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Alignment Overview

Query: NF1609_low_3 (Length: 400)

Name: NF1609_low_3
Description: NF1609
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1609_low_3
NF1609_low_3
[»] chr1 (30 HSPs)
chr1 (56-260)||(47533766-47533970)
chr1 (50-260)||(51693143-51693353)
chr1 (53-260)||(7110225-7110432)
chr1 (55-255)||(5488502-5488702)
chr1 (60-255)||(50484913-50485108)
chr1 (54-260)||(51468339-51468545)
chr1 (50-260)||(52086623-52086831)
chr1 (54-259)||(5488780-5488985)
chr1 (53-260)||(52759362-52759569)
chr1 (57-260)||(45229515-45229718)
chr1 (54-260)||(17244175-17244381)
chr1 (75-260)||(7111387-7111572)
chr1 (53-252)||(18819261-18819460)
chr1 (52-252)||(40187601-40187800)
chr1 (53-253)||(1823215-1823411)
chr1 (58-248)||(47532961-47533150)
chr1 (53-260)||(51468813-51469020)
chr1 (62-260)||(45228283-45228481)
chr1 (71-260)||(52087686-52087875)
chr1 (55-148)||(25181502-25181595)
chr1 (71-260)||(38235062-38235250)
chr1 (135-260)||(52761508-52761633)
chr1 (53-189)||(17245648-17245783)
chr1 (75-259)||(1821929-1822114)
chr1 (198-260)||(21203155-21203217)
chr1 (51-260)||(50483508-50483716)
chr1 (53-128)||(18820800-18820875)
chr1 (334-399)||(47533627-47533692)
chr1 (53-106)||(52761602-52761655)
chr1 (214-259)||(49619734-49619779)
[»] chr8 (29 HSPs)
chr8 (50-260)||(9244061-9244271)
chr8 (54-260)||(26364741-26364947)
chr8 (52-260)||(20308921-20309129)
chr8 (52-260)||(21095554-21095762)
chr8 (57-260)||(30644617-30644819)
chr8 (57-260)||(30640801-30641003)
chr8 (52-260)||(9245343-9245552)
chr8 (49-260)||(43584403-43584614)
chr8 (55-260)||(522009-522214)
chr8 (53-260)||(41636830-41637037)
chr8 (54-260)||(26366106-26366312)
chr8 (56-260)||(34642667-34642870)
chr8 (54-255)||(41638070-41638270)
chr8 (57-260)||(43585857-43586059)
chr8 (54-260)||(20309963-20310170)
chr8 (54-260)||(21096596-21096803)
chr8 (52-140)||(3714552-3714640)
chr8 (55-259)||(34643878-34644076)
chr8 (54-140)||(3713063-3713147)
chr8 (52-128)||(22013283-22013359)
chr8 (214-260)||(22012297-22012343)
chr8 (214-260)||(22013171-22013217)
chr8 (54-148)||(31202966-31203060)
chr8 (54-140)||(43134081-43134167)
chr8 (211-260)||(43133980-43134029)
chr8 (214-260)||(31203075-31203121)
chr8 (198-258)||(20066217-20066277)
chr8 (218-260)||(3714451-3714493)
chr8 (214-259)||(35462905-35462950)
[»] chr7 (56 HSPs)
chr7 (53-259)||(43113673-43113879)
chr7 (51-260)||(29186661-29186870)
chr7 (50-260)||(19217623-19217833)
chr7 (50-260)||(48792439-48792649)
chr7 (55-260)||(18787149-18787354)
chr7 (41-260)||(18788472-18788691)
chr7 (49-260)||(29187942-29188153)
chr7 (48-259)||(43962482-43962693)
chr7 (53-260)||(48793428-48793635)
chr7 (54-260)||(27072566-27072772)
chr7 (54-260)||(27205541-27205747)
chr7 (50-260)||(44417453-44417663)
chr7 (53-260)||(9392727-9392934)
chr7 (54-257)||(13750551-13750754)
chr7 (54-260)||(37237140-37237343)
chr7 (54-260)||(9391519-9391725)
chr7 (53-260)||(13597143-13597349)
chr7 (53-252)||(44230426-44230625)
chr7 (53-260)||(7011632-7011840)
chr7 (53-260)||(7026990-7027198)
chr7 (57-260)||(45399922-45400125)
chr7 (57-255)||(3537429-3537627)
chr7 (51-260)||(32519661-32519870)
chr7 (50-260)||(43960941-43961139)
chr7 (52-260)||(44420435-44420642)
chr7 (71-258)||(32518438-32518616)
chr7 (47-179)||(37235806-37235938)
chr7 (57-259)||(44746729-44746931)
chr7 (132-260)||(44748475-44748603)
chr7 (55-119)||(7057382-7057446)
chr7 (52-128)||(42611433-42611509)
chr7 (54-161)||(3538574-3538681)
chr7 (54-140)||(45688867-45688953)
chr7 (52-140)||(19016729-19016817)
chr7 (132-257)||(26005429-26005554)
chr7 (53-120)||(26006795-26006862)
chr7 (50-140)||(19008927-19009017)
chr7 (53-119)||(27071019-27071085)
chr7 (53-119)||(27207228-27207294)
chr7 (54-128)||(44231886-44231960)
chr7 (75-260)||(12630584-12630770)
chr7 (135-260)||(43114999-43115124)
chr7 (214-260)||(13599169-13599215)
chr7 (55-104)||(26005412-26005461)
chr7 (215-260)||(44231773-44231818)
chr7 (214-260)||(9357708-9357754)
chr7 (214-260)||(37235944-37235990)
chr7 (198-259)||(19218897-19218958)
chr7 (49-110)||(24653733-24653794)
chr7 (198-254)||(47536771-47536827)
chr7 (53-119)||(42612593-42612660)
chr7 (198-260)||(3538485-3538547)
chr7 (214-260)||(45398683-45398729)
chr7 (53-102)||(13749062-13749111)
chr7 (232-260)||(13749180-13749208)
chr7 (54-106)||(44748569-44748621)
[»] chr3 (71 HSPs)
chr3 (50-260)||(28777599-28777809)
chr3 (51-255)||(54354308-54354512)
chr3 (53-260)||(31937034-31937241)
chr3 (54-255)||(31938224-31938425)
chr3 (55-260)||(37609322-37609527)
chr3 (56-260)||(43393965-43394170)
chr3 (52-260)||(21727908-21728116)
chr3 (72-260)||(47431099-47431287)
chr3 (53-260)||(2232601-2232808)
chr3 (57-260)||(46902334-46902537)
chr3 (55-260)||(35759143-35759348)
chr3 (57-260)||(55209785-55209987)
chr3 (54-256)||(2233221-2233423)
chr3 (52-258)||(17116200-17116405)
chr3 (54-260)||(46903536-46903742)
chr3 (71-260)||(21729100-21729289)
chr3 (50-253)||(17742211-17742415)
chr3 (50-253)||(19043531-19043735)
chr3 (50-260)||(11346808-11347018)
chr3 (52-260)||(52521925-52522132)
chr3 (57-253)||(5691014-5691209)
chr3 (53-260)||(23073286-23073493)
chr3 (52-260)||(5689723-5689925)
chr3 (55-186)||(53765952-53766083)
chr3 (52-252)||(54353021-54353221)
chr3 (53-260)||(11348384-11348590)
chr3 (55-258)||(53180718-53180920)
chr3 (82-260)||(17740865-17741036)
chr3 (82-260)||(19042185-19042356)
chr3 (53-260)||(28776447-28776654)
chr3 (54-260)||(10979087-10979293)
chr3 (57-185)||(15290476-15290604)
chr3 (50-185)||(23091187-23091322)
chr3 (46-186)||(52525345-52525485)
chr3 (55-260)||(47429628-47429828)
chr3 (54-186)||(50881095-50881227)
chr3 (54-186)||(53178701-53178833)
chr3 (76-260)||(47917525-47917708)
chr3 (153-260)||(37610675-37610782)
chr3 (53-187)||(46986076-46986209)
chr3 (57-162)||(23072063-23072167)
chr3 (50-186)||(53764425-53764560)
chr3 (53-186)||(17117387-17117518)
chr3 (58-162)||(43392630-43392734)
chr3 (53-140)||(27750463-27750550)
chr3 (53-120)||(34014507-34014574)
chr3 (53-119)||(24376481-24376547)
chr3 (73-147)||(50879513-50879587)
chr3 (56-184)||(33113306-33113426)
chr3 (202-255)||(50879835-50879888)
chr3 (51-111)||(53101834-53101894)
chr3 (50-113)||(34015827-34015890)
chr3 (132-260)||(35758082-35758210)
chr3 (334-399)||(49949213-49949278)
chr3 (334-399)||(49958544-49958609)
chr3 (214-260)||(43392766-43392812)
chr3 (218-260)||(55210820-55210862)
chr3 (53-106)||(35758063-35758116)
chr3 (215-260)||(50881028-50881073)
chr3 (214-255)||(53764910-53764951)
chr3 (57-101)||(37610797-37610841)
chr3 (71-114)||(21729379-21729422)
chr3 (55-122)||(27749107-27749174)
chr3 (47-110)||(44115424-44115487)
chr3 (217-260)||(53101685-53101728)
chr3 (214-260)||(33111757-33111803)
chr3 (215-260)||(15290402-15290447)
chr3 (215-255)||(10978166-10978206)
chr3 (202-250)||(24376369-24376417)
chr3 (218-258)||(27749251-27749291)
chr3 (54-110)||(44116748-44116804)
[»] chr2 (18 HSPs)
chr2 (51-260)||(27892248-27892457)
chr2 (54-260)||(16602725-16602931)
chr2 (53-260)||(38243867-38244074)
chr2 (52-260)||(27891104-27891312)
chr2 (54-252)||(23832968-23833165)
chr2 (51-140)||(23833902-23833991)
chr2 (54-165)||(43814521-43814632)
chr2 (56-186)||(26388220-26388350)
chr2 (53-162)||(16604199-16604308)
chr2 (53-140)||(5034848-5034935)
chr2 (114-260)||(38242943-38243086)
chr2 (54-140)||(5033478-5033564)
chr2 (55-139)||(19577359-19577443)
chr2 (44-112)||(43814641-43814709)
chr2 (202-260)||(5033607-5033665)
chr2 (202-260)||(5034747-5034805)
chr2 (156-255)||(44800974-44801073)
chr2 (92-140)||(15496083-15496131)
[»] chr4 (40 HSPs)
chr4 (52-260)||(7261455-7261663)
chr4 (50-260)||(38031164-38031374)
chr4 (54-260)||(38032332-38032538)
chr4 (51-260)||(22621864-22622073)
chr4 (54-260)||(10802889-10803095)
chr4 (52-260)||(10804107-10804315)
chr4 (53-260)||(8815269-8815476)
chr4 (53-260)||(17356360-17356567)
chr4 (53-260)||(34095571-34095778)
chr4 (55-260)||(23757882-23758088)
chr4 (53-260)||(18091579-18091786)
chr4 (57-257)||(17357778-17357978)
chr4 (85-260)||(22623055-22623230)
chr4 (57-255)||(48499367-48499565)
chr4 (54-260)||(8814135-8814340)
chr4 (77-260)||(5433319-5433502)
chr4 (54-260)||(56234933-56235138)
chr4 (52-140)||(48463016-48463104)
chr4 (54-186)||(56233724-56233856)
chr4 (56-228)||(35193140-35193312)
chr4 (54-259)||(35191817-35192019)
chr4 (57-162)||(48081600-48081705)
chr4 (58-260)||(48501236-48501437)
chr4 (51-140)||(34122834-34122923)
chr4 (53-128)||(34121298-34121373)
chr4 (51-160)||(48080267-48080376)
chr4 (72-148)||(48081554-48081630)
chr4 (155-260)||(35927028-35927133)
chr4 (215-260)||(36074706-36074751)
chr4 (155-260)||(35925792-35925897)
chr4 (52-128)||(48462140-48462217)
chr4 (214-260)||(48081479-48081525)
chr4 (16-53)||(189742-189779)
chr4 (50-107)||(48081392-48081449)
chr4 (224-260)||(56233878-56233914)
chr4 (54-93)||(22624389-22624428)
chr4 (218-260)||(34122733-34122775)
chr4 (218-260)||(48081292-48081334)
chr4 (49-110)||(5574195-5574256)
chr4 (48-108)||(5470214-5470274)
[»] chr6 (22 HSPs)
chr6 (53-260)||(32348949-32349156)
chr6 (42-260)||(34996673-34996891)
chr6 (52-260)||(11801254-11801462)
chr6 (52-260)||(32347806-32348014)
chr6 (53-260)||(32713795-32714002)
chr6 (54-260)||(3000705-3000911)
chr6 (54-260)||(34995352-34995557)
chr6 (50-260)||(32712351-32712561)
chr6 (53-260)||(18572884-18573090)
chr6 (53-179)||(29479187-29479313)
chr6 (49-162)||(18574303-18574416)
chr6 (198-260)||(27719879-27719941)
chr6 (155-260)||(21094506-21094611)
chr6 (57-260)||(19383067-19383262)
chr6 (54-128)||(29477759-29477833)
chr6 (214-260)||(21095291-21095337)
chr6 (214-260)||(18574225-18574271)
chr6 (214-260)||(29477900-29477946)
chr6 (198-255)||(7628469-7628526)
chr6 (55-122)||(19788248-19788315)
chr6 (215-257)||(13561434-13561476)
chr6 (53-111)||(18497928-18497986)
[»] chr5 (21 HSPs)
chr5 (48-260)||(13278143-13278355)
chr5 (50-260)||(12372310-12372520)
chr5 (51-260)||(19229985-19230194)
chr5 (56-260)||(19228840-19229044)
chr5 (53-255)||(39350562-39350764)
chr5 (53-257)||(18654295-18654500)
chr5 (54-260)||(6803537-6803742)
chr5 (54-252)||(9083216-9083414)
chr5 (52-258)||(18655566-18655772)
chr5 (52-256)||(9081977-9082181)
chr5 (50-186)||(13276815-13276951)
chr5 (54-260)||(39349480-39349686)
chr5 (54-162)||(8447077-8447185)
chr5 (53-185)||(12373708-12373840)
chr5 (50-260)||(39164057-39164260)
chr5 (52-148)||(6801972-6802068)
chr5 (136-257)||(4031903-4032024)
chr5 (50-140)||(35952468-35952558)
chr5 (217-260)||(12373629-12373672)
chr5 (198-260)||(4032937-4032999)
chr5 (54-106)||(4031881-4031933)
[»] scaffold0878 (2 HSPs)
scaffold0878 (52-260)||(2938-3147)
scaffold0878 (132-260)||(1847-1974)
[»] scaffold1425 (2 HSPs)
scaffold1425 (53-260)||(1513-1720)
scaffold1425 (52-255)||(132-335)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (54-255)||(31033-31234)
scaffold0141 (54-255)||(35202-35403)
[»] scaffold0049 (2 HSPs)
scaffold0049 (54-255)||(79409-79610)
scaffold0049 (54-255)||(83578-83779)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (54-260)||(25256-25463)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (49-160)||(104296-104407)
scaffold0026 (214-260)||(104411-104457)
[»] scaffold0349 (1 HSPs)
scaffold0349 (198-260)||(9301-9363)
[»] scaffold0081 (1 HSPs)
scaffold0081 (215-259)||(42923-42967)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (50-118)||(21132-21200)
scaffold0035 (54-118)||(22523-22587)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 156; Significance: 9e-83; HSPs: 30)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 56 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 47533970 - 47533766
Alignment:
Q  56 cttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattcatt 155  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47533970 cttaattgatctgctggtctcttaaattatttcttttatttaatttagtcccataagttttaactttttcaaatacgtctcttaaattatttcattcatt 47533871  T
Q  156 caatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaattt 255  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||        |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47533870 caatttgattcaattttgataattataatcctccaaaaaaatagaccgttaaattagagagatctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaattt 47533771  T
Q  256 attta 260  Q
    |||||    
T  47533770 attta 47533766  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 50 - 260
Target Start/End: Original strand, 51693143 - 51693353
Alignment:
Q  50 tttaggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttca 149  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||| |||||||     
T  51693143 tttaggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttctcaaacacgtcctttaacttatttct 51693242  T
Q  150 ttcattcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacc 249  Q
    || |||||||||| | |||||||||||||| |||| | ||        |||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  51693243 tttattcaatttggttcaattttgataattttaataccctaaaaaaagagaccgttggattacggaggtctatcggattttatagtgtatcaccaacacc 51693342  T
Q  250 taatttattta 260  Q
    |||||||||||    
T  51693343 taatttattta 51693353  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 53 - 260
Target Start/End: Original strand, 7110225 - 7110432
Alignment:
Q  53 aggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattc 152  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | ||||| ||     
T  7110225 aggcttaattgatctgccggtcccttaatttatttcttttatttaatttggtcctataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaactgatttctttt 7110324  T
Q  153 attcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaa 252  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||        ||| |||| ||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  7110325 attcaatttggtccaattttgataattttaatcccctaaaaaaagagatcgttggattgcggaggtctatcagattttatagtgtatcatcaacgcctaa 7110424  T
Q  253 tttattta 260  Q
    ||||||||    
T  7110425 tttattta 7110432  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 55 - 255
Target Start/End: Original strand, 5488502 - 5488702
Alignment:
Q  55 gcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattcat 154  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||||  |||||||| ||||| |||||| |||| ||||||| || ||    
T  5488502 gcttaattgatctgttggtcccttaatttatttcttttattcaatttgattccataagacttaactttctcaaacacgtcctttaacttatttcttttat 5488601  T
Q  155 tcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaatt 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |        |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5488602 tcaatttgatccaattttgataattttaatcccttagaaaaagagaccgttggattacggaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacgtaatt 5488701  T
Q  255 t 255  Q
    |    
T  5488702 t 5488702  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 60 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 50485108 - 50484913
Alignment:
Q  60 attgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattcattcaat 159  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  50485108 attgatctgccggtcccttaacttatttcatttattcaatttggtctcataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttattcaat 50485009  T
Q  160 ttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaattt 255  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||| ||        ||||| || ||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  50485008 ttggtccaattttgataattttaatcccctaaaaaaagagaccattggattacataggtctatcagattttacagtgtatcaccaacacctaattt 50484913  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 54 - 260
Target Start/End: Original strand, 51468339 - 51468545
Alignment:
Q  54 ggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattca 153  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| || |    
T  51468339 ggcttaattgatctgccggtcccttaacttattttttttattcaatttggtctcataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttta 51468438  T
Q  154 ttcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaat 253  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||        |||  | | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  51468439 ttcaatttggtccaattttaataattttaatcccctaaaaaaaaagattgatggattacggaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacccaat 51468538  T
Q  254 ttattta 260  Q
    |||||||    
T  51468539 ttattta 51468545  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 50 - 260
Target Start/End: Original strand, 52086623 - 52086831
Alignment:
Q  50 tttaggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttca 149  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||     
T  52086623 tttaggcttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttct 52086722  T
Q  150 ttcattcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacc 249  Q
    || |||||||||  ||||||||| |||||| |||||| ||        | |||||| |||||   |||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    
T  52086723 tttattcaatttagtccaattttaataattttaatcccctaaaaaa--aaaccgttggattacgaaggtctataaaattttatagtgtatcaccatcacc 52086820  T
Q  250 taatttattta 260  Q
    |||||| ||||    
T  52086821 taattttttta 52086831  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 54 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 5488985 - 5488780
Alignment:
Q  54 ggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattca 153  Q
    ||||||||||||| || | |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| ||||||| || |    
T  5488985 ggcttaattgatccgccgatcccttaacttatttcttttattcaatttagtcccataagtcttaactttctcaaacacgttcattaacttatttctttta 5488886  T
Q  154 ttcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaat 253  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |        |||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5488885 ttcaatttggtccaattttgataattttaatcccttagaaaaagagaccgttggattacggaggtctatcaaattttatagtgtatcaccaacacctaat 5488786  T
Q  254 ttattt 259  Q
    ||||||    
T  5488785 ttattt 5488780  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 53 - 260
Target Start/End: Original strand, 52759362 - 52759569
Alignment:
Q  53 aggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattc 152  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||| |||||| |||| |||| |  ||     
T  52759362 aggcttaattgatctgccgatcccttaacttatttcttttatttaatttggtttcataagtcttaactttctcaaaaacgtccattaacttatctatttt 52759461  T
Q  153 attcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnnt-agaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacaccta 251  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||       | ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52759462 attcaatttagtccaattttgataattttaat-ctcttaaaaaatgagaccgttgaattacagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacaccta 52759560  T
Q  252 atttattta 260  Q
    |||||||||    
T  52759561 atttattta 52759569  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 57 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 45229718 - 45229515
Alignment:
Q  57 ttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattcattc 156  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||| || ||||    
T  45229718 ttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttggtctcataaatcttaattttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttattc 45229619  T
Q  157 aatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaattta 256  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |        |||  ||| |||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  45229618 aatttgatccaattttgataattttaatcctataaaaaaaaagattgttggattacggaggtctatcagattttataatggatcaccaacacctaattta 45229519  T
Q  257 ttta 260  Q
    ||||    
T  45229518 ttta 45229515  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 54 - 260
Target Start/End: Original strand, 17244175 - 17244381
Alignment:
Q  54 ggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattca 153  Q
    ||||||||| | |||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||| ||||||| || |    
T  17244175 ggcttaattaacctgccggttccttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtctcaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttga 17244274  T
Q  154 ttcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaat 253  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||        |||||||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  17244275 ttcaatttggtccaattttgataattttaatctcctaaaaaaagagaccgttggattacggaggtctatcagattttataatgtatcaccgatacctaat 17244374  T
Q  254 ttattta 260  Q
    |||||||    
T  17244375 ttattta 17244381  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 75 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 7111572 - 7111387
Alignment:
Q  75 ccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattcattcaatttgatccaattttga 174  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||| |||||| |||| | ||||| || |||||||||| |||||||||||    
T  7111572 ccttaatttatttcttttattcaatttggtcctataagtcttaactttctcaaacacgtccattaactgatttcttttattcaatttggtccaattttga 7111473  T
Q  175 taattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaatttattta 260  Q
    ||||| |||||| ||        |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7111472 taattttaatcccctaaaaaaagagaccgttggattacggaggtctatcagattttatagtgtatcatcaacacctaatttattta 7111387  T

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Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 53 - 252
Target Start/End: Original strand, 18819261 - 18819460
Alignment:
Q  53 aggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattc 152  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||| ||||||| ||     
T  18819261 aggcttaattgatctgccggttccttaaattattttttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaatcacgtcccttaatttatttctttt 18819360  T
Q  153 attcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaa 252  Q
    ||||||||||  |||||||| |||||| |||||| ||        | |||||| |||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18819361 attcaatttggcccaattttaataattttaatcccctatgaaaagaaaccgttggattacggaggtatatcagattttatagtgtatcaccaacacctaa 18819460  T

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Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 52 - 252
Target Start/End: Original strand, 40187601 - 40187800
Alignment:
Q  52 taggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcatt 151  Q
    |||||||||||||||||  ||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | || |||||| ||||||| ||    
T  40187601 taggcttaattgatctgacggtcctttcacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttatttcttt 40187699  T
Q  152 cattcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacaccta 251  Q
     | |||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||        |||||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40187700 tactcaatttggtccaatttttataattttaatcccctaaaaaaagagaccgttggattacggaggtctatcagattttatcgtgtatcaccaacaccta 40187799  T

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Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 53 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 1823411 - 1823215
Alignment:
Q  53 aggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattc 152  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||   | ||||| | ||| ||||| ||||||  ||     
T  1823411 aggcttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttagtcacataagtcttaa---tctcaaacatgtcgcttaacttattt-tttt 1823316  T
Q  153 attcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaa 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||       || |||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1823315 attcaatttgatccaattttgataattttaatcttctaaaaagataaaccgttggattacgaaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaa 1823216  T

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Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 58 - 248
Target Start/End: Original strand, 47532961 - 47533150
Alignment:
Q  58 taattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattcattca 157  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||| | |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  47532961 taattgatctgccggtcccttaagttattttttttattcaatttggtctcataaatcttaactttatcaaacacgttccttaaattatttcatttattca 47533060  T
Q  158 atttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacac 248  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| |||        |||| |||  ||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  47533061 atttgattcaattttgataattttaatcttctaaaaaac-agactgttgaattatggaagtctatcagattttataatgtatcaccaacac 47533150  T

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Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 53 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 51469020 - 51468813
Alignment:
Q  53 aggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattc 152  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| || ||||||| |      
T  51469020 aggcttaattgatctgtcagtcccttaacttattttttttattcaatttggtcccataaatcttaactttttcaaacacgtccctaaacttatttcttct 51468921  T
Q  153 attcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaa 252  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||        | | | || |||||  ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  51468920 attcaatttggtccaattttaataattttaatcccctaaaaaaaaaaagcattggattacggagatctattagattttacagtgtatcaccaacacctaa 51468821  T
Q  253 tttattta 260  Q
    ||||||||    
T  51468820 tttattta 51468813  T

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Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 62 - 260
Target Start/End: Original strand, 45228283 - 45228481
Alignment:
Q  62 tgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattcattcaattt 161  Q
    |||||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||| |||| | |||| ||||||| || |||||||||    
T  45228283 tgatctgccggttctttaacttatttcttttatttaattttgtcccataaattttaaccttatcaaacacgttctttaacttatttcttttattcaattt 45228382  T
Q  162 gatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaatttattta 260  Q
    | ||||||||| |||||| |||||| ||        |||||||| |||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  45228383 ggtccaattttaataattttaatcccctaaaaaaagagaccgttggattacggagatctatcaaattttatagtgtatcacaaacgcttaatttattta 45228481  T

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Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 71 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 52087875 - 52087686
Alignment:
Q  71 ggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattcattcaatttgatccaatt 170  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| || |||||||| ||||| |||||| || | ||||||| || |||||||||||| |||||    
T  52087875 ggtctcttaacttatttcttttattcaatttggtctcatatgtcttaactttctcaaacacgtcctttcacttatttcttttattcaatttgattcaatt 52087776  T
Q  171 ttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaatttattta 260  Q
    ||||||||| || ||| ||        ||||||||  ||||  ||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  52087775 ttgataattttagtcccctaaaaaaagagaccgttgaattacggaggtctatcaaattttacggtgtatcaccaacatctaatttattta 52087686  T

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Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 55 - 148
Target Start/End: Original strand, 25181502 - 25181595
Alignment:
Q  55 gcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttc 148  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  25181502 gcttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcctataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttc 25181595  T

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Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 71 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 38235250 - 38235062
Alignment:
Q  71 ggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattcattcaatttgatccaatt 170  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| || ||| |||||| |||||||    
T  38235250 ggtcccttaatttatttcttttattcaatttggtcatataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttattaaatttggtccaatt 38235151  T
Q  171 ttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaatttattta 260  Q
    || |||| | |||||| |         | |||||| |||||   | |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38235150 ttaataagtttaatcc-caaaaaaaacaaaccgttggattacgaatgtctataagattttacagtgtatcaccaacacctaatttattta 38235062  T

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Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 135 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 52761633 - 52761508
Alignment:
Q  135 ccttaaattatttcattcattcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatag 234  Q
    |||||| ||||||| || |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||        |||||||| ||||   |||||||||||||||||||||    
T  52761633 ccttaacttatttcttttattcaatttggtccaattttgataattttaatcccctgaaaaaagagaccgttggattgcggaggtctatcagattttatag 52761534  T
Q  235 tgtatcaccaacacctaatttattta 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  52761533 tgtatcaccaacacctaatttattta 52761508  T

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Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 53 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 17245783 - 17245648
Alignment:
Q  53 aggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattc 152  Q
    |||||||||||||| || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| | ||||| | ||||||||| ||||||  ||     
T  17245783 aggcttaattgatccgccggttccttaatttatttcttttattcaatttggtctcataagtcttaactctctcaaacaagtcccttaacttattt-tttt 17245685  T
Q  153 attcaatttgatccaattttgataattataatcctct 189  Q
    ||| |||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  17245684 attaaatttggtccaattttgatcattttaatcctct 17245648  T

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Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 75 - 259
Target Start/End: Original strand, 1821929 - 1822114
Alignment:
Q  75 ccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattc-attcaatttgatccaattttg 173  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||||| |||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||  ||  ||| |||||  || |||||||    
T  1821929 ccttaatttattttttttattcaattttgtcctataaattttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttttttttatttaatttagtctaattttg 1822028  T
Q  174 ataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaatttattt 259  Q
    |||||| ||||||| |        |||||||| | |||   ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  1822029 ataattttaatcctttaaaaaaagagaccgttgggttacgaaggtctatctgattttatagtgtatcattaacacctaatttattt 1822114  T

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Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 198 - 260
Target Start/End: Original strand, 21203155 - 21203217
Alignment:
Q  198 agaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaatttattta 260  Q
    |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21203155 agaccgttggattacaaaggtctatcagattttatagtgtatcatcaacacctaatttattta 21203217  T

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Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 51 - 260
Target Start/End: Original strand, 50483508 - 50483716
Alignment:
Q  51 ttaggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcat 150  Q
    ||||||||||||||||||  ||| | |||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||| |||| ||| | ||| |||||  |||| ||||||| |    
T  50483508 ttaggcttaattgatctgtcggt-ctttaacttatttcttgtattcaatttggtctcataagtcttaattttcttaaaaacgtcatttaatttatttctt 50483606  T
Q  151 tcattcaatttgatccaattttgataattataatcctct-nnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacc 249  Q
    | |||||||||| ||||||||| |||||| || ||| ||         |||| ||| |||||  || ||||| |||||||||| |||||| |||||||||    
T  50483607 ttattcaatttggtccaatttttataattttactcccctaaaaaaaagagactgttggattacggaagtcta-cagattttatcgtgtataaccaacacc 50483705  T
Q  250 taatttattta 260  Q
    |||||||||||    
T  50483706 taatttattta 50483716  T

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Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 53 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 18820875 - 18820800
Alignment:
Q  53 aggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaa 128  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||| ||||    
T  18820875 aggcttaattgatctaccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtctcataaatcttaacttttgcaaa 18820800  T

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Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 334 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 47533692 - 47533627
Alignment:
Q  334 aagtatcaagtgctgcaaaaacgacggtgttggaaattaccaacgaacactcatcccctttgcttc 399  Q
    |||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||    
T  47533692 aagtatcaagcgctgcaaaaacgttggtgttggaaattaccaacgaatactcatcccttatgcttc 47533627  T

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Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 53 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 52761655 - 52761602
Alignment:
Q  53 aggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcc 106  Q
    ||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  52761655 aggcttaattgatatgccggttccttaacttatttcttttattcaatttggtcc 52761602  T

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Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 49619779 - 49619734
Alignment:
Q  214 gaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaatttattt 259  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  49619779 gaggtctatcagatttaactgtgtatcaccaacacctgatttattt 49619734  T

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Target: chr8 (Bit Score: 118; Significance: 4e-60; HSPs: 29)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 50 - 260
Target Start/End: Original strand, 9244061 - 9244271
Alignment:
Q  50 tttaggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttca 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||      
T  9244061 tttaggcttaattgatctgctggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttat 9244160  T
Q  150 ttcattcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacc 249  Q
    || |||||||||| | |||||||||||||| ||||||  |        |||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9244161 tttattcaatttggttcaattttgataattttaatcccttaaaaaatgagaccgtaggattacggaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacc 9244260  T
Q  250 taatttattta 260  Q
    |||||||||||    
T  9244261 taatttattta 9244271  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 54 - 260
Target Start/End: Original strand, 26364741 - 26364947
Alignment:
Q  54 ggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattca 153  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||| || ||| |||| ||||||| || |    
T  26364741 ggcttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtctcataagtcttaactttctcaaacacatcctttaacttatttctttta 26364840  T
Q  154 ttcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaat 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26364841 ttcaatttgatccaattttgataattttaatcctctaaaaaaagagaccgttggattacagaggtctatcagattttataatgtatcaccaacacctaat 26364940  T
Q  254 ttattta 260  Q
    |||||||    
T  26364941 ttattta 26364947  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 52 - 260
Target Start/End: Original strand, 20308921 - 20309129
Alignment:
Q  52 taggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcatt 151  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||   ||    
T  20308921 taggcttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaattgagtcccataagttttaactttctcaaacacgtcccttaatttattgtttt 20309020  T
Q  152 cattcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacaccta 251  Q
     |||||||||| |||||||||||||||| | |||| ||        |||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20309021 tattcaatttggtccaattttgataattttgatcccctagaaaaagagaccgttggatcactgaggtctatcagattttatagtgtatcaccaataccta 20309120  T
Q  252 atttattta 260  Q
    |||||||||    
T  20309121 atttattta 20309129  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 52 - 260
Target Start/End: Original strand, 21095554 - 21095762
Alignment:
Q  52 taggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcatt 151  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||   ||    
T  21095554 taggcttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaattgagtcccataagttttaactttctcaaacacgtcccttaatttattgtttt 21095653  T
Q  152 cattcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacaccta 251  Q
     |||||||||| |||||||||||||||| | |||| ||        |||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21095654 tattcaatttggtccaattttgataattttgatcccctagaaaaagagaccgttggatcactgaggtctatcagattttatagtgtatcaccaataccta 21095753  T
Q  252 atttattta 260  Q
    |||||||||    
T  21095754 atttattta 21095762  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 57 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 30644819 - 30644617
Alignment:
Q  57 ttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattcattc 156  Q
    ||||||||||||  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||| || ||||    
T  30644819 ttaattgatctgtcggttccttaatttatttcttttatttaatttggtcccataaatcttaactttctcaaacacgtctcttaacttatttcttttattc 30644720  T
Q  157 aatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaattta 256  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||| |||||  ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  30644719 aatttgatccaattttgataattttaatcctctaaaaaag-agaccgttggattacggaggtctatcaaattttataatggatcaccaacacctaattta 30644621  T
Q  257 ttta 260  Q
    ||||    
T  30644620 ttta 30644617  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 57 - 260
Target Start/End: Original strand, 30640801 - 30641003
Alignment:
Q  57 ttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattcattc 156  Q
    ||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| | |||| ||||||| || ||||    
T  30640801 ttaattgatatgccggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagttttaaccttatcaaacacgt-cattaacttatttcttttattc 30640899  T
Q  157 aatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaattta 256  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| ||        |||||||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30640900 aatttgatccaattttaataattttaatcccctaaaaaaagagaccgttggattacggaggtctatcaaattttatagtgtatcaccaacacctaattta 30640999  T
Q  257 ttta 260  Q
    ||||    
T  30641000 ttta 30641003  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 52 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 9245552 - 9245343
Alignment:
Q  52 taggcttaattgatctgctggtcccttaaa-ttatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcat 150  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||  |    
T  9245552 taggcttaaatgatctgccggtccttttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaatttatttatt 9245453  T
Q  151 tcattcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacct 250  Q
    | |||||||||  ||||||||| |||||| |||||| ||        |||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9245452 ttattcaatttagtccaatttttataattttaatcccctaaaaaaagagaccgttggattgctgaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacct 9245353  T
Q  251 aatttattta 260  Q
    ||||||||||    
T  9245352 aatttattta 9245343  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 49 - 260
Target Start/End: Original strand, 43584403 - 43584614
Alignment:
Q  49 atttaggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttc 148  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||||||||| |||||| || ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  43584403 atttaggcttaattgatctgtcggtccattaacttatttcttttattcaatttgatctcataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttc 43584502  T
Q  149 attcattcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacac 248  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |        |||||||| ||||| | | ||||||||||||||||| |||||||||||       
T  43584503 ttttattcaatttgatccaattttgataattttaatcttttaaaaaaagagaccgttggattacaaaagtctatcagattttataatgtatcaccaatgt 43584602  T
Q  249 ctaatttattta 260  Q
    ||||||||||||    
T  43584603 ctaatttattta 43584614  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 55 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 522214 - 522009
Alignment:
Q  55 gcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattcat 154  Q
    |||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| | ||||||||| ||||||  || ||    
T  522214 gcttaattaatctgtcggtcccttaacttatttcttttattcaatttggttccataagtcttaactttctcaaacatgtcccttaacttatttattttat 522115  T
Q  155 tcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaatt 254  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||        |||| ||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  522114 tcaatttgatctaattttgataattttaatcccctagaaaaagagactgttggattacggaggtctatcaaattttatagtgtatcaccaacccctaatt 522015  T
Q  255 tattta 260  Q
    ||||||    
T  522014 tattta 522009  T

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Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 53 - 260
Target Start/End: Original strand, 41636830 - 41637037
Alignment:
Q  53 aggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattc 152  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| || | |||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||| ||||||| ||     
T  41636830 aggcttaattgatttgccggtccttttacttatttctttcattcaatttggtcccataagtcttaactttctaaaacacgtcccttaatttatttctttt 41636929  T
Q  153 attcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaa 252  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||||| |||||| ||        |||||||| |||||  || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41636930 attcaatttggtccaacttttataattttaatcccctaaaaaaagagaccgttggattacggaagtctatcagattttatcgtgtatcaccaacacctaa 41637029  T
Q  253 tttattta 260  Q
    ||||||||    
T  41637030 tttattta 41637037  T

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Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 54 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 26366312 - 26366106
Alignment:
Q  54 ggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattca 153  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| || ||||| | || || ||| ||||||| || |    
T  26366312 ggcttaattgatctgccgatcctttaacttatttcttttatttaatttggtttcataagtcttaaccttatcaaacatgttccataacttatttctttta 26366213  T
Q  154 ttcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaat 253  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||| |||||| ||        ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26366212 ttcaatttggtccatttttaataattttaatcccctaaaaaaaaagaccgttagattacggaggtctattagattttatagtgtatcaccaacacataat 26366113  T
Q  254 ttattta 260  Q
    |||||||    
T  26366112 ttattta 26366106  T

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Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 56 - 260
Target Start/End: Original strand, 34642667 - 34642870
Alignment:
Q  56 cttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattcatt 155  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| || |||    
T  34642667 cttaattgatctgccggtctcttaacttatttcttttattcaatttggtcatataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 34642766  T
Q  156 caatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaattt 255  Q
    ||||||| |  ||||||||||||| |||||| ||        | |||||| ||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  34642767 caatttggtttaattttgataattttaatcccctaaaaaaa-aaaccgttggattgcggaggtctatcagattttatagtatatcaccaacatctaattt 34642865  T
Q  256 attta 260  Q
    |||||    
T  34642866 attta 34642870  T

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Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 54 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 41638270 - 41638070
Alignment:
Q  54 ggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattca 153  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||  || ||||||| |||||||| ||||| | |||| |||| ||||||| || |    
T  41638270 ggcttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttattctcataagtcttaactttctcaaacatgtcctttaacttatttctttta 41638171  T
Q  154 ttcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaat 253  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||        ||||  || ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  41638170 ttcaatttggtccaattttaataattttaatcccctaaaaaag-agacaattggattacagaggtctatcatgttttatagtgtatcaccaacacctaat 41638072  T
Q  254 tt 255  Q
    ||    
T  41638071 tt 41638070  T

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Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 57 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 43586059 - 43585857
Alignment:
Q  57 ttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattcattc 156  Q
    ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| ||| ||||| | |||  ||||||||||||||| ||||    
T  43586059 ttaattgatctgtcggtcccttaacttatttcttttatttaatttgatctcataagtcttaattttctcaaacatgtctattaaattatttcatttattc 43585960  T
Q  157 aatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaattta 256  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||| |        ||||| || |||||   ||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  43585959 aatttgatccaattttaataattttaatcct-ttaaaaaaaagaccattggattatgaaggtctaccatattttatagtgtatcatcaatacctaattta 43585861  T
Q  257 ttta 260  Q
    ||||    
T  43585860 ttta 43585857  T

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Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 54 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 20310170 - 20309963
Alignment:
Q  54 ggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattca 153  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||| || |    
T  20310170 ggcttaattaatctgctcgtcccttaacttatttcttttattcattttggtctcataagtcttaagtttctcaaacacgtcccttaacttatttctttta 20310071  T
Q  154 ttcaatttgatccaattttgataattataat-cctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaa 252  Q
    ||| ||||| | |||||||||||||| |||| |||          |||||||| |||||   |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20310070 ttcgatttggttcaattttgataattttaatcccttagaaaaaaaagaccgttggattatgaaggtctgtcagattttatagtgtatcacctacacctaa 20309971  T
Q  253 tttattta 260  Q
     |||||||    
T  20309970 cttattta 20309963  T

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Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 54 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 21096803 - 21096596
Alignment:
Q  54 ggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattca 153  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||| || |    
T  21096803 ggcttaattaatctgctcgtcccttaacttatttcttttattcattttggtctcataagtcttaagtttctcaaacacgtcccttaacttatttctttta 21096704  T
Q  154 ttcaatttgatccaattttgataattataat-cctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaa 252  Q
    ||| ||||| | |||||||||||||| |||| |||          |||||||| |||||   |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21096703 ttcgatttggttcaattttgataattttaatcccttagaaaaaaaagaccgttggattatgaaggtctgtcagattttatagtgtatcacctacacctaa 21096604  T
Q  253 tttattta 260  Q
     |||||||    
T  21096603 cttattta 21096596  T

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Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 52 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 3714640 - 3714552
Alignment:
Q  52 taggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaa 140  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  3714640 taggcttaattgatctgccggttccttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagttttaactttctcaaacacatcccttaa 3714552  T

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Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 55 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 34644076 - 34643878
Alignment:
Q  55 gcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattcat 154  Q
    |||||||||||| |  |||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||| | |||||||| ||||| || ||  |||| ||||||| || ||    
T  34644076 gcttaattgatccgtcggtcccttgacttatttcttttattcaatttg-tcccataaatcttaactttctcaaacacctctattaatttatttcttttat 34643978  T
Q  155 tcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaatt 254  Q
    | |||||  | |||||||||||||| |||||| ||        |||||||| ||||   ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  34643977 ttaatttagttcaattttgataattttaatcccctaaaaaa--agaccgttggatt---gaggtctatcagattttatggcgtatcaccaacacctaatt 34643883  T

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Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 140
Target Start/End: Original strand, 3713063 - 3713147
Alignment:
Q  54 ggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaa 140  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  3713063 ggcttaattgatctgtcggtctcttaa-ttatttcttttatttaatttggt-tcataagttttaactttctcaaacacatcccttaa 3713147  T

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Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 52 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 22013359 - 22013283
Alignment:
Q  52 taggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaa 128  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  || | ||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  22013359 taggcttaattgaactgctggtcccttaacttatttctttatttcagtttggtcccataactcttaacttttgcaaa 22013283  T

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Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 214 - 260
Target Start/End: Original strand, 22012297 - 22012343
Alignment:
Q  214 gaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaatttattta 260  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22012297 gaggtctaccagattttatagtgtatcaccaacacctgatttattta 22012343  T

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Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 214 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 22013217 - 22013171
Alignment:
Q  214 gaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaatttattta 260  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22013217 gaggtctaccagattttatagtgtatcaccaacacctgatttattta 22013171  T

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Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 148
Target Start/End: Original strand, 31202966 - 31203060
Alignment:
Q  54 ggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttc 148  Q
    ||||||||| |||||  | | |||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| | |||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  31202966 ggcttaattaatctgtcgtttccttaacttatttcttttattcattttggtcccataaatcttaagtttctcaaacacgtcccttaacttatttc 31203060  T

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Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 43134167 - 43134081
Alignment:
Q  54 ggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaa 140  Q
    |||||||||||| ||  ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| | ||| || ||||||||    
T  43134167 ggcttaattgatatgtcggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcctataacttttaactttcttaaacacatcccttaa 43134081  T

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Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 211 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 43134029 - 43133980
Alignment:
Q  211 agagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaatttattta 260  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  43134029 agagaggtctaccagattttatagtgtatcaccaacacttgatttattta 43133980  T

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Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 260
Target Start/End: Original strand, 31203075 - 31203121
Alignment:
Q  214 gaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaatttattta 260  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  31203075 gaggtctatcaaattttataatgtatcaccaacacctaacttattta 31203121  T

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Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 198 - 258
Target Start/End: Original strand, 20066217 - 20066277
Alignment:
Q  198 agaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaatttatt 258  Q
    |||||||| ||| | |||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  20066217 agaccgttggataaaagagatccatcagatttaacagtgtatcaccaacacctaatttatt 20066277  T

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Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 218 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 3714493 - 3714451
Alignment:
Q  218 tctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaatttattta 260  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  3714493 tctatcagatcttatagtgtatcaccaacacttgatttattta 3714451  T

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Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 35462950 - 35462905
Alignment:
Q  214 gaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaatttattt 259  Q
    |||||||||| ||| | | |||||||||||||||||||||||||||    
T  35462950 gaggtctatctgatctaacagtgtatcaccaacacctaatttattt 35462905  T

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Target: chr7 (Bit Score: 118; Significance: 4e-60; HSPs: 56)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 53 - 259
Target Start/End: Original strand, 43113673 - 43113879
Alignment:
Q  53 aggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattc 152  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||     
T  43113673 aggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtctcataagttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttt 43113772  T
Q  153 attcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaa 252  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||        |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43113773 attcaatttggtccaattttgataattttaatcccctaaaaaaagagaccgttggattacagaggtctatcagattttatagtgtatcaccagcacctaa 43113872  T
Q  253 tttattt 259  Q
    |||||||    
T  43113873 tttattt 43113879  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 51 - 260
Target Start/End: Original strand, 29186661 - 29186870
Alignment:
Q  51 ttaggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcat 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||  |    
T  29186661 ttaggcttaattgatctgctggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttatt 29186760  T
Q  151 tcattcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacct 250  Q
    | |||||||||| | |||||||||||||| ||||||  |        |||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29186761 ttattcaatttggttcaattttgataattttaatcccttaaaaaatgagaccgtaggattacggaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacct 29186860  T
Q  251 aatttattta 260  Q
    ||||||||||    
T  29186861 aatttattta 29186870  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 50 - 260
Target Start/End: Original strand, 19217623 - 19217833
Alignment:
Q  50 tttaggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttca 149  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||| |||||||     
T  19217623 tttaggcttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttctcaaacacgtccattaacttatttct 19217722  T
Q  150 ttcattcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacc 249  Q
    || |||||||||| | |||||||||||||| |||| | ||        |||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19217723 tttattcaatttggtacaattttgataattttaataccctaaaaaaagagaccgttggattacggaggtctatcggattttatagtgtatcaccaacacc 19217822  T
Q  250 taatttattta 260  Q
    |||||||||||    
T  19217823 taatttattta 19217833  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 50 - 260
Target Start/End: Original strand, 48792439 - 48792649
Alignment:
Q  50 tttaggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttca 149  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||     
T  48792439 tttaggcttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagttttaactttttcaaacatgtcccttaacttatttct 48792538  T
Q  150 ttcattcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacc 249  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||        |||||||| ||||| |  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  48792539 tttattcaatttgatctaattttgataattttaatctcctaaaaaaagagaccgttggattacaagggtgtataagattttatagtgtatcaccaacacc 48792638  T
Q  250 taatttattta 260  Q
     ||||||||||    
T  48792639 aaatttattta 48792649  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 55 - 260
Target Start/End: Original strand, 18787149 - 18787354
Alignment:
Q  55 gcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattcat 154  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||    
T  18787149 gcttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttgtttaatttggtcccataaatcttaactttttcaaatatgtcccttaacttatttcttttat 18787248  T
Q  155 tcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaatt 254  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||       ||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  18787249 tcaatttggtccaattttgataattttaatcccctaaaaaaatagaccgttggattacggaggtttatcagattttatggtgtatcaccaacacttaatt 18787348  T
Q  255 tattta 260  Q
    ||||||    
T  18787349 tattta 18787354  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 41 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 18788691 - 18788472
Alignment:
Q  41 tttaaataatttaggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaa 140  Q
    |||||| || ||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| |||| | |||||||| ||||| | |||||||||    
T  18788691 tttaaaaaaattaggcttaattgatatgccggtcccttaatttatttcttttattcaatatggtcctataaatcttaactttctcaaacatgtcccttaa 18788592  T
Q  141 attatttcattcattcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatc 240  Q
     ||||||| || |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||       ||||||||| |||||   ||||||||||||||||||| ||||||    
T  18788591 cttatttcttttattcaatttggtccaattttgataattttaatcctctaaaaaaatagaccgttggattacgaaggtctatcagattttataatgtatc 18788492  T
Q  241 accaacacctaatttattta 260  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  18788491 accaacacctaatttattta 18788472  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 49 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 29188153 - 29187942
Alignment:
Q  49 atttaggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttc 148  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||     
T  29188153 atttaggcttaaatgatctgccggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaatttattta 29188054  T
Q  149 attcattcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacac 248  Q
     || |||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||        |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29188053 ttttattcaatttagtccaattttgataattttaatcccctaaaaaaagagaccgttggattgcagaggtctatcagattttatagtgcatcaccaacac 29187954  T
Q  249 ctaatttattta 260  Q
    ||||||||||||    
T  29187953 ctaatttattta 29187942  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 48 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 43962693 - 43962482
Alignment:
Q  48 aatttaggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattattt 147  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| |||| ||||| | ||||||||| ||||||    
T  43962693 aatttaggcttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcacataagtcttagctttctcaaacatgtcccttaacttattt 43962594  T
Q  148 cattcattcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaaca 247  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||        |||||||| |||||   ||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  43962593 cttttattcaatttgatccaattttgataattttaatcatctaaaaaaacagaccgttggattacgaaggtctatcagattttatagtatatcactaaca 43962494  T
Q  248 cctaatttattt 259  Q
    ||||||||||||    
T  43962493 cctaatttattt 43962482  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 53 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 48793635 - 48793428
Alignment:
Q  53 aggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattc 152  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||     
T  48793635 aggcttaattgatttgccggtcccttaacttatttcttttattcattttggtcccataagtcttaactttttcaaacacgtcccttaacttatttctttt 48793536  T
Q  153 attcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaa 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||        |||||||| ||||| | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  48793535 attcaatttgatccaattttgataattttaatctcctaaaaaaagagaccgttggattacaaaggtgtataagattttatagtgtatcaccaacaccaaa 48793436  T
Q  253 tttattta 260  Q
    ||||||||    
T  48793435 tttattta 48793428  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 54 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 27072772 - 27072566
Alignment:
Q  54 ggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattca 153  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||| ||||||| || |    
T  27072772 ggcttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacatgtcccttaacttatttctttta 27072673  T
Q  154 ttcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaat 253  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| |||||| ||        | |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27072672 ttcaatttggtcaaattttgataattttaatccactaaaaaaaaaaaccgttggattacagaggtctataagattttatagtttatcaccaacacctaat 27072573  T
Q  254 ttattta 260  Q
    |||||||    
T  27072572 ttattta 27072566  T

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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 54 - 260
Target Start/End: Original strand, 27205541 - 27205747
Alignment:
Q  54 ggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattca 153  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||| ||||||| || |    
T  27205541 ggcttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacatgtcccttaacttatttctttta 27205640  T
Q  154 ttcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaat 253  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| |||||| ||        | |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27205641 ttcaatttggtcaaattttgataattttaatccactaaaaaaaaaaaccgttggattacagaggtctataagattttatagtctatcaccaacacctaat 27205740  T
Q  254 ttattta 260  Q
    |||||||    
T  27205741 ttattta 27205747  T

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Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 50 - 260
Target Start/End: Original strand, 44417453 - 44417663
Alignment:
Q  50 tttaggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttca 149  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||      
T  44417453 tttaggcttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggttccataagtcttaacattctcaaacacgtcccttaacttatttat 44417552  T
Q  150 ttcattcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacc 249  Q
    ||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||        |||  ||| |||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44417553 tttcttcaatttggtccaattttgataattttaatcccctaaaaaaagagattgttggattacggaggtctatcagattttatagtctatcaccaacacc 44417652  T
Q  250 taatttattta 260  Q
    |||||||||||    
T  44417653 taatttattta 44417663  T

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Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 53 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 9392934 - 9392727
Alignment:
Q  53 aggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattc 152  Q
    ||||||||||||||| | | ||| |||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||| ||||| | ||||||||| ||||||| ||     
T  9392934 aggcttaattgatcttccgttcctttaacttatttcttttatttaatttattcctataagtcttaactttctcaaacatgtcccttaacttatttctttt 9392835  T
Q  153 attcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaa 252  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||        |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  9392834 attcaatttggtccaattttgataattttaatcccctagaaaaagagaccgttggattacagaggtctatcagattttatagtgtatcaccggcacctaa 9392735  T
Q  253 tttattta 260  Q
    ||||||||    
T  9392734 tttattta 9392727  T

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Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 54 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 13750754 - 13750551
Alignment:
Q  54 ggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattca 153  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| || |    
T  13750754 ggcttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttgatcacataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttta 13750655  T
Q  154 ttcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaat 253  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||        |||||||| |||||   |||||||| |||||||||||||||||| || || |||||    
T  13750654 ttcaatttggtccaattttgataattttaatcccctaaaaaaacagaccgttggattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcatcaactaat 13750555  T
Q  254 ttat 257  Q
    ||||    
T  13750554 ttat 13750551  T

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Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 54 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 37237343 - 37237140
Alignment:
Q  54 ggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattca 153  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| || |||||||| ||||||  || |    
T  37237343 ggcttaattgatctgcccgtcccttaatttatttcttttatttaatttggtctcataagtcttaactctctcaaacacatcccttaacttattt--ttta 37237246  T
Q  154 ttcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaat 253  Q
    || |||||| |||||||||||||||| |||||||||        ||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37237245 ttaaatttggtccaattttgataatt-taatcctctaaaaaaagagatcgttggattacggaggtctatcagattttatagtgtatgaccaacacctaat 37237147  T
Q  254 ttattta 260  Q
    |||||||    
T  37237146 ttattta 37237140  T

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Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 54 - 260
Target Start/End: Original strand, 9391519 - 9391725
Alignment:
Q  54 ggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattca 153  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||| | |||| ||| ||||| ||||||||| | ||||||| || |    
T  9391519 ggcttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcctataaatcttaattttctcaaacacgtcccttcacttatttctttta 9391618  T
Q  154 ttcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaat 253  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| ||||||| |        |||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  9391619 ttcaatttggtacaattttgataattttaatcctttaaaaaaagagaccgttggattacgaaggtctatcagattttatagtgtatcatcaacaccaaat 9391718  T
Q  254 ttattta 260  Q
    |||||||    
T  9391719 ttattta 9391725  T

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Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 53 - 260
Target Start/End: Original strand, 13597143 - 13597349
Alignment:
Q  53 aggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattc 152  Q
    |||||||||||| |||| | ||| ||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||||| ||     
T  13597143 aggcttaattgaactgccgatcctttaacgtatttcttttattcaatttggtcctataagtcttaactttctcaaacacgtccctgaacttatttctttt 13597242  T
Q  153 attcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaa 252  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||        | | |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13597243 attaaatttgat-caattttgataattttaatcctctaaaaaaagatatcgttggattagggaggtctataagattttatagtgtatcaccaacacctaa 13597341  T
Q  253 tttattta 260  Q
    ||||||||    
T  13597342 tttattta 13597349  T

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Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 53 - 252
Target Start/End: Original strand, 44230426 - 44230625
Alignment:
Q  53 aggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattc 152  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||  |||||| |||| ||||||| ||     
T  44230426 aggcttaattgatctgccgatcccttagattatttcttttattcaatttagttccataagttttaactttctcaatcacgtcctttaacttatttctttt 44230525  T
Q  153 attcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaa 252  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||  ||||| ||        |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  44230526 attcaatttggtccaattttaataatttcaatcccctacgaaaagagaccgttggattacagaggtctatcagattttacagtgtatcatcaacacctaa 44230625  T

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Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 53 - 260
Target Start/End: Original strand, 7011632 - 7011840
Alignment:
Q  53 aggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattc 152  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||| |||||||| ||||| | ||||||||  ||||||| ||     
T  7011632 aggcttaattgatctgtcagtcccttaacttatttcttttattcaatttgatctcataagtcttaactttatcaaacatgtcccttagcttatttctttt 7011731  T
Q  153 attcaatttgatccaattttgataattataatcc-tctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacaccta 251  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||| |          |||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7011732 attcaatttggtccaattttgataattttaatccattaaaaaaaaaagaccgttggattacggaggtctataagattttatagtgtatcaccaacaccta 7011831  T
Q  252 atttattta 260  Q
    |||||||||    
T  7011832 atttattta 7011840  T

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Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 53 - 260
Target Start/End: Original strand, 7026990 - 7027198
Alignment:
Q  53 aggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattc 152  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||| |||||||| ||||| | ||||||||  ||||||| ||     
T  7026990 aggcttaattgatctgtcagtcccttaacttatttcttttattcaatttgatctcataagtcttaactttatcaaacatgtcccttagcttatttctttt 7027089  T
Q  153 attcaatttgatccaattttgataattataatcc-tctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacaccta 251  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||| |          |||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7027090 attcaatttggtccaattttgataattttaatccattaaaaaaaaaagaccgttggattacggaggtctataagattttatagtgtatcaccaacaccta 7027189  T
Q  252 atttattta 260  Q
    |||||||||    
T  7027190 atttattta 7027198  T

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Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 57 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 45400125 - 45399922
Alignment:
Q  57 ttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattcattc 156  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||| |||  ||| |||||||| ||||| | ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| || |||     
T  45400125 ttaattgatctgccggtcccttaacttatttgtttattttgatttggtctcataactcttaacttttgcaaacacgtcccttaacttatttcttttattt 45400026  T
Q  157 aatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaattta 256  Q
    | |||| |||||||||||||||| |||||| ||        |||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45400025 actttggtccaattttgataattttaatcccctaaaaaaagagaccgttggattacgaaggtctatcagattttatagtgtatcactaacacctaattta 45399926  T
Q  257 ttta 260  Q
    ||||    
T  45399925 ttta 45399922  T

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Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 57 - 255
Target Start/End: Original strand, 3537429 - 3537627
Alignment:
Q  57 ttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattcattc 156  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| || ||||    
T  3537429 ttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttattc 3537528  T
Q  157 aatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaattt 255  Q
    |||||  || |||||| |||||| |||||| ||        | |||||| |||||   |||||||| | |||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  3537529 aatttagtctaattttaataattttaatcccctaaaaaaagaaaccgttggattacgaaggtctataaaattttatagtatatcaccatcacctaattt 3537627  T

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Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 51 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 32519870 - 32519661
Alignment:
Q  51 ttaggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcat 150  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||| || |||||||||||||||| |    
T  32519870 ttaggctaaattgatctgccggtcccttaatttatttcttttattcaatttggtcccataaatcttaactttctcaaacacatcccttaaattatttctt 32519771  T
Q  151 tcattcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacct 250  Q
    | |||||||||| | ||||||| |||||| ||||||  |        ||||||||  ||||   ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  32519770 ttattcaatttggttcaattttaataattttaatcccttaaaaaaagagaccgttgaattacgaaggtctaccagattgtatagtgtgtcaccaacacct 32519671  T
Q  251 aatttattta 260  Q
    ||||| ||||    
T  32519670 aattttttta 32519661  T

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Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 50 - 260
Target Start/End: Original strand, 43960941 - 43961139
Alignment:
Q  50 tttaggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttca 149  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | |            | ||||| ||||||||||| |||||||     
T  43960941 tttaggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtctcgt------------tctcaaacacgtcccttaatttatttct 43961028  T
Q  150 ttcattcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacc 249  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43961029 tttattcaatttgatccaattttgataattttaatcctctacaaaaacagaccgttggattacaaaggtctatcagattttatagtgtatcactaacacc 43961128  T

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Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 52 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 44420642 - 44420435
Alignment:
Q  52 taggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcatt 151  Q
    |||||||||||||| ||| | ||| |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||    
T  44420642 taggcttaattgatatgccgatcctttaacttatttcttttattcaatttggtctcataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttt 44420543  T
Q  152 cattcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacaccta 251  Q
     |||||||||  |||||||||||||||| |||| | ||        | |||||| |||||   |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  44420542 tattcaatttagtccaattttgataattttaatgccctaaaaaaagataccgttggattacgaaggtctatcaga-tttatagtgtatcaccaacatcta 44420444  T
Q  252 atttattta 260  Q
    |||||||||    
T  44420443 atttattta 44420435  T

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Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 71 - 258
Target Start/End: Original strand, 32518438 - 32518616
Alignment:
Q  71 ggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattcattcaatttgatccaatt 170  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| | |||||    
T  32518438 ggtcccttaatttatttcttttattcaatttggtcccataaatcttaactttctcaaacacgtcccttaaattatttcttttattcaatttggttcaatt 32518537  T
Q  171 ttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaatttatt 258  Q
    |         |||||| ||        |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32518538 t---------taatcccctaaaaaaaaagaccgttggattacggaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaatttatt 32518616  T

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Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 47 - 179
Target Start/End: Original strand, 37235806 - 37235938
Alignment:
Q  47 taatttaggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatt 146  Q
    |||| ||||||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |   |||||| |||||  |||||||||| |||||    
T  37235806 taatataggcttaattggcctgccggtcccttaacttatttcttttatttaatttggttccataaatcccaactttctcaaacgcgtcccttaacttatt 37235905  T
Q  147 tcattcattcaatttgatccaattttgataatt 179  Q
    || || |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  37235906 tctttgattcaatttggtccaattttgagaatt 37235938  T

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Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 57 - 259
Target Start/End: Original strand, 44746729 - 44746931
Alignment:
Q  57 ttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattcattc 156  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| |||||| ||||||| |||||| ||  |||||| |||| ||| ||||| | || | |||| ||||||| || ||||    
T  44746729 ttaattgatctgtcggtctcttaacttattttttttattcaatttgatcttataagtcttaattttctcaaacatgttcgttaacttatttcttttattc 44746828  T
Q  157 aatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaattta 256  Q
    |||||| || ||||||||||||| ||||||  |        |||||||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  44746829 aatttggtcaaattttgataattttaatcccttagaaaaagagaccgttggattacggaggtctatcatattttatagtgtattatcaacacctaattta 44746928  T
Q  257 ttt 259  Q
    |||    
T  44746929 ttt 44746931  T

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Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 132 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 44748603 - 44748475
Alignment:
Q  132 gtcccttaaattatttcattcattcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagatttta 231  Q
    ||||||||| ||||||| || ||||||| || |||||||||||||||| |||||| ||        |||| ||| |||||   |||||||||||||||||    
T  44748603 gtcccttaatttatttcttttattcaatatggtccaattttgataattttaatcccctagaaaaggagactgttggattacgaaggtctatcagatttta 44748504  T
Q  232 tagtgtatcaccaacacctaatttattta 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44748503 tagtgtatcaccaacacctaatttattta 44748475  T

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Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 55 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 7057446 - 7057382
Alignment:
Q  55 gcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaac 119  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7057446 gcttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagttttaac 7057382  T

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Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 52 - 128
Target Start/End: Original strand, 42611433 - 42611509
Alignment:
Q  52 taggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaa 128  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  42611433 taggcttaattgatctgccggtcctttaacttatttcttttattcaatttggttccataagttttaactttctcaaa 42611509  T

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Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 54 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 3538681 - 3538574
Alignment:
Q  54 ggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattca 153  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||  || | ||||||| || |    
T  3538681 ggcttaattgatccgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtctcataagtcttaactttctcaaacacgtcttttcacttatttctttta 3538582  T
Q  154 ttcaattt 161  Q
    ||||||||    
T  3538581 ttcaattt 3538574  T

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Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 54 - 140
Target Start/End: Original strand, 45688867 - 45688953
Alignment:
Q  54 ggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaa 140  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||| || ||||||||    
T  45688867 ggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcacataagtcttaactttctcaaacacatcccttaa 45688953  T

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Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 52 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 19016817 - 19016729
Alignment:
Q  52 taggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaa 140  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||| ||||  |||||||||||    
T  19016817 taggcttaattgatctgtcggtcccttaatttatttctttttttcaatttggtcccataagtattaaatttgtcaaccacgtcccttaa 19016729  T

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Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 132 - 257
Target Start/End: Original strand, 26005429 - 26005554
Alignment:
Q  132 gtcccttaaattatttcattcattcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagatttta 231  Q
    ||||||||| ||||||| || |||||||||| | |||||||||||||| || ||| ||        |||||||| ||||| | |||||||| ||||||||    
T  26005429 gtcccttaacttatttcttttattcaatttggttcaattttgataattttactccactaaaaaaagagaccgttggattacaaaggtctataagatttta 26005528  T
Q  232 tagtgtatcaccaacacctaatttat 257  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    
T  26005529 tagtgtatcaccaacacgtaatttat 26005554  T

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Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 53 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 26006862 - 26006795
Alignment:
Q  53 aggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaact 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  26006862 aggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttcttttgttcaatttggtcccataagttttaact 26006795  T

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Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 50 - 140
Target Start/End: Original strand, 19008927 - 19009017
Alignment:
Q  50 tttaggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaa 140  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||| ||||   ||||||||||    
T  19008927 tttaggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttctttttttcaatttggtcccataagtattaaatttgtcaatcgcgtcccttaa 19009017  T

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Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 53 - 119
Target Start/End: Original strand, 27071019 - 27071085
Alignment:
Q  53 aggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaac 119  Q
    ||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27071019 aggcttaattgatctgccggtcatttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagttttaac 27071085  T

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Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 53 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 27207294 - 27207228
Alignment:
Q  53 aggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaac 119  Q
    ||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27207294 aggcttaattgatctgccggtcatttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagttttaac 27207228  T

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Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 54 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 44231960 - 44231886
Alignment:
Q  54 ggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaa 128  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  44231960 ggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcccataaatcttaacttttgcaaa 44231886  T

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Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 75 - 260
Target Start/End: Original strand, 12630584 - 12630770
Alignment:
Q  75 ccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaa-attatttcattcattcaatttgatccaattttg 173  Q
    |||||| |||| |||||| || ||||||||| || |||| |||| ||| ||||| |||||||||||  || |||  || |||||||||| || |||||||    
T  12630584 ccttaacttatgtcttttcttcaatttggtctcaaaagtcttaattttctcaaacacgtcccttaacctttttttttttattcaatttggtctaattttg 12630683  T
Q  174 ataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaatttattta 260  Q
    |||||| |||||| ||        |||| ||| ||||| |||||| |||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||    
T  12630684 ataattttaatcccctagaaaaagagactgttggattacagaggtatatcagattttattatggatcactaacacctaatttattta 12630770  T

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Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 135 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 43115124 - 43114999
Alignment:
Q  135 ccttaaattatttcattcattcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatag 234  Q
    |||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |        |||||||| |||||  || ||||||||||||||||||    
T  43115124 ccttaacttatttcttttattcaatttgatccaattttgataattttaatcccttaaaaaagaagaccgttggattactgaagtctatcagattttatag 43115025  T
Q  235 tgtatcaccaacacctaatttattta 260  Q
    || |||| ||  ||||||||||||||    
T  43115024 tgcatcatcataacctaatttattta 43114999  T

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Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 214 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 13599215 - 13599169
Alignment:
Q  214 gaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaatttattta 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  13599215 gaggtctatcagattttatagtgtatcagtaacacctaatttattta 13599169  T

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Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 104
Target Start/End: Original strand, 26005412 - 26005461
Alignment:
Q  55 gcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggt 104  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  26005412 gcttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggt 26005461  T

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Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 215 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 44231818 - 44231773
Alignment:
Q  215 aggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaatttattta 260  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44231818 aggtctaccagattttatagtgtatcaccaacacctgatttattta 44231773  T

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Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 9357754 - 9357708
Alignment:
Q  214 gaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaatttattta 260  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9357754 gaggtttaccagatcttatagtgtatcaccaacacctaatttattta 9357708  T

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Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 260
Target Start/End: Original strand, 37235944 - 37235990
Alignment:
Q  214 gaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaatttattta 260  Q
    |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  37235944 gaggtcaatcagattttacaatgtatcaccaacacctaatttattta 37235990  T

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Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 198 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 19218958 - 19218897
Alignment:
Q  198 agaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaatttattt 259  Q
    |||||||| ||| | ||||||| || |||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  19218958 agaccgttggataaaagaggtccatgagatttaacagtgtatcaccaacacctaatttattt 19218897  T

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Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 49 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 24653794 - 24653733
Alignment:
Q  49 atttaggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccata 110  Q
    |||| |||||||||||||  | |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  24653794 attttggcttaattgatcctccggtcccttaacttaattcttttatttaaattggtcccata 24653733  T

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Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 198 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 47536827 - 47536771
Alignment:
Q  198 agaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaatt 254  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||    
T  47536827 agaccgttggataaaagaggtctatcagatctaatggtgtatcaccaacacctaatt 47536771  T

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Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 53 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 42612660 - 42612593
Alignment:
Q  53 aggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttattta-atttggtcccataagttttaac 119  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||| | | |||||||||||| |||||||    
T  42612660 aggcttaattgatatgcgggtcctttaatttatttcttttattaatacttggtcccataaattttaac 42612593  T

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Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 198 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 3538547 - 3538485
Alignment:
Q  198 agaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaatttattta 260  Q
    |||||||| |||||  ||| ||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  3538547 agaccgttggattacggagatctatcaaattttacggtgtatcaccaacatctaatttattta 3538485  T

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Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 214 - 260
Target Start/End: Original strand, 45398683 - 45398729
Alignment:
Q  214 gaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaatttattta 260  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45398683 gaggtttatcaaatcttatagtgtatcaccaacatctaatttattta 45398729  T

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Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 102
Target Start/End: Original strand, 13749062 - 13749111
Alignment:
Q  53 aggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttg 102  Q
    ||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||| |||||||||||    
T  13749062 aggcttaattgatctggcggtcccataacttatttcttatatttaatttg 13749111  T

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Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 232 - 260
Target Start/End: Original strand, 13749180 - 13749208
Alignment:
Q  232 tagtgtatcaccaacacctaatttattta 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13749180 tagtgtatcaccaacacctaatttattta 13749208  T

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Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 44748621 - 44748569
Alignment:
Q  54 ggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcc 106  Q
    |||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  44748621 ggcttaatcgatctgccagtcccttaatttatttcttttattcaatatggtcc 44748569  T

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Target: chr3 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 71)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 50 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 28777809 - 28777599
Alignment:
Q  50 tttaggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttca 149  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |||||     
T  28777809 tttaggcttaattgatctgccggtcccttaatttatttcttttattcaatttggtcctataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaactgatttct 28777710  T
Q  150 ttcattcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacc 249  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||        |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28777709 tttattcaatttggtccaattttgataattttaatcccctaaaaaaagagaccgttggattacggaggtctatcagattttatagtgtatcatcaacacc 28777610  T
Q  250 taatttattta 260  Q
    |||||||||||    
T  28777609 taatttattta 28777599  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 51 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 54354512 - 54354308
Alignment:
Q  51 ttaggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcat 150  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |    
T  54354512 ttaggcttaattgatctgccggtcccttaacctatttcttttatttaatttggtcccttaagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctt 54354413  T
Q  151 tcattcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacct 250  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||| |||| | ||        ||||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  54354412 tgattcaatttggtccaattttgataattttaattccctataaaaagagaccattggattatagaggtctatcagattttacagtgtatcaccaacacct 54354313  T
Q  251 aattt 255  Q
    |||||    
T  54354312 aattt 54354308  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 53 - 260
Target Start/End: Original strand, 31937034 - 31937241
Alignment:
Q  53 aggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattc 152  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| | ||||||  ||     
T  31937034 aggcttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttcacttatttatttt 31937133  T
Q  153 attcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaa 252  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||| |||||| ||        |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31937134 attcattttggtccaattttgataattttaatcccctaaaaaaagagaccgttggattacggaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaa 31937233  T
Q  253 tttattta 260  Q
    ||| ||||    
T  31937234 ttttttta 31937241  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 54 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 31938425 - 31938224
Alignment:
Q  54 ggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattca 153  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| || |    
T  31938425 ggcttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtctcataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttta 31938326  T
Q  154 ttcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaat 253  Q
    ||||||||  ||||||||| |||||| |||||| ||        |||||||| |||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31938325 ttcaatttagtccaattttaataattttaatcccctaaaaaaagagaccgttggattacgaaggtctataagattttatagtgtatcaccaacacctaat 31938226  T
Q  254 tt 255  Q
    ||    
T  31938225 tt 31938224  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 55 - 260
Target Start/End: Original strand, 37609322 - 37609527
Alignment:
Q  55 gcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattcat 154  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||||| || ||    
T  37609322 gcttaattgatctgccggtcctttaacttatttcttttatttaatttggtcatataagtcttaactttctcaaacacgtccctcaacttatttcttttat 37609421  T
Q  155 tcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaatt 254  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||        |||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||    
T  37609422 tcaatttgatccaattttaataattttaatcccctaaaaaaagagaccgttggattagggaggtctataagatttaatagtgtctcatcaacacctaatt 37609521  T
Q  255 tattta 260  Q
    ||||||    
T  37609522 tattta 37609527  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 56 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 43394170 - 43393965
Alignment:
Q  56 cttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaatta-tttcattcat 154  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||| || ||    
T  43394170 cttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtctcataagtcttaactttctcaaagacgtcccttaacttattttcttttat 43394071  T
Q  155 tcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaatt 254  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| ||| || ||        |||||||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43394070 tcaaattggtccaattttgataattttaaccccctaaaaaaagagaccgttggattacggaggtctatcagattttacagtgtatcaccaacacctaatt 43393971  T
Q  255 tattta 260  Q
    ||||||    
T  43393970 tattta 43393965  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 52 - 260
Target Start/End: Original strand, 21727908 - 21728116
Alignment:
Q  52 taggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcatt 151  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||| | ||||||||| ||||||| ||    
T  21727908 taggcttaattgatctgccggtcccataacttatttcttttattcaatttggtctcataagtcttaactttctcaaacatgtcccttaacttatttcttt 21728007  T
Q  152 cattcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacaccta 251  Q
     |||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||       ||||| |||||||||   |||||||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  21728008 tattcaatttgattcaattttgataattttaatctcctaaaaaagtagactgttagattacgaaggtctatctcattttataatgtatcaccaacaccta 21728107  T
Q  252 atttattta 260  Q
    |||||||||    
T  21728108 atttattta 21728116  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 72 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 47431287 - 47431099
Alignment:
Q  72 gtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattcattcaatttgatccaattt 171  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| ||  ||||||||| ||||||||    
T  47431287 gtcccttaatttatttcttttattcaatttggtctcataagttttaactttttcaaacacgttccttaacttatttcttttgttcaatttggtccaattt 47431188  T
Q  172 tgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaatttattta 260  Q
    |||||||| |||||| ||        |||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  47431187 tgataattttaatcccctaaaaaaagagaccgttggattatggaggtctattagattttatagtgtatcacccacacctaatttattta 47431099  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 53 - 260
Target Start/End: Original strand, 2232601 - 2232808
Alignment:
Q  53 aggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattc 152  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||     
T  2232601 aggcttaattgatctgccgatcccttaacttatttcttttattcaatttggtcacataagtcttaactttctcaaatacgtcccttaatttatttctttt 2232700  T
Q  153 attcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaa 252  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||        ||||| || |||||  ||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  2232701 attcaatttaatccaattttaataattttaatcccctagaaaaaaagaccattggattacggaggtctatgagattttacggtgtatcagcaacacctaa 2232800  T
Q  253 tttattta 260  Q
    ||||||||    
T  2232801 tttattta 2232808  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 57 - 260
Target Start/End: Original strand, 46902334 - 46902537
Alignment:
Q  57 ttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattcattc 156  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| || ||||    
T  46902334 ttaattgatctgtcggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcccataaatcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttattc 46902433  T
Q  157 aatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaattta 256  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||| ||        |||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  46902434 aatttggtgcaattttgataattttaatcccctaaaagaagagattgttagattacggaggtctatcagattttatagtgtatcactaacaccaaattta 46902533  T
Q  257 ttta 260  Q
    ||||    
T  46902534 ttta 46902537  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 55 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 35759348 - 35759143
Alignment:
Q  55 gcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattcat 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| || ||    
T  35759348 gcttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttagtcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaatttatttcttttat 35759249  T
Q  155 tcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaatt 254  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||            |||||||| |||||   | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35759248 tcaatttggtccaattttgataattttaatctaaaaaaaaaacagaccgttggattacgaatgtctatcagattttacagtgtatcaccaacacctaatt 35759149  T
Q  255 tattta 260  Q
    ||||||    
T  35759148 tattta 35759143  T

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Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 57 - 260
Target Start/End: Original strand, 55209785 - 55209987
Alignment:
Q  57 ttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattcattc 156  Q
    ||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| || |||     
T  55209785 ttaattgatctaccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggttccataagttttaactttctcaaacacgtcccttaatttatttcttttattt 55209884  T
Q  157 aatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaattta 256  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||| |         ||||| || |||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  55209885 aatttggtccaattttgataattttaatccac-gaaaaaagagaccattggattacggaggtctatcagaatttatagtgtattaccaacacctaattta 55209983  T
Q  257 ttta 260  Q
    ||||    
T  55209984 ttta 55209987  T

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Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 54 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 2233423 - 2233221
Alignment:
Q  54 ggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattca 153  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||| ||||| | ||||||||| ||||||| || |    
T  2233423 ggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttcttttattcaattcggtctcataagtcttaactttgtcaaacatgtcccttaacttatttctttta 2233324  T
Q  154 ttcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaat 253  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||        ||| |||| |||||  ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2233323 ttcaatttggtccaattttgataattttaatcctctaaaaaaagagatcgttggattatggagatctataagattttatagcgtatcaccaacacctaat 2233224  T
Q  254 tta 256  Q
    |||    
T  2233223 tta 2233221  T

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Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 52 - 258
Target Start/End: Original strand, 17116200 - 17116405
Alignment:
Q  52 taggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcatt 151  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||    
T  17116200 taggcttaattgatctgccgatcccttaacttatttcttttattcaatttggtctcataagtgttaagtttctcaaacacgtcccttaacttatttcttt 17116299  T
Q  152 cattcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacaccta 251  Q
     |||||||||| | |||||||||||||| |||||| ||        | |||||| |||||  |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17116300 tattcaatttggttcaattttgataattttaatcc-ctaaaaaatgacaccgttggattacggaggtccatcagagtttatagtgtatcaccaacaccta 17116398  T
Q  252 atttatt 258  Q
    |||||||    
T  17116399 atttatt 17116405  T

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Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 54 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 46903742 - 46903536
Alignment:
Q  54 ggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattca 153  Q
    ||||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||||||| |||||| |||| ||||||| || |    
T  46903742 ggcttaattgatctttcagtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcccataaatcttaagtttttcaaacacgtcctttaacttatttctttta 46903643  T
Q  154 ttcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaat 253  Q
    ||||||||| | |||||||||| ||| |||||| ||        |||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46903642 ttcaatttggtacaattttgatgattttaatcccctaaaaaaaaagaccgttggattacggaggtctattagattttatagtgtatcaccaacacctaat 46903543  T
Q  254 ttattta 260  Q
    |||||||    
T  46903542 ttattta 46903536  T

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Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 71 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 21729289 - 21729100
Alignment:
Q  71 ggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattcattcaatttgatccaatt 170  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||    
T  21729289 ggtcccttaatttatttcttttattcaatttagtcccataagttctaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttattcaatttgattcaatt 21729190  T
Q  171 ttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaatttattta 260  Q
    ||||||||| |||||||||        ||||| || |||||   ||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21729189 ttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccattggattatgaaggtctaccatattttatagtgtatcatcaacacctaatttattta 21729100  T

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Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 50 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 17742415 - 17742211
Alignment:
Q  50 tttaggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttca 149  Q
    ||||||||||||  |||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||     
T  17742415 tttaggcttaatacatctgccgatcccttaacttatttcttttattcaatttggtctcataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttct 17742316  T
Q  150 ttcattcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattt-tatagtgtatcaccaacac 248  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||        |||||||| |||||  |||||||||||||||| || ||||||||| ||||||    
T  17742315 tttattaaatttgatccaattttgataattttaatcccctaaaaaaagagaccgttggattacggaggtctatcagatttatacagtgtatcaacaacac 17742216  T
Q  249 ctaat 253  Q
    |||||    
T  17742215 ctaat 17742211  T

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Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 50 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 19043735 - 19043531
Alignment:
Q  50 tttaggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttca 149  Q
    ||||||||||||  |||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||     
T  19043735 tttaggcttaatacatctgccgatcccttaacttatttcttttattcaatttggtctcataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttct 19043636  T
Q  150 ttcattcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattt-tatagtgtatcaccaacac 248  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||        |||||||| |||||  |||||||||||||||| || ||||||||| ||||||    
T  19043635 tttattaaatttgatccaattttgataattttaatcccctaaaaaaagagaccgttggattacggaggtctatcagatttatacagtgtatcaacaacac 19043536  T
Q  249 ctaat 253  Q
    |||||    
T  19043535 ctaat 19043531  T

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Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 50 - 260
Target Start/End: Original strand, 11346808 - 11347018
Alignment:
Q  50 tttaggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttca 149  Q
    |||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| | |||||||| ||||| |||| |||||| |||||||     
T  11346808 tttatgcttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttatttaatttggtcatataaatcttaactttatcaaacacgtgccttaatttatttct 11346907  T
Q  150 ttcattcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacc 249  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||        ||||| || |||||   ||||||| || ||| ||||||||||||||||||||    
T  11346908 tttattcaatttgttccaattttgataattttaatcccctgaaaagagagaccattggattatgaaggtctaccatattgtatagtgtatcaccaacacc 11347007  T
Q  250 taatttattta 260  Q
    |||||||||||    
T  11347008 taatttattta 11347018  T

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Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 52 - 260
Target Start/End: Original strand, 52521925 - 52522132
Alignment:
Q  52 taggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcatt 151  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||  | |||||||| ||||| |||||| || | ||||||  ||    
T  52521925 taggtttaattgatctgctggtcccttaacttatttctttaattcaatttggtctcatagatcttaactttctcaaacacgtcctttcacttatttattt 52522024  T
Q  152 cattcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacaccta 251  Q
     |||||||||| |||||||||||||| | |||||| ||        |||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52522025 tattcaatttggtccaattttgataactttaatcccctaaaaaaa-agacagttggattacggaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacaccta 52522123  T
Q  252 atttattta 260  Q
    |||||||||    
T  52522124 atttattta 52522132  T

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Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 57 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 5691209 - 5691014
Alignment:
Q  57 ttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattcattc 156  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||| || |||     
T  5691209 ttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttagtcacataagtcttaattttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatta 5691110  T
Q  157 aatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaat 253  Q
    || ||| ||||||||||||||||  ||||| ||        |||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5691109 aacttg-tccaattttgataatttaaatcccctaaaaaaagagaccgttggattacggaggtctatcagattttacagtgtatcaccaacacctaat 5691014  T

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Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 53 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 23073493 - 23073286
Alignment:
Q  53 aggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattc 152  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||| | ||||||||| ||||||| ||     
T  23073493 aggcttaattgatctgccggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataaatcttaactttctcaaagatgtcccttaacttatttctttt 23073394  T
Q  153 attcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaa 252  Q
    ||||||  || | |||||||||||||| |||||| ||        ||||||||  ||||  ||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  23073393 attcaaactggttcaattttgataattttaatcccctaaaaaaagagaccgttgaattacggaggtgtatcaaattttacggtgtatcaccaacacctaa 23073294  T
Q  253 tttattta 260  Q
    ||||||||    
T  23073293 tttattta 23073286  T

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Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 52 - 260
Target Start/End: Original strand, 5689723 - 5689925
Alignment:
Q  52 taggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcatt 151  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| |||  |      ||| ||||||||||| ||||||| ||    
T  5689723 taggcttaattgatctgtcgctcccttagcttatttcttttattaaatttggtcccataagatttccc------aaacacgtcccttaacttatttcttt 5689816  T
Q  152 cattcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacaccta 251  Q
     ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| |        |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5689817 tattaaatttggtccaattttgataattttaatcctttaaaacaagagaccgttggattacggaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacactta 5689916  T
Q  252 atttattta 260  Q
    |||||||||    
T  5689917 atttattta 5689925  T

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Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 55 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 53766083 - 53765952
Alignment:
Q  55 gcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattcat 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||| || ||    
T  53766083 gcttaattgatctgcgggtcccttaacttatttcttttattcaatttggttccgtaagtcttaattttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttat 53765984  T
Q  155 tcaatttgatccaattttgataattataatcc 186  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  53765983 tcaatttgatccaattttaataattttaatcc 53765952  T

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Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 52 - 252
Target Start/End: Original strand, 54353021 - 54353221
Alignment:
Q  52 taggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcatt 151  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||| ||||||| ||    
T  54353021 taggcttaattgatctgacggtcctttaacttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttatcaaacatgtcccttaacttatttcttt 54353120  T
Q  152 cattcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacaccta 251  Q
     | |||||||| ||||||||| |||||| |||||| |         |||||||| |||||   |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  54353121 tactcaatttggtccaatttttataattttaatccccgaaaaaaagagaccgttggattacgaaggtctatcagattttatcgtgtatcactaacaccta 54353220  T
Q  252 a 252  Q
    |    
T  54353221 a 54353221  T

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Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 53 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 11348590 - 11348384
Alignment:
Q  53 aggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattc 152  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||| | | || |||||| | ||||| ||     
T  11348590 aggcttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtctcataagtattaactttatcatacatgttccttaactaatttctttt 11348491  T
Q  153 attcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaa 252  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||| |  |        ||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  11348490 atttaatttgatccaattttgataattttaattccttagaaaaagagaccgttgaattacggaggtctatcagattttatagtatatcacc-acacctaa 11348392  T
Q  253 tttattta 260  Q
    || |||||    
T  11348391 ttaattta 11348384  T

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Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 55 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 53180920 - 53180718
Alignment:
Q  55 gcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattcat 154  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||| || |||||||  ||||||| ||||| |||| | |||| ||||||  || ||    
T  53180920 gcttaattgatttgccggtcccttaacttattt-ttttattcaatttgatctcataagtcgtaactttctcaaacacgttctttaacttattttttttat 53180822  T
Q  155 tcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaatt 254  Q
    |||||||  ||||||||| |||||| |||||||||        |||||||| |||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  53180821 tcaatttagtccaattttaataattttaatcctctaaaaaaggagaccgttggattacggaggtctatcagattgtatagtgtatcaccaacacctaatt 53180722  T
Q  255 tatt 258  Q
    ||||    
T  53180721 tatt 53180718  T

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Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 82 - 260
Target Start/End: Original strand, 17740865 - 17741036
Alignment:
Q  82 ttatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattcattcaatttgatccaattttgataattat 181  Q
    |||||||||||||||||||||||| |       |||||||| ||||| | ||||||||| ||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  17740865 ttatttcttttatttaatttggtctc-------ttaactttctcaaacatgtcccttaacttatttcttttattaaatttgatccaattttgataatttt 17740957  T
Q  182 aatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaatttattta 260  Q
    |||||| |        |||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17740958 aatcctttaaaaatagagaccgtcggattacggaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaatttattta 17741036  T

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Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 82 - 260
Target Start/End: Original strand, 19042185 - 19042356
Alignment:
Q  82 ttatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattcattcaatttgatccaattttgataattat 181  Q
    |||||||||||||||||||||||| |       |||||||| ||||| | ||||||||| ||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  19042185 ttatttcttttatttaatttggtctc-------ttaactttctcaaacatgtcccttaacttatttcttttattaaatttgatccaattttgataatttt 19042277  T
Q  182 aatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaatttattta 260  Q
    |||||| |        |||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19042278 aatcctttaaaaatagagaccgtcggattacggaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaatttattta 19042356  T

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Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 53 - 260
Target Start/End: Original strand, 28776447 - 28776654
Alignment:
Q  53 aggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattc 152  Q
    |||||||||||||||    |||| |||| |||||| ||||||| |||||| ||| |||| | |||| ||| ||||| | ||||||||| | ||||| ||     
T  28776447 aggcttaattgatctatcagtcctttaatttattttttttattcaatttgatcctataaatcttaattttctcaaacaagtcccttaactgatttctttt 28776546  T
Q  153 attcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaa 252  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||        |||||||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  28776547 attcaatttggtccaattttgataattttaatcccctaaaaacagagaccgttggattacggaggtctatcagattttataatgtatcatcaacacctaa 28776646  T
Q  253 tttattta 260  Q
    ||||||||    
T  28776647 tttattta 28776654  T

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Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 54 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 10979293 - 10979087
Alignment:
Q  54 ggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattca 153  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| ||| ||||| |||||  || | ||||||| || |    
T  10979293 ggcttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcccataaatcttaaatttctcaaacacgtcatttcacttatttctttta 10979194  T
Q  154 ttcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaat 253  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || |||  |        ||||| || |||||  ||||| ||||| ||||||  |||||||||||||| |||||    
T  10979193 ttcaatttgattcaattttgataattttagtccctttaaaaaagagaccattggattacggaggtttatcaaattttacggtgtatcaccaacatctaat 10979094  T
Q  254 ttattta 260  Q
    |||||||    
T  10979093 ttattta 10979087  T

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Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 57 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 15290604 - 15290476
Alignment:
Q  57 ttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattcattc 156  Q
    ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| ||| ||||| | |||  ||||||||||||||| ||||    
T  15290604 ttaattgatctgtcggtcccttaacttatttcttttatttaatttgatcacataagtcttaattttctcaaacatgtctattaaattatttcatttattc 15290505  T
Q  157 aatttgatccaattttgataattataatc 185  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||    
T  15290504 aatttgatccaattttaataattttaatc 15290476  T

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Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 50 - 185
Target Start/End: Original strand, 23091187 - 23091322
Alignment:
Q  50 tttaggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttca 149  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||| |||     
T  23091187 tttaggcttaattgatctgccggtcttttaacttatttcttttattcaatttggtcacataagtcttaactttctcaaacacgtctcttaacttaattct 23091286  T
Q  150 ttcattcaatttgatccaattttgataattataatc 185  Q
    || |||||||||| ||||| |||||||||| |||||    
T  23091287 tttattcaatttggtccaactttgataattttaatc 23091322  T

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Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 46 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 52525485 - 52525345
Alignment:
Q  46 ataatttaggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattat 145  Q
    ||||||| | |||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||    
T  52525485 ataattttgacttaattgatttgtcggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtctcataagtcttaactttctcaaacacatcccttaacttat 52525386  T
Q  146 ttcattcattcaatttgatccaattttgataattataatcc 186  Q
    ||| || |||||||||  ||||||||| |||||| ||||||    
T  52525385 ttcttttattcaatttagtccaattttaataattttaatcc 52525345  T

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Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 55 - 260
Target Start/End: Original strand, 47429628 - 47429828
Alignment:
Q  55 gcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattcat 154  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||| |||       || ||  |    
T  47429628 gcttaattgatctgcatgtcccttaacttatttcttttattcaatttggtctcataagtcttaactttctcaaacacgtccttta-------tcttttgt 47429720  T
Q  155 tcaatttgatccaattttgataattataatcctct--nnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaa 252  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||          |||| ||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  47429721 tcaatttggtccaattttgataattttaatcccctaaaaaaaaaaagactgttggattacggaggtctattagattttatagtgtatcaccaacatctaa 47429820  T
Q  253 tttattta 260  Q
    ||||||||    
T  47429821 tttattta 47429828  T

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Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 54 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 50881227 - 50881095
Alignment:
Q  54 ggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattca 153  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||  | ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| || |    
T  50881227 ggcttaattgatgtgtcggtcccttaacttatttcttttattcaatttgaccacataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaatttatttctttta 50881128  T
Q  154 ttcaatttgatccaattttgataattataatcc 186  Q
    ||||||||  | |||||||||||||| ||||||    
T  50881127 ttcaatttagttcaattttgataattttaatcc 50881095  T

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Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 54 - 186
Target Start/End: Original strand, 53178701 - 53178833
Alignment:
Q  54 ggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattca 153  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||| |||||| |  ||||||  |||||||| ||||| |||| |||||| ||||||| || |    
T  53178701 ggcttaattgatctgccgatcccttaacttattttttttattcaatttgatttcataagccttaactttctcaaacacgttccttaacttatttctttta 53178800  T
Q  154 ttcaatttgatccaattttgataattataatcc 186  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  53178801 ttcaatttgatccaattttgatcattttaatcc 53178833  T

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Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 76 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 47917708 - 47917525
Alignment:
Q  76 cttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattcattcaatttgatccaattttgat 175  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||  ||| ||||| ||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||| |||||| ||    
T  47917708 cttaacttatttcttttatttaatttggtctcataaatcttagttttctcaaacacgtccc-taacttatttcttttattcaatttgatctaattttaat 47917610  T
Q  176 aattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaatttattta 260  Q
    |||| |||||| ||        |||  ||| |||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  47917609 aattttaatcccctaaaaataaagattgttggattacggaggtttatcagattttatagtgtattaccaacaccgaatttattta 47917525  T

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Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 153 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 37610782 - 37610675
Alignment:
Q  153 attcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaa 252  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||        |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37610782 attcaatttggtccaattttgataattttaatcccctaaaaaaaaagaccgttggattacggaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaa 37610683  T
Q  253 tttattta 260  Q
    ||||||||    
T  37610682 tttattta 37610675  T

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Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 53 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 46986209 - 46986076
Alignment:
Q  53 aggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattc 152  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||| | ||||| ||||||||||| ||||||  ||     
T  46986209 aggcttaattgatttgccggccccttaatttatttcttttattcaatttggtccaataagtcttaactctctcaaacacgtcccttaacttattttctt- 46986111  T
Q  153 attcaatttgatccaattttgataattataatcct 187  Q
    ||| |||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  46986110 attaaatttggtcaaattttgataattttaatcct 46986076  T

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Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 57 - 162
Target Start/End: Original strand, 23072063 - 23072167
Alignment:
Q  57 ttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattcattc 156  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| ||||||| || ||||    
T  23072063 ttaattgatctgctggtcccttaattcatttcatttattcaatttggtcccataagtcttaactttctcaaagacgt-ccttaacttatttcttttattc 23072161  T
Q  157 aatttg 162  Q
    ||||||    
T  23072162 aatttg 23072167  T

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Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 50 - 186
Target Start/End: Original strand, 53764425 - 53764560
Alignment:
Q  50 tttaggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttca 149  Q
    |||||| ||||||||||| | ||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||| |||| |||||||     
T  53764425 tttaggtttaattgatctaccggtcctttaacttattt-ttttattcaatttggtctcataagtcttaactttctcaaacacgtcctttaacttatttct 53764523  T
Q  150 ttcattcaatttgatccaattttgataattataatcc 186  Q
    || |||||||||  || ||||||||||||| ||||||    
T  53764524 tttattcaatttagtcaaattttgataattttaatcc 53764560  T

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Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 53 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 17117518 - 17117387
Alignment:
Q  53 aggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattc 152  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||| || |||  ||     
T  17117518 aggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtctcataagtcttaagtttctcaaacacgtcccttaattttttt--ttt 17117421  T
Q  153 attcaatttgatccaattttgataattataatcc 186  Q
    ||||||||||  | ||||||||| ||| ||||||    
T  17117420 attcaatttgggcaaattttgatgattttaatcc 17117387  T

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Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 58 - 162
Target Start/End: Original strand, 43392630 - 43392734
Alignment:
Q  58 taattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattcattca 157  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||  |||||||| || ||||||| || |||||    
T  43392630 taattgatctgtcggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtctcataagtcttaactttctcaagcacgtccctgaacttatttcttttattca 43392729  T
Q  158 atttg 162  Q
    |||||    
T  43392730 atttg 43392734  T

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Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 53 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 27750550 - 27750463
Alignment:
Q  53 aggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaa 140  Q
    ||||| |||||||||||  |||| |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  27750550 aggctcaattgatctgccagtcctttaatttatttcttttattcaatttggtctcataagttttaattttttcaaacacatcccttaa 27750463  T

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Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 53 - 120
Target Start/End: Original strand, 34014507 - 34014574
Alignment:
Q  53 aggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaact 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  34014507 aggcttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcccataaatcttaact 34014574  T

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Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 53 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 24376547 - 24376481
Alignment:
Q  53 aggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaac 119  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  24376547 aggcttaattgatctgccggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtctcataagttttaac 24376481  T

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Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 73 - 147
Target Start/End: Original strand, 50879513 - 50879587
Alignment:
Q  73 tcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattattt 147  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  50879513 tcccttaacttatttcttttattcaatttggtcccataaatcttaactttcttaaacacgtcccttaaattattt 50879587  T

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Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 56 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 33113426 - 33113306
Alignment:
Q  56 cttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttc-attcat 154  Q
    |||||||||||| | | |||||||| |||||||||||||| ||||||||         ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  || ||    
T  33113426 cttaattgatctaccgatcccttaatttatttcttttattcaatttggt---------tttaactttttcaaacacgtcccttaacttatttctttttat 33113336  T
Q  155 tcaatttgatccaattttgataattataat 184  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  33113335 tcaatttggtccaattttgataattttaat 33113306  T

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Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 202 - 255
Target Start/End: Original strand, 50879835 - 50879888
Alignment:
Q  202 cgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaattt 255  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50879835 cgttagattacggaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaattt 50879888  T

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Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 51 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 53101894 - 53101834
Alignment:
Q  51 ttaggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataa 111  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  53101894 ttaggcttaattgatctgccggtcccttaagttatttcttttattcaatttggtcctataa 53101834  T

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Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 50 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 34015890 - 34015827
Alignment:
Q  50 tttaggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagt 113  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34015890 tttaggcttaattgatttgtcggtcccttaagttatttcttttattcaatttggtcccataagt 34015827  T

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Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 132 - 260
Target Start/End: Original strand, 35758082 - 35758210
Alignment:
Q  132 gtcccttaaattatttcattcattcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagatttta 231  Q
    ||||||||| ||||||| || |||||||||| |||||||||||||||| ||||||           | |||||| |||||   | |||||||||||||||    
T  35758082 gtcccttaacttatttcttttattcaatttggtccaattttgataattttaatccaaaaaaaaaacaaaccgttggattacgaatgtctatcagatttta 35758181  T
Q  232 tagtgtatcaccaacacctaatttattta 260  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35758182 cagtgtatcaccaacacctaatttattta 35758210  T

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Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 334 - 399
Target Start/End: Original strand, 49949213 - 49949278
Alignment:
Q  334 aagtatcaagtgctgcaaaaacgacggtgttggaaattaccaacgaacactcatcccctttgcttc 399  Q
    |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||    
T  49949213 aagtatcaagcgctgcaaaaacgttggtgttggaaattaccaacgaaccctcatcccttctgcttc 49949278  T

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Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 334 - 399
Target Start/End: Original strand, 49958544 - 49958609
Alignment:
Q  334 aagtatcaagtgctgcaaaaacgacggtgttggaaattaccaacgaacactcatcccctttgcttc 399  Q
    |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||    
T  49958544 aagtatcaagcgctgcaaaaacgttggtgttggaaattaccaacgaaccctcatcccttctgcttc 49958609  T

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Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 214 - 260
Target Start/End: Original strand, 43392766 - 43392812
Alignment:
Q  214 gaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaatttattta 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  43392766 gaggtctatcagattttatagtgtaccaccaacaccaaatttattta 43392812  T

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Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 218 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 55210862 - 55210820
Alignment:
Q  218 tctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaatttattta 260  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  55210862 tctatcagattttataatgtatcaccaacacataatttattta 55210820  T

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Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 53 - 106
Target Start/End: Original strand, 35758063 - 35758116
Alignment:
Q  53 aggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcc 106  Q
    |||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  35758063 aggcttaatcaatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcc 35758116  T

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Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 215 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 50881073 - 50881028
Alignment:
Q  215 aggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaatttattta 260  Q
    ||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  50881073 aggtctaccatattttatagtgtaccaccaacacctaatttattta 50881028  T

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Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 214 - 255
Target Start/End: Original strand, 53764910 - 53764951
Alignment:
Q  214 gaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaattt 255  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  53764910 gaggtctatcagattttatggtgtatcaccaacacttaattt 53764951  T

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Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 57 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 37610841 - 37610797
Alignment:
Q  57 ttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaattt 101  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  37610841 ttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaattt 37610797  T

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Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 71 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 21729422 - 21729379
Alignment:
Q  71 ggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagtt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  21729422 ggtcccttaatttatttcttttattcaatttagtcccataagtt 21729379  T

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Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 55 - 122
Target Start/End: Original strand, 27749107 - 27749174
Alignment:
Q  55 gcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaacttt 122  Q
    ||||||||||||| | ||| |||||| |||| ||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  27749107 gcttaattgatctaccggttccttaacttatgtcttttattcaatttagtcacataagtcttaacttt 27749174  T

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Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 47 - 110
Target Start/End: Original strand, 44115424 - 44115487
Alignment:
Q  47 taatttaggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccata 110  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||| ||||    
T  44115424 taatttaggcttaattgatcctccggtcccttaacttaattcttttttttaaattggtctcata 44115487  T

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Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 217 - 260
Target Start/End: Original strand, 53101685 - 53101728
Alignment:
Q  217 gtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaatttattta 260  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  53101685 gtctaccagatcttatagtgtatcaccaacacttaatttattta 53101728  T

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Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 214 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 33111803 - 33111757
Alignment:
Q  214 gaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaatttattta 260  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  33111803 gaggtctataaaattttatagtgtatctcccacacctaatttattta 33111757  T

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Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 215 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 15290447 - 15290402
Alignment:
Q  215 aggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaatttattta 260  Q
    ||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  15290447 aggtctaccatattttatagtgtatcatcaatacctaatttattta 15290402  T

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Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 215 - 255
Target Start/End: Original strand, 10978166 - 10978206
Alignment:
Q  215 aggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaattt 255  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10978166 aggtctataaaattttatagtgtatcaccatcacctaattt 10978206  T

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Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 202 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 24376417 - 24376369
Alignment:
Q  202 cgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacct 250  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  24376417 cgttggataagagaggtctaccagatcttataatgtatcaccaacacct 24376369  T

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Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 218 - 258
Target Start/End: Original strand, 27749251 - 27749291
Alignment:
Q  218 tctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaatttatt 258  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  27749251 tctatcagatcttatagtgtatcaccaacacttgatttatt 27749291  T

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Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 44116804 - 44116748
Alignment:
Q  54 ggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccata 110  Q
    |||||||||||||  | |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  44116804 ggcttaattgatcctccggtcccttaacttaattcttttatttaaattggtcacata 44116748  T

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Target: chr2 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 18)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 51 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 27892457 - 27892248
Alignment:
Q  51 ttaggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcat 150  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| |    
T  27892457 ttaggcttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtctcataagtcttaactttctcagacacgtcccttaacttatttctt 27892358  T
Q  151 tcattcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacct 250  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| |||||            ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27892357 ttattcaatttgatccaattttgataattttaatcaaaaaaaaaaacagaccgttagattacgaaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacct 27892258  T
Q  251 aatttattta 260  Q
    ||||||||||    
T  27892257 aatttattta 27892248  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 54 - 260
Target Start/End: Original strand, 16602725 - 16602931
Alignment:
Q  54 ggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattca 153  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| || |    
T  16602725 ggcttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttta 16602824  T
Q  154 ttcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaat 253  Q
    || || ||| |||||||||||||||| ||||||           |||||||| |||||  || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16602825 tttaaattggtccaattttgataattttaatccctaaaaaaaaaagaccgttggattacggatgtctatcagattttacagtgtatcaccaacacctaat 16602924  T
Q  254 ttattta 260  Q
    |||||||    
T  16602925 ttattta 16602931  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 53 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 38244074 - 38243867
Alignment:
Q  53 aggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattc 152  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||     
T  38244074 aggcttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcattttggtcccataagtcttaactttttcaaacacgtcccttaacttatttctttt 38243975  T
Q  153 attcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaa 252  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||        | || ||| ||||| | |||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||    
T  38243974 attcaatttggtccaattttgataattttaatctcctaaaaaaagatactgttggattacaaaggtgtataagattttacagtgtattaccaacaccaaa 38243875  T
Q  253 tttattta 260  Q
    ||||||||    
T  38243874 tttattta 38243867  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 52 - 260
Target Start/End: Original strand, 27891104 - 27891312
Alignment:
Q  52 taggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcatt 151  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||    
T  27891104 taggcttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtctcataggtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttt 27891203  T
Q  152 cattcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacaccta 251  Q
     ||||| |||| | |||||||||||||| ||||             ||||||||||||||   | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  27891204 tattcattttggttcaattttgataattttaataaaaaaaaaaaacagaccgttagattacgaatgtctatcagattttccagtgtatcaccaacaccta 27891303  T
Q  252 atttattta 260  Q
    |||||||||    
T  27891304 atttattta 27891312  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 54 - 252
Target Start/End: Original strand, 23832968 - 23833165
Alignment:
Q  54 ggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattca 153  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| || |||  || |    
T  23832968 ggcttaattgatttgtcggtcccttaacttatttattttattccatttggtcccataagtcttaactttctcaaacacgt-ccttaacttttttatttta 23833066  T
Q  154 ttcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaa 252  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||        |||||||| |||||  ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23833067 ttcaatttagtccaattttgataattttaatcccctaaaaaagaagaccgttggattacggaggtctagaagattttatagtgtatcatcaacacctaa 23833165  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 51 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 23833991 - 23833902
Alignment:
Q  51 ttaggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaa 140  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  23833991 ttaggcttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaa 23833902  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 54 - 165
Target Start/End: Original strand, 43814521 - 43814632
Alignment:
Q  54 ggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattca 153  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||||| || |    
T  43814521 ggcttaattgatttgtcggtcccttaacttatttcttttattcaatttcgtctcataagtcttaactttctcaaatacgtcctttaacttatttctttta 43814620  T
Q  154 ttcaatttgatc 165  Q
    ||||||||||||    
T  43814621 ttcaatttgatc 43814632  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 56 - 186
Target Start/End: Original strand, 26388220 - 26388350
Alignment:
Q  56 cttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattcatt 155  Q
    |||||||||||||  |||| ||||| |||||| ||||||| |||||| || ||||||| |||||||| ||||| |||||| |||| ||||||| || |||    
T  26388220 cttaattgatctgtcggtctcttaacttattttttttattcaatttgatctcataagtcttaactttctcaaacacgtcctttaacttatttcttttatt 26388319  T
Q  156 caatttgatccaattttgataattataatcc 186  Q
     |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  26388320 taatttgattcaattttgataattttaatcc 26388350  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 53 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 16604308 - 16604199
Alignment:
Q  53 aggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattc 152  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||  |||||||| || ||||||| ||     
T  16604308 aggcttaattgatctaccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaagtttctcaagcacgtccctgaacttatttctttt 16604209  T
Q  153 attcaatttg 162  Q
    ||||||||||    
T  16604208 attcaatttg 16604199  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 53 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 5034935 - 5034848
Alignment:
Q  53 aggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaa 140  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| ||||| || ||||||||    
T  5034935 aggcttaattgatttgccggtcctttaacttatttcttttatttaatttggttctataacttttaactttctcaaacacatcccttaa 5034848  T

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Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 114 - 260
Target Start/End: Original strand, 38242943 - 38243086
Alignment:
Q  114 tttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattcattcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattaga 213  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||        |||||||| ||||| |    
T  38242943 tttaactttttcaaacatgtctcttaacttatttcttttatttaatttgatccaattttgataattttaatctcctaaaaaaagagaccgttggattaca 38243042  T
Q  214 gaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaatttattta 260  Q
     ||   ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  38243043 aag---tataagattttataatgtatcaccaacaccaaatttattta 38243086  T

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Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 140
Target Start/End: Original strand, 5033478 - 5033564
Alignment:
Q  54 ggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaa 140  Q
    |||||||| ||||||   |||| |||| |||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||    
T  5033478 ggcttaatagatctgtcagtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcctataacttttaactttctcaaatacatcccttaa 5033564  T

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Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 55 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 19577443 - 19577359
Alignment:
Q  55 gcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtccctta 139  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||  |||| || |||||||    
T  19577443 gcttaattgatctcccggtcccttaacttatttcttttagtcaatttggtcccataactcttaactttaacaaagacatccctta 19577359  T

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Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 44 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 43814709 - 43814641
Alignment:
Q  44 aaataatttaggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataag 112  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  |||||| |||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  43814709 aaataatttaggtttaattgatctgtcggtcccctaacatatttcttttattcaatttggtctcataag 43814641  T

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Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 202 - 260
Target Start/End: Original strand, 5033607 - 5033665
Alignment:
Q  202 cgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaatttattta 260  Q
    |||| ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  5033607 cgttggataagagagatctaccagattttatagtgtatcaccaacatttaatttattta 5033665  T

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Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 202 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 5034805 - 5034747
Alignment:
Q  202 cgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaatttattta 260  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||    
T  5034805 cgttggataagagaggtctaacagattttagagtgtatcaccaacacttgatttattta 5034747  T

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Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 156 - 255
Target Start/End: Original strand, 44800974 - 44801073
Alignment:
Q  156 caatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaattt 255  Q
    |||||||| |||||||||||||||  ||||| ||        |||||||| ||||| |||||| || ||||||| | |||||||||||||||||| ||||    
T  44800974 caatttgaaccaattttgataatttcaatcccctaaaaaacaagaccgttggattatagaggtttaccagatttcacagtgtatcaccaacacctgattt 44801073  T

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Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 92 - 140
Target Start/End: Original strand, 15496083 - 15496131
Alignment:
Q  92 tatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaa 140  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||    
T  15496083 tattcaatttggtcccataagtcttaactttcacaaacacgtcccttaa 15496131  T

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Target: chr4 (Bit Score: 108; Significance: 4e-54; HSPs: 40)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 52 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 7261663 - 7261455
Alignment:
Q  52 taggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcatt 151  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||    
T  7261663 taggcttaattgatctaccggtcccttaacttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttt 7261564  T
Q  152 cattcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacaccta 251  Q
     |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||       |||||| || |||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7261563 tattcaatttggtccaattttgataattttaatcccctaaaaaaatagaccattggattacgaaggtctataagattttatagtgtatcaccaacaccta 7261464  T
Q  252 atttattta 260  Q
    |||||||||    
T  7261463 atttattta 7261455  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 50 - 260
Target Start/End: Original strand, 38031164 - 38031374
Alignment:
Q  50 tttaggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttca 149  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |||||     
T  38031164 tttaggcttaattgatctgccggtcccttaatttatttcttttattcaatttggtcctataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaactgatttct 38031263  T
Q  150 ttcattcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacc 249  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |        ||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38031264 tttattcaatttggtccaattttgataattttaatcccataaaaaaaaagaccgttgaattacggaggtctatcagattttatagtgtatcatcaacacc 38031363  T
Q  250 taatttattta 260  Q
    |||||||||||    
T  38031364 taatttattta 38031374  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 54 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 38032538 - 38032332
Alignment:
Q  54 ggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattca 153  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | ||||| || |    
T  38032538 ggcttaattgatctgccggtcccttaatttatttcttttattcaatttggtcatataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaactgatttctttta 38032439  T
Q  154 ttcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaat 253  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||        |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38032438 ttcaatttggtccaattttgataattttaatcccctaaaaaaagagaccgttggattacggaggtctatcagattttatagtgtatcatcaacacctaat 38032339  T
Q  254 ttattta 260  Q
    |||||||    
T  38032338 ttattta 38032332  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 51 - 260
Target Start/End: Original strand, 22621864 - 22622073
Alignment:
Q  51 ttaggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcat 150  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| | ||||||| |    
T  22621864 ttaggcttaattgatctgccagtcccttaacttatttcttttattcaatttggtctcataagtcttaactttctcaaacacgtccctttacttatttctt 22621963  T
Q  151 tcattcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacct 250  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||        |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  22621964 ttattcaatttggtccaattttgataattttaatcccctaaaaaaagagaccgttggattacggaggtctatcagattttatagtgtatcaccgacaccg 22622063  T
Q  251 aatttattta 260  Q
    ||||||||||    
T  22622064 aatttattta 22622073  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 54 - 260
Target Start/End: Original strand, 10802889 - 10803095
Alignment:
Q  54 ggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattca 153  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| || |    
T  10802889 ggcttaattgatctgccgatcccttaacttatttcttttattcaatttggtcccataaattttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttta 10802988  T
Q  154 ttcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaat 253  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||| | ||        |||||||| |||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  10802989 ttcaatttggtccaattttgataattttaataccctaaaaaaagagaccgttggattacggaggtttatcagattttatattgtatcaccaacaccgaat 10803088  T
Q  254 ttattta 260  Q
    |||||||    
T  10803089 ttattta 10803095  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 52 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 10804315 - 10804107
Alignment:
Q  52 taggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcatt 151  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | ||||| || |||||| ||||||| ||    
T  10804315 taggcttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcctataagttttaactttcttaaataagttccttaacttatttcttt 10804216  T
Q  152 cattcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacaccta 251  Q
     |||||||||| | |||||||||||||| |||||| ||        |||||||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  10804215 tattcaatttggttcaattttgataattttaatccactaaaaaaaaagaccgttggattacggaggtctatcagattttacagtgtatcatcaacgccta 10804116  T
Q  252 atttattta 260  Q
    |||||||||    
T  10804115 atttattta 10804107  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 53 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 8815476 - 8815269
Alignment:
Q  53 aggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattc 152  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |      
T  8815476 aggcttaattgatttgccggtccgttaacttatttcttttattcaatttggtctcataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttct 8815377  T
Q  153 attcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaa 252  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||        | |||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8815376 attcaaattggtccaattttgataattttaatcctctaaaaaaaaaaaccgttggattacggaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacaccaaa 8815277  T
Q  253 tttattta 260  Q
    ||||||||    
T  8815276 tttattta 8815269  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 53 - 260
Target Start/End: Original strand, 17356360 - 17356567
Alignment:
Q  53 aggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattc 152  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || | |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||     
T  17356360 aggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttcttttattcaatttgatgccagaaatcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttt 17356459  T
Q  153 attcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaa 252  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||        |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17356460 attcaatttgttccaattttgataattttaatcccctaaaaaaagagaccgttggattacggaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctag 17356559  T
Q  253 tttattta 260  Q
    || |||||    
T  17356560 ttcattta 17356567  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 53 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 34095778 - 34095571
Alignment:
Q  53 aggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattc 152  Q
    |||||||||||||||  | ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||     
T  34095778 aggcttaattgatctattagtcccttaacttattttttttattcaatttggtctcataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttt 34095679  T
Q  153 attcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaa 252  Q
     ||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||        ||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34095678 gttcaatttggtccaattttgataattttaatcccctaaaaaaggagaccgttgaattacggaggtctatcagattttatagtgtatcacccacacctaa 34095579  T
Q  253 tttattta 260  Q
    ||||||||    
T  34095578 tttattta 34095571  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 55 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 23758088 - 23757882
Alignment:
Q  55 gcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattcat 154  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| || ||    
T  23758088 gcttaattgatctgccggttctttaatttatttcttttattcaatttagtctcataagttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttat 23757989  T
Q  155 tcaa-tttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaat 253  Q
    | || ||||||||||||||||||||| ||||||||         ||||||||  ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23757988 taaattttgatccaattttgataattttaatcctccaaaaaaagagaccgttgaattacggaggtctatcagattttatggtgtatcaccaacacctaat 23757889  T
Q  254 ttattta 260  Q
    |||||||    
T  23757888 ttattta 23757882  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 53 - 260
Target Start/End: Original strand, 18091579 - 18091786
Alignment:
Q  53 aggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattc 152  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||| |||||| |||| |||| |  ||     
T  18091579 aggcttaattgatctgccgatcccttaacttatttcttttatttaatttggtttcataagtcttaactttctcaaaaacgtccattaacttatctatttt 18091678  T
Q  153 attcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnnt-agaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacaccta 251  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||       | ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18091679 attcaatttagtccaattttgataattttaat-ctcttaaaaaatgagaccgttgaattacagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacaccta 18091777  T
Q  252 atttattta 260  Q
    |||||||||    
T  18091778 atttattta 18091786  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 57 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 17357978 - 17357778
Alignment:
Q  57 ttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattcattc 156  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| || ||||    
T  17357978 ttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggttccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttattc 17357879  T
Q  157 aatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaattta 256  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||  ||        ||||||||  ||||  |||||||| ||||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  17357878 aatatgatccaattttgataattttaatctcctgaaaaaagagaccgttgaattacggaggtctaccagattttataatgtatcagcaatacttaattta 17357779  T
Q  257 t 257  Q
    |    
T  17357778 t 17357778  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 85 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 22623230 - 22623055
Alignment:
Q  85 tttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattcattcaatttgatccaattttgataattataat 184  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||| | ||||||| || |||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  22623230 tttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttctcaagcacgtccctttacttatttcttttattcaatttggtccaattttgataattttaat 22623131  T
Q  185 cctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaatttattta 260  Q
    || ||        |||||||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  22623130 cccctacaaaaagagaccgttggattacggaggtctatcagattttataatgtatcaccaacatctaatttattta 22623055  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 57 - 255
Target Start/End: Original strand, 48499367 - 48499565
Alignment:
Q  57 ttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattcattc 156  Q
    ||||||||||||| |   |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| | ||||||||| ||||||  || ||||    
T  48499367 ttaattgatctgccgccaccttaacttatttcttttattcaatttggtcccataattcttaactttttcaaacatgtcccttaacttatttattttattc 48499466  T
Q  157 aatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaattt 255  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||| ||        ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  48499467 aatttggtccaattttgataattttaatcccctaaaaaaagagatcgttggattacagaggtctatcagattttacggtgtatcaccaacatctaattt 48499565  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 54 - 260
Target Start/End: Original strand, 8814135 - 8814340
Alignment:
Q  54 ggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattca 153  Q
    ||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||| |||| ||||| | ||||||||| ||||||| || |    
T  8814135 ggcttaattgatctatcggtcccttaacttatttcttttattcaatttagtcccataaatcttatctttctcaaacatgtcccttaacttatttctttta 8814234  T
Q  154 ttcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaat 253  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| |||| | ||       ||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8814235 ttcaatttggtcgaattttgataattttaataccct-aaaaaatagactgttggattacggaggtctatcagattttatagtgtaacaccaacacctaat 8814333  T
Q  254 ttattta 260  Q
    |||||||    
T  8814334 ttattta 8814340  T

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Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 77 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 5433502 - 5433319
Alignment:
Q  77 ttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattcattcaatttgatccaattttgata 176  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| | || |||||| ||||||  || |||||||||  |||||||||||||    
T  5433502 ttaacttatttcttttattcaatttggtcctataagttttaactttctcaaacatgtgccttaacttatttattttattcaatttactccaattttgata 5433403  T
Q  177 attataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaatttattta 260  Q
    ||| |||| | ||        |||| |||  ||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  5433402 attttaataccctaaaaattgagactgttgtattacggaggtctatcagattttataatgtatcacaaacacctaatttattta 5433319  T

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Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 54 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 56235138 - 56234933
Alignment:
Q  54 ggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattca 153  Q
    |||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||| |||||||| ||||| ||  ||||||| ||||||| || |    
T  56235138 ggcttaattgatctgtcagtcccttaatttatttcttttattcaatttgatctcataagtcttaactttatcaaacacaccccttaacttatttctttta 56235039  T
Q  154 ttcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaat 253  Q
    ||||||| | || |||||||||| || |||||||||        |||||  |  ||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  56235038 ttcaattcggtctaattttgatacttttaatcctctaaaaaac-agaccaatgaattacgaaggtctatcagattttataatgtatcaccaacacctaat 56234940  T
Q  254 ttattta 260  Q
    |||||||    
T  56234939 ttattta 56234933  T

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Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 52 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 48463104 - 48463016
Alignment:
Q  52 taggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaa 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  48463104 taggcttaattgatctgctggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtctcataagttttaactttctcaaacacatcccttaa 48463016  T

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Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 54 - 186
Target Start/End: Original strand, 56233724 - 56233856
Alignment:
Q  54 ggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattca 153  Q
    |||||||| |||||   |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||| ||||| | ||||||||| ||||||| || |    
T  56233724 ggcttaatagatctatcggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcgcataagtctcaactttctcaaacatgtcccttaacttatttctttta 56233823  T
Q  154 ttcaatttgatccaattttgataattataatcc 186  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  56233824 ttcaatttggtccaattttgataattttaatcc 56233856  T

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Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 56 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 35193312 - 35193140
Alignment:
Q  56 cttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattcatt 155  Q
    ||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||   |||||||| ||||| |||||| |||| ||||||| || |||    
T  35193312 cttaattgacctgccagtcccttaatttatttcttttattcaatttggtctcataaaacttaactttctcaaacacgtcctttaacttatttcttttatt 35193213  T
Q  156 caatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagatt 228  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| |||||| ||        |||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  35193212 caatttggtccatttttgataattttaatcccctagaaaaagagaccgttggattacggaggtctatcagatt 35193140  T

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Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 54 - 259
Target Start/End: Original strand, 35191817 - 35192019
Alignment:
Q  54 ggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattca 153  Q
    ||||||||||||  || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| ||||||| || |    
T  35191817 ggcttaattgattcgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtttcataagtcttaactttctcaaacacgttcattaacttatttctttta 35191916  T
Q  154 ttcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaat 253  Q
    ||||||||  | |||||||||||||| |||||| ||        ||| |||| |||||  || |||||||| ||||||||||||   |||| ||||||||    
T  35191917 ttcaatttagttcaattttgataattttaatcccctaaaaaaagagaacgttggattacggaagtctatcaaattttatagtgt---accaccacctaat 35192013  T
Q  254 ttattt 259  Q
    ||||||    
T  35192014 ttattt 35192019  T

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Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 57 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 48081705 - 48081600
Alignment:
Q  57 ttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattcattc 156  Q
    ||||||||| ||  |||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||    
T  48081705 ttaattgatgtgtcggtcccttaacttattccttttattcaatttggttccataagtcttaactttttcaaatatgtcccttaacttatttcttttattc 48081606  T
Q  157 aatttg 162  Q
    ||||||    
T  48081605 aatttg 48081600  T

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Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 58 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 48501437 - 48501236
Alignment:
Q  58 taattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattcattca 157  Q
    |||||||||||  ||| | |||| |||||||||||||| |||| |||  ||||| | |||||||| ||||| | |||| |||| ||||||| || |||||    
T  48501437 taattgatctgtcggttctttaacttatttcttttattcaattaggtttcataattcttaactttctcaaacatgtcctttaacttatttcttttattca 48501338  T
Q  158 atttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaatttat 257  Q
    ||||| || |||||| ||| || |||||| ||        ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  48501337 atttggtctaattttaatattt-taatcccctaaaaaaagagaccgttagattacggaggtctgtcagattttattgtgtatcatcaacacctaatttat 48501239  T
Q  258 tta 260  Q
    |||    
T  48501238 tta 48501236  T

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Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 51 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 34122923 - 34122834
Alignment:
Q  51 ttaggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaa 140  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||| || ||||||||    
T  34122923 ttaggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcccataaatcttaactttctcaaacacatcccttaa 34122834  T

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Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 53 - 128
Target Start/End: Original strand, 34121298 - 34121373
Alignment:
Q  53 aggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||||    
T  34121298 aggcttaattgatctgccggtcccttaatttatttcttttattcaatttggtctcataagtcttaactttctcaaa 34121373  T

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Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 51 - 160
Target Start/End: Original strand, 48080267 - 48080376
Alignment:
Q  51 ttaggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcat 150  Q
    ||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||   |||| |||| ||||||| |    
T  48080267 ttaggcttaattgatctgtcggtcacttaacttatttcttttatttaatttggtttcataagtcttaactttctcaaacttgtcctttaacttatttctt 48080366  T
Q  151 tcattcaatt 160  Q
    | ||||||||    
T  48080367 ttattcaatt 48080376  T

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Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 72 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 48081630 - 48081554
Alignment:
Q  72 gtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttc 148  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  48081630 gtcccttaacttatttcttttattcaatttggtctcataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaagttatttc 48081554  T

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Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 155 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 35927133 - 35927028
Alignment:
Q  155 tcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaatt 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||        ||| |||| |||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35927133 tcaatttgatccaattttgataattttaatctcctaaaaaaaaagatcgttggattacgaaggtctaccagattttatagtgtatcaccaacacctaatt 35927034  T
Q  255 tattta 260  Q
    ||||||    
T  35927033 tattta 35927028  T

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Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 215 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 36074751 - 36074706
Alignment:
Q  215 aggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaatttattta 260  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36074751 aggtctatcatattttatagtgtatcaccaacacctaatttattta 36074706  T

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Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 155 - 260
Target Start/End: Original strand, 35925792 - 35925897
Alignment:
Q  155 tcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaatt 254  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||        |||| ||| |||||  ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  35925792 tcaatttgatcaaattttgataattttaatcttctaaaaaaaaagactgttggattacggagatctatcagattttatagtgtatcgtcaacacctaatt 35925891  T
Q  255 tattta 260  Q
    ||||||    
T  35925892 tattta 35925897  T

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Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 128
Target Start/End: Original strand, 48462140 - 48462217
Alignment:
Q  52 taggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttattta-atttggtcccataagttttaactttttcaaa 128  Q
    |||| ||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||| | |||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  48462140 tagggttaattgatatgctggtcttttaatttatttcttttattaatatttggactcataagttttaactttttcaaa 48462217  T

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Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 48081525 - 48081479
Alignment:
Q  214 gaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaatttattta 260  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  48081525 gaggtctttcagagtttataatgtatcaccaacacctaatttattta 48081479  T

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Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 189779 - 189742
Alignment:
Q  16 ctaagtctagtaagagtcaaagagatttaaataattta 53  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  189779 ctaagcctagtaagagtcaaagagatttaaataattta 189742  T

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Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 50 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 48081449 - 48081392
Alignment:
Q  50 tttaggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtccc 107  Q
    ||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  48081449 tttagccttaattgatttgccggtcccttaacttattccttttattcaatttggtccc 48081392  T

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Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 224 - 260
Target Start/End: Original strand, 56233878 - 56233914
Alignment:
Q  224 agattttatagtgtatcaccaacacctaatttattta 260  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  56233878 agattttatagtgtatcgccaacacctaatttattta 56233914  T

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Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 54 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 22624428 - 22624389
Alignment:
Q  54 ggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttctttta 93  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  22624428 ggcttaattgatctgccggtcccttaacttatttctttta 22624389  T

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Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 218 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 34122775 - 34122733
Alignment:
Q  218 tctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaatttattta 260  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  34122775 tctatcagatcttatagtgtatcaccaacacttgatttattta 34122733  T

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Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 218 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 48081334 - 48081292
Alignment:
Q  218 tctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaatttattta 260  Q
    ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  48081334 tctatgagagtttatactgtatcaccaacacctaatttattta 48081292  T

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Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 110
Target Start/End: Original strand, 5574195 - 5574256
Alignment:
Q  49 atttaggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccata 110  Q
    |||| |||||||||||||  | |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||    
T  5574195 attttggcttaattgatcctccggtcccttaacttaattcttttatttaaattggtaccata 5574256  T

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Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 48 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 5470274 - 5470214
Alignment:
Q  48 aatttaggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtccca 108  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||| ||| |||||| || |||||||||    
T  5470274 aatttaggcttaattgaactgccgatcccttaacttaattcatttattcaagttggtccca 5470214  T

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Target: chr6 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 22)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 53 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 32349156 - 32348949
Alignment:
Q  53 aggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattc 152  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | ||||| ||     
T  32349156 aggcttaattgatctgccggtcccttaatttatttcttttattcaatttggtcttataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaactgatttctttt 32349057  T
Q  153 attcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaa 252  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||        |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32349056 attcaatttggtccaattttgataattttaatcccctaaaaaaagagaccgttggattacggaggtctatcagattttatagtgtatcatcaacacctaa 32348957  T
Q  253 tttattta 260  Q
    ||||||||    
T  32348956 tttattta 32348949  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 42 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 34996891 - 34996673
Alignment:
Q  42 ttaaataatttaggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaa 141  Q
    |||| |||||||| |||||||||| ||  ||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  34996891 ttaattaatttagacttaattgatttgtcggtccctgaacttatttcttttattcaatttagtcccataagtcttaactttctcaaatacgtcccttaac 34996792  T
Q  142 ttatttcattcattcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatca 241  Q
    ||||||| || |||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||        |||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  34996791 ttatttcttttattcaatttggtccaattttgataattttaatctcctaaaaaaacagaccgttggattacgaaggtctatcagattttatagtgtatca 34996692  T
Q  242 ccaacacctaatttattta 260  Q
    |||||||||||||||||||    
T  34996691 ccaacacctaatttattta 34996673  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 52 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 11801462 - 11801254
Alignment:
Q  52 taggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcatt 151  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | ||||| ||    
T  11801462 taggcttaattgatctgccggtcccttaatttatttcttttattcaatttggtcctataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaactgatttcttt 11801363  T
Q  152 cattcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacaccta 251  Q
     |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||        |||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||    
T  11801362 tattcaatttggtccaattttgataattttaatcccctcaaaaaagagaccgttggattacggaggtctatcaaattttatagtgtatcattaacaccta 11801263  T
Q  252 atttattta 260  Q
    |||||||||    
T  11801262 atttattta 11801254  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 52 - 260
Target Start/End: Original strand, 32347806 - 32348014
Alignment:
Q  52 taggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcatt 151  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | ||||| ||    
T  32347806 taggcttaattgatctgctggttccttaatttatttcttttattcaatttggtcatataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaagtgatttcttt 32347905  T
Q  152 cattcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacaccta 251  Q
     |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||        ||| |||| |||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32347906 tattcaatttggtccaattttgataattttaatcccctaaaaaaagagaacgttggattacgggggtctatcagattttatagtgtatcatcaacaccta 32348005  T
Q  252 atttattta 260  Q
    |||||||||    
T  32348006 atttattta 32348014  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 53 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 32714002 - 32713795
Alignment:
Q  53 aggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattc 152  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| | |||||| |||||| | |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||     
T  32714002 aggcttaattgatctgctggtcctgtaacttatttcttttattcagtttggttccataaatcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttt 32713903  T
Q  153 attcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaa 252  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||         ||||||| |||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32713902 attcaatttggtccaattttgataattttaatcccctaaaaaaagtgaccgttggattacggaggtctataagattttacagtgtatcaccaacacctaa 32713803  T
Q  253 tttattta 260  Q
    ||||||||    
T  32713802 tttattta 32713795  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 54 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 3000911 - 3000705
Alignment:
Q  54 ggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattca 153  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||| || |||||||| ||||||| || |    
T  3000911 ggcttaattgatttgtcggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcccataaatcttaactttctcaaacacctcccttaacttatttctttta 3000812  T
Q  154 ttcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaat 253  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||        ||| |||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3000811 ttcaatttagtccaattttgataattttaatcccctaaaaacacagatcgttggattacgaaggtctatcagattttatagtgtatcactaacacctaat 3000712  T
Q  254 ttattta 260  Q
    |||||||    
T  3000711 ttattta 3000705  T

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Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 54 - 260
Target Start/End: Original strand, 34995352 - 34995557
Alignment:
Q  54 ggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattca 153  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| ||||||| || |    
T  34995352 ggcttaattgatctgtcggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtctcataagtcttaactttctcaaacacgt-ctttaacttatttctttta 34995450  T
Q  154 ttcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaat 253  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||        ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34995451 ttcaatttggtccaattttaataattttaatcccctaaaaaaacagaccgttagattacgaaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacatctaat 34995550  T
Q  254 ttattta 260  Q
    |||||||    
T  34995551 ttattta 34995557  T

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Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 50 - 260
Target Start/End: Original strand, 32712351 - 32712561
Alignment:
Q  50 tttaggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttca 149  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| | |||||||| |||| | |||  ||| ||||||||||| ||||| |||||||     
T  32712351 tttaggtttaattgatctgtcggtcccttaacttatttcttttattcagtttggtcctataaatcttacatttctcaaatacgtctcttaacttatttct 32712450  T
Q  150 ttcattcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacc 249  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||        |||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  32712451 tttattcaatttggtccaattttgataattttaatcccctaaaaaaagagaccgttggattacggaggtctatcaaattttatagtgtaccaccaacacc 32712550  T
Q  250 taatttattta 260  Q
    ||| |||||||    
T  32712551 taacttattta 32712561  T

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Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 53 - 260
Target Start/End: Original strand, 18572884 - 18573090
Alignment:
Q  53 aggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattc 152  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||| ||||||| ||     
T  18572884 aggcttaattgatctgccggtccgttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttcttaaaaacgtcccttaacttatttctttt 18572983  T
Q  153 attcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaa 252  Q
    |||||| |||  ||||||||||||||| |||||| ||        | || ||| |||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||    
T  18572984 attcaaattgggccaattttgataattttaatcccctaaaaaag-acactgttggattacggaggtctatcaaattttacagtgtatcaccaacacataa 18573082  T
Q  253 tttattta 260  Q
    ||||||||    
T  18573083 tttattta 18573090  T

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Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 53 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 29479313 - 29479187
Alignment:
Q  53 aggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattc 152  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||| ||||||| ||     
T  29479313 aggcttaattgatctgccgatcccttaaattatttcttttattcaatctggtcccataagttttaactttctcaatcacgtcctttaacttatttctttt 29479214  T
Q  153 attcaatttgatccaattttgataatt 179  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||    
T  29479213 attcaatttggtccaattttaataatt 29479187  T

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Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 49 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 18574416 - 18574303
Alignment:
Q  49 atttaggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttc 148  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||  |||||||| || |||||||    
T  18574416 attttggcttaattgatctgccggtcccttgacttatttcttttattcaatttggttccataagtcttaactttctcaagcacgtccctgaacttatttc 18574317  T
Q  149 attcattcaatttg 162  Q
     || ||||||||||    
T  18574316 ttttattcaatttg 18574303  T

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Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 198 - 260
Target Start/End: Original strand, 27719879 - 27719941
Alignment:
Q  198 agaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaatttattta 260  Q
    |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27719879 agaccgttggattacggaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaatttattta 27719941  T

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Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 155 - 260
Target Start/End: Original strand, 21094506 - 21094611
Alignment:
Q  155 tcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaatt 254  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||| ||        |||||||| |||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21094506 tcaatttgatccaattttgataactttaatcccctaaaaaaagagaccgttggattacggaggtctactagattttatagtgtatcaccaacacctaatt 21094605  T
Q  255 tattta 260  Q
    ||||||    
T  21094606 tattta 21094611  T

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Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 57 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 19383262 - 19383067
Alignment:
Q  57 ttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattc--at 154  Q
    |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| ||||       |||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||  ||   ||    
T  19383262 ttaattgatccgccggtcccttaacttatttcttttattcaatt-------ataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttattttttttttat 19383170  T
Q  155 tcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaatt 254  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||| | ||        |||||||| |||||    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  19383169 tcaatttgatctaattttgataattttaatgccctaaaaag--agaccgttggattacgatggtctatcagattttatagtgtatca-caacatctaatt 19383073  T

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Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 54 - 128
Target Start/End: Original strand, 29477759 - 29477833
Alignment:
Q  54 ggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaa 128  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||| ||||    
T  29477759 ggcttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtctcataaatcttaacttttgcaaa 29477833  T

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Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 21095337 - 21095291
Alignment:
Q  214 gaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaatttattta 260  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21095337 gaggtctaccagattttatagtgtatcaccaacacctaatttattta 21095291  T

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Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 18574271 - 18574225
Alignment:
Q  214 gaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaatttattta 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  18574271 gaggtctatcagattttatagtgtaccaccaacaccggatttattta 18574225  T

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Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 260
Target Start/End: Original strand, 29477900 - 29477946
Alignment:
Q  214 gaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaatttattta 260  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  29477900 gaggtctaccagattttatggtgtatcaccaacacctgatttattta 29477946  T

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Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 198 - 255
Target Start/End: Original strand, 7628469 - 7628526
Alignment:
Q  198 agaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaattt 255  Q
    ||||||||||||||  ||| |||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  7628469 agaccgttagattatggagatctaccagatttcacagtgtatcaccaacacctaattt 7628526  T

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Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 55 - 122
Target Start/End: Original strand, 19788248 - 19788315
Alignment:
Q  55 gcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaacttt 122  Q
    |||||||| |||||  | |||||||| || ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||    
T  19788248 gcttaattcatctgtcgatcccttaacttgtttcttttattcaatttgatctcataagttttaacttt 19788315  T

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Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 215 - 257
Target Start/End: Original strand, 13561434 - 13561476
Alignment:
Q  215 aggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaatttat 257  Q
    ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  13561434 aggtccatcagatctaatagtgtatcaccaacacctaatttat 13561476  T

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Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 53 - 111
Target Start/End: Original strand, 18497928 - 18497986
Alignment:
Q  53 aggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataa 111  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||| |||||||| ||||||| ||||    
T  18497928 aggcttaattgatctgcggatcccttagattaattctgttatttaaattggtcctataa 18497986  T

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Target: chr5 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 21)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 48 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 13278355 - 13278143
Alignment:
Q  48 aatttaggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattattt 147  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  13278355 aatttaagtttaattgatctgtcggtcccttaatttattttttttattcaatttggtctcataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttattt 13278256  T
Q  148 cattcattcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaaca 247  Q
      ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |        |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13278255 ttttacttcaatttgatccaattttgataattttaatcccatagaaaaagagaccgttggattagggaggtctatcagattttatagtgtatcaccaaca 13278156  T
Q  248 cctaatttattta 260  Q
    |||||||||||||    
T  13278155 cctaatttattta 13278143  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 50 - 260
Target Start/End: Original strand, 12372310 - 12372520
Alignment:
Q  50 tttaggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttca 149  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||      
T  12372310 tttaggcttaattgatctgccggtcccttaacttatttgttttattcaatttggtctcataagtcttaactttctcaaacacgtctcttaacttatttgt 12372409  T
Q  150 ttcattcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacc 249  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||        | |||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12372410 tttattcaatttgatccaattttgataattttaataccctaaaaaaacataccgttggattacgaaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacc 12372509  T
Q  250 taatttattta 260  Q
    |||||||||||    
T  12372510 taatttattta 12372520  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 51 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 19230194 - 19229985
Alignment:
Q  51 ttaggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcat 150  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | ||||| |    
T  19230194 ttaggcttaattgatctgccgatcccttaatttatttcttttattcaatttggtcctataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaactgatttctt 19230095  T
Q  151 tcattcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacct 250  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||        |||||||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |    
T  19230094 ttattcaatttggtccaattttgataattttaatcccctcaaaaaagagaccgttggattacggaggtctatcaaattttatagtgtatcatcaacactt 19229995  T
Q  251 aatttattta 260  Q
    ||||||||||    
T  19229994 aatttattta 19229985  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 56 - 260
Target Start/End: Original strand, 19228840 - 19229044
Alignment:
Q  56 cttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattcatt 155  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||| |||| |||||| | ||||| || |||    
T  19228840 cttaattgatctgccggtcccttaatttatttcttttattcaatttggtcctataagtcttaactttctcaaacacgttccttaactgatttcttttatt 19228939  T
Q  156 caatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaattt 255  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||        |||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19228940 caatttggtccaattttgataattttaatcccctaaaaaaagagaccgttggattacggaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaattt 19229039  T
Q  256 attta 260  Q
    |||||    
T  19229040 attta 19229044  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 53 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 39350764 - 39350562
Alignment:
Q  53 aggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattc 152  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||     
T  39350764 aggcttaattgatatgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttagtcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttt 39350665  T
Q  153 attcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaa 252  Q
    | | |||||| ||||||||| |||||| |||||||||        |||||||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39350664 acttaatttggtccaatttttataattttaatcctctaaaaaaagagaccgttggattacggaggtctatcagattttacagtgtatcaccaacacctaa 39350565  T
Q  253 ttt 255  Q
    |||    
T  39350564 ttt 39350562  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 53 - 257
Target Start/End: Original strand, 18654295 - 18654500
Alignment:
Q  53 aggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattc 152  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||     
T  18654295 aggcttaattgatctgccggtcccttaatttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttt 18654394  T
Q  153 att-caatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacaccta 251  Q
    |||  |||||| |||||||||||| ||| ||||||  |        |||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18654395 attaaaatttggtccaattttgatcattttaatcccattaaaaaagagaccgttggattacggaggtctatcagattttacagtgtatcaccaacaccta 18654494  T
Q  252 atttat 257  Q
    ||||||    
T  18654495 atttat 18654500  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 54 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 6803742 - 6803537
Alignment:
Q  54 ggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattca 153  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||| | ||  ||||| ||||||| || |    
T  6803742 ggcttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttatttaatttggtcacataagtcttaattttctcaaacatgtttcttaacttatttctttta 6803643  T
Q  154 ttcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaat 253  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |        |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6803642 ttcaatttggtccaattttgataattttaatcctttaaaaaaacagaccgttagattaca-aagtctatcagattttatagtgtatcaccaacatctaat 6803544  T
Q  254 ttattta 260  Q
    |||||||    
T  6803543 ttattta 6803537  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 54 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 9083414 - 9083216
Alignment:
Q  54 ggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattca 153  Q
    |||||||||||||||| |||  ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || |||  || |    
T  9083414 ggcttaattgatctgccggtttcttaattcatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttttttatttta 9083315  T
Q  154 ttcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaa 252  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||        |||||||| |||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9083314 ttcaatttggtccaattttgataattttaatcccctaaaaaaggagaccgttggattacgaaggtctataagattttatagtgtatcaccaacacctaa 9083216  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 52 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 18655772 - 18655566
Alignment:
Q  52 taggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcatt 151  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||    
T  18655772 taggcttaattgatctgccggttccttaacttatttcttttattcaatttggtcacataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaatttatttcttt 18655673  T
Q  152 cattcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacaccta 251  Q
     |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||        ||||||||  ||||   | |||||||||||||||  ||||||||||||||  ||    
T  18655672 tattcaatttggtccaactttgataattttaatcccctaaaaaaagagaccgttgaattacgaaagtctatcagattttacggtgtatcaccaacaatta 18655573  T
Q  252 atttatt 258  Q
    |||||||    
T  18655572 atttatt 18655566  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 52 - 256
Target Start/End: Original strand, 9081977 - 9082181
Alignment:
Q  52 taggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcatt 151  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||||| | |||||||||||| |||||| | |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||    
T  9081977 taggcttaattgatctaccggttccttaactcatttcttttattcaatttgattccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttt 9082076  T
Q  152 cattcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacaccta 251  Q
     |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||        |||||||| ||| |  || ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||    
T  9082077 tattcaatttggtccaattttgataattttaatcccctagaaaatgagaccgttggatcacggatgtctatcagattttatagtatatcgctaacaccta 9082176  T
Q  252 attta 256  Q
    |||||    
T  9082177 attta 9082181  T

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Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 50 - 186
Target Start/End: Original strand, 13276815 - 13276951
Alignment:
Q  50 tttaggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttca 149  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||| | |||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||     
T  13276815 tttaggcttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcctataaatcttaattttctcaaacacgtcccttaacttatttct 13276914  T
Q  150 ttcattcaatttgatccaattttgataattataatcc 186  Q
    || |||||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  13276915 tttattcaatttggtcaaattttgataattttaatcc 13276951  T

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Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 54 - 260
Target Start/End: Original strand, 39349480 - 39349686
Alignment:
Q  54 ggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattca 153  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||| ||||| |||||| |||| ||||||| || |    
T  39349480 ggcttaattgatctgacggtcctttaacttatttcttttattcaatttggttccataactcttaactttctcaaacacgtcctttaacttatttctttta 39349579  T
Q  154 ttcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaat 253  Q
     |||||||| | ||||||| |||||| |||||| ||         ||||||| |||||  ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  39349580 ctcaatttggttcaatttttataattttaatcccctaaaaaaagtgaccgtttgattacggaggtctattagattttatcgtggatcaccaacacctaat 39349679  T
Q  254 ttattta 260  Q
    |||||||    
T  39349680 ttattta 39349686  T

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Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 54 - 162
Target Start/End: Original strand, 8447077 - 8447185
Alignment:
Q  54 ggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattca 153  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| || |    
T  8447077 ggcttaattgatctaccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttta 8447176  T
Q  154 ttcaatttg 162  Q
    |||||||||    
T  8447177 ttcaatttg 8447185  T

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Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 53 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 12373840 - 12373708
Alignment:
Q  53 aggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattc 152  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||  ||     
T  12373840 aggcttaattgatccgccggtcctttaacttatttcttttattcaatttagtcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttatttt 12373741  T
Q  153 attcaatttgatccaattttgataattataatc 185  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  12373740 attcaatttggtccaattttgataattttaatc 12373708  T

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Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 50 - 260
Target Start/End: Original strand, 39164057 - 39164260
Alignment:
Q  50 tttaggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttca 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||     ||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||     
T  39164057 tttaggcttaattgatctgctggtccattaactt-----ttttattcaatttagtctcataagtcttaactttatcaaacacgtcccttaacttatttct 39164151  T
Q  150 ttcattcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacc 249  Q
    || |||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||        |||| |||  ||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39164152 tttattcaatttggtccaattttgat-attttaatcc-cttaaaaaaaagactgttgaattacggaggcctatcaaattttatagtgtatcaccaacacc 39164249  T
Q  250 taatttattta 260  Q
    |||||||||||    
T  39164250 taatttattta 39164260  T

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Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 52 - 148
Target Start/End: Original strand, 6801972 - 6802068
Alignment:
Q  52 taggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttc 148  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  6801972 taggtttaattgatctgctggtcccttaacttatttcttttttttaatttggtctcataagtcttaattttctcaaacacgtcccttaacttatttc 6802068  T

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Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 136 - 257
Target Start/End: Original strand, 4031903 - 4032024
Alignment:
Q  136 cttaaattatttcattcattcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagt 235  Q
    ||||| ||||||| || |||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||        ||||||||  ||||  || ||||| |||||||||||||    
T  4031903 cttaacttatttcttttattcaatttagtccaattttgataattttaatccactaaaaaaagagaccgttgaattacggaagtctaccagattttatagt 4032002  T
Q  236 gtatcaccaacacctaatttat 257  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  4032003 gtatcaccaacacctaatttat 4032024  T

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Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 50 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 35952558 - 35952468
Alignment:
Q  50 tttaggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaa 140  Q
    ||||||||||| |||||||   |||| |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||| |||||  ||||||||||    
T  35952558 tttaggcttaactgatctgtcagtcctttaacttatttcttttattcaatttggtctcataaatcttaactttgtcaaacgcgtcccttaa 35952468  T

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Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 217 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 12373672 - 12373629
Alignment:
Q  217 gtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaatttattta 260  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  12373672 gtctatcagattttacactgtatcaccaacacctaatttattta 12373629  T

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Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 198 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 4032999 - 4032937
Alignment:
Q  198 agaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaatttattta 260  Q
    |||||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||    
T  4032999 agaccgttggattacggaggtctatcagattttataatgtatcattaacacctagtttattta 4032937  T

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Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 106
Target Start/End: Original strand, 4031881 - 4031933
Alignment:
Q  54 ggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcc 106  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  4031881 ggcttaattgatctgccggtcacttaacttatttcttttattcaatttagtcc 4031933  T

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Target: scaffold0878 (Bit Score: 101; Significance: 6e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0878
Description:

Target: scaffold0878; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 52 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 3147 - 2938
Alignment:
Q  52 taggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcatt 151  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||    
T  3147 taggcttaattgatctgccagtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttctcagacacgtcccttaacttatttcttt 3048  T
Q  152 cattcaatttgatccaattttgataattataatcc-tctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacct 250  Q
     |||||||||| |||||||||||||||| ||||||            ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3047 tattcaatttggtccaattttgataattttaatccaaaaaaaaaaacagaccgttagattacgaaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacct 2948  T
Q  251 aatttattta 260  Q
    ||||||||||    
T  2947 aatttattta 2938  T

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Target: scaffold0878; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 260
Target Start/End: Original strand, 1847 - 1974
Alignment:
Q  132 gtcccttaaattatttcattcattcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagatttta 231  Q
    ||||||||| ||||||| || |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||          |||||||||||||||   | |||||| |||||||     
T  1847 gtcccttaacttatttcttttattcaatttggtccaatttt-ataattttaatccaaaaaaaatatagaccgttagattacgaatgtctattagattttc 1945  T
Q  232 tagtgtatcaccaacacctaatttattta 260  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1946 cagtgtatcaccaacacctaatttattta 1974  T

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Target: scaffold1425 (Bit Score: 99; Significance: 9e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold1425
Description:

Target: scaffold1425; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 53 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 1720 - 1513
Alignment:
Q  53 aggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattc 152  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||| |||| ||||||| ||     
T  1720 aggcttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggttccataagtcttaactttctcaaacacgtcctttaatttatttccttt 1621  T
Q  153 attcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaa 252  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |        |||||||| ||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||    
T  1620 attcaatttggtccaattttgataattttaatcccttaaaaaaacagaccgttggattatagaggtctatcagattttacggtgtataaccaacacctaa 1521  T
Q  253 tttattta 260  Q
    ||| ||||    
T  1520 ttttttta 1513  T

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Target: scaffold1425; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 52 - 255
Target Start/End: Original strand, 132 - 335
Alignment:
Q  52 taggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcatt 151  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||| ||||||| ||    
T  132 taggcttaattgatctgccagtcccttaacttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcctttaatttatttcctt 231  T
Q  152 cattcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacaccta 251  Q
     |||||||||| || ||||||||||||| |||| |  |        |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  232 tattcaatttggtcaaattttgataattttaattccttaaaaaaagagaccgttggattacagaggtctatcagattttacagcgtatcaccaacaccta 331  T
Q  252 attt 255  Q
    ||||    
T  332 attt 335  T

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Target: scaffold0141 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 54 - 255
Target Start/End: Original strand, 31033 - 31234
Alignment:
Q  54 ggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattca 153  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||||| || |    
T  31033 ggcttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtctcataagtcttaactttctcaaacacgtccctcaacttatttctttta 31132  T
Q  154 ttcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaat 253  Q
     |||||||| |||| |||| |||||| |||||| ||        |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31133 ctcaatttggtccagtttttataattttaatcccctaaaaaaacagaccgttggattacggaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaat 31232  T
Q  254 tt 255  Q
    ||    
T  31233 tt 31234  T

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Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 54 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 35403 - 35202
Alignment:
Q  54 ggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattca 153  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||||| || |    
T  35403 ggcttaattgatctggcggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttctcaaacacgtccctcaacttatttctttta 35304  T
Q  154 ttcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaat 253  Q
     |||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||        |||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35303 ctcaatttggtccaatttttataattttaatcccctaaaaaaacagaccgttggattacggaggtctatcagattttacagtgtatcaccaacacctaat 35204  T
Q  254 tt 255  Q
    ||    
T  35203 tt 35202  T

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Target: scaffold0049 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 54 - 255
Target Start/End: Original strand, 79409 - 79610
Alignment:
Q  54 ggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattca 153  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||||| || |    
T  79409 ggcttaattgatctggcggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttctcaaacacgtccctcaacttatttctttta 79508  T
Q  154 ttcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaat 253  Q
     |||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||        |||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  79509 ctcaatttggtccaatttttataattttaatcccctaaaaaaacagaccgttggattacggaggtctatcagattttacagtgtatcaccaacacctaat 79608  T
Q  254 tt 255  Q
    ||    
T  79609 tt 79610  T

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Target: scaffold0049; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 54 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 83779 - 83578
Alignment:
Q  54 ggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattca 153  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||||| || |    
T  83779 ggcttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtctcataagtcttaactttctcaaacacgtccctcaacttatttctttta 83680  T
Q  154 ttcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnntagaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaat 253  Q
     |||||||| |||| |||| |||||| |||||| ||        |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  83679 ctcaatttggtccagtttttataattttaatcccctaaaaaaacagaccgttggattacggaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaat 83580  T
Q  254 tt 255  Q
    ||    
T  83579 tt 83578  T

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Target: scaffold0018 (Bit Score: 79; Significance: 8e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 54 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 25463 - 25256
Alignment:
Q  54 ggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttcattca 153  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| || |    
T  25463 ggcttaattgatctgccgctcccttaacttatttcttttattcaatttggtcacataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaatttatttctttta 25364  T
Q  154 ttcaatttgatccaattttgataattataatcctctnnnnnnnta-gaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaa 252  Q
    || |||||| |||||||||||||||| ||||| | |        | ||| ||| |||||  ||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||    
T  25363 ttaaatttggtccaattttgataattttaatcatttaaaacaagaggacagttggattacggaggtttatcacattttatagtgtattatcaacacctaa 25264  T
Q  253 tttattta 260  Q
    ||||||||    
T  25263 tttattta 25256  T

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Target: scaffold0026 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 49 - 160
Target Start/End: Original strand, 104296 - 104407
Alignment:
Q  49 atttaggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaactttttcaaatacgtcccttaaattatttc 148  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||    
T  104296 atttaggcttaattgatttgacggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagttttaacattctcaaacacgtcccttaacttatttc 104395  T
Q  149 attcattcaatt 160  Q
     || ||||||||    
T  104396 ttttattcaatt 104407  T

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Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 260
Target Start/End: Original strand, 104411 - 104457
Alignment:
Q  214 gaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaatttattta 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  104411 gaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacatctaatttattta 104457  T

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Target: scaffold0349 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 198 - 260
Target Start/End: Original strand, 9301 - 9363
Alignment:
Q  198 agaccgttagattagagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaatttattta 260  Q
    |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9301 agaccgttggattacggaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaatttattta 9363  T

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Target: scaffold0081 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 215 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 42967 - 42923
Alignment:
Q  215 aggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaatttattt 259  Q
    ||||| || |||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  42967 aggtccatgagatttaacagtgtatcaccaacacctaatttattt 42923  T

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Target: scaffold0035 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 50 - 118
Target Start/End: Original strand, 21132 - 21200
Alignment:
Q  50 tttaggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaa 118  Q
    ||||||||||||||| |  | |||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||| |||| ||||    
T  21132 tttaggcttaattgaacgcccggtcccttaacttaattcttttattcaaattggtcccaaaagtattaa 21200  T

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Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 22587 - 22523
Alignment:
Q  54 ggcttaattgatctgctggtcccttaaattatttcttttatttaatttggtcccataagttttaa 118  Q
    ||||||||||| |  | |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  22587 ggcttaattgaacacccggtcccttaacttaattcttttatttaaattggtcccaaaagtattaa 22523  T

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