View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF16036_low_2 (Length: 473)

Name: NF16036_low_2
Description: NF16036
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF16036_low_2
NF16036_low_2
[»] chr3 (50 HSPs)
chr3 (15-469)||(20748009-20748458)
chr3 (18-347)||(11656010-11656332)
chr3 (15-274)||(18476984-18477241)
chr3 (39-469)||(13790542-13790969)
chr3 (40-365)||(17702376-17702695)
chr3 (42-469)||(44452343-44452769)
chr3 (40-469)||(15635742-15636169)
chr3 (15-310)||(8224865-8225146)
chr3 (40-274)||(24195578-24195812)
chr3 (44-367)||(295428-295742)
chr3 (40-364)||(23954427-23954745)
chr3 (40-366)||(18547617-18547938)
chr3 (42-366)||(18064081-18064395)
chr3 (42-366)||(18034770-18035085)
chr3 (42-473)||(19633746-19634166)
chr3 (45-274)||(17042630-17042857)
chr3 (40-243)||(18483242-18483444)
chr3 (73-367)||(28051104-28051392)
chr3 (157-365)||(9031369-9031569)
chr3 (157-354)||(9036689-9036878)
chr3 (44-469)||(1919117-1919531)
chr3 (15-367)||(13913760-13914103)
chr3 (150-274)||(6580847-6580970)
chr3 (137-272)||(15686126-15686259)
chr3 (42-200)||(13515469-13515626)
chr3 (41-274)||(21718802-21719029)
chr3 (162-365)||(7495921-7496115)
chr3 (157-356)||(13917823-13918013)
chr3 (157-365)||(8749010-8749210)
chr3 (160-348)||(7479128-7479307)
chr3 (175-367)||(12054454-12054637)
chr3 (145-274)||(21253968-21254097)
chr3 (41-274)||(286769-286996)
chr3 (151-274)||(21094683-21094805)
chr3 (40-162)||(17136013-17136136)
chr3 (157-270)||(31649749-31649860)
chr3 (151-274)||(980348-980468)
chr3 (157-354)||(11558311-11558495)
chr3 (157-354)||(11567580-11567764)
chr3 (157-308)||(3552202-3552344)
chr3 (45-152)||(6579425-6579531)
chr3 (387-469)||(19532097-19532179)
chr3 (237-366)||(19531950-19532073)
chr3 (16-98)||(7478984-7479067)
chr3 (157-213)||(13100710-13100766)
chr3 (225-367)||(13524736-13524871)
chr3 (157-195)||(14406616-14406654)
chr3 (278-346)||(10189299-10189368)
chr3 (279-346)||(10082375-10082443)
chr3 (278-345)||(19584010-19584078)
[»] chr6 (62 HSPs)
chr6 (26-469)||(20558165-20558604)
chr6 (40-469)||(9281578-9282005)
chr6 (44-469)||(17855057-17855480)
chr6 (42-357)||(17864299-17864606)
chr6 (39-466)||(13195189-13195613)
chr6 (42-469)||(14258773-14259200)
chr6 (45-274)||(21723283-21723513)
chr6 (40-366)||(33665762-33666082)
chr6 (42-469)||(20989638-20990061)
chr6 (33-366)||(34657012-34657341)
chr6 (42-366)||(25805422-25805740)
chr6 (40-366)||(17527755-17528075)
chr6 (76-366)||(20470110-20470393)
chr6 (42-469)||(8465545-8465964)
chr6 (47-274)||(21706224-21706454)
chr6 (41-274)||(25964749-25964983)
chr6 (41-274)||(25969396-25969630)
chr6 (41-274)||(25973836-25974070)
chr6 (42-274)||(19171470-19171703)
chr6 (39-366)||(17234560-17234883)
chr6 (40-271)||(19894492-19894722)
chr6 (42-469)||(15897547-15897970)
chr6 (129-274)||(26965530-26965675)
chr6 (79-367)||(29254825-29255106)
chr6 (157-354)||(19215935-19216124)
chr6 (157-354)||(15003150-15003340)
chr6 (157-364)||(15038319-15038518)
chr6 (42-210)||(19100017-19100185)
chr6 (157-354)||(9384595-9384784)
chr6 (157-354)||(20003118-20003308)
chr6 (157-347)||(16309346-16309527)
chr6 (177-354)||(15007344-15007513)
chr6 (157-354)||(16137570-16137759)
chr6 (129-366)||(23882654-23882884)
chr6 (155-274)||(24501879-24501997)
chr6 (151-274)||(28623583-28623705)
chr6 (151-261)||(11960550-11960660)
chr6 (178-469)||(12039691-12039978)
chr6 (151-274)||(3567404-3567526)
chr6 (42-155)||(12039582-12039695)
chr6 (40-168)||(13870270-13870399)
chr6 (157-274)||(12444710-12444824)
chr6 (40-83)||(23879133-23879176)
chr6 (157-274)||(20764982-20765098)
chr6 (387-469)||(25948391-25948473)
chr6 (392-469)||(13870515-13870592)
chr6 (157-249)||(30425014-30425106)
chr6 (206-274)||(13870402-13870470)
chr6 (157-249)||(18152694-18152786)
chr6 (406-469)||(19077427-19077490)
chr6 (387-446)||(21717759-21717818)
chr6 (387-446)||(21725595-21725654)
chr6 (157-199)||(21323262-21323304)
chr6 (387-469)||(17864626-17864708)
chr6 (151-185)||(24563859-24563893)
chr6 (276-353)||(25782793-25782871)
chr6 (326-367)||(17869968-17870009)
chr6 (326-367)||(17879720-17879761)
chr6 (157-186)||(32452130-32452159)
chr6 (326-366)||(21706500-21706540)
chr6 (15-63)||(21727426-21727474)
chr6 (326-366)||(25948497-25948537)
[»] scaffold0338 (1 HSPs)
scaffold0338 (15-469)||(16061-16510)
[»] chr4 (42 HSPs)
chr4 (16-469)||(21477971-21478419)
chr4 (100-469)||(8163645-8164013)
chr4 (16-275)||(10722037-10722294)
chr4 (16-275)||(10935806-10936063)
chr4 (40-469)||(25116686-25117115)
chr4 (40-469)||(10190749-10191176)
chr4 (42-469)||(10724122-10724546)
chr4 (42-469)||(10937891-10938315)
chr4 (40-366)||(28019273-28019593)
chr4 (42-274)||(15162359-15162592)
chr4 (124-274)||(19659493-19659643)
chr4 (40-366)||(16383859-16384179)
chr4 (108-316)||(18618054-18618256)
chr4 (62-366)||(33898881-33899179)
chr4 (129-353)||(13399264-13399481)
chr4 (45-274)||(9069000-9069227)
chr4 (80-470)||(15700221-15700594)
chr4 (154-274)||(23400179-23400299)
chr4 (157-355)||(22554950-22555142)
chr4 (78-347)||(33745951-33746211)
chr4 (157-365)||(25354624-25354824)
chr4 (161-366)||(11905064-11905260)
chr4 (157-354)||(24143116-24143305)
chr4 (157-354)||(19894792-19894981)
chr4 (157-354)||(23541225-23541414)
chr4 (182-354)||(46741763-46741927)
chr4 (157-355)||(11325133-11325324)
chr4 (151-274)||(32861702-32861825)
chr4 (73-274)||(19183587-19183785)
chr4 (157-346)||(50907840-50908022)
chr4 (157-271)||(10198239-10198352)
chr4 (41-196)||(15622573-15622723)
chr4 (157-274)||(16655327-16655443)
chr4 (388-469)||(33899398-33899479)
chr4 (133-274)||(41785489-41785628)
chr4 (278-345)||(11865215-11865283)
chr4 (40-97)||(23400065-23400124)
chr4 (403-470)||(15162718-15162785)
chr4 (387-469)||(16383752-16383834)
chr4 (278-367)||(13268814-13268904)
chr4 (276-345)||(33737973-33738043)
chr4 (277-346)||(11289438-11289507)
[»] chr2 (25 HSPs)
chr2 (15-366)||(36398640-36398985)
chr2 (40-469)||(23758488-23758914)
chr2 (40-469)||(12910352-12910779)
chr2 (40-366)||(24790029-24790349)
chr2 (15-310)||(26860139-26860430)
chr2 (40-366)||(22610861-22611181)
chr2 (157-354)||(29565994-29566182)
chr2 (159-352)||(18765659-18765845)
chr2 (157-351)||(13314954-13315141)
chr2 (73-316)||(19466429-19466662)
chr2 (129-272)||(21250158-21250299)
chr2 (218-345)||(15328299-15328419)
chr2 (157-249)||(20476565-20476657)
chr2 (161-274)||(24317181-24317293)
chr2 (129-274)||(21530440-21530583)
chr2 (157-249)||(20475264-20475356)
chr2 (157-274)||(31587530-31587646)
chr2 (157-274)||(19198267-19198383)
chr2 (157-274)||(27107565-27107681)
chr2 (157-274)||(27111134-27111250)
chr2 (157-310)||(24317798-24317943)
chr2 (41-167)||(15328480-15328606)
chr2 (159-274)||(20649547-20649661)
chr2 (157-199)||(12952601-12952643)
chr2 (157-274)||(25347248-25347364)
[»] chr1 (31 HSPs)
chr1 (41-469)||(4245898-4246325)
chr1 (40-469)||(13165260-13165684)
chr1 (42-367)||(11667734-11668053)
chr1 (40-361)||(26972270-26972585)
chr1 (40-469)||(14745653-14746078)
chr1 (45-367)||(20841140-20841455)
chr1 (78-274)||(12753116-12753309)
chr1 (73-367)||(17851280-17851563)
chr1 (159-351)||(33062370-33062555)
chr1 (160-367)||(17038216-17038414)
chr1 (18-274)||(47941191-47941443)
chr1 (42-201)||(24986127-24986284)
chr1 (129-367)||(1973281-1973512)
chr1 (157-354)||(45599317-45599506)
chr1 (73-316)||(23477839-23478073)
chr1 (159-325)||(17012013-17012172)
chr1 (157-354)||(40313211-40313400)
chr1 (157-354)||(52436807-52436997)
chr1 (157-344)||(17379610-17379790)
chr1 (129-354)||(15804071-15804288)
chr1 (129-233)||(10340117-10340221)
chr1 (157-271)||(17355818-17355931)
chr1 (157-274)||(51472080-51472196)
chr1 (157-249)||(18390092-18390184)
chr1 (387-449)||(9452023-9452085)
chr1 (275-367)||(20859640-20859733)
chr1 (157-274)||(8281975-8282091)
chr1 (15-98)||(17038475-17038559)
chr1 (290-346)||(49086704-49086761)
chr1 (403-469)||(11668092-11668157)
chr1 (387-469)||(26972614-26972695)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (16-367)||(40303-40647)
[»] chr7 (70 HSPs)
chr7 (42-469)||(4458602-4459027)
chr7 (42-347)||(15506256-15506553)
chr7 (42-347)||(15436037-15436334)
chr7 (142-467)||(13455084-13455405)
chr7 (42-469)||(16207752-16208177)
chr7 (42-366)||(20991511-20991828)
chr7 (40-469)||(644996-645423)
chr7 (45-469)||(11998742-11999165)
chr7 (42-274)||(12325868-12326100)
chr7 (44-367)||(29546013-29546321)
chr7 (40-274)||(14165220-14165454)
chr7 (40-366)||(11521281-11521600)
chr7 (40-367)||(11588432-11588753)
chr7 (157-354)||(3290671-3290861)
chr7 (79-367)||(16436742-16437024)
chr7 (157-344)||(42782747-42782927)
chr7 (45-196)||(10660995-10661145)
chr7 (158-344)||(30226076-30226256)
chr7 (167-354)||(48797616-48797795)
chr7 (112-274)||(42636302-42636463)
chr7 (129-274)||(7586489-7586634)
chr7 (157-354)||(7620062-7620251)
chr7 (157-354)||(11628621-11628811)
chr7 (157-367)||(9564225-9564426)
chr7 (129-274)||(10038687-10038832)
chr7 (151-367)||(23956845-23957054)
chr7 (157-367)||(9566874-9567075)
chr7 (158-348)||(14984659-14984841)
chr7 (158-348)||(15414270-15414452)
chr7 (157-345)||(14975423-14975603)
chr7 (157-345)||(15404899-15405079)
chr7 (73-275)||(14926701-14926902)
chr7 (73-275)||(15350167-15350368)
chr7 (145-274)||(20925077-20925205)
chr7 (151-274)||(24902161-24902282)
chr7 (157-367)||(4794574-4794778)
chr7 (73-271)||(10279872-10280065)
chr7 (151-367)||(26132897-26133105)
chr7 (157-354)||(11560493-11560682)
chr7 (157-274)||(9894054-9894170)
chr7 (157-346)||(24813914-24814096)
chr7 (151-274)||(23082756-23082877)
chr7 (159-346)||(23174870-23175050)
chr7 (157-220)||(23296611-23296674)
chr7 (157-274)||(15708226-15708342)
chr7 (276-345)||(2076496-2076565)
chr7 (276-345)||(2082915-2082984)
chr7 (203-274)||(10658438-10658508)
chr7 (157-316)||(23579941-23580092)
chr7 (157-346)||(26195445-26195626)
chr7 (157-199)||(7508563-7508605)
chr7 (403-469)||(12325688-12325754)
chr7 (157-273)||(10251496-10251611)
chr7 (15-98)||(9567133-9567217)
chr7 (157-249)||(19353209-19353301)
chr7 (16-98)||(9564484-9564567)
chr7 (157-199)||(14687496-14687538)
chr7 (157-199)||(24049579-24049621)
chr7 (158-199)||(11406938-11406979)
chr7 (157-198)||(20596812-20596853)
chr7 (15-98)||(4547657-4547741)
chr7 (159-198)||(4547800-4547839)
chr7 (157-196)||(31269044-31269083)
chr7 (152-198)||(6045448-6045494)
chr7 (387-469)||(11521623-11521705)
chr7 (387-469)||(11588327-11588409)
chr7 (157-198)||(20588695-20588736)
chr7 (227-272)||(21260572-21260617)
chr7 (276-308)||(6045348-6045380)
chr7 (387-467)||(29546344-29546423)
[»] scaffold0226 (3 HSPs)
scaffold0226 (42-469)||(7413-7836)
scaffold0226 (42-469)||(18000-18421)
scaffold0226 (42-469)||(27394-27815)
[»] chr5 (39 HSPs)
chr5 (40-469)||(22404631-22405058)
chr5 (116-348)||(20845740-20845966)
chr5 (40-274)||(23420431-23420666)
chr5 (40-366)||(24189831-24190151)
chr5 (40-274)||(22246222-22246456)
chr5 (40-274)||(22251912-22252146)
chr5 (150-366)||(13734954-13735164)
chr5 (42-367)||(30605565-30605882)
chr5 (65-367)||(26036778-26037075)
chr5 (161-354)||(17920776-17920961)
chr5 (157-365)||(7897903-7898103)
chr5 (157-354)||(26183222-26183412)
chr5 (157-355)||(20498141-20498332)
chr5 (42-198)||(9422388-9422546)
chr5 (73-367)||(13338560-13338843)
chr5 (129-274)||(13941957-13942102)
chr5 (157-354)||(20740925-20741114)
chr5 (153-356)||(26329198-26329394)
chr5 (41-274)||(20714613-20714841)
chr5 (140-274)||(18221165-18221298)
chr5 (157-367)||(22130837-22131024)
chr5 (151-272)||(22184580-22184700)
chr5 (79-274)||(23623932-23624127)
chr5 (196-366)||(25105447-25105611)
chr5 (196-366)||(25164540-25164704)
chr5 (276-345)||(11204712-11204781)
chr5 (157-199)||(9522663-9522705)
chr5 (157-348)||(17661399-17661583)
chr5 (157-274)||(20127050-20127166)
chr5 (157-274)||(22979799-22979917)
chr5 (40-97)||(25105312-25105371)
chr5 (40-97)||(25164405-25164464)
chr5 (387-469)||(9422682-9422764)
chr5 (387-469)||(25105636-25105718)
chr5 (387-469)||(25164729-25164811)
chr5 (15-98)||(22130695-22130779)
chr5 (387-473)||(18220984-18221070)
chr5 (157-274)||(24117650-24117766)
chr5 (278-345)||(24394622-24394690)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (42-367)||(16494-16816)
[»] scaffold0103 (1 HSPs)
scaffold0103 (40-473)||(25544-25974)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (40-366)||(36975-37294)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (40-469)||(110129-110554)
[»] chr8 (36 HSPs)
chr8 (43-469)||(24091835-24092242)
chr8 (39-274)||(22476285-22476520)
chr8 (42-469)||(23541281-23541708)
chr8 (39-274)||(22485188-22485423)
chr8 (112-469)||(11221214-11221563)
chr8 (42-268)||(45136176-45136401)
chr8 (42-274)||(13660245-13660475)
chr8 (42-274)||(13718888-13719118)
chr8 (42-274)||(27925323-27925550)
chr8 (42-469)||(33976921-33977344)
chr8 (119-271)||(25240463-25240615)
chr8 (45-274)||(9996554-9996781)
chr8 (157-354)||(33466149-33466337)
chr8 (159-354)||(17279870-17280057)
chr8 (157-348)||(37155513-37155697)
chr8 (157-354)||(17880727-17880917)
chr8 (156-354)||(39080947-39081137)
chr8 (129-346)||(23864427-23864637)
chr8 (157-327)||(8726853-8727015)
chr8 (151-347)||(20254857-20255054)
chr8 (115-198)||(33961871-33961952)
chr8 (157-348)||(23249722-23249906)
chr8 (389-469)||(22472645-22472725)
chr8 (157-274)||(12814580-12814696)
chr8 (157-347)||(1683966-1684146)
chr8 (394-469)||(22480934-22481009)
chr8 (276-469)||(45133527-45133724)
chr8 (129-348)||(24850392-24850603)
chr8 (189-274)||(22874233-22874317)
chr8 (387-467)||(27925637-27925717)
chr8 (157-224)||(1562355-1562422)
chr8 (187-315)||(24384582-24384702)
chr8 (276-367)||(33961729-33961821)
chr8 (329-366)||(27925576-27925613)
chr8 (276-316)||(1562466-1562506)
chr8 (326-366)||(22485112-22485152)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (57-366)||(87704-88008)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (42-469)||(17151-17574)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (40-274)||(36647-36881)
[»] scaffold0059 (4 HSPs)
scaffold0059 (121-366)||(61424-61663)
scaffold0059 (40-212)||(48215-48387)
scaffold0059 (208-469)||(50130-50389)
scaffold0059 (387-467)||(61688-61768)
[»] scaffold0185 (1 HSPs)
scaffold0185 (40-366)||(2237-2549)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (40-212)||(12380-12553)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (79-367)||(26372-26654)
[»] scaffold0143 (1 HSPs)
scaffold0143 (157-354)||(36279-36467)
[»] scaffold0328 (1 HSPs)
scaffold0328 (157-351)||(16960-17147)
[»] scaffold0064 (2 HSPs)
scaffold0064 (157-354)||(52915-53102)
scaffold0064 (161-220)||(45858-45917)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (157-351)||(103090-103276)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (151-274)||(37420-37544)
[»] scaffold0480 (1 HSPs)
scaffold0480 (16-220)||(11296-11499)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (151-274)||(202450-202571)
[»] scaffold0520 (1 HSPs)
scaffold0520 (157-274)||(5473-5589)
[»] scaffold0333 (1 HSPs)
scaffold0333 (215-271)||(5703-5759)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (157-274)||(3177-3291)
[»] scaffold0505 (1 HSPs)
scaffold0505 (157-274)||(10024-10140)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (278-345)||(18540-18607)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (40-71)||(357171-357202)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 275; Significance: 1e-153; HSPs: 50)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 15 - 469
Target Start/End: Original strand, 20748009 - 20748458
Alignment:
Q  15 ctgtgaagcaaggagctaggtagattttgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagttgtttgtttgaaggtaacttcaatttttgtctttttgt 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  20748009 ctgtgaagcaaggagctaggtagattttgtactacaccgaagttgtgaaacaatgtgctagttgtttgtttgaaggtaacttcaatttttgtgtttgtgt 20748108  T
Q  115 ttaggtctgataggtcacaggggctgtgactgaccataggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtct 214  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||     
T  20748109 ttaggtctgatagatcacaggggttgtgactgaccataggatagtgagttgagatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagattggtaggtcc 20748208  T
Q  215 taggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttgaataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagt 314  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||       |||||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||    
T  20748209 taggtcataaagtgtaaacgatgagtttgttgagagcttttcaataaggactac-------actagtggatttccttcctggcttggta-gccccaaagt 20748300  T
Q  315 agatgacgttgcaccgaactgagttaacaaactcactgtgttctttactttc---tcatttannnnnnnnnnnnnatttctgtttatcgcgtgatgttgg 411  Q
    || ||| |||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||   |||||||             |||||||||||||||||||||||||    
T  20748301 aggtgatgttgcaccgaactgggttaacaaactcattatgttctttactttcttgtcatttattttcttgtttttatttctgtttatcgcgtgatgttgg 20748400  T
Q  412 aacattgaacataacatcgcaaacgttaaaacatcatacaaaacgtattaaaacaagt 469  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20748401 aacattgaacgtaacatcgcaaacgttaaaacatcatacaaaacatattaaaacaagt 20748458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 18 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 11656332 - 11656010
Alignment:
Q  18 tgaagcaaggagctaggtagattttgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagttgtttgtttgaaggtaacttcaatttttgtctttttgttta 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  ||| ||||||    
T  11656332 tgaagcaaggagctaggtagattgtgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagttgtttgtttgaaggtaacttcattgtttgagtttgtgttta 11656233  T
Q  118 ggtctgataggtcacaggggctgtgactgaccataggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttag 217  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||| || || ||||| |||    
T  11656232 ggtctgataggtcacagtggctgtgactggccataggatagtgagatgggaactcaaatctaggagttcctaggttgaaggctatacgggcaggtcctag 11656133  T
Q  218 gtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttgaataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtaga 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||       ||||| ||||  |||||| ||||||| || ||| |||||     
T  11656132 gtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttggataaggactacac-------tagtgaatttctttcctgacttggtagcctccagagtagg 11656040  T
Q  318 tgacgttgcaccgaactgagttaacaaact 347  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  11656039 tgacattgcaccaaactgggttaacaaact 11656010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 15 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 18477241 - 18476984
Alignment:
Q  15 ctgtgaagcaaggagctaggtagattttgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagttgtttgtttgaaggtaacttcaatttttgtctttttgt 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||  ||| |||    
T  18477241 ctgtgaagcaaggagctaggtagattgtgtactacaccaaagttgcgaaacaatgtgctagttgtttgtttgaaggtaacttc-atcattgagtttgtgt 18477143  T
Q  115 ttaggtctgataggtcacaggggctgtgactgaccataggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtct 214  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||  ||||||||    
T  18477142 ttaggtctgataggtcacaatggctgtgactgaccataggatagtgaggtgggatctcaaatctaggagttcctagtttgaagtctatacgagtaggtct 18477043  T
Q  215 taggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttgaataaggactacactagt 274  Q
    || ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18477042 tatgtc-ttaagtgtaaacgaggagtttgctgagagctttagaataaggactacactagt 18476984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 39 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 13790969 - 13790542
Alignment:
Q  39 ttttgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagttgtttgttt--gaaggtaacttcaatttttgtctttttgtttaggtctgataggtcacaggg 136  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| |  |||||||||||  |||||    |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13790969 ttttgtactacaccaaagttttgaaacacggtgctaattgtttgtgttggaaggtaacttttattttg---ttttggtttaggtctgataggtcacaggg 13790873  T
Q  137 gctgtgactgaccat-aggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacga 235  Q
    ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  13790872 gctgtgactgatcattagaatagtgagatgggatctcagatctaggagttcctaggttgaagtctatacgggtaggtcctaggtcatatagtgtaaacga 13790773  T
Q  236 ggagtttgctgagagcttttgaataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttg-caccgaact 334  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||        |||| |||| |||||||||| |||||||||||| ||   ||| |||||||||    
T  13790772 ggagtttgctgagagctattgaataaggactacactagta-------tatttccttcttggcttggtagcccccatagtaggtgtgtttgtcaccgaact 13790680  T
Q  335 gagttaacaaactcactgtgttctttactttc---tcatttannnnnnnnnnnnnatttctgtttatcgcgtgatgttggaacattgaacataacatcgc 431  Q
    | || |||||||||| ||||||||||||||||   || ||||             |||||||||||||||||||||||| |||||| | | |||||| ||    
T  13790679 gggtcaacaaactcattgtgttctttactttcatgtcttttattttcttgtttttatttctgtttatcgcgtgatgttgaaacattaatcgtaacattgc 13790580  T
Q  432 aaacgttaaaacatcatacaaaacgtattaaaacaagt 469  Q
    |||||    ||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  13790579 aaacgccgtaacatcatacagaacatattaaaacaagt 13790542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 40 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 17702695 - 17702376
Alignment:
Q  40 tttgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagttgtttgttt--gaaggtaacttcaatttttgtctttttgtttaggtctgataggtcacagggg 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||| | |||    |||| ||||||||||||||||||||  |||    
T  17702695 tttgtactacaccaaagttgtgaaacacggtgctagttgtttgtgttggaaggtaacttctactttg---ttttggtttaggtctgataggtcactaggg 17702599  T
Q  138 ctgtgactgaccat-aggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgag 236  Q
    | || |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  17702598 cagttactgcccattaggatagtgagatgggatctcagatctaggagttcctaggtttaagtctatacgggtaggtcctaggtcatatagtgtaaacgag 17702499  T
Q  237 gagtttgctgagagcttttgaataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttg-caccgaactg 335  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||       |||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| ||   ||| ||||||||||    
T  17702498 gagtttgctgagagctattgaataaggactacac-------tagtggatttccttcctggcttggtagcccccagagtagttgtgtttgtcaccgaactg 17702406  T
Q  336 agttaacaaactcactgtgttctttacttt 365  Q
     || |||||||||| |||||||||||||||    
T  17702405 ggtcaacaaactcattgtgttctttacttt 17702376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 42 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 44452769 - 44452343
Alignment:
Q  42 tgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagttgtttgt--ttgaaggtaacttcaatttttgtctttttgtttaggtctgataggtcacaggggct 139  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |    
T  44452769 tgtactacaccgaagttgtgaaacaaggtgttagttgtttgtgtttgaaggtaacttca-tctttgtgttttggtttaggtctgataggtcataggggtt 44452671  T
Q  140 gtgactgaccat-aggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgagga 238  Q
    |||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  44452670 gtgactgaccattacgataatgagatgggatctcagatctaggagttcctaggttgaagtctatacgggtaggtcatgggtcatatagtgtaaacgagga 44452571  T
Q  239 gtttgctgagagcttttgaataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccata-gtagatgacgttg-caccgaactga 336  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||       |||||||||| ||||||||||||| | |||| | | |||| ||   ||| ||||||||||     
T  44452570 gtttgctgagagctattgaataagaactacac-------tagtggatttccttcctggcttgg-agcccctagacgtaggtgtgtttgtcaccgaactgg 44452479  T
Q  337 gttaacaaactcactgtgttctttactttc---tcatttannnnnnnnnnnnnatttctgtttatcgcgtgatgttggaacattgaacataacatcgcaa 433  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||   || ||||             |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||  ||||| ||||    
T  44452478 gtcaacaaactcattgtgttctttactttcctgtcgtttattttcttgtttttatttctttttatcacgtgatgttggaacattaaacgaaacattgcaa 44452379  T
Q  434 acgttaaaacatcatacaaaacgtattaaaacaagt 469  Q
    |||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||    
T  44452378 acgttaaaacatctgacagaacatattaaaacaagt 44452343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 40 - 469
Target Start/End: Original strand, 15635742 - 15636169
Alignment:
Q  40 tttgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagttgtttgttt--gaaggtaacttcaatttttgtctttttgtttaggtctgataggtcacagggg 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| || |||||||| |  |||||||||||| || |||||  ||| ||||||||||||||||| ||||| |    
T  15635742 tttgtactacaccaaagttgtgaaacacagtgttaattgtttgtgttggaaggtaacttctatctttgt--tttggtttaggtctgataggtgacaggag 15635839  T
Q  138 ctgtgactgaccat-aggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgag 236  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||    
T  15635840 ctgtgattgaccattaggatagtgtgatgggatctcatatctaggagttcctagtttgaagtctatacgggtaggtcctagatcatatagtgtaaacgag 15635939  T
Q  237 gagtttgctgagagcttttgaataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttg-caccgaactg 335  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||       ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| ||||| ||   ||| ||||||||||    
T  15635940 gagtttactgagagctattgaataaggactac-------actagtgaatttccttcctggcttggtagcccccagagtaggtgtgtttgtcaccgaactg 15636032  T
Q  336 agttaacaaactcactgtgttctttactttc---tcatttannnnnnnnnnnnnatttctgtttatcgcgtgatgttggaacattgaacataacatcgca 432  Q
     || | |||||||| ||||||||||||||||   | |||||             |||||||||||||||||||||||| |||||| | | || ||| | |    
T  15636033 ggtcatcaaactcattgtgttctttactttcatgttatttattttcttgtttttatttctgtttatcgcgtgatgttgaaacattaatcgtagcattgaa 15636132  T
Q  433 aacgttaaaacatcatacaaaacgtattaaaacaagt 469  Q
    |||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  15636133 aacgctaaaacatcaaacagaacgtattaaaacaagt 15636169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 15 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 8225146 - 8224865
Alignment:
Q  15 ctgtgaagcaaggagctaggtagattttgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagtt-gtttgtttgaaggtaacttcaatttttgtctttttg 113  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||   ||      ||||    
T  8225146 ctgtgaaggaaggagataggtagattgtgcactacaccgaagttgtgaaacaaggtgttaggtagtttgtttgaaggtaacttcacagttg-----tttg 8225052  T
Q  114 tttaggtctgataggtcacaggggctgtgactgaccat-aggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggt 212  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||| ||||||||||| ||| || |||||||    
T  8225051 tttaggtctgataggtcacagtggttgtgactgaccattaggatagtgagatgggatctcaga----ggagttcctaggttgaagactatacgggtaggt 8224956  T
Q  213 cttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttgaataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatccccca 310  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||       |||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  8224955 cttaggtcatatagtgtaaacgaggagtttgctgagagctattgaataaggactacac-------tagtggatttccttcctggcttggtagccccca 8224865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 40 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 24195812 - 24195578
Alignment:
Q  40 tttgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagttgtttgttt--gaaggtaacttcaatttttgtctttttgtttaggtctgataggtcacagggg 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||| | |||    |||| ||||||||||||||||||||  |||    
T  24195812 tttgtactacaccaaagttgtgaaacacggtgctagttgtttgtgttggaaggtaacttctactttg---ttttggtttaggtctgataggtcactaggg 24195716  T
Q  138 ctgtgactgaccat-aggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgag 236  Q
    | || |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || ||||||||| |||||||| |||    
T  24195715 cagttactgcccattaggatagtgagatgggatctcagatctaggagttcctaggttgaagtctatacaggtagctcctaggtcatatagtgtaaatgag 24195616  T
Q  237 gagtttgctgagagcttttgaataaggactacactagt 274  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24195615 gagtttgctgagagctattgaataaggactacactagt 24195578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 44 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 295742 - 295428
Alignment:
Q  44 tactacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagttgtttgtttgaaggtaacttcaatttttgtctttttgtttaggtctgataggtcacaggggctgtga 143  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||  | || | ||| | ||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  295742 tactacaccaaagttgtgaagtaaggtactacttgtttgtttgaaggtaaattcatctgtt-tgtttgtttttag-tctgatagatcacaagggctgtga 295645  T
Q  144 ctgaccataggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttg 243  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| || | || |||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||    
T  295644 ctgactataggatagtgagatgggatctcagatctaggagttcctaagttgaaatcaatacgggtaggtcctaggtc-tttagtgtaaacgaggagtttg 295546  T
Q  244 ctgagagcttttgaataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttg-caccgaactgagttaac 342  Q
    ||||||||| | |||||||||||||       |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| ||   ||| |||||||||| || |||    
T  295545 ctgagagctatagaataaggactac-------actagtggatttccttcctggcttggtagcccccagagtaggtgtgtttgtcaccgaactgggtcaac 295453  T
Q  343 aaactcactgtgttctttactttct 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  295452 aaactcactgtgttctttactttct 295428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 40 - 364
Target Start/End: Original strand, 23954427 - 23954745
Alignment:
Q  40 tttgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagttgtttgttt--gaaggtaacttcaatttttgtctttttgtttaggtctgataggtcacagggg 137  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||| |  |||||||||||| | |||    |||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  23954427 tttgtactataccaaagttgtgaaacatagtgctaattgtttgtgttggaaggtaacttctactttg---ttttggtttaggtctgataggtcactgggg 23954523  T
Q  138 ctgtgactgaccat-aggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgag 236  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  23954524 cagtgactgaccattaggatagtgagatgggatctcaaatctaggagttcctaggttgaagtatatacaggtaggtcctaggtcatatagtgtaaacgag 23954623  T
Q  237 gagtttgctgagagcttttgaataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttg-caccgaactg 335  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||       ||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||| ||   ||| ||||||||||    
T  23954624 gagtttgctgagagctattgaataatgacta-------aactaatggatttccttcctggcttggtagcctccagagtaggtgtgtttgccaccgaactg 23954716  T
Q  336 agttaacaaactcactgtgttctttactt 364  Q
      | |||||||||| ||| ||||||||||    
T  23954717 gatcaacaaactcattgtattctttactt 23954745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 40 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 18547938 - 18547617
Alignment:
Q  40 tttgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagttgtttgttt--gaaggtaacttcaatttttgtctttttgtttaggtctgataggtcacagggg 137  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||| | ||||||  | | ||||||||||| ||||||| |||||    
T  18547938 tttgtactacaccgaagttgagaaacaaggtgttagttgtttgtgttggaaggtaacttctacttttgt--tctggtttaggtctgttaggtcatagggg 18547841  T
Q  138 ctgtgactgaccat-aggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgag 236  Q
     ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18547840 ttgtgactgaccattaggatagtaagatgggatcttagatctatgagttcctaggttgaagtctatacgggtaggtcttaggtcatatagtgtaaacgag 18547741  T
Q  237 gagtttgctgagagcttttgaataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttg-caccgaactg 335  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||||       |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| ||   ||| ||||||| ||    
T  18547740 gagtttgccaagagctattgaataaggactac-------actattggatttccttcctggcttggtagcccccagagtaggtgtgtttgtcaccgaattg 18547648  T
Q  336 agttaacaaactcactgtgttctttactttc 366  Q
     || |||||||||| ||| |||| |||||||    
T  18547647 ggtcaacaaactcattgtattctctactttc 18547617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 42 - 366
Target Start/End: Original strand, 18064081 - 18064395
Alignment:
Q  42 tgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagttgtttgtttgaaggtaacttcaatttttgtctttttgtttaggtctgataggtcacaggggctgt 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| ||   | | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  18064081 tgtactacaccaaagttgtgaaacacggtgttagttgtttgttcgaaggtaacttcaactt---tgtgtttgtttaggtcttataggtcgcaggggctgt 18064177  T
Q  142 gactgaccataggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtt 241  Q
    ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| || | || | |||||| |||||| |  |||||||||||||||||    
T  18064178 gactgaccattagatagtgagatgagatctcagatctaggagttcctaggttgaaatcaatacggttaggtcctaggtc-tttagtgtaaacgaggagtt 18064276  T
Q  242 tgctgagagcttttgaataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttg-caccgaactgagtta 340  Q
    || |||||||| | |||||||||||||       |||||||||||| ||||||| ||||||| || | | ||||| ||   ||| |||||||||| ||||    
T  18064277 tgttgagagctatagaataaggactac-------actagtggatttccttcctgccttggtagcctctagagtaggtgtgtttgtcaccgaactgggtta 18064369  T
Q  341 acaaactcactgtgttctttactttc 366  Q
    ||||||||| |||||  |||||||||    
T  18064370 acaaactcattgtgtcttttactttc 18064395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 42 - 366
Target Start/End: Original strand, 18034770 - 18035085
Alignment:
Q  42 tgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagttgtttgtttgaaggtaacttcaatttttgtctttttgtttaggtctgataggtcacaggggctgt 141  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||   | | ||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  18034770 tgtactacaccaacgttatgaaacacggtgttagttgtttgtttgaaggtaacttcaactt---tgtgtttgtttaggtctgataggtcgcaggggttgt 18034866  T
Q  142 gactgacca-taggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagt 240  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  | || |||||||| |||||| |   ||||||| |||||||    
T  18034867 gactgaccattaggatagtgagatgggatctcagatctaggagttcctaggttgaaatagatacgggtaggtcctaggtc-tttggtgtaaatgaggagt 18034965  T
Q  241 ttgctgagagcttttgaataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttg-caccgaactgagtt 339  Q
    ||||||||| || | |||||||||||||       |||||||||||| ||||||||||||||| || | | ||||| ||   ||| |||||||||| |||    
T  18034966 ttgctgagacctatagaataaggactac-------actagtggatttccttcctggcttggtagcctcaagagtaggtgtgtttgtcaccgaactgggtt 18035058  T
Q  340 aacaaactcactgtgttctttactttc 366  Q
    |||||||||| |||||  |||||||||    
T  18035059 aacaaactcattgtgtcttttactttc 18035085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 42 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 19634166 - 19633746
Alignment:
Q  42 tgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagttgtttgt--ttgaaggtaacttcaattttt-gtctttttgtttaggtctgataggtcacaggggc 138  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||||||  |||||||||||||| | |||  ||||    |||||||||||||| |||||||||||    
T  19634166 tgtactacactgaagttgtgaaacaagatgttagttgtttgtgtttgaaggtaacttctactttgagtct----gtttaggtctgataagtcacaggggc 19634071  T
Q  139 tgtgactgaccat-aggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgagg 237  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||      |||||  |||||||||||||| || |||||||| ||  || | | ||||||||||||    
T  19634070 tgtgactgaccattaggatagtgagataggatctcag------gagttcttaggttgaagtctatacgggtaggtcctatatcttta-gtgtaaacgagg 19633978  T
Q  238 agtttgctgagagcttttgaataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttg-caccgaactga 336  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||       |||||| ||||||||||||||| |||  | ||||||||   ||| | | |||||      
T  19633977 agtttgctgagagctatagaataaggactacactagt-------ggatttccttcctggcttggtagccct-agagtagatgtgtttgtcgctgaactag 19633886  T
Q  337 gttaacaaactcactgtgttctttactttct---catttannnnnnnnnnnnnatttctgtttatcgcgtgatgttggaacattgaacataacatcgcaa 433  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||   || |||             ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  19633885 gtcaacaaactcactgtgttatttactttcttgtcaattattttcttgtttttatttctgtttatcgcatgatgttggaacattgaacgtaacattgcaa 19633786  T
Q  434 acgttaaaacatcatacaaaacgtattaaaacaagtacgc 473  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  19633785 acgttaaaacatcatgcaaaacatattaaaacaagtacgc 19633746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 45 - 274
Target Start/End: Original strand, 17042630 - 17042857
Alignment:
Q  45 actacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagtt-gtttgtttgaaggtaacttcaatttttgtctttttgtttaggtctgataggtcacaggggctgtga 143  Q
    |||||||||||| |||||| || |||| ||| | |||||||||||||||||||||   |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17042630 actacaccaaagctgtgaagcacggtgttaggtagtttgtttgaaggtaacttcaccgtttgt--ttgtgtttaggtctgataggtcacaggggctgtca 17042727  T
Q  144 ctgaccataggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttg 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || | || |||||||| |||||| |  ||| |||||||||||||||    
T  17042728 ctgaccataggatagtgagatgggatctcagatctaggagttcctgggttgaaatcaatacgggtaggtcctaggtc-tttagtttaaacgaggagtttg 17042826  T
Q  244 ctgagagcttttgaataaggactacactagt 274  Q
     |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  17042827 ttgagagctatagaataaggactacactagt 17042857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 40 - 243
Target Start/End: Original strand, 18483242 - 18483444
Alignment:
Q  40 tttgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagttgtttgttt--gaaggtaacttcaatttttgtctttttgtttaggtctgataggtcacagggg 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |  |||||||||||| | |||    |||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  18483242 tttgtactacaccaaagttgtgaaacacggtgcta-ttgtttgtgttggaaggtaacttctactttg---ttttggtttcggtctgataggtcacagggg 18483337  T
Q  138 ctgtgactgaccat-aggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgag 236  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  18483338 ttgtgactgaccatcaggatagtgagatgggatctcagatccaggtgttcctaggttgaagtctatacgggtaggtcctaggtcatatagtgtaaacgag 18483437  T
Q  237 gagtttg 243  Q
    |||||||    
T  18483438 gagtttg 18483444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 73 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 28051392 - 28051104
Alignment:
Q  73 tagttgtttgtttgaaggtaacttcaatttttgtcttt-ttgtttag-gtctgataggtcacaggggctgtgactgaccataggatagtgagatgggatc 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||   ||||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||| ||||    
T  28051392 tagttgtttgtttgaaggtaacttca-tctttgtgtttgttgtttttagtctgatagatcacaggggttgtgactaactataggatagtgagatgagatc 28051294  T
Q  171 tcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttgaataaggactacac 270  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||| ||| |||| | |  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||      
T  28051293 tcagatctaggagttcctaggttgaaatcaatacaggtatgtcctagg-cctttagtgtaaacgaggagtttgctgagagctatagaataaggactac-- 28051197  T
Q  271 tagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttg-caccgaactgagttaacaaactcactgtgttctttactttct 367  Q
         |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| ||   ||| |||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28051196 -----actattggatttccttcctggcttggtagcccccagagtaggtgtgtttgtcaccaaactgggtcaacaaactcaccgtgttctttactttct 28051104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 157 - 365
Target Start/End: Original strand, 9031369 - 9031569
Alignment:
Q  157 agtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttg 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   || |||||||| |||||||| | |   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  9031369 agtgagatgggatctcagatctaggagttcctaggttgaagtcagtacgggtaggtcctaggtcatta-gcacaaacgaggagtttgctgagagctattg 9031467  T
Q  257 aataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttgcaccgaactgagttaacaaactcactgtgtt 356  Q
    ||||||||||||||||       |||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |    
T  9031468 aataaggactacacta-------gtggatttccttcctgacttggtagcccccagagtaggtgacgttgcaccgaactgggttaacaaactcattgtgct 9031560  T
Q  357 ctttacttt 365  Q
     ||||||||    
T  9031561 ttttacttt 9031569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 157 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 9036878 - 9036689
Alignment:
Q  157 agtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttg 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||||||| |||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  9036878 agtgagatgggatctcagatctaggagttcctaggttgaagtcaatacgggtaggtcctaggtc-tttagtgcaaacgaggagtttgctgagagctattg 9036780  T
Q  257 aataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttgcaccgaactgagttaacaaactcactgtg 354  Q
    ||||||||||||       |||||||||||| |||||||| |||||| |||||| ||||  ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  9036779 aataaggactac-------actagtggatttccttcctggtttggtagcccccagagtatgtgatgttgcaccgaactgggttaacaaattcactgtg 9036689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 44 - 469
Target Start/End: Original strand, 1919117 - 1919531
Alignment:
Q  44 tactacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagttgtttgttt--gaaggtaacttcaatttttgtctttttgtttaggtctgataggtcacaggggctgt 141  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||| |  ||    |||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  1919117 tactacaccaaagttgtgaaacacggtgctagttgtttgtcttggaaggtaacttctaccttg---ttttggtttaggtttgataggtcactggggcagt 1919213  T
Q  142 gactgaccat-aggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagt 240  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||  ||| || ||       ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  1919214 gactgaccattagcatagtgagatgggatctcatatttaggagttcctaggttgaaaactatacggg-------taggtcatatagtgtaaacgaagagt 1919306  T
Q  241 ttgctgagagcttttgaataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttg-caccgaactgagtt 339  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||       |  ||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||| ||   ||| ||  |||||| ||     
T  1919307 ttgctgaaagctattgaataaggactac-------atcagtggatttccttcttggcttggta-gccccatagtaggtgtgtttgtcatggaactgggtc 1919398  T
Q  340 aacaaactcactgtgttctttactttc---tcatttannnnnnnnnnnnnatttctgtttatcgcgtgatgttggaacattgaacataacatcgcaaacg 436  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||   |||||||             |||||||||||||||||||||||| |||||| |   |||||| |||||||    
T  1919399 aacaaactcattgtgttatttactttcctgtcatttactttcttgtttttatttctgtttatcgcgtgatgttgaaacattaattgtaacattgcaaacg 1919498  T
Q  437 ttaaaacatcatacaaaacgtattaaaacaagt 469  Q
       ||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  1919499 cggaaacaacatacagaacgtattaaaacaagt 1919531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 13914103 - 13913760
Alignment:
Q  15 ctgtgaagcaaggagctaggtagattttgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagtt-gtttgtttgaaggtaacttcaatttttgtctttttg 113  Q
    |||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||| || |||| ||| | |||||||||||||||||||||  |  | | ||| ||    
T  13914103 ctgtgaagcacggagataggtagtttgtgtactacaccaaagctgtgaagcacggtgttaggtagtttgtttgaaggtaacttcatctgatttgtttgtg 13914004  T
Q  114 tttaggt---ctgataggtcacaggggctgtgactgaccataggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtag 210  Q
    |||  ||   ||||| | ||||||||||||||| ||    ||||  |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||  | || |||||    
T  13914003 ttt--gtaacctgat-gatcacaggggctgtgattggttctaggg-agtgagatgaaatctcagatctaggagttcctaggttgaagttaaaacgggtag 13913908  T
Q  211 gtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttgaataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatccccca 310  Q
     || |||||| | | |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||        |||||| || |||||||||||| ||||||    
T  13913907 atcctaggtcttta-gtgtaaacgaggagtttgctgagagctagagaataaggagtacactagc-------ggatttcct-cctggcttggtagccccca 13913817  T
Q  311 tagtagatgacgttgcaccgaactgagttaacaaactcactgtgttctttactttct 367  Q
     ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  13913816 gagtaggtgacgttgcaccgaaccgggttaacaaactctctgtgttttttactttct 13913760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 150 - 274
Target Start/End: Original strand, 6580847 - 6580970
Alignment:
Q  150 ataggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgaga 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | || |||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  6580847 ataggatagtgagatgggatctcagatctaggagttcctaggttgaaatcaatacgggtaggtcctaggtc-tttagtgtaaacgaggagtttgctgaga 6580945  T
Q  250 gcttttgaataaggactacactagt 274  Q
    ||| | |||||||||||||||||||    
T  6580946 gctatagaataaggactacactagt 6580970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 137 - 272
Target Start/End: Original strand, 15686126 - 15686259
Alignment:
Q  137 gctgtgactgaccataggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgag 236  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| |||  |||||||| |    
T  15686126 gctgtgattgatcgtaggatagtgagatgggatctcagatctaggagttcctgggttgaagtctagacaggtaggtcataggtcttaagttgtaaacgtg 15686225  T
Q  237 gagtttgctgagagcttttgaataaggactacacta 272  Q
      ||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  15686226 --gtttgctgagaactttagaataaggactacacta 15686259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 42 - 200
Target Start/End: Original strand, 13515469 - 13515626
Alignment:
Q  42 tgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagttgtttgt--ttgaaggtaacttcaattttt-gtctttttgtttaggtctgataggtcacaggggc 138  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| | |||  ||||  |     |||||||||||||||||||||     
T  13515469 tgtactacaccgaagttgtgaaacaaggtgttagttgtttgtgtttgaaggtaacttctactttgagtctgct-----aggtctgataggtcacaggggt 13515563  T
Q  139 tgtgactgaccat-aggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtct 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  13515564 tgtgactgaccattaggatagtgagatgggatctcagatctaggagttcctaggttaaagtct 13515626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 41 - 274
Target Start/End: Original strand, 21718802 - 21719029
Alignment:
Q  41 ttgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagttgtttgtttgaaggtaacttcaatttttgtctttttgtttaggtctgataggtcacaggggctg 140  Q
    |||| |||||||||| |||| || ||||||  ||||||||||||||||||||||||||   ||||| | |||  |||| |||||||  ||||| |||||     
T  21718802 ttgtgctacaccaaacttgt-aagcaaggtcatagttgtttgtttgaaggtaacttcaccatttgtgtgttt--ttag-tctgataa-tcacatgggcta 21718896  T
Q  141 tgactgaccataggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagt 240  Q
    ||  ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| || |||||| | ||||||||||||||| |    
T  21718897 tggttgactgtaggatagtgagatgagatctcagatctaggagttcctaggttaaagtctagacgggtagatcctaggtc-ttaagtgtaaacgaggatt 21718995  T
Q  241 ttgctgagagcttttgaataaggactacactagt 274  Q
    ||| ||| | |||| |||||||||||||||||||    
T  21718996 ttgttgaaaactttagaataaggactacactagt 21719029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 162 - 365
Target Start/End: Original strand, 7495921 - 7496115
Alignment:
Q  162 gatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttgaataa 261  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |  |||||||| |||||| | | |||||||||||||||||||||||||||   ||||||    
T  7495921 gatgggatctcagatctaggagttcctaggttgaagtcaatatgggtaggtcctaggtcttta-gtgtaaacgaggagtttgctgagagctagagaataa 7496019  T
Q  262 ggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttgcaccgaactgagttaacaaactcactgtgttcttta 361  Q
    |||||||       ||||||||| |||| |||||||||| || |||||| | |||  || |||||||||||||||||||||||||||  |||| | ||||    
T  7496020 ggactac-------actagtgga-tttcctcctggcttgatagcccccaaattaggcgatgttgcaccgaactgagttaacaaactctttgtgcttttta 7496111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 157 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 13918013 - 13917823
Alignment:
Q  157 agtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttg 256  Q
    |||||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| |||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||   |    
T  13918013 agtgagatgaaatctcatatctaggagttcctaggttgaagtcaggacaggtaggtcctaggtc-tttagtgtaaacgaggaatttgctgagagctagag 13917915  T
Q  257 aataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttgcaccgaactgagttaacaaactcactgtgtt 356  Q
    |||||||| |||       |||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||    
T  13917914 aataaggagtac-------actattggatttcctt-ctggcttggtagcccccagagtaggtgacgttgcaccgaattgggttaacaaactctctgtgtt 13917823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 157 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 8749210 - 8749010
Alignment:
Q  157 agtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctag-acaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagctttt 255  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || ||||| || |||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||| ||    
T  8749210 agtgagatgagatctcagatctaggagttcctaggttgaagt-tagtacgggtagatcctaggtcatta-gtgcaaacgaggagcttgctgagagctatt 8749113  T
Q  256 gaataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttgcaccgaactgagttaacaaactcactgtgt 355  Q
    ||||| |||||||||       |||||||||| |||||| ||||||||  ||||| ||||| | ||||||||| ||| || ||||||||||||||| ||     
T  8749112 gaatacggactacac-------tagtggatttccttcctagcttggtagtccccagagtagctaacgttgcactgaattgggttaacaaactcactatgc 8749020  T
Q  356 tctttacttt 365  Q
     |||||||||    
T  8749019 cctttacttt 8749010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 160 - 348
Target Start/End: Original strand, 7479128 - 7479307
Alignment:
Q  160 gagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttgaat 259  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||| | |  |||||||| |||||| | | |||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  7479128 gagatgggatctcagatctaggacttcatatgttgaagtcaatatgggtaggtcctaggtcttta-gtgtaaacgaggagtttgctgagagctagagaat 7479226  T
Q  260 aaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttgcaccgaactgagttaacaaactc 348  Q
    |||||||||       ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7479227 aaggactac-------actagtgga-tttcctcctggcttggtagcccccagattaggcgacgttgcaccgaactgagttaacaaactc 7479307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 175 - 367
Target Start/End: Original strand, 12054454 - 12054637
Alignment:
Q  175 atctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttgaataaggactacactagt 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||    
T  12054454 atctaggagtttctaggttgaagtcaagacaggtaggtccaaggtc-tttagtgtaaacgaggagtttgctgagagctagagaataaggactacacttgt 12054552  T
Q  275 aactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttgcaccgaactgagttaacaaactcactgtgttctttactttct 367  Q
    |       || |||| |||  ||||||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||   ||||||||||    
T  12054553 a-------ga-tttcctccgagcttggtatcccctagagtaggtgacattgcaccgaactgggttaagaaactcactgtgccatttactttct 12054637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 145 - 274
Target Start/End: Original strand, 21253968 - 21254097
Alignment:
Q  145 tgaccataggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgc 244  Q
    |||| |||||||||| ||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |  ||| |||||||||||||     
T  21253968 tgactataggatagttagatgagatctcagatctaaaagttcctaggttgaagtctagacaggtaggtcctaggtctttagttgtgaacgaggagtttgt 21254067  T
Q  245 tgagagcttttgaataaggactacactagt 274  Q
    ||||| || | |||||||||||||||||||    
T  21254068 tgagaactatagaataaggactacactagt 21254097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 41 - 274
Target Start/End: Original strand, 286769 - 286996
Alignment:
Q  41 ttgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagttgtttgtttgaaggtaacttcaatttttgtctttttgtttaggtctgataggtcacaggggctg 140  Q
    |||| ||||||||||| | | || ||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||   |     ||||||  ||||||||| ||    
T  286769 ttgtgctacaccaaagcttttaagcaaggttgtagttgtttgtttgaaggtaacttcatcttttgtgttttgaat-----ctgataa-tcacaggggttg 286862  T
Q  141 tgactgaccataggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagt 240  Q
    ||| ||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |    | ||||| ||||||    
T  286863 tgattggtgttaggatagtgagatgggatctcagatctaggagttcctaggttgaaatctagacgggtaggtcctaggtcttgtgttataaacaaggagt 286962  T
Q  241 ttgctgagagcttttgaataaggactacactagt 274  Q
    || |||||| | || |||||||||||| ||||||    
T  286963 ttcctgagaacattagaataaggactatactagt 286996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 151 - 274
Target Start/End: Original strand, 21094683 - 21094805
Alignment:
Q  151 taggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaag-tctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgaga 249  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||  |||||||| |  |||| ||||||    
T  21094683 taggatagtgagacgggatctcagatctaggagttcctaggttgaagttctagacgggtaggtcctaggtcttaagttgtaaacgtg--gtttactgaga 21094780  T
Q  250 gcttttgaataaggactacactagt 274  Q
     |||| |||||||||||||||||||    
T  21094781 actttagaataaggactacactagt 21094805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 40 - 162
Target Start/End: Original strand, 17136013 - 17136136
Alignment:
Q  40 tttgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagttgtt--tgtttgaaggtaacttcaatttttgtctttttgtttaggtctgataggtcacagggg 137  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||  |||| |||||||||||| | |||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  17136013 tttgtactacaccaaagtggtgaaatacggtgctagttgtttgtgttggaaggtaacttctacttttg--ttttggtttaggtctgataggtcactgggg 17136110  T
Q  138 ctgtgactgacca-taggatagtgag 162  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||    
T  17136111 cagtgactgaccattaggatagtgag 17136136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 157 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 31649860 - 31649749
Alignment:
Q  157 agtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaag-tgtaaacgaggagtttgctgagagctttt 255  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||| |  |     
T  31649860 agtgagatgggatctcagatataggattttctaggttgaagtcaagacgggtaggtcctaggtc-tagagttgtaaacgaggagtttgctgagaac--ta 31649764  T
Q  256 gaataaggactacac 270  Q
    |||||||||||||||    
T  31649763 gaataaggactacac 31649749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 151 - 274
Target Start/End: Original strand, 980348 - 980468
Alignment:
Q  151 taggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagag 250  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||  |||||||| |  |||| |||| |     
T  980348 taggatcgtgagatgagatcttagatctaggagtt-ctaggttgaagtctagacaggtaggttctatgtcttaagttgtaaacgtg--gtttactgaaaa 980444  T
Q  251 cttttgaataaggactacactagt 274  Q
    |||| | |||||||||||||||||    
T  980445 ctttagtataaggactacactagt 980468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 157 - 354
Target Start/End: Original strand, 11558311 - 11558495
Alignment:
Q  157 agtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttg 256  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||   |  |||||||| ||||||||  |||| ||||| |  ||||||||| ||||||||    
T  11558311 agtgagatgggatctcaaatctaggagttcctaggttgaaatc---agtggtaggtcctaggtcat-tagtgcaaacgtg--gtttgctgaaagcttttg 11558404  T
Q  257 aataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttg-caccgaactgagttaacaaactcactgtg 354  Q
    |||| ||| |||       |||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||  |||| |||||||||  |||||||||||| |||||    
T  11558405 aatacggattac-------actagtggatttccttcctggcttggtagcctccatagtaggtg-tgttgtcaccgaacttggttaacaaactctctgtg 11558495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 157 - 354
Target Start/End: Original strand, 11567580 - 11567764
Alignment:
Q  157 agtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttg 256  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||   |  |||||||| ||||||||  |||| ||||| |  ||||||||| ||||||||    
T  11567580 agtgagatgggatctcaaatctaggagttcctaggttgaaatc---agtggtaggtcctaggtcat-tagtgcaaacgtg--gtttgctgaaagcttttg 11567673  T
Q  257 aataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttg-caccgaactgagttaacaaactcactgtg 354  Q
    |||| ||| |||       |||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||  |||| |||||||||  |||||||||||| |||||    
T  11567674 aatacggattac-------actagtggatttccttcctggcttggtagcctccatagtaggtg-tgttgtcaccgaacttggttaacaaactctctgtg 11567764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 157 - 308
Target Start/End: Original strand, 3552202 - 3552344
Alignment:
Q  157 agtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaag-tgtaaacgaggagtttgctgagagctttt 255  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||  |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| | ||| | ||     
T  3552202 agtgagatgg-atctcagatcaaggagttcctaagttgaagtcaagacgagtaggtcttaggtc-tagagttgtaaacgaggagtttgtttagaac-tta 3552298  T
Q  256 gaataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccc 308  Q
    |||||||||||||       |||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3552299 gaataaggactac-------actactggattttcttcctggcttggtagcccc 3552344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 45 - 152
Target Start/End: Original strand, 6579425 - 6579531
Alignment:
Q  45 actacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagtt-gtttgtttgaaggtaacttcaatttttgtctttttgtttaggtctgataggtcacaggggctgtga 143  Q
    |||||||||||| |||||| || | || ||| | |||||||||||||||||||||   |||||  || |||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  6579425 actacaccaaagctgtgaagcacgatgttaggtagtttgtttgaaggtaacttcaccgtttgt--ttgtgtttaggtctgataggttacatgggctgtga 6579522  T
Q  144 ctgaccata 152  Q
    |||||||||    
T  6579523 ctgaccata 6579531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 387 - 469
Target Start/End: Original strand, 19532097 - 19532179
Alignment:
Q  387 atttctgtttatcgcgtgatgttggaacattgaacataacatcgcaaacgttaaaacatcatacaaaacgtattaaaacaagt 469  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| | ||||| |  ||||||||| | ||| |||||||||||||    
T  19532097 atttctgtttatcgcgtgatgttgaaacattgatcgtaacattgaaaacgctgtaacatcatatagaacatattaaaacaagt 19532179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 237 - 366
Target Start/End: Original strand, 19531950 - 19532073
Alignment:
Q  237 gagtttgctgagagcttttgaataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttg-caccgaactg 335  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||       |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| ||   ||| ||||||| ||    
T  19531950 gagttttctgagagctattgaataaggacgacacta-------gtggatttccttcctggcttggtagcccccaaagtaggtgtgtttgtcaccgaattg 19532042  T
Q  336 agttaacaaactcactgtgttctttactttc 366  Q
      | |||||||||| ||||||||||||||||    
T  19532043 gatcaacaaactcattgtgttctttactttc 19532073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 16 - 98
Target Start/End: Original strand, 7478984 - 7479067
Alignment:
Q  16 tgtgaagcaaggagctaggtagattttgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagtt-gtttgtttgaaggtaacttca 98  Q
    ||||||||| |||| ||||||| || |||||||||| |||| |||||| || |||| ||| | |||||||||||||||||||||    
T  7478984 tgtgaagcacggagataggtagtttgtgtactacacaaaagctgtgaagcacggtgttaggtagtttgtttgaaggtaacttca 7479067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 157 - 213
Target Start/End: Original strand, 13100710 - 13100766
Alignment:
Q  157 agtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtc 213  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||| ||||||||    
T  13100710 agtgagataggatctcagatctagaagttcctagattgaagtcaagacgggtaggtc 13100766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 367
Target Start/End: Original strand, 13524736 - 13524871
Alignment:
Q  225 agtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttgaataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgtt 324  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || | |||||||||||||       || ||||||||| |||| || ||||||| |||||| ||||| ||   |     
T  13524736 agtgtaaatgaggagtttgctgagaactatagaataaggactac-------accagtggatttccttcttgacttggtagcccccagagtaggtgttttg 13524828  T
Q  325 gcaccgaactgagttaacaaactcactgtgttctttactttct 367  Q
      ||||||||| || |||||||||| | |||||||||||||||    
T  13524829 tgaccgaactgggtcaacaaactcattttgttctttactttct 13524871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 157 - 195
Target Start/End: Original strand, 14406616 - 14406654
Alignment:
Q  157 agtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttga 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  14406616 agtgagatgggatctcagatctaggagttcttaggttga 14406654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 278 - 346
Target Start/End: Original strand, 10189299 - 10189368
Alignment:
Q  278 tagtggattttcttcctggcttggtatcccccata-gtagatgacgttgcaccgaactgagttaacaaac 346  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||| |||| | | |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10189299 tagtgaatttccttcctagcttggtagcccctacatgtaggtgacgttgcaccgaactgggttaacaaac 10189368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 279 - 346
Target Start/End: Original strand, 10082375 - 10082443
Alignment:
Q  279 agtggattttcttcctggcttggtatcccccata-gtagatgacgttgcaccgaactgagttaacaaac 346  Q
    |||| |||| |||||| |||||||| |||| | | |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10082375 agtgaatttccttcctagcttggtagcccctagatgtaggtgacgttgcaccgaactgggttaacaaac 10082443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 278 - 345
Target Start/End: Original strand, 19584010 - 19584078
Alignment:
Q  278 tagtggattttcttcctggcttggtatcccccata-gtagatgacgttgcaccgaactgagttaacaaa 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||| | | |||| |||| |||||| |||||| |||||||||    
T  19584010 tagtggattttcttcctggcttggattcccctagatgtaggtgacattgcactgaactgggttaacaaa 19584078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 268; Significance: 1e-149; HSPs: 62)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 26 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 20558604 - 20558165
Alignment:
Q  26 ggagctaggtagattttgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagttgtttgtttgaaggtaacttcaatttttgtctttttgtttaggtctgat 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  20558604 ggagctaggtagattttgtactacaccgaagttgtgaaacaaggtgctagttgtttgtttcaaggtaactttaatttttgtgtttgtgtttaggtctgat 20558505  T
Q  126 aggtcacaggggctgtgactgaccataggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaa 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  20558504 aggtcacaggggctgtgactgaccataagatagtgagatgagatctcatatctaggagttcttaggttgaagtctagacgggtaggtcctaggtcataaa 20558405  T
Q  226 gtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttgaataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttg 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||       |||||||||||| ||||||||||||||| || ||| | ||| ||||||||    
T  20558404 gtgtaaacgaggagtttgctgagagttttagaataagggctac-------actagtggatttccttcctggcttggtagcctccagactaggtgacgttg 20558312  T
Q  326 caccgaactgagttaacaaactcactgtgttctttactttc---tcatttannnnnnnnnnnnnatttctgtttatcgcgtgatgttggaacattgaaca 422  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||             |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20558311 caccgaactgggttaacaaactcactgtgttctttactttcttgtcatttattttcttgtttttatttctgtttatcgcgtgatgttggaacattgaacg 20558212  T
Q  423 taacatcgcaaacgttaaaacatcatacaaaacgtattaaaacaagt 469  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  20558211 taacatcgcaaacgttaaaacatcatacataacatattaaaacaagt 20558165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 40 - 469
Target Start/End: Original strand, 9281578 - 9282005
Alignment:
Q  40 tttgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagttgtttgttt--gaaggtaacttcaatttttgtctttttgtttaggtctgataggtcacagggg 137  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||| | || |||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  9281578 tttgtactacaccgaagttgtgaaacaaggtgttagttgtttgttttggaaggtaacttctattct-gt-ttttggtttaggtctgataggtcactgggg 9281675  T
Q  138 ctgtgactgaccat-aggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgag 236  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9281676 cagtgactgaccattaggatagtgagatgggatctcaaatctaggagttcctaggttgaagtctatacgggtaggtcttaggtcatatagtgtaaacgag 9281775  T
Q  237 gagtttgctgagagcttttgaataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttg-caccgaactg 335  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||| ||   ||| |||||||||     
T  9281776 gagtttgctgagagctattgaataaggactac-------actagtggatttccttccaggcttggtagcccccagagtaggtgtgtttgtcaccgaacta 9281868  T
Q  336 agttaacaaactcactgtgttctttactt---tctcatttannnnnnnnnnnnnatttctgtttatcgcgtgatgttggaacattgaacataacatcgca 432  Q
      | |||||||||| ||||||| ||||||   | || ||||             ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | |    
T  9281869 gatcaacaaactcattgtgttcattacttttctgtcttttatttaattgtttttatttctgtttatcgcttgatgttggaacattgaacttaacattgaa 9281968  T
Q  433 aacgttaaaacatcatacaaaacgtattaaaacaagt 469  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9281969 aactttaaaacatcatacataacgtattaaaacaagt 9282005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 44 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 17855480 - 17855057
Alignment:
Q  44 tactacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagttgtttgttt--gaaggtaacttcaatttttgtctttttgtttaggtctgataggtcacaggggctgt 141  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |  |||||||||||| || |||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17855480 tactacaccaaagttgtgaaacacggtgctaattgtttgtgttggaaggtaacttctatctttgt--tttggtttaggtctgataggtcacagcggctgt 17855383  T
Q  142 gactgaccat-aggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagt 240  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  17855382 gactgaccattaggatagtgagatgagatctcagatctaggagttcctaggttgaagtctatacgggtaggtcctaggtcatatagtgtaaacgaggagt 17855283  T
Q  241 ttgctgagagcttttgaataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttg-caccgaactgagtt 339  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||       |||||||||| |||||||||||| || || ||| ||||| ||   ||| |||||| ||| ||     
T  17855282 ttgctgagagctattgaataaggactacac-------tagtggatttccttcctggcttgatagcctccagagtaggtgtgtttgtcaccgatctgggtc 17855190  T
Q  340 aacaaactcactgtgttctttactttc---tcatttannnnnnnnnnnnnatttctgtttatcgcgtgatgttggaacattgaacataacatcgcaaacg 436  Q
    |||||||||| || |||||||||||||   || ||||             | |||| ||||||| ||||||||| |||||| | | ||||||||||||      
T  17855189 aacaaactcattgcgttctttactttcctgtcttttattttcttgtttttaattctatttatcgtgtgatgttgaaacattaatcgtaacatcgcaaata 17855090  T
Q  437 ttaaaacatcatacaaaacgtattaaaacaagt 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17855089 ttaaaacatcatacaaaacgtattaaaacaagt 17855057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 42 - 357
Target Start/End: Original strand, 17864299 - 17864606
Alignment:
Q  42 tgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagttgtttgtttgaaggtaacttcaatttttgtctttttgtttaggtctgataggtcacaggggctgt 141  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17864299 tgtactacaccaaagttgtaaaacaaggtgtgagttgtttgtttgaaggtaacttca-tctttgagtttgtgtttaggtctgataggtcacaggggttgt 17864397  T
Q  142 gactgaccataggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtt 241  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || ||  |  |||||||||||||||||    
T  17864398 gacttaccataggatagtgagatgggatctcagatctaggagttcctaggttgaagtctatacaggtaggtccta-gtactttagtgtaaacgaggagtt 17864496  T
Q  242 tgctgagagcttttgaataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttg-caccgaactgagtta 340  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||       ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||   ||| |||||||||  || |    
T  17864497 tgctgagagctatagaataaggactac-------actagtggattttcttcctggattggtaacccccagagtaggtgtgtttgtcaccgaactaggtca 17864589  T
Q  341 acaaactcactgtgttc 357  Q
    ||||||| |||||||||    
T  17864590 acaaacttactgtgttc 17864606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 39 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 13195613 - 13195189
Alignment:
Q  39 ttttgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagttgtttgttt--gaaggtaacttcaatttttgtctttttgtttaggtctgataggtcacaggg 136  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||| | ||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||    
T  13195613 ttttgtactacaccgaagttatgaaacaaggtgttagttgtttgtgttggaaggtaacttctacttttgt--tttggtttaggtcttataggtcacaggg 13195516  T
Q  137 gctgtgactgaccat-aggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacga 235  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  13195515 -ctgtgactgaccattaggatagtgagatgggatctcagatctaggagttcctaggttgaagtctatacgggtaggtcctaggtcatatagtgtaaacga 13195417  T
Q  236 ggagtttgctgagagcttttgaataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttg-caccgaact 334  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||       |||||||||| |||| |||||||||| |||| | ||||| ||   ||| || ||||||    
T  13195416 ggagttttctgagagctattgaataaggactacac-------tagtggatttccttcatggcttggtagcccctagagtaggtgtgtttgtcatcgaact 13195324  T
Q  335 gagttaacaaactcactgtgttctttactttc---tcatttannnnnnnnnnnnnatttctgtttatcgcgtgatgttggaacattgaacataacatcgc 431  Q
      || |||||||||| ||||||||||||||||   |||||||             |||| ||||||| ||||||||||| |||||| |   |||||| ||    
T  13195323 aggtcaacaaactcattgtgttctttactttcctgtcatttattttcttgtttttatttatgtttattgcgtgatgttgaaacattaattgtaacattgc 13195224  T
Q  432 aaacgttaaaacatcatacaaaacgtattaaaaca 466  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  13195223 aaacgctaaaacatcataccaaacatattaaaaca 13195189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 42 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 14259200 - 14258773
Alignment:
Q  42 tgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagttgtttgttt--gaaggtaacttcaatttttgtctttttgtttaggtctgataggtcacaggggct 139  Q
    |||| |||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||  ||||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||| |    
T  14259200 tgtattacaccgaagttgtcaaacaatgtgttagttgtttgtttttgaaggtaacttcaacctttgtgtttgtgttcaggtctgataggtcacatgggtt 14259101  T
Q  140 gtgactgaccat-aggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgagga 238  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || || |||||||| || |||||||| ||||||||| | |||||||||  |    
T  14259100 gtgactgaccattaggatagtgagatgggatctcagatctaggagttcataagtggaagtctatacgggtaggtcctaggtcatatattgtaaacgataa 14259001  T
Q  239 gtttgctgagagcttttgaataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgtt-gcaccgaactgag 337  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||       |||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||| ||   ||  |||||||||| |    
T  14259000 gtttgttgagagctattgaataaggactacac-------tagtggatttccttcctcgcttggtagcccccaaagtaggtgtgtttctcaccgaactggg 14258908  T
Q  338 ttaacaaactcactgtgttctttactttc---tcatttannnnnnnnnnnnnatttctgtttatcgcgtgatgttggaacattgaacataacatcgcaaa 434  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||   |  ||||             ||||||| |||||||||||||||| |||||| | | |||||| |||||    
T  14258907 tcaacaaactcattgtgttctttactttcctattgtttattttcttgtttttatttctgcttatcgcgtgatgttgaaacattaatcgtaacattgcaaa 14258808  T
Q  435 cgttaaaacatcatacaaaacgtattaaaacaagt 469  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  14258807 cgttaaaacatcataaaaaacatattaaaacaagt 14258773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 45 - 274
Target Start/End: Original strand, 21723283 - 21723513
Alignment:
Q  45 actacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagttgtttgttt--gaaggtaacttcaatttttgtctttttgtttaggtctgataggtcacaggggctgtg 142  Q
    |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||| | ||||||  ||| |||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  21723283 actacaccgaggttgtgaaacaaggtgttagttgtttgtgttggaaggtaacttctacttttgt--tttggtttaggtttgataggtcacaaaggctgtg 21723380  T
Q  143 actgacca-taggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtt 241  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  21723381 actgaccagtaggatagtgagatgggatctcagatctaggagttcctaggttgaaatctagacgggtaggtcctaggtcatatagtgtaaacgaggagtt 21723480  T
Q  242 tgctgagagcttttgaataaggactacactagt 274  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21723481 tgctgagagctattgaataaggactacactagt 21723513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 40 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 33666082 - 33665762
Alignment:
Q  40 tttgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagttgtttgttt--gaaggtaacttcaatttttgtctttttgtttaggtctgataggtcacagggg 137  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||| | |||    |||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  33666082 tttgtactacaccgaagttgtgaaacaaggtgctagttgtttgtgttggaatgtaacttctactttg---ttttggtttaggtctgataggtcatagggg 33665986  T
Q  138 ctgtgactgaccat-aggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgag 236  Q
    || ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||| || |||||||| || |||||| ||||||||||||    
T  33665985 ctttgactgatcattaggatagtgagatgagatctcagatctaggagttccttggttgaagtctatacgggtaggtcctatgtcatatagtgtaaacgag 33665886  T
Q  237 gagtttgctgagagcttttgaataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttg-caccgaactg 335  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||       |||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||| ||   ||| |||||||||     
T  33665885 gagtttgctgagagctattgaataaggactacac-------tagtggatttccttcctggcttagtagcccccagagtaggtgtgtttgtcaccgaacta 33665793  T
Q  336 agttaacaaactcactgtgttctttactttc 366  Q
     || |||||||||| |||||| |||||||||    
T  33665792 ggtcaacaaactcattgtgttatttactttc 33665762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 42 - 469
Target Start/End: Original strand, 20989638 - 20990061
Alignment:
Q  42 tgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagttgtttgt--ttgaaggtaacttcaatttttgtctttttgtttaggtctgataggtcacaggggct 139  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||||||| | |||    | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20989638 tgtactacatcgaagttgtgaaacagggtgttagttgtttgtgtttgaaggtaacttctactttg---tgtttgtttaggtctgataggtcacaggggct 20989734  T
Q  140 gtgactgaccat-aggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgagga 238  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| | || ||||||||||||    
T  20989735 gtgattgaccattaggatagtgagatgagatctcggatctaggagtttctaggttcaagtctatacaggtaggtcataggtctttaa-tgtaaacgagga 20989833  T
Q  239 gtttgctgagagcttttgaataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttg-caccgaactgag 337  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||       |||||||||||| ||| ||| ||||||| |||||| ||||| ||    || |||||||||| |    
T  20989834 gtttgctgagagctatagaataaggactac-------actagtggatttcctttctgacttggtagcccccagagtaggtgtgtctgtcaccgaactggg 20989926  T
Q  338 ttaacaaactcactgtgttctttactttc---tcatttannnnnnnnnnnnnatttctgtttatcgcgtgatgttggaacattgaacataacatcgcaaa 434  Q
    | |||||||||| |||||| |||||||||   |||||||             ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |  ||||| |||||    
T  20989927 tcaacaaactcattgtgttatttactttcccatcatttattttcttgtttttatttctacttatcgtgtgatgttggaacattgatcggaacattgcaaa 20990026  T
Q  435 cgttaaaacatcatacaaaacgtattaaaacaagt 469  Q
     | |||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  20990027 tgctaaaacatcatacagaacatattaaaacaagt 20990061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 33 - 366
Target Start/End: Original strand, 34657012 - 34657341
Alignment:
Q  33 ggtagattttgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagtt-gtttgt--ttgaaggtaacttcaatttttgtctttttgtttaggtctgataggt 129  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||  |||||||||||||| | ||| |  ||| ||||||||||||||||||    
T  34657012 ggtagattgtgcactacaccgaagttgtgaaacaaggtgttaggtagtttgtgtttgaaggtaacttctacttt-gagtttgtgtttaggtctgataggt 34657110  T
Q  130 cacaggggctgtgactgaccat-aggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtg 228  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||| |||| || ||| |||| ||||||||| ||||    
T  34657111 cacagtggctgtgactgaccattaggatagtgagatgatatctcagatctgggagttcctaggttgaaatctatacgggttggtcctaggtcatatagtg 34657210  T
Q  229 taaacgaggagtttgctgagagcttttgaataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccata-gtagatgacgttgca 327  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||||||| |||| |||||||||| |||| | | |||| ||| ||||      
T  34657211 taaacgaggagtttgctgagagctattgaataaggactac-------actagtggatttccttcttggcttggtagcccctagatgtaggtga-gttgtg 34657302  T
Q  328 ccgaactgagttaacaaactcactgtgttctttactttc 366  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34657303 ccgaactgggttaacaaactctctgtgttctttactttc 34657341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 42 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 25805740 - 25805422
Alignment:
Q  42 tgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagttgtttgt--ttgaaggtaacttcaatttttgtctttttgtttaggtctgataggtcacaggggct 139  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||||    
T  25805740 tgtactacaccgaagttgttaaacaaggtgctagttgtttgtgtttgaaggtaacttcaacctttgtgtttgtgt--aggtctgataggtcacaggggct 25805643  T
Q  140 gtgactgaccatagg-atagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgagga 238  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | || |||||||| |||||| |  ||||||||||||||    
T  25805642 gtgactgaccattgggatagtgagatgggatctcagatctaggagttcctaggttgaaatcaatacgggtaggtcctaggtc-tttagtgtaaacgagga 25805544  T
Q  239 gtttgctgagagcttttgaataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttg-caccgaactgag 337  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||||||       |||||||||||| ||||||||||||||| || | | ||||| ||   ||| |||||| |||      
T  25805543 gtttgctgagagctatataataaggactac-------actagtggatttccttcctggcttggtagcctctagagtaggtgtgtttgtcaccgatctggt 25805451  T
Q  338 ttaacaaactcactgtgttctttactttc 366  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  25805450 ttaacaaaatcattgtgttctttactttc 25805422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 40 - 366
Target Start/End: Original strand, 17527755 - 17528075
Alignment:
Q  40 tttgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagttgtttgttt--gaaggtaacttcaatttttgtctttttgtttaggtctgataggtcacagggg 137  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||| ||| |    |||| ||||||||||||||||||||  |||    
T  17527755 tttgtactacaccgaagttttgaaacaaggtgttagttgtttgtgttggaaggtaacttctattatg---ttttggtttaggtctgataggtcactaggg 17527851  T
Q  138 ctgtgactgaccat-aggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgag 236  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||| ||||||||| ||    
T  17527852 cagtgactgaccattaggatagtgagatggaatctctgatctatgagttcctaggttgaagtctatatgggtaggtcctaggtcatatagtgtaaacaag 17527951  T
Q  237 gagtttgctgagagcttttgaataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttg-caccgaactg 335  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||       |||||||||||  ||| ||||||||||| |||| ||||||| ||   ||| ||| ||||||    
T  17527952 gagtttgctgagaactattgaataaggactac-------actagtggattaactttctggcttggtagccccaatagtaggtgtgtttgtcactgaactg 17528044  T
Q  336 agttaacaaactcactgtgttctttactttc 366  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17528045 ggttaacaaactcactgtgttctttactttc 17528075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 76 - 366
Target Start/End: Original strand, 20470110 - 20470393
Alignment:
Q  76 ttgtttgtttgaaggtaacttcaatttttgtctttttgtttaggtctgataggtcacaggggctgtgactgaccat-aggatagtgagatgggatctcag 174  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  20470110 ttgtttgttttaaggtaacttcaacttt-gtgtttgtgtttaggtctgataggtcacaggggctgtgactgaccattaggatagtgagatgagatctcag 20470208  T
Q  175 atctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttgaataaggactacactagt 274  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||          
T  20470209 atctaggagttcctaggttgaagtctatacgggtaggtcctaggtc-tttagtgtaaacgaggagtttgctgagagctatagaataaggagtac------ 20470301  T
Q  275 aactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttg-caccgaactgagttaacaaactcactgtgttctttactttc 366  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||| ||   ||| | |||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||    
T  20470302 -actagtggatttccttcctggcttggtagcctccagagtaggtgtgattgtcgccgaactgggtcaacaaactcattatgttctttactttc 20470393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 42 - 469
Target Start/End: Original strand, 8465545 - 8465964
Alignment:
Q  42 tgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagttgtttgtttgaaggtaacttcaatttttgtctttttgtttaggtctgataggtcacaggggctgt 141  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8465545 tgtactacaccgaagttgtgaaagaaggtgttagttgtttgtttgaaggtaacttc-acctttgagtttgtgtttaggtctgataggtcacaggggttgt 8465643  T
Q  142 gactgacca-taggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagt 240  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| || |||||||| |||||| |  ||||||||   |||||    
T  8465644 gactgaccattaagatagtgagatgggatctcagatctaggagttccaagattgaagtctatacgggtaggtcctaggtc-tttagtgtaaatttggagt 8465742  T
Q  241 ttgctgagagcttttgaataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttg-caccgaactgagtt 339  Q
    |||||||||||| | || ||||||||||       ||||| |||     |||||||||||| | |||||| ||||| ||   ||| ||||||| || ||     
T  8465743 ttgctgagagctatagagtaaggactac-------actagcgga----attcctggcttggcagcccccagagtaggtgtgtttgtcaccgaaatgggtc 8465831  T
Q  340 aacaaactcactgtgttctttactttc---tcatttannnnnnnnnnnnnatttctgtttatcgcgtgatgttggaacattgaacataacatcgcaaacg 436  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||   |||||||             ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  8465832 aacaaactcattgtgttctttactttcctgtcatttactttcttgtttttatttcagtttatttcgtgatgttggaacattgaacggaacattgcaaacg 8465931  T
Q  437 ttaaaacatcatacaaaacgtattaaaacaagt 469  Q
    ||||||||||||| | ||| |||||||||||||    
T  8465932 ttaaaacatcatatagaacatattaaaacaagt 8465964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 47 - 274
Target Start/End: Original strand, 21706224 - 21706454
Alignment:
Q  47 tacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagttgtttgttt--gaaggtaacttcaatttttgtctttttgtttaggtctgataggtcacaggggctgtgac 144  Q
    |||||| ||||| ||||||||| |  ||||||||||| |  |||||||||||| | ||||||  ||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  21706224 tacaccgaagttatgaaacaagtttttagttgtttgtgttggaaggtaacttctacttttgt--tttggtttaggtctgatatgtcataggggctgtgac 21706321  T
Q  145 tgacca-taggatagtgagatgggatctcagat--ctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtt 241  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  21706322 tgaccagtaggatagtgagatgggatctcagatatctaggagttcctaggttgatatctagacgggtaggtcctaggtcatatagtgtaaacgaggagtt 21706421  T
Q  242 tgctgagagcttttgaataaggactacactagt 274  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21706422 tgctgagagctattgaataaggactacactagt 21706454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 41 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 25964983 - 25964749
Alignment:
Q  41 ttgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagttgtttgttt--gaaggtaacttcaatttttgtctttttgtttaggtctgataggtcacaggggc 138  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||| || |||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||     
T  25964983 ttgtactacaccgaagttttgaaacaaggtgttagttgtttgtgttggaaggtaacttctatctttgt--tttagtttaggtctgataggtcacaagggt 25964886  T
Q  139 tgtgactgaccat-aggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgagg 237  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||| |    
T  25964885 tgtgactgaccattaggatagtgatatgggatctcagatctaggagttcctaggttgaagtctatacgggtaggtcctaggtcatatagtgtaaacgatg 25964786  T
Q  238 agtttgctgagagcttttgaataaggactacactagt 274  Q
    ||||| || || ||| | ||||||||||||| |||||    
T  25964785 agttttctaagggctatagaataaggactaccctagt 25964749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 41 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 25969630 - 25969396
Alignment:
Q  41 ttgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagttgtttgttt--gaaggtaacttcaatttttgtctttttgtttaggtctgataggtcacaggggc 138  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||| || |||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||     
T  25969630 ttgtactacaccgaagttttgaaacaaggtgttagttgtttgtgttggaaggtaacttctatctttgt--tttagtttaggtctgataggtcacaagggt 25969533  T
Q  139 tgtgactgaccat-aggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgagg 237  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||| |    
T  25969532 tgtgactgaccattaggatagtgatatgggatctcagatctaggagttcctaggttgaagtctatacgggtaggtcctaggtcatatagtgtaaacgatg 25969433  T
Q  238 agtttgctgagagcttttgaataaggactacactagt 274  Q
    ||||| || || ||| | ||||||||||||| |||||    
T  25969432 agttttctaagggctatagaataaggactaccctagt 25969396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 41 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 25974070 - 25973836
Alignment:
Q  41 ttgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagttgtttgttt--gaaggtaacttcaatttttgtctttttgtttaggtctgataggtcacaggggc 138  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||| || |||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||     
T  25974070 ttgtactacaccgaagttttgaaacaaggtgttagttgtttgtgttggaaggtaacttctatctttgt--tttagtttaggtctgataggtcacaagggt 25973973  T
Q  139 tgtgactgaccat-aggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgagg 237  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||| |    
T  25973972 tgtgactgaccattaggatagtgatatgggatctcagatctaggagttcctaggttgaagtctatacgggtaggtcctaggtcatatagtgtaaacgatg 25973873  T
Q  238 agtttgctgagagcttttgaataaggactacactagt 274  Q
    ||||| || || ||| | ||||||||||||| |||||    
T  25973872 agttttctaagggctatagaataaggactaccctagt 25973836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 42 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 19171703 - 19171470
Alignment:
Q  42 tgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagttgtttgttt--gaaggtaacttcaatttttgtctttttgtttaggtctgataggtcacaggggct 139  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| |  |||||||||||| | ||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19171703 tgtactacaccgaagttgtgaaacaatgtgttagttgtttgtgttggaaggtaacttctacttt-gt-tgtttgtttaggtctgataggtcacatgggct 19171606  T
Q  140 gtgactgaccat-aggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgagga 238  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||||||| ||||||||| ||| ||| | ||||    
T  19171605 gtgactgaccattaggatagtgagatggaatctcagatctaggagttcataggttgaagtctatacgggtaggtcctaggtcatatagtataagcaagga 19171506  T
Q  239 gtttgctgagagcttttgaataaggactacactagt 274  Q
     ||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  19171505 ctttgctgagagttattgaataaggactacactagt 19171470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 39 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 17234883 - 17234560
Alignment:
Q  39 ttttgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagttgtttgttt--gaaggtaacttcaatttttgtctttttgtttaggtctgataggtcacaggg 136  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||| |  |||||||||||| | ||| || |||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  17234883 ttttgtactacaccgaagttgtgaaataaggtgttagttatttgtgttggaaggtaacttctacttt-gtattttggtttcggtctgataggacacaggg 17234785  T
Q  137 gctgtgactgaccat-aggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacga 235  Q
    |||| |||||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||      
T  17234784 gctgagactgaccattaggatagtaagatgagatatcagatctaggagttcctaggttgaagtctatacgggtaggtcataggtcatatagtgtaaacag 17234685  T
Q  236 ggagtttgctgagagcttttgaataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttg-caccgaact 334  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||       ||| |||||||| ||||  ||||||||| |||| | ||||| ||   ||| |||| ||||    
T  17234684 ggagtttgcagagagctattgaataaggactac-------actggtggatttccttctgggcttggtagcccctagagtaggtgtgtttgtcaccaaact 17234592  T
Q  335 gagttaacaaactcactgtgttctttactttc 366  Q
    | || |||||||||| ||||||||||||||||    
T  17234591 gggtcaacaaactcattgtgttctttactttc 17234560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 40 - 271
Target Start/End: Original strand, 19894492 - 19894722
Alignment:
Q  40 tttgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagttgtt--tgtttgaaggtaacttcaatttttgtctttttgtttaggtctgataggtcacagggg 137  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| || ||||  |||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  19894492 tttgtactacaccgaagttgtgaaacaaggtgctagttgtttgtgttggaaggtaacttctatctttg--ttttggtttaggtctgataggtcacaaggg 19894589  T
Q  138 ctgtgactgacca-taggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgag 236  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||   | ||||||||||| |  |||||||| ||||||||| | ||||||| ||    
T  19894590 ctgtgactgagcattaggatagtgagatgggatct-agatctaggagttcagaagttgaagtctata-gggtaggtcctaggtcatataatgtaaacaag 19894687  T
Q  237 gagtttgctgagagcttttgaataaggactacact 271  Q
    || |||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  19894688 gaatttgatgagagctattgaataaggactacact 19894722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 42 - 469
Target Start/End: Original strand, 15897547 - 15897970
Alignment:
Q  42 tgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagttgtttgt--ttgaaggtaacttcaattttt-gtctttttgtttaggtctgataggtcacaggggc 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| | |||  ||||  ||    ||||| |||||||||||||||     
T  15897547 tgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgttagttgtttgtgtttgaaggtaacttctactttgagtctactt----aggtccgataggtcacaggggt 15897642  T
Q  139 tgtgactgaccat-aggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgagg 237  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||| | ||||| |  |||||||| |||||| | |  |||||| ||||    
T  15897643 tgtgacagaccattaggatagtgagattggatctcagatctagtcgttcctaggtttacgtctatatgggtaggtcctaggtcgttat-tgtaaatgagg 15897741  T
Q  238 agtttgctgagagcttttgaataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttg-caccgaactga 336  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||       |||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||| ||   ||| ||||||||||     
T  15897742 agtttgctaagagctatagaataaggactac-------actagtggatttccttcctagcttggtagcccccagagtaggtgtgtttgtcaccgaactgg 15897834  T
Q  337 gttaacaaactcactgtgttctttactttc---tcatttannnnnnnnnnnnnatttctgtttatcgcgtgatgttggaacattgaacataacatcgcaa 433  Q
    || |||||||||| | ||||||||||||||   || ||||             | |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||     
T  15897835 gtcaacaaactcattttgttctttactttcttgtcttttattttcttatttttacttctgtttatcgcgtgatgttgaaaccttgaacaaaacattgcat 15897934  T
Q  434 acgttaaaacatcatacaaaacgtattaaaacaagt 469  Q
    ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  15897935 acgttaaaacatcgtacataacatattaaaacaagt 15897970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 129 - 274
Target Start/End: Original strand, 26965530 - 26965675
Alignment:
Q  129 tcacaggggctgtgactgaccataggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtg 228  Q
    ||||||||| ||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||  ||    
T  26965530 tcacaggggttgtgattgattgtaggatagtgagatgggatctcagatctaggagttcctaggttgaagtctagacgggtaggtcctaggtcttaagttg 26965629  T
Q  229 taaacgaggagtttgctgagagcttttgaataaggactacactagt 274  Q
    |||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  26965630 taaatgaggagtttgctgagaactttagaataaggactacactagt 26965675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 79 - 367
Target Start/End: Original strand, 29254825 - 29255106
Alignment:
Q  79 tttgtttgaaggtaacttcaatttttgtcttt-ttgtttag-gtctgataggtcacaggggctgtgactgaccataggatagtgagatgggatctcagat 176  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||   ||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29254825 tttgtttgaaggtaacttca-tctttgtgtttgttgtttttagtctgatagatcacatgggctgtgattgactataggatagtgagatgggatctcagat 29254923  T
Q  177 ctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttgaataaggactacactagtaa 276  Q
    |||||||||  || |||||| || | || |||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||       |    
T  29254924 ctaggagttcataagttgaaatcaatacgggtaggtcctaggtc-tttagtgtaaacgaggagtttgctgagagctatagaataaggactac-------a 29255015  T
Q  277 ctagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttg-caccgaactgagttaacaaactcactgtgttctttactttct 367  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  ||| | ||||| ||   ||| ||| |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29255016 ctagtggattttcttcctggcttgata-gccctagagtaggtgtgtttgccactgaactgggtcaacaaactcaccgtgttctttactttct 29255106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 157 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 19216124 - 19215935
Alignment:
Q  157 agtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctag-acaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagctttt 255  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||| || |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  19216124 agtgagatgggatctcaaatctaggagttcctaagttgaagt-tagtacgggtaggtcctaggtcatatagtgaaaacgaggagtttgctgagagctatt 19216026  T
Q  256 gaataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttgcaccgaactgagttaacaaactcactgtg 354  Q
    ||||| |||||||||       |||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  19216025 gaatacggactacac-------tagtggatttccttcctggcttggtat-ccctagagtaggtgacgttgcaccgaactgggttaacaaactcaatgtg 19215935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 157 - 354
Target Start/End: Original strand, 15003150 - 15003340
Alignment:
Q  157 agtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttg 256  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||   || |||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| |||    
T  15003150 agtgagatgagatctcaaatctaggagttcctatgttgaagtcagtacgggtaggtcctaggtcatatagtgcaaacaaggagtttgctgagagctattg 15003249  T
Q  257 aataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttgcaccgaactgagttaacaaactcactgtg 354  Q
    ||||||||||||       |||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  15003250 aataaggactac-------actagtggatttccttcatggcttggtatccaccagagtaggtgacattgcaccgaactgggttaacgaactcactgtg 15003340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 157 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 15038518 - 15038319
Alignment:
Q  157 agtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttg 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   || ||| |||| ||||||||   ||| ||||||||||||| ||||||||| |||    
T  15038518 agtgagatgggatctcagatctaggagttactaggttgaagtcagtacgggttggtcctaggtcat-ttgtgcaaacgaggagtttcctgagagctattg 15038420  T
Q  257 aataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttgcaccgaactgagttaacaaactcactgtgtt 356  Q
    |||| |||||||       |||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||     
T  15038419 aatacggactac-------actagtggatttccttcctgacttggtagcccccagagtaggtgacgttgcaccaaactgggttaacaaactcactgtgtc 15038327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 42 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 19100185 - 19100017
Alignment:
Q  42 tgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagttgtttgt--ttgaaggtaacttcaattttt-gtctttttgtttaggtctgataggtcacaggggc 138  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||  |||||||||||||| | |||  ||||    ||||||||||||||||||||||||||    
T  19100185 tgtactacatcaaagttgtgaaacaagttgttagttgtttgtgtttgaaggtaacttctactttgagtct----gtttaggtctgataggtcacaggggc 19100090  T
Q  139 tgtgactgaccat-aggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtag 210  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| || |||||    
T  19100089 tgtgactgaccattaggatagtgagatgggatctcagatgtagaagttcctaggttgaagtctatacgggtag 19100017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 157 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 9384784 - 9384595
Alignment:
Q  157 agtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttg 256  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||   || |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  9384784 agtgagatgggatctcagatcaag-agttcctaggttgaagtcagtacgggtaggtcctaggtcatatagtgcaaacgaggagtttgctgagagctattg 9384686  T
Q  257 aataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttgcaccgaactgagttaacaaactcactgtg 354  Q
    ||||||||||||||       |||||||||| ||||||| ||||||| || ||| | |||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9384685 aataaggactacac-------tagtggatttccttcctgacttggtagccaccagaataggcgacgttgtaccgaactgggttaacaaactcactgtg 9384595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 157 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 20003308 - 20003118
Alignment:
Q  157 agtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttg 256  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    || |||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||| ||||||||| |||    
T  20003308 agtgagatgggatctcaaatctaggagttcctaggttgaagtaagtacgggtaggtcctaggtcatatagtgcaaacgaggggtttcctgagagctattg 20003209  T
Q  257 aataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttgcaccgaactgagttaacaaactcactgtg 354  Q
    |||||| |||||||       |||| ||||| ||||||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||    
T  20003208 aataagaactacac-------tagttgatttccttcctggcttggtagcccctaaagtaggtgacgttgcaccgaactgggttcacaaactcattgtg 20003118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 157 - 347
Target Start/End: Original strand, 16309346 - 16309527
Alignment:
Q  157 agtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttg 256  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  16309346 agtgagatgagatctcagatctacgagttcctaggttgaagtcaagacgggtaggtcctaggtc-tttagtgtaaacgaggagtttgctgagagctagag 16309444  T
Q  257 aataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttgcaccgaactgagttaacaaact 347  Q
    |||||||||||        ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  16309445 aataaggacta-------tactagtgga-tttcctcctggcttggtagcccccagagtaggtgacgttgcactgaactgggttaacaaact 16309527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 177 - 354
Target Start/End: Original strand, 15007344 - 15007513
Alignment:
Q  177 ctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttgaataaggactacactagtaa 276  Q
    ||||||||| |||||||||||||   || |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||       |    
T  15007344 ctaggagttcctaggttgaagtcagcacgggtaggtcctaggtcatatagtgcaaacgaggagtttgctgagagctattgaataagtactac-------a 15007436  T
Q  277 ctagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttgcaccgaactgagttaacaaactcactgtg 354  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  15007437 ctagtggatttccttcatggcttggtat-ccccagagtaggtgactttgcatcgaactgggttaacaaactcactgtg 15007513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 157 - 354
Target Start/End: Original strand, 16137570 - 16137759
Alignment:
Q  157 agtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttg 256  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||| |||||||||||||   || ||||| || |||||||| |  || ||||||||||||||||||||||| |||    
T  16137570 agtgagatgtgatctcagatttatgagttcctaggttgaagtcagtacgggtagatcctaggtcattac-tgcaaacgaggagtttgctgagagctattg 16137668  T
Q  257 aataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttgcaccgaactgagttaacaaactcactgtg 354  Q
    ||||||||||||       |||||||||||| ||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||    
T  16137669 aataaggactac-------actagtggatttccttcctggcttggtagccctcagagtaggtgacgttgcatcaaactgggttaacaaactcattgtg 16137759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 129 - 366
Target Start/End: Original strand, 23882654 - 23882884
Alignment:
Q  129 tcacaggggctgtgactgaccataggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtg 228  Q
    ||||||||||||||| ||||  || |||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||| || | ||||||||||| |||||| |  ||||    
T  23882654 tcacaggggctgtgattgactgtaagatagtgagatgagatatcagatctaggagttcataggttgaaatcaatacaggtaggtcctaggtc-tttagtg 23882752  T
Q  229 taaacgaggagtttgctgagagcttttgaataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttg-ca 327  Q
    ||||| | |||||||||| ||||| | |||||| ||||||       |||||||||||| |||||||  |||||| |||||| ||||| ||   ||| ||    
T  23882753 taaacaaagagtttgctgggagctatagaataaagactac-------actagtggatttccttcctgatttggtagcccccagagtaggtgtgtttgtca 23882845  T
Q  328 ccgaactgagttaacaaactcactgtgttctttactttc 366  Q
    |||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||    
T  23882846 ccgaactgggtcaacaaactcattgtgttctttactttc 23882884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 155 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 24501997 - 24501879
Alignment:
Q  155 atagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttt 254  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | || |||||||| |||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  24501997 atagtgagatgggatcttagatctaggagtttctaggttgaaatcaatacgggtaggtcctaggtc-tttagtgtaaatgaggagtttgctgagagctat 24501899  T
Q  255 tgaataaggactacactagt 274  Q
     |||||||||||||||||||    
T  24501898 agaataaggactacactagt 24501879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 151 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 28623705 - 28623583
Alignment:
Q  151 taggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagag 250  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| || | || |||||||| |||||| | |||||||||||| || |||||| ||||    
T  28623705 taggatagtgagatgagatctcaaatctaggagttcctaggttgaaatcaatacgggtaggtcctaggtc-ttaagtgtaaacgaagattttgctcagag 28623607  T
Q  251 cttttgaataaggactacactagt 274  Q
    |||| |||||||||||||||||||    
T  28623606 ctttagaataaggactacactagt 28623583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 151 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 11960660 - 11960550
Alignment:
Q  151 taggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagag 250  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||| | |  |||||||||||||||||||||||     
T  11960660 taggatagtgagatgagatatcagatgtaggagttcctaggttgaagtctagacgggtaggtcctaggtcttcagttgtaaacgaggagtttgctgagaa 11960561  T
Q  251 cttttgaataa 261  Q
    |||| ||||||    
T  11960560 ctttagaataa 11960550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 178 - 469
Target Start/End: Original strand, 12039691 - 12039978
Alignment:
Q  178 taggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttgaataaggactacactagtaac 277  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||| |||||| | | |||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||| |      
T  12039691 taggagttcctaggttgaagtctatacgagtaggtcctaggtcttta-gtgtaaacgaggagtttgttgagagctatagaataaggactacactagaa-- 12039787  T
Q  278 tagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttg-caccgaactgagttaacaaactcactgtgttctttactttc---tcattta 373  Q
         ||||| |||||| |||||||| |||||| ||||| ||   | | |||||||||  || |||||||||| ||||||||||||||||   || ||||    
T  12039788 -----gatttccttcctagcttggtagcccccaaagtaggtgtgttcgtcaccgaactaggtcaacaaactcattgtgttctttactttcttgtcgttta 12039882  T
Q  374 nnnnnnnnnnnnnatttctgtttatcgcgtgatgttggaacattgaacataacatcgcaaacgttaaaacatcatacaaaacgtattaaaacaagt 469  Q
                 ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |  | ||| |||||||||||||    
T  12039883 ttttcttgtttttatttctgtttatctcgtgatattggaacattgaacgaaacattgcaaacgttaaaacatcgtgtagaacatattaaaacaagt 12039978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 151 - 274
Target Start/End: Original strand, 3567404 - 3567526
Alignment:
Q  151 taggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagag 250  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||  ||||||||| || | || |||||||| |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  3567404 taggatagtgagatgagatcttagatctagaagttcttaggttgaaatcaatacgggtaggtcctaggtcttaa-gtgtaaacgaggattttgctgagag 3567502  T
Q  251 cttttgaataaggactacactagt 274  Q
    |||| ||||||| |||||||||||    
T  3567503 ctttagaataagaactacactagt 3567526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 42 - 155
Target Start/End: Original strand, 12039582 - 12039695
Alignment:
Q  42 tgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagttgttt-gtttgaaggtaacttcaatttttgtctttttgtttaggtctgataggtcacaggggctg 140  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||| ||| |  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12039582 tgtactacactgaagttgtgaaacaaggtgttagttgttttggttgaaggtagcttcaacttt-gagtttgtgtttaggtctgataggtcacaagggctg 12039680  T
Q  141 tgactgaccatagga 155  Q
    |||||||||||||||    
T  12039681 tgactgaccatagga 12039695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 40 - 168
Target Start/End: Original strand, 13870270 - 13870399
Alignment:
Q  40 tttgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagttgtttgt-ttgaagg-taacttcaatttttgtctttttgtttaggtctgataggtcacagggg 137  Q
    ||||| |||| || ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| | ||||||| | ||||||  ||| ||||||||||||||||||||  |||    
T  13870270 tttgtgctacgccgaagttgtgaaacaagctgttagttgtttgtgttgaaagataacttctacttttgt--tttggtttaggtctgataggtcactaggg 13870367  T
Q  138 ctgtgactgacca-taggatagtgagatggga 168  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13870368 ctgtgactgaccattaggatagtgagatggga 13870399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 157 - 274
Target Start/End: Original strand, 12444710 - 12444824
Alignment:
Q  157 agtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttg 256  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||   || |||||||| ||||||||  |||| ||||| |  ||||||||||||||||||    
T  12444710 agtgaggtgggatctcaaatctaggagttcctaggttgaagtcagtacgggtaggtcctaggtcat-tagtgcaaacgtg--gtttgctgagagcttttg 12444806  T
Q  257 aataaggactacactagt 274  Q
    |||| |||||||||||||    
T  12444807 aatacggactacactagt 12444824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 23879176 - 23879133
Alignment:
Q  40 tttgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagttgtttgt 83  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23879176 tttgtactacaccgaagttgtgaaacaaggtgctagttgtttgt 23879133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 157 - 274
Target Start/End: Original strand, 20764982 - 20765098
Alignment:
Q  157 agtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaag-tgtaaacgaggagtttgctgagagctttt 255  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||||| |||| |||||||| |||||| || || ||||||||   |||||| ||||| | ||     
T  20764982 agtgagatgagatctcagatctaagagttcttaggttgaagtcaagacgggtaggtcctaggtc-tagagttgtaaacggaaagtttgttgagaac-tta 20765079  T
Q  256 gaataaggactacactagt 274  Q
    |||||||||||||||||||    
T  20765080 gaataaggactacactagt 20765098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 387 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 25948473 - 25948391
Alignment:
Q  387 atttctgtttatcgcgtgatgttggaacattgaacataacatcgcaaacgttaaaacatcatacaaaacgtattaaaacaagt 469  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| | | || ||| ||||||| | ||||| |||||| || ||||||||||||||    
T  25948473 atttctgtttatcgcgtgatgttgaaacattaatcgtatcattgcaaacgctgaaacaacatacataatgtattaaaacaagt 25948391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 392 - 469
Target Start/End: Original strand, 13870515 - 13870592
Alignment:
Q  392 tgtttatcgcgtgatgttggaacattgaacataacatcgcaaacgttaaaacatcatacaaaacgtattaaaacaagt 469  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | | |||||| ||||||| | ||||||||| || ||| |||||||||||||    
T  13870515 tgtttatcgcgtgatgttgaaacattaatcgtaacattgcaaacgctgaaacatcattcagaacatattaaaacaagt 13870592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 157 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 30425106 - 30425014
Alignment:
Q  157 agtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaag-tgtaaacgaggagtttgctgaga 249  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | ||| ||||||| |||||| || || |||||||  ||||||||||||||    
T  30425106 agtgagataggatctcagatctagaagttcctaggttgaagtcaatacaagtaggtcctaggtc-tagagttgtaaacttggagtttgctgaga 30425014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 206 - 274
Target Start/End: Original strand, 13870402 - 13870470
Alignment:
Q  206 ggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttgaataaggactacactagt 274  Q
    |||||||| | ||||||| ||||||||| | ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13870402 ggtaggtcctcggtcatatagtgtaaacaatgagcttgatgagagctattgaataaggactacactagt 13870470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 249
Target Start/End: Original strand, 18152694 - 18152786
Alignment:
Q  157 agtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgaga 249  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    ||||||||||||| || ||||  ||| |||  |||||||| |||||    
T  18152694 agtgagatgagatctcagatctaggagttcctaggttgaagtcagtgcaggtaggtcttatgttataagttgtgaacttggagtttgttgaga 18152786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 406 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 19077490 - 19077427
Alignment:
Q  406 tgttggaacattgaacataacatcgcaaacgttaaaacatcatacaaaacgtattaaaacaagt 469  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||||    
T  19077490 tgttggaacattgatcgtaacattgcaaatgttaaaatatcatacagaacatattaaaacaagt 19077427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 387 - 446
Target Start/End: Original strand, 21717759 - 21717818
Alignment:
Q  387 atttctgtttatcgcgtgatgttggaacattgaacataacatcgcaaacgttaaaacatc 446  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||| |||||| ||||||||||    
T  21717759 atttctgtttatcacgtgatgttggaacattaaacggaacattgcaaacattaaaacatc 21717818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 387 - 446
Target Start/End: Original strand, 21725595 - 21725654
Alignment:
Q  387 atttctgtttatcgcgtgatgttggaacattgaacataacatcgcaaacgttaaaacatc 446  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||| |||||| ||||||||||    
T  21725595 atttctgtttatcacgtgatgttggaacattaaacggaacattgcaaacattaaaacatc 21725654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 199
Target Start/End: Original strand, 21323262 - 21323304
Alignment:
Q  157 agtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtc 199  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21323262 agtgagatgagatctcagatctaggagttcctaggttgaagtc 21323304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 387 - 469
Target Start/End: Original strand, 17864626 - 17864708
Alignment:
Q  387 atttctgtttatcgcgtgatgttggaacattgaacataacatcgcaaacgttaaaacatcatacaaaacgtattaaaacaagt 469  Q
    |||||| |||||  |||||||||| ||||||||||   |||| | ||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  17864626 atttctatttatttcgtgatgttgcaacattgaacggtacattgtaaacgttgaaacatcttacataacatattaaaacaagt 17864708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 151 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 24563893 - 24563859
Alignment:
Q  151 taggatagtgagatgggatctcagatctaggagtt 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24563893 taggatagtgagatgggatctcagatccaggagtt 24563859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 276 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 25782871 - 25782793
Alignment:
Q  276 actagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttg-caccgaactgagttaacaaactcactgt 353  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| || ||| ||||| ||   ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  25782871 actagtggatttccttactggcttggtagcctccagagtaggtgtgtttgtcaccgaactgggttaacaaactcactgt 25782793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 326 - 367
Target Start/End: Original strand, 17869968 - 17870009
Alignment:
Q  326 caccgaactgagttaacaaactcactgtgttctttactttct 367  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||    
T  17869968 caccgaactgggtcaacaaactcactgtgtcctttactttct 17870009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 326 - 367
Target Start/End: Original strand, 17879720 - 17879761
Alignment:
Q  326 caccgaactgagttaacaaactcactgtgttctttactttct 367  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||    
T  17879720 caccgaactgggtcaacaaactcactgtgtcctttactttct 17879761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 32452159 - 32452130
Alignment:
Q  157 agtgagatgggatctcagatctaggagttt 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32452159 agtgagatgggatctcagatctaggagttt 32452130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 326 - 366
Target Start/End: Original strand, 21706500 - 21706540
Alignment:
Q  326 caccgaactgagttaacaaactcactgtgttctttactttc 366  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21706500 caccaaactgggttaacaaactcattgtgttctttactttc 21706540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 15 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 21727474 - 21727426
Alignment:
Q  15 ctgtgaagcaaggagctaggtagattttgtactacaccaaagttgtgaa 63  Q
    |||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||| ||||||    
T  21727474 ctgtgaagcacggaggtaggtagtttgtgtactacaccaaagctgtgaa 21727426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 326 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 25948537 - 25948497
Alignment:
Q  326 caccgaactgagttaacaaactcactgtgttctttactttc 366  Q
    |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||    
T  25948537 caccgaactgggtcaacaaactcattgtgttctttactttc 25948497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 267; Significance: 1e-149; HSPs: 1)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 15 - 469
Target Start/End: Original strand, 16061 - 16510
Alignment:
Q  15 ctgtgaagcaaggagctaggtagattttgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagttgtttgtttgaaggtaacttcaatttttgtctttttgt 114  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  16061 ctgtgaagcaagaagctaggtagattttgtactacaccgaagttgtgaaacaaggtgctagttgtttgtttgaaggtaacttcaatttttgtgttt--gt 16158  T
Q  115 ttaggtctgataggtcacaggggctgtgactgaccataggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtct 214  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||     
T  16159 ttaggtctgatagctcacaggggctgtgactgaccataggacagtgagatgagatctcagatctaggagttcctaggttgaagtctagacgggtaggtcc 16258  T
Q  215 taggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttgaataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagt 314  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||       |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||    
T  16259 taggtcataaagtgtaaatgaggagtttgttgagagcttttgaataaggactac-------actagtggatttccttcctggcttggtagcccccaaagt 16351  T
Q  315 agatgacgttgcaccgaactgagttaacaaactcactgtgttctttactttc---tcatttannnnnnnnnnnnnat--ttctgtttatcgcgtgatgtt 409  Q
     | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||              |  |||||||||||||||||||||    
T  16352 ggttgacgttgcaccgaactgggttaacaaactcactgtgttctttactttcttgtcatttattttcttgttttttttcttctgtttatcgcgtgatgtt 16451  T
Q  410 ggaacattgaacataacatcgcaaacgttaaaacatcatacaaaacgtattaaaacaagt 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16452 ggaa-attaaacgtaacatcgcaaacgttaaaacatcatacataacgtattaaaacaagt 16510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 258; Significance: 1e-143; HSPs: 42)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 16 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 21478419 - 21477971
Alignment:
Q  16 tgtgaagcaaggagctaggtagattttgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagttgtttgtttgaaggtaacttcaatttttgtctttttgtt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |  |||  ||| ||||    
T  21478419 tgtgaagcaaggagctaggtagattgtgcactacaccaaagttgcgaaacaaggtgctatttgtttgtttgaagttaacttca-tcattgagtttgtgtt 21478321  T
Q  116 taggtctgataggtcacaggggctgtgactgaccataggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtctt 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |    
T  21478320 taggtctgataggtcacaggggctgtgactgaccataggatagtgagatgggatctcagatctaggagttcctaggttgaagtctagacgggtaggtcct 21478221  T
Q  216 aggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttgaataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagta 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||| |||| ||||||||||||||| || ||| ||||    
T  21478220 aggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttgaataaggactacac-------tagtgtatttccttcctggcttggtagcctccagagta 21478128  T
Q  316 gatgacgttgcaccgaactgagttaacaaactcactgtgttctttactttc---tcatttannnnnnnnnnnnnatttctgtttatcgcgtgatgttgga 412  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||             ||||||| ||||||||||||||||||    
T  21478127 ggtgacgttgcaccgaactgggttaacaaactcaccgtgttctttactttcttgtcatttattttcttgtttttatttctggttatcgcgtgatgttgga 21478028  T
Q  413 acattgaacataacatcgcaaacgttaaaacatcatacaaaacgtattaaaacaagt 469  Q
    ||||||||  | ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21478027 acattgaatgtgacatcacaaacattaaaacatcatacagaacgtattaaaacaagt 21477971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 100 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 8164013 - 8163645
Alignment:
Q  100 tttttgtctttttgtttaggtctgataggtcacaggggctgtgactgaccataggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtc 199  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8164013 tttttgtgtttttgtttaggtctaataggtcacaggggttgtgactgaccataggatagtgagatgggatctcagatctaggagttcctaggttgaagtc 8163914  T
Q  200 tagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttgaataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggctt 299  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |       ||||||| |||| |||||||||||    
T  8163913 tagacgggtaggtcctaggtcataaag-gtaaacgaggagtttgctgggagcttttgaataaggactgc-------actagtgaatttccttcctggctt 8163822  T
Q  300 ggtat----cccccatagtagatgacgttgcaccgaactgagttaacaaactcactgtgttctttactttc---tcatttannnnnnnnnnnnnatttct 392  Q
    ||  |     ||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||             |||| |    
T  8163821 ggcttggtagccctagagtaggtgacgttgcaccgaactgggttaacaaactcactgtgttctttactttcttgtcatttattttcttgtttttattttt 8163722  T
Q  393 gtttatcgcgtgatgttggaacattgaacataacatcgcaaacgttaaaacatcatacaaaacgtattaaaacaagt 469  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8163721 gtttatcgcgtgatgttggaacattgaacgtaacatcataaacgttaaaacatcatacataacgtattaaaacaagt 8163645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 10722294 - 10722037
Alignment:
Q  16 tgtgaagcaaggagctaggtagattttgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagttgtttgtttgaaggtaacttcaatttttgtctttttgtt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||| ||||    
T  10722294 tgtgaagcaaggagctaggtagattgtgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagttgtttgtttgaaggtaacttc-attattgagtttgtgtt 10722196  T
Q  116 taggtctgataggtcacaggggctgtgactgaccataggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtctt 215  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| |    
T  10722195 taggtctgataggtcatagtggctgtgaatcaccataggatagtgagatgagatctcagatctaggagttcctaggttgaagtctatacgggtaggtcct 10722096  T
Q  216 aggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttgaataaggactacactagta 275  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10722095 aggtc-ttaagtgtaaacgaggagtttgttgagagctttagaataaggactacactagta 10722037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 10936063 - 10935806
Alignment:
Q  16 tgtgaagcaaggagctaggtagattttgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagttgtttgtttgaaggtaacttcaatttttgtctttttgtt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||| ||||    
T  10936063 tgtgaagcaaggagctaggtagattgtgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagttgtttgtttgaaggtaacttc-attattgagtttgtgtt 10935965  T
Q  116 taggtctgataggtcacaggggctgtgactgaccataggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtctt 215  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| |    
T  10935964 taggtctgataggtcatagtggctgtgaatcaccataggatagtgagatgagatctcagatctaggagttcctaggttgaagtctatacgggtaggtcct 10935865  T
Q  216 aggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttgaataaggactacactagta 275  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10935864 aggtc-ttaagtgtaaacgaggagtttgttgagagctttagaataaggactacactagta 10935806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 40 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 25117115 - 25116686
Alignment:
Q  40 tttgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagttgtt--tgtttgaaggtaacttcaatttttgtctttttgtttaggtctgataggtcacagggg 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| |||||||||||  || | | | |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  25117115 tttgtactacaccaaagttgtgaaacacggtgctagttgtttgtgttggaaggtaactt--atatctttattttggtttagatctgataggtcacagggg 25117018  T
Q  138 ctgtgactgacca-taggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgag 236  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  25117017 ttgtgactgaccattaggatagtgagatgggatctcagatctaggagttcctaggttgaagtctatacgggtaggtcctaggtcatatagtgtaaacgag 25116918  T
Q  237 gagtttgctgagagcttttgaataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttg--gtatcccccatagtagatgacgttg-caccgaac 333  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||| ||||| ||   ||| ||||||||    
T  25116917 aagtttgctgagagctattgaataaggactac-------actagtggatttccttcctggcttggtgtagcccccagagtaggtgtgtttgtcaccgaac 25116825  T
Q  334 tgagttaacaaactcactgtgttctttactttc---tcatttannnnnnnnnnnnnatttctgtttatcgcgtgatgttggaacattgaacataacatcg 430  Q
    || || || ||||||| ||||||||||||||||   || ||||             |||||||||||||||||||||||| |||||| | | |||||| |    
T  25116824 tgggtcaataaactcattgtgttctttactttcctgtcgtttattttcttatttttatttctgtttatcgcgtgatgttgaaacattaatcgtaacattg 25116725  T
Q  431 caaacgttaaaacatcatacaaaacgtattaaaacaagt 469  Q
     ||| | | |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  25116724 taaatgctgaaacattatacagaacgtattaaaacaagt 25116686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 40 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 10191176 - 10190749
Alignment:
Q  40 tttgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagttgtttgttt--gaaggtaacttcaatttttgtctttttgtttaggtctgataggtcacagggg 137  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||| || |||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  10191176 tttgtactacaccgaagttgagaaactaggtgctagttgtttgtgttggaaggtaacttctatctttgt--tttggtttaggtctgataggtaacagggg 10191079  T
Q  138 ctgtgactgaccat-aggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgag 236  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||| || |||||| ||||||||||||    
T  10191078 ctgtggctgaccattaggatagtgagatggaatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctatacgagtaagtcctatgtcatatagtgtaaacgag 10190979  T
Q  237 gagtttgctgagagcttttgaataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttg-caccgaactg 335  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||       ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| ||   ||| ||||||||||    
T  10190978 gagtttgcttagagctattgaataaggactac-------actggtggatttccttcctggcttggtagcccccagagtaggtgtgtttgtcaccgaactg 10190886  T
Q  336 agttaacaaactcactgtgttctttactttc---tcatttannnnnnnnnnnnnatttctgtttatcgcgtgatgttggaacattgaacataacatcgca 432  Q
     || |||||||||| ||| ||||||||||||   |||||||             |||| |||||||||| |||||||| |||||| | | |||||| |||    
T  10190885 ggtcaacaaactcattgttttctttactttcctgtcatttattttcttgtttttatttttgtttatcgcttgatgttgaaacattaatcttaacattgca 10190786  T
Q  433 aacgttaaaacatcatacaaaacgtattaaaacaagt 469  Q
    || | | |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  10190785 aatgctgaaacatcatacagaacatattaaaacaagt 10190749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 42 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 10724546 - 10724122
Alignment:
Q  42 tgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagttgttt-gtttgaaggtaacttcaatttttgtctttttgttt-aggtctgataggtcacaggggct 139  Q
    ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||   ||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  10724546 tgtactacactgaagttgtgaaaccaggtgctagttgttttgtttgaagaaaacttcaccgttt-tgtttgtgtttgaggtctgataggtcacaggggtt 10724448  T
Q  140 gtgactgaccataggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggag 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||| | || |||||| ||||||    
T  10724447 gtgactgaccataggatagtgagatgggatctcagatctaggagttcctaggttgaagtctatacgggtaggttttaggtctttaa-tgtaaatgaggag 10724349  T
Q  240 tttgctgagagcttttgaataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttg-caccgaactgagt 338  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||       ||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||| ||||| ||   ||| |||||||||  ||    
T  10724348 tttgctgagagctatagaataaggactac-------actagtgaatttccttcctggctttgtagcccccaaagtaggtgtgtttgtcaccgaactaggt 10724256  T
Q  339 taacaaactcactgtgttctttactttc---tcatttannnnnnnnnnnnnatttctgtttatcgcgtgatgttggaacattgaacataacatcgcaaac 435  Q
     |||||||||||||| ||||||| ||||   |||||||             ||||||||||||   ||||||||||||||||||||  |||||  |||||    
T  10724255 caacaaactcactgtattctttaatttcttgtcatttattttcttgtttttatttctgtttattttgtgatgttggaacattgaacggaacattccaaac 10724156  T
Q  436 gttaaaacatcatacaaaacgtattaaaacaagt 469  Q
    | ||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  10724155 ggtaaaacatcttacaaaacatattaaaacaagt 10724122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 42 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 10938315 - 10937891
Alignment:
Q  42 tgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagttgttt-gtttgaaggtaacttcaatttttgtctttttgttt-aggtctgataggtcacaggggct 139  Q
    ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||   ||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  10938315 tgtactacactgaagttgtgaaaccaggtgctagttgttttgtttgaagaaaacttcaccgttt-tgtttgtgtttgaggtctgataggtcacaggggtt 10938217  T
Q  140 gtgactgaccataggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggag 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||| | || |||||| ||||||    
T  10938216 gtgactgaccataggatagtgagatgggatctcagatctaggagttcctaggttgaagtctatacgggtaggttttaggtctttaa-tgtaaatgaggag 10938118  T
Q  240 tttgctgagagcttttgaataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttg-caccgaactgagt 338  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||       ||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||| ||||| ||   ||| |||||||||  ||    
T  10938117 tttgctgagagctatagaataaggactac-------actagtgaatttccttcctggctttgtagcccccaaagtaggtgtgtttgtcaccgaactaggt 10938025  T
Q  339 taacaaactcactgtgttctttactttc---tcatttannnnnnnnnnnnnatttctgtttatcgcgtgatgttggaacattgaacataacatcgcaaac 435  Q
     |||||||||||||| ||||||| ||||   |||||||             ||||||||||||   ||||||||||||||||||||  |||||  |||||    
T  10938024 caacaaactcactgtattctttaatttcttgtcatttattttcttgtttttatttctgtttattttgtgatgttggaacattgaacggaacattccaaac 10937925  T
Q  436 gttaaaacatcatacaaaacgtattaaaacaagt 469  Q
    | ||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  10937924 ggtaaaacatcttacaaaacatattaaaacaagt 10937891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 40 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 28019593 - 28019273
Alignment:
Q  40 tttgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagttgtttgttt--gaaggtaacttcaatttttgtctttttgtttaggtctgataggtcacagggg 137  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| | |||    |||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  28019593 tttgtactacaccgaagttgtgaaacaaggtgctagttgtttgtgttggaaggtaacttctacttta---ttttggtttaggtctgataggtcactgggg 28019497  T
Q  138 ctgtgactgaccat-aggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgag 236  Q
    |  | ||||||||| |||||| |||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  28019496 caataactgaccattaggataatgagatgggatcacaaatataggagttcctaggttgaagtctatacgggtatgtcctaggtcatatagtgtaaacgag 28019397  T
Q  237 gagtttgctgagagcttttgaataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttg-caccgaactg 335  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||       |||||||||| |||| |||||||||| |||||| || |  ||   ||| ||||||||||    
T  28019396 gagtttgctgagagctattgaataaggactacac-------tagtggatttccttcttggcttggtagcccccagagcatgtgtgtttgtcaccgaactg 28019304  T
Q  336 agttaacaaactcactgtgttctttactttc 366  Q
     || |||||||||| |||||| |||||||||    
T  28019303 ggtcaacaaactcattgtgttatttactttc 28019273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 42 - 274
Target Start/End: Original strand, 15162359 - 15162592
Alignment:
Q  42 tgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagttgttt-gtttgaaggtaacttcaatttttgtctttttgttt-aggtctgataggtcacaggggct 139  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  15162359 tgtactacaccgaagttgtgaaacaaggtgctagttgttttgtttgaaggtaacttcaacttttgtgtttgtgtttgaggtctgataggtcacaggggtt 15162458  T
Q  140 gtgactgaccataggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggag 239  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| || || |||||||  | |||| |  ||||||||||| |||    
T  15162459 gtgactgaccaaaggatattgagatgggatctcaaatcgaggagttcctaggttgaagtttatacgggtaggttctcggtc-tttagtgtaaacgaagag 15162557  T
Q  240 tttgctgagagcttttgaataaggactacactagt 274  Q
    |||| |||||| | | |||||||||||||||||||    
T  15162558 tttgttgagagttatagaataaggactacactagt 15162592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 124 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 19659643 - 19659493
Alignment:
Q  124 ataggtcacaggggctgtgactgaccataggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcata 223  Q
    |||||||| ||||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  19659643 ataggtcataggggttgtgtctgactgtaggatagtgagatgggatctcagatctaggagttcctaggttgaagtctaaacatgtaggtcctaggtcata 19659544  T
Q  224 aagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttgaataaggactacactagt 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19659543 aagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttgaataaggactacactagt 19659493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 40 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 16384179 - 16383859
Alignment:
Q  40 tttgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagttgtttgttt--gaaggtaacttcaatttttgtctttttgtttaggtctgataggtcacagggg 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |  |||||||||||| | |||    |||| |||||||||||||||||||||| |     
T  16384179 tttgtactacaccaaagttgtgaaacacggtgatagttgtttgtgttggaaggtaacttctactttg---ttttggtttaggtctgataggtcacagaga 16384083  T
Q  138 ctgtgactgaccat-aggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgag 236  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    ||||| |||||||||||||  |||||||||||  | || |||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  16384082 ctgtgactgaccattaggatagtgaggcatgatcttagatctaggagttcataggttgaagttaatacgggtaggtcctaggtcatatagtgtaaacgag 16383983  T
Q  237 gagtttgctgagagcttttgaataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttg-caccgaactg 335  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||       |||||||||| ||||||||||||| | |||||| ||||| ||   ||| |||||||||     
T  16383982 gagtttgttgagagctattgaataaggactacac-------tagtggatttccttcctggcttggaagcccccagagtaggtgtgtttgtcaccgaacta 16383890  T
Q  336 agttaacaaactcactgtgttctttactttc 366  Q
     || ||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  16383889 ggtcaacaatctcattgtgttctttaatttc 16383859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 108 - 316
Target Start/End: Original strand, 18618054 - 18618256
Alignment:
Q  108 tttttgtttaggtctgataggtcacaggggctgtgactgaccat-aggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacag 206  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |    
T  18618054 ttttggtttaggtctgatagttcacaggggttgtgactgaccattaggatagtgagatgggatctcagatctagtagtccctaggttgaagtctagacgg 18618153  T
Q  207 gtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttgaataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcc 306  Q
    ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||       |||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  18618154 gtatgtcctaggtcatatagtgtaaacgaggagtttgttgagagatattgaataaggactac-------actagtggatttccttcctggcttggtagcc 18618246  T
Q  307 cccatagtag 316  Q
    |||| |||||    
T  18618247 cccagagtag 18618256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 62 - 366
Target Start/End: Original strand, 33898881 - 33899179
Alignment:
Q  62 aaacaaggtgctagttgtttgttt--gaaggtaacttcaatttttgtctttttgtttaggtctgataggtcacaggggctgtgactgaccat-aggatag 158  Q
    |||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||| | |||    |||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  33898881 aaacaaagtgctagttgtttgtgttggaaggtaacttctactttg---ttttggtttaggtctaataagtcacaggggatgtgactgaccattaggatag 33898977  T
Q  159 tgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttgaa 258  Q
    ||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  33898978 tgagatgagatctcaaacctaggagttcctaggttgaagtctatacgggtaggtcctaggtcatatagtgtaaacgagaagtttgctaagagctattgaa 33899077  T
Q  259 taaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttg-caccgaactgagttaacaaactcactgtgttc 357  Q
    | ||||||||       || ||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||| ||   ||| |||||||||| || |||||||||| |||||||    
T  33899078 tgaggactac-------accagtggattttcttcctgacttggtagcccctagagtaggtgtgtttgtcaccgaactgggtcaacaaactcattgtgttc 33899170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 129 - 353
Target Start/End: Original strand, 13399264 - 13399481
Alignment:
Q  129 tcacaggggctgtgactgaccataggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtg 228  Q
    ||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| || ||| | |||||    
T  13399264 tcacaggggttgtgattgactgtaggatagtgagatggaatctcagatctaggagttcctaggttgaaatctagacgggtaggtcctaagtc-ttaagtg 13399362  T
Q  229 taaacgaggagtttgctgagagcttttgaataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttg-ca 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| ||   ||| ||    
T  13399363 taaacgaggagtttgctgagagctttagaataaggactac-------actagtggattttcttcctggcttggtagcccctagagtaggtgtgtttgtca 13399455  T
Q  328 ccgaactgagttaacaaactcactgt 353  Q
    |||||||| || ||||||||||||||    
T  13399456 ccgaactgggtcaacaaactcactgt 13399481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 45 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 9069227 - 9069000
Alignment:
Q  45 actacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagtt-gtttgtttgaaggtaacttcaatttttgtctttttgtttaggtctgataggtcacaggggctgtga 143  Q
    ||||||||||||||||||| || |||| ||| | |||||||| ||||| |||| |   |||||  || ||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  9069227 actacaccaaagttgtgaagcacggtgttaggtagtttgttttaaggttactttaccgtttgt--ttgtgtttaggtctgataggtcacagaggttgtga 9069130  T
Q  144 ctgaccataggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttg 243  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| || | || |||||||| ||| || |  |||||||||||||||||||    
T  9069129 ctgaccataggatagtgagatgagatctcagatctaggagttcctagattgaaatcaatacgggtaggtcctagatc-tttagtgtaaacgaggagtttg 9069031  T
Q  244 ctgagagcttttgaataaggactacactagt 274  Q
    ||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  9069030 ctgagagcaatagaataaggactacactagt 9069000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 80 - 470
Target Start/End: Original strand, 15700221 - 15700594
Alignment:
Q  80 ttgtttgaaggtaacttcaa-tttttgtctttttgtttaggtctgataggtcacaggggctgtgactgaccataggatagtgagatgggatctcagatct 178  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| | ||  |||  ||||||||| ||| ||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15700221 ttgtttgaaggtaacttcatctttttgtttgttgtttttagtctgatagatcataggggatgtggttgactataggatagtgagatgggatctgagatct 15700320  T
Q  179 aggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttgaataaggactacactagtaact 278  Q
    ||||||| |||||||||| || | |  |||||||| |||||| | | |||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||        
T  15700321 aggagttcctaggttgaaatcaatatgggtaggtcctaggtcttta-gtgtaaacgaggagtttgctgaaagctatagaataaggactacactagt---- 15700415  T
Q  279 agtggattttcttcctggcttggtatcccccat-agtagatgacgttg-caccgaactgagttaacaaactcactgtgttctttactttctcatttannn 376  Q
       |||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||| ||   ||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  |||        
T  15700416 ---ggatttccttcctggcttggtagcccccaagagtaggtgtgtttgtcaccgaactgggtcaacaaactcactgtgttctttactttcttgttt---- 15700508  T
Q  377 nnnnnnnnnnatttctgtttatcgcgtgatgttggaacattgaacataacatcgcaaacgttaaaacatcatacaaaacgtattaaaacaagta 470  Q
              |||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||   |||| || ||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  15700509 --------ttatttctgtttaattcgtgatgttggaacattgaacaaaacattataaacattgaaacatcttacaaaacattttaaaacaagta 15700594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 154 - 274
Target Start/End: Original strand, 23400179 - 23400299
Alignment:
Q  154 gatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagctt 253  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  23400179 gatagtgagatgggatatcagatctaggagttcctaggttgaagtctatacgggtaggtcctaggtcatatagtgtaaacgaggagtttgctgagagcta 23400278  T
Q  254 ttgaataaggactacactagt 274  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  23400279 ttgaataaggactacactagt 23400299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 157 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 22555142 - 22554950
Alignment:
Q  157 agtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtc-ataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagctttt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||   || | |||||| |||||| ||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||    
T  22555142 agtgagatgggatctcagatctacgagttcctaggttgaagtcagtacggataggtcctaggtccatatagtgcatacgaggagtttgctgagagctatt 22555043  T
Q  256 gaataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttgcaccgaactgagttaacaaactcactgtgt 355  Q
    |||||||||||||||       |||||||||| ||||||||||||||| ||  || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22555042 gaataaggactacac-------tagtggatttccttcctggcttggtagccttcagagtaggtgacgttgcaccgaactgggttaacaaactcactgtgt 22554950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 78 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 33746211 - 33745951
Alignment:
Q  78 gtttgtttgaaggtaacttcaatttttgtctttttgtttaggtctgataggtcacaggggctgtgactgaccataggatagtgagatgggatctcagatc 177  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||  || ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33746211 gtttgtttgaaggtaacttcaccgtttgt--ttgtgtttaggtttgataggtcacacgggttgtgactgaccataggatagtgagatgagatctcagatc 33746114  T
Q  178 taggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttgaataaggactacactagtaac 277  Q
    ||| |||| |||||||||| |  | || |||||||| |||||| |  |||||||||||||| ||| ||||||||| |  ||||||||||||       ||    
T  33746113 tagaagttcctaggttgaaattaatacgggtaggtcctaggtc-tttagtgtaaacgaggaatttactgagagctataaaataaggactac-------ac 33746022  T
Q  278 tagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttg-caccgaactgagttaacaaact 347  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||| ||   ||| |||||||||| |||||||||||    
T  33746021 tagtggatttccttcctagcttggtagcctccatagtaggtgtttttgtcaccgaactgtgttaacaaact 33745951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 157 - 365
Target Start/End: Original strand, 25354624 - 25354824
Alignment:
Q  157 agtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttg 256  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||   || |||||||| |||||||| | ||| |||| |||||||||||||||| | |||    
T  25354624 agtgagatgtgatctcaaatctaggagttcctaggttgaagtcagtacgggtaggtcctaggtcatta-gtgcaaacaaggagtttgctgagagatattg 25354722  T
Q  257 aataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttgcaccgaactgagttaacaaactcactgtgtt 356  Q
    |||| | |||||||||       |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  25354723 aatacgaactacacta-------gtggatttccttcctggcttggtagcccccagagtaggtgacgttgcaccgaactgggttaacaaactcactgtgtc 25354815  T
Q  357 ctttacttt 365  Q
     ||||||||    
T  25354816 atttacttt 25354824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 161 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 11905260 - 11905064
Alignment:
Q  161 agatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttgaata 260  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| ||| |||||| |  |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  11905260 agatgggatctaagatctaggagttcctaggttgaagtcaatacaggtaagtcataggtc-tttagtgtaaacgagaagtttactgagagctattgaata 11905162  T
Q  261 aggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttgcaccgaactgagttaacaaactcactgtgttcttt 360  Q
    |||||| |       |||||||||||| ||||||| |||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||    
T  11905161 aggactgc-------actagtggatttccttcctgacttggta-accccaaagtaggtgacgttgcaccgaactgggttaacaaactcactgtatcattt 11905070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 157 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 24143305 - 24143116
Alignment:
Q  157 agtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttg 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||   || |||||||| |||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||| |||    
T  24143305 agtgagatgggatctcagatctaggagttcataggttaaagtcagtacgggtaggtcctaggtcatta-gtgcaaacgaggattttgctgagagctattg 24143207  T
Q  257 aataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttgcaccgaactgagttaacaaactcactgtg 354  Q
    |||| |||||||||       |||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||    
T  24143206 aatacggactacac-------tagtggatttccttcctgacttggtagcccccagagtaggtgacgttgcaccgaactaggttaacaaactctctgtg 24143116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 157 - 354
Target Start/End: Original strand, 19894792 - 19894981
Alignment:
Q  157 agtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttg 256  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||| |||    
T  19894792 agtgagatgggatctcagatttaggagtttctaggttgaagtcagtacgggtaggtcctaggtcat-tagttcaaacgaggagtttgctgagagctattg 19894890  T
Q  257 aataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttgcaccgaactgagttaacaaactcactgtg 354  Q
    |||| | |||||       ||||||||||||  |||||||||||||| | || | ||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  19894891 aatacgaactac-------actagtggatttcgttcctggcttggtagctcctagagtatgtgacgttgcaccgaactaggttaacaaactcactgtg 19894981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 157 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 23541414 - 23541225
Alignment:
Q  157 agtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttg 256  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  ||| |  ||||||||||   || |||||||| |||||| | | ||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  23541414 agtgagatgagatctcagatctagttgttcccgggttgaagtcagtacgggtaggtcctaggtcttta-gtgcaaacgaggagtttgctgagagctattg 23541316  T
Q  257 aataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttgcaccgaactgagttaacaaactcactgtg 354  Q
    |||| |||||||||||||       |||||| ||||||||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23541315 aatacggactacactagt-------ggatttccttcctggcttggtagcctccagagtaggtgacgttgcaccgaactgggttaacaaactcactgtg 23541225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 182 - 354
Target Start/End: Original strand, 46741763 - 46741927
Alignment:
Q  182 agtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttgaataaggactacactagtaactagt 281  Q
    |||| ||||||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||       ||||||    
T  46741763 agttcctaggttgaagtcaatacgggtaggtcctaggtcataa-gtgcaaacgaggagtttgctgagagctattgaataaggattac-------actagt 46741854  T
Q  282 ggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttgcaccgaactgagttaacaaactcactgtg 354  Q
    |||||| |||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  46741855 ggatttccttcatggcttggtagcccccagagtaggtgacgttgcaccgaaatgggttaacaaactcattgtg 46741927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 157 - 355
Target Start/End: Original strand, 11325133 - 11325324
Alignment:
Q  157 agtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctag-acaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagctttt 255  Q
    |||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||| || |||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  11325133 agtgagatggaatcttagatctacgagttcctaggttgaagt-tagtacgggtaggtcctaggtcatatagtgcaaacgaggagtttgttgagagctatt 11325231  T
Q  256 gaataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttgcaccgaactgagttaacaaactcactgtgt 355  Q
    |||||||||||||       |||||||||||| ||||||||||||||| || ||| || || ||||||||||| |||  | |||||||| ||||||||||    
T  11325232 gaataaggactac-------actagtggatttccttcctggcttggtagcctccagagcaggtgacgttgcacggaatcgggttaacaatctcactgtgt 11325324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 151 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 32861825 - 32861702
Alignment:
Q  151 taggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagag 250  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||  | ||||||||||||||| |||||     
T  32861825 taggacagtgagataggatctcaaatctaggagttcctaggttgaagtctagacgagtaggtcctaggtcttaagttataaacgaggagtttgttgagaa 32861726  T
Q  251 cttttgaataaggactacactagt 274  Q
    |||| |||||||||||||||||||    
T  32861725 ctttagaataaggactacactagt 32861702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 73 - 274
Target Start/End: Original strand, 19183587 - 19183785
Alignment:
Q  73 tagttgtttgtttgaaggtaacttcaatttttgtctttttgtttaggtctgataggtcacaggggctgtgactgaccataggatagtgagatgggatctc 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   ||||| | | | ||||| |||||||  ||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19183587 tagttgtttgtttgaaggtaacttcaccatttgtttgtgtttttag-tctgataa-tcacaagggctgtggttgaccgtaggatagtgagatgggatctc 19183684  T
Q  173 agatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttgaataaggactacacta 272  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||| | | |||| |||||| |  ||||||||| || |||||| |||||||| | |||||  || |||||||    
T  19183685 agatctaggagttcctaggttgaaatctagacggatgggtcctaggtc-tttagtgtaaacaagaagtttgttgagagctatagaatacagaatacacta 19183783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 157 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 50908022 - 50907840
Alignment:
Q  157 agtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaag-tgtaaacgaggagtttgctgagagctttt 255  Q
    ||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| | || |||||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||| | | ||     
T  50908022 agtgaaatggaatctcagatttaggagttcctaggttgaagtcaatacgggtaggtcctaggtc-tagagttgtaaacgaggagtttgctgataac-tta 50907925  T
Q  256 gaataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttg-caccgaactgagttaacaaac 346  Q
    |||||||||||||       |||||||||||||||||||| ||||||| ||| || ||||| ||   ||| |||||||||||||||||||||    
T  50907924 gaataaggactac-------actagtggattttcttcctgacttggtagccctcagagtaggtgtgtttgtcaccgaactgagttaacaaac 50907840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 157 - 271
Target Start/End: Original strand, 10198239 - 10198352
Alignment:
Q  157 agtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaag-tgtaaacgaggagtttgctgagagctttt 255  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| |||||| || || |||||||  |||||||||||||| | ||     
T  10198239 agtgagatgagatctcagatctaggagttcctaggttgaagtcaagacgggtaggtcctaggtc-tagagttgtaaacttggagtttgctgagaac-tta 10198336  T
Q  256 gaataaggactacact 271  Q
    ||||||||||||||||    
T  10198337 gaataaggactacact 10198352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 41 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 15622723 - 15622573
Alignment:
Q  41 ttgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagttgtttgtttgaaggtaacttcaatttttgtctttttgtttaggtctgataggtcacaggggctg 140  Q
    |||| ||||||||||| | | || ||||||  ||||||||||||||||||||||||||   ||||| |    |||||  |||||||  ||||||||||||    
T  15622723 ttgtgctacaccaaagcttttaagcaaggttgtagttgtttgtttgaaggtaacttcaccatttgtgt----gtttaaatctgataa-tcacaggggctg 15622629  T
Q  141 tgactgaccataggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaa 196  Q
    ||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  15622628 tgattgattgtaggatagtgagatgggatctcagatctaggagttcctaggatgaa 15622573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 157 - 274
Target Start/End: Original strand, 16655327 - 16655443
Alignment:
Q  157 agtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagt-gtaaacgaggagtttgctgagagctttt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||  |||||||| |||||| |||||| ||||   ||||||||||||||| | ||     
T  16655327 agtgagatgggatctcagatctaggagttcctaggttgaactcaagatgggtaggtcctaggtc-taaagtcgtaactaaggagtttgctgagaac-tta 16655424  T
Q  256 gaataaggactacactagt 274  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  16655425 gaataaggactaccctagt 16655443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 388 - 469
Target Start/End: Original strand, 33899398 - 33899479
Alignment:
Q  388 tttctgtttatcgcgtgatgttggaacattgaacataacatcgcaaacgttaaaacatcatacaaaacgtattaaaacaagt 469  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| | |||||||| ||||||| | |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  33899398 tttctgtttatcgcgtgatgttaaaacattaatcataacattgcaaacgctgaaacatcatacagaacctattaaaacaagt 33899479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 133 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 41785628 - 41785489
Alignment:
Q  133 aggggctgtgactgaccataggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaa 232  Q
    ||||||||||| |||   || |||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||| |||| ||||||||||  ||  || |||  ||||||    
T  41785628 aggggctgtgattgattgtaagatagtgagatgggatatcagatataagagttcctaggttgaaatctaaacaggtaggttctatatcttaagttgtaaa 41785529  T
Q  233 cgaggagtttgctgagagcttttgaataaggactacactagt 274  Q
    || |  ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||    
T  41785528 cgtg--gtttgctgagaactttagaatagggactacactagt 41785489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 278 - 345
Target Start/End: Original strand, 11865215 - 11865283
Alignment:
Q  278 tagtggattttcttcctggcttggtatcccccata-gtagatgacgttgcaccgaactgagttaacaaa 345  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  11865215 tagtgaattttcttcctggcttggtagcccccagacgtagaagacgttgcaccgaactgggttaacaaa 11865283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 40 - 97
Target Start/End: Original strand, 23400065 - 23400124
Alignment:
Q  40 tttgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagttgtt--tgtttgaaggtaacttc 97  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  23400065 tttgtactacaccgaaattgtgaaacaaggtgctagttgtttgtgttggaaggtaacttc 23400124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 403 - 470
Target Start/End: Original strand, 15162718 - 15162785
Alignment:
Q  403 tgatgttggaacattgaacataacatcgcaaacgttaaaacatcatacaaaacgtattaaaacaagta 470  Q
    ||||||||||||||| | |  ||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  15162718 tgatgttggaacattaatcgaaacatcgcaaacgttgaaacatcttacataacatattaaaacaagta 15162785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 387 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 16383834 - 16383752
Alignment:
Q  387 atttctgtttatcgcgtgatgttggaacattgaacataacatcgcaaacgttaaaacatcatacaaaacgtattaaaacaagt 469  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| | | ||||||  ||||||  | |||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  16383834 atttctgtttatcgcgtgatgttgaaacattaatcgtaacattacaaacgccataacatcttacagaacatattaaaacaagt 16383752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 278 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 13268904 - 13268814
Alignment:
Q  278 tagtggattttcttcctggcttggtatcccccata-gtagatgacgttgcaccgaactgagttaacaaactcactgtgttctttactttct 367  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||| |||||| | |||| ||| |||||||||||||| || |||||||   ||||| | ||||||||||    
T  13268904 tagtggatttccttcctgacttggtagcccccagatgtaggtgaagttgcaccgaactgggtgaacaaacaacctgtgctatttactttct 13268814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 276 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 33738043 - 33737973
Alignment:
Q  276 actagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttg-caccgaactgagttaacaaa 345  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||   ||| |||||||||| |||||||||    
T  33738043 actagtggatttccttcctggcttggtagcctccatagtaggtgtgtttgtcaccgaactgggttaacaaa 33737973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 277 - 346
Target Start/End: Original strand, 11289438 - 11289507
Alignment:
Q  277 ctagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttgcaccgaactgagttaacaaac 346  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || ||||    || | |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11289438 ctagtgaattttcttcctggcttgttaaccccagacgttggtgacgttgcaccgaactgggttaacaaac 11289507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 25)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 15 - 366
Target Start/End: Original strand, 36398640 - 36398985
Alignment:
Q  15 ctgtgaagcaaggagctaggtagattttgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagttgtttgtttgaaggtaacttcaatttttgtctttt-tg 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||| ||    
T  36398640 ctgtgaagcaaggagctaggtagattgtgtactacaccaaggttgtgaaacaaggtgctagttgtttgtttgaaggtaacttcaacttt-gtgttttgtg 36398738  T
Q  114 tttaggtctgataggtcacaggggctgtgactgaccataggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtc 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  36398739 tttaggtctgataggtcacaggggctgtgactgaccataggatagtgagatgggatctcagatctaggagttcctaggttgaagtctagacgggtaggtc 36398838  T
Q  214 ttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttgaataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatag 313  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||    
T  36398839 ctaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttgaataaggactac-------actagtggatttccttcctggcttggtagcccccagag 36398931  T
Q  314 tagatgacgttg-caccgaactgagttaacaaactcactgtgttctttactttc 366  Q
    ||| ||   ||| |||||||||| || |||||||||| || |||||||||||||    
T  36398932 taggtgtgtttgtcaccgaactgggtcaacaaactcattgcgttctttactttc 36398985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 40 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 23758914 - 23758488
Alignment:
Q  40 tttgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagttgtttgttt--gaaggtaacttcaatttttgtctttttgtttaggtctgataggtcacagggg 137  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||| |||||||| |||||    |||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  23758914 tttgtactacaccgaagttgtgaaacaaggtgttagttgtttgtgttggaaagtaacttctattttg---ttttggtttaggtctgataggtcactgggg 23758818  T
Q  138 ctgtgactgaccat-aggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgag 236  Q
    | |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  23758817 cagtgactgaccattacgatagtgagatgggatctcagatctaggagttcctaggttgaagtctatacgggtaggtcctaggtcatatagtgtaaacgag 23758718  T
Q  237 gagtttgctgagagcttttgaataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttg-caccgaactg 335  Q
    ||||||| ||||| || |||||||||||||||||       |||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| ||   ||| ||||||||||    
T  23758717 gagtttgttgagaactattgaataaggactacac-------tagtggatttccttcctggcttggtagcccccagagtagttgtgtttgtcaccgaactg 23758625  T
Q  336 agttaacaaactcactgtgttctttactttc---tcatttannnnnnnnnnnnnatttctgtttatcgcgtgatgttggaacattgaacataacatcgca 432  Q
     || |||||||||| ||||||||||||||||   || ||||             |||||||||||||||||||||||| |||||| | | |||||| |||    
T  23758624 ggtcaacaaactcattgtgttctttactttcctgtcttttattttcttgtttttatttctgtttatcgcgtgatgttgaaacattaatcgtaacattgca 23758525  T
Q  433 aacgttaaaacatcatacaaaacgtattaaaacaagt 469  Q
    |||  | ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  23758524 aacactgaaacatcatacaaaactaattaaaacaagt 23758488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 40 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 12910779 - 12910352
Alignment:
Q  40 tttgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagttgtttgttt--gaaggtaacttcaatttttgtctttttgtttaggtctgataggtcacagggg 137  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| |  ||| |||||||| || |||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||     
T  12910779 tttgtactacaccgatgttgtgaaacaaggtgttagttgtttgtgttggaatgtaacttctatctttgt--tttggtttaggtctgataggtcacatgga 12910682  T
Q  138 ctgtgactgaccat-aggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgag 236  Q
     ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| |||| |||| |||||||||||     
T  12910681 ttgtgactgatcattaggatagtgagatgggatctcagatctaggagttcctaggttgaagtctatacgggtaggtcctaggccatatagtgtaaacgac 12910582  T
Q  237 gagtttgctgagagcttttgaataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttg-caccgaactg 335  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||       ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| |    ||| ||||||||||    
T  12910581 gagtttgctgaaagctattgaataaggactac-------acttgtggatttccttcctggcttggtagcccccagagtaggtatgtttgtcaccgaactg 12910489  T
Q  336 agttaacaaactcactgtgttctttactt---tctcatttannnnnnnnnnnnnatttctgtttatcgcgtgatgttggaacattgaacataacatcgca 432  Q
     || |||||||||||||||||||||| ||   | |||||||             |||||||||||||||||||||||| ||| || | | |||||| |||    
T  12910488 ggtcaacaaactcactgtgttctttaattttctgtcatttattttcttgtttttatttctgtttatcgcgtgatgttgaaactttaatcgtaacattgca 12910389  T
Q  433 aacgttaaaacatcatacaaaacgtattaaaacaagt 469  Q
    |||| | |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12910388 aacgctgaaacatcatacagaacgtattaaaacaagt 12910352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 40 - 366
Target Start/End: Original strand, 24790029 - 24790349
Alignment:
Q  40 tttgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagttgtttgttt--gaaggtaacttcaatttttgtctttttgtttaggtctgataggtcacagggg 137  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||   |||| ||||||||||||| ||||||  |||    
T  24790029 tttgtactacaccgaagttgtgaaacaagatgctagttgtttgtgttggaaggtaacttctattttt---ttttggtttaggtctgatgggtcacttggg 24790125  T
Q  138 ctgtgactgaccat-aggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgag 236  Q
    | |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  24790126 cagtgactgaccattaggatagtgatatgggatctcagatctaggagttcctaggttgaagtctatacgggtaggtcctaggtcatatagtgtaaacgag 24790225  T
Q  237 gagtttgctgagagcttttgaataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttg-caccgaactg 335  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||        ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||| ||   ||| ||||||||||    
T  24790226 gagtttgctgagagatattgaataaggactac-------tctagtggatttccttcctgacttggtagcccccagagtaggtgtgtttgtcaccgaactg 24790318  T
Q  336 agttaacaaactcactgtgttctttactttc 366  Q
     || |||||||||| ||||||||||||||||    
T  24790319 ggtcaacaaactcattgtgttctttactttc 24790349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 15 - 310
Target Start/End: Original strand, 26860139 - 26860430
Alignment:
Q  15 ctgtgaagcaaggagctaggtagattttgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagtt-gtttgttt--gaaggtaacttcaatttttgtctttt 111  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||| ||| | |||||| |  |||||||||||| | ||| |  |||     
T  26860139 ctgtgaagcaaggagataggtagattgtgcactacaccgaagttgtgaaacaaggtgttaggtagtttgtgttggaaggtaacttctacttt-gagtttg 26860237  T
Q  112 tgtttaggtctgataggtcacaggggctgtgactgaccat-aggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtag 210  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || |||||    
T  26860238 tgtttaggtatgataggtcacagtggctgtgactgaccattaggatagtgagatgagatctcagatctaggagttcctaggttgaaatctatacgggtag 26860337  T
Q  211 gtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttgaataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatccccca 310  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  26860338 gtcctaggtcatatagtgtaaacgaggagtttgctgagagctattgaataaggactac-------actagtggatttccttcctggcttggtagccccca 26860430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 40 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 22611181 - 22610861
Alignment:
Q  40 tttgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagttgtttgttt--gaaggtaacttcaatttttgtctttttgtttaggtctgataggtcacagggg 137  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| | |||| |  ||| |||||||| |||||||||||  |||    
T  22611181 tttgtactacaccgaagttgtgaaacaaggtgctagttgtttgtgttggaaggtaacttctacttttat--tttggtttaggtttgataggtcactaggg 22611084  T
Q  138 ctgtgactgaccat-aggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgag 236  Q
    | ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  22611083 cagtgac-gaccattaggatagtgagatgggatctcagatctaggagttcctaggttgaagtctatacgggtaggtcctaggtcatatagtgtaaacgag 22610985  T
Q  237 gagtttgctgagagcttttgaataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttg-caccgaactg 335  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||       |||||||||| ||||||  |||||| |||||  | |||| ||   ||| ||||||||||    
T  22610984 gagtttgctgagagctattgaataaggactacac-------tagtggatttccttcctttcttggtttccccttttgtaggtgtgtttgtcaccgaactg 22610892  T
Q  336 agttaacaaactcactgtgttctttactttc 366  Q
     || |||||||||| ||||||||||||||||    
T  22610891 ggtcaacaaactcattgtgttctttactttc 22610861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 157 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 29566182 - 29565994
Alignment:
Q  157 agtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttg 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  29566182 agtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtcagtacgggtaggtcctaggtcat-tagtgcaaacgaggagtttgctgagagctattg 29566084  T
Q  257 aataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttgcaccgaactgagttaacaaactcactgtg 354  Q
    ||||||||||||       |||||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29566083 aataaggactac-------actagtggatttccttcctggcttggta-gccccagagtaggggacgttgcatcgaactgagttaacaaactcactgtg 29565994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 159 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 18765845 - 18765659
Alignment:
Q  159 tgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctag-acaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttga 257  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| || |||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  18765845 tgagatgggatctcagatctacgagttcctaggttgaagt-tagtacgggtaagtcctaggtcatatagtgcaaacgaggagtttactgagagctattga 18765747  T
Q  258 ataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttgcaccgaactgagttaacaaactcactg 352  Q
    |||||||||||||       |||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18765746 ataaggactacac-------tagtggatttccttcctggcttggtagcccccagagtaggtgacgttgcaccgaactgggttaacaaactcactg 18765659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 157 - 351
Target Start/End: Original strand, 13314954 - 13315141
Alignment:
Q  157 agtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttg 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||   || |||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  13314954 agtgagatgggatctcagatctaggagttccttgattgaagtcagtacgggtaggtcctaggtcatta-gtgcaaacgaggagtttgctgagagctcttg 13315052  T
Q  257 aataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggta-tcccccatagtagatgacgttgcaccgaactgagttaacaaactcact 351  Q
    ||||||||||||       |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13315053 aataaggactac-------actagtggattttcttcctggcttagtagccccccatagtaggtgacattgcaccgaactgggttaacaaactcact 13315141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 73 - 316
Target Start/End: Original strand, 19466429 - 19466662
Alignment:
Q  73 tagttgtttgtttgaaggtaacttcaatttttgtctttttgtttaggtctgataggtcacaggggctgtgactgaccataggatagtgagatgggatctc 172  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||| |||||| ||||||||  ||||||||| ||||  ||||  |||||||||||||| |||||||    
T  19466429 tagttgtttgtttgaaggtaacttca-tcattgtttttgtgtttaagtctgataa-tcacaggggttgtggttgactgtaggatagtgagattggatctc 19466526  T
Q  173 agatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttgaataaggactacacta 272  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |  | || |||||||| |||||| |  |||||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||        
T  19466527 agatctaggagttcctaggttgaaattaatacgggtaggtcctaggtc-tttagtgtaaatgaggagttttctgagagctatagaataaggactac---- 19466621  T
Q  273 gtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtag 316  Q
       |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||    
T  19466622 ---actagtggatttccttcctggcttggtagcccccagagtag 19466662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 129 - 272
Target Start/End: Original strand, 21250158 - 21250299
Alignment:
Q  129 tcacaggggctgtgactgaccataggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtg 228  Q
    ||||||||||||||| |||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||  ||    
T  21250158 tcacaggggctgtgattgattgtaggatagtgagatgagatctcagatctaggagatcctaggttgaagtctagacgggtaggtcctaggtcttaagttg 21250257  T
Q  229 taaacgaggagtttgctgagagcttttgaataaggactacacta 272  Q
    |||||| |  |||| |||||| ||||  ||||| ||||||||||    
T  21250258 taaacgtg--gtttactgagaactttaaaataacgactacacta 21250299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 218 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 15328419 - 15328299
Alignment:
Q  218 gtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttgaataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtaga 317  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||       |||| ||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||     
T  15328419 gtcataaagtgtaaatgaggagtttgcttagagcttttgaataaggactac-------actaatggatttccttcttggcttggtagcccccagagtagg 15328327  T
Q  318 tgacgttgcaccgaactgagttaacaaa 345  Q
    | || ||||||||||||| |||||||||    
T  15328326 taacattgcaccgaactgggttaacaaa 15328299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 157 - 249
Target Start/End: Original strand, 20476565 - 20476657
Alignment:
Q  157 agtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgaga 249  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||| ||||  |||||||  ||||||||||||||    
T  20476565 agtgagatgggatctcagatctaagagtttctaggttgaagtcaatacgggtaggtcctaggtgataagttgtaaacttggagtttgctgaga 20476657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 161 - 274
Target Start/End: Original strand, 24317181 - 24317293
Alignment:
Q  161 agatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaag-tgtaaacgaggagtttgctgagagcttttgaat 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | || |||||||| |||||| || || ||||||||||||||||| ||||| | || ||||    
T  24317181 agatgggatctcagatctaggagttcctagtttgaagtcaatacgggtaggtcctaggtc-tagagttgtaaacgaggagtttgttgagaac-ttagaat 24317278  T
Q  260 aaggactacactagt 274  Q
    |||||||||||||||    
T  24317279 aaggactacactagt 24317293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 129 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 21530583 - 21530440
Alignment:
Q  129 tcacaggggctgtgactgaccataggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtg 228  Q
    ||||||||| ||||| |||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| || | |  |||||||| |||||| |  || |    
T  21530583 tcacaggggttgtgattgattgtaggatagtgagatgggatctcagatttaggagttcctaagttgaaatcaata-tggtaggtcctaggtc-tttagcg 21530486  T
Q  229 taaacgaggagtttgctgagagcttttgaataaggactacactagt 274  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||    
T  21530485 taaacgaggaatttgctgagagctatagaataagaactacactagt 21530440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 157 - 249
Target Start/End: Original strand, 20475264 - 20475356
Alignment:
Q  157 agtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgaga 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| | || |||||||| ||||| ||||  |||||||  ||||||||||||||    
T  20475264 agtgagatgggatctcagatctaggagctcctaggttgaagtcaatacgggtaggtcctaggtgataagttgtaaacttggagtttgctgaga 20475356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 157 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 31587646 - 31587530
Alignment:
Q  157 agtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaag-tgtaaacgaggagtttgctgagagctttt 255  Q
    |||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | ||| ||||||| |||||| || || |||||||  |||||||||||||| | ||     
T  31587646 agtgggatgagatctaagatctaggagttcctaggttgaagtcaatacatgtaggtcctaggtc-tagagttgtaaacttggagtttgctgagaac-tta 31587549  T
Q  256 gaataaggactacactagt 274  Q
    |||||||||||||||||||    
T  31587548 gaataaggactacactagt 31587530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 274
Target Start/End: Original strand, 19198267 - 19198383
Alignment:
Q  157 agtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttg 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||   || |||||||||||||| ||||  |   |||  |||||||||||||| | || |    
T  19198267 agtgagatgggatctcagatctaggcgttcctaggttgaagtcagaacgggtaggtcttaggttataagtttggaactcggagtttgctgagaac-ttag 19198365  T
Q  257 aataaggactacactagt 274  Q
    || |||||||||||||||    
T  19198366 aacaaggactacactagt 19198383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 27107681 - 27107565
Alignment:
Q  157 agtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttg 256  Q
    ||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||   || |||||||| |||||| |||  |||||||  |||||||||||||| | || |    
T  27107681 agtgagacgagatctcaaatctaggagttcctaggttgaagtcagtacgggtaggtcctaggtcttaagttgtaaacttggagtttgctgagaac-ttag 27107583  T
Q  257 aataaggactacactagt 274  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  27107582 aataaggactacaatagt 27107565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 27111250 - 27111134
Alignment:
Q  157 agtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttg 256  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    || |||||||| ||| || |||  |||||||  | |||||||||||| | || |    
T  27111250 agtgagatgagatctcagatctaggagttcctaggttgaagtaagtacgggtaggtcctagttcttaagttgtaaacttgaagtttgctgagaac-ttag 27111152  T
Q  257 aataaggactacactagt 274  Q
    ||||||||||||||||||    
T  27111151 aataaggactacactagt 27111134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 157 - 310
Target Start/End: Original strand, 24317798 - 24317943
Alignment:
Q  157 agtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaag-tgtaaacgaggagtttgctgagagctttt 255  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||||| | |  |||||||| |||||| || || | ||||| ||||||||||||||| | ||     
T  24317798 agtgagatgcgatcacagatctaggacttcctaggttgaagtcaatatgggtaggtcctaggtc-tagagttataaaccaggagtttgctgagaac-tta 24317895  T
Q  256 gaataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatccccca 310  Q
    |||||||||||||       |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  24317896 gaataaggactac-------actagtggatttccttcctggcttggtaaccccca 24317943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 41 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 15328606 - 15328480
Alignment:
Q  41 ttgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagttgttt-gtttgaaggtaacttcaatttttgtctttttgtttag-gtctgataggtcacaggggc 138  Q
    |||| |||||||| || | | |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||   |||||  | |||||| | ||||||||| |||||||||     
T  15328606 ttgtgctacaccagagcttttaaacaaggtcgtagttgtttagtttgaaggtaacttcaccatttgt--tattgttttgagtctgatagatcacaggggt 15328509  T
Q  139 tgtgactgaccataggatagtgagatggg 167  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  15328508 tgtgattgactataggatagtgagatggg 15328480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 159 - 274
Target Start/End: Original strand, 20649547 - 20649661
Alignment:
Q  159 tgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttgaa 258  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |   || |||||||| ||||| ||||  |||||||  |||||||||| ||| | || |||    
T  20649547 tgagatgagatctcaaatctaggagttcctaggttgaagccagtacgggtaggtcctaggtgataagttgtaaacttggagtttgctaagaac-ttagaa 20649645  T
Q  259 taaggactacactagt 274  Q
     |||||||||||||||    
T  20649646 caaggactacactagt 20649661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 157 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 12952643 - 12952601
Alignment:
Q  157 agtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtc 199  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||    
T  12952643 agtgagatgggatctcaggtctaggagctcctaggttgaagtc 12952601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 157 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 25347364 - 25347248
Alignment:
Q  157 agtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctag-acaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagctttt 255  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||||||  ||||||||||| ||| || |||||||| ||| || |||  |||||||  |||||||||| ||| | ||     
T  25347364 agtgagctgggatcttagatcgaggagttcataggttgaagt-tagtacgggtaggtcctagttcttaagttgtaaacttggagtttgctaagaac-tta 25347267  T
Q  256 gaataaggactacactagt 274  Q
    |||||||||||||||||||    
T  25347266 gaataaggactacactagt 25347248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 31)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 41 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 4246325 - 4245898
Alignment:
Q  41 ttgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagttgtttgttt--gaaggtaacttcaatttttgtctttttgtttaggtctgataggtcacaggggc 138  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| |  |||||||||||| | ||| || |||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  4246325 ttgtactacaccgaagttgtgaaataaggtgttagttgtttgtgttggaaggtaacttctacttt-gtgttttggtttaggtctgataggtcagaggggc 4246227  T
Q  139 tgtgactgaccat-aggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgagg 237  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  4246226 tgtgactgaccattaggatagtgagataggatctcagatctaggagttcctaggttgaagtctatacaggtaggtcctaggtcatatagtgtaaacgagg 4246127  T
Q  238 agtttgctgagagcttttgaataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttg-caccgaactga 336  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||       |||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||| ||   ||| ||||||||||     
T  4246126 agtttgctgagagctattgaataaggactacac-------tagtggatttccttcctgtcttggtagcccccagagtaggtgtgtttgtcaccgaactgg 4246034  T
Q  337 gttaacaaactcactgtgttctttactttc---tcatttannnnnnnnnnnnnatttctgtttatcgcgtgatgttggaacattgaacataacatcgcaa 433  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||   |||||||             ||||||| |||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||    
T  4246033 gtcaacaaactcattgtgttctttactttcctgtcatttattttcttgtttttatttctgcttatcgcgtgatgttgaaacattaatcataacattgcaa 4245934  T
Q  434 acgttaaaacatcatacaaaacgtattaaaacaagt 469  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  4245933 acgtcaaaacatcatacataacatattaaaacaagt 4245898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 40 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 13165684 - 13165260
Alignment:
Q  40 tttgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagttgtttgttt--gaaggtaacttcaatttttgtctttttgtttaggtctgataggtcacagggg 137  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| | ||||||  ||| |||||||||||||||||||  | ||    
T  13165684 tttgtactacaccgaagttgtgaaacaaggtgctagttgtttgtgttagaaggtaacttctacttttgt--tttggtttaggtctgataggtcattgcgg 13165587  T
Q  138 ctgtgactgaccat-aggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgag 236  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||| | ||||||||||    
T  13165586 cagtgactgaccattaggatagtgagatgggatcttagatctaggagttcctatgttgaagtctatacgggtaggtcctaggtcatatactgtaaacgag 13165487  T
Q  237 gagtttgctgagagcttttgaataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttg-caccgaactg 335  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||       |||||||||| |||||| ||||||||  ||||| ||||| ||   ||| ||||||||||    
T  13165486 gagtatgctgagagctattgaataaggactacac-------tagtggatttccttcctagcttggta-gccccacagtaggtg--tttgtcaccgaactg 13165397  T
Q  336 agttaacaaactcactgtgttctttactttc---tcatttannnnnnnnnnnnnatttctgtttatcgcgtgatgttggaacattgaacataacatcgca 432  Q
    ||| |||||||| | ||||||||||||||||   || ||||             | |||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  13165396 agtcaacaaacttattgtgttctttactttcctatcttttattttcttgtttttaattctgtttatcgcgtgatgttgtaacattaatcataacatcgca 13165297  T
Q  433 aacgttaaaacatcatacaaaacgtattaaaacaagt 469  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13165296 aacgttaaaacatcatacagaacgtattaaaacaagt 13165260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 42 - 367
Target Start/End: Original strand, 11667734 - 11668053
Alignment:
Q  42 tgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagttgtttgtttgaaggtaacttcaatttttgtctttttgtttaggtctgataggtcacaggggctgt 141  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11667734 tgtactacaccgaagttatgaaacaaggtgttagttgtttgtttgaatgtaacttca-tatttgagtttgtgtttaggtctgataggtcacaggggttgt 11667832  T
Q  142 gactgaccata--ggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggag 239  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||   |||| |  |||||||||||||||    
T  11667833 gactgaccatataggatagtgagatggaatctcagatctaggagttcctaggttgaagtctatacgggtaggtccatggtc-tttagtgtaaacgaggag 11667931  T
Q  240 tttgctgagagcttttgaataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgtt-gcaccgaactgagt 338  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||       ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| ||   ||  || ||||||| ||    
T  11667932 tttgctgagagctatagaataaggactacactagta-------gatttccttcctggcttggtagcccccagagtaggtgtgtttctcatcgaactgggt 11668024  T
Q  339 taacaaactcactgtgttctttactttct 367  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11668025 caacaaactcactgtgttctttactttct 11668053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 40 - 361
Target Start/End: Original strand, 26972270 - 26972585
Alignment:
Q  40 tttgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagttgtttgttt--gaaggtaacttcaatttttgtctttttgtttaggtctgataggtcacagggg 137  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||    |||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  26972270 tttgtactacaccgaagttgtgaaacaaggtgctagttgtttgtattggaaggtaacttctattttg---ttttggtttaggtctgat-ggtcactgggg 26972365  T
Q  138 ctgtgactgaccat-aggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaa-gtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacga 235  Q
    | |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  26972366 cagtgactgaccattaagatagtgagatgggatctcagatctaggagttcctaggttgaaagtctatacgggtaggtcctaggtcatatagtgtaaacga 26972465  T
Q  236 ggagtttgctgagagcttttgaataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttg-caccgaact 334  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| ||||| ||   ||| |||||||||    
T  26972466 ggagtttgctgagagctattgaataaggactac-------actagtggatttccttactggcttggtagcccccagagtaggtgtgtttgtcaccgaact 26972558  T
Q  335 gagttaacaaactcactgtgttcttta 361  Q
    | || |||||||||| |||||||||||    
T  26972559 gggtcaacaaactcattgtgttcttta 26972585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 40 - 469
Target Start/End: Original strand, 14745653 - 14746078
Alignment:
Q  40 tttgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagttgtttgttt--gaaggtaacttcaatttttgtctttttgtttaggtctgataggtcacagggg 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |  ||||||||||||   |||    |||| ||||||||||||||| |||| |||     
T  14745653 tttgtactacaccaaagttgtgaaacacggtgctaattgtttgtgttggaaggtaacttctgctttg---ttttggtttaggtctgatagatcactggga 14745749  T
Q  138 ctgtgactgaccat-aggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgag 236  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  14745750 ctgtgactgaccattaggatagtgagatgtgatctcagatctaagagttcctaggttgaagtctatacgggtaggtct-atgtcatatagtgtaaacgag 14745848  T
Q  237 gagtttgctgagagcttttgaataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttg-caccgaactg 335  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||   ||| |||||| |||    
T  14745849 tagtttgctgagagctattgaataaggactac-------actagtggattttcttcctggcttggtagcccccagagttggtgtgtttgtcaccgagctg 14745941  T
Q  336 agttaacaaactcactgtgttctttactttc---tcatttannnnnnnnnnnnnatttctgtttatcgcgtgatgttggaacattgaacataacatcgca 432  Q
     || ||||||||| ||||||| |||||||||   |||||||              ||||||||||||||||||| ||| |||||| | | |||||| |||    
T  14745942 ggtcaacaaactcgctgtgttatttactttcctgtcatttattttcttgtttttgtttctgtttatcgcgtgatattgaaacattaatcttaacattgca 14746041  T
Q  433 aacgttaaaacatcatacaaaacgtattaaaacaagt 469  Q
    |||  |||||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  14746042 aacactaaaacatcatacataacctcttaaaacaagt 14746078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 45 - 367
Target Start/End: Original strand, 20841140 - 20841455
Alignment:
Q  45 actacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagttgtttgt--ttgaaggtaacttcaattttt-gtctttttgtttaggtctgataggtcacaggggctgt 141  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| | |||  ||||    ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20841140 actacaccgaagttgtaaaacaaggtgttagttgtttgtgtttgaaggtaacttctactttgagtct----gtttaggtctgataggtcacaggggatgt 20841235  T
Q  142 gactgaccat-aggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagt 240  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||||||| |||||| |  ||||||||||||||||    
T  20841236 gactaaccattaggatagtgagatgggatctcagatctaggagttcctaggttgaagtctgtacatgtaggtcctaggtc-tttagtgtaaacgaggagt 20841334  T
Q  241 ttgctgagagcttttgaataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttg-caccgaactgagtt 339  Q
    ||||| |||||| |  ||||||||||||       |||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||| ||   ||| |||||||||   |     
T  20841335 ttgctaagagctataaaataaggactac-------actagtggatttccttcctggcttggtagcccatatagtaggtgtgtttgtcaccgaactatttc 20841427  T
Q  340 aacaaactcactgtgttctttactttct 367  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||    
T  20841428 aacaaactcattgtgttctttactttct 20841455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 78 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 12753309 - 12753116
Alignment:
Q  78 gtttgtttgaaggtaacttcaatttttgtctttttgtttaggtctgataggtcacaggggctgtgactgaccataggatagtgagatgggatctcagatc 177  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12753309 gtttgtttgaaggtaacttcatcgtttgt--ttatgtttaggtctgatatgtcacaggggctgtgactgaccataggatagtgagatggaatctcagatc 12753212  T
Q  178 taggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttgaataaggactacactagt 274  Q
    ||||||||||||||||||| || | |  |||||||| |||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||    
T  12753211 taggagtttctaggttgaaatcaatatgggtaggtcctaggtc-tttagtgtaaacgaggagttcgctgagagctatagaataaggactacgctagt 12753116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 73 - 367
Target Start/End: Original strand, 17851280 - 17851563
Alignment:
Q  73 tagttgtttgtttgaaggtaacttcaatttttgtctttttgtttaggtctgataggtcacaggggctgtgactgaccataggatagtgagatgggatctc 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   |||   ||||  |||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||||||||    
T  17851280 tagttgtttgtttgaaggtaacttcaccgttt---ttttgttttaagtctgataa-tcacaggggctgtgattgactgtgggatagtgagatgggatctc 17851375  T
Q  173 agatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttgaataaggactacacta 272  Q
    ||||||||||||| |||||||||| | ||||| | |||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||        
T  17851376 agatctaggagttcctaggttgaaatgtagacggctaggtcctaggtc-tttagtgtaaacgaggagtttgctgagagctatagaataaggactac---- 17851470  T
Q  273 gtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttg-caccgaactgagttaacaaactcactgtgttctttactttct 367  Q
       |||||||||||| |||| |||||| ||| |||||| ||||| ||   ||| |||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17851471 ---actagtggatttccttcttggcttagtagcccccagagtaggtgtgtttgtcaccgaactaggtcaacaaactcactgtgttctatactttct 17851563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 159 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 33062555 - 33062370
Alignment:
Q  159 tgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttgaa 258  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||   |  |||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| |||||    
T  33062555 tgagatggggtctcagatctaggagttcctaggttgaagtcagtaagggtaggtcctaggtcatatagtgcaaacgaggagtttgctaagagctattgaa 33062456  T
Q  259 taaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttgcaccgaactgagttaacaaactcact 351  Q
    ||||||||||||       |||||||||| ||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33062455 taaggactacac-------tagtggatttcctttctggcttggtagcccccagagtaggtgacgttgcaccgaactgggttaacaaactcact 33062370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 160 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 17038414 - 17038216
Alignment:
Q  160 gagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttgaat 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||| || ||| | | |||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  17038414 gagatgggatctcagatctaggagttcctaggttgaagtcaagatgggtaggtcctatgtcttta-gtgtaaacgaggagtttgctgagagctagagaat 17038316  T
Q  260 aaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttgcaccgaactgagttaacaaactcactgtgttctt 359  Q
    |||||||||||       ||||||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||    
T  17038315 aaggactacac-------tagtgga-tttcctcctggcttggtagcccccagagtaggtgacgttgcaccgaactgggttaacaaacttcctgtgttttt 17038224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 18 - 274
Target Start/End: Original strand, 47941191 - 47941443
Alignment:
Q  18 tgaagcaaggagctaggtagattttgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagtt-gtttgtttgaaggtaacttcaatttttgtctttttgttt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| || |||| ||| | |||||||||||||||||||||   |||||    ||||||    
T  47941191 tgaagcaaggagctaggtagattgtgtactacaccaaagctgtgaagcacggtgttaggtagtttgtttgaaggtaacttcaccgtttgt----ttgttt 47941286  T
Q  117 aggtc-tgataggtcacaggggctgtgactgaccataggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtctt 215  Q
     |  | |||||  |||||| |||||||| ||    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |    
T  47941287 tgaacctgataa-tcacagtggctgtgattggttgtaggatagtgagatgagatctcagatttaggagttactaggttgaaatctagacgggtaggtcct 47941385  T
Q  216 aggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttgaataaggactacactagt 274  Q
    | ||| |  ||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  47941386 atgtc-tttagtgtaaacgaggagtttgctaagagctatagaataaggactacactagt 47941443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 42 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 24986284 - 24986127
Alignment:
Q  42 tgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagttgtttgtttgaaggtaacttcaatttttgtctttttgtttaggtctgataggtcacaggggctgt 141  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| | ||||  ||| ||||||||| |||||||| ||||| | |||    
T  24986284 tgtactacaccgaagttgtgaaacaaggtgttggttgttt-tttgaaggtaacttca-tctttgagtttgtgtttaggtttgataggttacaggagttgt 24986187  T
Q  142 gactgaccataggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtcta 201  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| |||||||||||||||    
T  24986186 gactgaccataggatagtgagatgagatctcagatctataagttcctaggttgaagtcta 24986127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 129 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 1973512 - 1973281
Alignment:
Q  129 tcacaggggctgtgactgaccataggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtg 228  Q
    ||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | || |||||||| |||||| |  ||||    
T  1973512 tcacaggggttgtgattgactgtaggatagtgagatgggatctcagatctaggagttcctaggttgaaatcaatacgggtaggtcctaggtc-tttagtg 1973414  T
Q  229 taaacgaggagtttgctgagagcttttgaataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttg-ca 327  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||       |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||  |   ||| ||    
T  1973413 taaatgaggagttttctgagagctatagaataaggactac-------actagtggatttccttcctgacttggtatcccccagagtaggagtgtttgtca 1973321  T
Q  328 ccgaactgagttaacaaactcactgtgttctttactttct 367  Q
    |||||||| || |||||||||||  ||||||||| |||||    
T  1973320 ccgaactgggtcaacaaactcaccatgttctttattttct 1973281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 157 - 354
Target Start/End: Original strand, 45599317 - 45599506
Alignment:
Q  157 agtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttg 256  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||   || |||||||| |||||||| | ||| ||| |||||||||| ||||| || |||    
T  45599317 agtgagatgagatctcagatctaggagttcctaggttgaagtcagtacgggtaggtcctaggtcatta-gtgcaaatgaggagtttgttgagaactattg 45599415  T
Q  257 aataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttgcaccgaactgagttaacaaactcactgtg 354  Q
    |||| |||||||| ||||       |||||| ||||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45599416 aatacggactacattagt-------ggatttccttcctggcttggtagccccgagagtaggtgacgttgcaccgaattgagttaacaaactcactgtg 45599506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 73 - 316
Target Start/End: Original strand, 23477839 - 23478073
Alignment:
Q  73 tagttgtttgtttgaaggtaacttcaatttttgtctttttgtttaggtctgataggtcacaggggctgtgactgaccataggatagtgagatgggatctc 172  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| | ||||| ||| |||||| || |||||| ||||||||||| ||| |||| | |||||  ||||||||||||||    
T  23477839 tagttgtttatttgaaggtaacttca-tctttgtgtttgtgtttaagtttgatagatcacaggggctatgattgactagaggattctgagatgggatctc 23477937  T
Q  173 agatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttgaataaggactacacta 272  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || | || |||||||  |||||| |  | ||||||| ||  |||||||||||||| | |||||||||||||        
T  23477938 agatctaggagttcctaggttgaaatcaatacgggtaggttctaggtc-tttattgtaaacaagttgtttgctgagagctatagaataaggactac---- 23478032  T
Q  273 gtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtag 316  Q
       |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||    
T  23478033 ---actagtggatttccttcctggcttggtagcccccagagtag 23478073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 159 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 17012172 - 17012013
Alignment:
Q  159 tgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttgaa 258  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||   ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  17012172 tgagatgagatctcagatccaggagttcctaggttgaagtcagtacaggtaggtcctaggtcatatagtgcaaacgaggagtttgctgaaagctgttgaa 17012073  T
Q  259 taaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttg 325  Q
    ||||||||||||       |||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||    
T  17012072 taaggactacac-------tagtggatttccttcctggcttggtagcccccagagtaggtgatgttg 17012013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 157 - 354
Target Start/End: Original strand, 40313211 - 40313400
Alignment:
Q  157 agtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttg 256  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||| |||||||||||||   || | |||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  40313211 agtgagatgagatctcagatatatgagttcctaggttgaagtcagtacggctaggtcctaggtcatta-gtgcaaacgaggagtttgctgagagctattg 40313309  T
Q  257 aataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttgcaccgaactgagttaacaaactcactgtg 354  Q
    |||| |||||||       |||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  40313310 aatacggactac-------actagtggatttccttcctggcttggtagccccctgagtaggtaacgttgcactgaactgggttaacaaactcactgtg 40313400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 157 - 354
Target Start/End: Original strand, 52436807 - 52436997
Alignment:
Q  157 agtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttg 256  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||   || ||||| || || |||||| ||||  |||||||||||| |||| |||| |||    
T  52436807 agtgggatgagatctcagatctaggagttcctaggttgaagtcagtacgggtagatcctatgtcatatagtgcgaacgaggagtttactgaaagctattg 52436906  T
Q  257 aataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttgcaccgaactgagttaacaaactcactgtg 354  Q
    ||||||||||      ||| ||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  52436907 aataaggact------gta-ctagtggattttcttcctgactcggtagcctccagagtaggtgacgttgcaccgaactgggttaacaaactcactgtg 52436997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 157 - 344
Target Start/End: Original strand, 17379610 - 17379790
Alignment:
Q  157 agtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaag-tgtaaacgaggagtttgctgagagctttt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||||   ||     
T  17379610 agtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtcaagacgggtaggtcctaggtc-tagagttgtaaacgaggagtttgctgaga-aatta 17379707  T
Q  256 gaataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttg-caccgaactgagttaacaa 344  Q
    |||||||||||||       |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| ||   ||| |||||||||| ||||||||    
T  17379708 gaataaggactac-------actagtggatttccttcctggcttggtagcccccagagtaggtgtgtttgtcaccgaactgggttaacaa 17379790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 129 - 354
Target Start/End: Original strand, 15804071 - 15804288
Alignment:
Q  129 tcacaggggctgtgactgaccataggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtg 228  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  || |||||| || | || |||||||| |||||| |    ||    
T  15804071 tcacaggggctgtgattgactgtaggatagtgaaatgagatctcagatctaggagttcttaagttgaaatcaatacgggtaggtcctaggtcttgtgttg 15804170  T
Q  229 taaacgaggagtttgctgagagcttttgaataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttg-ca 327  Q
    |||||| |  ||||||||||| | || |||||||||||||       ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||   ||| ||    
T  15804171 taaacgtg--gtttgctgagaacattagaataaggactac-------actagtgaattttcttcctggcttggtagcccccatagtaggtgtgtttgtca 15804261  T
Q  328 ccgaactgagttaacaaactcactgtg 354  Q
    | |||||| |||||||||||| |||||    
T  15804262 ctgaactgggttaacaaactcgctgtg 15804288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 129 - 233
Target Start/End: Original strand, 10340117 - 10340221
Alignment:
Q  129 tcacaggggctgtgactgaccataggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtg 228  Q
    ||||||||||||||| |||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| |||||||| |||||| |||  ||    
T  10340117 tcacaggggctgtgattgattgtaggatagtgagatgagatctcagatctaggagttcctaggttgaaatatagacgggtaggtcctaggtcgtaagttg 10340216  T
Q  229 taaac 233  Q
    |||||    
T  10340217 taaac 10340221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 157 - 271
Target Start/End: Original strand, 17355818 - 17355931
Alignment:
Q  157 agtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaag-tgtaaacgaggagtttgctgagagctttt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||||| |||||  || || |||||||||||||||||||||||   ||     
T  17355818 agtgagatgggatctcagatctatgagttcctaggttgaagtcaagacgggtaggtcctaggt-gtagagttgtaaacgaggagtttgctgaga-aatta 17355915  T
Q  256 gaataaggactacact 271  Q
    ||||||||||||||||    
T  17355916 gaataaggactacact 17355931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 157 - 274
Target Start/End: Original strand, 51472080 - 51472196
Alignment:
Q  157 agtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaag-tgtaaacgaggagtttgctgagagctttt 255  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||| |||||||| |||||| || || ||||||||||||||||| ||||| | ||     
T  51472080 agtgagattggatctcagatctaggagttcctaggttgaaataaagacgggtaggtcctaggtc-tagagttgtaaacgaggagtttgatgagaac-tta 51472177  T
Q  256 gaataaggactacactagt 274  Q
    |||||||||||||||||||    
T  51472178 gaataaggactacactagt 51472196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 157 - 249
Target Start/End: Original strand, 18390092 - 18390184
Alignment:
Q  157 agtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgaga 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||| |||| ||||| ||||  |||||||   |||||||||||||    
T  18390092 agtgagatgggatctcagatctaggagtttctacgttgaagtcaatacgggttggtcctaggtgataagttgtaaacttcgagtttgctgaga 18390184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 387 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 9452085 - 9452023
Alignment:
Q  387 atttctgtttatcgcgtgatgttggaacattgaacataacatcgcaaacgttaaaacatcata 449  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  9452085 atttctgcttatcgcgtgatgttggaacattaatcgtaacattgcaaacgttaaaacatcata 9452023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 367
Target Start/End: Original strand, 20859640 - 20859733
Alignment:
Q  275 aactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttg-caccgaactgagttaacaaactcactgtgttctttactttct 367  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| ||   ||| |||||||||| || |||||| ||| |||||||||||||||||    
T  20859640 aactagtggatttccttcctggcttggtagcccccagagtaggtgtgtttgtcaccgaactgggtcaacaaaatcattgtgttctttactttct 20859733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 157 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 8282091 - 8281975
Alignment:
Q  157 agtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaag-tgtaaacgaggagtttgctgagagctttt 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  |||| |||||||| | |||| || || ||||||| ||||||||| ||||| | ||     
T  8282091 agtgagatgggatctcagatctaggaattcctaggttgaagttaagacgggtaggtccttggtc-tagagttgtaaacaaggagtttgttgagaac-tta 8281994  T
Q  256 gaataaggactacactagt 274  Q
     ||||||||||||| ||||    
T  8281993 caataaggactacaatagt 8281975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 17038559 - 17038475
Alignment:
Q  15 ctgtgaagcaaggagctaggtagattttgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgcta-gttgtttgtttgaaggtaacttca 98  Q
    |||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||| || |||| || ||  ||||||||||||||||||||    
T  17038559 ctgtgaagcacggagataggtagtttgtgtactacaccaaagctgtgaagcacggtgttaggtaatttgtttgaaggtaacttca 17038475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 346
Target Start/End: Original strand, 49086704 - 49086761
Alignment:
Q  290 ttcctggcttggtatcccccata-gtagatgacgttgcaccgaactgagttaacaaac 346  Q
    |||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  49086704 ttcctggcttggtagcccccacatgtaggtgacgttgcaccgaactgggttaacaaac 49086761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 403 - 469
Target Start/End: Original strand, 11668092 - 11668157
Alignment:
Q  403 tgatgttggaacattgaacataacatcgcaaacgttaaaacatcatacaaaacgtattaaaacaagt 469  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| | ||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  11668092 tgatgttggaacattgaacggaacattgtaaacgttgaaacatcttac-aaacatattaaaacaagt 11668157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 387 - 469
Target Start/End: Original strand, 26972614 - 26972695
Alignment:
Q  387 atttctgtttatcgcgtgatgttggaacattgaacataacatcgcaaacgttaaaacatcatacaaaacgtattaaaacaagt 469  Q
    ||| |||||||||||  ||||||| |||||| | | |||||||| |||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  26972614 attactgtttatcgccggatgttgaaacattaatcgtaacatcg-aaacgttgtaacatcatacagaacatattaaaacaagt 26972695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 184; Significance: 2e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 16 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 40647 - 40303
Alignment:
Q  16 tgtgaagcaaggagctaggtagattttgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagtt-gtttgtttgaaggtaacttcaatttttgtctttttgt 114  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||| || |||| ||| | |||| |||||||||||||||| | ||||  ||| |||    
T  40647 tgtgaagcaaggagcaaggtagattgtgtactacaccaaagcggtgaagcacggtgttaggtagtttttttgaaggtaacttca-tctttgagtttgtgt 40549  T
Q  115 ttaggtctgataggtcacaggggctgtgactgaccataggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtct 214  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || ||||||||     
T  40548 ttaggtctgataggtcacaggggttgtgactgaccataggatagtgagatgggatctcagatctaggagttcctaggttgaattctatactggtaggtcc 40449  T
Q  215 taggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttgaataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagt 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||| |||||| |||||||| |||||| |||    
T  40448 taggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttgaataaggactacac-------tagtggatttccttcctagcttggtagcccccagagt 40356  T
Q  315 agatgacgttg-caccgaactgagttaacaaactcactgtgttctttactttct 367  Q
    || ||  |||| ||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40355 aggtg-tgttgtcactgaactgggtcaacaaactcactgtgttctttactttct 40303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 181; Significance: 1e-97; HSPs: 70)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 42 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 4459027 - 4458602
Alignment:
Q  42 tgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagttgtttgt--ttgaaggtaacttcaatttttgtctttttgtttaggtctgataggtcacaggggct 139  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  || |||||||||||| | ||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  4459027 tgtactacaccaaagttgtgaaataaggtgttagttgtttgtgtttaaaggtaacttca-tctttgtgtttg-gtttaggtctgataggtcacaggggct 4458930  T
Q  140 gtgactgaccat-aggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgagga 238  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4458929 gtgactgaccattaggatagtgagatgggatctcagatctaggagttcctaggttgaagtctatacgggtaggtcctaggtcataaagtgtaaacgagga 4458830  T
Q  239 gtttgctgagagcttttgaataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttg-caccgaactgag 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| ||   ||| |||||||||  |    
T  4458829 gtttgctgagagcttttgaataaggactacactagta-------gatttccttcctggcttggtagcccccagagtaggtgtgtttgtcaccgaactcgg 4458737  T
Q  338 ttaacaaactcactgtgttctttactttc---tcatttannnnnnnnnnnnnatttctgtttatcgcgtgatgttggaacattgaacataacatcgcaaa 434  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||   |||||||             |||||||||| |  || |||||||||||||| |||  ||||| |||||    
T  4458736 tcaacaaattcactgtgttctttactttcctgtcatttattttcttgtttttatttctgtttgttacgcgatgttggaacattaaacggaacattgcaaa 4458637  T
Q  435 cgttaaaacatcatacaaaacgtattaaaacaagt 469  Q
    ||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||    
T  4458636 cgttaaaacatctgacagaacatattaaaacaagt 4458602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 42 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 15506553 - 15506256
Alignment:
Q  42 tgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagttgttt-gtttgaaggtaacttcaatttttgtctttttgtttaggtctgataggtcacaggggctg 140  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15506553 tgtactacaccgaagttgtgaaacaaggtgctagttgttttgtttgaaggtaacttcaacttttgtgtttgagtttaggtctgataggtcacaggggttg 15506454  T
Q  141 tgactgaccataggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagt 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  15506453 tgactgaccataggatagtgagatgggatc--agatctaggagttcctaggttgaagtctatacgggtaggtcctaggtcataaaatgtaaacgaggagt 15506356  T
Q  241 ttgctgagagcttttgaataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttgcaccgaactgagtta 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||| | | ||||||||||| |||| | ||||| |||||||||| |||| || ||||    
T  15506355 ttgctgagagcttttgaataaggactacac-------tagtggatttccattctggcttggtagcccctagagtaggtgacgttgcatcgaattgggtta 15506263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 42 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 15436334 - 15436037
Alignment:
Q  42 tgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagttgttt-gtttgaaggtaacttcaatttttgtctttttgtttaggtctgataggtcacaggggctg 140  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15436334 tgtactacaccgaagttgtgaaacaaggtgctagttgttttgtttgaaggtaacttcaacttctgtgtttgagtttaggtctgataggtcacaggggctg 15436235  T
Q  141 tgactgaccataggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagt 240  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  | || |||||||| ||| ||||||||||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  15436234 tgactgaccataggatagcgagatgggatc--aaatataggagttcctacgttgaagtctatatgggtaggtcctaagtcataaagtgtaaacgaggagt 15436137  T
Q  241 ttgctgagagcttttgaataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttgcaccgaactgagtta 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||| ||| ||||||||||| |||| | ||||| |||||||||| |||| || ||||    
T  15436136 ttgctgagagcttttgaataaggactacac-------tagtggatttcctttctggcttggtagcccctagagtaggtgacgttgcatcgaattgggtta 15436044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 142 - 467
Target Start/End: Original strand, 13455084 - 13455405
Alignment:
Q  142 gactgaccataggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtt 241  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  13455084 gactgacaataggatagtgagatgggatctcagatctaggagttcctaggttgaagtctagacgggtaggtcctaagtcataaagtgtaaacgaggagtt 13455183  T
Q  242 tgctgagagcttttgaataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttgcaccgaactgagttaa 341  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||       |||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||    
T  13455184 tgccaagagcttttgaataaggactac-------actagtggatttccttccttgcttggtagcccccagagtaggtgacgttgcaccgaactaggttaa 13455276  T
Q  342 caaactcactgtgttctttactttc---tcatttannnnnnnnnnnnnatttctgtttatcgcgtgatgttggaacattgaacataacatcgcaaacgtt 438  Q
    |||||||| ||||||||||||||||   |||||||             | ||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  13455277 caaactcattgtgttctttactttcttgtcatttattctcttgtttttagttctgtttataacgtgatgttggaacatttaacgtaacatcgaaaacgtt 13455376  T
Q  439 aaaacatcatacaaaacgtattaaaacaa 467  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  13455377 aaaacatcatacagaacatattaaaacaa 13455405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 42 - 469
Target Start/End: Original strand, 16207752 - 16208177
Alignment:
Q  42 tgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagttgtttgt--ttgaaggtaacttcaatttttgtctttttgtttaggtctgataggtcacaggggct 139  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||  ||||||||||||||||  || || ||| | || ||||||||||||||||||||| |    
T  16207752 tgtactacaccgaagttgtgaaacaatgtgttagttgtttgtgtttgaaggtaacttcaacctt-gtgtttgt-ttgaggtctgataggtcacaggggtt 16207849  T
Q  140 gtgactgaccat-aggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgagga 238  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| || | || |||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  16207850 gtgactggccattaggatagtgagatgggatctcagatctatgagttcctaggttgaaatcaatacgggtaggtgctaggtcataaagtgtaaacgagga 16207949  T
Q  239 gtttgctgagagcttttgaataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttg-caccgaactgag 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| ||   ||| | ||||| || |    
T  16207950 gtttgctgagagcttttgaataaggactac-------actagtggatttccttcctggcttggtagcccccagagtaggtgtgtttgtcgccgaaatggg 16208042  T
Q  338 ttaacaaactcactgtgttctttactttc---tcatttannnnnnnnnnnnnatttctgtttatcgcgtgatgttggaacattgaacataacatcgcaaa 434  Q
    | |||||||||| ||| ||||||||||||   |||||||             |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||  ||||    
T  16208043 tcaacaaactcattgtcttctttactttcctatcatttattttattgtttttatttatgtttattgcgtgatgttggaacattgaacgaaacattacaaa 16208142  T
Q  435 cgttaaaacatcatacaaaacgtattaaaacaagt 469  Q
     |||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  16208143 tgttaaaacatcatacataacatattaaaacaagt 16208177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 42 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 20991828 - 20991511
Alignment:
Q  42 tgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagttgtttgtttgaaggtaacttcaatttttgtctttttgtttaggtctgataggtcacaggggctgt 141  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20991828 tgtactacactgaagttgtgaaacaaggtgttagttgtttgtttgaaggtaacttcaa-ctttgaatttttgtttaggtctgataggtcacaggggctgt 20991730  T
Q  142 gactgacca-taggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagt 240  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    | |||||| |||||| |  ||||||||||||||||    
T  20991729 gactgaccattaggatagtgagataggatctcagatctaggagttcctaggttgaagtctatctggataggtcctaggtc-tttagtgtaaacgaggagt 20991631  T
Q  241 ttgctgagagcttttgaataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttg-caccgaactgagtt 339  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||       |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| ||   ||| |||||||||| ||     
T  20991630 ttgctgagagctataaaataaggactac-------actagtggatttccttcctggcttggtagcccccagagtaggtgtgtttgtcaccgaactgggtc 20991538  T
Q  340 aacaaactcactgtgttctttactttc 366  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||    
T  20991537 aacaaactcattgtgttctttactttc 20991511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 40 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 645423 - 644996
Alignment:
Q  40 tttgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagttgtttgttt--gaaggtaacttcaatttttgtctttttgtttaggtctgataggtcacagggg 137  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| || |||||  ||| ||||| |||||||||||||||| ||    
T  645423 tttgtactacaccgaagttgtgaaacaaggtgctagttgtttgtgttggaaggtaacttctatctttgt--tttggtttatgtctgataggtcacagtgg 645326  T
Q  138 ctgtgactgaccat-aggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgag 236  Q
     |||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || || ||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  645325 ttgtgaccgaccattacgatagtgagatgggatctcagatctaggagttcctaggttgaaatctatacggggaggtcctaggtcatgtagtgtaaacgag 645226  T
Q  237 gagtttgctgagagcttttgaataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttg-caccgaactg 335  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||       ||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| ||   ||| ||| ||||||    
T  645225 aagtttgctgagagctattgaataaggactac-------actggtggatttccttcctggcttcgtagcccccatagtaggtgtgtttgtcactgaactg 645133  T
Q  336 agttaacaaactcactgtgttctttactttc---tcatttannnnnnnnnnnnnatttctgtttatcgcgtgatgttggaacattgaacataacatcgca 432  Q
     ||||||||| ||| |||||| |||||||||   |||||||             |||||||||||||||||||||||| ||||||     |||||| |||    
T  645132 ggttaacaaattcattgtgttatttactttcctgtcatttattttcttgtttttatttctgtttatcgcgtgatgttgaaacattagttgtaacattgca 645033  T
Q  433 aacgttaaaacatcatacaaaacgtattaaaacaagt 469  Q
    |||| | |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  645032 aacgattaaacatcatacagaacgtattaaaacaagt 644996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 45 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 11999165 - 11998742
Alignment:
Q  45 actacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagttgttt--gtttgaaggtaacttcaatttttgtctttttgtttaggtctgataggtcacaggggctgtg 142  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||| || ||||||||    
T  11999165 actacaccgaagttgtgaaacaaggtgttagttgtttatgtttgaaggtaacttca-tctttgtgttttggtttaggtctgataggtcgcaagggctgtg 11999067  T
Q  143 actgaccat-aggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtt 241  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||    
T  11999066 actgaccattaggataatgagatgggatctcagatctaggagttcctaggttgaagtctatacgggtaggtcctaggtcatatagtgtaaatgaggagtt 11998967  T
Q  242 tgctgagagcttttgaataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccata-gtagatgacgttg-caccgaactgagtt 339  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||       |||||||||| ||||||||||||| | |||||  | |||| ||   ||| || ||||||| ||     
T  11998966 tgttgagagctattgaataaggactacac-------tagtggatttccttcctggcttgg-agcccccggacgtaggtgtgtttgtcatcgaactgggtc 11998875  T
Q  340 aacaaactcactgtgttctttactttc---tcatttannnnnnnnnnnnnatttctgtttatcgcgtgatgttggaacattgaacataacatcgcaaacg 436  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||   || ||||              |||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||    
T  11998874 aacaaactcattgtgttctttactttcctgtcgtttattttcttgtttttgtttctgtttatcacgtgatgttggaacattaaacggaacattgcaaacg 11998775  T
Q  437 ttaaaacatcatacaaaacgtattaaaacaagt 469  Q
    ||||||||||  ||| ||| |||||||||||||    
T  11998774 ttaaaacatctgacataacatattaaaacaagt 11998742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 42 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 12326100 - 12325868
Alignment:
Q  42 tgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagttgtttgttt--gaaggtaacttca-atttttgtctttttgtttaggtctgataggtcacaggggc 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  || |||||||||| ||||  ||||    ||||| |||||||||||||||||||     
T  12326100 tgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgttagttgtttgtgttcgatggtaacttcatatttgagtct----gtttatgtctgataggtcacaggggt 12326005  T
Q  139 tgtgactgaccat-aggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgagg 237  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  12326004 tgtggctgaccattaggatagtgagattggatctcagatgtaggagttcctaggttgaagtctatacaggtaggtccaaggtcataaagtgtaaatgagg 12325905  T
Q  238 agtttgctgagagcttttgaataaggactacactagt 274  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12325904 agtttgctgagagcttttgaataatgactacactagt 12325868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 44 - 367
Target Start/End: Original strand, 29546013 - 29546321
Alignment:
Q  44 tactacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagttgtttgtttgaaggtaacttcaatttttgtctttttgtttaggtctgataggtcacaggggctgtga 143  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||   ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29546013 tactacaccgaagttgtgtaacaaggtgctagttgtttgtttgaaggtaacttca-tctttaagtttgtgtttaggtctgataggtcacagaggctgtga 29546111  T
Q  144 ctgaccataggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttg 243  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| || |||||||| |||||| |  |||||||||||| ||||||    
T  29546112 ctggccataggatagtgagatgagatctcagatctaggagttcctaggctaaagtctatacgggtaggtcctaggtc-tttagtgtaaacgagaagtttg 29546210  T
Q  244 ctgagagcttttgaataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttgcaccgaactgagttaaca 343  Q
    ||||||| | | |||||||||||||       | |||||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||      | || || ||| || || ||||    
T  29546211 ctgagagttatagaataaggactac-------agtagtggatttccttcctggcttggtagccccgagagta------ggtgtactgaattgggtcaaca 29546297  T
Q  344 aactcactgtgttctttactttct 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  29546298 aactcactgtgttctttactttct 29546321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 40 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 14165454 - 14165220
Alignment:
Q  40 tttgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagttgtttgttt--gaaggtaacttcaatttttgtctttttgtttaggtctgataggtcacagggg 137  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||| ||| |    |||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  14165454 tttgtactacatcgaagttgtgaaacaaggtgttagttgtttgtgttggaaggtaacttctattatg---ttttggtttaggtctgataggtcactgggg 14165358  T
Q  138 ctgtgactgaccat-aggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgag 236  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||  ||| ||||| ||||||||||||    
T  14165357 cagtgactgaccattaggatagtgagatgtgatctcagatctaggagttcctaggttgaagtctatacgggtaggttctagatcatatagtgtaaacgag 14165258  T
Q  237 gagtttgctgagagcttttgaataaggactacactagt 274  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14165257 gagtttgttgagagctattgaataaggactacactagt 14165220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 40 - 366
Target Start/End: Original strand, 11521281 - 11521600
Alignment:
Q  40 tttgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagttgtttgttt--gaaggtaacttcaatttttgtctttttgtttaggtctgataggtcacagggg 137  Q
    |||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| | ||||    ||| |||||||||||| |||||||  |||    
T  11521281 tttgtactgcaccgaagtggtgaaacaaggtgctagttgtttgtgttggaaggtaacttctactttt----tttggtttaggtctgacaggtcactaggg 11521376  T
Q  138 ctgtgactgaccat-aggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgag 236  Q
      |||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||| || || |||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  11521377 tagtgactgaccattaggatagtgagatgggattttagatctaggagttcctaggttggagtatatacgggtaggtcctaggtcatatagtgtaaacgag 11521476  T
Q  237 gagtttgctgagagcttttgaataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttg-caccgaactg 335  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||       ||||| ||||||||||||||| |||| | ||||| ||   ||| |||| |||||    
T  11521477 gagtttgctgagagctattgaataaggactacactagta-------gatttccttcctggcttggtagcccctagagtaggtgtgtttgtcaccaaactg 11521569  T
Q  336 agttaacaaactcactgtgttctttactttc 366  Q
     || |||||||||| |||||| |||||||||    
T  11521570 ggtcaacaaactcattgtgttatttactttc 11521600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 40 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 11588753 - 11588432
Alignment:
Q  40 tttgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagttgtttgttt--gaaggtaacttcaatttttgtctttttgtttaggtctgataggtcacagggg 137  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||    | || ||||||||||||||||||||  |||    
T  11588753 tttgtattacgccgaagttgtgaaacaaggtgctagttgtttgtgttggaaggtaacttctattttg---tgttggtttaggtctgataggtcactaggg 11588657  T
Q  138 ctgtgactgaccat-aggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgag 236  Q
    | || ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||||| | ||||||||||||    
T  11588656 cagttactgaccattaagatagtgagatgggatctcagatataggagttcctaggttgaagtctatacgggtaggtcctaggtcaaatagtgtaaacgag 11588557  T
Q  237 gagtttgctgagagcttttgaataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttg-caccgaactg 335  Q
    ||||||   ||||||| |||||||||||||||||       |||||||||| ||||||||||||||| || | | ||||| ||   ||| |||||| |||    
T  11588556 gagtttttagagagctattgaataaggactacac-------tagtggatttccttcctggcttggtagccgctagagtaggtgtgtttgtcaccgagctg 11588464  T
Q  336 agttaacaaactcactgtgttctttactttct 367  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11588463 ggtcaacaaactcactgtgttctttactttct 11588432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 157 - 354
Target Start/End: Original strand, 3290671 - 3290861
Alignment:
Q  157 agtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttg 256  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||   || |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  3290671 agtgaaatgagatctcagatctaggagttcctaggttgaagtcagtacgggtaggtcctaggtcatatagtgaaaacgaggagtttgctgagagctattg 3290770  T
Q  257 aataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttgcaccgaactgagttaacaaactcactgtg 354  Q
    ||||||||||||       |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  3290771 aataaggactac-------actagtggatttccttcctggcttggtagcccccagagttggtgacgttgcaccaaactgggttaacaaactcactgtg 3290861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 79 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 16437024 - 16436742
Alignment:
Q  79 tttgtttgaaggtaacttcaatttttgtcttt-ttgtt-taggtctgataggtcacaggggctgtgactgaccataggatagtgagatgggatctcagat 176  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||| |  ||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  16437024 tttgtttgaaggtaacttca-tctttgtgtttgttgttgttagtctgatagatcacaggggctgtgattgactgtaggatagtgagatgggatgtcagat 16436926  T
Q  177 ctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttgaataaggactacactagtaa 276  Q
    ||||||||| |||||||||| || | || |||||||| |||||| |  |||||||| |||||||||| ||||||||   |||||||||||||       |    
T  16436925 ctaggagttcctaggttgaaatcaatacgggtaggtcctaggtc-tttagtgtaaatgaggagtttgttgagagctacagaataaggactac-------a 16436834  T
Q  277 ctagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttg-caccgaactgagttaacaaactcactgtgttctttactttct 367  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||   ||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16436833 ctagtggatttccttccttgcttggtagcccccatagtaggtgtgtttgtcaccgaattgggtcaacaaactcactgtgttctttactttct 16436742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 157 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 42782927 - 42782747
Alignment:
Q  157 agtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttg 256  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||   || |||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| |||    
T  42782927 agtgagatgagatctcagatctaggagttcctaggttgaagtcagtacgggtaggtcctaggtcatatattgcaaacgaggagtttgctgagagctattg 42782828  T
Q  257 aataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttgcaccgaactgagttaacaa 344  Q
    ||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||    
T  42782827 aataaggactacac-------tagtggattttcttcctggcttggtagcccccagagtaggtgacattgcaccgaactgggttaacaa 42782747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 45 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 10661145 - 10660995
Alignment:
Q  45 actacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagtt-gtttgtttgaaggtaacttcaatttttgtctttttgtttaggtctgataggtcacaggggctgtga 143  Q
    ||||||||||||||||||| || |||| ||| | ||||||||||||||||||||| | |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10661145 actacaccaaagttgtgaagcacggtgttaggtagtttgtttgaaggtaacttcactgtttgt--ttgtgtttaggtctgataggtcacaggggctgtga 10661048  T
Q  144 ctgaccataggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaa 196  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10661047 ctgactataagatagtgagatgggatctcagatctaggagttcctaggttgaa 10660995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 158 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 30226256 - 30226076
Alignment:
Q  158 gtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttga 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   || |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30226256 gtgagatgggatctcagatctaggagttcctaggttgaagtcagtacgggtaggtcctaggtcatatagtgcaaacgaggagtttgctgagagctattga 30226157  T
Q  258 ataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccata-gtagatgacgttgcaccgaactgagttaacaa 344  Q
    |||||||||||||       |||||||||| ||||||| ||||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  30226156 ataaggactacac-------tagtggatttccttcctgacttggtagcccccagatgtaggtgacgttgcaccgaactgggttaacaa 30226076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 167 - 354
Target Start/End: Original strand, 48797616 - 48797795
Alignment:
Q  167 gatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttgaataaggact 266  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||   || |||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  48797616 gatctcagatctaggagttcctaggttgaagtcagtacgggtaggtcctaggtcatta-gtgcaaacgaggagtttgctgagagctattgaataaggact 48797714  T
Q  267 acactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttgcaccgaactgagttaacaaactcactgtg 354  Q
    ||       |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  48797715 ac-------actagtggatttccttcctggcttggtagcccccagagtaggtgacgttgcactgaactgggttaacaaactcactgtg 48797795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 112 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 42636463 - 42636302
Alignment:
Q  112 tgtttaggtctgataggtcacaggggctgtgactgaccataggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtagg 211  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| || | |  ||||||    
T  42636463 tgtttaggtctgatagatcacaggggctgtgattgaccctaggatagtgagatgagatctcagatctaggagttcctaggttgaaatcaatatgggtagg 42636364  T
Q  212 tcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttgaataaggactacactagt 274  Q
    || |||||| |  ||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  42636363 tcctaggtc-tttagtgtaaacaaggagtttgctgagagctatagaataaggactacactagt 42636302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 129 - 274
Target Start/End: Original strand, 7586489 - 7586634
Alignment:
Q  129 tcacaggggctgtgactgaccataggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtg 228  Q
    ||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||  ||    
T  7586489 tcacaggggttgtgattgactgtaggatagtgagatgggatcttagatctaggagtttctaggttgaagtctagacgggtaggtcctaggtcttaagttg 7586588  T
Q  229 taaacgaggagtttgctgagagcttttgaataaggactacactagt 274  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  7586589 taaacgaggattttgctgagaagtttagaataaggactacactagt 7586634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 157 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 7620251 - 7620062
Alignment:
Q  157 agtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctag-acaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagctttt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || |||| ||| |||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||| ||    
T  7620251 agtgagatgggatctcagatctaggagttcctaggttgaagt-tagtacgggtaagtcctaggtcatta-gtgcaaacgaggattttgctgagagctatt 7620154  T
Q  256 gaataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttgcaccgaactgagttaacaaactcactgtg 354  Q
    |||||||||||||||       |||||||||| ||||||| ||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7620153 gaataaggactacac-------tagtggatttccttcctgacttggtagcctccaaagtaggtgacgttgcaccgaactgggttaacaaactcactgtg 7620062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 157 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 11628811 - 11628621
Alignment:
Q  157 agtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttg 256  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||   || |||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| |||    
T  11628811 agtgaggtgggatcttcgatctaggagttcctaggctgaagtcagtacgggtaggtcctaggtcatatagtgcaaacgaggagtttgctaagagctattg 11628712  T
Q  257 aataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttgcaccgaactgagttaacaaactcactgtg 354  Q
    |||||||||||||  ||     ||||||||| |||||| | |||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11628711 aataaggactaca--ag-----agtggatttccttcctagtttggtaacccccaaagtaggtgacgttgcaccgaactgggttaacaaactcactgtg 11628621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 157 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 9564426 - 9564225
Alignment:
Q  157 agtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttg 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||| |||||| |   |||||||||||||||||||||||||||   |    
T  9564426 agtgagatgggatctcagatctaggagttcctaggttgaagtcaaggcgggtaggtcctaggtc-ttttgtgtaaacgaggagtttgctgagagctagag 9564328  T
Q  257 aataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttgcaccgaactgagttaacaaactcactgtgtt 356  Q
    ||||||||||||       |||| |||| |||| ||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||      
T  9564327 aataaggactac-------actattgga-tttcctcctggctttgtagcccccagagtaggtgacgttgcaccgaactgggttaacaaactctctgtgcc 9564236  T
Q  357 ctttactttct 367  Q
     ||||||||||    
T  9564235 ttttactttct 9564225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 129 - 274
Target Start/End: Original strand, 10038687 - 10038832
Alignment:
Q  129 tcacaggggctgtgactgaccataggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtg 228  Q
    ||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  | ||||| |||||| |||  ||    
T  10038687 tcacaggggctgtgattgattgtaggatagtgagatgggatctcagatctaggagttcttaggttgaagtctagacgagcaggtcctaggtcttaagttg 10038786  T
Q  229 taaacgaggagtttgctgagagcttttgaataaggactacactagt 274  Q
    ||||||| |||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||    
T  10038787 taaacgaagagtttgccgagaactttagaataaggactacactagt 10038832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 151 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 23957054 - 23956845
Alignment:
Q  151 taggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaag-tgtaaacgaggagtttgctgaga 249  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| |||||||| |  |||||||||||    
T  23957054 taggatagggagatgagatctcagatctaggagttcctaggttgaagtctagacgggtaggtcctaggtcttaaagttgtaaacgtg--gtttgctgaga 23956957  T
Q  250 gcttttgaataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttg-caccgaactgagttaacaaactc 348  Q
     |||| |||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||| || | | ||||||||   ||| |||||||||  || |||||||||    
T  23956956 actttagaataaggactac-------actagtggattttcttcctggcttggtagcctctaaagtagatgtgtttgtcaccgaactaggtcaacaaactc 23956864  T
Q  349 actgtgttctttactttct 367  Q
     |||||   ||||||||||    
T  23956863 tctgtgccttttactttct 23956845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 157 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 9567075 - 9566874
Alignment:
Q  157 agtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttg 256  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| || |||  |||||||| |||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||   |    
T  9567075 agtgagatgggatctcagatctatgagttcctaggttgaactcaagatgggtaggtcctaggtc-tttagtgtaaatgaggagtttgctgagagctagag 9566977  T
Q  257 aataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttgcaccgaactgagttaacaaactcactgtgtt 356  Q
    ||||||||||||       ||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||  ||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  9566976 aataaggactac-------acttgtgga-tttcctcctggcttggtagccccctgagtaggtaacgttgcaccgaactgggttaacaaactctctgtgct 9566885  T
Q  357 ctttactttct 367  Q
     ||||||||||    
T  9566884 ttttactttct 9566874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 158 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 14984841 - 14984659
Alignment:
Q  158 gtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttga 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||   || |||||||  |||||||| | ||| ||||  |||||||| |||||| | ||||    
T  14984841 gtgagatgggatctcagatctaggaattcctaggttgaagtcagtacgggtaggttctaggtcatta-gtgcaaacagggagtttgttgagagatattga 14984743  T
Q  258 ataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttgcaccgaactgagttaacaaactc 348  Q
    |||||||||||||||||       |||||| |||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14984742 ataaggactacactagt-------ggatttccttcctggcttgatagcccccagagtaggtgacgttgcaccgaactgggttaacaaactc 14984659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 158 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 15414452 - 15414270
Alignment:
Q  158 gtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttga 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||   || |||||||  |||||||| | ||| ||||  |||||||| |||||| | ||||    
T  15414452 gtgagatgggatctcagatctaggaattcctaggttgaagtcagtacgggtaggttctaggtcatta-gtgcaaacagggagtttgttgagagatattga 15414354  T
Q  258 ataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttgcaccgaactgagttaacaaactc 348  Q
    |||||||||||||||||       |||||| |||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15414353 ataaggactacactagt-------ggatttccttcctggcttgatagcccccagagtaggtgacgttgcaccgaactgggttaacaaactc 15414270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 157 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 14975603 - 14975423
Alignment:
Q  157 agtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttg 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   || |||||||| ||||||||  |||| ||||||| |||||| |||||||| |||    
T  14975603 agtgagatgggatctcagatctaggagttcctaggttgaagtcagtacgggtaggtcctaggtcat-tagtgcaaacgagaagtttgttgagagctattg 14975505  T
Q  257 aataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttgcaccgaactgagttaacaaa 345  Q
    |||||||| ||||||||||       |||||  |||||||| ||||  |||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  14975504 aataaggaatacactagta-------gatttcgttcctggcatggttgcccccggagtaggtgacgttgcaccgaactgggttaacaaa 14975423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 157 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 15405079 - 15404899
Alignment:
Q  157 agtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttg 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   || |||||||| ||||||||  |||| ||||||| |||||| |||||||| |||    
T  15405079 agtgagatgggatctcagatctaggagttcctaggttgaagtcagtacgggtaggtcctaggtcat-tagtgcaaacgagaagtttgttgagagctattg 15404981  T
Q  257 aataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttgcaccgaactgagttaacaaa 345  Q
    |||||||| ||||||||||       |||||  |||||||| ||||  |||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  15404980 aataaggaatacactagta-------gatttcgttcctggcatggttgcccccggagtaggtgacgttgcaccgaactgggttaacaaa 15404899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 73 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 14926902 - 14926701
Alignment:
Q  73 tagttgtttgtttgaaggtaacttcaatttttgtcttt--ttgtttaggtctgataggtcacaggggctgtgactgaccataggatagtgagatgggatc 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||   ||||||| || |||||  ||||||||| ||||| |||   |||||||||||||||  |||    
T  14926902 tagttgtttgtttgaaggtaacttca-tcattgttttgagttgtttaagtatgataa-tcacaggggttgtgattgattgtaggatagtgagatgaaatc 14926805  T
Q  171 tcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttgaataaggactacac 270  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||| || | || |||||||| |||||| | |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14926804 tcatatctagaagtttctaggttgaaatcaatacgggtaggtcctaggtctttac-tgtaaacgaggagtttgctgagagctattgaataaggactacac 14926706  T
Q  271 tagta 275  Q
    |||||    
T  14926705 tagta 14926701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 73 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 15350368 - 15350167
Alignment:
Q  73 tagttgtttgtttgaaggtaacttcaatttttgtcttt--ttgtttaggtctgataggtcacaggggctgtgactgaccataggatagtgagatgggatc 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||   ||||||| || |||||  ||||||||| ||||| |||   |||||||||||||||  |||    
T  15350368 tagttgtttgtttgaaggtaacttca-tcattgttttgagttgtttaagtatgataa-tcacaggggttgtgattgattgtaggatagtgagatgaaatc 15350271  T
Q  171 tcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttgaataaggactacac 270  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||| || | || |||||||| |||||| | |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15350270 tcatatctagaagtttctaggttgaaatcaatacgggtaggtcctaggtctttac-tgtaaacgaggagtttgctgagagctattgaataaggactacac 15350172  T
Q  271 tagta 275  Q
    |||||    
T  15350171 tagta 15350167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 145 - 274
Target Start/End: Original strand, 20925077 - 20925205
Alignment:
Q  145 tgaccataggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgc 244  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||     
T  20925077 tgactataggaaagtgagatgggatctcaaatttaggagttcctaagttgaagtctagacaggtaggtcttaggtc-tttagtgtaaacgaggagtttgt 20925175  T
Q  245 tgagagcttttgaataaggactacactagt 274  Q
    |||||||| | |||||||||| | ||||||    
T  20925176 tgagagctatagaataaggacgaaactagt 20925205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 151 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 24902282 - 24902161
Alignment:
Q  151 taggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagag 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||  |||||||| |  |||| ||||||     
T  24902282 taggatagtgagatgggatctcagatctaggagttcctaggttgaagtctagacgggtaggtcctaggtcttaagttgtaaacgtg--gtttactgagaa 24902185  T
Q  251 cttttgaataaggactacactagt 274  Q
    ||||  ||||||||||||||||||    
T  24902184 ctttataataaggactacactagt 24902161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 157 - 367
Target Start/End: Original strand, 4794574 - 4794778
Alignment:
Q  157 agtgagatgggatctcagatctaggagtttct---aggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagctt 253  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||   ||||||||||| |||| |||||||| |||||| | | ||||||||||||||||| | |||||||     
T  4794574 agtgagatgcgatctcagatctaggagttcctcctaggttgaagtcaagacgggtaggtcctaggtcttta-gtgtaaacgaggagttttccgagagcta 4794672  T
Q  254 ttgaataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttgcaccgaactgagttaacaaactcactgt 353  Q
      |||||||||||||       ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||    
T  4794673 gagaataaggactac-------actagtgga-tttcctcctggcttggtagcccccagagtaggtgacgttgcactgaactgggttaaaaaactctctgt 4794764  T
Q  354 gttctttactttct 367  Q
    | | |||| |||||    
T  4794765 gctttttaatttct 4794778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 73 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 10280065 - 10279872
Alignment:
Q  73 tagttgtttgtttgaaggtaacttcaatttttgtctttttgtttaggtctgataggtcacaggggctgtgactgaccataggatagtgagatgggatctc 172  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||   | ||| ||| |||||  ||||||||| |||||||| ||| || |||| || ||||| ||||||| ||||||    
T  10280065 tagttgtctgtttgaaggtaacttca---tctgtgtttgtgttttagtctgatagatcacaggg-ctgggattgactatgggataatgagatgagatctc 10279970  T
Q  173 agatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttgaataaggactacact 271  Q
    ||||||| ||||| |||||||||| || | || | |||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  10279969 agatctacgagttcctaggttgaaatcaatacggataggtcctaggt-atttagtgcaaacgaggagtttgctgagagctatagaataaggactacact 10279872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 151 - 367
Target Start/End: Original strand, 26132897 - 26133105
Alignment:
Q  151 taggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagag 250  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| || | || ||||||||||||||| |    |||||| | |  |||||||||||     
T  26132897 taggatagtgagatgagatctcagatctaggagttcctaggttgaaatcaatacgggtaggtcttaggtcttgtgttgtaaatgtg--gtttgctgagaa 26132994  T
Q  251 cttttgaataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttg-caccgaactgagttaacaaactca 349  Q
    | || |||||||||||||       |||||||||||| |||||||||||| || |||||| ||||| || | ||| |||||||||| |||||||||||||    
T  26132995 cattagaataaggactac-------actagtggatttccttcctggcttgatagcccccagagtaggtgtctttgtcaccgaactgggttaacaaactca 26133087  T
Q  350 ctgtgttctttactttct 367  Q
     |||||  ||||||||||    
T  26133088 ttgtgtcttttactttct 26133105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 157 - 354
Target Start/End: Original strand, 11560493 - 11560682
Alignment:
Q  157 agtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttg 256  Q
    ||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| | || |||||||  |||||| |  |||||||| ||||||||| ||||||||| |||    
T  11560493 agtgagatgagatatcagatccaggagttcctaggttgaagtcaatacgggtaggttgtaggtc-tttagtgtaaatgaggagtttactgagagctattg 11560591  T
Q  257 aataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttgcaccgaactgagttaacaaactcactgtg 354  Q
    |||||| |||||       | ||| |||||| |||||| |||||||| |||||| ||||| ||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11560592 aataagcactac-------aatagcggatttccttcctagcttggtagcccccagagtaggtgacagtgcaccgaactgggttaacaaactcactgtg 11560682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 157 - 274
Target Start/End: Original strand, 9894054 - 9894170
Alignment:
Q  157 agtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttg 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||| ||| |||||| |||  |||||||  ||| |||||||||| | || |    
T  9894054 agtgagatgggatctcagatctaggagttcctaggttgaagtcaatacgggtatgtcctaggtcttaagttgtaaacttggaatttgctgagaac-ttag 9894152  T
Q  257 aataaggactacactagt 274  Q
    ||||||||||||||||||    
T  9894153 aataaggactacactagt 9894170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 157 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 24814096 - 24813914
Alignment:
Q  157 agtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaag-tgtaaacgaggagtttgctgagagctttt 255  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  | || |||||||| |||||| || || | ||||| || |||||||||||||| ||     
T  24814096 agtgagataggatctcagatctaggagttcctaggttgaagttgatacgggtaggtcctaggtc-tagagttttaaactagtagtttgctgagagc-tta 24813999  T
Q  256 gaataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccata-gtagatgacgttgcaccgaactgagttaacaaac 346  Q
     ||||||||||||       |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||| | | |||||||||||||| ||||||||||    
T  24813998 caataaggactac-------actagtggatttccttcctggcttggtagcccccctatgtaggtcatgttgcaccgaactgggttaacaaac 24813914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 151 - 274
Target Start/End: Original strand, 23082756 - 23082877
Alignment:
Q  151 taggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagag 250  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||| || || ||| |||  |||||||| |  |||||||||||     
T  23082756 taggacagtgacatgggatctcagatctatgagttcctaggttgaagtctagacggctagatcctacgtcttaagttgtaaacgtg--gtttgctgagaa 23082853  T
Q  251 cttttgaataaggactacactagt 274  Q
    |||| |||||||||||||||||||    
T  23082854 ctttagaataaggactacactagt 23082877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 159 - 346
Target Start/End: Original strand, 23174870 - 23175050
Alignment:
Q  159 tgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagt-gtaaacgaggagtttgctgagagcttttga 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | || |||| ||| |||||| || ||| |||||||||   |||||||| | |||  ||    
T  23174870 tgagatgggatctcagatctaggagttcctatgttgaagtcaatacgggtaagtcctaggtc-tagagttgtaaacgagagatttgctgataactta-ga 23174967  T
Q  258 ataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccata-gtagatgacgttgcaccgaactgagttaacaaac 346  Q
    |||||||||||||||       |||||||| ||||||||||||||| |||| | | |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  23174968 ataaggactacacta-------gtggatttccttcctggcttggtagcccctagatgtaggtgatgttgcaccgaactgggttaacaaac 23175050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 157 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 23296674 - 23296611
Alignment:
Q  157 agtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtc 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||    
T  23296674 agtgagatgggatctcagatctaggagttcctaggttgaagtcaagacgggtaggtcctaggtc 23296611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 157 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 15708342 - 15708226
Alignment:
Q  157 agtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaag-tgtaaacgaggagtttgctgagagctttt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | || |||||||| |||||| || || |||||||||||||||| |||| | | ||     
T  15708342 agtgagatgggatctcagatctaggagttcctaggttcaagtcaatacgggtaggtcgtaggtc-tagagttgtaaacgaggagttttctgaaaac-tta 15708245  T
Q  256 gaataaggactacactagt 274  Q
     ||||||||||||||||||    
T  15708244 aaataaggactacactagt 15708226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 276 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 2076565 - 2076496
Alignment:
Q  276 actagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttgcaccgaactgagttaacaaa 345  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  2076565 actagtggatttccttcatggcttggtagcccccagagtaggtgacgttgcaccgaactgggttaacaaa 2076496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 276 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 2082984 - 2082915
Alignment:
Q  276 actagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttgcaccgaactgagttaacaaa 345  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  2082984 actagtggatttccttcatggcttggtagcccccagagtaggtgacgttgcaccgaactgggttaacaaa 2082915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 203 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 10658508 - 10658438
Alignment:
Q  203 acaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttgaataaggactacactagt 274  Q
    ||||||||||| |||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  10658508 acaggtaggtcctaggtcttta-gtgtaaacgaggagtttgctgagagctatagaataaggactacactagt 10658438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 157 - 316
Target Start/End: Original strand, 23579941 - 23580092
Alignment:
Q  157 agtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaag-tgtaaacgaggagtttgctgagagctttt 255  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||| || |||| |||||||| |||||  || || ||||||||||||||||||||| | | ||     
T  23579941 agtgagatgagatcccagatctaggagttcttaggttgaattcaagacgggtaggtcctaggt-ttatagttgtaaacgaggagtttgctgaaaac-tta 23580038  T
Q  256 gaataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtag 316  Q
     |||||||||||||||||||       ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||    
T  23580039 aaataaggactacactagta-------gatttccttcttggcttggtaacccccatagtag 23580092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 346
Target Start/End: Original strand, 26195445 - 26195626
Alignment:
Q  157 agtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaag-tgtaaacgaggagtttgctgagagctttt 255  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||| |  | ||||||||||| |||||| || || |||||||||||| |||||||||| | ||     
T  26195445 agtgagatggaatctcagatttaggagttcctaggttgaatttaatacaggtaggtcctaggtc-tagagttgtaaacgaggaatttgctgagaac-tta 26195542  T
Q  256 gaataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccata-gtagatgacgttgcaccgaactgagttaacaaac 346  Q
    ||||||||| |||       | ||||| ||||||||| |||||||||| || ||| | |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  26195543 gaataaggaatac-------agtagtgaattttcttcttggcttggtagcctccagatgtaggtga-gttgcaccgaactgggttaacaaac 26195626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 157 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 7508605 - 7508563
Alignment:
Q  157 agtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtc 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7508605 agtgagatgggatctcagatctaggagttcctaggttgaagtc 7508563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 403 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 12325754 - 12325688
Alignment:
Q  403 tgatgttggaacattgaacataacatcgcaaacgttaaaacatcatacaaaacgtattaaaacaagt 469  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  12325754 tgatgttggaacattgaacggaacattgcaaatgttaaaacatcatacagaacatcttaaaacaagt 12325688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 157 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 10251611 - 10251496
Alignment:
Q  157 agtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaag-tgtaaacgaggagtttgctgagagctttt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| | || |||||||| |||||| || || ||||| |  |||||||||||||| | ||     
T  10251611 agtgagatgggatctcagatctaagagttcttatgttgaagtcaatacgggtaggtcctaggtc-tagagttgtaagcttggagtttgctgagaac-tta 10251514  T
Q  256 gaataaggactacactag 273  Q
    ||||||||||||||||||    
T  10251513 gaataaggactacactag 10251496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 9567217 - 9567133
Alignment:
Q  15 ctgtgaagcaaggagctaggtagattttgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgcta-gttgtttgtttgaaggtaacttca 98  Q
    |||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||| || |||| || || |||||||||||| ||||||||    
T  9567217 ctgtgaagcatggagataggtagtttgtgtactacaccaaagctgtgaagcacggtgttaggtagtttgtttgaagttaacttca 9567133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 19353301 - 19353209
Alignment:
Q  157 agtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgaga 249  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||  | || |||||||||| ||| ||||  ||| |||  ||||||||||||||    
T  19353301 agtgagatggaatctcagatctaggagttcctcggttgaagtgaatacgggtaggtctttggttataagttgtgaacttggagtttgctgaga 19353209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 16 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 9564567 - 9564484
Alignment:
Q  16 tgtgaagcaaggagctaggtagattttgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgcta-gttgtttgtttgaaggtaacttca 98  Q
    ||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||| || | || || || |||||||||||||||||||||    
T  9564567 tgtgaagcacggagataggtagtttgtgtactacaccaaagctgtgaagcacgatgttaggtagtttgtttgaaggtaacttca 9564484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 14687538 - 14687496
Alignment:
Q  157 agtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtc 199  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14687538 agtgagatggaatctcagatctaggagttcctaggttgaagtc 14687496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 24049621 - 24049579
Alignment:
Q  157 agtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtc 199  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24049621 agtgagatgtgatctcagatctaggagttcctaggttgaagtc 24049579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 158 - 199
Target Start/End: Original strand, 11406938 - 11406979
Alignment:
Q  158 gtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtc 199  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11406938 gtgagatggaatctcagatctaggagttcctaggttgaagtc 11406979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 157 - 198
Target Start/End: Original strand, 20596812 - 20596853
Alignment:
Q  157 agtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagt 198  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20596812 agtgatatgggatctcagatctaggagttcctaggttgaagt 20596853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 98
Target Start/End: Original strand, 4547657 - 4547741
Alignment:
Q  15 ctgtgaagcaaggagctaggtagattttgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgcta-gttgtttgtttgaaggtaacttca 98  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| || || | ||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  4547657 ctgtgtagcaatgagctaggtatattgtgtactacaccaaagctgtaaagcacgatgctatgtagtttgtttcaaggtaacttca 4547741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 198
Target Start/End: Original strand, 4547800 - 4547839
Alignment:
Q  159 tgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  4547800 tgagatgggatctcagatctaggagttcttaggttgaagt 4547839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 196
Target Start/End: Original strand, 31269044 - 31269083
Alignment:
Q  157 agtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaa 196  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31269044 agtgagatgagatctcagatctaggagttcctaggttgaa 31269083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 152 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 6045494 - 6045448
Alignment:
Q  152 aggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagt 198  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  6045494 aggaaagtgagatgagatcttagatctacgagtttctaggttgaagt 6045448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 387 - 469
Target Start/End: Original strand, 11521623 - 11521705
Alignment:
Q  387 atttctgtttatcgcgtgatgttggaacattgaacataacatcgcaaacgttaaaacatcatacaaaacgtattaaaacaagt 469  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| |||||| | | |||||| ||||||| |  ||||||||| | ||| |||||||||||||    
T  11521623 atttcagtttatcacgtgatgttgaaacattaatcgtaacattgcaaacgctgtaacatcatatataacttattaaaacaagt 11521705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 387 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 11588409 - 11588327
Alignment:
Q  387 atttctgtttatcgcgtgatgttggaacattgaacataacatcgcaaacgttaaaacatcatacaaaacgtattaaaacaagt 469  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||| | | |||||| ||||||||   ||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  11588409 atttctgtttgttgcatgatgttgaaacattaatcgtaacattgcaaacgtcgtaacatcatacataacatattaaaacaagt 11588327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 198
Target Start/End: Original strand, 20588695 - 20588736
Alignment:
Q  157 agtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagt 198  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  20588695 agtgagatgagatctcagatctaggagttcttaggttgaagt 20588736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 227 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 21260617 - 21260572
Alignment:
Q  227 tgtaaacgaggagtttgctgagagcttttgaataaggactacacta 272  Q
    |||||||||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  21260617 tgtaaacgagtagtttgttgagaactttagaataaggactacacta 21260572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 276 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 6045380 - 6045348
Alignment:
Q  276 actagtggattttcttcctggcttggtatcccc 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6045380 actagtggattttcttcctggcttggtagcccc 6045348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 387 - 467
Target Start/End: Original strand, 29546344 - 29546423
Alignment:
Q  387 atttctgtttatcgcgtgatgttggaacattgaacataacatcgcaaacgttaaaacatcatacaaaacgtattaaaacaa 467  Q
    ||||||||||||   ||||||||||||||||||||  |||||   ||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  29546344 atttctgtttattttgtgatgttggaacattgaacggaacattataaacgttgaaacatcttac-aaacatattaaaacaa 29546423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0226 (Bit Score: 173; Significance: 8e-93; HSPs: 3)
Name: scaffold0226
Description:

Target: scaffold0226; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 42 - 469
Target Start/End: Original strand, 7413 - 7836
Alignment:
Q  42 tgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagttgtttgtttgaaggtaacttcaatttttgtctttttgtttaggtctgataggtcacaggggctgt 141  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7413 tgtactacaccgaagttgttaaacaaggtgttagttgtttgtttgaaggtaacttcaacttttgagtttgtgtttaggtctgataggtcacaggggttgt 7512  T
Q  142 gactgaccataggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtt 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |  |||||||| ||||||||    
T  7513 gactgaccataggatagtgagatgggatctcagatctaggagttcctaggttgaagtctatatgggtaggtcctaggtc-tttagtgtaaatgaggagtt 7611  T
Q  242 tgctgagagcttttgaataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttg-caccgaactgagtta 340  Q
    || |||||||| | |||||||||||||       ||||||| |||| ||||||||||||||| |||| | ||||  ||   ||| |||||||||  || |    
T  7612 tgttgagagctatagaataaggactac-------actagtgaatttccttcctggcttggtagcccctagagtaagtgtgtttgtcaccgaactaggtca 7704  T
Q  341 acaaactcactgtgttctttactttc---tcatttannnnnnnnnnnnnatttctgtttatcgcgtgatgttggaacattgaacataacatcgcaaacgt 437  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   | |||||             ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  7705 acaaactcactgtgttctttactttcttgtaatttattttcttgtttttatttctgtttatctcgtgatattggaacattgaacatgacattgcaaacgt 7804  T
Q  438 taaaacatcatacaaaacgtattaaaacaagt 469  Q
    |||| |||| |||| ||| |||||||||||||    
T  7805 taaatcatcttacagaacatattaaaacaagt 7836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0226; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 42 - 469
Target Start/End: Original strand, 18000 - 18421
Alignment:
Q  42 tgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagttgtttgtttgaaggtaacttcaatttttgtctttttgtttaggtctgataggtcacaggggctgt 141  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  18000 tgtactacaccgaagttgtgaaacaaggtgttagttgtttgtttgaaggtaacttcaacttttgagtttgtgtttagttctgataggtcacaggggttgt 18099  T
Q  142 gactgaccataggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtt 241  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| || ||| |  ||||||| |||||||||    
T  18100 gactgaccataagatagtgtgatgggatctcagatctaggagttcctaggttgaagtctatacgggtaggtccta-gtc-tttagtgtaatcgaggagtt 18197  T
Q  242 tgctgagagcttttgaataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggta-tcccccatagtagatgacgttg-caccgaactgagtt 339  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||       |||||||||||| |||| |||||| |||  |||||| ||||| ||   ||| |||||||||  ||     
T  18198 tgctgagagctatagaataaggactac-------actagtggatttccttcttggcttcgtagccccccagagtaggtgtgtttgtcaccgaactaggtc 18290  T
Q  340 aacaaactcactgtgttctttactttc---tcatttannnnnnnnnnnnnatttctgtttatcgcgtgatgttggaacattgaacataacatcgcaaacg 436  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||   |||||||             |||| |||||||  |||||||||||||| ||||||   |||| |||||||    
T  18291 aacaaactcactatgttctttactttcttgtcatttattttcttgtttttatttttgtttat--cgtgatgttggaacgttgaacgggacattgcaaacg 18388  T
Q  437 ttaaaacatcatacaaaacgtattaaaacaagt 469  Q
    |||||||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  18389 ttaaaacatcttacagaacatattaaaacaagt 18421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0226; HSP #3
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 42 - 469
Target Start/End: Original strand, 27394 - 27815
Alignment:
Q  42 tgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagttgtttgtttgaaggtaacttcaatttttgtctttttgtttaggtctgataggtcacaggggctgt 141  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  27394 tgtactacaccgaagttgtgaaacaaggtgttagttgtttgtttgaaggtaacttcaacttttgagtttgtgtttagttctgataggtcacaggggttgt 27493  T
Q  142 gactgaccataggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtt 241  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| || ||| |  ||||||| |||||||||    
T  27494 gactgaccataagatagtgtgatgggatctcagatctaggagttcctaggttgaagtctatacgggtaggtccta-gtc-tttagtgtaatcgaggagtt 27591  T
Q  242 tgctgagagcttttgaataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggta-tcccccatagtagatgacgttg-caccgaactgagtt 339  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||       |||||||||||| |||| |||||| |||  |||||| ||||| ||   ||| |||||||||  ||     
T  27592 tgctgagagctatagaataaggactac-------actagtggatttccttcttggcttcgtagccccccagagtaggtgtgtttgtcaccgaactaggtc 27684  T
Q  340 aacaaactcactgtgttctttactttc---tcatttannnnnnnnnnnnnatttctgtttatcgcgtgatgttggaacattgaacataacatcgcaaacg 436  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||   |||||||             |||| |||||||  |||||||||||||| ||||||   |||| |||||||    
T  27685 aacaaactcactatgttctttactttcttgtcatttattttcttgtttttatttttgtttat--cgtgatgttggaacgttgaacgggacattgcaaacg 27782  T
Q  437 ttaaaacatcatacaaaacgtattaaaacaagt 469  Q
    |||||||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  27783 ttaaaacatcttacagaacatattaaaacaagt 27815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 164; Significance: 2e-87; HSPs: 39)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 40 - 469
Target Start/End: Original strand, 22404631 - 22405058
Alignment:
Q  40 tttgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagttgtttgttt--gaaggtaacttcaatttttgtctttttgtttaggtctgataggtcacagggg 137  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |  |||||||||||| || |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22404631 tttgtactaaaccaaagttgtgaaacacggtgctagttttttgtgttggaaggtaacttctatctttgt--tttggtttaggtctgataggtcacagggg 22404728  T
Q  138 ctgtgactgaccat-aggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgag 236  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  22404729 ctgtgactgaccattaggatagtgagatgggatctcagatctaggagttcctaggttgaagtctatacgggtaggtcctaggtcatatagtgtaaacgag 22404828  T
Q  237 gagtttgctgagagcttttgaataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttg-caccgaactg 335  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||        |||||||||||| ||||||||||||||| |||| | || || ||   ||| ||||||||||    
T  22404829 gagtttgctgagagctattgaataaggacta-------tactagtggatttccttcctggcttggtagcccctagagcaggtgtgtttgtcaccgaactg 22404921  T
Q  336 agttaacaaactcactgtgttctttactttc---tcatttannnnnnnnnnnnnatttctgtttatcgcgtgatgttggaacattgaacataacatcgca 432  Q
     || |||||||||| |||||| |||||||||   |||||||              |||||||||||||| |||||||| |||||| | | |||||| |||    
T  22404922 ggtcaacaaactcattgtgttatttactttcctttcatttattttcttgtttttgtttctgtttatcgcatgatgttgaaacattaatcgtaacattgca 22405021  T
Q  433 aacgttaaaacatcatacaaaacgtattaaaacaagt 469  Q
    || | | |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  22405022 aatgctgaaacatcatacataacctattaaaacaagt 22405058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 116 - 348
Target Start/End: Original strand, 20845740 - 20845966
Alignment:
Q  116 taggtctgataggtcacaggggct-gtgactgaccataggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtct 214  Q
    |||||||||||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||     
T  20845740 taggtctgatagatcacagggggttgtgactcaccataggatagtgagataagatctcagatctaggagttcctaggttgaagtctagacgggtaggtcc 20845839  T
Q  215 taggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttgaataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagt 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||       |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||    
T  20845840 taggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagattttgaataaggactac-------actagtggatttccttcctgacttggtagcccccatagt 20845932  T
Q  315 agatgacgttgcaccgaactgagttaacaaactc 348  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20845933 aggtgacgttgcaccgaactgggttaacaaactc 20845966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 40 - 274
Target Start/End: Original strand, 23420431 - 23420666
Alignment:
Q  40 tttgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagttgtttgttt--gaaggtaacttcaatttttgtctttttgtttaggtctgataggtcacagggg 137  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||| |  |||||||||||| | ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23420431 tttgtactacaccgaagttgtgaaacaatatgttagttgtttgtgttggaaggtaacttctacttt-gt-tgtttgtttaggtctgataggtcacagggg 23420528  T
Q  138 ctgtgactgaccat-aggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgag 236  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||| |||    
T  23420529 ctgtgactgaccattaggatagtgagatgggatctcagatctaacagttcctaggttgaagtctatacgggtaggtcctaggtcatatagtgtaaatgag 23420628  T
Q  237 gagtttgctgagagcttttgaataaggactacactagt 274  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23420629 gagtttgctgagagctattgaataaggactacactagt 23420666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 40 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 24190151 - 24189831
Alignment:
Q  40 tttgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagttgtttgttt--gaaggtaacttcaatttttgtctttttgtttaggtctgataggtcacagggg 137  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||| |||||    |||| ||||||||||||||||||||  |||    
T  24190151 tttgtactacaccgaatttatgaaacaaggttttagttgtttgtgttggaaggtaacttctattttg---ttttggtttaggtctgataggtcactaggg 24190055  T
Q  138 ctgtgactgaccat-aggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgag 236  Q
    | ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  24190054 cagtgactgactattaggatagtgagatgggatctcagatctatgagttcctaggttgaagtctatacgggtaggtcctaggtcatatagtgtaaacgag 24189955  T
Q  237 gagtttgctgagagcttttgaataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttg-caccgaactg 335  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||       ||||| |||| ||||| ||||||||| |||||| ||||  ||   ||| |||||||||     
T  24189954 gagtttgctgagagctattgaataaagactacac-------tagtgaatttccttcccggcttggtagcccccagagtatgtgtgtttgtcaccgaacta 24189862  T
Q  336 agttaacaaactcactgtgttctttactttc 366  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||    
T  24189861 ggtcaacaaactcactgtgttctttactttc 24189831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 40 - 274
Target Start/End: Original strand, 22246222 - 22246456
Alignment:
Q  40 tttgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagttgtttgttt--gaaggtaacttcaatttttgtctttttgtttaggtctgataggtcacagggg 137  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||| ||| ||   |||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  22246222 tttgtactacactgaagttatgaaacaaggtgttagttgtttgtgttggaaggtaacttctattctt---ttttggtttaggtctgataggtcactgggg 22246318  T
Q  138 ctgtgactgaccat-aggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgag 236  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||||| | ||||||||||||    
T  22246319 cagtgactgaccattaggatagtgagatgtgatctatgatctaggagttcctaggttgaagtctatacgggtaggtcctaggtcaaatagtgtaaacgag 22246418  T
Q  237 gagtttgctgagagcttttgaataaggactacactagt 274  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22246419 gagtttgctgagagctattgaataaggactacactagt 22246456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 40 - 274
Target Start/End: Original strand, 22251912 - 22252146
Alignment:
Q  40 tttgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagttgtttgttt--gaaggtaacttcaatttttgtctttttgtttaggtctgataggtcacagggg 137  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||| ||| |    |||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  22251912 tttgtactacaccgaagttatgaaacaaggtgttagttgtttgtgttggaaggtaacttctattctg---ttttggtttaggtctgataggtcactgggg 22252008  T
Q  138 ctgtgactgaccat-aggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgag 236  Q
    | |||||||||||| |||||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||| |||    
T  22252009 cagtgactgaccattaggataatgagataggatctaagatctaggagttcctaggttgaagtctatacgggtaggtcctaggtcatatagtgtaaatgag 22252108  T
Q  237 gagtttgctgagagcttttgaataaggactacactagt 274  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22252109 gagtttgttgagagctattgaataaggactacactagt 22252146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 150 - 366
Target Start/End: Original strand, 13734954 - 13735164
Alignment:
Q  150 ataggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgaga 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13734954 ataggatagtgagatgggatctcagatctaggagttcctaggttgaagtctagacgggtaggtcctaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgaga 13735053  T
Q  250 gcttttgaataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttg-caccgaactgagttaacaaactc 348  Q
    |||||||||||||||||||       |||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||| ||   ||| ||||||| || || |||||||||    
T  13735054 gcttttgaataaggactac-------actaatggatttccttcctgacttggtaacccccagagtaggtgtgtttgtcaccgaagtgggtcaacaaactc 13735146  T
Q  349 actgtgttctttactttc 366  Q
    |||||||  |||||||||    
T  13735147 actgtgtcttttactttc 13735164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 42 - 367
Target Start/End: Original strand, 30605565 - 30605882
Alignment:
Q  42 tgtactacaccaaag-ttgtgaaacaaggtgctagttgtttgtttgaaggtaacttcaatttttgtctttttgtttaggtctgataggtcacaggggctg 140  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||   || || | | | |||||||||||||||||||| ||| ||    
T  30605565 tgtactacaccaaagcttgt-aagcaaggtgttagttgtatgtttgaaggtaacttcaccgttagtttgtgt-tttaggtctgataggtcacatgggttg 30605662  T
Q  141 tgactgaccataggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagt 240  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| || | |  |||||||| |||||| |  ||||||||||||||||    
T  30605663 tgattgaccataggatagtgagatgagatctcagatctaggagttcctagattgaaatcaatatgggtaggtcctaggtc-tttagtgtaaacgaggagt 30605761  T
Q  241 ttgctgagagcttttgaataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttg-caccgaactgagtt 339  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| |       |||||||||||| |||||||| |||||| |||||| ||||| ||   ||| |||||||||| ||     
T  30605762 ttgctgagagctatagaataaggactgc-------actagtggatttccttcctggattggtagcccccagagtaggtgtgtttgtcaccgaactgggtc 30605854  T
Q  340 aacaaactcactgtgttctttactttct 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30605855 aacaaactcactgtgttctttactttct 30605882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 65 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 26037075 - 26036778
Alignment:
Q  65 caaggtgctagttgtt-tgtttgaaggtaacttcaatttttgtctttttgttta-ggtctgataggtcacaggggctgtgactgaccataggatagtgag 162  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||    || ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  26037075 caaggtgttagttgttgtgtttgaaggtaacttcatctttaagattgttgtttaaggtctaataggtcacaggggctgtgactgaccatatgatagtgaa 26036976  T
Q  163 atgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttgaataag 262  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| || |||||||| |||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||    
T  26036975 atgggatctcagatctacaagttcctaggttgaagtctatacgggtaggtcctaggtc-tttagtgtaaacgatgagtttgctgagagctatagaataag 26036877  T
Q  263 gactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatg-acgttgcaccgaactgagttaacaaactcactgtgttcttta 361  Q
    ||| ||       |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| ||    || |||||||||| || |||||||||||| |||| ||||    
T  26036876 gacaac-------actagtggatttccttcctggcttggtagcccccagagtaggtgtgttttccaccgaactgggtcaacaaactcactttgttgttta 26036784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 161 - 354
Target Start/End: Original strand, 17920776 - 17920961
Alignment:
Q  161 agatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttgaata 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   || |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17920776 agatgggatctcagatctaggagttcctaggttgaagtcagtacgggtaggtcctaggtcataa-gtgcaaacgaggagtttgctgagagcttttgaata 17920874  T
Q  261 aggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttgcaccgaactgagttaacaaactcactgtg 354  Q
     |||||||       |||||||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17920875 cggactac-------actagtggatttccttcctggcttggtagcccctagagtaggtgacgttgcaccgaactgggttaacaaactcactgtg 17920961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 157 - 365
Target Start/End: Original strand, 7897903 - 7898103
Alignment:
Q  157 agtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttg 256  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||   || |||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  7897903 agtgagatgggatctcagatctaagagttcctaggttgaagtcagtacgggtaggtcctaggtcatta-gtgcaaacgaggagtttgctgagagctattg 7898001  T
Q  257 aataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttgcaccgaactgagttaacaaactcactgtgtt 356  Q
    ||||||||||||       |||||||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  7898002 aataaggactac-------actagtggatttccttcctggcttggtagcctccagagtaggtgacgttgcaccgaactgggttaacaaactcactgtgtc 7898094  T
Q  357 ctttacttt 365  Q
     ||||||||    
T  7898095 ttttacttt 7898103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 157 - 354
Target Start/End: Original strand, 26183222 - 26183412
Alignment:
Q  157 agtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttg 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   || |||||||  ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |||    
T  26183222 agtgagatgggatctcagatctaggagttcctaggttgaagtcagtacgggtaggttctaggtcatatagtgcaaacgagaagtttgctgagagctattg 26183321  T
Q  257 aataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttgcaccgaactgagttaacaaactcactgtg 354  Q
    ||||||||||||       ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  26183322 aataaggactac-------actagtgtatttccttcctggcttggtagcccccagagtaggtgacgttgcaccgaactgggttaacaaactctctgtg 26183412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 157 - 355
Target Start/End: Original strand, 20498141 - 20498332
Alignment:
Q  157 agtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttg 256  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||   || |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  20498141 agtgagatgagatctcagatctaggagttcctaggttgaagtcagtacgggtaggtcctaggtcatatagtgcaaacgaggagtttgctgagagctattg 20498240  T
Q  257 aataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttgcaccgaactgagttaacaaactcactgtgt 355  Q
    ||||||||||||       || ||||||||| ||||||| ||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  20498241 aataaggactac-------acgagtggatttccttcctgacttggtagcctccagagtaggtgacgttgcaccgaactgggttaacaaattcactgtgt 20498332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 42 - 198
Target Start/End: Original strand, 9422388 - 9422546
Alignment:
Q  42 tgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagttgtttgt--ttgaaggtaacttcaatttttgtctttttgtttaggtctgataggtcacaggggct 139  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||| |||||||| | ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  9422388 tgtactacaccgaagttgtgaaacaaggtgttagttgtttgtgtttgaagctaacttca-tctttgtgttttggtttaggtctaataggtcacaggggct 9422486  T
Q  140 gtgactgaccat-aggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagt 198  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  9422487 atgactgaccattaggatagtgagatgggatctcagatctaggagttcataggttgaagt 9422546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 73 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 13338843 - 13338560
Alignment:
Q  73 tagttgtttgtttgaaggtaacttcaatttttgtctttttgtttaggtctgataggtcacaggggctgtgactgaccataggatagtgagatgggatctc 172  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||| | ||| ||||| |||||||  ||||| ||| ||||  ||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  13338843 tagttgtttgtttgaaggtaacttcactgtttgtttattt-tttag-tctgataa-tcacaagggttgtggttgactgtaggatagtgagatgagatctc 13338747  T
Q  173 agatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttgaataaggactacacta 272  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| || | || |||| ||| |||||| | | ||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| |||        
T  13338746 agatctaggagttcctaggtagaaatcaataccggtatgtcctaggtcttta-gtgtaaacgaggagtttgctgagagttatagaataaggattac---- 13338652  T
Q  273 gtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttg-caccgaactgagttaacaaactcactgtgttctttactttct 367  Q
       |||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||  ||   ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13338651 ---actagtggatttccttcctggcttggta-gccccagagtatgtgtgtttgtcaccgaactgggttaacaaactcactgtgttctttactttct 13338560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 129 - 274
Target Start/End: Original strand, 13941957 - 13942102
Alignment:
Q  129 tcacaggggctgtgactgaccataggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtg 228  Q
    ||||||||| ||||| |||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||  |||  ||    
T  13941957 tcacaggggttgtgattgattgtaggataatgagatgggatctcagatctaggagttcctaggttgaagtgtagacgggtaggtcctaggttttaagttg 13942056  T
Q  229 taaacgaggagtttgctgagagcttttgaataaggactacactagt 274  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  13942057 taaacgaggagtttgctgagaactttagaataaggactacactagt 13942102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 157 - 354
Target Start/End: Original strand, 20740925 - 20741114
Alignment:
Q  157 agtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttg 256  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  20740925 agtgagatgagatctcagatctaggagttcctaggttgaagtcaagacggataggtcctaggtc-tttagtgtaaacgaggagtttgctgagagctagag 20741023  T
Q  257 aataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttgcaccgaactgagttaacaaactcactgtg 354  Q
    ||||||||||||       |||||||||||| | |||| |||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||| || ||||||| ||||||||||    
T  20741024 aataaggactac-------actagtggatttccctcctcgcttggtagcccccagagtaggtgacgttgaaccgaattgggttaacagactcactgtg 20741114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 153 - 356
Target Start/End: Original strand, 26329198 - 26329394
Alignment:
Q  153 ggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagct 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | || |||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26329198 ggatagtgagatgggatctcagatctaggagttcctaggttgaaatcaatacgggtaggtcctaggtc-tttagtgtaaacgaggagtttgctgagagct 26329296  T
Q  253 tttgaataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgtt-gcaccgaactgagttaacaaactcact 351  Q
     | |||||||||||||       || ||||||||| ||||||||||||||| | | || ||||| ||   ||  |||||||||| || ||||||||||||    
T  26329297 atagaataaggactac-------accagtggatttccttcctggcttggtagctcacagagtaggtgtgtttatcaccgaactgggtcaacaaactcact 26329389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 41 - 274
Target Start/End: Original strand, 20714613 - 20714841
Alignment:
Q  41 ttgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagttgtttgtttgaaggtaacttcaatttttgtctttttgtttaggtctgataggtcacaggggctg 140  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||||||||||   |||||| |    |||||  |||||||  ||| ||  ||||    
T  20714613 ttgtgctacaccaaagttgttaagcaaggttgtagttgtttgtttgaaggtaacttcttcttttgtgt----gtttaaatctgataa-tcatagaagctg 20714707  T
Q  141 tgactgaccataggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagt 240  Q
    ||| |||   |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||| || | || |||||||| |||||| |    ||||||||||||||    
T  20714708 tgattgattgtaggatagtgagatgaaatctcagatctaggagttcctaggttgaaatcaatacgggtaggtcctaggtcttgtgttgtaaacgaggagt 20714807  T
Q  241 ttgctgagagcttttgaataaggactacactagt 274  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||||||||    
T  20714808 ttgctgagaacattagaataaggactacactagt 20714841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 140 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 18221298 - 18221165
Alignment:
Q  140 gtgactgaccataggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggag 239  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | || ||||| || |||||| |  |||||||||||| ||    
T  18221298 gtgattgactataggatagtgagatgggatctcagatctaggagttcctaggttgaactcaatactggtagctcctaggtc-tttagtgtaaacgagaag 18221200  T
Q  240 tttgctgagagcttttgaataaggactacactagt 274  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  18221199 tttggtgagagctatggaataaggactacactagt 18221165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 157 - 367
Target Start/End: Original strand, 22130837 - 22131024
Alignment:
Q  157 agtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttg 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  22130837 agtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtcc-------taggtcttt--------agtgtaaacgaggagtttgctgagagctagag 22130921  T
Q  257 aataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttgcaccgaactgagttaacaaactcactgtgtt 356  Q
    |||||||| |||||||||       |||||| || |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  22130922 aataaggattacactagt-------ggatttcct-cctggcttggtagcccccagagtaggtgacgttgcaccgaactgggttaacaaactctctgtgct 22131013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 151 - 272
Target Start/End: Original strand, 22184580 - 22184700
Alignment:
Q  151 taggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagag 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |  | |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  22184580 taggatagtgagatgggatctcagatctaggagttcctaggttgaaatcaatgcgggtaggtcataggtc-ttaagtgtaaacgaggagtttgctgagag 22184678  T
Q  251 cttttgaataaggactacacta 272  Q
    |||| ||||  |||||| ||||    
T  22184679 ctttagaattcggactagacta 22184700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 79 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 23624127 - 23623932
Alignment:
Q  79 tttgtttgaaggtaacttcaatttttgtcttt-ttgtt-taggtctgataggtcacaggggctgtgactgaccataggatagtgagatgggatctcagat 176  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||| |  ||||||||| ||||||||| ||||| | || |||||| ||||||||| ||||||| ||    
T  23624127 tttgtttgaaggtaacttca-tctttgtgtttgttgttgttagtctgatagatcacaggggttgtgattaactataggaaagtgagatgagatctcaaat 23624029  T
Q  177 ctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttgaataaggactacactagt 274  Q
    ||| ||||| |||||||||| || | || |||||||| ||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  23624028 ctaagagttcctaggttgaaatcaatacgggtaggtcctaggt-atttagtgtaaatgaggagtttgctgagagctatagaataacgactacactagt 23623932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 196 - 366
Target Start/End: Original strand, 25105447 - 25105611
Alignment:
Q  196 agtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttgaataaggactacactagtaactagtggattttcttcctg 295  Q
    |||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||       |||||||||||| |||||||    
T  25105447 agtctatacgggtaggtcctaggtcatatagtgtaaacgaggagtttgctgaaagctattgaataaggactac-------actagtggatttccttcctg 25105539  T
Q  296 gcttggtatcccccatagtagatgacgttg-caccgaactgagttaacaaactcactgtgttctttactttc 366  Q
     ||||||| |||| |  |||| ||   ||| |||||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  25105540 acttggtagcccctagtgtaggtgcgcttgtcaccgaactgggtcaacaagctcactgtgttctttagtttc 25105611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 196 - 366
Target Start/End: Original strand, 25164540 - 25164704
Alignment:
Q  196 agtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttgaataaggactacactagtaactagtggattttcttcctg 295  Q
    |||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||       |||||||||||| |||||||    
T  25164540 agtctatacgggtaggtcctaggtcatatagtgtaaacgaggagtttgctgaaagctattgaataaggactac-------actagtggatttccttcctg 25164632  T
Q  296 gcttggtatcccccatagtagatgacgttg-caccgaactgagttaacaaactcactgtgttctttactttc 366  Q
     ||||||| |||| |  |||| ||   ||| |||||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  25164633 acttggtagcccctagtgtaggtgcgcttgtcaccgaactgggtcaacaagctcactgtgttctttagtttc 25164704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 276 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 11204781 - 11204712
Alignment:
Q  276 actagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttgcaccgaactgagttaacaaa 345  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  11204781 actagtggatttccttcctggcttggtagcccccagagtaggtgacgttgcaccgaactgggttaacaaa 11204712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 157 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 9522705 - 9522663
Alignment:
Q  157 agtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtc 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9522705 agtgagatgggatctcagatctaggagttcctaggttgaagtc 9522663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 157 - 348
Target Start/End: Original strand, 17661399 - 17661583
Alignment:
Q  157 agtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttg 256  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| | |  |||||||| ||||| ||||  ||| ||   ||| |||||||||| | || |    
T  17661399 agtgagatggaatctcagatctaggagttcctaggttgaagtcaatatgggtaggtcctaggttataagttgtgaatttggaatttgctgagaac-ttag 17661497  T
Q  257 aataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttg-caccgaactgagttaacaaactc 348  Q
    || |||||| ||       ||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||   ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  17661498 aacaaggacaac-------actagtgaatttccttccaggcttggtagcccccatagtaggtgtgtttgtcaccgaactgggttaacaaactc 17661583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 157 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 20127166 - 20127050
Alignment:
Q  157 agtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaag-tgtaaacgaggagtttgctgagagctttt 255  Q
    ||||||||||||||  |||||||| ||||  | |||||||||| |||| |||||||| |||||  || || ||||||||||||||||||||||| | ||     
T  20127166 agtgagatgggatccaagatctagaagttcatgggttgaagtcaagacgggtaggtcctaggt-ttagagttgtaaacgaggagtttgctgagaac-tta 20127069  T
Q  256 gaataaggactacactagt 274  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  20127068 gaataaggattacactagt 20127050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 22979917 - 22979799
Alignment:
Q  157 agtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggag--tttgctgagagcttt 254  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| | || || | ||||||||| ||||  |||||||  ||||  |||||||||| | ||    
T  22979917 agtgagatgagatctcagatctaagagttcctaggttgaagtcaatacgggcaagtcttaggtgataagttgtaaacttggagtatttgctgagaac-tt 22979819  T
Q  255 tgaataaggactacactagt 274  Q
     ||| |||||||||||||||    
T  22979818 agaacaaggactacactagt 22979799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 40 - 97
Target Start/End: Original strand, 25105312 - 25105371
Alignment:
Q  40 tttgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagttgtttgttt--gaaggtaacttc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||  ||||||||||||    
T  25105312 tttgtactacaccaaagttgtgaaacacgatgttagttgtttgttttggaaggtaacttc 25105371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 40 - 97
Target Start/End: Original strand, 25164405 - 25164464
Alignment:
Q  40 tttgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagttgtttgttt--gaaggtaacttc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||  ||||||||||||    
T  25164405 tttgtactacaccaaagttgtgaaacacgatgttagttgtttgttttggaaggtaacttc 25164464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 387 - 469
Target Start/End: Original strand, 9422682 - 9422764
Alignment:
Q  387 atttctgtttatcgcgtgatgttggaacattgaacataacatcgcaaacgttaaaacatcatacaaaacgtattaaaacaagt 469  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| | |||  ||||| ||||| |||||||||||  ||| ||| |||||||||||||    
T  9422682 atttctgtttatcatgtgatgttggaacactaaacggaacattgcaaatgttaaaacatctgacagaacatattaaaacaagt 9422764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 387 - 469
Target Start/End: Original strand, 25105636 - 25105718
Alignment:
Q  387 atttctgtttatcgcgtgatgttggaacattgaacataacatcgcaaacgttaaaacatcatacaaaacgtattaaaacaagt 469  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||| | | |||||| |||||||    ||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  25105636 atttctgtttatcgtgtgatgttgaaacattaatcgtaacattgcaaacgccgtaacatcatacagaacatattaaaacaagt 25105718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 387 - 469
Target Start/End: Original strand, 25164729 - 25164811
Alignment:
Q  387 atttctgtttatcgcgtgatgttggaacattgaacataacatcgcaaacgttaaaacatcatacaaaacgtattaaaacaagt 469  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||| | | |||||| |||||||    ||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  25164729 atttctgtttatcgtgtgatgttgaaacattaatcgtaacattgcaaacgccgtaacatcatacagaacatattaaaacaagt 25164811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 98
Target Start/End: Original strand, 22130695 - 22130779
Alignment:
Q  15 ctgtgaagcaaggagctaggtagattttgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgcta-gttgtttgtttgaaggtaacttca 98  Q
    |||||||||| |||| ||||||| || | ||||||||||||| |||||| || |||| || || |||| ||||||||||||||||    
T  22130695 ctgtgaagcacggagataggtagtttgtatactacaccaaagctgtgaagcacggtgttaggtagtttatttgaaggtaacttca 22130779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 387 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 18221070 - 18220984
Alignment:
Q  387 atttctgtttatcgcgtgatgttggaacattgaacataacatcgcaaacgttaaaacatcatacaaaacgtattaaaacaagtacgc 473  Q
    |||||||||||   |||||||||||||||||||||  |||||   |||| || ||||||| ||| |||| | |||||||||||||||    
T  18221070 atttctgtttaattcgtgatgttggaacattgaacggaacattataaacattgaaacatcttacgaaactttttaaaacaagtacgc 18220984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 157 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 24117766 - 24117650
Alignment:
Q  157 agtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaac-gaggagtttgctgagagctttt 255  Q
    ||||||||||||||||||||| || | || ||||||| ||||| | || |||||||| ||||||  ||  ||||||| |||| |||||||||||  |||     
T  24117766 agtgagatgggatctcagatcaagaaattcctaggttaaagtcaatacgggtaggtcctaggtctgaagttgtaaactgagg-gtttgctgaga-attta 24117669  T
Q  256 gaataaggactacactagt 274  Q
     ||||||||||||||||||    
T  24117668 caataaggactacactagt 24117650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 278 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 24394690 - 24394622
Alignment:
Q  278 tagtggattttcttcctggcttggtatcccccata-gtagatgacgttgcaccgaactgagttaacaaa 345  Q
    |||||||||| |||||||||||||   |||||| | |||| ||||||||||||||| || |||||||||    
T  24394690 tagtggatttccttcctggcttggatgcccccagatgtaggtgacgttgcaccgaaatgggttaacaaa 24394622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 42 - 367
Target Start/End: Original strand, 16494 - 16816
Alignment:
Q  42 tgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagttgttt--gtttgaaggtaacttcaatttttgtctttttgtttaggtctgataggtcacagggg-c 138  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| | ||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||| |    
T  16494 tgtactacaccgaagtagtgaaacaaggtgttagttgtttatgtttgaaggtaacttca-tctttgtgtttgtgttcaggtctgataggtcatagggggc 16592  T
Q  139 tgtgactgaccat-aggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgagg 237  Q
    ||||| ||||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  16593 tgtgattgaccattaagatagtgagatgggatcttagatataggagttcctaggttgaagtctatacgggtaggtcctaggtcataaagtgtaaatgagg 16692  T
Q  238 agtttgctgagagcttttgaataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttg-caccgaactga 336  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||       | |||||||||| ||| ||||||||||| |||||  ||||| ||   ||| |||||||||||    
T  16693 agtttgcttatagcttttgaataaggactac-------agtagtggatttcctttctggcttggtagcccccggagtaggtgtgtttgtcaccgaactga 16785  T
Q  337 gttaacaaactcactgtgttctttactttct 367  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16786 gtcaacaaactcactgtgttctttactttct 16816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103 (Bit Score: 141; Significance: 1e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0103
Description:

Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 40 - 473
Target Start/End: Original strand, 25544 - 25974
Alignment:
Q  40 tttgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagttgtttgttt--gaaggtaacttcaatttttgtctttttgtttaggtctgataggtcacagggg 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||    |||| |||||||||  |||||||||  |||    
T  25544 tttgtactacaccaaagttgtgaaacacagtgctagttgtttgtgttggaaggtaacttctatttta---ttttggtttaggtcatataggtcactaggg 25640  T
Q  138 ctgtgactgaccat-aggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgag 236  Q
    | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  25641 cagtggctgaccattaggatagtgagatgggatctcagatctaggagttcgtaggttgaagtctatacgggtaggtcctaggtcatctagtgtaaacgag 25740  T
Q  237 gagtttgctgagagcttttgaataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttg-caccgaactg 335  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||       || ||||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||| ||   ||| ||||||||||    
T  25741 gagtttgttgagagctattgaataaggactac-------accagtggatttccttcctggcttggtagctcccagagtaggtgtgtttgtcaccgaactg 25833  T
Q  336 agttaacaaactcactgtgttctttactttc---tcatttannnnnnnnnnnnnatttctgtttatcgcgtgatgttggaacattgaacataacatcgca 432  Q
     || || ||||||| |||||| |||||||||   |||||||             |||| ||||||||||||||||||| |||||| | | || ||| |||    
T  25834 ggtcaataaactcattgtgttatttactttcctgtcatttattttcttgtttttatttatgtttatcgcgtgatgttgaaacattaatcgtagcattgca 25933  T
Q  433 aacgttaaaacatcatacaaaacgtattaaaacaagtacgc 473  Q
    |||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25934 aacgctgaaacatcatacagaacgtattaaaacaagtacgc 25974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 136; Significance: 9e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 40 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 37294 - 36975
Alignment:
Q  40 tttgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagttgtttgttt--gaaggtaacttcaatttttgtctttttgtttaggtctgataggtcacagggg 137  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||| ||| |    |||| |||||||||||||||||||| | ||    
T  37294 tttgtactacaccgaagtcgtgaaacaaggtgttagttgtttgtgttggaaggtaacttctattctg---ttttggtttaggtctgataggtcactgagg 37198  T
Q  138 ctgtgactgaccat-aggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgag 236  Q
    |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  37197 caatgactgaccattaggatagtgagatgggatctcagatctaggagttcctaggttgaagtctatacgggtaggtcctaggtcatatggtgtaaacgag 37098  T
Q  237 gagtttgctgagagcttttgaataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttg-caccgaactg 335  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||       |||||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||| ||   ||| ||||||||||    
T  37097 gagtttgctgagagctattgaataaggactacac-------tagtggatttccttcctggcttggtagcctccagagtaggtgtgtttgtcaccgaactg 37005  T
Q  336 agttaacaaactcactgtgttctttactttc 366  Q
     || |||||||||| |||||| |||||||||    
T  37004 ggtcaacaaactcattgtgtt-tttactttc 36975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 136; Significance: 9e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 40 - 469
Target Start/End: Original strand, 110129 - 110554
Alignment:
Q  40 tttgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagttgtttgtttgaaggtaacttcaatttttgtctttttgtttaggtctgataggtcacaggggct 139  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| |||||    |||  |||||||||||||||||||   ||||     
T  110129 tttgtactataccaaagttgtgaaacacggtgttagttgtttgttggaaggtaacttctattttg---tttcggtttaggtctgataggtcattagggca 110225  T
Q  140 gtgactgaccat-aggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgagga 238  Q
    |||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  110226 gtgactgttcattaggatagtgagatgggatctcaaatctaggagttcctaggttgaagtctatacgggtaggtcctaggtcatatagtgtaaacgagga 110325  T
Q  239 gtttgctgagagcttttgaataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgtt--gcaccgaactga 336  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||||||| ||||||| ||||||| |||| | ||||  ||   ||   ||||||||||     
T  110326 gtttgctgagagctattgaataaggactac-------actagtggatttccttcctgacttggtagcccctagagtatgtgtgttttgtcaccgaactgg 110418  T
Q  337 gttaacaaactcactgtgttctttactttc---tcatttannnnnnnnnnnnnatttctgtttatcgcgtgatgttggaacattgaacataacatcgcaa 433  Q
     | |||||||||| |||||| |||||||||   |||||||             |||||||||||||| ||||||||| |||||| | | |||||| ||||    
T  110419 ttcaacaaactcattgtgttatttactttcctgtcatttactttcttgtttttatttctgtttatcgagtgatgttgaaacattaatcgtaacattgcaa 110518  T
Q  434 acgttaaaacatcatacaaaacgtattaaaacaagt 469  Q
     || | |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  110519 tcgctgaaacatcatacataacgtattaaaacaagt 110554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 136; Significance: 9e-71; HSPs: 36)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 43 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 24092242 - 24091835
Alignment:
Q  43 gtactacaccaaag-ttgtgaaacaaggtgctagttgtttgtttgaaggtaacttcaatttttgtctttttgtttaggtctgataggtcacaggggctgt 141  Q
    |||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||  | | ||||   ||||||||| || ||||||||||    
T  24092242 gtactacaccaaagcttgt-aagcaaggtgctagttgtttgtttgaaggtaacttcaccgtttgagtctgtgttctagtctgatagctcgcaggggctgt 24092144  T
Q  142 gactgaccataggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtt 241  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | || |||||||| |||||| |  |||||||||||||||||    
T  24092143 gactgactataggatagtgagatgggatctcagatctaggagttcctaggttgaaatcaatacgggtaggtcctaggtc-tttagtgtaaacgaggagtt 24092045  T
Q  242 tgctgagagcttttgaataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttg-caccgaactgagtta 340  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||       |||||||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||| ||   ||| |||||||||  || |    
T  24092044 tgctgagagctgtagaataaggactac-------actagtggatttccttcctggcttggtagcccctagagtaggtgtgtttgtcaccgaactaggtca 24091952  T
Q  341 acaaactcactgtgttctttactttctcatttannnnnnnnnnnnnatttctgtttatcgcgtgatgttggaacattgaacataacatcgcaaacgttaa 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||              ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||   ||||||| |    
T  24091951 acaaactcactgtgttctttactttcttgttt------------ttatttctgtttatttcgtgatgttggaacattgaacagaacattataaacgttga 24091864  T
Q  441 aacatcatacaaaacgtattaaaacaagt 469  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  24091863 aacatcttacagaacatattaaaacaagt 24091835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 39 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 22476520 - 22476285
Alignment:
Q  39 ttttgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagttgtttgttt--gaaggtaacttcaatttttgtctttttgtttaggtctgataggtcacaggg 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||| |  |||||||||||| | |||    ||||  |||||||||||||||||||  ||    
T  22476520 ttttgtactacaccaaagttgtgaaacacgatgttagttgtttgtgttggaaggtaacttctactttg---ttttgatttaggtctgataggtcactagg 22476424  T
Q  137 gctgtgactgaccat-aggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacga 235  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  22476423 gcagtgactgaccattaggatagtgagatgggatctcaaatctaggagttcctaggttgaagtctatatgggtaggtcctaggtcatatagtgtaaacga 22476324  T
Q  236 ggagtttgctgagagcttttgaataaggactacactagt 274  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22476323 ggagtttgctgagagctattgaataaggactacactagt 22476285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 42 - 469
Target Start/End: Original strand, 23541281 - 23541708
Alignment:
Q  42 tgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagttgtttgt--ttgaaggtaacttcaatttttgtctttttgtttaggtctgataggtcacaggggct 139  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||| |  |||||||||||||||| ||| || ||| |||| |||| | |||||| ||||||| |    
T  23541281 tgtacttcaccaaagttgtgaaacaaggtgtatgttgtttctatttgaaggtaacttcaacttt-gtgtttgtgttcaggtttaataggttacaggggtt 23541379  T
Q  140 gtgactgaccat-aggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgagga 238  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||  ||||||| ||||| ||| ||||||||||  ||    
T  23541380 gtgactgaccattaggatagtgagataggatctcagatctaggagttcctaggttgaattctatacgagtaggtcctaggtaatatagtgtaaacggcga 23541479  T
Q  239 gtttgctgagagcttttgaataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttg-caccgaactgag 337  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||       |||||||||||| ||||| || |||||| |||||| ||||| ||   ||| |||||||||  |    
T  23541480 gtttgctgagagctattgaataagtactac-------actagtggatttccttcccggtttggtagcccccagagtaggtgtgtttgtcaccgaactagg 23541572  T
Q  338 ttaacaaactcactgtgttctttactttc---tcatttannnnnnnnnnnnnatttctgtttatcgcgtgatgttggaacattgaacat-aacatcgcaa 433  Q
    | |||||||||| |||||||||||| |||   |||||||             ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||||    
T  23541573 tcaacaaactcattgtgttctttacattcctgtcatttattttcttgtttttatttctgcttatcgcgtgatgttggaacattgatcgtaaacattgcaa 23541672  T
Q  434 acgttaaaacatcatacaaaacgtattaaaacaagt 469  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||    
T  23541673 acgttaaaacatcatacataacatattaaaataagt 23541708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 39 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 22485423 - 22485188
Alignment:
Q  39 ttttgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagttgtttgt--ttgaaggtaacttcaatttttgtctttttgtttaggtctgataggtcacaggg 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||  |||||||||||||| | |||    ||||  |||||||||||||||||||  ||    
T  22485423 ttttgtactacaccaaagttgtgaaatacggtgttagttgtttgtgtttgaaggtaacttctactttg---ttttgatttaggtctgataggtcactagg 22485327  T
Q  137 gctgtgactgaccat-aggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacga 235  Q
    |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || | ||  || ||||||||| |||||||||||    
T  22485326 gtagtgactgaccattaggatagtgagatgggatctcagatctaggagttcttaggttgaagtctatacggataattcctaggtcatatagtgtaaacga 22485227  T
Q  236 ggagtttgctgagagcttttgaataaggactacactagt 274  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22485226 ggagtttgctgagagctattgaataaggactacactagt 22485188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 112 - 469
Target Start/End: Original strand, 11221214 - 11221563
Alignment:
Q  112 tgtttaggtctgataggtcacaggggctgtgactgaccat-aggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtag 210  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||    
T  11221214 tgtttaggtctgataggtcacaagggttgtgactgatcattaggatagtgagatgggatctcagatctaggagttcctaggttgaagtctatacgggtag 11221313  T
Q  211 gtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttgaataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatccccca 310  Q
    ||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||            |||| |||||||| |||||| ||||||    
T  11221314 gtcctaggtc-tttagtgtaaacgaggagtttgctgagagctatagaataaggactacact------------atttccttcctggtttggtagccccca 11221400  T
Q  311 tagtagatgacgttg-caccgaactgagttaacaaactcactgtgttctttactttc---tcatttannnnnnnnnnnnnatttctgtttatcgcgtgat 406  Q
     ||||| ||   ||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||   |||||||             ||||||||||||  | ||||    
T  11221401 gagtaggtgtgtttgtcaccgaactaggtcaacaaactcactgtgttctttactttcctgtcatttattttcttgtttttatttctgtttatttcatgat 11221500  T
Q  407 gttggaacattgaacataacatcgcaaacgttaaaacatcatacaaaacgtattaaaacaagt 469  Q
    |||||||||||||||  ||||| | ||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  11221501 gttggaacattgaacggaacattgaaaacgtttaaacatcgtacaaaacaaattaaaacaagt 11221563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 42 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 45136401 - 45136176
Alignment:
Q  42 tgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagttgtttgt--ttgaaggtaacttcaatttttgtctttttgtttaggtctgataggtcacaggggct 139  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| | |||      ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45136401 tgtactacaccgaagttgtgaaacaaggtgttagttgtttgtgtttgaaggtaacttctactttgag---tttgtttaggtctgagaggtcacaggggct 45136305  T
Q  140 gtgactgaccat-aggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgagga 238  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| |||||| |  |||||||| |||||    
T  45136304 gtgactgaccattaggatagtgagatgggatctcatatctaggagttcctaggttgaagtctatacgggtaggtcctaggtc-tttagtgtaaatgagga 45136206  T
Q  239 gtttgctgagagcttttgaataaggactac 268  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||||||    
T  45136205 gtttgctgagagctatcgaataatgactac 45136176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 42 - 274
Target Start/End: Original strand, 13660245 - 13660475
Alignment:
Q  42 tgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagttgtttgtttgaaggtaacttcaatttttgtctttttgtttaggtctgataggtcacaggggctgt 141  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| | || |  ||| |||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  13660245 tgtactacaccgaagttgtgaaacaaggtgttagttgtttgtttgaagataatttcactgtt-gagtttgtgtttaggtctgataggtcacatgggctat 13660343  T
Q  142 gactgaccat-aggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagt 240  Q
    ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||  ||||| |  || |||||||||||||    
T  13660344 gaccgaccattaggagagtgagatgggatctcagatctaggagttcctaggttgaagtctatacgggtaggtcccaggtc-tttagagtaaacgaggagt 13660442  T
Q  241 ttgctgagagcttttgaataaggactacactagt 274  Q
    ||||||||||| || |||||| ||||||||||||    
T  13660443 ttgctgagagc-ttagaataaagactacactagt 13660475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 42 - 274
Target Start/End: Original strand, 13718888 - 13719118
Alignment:
Q  42 tgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagttgtttgtttgaaggtaacttcaatttttgtctttttgtttaggtctgataggtcacaggggctgt 141  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| | || |  ||| |||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  13718888 tgtactacaccgaagttgtgaaacaaggtgttagttgtttgtttgaagataatttcactgtt-gagtttgtgtttaggtctgataggtcacatgggctat 13718986  T
Q  142 gactgaccat-aggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagt 240  Q
    ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||  ||||| |  || |||||||||||||    
T  13718987 gaccgaccattaggagagtgagatgggatctcagatctaggagttcctaggttgaagtctatacgggtaggtcccaggtc-tttagagtaaacgaggagt 13719085  T
Q  241 ttgctgagagcttttgaataaggactacactagt 274  Q
    ||||||||||| || |||||| ||||||||||||    
T  13719086 ttgctgagagc-ttagaataaagactacactagt 13719118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 42 - 274
Target Start/End: Original strand, 27925323 - 27925550
Alignment:
Q  42 tgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagttgtttgt--ttgaaggtaacttcaatttttgtctttttgtttaggtctgataggtcacaggggct 139  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||       |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  27925323 tgtactacactgaagttgtgaaacaaggtgttagttgtttgtgtttgaaggtaacttcaa-------ctttgtgttcaggtctgataggtcacaggggct 27925415  T
Q  140 gtgactgaccat-aggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgagga 238  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || |||||||| || ||| |   ||||||| | |||    
T  27925416 gtgactgacctttaggatagtgagatgggatctcagatctaggagttcctaggatgaagtctatacgggtaggtcctatgtc-tttggtgtaaatgtgga 27925514  T
Q  239 gtttgctgagagcttttgaataaggactacactagt 274  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  27925515 gtttgttgagagctatagaataaggactacactagt 27925550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 42 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 33977344 - 33976921
Alignment:
Q  42 tgtactacaccaaag-ttgtgaaacaaggtgctagttgtt-tgtttgaaggtaacttcaatttttgtctttttgtttaggtctgataggtcacaggggct 139  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |  |||  ||| |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  33977344 tgtactacaccaaagcttgt-aagcaaggtgttacttgttgtgtttgaaggtaacttca-tccttgagtttgtgtttaagtctgataggtcataggggct 33977247  T
Q  140 gtgactgaccataggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggag 239  Q
     |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||||| || || |||||||  |||||| |  ||||||||| |||||    
T  33977246 ctgactgaccatatgatagtgagatgatatctcagatctaggagttcctagattgaagtatatacgggtaggttctaggtc-tttagtgtaaacaaggag 33977148  T
Q  240 tttgctgagagcttttgaataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttg-caccgaactgagt 338  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||       |||||||||||| ||| ||| ||||||| |||||| ||||| ||   |||  ||||||||| ||    
T  33977147 tttgctgagagctatagaataaggactac-------actagtggatttcctttctgacttggtagcccccagagtaggtgcgtttgttaccgaactgggt 33977055  T
Q  339 taacaaactcactgtgttctttactttc---tcatttannnnnnnnnnnnnatttctgtttatcgcgtgatgttggaacattgaacataacatcgcaaac 435  Q
     ||||||||||| || ||||||||||||   |||||||             ||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||  ||||     
T  33977054 caacaaactcacagtattctttactttcttgtcatttattttcttgttttgatttctgtttatttcgtgatgttggaacattgaacggaacattacaaat 33976955  T
Q  436 gttaaaacatcatacaaaacgtattaaaacaagt 469  Q
     || ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  33976954 attgaaacatcttacaaaacatattaaaacaagt 33976921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 119 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 25240615 - 25240463
Alignment:
Q  119 gtctgataggtcacaggggctgtgactgaccataggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttagg 218  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  25240615 gtctaataagtcacaggggctgtgactgactataagatagtaagatgagatcgcagatctaggagttcttaggttgaagtctagacgggtaggtcctagg 25240516  T
Q  219 tcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttgaataaggactacact 271  Q
    || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25240515 tcgtaaagtgtaaagaaggagtttgctgagagcttttgaataaggactacact 25240463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 45 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 9996781 - 9996554
Alignment:
Q  45 actacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagtt-gtttgtttgaaggtaacttcaatttttgtctttttgtttaggtctgataggtcacaggggctgtga 143  Q
    ||||||||||||||||||| || |||| ||| | |||||||||||||||||||||    ||||  || |||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  9996781 actacaccaaagttgtgaagcacggtgttaggtagtttgtttgaaggtaacttcaccgcttgt--ttgtgtttaggtctgataggtcacatgggttgtga 9996684  T
Q  144 ctgaccataggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttg 243  Q
    ||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| || | || |||||||| |||||| |  |||||||| ||||||||||    
T  9996683 ctggctataggatagtgagatgtgatctcagacctaggagttcctaggttgaaatcaatacgggtaggtcctaggtc-tttagtgtaaatgaggagtttg 9996585  T
Q  244 ctgagagcttttgaataaggactacactagt 274  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| ||||    
T  9996584 ctgagagctatagaataaggactacaatagt 9996554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 157 - 354
Target Start/End: Original strand, 33466149 - 33466337
Alignment:
Q  157 agtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttg 256  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||   || |||||||| |||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  33466149 agtgagatggg-tctcagatctaggagttcctaggttgaagtcagtaccggtaggtcctaggtcatta-gtgcaaacgagaagtttgctgagagcttttg 33466246  T
Q  257 aataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttgcaccgaactgagttaacaaactcactgtg 354  Q
    ||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  33466247 aataaggactac-------actagtggattttcttcctggcttggtagcccccagagtaggtgacgttgcaccgaactggattaacaaactctctgtg 33466337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 159 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 17280057 - 17279870
Alignment:
Q  159 tgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttgaa 258  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||   |  |||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||| |||||    
T  17280057 tgagatgggatctcagatctagaagttcctaggttgaagtcagtatgggtaggtcctaggtcatta-gtgcaaacgaggagtttgcttagagctattgaa 17279959  T
Q  259 taaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttgcaccgaactgagttaacaaactcactgtg 354  Q
    || | |||||||||||       |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  17279958 tacgaactacactagt-------ggatttccttcctggcttggtatcccccagagtaggtgacgttgcaccgaactgggttaacaaactctctgtg 17279870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 157 - 348
Target Start/End: Original strand, 37155513 - 37155697
Alignment:
Q  157 agtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttg 256  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||   || |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  37155513 agtgagatgggatctcagatcttggagttcctaggttgaagtcagtacgggtaggtcctaggtcatatagtgcaaacgaggagtttgctgagagctattg 37155612  T
Q  257 aataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttgcaccgaactgagttaacaaactc 348  Q
    |||||||| |||       ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||  ||||||||| | ||||||||||    
T  37155613 aataaggattac-------actagtgaatttccttcctggcttggtagcccccagagtaggtgacgttataccgaactgggctaacaaactc 37155697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 157 - 354
Target Start/End: Original strand, 17880727 - 17880917
Alignment:
Q  157 agtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttg 256  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||   || ||| | || |||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  17880727 agtgagatgagatctcagatctaggagttcctaggttgaagtcagtacgggtcgttcctaggtcatta-gtgcaaacgaggagtttgctgagagctattg 17880825  T
Q  257 aataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggta-tcccccatagtagatgacgttgcaccgaactgagttaacaaactcactgtg 354  Q
    |||||| |||||       |||||||||||| |||| ||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17880826 aataagaactac-------actagtggatttccttcttggcttggtagccccccagagtaggtgacgttgcaccgaactgggttaacaaactcactgtg 17880917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 156 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 39081137 - 39080947
Alignment:
Q  156 tagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagctttt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||   || |||||||  ||||||||  |||| ||| |||||||||| |||||||| ||    
T  39081137 tagtgagatgggatctcagatctagtagttcctaggttgaagtcagtacgggtaggttctaggtcat-tagtgcaaatgaggagtttgttgagagctatt 39081039  T
Q  256 gaataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttgcaccgaactgagttaacaaactcactgtg 354  Q
    |||||||||||||       |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||    
T  39081038 gaataaggactac-------actagtggatttccttcctggcttggtagcccccagagtaggtgacgttgcattgtactgagttaacaaactctctgtg 39080947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 129 - 346
Target Start/End: Original strand, 23864427 - 23864637
Alignment:
Q  129 tcacaggggctgtgactgaccataggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtg 228  Q
    ||||| ||||||||| |||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||||||| ||||||   || ||    
T  23864427 tcacatgggctgtgattgattgtaggaaagtgagatgggatctcagatctaggagttcctaggttgaagtcaaaacgggtaggtcctaggtctagaattg 23864526  T
Q  229 taaacgaggagtttgctgagagcttttgaataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccata-gtagatgacgttgca 327  Q
    ||| ||||||||||||||||| | || |||||||||||||       |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| ||| ||||||    
T  23864527 taagcgaggagtttgctgagaac-ttagaataaggactac-------actagtggattttcttcctgacttggtatcccccagatgtaggtgatgttgca 23864618  T
Q  328 ccgaactgagttaacaaac 346  Q
    || || || ||||| ||||    
T  23864619 ccaaattgggttaaaaaac 23864637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 157 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 8727015 - 8726853
Alignment:
Q  157 agtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttg 256  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||   || |||||||| |||||| | | ||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  8727015 agtgagatgagatctcagatctaggagttcataggttgaagtcattacgggtaggtcctaggtcgtta-gtgcaaacgaggagtttgctgagagctattg 8726917  T
Q  257 aataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttgca 327  Q
    |||| |||||||||       |||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  8726916 aatatggactacac-------tagtggatttccttcctggcttggtagcccccagagtaggtgacgttgca 8726853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 151 - 347
Target Start/End: Original strand, 20254857 - 20255054
Alignment:
Q  151 taggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtag-------gtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttg 243  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||       ||| |||||| | |  |||||||||||||||||    
T  20254857 taggatagtgagatgggatgtcagatctaggagttcctaggttgaagtctagacgggtaggtcctacgtcctaggtcttcagttgtaaacgaggagtttg 20254956  T
Q  244 ctgagagcttttgaataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttg-caccgaactgagttaac 342  Q
    |||||| |||| |||||||||| ||       |||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||   ||| |||||||||| || |||    
T  20254957 ctgagaactttagaataaggaccac-------actagtggatttccttcctagcttggtagcccccatagtacatgtgtttgtcaccgaactgggtcaac 20255049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 115 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 33961952 - 33961871
Alignment:
Q  115 ttaggtctgataggtcacaggggctgtgactgaccataggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33961952 ttaggtctgataggtcacaggggctgtgactgaacataagata--gagatgggatctcagatctaggagttcctaggttgaagt 33961871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 157 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 23249906 - 23249722
Alignment:
Q  157 agtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagt-gtaaacgaggagtttgctgagagctttt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||| |||| |||||| || ||| | |||| | ||||||| ||| |   ||     
T  23249906 agtgagatgggatctcagatctaggagttcctaggttgaagtcaatacaggttggtcctaggtc-tagagttgcaaacaatgagtttgttgataaactta 23249808  T
Q  256 gaataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttgcaccgaactgagttaacaaactc 348  Q
     ||||||||||||||||||       |||||| |||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  23249807 taataaggactacactagt-------ggatttccttcttggcttggtagcccccagagtaggtgacgttgcaccgaattgggttaacaaactc 23249722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 389 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 22472725 - 22472645
Alignment:
Q  389 ttctgtttatcgcgtgatgttggaacattgaacataacatcgcaaacgttaaaacatcatacaaaacgtattaaaacaagt 469  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22472725 ttctgtttatcgtgtgatgttgaaacattaatcgtaacatcgcaaacgttaaaacatcatacagaacgtattaaaacaagt 22472645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 157 - 274
Target Start/End: Original strand, 12814580 - 12814696
Alignment:
Q  157 agtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaag-tgtaaacgaggagtttgctgagagctttt 255  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||| | ||     
T  12814580 agtgagattggatcttaaatctaggagtttctaggttgacgtcaagacgggtaggtcctaggtc-tacagttgtaaacgaggagtttgctgagaac-tta 12814677  T
Q  256 gaataaggactacactagt 274  Q
    |||||||||||||||||||    
T  12814678 gaataaggactacactagt 12814696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 157 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 1684146 - 1683966
Alignment:
Q  157 agtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttg 256  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||| |||| | | |||||| |  |||||||||||||||||||||| ||| |   |    
T  1684146 agtgagatgggatctcagaactaggagttcttaggttgaagtcaagacgggtatgacctaggtc-tttagtgtaaacgaggagtttgctgggagttagag 1684048  T
Q  257 aataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttgcaccgaactgagttaacaaact 347  Q
    ||||||||||||       ||||||||| |||| |||||||||||||  | ||| ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  1684047 aataaggactac-------actagtgga-tttcctcctggcttggta-gcgccagagtaggtgacgttgcaccgaattgggttaacaaact 1683966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 394 - 469
Target Start/End: Original strand, 22480934 - 22481009
Alignment:
Q  394 tttatcgcgtgatgttggaacattgaacataacatcgcaaacgttaaaacatcatacaaaacgtattaaaacaagt 469  Q
    ||||||||||||||||| |||||| | | |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  22480934 tttatcgcgtgatgttgaaacattaatcgtaacatcgcaaacgttaaaatatcatacaaaacatattaaaacaagt 22481009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 276 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 45133724 - 45133527
Alignment:
Q  276 actagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttg-caccgaactgagttaacaaactcactgtgttctttactttct---catt 371  Q
    |||||||||||| |||||||||||| || |||||| ||||| ||   ||| |||||||||| || |||||||||| ||||| |||||||||||   | ||    
T  45133724 actagtggatttccttcctggcttgatagcccccagagtaggtgtgtttgtcaccgaactgggtcaacaaactcaatgtgtcctttactttcttgtcgtt 45133625  T
Q  372 tannnnnnnnnnnnnatttctgtttatcgcgtgatgttggaacattgaacataacatcgcaaacgttaaaacatcatacaaaacgtattaaaacaagt 469  Q
    ||             ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| || | ||| |||||||||||||    
T  45133624 tattttcttgtttttatttctgtttatcgcatgatgttagaacattgaacagaacattgcaaatgttaaaacatcgtagagaacatattaaaacaagt 45133527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 129 - 348
Target Start/End: Original strand, 24850392 - 24850603
Alignment:
Q  129 tcacaggggctgtgactgaccataggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaag-t 227  Q
    ||||||||||||||| |||   ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||| || | |  ||||| || |||||| || || |    
T  24850392 tcacaggggctgtgattgattgtaggatagtgagatgagatcttagatctaggagttcctagattgaaatcaatatgggtagctcctaggtc-tagagtt 24850490  T
Q  228 gtaaacgaggagtttgctgagagcttttgaataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccata-gtagatgacgttgc 326  Q
    |||||||||||||||||||| | | || |||||||||||||       |||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||| ||| ||||     
T  24850491 gtaaacgaggagtttgctgataac-ttagaataaggactac-------actagtggatttccttcctagcttggtagcccccatatgtaggtga-gttgt 24850581  T
Q  327 accgaactgagttaacaaactc 348  Q
     || ||||| ||||||||||||    
T  24850582 gccaaactgggttaacaaactc 24850603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 189 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 22874317 - 22874233
Alignment:
Q  189 aggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttgaataaggactacactagt 274  Q
    |||||||||||   || |||||||| |||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22874317 aggttgaagtcagtacgggtaggtcctaggtcatta-gtgcaaatgaggagtttgctgagagcttttgaataaggactacactagt 22874233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 387 - 467
Target Start/End: Original strand, 27925637 - 27925717
Alignment:
Q  387 atttctgtttatcgcgtgatgttggaacattgaacataacatcgcaaacgttaaaacatcatacaaaacgtattaaaacaa 467  Q
    ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||  ||| ||| |||||||||||    
T  27925637 atttctgtttatttcgtgatgttgaaacattgaacgaaacattgcatacgttaaaacatctgacataacatattaaaacaa 27925717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 157 - 224
Target Start/End: Original strand, 1562355 - 1562422
Alignment:
Q  157 agtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataa 224  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||   || |||||||| ||||| ||||    
T  1562355 agtgagatgggatctcagatgtaggagtttttaggttgaagtcagtacgggtaggtcctaggttataa 1562422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 24384702 - 24384582
Alignment:
Q  187 ctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttgaataaggactacactagtaactagtggatt 286  Q
    |||||||||||||   || |||||| | |||||| |||  |||||||  |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||       |||||    
T  24384702 ctaggttgaagtcactacgggtaggccctaggtcttaagttgtaaacttggagtttgctgagaactta-gaataaggactacactagt-------ggatt 24384611  T
Q  287 ttcttcctggcttggtatcccccatagta 315  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  24384610 ttcttcctggcttggtagcccccagagta 24384582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 276 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 33961821 - 33961729
Alignment:
Q  276 actagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttgc-accgaactgagttaacaaactcactgtgttctttactttct 367  Q
    |||||| ||||| ||||||| | ||||| |||||| ||||| |||  |||  ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33961821 actagttgatttccttcctgacgtggtagcccccagagtaggtgagtttgttaccgaactgggtcaacaaactcacagtgttctttactttct 33961729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 329 - 366
Target Start/End: Original strand, 27925576 - 27925613
Alignment:
Q  329 cgaactgagttaacaaactcactgtgttctttactttc 366  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  27925576 cgaactgggtcaacaaactcactgtgttctttactttc 27925613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 276 - 316
Target Start/End: Original strand, 1562466 - 1562506
Alignment:
Q  276 actagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtag 316  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||    
T  1562466 actagtggatttccttcctggcttggtagcccccaaagtag 1562506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 326 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 22485152 - 22485112
Alignment:
Q  326 caccgaactgagttaacaaactcactgtgttctttactttc 366  Q
    |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||    
T  22485152 caccgaactgggtcaacaaactcattgtgttctttactttc 22485112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 135; Significance: 4e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 57 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 88008 - 87704
Alignment:
Q  57 ttgtgaaacaaggtgctagttgtttgttt--gaaggtaacttcaatttttgtctttttgtttaggtctgataggtcacaggggctgtgactgacca-tag 153  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |  |||||||||||| | |||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||    
T  88008 ttgtgaaacaagatgttagttgtttgtgttggaaggtaacttctacttttat--tttggtttaggtctgataggtcacaggggctatgactgacccgtag 87911  T
Q  154 gatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagctt 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  87910 gatagtgagatgggatctcagatctaggagttcctgggttgaagtctagacgggtaggtcctaggtcatatagtgtaaacgaggagtttgctgagagcta 87811  T
Q  254 ttgaataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccata-gtagatgacgttg-caccgaactgagttaacaaactcact 351  Q
    |||||||||||||||||       |||||||||| |||||| |||||| | |||||||| |||| ||   ||| |||||||||| || |||||||||| |    
T  87810 ttgaataaggactacac-------tagtggatttccttcctagcttgg-agcccccatacgtaggtgtgtttgtcaccgaactgggtcaacaaactcatt 87719  T
Q  352 gtgttctttactttc 366  Q
    |||||||||||||||    
T  87718 gtgttctttactttc 87704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 121; Significance: 8e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 42 - 469
Target Start/End: Original strand, 17151 - 17574
Alignment:
Q  42 tgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagttgtttgt--ttgaaggtaacttcaattttt-gtctttttgtttaggtctgataggtcacaggggc 138  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||| | |||  |||  |||    |||| |||||||||||| ||||    
T  17151 tgtactacaccgaagttgtgaaacaaggtgttagttatttgtgtttgaaggtaacttctactttgagtcaattt----aggtttgataggtcacatgggc 17246  T
Q  139 tgtgactgaccat-aggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgagg 237  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| |  ||||| |||||||    
T  17247 tgtgactgaccattaagatagtgagatgagatctcagatctaagagtttctaggttgaagtctatacgggtaggtcctaggtc-tttagtgttaacgagg 17345  T
Q  238 agtttgctgagagcttttgaataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttg-caccgaactga 336  Q
    | ||||||||||||| | |||||||||||||       |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||   ||| |||  |||||     
T  17346 aatttgctgagagctatagaataaggactac-------actagtggattttcttcctgacttggtagcccccagagtaggtgtgtttgtcacgaaactgg 17438  T
Q  337 gttaacaaactcactgtgttctttactttc---tcatttannnnnnnnnnnnnatttctgtttatcgcgtgatgttggaacattgaacataacatcgcaa 433  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||   |||||||             |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||| ||||    
T  17439 gtcaacaaactcactgtgttttttactttcttgtcatttattttattgattttatttttgtttatcgcgtgattttgaaacattgaactgaacattgcaa 17538  T
Q  434 acgttaaaacatcatacaaaacgtattaaaacaagt 469  Q
    ||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  17539 acgttaaaacatcgtacagaacatactaaaacaagt 17574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 40 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 36881 - 36647
Alignment:
Q  40 tttgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagttgtt--tgtttgaaggtaacttcaatttttgtctttttgtttaggtctgataggtcacagggg 137  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||  |||| |||||||||||  |  ||||  |||| |||||||||||||||||||||  ||    
T  36881 tttgtactacaccgaagttgtgacacaaggtgttagttgtttatgttggaaggtaacttataactttg--ttttggtttaggtctgataggtcaca-agg 36785  T
Q  138 ctgtgactgacca-taggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgag 236  Q
     |||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  36784 atgtgactgaccattaagatagtgaaatgggatctcagatctgggagttcctagtttgaagtatatacaggtaggtcctaggtcatatagtgtaaacgag 36685  T
Q  237 gagtttgctgagagcttttgaataaggactacactagt 274  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36684 gagtttgttgagagctattgaataaggactacactagt 36647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059 (Bit Score: 110; Significance: 3e-55; HSPs: 4)
Name: scaffold0059
Description:

Target: scaffold0059; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 121 - 366
Target Start/End: Original strand, 61424 - 61663
Alignment:
Q  121 ctgataggtcacaggggctgtgactgaccat-aggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggt 219  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  61424 ctgataggtcactggggcagtgactgaccattaggatagtgagatgggatctcagatctaggagttcctaggttgaagtctatacgggtaggtcttaggt 61523  T
Q  220 cataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttgaataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatg 319  Q
    |||| ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| |||||       |||||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||| |||    
T  61524 catatagtgtaaacaatgagtttgctgagagctattgaataagaactac-------actagtggatttccttcttggcttggtagcccccagagta-atg 61615  T
Q  320 acgttg-caccgaactgagttaacaaactcactgtgttctttactttc 366  Q
       ||| |||||||||| || |||||||||| |||| | |||||||||    
T  61616 tgtttgtcaccgaactgggtcaacaaactcattgtgctatttactttc 61663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 40 - 212
Target Start/End: Original strand, 48215 - 48387
Alignment:
Q  40 tttgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagttgtttgttt--gaaggtaacttcaatttttgtctttttgtttaggtctgataggtcacagggg 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |  |||| ||||||| |||||    |||| |||||||| ||||||| ||| ||||    
T  48215 tttgtactacaccaaagttgtgaaacacggtggtagttgtttgtgttggaagataacttctattttg---ttttggtttaggtttgataggacactgggg 48311  T
Q  138 ctgtgactgaccat-aggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggt 212  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||    
T  48312 cagtgactgaccattaggatagtgagatgagatcttagatctaggagttcctaggttgaagtgtaaataggtaggt 48387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 208 - 469
Target Start/End: Original strand, 50130 - 50389
Alignment:
Q  208 taggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttgaataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatccc 307  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||       |||||||||||| ||||||| ||||||| |||    
T  50130 taggtcgtaggtcatatagtgtaaacgaggattttgttgagagctattgaataaggactac-------actagtggatttccttcctgacttggtagccc 50222  T
Q  308 ccatagtagatgacgttg-caccgaactgagttaacaaactcactgtgttctttactttc---tcattta-nnnnnnnnnnnnnatttctgtttatcgcg 402  Q
    | | ||||| ||   ||| |||||||||| || |||||||||| |||||| |||||||||   |||||||              ||||||||||||||||    
T  50223 ctagagtaggtgtgtttgtcaccgaactgggtcaacaaactcattgtgttatttactttcatgtcatttactttcttgttttttatttctgtttatcgcg 50322  T
Q  403 tgatgttggaacattgaacataacatcgcaaacgttaaaacatcatacaaaacgtattaaaacaagt 469  Q
    |||||||| |||||| | | |||||| |||||||    ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  50323 tgatgttgaaacattaatcgtaacattgcaaacgccttaacatcatacagaacgtattaaaacaagt 50389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 387 - 467
Target Start/End: Original strand, 61688 - 61768
Alignment:
Q  387 atttctgtttatcgcgtgatgttggaacattgaacataacatcgcaaacgttaaaacatcatacaaaacgtattaaaacaa 467  Q
    |||| ||||||||||||||||||| || ||| | | |||||| |||||||    ||||||||||||||| |||||||||||    
T  61688 atttttgtttatcgcgtgatgttgaaatattaatcgtaacattgcaaacgccgtaacatcatacaaaacatattaaaacaa 61768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0185 (Bit Score: 105; Significance: 3e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0185
Description:

Target: scaffold0185; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 40 - 366
Target Start/End: Original strand, 2237 - 2549
Alignment:
Q  40 tttgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagttgtttgtttgaaggtaacttcaatttttgtctttttgtttaggtctgataggtcacaggggct 139  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||||||| | |||    |||| ||||||||| ||||||||||| ||  |    
T  2237 tttgtactacaccgaagttgtgaaacaaggtgttagtt-tgtgttggaaggtaacttctactttg---ttttggtttaggtccgataggtcacatggatt 2332  T
Q  140 gtgactgaccat-aggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgagga 238  Q
    |||||||||||| |||||     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  2333 gtgactgaccattaggat-----gatgggatctcagatctaggagttcctaggttgaagtctatacggctaggtcctaggtcatatagtgtaaacgggga 2427  T
Q  239 gtttgctgagagcttttgaataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttg-caccgaactgag 337  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||       |||| |||| || |||||||||||| || |||| | ||||| ||   ||| ||||||| || |    
T  2428 gtttgctgagagctattgaataaggactac-------actattggacttccttcctggcttgatagcccctaaagtaggtgtgcttgtcaccgaaatggg 2520  T
Q  338 ttaacaaactcactgtgttctttactttc 366  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||    
T  2521 tcaacaaactcattgtgttctttactttc 2549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 102; Significance: 2e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 40 - 212
Target Start/End: Original strand, 12380 - 12553
Alignment:
Q  40 tttgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgctagttgttt--gtttgaaggtaacttcaatttttgtctttttgtttaggtctgataggtcacagggg 137  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  12380 tttgtgctacaccgaagttgtgaaacaaggtgttagttgtttctgttagaaggtaacttctatttttgt--tttggtttaggtctgataagtcacatggg 12477  T
Q  138 ctgtgactgaccat-aggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggt 212  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  12478 ttgtgactgaccattaggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctatacgggtaggt 12553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 98; Significance: 4e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 79 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 26654 - 26372
Alignment:
Q  79 tttgtttgaaggtaacttcaatttttgtcttt-ttgtt-taggtctgataggtcacaggggctgtgactgaccataggatagtgagatgggatctcagat 176  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||| |  ||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  26654 tttgtttgaaggtaacttca-tctttgtgtttgttgttgttagtctgatagatcacaggggctgtgattgactgtaggatagtgagatgggatgtcagat 26556  T
Q  177 ctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttgaataaggactacactagtaa 276  Q
    ||||||||| |||||||||| || | || |||||||| |||||| |  |||||||| |||||||||| ||||||||   |||||||||||||       |    
T  26555 ctaggagttcctaggttgaaatcaatacgggtaggtcctaggtc-tttagtgtaaatgaggagtttgttgagagctacagaataaggactac-------a 26464  T
Q  277 ctagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttg-caccgaactgagttaacaaactcactgtgttctttactttct 367  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||   ||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26463 ctagtggatttccttccttgcttggtagcccccatagtaggtgtgtttgtcaccgaattgggtcaacaaactcactgtgttctttactttct 26372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 96; Significance: 7e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 157 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 36467 - 36279
Alignment:
Q  157 agtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttg 256  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||   || |||||||| |||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  36467 agtgagatggg-tctcagatctaggagttcctaggttgaagtcagtaccggtaggtcctaggtcatta-gtgcaaacgagaagtttgctgagagcttttg 36370  T
Q  257 aataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttgcaccgaactgagttaacaaactcactgtg 354  Q
    ||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  36369 aataaggactacac-------tagtggattttcttcctggcttggtagcccccagagtaggtgacgttgcaccgaactggattaacaaactctctgtg 36279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0328 (Bit Score: 93; Significance: 4e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0328
Description:

Target: scaffold0328; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 157 - 351
Target Start/End: Original strand, 16960 - 17147
Alignment:
Q  157 agtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttg 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   || ||| |||  ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |||    
T  16960 agtgagatgggatctcagatctaggagttcctaggttgaagtcagtacgggtgggtactaggtcatatagtgcaaacgaggagtttgttgagagctattg 17059  T
Q  257 aataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttgcaccgaactgagttaacaaactcact 351  Q
    ||||||||||||       |||||||||||| |||||||| |||||   ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17060 aataaggactac-------actagtggatttccttcctggattggttagccccatagtaggtgacgttgcaccgaactgggttaacaaactcact 17147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 88; Significance: 4e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 157 - 354
Target Start/End: Original strand, 52915 - 53102
Alignment:
Q  157 agtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttg 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | | || |||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  52915 agtgagatgggatctcagatctaggagttcctaggttgaa-accaaacgggtaggtcctaggtc-tttagtgtaaacgaggagtttgctgagagctatag 53012  T
Q  257 aataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttgcaccgaactgagttaacaaactcactgtg 354  Q
    ||||||||||||       ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  53013 aataaggactac-------actagtgga-tttcctcctggcttggtagcccccagagtaggtgacgttgcaccgaactgggttaacaaactcactgtg 53102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 220
Target Start/End: Original strand, 45858 - 45917
Alignment:
Q  161 agatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtc 220  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| | || |||||||| ||||||    
T  45858 agatgggatctcagatcaaggagttcttaggttgaagtcaatacgggtaggtcctaggtc 45917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 157 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 103276 - 103090
Alignment:
Q  157 agtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttg 256  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||   || |||||||| |||||| |   ||| |||| ||||||||||| |||||| |||    
T  103276 agtgagaagggatctcagatctaggagttcctaggttgaagtcagtacgggtaggtcctaggtc-tttggtgcaaacaaggagtttgctcagagctattg 103178  T
Q  257 aataaggactacactagtaactagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttgcaccgaactgagttaacaaactcact 351  Q
    ||||||||||||       |||||||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  103177 aataaggactac-------actagtggatttccttcctggcttggtagcccctagagtaggtgacgttgcactgaactgggttaacaaactcact 103090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 151 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 37544 - 37420
Alignment:
Q  151 taggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaa-gtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgaga 249  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||  |||||| ||||||||||||||||    
T  37544 taggataatgagatgggatctcatatctaggagttcctaggttgaaagtctagacgggtaggtcctaggtcttaagttgtaaatgaggagtttgctgaga 37445  T
Q  250 gcttttgaataaggactacactagt 274  Q
     |||| |||||||||||||||||||    
T  37444 actttagaataaggactacactagt 37420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480 (Bit Score: 59; Significance: 8e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0480
Description:

Target: scaffold0480; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 11499 - 11296
Alignment:
Q  16 tgtgaagcaaggagctaggtagattttgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtgcta-gttgtttgtttgaaggtaacttcaatttttgtctttttgt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| || || || |||||||||||||||||||| ||  || | |||  ||    
T  11499 tgtgaagcaaggagctaggtagattgtgtactacaccaaagctgtgaagcaagatgttaggtagtttgtttgaaggtaacttc-atccttttgtttgagt 11401  T
Q  115 tt-aggtctgataggtcacaggggctgtgactgaccataggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtc 213  Q
    ||    |||||||  ||||||||||||||| |||   | ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | || ||||||||    
T  11400 ttgtaatctgata-atcacaggggctgtgattgattgtggga-agtgagatgggatctcagatctaggagtacctaggttgaagtcaataccggtaggtc 11303  T
Q  214 ttaggtc 220  Q
     ||||||    
T  11302 ctaggtc 11296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 151 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 202571 - 202450
Alignment:
Q  151 taggatagtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagag 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||  |||||||| |||||| |||  |||||| | |   ||| ||||||     
T  202571 taggatagtgagatgggatctcagatctagaagttcctaggttgaagtccagatgggtaggtcctaggtcttaagttgtaaatgtg--atttactgagaa 202474  T
Q  251 cttttgaataaggactacactagt 274  Q
    |||| |||||||||||||||||||    
T  202473 ctttagaataaggactacactagt 202450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0520 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0520
Description:

Target: scaffold0520; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 157 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 5589 - 5473
Alignment:
Q  157 agtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaag-tgtaaacgaggagtttgctgagagctttt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| ||| |||||| || || |||||||  |||||||||| ||| | ||     
T  5589 agtgagatgggatctcagatctaggagttcctaggttgaagttaagacaggtaagtcctaggtc-tagagttgtaaacttggagtttgctcagaac-ttg 5492  T
Q  256 gaataaggactacactagt 274  Q
    |||||||||||||||||||    
T  5491 gaataaggactacactagt 5473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 215 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 5759 - 5703
Alignment:
Q  215 taggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttgaataaggactacact 271  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5759 taggtcatatagtgtaaacgatgagtttgctgagagctattgaataaggactacact 5703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 157 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 3291 - 3177
Alignment:
Q  157 agtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaagtgtaaacgaggagtttgctgagagcttttg 256  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||   || |||||||| ||||||||  |||| ||||| |  |||||||||||||| |||    
T  3291 agtgagatgggatctcaaatctaggagttcctaggttgaaatcagtacgggtaggtcctaggtcat-tagtgcaaacgtg--gtttgctgagagctgttg 3195  T
Q  257 aataaggactacactagt 274  Q
    |||| | |||||||||||    
T  3194 aatacgtactacactagt 3177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0505 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0505
Description:

Target: scaffold0505; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 157 - 274
Target Start/End: Original strand, 10024 - 10140
Alignment:
Q  157 agtgagatgggatctcagatctaggagtttctaggttgaagtctagacaggtaggtcttaggtcataaag-tgtaaacgaggagtttgctgagagctttt 255  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| | |||||| |||||| || || ||||||| ||||||||| |||||   ||     
T  10024 agtgagatgagatctcagatctaggagttcctcggttgaagtcaagacggataggtcctaggtc-tagagttgtaaacaaggagtttggtgaga-agtta 10121  T
Q  256 gaataaggactacactagt 274  Q
    | |||||||||||||||||    
T  10122 gtataaggactacactagt 10140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 278 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 18607 - 18540
Alignment:
Q  278 tagtggattttcttcctggcttggtatcccccatagtagatgacgttgcaccgaactgagttaacaaa 345  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| |||| | ||||| ||| |||||||||||||| || ||||||    
T  18607 tagtggatttccttcatggcttggtagccccaaaagtaggtgaagttgcaccgaactgggtcaacaaa 18540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 40 - 71
Target Start/End: Original strand, 357171 - 357202
Alignment:
Q  40 tttgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtg 71  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  357171 tttgtactacaccaaagttgtgaaacaaggtg 357202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University