View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF16006_high_26 (Length: 344)

Name: NF16006_high_26
Description: NF16006
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF16006_high_26
NF16006_high_26
[»] chr8 (28 HSPs)
chr8 (1-339)||(23547806-23548144)
chr8 (1-275)||(40125149-40125425)
chr8 (1-330)||(1910154-1910484)
chr8 (1-275)||(33417096-33417371)
chr8 (1-329)||(17020917-17021244)
chr8 (1-329)||(17551354-17551681)
chr8 (1-330)||(1808012-1808341)
chr8 (1-159)||(2966197-2966353)
chr8 (1-326)||(18875595-18875918)
chr8 (80-275)||(17026565-17026758)
chr8 (80-275)||(17557057-17557250)
chr8 (1-159)||(38181612-38181772)
chr8 (1-159)||(19167213-19167373)
chr8 (2-243)||(15950839-15951081)
chr8 (121-275)||(17026828-17026981)
chr8 (121-275)||(17557320-17557473)
chr8 (55-143)||(18260461-18260548)
chr8 (1-156)||(26779683-26779845)
chr8 (228-331)||(2966373-2966476)
chr8 (209-330)||(38181488-38181607)
chr8 (1-275)||(44925165-44925451)
chr8 (235-330)||(19168560-19168653)
chr8 (47-104)||(17953398-17953454)
chr8 (252-330)||(24672525-24672603)
chr8 (296-330)||(26779960-26779994)
chr8 (266-330)||(22714204-22714267)
chr8 (1-82)||(7002218-7002299)
chr8 (47-120)||(17794090-17794162)
[»] chr7 (29 HSPs)
chr7 (1-330)||(10392296-10392623)
chr7 (8-330)||(10387557-10387878)
chr7 (1-339)||(21671761-21672099)
chr7 (1-330)||(3046137-3046464)
chr7 (55-330)||(3880586-3880858)
chr7 (47-330)||(27238765-27239045)
chr7 (1-330)||(42625789-42626118)
chr7 (1-331)||(12799952-12800281)
chr7 (1-275)||(4930787-4931064)
chr7 (47-330)||(2595439-2595716)
chr7 (1-330)||(8268861-8269190)
chr7 (1-233)||(3285067-3285294)
chr7 (184-339)||(12181958-12182113)
chr7 (97-275)||(26341870-26342048)
chr7 (8-106)||(26286567-26286665)
chr7 (1-149)||(16372964-16373107)
chr7 (229-330)||(12256812-12256912)
chr7 (25-141)||(15973344-15973459)
chr7 (97-159)||(44509767-44509829)
chr7 (1-106)||(13313710-13313813)
chr7 (8-95)||(9008708-9008794)
chr7 (1-144)||(15642812-15642954)
chr7 (1-106)||(30258668-30258775)
chr7 (15-144)||(23319498-23319628)
chr7 (256-330)||(23247946-23248018)
chr7 (250-330)||(27246752-27246831)
chr7 (57-150)||(6590400-6590494)
chr7 (1-95)||(10532290-10532383)
chr7 (250-330)||(6590219-6590298)
[»] chr2 (21 HSPs)
chr2 (1-330)||(40846788-40847118)
chr2 (1-275)||(30651483-30651755)
chr2 (1-330)||(25477495-25477824)
chr2 (1-275)||(1934246-1934523)
chr2 (1-275)||(9184673-9184947)
chr2 (1-275)||(9179982-9180256)
chr2 (96-275)||(17968217-17968396)
chr2 (72-339)||(24537226-24537478)
chr2 (1-330)||(12797492-12797819)
chr2 (100-330)||(12360914-12361142)
chr2 (1-330)||(19896595-19896912)
chr2 (97-275)||(19891734-19891912)
chr2 (97-275)||(18345074-18345248)
chr2 (1-159)||(29678323-29678483)
chr2 (199-275)||(17974606-17974682)
chr2 (215-330)||(25496590-25496703)
chr2 (92-330)||(34495308-34495536)
chr2 (1-106)||(31327318-31327425)
chr2 (7-95)||(17453048-17453129)
chr2 (250-302)||(21523495-21523547)
chr2 (1-106)||(19578003-19578107)
[»] chr6 (26 HSPs)
chr6 (1-339)||(19994587-19994925)
chr6 (2-329)||(20747504-20747830)
chr6 (1-330)||(17914153-17914482)
chr6 (47-330)||(11559417-11559697)
chr6 (1-243)||(17599935-17600181)
chr6 (47-330)||(11533907-11534187)
chr6 (1-330)||(33686849-33687177)
chr6 (1-330)||(11428525-11428856)
chr6 (175-330)||(11613109-11613263)
chr6 (1-275)||(6407115-6407391)
chr6 (56-339)||(22694566-22694838)
chr6 (47-330)||(14509587-14509867)
chr6 (97-285)||(8748423-8748610)
chr6 (1-275)||(16835418-16835688)
chr6 (97-330)||(5856644-5856875)
chr6 (1-330)||(12405566-12405886)
chr6 (44-159)||(4156721-4156835)
chr6 (1-243)||(25313739-25313983)
chr6 (1-243)||(26201233-26201477)
chr6 (97-275)||(17963813-17963991)
chr6 (1-243)||(2699379-2699623)
chr6 (47-135)||(11570138-11570225)
chr6 (199-328)||(11569899-11570027)
chr6 (220-331)||(4156540-4156649)
chr6 (49-106)||(19674403-19674459)
chr6 (287-331)||(2699320-2699364)
[»] chr4 (34 HSPs)
chr4 (1-330)||(51698487-51698816)
chr4 (1-330)||(16421607-16421936)
chr4 (1-275)||(37259118-37259394)
chr4 (1-275)||(37263818-37264094)
chr4 (1-330)||(33468203-33468533)
chr4 (1-275)||(31274079-31274355)
chr4 (8-330)||(13065015-13065325)
chr4 (1-339)||(6943347-6943676)
chr4 (90-275)||(31766528-31766713)
chr4 (97-275)||(5270678-5270856)
chr4 (2-330)||(32220768-32221096)
chr4 (97-275)||(8694376-8694554)
chr4 (97-330)||(13060125-13060356)
chr4 (1-159)||(55252231-55252391)
chr4 (97-330)||(19906904-19907138)
chr4 (101-275)||(31728620-31728794)
chr4 (80-330)||(32081371-32081616)
chr4 (48-322)||(12823099-12823368)
chr4 (97-275)||(5927472-5927650)
chr4 (1-135)||(31269590-31269726)
chr4 (47-159)||(19540549-19540660)
chr4 (47-330)||(33462555-33462845)
chr4 (5-159)||(30054434-30054587)
chr4 (7-330)||(23093687-23093999)
chr4 (47-131)||(2820419-2820501)
chr4 (32-109)||(39216507-39216583)
chr4 (3-106)||(19107178-19107283)
chr4 (250-330)||(39216304-39216383)
chr4 (228-330)||(29349413-29349513)
chr4 (1-82)||(15805088-15805169)
chr4 (1-41)||(39216592-39216632)
chr4 (284-340)||(40408780-40408836)
chr4 (1-40)||(42758347-42758386)
chr4 (5-79)||(26188138-26188212)
[»] chr5 (24 HSPs)
chr5 (1-330)||(20180356-20180685)
chr5 (1-275)||(39518964-39519236)
chr5 (1-275)||(37248055-37248330)
chr5 (1-275)||(39523603-39523875)
chr5 (80-330)||(6511838-6512086)
chr5 (1-280)||(16115481-16115760)
chr5 (97-275)||(26667941-26668119)
chr5 (97-275)||(26939538-26939716)
chr5 (1-274)||(12103593-12103866)
chr5 (108-275)||(37537193-37537360)
chr5 (97-275)||(36424301-36424479)
chr5 (98-273)||(29167230-29167405)
chr5 (108-275)||(37646312-37646479)
chr5 (97-275)||(6154688-6154866)
chr5 (97-270)||(7452416-7452589)
chr5 (59-314)||(40148522-40148774)
chr5 (1-159)||(15414268-15414422)
chr5 (1-111)||(4872467-4872578)
chr5 (1-84)||(23757259-23757342)
chr5 (1-84)||(23822715-23822798)
chr5 (64-159)||(35779958-35780051)
chr5 (199-272)||(36430284-36430357)
chr5 (3-91)||(1429626-1429715)
chr5 (47-106)||(35679311-35679369)
[»] chr1 (23 HSPs)
chr1 (47-320)||(20107964-20108238)
chr1 (1-330)||(19798201-19798530)
chr1 (1-330)||(38621273-38621602)
chr1 (1-330)||(16648836-16649164)
chr1 (1-275)||(47450478-47450754)
chr1 (1-275)||(25844320-25844597)
chr1 (1-327)||(39199966-39200291)
chr1 (4-336)||(8138198-8138517)
chr1 (97-275)||(10135988-10136166)
chr1 (97-275)||(26926975-26927153)
chr1 (1-325)||(16834040-16834364)
chr1 (47-159)||(33300613-33300724)
chr1 (96-275)||(10140755-10140934)
chr1 (1-134)||(11806828-11806961)
chr1 (1-106)||(16036187-16036292)
chr1 (184-339)||(11806958-11807112)
chr1 (111-275)||(51040776-51040940)
chr1 (1-106)||(7882551-7882659)
chr1 (4-106)||(12260562-12260663)
chr1 (47-135)||(10999287-10999374)
chr1 (1-106)||(39587781-39587888)
chr1 (284-330)||(33300467-33300513)
chr1 (47-104)||(23192251-23192307)
[»] chr3 (23 HSPs)
chr3 (1-330)||(3419554-3419883)
chr3 (47-330)||(12965089-12965368)
chr3 (1-275)||(23665376-23665653)
chr3 (1-275)||(7570469-7570746)
chr3 (1-330)||(20520522-20520851)
chr3 (1-330)||(46964577-46964903)
chr3 (1-275)||(55326343-55326618)
chr3 (77-332)||(12111805-12112064)
chr3 (1-275)||(27709497-27709772)
chr3 (1-272)||(757620-757894)
chr3 (97-339)||(14437893-14438132)
chr3 (80-324)||(55431875-55432117)
chr3 (1-159)||(23660833-23660994)
chr3 (97-285)||(18472669-18472856)
chr3 (97-275)||(18467875-18468053)
chr3 (101-275)||(32473278-32473452)
chr3 (139-330)||(12971016-12971205)
chr3 (16-115)||(11399944-11400043)
chr3 (199-275)||(23660744-23660820)
chr3 (1-82)||(10708150-10708231)
chr3 (1-106)||(29350806-29350913)
chr3 (233-275)||(39775080-39775122)
chr3 (1-66)||(25726239-25726304)
[»] scaffold0352 (1 HSPs)
scaffold0352 (1-275)||(7672-7949)
[»] scaffold0002 (2 HSPs)
scaffold0002 (1-275)||(4629-4905)
scaffold0002 (47-314)||(443161-443424)
[»] scaffold0690 (1 HSPs)
scaffold0690 (6-330)||(5801-6122)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (4-158)||(4543-4696)
[»] scaffold0054 (2 HSPs)
scaffold0054 (1-330)||(29741-30067)
scaffold0054 (1-106)||(26021-26128)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (1-106)||(147814-147919)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (47-106)||(145845-145903)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (110-159)||(35800-35849)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 283; Significance: 1e-158; HSPs: 28)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 23548144 - 23547806
Alignment:
Q  1 aaaaaggagatgaagagaagaatagctcgtcaacacaagttgtagagagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgatttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23548144 aaaaaggagatgaagagaagaatagctcgtcaacacaagttggagagagaagatagaaagagttctcgaccactcaatagaaactctttggtgtgatttt 23548045  T
Q  101 tgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattagatcaaaggagaactt 200  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  23548044 tgaactaggtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattgaagcaacagttaatttaatgaataagatcaaaagagaactt 23547945  T
Q  201 atacattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaaggaatagatccacaaaagtggaggaaacaaactcattgaattttgaatgaattaaaga 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  23547944 atacattaaacaattcaataacacatatggataggatcaaaaggaacagatccacaaaagtggaggaaacaaactcattgaattttgaatgaaggaaaga 23547845  T
Q  301 taagaaattcaattgaattcttattcttattcttatcac 339  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23547844 taagaaattccattgaattcttattcttattcttatcac 23547806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 40125425 - 40125149
Alignment:
Q  1 aaaaaggagatgaagagaagaatagctcgtcaacacaagttgt---agagagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgat 97  Q
    ||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||      || ||||||| |||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||| |    
T  40125425 aaaaaggagatgaagagaagaaagacttgtcaacacaagtcaagaaagggagaagagagaaagagttcccgacaactcaat-gaaactctttggtgtgtt 40125327  T
Q  98 ttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattagatcaaaggagaa 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||  ||| | ||||| || |||| |||   ||     
T  40125326 ttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattctgtaactgttttagcaaaaattgagacaacaattactctaatggataagattaaaatggag 40125227  T
Q  198 cttatacattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaaggaatagatccacaaaagtggaggaaacaaact 275  Q
     |||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||    
T  40125226 tttatccattaatcagttcaacaacacttgtggataggatcaaaagaaacaaatccacaaaagtggaggaaacaaact 40125149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 1910484 - 1910154
Alignment:
Q  1 aaaaaggagatgaagagaagaatagctcgtcaacacaagttgt---agagagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgat 97  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||      ||  |||||| |||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||| |    
T  1910484 aaaaaggagatgaagagaagaaagactcgtcaacacaagtcaagaaaggaagaagagagaaagagttcccgacaactcaat-gaaactctttggtgtgtt 1910386  T
Q  98 ttttg-aactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattagatcaaaggaga 196  Q
    ||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||| |||| | ||||| || |||| |||   ||    
T  1910385 ttttttaactgagcggagtactctatttatatagagattctgtaactgttttagcaaaaattgcgacaacagttactataatggataagattaaaatgga 1910286  T
Q  197 acttatacattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaaggaatagatccacaaaagtggaggaaacaaactcattgaattttgaatgaatta 296  Q
      |||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||| || | |||||||||||| ||||||| ||||| |||| | ||||||||||  |    
T  1910285 gtttatccattaatcagttcaacaacacttgtggatatgatcaaaagaaacaaatccacaaaagttgaggaaataaact-attgga-tttgaatgaagga 1910188  T
Q  297 aagataagaaattcaattgaattcttattcttat 330  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1910187 aatataagaaattcaattaaattcttattcttat 1910154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Original strand, 33417096 - 33417371
Alignment:
Q  1 aaaaaggagatgaagagaagaatagctcgtcaacacaagttgt---agagagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgat 97  Q
    ||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||      || ||||||| |||||||||||  ||| ||||||| |||||||||| ||||| |    
T  33417096 aaaaatgagatgaagagaagaaagactcgtcaacacaagtcaagaaagggagaagagagaaagagttcccgacaactcaat-gaaactctttagtgtg-t 33417193  T
Q  98 ttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattagatcaaaggagaa 197  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| |||| | | |||||| |||| |||    |     
T  33417194 ttatgaactaagtggagtcctctatttatatagagattttgtaactgttttagcaaaaattgcaacaacagttactctcatgaataagattaaaatgaag 33417293  T
Q  198 cttatacattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaaggaatagatccacaaaagtggaggaaacaaact 275  Q
     |||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||    
T  33417294 tttatccattaatcagttcaacaacacttgtggatagaatcaaaagaaacaaatccacaatagtggaggaaacaaact 33417371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 329
Target Start/End: Original strand, 17020917 - 17021244
Alignment:
Q  1 aaaaaggagatgaagagaagaatagctcgtcaacacaagttgtaga---gagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgat 97  Q
    ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||   | |   ||||||| ||||||||||   ||| ||| ||| |||||||||||||||| |    
T  17020917 aaaaaggagatgaagagaagaaagaatcgtcaacacaagtcaaaaaagggagaagagagaaagagtttccgacaacttaat-gaaactctttggtgtgtt 17021015  T
Q  98 ttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattagatcaaaggagaa 197  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||   |||  |||| | ||||| || |||| |||  |||     
T  17021016 tcttgaactgagtggagtcctctatttatacagagattttgtaactgttttagcaaaaattgcgacaatagttactctaatggataagattaaaatagag 17021115  T
Q  198 cttatacattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaaggaatagatccacaaaagtggaggaaacaaactcattgaattttgaatgaattaa 297  Q
     |||| |||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||| || | ||||| |||| |||||||||| ||||  | ||  ||||||||||  ||    
T  17021116 tttatccattaatcaattcaacaacacttgtggataggatcaaaagaaacaaatccataaaaatggaggaaac-aacttttgga--tttgaatgaaggaa 17021212  T
Q  298 agataagaaattcaattgaattcttattctta 329  Q
    | |||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  17021213 atataagaaatttaattaaattcttattctta 17021244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 329
Target Start/End: Original strand, 17551354 - 17551681
Alignment:
Q  1 aaaaaggagatgaagagaagaatagctcgtcaacacaagttgtaga---gagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgat 97  Q
    ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||   | |   ||||||| ||||||||||   ||| ||| ||| |||||||||||||||| |    
T  17551354 aaaaaggagatgaagagaagaaagaatcgtcaacacaagtcaaaaaagggagaagagagaaagagtttccgacaacttaat-gaaactctttggtgtgtt 17551452  T
Q  98 ttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattagatcaaaggagaa 197  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||   |||  |||| | ||||| || |||| |||  |||     
T  17551453 tcttgaactgagtggagtcctctatttatacagagattttgtaactgttttagcaaaaattgcgacaatagttactctaatggataagattaaaatagag 17551552  T
Q  198 cttatacattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaaggaatagatccacaaaagtggaggaaacaaactcattgaattttgaatgaattaa 297  Q
     |||| |||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||| || | ||||| |||| |||||||||| ||||  | ||  ||||||||||  ||    
T  17551553 tttatccattaatcaattcaacaacacttgtggataggatcaaaagaaacaaatccataaaaatggaggaaac-aacttttgga--tttgaatgaaggaa 17551649  T
Q  298 agataagaaattcaattgaattcttattctta 329  Q
    | |||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  17551650 atataagaaatttaattaaattcttattctta 17551681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Original strand, 1808012 - 1808341
Alignment:
Q  1 aaaaaggagatgaagagaagaatagctcgtcaacacaagttgtaga----gagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtga 96  Q
    |||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||   |||    ||||||| | |||||||||   || ||||||| |||||| |||||||||     
T  1808012 aaaaaggagatgaatagaagaaagactcgtcaacacaagtca-agaaatggagaagagataaagagttcccaacaactcaat-gaaactttttggtgtgt 1808109  T
Q  97 tttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattagatcaaaggaga 196  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   || | |||| | ||||| || ||||||||   ||    
T  1808110 tttttgaactgagtgtagtcttctatttatatagagattttgtaactgttttagcaaaaattgcgacagcagttactctaatggataagatcaaaatgga 1808209  T
Q  197 acttatacattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaaggaatagatccacaaaagtggaggaaacaaactcattgaattttgaatgaatta 296  Q
      |||| |||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||| || | ||||||| |||||||| |||||||||  | ||  ||||||||||  |    
T  1808210 gtttatccattaatcaattcaacaacacttgtggataggatcaaaagaaacaaatccacacaagtggagcaaacaaactattaga--tttgaatgaagga 1808307  T
Q  297 aagataagaaattcaattgaattcttattcttat 330  Q
    || |||| ||||| |||| |||||||||||||||    
T  1808308 aatataaaaaatttaattaaattcttattcttat 1808341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Original strand, 2966197 - 2966353
Alignment:
Q  1 aaaaaggagatgaagagaagaatagctcgtcaacacaagttgtagagagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgatttt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||| ||||||| |||| ||| | | |||||||||||||||||||||||||    
T  2966197 aaaaagaagatgaagagaagaataactcgtcaacacaagctggagggagaagagagaaagaattctcgacaatttaatagaaactctttggtgtgatttt 2966296  T
Q  101 tgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattg 159  Q
    ||||||||||  |||| || ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  2966297 tgaactgagt--agtcttcaatttatatagagattttgtaactgctttagcaaaaattg 2966353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 18875918 - 18875595
Alignment:
Q  1 aaaaaggagatgaagagaagaatagctcgtcaacacaagttgt---agagagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgat 97  Q
    ||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||     |||||||||| |||||||||||  ||| ||||||| |||||||| ||||||| |    
T  18875918 aaaaaggagatgaagagaagaaagattcgtcaacacaagttaagaaagagagaagagagaaagagttcccgacaactcaat-gaaactctatggtgtgtt 18875820  T
Q  98 ttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattagatcaaaggagaa 197  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||   ||   |||| | |||||||| | || |||   ||     
T  18875819 tattgaactgagtggagtcctctatttatatagagattctgtaactgtttta-caaaaattgcgacattagttactctaatgaataaaattaaaatggag 18875721  T
Q  198 cttatacattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaaggaatagatccacaaaagtggaggaaacaaactcattgaattttgaatgaattaa 297  Q
     ||||  ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| || | ||||||    |||||||||||||||| |||| | | ||||||||  ||    
T  18875720 tttatctattaatcagttcaacaacacttgtggataggatcaaaagaaacaaatccac-tttgtggaggaaacaaact-attgga-tatgaatgaaggaa 18875624  T
Q  298 agataagaaattcaattgaattcttattc 326  Q
    | |||||||||| |||| |||||||||||    
T  18875623 atataagaaatttaatttaattcttattc 18875595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 80 - 275
Target Start/End: Original strand, 17026565 - 17026758
Alignment:
Q  80 gaaactctttggtgtgatttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatg 179  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | || |  ||| | |||||    
T  17026565 gaaactctttggtgtgttttttgaattgagtggagtcctctatttatatagagattctgtaattgttttagcaaaaattgcaacagcaattactctaatg 17026664  T
Q  180 aattagatcaaaggagaacttatacattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaaggaatagatccacaaaagtggaggaaacaaact 275  Q
     || |||| |||   ||  |||| |||||| |||||||| ||||||| | |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17026665 gataagattaaaattgagtttatccattaatcagttcaacaacacttgt-gata-gatcaaaagaaataaatccacaaaagtggaggaaacaaact 17026758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 80 - 275
Target Start/End: Original strand, 17557057 - 17557250
Alignment:
Q  80 gaaactctttggtgtgatttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatg 179  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | || |  ||| | |||||    
T  17557057 gaaactctttggtgtgttttttgaattgagtggagtcctctatttatatagagattctgtaattgttttagcaaaaattgcaacagcaattactctaatg 17557156  T
Q  180 aattagatcaaaggagaacttatacattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaaggaatagatccacaaaagtggaggaaacaaact 275  Q
     || |||| |||   ||  |||| |||||| |||||||| ||||||| | |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17557157 gataagattaaaattgagtttatccattaatcagttcaacaacacttgt-gata-gatcaaaagaaataaatccacaaaagtggaggaaacaaact 17557250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 38181772 - 38181612
Alignment:
Q  1 aaaaaggagatgaagagaagaatagctcgtcaacacaagttgt---agagagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgat 97  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||      || ||||||| |||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||| |    
T  38181772 aaaaaggagatgaagagaagaaagactcgtcaacacaagtcaagaaagggagaagagagaaagagttcccgacaactcaat-gaaactctttggtgtgtt 38181674  T
Q  98 ttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattg 159  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  38181673 ttttaaactgagtggagtcctctatttatatagagattttgtaaccgttttagcaaaaattg 38181612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Original strand, 19167213 - 19167373
Alignment:
Q  1 aaaaaggagatgaagagaagaatagctcgtcaacacaagttgt---agagagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgat 97  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||      || ||||||| | |||||||||   || ||||||| |||||||||||||||| |    
T  19167213 aaaaaggagatgaagagaagaaagactcgtcaacacaagtcaagaaagggagaagagataaagagttcccaacaactcaat-gaaactctttggtgtgtt 19167311  T
Q  98 ttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattg 159  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  19167312 ttttgaactgagtggagtcttctatttatatagagattttgtaactgtttcagcaaaaattg 19167373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 2 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 15951081 - 15950839
Alignment:
Q  2 aaaaggagatgaagagaagaatagctcgtcaacacaagttgt---agagagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgatt 98  Q
    ||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||      || ||||||| |||||||||||  ||| ||||||| |||| ||||||||||| ||    
T  15951081 aaaaggagaagaagaaaagaaaggctcgtcaacacaagtcaagaaagggagaagagagaaagagttcccgacaactcaat-gaaattctttggtgtg-tt 15950984  T
Q  99 tttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattagatcaaaggagaac 198  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   || |  ||| | |||||||| |||| |||   ||      
T  15950983 tttgaactaagtggagtcctctttttatatagagattctgtaactgttttagcaaaaattgcgacagcaattactctaatgaataagattaaaatggagt 15950884  T
Q  199 ttatacattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaag 243  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||||    
T  15950883 ttatccattaatcagttcaacaacacttgtggataagatcaaaag 15950839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 121 - 275
Target Start/End: Original strand, 17026828 - 17026981
Alignment:
Q  121 atttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattagatcaaaggagaacttatacattaaacagttcaata 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | || |  ||| | ||||| || |||| |||   ||  |||| |||||| |||||||| |    
T  17026828 atttatatagagattctgtaactgttttagcaaaaattgcaacagcaattactctaatggataagattaaaattgagtttatccattaatcagttcaaca 17026927  T
Q  221 acacttatggataggatcaaaaggaatagatccacaaaagtggaggaaacaaact 275  Q
    |||||| ||||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||    
T  17026928 acacttgtggatag-atcaaaagaaacaaatccacaaaagtggaggaaacaaact 17026981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 121 - 275
Target Start/End: Original strand, 17557320 - 17557473
Alignment:
Q  121 atttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattagatcaaaggagaacttatacattaaacagttcaata 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | || |  ||| | ||||| || |||| |||   ||  |||| |||||| |||||||| |    
T  17557320 atttatatagagattctgtaactgttttagcaaaaattgcaacagcaattactctaatggataagattaaaattgagtttatccattaatcagttcaaca 17557419  T
Q  221 acacttatggataggatcaaaaggaatagatccacaaaagtggaggaaacaaact 275  Q
    |||||| ||||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||    
T  17557420 acacttgtggatag-atcaaaagaaacaaatccacaaaagtggaggaaacaaact 17557473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 55 - 143
Target Start/End: Original strand, 18260461 - 18260548
Alignment:
Q  55 agaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgatttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaact 143  Q
    |||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18260461 agaaagagttctcgacaactcaaca-aaactatttggtgtgatttatgaattgagtggagtcctctatttatatagagattttgtaact 18260548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 26779683 - 26779845
Alignment:
Q  1 aaaaaggagatgaagagaagaatagctcgtcaacacaagttgtagagagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactc--------tttggt 92  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||  | |  ||||||| |||||||||| | ||| ||||||| |||||||        |||  |    
T  26779683 aaaaatgagatgaggagaagaataactcgtcaacacaagccggatggagaagagagaaagagttatcgacaactcaatggaaactcgttttttttttttt 26779782  T
Q  93 gtgatttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaa 156  Q
    |||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  26779783 gtgatttttgaattgagtggagtcc-ctgtttatatagagattttgtaactattttagcaaaaa 26779845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 228 - 331
Target Start/End: Original strand, 2966373 - 2966476
Alignment:
Q  228 tggataggatcaaaaggaatagatccacaaaagtggaggaaacaaactcattgaattttgaatgaattaaagat-aagaaattcaattgaattcttattc 326  Q
    ||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||  |||||| || ||||| | ||||||||||||||    
T  2966373 tggatcggatcaaaagaaacaaatccacaaaagtggaggaaacaaactcattgga-tatgaatgaaggaaagataaaaaaatttagttgaattcttattc 2966471  T
Q  327 ttatt 331  Q
    |||||    
T  2966472 ttatt 2966476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 209 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 38181607 - 38181488
Alignment:
Q  209 aacagttcaataacacttatggataggatcaaaaggaatagatccacaaaagtggaggaaacaaactcattgaattttgaatgaattaaagataagaaat 308  Q
    |||||||| | ||||||| |||||| ||||||||| || | || || ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||  ||| |||||||||    
T  38181607 aacagttcgacaacacttgtggatatgatcaaaagaaacaaatgcataaaagcggaggaaacaaact-attgaa-tttgaataaaggaaatataagaaat 38181510  T
Q  309 tcaattgaattcttattcttat 330  Q
    | |||| |||||||||||||||    
T  38181509 ttaattaaattcttattcttat 38181488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 44925451 - 44925165
Alignment:
Q  1 aaaaaggagatgaagagaagaatagctcgtcaacacaagttgt---agagagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgat 97  Q
    ||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||      || ||||||| ||||||||||   ||| ||||||| ||||||||||| |||  |    
T  44925451 aaaaaggagatgaagagaataaagactcgtcaacacaagtcaagaaagggagaagagagaaagagtttccgacaactcaat-gaaactctttgttgtttt 44925353  T
Q  98 ttttgaactgagtggagtcctctatttatat------agagattgtgtaactgttttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattagatcaaa 191  Q
    || |||||| |||| |||||| |||||||||      ||||||| ||||||||||||||||||||||| | || | |||| | ||||| || |||| |||    
T  44925352 ttgtgaactaagtgaagtcctatatttatatttatatagagattctgtaactgttttagcaaaaattgcaacagcagttactctaatggataagattaaa 44925253  T
Q  192 ggagaacttatacattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaaggaatagatc----cacaaaagtggaggaaacaaact 275  Q
        |  |||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| ||| ||||| || | |||    |||| ||||||||||||||||||    
T  44925252 atgaagtttatccattaatcagttcaacaacacttctggatatgataaaaagaaacaaatccatacacacaagtggaggaaacaaact 44925165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 235 - 330
Target Start/End: Original strand, 19168560 - 19168653
Alignment:
Q  235 gatcaaaaggaatagatccacaaaagtggaggaaacaaactcattgaattttgaatgaattaaagataagaaattcaattgaattcttattcttat 330  Q
    ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||  | ||  ||||||| ||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19168560 gatcaaaagaaacaaatccacaaaagtggaggaaacaaactattaga--tttgaataaaggaaatataagaaattcaattaaattcttattcttat 19168653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 17953454 - 17953398
Alignment:
Q  47 gagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgatttttgaa 104  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17953454 gagaagagagaaagagttctcgacaactcaatag-aactctttggtgtgatttttgaa 17953398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 252 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 24672603 - 24672525
Alignment:
Q  252 ccacaaaagtggaggaaacaaactcattgaattttgaatgaattaaagataagaaattcaattgaattcttattcttat 330  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||   | | ||||||| |||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  24672603 ccacataagtggaggaaacaaactcattgggatataaatgaatgaaagatagaaaactcagttgaattcttattcttat 24672525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 296 - 330
Target Start/End: Original strand, 26779960 - 26779994
Alignment:
Q  296 aaagataagaaattcaattgaattcttattcttat 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26779960 aaagataagaaattcaattgaattcttattcttat 26779994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 266 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 22714267 - 22714204
Alignment:
Q  266 gaaacaaactcattgaattttgaatgaattaaagataagaaattcaattgaattcttattcttat 330  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||  || || |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22714267 gaaacaaactcattgaatat-gaatgaaagaatgacaagaaactcaattgaattcttattcttat 22714204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Original strand, 7002218 - 7002299
Alignment:
Q  1 aaaaaggagatgaagagaagaatagctcgtcaacacaagttgtagagagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaa 82  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| | ||| |||| ||| || || ||||| | |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  7002218 aaaaaggagatgaggagtagaataacacgttaacataagctggagggagaacagagaaagagttctcgacaactcaatagaa 7002299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 120
Target Start/End: Original strand, 17794090 - 17794162
Alignment:
Q  47 gagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgatttttgaactgagtggagtcctct 120  Q
    ||||||| |||||||||||| ||  |||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||    
T  17794090 gagaagagagaaagagttctcgataactcaata-aaattctttggtgtgttttatgaactacgtggagtcctct 17794162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 29)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 10392623 - 10392296
Alignment:
Q  1 aaaaaggagatgaagagaagaatagctcgtcaacacaagttgtagagagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgatttt 100  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10392623 aaaaaagagatgaggagaagaatagctcgtcaacacaagctggagggagaagagagaaagagttctagacaactcaatagaaactctttgatgtgatttt 10392524  T
Q  101 tgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattagatcaaaggagaactt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||   ||||  ||| ||| ||| || ||||||||    |||||    
T  10392523 tgaactgagtggagtcctctatttatatagagattttg-aactgttttggcaaaaattgcggcaacaattactttgatggataagatcaaaatgaaactt 10392425  T
Q  201 atacattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaaggaatagatccacaaaagtggaggaaacaaactcattgaattttgaatgaattaaaga 300  Q
    || |||||| |||||||||||||||| ||||||| || ||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||    
T  10392424 atccattaatcagttcaataacacttgtggatagaattaaaagaaacaaatccacaaaagtggaggaaacaaactcattgga-tttgaatgaaggaaaga 10392326  T
Q  301 taagaaattcaattgaattcttattcttat 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10392325 taagaaattcaattgaattcttattcttat 10392296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 8 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 10387878 - 10387557
Alignment:
Q  8 agatgaagagaagaatagctcgtcaacacaagttgtagagagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgatttttgaactg 107  Q
    |||||| |||||||||| |||| ||||||||| || || ||||||| |||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  10387878 agatgaggagaagaataactcgacaacacaagctggagggagaagagagaaagagttatcgacaactcaatagaaactctttgatgtgatttttgaacta 10387779  T
Q  108 agtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattagatcaaaggagaacttatacatt 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||   |||| |||| | | ||| || ||||||||   |||||||| ||||    
T  10387778 agtggagtcctctatttatatagagattttgtaactattttagcaaaaattgcggcaacagttactctgatggataagatcaaaaaggaacttattcatt 10387679  T
Q  208 aaacagttcaataacacttatggataggatcaaaaggaatagatccacaaaagtggaggaaacaaactcattgaattttgaatgaattaaagataagaaa 307  Q
    |   ||||||| ||||||| |||||||||||||||| || | || |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||  ||||||||||||    
T  10387678 atttagttcaacaacacttgtggataggatcaaaagaaacaaattcacaaaagtggaggaaacaaactcgttgga-tttgaatgaagaaaagataagaaa 10387580  T
Q  308 ttcaattgaattcttattcttat 330  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  10387579 ttcaattgaattcttattcttat 10387557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Original strand, 21671761 - 21672099
Alignment:
Q  1 aaaaaggagatgaagagaagaatagctcgtcaacacaagttgtagagagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgatttt 100  Q
    ||||| |||| || ||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||| ||||| ||||||   | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21671761 aaaaatgagacgaggagaagaatagctcgccaacacaagctggagggagaagagagaaaaagttctcagcaactcaatagaaactctttggtatgatttt 21671860  T
Q  101 tgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattagatcaaaggagaactt 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||| |||||| ||||  || | |||||| | ||||||    
T  21671861 tgaactgagtggagtactctatttatatagagattttgtaactgttttagcaaaaattgcggcaacagttaatctaatagataatatcaaaagggaactt 21671960  T
Q  201 atacattaaacagttcaataacacttatggataggat-caaaaggaatagatccacaaaagtggaggaaacaaactcattgaattttgaatgaattaaag 299  Q
    || |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||  ||||| || | ||||| ||||||| ||| ||| ||||||||| | |||||| |||| |||     
T  21671961 atccattaatcagttcaacaacacttgtggataagataaaaaagaaacaaatccataaaagtgaagggaactaactcattgga-tttgaaggaatgaaat 21672059  T
Q  300 ataagaaattcaattgaattcttattcttattcttatcac 339  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21672060 ataagaaattcaattaaattcttattcttattcttatcac 21672099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Original strand, 3046137 - 3046464
Alignment:
Q  1 aaaaaggagatgaagagaagaatagctcgtcaacacaagttgtagagagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgatttt 100  Q
    |||||||||||||  |||||||||| || |||||||||| || || ||||||| |||||||||| | | | |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  3046137 aaaaaggagatgagaagaagaatagttcatcaacacaagctgaagggagaagagagaaagagttatcgccaactcaatagaaactttttggtgtaatttt 3046236  T
Q  101 tgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattagatcaaaggagaactt 200  Q
    |||||||||| || || |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    ||| |||| ||||||| || |||||||| | ||||||    
T  3046237 tgaactgagtagaatcatctattgatatagagatt-tgtaactgttttagcaaaaattg-cggaacagttactttaatggataagatcaaaagggaactt 3046334  T
Q  201 atacattaaacagttcaataacacttatggatagga-tcaaaaggaatagatccacaaaagtggaggaaacaaactcattgaattttgaatgaattaaag 299  Q
    || ||||||  ||||||| ||||||| ||||||  | | ||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||  ||||    
T  3046335 atccattaataagttcaacaacacttgtggataatattaaaaataaacaaatccacaaaagtggaggaaacaaactcatt-agatttgaatgaaggaaag 3046433  T
Q  300 ataagaaattcaattgaattcttattcttat 330  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3046434 ataagacattcaattgaattcttattcttat 3046464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 55 - 330
Target Start/End: Original strand, 3880586 - 3880858
Alignment:
Q  55 agaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgatttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaa 154  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  3880586 agaaagagttcccgacaactcaat-gaaactctttggtgtgtttttagaactgagtggagtcctctatttatatagagattttgtaactattttagcaaa 3880684  T
Q  155 aattgaatcaacggttaatttaatgaattagatcaaaggagaacttatacattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaaggaatagatcca 254  Q
    |||||   || | |||| | ||||| ||  |||||||   ||| |||| |||||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||| || | |||||    
T  3880685 aattgcgacagcagttactctaatggatacgatcaaaatggaatttatccattaatcagttcaacaacacctgtggataggatcaaaagaaacaaatcca 3880784  T
Q  255 caaaagtggaggaaacaaactcattgaattttgaatgaattaaagataagaaattcaattgaattcttattcttat 330  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  3880785 caaaagtggaggaaacaaact-attgaa-tttgaatgaatgaaatataagaaattcaattaaattattattcttat 3880858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 47 - 330
Target Start/End: Original strand, 27238765 - 27239045
Alignment:
Q  47 gagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgatttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgtt 146  Q
    ||||||| |||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27238765 gagaagagagaaagagttcccgacaactcaat-gaaactctttggtgtgtttattgaactgagtggagtcctctatttatatagagattttgtaactgtt 27238863  T
Q  147 ttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattagatcaaaggagaacttatacattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaaggaa 246  Q
    ||||||||||||| |  | | |||| ||||||| || |||| |||   ||  |||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| || |||| | ||    
T  27238864 ttagcaaaaattgcaatagcagttagtttaatggataagattaaaattgagtttatccattaatcagttcaacaacacttgtggatatgaccaaacgaaa 27238963  T
Q  247 tagatccacaaaagtggaggaaacaaactcattgaattttgaatgaattaaagataagaaattcaattgaattcttattcttat 330  Q
     | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  27238964 caaatccacaaaagtggaggaaacaaact-attgaa-tttgaatgaatgaaatataagaaattcaattaaattcttattgttat 27239045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 42626118 - 42625789
Alignment:
Q  1 aaaaaggagatgaagagaagaatagctcgtcaacacaagttgt---agagagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgat 97  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||      || ||||||| |||||||||||  ||| ||||||| ||||||| ||||||| ||    
T  42626118 aaaaaggagatgaagagaagaaagactcgtcaacacaagtcaagaaagggagaagagagaaagagttcccgacaactcaat-gaaactcattggtgtaat 42626020  T
Q  98 ttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattagatcaaaggagaa 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||| |||| | ||||  || |||| |||   ||     
T  42626019 ttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattatgtaactgttttagcaaaaattgcgacaactgttattctaatagataagattaaaattgag 42625920  T
Q  198 cttatacattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaaggaatagatccacaaaagtggaggaaacaaactcattgaattttgaatgaattaa 297  Q
     |||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||| | | | ||||||  ||    
T  42625919 tttatccattaatcagtttaacaacacttatggataggatcaaaagaaataaatccacacaagtggaggaaataaact-attgga-tgtaaatgaaggaa 42625822  T
Q  298 agataagaaattcaattgaattcttattcttat 330  Q
    | |||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  42625821 atataagaaatttaattaaattcttattcttat 42625789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Original strand, 12799952 - 12800281
Alignment:
Q  1 aaaaaggagatgaagagaagaatagctcgtcaacacaagttgt---agagagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgat 97  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||      || ||||||| ||||||||||   ||| ||||||| |||||||||||||||| |    
T  12799952 aaaaaggagatgaagagaagaaagactcgtcaacacaagtcaagaaagggagaagagagaaagagtttccgacaactcaat-gaaactctttggtgtgtt 12800050  T
Q  98 ttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattagatcaaaggagaa 197  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | |||| |||| | ||||| || ||||||||   ||     
T  12800051 ttttgaactaagtgaagtcctctatttatatagtgattctgtaactgttttagcaaaaattgga-caacagttactctaatggataagatcaaaatggag 12800149  T
Q  198 cttatacattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaaggaatagatccacaaaagtggaggaaacaaactcattgaattttgaatgaattaa 297  Q
     |||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||||||||  | ||  ||||||||||  ||    
T  12800150 tttatccattaatcagttcaacaacacttgtggataggatcaaaagaaacaaatccacaaaagtgaaggaaacaaactattaga--tttgaatgaaggaa 12800247  T
Q  298 agataagaaattcaattgaattcttattcttatt 331  Q
    |  |||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  12800248 atttaagaaattcaataaaattcttattcttatt 12800281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Original strand, 4930787 - 4931064
Alignment:
Q  1 aaaaaggagatgaagagaagaatagctcgtcaacacaagttgt---agagagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgat 97  Q
    ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||      || ||||||| |||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||| |    
T  4930787 aaaaaggagatgaagagaagaaagattcgtcaacacaagtcaagaaagggagaagagagaaagagttcccgacaactcaat-gaaactctttggtgtgtt 4930885  T
Q  98 ttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattagatcaaa--ggag 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||  ||| | ||||| || |||| |||  ||||    
T  4930886 ttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattctgtaactgttttagcaaaaattgcgacaacaattactctaatggataagattaaaatggag 4930985  T
Q  196 aacttatacattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaaggaatagatccacaaaagtggaggaaacaaact 275  Q
       |||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||||||||| ||||||||    
T  4930986 -ttttatccattaatcagttcaacaacacttgtggataggatcaaaagaaacaaatccacaaaagtggaggtaacaaact 4931064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 47 - 330
Target Start/End: Original strand, 2595439 - 2595716
Alignment:
Q  47 gagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgatttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgtt 146  Q
    ||||||| |||||| ||||  ||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| || |||||||    
T  2595439 gagaagagagaaagggttcccgacaactcaat-gaaactctttcgtgtgttttttgaactgagtggagtcctctatt--tatagagattttgcaactgtt 2595535  T
Q  147 ttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattagatcaaaggagaacttatacattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaaggaa 246  Q
    |||||||||||||   || | |||| ||||||| || |||| |||    |  |||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||    
T  2595536 ttagcaaaaattgtgacagcagttactttaatggataagattaaaatgcagtttatccattaatcagttcaacaacacttgtggataggatcaaaagaaa 2595635  T
Q  247 tagatccacaaaagtggaggaaacaaactcattgaattttgaatgaattaaagataagaaattcaattgaattcttattcttat 330  Q
     | ||||||||||||||||||||| ||||  | ||  ||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  2595636 caaatccacaaaagtggaggaaac-aactattaga--tttgaatgaagaaaatataagaaattcaattaaattctttttcttat 2595716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Original strand, 8268861 - 8269190
Alignment:
Q  1 aaaaaggagatgaagagaagaatagctcgtcaacacaagttgt---agagagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgat 97  Q
    ||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||      || ||||||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  8268861 aaaaatgagatgaagagaagaaagactcgtcaacacaagtcaacaaagggagaagagagaaagagttctcgacaactcaat-gaaactctttggtgtaat 8268959  T
Q  98 ttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattagatcaaaggagaa 197  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||   |    |||| | ||||| || |||| |||   ||     
T  8268960 ttttgaaccgagtagagtcctctatttatttagagattttataactgttttagcaaaaattgcgacggaagttactctaatggataagattaaaatggag 8269059  T
Q  198 cttatacattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaaggaatagatccacaaaagtggaggaaacaaactcattgaattttgaatgaattaa 297  Q
     |||| |||||| |||||||| ||||||| || || |||||||||| ||    ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  ||    
T  8269060 tttatccattaatcagttcaacaacacttgtgaattggatcaaaagaaacgattccacaaaagtggaggaaacaaact-attgga-tttgaatgaaggaa 8269157  T
Q  298 agataagaaattcaattgaattcttattcttat 330  Q
    | |||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  8269158 atataagaaatttaattaaattcttatccttat 8269190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 3285067 - 3285294
Alignment:
Q  1 aaaaaggagatgaagagaagaatagctcgtcaacacaagttgtagagagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgatttt 100  Q
    |||||||||| |  ||||||||||  ||||||||||||| || || ||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3285067 aaaaaggagacggggagaagaataattcgtcaacacaagctggagggagaagagagaaagagttctccacaactcaatagaaactctttggtatgatttt 3285166  T
Q  101 tgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattagatcaaaggagaactt 200  Q
    | ||||||||||||||||||||     |||||||| ||||||| ||||||||||||| |   |||| ||||   ||||| || |||||||| | ||||||    
T  3285167 taaactgagtggagtcctctat-----tagagattttgtaactattttagcaaaaatcgcggcaacagttacactaatggataagatcaaaagggaactt 3285261  T
Q  201 atacattaaacagttcaataacacttatggata 233  Q
    || |||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  3285262 atccattaatcagttcaacaacacttaaggata 3285294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 184 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 12182113 - 12181958
Alignment:
Q  184 agatcaaaggagaacttatacattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaa--ggaatagatccacaaaagtggaggaaacaaactcattga 281  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| ||| ||||  | || | |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12182113 agatcaaaagagaacttatccattaatcagttcaacaacacttgtggataagataaaaaaagaaacaaatccacaaaagtggaggaaacaaactcattgg 12182014  T
Q  282 attttgaatgaattaaagataagaaattcaattgaattcttattcttattcttatcac 339  Q
    |||| ||| |||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12182013 attt-gaacgaaggaaatataagaa-ttcaattgaattcttattcttattcttatcac 12181958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 97 - 275
Target Start/End: Original strand, 26341870 - 26342048
Alignment:
Q  97 tttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattagatcaaaggaga 196  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||   |||| |||| | ||||| || |||| |||    |    
T  26341870 tttttgaactaagtgaagtcctctatttatatagagattctgtaactgttttcgcaaaaattgcgacaacagttactctaatggataagattaaaatgaa 26341969  T
Q  197 acttatacattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaaggaatagatccacaaaagtggaggaaacaaact 275  Q
      ||||  ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||    
T  26341970 gtttatctattaatcagttcaacaacacttgtggataggatcaaaagaaacaaatccacaaaagtggaggaaacaaact 26342048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 8 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 26286665 - 26286567
Alignment:
Q  8 agatgaagagaagaatagctcgtcaacacaagttgtagagagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgatttttgaact 106  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||| || || ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26286665 agatgaggagaagaataactcgtcaacacaagctggagggagaagagagaaagagttctcgacaactcaatagaaactctttggtgtgatttttgaact 26286567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Original strand, 16372964 - 16373107
Alignment:
Q  1 aaaaaggagatgaagagaagaatagctcgtcaacacaagttgtagagagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgatttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || |||||||  ||    ||| ||| |||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16372964 aaaaaggagatgaagagaagaataacttgttaacacaaactg----gaggagagagaaagagtttttgataactcaatagaa-ctctttggtgtgatttt 16373058  T
Q  101 tgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgtttta 149  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  16373059 tgaattgagtggagtcctttatttatatagtaattttgtaactgtttta 16373107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 229 - 330
Target Start/End: Original strand, 12256812 - 12256912
Alignment:
Q  229 ggataggatcaaaaggaatagatccacaaaagtggaggaaacaaactcattgaattttgaatgaattaaagataagaaattcaattgaattcttattctt 328  Q
    ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12256812 ggataggatcaaaagaaacaaatccacaaaagtggaggaaacaaactcattgga-tttgaatgaaggaaaaataagaaattcaattgaattcctattctt 12256910  T
Q  329 at 330  Q
    ||    
T  12256911 at 12256912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 25 - 141
Target Start/End: Original strand, 15973344 - 15973459
Alignment:
Q  25 gctcgtcaacacaagttgtagagagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgatttttgaactgagtggagtcctctattt 124  Q
    |||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||| | ||||     
T  15973344 gctcgttaacacaagttgaagggagaagatagaaagagttctcgacaacctaatagaa-ctctttcatgtgctttttgaactgagtggagtcatttattc 15973442  T
Q  125 atatagagattgtgtaa 141  Q
    ||||||||||| |||||    
T  15973443 atatagagattttgtaa 15973459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 44509829 - 44509767
Alignment:
Q  97 tttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattg 159  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||    
T  44509829 tttttgaactaagtggaatcctctatttatatagaaattttttaactgttttagcaaaaattg 44509767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 13313813 - 13313710
Alignment:
Q  1 aaaaaggagatgaagagaagaatagctcgtcaacacaagttgtagagagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgatttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |  || ||||||| |||||||||||   || |||||||| |||||||||||||| |||||    
T  13313813 aaaaaggagatgaagagaagaaagactcgtcaacacaag-tcaagggagaagagagaaagagttccctacaactcaata-aaactctttggtgtaatttt 13313716  T
Q  101 tgaact 106  Q
    ||||||    
T  13313715 tgaact 13313710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 95
Target Start/End: Original strand, 9008708 - 9008794
Alignment:
Q  8 agatgaagagaagaatagctcgtcaacacaagttgtagagagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| | || || |||||||  ||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  9008708 agatgaagagaagaatagctcgttaacacaggctggagggagaagaaggaaagagttctcgacaactaaatag-aactctttggtgtg 9008794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Original strand, 15642812 - 15642954
Alignment:
Q  1 aaaaaggagatgaagagaagaatagctcgtcaacacaagttgtagagagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgatttt 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||| | || ||| |||  || |  ||||| | |||| || |||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||    
T  15642812 aaaaaggagatgaggataagaatagattgttaacccaaactggatggagaatagagaatgatttcttgacaactcaatagaaa-tatttggtgttatttt 15642910  T
Q  101 tgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactg 144  Q
    | || ||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  15642911 tcaattgagtggaaccctctatttatatagagattttgttactg 15642954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Original strand, 30258668 - 30258775
Alignment:
Q  1 aaaaaggagatgaagagaagaatagctcgtcaacacaagttgt---agagagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgat 97  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||      || ||||||| | ||||||| | |||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  30258668 aaaaaggagatgaagagaagaaagactcgtcaacacaagtcaagaaagggagaagagaaaaagagtgcctgacaactcaat-gaaactctttggtgtgat 30258766  T
Q  98 ttttgaact 106  Q
    |||||||||    
T  30258767 ttttgaact 30258775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 15 - 144
Target Start/End: Original strand, 23319498 - 23319628
Alignment:
Q  15 gagaagaatagctcgtcaacacaagttgtagagagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtga--tttttgaactgagtgg 112  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| |  || || |||| ||||| | || | ||| ||||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||    
T  23319498 gagaagaatagctcatcaagacaagctaaagggaaaagagagaaataattatcgacaactcaat-gaaactctttggtgtgaaatttttgaattgagtgg 23319596  T
Q  113 agtcctctatttatatagagattgtgtaactg 144  Q
    || | ||||||||||| ||| || ||||||||    
T  23319597 agacttctatttatattgaggttttgtaactg 23319628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 256 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 23248018 - 23247946
Alignment:
Q  256 aaaagtggaggaaacaaactcattgaattttgaatgaattaaagataagaaattcaattgaattcttattcttat 330  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  23248018 aaaagtggaggaaacaaact-attgaa-tttgaacgaatgaaatataaaaaattcaattaaatttttattcttat 23247946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 250 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 27246831 - 27246752
Alignment:
Q  250 atccacaaaagtggaggaaacaaactcattgaattttgaatgaattaaagataagaaattcaattgaattcttattcttat 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||  ||||||| |||||||  || |||||||||| ||||    
T  27246831 atccacaaaagtggaggaaacaaacttattgga-tatgaatgaaagaaagataggaaattcgcttaaattcttatttttat 27246752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 57 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 6590494 - 6590400
Alignment:
Q  57 aaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgattttt-gaactgagtggagtcc-tctatttatatagagattgtgtaactgttttag 150  Q
    |||||||||| ||| |||||||| ||  ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| | || ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  6590494 aaagagttctcgacaactcaatataat-tctttggtgtgtttttttgaactgaggggagtccctataattatatagagattttgtaactattttag 6590400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 10532383 - 10532290
Alignment:
Q  1 aaaaaggagatgaagagaagaatagctcgtcaacacaagttgtagagagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtg 95  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||||  | || ||||||| ||||||||||||  |  ||||||| | ||||||||||||||    
T  10532383 aaaaaagagatgaagagaagaataactcattaacacaagccggagggagaagagagaaagagttctcaaaaactcaattg-aactctttggtgtg 10532290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 250 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 6590298 - 6590219
Alignment:
Q  250 atccacaaaagtggaggaaacaaactcattgaattttgaatgaattaaagataagaaattcaattgaattcttattcttat 330  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||| | | ||||||||  |||||||  ||||||| || |||| ||||||||||    
T  6590298 atccacaaaaggggaggaaacaaattcattgga-tatgaatgaaagaaagatagaaaattcagttaaatttttattcttat 6590219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 133; Significance: 4e-69; HSPs: 21)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 40847118 - 40846788
Alignment:
Q  1 aaaaaggagatgaagagaagaatagctcgtcaacacaagttgtagagagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgatttt 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| || |  ||||||| ||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  40847118 aaaaaggagatgaggagaagaatagctcgtcagcagaagctggatggagaagagagaaagaattctcgacaactcaatataaactcttttgtgtgatttt 40847019  T
Q  101 tgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattagatcaaaggagaactt 200  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||   |||| |||| | ||||| ||   |||||| |  || ||    
T  40847018 tgaaccgagtggagtcctctgtttatatagaaattttgtaattattttagcaaaaattgcggcaacagttattctaatggatagtatcaaaaggaaattt 40846919  T
Q  201 atacattaaacagttcaataacacttatggataggat--caaaaggaatagatccacaaaagtggaggaaacaaactcattgaattttgaatgaattaaa 298  Q
    || |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||   ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||    
T  40846918 attcattaatcagttcaacaacacttgtggataagataaaaaaagaaacaaatccacaaaagtggaggaaacaaactcatt-aaatttgaatgaaggaaa 40846820  T
Q  299 gataagaaattcaattgaattcttattcttat 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40846819 gataagaaattcaattgaattcttattcttat 40846788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Original strand, 30651483 - 30651755
Alignment:
Q  1 aaaaaggagatgaagagaagaatagctcgtcaacacaagttgtagagagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgatttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||   || ||||||| |||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  30651483 aaaaaggagatgaagagaagaaagactcgtcaacacaagtca-agggagaagagagaaagagttcccgacaactcaata-aaactctttggtgtgttttt 30651580  T
Q  101 tgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattagatcaaaggagaactt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||| |||| | || || || |||| |||    |  ||    
T  30651581 tgaactgagtggagtcctctatttatatagagattctgtaactgttttagcaaaaattgtgacaacagttactctagtggataagattaaaatgaagttt 30651680  T
Q  201 atacattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaaggaatagatccacaaaagtggaggaaacaaact 275  Q
    || |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||    
T  30651681 atccattaatcagttcaacaacacttgtggataggatcaaaagaaacaaatccacaaaagtggaggaaacaaact 30651755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 25477824 - 25477495
Alignment:
Q  1 aaaaaggagatgaagagaagaatagctcgtcaacacaagttgt---agagagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgat 97  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||      |||||||||| ||||| || ||  ||| ||||||| |||||||||||||||| |    
T  25477824 aaaaaggagatgaagagaagaaagactcgtcaacacaagtcaagaaagagagaagagagaaatagctcccgacaactcaat-gaaactctttggtgtgtt 25477726  T
Q  98 ttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattagatcaaaggagaa 197  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   || | |||| | ||||| || |||| |||    |     
T  25477725 ttttgaattgagtggagtcctctatttatatagagattctgtaactgttttagcaaaaattgcgacagcagttactctaatggataagattaaaatgaag 25477626  T
Q  198 cttatacattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaaggaatagatccacaaaagtggaggaaacaaactcattgaattttgaatgaattaa 297  Q
     |||| |||||| |||||||| ||||||| | |||||||||||||| || | ||||||| |||| ||||||||||||| |||| | ||||||||||  ||    
T  25477625 tttattcattaatcagttcaacaacacttgtagataggatcaaaagaaacaaatccacacaagtagaggaaacaaact-attgga-tttgaatgaaggaa 25477528  T
Q  298 agataagaaattcaattgaattcttattcttat 330  Q
    | |||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  25477527 atataagaaatttaattaaattcttattcttat 25477495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 1934523 - 1934246
Alignment:
Q  1 aaaaaggagatgaagagaagaatagctcgtcaacacaagttgt---agagagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgat 97  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||      || ||||||| |||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||| |    
T  1934523 aaaaaggagatgaagagaagaaagactcgtcaacacaagtcaagaaagggagaagagagaaagagttcccgacaactcaat-gaaactctttggtgtgtt 1934425  T
Q  98 tttt-gaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattagatcaaaggaga 196  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||| |||| | || || || |||| |||    |    
T  1934424 tttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattctgtaactgttttagcaaaaattgcgacaacagttactctagtggataagattaaaatgaa 1934325  T
Q  197 acttatacattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaaggaatagatccacaaaagtggaggaaacaaact 275  Q
      |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||    
T  1934324 gtttatccattaatcagttcaacaacacttatggataggatcaaaagaaacaaatccacaaaagtggaggaaccaaact 1934246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 9184947 - 9184673
Alignment:
Q  1 aaaaaggagatgaagagaagaatagctcgtcaacacaagttgt---agagagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgat 97  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||      || ||||||| |||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||| |    
T  9184947 aaaaaggagatgaagagaagaaaggctcgtcaacacaagtcaagaaagggagaagagagaaagagttcccgacaactcaat-gaaactctttggtgtg-t 9184850  T
Q  98 ttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattagatcaaaggagaa 197  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||  ||| | ||||| || |||| |||   ||     
T  9184849 ttttgaacttagtggagtcctctatttatatagagattctgtaactgttttagcaaaaattgcgacaacaattactctaatggataagattaaaatggag 9184750  T
Q  198 cttatacattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaaggaatagatccacaaaagtggaggaaacaaact 275  Q
     |||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||| || | |||||||||| |||||||||||||||    
T  9184749 tttatccattaataagttcaacaacacttgtggataggatcaaaagaaacaaatccacaaaa-tggaggaaacaaact 9184673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 9180256 - 9179982
Alignment:
Q  1 aaaaaggagatgaagagaagaatagctcgtcaacacaagttgt---agagagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgat 97  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||      || ||||||| |||||||||||  |||  |||||| |||||||||||||||| |    
T  9180256 aaaaaggagatgaagagaagaaagactcgtcaacacaagtcaagaaagggagaagagagaaagagttcccgacatctcaat-gaaactctttggtgtg-t 9180159  T
Q  98 ttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattagatcaaaggagaa 197  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||  ||| | ||||| || |||| |||   ||     
T  9180158 ttttgaacttagtggagtcctctatttatatagagattctgtaactgttttagcaaaaattgcgacaacaattactctaatggataagattaaaatggag 9180059  T
Q  198 cttatacattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaaggaatagatccacaaaagtggaggaaacaaact 275  Q
     |||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||| || | |||||||||| |||||||||||||||    
T  9180058 tttatccattaataagttcaacaacacttgtggataggatcaaaagaaacaaatccacaaaa-tggaggaaacaaact 9179982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 96 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 17968396 - 17968217
Alignment:
Q  96 atttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattagatcaaaggag 195  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||   |||| |||| | ||||| || |||| |||  ||    
T  17968396 atttttgaactaagtggagtcctctatttatatagagattctgtaactgttttaccaaaaattgcgacaacagttactctaatggataagattaaaatag 17968297  T
Q  196 aacttatacattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaaggaatagatccacaaaagtggaggaaacaaact 275  Q
    |  |||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  17968296 agtttatccattaatcagttcaacaacacttgtggataggatcaaaaggaacaaatccacaaaagtggaggaaacaaact 17968217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 72 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 24537478 - 24537226
Alignment:
Q  72 actcaatagaaactctttggtgtgatttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattgaatcaacggtta 171  Q
    ||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||| | ||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||||||||   |||| ||||    
T  24537478 actcaatagaa-ctctttggtgtactttttgaattgattagagtcctctctatatatagagcttttgtaactgttttagcaaaaattgcgccaacagtta 24537380  T
Q  172 atttaatgaattagatcaaaggagaacttatacattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaaggaatagatccacaaaagtggaggaaaca 271  Q
     | ||||| || |||||||| ||||| |||| |||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||| || || | |||||||||||               
T  24537379 ctctaatggataagatcaaaagagaatttatccattaatcagttcaaaaacacttgtagataggatcaagagaaacaaatccacaaaag----------- 24537291  T
Q  272 aactcattgaattttgaatgaattaaagataagaaattcaattgaattcttattcttattcttatcac 339  Q
       |||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  24537290 ---tcattggattttgaatgaaggaaagataagaaattcaattgaaatcttattcatattcttatcac 24537226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Original strand, 12797492 - 12797819
Alignment:
Q  1 aaaaaggagatgaagagaagaatagctcgtcaacacaagttgt---agagagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgat 97  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||      || ||||||| | ||||||||   ||| ||||||| |||||||||||||||  |    
T  12797492 aaaaaggagatgaagagaagaaagactcgtcaacacaagtcaagaaagggagaagagataaagagtttccgacaactcaat-gaaactctttggtgt--t 12797588  T
Q  98 ttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattagatcaaaggagaa 197  Q
    |||| || |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||   |||| ||   | ||||| || |||| |||   ||     
T  12797589 ttttaaattgagtgcagtcctctatttatatagagaatttgtaactgttttagcgaaaattgcgacaacagtcgctctaatggataagattaaaatggag 12797688  T
Q  198 cttatacattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaaggaatagatccacaaaagtggaggaaacaaactcattgaattttgaatgaattaa 297  Q
     |||| |||||| || ||||| ||||||| |||||| ||||||||| || | ||||||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||||||  ||    
T  12797689 tttatccattaatcatttcaacaacacttgtggatatgatcaaaagaaacaaatccacaaaagcggaggaaacaaact-attgga-tttgaatgaaggaa 12797786  T
Q  298 agataagaaattcaattgaattcttattcttat 330  Q
    | |||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  12797787 atataagaaatttaattaaattcttattcttat 12797819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 100 - 330
Target Start/End: Original strand, 12360914 - 12361142
Alignment:
Q  100 ttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattagatcaaaggagaact 199  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |  | |||| | ||||| || | || |||    |  |    
T  12360914 ttgaactaagtggagtcctctatttatatagagattctgtaactgttttagcaaaaattgcgacggcagttactctaatggataaaattaaaatgaagtt 12361013  T
Q  200 tatacattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaaggaatagatccacaaaagtggaggaaacaaactcattgaattttgaatgaattaaag 299  Q
    ||| |||||| |||||||| ||||||| | |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||     
T  12361014 tatccattaatcagttcaacaacacttgttgataggatcaaaagaaacaaatccacaaaagtggaggaaacaaact-attgga-tttgaatgaaggaaat 12361111  T
Q  300 ataagaaattcaattgaattcttattcttat 330  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  12361112 ataagaaatttaattaaattcttattcttat 12361142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Original strand, 19896595 - 19896912
Alignment:
Q  1 aaaaaggagatgaagagaagaatagctcgtcaacacaagttgtagagagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgatttt 100  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||       || |||   ||| |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  19896595 aaaaatgagatgaggagaagaatagctcgtcaagacaagctgaagagagaa-------agtgtttccgacaactcaatagaaactttttggtgtaatttt 19896687  T
Q  101 tgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattagatcaaaggagaactt 200  Q
    |||        |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||   ||   |||| | ||| | || |||||||| | ||||||    
T  19896688 tga--------gagtcctctatttatatagagattttgtaattgttttaacaaaaattgcggcaggagttagtctaacggataagatcaaaagggaactt 19896779  T
Q  201 atacattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaaggaataga----tccacaaaagtggaggaaacaaactcattgaattttgaatgaatta 296  Q
    || ||| || |||||||||||||||| |||||  ||| | ||  || | |    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  19896780 atccataaatcagttcaataacacttgtggatgagataagaaaaaaaaaacgaatccacaaaagtgaaggaaacaaactcattgaa-tttgaatgaatga 19896878  T
Q  297 aagataagaaattcaattgaattcttattcttat 330  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  19896879 aatataagaaattcaattgaatttttatttttat 19896912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 97 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 19891912 - 19891734
Alignment:
Q  97 tttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattagatcaaaggaga 196  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||   |||  |||  | ||||| || |||| |||   ||    
T  19891912 tttttgaactaagtggagtcctctatttatatagagattctgtaactattttagcaaaaattgcgacaatagtttctctaatggataagattaaaatgga 19891813  T
Q  197 acttatacattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaaggaatagatccacaaaagtggaggaaacaaact 275  Q
      |||| |||| |  ||||||| ||||||| ||||||  |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  19891812 ctttatccattgattagttcaacaacacttgtggataaaatcaaaagaaacaaatctacaaaagtggaggaaacaaact 19891734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 97 - 275
Target Start/End: Original strand, 18345074 - 18345248
Alignment:
Q  97 tttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattagatcaaaggaga 196  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||| || | | ||||| || |||| |||   ||    
T  18345074 tttttgaactaagtggggtcctctatttatatagagattctgtaactgttttagcaaaaattgcgacaacagtcactctaatggataagattaaaatgga 18345173  T
Q  197 acttatacattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaaggaatagatccacaaaagtggaggaaacaaact 275  Q
      |||| |||||  |||||||| ||||||| || ||||||||||||| || | ||||    ||||||||||||||||||    
T  18345174 gtttatccattagtcagttcaacaacacttgtgaataggatcaaaagaaacaaatcc----aagtggaggaaacaaact 18345248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Original strand, 29678323 - 29678483
Alignment:
Q  1 aaaaaggagatgaagagaagaatagctcgtcaacacaagttgt---agagagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgat 97  Q
    ||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||      || ||||||| |||||||||||  ||| ||||||| |||| |||||| |||| |    
T  29678323 aaaaatgagatgaagagaagaaagactcgtcaacacaagtcaagaaagggagaagagagaaagagttcc-gacaactcaat-gaaattctttgatgtgtt 29678420  T
Q  98 ttttgaa-ctgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattg 159  Q
    |||| || || |||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  29678421 tttttaaactaagtggagtcctcaatttatatagagagtctgtaactgttttagcaaaaattg 29678483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 199 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 17974682 - 17974606
Alignment:
Q  199 ttatacattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaaggaatagatccacaaaagtggaggaaacaaact 275  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| || | || |||||||||||||||||||||||    
T  17974682 ttatccattaatcagttcaacaacacttgtggataggatcaaaagaaacaaattcacaaaagtggaggaaacaaact 17974606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 215 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 25496703 - 25496590
Alignment:
Q  215 tcaataacacttatggataggatcaaaaggaatagatccacaaaagtggaggaaacaaactcattgaattttgaatgaattaaagataagaaattcaatt 314  Q
    |||| ||||||| | |||||||||||||| || | ||||||| |||| ||||||||||||| |||| | ||||||||||  ||| |||||||||| ||||    
T  25496703 tcaacaacacttgtagataggatcaaaagaaacaaatccacacaagtcgaggaaacaaact-attgga-tttgaatgaaggaaatataagaaatttaatt 25496606  T
Q  315 gaattcttattcttat 330  Q
     |||||||||||||||    
T  25496605 aaattcttattcttat 25496590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 92 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 34495536 - 34495308
Alignment:
Q  92 tgtgatttttgaactgagtggagtcctctatttatatagag--attgtgtaactgttttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattagatca 189  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||  ||||||   ||||  ||| | ||||| || ||||||    
T  34495536 tgtgatttttgaatcgagtggagtcctctatttatatagagatattttgtaactgttttagctgaaattgcgacaacaattactctaatggataagatca 34495437  T
Q  190 aaggagaacttatacattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaaggaatagatccacaaaagtggaggaaacaaactcattgaattttgaa 289  Q
    || |  ||||||  || ||| |||||||| ||||||||           ||||  || | ||| |||||||||||| ||||||| | |||||| | ||||    
T  34495436 aaaggaaacttaaccactaatcagttcaacaacactta-----------aaaataaacaaatctacaaaagtggagcaaacaaatttattgaa-tatgaa 34495349  T
Q  290 tgaattaaagataagaaattcaattgaattcttattcttat 330  Q
    ||||  |||||| ||||||||| || |||||||||||||||    
T  34495348 tgaaggaaagatgagaaattcagttaaattcttattcttat 34495308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Original strand, 31327318 - 31327425
Alignment:
Q  1 aaaaaggagatgaagagaagaatagctcgtcaacacaagttgtaga---gagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgat 97  Q
    ||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||   | |   ||||||| |||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  31327318 aaaaaggagatgaagagaagaaagacttgtcaacacaagtcaaaaaagggagaagagagaaagagttcccgacaactcaat-gaaactctttggtgtgat 31327416  T
Q  98 ttttgaact 106  Q
    |||||||||    
T  31327417 ttttgaact 31327425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 17453129 - 17453048
Alignment:
Q  7 gagatgaagagaagaatagctcgtcaacacaagttgtagagagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtg 95  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||       ||||||| |||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  17453129 gagatgaagagaagaatagcttgttaacacaagg------gagaagagagaaagagttctcgacaactcaata-aaactctttggtgtg 17453048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 250 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 21523547 - 21523495
Alignment:
Q  250 atccacaaaagtggaggaaacaaactcattgaattttgaatgaattaaagata 302  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||    
T  21523547 atccacaaaagtagaggaaacaaactcattgaaatatgaatgaaggaaagata 21523495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 19578107 - 19578003
Alignment:
Q  1 aaaaaggagatgaagagaagaatagctcgtcaacacaagttgtagagagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgatttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| ||||| |||| |   || || ||||||| |||||||||| | ||| |||||||| ||| | ||| ||||||||||    
T  19578107 aaaaaggagatgaggagaaaaataactcgttaacaaaccctggagggagaagagagaaagagttttcgacaactcaata-aaaatatttagtgtgatttt 19578009  T
Q  101 tgaact 106  Q
    ||||||    
T  19578008 tgaact 19578003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 128; Significance: 4e-66; HSPs: 26)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 19994925 - 19994587
Alignment:
Q  1 aaaaaggagatgaagagaagaatagctcgtcaacacaagttgtagagagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgatttt 100  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| || || ||||||| ||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||| |||||    
T  19994925 aaaaaggagattaggagaagaatagatcgtcaacacaagctggagggagaagagagaaagagttctctacaactcaatataaactctttggtgtaatttt 19994826  T
Q  101 tgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattagatcaaaggagaactt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    || | | || | ||||  || |||| ||| |  || ||    
T  19994825 tgaactgagtggagtcctctatttatatagagattttgtaactgttttagcaaaaattacgacatcagatactctaattgataagataaaaaggtaaatt 19994726  T
Q  201 atacattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaagga-atagatccacaaaagtggaggaaacaaactcattgaattttgaatgaattaaag 299  Q
    || |||||| |||||||| |||| |  |||||| ||||||||  | | | ||||||||||   |||||||||||||||||| | ||||||||||  |||     
T  19994725 atccattaatcagttcaacaacattggtggataagatcaaaaacacagaaatccacaaaatatgaggaaacaaactcattgga-tttgaatgaaggaaat 19994627  T
Q  300 ataagaaattcaattgaattcttattcttattcttatcac 339  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19994626 ataagaaatttaattgaattcttattcttattcttatcac 19994587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 20747830 - 20747504
Alignment:
Q  2 aaaaggagatgaagagaagaatagctcgtcaacacaagttgt---agagagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgatt 98  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||      || ||||||| |||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  20747830 aaaaggagatgaagagaagaaaaactcgtcaacgcaagtcaagaaagggagaagagagaaagagttcc-gacaactcaat-gaaactctttggtgtgatt 20747733  T
Q  99 tttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattagatcaaaggagaac 198  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||   || | |||| | ||||| || |||| |||   ||      
T  20747732 ttttaactgagtggagtcctctatttatatagagatttggtaactgttttagcaaaaattgtgacagcagttactctaatggataagattaaaatggagt 20747633  T
Q  199 ttatacattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaaggaatagatccacaaaagtggaggaaacaaactcattgaattttgaatgaattaaa 298  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  |||    
T  20747632 ttatccattaatcagttcaacaacacttgtggataggatcaaaagaaacaaatccacaaaagtggaggaaacaaact-attgaa-tttgaatgaaggaaa 20747535  T
Q  299 gataagaaattcaattgaattcttattctta 329  Q
     ||||||||||||||| ||| ||| ||||||    
T  20747534 tataagaaattcaattaaatccttgttctta 20747504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Original strand, 17914153 - 17914482
Alignment:
Q  1 aaaaaggagatgaagagaagaatagctcgtcaacacaagttgtagagagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgatttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||  |||||||||||| ||  || ||||||||||  |||||| |||||||    
T  17914153 aaaaaggagatgaggagaagaatagctcgtcaacacaagctggagggagaagtgagaaagagttctcgaaaacacaatagaaacaatttggtttgatttt 17914252  T
Q  101 tgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattagatcaaaggagaactt 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    |   |||| | ||| | || | ||||||    |||||    
T  17914253 tgaactgaggggagtcctctattaatatagagattttgtaacttttttagcaaaaattgcggtagaagttactctaacggataatatcaaaatgaaactt 17914352  T
Q  201 atacattaaacagttcaataacacttatggataggatc-aaaaggaatagatccacaaaagtggaggaaacaaactcattgaattttgaatgaattaaag 299  Q
    || |||||| |||||||| ||||||| ||||||  ||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| |  ||||||||||  ||||    
T  17914353 atccattaatcagttcaacaacacttgtggataatatcaaaaagaaataaatccacaaaagtgaaggaatcaaactcatt-agatttgaatgaaggaaag 17914451  T
Q  300 ataagaaattcaattgaattcttattcttat 330  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  17914452 atatgaaattgaattgaattcttattcttat 17914482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 47 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 11559697 - 11559417
Alignment:
Q  47 gagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgatttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgtt 146  Q
    ||||||| |||||||||||   || ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  11559697 gagaagagagaaagagttccacacaactcaat-gaaactctttggtgtgttttttgaactgagtggagtcctctatttataaagagattctgtaactgtt 11559599  T
Q  147 ttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattagatcaaaggagaacttatacattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaaggaa 246  Q
    |||||||||||||    ||| |||| | ||||| || |||| |||   ||  |||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||    
T  11559598 ttagcaaaaattgcgataacagttactctaatggataagattaaaatggagtttatccattaatcagttcaacaacacttgtggataggatcaaaagaaa 11559499  T
Q  247 tagatccacaaaagtggaggaaacaaactcattgaattttgaatgaattaaagataagaaattcaattgaattcttattcttat 330  Q
     | ||||||| |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  11559498 caaatccacacaagtggaggaaacaaact-attgga-tttgaatgaaggaaatataagaaatttaattaaattcttattcttat 11559417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 17599935 - 17600181
Alignment:
Q  1 aaaaaggagatgaagagaagaatagctcgtcaacacaagttgtagagagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgatttt 100  Q
    |||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||| | ||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17599935 aaaaagaagattaggagaagaatagctcgtcaacacaagttggatggagaagagagaaagagttttcgacaactcaatagaaactctttagtgtgatttt 17600034  T
Q  101 tgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattgaat----caacggttaatttaatgaattagatcaaaggaga 196  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||| ||||||| | |    |||| |||| |  |||| || |||||||| || |    
T  17600035 tgaactgagtgaagtcctctatttatttagagattttgtaatttttttagtaaaaattaattgcggcaacagttactcaaatggataagatcaaaagaaa 17600134  T
Q  197 acttatacattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaag 243  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  17600135 acttattcattaatcagttcaacaacacttgtggataggatcaaaag 17600181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 47 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 11534187 - 11533907
Alignment:
Q  47 gagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgatttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgtt 146  Q
    ||||||| ||||||||||    || ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  11534187 gagaagagagaaagagtttcccacaactcaat-gaaactctttggtgtgttttttgaactgagtgaagtcctctatttataaagagattctgtaactgtt 11534089  T
Q  147 ttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattagatcaaaggagaacttatacattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaaggaa 246  Q
    |||||||||||||    | | |||| | ||||| || |||| |||   ||  |||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||    
T  11534088 ttagcaaaaattgcggtagcagttactctaatggataagattaaaatggagtttatccattaatcagttcaacaacacttgtggataggatcaaaagaaa 11533989  T
Q  247 tagatccacaaaagtggaggaaacaaactcattgaattttgaatgaattaaagataagaaattcaattgaattcttattcttat 330  Q
     | ||||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  11533988 caaatccacacaagtggaggaaacaaact-attgga-tttgaatgaagtaaatataagaaatttaattaaattcttattcttat 11533907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 33687177 - 33686849
Alignment:
Q  1 aaaaaggagatgaagagaagaatagctcgtcaacacaagttgt---agagagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgat 97  Q
    |||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||      || ||||||| | |||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||| |    
T  33687177 aaaaaggagatgaagaaaagaaagactcgtcaacacaagtcaagaaagggagaagagaaaaagagttcccgacaactcaat-gaaactctttggtgtg-t 33687080  T
Q  98 ttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattagatcaaaggagaa 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||   || | |||| | |||||  | |||| ||| | ||     
T  33687079 ttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattctgtaattgttttaacaaaaattgcgacagcagttactctaatggttaagattaaaagggag 33686980  T
Q  198 cttatacattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaaggaatagatccacaaaagtggaggaaacaaactcattgaattttgaatgaattaa 297  Q
     |||| |||||| |||||| | |||| || |||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  | ||  ||||||||||| ||    
T  33686979 tttatccattaatcagttcgacaacagttgtggatatgatcaaaagaaacagatccacaaaagtggaggaaacaaactattaga--tttgaatgaatgaa 33686882  T
Q  298 agataagaaattcaattgaattcttattcttat 330  Q
    | ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  33686881 atataagaaattcaatttaattattattcttat 33686849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Original strand, 11428525 - 11428856
Alignment:
Q  1 aaaaaggagatgaagagaagaatagctcgtcaacacaagttgt---agagagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgat 97  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||      || ||||||| |||||||||||  ||| ||||||| |||||| |||| |||| |    
T  11428525 aaaaaggagatgaagagaagaaatactcgtcaacataagtcaagaaagggagaagagagaaagagttcccgacaactcaat-gaaactttttgatgtgtt 11428623  T
Q  98 tttt-gaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattagatcaaaggaga 196  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||     | | |||| | ||||| || |||| |||   ||    
T  11428624 tttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattttgtaactcttttagcaaaaattacgatagcagttactctaatggataagattaaaatgga 11428723  T
Q  197 acttatacattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaaggaatagatccacaaaagtggaggaaacaaactcattgaattttgaatgaatta 296  Q
      |||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||  |    
T  11428724 gtttatccattaatcagttcaacaacacttgtggataggatcaaaagaaacaaatccacaaaagtggaggaaacaaa-ttatttgattttgaatgaagga 11428822  T
Q  297 aagataagaaattcaattgaattcttattcttat 330  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  11428823 aatataagaaattcaattgaattcatatttttat 11428856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 175 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 11613263 - 11613109
Alignment:
Q  175 taatgaattagatcaaaggagaacttatacattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaaggaatagatccacaaaagtggaggaaacaaac 274  Q
    ||||| || ||||||||  ||| ||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11613263 taatggataagatcaaaaaagatcttatccattaatcagttcaacaacacttgtggataggatcaaaagaaataaatccacaaaagtggaggaaacaaac 11613164  T
Q  275 tcattgaattttgaatgaattaaagataagaaattcaattgaattcttattcttat 330  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11613163 tcattgaa-tttgaatgaatgaaagataagaaattcaattgaattcttattcttat 11613109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 6407391 - 6407115
Alignment:
Q  1 aaaaaggagatgaagagaagaatagctcgtcaacacaagttgt---agagagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgat 97  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||      || ||||||| |||||||||||   || ||||||| ||||||||||| |||| |    
T  6407391 aaaaaggagatgaagagaagaaagactcgtcaacacaagtcaagaaagggagaagagagaaagagttcccaacaactcaat-gaaactctttgatgtgtt 6407293  T
Q  98 ttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattagatcaaaggagaa 197  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||  ||| | ||||| || |||| |||    |     
T  6407292 ttttgaattgagtggagtcctctatttatatagagattctgtaactgttttagcaaaaattgcgacaacaattactctaatggataagattaaaatgaag 6407193  T
Q  198 cttatacattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaaggaatagatccacaaaagtggaggaaacaaact 275  Q
     |||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| || | |||||||||| |||||||||||||||    
T  6407192 tttatccattaatcagttcaacaacacttgtggataggatcaaaagaaacaaatccacaaaaatggaggaaacaaact 6407115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 56 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 22694838 - 22694566
Alignment:
Q  56 gaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgatttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaa 155  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22694838 gaaagagttctcgacaagtcaatagaaactctttggtgtgatttttgaacttagtggaatcctctgtttatatagagattttgtaactgttttagcaaaa 22694739  T
Q  156 attgaatcaacggttaatttaatgaattagatcaaaggagaacttatacattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaaggaatagatccac 255  Q
    ||||   ||||  ||| | ||||  || ||||||||   |||||||| || | || |||||||  |||||| | |         |||| || | ||| ||    
T  22694738 attgcggcaacaattactctaatagataagatcaaaatggaacttatcca-tgaatagttcaacgacacttgttg---------aaagaaacaaatctac 22694649  T
Q  256 aaaagtggaggaaacaaactcattgaattttgaatgaattaaagataagaaattcaattgaattcttattcttattcttatcac 339  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22694648 aaaagtggaggaaacaaactcattgga-tttgaatgaaggaaaaataagaaattcaattgaattcttattcttattcttatcac 22694566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 47 - 330
Target Start/End: Original strand, 14509587 - 14509867
Alignment:
Q  47 gagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgatttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgtt 146  Q
    ||||||| |||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  14509587 gagaagagagaaagagttcccgacaactcaat-gaaactctttggtgtgttttttgaacttagtggagtcctctatttataaagagattttgtaaatgtt 14509685  T
Q  147 ttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattagatcaaaggagaacttatacattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaaggaa 246  Q
    |||||||||||||   ||||  ||| | ||||| || |||| |||    |  |||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||    
T  14509686 ttagcaaaaattgcgacaacaattactctaatgtataagattaaaatgaagtttatccattaatcagttcaacaacacttgtggataggataaaaagaaa 14509785  T
Q  247 tagatccacaaaagtggaggaaacaaactcattgaattttgaatgaattaaagataagaaattcaattgaattcttattcttat 330  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||  | ||  |||||||||   ||| |||||||||| |||| ||||| |||||||||    
T  14509786 caaatccacaaaagtggaggaaacaaactattaga--tttgaatgatggaaatataagaaatttaattaaattcctattcttat 14509867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 97 - 285
Target Start/End: Original strand, 8748423 - 8748610
Alignment:
Q  97 tttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattagatcaaaggaga 196  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||  ||| | ||||| || |||| |||   ||    
T  8748423 tttttgaactaagtggagtcctctatttatatagagattctgtaactgttttagcaaaaattgagacaacaattactctaatggataagattaaaatgga 8748522  T
Q  197 acttatacattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaaggaatagatccacaaaagtggaggaaacaaactcattgaattt 285  Q
      |||| |||||| |||||||| |||| || |||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8748523 gtttatccattaatcagttcaacaacaattgtggataggatcaaaagaaacaaatccacaaaagtggaggaaacaaact-attgaattt 8748610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 16835688 - 16835418
Alignment:
Q  1 aaaaaggagatgaagagaagaatagctcgtcaacacaagttgt---agagagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgat 97  Q
    ||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||      || ||||||| |||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||| |    
T  16835688 aaaaatgagatgaagagaagaaagactcgtcaacacaagtcaagagagggagaagagagaaagagttcccgacaactcaat-gaaactctttggtgtgtt 16835590  T
Q  98 ttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattagatcaaaggagaa 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||      ||||||||||   |||| |||| | || || || |||| |||   ||     
T  16835589 ttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattctgtaact------gcaaaaattgcgacaacagttactctagtggataagattaaaatggag 16835496  T
Q  198 cttatacattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaaggaatagatccacaaaagtggaggaaacaaact 275  Q
     |||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||||||||| ||||||||    
T  16835495 tttatccattaatcagttcaacaacacttgtggataggatcaaaagaaacaaatccacaaaagtggaggtaacaaact 16835418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 97 - 330
Target Start/End: Original strand, 5856644 - 5856875
Alignment:
Q  97 tttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattagatcaaaggaga 196  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||   ||   |||  | ||||| || |||| |||   ||    
T  5856644 ttttttaactgagtagagtcctctatttatatagagattttgtaactattttagcaaaaattgcgacagtagtttctctaatggataagattaaaatgga 5856743  T
Q  197 acttatacattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaaggaatagatccacaaaagtggaggaaacaaactcattgaattttgaatgaatta 296  Q
      |||| |||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  |    
T  5856744 gtttatccattaatcagatcaacaacacttatggatatgatcaaaagaaacaaatccacaaaagtggaggaaacaaact-attgga-tttgaatgaagga 5856841  T
Q  297 aagataagaaattcaattgaattcttattcttat 330  Q
    || |||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  5856842 aatataagaaatttaattaaattcttattcttat 5856875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 12405886 - 12405566
Alignment:
Q  1 aaaaaggagatgaagagaagaatagctcgtcaacacaagttgtagagagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgatttt 100  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||   ||||| |||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  12405886 aaaaatgagatgaggagaagaatagctcgccaacacaagctggag---gaagagagaaagagttctcgacaactcaattgaaactttttggtgtgttttt 12405790  T
Q  101 tgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattagatcaaaggag-aact 199  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||||| |||||       ||| ||||||||||||     | | |||| | ||||| || | || |||   | ||||    
T  12405789 tgaattgagtggagttttctatttatataaagatt-------tgtgttagcaaaaattacggtagcagttattctaatggataaaataaaaaatgaaact 12405697  T
Q  200 tatacattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaag-gaatagatccacaaaagtggaggaaacaaactcattgaattttgaatgaattaaa 298  Q
    ||| |||| | |||||||| |||||||   |||||||| |||||  || | |||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||   |||    
T  12405696 tatccatttatcagttcaacaacacttgcagataggattaaaagaaaaaaaatccacaaaaatggaggaaacaaactcattgga-tttgaatgatggaaa 12405598  T
Q  299 gataagaaattcaattgaattcttattcttat 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12405597 gataagaaattcaattgaattcttattcttat 12405566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 44 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 4156835 - 4156721
Alignment:
Q  44 agagagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgatttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaact 143  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||| ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  4156835 agagagaagagagaaagagttcccgacaactcaat-gaaactttttggtgtaatttttgaactgagtggagtcctttatttatatatagattctgtaact 4156737  T
Q  144 gttttagcaaaaattg 159  Q
    ||||||||||||||||    
T  4156736 gttttagcaaaaattg 4156721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 25313983 - 25313739
Alignment:
Q  1 aaaaaggagatgaagagaagaatagctcgtcaacacaagttgt---agagagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgat 97  Q
    |||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||      || || ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||  |    
T  25313983 aaaaaggagatgaagaaaagaaagactcgtcaacacaagtcaagaaagggataagatagaaagagttcccgacaactcaat-gaaactctttggtgtatt 25313885  T
Q  98 ttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattagatcaaaggagaa 197  Q
    ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||| |||| | ||||| || |||| |||   ||     
T  25313884 ttttgaactaagttgagtcatctatttatatagagattctgtaactgttttagcaaaaattgtgacaacagttactctaatggataagattaaaaaggag 25313785  T
Q  198 cttatacattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaag 243  Q
     |||| |||||| |||||||| ||||||| | |||| |||||||||    
T  25313784 tttatccattaatcagttcaacaacacttgttgatatgatcaaaag 25313739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 26201477 - 26201233
Alignment:
Q  1 aaaaaggagatgaagagaagaatagctcgtcaacacaagttgt---agagagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgat 97  Q
    |||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||      || || ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||  |    
T  26201477 aaaaaggagatgaagaaaagaaagactcgtcaacacaagtcaagaaagggataagatagaaagagttcccgacaactcaat-gaaactctttggtgtatt 26201379  T
Q  98 ttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattagatcaaaggagaa 197  Q
    ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||| |||| | ||||| || |||| |||   ||     
T  26201378 ttttgaactaagttgagtcatctatttatatagagattctgtaactgttttagcaaaaattgtgacaacagttactctaatggataagattaaaaaggag 26201279  T
Q  198 cttatacattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaag 243  Q
     |||| |||||| |||||||| ||||||| | |||| |||||||||    
T  26201278 tttatccattaatcagttcaacaacacttgttgatatgatcaaaag 26201233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 97 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 17963991 - 17963813
Alignment:
Q  97 tttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattagatcaaaggaga 196  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||   |||| |||| | ||||| || |||| |||   ||    
T  17963991 tttttgaactaagtggagtcctttatttatatagagattctgtaactgttttaccaaaaattgcgacaacagttactctaatggataagattaaaatgga 17963892  T
Q  197 acttatacattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaaggaatagatccacaaaagtggaggaaacaaact 275  Q
      |||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||| ||||| || | |||||||| |||||||||||||||||    
T  17963891 gtttatccattaatcagttcaacaacacttgtggataggattaaaagaaacaaatccacaatagtggaggaaacaaact 17963813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 2699623 - 2699379
Alignment:
Q  1 aaaaaggagatgaagagaagaatagctcgtcaacacaagttgtaga---gagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgat 97  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||   | |   ||||||| |||||||||||   || ||| ||| |||||| ||||||||| |    
T  2699623 aaaaaggagatgaagagaagaaagactcgtcaacacaagtcaaaaaagggagaagagagaaagagttcccaacaactaaat-gaaactatttggtgtgtt 2699525  T
Q  98 ttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattagatcaaaggagaa 197  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||   || | |||| | ||||| || |||| |||   ||     
T  2699524 ttttgaactgagtgaattcctctatttatatagagattttgtaactgttttagtaaaaattgcgacagcagttactctaatggataagattaaaattgag 2699425  T
Q  198 cttatacattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaag 243  Q
     |||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||| |||||    
T  2699424 tttatccattaatcagttcaacaacacttgtggataggattaaaag 2699379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 47 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 11570225 - 11570138
Alignment:
Q  47 gagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgatttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagatt 135  Q
    ||||||| |||||||||||   |  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11570225 gagaagagagaaagagttccgtagaactcaat-gaaactctttggtgtgttttttgaactgagtggagtcctctatttataaagagatt 11570138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 199 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 11570027 - 11569899
Alignment:
Q  199 ttatacattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaaggaatagatccacaaaagtggaggaaacaaactcattgaattttgaatgaattaaa 298  Q
    |||| |||||| |||||||| || |||| | |||||||||||||| || | ||||||  ||||||||||||||||   |||| | ||||||||||  |||    
T  11570027 ttatccattaatcagttcaacaatacttgtagataggatcaaaagaaacaaatccacccaagtggaggaaacaaaactattgga-tttgaatgaaggaaa 11569929  T
Q  299 gataagaaattcaattgaattcttattctt 328  Q
     |||||||||| |||| |||||||||||||    
T  11569928 tataagaaatttaattaaattcttattctt 11569899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 220 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 4156649 - 4156540
Alignment:
Q  220 aacacttatggataggatcaaaaggaatagatccacaaaagtggaggaaacaaactcattgaattttgaatgaattaaagataagaaattcaattgaatt 319  Q
    ||||||| |||||||  ||||||  || | |||||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||| ||  ||| |||||||||| |||| ||||    
T  4156649 aacacttgtggatagactcaaaataaacaaatccacaaaaatggaggaaacaaact-attgga-tttgaataaaggaaatataagaaatttaattaaatt 4156552  T
Q  320 cttattcttatt 331  Q
    ||||||||||||    
T  4156551 cttattcttatt 4156540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 106
Target Start/End: Original strand, 19674403 - 19674459
Alignment:
Q  49 gaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgatttttgaact 106  Q
    ||||| |||||||||||  |||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19674403 gaagagagaaagagttcccgacagctcaat-gaaactctttggtgtgatttttgaact 19674459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 287 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 2699364 - 2699320
Alignment:
Q  287 gaatgaattaaagataagaaattcaattgaattcttattcttatt 331  Q
    |||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2699364 gaatgaagaaaatataagaaattcaattaaattcttattcttatt 2699320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 34)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Original strand, 51698487 - 51698816
Alignment:
Q  1 aaaaaggagatgaagagaagaatagctcgtcaacacaagttgt---agagagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgat 97  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||      || ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| |    
T  51698487 aaaaaggagatgaagagaagaaagactcgtcaacacaagtcaagaaagggagaagatagaaagagttcctgacaactcaat-gaaactctttggtgtgtt 51698585  T
Q  98 ttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattagatcaaaggagaa 197  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||   |||| |||| | ||||| || |||| |||   ||     
T  51698586 ttatgaactgagtggagtcatctatttatatagagattctgtaattgttttagcaaaaattgcgacaacagttactctaatggataagattaaaatggag 51698685  T
Q  198 cttatacattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaaggaatagatccacaaaagtggaggaaacaaactcattgaattttgaatgaattaa 297  Q
     |||| |||||| ||||| || ||||||| |||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  ||    
T  51698686 tttatccattaatcagtttaacaacacttgtggataggatcaaaagaaacaaatccacaaaagtggaggaaacaaact-attgga-tttgaatgaaggaa 51698783  T
Q  298 agataagaaattcaattgaattcttattcttat 330  Q
    | |||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  51698784 atataagaaatttaattaaattcttattcttat 51698816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Original strand, 16421607 - 16421936
Alignment:
Q  1 aaaaaggagatgaagagaagaatagctcgtcaacacaagttgt---agagagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgat 97  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||      || ||||||| ||||||||||   ||| ||||||| |||||||||||||||| |    
T  16421607 aaaaaggagatgaagagaagaaagactcgtcaacacaagtcaagaaagggagaagagagaaagagtttccgacaactcaat-gaaactctttggtgtgtt 16421705  T
Q  98 ttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattagatcaaaggagaa 197  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||| |||| | ||||| || |||| |||   ||     
T  16421706 ttttgaactgattggagtcctctatttatatagagattctgtaactgttttagcaaaaattgcgacaacagttactctaatggataagattaaaatggag 16421805  T
Q  198 cttatacattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaaggaatagatccacaaaagtggaggaaacaaactcattgaattttgaatgaattaa 297  Q
     |||| |||||| || ||||| ||||||| || ||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||  ||    
T  16421806 tttatccattaatcaattcaacaacacttgtgaataggatcaaaagaaacaaatcctcaaaagtggaggaaacaaactatttga--tttgaatgaaggaa 16421903  T
Q  298 agataagaaattcaattgaattcttattcttat 330  Q
    | |||| ||||| |||| |||||||||||||||    
T  16421904 atataataaatttaattaaattcttattcttat 16421936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 37259394 - 37259118
Alignment:
Q  1 aaaaaggagatgaagagaagaatagctcgtcaacacaagttgt---agagagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgat 97  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||      || ||||||| |||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||| |    
T  37259394 aaaaaggagatgaagagaagaaagactcgtcaacacaagtcaagaaagggagaagagagaaagagttcccgacaactcaat-gaaactctttggtgtgtt 37259296  T
Q  98 ttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattagatcaaaggagaa 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||  ||| | || || || |||| |||   ||     
T  37259295 ttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattgcgacaacaattactctagtggataagattaaaatggag 37259196  T
Q  198 cttatacattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaaggaatagatccacaaaagtggaggaaacaaact 275  Q
     |||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||    
T  37259195 tttatccattaatcagttcaacaacacttgtggataggatcaaaagaaacaaatccacaaaagtggaggaaccaaact 37259118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 37264094 - 37263818
Alignment:
Q  1 aaaaaggagatgaagagaagaatagctcgtcaacacaagttgt---agagagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgat 97  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||      || ||||||| |||||||||||  ||| | ||||| |||||||||||||||| |    
T  37264094 aaaaaggagatgaagagaagaaagactcgtcaacacaagtcaagaaagggagaagagagaaagagttcccgacaattcaat-gaaactctttggtgtgtt 37263996  T
Q  98 ttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattagatcaaaggagaa 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||| |||| | || || || |||| |||   ||     
T  37263995 ttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattctgtaactgttttagcaaaaattgcgacaacagttactctagtggataagattaaaatggag 37263896  T
Q  198 cttatacattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaaggaatagatccacaaaagtggaggaaacaaact 275  Q
     |||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||    
T  37263895 tttatccattaatcagttcaacaacacttgtggataggatcaaaagaaacaaatccacaaaagtggaggaaccaaact 37263818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 33468533 - 33468203
Alignment:
Q  1 aaaaaggagatgaagagaagaatagctcgtcaacacaagttgt---agagagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgat 97  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||      || ||||||| |||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||| | |    
T  33468533 aaaaaggagatgaagagaagaaagactcgtcaacacaagtcaagaaagggagaagagagaaagagttcccgacaactcaat-gaaactctttggtgcgtt 33468435  T
Q  98 tttt-gaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattaga-tcaaaggag 195  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    |  | |||| | ||||| || ||| | ||| ||     
T  33468434 tttttgaactgagtggagtcctctatttatataaagattctgtaactgttttagcaaaaattacgactgcagttactctaatggataagactaaaatga- 33468336  T
Q  196 aacttatacattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaaggaatagatccacaaaagtggaggaaacaaactcattgaattttgaatgaatt 295  Q
    |  |||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||      
T  33468335 agtttatccattaaccagttcaacaacacttgtggatatgatcaaaagaaacaaatccacaaaagtggaggaaacaaact-attgaa-tttgaatgaagg 33468238  T
Q  296 aaagataagaaattcaattgaattcttattcttat 330  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33468237 aaatataagaaattcaattaaattcttattcttat 33468203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Original strand, 31274079 - 31274355
Alignment:
Q  1 aaaaaggagatgaagagaagaatagctcgtcaacacaagttgt---agagagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgat 97  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||      || ||||||| ||||||||||   ||| ||||||| |||||||||||||||| |    
T  31274079 aaaaaggagatgaagagaagaaagactcgtcaacacaagtcaagaaagggagaagagagaaagagtttccgacaactcaat-gaaactctttggtgtgtt 31274177  T
Q  98 ttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattagatcaaaggagaa 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||| |||| | || || || |||| |||   ||     
T  31274178 ttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattctgtaactgttttagcaaaaattgcgacaacagttactctagtggataagattaaaatggag 31274277  T
Q  198 cttatacattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaaggaatagatccacaaaagtggaggaaacaaact 275  Q
     |||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| || | |||||||||| |||||||| ||||||    
T  31274278 tttatccattaatcagttcaacaacacttgtggataggatcaaaagaaacaaatccacaaaaatggaggaaccaaact 31274355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 8 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 13065325 - 13065015
Alignment:
Q  8 agatgaagagaagaatagctcgtcaacacaagttgtagagagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgatttttgaactg 107  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||||||||| || || ||||||| | ||||| || | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  13065325 agatgaggagaagaatggctcatcaacacaagctggagggagaagagataaagatttttcgacaactcaatagaaactctttggtgtgttttttgaacta 13065226  T
Q  108 agtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattagatcaaaggagaacttatacatt 207  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |    ||   |||| | ||||| || |||||||| | |||||||| ||||    
T  13065225 agtggagtcctgtatttatatagagattttgtaactgtattagcaaaaaatttcgcagtagttactctaatggataagatcaaaagggaacttatccatt 13065126  T
Q  208 aaacagttcaataacacttatggataggatc--aaaaggaatagatccacaaaagtggaggaaacaaactcattgaattttgaatgaattaaagataaga 305  Q
                 |||||| |||||| ||||  ||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||| ||||||    
T  13065125 -------------acacttgtggataagatcaaaaaagaaacaaatccacaaaagtggaggaaacaaactcattga--tttgaatgaagaaaatataaga 13065041  T
Q  306 aa-ttcaattgaattcttattcttat 330  Q
    || |||||||||||||||||||||||    
T  13065040 aatttcaattgaattcttattcttat 13065015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Original strand, 6943347 - 6943676
Alignment:
Q  1 aaaaaggagatgaagagaagaatagctcgtcaacacaagttgtagagagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgatttt 100  Q
    |||||||||| || || |||||||||| ||||||||||| || || |||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6943347 aaaaaggagacgaggataagaatagctagtcaacacaagctggagggagaagagcgaaagagttctcgacaactcaatagaaactctttgatgtgatttt 6943446  T
Q  101 tgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattagatcaaaggagaactt 200  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||||   ||   |||| | ||||| || ||||       ||||||    
T  6943447 tgaactgagtagagtcctatgtttatattgagattttgtagctgttttagcgaaaattgcgacagtagttactctaatggataagat------ggaactt 6943540  T
Q  201 atacattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaaggaatag-atccacaaaagtggaggaaacaaactcattgaattttgaatgaattaaag 299  Q
    ||  ||||| |||||||| ||||||| |||| | |||||||| ||| || || ||||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||||   |||    
T  6943541 atctattaatcagttcaacaacacttctggacaagatcaaaaagaaaagaatacacaaaagttgaggaaacaaactcattgga-tatgaatgaagggaag 6943639  T
Q  300 ataagaaattcaattgaattcttattcttattcttatcac 339  Q
    ||| |||||||| |||||    ||||||||||||||||||    
T  6943640 ataggaaattcagttgaa---atattcttattcttatcac 6943676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 90 - 275
Target Start/End: Original strand, 31766528 - 31766713
Alignment:
Q  90 ggtgtgatttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattagatca 189  Q
    |||||| || ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||| |||| | ||||| || |||| |    
T  31766528 ggtgtgtttcttgaactaagtggactcctctatttatatagagattctgtaactgttttagcaaaaattgcgacaacagttactctaatggataagatta 31766627  T
Q  190 aaggagaacttatacattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaaggaatagatccacaaaagtggaggaaacaaact 275  Q
    ||   ||| |||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||    
T  31766628 aaatggaatttatccattaatcagttcaacaacacttgtggataggatcaaaagaaacaaatccacaaaagtggaggaaacaaact 31766713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 97 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 5270856 - 5270678
Alignment:
Q  97 tttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattagatcaaaggaga 196  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||| |||| | ||||| || |||| |||   ||    
T  5270856 tttttgaactaagtggagtcctctatttatatagagattctgtaactgttttagcaaaaattgcgacaacagttactctaatggataagattaaaatgga 5270757  T
Q  197 acttatacattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaaggaatagatccacaaaagtggaggaaacaaact 275  Q
      |||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||    
T  5270756 gtttatccattaatcagttcaacaacacttgtggataagatcaaaagaaacaaatccacaaaagtggaggaaacaaact 5270678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 2 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 32221096 - 32220768
Alignment:
Q  2 aaaaggagatgaagagaagaatagctcgtcaacacaagttgt---agagagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgatt 98  Q
    |||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||      || ||||||| ||||||||||   ||| ||||||| |||||| ||||||||  ||    
T  32221096 aaaaagagatgaagagaagaaagactcgtcaacacaagtcaagaaagggagaagagagaaagagtttccgacaactcaat-gaaactttttggtgtattt 32220998  T
Q  99 tttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattagatcaaaggagaac 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||   |||| |||| | ||||| || |||| |||    |      
T  32220997 tttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattatgtaactgttttagcataaattgcgacaacagttactctaatggataagattaaaatgaagt 32220898  T
Q  199 ttatacattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaaggaatagatccacaaaagtggaggaaacaaactcattgaattttgaatgaattaaa 298  Q
    |||| |||||| || ||||| ||||||| |  ||||||||||||| || | |||||||||| || |||||| |||| |||| |  ||||||||||  |||    
T  32220897 ttattcattaatcatttcaacaacacttgtatataggatcaaaagaaacaaatccacaaaaatgaaggaaagaaac-catt-agatttgaatgaaggaaa 32220800  T
Q  299 gataagaaattcaattgaattcttattcttat 330  Q
     |||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  32220799 tataagaaatttaattaaattcttattcttat 32220768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 97 - 275
Target Start/End: Original strand, 8694376 - 8694554
Alignment:
Q  97 tttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattagatcaaaggaga 196  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||| |||| | ||||| || |||| |||   ||    
T  8694376 tttttgaactaagtggagtcctctatttatatagagattttgtaactgttttagcaaaaattgcgacaacagttactctaatggataagattaaaatgga 8694475  T
Q  197 acttatacattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaaggaatagatccacaaaagtggaggaaacaaact 275  Q
      |||| |||||| ||||| || ||||||| |||||||||||||||| || | || |||||||||||||||||||||||    
T  8694476 gtttatccattaatcagtttaacaacacttgtggataggatcaaaagaaacaaattcacaaaagtggaggaaacaaact 8694554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 97 - 330
Target Start/End: Original strand, 13060125 - 13060356
Alignment:
Q  97 tttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattagatcaaaggaga 196  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||  || | | | ||  || |||| |||  |||    
T  13060125 tttttgaactcagtggagtcctctatttatatagagattttgtaactgttttagcaaaaattgcgacaaaagtcactctgatagataagattaaaataga 13060224  T
Q  197 acttatacattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaaggaatagatccacaaaagtggaggaaacaaactcattgaattttgaatgaatta 296  Q
      |||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||| ||||| || | ||| |||||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||  |    
T  13060225 gtttatccattaatcagttcaacaacacttgtggataggatgaaaagaaacaaatcaacaaaagtggaggaaacaaagt-attgga-tttgaatgaagga 13060322  T
Q  297 aagataagaaattcaattgaattcttattcttat 330  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  13060323 aatataagaaattcaattaaattcttatttttat 13060356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Original strand, 55252231 - 55252391
Alignment:
Q  1 aaaaaggagatgaagagaagaatagctcgtcaacacaagttgt---agagagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgat 97  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||      || || |||| |||||||| ||  ||| ||||||| |||| ||||||||||| |    
T  55252231 aaaaaggagatgaagagaagaaagactcgtcaacacaagtcaagaaagggataagagagaaagagctcccgacaactcaat-gaaattctttggtgtgtt 55252329  T
Q  98 ttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  55252330 ttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattctgtaactgttttagcaaaaattg 55252391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 97 - 330
Target Start/End: Original strand, 19906904 - 19907138
Alignment:
Q  97 tttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattagatcaaaggaga 196  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||   |||| || | | ||||| || |||| |||   ||    
T  19906904 tttttaaactgagtggagtcctctatttatatagagattttgtaattgttttagcaacaattgcgacaacagtcactctaatggataagatgaaattgga 19907003  T
Q  197 acttatacattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaaggaatagatccacaaaa---gtggaggaaacaaactcattgaattttgaatgaa 293  Q
      |||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||   |||||||||||||||| |||| | |||||| |||    
T  19907004 gtttatccattaatcagttcaacaacacttgtggataggatcaaaagaaacaaatccacaaaagtggtggaggaaacaaact-attgga-tttgaacgaa 19907101  T
Q  294 ttaaagataagaaattcaattgaattcttattcttat 330  Q
      ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  19907102 ggaaatataagaaatttaattaaattcttattcttat 19907138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 101 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 31728794 - 31728620
Alignment:
Q  101 tgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattagatcaaaggagaactt 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||   |||| |||| | ||||| || |||| |||   ||  |     
T  31728794 tgaactaagtggagtcctctatttatatagagattctgtaactgttttggcaaaaattgcgacaacagttactctaatggataagattaaaatggagtta 31728695  T
Q  201 atacattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaaggaatagatccacaaaagtggaggaaacaaact 275  Q
    || |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||    
T  31728694 atccattaatcagttcaataacacttgtggatatgatcaaaagaaacaaatccacaaaagtggaggaaacaaact 31728620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 80 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 32081616 - 32081371
Alignment:
Q  80 gaaactctttggtgtgatttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatg 179  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||   |||| |||| | ||||     
T  32081616 gaaactttttggtgtgttttttgaactgagtggagtcttctatt--tatagagattctgtaactgttttagcataaattgcgacaacagttactctaatc 32081519  T
Q  180 aattagatcaaaggagaacttatacattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaaggaatagatccacaaaagtggaggaaacaaactcatt 279  Q
     || |||| |||    |  |||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||  | || | ||||||||||||||||||||||||||  |     
T  32081518 gataagattaaaatgaagtttatccattaatcagttcaacaacacttgtggataggatcaactgaaacaaatccacaaaagtggaggaaacaaactgttg 32081419  T
Q  280 gaattttgaatgaattaaagataagaaattcaattgaattcttattcttat 330  Q
    ||   |||||||||  ||| |||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  32081418 ga---ttgaatgaagaaaatataaaaaattcaattaaattcttattcttat 32081371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 48 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 12823368 - 12823099
Alignment:
Q  48 agaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgatttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttt 147  Q
    |||||| ||||||||||   ||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  12823368 agaagagagaaagagttaccgacaactcaat-gaaattctttggtgtgttttttgaactgagtgaagttttctattgatatagagattctgcaactgttt 12823270  T
Q  148 tagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattagatcaaaggagaacttatacattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaaggaat 247  Q
    ||||||||||||   |||| |||| | ||||| || |||| |||   ||  |||| |||||| || ||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||     
T  12823269 tagcaaaaattgcgacaacagttactctaatggataagattaaaatggagtttatccattaatcaattcaacaacacttgtggatatgatcaaaagaaac 12823170  T
Q  248 agatccacaaaagtggaggaaacaaactcattgaattttgaatgaattaaagataagaaattcaattgaattctt 322  Q
    | |||  ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  ||| ||||||||||||||  |||||||    
T  12823169 aaatc--caaaagtggaggaaacaaact-attgga-tttgaatgaaggaaatataagaaattcaatcaaattctt 12823099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 97 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 5927650 - 5927472
Alignment:
Q  97 tttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattagatcaaaggaga 196  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||| ||||   |||| |||| | ||||| || |||| |||    |    
T  5927650 tttttgaactaagtggagtcctctatttatatggagattctgtaattgttttagcaaatattgtgacaacagttactctaatggataagattaaaatgaa 5927551  T
Q  197 acttatacattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaaggaatagatccacaaaagtggaggaaacaaact 275  Q
      |||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||    
T  5927550 gtttatccattaatcagttcaacaacacttgtggataggatcaaaagaaacaaatccacaaaagtggaggaaacaaact 5927472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 31269590 - 31269726
Alignment:
Q  1 aaaaaggagatgaagagaagaatagctcgtcaacacaagttgt---agagagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgat 97  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||      || ||||||| |||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||| |    
T  31269590 aaaaaggagatgaagagaagaaagactcgtcaacacaagtcaagaaagggagaagagagaaagagttcccgacaactcaat-gaaactctttggtgtgtt 31269688  T
Q  98 ttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagatt 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31269689 ttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagatt 31269726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 47 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 19540660 - 19540549
Alignment:
Q  47 gagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgatttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgtt 146  Q
    ||||||| ||||||||||   ||| ||||||| |||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19540660 gagaagagagaaagagttgccgacaactcaat-gaaactctttagtttattttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattttgtaactgtt 19540562  T
Q  147 ttagcaaaaattg 159  Q
    ||| |||||||||    
T  19540561 ttatcaaaaattg 19540549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 47 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 33462845 - 33462555
Alignment:
Q  47 gagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgattttt-gaactgagtggagt-----cctctatttatatagagattgtgta 140  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     ||| |||||||||| ||||| | ||    
T  33462845 gagaagagagaaagagttctcgacaactcaat-gaaactctttggtgtgtttttttgaactgagtggagtggagtcctttatttatataaagattctata 33462747  T
Q  141 actgttttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattaga-tcaaaggagaacttatacattaaacagttcaataacacttatggataggatca 239  Q
    | |||||||||||||||||   ||||  ||| | ||||| || ||| | ||| || |  |||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  33462746 attgttttagcaaaaattgcgacaacaattactctaatggataagactaaaatga-agtttatccattaatcagttcaacaacacttgtggataggatca 33462648  T
Q  240 aaaggaatagatccacaaaagt----ggaggaaacaaactcattgaattttgaatgaattaaagataagaaattcaattgaattcttattcttat 330  Q
    |||| || | ||||||||||||    | |||||||||| | |||| | ||||||||||  ||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  33462647 aaagaaacaaatccacaaaagtaaaggaaggaaacaaa-ttattgga-tttgaatgaaggaaatataaaaaattcaattaaattattattcttat 33462555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 5 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 30054587 - 30054434
Alignment:
Q  5 aggagatgaagagaagaatagctcgtcaacacaagttgtagagagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgatttttgaa 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||  || || ||||||| |||||| |||||  || ||| ||||| |||||||| ||||||||||  ||    
T  30054587 aggagatgaagagaagaatagctcgttaacacaaactgaagggagaagagagaaagtgttctcaacaacttaatag-aactctttagtgtgattttgaaa 30054489  T
Q  105 ctgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattg 159  Q
    || ||| |||||||||||||||||| || |  |||||||| |||| | |||||||    
T  30054488 ctaagtagagtcctctatttatataaaggtcttgtaactggtttaactaaaattg 30054434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 330
Target Start/End: Original strand, 23093687 - 23093999
Alignment:
Q  7 gagatgaagagaagaatagctcgtcaacacaagttgtagagagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgatttttgaact 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||| ||||||| |||| ||| |         ||||||||| |||| ||||||||||    
T  23093687 gagatgaagagaagaatagctcgtcaacacagactggagagagaagagagaaagaattctcgacaa---------aactctttgatgtgttttttgaact 23093777  T
Q  107 gagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattagatcaaaggagaacttatacat 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||| | ||||   |||||||   ||||  |||   || || || |||||||| |  ||||||   |     
T  23093778 gagtggagtcctctatttatttagaggttttgtaaccggtttaattaaaattgcggcaacaattacactagtggataagatcaaaaggaaacttaataac 23093877  T
Q  207 taaacagttcaataacacttatggataggatcaaaaggaatagatccacaaaagtggaggaaacaaactcattgaattttgaatgaattaaagataagaa 306  Q
    |||   |||||| ||  ||| |||||| ||| |||| ||  | | | ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||  |||||||| ||    
T  23093878 taatttgttcaacaaatcttgtggataagatgaaaaagacaaaaactacaaaagtggaggaaacaaactcattgaa-tatgaaagaaagaaagataa-aa 23093975  T
Q  307 attcaattgaattcttattcttat 330  Q
    | ||||||||||||||||||||||    
T  23093976 actcaattgaattcttattcttat 23093999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 131
Target Start/End: Original strand, 2820419 - 2820501
Alignment:
Q  47 gagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgatttttgaactgagtggagtcctctatttatataga 131  Q
    ||||||| | |||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2820419 gagaagagaaaaagagttctcgacgactcaatagaa-ctatttggtgttatttt-gaactgagtggagtcatctatttatataga 2820501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 39216583 - 39216507
Alignment:
Q  32 aacacaagttgtagagagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgatttttgaactgag 109  Q
    |||||||| || || ||||||| |||||||||||| ||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39216583 aacacaagctggagggagaagagagaaagagttctagaaacctcaatagaa-ctctttggtgtgatttttgaactgag 39216507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 106
Target Start/End: Original strand, 19107178 - 19107283
Alignment:
Q  3 aaaggagatgaagagaagaatagctcgtcaacacaagttgt---agagagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgattt 99  Q
    ||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||      |||||||||| ||||||||||   ||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19107178 aaaggagataaagagaagaaagactcgtcaacacaagtcaagaaagagagaagagagaaagagtttccgacaactcaat-gaaactctttggtgtgattt 19107276  T
Q  100 ttgaact 106  Q
    |||||||    
T  19107277 ttgaact 19107283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 250 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 39216383 - 39216304
Alignment:
Q  250 atccacaaaagtggaggaaacaaactcattgaattttgaatgaattaaagataagaaattcaattgaattcttattcttat 330  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||  ||  |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  39216383 atccacaaaagtgtaggaaacaaactcattgaatat-gaaccaaggaaagatagaaaactcaattgaattcttattcttat 39216304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 228 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 29349513 - 29349413
Alignment:
Q  228 tggataggatcaaaaggaatagatccacaaaagtggaggaaacaaactcattgaattttgaatgaattaaagataagaaattcaattgaattcttattct 327  Q
    |||||| ||||||||| || | || ||||||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||  ||| |||||||||| |||| |||| |||||||    
T  29349513 tggataagatcaaaagaaacaaattcacaaaagtggaggaaacaaa-ttattgga-tttgaatgaaggaaatataagaaatttaattaaatttttattct 29349416  T
Q  328 tat 330  Q
    |||    
T  29349415 tat 29349413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 15805169 - 15805088
Alignment:
Q  1 aaaaaggagatgaagagaagaatagctcgtcaacacaagttgtagagagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaa 82  Q
    |||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||| || |  ||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  15805169 aaaaagtagatgaggagaagaatatctcgttaacacaagctggaaggagaagagagaaagagttctcgacaactcaagagaa 15805088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Complemental strand, 39216632 - 39216592
Alignment:
Q  1 aaaaaggagatgaagagaagaatagctcgtcaacacaagtt 41  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  39216632 aaaaaggagatgaggagaagaatagctcgttaacacaagtt 39216592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 284 - 340
Target Start/End: Original strand, 40408780 - 40408836
Alignment:
Q  284 tttgaatgaattaaagataagaaattcaattgaattcttattcttattcttatcact 340  Q
    ||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  40408780 tttgaatgaaagaaaaataaaaaattcaattgaattcttattcttatttctatcact 40408836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Complemental strand, 42758386 - 42758347
Alignment:
Q  1 aaaaaggagatgaagagaagaatagctcgtcaacacaagt 40  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  42758386 aaaaaggagatgaagagaagaaaaactcgtcaacacaagt 42758347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 26188212 - 26188138
Alignment:
Q  5 aggagatgaagagaagaatagctcgtcaacacaagttgtagagagaagatagaaagagttcttgaccactcaata 79  Q
    |||||||||  |||| |||||| ||| |||||||| || || ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  26188212 aggagatgagaagaaaaatagcacgttaacacaagctggagggagaagagagaaagagttctcgacaactcaata 26188138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 123; Significance: 4e-63; HSPs: 24)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 20180685 - 20180356
Alignment:
Q  1 aaaaaggagatgaagagaagaatagctcgtcaacacaagttgt---agagagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgat 97  Q
    |||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||      || ||||||| | ||| |||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  20180685 aaaaaggagatgaagaaaagaaagactcgtcaacacaagtcaagaaagggagaagagataaacagttcccgacaactcaat-gaaactctttggtgtgat 20180587  T
Q  98 ttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattagatcaaaggagaa 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  |||| |||| | ||||| || | || |||    |     
T  20180586 ttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattctgtaactgttttagcaaaagttgagacaacagttactctaatggataatattaaaatgaag 20180487  T
Q  198 cttatacattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaaggaatagatccacaaaagtggaggaaacaaactcattgaattttgaatgaattaa 297  Q
     |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||| |||  ||    
T  20180486 tttatccattaatcagttcaacaacacttatggataggatcaaaagaaacaaatccacataagtggaggaaacaaact-attgaa-tttgaacgaaggaa 20180389  T
Q  298 agataagaaattcaattgaattcttattcttat 330  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20180388 atataagaaattcaattaaattcttattcttat 20180356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Original strand, 39518964 - 39519236
Alignment:
Q  1 aaaaaggagatgaagagaagaatagctcgtcaacacaagttgtagagagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgatttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||   || ||||||| |||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  39518964 aaaaaggagatgaagagaagaaagactcgtcaacacaagtca-agggagaagagagaaagagttcccgacaactcaata-aaactctttggtgtgttttt 39519061  T
Q  101 tgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattagatcaaaggagaactt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||| |||| | || || || |||| |||    |  ||    
T  39519062 tgaactgagtggagtcctctatttatatagagattctgtaactgttttagcaaaaattgtgacaacagttactctagtggataagattaaaatgaagttt 39519161  T
Q  201 atacattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaaggaatagatccacaaaagtggaggaaacaaact 275  Q
    || |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||| ||||||    
T  39519162 atccattaatcagttcaacaacacttgtggataggatcaaaataaacaaatccacaaaagtggaggaaccaaact 39519236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 37248330 - 37248055
Alignment:
Q  1 aaaaaggagatgaagagaagaatagctcgtcaacacaagttgt---agagagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgat 97  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||      |||||||||| |||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||  |    
T  37248330 aaaaaggagatgaagagaagaaagactcgtcaacacaagtcaagaaagagagaagagagaaagagttcccgacaactcaat-gaaactctttggtgt--t 37248234  T
Q  98 ttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattagatcaaa--ggag 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||  ||| | ||||| || |||| |||  ||||    
T  37248233 ttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattctgtaactgttttagcaaaaattgcgacaacaattactctaatggataagattaaaatggag 37248134  T
Q  196 aacttatacattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaaggaatagatccacaaaagtggaggaaacaaact 275  Q
       |||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||||||||| ||||||||    
T  37248133 -ttttatccattaatcagttcaacaacacttgtggataggatcaaaagaaacaaatccacaaaagtggaggtaacaaact 37248055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Original strand, 39523603 - 39523875
Alignment:
Q  1 aaaaaggagatgaagagaagaatagctcgtcaacacaagttgtagagagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgatttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||   || ||||||| |||||||||||  ||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  39523603 aaaaaggagatgaagagaagaaagactcgtcaacacaagtca-agggagaagagagaaagagttcccgacaactcgata-aaattctttggtgtgttttt 39523700  T
Q  101 tgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattagatcaaaggagaactt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||| |||| | || || || |||| |||    |  ||    
T  39523701 tgaactgagtggagtcctctatttatatagagattctgtaactgttttagcaaaaattgcgacaacagttactctagtggataagattaaaatgaagttt 39523800  T
Q  201 atacattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaaggaatagatccacaaaagtggaggaaacaaact 275  Q
    || |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||| ||||||    
T  39523801 atccattaatcagttcaacaacacttgtggataggatcaaaataaacaaatccacaaaagtggaggaaccaaact 39523875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 80 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 6512086 - 6511838
Alignment:
Q  80 gaaactctttggtgtgatttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatg 179  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||   |||| |||||| |||||    
T  6512086 gaaactctttgatgtgttttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattctgcaactgttttagcaaaaaatgcgacaacagttaatctaatg 6511987  T
Q  180 aattagatcaaaggagaacttatacattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaaggaatagatccacaaaagtggaggaaacaaactcatt 279  Q
     || |||| |||    |  |||| |||||| ||||| || ||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||| ||| |||||||||| |||    
T  6511986 gataagattaaaatgaagtttatccattaatcagtttaacaacacttgtggataggatcaaaagaaacaaatccacaaaagcggaagaaacaaact-att 6511888  T
Q  280 gaattttgaatgaattaaagataagaaattcaattgaattcttattcttat 330  Q
    | | ||||||||||| ||| |||| ||||| |||| |||||||||||||||    
T  6511887 gga-tttgaatgaatgaaatataaaaaatttaattaaattcttattcttat 6511838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 16115760 - 16115481
Alignment:
Q  1 aaaaaggagatgaagagaagaatagctcgtcaacacaagttgtagagagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgatttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| ||||| |||||||| || || |||| || ||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||    
T  16115760 aaaaaggagatgaggagaaaaataactcgttaacacaagctggagggagatgagagaaagagttcttaacaactcaatataa-ctctttggtgtgatttt 16115662  T
Q  101 tgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattagatcaaaggagaactt 200  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||   ||||   || ||||||| || |||||||| |  |||||    
T  16115661 tgaactgagtggaatcctctgtttatatagagattttgtaaatgttttagctaaaattgcggcaacatgtactttaatggataagatcaaaaggaaactt 16115562  T
Q  201 atacattaaacagttcaataacacttatggataggat-caaaaggaatagatccacaaaagtggaggaaacaaactcattg 280  Q
    |  || ||| |||||||| |||| || |||| | |||  ||||| || | |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  16115561 aaccactaatcagttcaacaacaattgtggaaatgataaaaaagaaagaaatccacaaaagtggagaaaacgaactcattg 16115481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 97 - 275
Target Start/End: Original strand, 26667941 - 26668119
Alignment:
Q  97 tttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattagatcaaaggaga 196  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||| |||| | ||||| || |||| |||   ||    
T  26667941 tttttgaactaagtggagtcctctatttatatagagattctgtaactgttttagcaaaaattgcgacaacagttactctaatggataagattaaaatgga 26668040  T
Q  197 acttatacattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaaggaatagatccacaaaagtggaggaaacaaact 275  Q
      |||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||    
T  26668041 gtttatccattaatcagttcaacaacacttgtggataggatcaaaagaaacaaatccacaaaagtggaggaaacaaact 26668119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 97 - 275
Target Start/End: Original strand, 26939538 - 26939716
Alignment:
Q  97 tttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattagatcaaaggaga 196  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||| |||| | ||||| || |||| |||   ||    
T  26939538 tttttgaactaagtggagtcctctatttatatagagattctgtaactgttttagcaaaaattgcgacaacagttactctaatggataagattaaaatgga 26939637  T
Q  197 acttatacattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaaggaatagatccacaaaagtggaggaaacaaact 275  Q
      |||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||    
T  26939638 gtttatccattaatcagttcaacaacacttgtggataggatcaaaagaaacaaatccacaaaagtggaggaaacaaact 26939716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 12103593 - 12103866
Alignment:
Q  1 aaaaaggagatgaagagaagaatagctcgtcaacacaagt---tgtagagagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgat 97  Q
    |||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||   |  || ||||||| |||  ||||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||      
T  12103593 aaaatggagatgaagagaagaaagactcgtcaacacaagtcaataaagggagaagagaga--gagttcccgacaactcaat-gaaactatttggtgtgtg 12103689  T
Q  98 ttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattagatcaaaggagaa 197  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||| |||| | ||| | || |||| |||   ||     
T  12103690 ttttaaactgagtggagtcctctatttatatagagattttgtaactgttttagcaaaaattgcgacaacagttactctaaaggataagattaaaatggag 12103789  T
Q  198 cttatacattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaaggaatagatccacaaaagtggaggaaacaaac 274  Q
     |||| |||||| |||||||| ||||||| | |||| ||||||||| || |  |||||||||| |||||||||||||    
T  12103790 tttatccattaatcagttcaacaacacttgtagatatgatcaaaagaaacaagtccacaaaagcggaggaaacaaac 12103866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 108 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 37537360 - 37537193
Alignment:
Q  108 agtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattagatcaaaggagaacttatacatt 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||| |||| | |||||||| |||| |||   ||  ||||  |||    
T  37537360 agtggagtcctctatttatatagagattctgtaactgttttagcaaaaattgcgacaacagttactctaatgaataagattaaaatggagtttatctatt 37537261  T
Q  208 aaacagttcaataacacttatggataggatcaaaaggaatagatccacaaaagtggaggaaacaaact 275  Q
    || |||||||| ||||||| |||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| |||||    
T  37537260 aatcagttcaacaacacttgtggataggatcaaaagaaacaaatccacaaaagtggaggaaaaaaact 37537193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 97 - 275
Target Start/End: Original strand, 36424301 - 36424479
Alignment:
Q  97 tttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattagatcaaaggaga 196  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||| |||| | ||||| || |||| |||    |    
T  36424301 tttttgaactaagtggagtcctctatttatatagagattctgtaactgttttagcaaaaattgcgacaacagttactctaatggataagattaaaatgaa 36424400  T
Q  197 acttatacattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaaggaatagatccacaaaagtggaggaaacaaact 275  Q
      |||| |||||| |||||||| ||||||| || ||||||| ||||| || | ||||||||||||||||||||||||||    
T  36424401 gtttatccattaatcagttcaacaacacttgtgaataggatgaaaagaaacaaatccacaaaagtggaggaaacaaact 36424479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 98 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 29167405 - 29167230
Alignment:
Q  98 ttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattagatcaaaggagaa 197  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||| |||| | ||||| || |||| |||   ||     
T  29167405 ttttgaactaagtggagtcctcgatttatatagagattctgtaactgttttagcaaaaattgcggcaacagttactctaatggataagattaaaatggag 29167306  T
Q  198 cttatacattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaaggaatagatccacaaaagtggaggaaacaaa 273  Q
     |||| |||| | |||||||| ||||||| ||||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||    
T  29167305 tttatccattgatcagttcaacaacacttgtggatagaatcaaaagaaacaaatccacaaaagtggaggaaacaaa 29167230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 108 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 37646479 - 37646312
Alignment:
Q  108 agtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattagatcaaaggagaacttatacatt 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||| |||| | ||||| || |||| |||   ||  ||||  |||    
T  37646479 agtggagtcctctatttatatagagattctgtaactgttttagcaaaaattgtgacaacagttactctaatggataagattaaaatggagtttatctatt 37646380  T
Q  208 aaacagttcaataacacttatggataggatcaaaaggaatagatccacaaaagtggaggaaacaaact 275  Q
    || |||||||| ||||||| |||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| |||||    
T  37646379 aatcagttcaacaacacttgtggataggatcaaaagaaacaaatccacaaaagtggaggaaaaaaact 37646312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 97 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 6154866 - 6154688
Alignment:
Q  97 tttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattagatcaaaggaga 196  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   || | |||| | ||||| || |||| |||   ||    
T  6154866 tttttgaactaagttgagtcctctatttatatagagattctgtaactgttttagcaaaaattgcgacatcagttactctaatggataagattaaaatgga 6154767  T
Q  197 acttatacattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaaggaatagatccacaaaagtggaggaaacaaact 275  Q
      | || |||||| ||||| || ||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||    
T  6154766 gttcatccattaatcagtttaacaacacttgtggataggatcaaaagaaacaaatccacaaaagtggaggaaacaaact 6154688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 97 - 270
Target Start/End: Original strand, 7452416 - 7452589
Alignment:
Q  97 tttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattagatcaaaggaga 196  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   |||| |||| | ||||| || | || |||   ||    
T  7452416 tttttgaactaagcggagtcctctatttatatagagattctgtatctgttttagcaaaaattgcgacaacagttactctaatggataaaattaaaatgga 7452515  T
Q  197 acttatacattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaaggaatagatccacaaaagtggaggaaac 270  Q
      |||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||    
T  7452516 gtttatccattaatcagttcaacaacacttgtggataggatcaaaagaaacaaatccacaaaagtggaggaaac 7452589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 59 - 314
Target Start/End: Original strand, 40148522 - 40148774
Alignment:
Q  59 agagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgatttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaatt 158  Q
    |||||||  ||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  40148522 agagttcccgacaactcaat-gaaactctttcgtgtgttttttgaactaagtgaagtcctttatttatatagagattctataattgttttagcaaaaatt 40148620  T
Q  159 gaatcaacggttaatttaatgaattagatcaaaggagaacttatacattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaaggaatagatccacaaa 258  Q
    |   |||| |||| | ||||| ||  ||| |||    |  |||| ||||||  ||||||| ||| ||| ||||||| |||||||| || | || |||| |    
T  40148621 gcgacaacagttactctaatggatatgattaaaatgaagtttatccattaataagttcaacaacccttgtggatagaatcaaaagaaacaaattcacaca 40148720  T
Q  259 agtggaggaaacaaactcattgaattttgaatgaattaaagataagaaattcaatt 314  Q
    ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  ||| |||||||||| ||||    
T  40148721 agtggaggaaacaaact-attgga-tttgaatgaagaaaatataagaaattaaatt 40148774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 15414422 - 15414268
Alignment:
Q  1 aaaaaggagatgaagagaagaatagctcgtcaacacaagttgtagagagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgatttt 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || || |||||||| || || ||||||| |||  ||||||| ||| ||| ||||||| || |||| ||| |||||    
T  15414422 aaaaaggagatgaggagaagaataacttgttaacacaagctggagggagaagagaga--gagttctcgacaactgaatagaa-ctttttgatgtaatttt 15414326  T
Q  101 tgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattg 159  Q
    | |||| |||||| |||||||||||||||||| || |||||||  |||||| |||||||    
T  15414325 ttaactaagtggaatcctctatttatatagaggtt-tgtaactagtttagctaaaattg 15414268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 111
Target Start/End: Original strand, 4872467 - 4872578
Alignment:
Q  1 aaaaaggagatgaagagaagaatagctcgtcaacacaagt--tgtagagagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgatt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||   | || ||||||| |||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||| |||||    
T  4872467 aaaaaggagatgaagagaagaaagactcgtcaacacaagtcaagaagggagaagagagaaagagttcccgacaactcaat-gaaactctttggtatgatt 4872565  T
Q  99 tttgaactgagtg 111  Q
    |||||||| ||||    
T  4872566 tttgaactaagtg 4872578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 23757342 - 23757259
Alignment:
Q  1 aaaaaggagatgaagagaagaatagctcgtcaacacaagttgtagagagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaac 84  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |  || ||||||| | |||||||||| ||| |||||||||||||    
T  23757342 aaaaaggatatgaggagaagaatagctcgtcaacataagctagagggagaagagaaaaagagttctcgacaactcaatagaaac 23757259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 23822798 - 23822715
Alignment:
Q  1 aaaaaggagatgaagagaagaatagctcgtcaacacaagttgtagagagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaac 84  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |  || ||||||| | |||||||||| ||| |||||||||||||    
T  23822798 aaaaaggatatgaggagaagaatagctcgtcaacataagctagagggagaagagaaaaagagttctcgacaactcaatagaaac 23822715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 35780051 - 35779958
Alignment:
Q  64 tcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgatttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattg 159  Q
    ||||||| ||||||| ||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||   |||||| |||||||    
T  35780051 tcttgacaactcaatggaa-ctctttggtatgttttttgaaccgagtggagtcctcta-ttatatagagattttgtaacgagtttagctaaaattg 35779958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 199 - 272
Target Start/End: Original strand, 36430284 - 36430357
Alignment:
Q  199 ttatacattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaaggaatagatccacaaaagtggaggaaacaa 272  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||  |||| || | |||||||||||||||||||||||    
T  36430284 ttatccattaatcagttcaacaacacttgtgggtaggatgtaaagaaacaaatccacaaaagtggaggaaacaa 36430357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 1429715 - 1429626
Alignment:
Q  3 aaaggagatgaagagaagaatagctcgtcaacacaagttgtagagaga--agatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttgg 91  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||  ||| |||||||||| | ||| |||| |||| ||||||||||    
T  1429715 aaaggagatgaagagaggaatagctcgttaacacaagctggagggagaagagagagaaagagttatcgacaactcgatag-aactctttgg 1429626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 47 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 35679369 - 35679311
Alignment:
Q  47 gagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgatttttgaact 106  Q
    ||||||| |||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  35679369 gagaagaaagaaagagttcccgacaactcaat-gaaactctttggtgtgttttttgaact 35679311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 123; Significance: 4e-63; HSPs: 23)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 47 - 320
Target Start/End: Original strand, 20107964 - 20108238
Alignment:
Q  47 gagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgatttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgtt 146  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||    
T  20107964 gagaagagagaaagagttctcgacaactcaatagaatctctttggtgtaattttagaactgagtagagtcctatatttatatagagattttttaactgtt 20108063  T
Q  147 ttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattagatcaaaggagaacttatacattaaacagttcaataacacttatggataggatc-aaaagga 245  Q
    ||||||||||||  | |||| |||| ||||||| || |||| |||  ||||||||| ||||||  ||||||| |||||||||| ||| |||| ||||| |    
T  20108064 ttagcaaaaattacaacaacagttactttaatggataagattaaaaaagaacttatccattaattagttcaacaacacttatgaataagatcaaaaagaa 20108163  T
Q  246 atagatccacaaaagtggaggaaacaaactcattgaattttgaatgaattaaagataagaaattcaattgaattc 320  Q
    | | |||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  20108164 acaaatccccaaaagtggaggaaacaaactcattacaatttgaatggaggaaagataagaaattcaattgaattc 20108238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 19798530 - 19798201
Alignment:
Q  1 aaaaaggagatgaagagaagaatagctcgtcaacacaagtt--gtagag-agaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgat 97  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||   | | || |||||| |||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||  |    
T  19798530 aaaaaggagatgaagagaagaaagactcgtcaacacaagtcaagaaaaggagaagagagaaagagttcccgacaactcaat-gaaactctttggtgtatt 19798432  T
Q  98 ttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattagatcaaaggagaa 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| |||| | ||||| || |||| |||   ||     
T  19798431 ttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattctgtaactgttttagcaaaaattgcaacaacagttactctaatggataagattaaaatggag 19798332  T
Q  198 cttatacattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaaggaatagatccacaaaagtggaggaaacaaactcattgaattttgaatgaattaa 297  Q
     |||| |||||| |||||||| ||||| | || ||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||| |  | ||  ||||||||||  ||    
T  19798331 tttatccattaatcagttcaacaacacatgtgaataggatcaaaagaaacaaatccacaaaagtagaggaaacaaaatattaga--tttgaatgaaggaa 19798234  T
Q  298 agataagaaattcaattgaattcttattcttat 330  Q
    | |||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  19798233 atataagaaattaaattaaattcttattcttat 19798201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Original strand, 38621273 - 38621602
Alignment:
Q  1 aaaaaggagatgaagagaagaatagctcgtcaacacaagttgt---agagagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgat 97  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||      || ||||||| |||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||| |    
T  38621273 aaaaaggagatgaagagaagaaaaactcgtcaacacaagtcaagaaagggagaagagagaaagagttcccgacaactcaat-gaaactctttggtgtgtt 38621371  T
Q  98 ttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattagatcaaaggagaa 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||| |||| | ||||| || |||| |||   ||     
T  38621372 ttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattttgtaactgttttagcaaaaattgcgacaacagttactctaatggataagattaaaatggag 38621471  T
Q  198 cttatacattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaaggaatagatccacaaaagtggaggaaacaaactcattgaattttgaatgaattaa 297  Q
     |||| |||||| |||||||| ||||||| | |||| ||||||||| || | ||||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||| |||  ||    
T  38621472 tttatccattaatcagttcaacaacacttgtagatatgatcaaaagaaacaaatccacagaagtggaggaaacaaact-attgga-tttgaacgaaggaa 38621569  T
Q  298 agataagaaattcaattgaattcttattcttat 330  Q
    | |||| || ||||||  |||||||||||||||    
T  38621570 atataaaaacttcaatcaaattcttattcttat 38621602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 16649164 - 16648836
Alignment:
Q  1 aaaaaggagatgaagagaagaatagctcgtcaacacaagtt--gtagagagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgatt 98  Q
    |||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||   | || ||||||| ||||| |||||  ||| ||||||| |||||| ||||||||| ||    
T  16649164 aaaaaggagatgaatagaagaaagactcgtcaacacaagtcaagaagggagaagagagaaaaagttcccgacaactcaat-gaaactttttggtgtgttt 16649066  T
Q  99 tttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattagatcaaaggagaac 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||   |||| |||| | ||||| || |||| |||    |      
T  16649065 tttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattctgtaactattttaacaaaaattgcgacaacagttactctaatggataagattaaaatgaagt 16648966  T
Q  199 ttatacattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaaggaatagatccacaaaagtggaggaaacaaactcattgaattttgaatgaattaaa 298  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||    
T  16648965 ttatccattaatcagttcaacaacacttgtgaataggatcaaaagaaacaaatccacaaaagtggaggaaacaaact-attgga-tttgaatgaaggaaa 16648868  T
Q  299 gataagaaattcaattgaattcttattcttat 330  Q
     |||||||||| | || |||| ||||||||||    
T  16648867 tataagaaatttagttaaatttttattcttat 16648836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 47450754 - 47450478
Alignment:
Q  1 aaaaaggagatgaagagaagaatagctcgtcaacacaagttgt---agagagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgat 97  Q
    ||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||      || ||||||| |||||||||||  ||  ||||||| ||||||||||| |||| |    
T  47450754 aaaaaggtgatgaagagaagaaagactcgtcaacacaagtcaagaaagggagaagagagaaagagttcccgataactcaat-gaaactctttgatgtgtt 47450656  T
Q  98 ttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattagatcaaaggagaa 197  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||| |||| | ||||| || |||| |||  |||     
T  47450655 ttttaaactgagtggagtcctctatttatatagagattctgtaactgttttagcaaaaattgtgacaacagttactctaatggataagattaaaatagag 47450556  T
Q  198 cttatacattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaaggaatagatccacaaaagtggaggaaacaaact 275  Q
     |||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||    
T  47450555 tttatccattaatcagttcaacaacacttgtggatagaatcaaaagaaacaaatccacgaaagtggaggaaacaaact 47450478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Original strand, 25844320 - 25844597
Alignment:
Q  1 aaaaaggagatgaagagaagaatagctcgtcaacacaagttgt---agagagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgat 97  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||      || ||||||| |||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||| |    
T  25844320 aaaaaggagatgaagagaagaaagactcgtcaacacaagtcaagaaagggagaagagagaaagagttcccgacaactcaat-gaaactctttggtgtgtt 25844418  T
Q  98 tttt-gaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattagatcaaaggaga 196  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||| |||| | || || || |||| |||   ||    
T  25844419 tttttgaaccgagtggagtcctctatttatatagagattctgtaactgttttagcaaaaattgcgacaacagttactctagtggataagattaaaatgga 25844518  T
Q  197 acttatacattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaaggaatagatccacaaaagtggaggaaacaaact 275  Q
      |||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| | || | ||||||||||||||||||| ||||||    
T  25844519 gtttatccattaatcagttcaacaacacttgtggataggatcaaaggaaacaaatccacaaaagtggaggaaccaaact 25844597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 39200291 - 39199966
Alignment:
Q  1 aaaaaggagatgaagagaagaatagctcgtcaacacaagttgt---agagagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgat 97  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||      || ||||||| |||||| ||||  ||| ||||||| |||||||||||||||| |    
T  39200291 aaaaaggagatgaagagaagaaagactcgtcaacacaagtcaagaaagggagaagagagaaagggttcccgacaactcaat-gaaactctttggtgtg-t 39200194  T
Q  98 ttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattagatcaaaggagaa 197  Q
    |||| |||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   || | |||| | ||| | || |||| |||   ||     
T  39200193 ttttaaaccaagtggagtcctctatttatatagagattatgtagctgttttagcaaaaattgcgacagcagttactctaacggataagattaaaatggag 39200094  T
Q  198 cttatacattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaaggaatagatccacaaaagtggaggaaacaaactcattgaattttgaatgaattaa 297  Q
     |||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||  ||    
T  39200093 tttatccattaatcagttcaacaacacttgtggataggatcaaaagaaacaaatcgacaaaagtggaggaaacaaactatttga--tttgaatgaaggaa 39199996  T
Q  298 agataagaaattcaattgaattcttattct 327  Q
    | |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  39199995 atataagaaatttaattaaattcttattct 39199966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 4 - 336
Target Start/End: Original strand, 8138198 - 8138517
Alignment:
Q  4 aaggagatgaagagaagaatagctcgtcaacacaagttgtagagagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgatttttga 103  Q
    |||||||| | || |||||||||||||||| ||||| || |  ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||           |||| ||||||||    
T  8138198 aaggagataaggaaaagaatagctcgtcaatacaagctgaatggagaagagagaaagagttctcgacaactcaatat----------gtgtaatttttga 8138287  T
Q  104 actgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattagatcaaaggagaacttata 203  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | ||   |||| | ||| | || |||||||| | ||||||||     
T  8138288 actgagtgaagttctctatttatatagagattttgtaactgttttagcaaaagttgcagcagtagttactctaacggataagatcaaaagggaacttatc 8138387  T
Q  204 cattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaaggaatagatccacaaaagtggaggaaacaaactcattgaattttgaatgaattaaagataa 303  Q
    ||||||  ||||||| ||||||| | |||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| |||||| | | || | |||  |||||||     
T  8138388 cattaatgagttcaacaacacttgtagataagatcaaaagaaataaaaccacaaaagtggaggaaacaaattcattgga-tatggacgaaggaaagatag 8138486  T
Q  304 gaaattcaattgaattcttattcttattcttat 336  Q
    |||||||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  8138487 gaaattcagttgaattc--attcttattcttat 8138517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 97 - 275
Target Start/End: Original strand, 10135988 - 10136166
Alignment:
Q  97 tttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattagatcaaaggaga 196  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||| |||| | ||||| || |||| |||   ||    
T  10135988 tttttgaactaagtggagtcctctatttatatagagattctgtaactgttttagcaaaaattgcgacaacagttactctaatggataagattaaaatgga 10136087  T
Q  197 acttatacattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaaggaatagatccacaaaagtggaggaaacaaact 275  Q
      |||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||    
T  10136088 gtttatccattaatcagttcaacaacacttgtggataggatcaaaagaaacaaatccacaaaagtggaggaaacaaact 10136166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 97 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 26927153 - 26926975
Alignment:
Q  97 tttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattagatcaaaggaga 196  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||| |||| | ||||| || |||| |||   ||    
T  26927153 tttttgaactaagtggagtcctctatttatatagagattctgtaactgttttagcaaaaattgcgacaacagttactctaatggataagattaaaatgga 26927054  T
Q  197 acttatacattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaaggaatagatccacaaaagtggaggaaacaaact 275  Q
      |||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||    
T  26927053 gtttatccattaatcagttcaacaacacttgtggataggatcaaaagaaacaaatccacaaaagtggaggaaacaaact 26926975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 16834040 - 16834364
Alignment:
Q  1 aaaaaggagatgaagagaagaatagctcgtcaacacaagttgt---agagagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgat 97  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||      || ||||||| |||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||  |    
T  16834040 aaaaaggagatgaagagaagaaagactcatcaacacaagtcaagaaagggagaagagagaaagagttcccgacaactcaat-gaaactctttggtgtatt 16834138  T
Q  98 ttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattagatcaaaggagaa 197  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    |||  ||| | ||||| || |||| |||    |     
T  16834139 gtttgaactaagtggagtcctctatttatatagagattttgtaactgttttagccaaaattgcgataacaattactctaatggataagattaaaatgaag 16834238  T
Q  198 cttatacattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaaggaatagatccacaaaagtggaggaaacaaactcattgaattttgaatgaattaa 297  Q
     |||| |||||| |||||||| |||| || |||||||||||||| | || | |||||||||||| ||||||||||||| |||| | ||| ||| ||  ||    
T  16834239 tttatgcattaatcagttcaacaacatttgtggataggatcaaaggaaacaaatccacaaaagtagaggaaacaaact-attgga-tttaaataaaggaa 16834336  T
Q  298 agataagaaattcaattgaattcttatt 325  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||    
T  16834337 atataagaaattcaattaaattcttatt 16834364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 47 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 33300724 - 33300613
Alignment:
Q  47 gagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgatttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgtt 146  Q
    ||||||| |||||||||||  ||| | ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33300724 gagaagagagaaagagttcccgacaattcaat-gaaactctttggtgtgttttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattttgtaactgtt 33300626  T
Q  147 ttagcaaaaattg 159  Q
    |||||||||||||    
T  33300625 ttagcaaaaattg 33300613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 96 - 275
Target Start/End: Original strand, 10140755 - 10140934
Alignment:
Q  96 atttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattagatcaaaggag 195  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||   |||| |||| | ||||| || |||| |||   |    
T  10140755 atttttgaattaagtggagtcctctatttatacagagattctgtaactgttttagcaaaaattgcgacaacagttactctaatggataagattaaaatgg 10140854  T
Q  196 aacttatacattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaaggaatagatccacaaaagtggaggaaacaaact 275  Q
    |  |||| |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||| ||||||||    
T  10140855 agtttatccattaatcagttcaataacacttgtggatatgatcaaaagaaacaaatccacaaaagtggaggtaacaaact 10140934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 11806828 - 11806961
Alignment:
Q  1 aaaaaggagatgaagagaagaatagctcgtcaacacaagttgtagagagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgatttt 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||||| ||||||  |  |||||||||||||||||||| || |||||    
T  11806828 aaaaaggagatgaggagaagaatagctcatcaacacaagatggaggaagaagagagaaatagttctcaataactcaatagaaactctttggcgtaatttt 11806927  T
Q  101 tgaactgagtggagtcctctatttatatagagat 134  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11806928 tgaaatgagtggagtcctctatttatatagagat 11806961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Original strand, 16036187 - 16036292
Alignment:
Q  1 aaaaaggagatgaagagaagaatagctcgtcaacacaagttgtagagagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgatttt 100  Q
    |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  16036187 aaaaaggagtcgaggagaagaatagctcgtcaacacaagctggagggagaagagagaaagagttctcgacaacttaatagaaactctttggtgtaatttt 16036286  T
Q  101 tgaact 106  Q
    ||||||    
T  16036287 tgaact 16036292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 184 - 339
Target Start/End: Original strand, 11806958 - 11807112
Alignment:
Q  184 agatcaaaggagaacttatacattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaaggaat-agatccacaaaagtggaggaaacaaactcattgaa 282  Q
    |||||||| | |||||||| ||||||  ||||| | ||| ||| |||||| |||||||| |||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  11806958 agatcaaaagggaacttatccattaataagttcgacaacgcttgtggataagatcaaaaagaaacaaatccacaaaagtggatgaaacaaactcattgga 11807057  T
Q  283 ttttgaatgaattaaagataagaaattcaattgaattcttattcttattcttatcac 339  Q
    ||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11807058 ttt-gaatgaaagaaagataagaa-ttcaattgaattcttatttttattcttatcac 11807112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 111 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 51040940 - 51040776
Alignment:
Q  111 ggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattagatcaaaggagaacttatacattaaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||| |||| | ||||| || | || |||    |  |||| ||||||     
T  51040940 ggagtcctctatttatatagagattctgtaactgttttagcaaaaattgcgacaacagttactctaatggataaaattaaaatgaagtttatccattaat 51040841  T
Q  211 cagttcaataacacttatggataggatcaaaaggaatagatccacaaaagtggaggaaacaaact 275  Q
    |||||||| ||||||| |||||| ||||||| | || | ||||||||||||||||||||||||||    
T  51040840 cagttcaacaacacttgtggataagatcaaatgaaacaaatccacaaaagtggaggaaacaaact 51040776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Original strand, 7882551 - 7882659
Alignment:
Q  1 aaaaaggagatgaagagaagaatagctcgtcaacacaagttgt---agagagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgat 97  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||     || ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  7882551 aaaaaggagatgaagagaagaaagactcgtcaacacaagttaagaaagggagaagagagaaagagttctcgacaactcaatagaaactctttgatgtgat 7882650  T
Q  98 ttttgaact 106  Q
     ||||||||    
T  7882651 ctttgaact 7882659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 106
Target Start/End: Original strand, 12260562 - 12260663
Alignment:
Q  4 aaggagatgaagagaagaatagctcgtcaacacaagttgtagagagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgatttttga 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||||| ||||||||||||  || ||||||||| || ||||||||||| || ||||    
T  12260562 aaggagatgaagagaagaataactcgttaacacaagctgaagggagaagagagaaagagttctcaacaactcaatag-aattctttggtgtgtttcttga 12260660  T
Q  104 act 106  Q
    |||    
T  12260661 act 12260663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 47 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 10999374 - 10999287
Alignment:
Q  47 gagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgatttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagatt 135  Q
    ||||||| | ||| |||||| ||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  10999374 gagaagagataaaaagttctcgacaactcaata-aaattatttggtgtgatttttgaactaagtggactcctctgtttatatggagatt 10999287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 39587888 - 39587781
Alignment:
Q  1 aaaaaggagatgaagagaagaatagctcgtcaacacaagtt---gtagagagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgat 97  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||   | |  ||||||| ||||| ||||| |||| ||||||| |||||| ||| ||||| |    
T  39587888 aaaaaggagatgaagagaagaaagactcgtcaacacaagttaaggaatggagaagagagaaatagttcctgacaactcaat-gaaactatttagtgtgtt 39587790  T
Q  98 ttttgaact 106  Q
    |||||||||    
T  39587789 ttttgaact 39587781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 284 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 33300513 - 33300467
Alignment:
Q  284 tttgaatgaattaaagataagaaattcaattgaattcttattcttat 330  Q
    |||||||||| |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  33300513 tttgaatgaagtaaatataaaaaattcaattaaattcttattcttat 33300467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 23192307 - 23192251
Alignment:
Q  47 gagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgatttttgaa 104  Q
    ||||||| |||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  23192307 gagaagagagaaagagttcccgacaactcaat-gaaactctttggtgtaatttttgaa 23192251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 119; Significance: 9e-61; HSPs: 23)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Original strand, 3419554 - 3419883
Alignment:
Q  1 aaaaaggagatgaagagaagaatagctcgtcaacacaagttgt---agagagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgat 97  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||      || ||||||| |||||||||||  ||| ||||| | |||||||||||||||| |    
T  3419554 aaaaaggagatgaagagaagaaagactcgtcaacacaagtcaagaaagggagaagagagaaagagttcccgacaactcagt-gaaactctttggtgtgtt 3419652  T
Q  98 ttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattagatcaaaggagaa 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||   |||| |||| | |||||||| |||| |||   ||     
T  3419653 ttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattctctaactattttagcaaaaattgcgacaacagttactctaatgaataagattaaaatggat 3419752  T
Q  198 cttatacattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaaggaatagatccacaaaagtggaggaaacaaactcattgaattttgaatgaattaa 297  Q
     |||| |||||| |||||| | |||| || ||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||  ||    
T  3419753 tttatccattaatcagttcgacaacagttgtggataggatcaaaa-gaaaaaattcacaaaagtggaggaaacaaactatttgaa-tttgaatgaaggaa 3419850  T
Q  298 agataagaaattcaattgaattcttattcttat 330  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3419851 atataagaaattcaattaaattcttattcttat 3419883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 47 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 12965368 - 12965089
Alignment:
Q  47 gagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgatttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgtt 146  Q
    ||||||| |||||||||||  ||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||    
T  12965368 gagaagagagaaagagttcccgacaactcaata-aaactcttttgtgtaatttttgaactgagtggagtcttttatttatatagagattttgtaactgtt 12965270  T
Q  147 ttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattagatcaaaggagaacttatacattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaaggaa 246  Q
    ||| |||||||||   || | |||| | ||||| || |||||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||    
T  12965269 ttaacaaaaattgcggca-cagttactctaatggataagatcaaaagagaacttatccattaaccagttcaacaacacttgtggataagatcaaaagaaa 12965171  T
Q  247 tagatccacaaaagtggaggaaacaaactcattgaattttgaatgaattaaagataagaaattcaattgaattcttattcttat 330  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| ||||  | ||  ||||||||||  ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  12965170 tagatcgacaaaagcggaggaaacgaactactgga--tttgaatgaaggaaatataagaaattgaattaaattcttattcttat 12965089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 23665653 - 23665376
Alignment:
Q  1 aaaaaggagatgaagagaagaatagctcgtcaacacaagttgt---agagagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgat 97  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||      || ||||||| |||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||| |    
T  23665653 aaaaaggagatgaagagaagaaagactcgtcaacacaagtcaagaaagggagaagagagaaagagttcccgacaactcaat-gaaactctttggtgtgtt 23665555  T
Q  98 tttt-gaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattagatcaaaggaga 196  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||| |||| | || || || |||| |||   ||    
T  23665554 tttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattctgtaactgttttagcaaaaattgcgacaacagttactctagtggataagattaaaatgga 23665455  T
Q  197 acttatacattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaaggaatagatccacaaaagtggaggaaacaaact 275  Q
      |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||    
T  23665454 gtttatccattaatcagttcaacaacacttatggatagaatcaaaagaaacaaatccacaaaagtggaggaaccaaact 23665376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 7570746 - 7570469
Alignment:
Q  1 aaaaaggagatgaagagaagaatagctcgtcaacacaagttgt---agagagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgat 97  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||      || ||||||| |||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||| |    
T  7570746 aaaaaggagatgaagagaagaaagactcgtcaacacaagtcaagaaagggagaagagagaaagagttcccgacaactcaat-gaaactctttggtgtgtt 7570648  T
Q  98 tttt-gaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattagatcaaaggaga 196  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||   ||||  ||| | ||||| || |||| |||    |    
T  7570647 tttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattctgtaactgttttagcaaaaactgcgacaacaattactctaatggataagattaaaatgaa 7570548  T
Q  197 acttatacattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaaggaatagatccacaaaagtggaggaaacaaact 275  Q
      |||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||    
T  7570547 gtttatccattaatcagttcaacaacacttgtggataggatcaaaagaaacaaatccacaaaagtggaggaaacaaact 7570469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Original strand, 20520522 - 20520851
Alignment:
Q  1 aaaaaggagatgaagagaagaatagctcgtcaacacaagttgt---agagagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgat 97  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||      || ||||||| ||||||||||   | | ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  20520522 aaaaaggagatgaagagaagaaagactcgtcaacacaagtcaagaaagggagaagagagaaagagtttccgccaactcaat-gaaactctttggtgtaat 20520620  T
Q  98 ttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattagatcaaaggagaa 197  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||   |||| | || | ||||| || |||| |||   ||     
T  20520621 tttggaactgagtggagtcctctatttatatcgagattttgtaaccgttttagcaaaaattgcgacaacagatactctaatggataagattaaaatggag 20520720  T
Q  198 cttatacattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaaggaatagatccacaaaagtggaggaaacaaactcattgaattttgaatgaattaa 297  Q
     |||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| || | |||||||||||  ||||||||||||| ||||   ||||||| ||  ||    
T  20520721 tttatccattaatcagttcaacaacacttgtggataggatcaaaagaaacaaatccacaaaagcagaggaaacaaact-attg-ggtttgaataaaggaa 20520818  T
Q  298 agataagaaattcaattgaattcttattcttat 330  Q
    | |||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  20520819 atataagaaatttaattaaattcttattcttat 20520851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Original strand, 46964577 - 46964903
Alignment:
Q  1 aaaaaggagatgaagagaagaatagctcgtcaacacaagttgt---agagagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgat 97  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |      || ||||||| |||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  46964577 aaaaaggagatgaagagaagaaagactcgtcaacacaaatcaagaaagggagaagagagaaagagttcccgacaactcaat-gaaactctttggtgtgat 46964675  T
Q  98 ttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattagatcaaaggagaa 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||   |||| |||| | ||||| || |||| |||   ||     
T  46964676 ttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattcagtaactattttagtaaaaattgcgacaacagttactctaatggataagattaaaatggag 46964775  T
Q  198 cttatacattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaaggaatagatccacaaaagtggaggaaacaaactcattgaattttgaatgaattaa 297  Q
     |||| |||||| || |||   ||||||  |||||| ||||||||| || | |||||||| ||||||| |||||||||  | ||  ||||||||||  ||    
T  46964776 tttatccattaatcaattc---aacactcgtggataagatcaaaagaaacaaatccacaagagtggagaaaacaaactactgga--tttgaatgaaggaa 46964870  T
Q  298 agataagaaattcaattgaattcttattcttat 330  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  46964871 atataagaaattcaattaaattcttattcttat 46964903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Original strand, 55326343 - 55326618
Alignment:
Q  1 aaaaaggagatgaagagaagaatagctcgtcaacacaagttgt---agagagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgat 97  Q
    |||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||      || ||||||| |||||||||||  ||| ||||||| |||| ||||||||||| |    
T  55326343 aaaaagaagatgaagagaagaaagactcgtcaacacaagtcaagaaagggagaagagagaaagagttcccgacaactcaat-gaaaatctttggtgtg-t 55326440  T
Q  98 ttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattagatcaaaggagaa 197  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||  ||| | ||||| || |||| |||   ||     
T  55326441 ttttgaacttagtggagtcctctatttatatagagattctgtaactgttttagcaaaaattgcgacaacaattactctaatggataagattaaaatggag 55326540  T
Q  198 cttatacattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaaggaatagatccacaaaagtggaggaaacaaact 275  Q
     |||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  55326541 tttatccattaataagttcaacaacacttgtggataggatcaaaagaaacaaatccacaaaagttgaggaaacaaact 55326618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 77 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 12112064 - 12111805
Alignment:
Q  77 atagaaactctttggtgtgatttttg---aactgagtg-gagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattgaatcaacggttaa 172  Q
    |||||||||||||||||| ||||||    |||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||  |||     
T  12112064 atagaaactctttggtgtaatttttttttaaccaagtgagagtcctctatttatatagagattttgtaactgttttagcaaaaattgcggcaacaattac 12111965  T
Q  173 tttaatgaattagatcaaaggagaacttatacattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaaggaat-agatccacaaaagtggaggaaaca 271  Q
    | ||||| || |||| |||   |||||||| |||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||    
T  12111964 tctaatggataagattaaaaaggaacttatccattaatcagttcaacaacacttgtagataggatcaaaaagaaacaaatccacaaaagtggaggaaaca 12111865  T
Q  272 aactcattgaattttgaatgaattaaagataagaaattcaattgaattcttattcttattc 332  Q
    || |||||| |||| ||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  12111864 aattcattggattt-gaacgaagtaaatataagaaattcaattaaattcttattcatattc 12111805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Original strand, 27709497 - 27709772
Alignment:
Q  1 aaaaaggagatgaagagaagaatagctcgtcaacacaagtt--gtagag-agaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgat 97  Q
    |||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||   | | || |||||| ||||||||||   ||| ||||||| |||||||||||||||| |    
T  27709497 aaaaagtagatgaagagaagaaagactcgtcaacacaagtcaagaaaaggagaagagagaaagagtttccgacaactcaat-gaaactctttggtgtgtt 27709595  T
Q  98 ttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattagatcaaaggagaa 197  Q
     ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||| || | | ||||| || |||| |||   ||     
T  27709596 ctttaaactgagtggagtc-tctatttatatagagattctgtaactgttttagcaaaaattgcgacaacagtaactctaatggataagattaaaatggag 27709694  T
Q  198 cttatacattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaaggaatagatccacaaaagtggaggaaacaaact 275  Q
     |||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||    
T  27709695 tttatccattaatcagttcaacaacacttgtggataggatcaaaagaaacaaatccacaaaagtggaggaaacaaact 27709772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 757894 - 757620
Alignment:
Q  1 aaaaaggagatgaagagaagaatagctcgtcaacacaagttgt---agagagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgat 97  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||      || ||||||| ||||||| |||  ||| ||||||| |||||||||||||||| |    
T  757894 aaaaaggagatgaagagaagaaagactcgtcaacacaagtcaagaaagggagaagagagaaagaattcccgacaactcaat-gaaactctttggtgtgtt 757796  T
Q  98 ttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattagatcaaa--ggag 195  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||  ||| | ||||| || |||| |||  ||||    
T  757795 ttttgagctgagtggagttctctatttatatagagattatgtaactgttttagcaaaaattgcgacaacaattactctaatggataagattaaaatggag 757696  T
Q  196 aacttatacattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaaggaatagatccacaaaagtggaggaaacaa 272  Q
       |||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||||| || | ||||||||||||||||| |||||    
T  757695 -ttttatccattaatcagttcaacaacacttgtggatagtatcaaaagaaacaaatccacaaaagtggaggtaacaa 757620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 97 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 14438132 - 14437893
Alignment:
Q  97 tttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattagatcaaaggaga 196  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||| |||| | ||||| || |||| |||   ||    
T  14438132 tttttgaactaagtgaagtcctctatttatatagagattctgtaactgttttagcaaaaattgcgacaacagttactctaatggataagattaaaatgga 14438033  T
Q  197 acttatacattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaaggaatagatccacaaaagtggaggaaacaaactcattgaattttgaatgaatta 296  Q
      |||| |||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||| || | ||||||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||||||  |    
T  14438032 gtttatccattaatcagttcaacaaaacttgtggataggatcaaaagaaacaaatccacaaaagcggaggaaacaaact-attgga-tttgaatgaagga 14437935  T
Q  297 aagataagaaattcaattgaattcttattcttattcttatcac 339  Q
    || ||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||    
T  14437934 aatataagaaattcaattaaatt-aaattcttattcttatcac 14437893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 80 - 324
Target Start/End: Original strand, 55431875 - 55432117
Alignment:
Q  80 gaaactctttggtgtgatttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatg 179  Q
    |||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||   |||| |||| | |||||    
T  55431875 gaaactctttggtgtattttttaaattgagtggagtcctctatttatatagagattctgtaactgttttaacaaaaattgcgacaacagttactctaatg 55431974  T
Q  180 aattagatcaaaggagaacttatacattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaaggaatagatccacaaaagtggaggaaacaaactcatt 279  Q
     || |||| |||    |  ||||  ||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  55431975 gataagattaaaatgaagtttatcaattaatcagttcaacaacacttgtggatatgatcaaaagaaataaatccacaaaagcggaggaaacaaact-att 55432073  T
Q  280 gaattttgaatgaattaaagataagaaattcaattgaattcttat 324  Q
    | | ||||||||||  ||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  55432074 gga-tttgaatgaaggaaatataagaaatttaattaaattcttat 55432117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 23660994 - 23660833
Alignment:
Q  1 aaaaaggagatgaagagaagaatagctcgtcaacacaagttgt---agagagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgat 97  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||      || ||||||| |||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||| |    
T  23660994 aaaaaggagatgaagagaagaaagactcgtcaacacaagtcaagaaagggagaagagagaaagagttcccgacaactcaat-gaaactctttggtgtgtt 23660896  T
Q  98 tttt-gaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattg 159  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23660895 tttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattctgtaactgttttagcaaaaattg 23660833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 97 - 285
Target Start/End: Original strand, 18472669 - 18472856
Alignment:
Q  97 tttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattagatcaaaggaga 196  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||   |||| |||| | ||||| || |||| |||   ||    
T  18472669 tttttgaactaagtggaatcctctatttatatatagattcggtaactgttttagcaaaaattgcgacaacagttactctaatggataagattaaaatgga 18472768  T
Q  197 acttatacattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaaggaatagatccacaaaagtggaggaaacaaactcattgaattt 285  Q
      |||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18472769 gtttatccattaatcagttcaacaacacttgtggataggatcaaaagaaacaaatccacaaaagtggaggaaacaaact-attgaattt 18472856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 97 - 275
Target Start/End: Original strand, 18467875 - 18468053
Alignment:
Q  97 tttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattagatcaaaggaga 196  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||| |||| | ||||| || |||| |||   ||    
T  18467875 tttttgaactaagtggaatcctctatttatatagagattctgtaactgttttagcaaaaattgcgacaacagttactctaatggataagattaaaatgga 18467974  T
Q  197 acttatacattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaaggaatagatccacaaaagtggaggaaacaaact 275  Q
      |||| |||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||| |||||    
T  18467975 gtttatccattaatcagttcaacaacacttgcggatatgatcaaaagaaacaaatccacaaaagtggaggaaaaaaact 18468053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 101 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 32473452 - 32473278
Alignment:
Q  101 tgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattagatcaaaggagaactt 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||  ||| | ||||| || |||| |||   ||  ||    
T  32473452 tgaacttagtggagtcctctatttatatagagattctgtaactgttttagcaaaaattgcgacaacaattactctaatggataagattaaaatggagttt 32473353  T
Q  201 atacattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaaggaatagatccacaaaagtggaggaaacaaact 275  Q
    || |||||| |||||||| |||| || |||||||||||||||| || | || |||||||||||||||||||||||    
T  32473352 atccattaatcagttcaacaacatttgtggataggatcaaaagaaacaaattcacaaaagtggaggaaacaaact 32473278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 139 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 12971205 - 12971016
Alignment:
Q  139 taactgttttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattagatcaaaggagaacttatacattaaacagttcaataacacttatggataggatc 238  Q
    ||||| |||||||||||||||   |||| |||| | ||||  || |||| ||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  12971205 taactattttagcaaaaattgcggcaacagttactctaattgataagataaaaagagaacttatccattaatcagttcaacaacacttgtggataggatc 12971106  T
Q  239 aaaaggaatagatccacaaaagtggaggaaacaaactcattgaattttgaatgaattaaagataagaaattcaattgaattcttattcttat 330  Q
    ||||| || | ||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||||  ||| |||||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  12971105 aaaagaaacaaatccacaaaagtggacgaaacaaact-attgga-tttgaatgaaggaaatataagaaatttaattaaattcttattattat 12971016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 16 - 115
Target Start/End: Original strand, 11399944 - 11400043
Alignment:
Q  16 agaagaatagctcgtcaacacaagttgtagagagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgatttttgaactgagtggagt 115  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || || ||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||    
T  11399944 agaagaatagctcgtcaactcaagctggagggagaagagagaaagagttctcgacaactcgatagaaactctttggtcttatttttaaactgagtggagt 11400043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 199 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 23660820 - 23660744
Alignment:
Q  199 ttatacattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaaggaatagatccacaaaagtggaggaaacaaact 275  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||    
T  23660820 ttatccattaatcagttcaacaacacttatggatagaatcaaaagaaacaaatccacaaaagtggaggaaccaaact 23660744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 10708231 - 10708150
Alignment:
Q  1 aaaaaggagatgaagagaagaatagctcgtcaacacaagttgtagagagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaa 82  Q
    |||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||| || || ||||||| ||||||||||||  || |||||||||||    
T  10708231 aaaaaggagatgagaagaagaatagttcgtcaagacaagatggagggagaagagagaaagagttctctacaactcaatagaa 10708150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Original strand, 29350806 - 29350913
Alignment:
Q  1 aaaaaggagatgaagagaagaatagctcgtcaacacaagt---tgtagagagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgat 97  Q
    ||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||   |  ||  |||||| |||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||| |    
T  29350806 aaaaatgagatgaagagaagaaagactcgtcaacacaagtcaataaaggaagaagagagaaagagttcccgacaactcaat-gaaactctttggtgtgtt 29350904  T
Q  98 ttttgaact 106  Q
    |||||||||    
T  29350905 ttttgaact 29350913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 233 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 39775122 - 39775080
Alignment:
Q  233 aggatcaaaaggaatagatccacaaaagtggaggaaacaaact 275  Q
    ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||    
T  39775122 aggatcaaaagaaacaaatccacaaaagtggaggaaacaaact 39775080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 25726304 - 25726239
Alignment:
Q  1 aaaaaggagatgaagagaagaatagctcgtcaacacaagttgtagagagaagatagaaagagttct 66  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||  | |  ||||||| ||||||||||||    
T  25726304 aaaaaggagatgaagagaagaataattcgttaacacaagccgaaatgagaagagagaaagagttct 25726239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352 (Bit Score: 101; Significance: 5e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0352
Description:

Target: scaffold0352; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Original strand, 7672 - 7949
Alignment:
Q  1 aaaaaggagatgaagagaagaatagctcgtcaacacaagttgt---agagagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgat 97  Q
    |||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||      || ||||| | |||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||| |    
T  7672 aaaaaggagatgaagataagaacgactcgtcaacacaagtcaagaaagggagaaaagagaaagagttcccgacaactcaat-gaaactctttggtgtgtt 7770  T
Q  98 tttt-gaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattagatcaaaggaga 196  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||| |||| | ||||| || |||| |||   ||    
T  7771 tttttgaaccgagtggagtcctctatttatatagagattctgtaactgttttagcaaaaattgcgacaacagttactctaatggataagattaaaatgga 7870  T
Q  197 acttatacattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaaggaatagatccacaaaagtggaggaaacaaact 275  Q
      |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||    
T  7871 gtttatccattaaacagttcaacaacacttgtggataggatcaaaagaaacaaatccacaatagtggaggaaacaaact 7949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Original strand, 4629 - 4905
Alignment:
Q  1 aaaaaggagatgaagagaagaatagctcgtcaacacaagttgt---agagagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgat 97  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||      || ||||||| |||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||| |    
T  4629 aaaaaggagatgaagagaagaaagactcgtcaacacaagtcaagaaagggagaagagagaaagagttcccgacaactcaat-gaaactctttggtgtgtt 4727  T
Q  98 ttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattagatcaaaggagaa 197  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||| |||| | || || || |||| |||    |     
T  4728 ttttgaactgagtggagtcatctatttatatagagattctgtaactgttttagcaaaaattgcgacaacagttactctagtggataagattaaaatgaag 4827  T
Q  198 cttatacattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaaggaatagatccacaaaagtggaggaaacaaact 275  Q
     |||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| | || | ||||||||||||||||||| ||||||    
T  4828 tttatccattaatcagttcaacaacacttgtggataggatcaaaggaaacaaatccacaaaagtggaggaaccaaact 4905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 47 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 443424 - 443161
Alignment:
Q  47 gagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgatttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgtt 146  Q
    ||||| |||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  443424 gagaaaatagaaagagttcccgacaactcaat-gaaactctttggtgtgttttttgaactgagtggagtcctctatttgtatagagattctgtaactgtt 443326  T
Q  147 ttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattagatcaaaggagaacttatacattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaaggaa 246  Q
    |||||||||||||   ||   |||| | ||||| || |||| |||    |  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||| |    
T  443325 ttagcaaaaattgtgacagtagttactctaatggataagataaaaatgaagtttatacattaatcagttcaacaacacttatggataagatc-aaaggta 443227  T
Q  247 tagatccacaaaagtggaggaaacaaactcattgaattttgaatgaattaaagataagaaattcaatt 314  Q
     | ||||| | ||||| |||||||||||| |||| | ||||||||||  ||| |||||||||| ||||    
T  443226 caaatccatacaagtgaaggaaacaaact-attgga-tttgaatgaaggaaatataagaaatttaatt 443161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0690 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0690
Description:

Target: scaffold0690; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 6 - 330
Target Start/End: Original strand, 5801 - 6122
Alignment:
Q  6 ggagatgaagagaagaatagctcgtcaacacaagttgtagagagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgatttttgaac 105  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||| |||||| || || ||||||| |||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||||   ||| ||||    
T  5801 ggagacgaggagaacaatagctcgtcaccacaagatgcagggagaagagagaaagagttatcgacaactcaataaaaactctttggtgtctctttcgaac 5900  T
Q  106 tgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattagatcaaaggagaacttataca 205  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |  |   |  | ||||| || |||||||| | |||  |||  |    
T  5901 taagtggagtcctctatttatatagagattttgtaactgttttagcaaaaattgcgcc--caaatgctctaatggataagatcaaacg-gaaactatcta 5997  T
Q  206 ttaaacagttcaataacacttatggat-aggatcaaaaggaatagatccacaaaagtggaggaaacaaactcattgaattttgaatgaattaaagataag 304  Q
    |||| |||||||| ||||||| ||||| |||   ||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||  |||||||||    
T  5998 ttaatcagttcaacaacacttgtggataaggtaaaaaagaaacaaatccacaaaagtggaggaaacaaactcatttga-tttgaatgaaggaaagataag 6096  T
Q  305 aaattcaattgaattcttattcttat 330  Q
    ||||| |  |||||||||||||||||    
T  6097 aaatttaggtgaattcttattcttat 6122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 158
Target Start/End: Original strand, 4543 - 4696
Alignment:
Q  4 aaggagatgaagagaagaatagctcgtcaacacaagttgtagagagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgatttttga 103  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||  |||||||| |||||    ||||| ||||||||    
T  4543 aaggagatgaggagaagaatagctcgtcaacacaagttggag-gagaagagagaaagagttctcgaaaactcaatataaactgcacggtgtaatttttga 4641  T
Q  104 actgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaatt 158  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  4642 actgagtggagtcctctgtatatatagagattttgtaattgttttagcaaaaatt 4696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Original strand, 29741 - 30067
Alignment:
Q  1 aaaaaggagatgaagagaagaatagctcgtcaacacaagttgt---agagagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgat 97  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||      || ||||||| ||||| ||||   ||| ||||||| |||||||||||||||| |    
T  29741 aaaaaggagatgaagagaagaaagactcgtcaacacaagtcaagaaagggagaagagagaaaaagtttccgacaactcaat-gaaactctttggtgtg-t 29838  T
Q  98 ttttgaactgagtggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattgaatcaacggttaatttaatgaattagatcaaaggagaa 197  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||   |||| |||| | ||||| || |||| |||   ||     
T  29839 ttttgaactgattggagtcctctatttatatagagattctataactgttttagaaaaaattgcgacaacagttactctaatggataagattaaaatggag 29938  T
Q  198 cttatacattaaacagttcaataacacttatggataggatcaaaaggaatagatccacaaaagtggaggaaacaaactcattgaattttgaatgaattaa 297  Q
     |||| |||||| || ||||| ||||||| |||||||||| ||||  || | |||||||||||| || |||||||| | |||| | ||| || |||  ||    
T  29939 tttatccattaatcaattcaacaacacttgtggataggat-aaaaaaaacaaatccacaaaagtaga-gaaacaaa-ttattgga-tttcaacgaaggaa 30034  T
Q  298 agataagaaattcaattgaattcttattcttat 330  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30035 atataagaaattcaattaaattcttattcttat 30067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Original strand, 26021 - 26128
Alignment:
Q  1 aaaaaggagatgaagagaagaatagctcgtcaacacaagttgt---agagagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgat 97  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||      || ||||||| |||||||||||  | | ||||||| ||||||||||||||||||    
T  26021 aaaaaggagatgaagagaagaaagactcatcaacacaagtcaagaaagggagaagagagaaagagttcccggcaactcaat-gaaactctttggtgtgat 26119  T
Q  98 ttttgaact 106  Q
    |||||||||    
T  26120 ttttgaact 26128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 147919 - 147814
Alignment:
Q  1 aaaaaggagatgaagagaagaatagctcgtcaacacaagttgtagagagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgatttt 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |  || | ||||| | |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  147919 aaaaaggagatgaggagaagaatatctcgtcaacacaagctagagggggaagagataaagagttctcgacaattcaatagaaactctttggtgtgatttt 147820  T
Q  101 tgaact 106  Q
    ||||||    
T  147819 tgaact 147814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 145903 - 145845
Alignment:
Q  47 gagaagatagaaagagttcttgaccactcaatagaaactctttggtgtgatttttgaact 106  Q
    ||||||| |||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  145903 gagaagagagaaagagttatcgacaactcaatagaa-ctctttggtgtgatttttgaact 145845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 110 - 159
Target Start/End: Original strand, 35800 - 35849
Alignment:
Q  110 tggagtcctctatttatatagagattgtgtaactgttttagcaaaaattg 159  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||    
T  35800 tggagtcctctgtttatatagaaattttgtaactgttttagcaaacattg 35849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University