View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF16006_high_2 (Length: 810)

Name: NF16006_high_2
Description: NF16006
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF16006_high_2
NF16006_high_2
[»] chr4 (67 HSPs)
chr4 (15-194)||(4739915-4740094)
chr4 (257-376)||(4739430-4739549)
chr4 (244-412)||(22129966-22130135)
chr4 (253-433)||(7061672-7061852)
chr4 (257-412)||(16821360-16821516)
chr4 (253-433)||(49428350-49428529)
chr4 (253-433)||(5841435-5841616)
chr4 (252-410)||(49175965-49176124)
chr4 (253-433)||(47773027-47773207)
chr4 (555-629)||(4730521-4730595)
chr4 (253-433)||(38405110-38405291)
chr4 (253-446)||(52859794-52859982)
chr4 (217-427)||(17512353-17512562)
chr4 (253-412)||(42616932-42617091)
chr4 (253-371)||(35311293-35311413)
chr4 (253-433)||(11907607-11907787)
chr4 (301-419)||(4744758-4744876)
chr4 (252-430)||(36985718-36985896)
chr4 (255-427)||(49746895-49747068)
chr4 (257-433)||(34360592-34360768)
chr4 (253-412)||(35380362-35380522)
chr4 (253-433)||(21240712-21240888)
chr4 (253-412)||(26147644-26147806)
chr4 (253-446)||(2066724-2066915)
chr4 (257-433)||(17114377-17114553)
chr4 (257-413)||(53412044-53412201)
chr4 (554-629)||(4734294-4734367)
chr4 (276-412)||(54506744-54506880)
chr4 (257-412)||(2653357-2653512)
chr4 (283-446)||(3689525-3689688)
chr4 (253-444)||(25233115-25233305)
chr4 (258-412)||(35998750-35998903)
chr4 (253-363)||(51624719-51624829)
chr4 (257-433)||(2942653-2942831)
chr4 (555-626)||(4751112-4751182)
chr4 (340-446)||(6609781-6609887)
chr4 (257-315)||(9301469-9301527)
chr4 (254-433)||(6643668-6643846)
chr4 (257-433)||(47464373-47464550)
chr4 (340-409)||(52247460-52247529)
chr4 (258-409)||(30682228-30682380)
chr4 (424-527)||(4751187-4751290)
chr4 (258-412)||(7986914-7987066)
chr4 (276-323)||(17121200-17121247)
chr4 (290-433)||(17237304-17237447)
chr4 (282-446)||(43237203-43237369)
chr4 (347-446)||(44536191-44536290)
chr4 (340-438)||(461978-462076)
chr4 (340-446)||(11288625-11288730)
chr4 (340-433)||(40122862-40122955)
chr4 (253-446)||(33790726-33790921)
chr4 (254-310)||(39139868-39139923)
chr4 (340-412)||(47358978-47359050)
chr4 (274-409)||(18532133-18532268)
chr4 (257-304)||(28911293-28911340)
chr4 (347-433)||(23915438-23915524)
chr4 (259-305)||(30471794-30471840)
chr4 (259-333)||(31096234-31096308)
chr4 (251-357)||(35251830-35251936)
chr4 (77-126)||(4751981-4752030)
chr4 (245-322)||(8175709-8175785)
chr4 (340-413)||(18741502-18741575)
chr4 (253-306)||(28501020-28501073)
chr4 (355-472)||(32469917-32470034)
chr4 (340-433)||(32884821-32884914)
chr4 (340-433)||(38502490-38502583)
chr4 (340-412)||(43902271-43902346)
[»] scaffold0095 (2 HSPs)
scaffold0095 (229-433)||(50113-50317)
scaffold0095 (228-409)||(22254-22437)
[»] chr8 (39 HSPs)
chr8 (229-433)||(39405671-39405875)
chr8 (257-433)||(10179950-10180126)
chr8 (253-411)||(17719283-17719441)
chr8 (244-446)||(22771825-22772027)
chr8 (257-433)||(396614-396790)
chr8 (255-433)||(45425669-45425848)
chr8 (253-446)||(26626102-26626295)
chr8 (234-426)||(36006897-36007091)
chr8 (242-372)||(39301020-39301150)
chr8 (244-433)||(4428354-4428541)
chr8 (340-433)||(31331428-31331521)
chr8 (290-409)||(4924094-4924214)
chr8 (253-440)||(34948683-34948868)
chr8 (253-446)||(13335150-13335342)
chr8 (257-410)||(31231667-31231820)
chr8 (349-433)||(2767294-2767378)
chr8 (253-412)||(32476221-32476379)
chr8 (228-409)||(39466064-39466247)
chr8 (257-433)||(21216104-21216279)
chr8 (253-315)||(40109646-40109707)
chr8 (253-430)||(44761500-44761675)
chr8 (253-433)||(10097994-10098175)
chr8 (340-433)||(31082639-31082732)
chr8 (253-433)||(39482545-39482728)
chr8 (244-332)||(41091921-41092007)
chr8 (289-433)||(7172883-7173027)
chr8 (255-371)||(29226593-29226708)
chr8 (257-332)||(50753-50828)
chr8 (276-427)||(44648541-44648686)
chr8 (244-305)||(13831703-13831764)
chr8 (340-409)||(27294086-27294155)
chr8 (245-333)||(42182033-42182119)
chr8 (253-296)||(5053292-5053335)
chr8 (282-412)||(31270985-31271113)
chr8 (253-332)||(36967307-36967385)
chr8 (352-446)||(40996355-40996449)
chr8 (340-433)||(51133-51225)
chr8 (352-433)||(1875595-1875676)
chr8 (259-332)||(1875843-1875916)
[»] chr5 (33 HSPs)
chr5 (253-433)||(1248604-1248784)
chr5 (253-409)||(6315801-6315957)
chr5 (257-433)||(7827926-7828102)
chr5 (253-433)||(40899851-40900031)
chr5 (258-409)||(21060569-21060719)
chr5 (244-427)||(41496004-41496187)
chr5 (255-409)||(6753682-6753836)
chr5 (253-433)||(8725009-8725189)
chr5 (253-427)||(6615886-6616060)
chr5 (255-443)||(31654987-31655176)
chr5 (251-427)||(7330439-7330614)
chr5 (256-412)||(19929882-19930038)
chr5 (255-433)||(40530224-40530403)
chr5 (286-427)||(4440987-4441128)
chr5 (253-433)||(4818483-4818664)
chr5 (253-412)||(41062181-41062339)
chr5 (253-433)||(8698241-8698422)
chr5 (253-371)||(6753962-6754080)
chr5 (253-427)||(26285484-26285658)
chr5 (340-430)||(27580620-27580710)
chr5 (274-332)||(41480103-41480163)
chr5 (340-412)||(11796188-11796260)
chr5 (253-433)||(27542728-27542908)
chr5 (296-412)||(29374318-29374434)
chr5 (253-304)||(3348259-3348310)
chr5 (261-412)||(24454982-24455130)
chr5 (274-332)||(41478737-41478797)
chr5 (253-305)||(2588192-2588243)
chr5 (342-433)||(5129232-5129323)
chr5 (245-340)||(30118310-30118404)
chr5 (251-305)||(41478637-41478691)
chr5 (251-305)||(41492189-41492243)
chr5 (382-427)||(29412049-29412094)
[»] chr2 (33 HSPs)
chr2 (253-433)||(14523372-14523552)
chr2 (253-433)||(17695261-17695443)
chr2 (257-433)||(43410363-43410539)
chr2 (253-446)||(36354430-36354622)
chr2 (255-438)||(8947047-8947232)
chr2 (257-413)||(34225527-34225683)
chr2 (253-433)||(16463620-16463802)
chr2 (244-446)||(35242284-35242486)
chr2 (251-408)||(19444077-19444234)
chr2 (255-433)||(16377656-16377833)
chr2 (205-294)||(34451471-34451560)
chr2 (253-433)||(5789648-5789827)
chr2 (274-433)||(16805836-16805994)
chr2 (274-433)||(16845117-16845275)
chr2 (253-433)||(35313820-35314000)
chr2 (253-412)||(37322362-37322520)
chr2 (253-412)||(15359108-15359269)
chr2 (206-371)||(19937270-19937436)
chr2 (287-433)||(39691457-39691603)
chr2 (255-412)||(38187904-38188060)
chr2 (253-433)||(9458271-9458445)
chr2 (253-432)||(25637413-25637593)
chr2 (253-433)||(36794217-36794397)
chr2 (276-433)||(43115802-43115959)
chr2 (253-305)||(45235512-45235564)
chr2 (253-362)||(7494909-7495019)
chr2 (255-304)||(11366719-11366768)
chr2 (355-412)||(27866527-27866583)
chr2 (274-350)||(16028270-16028345)
chr2 (206-293)||(7491041-7491128)
chr2 (310-417)||(12872762-12872869)
chr2 (255-306)||(25904722-25904773)
chr2 (253-306)||(11742656-11742709)
[»] chr6 (27 HSPs)
chr6 (234-412)||(34299908-34300087)
chr6 (254-422)||(181491-181658)
chr6 (253-446)||(29363237-29363432)
chr6 (253-433)||(24983450-24983628)
chr6 (245-446)||(1063591-1063791)
chr6 (253-433)||(11655947-11656128)
chr6 (253-433)||(31894211-31894388)
chr6 (253-412)||(7920174-7920330)
chr6 (253-430)||(32440649-32440828)
chr6 (253-433)||(30716832-30717013)
chr6 (253-412)||(5302284-5302443)
chr6 (253-412)||(6801863-6802023)
chr6 (258-433)||(13909361-13909537)
chr6 (208-298)||(23397753-23397844)
chr6 (253-307)||(27367226-27367280)
chr6 (253-307)||(27457573-27457627)
chr6 (340-433)||(3291769-3291862)
chr6 (257-409)||(15058055-15058206)
chr6 (245-299)||(12307729-12307783)
chr6 (252-306)||(13207220-13207274)
chr6 (255-305)||(21425688-21425738)
chr6 (340-412)||(13087550-13087622)
chr6 (253-305)||(21478224-21478276)
chr6 (264-315)||(8694989-8695040)
chr6 (340-399)||(17828960-17829019)
chr6 (257-299)||(15582222-15582264)
chr6 (253-295)||(23142601-23142643)
[»] chr1 (50 HSPs)
chr1 (254-433)||(39864045-39864224)
chr1 (253-433)||(31042730-31042910)
chr1 (253-433)||(37506057-37506240)
chr1 (229-433)||(12038991-12039195)
chr1 (253-412)||(49224012-49224171)
chr1 (251-433)||(27896886-27897068)
chr1 (244-430)||(41121833-41122017)
chr1 (244-446)||(9379156-9379358)
chr1 (253-366)||(37177769-37177882)
chr1 (253-412)||(7351572-7351728)
chr1 (253-412)||(20209866-20210025)
chr1 (255-482)||(40144803-40145030)
chr1 (257-379)||(52429279-52429403)
chr1 (251-443)||(6160454-6160637)
chr1 (255-427)||(7759150-7759322)
chr1 (244-307)||(6268375-6268438)
chr1 (253-372)||(35367735-35367854)
chr1 (253-379)||(6785189-6785315)
chr1 (244-433)||(23168998-23169185)
chr1 (340-433)||(26093414-26093507)
chr1 (258-433)||(9307564-9307740)
chr1 (229-366)||(24991725-24991863)
chr1 (253-446)||(16395039-16395230)
chr1 (276-400)||(22856275-22856399)
chr1 (255-412)||(12151123-12151268)
chr1 (257-433)||(13579626-13579801)
chr1 (252-316)||(17988867-17988931)
chr1 (253-433)||(33733268-33733447)
chr1 (253-360)||(4659710-4659816)
chr1 (253-332)||(35682900-35682978)
chr1 (244-299)||(37238951-37239006)
chr1 (343-441)||(978854-978952)
chr1 (253-332)||(26252565-26252646)
chr1 (338-427)||(44426746-44426838)
chr1 (255-409)||(44761560-44761710)
chr1 (340-412)||(15699142-15699214)
chr1 (253-305)||(21910141-21910193)
chr1 (281-413)||(44707785-44707917)
chr1 (257-316)||(3312056-3312115)
chr1 (355-446)||(35538678-35538769)
chr1 (350-433)||(36701951-36702034)
chr1 (350-433)||(36718055-36718138)
chr1 (388-443)||(37177913-37177968)
chr1 (253-304)||(43500874-43500925)
chr1 (244-366)||(2137441-2137562)
chr1 (259-365)||(31879177-31879281)
chr1 (255-293)||(37275536-37275574)
chr1 (206-304)||(44426840-44426938)
chr1 (347-412)||(3312138-3312203)
chr1 (253-294)||(15699073-15699114)
[»] chr7 (58 HSPs)
chr7 (253-446)||(759087-759280)
chr7 (253-433)||(34947440-34947620)
chr7 (253-433)||(7463152-7463333)
chr7 (253-433)||(9785928-9786108)
chr7 (253-412)||(24516319-24516478)
chr7 (253-446)||(83324-83518)
chr7 (253-374)||(23745399-23745521)
chr7 (244-379)||(38032668-38032804)
chr7 (253-433)||(21759993-21760173)
chr7 (253-433)||(28202318-28202498)
chr7 (254-446)||(41506061-41506253)
chr7 (244-419)||(17610561-17610736)
chr7 (229-446)||(21390210-21390428)
chr7 (255-372)||(2459413-2459530)
chr7 (340-433)||(13961986-13962079)
chr7 (253-433)||(11373437-11373617)
chr7 (253-372)||(21350695-21350815)
chr7 (253-433)||(32346061-32346241)
chr7 (255-444)||(33819154-33819345)
chr7 (253-433)||(43873863-43874043)
chr7 (253-392)||(25571360-25571498)
chr7 (259-433)||(21937796-21937970)
chr7 (276-410)||(22738665-22738798)
chr7 (257-433)||(34100556-34100732)
chr7 (244-332)||(37245621-37245709)
chr7 (340-428)||(39005448-39005536)
chr7 (253-412)||(6494964-6495122)
chr7 (255-422)||(10042223-10042389)
chr7 (244-433)||(32769725-32769914)
chr7 (253-372)||(36790678-36790799)
chr7 (253-446)||(38391692-38391881)
chr7 (255-412)||(7457451-7457607)
chr7 (252-366)||(16904316-16904432)
chr7 (243-372)||(44424075-44424203)
chr7 (253-433)||(8592449-8592629)
chr7 (353-433)||(12631345-12631425)
chr7 (253-304)||(27920926-27920977)
chr7 (253-304)||(31930640-31930691)
chr7 (244-366)||(36425106-36425228)
chr7 (340-446)||(16560566-16560672)
chr7 (340-446)||(16604990-16605096)
chr7 (253-366)||(19271809-19271921)
chr7 (253-303)||(37850864-37850914)
chr7 (260-412)||(17828381-17828533)
chr7 (244-293)||(49101602-49101651)
chr7 (276-360)||(37490338-37490422)
chr7 (384-427)||(40614658-40614701)
chr7 (257-412)||(3178234-3178391)
chr7 (251-293)||(30546499-30546540)
chr7 (253-299)||(42935598-42935644)
chr7 (206-433)||(48608760-48608982)
chr7 (382-427)||(6855254-6855299)
chr7 (382-423)||(17609349-17609390)
chr7 (382-423)||(17609592-17609633)
chr7 (382-423)||(17609835-17609876)
chr7 (382-423)||(17610078-17610119)
chr7 (382-423)||(17610321-17610362)
chr7 (347-412)||(31930527-31930592)
[»] chr3 (41 HSPs)
chr3 (253-431)||(30190664-30190842)
chr3 (229-433)||(43253865-43254070)
chr3 (253-433)||(44301494-44301675)
chr3 (253-433)||(19822944-19823124)
chr3 (251-433)||(30711005-30711186)
chr3 (245-433)||(12736574-12736761)
chr3 (253-399)||(36460452-36460598)
chr3 (257-446)||(37311886-37312076)
chr3 (249-305)||(30710578-30710634)
chr3 (258-393)||(39043799-39043932)
chr3 (244-446)||(37497415-37497618)
chr3 (257-446)||(11905760-11905948)
chr3 (265-433)||(37695668-37695837)
chr3 (253-433)||(51837961-51838142)
chr3 (253-436)||(3901148-3901331)
chr3 (253-366)||(10366718-10366831)
chr3 (252-412)||(12904796-12904957)
chr3 (282-446)||(8679043-8679206)
chr3 (253-433)||(36476517-36476697)
chr3 (244-299)||(33458973-33459028)
chr3 (253-433)||(37772966-37773148)
chr3 (340-446)||(24569089-24569195)
chr3 (342-412)||(34750518-34750588)
chr3 (251-433)||(38795275-38795457)
chr3 (253-446)||(34957437-34957629)
chr3 (260-433)||(52290834-52291006)
chr3 (340-412)||(19611929-19612000)
chr3 (340-412)||(29023989-29024060)
chr3 (257-305)||(48541122-48541170)
chr3 (246-392)||(42469724-42469868)
chr3 (253-304)||(43715239-43715290)
chr3 (250-296)||(37804668-37804714)
chr3 (295-412)||(14194531-14194647)
chr3 (340-433)||(30682068-30682161)
chr3 (340-413)||(36462968-36463041)
chr3 (340-412)||(54477482-54477554)
chr3 (229-356)||(27471244-27471371)
chr3 (340-433)||(23004384-23004477)
chr3 (251-356)||(33634267-33634372)
chr3 (255-332)||(38137549-38137626)
chr3 (253-310)||(51065139-51065195)
[»] scaffold0330 (1 HSPs)
scaffold0330 (253-404)||(5325-5474)
[»] scaffold0159 (1 HSPs)
scaffold0159 (253-433)||(34021-34200)
[»] scaffold0328 (1 HSPs)
scaffold0328 (253-433)||(7983-8164)
[»] scaffold2146 (1 HSPs)
scaffold2146 (304-419)||(389-504)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (244-392)||(252848-252994)
[»] scaffold0583 (1 HSPs)
scaffold0583 (343-409)||(2048-2114)
[»] scaffold0182 (1 HSPs)
scaffold0182 (340-412)||(20376-20448)
[»] scaffold0464 (1 HSPs)
scaffold0464 (251-313)||(5976-6037)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (244-293)||(16884-16933)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 140; Significance: 7e-73; HSPs: 67)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 15 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 4740094 - 4739915
Alignment:
Q  15 attttgattgtaggatgcgtacgtgtgtatatcctactgtttcagtgtgtattgatcgcttatgtcgctgtcgtcgtcctccaactatgtgataagaaat 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  4740094 attttgattgtaggatgcgtatgtgtgtatatcctactgtttcagtgtgtattgatcgcctttgtcgttgtcgtcgtcctccaaatatgtgataagagat 4739995  T
Q  115 tgataatgtaaccaaagggagtgagttaaaatctcaacatatggaatacttataaaacggttcttaaagccactgatata 194  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  4739994 tgataatgtaatcaaagggactgagttaaaatctcaacatatggaatacttataaaacggttcacaaagccactgatata 4739915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 257 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 4739549 - 4739430
Alignment:
Q  257 aaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccacta 356  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  4739549 aaaataattgtcttttcagaatatcgatgcaacatttattattatttttcactaatatacccttattaatttaattataatccacttaattactccacta 4739450  T
Q  357 actacaattattaaggatat 376  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  4739449 actacaattattaaggatat 4739430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 244 - 412
Target Start/End: Original strand, 22129966 - 22130135
Alignment:
Q  244 ttttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttc-actaatatacctttattaatttaattctactccact 342  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||| ||| ||||  |  | |||    
T  22129966 ttttttttttctcaaaataattgtcattttacaataccaatgcaacatttattattttttttccattattatacctttatttattgaatttcatccaact 22130065  T
Q  343 taattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 412  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||| || |||| |||||||    
T  22130066 taattactccactaactacaattaataaggatgtttttgtaaatgatactaattataccattgaaatcaa 22130135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 253 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 7061852 - 7061672
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 352  Q
    ||||||||||||||| | || | ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||| ||| ||||  | || ||||||||| |||    
T  7061852 tctcaaaataattgttactttaaaatatcaatacaacatttattatttattttcactattatacccttatttattgaatttcattcaacttaattaatcc 7061753  T
Q  353 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 433  Q
    |||||||||||||| ||| |||||| |  ||||| |||||||||||| |||| |||||||  ||| |||| ||||||||||    
T  7061752 actaactacaattaataaagatattatagtaaatgatactaattttaccattgaaatcaacacaattaatcatttccttaa 7061672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 257 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 16821516 - 16821360
Alignment:
Q  257 aaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattattttt-cactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccact 355  Q
    ||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||| ||||  | || |||||| |||||||||    
T  16821516 aaaataattgtcactttagaataccaatgcagcatttattattatttttgcactattatacccttatttattgaatttcattcaacttaaatactccact 16821417  T
Q  356 aactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 412  Q
    ||||| ||||| |||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  16821416 aactataattaataaggatattatagtaaatgatactaattttatcattgaaatcaa 16821360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 253 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 49428529 - 49428350
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 352  Q
    ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| | |||| || || |||||| ||||| ||| ||||  |  | |||||||||||||    
T  49428529 tctcaaaataattgtcactttagaa-atcaatgcaacatttattacttttttccattattatacccttatttattgaatttcatccaacttaattactcc 49428431  T
Q  353 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 433  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||| |||||||| |||| |||||||  ||| |||| ||||||||||    
T  49428430 actaactacaattaataagggtattttagtaaattatattaattttaccattgaaatcaacacaaataatcatttccttaa 49428350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 253 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 5841616 - 5841435
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccactt-aattactc 351  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||| ||| || || |||||||||||| ||| ||||  |  | |||| || |||||    
T  5841616 tctcaaaataattgtcactttagaatatcaatgcatcatttattattaatttccattattatacctttatttattgaatttcatccaacttaaactactc 5841517  T
Q  352 cactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 433  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||| ||| |||||||| ||||||||||||  |||  ||| ||||||||||    
T  5841516 cactaactacaattaataagggtattttagtaaatgatattaattttaccattaaaatcaacgcaatcaatcatttccttaa 5841435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 252 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 49176124 - 49175965
Alignment:
Q  252 gtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttc-actaatatacctttattaatttaattctactccacttaattact 350  Q
    |||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| |||||||| |||| | |||| |||||| ||||| ||| |||| ||  | |||||| ||||    
T  49176124 gtctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcaacaattattatttttttcccactattatacccttatttattgaattttatccaacttaactact 49176025  T
Q  351 ccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatc 410  Q
    || ||||||||||||| ||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  49176024 ccgctaactacaattaataaggttattttagtaaatgatactaattttatcattgaaatc 49175965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 253 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 47773207 - 47773027
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 352  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||| |||| || ||  ||||| ||||| ||| || |  |  | |||||| ||||||    
T  47773207 tctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcagcatttattatttttttccattataatacccttatttattgaacttcatccaacttaactactcc 47773108  T
Q  353 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 433  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||  ||||| |||||||||||| ||| ||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  47773107 actaactacaattaataagggtgttttagtaaatgatactaattttaccatcaaaatcaacacaattaattatttccttaa 47773027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 555 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 4730595 - 4730521
Alignment:
Q  555 tttattttataatgttgttacgtttatgacttgtcacacactttaatttaaataattttgttctttaaacttcct 629  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  4730595 tttattttataatgttgttacgtttatgacttgtctcacactttaatttaaataatgttgtcctttgaacttcct 4730521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 253 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 38405291 - 38405110
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttc-actaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactc 351  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| | |||||| | || |||||||||||| ||| ||||  |  | |||||| ||| |    
T  38405291 tctcaaaataattgtcactttagaatagcaatgcaacatttattactttttttccattattatacctttatttattgaatttcatccaacttaactacac 38405192  T
Q  352 cactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 433  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||| ||| |||||||| |||| |||||||   || |||| ||||||||||    
T  38405191 cactaactacaattaataagggtattttagtaaatgatattaattttaccatttaaatcaacagaattaatcatttccttaa 38405110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 253 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 52859982 - 52859794
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 352  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||  || || |||||| |  | ||||| |||| |||     ||| ||||||    
T  52859982 tctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcaacatttattattttttcccattattataccctattgaatttcattcaact-----taactactcc 52859888  T
Q  353 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattgtacataa 446  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||  ||||| |||||||||||| ||| ||||||||  ||| |||| |||||||||| ||| || |||||    
T  52859887 actaactacaattaataaggatgttttagtaaatgatactaattttaccatcaaaatcaacacaattaatcatttccttaataatcgtgcataa 52859794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 217 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 17512562 - 17512353
Alignment:
Q  217 tcttattttaactgtctctttagtttcttttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatac 316  Q
    ||||||||||| |||| ||||| | | || |||||  || |||||||||||||||| | ||||| |||| || |||||||||| |||| ||||||||| |    
T  17512562 tcttattttaattgtcactttaatattttctttat--cttaaaataattgtcattttaaaatatgaatgtaatatttattatttttttccactaatatgc 17512465  T
Q  317 ctttat-taatttaattctactccacttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattc 415  Q
      |||| | ||| ||||| |||| ||||||||| || || ||||||||||| ||| | ||||||  ||||||||| |||||||| | |||||||||| ||    
T  17512464 acttatattattgaattcaactctacttaattattcgacaaactacaattaataatggtattttagtaaattatattaattttacctttaaaatcaactc 17512365  T
Q  416 aactaattattt 427  Q
    ||||||| ||||    
T  17512364 aactaatcattt 17512353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 253 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 42617091 - 42616932
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 352  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||||||||||||||| || || |||||  ||||| ||| ||||  | || |||||| ||||||    
T  42617091 tctcaaaataattgtcactttagaatacaaatgcaacatttattattattttccattattatacacttatttattgaatttcattcgacttaactactcc 42616992  T
Q  353 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 412  Q
    ||| |||||||||| |||  |||||||  ||||| ||| |||||||| |||| |||||||    
T  42616991 acttactacaattaataaaaatattttagtaaatgatattaattttaccattgaaatcaa 42616932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 253 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 35311413 - 35311293
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattattttt--cactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattact 350  Q
    ||||||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||||||||||  || || |||||||||||| ||| ||||  |  | |||||||||||    
T  35311413 tctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaacatttattattattttttccaatattatacctttatttattgaatttcatccaacttaattact 35311314  T
Q  351 ccactaactacaattattaag 371  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  35311313 ccactaactacaattaataag 35311293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 253 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 11907787 - 11907607
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 352  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||| |||| || ||  |||| |||||| ||| || |  |  | |||||| ||||||    
T  11907787 tctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcagcatttattatttttttccattataatacatttatttattgaacttcatccaacttaactactcc 11907688  T
Q  353 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 433  Q
    | |||||||||||| ||||| | ||||  ||||| |||||||||||| ||| ||||||||  ||| |||| ||||||||||    
T  11907687 aataactacaattaataagggtgttttagtaaatgatactaattttaccatcaaaatcaacacaattaatcatttccttaa 11907607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 301 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 4744876 - 4744758
Alignment:
Q  301 tttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttat 400  Q
    ||||||| ||||||| | ||||| ||||||||| ||| ||||||| ||||| | ||||||| |||| | |  |||||||| |||||||||||||||||      
T  4744876 tttttcattaatataacattatttatttaattccacttcacttaactactcgattaactacgattaattaatatatttttgtaaattatactaatttttc 4744777  T
Q  401 cattaaaatcaattcaact 419  Q
    |||||||||||||||||||    
T  4744776 cattaaaatcaattcaact 4744758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 252 - 430
Target Start/End: Original strand, 36985718 - 36985896
Alignment:
Q  252 gtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactc 351  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||| | |||||| | || |||| ||| | |||||| ||||| ||| ||||  |  | ||||||||| ||    
T  36985718 gtctcaaaataattgtcagtttagaatatcaatgaagcatttactgtttttttccaccattatacccttatttattgaatttcatccaacttaattattc 36985817  T
Q  352 cactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttcct 430  Q
     |||||||||||||| || || ||||||  ||||| |||||||||||| |||| |||||||  ||| |||| |||||||    
T  36985818 tactaactacaattaatacgggtattttagtaaatgatactaattttaccattgaaatcaacacaattaatcatttcct 36985896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 255 - 427
Target Start/End: Original strand, 49746895 - 49747068
Alignment:
Q  255 tcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattattttt-cactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcca 353  Q
    ||||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||||||||||| || || |||||| ||||| ||| ||||  |  | |||||| ||||| |    
T  49746895 tcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaacatttattattatttttccattattatacccttatttattgaatttcatccaacttaactactcaa 49746994  T
Q  354 ctaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattattt 427  Q
    ||||||| ||||| | | | ||||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||    
T  49746995 ctaactataattaatgaaggtattttagtaaatactactaattttatcattgaaatcaacacaattaattattt 49747068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 257 - 433
Target Start/End: Original strand, 34360592 - 34360768
Alignment:
Q  257 aaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccacta 356  Q
    ||||||||||||| || | |||| ||||  ||||||| || || |||| ||||| |||||| ||||| ||| |||| || || |||||| ||||||||||    
T  34360592 aaaataattgtcactttacaataccaatttaacattttttttttttttccactattatacccttatttattgaattttattcaacttaactactccacta 34360691  T
Q  357 actacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 433  Q
    |||||||||| ||||  | ||||  |||||  ||||||||||| |||| |||||||| ||| |||| ||||| ||||    
T  34360692 actacaattaataagagtgttttagtaaatgctactaattttaccattgaaatcaatacaattaatcatttctttaa 34360768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 253 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 35380522 - 35380362
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattattttt-cactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactc 351  Q
    ||||||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||||| ||||| || || |||||  ||||| ||| ||||  |  | ||||||  ||||    
T  35380522 tctcaaaataattgtcactttataataccaatgcaacatttattattttttttccattattatactcttatttattgaatttcatccaacttaaccactc 35380423  T
Q  352 cactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 412  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| ||||  |||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  35380422 cactaactacaattaataatgatgttttagtaaatgctactaattttaccattaaaatcaa 35380362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 253 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 21240888 - 21240712
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 352  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    ||||| || || |||||| ||||| ||| ||||  |  | |||||| |||||     
T  21240888 tctcaaaataaatgtcactttagaatatcaatgcaacatttat----attttccattattatacccttatttattgaatttcatccaacttaactactca 21240793  T
Q  353 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 433  Q
    |||||||||||||| ||||||| | ||  ||||| |||||||||||| ||| ||||||||  ||  |||| ||||||||||    
T  21240792 actaactacaattaataaggatgtgttagtaaatgatactaattttaccatcaaaatcaacacagttaatcatttccttaa 21240712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 253 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 26147806 - 26147644
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttatt--attatttttcactaatatacctttattaatttaattctactcca-cttaattac 349  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| |||| |||||||||||  ||| |||| || || |||||| ||||| ||| ||   |  |||| |||||||||    
T  26147806 tctcaaaataattgtcactttagaataccaatacaacatttattttatttttttccattattatacccttatttattgaaaattcatccaacttaattac 26147707  T
Q  350 tccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 412  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||||  ||||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  26147706 tccactaactacaattaataagaatgttttagtaaatgatactaattttaccatcaaaatcaa 26147644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 253 - 446
Target Start/End: Original strand, 2066724 - 2066915
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 352  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||| | ||||||||||  ||||||| || |||||||||||| ||| ||||  |    |||||| ||| ||    
T  2066724 tctcaaaataattgtcactttagaataccaatgaagcatttattat--tttttcattattatacctttatttattgaatttcatctaacttaactacccc 2066821  T
Q  353 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattgtacataa 446  Q
    |||||||| ||||| ||||| | ||||  ||||| ||||||| |||| ||| ||||||||  ||| |||| |||||||||| ||| || |||||    
T  2066822 actaactaaaattaataagggtgttttaataaataatactaactttaccatcaaaatcaacacaattaatcatttccttaataatcgtgcataa 2066915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 257 - 433
Target Start/End: Original strand, 17114377 - 17114553
Alignment:
Q  257 aaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccac-ttaattactccact 355  Q
    |||||||||||||||| ||||||   ||||| | ||||||||| |||| || ||  ||||||||||| ||| || | | |||||  |||| |||||||||    
T  17114377 aaaataattgtcattttagaatacttatgcagcgtttattatttttttccattataatacctttatttattgaact-tcctccaaattaactactccact 17114475  T
Q  356 aactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 433  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||  ||||| |||||||||||| ||| ||||||||  ||| |||| ||||||||||    
T  17114476 aactacaattaataagggtgttttagtaaatgatactaattttaccatcaaaatcaacacaattaatcatttccttaa 17114553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 257 - 413
Target Start/End: Original strand, 53412044 - 53412201
Alignment:
Q  257 aaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttatta-ttatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccact 355  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||| ||||| |||||| ||| ||||  |  | |||||| || |||||     
T  53412044 aaaataattgtcattttagaataccaatgtaacatctattatttttttttcactattatacttttatttattgaatttcatccaacttaactattccaca 53412143  T
Q  356 aactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaat 413  Q
    ||||| ||||| |||  |||||||  ||||| |||||||||||| |||| ||||||||    
T  53412144 aactataattaataaaaatattttagtaaatgatactaattttaccattgaaatcaat 53412201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 554 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 4734367 - 4734294
Alignment:
Q  554 gtttattttataatgttgttacgtttatgacttgtcacacactttaatttaaataattttgttctttaaacttcct 629  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  4734367 gtttattttataatgttgttacgtttatgatttgt--ctcactttaatttaaataatgttgtcctttgaacttcct 4734294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 276 - 412
Target Start/End: Original strand, 54506744 - 54506880
Alignment:
Q  276 aatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccactaactacaattattaaggata 375  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||   ||||||||| ||||  |    |||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||    
T  54506744 aatatcgatgcaacatttattattatttttcattattatattcttattaattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattgataatgata 54506843  T
Q  376 tttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 412  Q
    ||||  ||||| ||| |||||||| |||| |||||||    
T  54506844 ttttaataaatgatattaattttaccattgaaatcaa 54506880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 257 - 412
Target Start/End: Original strand, 2653357 - 2653512
Alignment:
Q  257 aaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccacta 356  Q
    |||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||  |||| || || |||||||||||| ||| ||||  |  | | |||| ||||||  ||    
T  2653357 aaaatagttgtcactttagaatatcaatgcaacatttattatctttttccattattatacctttatttattaaatttcatccaatttaactactccttta 2653456  T
Q  357 actacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 412  Q
    |||||||||| ||||  ||||||  ||||| ||||||||||||  ||| |||||||    
T  2653457 actacaattaataagagtattttaataaatgatactaattttacaattgaaatcaa 2653512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 283 - 446
Target Start/End: Original strand, 3689525 - 3689688
Alignment:
Q  283 atgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccactaactacaattattaaggatatttttct 382  Q
    |||||||||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||||  |    ||||||  |||| |||||||| ||||| ||||  | ||||  |    
T  3689525 atgcaacatttattattattttccattattatacccttattaatttaatttcatctaacttaacaactcaactaactataattaataagagtgttttagt 3689624  T
Q  383 aaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattgtacataa 446  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||| ||||| |||| ||  ||||||||    
T  3689625 aaatgatactaattttaccatcaaaatcaatacaattaatcatttctttaataaccgtacataa 3689688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 253 - 444
Target Start/End: Original strand, 25233115 - 25233305
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 352  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||| ||||||| ||| || |  |  | |||||| |||| |    
T  25233115 tctcaaaataattgtcactttagaatatcaatgcaacatttattatt-tttttcattataatatctttatttattgaacttcatccaacttaactacttc 25233213  T
Q  353 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattgtacat 444  Q
    |||||||| ||||| ||    | ||||  ||||| |||||||||||| ||| ||||| ||  ||| |||||||||| |||| || |||||||    
T  25233214 actaactataattaatactagtgttttagtaaatgatactaattttaccatcaaaattaacacaattaattatttctttaataactgtacat 25233305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 258 - 412
Target Start/End: Original strand, 35998750 - 35998903
Alignment:
Q  258 aaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccactaa 357  Q
    |||||||||||| || | |||||||||  | ||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| ||| ||||| |  | |||||| |||||||  ||    
T  35998750 aaataattgtcaatttacaatatcaatatagcatttattattctttttcactattatatctttatttattgaattc-atccaacttaactactccatcaa 35998848  T
Q  358 ctacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 412  Q
    ||||||||| ||| ||||||||  |||||  |||||||||||   ||||||||||    
T  35998849 ctacaattaataatgatattttaataaatgttactaattttactgttaaaatcaa 35998903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 253 - 363
Target Start/End: Original strand, 51624719 - 51624829
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 352  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||||||| |||| |||||  ||||| ||||| ||| ||||  |  | |||||| ||||||    
T  51624719 tctcaaaataattgtcactttacaatatcaatgtaacatttattatttttttccactatcatacccttatttattgaatttcatccaacttaactactcc 51624818  T
Q  353 actaactacaa 363  Q
    |||||||||||    
T  51624819 actaactacaa 51624829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 257 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 2942831 - 2942653
Alignment:
Q  257 aaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattattttt---cactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcca 353  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||||||||||   ||||| |||| |||| || ||| || |  | || ||||||  ||||||    
T  2942831 aaaataattgtcattttacaatatcaatgaaatatttattattatttttttccactattatatctttgtttattgaaattcattcaacttaaccactcca 2942732  T
Q  354 ctaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 433  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||||  |||||  |||||||||||||||  |||||||  ||| |||| ||||| ||||    
T  2942731 ctaactacaattaataagg-tgttttagtaaatgctactaattttatcatcgaaatcaacacaattaatcatttctttaa 2942653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 555 - 626
Target Start/End: Complemental strand, 4751182 - 4751112
Alignment:
Q  555 tttattttataatgttgttacgtttatgacttgtcacacactttaatttaaataattttgttctttaaactt 626  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||   || ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  4751182 tttattttataatgttattacgtttatgaccattcgcacactttaatttaaataa-tttgtcctttaaactt 4751112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 340 - 446
Target Start/End: Original strand, 6609781 - 6609887
Alignment:
Q  340 acttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattg 439  Q
    |||||| ||||||| ||| |||||||| ||| ||| ||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||  ||| |||| |||||||||| ||| |    
T  6609781 acttaactactccaataattacaattaataaagatgtttttgtaaatgatactaattttaccatcaaaatcaacacaattaatcatttccttaataatcg 6609880  T
Q  440 tacataa 446  Q
    | |||||    
T  6609881 tgcataa 6609887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 257 - 315
Target Start/End: Original strand, 9301469 - 9301527
Alignment:
Q  257 aaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatata 315  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||    
T  9301469 aaaataattgtcattttagaatatcaatgtattgtttattattatttttcactaatata 9301527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 254 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 6643846 - 6643668
Alignment:
Q  254 ctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttc-actaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 352  Q
    |||||||||||||||| || | ||| |||| ||| ||||||||  |||||||| |||| |||||| ||||| ||| ||||  |  | |||||| ||  ||    
T  6643846 ctcaaaataattgtcactttacaatttcaacgcagcatttatt--tatttttccactattatacccttatttattgaatttcatccaacttaactatacc 6643749  T
Q  353 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 433  Q
    |||||||||||||| ||| ||| ||||  |||||  ||||||||||| |||| |||||||  ||| |||| ||||||||||    
T  6643748 actaactacaattaataaagatgttttagtaaatgctactaattttaccattgaaatcaacacaattaatcatttccttaa 6643668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 257 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 47464550 - 47464373
Alignment:
Q  257 aaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttc-actaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccact 355  Q
    ||||||||| || ||| | |||| |||||||  |||||||||| |||||| |||| |||||| ||||| ||| ||||  |  | |||||| ||||||||     
T  47464550 aaaataattatcgttttacaataccaatgcattatttattattttttttccactattatacccttatttattgaatttcatccaacttaactactccacc 47464451  T
Q  356 aactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 433  Q
    ||||||||||| ||||  | ||||  |||||  ||||||||||| |||| |||||||  ||| |||| ||||||||||    
T  47464450 aactacaattaataagagttttttagtaaatgctactaattttaccattgaaatcaacacaattaatcatttccttaa 47464373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 340 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 52247529 - 52247460
Alignment:
Q  340 acttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaat 409  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| || |||||||| |||| ||||    
T  52247529 acttaactactccactaactacaattaataaggatattttagtaaattgtattaattttaccattgaaat 52247460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 258 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 30682380 - 30682228
Alignment:
Q  258 aaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattat-ttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccacta 356  Q
    |||||||||||| || |||| ||||||| | ||||||||||||| |||||| || ||| | |||||| ||| ||||  | || | |||| ||||| ||||    
T  30682380 aaataattgtcactttagaaaatcaatgtagcatttattattattttttcattattatgcttttatttattgaatttcattcaaattaactactctacta 30682281  T
Q  357 actacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaat 409  Q
    ||||||| || |||||||||| |  ||||| ||| |||||||| || ||||||    
T  30682280 actacaactaataaggatattatagtaaatgatattaattttaccaataaaat 30682228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 424 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 4751290 - 4751187
Alignment:
Q  424 atttccttaacaattgtacataactctataacaactattagtttgagatggtgggagtaattttatttgcttttaaacctaaaattttatttgcatgtct 523  Q
    |||||||||| ||| | ||| ||||||| ||| || ||||   ||||| || ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||     
T  4751290 atttccttaataatcgcacacaactctaaaacgaccattaaaatgagacggagggaggaattttatttgctcttaagcctaaaatttaatttgcatgtca 4751191  T
Q  524 taac 527  Q
    ||||    
T  4751190 taac 4751187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 258 - 412
Target Start/End: Original strand, 7986914 - 7987066
Alignment:
Q  258 aaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccactaa 357  Q
    |||||||| ||| || | |||||||||| |||| |||||||   ||||| ||| ||||| |||||| ||||||||  | |  |||||| ||||| |||||    
T  7986914 aaataattatcactttaaaatatcaatgtaacacttattata--ttttccctattatacttttatttatttaatttcattaaacttaactactctactaa 7987011  T
Q  358 ctacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 412  Q
    | | ||||| |||  |||||||  || || |||||||||||||||||||||||||    
T  7987012 caataattaataataatattttagtagatgatactaattttatcattaaaatcaa 7987066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 276 - 323
Target Start/End: Original strand, 17121200 - 17121247
Alignment:
Q  276 aatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttatt 323  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  17121200 aataccaatgcaacatttattattatttttcactaacataccattatt 17121247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 290 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 17237447 - 17237304
Alignment:
Q  290 atttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattat 389  Q
    |||||||| | |||| ||||| |||||| ||||| ||| ||||  |  | |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||  |||||  |    
T  17237447 atttattagttttttccactattatacccttatttattgaatttcatccaacttaactactccactaactacaattaataaggttgttttagtaaatgtt 17237348  T
Q  390 actaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 433  Q
    |||||||||| ||||  ||||||  ||| ||||||||| |||||    
T  17237347 actaattttaccattgcaatcaacacaattaattattttcttaa 17237304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 282 - 446
Target Start/End: Original strand, 43237203 - 43237369
Alignment:
Q  282 aatgcaacatttattattattttt--cactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccactaactacaattattaaggatatttt 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||  ||||| ||| ||||  |  | |||||| |||| ||||||||| ||||| ||| ||| ||||    
T  43237203 aatgcaacatttattattatttttttcactattatacacttatttattgaatttcatccaacttaactacttcactaactataattaataatgatttttt 43237302  T
Q  380 tctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattgtacataa 446  Q
      |||||  ||||||||||| |||| |||| ||  ||| |||| |||||||||| ||| || |||||    
T  43237303 agtaaatattactaattttaccattgaaataaacacaattaatcatttccttaataatcgtgcataa 43237369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 347 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 44536290 - 44536191
Alignment:
Q  347 tactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattgtacataa 446  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | ||||  |||||  | ||||||||| ||||||||||||  ||| |||| |||||||||| ||| || |||||    
T  44536290 tactccactaactacaattaataagggtgttttaataaatcctgctaattttaccattaaaatcaacacaattaatcatttccttaataatcgtgcataa 44536191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 340 - 438
Target Start/End: Original strand, 461978 - 462076
Alignment:
Q  340 acttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaatt 438  Q
    |||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||  ||||| ||| || ||||| |||| |||||||| ||| |||| |||| ||||| ||||    
T  461978 acttaactactccgctaattacaattaataaggatattttagtaaataatattacttttaccattgaaatcaatacaattaatcattttcttaaaaatt 462076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 340 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 11288730 - 11288625
Alignment:
Q  340 acttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattg 439  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||||||  ||||| ||| |||||||  |||| |||||||| ||| |||| |||| ||||| ||| |    
T  11288730 acttaactactccaccaactacaattaataa-gatattttagtaaatgatattaattttgccattgaaatcaatacaattaatcattttcttaataatcg 11288632  T
Q  440 tacataa 446  Q
    |||||||    
T  11288631 tacataa 11288625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 340 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 40122955 - 40122862
Alignment:
Q  340 acttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 433  Q
    |||||| | |||||||||||||||| | ||||| | ||||  |||||  ||||||||||| ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||    
T  40122955 acttaactgctccactaactacaatcaataagggtgttttagtaaatgctactaattttaacattaaaatcaacgcaattaatcatttccttaa 40122862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 253 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 33790921 - 33790726
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattattttt--cactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattact 350  Q
    ||||||||||||||||| || |||||  ||| ||| |||||||| || || ||  || || |||||| ||||| ||| ||||  |  | |||||| ||||    
T  33790921 tctcaaaataattgtcactttagaattccaacgcagcatttattttttttctttccattattatacccttatttattgaatttcatccaacttaactact 33790822  T
Q  351 ccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattgtacataa 446  Q
    |||||||||||||||| ||||| | ||||   |||| | |||||||||| ||| ||||||||  ||| |||| |||| ||||| ||| || |||||    
T  33790821 ccactaactacaattaataagggtgttttagcaaatgaaactaattttaccatcaaaatcaacacaattaatcattttcttaataatcgtgcataa 33790726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 254 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 39139923 - 39139868
Alignment:
Q  254 ctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcacta 310  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  39139923 ctcataataattgtcattt-agaataacaatgcaacattcattattattttccacta 39139868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 340 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 47359050 - 47358978
Alignment:
Q  340 acttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 412  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||   ||||||   ||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  47359050 acttaattactccactgactacaattaataaaagtattttagaaaattattctaattttatcattgaaatcaa 47358978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 274 - 409
Target Start/End: Original strand, 18532133 - 18532268
Alignment:
Q  274 agaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccactaactacaattattaagga 373  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| | | ||| ||| ||||  |  | | ||||  |||||||| |||| ||||| |||       
T  18532133 agaatatcaatgtaatatttattattatttttcactattatatcataatttattgaatttcatcctagttaaccactccacttactataattaataaaac 18532232  T
Q  374 tatttttctaaattatactaattttatcattaaaat 409  Q
    ||||||  ||||| |||||||||||| |||||||||    
T  18532233 tattttaataaatcatactaattttaccattaaaat 18532268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 257 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 28911340 - 28911293
Alignment:
Q  257 aaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttt 304  Q
    ||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28911340 aaaataattgtcgatttagaatatcaatgcaacatttattattttttt 28911293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 347 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 23915524 - 23915438
Alignment:
Q  347 tactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 433  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||  ||||||| ||  |||||| ||||||||||||  | |||||| ||||||||||    
T  23915524 tactccactaactataattaataatgatgttttagtaaattaaacatattttaccattaaaatcaacactactaatcatttccttaa 23915438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 259 - 305
Target Start/End: Original strand, 30471794 - 30471840
Alignment:
Q  259 aataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattattttt 305  Q
    ||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30471794 aataattgtctctttaaaatatcaatgcaacatttattattattttt 30471840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 259 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 31096308 - 31096234
Alignment:
Q  259 aataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattc 333  Q
    |||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||| ||||  ||| ||||| ||||||| ||| |||||    
T  31096308 aataattgtcattttataatatcaaaacaacatttattatttttttctactgatatatctttatttattgaattc 31096234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 251 - 357
Target Start/End: Original strand, 35251830 - 35251936
Alignment:
Q  251 tgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattact 350  Q
    |||||| |||||||| ||| || |||||| |||  |||||||||||||||||||||| || |||| | ||||| ||| ||||  |    |||||||||||    
T  35251830 tgtctccaaataattatcaatttagaataccaaaacaacatttattattatttttcattattatatccttatttattgaatttcatctaacttaattact 35251929  T
Q  351 ccactaa 357  Q
    |||||||    
T  35251930 ccactaa 35251936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 77 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 4752030 - 4751981
Alignment:
Q  77 tgtcgctgtcgtcgtcctccaactatgtgataagaaattgataatgtaac 126  Q
    ||||||||||| |||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||    
T  4752030 tgtcgctgtcgccgtcctccaaatttgtgataagagattgacaatgtaac 4751981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 8175785 - 8175709
Alignment:
Q  245 tttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttat 322  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| || ||||||| |||||||||||||||| | ||||  |||  |||||||||||    
T  8175785 tttttctgtctcaaaata-ttgtcactttagaatattaatgcaacatttattaattttttctactgttatacctttat 8175709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 340 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 18741575 - 18741502
Alignment:
Q  340 acttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaat 413  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||  ||||| | |||||||||| | || ||||||||    
T  18741575 acttaactactccattaactacaattaataaagatattttaataaatgacactaattttaccgttgaaatcaat 18741502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 253 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 28501073 - 28501020
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttc 306  Q
    ||||||||||||||||  || |||||| |||| |||||||||||||| ||||||    
T  28501073 tctcaaaataattgtctctttagaataccaatacaacatttattattttttttc 28501020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 355 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 32470034 - 32469917
Alignment:
Q  355 taactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattgtacataactctataa 454  Q
    |||||||| ||| |||| || ||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||| |||| |||| ||| | |||| | ||||| |||  ||    
T  32470034 taactacagttaataagaatgttttaataaatgatactaattttaccattaaaatcaacacaattaatcattttctttaaaattatgcataaatcttaaa 32469935  T
Q  455 caactattagtttgagat 472  Q
    ||| ||||| ||||||||    
T  32469934 caaatattattttgagat 32469917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 340 - 433
Target Start/End: Original strand, 32884821 - 32884914
Alignment:
Q  340 acttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 433  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||  | |||| ||||||  |||||||| || |||| |||||||  ||| |||| |||| |||||    
T  32884821 acttaactactccactaactacaattaataagagtgttttactaaatgctactaattctaccattgaaatcaacacaattaatcattttcttaa 32884914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 340 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 38502583 - 38502490
Alignment:
Q  340 acttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 433  Q
    |||||| |||| || |||||| ||||| |||   ||||||  ||||| |||||||||||| ||| ||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  38502583 acttaactactacattaactataattaataaaagtattttaataaatgatactaattttaccatcaaaatcaacacaattaattatttccttaa 38502490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 340 - 412
Target Start/End: Original strand, 43902271 - 43902346
Alignment:
Q  340 acttaattactccactaactacaattattaaggatatttttcta---aattatactaattttatcattaaaatcaa 412  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||  ||   ||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  43902271 acttaattactccactaactatgattaataagaatattttaataaataataatattaattttatcattaaaatcaa 43902346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095 (Bit Score: 85; Significance: 4e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0095
Description:

Target: scaffold0095; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 229 - 433
Target Start/End: Original strand, 50113 - 50317
Alignment:
Q  229 tgtctctttagtttcttttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaattt 328  Q
    |||||||||||  | |||||| | | ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  50113 tgtctctttagcattttttttctttgtcaaaataattgtcactttagaatatcaatgcagcatttattattatttttcactattatacccttatttattt 50212  T
Q  329 aattctactccacttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttc 428  Q
    ||||  | || ||||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||| |  ||||| ||||||||||||||||| |||| ||  ||| |||| |||||    
T  50213 aatttcattcaacttaattactccactaactgtaattaataaagatattatagtaaatgatactaattttatcattgaaattaacacaattaatcatttc 50312  T
Q  429 cttaa 433  Q
    |||||    
T  50313 cttaa 50317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 228 - 409
Target Start/End: Original strand, 22254 - 22437
Alignment:
Q  228 ctgtctctttag--tttcttttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaa 325  Q
    ||||||||||||  ||| |||| | ||||||||||||||| ||| || | |||| | || |||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||| |    
T  22254 ctgtctctttagccttttttttctctgtctcaaaataattatcactttacaataccgatacaacatttattatt-tttttcactattatatccttattta 22352  T
Q  326 tttaattctactcca--cttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaat 409  Q
    || |||| || ||||   |||| |||| ||||||| || |||| ||| ||||||||  ||||| |||||||||||| |||||||||    
T  22353 ttgaatttta-tccaattttaactactgcactaaccacgattaataaagatattttagtaaatgatactaattttagcattaaaat 22437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 85; Significance: 4e-40; HSPs: 39)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 229 - 433
Target Start/End: Original strand, 39405671 - 39405875
Alignment:
Q  229 tgtctctttagtttcttttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaattt 328  Q
    |||||||||||  | |||||| | | ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  39405671 tgtctctttagcattttttttctttgtcaaaataattgtcactttagaatatcaatgcagcatttattattatttttcactattatacccttatttattt 39405770  T
Q  329 aattctactccacttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttc 428  Q
    ||||  | || ||||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||| |  ||||| ||||||||||||||||| |||| ||  ||| |||| |||||    
T  39405771 aatttcattcaacttaattactccactaactgtaattaataaagatattatagtaaatgatactaattttatcattgaaattaacacaattaatcatttc 39405870  T
Q  429 cttaa 433  Q
    |||||    
T  39405871 cttaa 39405875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 257 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 10180126 - 10179950
Alignment:
Q  257 aaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccacta 356  Q
    ||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  | || |||||  ||||||||| ||||  | || |||||| ||||||||||    
T  10180126 aaaataattgtcactttagaataccaatgcaacatttattattattttctattattatacacttattaattgaatttcattcaacttaactactccacta 10180027  T
Q  357 actacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 433  Q
    |||||||||| ||||  ||||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| | |||| |||||    
T  10180026 actacaattaataagtgtattttagtaaattatactaattttaccattgaaatcaatacaactactcattttcttaa 10179950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 253 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 17719441 - 17719283
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 352  Q
    |||| |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||  |||| || || |||||||||||| ||| ||||  |  | |||||| ||||||    
T  17719441 tctctaaataattgtcactttagaataccaatgcaacatttattatctttttccattattatacctttatttattaaatttcatccaacttaactactcc 17719342  T
Q  353 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatca 411  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| |||| |||||||||||    
T  17719341 actaactataattaataaggatattttagtaaataatactaactttaccattaaaatca 17719283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 244 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 22772027 - 22771825
Alignment:
Q  244 ttttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccactt 343  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||| ||||| ||| ||||  |  | || |    
T  22772027 ttttttttttctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcaacatttattattacttttcattattatacccttatttattgaatttcatccaacat 22771928  T
Q  344 aattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattgtaca 443  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||  ||||| | |||||||||| ||| ||||||||  ||| |||| | |||||||| || ||| ||    
T  22771927 aattacttcactaactacaattaataagggtgttttaataaatgacactaattttaccatcaaaatcaacccaattaatcaattccttaataactgtgca 22771828  T
Q  444 taa 446  Q
    |||    
T  22771827 taa 22771825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 257 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 396790 - 396614
Alignment:
Q  257 aaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccact-taattactccact 355  Q
    ||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||| || |||| | ||| |||| || |    
T  396790 aaaataattgtcactttagaataccaatgcaacatttattattatttttcattattatacccttattaattgaatttta-tccaatataactacttcatt 396692  T
Q  356 aactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 433  Q
    ||||||||||| |||||||||| |  ||||| |||||||||||| | || |||||||   || |||| ||||||||||    
T  396691 aactacaattaataaggatattgtagtaaatgatactaattttaccgttgaaatcaacataattaatcatttccttaa 396614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 255 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 45425848 - 45425669
Alignment:
Q  255 tcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttc-actaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcca 353  Q
    ||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||| ||| ||||  |  | ||||||||||||||    
T  45425848 tcaaaataattgtcactttacaatatcaatgtaacatttattattttttttccactattatacccttatttattgaatttcatacaacttaattactcca 45425749  T
Q  354 ctaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 433  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||  |||||  || |||||||| ||||||||||||  ||| |||| |||| |||||    
T  45425748 ctaactacaattaataagaatgttttaataaatgttattaattttaccattaaaatcaacacaattaatcattttcttaa 45425669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 253 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 26626295 - 26626102
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 352  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||| |||  || || |||||| ||||| ||| ||||  | || ||   | ||||||    
T  26626295 tctcaaaataattgtcactttaaaatatcaatgcagcatttattattttttcccattattatacccttatttattgaatttcattcaaccggactactcc 26626196  T
Q  353 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattgtacataa 446  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||| ||| ||||  ||| |||| |||||||||| ||| || |||||    
T  26626195 actaactacaattaataaggatattttaataaattatacaaattttaccatcaaattcaacacaattaatcatttccttaataatcgtgcataa 26626102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 234 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 36007091 - 36006897
Alignment:
Q  234 ctttagtttcttttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattattttt--cactaatatacctttattaatttaat 331  Q
    |||||| || ||||||  |||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||| ||||| ||||||||  ||||| ||| |  ||||| ||| |||    
T  36007091 ctttagatttttttttccgtctcaaaataattgtcactttagaatactaatgcaacaattatttttatttttttcactattatgctcttatttattgaat 36006992  T
Q  332 tctactccacttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatt 426  Q
    |  |    |||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||  | ||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  36006991 ttcatcaaacttaattaccccactaactacaattaatagggatattttagtcaataatattaattttatcattaaaatcaacacaactaattatt 36006897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 242 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 39301150 - 39301020
Alignment:
Q  242 tcttttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccac 341  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||| | | |||||||||||||| || || ||||| |||||| ||| ||||  | || ||    
T  39301150 tcttttttttctctcaaaataattgtcattttagaatatcaatgaatcgtttattattattttccattattatacttttatttattgaatttcattcaac 39301051  T
Q  342 ttaattactccactaactacaattattaagg 372  Q
    | || |||| ||||||||||||||| |||||    
T  39301050 tgaactacttcactaactacaattaataagg 39301020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 244 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 4428541 - 4428354
Alignment:
Q  244 ttttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccactt 343  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| || |||||||||||| |||| |||||||  |||| ||||| ||||| |||||| ||| ||||  |    ||||    
T  4428541 ttttctatgcctcaaaataattgtcactttagaatatcaatgtaacaattattat--ttttccactattatacttttatttattgaatttcatctaactt 4428444  T
Q  344 aattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 433  Q
    || || | ||||||||||||||| |||   ||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||  ||| |||| |||| |||||    
T  4428443 aactaattcactaactacaattaataattgtattttagtaaatgataataattttatcattaaaatcaacacaaataatcattttcttaa 4428354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 340 - 433
Target Start/End: Original strand, 31331428 - 31331521
Alignment:
Q  340 acttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 433  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||| ||| ||||||||| ||| |||||||| ||| |||| ||||||||||    
T  31331428 acttaattacttcactaactacaattaataatgatattttagtaaataataataattttataattgaaatcaatacaattaatcatttccttaa 31331521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 290 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 4924214 - 4924094
Alignment:
Q  290 atttattattattttt-cactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaatta 388  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| | ||  | || |||||| ||||| | |||||||||||| ||| ||||||||  ||||| |    
T  4924214 atttattattattttttcactaatatacccttatttattaagtttcattcaacttaactactctattaactacaattaataaagatattttagtaaataa 4924115  T
Q  389 tactaattttatcattaaaat 409  Q
    ||||||||||| |||||||||    
T  4924114 tactaattttaccattaaaat 4924094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 253 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 34948868 - 34948683
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 352  Q
    ||||||||||||||| | || |||||| |||||||| |||||||||| ||||||| |  |||||||| ||| ||| ||||  |  | |||||| ||||||    
T  34948868 tctcaaaataattgttactttagaataccaatgcaatatttattatt-tttttcattgttatacctt-atttattgaatttcatccaacttaactactcc 34948771  T
Q  353 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattgt 440  Q
    |||||||||||||| |||   | ||| | ||||| ||||||||||||  ||| |||||||  ||| |||| |||||||||| ||||||    
T  34948770 actaactacaattaataaatgtgtttctgtaaatgatactaattttactatttaaatcaacacaattaatcatttccttaataattgt 34948683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 253 - 446
Target Start/End: Original strand, 13335150 - 13335342
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 352  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||| || || |||||| | ||| ||| ||||  |    |||||| |||||     
T  13335150 tctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcaacatttattatt-ttttccattattataccctgatttattgaatttcatcaaacttaactactct 13335248  T
Q  353 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattgtacataa 446  Q
    ||||||| |||||| |||   | |||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||||  ||| |||  |||||||||| ||| || |||||    
T  13335249 actaactgcaattaataaatgtgttttactaaatgatactaattttaccatcaaaatcaacacaattaaccatttccttaataatcgtgcataa 13335342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 257 - 410
Target Start/End: Original strand, 31231667 - 31231820
Alignment:
Q  257 aaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccacta 356  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||||||| |||| || ||  ||||| ||||| ||| || | ||  | |||||| ||||||||||    
T  31231667 aaaataattgtcattttataataccaatgcatcatttattatttttttccattataatacccttatttattgaactttatccaacttaactactccacta 31231766  T
Q  357 actacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatc 410  Q
    |||||||||| ||||| | |||   ||||| ||| |||||||| ||| ||||||    
T  31231767 actacaattaataagggtgtttcagtaaatgatattaattttaccatcaaaatc 31231820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 349 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 2767378 - 2767294
Alignment:
Q  349 ctccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 433  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| ||||  ||||| |||||||||||| ||| ||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  2767378 ctccactaactacaaataataaggatgttttaataaatgatactaattttaccatcaaaatcaacacaattaattatttccttaa 2767294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 253 - 412
Target Start/End: Original strand, 32476221 - 32476379
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 352  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||| | | ||||||| ||||||| |  |||||| ||||| ||| ||||  |    |||||| |||| |    
T  32476221 tctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcagcgtatattatt-tttttcattgttatacccttatttattgaatttcatcaaacttaactacttc 32476319  T
Q  353 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 412  Q
    | |||||||||||| ||||| ||||||  ||||| ||| ||||||||||||| |||||||    
T  32476320 attaactacaattaataagggtattttaataaatgatattaattttatcattgaaatcaa 32476379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 228 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 39466247 - 39466064
Alignment:
Q  228 ctgtctctttag--tttcttttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaa 325  Q
    ||||||||||||  ||| |||| | ||||||||||||||| ||| || | |||| | || |||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||| |    
T  39466247 ctgtctctttagccttttttttctctgtctcaaaataattatcactttacaataccgatacaacatttattatt-tttttcactattatatccttattta 39466149  T
Q  326 tttaattctactcca--cttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaat 409  Q
    || |||| || ||||   |||| |||| ||||||| || |||| ||| ||||||||  ||||| |||||||||||| |||||||||    
T  39466148 ttgaatttta-tccaattttaactactgcactaaccacgattaataaagatattttagtaaatgatactaattttagcattaaaat 39466064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 257 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 21216279 - 21216104
Alignment:
Q  257 aaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttc-actaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccact 355  Q
    ||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||  | |||||| |||| |||||| || |  ||| ||||  |  | |||||| |||||||||    
T  21216279 aaaataattgtcactttacaataccaatgcaacatttatttatttttttctactattataccatttt--attgaatttcatccaacttaactactccact 21216182  T
Q  356 aactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 433  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||  |||||   |||||||||| |||| |||||||  ||| |||| ||||||||||    
T  21216181 aactacaattaataaggatgttttagtaaatgcaactaattttaccattgaaatcaacacaattaatcatttccttaa 21216104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 253 - 315
Target Start/End: Original strand, 40109646 - 40109707
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatata 315  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  40109646 tctcaaaataattgtcattttagaatat-aatgcaacatttattatatttttccactaatata 40109707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 253 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 44761675 - 44761500
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 352  Q
    ||||||||||||||||| || | |||| ||||||| |||  |||| | |||| ||||| |||||| | ||| ||| ||||  |  | |||||| ||||||    
T  44761675 tctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcagcat--attagttttttccactattataccctcatttattgaatttcatccaacttaactactcc 44761578  T
Q  353 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttcct 430  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||  |||||  ||||||||||| |||| |||||||  ||| |||| |||||||    
T  44761577 actaactacaattaataagggtgttttagtaaatgctactaattttaccattgaaatcaacacaattaatcatttcct 44761500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 253 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 10098175 - 10097994
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaata-tacctttattaatttaattctactccacttaattactc 351  Q
    ||||||||||||||| | || |||||| |||| || ||||||||||| ||||||  | ||| || ||||||| ||| || |  |  | |||||| |||||    
T  10098175 tctcaaaataattgttactttagaataccaatacatcatttattattttttttccattataatatctttatttattgaacttcatccaacttaactactc 10098076  T
Q  352 cactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 433  Q
    ||||||||||||||| ||||| | || |  ||||| ||| |||||||| ||| ||||||||| ||| |||| |||| |||||    
T  10098075 cactaactacaattaataagggtgttatagtaaatgatattaattttaccatcaaaatcaatacaattaatcattttcttaa 10097994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 340 - 433
Target Start/End: Original strand, 31082639 - 31082732
Alignment:
Q  340 acttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 433  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||||| | ||||  |||||   |||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||    
T  31082639 acttaactactccactaactataattaataagggtgttttagtaaataccactaattttatcattaaaatcaagacaattaatcatttccttaa 31082732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 253 - 433
Target Start/End: Original strand, 39482545 - 39482728
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatat---acctttattaatttaattctactccacttaattac 349  Q
    ||||||||||||||||| || | |||| |||||||  |||||||||| |||  ||||| |||   ||| ||||| ||| ||||  | ||||||||| ||     
T  39482545 tctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcagtatttattattttttcccactattattatacccttatttattgaatttcattccacttaactag 39482644  T
Q  350 tccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 433  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| | ||||  |||||| ||||||||||| | || |||||||  ||| |||| |||| |||||    
T  39482645 tccactaactataattaataagggtgttttagtaaattctactaattttacccttgaaatcaacacaattaatcattttcttaa 39482728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 332
Target Start/End: Original strand, 41091921 - 41092007
Alignment:
Q  244 ttttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaatt 332  Q
    |||||| |||||||| ||||||| || || |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||    
T  41091921 ttttttttgtctcaacataattgccaatttagaatatcaatgcagcatttat--ttatttttcactattatacccttatttattgaatt 41092007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 289 - 433
Target Start/End: Original strand, 7172883 - 7173027
Alignment:
Q  289 catttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaatta 388  Q
    ||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||| ||| ||||  | || |||||| |||| || |||||||||||| |||  || ||||  |||||      
T  7172883 catttattatttttttccactattatacccttatttattgaatttcattcaacttaactacttcattaactacaattaataaatatgttttagtaaatgc 7172982  T
Q  389 tactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 433  Q
    |||||||||||||||| |||||||  ||| |||| ||||| ||||    
T  7172983 tactaattttatcattgaaatcaacacaattaatcatttctttaa 7173027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 255 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 29226708 - 29226593
Alignment:
Q  255 tcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccac 354  Q
    ||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||| ||||||||| || | |||| ||||| ||| ||||  |    |||||| ||||||||    
T  29226708 tcaaaataattgtcactttaaaatatcaatgcagcatttatta-tatttttcattattgtacccttatttattgaatttcatctaacttaactactccac 29226610  T
Q  355 taactacaattattaag 371  Q
    |||||||||||| ||||    
T  29226609 taactacaattaataag 29226593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 257 - 332
Target Start/End: Original strand, 50753 - 50828
Alignment:
Q  257 aaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaatt 332  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||  |||| || || |||||||||||| ||| ||||    
T  50753 aaaataattgtcactttagaatatcaatgcagcatttattatctttttccattattatacctttatttattaaatt 50828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 276 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 44648686 - 44648541
Alignment:
Q  276 aatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccactaactacaattattaaggata 375  Q
    ||||||||| |||||||||||| | || |||| |||||| |||| |||||||| |     || || || ||||||||||||| |||||||| |||| ||     
T  44648686 aatatcaatacaacatttattaattttgttcattaatatccctt-attaatttca-----ctacattttattactccactaattacaattagtaagtatg 44648593  T
Q  376 tttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattattt 427  Q
    ||||  ||||| |||||||||||| |||| ||||||| | ||||||| ||||    
T  44648592 ttttagtaaatgatactaattttaccattgaaatcaactaaactaatcattt 44648541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 13831764 - 13831703
Alignment:
Q  244 ttttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattattttt 305  Q
    ||||| || |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13831764 tttttcatatctcaaaagaactgtcactttagaatatcaatgcaacatttatcattattttt 13831703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 340 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 27294155 - 27294086
Alignment:
Q  340 acttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaat 409  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||  |||||||  ||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  27294155 acttaattactccactaactgcaattaataaatatattttagtaaaagatactaattttatcattcaaat 27294086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 245 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 42182119 - 42182033
Alignment:
Q  245 tttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattc 333  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||| ||||| ||| |||||    
T  42182119 tttttttgtcttaaaataattgtcgttttagaata-caatgcaacatttataatta-ttttcaccaatgtacccttatttattgaattc 42182033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 253 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 5053335 - 5053292
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttatt 296  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||    
T  5053335 tctcaaaataattgtcactttaaaatatcaatgcaacatttatt 5053292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 282 - 412
Target Start/End: Original strand, 31270985 - 31271113
Alignment:
Q  282 aatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccactaactacaattattaaggatatttttc 381  Q
    ||||||| |||||||||| ||||  | || |||||| ||||| ||| |||| ||  | |||||| |||||||||||||| ||||| ||||  ||||||      
T  31270985 aatgcaatatttattattttttt--attactatacccttatttattgaattttatccaacttaactactccactaactataattaataagagtattttag 31271082  T
Q  382 taaattatactaattttatcattaaaatcaa 412  Q
    || || ||| |||||||| ||||||||||||    
T  31271083 tatatgatattaattttaccattaaaatcaa 31271113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 253 - 332
Target Start/End: Original strand, 36967307 - 36967385
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaatt 332  Q
    ||||||||||||||| | || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||| || |||||| ||||| ||| ||||    
T  36967307 tctcaaaataattgttactttagaatatcaatgcataatttattatt-tttttcattattatacccttatttattgaatt 36967385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 352 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 40996449 - 40996355
Alignment:
Q  352 cactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcatt-aaaatcaattcaactaattatttccttaacaattgtacataa 446  Q
    ||||||||||||||| ||||| | ||||  ||||| | |||||||||| |||| ||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  40996449 cactaactacaattaataagggtgttttagtaaatgaaactaatttta-cattcaaaatcaacacaattaatcatttccttaacaattgtgcataa 40996355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 340 - 433
Target Start/End: Original strand, 51133 - 51225
Alignment:
Q  340 acttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 433  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||   | ||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||  ||| |||| |||| |||||    
T  51133 acttaattaatccactaactacaattaataaatgtgtttttgtaaatgatacttatttta-cattaaaatcaacacaattaatcattttcttaa 51225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 352 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 1875676 - 1875595
Alignment:
Q  352 cactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 433  Q
    ||||||||||||||| ||||| | ||||  |||||  ||||||||||| |||| |||||||  ||| |||| ||||||||||    
T  1875676 cactaactacaattaataagggtgttttagtaaatgctactaattttaccattgaaatcaacacaattaatcatttccttaa 1875595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 259 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 1875916 - 1875843
Alignment:
Q  259 aataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaatt 332  Q
    ||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||| | |||| ||||| |||||| ||||| ||| ||||    
T  1875916 aataattgtcactttacaataccaatgcaacatttattacttttttccactagtatacccttatttattaaatt 1875843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 85; Significance: 4e-40; HSPs: 33)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 253 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 1248784 - 1248604
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 352  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||| || || |||||| |||| |    
T  1248784 tctcaaaataattgtcactttagaatatcaatgcaacatttattattatttttcattattatacccttattaattgaattttattcaacttaactacttc 1248685  T
Q  353 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 433  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||  ||||| ||| |||||||| |||| |||||||   || |||| ||||||||||    
T  1248684 actaactacaattaataagggtattttagtaaatgatattaattttaccattgaaatcaacataattaataatttccttaa 1248604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 253 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 6315957 - 6315801
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 352  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| || || |||||| ||||| ||| ||||  |  | |||||| |||| |    
T  6315957 tctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcaacatttattattattttccattattatacccttatttattgaatttcatccaacttaactacttc 6315858  T
Q  353 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaat 409  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||  ||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  6315857 actaactacaattaataagggtattttagtaaatgatattaattttatcattgaaat 6315801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 257 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 7828102 - 7827926
Alignment:
Q  257 aaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccacta 356  Q
    |||| |||| |||||| | ||||||||||||| |||||||||  ||||||| || |||| | ||||| ||| ||||  |  | |||||| ||||||||||    
T  7828102 aaaaaaattatcattttaaaatatcaatgcaatatttattatcttttttcattattatatccttatttattaaatttcatccaacttaactactccacta 7828003  T
Q  357 actacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 433  Q
    |||||||||| ||||| ||||||  ||||| |||||||||||| |||| |||||||  ||| ||||||||| |||||    
T  7828002 actacaattaataagggtattttaataaatgatactaattttaccattgaaatcaacacaattaattattttcttaa 7827926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 253 - 433
Target Start/End: Original strand, 40899851 - 40900031
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 352  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| || |||| |||||||||||||||| || || |||||| ||||| ||| ||||  |    |||||| ||||||    
T  40899851 tctcaaaataattgtcactttagaataacattgcagcatttattattattttccattattatacccttatttattgaatttcatctaacttaactactcc 40899950  T
Q  353 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 433  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||  ||||| |||||||||||  ||| ||||||||  ||| |||| ||||||||||    
T  40899951 actaactacaattaataagggtgttttagtaaatgatactaattttgccatcaaaatcaacacaattaatcatttccttaa 40900031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 258 - 409
Target Start/End: Original strand, 21060569 - 21060719
Alignment:
Q  258 aaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccactaa 357  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||| || || |||||| ||||| ||| |||| ||  | |||||| |||||||||||    
T  21060569 aaataattgtcactttagaatatcaatgcatcatttatt-ttattttccattattataccattatttattgaattttatccaacttaactactccactaa 21060667  T
Q  358 ctacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaat 409  Q
    ||||||||| ||||  ||||||  ||||| |||||||||||| ||| |||||    
T  21060668 ctacaattaataagagtattttagtaaataatactaattttaccatcaaaat 21060719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 244 - 427
Target Start/End: Original strand, 41496004 - 41496187
Alignment:
Q  244 ttttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccactt 343  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| || | ||||  |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| |||  |||  |  | | ||    
T  41496004 ttttttttttctcaaaataattgtcactttacaatactaatgcaacatttattattcttttccactattatacctttatttattgcatttcatccaattt 41496103  T
Q  344 aattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattattt 427  Q
    || |||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||   |||||||||| |||| |||||||  ||| |||||||||    
T  41496104 aactactccactaactacaattaataatgatgttttactaaatgcaactaattttaccattgaaatcaacacaattaattattt 41496187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 255 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 6753836 - 6753682
Alignment:
Q  255 tcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccac 354  Q
    ||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||||||||||  |||| || || |||||| ||||| ||| ||||  |  | |||||| ||||||||    
T  6753836 tcaaaataattatcactttagaataccaatgcaacatttattatctttttccattattatacccttatttattaaatttcatccaacttaactactccac 6753737  T
Q  355 taactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaat 409  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||  ||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  6753736 taactacaattaataagggtattttagtaaatgatactaattttaccattgaaat 6753682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 253 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 8725189 - 8725009
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 352  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| || || ||||||||||||| || |||||  ||||| ||| ||||  | || | |||| ||||||    
T  8725189 tctcaaaataattgtcattttagaataacaatgcagcagtttttattatttttcattattatactattatttattgaatttcattcaagttaactactcc 8725090  T
Q  353 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 433  Q
    |||||||||||||| ||||  | ||||  ||||| ||| |||||||| |||| |||||||  ||| |||| ||||| ||||    
T  8725089 actaactacaattaataagtgtgttttagtaaatgatattaattttaccattgaaatcaacacaattaatcatttctttaa 8725009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 253 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 6616060 - 6615886
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttc-actaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactc 351  Q
    ||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||| ||| |||||  | | ||||||  ||||    
T  6616060 tctcaaaataattgtcactttacaatacctatgcaacatttattattttttttccactattatacccttatttattgaattcatc-caacttaaccactc 6615962  T
Q  352 cactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattattt 427  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| ||||  |||||  ||||||||||| |||| |||||||  ||| |||||||||    
T  6615961 cactaactaaaattaataaggatgttttggtaaatgctactaattttaccattgaaatcaacacaattaattattt 6615886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 255 - 443
Target Start/End: Original strand, 31654987 - 31655176
Alignment:
Q  255 tcaaaataattgtca-tttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcca 353  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||| |||| ||| | ||||||||  ||| ||||| |||||| ||||| ||| ||||  | || || |||||||||||    
T  31654987 tcaaaataattgtcactttaaaaataccaatacaataattattatttatttccactattatacccttatttattgaatttcattcaacataattactcca 31655086  T
Q  354 ctaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattgtaca 443  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |  ||||| ||| |||||||| |||| |||||||  ||| |||| ||||| |||| ||| |||||    
T  31655087 ctaactacaattaataaggatattatagtaaatgatattaattttaccattgaaatcaacacaattaatcatttctttaataatcgtaca 31655176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 251 - 427
Target Start/End: Original strand, 7330439 - 7330614
Alignment:
Q  251 tgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattact 350  Q
    ||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||  | ||||||||||||||  ||| |||| || |||| |||| ||||    
T  7330439 tgtctcaaaataattatcattttaaaatatcaatgcaacattaattatttttttctagtaatatacctttatgtattaaatttta-tccaattaactact 7330537  T
Q  351 ccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattattt 427  Q
    ||||||| || ||||| ||||  | |||| || ||| ||| ||||||||  ||||||| | ||||| | ||||||||    
T  7330538 ccactaattagaattaataagagtgttttactgaatgatattaattttacgattaaaaccgattcaccaaattattt 7330614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 256 - 412
Target Start/End: Original strand, 19929882 - 19930038
Alignment:
Q  256 caaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccact 355  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| || || |||||| ||||| ||| ||||  |  | |||||| || | ||||    
T  19929882 caaaataattgtcactttagaataccaatgcaacatttattattattttccattattatacccttatttattgaatttcatccaacttaactatttcact 19929981  T
Q  356 aactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 412  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||  ||||| |  ||| ||||| ||| ||||||||    
T  19929982 aactacaattaataaggatgttttagtaaatgacgctagttttaccatcaaaatcaa 19930038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 255 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 40530403 - 40530224
Alignment:
Q  255 tcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattatt-atttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcca 353  Q
    ||||||||||||||| || | |||| ||||||| ||||||||||| ||||  ||||| |||||| ||||| ||||||||  |  | ||||||  ||||||    
T  40530403 tcaaaataattgtcactttacaataccaatgcagcatttattatttatttcccactattatacccttatttatttaatttcatccaacttaaccactcca 40530304  T
Q  354 ctaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 433  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||||  |||||  ||||||||||| |||| |||||||  ||| |||| |||| |||||    
T  40530303 ctaactacaattaataagggtgttttagtaaatgctactaattttaccattgaaatcaacacaattaatcattttcttaa 40530224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 286 - 427
Target Start/End: Original strand, 4440987 - 4441128
Alignment:
Q  286 caacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaa 385  Q
    |||||||||||||| ||||  |||| |||||| ||||| ||| ||||  |  | | |||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||    
T  4440987 caacatttattatttttttctactattataccgttatttattgaatttcatccaatttaactactccactaactacaattaataaaaatattttagtaaa 4441086  T
Q  386 ttatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattattt 427  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  4441087 taatattaattttatcattaaaatcaacacaattaattattt 4441128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 253 - 433
Target Start/End: Original strand, 4818483 - 4818664
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttc-actaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactc 351  Q
    ||||||||||||||||| || | |||| ||||| | ||||||||||| |||| | |||| |||||| ||||| ||| ||||  |    ||||||| ||||    
T  4818483 tctcaaaataattgtcactttataataccaatgtagcatttattatttttttcccactattatacccttatttattgaatttcatctaacttaatcactc 4818582  T
Q  352 cactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 433  Q
    ||||||||||||||| ||||| | ||||  |||||  |||||||||||  ||| |||||||  ||| |||||||||||||||    
T  4818583 cactaactacaattaataagggtgttttagtaaatgctactaattttacaattgaaatcaacacaattaattatttccttaa 4818664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 253 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 41062339 - 41062181
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactcca-cttaattactc 351  Q
    ||||||||||||| | | || |||||| ||||||||||||||||||| |||| || ||  ||||| ||||| ||| || || | |||| |||||||| ||    
T  41062339 tctcaaaataattataactttagaataccaatgcaacatttattatt-ttttccattataatacccttatttattgaactcca-tccagcttaattattc 41062242  T
Q  352 cactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 412  Q
     |||||||||||||| ||||| | ||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  41062241 tactaactacaattaataagggtgttttagtaaatgatactaattttatcatcaaaatcaa 41062181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 253 - 433
Target Start/End: Original strand, 8698241 - 8698422
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattattttt-cactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactc 351  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||||||| |  |||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||| ||| ||||  |  | ||||||  ||||    
T  8698241 tctcaaaataattgtcactttacaatatcaatgtagtatttattattttttttccactattatacccttatttattgaatttcatccaacttaaccactc 8698340  T
Q  352 cactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 433  Q
    ||||||||||||||| ||||| | ||||  |||||   |||||||||| |||| |||||||  ||| |||| ||||| ||||    
T  8698341 cactaactacaattaataagggtgttttggtaaatgcaactaattttaccattgaaatcaacacaattaatcatttctttaa 8698422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 253 - 371
Target Start/End: Original strand, 6753962 - 6754080
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 352  Q
    ||||||||||||||||| || | |||| ||||||||||||| || || |||| ||  |||||||| ||||| ||| ||||  |  | |||||| ||||||    
T  6753962 tctcaaaataattgtcactttataataccaatgcaacattttttttttttttccatcaatatacccttatttattgaatttcatccaacttaactactcc 6754061  T
Q  353 actaactacaattattaag 371  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  6754062 actaactacaattaataag 6754080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 253 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 26285658 - 26285484
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 352  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||| |||| |  |||||||  | |||  |||||| |||| |||||| ||| |||| ||  | |||||| |||| |    
T  26285658 tctcaaaataattgtcaattgagaatattaatgtagtatttattgatttttcccactaacatacatttatttattgaattttatacaacttaactacttc 26285559  T
Q  353 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattattt 427  Q
    | |||||||||||| || |  | ||||  ||||| |||||||||||| | |||||||||| ||||||||| ||||    
T  26285558 attaactacaattaatacgtgtgttttcataaatgatactaattttaccgttaaaatcaagtcaactaatcattt 26285484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 340 - 430
Target Start/End: Original strand, 27580620 - 27580710
Alignment:
Q  340 acttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttcct 430  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||| ||| |||||||| |||| |||||||  ||| |||| |||||||    
T  27580620 acttaactactccactaactacaattaataagggtattttagtaaatgatattaattttaccattgaaatcaacacaattaatcatttcct 27580710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 274 - 332
Target Start/End: Original strand, 41480103 - 41480163
Alignment:
Q  274 agaatatcaatgcaacatttattatta--tttttcactaatatacctttattaatttaatt 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  41480103 agaatatcaatgcaacatttattattatttttttcactattatacctttatttattgaatt 41480163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 11796260 - 11796188
Alignment:
Q  340 acttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 412  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| |||  |||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  11796260 acttaactactacactaactacaattaataataatattttagtaaataatattaattttatcattaaaatcaa 11796188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 253 - 433
Target Start/End: Original strand, 27542728 - 27542908
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 352  Q
    ||||||||||||||| | || ||||||  |||||| ||| ||||| | |||| || || |||||  ||||| ||| |||| ||  | |||||| ||||||    
T  27542728 tctcaaaataattgtgactttagaatactaatgcagcatgtattacttttttccattattatactcttatttattgaattttatccaacttaactactcc 27542827  T
Q  353 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 433  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||  |||||  || |||||||| |||| |||||||  |||  ||| ||||||||||    
T  27542828 actaactacaattaataagagtattttagtaaatggtattaattttaccattgaaatcaacacaatcaatcatttccttaa 27542908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 296 - 412
Target Start/End: Original strand, 29374318 - 29374434
Alignment:
Q  296 tattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaat 395  Q
    |||| |||||||||| |||||| ||||| ||| |||| || || | |||| |||||||||||||||||||| ||| | | ||||  |||||  || ||||    
T  29374318 tattttttttcactattatacccttatttattgaattttattcaatttaactactccactaactacaattaataaaggtcttttagtaaatgctattaat 29374417  T
Q  396 tttatcattaaaatcaa 412  Q
    ||||||||| |||||||    
T  29374418 tttatcattgaaatcaa 29374434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 253 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 3348310 - 3348259
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttt 304  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  3348310 tctcaaaataattgtcattttagaataccaatgcagcatttattattttttt 3348259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 261 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 24455130 - 24454982
Alignment:
Q  261 taattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccactaacta 360  Q
    |||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||   ||  |||||||||   ||||| ||| ||||  |||||  ||| ||||||||| |||||    
T  24455130 taattgtcacattagaatatcaatacaacatttattatt---ttcgactaatatagtcttatttattaaatttcactccgtttagttactccacaaacta 24455034  T
Q  361 caattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 412  Q
    |||||| |||   ||||||  ||| |||||||| |||||| |||||||||||    
T  24455033 caattaataaaagtattttaataagttatactagttttataattaaaatcaa 24454982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 274 - 332
Target Start/End: Original strand, 41478737 - 41478797
Alignment:
Q  274 agaatatcaatgcaacatttattattattttt--cactaatatacctttattaatttaatt 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| |||||||||||| ||| ||||    
T  41478737 agaatatcaatgcaacatttattattattttttctactattatacctttatttattgaatt 41478797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 253 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 2588243 - 2588192
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattattttt 305  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  2588243 tctcaaaataattgtcactttagaatatcaatgcagcatttatt-ttattttt 2588192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 5129323 - 5129232
Alignment:
Q  342 ttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 433  Q
    |||| ||||| | |||||||||||| |||| || || |  ||||||||| |||||||| |||| ||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  5129323 ttaactactctaataactacaattaataagaatgttatagtaaattatattaattttaccattcaaaccaatgcaactaattattttcttaa 5129232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 30118404 - 30118310
Alignment:
Q  245 tttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactcca 340  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| | || |||||||  |||||||||||||| ||| |||||| || ||||| |||||| ||| |||| |||||||    
T  30118404 tttttatatcttaaaataattgtaactttagaatattcatgcaacatttattttta-ttttcattagtatacatttatttattgaattttactcca 30118310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 251 - 305
Target Start/End: Original strand, 41478637 - 41478691
Alignment:
Q  251 tgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattattttt 305  Q
    ||||||||||||||| ||| || ||||||| |||||| || ||||||||||||||    
T  41478637 tgtctcaaaataattatcactttagaatattaatgcagcacttattattattttt 41478691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 251 - 305
Target Start/End: Original strand, 41492189 - 41492243
Alignment:
Q  251 tgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattattttt 305  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||  | || ||||||||||||||    
T  41492189 tgtctcaaaataattgtcactttagaatatcaataaagcacttattattattttt 41492243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 382 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 29412094 - 29412049
Alignment:
Q  382 taaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattattt 427  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||    
T  29412094 taaatcatactaattttaccattaaaatcaatcgaactaattattt 29412049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 73; Significance: 6e-33; HSPs: 33)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 253 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 14523552 - 14523372
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 352  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||| | ||||||||| ||||  |    |||||| ||||||    
T  14523552 tctcaaaataattgtcactttagaatatcaatgcaacatttattattattttccattattatatccttattaattgaatttcatctaacttaactactcc 14523453  T
Q  353 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 433  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||| |||||||| |||| |||||||  |||  ||| ||||||||||    
T  14523452 actaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttaccattgaaatcaacacaaaaaatcatttccttaa 14523372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 253 - 433
Target Start/End: Original strand, 17695261 - 17695443
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattattttt--cactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattact 350  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||| ||| ||||  |  | |||||| ||||    
T  17695261 tctcaaaataattgtcactttagaatatcaatgcagcatttattattattttttccactattatacccttatttattgaatttcatccaacttaactact 17695360  T
Q  351 ccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 433  Q
    | |||||||| ||||| |||| |||||||| ||||| |||  ||||||| |||| |||||||| ||| |||| ||||||||||    
T  17695361 ctactaactataattaataagaatatttttgtaaatgatatcaattttaccattgaaatcaatacaattaatcatttccttaa 17695443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 257 - 433
Target Start/End: Original strand, 43410363 - 43410539
Alignment:
Q  257 aaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccacta 356  Q
    ||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||| |||| || || |||||  | ||| ||| ||||  | || |||||| ||||||| ||    
T  43410363 aaaataattgtcactttagaatactaatgcaacatttattatttttttccattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccatta 43410462  T
Q  357 actacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 433  Q
    |||||||||| ||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||| | |||||  ||| |||| ||||||||||    
T  43410463 actacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatatcaacacaattaataatttccttaa 43410539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 253 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 36354622 - 36354430
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 352  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| |||||||  |||||||||| |||| || || |||||| ||||| ||| ||||  |  | |||||| ||||||    
T  36354622 tctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcagaatttattatt-ttttccattattataccattatttattgaatttcatccaacttaactactcc 36354524  T
Q  353 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattgtacataa 446  Q
    |||||||||||||| ||||  | |||   ||||| |||||||||||| ||| ||||||||  |||||| | |||||||||| ||| ||||||||    
T  36354523 actaactacaattaataagagtgtttcaataaataatactaattttaccatcaaaatcaacacaactagtcatttccttaataatcgtacataa 36354430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 255 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 8947232 - 8947047
Alignment:
Q  255 tcaaaataattgtcattt---cagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactc 351  Q
    ||||||||||||||||||    | |||| |||||||| |||||||||| ||||||| || |||||| ||||| ||| ||||  |  | |||||| |||||    
T  8947232 tcaaaataattgtcattttacaacaataccaatgcaatatttattatt-tttttcattattatacccttatttattgaatttcatccaacttaactactc 8947134  T
Q  352 cactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaatt 438  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||| ||||    
T  8947133 cactaactataattaataaggatgttttagtaaatattactaattttatcattgaaatcaacacaattaatcatttccttaataatt 8947047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 257 - 413
Target Start/End: Original strand, 34225527 - 34225683
Alignment:
Q  257 aaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccacta 356  Q
    ||||||||||||| ||  ||||| |||||||  |||||||||| ||||||| || |||||| ||||| ||| ||||  | || |||||| ||||||| ||    
T  34225527 aaaataattgtcactttggaataccaatgcagtatttattattttttttcattattatacccttatttattaaatttcattcaacttaaatactccatta 34225626  T
Q  357 actacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaat 413  Q
    |||||||||| ||||| | ||||  ||||| ||||||| |||| |||||||||||||    
T  34225627 actacaattaataagggtgttttagtaaataatactaagtttaccattaaaatcaat 34225683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 253 - 433
Target Start/End: Original strand, 16463620 - 16463802
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattattttt--cactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattact 350  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||||  || || | |||| ||||| ||| ||||  |    |||| | ||||    
T  16463620 tctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcagcatttattattattttttccattattttaccattatttattaaatttcatcaaactttactact 16463719  T
Q  351 ccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 433  Q
    |||||||||||||||| ||||| | ||||  ||||| |||||||||||| ||| ||||||||  ||| |||| ||||||||||    
T  16463720 ccactaactacaattaataagggtgttttagtaaatgatactaattttaccatcaaaatcaacacaattaatcatttccttaa 16463802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 244 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 35242486 - 35242284
Alignment:
Q  244 ttttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccactt 343  Q
    |||| ||||||| |||||| || | | || |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| ||| ||||  |  | ||||    
T  35242486 ttttctatgtctgaaaatagttataactttagaataccaatgcaatatttattattagttttcactattatacttttatttattgaatttcatccaactt 35242387  T
Q  344 aattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattgtaca 443  Q
    || ||||| |||||||||||||| |||  ||||| |  ||||| || ||||||||| ||||||||||||  ||| |||  || ||||||| |||||| ||    
T  35242386 aactactcaactaactacaattaataaatatattctagtaaatgattctaattttaacattaaaatcaacacaattaaacatctccttaaaaattgtgca 35242287  T
Q  444 taa 446  Q
    |||    
T  35242286 taa 35242284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 251 - 408
Target Start/End: Original strand, 19444077 - 19444234
Alignment:
Q  251 tgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactcca-cttaattac 349  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| || || |||||| || || ||| || | || |||| ||||| |||    
T  19444077 tgtcttaaaataattgtcacttcaaaatatcaatgcaacatttattatttttttacattattatacccttgtttattgaaattta-tccatcttaactac 19444175  T
Q  350 tccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaa 408  Q
    || ||||| |||||||| |||  | |||||  ||||| ||| |||||||||||||||||    
T  19444176 tcgactaattacaattaataataacattttagtaaataatattaattttatcattaaaa 19444234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 255 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 16377833 - 16377656
Alignment:
Q  255 tcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaat----tact 350  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     || |||||||||| ||||| |||||| ||| ||||  |  | |||||||    ||||    
T  16377833 tcaaaataattgtcattttagaatatcaatgcaacatt-----ttttttttcactattatacttttatttattgaatttcatccaacttaattaactact 16377739  T
Q  351 ccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 433  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||| ||| |||||||| ||||  ||||||  ||| |||| ||||| ||||    
T  16377738 ccactaactacaattaataaggttattttggtaaatgatattaattttaccattgtaatcaacacaattaatcatttctttaa 16377656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 205 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 34451560 - 34451471
Alignment:
Q  205 ttactccctccatcttattttaactgtctctttagtttcttttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacattta 294  Q
    ||||||||||||||| |   ||| |||||||||||| | |||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  34451560 ttactccctccatctcaaaataattgtctctttagtattttttttctatctcaaaataattgtcactttagaatatcaatgcaacattta 34451471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 253 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 5789827 - 5789648
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 352  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||| ||| ||||  |  | |||||| || | |    
T  5789827 tctcaaaataattgtcactttacaatatcaatgcatcatttattatt-ttttccactattataccattatttattgaatttcatccaacttaactatttc 5789729  T
Q  353 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 433  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||  |||||   ||||||||||  ||| || ||||| ||| |||| ||||||||||    
T  5789728 actaactacaattaataagggtgttttagtaaatgccactaattttactattgaattcaatacaattaatcatttccttaa 5789648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 274 - 433
Target Start/End: Original strand, 16805836 - 16805994
Alignment:
Q  274 agaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactcca-cttaattactccactaactacaattattaagg 372  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  ||||||| || ||| |||| ||  ||| |||| || |||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  16805836 agaatatcaatgcatcatttattatcttttttcattattatccctt-atctattaaatt-taatccaacttaacaactccactaactacaattaataagg 16805933  T
Q  373 atatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 433  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||  |||||||||||  ||| |||| ||||| ||||    
T  16805934 atattttagtaaatgatactaattttactattaaaatcaacacaattaatcatttctttaa 16805994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 274 - 433
Target Start/End: Original strand, 16845117 - 16845275
Alignment:
Q  274 agaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactcca-cttaattactccactaactacaattattaagg 372  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  ||||||| || ||| |||| ||  ||| |||| || |||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  16845117 agaatatcaatgcatcatttattatcttttttcattattatccctt-atctattaaatt-taatccaacttaacaactccactaactacaattaataagg 16845214  T
Q  373 atatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 433  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||  |||||||||||  ||| |||| ||||| ||||    
T  16845215 atattttagtaaatgatactaattttactattaaaatcaacacaattaatcatttctttaa 16845275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 253 - 433
Target Start/End: Original strand, 35313820 - 35314000
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 352  Q
    ||||||||||||||||| || | ||||  |||||||||||||||| | |||| ||||| |||||  ||||| ||| ||||  |    |||||| ||||||    
T  35313820 tctcaaaataattgtcactttacaataataatgcaacatttattacttttttccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcc 35313919  T
Q  353 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 433  Q
    |||||||||||||| ||||| |  |||  |||||  ||||||||||| |||| |||||||  ||| |||| ||||||||||    
T  35313920 actaactacaattaataaggttgctttaataaatactactaattttaccattgaaatcaacacaattaatcatttccttaa 35314000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 253 - 412
Target Start/End: Original strand, 37322362 - 37322520
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 352  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| | ||| | ||||||||||| |||| || || |||||| ||||| ||| ||||  |    |||||| ||||||    
T  37322362 tctcaaaataattgtcactttagaatacctatgtagcatttattatt-ttttccattattatacccttatttattgaatttcatctaacttaactactcc 37322460  T
Q  353 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 412  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||  ||||| ||| |||||||| |||| |||||||    
T  37322461 actaactacaattaataagggtattttaataaatgatattaattttaccattgaaatcaa 37322520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 253 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 15359269 - 15359108
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattattttt--cactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattact 350  Q
    ||||||||||||||| | || ||||||||||||||  |||||||| |||||||  || ||  ||||| ||||| ||| || |  |  | |||||| ||||    
T  15359269 tctcaaaataattgttactttagaatatcaatgcagtatttattagtatttttttcattataatacccttatttattgaacttcatccaacttaactact 15359170  T
Q  351 ccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 412  Q
    |||||||||||||||| ||||| | ||||  ||||| ||| |||||||||||| ||||||||    
T  15359169 ccactaactacaattaataagggtgttttagtaaatgatattaattttatcatcaaaatcaa 15359108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 206 - 371
Target Start/End: Original strand, 19937270 - 19937436
Alignment:
Q  206 tactccctccatcttattttaactgtctctttagtttcttttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattattttt 305  Q
    |||||||||| ||| ||  ||| ||| | |||||||| |||| | | ||||| ||||||||||| || || ||| |||||||||||||| | || ||||     
T  19937270 tactccctccgtctcatgataattgtttttttagttttttttctttttctcataataattgtcactttagtataacaatgcaacatttaatttttttttc 19937369  T
Q  306 c-actaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccactaactacaattattaag 371  Q
    | | || |||||||||||| ||| |||| || || |||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  19937370 ccattattatacctttatttattgaattttattcaacttaactactccactaactacaattaataag 19937436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 287 - 433
Target Start/End: Original strand, 39691457 - 39691603
Alignment:
Q  287 aacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaat 386  Q
    |||||||||||||||||| || || |||||| ||||| ||| ||||  | || |||| | ||||||||||||| |||||| ||||  ||||||  |||||    
T  39691457 aacatttattattattttccattattatacccttatttattgaatttcattcaactttactactccactaactgcaattaataagagtattttagtaaat 39691556  T
Q  387 tatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 433  Q
     ||| ||||||||||||| |||||||  ||| |||| |||| |||||    
T  39691557 gatattaattttatcattgaaatcaacacaattaatcattttcttaa 39691603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 255 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 38188060 - 38187904
Alignment:
Q  255 tcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccac 354  Q
    ||||| ||| |||||||| |||||| |||  |||||||||||| | |||| |||| ||||||| ||||| ||| ||||  ||| ||||||  ||||| ||    
T  38188060 tcaaactaaatgtcattttagaataccaaatcaacatttattaat-ttttccactcatataccattatttattgaatttcacttcacttacatactcgac 38187962  T
Q  355 taactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 412  Q
    |||||||||||| || || | ||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  38187961 taactacaattaataggggtgttttagtaaattaaactaattttaccattaaagtcaa 38187904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 253 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 9458445 - 9458271
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 352  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||| |||| || || |||||| ||||| ||| ||||  |  | |||| | ||||||    
T  9458445 tctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcagcatttattatt-ttttccattattatacccttatttattaaatttcatccaactttactactcc 9458347  T
Q  353 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 433  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||     | || |||||||||| ||| ||||||||  ||| ||||||||| |||||    
T  9458346 actaactacaattaataagggtgtttt-----aatacactaattttaccatcaaaatcaacacaattaattattttcttaa 9458271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 253 - 432
Target Start/End: Original strand, 25637413 - 25637593
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattattttt-cactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactc 351  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||| ||||| ||| ||||  |  | |||||| |||||    
T  25637413 tctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcagcatttattattttttttccattattacacccttatttattaaatttcatccaacttaactactc 25637512  T
Q  352 cactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttcctta 432  Q
    |  |||||||||||| ||| | | ||||  ||||| | |||||||||| ||| ||||||||  ||| |||| |||||||||    
T  25637513 ctataactacaattaataaaggtgttttagtaaatgacactaattttaccatcaaaatcaacacaattaatcatttcctta 25637593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 253 - 433
Target Start/End: Original strand, 36794217 - 36794397
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 352  Q
    ||||||||||||| ||| || | |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| ||  ||||| ||||| ||| || |  |  | |||||| ||||||    
T  36794217 tctcaaaataattatcactttaaaataccaatgcagcatttattattttttttcattataatacccttatttattgaacttcatccaacttaactactcc 36794316  T
Q  353 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 433  Q
    |||||||||| ||| |||||   ||||  ||||  |||||||||||| ||| ||||||||  ||| |||| ||||||||||    
T  36794317 actaactacagttaataagggcgttttagtaaaagatactaattttaccatcaaaatcaacacaattaatcatttccttaa 36794397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 276 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 43115959 - 43115802
Alignment:
Q  276 aatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccactaactacaattattaaggata 375  Q
    |||||||||| | ||||||||||| |||| || || |||||| |||||  || ||||  | || |||||| |||||||||||||||||| | ||||  ||    
T  43115959 aatatcaatgtagcatttattatttttttccattattataccattattcgttgaatttcattcaacttaactactccactaactacaataaataagagta 43115860  T
Q  376 tttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 433  Q
    ||||  |||||  |||||| ||||||||| |||||||  ||| |||| ||||| ||||    
T  43115859 ttttagtaaatgctactaactttatcattgaaatcaacacaattaatcatttctttaa 43115802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 253 - 305
Target Start/End: Original strand, 45235512 - 45235564
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattattttt 305  Q
    ||||||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  45235512 tctcaaaataattgtcactttataataccaatgcaacatttattattattttt 45235564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 253 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 7495019 - 7494909
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttatta-ttatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactc 351  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||| || ||||||| || |||||| ||||| ||| ||||  |  | |||||| |||||    
T  7495019 tctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcagcatttattatttttttttcattattatacccttatttattgaatttcatccaacttaactactc 7494920  T
Q  352 cactaactaca 362  Q
    | |||||||||    
T  7494919 cgctaactaca 7494909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 255 - 304
Target Start/End: Original strand, 11366719 - 11366768
Alignment:
Q  255 tcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttt 304  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11366719 tcaaaatatttgtcattttacaatatcaatgcaacatttattattttttt 11366768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 355 - 412
Target Start/End: Original strand, 27866527 - 27866583
Alignment:
Q  355 taactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 412  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  27866527 taactacaattaataaggatattttactaaa-gatattaattttatcattaaaatcaa 27866583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 274 - 350
Target Start/End: Original strand, 16028270 - 16028345
Alignment:
Q  274 agaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattact 350  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||| ||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  16028270 agaatattaatgcaacatttataatt-tttttcactattatacatttatttattgaatttcactccacttaactact 16028345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 206 - 293
Target Start/End: Original strand, 7491041 - 7491128
Alignment:
Q  206 tactccctccatcttattttaactgtctctttagtttcttttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacattt 293  Q
    ||||| || ||||| ||||||| |||  |||| || | |||| ||||||||||||||||||||| || | |||||||||| |||||||    
T  7491041 tactctcttcatctcattttaattgttacttttgtattttttctatgtctcaaaataattgtcactttaaaatatcaatgaaacattt 7491128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 310 - 417
Target Start/End: Original strand, 12872762 - 12872869
Alignment:
Q  310 aatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaat 409  Q
    ||||| |||||||||||| ||||  |||||| ||||||||| || | ||||| |||| ||| |||  | |  ||||||||| |||||||| |||||||||    
T  12872762 aatattcctttattaattgaatttcactccatttaattactacattcactacgattaataatgatggtgtagtaaattatattaattttaccattaaaat 12872861  T
Q  410 caattcaa 417  Q
    ||| ||||    
T  12872862 caactcaa 12872869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 255 - 306
Target Start/End: Original strand, 25904722 - 25904773
Alignment:
Q  255 tcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttc 306  Q
    ||||||||||||||| || | ||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  25904722 tcaaaataattgtcactttaaaatattaatgcatcatttattattatttttc 25904773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 253 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 11742709 - 11742656
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttc 306  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||  |||| ||||||||||||| ||||||    
T  11742709 tctcaaaataattgtcactttagaatacgaatgaaacatttattattttttttc 11742656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 68; Significance: 6e-30; HSPs: 27)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 234 - 412
Target Start/End: Original strand, 34299908 - 34300087
Alignment:
Q  234 ctttagtttcttttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttc-actaatatacctttattaatttaatt 332  Q
    ||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| | |||| ||||||||| | ||||| ||| |||     
T  34299908 ctttagtttttttcttttgtcttaaaataattgtcactttagaatatcaatacaacatttattattttctttccactaatatatccttatttattgaata 34300007  T
Q  333 ctactccacttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 412  Q
    | |  | |||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  34300008 ccatccaacttaactacttcactaaccacaattaataaggatattttagtaaataatactaattttatcattcaaatcaa 34300087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 254 - 422
Target Start/End: Original strand, 181491 - 181658
Alignment:
Q  254 ctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcca 353  Q
    |||||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||  |  | |||||| |||||||    
T  181491 ctcaaaataattgtcactttacaata-caatgcaacatttattattatttttcactattatacccttatttattgaatttcatccaacttaactactcca 181589  T
Q  354 ctaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaat 422  Q
    ||||||| ||||| ||| ||| ||||  |||||  |||||||||||  ||| |||||||| ||| ||||    
T  181590 ctaactataattaataatgatgttttagtaaatactactaattttactattgaaatcaatacaattaat 181658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 253 - 446
Target Start/End: Original strand, 29363237 - 29363432
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattattttt--cactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattact 350  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  || || |||||  ||||| ||| ||||  |  | |||||| || |    
T  29363237 tctcaaaataattgtcacttcagaataccaatgcagcatttattattattttttccattattatactcttatttattgaatttcatccaacttaactaat 29363336  T
Q  351 ccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattgtacataa 446  Q
    || ||||||||||||| ||||||| ||||  ||||| |||||| ||||| ||| ||||||||  ||| |||| |||| ||||| |||||| |||||    
T  29363337 ccgctaactacaattaataaggatgttttagtaaatgatactagttttaccatcaaaatcaacacaattaatcattttcttaataattgtgcataa 29363432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 253 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 24983628 - 24983450
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 352  Q
    ||||||||||||||||| || ||| || ||| || ||||| ||| || || | |||||||||||| ||||| ||| ||||  || | |||||| ||||||    
T  24983628 tctcaaaataattgtcactttagattaccaacgccacatt-attttt-ttatccactaatatacccttatttattgaatttcacccaacttaactactcc 24983531  T
Q  353 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 433  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||  ||||| | |||||||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  24983530 actaactacaattaataagggtgttttagtaaatgacactaattttaccattgaaatcaactcaactaatcatttccttaa 24983450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 245 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 1063791 - 1063591
Alignment:
Q  245 tttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccactta 344  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| | |||| | ||| | ||||||||||| |||| ||  | |||||| ||| | ||| ||||  | |  |||||    
T  1063791 tttttctgtctcaaaataattgtcattttaaaataccgatgtagcatttattatt-ttttccatcattatacccttacttattaaatttcatttaactta 1063693  T
Q  345 attactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattgtacat 444  Q
    | |||||||||||||||||||| | ||  ||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||| |||| |||| ||||| |||| |||||    
T  1063692 actactccactaactacaattactcagagtattttagtaaataatactaattttatcattgaaatcaacacaattaatcattttcttaaaaattatacat 1063593  T
Q  445 aa 446  Q
    ||    
T  1063592 aa 1063591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 253 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 11656128 - 11655947
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttt-tcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactc 351  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||  || || |||||| ||||| ||| ||||  |  | |||| | |||||    
T  11656128 tctcaaaataattgtcactttagaatatcaatgcagcatttattatttttttcccattattatacccttatttattgaatttcatccaactttactactc 11656029  T
Q  352 cactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 433  Q
    ||||||||||||||| ||||| | ||||  ||||| | |||||||||| ||| ||||||||  ||| |||| |||| |||||    
T  11656028 cactaactacaattaataagggtgttttagtaaatgacactaattttaccatcaaaatcaacacaattaatcattttcttaa 11655947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 253 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 31894388 - 31894211
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 352  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||| ||| ||||  |  | |||||| |||| |    
T  31894388 tctcaaaataaatgtcattt-acaatatcaatgcaacatttattatt--ttttcactattatacccttatttattaaatttcatccaacttaactacttc 31894292  T
Q  353 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 433  Q
    |||||||||||||| ||| ||  ||||  |||||  ||||||||||| |||| |||||||  ||| |||| |||| |||||    
T  31894291 actaactacaattaataatgacgttttagtaaatgctactaattttaccattgaaatcaacacaattaatcattttcttaa 31894211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 253 - 412
Target Start/End: Original strand, 7920174 - 7920330
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 352  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||  | || | |||| |||| |    
T  7920174 tctcaaaataattatcactttagaatatcaatgcaacatttat--ttatttttcactattataccattatttattgaatttcattcaaattaaatacttc 7920271  T
Q  353 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 412  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||  |||||  |  |||||||| |||| |||||||    
T  7920272 actaactacaattaataa-gatattttagtaaatggttttaattttaccattgaaatcaa 7920330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 253 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 32440828 - 32440649
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaa--tatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattact 350  Q
    ||||||||||||||||| || ||||  |||||||||| |||||||||||||||| || || | |||||||||| |||  |||  |  | |||||| ||||    
T  32440828 tctcaaaataattgtcactttagaaaatatcaatgcagcatttattattattttccattattgtacctttatttattacatttcatccaacttaactact 32440729  T
Q  351 ccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttcct 430  Q
    | ||||| |||||||| ||||| | ||||  ||||| |||||||||||| ||| ||||||||  ||| |||| |||||||    
T  32440728 ctactaattacaattaataagggtgttttagtaaataatactaattttaccatcaaaatcaacacaattaatcatttcct 32440649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 253 - 433
Target Start/End: Original strand, 30716832 - 30717013
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattattttt-cactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactc 351  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| || |||||||||||||||| ||||| || ||  ||||  ||||| ||| |||| ||  | |||| | |||||    
T  30716832 tctcaaaataattgtcactttagaataccagtgcaacatttattattttttttccattataatactcttatttattgaattttatccaactttactactc 30716931  T
Q  352 cactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 433  Q
    ||||||||||||||| ||||| | |||   ||||| |||||||||||| ||| ||| |||||  || |||| ||||||||||    
T  30716932 cactaactacaattaataagggtgtttaagtaaatgatactaattttaccatcaaagtcaataaaattaatcatttccttaa 30717013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 253 - 412
Target Start/End: Original strand, 5302284 - 5302443
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 352  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||  |||||| ||||||||||| |||| || ||  |||||  |||| ||| || |  |  | |||||| ||||||    
T  5302284 tctcaaaataattgtcactttagaatactaatgcagcatttattatttttttccattataatacccgtatttattgaacttcatccaacttaactactcc 5302383  T
Q  353 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 412  Q
    | |||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||| |||||||| ||| ||||||||    
T  5302384 attaactacaattaataaggatgttttggtaaattatattaattttaccatcaaaatcaa 5302443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 253 - 412
Target Start/End: Original strand, 6801863 - 6802023
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattattttt-cactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactc 351  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||  ||||| ||||| ||  || |  |  | |||||| |||||    
T  6801863 tctcaaaataattgtcactttataatatcaatgcaacatttattattttttttccattataatacccttatttatcgaacttcatccaacttaactactc 6801962  T
Q  352 cactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 412  Q
    ||||||||||||||| |||||   ||||  ||||| ||| |||||||| ||| ||||||||    
T  6801963 cactaactacaattaataagggcgttttagtaaatgatattaattttaccatcaaaatcaa 6802023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 258 - 433
Target Start/End: Original strand, 13909361 - 13909537
Alignment:
Q  258 aaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttt-tcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccacta 356  Q
    |||||||||| |||| |  |||||||| |||||||||||||| |||| ||| || |||||  ||||| ||| ||||  |    |||||||||||||||||    
T  13909361 aaataattgtaattttacgatatcaatacaacatttattatttttttctcattattatactcttatttattcaatttcatctaacttaattactccacta 13909460  T
Q  357 actacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 433  Q
    |||||||||| ||||| ||||||  |||||   |||||||||| |||| |||||||  ||  |||| ||||||||||    
T  13909461 actacaattaataagggtattttagtaaatgtcactaattttaccattgaaatcaacacatttaatcatttccttaa 13909537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 23397844 - 23397753
Alignment:
Q  208 ctccctccatcttattttaactgtc-tctttagtttcttttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattat 298  Q
    |||||||||||| ||||||| |||| ||||||  || |||| | | | ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  23397844 ctccctccatctcattttaattgtcatctttacattattttctttttatcaaaataattgtcactttagaatatcaatgcaacatttattat 23397753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 253 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 27367280 - 27367226
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttca 307  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  27367280 tctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcatcatttattattatttttca 27367226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 253 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 27457627 - 27457573
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttca 307  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  27457627 tctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcatcatttattattatttttca 27457573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 340 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 3291862 - 3291769
Alignment:
Q  340 acttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 433  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| ||| | ||||||  ||||| |||||||| ||| |||||||||| || ||| |||| ||||||||||    
T  3291862 acttaactacttcactaactacaattaataaaggtattttagtaaataatactaatattaccattaaaatcgatacaattaatcatttccttaa 3291769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 257 - 409
Target Start/End: Original strand, 15058055 - 15058206
Alignment:
Q  257 aaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccacta 356  Q
    ||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||||| ||| | |||| |||||| ||||| ||| ||||  |  | |||||| |||| |||||    
T  15058055 aaaataattgtcactttataataccgatgcaacatttattattttttgt-actattatacccttatttattgaatttcatccaacttaaatacttcacta 15058153  T
Q  357 actacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaat 409  Q
    |||||||||| ||||| ||||||  |||||   |||||||||| |||| ||||    
T  15058154 actacaattaataagggtattttagtaaatgccactaattttaccattgaaat 15058206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 12307783 - 12307729
Alignment:
Q  245 tttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattatt 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || | ||||| ||| ||||||||||||||    
T  12307783 tttttatgtctcaaaataattgtcactttaaaatattaatacaacatttattatt 12307729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 252 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 13207274 - 13207220
Alignment:
Q  252 gtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttc 306  Q
    |||||| ||||||||||| || ||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  13207274 gtctcataataattgtcactttagactaccaatgcaacatttattattatttttc 13207220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 255 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 21425738 - 21425688
Alignment:
Q  255 tcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattattttt 305  Q
    ||||||||||||| | || | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21425738 tcaaaataattgttactttacaatatcaatgcaacatttattattattttt 21425688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 340 - 412
Target Start/End: Original strand, 13087550 - 13087622
Alignment:
Q  340 acttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 412  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||  ||||| ||| |||||||| |||| |||||||    
T  13087550 acttaattacttcactaactataattaataaggatgttttagtaaatgatattaattttaccattgaaatcaa 13087622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 253 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 21478276 - 21478224
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattattttt 305  Q
    ||||||||||||||||| || | |||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  21478276 tctcaaaataattgtcactttacaataccaatacaacatttattattattttt 21478224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 264 - 315
Target Start/End: Original strand, 8694989 - 8695040
Alignment:
Q  264 ttgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatata 315  Q
    |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  8694989 ttgtcattacatattatcaatgcaacatttattattattttccactagtata 8695040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 399
Target Start/End: Original strand, 17828960 - 17829019
Alignment:
Q  340 acttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaatttta 399  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||| ||| ||||||||    
T  17828960 acttaattacttcactaactacaattaataaagatattttagtaaatgatattaatttta 17829019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 257 - 299
Target Start/End: Original strand, 15582222 - 15582264
Alignment:
Q  257 aaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattatt 299  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||    
T  15582222 aaaataattgtcattttagaatatcaatgcaataattattatt 15582264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 253 - 295
Target Start/End: Original strand, 23142601 - 23142643
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttat 295  Q
    ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  23142601 tctcaaaataattgtcactttacaatatcaatgcaacatttat 23142643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 68; Significance: 6e-30; HSPs: 50)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 254 - 433
Target Start/End: Original strand, 39864045 - 39864224
Alignment:
Q  254 ctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcca 353  Q
    |||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||| ||| ||||  |  | |||||| |||||||    
T  39864045 ctcaaaataattgtcactttacaatatcaatgcaacatttattatttttttccactattatacccttatttattgaatttcatccaacttaactactcca 39864144  T
Q  354 ctaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 433  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||  |||||  ||||||||||| |||| |||||||  ||| |||| ||||||||||    
T  39864145 ctaactacaattaataagagtattttagtaaatgctactaattttaccattgaaatcaacacaattaatcatttccttaa 39864224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 253 - 433
Target Start/End: Original strand, 31042730 - 31042910
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 352  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||  ||| ||||||| ||| ||||  | || ||||||||||| |    
T  31042730 tctcaaaataattgtcactttagaatatcaatacatcatttattatttttttccactatgatatctttatttattgaatttcattcaacttaattacttc 31042829  T
Q  353 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 433  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||    ||||| |||||||||||| |||| |||||||  ||| |||| ||||||||||    
T  31042830 actacctacaattaataagggtattacagtaaatgatactaattttaccattgaaatcaacacaattaatcatttccttaa 31042910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 253 - 433
Target Start/End: Original strand, 37506057 - 37506240
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 352  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| || ||  ||||| ||||| ||| ||||  | || |||||| ||||||    
T  37506057 tctcaaaataattgtcactttagaatatcaatgcaacatttattatttttttccattataatacccttatttattgaatttcattcaacttaactactcc 37506156  T
Q  353 actaactacaattattaaggatatttttctaaatta---tactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 433  Q
    |||||||||||||| |||   | ||||  ||||| |   ||||||||||||||| ||||||||  ||| |||| ||||||||||    
T  37506157 actaactacaattaataaaagtgttttagtaaatgatagtactaattttatcatcaaaatcaacacaattaatcatttccttaa 37506240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 229 - 433
Target Start/End: Original strand, 12038991 - 12039195
Alignment:
Q  229 tgtctctttagtttcttttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaattt 328  Q
    |||||||||||| | |||||  | ||||||||||||||||| || | ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||     
T  12038991 tgtctctttagtatttttttattttctcaaaataattgtcactttacaatactaatgcaacatttattattattttccactattatacccttatttattg 12039090  T
Q  329 aattctactccacttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttc 428  Q
    ||||  |  | |||||| ||||||| |||||||||||| ||||  | | ||  |||||  ||||||||||| |||| |||||||  ||| |||| |||||    
T  12039091 aattacatccaacttaaatactccattaactacaattaataagagtgtattagtaaatgttactaattttaccattgaaatcaacacaattaatcatttc 12039190  T
Q  429 cttaa 433  Q
    |||||    
T  12039191 cttaa 12039195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 253 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 49224171 - 49224012
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 352  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||| ||||| ||| || |  |  | |||||| ||||||    
T  49224171 tctcaaaataattgtcactttagaatactaatgcaacatttattattttttttcattataatacccttatttattgaacttcatccaacttaactactcc 49224072  T
Q  353 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 412  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||  ||||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  49224071 actaactacaattaataagggtgttttagtaaatgatactaattttaccatcaaaatcaa 49224012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 251 - 433
Target Start/End: Original strand, 27896886 - 27897068
Alignment:
Q  251 tgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattact 350  Q
    |||||| ||||| || ||| || |||||||| || ||  || ||||||| ||||  |||| |||||||||||| ||| ||||  |  | ||| |||||||    
T  27896886 tgtctccaaatatttatcactttagaatatctattcagtatatattatttttttcgactattatacctttatttattaaatttcatccaactaaattact 27896985  T
Q  351 ccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 433  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |   |||||||||||||||    
T  27896986 ccactaactataattaataagaatattttgataaattatactaattttatcattaaaatcaacacgtttaattatttccttaa 27897068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 244 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 41122017 - 41121833
Alignment:
Q  244 ttttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccactt 343  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| || | ||||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||| |||| |||||| ||  | | ||       
T  41122017 ttttttttttctcaaaataattgtcactttaaaatatcaatacaacatttattattttttttcattattatacccttat-aattta-ttaaatttcatca 41121920  T
Q  344 aattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttcct 430  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||| ||||||||| ||| ||||||||  ||| |||| |||||||    
T  41121919 aactactccactaactacaattaataagggtattttagtaaattatgctaattttaccatcaaaatcaacacaattaatcatttcct 41121833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 244 - 446
Target Start/End: Original strand, 9379156 - 9379358
Alignment:
Q  244 ttttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttc-actaatatacctttattaatttaattctactccact 342  Q
    |||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||| | || ||||||| |||| ||| ||||  |    |||    
T  9379156 ttttttctttcttaaaataattgtcattttagaatatcaatgcaatatttatt--tatttttccattattatacctatatttattaaatttcatcaaact 9379253  T
Q  343 taattactcc-actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattgta 441  Q
    ||| |||||| |||||||||||||| |||  |||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||| | ||| |||| ||||| |||| ||||||     
T  9379254 taactactcccactaactacaattaataaatatattttaataaatgatattaattttatcattaaaatcattacaattaatcatttctttaaaaattgtg 9379353  T
Q  442 cataa 446  Q
    |||||    
T  9379354 cataa 9379358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 253 - 366
Target Start/End: Original strand, 37177769 - 37177882
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 352  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||| ||  | |||||| ||||      
T  37177769 tctcaaaataattgtcattttagaatgtcaatgtaacacttattattatttttcactattatactcttatttatttaattttatccaacttaactactat 37177868  T
Q  353 actaactacaatta 366  Q
    ||||||||| ||||    
T  37177869 actaactaccatta 37177882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 253 - 412
Target Start/End: Original strand, 7351572 - 7351728
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 352  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||| |||  |||||| || |||||  ||||| ||| |||| |   | ||||||||| |||    
T  7351572 tctcaaaataattgtcattttagaatactaatgcaac-tttatcatt--ttttcattattatactcttatttattgaattttgtccaacttaattattcc 7351668  T
Q  353 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 412  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  7351669 actaactagaattaataaggttattttagtaaataatattaattttatcattaaaatcaa 7351728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 253 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 20210025 - 20209866
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 352  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||| |||  || ||  ||||| ||||| ||| || |  |  | |||||| ||||||    
T  20210025 tctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcagcatttattattttttcccattataatacccttatttattgaacttcatccaacttaactactcc 20209926  T
Q  353 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 412  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||  ||||| ||||||||||||  || ||||||||    
T  20209925 actaactacaattaataaggatgttttagtaaatgatactaattttactatcaaaatcaa 20209866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 255 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 40145030 - 40144803
Alignment:
Q  255 tcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccac 354  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||  || ||  ||||| ||||| ||| || |  |  | |||||| |||||||     
T  40145030 tcaaaataattgtcactttagaatatcaatgcaacatttattattttttcccattataatacccttatttattgaacttcatccaacttaactactccat 40144931  T
Q  355 taactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattgtacataactctataa 454  Q
    |||||||||||| ||||| | ||||  ||||| ||| |||||||| ||| ||||||||  ||| |||| |||| ||||| || ||| ||| | |||  ||    
T  40144930 taactacaattaataagggtgttttagtaaatgatattaattttaccatcaaaatcaacacaattaatcattttcttaataactgtgcatcaatcttgaa 40144831  T
Q  455 caactattagtttgagatggtgggagta 482  Q
    | ||||||| || ||||| | |||||||    
T  40144830 cgactattatttagagattgagggagta 40144803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 257 - 379
Target Start/End: Original strand, 52429279 - 52429403
Alignment:
Q  257 aaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcac--taatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccac 354  Q
    ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||| |  || |||||| ||||| | | ||||  | || |||||| ||||||||    
T  52429279 aaaataattgtcactttacaatatcaatgcaacatttattattttttttctcattattatacccttatttaatgaatttcattcaacttaactactccac 52429378  T
Q  355 taactacaattattaaggatatttt 379  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||    
T  52429379 taactacaattaataagggtatttt 52429403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 251 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 6160637 - 6160454
Alignment:
Q  251 tgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattact 350  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||         | || || |||||| || || ||| ||||  | || |||||| || |    
T  6160637 tgtctcaaaataattgtcattttagaatatcaatgcaacattta---------tgcattattatacccttgtttattgaattacattcaacttaactatt 6160547  T
Q  351 ccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattgtaca 443  Q
    ||| |||||||||||| ||||  ||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||| |||| |||| ||||| ||| |||||    
T  6160546 ccattaactacaattaataagagtattttagtaaataatactaattttatcattgaaatcaacacaattaatcattttcttaaaaatcgtaca 6160454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 255 - 427
Target Start/End: Original strand, 7759150 - 7759322
Alignment:
Q  255 tcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccac 354  Q
    ||||||||||||||| || | ||||  |||||| ||||||||||| |||| || || |||||| ||||| ||| ||||  | || |||||| || |||||    
T  7759150 tcaaaataattgtcactttacaataataatgcatcatttattatttttttccattattatacccttatttattgaatttcattcaacttaactattccac 7759249  T
Q  355 taactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattattt 427  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||  ||||| ||| |||||| | |||| |||||||  ||| |||||||||    
T  7759250 taactacaattaataagagtattttagtaaatgatattaatttcaccattgaaatcaacacaattaattattt 7759322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 6268438 - 6268375
Alignment:
Q  244 ttttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttca 307  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  6268438 ttttttctgtctccaaataattgtcattttagaatatcaatgtaacatttattaatatttttca 6268375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 253 - 372
Target Start/End: Original strand, 35367735 - 35367854
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 352  Q
    ||||||||||||||||| || | |||| ||||| ||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||| ||| ||||  |    |||||| ||||||    
T  35367735 tctcaaaataattgtcactttacaataccaatgaaacatttattagtctttttcactattatacccttatttattgaatttcatctaacttaactactcc 35367834  T
Q  353 actaactacaattattaagg 372  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  35367835 actaactacaattaataagg 35367854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 253 - 379
Target Start/End: Original strand, 6785189 - 6785315
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 352  Q
    ||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||| ||| ||||  |    |||||| ||||||    
T  6785189 tctcaaaataattgtcactttacaatacctatgcaacatttattatttttttccactattatacccttatttattgaatttcatcaaacttaactactcc 6785288  T
Q  353 actaactacaattattaaggatatttt 379  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||    
T  6785289 actaactacaattaatgaagatatttt 6785315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 23169185 - 23168998
Alignment:
Q  244 ttttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccactt 343  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||   |||| ||||| |||||  ||||| ||| ||||  ||  |||||    
T  23169185 ttttttttttctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaacatttatta--cttttccactattatactcttatttattgaatttcacctcactt 23169088  T
Q  344 aattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 433  Q
    || || |  |||||||| ||||| ||||||| ||||  |||||  ||||||||||| |||| |||||||  ||| ||||||||| |||||    
T  23169087 aactatttaactaactataattaataaggatgttttagtaaatgctactaattttaccattgaaatcaacacaattaattattttcttaa 23168998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 433
Target Start/End: Original strand, 26093414 - 26093507
Alignment:
Q  340 acttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 433  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||| |||||||| |||| |||||||  ||| |||| |||| |||||    
T  26093414 acttaattacttcactaactacaattaataaggatattttaataaatgatattaattttaccattgaaatcaacacaattaatcattttcttaa 26093507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 258 - 433
Target Start/End: Original strand, 9307564 - 9307740
Alignment:
Q  258 aaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttc-actaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccacta 356  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||| |  |||||||||| |||| | |||| |||||||||||| ||| ||||  |  | |||||| ||||||||||    
T  9307564 aaataattgtcattttacgatatcaatgtagtatttattatttttttcccactattatacctttatttattgaatttcatccaacttaactactccacta 9307663  T
Q  357 actacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 433  Q
    ||||||||||  |||| | ||||  |||||  || ||||||||||||| |||||||  ||  |||| ||||||||||    
T  9307664 actacaattaacaagggtgttttagtaaatgctattaattttatcattgaaatcaacacagttaatcatttccttaa 9307740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 229 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 24991863 - 24991725
Alignment:
Q  229 tgtctctttagtttcttttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttt-tcactaatatacctttattaatt 327  Q
    |||||||||||  | ||||||   ||||||||||||||||| || | ||||  |||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||| |||    
T  24991863 tgtctctttagcattttttttccttctcaaaataattgtcactttacaatactaatgcaacatttattatttttttcccactattatacctttatttatt 24991764  T
Q  328 taattctactccacttaattactccactaactacaatta 366  Q
     ||||  |  | |||||| || |||||||||||||||||    
T  24991763 gaatttcatccaacttaactattccactaactacaatta 24991725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 253 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 16395230 - 16395039
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 352  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||| |  |||||||||| ||||||| || |||| | ||||| ||| ||||  |    |||||| ||||||    
T  16395230 tctcaaaataattgtcactttagaataccaatgtaggatttattatt-tttttcattattatatcattatttattgaatttcatctaacttaactactcc 16395132  T
Q  353 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattgtacataa 446  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||||  ||||| ||||||||||||  || ||||||||  ||| |||| |||| ||||| ||| || |||||    
T  16395131 actaactacaattaaaaagg-tattttagtaaatgatactaattttactatcaaaatcaacacaattaatcattttcttaataatcgtgcataa 16395039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 276 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 22856399 - 22856275
Alignment:
Q  276 aatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactcca-cttaattactccactaactacaattattaaggat 374  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||| ||| |||| |  |||| ||||| |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  22856399 aatatcaattcaacatttattatttttttgcactattatacttttatttattgaatt-tcatccagcttaactactccactaactacaattaattagggt 22856301  T
Q  375 atttttctaaattatactaattttat 400  Q
    |||||  |||||  || |||||||||    
T  22856300 attttagtaaatggtattaattttat 22856275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 255 - 412
Target Start/End: Original strand, 12151123 - 12151268
Alignment:
Q  255 tcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccac 354  Q
    ||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||             ||||| || | |||||| | ||||||    
T  12151123 tcaaaataattgtcactttataatatcaatgcagcatttattattatttttcattattatag------------aattccacccaacttaactgctccac 12151210  T
Q  355 taactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 412  Q
    |||||||||||| | |  |||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  12151211 taactacaattaattacaatattttagtaaatgatactaattttatcattgaaatcaa 12151268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 257 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 13579801 - 13579626
Alignment:
Q  257 aaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccacta 356  Q
    ||||||||||||| || | |||| | |||||| |||||||||||||||| | || |||||| ||||| ||| ||||  |    |||||| ||||||||||    
T  13579801 aaaataattgtcactttaaaataccgatgcaatatttattattattttt-attattatacccttatttattgaatttcatcaaacttaaatactccacta 13579703  T
Q  357 actacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 433  Q
    |||||||||| || || | ||||| ||||| ||| |||| || |||| ||||||||  ||| |||| ||||| ||||    
T  13579702 actacaattaatatgggtgtttttgtaaatgatattaatattgtcatcaaaatcaacacaattaatcatttctttaa 13579626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 252 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 17988931 - 17988867
Alignment:
Q  252 gtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatac 316  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||| |||||    
T  17988931 gtctcaaaataattgtcattttaaaatattaatgcaacatttattatttctttccactattatac 17988867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 253 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 33733447 - 33733268
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 352  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||| | ||||||||||| |||| || || |||||| ||||| ||| ||||  | || || |||  ||||     
T  33733447 tctcaaaataattgtcactttagaataccaatgaagcatttattattcttttccattattatacccttatttattgaatttcattctacctaaccactct 33733348  T
Q  353 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 433  Q
    |||||||||||||| |||   ||||||  |||||  || |||||||| |||| |||||||  ||| |||| ||||||||||    
T  33733347 actaactacaattaataaaagtattttagtaaatgttaataattttaccattgaaatcaacacaa-taatcatttccttaa 33733268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 253 - 360
Target Start/End: Original strand, 4659710 - 4659816
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 352  Q
    ||||||||||||||||| || | |||| ||||||||||||  ||||| |||| ||||| |||| | ||||| ||| ||||  | || |||||||||||||    
T  4659710 tctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaacattatttatt-ttttccactattatatccttatttattgaatttcattcaacttaattactcc 4659808  T
Q  353 actaacta 360  Q
    ||||||||    
T  4659809 actaacta 4659816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 253 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 35682978 - 35682900
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaatt 332  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| |||||| ||||| ||| ||||    
T  35682978 tctcaaaataattgccaatttagaatatcaatgcaatatttattatt-ttttccactattatacccttatttattgaatt 35682900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 244 - 299
Target Start/End: Original strand, 37238951 - 37239006
Alignment:
Q  244 ttttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattatt 299  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||||    
T  37238951 ttttttctgtctcaaaataattgtcattttaaaatattaatgcagcatttattatt 37239006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 343 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 978952 - 978854
Alignment:
Q  343 taattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattgta 441  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||   ||||| | ||  ||||||||||| |||||||  |||||||| |||| ||||| |||||||    
T  978952 taattgctccactaactactattaataaggatatttcattaaatgaaacacattttatcattgaaatcaacacaactaatcattttcttaagaattgta 978854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 253 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 26252646 - 26252565
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacattta--ttattatttttcactaatatacctttattaatttaatt 332  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||    
T  26252646 tctcaaaataattgtcattttacaatttcaaagcaacatttattttattttttttcattaatatacccttatttattgaatt 26252565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 338 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 44426838 - 44426746
Alignment:
Q  338 ccacttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatacta---attttatcattaaaatcaattcaactaattattt 427  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||| ||| ||| ||||  ||||| ||||||   |||||| |||| ||||||| ||||||||||||||    
T  44426838 ccacttaattgctccactaattacaattaataaagatgttttagtaaatgatactacaaattttaccattgaaatcaactcaactaattattt 44426746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 255 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 44761710 - 44761560
Alignment:
Q  255 tcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccac 354  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||  || ||||| ||    | |||||| ||||| ||| ||||  | || ||||||  | |||||    
T  44761710 tcaaaataattgtcactttagaatattaacgcaacattattttttattatt----attatacccttatttattgaatttcattcaacttaaccattccac 44761615  T
Q  355 taactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaat 409  Q
    |||||| ||||| ||| ||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  44761614 taactataattaataaagatattttagtaaatgatattaattttatcattaaaat 44761560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 340 - 412
Target Start/End: Original strand, 15699142 - 15699214
Alignment:
Q  340 acttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 412  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||  ||||| ||| |||||||| ||| ||||||||    
T  15699142 acttaactactccactaactacaattaataagggtgttttagtaaatgatattaattttaccatcaaaatcaa 15699214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 253 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 21910193 - 21910141
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattattttt 305  Q
    ||||| ||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21910193 tctcagaataattgtcactttaaaatatcaatgccacatttattattattttt 21910141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 281 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 44707917 - 44707785
Alignment:
Q  281 caatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccactaactacaattattaaggatattttt 380  Q
    |||||||| ||||||||||  ||| ||||| |||||||||||| ||| ||||  |  | |||||| | || ||||||||||||||| |||   | ||||     
T  44707917 caatgcaatatttattatttgtttccactattatacctttatttattgaatttcatccaacttaactgcttcactaactacaattaataaatgtgtttta 44707818  T
Q  381 ctaaattatactaattttatcattaaaatcaat 413  Q
     |||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  44707817 gtaaatactactaattttatcattgaaatcaat 44707785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 257 - 316
Target Start/End: Original strand, 3312056 - 3312115
Alignment:
Q  257 aaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatac 316  Q
    ||||||||||||| || | ||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  3312056 aaaataattgtcactttataatatcaatacaacatttattattatattccactattatac 3312115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 355 - 446
Target Start/End: Original strand, 35538678 - 35538769
Alignment:
Q  355 taactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattgtacataa 446  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||   ||||||||||| |||||||  ||| |||| |||| ||||| ||||||| ||||    
T  35538678 taactacaattaataaggatattttagtaaataatatccattttatcattgaaatcaacacaattaataattttcttaaaaattgtaaataa 35538769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 350 - 433
Target Start/End: Original strand, 36701951 - 36702034
Alignment:
Q  350 tccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 433  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||||  ||||| |||||||||||| |||| |||||||   || |||| ||||||||||    
T  36701951 tccactaactacaattaataagggcattttagtaaatgatactaattttaccattgaaatcaacataattaatcatttccttaa 36702034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 350 - 433
Target Start/End: Original strand, 36718055 - 36718138
Alignment:
Q  350 tccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 433  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||||  ||||| |||||||||||| |||| |||||||   || |||| ||||||||||    
T  36718055 tccactaactacaattaataagggcattttagtaaatgatactaattttaccattgaaatcaacataattaatcatttccttaa 36718138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 388 - 443
Target Start/End: Original strand, 37177913 - 37177968
Alignment:
Q  388 atactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattgtaca 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||| ||| |||||    
T  37177913 atactaattttatcattaaaatcaatgcaattaattgttttcttaaaaatcgtaca 37177968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 253 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 43500925 - 43500874
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttt 304  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  43500925 tctcaaaataattgtcactttagaatactaatgcagcatttattattatttt 43500874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 244 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 2137562 - 2137441
Alignment:
Q  244 ttttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccactt 343  Q
    |||||| | ||| |||||||||  ||| | |||||||  ||||||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||| ||| |||| ||  | ||||    
T  2137562 ttttttttctcttaaaataattaacatattagaatatttatgcaacatttattatt-tttttcattattatatctttatttattgaattttatccaactt 2137464  T
Q  344 aattactccactaactacaatta 366  Q
    || ||||||| |||| |||||||    
T  2137463 aaatactccaataacaacaatta 2137441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 259 - 365
Target Start/End: Original strand, 31879177 - 31879281
Alignment:
Q  259 aataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccactaac 358  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||   ||||| ||| |||| |||||||| | |||||||| |||||    
T  31879177 aataattgtcattttgaaatatcaatgcaatattt-ttatt-tttttcattaatatattattatttattgaattttactccacgttattactcctctaac 31879274  T
Q  359 tacaatt 365  Q
    || ||||    
T  31879275 tataatt 31879281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 255 - 293
Target Start/End: Original strand, 37275536 - 37275574
Alignment:
Q  255 tcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacattt 293  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  37275536 tcaaaataattgtcactttagaatatcaatgcaacattt 37275574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 206 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 44426938 - 44426840
Alignment:
Q  206 tactccctccatcttattttaactgtctctttagtttcttttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttt 304  Q
    |||||||||| ||| ||||| | |||| ||||||    |||| | ||||||||||| ||||||| || ||||||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  44426938 tactccctccgtctcatttttattgtcactttagcactttttctctgtctcaaaattattgtcactttagaatataaatacaacatttattattttttt 44426840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 347 - 412
Target Start/End: Original strand, 3312138 - 3312203
Alignment:
Q  347 tactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 412  Q
    |||||||||||||||||||| ||   ||||| |  ||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  3312138 tactccactaactacaattaatatcaatattatagtaaatgatactaatttaatcattaaaatcaa 3312203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 253 - 294
Target Start/End: Original strand, 15699073 - 15699114
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacattta 294  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  15699073 tctcaaaataattgtcactttagaatatcaatgcagcattta 15699114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 66; Significance: 1e-28; HSPs: 58)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 253 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 759280 - 759087
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 352  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||| |||| || || |||||| ||||| ||| ||||  |  | |||||| ||||||    
T  759280 tctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcagcatttattatttttttccattattatacccttatttattgaatttcatccaacttaactactcc 759181  T
Q  353 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattgtacataa 446  Q
     ||||||||||||| ||||||| ||||  ||||| |||||| ||||| ||| ||||||||  ||| |||| |||||||||| |||||| |||||    
T  759180 gctaactacaattaataaggatgttttagtaaatgatactagttttaccatcaaaatcaacacaattaatcatttccttaataattgtgcataa 759087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 253 - 433
Target Start/End: Original strand, 34947440 - 34947620
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 352  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||| || || |||||| | ||| ||| ||||  |  | |||||| ||||||    
T  34947440 tctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcaacatttattatttttttccattattataccctcatttattgaatttcatccaacttaactactcc 34947539  T
Q  353 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 433  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||  ||||| ||| |||||||| |||| |||||||  ||| |||| ||||| ||||    
T  34947540 actaactacaattaataagggtgttttagtaaatgataataattttaccattgaaatcaacacaattaatcatttctttaa 34947620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 253 - 433
Target Start/End: Original strand, 7463152 - 7463333
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaa-tgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactc 351  Q
    |||||||||||| |||| || | |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| | || ||||||| ||| ||||  |  | |||||| |||||    
T  7463152 tctcaaaataatcgtcactttacaataacaaatgcatcatttattattatttttcactattctatctttatttattgaatttcatccaacttaactactc 7463251  T
Q  352 cactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 433  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||   |||||  |||||||||||||||| |||||||  ||| |||| ||||||||||    
T  7463252 cactaactacaattaatgagggtatttaagtaaatgctactaattttatcattgaaatcaacacaattaatcatttccttaa 7463333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 253 - 433
Target Start/End: Original strand, 9785928 - 9786108
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 352  Q
    ||||||||||||||||| || | ||||| |||||| ||||||||||||||||||  || |||||| ||||| ||| |||| ||  | |||||| |||| |    
T  9785928 tctcaaaataattgtcactttaaaatattaatgcagcatttattattatttttctttattatacccttatttattgaattttatccaacttaactacttc 9786027  T
Q  353 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 433  Q
    |||||||||||||| ||||  | ||||  ||||| | | |||||||| ||| ||||||||  ||| |||| ||||||||||    
T  9786028 actaactacaattaataagcgtgttttagtaaatgaaattaattttaccatcaaaatcaacacaattaatcatttccttaa 9786108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 253 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 24516478 - 24516319
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 352  Q
    |||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||  ||||| | || ||||||| ||| ||||  |  | |||||| ||||||    
T  24516478 tctcgaaataattgtcattttacaatatcaatgcaacatttattatcttttcccactattttatctttatttattgaatttcatccaacttaactactcc 24516379  T
Q  353 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 412  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||  |||||  ||||||||||| |||| |||||||    
T  24516378 actaactacaattaataaggtttttttagtaaatgttactaattttaccattgaaatcaa 24516319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 253 - 446
Target Start/End: Original strand, 83324 - 83518
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaat-atacctttattaatttaattctactccacttaattactc 351  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||  | || ||||  ||||| ||| ||||  |    |||||| |||||    
T  83324 tctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcagcatttattattttttttccattatcatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactc 83423  T
Q  352 cactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattgtacataa 446  Q
    | ||||||||||||| |||| || ||||  ||||| |||||||||||| ||| ||||||||  ||| |||| |||||||||| |||||| |||||    
T  83424 cgctaactacaattaataagaatgttttagtaaatgatactaattttaccatcaaaatcaacacaattaatcatttccttaataattgtgcataa 83518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 253 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 23745521 - 23745399
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattat-tatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactc 351  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  ||||| ||| |||| || ||||||||| |||||    
T  23745521 tctcaaaataattgttattttagaatattaatgcaacatttattatatttttttcactaatatacacttatttattgaattatattccacttaactactc 23745422  T
Q  352 cactaactacaattattaaggat 374  Q
     |  || |||||||| |||||||    
T  23745421 taagaagtacaattaataaggat 23745399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 244 - 379
Target Start/End: Original strand, 38032668 - 38032804
Alignment:
Q  244 ttttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatata---cctttattaatttaattctactcca 340  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| |||||||||  ||||||| |||||||   || ||||| ||||||||  ||||||    
T  38032668 ttttctatgtctcaaaataactgtcattttaaaatatcattgcaaaatttattat--tttttcattaatatataccccttatttatttaattgcactcca 38032765  T
Q  341 cttaattactccactaactacaattattaaggatatttt 379  Q
    ||||| || | ||||||||||||||| |||| |||||||    
T  38032766 cttaactaatacactaactacaattaataagaatatttt 38032804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 253 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 21760173 - 21759993
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 352  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  |||| |  || |||||| | | | ||| ||||  |  | |||||| ||||||    
T  21760173 tctcaaaataattgtcactttagaatatcaatgcaacatttattatatttttcctttattataccctcaattattgaatttcatccaacttaactactcc 21760074  T
Q  353 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 433  Q
    | |||||||||||| ||||| | ||||  ||||| |||||||||||| ||| ||||||||  ||| |||| |||| |||||    
T  21760073 attaactacaattagtaagggtgttttattaaatgatactaattttaccatcaaaatcaacacaattaatcattttcttaa 21759993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 253 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 28202498 - 28202318
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 352  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| |||| || ||||||||||| |||| || || |||||  ||||| ||| ||||  |  | |||| | ||||||    
T  28202498 tctcaaaataattgtcactttagaataccaatacagcatttattatttttttccattattatactcttatttattgaatttcatccaactttactactcc 28202399  T
Q  353 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 433  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||  ||||| | | |||||||| ||| ||||||||  ||| ||||||||| |||||    
T  28202398 actaactacaattaataaggatgttttagtaaatgacattaattttaccatcaaaatcaacacaattaattattttcttaa 28202318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 254 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 41506253 - 41506061
Alignment:
Q  254 ctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcca 353  Q
    |||||||||||| ||| || | ||||||||||||| |||||||| | ||||||| || |||||  ||||| ||| ||||  |  | |||||| |||||||    
T  41506253 ctcaaaataattatcactttacaatatcaatgcaatatttattaatttttttcaatattatactcttatttattgaatttcatccaacttaactactcca 41506154  T
Q  354 ctaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattgtacataa 446  Q
    ||||||||||||| ||||  | ||||  |||||  ||||||||||| ||||||||| ||  ||| |||| |||||||||| ||| || |||||    
T  41506153 ctaactacaattaataagagtgttttagtaaatgctactaattttaccattaaaattaacacaattaatcatttccttaataatcgtgcataa 41506061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 244 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 17610736 - 17610561
Alignment:
Q  244 ttttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccactt 343  Q
    ||||||||||||  |||||| ||| | || |||||||||||  ||||||||||  | |||| |||||||||| |  |||| ||| ||||  |||| | ||    
T  17610736 ttttttatgtcttcaaataactgtgactttagaatatcaatataacatttatttattttttccactaatatatccctatttattgaatttcactctaatt 17610637  T
Q  344 aattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaact 419  Q
    || || | |||||| || ||||| |||| |||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  17610636 aactatttcactaattaaaattaataagaatattttaataaattatactaattttaccattaaaatcaactcaact 17610561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 229 - 446
Target Start/End: Original strand, 21390210 - 21390428
Alignment:
Q  229 tgtctctttagtttcttttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattattttt-cactaatatacctttattaatt 327  Q
    |||||||||||  |||||| | | ||||||||||||||||| || | |||| ||||||||| ||||||||| ||||| || || |||||| ||||| |||    
T  21390210 tgtctctttagcatcttttctttttctcaaaataattgtcactttataataccaatgcaacgtttattattttttttccattattatacccttatttatt 21390309  T
Q  328 taattctactccacttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattattt 427  Q
     ||||  |    |||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||  ||||| ||| || ||||| ||| ||||| ||  ||| |||| ||||    
T  21390310 gaatttcatctaacttaactactccactaactacaatcaataaggatgttttagtaaatgatattagttttaccatcaaaattaacacaattaatcattt 21390409  T
Q  428 ccttaacaattgtacataa 446  Q
    |||||| ||| || |||||    
T  21390410 ccttaataatcgtgcataa 21390428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 255 - 372
Target Start/End: Original strand, 2459413 - 2459530
Alignment:
Q  255 tcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccac 354  Q
    |||||||||||| || || | |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||| ||||  |  | |||||| ||||||||    
T  2459413 tcaaaataattgacactttacaataccaatgcagcatttattattttttttcactattatacccttatttattgaatttcatcctacttaactactccac 2459512  T
Q  355 taactacaattattaagg 372  Q
    |||||||||||| |||||    
T  2459513 taactacaattaataagg 2459530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 340 - 433
Target Start/End: Original strand, 13961986 - 13962079
Alignment:
Q  340 acttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 433  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||| | ||| |||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||    
T  13961986 acttaactactccactaactacacttaataaggatattttattaagtgatattaattttatcattaaaatcaacacaattaatcatttccttaa 13962079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 253 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 11373617 - 11373437
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 352  Q
    ||||||||||||||| | || | |||||||||||| ||||||||||| |||  ||||| |||||  ||||| ||| ||||  |  | |||||| ||||||    
T  11373617 tctcaaaataattgttactttacaatatcaatgcagcatttattattttttcccactattatactcttatttattgaatttcatccaacttaactactcc 11373518  T
Q  353 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 433  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||  |||||  ||||||||||| |||  |||||||  ||| |||  ||||||||||    
T  11373517 actaactacaattaataagggtgttttagtaaatgctactaattttaccatcgaaatcaacacaattaaacatttccttaa 11373437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 253 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 21350815 - 21350695
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattattttt-cactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactc 351  Q
    ||||||||||||||||| || | |||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||| ||| ||||  |  | |||||| |||||    
T  21350815 tctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcagcatttattattttttttccactattatacccttatttattgaatttcatccaacttaactactc 21350716  T
Q  352 cactaactacaattattaagg 372  Q
    ||||||||||||||| |||||    
T  21350715 cactaactacaattaataagg 21350695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 253 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 32346241 - 32346061
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 352  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||  |||||| ||||||||||  |||| || || |||||| ||||| ||| ||||  | || |||||| ||||||    
T  32346241 tctcaaaataattatcattttagaatactaatgcagcatttattatctttttccattattatacccttatttattgaatttcattcaacttaactactcc 32346142  T
Q  353 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 433  Q
    ||||| || ||||| ||||  ||||||  || || ||| |||||||| |||| |||||||  |||  ||||||||||||||    
T  32346141 actaattataattaataagagtattttagtagatgatattaattttaccattgaaatcaacacaatcaattatttccttaa 32346061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 255 - 444
Target Start/End: Original strand, 33819154 - 33819345
Alignment:
Q  255 tcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattat--ttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 352  Q
    ||||||||||||||| || | |||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||| | | ||||  | || |||| | ||||||    
T  33819154 tcaaaataattgtcactttacaataccaatgcagcatttattattattattttcactattatacccttatttaatgaatttcattcaacttcactactcc 33819253  T
Q  353 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattgtacat 444  Q
    || ||| ||||||| ||||  |  |||| |||||  ||||||||||| |||| |||||||  ||| |||| |||||||||| ||| ||||||    
T  33819254 acaaacaacaattaataagagtgattttgtaaatgctactaattttaccattgaaatcaacacaattaatcatttccttaataatcgtacat 33819345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 253 - 433
Target Start/End: Original strand, 43873863 - 43874043
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 352  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||  || ||  |||| |||||| ||| || |  |  | |||||| ||||||    
T  43873863 tctcaaaataattgtcactttagaatatcaatgcagcatttattattttttcccattataatacatttatttattaaacttcatccaacttaactactcc 43873962  T
Q  353 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 433  Q
    |||||||||| ||| ||||| | ||||  ||||| ||| |||||||| ||| ||||||||  ||| |||| ||||| ||||    
T  43873963 actaactacatttaataagggtgttttagtaaatgatattaattttaccatcaaaatcaacacaattaatcatttctttaa 43874043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 253 - 392
Target Start/End: Original strand, 25571360 - 25571498
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 352  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| ||||| | || |||||| ||||| ||| ||||  |  | |||||| || |||    
T  25571360 tctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcaacatttattatt-tttttaattattatacccttatttattgaatttcatccaacttaactattcc 25571458  T
Q  353 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatact 392  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||  ||||| |||||    
T  25571459 actaactacaactaataagggtattttagtaaatgatact 25571498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 259 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 21937970 - 21937796
Alignment:
Q  259 aataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccactaac 358  Q
    ||||||||||| || |||||  ||||||| ||||||||||| |    |||||||| ||| || || ||| ||||| ||  || |||| ||||||||||||    
T  21937970 aataattgtcaatttagaatgccaatgcagcatttattattttcccccactaatacacccttgtttattaaattccacctcaattaactactccactaac 21937871  T
Q  359 tacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 433  Q
    |||||||| ||||  |  |||  ||||| | |||||||||||||||||||| || | ||||||| ||||||||||    
T  21937870 tacaattaataagagtgctttagtaaatgacactaattttatcattaaaataaagttaactaatcatttccttaa 21937796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 276 - 410
Target Start/End: Original strand, 22738665 - 22738798
Alignment:
Q  276 aatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccactaactacaattattaaggata 375  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||| ||||  |  | |||||| || || |||||||||||||| | ||||||    
T  22738665 aataccaatggaacatttattatt-ttttccactattatacctttatttattaaatttcatccaacttaactaatctactaactacaattaatgaggata 22738763  T
Q  376 tttttctaaattatactaattttatcattaaaatc 410  Q
    ||||  ||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  22738764 ttttagtaaatgatactaattttaccattgaaatc 22738798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 257 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 34100732 - 34100556
Alignment:
Q  257 aaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccacta 356  Q
    ||||||||||||| || | ||||  |||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||| ||| |||   |  | |||||| |||| || ||    
T  34100732 aaaataattgtcactttacaatactaatgcaacatttattatgttttttcactattatacccttatttattgaatgtcatccaacttaactacttcagta 34100633  T
Q  357 actacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 433  Q
    |||||||||| ||| ||||||||  |||||  |||||||||||  ||| |||||||  ||| |||| |||| |||||    
T  34100632 actacaattaataaagatattttagtaaatgctactaattttactattgaaatcaacacaattaatcattttcttaa 34100556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 244 - 332
Target Start/End: Original strand, 37245621 - 37245709
Alignment:
Q  244 ttttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaatt 332  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||| ||||    
T  37245621 ttttttttttctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaacatttattattttttctcactattatacccttatttattgaatt 37245709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 340 - 428
Target Start/End: Original strand, 39005448 - 39005536
Alignment:
Q  340 acttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttc 428  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||| | ||||||  ||||| |||||||||||| ||||  |||||| ||||||||| |||||    
T  39005448 acttaattaatctactaactacaattattaaaggtattttagtaaatgatactaattttaccattttaatcaactcaactaataatttc 39005536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 253 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 6495122 - 6494964
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 352  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||| | |||||||| || ||||||| || |||||| ||||| ||| ||||  |  | |||| | ||||||    
T  6495122 tctcaaaataattgtcactttagaatatcaatgtagcatttatt-ttttttttcattattatacccttatttattaaatttcatccaactttactactcc 6495024  T
Q  353 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 412  Q
    |||||||||||||| |||   | ||||  ||||| | |||||||||| ||| ||||||||    
T  6495023 actaactacaattaataaaagtgttttagtaaataacactaattttaccatcaaaatcaa 6494964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 255 - 422
Target Start/End: Original strand, 10042223 - 10042389
Alignment:
Q  255 tcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccac 354  Q
    ||||||||||  |||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||| ||||||  ||||| ||| | ||||| |  |||||| |||||||     
T  10042223 tcaaaataatcttcattttagaatatcaatgcatcgtttattattttttctcactgatatactcttatttattgagttctattttacttaactactccaa 10042322  T
Q  355 taactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaat 422  Q
    ||| || ||||| |||| |||||||  ||||| ||| ||| |||| || |||||| |||| |||||||    
T  10042323 taattataattaataagaatattttaataaatgatattaagtttacca-taaaataaatttaactaat 10042389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 32769914 - 32769725
Alignment:
Q  244 ttttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccactt 343  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||  | ||||||||||   ||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| | | ||||  | | || ||    
T  32769914 ttttttctgtctcagaataattgtcattctaaaatatcaatgttgcatttattattcttttccactaacataccattattcaatgaatttcatttcattt 32769815  T
Q  344 aattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcatt-aaaatcaattcaactaattatttccttaa 433  Q
    || |||||||  ||||||||||| |||| ||  |||  ||||||||||| |||| | |||| |||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  32769814 aactactccatcaactacaattaataagaat-gtttagtaaattatacttatttaaccattaaaaatcaatctaactaatcatttccttaa 32769725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 253 - 372
Target Start/End: Original strand, 36790678 - 36790799
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattattttt--cactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattact 350  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||||  || || |||||| ||||| ||| ||||  |  | || ||| ||||    
T  36790678 tctcaaaataattgtcactttagaatagcaatgcagcatttattattattttttccattattatacccttatttattgaatttcatccgacataactact 36790777  T
Q  351 ccactaactacaattattaagg 372  Q
    | |||||||||||||| |||||    
T  36790778 caactaactacaattaataagg 36790799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 253 - 446
Target Start/End: Original strand, 38391692 - 38391881
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattattttt-cactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactc 351  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||||||     |||||||||| ||||| || || ||||| |||||| ||| ||||  |  | ||||||||| ||    
T  38391692 tctcaaaataattgtcactttataatatcaat-----atttattatttttttttcattattatacttttatttattgaatttcatccaacttaattattc 38391786  T
Q  352 cactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattgtacataa 446  Q
    |||||||||||||||  |||  | ||||  ||||| |||||||||||| ||| ||||||||  ||| |||| |||| ||||| |||||| |||||    
T  38391787 cactaactacaattaacaagagtgttttagtaaatgatactaattttaccatcaaaatcaacacaattaatcattttcttaataattgtgcataa 38391881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 255 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 7457607 - 7457451
Alignment:
Q  255 tcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccac 354  Q
    ||||||||||| ||| || | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||  ||||| ||| ||||  | |  ||||||||| ||| |    
T  7457607 tcaaaataattatcactttacaatatcaatgcaacatttattatt-ttttccactattatactcttatttattgaatttaatttaacttaattattccgc 7457509  T
Q  355 taactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 412  Q
    |||||||| ||| ||||| | ||||  |||||   |||||||||| |||| |||||||    
T  7457508 taactacatttaataagggtcttttagtaaatgtaactaattttaccattgaaatcaa 7457451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 252 - 366
Target Start/End: Original strand, 16904316 - 16904432
Alignment:
Q  252 gtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattattttt--cactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattac 349  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||| ||| ||||  |  | |||||||||     
T  16904316 gtctcaaaataattgtctttttagaatatcaatgtagtatttattattattttttccactattatacccttatttattgaatttgatccaacttaattat 16904415  T
Q  350 tccactaactacaatta 366  Q
    | ||||||||| |||||    
T  16904416 ttcactaactataatta 16904432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 243 - 372
Target Start/End: Original strand, 44424075 - 44424203
Alignment:
Q  243 cttttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccact 342  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||| || | |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||  ||||| ||||| ||| || |  |  | |||    
T  44424075 cttttttttttctcaaaataattatcactttaaaatatcaatgcagcatttattatt-tttttcattataatacccttatttattgaacttcatccaact 44424173  T
Q  343 taattactccactaactacaattattaagg 372  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  44424174 taattactccactaactacatttaataagg 44424203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 253 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 8592629 - 8592449
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 352  Q
    ||||||||||||| |||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||   |||| |||||  ||||| ||| ||||  |    |||| | ||||||    
T  8592629 tctcaaaataattttcattttacaatatcaatgcagcatttattattttttcctactattatactcttatttattaaatttcatctaactttactactcc 8592530  T
Q  353 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 433  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||  |||||  ||||||||| | |||| |||||||  ||| |||| ||||| ||||    
T  8592529 actaactacaattaataagggtgttttattaaatactactaatttaaccattgaaatcaacacaattaatcatttctttaa 8592449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 353 - 433
Target Start/End: Original strand, 12631345 - 12631425
Alignment:
Q  353 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 433  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||  |||||  |||||||||||  ||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  12631345 actaactacaattaataaggatgttttgataaatactactaattttactattgaaatcaatacaattaattatttccttaa 12631425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 253 - 304
Target Start/End: Original strand, 27920926 - 27920977
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttt 304  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  27920926 tctcaaaataattgtcactttagaatattaatgcaacatttattattttttt 27920977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 253 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 31930691 - 31930640
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttt 304  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  31930691 tctcaaaataattgtcactttagaatatcaatgaaacatttattattttttt 31930640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 244 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 36425228 - 36425106
Alignment:
Q  244 ttttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatt-taattctactccact 342  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||||| |||| || |||| |||| ||||| ||| || ||| ||| |||     
T  36425228 ttttttatttctaaaaataattgtcatttcaaaatattaatttaacatttattatt-ttttgcaataatgtacccttatttattatacttcaacttcacg 36425130  T
Q  343 taattactccactaactacaatta 366  Q
    ||| || | |||||||||||||||    
T  36425129 taactatttcactaactacaatta 36425106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 340 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 16560672 - 16560566
Alignment:
Q  340 acttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattg 439  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||| |||||| ||||| ||| ||||| ||  ||| |||| |||||||||| ||| |    
T  16560672 acttaactaccccactaactacaattaataaggatgttttagtaaatgatactagttttaccatcaaaataaacacaattaatcatttccttaataatcg 16560573  T
Q  440 tacataa 446  Q
    | |||||    
T  16560572 tgcataa 16560566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 340 - 446
Target Start/End: Original strand, 16604990 - 16605096
Alignment:
Q  340 acttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattg 439  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||| |||||| ||||| ||| ||||| ||  ||| |||| |||||||||| ||| |    
T  16604990 acttaactaccccactaactacaattaataaggatgttttagtaaatgatactagttttaccatcaaaataaacacaattaatcatttccttaataatcg 16605089  T
Q  440 tacataa 446  Q
    | |||||    
T  16605090 tgcataa 16605096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 253 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 19271921 - 19271809
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactcc-acttaattactc 351  Q
    ||||||||||||||| | || | |||| ||||||||||||||||||| |||| || || |||||| ||||| | |||||| |  ||| |||||| |||||    
T  19271921 tctcaaaataattgttactttacaataccaatgcaacatttattatt-ttttccaatattatacccttattta-ttaattttcatccaacttaactactc 19271824  T
Q  352 cactaactacaatta 366  Q
    |||||||||||||||    
T  19271823 cactaactacaatta 19271809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 253 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 37850914 - 37850864
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattattt 303  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||| || |||||||||||||||    
T  37850914 tctcaaaataattgtcattttagaatattaattcatcatttattattattt 37850864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 260 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 17828533 - 17828381
Alignment:
Q  260 ataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattattttt-cactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccactaac 358  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||   ||||||||||| ||||| || || |||| | ||||| ||| |||||  | | |||||||||||||||||||    
T  17828533 ataattgtcattttcgaataccaatgttgcatttattatttttttttcattattatatcattatttattgaattcatc-caacttaattactccactaac 17828435  T
Q  359 tacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 412  Q
    |||||||  ||||  || |||| ||||| ||| |||||||| |||| |||||||    
T  17828434 tacaattgataagagtaattttgtaaatgatattaattttaccattgaaatcaa 17828381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 293
Target Start/End: Original strand, 49101602 - 49101651
Alignment:
Q  244 ttttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacattt 293  Q
    |||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  49101602 ttttttttgtcttaaactaattgtcattttagaatatcaatgcaacattt 49101651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 276 - 360
Target Start/End: Original strand, 37490338 - 37490422
Alignment:
Q  276 aatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccactaacta 360  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |  ||||| ||| ||||  | || | |||||||||||||||||||    
T  37490338 aataccaatgcaacatttattattattttttactagtatgctcttatttattgaatttcattcaatttaattactccactaacta 37490422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 384 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 40614701 - 40614658
Alignment:
Q  384 aattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattattt 427  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  40614701 aattatattaattttatcattgaaatcaattcaattaattattt 40614658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 257 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 3178391 - 3178234
Alignment:
Q  257 aaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacat--ttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccac 354  Q
    ||||||||||| | || ||||||  ||||||||||  |||||||  |||  || ||||||||| ||||| ||| ||||  |  | |||||| ||||||||    
T  3178391 aaaataattgttactttagaatactaatgcaacatatttattatgttttcccattaatatacccttatttattgaatttcatccaacttaactactccac 3178292  T
Q  355 taactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 412  Q
    |||||||||||| ||| | | ||||  ||||| ||| |||||||| ||| ||||||||    
T  3178291 taactacaattaataaaggtgttttagtaaatgatattaattttaccatcaaaatcaa 3178234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 251 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 30546540 - 30546499
Alignment:
Q  251 tgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacattt 293  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  30546540 tgtctcaaaataattgtcattt-ggaatatcaatgcaacattt 30546499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 253 - 299
Target Start/End: Original strand, 42935598 - 42935644
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattatt 299  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||||||||||    
T  42935598 tctcaaaataattgtcactttagaatacaaatgcaacatttattatt 42935644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 206 - 433
Target Start/End: Original strand, 48608760 - 48608982
Alignment:
Q  206 tactccctccatcttattttaactgtctctttagtttcttttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattattttt 305  Q
    |||||||||| ||| ||  ||||||||||||||   |||||| | | ||||||||||||||||| || | ||||| ||||||  |||||||||| ||||     
T  48608760 tactccctccgtctcataataactgtctctttaccatcttttctttttctcaaaataattgtcactttaaaatattaatgcagtatttattatt-ttttc 48608858  T
Q  306 cactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcatta 405  Q
    || || |||||  ||||| ||| ||||  |  | |||||| |||  |||||||||| |||| ||||||| ||||    | | |||||| ||||| ||| |    
T  48608859 cattattatactcttatttattgaatttcatccaacttaactacatcactaactacgattaataaggatgtttt----agtaatactagttttaccatca 48608954  T
Q  406 aaatcaattcaactaattatttccttaa 433  Q
    |||||||  ||| |||| ||||||||||    
T  48608955 aaatcaacacaattaatcatttccttaa 48608982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 382 - 427
Target Start/End: Original strand, 6855254 - 6855299
Alignment:
Q  382 taaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattattt 427  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||    
T  6855254 taaataatactaattttaccattaaaataaattcaactaatcattt 6855299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 382 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 17609390 - 17609349
Alignment:
Q  382 taaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaatt 423  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  17609390 taaattatactaattttaccattaaaatcaactcaattaatt 17609349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 382 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 17609633 - 17609592
Alignment:
Q  382 taaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaatt 423  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  17609633 taaattatactaattttaccattaaaatcaactcaattaatt 17609592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 382 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 17609876 - 17609835
Alignment:
Q  382 taaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaatt 423  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  17609876 taaattatactaattttaccattaaaatcaactcaattaatt 17609835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 382 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 17610119 - 17610078
Alignment:
Q  382 taaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaatt 423  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  17610119 taaattatactaattttaccattaaaatcaactcaattaatt 17610078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 382 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 17610362 - 17610321
Alignment:
Q  382 taaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaatt 423  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  17610362 taaattatactaattttaccattaaaatcaactcaattaatt 17610321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 347 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 31930592 - 31930527
Alignment:
Q  347 tactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 412  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||   |||||| | || ||||| ||||||||||||    
T  31930592 tactccactaactacaattaataagggtattttaaaaaattagattagttttaccattaaaatcaa 31930527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 63; Significance: 6e-27; HSPs: 41)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 253 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 30190842 - 30190664
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 352  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||  |||| |||||||||||||| ||| || || | |||| ||||||||| ||||  |  | |||||| ||||||    
T  30190842 tctcaaaataattgtcactttagaataaaaatgtaacatttattattaatttccattattttacccttattaattgaatttcatccaacttaactactcc 30190743  T
Q  353 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttcctt 431  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||  ||||| |||||||||||| |||| |||||||  ||| |||| ||||||||    
T  30190742 actaactacaattaataagggtattttagtaaatgatactaattttaccattgaaatcaacacaattaatcatttcctt 30190664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 229 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 43254070 - 43253865
Alignment:
Q  229 tgtctctttagtttcttttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttc-actaatatacctttattaatt 327  Q
    |||||||||||  | |||| ||| ||||||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||| | |||||| |||| |||||| ||||| | |    
T  43254070 tgtctctttagcattttttctatttctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaacatttattagtttttttccactattatacccttatttaat 43253971  T
Q  328 taattctactccacttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattattt 427  Q
     ||||  |  |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||  |||||  ||||||||||| |||| |||||||  ||| |||| ||||    
T  43253970 gaatttcatcccacttaactactccactaactacaattaataagggtgttttagtaaatgctactaattttaccattgaaatcaacacaattaatcattt 43253871  T
Q  428 ccttaa 433  Q
    ||||||    
T  43253870 ccttaa 43253865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 253 - 433
Target Start/End: Original strand, 44301494 - 44301675
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattattttt-cactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactc 351  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||  ||||| ||| ||||  |  | |||||| |||||    
T  44301494 tctcaaaataattgtcactttataatatcaatgcaacatttattaatatttttccactattatactcttatttattgaatttcatccaacttaactactc 44301593  T
Q  352 cactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 433  Q
    |||||| |||||||  ||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||   || ||| |||||||||||    
T  44301594 cactaattacaattgataagggtattttagtaaatgatactaattttatcattgaaatcaacataattaaatatttccttaa 44301675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 253 - 433
Target Start/End: Original strand, 19822944 - 19823124
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtca-tttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactc 351  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||  |  | |||||| || ||    
T  19822944 tctcaaaataattgtcacttttagaataccaatgcagcatttattatt-tttttcattaatatacccttatttattgaatttcatccaacttaactattc 19823042  T
Q  352 cactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 433  Q
    ||||||||||||||| ||||| | ||||  ||||| ||||||||| || ||| ||||||||  ||| |||| ||||||||||    
T  19823043 cactaactacaattaataagggtgttttagtaaatgatactaattctaccatcaaaatcaacacaattaatcatttccttaa 19823124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 251 - 433
Target Start/End: Original strand, 30711005 - 30711186
Alignment:
Q  251 tgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattact 350  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||   ||||| ||| ||||  |    |||||||| ||    
T  30711005 tgtctcaacataattgtcattttagaatatcaatacaacatttattatt-tttttcactattataatcttatttattgaatttcatctaacttaattgct 30711103  T
Q  351 ccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 433  Q
    ||| |||||||||||| ||| | | ||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||   || |||||||||| ||||    
T  30711104 ccattaactacaattaataatggtgttttagtaaatgatattaattttatcattaaaatcaacataattaattatttctttaa 30711186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 245 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 12736761 - 12736574
Alignment:
Q  245 tttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccactta 344  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||||  |  |||||||||| |||| ||||| |||||| ||||| ||| |||| ||  | | |||    
T  12736761 tttttctgtctcaaaataattgtcactttagaatgtcaatctagtatttattattgtttt-cactattatacccttatttattgaattttatccaaatta 12736663  T
Q  345 attactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 433  Q
    | |||| |||||| |||||||| ||||| |||| |  ||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||| |||| ||||||||||    
T  12736662 actactacactaagtacaattaataagggtattgtagtaaatgatactaattttatcattagaatcaacacaattaatcatttccttaa 12736574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 253 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 36460598 - 36460452
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 352  Q
    ||||||||||||||||| || |  |||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| |||||| ||||| ||| ||||  |  | |||||||||||||    
T  36460598 tctcaaaataattgtcactttacgatatcaatgcaatatttattatttgtttccactattatacccttatttattgaatttcatccaacttaattactcc 36460499  T
Q  353 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaatttta 399  Q
    | |||||||||||| |||| |||||||  |||||  |||||||||||    
T  36460498 attaactacaattaataagaatattttaataaatgttactaatttta 36460452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 257 - 446
Target Start/End: Original strand, 37311886 - 37312076
Alignment:
Q  257 aaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttc-actaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccact 355  Q
    ||||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||||||| | || |||||  ||||| ||| ||||  | |  | |||| |||||||||    
T  37311886 aaaataattgtcactttacaatatcaatgcagcatttattattatttttctattattatactcttatttattgaatttcattaaatttaactactccact 37311985  T
Q  356 aactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattgtacataa 446  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||  |||||  ||||||||||| |||| |||||||  ||| |||| |||||||||| ||| || |||||    
T  37311986 aactacaattaataagggttttttagtaaatgctactaattttaccattgaaatcaacacaattaatcatttccttaataatcgtgcataa 37312076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 249 - 305
Target Start/End: Original strand, 30710578 - 30710634
Alignment:
Q  249 tatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattattttt 305  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30710578 tatgtctcaaaataattgtcactttagaatatcaatgcaacatttattattattttt 30710634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 258 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 39043932 - 39043799
Alignment:
Q  258 aaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccactaa 357  Q
    |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||  ||||||| || |||||| ||||| ||| ||||  | || |||||| |||||||||||    
T  39043932 aaataattgtcactttagaataccaatgcaacatttattat--tttttcattattatacccttatttattgaatttcattcaacttaactactccactaa 39043835  T
Q  358 ctacaattattaaggatatttttctaaattatacta 393  Q
    ||||||||| ||| | ||||||  ||||| ||||||    
T  39043834 ctacaattaataaaggtattttagtaaatgatacta 39043799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 244 - 446
Target Start/End: Original strand, 37497415 - 37497618
Alignment:
Q  244 ttttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattatta-tttttcactaatatacctttattaatttaattctactccact 342  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| || | |||| |||| ||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||| ||| ||||  |  | |||    
T  37497415 ttttttttctctcaaaataattgtcactttataataccaatacaacatttattattattttttcattattatacgtttatttattgaatttcatccaact 37497514  T
Q  343 taattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattgtac 442  Q
    ||| |||||||||||||||| |||  || | | ||||  ||||| |||||||||||| ||| ||||||||  |||  ||| |||||||||| ||| || |    
T  37497515 taactactccactaactacagttaacaacggtgttttagtaaatgatactaattttaccatcaaaatcaacacaataaatcatttccttaataatcgtgc 37497614  T
Q  443 ataa 446  Q
    ||||    
T  37497615 ataa 37497618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 257 - 446
Target Start/End: Original strand, 11905760 - 11905948
Alignment:
Q  257 aaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccacta 356  Q
    ||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| || || |||| ||||||| ||| ||||  |  | ||||||  |||||| ||    
T  11905760 aaaataatttttattttagaatatcaatgcaacatttattatt-ttttccattattatatctttatttattgaatttcatccaacttaacaactccatta 11905858  T
Q  357 actacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattgtacataa 446  Q
    |||||||||| ||||| |  |||  ||||| |||||||||||||||| ||||| ||  ||| |||| |||| ||||| ||| || |||||    
T  11905859 actacaattaataagggtgctttagtaaatgatactaattttatcatcaaaattaacacaattaatcattttcttaataatcgtgcataa 11905948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 265 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 37695837 - 37695668
Alignment:
Q  265 tgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttc-actaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccactaactacaa 363  Q
    ||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||||| | || |||||| ||||| ||| ||||  |    |||||| |||||||||||||||||    
T  37695837 tgtcactttagaataccaatgcaacatttattattttttttccattattatacccttatttattgaatttcatctaacttaactactccactaactacaa 37695738  T
Q  364 ttattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 433  Q
    ||| ||||| | ||||  ||||| ||| |||||||| |||| |||||||  ||| |||| ||||||||||    
T  37695737 ttaataagggtgttttagtaaatgatattaattttaccattgaaatcaacacaattaatcatttccttaa 37695668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 253 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 51838142 - 51837961
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttc-actaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactc 351  Q
    ||||||||||||||||| || | |||   |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||| | | ||||  | || || ||| |||||    
T  51838142 tctcaaaataattgtcactttacaattataatgcaacatttattattttttttccactattatacccttatttaatgaatttcattcaacgtaactactc 51838043  T
Q  352 cactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 433  Q
    ||||| |||||| || ||||| ||||||  ||||| ||| ||||||||||||| |||||||  ||| |||| |||| |||||    
T  51838042 cactagctacaactaataagggtattttagtaaatgatattaattttatcattgaaatcaacacaattaatcatttacttaa 51837961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 253 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 3901331 - 3901148
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 352  Q
    ||||||||||||||| | |   ||||| ||||| ||||||||||||| |||| || || |||||| ||||| ||| ||||  |  | |||||| ||| ||    
T  3901331 tctcaaaataattgttactcttgaataccaatgtaacatttattatttttttccattattatacccttatttattgaatttcatccaacttaagtacccc 3901232  T
Q  353 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaa 436  Q
    ||||||||||| || |||| || ||||  ||||| ||| ||||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||| ||||||||    
T  3901231 actaactacaactaataagaatgttttagtaaatgatattaattttatcattgaaattaatacaattaatcattttcttaacaa 3901148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 253 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 10366831 - 10366718
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 352  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||  || || |||||| ||||| ||| ||||  |  | |||||| |||| |    
T  10366831 tctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcaacatttattattttttcccattattatacccttatttattgaatttcatccaacttaactacttc 10366732  T
Q  353 actaactacaatta 366  Q
    ||||||||||||||    
T  10366731 actaactacaatta 10366718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 252 - 412
Target Start/End: Original strand, 12904796 - 12904957
Alignment:
Q  252 gtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactc 351  Q
    |||||||||||||||| | || | ||||  |||| | | |||||| || |||| ||||| |||||| ||||| ||| ||||  |  | ||||||||||||    
T  12904796 gtctcaaaataattgttaatttataatactaatggagcttttattttttttttccactattatacccttatttattgaatttcatccaacttaattactc 12904895  T
Q  352 cactaactacaatt-attaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 412  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||  ||||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  12904896 cactaactacaattaataaaagatattttgataaatcatactaattttataattgaaatcaa 12904957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 282 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 8679206 - 8679043
Alignment:
Q  282 aatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccactaactacaattattaaggatatttttc 381  Q
    |||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||| ||| ||||  |  | ||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||| ||||      
T  8679206 aatgcatcatttattatt-ttttccactattatacccttatttattgaatttcatccaacttaattaattcactaactataattaataaggatcttttag 8679108  T
Q  382 taaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattgtacataa 446  Q
    |||||  ||||||||||| |||| |||||||  ||| |||| |||||||||| ||| || |||||    
T  8679107 taaatgctactaattttaccattgaaatcaacacaattaatcatttccttaataatcgtgcataa 8679043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 253 - 433
Target Start/End: Original strand, 36476517 - 36476697
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 352  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||| | ||||  | || |||||| ||||| ||| ||||  |    |||||| |||||     
T  36476517 tctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcagcatttattacttttttctattattatacccttatttattgaatttcatcaaacttaactactct 36476616  T
Q  353 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 433  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||  ||||| ||| |||||||| ||||  ||||||  |||  |||||||| |||||    
T  36476617 actaactacaattaataagggtattttagtaaatgatattaattttaccattgcaatcaacacaatcaattattttcttaa 36476697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 299
Target Start/End: Original strand, 33458973 - 33459028
Alignment:
Q  244 ttttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattatt 299  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  33458973 ttttttttgtctcaaaataattgtcattttagattatcaatacaacatttattatt 33459028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 253 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 37773148 - 37772966
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacattta--ttattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattact 350  Q
    ||||||||||||||||| || | |||| ||||||| ||||||  ||||| |||| || || |||||| ||||| | | ||||  | || |||||| || |    
T  37773148 tctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcagcatttattttatttttttccattattatacccttatttaatgaatttcattcaacttaactatt 37773049  T
Q  351 ccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 433  Q
    ||||| |||| ||||| ||||| ||||||  ||||| ||| |||||||| ||||  ||||||| ||| |||| ||||||||||    
T  37773048 ccactgactataattaataagggtattttagtaaatgatattaattttaccattgtaatcaatacaattaatcatttccttaa 37772966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 340 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 24569195 - 24569089
Alignment:
Q  340 acttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattg 439  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||| ||| |||||||| |||| |||||||  ||| |||| |||| ||||| ||| |    
T  24569195 acttaactactccactaactacaattaataagggtattttagtaaataatattaattttaccattgaaatcaacacaattaatcattttcttaataatcg 24569096  T
Q  440 tacataa 446  Q
    | |||||    
T  24569095 tgcataa 24569089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 412
Target Start/End: Original strand, 34750518 - 34750588
Alignment:
Q  342 ttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 412  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  34750518 ttaactactccaccaactacaattaataaggatgttttagtaaatgatactaattttaccattaaaatcaa 34750588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 251 - 433
Target Start/End: Original strand, 38795275 - 38795457
Alignment:
Q  251 tgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattact 350  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||  | ||||||| ||||| ||| || || || ||| ||||  |  | ||||||  |||    
T  38795275 tgtctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcaatattttattttattttccactattatgcccttttttattaaatttcatccaacttaacaact 38795374  T
Q  351 ccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 433  Q
    |||| ||||||||||| |||||  ||||   ||||| |||||||||||| |||| |||| ||  ||| |||| ||||||||||    
T  38795375 ccaccaactacaattaataagggcatttgggtaaatgatactaattttaccattgaaataaacacaattaatcatttccttaa 38795457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 253 - 446
Target Start/End: Original strand, 34957437 - 34957629
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 352  Q
    ||||||||||||| ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| |||| |  || |||| | ||||| ||| ||||  | |  ||| || ||||||    
T  34957437 tctcaaaataattatcactttaaaataccaatgtaacatttattatt-ttttccgttactatatccttatttattgaatttcatttaactgaactactcc 34957535  T
Q  353 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattgtacataa 446  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||   |||||||||| ||||||| ||| ||| ||||  ||| |||| |||||||||  |||||| |||||    
T  34957536 actaactataattaataaggatatttaagtaaattatacaaattttaccatcaaattcaacacaattaatcatttccttagtaattgtccataa 34957629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 260 - 433
Target Start/End: Original strand, 52290834 - 52291006
Alignment:
Q  260 ataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccactaact 359  Q
    |||||||| | || |||||| ||||||| ||||||||||| |||| || ||  ||| | ||||| ||| || | || || |||||| |||||||||||||    
T  52290834 ataattgtgactttagaataccaatgcagcatttattatt-ttttacattataatatccttatttattgaactttattcaacttaactactccactaact 52290932  T
Q  360 acaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 433  Q
    | ||||| ||||| | ||||  |||||  ||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||| |||| |||||    
T  52290933 ataattaataaggctgttttaataaatggtactaattttaccatcaaaatcaatacaattaatcattttcttaa 52291006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 412
Target Start/End: Original strand, 19611929 - 19612000
Alignment:
Q  340 acttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 412  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||| |||||||    
T  19611929 acttaactactccactaacaacaattaataaggatattttagtaaattata-taattttaacattgaaatcaa 19612000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 29024060 - 29023989
Alignment:
Q  340 acttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||  ||||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  29024060 acttaattactccactaactacaattaataa-gatgttttagtaaatgatactaattttaccatcaaaatcaa 29023989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 257 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 48541170 - 48541122
Alignment:
Q  257 aaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattattttt 305  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  48541170 aaaataattgtcattttataatatcagtgcaacatttattattattttt 48541122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 246 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 42469868 - 42469724
Alignment:
Q  246 ttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaa 345  Q
    |||| ||||||||||||||||||| || | ||||| |||| ||||||||   |||||||| | ||||||||  ||||| ||| |||| || ||||| |||    
T  42469868 ttttttgtctcaaaataattgtcactttaaaatattaatgtaacattta--cttatttttaattaatatactcttatttattgaattataatccacctaa 42469771  T
Q  346 ttactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatact 392  Q
     ||||| |||||||| | ||| ||||  ||||||  |||||||||||    
T  42469770 atactcaactaactagagttaataagagtattttagtaaattatact 42469724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 253 - 304
Target Start/End: Original strand, 43715239 - 43715290
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttt 304  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  43715239 tctcaaaataattgtcactttagaatatcaatgtaacatttattattttttt 43715290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 250 - 296
Target Start/End: Original strand, 37804668 - 37804714
Alignment:
Q  250 atgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttatt 296  Q
    |||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||    
T  37804668 atgtctcaaaataattgtccctttagaatatcaatgcaacatttatt 37804714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 412
Target Start/End: Original strand, 14194531 - 14194647
Alignment:
Q  295 ttattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaa 394  Q
    ||||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||  |  | ||||||||||||||||||| ||||||  |||   ||||||  |||||  ||||||    
T  14194531 ttattatttgtcattattatacctttattaattgaatttcatccaacttaattactccactaac-acaattcataaaagtattttagtaaatggtactaa 14194629  T
Q  395 ttttatcattaaaatcaa 412  Q
    |||||||||| |||||||    
T  14194630 ttttatcattgaaatcaa 14194647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 340 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 30682161 - 30682068
Alignment:
Q  340 acttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 433  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||||  ||||||  ||||| ||||| |||||| ||||||||| ||  ||| |||| ||||||||||    
T  30682161 acttaattattccattaactacaattaataagattattttagtaaatgatactcattttaacattaaaattaaaacaattaatcatttccttaa 30682068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 340 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 36463041 - 36462968
Alignment:
Q  340 acttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaat 413  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||  |||||  ||| ||||||| |||||||||||||    
T  36463041 acttaattactccacaaacaacaattaataaggttattttagtaaatgctaccaattttaacattaaaatcaat 36462968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 340 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 54477554 - 54477482
Alignment:
Q  340 acttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 412  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| |||  |||||||  ||||| ||| |||||||| ||||||||||||    
T  54477554 acttaactactccattaactacaattaataaaaatattttagtaaatgatattaattttaccattaaaatcaa 54477482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 229 - 356
Target Start/End: Original strand, 27471244 - 27471371
Alignment:
Q  229 tgtctctttagtttcttttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaattt 328  Q
    |||||||||||  | |||| | | ||||||||||||||||| || | |||| |||| || ||||||||||| || | |||||  ||||||||||| |||     
T  27471244 tgtctctttagcattttttctttttctcaaaataattgtcactttataataccaatacagcatttattatttttgtccactaccatacctttatttattg 27471343  T
Q  329 aattctactccacttaattactccacta 356  Q
    ||||  | || |||||| ||||||||||    
T  27471344 aatttcattcaacttaactactccacta 27471371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 340 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 23004477 - 23004384
Alignment:
Q  340 acttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 433  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||  || ||  ||||||||||| |||| ||||| |  ||| |||| ||||||||||    
T  23004477 acttaactactccactaactacaattaataagggtgttttagtatatactactaattttaccattgaaatcgacacaattaatcatttccttaa 23004384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 251 - 356
Target Start/End: Original strand, 33634267 - 33634372
Alignment:
Q  251 tgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattact 350  Q
    ||||| ||||||||| |||| | | ||||| ||| ||| |||||||||| |||| ||  |||||| | ||||| ||| ||||  ||||||||||||||||    
T  33634267 tgtcttaaaataattatcatattataatattaatacaatatttattatttttttccatcaatatatcattatttattgaattagactccacttaattact 33634366  T
Q  351 ccacta 356  Q
     |||||    
T  33634367 acacta 33634372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 255 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 38137626 - 38137549
Alignment:
Q  255 tcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaatt 332  Q
    ||||||||||||||| ||   ||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||| ||||    
T  38137626 tcaaaataattgtcactttgcaatactaatgcaatatttattattattttccactattatatctttatttattgaatt 38137549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 253 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 51065195 - 51065139
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcacta 310  Q
    |||| ||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  51065195 tctctaaataattgtcattttacaataccaatgcagcatttattatt-tttttcacta 51065139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0330 (Bit Score: 45; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0330
Description:

Target: scaffold0330; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 253 - 404
Target Start/End: Original strand, 5325 - 5474
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 352  Q
    ||||||||||||||| | || |||||  |||| ||||||||||||||  |||||  | ||||||||||||| ||| ||||  |  | |||||| ||||||    
T  5325 tctcaaaataattgttactttagaatgccaatacaacatttattatt--ttttccattatatacctttatttattgaatttcatccaacttaactactcc 5422  T
Q  353 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcatt 404  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||  ||||| ||| |||||||| ||||    
T  5423 actaactaaaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttaccatt 5474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 45; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 253 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 34200 - 34021
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 352  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||| ||| ||||  |  | |||||| || | |    
T  34200 tctcaaaataattgtcactttacaatatcaatgcatcatttattatt-ttttccactattataccattatttattgaatttcatccaacttaactatttc 34102  T
Q  353 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 433  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||  |||||   ||||||||||  ||| || ||||| ||| |||| ||||||||||    
T  34101 actaactacaattaataagggtgttttagtaaatgccactaattttactattgaattcaatacaattaatcatttccttaa 34021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0328 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0328
Description:

Target: scaffold0328; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 253 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 8164 - 7983
Alignment:
Q  253 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaata-tacctttattaatttaattctactccacttaattactc 351  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||| |||| |  | ||| |||| ||||| ||| || |  |  | ||||||||||||    
T  8164 tctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcagcatttattatttttttcccattataatacccttatttattgaacttcatccaacttaattactc 8065  T
Q  352 cactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 433  Q
    ||||||||||||||| ||||| | ||||  ||||| ||| |||||||| |||  |||||||   || |||| ||||||||||    
T  8064 cactaactacaattaataagggtgttttggtaaataatattaattttaccatccaaatcaacaaaattaatcatttccttaa 7983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2146 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold2146
Description:

Target: scaffold2146; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 304 - 419
Target Start/End: Original strand, 389 - 504
Alignment:
Q  304 ttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcat 403  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||| ||||||||   ||||||||| |||||||||||| |||| ||||| | ||||  | ||| |||||||||||| |||    
T  389 ttcattaatatacccttatttattgaattctaccttacttaattaatccactaactactattaataagggtgttttattgaatgatactaattttaacat 488  T
Q  404 taaaatcaattcaact 419  Q
    |||||| || ||||||    
T  489 taaaataaaatcaact 504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 244 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 252994 - 252848
Alignment:
Q  244 ttttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccactt 343  Q
    |||||| | |||||||| |||||||| || | |||| ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||  ||||| ||| ||||  | || ||||    
T  252994 ttttttttttctcaaaaaaattgtcactttataataccaatgcaacatttattatt-tttttcattattatactcttatttattgaatttcattcaactt 252896  T
Q  344 aattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatact 392  Q
    || ||||||| | |||||||||| ||| ||||||||  ||||| |||||    
T  252895 aactactccaat-actacaattaataacgatattttagtaaatgatact 252848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0583 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0583
Description:

Target: scaffold0583; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 343 - 409
Target Start/End: Original strand, 2048 - 2114
Alignment:
Q  343 taattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaat 409  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  2048 taattaatccactaactacaattaataaggatgttttagtaaatgatattaattttatcattgaaat 2114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0182 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0182
Description:

Target: scaffold0182; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 340 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 20448 - 20376
Alignment:
Q  340 acttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 412  Q
    |||||| |||| |||||||| |||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||||  || ||||||||    
T  20448 acttaactacttcactaactgcaattaataagggtattttactaaatgatactaattttacaatcaaaatcaa 20376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0464 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0464
Description:

Target: scaffold0464; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 251 - 313
Target Start/End: Original strand, 5976 - 6037
Alignment:
Q  251 tgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaata 313  Q
    ||||||||||||||| ||| || ||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||    
T  5976 tgtctcaaaataattatcactttagaatatcaatccagcatttattatt-gttttcactaata 6037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 16933 - 16884
Alignment:
Q  244 ttttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacattt 293  Q
    |||||| ||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| ||||    
T  16933 ttttttttgtctcaaaataatttttattttagaatatcaatgcaagattt 16884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University