View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF16052_low_2 (Length: 609)

Name: NF16052_low_2
Description: NF16052
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF16052_low_2
NF16052_low_2
[»] scaffold0328 (2 HSPs)
scaffold0328 (1-599)||(14642-15243)
scaffold0328 (409-543)||(13048-13182)
[»] chr6 (40 HSPs)
chr6 (348-543)||(9238973-9239171)
chr6 (348-543)||(34147344-34147542)
chr6 (348-543)||(34159960-34160158)
chr6 (348-543)||(15360099-15360297)
chr6 (350-543)||(11448871-11449067)
chr6 (348-543)||(3222637-3222833)
chr6 (343-543)||(654147-654350)
chr6 (348-543)||(21982322-21982519)
chr6 (348-543)||(1344935-1345131)
chr6 (348-543)||(9843936-9844134)
chr6 (348-543)||(28672065-28672263)
chr6 (348-543)||(21148512-21148709)
chr6 (348-543)||(5360072-5360270)
chr6 (348-535)||(11007163-11007353)
chr6 (348-543)||(17081055-17081253)
chr6 (344-543)||(14212886-14213078)
chr6 (358-543)||(11840909-11841096)
chr6 (390-518)||(12390465-12390596)
chr6 (343-463)||(12591630-12591750)
chr6 (348-543)||(9208250-9208448)
chr6 (348-456)||(13753238-13753346)
chr6 (352-543)||(9690639-9690833)
chr6 (348-543)||(33499472-33499671)
chr6 (348-433)||(22576065-22576150)
chr6 (374-518)||(17149482-17149629)
chr6 (343-535)||(33718478-33718662)
chr6 (373-535)||(17706328-17706481)
chr6 (348-441)||(8479310-8479403)
chr6 (367-456)||(28968133-28968222)
chr6 (343-501)||(31039013-31039173)
chr6 (448-543)||(15730496-15730594)
chr6 (349-542)||(10377714-10377911)
chr6 (478-543)||(14504083-14504148)
chr6 (482-519)||(32596211-32596248)
chr6 (479-530)||(27866217-27866268)
chr6 (462-534)||(21903629-21903703)
chr6 (510-543)||(4797260-4797293)
chr6 (478-543)||(17225797-17225862)
chr6 (375-440)||(28741948-28742013)
chr6 (401-441)||(6385921-6385961)
[»] chr7 (71 HSPs)
chr7 (343-543)||(7275274-7275477)
chr7 (348-543)||(22119890-22120088)
chr7 (348-543)||(40542911-40543109)
chr7 (348-535)||(7175871-7176061)
chr7 (348-543)||(2751273-2751471)
chr7 (348-543)||(21217834-21218032)
chr7 (348-543)||(21835153-21835351)
chr7 (343-543)||(11997846-11998049)
chr7 (348-543)||(2103057-2103253)
chr7 (348-543)||(10091190-10091387)
chr7 (348-543)||(18044109-18044307)
chr7 (348-543)||(28089818-28090019)
chr7 (348-543)||(17196951-17197149)
chr7 (346-543)||(23012509-23012709)
chr7 (363-535)||(22703503-22703678)
chr7 (388-543)||(654706-654863)
chr7 (343-535)||(17212050-17212245)
chr7 (348-543)||(2344301-2344499)
chr7 (349-543)||(27312155-27312352)
chr7 (348-543)||(27009361-27009560)
chr7 (343-543)||(22638289-22638488)
chr7 (347-543)||(27704003-27704201)
chr7 (355-543)||(28950877-28951071)
chr7 (355-543)||(42913514-42913705)
chr7 (348-543)||(19421233-19421431)
chr7 (348-475)||(7799902-7800031)
chr7 (386-543)||(16374034-16374194)
chr7 (373-543)||(31273941-31274113)
chr7 (343-460)||(13332510-13332627)
chr7 (398-543)||(29861722-29861870)
chr7 (343-543)||(32849588-32849791)
chr7 (348-543)||(31197593-31197790)
chr7 (348-535)||(39145661-39145851)
chr7 (342-533)||(25333415-25333593)
chr7 (343-540)||(43785303-43785503)
chr7 (360-441)||(22299863-22299944)
chr7 (348-543)||(31712903-31713094)
chr7 (343-418)||(23854393-23854468)
chr7 (417-543)||(23092167-23092296)
chr7 (401-543)||(41907515-41907659)
chr7 (430-543)||(3851841-3851957)
chr7 (348-543)||(23330740-23330938)
chr7 (378-543)||(36772304-36772471)
chr7 (349-543)||(28646972-28647169)
chr7 (348-531)||(9683828-9684014)
chr7 (349-463)||(42814867-42814981)
chr7 (344-543)||(22696318-22696521)
chr7 (348-463)||(9718071-9718186)
chr7 (348-423)||(21370599-21370674)
chr7 (374-498)||(14199713-14199839)
chr7 (348-543)||(21574103-21574302)
chr7 (348-441)||(8435801-8435894)
chr7 (348-441)||(40332101-40332194)
chr7 (348-436)||(12211646-12211734)
chr7 (344-394)||(577677-577727)
chr7 (374-535)||(22643351-22643515)
chr7 (347-412)||(28003837-28003902)
chr7 (449-535)||(8943410-8943500)
chr7 (465-543)||(33137826-33137904)
chr7 (340-417)||(1469106-1469183)
chr7 (345-441)||(3951096-3951193)
chr7 (342-427)||(22264622-22264707)
chr7 (345-440)||(3950895-3950991)
chr7 (414-463)||(6491675-6491724)
chr7 (401-445)||(21558187-21558231)
chr7 (344-440)||(38864553-38864649)
chr7 (348-530)||(36173037-36173223)
chr7 (478-535)||(1766153-1766210)
chr7 (425-518)||(21373789-21373885)
chr7 (489-542)||(30345511-30345564)
chr7 (354-434)||(26459394-26459477)
[»] chr5 (68 HSPs)
chr5 (348-543)||(8484662-8484860)
chr5 (348-543)||(11926502-11926701)
chr5 (351-535)||(38684209-38684395)
chr5 (348-543)||(15641107-15641304)
chr5 (348-543)||(27498732-27498930)
chr5 (348-543)||(32059441-32059639)
chr5 (343-543)||(30485821-30486024)
chr5 (367-543)||(19456212-19456389)
chr5 (354-535)||(33709512-33709694)
chr5 (348-535)||(13038464-13038653)
chr5 (348-535)||(13108459-13108648)
chr5 (374-543)||(18207231-18207403)
chr5 (342-543)||(34310134-34310338)
chr5 (348-543)||(19145413-19145610)
chr5 (343-543)||(31287947-31288150)
chr5 (361-543)||(37495058-37495250)
chr5 (348-543)||(7085627-7085825)
chr5 (348-535)||(36954816-36955006)
chr5 (348-543)||(4603775-4603973)
chr5 (348-535)||(11464917-11465106)
chr5 (356-535)||(42193491-42193671)
chr5 (354-543)||(6014281-6014473)
chr5 (335-535)||(23270531-23270734)
chr5 (348-499)||(25586930-25587085)
chr5 (348-543)||(38630980-38631160)
chr5 (352-535)||(10869574-10869760)
chr5 (347-522)||(15971144-15971322)
chr5 (342-543)||(22392693-22392884)
chr5 (348-535)||(27487563-27487754)
chr5 (338-461)||(1827616-1827739)
chr5 (348-543)||(25750614-25750810)
chr5 (367-543)||(12398449-12398628)
chr5 (348-543)||(12317156-12317349)
chr5 (348-500)||(15931057-15931211)
chr5 (348-543)||(34049820-34050007)
chr5 (348-543)||(21236363-21236561)
chr5 (401-531)||(5049188-5049320)
chr5 (419-535)||(35425082-35425201)
chr5 (348-543)||(26009265-26009463)
chr5 (477-543)||(22693065-22693131)
chr5 (430-543)||(9659312-9659428)
chr5 (462-543)||(41351105-41351186)
chr5 (348-543)||(930487-930684)
chr5 (341-518)||(15485317-15485498)
chr5 (367-458)||(7151346-7151437)
chr5 (349-440)||(37397712-37397803)
chr5 (477-535)||(13659254-13659312)
chr5 (364-543)||(28614487-28614667)
chr5 (363-543)||(36895438-36895621)
chr5 (339-543)||(10399762-10399970)
chr5 (348-441)||(40330631-40330724)
chr5 (343-427)||(5067294-5067378)
chr5 (478-533)||(5067392-5067447)
chr5 (367-543)||(17015420-17015593)
chr5 (349-401)||(3715055-3715107)
chr5 (493-543)||(10631290-10631340)
chr5 (344-394)||(42006787-42006837)
chr5 (348-543)||(22253145-22253344)
chr5 (341-388)||(19230466-19230513)
chr5 (344-395)||(21042677-21042728)
chr5 (348-395)||(33025478-33025525)
chr5 (484-543)||(41084120-41084179)
chr5 (403-441)||(21589349-21589387)
chr5 (348-417)||(16616117-16616186)
chr5 (482-535)||(42006868-42006921)
chr5 (483-543)||(8821120-8821180)
chr5 (479-543)||(25548535-25548599)
chr5 (483-543)||(33737878-33737937)
[»] chr3 (76 HSPs)
chr3 (351-543)||(26174114-26174309)
chr3 (348-543)||(53424178-53424375)
chr3 (348-543)||(35492909-35493107)
chr3 (342-543)||(8456151-8456355)
chr3 (348-543)||(30807154-30807352)
chr3 (354-543)||(15566501-15566692)
chr3 (348-543)||(45529756-45529953)
chr3 (348-543)||(46576346-46576544)
chr3 (349-543)||(52821637-52821833)
chr3 (340-543)||(25289716-25289921)
chr3 (348-543)||(40133450-40133648)
chr3 (348-543)||(49258263-49258461)
chr3 (348-543)||(21362941-21363139)
chr3 (348-535)||(30257622-30257812)
chr3 (348-543)||(48977386-48977584)
chr3 (349-535)||(25379760-25379949)
chr3 (348-543)||(45272417-45272615)
chr3 (348-535)||(18176896-18177086)
chr3 (342-543)||(31537839-31538043)
chr3 (343-543)||(34492576-34492779)
chr3 (362-543)||(53233912-53234095)
chr3 (367-543)||(10190743-10190922)
chr3 (348-543)||(40940823-40941021)
chr3 (367-543)||(10083820-10083999)
chr3 (371-543)||(39041853-39042028)
chr3 (348-543)||(52455650-52455848)
chr3 (348-543)||(7485532-7485724)
chr3 (348-526)||(29915288-29915468)
chr3 (348-526)||(29964441-29964621)
chr3 (354-543)||(32151428-32151620)
chr3 (357-500)||(26108299-26108445)
chr3 (348-516)||(7470244-7470414)
chr3 (344-543)||(4462627-4462828)
chr3 (390-543)||(8097280-8097436)
chr3 (398-543)||(24407309-24407457)
chr3 (348-543)||(25344059-25344256)
chr3 (449-543)||(24165716-24165812)
chr3 (374-535)||(33398477-33398641)
chr3 (379-543)||(1692863-1693029)
chr3 (356-532)||(53288725-53288903)
chr3 (401-535)||(2511306-2511443)
chr3 (349-535)||(11390601-11390790)
chr3 (354-535)||(19857056-19857239)
chr3 (373-543)||(8958036-8958210)
chr3 (344-535)||(26158812-26158999)
chr3 (348-518)||(51532787-51532960)
chr3 (348-535)||(4252405-4252595)
chr3 (477-543)||(53848435-53848501)
chr3 (348-434)||(55287801-55287887)
chr3 (357-436)||(9853623-9853702)
chr3 (348-518)||(50582990-50583162)
chr3 (403-543)||(17579136-17579280)
chr3 (341-543)||(6041671-6041878)
chr3 (343-463)||(38732959-38733079)
chr3 (349-535)||(55371303-55371483)
chr3 (406-543)||(1178228-1178366)
chr3 (342-436)||(9842913-9843006)
chr3 (449-543)||(54475780-54475877)
chr3 (404-543)||(48972715-48972854)
chr3 (372-518)||(34844400-34844548)
chr3 (477-543)||(48105007-48105073)
chr3 (482-543)||(4048085-4048146)
chr3 (364-440)||(49167070-49167146)
chr3 (483-543)||(50731238-50731298)
chr3 (483-543)||(50781556-50781616)
chr3 (342-441)||(25017508-25017606)
chr3 (413-513)||(1242036-1242139)
chr3 (496-543)||(3747730-3747777)
chr3 (357-529)||(14343304-14343478)
chr3 (348-395)||(16140295-16140342)
chr3 (354-434)||(10445123-10445207)
chr3 (348-418)||(36660768-36660838)
chr3 (478-543)||(25017620-25017684)
chr3 (462-519)||(33793567-33793624)
chr3 (354-444)||(11092144-11092236)
chr3 (462-514)||(26599429-26599481)
[»] chr8 (58 HSPs)
chr8 (348-543)||(4718647-4718845)
chr8 (348-543)||(34237656-34237854)
chr8 (349-543)||(28193477-28193674)
chr8 (343-535)||(39349253-39349448)
chr8 (348-543)||(3734624-3734822)
chr8 (348-543)||(2618188-2618386)
chr8 (357-543)||(21603241-21603430)
chr8 (348-543)||(19471611-19471810)
chr8 (348-543)||(19542535-19542734)
chr8 (348-543)||(19589962-19590161)
chr8 (343-543)||(32879276-32879479)
chr8 (348-543)||(15259407-15259605)
chr8 (348-543)||(20305910-20306108)
chr8 (348-543)||(21092543-21092741)
chr8 (372-543)||(8765527-8765701)
chr8 (348-543)||(42643119-42643317)
chr8 (348-543)||(42328007-42328204)
chr8 (349-535)||(264409-264597)
chr8 (349-535)||(651324-651512)
chr8 (349-535)||(837059-837247)
chr8 (348-531)||(27746348-27746534)
chr8 (352-535)||(28088292-28088478)
chr8 (367-535)||(14632975-14633146)
chr8 (354-543)||(4698724-4698916)
chr8 (348-543)||(7557952-7558142)
chr8 (348-543)||(18532109-18532298)
chr8 (372-543)||(20469943-20470116)
chr8 (348-531)||(26168862-26169047)
chr8 (348-543)||(2166699-2166896)
chr8 (401-543)||(6953009-6953153)
chr8 (365-543)||(34610688-34610869)
chr8 (349-543)||(24018385-24018583)
chr8 (404-543)||(25248407-25248546)
chr8 (348-531)||(28964035-28964220)
chr8 (348-543)||(34694576-34694775)
chr8 (348-525)||(21667552-21667731)
chr8 (477-543)||(2639412-2639478)
chr8 (399-543)||(10292108-10292254)
chr8 (348-535)||(36848759-36848948)
chr8 (348-535)||(8042656-8042834)
chr8 (348-460)||(34639295-34639405)
chr8 (348-543)||(18128515-18128713)
chr8 (401-501)||(24999289-24999392)
chr8 (352-441)||(41070767-41070856)
chr8 (463-543)||(12312965-12313045)
chr8 (348-441)||(8387550-8387643)
chr8 (355-441)||(15974915-15974999)
chr8 (348-543)||(3403503-3403701)
chr8 (348-437)||(3794793-3794882)
chr8 (474-535)||(13749187-13749248)
chr8 (477-543)||(33747016-33747082)
chr8 (344-386)||(13580064-13580106)
chr8 (406-531)||(1219409-1219537)
chr8 (498-543)||(9713609-9713654)
chr8 (482-535)||(16990722-16990775)
chr8 (462-531)||(42332025-42332094)
chr8 (477-534)||(43817759-43817816)
chr8 (401-445)||(6536579-6536623)
[»] chr1 (73 HSPs)
chr1 (348-543)||(4621238-4621436)
chr1 (348-543)||(7766728-7766926)
chr1 (344-543)||(24122017-24122219)
chr1 (348-535)||(24674391-24674581)
chr1 (343-543)||(46607803-46608006)
chr1 (342-543)||(15059403-15059607)
chr1 (348-535)||(27454873-27455065)
chr1 (348-542)||(8077645-8077841)
chr1 (342-543)||(30677168-30677372)
chr1 (343-543)||(7197248-7197450)
chr1 (341-543)||(34778333-34778535)
chr1 (358-543)||(17935777-17935965)
chr1 (372-543)||(9500356-9500530)
chr1 (343-543)||(32729538-32729740)
chr1 (348-535)||(168199-168389)
chr1 (360-543)||(7578419-7578605)
chr1 (348-535)||(23734114-23734305)
chr1 (348-535)||(23741306-23741497)
chr1 (355-540)||(1378903-1379090)
chr1 (348-515)||(7946842-7947011)
chr1 (348-535)||(21726727-21726917)
chr1 (365-543)||(37351454-37351643)
chr1 (372-535)||(45859052-45859218)
chr1 (349-535)||(18646852-18647041)
chr1 (374-543)||(36155889-36156061)
chr1 (367-543)||(33905511-33905690)
chr1 (348-501)||(23232304-23232464)
chr1 (349-454)||(46113495-46113600)
chr1 (343-535)||(2272337-2272532)
chr1 (398-543)||(8254753-8254901)
chr1 (348-440)||(20487297-20487389)
chr1 (348-518)||(29057364-29057536)
chr1 (374-535)||(8779745-8779909)
chr1 (349-535)||(25496503-25496686)
chr1 (342-436)||(14258538-14258632)
chr1 (350-535)||(32930749-32930937)
chr1 (348-543)||(1486418-1486616)
chr1 (477-543)||(48699889-48699955)
chr1 (348-535)||(18533733-18533923)
chr1 (348-442)||(24216976-24217070)
chr1 (356-441)||(25237095-25237180)
chr1 (342-438)||(1378737-1378833)
chr1 (348-422)||(1818732-1818806)
chr1 (348-524)||(2537702-2537870)
chr1 (466-543)||(26513149-26513226)
chr1 (430-543)||(45331622-45331739)
chr1 (477-543)||(22910001-22910067)
chr1 (477-543)||(35138118-35138184)
chr1 (348-440)||(1138577-1138669)
chr1 (467-543)||(27159205-27159281)
chr1 (349-535)||(40145890-40146079)
chr1 (480-543)||(23041655-23041718)
chr1 (348-395)||(47091688-47091735)
chr1 (364-441)||(19034492-19034569)
chr1 (348-441)||(52135128-52135221)
chr1 (348-441)||(16899509-16899594)
chr1 (354-459)||(39964514-39964621)
chr1 (401-535)||(16539659-16539795)
chr1 (348-543)||(40802070-40802266)
chr1 (481-543)||(50202680-50202741)
chr1 (343-388)||(1095154-1095199)
chr1 (494-543)||(5315478-5315527)
chr1 (354-395)||(6776148-6776189)
chr1 (498-543)||(14603947-14603992)
chr1 (354-441)||(809226-809313)
chr1 (477-515)||(12876965-12877003)
chr1 (354-441)||(15581119-15581208)
chr1 (477-535)||(47091751-47091809)
chr1 (482-535)||(52135261-52135314)
chr1 (403-543)||(26820240-26820383)
chr1 (354-434)||(33700757-33700840)
chr1 (462-543)||(36921513-36921595)
chr1 (478-534)||(43769975-43770031)
[»] chr4 (77 HSPs)
chr4 (343-543)||(32986190-32986393)
chr4 (348-543)||(33696280-33696478)
chr4 (348-543)||(34844759-34844957)
chr4 (348-543)||(40058853-40059051)
chr4 (348-543)||(52983617-52983815)
chr4 (343-543)||(5609203-5609406)
chr4 (348-543)||(46714390-46714589)
chr4 (348-543)||(19660533-19660731)
chr4 (352-543)||(27528796-27528990)
chr4 (348-543)||(20566347-20566546)
chr4 (348-543)||(25852212-25852411)
chr4 (342-543)||(45787705-45787908)
chr4 (343-535)||(54127351-54127546)
chr4 (349-543)||(44343512-44343710)
chr4 (342-535)||(51535605-51535809)
chr4 (372-542)||(20077986-20078159)
chr4 (354-535)||(35229172-35229356)
chr4 (367-543)||(7391966-7392143)
chr4 (348-543)||(36131511-36131709)
chr4 (364-535)||(49287872-49288045)
chr4 (340-463)||(22625154-22625277)
chr4 (348-518)||(13873321-13873494)
chr4 (346-531)||(34835525-34835713)
chr4 (349-529)||(32942369-32942552)
chr4 (336-494)||(33992612-33992773)
chr4 (343-543)||(35674750-35674945)
chr4 (343-543)||(1985829-1986030)
chr4 (399-543)||(34723848-34723995)
chr4 (348-543)||(18875518-18875715)
chr4 (403-531)||(32990488-32990619)
chr4 (388-535)||(27574356-27574506)
chr4 (347-458)||(43719154-43719265)
chr4 (374-543)||(12500060-12500231)
chr4 (357-461)||(2351020-2351124)
chr4 (401-535)||(9517650-9517787)
chr4 (348-531)||(13550206-13550392)
chr4 (350-531)||(55961767-55961939)
chr4 (341-423)||(42245737-42245819)
chr4 (374-535)||(30879175-30879338)
chr4 (348-463)||(13584338-13584453)
chr4 (382-543)||(20527035-20527198)
chr4 (348-460)||(41621684-41621795)
chr4 (397-535)||(21387496-21387635)
chr4 (481-543)||(23639758-23639820)
chr4 (481-543)||(23645416-23645478)
chr4 (354-543)||(4911926-4912122)
chr4 (482-543)||(52494623-52494684)
chr4 (350-535)||(25969512-25969700)
chr4 (477-535)||(4064990-4065048)
chr4 (477-543)||(9978510-9978576)
chr4 (349-402)||(34722169-34722222)
chr4 (477-535)||(43719096-43719154)
chr4 (478-543)||(55158344-55158409)
chr4 (483-543)||(23131437-23131497)
chr4 (473-535)||(33289180-33289242)
chr4 (401-454)||(3392759-3392811)
chr4 (430-535)||(22488037-22488145)
chr4 (478-543)||(51595153-51595218)
chr4 (483-543)||(17637853-17637912)
chr4 (401-441)||(22630292-22630332)
chr4 (483-535)||(37302623-37302675)
chr4 (484-543)||(7093508-7093567)
chr4 (480-543)||(9646217-9646280)
chr4 (401-440)||(38740901-38740940)
chr4 (372-434)||(38869797-38869860)
chr4 (465-543)||(45302953-45303032)
chr4 (463-525)||(4585732-4585793)
chr4 (477-531)||(13017843-13017897)
chr4 (481-535)||(13716459-13716513)
chr4 (360-421)||(12710189-12710250)
chr4 (482-535)||(12824535-12824588)
chr4 (348-441)||(13771589-13771682)
chr4 (373-441)||(28635726-28635795)
chr4 (351-391)||(10125783-10125823)
chr4 (354-434)||(37109335-37109418)
chr4 (483-543)||(41621583-41621643)
chr4 (351-427)||(43352444-43352520)
[»] chr2 (69 HSPs)
chr2 (343-543)||(44946054-44946257)
chr2 (348-543)||(11941211-11941409)
chr2 (343-543)||(33827574-33827777)
chr2 (343-543)||(17324759-17324960)
chr2 (343-543)||(15037952-15038155)
chr2 (347-525)||(44976172-44976354)
chr2 (348-543)||(30466831-30467029)
chr2 (348-543)||(24196002-24196198)
chr2 (348-543)||(25293164-25293355)
chr2 (348-543)||(19054023-19054222)
chr2 (348-535)||(4567438-4567636)
chr2 (381-543)||(35171831-35171996)
chr2 (367-543)||(43374331-43374505)
chr2 (363-518)||(10582018-10582174)
chr2 (348-535)||(41313990-41314179)
chr2 (366-535)||(34516423-34516589)
chr2 (349-543)||(41329842-41330038)
chr2 (348-543)||(8192353-8192550)
chr2 (367-535)||(36242321-36242492)
chr2 (348-543)||(36390570-36390765)
chr2 (397-543)||(2140487-2140633)
chr2 (349-535)||(8258896-8259085)
chr2 (360-543)||(27290598-27290770)
chr2 (348-543)||(27269345-27269549)
chr2 (348-441)||(32845089-32845182)
chr2 (367-535)||(5394034-5394205)
chr2 (344-435)||(4852552-4852643)
chr2 (367-543)||(13266507-13266685)
chr2 (367-528)||(1191530-1191694)
chr2 (348-424)||(18976548-18976624)
chr2 (423-543)||(28668946-28669069)
chr2 (367-535)||(45271401-45271572)
chr2 (401-535)||(3943791-3943928)
chr2 (348-441)||(6714387-6714480)
chr2 (359-496)||(23787056-23787196)
chr2 (348-543)||(14946777-14946974)
chr2 (354-441)||(19605951-19606038)
chr2 (374-543)||(29361578-29361744)
chr2 (477-543)||(18692090-18692156)
chr2 (437-543)||(31778114-31778227)
chr2 (478-535)||(18976464-18976521)
chr2 (347-462)||(918782-918899)
chr2 (348-463)||(40997434-40997549)
chr2 (477-543)||(14486955-14487021)
chr2 (348-441)||(28194239-28194333)
chr2 (477-543)||(44929847-44929913)
chr2 (352-437)||(4618795-4618880)
chr2 (404-535)||(19174817-19174950)
chr2 (364-531)||(19849847-19850017)
chr2 (480-543)||(39957891-39957954)
chr2 (450-543)||(44610139-44610235)
chr2 (478-534)||(4852660-4852716)
chr2 (348-463)||(5608118-5608233)
chr2 (343-422)||(18691975-18692054)
chr2 (404-516)||(19525428-19525539)
chr2 (348-421)||(32526211-32526284)
chr2 (479-543)||(6714296-6714360)
chr2 (477-543)||(714126-714192)
chr2 (356-434)||(3405265-3405343)
chr2 (477-535)||(9400970-9401028)
chr2 (477-543)||(28194139-28194205)
chr2 (400-434)||(33569842-33569876)
chr2 (366-416)||(44610090-44610140)
chr2 (477-535)||(45132417-45132475)
chr2 (367-460)||(29698164-29698256)
chr2 (401-441)||(12086106-12086146)
chr2 (352-441)||(13747611-13747702)
chr2 (483-543)||(19605847-19605907)
chr2 (477-525)||(32845206-32845254)
[»] scaffold0576 (1 HSPs)
scaffold0576 (348-543)||(5083-5281)
[»] scaffold0623 (1 HSPs)
scaffold0623 (347-543)||(1058-1256)
[»] scaffold0366 (2 HSPs)
scaffold0366 (347-543)||(9301-9499)
scaffold0366 (347-526)||(12019-12200)
[»] scaffold0459 (1 HSPs)
scaffold0459 (347-543)||(10696-10893)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (348-543)||(40323-40520)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (349-535)||(7318-7507)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (372-543)||(161831-162005)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (348-543)||(52872-53070)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (348-543)||(97367-97565)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (348-535)||(41654-41843)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (389-543)||(39131-39288)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (343-543)||(66755-66950)
[»] scaffold0199 (2 HSPs)
scaffold0199 (348-441)||(8513-8606)
scaffold0199 (482-543)||(8452-8513)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (404-543)||(32342-32483)
[»] scaffold0157 (1 HSPs)
scaffold0157 (374-543)||(20246-20417)
[»] scaffold0460 (1 HSPs)
scaffold0460 (348-440)||(8286-8378)
[»] scaffold0160 (1 HSPs)
scaffold0160 (349-543)||(29144-29340)
[»] scaffold0717 (1 HSPs)
scaffold0717 (355-501)||(1-150)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (348-543)||(27774-27966)
[»] scaffold1175 (1 HSPs)
scaffold1175 (449-543)||(2427-2524)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (349-417)||(12884-12952)
[»] scaffold0200 (1 HSPs)
scaffold0200 (343-440)||(26650-26747)
[»] scaffold0299 (1 HSPs)
scaffold0299 (372-434)||(11557-11620)


Alignment Details
Target: scaffold0328 (Bit Score: 491; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0328
Description:

Target: scaffold0328; HSP #1
Raw Score: 491; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 599
Target Start/End: Original strand, 14642 - 15243
Alignment:
Q  1 atgatccagatcagttaatgtgtgaaatgaatagaatctggatcctcatatacatctatcaatttgcttaatatgaggaaatacggatttaggttctata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14642 atgatccagatcagttaatgtgtgaaatgaatagaatctggatcctcatatacatctatcaatttgcttaatatgaggaaatacggatttaggttctata 14741  T
Q  101 tataatgcaagtcgtcgaacaatttaatttgtgaaattaatgaaattttcaagtgatcttgaaaaataaaaattctctttcagctactacaatgtgatca 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14742 tataatgcaagtcgtcgaacaatttaatttgtgaaattaatgaaattttcaagtgatcttgaaaaataaaaattctctttcagctactacaatgtgatca 14841  T
Q  201 agaaattaaaaattttattaatttgaagaccaaaatattgttccctctttacaattctatggactaaaatgataaaggtgtttgtgtgcttagtgataaa 300  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14842 agaaatttaaaattttattaatttgaagaccaaaatattgttccctctttacaattctatggactaaaatgataaaggtgtttgtgtgcttagtgataaa 14941  T
Q  301 agttagattgtgtagaagagtatgattagatgacaatattataaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccag 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  14942 agttagattgtgtagaagagtatgattaaatgacaatattataaacccatttggggttggcctagtggttggcctgggatcttggagtttgctcctccag 15041  T
Q  401 aggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtggg 497  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  15042 aggtctcaggttcaattccctctggtgctaatttcggtgggttaagtccatccagagcttgctctggctttaaatgggccccccgcaagtgggcgg-ggg 15140  T
Q  498 attgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt-nnnnnnntgacaatattataagatggtaaatttaaaaaatgctattgatgatg 596  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||        |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15141 attggtctcctcggattagtcaattcttggatcggataacaagtttaaaaaaaatgacaatattataagatggtaaatttgaaaaatgctattgatgatg 15240  T
Q  597 atg 599  Q
    |||    
T  15241 atg 15243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0328; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 409 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 13182 - 13048
Alignment:
Q  409 ggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgctggctttaaatggc-cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccc 507  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  13182 ggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggttaagtccatacagagcttgcta-ctttaaacggggcccccgcaagtggacggtgggattgatcccc 13084  T
Q  508 tcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    || |||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  13083 tcagattagttgattcttggatcggataccgagttt 13048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 140; Significance: 5e-73; HSPs: 40)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 348 - 543
Target Start/End: Original strand, 9238973 - 9239171
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  9238973 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggttaagt 9239072  T
Q  448 tcatacagagcttgc--tggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
     |||| |||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  9239073 ccatatagagcttgctttggctttaaatggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 9239171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 348 - 543
Target Start/End: Original strand, 34147344 - 34147542
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |    
T  34147344 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcttccagaagtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagt 34147443  T
Q  448 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
     |||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  34147444 ccatacagagcttgctctggctttaaacgggccccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 34147542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 348 - 543
Target Start/End: Original strand, 34159960 - 34160158
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |    
T  34159960 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcttccagaagtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagt 34160059  T
Q  448 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
     |||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  34160060 ccatacagagcttgctctggctttaaacgggccccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 34160158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 348 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 15360297 - 15360099
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |    
T  15360297 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagt 15360198  T
Q  448 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
     |||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  15360197 ccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaaatgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 15360099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 350 - 543
Target Start/End: Original strand, 11448871 - 11449067
Alignment:
Q  350 tttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 449  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| | |    
T  11448871 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattctctctggtgccaatttcggtgggctaagtcc 11448970  T
Q  450 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  11448971 atacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttgaatcggatatcgagttt 11449067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 348 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 3222833 - 3222637
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |    
T  3222833 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttgcagtttgctcctc-agaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagt 3222735  T
Q  448 tcatacagagcttgct--ggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
     |||||||||||||||  | ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  3222734 ccatacagagcttgctctgtctttaaacggggccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 3222637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 343 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 654350 - 654147
Alignment:
Q  343 aaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggt 442  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  654350 aaacccatttgggtttggcctagtggctgacttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggc 654251  T
Q  443 taaattcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacga 539  Q
    ||| | |||||||||||||  |||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||    
T  654250 taagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggctcccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattattggatcggataccga 654151  T
Q  540 gttt 543  Q
    ||||    
T  654150 gttt 654147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 348 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 21982519 - 21982322
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||| ||||| ||| |    
T  21982519 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttgaagtttgctcctccagaggtctgaggttcgattcccgatggtgccaatttcagtgggctaagt 21982420  T
Q  448 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
     |||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  21982419 ccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggt-ccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 21982322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 348 - 543
Target Start/End: Original strand, 1344935 - 1345131
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    |||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| |    
T  1344935 catttggggttgacctagtggttgg--tgggatcttggagtttgttcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcagtgggctaagt 1345032  T
Q  448 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
     |||||| ||||||  |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  1345033 ccatacaaagcttgctctggctttaaacgggccccccgcaagtggacggtgggattggtccccttggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 1345131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 348 - 543
Target Start/End: Original strand, 9843936 - 9844134
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | |||||||||  ||||| |||||||||| |    
T  9843936 catttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctctagaggtctcaggttcgacttcctctggtgtcaattttggtgggttaagt 9844035  T
Q  448 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
     |||||||||||||  |||||||||||  || ||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  9844036 ccatacagagcttgttctggctttaaacggggccccctcaagtgggcggtgagattggtcccttcggattagtcgattcttggatcggatatcgagttt 9844134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 348 - 543
Target Start/End: Original strand, 28672065 - 28672263
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||| |    
T  28672065 catttggggttggcctagtggttgacttgagatcttggagtttgctcctctagaggtcttaggttcgattccctctggtgtcaattttggtgggctaagt 28672164  T
Q  448 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
     |||||||||||||   ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  28672165 ccatacagagcttgttttggctttaaacgggcccctcgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcagataccgagttt 28672263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 348 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 21148709 - 21148512
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||| |    
T  21148709 catttggagttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctttttcagaggtctcaagttcgattccctctagtgccaatttcgatgggctaagt 21148610  T
Q  448 tcatacagagcttgct--ggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
     |||||||||||||||  | ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  21148609 ccatacagagcttgctctgactttaaacggggccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttgaatcggataccgagttt 21148512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 348 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 5360270 - 5360072
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    ||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||| |    
T  5360270 catttggagttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgcttctcaagaggtctcaggttcgattccctctaatgccaatttcggtgggctaagt 5360171  T
Q  448 tcatacagagcttg--ctggctttaaatgg-ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
     |||||||||||||  ||| ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  5360170 ccatacagagcttgctctgactttaaacggaacccccacaagtgggcggtgggattggtcccctcgaattagtcgattcttagatcggataccgagttt 5360072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 348 - 535
Target Start/End: Original strand, 11007163 - 11007353
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| |   |||||||||||| ||| |    
T  11007163 catttggggttgatctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattcactctgctctcaatttcggtgggctaagt 11007262  T
Q  448 tcatacagagcttg--ctggctttaa-atggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 535  Q
     |||||| ||||||  || |||||||   || |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  11007263 ccatacaaagcttgctctagctttaagcggggcccccgcaagtgggcggtgggattggccccctcggattagtcgattctttgatcggata 11007353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 348 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 17081253 - 17081055
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    |||||| |||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||| |    
T  17081253 catttgaggttagtctagtggttggcttaggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaagtttgattccctctggtgtcaatttcggtgggctaagt 17081154  T
Q  448 tcatacagagcttg--ctggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
     |||||||||||||  ||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||   ||||||||||| ||| |||||||    
T  17081153 ccatacagagcttgctctgactttaaatggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcgaataagttgtttcttggatcgaataccgagttt 17081055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 344 - 543
Target Start/End: Original strand, 14212886 - 14213078
Alignment:
Q  344 aactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggtt 443  Q
    |||||||||||| ||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| |    
T  14212886 aactcatttgggattgacctaatggttggctcgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaattttgatgggct 14212985  T
Q  444 aaattcatacagagcttgctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    || | |||| ||||||       || ||  ||  ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  14212986 aagtccatatagagct-------ttaaacgggggccccgcaagtgggtggtgggattggtccactcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 14213078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 358 - 543
Target Start/End: Original strand, 11840909 - 11841096
Alignment:
Q  358 tggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagag 457  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| || || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||    
T  11840909 tggccaagtggttggcttgggatattagaatttgctcctccagaggtctcaggctcgattccctctggtgccaatttcggtgggttaagtccatacaaag 11841008  T
Q  458 cttgc--tggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    |||||  ||| |||||| ||  ||||  |||||| ||||||||||  |||||||| ||||||| ||| |||||||||||| |||||||    
T  11841009 cttgctttggttttaaacggggccccataagtggacggtgggattagtcccctcgaattagtcgattattggatcggataccgagttt 11841096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 390 - 518
Target Start/End: Original strand, 12390465 - 12390596
Alignment:
Q  390 tgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaag 486  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||    
T  12390465 tgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacagggcccccgcaag 12390564  T
Q  487 tgggcggtgggattgttcccctcggattagtc 518  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12390565 tgggcggtgggattggtcccctcggattagtc 12390596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 343 - 463
Target Start/End: Original strand, 12591630 - 12591750
Alignment:
Q  343 aaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggt 442  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||     
T  12591630 aaacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctcgtgccaatttcagtgggc 12591729  T
Q  443 taaattcatacagagcttgct 463  Q
    ||| | |||||||||||||||    
T  12591730 taagtccatacagagcttgct 12591750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 348 - 543
Target Start/End: Original strand, 9208250 - 9208448
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    ||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  || |    
T  9208250 catttggggttgttctagtggttggattgggatcttggagtttgctcctctcaaggtctcaggttcgattccccctggtgccaatttcggtggg-caagt 9208348  T
Q  448 tcatacagag-cttgc--tggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
     ||||||||| |||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||||| |||||||||||  ||| |||||||    
T  9208349 ccatacagagccttgctttggctttaaatggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtctcctcagaatagtcgattcttggatcaaataccgagttt 9208448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 348 - 456
Target Start/End: Original strand, 13753238 - 13753346
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| |||||    
T  13753238 catttggggttggcctagtggttggctttggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcaattctctctggtgccaatttcggtgggctaaat 13753337  T
Q  448 tcatacaga 456  Q
     ||||||||    
T  13753338 ccatacaga 13753346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 352 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 9690833 - 9690639
Alignment:
Q  352 tggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcat 451  Q
    |||||||| |||||||||| | ||| ||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||||| | ||| |||  |||||||||||| ||| | |||    
T  9690833 tggggttgacctagtggttggtttgagattttggagtttgctcttccagaggtcttaggttcgatttcttctagtgtcaatttcggtgggctaagtccat 9690734  T
Q  452 acagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    ||||||||||  |||||||||||  || ||| | ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  9690733 acagagcttgctctggctttaaacggggccctcacaagtggacggtgggattggtcctctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 9690639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 348 - 543
Target Start/End: Original strand, 33499472 - 33499671
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttc-gattccctctggtgctaatttcggtgggttaaa 446  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| | |     
T  33499472 catttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctctcaaggtctcaggttcagattccctctggtgtcaatttcggtgggct-ag 33499570  T
Q  447 ttcatacagagc-ttgc--tggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagtt 542  Q
    | |||||| | | ||||  ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||| |||||| ||||||    
T  33499571 tccatacaaatctttgctttggctttaaatgggccctccacaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcagttgatggaccggataccgagtt 33499670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 348 - 433
Target Start/End: Original strand, 22576065 - 22576150
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatt 433  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  22576065 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcagattcgattccctctggtgccaatt 22576150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 374 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 17149629 - 17149482
Alignment:
Q  374 ttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagag-cttgc--tggcttta 470  Q
    ||||||||||||||| |||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || | ||||||||| |||||  ||||||||    
T  17149629 ttgggatcttggagtgtgctcctctcaaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggttgg-caagtccatacagagccttgctttggcttta 17149531  T
Q  471 aat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtc 518  Q
    ||| || ||||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  17149530 aatggggcccccgcaagtgaacggtgggattggtcccctcgaattagtc 17149482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 343 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 33718662 - 33718478
Alignment:
Q  343 aaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggt 442  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||       
T  33718662 aaacccatttagggttggtctagtggttggtttgggatcttggagtttacttctccagagatctcaggttcgattctctctggtgcaaattttggtgaac 33718563  T
Q  443 taaattcatacagagcttgctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 535  Q
    ||| | |||||||||         ||||||  || || | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33718562 taagtacatacagag---------tttaaacggggcctctgcaagtggacggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttggatcggata 33718478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 373 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 17706481 - 17706328
Alignment:
Q  373 cttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgctggctttaaa 472  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||  |||||||||||  ||| ||        |||  |||||||||||    
T  17706481 cttgggatcttggagtttgctcctccagaagtctcaagttcgattccttctggtgtcaatttcggtggactaattt--------gct--ctggctttaaa 17706392  T
Q  473 -tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 535  Q
     ||| ||| ||||||||| ||||| ||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17706391 ctgggccctcgcaagtggacggtgtgattggtttcctcggataagtcaattcttggatcggata 17706328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 348 - 441
Target Start/End: Original strand, 8479310 - 8479403
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtggg 441  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |   || | |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  8479310 catttggggttggcctagtggttgacttgggatcttggagtgtgctcctcttaagatttcaggttcgatttcctctggtgtcaatttcggtggg 8479403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 367 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 28968222 - 28968133
Alignment:
Q  367 ggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacaga 456  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||| | |  |||||||||||||||| | ||||||||    
T  28968222 ggttggcttgggatcttggagtttgctcctctagaggtctcagattcgattctctctagcgtcaatttcggtgggttaagtccatacaga 28968133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 343 - 501
Target Start/End: Original strand, 31039013 - 31039173
Alignment:
Q  343 aaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggt 442  Q
    |||| |||||||||||| || ||| ||| |||| | ||||||||||||||||| ||| || ||||| ||| |||||||||| ||   ||||||| ||||     
T  31039013 aaacccatttggggttgacccagtagttggctttgaatcttggagtttgctccaccaaagatctcaagtttgattccctctagtatcaatttcgatgggc 31039112  T
Q  443 taaattcatacagagcttgc--tggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattg 501  Q
    ||| | ||||||||| ||||  ||||| | ||||| ||||| ||||||||||||| |||||    
T  31039113 taagtccatacagagtttgctatggctatgaatggacccccacaagtgggcggtgtgattg 31039173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 448 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 15730594 - 15730496
Alignment:
Q  448 tcatacagagcttg--ctggctttaaatg-gccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| | | ||||| || |||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  15730594 tcatacagagcttgttctggctttaaacgtggcccccacacgtgggcggtgggattggtcacctcggattagtcgattctttgatcggatatcgagttt 15730496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 349 - 542
Target Start/End: Original strand, 10377714 - 10377911
Alignment:
Q  349 atttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaatt 448  Q
    |||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||| |||||      ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||  || |     
T  10377714 atttggggttggcccagttgttggcttgagatcttggagtgtgctcatgtcaaggtctcaggttcaattccctatggtgccaatttcggtgggc-aagtc 10377812  T
Q  449 catacagagcttg---ctggctttaaatgg--ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagtt 542  Q
    |||||| |||||    ||| ||| ||| ||  |||||| |||||||||||||| |||| |||||||||| |||||  | ||||||| ||||| ||||||    
T  10377813 catacatagctttgctctgacttaaaacggggccccccacaagtgggcggtggcattggtcccctcggagtagtcggtccttggattggataccgagtt 10377911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 478 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 14504148 - 14504083
Alignment:
Q  478 ccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  14504148 ccccgcaagtgggcggtgggattgatcctctcgaattagtcgatccttgtatcggataccgagttt 14504083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 482 - 519
Target Start/End: Original strand, 32596211 - 32596248
Alignment:
Q  482 gcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtca 519  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32596211 gcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtca 32596248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 479 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 27866268 - 27866217
Alignment:
Q  479 cccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatc 530  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  27866268 cccgcaagtgggcggtgggattagtcccctcgaattagtcgatttttggatc 27866217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 462 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 21903703 - 21903629
Alignment:
Q  462 ctggctttaaatggcccccc-gcaagtgggcggtgggattgttcccc-tcggattagtcaattcttggatcggat 534  Q
    ||||||||||||||  | || ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| |||||||||||||||    
T  21903703 ctggctttaaatggggcaccagcaagtgggcggtgggaatggtccccctcagattagtcgattcttggatcggat 21903629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 510 - 543
Target Start/End: Original strand, 4797260 - 4797293
Alignment:
Q  510 ggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4797260 ggattagtcgattcttggatcggataacgagttt 4797293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 478 - 543
Target Start/End: Original strand, 17225797 - 17225862
Alignment:
Q  478 ccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || |||| ||||||||  | ||| ||||||||| |||||||    
T  17225797 ccccgcaaatgggcggtgggattgatctcctcagattagtcggtccttagatcggatatcgagttt 17225862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 375 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 28742013 - 28741948
Alignment:
Q  375 tgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgg 440  Q
    |||||||||||||| |||||| |   ||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||    
T  28742013 tgggatcttggagtgtgctcctctcaaggtctcaggttcgattcgttctggtgttaattttggtgg 28741948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 401 - 441
Target Start/End: Original strand, 6385921 - 6385961
Alignment:
Q  401 aggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtggg 441  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  6385921 aggtctcaggttcgattctctccggtgctaatttgggtggg 6385961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 137; Significance: 3e-71; HSPs: 71)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 343 - 543
Target Start/End: Original strand, 7275274 - 7275477
Alignment:
Q  343 aaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggt 442  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  7275274 aaacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggc 7275373  T
Q  443 taaattcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacga 539  Q
    ||| | |||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  7275374 taagtccatacagagcttgctctggctttaaacagggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccga 7275473  T
Q  540 gttt 543  Q
    ||||    
T  7275474 gttt 7275477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 348 - 543
Target Start/End: Original strand, 22119890 - 22120088
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |    
T  22119890 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagt 22119989  T
Q  448 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
     |||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  22119990 ccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 22120088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 348 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 40543109 - 40542911
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |    
T  40543109 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagt 40543010  T
Q  448 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
     |||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  40543009 ccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 40542911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 348 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 7176061 - 7175871
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |    
T  7176061 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagt 7175962  T
Q  448 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 535  Q
     |||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7175961 ccatacagagcttgctctggctttaaacaggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggata 7175871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 348 - 543
Target Start/End: Original strand, 2751273 - 2751471
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |    
T  2751273 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagt 2751372  T
Q  448 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
     |||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  2751373 ccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaaatgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 2751471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 348 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 21218032 - 21217834
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| |    
T  21218032 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctgatgccaatttcggtgggctaagt 21217933  T
Q  448 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
     |||||||||||||  || ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  21217932 ccatacagagcttgctctagctttaaacgggccccccacaagtgggcggtgggattgatcccctcggattagttgattcttggatcggataccgagttt 21217834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 348 - 543
Target Start/End: Original strand, 21835153 - 21835351
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |    
T  21835153 catttagggttgacctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagagatctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagt 21835252  T
Q  448 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
     |||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  21835253 ccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggatatcgagttt 21835351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 343 - 543
Target Start/End: Original strand, 11997846 - 11998049
Alignment:
Q  343 aaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggt 442  Q
    |||| |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||     
T  11997846 aaacccatttgtggttgggctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctctagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggttggc 11997945  T
Q  443 taaattcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacga 539  Q
    ||| | |||||| ||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||    
T  11997946 taagtccatacatagcttgctctggctttaaactgggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcgaattagtcgattcttggatcggataccga 11998045  T
Q  540 gttt 543  Q
    ||||    
T  11998046 gttt 11998049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 348 - 543
Target Start/End: Original strand, 2103057 - 2103253
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| |    
T  2103057 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggagccaatttcggtgggctaagt 2103156  T
Q  448 tcatacagagcttg--ctggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
     |||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| | ||||||||| |||||||    
T  2103157 ccatacagagcttgctctggctttaaatggggcccccgcaagtgggcggtgggattggt-ccctcggattagtcgattcat-gatcggataccgagttt 2103253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 348 - 543
Target Start/End: Original strand, 10091190 - 10091387
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| |    
T  10091190 catttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggagccaatttcggtgggctaagt 10091289  T
Q  448 tcatacagagcttg--ctggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
     |||||||||||||  |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| |||| |||||||    
T  10091290 ccatacagagcttgctctggctttaaatggggtccccgcaagtgggcggtgggattgatcccctcggattagtcgattctt-gatccgataccgagttt 10091387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 348 - 543
Target Start/End: Original strand, 18044109 - 18044307
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| |    
T  18044109 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcccaggttcgattccctcttgtgccaatttcggtgggctaagt 18044208  T
Q  448 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
     |||||||||||||  |||||||||||  || ||||| |||||||| ||||| |||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  18044209 ccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccacaagtgggtggtggaattggtcccctcagattagtcgattcttggatcggataccgagttt 18044307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 348 - 543
Target Start/End: Original strand, 28089818 - 28090019
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||| |    
T  28089818 catttggggttggcctagtggttggcttgagatcttggagtttgctcctccagatgtctcaggttcgataccctctggtgtcaatttcggtgggctaagt 28089917  T
Q  448 tcataca----gagcttg--ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagt 541  Q
     ||||||    |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  28089918 ccatacaaagtgagcttgctctggctttaaatgggcccccgcaagtgggcgatgagattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagt 28090017  T
Q  542 tt 543  Q
    ||    
T  28090018 tt 28090019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 348 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 17197149 - 17196951
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    |||||||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| |    
T  17197149 catttggggtcggcctagtggttggtttgcgatcttggagtttgctcctccataggtctcaagttcgattccctctggtgccaatttcggtgagctaagt 17197050  T
Q  448 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
     |||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  17197049 ccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcgaattagtcgattcttggatcggataccgagttt 17196951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 346 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 23012709 - 23012509
Alignment:
Q  346 ctcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaa 445  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||||| |||    
T  23012709 ctcatttagggttggcccagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtcttaggtttgattccctctagtgccaatttcggtgggctaa 23012610  T
Q  446 attcatacagagcttg--ctggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagtt 542  Q
     | |||||||||||||  |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  23012609 gtccatacagagcttgctctggctttaaatggggcccccacaagtgggcggtgggattggtcccctcgtattagtcaattcattgatcggataccgagtt 23012510  T
Q  543 t 543  Q
    |    
T  23012509 t 23012509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 363 - 535
Target Start/End: Original strand, 22703503 - 22703678
Alignment:
Q  363 tagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg- 461  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| | |||||| ||||||     
T  22703503 tagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacaaagcttgc 22703602  T
Q  462 -ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 535  Q
     |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  22703603 tctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattctttgatcggata 22703678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 388 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 654863 - 654706
Alignment:
Q  388 tttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct--ggctttaaatggccccccgcaa 485  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||    
T  654863 tttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacgggcccccgcaa 654764  T
Q  486 gtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  654763 gtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcggttcttggatcggataccgagttt 654706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 343 - 535
Target Start/End: Original strand, 17212050 - 17212245
Alignment:
Q  343 aaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggt 442  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||     
T  17212050 aaacccatttggggttggcttagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcaattctctctggtgccaatttcggtgggc 17212149  T
Q  443 taaattcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 535  Q
    ||| | ||||||||| |||  ||||||| |||  || |||| ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  17212150 taagtccatacagagattgctctggcttaaaacgggacccctgcaagtgagtggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcagata 17212245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 348 - 543
Target Start/End: Original strand, 2344301 - 2344499
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||| |    
T  2344301 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaagctctcagattcgattccttctggtgccaattttggtgggctaagt 2344400  T
Q  448 tcatacagagc--ttgctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
     ||||||||||  ||  ||||||||||  || |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||    
T  2344401 ccatacagagctttttttggctttaaacgggacccccgcaagtgagcggtgggattggtcccctcggattagtcggtccttggatcggataccgagttt 2344499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 349 - 543
Target Start/End: Original strand, 27312155 - 27312352
Alignment:
Q  349 atttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaatt 448  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||| || |  || |     
T  27312155 atttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctctagaggtttcaggttcgattccctctagtgccaatttcgatgtgccaagtc 27312254  T
Q  449 catacagagct--tgctggctttaaatgg-ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    |||||||||||    ||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  27312255 catacagagctacctctgactttaaacggagcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcagattagtcgattcttggatcggataccgagttt 27312352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 348 - 543
Target Start/End: Original strand, 27009361 - 27009560
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |    
T  27009361 catttggggttggcctagtggttggcttcggatcttggagtttgctcatccagaggtctcaggttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagt 27009460  T
Q  448 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgc-aagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
     |||||||||||||  ||| |||||||  || |||| || |||||| ||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  27009461 ccatacagagcttgctctgactttaaacggggcccctgcaaagtggacggtgggattggtcccctcaaattagtcgattcttggattggataccgagttt 27009560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 343 - 543
Target Start/End: Original strand, 22638289 - 22638488
Alignment:
Q  343 aaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggt 442  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||  |||| |||||| ||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22638289 aaacccatttggggttggtctagtggttgacttgagatcttagagtttgctctttcaaaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggt 22638388  T
Q  443 taaattcatacagagcttgct--ggctttaaatggcccc-ccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacga 539  Q
    ||| ||||    |||||||||  ||||||||| ||  || |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||    
T  22638389 taagttca----gagcttgctctggctttaaacggggcctccgcaagtgggcggtgggattgatctcctcgaattagtcgattcttggatcggataccga 22638484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 347 - 543
Target Start/End: Original strand, 27704003 - 27704201
Alignment:
Q  347 tcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaa 446  Q
    |||||||| ||||| | ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| |||     
T  27704003 tcatttggagttggtccagtggttggcttgagatcttgaagtttgctcctacagaggtctcaggttcgatttcctttggtgccaatttcggtgggctaag 27704102  T
Q  447 ttcatacagagcttgc--tggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    | |||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||| |||| |||||||    
T  27704103 tccatagagagcttgctttggctttaaatggacccccgcaagtgggtggtgtgattgatcccctcagattagtcgattcttgaatcagataccgagttt 27704201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 355 - 543
Target Start/End: Original strand, 28950877 - 28951071
Alignment:
Q  355 ggttggcctagtggttagcttgggatcttggagt---ttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcat 451  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||   |||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||    
T  28950877 ggttggcctagtggttggcttggggtcttggagtagtttgctccttcagaggtctcaggttcgactccctctggtgccaatttcggtgggctaagttcat 28950976  T
Q  452 acagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    | ||||||||  |||||||||||  || ||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  28950977 atagagcttgctctggctttaaacgggtccctcgcaagtcggcggtgggattggtcccctcgaactagacaattcttggatcggataccgagttt 28951071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 355 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 42913705 - 42913514
Alignment:
Q  355 ggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcataca 454  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | | |||||| ||||||| |||| ||| | |||||     
T  42913705 ggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctctagaggtctcaggttcgatttcatatggtgccaatttcgatgggataagtccatacg 42913606  T
Q  455 gagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    || ||||  |||||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||    
T  42913605 gaacttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtggacggtgggattggtcccctcggattagttgattcttagatcggataccgagttt 42913514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 348 - 543
Target Start/End: Original strand, 19421233 - 19421431
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||| |||| ||| |    
T  19421233 catttggggttgacttagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctctagaggtctcaggttcgatttcttctggtgtcaatttcgatgggctaagt 19421332  T
Q  448 tcatacagagcttg--ctggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
     |||||||||||||  ||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||    
T  19421333 ccatacagagcttgctctgactttaaatggggcgcccacaagtgggcggtgggattggtctcctcggattagtcgattcttgaatcagataccgagttt 19421431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 348 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 7800031 - 7799902
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |    
T  7800031 catttggggttgacctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcagtgggttaagt 7799932  T
Q  448 tcatacagagcttgc--tggctttaaatgg 475  Q
     |||| |||||||||  |||||||||||||    
T  7799931 ccatagagagcttgctatggctttaaatgg 7799902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 386 - 543
Target Start/End: Original strand, 16374034 - 16374194
Alignment:
Q  386 agtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgc--tggctttaaa-tggccccccg 482  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||  ||||  ||||||||||  || ||||||    
T  16374034 agtttgctcctccagaggtctcagattcgattccctctggtgccaatttcggtgggttaagtccatacagaatttgctatggctttaaacgggacccccg 16374133  T
Q  483 caagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  16374134 caaatggacggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 16374194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 373 - 543
Target Start/End: Original strand, 31273941 - 31274113
Alignment:
Q  373 cttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctggcttta 470  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||  |||||||||    
T  31273941 cttgggatcttggagtttgctcctccagagctctcaagttcgattccctctggagctaatttcggcgggctaagtccatacagagcttgctctggcttta 31274040  T
Q  471 aatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    || ||  | |||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||||    
T  31274041 aacggggctccgcaagtgggcagtgagattggtcccctcgaattagtcgattcttggaccggataccgagttt 31274113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 343 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 13332627 - 13332510
Alignment:
Q  343 aaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggt 442  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||     
T  13332627 aaactcatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctcctgaggtctcaggtacgattccctctggagccaatttcggtgggc 13332528  T
Q  443 taaattcatacagagctt 460  Q
    ||| | ||||||||||||    
T  13332527 taagtccatacagagctt 13332510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 398 - 543
Target Start/End: Original strand, 29861722 - 29861870
Alignment:
Q  398 cagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct--ggctttaaatggc-cccccgcaagtgggcggt 494  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||| ||||||  ||||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  29861722 cagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagaacttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggt 29861821  T
Q  495 gggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  29861822 gggattgatcccctcgaattagtcgattcttagatcggataccgagttt 29861870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 343 - 543
Target Start/End: Original strand, 32849588 - 32849791
Alignment:
Q  343 aaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggt 442  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||   ||||| ||||||     
T  32849588 aaacccatttggggttagcctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcgggtttgattccctctagtctcaattttggtgggc 32849687  T
Q  443 taaattcatacagagcttg--ctggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacga 539  Q
    ||| | || || |||||||  |||||||||||| || | |||  |||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||    
T  32849688 taagtccacactgagcttgctctggctttaaatgggactcccataagtgggcagtgggattggtcccctcagattagtcgattcttggatcggataccga 32849787  T
Q  540 gttt 543  Q
    ||||    
T  32849788 gttt 32849791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 348 - 543
Target Start/End: Original strand, 31197593 - 31197790
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||  | || ||  ||||||||||| |||| |    
T  31197593 catttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcatccagatgtctcaggtttgattcattatg-tgtcaatttcggtggattaagt 31197691  T
Q  448 tcatacagagcttgctg--gctttaaatggc-cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
     |||||||| ||||||   |||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  31197692 ccatacagatcttgctcttgctttaaacggggcccccgcaagtggtcggtgggattggtcccctcagattagtcgattcttggatcggatatcgagttt 31197790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 348 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 39145851 - 39145661
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    |||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| |    
T  39145851 catttgaggttgacctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccagatgtcttcggttcgattccctgtggtgccaatttcggtgggctaagt 39145752  T
Q  448 tcat-acagagcttg--ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 535  Q
      || ||||||||||  ||||||||||| || |||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||    
T  39145751 caataacagagcttgctctggctttaaacgggcccctgcaagtggacggtgggattggtcccctcgaattagtcgattcttgaatcagata 39145661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 342 - 533
Target Start/End: Original strand, 25333415 - 25333593
Alignment:
Q  342 taaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtggg 441  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||| ||||    
T  25333415 taaacccatttggggttggcttagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgataccctctggcaccaatttcgttggg 25333514  T
Q  442 ttaaattcatacagagcttgctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcgga 533  Q
    |||| |              ||| |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25333515 ttaact--------------ctgactttaaacaggccccccgcaagtgggcagtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcgga 25333593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 343 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 43785503 - 43785303
Alignment:
Q  343 aaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggt 442  Q
    |||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||      
T  43785503 aaacccatttggggttgacctaatggttggcttgggatctttgagattgctcctccaaaggtctcaagttcgattcccacttgtgctaatttcagtggac 43785404  T
Q  443 taaattcatacagagctt--gctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacga 539  Q
    ||| | ||||||||||||   |||| ||||||  || || |||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||| ||| |||||||||||| |||    
T  43785403 taagtccatacagagcttactctggttttaaacggggcctccgcaagtggacggtgagattggtccccttggattagtcgatttttggatcggataccga 43785304  T
Q  540 g 540  Q
    |    
T  43785303 g 43785303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 360 - 441
Target Start/End: Original strand, 22299863 - 22299944
Alignment:
Q  360 gcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtggg 441  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22299863 gcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaagttcgattccctctggtgccaatttcggtggg 22299944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 348 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 31713094 - 31712903
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | |||| |||||||||| |||        | ||| |    
T  31713094 catttggggttggcctagtggttggtttgggatcttggagtttgctcctcgagaggtctcaggattgatttcctctggtgccaat-------agataagt 31713002  T
Q  448 tcatacagagctt--gctggctttaa-atggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
     ||||||  ||||   ||||||||||   || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  31713001 ccatacaacgcttactctggctttaagcgggaccctcgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 31712903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 343 - 418
Target Start/End: Original strand, 23854393 - 23854468
Alignment:
Q  343 aaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattc 418  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23854393 aaacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattc 23854468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 417 - 543
Target Start/End: Original strand, 23092167 - 23092296
Alignment:
Q  417 tccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct--ggctttaaatggc-cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggat 513  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||||  ||||||||| ||  ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  23092167 tccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaaatggacggtgggattggtcccctcggat 23092266  T
Q  514 tagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  23092267 tagtcgattcatggatcggataccgagttt 23092296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 401 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 41907659 - 41907515
Alignment:
Q  401 aggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctggctttaaatg-gccccccgcaagtgggcggtggg 497  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||| | ||||||||| |||  ||||||||||| | | |||||||||||||| ||||||    
T  41907659 aggtctcaggttcgattctctctggtgccaatttcagtgggctaagtccatacagaggttgctctggctttaaacgtggcccccgcaagtgggtggtggg 41907560  T
Q  498 attgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    |||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  41907559 attggtcccc-cagattagtcgattcttggatcggataccgagttt 41907515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 430 - 543
Target Start/End: Original strand, 3851841 - 3851957
Alignment:
Q  430 aatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct--ggctttaaatggc-cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttg 526  Q
    |||||||||||| ||| | |||| ||||||||||  ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  3851841 aatttcggtgggctaagtccatatagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 3851940  T
Q  527 gatcggataacgagttt 543  Q
    ||||||||| |||||||    
T  3851941 gatcggataccgagttt 3851957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 348 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 23330938 - 23330740
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||| |||||| |   ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||  || |    
T  23330938 catttggggttagcctagtggttggcttgggattttagagtgtgctcctctcaaggtctcaggttcgactccctccggtgccaatttcggtggg-caagt 23330840  T
Q  448 tcatacagagctt---gctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
     ||||||||||||    ||||||| |||  || || |||||||||||||||  ||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  23330839 ccatacagagctttgctctggcttaaaacgggacctccgcaagtgggcggtaagattggtcccctcaaattagtcaatccttggatcggataccgagttt 23330740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 378 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 36772471 - 36772304
Alignment:
Q  378 gatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct--ggctttaaatgg 475  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| || ||  ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  36772471 gatcttggagtttgctcctctagaggtctcaggtttgatttccccta-tgccaatttcggtgggctaagttcatacagagcttgctctggctttaaacgg 36772373  T
Q  476 c-cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
      ||||||  |||||||||||| |||  ||| |||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  36772372 ggcccccgggagtgggcggtggaattagtcctctcggattagtcgattctttgatcggataccgagttt 36772304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 349 - 543
Target Start/End: Original strand, 28646972 - 28647169
Alignment:
Q  349 atttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaatt 448  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||| | |   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || |     
T  28646972 atttggggttggcctagtgattgacttgggatcttggagtgtgcttctctcaaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtggg-caagtc 28647070  T
Q  449 catacagagctt---gctggctt-taaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
     |||||||| ||    ||||||| |||  || ||||| ||||||||||||||||||| | |||||| |||||||  | ||||||||||||| |||||||    
T  28647071 aatacagagttttgctctggcttataacggggcccccacaagtgggcggtgggattggttccctcgaattagtctgtccttggatcggatatcgagttt 28647169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 348 - 531
Target Start/End: Original strand, 9683828 - 9684014
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||    ||||||||| |||| |||||||||||| ||| |    
T  9683828 catttgcggttggcctagtggttgacttgagatctgggagtttgctcctctagaggtctcaggcctaattccctctagtgccaatttcggtgggctaagt 9683927  T
Q  448 tcatacagagctt--gctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcg 531  Q
     ||||| ||||||   |||||||||||  ||  |||| |||||||||||| |||| | ||||||||||||| || ||||||||||||    
T  9683928 ccataccgagcttactctggctttaaacggggtccccacaagtgggcggtaggataggtcccctcggattaatcgattcttggatcg 9684014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 349 - 463
Target Start/End: Original strand, 42814867 - 42814981
Alignment:
Q  349 atttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaatt 448  Q
    |||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |     
T  42814867 atttggagttggcttagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctcttgaagtctcaggttcgattccctctggtgtcaatttcggtgggctaagtc 42814966  T
Q  449 catacagagcttgct 463  Q
    |||||| ||||||||    
T  42814967 catacaaagcttgct 42814981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 344 - 543
Target Start/End: Original strand, 22696318 - 22696521
Alignment:
Q  344 aactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggtt 443  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||| |   |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||      
T  22696318 aactcattaggggttggcctagtggttgatttgggatcttggagtgtgctcctctcaaggtctcaggtttgattccctctggtgccaatttcggtggg-- 22696415  T
Q  444 aaattcatacagagctt---gctggctttaaa--tggccccc-cgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataac 537  Q
     | | ||||||||||||    |||||||  ||   ||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||  | ||||||||||||| |    
T  22696416 gactccatacagagctttgctctggcttagaacgaggcccccgcgcaagtaggcggcgggattggtcctctcggattagtcggtccttggatcggatacc 22696515  T
Q  538 gagttt 543  Q
    ||||||    
T  22696516 gagttt 22696521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 348 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 9718186 - 9718071
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    |||||| |||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||| |    
T  9718186 catttgaggttggcctagtggttggcctgagatattggagtttgctcctccaaaagtctcaagttcgattccctctggtgtcaatttcgatgggctaagt 9718087  T
Q  448 tcatacagagcttgct 463  Q
     |||| ||||||||||    
T  9718086 ccatagagagcttgct 9718071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 348 - 423
Target Start/End: Original strand, 21370599 - 21370674
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctct 423  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||||    
T  21370599 catttggggttggcctagtggttggtttgggatcttggagtttactccttcagatgtctcaggttcgattccctct 21370674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 374 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 14199839 - 14199713
Alignment:
Q  374 ttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctggctttaa 471  Q
    |||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| |||||| ||| |  ||| ||||||||  ||| ||||||    
T  14199839 ttggaatcttggagtttcctcctccagaggtctcaggttcgattccctctaatgccaattttggtgggctaagtctatatagagcttgctctgcctttaa 14199740  T
Q  472 atggccccccgcaagtgggcggtggga 498  Q
    | ||  ||||||||||||| |||||||    
T  14199739 acggggccccgcaagtgggtggtggga 14199713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 348 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 21574302 - 21574103
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgatt-ccctctggtgctaatttcggtgggttaaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| |||||| |   ||||| ||||||||||| |||| |||||| || |||||||||  ||     
T  21574302 catttggggttggcctagtggttggtttgggattttggagtgtgctcctctcaaggtcacaggttcgattcccctttggtgccaacttcggtggg-caag 21574204  T
Q  447 ttcatacagagctt---gctggctt-taaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagtt 542  Q
    | ||||||||||||    | |||||  ||  || ||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||    
T  21574203 tccatacagagctttgcccaggcttagaacggggcccccacaagtaggcggtgagattggtcccctcggattagtcggtccttggatcggataccgagtt 21574104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 348 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 8435894 - 8435801
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtggg 441  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||     || ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  8435894 catttggggttggtctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctttgaagatcttaggttcgatttcctctggtgccaatttcggtggg 8435801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 348 - 441
Target Start/End: Original strand, 40332101 - 40332194
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtggg 441  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| |||||  ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||    
T  40332101 catttggagttggtctagtggttggcttgaaatcttggagtttgctcctctaaaggtctcaggttcgatttcctctggtgtcaatttcgatggg 40332194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 348 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 12211734 - 12211646
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcg 436  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| |   || ||||||||| |||| |||||||||| |||||||    
T  12211734 catttggggttggcctagtggttggcttaggatcttggagtgtgctcctctcaagatctcaggtttgatttcctctggtgccaatttcg 12211646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 344 - 394
Target Start/End: Original strand, 577677 - 577727
Alignment:
Q  344 aactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctc 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  577677 aactcatttggggttggcctagtggtttgcttgggatcttagagtttgctc 577727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 374 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 22643515 - 22643351
Alignment:
Q  374 ttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctggctttaa 471  Q
    ||||||||||| ||||| |||| | |||||||| | |||||||| |||||| ||  ||||||||| || ||| | |||||||||||||  ||| ||||||    
T  22643515 ttgggatcttgaagtttactccactagaggtcttatgttcgatttcctctgatgtcaatttcggtaggctaagtccatacagagcttgctctgactttaa 22643416  T
Q  472 atgg-ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 535  Q
    | ||  ||| ||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||| || |||||| |||| ||||    
T  22643415 acggagccctcgcaagtggccggtgtgattagtcccctcggattaatcgattctttgatcagata 22643351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 347 - 412
Target Start/End: Original strand, 28003837 - 28003902
Alignment:
Q  347 tcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggtt 412  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||    
T  28003837 tcatttggggttgatctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaagtcttaggtt 28003902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 449 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 8943500 - 8943410
Alignment:
Q  449 catacagagcttg--ctggctttaaatgg--ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 535  Q
    |||||||||||||  |||| |||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||||    
T  8943500 catacagagcttggtctggttttaaacgggcccccccgcaagtgggcggtgtgattggtccccttgaattagtcgattcttggatcggata 8943410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 465 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 33137904 - 33137826
Alignment:
Q  465 gctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  33137904 gctttaaatggggccctgcaagtgggcggtgaaattggtcccctcgaattagtcgattcttagatcggatatcgagttt 33137826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 340 - 417
Target Start/End: Original strand, 1469106 - 1469183
Alignment:
Q  340 tataaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgatt 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||| ||  |   |||||||||||||||||    
T  1469106 tataaactcatttggggttggcctagtggttgacttgaaatcttggagtttgttcatctcaaggtctcaggttcgatt 1469183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 345 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 3951193 - 3951096
Alignment:
Q  345 actcatttggggttggcctagtggttagctt-gggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtggg 441  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| |   | ||||| |||||| ||  ||||| ||||||||||||||||    
T  3951193 actcatttggggttggtctagtggttggcttggggatcttggagtgtgctcctctcaaagtctcgggttcgcttttctctgatgctaatttcggtggg 3951096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 342 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 22264707 - 22264622
Alignment:
Q  342 taaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtg 427  Q
    ||||| ||||||||||||||| |  |||| | |||| ||||||||||||||||| |   ||||||||| |||||||||||||||||    
T  22264707 taaacccatttggggttggccgaagggttggtttggaatcttggagtttgctcctctcaaggtctcagattcgattccctctggtg 22264622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 3950991 - 3950895
Alignment:
Q  345 actcatttggggttggcctagtggttagcttggga-tcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgg 440  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||  |||||| |   | |||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  3950991 actcatttggggttggtctagtggttggcttgagaatcttggagcgtgctcctctcaatgtctcatgttcgattccctttggtgctaattttggtgg 3950895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 414 - 463
Target Start/End: Original strand, 6491675 - 6491724
Alignment:
Q  414 gattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct 463  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  6491675 gattccctctggtgtcaatttcgatgggctaaattcatacagagcttgct 6491724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 401 - 445
Target Start/End: Original strand, 21558187 - 21558231
Alignment:
Q  401 aggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaa 445  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  21558187 aggtctcaggttcgattctctctggtgccaatttaggtgggttaa 21558231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 344 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 38864649 - 38864553
Alignment:
Q  344 aactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgg 440  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||| ||||||| |   ||||| |||||| ||| |||||| | | |||| |||||||||||    
T  38864649 aactcatttggggttgacctagtggttgacttgagatctttgagtttgtttttccagaagtctcacgtttgattccttttagtgccaatttcggtgg 38864553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 348 - 530
Target Start/End: Original strand, 36173037 - 36173223
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    ||||||||||||||||  || ||  |||||||| |||||||||| ||  |   |||| |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||  || |    
T  36173037 catttggggttggccttatgattgacttgggattttggagtttgttcatctcaaggtttcaggttcgattccctcttgtgccaattttggtggg-caagt 36173135  T
Q  448 tcatacagagct---tgctggctttaaatgg--ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatc 530  Q
     |||||||||||     || | || ||||||  ||||||| |||| |||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  36173136 ccatacagagctaagctcttgtttaaaatgggcccccccgtaagttggcgctgggattggtcctctcgaattagtcaattcttcgatc 36173223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 478 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 1766210 - 1766153
Alignment:
Q  478 ccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 535  Q
    |||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  | |||| ||||||||    
T  1766210 ccccacaagtgggcggttggattggtcccctcggattagtcggtacttgaatcggata 1766153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 425 - 518
Target Start/End: Original strand, 21373789 - 21373885
Alignment:
Q  425 gtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct--ggctttaaatggc-cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtc 518  Q
    |||| |||||||||||| ||| |  ||||||||||||||  ||||||||| ||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||||    
T  21373789 gtgccaatttcggtgggctaagtctatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtggacggtgagattggtcctcacggattagtc 21373885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 489 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 30345564 - 30345511
Alignment:
Q  489 ggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagtt 542  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||| ||||||||| ||||||    
T  30345564 ggcggtgggattggtcccctcgggttagtcggttcttagatcggataccgagtt 30345511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 354 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 26459477 - 26459394
Alignment:
Q  354 gggttggcctagtggt--tagcttgggatcttggagtttgctcccccaga-ggtctcaggttcgattccctctggtgctaattt 434  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||| || ||||| |||||| ||  | ||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  26459477 gggttggcctagtggtattggcttgggacctgggagtgtgctcctcctcaaggtctcaggttcgattctctctggtgccaattt 26459394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 136; Significance: 1e-70; HSPs: 68)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 348 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 8484860 - 8484662
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||| |    
T  8484860 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggtttgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagt 8484761  T
Q  448 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  8484760 tcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 8484662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 348 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 11926701 - 11926502
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||| |    
T  11926701 catttggggttggcctagtggttggtttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttagattccctctggtgccaatttcggtgggctaagt 11926602  T
Q  448 tcatacagagcttg--ctggctttaaa--tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
     |||||||||||||  |||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  11926601 ccatacagagcttgctctggctttaaacggggccccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 11926502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 351 - 535
Target Start/End: Original strand, 38684209 - 38684395
Alignment:
Q  351 ttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattca 450  Q
    |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||    
T  38684209 ttggggttggcccagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtcca 38684308  T
Q  451 tacagagcttg--ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 535  Q
    |||||||||||  ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38684309 tacagagcttgctctggctttaaacgggcccccgcaagtgagcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggata 38684395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 348 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 15641304 - 15641107
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| |    
T  15641304 catttggggttagcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggagccaatttcggtgggctaagt 15641205  T
Q  448 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
     |||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  15641204 ccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattctt-gatcggataccgagttt 15641107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 348 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 27498930 - 27498732
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |    
T  27498930 catttggggttgacctagtggttggcttggaatcttggagtttgctcctctagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagt 27498831  T
Q  448 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
     |||||| ||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  27498830 ccatacatagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 27498732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 348 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 32059639 - 32059441
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| |    
T  32059639 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccttctggtgccaatttcggtgggctaagt 32059540  T
Q  448 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
     |||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||    
T  32059539 ccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcggtccttggatcggataccgagttt 32059441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 343 - 543
Target Start/End: Original strand, 30485821 - 30486024
Alignment:
Q  343 aaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggt 442  Q
    |||| ||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||     
T  30485821 aaacccatttggggttggcccagcggttggcttgggatcttggagtttgctccttcagaggtctcaggttcgattcactctggtgtcaatttcggtgggc 30485920  T
Q  443 taaattcatacagagcttg--ctggctttaaatg-gccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacga 539  Q
    ||| | |||||||||||||  ||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  30485921 taagtccatacagagcttgctctggctttaaacgatgcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcaattcttggatcggataccga 30486020  T
Q  540 gttt 543  Q
    ||||    
T  30486021 gttt 30486024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 367 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 19456389 - 19456212
Alignment:
Q  367 ggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct--g 464  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||||  |    
T  19456389 ggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgat-ccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctg 19456291  T
Q  465 gctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  19456290 gctttaaacggggccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 19456212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 354 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 33709694 - 33709512
Alignment:
Q  354 gggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatac 453  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||    
T  33709694 gggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaagttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatac 33709595  T
Q  454 agagcttgctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 535  Q
    ||||    |||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33709594 agagagctctggctttaaacgggacccccacaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggata 33709512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 348 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 13038653 - 13038464
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||| |    
T  13038653 catttggggttggcctagtggttggtttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaattttgatgggctaagt 13038554  T
Q  448 tcatacagagcttg-ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 535  Q
    |||||||||||  |  ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  13038553 tcatacagagcaagtatggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattgatcccctcgaattagtcgattcttggatcggata 13038464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 348 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 13108648 - 13108459
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||| |    
T  13108648 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagagatctcaggttcgattccctctggtgccaattttgatgggctaagt 13108549  T
Q  448 tcatacagagcttg-ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 535  Q
    |||||||||||  | ||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  13108548 tcatacagagcaagtctgcctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattgatcccctcgaattagtcgattcttggatcggata 13108459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 374 - 543
Target Start/End: Original strand, 18207231 - 18207403
Alignment:
Q  374 ttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctggctttaa 471  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||  ||||||||||    
T  18207231 ttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctccggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgttctggctttaa 18207330  T
Q  472 atg-gccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    | | | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  18207331 acgaggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 18207403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 342 - 543
Target Start/End: Original strand, 34310134 - 34310338
Alignment:
Q  342 taaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtggg 441  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  34310134 taaacccatttggggttggcctagtggtcggcttggaatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaattttggtggg 34310233  T
Q  442 ttaaattcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacg 538  Q
     ||| | |||||||||||||  |||||||||||  || |||||  |||||| ||||||||||| |||||||| |||| || |||||||||||||||| ||    
T  34310234 ctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacgggacccccataagtggacggtgggattggtcccctcgaattaatcgattcttggatcggataccg 34310333  T
Q  539 agttt 543  Q
    |||||    
T  34310334 agttt 34310338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 348 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 19145610 - 19145413
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |   ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  || |    
T  19145610 catttggggttggcctagtggttgacttgggatcttggagtatgctcctctcaaggtctccggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggc-aagt 19145512  T
Q  448 tcatacagagcttg---ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
     ||||||||||||    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||    
T  19145511 ccatacagagctttgctctggctttaaatggtcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttggttcttggatcggataccgagttt 19145413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 343 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 31288150 - 31287947
Alignment:
Q  343 aaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggt 442  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  31288150 aaacccattttgggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcatgttcgattccctttggtgccaatttcggtgggt 31288051  T
Q  443 taaattcatacagagcttgc--tggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacga 539  Q
    ||| | |||||| |||||||  || |||||||  || ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||  |||||||| |||||| |||    
T  31288050 taagtccatacaaagcttgctttgactttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtctcctcgaattagtcggttcttggaccggataccga 31287951  T
Q  540 gttt 543  Q
    ||||    
T  31287950 gttt 31287947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 361 - 543
Target Start/End: Original strand, 37495058 - 37495250
Alignment:
Q  361 cctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagctt 460  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| | ||||||||||||    
T  37495058 cctagtggttggcttgagatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaattttggtgggctaagtccatacagagctt 37495157  T
Q  461 g--ctggctttaaatggccc--------cccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    |  ||||||||||| | |||        ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  37495158 gctctggctttaaacgcccccccccccgcccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 37495250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 348 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 7085825 - 7085627
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||| |    
T  7085825 catttggggctggcttagtggttggcttgggatcttggagttttctcctccagaggtctccggttcgattccctctagtgtcaatttcggtgggctaagt 7085726  T
Q  448 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
     |||||||||||||  ||| |||||||  ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  7085725 ccatacagagcttgctctgactttaaacggggtccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttgaatcggataccgagttt 7085627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 348 - 535
Target Start/End: Original strand, 36954816 - 36955006
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||| |    
T  36954816 catttggggttggcctagtggttgccttgggatcttggagtttgctcctctagaggtctcaggttcgattccctctggttctaatttcggcgtgctaagt 36954915  T
Q  448 tcatacagagcttgc--tggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 535  Q
     ||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||  |||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  36954916 ccatacagagtttgctttggctttaaatgggccccccgcaagtggactgtgggattagtcccctcatattagtcgattcttggatcggata 36955006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 348 - 543
Target Start/End: Original strand, 4603775 - 4603973
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||| |    
T  4603775 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaagatctcaagttcgattccttctggtgccaatttcgatgggctaagt 4603874  T
Q  448 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
     ||||||||||| |  |||||||||||  || |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||    
T  4603875 ccatacagagctcgctctggctttaaacggggcccctgcaagtggacggtgggattggtcccctcggattagtcggtccttggatcggataccgagttt 4603973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 348 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 11465106 - 11464917
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||| |    
T  11465106 catttcgggttggcctagtgattggcttgaaatcttggagtttgctcctccaaatgtctcaggttcgatttcctctggtgccaattttggtgggctaagt 11465007  T
Q  448 tcatacagagctt--gctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 535  Q
    |||||||||||||   ||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  11465006 tcatacagagcttactctggctttaaacggggccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcgaattagtcgattcttggatcggata 11464917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 356 - 535
Target Start/End: Original strand, 42193491 - 42193671
Alignment:
Q  356 gttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacag 455  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||| |  ||||||    
T  42193491 gttggcctagtggttgacttgggatcttggagtttgcttccccagaggtctcaggttcgatttcctctgatgccaatttcggtgggctaagtctatacag 42193590  T
Q  456 agcttgc--tggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 535  Q
    || ||||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  42193591 agtttgctttggctttaaatgg-accccgcaagtgggcggtggggttggtcctctcggattagtcgattcttggatcagata 42193671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 354 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 6014473 - 6014281
Alignment:
Q  354 gggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatac 453  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| | |||||    
T  6014473 gggttggcctagtgattggcttgggatcttggagtttgcttctccagagatctcaggttcgattacttctggtgccaatttcggtgggttaagtccatac 6014374  T
Q  454 agagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    ||||||||  |||||||||||  ||  || ||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  6014373 agagcttgctctggctttaaacggggtccacgcaagtgggcggtgagattagtcccctcgaattagtcgattcttggatcggatatcgagttt 6014281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 335 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 23270734 - 23270531
Alignment:
Q  335 aatattataaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaattt 434  Q
    ||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||| |||| | ||| |||||    
T  23270734 aatataatcaacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcatccaaaggtctcaagttcgatttcctccgatgccaattt 23270635  T
Q  435 cggtgggttaaattcatacagagcttgc--tggctttaaatgg-ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcg 531  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||  |||||||||| ||  ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| |    
T  23270634 cggtgggctaagtccatacagagcttgctttggctttaaacggagcccccgcaaatggacggtgggattggtcccctcggattagttgattcttggattg 23270535  T
Q  532 gata 535  Q
    ||||    
T  23270534 gata 23270531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 348 - 499
Target Start/End: Original strand, 25586930 - 25587085
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |    
T  25586930 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgatttcctctggtgccaatttcggtgggctaagt 25587029  T
Q  448 tcatacagagcttg--ctggctttaa--atggccccccgcaagtgggcggtgggat 499  Q
     |||||||||||||  ||||||||||  | | |||||| |||||||||||| ||||    
T  25587030 ccatacagagcttgctctggctttaaacaggaccccccccaagtgggcggtcggat 25587085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 348 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 38631160 - 38630980
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |    
T  38631160 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcagattcgattccctctggtgccaatttcgatgggctaagt 38631061  T
Q  448 tcatacagagcttgctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
     ||||||||||                | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||    
T  38631060 ccatacagagc---------------aggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattaatcgattcttggatcggataccgagttt 38630980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 352 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 10869760 - 10869574
Alignment:
Q  352 tggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcat 451  Q
    |||||||||| | ||||||  |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| ||| | ||     
T  10869760 tggggttggcatggtggttgacttgcgatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccatctggttccaatttcggtgggctaagtccac 10869661  T
Q  452 acagagcttg--ctggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 535  Q
    || |||||||  |||||||||||| || || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  10869660 actgagcttgctctggctttaaatggggcctccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcggttcttggatcggata 10869574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 347 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 15971322 - 15971144
Alignment:
Q  347 tcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaa 446  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||  |||||||||||| |||     
T  15971322 tcatttagggttggcttagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgatttcctctgatgtcaatttcggtgggctaag 15971223  T
Q  447 ttcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaatt 522  Q
    | |||||| ||||||  ||| |||||||  || ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  15971222 tccatacatagcttgctctgactttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgagattgatcccctcggattaatcaatt 15971144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 342 - 543
Target Start/End: Original strand, 22392693 - 22392884
Alignment:
Q  342 taaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtggg 441  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||    
T  22392693 taaacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctc---tgccaatttcggtggg 22392789  T
Q  442 ttaaattcatacagagcttgctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgag 540  Q
     | || || |     |||  |||||||||||  || |||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  22392790 ct-aagtctt-----gct--ctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcagattagtcgatttttggatcggataccgag 22392881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 348 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 27487754 - 27487563
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||| || | |||||| |||||||||||  ||| |    
T  27487754 catttggggttggcctagtggttgatttgggattttggagtttgctcttccagaggtctcaggtttgatcccatttggtgccaatttcggtggactaagt 27487655  T
Q  448 tcatacagagcttg--ctggctttaaa--tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 535  Q
     |||||||||||||  || ||||||||   || |||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27487654 ccatacagagcttgctctagctttaaacgggggcccttgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggata 27487563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 338 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 1827739 - 1827616
Alignment:
Q  338 attataaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcgg 437  Q
    ||||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||    
T  1827739 attattaacccatttggggttgacctagtggttggcttgagatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctgataccaatttcgg 1827640  T
Q  438 tgggttaaattcatacagagcttg 461  Q
    |||||||| | |||||||||||||    
T  1827639 tgggttaagtccatacagagcttg 1827616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 348 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 25750810 - 25750614
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcg--attccctctggtgctaatttcggtgggttaa 445  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |  ||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  25750810 catttggggttggcctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaagttggatattccttctggtgccaatttcggtgggttaa 25750711  T
Q  446 attcatacagagcttg--ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
     | |||| ||||||||  ||||| ||||  || ||||  |||||||| |||| ||||| |||| || |||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  25750710 gtccatatagagcttgctctggc-ttaacgggacccc--caagtggggggtgagattggtcccttcagattagtcgattcttggatcggataccgagttt 25750614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 367 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 12398628 - 12398449
Alignment:
Q  367 ggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctg 464  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||  ||| |||||||||||||||  |||    
T  12398628 ggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctatggtgtcaatttcggtggcctaagttcatacagagcttgctctg 12398529  T
Q  465 gctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    ||||||||| || ||||||||| ||| ||||| ||||| ||| |||  |||||||  ||||||||| ||||| |||||||    
T  12398528 gctttaaatggggcccccgcaaatggacggtgagattgatcctctcaaattagtcggttcttggattggataccgagttt 12398449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 348 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 12317349 - 12317156
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |  |||||||| |||| |||| | |||||||  ||||||||||||||||      
T  12317349 catttggggttggcctagtggttggcttggaatcttggagtttgctcctcttgaggtctcgggtttgatttcatctggtgtcaatttcggtgggttaa-- 12317252  T
Q  448 tcatacagagcttg--ctggctttaa-atggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
       | |||||||||  ||| ||||||   ||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  12317251 --gtccagagcttgctctgactttaagcgggccccccgcaagtgggtggtgggattgat-ccctcggattagtcaattcttagatcggataccgagttt 12317156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 348 - 500
Target Start/End: Original strand, 15931057 - 15931211
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || |    
T  15931057 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgcttcttcacaagtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtggct-aagt 15931155  T
Q  448 tcatacagagcttgct--ggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggatt 500  Q
     |||||||||| ||||  |||||||||  || | | ||||||||||||||||||||    
T  15931156 ccatacagagcctgctctggctttaaacagggctctcgcaagtgggcggtgggatt 15931211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 348 - 543
Target Start/End: Original strand, 34049820 - 34050007
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||           | |||||| ||| |    
T  34049820 catttggggttgggctagtagttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccttc-----------taggtgggctaagt 34049908  T
Q  448 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
     |||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||  |||||   |||||||| |||||||    
T  34049909 ccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtggtcggtaggattggtcccctcggattagttgattctcaaatcggataccgagttt 34050007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 348 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 21236561 - 21236363
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    ||||| |||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||| ||||  |||||||||  |||||||||| |||| |||  ||||||  |||| ||| |    
T  21236561 catttagggttggcttagtagttcgcttaggatcttggagttttctccttcagaggtcttcggttcgattctctctagtgtcaatttcaatgggctaagt 21236462  T
Q  448 tcatacagagcttgct--ggctttaaatggc-cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
     ||||||||| || ||  | ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  21236461 ccatacagagttttctctgactttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattagtcccctcagattagtcgattcttgaatcggataccgagttt 21236363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 401 - 531
Target Start/End: Original strand, 5049188 - 5049320
Alignment:
Q  401 aggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct--ggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtggga 498  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| | ||||||| |||  ||| |||||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||    
T  5049188 aggtctcagattcaattccctctggtaccaatttcgatggtctaagttcatacagagcttgctctggctttaaacgggcccccgcaaatggacggtggga 5049287  T
Q  499 ttgttcccctcggattagtcaattcttggatcg 531  Q
    ||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  5049288 ttggtcccatcgaattagtcgattcttggatcg 5049320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 419 - 535
Target Start/End: Original strand, 35425082 - 35425201
Alignment:
Q  419 cctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct--ggctttaaatggc-cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggatta 515  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||| | ||||||||||| |||  ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  35425082 cctctagtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagctcgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcctctcggatta 35425181  T
Q  516 gtcaattcttggatcggata 535  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  35425182 gtcgattcttggatcggata 35425201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 348 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 26009463 - 26009265
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    |||||||| || ||||||||||| | |||||||||  |||||| |||| | | |||| || ||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||| |    
T  26009463 catttgggttttgcctagtggttggtttgggatctcagagtttactcctcgaaaggtttccggttcgattccctttggtgccaatttcagtgggctaagt 26009364  T
Q  448 tcatacagagctt--gctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
     ||| ||||||||   |||||||||||  || ||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||  |||||| |||| ||| |||||||    
T  26009363 ccatgcagagcttactctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtagtgggattagtcccctcggattagtcggttcttgaatcgaatatcgagttt 26009265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 477 - 543
Target Start/End: Original strand, 22693065 - 22693131
Alignment:
Q  477 cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  22693065 cccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 22693131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 430 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 9659428 - 9659312
Alignment:
Q  430 aatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct--ggctttaaatgg-ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttg 526  Q
    |||||||||||| ||| | |||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||  |||||||    
T  9659428 aatttcggtgggctaagtccatacacagcttgctctggctttaaatgggccccccgcaagtggacggtgggattggtcccttcggattagttgattcttg 9659329  T
Q  527 gatcggataacgagttt 543  Q
    ||| ||||| |||||||    
T  9659328 gatgggataccgagttt 9659312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 462 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 41351186 - 41351105
Alignment:
Q  462 ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    ||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  41351186 ctggctttaaacggggctccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 41351105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 348 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 930684 - 930487
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctc-tggtgctaatttcggtgggttaaa 446  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| || ||||||||||| |   | |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||  |||    
T  930684 catttggggttggcccagtggttggcttgagattttagagtttgctcctctcaaagtctcaggttcgattcccacttggtgccaatttcggt-ggacaaa 930586  T
Q  447 ttcatacagagcttgct--ggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    |||||||| ||||||||  |||||  ||    ||| ||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||    
T  930585 ttcatacatagcttgctccggcttagaacaagccctcgcaagtggacagtgtgattggtcccctcggattagtcggtccttggatcggatatcgagttt 930487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 341 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 15485498 - 15485317
Alignment:
Q  341 ataaactcatttggggttggcctagtgg-ttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtg 439  Q
    |||||| |||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||| |||||| |   |||||||||||||||||||| |||   | ||||||||||    
T  15485498 ataaacccatttggggttggcctagcgggttggcttgggaccttggagtgtgctcctctcaaggtctcaggttcgattccc-ctgacaccaatttcggtg 15485400  T
Q  440 ggttaaattcatacagagct---tgctggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtc 518  Q
    |||||| | |||||| | ||   | |||||||||||| ||  ||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||    
T  15485399 ggttaagtccatacaaaactatgttctggctttaaatggggtccccgcaagtggatggtgggattggacccctcggattagtc 15485317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 367 - 458
Target Start/End: Original strand, 7151346 - 7151437
Alignment:
Q  367 ggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagc 458  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||| |  |||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  7151346 ggttggcttgggatcttggagtttgctcctcaagaggtcttaggttcgactccctctggcgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagc 7151437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 349 - 440
Target Start/End: Original strand, 37397712 - 37397803
Alignment:
Q  349 atttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgg 440  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||| ||||||  ||||| |||||    
T  37397712 atttggggttggtctagtggttggcttgtgatcttggagtttgctcctccaaaggtctaaggtttgattccccctggtgtcaattttggtgg 37397803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 477 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 13659312 - 13659254
Alignment:
Q  477 cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 535  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  13659312 cccccgcaagtgggcggtgggattgatcccctcggattaatcgattcttggatcggata 13659254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 364 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 28614667 - 28614487
Alignment:
Q  364 agtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg-- 461  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||||| ||| ||| || |||||||||||||| |||||| ||  |||| ||||| | ||| | |||||| ||||||      
T  28614667 agtggttggcttgagatcttagagtttgttcctccaaagatctcaggttcgattacctctgatgtcaatt-cggtgagataagtccatacaaagcttgtt 28614569  T
Q  462 ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    ||| ||||||| ||   ||||||  ||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||||| |||||||    
T  28614568 ctgactttaaacgggatcccgcagatggacggtgggattgatcccctcgaattagtcgatttttggatcggataccgagttt 28614487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 363 - 543
Target Start/End: Original strand, 36895438 - 36895621
Alignment:
Q  363 tagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg- 461  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |   |||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| | || | |||||| |||||      
T  36895438 tagtgattagcttgggatcttggagtgtgctcctctcaaggtttcatgttcgattccctctggtaccaatttcggtgg-tcaagtccatacaaagctttg 36895536  T
Q  462 --ctggctttaaatggcccc-ccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
      |||||||  || |   || |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  36895537 ctctggcttagaacgtagccgccgcaagtgggcggggggattgttctcctcgaattagtcggttcttggatcggataccgagttt 36895621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 339 - 543
Target Start/End: Original strand, 10399762 - 10399970
Alignment:
Q  339 ttataaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggt 438  Q
    |||||||  ||||||| ||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||| |  || || | ||||||| ||||| |||||| || ||||||| |    
T  10399762 ttataaatccatttggtgttggtctagtggttgactttggatcttggagtttgcttcttcaaagatttcaggtttgattctctctggcgccaatttcgat 10399861  T
Q  439 gggttaaattcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttc-ccctcggattagtcaattcttggatcggat 534  Q
    ||| ||| | ||||| |||| ||  ||| |||||||  || |||||| |||||| ||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||||||  ||    
T  10399862 gggctaagtccatacggagcatgctctgactttaaacggggcccccgtaagtggacggtgggattggtcaccctcgaattagtcgattcttggatcaaat 10399961  T
Q  535 aacgagttt 543  Q
    | |||||||    
T  10399962 agcgagttt 10399970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 348 - 441
Target Start/End: Original strand, 40330631 - 40330724
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtggg 441  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |   |||||||| |||| |||| || |||||||||||||| ||||    
T  40330631 catttgaggttggcttagtggttagcttgagatcttggagtttgctcctctcaaggtctcaagttcaattctctatggtgctaatttcgttggg 40330724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 343 - 427
Target Start/End: Original strand, 5067294 - 5067378
Alignment:
Q  343 aaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtg 427  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  5067294 aaacccatttggagttggtctagtggttgacttgggatcttcgagtttgctcctccagagatctcaggttcgattttctctggtg 5067378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 478 - 533
Target Start/End: Original strand, 5067392 - 5067447
Alignment:
Q  478 ccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcgga 533  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  5067392 ccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctctgattagtcgattcttggatcgga 5067447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 367 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 17015593 - 17015420
Alignment:
Q  367 ggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgctggc 466  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||| |||   ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||| ||| | |||||   ||||  ||||    
T  17015593 ggttggcttgagatcttgaagtttcctctttcagaggtctcaggtttgattccctctggtgccaatttcattgggataagtccatac-ttgctt--tggc 17015497  T
Q  467 tttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    |||||| ||  ||||||||||  ||||| ||| || | ||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||    
T  17015496 tttaaacggatccccgcaagtaagcggtaggaatggtaccctcggattaattaattcttgaatcggataccgagttt 17015420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 349 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 3715107 - 3715055
Alignment:
Q  349 atttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaga 401  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||    
T  3715107 atttggggttggcctagtggttggtttgggatcttggagtttgctcctccaga 3715055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 493 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 10631340 - 10631290
Alignment:
Q  493 gtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  10631340 gtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 10631290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 344 - 394
Target Start/End: Original strand, 42006787 - 42006837
Alignment:
Q  344 aactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctc 394  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  42006787 aactcatttggggttgggctagtggttggcttgagatcttggagtttgctc 42006837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 348 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 22253344 - 22253145
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||||||| |   || |||||||||||| |  |||| |||| ||||||| |||| ||| |    
T  22253344 catttggggttggtctagtggttggcttgggatctttgactttgctcctctctagatctcaggttcgactttctctagtgccaatttcgatgggctaagt 22253245  T
Q  448 tcatacagagct---tgctggctttaaatg-gccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
     |||||| ||||   | |||| |||||||| | ||||| ||| ||| | | ||||||  |||||||  |||||||   |||||||||| |||||||||||    
T  22253244 ccatacaaagctatgttctggatttaaatgaggcccccacaactggacagcgggattcgtcccctcaaattagtcggatcttggatcgaataacgagttt 22253145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 341 - 388
Target Start/End: Original strand, 19230466 - 19230513
Alignment:
Q  341 ataaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagt 388  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19230466 ataaacccaattggggttggcctagtggttagtttgggatcttggagt 19230513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 344 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 21042728 - 21042677
Alignment:
Q  344 aactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcc 395  Q
    |||||||||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||||||||    
T  21042728 aactcatttggggttggtttagtgattggtttgggatcttggagtttgctcc 21042677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 348 - 395
Target Start/End: Original strand, 33025478 - 33025525
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcc 395  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  33025478 catttggggttggcctcgcggttggcttgggatcttggagtgtgctcc 33025525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 484 - 543
Target Start/End: Original strand, 41084120 - 41084179
Alignment:
Q  484 aagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||  |||||| |||||||| |||||||    
T  41084120 aagtgggcggtaggattgatcccttcggattagtcggttcttgaatcggataccgagttt 41084179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 403 - 441
Target Start/End: Original strand, 21589349 - 21589387
Alignment:
Q  403 gtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtggg 441  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  21589349 gtctcaggttcgattccctctggtgccaatttaggtggg 21589387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 348 - 417
Target Start/End: Original strand, 16616117 - 16616186
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgatt 417  Q
    |||||| | ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| | | || |||||| |||||||    
T  16616117 catttgagattggcttagtagttggcttgggatcttggagtttgctcctctaaagatctcagattcgatt 16616186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 482 - 535
Target Start/End: Original strand, 42006868 - 42006921
Alignment:
Q  482 gcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 535  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || ||||||||  |||||| |||||||||    
T  42006868 gcaagtgggcggtggaattgttccacttggattagttgattctttgatcggata 42006921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 483 - 543
Target Start/End: Original strand, 8821120 - 8821180
Alignment:
Q  483 caagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    |||||||| |||||||||| || | ||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  8821120 caagtgggtggtgggattggtcacttcgaattagtctattcttggatcagataccgagttt 8821180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 479 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 25548599 - 25548535
Alignment:
Q  479 cccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||  |||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  25548599 cccgcaagtacgcggtgggattggtcatctcgaattagtcgattcttggatcgaataccgagttt 25548535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 483 - 543
Target Start/End: Original strand, 33737878 - 33737937
Alignment:
Q  483 caagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||  ||||||| |||||||| |||||||    
T  33737878 caagtgggcggtgagattggtcccctcgg-ttagttgattcttgaatcggataccgagttt 33737937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 133; Significance: 7e-69; HSPs: 76)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 351 - 543
Target Start/End: Original strand, 26174114 - 26174309
Alignment:
Q  351 ttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattca 450  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||    
T  26174114 ttggagttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgatttcctctggtgccaatttcggtgggttaagtcca 26174213  T
Q  451 tacagagcttg--ctggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    |||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  26174214 tacagagcttgctctggctttaaatagggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 26174309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 348 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 53424375 - 53424178
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| |    
T  53424375 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagt 53424276  T
Q  448 tcatacagagcttgc--tggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
     ||||||||| ||||  |||||||||| || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  53424275 ccatacagagtttgctatggctttaaacgggcccccgcaagtgagcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 53424178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 348 - 543
Target Start/End: Original strand, 35492909 - 35493107
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |    
T  35492909 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagt 35493008  T
Q  448 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
     |||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||| |||||||    
T  35493009 ccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggattgaataccgagttt 35493107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 342 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 8456355 - 8456151
Alignment:
Q  342 taaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtggg 441  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8456355 taaacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttcgagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtggg 8456256  T
Q  442 ttaaattcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacg 538  Q
     ||| | |||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||    
T  8456255 ctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcagtgggattggtcccctcggattagtcgattcttgaatcggataccg 8456156  T
Q  539 agttt 543  Q
    |||||    
T  8456155 agttt 8456151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 348 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 30807352 - 30807154
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |    
T  30807352 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagt 30807253  T
Q  448 tcatacagagcttg--ctggctttaaa--tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
     |||||||||||||  |||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  30807252 ccatacagagcttgctctggctttaaacggggccccccgcaagtgggcggtaggattggt-ccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 30807154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 354 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 15566692 - 15566501
Alignment:
Q  354 gggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatac 453  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| | |||||    
T  15566692 gggttggcctagtggttggcttgagatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctagtgccaatttcggtgggctaagtccatac 15566593  T
Q  454 agagcttg--ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    ||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  15566592 agagcttgctctggctttaaacgggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcagattagtcgattcttggatcggataccgagttt 15566501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 348 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 45529953 - 45529756
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| ||| |    
T  45529953 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggagccaatttcgatgggctaagt 45529854  T
Q  448 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
     |||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  45529853 ccatacagagcttgctctggctttaaacgggccccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattctt-gatcggataccgagttt 45529756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 348 - 543
Target Start/End: Original strand, 46576346 - 46576544
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| |    
T  46576346 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcagtgggctaagt 46576445  T
Q  448 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
     |||||||||||||  |||||||||||  || |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  46576446 ccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtcggattggtccccttggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 46576544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 349 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 52821833 - 52821637
Alignment:
Q  349 atttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaatt 448  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| |     
T  52821833 atttggtgttggcctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgagctaagtc 52821734  T
Q  449 catacagagcttg--ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  52821733 catacagagcttgctctggctttaaacggggccccgtaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 52821637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 340 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 25289921 - 25289716
Alignment:
Q  340 tataaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtg 439  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  25289921 tataaacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctagtgccaatttcggtg 25289822  T
Q  440 ggttaaattcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataa 536  Q
    || ||| | |||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||||     
T  25289821 ggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggt-ccctcgaattagtcgattcttggatcggatac 25289723  T
Q  537 cgagttt 543  Q
    |||||||    
T  25289722 cgagttt 25289716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 348 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 40133648 - 40133450
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |    
T  40133648 catttggggttggcctagtggttggcttgggattttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctggtgtcaatttcggtgggctaagt 40133549  T
Q  448 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
     |||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  40133548 ccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcgaattagtcgattcttggatcggataccgagttt 40133450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 348 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 49258461 - 49258263
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| |    
T  49258461 catttggggtttgcctagtggttggcttgggatcttgcagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctagtgccaatttcggtgggctaagt 49258362  T
Q  448 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
     |||||||||||||  |||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  49258361 ccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccacaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 49258263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 348 - 543
Target Start/End: Original strand, 21362941 - 21363139
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||| |    
T  21362941 catttggggttggcctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgtcaatttcggtaggctaagt 21363040  T
Q  448 tcatacagagcttg--ctggctttaaatgg-ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
     |||||||||||||  ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||    
T  21363041 ccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtgggattggttccctcggattaatcgattcttggatcggataccgagttt 21363139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 348 - 535
Target Start/End: Original strand, 30257622 - 30257812
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||  ||| |    
T  30257622 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcgatggactaagt 30257721  T
Q  448 tcatacagagcttg--ctggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 535  Q
     |||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30257722 ccatacagagcttgctctggctttaaatggggcccccgcaagtgggcggtggcattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggata 30257812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 348 - 543
Target Start/End: Original strand, 48977386 - 48977584
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |    
T  48977386 catttggggttggcctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccttctggtgccaatttcggtgggttaagt 48977485  T
Q  448 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
     |||||||||||||  |||||||||||  || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||    
T  48977486 ccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccctgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcggtccttggatcggataccgagttt 48977584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 349 - 535
Target Start/End: Original strand, 25379760 - 25379949
Alignment:
Q  349 atttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaatt 448  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||| ||| |     
T  25379760 atttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccttctagtgccaatttcggagggctaagtc 25379859  T
Q  449 catacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 535  Q
    |||||||||||||  |||||||||||  || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25379860 catacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagcgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggata 25379949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 348 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 45272615 - 45272417
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |    
T  45272615 catttggggttggcctagtcgttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcagtttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagt 45272516  T
Q  448 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
     ||||| |||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||    
T  45272515 ccatacggagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgactcttggatcggataccgagttt 45272417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 348 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 18177086 - 18176896
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| |    
T  18177086 catttggggttggcctagtggttgacttgagatcttggagtttgctcttccagaggtatcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtggactaagt 18176987  T
Q  448 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 535  Q
     |||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18176986 ccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccatcggattagtcgattcttggatcggata 18176896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 342 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 31538043 - 31537839
Alignment:
Q  342 taaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtggg 441  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  31538043 taaacccatttggggttggcctagtggttggcttaggatcttggagtttgctcctccagaggtctcatgtttgattccctctggtgccaattttggtggg 31537944  T
Q  442 ttaaattcatacagagctt--gctggctttaaatgg-ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacg 538  Q
     ||| |  |||||||||||   ||||||||||| ||  |||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  31537943 ctaagtctatacagagcttactctggctttaaacggagcccctgcaagtgggcggtgagattggtcccctcgaattagtcaattcttggatcggatatcg 31537844  T
Q  539 agttt 543  Q
    |||||    
T  31537843 agttt 31537839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 343 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 34492779 - 34492576
Alignment:
Q  343 aaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggt 442  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||     
T  34492779 aaacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcatgttcgattccctctgctgccaatttcgttgggc 34492680  T
Q  443 taaattcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacga 539  Q
    ||| | |||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||||  ||||||||||| |||| |||    
T  34492679 taagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtccattcagattagttgattcttggatctgataccga 34492580  T
Q  540 gttt 543  Q
    ||||    
T  34492579 gttt 34492576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 362 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 53234095 - 53233912
Alignment:
Q  362 ctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg 461  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||    
T  53234095 ctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaagtctcaggttcgattctctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttg 53233996  T
Q  462 --ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
      |||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  53233995 ctctggctctaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattctt-gatcggataccgagttt 53233912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 367 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 10190922 - 10190743
Alignment:
Q  367 ggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctg 464  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||  |||    
T  10190922 ggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagagggctcaggtttgattccctctagtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctg 10190823  T
Q  465 gctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    ||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  10190822 gctttaaacggggcccccgcaagtggacggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 10190743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 348 - 543
Target Start/End: Original strand, 40940823 - 40941021
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| |    
T  40940823 catttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtggactaagt 40940922  T
Q  448 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
     |||||||||||||  ||| |||||||  || ||||| |||||||| ||| |||||| |||||||| |||| |||||||||| ||| |||| |||||||    
T  40940923 ccatacagagcttgctctgactttaaacggggcccccacaagtgggtggtaggattggtcccctcgaattactcaattcttgaatcagataccgagttt 40941021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 367 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 10083999 - 10083820
Alignment:
Q  367 ggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctg 464  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||  |||    
T  10083999 ggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagagggctcaggtttgattccctctagtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctg 10083900  T
Q  465 gctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    ||||||||  || ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  10083899 gctttaaacggggcccccacaagtggacggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 10083820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 371 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 39042028 - 39041853
Alignment:
Q  371 agcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctggctt 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| | ||| |||||||||  |||||||    
T  39042028 agcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaagttcgattctctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatgcagagcttgctctggctt 39041929  T
Q  469 taaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    ||||  || |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  39041928 taaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtccactcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 39041853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 348 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 52455848 - 52455650
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||| |    
T  52455848 catttggggttggcctagtggttggctagggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaattttgatgggctaagt 52455749  T
Q  448 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
      | ||||||||||  ||| |||||||  || ||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  52455748 ctacacagagcttgctctgactttaaacggggcccccgcaagtgactggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggattggataccgagttt 52455650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 348 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 7485724 - 7485532
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| |    
T  7485724 catttggggttggcatagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctgatgccaatttcggtgggctaagt 7485625  T
Q  448 tcatacagagcttg--ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    ||||    ||||||  |||||||||||  | |||| |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  7485624 tcat----agcttgatctggctttaaacaggcccctgcaagtggccggtgggattggt-ccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 7485532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 348 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 29915468 - 29915288
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    ||||| |||||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||| ||| |    
T  29915468 catttagggttgacctaatggttgacttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgatttcttctggtgccattttcggtgggctaagt 29915369  T
Q  448 tcatacagagcttg--ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttg 526  Q
     |||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| |||||||    
T  29915368 acatacagagcttgccctggctttaaacgggcccccgcaagtgggcggtgggattgatcccatcgaattagtcgattcttg 29915288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 348 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 29964621 - 29964441
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    ||||| |||||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||| ||| |    
T  29964621 catttagggttgacctaatggttgacttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgatttcttctggtgccattttcggtgggctaagt 29964522  T
Q  448 tcatacagagcttg--ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttg 526  Q
     |||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| |||||||    
T  29964521 acatacagagcttgccctggctttaaacgggcccccgcaagtgggcggtgggattgatcccatcgaattagtcgattcttg 29964441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 354 - 543
Target Start/End: Original strand, 32151428 - 32151620
Alignment:
Q  354 gggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatac 453  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||  |||||||| |||| |||| |||||||||||| |||  ||||||    
T  32151428 gggttggcctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtttcaaattcgattctctctagtgccaatttcggtgggctaagctcatac 32151527  T
Q  454 agagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    ||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  32151528 agagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgagattggtcccctcgaattagtcgattcttggatcggataccgagttt 32151620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 357 - 500
Target Start/End: Original strand, 26108299 - 26108445
Alignment:
Q  357 ttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacaga 456  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||||    
T  26108299 ttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacaga 26108398  T
Q  457 gcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggatt 500  Q
    |||||  |||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||    
T  26108399 gcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggctgtgggatt 26108445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 348 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 7470414 - 7470244
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    ||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||| |    
T  7470414 catttggggtttgcctagtggttgacttgagatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctaatgccaatttcggtgggctaagt 7470315  T
Q  448 tcatacagagcttg--ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattag 516  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| ||  ||| |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||    
T  7470314 tcatacagagcttgctctggctttaaacggggccctgcaagtgggcagtgggattggtcccctcagattag 7470244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 344 - 543
Target Start/End: Original strand, 4462627 - 4462828
Alignment:
Q  344 aactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggtt 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |  || | |||||| ||||||||||||||||  | ||||||| |||| |    
T  4462627 aactcatttggggttggcctagtggttggcttgagatcttggagtttgctacttcaaaagtctcatgttcgattccctctggcaccaatttcgatgggct 4462726  T
Q  444 aaattcatacagagctt--gctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagt 541  Q
    || ||||||||||||||   || |||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||| ||||| |||||    
T  4462727 aagttcatacagagcttactctagctttaaacggggccccgcaagtggacggtgggattgatccactcggattagtttattcttggattggataccgagt 4462826  T
Q  542 tt 543  Q
    ||    
T  4462827 tt 4462828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 390 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 8097436 - 8097280
Alignment:
Q  390 tgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct--ggctttaaatggc-cccccgcaag 486  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||| | |||||||||| ||||  ||||||||| ||  ||||||||||    
T  8097436 tgctcctccagaggcctcaggttcgattccctcttgtgctaatttcgatgggctaagtccatacagagcatgctctggctttaaacggggcccccgcaag 8097337  T
Q  487 tgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  8097336 tgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 8097280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 398 - 543
Target Start/End: Original strand, 24407309 - 24407457
Alignment:
Q  398 cagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct--ggctttaaatggccccc-cgcaagtgggcggt 494  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||  |||||  | ||||||| ||  ||  ||||||||||||||    
T  24407309 cagaggtctcagattcgattctctctggtgctaatttcggtgggttaagtatatacagaatttgctctgactttaaacggggccatcgcaagtgggcggt 24407408  T
Q  495 gggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  24407409 gggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 24407457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 348 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 25344256 - 25344059
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| |||||  |||||  ||||  ||| |    
T  25344256 catttggggttggcctagtggttgacttgggatcttcgagtttgctcctccagagatctcaggtttgattccctttggtgtcaatttttgtggtctaagt 25344157  T
Q  448 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
     ||||||||| |||  |||||||||||  || ||||||| |||||||| |||||||| |  ||||||||||||| |||||| ||||| ||| |||||||    
T  25344156 ccatacagagtttgctctggctttaaacggggcccccgctagtgggcgatgggattggt-tcctcggattagtcgattcttagatcgaataccgagttt 25344059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 449 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 24165812 - 24165716
Alignment:
Q  449 catacagagcttgct--ggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  24165812 catacagagcttgctctggctttaaacggggccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 24165716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 374 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 33398641 - 33398477
Alignment:
Q  374 ttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgctg--gctttaa 471  Q
    ||||||||||| |||||||||  | | || ||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||||||  | |||||||||||||||   |||||||    
T  33398641 ttgggatcttgtagtttgctcttctaaagatctcaagttcgattccctctagtgccaattttggtgggttatgtccatacagagcttgctctagctttaa 33398542  T
Q  472 atggc-cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 535  Q
    | ||  ||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  33398541 acggggcccccgcaagtgggcggtgggattggttccctcgaattagtcgattcttggatcggata 33398477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 379 - 543
Target Start/End: Original strand, 1692863 - 1693029
Alignment:
Q  379 atcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct--ggctttaaatggc 476  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||  |||||||||||  ||| |  ||||||| ||||||  ||||||| |  |     
T  1692863 atcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccatttagtgtcaatttcggtggactaagtctatacagaacttgctctggctttagacagg 1692962  T
Q  477 cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  1692963 cccccgcaagtgggcggtgggatttgccccctcagattagtcgattcttgaatcggataccgagttt 1693029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 356 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 53288903 - 53288725
Alignment:
Q  356 gttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacag 455  Q
    ||||||| ||||||| | ||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||| | ||||||     
T  53288903 gttggccaagtggttggtttgggatattagagtttgctcctccaaaggtctcaggctcgattccctctggtgccaatttcggtggactaagtccatacaa 53288804  T
Q  456 agcttgc--tggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcgg 532  Q
    |||||||  |||||||||| ||  ||||||||  || ||||| ||||  |||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  53288803 agcttgctttggctttaaacggggccccgcaaacggacggtgagattagtcccctcgaattagtcgattattggatcgg 53288725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 401 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 2511443 - 2511306
Alignment:
Q  401 aggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtggg 497  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| |  ||| |||||||  || || ||||||||||||||||||    
T  2511443 aggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagctcgctctgactttaaacgggacctccgcaagtgggcggtggg 2511344  T
Q  498 attgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 535  Q
    |||| || ||||| ||||||  ||||||| ||||||||    
T  2511343 attggtctcctcgaattagtagattcttgaatcggata 2511306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 349 - 535
Target Start/End: Original strand, 11390601 - 11390790
Alignment:
Q  349 atttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaatt 448  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||| ||| || | ||||||| |||| |||||||||  ||||| |||||| ||| |     
T  11390601 atttggggttggcctagtggttggtttgagatcttggagttttctcctccaaagatttcaggtttgatttcctctggtgtcaattttggtgggctaagtc 11390700  T
Q  449 catacagagcttg--ctggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 535  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||| || || |||||| ||    ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11390701 catacagagcttgctctgtctttaaatgggtcctccgcaaatgattcgtgagattattcccctcggattagtcgattcttggatcggata 11390790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 354 - 535
Target Start/End: Original strand, 19857056 - 19857239
Alignment:
Q  354 gggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatac 453  Q
    |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||| ||||       
T  19857056 gggttggcctggtggttggcttgg-atcttggagtttgctcctccagatgtctcaggttcgattccctttggtgtcaatttcggtgggctaagttcagtt 19857154  T
Q  454 agagcttg--ctggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 535  Q
    ||||||||  ||  |||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||| ||||||| || |||||    
T  19857155 agagcttgctctaactttaaatggggtctccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcgcaatagtcgattcttgaattggata 19857239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 373 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 8958210 - 8958036
Alignment:
Q  373 cttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgctg--gcttta 470  Q
    |||||||||||||||| ||||||  || |||||| | |||||||| |||||||||  ||||| |||||| ||| | |||||| ||||||||   ||||||    
T  8958210 cttgggatcttggagtctgctccttcaaaggtcttatgttcgatttcctctggtgtcaattttggtgggctaagtccatacaaagcttgctctagcttta 8958111  T
Q  471 aat--ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    ||   || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||| |||| |||||||    
T  8958110 aaatggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctctgattaatcgattcttggatcagataccgagttt 8958036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 344 - 535
Target Start/End: Original strand, 26158812 - 26158999
Alignment:
Q  344 aactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggtt 443  Q
    |||||||||||||||||||||   ||| ||||| ||||||||||| |||||| |   ||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||| |    
T  26158812 aactcatttggggttggcctatgtgttggcttgagatcttggagtgtgctcctctcaaggtctcaggtttcattccctttggtgccaatttcggtggg-t 26158910  T
Q  444 aaattcatacagagcttgctggctttaaatgg-ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 535  Q
    || | |||||  ||||  |||||||  || ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  26158911 aagtccatac--agct--ctggcttagaacggagcccccgcaagtgggcggtgggattgatcccctcggattagtcggtccttggatcggata 26158999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 348 - 518
Target Start/End: Original strand, 51532787 - 51532960
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    |||||||||||| |||| | ||| | ||| ||| |||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||| ||||  ||| |||||||||||| ||| |    
T  51532787 catttggggttgacctattagttggtttgagattttggagtttgcttctccaaaggtctcatgttcgattctctctaatgccaatttcggtgggctaagt 51532886  T
Q  448 tcatacagagcttg--ctggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtc 518  Q
     |||||||||||||  ||  |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  51532887 ccatacagagcttgctctaactttaaatgggacccccgcaagtggacggtgggattggtcccctcagattagtc 51532960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 348 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 4252595 - 4252405
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |   |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| || | | || |    
T  4252595 catttggggttggcctagtggttggcttgagatcttggagtgtgctcctctcaaggtctcaagtttgattccctctggtgccaatttcagt-gatcaagt 4252497  T
Q  448 tcatacagagctt---gctggctttaaatgg-ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 535  Q
     |||||| |||||    |||| ||  || || |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  4252496 ccatacaaagctttactctggtttagaacggcccccccacaagtggacggtgggattggtcccctcggattagtcgatccttggatcggata 4252405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 477 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 53848501 - 53848435
Alignment:
Q  477 cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  53848501 cccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 53848435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 348 - 434
Target Start/End: Original strand, 55287801 - 55287887
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaattt 434  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  55287801 catttggggttggcatagtggttggcttggaatcttagagtttgctccttcagaggtttcaggttcgattccctctggtgccaattt 55287887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 357 - 436
Target Start/End: Original strand, 9853623 - 9853702
Alignment:
Q  357 ttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcg 436  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | ||||| |||||||    
T  9853623 ttggtctagtggttagtttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattcccaccggtgccaatttcg 9853702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 348 - 518
Target Start/End: Original strand, 50582990 - 50583162
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |   |||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||| ||| |    
T  50582990 catttggggttggcctagtggttggtttgggatcttggagtttgctcctcttaaggtttcaggttcgatttcctctgttgccaatttcgttggg-taagt 50583088  T
Q  448 tcatacagagctt---gctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtc 518  Q
     |||||| | |||     || ||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  50583089 ccatacaaaactttgatttgactttaaatggagccccgtaagtgagcggtgggattggtcctctcgaattagtc 50583162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 403 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 17579280 - 17579136
Alignment:
Q  403 gtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgctg--gctttaaatgg--ccccccgcaagtgggcggtggga 498  Q
    |||||||||| |||| ||||| ||| |||||| |||||| ||| | |||||||||||||||   |||||||| ||  ||| |||||||||||||||| ||    
T  17579280 gtctcaggtttgatttcctctagtgttaattttggtgggctaagtccatacagagcttgctttagctttaaacgggaccctccgcaagtgggcggtgaga 17579181  T
Q  499 ttgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    ||| ||||||| |||||||| ||| |||||||| ||| |||||||    
T  17579180 ttggtcccctcagattagtcgatttttggatcgaatatcgagttt 17579136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 341 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 6041878 - 6041671
Alignment:
Q  341 ataaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgg 440  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||  ||||||||||||||||| |   |||  ||| |||||||| || || |||| |||||||||||    
T  6041878 ataaactcatttggggttgccctaatggttgacttgaaatcttggagtttgctcctctcaaggagtcatgttcgattgcccctagtgccaatttcggtgg 6041779  T
Q  441 gttaaattcatacagagct-tg--ctggctttaaatg--gccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 535  Q
     |||| | ||||||||| | ||  ||| ||||||| |  ||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||  |||||||||| ||||    
T  6041778 attaagtccatacagagttatgctctgactttaaacgaagcccccctcaaatgggcggtgagattgttccccttagattagtcggttcttggatcagata 6041679  T
Q  536 acgagttt 543  Q
     |||||||    
T  6041678 ccgagttt 6041671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 343 - 463
Target Start/End: Original strand, 38732959 - 38733079
Alignment:
Q  343 aaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggt 442  Q
    |||| |||||| |||||| ||| |||||  ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| ||||| ||  ||||||||||||     
T  38732959 aaacccatttgaggttgggctaatggttgacttggaatcttggagtttgttcctccagaggtctcaggtccgattctctctgttgtcaatttcggtgggc 38733058  T
Q  443 taaattcatacagagcttgct 463  Q
    | | ||||||||||| |||||    
T  38733059 tgagttcatacagaggttgct 38733079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 349 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 55371483 - 55371303
Alignment:
Q  349 atttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaatt 448  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||| | |   |||||||| |||||||||||| |||||| |||||||| ||   || ||    
T  55371483 atttgaggttggcctagtggttggcttgcgattttggagtatgcttctctcaaggtctcatgttcgattccctttggtgccaatttcggcggac-aagtt 55371385  T
Q  449 catacagagcttgctggctttaaatggccccc-cgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 535  Q
    ||||    |||  ||||||| ||| ||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  55371384 cata----gct--ctggcttaaaacggggccctcgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgatccttggatcggata 55371303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 406 - 543
Target Start/End: Original strand, 1178228 - 1178366
Alignment:
Q  406 tcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg---ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgt 502  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||  || | |||||||| |||    ||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||     
T  1178228 tcaggttcgattctccctggtgccaatttcggtgggc-aagtccatacagaactttgctctggctttaaatggggccccacacgtgggcggtgggattgg 1178326  T
Q  503 tcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    |||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||    
T  1178327 tccc-tcggattagtcgaatcttggatcggataccgagttt 1178366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 342 - 436
Target Start/End: Original strand, 9842913 - 9843006
Alignment:
Q  342 taaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcg 436  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||  |||||||    
T  9842913 taaacccatttggggttggtctagtggttggtttgggatcttggagttttctcctccagaggtctc-gattcgattcccactggtgtcaatttcg 9843006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 449 - 543
Target Start/End: Original strand, 54475780 - 54475877
Alignment:
Q  449 catacagagcttgct--ggctttaaatggcccc-ccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| ||  || |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  54475780 catacagagcttgctttggctttaaacggggccaccgcaagtgggcggtgggattggtccccttggattagtcgattcttggatcagataccgagttt 54475877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 404 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 48972854 - 48972715
Alignment:
Q  404 tctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattg 501  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||| |||  ||| ||||||| ||  |||  |||||||| ||||  ||||    
T  48972854 tctcaggttcgattccctctggtgccaatttcgatgggttaagttcatatagagtttgctctgactttaaacggatccc--caagtggggggtgaaattg 48972757  T
Q  502 ttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
     |||  ||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  48972756 gtccattcgaattagtcgattcttgaatcggataccgagttt 48972715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 372 - 518
Target Start/End: Original strand, 34844400 - 34844548
Alignment:
Q  372 gcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagctt-gct--ggctt 468  Q
    ||||| || |||||||| |||||| |   ||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||  ||  | |||||||||||| |||  |||||    
T  34844400 gcttgagaccttggagtgtgctcctctcaaggtctcaggttcgattccctccagagccaatttcggtggactag-tacatacagagctttgctatggctt 34844498  T
Q  469 taaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtc 518  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||    
T  34844499 taaatgggcccccgcaagtggatggtgggattggacccctcggattagtc 34844548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 477 - 543
Target Start/End: Original strand, 48105007 - 48105073
Alignment:
Q  477 cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  48105007 cccccacaagtgggcggtgagattggtcccttcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 48105073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 482 - 543
Target Start/End: Original strand, 4048085 - 4048146
Alignment:
Q  482 gcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  4048085 gcaagtggacggtgggattggtcccctcggattagttgattcttggatcggataccgagttt 4048146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 364 - 440
Target Start/End: Original strand, 49167070 - 49167146
Alignment:
Q  364 agtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgg 440  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  49167070 agtggttggcttgagatcttggagtttgctcctccaaagatatcaggttcgattctctctggtgtcaatttcggtgg 49167146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 483 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 50731298 - 50731238
Alignment:
Q  483 caagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  50731298 caagtgggcggtgggattggtcccctcagattagtcgatccttggatcggataccgagttt 50731238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 483 - 543
Target Start/End: Original strand, 50781556 - 50781616
Alignment:
Q  483 caagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  50781556 caagtgggcggtgggattggtcccctcagattagtcgatccttggatcggataccgagttt 50781616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 441
Target Start/End: Original strand, 25017508 - 25017606
Alignment:
Q  342 taaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtggg 441  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||  ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| || ||| |||||||||||| ||| |||  ||||||||||||    
T  25017508 taaacccatttggggttggcccagatgttggcttgg-atcttggagtttgctcctccaaagatcttaggttcgattccatctagtgtcaatttcggtggg 25017606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 413 - 513
Target Start/End: Original strand, 1242036 - 1242139
Alignment:
Q  413 cgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagctt---gctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctc 509  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||| ||| | ||||||||||||    ||||||||||| ||   |||||||||||||||||| |||| ||||||     
T  1242036 cgattccctctggtgccaattttggtgggctaagtccatacagagctttgctctggctttaaacggggtcccgcaagtgggcggtggaattggtcccctt 1242135  T
Q  510 ggat 513  Q
    ||||    
T  1242136 ggat 1242139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 496 - 543
Target Start/End: Original strand, 3747730 - 3747777
Alignment:
Q  496 ggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  3747730 ggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 3747777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 357 - 529
Target Start/End: Complemental strand, 14343478 - 14343304
Alignment:
Q  357 ttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacaga 456  Q
    |||| ||| ||||| | ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| | ||||  || ||||||  |||| ||| | ||||||||    
T  14343478 ttggtctattggttggtttgagatcttggagtttgctcctccagatgtctcagattcgatttcatctgacgccaatttcaatgggctaagtccatacaga 14343379  T
Q  457 gcttg--ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggat 529  Q
     ||||  ||| ||||||| ||   ||| |||||| ||||| | |||| ||||||  |||||||| ||||||||||    
T  14343378 acttgctctgcctttaaacggtatcccacaagtgagcggtagaattgatccccttagattagtcgattcttggat 14343304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 348 - 395
Target Start/End: Original strand, 16140295 - 16140342
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcc 395  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||    
T  16140295 catttggggttggcctagtgattagtttgggatcttggagcttgctcc 16140342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 354 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 10445207 - 10445123
Alignment:
Q  354 gggttggcctagtgg---ttagcttgggatcttggagtttgctccccca-gaggtctcaggttcgattccctctggtgctaattt 434  Q
    |||||||||||||||   || |||||||| || ||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10445207 gggttggcctagtggcaattggcttgggacctgggagtgtgctcctcctcgaggtctcaggttcgattctctctggtgctaattt 10445123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 348 - 418
Target Start/End: Original strand, 36660768 - 36660838
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattc 418  Q
    |||||||||||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||| |   ||||||||||||| ||||    
T  36660768 catttggggttgacctagtggttggtttaggatcttggagtttgctcctctcaaggtctcaggttcaattc 36660838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 478 - 543
Target Start/End: Original strand, 25017620 - 25017684
Alignment:
Q  478 ccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  25017620 ccccgcaagtgggcggtgggattggt-tccttggattagtcgattcttggatcgaataccgagttt 25017684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 462 - 519
Target Start/End: Original strand, 33793567 - 33793624
Alignment:
Q  462 ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtca 519  Q
    ||||||| ||| || | ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33793567 ctggcttaaaaagggctcccgcaagtggacggtgggattggtcccctcggattagtca 33793624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 354 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 11092236 - 11092144
Alignment:
Q  354 gggttggcctagtggt--tagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggtta 444  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||| |||| ||| |||| | |   ||||||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  11092236 gggttggcctagtggtgttggcttgggaccttgtagtgtgctactctcaaggtctcaacttcgattctccctggtgctaatttcggtgggtta 11092144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 462 - 514
Target Start/End: Original strand, 26599429 - 26599481
Alignment:
Q  462 ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggatt 514  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||  |||||| ||||    
T  26599429 ctggctttaaatggcgccccacaagtggacggtgggattggacccctcagatt 26599481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 132; Significance: 3e-68; HSPs: 58)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 348 - 543
Target Start/End: Original strand, 4718647 - 4718845
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |    
T  4718647 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctccttcagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagt 4718746  T
Q  448 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
     |||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  4718747 ccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 4718845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 348 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 34237854 - 34237656
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |    
T  34237854 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagt 34237755  T
Q  448 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
     |||||||||||||  |||||||||||  || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  34237754 ccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgagcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 34237656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 349 - 543
Target Start/End: Original strand, 28193477 - 28193674
Alignment:
Q  349 atttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaatt 448  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |     
T  28193477 atttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggttaagtc 28193576  T
Q  449 catacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    |||||||||||||  |||||||||||  || ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  28193577 catacagagcttgctctggctttaaacggggcccctacaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 28193674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 343 - 535
Target Start/End: Original strand, 39349253 - 39349448
Alignment:
Q  343 aaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggt 442  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  39349253 aaacccatttggggttggcccagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggc 39349352  T
Q  443 taaattcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 535  Q
    ||| | |||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39349353 taagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttggatcggata 39349448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 348 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 3734822 - 3734624
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |    
T  3734822 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagt 3734723  T
Q  448 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
     |||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  3734722 ccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaaatgggcagtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 3734624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 348 - 543
Target Start/End: Original strand, 2618188 - 2618386
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| |    
T  2618188 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttgggttcgattccctctggtgccaatttcagtgggctaagt 2618287  T
Q  448 tcatacagagcttg--ctggctttaaatgg-ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
     |||||||||||||  ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  2618288 ccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggattccgagttt 2618386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 357 - 543
Target Start/End: Original strand, 21603241 - 21603430
Alignment:
Q  357 ttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacaga 456  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||   ||||||||    
T  21603241 ttggcctagtggttggcttgggatcttagagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctatggtgccaatttcggtgggctaagcccatacaga 21603340  T
Q  457 gcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    |||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  21603341 gcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 21603430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 348 - 543
Target Start/End: Original strand, 19471611 - 19471810
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| | ||| |    
T  19471611 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggtttgattccctctggtgccaattttggtgagctaagt 19471710  T
Q  448 tcatacagagcttg--ctggctttaaa--tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
     |||||||||||||  |||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  19471711 ccatacagagcttgctctggctttaaacggggccccccgcaagtgggcgatgggattggtcccctcgaattagtcgatacttggatcggataccgagttt 19471810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 348 - 543
Target Start/End: Original strand, 19542535 - 19542734
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| | ||| |    
T  19542535 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggtttgattccctctggtgccaattttggtgagctaagt 19542634  T
Q  448 tcatacagagcttg--ctggctttaaa--tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
     |||||||||||||  |||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  19542635 ccatacagagcttgctctggctttaaacggggccccccgcaagtgggcgatgggattggtcccctcgaattagtcgatacttggatcggataccgagttt 19542734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 348 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 19590161 - 19589962
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| | ||| |    
T  19590161 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggtttgattccctctggtgccaattttggtgagctaagt 19590062  T
Q  448 tcatacagagcttg--ctggctttaaa--tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
     |||||||||||||  |||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  19590061 ccatacagagcttgctctggctttaaacggggccccccgcaagtgggcgatgggattggtcccctcgaattagtcgatacttggatcggataccgagttt 19589962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 343 - 543
Target Start/End: Original strand, 32879276 - 32879479
Alignment:
Q  343 aaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggt 442  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  32879276 aaacccatttggggttggtctagtggttgacttgggatcttcgagtttggtcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggc 32879375  T
Q  443 taaattcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacga 539  Q
    ||| |||||||||||||||  ||| | |||||  || ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||    
T  32879376 taagttcatacagagcttgctctgacattaaacggggcccccacaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggattggataccga 32879475  T
Q  540 gttt 543  Q
    ||||    
T  32879476 gttt 32879479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 348 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 15259605 - 15259407
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |    
T  15259605 catttggggttggtctagtggttggtttgggatcttggattttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagt 15259506  T
Q  448 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
     |||||||||||||  |||||||||||  || |||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  15259505 ccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgtaattggtcccctcgaattagtcgattcttggatcggatgccgagttt 15259407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 348 - 543
Target Start/End: Original strand, 20305910 - 20306108
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||| |    
T  20305910 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttagagtttgctcctccaaaggtctcagtttcgattccttctggtgccaatttcgatgggctaagt 20306009  T
Q  448 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
     |||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  20306010 ccatacagagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcgaattagtcgatccttggatcggataccgagttt 20306108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 348 - 543
Target Start/End: Original strand, 21092543 - 21092741
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||| |    
T  21092543 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttagagtttgctcctccaaaggtctcagtttcgattccttctggtgccaatttcgatgggctaagt 21092642  T
Q  448 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
     |||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  21092643 ccatacagagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcgaattagtcgatccttggatcggataccgagttt 21092741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 372 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 8765701 - 8765527
Alignment:
Q  372 gcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctggcttt 469  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| | |||||||||||||  ||||||||    
T  8765701 gcttgagatcttggagtttgctcccccagagatctcaggttcgattccctctggtgccaatttcgatgggctaagtccatacagagcttgctctggcttt 8765602  T
Q  470 aaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    |||  || | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  8765601 aaacggggctcccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 8765527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 348 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 42643317 - 42643119
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| |    
T  42643317 catttggggttggcctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcagattcgattccctctagtgccaatttcggtgggctaagt 42643218  T
Q  448 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
     |||||||||||||  ||| ||| |||  ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  42643217 ccatacagagcttgctctgtcttgaaacgggggccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcgcattagttgattcttggatcggataccgagttt 42643119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 348 - 543
Target Start/End: Original strand, 42328007 - 42328204
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| ||| |    
T  42328007 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagttt-ctcctccagaggtgtcaggtttgattccctctgttgccaatttcggtgggctaagt 42328105  T
Q  448 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
     |||||||||||||  |||||||||||  || ||||| ||||||| || |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  42328106 ccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccacaagtggacgatgggattggtcccctcgaattagtcgattcttggatcggataccgagttt 42328204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 349 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 264597 - 264409
Alignment:
Q  349 atttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaatt 448  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| |     
T  264597 atttggcgttggcctagtggttggcttgggatcttcgagtttgctcctccagagatctcaggttcgattccctctagtgccaatttcggtgggctaagtc 264498  T
Q  449 catacagagcttg--ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 535  Q
     ||||| ||||||  ||||||||||| || ||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  264497 tatacatagcttgctctggctttaaacgggcccccacaaatgggcggtgagattgatcccctcgaattagtcgattcttggatcggata 264409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 349 - 535
Target Start/End: Original strand, 651324 - 651512
Alignment:
Q  349 atttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaatt 448  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| |     
T  651324 atttggcgttggcctagtggttggcttgggatcttcgagtttgctcctccagagatctcaggttcgattccctctagtgccaatttcggtgggctaagtc 651423  T
Q  449 catacagagcttg--ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 535  Q
     ||||| ||||||  ||||||||||| || ||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  651424 tatacatagcttgctctggctttaaacgggcccccacaaatgggcggtgagattgatcccctcgaattagtcgattcttggatcggata 651512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 349 - 535
Target Start/End: Original strand, 837059 - 837247
Alignment:
Q  349 atttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaatt 448  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| |     
T  837059 atttggcgttggcctagtggttggcttgggatcttcgagtttgctcctccagagatctcaggttcgattccctctagtgccaatttcggtgggctaagtc 837158  T
Q  449 catacagagcttg--ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 535  Q
     ||||| ||||||  ||||||||||| || ||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  837159 tatacatagcttgctctggctttaaacgggcccccacaaatgggcggtgagattgatcccctcgaattagtcgattcttggatcggata 837247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 348 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 27746534 - 27746348
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| |    
T  27746534 catttggggttggcctagtggttggtttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagt 27746435  T
Q  448 tcatacagagcttg--ctggctttaaatggccccccgcaagt-gggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcg 531  Q
     |||||||||||||  ||||||||||| ||  |||| ||||| ||||| ||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27746434 ccatacagagcttgctctggctttaaaaggggccccacaagtggggcgatggaattagtcccctcggattagtcgattcttggatcg 27746348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 352 - 535
Target Start/End: Original strand, 28088292 - 28088478
Alignment:
Q  352 tggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcat 451  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||| | |||    
T  28088292 tggggttggcttagtggttgacttgggatcttggagtttgttcatccagaggtctcagattcgattccctttggtgtcaatttcggtgggttaagtccat 28088391  T
Q  452 acagagcttg--ctggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 535  Q
    ||||||||||  ||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  28088392 acagagcttgctctgactttaaatggggcctccgcaagtgggcggtgggattgatcccctcagaatagtcgattcttggatcggata 28088478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 367 - 535
Target Start/End: Original strand, 14632975 - 14633146
Alignment:
Q  367 ggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctg 464  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |  ||||||||||||  |||    
T  14632975 ggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtctatacagagcttgctctg 14633074  T
Q  465 gctttaaatgg-ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 535  Q
    ||||| || ||  |  || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  14633075 gctttgaacggagcgtccacaagtgggcggtgggattggtccccttggattagtcgattcttggatcggata 14633146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 354 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 4698916 - 4698724
Alignment:
Q  354 gggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatac 453  Q
    ||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| | |||      
T  4698916 gggttggcccagcggttggtttgggatcttggagtttgctccttcagaggtctcaggttcgattccctctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatga 4698817  T
Q  454 agagcttg--ctggctttaaatgg-ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    ||| ||||  ||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||    
T  4698816 agaacttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgagcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcatggattggataccgagttt 4698724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 348 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 7558142 - 7557952
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||| |    
T  7558142 catttggggttggcctagtagttagcttgggatcttggagtttgctcctccagaagtctcagattcgatttcctctggtgccaattttggtgggctaagt 7558043  T
Q  448 tcatacagagcttg--ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
     |       |||||  ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||| |||||||| |||||||    
T  7558042 cc-------gcttgttctggctttaaacggacccccgcaagtggacggtgggattggtcccctcgaattagtcgatttttgcatcggataccgagttt 7557952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 348 - 543
Target Start/End: Original strand, 18532109 - 18532298
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||| ||| |    
T  18532109 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctcagatgtcaatttcggtgggctaagt 18532208  T
Q  448 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
     |||||||| ||||  |||| ||||||  || |||| |||||||||||||| ||||         ||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  18532209 ccatacagaacttgctctggatttaaacggggcccctgcaagtgggcggtgagatt---------ggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 18532298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 372 - 543
Target Start/End: Original strand, 20469943 - 20470116
Alignment:
Q  372 gcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctggcttt 469  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| | |||| ||| | |||||||||||||  ||||||||    
T  20469943 gcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctagagccaatttagatgggctaagtccatacagagcttgctctggcttt 20470042  T
Q  470 aaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    |||  |  ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||    
T  20470043 aaacagagcccccgcaagtgggcggtgggattggt-tcctcggattagtcgatttttggatcggataccgagttt 20470116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 348 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 26169047 - 26168862
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||| ||||||  ||| ||| ||||||||||||  || |    
T  26169047 catttagggttggcctagtggtttgcttgggatcttggagtttgctcctctcaaggtctcaggtttgattcctcctgatgccaatttcggtggg-caagt 26168949  T
Q  448 tcatacagagcttg--ctggctttaaatg-gccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcg 531  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||| | || ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  26168948 tcatacagagcttgttctggctttaaatgagcccctcgcaagtgggggatgagattggtcccctcggagtagtcgattcttggatcg 26168862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 348 - 543
Target Start/End: Original strand, 2166699 - 2166896
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtg--gttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaa 445  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||| | |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||  |||| |||||| || || |||    
T  2166699 catttggggttggcccagtgcagttggtttgggatcttggagtttgcttctccaaaggtctcaggttcgattccctc--gtgccaatttcagtaggctaa 2166796  T
Q  446 attcatacagagcttgct--ggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
     | |||||||||||||||  ||||||||||    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| || ||| ||||| |||||||    
T  2166797 gtccatacagagcttgctctggctttaaataagaccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcagattagtcgattttttgattggataccgagttt 2166896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 401 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 6953153 - 6953009
Alignment:
Q  401 aggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtggg 497  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||| |||||||||    
T  6953153 aggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacagggcccccgcaagttggcggtggg 6953054  T
Q  498 attgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    |||| | |||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  6953053 attggt-ccctcggattagtcgattcttggatcgaataccgagttt 6953009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 365 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 34610869 - 34610688
Alignment:
Q  365 gtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct- 463  Q
    |||||| |||| |||| |||||||||| ||  ||||| |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||  ||| |  ||||||||||||||     
T  34610869 gtggttggcttaggattttggagtttgttcatccagatgtctgaggttcgattccctctgatgccaatttcggtggtctaagtctatacagagcttgctc 34610770  T
Q  464 -ggctttaaatg-gccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
     ||||||||| | ||||| |||||||||||||| | |||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  34610769 tggctttaaacgagcccctcgcaagtgggcggtagaattggtcccctcgaattagtcgattcttggatcggataccgagttt 34610688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 349 - 543
Target Start/End: Original strand, 24018385 - 24018583
Alignment:
Q  349 atttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaatt 448  Q
    |||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| |||||  ||  |||||| ||||| ||| |     
T  24018385 atttggggttgatctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctgaggttcgatttcctctaatgtcaatttcagtgggctaagtc 24018484  T
Q  449 catacagagcttg--ctggctttaaatgg--ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| ||  | |||| ||||||||||||| ||||| |||||| | |||||||  |||||||| |||||| |||||||    
T  24018485 catacagagcttgctctggctttaaacgggcctccccacaagtgggcggtgagattggtccccttgaattagtcggttcttggaccggatatcgagttt 24018583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 404 - 543
Target Start/End: Original strand, 25248407 - 25248546
Alignment:
Q  404 tctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct--ggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattg 501  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||| | ||||||||| |||||  ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  25248407 tctcaggttcgattccctctggtgtcaatttcggtaggctaagt-catacagagtttgctctggctttaaacgggccctcgcaagtgggcggtgggattg 25248505  T
Q  502 ttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
     |||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||    
T  25248506 gtcccctcggattagtcgatt-tttgatcggataccgagttt 25248546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 348 - 531
Target Start/End: Original strand, 28964035 - 28964220
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||| ||||||||||| |   |||| ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| |    
T  28964035 catttggggttggtctagtggttggtttgagatcttagagtttgctcctcttaaggtttcatgttcgattccatctggtgccaatttcggtgggctaagt 28964134  T
Q  448 tcatacagagct-tg-ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcg 531  Q
     ||||| ||||| || |||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  28964135 ccatacggagctatgtctggctttaaacggggcccccgcaagtgggc-gtgggattggtcccctcgaattagtcgattcttagatcg 28964220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 348 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 34694775 - 34694576
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||| |   |||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||    
T  34694775 catttggggttggtctagtggttgacttgtgatcttggagtttgctcctctcaaggtcttaggttcgattccatctggtgccaatttcggtggg-caaat 34694677  T
Q  448 tcatacagagc-ttgct--ggctttaaatgg--ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagtt 542  Q
    ||||||| ||| |||||  |||||  || ||   ||||| | ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  34694676 tcatacaaagctttgctccggcttagaacggaatccccctctagtggacggtgggattggtcccctcagattagtctgtccttggatcggataacgagtt 34694577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 348 - 525
Target Start/End: Original strand, 21667552 - 21667731
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    |||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||| || | |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  21667552 catttgaggttggtctagtggttggcttggaatcttggaggttgctcctccaaagatttcaggttcgatttcctttggtgctaatttcggtgggctaagt 21667651  T
Q  448 tcatacagagcttg--ctggctttaaatgg-ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattctt 525  Q
     |||||||||||||  ||| ||||||| ||  |  ||||||||||||||||| |||| | ||||| |||||||| ||||||    
T  21667652 ccatacagagcttgctctgcctttaaacggagcatccgcaagtgggcggtggaattggt-ccctcagattagtcgattctt 21667731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 477 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 2639478 - 2639412
Alignment:
Q  477 cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  2639478 cccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 2639412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 399 - 543
Target Start/End: Original strand, 10292108 - 10292254
Alignment:
Q  399 agaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct--ggctttaaatggc-cccccgcaagtgggcggtg 495  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| | | | ||| ||||| |||||  ||||||||| ||  ||||| |||||||||||||    
T  10292108 agaggtctcaggttcgattccctctgatgccaatttcagtgggctgagtccat-cagagattgctctggctttaaacggggcccccacaagtgggcggtg 10292206  T
Q  496 ggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    |||||| |||| ||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||    
T  10292207 ggattggtcccttcggattagttgattcttggatcgaataccgagttt 10292254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 348 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 36848948 - 36848759
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||| | |||||||||||||| |   |||| | || ||| ||| |||||||||| |||||||||||| ||| |    
T  36848948 catttggggttggcatagtggttgacttgggtttttggagtttgctcctctcaaggttttagattccatttcctctggtgccaatttcggtgggctaagt 36848849  T
Q  448 tcatacagagcttgct--ggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 535  Q
     ||||| ||| |||||  |||||||||||   | || ||||||||||||||||||  |||||||  |||||||  || ||||||||||||    
T  36848848 ccatacggagtttgctcgggctttaaatgaggcaccacaagtgggcggtgggattagtcccctcaaattagtcggtttttggatcggata 36848759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 348 - 535
Target Start/End: Original strand, 8042656 - 8042834
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||       |||||| ||||| |||||| ||  |    
T  8042656 catttggggttgacctagtgcttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaagtctcaggttcga-------tggtgccaattttggtgggctatgt 8042748  T
Q  448 tcatacagagcttgctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 535  Q
     ||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||| ||  ||||||||||| | |||| | |||| ||  |||||||||||||||    
T  8042749 ccatacagagtttgctggcttttaatgg-tccccgcaaatgaacggtgggattggt-cccttgaattaatcggttcttggatcggata 8042834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 348 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 34639405 - 34639295
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |   |||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| ||| |    
T  34639405 catttggggttagtctagtggttggcttgggatcttggagtgtgctcctctcaaggtctcaggctcga-tccctctggtgccaatttcggtggg-taagt 34639308  T
Q  448 tcatacagagctt 460  Q
     ||||||||||||    
T  34639307 ccatacagagctt 34639295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 348 - 543
Target Start/End: Original strand, 18128515 - 18128713
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    |||||||| |||||  | |||||  |||||||||||| ||| ||||||     |||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||||  || |    
T  18128515 catttgggattggctcattggttgacttgggatcttgaagtgtgctcctttcaaggtcttagattcgattctctctggtgccaatttcggtgggcgaa-t 18128613  T
Q  448 tcatacagagcttg---ctggctttaaatggc-cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
     |||| |||||||    ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| |||||||    
T  18128614 ccataaagagctttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcctctcagattagtcggttcttggatcgaataccgagttt 18128713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 401 - 501
Target Start/End: Original strand, 24999289 - 24999392
Alignment:
Q  401 aggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtggg 497  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| | |||| ||| |||||| ||||||||  |||||||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  24999289 aggtcttaggttcgattccctctgatgccaattttgatgggctaagttcatatagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtggg 24999388  T
Q  498 attg 501  Q
    ||||    
T  24999389 attg 24999392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 352 - 441
Target Start/End: Original strand, 41070767 - 41070856
Alignment:
Q  352 tggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtggg 441  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| | |   |||||||| |||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  41070767 tggggttggcctagtggttgacttgggatcttggagtgtgctactctcaaggtctcaagttcgattccctttggtgtcaatttcggtggg 41070856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 463 - 543
Target Start/End: Original strand, 12312965 - 12313045
Alignment:
Q  463 tggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| || |||| | |||||||    
T  12312965 tggctttaaatgggcccccacaagtgggcggtgggattgatcccctcgaattagtcggttcttagagcggaaaccgagttt 12313045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 348 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 8387643 - 8387550
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgc-tcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtggg 441  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  8387643 catttggggttggcctagtggttgtcttgagatcttagagtttgcttctctcag-ggtctcaagttcgatttcctctggtgccaattttggtggg 8387550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 355 - 441
Target Start/End: Original strand, 15974915 - 15974999
Alignment:
Q  355 ggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtggg 441  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |   |||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||||    
T  15974915 ggttggcctagtggtta-cttgggatcttggagtatgctcctctcaaggtctcaagttcgattccc-ctagtgcaaatttcggtggg 15974999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 348 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 3403701 - 3403503
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    |||||| ||||||||| | |||| || || |||||||||||||||||  |   |||||| | |||||||||| |||||||| ||||||||||||  || |    
T  3403701 catttgaggttggccttggggttggcctgagatcttggagtttgctcatctcaaggtcttatgttcgattccatctggtgccaatttcggtggg-caagt 3403603  T
Q  448 tcatacagagct---tgctggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
     |||||| | ||   |  ||||||||||| || ||| || |||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||| || | |||| |||||||    
T  3403602 ccatacaaaactttgttttggctttaaatggggccctcgtaagtgggcggtgaggttggtcccctcgaattagtcaattcttagaccagataccgagttt 3403503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 348 - 437
Target Start/End: Original strand, 3794793 - 3794882
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcgg 437  Q
    |||||| ||||| |||| ||||| |||| |||||||| |||||||||| |   |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  3794793 catttgtggttgacctaatggttggcttaggatcttgaagtttgctcctctcaaggtctcatgttcggttccctctggtgccaatttcgg 3794882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 474 - 535
Target Start/End: Original strand, 13749187 - 13749248
Alignment:
Q  474 ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 535  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| | |||||||| ||||    
T  13749187 ggccccccgcaagtgggcagtggaattggtcccctcggattagtcagtccttggatcagata 13749248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 477 - 543
Target Start/End: Original strand, 33747016 - 33747082
Alignment:
Q  477 cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| | | |||||||||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  33747016 cccccgcaagtggacggtggaattggttctctcggattagtcgatccttggatcggataccgagttt 33747082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 344 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 13580106 - 13580064
Alignment:
Q  344 aactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttgga 386  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  13580106 aactcatttggggttggtctagtagttaggttgggatcttgga 13580064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 406 - 531
Target Start/End: Original strand, 1219409 - 1219537
Alignment:
Q  406 tcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctggctttaaatggc-cccccgcaagtgggcggtgggattgt 502  Q
    ||||||||||||||||||| |   |||||| ||||| ||| | ||||||||  |||  ||||||||||| ||  |||||  ||||||||||| |||| |     
T  1219409 tcaggttcgattccctctgatatcaatttcagtgggctaagtccatacagaatttgttctggctttaaacggggcccccataagtgggcggtaggatcgg 1219508  T
Q  503 tcccctcggattagtcaattcttggatcg 531  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||||    
T  1219509 tcccttcggattagtcgattcttagatcg 1219537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 498 - 543
Target Start/End: Original strand, 9713609 - 9713654
Alignment:
Q  498 attgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    |||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  9713609 attggtccactcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 9713654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 482 - 535
Target Start/End: Original strand, 16990722 - 16990775
Alignment:
Q  482 gcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 535  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||  | |||||||||||||    
T  16990722 gcaagtgggcggtgggactggtccccttggattagtcggtccttggatcggata 16990775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 462 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 42332094 - 42332025
Alignment:
Q  462 ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcg 531  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||| | |||||| |||| || ||| |||||||| ||||||||    
T  42332094 ctggctttaaacggtcctccgcaagtgggcgttaggattggtcccttcagataagtcaattattggatcg 42332025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 477 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 43817816 - 43817759
Alignment:
Q  477 cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggat 534  Q
    |||||||||||||||||||| |||| || ||||  |||| || |||||||||||||||    
T  43817816 cccccgcaagtgggcggtggaattggtctcctcaaattaatcgattcttggatcggat 43817759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 401 - 445
Target Start/End: Original strand, 6536579 - 6536623
Alignment:
Q  401 aggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaa 445  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  6536579 aggtctcaggttcaattctctctggtgccaatttaggtgggttaa 6536623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 132; Significance: 3e-68; HSPs: 73)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 348 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 4621436 - 4621238
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |    
T  4621436 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagt 4621337  T
Q  448 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
     |||||||||||||  |||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  4621336 ccatacagagcttgctctggctttaaacggggtccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 4621238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 348 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 7766926 - 7766728
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  7766926 cattcggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggctaagt 7766827  T
Q  448 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
     |||||||||||||  ||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  7766826 ccatacagagcttgctctgactttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttgaatcggatatcgagttt 7766728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 344 - 543
Target Start/End: Original strand, 24122017 - 24122219
Alignment:
Q  344 aactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggtt 443  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  24122017 aactcatttggggttggcttagtggttggcttgggatcttggggtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggct 24122116  T
Q  444 aaattcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgag 540  Q
    || | |||||||||||||  |||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  24122117 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggctcccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgag 24122216  T
Q  541 ttt 543  Q
    |||    
T  24122217 ttt 24122219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 348 - 535
Target Start/End: Original strand, 24674391 - 24674581
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |    
T  24674391 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagt 24674490  T
Q  448 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 535  Q
     |||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  24674491 ccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcgtattagtcgattcttggatcggata 24674581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 343 - 543
Target Start/End: Original strand, 46607803 - 46608006
Alignment:
Q  343 aaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggt 442  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  46607803 aaacccatttggggttggcctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggc 46607902  T
Q  443 taaattcatacagagcttg--ctggctttaaatgg-ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacga 539  Q
    ||| | |||||||||||||  ||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||    
T  46607903 taagtccatacagagcttgctctgactttaaaaggcccccccgcaagtgggcggtgggattgatcccctcggattagtcggtccttggatcggatatcga 46608002  T
Q  540 gttt 543  Q
    ||||    
T  46608003 gttt 46608006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 342 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 15059607 - 15059403
Alignment:
Q  342 taaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtggg 441  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  15059607 taaacccatttggggttggcctagtggttggcttggaatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattctctctggtgccaatttcggtggg 15059508  T
Q  442 ttaaattcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacg 538  Q
     ||| | |||||||||||||  |||||||||||  ||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||    
T  15059507 ctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggtccccgcaagtgggcggtgagattggtcccctcgaattagtcgattcttggatcggataccg 15059408  T
Q  539 agttt 543  Q
    |||||    
T  15059407 agttt 15059403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 348 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 27455065 - 27454873
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| | ||| |    
T  27455065 catttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattcactctgatgccaatttcggtgagctaagt 27454966  T
Q  448 tcatacagagcttg--ctggctttaaatgg---ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 535  Q
     |||||||||||||  ||||||||||| ||   ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27454965 ccatacagagcttgctctggctttaaacgggccccccccgcatgtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggata 27454873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 348 - 542
Target Start/End: Original strand, 8077645 - 8077841
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |    
T  8077645 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattctctctggtgccaatttcggtgggctaagt 8077744  T
Q  448 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagtt 542  Q
     |||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||| |||||||||| | ||||||    
T  8077745 ccatacagagcttgctctggctttaaacagggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctc-gattaatcgattattggatcggagaccgagtt 8077841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 342 - 543
Target Start/End: Original strand, 30677168 - 30677372
Alignment:
Q  342 taaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtggg 441  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||| | ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30677168 taaacccatttggggttgacctagtggttggtttgggatctaggagtttgctcctccaaaggtctcaggtttgattccctctggtgccaatttcggtggg 30677267  T
Q  442 ttaaattcatacagagcttgc--tggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacg 538  Q
     ||| | ||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||| |||||| ||    
T  30677268 ctaagtccatacagagcttgctttggctttaaatgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcagattagtcggttcttggaccggatatcg 30677367  T
Q  539 agttt 543  Q
    |||||    
T  30677368 agttt 30677372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 343 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 7197450 - 7197248
Alignment:
Q  343 aaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggt 442  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||     
T  7197450 aaacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctgatgccaatttcggtggg- 7197352  T
Q  443 taaattcatacagagcttg--ctggctttaaatg-gccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacga 539  Q
    ||| |  ||||||| ||||  ||||||||||| | | |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||    
T  7197351 taagtcaatacagaccttgctctggctttaaacgaggcccctgcaagtgggcggtgagattggtcccctcggattagtcgattcatggatcggataccga 7197252  T
Q  540 gttt 543  Q
    ||||    
T  7197251 gttt 7197248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 341 - 543
Target Start/End: Original strand, 34778333 - 34778535
Alignment:
Q  341 ataaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgg 440  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||    
T  34778333 ataaacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggtttgattccctctggtaccaattttggtgg 34778432  T
Q  441 gttaaattcatacagagcttgc--tggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataac 537  Q
    |||   | ||||||||| ||||  ||||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||| |    
T  34778433 gtt---tccatacagagtttgctttggctttaaacggggcccccgcaagtggacggtgggattggtccccttggattagtcgattcttggatcggatacc 34778529  T
Q  538 gagttt 543  Q
    ||||||    
T  34778530 gagttt 34778535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 358 - 543
Target Start/End: Original strand, 17935777 - 17935965
Alignment:
Q  358 tggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagag 457  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||| | |||||||||    
T  17935777 tggcatagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccttctagtgccaatttcggtgggctaagtccatacagag 17935876  T
Q  458 cttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
     |||  |||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  17935877 tttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcgatgggattggtccactcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 17935965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 372 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 9500530 - 9500356
Alignment:
Q  372 gcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctggcttt 469  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||  ||||||||    
T  9500530 gcttgggatcttggagtttgctccttcagaggtctcaggttcgattctctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggcttt 9500431  T
Q  470 aaatgg-ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    ||| ||  ||||| ||||||||||||| ||||| || | ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  9500430 aaacggagcccccacaagtgggcggtgagattggtctcttcggattagtcgattcttggatcggatatcgagttt 9500356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 343 - 543
Target Start/End: Original strand, 32729538 - 32729740
Alignment:
Q  343 aaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggt 442  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |   | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||     
T  32729538 aaacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttcgagtttgctcctctcaaagtctcaggttcgattccctatggtgccaatttcggtggg- 32729636  T
Q  443 taaattcatacagagcttg--ctggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacga 539  Q
     || | |||||||||||||  |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  |  |||||||||||| |||    
T  32729637 caagtccatacagagcttgctctggctttaaatggggtccccgcaagtgggcggtgggattgatccccttggattagtcggtctttggatcggataccga 32729736  T
Q  540 gttt 543  Q
    ||||    
T  32729737 gttt 32729740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 348 - 535
Target Start/End: Original strand, 168199 - 168389
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |    
T  168199 catttggagttggcctagtggttggcttgggatcttagagtttgctctttcaaaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagt 168298  T
Q  448 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 535  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||  || | ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| || ||||||    
T  168299 tcatacagagcttgttctgactttaaacgggactcccgctagtggccggtgggattggtcccctcggattagttagttcttagaccggata 168389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 360 - 543
Target Start/End: Original strand, 7578419 - 7578605
Alignment:
Q  360 gcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagct 459  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| | |||||| ||||    
T  7578419 gcctagtggttggcttgggatcttggagtttgttcctccagaggtctcaggttcgattccctatggtgccaatttcggtgggctaagtccatacaaagct 7578518  T
Q  460 tg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    ||  ||| |||||||  || ||| |||||||||| |||||||||| | |||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||    
T  7578519 tgctctgactttaaacggggccctcgcaagtgggtggtgggattggttccctcggattagttgatttttggatcggataccgagttt 7578605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 348 - 535
Target Start/End: Original strand, 23734114 - 23734305
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    |||||||||||||  |||| ||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| |    
T  23734114 catttggggttggtttagtagttggcttgggatcttagaatttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctgatgccaatttcggtgggctaagt 23734213  T
Q  448 tcatacagagcttgc--tggctttaaa--tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 535  Q
     ||||||||| ||||  || |||||||   ||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||    
T  23734214 ccatacagagtttgctatgcctttaaacggggccccccgcaagtgggcggtgaaattggtcccctcagattagtcgattcttgaatcggata 23734305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 348 - 535
Target Start/End: Original strand, 23741306 - 23741497
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    |||||||||||||  |||| ||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| |    
T  23741306 catttggggttggtttagtagttggcttgggatcttagaatttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctgatgccaatttcggtgggctaagt 23741405  T
Q  448 tcatacagagcttgc--tggctttaaa--tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 535  Q
     ||||||||| ||||  || |||||||   ||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||    
T  23741406 ccatacagagtttgctatgcctttaaacggggccccccgcaagtgggcggtgaaattggtcccctcagattagtcgattcttgaatcggata 23741497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 355 - 540
Target Start/End: Original strand, 1378903 - 1379090
Alignment:
Q  355 ggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcataca 454  Q
    ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| |||||||| |||||||||  |||||||||||| ||| | ||||||    
T  1378903 ggttggcttagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccaaaagtctcatgttcgatttcctctggtgtcaatttcggtgggctaagtccataca 1379002  T
Q  455 gagcttg--ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgag 540  Q
    || ||||  ||||||||||| || ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  1379003 gaacttgctctggctttaaacgggcccccgcaagtggacggtgagattggtcccctcagattagtcgattcttagatcggataccgag 1379090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 348 - 515
Target Start/End: Original strand, 7946842 - 7947011
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    |||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |    
T  7946842 catttggggtcgacctagtggttggcttgagatcttgaagtttgctcctccagaggtctcaagttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagt 7946941  T
Q  448 tcatacagagcttg--ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggatta 515  Q
      ||||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||    
T  7946942 ctatacagagcttgctctcgctttaaatggggccccgcaagtgggtggtgagattggtcccctcagatta 7947011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 348 - 535
Target Start/End: Original strand, 21726727 - 21726917
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    |||||| ||||| ||||||||||   ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |    
T  21726727 catttgaggttgacctagtggttgatttgggttcttgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcgatgggttaagt 21726826  T
Q  448 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 535  Q
     |||| ||||||||  || ||||||||  || ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  21726827 ccatatagagcttgttctagctttaaacgggtcccccacaagtgggcggtggggttgatcccctcagattaatcgattcttggatcggata 21726917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 365 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 37351643 - 37351454
Alignment:
Q  365 gtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--- 461  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||       
T  37351643 gtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaatgtctcaggttcgattccttctgatgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctc 37351544  T
Q  462 --------ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
            ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||    
T  37351543 tggaagctctggctttaaacgggcccccacaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcggtccttggatcggataccgagttt 37351454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 372 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 45859218 - 45859052
Alignment:
Q  372 gcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctggcttt 469  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||  |||||  || |||||    
T  45859218 gcttgggatcttggagtttgctcctctagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacatcgcttgctcttgcttt 45859119  T
Q  470 aaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 535  Q
    |||  || |||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  45859118 aaacagggcccccgcaagtgggtggtaggattggtcccctcggattagttgattattggatcggata 45859052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 349 - 535
Target Start/End: Original strand, 18646852 - 18647041
Alignment:
Q  349 atttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaatt 448  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |     
T  18646852 atttggggttgacctagtggttggcttgtgatctttgagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattctctctggtgccaatttcggtgggctaagtc 18646951  T
Q  449 catacagagcttg--ctggctttaaatgg-ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 535  Q
     ||||| || |||  ||||||||||| ||  |||| | |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||    
T  18646952 tatacaaagtttgctctggctttaaacggagcccctgtaagtgggcggtgagattgatcccctcgaattagtcgattcttgaatcggata 18647041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 374 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 36156061 - 36155889
Alignment:
Q  374 ttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgc--tggctttaa 471  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || | ||| ||||||||||  | | |||||    
T  36156061 ttgggatcttggagtttgctcctccagaggtgtcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggccaagtccatgcagagcttgctttagttttaa 36155962  T
Q  472 a-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    |  || |||||||| |||||||||||||||| |||| ||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  36155961 acagggcccccgcaggtgggcggtgggattggtcccttcaaattagtcgattcttggatcggataccgagttt 36155889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 367 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 33905690 - 33905511
Alignment:
Q  367 ggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctg 464  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| | ||||||||| |||  |||    
T  33905690 ggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtatcaatttcggtgggttaagtccatacagagtttgttctg 33905591  T
Q  465 gctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    ||||||||  || || ||| |||||| ||||||||||| |||||||  |||  || |||||| ||||||||| |||||||    
T  33905590 gctttaaacggggcctccgtaagtggacggtgggattgatcccctcaaatttatcgattctttgatcggataccgagttt 33905511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 348 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 23232464 - 23232304
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| |    
T  23232464 catttgggattggcctagtggttgacttgggatcttgaagtttgctcttccagaggtttcaggttcgattccctctggcgccaatttcggtgggctaagt 23232365  T
Q  448 tcatacagagcttg------ctggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattg 501  Q
     |||||||||||||      |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  23232364 ccatacagagcttgcaagctctggctttaaatgggacccccgcaagtgggtggtgggattg 23232304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 349 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 46113600 - 46113495
Alignment:
Q  349 atttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaatt 448  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |     
T  46113600 atttggggttggcctagtggttggtttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtaccaatttcggtgggctaagtc 46113501  T
Q  449 cataca 454  Q
    ||||||    
T  46113500 cataca 46113495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 343 - 535
Target Start/End: Original strand, 2272337 - 2272532
Alignment:
Q  343 aaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggt 442  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||     
T  2272337 aaacacatttggggttggcctagtggttgacttgggatcttagagtttgctcctacagaggtctcaggtttgattccctctgatgccaatttcgctgggc 2272436  T
Q  443 taaattcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 535  Q
    ||| |||||||| || |||  ||| |||||||  || ||||  |||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||  |||||||||    
T  2272437 taagttcatacaaagtttgctctgactttaaacggggcccctacaagggggcggtaggattgatcccatcggattagtcgattctaagatcggata 2272532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 398 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 8254901 - 8254753
Alignment:
Q  398 cagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct--ggctttaaatggc-cccccgcaagtgggcggt 494  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||  ||||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  8254901 cagaggtctcaggttcgattatctctggtgtcaatttcggtgggctaagttcatacagaacttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggt 8254802  T
Q  495 gggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    ||||||| |||||| | ||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  8254801 gggattgatccccttgaattagtcgattcttgaatcggataccgagttt 8254753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 348 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 20487389 - 20487297
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgg 440  Q
    |||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20487389 catttggggttggtttagtggttggctcgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaagttcgattccctctggtgccaatttcggtgg 20487297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 348 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 29057536 - 29057364
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||  ||||     
T  29057536 catttggggttggcctagtggttggtttgggatcttggagtttgctgctccaaaggtctcaggttcgattccctcttgtgccaatttcgatgg--taaag 29057439  T
Q  448 tc-atacagagcttg--ctggcttt-aaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtc 518  Q
    || ||||||||||||  |||||||| ||  || ||||||||| |||||| || ||||| |||||||  |||||||    
T  29057438 tctatacagagcttgctctggctttcaacgggacccccgcaaatgggcgatgtgattggtcccctcaaattagtc 29057364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 374 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 8779909 - 8779745
Alignment:
Q  374 ttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgctg--gctttaa 471  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| | ||| |||  |||||||||||| ||| | |||||| ||||| ||   |||||||    
T  8779909 ttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcagcttcgatttcttctagtgtcaatttcggtgggctaagtccatacacagcttactctagctttaa 8779810  T
Q  472 atggc-cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 535  Q
    | ||  ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  8779809 acggggcccccacaagtaggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttagatcggata 8779745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 349 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 25496686 - 25496503
Alignment:
Q  349 atttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaatt 448  Q
    |||||| |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| |   |||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||| |  || ||    
T  25496686 atttggcgttggcctagtgattggcttgggatcttggagattgctcctcttaaggtctcaagttcgattccctctagtgcctatttcggtgag-caagtt 25496588  T
Q  449 catacagagcttgctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 535  Q
    ||||  |||||| ||||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||  | |||||||||||||    
T  25496587 catattgagcttactggcttaaaatggggctccgcaagtggacggtgggattgatcccct--gattagtctgtacttggatcggata 25496503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 342 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 14258632 - 14258538
Alignment:
Q  342 taaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcg 436  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  14258632 taaacccatttgggcttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgttcctccagatgtctctggttcgattccctctggtaccaatttcg 14258538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 350 - 535
Target Start/End: Original strand, 32930749 - 32930937
Alignment:
Q  350 tttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 449  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||| |||||| ||| | |    
T  32930749 tttggggttgacctagtggttggtttggaatcttggagtttactccttcagaggtctcaagttcgatttcctctggtgcccattttggtgggctaagtcc 32930848  T
Q  450 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 535  Q
    || |||||||||  |||||||||||  ||  ||| ||||||||  |||||||||| ||||||| ||||| || |||||| ||| |||||    
T  32930849 atgcagagcttgctctggctttaaacggggtccctgcaagtggatggtgggattgatcccctcagattaatcgattcttagattggata 32930937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 348 - 543
Target Start/End: Original strand, 1486418 - 1486616
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||| | |   ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| || |    
T  1486418 catttggggttgacctagtggttggcttgggatcttggagt--gctactctcaaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcgatgggt-aagt 1486514  T
Q  448 tcatacagagcttg---ctggctttaaatgg---ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagt 541  Q
     ||||||||||||    ||| |||  || ||   |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||  | ||||||||||||| |||||    
T  1486515 ccatacagagctttgctctgacttagaacggggcccccccgcaagtggacggtgggatcggtcccctccgattagtcggtccttggatcggataccgagt 1486614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 477 - 543
Target Start/End: Original strand, 48699889 - 48699955
Alignment:
Q  477 cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  48699889 cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccttcggattagtcgattcttggatcggatatcgagttt 48699955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 348 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 18533923 - 18533733
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    |||||||||||| | ||||||||  |||| |||||| ||||||||||| |||||||| |||| || ||||| |||| |||| ||||||| |||  ||| |    
T  18533923 catttggggttgacatagtggttgacttgagatcttagagtttgctcctccagaggtatcagatttgattctctctagtgccaatttcgatggactaagt 18533824  T
Q  448 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 535  Q
     |||| ||||||||  ||| |||||||  || |||| |||||||||| ||||||||| |||||||  |||| || |||||| |||||||||    
T  18533823 ccatatagagcttgttctgactttaaacggggcccctgcaagtgggccgtgggattggtcccctcatattaatcgattcttagatcggata 18533733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 348 - 442
Target Start/End: Original strand, 24216976 - 24217070
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggt 442  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |   ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  24216976 catttggggttgacctagtggttgacttgggatcttggagtgtgctcctctcaaggtctcaggttcgattacctttggtgccaatttcggtgggt 24217070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 356 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 25237180 - 25237095
Alignment:
Q  356 gttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtggg 441  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | |   ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  25237180 gttggcctaatggttagtttgggatcttggagtttgcttctctcaaggtctcaggttcgattccctctagtgccaatttcggtggg 25237095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 342 - 438
Target Start/End: Original strand, 1378737 - 1378833
Alignment:
Q  342 taaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggt 438  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||  ||||||||  |||||||||    
T  1378737 taaactcatttggggttggtctagtggttgacttggaatcttggagtttactcctccaaaggtctcatgttcgattttctctggtgtcaatttcggt 1378833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 348 - 422
Target Start/End: Original strand, 1818732 - 1818806
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctc 422  Q
    |||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  1818732 catttggggttggcctggtagttggcttaggatcttggagtttgctcttccagaggtttcaggttcgattccctc 1818806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 348 - 524
Target Start/End: Original strand, 2537702 - 2537870
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||      |||||| |   |||||||||||| |||||| | |||||| |||||||||||| ||  |    
T  2537702 catttggggttggcctagtggttggattgggatctt------tgctcctctcaaggtctcaggtttgattccatttggtgccaatttcggtgggctatgt 2537795  T
Q  448 tcatacagagcttgct--ggctttaaatgg-ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattct 524  Q
     ||     ||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  2537796 cca-----agcttgctttggctttaaacgggccccccgcaagtgggcggagggattggtcccctcggattagtcagttct 2537870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 466 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 26513226 - 26513149
Alignment:
Q  466 ctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  26513226 ctttaaacgggcccccacaagtgggcggtgggaatggtcccctcggattagtcgattcttggatcgaataccgagttt 26513149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 430 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 45331739 - 45331622
Alignment:
Q  430 aatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct--ggctttaaatgg--ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattctt 525  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||||||||||  ||||||||| ||  | |||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||    
T  45331739 aatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctttggctttaaacggggctccccgcaagtggacggtgggattaatcccctcagattaatcgattctt 45331640  T
Q  526 ggatcggataacgagttt 543  Q
    | |||||||| |||||||    
T  45331639 gaatcggataccgagttt 45331622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 477 - 543
Target Start/End: Original strand, 22910001 - 22910067
Alignment:
Q  477 cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || ||| ||||||||| |||||||    
T  22910001 cccccgcaagtgggcggtgggatttgtcccctcggattagtcgatacttcgatcggataccgagttt 22910067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 477 - 543
Target Start/End: Original strand, 35138118 - 35138184
Alignment:
Q  477 cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||    
T  35138118 cccccgcaagtgggcggtgggattgattccctcggattagtcggtccttggatcggataccgagttt 35138184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 348 - 440
Target Start/End: Original strand, 1138577 - 1138669
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgg 440  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |   |||||| |||||||| || |||| |||| |||||||||||    
T  1138577 catttggggttgacctagtggttggcttgagatcttggagtgtgctcctctcaaggtcttaggttcgaatctctctagtgccaatttcggtgg 1138669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 467 - 543
Target Start/End: Original strand, 27159205 - 27159281
Alignment:
Q  467 tttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    |||||| || ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||| |||||||    
T  27159205 tttaaacgggcccccgcaagtggacggtgggattggtcccctcagattagtcgatctttggatcggatatcgagttt 27159281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 349 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 40146079 - 40145890
Alignment:
Q  349 atttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaatt 448  Q
    |||||| |||| ||||||||||   ||| ||||||| ||||||||||  |||     |||||||||||| ||||| |||| |||||  ||||| ||| |     
T  40146079 atttggagttgacctagtggttgatttgtgatcttgaagtttgctccttcag-----tcaggttcgatttcctctagtgccaatttatgtgggctaagtc 40145985  T
Q  449 catacagagcttgct--ggctttaaatggccccccgcaa------gtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 535  Q
    |||||||||||||||  | |||||||||| ||||| |||      ||||| |||| | ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40145984 catacagagcttgctctgactttaaatgggcccccacaaccacaagtgggtggtgagtttggtcccctcggattagtcgattcttggatcggata 40145890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 480 - 543
Target Start/End: Original strand, 23041655 - 23041718
Alignment:
Q  480 ccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    |||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  23041655 ccgcaagtggacagtgggattggtcccctcgaattagtcgattcttggatcggataccgagttt 23041718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 348 - 395
Target Start/End: Original strand, 47091688 - 47091735
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcc 395  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  47091688 catttggggttggcctagtggttggcttgagatcttggagtttgctcc 47091735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 364 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 19034569 - 19034492
Alignment:
Q  364 agtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtggg 441  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| ||| | | |||| ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  19034569 agtggttggtttgggatcttggagtttgttcctcaaaaggtttcaggttcgattatctctggtgccaatttcggtggg 19034492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 348 - 441
Target Start/End: Original strand, 52135128 - 52135221
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtggg 441  Q
    ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||  |   | |||||||||||||||  |||| |||| |||| |||||||    
T  52135128 catttggggttggtctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcatctcaatgtctcaggttcgattatctctagtgccaattccggtggg 52135221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 348 - 441
Target Start/End: Original strand, 16899509 - 16899594
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtggg 441  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||| |||| |        ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16899509 catttggggttggcctagtggttgacttgtaatcttggagtgtgctgc--------tctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtggg 16899594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 354 - 459
Target Start/End: Original strand, 39964514 - 39964621
Alignment:
Q  354 gggttggcctagtggt--tagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcat 451  Q
    |||||||||||| |||  | ||||| || |||||||| |||||| |   |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | | ||||     
T  39964514 gggttggcctagaggtgttggcttgcgaccttggagtgtgctcctctcaaggtctcaggtttgattccctctggtgccaatttcggtgggctgagttcac 39964613  T
Q  452 acagagct 459  Q
    ||||||||    
T  39964614 acagagct 39964621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 401 - 535
Target Start/End: Original strand, 16539659 - 16539795
Alignment:
Q  401 aggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagctt---gctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtggg 497  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||  || | ||||||||||||   ||||||||  || ||  ||| | ||||||| ||||||    
T  16539659 aggtctcaggtttgattccctctggtgccaattttggtggg-caagtccatacagagctttgcgctggcttagaacggggccctgtaagtgggtggtggg 16539757  T
Q  498 attgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 535  Q
    |||| |||||||  ||||||| || |||| ||||||||    
T  16539758 attggtcccctcaaattagtcgatacttgtatcggata 16539795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 348 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 40802266 - 40802070
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||||| ||| |||||||||||||  |   |||||||| ||| ||||| |  |||||| ||||| | || |  || |    
T  40802266 catttggggttggctttgtggttggcttgagatattggagtttgctcatctcaaggtctcatgtttgattctccatggtgccaattttgatgagc-aagt 40802168  T
Q  448 tcatacagagcttgct--ggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
     |||||||||||||||  | ||||||| ||  ||||||||||||| |||| ||||| ||| || | ||||||| ||||||| |||| ||| |||||||    
T  40802167 ccatacagagcttgctctgactttaaacgggtccccgcaagtgggtggtgagattggtcctctagaattagtcgattcttgaatcgaataccgagttt 40802070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 481 - 543
Target Start/End: Original strand, 50202680 - 50202741
Alignment:
Q  481 cgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||    
T  50202680 cgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattaatcgattctt-gatcggatatcgagttt 50202741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 343 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 1095199 - 1095154
Alignment:
Q  343 aaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagt 388  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  1095199 aaacttatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagt 1095154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 494 - 543
Target Start/End: Original strand, 5315478 - 5315527
Alignment:
Q  494 tgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||    
T  5315478 tgggattggtcccctcggataagtcgattcttggatcggataccgagttt 5315527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 354 - 395
Target Start/End: Original strand, 6776148 - 6776189
Alignment:
Q  354 gggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcc 395  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  6776148 gggttggcctagtggttggtttgggatcttggagtttgctcc 6776189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 498 - 543
Target Start/End: Original strand, 14603947 - 14603992
Alignment:
Q  498 attgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  14603947 attggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 14603992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 354 - 441
Target Start/End: Original strand, 809226 - 809313
Alignment:
Q  354 gggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtggg 441  Q
    |||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| |||| |   |||||||||||| |||| || || |||  ||||||||||||    
T  809226 gggttggcctcgtggttggtttgggatcttggagtttactcctcttaaggtctcaggtttgattacccctagtgtcaatttcggtggg 809313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 477 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 12877003 - 12876965
Alignment:
Q  477 cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggatta 515  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  12877003 cccccgcaagtggacggtgggattggtcccctcggatta 12876965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 354 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 15581208 - 15581119
Alignment:
Q  354 gggttggcctagtggt--tagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtggg 441  Q
    |||||||||| |||||  | |||||||| |||||||| |||||| | | ||||||||||||| |||| | | |||||| |||||||||||    
T  15581208 gggttggcctggtggtgttggcttgggaccttggagtgtgctcctctaaaggtctcaggttcaattctccccggtgctgatttcggtggg 15581119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 477 - 535
Target Start/End: Original strand, 47091751 - 47091809
Alignment:
Q  477 cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 535  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||  |||  ||||| |||||||||||||||||    
T  47091751 cccccgcaagtggggggtgggattggtccattcgatttagtaaattcttggatcggata 47091809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 482 - 535
Target Start/End: Original strand, 52135261 - 52135314
Alignment:
Q  482 gcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 535  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||  |||||||||||||||    
T  52135261 gcaagtggacggtgggattggtcccctcatattagtcggttcttggatcggata 52135314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 403 - 543
Target Start/End: Original strand, 26820240 - 26820383
Alignment:
Q  403 gtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct--ggctttaaatggcccccc-gcaagtgggcggtgggat 499  Q
    ||||||| ||||||||||| || ||  |||||   |||||||| | |||||||| ||||||  | ||||||||||  |||| ||||||||  ||||| ||    
T  26820240 gtctcagattcgattccctatgatgtcaatttttatgggttaagtccatacagaacttgctctgcctttaaatgggacccctgcaagtggatggtggaat 26820339  T
Q  500 tgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    || || | ||||||||||| |||||||||| | ||| |||||||    
T  26820340 tgatcgcttcggattagtcgattcttggattgaataccgagttt 26820383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 354 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 33700840 - 33700757
Alignment:
Q  354 gggttggcctagtggt--tagcttgggatcttggagtttgctcccccaga-ggtctcaggttcgattccctctggtgctaattt 434  Q
    ||||||||||||||||  | |||||| |||| ||||| |||||| ||  | ||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  33700840 gggttggcctagtggtattggcttggaatctgggagtgtgctcctcctcaaggtctcaggttcgattctctctggtgccaattt 33700757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 462 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 36921595 - 36921513
Alignment:
Q  462 ctggctttaaatgg--ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||  | |||||  ||||||| ||| ||| |||||||| |||||||    
T  36921595 ctggctttaaatgggaccccccgcaagtggacggtgggattagt-ccctcaaattagtcgattattgaatcggataccgagttt 36921513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 478 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 43770031 - 43769975
Alignment:
Q  478 ccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggat 534  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  43770031 ccccacaaatgggcggtgggattggtcccttcgaattagtcgattctaggatcggat 43769975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 129; Significance: 2e-66; HSPs: 77)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 343 - 543
Target Start/End: Original strand, 32986190 - 32986393
Alignment:
Q  343 aaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggt 442  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||     
T  32986190 aaacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcaattccctctggtgccaatttcggtgggc 32986289  T
Q  443 taaattcatacagagcttg--ctggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacga 539  Q
    ||| | |||||||||||||  ||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||    
T  32986290 taagtccatacagagcttgctctgactttaaatggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggaatagtcgattcttggatcggataccga 32986389  T
Q  540 gttt 543  Q
    ||||    
T  32986390 gttt 32986393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 348 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 33696478 - 33696280
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||| |    
T  33696478 catttagggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcaattccctctggtgccaatttcggtgggctaagt 33696379  T
Q  448 tcatacagagcttg--ctggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
     |||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33696378 ccatacagagcttgctctggctttaaatggggcccccgcaagtgggcggtgagattggtcctctcggattagtcaattcttggatcggatatcgagttt 33696280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 348 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 34844957 - 34844759
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |    
T  34844957 catttggggttggcctagtggtttgcttgagatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattctctctggtgccaatttcggtgggctaagt 34844858  T
Q  448 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
     |||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  34844857 ccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 34844759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 348 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 40059051 - 40058853
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |    
T  40059051 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctctagaggtctcaggttcgattctctctggtgccaatttcggtgggctaagt 40058952  T
Q  448 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
     |||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  40058951 ccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 40058853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 348 - 543
Target Start/End: Original strand, 52983617 - 52983815
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| |    
T  52983617 catttggggttggcctagtggttggcttgagatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcagtgggctaagt 52983716  T
Q  448 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
     |||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  52983717 ccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 52983815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 343 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 5609406 - 5609203
Alignment:
Q  343 aaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggt 442  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||     
T  5609406 aaacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcattcagtggtctcaggttcgattctctctggtgccaatttcggtgggc 5609307  T
Q  443 taaattcatacagagcttg--ctggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacga 539  Q
    ||| | |||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  5609306 taagtccatacagagcttgctctggctttaaatggggcccccgcaagtggacggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttggatcggataccga 5609207  T
Q  540 gttt 543  Q
    ||||    
T  5609206 gttt 5609203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 348 - 543
Target Start/End: Original strand, 46714390 - 46714589
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcga-ttccctctggtgctaatttcggtgggttaaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||| |||     
T  46714390 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgatttccctttggtgccaatttcggtgggctaag 46714489  T
Q  447 ttcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    | |||||||||||||  || ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  46714490 tccatacagagcttgcccttgctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcaattcttgaatcggataccgagttt 46714589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 348 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 19660731 - 19660533
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||| ||| |    
T  19660731 catttggagttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggtttgattctctctgatgcaaatttcggtgggataagt 19660632  T
Q  448 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
     |||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  19660631 ccatacagagcttgctctggctttaaacagggcccccgcaagtgggcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 19660533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 352 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 27528990 - 27528796
Alignment:
Q  352 tggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcat 451  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||    
T  27528990 tggggttggcttagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccat 27528891  T
Q  452 acagagcttg--ctggcttta-aatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    ||||||||||  ||||||||| |  || ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  27528890 acagagcttgctctggctttatacggggcccccgcaagtgggcggtgagattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 27528796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 348 - 543
Target Start/End: Original strand, 20566347 - 20566546
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggt-ctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||     
T  20566347 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtgatcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggcaaag 20566446  T
Q  447 ttcatacagagcttg--ctggctttaaatgg-ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    | |||||||||||||  ||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  20566447 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcgctgggattggtcccctcagattagtcgattcttggatcggatatcgagttt 20566546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 348 - 543
Target Start/End: Original strand, 25852212 - 25852411
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |    
T  25852212 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagt 25852311  T
Q  448 tcatacagagcttg--ctggctttaaa--tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
     |||||||||||||  |||||||||||   || ||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||| |||||||    
T  25852312 ccatacagagcttgctctggctttaaaacgggaccctcgcaagtgggcaatgggattggtcccctcggattagtcggttcttggaccggataccgagttt 25852411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 342 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 45787908 - 45787705
Alignment:
Q  342 taaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtggg 441  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  45787908 taaactcatttggggttggcctagtggttggcttggaatcttgga-tttgctcctccagagatctcaggttcgattccctctgatgccaatttcagtggg 45787810  T
Q  442 ttaaattcatacagagcttgct--ggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacg 538  Q
     ||| | |||||||||||||||  |||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||    
T  45787809 ctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacagggcccccgcaagtggacggtgggattggtcccctcgaattagtcgattcttggatcggataccg 45787710  T
Q  539 agttt 543  Q
    |||||    
T  45787709 agttt 45787705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 343 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 54127546 - 54127351
Alignment:
Q  343 aaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggt 442  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||     
T  54127546 aaacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcaattccctcttgtgccaatttcggtgggc 54127447  T
Q  443 taaattcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 535  Q
    ||| |  ||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||||    
T  54127446 taagtctatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcggttcttggaccggata 54127351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 349 - 543
Target Start/End: Original strand, 44343512 - 44343710
Alignment:
Q  349 atttggggttggcctagtggttag-cttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |    
T  44343512 atttggggttgggctagtggtttggcttgggatcttggagtttgctcccccaaaggactcaagttcgattccctctggtgctaattttggtgggctaagt 44343611  T
Q  448 tcatacagagcttgct--ggctttaaatggccc-cccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
     |||||||||||||||  | ||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  44343612 ccatacagagcttgctctgactttaaacggggctcccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcgaattagtcgattcttgaatcggataccgagttt 44343710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 342 - 535
Target Start/End: Original strand, 51535605 - 51535809
Alignment:
Q  342 taaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtggg 441  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  51535605 taaactcatttagggttggcctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccacaggtctcaggttcgattccctctggtgccaattttggtggg 51535704  T
Q  442 ----ttaaattcatacagagcttg-----ctggctttaaa--tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatc 530  Q
        |||| | |||||||||||||     |||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  51535705 ctaattaagtccatacagagcttgcagctctggctttaaacggggcccccagcaagtgggcggtgggattggtcccctcgaattagtcgattcttagatc 51535804  T
Q  531 ggata 535  Q
    |||||    
T  51535805 ggata 51535809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 372 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 20078159 - 20077986
Alignment:
Q  372 gcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctggcttt 469  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||  ||||||||    
T  20078159 gcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggtttgattcccactggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggcttt 20078060  T
Q  470 aaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagtt 542  Q
    |||  || |||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  20078059 aaacggggcccccgtaagtgggcggtgggattagttccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagtt 20077986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 354 - 535
Target Start/End: Original strand, 35229172 - 35229356
Alignment:
Q  354 gggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatac 453  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||| ||| | |||||    
T  35229172 gggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccttct-atgccaatttcggtgggctaagtccatac 35229270  T
Q  454 agagcttg--ctggctttaaatgg--ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 535  Q
    | ||||||  ||| ||||||| ||  |||||| |||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  35229271 atagcttgctctgactttaaacgggtccccccacaagtgagcggtgggattggtcccctcgaattagtcgattcttggatcggata 35229356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 367 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 7392143 - 7391966
Alignment:
Q  367 ggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctg 464  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| | ||||||||| |||  |||    
T  7392143 ggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctatggtgccaatttcggt-ggttaagtccatacagagtttgctctg 7392045  T
Q  465 gctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    |||||||||||  ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| |||||||    
T  7392044 gctttaaatgggacccccatagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcggttcttcgattggataccgagttt 7391966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 348 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 36131709 - 36131511
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||| |    
T  36131709 catttggggttggcatagtggtttgcttgggattttggagttcgttcctccagatgtctcaggttcgattccctatggtgccaatttcggtggcctaagt 36131610  T
Q  448 tcatacagagcttgc--tggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
     ||||||||||||||  || |||||||  || |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||| |||| |||||||    
T  36131609 ccatacagagcttgctatgactttaaacgggacccccgtaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattattagatcagataccgagttt 36131511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 364 - 535
Target Start/End: Original strand, 49287872 - 49288045
Alignment:
Q  364 agtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgc- 462  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| | |||||| |  ||||     
T  49287872 agtggttggtttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattctctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacaaaatttgct 49287971  T
Q  463 -tggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 535  Q
     |||||||||| || | |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  49287972 atggctttaaacgggctcccgcaagtgggcgctgagattggtcccctcggattagtcgattcttggatcagata 49288045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 340 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 22625277 - 22625154
Alignment:
Q  340 tataaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtg 439  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  22625277 tataaacccatttgaggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttactcctccagaggtctcaggttcgattccctctggagccaatttcggtg 22625178  T
Q  440 ggttaaattcatacagagcttgct 463  Q
    || ||| | |||||||||||||||    
T  22625177 ggctaagtccatacagagcttgct 22625154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 348 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 13873494 - 13873321
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| |    
T  13873494 catttggggttggcctagtggtttgcttgggatcttggagtttgctccttcaaaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtaggctaagt 13873395  T
Q  448 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtc 518  Q
    |||||||||| |||  || |||| |||  || |||||||||||||| ||||| |||| ||| || |||||||||    
T  13873394 tcatacagagtttgctctagcttcaaacagggcccccgcaagtgggtggtggaattgatcctctgggattagtc 13873321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 346 - 531
Target Start/End: Original strand, 34835525 - 34835713
Alignment:
Q  346 ctcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaa 445  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |   |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||    
T  34835525 ctcatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttagagtttgctcctcttaaggtctcatgttcgattccctctggtgtcaatttcggtgggctaa 34835624  T
Q  446 attcatacagagct-tg-ctggctttaaat--ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcg 531  Q
     | ||||| ||||| || ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| |||||| |||||    
T  34835625 gtccatacggagctatgtctggctttaaatagggccccccgcaagtgggc-gtgagattggtcccctcggattagtcgattcttagatcg 34835713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 349 - 529
Target Start/End: Original strand, 32942369 - 32942552
Alignment:
Q  349 atttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaatt 448  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||| |     
T  32942369 atttggggttggtctagtggttggcttgagatcttggagtttactcctccagaggtttaaggttcgattctctctgatgccaatttcggtgggctaagtc 32942468  T
Q  449 catacagagctt--gctggctttaaatgg-ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggat 529  Q
    ||||||||||||   ||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| | || ||||||||||    
T  32942469 catacagagcttactctggctttaaacggcccccccacaagtggacggtgggattggtcccctcggataaatcgattcttggat 32942552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 336 - 494
Target Start/End: Original strand, 33992612 - 33992773
Alignment:
Q  336 atattataaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttc 435  Q
    |||||| |||| ||||| |||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  33992612 atattaaaaacccatttagggttgacctagtggttggtttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattctctctggtgccaatttc 33992711  T
Q  436 ggtgggttaaattcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggt 494  Q
    |||||| ||| | |||||| ||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  33992712 ggtgggctaagtccatacatagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggt 33992773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 343 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 35674945 - 35674750
Alignment:
Q  343 aaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggt 442  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||     
T  35674945 aaacccatttggggttggccaagtggttggcttgggatcttggagtttgctcttccaaaggtcacaggttcgattccctctggagccaatttcggtgggc 35674846  T
Q  443 taaattcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacga 539  Q
    ||| | |||||||||||||  ||| |||||||  || |||||||||||||||||| ||||       |||||||||||| |||||| ||||||||| |||    
T  35674845 taagtccatacagagcttgctctgcctttaaacggggcccccgcaagtgggcggttggat-------ctcggattagtcgattctt-gatcggataccga 35674754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 343 - 543
Target Start/End: Original strand, 1985829 - 1986030
Alignment:
Q  343 aaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggt 442  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||     
T  1985829 aaacccatttgggattggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgcgaatttcgatgggc 1985928  T
Q  443 taaattcatacagag----cttgctggctttaaatgg-ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataac 537  Q
    ||| | |||||||||    ||  ||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||| |||| | |  ||||||||||| |||||||||| ||||| |    
T  1985929 taagtccatacagagtaaact--ctggctttaaacggagcccccacaagtgggcggtggaattggt-ctatcggattagtcgattcttggat-ggatacc 1986024  T
Q  538 gagttt 543  Q
    ||||||    
T  1986025 gagttt 1986030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 399 - 543
Target Start/End: Original strand, 34723848 - 34723995
Alignment:
Q  399 agaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct--ggctttaaatggc-cccccgcaagtgggcggtg 495  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||| ||||||||  ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||    
T  34723848 agaggcctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacaaagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtg 34723947  T
Q  496 ggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    |||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  34723948 ggattggtcctctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 34723995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 348 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 18875715 - 18875518
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    |||||| ||||| | |||||||| | ||||||| || ||||||| | |  || || ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||| |    
T  18875715 catttgtggttgacatagtggttggtttgggattttagagtttgtttcttcaaagatctcaggttcgattccctctgatgtcaatttcggtgggctaagt 18875616  T
Q  448 tcatacagagcttgct--ggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
     |||||||||||||||  ||||||||| || ||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||    
T  18875615 ccatacagagcttgctctggctttaaacgggcccccacaagtgggtagtgggattgatcccctcggattagtcaatttttggatcagataccgagttt 18875518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 403 - 531
Target Start/End: Original strand, 32990488 - 32990619
Alignment:
Q  403 gtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct--ggctttaaatggc-cccccgcaagtgggcggtgggat 499  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||||  ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  32990488 gtctcaggttcgattccctttagtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggat 32990587  T
Q  500 tgttcccctcggattagtcaattcttggatcg 531  Q
    || |||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  32990588 tggtcccctcggactagtcgattcttggatcg 32990619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 388 - 535
Target Start/End: Original strand, 27574356 - 27574506
Alignment:
Q  388 tttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct--ggctttaaatggc-cccccgca 484  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||  | | ||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||  ||||||||    
T  27574356 tttgctcctccataggtctcaggttcgattttctcttattccaatttcggtaggctaaattcatacagagcttgctctggctttaaaaggggcccccgca 27574455  T
Q  485 agtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 535  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27574456 agtgggcggtgagtttggtcccctcggattaatcaattcttggatcggata 27574506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 347 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 43719265 - 43719154
Alignment:
Q  347 tcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaa 446  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||     
T  43719265 tcatttggggttggtctagtggttggtttgagatcttggagtttgctcctccagaggtttcaggttcgattctctctagtgctaatttcggtgggctaag 43719166  T
Q  447 ttcatacagagc 458  Q
    | ||||||||||    
T  43719165 tccatacagagc 43719154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 374 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 12500231 - 12500060
Alignment:
Q  374 ttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctggctttaa 471  Q
    ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||| ||| | |||||| ||||||  ||||||||||    
T  12500231 ttgggatcttggagtttgctccttcaaaggtctcaggtttgattccctctggtgccaatttcaatgggctaagtccatacatagcttgctctggctttaa 12500132  T
Q  472 a-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    |  || ||||||||||||||||||   |||| | | |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  12500131 acgggacccccgcaagtgggcggtaaaattgat-ctctcggattagtcaattcttggaccggataccgagttt 12500060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 357 - 461
Target Start/End: Original strand, 2351020 - 2351124
Alignment:
Q  357 ttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacaga 456  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  ||||| |||||| |    
T  2351020 ttggcctagtggttggcttggaatcttgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtcgactaaatccatacata 2351119  T
Q  457 gcttg 461  Q
    |||||    
T  2351120 gcttg 2351124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 401 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 9517787 - 9517650
Alignment:
Q  401 aggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct--ggctttaaatggc-cccccgcaagtgggcggtggg 497  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||| | |||||||||||||||  | ||||||| ||  |||||||| ||||| |||| |    
T  9517787 aggtctcaggttcgattctctctggtgccaatttcagtgggctaagtccatacagagcttgctctgactttaaacggggcccccgcaggtgggtggtgag 9517688  T
Q  498 attgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 535  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9517687 attggtcccctcggattagtcgattcttggatcggata 9517650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 348 - 531
Target Start/End: Original strand, 13550206 - 13550392
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||    ||||||||| |||| |||||||||||| ||| |    
T  13550206 catttgcggttggcctagtggttgacttgagatctgggagtttgctcctctagaggtctcaggcctaattccctctagtgccaatttcggtgggctaagt 13550305  T
Q  448 tcatacagagctt--gctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcg 531  Q
     ||||| ||||||   |||||||||||  ||  |||| |||||||||||| |||| | ||||||||||||| || ||||||||||||    
T  13550306 ccataccgagcttactctggctttaaacggggtccccacaagtgggcggtaggataggtcccctcggattaatcgattcttggatcg 13550392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 350 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 55961939 - 55961767
Alignment:
Q  350 tttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 449  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||           | |||||||||| |||||||||||| ||| | |    
T  55961939 tttgggattggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtc-----------ttcctctggtgccaatttcggtgggctaagtcc 55961851  T
Q  450 atacagagcttg--ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcg 531  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||| | || |||||||| || ||||||| ||||    
T  55961850 atacagagcttgctctgactttaaacggggccccacaagtgggcggtgggattggttccttcggattaatcgattcttgaatcg 55961767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 341 - 423
Target Start/End: Original strand, 42245737 - 42245819
Alignment:
Q  341 ataaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctct 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| | | ||||||| |||||||||||||||    
T  42245737 ataaactcatttggggttggcctagtggttgacttgggatcttagagtttgctcctctaaaggtctcgggttcgattccctct 42245819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 374 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 30879338 - 30879175
Alignment:
Q  374 ttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctggctttaa 471  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||  ||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| || |||  ||||||||||    
T  30879338 ttgggatcttgtagtttgctccttcatgggttttaggtttgattccctctggtgccaatttcgatgggttaaatccatacaaagtttgctctggctttaa 30879239  T
Q  472 atggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 535  Q
    | ||   || |||||||| ||||||||||| | ||||| ||||| || ||||||||||| ||||    
T  30879238 agggggtcctgcaagtggacggtgggattggttccctcagattaatcgattcttggatcagata 30879175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 348 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 13584453 - 13584338
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    |||||| |||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||| |    
T  13584453 catttgaggttggcctagtggttggcctgagatattggagtttgctcctccaaaagtctcaagttcgattccctctggtgtcaatttcgatgggctaagt 13584354  T
Q  448 tcatacagagcttgct 463  Q
     |||| ||||||||||    
T  13584353 ccatagagagcttgct 13584338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 382 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 20527198 - 20527035
Alignment:
Q  382 ttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctggctttaaatggcccc 479  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||| ||| | |||| ||||||||   | | ||||||  |  ||    
T  20527198 ttggagtttgttcctccagaggtctcaagtttgattccctctggcgccaatttcggtgggctaagtccatatagagcttgatttcggtttaaacagggcc 20527099  T
Q  480 ccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    ||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||||| ||| |||||||  ||| |||||||    
T  20527098 ccgtaagtgggcggtaggattggtctcctcggattagtcgatttttggatcaaataccgagttt 20527035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 348 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 41621795 - 41621684
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |   |||||||| ||| |||| |||||||||| ||||| ||||||  ||||    
T  41621795 catttggggttggcctaatggttggcttgagatcttggagtttgctcctctcaaggtctcatgtttgatttcctctggtgccaattttggtggg-caaat 41621697  T
Q  448 tcatacagagctt 460  Q
     ||||||||||||    
T  41621696 ccatacagagctt 41621684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 397 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 21387635 - 21387496
Alignment:
Q  397 ccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcgg 493  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||  ||||| |||||| ||| |  ||||||||||||  |||||||||||  ||  ||||||||||||||||    
T  21387635 ccagagatctcaggttcgattccctatagtgtcaattttggtgggctaagtctatacagagcttgctctggctttaaacgggatccccgcaagtgggcgg 21387536  T
Q  494 tgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 535  Q
    ||||  || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  21387535 tggg--tggtcccctcggattagtcgattattggatcggata 21387496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 481 - 543
Target Start/End: Original strand, 23639758 - 23639820
Alignment:
Q  481 cgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  23639758 cgcaagtggacggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 23639820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 481 - 543
Target Start/End: Original strand, 23645416 - 23645478
Alignment:
Q  481 cgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  23645416 cgcaagtggacggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 23645478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 354 - 543
Target Start/End: Original strand, 4911926 - 4912122
Alignment:
Q  354 gggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatac 453  Q
    |||||||| ||||||||  |||  ||||||||||||||||     ||| || |||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||  | ||||     
T  4911926 gggttggcttagtggttgacttaagatcttggagtttgcttttttagaagtttcaggttcgattccctctggtgttaattttggtggcctatgtccatat 4912025  T
Q  454 agagcttgct------ggctttaaatggc-cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    ||||||||||      ||||||||| ||  |||||||||||||| |||| ||||| ||||| || ||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  4912026 agagcttgcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggtggtgtgattgatccccccgaattagtcgattcttggatcagataccgagttt 4912122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 482 - 543
Target Start/End: Original strand, 52494623 - 52494684
Alignment:
Q  482 gcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  52494623 gcaagtgggcggtgggattggtcccctcgaattagtcgattcttggatcggataccgagttt 52494684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 350 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 25969700 - 25969512
Alignment:
Q  350 tttggggttggcctagtggttagcttggg-atcttggagtttgctcccccagaggtctcag--gttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaa 446  Q
    ||||||||||||||| |||||   ||||| ||||||||||||||||| |   ||||| |||  ||| ||||||| ||||||| |||||||||||   ||     
T  25969700 tttggggttggcctactggttgatttggggatcttggagtttgctcctctcaaggtcccagaggttggattccccctggtgccaatttcggtggcc-aag 25969602  T
Q  447 ttcatacagagcttgct--ggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 535  Q
    | |||||||| ||||||  ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||| ||||||||    
T  25969601 tccatacagaacttgctctggctttaaacgggcccccgtaagtgagcggtgggattggt-ccctcgaattagtcgattcttgaatcggata 25969512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 477 - 535
Target Start/End: Original strand, 4064990 - 4065048
Alignment:
Q  477 cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 535  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  4064990 cccccacaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgatttttggatcggata 4065048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 477 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 9978576 - 9978510
Alignment:
Q  477 cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||    
T  9978576 cccccgcaagtgggcggtgggattggtcccatcggattagttgattcttagatcggataccgagttt 9978510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 349 - 402
Target Start/End: Original strand, 34722169 - 34722222
Alignment:
Q  349 atttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagag 402  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34722169 atttggggttggcttagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagag 34722222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 477 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 43719154 - 43719096
Alignment:
Q  477 cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 535  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43719154 cccccgaaagtgggcggtgggattggtcatctcggattagtcgattcttggatcggata 43719096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 478 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 55158409 - 55158344
Alignment:
Q  478 ccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||    
T  55158409 ccccgcaaatgggtggtgggattggtcccctcggattagtcgatttttggatcggaaaccgagttt 55158344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 483 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 23131497 - 23131437
Alignment:
Q  483 caagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  23131497 caagtgggcggtaggattggtcccctcgaattagtcgattcttcgatcggataccgagttt 23131437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 473 - 535
Target Start/End: Original strand, 33289180 - 33289242
Alignment:
Q  473 tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 535  Q
    ||||||||  ||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33289180 tggccccctacaagtggacggtgagattagtcccctcggattagtcgattcttggatcggata 33289242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 401 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 3392811 - 3392759
Alignment:
Q  401 aggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcataca 454  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  3392811 aggtctcaggttcgatttcctctggtgttaatttcggtggg-aaaattcataca 3392759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 430 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 22488145 - 22488037
Alignment:
Q  430 aatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctggctttaaatggc-cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttg 526  Q
    |||||||||||  ||| | |||| ||||||||  ||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||  | ||||    
T  22488145 aatttcggtggactaagtccatatagagcttgttctggctttaaacggggcccccgcaaatgggcggtgggattgatcccctcaaattagtcggtccttg 22488046  T
Q  527 gatcggata 535  Q
    |||||||||    
T  22488045 gatcggata 22488037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 478 - 543
Target Start/End: Original strand, 51595153 - 51595218
Alignment:
Q  478 ccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    |||||||||||| |||||| |||| || | |||||||| || |||||||||||||||| |||||||    
T  51595153 ccccgcaagtggacggtggaattgatctcttcggattaatcgattcttggatcggataccgagttt 51595218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 483 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 17637912 - 17637853
Alignment:
Q  483 caagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    |||||||||||||  |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  17637912 caagtgggcggtgatattggtcccctcggattagtcgattctt-gatcggataccgagttt 17637853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 401 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 22630332 - 22630292
Alignment:
Q  401 aggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtggg 441  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  22630332 aggtctcaggttcgattccctctggtgccaattttggtggg 22630292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 483 - 535
Target Start/End: Original strand, 37302623 - 37302675
Alignment:
Q  483 caagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 535  Q
    |||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  37302623 caagtgggcgatgggattggtcccttcggattagtcgattcttgaatcggata 37302675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 484 - 543
Target Start/End: Original strand, 7093508 - 7093567
Alignment:
Q  484 aagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||| |||||||  | ||||||||||||| |||||||    
T  7093508 aagtgggcggtgggattggtcccttcgaattagtcggtccttggatcggatatcgagttt 7093567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 480 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 9646280 - 9646217
Alignment:
Q  480 ccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  |  ||||||||| || |||||||    
T  9646280 ccgcaagtgggcagtgggattgatcccctcggattagtcggtcattggatcgggtaccgagttt 9646217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 401 - 440
Target Start/End: Original strand, 38740901 - 38740940
Alignment:
Q  401 aggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgg 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  38740901 aggtctcaggttcgattccctctggtgtcaatttcggtgg 38740940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 372 - 434
Target Start/End: Original strand, 38869797 - 38869860
Alignment:
Q  372 gcttgggatcttggagtttgctcccccaga-ggtctcaggttcgattccctctggtgctaattt 434  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38869797 gcttgggatctgggagtgtgctcctcctcaaggtctcaggttcgattccctctggtgccaattt 38869860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 465 - 543
Target Start/End: Original strand, 45302953 - 45303032
Alignment:
Q  465 gctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggatt-gttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    |||||||||||  || ||||||||| ||||| |||| | ||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  45302953 gctttaaatggggcctcgcaagtggacggtgagatttggtcatctcggattagtcaattcttgaatcggataccgagttt 45303032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 463 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 4585793 - 4585732
Alignment:
Q  463 tggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattctt 525  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||| ||||||    
T  4585793 tggctttaaacgggcccccgcaagtgggcggt-ggattggtcctttcggattagtcgattctt 4585732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 477 - 531
Target Start/End: Original strand, 13017843 - 13017897
Alignment:
Q  477 cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcg 531  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||  | |||||||||    
T  13017843 cccccgcaagtgggcagtgggattggtccactcggattagtcggtccttggatcg 13017897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 481 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 13716513 - 13716459
Alignment:
Q  481 cgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 535  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || ||||| |||| |||||| ||||||||    
T  13716513 cgcaagtgggcggtgggattggtcctcttggattggtcagttcttgaatcggata 13716459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 360 - 421
Target Start/End: Original strand, 12710189 - 12710250
Alignment:
Q  360 gcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccct 421  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||| |||| | |   |||||||||||||||||||||    
T  12710189 gcctagtggttggtttgggatcttggagtatgcttctcttaaggtctcaggttcgattccct 12710250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 482 - 535
Target Start/End: Original strand, 12824535 - 12824588
Alignment:
Q  482 gcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 535  Q
    |||||||| ||||||||||| || | ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  12824535 gcaagtggacggtgggattggtctcatcgaattagtcgattcttggatcggata 12824588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 348 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 13771682 - 13771589
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtggg 441  Q
    ||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||| |||||||||  |   ||||||||  |||||||||||||| ||  ||| ||||||||    
T  13771682 catttggggttggtctgatggttggcttgggatcttgaagtttgctcatctcaaggtctcaaattcgattccctctgatgtcaatctcggtggg 13771589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 373 - 441
Target Start/End: Original strand, 28635726 - 28635795
Alignment:
Q  373 cttgggatcttggagtttgctcccccag-aggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtggg 441  Q
    |||||||||| ||||| |||||| || | |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  28635726 cttgggatctgggagtgtgctcctcctggaggtcttaggttcgattctctctggtgccaatttgggtggg 28635795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 351 - 391
Target Start/End: Original strand, 10125783 - 10125823
Alignment:
Q  351 ttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttg 391  Q
    |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  10125783 ttggagttggcctagtggttgacttgggatcttggagtttg 10125823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 354 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 37109418 - 37109335
Alignment:
Q  354 gggttggcctagtggt--tagcttgggatcttggagtttgctcccccaga-ggtctcaggttcgattccctctggtgctaattt 434  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||| || ||||| |||||| ||  | ||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  37109418 gggttggcctagtggtattggcttgggacctgggagtgtgctcctcctcaaggtctcaggttcgattctctctggtgccaattt 37109335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 483 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 41621643 - 41621583
Alignment:
Q  483 caagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    |||||||| ||||||| |  ||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  41621643 caagtgggtggtgggactaatcccctcagattagtcggtccttggatcggataacgagttt 41621583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 351 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 43352520 - 43352444
Alignment:
Q  351 ttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtg 427  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||| |   ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  43352520 ttggggttggtctaatggttggcttgagatcatggagtttgctcctctcaagaactcaggttcgattctctctggtg 43352444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 129; Significance: 2e-66; HSPs: 69)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 343 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 44946257 - 44946054
Alignment:
Q  343 aaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggt 442  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||     
T  44946257 aaacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggc 44946158  T
Q  443 taaattcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacga 539  Q
    ||| | |||||||| ||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  44946157 taagtccatacagaacttgctctggctttaaacgggccccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccga 44946058  T
Q  540 gttt 543  Q
    ||||    
T  44946057 gttt 44946054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 348 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 11941409 - 11941211
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||| |    
T  11941409 catttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcaattccctatggtgccaattttggtgggttaagt 11941310  T
Q  448 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
     |||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  11941309 ccatacagagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 11941211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 343 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 33827777 - 33827574
Alignment:
Q  343 aaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggt 442  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     
T  33827777 aaacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagattgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcgttgggc 33827678  T
Q  443 taaattcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacga 539  Q
    ||| | |||||||||||||  |||||||||||  || |||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  33827677 taagtccatacagagcttgctctggctttaaacgggacccctgcaagtgggcggtgggattggtccccttggattagtcgattcttggatcggataccga 33827578  T
Q  540 gttt 543  Q
    ||||    
T  33827577 gttt 33827574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 343 - 543
Target Start/End: Original strand, 17324759 - 17324960
Alignment:
Q  343 aaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggt 442  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  17324759 aaactcatttggggttggcctagtggttggtttggtatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggc 17324858  T
Q  443 taaattcatacagagcttg--ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgag 540  Q
    ||| | |||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||  ||||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  17324859 taagtccatacagagcttgctctggctttaaatgggcccccacaagtgggcggtgggattagtcccctcaaattagtcgattctt-gatcggatatcgag 17324957  T
Q  541 ttt 543  Q
    |||    
T  17324958 ttt 17324960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 343 - 543
Target Start/End: Original strand, 15037952 - 15038155
Alignment:
Q  343 aaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggt 442  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||     
T  15037952 aaacccatttggggttggcctagtggttgactcgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggc 15038051  T
Q  443 taaattcatacagagcttgc--tggctttaaatgg-ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacga 539  Q
    ||| | ||||||||||||||  |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||    
T  15038052 taagtccatacagagcttgctttggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcagattagtcgattcttggatcggataccga 15038151  T
Q  540 gttt 543  Q
    ||||    
T  15038152 gttt 15038155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 347 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 44976354 - 44976172
Alignment:
Q  347 tcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||     
T  44976354 tcatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggggtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaattttggtgggctaag 44976255  T
Q  447 ttcatacagagcttg--ctggctttaaa--tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattctt 525  Q
    | ||||||||| |||  |||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  44976254 tccatacagagtttgctctggctttaaacggggctccccgcaagtgggcggtgggattgatcccttcggattagtcgattctt 44976172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 348 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 30467029 - 30466831
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||| |    
T  30467029 catttggggttggcctagtggttggtttgggatattggagtttgttcctctagaggtctcaggttcgattctctctgctgccaatttcggtgggctaagt 30466930  T
Q  448 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
     |||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  30466929 ccatacagagcttgctctggctttaaaccgggcccccgcaagtgggcagtgggattggtcccttcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 30466831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 348 - 543
Target Start/End: Original strand, 24196002 - 24196198
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |    
T  24196002 catttggggttggcctagtggttggcttgggattttggggttcgctcctccagaggtttcaggttcgattccctctggtgcaaatttcggtgggctaagt 24196101  T
Q  448 tcatacagagcttg--ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
     |||||||| ||||  ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||| ||||| |||||||    
T  24196102 ccatacagaacttgctctggctttaaacgg-gccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattttttgattggataccgagttt 24196198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 348 - 543
Target Start/End: Original strand, 25293164 - 25293355
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    |||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |    
T  25293164 catttgaggttggtctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctcgagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagt 25293263  T
Q  448 tcatacagagcttgctggctttaaa--tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    ||||    ||||  |||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  25293264 tcat----agct--ctggctttaaacggggccccccgcaagtgggcgatgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 25293355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 348 - 543
Target Start/End: Original strand, 19054023 - 19054222
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    |||||||||| ||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||| ||| |    
T  19054023 catttggggtgggcctagtgattggcttgagatcttggagtctgctcctccaaaggtctcaggtttgattccttctggtgttaacttcggtgggctaagt 19054122  T
Q  448 tcatacagagcttgc--tggctttaaatgg--ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
     ||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  19054123 ccatacagagcttgctttggctttaaatggaaccccccgcaagtgggcggtgggattggtccgctcggattagtcgattcttggatcagataccgagttt 19054222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 348 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 4567636 - 4567438
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||    
T  4567636 catttggggttggcctagtagttggcttgggatcttgaagtttgctccttcagaagtctcaggttcgatttcctctggtgccaatttcggtgggctaaat 4567537  T
Q  448 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgt--------tcccctcggattagtcaattcttggatcggata 535  Q
     |||||||||||||  |||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||        ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4567536 ccatacagagcttgttctggctttaaacggggcccccacaagtgggcggtgggattgtgggattggtcctctcggattagtcaattcttggatcggata 4567438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 381 - 543
Target Start/End: Original strand, 35171831 - 35171996
Alignment:
Q  381 cttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggcc 477  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||| ||| | |||||||||||||  |||||||||||  || |    
T  35171831 cttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggcaccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggc 35171930  T
Q  478 ccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  35171931 ccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttgaatcggataccgagttt 35171996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 367 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 43374505 - 43374331
Alignment:
Q  367 ggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctg 464  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || ||||| ||||||  |||    
T  43374505 ggttggcttgggatcttggagtttgctccttcagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtttatacaaagcttgctctg 43374406  T
Q  465 gctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    |||||||     |||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  43374405 gctttaa----gcccccgcaagtgagcggtgggattggtcccttcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 43374331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 363 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 10582174 - 10582018
Alignment:
Q  363 tagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg- 461  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||     
T  10582174 tagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgc 10582075  T
Q  462 -ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtc 518  Q
     || |||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||    
T  10582074 tctagctttaaacgggccctcgcaagtgggc-gtgggattggtcccctcgaattagtc 10582018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 348 - 535
Target Start/End: Original strand, 41313990 - 41314179
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    |||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |    
T  41313990 catttggggttgccgtagtggttggtttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgtcaatttcggtgggctaagt 41314089  T
Q  448 tcatacagagcttg--ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 535  Q
      ||||||||||||  ||| ||||||| ||   ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| || |||||| |||||||||    
T  41314090 ctatacagagcttgctctgactttaaacgggatcccgcaagtggacggtgggattggtcccctcagattaatcgattcttcgatcggata 41314179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 366 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 34516589 - 34516423
Alignment:
Q  366 tggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgctg- 464  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||     |||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||      
T  34516589 tggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtttcaggttcgattc-----ggtggtaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctct 34516495  T
Q  465 -gctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 535  Q
     |||||||| || |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34516494 cgctttaaacgggcccctgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggata 34516423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 349 - 543
Target Start/End: Original strand, 41329842 - 41330038
Alignment:
Q  349 atttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaatt 448  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||| |||||||||||||||||| ||||| || ||| ||| |     
T  41329842 atttggggttggcctagtggttagtttgggatcttagagtttgctcctccaaaggtttcagattcgattccctctggtgccaattttggcgggctaagtc 41329941  T
Q  449 catacagagcttg--ctggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||  |||||||| |||||| |||||||    
T  41329942 cata-agagcttgctctggctttaaatggggcccccacaagtgggcggtgagattggtcccctcagattagtcggttcttggaccggataccgagttt 41330038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 348 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 8192550 - 8192353
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |   |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  || |    
T  8192550 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtgtgctcctctcaaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatgtcggtggg-caagt 8192452  T
Q  448 tcatacagagctt---gctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
     |||| |||||||    |||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||    
T  8192451 ccatatagagctttgctctggcttagaacggcccctcgcaagtgggcggtgggattgggcccctcggattagtcggtccttggatcggataccgagttt 8192353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 367 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 36242492 - 36242321
Alignment:
Q  367 ggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctg 464  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| | ||  |||||||||  |||    
T  36242492 ggttggcttgggatcttgaaatttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgtcaatttcggtgggctaagtccagccagagcttgctctg 36242393  T
Q  465 gctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 535  Q
    ||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  36242392 gctttaaacggggtccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattaatcgattcttggatcggata 36242321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 348 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 36390765 - 36390570
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  ||| |    
T  36390765 catttggggttggcctagtggttggtttgggatct--gagtttgcttctccaaaggtctcaggttcgatttcctctggtgccaatttcggtggactaagt 36390668  T
Q  448 tcatacagagcttg--ctggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
     |||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| || |||| |||||||| |||||||    
T  36390667 ccatacaaagcttgctctgactttaaatgggacccccgcaagtgggcggtgggattggt-ccctcggatcagtcgatacttgaatcggataccgagttt 36390570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 397 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 2140633 - 2140487
Alignment:
Q  397 ccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct--ggctttaaatgg--ccccccgcaagtgggcg 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    | | |||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  2140633 ccagaggtctcaggttcgattccctctggtgtcaatttcggtgg----agtccatacagagcttgctctggctttaaatgggcccccccgcaagtgggcg 2140538  T
Q  493 gtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||    
T  2140537 gtgggattggtcccctcggattagtcgattattggatcggataccgagttt 2140487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 349 - 535
Target Start/End: Original strand, 8258896 - 8259085
Alignment:
Q  349 atttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaatt 448  Q
    ||||||||||| | || ||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||| |     
T  8258896 atttggggttgacataatggttagtttgagatcttggagtttgctcctccagatgtctcaggttcgattccctctgacgccaattttggtgggttaagtc 8258995  T
Q  449 catacagagcttg--ctggctttaa-atggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 535  Q
    |||||||| ||||  ||||||||||   || ||||||||||| ||||||||||||  | || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8258996 catacagatcttgttctggctttaatcggggcccccgcaagtaggcggtgggattagttccttcggattagtcgattcttggatcggata 8259085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 360 - 543
Target Start/End: Original strand, 27290598 - 27290770
Alignment:
Q  360 gcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagct 459  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  27290598 gcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattcccttcggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagct 27290697  T
Q  460 tgct--ggctttaaatgg-ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    ||||  ||||||||| || |||||||||||||              |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  27290698 tgctctggctttaaacgggccccccgcaagtg--------------tcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 27290770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 348 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 27269549 - 27269345
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgct------aatttcggtggg 441  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| | | |||| | ||||| ||||||||||||||        ||||||||||||    
T  27269549 catttggggttggcatagtggttggcttgggatcttcgagtttgctcctctaaaggttttaggtttgattccctctggtgtcggtgtcaatttcggtggg 27269450  T
Q  442 ttaaattcatacagagcttgct--ggctttaaatggccc-cccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacg 538  Q
     ||| | |||| ||| ||||||  |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||    
T  27269449 ctaagtccatatagaacttgctctggctttaaacagccctcccgcaagtgggcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttggataggataccg 27269350  T
Q  539 agttt 543  Q
    |||||    
T  27269349 agttt 27269345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 348 - 441
Target Start/End: Original strand, 32845089 - 32845182
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtggg 441  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32845089 catttggggttggcctagtagttagcttgggatcttggagtttgctcctccaaaagtttcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtggg 32845182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 367 - 535
Target Start/End: Original strand, 5394034 - 5394205
Alignment:
Q  367 ggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctg 464  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||| | ||||||||| |||  |||    
T  5394034 ggttggcttgagatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctggtgtcaatttcgatgggctaagtccatacagagtttgctctg 5394133  T
Q  465 gctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 535  Q
     |||||||| || || |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||  | ||| |||||||||    
T  5394134 actttaaatggggccgccgcaagtgggcggtgggattggtccgttcggattagtcggtccttagatcggata 5394205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 344 - 435
Target Start/End: Original strand, 4852552 - 4852643
Alignment:
Q  344 aactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttc 435  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4852552 aactcatttggggttgacctagtggttgacttggaatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttc 4852643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 367 - 543
Target Start/End: Original strand, 13266507 - 13266685
Alignment:
Q  367 ggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctg 464  Q
    |||| ||||| ||||||||| ||||||||   |||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| ||||||  ||| | |||||||||||||  |||    
T  13266507 ggttggcttgagatcttggaatttgctcctttagaggtctcatgttcgattcactctggtgccaattccggtggactaagtccatacagagcttgctctg 13266606  T
Q  465 gctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||   |||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  13266607 gctttaaacggggccccgcaagtgggtaatgggattggtcccctcaaattagtcgattcttggatcggatatcgagttt 13266685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 367 - 528
Target Start/End: Original strand, 1191530 - 1191694
Alignment:
Q  367 ggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctg 464  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || | |||||||||||| ||| | ||||||||| |||  |||    
T  1191530 ggttggcttgagatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgtttccctctagtaccaatttcggtgggctaagtccatacagagtttgctctg 1191629  T
Q  465 gctttaaatgg-ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttgga 528  Q
    |||||||| ||   ||||| |||||  |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  1191630 gctttaaacggtgtccccgaaagtgaacggtggaattgttcccctcgaattagtcgattcttgga 1191694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 348 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 18976624 - 18976548
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctg 424  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  18976624 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcatgttcgattccctctg 18976548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 423 - 543
Target Start/End: Original strand, 28668946 - 28669069
Alignment:
Q  423 tggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct--ggctttaaatggc-cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtca 519  Q
    |||||| |||||||||||  ||| | |||||||||||||||  ||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  28668946 tggtgccaatttcggtggactaagtccatacagagcttgctttggctttaaacggggcccccacaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcg 28669045  T
Q  520 attcttggatcggataacgagttt 543  Q
    ||| |||||||||||| |||||||    
T  28669046 atttttggatcggataccgagttt 28669069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 367 - 535
Target Start/End: Original strand, 45271401 - 45271572
Alignment:
Q  367 ggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctg 464  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||| | |||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| | |||||||||||||  |||    
T  45271401 ggttggcttgggatcttagagtttgcttctccagaggtttcatgttcgattccctctggtgccaatttcagtgggctaagtccatacagagcttgctctg 45271500  T
Q  465 gctttaaatg-gccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 535  Q
    |||||||| |   |||| ||||||| |||| | ||||| |||||||  ||||||| |||||| ||| |||||    
T  45271501 gctttaaacgaagcccctgcaagtgagcggagagattgatcccctcaaattagtcgattctttgattggata 45271572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 401 - 535
Target Start/End: Original strand, 3943791 - 3943928
Alignment:
Q  401 aggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct--ggctttaaatggccc-cccgcaagtgggcggtggg 497  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||| || ||| | |||||||||||||||  ||||||||| ||  | |||||||||||| ||||||    
T  3943791 aggtctcagattcgattttctctggtgccaatttcggttggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggctcccgcaagtgggtggtggg 3943890  T
Q  498 attgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 535  Q
    |||| |||||| |||||||||  || ||||||||||||    
T  3943891 attggtccccttggattagtcggttattggatcggata 3943928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 348 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 6714480 - 6714387
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtggg 441  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| |   |||||||||||||    
T  6714480 catttgggattggcctaatggttggcttgagatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggtttgattccatctagcattaatttcggtggg 6714387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 359 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 23787196 - 23787056
Alignment:
Q  359 ggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagc 458  Q
    |||||||||||| | |||  || ||||| |||||| |  || |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||     
T  23787196 ggcctagtggttggtttgaaattttggaatttgcttctacaaaggtctcaggtttgattccctctggtgccaatttcggtgggctaaatccatacagagt 23787097  T
Q  459 ttg--ctggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgg 496  Q
    |||  ||| |||||||| || || |||||||||||||||||    
T  23787096 ttgctctgactttaaatgggacctccgcaagtgggcggtgg 23787056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 348 - 543
Target Start/End: Original strand, 14946777 - 14946974
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||| |||||||||| |   |||| | ||||||||||  ||||||||  |||||| ||||| ||| |    
T  14946777 catttggagttggcctagtggttgacttgagatcttgaagtttgctcctctcaaggttttaggttcgattttctctggtgtcaatttcagtgggctaagt 14946876  T
Q  448 tcatacagagct-tg--ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
     ||||| ||||| ||  || |||||||| || ||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||| | |||||||    
T  14946877 ccatacggagctatgctctagctttaaacggaccccc-caagtaggcagtgggattggtcccctcagattagtcagtttttggatcggagaccgagttt 14946974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 354 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 19606038 - 19605951
Alignment:
Q  354 gggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtggg 441  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||||| |   |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  19606038 gggttgccctagtggttggcttgggatcttggagtgcgctcctctcaaggtctcaggttcgattccctctaatgctaatttcggtggg 19605951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 374 - 543
Target Start/End: Original strand, 29361578 - 29361744
Alignment:
Q  374 ttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgc--tggctttaa 471  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| |||||| ||  |||||||||||  ||| | ||    ||||||||  |||||||||    
T  29361578 ttgggatcttggagtttgctcctccaaagatctcaggt-cgatttcctctgatgtcaatttcggtggactaagtcca----gagcttgccgtggctttaa 29361672  T
Q  472 atggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    | ||  |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| |  |||| ||||||||||| |||||||    
T  29361673 acggagccccgcaagtgggcagtgggattgatctcctcggattaattgattcctggatcggatatcgagttt 29361744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 477 - 543
Target Start/End: Original strand, 18692090 - 18692156
Alignment:
Q  477 cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  18692090 cccccacaagtgggcggtgggattggtcccctcgtattagtcgattcttggatcggataccgagttt 18692156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 437 - 543
Target Start/End: Original strand, 31778114 - 31778227
Alignment:
Q  437 gtgggttaaattcatacagagcttgct------ggctttaaatggc-cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggat 529  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||      ||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||    
T  31778114 gtgggttaagttcatacagagcttgcttgctctggctttaaatggggcccccgcaagtggacggtgagattggtcctctcagattagtcagttcttggat 31778213  T
Q  530 cggataacgagttt 543  Q
    |||||| |||||||    
T  31778214 cggataccgagttt 31778227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 478 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 18976521 - 18976464
Alignment:
Q  478 ccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 535  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  18976521 ccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcgaattagtcgattcttggatcggata 18976464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 347 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 918899 - 918782
Alignment:
Q  347 tcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggt---tcgattccctctggtgctaatttcggtgggtt 443  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| |||||||| || | ||||||||| ||   |||||||||||| |||| ||||||| |||| |    
T  918899 tcatttggggttgacctagtggttggcttgggattttgaagtttgct-cctctgaggtctcaagttcgtcgattccctcttgtgccaatttcgttgggct 918801  T
Q  444 aaattcatacagagcttgc 462  Q
    || | ||||||||||||||    
T  918800 aagtccatacagagcttgc 918782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 348 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 40997549 - 40997434
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    |||||| ||| || |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| |||||| || || | |||||||||| | ||| |    
T  40997549 catttgaggtgggtctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcatgttcaattccccctagtaccaatttcggtgagataagt 40997450  T
Q  448 tcatacagagcttgct 463  Q
      ||||||||||||||    
T  40997449 caatacagagcttgct 40997434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 477 - 543
Target Start/End: Original strand, 14486955 - 14487021
Alignment:
Q  477 cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||    
T  14486955 cccctgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcggtccttggatcggataccgagttt 14487021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 348 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 28194333 - 28194239
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttag-cttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtggg 441  Q
    |||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||| |||||| |   |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  28194333 catttggggttggcgtagtgatttggcttgggatcttggagtgtgctcctcttaaggtcttaggttcgattctctctggtgccaatttcggtggg 28194239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 477 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 44929913 - 44929847
Alignment:
Q  477 cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  44929913 cccccgcaagtggacggtgggattggtccccttgaattagtcgattcttggatcggataccgagttt 44929847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 352 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 4618880 - 4618795
Alignment:
Q  352 tggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcgg 437  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |   |||| |||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  4618880 tggggttggcctagtggttggcttggaatcttggagtatgctcctctcaaggtttcaggttcgatttcccctggtgccaatttcgg 4618795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 404 - 535
Target Start/End: Original strand, 19174817 - 19174950
Alignment:
Q  404 tctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagctt---gctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggatt 500  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||  | ||||||||||||    |||||||  || ||  ||||| || ||||||||||||||    
T  19174817 tctcaggttcgattccttctggtgccaatttcggtggg-taggtccatacagagctttgctctggcttagaacggagccccgtaaatgggcggtgggatt 19174915  T
Q  501 gttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 535  Q
    | ||||||||||||| ||  | |||||||||||||    
T  19174916 gatcccctcggattaatcggtccttggatcggata 19174950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 364 - 531
Target Start/End: Original strand, 19849847 - 19850017
Alignment:
Q  364 agtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct 463  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||||||||| ||| |||||| | |||||||||| | | |||  ||||| | |||  ||| |  ||||||||||||||    
T  19849847 agtggttggtttgagatcttggagtttgctcctccaaaggtcttaagttcgattccttttagtgtcaattttgatggactaagtctatacagagcttgct 19849946  T
Q  464 --ggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcg 531  Q
      |||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||  |||| || ||||||||||||    
T  19849947 ctggctttaaacagggcccccgcaagtgggcggtgagattggtcctctcaaattaatcgattcttggatcg 19850017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 480 - 543
Target Start/End: Original strand, 39957891 - 39957954
Alignment:
Q  480 ccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    ||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  39957891 ccgcaagtgggcgatgggattggttccctcggattagtcgattcttggattggataccgagttt 39957954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 450 - 543
Target Start/End: Original strand, 44610139 - 44610235
Alignment:
Q  450 atacagagcttgctg--gctttaaatggcccccc-gcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||| || ||| |||||||    
T  44610139 atacagagcttgctctagctttaaatggggcccctgcaagtgggcggtgggattggtcccatcggattagtcggttcttggaccgaataccgagttt 44610235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 478 - 534
Target Start/End: Original strand, 4852660 - 4852716
Alignment:
Q  478 ccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggat 534  Q
    |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  4852660 ccccgcaagtggacggtggaattggtcccctcggattaatcgattcttggatcggat 4852716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 348 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 5608233 - 5608118
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    ||||| ||||||| ||||  ||| |||||  |||||||| ||||||||  |||||||||||  |||||||| ||||||||  ||||| |||||| ||| |    
T  5608233 catttcgggttggtctagcagttggcttgaaatcttggaatttgctccttcagaggtctcatattcgattctctctggtgtcaattttggtgggctaagt 5608134  T
Q  448 tcatacagagcttgct 463  Q
     |||| ||||||||||    
T  5608133 ccatatagagcttgct 5608118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 343 - 422
Target Start/End: Original strand, 18691975 - 18692054
Alignment:
Q  343 aaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctc 422  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||| |||||  |   || |||||||||||||||||||    
T  18691975 aaactcatttggggttggcctaatggtttgcttggaattttggagtgtgctcatctcaagatctcaggttcgattccctc 18692054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 404 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 19525539 - 19525428
Alignment:
Q  404 tctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgctggctttaaatg-gccccccgcaagtgggcggtgggattgt 502  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  || | ||||||  || |  |||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||     
T  19525539 tctcaggttcgattccctctggtgccaattttggtggg-caagtccatacaatgc-taatggctttaaatgaggcccccgcaagtgggtggtgagattgg 19525442  T
Q  503 tcccctcggattag 516  Q
    |||||| |||||||    
T  19525441 tccccttggattag 19525428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 348 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 32526284 - 32526211
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccct 421  Q
    ||||||| |||||| ||||||||   ||||||||||| |||||||||| |   |||||||||||||||||||||    
T  32526284 catttggagttggcttagtggttgatttgggatcttgaagtttgctcctctcaaggtctcaggttcgattccct 32526211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 479 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 6714360 - 6714296
Alignment:
Q  479 cccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |||||||  ||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  6714360 cccgcaagtggacggtgagattggtcccctcaaattagtcgattcttggattggataccgagttt 6714296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 477 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 714192 - 714126
Alignment:
Q  477 cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||  ||||||| |||||||| |||||| ||| ||||| |||||||    
T  714192 cccccgcaaatgggcggtgggtttcgtcccctcagattagtcgattcttagattggataccgagttt 714126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 356 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 3405343 - 3405265
Alignment:
Q  356 gttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaattt 434  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||||||| | |||||  |   ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  3405343 gttgacctagtggttgacttgggatcttggaatgtgctcatctcaaggtcacaggttcgattccctctggtgccaattt 3405265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 477 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 9401028 - 9400970
Alignment:
Q  477 cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 535  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |  |||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  9401028 cccccgcaagtgggcagtgggattggtttccttagattagtcgattcttggatcggata 9400970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 477 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 28194205 - 28194139
Alignment:
Q  477 cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || | || ||||||||  | ||||||||||||| |||||||    
T  28194205 cccccgcaagtaggcggtgggattggtctcgtcagattagtcggtccttggatcggataccgagttt 28194139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 400 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 33569876 - 33569842
Alignment:
Q  400 gaggtctcaggttcgattccctctggtgctaattt 434  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33569876 gaggtctcaggttcgattctctctggtgctaattt 33569842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 366 - 416
Target Start/End: Original strand, 44610090 - 44610140
Alignment:
Q  366 tggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgat 416  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  44610090 tggttggcttgagatcttggagtttgctcttccaaaggtctcaggttcgat 44610140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 477 - 535
Target Start/End: Original strand, 45132417 - 45132475
Alignment:
Q  477 cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 535  Q
    ||||| ||||||||| || |||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||||||    
T  45132417 cccccacaagtgggcagtaggattggtcctctcggattaatcgattcttggatcggata 45132475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 367 - 460
Target Start/End: Original strand, 29698164 - 29698256
Alignment:
Q  367 ggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagctt 460  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| |   |||||||| |||  ||| |||||||||  ||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  29698164 ggttggcttgggatcttggaatttgctcctctcaaggtctcaagttttatttcctctggtgtcaatttcggtggg-caagttcatacagagctt 29698256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 401 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 12086146 - 12086106
Alignment:
Q  401 aggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtggg 441  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  12086146 aggtctcgggttcgattccctccggtgctaatttaggtggg 12086106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 352 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 13747702 - 13747611
Alignment:
Q  352 tggggttggcctagtggt--tagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtggg 441  Q
    |||||||||| |||||||  | |||||||| |||||||| |||||| ||  |||||||||||| || |||| | |||||  |||||||||||    
T  13747702 tggggttggcttagtggtgttggcttgggaccttggagtatgctcctcccaaggtctcaggtttgaatccccccggtgccgatttcggtggg 13747611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 483 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 19605907 - 19605847
Alignment:
Q  483 caagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||  |  ||||||||||||| |||||||    
T  19605907 caagtgggcggtgagattggtcccctcgaattagttgacacttggatcggatatcgagttt 19605847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 477 - 525
Target Start/End: Original strand, 32845206 - 32845254
Alignment:
Q  477 cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattctt 525  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||    
T  32845206 cccctgcaagtgggcggtgggattggtcccttcgaattagtcgattctt 32845254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0576 (Bit Score: 128; Significance: 7e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0576
Description:

Target: scaffold0576; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 348 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 5281 - 5083
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |    
T  5281 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagt 5182  T
Q  448 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
     |||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  5181 ccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaaatgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 5083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0623 (Bit Score: 121; Significance: 1e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0623
Description:

Target: scaffold0623; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 347 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 1256 - 1058
Alignment:
Q  347 tcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||     
T  1256 tcatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggagccaatttcggtgggctaag 1157  T
Q  447 ttcatacagagcttg--ctggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    | |||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  1156 tccatacagagcttgctctggctttaaatggggcccccgcaagtggacggtgggattggtcccctcgaattagtcgattctt-gatcggataccgagttt 1058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0366 (Bit Score: 121; Significance: 1e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0366
Description:

Target: scaffold0366; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 347 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 9499 - 9301
Alignment:
Q  347 tcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||     
T  9499 tcatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggagccaatttcggtgggctaag 9400  T
Q  447 ttcatacagagcttg--ctggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    | |||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  9399 tccatacagagcttgctctggctttaaatggggcccccgcaagtggacggtgggattggtcccctcgaattagtcgattctt-gatcggataccgagttt 9301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0366; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 347 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 12200 - 12019
Alignment:
Q  347 tcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||     
T  12200 tcatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgatttcctctggagccaatttcggtgggctaag 12101  T
Q  447 ttcatacagagcttg--ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttg 526  Q
    | |||||||||||||  ||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  12100 tccatacagagcttgctctggctttaaatggggccccacaagtggacggtgggattggtcccctcgaattagtcaattcttg 12019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0459 (Bit Score: 120; Significance: 4e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0459
Description:

Target: scaffold0459; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 347 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 10893 - 10696
Alignment:
Q  347 tcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||     
T  10893 tcatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgatttcctctggagccaatttcggtgggctaag 10794  T
Q  447 ttcatacagagcttg--ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    | |||||||||||||  ||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  10793 tccatacagagcttgctctggctttaaatggggccccacaagtggacggtgggattggtcccctcgaattagtcaattctt-gatcggataccgagttt 10696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 120; Significance: 4e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 348 - 543
Target Start/End: Original strand, 40323 - 40520
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |    
T  40323 catttggggttggcctagtggttggcttaggatcttggagtttgctccttcagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagt 40422  T
Q  448 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
     |||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  40423 ccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggt-ccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 40520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 115; Significance: 4e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 349 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 7507 - 7318
Alignment:
Q  349 atttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaatt 448  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| |     
T  7507 atttggggttggcctagtagttggcttgggatcttggagtttgctcctccagagatctcaggttcgattccctccggtgccaatttcggtgggctaagtc 7408  T
Q  449 catacagagctt--gctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 535  Q
    ||||||||||||   |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7407 catacagagctttctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggata 7318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 112; Significance: 3e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 372 - 543
Target Start/End: Original strand, 161831 - 162005
Alignment:
Q  372 gcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctggcttt 469  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||  ||||||||    
T  161831 gcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggcttt 161930  T
Q  470 aaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
     ||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  161931 taatggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcagataccgagttt 162005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 108; Significance: 6e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 348 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 53070 - 52872
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||    
T  53070 catttgggattggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggcttcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggcaaaat 52971  T
Q  448 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
     |||||||||||||  |||||||||||  || |||||||| ||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  52970 ccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaggtgggcggtaggattggtcctctcggattagtcgattcttgaatcggataccgagttt 52872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 348 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 97565 - 97367
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |    
T  97565 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttgtagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagt 97466  T
Q  448 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
     |||||||||||||  ||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||  || ||||| |||||| |||||||    
T  97465 ccatacagagcttgctctgactttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcctctcgtattagtcggtttttggaccggataccgagttt 97367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 348 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 41843 - 41654
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| || | ||| |    
T  41843 catttggggttggcctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctcttgttccaatttcgttgtgctaagt 41744  T
Q  448 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 535  Q
     |||||||||||||  |||||||||||  || |||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  41743 ccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccctgcaagtgggcaatgggattggtcccctcggattagtcgattctt-gatcggata 41654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 83; Significance: 5e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 389 - 543
Target Start/End: Original strand, 39131 - 39288
Alignment:
Q  389 ttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctggctttaaatggc-cccccgcaa 485  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  | |||||||| ||||  ||||||||||| ||  |||||||||    
T  39131 ttgctcctccagaggtctcaagttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctatgtccatacagaacttgttctggctttaaacggggcccccgcaa 39230  T
Q  486 gtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  39231 gtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcagataccgagttt 39288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 76; Significance: 8e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 343 - 543
Target Start/End: Original strand, 66755 - 66950
Alignment:
Q  343 aaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggt 442  Q
    |||| |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||||     
T  66755 aaacccatttgggattggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcacgttcgattccttctggtgccaattttggtgggc 66854  T
Q  443 taaattcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacga 539  Q
    ||| |         |||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||    
T  66855 taagt--------cgcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcggtccttggatcggataccga 66946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0199
Description:

Target: scaffold0199; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 348 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 8606 - 8513
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtggg 441  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  8606 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattatctctggtgccaatttcggtggg 8513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 482 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 8513 - 8452
Alignment:
Q  482 gcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  8513 gcaagtgggcggtgggattggtccgctcggattagtcgattcttagatcggataccgagttt 8452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 404 - 543
Target Start/End: Original strand, 32342 - 32483
Alignment:
Q  404 tctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct--ggctttaaatg-gccccccgcaagtgggcggtgggatt 500  Q
    |||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||| | |||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  32342 tctcaggttcgatttcctctggagccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaatgtggcccccgcaagtgggtggtgggatt 32441  T
Q  501 gttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    | |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  32442 ggtcccctcggattagtcgattctt-gatcggataccgagttt 32483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 66; Significance: 7e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 374 - 543
Target Start/End: Original strand, 20246 - 20417
Alignment:
Q  374 ttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctggctttaa 471  Q
    ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||| ||| | |||||| ||||||  ||||||||||    
T  20246 ttgggatcttggagtttgctccttcaaaggtctcaggtttgattccctctggtgccaatttcaatgggctaagtccatacatagcttgctctggctttaa 20345  T
Q  472 a-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    |  || ||||||||||||||||||   |||| | | |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  20346 acgggacccccgcaagtgggcggtaaaattgat-ctctcggattagtcaattcttggaccggataccgagttt 20417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0460 (Bit Score: 65; Significance: 3e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0460
Description:

Target: scaffold0460; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 348 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 8378 - 8286
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgg 440  Q
    |||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8378 catttggggttggtttagtggttggctcgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaagttcgattccctctggtgccaatttcggtgg 8286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160 (Bit Score: 60; Significance: 3e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0160
Description:

Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 349 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 29340 - 29144
Alignment:
Q  349 atttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaatt 448  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||| || ||| |   |||||| ||||||||||||| ||| ||| | ||||||| ||| || |     
T  29340 atttgggattggcctagtggttggcttggaatcttgaagtgtgttcctctcaaggtcttaggttcgattcccgctgatgccattttcggtcggt-aagtc 29242  T
Q  449 catacagagcttg---ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    ||||||||||||    ||||||| |||||| ||||||||| ||| | ||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||||| |||||||    
T  29241 catacagagctttgctctggcttaaaatggacccccgcaaatggacagtgggattggtcccctcagattagtcagtccttggatcggataccgagttt 29144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0717 (Bit Score: 59; Significance: 1e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0717
Description:

Target: scaffold0717; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 355 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 150 - 1
Alignment:
Q  355 ggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcataca 454  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||| |||| ||| | ||||||    
T  150 ggttggcctagtggttggcttgtgatcttggagtttgctcgtccagaggtctcaggttcgattccctcttatgtcaatttcgatgggctaagtccataca 51  T
Q  455 gagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattg 501  Q
    ||| |||  || ||||||||  || ||||| || ||||||||||||||||    
T  50 gagtttgctctagctttaaacggggcccccacatgtgggcggtgggattg 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 54; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 348 - 543
Target Start/End: Original strand, 27774 - 27966
Alignment:
Q  348 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 447  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||||||| |   ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||  ||||| ||| |    
T  27774 catttggggttggtctagtggttggtttgggattttggagtttgctcctctcaaggtctcgggttcgattccctgtggtgccaatttgagtgggctaagt 27873  T
Q  448 tcatacagagcttgctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
     |||||  ||||     ||||||||| |  | ||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||    
T  27874 ccatacgaagct---atgctttaaatagggcgccgcaagtgggtggtgagatttgtcccctcggattagtcggttcttggatcagataccgagttt 27966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1175 (Bit Score: 47; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold1175
Description:

Target: scaffold1175; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 449 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 2524 - 2427
Alignment:
Q  449 catacagagcttgct--ggctttaaatggc-cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 543  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||| |||||||| |||||||    
T  2524 catacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtccgtccttgaatcggataccgagttt 2427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 349 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 12952 - 12884
Alignment:
Q  349 atttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgatt 417  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  12952 atttgggattggcctagtggttgacttgggatcttggagttcgctcctccagagatctcaggttcgatt 12884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0200 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0200
Description:

Target: scaffold0200; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 343 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 26747 - 26650
Alignment:
Q  343 aaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgg 440  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||   | |||||||||| ||| ||||| ||||  ||| |||||||||||    
T  26747 aaacccatttggggttggcctactggttggcttaggatcttggagtttgcttttcaagaggtctcatgtttgattctctcttatgccaatttcggtgg 26650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0299 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0299
Description:

Target: scaffold0299; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 372 - 434
Target Start/End: Original strand, 11557 - 11620
Alignment:
Q  372 gcttgggatcttggagtttgctccccca-gaggtctcaggttcgattccctctggtgctaattt 434  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  11557 gcttgggatctgggagtgtgctcctcctcgaggtctcaggttcgattctctctggtgttaattt 11620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University