View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF15994_low_2 (Length: 402)

Name: NF15994_low_2
Description: NF15994
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF15994_low_2
NF15994_low_2
[»] chr3 (189 HSPs)
chr3 (1-249)||(16751552-16751800)
chr3 (1-249)||(19774379-19774612)
chr3 (65-244)||(17318111-17318292)
chr3 (65-247)||(7108647-7108830)
chr3 (65-247)||(7112582-7112765)
chr3 (65-247)||(22320615-22320798)
chr3 (65-247)||(22335670-22335853)
chr3 (65-247)||(28948793-28948976)
chr3 (65-247)||(4108214-4108397)
chr3 (65-247)||(4112066-4112249)
chr3 (65-247)||(11069099-11069282)
chr3 (65-247)||(11166503-11166686)
chr3 (65-247)||(30064798-30064982)
chr3 (65-247)||(55021936-55022119)
chr3 (57-221)||(27411044-27411208)
chr3 (65-247)||(14498356-14498539)
chr3 (74-247)||(15616586-15616760)
chr3 (57-221)||(15963913-15964078)
chr3 (57-221)||(15971761-15971926)
chr3 (57-221)||(15967837-15968002)
chr3 (102-207)||(14159826-14159933)
chr3 (182-247)||(15963857-15963922)
chr3 (182-247)||(15967781-15967846)
chr3 (182-247)||(15971705-15971770)
chr3 (116-176)||(14067598-14067658)
chr3 (57-125)||(37440504-37440572)
chr3 (65-126)||(8490047-8490108)
chr3 (57-126)||(14664794-14664863)
chr3 (57-126)||(14667958-14668027)
chr3 (117-178)||(31097889-31097950)
chr3 (55-129)||(11853911-11853985)
chr3 (345-395)||(16751895-16751945)
chr3 (65-126)||(8490154-8490215)
chr3 (57-126)||(11301277-11301346)
chr3 (3-83)||(4589867-4589946)
chr3 (4-64)||(12338828-12338888)
chr3 (59-126)||(5220147-5220214)
chr3 (4-83)||(12853052-12853131)
chr3 (9-96)||(18440565-18440652)
chr3 (9-96)||(19485639-19485726)
chr3 (5-83)||(12338842-12338920)
chr3 (344-394)||(12853356-12853406)
chr3 (9-83)||(14664725-14664799)
chr3 (9-83)||(14667889-14667963)
chr3 (344-394)||(16795539-16795589)
chr3 (117-178)||(7574705-7574766)
chr3 (345-394)||(10834935-10834984)
chr3 (346-394)||(14670062-14670110)
chr3 (343-395)||(19774233-19774285)
chr3 (9-80)||(18440487-18440558)
chr3 (9-80)||(19485561-19485632)
chr3 (29-96)||(49390330-49390397)
chr3 (344-394)||(4590153-4590203)
chr3 (344-394)||(13435854-13435904)
chr3 (344-394)||(18933348-18933398)
chr3 (4-96)||(24513307-24513401)
chr3 (344-394)||(30064421-30064471)
chr3 (117-178)||(1983181-1983242)
chr3 (117-178)||(7793697-7793757)
chr3 (34-83)||(12853049-12853098)
chr3 (117-178)||(15482372-15482433)
chr3 (19-83)||(7108574-7108638)
chr3 (19-83)||(7112509-7112573)
chr3 (19-83)||(11069026-11069090)
chr3 (19-83)||(11166695-11166759)
chr3 (19-83)||(14498283-14498347)
chr3 (19-83)||(15616513-15616577)
chr3 (19-83)||(22320542-22320606)
chr3 (19-83)||(22335597-22335661)
chr3 (19-83)||(28948720-28948784)
chr3 (19-83)||(30064725-30064789)
chr3 (19-83)||(55021863-55021927)
chr3 (115-178)||(2898173-2898236)
chr3 (344-395)||(5219882-5219933)
chr3 (344-395)||(7108273-7108324)
chr3 (344-395)||(7112208-7112259)
chr3 (9-83)||(8490210-8490287)
chr3 (344-391)||(8928860-8928907)
chr3 (344-395)||(11068648-11068699)
chr3 (24-83)||(11301388-11301447)
chr3 (344-395)||(11853741-11853792)
chr3 (344-395)||(14497982-14498033)
chr3 (55-126)||(14670231-14670301)
chr3 (344-395)||(22320164-22320215)
chr3 (344-395)||(22335219-22335270)
chr3 (344-395)||(55021411-55021462)
chr3 (344-394)||(3802006-3802056)
chr3 (65-119)||(4589816-4589870)
chr3 (352-394)||(11912463-11912505)
chr3 (29-83)||(14067703-14067757)
chr3 (56-126)||(14681753-14681822)
chr3 (344-394)||(14764788-14764838)
chr3 (344-394)||(18899489-18899539)
chr3 (344-394)||(20249842-20249892)
chr3 (344-394)||(29545931-29545981)
chr3 (344-394)||(37440673-37440723)
chr3 (344-394)||(54519633-54519683)
chr3 (117-178)||(327512-327572)
chr3 (121-198)||(3833360-3833439)
chr3 (4-83)||(14067711-14067787)
chr3 (9-82)||(14670164-14670236)
chr3 (117-178)||(20461847-20461907)
chr3 (33-82)||(22791677-22791726)
chr3 (4-64)||(14667875-14667935)
chr3 (65-113)||(19774613-19774661)
chr3 (351-394)||(8491732-8491775)
chr3 (344-395)||(11167086-11167137)
chr3 (344-395)||(11301658-11301709)
chr3 (344-395)||(14664460-14664511)
chr3 (344-395)||(14667624-14667675)
chr3 (344-395)||(15616212-15616263)
chr3 (4-126)||(16613438-16613564)
chr3 (4-82)||(18440593-18440672)
chr3 (4-82)||(19485667-19485746)
chr3 (4-126)||(22045689-22045815)
chr3 (3-66)||(27410950-27411013)
chr3 (344-395)||(28948496-28948547)
chr3 (344-394)||(9532294-9532344)
chr3 (19-96)||(11914694-11914772)
chr3 (344-394)||(12304210-12304260)
chr3 (344-394)||(14068055-14068105)
chr3 (346-392)||(15463916-15463962)
chr3 (352-394)||(16840204-16840246)
chr3 (344-394)||(17318502-17318552)
chr3 (117-170)||(3403327-3403380)
chr3 (117-178)||(11557756-11557817)
chr3 (346-394)||(14681586-14681632)
chr3 (9-82)||(14681686-14681758)
chr3 (344-393)||(23372536-23372585)
chr3 (121-198)||(38814070-38814149)
chr3 (344-393)||(51299570-51299619)
chr3 (11-82)||(1466099-1466171)
chr3 (4-64)||(11301401-11301461)
chr3 (5-63)||(35962387-35962447)
chr3 (4-52)||(49390338-49390386)
chr3 (199-238)||(855751-855790)
chr3 (45-96)||(1466100-1466151)
chr3 (199-238)||(16369070-16369109)
chr3 (203-238)||(16909543-16909578)
chr3 (117-200)||(322237-322322)
chr3 (97-131)||(4589991-4590025)
chr3 (345-395)||(9708156-9708206)
chr3 (117-216)||(11298925-11299025)
chr3 (45-83)||(14067917-14067955)
chr3 (45-83)||(16795742-16795780)
chr3 (45-83)||(17318334-17318372)
chr3 (45-83)||(17318370-17318408)
chr3 (45-83)||(18440490-18440528)
chr3 (45-83)||(19485564-19485602)
chr3 (117-200)||(19726289-19726374)
chr3 (344-393)||(23173334-23173384)
chr3 (65-119)||(27410899-27410953)
chr3 (351-392)||(41172-41213)
chr3 (351-392)||(2249216-2249257)
chr3 (351-392)||(5841204-5841245)
chr3 (345-394)||(7781858-7781907)
chr3 (122-216)||(12172430-12172526)
chr3 (345-394)||(13152325-13152374)
chr3 (45-82)||(14067856-14067893)
chr3 (11-64)||(15963767-15963820)
chr3 (11-64)||(15967691-15967744)
chr3 (11-64)||(15971615-15971668)
chr3 (351-392)||(16326041-16326082)
chr3 (345-394)||(16454822-16454871)
chr3 (11-79)||(16795710-16795781)
chr3 (345-394)||(17462741-17462790)
chr3 (4-83)||(24180668-24180749)
chr3 (345-394)||(34158889-34158938)
chr3 (351-392)||(45220962-45221003)
chr3 (345-394)||(45607441-45607490)
chr3 (345-394)||(55476085-55476134)
chr3 (345-394)||(55500514-55500563)
chr3 (47-83)||(1466061-1466097)
chr3 (4-64)||(7108560-7108620)
chr3 (4-64)||(7112495-7112555)
chr3 (4-64)||(11069012-11069072)
chr3 (4-64)||(11166713-11166773)
chr3 (344-395)||(12337291-12337340)
chr3 (4-64)||(14664711-14664771)
chr3 (31-79)||(14667819-14667867)
chr3 (4-64)||(15616499-15616559)
chr3 (4-64)||(22320528-22320588)
chr3 (4-64)||(22335583-22335643)
chr3 (4-82)||(22651540-22651620)
chr3 (32-83)||(22651573-22651625)
chr3 (4-64)||(28948706-28948766)
chr3 (4-64)||(30064711-30064771)
chr3 (362-394)||(38312868-38312900)
chr3 (4-64)||(55021849-55021909)
[»] chr1 (98 HSPs)
chr1 (1-249)||(39244863-39245111)
chr1 (1-249)||(39248418-39248666)
chr1 (1-249)||(41389311-41389559)
chr1 (65-247)||(1009671-1009854)
chr1 (65-247)||(1926128-1926311)
chr1 (65-247)||(20925142-20925325)
chr1 (65-247)||(16376379-16376562)
chr1 (65-247)||(52634757-52634925)
chr1 (57-215)||(33796553-33796716)
chr1 (182-247)||(33796491-33796556)
chr1 (3-83)||(20229925-20230005)
chr1 (342-395)||(39245161-39245214)
chr1 (342-395)||(39248716-39248769)
chr1 (343-395)||(41389656-41389708)
chr1 (4-83)||(35982317-35982396)
chr1 (344-394)||(41801271-41801321)
chr1 (65-113)||(41389262-41389310)
chr1 (4-79)||(20315603-20315678)
chr1 (344-394)||(22132091-22132141)
chr1 (117-178)||(3705436-3705497)
chr1 (19-83)||(21406543-21406607)
chr1 (11-83)||(22131826-22131898)
chr1 (7-83)||(33796281-33796356)
chr1 (19-83)||(33796418-33796482)
chr1 (4-79)||(20229959-20230034)
chr1 (13-96)||(28195093-28195176)
chr1 (9-76)||(41801075-41801142)
chr1 (65-119)||(20229874-20229928)
chr1 (344-394)||(20230131-20230181)
chr1 (344-394)||(21406289-21406339)
chr1 (4-82)||(41801103-41801180)
chr1 (4-79)||(20315823-20315895)
chr1 (14-79)||(21740466-21740531)
chr1 (117-178)||(36819644-36819705)
chr1 (19-83)||(1009598-1009662)
chr1 (19-83)||(1926320-1926384)
chr1 (19-83)||(16376571-16376635)
chr1 (19-83)||(20925334-20925398)
chr1 (19-83)||(52634684-52634748)
chr1 (344-395)||(1009297-1009348)
chr1 (344-395)||(1926788-1926839)
chr1 (344-395)||(16376808-16376859)
chr1 (344-395)||(20925802-20925853)
chr1 (344-395)||(33796068-33796119)
chr1 (55-126)||(41801010-41801080)
chr1 (344-395)||(52634303-52634354)
chr1 (344-394)||(16370961-16371011)
chr1 (4-83)||(12271051-12271132)
chr1 (117-178)||(18394334-18394395)
chr1 (117-178)||(21172711-21172771)
chr1 (117-178)||(21312827-21312887)
chr1 (4-83)||(22357215-22357296)
chr1 (4-83)||(22358901-22358982)
chr1 (14-79)||(41306224-41306289)
chr1 (4-83)||(22131852-22131934)
chr1 (65-113)||(39244814-39244862)
chr1 (65-113)||(39248369-39248417)
chr1 (4-126)||(21406469-21406589)
chr1 (4-83)||(21740359-21740437)
chr1 (4-121)||(21740489-21740606)
chr1 (199-238)||(22831790-22831829)
chr1 (4-83)||(41306247-41306325)
chr1 (45-83)||(21406433-21406471)
chr1 (4-121)||(41306345-41306460)
chr1 (351-392)||(11809949-11809990)
chr1 (7-63)||(12271038-12271095)
chr1 (14-79)||(20315791-20315855)
chr1 (14-79)||(21740401-21740466)
chr1 (11-83)||(22131790-22131865)
chr1 (4-53)||(28195117-28195166)
chr1 (4-53)||(35982350-35982399)
chr1 (147-216)||(3473339-3473409)
chr1 (4-126)||(13883260-13883383)
chr1 (4-64)||(33796267-33796327)
chr1 (8-83)||(33796382-33796460)
chr1 (35-83)||(35982315-35982363)
chr1 (146-198)||(46975176-46975231)
chr1 (4-83)||(20315567-20315645)
chr1 (32-79)||(21740354-21740401)
chr1 (4-83)||(21740424-21740502)
chr1 (11-82)||(22131895-22131966)
chr1 (4-79)||(41306280-41306354)
chr1 (117-200)||(18182512-18182597)
chr1 (32-78)||(20315539-20315585)
chr1 (345-394)||(13988473-13988522)
chr1 (345-394)||(21475629-21475678)
chr1 (345-394)||(21923841-21923890)
chr1 (4-83)||(22357181-22357262)
chr1 (4-83)||(22358867-22358948)
chr1 (345-394)||(23594277-23594326)
chr1 (199-236)||(42865679-42865716)
chr1 (4-64)||(1009584-1009644)
chr1 (4-64)||(1926338-1926398)
chr1 (4-64)||(16376589-16376649)
chr1 (4-64)||(20925352-20925412)
chr1 (196-236)||(22469164-22469204)
chr1 (357-393)||(32649104-32649140)
chr1 (4-64)||(52634670-52634730)
[»] chr7 (166 HSPs)
chr7 (1-249)||(18424416-18424665)
chr7 (65-247)||(32057-32240)
chr7 (65-247)||(12705642-12705825)
chr7 (65-247)||(12713872-12714055)
chr7 (65-247)||(18278391-18278574)
chr7 (65-247)||(18282354-18282537)
chr7 (65-247)||(12717696-12717879)
chr7 (65-247)||(12722607-12722790)
chr7 (65-247)||(71782-71980)
chr7 (65-247)||(75891-76089)
chr7 (57-221)||(45170998-45171163)
chr7 (1-113)||(18424666-18424778)
chr7 (182-247)||(45171154-45171219)
chr7 (57-125)||(39721383-39721451)
chr7 (4-83)||(2833185-2833263)
chr7 (340-395)||(18424270-18424325)
chr7 (57-126)||(2833093-2833162)
chr7 (3-83)||(26291364-26291444)
chr7 (4-83)||(9390354-9390433)
chr7 (60-126)||(2530979-2531045)
chr7 (9-83)||(25928178-25928252)
chr7 (57-126)||(7519933-7520002)
chr7 (68-125)||(15083413-15083470)
chr7 (182-238)||(16582849-16582905)
chr7 (4-83)||(6170770-6170849)
chr7 (4-83)||(16582721-16582800)
chr7 (9-83)||(2531040-2531114)
chr7 (9-83)||(6170742-6170816)
chr7 (344-394)||(7520208-7520258)
chr7 (344-394)||(10607313-10607363)
chr7 (344-394)||(11660318-11660368)
chr7 (344-394)||(13891666-13891716)
chr7 (344-394)||(20486778-20486828)
chr7 (344-394)||(39268306-39268356)
chr7 (29-82)||(10607143-10607196)
chr7 (117-178)||(12317834-12317895)
chr7 (346-394)||(13892049-13892097)
chr7 (4-111)||(14270759-14270865)
chr7 (117-176)||(15605609-15605668)
chr7 (4-79)||(16582659-16582734)
chr7 (4-83)||(18278254-18278332)
chr7 (4-83)||(18282217-18282295)
chr7 (9-83)||(2833157-2833230)
chr7 (4-96)||(8939661-8939755)
chr7 (344-394)||(16582457-16582507)
chr7 (344-394)||(18301387-18301437)
chr7 (9-83)||(20486903-20486976)
chr7 (344-394)||(25928364-25928414)
chr7 (344-394)||(26291193-26291243)
chr7 (7-96)||(6170806-6170895)
chr7 (4-126)||(8467777-8467900)
chr7 (14-79)||(17232048-17232113)
chr7 (345-394)||(39721232-39721281)
chr7 (19-83)||(31984-32048)
chr7 (117-198)||(2759785-2759868)
chr7 (118-178)||(9446531-9446591)
chr7 (19-83)||(12713799-12713863)
chr7 (19-83)||(12717623-12717687)
chr7 (19-83)||(12722534-12722598)
chr7 (344-395)||(31760-31811)
chr7 (344-395)||(2833474-2833525)
chr7 (344-395)||(12706115-12706166)
chr7 (344-395)||(12713575-12713626)
chr7 (344-395)||(12722233-12722284)
chr7 (4-79)||(14270727-14270801)
chr7 (344-395)||(16908502-16908553)
chr7 (4-79)||(17231853-17231927)
chr7 (4-83)||(17231882-17231960)
chr7 (4-79)||(17231918-17231992)
chr7 (4-83)||(17231947-17232025)
chr7 (4-79)||(17231983-17232057)
chr7 (4-83)||(17232012-17232090)
chr7 (344-395)||(18281993-18282044)
chr7 (4-79)||(26291335-26291410)
chr7 (120-178)||(9593056-9593113)
chr7 (344-394)||(9752500-9752550)
chr7 (344-394)||(14420823-14420873)
chr7 (344-394)||(15083262-15083312)
chr7 (344-394)||(16005040-16005090)
chr7 (5-83)||(16582623-16582700)
chr7 (344-394)||(18606374-18606424)
chr7 (344-394)||(18871333-18871383)
chr7 (55-126)||(25928110-25928183)
chr7 (65-119)||(26291441-26291495)
chr7 (121-198)||(13148841-13148920)
chr7 (4-83)||(15112375-15112456)
chr7 (4-83)||(15115947-15116028)
chr7 (117-178)||(42203681-42203742)
chr7 (4-56)||(25928206-25928258)
chr7 (344-394)||(838125-838176)
chr7 (344-394)||(1203305-1203356)
chr7 (32-79)||(8467858-8467905)
chr7 (203-238)||(9752124-9752159)
chr7 (344-395)||(12717322-12717373)
chr7 (4-83)||(14270694-14270772)
chr7 (344-394)||(16109967-16110018)
chr7 (67-126)||(16908188-16908246)
chr7 (344-395)||(18278029-18278080)
chr7 (55-126)||(20486971-20487041)
chr7 (344-394)||(146536-146586)
chr7 (346-392)||(1860016-1860062)
chr7 (9-83)||(9752335-9752409)
chr7 (344-394)||(10897889-10897939)
chr7 (346-392)||(13919407-13919453)
chr7 (117-200)||(14429529-14429614)
chr7 (352-394)||(15213084-15213126)
chr7 (5-83)||(16582688-16582766)
chr7 (4-121)||(17231747-17231862)
chr7 (45-83)||(18301531-18301569)
chr7 (34-83)||(9390351-9390400)
chr7 (121-178)||(13635803-13635860)
chr7 (117-178)||(14152340-14152400)
chr7 (14-79)||(14270671-14270736)
chr7 (7-63)||(15112362-15112419)
chr7 (7-63)||(15115934-15115991)
chr7 (351-392)||(16185562-16185603)
chr7 (362-395)||(23666463-23666496)
chr7 (4-64)||(2833217-2833277)
chr7 (196-236)||(9702936-9702976)
chr7 (5-83)||(14982135-14982215)
chr7 (4-76)||(18278294-18278364)
chr7 (4-76)||(18282257-18282327)
chr7 (196-236)||(32216952-32216992)
chr7 (4-83)||(8467887-8467965)
chr7 (4-63)||(9752363-9752422)
chr7 (4-78)||(10502019-10502094)
chr7 (29-83)||(16998076-16998131)
chr7 (199-238)||(17138527-17138566)
chr7 (120-178)||(20692-20749)
chr7 (345-394)||(455893-455942)
chr7 (4-53)||(9390387-9390436)
chr7 (345-394)||(11393817-11393866)
chr7 (351-392)||(11394878-11394919)
chr7 (345-394)||(11972059-11972108)
chr7 (19-64)||(12705834-12705879)
chr7 (4-83)||(14157546-14157627)
chr7 (345-394)||(14949671-14949720)
chr7 (345-394)||(15377263-15377312)
chr7 (4-83)||(15719527-15719608)
chr7 (345-394)||(16232083-16232132)
chr7 (345-394)||(16409631-16409680)
chr7 (345-394)||(20385672-20385721)
chr7 (345-394)||(21190145-21190194)
chr7 (345-394)||(24701818-24701867)
chr7 (345-394)||(24704268-24704317)
chr7 (345-394)||(26356500-26356549)
chr7 (345-394)||(26358952-26359001)
chr7 (345-394)||(27216438-27216487)
chr7 (345-394)||(32125062-32125111)
chr7 (351-392)||(41283683-41283724)
chr7 (345-394)||(41522500-41522549)
chr7 (345-394)||(41524962-41525011)
chr7 (11-64)||(45171256-45171309)
chr7 (4-64)||(31970-32030)
chr7 (9-65)||(7519997-7520053)
chr7 (196-236)||(11858195-11858235)
chr7 (4-64)||(12713785-12713845)
chr7 (4-64)||(12717609-12717669)
chr7 (4-64)||(12722520-12722580)
chr7 (29-96)||(15719548-15719616)
chr7 (29-121)||(16323503-16323588)
chr7 (4-64)||(18282203-18282263)
chr7 (196-236)||(19649951-19649991)
chr7 (4-56)||(20486897-20486948)
chr7 (196-236)||(24054080-24054120)
chr7 (363-395)||(45171512-45171544)
[»] chr6 (114 HSPs)
chr6 (1-249)||(16622970-16623218)
chr6 (65-247)||(16759185-16759368)
chr6 (65-247)||(11565810-11565993)
chr6 (65-247)||(12619817-12620000)
chr6 (65-247)||(23988908-23989091)
chr6 (65-247)||(22948065-22948248)
chr6 (65-247)||(22952021-22952204)
chr6 (65-247)||(23870509-23870692)
chr6 (65-247)||(23874465-23874648)
chr6 (57-206)||(31479183-31479332)
chr6 (65-247)||(8242822-8243005)
chr6 (57-247)||(23413909-23414115)
chr6 (65-247)||(23394001-23394199)
chr6 (65-221)||(19869603-19869760)
chr6 (66-173)||(14471317-14471424)
chr6 (182-247)||(19869547-19869612)
chr6 (3-83)||(1643542-1643622)
chr6 (57-126)||(22074997-22075066)
chr6 (3-83)||(18918400-18918479)
chr6 (342-395)||(16622870-16622923)
chr6 (4-83)||(22075089-22075168)
chr6 (343-395)||(31479454-31479506)
chr6 (344-394)||(23400714-23400764)
chr6 (65-119)||(23400974-23401028)
chr6 (57-126)||(22074890-22074958)
chr6 (65-126)||(22862017-22862077)
chr6 (9-83)||(22075061-22075135)
chr6 (344-394)||(2076322-2076372)
chr6 (344-394)||(18918573-18918623)
chr6 (117-178)||(27567981-27568042)
chr6 (19-83)||(8242749-8242813)
chr6 (19-83)||(11565737-11565801)
chr6 (19-83)||(12620009-12620073)
chr6 (19-83)||(22947992-22948056)
chr6 (19-83)||(22951948-22952012)
chr6 (19-83)||(23870436-23870500)
chr6 (19-83)||(23874392-23874456)
chr6 (19-83)||(23988835-23988899)
chr6 (209-249)||(31479320-31479360)
chr6 (344-395)||(8242447-8242498)
chr6 (344-395)||(11565436-11565487)
chr6 (344-395)||(11716933-11716984)
chr6 (344-395)||(12620326-12620377)
chr6 (4-79)||(18913297-18913371)
chr6 (344-395)||(23988338-23988389)
chr6 (344-395)||(27555574-27555625)
chr6 (65-119)||(1643619-1643673)
chr6 (9-126)||(2076519-2076640)
chr6 (55-126)||(2076635-2076708)
chr6 (65-119)||(18918350-18918403)
chr6 (344-394)||(18953476-18953526)
chr6 (120-178)||(19298105-19298162)
chr6 (348-394)||(23538017-23538063)
chr6 (344-394)||(27222868-27222918)
chr6 (65-113)||(16623219-16623267)
chr6 (344-395)||(22861790-22861841)
chr6 (120-178)||(12706398-12706455)
chr6 (344-394)||(12941257-12941307)
chr6 (117-200)||(16523770-16523855)
chr6 (120-178)||(16740916-16740974)
chr6 (352-394)||(25737928-25737970)
chr6 (352-394)||(34297773-34297815)
chr6 (345-394)||(12741889-12741938)
chr6 (117-178)||(17803896-17803956)
chr6 (117-178)||(27553942-27554003)
chr6 (32-83)||(15874924-15874976)
chr6 (35-79)||(18913329-18913373)
chr6 (9-56)||(2076477-2076524)
chr6 (29-83)||(2200815-2200870)
chr6 (4-126)||(8242674-8242795)
chr6 (199-238)||(21740434-21740473)
chr6 (4-79)||(31630879-31630953)
chr6 (120-178)||(21701996-21702053)
chr6 (7-64)||(22075125-22075182)
chr6 (37-126)||(23400889-23400976)
chr6 (344-394)||(28290887-28290937)
chr6 (97-126)||(1643471-1643500)
chr6 (345-394)||(2291730-2291779)
chr6 (345-394)||(8054592-8054641)
chr6 (121-198)||(9482632-9482711)
chr6 (345-394)||(18335142-18335191)
chr6 (4-121)||(18913220-18913338)
chr6 (3-64)||(18953233-18953294)
chr6 (345-394)||(19004609-19004658)
chr6 (11-64)||(19869457-19869510)
chr6 (344-395)||(22075379-22075434)
chr6 (11-64)||(23393911-23393964)
chr6 (11-64)||(23413819-23413872)
chr6 (345-394)||(24422110-24422159)
chr6 (117-166)||(25767477-25767526)
chr6 (345-394)||(26925189-26925238)
chr6 (351-392)||(28707897-28707938)
chr6 (345-394)||(33861358-33861407)
chr6 (345-394)||(33863841-33863890)
chr6 (366-394)||(1254195-1254223)
chr6 (4-51)||(2200814-2200862)
chr6 (357-393)||(4475832-4475868)
chr6 (4-64)||(11565723-11565783)
chr6 (4-64)||(12620027-12620087)
chr6 (75-119)||(18953192-18953236)
chr6 (196-236)||(19862593-19862633)
chr6 (363-395)||(19869222-19869254)
chr6 (196-236)||(19872735-19872775)
chr6 (363-395)||(22947702-22947734)
chr6 (4-64)||(22947978-22948038)
chr6 (363-395)||(22951658-22951690)
chr6 (4-64)||(22951934-22951994)
chr6 (363-395)||(23393676-23393708)
chr6 (363-395)||(23413584-23413616)
chr6 (363-395)||(23870146-23870178)
chr6 (4-64)||(23870422-23870482)
chr6 (363-395)||(23874102-23874134)
chr6 (4-64)||(23874378-23874438)
chr6 (4-64)||(23988821-23988881)
[»] chr4 (122 HSPs)
chr4 (1-249)||(15223727-15223976)
chr4 (65-247)||(9555478-9555661)
chr4 (65-247)||(14758401-14758584)
chr4 (65-247)||(14955166-14955349)
chr4 (65-247)||(5757785-5757968)
chr4 (65-247)||(33741248-33741431)
chr4 (65-247)||(4562260-4562443)
chr4 (65-247)||(25688851-25689034)
chr4 (68-221)||(12486659-12486813)
chr4 (182-247)||(12486603-12486668)
chr4 (57-126)||(20158198-20158267)
chr4 (57-126)||(20160874-20160943)
chr4 (57-126)||(20163652-20163721)
chr4 (340-395)||(15223581-15223636)
chr4 (182-236)||(13813683-13813737)
chr4 (182-243)||(13818195-13818256)
chr4 (57-125)||(10712012-10712080)
chr4 (57-125)||(10925782-10925850)
chr4 (4-96)||(15189714-15189806)
chr4 (9-83)||(15189760-15189834)
chr4 (3-83)||(27532932-27533011)
chr4 (344-394)||(631740-631790)
chr4 (344-394)||(13813825-13813875)
chr4 (344-394)||(13818313-13818363)
chr4 (344-394)||(17052438-17052488)
chr4 (344-394)||(22634919-22634969)
chr4 (344-394)||(23996959-23997009)
chr4 (344-394)||(24048377-24048427)
chr4 (344-393)||(12422980-12423029)
chr4 (117-178)||(15353677-15353738)
chr4 (57-126)||(20158091-20158159)
chr4 (344-394)||(10711861-10711911)
chr4 (344-394)||(10925631-10925681)
chr4 (344-394)||(27532788-27532838)
chr4 (65-119)||(27533008-27533062)
chr4 (57-126)||(20160767-20160835)
chr4 (57-126)||(20163545-20163613)
chr4 (19-83)||(4562452-4562516)
chr4 (19-83)||(9555405-9555469)
chr4 (19-83)||(14758593-14758657)
chr4 (19-83)||(14955358-14955422)
chr4 (19-83)||(25688778-25688842)
chr4 (19-83)||(33741175-33741239)
chr4 (344-395)||(4562766-4562817)
chr4 (344-395)||(5758448-5758499)
chr4 (344-395)||(9555104-9555155)
chr4 (344-395)||(14758984-14759035)
chr4 (344-395)||(14955752-14955803)
chr4 (4-79)||(15482003-15482077)
chr4 (344-395)||(17807089-17807140)
chr4 (344-395)||(25688477-25688528)
chr4 (344-395)||(33740871-33740922)
chr4 (29-83)||(631592-631646)
chr4 (120-178)||(1952099-1952156)
chr4 (344-394)||(15533255-15533305)
chr4 (344-394)||(18211640-18211690)
chr4 (344-394)||(20158440-20158490)
chr4 (344-394)||(49549075-49549125)
chr4 (117-178)||(11250930-11250991)
chr4 (346-395)||(12486306-12486355)
chr4 (14-79)||(15481980-15482045)
chr4 (65-122)||(17807243-17807299)
chr4 (14-79)||(19857001-19857066)
chr4 (117-178)||(36134286-36134346)
chr4 (19-83)||(5757977-5758041)
chr4 (16-83)||(12423211-12423281)
chr4 (29-83)||(23996762-23996813)
chr4 (4-79)||(361511-361585)
chr4 (4-79)||(361543-361617)
chr4 (120-216)||(15093394-15093492)
chr4 (4-83)||(15481938-15482016)
chr4 (4-79)||(19856969-19857043)
chr4 (344-395)||(20163891-20163942)
chr4 (344-394)||(30145819-30145870)
chr4 (11-65)||(12423196-12423250)
chr4 (9-63)||(22634787-22634841)
chr4 (344-394)||(36036988-36037038)
chr4 (121-198)||(2014465-2014544)
chr4 (14-79)||(15481915-15481980)
chr4 (121-198)||(16243740-16243819)
chr4 (117-178)||(18603067-18603127)
chr4 (203-236)||(22634750-22634783)
chr4 (4-111)||(631600-631709)
chr4 (4-64)||(5757995-5758055)
chr4 (196-236)||(13569175-13569215)
chr4 (11-82)||(17048966-17049037)
chr4 (344-395)||(20161116-20161167)
chr4 (120-178)||(3412507-3412564)
chr4 (166-221)||(13818162-13818219)
chr4 (35-81)||(15098691-15098737)
chr4 (196-238)||(15125504-15125546)
chr4 (3-83)||(15876838-15876920)
chr4 (45-83)||(17048967-17049005)
chr4 (120-178)||(17152823-17152880)
chr4 (120-178)||(18222717-18222774)
chr4 (120-178)||(18609642-18609699)
chr4 (345-395)||(38106981-38107031)
chr4 (4-81)||(361574-361650)
chr4 (345-394)||(1838053-1838102)
chr4 (14-79)||(6190069-6190134)
chr4 (345-394)||(12033681-12033730)
chr4 (11-64)||(12486513-12486566)
chr4 (182-215)||(13813639-13813672)
chr4 (345-394)||(14739599-14739648)
chr4 (345-394)||(15118902-15118951)
chr4 (120-177)||(18236603-18236659)
chr4 (121-198)||(19757940-19758019)
chr4 (121-198)||(19781787-19781866)
chr4 (203-244)||(23996574-23996615)
chr4 (351-392)||(28384889-28384930)
chr4 (345-394)||(29267226-29267275)
chr4 (345-394)||(44614851-44614900)
chr4 (345-394)||(50222889-50222938)
chr4 (4-64)||(4562470-4562530)
chr4 (4-64)||(9555391-9555451)
chr4 (4-64)||(14758611-14758671)
chr4 (4-64)||(14955376-14955436)
chr4 (4-51)||(17994970-17995018)
chr4 (345-381)||(18239969-18240005)
chr4 (29-121)||(19856895-19856986)
chr4 (4-64)||(25688764-25688824)
chr4 (4-64)||(33741161-33741221)
[»] chr5 (102 HSPs)
chr5 (57-247)||(18355222-18355414)
chr5 (65-235)||(40724510-40724682)
chr5 (65-247)||(19473659-19473842)
chr5 (65-247)||(20294849-20295032)
chr5 (57-206)||(10752026-10752175)
chr5 (1-126)||(15237852-15237977)
chr5 (1-113)||(15237739-15237851)
chr5 (118-247)||(11219915-11220045)
chr5 (118-247)||(11224501-11224631)
chr5 (118-247)||(11230313-11230443)
chr5 (118-241)||(11228330-11228454)
chr5 (4-83)||(22108175-22108254)
chr5 (57-130)||(20911836-20911909)
chr5 (4-83)||(22120320-22120399)
chr5 (343-395)||(10751852-10751904)
chr5 (7-83)||(18355045-18355120)
chr5 (344-395)||(15238110-15238161)
chr5 (344-395)||(22108442-22108493)
chr5 (9-83)||(5889799-5889873)
chr5 (117-216)||(23439625-23439726)
chr5 (117-216)||(23450992-23451093)
chr5 (117-216)||(23458236-23458337)
chr5 (117-216)||(23462497-23462598)
chr5 (57-126)||(24768164-24768232)
chr5 (344-395)||(20912245-20912296)
chr5 (9-83)||(22108147-22108221)
chr5 (344-394)||(22120584-22120634)
chr5 (9-83)||(24768227-24768300)
chr5 (172-217)||(11226495-11226540)
chr5 (4-83)||(5889827-5889909)
chr5 (209-249)||(10751998-10752038)
chr5 (19-83)||(19473851-19473915)
chr5 (19-83)||(20294776-20294840)
chr5 (344-395)||(18354832-18354883)
chr5 (344-395)||(19474165-19474216)
chr5 (344-395)||(20294549-20294600)
chr5 (4-111)||(20912108-20912214)
chr5 (4-83)||(22120287-22120366)
chr5 (117-172)||(24221568-24221623)
chr5 (117-216)||(1859351-1859452)
chr5 (117-178)||(17919525-17919587)
chr5 (344-394)||(19510498-19510548)
chr5 (344-394)||(22339048-22339098)
chr5 (344-394)||(23113395-23113445)
chr5 (344-394)||(28372074-28372124)
chr5 (344-394)||(37600001-37600051)
chr5 (344-394)||(38146411-38146461)
chr5 (117-178)||(17410179-17410239)
chr5 (19-83)||(18355146-18355213)
chr5 (34-83)||(22120284-22120333)
chr5 (121-198)||(33408914-33408993)
chr5 (344-393)||(41878644-41878693)
chr5 (11-63)||(5889870-5889922)
chr5 (9-96)||(21742235-21742323)
chr5 (356-395)||(9774975-9775014)
chr5 (344-395)||(24768555-24768606)
chr5 (120-178)||(18773913-18773970)
chr5 (120-178)||(18783756-18783813)
chr5 (344-394)||(22335518-22335568)
chr5 (344-394)||(22749197-22749247)
chr5 (120-178)||(23535904-23535962)
chr5 (120-178)||(26743084-26743141)
chr5 (352-394)||(36459584-36459626)
chr5 (19-64)||(11226427-11226472)
chr5 (182-247)||(11226481-11226545)
chr5 (4-64)||(18355031-18355091)
chr5 (4-64)||(24768254-24768314)
chr5 (55-126)||(29447377-29447447)
chr5 (117-178)||(123685-123747)
chr5 (120-178)||(17730747-17730804)
chr5 (200-238)||(18770395-18770433)
chr5 (182-216)||(20766628-20766662)
chr5 (117-200)||(21367052-21367137)
chr5 (120-178)||(42805130-42805187)
chr5 (345-394)||(265311-265360)
chr5 (345-394)||(10733481-10733530)
chr5 (351-392)||(19075927-19075968)
chr5 (345-394)||(20908575-20908624)
chr5 (345-394)||(29345544-29345593)
chr5 (345-394)||(29348025-29348074)
chr5 (345-394)||(29350498-29350547)
chr5 (345-394)||(31143851-31143900)
chr5 (97-126)||(40727230-40727259)
chr5 (345-394)||(42245906-42245955)
chr5 (4-126)||(262578-262701)
chr5 (363-395)||(11219590-11219622)
chr5 (363-395)||(11224176-11224208)
chr5 (363-395)||(11226192-11226224)
chr5 (363-395)||(11227998-11228030)
chr5 (363-395)||(11229988-11230020)
chr5 (121-177)||(16673863-16673918)
chr5 (4-64)||(19473869-19473929)
chr5 (4-64)||(20294762-20294822)
chr5 (196-236)||(21276016-21276056)
chr5 (196-236)||(21886903-21886943)
chr5 (196-236)||(23200973-23201013)
chr5 (196-236)||(23501773-23501813)
chr5 (4-51)||(24211985-24212033)
chr5 (196-236)||(26703691-26703731)
chr5 (196-236)||(26973424-26973464)
chr5 (9-53)||(29915654-29915698)
chr5 (36-64)||(40727171-40727199)
[»] scaffold0525 (3 HSPs)
scaffold0525 (65-247)||(4833-5016)
scaffold0525 (19-83)||(5025-5089)
scaffold0525 (4-64)||(5043-5103)
[»] chr8 (87 HSPs)
chr8 (65-247)||(21977607-21977790)
chr8 (65-247)||(22110999-22111182)
chr8 (65-247)||(43250759-43250942)
chr8 (65-247)||(21973516-21973699)
chr8 (57-247)||(21828943-21829149)
chr8 (57-247)||(30941077-30941283)
chr8 (78-221)||(18863623-18863767)
chr8 (182-247)||(18863758-18863823)
chr8 (57-125)||(21410088-21410156)
chr8 (57-125)||(21804580-21804648)
chr8 (57-126)||(21386407-21386476)
chr8 (65-126)||(21386515-21386576)
chr8 (3-65)||(15924281-15924343)
chr8 (57-126)||(14398770-14398839)
chr8 (4-82)||(20983495-20983573)
chr8 (344-394)||(44385826-44385876)
chr8 (117-178)||(20856811-20856872)
chr8 (65-119)||(15924230-15924284)
chr8 (344-394)||(21386195-21386245)
chr8 (344-394)||(23427862-23427912)
chr8 (344-394)||(23913301-23913351)
chr8 (6-83)||(20983530-20983607)
chr8 (14-79)||(38550622-38550687)
chr8 (4-128)||(1323835-1323957)
chr8 (19-83)||(22110926-22110990)
chr8 (19-83)||(43250686-43250750)
chr8 (4-79)||(13428702-13428776)
chr8 (9-64)||(14398834-14398889)
chr8 (344-395)||(14399085-14399136)
chr8 (344-395)||(21974176-21974227)
chr8 (344-395)||(21978286-21978337)
chr8 (4-79)||(38550710-38550784)
chr8 (344-395)||(43250237-43250288)
chr8 (120-178)||(16231813-16231870)
chr8 (352-394)||(21328602-21328644)
chr8 (344-394)||(21409937-21409987)
chr8 (344-394)||(21804429-21804479)
chr8 (120-178)||(22044594-22044651)
chr8 (33-82)||(5610331-5610380)
chr8 (121-198)||(23847355-23847434)
chr8 (147-216)||(16184339-16184410)
chr8 (29-81)||(20983487-20983539)
chr8 (19-83)||(21973708-21973772)
chr8 (19-59)||(21977799-21977839)
chr8 (4-83)||(1323737-1323815)
chr8 (4-79)||(27472940-27473014)
chr8 (344-394)||(27942677-27942728)
chr8 (4-83)||(38550645-38550723)
chr8 (32-79)||(38550705-38550752)
chr8 (120-178)||(23833882-23833939)
chr8 (9-63)||(23913389-23913442)
chr8 (34-79)||(1323734-1323779)
chr8 (14-79)||(13428679-13428744)
chr8 (5-96)||(16402230-16402323)
chr8 (351-392)||(21967992-21968033)
chr8 (351-392)||(21980832-21980873)
chr8 (351-392)||(21985815-21985856)
chr8 (351-392)||(22000778-22000819)
chr8 (351-392)||(22009196-22009237)
chr8 (351-392)||(34950124-34950165)
chr8 (4-79)||(1323770-1323844)
chr8 (203-238)||(19259961-19259996)
chr8 (199-238)||(20466450-20466489)
chr8 (55-126)||(23913437-23913507)
chr8 (352-391)||(42560882-42560921)
chr8 (351-394)||(44494223-44494266)
chr8 (345-394)||(1483965-1484014)
chr8 (345-394)||(4482875-4482924)
chr8 (345-394)||(4542922-4542971)
chr8 (345-394)||(5853841-5853890)
chr8 (4-83)||(14103570-14103651)
chr8 (345-394)||(14823338-14823387)
chr8 (345-394)||(18678574-18678623)
chr8 (345-394)||(18717763-18717812)
chr8 (345-394)||(20402790-20402839)
chr8 (196-237)||(21169188-21169229)
chr8 (345-394)||(22001324-22001373)
chr8 (11-64)||(30941320-30941373)
chr8 (356-392)||(11252087-11252123)
chr8 (363-395)||(18864116-18864148)
chr8 (196-236)||(19898701-19898741)
chr8 (196-236)||(21162523-21162563)
chr8 (363-395)||(21829472-21829504)
chr8 (4-64)||(22110912-22110972)
chr8 (196-236)||(23777298-23777338)
chr8 (363-395)||(30941576-30941608)
chr8 (4-64)||(43250672-43250732)
[»] chr2 (79 HSPs)
chr2 (65-247)||(10102783-10102966)
chr2 (65-247)||(24629454-24629637)
chr2 (65-247)||(24648303-24648486)
chr2 (65-247)||(30345990-30346173)
chr2 (66-247)||(27380328-27380510)
chr2 (66-247)||(27384374-27384556)
chr2 (65-247)||(27600780-27600963)
chr2 (57-247)||(1282384-1282590)
chr2 (57-221)||(41531940-41532105)
chr2 (182-247)||(41532096-41532161)
chr2 (59-126)||(31344279-31344346)
chr2 (117-178)||(24174485-24174546)
chr2 (117-221)||(22812291-22812397)
chr2 (344-394)||(9784030-9784080)
chr2 (65-126)||(12902360-12902420)
chr2 (19-83)||(10102975-10103039)
chr2 (19-83)||(24629646-24629710)
chr2 (19-83)||(27600707-27600771)
chr2 (19-83)||(30346182-30346246)
chr2 (344-395)||(24630040-24630091)
chr2 (344-395)||(24645186-24645237)
chr2 (344-395)||(24647962-24648013)
chr2 (344-395)||(27380986-27381037)
chr2 (344-395)||(27384956-27385007)
chr2 (344-395)||(27600406-27600457)
chr2 (344-395)||(30346650-30346701)
chr2 (344-394)||(6481820-6481870)
chr2 (344-394)||(6485287-6485337)
chr2 (344-394)||(19663550-19663600)
chr2 (120-182)||(19928841-19928902)
chr2 (344-394)||(20260293-20260343)
chr2 (344-394)||(21074500-21074550)
chr2 (117-178)||(25961903-25961965)
chr2 (117-216)||(25964102-25964203)
chr2 (9-83)||(31344211-31344284)
chr2 (345-394)||(9240710-9240759)
chr2 (117-178)||(19691982-19692042)
chr2 (118-178)||(24735102-24735161)
chr2 (19-83)||(27384565-27384629)
chr2 (344-395)||(10103289-10103340)
chr2 (344-395)||(12902599-12902650)
chr2 (117-178)||(24655708-24655770)
chr2 (117-200)||(37524329-37524414)
chr2 (196-238)||(40622673-40622715)
chr2 (4-83)||(13102057-13102138)
chr2 (19-83)||(27380519-27380583)
chr2 (117-172)||(24869571-24869626)
chr2 (344-395)||(31343952-31344003)
chr2 (88-126)||(9784216-9784253)
chr2 (182-216)||(22812373-22812407)
chr2 (345-395)||(23130440-23130490)
chr2 (345-395)||(23132907-23132957)
chr2 (117-216)||(24673185-24673286)
chr2 (117-216)||(24679810-24679911)
chr2 (345-394)||(570968-571017)
chr2 (11-64)||(1282294-1282347)
chr2 (345-394)||(18808506-18808555)
chr2 (345-394)||(23135155-23135204)
chr2 (345-394)||(23710082-23710131)
chr2 (19-64)||(24648249-24648294)
chr2 (345-394)||(24898753-24898802)
chr2 (345-394)||(24901228-24901277)
chr2 (345-394)||(24903705-24903754)
chr2 (345-394)||(24906182-24906231)
chr2 (345-394)||(24908657-24908706)
chr2 (345-394)||(26504943-26504992)
chr2 (345-394)||(26507421-26507470)
chr2 (345-394)||(32040040-32040089)
chr2 (345-394)||(34403049-34403098)
chr2 (351-392)||(37379074-37379115)
chr2 (345-394)||(39681877-39681926)
chr2 (11-64)||(41532198-41532251)
chr2 (4-64)||(10102993-10103053)
chr2 (4-51)||(20634498-20634546)
chr2 (147-216)||(23020133-23020204)
chr2 (363-395)||(24647129-24647161)
chr2 (4-64)||(27600693-27600753)
chr2 (4-64)||(30346200-30346260)
chr2 (363-395)||(41532454-41532486)
[»] scaffold0061 (3 HSPs)
scaffold0061 (65-247)||(68155-68338)
scaffold0061 (19-64)||(68347-68392)
scaffold0061 (344-391)||(68548-68595)
[»] scaffold0372 (3 HSPs)
scaffold0372 (65-247)||(5994-6177)
scaffold0372 (344-395)||(6313-6364)
scaffold0372 (19-65)||(6186-6232)
[»] scaffold0141 (3 HSPs)
scaffold0141 (57-247)||(15087-15293)
scaffold0141 (11-64)||(15330-15383)
scaffold0141 (363-395)||(15586-15618)
[»] scaffold0029 (11 HSPs)
scaffold0029 (65-247)||(79523-79704)
scaffold0029 (3-83)||(62552-62631)
scaffold0029 (3-83)||(66468-66547)
scaffold0029 (4-83)||(79418-79496)
scaffold0029 (344-394)||(62832-62882)
scaffold0029 (65-119)||(66417-66471)
scaffold0029 (65-119)||(62501-62555)
scaffold0029 (97-130)||(62675-62708)
scaffold0029 (30-76)||(79458-79503)
scaffold0029 (97-126)||(66591-66620)
scaffold0029 (4-64)||(79404-79464)
[»] scaffold0157 (4 HSPs)
scaffold0157 (68-221)||(33664-33818)
scaffold0157 (182-247)||(33809-33874)
scaffold0157 (346-395)||(34122-34171)
scaffold0157 (11-64)||(33911-33964)
[»] scaffold0349 (4 HSPs)
scaffold0349 (65-247)||(11465-11633)
scaffold0349 (19-83)||(11392-11456)
scaffold0349 (344-395)||(11086-11137)
scaffold0349 (4-64)||(11378-11438)
[»] scaffold0023 (4 HSPs)
scaffold0023 (57-126)||(11996-12065)
scaffold0023 (57-126)||(12104-12172)
scaffold0023 (344-394)||(11813-11863)
scaffold0023 (345-394)||(93974-94023)
[»] scaffold0200 (3 HSPs)
scaffold0200 (4-83)||(11084-11163)
scaffold0200 (4-83)||(11051-11130)
scaffold0200 (4-64)||(11037-11097)
[»] scaffold0486 (3 HSPs)
scaffold0486 (57-126)||(8944-9013)
scaffold0486 (9-83)||(8875-8949)
scaffold0486 (344-395)||(8612-8663)
[»] scaffold1220 (1 HSPs)
scaffold1220 (117-200)||(1452-1537)
[»] scaffold0601 (4 HSPs)
scaffold0601 (9-83)||(8537-8611)
scaffold0601 (4-83)||(8565-8644)
scaffold0601 (4-83)||(8598-8677)
scaffold0601 (4-65)||(8631-8692)
[»] scaffold0327 (5 HSPs)
scaffold0327 (9-83)||(19118-19192)
scaffold0327 (9-83)||(19222-19296)
scaffold0327 (344-394)||(18859-18909)
scaffold0327 (4-64)||(19104-19164)
scaffold0327 (97-126)||(19291-19320)
[»] scaffold0293 (4 HSPs)
scaffold0293 (9-83)||(21146-21220)
scaffold0293 (344-394)||(21332-21382)
scaffold0293 (55-126)||(21078-21151)
scaffold0293 (4-56)||(21174-21226)
[»] scaffold0299 (3 HSPs)
scaffold0299 (4-64)||(6029-6089)
scaffold0299 (5-83)||(6043-6121)
scaffold0299 (344-395)||(5860-5909)
[»] scaffold0031 (5 HSPs)
scaffold0031 (343-394)||(37194-37245)
scaffold0031 (9-81)||(37046-37117)
scaffold0031 (55-126)||(36981-37051)
scaffold0031 (117-178)||(53264-53324)
scaffold0031 (196-236)||(66259-66299)
[»] scaffold0575 (3 HSPs)
scaffold0575 (344-394)||(6953-7003)
scaffold0575 (55-126)||(6761-6831)
scaffold0575 (9-82)||(6826-6898)
[»] scaffold0239 (2 HSPs)
scaffold0239 (4-120)||(22132-22249)
scaffold0239 (4-83)||(22064-22145)
[»] scaffold0166 (4 HSPs)
scaffold0166 (57-126)||(10661-10729)
scaffold0166 (9-83)||(10724-10797)
scaffold0166 (344-395)||(11052-11103)
scaffold0166 (4-64)||(10751-10811)
[»] scaffold0080 (4 HSPs)
scaffold0080 (344-393)||(28509-28558)
scaffold0080 (344-393)||(33974-34023)
scaffold0080 (199-238)||(19114-19153)
scaffold0080 (199-238)||(55850-55889)
[»] scaffold0044 (3 HSPs)
scaffold0044 (117-178)||(18897-18958)
scaffold0044 (117-172)||(12619-12674)
scaffold0044 (345-394)||(39964-40013)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (117-178)||(195296-195357)
[»] scaffold0001 (4 HSPs)
scaffold0001 (117-178)||(173003-173064)
scaffold0001 (196-236)||(204498-204538)
scaffold0001 (146-200)||(422920-422977)
scaffold0001 (146-178)||(178706-178738)
[»] scaffold0380 (4 HSPs)
scaffold0380 (19-83)||(945-1009)
scaffold0380 (348-394)||(4010-4056)
scaffold0380 (45-83)||(832-870)
scaffold0380 (4-64)||(931-991)
[»] scaffold1852 (3 HSPs)
scaffold1852 (75-126)||(526-577)
scaffold1852 (16-121)||(401-505)
scaffold1852 (344-395)||(813-864)
[»] scaffold0013 (4 HSPs)
scaffold0013 (9-83)||(74067-74142)
scaffold0013 (347-394)||(74327-74374)
scaffold0013 (120-178)||(81563-81620)
scaffold0013 (117-173)||(3007-3062)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (117-200)||(414419-414505)
scaffold0003 (120-178)||(100782-100839)
[»] scaffold0550 (1 HSPs)
scaffold0550 (121-200)||(7136-7217)
[»] scaffold0124 (4 HSPs)
scaffold0124 (344-394)||(25560-25610)
scaffold0124 (4-82)||(25423-25501)
scaffold0124 (117-216)||(42265-42366)
scaffold0124 (10-83)||(25396-25469)
[»] scaffold0109 (4 HSPs)
scaffold0109 (344-394)||(37190-37240)
scaffold0109 (75-121)||(36942-36988)
scaffold0109 (45-83)||(37063-37101)
scaffold0109 (120-177)||(6672-6728)
[»] scaffold0120 (1 HSPs)
scaffold0120 (117-178)||(20347-20408)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (117-178)||(228705-228766)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (117-213)||(34223-34322)
[»] scaffold0278 (4 HSPs)
scaffold0278 (4-79)||(6925-6999)
scaffold0278 (4-79)||(6957-7031)
scaffold0278 (4-83)||(6986-7064)
scaffold0278 (14-79)||(7022-7087)
[»] scaffold0116 (4 HSPs)
scaffold0116 (4-83)||(44444-44522)
scaffold0116 (4-79)||(44477-44551)
scaffold0116 (14-79)||(44421-44486)
scaffold0116 (4-121)||(44542-44657)
[»] scaffold0043 (3 HSPs)
scaffold0043 (4-79)||(9034-9108)
scaffold0043 (32-79)||(9066-9113)
scaffold0043 (196-236)||(17851-17891)
[»] scaffold0028 (7 HSPs)
scaffold0028 (344-395)||(60318-60369)
scaffold0028 (65-126)||(59850-59910)
scaffold0028 (345-394)||(133775-133824)
scaffold0028 (345-394)||(136244-136293)
scaffold0028 (345-394)||(138713-138762)
scaffold0028 (345-394)||(141182-141231)
scaffold0028 (345-394)||(143651-143700)
[»] scaffold0004 (9 HSPs)
scaffold0004 (4-79)||(362019-362093)
scaffold0004 (4-83)||(362178-362256)
scaffold0004 (4-83)||(362080-362158)
scaffold0004 (4-121)||(361945-362060)
scaffold0004 (34-79)||(362051-362096)
scaffold0004 (4-79)||(362116-362191)
scaffold0004 (32-79)||(362214-362261)
scaffold0004 (199-236)||(69409-69446)
scaffold0004 (14-83)||(362145-362214)
[»] scaffold1427 (1 HSPs)
scaffold1427 (344-394)||(236-286)
[»] scaffold0842 (1 HSPs)
scaffold0842 (344-394)||(5278-5328)
[»] scaffold0599 (2 HSPs)
scaffold0599 (352-394)||(4157-4199)
scaffold0599 (5-96)||(6430-6523)
[»] scaffold0476 (2 HSPs)
scaffold0476 (117-216)||(5222-5323)
scaffold0476 (117-216)||(6417-6518)
[»] scaffold0337 (1 HSPs)
scaffold0337 (344-394)||(10814-10864)
[»] scaffold0142 (3 HSPs)
scaffold0142 (344-394)||(8732-8782)
scaffold0142 (37-83)||(8504-8550)
scaffold0142 (19-63)||(8461-8505)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (117-216)||(5203-5304)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (344-394)||(109637-109687)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (344-394)||(224135-224185)
[»] scaffold0439 (1 HSPs)
scaffold0439 (117-178)||(10666-10726)
[»] scaffold0228 (1 HSPs)
scaffold0228 (117-178)||(18968-19029)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (121-198)||(9107-9186)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (117-178)||(4572-4633)
[»] scaffold0165 (4 HSPs)
scaffold0165 (10-83)||(2908-2981)
scaffold0165 (10-83)||(6971-7044)
scaffold0165 (10-82)||(2876-2948)
scaffold0165 (10-82)||(6939-7011)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (117-178)||(66762-66822)
[»] scaffold0410 (2 HSPs)
scaffold0410 (344-395)||(14879-14930)
scaffold0410 (117-178)||(1857-1917)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (351-394)||(23937-23980)
[»] scaffold0484 (1 HSPs)
scaffold0484 (29-83)||(24-78)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (117-178)||(7653-7715)
[»] scaffold0111 (1 HSPs)
scaffold0111 (196-238)||(32059-32101)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (117-216)||(47123-47224)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (120-178)||(22926-22983)
[»] scaffold1873 (2 HSPs)
scaffold1873 (206-243)||(848-885)
scaffold1873 (117-162)||(954-999)
[»] scaffold0561 (1 HSPs)
scaffold0561 (4-83)||(10110-10191)
[»] scaffold0544 (1 HSPs)
scaffold0544 (344-393)||(3509-3558)
[»] scaffold0076 (2 HSPs)
scaffold0076 (4-83)||(26808-26889)
scaffold0076 (4-83)||(26842-26923)
[»] scaffold0081 (3 HSPs)
scaffold0081 (196-236)||(23298-23338)
scaffold0081 (196-236)||(38722-38762)
scaffold0081 (196-226)||(14287-14317)
[»] scaffold1296 (1 HSPs)
scaffold1296 (117-213)||(29-127)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (203-238)||(1793-1828)
[»] scaffold0673 (1 HSPs)
scaffold0673 (117-216)||(8199-8294)
[»] scaffold0210 (4 HSPs)
scaffold0210 (199-238)||(22303-22342)
scaffold0210 (199-238)||(30195-30234)
scaffold0210 (199-231)||(22271-22303)
scaffold0210 (199-231)||(30163-30195)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (32-79)||(79884-79931)
scaffold0056 (4-63)||(79889-79947)
[»] scaffold1552 (1 HSPs)
scaffold1552 (120-178)||(77-134)
[»] scaffold0574 (1 HSPs)
scaffold0574 (196-226)||(8278-8308)
[»] scaffold0311 (1 HSPs)
scaffold0311 (117-200)||(7524-7609)
[»] scaffold0181 (1 HSPs)
scaffold0181 (117-178)||(27505-27567)
[»] scaffold0679 (1 HSPs)
scaffold0679 (351-392)||(3265-3306)
[»] scaffold0546 (1 HSPs)
scaffold0546 (120-177)||(6579-6635)
[»] scaffold0462 (1 HSPs)
scaffold0462 (4-83)||(7752-7833)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (345-394)||(12955-13004)
[»] scaffold0356 (1 HSPs)
scaffold0356 (4-83)||(1007-1088)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (345-394)||(20310-20359)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (345-394)||(13518-13567)
[»] scaffold0145 (1 HSPs)
scaffold0145 (345-394)||(9312-9361)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (345-394)||(37385-37434)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (4-83)||(2479-2560)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (19-83)||(15-80)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (4-121)||(22246-22364)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (4-84)||(75855-75936)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (19-83)||(170395-170460)
scaffold0020 (196-236)||(178515-178555)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (4-83)||(126500-126581)
[»] scaffold0674 (1 HSPs)
scaffold0674 (4-51)||(2994-3042)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (119-200)||(17507-17590)
[»] scaffold0149 (2 HSPs)
scaffold0149 (196-236)||(3356-3396)
scaffold0149 (196-236)||(7787-7827)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 245; Significance: 1e-136; HSPs: 189)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 16751552 - 16751800
Alignment:
Q  1 gctatgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaatta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16751552 gctatgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaatta 16751651  T
Q  101 ttattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctattgtttaagatgattatgtt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16751652 ttattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctattgtttaagatgactatgtt 16751751  T
Q  201 taagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagtacg 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16751752 taagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagtacg 16751800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 19774612 - 19774379
Alignment:
Q  1 gctatgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaatta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19774612 gctatgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaatta 19774513  T
Q  101 ttattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctattgtttaagatgattatgtt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||                
T  19774512 ttattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattttttatcaaagatgctattgtttaa------------ 19774425  T
Q  201 taagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagtacg 249  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19774424 ---gatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagtacg 19774379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 65 - 244
Target Start/End: Original strand, 17318111 - 17318292
Alignment:
Q  65 aagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattg 164  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  17318111 aagtgatgaatatgttgatctatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaaagttgtgattacttgataattg 17318210  T
Q  165 tttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgtta 244  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17318211 tttatcaaagatgctatgatgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagttttatgatgttgattatggtgtta 17318292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 65 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 7108830 - 7108647
Alignment:
Q  65 aagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattg 164  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7108830 aagtgatgaatatgttgttctatatatgattaat-attattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattg 7108732  T
Q  165 tttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 247  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7108731 tttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattttggtgttagta 7108647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 65 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 7112765 - 7112582
Alignment:
Q  65 aagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattg 164  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7112765 aagtgatgaatatgttgttctatatatgattaat-attattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattg 7112667  T
Q  165 tttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 247  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7112666 tttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattttggtgttagta 7112582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 65 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 22320798 - 22320615
Alignment:
Q  65 aagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattg 164  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22320798 aagtgatgaatatgttgttctatatatgattaat-attattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattg 22320700  T
Q  165 tttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 247  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22320699 tttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattttggtgttagta 22320615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 65 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 22335853 - 22335670
Alignment:
Q  65 aagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattg 164  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22335853 aagtgatgaatatgttgttctatatatgattaat-attattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattg 22335755  T
Q  165 tttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 247  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22335754 tttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattttggtgttagta 22335670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 65 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 28948976 - 28948793
Alignment:
Q  65 aagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattg 164  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28948976 aagtgatgaatatgttgttctatatatgattaat-attattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattg 28948878  T
Q  165 tttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 247  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28948877 tttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattttggtgttagta 28948793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 65 - 247
Target Start/End: Original strand, 4108214 - 4108397
Alignment:
Q  65 aagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattg 164  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4108214 aagtgatgaatatgttgttctatatatgattaat-attattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattg 4108312  T
Q  165 tttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 247  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  4108313 tttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgactttggtgttagta 4108397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 65 - 247
Target Start/End: Original strand, 4112066 - 4112249
Alignment:
Q  65 aagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattg 164  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4112066 aagtgatgaatatgttgttctatatatgattaat-attattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattg 4112164  T
Q  165 tttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 247  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  4112165 tttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgactttggtgttagta 4112249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 65 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 11069282 - 11069099
Alignment:
Q  65 aagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattg 164  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11069282 aagtgatgaatatgttgttctatatatgattaat-attattaaatgaatattatattatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattg 11069184  T
Q  165 tttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 247  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11069183 tttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 11069099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 65 - 247
Target Start/End: Original strand, 11166503 - 11166686
Alignment:
Q  65 aagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattg 164  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11166503 aagtgatgaatatgttgttctatatatgattaat-attattaaatgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattg 11166601  T
Q  165 tttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 247  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11166602 tttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattttggtgttagta 11166686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 65 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 30064982 - 30064798
Alignment:
Q  65 aagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattg 164  Q
    ||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30064982 aagtgatgattatgttgtcctatataggattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattg 30064883  T
Q  165 tttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 247  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30064882 tttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattttggtgttagta 30064798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 65 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 55022119 - 55021936
Alignment:
Q  65 aagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattg 164  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  55022119 aagtgatgaatatgttgttctatatatgattaat-attattaaatgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattg 55022021  T
Q  165 tttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 247  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  55022020 tttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattttggtgttagta 55021936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 57 - 221
Target Start/End: Original strand, 27411044 - 27411208
Alignment:
Q  57 ttattataaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattactt 156  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27411044 ttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgataaattattattaagtaaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattactt 27411143  T
Q  157 ggtaattgtttatcaaagatgctattgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagat 221  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27411144 ggtaattgtttatcaaagatgttattgtttaagatgattatgtttaagatgtatatgttgaagat 27411208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 65 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 14498539 - 14498356
Alignment:
Q  65 aagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattg 164  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14498539 aagtgatgaatatgttgttctatatatgattaat-attgttaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattg 14498441  T
Q  165 tttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 247  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14498440 tttatcaaagatgctatgatatttaagatgatattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattttggtgttagta 14498356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 74 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 15616760 - 15616586
Alignment:
Q  74 atatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaa 173  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15616760 atatgttgttctatatatgattaat-attattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaa 15616662  T
Q  174 gatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 247  Q
    ||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  15616661 gatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttaattttggtgttagta 15616586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 57 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 15964078 - 15963913
Alignment:
Q  57 ttattataaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattactt 156  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15964078 ttattattaagtgatgaatatgttgttctatatatgattaat-attattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattactt 15963980  T
Q  157 ggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagat 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||    
T  15963979 ggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgattatgtttaagat 15963913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 57 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 15971926 - 15971761
Alignment:
Q  57 ttattataaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattactt 156  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15971926 ttattattaagtgatgaatatgttgttctatatatgattaat-attattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattactt 15971828  T
Q  157 ggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagat 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||    
T  15971827 ggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgattatgtttaagat 15971761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 57 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 15968002 - 15967837
Alignment:
Q  57 ttattataaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattactt 156  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15968002 ttattattaagtgatgaatatgttgttctatatatgactaat-attattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattactt 15967904  T
Q  157 ggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagat 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||    
T  15967903 ggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgattatgtttaagat 15967837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 102 - 207
Target Start/End: Original strand, 14159826 - 14159933
Alignment:
Q  102 tattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  |||    
T  14159826 tattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgt 14159925  T
Q  200 ttaagatg 207  Q
    ||||||||    
T  14159926 ttaagatg 14159933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 182 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 15963922 - 15963857
Alignment:
Q  182 tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15963922 tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 15963857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 182 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 15967846 - 15967781
Alignment:
Q  182 tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15967846 tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 15967781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 182 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 15971770 - 15971705
Alignment:
Q  182 tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15971770 tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 15971705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 116 - 176
Target Start/End: Original strand, 14067598 - 14067658
Alignment:
Q  116 tatgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagat 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14067598 tatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagat 14067658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 57 - 125
Target Start/End: Original strand, 37440504 - 37440572
Alignment:
Q  57 ttattataaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgt 125  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37440504 ttattattaagtgatgaatatgttgtactatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgt 37440572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 65 - 126
Target Start/End: Original strand, 8490047 - 8490108
Alignment:
Q  65 aagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 126  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490047 aagtgatgaatatgttgtactatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 8490108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 57 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 14664863 - 14664794
Alignment:
Q  57 ttattataaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 126  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14664863 ttattattaagtgatgattatgttgtactatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 14664794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 57 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 14668027 - 14667958
Alignment:
Q  57 ttattataaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 126  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14668027 ttattattaagtgatgattatgttgtactatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 14667958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 117 - 178
Target Start/End: Original strand, 31097889 - 31097950
Alignment:
Q  117 atgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 178  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31097889 atgttatgttattgatgatgattgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 31097950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 55 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 11853985 - 11853911
Alignment:
Q  55 tattattataaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttatt 129  Q
    ||||||||| || || |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11853985 tattattattaactggtgaatatgttgtactatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatattatt 11853911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 345 - 395
Target Start/End: Original strand, 16751895 - 16751945
Alignment:
Q  345 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 395  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16751895 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 16751945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 65 - 126
Target Start/End: Original strand, 8490154 - 8490215
Alignment:
Q  65 aagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 126  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490154 aagttatgaatatgttgtacgatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 8490215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 57 - 126
Target Start/End: Original strand, 11301277 - 11301346
Alignment:
Q  57 ttattataaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 126  Q
    ||||||| |||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11301277 ttattattaagtggcgaatatgttgtactatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 11301346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 3 - 83
Target Start/End: Original strand, 4589867 - 4589946
Alignment:
Q  3 tatgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||   |||||||||||||||    
T  4589867 tatgaatatgttgttgtgatattttcataagatgatgaatacgttgttgttata-taatataagaagatgaatatgttgtt 4589946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 12338888 - 12338828
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattata 64  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12338888 atgaatatgttgttgttatattttcataagaagatgaatatgttgttgttatattattata 12338828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 59 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 5220214 - 5220147
Alignment:
Q  59 attataaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 126  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5220214 attattaagtgatgaatatgatgtactatatatgattaattattattaagagaatattatgttatgtt 5220147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 83
Target Start/End: Original strand, 12853052 - 12853131
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    ||||||||||||||||||| || | |||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||    
T  12853052 atgaatatgttgttgttatattattataaaatgatgaatatgttgttgttatattactattaaatgatgaatatgttgtt 12853131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 96
Target Start/End: Original strand, 18440565 - 18440652
Alignment:
Q  9 tatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgttccatatatgatta 96  Q
    |||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||   ||||||||||    
T  18440565 tatgttgttgttatattattataagatgatgaatatgttgttgttatattattataagatgatgaataagttgttgtttatatgatta 18440652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 96
Target Start/End: Original strand, 19485639 - 19485726
Alignment:
Q  9 tatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgttccatatatgatta 96  Q
    |||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||   ||||||||||    
T  19485639 tatgttgttgttatattattataagatgatgaatatgttgttgttatattattataagatgatgaataagttgttgtttatatgatta 19485726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 5 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 12338920 - 12338842
Alignment:
Q  5 tgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||   |||||||||||||||    
T  12338920 tgaatatgttgttgttatattttcataagaagatgaatatgttgttgttatattttcataagaagatgaatatgttgtt 12338842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 344 - 394
Target Start/End: Original strand, 12853356 - 12853406
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12853356 gatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 12853406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 9 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 14664799 - 14664725
Alignment:
Q  9 tatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||   |||||||||||||||    
T  14664799 tatgttgttgttatatttttataagatgatgaatacgtttttgttatattaatataagaagatgaatatgttgtt 14664725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 9 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 14667963 - 14667889
Alignment:
Q  9 tatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||    
T  14667963 tatgttgttgttatatttttataagatgatgaatatgttgttgttatattaatataagaagatgaatatgttgtt 14667889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 344 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 16795589 - 16795539
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16795589 gatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 16795539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 117 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 7574766 - 7574705
Alignment:
Q  117 atgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 178  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7574766 atgttatgttattgatgatgattgaaagctgtgattacttgataattgtttatcaaagatgc 7574705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 345 - 394
Target Start/End: Original strand, 10834935 - 10834984
Alignment:
Q  345 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10834935 atgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 10834984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 346 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 14670110 - 14670062
Alignment:
Q  346 tgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14670110 tgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 14670062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 343 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 19774285 - 19774233
Alignment:
Q  343 agatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 395  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19774285 agatgatgattacatgatattgtctgtgagttgttaaatgtacttgatgatgt 19774233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 80
Target Start/End: Original strand, 18440487 - 18440558
Alignment:
Q  9 tatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgtt 80  Q
    |||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  18440487 tatgttgttgttatattattataagatgatgaatatgttgttgctatattattataagatgatgaatatgtt 18440558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 80
Target Start/End: Original strand, 19485561 - 19485632
Alignment:
Q  9 tatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgtt 80  Q
    |||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  19485561 tatgttgttgttatattattataagatgatgaatatgttgttgctatattattataagatgatgaatatgtt 19485632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 29 - 96
Target Start/End: Original strand, 49390330 - 49390397
Alignment:
Q  29 ataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgttccatatatgatta 96  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||   ||||||||||    
T  49390330 ataagatgatgaatatgttgttgttatattattataagatgatgaatatgttgttgtctatatgatta 49390397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 394
Target Start/End: Original strand, 4590153 - 4590203
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4590153 gatgatgattacatgatgttatctaggagttgttaaatgtacttgatgatg 4590203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 13435904 - 13435854
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13435904 gatgatgattacatgatgttatatatgagttgttaaatgtacttgatgatg 13435854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 394
Target Start/End: Original strand, 18933348 - 18933398
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18933348 gatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaagtgtacttgatgatg 18933398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 24513401 - 24513307
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttg-ttatgttttcataagatgatgaatacgttgttg-ttatattattataaagtgatgaatatgttgttccatatatgatta 96  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  24513401 atgaatatgttgttgcttatgttattataagatgatgaatatgttgtttcttatgttattataagatgatgaatatgttgttctttatatgatta 24513307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 30064471 - 30064421
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30064471 gatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaagtgtacttgatgatg 30064421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 117 - 178
Target Start/End: Original strand, 1983181 - 1983242
Alignment:
Q  117 atgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 178  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  1983181 atgttatgttattgatgatgattgaatgatgtgattacttgataattatttatcaaagatgc 1983242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 117 - 178
Target Start/End: Original strand, 7793697 - 7793757
Alignment:
Q  117 atgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 178  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  7793697 atgttatgttattgatgatgattgaatgttgtgattacttgataattg-ttatcaaagatgc 7793757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 83
Target Start/End: Original strand, 12853049 - 12853098
Alignment:
Q  34 atgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12853049 atgatgaatatgttgttgttatattattataaaatgatgaatatgttgtt 12853098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 117 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 15482433 - 15482372
Alignment:
Q  117 atgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 178  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  15482433 atgttatgttattgatgatgattgaatgctgtgattacttgataactgtttatcaaagatgc 15482372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 7108638 - 7108574
Alignment:
Q  19 ttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||   |||||||||||||||    
T  7108638 ttatattttcataagatgatgaatacgttgttgttatattaatacaagaagatgaatatgttgtt 7108574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 7112573 - 7112509
Alignment:
Q  19 ttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||   |||||||||||||||    
T  7112573 ttatattttcataagatgatgaatacgttgttgttatattaatacaagaagatgaatatgttgtt 7112509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 11069090 - 11069026
Alignment:
Q  19 ttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||   |||||||||||||||    
T  11069090 ttatattttcataagatgatgaatacgttgttgttatattaatacaagaagatgaatatgttgtt 11069026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 83
Target Start/End: Original strand, 11166695 - 11166759
Alignment:
Q  19 ttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||   |||||||||||||||    
T  11166695 ttatattttcataagatgatgaatacgttgttgttatattaatacaagaggatgaatatgttgtt 11166759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 14498347 - 14498283
Alignment:
Q  19 ttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||   |||||||||||||||    
T  14498347 ttatattttcataagatgatgaatacgttgttgttatattaatacaagaagatgaatatgttgtt 14498283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 15616577 - 15616513
Alignment:
Q  19 ttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||   |||||||||||||||    
T  15616577 ttatattttcataagatgatgaatacgttgttgttatattaatacaagaagatgaatatgttgtt 15616513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 22320606 - 22320542
Alignment:
Q  19 ttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||   |||||||||||||||    
T  22320606 ttatattttcataagatgatgaatacgttgttgttatattaatacaagaagatgaatatgttgtt 22320542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 22335661 - 22335597
Alignment:
Q  19 ttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||   |||||||||||||||    
T  22335661 ttatattttcataagatgatgaatacgttgttgttatattaatacaagaagatgaatatgttgtt 22335597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 28948784 - 28948720
Alignment:
Q  19 ttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||   |||||||||||||||    
T  28948784 ttatattttcataagatgatgaatacgttgttgttatattaatacaagaagatgaatatgttgtt 28948720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 30064789 - 30064725
Alignment:
Q  19 ttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||   |||||||||||||||    
T  30064789 ttatattttcataagatgatgaatacgttgttgttatattaatacaagaagatgaatatgttgtt 30064725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 55021927 - 55021863
Alignment:
Q  19 ttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||   |||||||||||||||    
T  55021927 ttatattttcataagatgatgaatacgttgttgttatattaatacaagaagatgaatatgttgtt 55021863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 178
Target Start/End: Original strand, 2898173 - 2898236
Alignment:
Q  115 ttatgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 178  Q
    |||||||||||||||| ||||| | ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2898173 ttatgttatgttattggtgatggttgaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgc 2898236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 5219933 - 5219882
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 395  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5219933 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 5219882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 7108324 - 7108273
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 395  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7108324 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 7108273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 7112259 - 7112208
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 395  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7112259 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 7112208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 83
Target Start/End: Original strand, 8490210 - 8490287
Alignment:
Q  9 tatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttg---ttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||||||||||||| || | |||| |||||||||| ||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8490210 tatgttgttgttatattattataaaatgatgaatatgttgttgttgttatattattataaaatgatgaatatgttgtt 8490287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 391
Target Start/End: Original strand, 8928860 - 8928907
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatg 391  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8928860 gatgatgattgcatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatg 8928907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 11068699 - 11068648
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 395  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11068699 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 11068648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 83
Target Start/End: Original strand, 11301388 - 11301447
Alignment:
Q  24 ttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||    
T  11301388 tttttataagatgatgaatacgttgttgttatattaatataagaagatgaatatgttgtt 11301447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 11853792 - 11853741
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 395  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11853792 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 11853741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 14498033 - 14497982
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 395  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14498033 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 14497982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 14670301 - 14670231
Alignment:
Q  55 tattattataaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 126  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||   | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14670301 tattattattaagtgatgattatgttgtattagatatgatta-ttattattaagtgaatattatgttatgtt 14670231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 22320215 - 22320164
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 395  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22320215 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 22320164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 22335270 - 22335219
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 395  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22335270 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 22335219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 55021462 - 55021411
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 395  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  55021462 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 55021411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 344 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 3802056 - 3802006
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3802056 gatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 3802006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 65 - 119
Target Start/End: Original strand, 4589816 - 4589870
Alignment:
Q  65 aagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatg 119  Q
    ||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4589816 aagtgatgattatgttgtcctatatatgattaattattattaagtgaatgttatg 4589870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 352 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 11912505 - 11912463
Alignment:
Q  352 ttacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11912505 ttacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 11912463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 29 - 83
Target Start/End: Original strand, 14067703 - 14067757
Alignment:
Q  29 ataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||    
T  14067703 ataagatgatgaatacgttgttgttatatttttataagatgatgaatacgttgtt 14067757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 56 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 14681822 - 14681753
Alignment:
Q  56 attattataaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 126  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||   | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14681822 attattattaagtgatgattatgttgtattagatatgatta-ttattattaagtgaatattatgttatgtt 14681753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 344 - 394
Target Start/End: Original strand, 14764788 - 14764838
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14764788 gatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 14764838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 344 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 18899539 - 18899489
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18899539 gatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 18899489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 344 - 394
Target Start/End: Original strand, 20249842 - 20249892
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20249842 gatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 20249892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 344 - 394
Target Start/End: Original strand, 29545931 - 29545981
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29545931 gatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 29545981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 344 - 394
Target Start/End: Original strand, 37440673 - 37440723
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37440673 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatg 37440723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 344 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 54519683 - 54519633
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54519683 gatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 54519633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 178
Target Start/End: Original strand, 327512 - 327572
Alignment:
Q  117 atgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 178  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  327512 atgttatgttattgatgatgattgaatgctgtgattacttgttaattg-ttatcaaagatgc 327572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 121 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 3833439 - 3833360
Alignment:
Q  121 tatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgcta--ttgtttaag-atgattatg 198  Q
    |||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  3833439 tatgttattgattatgattgaa-gctgtgattacttgataattgtttatcaaagatgctatgttgtttaagaatgattatg 3833360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 83
Target Start/End: Original strand, 14067711 - 14067787
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||   ||||| |||||   |||||||||||||||    
T  14067711 atgaatacgttgttgttatatttttataagatgatgaatacgttgttg---tattaatataagaagatgaatatgttgtt 14067787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 14670236 - 14670164
Alignment:
Q  9 tatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgt 82  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| ||| ||||    
T  14670236 tatgttgttgttatattttgataagatgatgaata-gttgttgatatattattataagatgatgattatattgt 14670164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 178
Target Start/End: Original strand, 20461847 - 20461907
Alignment:
Q  117 atgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 178  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  20461847 atgttatgttattgatgatgattgaatgctgtgattacttgataattg-ttatcaaagatgc 20461907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 22791726 - 22791677
Alignment:
Q  33 gatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgt 82  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  22791726 gatgatgaatatgttgttgttatattattattaagtgatgattatgttgt 22791677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 4 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 14667935 - 14667875
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattata 64  Q
    ||||||||||||||||||| ||   |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14667935 atgaatatgttgttgttatattaatataagaagatgaatatgttgttgttatattattata 14667875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 65 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 19774661 - 19774613
Alignment:
Q  65 aagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaat 113  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19774661 aagtgatggatatgttgtactatatatgattaattattattaagtgaat 19774613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 351 - 394
Target Start/End: Original strand, 8491732 - 8491775
Alignment:
Q  351 attacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8491732 attacatgatgttatctaggagttgttaaatgtacttgatgatg 8491775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 344 - 395
Target Start/End: Original strand, 11167086 - 11167137
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 395  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  11167086 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtttacttgatgatgt 11167137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 344 - 395
Target Start/End: Original strand, 11301658 - 11301709
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 395  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11301658 gatgatgattgcatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 11301709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 344 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 14664511 - 14664460
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 395  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14664511 gatgatgattacataatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 14664460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 344 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 14667675 - 14667624
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 395  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14667675 gatgatgattacatgatgagatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 14667624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 344 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 15616263 - 15616212
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 395  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  15616263 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgaagatgt 15616212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 16613564 - 16613438
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttg-ttatgttttcataagatgatgaatacgttgttg-ttatattattataaagtgatgaatatgttgttccatatatgatta--att 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| || ||||||| |||||||||||| |  |||||| || |||||    ||||||||||  |||    
T  16613564 atgaatatgttgttgcttatgttattataagatgatgattatgttgttgtttatattattatgagatgatgattacgttgtgttgtatatgattattatt 16613465  T
Q  100 attattaagtgaatattatgttatgtt 126  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||||    
T  16613464 attattaagtgatgattatgttgtgtt 16613438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 82
Target Start/End: Original strand, 18440593 - 18440672
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttg-ttatattattataaagtgatgaatatgttgt 82  Q
    ||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| |  |||||| ||||||||    
T  18440593 atgaatatgttgttgttatattattataagatgatgaataagttgttgtttatatgattatgagatgatgattatgttgt 18440672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 82
Target Start/End: Original strand, 19485667 - 19485746
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttg-ttatattattataaagtgatgaatatgttgt 82  Q
    ||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| |  |||||| ||||||||    
T  19485667 atgaatatgttgttgttatattattataagatgatgaataagttgttgtttatatgattatgagatgatgattatgttgt 19485746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 126
Target Start/End: Original strand, 22045689 - 22045815
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttg-ttatgttttcataagatgatgaatacgttgttg-ttatattattataaagtgatgaatatgttgttccatatatgatta--att 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| || ||||||| |||||||||||| |  |||||| || |||||    ||||||||||  |||    
T  22045689 atgaatatgttgttgcttatgttattataagatgatgattatgttgttgtttatattattatgagatgatgattacgttgtgttgtatatgattattatt 22045788  T
Q  100 attattaagtgaatattatgttatgtt 126  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||||    
T  22045789 attattaagtgatgattatgttgtgtt 22045815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 3 - 66
Target Start/End: Original strand, 27410950 - 27411013
Alignment:
Q  3 tatgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaa 66  Q
    |||||| ||||||||||||| ||   |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27410950 tatgaacatgttgttgttatattaatataagaagatgaatatgttgttgttatattattataaa 27411013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 344 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 28948547 - 28948496
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 395  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  28948547 gatgatgattacatgatgatatctataagttgttaagtgtacttgatgatgt 28948496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 344 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 9532344 - 9532294
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9532344 gatgatgattatgagatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 9532294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 96
Target Start/End: Original strand, 11914694 - 11914772
Alignment:
Q  19 ttatgttttcataagatgatgaatacgttgttg-ttatattattataaagtgatgaatatgttgttccatatatgatta 96  Q
    ||||||| | |||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  11914694 ttatgttattataagatggtgaatatgttgttgcttatgttattataagatgatgaatatgttgttctttatatgatta 11914772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 344 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 12304260 - 12304210
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12304260 gatgatgattatgagatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 12304210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 344 - 394
Target Start/End: Original strand, 14068055 - 14068105
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||||    
T  14068055 gatgatgattacatgatgttatctaggagttgctaaatgtatttgatgatg 14068105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 346 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 15463962 - 15463916
Alignment:
Q  346 tgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatga 392  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15463962 tgatgattacaggatgttatatatgagttgttaaatgtacttgatga 15463916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 352 - 394
Target Start/End: Original strand, 16840204 - 16840246
Alignment:
Q  352 ttacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16840204 ttacatgattttatctatgagttgttaaatgtatttgatgatg 16840246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 344 - 394
Target Start/End: Original strand, 17318502 - 17318552
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17318502 gatgatgaatacatgaagttatctaggagttgttaaatgtacttgatgatg 17318552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 117 - 170
Target Start/End: Original strand, 3403327 - 3403380
Alignment:
Q  117 atgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatc 170  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||    
T  3403327 atgttttgttattgatgatgattgaatgatgtgattacttgataattgtttatc 3403380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 117 - 178
Target Start/End: Original strand, 11557756 - 11557817
Alignment:
Q  117 atgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 178  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  11557756 atgttatgttattgatgatgattgaatgaagtgattacttgataactgtttaacaaagatgc 11557817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 346 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 14681632 - 14681586
Alignment:
Q  346 tgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  14681632 tgatgattacatgatgttatct--gagttgttaaatgtacttgatgatg 14681586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 9 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 14681758 - 14681686
Alignment:
Q  9 tatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgt 82  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||  |||||| ||| ||||    
T  14681758 tatgttgttgttatatttttataagatgataaata-gttgttgatatattattataagatgatgattatattgt 14681686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 344 - 393
Target Start/End: Original strand, 23372536 - 23372585
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgat 393  Q
    |||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23372536 gatgatgattatgtgatgttatttatgagttgttaaatgtacttgatgat 23372585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 121 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 38814149 - 38814070
Alignment:
Q  121 tatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgcta--ttgtttaaga-tgattatg 198  Q
    |||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||| |||||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  38814149 tatgttattgattatgattgaa-gctgtgattacttgataattggttatcaaagatgctatgttgtttaagactgattatg 38814070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 344 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 51299619 - 51299570
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgat 393  Q
    |||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  51299619 gatgatgattatgtgatgttatttatgagttgttaaatgtacttgatgat 51299570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 82
Target Start/End: Original strand, 1466099 - 1466171
Alignment:
Q  11 tgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgt-tatattattataaagtgatgaatatgttgt 82  Q
    |||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||| || ||||||||    
T  1466099 tgttgttgttatattattataagatgatgaatatgttgttgtctatatgattatgaagtgaggattatgttgt 1466171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 64
Target Start/End: Original strand, 11301401 - 11301461
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattata 64  Q
    ||||||| ||||||||||| ||   |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11301401 atgaatacgttgttgttatattaatataagaagatgaatatgttgttgttatattattata 11301461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 63
Target Start/End: Original strand, 35962387 - 35962447
Alignment:
Q  5 tgaatatgttgttg-ttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgt-tatattattat 63  Q
    |||||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  35962387 tgaatatgttgttgcttatgttattataagatggtgaatacgttgttgtgtatattattat 35962447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 52
Target Start/End: Original strand, 49390338 - 49390386
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgt 52  Q
    ||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||    
T  49390338 atgaatatgttgttgttatattattataagatgatgaatatgttgttgt 49390386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 199 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 855790 - 855751
Alignment:
Q  199 tttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatg 238  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  855790 tttaagatgcttatgttgaagatttatgatgttaattatg 855751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 45 - 96
Target Start/End: Original strand, 1466100 - 1466151
Alignment:
Q  45 gttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgttccatatatgatta 96  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||   ||||||||||    
T  1466100 gttgttgttatattattataagatgatgaatatgttgttgtctatatgatta 1466151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 199 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 16369109 - 16369070
Alignment:
Q  199 tttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatg 238  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16369109 tttaagatgcttatgttgaagatttatgatgttaattatg 16369070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 203 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 16909578 - 16909543
Alignment:
Q  203 agatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatg 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16909578 agatgtttatgttgaagatttatgatgttaattatg 16909543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 117 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 322322 - 322237
Alignment:
Q  117 atgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |  |||||||||||  | ||| ||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||    
T  322322 atgttatgttatttatgatgattgaatgaagtgattacttgacatttgattatcaaagatgcaatgatgtttaagatgtttatgtt 322237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 131
Target Start/End: Original strand, 4589991 - 4590025
Alignment:
Q  97 attattattaagtgaatattatgttatgttattga 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4589991 attattattaagtgaatattatgttatgttgttga 4590025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 345 - 395
Target Start/End: Original strand, 9708156 - 9708206
Alignment:
Q  345 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 395  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  9708156 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgt 9708206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 117 - 216
Target Start/End: Original strand, 11298925 - 11299025
Alignment:
Q  117 atgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgt 214  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||| |   ||| |||||| || ||| |||||||||||| |||  |||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  11298925 atgttatgttatttattatgattgaaagaaatgagtacttgatatttgattatcaaagatg-tatgatgtttaagatgattatattgaagatgtttatgt 11299023  T
Q  215 tg 216  Q
    ||    
T  11299024 tg 11299025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 45 - 83
Target Start/End: Original strand, 14067917 - 14067955
Alignment:
Q  45 gttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  14067917 gttgttgttatattattataaaatgatgactatgttgtt 14067955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 45 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 16795780 - 16795742
Alignment:
Q  45 gttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  16795780 gttgttgttatattattataaaatgatgaatatcttgtt 16795742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 45 - 83
Target Start/End: Original strand, 17318334 - 17318372
Alignment:
Q  45 gttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  17318334 gttgttgttatattattataaaatgacgaatatgttgtt 17318372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 45 - 83
Target Start/End: Original strand, 17318370 - 17318408
Alignment:
Q  45 gttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  17318370 gttgttgttatattattataatatgatgaatatgttgtt 17318408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 45 - 83
Target Start/End: Original strand, 18440490 - 18440528
Alignment:
Q  45 gttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  18440490 gttgttgttatattattataagatgatgaatatgttgtt 18440528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 45 - 83
Target Start/End: Original strand, 19485564 - 19485602
Alignment:
Q  45 gttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  19485564 gttgttgttatattattataagatgatgaatatgttgtt 19485602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 117 - 200
Target Start/End: Original strand, 19726289 - 19726374
Alignment:
Q  117 atgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |  ||||||||||| || ||  ||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  19726289 atgttatgttatttatgatgattgaatgaagtgattacttgatattttattatcaatgatgctatgatgtttaagatgtttatgtt 19726374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 344 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 23173384 - 23173334
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattat-ctatgagttgttaaatgtacttgatgat 393  Q
    ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  23173384 gatgatgattacatgatgttaagctatgagttgttaaatatacttgatgat 23173334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 65 - 119
Target Start/End: Original strand, 27410899 - 27410953
Alignment:
Q  65 aagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatg 119  Q
    |||||| || |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  27410899 aagtgacgagtatgttgtactatatatgattaattattattaactgaatgttatg 27410953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 351 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 41213 - 41172
Alignment:
Q  351 attacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatga 392  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41213 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatga 41172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 351 - 392
Target Start/End: Original strand, 2249216 - 2249257
Alignment:
Q  351 attacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatga 392  Q
    |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  2249216 attacatgatgttacctatgagttattaaatgtacttgatga 2249257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 351 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 5841245 - 5841204
Alignment:
Q  351 attacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatga 392  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5841245 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatga 5841204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 394
Target Start/End: Original strand, 7781858 - 7781907
Alignment:
Q  345 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  7781858 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatg 7781907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 12172526 - 12172430
Alignment:
Q  122 atgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttg 216  Q
    |||||||| |||||||| ||| |  ||||||||||  || ||  ||||||| ||||||||  | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  12172526 atgttatttatgatgattgaatggagtgattacttaatattttattatcaatgatgctatgatatttaagatgcttatgttgaagatgtttatgttg 12172430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 394
Target Start/End: Original strand, 13152325 - 13152374
Alignment:
Q  345 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  13152325 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatg 13152374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 45 - 82
Target Start/End: Original strand, 14067856 - 14067893
Alignment:
Q  45 gttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgt 82  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  14067856 gttgttgttatattattataaaatgatgactatgttgt 14067893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 15963820 - 15963767
Alignment:
Q  11 tgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattata 64  Q
    |||||||||||| || | ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15963820 tgttgttgttatattattatatgaagatgaatatgttgttgttatattattata 15963767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 15967744 - 15967691
Alignment:
Q  11 tgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattata 64  Q
    |||||||||||| || | ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15967744 tgttgttgttatattattatatgaagatgaatatgttgttgttatattattata 15967691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #162
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 15971668 - 15971615
Alignment:
Q  11 tgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattata 64  Q
    |||||||||||| || | ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15971668 tgttgttgttatattattatatgaagatgaatatgttgttgttatattattata 15971615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #163
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 351 - 392
Target Start/End: Original strand, 16326041 - 16326082
Alignment:
Q  351 attacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatga 392  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16326041 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatga 16326082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #164
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 394
Target Start/End: Original strand, 16454822 - 16454871
Alignment:
Q  345 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  16454822 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatg 16454871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #165
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 16795781 - 16795710
Alignment:
Q  11 tgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttg---ttatattattataaagtgatgaatatgt 79  Q
    |||||||||||| || | |||| ||||||||||  ||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16795781 tgttgttgttatattattataaaatgatgaatatcttgttgatgttatattattataaaatgatgaatatgt 16795710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #166
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 17462790 - 17462741
Alignment:
Q  345 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  17462790 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatg 17462741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #167
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 83
Target Start/End: Original strand, 24180668 - 24180749
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttg-ttatgttttcataagatgatgaatacgttgttg-ttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||  ||  ||||||||||||    
T  24180668 atgattatgttgttgcttatgttattataagatgatgaatatgttgttgcttatgttattataagatggggaatatgttgtt 24180749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #168
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 34158938 - 34158889
Alignment:
Q  345 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  34158938 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatg 34158889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #169
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 351 - 392
Target Start/End: Original strand, 45220962 - 45221003
Alignment:
Q  351 attacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatga 392  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  45220962 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatga 45221003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #170
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 394
Target Start/End: Original strand, 45607441 - 45607490
Alignment:
Q  345 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  45607441 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatg 45607490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #171
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 55476134 - 55476085
Alignment:
Q  345 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  55476134 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatg 55476085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #172
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 55500563 - 55500514
Alignment:
Q  345 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  55500563 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatg 55500514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #173
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 47 - 83
Target Start/End: Original strand, 1466061 - 1466097
Alignment:
Q  47 tgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  1466061 tgttgttatattattataagatgatgaatatgttgtt 1466097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #174
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 4 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 7108620 - 7108560
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattata 64  Q
    ||||||| ||||||||||| ||   | |||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7108620 atgaatacgttgttgttatattaatacaagaagatgaatatgttgttgttatattattata 7108560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #175
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 4 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 7112555 - 7112495
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattata 64  Q
    ||||||| ||||||||||| ||   | |||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7112555 atgaatacgttgttgttatattaatacaagaagatgaatatgttgttgttatattattata 7112495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #176
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 4 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 11069072 - 11069012
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattata 64  Q
    ||||||| ||||||||||| ||   | |||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11069072 atgaatacgttgttgttatattaatacaagaagatgaatatgttgttgttatattattata 11069012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #177
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 4 - 64
Target Start/End: Original strand, 11166713 - 11166773
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattata 64  Q
    ||||||| ||||||||||| ||   | |||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11166713 atgaatacgttgttgttatattaatacaagaggatgaatatgttgttgttatattattata 11166773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #178
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 344 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 12337340 - 12337291
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 395  Q
    |||||||||||||||||  |||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  12337340 gatgatgattacatgatgatat--atgagttgttaagtgtacttgatgatgt 12337291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #179
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 4 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 14664771 - 14664711
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattata 64  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||   |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14664771 atgaatacgtttttgttatattaatataagaagatgaatatgttgttgttatattattata 14664711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #180
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 31 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 14667867 - 14667819
Alignment:
Q  31 aagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgt 79  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  14667867 aagatgatgtatatgttgttgttatattattataagatgattaatatgt 14667819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #181
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 4 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 15616559 - 15616499
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattata 64  Q
    ||||||| ||||||||||| ||   | |||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15616559 atgaatacgttgttgttatattaatacaagaagatgaatatgttgttgttatattattata 15616499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #182
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 4 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 22320588 - 22320528
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattata 64  Q
    ||||||| ||||||||||| ||   | |||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22320588 atgaatacgttgttgttatattaatacaagaagatgaatatgttgttgttatattattata 22320528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #183
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 4 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 22335643 - 22335583
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattata 64  Q
    ||||||| ||||||||||| ||   | |||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22335643 atgaatacgttgttgttatattaatacaagaagatgaatatgttgttgttatattattata 22335583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #184
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 4 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 22651620 - 22651540
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgtt-atgttttcataagatgatgaatacgttgttg-ttatattattataaagtgatgaatatgttgt 82  Q
    ||||||||||||||||| || || | |||||||||||| || ||||||| |||||||||||| |  |||||| ||||||||    
T  22651620 atgaatatgttgttgtttatattattataagatgatgattatgttgttgtttatattattatgagatgatgattatgttgt 22651540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #185
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 32 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 22651625 - 22651573
Alignment:
Q  32 agatgatgaatacgttgttgtt-atattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||| |||||||||    
T  22651625 agatgatgaatatgttgttgtttatattattataagatgatgattatgttgtt 22651573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #186
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 4 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 28948766 - 28948706
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattata 64  Q
    ||||||| ||||||||||| ||   | |||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28948766 atgaatacgttgttgttatattaatacaagaagatgaatatgttgttgttatattattata 28948706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #187
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 4 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 30064771 - 30064711
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattata 64  Q
    ||||||| ||||||||||| ||   | |||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30064771 atgaatacgttgttgttatattaatacaagaagatgaatatgttgttgttatattattata 30064711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #188
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 362 - 394
Target Start/End: Original strand, 38312868 - 38312900
Alignment:
Q  362 ttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38312868 ttatctatgagtggttaaatgtacttgatgatg 38312900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #189
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 4 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 55021909 - 55021849
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattata 64  Q
    ||||||| ||||||||||| ||   | |||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  55021909 atgaatacgttgttgttatattaatacaagaagatgaatatgttgttgttatattattata 55021849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 98)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 39244863 - 39245111
Alignment:
Q  1 gctatgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaatta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39244863 gctatgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaatta 39244962  T
Q  101 ttattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctattgtttaagatgattatgtt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39244963 ttattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctattgtttaagatgattatgtt 39245062  T
Q  201 taagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagtacg 249  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39245063 taagatgtttatgttaaagatttatgatgttaattatggtgttagtacg 39245111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 39248418 - 39248666
Alignment:
Q  1 gctatgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaatta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39248418 gctatgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaatta 39248517  T
Q  101 ttattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctattgtttaagatgattatgtt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39248518 ttattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctattgtttaagatgattatgtt 39248617  T
Q  201 taagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagtacg 249  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39248618 taagatgtttatgttaaagatttatgatgttaattatggtgttagtacg 39248666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 41389311 - 41389559
Alignment:
Q  1 gctatgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaatta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41389311 gctatgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtttcatatatgattaatta 41389410  T
Q  101 ttattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctattgtttaagatgattatgtt 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41389411 ttattaagtgaatattatattatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctattgtttaagatgattatgtt 41389510  T
Q  201 taagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagtacg 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41389511 taagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagtacg 41389559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 65 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 1009854 - 1009671
Alignment:
Q  65 aagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattg 164  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1009854 aagtgatgaatatgttgttctatatatgattaat-attattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattg 1009756  T
Q  165 tttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 247  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1009755 tttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattttggtgttagta 1009671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 65 - 247
Target Start/End: Original strand, 1926128 - 1926311
Alignment:
Q  65 aagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattg 164  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1926128 aagtgatgaatatgttgttctatatatgattaat-attattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattg 1926226  T
Q  165 tttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 247  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1926227 tttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattttggtgttagta 1926311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 65 - 247
Target Start/End: Original strand, 20925142 - 20925325
Alignment:
Q  65 aagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattg 164  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20925142 aagtgatgaatatgttgttctatatatgattaat-attattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattg 20925240  T
Q  165 tttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 247  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20925241 tttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattttggtgttagta 20925325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 65 - 247
Target Start/End: Original strand, 16376379 - 16376562
Alignment:
Q  65 aagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattg 164  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  16376379 aagtgatgaatatgttgttctatatatgattaat-attattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcaaatgttgtgattacttggtaattg 16376477  T
Q  165 tttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 247  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16376478 tttatcaaagatgccatgatgtttaagatgatattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattttggtgttagta 16376562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 65 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 52634925 - 52634757
Alignment:
Q  65 aagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattg 164  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  52634925 aagtgatgaatatgttgttctatatatgattagt-attattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattg 52634827  T
Q  165 tttatcaaagatgctattgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 247  Q
    |||||||||||||||             || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  52634826 tttatcaaagatgct-------------atgatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattttggtgttagta 52634757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 57 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 33796716 - 33796553
Alignment:
Q  57 ttattataaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattatta---agtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgatta 153  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  33796716 ttattattaagtgatgaatatgttgttctatatatgattaattattattattaagtgaatattatgttatgttattgaagatgatcgaatgttgtgatta 33796617  T
Q  154 cttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgtt 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||  ||||||||||| |||||||    
T  33796616 cttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagataatactgtttaagatgattatgtt 33796553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 182 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 33796556 - 33796491
Alignment:
Q  182 tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 247  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33796556 tgtttaaggtgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 33796491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 3 - 83
Target Start/End: Original strand, 20229925 - 20230005
Alignment:
Q  3 tatgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||    
T  20229925 tatgaatatgttattgttatattttcataagatgatgaatacgttgttgttatattaatataagaagatgaatatgttgtt 20230005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 342 - 395
Target Start/End: Original strand, 39245161 - 39245214
Alignment:
Q  342 aagatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39245161 aagatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 39245214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 342 - 395
Target Start/End: Original strand, 39248716 - 39248769
Alignment:
Q  342 aagatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39248716 aagatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 39248769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 343 - 395
Target Start/End: Original strand, 41389656 - 41389708
Alignment:
Q  343 agatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 395  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41389656 agatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 41389708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 83
Target Start/End: Original strand, 35982317 - 35982396
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  35982317 atgattatgttgttgttatattattataagatgatgaatatgttgttgttatattattataagatgatgaatatgttgtt 35982396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 344 - 394
Target Start/End: Original strand, 41801271 - 41801321
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41801271 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 41801321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 65 - 113
Target Start/End: Original strand, 41389262 - 41389310
Alignment:
Q  65 aagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaat 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41389262 aagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaat 41389310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 20315678 - 20315603
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgt 79  Q
    ||||||||||||||||||| || | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  20315678 atgaatatgttgttgttatattatgatgagatgatgaatatgttgttgttatattattataagatgatgaatatgt 20315603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 344 - 394
Target Start/End: Original strand, 22132091 - 22132141
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22132091 gatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 22132141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 117 - 178
Target Start/End: Original strand, 3705436 - 3705497
Alignment:
Q  117 atgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 178  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3705436 atgttatgttattgatgatgattgaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgc 3705497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 21406607 - 21406543
Alignment:
Q  19 ttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||    
T  21406607 ttatattttcataagatgatgaatacgttgttgttatattaatataagaagatgaatatgttgtt 21406543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 83
Target Start/End: Original strand, 22131826 - 22131898
Alignment:
Q  11 tgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||||||||||| || | |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22131826 tgttgttgttatattattataaaatgatgaacatgttgttgttatattattataaaatgatgaatatgttgtt 22131898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 33796356 - 33796281
Alignment:
Q  7 aatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||    
T  33796356 aatatgtcgttgttatatttt-ataagatgatgaatacgttgttgttatattaatataagaagatgaatatgttgtt 33796281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 33796482 - 33796418
Alignment:
Q  19 ttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33796482 ttatatttttataagatgatgtatatgttgttgttatattattataaaatgatgaatatgttgtt 33796418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 79
Target Start/End: Original strand, 20229959 - 20230034
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgt 79  Q
    ||||||| ||||||||||| ||   |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20229959 atgaatacgttgttgttatattaatataagaagatgaatatgttgttgttatattattataaaatgatgaatatgt 20230034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 96
Target Start/End: Original strand, 28195093 - 28195176
Alignment:
Q  13 ttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgttccatatatgatta 96  Q
    |||||||||| || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||   ||||||||||    
T  28195093 ttgttgttatattattataagatgatgaatatgttgttgttatattattataagatgatgaataagttgttgtttatatgatta 28195176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 76
Target Start/End: Original strand, 41801075 - 41801142
Alignment:
Q  9 tatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaata 76  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  41801075 tatgttgttgttatatttttataagatgatgaatatgttgttgttatatttttataagatgatgaata 41801142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 119
Target Start/End: Original strand, 20229874 - 20229928
Alignment:
Q  65 aagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatg 119  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20229874 aagtgatgaatatgttgtactatatatgattaattattattaagtgaatgttatg 20229928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 394
Target Start/End: Original strand, 20230131 - 20230181
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20230131 gatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaagtgtacttgatgatg 20230181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 21406339 - 21406289
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21406339 gatgatgattacatgatgttatctaggagttgttaaatgtacttgatgatg 21406289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 82
Target Start/End: Original strand, 41801103 - 41801180
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgt 82  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| ||| ||||    
T  41801103 atgaatatgttgttgttatatttttataagatgatgaata-gttgttgatatattattataagatgatgattatattgt 41801180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 20315895 - 20315823
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgt 79  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||   |||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  20315895 atgaatatgttgttgttatattttgatgagatgatgaata---tgttgttatattattataagatgatgaatatgt 20315823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 79
Target Start/End: Original strand, 21740466 - 21740531
Alignment:
Q  14 tgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgt 79  Q
    ||||||||| || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  21740466 tgttgttatattatgatgagatgatgaatacgttgttgttatattattataagatgatgaatatgt 21740531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 117 - 178
Target Start/End: Original strand, 36819644 - 36819705
Alignment:
Q  117 atgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 178  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36819644 atgttatgttatagatgatgattgaatgctgtgattacttgataattgtttatcaaagatgc 36819705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 1009662 - 1009598
Alignment:
Q  19 ttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||   |||||||||||||||    
T  1009662 ttatattttcataagatgatgaatacgttgttgttatattaatacaagaagatgaatatgttgtt 1009598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 83
Target Start/End: Original strand, 1926320 - 1926384
Alignment:
Q  19 ttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||   |||||||||||||||    
T  1926320 ttatattttcataagatgatgaatacgttgttgttatattaatacaagaagatgaatatgttgtt 1926384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 83
Target Start/End: Original strand, 16376571 - 16376635
Alignment:
Q  19 ttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||   |||||||||||||||    
T  16376571 ttatattttcataagatgatgaatacgttgttgttatattaatacaagaagatgaatatgttgtt 16376635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 83
Target Start/End: Original strand, 20925334 - 20925398
Alignment:
Q  19 ttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||   |||||||||||||||    
T  20925334 ttatattttcataagatgatgaatacgttgttgttatattaatacaagaagatgaatatgttgtt 20925398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 52634748 - 52634684
Alignment:
Q  19 ttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||   |||||||||||||||    
T  52634748 ttatattttcataagatgatgaatacgttgttgttatattaatacaagaagatgaatatgttgtt 52634684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 1009348 - 1009297
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 395  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1009348 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 1009297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 395
Target Start/End: Original strand, 1926788 - 1926839
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 395  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1926788 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 1926839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 395
Target Start/End: Original strand, 16376808 - 16376859
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 395  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16376808 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 16376859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 395
Target Start/End: Original strand, 20925802 - 20925853
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 395  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20925802 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 20925853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 33796119 - 33796068
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 395  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33796119 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 33796068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 126
Target Start/End: Original strand, 41801010 - 41801080
Alignment:
Q  55 tattattataaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 126  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||   | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41801010 tattattattaagtgatgattatgttgtattagatatgatta-ttattattaagtgaatattatgttatgtt 41801080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 52634354 - 52634303
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 395  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  52634354 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 52634303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 344 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 16371011 - 16370961
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16371011 gatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 16370961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 12271132 - 12271051
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttg-ttatgttttcataagatgatgaatacgttgttg-ttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  12271132 atgattatgttgttgcttatgttattataagatgattaatatgttgttgcttatattattataagatgatgaatatgttgtt 12271051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 178
Target Start/End: Original strand, 18394334 - 18394395
Alignment:
Q  117 atgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 178  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  18394334 atgttatgttattgatgatgattgaatgatgtgattaattgatgattgtttatcaaagatgc 18394395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 21172771 - 21172711
Alignment:
Q  117 atgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 178  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  21172771 atgttatgttattgatgatgattgaatgctgtgattacttgataattg-ttatcaaagatgc 21172711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 21312887 - 21312827
Alignment:
Q  117 atgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 178  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  21312887 atgttatgttattgatgatgattgaatgttgggattacttgataattg-ttatcaaagatgc 21312827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 22357296 - 22357215
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttg-ttatgttttcataagatgatgaatacgttgttg-ttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  22357296 atgattatgttgttgcttatgttattataagatgatgaatatgttgttgcttattttattataagatgatgaatatgttgtt 22357215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 22358982 - 22358901
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttg-ttatgttttcataagatgatgaatacgttgttg-ttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  22358982 atgattatgttgttgcttatgttattataagatgatgaatatgttgttgcttattttattataagatgatgaatatgttgtt 22358901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 79
Target Start/End: Original strand, 41306224 - 41306289
Alignment:
Q  14 tgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgt 79  Q
    ||||||||| || | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  41306224 tgttgttatattatgatgagatgatgaatatgttgttgttatattattataagatgatgaatatgt 41306289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 4 - 83
Target Start/End: Original strand, 22131852 - 22131934
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttg---ttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    ||||| ||||||||||||| || | |||| |||||||||| ||||   |||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  22131852 atgaacatgttgttgttatattattataaaatgatgaatatgttgttgttgttatattattataaaatggtgaatatgttgtt 22131934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 65 - 113
Target Start/End: Original strand, 39244814 - 39244862
Alignment:
Q  65 aagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaat 113  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39244814 aagtgatggatatgttgtactatatatgattaattattattaagtgaat 39244862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 65 - 113
Target Start/End: Original strand, 39248369 - 39248417
Alignment:
Q  65 aagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaat 113  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39248369 aagtgatggatatgttgtactatatatgattaattattattaagtgaat 39248417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 21406589 - 21406469
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgttccatatatgatta--attat 101  Q
    ||||||| ||||||||||| ||   |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||   ||| | | ||| |||   |||||| ||||  |||||    
T  21406589 atgaatacgttgttgttatattaatataagaagatgaatatgttgttgttatattattatattatgacg-agatgatgt---atatataattattattat 21406494  T
Q  102 tattaagtgaatattatgttatgtt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  21406493 tattaagtgaatattatgttatgtt 21406469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 83
Target Start/End: Original strand, 21740359 - 21740437
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    ||||||||||||||||||| || | |||||||||| |||| | |||||||||||||| || |  ||||||||||||||||    
T  21740359 atgaatatgttgttgttatattattataagatgataaatatg-tgttgttatattatgatgagatgatgaatatgttgtt 21740437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 121
Target Start/End: Original strand, 21740489 - 21740606
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgtt-atattattataaagtgatgaatatgtt-gttccatatatgattaattat 101  Q
    ||||||| ||||||||||| || | ||||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||    |||||||||| ||||    
T  21740489 atgaatacgttgttgttatattattataagatgatgaatatgt-gttgtttatattattattaagtgatgattatgtttgtgttgtatatgatta-ttat 21740586  T
Q  102 tattaagtgaatattatgtt 121  Q
    ||||||||||  ||||||||    
T  21740587 tattaagtgatgattatgtt 21740606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 238
Target Start/End: Original strand, 22831790 - 22831829
Alignment:
Q  199 tttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatg 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22831790 tttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttaattatg 22831829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 83
Target Start/End: Original strand, 41306247 - 41306325
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    ||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| | |||||||||||||| || |  |||| |||||||||||    
T  41306247 atgaatatgttgttgttatattattataagatgatgaatatg-tgttgttatattatgatgagatgattaatatgttgtt 41306325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 45 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 21406471 - 21406433
Alignment:
Q  45 gttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21406471 gttgttgttatattattataaaatgatgaatatgttgtt 21406433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 121
Target Start/End: Original strand, 41306345 - 41306460
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgtt-atattattataaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattatt 102  Q
    |||||||||| |||||| | || | ||||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||    ||||||||| ||||||    
T  41306345 atgaatatgt-gttgttgtattattataagatgatgaatatgt-gttgtttatattattattaagtgatgattatgttgtgttgtatatgatt-attatt 41306441  T
Q  103 attaagtgaatattatgtt 121  Q
    |||||||||  ||||||||    
T  41306442 attaagtgatgattatgtt 41306460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 351 - 392
Target Start/End: Original strand, 11809949 - 11809990
Alignment:
Q  351 attacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatga 392  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11809949 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgatga 11809990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 12271095 - 12271038
Alignment:
Q  7 aatatgttgttg-ttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattat 63  Q
    |||||||||||| |||| || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12271095 aatatgttgttgcttatattattataagatgatgaatatgttgttgttatattattat 12271038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 14 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 20315855 - 20315791
Alignment:
Q  14 tgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgt 79  Q
    ||||||||| || | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  20315855 tgttgttatattattataagatgatgaatatgt-gttgttatattattataagatgatgaatatgt 20315791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 14 - 79
Target Start/End: Original strand, 21740401 - 21740466
Alignment:
Q  14 tgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgt 79  Q
    ||||||||| || | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  21740401 tgttgttatattatgatgagatgatgaatatgttgttgttatattattataagatgataaatatgt 21740466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 83
Target Start/End: Original strand, 22131790 - 22131865
Alignment:
Q  11 tgttgttgttatgttttcataagatgatgaata---cgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||||||||||| || | |||| ||||||||||    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  22131790 tgttgttgttatattattataaaatgatgaatatattgttgttgttatattattataaaatgatgaacatgttgtt 22131865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 4 - 53
Target Start/End: Original strand, 28195117 - 28195166
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgtt 53  Q
    ||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||||||    
T  28195117 atgaatatgttgttgttatattattataagatgatgaataagttgttgtt 28195166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 4 - 53
Target Start/End: Original strand, 35982350 - 35982399
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgtt 53  Q
    ||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||||||    
T  35982350 atgaatatgttgttgttatattattataagatgatgaatatgttgttgtt 35982399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 147 - 216
Target Start/End: Original strand, 3473339 - 3473409
Alignment:
Q  147 gtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttg 216  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  3473339 gtgattacttgatatttgattatcaaagatgcaatgatgtttaagatgatt-tgttgaagatgtttatgttg 3473409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 126
Target Start/End: Original strand, 13883260 - 13883383
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttg-ttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgtt-atattattataaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattat 101  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| |  ||||||||| || ||||||| |  |||||| ||||||||    |||||||||| ||||    
T  13883260 atgaatatgttgttgcttatgttattataagatgatgattttgttgttgtttatgttattatgagatgatgattatgttgtgttgtatatgatta-ttat 13883358  T
Q  102 tattaagtgaatattatgttatgtt 126  Q
    ||||||||||  |||||||| ||||    
T  13883359 tattaagtgatgattatgttgtgtt 13883383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 33796327 - 33796267
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattata 64  Q
    ||||||| ||||||||||| ||   |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33796327 atgaatacgttgttgttatattaatataagaagatgaatatgttgttgttatattattata 33796267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 33796460 - 33796382
Alignment:
Q  8 atatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgtt---atattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    ||||||||||||||| || | |||| |||||||||| |||||||||   |||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  33796460 atatgttgttgttatattattataaaatgatgaatatgttgttgttgttatattattataaaacgatgattatgttgtt 33796382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 83
Target Start/End: Original strand, 35982315 - 35982363
Alignment:
Q  35 tgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  35982315 tgatgattatgttgttgttatattattataagatgatgaatatgttgtt 35982363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 146 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 46975231 - 46975176
Alignment:
Q  146 tgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgcta--ttgtttaaga-tgattatg 198  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  46975231 tgtgattacttgataattgtttatcaaagatgctatgttgtttaagactgattatg 46975176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 4 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 20315645 - 20315567
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    ||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| || ||| ||||||||  || |  ||||||||||||||||    
T  20315645 atgaatatgttgttgttatattattataagatgatgaatatgt-gttcttatattacgatgagatgatgaatatgttgtt 20315567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 32 - 79
Target Start/End: Original strand, 21740354 - 21740401
Alignment:
Q  32 agatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgt 79  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  21740354 agatgatgaatatgttgttgttatattattataagatgataaatatgt 21740401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 4 - 83
Target Start/End: Original strand, 21740424 - 21740502
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    ||||||||||||||||||| || | |||||||||| |||| | |||||||||||||| || |  ||||||||| ||||||    
T  21740424 atgaatatgttgttgttatattattataagatgataaatatg-tgttgttatattatgatgagatgatgaatacgttgtt 21740502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 11 - 82
Target Start/End: Original strand, 22131895 - 22131966
Alignment:
Q  11 tgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgt 82  Q
    |||||||||||| || | |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||    
T  22131895 tgttgttgttatattattataaaatggtgaatatgttgttgttatattattataagatgatgtttatgttgt 22131966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 4 - 79
Target Start/End: Original strand, 41306280 - 41306354
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgt 79  Q
    |||||||||| |||||||| || | || ||||||| |||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  41306280 atgaatatgt-gttgttatattatgatgagatgattaatatgttgttgttatactattataagatgatgaatatgt 41306354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 117 - 200
Target Start/End: Original strand, 18182512 - 18182597
Alignment:
Q  117 atgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |  ||||||||||| || ||  ||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  18182512 atgttatgttatttatgatgattgaatgaagtgattacttgatattttattatcaatgatgctatgatgtttaagatgtttatgtt 18182597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 32 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 20315585 - 20315539
Alignment:
Q  32 agatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatg 78  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  20315585 agatgatgaatatgttgttgttatattattttaagatgatgaatatg 20315539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 13988522 - 13988473
Alignment:
Q  345 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  13988522 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatg 13988473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 394
Target Start/End: Original strand, 21475629 - 21475678
Alignment:
Q  345 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  21475629 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatg 21475678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 394
Target Start/End: Original strand, 21923841 - 21923890
Alignment:
Q  345 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  21923841 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatg 21923890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 22357262 - 22357181
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttg-ttatgttttcataagatgatgaatacgttgttg-ttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    ||||||||||||||| |||| || | ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||  || ||| |||||||||    
T  22357262 atgaatatgttgttgcttattttattataagatgatgaatatgttgttgcttatgttattataagatggtgattatgttgtt 22357181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 22358948 - 22358867
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttg-ttatgttttcataagatgatgaatacgttgttg-ttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    ||||||||||||||| |||| || | ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||  || ||| |||||||||    
T  22358948 atgaatatgttgttgcttattttattataagatgatgaatatgttgttgcttatgttattataagatggtgattatgttgtt 22358867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 394
Target Start/End: Original strand, 23594277 - 23594326
Alignment:
Q  345 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  23594277 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatg 23594326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 199 - 236
Target Start/End: Original strand, 42865679 - 42865716
Alignment:
Q  199 tttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgatta 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  42865679 tttaagatgtttatgttgaagatttatgttgttaatta 42865716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 4 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 1009644 - 1009584
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattata 64  Q
    ||||||| ||||||||||| ||   | |||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1009644 atgaatacgttgttgttatattaatacaagaagatgaatatgttgttgttatattattata 1009584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 4 - 64
Target Start/End: Original strand, 1926338 - 1926398
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattata 64  Q
    ||||||| ||||||||||| ||   | |||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1926338 atgaatacgttgttgttatattaatacaagaagatgaatatgttgttgttatattattata 1926398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 4 - 64
Target Start/End: Original strand, 16376589 - 16376649
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattata 64  Q
    ||||||| ||||||||||| ||   | |||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16376589 atgaatacgttgttgttatattaatacaagaagatgaatatgttgttgttatattattata 16376649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 4 - 64
Target Start/End: Original strand, 20925352 - 20925412
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattata 64  Q
    ||||||| ||||||||||| ||   | |||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20925352 atgaatacgttgttgttatattaatacaagaagatgaatatgttgttgttatattattata 20925412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 196 - 236
Target Start/End: Original strand, 22469164 - 22469204
Alignment:
Q  196 atgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgatta 236  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  22469164 atgtttacgatgtttatgttgaagatttatgttgttaatta 22469204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 357 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 32649140 - 32649104
Alignment:
Q  357 tgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgat 393  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32649140 tgatgttatttatgagttgttaaatgtacttgatgat 32649104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 4 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 52634730 - 52634670
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattata 64  Q
    ||||||| ||||||||||| ||   | |||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  52634730 atgaatacgttgttgttatattaatacaagaagatgaatatgttgttgttatattattata 52634670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 238; Significance: 1e-131; HSPs: 166)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 18424665 - 18424416
Alignment:
Q  1 gctatgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaatta 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18424665 gctatgaatatgttgttgctatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaatta 18424566  T
Q  101 ttattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatc-aaagatgctattgtttaagatgattatgt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18424565 ttattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaaagatgctattgtttaagatgattatgt 18424466  T
Q  200 ttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagtacg 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18424465 ttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagtacg 18424416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 65 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 32240 - 32057
Alignment:
Q  65 aagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattg 164  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32240 aagtgatgaatatgttgttctatatatgattaat-attattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattg 32142  T
Q  165 tttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 247  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32141 tttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattttggtgttagta 32057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 65 - 247
Target Start/End: Original strand, 12705642 - 12705825
Alignment:
Q  65 aagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattg 164  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12705642 aagttatgaatatgttgttctatatatgattaat-attattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattg 12705740  T
Q  165 tttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 247  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12705741 tttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattttggtgttagta 12705825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 65 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 12714055 - 12713872
Alignment:
Q  65 aagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattg 164  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  12714055 aagtgatgaatatgttgttctatatatgattaat-attattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattg 12713957  T
Q  165 tttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 247  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12713956 tttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattttggtgttagta 12713872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 65 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 18278574 - 18278391
Alignment:
Q  65 aagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattg 164  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  18278574 aagtgatgaatatgttgttctatatatgattaat-attattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaattttgtgattacttggtaattg 18278476  T
Q  165 tttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 247  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18278475 tttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattttggtgttagta 18278391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 65 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 18282537 - 18282354
Alignment:
Q  65 aagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattg 164  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  18282537 aagtgatgaatatgttgttctatatatgattaat-attattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaattttgtgattacttggtaattg 18282439  T
Q  165 tttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 247  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18282438 tttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattttggtgttagta 18282354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 65 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 12717879 - 12717696
Alignment:
Q  65 aagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattg 164  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12717879 aagtgatgaatatgttgttctatatatgattaat-attgttaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattg 12717781  T
Q  165 tttatcaaagatgcta--ttgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 247  Q
    ||||||||||||||||   ||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12717780 tttatcaaagatgctaggatgtttaaaatgatattgtttaacatgtttatgttgaagatttatgatgttgattttggtgttagta 12717696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 65 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 12722790 - 12722607
Alignment:
Q  65 aagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattg 164  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12722790 aagtgatgaatatgttgttctatatatgattaat-attgttaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattg 12722692  T
Q  165 tttatcaaagatgcta--ttgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 247  Q
    ||||||||||||||||   ||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12722691 tttatcaaagatgctaggatgtttaaaatgatattgtttaacatgtttatgttgaagatttatgatgttgattttggtgttagta 12722607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 65 - 247
Target Start/End: Original strand, 71782 - 71980
Alignment:
Q  65 aagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattg 164  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  71782 aagtgatgaatatgttgttctatatatgattaat-attattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattg 71880  T
Q  165 tttatcaaagatgc-----------------tattgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 247  Q
    ||||||||||||||                 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  71881 tttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattttggtgttagta 71980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 65 - 247
Target Start/End: Original strand, 75891 - 76089
Alignment:
Q  65 aagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattg 164  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  75891 aagtgatgaatatgttgttctatatatgattaat-attattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattg 75989  T
Q  165 tttatcaaagatgc-----------------tattgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 247  Q
    ||||||||||||||                 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  75990 tttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattttggtgttagta 76089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 57 - 221
Target Start/End: Original strand, 45170998 - 45171163
Alignment:
Q  57 ttattataaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattactt 156  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45170998 ttattattaagtgatgaatatgttgttctatatatgattaat-attattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattactt 45171096  T
Q  157 ggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagat 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||    
T  45171097 ggtaattgtttatcaaagatgctatgatttttaagatgatattgtttaagatgattatgtttaagat 45171163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 18424778 - 18424666
Alignment:
Q  1 gctatgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaatta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  18424778 gctatgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtactatatatgattaatta 18424679  T
Q  101 ttattaagtgaat 113  Q
    |||||||||||||    
T  18424678 ttattaagtgaat 18424666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 182 - 247
Target Start/End: Original strand, 45171154 - 45171219
Alignment:
Q  182 tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45171154 tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 45171219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 57 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 39721451 - 39721383
Alignment:
Q  57 ttattataaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgt 125  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39721451 ttattattaagtgatgaatatgttgtactatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgt 39721383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 4 - 83
Target Start/End: Original strand, 2833185 - 2833263
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  2833185 atgaatatgttgttgttatatttt-ataagatgatgaatacgttgttgttatattattataagaagatgaatatgttgtt 2833263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 340 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 18424325 - 18424270
Alignment:
Q  340 ggaagatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18424325 ggaagatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 18424270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 57 - 126
Target Start/End: Original strand, 2833093 - 2833162
Alignment:
Q  57 ttattataaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 126  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2833093 ttattattaagtgatgattatgttgtactatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 2833162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 3 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 26291444 - 26291364
Alignment:
Q  3 tatgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    ||||||||||||||    
T  26291444 tatgaatatgttattgttatattttcataagatgatgaatacgttgttgttatattaatataagaaaatgaatatgttgtt 26291364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 83
Target Start/End: Original strand, 9390354 - 9390433
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    ||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  9390354 atgaatatgttgttgttatattattataagatgatgaatatgatgttgttatattattataagatgatgaatatgttgtt 9390433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 60 - 126
Target Start/End: Original strand, 2530979 - 2531045
Alignment:
Q  60 ttataaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 126  Q
    |||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2530979 ttattaagtgatgaatatgttgtactatatatgattaattattattaagagaatattatgttatgtt 2531045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 9 - 83
Target Start/End: Original strand, 25928178 - 25928252
Alignment:
Q  9 tatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  25928178 tatgttgttgttatatttttataagatgatgaatatgttgttgttatatttttataagatgatgaatatgttgtt 25928252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 57 - 126
Target Start/End: Original strand, 7519933 - 7520002
Alignment:
Q  57 ttattataaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 126  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  7519933 ttattattaagtgatgaatatgttgtactatatatgattaattaatattaagggaatattatgttatgtt 7520002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 68 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 15083470 - 15083413
Alignment:
Q  68 tgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgt 125  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15083470 tgatgaatatgttgtactatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgt 15083413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 182 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 16582905 - 16582849
Alignment:
Q  182 tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatg 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  16582905 tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgtttaagatttaagatgttgattatg 16582849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 83
Target Start/End: Original strand, 6170770 - 6170849
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    ||||||||||||||||||| || | |||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  6170770 atgaatatgttgttgttatattattataagatgatcaatatgttgttgtcatattattataagatgatgaatatgttgtt 6170849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 16582800 - 16582721
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||| |||||||||||||| |||  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  16582800 atgagtatgttgttgttatatttctataagatggtgaatatgttgttgttatattattataaaatgatgagtatgttgtt 16582721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 9 - 83
Target Start/End: Original strand, 2531040 - 2531114
Alignment:
Q  9 tatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||   |||||| ||||||||    
T  2531040 tatgttgttgttatattttcataagatgatgattacgttgttgttatattaatataagaagatgaacatgttgtt 2531114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 9 - 83
Target Start/End: Original strand, 6170742 - 6170816
Alignment:
Q  9 tatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  6170742 tatgttgttgttatattattataagatgatgaatatgttgttgttatattattataagatgatcaatatgttgtt 6170816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 344 - 394
Target Start/End: Original strand, 7520208 - 7520258
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7520208 gatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 7520258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 344 - 394
Target Start/End: Original strand, 10607313 - 10607363
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10607313 gatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 10607363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 344 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 11660368 - 11660318
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11660368 gatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 11660318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 344 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 13891716 - 13891666
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13891716 gatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 13891666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 344 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 20486828 - 20486778
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20486828 gatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 20486778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 344 - 394
Target Start/End: Original strand, 39268306 - 39268356
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39268306 gatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 39268356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 29 - 82
Target Start/End: Original strand, 10607143 - 10607196
Alignment:
Q  29 ataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgt 82  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10607143 ataagatgatgaatatgttgttgttatattattataaaatgatgaatatgttgt 10607196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 117 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 12317895 - 12317834
Alignment:
Q  117 atgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 178  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12317895 atgttatgttattgatgatgattgaatgctgtgattacttgataattgtttatcaaagatgc 12317834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 346 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 13892097 - 13892049
Alignment:
Q  346 tgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13892097 tgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 13892049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 111
Target Start/End: Original strand, 14270759 - 14270865
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgtt-atattattataaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattatt 102  Q
    ||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||    ||||||||| ||||||    
T  14270759 atgaatatgttgttgttatattattataagatgatgaatatgt-gttgtttatattattattaagtgatgattatgttgtgttgtatatgatt-attatt 14270856  T
Q  103 attaagtga 111  Q
    |||||||||    
T  14270857 attaagtga 14270865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 117 - 176
Target Start/End: Original strand, 15605609 - 15605668
Alignment:
Q  117 atgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagat 176  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15605609 atgttatgttattgatgatgattgaatgctgtgattacttgataattgtttatcaaagat 15605668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 16582734 - 16582659
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgt 79  Q
    |||| |||||||||||||| |||  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  16582734 atgagtatgttgttgttatatttctataagatggtgaatatgttgttgttatattattataagatgatgaatatgt 16582659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 18278332 - 18278254
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||   |||||||||||||||    
T  18278332 atgaatacgttgttgttatatttt-ataagatgatgaatacattgttgttatattaatataagaagatgaatatgttgtt 18278254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 18282295 - 18282217
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||   |||||||||||||||    
T  18282295 atgaatacgttgttgttatatttt-ataagatgatgaatacattgttgttatattaatataagaagatgaatatgttgtt 18282217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 83
Target Start/End: Original strand, 2833157 - 2833230
Alignment:
Q  9 tatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||    
T  2833157 tatgttgttgttatatttttataagatgatgaatatgttgttgttatatt-ttataagatgatgaatacgttgtt 2833230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 8939755 - 8939661
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttg-ttatgttttcataagatgatgaatacgttgttg-ttatattattataaagtgatgaatatgttgttccatatatgatta 96  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  8939755 atgaatatgttgttgcttatgttattataagatgatgaatatgttgtttcttatgttattataagatgatgaatatgttgttctttatatgatta 8939661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 16582507 - 16582457
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16582507 gatgatgattacatgatgttatttatgagttgttaaatgtacttgatgatg 16582457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 18301437 - 18301387
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18301437 gatgatgattacatgatgttatctaggagttgttaaatgtacttgatgatg 18301387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 20486976 - 20486903
Alignment:
Q  9 tatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  20486976 tatgttgttgttatatttttataagatgatgaatatgttgttg-tatatttttataagatgatgaatatgttgtt 20486903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 394
Target Start/End: Original strand, 25928364 - 25928414
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25928364 gatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtactttatgatg 25928414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 26291243 - 26291193
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26291243 gatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaagtgtacttgatgatg 26291193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 96
Target Start/End: Original strand, 6170806 - 6170895
Alignment:
Q  7 aatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgttccatatatgatta 96  Q
    ||||||||||||| || || | ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||   ||||||||||    
T  6170806 aatatgttgttgtcatattattataagatgatgaatatgttgttgtcatattattataagatgatgaacatgttgttgtttatatgatta 6170895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 8467900 - 8467777
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgttccatatatgatta--attat 101  Q
    ||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||  |||||| |||||| |    ||||||||||  |||||    
T  8467900 atgaatatgttgttgttatattattataagatgatgaatatg-tgttgttgtattattataagatgatgactatgttatgttgtatatgattattattat 8467802  T
Q  102 tattaagtgaatattatgttatgtt 126  Q
    ||||||||||  |||||||| ||||    
T  8467801 tattaagtgatgattatgttgtgtt 8467777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 17232113 - 17232048
Alignment:
Q  14 tgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgt 79  Q
    |||||||||||| | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  17232113 tgttgttatgttatgatgagatgatgaatatgttgttgttatattattataagatgatgaatatgt 17232048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 39721281 - 39721232
Alignment:
Q  345 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39721281 atgatgattacatgatgatatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 39721232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 32048 - 31984
Alignment:
Q  19 ttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||   |||||||||||||||    
T  32048 ttatattttcataagatgatgaatacgttgttgttatattaatacaagaagatgaatatgttgtt 31984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 117 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 2759868 - 2759785
Alignment:
Q  117 atgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatg 198  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||    
T  2759868 atgttatgatattgatgatgattgaatgaagtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgtttaagatgtttatg 2759785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 118 - 178
Target Start/End: Original strand, 9446531 - 9446591
Alignment:
Q  118 tgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 178  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  9446531 tgttatgttattgatgatgattgaatgatgtgaatacttgttaattgtttatcaaagatgc 9446591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 12713863 - 12713799
Alignment:
Q  19 ttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||   |||||||||||||||    
T  12713863 ttatattttcataagatgatgaatacgttgttgttatattaatacaagaagatgaatatgttgtt 12713799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 12717687 - 12717623
Alignment:
Q  19 ttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||   |||||||||||||||    
T  12717687 ttatattttcataagatgatgaatacgttgttgttatattaatacaagaagatgaatatgttgtt 12717623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 12722598 - 12722534
Alignment:
Q  19 ttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||   |||||||||||||||    
T  12722598 ttatattttcataagatgatgaatacgttgttgttatattaatacaagaagatgaatatgttgtt 12722534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 31811 - 31760
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 395  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31811 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 31760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 395
Target Start/End: Original strand, 2833474 - 2833525
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 395  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2833474 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 2833525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 395
Target Start/End: Original strand, 12706115 - 12706166
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 395  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12706115 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 12706166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 12713626 - 12713575
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 395  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12713626 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 12713575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 12722284 - 12722233
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 395  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12722284 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 12722233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 79
Target Start/End: Original strand, 14270727 - 14270801
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgt 79  Q
    |||||||||| |||||||| || | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  14270727 atgaatatgt-gttgttatattatgatgagatgatgaatatgttgttgttatattattataagatgatgaatatgt 14270801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 395
Target Start/End: Original strand, 16908502 - 16908553
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 395  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16908502 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 16908553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 17231927 - 17231853
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgt 79  Q
    |||||||||| |||||||| || | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  17231927 atgaatatgt-gttgttatattatgatgagatgatgaatatgttgttgttatattattataagatgatgaatatgt 17231853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 17231960 - 17231882
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    ||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| || ||||||||||||| || |  ||||||||||||||||    
T  17231960 atgaatatgttgttgttatattattataagatgatgaatatgt-gttgttatattatgatgagatgatgaatatgttgtt 17231882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 17231992 - 17231918
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgt 79  Q
    |||||||||| |||||||| || | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  17231992 atgaatatgt-gttgttatattatgatgagatgatgaatatgttgttgttatattattataagatgatgaatatgt 17231918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 17232025 - 17231947
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    ||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| || ||||||||||||| || |  ||||||||||||||||    
T  17232025 atgaatatgttgttgttatattattataagatgatgaatatgt-gttgttatattatgatgagatgatgaatatgttgtt 17231947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 17232057 - 17231983
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgt 79  Q
    |||||||||| |||||||| || | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  17232057 atgaatatgt-gttgttatattatgatgagatgatgaatatgttgttgttatattattataagatgatgaatatgt 17231983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 17232090 - 17232012
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    ||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| | |||||||||||||| || |  ||||||||||||||||    
T  17232090 atgaatatgttgttgttatattattataagatgatgaatatg-tgttgttatattatgatgagatgatgaatatgttgtt 17232012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 18282044 - 18281993
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 395  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18282044 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 18281993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 26291410 - 26291335
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgt 79  Q
    ||||||| ||||||||||| ||   ||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26291410 atgaatacgttgttgttatattaatataagaaaatgaatatgttgttgttatattattataaaatgatgaatatgt 26291335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 120 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 9593113 - 9593056
Alignment:
Q  120 ttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 178  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9593113 ttatgttattgatgatgattgaa-gctgtgattacttgataattgtttatcaaagatgc 9593056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 344 - 394
Target Start/End: Original strand, 9752500 - 9752550
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9752500 gatgataattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttggtgatg 9752550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 344 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 14420873 - 14420823
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14420873 gatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 14420823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 344 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 15083312 - 15083262
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15083312 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatg 15083262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 344 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 16005090 - 16005040
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16005090 gatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 16005040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 5 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 16582700 - 16582623
Alignment:
Q  5 tgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||   |||||||||||||||    
T  16582700 tgaatatgttgttgttatattattataagatgatgaatatgt-gttgttgtattattataagacgatgaatatgttgtt 16582623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 344 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 18606424 - 18606374
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18606424 gatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 18606374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 344 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 18871383 - 18871333
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18871383 gatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 18871333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 55 - 126
Target Start/End: Original strand, 25928110 - 25928183
Alignment:
Q  55 tattattataaagtgatgaatatgttgttccatatatgatta--attattattaagtgaatattatgttatgtt 126  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||   | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25928110 tattattattaagtgatgattatgttgtattagatatgattattattattattaagtgaatattatgttatgtt 25928183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 65 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 26291495 - 26291441
Alignment:
Q  65 aagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatg 119  Q
    ||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26291495 aagtgataaatatgttgtactatatatgattaattattattaagtgaatgttatg 26291441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 121 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 13148920 - 13148841
Alignment:
Q  121 tatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgcta--ttgtttaaga-tgattatg 198  Q
    |||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  13148920 tatgttattgattatgattgaa-gctgtgattacttgataattgtttatcaaagatgctatgttgtttaagactgattatg 13148841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 15112456 - 15112375
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttg-ttatgttttcataagatgatgaatacgttgttg-ttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  15112456 atgattatgttgttgcttatgttattataagatgattaatatgttgttgcttatattattataagatgatgaatatgttgtt 15112375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 15116028 - 15115947
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttg-ttatgttttcataagatgatgaatacgttgttg-ttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  15116028 atgattatgttgttgcttatgttattataagatgattaatatgttgttgcttatattattataagatgatgaatatgttgtt 15115947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 42203742 - 42203681
Alignment:
Q  117 atgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 178  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| | ||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  42203742 atgttatgttattgatgacgattgaatgatgtgaatacttgttaattgtttatcaaagatgc 42203681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 4 - 56
Target Start/End: Original strand, 25928206 - 25928258
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttata 56  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||||    
T  25928206 atgaatatgttgttgttatatttttataagatgatgaatatgttgttattata 25928258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 344 - 394
Target Start/End: Original strand, 838125 - 838176
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattat-ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  838125 gatgatgattacatgatgttaagctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 838176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 344 - 394
Target Start/End: Original strand, 1203305 - 1203356
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattat-ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1203305 gatgatgattacatgatgttaagctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 1203356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 32 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 8467905 - 8467858
Alignment:
Q  32 agatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgt 79  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  8467905 agatgatgaatatgttgttgttatattattataagatgatgaatatgt 8467858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 203 - 238
Target Start/End: Original strand, 9752124 - 9752159
Alignment:
Q  203 agatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatg 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9752124 agatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatg 9752159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 344 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 12717373 - 12717322
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 395  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  12717373 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgctgatgt 12717322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 83
Target Start/End: Original strand, 14270694 - 14270772
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||| | |||||||||||||| || |  ||||||||||||||||    
T  14270694 atgaatattttgttgttatattattataagatgatgaatatg-tgttgttatattatgatgagatgatgaatatgttgtt 14270772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 344 - 394
Target Start/End: Original strand, 16109967 - 16110018
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattat-ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16109967 gatgatgattacatgatgttaagctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 16110018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 67 - 126
Target Start/End: Original strand, 16908188 - 16908246
Alignment:
Q  67 gtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 126  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  16908188 gtgatgaatatattgttctatatatgattaa-tattattaagtgaatatcatgctatgtt 16908246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 344 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 18278080 - 18278029
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 395  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18278080 gatgatgattgcatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 18278029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 55 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 20487041 - 20486971
Alignment:
Q  55 tattattataaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 126  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||   | ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20487041 tattattattaagtgatgattatgttgtattagatatgatta-ttattattaagtgaatattacgttatgtt 20486971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 344 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 146586 - 146536
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  146586 gatgatgattatgcgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 146536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 346 - 392
Target Start/End: Original strand, 1860016 - 1860062
Alignment:
Q  346 tgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatga 392  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1860016 tgatgattacaggatgttatatatgagttgttaaatgtacttgatga 1860062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 83
Target Start/End: Original strand, 9752335 - 9752409
Alignment:
Q  9 tatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||||||||||||| || | ||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||   | ||||||||||||||    
T  9752335 tatgttgttgttatattattatatgatgatgaatatgttgttgttatattactatatgattatgaatatgttgtt 9752409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 344 - 394
Target Start/End: Original strand, 10897889 - 10897939
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10897889 gatgatgattatgtgatgttatctatgagtcgttaaatgtacttgatgatg 10897939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 346 - 392
Target Start/End: Original strand, 13919407 - 13919453
Alignment:
Q  346 tgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatga 392  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13919407 tgatgattacaggatgttatatatgagttgttaaatgtacttgatga 13919453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 117 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 14429614 - 14429529
Alignment:
Q  117 atgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |  ||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||    
T  14429614 atgttatgttatttatgatgattgaatgaagtgattacttgatatttgattatcaaagatgcaatgatgtttaagatgtttatgtt 14429529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 352 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 15213126 - 15213084
Alignment:
Q  352 ttacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15213126 ttacatgatgttatccatgagttgttaaatgtacttgatgatg 15213084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 16582766 - 16582688
Alignment:
Q  5 tgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||||||||||||||||| || | |||| ||||||| || ||||||||||||||  |||||  || |||||||||||||    
T  16582766 tgaatatgttgttgttatattattataaaatgatgagtatgttgttgttatatttctataagatggtgaatatgttgtt 16582688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 17231862 - 17231747
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgtt-atattattataaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattatt 102  Q
    |||||||||| |||||| | || | ||||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||    ||||||||| ||||||    
T  17231862 atgaatatgt-gttgttgtattattataagatgatgaatatgt-gttgtttatattattattaagtgatgattatgttgtgttgtatatgatt-attatt 17231766  T
Q  103 attaagtgaatattatgtt 121  Q
    |||||||||  ||||||||    
T  17231765 attaagtgatgattatgtt 17231747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 45 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 18301569 - 18301531
Alignment:
Q  45 gttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18301569 gttgttgttatattattataaaatgatgaatatgttgtt 18301531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 34 - 83
Target Start/End: Original strand, 9390351 - 9390400
Alignment:
Q  34 atgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  9390351 atgatgaatatgttgttgttatattattataagatgatgaatatgatgtt 9390400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 121 - 178
Target Start/End: Original strand, 13635803 - 13635860
Alignment:
Q  121 tatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 178  Q
    |||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  13635803 tatgttattgatgatgattgaatgctgtgattaattgataactgtttatcaaagatgc 13635860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 117 - 178
Target Start/End: Original strand, 14152340 - 14152400
Alignment:
Q  117 atgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 178  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  14152340 atgttatgttattaatgatgattgaatgctgtgattacttgataattg-ttatcaaagatgc 14152400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 14 - 79
Target Start/End: Original strand, 14270671 - 14270736
Alignment:
Q  14 tgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgt 79  Q
    ||||||||| || | || ||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  14270671 tgttgttatattatgatgagatgatgaatattttgttgttatattattataagatgatgaatatgt 14270736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 15112419 - 15112362
Alignment:
Q  7 aatatgttgttg-ttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattat 63  Q
    |||||||||||| |||| || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15112419 aatatgttgttgcttatattattataagatgatgaatatgttgttgttatattattat 15112362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 15115991 - 15115934
Alignment:
Q  7 aatatgttgttg-ttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattat 63  Q
    |||||||||||| |||| || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15115991 aatatgttgttgcttatattattataagatgatgaatatgttgttgttatattattat 15115934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 351 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 16185603 - 16185562
Alignment:
Q  351 attacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatga 392  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16185603 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgatga 16185562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 362 - 395
Target Start/End: Original strand, 23666463 - 23666496
Alignment:
Q  362 ttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23666463 ttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 23666496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 64
Target Start/End: Original strand, 2833217 - 2833277
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattata 64  Q
    ||||||| ||||||||||| || | |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||    
T  2833217 atgaatacgttgttgttatattattataagaagatgaatatgttgttgttatactattata 2833277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 196 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 9702976 - 9702936
Alignment:
Q  196 atgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgatta 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  9702976 atgtttaagatgtttatgttgaagatttatgttgttaatta 9702936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 83
Target Start/End: Original strand, 14982135 - 14982215
Alignment:
Q  5 tgaatatgttgttg-ttatgttttcataagatgatgaatacgttgttg-ttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||||||||||||| ||||||| | || |||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |  ||||||||||||||||    
T  14982135 tgaatatgttgttgcttatgttattatgagatgatgaatatgttgttgcttatgttattatgagatgatgaatatgttgtt 14982215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 18278364 - 18278294
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaata 76  Q
    ||||||| ||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  18278364 atgaatacgttgttgctatatctt-ataagatgatgaatacgttgttgttatatt-ttataagatgatgaata 18278294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 18282327 - 18282257
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaata 76  Q
    ||||||| || |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  18282327 atgaatacgtcgttgctatatttt-ataagatgatgaatacgttgttgttatatt-ttataagatgatgaata 18282257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 196 - 236
Target Start/End: Original strand, 32216952 - 32216992
Alignment:
Q  196 atgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgatta 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  32216952 atgtttaagatgtttatgttgaagatttatgttgttaatta 32216992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 4 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 8467965 - 8467887
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||||||||||||||||| ||| | || |||||||||||| | | |||||||||||| || |  ||||||||||||||||    
T  8467965 atgaatatgttgttgttaagttattatgagatgatgaatatg-tattgttatattatgatgagatgatgaatatgttgtt 8467887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 4 - 63
Target Start/End: Original strand, 9752363 - 9752422
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattat 63  Q
    ||||||||||||||||||| ||   ||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  9752363 atgaatatgttgttgttatattactatatgattatgaatatgttgttgttatattattat 9752422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 4 - 78
Target Start/End: Original strand, 10502019 - 10502094
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttg-ttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatg 78  Q
    ||||||||||||||| |||| || | || |||||| ||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  10502019 atgaatatgttgttgcttatattatgatgagatgaggaatatgttgttgttatattaatataagatgatgaatatg 10502094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 29 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 16998131 - 16998076
Alignment:
Q  29 ataagatgatgaatacgttgttg-ttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||    
T  16998131 ataagatgatgaatatgttgttgcttatattattataagatgatgattatgttgtt 16998076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 199 - 238
Target Start/End: Original strand, 17138527 - 17138566
Alignment:
Q  199 tttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatg 238  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17138527 tttaagatgcttatgttgaagatttatgatgttaattatg 17138566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 120 - 178
Target Start/End: Original strand, 20692 - 20749
Alignment:
Q  120 ttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 178  Q
    |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  20692 ttatgttatttatgatgattgaa-gttgtgattatgtgataattgtttatcaaagatgc 20749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 455942 - 455893
Alignment:
Q  345 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  455942 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatg 455893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 53
Target Start/End: Original strand, 9390387 - 9390436
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgtt 53  Q
    ||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||| |||||||||    
T  9390387 atgaatatgatgttgttatattattataagatgatgaatatgttgttgtt 9390436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 394
Target Start/End: Original strand, 11393817 - 11393866
Alignment:
Q  345 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  11393817 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatg 11393866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 351 - 392
Target Start/End: Original strand, 11394878 - 11394919
Alignment:
Q  351 attacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatga 392  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11394878 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatga 11394919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 11972108 - 11972059
Alignment:
Q  345 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  11972108 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatg 11972059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Original strand, 12705834 - 12705879
Alignment:
Q  19 ttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattata 64  Q
    |||| ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12705834 ttatattttcataaaaagatgaatatgttgttgttatattattata 12705879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 83
Target Start/End: Original strand, 14157546 - 14157627
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttg-ttatgttttcataagatgatgaatacgttgttg-ttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||| ||||||| |||| |||||||||  || |||||||||||||    
T  14157546 atgattatgttgttgcttatgttattataagatgaagaatatgttgttgcttatgttattataagatggtgaatatgttgtt 14157627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 394
Target Start/End: Original strand, 14949671 - 14949720
Alignment:
Q  345 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  14949671 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatg 14949720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #138
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 394
Target Start/End: Original strand, 15377263 - 15377312
Alignment:
Q  345 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  15377263 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatg 15377312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #139
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 15719608 - 15719527
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgtt-atgttttcataagatgatgaatacgttgttg-ttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||| |||||||||||| || || | |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||    
T  15719608 atgattatgttgttgtttatattattataagatgataaatatgttgttgcttatattattataagatgatgattatgttgtt 15719527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #140
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 16232132 - 16232083
Alignment:
Q  345 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  16232132 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatg 16232083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #141
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 16409680 - 16409631
Alignment:
Q  345 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  16409680 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatg 16409631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #142
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 394
Target Start/End: Original strand, 20385672 - 20385721
Alignment:
Q  345 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  20385672 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatg 20385721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #143
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 394
Target Start/End: Original strand, 21190145 - 21190194
Alignment:
Q  345 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  21190145 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatg 21190194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #144
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 24701867 - 24701818
Alignment:
Q  345 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  24701867 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatg 24701818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #145
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 24704317 - 24704268
Alignment:
Q  345 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  24704317 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatg 24704268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #146
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 394
Target Start/End: Original strand, 26356500 - 26356549
Alignment:
Q  345 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  26356500 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatg 26356549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #147
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 394
Target Start/End: Original strand, 26358952 - 26359001
Alignment:
Q  345 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  26358952 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatg 26359001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #148
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 27216487 - 27216438
Alignment:
Q  345 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  27216487 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatg 27216438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #149
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 32125111 - 32125062
Alignment:
Q  345 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  32125111 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatg 32125062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #150
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 351 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 41283724 - 41283683
Alignment:
Q  351 attacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatga 392  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41283724 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatga 41283683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #151
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 41522549 - 41522500
Alignment:
Q  345 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  41522549 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatg 41522500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #152
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 41525011 - 41524962
Alignment:
Q  345 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  41525011 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatg 41524962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #153
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 64
Target Start/End: Original strand, 45171256 - 45171309
Alignment:
Q  11 tgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattata 64  Q
    |||||||||||| || | ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45171256 tgttgttgttatattattatatgaagatgaatatgttgttgttatattattata 45171309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #154
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 4 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 32030 - 31970
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattata 64  Q
    ||||||| ||||||||||| ||   | |||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32030 atgaatacgttgttgttatattaatacaagaagatgaatatgttgttgttatattattata 31970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #155
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 9 - 65
Target Start/End: Original strand, 7519997 - 7520053
Alignment:
Q  9 tatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataa 65  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||  ||||| |||||||| |||||    
T  7519997 tatgttgttgttatatttttataagatgatgtatatcttgttattatattaatataa 7520053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #156
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 196 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 11858235 - 11858195
Alignment:
Q  196 atgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgatta 236  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||    
T  11858235 atgtttaagatgcttatgttgaagttttatgttgttgatta 11858195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #157
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 4 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 12713845 - 12713785
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattata 64  Q
    ||||||| ||||||||||| ||   | |||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12713845 atgaatacgttgttgttatattaatacaagaagatgaatatgttgttgttatattattata 12713785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #158
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 4 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 12717669 - 12717609
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattata 64  Q
    ||||||| ||||||||||| ||   | |||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12717669 atgaatacgttgttgttatattaatacaagaagatgaatatgttgttgttatattattata 12717609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #159
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 4 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 12722580 - 12722520
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattata 64  Q
    ||||||| ||||||||||| ||   | |||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12722580 atgaatacgttgttgttatattaatacaagaagatgaatatgttgttgttatattattata 12722520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #160
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 29 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 15719616 - 15719548
Alignment:
Q  29 ataagatgatgaatacgttgttgtt-atattattataaagtgatgaatatgttgttccatatatgatta 96  Q
    |||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||||| | ||||| ||||    
T  15719616 ataagatgatgattatgttgttgtttatattattataagatgataaatatgttgttgcttatattatta 15719548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #161
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 29 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 16323588 - 16323503
Alignment:
Q  29 ataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgtt 121  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||| || |  ||||||||||||||     ||||||||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  16323588 ataagatgatgaatatgt-gttgttatattatgatgagatgatgaatatgttg-----tatatgatt-attattattaagtgacgattatgtt 16323503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #162
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 4 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 18282263 - 18282203
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattata 64  Q
    |||||||  |||||||||| ||   |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18282263 atgaatacattgttgttatattaatataagaagatgaatatgttgttgttatattattata 18282203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #163
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 196 - 236
Target Start/End: Original strand, 19649951 - 19649991
Alignment:
Q  196 atgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgatta 236  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  19649951 atgtttaagatgcttatgttgaagatttatgttgttaatta 19649991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #164
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 4 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 20486948 - 20486897
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttata 56  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||| |||||    
T  20486948 atgaatatgttgttgt-atatttttataagatgatgaatatgttgttattata 20486897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #165
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 196 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 24054120 - 24054080
Alignment:
Q  196 atgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgatta 236  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  24054120 atgtttaagatgcttatgttgaagatttatgttgttaatta 24054080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #166
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 363 - 395
Target Start/End: Original strand, 45171512 - 45171544
Alignment:
Q  363 tatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 395  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45171512 tatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 45171544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 114)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 16623218 - 16622970
Alignment:
Q  1 gctatgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaatta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16623218 gctatgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatatgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaatta 16623119  T
Q  101 ttattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctattgtttaagatgattatgtt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16623118 ttattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctattgtttaagatgattatgtt 16623019  T
Q  201 taagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagtacg 249  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16623018 taagatgtttatgttaaagatttatgatgttaattatggtgttagtacg 16622970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 65 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 16759368 - 16759185
Alignment:
Q  65 aagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattg 164  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16759368 aagtgatgaatatgttgttctatatatgattaat-attattaagtaaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattg 16759270  T
Q  165 tttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 247  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16759269 tttatcaaagatgctatgatgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattttggtgttagta 16759185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 65 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 11565993 - 11565810
Alignment:
Q  65 aagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattg 164  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11565993 aagtgatgaatatgttgttctatatatgattaat-attattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattg 11565895  T
Q  165 tttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 247  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11565894 tttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattttggtgttagta 11565810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 65 - 247
Target Start/End: Original strand, 12619817 - 12620000
Alignment:
Q  65 aagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattg 164  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12619817 aagtgacgaatatgttgttctatatatgattaat-attattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattg 12619915  T
Q  165 tttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 247  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12619916 tttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattttggtgttagta 12620000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 65 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 23989091 - 23988908
Alignment:
Q  65 aagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattg 164  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23989091 aagtgatgaatatgttgttcaatatatgattaat-attattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattg 23988993  T
Q  165 tttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 247  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23988992 tttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgtttatgtttaagatttatgatgttgattttggtgttagta 23988908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 65 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 22948248 - 22948065
Alignment:
Q  65 aagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattg 164  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22948248 aagtgatgaatatgttgttctatatatgattaat-attattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattg 22948150  T
Q  165 tttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 247  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22948149 tttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgattatgtttaagatttatgatgttgattagggtgttagta 22948065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 65 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 22952204 - 22952021
Alignment:
Q  65 aagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattg 164  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22952204 aagtgatgaatatgttgttctatatatgattaat-attattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattg 22952106  T
Q  165 tttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 247  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22952105 tttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgattatgtttaagatttatgatgttgattagggtgttagta 22952021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 65 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 23870692 - 23870509
Alignment:
Q  65 aagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattg 164  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23870692 aagtgatgaatatgttgttctatatatgattaat-attattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattg 23870594  T
Q  165 tttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 247  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23870593 tttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgattatgtttaagatttatgatgttgattagggtgttagta 23870509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 65 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 23874648 - 23874465
Alignment:
Q  65 aagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattg 164  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23874648 aagtgatgaatatgttgttctatatatgattaat-attattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattg 23874550  T
Q  165 tttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 247  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23874549 tttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgattatgtttaagatttatgatgttgattagggtgttagta 23874465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 57 - 206
Target Start/End: Original strand, 31479183 - 31479332
Alignment:
Q  57 ttattataaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattactt 156  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31479183 ttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattactt 31479282  T
Q  157 ggtaattgtttatcaaagatgctattgtttaagatgattatgtttaagat 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31479283 ggtaattgtttatcaaagatgctattgtttaagatgattatgttgaagat 31479332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 65 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 8243005 - 8242822
Alignment:
Q  65 aagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattg 164  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  8243005 aagtgatgaatatgttgttctatatatgattaat-attattaaatgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttgctaattg 8242907  T
Q  165 tttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 247  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8242906 tttatcaaatatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattttggtgttagta 8242822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 57 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 23414115 - 23413909
Alignment:
Q  57 ttattataaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattactt 156  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23414115 ttattattaagtgatgaatatgttgttctatatatgattaat-attattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattactt 23414017  T
Q  157 ggtaattgtttatcaaagatgc-----------------tattgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatgg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||                 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23414016 ggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatgg 23413917  T
Q  240 tgttagta 247  Q
    ||||||||    
T  23413916 tgttagta 23413909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 65 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 23394199 - 23394001
Alignment:
Q  65 aagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattg 164  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23394199 aagtgatgaatatgttgttctatatatgattaat-attattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattg 23394101  T
Q  165 tttatcaaagatgctat-----------------tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 247  Q
    |||||||||||||||||                 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23394100 tttatcaaagatgctatgatgtttaagatgataatgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 23394001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 65 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 19869760 - 19869603
Alignment:
Q  65 aagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattg 164  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19869760 aagtgatgaatatgttgttctatatatgattaat-attattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattg 19869662  T
Q  165 tttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagat 221  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||    
T  19869661 tttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgattatgtttaagat 19869603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 66 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 14471424 - 14471317
Alignment:
Q  66 agtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgt 165  Q
    |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14471424 agtgatgattatgtcgttctatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgt 14471325  T
Q  166 ttatcaaa 173  Q
    ||||||||    
T  14471324 ttatcaaa 14471317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 182 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 19869612 - 19869547
Alignment:
Q  182 tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19869612 tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 19869547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 3 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 1643622 - 1643542
Alignment:
Q  3 tatgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||    
T  1643622 tatgaatatgttattgttatattttcataagatgatgaatacgttgttgttatattaatataaggagatgaatatattgtt 1643542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 57 - 126
Target Start/End: Original strand, 22074997 - 22075066
Alignment:
Q  57 ttattataaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 126  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22074997 ttattattaagtgatgaatatgttttactatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 22075066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 3 - 83
Target Start/End: Original strand, 18918400 - 18918479
Alignment:
Q  3 tatgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||   |||||||||||||||    
T  18918400 tatgaatatgttgttgttatattttcataagatgatgaatacgttgttgttata-taatataagaagatgaatatgttgtt 18918479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 342 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 16622923 - 16622870
Alignment:
Q  342 aagatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 395  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16622923 aagatgatgattacatgatattatctatgaattgttaaatgtacttgatgatgt 16622870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 83
Target Start/End: Original strand, 22075089 - 22075168
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||    
T  22075089 atgaatatgttgttgttatatttttataagatgattaatangttgttgttatattaatataagaagatgaatatgttgtt 22075168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 343 - 395
Target Start/End: Original strand, 31479454 - 31479506
Alignment:
Q  343 agatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 395  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31479454 agatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtatttgatgatgt 31479506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 344 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 23400764 - 23400714
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23400764 gatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 23400714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 65 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 23401028 - 23400974
Alignment:
Q  65 aagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatg 119  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23401028 aagtgatgaatatgttgtactatatatgattaattattattaagtgaatattatg 23400974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 57 - 126
Target Start/End: Original strand, 22074890 - 22074958
Alignment:
Q  57 ttattataaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 126  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22074890 ttattattaagtgatgattatgttgtactatatatgatta-ttattattaagtgaatattatgttatgtt 22074958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 65 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 22862077 - 22862017
Alignment:
Q  65 aagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 126  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22862077 aagtgatgaatatgttgttctatatatgatt-attattattaagtgaatatcatgttatgtt 22862017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 83
Target Start/End: Original strand, 22075061 - 22075135
Alignment:
Q  9 tatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||  |||| |||| ||||||    
T  22075061 tatgttgttgttatatttttataagatgatgaatatgttgttgttatatttttataagatgattaatangttgtt 22075135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 2076372 - 2076322
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2076372 gatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtatttgatgatg 2076322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 394
Target Start/End: Original strand, 18918573 - 18918623
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18918573 gatgatgattacatgatgttatctaggagttgttaaatgtacttgatgatg 18918623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 117 - 178
Target Start/End: Original strand, 27567981 - 27568042
Alignment:
Q  117 atgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 178  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  27567981 atgttatgttattgatgatgattgaatgatgtgaatacttgttaattgtttatcaaagatgc 27568042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 8242813 - 8242749
Alignment:
Q  19 ttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||   |||||||||||||||    
T  8242813 ttatattttcataagatgatgaatacgttgttgttatattaatacaagaagatgaatatgttgtt 8242749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 11565801 - 11565737
Alignment:
Q  19 ttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||   |||||||||||||||    
T  11565801 ttatattttcataagatgatgaatacgttgttgttatattaatacaagaagatgaatatgttgtt 11565737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 83
Target Start/End: Original strand, 12620009 - 12620073
Alignment:
Q  19 ttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||   |||||||||||||||    
T  12620009 ttatattttcataagatgatgaatacgttgttgttatattaatacaagaagatgaatatgttgtt 12620073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 22948056 - 22947992
Alignment:
Q  19 ttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||   |||||||||||||||    
T  22948056 ttatattttcataagatgatgaatacgttgttgttatattaatacaagaagatgaatatgttgtt 22947992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 22952012 - 22951948
Alignment:
Q  19 ttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||   |||||||||||||||    
T  22952012 ttatattttcataagatgatgaatacgttgttgttatattaatacaagaagatgaatatgttgtt 22951948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 23870500 - 23870436
Alignment:
Q  19 ttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||   |||||||||||||||    
T  23870500 ttatattttcataagatgatgaatacgttgttgttatattaatacaagaagatgaatatgttgtt 23870436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 23874456 - 23874392
Alignment:
Q  19 ttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||   |||||||||||||||    
T  23874456 ttatattttcataagatgatgaatacgttgttgttatattaatacaagaagatgaatatgttgtt 23874392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 23988899 - 23988835
Alignment:
Q  19 ttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||   |||||||||||||||    
T  23988899 ttatattttcataagatgatgaatacgttgttgttatattaatacaagaagatgaatatgttgtt 23988835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 209 - 249
Target Start/End: Original strand, 31479320 - 31479360
Alignment:
Q  209 ttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagtacg 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31479320 ttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagtacg 31479360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 8242498 - 8242447
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 395  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8242498 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 8242447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 11565487 - 11565436
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 395  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11565487 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 11565436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 395
Target Start/End: Original strand, 11716933 - 11716984
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 395  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11716933 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 11716984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 395
Target Start/End: Original strand, 12620326 - 12620377
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 395  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12620326 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 12620377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 18913371 - 18913297
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgt 79  Q
    ||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||  ||||||||||||    
T  18913371 atgaatatgttgttgttatattattataagatgatgaatatg-tgttgttgtattattataagatgatgaatatgt 18913297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 23988389 - 23988338
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 395  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23988389 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 23988338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 27555625 - 27555574
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 395  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27555625 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 27555574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 65 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 1643673 - 1643619
Alignment:
Q  65 aagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatg 119  Q
    |||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1643673 aagtgatgaatatgttttactatatatgattaattattattaagtgaatgttatg 1643619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 9 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 2076640 - 2076519
Alignment:
Q  9 tatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgttccat------atatgatta--atta 100  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||||  ||     ||||||||||||||||| | ||      |||||||||  ||||    
T  2076640 tatgttgttgttatatttttataagatgatgaatatgttgttattataagat----gagtgatgaatatgttgtactatatatagatatgattattatta 2076545  T
Q  101 ttattaagtgaatattatgttatgtt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  2076544 ttattaagtgaatattatgttatgtt 2076519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 55 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 2076708 - 2076635
Alignment:
Q  55 tattattataaagtgatgaatatgttgttccatatatgatta--attattattaagtgaatattatgttatgtt 126  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||   | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2076708 tattattattaagtgatgattatgttgtattagatatgattattattattattaagtgaatattatgttatgtt 2076635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 65 - 119
Target Start/End: Original strand, 18918350 - 18918403
Alignment:
Q  65 aagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatg 119  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18918350 aagtgatgaat-tgttgtaccatatatgattaattattattaagtgaatgttatg 18918403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 344 - 394
Target Start/End: Original strand, 18953476 - 18953526
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18953476 gatgatgattacatgatgtcatctaggagttgttaaatgtacttgatgatg 18953526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 120 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 19298162 - 19298105
Alignment:
Q  120 ttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 178  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19298162 ttatgttattgatgatgattgaa-gctgtgattacttgataattgtttatcaaagatgc 19298105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 348 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 23538063 - 23538017
Alignment:
Q  348 atgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23538063 atgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 23538017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 344 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 27222918 - 27222868
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27222918 gatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 27222868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 65 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 16623267 - 16623219
Alignment:
Q  65 aagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaat 113  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16623267 aagtgatggatatgttgtactatatatgattaattattattaagtgaat 16623219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 344 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 22861841 - 22861790
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 395  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  22861841 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttggtgatgt 22861790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 12706455 - 12706398
Alignment:
Q  120 ttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 178  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  12706455 ttatgttattgatgatgattgaa-gctgtgattacttgataattttttatcaaagatgc 12706398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 344 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 12941307 - 12941257
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12941307 gatgatgattatgagatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 12941257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 117 - 200
Target Start/End: Original strand, 16523770 - 16523855
Alignment:
Q  117 atgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |  ||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||    
T  16523770 atgttatgttatttatgatgattgaatgaagtgattacttgatatttgattatcaaagatgcaatgatgtttaagatgtttatgtt 16523855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 16740974 - 16740916
Alignment:
Q  120 ttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 178  Q
    |||||||||||||||||||   | | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16740974 ttatgttattgatgatgatttgaagctgtgattacttgataattgtttatcaaagatgc 16740916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 352 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 25737970 - 25737928
Alignment:
Q  352 ttacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25737970 ttacatgatgttatctatgagttggtaaatgtacttgatgatg 25737928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 352 - 394
Target Start/End: Original strand, 34297773 - 34297815
Alignment:
Q  352 ttacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34297773 ttacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgctgatg 34297815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 345 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 12741938 - 12741889
Alignment:
Q  345 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  12741938 atgatgattacatgatattgtctatgagttgttaaatatgattgatgatg 12741889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 117 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 17803956 - 17803896
Alignment:
Q  117 atgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 178  Q
    |||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  17803956 atgttatgttattgatgatgattgaatactgtgattacttgttaattg-ttatcaaagatgc 17803896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 117 - 178
Target Start/End: Original strand, 27553942 - 27554003
Alignment:
Q  117 atgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 178  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | ||||  |||||  ||||||||||||||||||||    
T  27553942 atgttatgttattgatgatgattgaatgatgtggatacttattaattgtttatcaaagatgc 27554003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 15874976 - 15874924
Alignment:
Q  32 agatgatgaatacgttgttgtt-atattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15874976 agatgatgaatatgttgtcgtttatattattataaaatgatgaatatgttgtt 15874924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 18913373 - 18913329
Alignment:
Q  35 tgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgt 79  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  18913373 tgatgaatatgttgttgttatattattataagatgatgaatatgt 18913329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 9 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 2076524 - 2076477
Alignment:
Q  9 tatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttata 56  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||||    
T  2076524 tatgttgttgttatatttttataagatgatgaatatgttgttattata 2076477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 29 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 2200870 - 2200815
Alignment:
Q  29 ataagatgatgaatacgttgttg-ttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  2200870 ataagatgatgaatatgttgttgcttatgttattataagatgatgaatatgttgtt 2200815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 4 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 8242795 - 8242674
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgttccatatatgatta--attat 101  Q
    ||||||| ||||||||||| ||   | |||| |||||||| ||||||||||||||||||||   | ||||| |  ||| |  |||||| ||||  |||||    
T  8242795 atgaatacgttgttgttatattaatacaagaagatgaatatgttgttgttatattattata---ttatgaagagattgatgtatatataattattattat 8242699  T
Q  102 tattaagtgaatattatgttatgtt 126  Q
    |||||||||||||| ||||||||||    
T  8242698 tattaagtgaatatcatgttatgtt 8242674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 199 - 238
Target Start/End: Original strand, 21740434 - 21740473
Alignment:
Q  199 tttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatg 238  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  21740434 tttaagatgtttatgttgaatatttatgatgttaattatg 21740473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 4 - 79
Target Start/End: Original strand, 31630879 - 31630953
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgt 79  Q
    |||||||||| |||||||| || | || ||||||||||||  |||| |||||||||||||||  ||||||||||||    
T  31630879 atgaatatgt-gttgttatattatgatgagatgatgaatatattgtcgttatattattataagatgatgaatatgt 31630953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 120 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 21702053 - 21701996
Alignment:
Q  120 ttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 178  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  21702053 ttatgttattgatgaagattgaa-gttgtgattacgtgatacttgtttatcaaagatgc 21701996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 7 - 64
Target Start/End: Original strand, 22075125 - 22075182
Alignment:
Q  7 aatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattata 64  Q
    |||| ||||||||||| ||   |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22075125 aatangttgttgttatattaatataagaagatgaatatgttgttgttatattattata 22075182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 37 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 23400976 - 23400889
Alignment:
Q  37 atgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgttccatatatgatta--attattattaagtgaatattatgttatgtt 126  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||   ||| ||| ||| |||   |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23400976 atgaatatgttgttgttatattattatattatgacgaa-atgatgt---atatataattattattattattaagtgaatattatgttatgtt 23400889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 344 - 394
Target Start/End: Original strand, 28290887 - 28290937
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||   ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28290887 gatgatgattatgagatgttatctataagttgttaaatgtacttgatgatg 28290937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 1643500 - 1643471
Alignment:
Q  97 attattattaagtgaatattatgttatgtt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1643500 attattattaagtgaatattatgttatgtt 1643471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 394
Target Start/End: Original strand, 2291730 - 2291779
Alignment:
Q  345 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  2291730 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatg 2291779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 8054641 - 8054592
Alignment:
Q  345 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  8054641 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatg 8054592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 198
Target Start/End: Original strand, 9482632 - 9482711
Alignment:
Q  121 tatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgcta--ttgtttaaga-tgattatg 198  Q
    |||||||||||| ||||| |||  | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||    
T  9482632 tatgttattgattatgattgaaact-gtgattacttgataattgtttatcaaggatgctatgttgtttaagactgattatg 9482711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 394
Target Start/End: Original strand, 18335142 - 18335191
Alignment:
Q  345 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  18335142 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatg 18335191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 18913338 - 18913220
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgtt-atattattataaagtgatgaatatgttgttccatatatgatta--atta 100  Q
    |||||||||| |||||| | || | ||||||||||||||| || |||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||    ||||||||||  ||||    
T  18913338 atgaatatgt-gttgttgtattattataagatgatgaatatgt-gttgtttatattattagtaagtgatgattatgttgtgttgtatatgattattatta 18913241  T
Q  101 ttattaagtgaatattatgtt 121  Q
    |||||||||||  ||||||||    
T  18913240 ttattaagtgatgattatgtt 18913220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Original strand, 18953233 - 18953294
Alignment:
Q  3 tatgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattata 64  Q
    |||||| ||||||||||||| ||   |||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  18953233 tatgaacatgttgttgttatattaatataagaagatgaatatgttattgttatattattata 18953294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 19004658 - 19004609
Alignment:
Q  345 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  19004658 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatg 19004609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 19869510 - 19869457
Alignment:
Q  11 tgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattata 64  Q
    |||||||||||| || | ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19869510 tgttgttgttatattattatatgaagatgaatatgttgttgttatattattata 19869457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 344 - 395
Target Start/End: Original strand, 22075379 - 22075434
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgat---at-tatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 395  Q
    |||||||||||||||||   || ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22075379 gatgatgattacatgatgatatatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 22075434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 23393964 - 23393911
Alignment:
Q  11 tgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattata 64  Q
    |||||||||||| || | ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23393964 tgttgttgttatattattatatgaagatgaatatgttgttgttatattattata 23393911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 23413872 - 23413819
Alignment:
Q  11 tgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattata 64  Q
    |||||||||||| || | ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23413872 tgttgttgttatattattatatgaagatgaatatgttgttgttatattattata 23413819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 24422159 - 24422110
Alignment:
Q  345 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  24422159 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatg 24422110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 117 - 166
Target Start/End: Original strand, 25767477 - 25767526
Alignment:
Q  117 atgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtt 166  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||    
T  25767477 atgttatgttattggtgatgattgaatgctgtgattacttgataattgtt 25767526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 394
Target Start/End: Original strand, 26925189 - 26925238
Alignment:
Q  345 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  26925189 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatg 26925238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 351 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 28707938 - 28707897
Alignment:
Q  351 attacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatga 392  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28707938 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatga 28707897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 33861407 - 33861358
Alignment:
Q  345 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  33861407 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatg 33861358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 33863890 - 33863841
Alignment:
Q  345 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  33863890 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatg 33863841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 366 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 1254223 - 1254195
Alignment:
Q  366 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1254223 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 1254195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 4 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 2200862 - 2200814
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttg-ttatgttttcataagatgatgaatacgttgttg 51  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||||||    
T  2200862 atgaatatgttgttgcttatgttattataagatgatgaatatgttgttg 2200814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 357 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 4475868 - 4475832
Alignment:
Q  357 tgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgat 393  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4475868 tgatgttatttatgagttgttaaatgtacttgatgat 4475832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 4 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 11565783 - 11565723
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattata 64  Q
    ||||||| ||||||||||| ||   | |||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11565783 atgaatacgttgttgttatattaatacaagaagatgaatatgttgttgttatattattata 11565723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 4 - 64
Target Start/End: Original strand, 12620027 - 12620087
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattata 64  Q
    ||||||| ||||||||||| ||   | |||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12620027 atgaatacgttgttgttatattaatacaagaagatgaatatgttgttgttatattattata 12620087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 75 - 119
Target Start/End: Original strand, 18953192 - 18953236
Alignment:
Q  75 tatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatg 119  Q
    |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  18953192 tatgttgtactatatatgattaattgttattaagtgaatgttatg 18953236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 196 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 19862633 - 19862593
Alignment:
Q  196 atgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgatta 236  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  19862633 atgtttaagatgcttatgttgaagatttatgttgttaatta 19862593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 363 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 19869254 - 19869222
Alignment:
Q  363 tatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 395  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19869254 tatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 19869222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 196 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 19872775 - 19872735
Alignment:
Q  196 atgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgatta 236  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  19872775 atgtttaagatgcttatgttgaagatttatgttgttaatta 19872735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 363 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 22947734 - 22947702
Alignment:
Q  363 tatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 395  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22947734 tatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 22947702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 4 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 22948038 - 22947978
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattata 64  Q
    ||||||| ||||||||||| ||   | |||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22948038 atgaatacgttgttgttatattaatacaagaagatgaatatgttgttgttatattattata 22947978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 363 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 22951690 - 22951658
Alignment:
Q  363 tatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 395  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22951690 tatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 22951658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #107
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 4 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 22951994 - 22951934
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattata 64  Q
    ||||||| ||||||||||| ||   | |||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22951994 atgaatacgttgttgttatattaatacaagaagatgaatatgttgttgttatattattata 22951934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 363 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 23393708 - 23393676
Alignment:
Q  363 tatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 395  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23393708 tatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 23393676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 363 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 23413616 - 23413584
Alignment:
Q  363 tatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 395  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23413616 tatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 23413584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 363 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 23870178 - 23870146
Alignment:
Q  363 tatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 395  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23870178 tatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 23870146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #111
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 4 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 23870482 - 23870422
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattata 64  Q
    ||||||| ||||||||||| ||   | |||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23870482 atgaatacgttgttgttatattaatacaagaagatgaatatgttgttgttatattattata 23870422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #112
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 363 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 23874134 - 23874102
Alignment:
Q  363 tatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 395  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23874134 tatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 23874102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #113
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 4 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 23874438 - 23874378
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattata 64  Q
    ||||||| ||||||||||| ||   | |||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23874438 atgaatacgttgttgttatattaatacaagaagatgaatatgttgttgttatattattata 23874378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #114
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 4 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 23988881 - 23988821
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattata 64  Q
    ||||||| ||||||||||| ||   | |||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23988881 atgaatacgttgttgttatattaatacaagaagatgaatatgttgttgttatattattata 23988821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 122)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 15223976 - 15223727
Alignment:
Q  1 gctatgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaatta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  15223976 gctatgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtactatatatgattaatta 15223877  T
Q  101 ttattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatc-aaagatgctattgtttaagatgattatgt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15223876 ttattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaaagatgctattgtttaagatgattatgt 15223777  T
Q  200 ttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagtacg 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15223776 ttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagtacg 15223727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 65 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 9555661 - 9555478
Alignment:
Q  65 aagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattg 164  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9555661 aagtgatgaatatgttgttctatatatgattaat-attattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattg 9555563  T
Q  165 tttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 247  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9555562 tttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattttggtgttagta 9555478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 65 - 247
Target Start/End: Original strand, 14758401 - 14758584
Alignment:
Q  65 aagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattg 164  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14758401 aagtgatgaatatgttgttctatatatgattaat-attattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattg 14758499  T
Q  165 tttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 247  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14758500 tttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattttggtgttagta 14758584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 65 - 247
Target Start/End: Original strand, 14955166 - 14955349
Alignment:
Q  65 aagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattg 164  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14955166 aagtgatgaatatgttgttctatatatgattaat-attattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattg 14955264  T
Q  165 tttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 247  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14955265 tttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattttggtgttagta 14955349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 65 - 247
Target Start/End: Original strand, 5757785 - 5757968
Alignment:
Q  65 aagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattg 164  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5757785 aagtgatgaatatgttgttctatatatgattaat-attattaaatgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattg 5757883  T
Q  165 tttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 247  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5757884 tttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattttggtgttagta 5757968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 65 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 33741431 - 33741248
Alignment:
Q  65 aagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattg 164  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33741431 aagtgacgaatatgttgttctatatatgattaat-attattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattg 33741333  T
Q  165 tttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 247  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33741332 tttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattttggtgttagta 33741248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 65 - 247
Target Start/End: Original strand, 4562260 - 4562443
Alignment:
Q  65 aagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattg 164  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4562260 aagtgatgaatatgttgttctatatatgattaat-attattaagtgaatatcatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattg 4562358  T
Q  165 tttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 247  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4562359 tttatcaaagatgctatgatgtttaagaagatattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattttggtgttagta 4562443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 65 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 25689034 - 25688851
Alignment:
Q  65 aagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattg 164  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25689034 aagtgatgaatatgttgttctatatatgattaat-attattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattg 25688936  T
Q  165 tttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 247  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25688935 tttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgattatgtttaagatttatgatgttgattagggtgttagta 25688851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 68 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 12486813 - 12486659
Alignment:
Q  68 tgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgttt 167  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12486813 tgatgaatatgttgttctatatatgattaat-attattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgttt 12486715  T
Q  168 atcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagat 221  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||    
T  12486714 atcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgattatgtttaagat 12486659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 182 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 12486668 - 12486603
Alignment:
Q  182 tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12486668 tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 12486603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 57 - 126
Target Start/End: Original strand, 20158198 - 20158267
Alignment:
Q  57 ttattataaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 126  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20158198 ttattattaagtgatgaatatgttgtactatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 20158267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 57 - 126
Target Start/End: Original strand, 20160874 - 20160943
Alignment:
Q  57 ttattataaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 126  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20160874 ttattattaagtgatgaatatgttgtactatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 20160943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 57 - 126
Target Start/End: Original strand, 20163652 - 20163721
Alignment:
Q  57 ttattataaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 126  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20163652 ttattattaagtgatgaatatgttgtactatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 20163721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 340 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 15223636 - 15223581
Alignment:
Q  340 ggaagatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15223636 ggaagatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 15223581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 182 - 236
Target Start/End: Original strand, 13813683 - 13813737
Alignment:
Q  182 tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgatta 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13813683 tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgatta 13813737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 182 - 243
Target Start/End: Original strand, 13818195 - 13818256
Alignment:
Q  182 tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgtt 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  13818195 tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttaattatgatgtt 13818256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 57 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 10712080 - 10712012
Alignment:
Q  57 ttattataaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgt 125  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10712080 ttattattaagtgatgaatatgttgcactatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgt 10712012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 57 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 10925850 - 10925782
Alignment:
Q  57 ttattataaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgt 125  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10925850 ttattattaagtgatgaatatgttgcactatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgt 10925782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 15189806 - 15189714
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgttccatatatgatta 96  Q
    ||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||   ||||||||||    
T  15189806 atgaatatgttgttgttatattattataagatgatgaatatgttgttgttatattattataagatgatgaataagttgttgtttatatgatta 15189714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 9 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 15189834 - 15189760
Alignment:
Q  9 tatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  15189834 tatgttgttgttatattattataagatgatgaatatgttgttgttatattattataagatgatgaatatgttgtt 15189760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 3 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 27533011 - 27532932
Alignment:
Q  3 tatgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||   |||||||||||||||    
T  27533011 tatgaatacgttgttgttatattttcataagatgatgaatacgttgttgttata-taatataagaagatgaatatgttgtt 27532932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 344 - 394
Target Start/End: Original strand, 631740 - 631790
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  631740 gatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 631790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 344 - 394
Target Start/End: Original strand, 13813825 - 13813875
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13813825 gatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 13813875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 344 - 394
Target Start/End: Original strand, 13818313 - 13818363
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13818313 gatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 13818363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 344 - 394
Target Start/End: Original strand, 17052438 - 17052488
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17052438 gatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 17052488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 344 - 394
Target Start/End: Original strand, 22634919 - 22634969
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22634919 gatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 22634969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 344 - 394
Target Start/End: Original strand, 23996959 - 23997009
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23996959 gatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 23997009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 344 - 394
Target Start/End: Original strand, 24048377 - 24048427
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24048377 gatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 24048427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 344 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 12423029 - 12422980
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgat 393  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12423029 gatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgat 12422980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 117 - 178
Target Start/End: Original strand, 15353677 - 15353738
Alignment:
Q  117 atgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 178  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15353677 atgttatgttattgatgatgattgaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgc 15353738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 57 - 126
Target Start/End: Original strand, 20158091 - 20158159
Alignment:
Q  57 ttattataaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 126  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20158091 ttattattaagtgatgattatgttgtactatatatgatta-ttattattaagtgaatattatgttatgtt 20158159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 10711911 - 10711861
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10711911 gatgatgattacatgatgttatctaggagttgttaaatgtacttgatgatg 10711861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 10925681 - 10925631
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10925681 gatgatgattacatgatgttatctaggagttgttaaatgtacttgatgatg 10925631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 27532838 - 27532788
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27532838 gatgatgattacatgatgttatctaggagttgttaaatgtacttgatgatg 27532788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 27533062 - 27533008
Alignment:
Q  65 aagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatg 119  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27533062 aagtgatgaatatgttgtactatatatgattaattattattaagtgaatgttatg 27533008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 57 - 126
Target Start/End: Original strand, 20160767 - 20160835
Alignment:
Q  57 ttattataaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 126  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20160767 ttattattaagtgatgattatgttgtactatatatgatta-ttattattcagtgaatattatgttatgtt 20160835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 57 - 126
Target Start/End: Original strand, 20163545 - 20163613
Alignment:
Q  57 ttattataaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 126  Q
    ||||||| |||| |||| |||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20163545 ttattattaagtcatgattatgttgtactatatatgatta-ttattattaagtgaatattatgttatgtt 20163613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 83
Target Start/End: Original strand, 4562452 - 4562516
Alignment:
Q  19 ttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||   |||||||||||||||    
T  4562452 ttatattttcataagatgatgaatacgttgttgttatattaatacaagaagatgaatatgttgtt 4562516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 9555469 - 9555405
Alignment:
Q  19 ttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||   |||||||||||||||    
T  9555469 ttatattttcataagatgatgaatacgttgttgttatattaatacaagaagatgaatatgttgtt 9555405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 83
Target Start/End: Original strand, 14758593 - 14758657
Alignment:
Q  19 ttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||   |||||||||||||||    
T  14758593 ttatattttcataagatgatgaatacgttgttgttatattaatacaagaagatgaatatgttgtt 14758657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 83
Target Start/End: Original strand, 14955358 - 14955422
Alignment:
Q  19 ttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||   |||||||||||||||    
T  14955358 ttatattttcataagatgatgaatacgttgttgttatattaatacaagaagatgaatatgttgtt 14955422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 25688842 - 25688778
Alignment:
Q  19 ttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||   |||||||||||||||    
T  25688842 ttatattttcataagatgatgaatacgttgttgttatattaatacaagaagatgaatatgttgtt 25688778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 33741239 - 33741175
Alignment:
Q  19 ttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||   |||||||||||||||    
T  33741239 ttatattttcataagatgatgaatacgttgttgttatattaatacaagaagatgaatatgttgtt 33741175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 395
Target Start/End: Original strand, 4562766 - 4562817
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 395  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4562766 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 4562817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 395
Target Start/End: Original strand, 5758448 - 5758499
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 395  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5758448 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 5758499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 9555155 - 9555104
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 395  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9555155 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 9555104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 395
Target Start/End: Original strand, 14758984 - 14759035
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 395  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14758984 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 14759035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 395
Target Start/End: Original strand, 14955752 - 14955803
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 395  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14955752 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 14955803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 79
Target Start/End: Original strand, 15482003 - 15482077
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgt 79  Q
    ||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||  ||||||||||||    
T  15482003 atgaatatgttgttgttatattattataagatgatgaatatg-tgttgttgtattattataagatgatgaatatgt 15482077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 17807140 - 17807089
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 395  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17807140 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 17807089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 25688528 - 25688477
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 395  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25688528 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 25688477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 33740922 - 33740871
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 395  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33740922 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 33740871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 29 - 83
Target Start/End: Original strand, 631592 - 631646
Alignment:
Q  29 ataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  631592 ataaaatgatgaatatgttgttgttatattattataaaaagatgaatatgttgtt 631646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 120 - 178
Target Start/End: Original strand, 1952099 - 1952156
Alignment:
Q  120 ttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 178  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1952099 ttatgttattgatgatgattgaa-gctgtgattacttgataattgtttatcaaagatgc 1952156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 344 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 15533305 - 15533255
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15533305 gatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 15533255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 344 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 18211690 - 18211640
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18211690 gatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 18211640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 344 - 394
Target Start/End: Original strand, 20158440 - 20158490
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20158440 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatg 20158490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 344 - 394
Target Start/End: Original strand, 49549075 - 49549125
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49549075 gatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 49549125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 178
Target Start/End: Original strand, 11250930 - 11250991
Alignment:
Q  117 atgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 178  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  11250930 atgttatgttgttgatgatgattgaacgatgtgattacttgctaattgtttattgaagatgc 11250991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 346 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 12486355 - 12486306
Alignment:
Q  346 tgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 395  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12486355 tgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 12486306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 79
Target Start/End: Original strand, 15481980 - 15482045
Alignment:
Q  14 tgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgt 79  Q
    ||||||||| || | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  15481980 tgttgttatattatgatgagatgatgaatatgttgttgttatattattataagatgatgaatatgt 15482045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 17807299 - 17807243
Alignment:
Q  65 aagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgtta 122  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  17807299 aagtgatgaatatgttgttctatatattatt-attattattaagtgaatatcatgtta 17807243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 19857066 - 19857001
Alignment:
Q  14 tgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgt 79  Q
    ||||||||| || | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  19857066 tgttgttatattatgatgagatgatgaatatgttgttgttatattattataagatgatgaatatgt 19857001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 178
Target Start/End: Original strand, 36134286 - 36134346
Alignment:
Q  117 atgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 178  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  36134286 atgttatgttattgatgatgattgaatgctgtgattacttgataattg-ttatcaaagatgc 36134346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 19 - 83
Target Start/End: Original strand, 5757977 - 5758041
Alignment:
Q  19 ttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||   |||||||||||||||    
T  5757977 ttatattttcataagatgatgaatatgttgttgttatattaatacaagaagatgaatatgttgtt 5758041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 16 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 12423281 - 12423211
Alignment:
Q  16 ttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgtt---atattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    ||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12423281 ttgttatatatttataagatgatgaatatgttgttgttgttatattattataaaatgatgaatatgttgtt 12423211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 29 - 83
Target Start/End: Original strand, 23996762 - 23996813
Alignment:
Q  29 ataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23996762 ataagatgatgaata---tgttgttatattattataaaatgatgaatatgttgtt 23996813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 361585 - 361511
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgt 79  Q
    |||||||||||| |||||| || | ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||  ||||||||||||    
T  361585 atgaatatgttgctgttatattattataagatgatgaatatgt-gttgttgtattattataagatgatgaatatgt 361511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 361617 - 361543
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgt 79  Q
    |||||||||| |||||||| || | || |||||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  361617 atgaatatgt-gttgttatattatgatgagatgatgaatatgttgctgttatattattataagatgatgaatatgt 361543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 120 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 15093492 - 15093394
Alignment:
Q  120 ttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttg 216  Q
    |||||||||| |||||| |  ||||  ||||||||||| || ||  ||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  15093492 ttatgttatttatgatgtttaaacgaagtgattacttgatattttattatcaatgatgctatgatgtttaagatgcttatgttgaagatgtttatgttg 15093394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 83
Target Start/End: Original strand, 15481938 - 15482016
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    ||||||||||||||||||| || | |||||||||| |||| | |||||||||||||| || |  ||||||||||||||||    
T  15481938 atgaatatgttgttgttatattattataagatgataaatatg-tgttgttatattatgatgagatgatgaatatgttgtt 15482016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 19857043 - 19856969
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgt 79  Q
    ||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||  ||||||||||||    
T  19857043 atgaatatgttgttgttatattattataagatgatgaatatg-tgttgtagtattattataagatgatgaatatgt 19856969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 344 - 395
Target Start/End: Original strand, 20163891 - 20163942
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 395  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20163891 gatgacgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 20163942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 344 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 30145870 - 30145819
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattat-ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30145870 gatgatgattacatgatgttaagctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 30145819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 12423250 - 12423196
Alignment:
Q  11 tgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataa 65  Q
    |||||||||||| || | |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12423250 tgttgttgttatattattataaaatgatgaatatgttgttgttatattattataa 12423196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 63
Target Start/End: Original strand, 22634787 - 22634841
Alignment:
Q  9 tatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattat 63  Q
    |||||||||||||| || | ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22634787 tatgttgttgttatattattatatgatgatgaatatgttgttgttatattattat 22634841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 344 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 36037038 - 36036988
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36037038 gatgatgattatgagatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 36036988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 121 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 2014544 - 2014465
Alignment:
Q  121 tatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgcta--ttgtttaaga-tgattatg 198  Q
    |||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||| ||||||||    
T  2014544 tatgttattgattatgattgaa-gctgtgattacttggtaattgtttatccaggatgctatgttgtttaagactgattatg 2014465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 14 - 79
Target Start/End: Original strand, 15481915 - 15481980
Alignment:
Q  14 tgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgt 79  Q
    ||||||||| || | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  15481915 tgttgttatattatgatgagatgatgaatatgttgttgttatattattataagatgataaatatgt 15481980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 121 - 198
Target Start/End: Original strand, 16243740 - 16243819
Alignment:
Q  121 tatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgcta--ttgtttaaga-tgattatg 198  Q
    |||||||||||| ||||| ||| | ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  16243740 tatgttattgattatgattgaa-gctgtgactacttgataattgtttatcaaagatgctatgttgtttaagactgattatg 16243819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 117 - 178
Target Start/End: Original strand, 18603067 - 18603127
Alignment:
Q  117 atgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 178  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  18603067 atgttatgtcattgatgatgattgaa-gttgtgattaagtgataattgtttatcaaagatgc 18603127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 203 - 236
Target Start/End: Original strand, 22634750 - 22634783
Alignment:
Q  203 agatgtttatgttgaagatttatgatgttgatta 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22634750 agatgtttatgttgaagatttatgatgttgatta 22634783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 111
Target Start/End: Original strand, 631600 - 631709
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgt---tatattattataaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaatta 100  Q
    ||||||||||||||||||| || | |||| | |||||||| ||||||||   |||||||||||||| |||||  ||||||||    ||||| ||| ||||    
T  631600 atgaatatgttgttgttatattattataaaaagatgaatatgttgttgttgatatattattataaaatgatgtttatgttgtgatgtatataatt-atta 631698  T
Q  101 ttattaagtga 111  Q
    |||||||||||    
T  631699 ttattaagtga 631709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 64
Target Start/End: Original strand, 5757995 - 5758055
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattata 64  Q
    ||||||||||||||||||| ||   | |||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5757995 atgaatatgttgttgttatattaatacaagaagatgaatatgttgttgttatattattata 5758055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 196 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 13569215 - 13569175
Alignment:
Q  196 atgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgatta 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  13569215 atgtttaagatgtttatgttgaagatttatgttgttaatta 13569175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 11 - 82
Target Start/End: Original strand, 17048966 - 17049037
Alignment:
Q  11 tgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgt 82  Q
    |||||||||||| || | |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||    
T  17048966 tgttgttgttatattattataaaatgatgaacatgttgttgttatattattataagatgatgtttatgttgt 17049037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 344 - 395
Target Start/End: Original strand, 20161116 - 20161167
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 395  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  20161116 gatgacgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgataatgt 20161167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 120 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 3412564 - 3412507
Alignment:
Q  120 ttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 178  Q
    |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  3412564 ttatgtcattgatgatgattgaa-gttgtgattaagtgataattgtttatcaaagatgc 3412507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 166 - 221
Target Start/End: Original strand, 13818162 - 13818219
Alignment:
Q  166 ttatcaaagatgctatt--gtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagat 221  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||    
T  13818162 ttatcaatgatgctattatgtttaagatgatgatgtttaagatgattatgtttaagat 13818219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 35 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 15098737 - 15098691
Alignment:
Q  35 tgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttg 81  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  15098737 tgatgattatgttgttgttatattattataagatgatgaatatgttg 15098691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 196 - 238
Target Start/End: Original strand, 15125504 - 15125546
Alignment:
Q  196 atgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatg 238  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  15125504 atgtttaagatggttatgttgaagatttatgttgttaattatg 15125546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 3 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 15876920 - 15876838
Alignment:
Q  3 tatgaatatgttgttg-ttatgttttcataagatgatgaatacgttgttg-ttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||  |||| |||| ||||||    
T  15876920 tatgaatatgttgttgcttatgttattataagatgatgaatatgttgttgcttatgtcattataagatgattaatacgttgtt 15876838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 45 - 83
Target Start/End: Original strand, 17048967 - 17049005
Alignment:
Q  45 gttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  17048967 gttgttgttatattattataaaatgatgaacatgttgtt 17049005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 120 - 178
Target Start/End: Original strand, 17152823 - 17152880
Alignment:
Q  120 ttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 178  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  17152823 ttatgttattgatgacgattgaa-gttgtgattatgtgataattgtttatcaaagatgc 17152880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 120 - 178
Target Start/End: Original strand, 18222717 - 18222774
Alignment:
Q  120 ttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 178  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  || |||||||||||||| |||||    
T  18222717 ttatgttattgatgatgattgaa-gttgtgattatgtgataattgtttatcaatgatgc 18222774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 120 - 178
Target Start/End: Original strand, 18609642 - 18609699
Alignment:
Q  120 ttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 178  Q
    |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  18609642 ttatgtcattgatgatgattgaa-gttgtgattaagtgataattgtttatcaaagatgc 18609699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 345 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 38107031 - 38106981
Alignment:
Q  345 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 395  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  38107031 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgt 38106981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 361650 - 361574
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttg 81  Q
    |||||||||||||| ||| ||| | || |||||||||||| | |||||||||||||| || |  ||||||||||||||    
T  361650 atgaatatgttgtttttaagttattatgagatgatgaatatg-tgttgttatattatgatgagatgatgaatatgttg 361574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 394
Target Start/End: Original strand, 1838053 - 1838102
Alignment:
Q  345 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  1838053 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatg 1838102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 6190134 - 6190069
Alignment:
Q  14 tgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgt 79  Q
    ||||||||| || | || |||||||||||  ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||    
T  6190134 tgttgttatattatgatgagatgatgaatgtgttgtggttatattattataagatgatgaatatgt 6190069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 394
Target Start/End: Original strand, 12033681 - 12033730
Alignment:
Q  345 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  12033681 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatg 12033730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 12486566 - 12486513
Alignment:
Q  11 tgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattata 64  Q
    |||||||||||| || | ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12486566 tgttgttgttatattattatatgaagatgaatatgttgttgttatattattata 12486513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 182 - 215
Target Start/End: Original strand, 13813639 - 13813672
Alignment:
Q  182 tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgtt 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13813639 tgtttaagatgattatgtttaagatgattatgtt 13813672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 394
Target Start/End: Original strand, 14739599 - 14739648
Alignment:
Q  345 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  14739599 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatg 14739648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 394
Target Start/End: Original strand, 15118902 - 15118951
Alignment:
Q  345 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  15118902 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatg 15118951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 18236659 - 18236603
Alignment:
Q  120 ttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatg 177  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||| |||  || |||||||||||||||||||    
T  18236659 ttatgttattgatgatgattgaa-gttgtgtttatgtgataattgtttatcaaagatg 18236603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 198
Target Start/End: Original strand, 19757940 - 19758019
Alignment:
Q  121 tatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgcta--ttgtttaaga-tgattatg 198  Q
    |||||||||||| ||||| | | | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||||    
T  19757940 tatgttattgattatgattgga-gctgtgattacttgataattgtttatcaaagacgctatgttgtttaagactgattatg 19758019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 19781866 - 19781787
Alignment:
Q  121 tatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgcta--ttgtttaaga-tgattatg 198  Q
    |||||||||||| ||||| | | | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||||    
T  19781866 tatgttattgattatgattgga-gctgtgattacttgataattgtttatcaaagacgctatgttgtttaagactgattatg 19781787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 203 - 244
Target Start/End: Original strand, 23996574 - 23996615
Alignment:
Q  203 agatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgtta 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||    
T  23996574 agatgtttatgttgaagatttatgatattggttatgatgtta 23996615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 351 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 28384930 - 28384889
Alignment:
Q  351 attacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatga 392  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28384930 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatga 28384889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 29267275 - 29267226
Alignment:
Q  345 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  29267275 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatg 29267226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 44614900 - 44614851
Alignment:
Q  345 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  44614900 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatg 44614851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 394
Target Start/End: Original strand, 50222889 - 50222938
Alignment:
Q  345 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  50222889 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatg 50222938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 4 - 64
Target Start/End: Original strand, 4562470 - 4562530
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattata 64  Q
    ||||||| ||||||||||| ||   | |||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4562470 atgaatacgttgttgttatattaatacaagaagatgaatatgttgttgttatattattata 4562530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 4 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 9555451 - 9555391
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattata 64  Q
    ||||||| ||||||||||| ||   | |||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9555451 atgaatacgttgttgttatattaatacaagaagatgaatatgttgttgttatattattata 9555391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 4 - 64
Target Start/End: Original strand, 14758611 - 14758671
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattata 64  Q
    ||||||| ||||||||||| ||   | |||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14758611 atgaatacgttgttgttatattaatacaagaagatgaatatgttgttgttatattattata 14758671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 4 - 64
Target Start/End: Original strand, 14955376 - 14955436
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattata 64  Q
    ||||||| ||||||||||| ||   | |||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14955376 atgaatacgttgttgttatattaatacaagaagatgaatatgttgttgttatattattata 14955436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 4 - 51
Target Start/End: Original strand, 17994970 - 17995018
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttg-ttatgttttcataagatgatgaatacgttgttg 51  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||||||    
T  17994970 atgaatatgttgttgcttatgttattataagatgatgaatatgttgttg 17995018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 345 - 381
Target Start/End: Original strand, 18239969 - 18240005
Alignment:
Q  345 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaat 381  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  18239969 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaat 18240005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 29 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 19856986 - 19856895
Alignment:
Q  29 ataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgtt 121  Q
    ||||||||||||||| ||  |  |||||||||||| ||||||||| ||||||||    ||||||| || ||||||||||||||  ||||||||    
T  19856986 ataagatgatgaatatgtattgtttatattattattaagtgatgattatgttgtgttgtatatga-tatttattattaagtgatgattatgtt 19856895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 4 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 25688824 - 25688764
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattata 64  Q
    ||||||| ||||||||||| ||   | |||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25688824 atgaatacgttgttgttatattaatacaagaagatgaatatgttgttgttatattattata 25688764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 4 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 33741221 - 33741161
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattata 64  Q
    ||||||| ||||||||||| ||   | |||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33741221 atgaatacgttgttgttatattaatacaagaagatgaatatgttgttgttatattattata 33741161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 158; Significance: 6e-84; HSPs: 102)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 57 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 18355414 - 18355222
Alignment:
Q  57 ttattataaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattactt 156  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18355414 ttattattaagtgatgaatatgttgttctatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattactt 18355315  T
Q  157 ggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18355314 ggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagacgatattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 18355222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 65 - 235
Target Start/End: Original strand, 40724510 - 40724682
Alignment:
Q  65 aagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattg 164  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40724510 aagtgatgaatatgttgttctatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattg 40724609  T
Q  165 tttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgatt 235  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40724610 tttagcaaagatgctatgatgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgatt 40724682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 65 - 247
Target Start/End: Original strand, 19473659 - 19473842
Alignment:
Q  65 aagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattg 164  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19473659 aagtgatgaatatgttgttctatatatgattaat-attattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattg 19473757  T
Q  165 tttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 247  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19473758 tttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgattatgtttaagatttatgatgttgattatggtgttagta 19473842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 65 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 20295032 - 20294849
Alignment:
Q  65 aagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattg 164  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20295032 aagtgatgaatatgttgttctatatatgattaat-attattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattg 20294934  T
Q  165 tttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 247  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20294933 tttatcaaagatgccatgatgtttaagatgatattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattttggtgttagta 20294849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 57 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 10752175 - 10752026
Alignment:
Q  57 ttattataaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattactt 156  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10752175 ttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattactt 10752076  T
Q  157 ggtaattgtttatcaaagatgctattgtttaagatgattatgtttaagat 206  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10752075 gataattgtttatcaaagatgctattgtttaagatgattatgttgaagat 10752026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 15237852 - 15237977
Alignment:
Q  1 gctatgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaatta 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  15237852 gctatgaatatgttgtcgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttacttaattattataaagtgatgaacatgttgttacatatatgattaatta 15237951  T
Q  101 ttattaagtgaatattatgttatgtt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  15237952 ttattaagtgaatattatgttatgtt 15237977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 15237739 - 15237851
Alignment:
Q  1 gctatgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaatta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15237739 gctatgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttacttaattattataaagtgatgaacatgttgttccatatatgattaatta 15237838  T
Q  101 ttattaagtgaat 113  Q
    |||||||||||||    
T  15237839 ttattaagtgaat 15237851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 118 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 11220045 - 11219915
Alignment:
Q  118 tgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgtt 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  11220045 tgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgattatgtt 11219946  T
Q  216 gaagatttatgatgttgattatggtgttagta 247  Q
     ||||| | | |||||||||||||||||||||    
T  11219945 taagatgt-ttatgttgattatggtgttagta 11219915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 118 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 11224631 - 11224501
Alignment:
Q  118 tgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgtt 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  11224631 tgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgattatgtt 11224532  T
Q  216 gaagatttatgatgttgattatggtgttagta 247  Q
     ||||| | | |||||||||||||||||||||    
T  11224531 taagatgt-ttatgttgattatggtgttagta 11224501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 118 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 11230443 - 11230313
Alignment:
Q  118 tgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgtt 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  11230443 tgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgattatgtt 11230344  T
Q  216 gaagatttatgatgttgattatggtgttagta 247  Q
     ||||| | | |||||||||||||||||||||    
T  11230343 taagatgt-ttatgttgattatggtgttagta 11230313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 118 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 11228454 - 11228330
Alignment:
Q  118 tgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgtt 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  11228454 tgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgattatgtt 11228355  T
Q  216 gaagatttatgatgttgattatggtg 241  Q
     ||||| | | |||||||||||||||    
T  11228354 taagatgt-ttatgttgattatggtg 11228330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 83
Target Start/End: Original strand, 22108175 - 22108254
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22108175 atgaatatgttgttgttatatttttataagatgatgaatatgttgttgttatattattataaaatgatgaatatgttgtt 22108254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 57 - 130
Target Start/End: Original strand, 20911836 - 20911909
Alignment:
Q  57 ttattataaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattg 130  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20911836 ttattattaagtgatgattatgttgtactatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattg 20911909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 4 - 83
Target Start/End: Original strand, 22120320 - 22120399
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22120320 atgagtatgttgttgttatatttctataagatgatgaatatgttgttgttatattattataaaatgatgaatatgttgtt 22120399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 343 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 10751904 - 10751852
Alignment:
Q  343 agatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 395  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10751904 agatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 10751852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 18355120 - 18355045
Alignment:
Q  7 aatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||    
T  18355120 aatatgttgttgttatatttt-ataagatgatgaatacgttgttgttatattaatataagaagatgaatatgttgtt 18355045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 344 - 395
Target Start/End: Original strand, 15238110 - 15238161
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 395  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15238110 gatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 15238161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 344 - 395
Target Start/End: Original strand, 22108442 - 22108493
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 395  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22108442 gatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 22108493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 9 - 83
Target Start/End: Original strand, 5889799 - 5889873
Alignment:
Q  9 tatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||||||||||||| || | ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  5889799 tatgttgttgttatattattataagatgatgaatatgatgttgttatattattataagatgatgaatatgttgtt 5889873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 117 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 23439726 - 23439625
Alignment:
Q  117 atgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgt 214  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||| |  ||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23439726 atgttatgttatttgtgatgattgaatgaagtgattacttgataatttgttatcaatgatgctatgatgtttaagatgattatgttgaagatgtttatgt 23439627  T
Q  215 tg 216  Q
    ||    
T  23439626 tg 23439625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 117 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 23451093 - 23450992
Alignment:
Q  117 atgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgt 214  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||| |  ||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23451093 atgttatgttatttgtgatgattgaatgaagtgattacttgataatttgttatcaatgatgctatgatgtttaagatgattatgttgaagatgtttatgt 23450994  T
Q  215 tg 216  Q
    ||    
T  23450993 tg 23450992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 117 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 23458337 - 23458236
Alignment:
Q  117 atgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgt 214  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |  ||||||||||| |||||  |||| || ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23458337 atgttatgttatttatgatgattgaatgaagtgattacttgataatttgttatgaatgatgctatgatgtttaagatgattatgttgaagatgtttatgt 23458238  T
Q  215 tg 216  Q
    ||    
T  23458237 tg 23458236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 117 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 23462598 - 23462497
Alignment:
Q  117 atgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgt 214  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |  ||||||||||| |||||  |||| || ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23462598 atgttatgttatttatgatgattgaatgaagtgattacttgataatttgttatgaatgatgctatgatgtttaagatgattatgttgaagatgtttatgt 23462499  T
Q  215 tg 216  Q
    ||    
T  23462498 tg 23462497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 57 - 126
Target Start/End: Original strand, 24768164 - 24768232
Alignment:
Q  57 ttattataaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 126  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24768164 ttattattaagtgatgattatgttgtactatatatgattaattattattaagtg-atattatgttatgtt 24768232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 344 - 395
Target Start/End: Original strand, 20912245 - 20912296
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 395  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20912245 gatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 20912296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 83
Target Start/End: Original strand, 22108147 - 22108221
Alignment:
Q  9 tatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||||||||||||| || | |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  22108147 tatgttgttgttatattattataaaatgatgaatatgttgttgttatatttttataagatgatgaatatgttgtt 22108221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 394
Target Start/End: Original strand, 22120584 - 22120634
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22120584 gatgatgattatatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 22120634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 83
Target Start/End: Original strand, 24768227 - 24768300
Alignment:
Q  9 tatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||    
T  24768227 tatgttgttgttatacttt-ataagatgatgaatacgttgttgttatattaatataagaagatgaatatgttgtt 24768300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 11226540 - 11226495
Alignment:
Q  172 aagatgctattgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttga 217  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11226540 aagatgatattgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttga 11226495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 83
Target Start/End: Original strand, 5889827 - 5889909
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttg---ttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    ||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  5889827 atgaatatgatgttgttatattattataagatgatgaatatgttgttgttgttatattattataagatgatgaatatgttgtt 5889909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 209 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 10752038 - 10751998
Alignment:
Q  209 ttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagtacg 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10752038 ttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagtacg 10751998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 83
Target Start/End: Original strand, 19473851 - 19473915
Alignment:
Q  19 ttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||   |||||||||||||||    
T  19473851 ttatattttcataagatgatgaatacgttgttgttatattaatacaagaagatgaatatgttgtt 19473915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 20294840 - 20294776
Alignment:
Q  19 ttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||   |||||||||||||||    
T  20294840 ttatattttcataagatgatgaatacgttgttgttatattaatacaagaagatgaatatgttgtt 20294776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 18354883 - 18354832
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 395  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18354883 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 18354832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 395
Target Start/End: Original strand, 19474165 - 19474216
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 395  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19474165 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 19474216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 20294600 - 20294549
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 395  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20294600 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 20294549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 111
Target Start/End: Original strand, 20912108 - 20912214
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattatta 103  Q
    |||||||| |||||||||| ||   |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||  |||||||    |||||||||| |||||||    
T  20912108 atgaatatattgttgttatattaatataagaagatgaatatgttgttgttatattattataagatgatgtttatgttgcggtatatatgatt-attatta 20912206  T
Q  104 ttaagtga 111  Q
    ||||||||    
T  20912207 ttaagtga 20912214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 83
Target Start/End: Original strand, 22120287 - 22120366
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    ||||||||||||||||||| || | |||| ||||||| || ||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||    
T  22120287 atgaatatgttgttgttatattattataaaatgatgagtatgttgttgttatatttctataagatgatgaatatgttgtt 22120366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 24221623 - 24221568
Alignment:
Q  117 atgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaa 172  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  24221623 atgttatgttattgatgatgattgaatgatgtgattacttgataattgtttatcaa 24221568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 117 - 216
Target Start/End: Original strand, 1859351 - 1859452
Alignment:
Q  117 atgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgt 214  Q
    ||||||||||| |  ||||||| ||| | |||||||||||| || ||  ||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1859351 atgttatgttaattgtgatgattgaatgatgtgattacttgatattttattatcaatgatgttatgatgtttaagatgattatgttaaagatgtttatgt 1859450  T
Q  215 tg 216  Q
    ||    
T  1859451 tg 1859452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 117 - 178
Target Start/End: Original strand, 17919525 - 17919587
Alignment:
Q  117 atgttatgttattgatgatgatcgaac-gttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 178  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17919525 atgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgc 17919587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 344 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 19510548 - 19510498
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19510548 gatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 19510498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 344 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 22339098 - 22339048
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22339098 gatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 22339048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 344 - 394
Target Start/End: Original strand, 23113395 - 23113445
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23113395 gatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 23113445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 344 - 394
Target Start/End: Original strand, 28372074 - 28372124
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28372074 gatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 28372124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 344 - 394
Target Start/End: Original strand, 37600001 - 37600051
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37600001 gatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 37600051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 344 - 394
Target Start/End: Original strand, 38146411 - 38146461
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38146411 gatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 38146461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 17410239 - 17410179
Alignment:
Q  117 atgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 178  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  17410239 atgttatgttattggtgatgattgaatgttgtgattacttgataattg-ttatcaaagatgc 17410179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 18355213 - 18355146
Alignment:
Q  19 ttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgtt---atattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18355213 ttatatttttataagatgatgaatatgttgttgtttttatattattataaaatgatgaatatgttgtt 18355146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 83
Target Start/End: Original strand, 22120284 - 22120333
Alignment:
Q  34 atgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  22120284 atgatgaatatgttgttgttatattattataaaatgatgagtatgttgtt 22120333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 121 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 33408993 - 33408914
Alignment:
Q  121 tatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgcta--ttgtttaaga-tgattatg 198  Q
    |||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  33408993 tatgttattgattatgattgaa-gctgtgattacttgataattgtttatcaaagatgctatgttgtttaagactgattatg 33408914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 393
Target Start/End: Original strand, 41878644 - 41878693
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgat 393  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41878644 gatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgat 41878693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 11 - 63
Target Start/End: Original strand, 5889870 - 5889922
Alignment:
Q  11 tgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattat 63  Q
    |||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5889870 tgttgttgttatattattataagatgatgaatatgttgttgttatattattat 5889922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 9 - 96
Target Start/End: Original strand, 21742235 - 21742323
Alignment:
Q  9 tatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttg-ttatattattataaagtgatgaatatgttgttccatatatgatta 96  Q
    |||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| |  ||||||||||||||||   ||||||||||    
T  21742235 tatgttgttgttatattattataagatgatgaatatgttgttgtttatatgattatgagatgatgaatatgttgttgtctatatgatta 21742323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 356 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 9775014 - 9774975
Alignment:
Q  356 atgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 395  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9775014 atgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 9774975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 344 - 395
Target Start/End: Original strand, 24768555 - 24768606
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 395  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  24768555 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacctgatgatgt 24768606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 18773970 - 18773913
Alignment:
Q  120 ttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 178  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  18773970 ttatgttattgatgatgattgaa-gttgtgattatgtgataattgtttatcaaagatgc 18773913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 18783813 - 18783756
Alignment:
Q  120 ttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 178  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  18783813 ttatgttattgatgatgattgaa-gttgtgattatgtgataattgtttatcaaagatgc 18783756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 344 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 22335568 - 22335518
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22335568 gatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtatttgatgatg 22335518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 344 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 22749247 - 22749197
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22749247 gatgatgattatgtgatgttatctatgagtggttaaatgtacttgatgatg 22749197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 178
Target Start/End: Original strand, 23535904 - 23535962
Alignment:
Q  120 ttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 178  Q
    ||||||||||||||||||| |||   |||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  23535904 ttatgttattgatgatgattgaaatctgtgattacttgataactgtttatcaaagatgc 23535962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 178
Target Start/End: Original strand, 26743084 - 26743141
Alignment:
Q  120 ttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 178  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  26743084 ttatgttgttgatgatgattgaa-gttgtgattacgtgataattgtttatcaaagatgc 26743141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 352 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 36459626 - 36459584
Alignment:
Q  352 ttacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36459626 ttacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttaatgatg 36459584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 11226472 - 11226427
Alignment:
Q  19 ttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattata 64  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11226472 ttatattttgataagatgatgaatatgttgttgttatattattata 11226427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 182 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 11226545 - 11226481
Alignment:
Q  182 tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 247  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||| | | |||||||||||||||||||||    
T  11226545 tgtttaagatgatattgtttaagatgattatgtttaagatgt-ttatgttgattatggtgttagta 11226481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 18355091 - 18355031
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattata 64  Q
    ||||||| ||||||||||| ||   |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18355091 atgaatacgttgttgttatattaatataagaagatgaatatgttgttgttatattattata 18355031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 64
Target Start/End: Original strand, 24768254 - 24768314
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattata 64  Q
    ||||||| ||||||||||| ||   |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24768254 atgaatacgttgttgttatattaatataagaagatgaatatgttgttgttatattattata 24768314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 55 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 29447447 - 29447377
Alignment:
Q  55 tattattataaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 126  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||    
T  29447447 tattattattaagtgatgattatgttgtgctgtatatgattaa-tattattaagtgatgattatgttgtgtt 29447377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 117 - 178
Target Start/End: Original strand, 123685 - 123747
Alignment:
Q  117 atgttatgttattgatgatgatcg-aacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 178  Q
    |||||||||||||||||||||| | || | |||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  123685 atgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttattgaagatgc 123747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 120 - 178
Target Start/End: Original strand, 17730747 - 17730804
Alignment:
Q  120 ttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 178  Q
    |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  17730747 ttatgtcattgatgatgattgaa-gttgtgattaagtgataattgtttatcaaagatgc 17730804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 200 - 238
Target Start/End: Original strand, 18770395 - 18770433
Alignment:
Q  200 ttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatg 238  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18770395 ttaagatgcttatgttgaagatttatgatgttaattatg 18770433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 182 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 20766662 - 20766628
Alignment:
Q  182 tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttg 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20766662 tgtttaagatgattatgttgaagatgtttatgttg 20766628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 117 - 200
Target Start/End: Original strand, 21367052 - 21367137
Alignment:
Q  117 atgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |  ||||||||||| || ||  ||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  21367052 atgttatgttatttatgatgattgaatgaagtgattacttgatattttattatcaatgatgctatgatgtttaagatgtttatgtt 21367137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 120 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 42805187 - 42805130
Alignment:
Q  120 ttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 178  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||   | ||||||||||||||||||||    
T  42805187 ttatgttattgatgatgattgaa-gttgtgattatgcgataattgtttatcaaagatgc 42805130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 394
Target Start/End: Original strand, 265311 - 265360
Alignment:
Q  345 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  265311 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatg 265360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 394
Target Start/End: Original strand, 10733481 - 10733530
Alignment:
Q  345 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  10733481 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatg 10733530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 351 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 19075968 - 19075927
Alignment:
Q  351 attacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatga 392  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19075968 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatga 19075927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 20908624 - 20908575
Alignment:
Q  345 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  20908624 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatg 20908575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 29345593 - 29345544
Alignment:
Q  345 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  29345593 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatg 29345544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 29348074 - 29348025
Alignment:
Q  345 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  29348074 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatg 29348025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 29350547 - 29350498
Alignment:
Q  345 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  29350547 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatg 29350498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 31143900 - 31143851
Alignment:
Q  345 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  31143900 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatg 31143851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 126
Target Start/End: Original strand, 40727230 - 40727259
Alignment:
Q  97 attattattaagtgaatattatgttatgtt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40727230 attattattaagtgaatattatgttatgtt 40727259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 394
Target Start/End: Original strand, 42245906 - 42245955
Alignment:
Q  345 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  42245906 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatg 42245955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 4 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 262701 - 262578
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttg-ttatgttttcataagatgatgaatacgttgttg-ttatattattataaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattat 101  Q
    ||||||||||||||| || |||| | |||||||||||| || ||||||| |||| ||||||| |  |||||| ||||||||    ||||||||| || ||    
T  262701 atgaatatgttgttgcttgtgttattataagatgatgattatgttgttgtttatgttattatgagatgatgattatgttgtgttgtatatgatt-atgat 262603  T
Q  102 tattaagtgaatattatgttatgtt 126  Q
    ||||||||||  |||||||| ||||    
T  262602 tattaagtgatgattatgttgtgtt 262578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 363 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 11219622 - 11219590
Alignment:
Q  363 tatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 395  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11219622 tatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 11219590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 363 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 11224208 - 11224176
Alignment:
Q  363 tatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 395  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11224208 tatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 11224176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 363 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 11226224 - 11226192
Alignment:
Q  363 tatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 395  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11226224 tatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 11226192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 363 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 11228030 - 11227998
Alignment:
Q  363 tatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 395  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11228030 tatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 11227998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 363 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 11230020 - 11229988
Alignment:
Q  363 tatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 395  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11230020 tatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 11229988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 121 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 16673918 - 16673863
Alignment:
Q  121 tatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatg 177  Q
    |||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  16673918 tatgttattgattatgattgaa-gctgtgattacttgataattgtttattaaagatg 16673863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 4 - 64
Target Start/End: Original strand, 19473869 - 19473929
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattata 64  Q
    ||||||| ||||||||||| ||   | |||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19473869 atgaatacgttgttgttatattaatacaagaagatgaatatgttgttgttatattattata 19473929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 4 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 20294822 - 20294762
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattata 64  Q
    ||||||| ||||||||||| ||   | |||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20294822 atgaatacgttgttgttatattaatacaagaagatgaatatgttgttgttatattattata 20294762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 196 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 21276056 - 21276016
Alignment:
Q  196 atgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgatta 236  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  21276056 atgtttaagatgcttttgttgaagatttatgatgttaatta 21276016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 196 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 21886943 - 21886903
Alignment:
Q  196 atgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgatta 236  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  21886943 atgtttaagatgcttacgttgaagatttatgatgttaatta 21886903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 196 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 23201013 - 23200973
Alignment:
Q  196 atgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgatta 236  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  23201013 atgtttaagatgcttatgttgaagatttatgttgttaatta 23200973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 196 - 236
Target Start/End: Original strand, 23501773 - 23501813
Alignment:
Q  196 atgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgatta 236  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  23501773 atgtttaagatgcttatgttgaagatttatgttgttaatta 23501813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 4 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 24212033 - 24211985
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttg-ttatgttttcataagatgatgaatacgttgttg 51  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||||||    
T  24212033 atgaatatgttgttgcttatgttattataagatgatgaatatgttgttg 24211985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 196 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 26703731 - 26703691
Alignment:
Q  196 atgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgatta 236  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  26703731 atgtttaagatgcttatgttgaagatttatgttgttaatta 26703691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 196 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 26973464 - 26973424
Alignment:
Q  196 atgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgatta 236  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  26973464 atgtttaagatgcttatgttgaagatttatgttgttaatta 26973424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 9 - 53
Target Start/End: Original strand, 29915654 - 29915698
Alignment:
Q  9 tatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgtt 53  Q
    ||||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||    
T  29915654 tatgttgttgtgatattattataagatgatgaatacgttgttgtt 29915698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 36 - 64
Target Start/End: Original strand, 40727171 - 40727199
Alignment:
Q  36 gatgaatacgttgttgttatattattata 64  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40727171 gatgaatacgttgttgttatattattata 40727199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525 (Bit Score: 146; Significance: 8e-77; HSPs: 3)
Name: scaffold0525
Description:

Target: scaffold0525; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 65 - 247
Target Start/End: Original strand, 4833 - 5016
Alignment:
Q  65 aagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattg 164  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4833 aagtgatgaatatgttgttctatatatgattaat-attattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattg 4931  T
Q  165 tttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 247  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4932 tttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattttggtgttagta 5016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 83
Target Start/End: Original strand, 5025 - 5089
Alignment:
Q  19 ttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||  |||||||||||||||    
T  5025 ttatgttttcataagatgatgaatatgttgttgttatattaatacaaaaagatgaatatgttgtt 5089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 4 - 64
Target Start/End: Original strand, 5043 - 5103
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattata 64  Q
    ||||||||||||||||||| ||   | || | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5043 atgaatatgttgttgttatattaatacaaaaagatgaatatgttgttgttatattattata 5103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 146; Significance: 8e-77; HSPs: 87)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 65 - 247
Target Start/End: Original strand, 21977607 - 21977790
Alignment:
Q  65 aagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattg 164  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21977607 aagtgatgaatatgttgttctatatatgattaat-attattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattg 21977705  T
Q  165 tttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 247  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21977706 tttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattttggtgttagta 21977790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 65 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 22111182 - 22110999
Alignment:
Q  65 aagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattg 164  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22111182 aagtgatgaatatgttgttctatatatgattaat-attattaaatgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattg 22111084  T
Q  165 tttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 247  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22111083 tttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattttggtgttagta 22110999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 65 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 43250942 - 43250759
Alignment:
Q  65 aagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattg 164  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43250942 aagtgatgaatatgttgttctatatatgattaat-attattaaatgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattg 43250844  T
Q  165 tttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 247  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43250843 tttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattttggtgttagta 43250759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 65 - 247
Target Start/End: Original strand, 21973516 - 21973699
Alignment:
Q  65 aagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattg 164  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21973516 aagtgataaatatgttgttctatatatgattaat-attattaagtgaatattatgttatgttattgataatgatcgaatgttgtgattacttggtaattg 21973614  T
Q  165 tttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 247  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21973615 tttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattttggtgttagta 21973699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 57 - 247
Target Start/End: Original strand, 21828943 - 21829149
Alignment:
Q  57 ttattataaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattactt 156  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21828943 ttattattaagtgatgaatatgttgttctatatatgattaat-attattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattactt 21829041  T
Q  157 ggtaattgtttatcaaagatgc-----------------tattgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatgg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||                 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21829042 ggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattttgg 21829141  T
Q  240 tgttagta 247  Q
    ||||||||    
T  21829142 tgttagta 21829149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 57 - 247
Target Start/End: Original strand, 30941077 - 30941283
Alignment:
Q  57 ttattataaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattactt 156  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30941077 ttattattaagtgatgaatatgttgttctatatatgattaat-attattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattactt 30941175  T
Q  157 ggtaattgtttatcaaagatgc-----------------tattgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatgg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||                 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30941176 ggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgattatatttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatgg 30941275  T
Q  240 tgttagta 247  Q
    ||||||||    
T  30941276 tgttagta 30941283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 78 - 221
Target Start/End: Original strand, 18863623 - 18863767
Alignment:
Q  78 gttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatg 177  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18863623 gttgttctatatatgattaat-attattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttgtcaaagatg 18863721  T
Q  178 ctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagat 221  Q
    ||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||    
T  18863722 ctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgattatgtttaagat 18863767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 182 - 247
Target Start/End: Original strand, 18863758 - 18863823
Alignment:
Q  182 tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18863758 tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 18863823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 57 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 21410156 - 21410088
Alignment:
Q  57 ttattataaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgt 125  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21410156 ttattattaagtgatgaatatgttgtactatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgt 21410088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 57 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 21804648 - 21804580
Alignment:
Q  57 ttattataaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgt 125  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21804648 ttattattaagtgatgaatatgttgtactatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgt 21804580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 57 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 21386476 - 21386407
Alignment:
Q  57 ttattataaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 126  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21386476 ttattattaagtgatgaatatgttgtactatatatgattaattattattaagtgaatgttatgttatgtt 21386407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 65 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 21386576 - 21386515
Alignment:
Q  65 aagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 126  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21386576 aagtgatgaatatgttgtactatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 21386515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 3 - 65
Target Start/End: Original strand, 15924281 - 15924343
Alignment:
Q  3 tatgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataa 65  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15924281 tatgaatatgttattgttatattttcataagatgatgaatacgttgttgttatattaatataa 15924343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 57 - 126
Target Start/End: Original strand, 14398770 - 14398839
Alignment:
Q  57 ttattataaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 126  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14398770 ttattattaagtaatgaatatgttgtaatatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 14398839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 82
Target Start/End: Original strand, 20983495 - 20983573
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgt 82  Q
    ||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  20983495 atgaatatgttgttgttatattattataagatgaggaatatgttgatgttatattattataagatgatgaatatgttgt 20983573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 344 - 394
Target Start/End: Original strand, 44385826 - 44385876
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44385826 gatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 44385876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 117 - 178
Target Start/End: Original strand, 20856811 - 20856872
Alignment:
Q  117 atgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 178  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20856811 atgttatgttattgatgatgattgaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgc 20856872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 119
Target Start/End: Original strand, 15924230 - 15924284
Alignment:
Q  65 aagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatg 119  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15924230 aagtgatgaatatgttgtactatatatgattaattattattaagtgaatgttatg 15924284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 21386245 - 21386195
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21386245 gatgatgattacatgatgttatctaggagttgttaaatgtacttgatgatg 21386195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 23427912 - 23427862
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23427912 gatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttaatgatg 23427862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 23913351 - 23913301
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23913351 gatgatgattacatgatgttatctataagttgttaaatgtacttgatgatg 23913301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 83
Target Start/End: Original strand, 20983530 - 20983607
Alignment:
Q  6 gaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||||||||| |||||| || | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  20983530 gaatatgttgatgttatattattataagatgatgaatatgttgtggttatattattataagatgataaatatgttgtt 20983607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 79
Target Start/End: Original strand, 38550622 - 38550687
Alignment:
Q  14 tgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgt 79  Q
    ||||||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  38550622 tgttgttatattttgatgagatgatgaatatgttgttgttatattattataagatgatgaatatgt 38550687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 128
Target Start/End: Original strand, 1323835 - 1323957
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattatta 103  Q
    |||||||||| |||||| | || | ||||||||||||||| ||  |  |||||||||||| ||||||||| ||||||||    |||||||||| ||||||    
T  1323835 atgaatatgt-gttgttgtattattataagatgatgaatatgtattgtttatattattattaagtgatgattatgttgtgttgtatatgatta-ttatta 1323932  T
Q  104 ttaagtgaatattatgttatgttat 128  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||    
T  1323933 ttaagtgattattatgttatattat 1323957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 22110990 - 22110926
Alignment:
Q  19 ttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||   |||||||||||||||    
T  22110990 ttatattttcataagatgatgaatacgttgttgttatattaatacaagaagatgaatatgttgtt 22110926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 43250750 - 43250686
Alignment:
Q  19 ttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||   |||||||||||||||    
T  43250750 ttatattttcataagatgatgaatacgttgttgttatattaatacaagaagatgaatatgttgtt 43250686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 79
Target Start/End: Original strand, 13428702 - 13428776
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgt 79  Q
    ||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  13428702 atgaatatgttgttgctatattattataagatgatgaatatgt-gttgttgtattattataaaatgatgaatatgt 13428776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 64
Target Start/End: Original strand, 14398834 - 14398889
Alignment:
Q  9 tatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattata 64  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14398834 tatgttgttgttatatttttataagaagatgaatatgttgttgttatattattata 14398889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 395
Target Start/End: Original strand, 14399085 - 14399136
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 395  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14399085 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 14399136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 395
Target Start/End: Original strand, 21974176 - 21974227
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 395  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21974176 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 21974227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 395
Target Start/End: Original strand, 21978286 - 21978337
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 395  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21978286 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 21978337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 79
Target Start/End: Original strand, 38550710 - 38550784
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgt 79  Q
    ||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||  ||||||||||||    
T  38550710 atgaatatgttgttgttatattattataagatgatgaatatg-tgttgttgtattattataagatgatgaatatgt 38550784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 43250288 - 43250237
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 395  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43250288 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 43250237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 120 - 178
Target Start/End: Original strand, 16231813 - 16231870
Alignment:
Q  120 ttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 178  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16231813 ttatgttattgatgatgattgaa-gctgtgattacttgataattgtttatcaaagatgc 16231870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 352 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 21328644 - 21328602
Alignment:
Q  352 ttacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21328644 ttacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 21328602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 344 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 21409987 - 21409937
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21409987 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatg 21409937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 344 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 21804479 - 21804429
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21804479 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatg 21804429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 120 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 22044651 - 22044594
Alignment:
Q  120 ttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 178  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22044651 ttatgttattgatgatgattgaa-gctgtgattacttgataattgtttatcaaagatgc 22044594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 82
Target Start/End: Original strand, 5610331 - 5610380
Alignment:
Q  33 gatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgt 82  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  5610331 gatgatgaatatgttgttgttatattattattaagtgatgattatgttgt 5610380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 121 - 198
Target Start/End: Original strand, 23847355 - 23847434
Alignment:
Q  121 tatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgcta--ttgtttaaga-tgattatg 198  Q
    |||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  23847355 tatgttattgattatgattgaa-gctgtgattacttgataattgtttatcaaagatgctatgttgtttaagactgattatg 23847434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 147 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 16184410 - 16184339
Alignment:
Q  147 gtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttg 216  Q
    ||||||||||| || ||  ||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16184410 gtgattacttgatattttattatcaatgatgctatgatgtttaagatgtttatgtttaagatgtttatgttg 16184339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 29 - 81
Target Start/End: Original strand, 20983487 - 20983539
Alignment:
Q  29 ataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttg 81  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  20983487 ataagatgatgaatatgttgttgttatattattataagatgaggaatatgttg 20983539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 19 - 83
Target Start/End: Original strand, 21973708 - 21973772
Alignment:
Q  19 ttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||   |||||||||||||||    
T  21973708 ttatattttcataagatgatgaataccttgttgttatattaatacaagaagatgaatatgttgtt 21973772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 19 - 59
Target Start/End: Original strand, 21977799 - 21977839
Alignment:
Q  19 ttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatatta 59  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21977799 ttatattttcataagatgatgaatacgttgttgttatatta 21977839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 83
Target Start/End: Original strand, 1323737 - 1323815
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    ||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| | |||||||||||||| || |  |||||||| |||||||    
T  1323737 atgaatatgttgttgttatattattataagatgatgaatatg-tgttgttatattatgatgagatgatgaatttgttgtt 1323815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 79
Target Start/End: Original strand, 27472940 - 27473014
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgt 79  Q
    |||||||||||||||||| ||| | || |||||||||||| | ||||||| |||||||||||  ||||||||||||    
T  27472940 atgaatatgttgttgttaagttattatgagatgatgaatatg-tgttgttgtattattataagatgatgaatatgt 27473014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 344 - 394
Target Start/End: Original strand, 27942677 - 27942728
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattat-ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27942677 gatgatgattacatgatgttaagctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 27942728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 83
Target Start/End: Original strand, 38550645 - 38550723
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    ||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| | ||||||| |||||| || |  ||||||||||||||||    
T  38550645 atgaatatgttgttgttatattattataagatgatgaatatg-tgttgttgtattatgatgagatgatgaatatgttgtt 38550723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 32 - 79
Target Start/End: Original strand, 38550705 - 38550752
Alignment:
Q  32 agatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgt 79  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  38550705 agatgatgaatatgttgttgttatattattataagatgatgaatatgt 38550752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 23833939 - 23833882
Alignment:
Q  120 ttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 178  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  23833939 ttatgttattgatgatgattgaa-gttgtgattatgtgataattgtttatcaaagatgc 23833882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 23913442 - 23913389
Alignment:
Q  9 tatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattat 63  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  23913442 tatgttgttgttatatttttataagatgatgaata-gttgttgatatattattat 23913389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 34 - 79
Target Start/End: Original strand, 1323734 - 1323779
Alignment:
Q  34 atgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgt 79  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  1323734 atgatgaatatgttgttgttatattattataagatgatgaatatgt 1323779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 14 - 79
Target Start/End: Original strand, 13428679 - 13428744
Alignment:
Q  14 tgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgt 79  Q
    ||||||||| || | || |||||||||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||    
T  13428679 tgttgttatattatgatgagatgatgaatatgttgttgctatattattataagatgatgaatatgt 13428744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 5 - 96
Target Start/End: Original strand, 16402230 - 16402323
Alignment:
Q  5 tgaatatgttgttg-ttatgttttcataagatgatgaatacgttgttg-ttatattattataaagtgatgaatatgttgttccatatatgatta 96  Q
    |||||||||||||  ||||||| | |||||||| |||||| ||||||  |||| |||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  16402230 tgaatatgttgttccttatgttattataagatgctgaatatgttgtttcttatgttattataagatgatgaatatgttgttctttatatgatta 16402323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 351 - 392
Target Start/End: Original strand, 21967992 - 21968033
Alignment:
Q  351 attacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatga 392  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21967992 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgatga 21968033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 351 - 392
Target Start/End: Original strand, 21980832 - 21980873
Alignment:
Q  351 attacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatga 392  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21980832 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgatga 21980873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 351 - 392
Target Start/End: Original strand, 21985815 - 21985856
Alignment:
Q  351 attacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatga 392  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21985815 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgatga 21985856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 351 - 392
Target Start/End: Original strand, 22000778 - 22000819
Alignment:
Q  351 attacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatga 392  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22000778 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgatga 22000819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 351 - 392
Target Start/End: Original strand, 22009196 - 22009237
Alignment:
Q  351 attacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatga 392  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22009196 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgatga 22009237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 351 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 34950165 - 34950124
Alignment:
Q  351 attacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatga 392  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34950165 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgatga 34950124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 4 - 79
Target Start/End: Original strand, 1323770 - 1323844
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgt 79  Q
    |||||||||| |||||||| || | || |||||||||||  ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||    
T  1323770 atgaatatgt-gttgttatattatgatgagatgatgaatttgttgttgctatattattataagatgatgaatatgt 1323844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 203 - 238
Target Start/End: Original strand, 19259961 - 19259996
Alignment:
Q  203 agatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatg 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19259961 agatgtttatgttgaagatttatgatgttaattatg 19259996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 199 - 238
Target Start/End: Original strand, 20466450 - 20466489
Alignment:
Q  199 tttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatg 238  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20466450 tttaagatgcttatgttgaagatttatgatgttaattatg 20466489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 55 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 23913507 - 23913437
Alignment:
Q  55 tattattataaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 126  Q
    ||||||||| || |||||| ||||||||   | ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23913507 tattattattaaatgatgattatgttgtattagatatgatta-ttattattaagttaatattatgttatgtt 23913437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 352 - 391
Target Start/End: Original strand, 42560882 - 42560921
Alignment:
Q  352 ttacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatg 391  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42560882 ttacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacgtgatg 42560921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 351 - 394
Target Start/End: Original strand, 44494223 - 44494266
Alignment:
Q  351 attacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44494223 attacatgatgttacctatgaattgttaaatgtacttgatgatg 44494266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 1484014 - 1483965
Alignment:
Q  345 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  1484014 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatg 1483965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 4482924 - 4482875
Alignment:
Q  345 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  4482924 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatg 4482875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 394
Target Start/End: Original strand, 4542922 - 4542971
Alignment:
Q  345 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  4542922 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatg 4542971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 394
Target Start/End: Original strand, 5853841 - 5853890
Alignment:
Q  345 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  5853841 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatg 5853890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 83
Target Start/End: Original strand, 14103570 - 14103651
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttg-ttatgttttcataagatgatgaatacgttgttg-ttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    ||||||||||||||| ||||| | | |||||||||||| || ||||||| |||| ||||||| |  ||||||||||||||||    
T  14103570 atgaatatgttgttgtttatgctattataagatgatgattatgttgttgtttatgttattatgagatgatgaatatgttgtt 14103651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 14823387 - 14823338
Alignment:
Q  345 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  14823387 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatg 14823338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 394
Target Start/End: Original strand, 18678574 - 18678623
Alignment:
Q  345 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  18678574 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatg 18678623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 394
Target Start/End: Original strand, 18717763 - 18717812
Alignment:
Q  345 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  18717763 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatg 18717812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 20402839 - 20402790
Alignment:
Q  345 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  20402839 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatg 20402790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 196 - 237
Target Start/End: Original strand, 21169188 - 21169229
Alignment:
Q  196 atgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattat 237  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  21169188 atgtttaagatgcttatgttgaagatgtatgatgtttattat 21169229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 22001373 - 22001324
Alignment:
Q  345 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  22001373 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatg 22001324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 64
Target Start/End: Original strand, 30941320 - 30941373
Alignment:
Q  11 tgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattata 64  Q
    |||||||||||| || | ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30941320 tgttgttgttatattattatatgaagatgaatatgttgttgttatattattata 30941373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 356 - 392
Target Start/End: Original strand, 11252087 - 11252123
Alignment:
Q  356 atgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatga 392  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11252087 atgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgatga 11252123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 363 - 395
Target Start/End: Original strand, 18864116 - 18864148
Alignment:
Q  363 tatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 395  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18864116 tatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 18864148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 196 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 19898741 - 19898701
Alignment:
Q  196 atgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgatta 236  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||    
T  19898741 atgtttaagatgcttatgttgaagttttatgttgttgatta 19898701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 196 - 236
Target Start/End: Original strand, 21162523 - 21162563
Alignment:
Q  196 atgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgatta 236  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  21162523 atgtttaagatgcttatgttgaagatgtatgatgttaatta 21162563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 363 - 395
Target Start/End: Original strand, 21829472 - 21829504
Alignment:
Q  363 tatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 395  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21829472 tatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 21829504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 4 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 22110972 - 22110912
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattata 64  Q
    ||||||| ||||||||||| ||   | |||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22110972 atgaatacgttgttgttatattaatacaagaagatgaatatgttgttgttatattattata 22110912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 196 - 236
Target Start/End: Original strand, 23777298 - 23777338
Alignment:
Q  196 atgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgatta 236  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  23777298 atgtttaagatgcttttgttgaagatttatgatgttaatta 23777338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 363 - 395
Target Start/End: Original strand, 30941576 - 30941608
Alignment:
Q  363 tatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 395  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30941576 tatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 30941608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 4 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 43250732 - 43250672
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattata 64  Q
    ||||||| ||||||||||| ||   | |||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43250732 atgaatacgttgttgttatattaatacaagaagatgaatatgttgttgttatattattata 43250672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 146; Significance: 8e-77; HSPs: 79)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 65 - 247
Target Start/End: Original strand, 10102783 - 10102966
Alignment:
Q  65 aagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattg 164  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10102783 aagtgatgaatatgttgttctatatatgattaat-attattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattg 10102881  T
Q  165 tttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 247  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10102882 tttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattttggtgttagta 10102966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 65 - 247
Target Start/End: Original strand, 24629454 - 24629637
Alignment:
Q  65 aagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattg 164  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24629454 aagtgatgaatatgttgttctatatatgattaat-attattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattg 24629552  T
Q  165 tttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 247  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24629553 tttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattttggtgttagta 24629637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 65 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 24648486 - 24648303
Alignment:
Q  65 aagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattg 164  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24648486 aagtgatgaatatgttgttctatatatgattaat-attattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattg 24648388  T
Q  165 tttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 247  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24648387 tttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattttggtgttagta 24648303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 65 - 247
Target Start/End: Original strand, 30345990 - 30346173
Alignment:
Q  65 aagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattg 164  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30345990 aagtgatgaatatgttgttctatatatgattaat-attattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattg 30346088  T
Q  165 tttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 247  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30346089 tttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattttggtgttagta 30346173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 66 - 247
Target Start/End: Original strand, 27380328 - 27380510
Alignment:
Q  66 agtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgt 165  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27380328 agtgatgaatatgttgttctatatatgattaat-attattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgt 27380426  T
Q  166 ttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 247  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27380427 ttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattttggtgttagta 27380510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 66 - 247
Target Start/End: Original strand, 27384374 - 27384556
Alignment:
Q  66 agtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgt 165  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27384374 agtgatgaatatgttgttctatatatgattaat-attattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgt 27384472  T
Q  166 ttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 247  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27384473 ttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattttggtgttagta 27384556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 65 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 27600963 - 27600780
Alignment:
Q  65 aagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattg 164  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27600963 aagtgatgaatatgttgttctatatatgattaat-attattaaatgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattg 27600865  T
Q  165 tttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 247  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27600864 tttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattttggtgttagta 27600780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 57 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 1282590 - 1282384
Alignment:
Q  57 ttattataaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattactt 156  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  1282590 ttattattaagtgatgaatatgttgttctatatatgattaat-attattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcaaatgttgtgattactt 1282492  T
Q  157 ggtaattgtttatcaaagatgc-----------------tattgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatgg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||                 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1282491 ggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatgg 1282392  T
Q  240 tgttagta 247  Q
    ||||||||    
T  1282391 tgttagta 1282384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 57 - 221
Target Start/End: Original strand, 41531940 - 41532105
Alignment:
Q  57 ttattataaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattactt 156  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41531940 ttattattaagtgatgaatatgttgttctatatatgattaat-attattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattactt 41532038  T
Q  157 ggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagat 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||    
T  41532039 ggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgattatgtttaagat 41532105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 182 - 247
Target Start/End: Original strand, 41532096 - 41532161
Alignment:
Q  182 tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41532096 tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 41532161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 59 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 31344346 - 31344279
Alignment:
Q  59 attataaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 126  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31344346 attattaagtgatgattatgttgtaccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 31344279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 117 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 24174546 - 24174485
Alignment:
Q  117 atgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 178  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24174546 atgttatgttattgatgatgattgaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgc 24174485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 117 - 221
Target Start/End: Original strand, 22812291 - 22812397
Alignment:
Q  117 atgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgt 214  Q
    |||||||| |||| |||| ||| ||| |  ||||||||||| || ||  ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22812291 atgttatgatatttatgaagatagaatgaagtgattacttgatattttattatcaatgatgctatgatgtttaagatgattatgtttaagatgattatgt 22812390  T
Q  215 tgaagat 221  Q
    |||||||    
T  22812391 tgaagat 22812397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 9784080 - 9784030
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9784080 gatgatgattacatgatgttatctatgagttgtttaatgtacttgatgatg 9784030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 126
Target Start/End: Original strand, 12902360 - 12902420
Alignment:
Q  65 aagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 126  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  12902360 aagtgatgaatatgttgttctatatatgattaa-tattattaagtgaatatcatgctatgtt 12902420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 83
Target Start/End: Original strand, 10102975 - 10103039
Alignment:
Q  19 ttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||   |||||||||||||||    
T  10102975 ttatattttcataagatgatgaatacgttgttgttatattaatacaagaagatgaatatgttgtt 10103039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 83
Target Start/End: Original strand, 24629646 - 24629710
Alignment:
Q  19 ttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||   |||||||||||||||    
T  24629646 ttatattttcataagatgatgaatacgttgttgttatattaatacaagaagatgaatatgttgtt 24629710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 27600771 - 27600707
Alignment:
Q  19 ttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||   |||||||||||||||    
T  27600771 ttatattttcataagatgatgaatacgttgttgttatattaatacaagaagatgaatatgttgtt 27600707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 83
Target Start/End: Original strand, 30346182 - 30346246
Alignment:
Q  19 ttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||   |||||||||||||||    
T  30346182 ttatattttcataagatgatgaatacgttgttgttatattaatacaagaagatgaatatgttgtt 30346246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 395
Target Start/End: Original strand, 24630040 - 24630091
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 395  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24630040 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 24630091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 24645237 - 24645186
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 395  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24645237 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 24645186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 24648013 - 24647962
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 395  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24648013 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 24647962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 395
Target Start/End: Original strand, 27380986 - 27381037
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 395  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27380986 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 27381037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 395
Target Start/End: Original strand, 27384956 - 27385007
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 395  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27384956 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 27385007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 27600457 - 27600406
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 395  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27600457 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 27600406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 395
Target Start/End: Original strand, 30346650 - 30346701
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 395  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30346650 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 30346701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 344 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 6481870 - 6481820
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6481870 gatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 6481820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 344 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 6485337 - 6485287
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6485337 gatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 6485287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 344 - 394
Target Start/End: Original strand, 19663550 - 19663600
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19663550 gatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 19663600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 120 - 182
Target Start/End: Original strand, 19928841 - 19928902
Alignment:
Q  120 ttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatt 182  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19928841 ttatgttattgattatgattgaa-gctgtgattacttgataattgtttatcaaagatgctatt 19928902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 344 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 20260343 - 20260293
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20260343 gatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 20260293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 344 - 394
Target Start/End: Original strand, 21074500 - 21074550
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21074500 gatgatgacaacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 21074550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 117 - 178
Target Start/End: Original strand, 25961903 - 25961965
Alignment:
Q  117 atgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtga-ttacttggtaattgtttatcaaagatgc 178  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25961903 atgttatgttattgatgatgattgaatgatgtgatttacttgataattgtttatcaaagatgc 25961965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 117 - 216
Target Start/End: Original strand, 25964102 - 25964203
Alignment:
Q  117 atgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgt 214  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||    ||||||||||| || ||  ||||||| ||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  25964102 atgttatgttatttatgatgattgaataaagtgattacttgatattttattatcaatgatgctatgatgtttaagatgaatatgttgaagatgtttatgt 25964201  T
Q  215 tg 216  Q
    ||    
T  25964202 tg 25964203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 9 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 31344284 - 31344211
Alignment:
Q  9 tatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||   |||||||||||||||    
T  31344284 tatgttgttgttatatttt-ataagatgatgaatacgttattgttatattaatacaagaagatgaatatgttgtt 31344211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 9240759 - 9240710
Alignment:
Q  345 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9240759 atgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 9240710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 178
Target Start/End: Original strand, 19691982 - 19692042
Alignment:
Q  117 atgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 178  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  19691982 atgttatgttattgatgatgattgaatgctgtgattacttgttaattg-ttatcaaagatgc 19692042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 118 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 24735161 - 24735102
Alignment:
Q  118 tgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 178  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  24735161 tgttatgttattgatgatgattgaatgatgtgattacttgataattg-ttatcaaagatgc 24735102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 19 - 83
Target Start/End: Original strand, 27384565 - 27384629
Alignment:
Q  19 ttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||   |||||||||||||||    
T  27384565 ttatattttcataagatgatgaatacgttgtcgttatattaatacaagaagatgaatatgttgtt 27384629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 344 - 395
Target Start/End: Original strand, 10103289 - 10103340
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 395  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10103289 gatgatgattacatgttgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 10103340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 344 - 395
Target Start/End: Original strand, 12902599 - 12902650
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 395  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12902599 gatgatgattacataatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 12902650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 117 - 178
Target Start/End: Original strand, 24655708 - 24655770
Alignment:
Q  117 atgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttat-caaagatgc 178  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  24655708 atgttttgttattgatgatgattgaatgatgtgattacttgataattgtttatccaaagatgc 24655770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 117 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 37524414 - 37524329
Alignment:
Q  117 atgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |  ||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||    
T  37524414 atgttatgttatttatgatgattgaatgaagtgattacttgatatttgattatcaaagatgcaatgatgtttaagatgtttatgtt 37524329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 196 - 238
Target Start/End: Original strand, 40622673 - 40622715
Alignment:
Q  196 atgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatg 238  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40622673 atgtttaagatgcttatgttgaagatttatgatgttaattatg 40622715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 4 - 83
Target Start/End: Original strand, 13102057 - 13102138
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttg-ttatgttttcataagatgatgaatacgttgttg-ttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||  | |||| |||||||||    
T  13102057 atgaatatgttgttgcttatgttattataagatgatgaatatgttgttgcttatgttattataagattatgattatgttgtt 13102138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 83
Target Start/End: Original strand, 27380519 - 27380583
Alignment:
Q  19 ttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||   ||| |||||||||||    
T  27380519 ttatattttcataagatgatgaatacgttgtcgttatattaatacaagaagataaatatgttgtt 27380583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 117 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 24869626 - 24869571
Alignment:
Q  117 atgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaa 172  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| ||| ||||||||||||||    
T  24869626 atgttatgttattcatgatgattgaatgatgtgattatttgataattgtttatcaa 24869571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 344 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 31344003 - 31343952
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 395  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  31344003 gatgatgattacatgaagatatctatgagttgttaggtgtacttgatgatgt 31343952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 88 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 9784253 - 9784216
Alignment:
Q  88 atatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 126  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9784253 atatgatta-ttattattaagtgaatattatgttatgtt 9784216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 182 - 216
Target Start/End: Original strand, 22812373 - 22812407
Alignment:
Q  182 tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttg 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22812373 tgtttaagatgattatgttgaagatgtttatgttg 22812407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 345 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 23130490 - 23130440
Alignment:
Q  345 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 395  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  23130490 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgt 23130440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 345 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 23132957 - 23132907
Alignment:
Q  345 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 395  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  23132957 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgt 23132907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 117 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 24673286 - 24673185
Alignment:
Q  117 atgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgt 214  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||| |  ||||||||| |||| ||  ||||||| || | |||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  24673286 atgttaggttatttatgatgattgaatgaagtgattactgggtattttattatcaatgaagttatgatgtttaagatgcttatgttgaagatgtttatgt 24673187  T
Q  215 tg 216  Q
    ||    
T  24673186 tg 24673185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 117 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 24679911 - 24679810
Alignment:
Q  117 atgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgt 214  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||| |  ||||||||| |||| ||  ||||||| || | |||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  24679911 atgttaggttatttatgatgattgaatgaagtgattactgggtattttattatcaatgaagttatgatgtttaagatgcttatgttgaagatgtttatgt 24679812  T
Q  215 tg 216  Q
    ||    
T  24679811 tg 24679810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 571017 - 570968
Alignment:
Q  345 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  571017 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatg 570968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 1282347 - 1282294
Alignment:
Q  11 tgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattata 64  Q
    |||||||||||| || | ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1282347 tgttgttgttatattattatatgaagatgaatatgttgttgttatattattata 1282294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 18808555 - 18808506
Alignment:
Q  345 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  18808555 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatg 18808506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 23135204 - 23135155
Alignment:
Q  345 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  23135204 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatg 23135155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 394
Target Start/End: Original strand, 23710082 - 23710131
Alignment:
Q  345 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  23710082 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatg 23710131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 24648294 - 24648249
Alignment:
Q  19 ttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattata 64  Q
    |||| ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24648294 ttatattttcataaaaagatgaatatgttgttgttatattattata 24648249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 394
Target Start/End: Original strand, 24898753 - 24898802
Alignment:
Q  345 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  24898753 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatg 24898802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 394
Target Start/End: Original strand, 24901228 - 24901277
Alignment:
Q  345 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  24901228 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatg 24901277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 394
Target Start/End: Original strand, 24903705 - 24903754
Alignment:
Q  345 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  24903705 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatg 24903754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 394
Target Start/End: Original strand, 24906182 - 24906231
Alignment:
Q  345 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  24906182 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatg 24906231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 394
Target Start/End: Original strand, 24908657 - 24908706
Alignment:
Q  345 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  24908657 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatg 24908706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 26504992 - 26504943
Alignment:
Q  345 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  26504992 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatg 26504943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 26507470 - 26507421
Alignment:
Q  345 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  26507470 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatg 26507421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 394
Target Start/End: Original strand, 32040040 - 32040089
Alignment:
Q  345 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  32040040 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatg 32040089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 394
Target Start/End: Original strand, 34403049 - 34403098
Alignment:
Q  345 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  34403049 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatg 34403098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 351 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 37379115 - 37379074
Alignment:
Q  351 attacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatga 392  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37379115 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatga 37379074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 39681926 - 39681877
Alignment:
Q  345 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  39681926 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatg 39681877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 64
Target Start/End: Original strand, 41532198 - 41532251
Alignment:
Q  11 tgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattata 64  Q
    |||||||||||| || | ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41532198 tgttgttgttatattattatatgaagatgaatatgttgttgttatattattata 41532251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 4 - 64
Target Start/End: Original strand, 10102993 - 10103053
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattata 64  Q
    ||||||| ||||||||||| ||   | |||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10102993 atgaatacgttgttgttatattaatacaagaagatgaatatgttgttgttatattattata 10103053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 4 - 51
Target Start/End: Original strand, 20634498 - 20634546
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttg-ttatgttttcataagatgatgaatacgttgttg 51  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||||||    
T  20634498 atgaatatgttgttgcttatgttattataagatgatgaatatgttgttg 20634546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 147 - 216
Target Start/End: Original strand, 23020133 - 23020204
Alignment:
Q  147 gtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttg 216  Q
    ||||||||||| || ||  ||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  23020133 gtgattacttgatattttattatcaatgatgctatgatgtttaagatgcttatgttgaaaatgtttatgttg 23020204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 363 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 24647161 - 24647129
Alignment:
Q  363 tatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 395  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24647161 tatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 24647129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 4 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 27600753 - 27600693
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattata 64  Q
    ||||||| ||||||||||| ||   | |||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27600753 atgaatacgttgttgttatattaatacaagaagatgaatatgttgttgttatattattata 27600693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 4 - 64
Target Start/End: Original strand, 30346200 - 30346260
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattata 64  Q
    ||||||| ||||||||||| ||   | |||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30346200 atgaatacgttgttgttatattaatacaagaagatgaatatgttgttgttatattattata 30346260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 363 - 395
Target Start/End: Original strand, 41532454 - 41532486
Alignment:
Q  363 tatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 395  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41532454 tatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 41532486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 3)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 65 - 247
Target Start/End: Original strand, 68155 - 68338
Alignment:
Q  65 aagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattg 164  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  68155 aagtgatgaatatgttgttctatatatgattaat-attattaaatgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattg 68253  T
Q  165 tttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 247  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  68254 tttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattttggtgttagta 68338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Original strand, 68347 - 68392
Alignment:
Q  19 ttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattata 64  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  68347 ttatattttcataagatgatgaatatgttgttgttatattattata 68392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 344 - 391
Target Start/End: Original strand, 68548 - 68595
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatg 391  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  68548 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatg 68595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0372 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 3)
Name: scaffold0372
Description:

Target: scaffold0372; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 65 - 247
Target Start/End: Original strand, 5994 - 6177
Alignment:
Q  65 aagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattg 164  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5994 aagtgaggaatatgttgttctatatatgattaat-attgttaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattg 6092  T
Q  165 tttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 247  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6093 tttatcaaagatgctatgatatttaagatgatattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattttggtgttagta 6177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0372; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 395
Target Start/End: Original strand, 6313 - 6364
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 395  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6313 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 6364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0372; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 65
Target Start/End: Original strand, 6186 - 6232
Alignment:
Q  19 ttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataa 65  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6186 ttatattttcataagatgatgaatacgttgttgttatattaatataa 6232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 128; Significance: 5e-66; HSPs: 3)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 57 - 247
Target Start/End: Original strand, 15087 - 15293
Alignment:
Q  57 ttattataaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattactt 156  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15087 ttattattaagtgatgaatatgttgttctatatatgattaat-attattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattactt 15185  T
Q  157 ggtaattgtttatcaaagatgc-----------------tattgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatgg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||                 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15186 ggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatatatgatgttgattatgg 15285  T
Q  240 tgttagta 247  Q
    ||||||||    
T  15286 tgttagta 15293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 64
Target Start/End: Original strand, 15330 - 15383
Alignment:
Q  11 tgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattata 64  Q
    |||||||||||| || | ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15330 tgttgttgttatattattatatgaagatgaatatgttgttgttatattattata 15383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 363 - 395
Target Start/End: Original strand, 15586 - 15618
Alignment:
Q  363 tatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 395  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15586 tatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 15618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 11)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 65 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 79704 - 79523
Alignment:
Q  65 aagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattg 164  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  79704 aagtgatgaatatgttgttttatatatgattaat-attattaagtgaatattgtgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattg 79606  T
Q  165 tttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 247  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||  |  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  79605 tttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgttta--tcaaagatttatgatgttgactatggtgttagta 79523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 3 - 83
Target Start/End: Original strand, 62552 - 62631
Alignment:
Q  3 tatgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||   |||||||||||||||    
T  62552 tatgaatatgttgttgttatattttcataagatgttgaatacgttgttgttata-taatataagaagatgaatatgttgtt 62631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 3 - 83
Target Start/End: Original strand, 66468 - 66547
Alignment:
Q  3 tatgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||   |||||||||||||||    
T  66468 tatgaatatgttgttgttatattttcataagatgttgaatacgttgttgttata-taatataagaagatgaatatgttgtt 66547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #4
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 79496 - 79418
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||   |||||||||||||||    
T  79496 atgaatacgttgttgttatatttt-ataagatgatgaatacattgttgttatattaatataagaagatgaatatgttgtt 79418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #5
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 394
Target Start/End: Original strand, 62832 - 62882
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  62832 gatgatgattacatgatgttatctaggagttgttaaatgtacttgatgatg 62882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #6
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 65 - 119
Target Start/End: Original strand, 66417 - 66471
Alignment:
Q  65 aagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatg 119  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  66417 aagtgatgaatatgttgtactatatatgattaactattattaagtgaatgttatg 66471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #7
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 119
Target Start/End: Original strand, 62501 - 62555
Alignment:
Q  65 aagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatg 119  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  62501 aagtcatgaatatgttgtactatatatgattaactattattaagtgaatgttatg 62555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #8
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 97 - 130
Target Start/End: Original strand, 62675 - 62708
Alignment:
Q  97 attattattaagtgaatattatgttatgttattg 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  62675 attattattaagtgaatattatgttatgttattg 62708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #9
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 79503 - 79458
Alignment:
Q  30 taagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaata 76  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  79503 taagatgatgaatacgttgttgttatatt-ttataagatgatgaata 79458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #10
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 126
Target Start/End: Original strand, 66591 - 66620
Alignment:
Q  97 attattattaagtgaatattatgttatgtt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  66591 attattattaagtgaatattatgttatgtt 66620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #11
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 4 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 79464 - 79404
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattata 64  Q
    |||||||  |||||||||| ||   |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  79464 atgaatacattgttgttatattaatataagaagatgaatatgttgttgttatattattata 79404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 113; Significance: 4e-57; HSPs: 4)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 68 - 221
Target Start/End: Original strand, 33664 - 33818
Alignment:
Q  68 tgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgttt 167  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33664 tgatgaatatgttgttctatatatgattaat-attattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgttt 33762  T
Q  168 atcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagat 221  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||    
T  33763 atcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgattatgtttaagat 33818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 182 - 247
Target Start/End: Original strand, 33809 - 33874
Alignment:
Q  182 tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33809 tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 33874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 346 - 395
Target Start/End: Original strand, 34122 - 34171
Alignment:
Q  346 tgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 395  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34122 tgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 34171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 64
Target Start/End: Original strand, 33911 - 33964
Alignment:
Q  11 tgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattata 64  Q
    |||||||||||| || | ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33911 tgttgttgttatattattatatgaagatgaatatgttgttgttatattattata 33964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 103; Significance: 4e-51; HSPs: 4)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 65 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 11633 - 11465
Alignment:
Q  65 aagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattg 164  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  11633 aagtgatgaatatgttgttctatatatgattaat-attattaaatgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtagttg 11535  T
Q  165 tttatcaaagatgctattgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 247  Q
    |||||||||||| ||             || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11534 tttatcaaagatact-------------atgatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattttggtgttagta 11465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 11456 - 11392
Alignment:
Q  19 ttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||   |||||||||||||||    
T  11456 ttatattttcataagatgatgaatacgttgttgttatattaatacaagaagatgaatatgttgtt 11392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 11137 - 11086
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 395  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11137 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 11086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 4 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 11438 - 11378
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattata 64  Q
    ||||||| ||||||||||| ||   | |||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11438 atgaatacgttgttgttatattaatacaagaagatgaatatgttgttgttatattattata 11378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 4)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 57 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 12065 - 11996
Alignment:
Q  57 ttattataaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 126  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12065 ttattattaagtgatgaatatgttgtactatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 11996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 57 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 12172 - 12104
Alignment:
Q  57 ttattataaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 126  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12172 ttattattaagtgatgattatgttgtactatatatgatta-ttattattaagtgaatattatgttatgtt 12104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 344 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 11863 - 11813
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11863 gatgatgattacatgatgaaatctatgagttgttaagtgtacttgatgatg 11813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 94023 - 93974
Alignment:
Q  345 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  94023 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatg 93974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0200 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 3)
Name: scaffold0200
Description:

Target: scaffold0200; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 4 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 11163 - 11084
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||    
T  11163 atgaatatgttgttgttatattttcataagatgatgaatacattgttgttatatttttataagatgatgaatacgttgtt 11084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0200; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 11130 - 11051
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||    
T  11130 atgaatacattgttgttatatttttataagatgatgaatacgttgttgttatattaatataagaagatgaatatgttgtt 11051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0200; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 11097 - 11037
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattata 64  Q
    ||||||| ||||||||||| ||   |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11097 atgaatacgttgttgttatattaatataagaagatgaatatgttgttgttatattattata 11037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0486 (Bit Score: 54; Significance: 7e-22; HSPs: 3)
Name: scaffold0486
Description:

Target: scaffold0486; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 57 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 9013 - 8944
Alignment:
Q  57 ttattataaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 126  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9013 ttattattaagtgatgattatgttgtactatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 8944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0486; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 9 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 8949 - 8875
Alignment:
Q  9 tatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||    
T  8949 tatgttgttgttatatttttataaaatgatgaatacgtttttgttatattaatataaaaagatgaatatgttgtt 8875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0486; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 8663 - 8612
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 395  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8663 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 8612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1220 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold1220
Description:

Target: scaffold1220; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 117 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 1537 - 1452
Alignment:
Q  117 atgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtt 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||    
T  1537 atgttatgttattgatgatgattgaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgtttaagatgtttatgtt 1452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0601 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 4)
Name: scaffold0601
Description:

Target: scaffold0601; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 9 - 83
Target Start/End: Original strand, 8537 - 8611
Alignment:
Q  9 tatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  8537 tatgttgttgttatattattataagatgatgaatatgttgttgttatattattataaaatgatgaatatattgtt 8611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0601; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 83
Target Start/End: Original strand, 8565 - 8644
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    ||||||||||||||||||| || | |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  8565 atgaatatgttgttgttatattattataaaatgatgaatatattgttgttatattattataagatgatgaatatgttgtt 8644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0601; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 83
Target Start/End: Original strand, 8598 - 8677
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  8598 atgaatatattgttgttatattattataagatgatgaatatgttgttgttatattattagaagatgatgaatatgttgtt 8677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0601; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 65
Target Start/End: Original strand, 8631 - 8692
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataa 65  Q
    ||||||||||||||||||| || | | ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  8631 atgaatatgttgttgttatattattagaagatgatgaatatgttgttgttatattatcataa 8692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 5)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 9 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 19192 - 19118
Alignment:
Q  9 tatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||    
T  19192 tatgttgttgttatatttttataagatgatgaatacgttgttgttatattaatataagaagatgaatatgttgtt 19118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 9 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 19296 - 19222
Alignment:
Q  9 tatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||   |||||||||||||||    
T  19296 tatgttgttgttatatttttataagatgatgaatacgttgttgttagattaatataagaagatgaatatgttgtt 19222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 344 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 18909 - 18859
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18909 gatgatgattatgtgatgttatctataagttgttaaatgtacttgatgatg 18859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 19164 - 19104
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattata 64  Q
    ||||||| ||||||||||| ||   |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19164 atgaatacgttgttgttatattaatataagaagatgaatatgttgttgttatattattata 19104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 19320 - 19291
Alignment:
Q  97 attattattaagtgaatattatgttatgtt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19320 attattattaagtgaatattatgttatgtt 19291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 4)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 9 - 83
Target Start/End: Original strand, 21146 - 21220
Alignment:
Q  9 tatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  21146 tatgttgttgttatatttttataagatgatgaatatgttgttgttatatttttataagatgatgaatatgttgtt 21220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 344 - 394
Target Start/End: Original strand, 21332 - 21382
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21332 gatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 21382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 55 - 126
Target Start/End: Original strand, 21078 - 21151
Alignment:
Q  55 tattattataaagtgatgaatatgttgttccatatatgatta--attattattaagtgaatattatgttatgtt 126  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||   | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21078 tattattattaagtgatgattatgttgtattagatatgattattattattattaagtgaatattatgttatgtt 21151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 4 - 56
Target Start/End: Original strand, 21174 - 21226
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttata 56  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||||    
T  21174 atgaatatgttgttgttatatttttataagatgatgaatatgttgttattata 21226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0299 (Bit Score: 49; Significance: 6e-19; HSPs: 3)
Name: scaffold0299
Description:

Target: scaffold0299; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 6089 - 6029
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattata 64  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6089 atgaatatgttgttgttatattttcataagaagatgaatatgttgttgttatattattata 6029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0299; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 5 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 6121 - 6043
Alignment:
Q  5 tgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||   |||||||||||||||    
T  6121 tgaatatgttgttgttatattttcataagaagatgaatatgttgttgttatattttcataagaagatgaatatgttgtt 6043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0299; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 344 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 5909 - 5860
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 395  Q
    |||||||||||||||||  |||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  5909 gatgatgattacatgatgatat--atgagttgttaagtgtacttgatgatgt 5860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 5)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 343 - 394
Target Start/End: Original strand, 37194 - 37245
Alignment:
Q  343 agatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37194 agatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 37245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 9 - 81
Target Start/End: Original strand, 37046 - 37117
Alignment:
Q  9 tatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttg 81  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||    
T  37046 tatgttgttgttatatttttataagatgatgaatatgttgttg-tatatttttataagatgatgaatatgttg 37117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 126
Target Start/End: Original strand, 36981 - 37051
Alignment:
Q  55 tattattataaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 126  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||   | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36981 tattattattaagtgatgattatgttgtattagatatgatta-ttattattaagtgaatattatgttatgtt 37051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 53324 - 53264
Alignment:
Q  117 atgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 178  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  53324 atgttatgttattgatgatgattgaatgctgtgattacttgataattg-ttatcaaagatgc 53264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 196 - 236
Target Start/End: Original strand, 66259 - 66299
Alignment:
Q  196 atgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgatta 236  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  66259 atgtttaagatgcttatgttgaagatttatgttgttaatta 66299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 3)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 344 - 394
Target Start/End: Original strand, 6953 - 7003
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6953 gatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 7003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 126
Target Start/End: Original strand, 6761 - 6831
Alignment:
Q  55 tattattataaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 126  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||   | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6761 tattattattaagtgatgattatgttgtattagatatgatta-ttattattaagtgaatattatgttatgtt 6831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 82
Target Start/End: Original strand, 6826 - 6898
Alignment:
Q  9 tatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgt 82  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| ||| ||||    
T  6826 tatgttgttgttatatttttataagatgatgaata-gttgttgatatattattataagatgatgattatattgt 6898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 120
Target Start/End: Original strand, 22132 - 22249
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttg-ttatgttttcataagatgatgaatacgttgttg-ttatattattataaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattat 101  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| || ||||||| |||| ||||||| ||||||||| |||||||| |  ||||||||| |||||    
T  22132 atgaatatgttgttgcttatgttattataagatgatgattatgttgttgtttatgttattatgaagtgatgattatgttgtgctgtatatgatt-attat 22230  T
Q  102 tattaagtgaatattatgt 120  Q
    ||||||||||  |||||||    
T  22231 tattaagtgatgattatgt 22249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 83
Target Start/End: Original strand, 22064 - 22145
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgtt-atgttttcataagatgatgaatacgttgttgtt-atattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||| |||||||||||| || || |||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||    
T  22064 atgattatgttgttgtttatattatcatgagatgatgattatgttgttgtttatattattataagaggatgaatatgttgtt 22145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0166 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 4)
Name: scaffold0166
Description:

Target: scaffold0166; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 57 - 126
Target Start/End: Original strand, 10661 - 10729
Alignment:
Q  57 ttattataaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 126  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10661 ttattattaagtgatgattatgttgtactatatatgattaattattattaagtg-atattatgttatgtt 10729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0166; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 83
Target Start/End: Original strand, 10724 - 10797
Alignment:
Q  9 tatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||    
T  10724 tatgttgttgttatacttt-ataagatgatgaatacgttgttgttatattaatataagaagatgaatatgttgtt 10797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0166; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 344 - 395
Target Start/End: Original strand, 11052 - 11103
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 395  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  11052 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacctgatgatgt 11103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0166; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 64
Target Start/End: Original strand, 10751 - 10811
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattata 64  Q
    ||||||| ||||||||||| ||   |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10751 atgaatacgttgttgttatattaatataagaagatgaatatgttgttgttatattattata 10811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 4)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 344 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 28558 - 28509
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgat 393  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28558 gatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgat 28509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 344 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 34023 - 33974
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgat 393  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34023 gatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgat 33974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 199 - 238
Target Start/End: Original strand, 19114 - 19153
Alignment:
Q  199 tttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatg 238  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19114 tttaagatgcttatgttgaagatttatgatgttaattatg 19153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 199 - 238
Target Start/End: Original strand, 55850 - 55889
Alignment:
Q  199 tttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatg 238  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  55850 tttaagatgcttatgttgaagatttatgatgttaattatg 55889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 3)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 117 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 18958 - 18897
Alignment:
Q  117 atgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 178  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  18958 atgttatgttattgatgatgattgaatgttgtgattacttgataactgtttatcaaagatgc 18897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 117 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 12674 - 12619
Alignment:
Q  117 atgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaa 172  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  12674 atgttatgttattgatgatgattgaatgctgtgattacttgataactgtttatcaa 12619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 40013 - 39964
Alignment:
Q  345 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  40013 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatg 39964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 117 - 178
Target Start/End: Original strand, 195296 - 195357
Alignment:
Q  117 atgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 178  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  195296 atgttatgttattgatgatgattgaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgc 195357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 4)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 117 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 173064 - 173003
Alignment:
Q  117 atgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 178  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  173064 atgttatgttattgatgatgattgaatgctgtgattacttgataattgtttatcaaagatgc 173003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 196 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 204538 - 204498
Alignment:
Q  196 atgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgatta 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  204538 atgtttaagatgtttatgttgaagatttatgttgttaatta 204498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 146 - 200
Target Start/End: Original strand, 422920 - 422977
Alignment:
Q  146 tgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc---tattgtttaagatgattatgtt 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||||| |||||||    
T  422920 tgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgattgtttaagatgtttatgtt 422977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 146 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 178738 - 178706
Alignment:
Q  146 tgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 178  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  178738 tgtgattacttgataattgtttatcaaagatgc 178706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0380 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 4)
Name: scaffold0380
Description:

Target: scaffold0380; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 1009 - 945
Alignment:
Q  19 ttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||    
T  1009 ttatattttcataagatgatgaatacgttgttgttatattaatataagaagatgaatatgttgtt 945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0380; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 348 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 4056 - 4010
Alignment:
Q  348 atgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4056 atgattacatgatgttatctaggagttgttaaatgtacttgatgatg 4010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0380; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 45 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 870 - 832
Alignment:
Q  45 gttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  870 gttgttgttatattattataaaatgatgaatatgttgtt 832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0380; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 991 - 931
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattata 64  Q
    ||||||| ||||||||||| ||   |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  991 atgaatacgttgttgttatattaatataagaagatgaatatgttgttgttatattattata 931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1852 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 3)
Name: scaffold1852
Description:

Target: scaffold1852; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 75 - 126
Target Start/End: Original strand, 526 - 577
Alignment:
Q  75 tatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 126  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  526 tatgttgtactatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1852; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 121
Target Start/End: Original strand, 401 - 505
Alignment:
Q  16 ttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatat 115  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||  |||||  ||||||||    ||||| ||| |||||||||||||||| ||    
T  401 ttgttatatttttataagatgatgaatatgttgtggttatatttttataagatgatgtttatgttgtgatgtatataatt-attattattaagtgaagat 499  T
Q  116 tatgtt 121  Q
    ||||||    
T  500 tatgtt 505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1852; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 344 - 395
Target Start/End: Original strand, 813 - 864
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 395  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  813 gatgatgattgcatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 4)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 83
Target Start/End: Original strand, 74067 - 74142
Alignment:
Q  9 tatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattatt-ataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  74067 tatgttgttgttatatttctataagatgatgaatatgttgttgttatattattaaaaaaatgatgaatatgttgtt 74142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 347 - 394
Target Start/End: Original strand, 74327 - 74374
Alignment:
Q  347 gatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  74327 gatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 74374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 178
Target Start/End: Original strand, 81563 - 81620
Alignment:
Q  120 ttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 178  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  81563 ttatgttattgatgatgattgaa-gttgtgattatgtgataattgtttatcaaagatgc 81620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 173
Target Start/End: Original strand, 3007 - 3062
Alignment:
Q  117 atgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaa 173  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  3007 atgttatgt-attgatgatgattgaatgttttgatttcttggtaattgtttatcaaa 3062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 117 - 200
Target Start/End: Original strand, 414419 - 414505
Alignment:
Q  117 atgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtga-ttacttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtt 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||    
T  414419 atgttatgttattgatgatgattgaatgatgtgatttacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgtttaagatgtttatgtt 414505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 120 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 100839 - 100782
Alignment:
Q  120 ttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 178  Q
    |||||||||||||| |||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  100839 ttatgttattgatggtgattgaa-gctgtgattacttgataattgtttatcaaaaatgc 100782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0550 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0550
Description:

Target: scaffold0550; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 121 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 7217 - 7136
Alignment:
Q  121 tatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc--tattgtttaagatgattatgtt 200  Q
    |||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||  |  ||||||||||| |||||||    
T  7217 tatgttattgatgatgattgaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcattgatgtttaagatgtttatgtt 7136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 4)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 394
Target Start/End: Original strand, 25560 - 25610
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25560 gatgatgaatacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 25610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 4 - 82
Target Start/End: Original strand, 25423 - 25501
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgt 82  Q
    ||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||  ||||||||    
T  25423 atgaatatgttgttgttatattattatatgatgatgaatatgttgttgttatattactataagatgatgtttatgttgt 25501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 117 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 42366 - 42265
Alignment:
Q  117 atgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgt 214  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |  ||| | ||||| || ||  ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42366 atgttatgttatttatgatgatagaatgaagtggtaacttgatattttattatcaatgatgctatgatgtttaagatgattatgttgaagatgtttatgt 42267  T
Q  215 tg 216  Q
    ||    
T  42266 tg 42265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 83
Target Start/End: Original strand, 25396 - 25469
Alignment:
Q  10 atgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    ||||||||||||| || | | | ||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  25396 atgttgttgttatattattacatgatgatgaatatgttgttgttatattattatatgatgatgaatatgttgtt 25469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 4)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 394
Target Start/End: Original strand, 37190 - 37240
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37190 gatgatgattacatgatgttatctaggagttgttaaatgtacttgatgatg 37240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 75 - 121
Target Start/End: Original strand, 36942 - 36988
Alignment:
Q  75 tatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgtt 121  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36942 tatgttgtactatatatgattaattattattaagtgaatgttatgtt 36988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 45 - 83
Target Start/End: Original strand, 37063 - 37101
Alignment:
Q  45 gttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  37063 gttgttgttatattattataaaatgatgactatgttgtt 37101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 6728 - 6672
Alignment:
Q  120 ttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatg 177  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||   | |||||||||||||||||||    
T  6728 ttatgttattgatgatgattgaa-gttgtgattatgcgataattgtttatcaaagatg 6672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 117 - 178
Target Start/End: Original strand, 20347 - 20408
Alignment:
Q  117 atgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 178  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20347 atgttatgttatcgatgatgattgaatgctgtgattacttgataattgtttatcaaagatgc 20408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 117 - 178
Target Start/End: Original strand, 228705 - 228766
Alignment:
Q  117 atgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 178  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  228705 atgttatgttattgatgatgattgaatgctgtgattacttgataactgtttatcaaagatgc 228766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 117 - 213
Target Start/End: Original strand, 34223 - 34322
Alignment:
Q  117 atgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctat--tg-tttaagatgattatgtttaagatgtttatg 213  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |  ||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34223 atgttatgttatttatgatgattgaatgaagtgattacttgataatttattatcaatgatgctatgatgttttaagatgattatgttgaagatgtttatg 34322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 4)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 6999 - 6925
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgt 79  Q
    ||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||  ||||||||||||    
T  6999 atgaatatgttgttgttatattattataagatgatgaatatgt-gttgttgtattattataagatgatgaatatgt 6925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 7031 - 6957
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgt 79  Q
    |||||||||| |||||||| || | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  7031 atgaatatgt-gttgttatattatgatgagatgatgaatatgttgttgttatattattataagatgatgaatatgt 6957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 7064 - 6986
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    ||||||||||||||||| | || | ||||||||||||||| | |||||||||||||| || |  ||||||||||||||||    
T  7064 atgaatatgttgttgttgtattattataagatgatgaatatg-tgttgttatattatgatgagatgatgaatatgttgtt 6986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 14 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 7087 - 7022
Alignment:
Q  14 tgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgt 79  Q
    ||||||||| || | || |||||||||||| ||||||||| |||||||||||  ||||||||||||    
T  7087 tgttgttatattatgatgagatgatgaatatgttgttgttgtattattataagatgatgaatatgt 7022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 4)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 83
Target Start/End: Original strand, 44444 - 44522
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    ||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| | |||||||||||||| || |  ||||||||||||||||    
T  44444 atgaatatgttgttgttatattattataagatgatgaatatg-tgttgttatattatgatgagatgatgaatatgttgtt 44522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 79
Target Start/End: Original strand, 44477 - 44551
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgt 79  Q
    |||||||||| |||||||| || | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  44477 atgaatatgt-gttgttatattatgatgagatgatgaatatgttgttgttatattattataagatgatgaatatgt 44551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 79
Target Start/End: Original strand, 44421 - 44486
Alignment:
Q  14 tgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgt 79  Q
    ||||||||| || | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  44421 tgttgttatattatgatgagatgatgaatatgttgttgttatattattataagatgatgaatatgt 44486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 121
Target Start/End: Original strand, 44542 - 44657
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgtt-atattattataaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattatt 102  Q
    |||||||||| |||||| | || | ||||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||    ||||||||| ||||||    
T  44542 atgaatatgt-gttgttgtattattataagatgatgaatatgt-gttgtttatattattattaagtgatgattatgttgtgttgtatatgatt-attatt 44638  T
Q  103 attaagtgaatattatgtt 121  Q
    |||||||||  ||||||||    
T  44639 attaagtgatgattatgtt 44657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 3)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 9108 - 9034
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgt 79  Q
    ||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||  ||||||||||||    
T  9108 atgaatatgttgttgttatattattataagatgatgaatatg-tgttgttgtattattataagatgatgaatatgt 9034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 32 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 9113 - 9066
Alignment:
Q  32 agatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgt 79  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  9113 agatgatgaatatgttgttgttatattattataagatgatgaatatgt 9066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 196 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 17891 - 17851
Alignment:
Q  196 atgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgatta 236  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  17891 atgttcaagatgtttatgttgaagatttatgttgttaatta 17851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 7)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 395
Target Start/End: Original strand, 60318 - 60369
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 395  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  60318 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 60369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 126
Target Start/End: Original strand, 59850 - 59910
Alignment:
Q  65 aagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 126  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  59850 aagtgatgaatatgttgttctatatattatt-attattattaagtgaatatcatgctatgtt 59910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 133824 - 133775
Alignment:
Q  345 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  133824 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatg 133775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 136293 - 136244
Alignment:
Q  345 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  136293 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatg 136244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 138762 - 138713
Alignment:
Q  345 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  138762 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatg 138713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 141231 - 141182
Alignment:
Q  345 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  141231 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatg 141182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 143700 - 143651
Alignment:
Q  345 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  143700 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatg 143651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 9)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 362093 - 362019
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgt 79  Q
    ||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||  ||||||||||||    
T  362093 atgaatatgttgttgttatattattataagatgatgaatatg-tgttgttgtattattataagatgatgaatatgt 362019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 362256 - 362178
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    ||||||||||||||||||| || | |||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  362256 atgaatatgttgttgttatattattataagatgataaatatg-tgttgttatattattatgagatgatgaatatgttgtt 362178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 362158 - 362080
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||||||| ||||||||||||| |  ||||||||| |||| || ||||||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  362158 atgaatattttgttgttatgttattctaagatgataaatatgt-gttgttatattatgatgaaatgatgaatatgttgtt 362080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 362060 - 361945
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgtt-atattattataaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattatt 102  Q
    |||||||||| |||||| | || | ||||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||    ||||||||| ||||||    
T  362060 atgaatatgt-gttgttgtattattataagatgatgaatatgt-gttgtttatattattattaagtgatgattatgttgtgttgtatatgatt-attatt 361964  T
Q  103 attaagtgaatattatgtt 121  Q
    |||||||||  ||||||||    
T  361963 attaagtgatgattatgtt 361945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 34 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 362096 - 362051
Alignment:
Q  34 atgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgt 79  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  362096 atgatgaatatgttgttgttatattattataagatgatgaatatgt 362051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #6
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 4 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 362191 - 362116
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgt 79  Q
    ||||||||||||||||||| || | || ||||||||||||  |||||||||| ||||| |||  |||| |||||||    
T  362191 atgaatatgttgttgttatattatgatgagatgatgaatattttgttgttatgttattctaagatgataaatatgt 362116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #7
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 32 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 362261 - 362214
Alignment:
Q  32 agatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgt 79  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  362261 agatgatgaatatgttgttgttatattattataagatgataaatatgt 362214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #8
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 199 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 69446 - 69409
Alignment:
Q  199 tttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgatta 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  69446 tttaagatgtttatgttgaagatttatgttgttaatta 69409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #9
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 362214 - 362145
Alignment:
Q  14 tgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    ||||||||| || | || |||||||||||| |||||||||||||||| || |  |||||||||| |||||    
T  362214 tgttgttatattattatgagatgatgaatatgttgttgttatattatgatgagatgatgaatattttgtt 362145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1427 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold1427
Description:

Target: scaffold1427; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 344 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 286 - 236
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  286 gatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0842 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0842
Description:

Target: scaffold0842; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 344 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 5328 - 5278
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5328 gatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 5278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0599 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0599
Description:

Target: scaffold0599; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 352 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 4199 - 4157
Alignment:
Q  352 ttacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4199 ttacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 4157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0599; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 96
Target Start/End: Original strand, 6430 - 6523
Alignment:
Q  5 tgaatatgttgttg-ttatgttttcataagatgatgaatacgttgttg-ttatattattataaagtgatgaatatgttgttccatatatgatta 96  Q
    |||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||| ||  |||| |||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  6430 tgaatatgttgttgcttatgttattataagatgatgaatatgttatttcttatgttattataagatgatgaatatgttgttctttatatgatta 6523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 117 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 5323 - 5222
Alignment:
Q  117 atgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgt 214  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||| |  ||||||| ||| || ||  ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5323 atgttatgttatttacgatgattgaatgaagtgattaattgatattttattatcaatgatgctatgatgtttaagatgattatgttgaagatgtttatgt 5224  T
Q  215 tg 216  Q
    ||    
T  5223 tg 5222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 117 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 6518 - 6417
Alignment:
Q  117 atgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgt 214  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||| |  ||||||| ||| || ||  ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6518 atgttatgttatttacgatgattgaatgaagtgattaattgatattttattatcaatgatgctatgatgtttaagatgattatgttgaagatgtttatgt 6419  T
Q  215 tg 216  Q
    ||    
T  6418 tg 6417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0337 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0337
Description:

Target: scaffold0337; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 344 - 394
Target Start/End: Original strand, 10814 - 10864
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10814 gatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 10864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 3)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 344 - 394
Target Start/End: Original strand, 8732 - 8782
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  8732 gatgatgattacatgatgttatctacgagttgttaaatgtacatgatgatg 8782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 83
Target Start/End: Original strand, 8504 - 8550
Alignment:
Q  37 atgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  8504 atgaatatgttgttgttatattattataaaatgatgagtatgttgtt 8550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 63
Target Start/End: Original strand, 8461 - 8505
Alignment:
Q  19 ttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattat 63  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  8461 ttatatttttataagatgatgaatatgttgttgttatatttttat 8505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 117 - 216
Target Start/End: Original strand, 5203 - 5304
Alignment:
Q  117 atgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgt 214  Q
    ||||||||||||| ||||||||  || |  ||||||||||| || ||  ||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  5203 atgttatgttatttatgatgattaaatgaagtgattacttgatattttattatcaatgatgctatgatgtttaagatgcttatgttgaagatgtttatgt 5302  T
Q  215 tg 216  Q
    ||    
T  5303 tg 5304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 344 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 109687 - 109637
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  109687 gatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 109637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 344 - 394
Target Start/End: Original strand, 224135 - 224185
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  224135 gatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 224185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0439
Description:

Target: scaffold0439; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 178
Target Start/End: Original strand, 10666 - 10726
Alignment:
Q  117 atgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 178  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10666 atgttatgttattgatgatgattgaatat-gtgattacttgataattgtttatcaaagatgc 10726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 178
Target Start/End: Original strand, 18968 - 19029
Alignment:
Q  117 atgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 178  Q
    |||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  18968 atgttatgttattgatgatgattgaatactgtgattacttgataattgtttctcaaagatgc 19029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 121 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 9186 - 9107
Alignment:
Q  121 tatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgcta--ttgtttaaga-tgattatg 198  Q
    |||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  9186 tatgttattgattatgattgaa-gctgtgattacttgataattgtttatcaaagatgctatgttgtttaagactgattatg 9107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 178
Target Start/End: Original strand, 4572 - 4633
Alignment:
Q  117 atgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 178  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  4572 atgttatgttattgatgatgattgaatgatgtgattaattgatgattgtttatcaaagatgc 4633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 4)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 2981 - 2908
Alignment:
Q  10 atgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    ||||||||||||| || | |||| ||||| || | |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  2981 atgttgttgttatattatgataaaatgataaacatgttgttgttatattattataaaatgatgaacatgttgtt 2908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 7044 - 6971
Alignment:
Q  10 atgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    ||||||||||||| || | |||| ||||| || | |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  7044 atgttgttgttatattatgataaaatgataaacatgttgttgttatattattataaaatgatgaacatgttgtt 6971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 2948 - 2876
Alignment:
Q  10 atgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgt 82  Q
    ||||||||||||| || | |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||    
T  2948 atgttgttgttatattattataaaatgatgaacatgttgttgttatattattataagatgatgtttatgttgt 2876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 7011 - 6939
Alignment:
Q  10 atgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgt 82  Q
    ||||||||||||| || | |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||    
T  7011 atgttgttgttatattattataaaatgatgaacatgttgttgttatattattataagatgatgtttatgttgt 6939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 178
Target Start/End: Original strand, 66762 - 66822
Alignment:
Q  117 atgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 178  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  66762 atgttatgttattgatgatgattgaatgctgtgattacttgttaattg-ttatcaaagatgc 66822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0410
Description:

Target: scaffold0410; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 344 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 14930 - 14879
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 395  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14930 gatgatgattacatgaagatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 14879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 117 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 1917 - 1857
Alignment:
Q  117 atgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 178  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| |  ||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  1917 atgttatattattgatgatgattgaatgaagtgattacttgataattg-ttatcaaagatgc 1857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 351 - 394
Target Start/End: Original strand, 23937 - 23980
Alignment:
Q  351 attacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23937 attacatgatgttatctaggagttgttaaatgtacttgatgatg 23980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0484
Description:

Target: scaffold0484; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 78 - 24
Alignment:
Q  29 ataagatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||| |||||||| | |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  78 ataaaatgatgaacatgttgttattatattattataaaatgatgaatatgttgtt 24  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 117 - 178
Target Start/End: Original strand, 7653 - 7715
Alignment:
Q  117 atgttatgttattgatgatgatcgaac-gttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 178  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  7653 atgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttataaaagatgc 7715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 196 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 32101 - 32059
Alignment:
Q  196 atgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatg 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  32101 atgtttaagatgtttatgttgaagatttatgttgttaattatg 32059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 117 - 216
Target Start/End: Original strand, 47123 - 47224
Alignment:
Q  117 atgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgt 214  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |  ||||||||||| || ||   |||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||    
T  47123 atgttatgttatttatgatgattgaatgaagtgattacttgatattttaatatcaatgatgctatgatgtttaagatgcttatgttgaagaagtttatgt 47222  T
Q  215 tg 216  Q
    ||    
T  47223 tg 47224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 22983 - 22926
Alignment:
Q  120 ttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 178  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  22983 ttatgttattgatgatgattgaa-gttgtgattatgtgataattgtttatcaaagatgc 22926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1873 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold1873
Description:

Target: scaffold1873; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 206 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 885 - 848
Alignment:
Q  206 tgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgtt 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  885 tgtttatgttgaagatttatgatgttgattatgatgtt 848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1873; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 117 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 999 - 954
Alignment:
Q  117 atgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaat 162  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||    
T  999 atgttatgttattgatgatgattgaatgctgtgattacttgataat 954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0561 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0561
Description:

Target: scaffold0561; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 4 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 10191 - 10110
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgtt-atgttttcataagatgatgaatacgttgttg-ttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||| |||||||||||| ||||| | |||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  10191 atgattatgttgttgtttatgttattataagatgatgaatatattgttgcttatgttattataagatgatgaatatgttgtt 10110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0544 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0544
Description:

Target: scaffold0544; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 344 - 393
Target Start/End: Original strand, 3509 - 3558
Alignment:
Q  344 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgat 393  Q
    |||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3509 gatgatgattatgtgatgttatttatgagttgttaaatgtacttgatgat 3558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 4 - 83
Target Start/End: Original strand, 26808 - 26889
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttg-ttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgtt-atattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||  |||||| |||||||||    
T  26808 atgaatatattgttgcttatgttattataagatgatgattatgttgttgtttatattattataagatgatgattatgttgtt 26889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 83
Target Start/End: Original strand, 26842 - 26923
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgtt-atgttttcataagatgatgaatacgttgttgtt-atattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||| |||||||||||| || || | |||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||  |||||| |||||||||    
T  26842 atgattatgttgttgtttatattattataagatgatgattatgttgttgtttatattattataagatgatgattatgttgtt 26923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 3)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 196 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 23338 - 23298
Alignment:
Q  196 atgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgatta 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  23338 atgtttaagatgtttatgttgaagatttatgttgttaatta 23298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 196 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 38762 - 38722
Alignment:
Q  196 atgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgatta 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  38762 atgtttaagatgtttatgttgaagatttatgttgttaatta 38722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 196 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 14317 - 14287
Alignment:
Q  196 atgtttaagatgtttatgttgaagatttatg 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14317 atgtttaagatgtttatgttgaagatttatg 14287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1296 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold1296
Description:

Target: scaffold1296; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 117 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 127 - 29
Alignment:
Q  117 atgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatg 213  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||| |  |||||||| || || ||  ||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  127 atgttatgttatttacgatgattgaatgaagtgattacctgatattttattatcaatgatgctatgatgtttaagatgcttatgttgaagatgtttatg 29  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 203 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 1828 - 1793
Alignment:
Q  203 agatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatg 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1828 agatgtttatgttgaagatttatgatgttaattatg 1793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0673
Description:

Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 117 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 8294 - 8199
Alignment:
Q  117 atgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgt 214  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |  ||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||  ||||||||      |||||||||||||||||||    
T  8294 atgttatgttatttatgatgattgaatgaagtgattacttgatatttgattatcaaagatgcaatgatgtttaag------atgtttaagatgtttatgt 8201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 4)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 199 - 238
Target Start/End: Original strand, 22303 - 22342
Alignment:
Q  199 tttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatg 238  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22303 tttaagatgcttatgttgaagatttatgatgttaattatg 22342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 199 - 238
Target Start/End: Original strand, 30195 - 30234
Alignment:
Q  199 tttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatg 238  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30195 tttaagatgcttatgttgaagatttatgatgttaattatg 30234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 199 - 231
Target Start/End: Original strand, 22271 - 22303
Alignment:
Q  199 tttaagatgtttatgttgaagatttatgatgtt 231  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22271 tttaagatgcttatgttgaagatttatgatgtt 22303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 199 - 231
Target Start/End: Original strand, 30163 - 30195
Alignment:
Q  199 tttaagatgtttatgttgaagatttatgatgtt 231  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30163 tttaagatgcttatgttgaagatttatgatgtt 30195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 32 - 79
Target Start/End: Original strand, 79884 - 79931
Alignment:
Q  32 agatgatgaatacgttgttgttatattattataaagtgatgaatatgt 79  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  79884 agatgatgaatatgttattgttatattattataagatgatgaatatgt 79931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 4 - 63
Target Start/End: Original strand, 79889 - 79947
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgttatattattat 63  Q
    ||||||||||| ||||||| || | ||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  79889 atgaatatgttattgttatattattataagatgatgaatatg-tgttgttatattattat 79947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1552 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1552
Description:

Target: scaffold1552; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 120 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 134 - 77
Alignment:
Q  120 ttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 178  Q
    |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  134 ttatgtcattgatgatgattgaa-gttgtgattaagtgataattgtttatcaaagatgc 77  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 196 - 226
Target Start/End: Original strand, 8278 - 8308
Alignment:
Q  196 atgtttaagatgtttatgttgaagatttatg 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8278 atgtttaagatgtttatgttgaagatttatg 8308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0311 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0311
Description:

Target: scaffold0311; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 117 - 200
Target Start/End: Original strand, 7524 - 7609
Alignment:
Q  117 atgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtt 200  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||| || ||||||||||| || ||  ||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  7524 atgttatgttatttatgatgtttgaatgtagtgattacttgatattttattatcaatgatgctatgatgtttaagatgtttatgtt 7609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0181 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0181
Description:

Target: scaffold0181; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 117 - 178
Target Start/End: Original strand, 27505 - 27567
Alignment:
Q  117 atgttatgttattgatgatgatcgaac-gttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 178  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||  | |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  27505 atgttatgttattgatgatgatttaaatgatgtgattactcgataattgtttatcaaagatgc 27567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0679 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0679
Description:

Target: scaffold0679; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 351 - 392
Target Start/End: Original strand, 3265 - 3306
Alignment:
Q  351 attacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatga 392  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3265 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatga 3306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 177
Target Start/End: Original strand, 6579 - 6635
Alignment:
Q  120 ttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatg 177  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||   | |||||||||||||||||||    
T  6579 ttatgttattgatgatgattgaa-gttgtgattatgcgataattgtttatcaaagatg 6635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0462
Description:

Target: scaffold0462; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 7833 - 7752
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgtt-atgttttcataagatgatgaatacgttgttgtt-atattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||| |||||||||||| || || | || ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  7833 atgattatgttgttgtttatattattatgagatgatgattatgttgttgtttatattattataagatgatgaatatgttgtt 7752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 13004 - 12955
Alignment:
Q  345 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  13004 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatg 12955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0356 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0356
Description:

Target: scaffold0356; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 83
Target Start/End: Original strand, 1007 - 1088
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttg-ttatgttttcataagatgatgaatacgttgttg-ttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    ||||||||||||||| ||||| | | |||||||||||| || ||||||| |||| ||||||| |  ||||||||||||||||    
T  1007 atgaatatgttgttgtttatgctattataagatgatgattatgttgttgtttatgttattatgagatgatgaatatgttgtt 1088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 20359 - 20310
Alignment:
Q  345 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  20359 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatg 20310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 13567 - 13518
Alignment:
Q  345 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  13567 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatg 13518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 9361 - 9312
Alignment:
Q  345 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  9361 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatg 9312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 37434 - 37385
Alignment:
Q  345 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 394  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  37434 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatg 37385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 83
Target Start/End: Original strand, 2479 - 2560
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttg-ttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgtt-atattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |  |||||| |||||||||    
T  2479 atgaatatgttattgattatgttattataagatgatgattatgttgttgttgatattattatgagatgatgattatgttgtt 2560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 80 - 15
Alignment:
Q  19 ttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgtt-atattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    ||||||| | || ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  80 ttatgttattatgagatgatgattatgttgttgtttatattattataagatgatgaatatgttgtt 15  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 121
Target Start/End: Original strand, 22246 - 22364
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttgtt-atattattataaagtgatgaatatgttgttccatatatgatta--atta 100  Q
    |||||||||| |||||| | || | |||||||||| |||| || |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||    ||||||||||  ||||    
T  22246 atgaatatgt-gttgttgtattattataagatgataaatatgt-gttgtttatattattattaagtgatgattatgttgtgttgtatatgattattatta 22343  T
Q  101 ttattaagtgaatattatgtt 121  Q
    |||||||||||  ||||||||    
T  22344 ttattaagtgatgattatgtt 22364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 75936 - 75855
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttgttatgttttcataagatgatgaatacgttgttg-ttatattattataaagtgatgaatatgttgttc 84  Q
    |||| ||||||||  |||| || | ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||  |||||| ||||||||||    
T  75936 atgattatgttgtgtttatattattataagatgatgaatatgttgttgcttatgttattataagatgatgattatgttgttc 75855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 83
Target Start/End: Original strand, 170395 - 170460
Alignment:
Q  19 ttatgttttcataagatgatgaatacgttgttg-ttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||  |||||| |||||||||    
T  170395 ttatatttttataagatgatgaatatgttgttgcttatgttattataagatgatgattatgttgtt 170460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 196 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 178555 - 178515
Alignment:
Q  196 atgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgatta 236  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  178555 atgtttaagatgcttatgttgaagatttatgttgttaatta 178515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 126581 - 126500
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttg-ttatgttttcataagatgatgaatacgttgttg-ttatattattataaagtgatgaatatgttgtt 83  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||  || ||||||| |||||    
T  126581 atgattatgttgttgcttatgttattataagatgatgaatatgttgttgcttatgttattataagatggtgaatatattgtt 126500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0674 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0674
Description:

Target: scaffold0674; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 4 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 3042 - 2994
Alignment:
Q  4 atgaatatgttgttg-ttatgttttcataagatgatgaatacgttgttg 51  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||||||    
T  3042 atgaatatgttgttgcttatgttattataagatgatgaatatgttgttg 2994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 119 - 200
Target Start/End: Original strand, 17507 - 17590
Alignment:
Q  119 gttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtt 200  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| |  ||||||||||| || ||  ||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  17507 gttatgttatttatgatgattgaatgaagtgattacttgatattttattatcaatgatgctatgatgtttaagatgtttatgtt 17590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 196 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 3396 - 3356
Alignment:
Q  196 atgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgatta 236  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  3396 atgtttaagatgcttatgttgaagatttatgttgttaatta 3356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 196 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 7827 - 7787
Alignment:
Q  196 atgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgatta 236  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  7827 atgtttaagatgcttatgttgaagatttatgttgttaatta 7787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University