag 33709274  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    |||||| ||| |||||||| |||||  | ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| |||  ||||||||   ||| ||||    
T  33709275 attaagcgtattcttgttaatctgaatatttgatgatactatggggactgaacttttgatgtcactgtactaacagtggagtgttactcgcaacactttt 33709374  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttcac 322  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  33709375 gatgttatagtgttaacttcac 33709396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 41961200 - 41960939
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |    
T  41961200 tgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg 41961101  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
    | |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |    
T  41961100 gcatctttaacatgcaaaccgatttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttgaaacaaggtaggataaaattag 41961001  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgt 262  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  41961000 attaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgt 41960939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 8 - 359
Target Start/End: Original strand, 4263926 - 4264280
Alignment:
Q  8 ttttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctt 107  Q
    ||||| ||||||| |||  |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  4263926 tttttaaattgttgattactgatcaatgatcaatattatttcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttatatgtactattttattgttggcatctt 4264025  T
Q  108 taacatgcaaacatagttgatgatattatgt-gatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattggattaag 206  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||    
T  4264026 taacatgcaaacagagttgctgatatcatgttgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttaaacttaaaacaaggtaggataaaattagattaag 4264125  T
Q  207 tgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttttgatgtt 306  Q
    |||| |||| ||| | |||||| ||||| | ||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||| |    
T  4264126 tgtattcttcttaatatgatgaattgataatactatggagactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtgggatgttactcacaacacttttgatgct 4264225  T
Q  307 atagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcc 359  Q
    ||||||||||||| ||   |||| ||||| | ||||||||||| || ||||||||    
T  4264226 atagtgttaactttaccagaaaagtcattatgatgacttcaccatagaattttcc 4264280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 4763991 - 4763627
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| |||| || |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||      
T  4763991 tgattcatttttaaattattgattactgattaatgatcaatagtaattcaactagtaatgcttgcaatatcttggacttacaggtactattttatcgtta 4763892  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
    | |||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||  |||||||| |    
T  4763891 gcatctttaacatgcaaaaagaattgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgctacacttgaaacaaggtagaataaaattag 4763792  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||| ||||| | |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||    
T  4763791 attaagtgtagttttgttaatctgatgaattgattatactatgggaactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactcactacagtttt 4763692  T
Q  301 gatgttatag---tgttaacttca-ca-aaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcca 360  Q
    | || |||||   ||||||||||| || |||| ||||| ||||||||||| | || |||||||||    
T  4763691 gttgatatagtgttgttaacttcatcagaaaagtcattttcatgacttcatcatagaattttcca 4763627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 29241988 - 29242341
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |       |||||||||||||| |||||||| ||| || |    
T  29241988 tgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgttcaatagtaattcatctagtaattc-------atcttggacttacaggtactattgtatcgttg 29242080  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
      ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |    
T  29242081 acatctttaacatacaaccagagttgatgatattatgtgatagtcttaggtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattag 29242180  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||  || |||||||||| |||| |||||| || || ||||||    
T  29242181 attaagtgtagttttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgataccactgtacaaacagtggggtgttacgcactatattttt 29242280  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcc 359  Q
     |||||||||| ||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  29242281 tatgttatagttttaacttcaccaaaaaaaccattttcatgacttcaccatagaattttcc 29242341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 35959252 - 35958906
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||| || |    
T  35959252 tgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggac----atgtactattttatcgttg 35959157  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||      
T  35959156 aaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaactgttacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtaggat-aaattat 35959058  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    |||||||| |||||||||| | |||||| ||||||            |||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||    
T  35959057 attaagtgcagtcttgttaatatgatgaattgatg------------ctgaacttttaatgtcattgtacaaacagtggggtgttgctcattacattttt 35958970  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttccata 362  Q
     |||||||||||  ||||||||  ||||| ||||| | ||||||||| | || |||||||||||    
T  35958969 tatgttatagtggcaacttcaccaaaaaagtcatttttatgacttcatcatagaattttccata 35958906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 27349791 - 27350142
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| || |    
T  27349791 tgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacagatactattttatcgttg 27349890  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||  |||||| ||||||         ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |    
T  27349891 gaatctttaacttgcaaacagagttcctgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggttggataaaattag 27349981  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||||||  ||||||||    
T  27349982 attaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaag-ggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtgtggtgttactcacaacattttt 27350080  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttcac---aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcc 359  Q
    |||| |||||||||||||||||   |||| || ||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  27350081 gatgctatagtgttaacttcaccaaaaaatattattttaatgacttcaccataaaattttcc 27350142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 67 - 359
Target Start/End: Original strand, 17054005 - 17054299
Alignment:
Q  67 acatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggg 166  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||| || |||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17054005 acatcttggatttacaggtactattttatcgttggaacctttaacatgcaaacaaatttgatgatattatgtgatagtnttaagtgttacactttgtggg 17054104  T
Q  167 gtgttacacttataacaaggtaagataaaattggattaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcatt 266  Q
    ||||||| |||| || |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| | |||||  || | |||||||||||||||    
T  17054105 gtgttacgcttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtggtcttgttaatctgatgaattgatgatattatgaataccgnacttttgatgtcatt 17054204  T
Q  267 gtacaaacaatgggatgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcc 359  Q
    |||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  17054205 gtacaaacaatgagatgttacttactacatttttgatgttatagtattaacttcaccaaaaaagtcattcgcatgacttcaccatagaattttcc 17054299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 31570577 - 31570937
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| |||  || |||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| || |    
T  31570577 tgattcatttttaaatatttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagcaatgcttgcaacatcttaaacttacaagtactattttatcgttg 31570676  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
    | |||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |    
T  31570677 gcatctttaacatgtaaacagagttgttgatatcatgtgacagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacacttaaaacaatgtaagataaaattag 31570776  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| || |||| |||||| |||||||||||||||||||| | || ||| | |||| ||||||| |  ||| ||||    
T  31570777 attaagtgtattcttgttaatctgatgaattcatgatactatgtggactgaacttttgatgtcactataaaaatagtggggtgttacttacaacactttt 31570876  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcc 359  Q
     ||||||||||||||| |||||   |||| | |||||||| |||||||| || ||||||||    
T  31570877 aatgttatagtgttaatttcaccagaaaagttattctcataacttcaccatagaattttcc 31570937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 9 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 4478717 - 4478401
Alignment:
Q  9 tttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatcttt 108  Q
    |||| ||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||  | || ||||||    
T  4478717 ttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagcaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaccgatactattttatcattggcatcttt 4478618  T
Q  109 aacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagat-aaaattggattaagt 207  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||     |||||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||    
T  4478617 aacatggaaacagagttggtgatatcatgtgatagacttaagtgttacacttt-----gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaattagattaagt 4478523  T
Q  208 gtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttttgatgtta 307  Q
    ||| |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||  ||| |||||||||||    
T  4478522 gtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactaaacttttgatgccactgtacaaacaatggagtgttactcacaacacttttgatgtta 4478423  T
Q  308 tagtgttaacttcacaaaaaat 329  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  4478422 tagtgttaacttcaccaaaaat 4478401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Original strand, 43770691 - 43771039
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||| |    
T  43770691 tgattcatttttaaattgttgatttctaattaatgatcaatagaaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttaaagatactattttattgttg 43770790  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
    | |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||         ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||      
T  43770791 gcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtga---------gtgttacactttgtgaggtgttacacttaaaacaaggcaggataaaattaa 43770881  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||| ||||||| | || | ||||||||||||||||| || |||| ||||| |||| |||||||||  ||| ||||    
T  43770882 attaagtatattcttgttaatctgatgaattgatgatattaaggggactgaacttttgatgccactgtataaacagtggggtgttactcacaacactttt 43770981  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttca-caaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaatttt 357  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  43770982 gatgttatagtgttaacttcaccaaaaaatcattctaatgacttcaccatagaatttt 43771039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 3 - 359
Target Start/End: Original strand, 39167214 - 39167566
Alignment:
Q  3 attcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcgga 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||  ||||| || || |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| || |      
T  39167214 attcatttttaaattgttgattactgattcataattaatagtaattcatctagtaatgctagcaacaatttggacttacatgtactattttatcgttgac 39167313  T
Q  103 atctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattggat 202  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||| ||     
T  39167314 atctttaacatacaaacagagttgatgatattatgtgatagt------tgttacactttgtgggatgttacacttaaaacaaggtataataaaattagaa 39167407  T
Q  203 taagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttttga 302  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||  | | ||||||    
T  39167408 taagtgtattcttgttactctaatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtgaggtgttactcacaatacttttga 39167507  T
Q  303 tgttatagtgttaacttca--caaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcc 359  Q
    |  |||  |||||||||||   |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  39167508 tactattctgttaacttcatcaaaaaaatcattctcgtgacttcaccataaaattttcc 39167566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 31862212 - 31861948
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31862212 tgattcatttttaaatcgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtctacaatatcttggacttacaagtactattttattgtcg 31862113  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||| |    
T  31862112 gaatccttaacatgcaaacagacttgatgatattatgtgataattttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataacaatgtatgttaaaattag 31862013  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcat 265  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| | ||||||| ||||||| ||||    
T  31862012 attaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactataatgactgaaattttgatatcat 31861948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 27 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 44286283 - 44285951
Alignment:
Q  27 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttg 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||  | || ||||||||||||||| |||||    
T  44286283 tgattaatgatcaatagtaattcatctaacaatgcttgcaacatcttagacttacagatactattttatcgttagcatatttaacatgcaaacaaagttg 44286184  T
Q  127 atgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattggattaagtgtagtcttgttattctgat 226  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||| | |||||| ||||||    
T  44286183 ttgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattattgttaatctgat 44286084  T
Q  227 gagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttca-ca-a 324  Q
    || || |||| |||||| ||||| ||||||||||| || | |||||||| || ||| || |||   ||| |||||||| |||||||||||||||| || |    
T  44286083 gaatttatgatactatgtggactaaacttttgatgccactatacaaacagtgagatattgctcgcaacacttttgatgctatagtgttaacttcatcaga 44285984  T
Q  325 aaaatcattctcatgacttcaccctaaaatttt 357  Q
    |||||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  44285983 aaaatcattcgcatgacttcaccgtataatttt 44285951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Original strand, 33660220 - 33660569
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||| || |    
T  33660220 tgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctcagacttacagatactattttatcgttg 33660319  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
      |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||          ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |    
T  33660320 acatctttaacatgcaaacaaagttgctgatatcatgtgg---------gtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattag 33660410  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    |||||||||| || ||||| ||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| | || |||||||||  ||| ||||    
T  33660411 attaagtgtattcctgttaatctaatgaattgatgatactaagaggactgaacttttgatgccactgtacaaacagttgggtgttactcacaacactttt 33660510  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaatttt 357  Q
    ||||||||||||||||||| ||   |||| ||||| | ||||||||||| || ||||||    
T  33660511 gatgttatagtgttaacttaactagaaaagtcattttaatgacttcaccatagaatttt 33660569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 27 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 19314181 - 19313850
Alignment:
Q  27 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggactta---catgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatag 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||| |  |  |||||||||||||||||||||    
T  19314181 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttataacatgtactattttatcgctgacatctttaacatgcaaacatag 19314082  T
Q  124 ttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattggattaagtgtagtcttgttattct 223  Q
    ||| |||||| ||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  19314081 ttgctgatatcatgtgatagt-------gttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattcgattaagtgtattcttgttaatct 19313989  T
Q  224 gatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcac- 322  Q
    ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| | |  | |||||||||  ||| |||||||| |||| ||||||||||||     
T  19313988 gatgaattgatgatactat-aggactgaacttttgatgtcactgtataaatagtaaggtgttactcacaacacttttgatgctataatgttaacttcacc 19313890  T
Q  323 -aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttccat 361  Q
      |||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  19313889 agaaaagtcattctaatgacttcaccatagaattttccat 19313850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 2 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 41465860 - 41465508
Alignment:
Q  2 gattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcgg 101  Q
    |||||| |||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  41465860 gattcaattttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtaattcatatagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgg 41465761  T
Q  102 aatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgga 201  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||    
T  41465760 catctttaacatgcaaacataattgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacactttctgaggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattaga 41465661  T
Q  202 ttaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttttg 301  Q
    ||||||  |||||||| | ||| |||| ||||||| | |||  |||||||||||||||        ||| | |  | || || |||||| ||||  ||||    
T  41465660 ttaagttcagtcttgtgaatctaatgaattgatgatattatagggactgaacttttga--------taccagcgttagggtgctactcactacacctttg 41465569  T
Q  302 atgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcca 360  Q
    ||| |||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  41465568 atgctatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcca 41465508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Original strand, 18494124 - 18494385
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  18494124 tgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagcaattcatctagtaatgcttacaacatcttggacttacatgtactattttatcgttg 18494223  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
    | |||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||||  |||||||| ||||||||| |    
T  18494224 gcatctttaacatgcaaacagagtcgttgatatcatgtgatagtcttaagtgtgactctttgtgaggt-ttacacttaatacaaggtaggataaaattag 18494322  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtc 263  Q
    || ||||||| ||| || | |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18494323 atcaagtgtattctagtgaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtc 18494385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 56 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 45328025 - 45327801
Alignment:
Q  56 taatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgtta 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  45328025 taatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagtttatgatattatgcgatagtcttatgtgtta 45327926  T
Q  156 cactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattggattaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaactt 255  Q
    |||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||    
T  45327925 cactttctgaggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgatgactgaactt 45327826  T
Q  256 ttgatgtcattgtacaaacaatggg 280  Q
    |||||||||  ||| ||||||||||    
T  45327825 ttgatgtcaccgtataaacaatggg 45327801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 56 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 36642293 - 36641988
Alignment:
Q  56 taatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgtta 155  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| || || |||||||||||| ||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  36642293 taatgcttgcaacatcttgaacttaccggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaacagagttgctggtatcatgtgatagtcttaagtgtta 36642194  T
Q  156 cactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagat--aaaattggattaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaac 253  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||  |||||| ||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  36642193 cactttgtagggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaaattagattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaac 36642094  T
Q  254 ttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaa 351  Q
    ||||||||||| |||||||||| || | ||||||||   ||| |||||||| |||||| |||| |||||   |||| ||||||||||||||||||| ||     
T  36642093 ttttgatgtcactgtacaaacagtgaggtgttactcgcaacacttttgatgctatagtattaatttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatag 36641994  T
Q  352 aatttt 357  Q
    ||||||    
T  36641993 aatttt 36641988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 13711819 - 13711465
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| |||||||||||| |  |    
T  13711819 tgattcatttttaaatcgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtattgtttgcaacatcttagacttacaggtactattttatcgctg 13711720  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
    | |||||||||||||| ||| ||||| |||||| |||| |||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||| |||     | ||||||||| |    
T  13711719 gcatctttaacatgcatacagagttgctgatatcatgtcatagtcttaactattatactttatggggtgttacacttaaaac-----atgataaaattag 13711625  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    ||||| |||| |||||||| |||||||| ||||||| || ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||  |||| |||||||||  ||| ||||    
T  13711624 attaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgataccatgtggactaaacttttgatgtcactgtacaaactgtggggtgttactcacaacactttt 13711525  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttc 358  Q
    |||| |||| ||||||||||||   |||| ||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  13711524 gatgctataatgttaacttcaccagaaaagtcattctgatgacttcaccatagaattttc 13711465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 5881889 - 5881610
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  5881889 tgattcatttttaaattgttgattactgaataatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttattgttg 5881790  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
      |||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||         |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||| |    
T  5881789 acatctttaacatgcaaacaaaattgttgatatcatgtg---------agtgttacactttgtgaggtattacacttaaaacaaggtatgat-aaattag 5881700  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactca 290  Q
    ||||| |||| |||||||| | |||||| ||||||| |||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  5881699 attaaatgtattcttgttaatatgatgaattgatgatactaaggggactcaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactca 5881610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 290
Target Start/End: Original strand, 7006781 - 7007053
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  7006781 tgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagaaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtactattttatcgttg 7006880  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
    | |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||||                 |||||||||||| ||||||||| ||||||||| |    
T  7006881 gcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatattcttaa-----------------gtgttacacttaaaacaaggtatgataaaattag 7006963  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactca 290  Q
    |||||||||| |||||||| ||| || | ||||||| |||||| | ||| |||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||    
T  7006964 attaagtgtattcttgttaatcttataaattgatgatactatgggaactaaacttttgatgctactgtacaaacagtgggatgttactca 7007053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 108 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 33902319 - 33902066
Alignment:
Q  108 taacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattggattaagt 207  Q
    ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||| |||||| |    
T  33902319 taacatggaaacagagttaatgatattatgtgatactattaagtgttacactttgtggggtgctacccttaaaacaaggtaggataaaattcgattaaat 33902220  T
Q  208 gtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttttgatgtta 307  Q
     ||||||||||| ||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| | ||||||| ||||||||| ||||      
T  33902219 atagtcttgttaatctgatgaactgatgatactttgaggactgaacttttgatgtcattttacaaacagtggggtattactcactacattttttatgt-- 33902122  T
Q  308 tagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttccat 361  Q
    |||||||||||||||   |||| ||||||| | ||||||| | || ||||||||||    
T  33902121 tagtgttaacttcaccagaaaagtcattctaacgacttcatcatagaattttccat 33902066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 103 - 357
Target Start/End: Original strand, 41463795 - 41464051
Alignment:
Q  103 atctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattggat 202  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||| ||| |||||||||  ||    
T  41463795 atctttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtcttaaatgttacattttgtgaggtgttacaattaaaacaaagtatgataaaattatat 41463894  T
Q  203 taagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttttga 302  Q
    |||  ||| |||||||| | |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| || |||||||||| || | |||||||||  ||| ||||||    
T  41463895 taaaagtattcttgttaatatgatgaattgatgatactatgaggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttttga 41463994  T
Q  303 tgttatagtgttaacttcacaaaaaa--tcattctcatgacttcaccctaaaatttt 357  Q
    | ||||||| |||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||| || ||||||    
T  41463995 ttttatagtattaacttcaccaaaaatgtcattctcacgacttcaccatagaatttt 41464051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Original strand, 19500758 - 19500923
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||      
T  19500758 tgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgaaattacatgtactattttatcgtta 19500857  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggg 166  Q
      |||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19500858 acatctttaacatgtaaatagagttgataatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtggg 19500923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 85 - 219
Target Start/End: Original strand, 18258214 - 18258348
Alignment:
Q  85 tactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaa 184  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||    
T  18258214 tactattttatcgttgggatctttaacatgcaaagagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttatggggtgttacacttaaaaaaa 18258313  T
Q  185 ggtaagataaaattggattaagtgtagtcttgtta 219  Q
     ||| ||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  18258314 tgtaggataaaattagattaagtttattcttgtta 18258348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 41051143 - 41051237
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttat 95  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  41051143 tgattcatttttgaattgttgattattgattaatgatcaataacaattcatctagcaatgcttacaacatcttgaacttacaggtactattttat 41051237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Original strand, 41463433 - 41463512
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggactta 80  Q
    |||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||| ||||||    
T  41463433 tgattcatttttaaattattaattattgattaatgatcaatagtaatttatctattaatgtttacaacatcttagactta 41463512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 27 - 73
Target Start/End: Original strand, 18257407 - 18257453
Alignment:
Q  27 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 73  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18257407 tgattaatgataaataataattcatctagtaatgcttgcaacatctt 18257453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 216 - 261
Target Start/End: Original strand, 41051263 - 41051308
Alignment:
Q  216 gttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatg 261  Q
    |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41051263 gttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatg 41051308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 324 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 19093448 - 19093413
Alignment:
Q  324 aaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcc 359  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19093448 aaaaatcattctcatgacttcaccataaaattttcc 19093413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 277 - 347
Target Start/End: Original strand, 18494387 - 18494459
Alignment:
Q  277 tgggatgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcacc 347  Q
    |||| |||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||   |||| ||||| |||||||||||||    
T  18494387 tggggtgttactcacaacacttttgatgctatagtgttaacttcaccagaaaagtcattttcatgacttcacc 18494459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 323 - 359
Target Start/End: Original strand, 7007057 - 7007093
Alignment:
Q  323 aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcc 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  7007057 aaaaaatcattctcatgacttcaccatagaattttcc 7007093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 297 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 41960947 - 41960883
Alignment:
Q  297 ttttgatgttatagtgttaacttca-caaaaaa-tcattctcatgacttcaccctaaaattttcc 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||   ||||||||||| || ||||||||    
T  41960947 ttttgatgttatagtgttaacttcatcaaaaaagtcatttctatgacttcaccatagaattttcc 41960883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 18)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 1946195 - 1945833
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtc 99  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  1946195 tgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctaataatgcttgtaacatcttggacttacatgtactattttatcgtt 1946096  T
Q  100 ggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattg 199  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||     
T  1946095 ggaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttagaacaaggtatgataaaatta 1945996  T
Q  200 gattaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttt 299  Q
     |||||||||||||||||||   |||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  1945995 tattaagtgtagtcttgttaacttgatgaattcatgatactatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagtggggtgttactcattacatttt 1945896  T
Q  300 tgatgttatagtgttaacttcac---aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcc 359  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  1945895 tgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaagtcattcttatgacttcaccgtagaattttcc 1945833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 5627752 - 5627391
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtc 99  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||     
T  5627752 tgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcacctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgtt 5627653  T
Q  100 ggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattg 199  Q
    | ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||| |||||||||     
T  5627652 gaaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtattacactttgtagggtgttatgcttagaacaaggtatgataaaatta 5627553  T
Q  200 gattaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttt 299  Q
     |||||||||||||||||||  ||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||||| |||||    
T  5627552 tattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgataatactatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaatagtggggtgttactcattatatttt 5627453  T
Q  300 tgatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcc 359  Q
    | |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  5627452 ttatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattcttatgacttcaccttagaattttcc 5627391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 3879763 - 3880123
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  3879763 tgattcatttttaaattgttgattactgattcatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtactattttatcgttg 3879862  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
      |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| |    
T  3879863 acatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacatttaaaacaaggtaggataaaattag 3879962  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    | ||||| || |||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||  ||| ||||    
T  3879963 aataagtatattcttgttagtctgatgaattgatgatactatggggattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtagggtgttactcacaacactttt 3880062  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcc 359  Q
    |||  |||| ||||||||||||   |||| |||||||| |||||||||| || ||||||||    
T  3880063 gatactataatgttaacttcaccagaaaagtcattctcgtgacttcaccatagaattttcc 3880123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 27 - 363
Target Start/End: Original strand, 7234885 - 7235222
Alignment:
Q  27 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttg 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||||    
T  7234885 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatttttaacatgcaaacatagttg 7234984  T
Q  127 atgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattggattaagtgtagtcttgttattctgat 226  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  7234985 atgatattatgcgatagtcttaagcgttacactttctggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgat 7235084  T
Q  227 gagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcac--aa 324  Q
    || ||||| | ||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||| |||| || |||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||   |    
T  7235085 gaattgataatactatga-gactgaacttttgatggcaccgtacaaacagtggggtgctactcactacacttttgatgttatagtgttgacttcaccgga 7235183  T
Q  325 aaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttccataa 363  Q
    ||| |||||||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  7235184 aaagtcattctcataacttcaccatagaattttccataa 7235222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 346
Target Start/End: Original strand, 6091006 - 6091353
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||      
T  6091006 tgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttt 6091105  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtc-ttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattg 199  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||     
T  6091106 gaatctttaatatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttgttgggtgttacgcttaaaacaaggtatgataaaatta 6091205  T
Q  200 gattaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttt 299  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  6091206 gattaagtgtagttttgttaatctaatgaattgatgatactacgagtactgaacttttgatggcattgtacaaacaatggtgtgttactcactacatttt 6091305  T
Q  300 tgatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcac 346  Q
    | |||||| | ||||||||| ||  ||||||| ||| ||||||||||||    
T  6091306 ttatgttaca-tgttaactttaccaaaaaaattattttcatgacttcac 6091353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 4318646 - 4319007
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| || || |    
T  4318646 tgatttatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggactttcccgtactatttcatcgttg 4318745  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagat-aaaattg 199  Q
      |||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||     
T  4318746 acatctttaacatgaaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttatagggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaatta 4318845  T
Q  200 gattaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttt 299  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| |||| ||||||| |||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| ||| |||    
T  4318846 gattaagtgtattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgggggttgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactcataacacttt 4318945  T
Q  300 tgatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcc 359  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  4318946 tgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcc 4319007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 3 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 20768440 - 20768087
Alignment:
Q  3 attcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcgga 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |      
T  20768440 attcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacaccttggacttacatgtactattttatcgttgac 20768341  T
Q  103 atctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattggat 202  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||    
T  20768340 atctttaacatgcaaacataattgatgatattatgcgatgatcttaagtgttacactttatgggatgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagat 20768241  T
Q  203 taagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttttga 302  Q
    |||  ||| |||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| || |  ||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||    
T  20768240 taa--gtaatcttgttaatctgatgaattaatgatactatgaggactgaacttttgatgccact-aacaaacaat-ggatgctactcactacacttttga 20768145  T
Q  303 tgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttc 358  Q
    || ||||||||| |||||||   |||| ||||||||||||||||||| || |||||||    
T  20768144 tgctatagtgttgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttc 20768087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Original strand, 33892836 - 33893187
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33892836 tgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatttagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgttg 33892935  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
    | |||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||         ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||| |    
T  33892936 gcatctttaacatgcaaactgagttgctgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtgttatacataaaacaaggtaggataaaattag 33893026  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||| || |||||||||||| | |||| |||||||||  ||| ||||    
T  33893027 attaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaag-ggactgaacttttaatatcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacactttt 33893125  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcca 360  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||| ||| || |||||||||    
T  33893126 gatgttatagtgttaacttcactaaaaaaattattctaatgactttaccatagaattttcca 33893187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 29182521 - 29182165
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || |    
T  29182521 tgattcatttttaaattgttgattgttgattaatgatca---gtaattcatctagtaatacttgcaacatcttagacttacaagtactattttatcgttg 29182425  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt-ggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattg 199  Q
    | ||||||||| |||||| | ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || | |||| |||||||||     
T  29182424 gcatctttaacctgcaaatagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttatgggggtgttacacttaaaatatggtaggataaaatta 29182325  T
Q  200 gattaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttt 299  Q
    ||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||| | ||||  |||||||||||||||| || |||| ||||| |||| |||||||||  ||| |||    
T  29182324 gattaagtgtattcttattaatctgatgaattgatgataatatggagactgaacttttgatgacactgtataaacagtggggtgttactcacaacacttt 29182225  T
Q  300 tgatgttatagtgttaacttca-caa-aaaatcattctcatgacttcaccctaaaatttt 357  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29182224 tgatgttatagtgttaacttcatcaataaaatcattctcatgacttcaccataaaatttt 29182165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Original strand, 21016942 - 21017294
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||| | ||||||| |||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||      |||||||||||| || |    
T  21016942 tgattcatttataaattgttgattactgattcatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagac------gtactattttatcgttg 21017035  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
      || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||| ||||||||| |    
T  21017036 acatatttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaataacgtaggataaaattag 21017135  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||    
T  21017136 attaagtttattcttgttagtctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgccattgtacaaataatggggtgttactcacaacattttt 21017235  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaatttt 357  Q
     ||  || | ||||||||||||  ||||| ||||| || |||||||||| || ||||||    
T  21017236 tatactacaatgttaacttcaccaaaaaagtcattttcgtgacttcaccgtataatttt 21017294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 27 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 8513562 - 8513233
Alignment:
Q  27 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttg 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||  | || |||||||||||| ||||| |||||    
T  8513562 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaagattttggacttaccggtactattttatcattggcatctttaacatggaaacagagttg 8513463  T
Q  127 atgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagat-aaaattggattaagtgtagtcttgttattctga 225  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||      ||| ||||||||| ||| |||||| ||| ||||||| |||||||| | |||    
T  8513462 ctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtg------ttaaaacaaggtaggataaaaattagatcaagtgtattcttgttaatatga 8513369  T
Q  226 tgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcac--a 323  Q
    ||| ||||||| | |||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||       
T  8513368 tgaattgatgatattatggggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatattatagtgttaacttcaccag 8513269  T
Q  324 aaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcc 359  Q
    |||| ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  8513268 aaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcc 8513233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 103 - 359
Target Start/End: Original strand, 7055141 - 7055399
Alignment:
Q  103 atctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattggat 202  Q
    ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||    
T  7055141 atctttaacatccaaatagagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtagcgtgttacacttagaacaaggtatgataaaattatat 7055240  T
Q  203 taagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttttga 302  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | || | ||||||| |||| |||||| |    
T  7055241 taagtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatactatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaatagtgaggtgttactaattatatttttta 7055340  T
Q  303 tgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcc 359  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  7055341 tgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcattcttatgacttcaccataaaattttcc 7055399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 29 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 33619162 - 33618832
Alignment:
Q  29 attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatct-----ttaacatgcaaacatag 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || ||||     |||||||||||||||||    
T  33619162 attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatattggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacttaacatgcaaacatag 33619063  T
Q  124 ttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattggattaagtgtagtcttgttattct 223  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||| |||| || | ||||||||||||        |||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  33619062 ttgatgatattatgcgatactcttaagtgtcacac-ttctagggtgttacact--------ggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatct 33618972  T
Q  224 gatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcac- 322  Q
    ||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||| |||||| || |||||| |||| ||||||||  |||||||| |||||||     
T  33618971 gatgaattgatgatactatgagaactgaacttttgatgccaccgtacaaataatgggttgctactcactacacttttgatgcgatagtgttgacttcacc 33618872  T
Q  323 -aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttccat 361  Q
      |||| |  ||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  33618871 agaaaagtatttcccatgacttcaccgtagaattttccat 33618832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 27 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 6089237 - 6088910
Alignment:
Q  27 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttg 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| || || |||||||||||| ||||| |||||    
T  6089237 tgattaatgatcaatagtaattcatatagtaatgcttgcaacattttggacttactggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaacagagttg 6089138  T
Q  127 atgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagat-aaaattggattaagtgtagtcttgttattctga 225  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||| || |||| | |||      ||| ||||||||| ||| |||||| ||| |||  || |||||||| |||||    
T  6089137 ctgatatcatgtgatagtcttaagtgttataccttgtagagtg------ttaaaacaaggtaggataaaaattagatcaaggatattcttgttaatctga 6089044  T
Q  226 tgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcac--a 323  Q
    ||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||| || | |||||||| ||||  ||||||||  ||| |||||||  |||||||||||||||||       
T  6089043 tgaattgatgatactatggtgactgaacttttgatgccactttacaaacagtggggcgttactcacaacacttttgatactatagtgttaacttcaccag 6088944  T
Q  324 aaaaatcattctcatgacttcaccctaaaatttt 357  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  6088943 aaaaatcattctcatgacttcaccatagaatttt 6088910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 75 - 357
Target Start/End: Original strand, 30353256 - 30353540
Alignment:
Q  75 gacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttaca 174  Q
    ||||||||||||||||||||| || |  || ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30353256 gacttacatgtactattttatcgttgacatttttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgggatgttaca 30353355  T
Q  175 cttataacaaggtaagataaaattggattaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaac 274  Q
    |||| ||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||  | |||||| ||||||| ||||||  ||||||||| | |||| || |||||||||    
T  30353356 cttaaaacaaggcatgataaaattagattaagtgtattcttgtttatatgatgaattgatgatactatggagactgaactatcgatgccactgtacaaac 30353455  T
Q  275 aatgggatgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaatttt 357  Q
    | || ||| ||||||   ||| ||||||||||||| ||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||| || ||||||    
T  30353456 agtgagatattactcgcaacacttttgatgttataatgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaatttt 30353540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 103 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 15491873 - 15491654
Alignment:
Q  103 atctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattggat 202  Q
    ||||||||||| |||||| | ||| |||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||    
T  15491873 atctttaacatccaaacagaattgctgatatcatgtgatatttttaagtgttacattttgtggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagat 15491774  T
Q  203 taagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttttga 302  Q
    |||||| | |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| || |||||||| | |||| |||||||||  ||| ||||||    
T  15491773 taagtgcattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagggctgaacttttgatgccactgtacaaatagtggggtgttactcacaacacttttga 15491674  T
Q  303 tgttatagtgttaacttcac 322  Q
    ||||| | ||||||||||||    
T  15491673 tgttacaatgttaacttcac 15491654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 7054596 - 7054704
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtc 99  Q
    |||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||     
T  7054596 tgattcatctttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatttagtaatgtttgcaacatcttggacttacagttactattttatcgtt 7054695  T
Q  100 ggaatcttt 108  Q
    |||||||||    
T  7054696 ggaatcttt 7054704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 230 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 18498565 - 18498446
Alignment:
Q  230 ttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaat-gggatgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacaa--aa 326  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||  | ||| |||| |||| |||| |||||||| |||| |||||||||||| |  ||    
T  18498565 ttgatgatactatgaggactgaacttttgatgccactgtacaaactgtgggggtgttgctcactacacttttgatgctataatgttaacttcaccaggaa 18498466  T
Q  327 aatcattctcatgacttcac 346  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  18498465 agtcattctcatgacttcac 18498446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 4)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Original strand, 408254 - 408559
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  408254 tgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttg 408353  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |    
T  408354 gaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattgtgtgatagtcttaagtgttccactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattag 408453  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||  |  | |||||||||||||||||||    
T  408454 attaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatacta-gaggactgaacttttgatttcattttacaaacggtaaggtgttactcattacattttt 408552  T
Q  301 gatgtta 307  Q
    |||||||    
T  408553 gatgtta 408559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 488 - 134
Alignment:
Q  1 tgattcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||| || |    
T  488 tgattcatttttaaattgttgattactgattcatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggac------gtactattttatcgttg 395  T
Q  101 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgg 200  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| || ||||||||| |    
T  394 gcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttatggggtgttacacttaaaataagataggataaaattag 295  T
Q  201 attaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacattttt 300  Q
    ||||| |||| |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||  ||||||||    
T  294 attaaatgtattcttgttagtctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccattgtacaaacagtggagtgttactcacaacattttt 195  T
Q  301 gatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcc 359  Q
     ||  || ||||||||||||||   |||| ||||| || |||||||||| || ||||||||    
T  194 tatactacagtgttaacttcaccagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 124 - 321
Target Start/End: Original strand, 94331 - 94528
Alignment:
Q  124 ttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattggattaagtgtagtcttgttattct 223  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||  ||||||||  ||||||||||||||||||| |||    
T  94331 ttgatgatattatgtaatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttgaaacaagctagaataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatct 94430  T
Q  224 gatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttca 321  Q
     |||| ||||||| | |||| ||||  ||||||||||| || |||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  94431 catgaattgatgatagtatggggaccaaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactacaattttgatgttataatgttaacttca 94528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #4
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 9 - 132
Target Start/End: Original strand, 93933 - 94056
Alignment:
Q  9 tttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatcttt 108  Q
    |||| ||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |  ||||||    
T  93933 ttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagcaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtactattttatcgttgacatcttt 94032  T
Q  109 aacatgcaaacatagttgatgata 132  Q
    |||||||||||| | |||||||||    
T  94033 aacatgcaaacaaatttgatgata 94056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 1)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 3 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 44314 - 43990
Alignment:
Q  3 attcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcgga 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || | |    
T  44314 attcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcattcagtaatgcttgcaacaacttggacttacatgtactattttatcgttgaa 44215  T
Q  103 atctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattggat 202  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||||  ||    
T  44214 atctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatag-cttaagtgttacactttgtggggtgttaagcttataacaagatatgataaaattatat 44116  T
Q  203 taagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttttga 302  Q
    ||| ||||||||| ||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  44115 taaatgtagtcttattaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaactttttatgccattgtacaaacaacggggtgttactcattacatttttga 44016  T
Q  303 tgttatagtgttaacttcacaaaaaa 328  Q
    | |||||| ||||||||||| |||||    
T  44015 tattatagcgttaacttcaccaaaaa 43990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 3 - 328
Target Start/End: Original strand, 154473 - 154797
Alignment:
Q  3 attcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcgga 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || | |    
T  154473 attcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcattcagtaatgcttgcaacaacttggacttacatgtactattttatcgttgaa 154572  T
Q  103 atctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattggat 202  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||||  ||    
T  154573 atctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatag-cttaagtgttacactttgtggggtgttaagcttataacaagatatgataaaattatat 154671  T
Q  203 taagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttttga 302  Q
    ||| ||||||||| ||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  154672 taaatgtagtcttattaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaactttttatgccattgtacaaacaacggggtgttactcattacatttttga 154771  T
Q  303 tgttatagtgttaacttcacaaaaaa 328  Q
    | |||||| ||||||||||| |||||    
T  154772 tattatagcgttaacttcaccaaaaa 154797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 3 - 357
Target Start/End: Original strand, 145842 - 146199
Alignment:
Q  3 attcattttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcgg 101  Q
    |||||||||| |||| || |||  ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| || ||    
T  145842 attcatttttaaattttttattactgattaatgatcaattgtatattcatttagtaatgcttgcaacatcttggacttacagacactattttatcgttgg 145941  T
Q  102 aatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattgga 201  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||| |||||||||  |    
T  145942 aatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttatgcttagaacaaggtatgataaaattata 146041  T
Q  202 ttaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatgggatgttactcattacatttttg 301  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||     
T  146042 ttaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatactatgaaggctgaacttttgatgtcattctacaaataatggggtgttactcattacatttttt 146141  T
Q  302 atgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaatttt 357  Q
    |||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  146142 atgttataatgttaacttaaccaaaaaaatcattcttatgacttcaccgtagaatttt 146199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0318 (Bit Score: 177; Significance: 3e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0318
Description:

Target: scaffold0318; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 7 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 12263 - 11908
Alignment:
Q  7 attttttaattgttaatttatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatct 106  Q
    |||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||    
T  12263 atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttggcatct 12164  T
Q  107 ttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattggattaag 206  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| |||||||    
T  12163 ttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgcgatagtcttaagtgtgacactttgtggggtgttacacttaaaacaagataggataaaattagattaag 12064  T
Q  207 tgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactatgaggactgaacttttgatgtcattg-tacaaacaat-gggatgttactcattacatttttgatg 304  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||  || || |||||||||| ||| |||||||||  ||| |||| |||    
T  12063 tgtattcttgttaatctgatgaattgatgatattatgaggactgaacttttgataccactgatacaaacaatgggggtgttactcacaacacttttaatg 11964  T
Q  305 ttatagtgttaacttcac--aaaaaatca-ttctcatgacttcaccctaaaatttt 357  Q
    |||| ||||||| |||||   |||| ||| |||||||||||||||| || ||||||    
T  11963 ttatggtgttaatttcaccagaaaagtcatttctcatgacttcaccatagaatttt 11908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 44 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 267602 - 267282
Alignment:
Q  44 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatag 143  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  267602 taattcatctagtaattcttgcagcatcttggacttacatgtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatag 267503  T
Q  144 tc-ttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattggattaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgaaactat 242  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||| | |||    
T  267502 tctttaagtgttacactttgtgggatgttacatttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgctaatctaatgaattgatgatattat 267403  T
Q  243 gaggactgaacttttgatgtcattgtac-aaacaatgggatgttactcattacatttttgatgttatagtgttaactt---cacaaaaaatcattctcat 338  Q
       |||||||||||||||| || ||||| ||||| | |||||||||||| || |||||||||| |||||||| ||  |   || ||||||| ||| ||||    
T  267402 agagactgaacttttgatgacactgtacaaaacagttggatgttactcactatatttttgatgctatagtgtaaatattaccaaaaaaaataattttcat 267303  T
Q  339 gacttcaccctaaaattttcc 359  Q
    ||||||||| || ||||||||    
T  267302 gacttcaccatagaattttcc 267282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 3)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 277 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 42432 - 42348
Alignment:
Q  277 tgggatgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcc 359  Q
    |||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42432 tggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaattattctcatgacttcaccataaaattttcc 42348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 296 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 100886 - 100821
Alignment:
Q  296 tttttgatgttatagtgttaacttcac--aaaaaatcattctcatgacttcaccctaaaattttcc 359  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  100886 tttttgatgttatagcgttaacttcaccaaaaaaatcattctcatgacttcaccatagaattttcc 100821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 101047 - 100948
Alignment:
Q  27 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttg 126  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||            || || ||||||||||||||||||||| |||||    
T  101047 tgattaatgatc--tagtaatgcatttagtaatgcttgcaacatcttggacttac------------atcgttggaatctttaacatgcaaacagagttg 100962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University