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Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF16112_high_1 (Length: 845)

Name: NF16112_high_1
Description: NF16112
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF16112_high_1
NF16112_high_1
[»] chr4 (1 HSPs)
chr4 (1-834)||(54013680-54014508)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 786; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 786; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 834
Target Start/End: Complemental strand, 54014508 - 54013680
Alignment:
Q  1 catcattcatctccggtaccaacgcctttaaccggtgagattctcagatcttcaatttaactttttaagccttatcacatggattatgtttttggaaact 100  Q
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T  54014508 catcattcatctccggtaccaacgcctttaaccggtgagattctcagatcttcaatttaactttttaagccttatcacatggattatgtttttggaaact 54014409  T
Q  101 gtctatttatacagccatagaggaagaccagttgcatatttattccggttcatgaaccatgatacctccatgtgtttactatttactttatccacacgat 200  Q
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T  54014408 gtctatttataaagccataaaggaagaccagttacatatttattccggttcatgaaccatgatacctccatgtgtttactatttactttatccacacgat 54014309  T
Q  201 caattaatcagagtaaacatttttacacacgcatctaattaaattacacaatgatatcgttttcttaaatttattgttaaaatatgtacataaatatcta 300  Q
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T  54014308 caattaatcagagtaaacatttttacacacgcatctaattaaattacacaatgatatcgttttcttaaatttattgttaaaatatgttcataaatatcta 54014209  T
Q  301 tctgattatatggttagatgtgattgaatacacgtgtaattttttgaccgaccctatattagaataggacctatcctatattggaacctattctatactc 400  Q
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T  54014208 tatgattatatggttagatgtgattgaatacacgtgtaattttttgaccgaccctatattagaataggaccgatcctatattggaacctattctatactc 54014109  T
Q  401 cttccaaactacatgtaaatattgtattggtgattaagcatgactttgtattggtgcagctggaaatgcaacatttttggaacatctaattttgatggca 500  Q
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T  54014108 cttccaaactacatgtaaatattgtattggtgattaagcatgactttgtattggtgcagctggaaatgcaacatttttggaacatctaattttgatggca 54014009  T
Q  501 gtgattggaatacctatctttggggcttcaatgatgggatatggatccggaagtttggtatacggctatgttttgatttttgattttctaagatgcttgg 600  Q
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T  54014008 gtgattggaatacctatctttggggcttcaatgatgggatatggatccggaagtttggtatacggctatgttttgatttttgattttctaagatgcttgg 54013909  T
Q  601 gtcattgcaacgttgaaataatcccacacaaattgttcaaggcatttccatttcttagatatgtgatatacacaccaacgtaagtttattaaaatttaca 700  Q
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T  54013908 gtcattgcaacgttgaaataatcccacacaaattgttcaaggcatttccatttcttagatatgtgatacacacaccaacgtaagtttattaaaatttaca 54013809  T
Q  701 tttacatttgtccaaaatttagattacagttaatgcacccttgaggttgagtaacaaaacaaagtacgaatctctcttacttacactcattacttgttca 800  Q
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T  54013808 tttacatttgtccaaaatttagattacagttaatgcacccttgaggttgagtaa-----caaagtacgaatctctcttacttacactcattacttgttca 54013714  T
Q  801 attgtcagacacataaaatagccccctcattcat 834  Q
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T  54013713 attgtcagacacataaaatagccccctcattcat 54013680  T

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