View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF16113_high_2 (Length: 352)

Name: NF16113_high_2
Description: NF16113
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF16113_high_2
NF16113_high_2
[»] chr7 (25 HSPs)
chr7 (12-329)||(10000307-10000625)
chr7 (12-329)||(16418498-16418816)
chr7 (14-209)||(15950730-15950927)
chr7 (11-209)||(15760050-15760250)
chr7 (14-209)||(13758490-13758687)
chr7 (14-209)||(18979960-18980157)
chr7 (11-209)||(14250834-14251034)
chr7 (41-209)||(7822848-7823018)
chr7 (41-209)||(7830159-7830329)
chr7 (41-209)||(27101603-27101773)
chr7 (41-209)||(27108951-27109121)
chr7 (41-209)||(27176553-27176723)
chr7 (41-209)||(38783695-38783865)
chr7 (14-209)||(15927688-15927885)
chr7 (12-192)||(48622603-48622783)
chr7 (43-97)||(13572910-13572964)
chr7 (30-160)||(13910975-13911106)
chr7 (30-96)||(16478913-16478979)
chr7 (30-97)||(10989643-10989710)
chr7 (191-285)||(371132-371227)
chr7 (30-99)||(2437689-2437758)
chr7 (118-235)||(13321107-13321227)
chr7 (11-76)||(18253779-18253844)
chr7 (32-76)||(15862174-15862218)
chr7 (276-329)||(15760317-15760370)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (12-329)||(7210-7528)
[»] chr2 (24 HSPs)
chr2 (12-329)||(5888567-5888885)
chr2 (14-329)||(23774137-23774453)
chr2 (11-209)||(23777981-23778181)
chr2 (12-185)||(21142040-21142214)
chr2 (14-209)||(8943966-8944163)
chr2 (14-209)||(12641581-12641778)
chr2 (14-209)||(12728512-12728709)
chr2 (14-209)||(34824595-34824792)
chr2 (32-209)||(3798560-3798739)
chr2 (14-209)||(12635807-12636004)
chr2 (14-209)||(42177908-42178105)
chr2 (14-192)||(16935731-16935910)
chr2 (14-192)||(17006391-17006570)
chr2 (41-209)||(11231304-11231474)
chr2 (41-209)||(22513151-22513321)
chr2 (41-209)||(24685747-24685917)
chr2 (41-209)||(28775773-28775943)
chr2 (30-97)||(19886612-19886679)
chr2 (191-268)||(15633273-15633351)
chr2 (191-268)||(28031356-28031434)
chr2 (191-268)||(17204391-17204469)
chr2 (191-268)||(24826836-24826914)
chr2 (191-268)||(25213108-25213186)
chr2 (276-329)||(21141895-21141948)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (14-329)||(6598-6914)
[»] chr1 (17 HSPs)
chr1 (14-329)||(22035448-22035764)
chr1 (14-329)||(7640873-7641189)
chr1 (41-209)||(18059724-18059894)
chr1 (14-209)||(17148687-17148884)
chr1 (191-329)||(20254312-20254451)
chr1 (31-192)||(46523527-46523689)
chr1 (41-209)||(17004758-17004928)
chr1 (33-209)||(38055049-38055227)
chr1 (41-192)||(19962465-19962617)
chr1 (14-97)||(22228042-22228125)
chr1 (14-97)||(22232739-22232822)
chr1 (191-285)||(21650157-21650252)
chr1 (43-97)||(5072352-5072406)
chr1 (43-97)||(18601082-18601136)
chr1 (31-80)||(45051673-45051722)
chr1 (30-93)||(2116492-2116555)
chr1 (280-324)||(46523394-46523438)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (14-329)||(23688-24004)
[»] chr6 (28 HSPs)
chr6 (14-329)||(29869715-29870031)
chr6 (11-209)||(1556125-1556325)
chr6 (32-209)||(18086780-18086959)
chr6 (14-209)||(16232012-16232209)
chr6 (14-209)||(23977889-23978086)
chr6 (41-209)||(22225704-22225874)
chr6 (15-209)||(13620734-13620930)
chr6 (41-209)||(10488819-10488989)
chr6 (41-209)||(16376339-16376509)
chr6 (41-209)||(16383663-16383833)
chr6 (14-187)||(19610161-19610335)
chr6 (41-209)||(16556105-16556275)
chr6 (41-209)||(16632661-16632831)
chr6 (41-192)||(19299375-19299527)
chr6 (41-156)||(22251532-22251648)
chr6 (30-97)||(16825703-16825770)
chr6 (30-96)||(1650056-1650122)
chr6 (41-107)||(25175787-25175853)
chr6 (47-192)||(29666011-29666157)
chr6 (191-268)||(32276881-32276959)
chr6 (191-285)||(19629373-19629468)
chr6 (30-97)||(27653934-27654001)
chr6 (225-268)||(16300133-16300176)
chr6 (196-269)||(18823510-18823584)
chr6 (280-329)||(19610018-19610067)
chr6 (191-269)||(18839360-18839439)
chr6 (191-268)||(4991132-4991210)
chr6 (149-235)||(27740931-27741019)
[»] chr5 (34 HSPs)
chr5 (14-329)||(23328558-23328874)
chr5 (14-327)||(24616165-24616478)
chr5 (14-327)||(24712541-24712854)
chr5 (14-327)||(24745559-24745872)
chr5 (11-209)||(23514681-23514881)
chr5 (14-329)||(35791037-35791355)
chr5 (14-209)||(10777909-10778106)
chr5 (14-192)||(7425462-7425641)
chr5 (14-192)||(11212004-11212183)
chr5 (14-209)||(1219459-1219656)
chr5 (14-186)||(17471527-17471700)
chr5 (41-209)||(21932347-21932517)
chr5 (41-209)||(21938517-21938687)
chr5 (41-209)||(22883050-22883220)
chr5 (41-209)||(35582156-35582326)
chr5 (41-209)||(36989736-36989906)
chr5 (30-97)||(18777943-18778010)
chr5 (43-97)||(27010075-27010129)
chr5 (30-97)||(12608-12675)
chr5 (30-97)||(25426862-25426929)
chr5 (30-97)||(19500133-19500200)
chr5 (30-97)||(21073546-21073613)
chr5 (30-97)||(22366432-22366499)
chr5 (191-268)||(7528960-7529038)
chr5 (30-99)||(4199936-4200005)
chr5 (41-97)||(43443357-43443413)
chr5 (191-265)||(17909568-17909643)
chr5 (30-96)||(29188235-29188301)
chr5 (191-268)||(108950-109028)
chr5 (191-268)||(9730500-9730578)
chr5 (191-268)||(16105703-16105781)
chr5 (276-329)||(11212268-11212321)
chr5 (280-329)||(7425324-7425373)
chr5 (136-184)||(32950840-32950888)
[»] chr4 (28 HSPs)
chr4 (14-329)||(26339020-26339336)
chr4 (14-329)||(22352003-22352302)
chr4 (12-329)||(22738269-22738588)
chr4 (14-329)||(17145596-17145913)
chr4 (14-209)||(18169090-18169287)
chr4 (13-192)||(19020624-19020804)
chr4 (14-209)||(7132004-7132201)
chr4 (41-181)||(18248367-18248508)
chr4 (14-209)||(20000843-20001040)
chr4 (14-192)||(15287184-15287363)
chr4 (14-192)||(15294293-15294472)
chr4 (30-97)||(10644453-10644520)
chr4 (118-192)||(8374646-8374720)
chr4 (30-97)||(47357888-47357955)
chr4 (191-285)||(14996170-14996265)
chr4 (191-285)||(19697490-19697585)
chr4 (191-285)||(19708075-19708170)
chr4 (191-268)||(14500334-14500412)
chr4 (191-268)||(16522878-16522956)
chr4 (41-97)||(8378385-8378441)
chr4 (191-268)||(9295754-9295832)
chr4 (276-329)||(15287448-15287501)
chr4 (276-329)||(15294557-15294610)
chr4 (224-267)||(32460847-32460890)
chr4 (138-192)||(40885626-40885679)
chr4 (276-329)||(8374508-8374561)
chr4 (276-329)||(18248218-18248271)
chr4 (224-268)||(9795276-9795320)
[»] chr3 (28 HSPs)
chr3 (14-329)||(12264731-12265049)
chr3 (11-192)||(12902026-12902208)
chr3 (14-209)||(18911113-18911310)
chr3 (32-209)||(25058859-25059038)
chr3 (12-185)||(44229130-44229304)
chr3 (41-209)||(49232556-49232726)
chr3 (14-186)||(15468279-15468452)
chr3 (14-186)||(22275353-22275526)
chr3 (41-209)||(1467705-1467875)
chr3 (11-209)||(5228433-5228632)
chr3 (41-209)||(12811961-12812131)
chr3 (14-161)||(18896983-18897131)
chr3 (32-97)||(41270309-41270374)
chr3 (12-192)||(54651595-54651776)
chr3 (30-97)||(16821373-16821440)
chr3 (191-269)||(19946757-19946836)
chr3 (43-97)||(55316453-55316507)
chr3 (196-268)||(14285021-14285094)
chr3 (191-265)||(11477308-11477383)
chr3 (191-285)||(16934091-16934186)
chr3 (30-80)||(15615084-15615134)
chr3 (11-76)||(15936571-15936636)
chr3 (11-76)||(15938413-15938478)
chr3 (276-329)||(44228985-44229038)
chr3 (191-285)||(8268862-8268957)
chr3 (191-285)||(8275962-8276057)
chr3 (191-268)||(9303217-9303295)
chr3 (136-192)||(11986236-11986292)
[»] chr8 (25 HSPs)
chr8 (14-209)||(13720867-13721064)
chr8 (14-209)||(22006197-22006394)
chr8 (14-209)||(16872990-16873187)
chr8 (14-329)||(16195230-16195548)
chr8 (41-209)||(271326-271496)
chr8 (41-209)||(644424-644594)
chr8 (41-209)||(830159-830329)
chr8 (14-209)||(13662204-13662401)
chr8 (11-209)||(22088730-22088930)
chr8 (41-209)||(15319125-15319295)
chr8 (41-209)||(15499494-15499664)
chr8 (43-97)||(21844536-21844590)
chr8 (43-97)||(21851929-21851983)
chr8 (30-96)||(24549216-24549282)
chr8 (42-97)||(30120956-30121011)
chr8 (30-96)||(6774209-6774275)
chr8 (191-268)||(22147498-22147576)
chr8 (43-96)||(16674356-16674409)
chr8 (191-268)||(22886387-22886464)
chr8 (191-269)||(2545005-2545084)
chr8 (191-285)||(3431398-3431493)
chr8 (224-268)||(21494600-21494644)
chr8 (282-329)||(13662474-13662521)
chr8 (191-285)||(18612449-18612544)
chr8 (191-285)||(18619354-18619449)
[»] scaffold0023 (3 HSPs)
scaffold0023 (14-209)||(153946-154143)
scaffold0023 (30-97)||(169863-169930)
scaffold0023 (30-98)||(36326-36394)
[»] scaffold0191 (2 HSPs)
scaffold0191 (14-185)||(7395-7567)
scaffold0191 (276-329)||(7659-7712)
[»] scaffold1500 (1 HSPs)
scaffold1500 (14-209)||(1453-1650)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (14-209)||(1514-1711)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (12-192)||(54013-54193)
[»] scaffold0467 (1 HSPs)
scaffold0467 (15-209)||(10279-10475)
[»] scaffold0107 (2 HSPs)
scaffold0107 (41-209)||(31429-31599)
scaffold0107 (42-209)||(39766-39935)
[»] scaffold0076 (2 HSPs)
scaffold0076 (41-209)||(39223-39393)
scaffold0076 (41-97)||(43231-43287)
[»] scaffold0892 (1 HSPs)
scaffold0892 (12-192)||(3552-3732)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (32-186)||(2536-2691)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (41-209)||(29282-29452)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (12-209)||(34095-34294)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (30-235)||(3056-3263)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (43-97)||(64487-64541)
scaffold0026 (11-76)||(108001-108066)
[»] scaffold0516 (1 HSPs)
scaffold0516 (14-97)||(12066-12149)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (14-160)||(3892-4039)
[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (30-93)||(9300-9363)
scaffold0215 (30-93)||(16198-16261)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (43-97)||(269-323)
[»] scaffold0066 (3 HSPs)
scaffold0066 (47-192)||(45168-45314)
scaffold0066 (47-329)||(54416-54700)
scaffold0066 (276-329)||(45011-45064)
[»] scaffold1666 (1 HSPs)
scaffold1666 (109-209)||(31-132)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (30-99)||(21067-21136)
scaffold0139 (30-77)||(14013-14060)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (30-98)||(31626-31694)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (14-97)||(5151-5234)
[»] scaffold1711 (1 HSPs)
scaffold1711 (43-97)||(1268-1322)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (191-285)||(11788-11882)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (14-99)||(10687-10772)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (41-96)||(13287-13342)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (191-265)||(17761-17836)
[»] scaffold0173 (1 HSPs)
scaffold0173 (191-285)||(5264-5359)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (198-268)||(49972-50043)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (191-268)||(5698-5776)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (191-268)||(165083-165161)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (191-267)||(34530-34607)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (191-268)||(130616-130694)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (136-192)||(56169-56225)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (199-268)||(13409-13479)
[»] scaffold0615 (1 HSPs)
scaffold0615 (197-265)||(6339-6408)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 271; Significance: 1e-151; HSPs: 25)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 12 - 329
Target Start/End: Original strand, 10000307 - 10000625
Alignment:
Q  12 tcatcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10000307 tcatcataatcaatttcaaattttgcatcttctcatgttgtataaaaatgggttgatgaacaatttatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt 10000406  T
Q  112 cttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatgat 210  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10000407 cttatacatgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaaattttgcttaattgatgat 10000506  T
Q  211 ttgtgataagttgtgttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttgacaaaacatgttgttgtgagtgaataataacttgggtatata 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||      
T  10000507 ttgtgataagttgtgttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgctgttgacaaaacatgttgttgtgagtgaattataacttgggtatact 10000606  T
Q  311 taattatggattgatgatg 329  Q
    |||||||||||||||||||    
T  10000607 taattatggattgatgatg 10000625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 12 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 16418816 - 16418498
Alignment:
Q  12 tcatcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  16418816 tcatcataatcaatttcaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgctgttg 16418717  T
Q  112 cttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatgat 210  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  16418716 cttatacatgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaaattttgcctaattaatgat 16418617  T
Q  211 ttgtgataagttgtgttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttgacaaaacatgttgttgtgagtgaataataacttgggtatata 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| |    
T  16418616 ttgtgataagttgtgttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttgacaaaccatgttgttgtgagtgaattatgacttgggtataca 16418517  T
Q  311 taattatggattgatgatg 329  Q
    |||||||||||||||||||    
T  16418516 taattatggattgatgatg 16418498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 209
Target Start/End: Original strand, 15950730 - 15950927
Alignment:
Q  14 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttg-ttgtttc 112  Q
    ||||||||||  | ||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | || || |  ||||    
T  15950730 atcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttc 15950829  T
Q  113 ttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 209  Q
    || | |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||    
T  15950830 ttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 15950927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 11 - 209
Target Start/End: Original strand, 15760050 - 15760250
Alignment:
Q  11 atcatcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttg-ttgt 109  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | || || |  |    
T  15760050 atcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattattgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctatt 15760149  T
Q  110 ttcttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatg 208  Q
    ||||| | |||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| | |||||||||||    
T  15760150 ttcttgtgcatgaattgatgattatgatatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatg 15760249  T
Q  209 a 209  Q
    |    
T  15760250 a 15760250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 13758687 - 13758490
Alignment:
Q  14 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-c 112  Q
    ||||||||||  | ||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |  ||||||||||||||||| |  |||| ||| |    
T  13758687 atcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgctcttgttgtaatgttattttc 13758588  T
Q  113 ttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 209  Q
    || | |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| | ||||||||||||    
T  13758587 ttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatga 13758490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 209
Target Start/End: Original strand, 18979960 - 18980157
Alignment:
Q  14 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttg-ttgtttc 112  Q
    ||||||||||  | ||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | || || |  ||||    
T  18979960 atcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttc 18980059  T
Q  113 ttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 209  Q
    || | |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| | ||||||||||||    
T  18980060 ttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatga 18980157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 209
Target Start/End: Original strand, 14250834 - 14251034
Alignment:
Q  11 atcatcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgtt 110  Q
    |||||| ||||||  ||||  ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |  || | ||    
T  14250834 atcatcgtaatcatgttcattttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgttgtaatgctatt 14250933  T
Q  111 t-cttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatg 208  Q
    | ||| | |||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| | |||||||||||    
T  14250934 ttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttttgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatg 14251033  T
Q  209 a 209  Q
    |    
T  14251034 a 14251034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 41 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 7823018 - 7822848
Alignment:
Q  41 ttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-cttatacatgaattgattgttatggtat 139  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| | || || | ||| ||| | | |||||||||  |||||||||    
T  7823018 ttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtat 7822919  T
Q  140 gtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 209  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||    
T  7822918 gtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 7822848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 41 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 7830329 - 7830159
Alignment:
Q  41 ttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-cttatacatgaattgattgttatggtat 139  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| | || || | ||| ||| | | |||||||||  |||||||||    
T  7830329 ttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtat 7830230  T
Q  140 gtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 209  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||    
T  7830229 gtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 7830159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 41 - 209
Target Start/End: Original strand, 27101603 - 27101773
Alignment:
Q  41 ttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-cttatacatgaattgattgttatggtat 139  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| | || || | ||| ||| | | |||||||||  |||||||||    
T  27101603 ttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtat 27101702  T
Q  140 gtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 209  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||    
T  27101703 gtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 27101773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 41 - 209
Target Start/End: Original strand, 27108951 - 27109121
Alignment:
Q  41 ttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-cttatacatgaattgattgttatggtat 139  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| | || || | ||| ||| | | |||||||||  |||||||||    
T  27108951 ttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtat 27109050  T
Q  140 gtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 209  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||    
T  27109051 gtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 27109121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 41 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 27176723 - 27176553
Alignment:
Q  41 ttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-cttatacatgaattgattgttatggtat 139  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| | || || | ||| ||| | | |||||||||  |||||||||    
T  27176723 ttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtat 27176624  T
Q  140 gtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 209  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||    
T  27176623 gtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 27176553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 41 - 209
Target Start/End: Original strand, 38783695 - 38783865
Alignment:
Q  41 ttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-cttatacatgaattgattgttatggtat 139  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| | || || | ||| ||| | | |||||||||  |||||||||    
T  38783695 ttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtat 38783794  T
Q  140 gtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 209  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||    
T  38783795 gtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 38783865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 15927885 - 15927688
Alignment:
Q  14 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-c 112  Q
    ||||||||||  | ||| ||||| || ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||  ||  ||||||||||||||||| || || | ||| |    
T  15927885 atcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgatcaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttc 15927786  T
Q  113 ttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 209  Q
    || | |||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| | ||||||||||||    
T  15927785 ttgtgcatgaattgatgattatggtatgcttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatga 15927688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 192
Target Start/End: Original strand, 48622603 - 48622783
Alignment:
Q  12 tcatcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttg-ttgtt 110  Q
    |||||||||||||||  || ||||| || |||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||  | || || |  ||    
T  48622603 tcatcataatcaattcaaatttttgcattttctcatgttttacgaaaatgggttgatgaacaattgatgctaaattcgtgctcttactgtgatgatattt 48622702  T
Q  111 tcttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaa 192  Q
    |||| | |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||| |||| ||| ||||||||||    
T  48622703 tcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacat-gttcaaagcatgcataattgttaagttgtgaa 48622783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 43 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 13572964 - 13572910
Alignment:
Q  43 ctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 97  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13572964 ctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 13572910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 160
Target Start/End: Original strand, 13910975 - 13911106
Alignment:
Q  30 aattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgt-ttcttatacatgaattgat 128  Q
    ||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || |||| | ||  ||| |||||||||||    
T  13910975 aattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgat 13911074  T
Q  129 tgttatggtatgtttgtggatgaaattacatg 160  Q
      | || ||||| |||| | ||||||||||||    
T  13911075 gttaattgtatgattgttggtgaaattacatg 13911106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 96
Target Start/End: Original strand, 16478913 - 16478979
Alignment:
Q  30 aattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctctt 96  Q
    ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  16478913 aattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgttagattcgtgctctt 16478979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 10989710 - 10989643
Alignment:
Q  30 aattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 97  Q
    ||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  10989710 aattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaaatcatgctaaattcgtgctcttg 10989643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 371227 - 371132
Alignment:
Q  191 aattttgcttaattgatgatttgtgataagttgt-gttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttgacaaaacatgttgttgt 285  Q
    |||| |||||||||||||| || ||| | ||||| |||||||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||||| | | ||||||||||||    
T  371227 aattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattaaggtgagaatcaagtttcgattgatgttgttgttgccgagacatgttgttgt 371132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 2437758 - 2437689
Alignment:
Q  30 aattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgtt 99  Q
    ||||||| || ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  2437758 aattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggataatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgtt 2437689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 13321227 - 13321107
Alignment:
Q  118 catgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatgatttgtga 216  Q
    |||||||||||  | || ||||| |||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||| ||||| ||| || ||     
T  13321227 catgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgtcaagttatgaaattgtgctcaattggtgaattttgc 13321128  T
Q  217 taagttg--tgttgaattgag 235  Q
    |||||||  ||||||||||||    
T  13321127 taagttgattgttgaattgag 13321107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 76
Target Start/End: Original strand, 18253779 - 18253844
Alignment:
Q  11 atcatcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaatt 76  Q
    ||||| |||||||  ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18253779 atcattataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaatt 18253844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 15862218 - 15862174
Alignment:
Q  32 ttttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaatt 76  Q
    ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15862218 ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaatt 15862174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 276 - 329
Target Start/End: Original strand, 15760317 - 15760370
Alignment:
Q  276 atgttgttgtgagtgaataataacttgggtatatataattatggattgatgatg 329  Q
    ||||| ||||||||||||||| | |||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  15760317 atgttattgtgagtgaataatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 15760370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 12 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 7528 - 7210
Alignment:
Q  12 tcatcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  7528 tcatcataatcaatttcaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgctgttg 7429  T
Q  112 cttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatgat 210  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  7428 cttatacatgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaaattttgcctaattaatgat 7329  T
Q  211 ttgtgataagttgtgttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttgacaaaacatgttgttgtgagtgaataataacttgggtatata 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| |    
T  7328 ttgtgataagttgtgttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttgacaaaccatgttgttgtgagtgaattatgacttgggtataca 7229  T
Q  311 taattatggattgatgatg 329  Q
    |||||||||||||||||||    
T  7228 taattatggattgatgatg 7210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 24)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 12 - 329
Target Start/End: Original strand, 5888567 - 5888885
Alignment:
Q  12 tcatcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  5888567 tcatcataatcaatttcaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgctgttg 5888666  T
Q  112 cttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatgat 210  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  5888667 cttatacatgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaaattttgcctaattaatgat 5888766  T
Q  211 ttgtgataagttgtgttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttgacaaaacatgttgttgtgagtgaataataacttgggtatata 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| |    
T  5888767 ttgtgataagttgtgttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttgacaaaccatgttgttgtgagtgaattatgacttgggtataca 5888866  T
Q  311 taattatggattgatgatg 329  Q
    |||||||||||||||||||    
T  5888867 taattatggattgatgatg 5888885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 14 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 23774453 - 23774137
Alignment:
Q  14 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgtttct 113  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23774453 atcataatcaagttcaaattttacatcttttcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgctgtttct 23774354  T
Q  114 tatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatgattt 212  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  23774353 tatacttgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaaattttgcctaattaatgattt 23774254  T
Q  213 gtgataagttgtgttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttgacaaaacatgttgttgtgagtgaataataacttgggtatatata 312  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||    
T  23774253 gtgataagttgtgttggattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttgacaaaacatgttgttgtgagtgaattataacttgggtatactta 23774154  T
Q  313 attatggattgatgatg 329  Q
    |||||||||||||||||    
T  23774153 attatggattgatgatg 23774137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 11 - 209
Target Start/End: Original strand, 23777981 - 23778181
Alignment:
Q  11 atcatcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttg-ttgt 109  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| | || || |  |    
T  23777981 atcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctatt 23778080  T
Q  110 ttcttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatg 208  Q
    ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| | |||||||||||    
T  23778081 ttcttatgcatgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatg 23778180  T
Q  209 a 209  Q
    |    
T  23778181 a 23778181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 12 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 21142214 - 21142040
Alignment:
Q  12 tcatcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatg-ttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgtt 110  Q
    |||||||||||||||  ||| |||  || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || || | ||    
T  21142214 tcatcataatcaattcaaaaattttcat-ttctcatggttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgatgttaaattcgtgctcttgttgtgatgctatt 21142116  T
Q  111 t-cttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaag 185  Q
    | ||| | ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  21142115 ttcttgtgcatgaattgaggattatggtatgtttgtggatgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgtcaag 21142040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 8944163 - 8943966
Alignment:
Q  14 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-c 112  Q
    ||||||||||  | ||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||| || || | ||| |    
T  8944163 atcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttc 8944064  T
Q  113 ttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 209  Q
    || | |||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| | ||||||||||||    
T  8944063 ttgtgcatgaattgatgattatggtatatttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatga 8943966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 209
Target Start/End: Original strand, 12641581 - 12641778
Alignment:
Q  14 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-c 112  Q
    ||||||||||  | ||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |  ||||||||||||||||| |  |||| ||| |    
T  12641581 atcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgctcttgttgtaatgttattttc 12641680  T
Q  113 ttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 209  Q
    || | |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| | ||||||||||||    
T  12641681 ttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtggctgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatga 12641778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 12728709 - 12728512
Alignment:
Q  14 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttg-ttgtttc 112  Q
    ||||||||||  | ||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | || || |  ||||    
T  12728709 atcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttc 12728610  T
Q  113 ttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 209  Q
    || | |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| | ||||||||||||    
T  12728609 ttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattattcttaattgatga 12728512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 34824792 - 34824595
Alignment:
Q  14 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttg-ttgtttc 112  Q
    ||||||||||  | ||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | || || |  ||||    
T  34824792 atcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttc 34824693  T
Q  113 ttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 209  Q
    || | |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| | ||||||||||||    
T  34824692 ttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattattcttaattgatga 34824595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 32 - 209
Target Start/End: Original strand, 3798560 - 3798739
Alignment:
Q  32 ttttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-cttatacatgaattgattg 130  Q
    ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |  ||||||||||||||||| |  |||| ||| ||| | |||||||||||      
T  3798560 ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgctcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatga 3798659  T
Q  131 ttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 209  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| | ||||||||||||    
T  3798660 ttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatga 3798739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 209
Target Start/End: Original strand, 12635807 - 12636004
Alignment:
Q  14 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-c 112  Q
    ||||||||||  | ||| ||||| || | ||||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||| || || | ||| |    
T  12635807 atcataatcatgtacaatttttgcatttcctcatgttgtatgaaaataggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttc 12635906  T
Q  113 ttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 209  Q
    || | |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| | ||||||||||||    
T  12635907 ttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatga 12636004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 209
Target Start/End: Original strand, 42177908 - 42178105
Alignment:
Q  14 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-c 112  Q
    ||||||||||  | ||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||| |  || | ||| |    
T  42177908 atcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtaatgctattttc 42178007  T
Q  113 ttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 209  Q
    || | |||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| | ||||||||||||    
T  42178008 ttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttttgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatga 42178105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 16935910 - 16935731
Alignment:
Q  14 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttg-ttgtttc 112  Q
    ||||||||||  | ||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||| | || || |  ||||    
T  16935910 atcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcatgctcttgctgtgatgctattttc 16935811  T
Q  113 ttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaa 192  Q
    || | |||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  16935810 ttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgcgtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa 16935731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 17006570 - 17006391
Alignment:
Q  14 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttg-ttgtttc 112  Q
    ||||||||||  | ||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||| | || || |  ||||    
T  17006570 atcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcatgctcttgctgtgatgctattttc 17006471  T
Q  113 ttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaa 192  Q
    || | |||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  17006470 ttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgcgtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa 17006391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 41 - 209
Target Start/End: Original strand, 11231304 - 11231474
Alignment:
Q  41 ttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-cttatacatgaattgattgttatggtat 139  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| | || || | ||| ||| | | |||||||||  |||||||||    
T  11231304 ttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtat 11231403  T
Q  140 gtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 209  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||    
T  11231404 gtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 11231474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 41 - 209
Target Start/End: Original strand, 22513151 - 22513321
Alignment:
Q  41 ttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-cttatacatgaattgattgttatggtat 139  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| | || || | ||| ||| | | |||||||||  |||||||||    
T  22513151 ttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtat 22513250  T
Q  140 gtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 209  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||    
T  22513251 gtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 22513321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 41 - 209
Target Start/End: Original strand, 24685747 - 24685917
Alignment:
Q  41 ttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-cttatacatgaattgattgttatggtat 139  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| | || || | ||| ||| | | |||||||||  |||||||||    
T  24685747 ttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtat 24685846  T
Q  140 gtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 209  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||    
T  24685847 gtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 24685917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 41 - 209
Target Start/End: Original strand, 28775773 - 28775943
Alignment:
Q  41 ttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-cttatacatgaattgattgttatggtat 139  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| | || || | ||| ||| | | |||||||||  |||||||||    
T  28775773 ttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtat 28775872  T
Q  140 gtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 209  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||    
T  28775873 gtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 28775943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 97
Target Start/End: Original strand, 19886612 - 19886679
Alignment:
Q  30 aattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 97  Q
    ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  19886612 aattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 19886679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 191 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 15633351 - 15633273
Alignment:
Q  191 aattttgcttaattgatgatttgtgataagttgt-gttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttg 268  Q
    |||| |||||||||||||| || ||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15633351 aattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaaacaagtttcaattgatgttgttgttg 15633273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 191 - 268
Target Start/End: Original strand, 28031356 - 28031434
Alignment:
Q  191 aattttgcttaattgatgatttgtgataagttgt-gttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttg 268  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  28031356 aattatgcttaattgatgaattatgatatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 28031434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 191 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 17204469 - 17204391
Alignment:
Q  191 aattttgcttaattgatgatttgtgataagttgt-gttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttg 268  Q
    |||| |||||||||||||| || ||| | ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  17204469 aattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattgaggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 17204391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 191 - 268
Target Start/End: Original strand, 24826836 - 24826914
Alignment:
Q  191 aattttgcttaattgatgatttgtgataagttgt-gttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttg 268  Q
    |||| |||||||||||||| || ||| | ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  24826836 aattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattgaggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 24826914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 25213186 - 25213108
Alignment:
Q  191 aattttgcttaattgatgatttgtgataagttgt-gttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttg 268  Q
    |||| |||||||||||||| || ||| | ||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  25213186 aattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 25213108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 276 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 21141948 - 21141895
Alignment:
Q  276 atgttgttgtgagtgaataataacttgggtatatataattatggattgatgatg 329  Q
    ||||||||||| |||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21141948 atgttgttgtgggtgaattacgacttgggtatacataattatggattgatgatg 21141895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 14 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 6914 - 6598
Alignment:
Q  14 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgtttct 113  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6914 atcataatcaatttcaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgctgtttct 6815  T
Q  114 tatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatgattt 212  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  6814 tatacatgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaaattttgcttaattaatgattt 6715  T
Q  213 gtgataagttgtgttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttgacaaaacatgttgttgtgagtgaataataacttgggtatatata 312  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||    
T  6714 gtgataagttgtgttggattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttattgttgacaaaacatgttgttgtgagtgaattataacttgggtatactta 6615  T
Q  313 attatggattgatgatg 329  Q
    ||| |||||||||||||    
T  6614 attgtggattgatgatg 6598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 17)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 14 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 22035764 - 22035448
Alignment:
Q  14 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgtttct 113  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22035764 atcataatcaatttcaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgctgtttct 22035665  T
Q  114 tatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatgattt 212  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  22035664 tatacttgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaaattttgcctaattaatgattt 22035565  T
Q  213 gtgataagttgtgttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttgacaaaacatgttgttgtgagtgaataataacttgggtatatata 312  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||    
T  22035564 gtgataagttgtgttggattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttgacaaaacatgttgttgtgagtgaattataacttgggtatactta 22035465  T
Q  313 attatggattgatgatg 329  Q
    |||||||||||||||||    
T  22035464 attatggattgatgatg 22035448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 14 - 329
Target Start/End: Original strand, 7640873 - 7641189
Alignment:
Q  14 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgtttct 113  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7640873 atcataatcaatttcaaattttacatcttttcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgctgtttct 7640972  T
Q  114 tatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatgattt 212  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  7640973 tatacttgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaaattttgcctaattaatgattt 7641072  T
Q  213 gtgataagttgtgttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttgacaaaacatgttgttgtgagtgaataataacttgggtatatata 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||    
T  7641073 gtgataagttgtgttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttgacaaaacatgttgttgtgagtgaattataacttgggtgtactta 7641172  T
Q  313 attatggattgatgatg 329  Q
    |||||||||||||||||    
T  7641173 attatggattgatgatg 7641189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 41 - 209
Target Start/End: Original strand, 18059724 - 18059894
Alignment:
Q  41 ttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttg-ttgtttcttatacatgaattgattgttatggtat 139  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| | || || |  |||||| | |||||||||||  |||||||||    
T  18059724 ttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtat 18059823  T
Q  140 gtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 209  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||    
T  18059824 gtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 18059894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 17148884 - 17148687
Alignment:
Q  14 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-c 112  Q
    ||||||||||  | ||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |  ||||||||||||||||| |  |||| ||| |    
T  17148884 atcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgctcttgttgtaatgttattttc 17148785  T
Q  113 ttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 209  Q
    || | |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| | ||||||||||||    
T  17148784 ttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatga 17148687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 191 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 20254451 - 20254312
Alignment:
Q  191 aattttgcttaattgatgatttgtgataagttgt-gttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttgacaaaacatgttgttgtgagt 289  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||   | ||||||||||||| ||    
T  20254451 aattatgcttaattgatgaattgtgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgttgttgttgctgagacatgttgttgtgggt 20254352  T
Q  290 gaataataacttgggtatatataattatggattgatgatg 329  Q
    |||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20254351 gaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatg 20254312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 31 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 46523689 - 46523527
Alignment:
Q  31 attttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-cttatacatgaattgatt 129  Q
    |||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||| || || | ||| ||| | |||||||||||     
T  46523689 attttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatg 46523590  T
Q  130 gttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaa 192  Q
     ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  46523589 tttatgttatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa 46523527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 41 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 17004928 - 17004758
Alignment:
Q  41 ttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-cttatacatgaattgattgttatggtat 139  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| | || || | ||| ||| | | |||||||||  |||||||||    
T  17004928 ttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtat 17004829  T
Q  140 gtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 209  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||    
T  17004828 gtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 17004758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 33 - 209
Target Start/End: Original strand, 38055049 - 38055227
Alignment:
Q  33 tttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-cttatacatgaattgattgt 131  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||| ||  | || |||| ||| ||| | | |||||||||  |    
T  38055049 tttgcatcttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgcttttactgtgatgttattttcttgtgcttgaattgatgat 38055148  T
Q  132 tatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 209  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||    
T  38055149 tatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 38055227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 41 - 192
Target Start/End: Original strand, 19962465 - 19962617
Alignment:
Q  41 ttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttg-ttgtttcttatacatgaattgattgttatggtat 139  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||| | |  || |  |||||| |   |||||||||  |||||||||    
T  19962465 ttctcatgttgtatgaaaatgggttgatggacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtaatgctattttcttgtgtttgaattgatgattatggtat 19962564  T
Q  140 gtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaa 192  Q
    |||| ||| || ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  19962565 gtttatgggtggaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa 19962617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 22228125 - 22228042
Alignment:
Q  14 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 97  Q
    ||||||||||  | ||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  22228125 atcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttg 22228042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 22232822 - 22232739
Alignment:
Q  14 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 97  Q
    ||||||||||  | ||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  22232822 atcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttg 22232739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 285
Target Start/End: Original strand, 21650157 - 21650252
Alignment:
Q  191 aattttgcttaattgatgatttgtgataagttgt-gttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttgacaaaacatgttgttgt 285  Q
    |||| |||||||||||||| || ||| | ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||   | ||||||||||||    
T  21650157 aattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattaaggtgagaatcaagtttcaattgatgttgttgttgttgagacatgttgttgt 21650252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 43 - 97
Target Start/End: Original strand, 5072352 - 5072406
Alignment:
Q  43 ctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 97  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  5072352 ctcaagttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 5072406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 43 - 97
Target Start/End: Original strand, 18601082 - 18601136
Alignment:
Q  43 ctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 97  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  18601082 ctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttg 18601136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 45051722 - 45051673
Alignment:
Q  31 attttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatg 80  Q
    |||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  45051722 attttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatg 45051673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 2116555 - 2116492
Alignment:
Q  30 aattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgct 93  Q
    ||||||| || |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  2116555 aattttgcattttctcatgttgtataaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgct 2116492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 280 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 46523438 - 46523394
Alignment:
Q  280 tgttgtgagtgaataataacttgggtatatataattatggattga 324  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||    
T  46523438 tgttgtgagtgaatcatgacttgggtatacttaattatggattga 46523394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 14 - 329
Target Start/End: Original strand, 23688 - 24004
Alignment:
Q  14 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgtttct 113  Q
    |||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23688 atcatattcaatttcaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaactcatgtcaaattcgtgctctggttatgttgttgtttct 23787  T
Q  114 tatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatgattt 212  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  23788 tatacatggattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaaattttgcctaattaatgattt 23887  T
Q  213 gtgataagttgtgttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttgacaaaacatgttgttgtgagtgaataataacttgggtatatata 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||    
T  23888 gtgataagttgtgttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttgacaaaacatgttgttgtgagtgaattataacttgggtgtactta 23987  T
Q  313 attatggattgatgatg 329  Q
    |||||||||||||||||    
T  23988 attatggattgatgatg 24004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 28)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 14 - 329
Target Start/End: Original strand, 29869715 - 29870031
Alignment:
Q  14 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgtttct 113  Q
    |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29869715 atcataatcaatttaaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgctgtttct 29869814  T
Q  114 tatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatgattt 212  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  29869815 tatacatgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataagtgtcaagttgtgaaattttgcctaattaatgattt 29869914  T
Q  213 gtgataagttgtgttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttgacaaaacatgttgttgtgagtgaataataacttgggtatatata 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||    
T  29869915 gtgataagttgtgttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttgacaaaacatgttgttgtgagtgaattataacttgggtgtactta 29870014  T
Q  313 attatggattgatgatg 329  Q
    || ||||||||||||||    
T  29870015 atgatggattgatgatg 29870031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 11 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 1556325 - 1556125
Alignment:
Q  11 atcatcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttg-ttgt 109  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | || || |  |    
T  1556325 atcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctatt 1556226  T
Q  110 ttcttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatg 208  Q
    ||||| | |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| | |||||||||||    
T  1556225 ttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatg 1556126  T
Q  209 a 209  Q
    |    
T  1556125 a 1556125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 32 - 209
Target Start/End: Original strand, 18086780 - 18086959
Alignment:
Q  32 ttttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-cttatacatgaattgattg 130  Q
    ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||| || || | ||| ||| | |||||||||||      
T  18086780 ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatga 18086879  T
Q  131 ttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 209  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| | ||||||||||||    
T  18086880 ttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatga 18086959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 16232209 - 16232012
Alignment:
Q  14 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttg-ttgtttc 112  Q
    ||||||||||  | ||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | || || |  ||||    
T  16232209 atcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttc 16232110  T
Q  113 ttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 209  Q
    || | |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| | ||||||||||||    
T  16232109 ttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatga 16232012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23978086 - 23977889
Alignment:
Q  14 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-c 112  Q
    ||||||||||  | ||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |  ||||||||||||||||| |  |||| ||| |    
T  23978086 atcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgctcttgttgtaatgttattttc 23977987  T
Q  113 ttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 209  Q
    || | |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| | ||||||||||||    
T  23977986 ttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatga 23977889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 41 - 209
Target Start/End: Original strand, 22225704 - 22225874
Alignment:
Q  41 ttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-cttatacatgaattgattgttatggtat 139  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||  | || || | ||| ||| | |||||||||||  |||||||||    
T  22225704 ttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctctttctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtat 22225803  T
Q  140 gtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 209  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||    
T  22225804 gtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 22225874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 209
Target Start/End: Original strand, 13620734 - 13620930
Alignment:
Q  15 tcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-ct 113  Q
    |||||||||  | ||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||| |  || | ||| ||    
T  13620734 tcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtaatgctattttct 13620833  T
Q  114 tatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 209  Q
    | | |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| | ||||||||||||    
T  13620834 tgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattgcatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatga 13620930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 41 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 10488989 - 10488819
Alignment:
Q  41 ttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-cttatacatgaattgattgttatggtat 139  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| | || || | ||| ||| | | |||||||||  |||||||||    
T  10488989 ttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtat 10488890  T
Q  140 gtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 209  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||    
T  10488889 gtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 10488819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 41 - 209
Target Start/End: Original strand, 16376339 - 16376509
Alignment:
Q  41 ttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-cttatacatgaattgattgttatggtat 139  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| | || || | ||| ||| | | |||||||||  |||||||||    
T  16376339 ttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtat 16376438  T
Q  140 gtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 209  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||    
T  16376439 gtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 16376509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 41 - 209
Target Start/End: Original strand, 16383663 - 16383833
Alignment:
Q  41 ttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-cttatacatgaattgattgttatggtat 139  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| | || || | ||| ||| | | |||||||||  |||||||||    
T  16383663 ttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtat 16383762  T
Q  140 gtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 209  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||    
T  16383763 gtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 16383833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 19610335 - 19610161
Alignment:
Q  14 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttg-ttgtttc 112  Q
    ||||||||||  | ||| ||||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | || || |  ||||    
T  19610335 atcataatcatgtacaatttttgcattttctgatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattattgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttc 19610236  T
Q  113 ttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagtt 187  Q
    || | ||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  19610235 ttgtgcatgaatcgatggttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtt 19610161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 41 - 209
Target Start/End: Original strand, 16556105 - 16556275
Alignment:
Q  41 ttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-cttatacatgaattgattgttatggtat 139  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||| || | || || | ||| ||| | | |||||||||  |||||||||    
T  16556105 ttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcctgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtat 16556204  T
Q  140 gtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 209  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||    
T  16556205 gtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 16556275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 41 - 209
Target Start/End: Original strand, 16632661 - 16632831
Alignment:
Q  41 ttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-cttatacatgaattgattgttatggtat 139  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||| || | || || | ||| ||| | | |||||||||  |||||||||    
T  16632661 ttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcctgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtat 16632760  T
Q  140 gtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 209  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||    
T  16632761 gtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 16632831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 41 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 19299527 - 19299375
Alignment:
Q  41 ttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-cttatacatgaattgattgttatggtat 139  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||| | |  || | ||| ||| |   |||||||||  |||||||||    
T  19299527 ttctcatgttgtatgaaaatgggttgatggacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtaatgctattttcttgtgtttgaattgatgattatggtat 19299428  T
Q  140 gtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaa 192  Q
    |||| ||| || ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  19299427 gtttatgggtggaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa 19299375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 41 - 156
Target Start/End: Original strand, 22251532 - 22251648
Alignment:
Q  41 ttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttg-ttgtttcttatacatgaattgattgttatggtat 139  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| | || || |  |||||| | |||||||||||  |||||||||    
T  22251532 ttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtat 22251631  T
Q  140 gtttgtggatgaaatta 156  Q
    |||| ||| ||||||||    
T  22251632 gtttatgggtgaaatta 22251648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 97
Target Start/End: Original strand, 16825703 - 16825770
Alignment:
Q  30 aattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 97  Q
    ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  16825703 aattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 16825770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 96
Target Start/End: Original strand, 1650056 - 1650122
Alignment:
Q  30 aattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctctt 96  Q
    ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  1650056 aattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgctctt 1650122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 25175853 - 25175787
Alignment:
Q  41 ttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgtt 107  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||| | |||||||    
T  25175853 ttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgttgtt 25175787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 29666157 - 29666011
Alignment:
Q  47 tgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-cttatacatgaattgattgttatggtatgtttgt 145  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| | ||||  ||| ||||||||||||| | | || |||| ||| |||||  ||||||||||  | || ||||| ||||    
T  29666157 tgttgtatgaaaatggggtgatggataattgttgttaaattcgtgctctagctgtgatgttattttcttatgtatgaattgatgataattgtatgattgt 29666058  T
Q  146 ggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaa 192  Q
    || |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  29666057 gggtgaaattacatgtttcaaagtatgcataaatgtcaagttatgaa 29666011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 191 - 268
Target Start/End: Original strand, 32276881 - 32276959
Alignment:
Q  191 aattttgcttaattgatgatttgtgataagttgt-gttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttg 268  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| | ||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  32276881 aattatgcttaattgatgaattgtgacatgttattgttgaattgaggtgagaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 32276959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 19629468 - 19629373
Alignment:
Q  191 aattttgcttaattgatgatttgtgataagttgt-gttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttgacaaaacatgttgttgt 285  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||| |||| || ||| |||||||||||||   | ||||||||||||    
T  19629468 aattatgcttaattgatgaattgtgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagatttaattgatgttgttgttgctgagacatgttgttgt 19629373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 97
Target Start/End: Original strand, 27653934 - 27654001
Alignment:
Q  30 aattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 97  Q
    ||||||| || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  27653934 aattttgcattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaaatcatgctaaattcgtgctcttg 27654001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 268
Target Start/End: Original strand, 16300133 - 16300176
Alignment:
Q  225 gttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttg 268  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  16300133 gttgaattgaggtgagaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 16300176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 196 - 269
Target Start/End: Original strand, 18823510 - 18823584
Alignment:
Q  196 tgcttaattgatgatttgtgataagttgt-gttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttga 269  Q
    |||||||||||||| || ||| | ||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  18823510 tgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattgcggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttga 18823584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 280 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 19610067 - 19610018
Alignment:
Q  280 tgttgtgagtgaataataacttgggtatatataattatggattgatgatg 329  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  19610067 tgttgtgagtgaatcatgacttgggtatacttaattatggattgatgatg 19610018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 191 - 269
Target Start/End: Original strand, 18839360 - 18839439
Alignment:
Q  191 aattttgcttaattgatgatttgtgataagttgt-gttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttga 269  Q
    |||| |||||||||||||| || ||| | ||| | ||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  18839360 aattatgcttaattgatgacttatgacatgttattgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttga 18839439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 191 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 4991210 - 4991132
Alignment:
Q  191 aattttgcttaattgatgatttgtgataagttgt-gttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttg 268  Q
    |||| |||||||||||||| || ||| | ||||| |||||||||  ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  4991210 aattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggtgtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 4991132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 149 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 27741019 - 27740931
Alignment:
Q  149 tgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatgatttgtgataagttg-tgttgaattgag 235  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || |||| |||| ||||| ||| || || ||||| | ||||||||||||    
T  27741019 tgaaattacatgtttcgaagtatgtataaatgtcaagttatgaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagtcgttgttgaattgag 27740931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 34)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 14 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 23328874 - 23328558
Alignment:
Q  14 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgtttct 113  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23328874 atcataatcaatttcaaattttacatcttttcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgctgtttct 23328775  T
Q  114 tatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatgattt 212  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  23328774 tatacttgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaaattttgcctaattaatgattt 23328675  T
Q  213 gtgataagttgtgttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttgacaaaacatgttgttgtgagtgaataataacttgggtatatata 312  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||    
T  23328674 gtgataagttgtgttggattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttgacaaaacatgttgttgtgagtgaattataacttgggtatactta 23328575  T
Q  313 attatggattgatgatg 329  Q
    ||| |||||||||||||    
T  23328574 attgtggattgatgatg 23328558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 14 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 24616478 - 24616165
Alignment:
Q  14 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgtttct 113  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24616478 atcataatcaatttcaaattttacatcttttcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgctgtttct 24616379  T
Q  114 tatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatgattt 212  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  24616378 tatacttgaattgataattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaaattttgcctaattaatgattt 24616279  T
Q  213 gtgataagttgtgttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttgacaaaacatgttgttgtgagtgaataataacttgggtatatata 312  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||    
T  24616278 gtgataagttgtgttggattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttgac-aaacatgttgttgtgagtgaattataacttgggtatactta 24616180  T
Q  313 attatggattgatga 327  Q
    ||| |||||||||||    
T  24616179 attgtggattgatga 24616165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 14 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 24712854 - 24712541
Alignment:
Q  14 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgtttct 113  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24712854 atcataatcaatttcaaattttacatcttttcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgctgtttct 24712755  T
Q  114 tatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatgattt 212  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  24712754 tatacttgaattgataattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaaattttgcctaattaatgattt 24712655  T
Q  213 gtgataagttgtgttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttgacaaaacatgttgttgtgagtgaataataacttgggtatatata 312  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||    
T  24712654 gtgataagttgtgttggattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttgac-aaacatgttgttgtgagtgaattataacttgggtatactta 24712556  T
Q  313 attatggattgatga 327  Q
    ||| |||||||||||    
T  24712555 attgtggattgatga 24712541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 14 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 24745872 - 24745559
Alignment:
Q  14 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgtttct 113  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24745872 atcataatcaatttcaaattttacatcttttcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgctgtttct 24745773  T
Q  114 tatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatgattt 212  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  24745772 tatacttgaattgataattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaaattttgcctaattaatgattt 24745673  T
Q  213 gtgataagttgtgttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttgacaaaacatgttgttgtgagtgaataataacttgggtatatata 312  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||    
T  24745672 gtgataagttgtgttggattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttgac-aaacatgttgttgtgagtgaattataacttgggtatactta 24745574  T
Q  313 attatggattgatga 327  Q
    ||| |||||||||||    
T  24745573 attgtggattgatga 24745559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 11 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23514881 - 23514681
Alignment:
Q  11 atcatcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttg-ttgt 109  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | || || |  |    
T  23514881 atcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctatt 23514782  T
Q  110 ttcttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatg 208  Q
    ||||| | |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| | |||||||||||    
T  23514781 ttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatg 23514682  T
Q  209 a 209  Q
    |    
T  23514681 a 23514681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 329
Target Start/End: Original strand, 35791037 - 35791355
Alignment:
Q  14 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-c 112  Q
    ||||||||||  | ||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | || |||| ||| |    
T  35791037 atcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttattttc 35791136  T
Q  113 ttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtga-attttgcttaattgatg-at 210  Q
    || | |||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||| | ||||||||||| |     
T  35791137 ttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgagtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgagattatacttaattgatgaaa 35791236  T
Q  211 ttgtgataagttg-tgttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttgacaaaacatgttgttgtgagtgaataataacttgggtatat 309  Q
    || ||||| |||| ||||||| |||| || ||  || | ||| || |||||||||| |   ||   ||||||||| | |||||| || |||||||||||     
T  35791237 ttttgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatg-ttccattgatgttgttgctattaactgatgttgttgagggtgaattatgacttgggtatac 35791335  T
Q  310 ataattatggattgatgatg 329  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  35791336 ataattatggattgatgatg 35791355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 209
Target Start/End: Original strand, 10777909 - 10778106
Alignment:
Q  14 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttg-ttgtttc 112  Q
    ||||||||||  | ||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | || || |  ||||    
T  10777909 atcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttc 10778008  T
Q  113 ttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 209  Q
    || | |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||    
T  10778009 ttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 10778106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 7425641 - 7425462
Alignment:
Q  14 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-c 112  Q
    ||||||||||  | ||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | || |||| ||| |    
T  7425641 atcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattattgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttattttc 7425542  T
Q  113 ttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaa 192  Q
    || | ||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  7425541 ttgtgcatgaatcgatggttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa 7425462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 192
Target Start/End: Original strand, 11212004 - 11212183
Alignment:
Q  14 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttg-ttgtttc 112  Q
    ||||||||||  ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| | || || |  ||||    
T  11212004 atcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttc 11212103  T
Q  113 ttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaa 192  Q
    || | |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||    
T  11212104 ttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtgtgtataaatgttaagttatgaa 11212183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 209
Target Start/End: Original strand, 1219459 - 1219656
Alignment:
Q  14 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttg-ttgtttc 112  Q
    ||||||||||  | ||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | || || |  ||||    
T  1219459 atcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttc 1219558  T
Q  113 ttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 209  Q
    || | ||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||    
T  1219559 ttgtgcattaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 1219656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 186
Target Start/End: Original strand, 17471527 - 17471700
Alignment:
Q  14 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttg-ttgtttc 112  Q
    ||||||||||  | ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | || || |  ||||    
T  17471527 atcataatcatgtacaaattttgtattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgataaattcgtgctcttgctgtgatgctattttc 17471626  T
Q  113 ttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagt 186  Q
    || | |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  17471627 ttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagt 17471700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 41 - 209
Target Start/End: Original strand, 21932347 - 21932517
Alignment:
Q  41 ttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-cttatacatgaattgattgttatggtat 139  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| | || || | ||| ||| | | |||||||||  |||||||||    
T  21932347 ttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtat 21932446  T
Q  140 gtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 209  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||    
T  21932447 gtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 21932517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 41 - 209
Target Start/End: Original strand, 21938517 - 21938687
Alignment:
Q  41 ttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-cttatacatgaattgattgttatggtat 139  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| | || || | ||| ||| | | |||||||||  |||||||||    
T  21938517 ttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtat 21938616  T
Q  140 gtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 209  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||    
T  21938617 gtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 21938687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 41 - 209
Target Start/End: Original strand, 22883050 - 22883220
Alignment:
Q  41 ttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-cttatacatgaattgattgttatggtat 139  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||| ||||| ||||||||| | || || | ||| ||| | | |||||||||  |||||||||    
T  22883050 ttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaatttgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtat 22883149  T
Q  140 gtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 209  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||    
T  22883150 gtttatggatgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 22883220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 41 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 35582326 - 35582156
Alignment:
Q  41 ttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-cttatacatgaattgattgttatggtat 139  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| | || || | ||| ||| | | |||||||||  |||||||||    
T  35582326 ttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtat 35582227  T
Q  140 gtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 209  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||    
T  35582226 gtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 35582156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 41 - 209
Target Start/End: Original strand, 36989736 - 36989906
Alignment:
Q  41 ttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-cttatacatgaattgattgttatggtat 139  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||| | | || || | ||| ||| | | |||||||||  |||||||||    
T  36989736 ttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctctagctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtat 36989835  T
Q  140 gtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 209  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||    
T  36989836 gtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 36989906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 97
Target Start/End: Original strand, 18777943 - 18778010
Alignment:
Q  30 aattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 97  Q
    ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18777943 aattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgttaaattcgtgctcttg 18778010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 43 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 27010129 - 27010075
Alignment:
Q  43 ctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 97  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27010129 ctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 27010075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 12675 - 12608
Alignment:
Q  30 aattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 97  Q
    ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  12675 aattttgtattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 12608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 25426929 - 25426862
Alignment:
Q  30 aattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 97  Q
    ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  25426929 aattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 25426862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 19500200 - 19500133
Alignment:
Q  30 aattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 97  Q
    ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||    
T  19500200 aattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacacttcatgctaaattcgtgctcttg 19500133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 97
Target Start/End: Original strand, 21073546 - 21073613
Alignment:
Q  30 aattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 97  Q
    ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  21073546 aattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttaatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 21073613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 97
Target Start/End: Original strand, 22366432 - 22366499
Alignment:
Q  30 aattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 97  Q
    ||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  22366432 aattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgagcaattcatgctaaattcgtgctcttg 22366499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 191 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 7529038 - 7528960
Alignment:
Q  191 aattttgcttaattgatgatttgtgataagttgt-gttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttg 268  Q
    |||| |||||||||||||| || ||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  7529038 aattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 7528960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 99
Target Start/End: Original strand, 4199936 - 4200005
Alignment:
Q  30 aattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgtt 99  Q
    ||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  4199936 aattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgtt 4200005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 41 - 97
Target Start/End: Original strand, 43443357 - 43443413
Alignment:
Q  41 ttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 97  Q
    |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43443357 ttctcatgttatatgaaaatggattgatgaacaattcatgttaaattcgtgctcttg 43443413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 17909643 - 17909568
Alignment:
Q  191 aattttgcttaattgatgatttgtgataagttgt-gttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttg 265  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  17909643 aattatgcttaattgatgaattgtgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgttgttg 17909568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 96
Target Start/End: Original strand, 29188235 - 29188301
Alignment:
Q  30 aattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctctt 96  Q
    ||||||| || ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  29188235 aattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggtcgatgaacaattcatgctagattcgtgctctt 29188301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 268
Target Start/End: Original strand, 108950 - 109028
Alignment:
Q  191 aattttgcttaattgatgatttgtgataagttgt-gttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttg 268  Q
    |||| |||||||||||||| || ||| | ||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  108950 aattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 109028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 268
Target Start/End: Original strand, 9730500 - 9730578
Alignment:
Q  191 aattttgcttaattgatgatttgtgataagttgt-gttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttg 268  Q
    |||| |||||||||||||| || ||| | ||||| |||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||||    
T  9730500 aattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattaaggtgagaatcaagtttcgattgatgttgttgttg 9730578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 16105781 - 16105703
Alignment:
Q  191 aattttgcttaattgatgatttgtgataagttgt-gttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttg 268  Q
    |||| |||||||||||||| || ||| | ||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  16105781 aattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 16105703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 276 - 329
Target Start/End: Original strand, 11212268 - 11212321
Alignment:
Q  276 atgttgttgtgagtgaataataacttgggtatatataattatggattgatgatg 329  Q
    ||||||||||| ||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11212268 atgttgttgtgggtggattatgacttgggtatacataattatggattgatgatg 11212321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 280 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 7425373 - 7425324
Alignment:
Q  280 tgttgtgagtgaataataacttgggtatatataattatggattgatgatg 329  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  7425373 tgttgtgagtgaatcatgacttggatatacttaattatggattgatgatg 7425324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 136 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 32950888 - 32950840
Alignment:
Q  136 gtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaa 184  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  32950888 gtatgattgtggttgaaattacatgtttcaaagtatgtataaaggtcaa 32950840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 28)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 14 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 26339336 - 26339020
Alignment:
Q  14 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgtttct 113  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26339336 atcataatcaatttcaaattttacatcttttcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgctgtttct 26339237  T
Q  114 tatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatgattt 212  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  26339236 tatacttgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatctatgtataaatgtcaagttgtgaaattttgcttaattaatgattt 26339137  T
Q  213 gtgataagttgtgttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttgacaaaacatgttgttgtgagtgaataataacttgggtatatata 312  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||    
T  26339136 gtgataagttgtgttgaattgaggagagaaacaagtttcaatggatgttgttgttgacaaaacatgttgttgtgagtgaattataacttgggtatactta 26339037  T
Q  313 attatggattgatgatg 329  Q
    |||||||||| ||||||    
T  26339036 attatggattaatgatg 26339020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 14 - 329
Target Start/End: Original strand, 22352003 - 22352302
Alignment:
Q  14 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgtttct 113  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  22352003 atcataatcaatttcaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcatgctcttgttatgttgctgtttct 22352102  T
Q  114 tatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatgattt 212  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||                  
T  22352103 tatacatgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaaattttgc-------------- 22352188  T
Q  213 gtgataagttgtgttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttgacaaaacatgttgttgtgagtgaataataacttgggtatatata 312  Q
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||    
T  22352189 ---ctaagttgtgttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttgacaaaacatgttgttgtgagtgaattataacttgggtatactta 22352285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 12 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 22738588 - 22738269
Alignment:
Q  12 tcatcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttg-ttgtt 110  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| |||| ||||||||| ||||| | || || |  ||    
T  22738588 tcatcataatcaatttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggctgaggaacaattgatgttaaattcgtgttcttgctgtgatgctattt 22738489  T
Q  111 tcttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 209  Q
    |||| | |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||     
T  22738488 tcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttgtgaaattatgcttaattgatgg 22738389  T
Q  210 tttgtgataagttg-tgttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttgacaaaacatgttgttgtgagtgaataataacttgggtata 308  Q
    ||| |||| ||||| | ||||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||   | ||||||||||| | |||||| || |||||||||||    
T  22738388 tttatgatgagttgttattgaattga-gtgtgaatcaagttccaatggatgttgttgttgcttagacatgttgttgagggtgaattatgacttgggtata 22738290  T
Q  309 tataattatggattgatgatg 329  Q
      ||||| |||||| ||||||    
T  22738289 cttaattgtggattaatgatg 22738269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 329
Target Start/End: Original strand, 17145596 - 17145913
Alignment:
Q  14 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-c 112  Q
    ||||||||||  ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||  | || || | ||| |    
T  17145596 atcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattgatgttaaattcgtgctcttactgtgatgctattttc 17145695  T
Q  113 ttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatgatt 211  Q
    || |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||| | || ||||  ||| |    
T  17145696 ttgtacatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttgtgaaattatactcaattagtgaat 17145795  T
Q  212 tgtgataagttg-tgttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttgacaaaacatgttgttgtgagtgaataataacttgggtatata 310  Q
    | ||||| |||| ||||||| |||| || ||  || | ||| || |||||||||| |   ||   ||||||||||| |||||| || ||||||||||| |    
T  17145796 tttgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatg-ttccattgatgttgttgctattaactgatgttgttgtgggtgaattatgacttgggtataca 17145894  T
Q  311 taattatggattgatgatg 329  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  17145895 taattacggattgatgatg 17145913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 18169287 - 18169090
Alignment:
Q  14 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttg-ttgtttc 112  Q
    ||||||||||  | ||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | || || |  ||||    
T  18169287 atcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttc 18169188  T
Q  113 ttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 209  Q
    || | |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||    
T  18169187 ttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 18169090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 19020804 - 19020624
Alignment:
Q  13 catcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttg-ttgttt 111  Q
    |||||||||||  ||||| ||||| || || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| | || || |  |||    
T  19020804 catcataatcatgttcaatttttgcattttgtcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctatttt 19020705  T
Q  112 cttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaa 192  Q
    ||| | |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  19020704 cttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa 19020624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 209
Target Start/End: Original strand, 7132004 - 7132201
Alignment:
Q  14 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-c 112  Q
    ||||||||||  | ||| ||||| || |||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||| || || | ||| |    
T  7132004 atcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttatatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttc 7132103  T
Q  113 ttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 209  Q
    || | |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| | ||||||||||||    
T  7132104 ttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatga 7132201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 41 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 18248508 - 18248367
Alignment:
Q  41 ttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttg-ttgtttcttatacatgaattgattgttatggtat 139  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | || || |  |||||| | ||||||||||   |||||||||    
T  18248508 ttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgatgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgaggattatggtat 18248409  T
Q  140 gtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgt 181  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  18248408 gtttgtggatgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgt 18248367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 20001040 - 20000843
Alignment:
Q  14 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-c 112  Q
    ||||||||||  | ||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |  ||||||||||||||||| |  |||| ||| |    
T  20001040 atcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgctcttgttgtaatgttattttc 20000941  T
Q  113 ttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 209  Q
    || | |||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| | ||||||||||||    
T  20000940 ttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttctgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatga 20000843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 192
Target Start/End: Original strand, 15287184 - 15287363
Alignment:
Q  14 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttg-ttgtttc 112  Q
    ||||||||||  | ||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||   |  ||||||||||||||| | || || |  ||||    
T  15287184 atcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggatgatgaacaattatagctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttc 15287283  T
Q  113 ttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaa 192  Q
    || | ||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  15287284 ttgtgcatgaatcgatggttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa 15287363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 192
Target Start/End: Original strand, 15294293 - 15294472
Alignment:
Q  14 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttg-ttgtttc 112  Q
    ||||||||||  | ||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||   |  ||||||||||||||| | || || |  ||||    
T  15294293 atcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggatgatgaacaattatagctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttc 15294392  T
Q  113 ttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaa 192  Q
    || | ||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||| ||||    
T  15294393 ttgtgcatgaatcgatggttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatatataaatgttaagttatgaa 15294472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 10644520 - 10644453
Alignment:
Q  30 aattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 97  Q
    ||||||| || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10644520 aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 10644453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 118 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 8374720 - 8374646
Alignment:
Q  118 catgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaa 192  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  8374720 catgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgcttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa 8374646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 47357955 - 47357888
Alignment:
Q  30 aattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 97  Q
    ||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  47357955 aattttgcatttcctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 47357888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 14996265 - 14996170
Alignment:
Q  191 aattttgcttaattgatgatttgtgataagttgt-gttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttgacaaaacatgttgttgt 285  Q
    |||| |||||||||||||| || ||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||   | ||||||||||||    
T  14996265 aattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgttgttgttgctgagacatgttgttgt 14996170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 285
Target Start/End: Original strand, 19697490 - 19697585
Alignment:
Q  191 aattttgcttaattgatgatttgtgataagttgt-gttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttgacaaaacatgttgttgt 285  Q
    |||| |||||||||||||| || ||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||   | ||||||||||||    
T  19697490 aattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgttgttgttgctgagacatgttgttgt 19697585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 285
Target Start/End: Original strand, 19708075 - 19708170
Alignment:
Q  191 aattttgcttaattgatgatttgtgataagttgt-gttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttgacaaaacatgttgttgt 285  Q
    |||| |||||||||||||| || ||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||   | ||||||||||||    
T  19708075 aattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgttgttgttgctgagacatgttgttgt 19708170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 191 - 268
Target Start/End: Original strand, 14500334 - 14500412
Alignment:
Q  191 aattttgcttaattgatgatttgtgataagttgt-gttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttg 268  Q
    |||| |||||||||||||| || ||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  14500334 aattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgttgttgttg 14500412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 191 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 16522956 - 16522878
Alignment:
Q  191 aattttgcttaattgatgatttgtgataagttgt-gttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttg 268  Q
    |||| |||||||||||||| || ||| | ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  16522956 aattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattgaggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 16522878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 41 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 8378441 - 8378385
Alignment:
Q  41 ttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 97  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||    
T  8378441 ttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttg 8378385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 9295832 - 9295754
Alignment:
Q  191 aattttgcttaattgatgatttgtgataagttgt-gttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttg 268  Q
    |||| |||||||||||||| || ||| | ||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  9295832 aattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 9295754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 276 - 329
Target Start/End: Original strand, 15287448 - 15287501
Alignment:
Q  276 atgttgttgtgagtgaataataacttgggtatatataattatggattgatgatg 329  Q
    ||| |||||||||||||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  15287448 atgctgttgtgagtgaatcatgacttgggtatacttaattatggattgatgatg 15287501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 276 - 329
Target Start/End: Original strand, 15294557 - 15294610
Alignment:
Q  276 atgttgttgtgagtgaataataacttgggtatatataattatggattgatgatg 329  Q
    ||| |||||||||||||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  15294557 atgctgttgtgagtgaatcatgacttgggtatacttaattatggattgatgatg 15294610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 224 - 267
Target Start/End: Original strand, 32460847 - 32460890
Alignment:
Q  224 tgttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgtt 267  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  32460847 tgttggattgaggtgagaatcaagtttcaattgatgttgttgtt 32460890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 138 - 192
Target Start/End: Original strand, 40885626 - 40885679
Alignment:
Q  138 atgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaa 192  Q
    |||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  40885626 atgtttgttggtgaaattacatg-ttcaaagtatgtataaatgtcaagttatgaa 40885679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 276 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 8374561 - 8374508
Alignment:
Q  276 atgttgttgtgagtgaataataacttgggtatatataattatggattgatgatg 329  Q
    ||||||||||| |||||| ||  |||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  8374561 atgttgttgtgggtgaattatggcttgggtatacataattatcgattgatgatg 8374508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 276 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 18248271 - 18248218
Alignment:
Q  276 atgttgttgtgagtgaataataacttgggtatatataattatggattgatgatg 329  Q
    ||||||||||| |||||| || |||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  18248271 atgttgttgtgggtgaattatgactttggtatacataattatcgattgatgatg 18248218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 224 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 9795320 - 9795276
Alignment:
Q  224 tgttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttg 268  Q
    |||||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||||||    
T  9795320 tgttgaattgaggtggaaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 9795276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 84; Significance: 7e-40; HSPs: 28)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 329
Target Start/End: Original strand, 12264731 - 12265049
Alignment:
Q  14 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttg-ttgtttc 112  Q
    ||||||||||  | ||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | || || |  ||||    
T  12264731 atcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttc 12264830  T
Q  113 ttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtga-attttgcttaattgatg-at 210  Q
    || | |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||| | ||||||||||| |     
T  12264831 ttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgagattatacttaattgatgaaa 12264930  T
Q  211 ttgtgataagttg-tgttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttgacaaaacatgttgttgtgagtgaataataacttgggtatat 309  Q
    || ||||| |||| ||||||| |||| || ||  || | ||| || |||||||||| |   ||   ||||||||||| |||||| || |||||||||||     
T  12264931 ttttgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatg-ttccattgatgttgttgctattaactgatgttgttgtgggtgaattatgacttgggtatac 12265029  T
Q  310 ataattatggattgatgatg 329  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  12265030 ataattatggattgatgatg 12265049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 192
Target Start/End: Original strand, 12902026 - 12902208
Alignment:
Q  11 atcatcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgtt 110  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||  ||||||||||||||| | || |||| ||    
T  12902026 atcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataatttttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatt 12902125  T
Q  111 t-cttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaa 192  Q
    | ||| | |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  12902126 ttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa 12902208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 18911310 - 18911113
Alignment:
Q  14 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-c 112  Q
    ||||||||||  | ||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||| || || | ||| |    
T  18911310 atcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttc 18911211  T
Q  113 ttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 209  Q
    || | |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| | ||||||||||||    
T  18911210 ttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatga 18911113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 32 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 25059038 - 25058859
Alignment:
Q  32 ttttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttg-ttgtttcttatacatgaattgattg 130  Q
    ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | || || |  |||||| | |||||||||||      
T  25059038 ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatga 25058939  T
Q  131 ttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 209  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||    
T  25058938 ttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 25058859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 12 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 44229304 - 44229130
Alignment:
Q  12 tcatcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatg-ttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgtt 110  Q
    |||||||||||||||  || ||||  || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| || || | ||    
T  44229304 tcatcataatcaattcaaattttttcat-ttctcatggttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgatgttaaatccgtgctcttgttgtgatgctatt 44229206  T
Q  111 t-cttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaag 185  Q
    | ||| | |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  44229205 ttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgtcaag 44229130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 41 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 49232726 - 49232556
Alignment:
Q  41 ttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttg-ttgtttcttatacatgaattgattgttatggtat 139  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | || || |  |||||| | |||||||||||  |||||||||    
T  49232726 ttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtat 49232627  T
Q  140 gtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 209  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||    
T  49232626 gtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 49232556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 186
Target Start/End: Original strand, 15468279 - 15468452
Alignment:
Q  14 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-c 112  Q
    ||||||||||  | ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||  ||||||||||||||| |||| || | ||| |    
T  15468279 atcataatcatgtacaaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgaggaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctatgatgctattttc 15468378  T
Q  113 ttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagt 186  Q
    || | |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  15468379 ttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagt 15468452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 22275526 - 22275353
Alignment:
Q  14 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-c 112  Q
    ||||||||||  | ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | || ||   ||| |    
T  22275526 atcataatcatgtacaaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgccattttc 22275427  T
Q  113 ttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagt 186  Q
    || | |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  22275426 ttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagt 22275353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 41 - 209
Target Start/End: Original strand, 1467705 - 1467875
Alignment:
Q  41 ttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-cttatacatgaattgattgttatggtat 139  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| | || || | ||| ||| | | |||||||||  |||||||||    
T  1467705 ttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtat 1467804  T
Q  140 gtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 209  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||    
T  1467805 gtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 1467875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 5228632 - 5228433
Alignment:
Q  11 atcatcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgtt 110  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||| || |||||||||  || ||||||||||||||||||| ||  ||  ||||||||||||||| | || |||| ||    
T  5228632 atcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgtgttatgaaaatgggttgatgaaca-ttgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatt 5228534  T
Q  111 tc-ttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtga-attttgcttaattgatg 208  Q
    || || | |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||| ||| ||| | |||||||||||    
T  5228533 tccttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaaatatgtataaatgttaagttatgagattatacttaattgatg 5228434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 41 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 12812131 - 12811961
Alignment:
Q  41 ttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-cttatacatgaattgattgttatggtat 139  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||| | |  || | ||| ||| | | |||||||||  |||||||||    
T  12812131 ttctcatattgtatgaaaatgggttgatggacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtaatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtat 12812032  T
Q  140 gtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaattt-tgcttaattgatga 209  Q
    |||| ||| || ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  12812031 gtttatgggtggaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaatttatgcttaattgatga 12811961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 161
Target Start/End: Original strand, 18896983 - 18897131
Alignment:
Q  14 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttg-ttgtttc 112  Q
    ||||||||||  | ||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | || || |  ||||    
T  18896983 atcataatcatgtacaagttttgtattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgataaattcgtgctcttgctgtgatgctattttc 18897082  T
Q  113 ttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatgg 161  Q
    || | |||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  18897083 ttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtggaattacatgg 18897131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 32 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 41270374 - 41270309
Alignment:
Q  32 ttttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 97  Q
    ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  41270374 ttttgcatctactcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 41270309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 54651776 - 54651595
Alignment:
Q  12 tcatcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttg-ttgtt 110  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||  ||||||||||||||| | || || |  ||    
T  54651776 tcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattt 54651677  T
Q  111 tcttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaa 192  Q
    |||| | |||||||||||  | || ||||| |||||  ||||||| |||| | ||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  54651676 tcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgtgagtgaaattgcatgttgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa 54651595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 16821440 - 16821373
Alignment:
Q  30 aattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 97  Q
    ||||||| || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  16821440 aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaatttatgtcaaatccgtgctcttg 16821373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 191 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 19946836 - 19946757
Alignment:
Q  191 aattttgcttaattgatgatttgtgataagttgt-gttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttga 269  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  19946836 aattatgcttaattgatgatttatgacatgttgttgttgaattgaggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttga 19946757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 55316507 - 55316453
Alignment:
Q  43 ctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 97  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  55316507 ctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 55316453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 196 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 14285094 - 14285021
Alignment:
Q  196 tgcttaattgatgatttgtgataagttgt-gttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttg 268  Q
    |||||||||||||| || ||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  14285094 tgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 14285021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 265
Target Start/End: Original strand, 11477308 - 11477383
Alignment:
Q  191 aattttgcttaattgatgatttgtgataagttgtg-ttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttg 265  Q
    |||| |||||||||||||| || ||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  11477308 aattatgcttaattgatgaattatgacatgttgtggttgaattgaggtgagaatcaagtttcaattgatgttgttg 11477383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 285
Target Start/End: Original strand, 16934091 - 16934186
Alignment:
Q  191 aattttgcttaattgatgatttgtgataagttgt-gttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttgacaaaacatgttgttgt 285  Q
    |||| |||||||||||||| || ||| | ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||   | ||||||||||||    
T  16934091 aattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattaaggtgagaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagacatgttgttgt 16934186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 15615134 - 15615084
Alignment:
Q  30 aattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatg 80  Q
    ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15615134 aattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatg 15615084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 76
Target Start/End: Original strand, 15936571 - 15936636
Alignment:
Q  11 atcatcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaatt 76  Q
    ||||| |||||||  ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15936571 atcattataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaatt 15936636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 76
Target Start/End: Original strand, 15938413 - 15938478
Alignment:
Q  11 atcatcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaatt 76  Q
    ||||| |||||||  ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15938413 atcattataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaatt 15938478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 276 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 44229038 - 44228985
Alignment:
Q  276 atgttgttgtgagtgaataataacttgggtatatataattatggattgatgatg 329  Q
    ||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44229038 atgttgttgtgggtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatg 44228985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 191 - 285
Target Start/End: Original strand, 8268862 - 8268957
Alignment:
Q  191 aattttgcttaattgatgatttgtgataagttgt-gttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttgacaaaacatgttgttgt 285  Q
    |||| |||||||||||||| || ||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||   | ||||||||||||    
T  8268862 aattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgttattgttgctgagacatgttgttgt 8268957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 191 - 285
Target Start/End: Original strand, 8275962 - 8276057
Alignment:
Q  191 aattttgcttaattgatgatttgtgataagttgt-gttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttgacaaaacatgttgttgt 285  Q
    |||| |||||||||||||| || ||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||   | ||||||||||||    
T  8275962 aattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgttattgttgctgagacatgttgttgt 8276057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 268
Target Start/End: Original strand, 9303217 - 9303295
Alignment:
Q  191 aattttgcttaattgatgatttgtgataagttg-tgttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttg 268  Q
    |||| |||||||||||||| || ||| | |||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  9303217 aattatgcttaattgatgacttatgacatgttgctgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 9303295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 136 - 192
Target Start/End: Original strand, 11986236 - 11986292
Alignment:
Q  136 gtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaa 192  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| || || |||||||| ||||||||||| ||||    
T  11986236 gtatgattgtggttgaaattacatgttttaaagtatgtattaatgtcaagttatgaa 11986292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 25)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 209
Target Start/End: Original strand, 13720867 - 13721064
Alignment:
Q  14 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-c 112  Q
    ||||||||||  | ||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||| || || | ||| |    
T  13720867 atcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttc 13720966  T
Q  113 ttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 209  Q
    || | |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| | ||||||||||||    
T  13720967 ttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatga 13721064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 209
Target Start/End: Original strand, 22006197 - 22006394
Alignment:
Q  14 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttg-ttgtttc 112  Q
    ||||||||||  | ||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | || || |  ||||    
T  22006197 atcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttc 22006296  T
Q  113 ttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 209  Q
    || | |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||    
T  22006297 ttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 22006394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 209
Target Start/End: Original strand, 16872990 - 16873187
Alignment:
Q  14 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-c 112  Q
    ||||||||||  | ||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |  ||||||||||||||||| |  |||| ||| |    
T  16872990 atcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgctcttgttgtaatgttattttc 16873089  T
Q  113 ttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 209  Q
    || | |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| | ||||||||||||    
T  16873090 ttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatga 16873187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 16195548 - 16195230
Alignment:
Q  14 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgt-ttc 112  Q
    ||||||||||  | ||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||  |||||||| ||| || | || || | | |||    
T  16195548 atcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgttctcgtgctgtgatgctatgttc 16195449  T
Q  113 ttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtga-attttgcttaattgatg-at 210  Q
    || | |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||| | ||||||| ||| |     
T  16195448 ttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgagattatacttaatttatgaaa 16195349  T
Q  211 ttgtgataagttg-tgttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttgacaaaacatgttgttgtgagtgaataataacttgggtatat 309  Q
    || ||||| |||| ||||||| |||| || ||  || | ||| || |||||||||| |   ||   ||||||||| | |||||| || |||| |||||||    
T  16195348 ttttgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatg-ttccattgatgttgttgctattaactgatgttgttgagggtgaattatgacttaggtatat 16195250  T
Q  310 ataattatggattgatgatg 329  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  16195249 ataattatggattgatgatg 16195230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 41 - 209
Target Start/End: Original strand, 271326 - 271496
Alignment:
Q  41 ttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-cttatacatgaattgattgttatggtat 139  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| | || || | ||| ||| | | |||||||||  |||||||||    
T  271326 ttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtat 271425  T
Q  140 gtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 209  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||    
T  271426 gtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 271496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 41 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 644594 - 644424
Alignment:
Q  41 ttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-cttatacatgaattgattgttatggtat 139  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| | || || | ||| ||| | | |||||||||  |||||||||    
T  644594 ttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtat 644495  T
Q  140 gtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 209  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||    
T  644494 gtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 644424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 41 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 830329 - 830159
Alignment:
Q  41 ttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-cttatacatgaattgattgttatggtat 139  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| | || || | ||| ||| | | |||||||||  |||||||||    
T  830329 ttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtat 830230  T
Q  140 gtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 209  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||    
T  830229 gtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 830159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 209
Target Start/End: Original strand, 13662204 - 13662401
Alignment:
Q  14 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-c 112  Q
    ||||||||||  | ||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||  ||||||||||||||| | || || | ||| |    
T  13662204 atcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgataaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttc 13662303  T
Q  113 ttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 209  Q
    || | |||||||  ||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||    
T  13662304 ttgtgcatgaatgnatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 13662401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 209
Target Start/End: Original strand, 22088730 - 22088930
Alignment:
Q  11 atcatcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgtt 110  Q
    |||||||||||||  | |||  |||| || ||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| | || || | ||    
T  22088730 atcatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgtgttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctatt 22088829  T
Q  111 t-cttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatg 208  Q
    | ||| | | |||||||||  ||||||||||||| | | |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||||    
T  22088830 ttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttataggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatg 22088929  T
Q  209 a 209  Q
    |    
T  22088930 a 22088930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 41 - 209
Target Start/End: Original strand, 15319125 - 15319295
Alignment:
Q  41 ttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-cttatacatgaattgattgttatggtat 139  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| | || |  | ||| ||| | | |||||||||  |||||||||    
T  15319125 ttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatactattttcttgtgcttgaattgatgattatggtat 15319224  T
Q  140 gtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 209  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||| | ||||||||||||||  |||| || |||| ||||||||||||||    
T  15319225 gtttatgggtgaaattacatgtttctaagtatgtataaatgttgagttatgaaattatgcttaattgatga 15319295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 41 - 209
Target Start/End: Original strand, 15499494 - 15499664
Alignment:
Q  41 ttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-cttatacatgaattgattgttatggtat 139  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| | || |  | ||| ||| | | |||||||||  |||||||||    
T  15499494 ttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatactattttcttgtgcttgaattgatgattatggtat 15499593  T
Q  140 gtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 209  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||| | ||||||||||||||  |||| || |||| ||||||||||||||    
T  15499594 gtttatgggtgaaattacatgtttctaagtatgtataaatgttgagttatgaaattatgcttaattgatga 15499664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 43 - 97
Target Start/End: Original strand, 21844536 - 21844590
Alignment:
Q  43 ctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 97  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21844536 ctcatgttgtatgaaattgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 21844590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 43 - 97
Target Start/End: Original strand, 21851929 - 21851983
Alignment:
Q  43 ctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 97  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21851929 ctcatgttgtatgaaattgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 21851983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 24549282 - 24549216
Alignment:
Q  30 aattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctctt 96  Q
    ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  24549282 aattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgctctt 24549216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 30121011 - 30120956
Alignment:
Q  42 tctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 97  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  30121011 tctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 30120956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 96
Target Start/End: Original strand, 6774209 - 6774275
Alignment:
Q  30 aattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctctt 96  Q
    ||||||| || |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  6774209 aattttgcattttctcatgttatatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgctctt 6774275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 191 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 22147576 - 22147498
Alignment:
Q  191 aattttgcttaattgatgatttgtgataagttgt-gttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttg 268  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||    
T  22147576 aattatgcttaattgatgaattgtgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaaattttaattgatgttgttgttg 22147498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 96
Target Start/End: Original strand, 16674356 - 16674409
Alignment:
Q  43 ctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctctt 96  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  16674356 ctcatgttgtatgaaaatgggttgttgaacaattcatgctaaattcgtgctctt 16674409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 191 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 22886464 - 22886387
Alignment:
Q  191 aattttgcttaattgatgatttgtgataagttgtgttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttg 268  Q
    |||| ||||||||||||||  | ||| | |||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  22886464 aattatgcttaattgatgaactatgacatgttgttgtgaattgaggtgagaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 22886387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 191 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 2545084 - 2545005
Alignment:
Q  191 aattttgcttaattgatgatttgtgataagttgt-gttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttga 269  Q
    |||| |||||||||||||| || | | | ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  2545084 aattatgcttaattgatgaattataacatgttgttgttgaattgaggtgggaatcaagtttcaattgatgttgttgttga 2545005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 191 - 285
Target Start/End: Original strand, 3431398 - 3431493
Alignment:
Q  191 aattttgcttaattgatgatttgtgataagttgt-gttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttgacaaaacatgttgttgt 285  Q
    |||| |||||||||||||| || ||| | ||||| |||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||||   | ||||||||||||    
T  3431398 aattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattaaggtgagaatcaagtttcgattgatgttgttgttgctgagacatgttgttgt 3431493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 224 - 268
Target Start/End: Original strand, 21494600 - 21494644
Alignment:
Q  224 tgttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttg 268  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  21494600 tgttggattgaggtgagaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 21494644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 282 - 329
Target Start/End: Original strand, 13662474 - 13662521
Alignment:
Q  282 ttgtgagtgaataataacttgggtatatataattatggattgatgatg 329  Q
    |||||||||||| || | ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13662474 ttgtgagtgaatcatgatttgggtatacataattatggattgatgatg 13662521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 191 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 18612544 - 18612449
Alignment:
Q  191 aattttgcttaattgatgatttgtgataagttgt-gttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttgacaaaacatgttgttgt 285  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||  || |||| || ||| |||||||||||||   | ||||||||||||    
T  18612544 aattatgcttaattgatgaattgtgacatgttgttgttgaattgaggtggaaatcaagatttaattgatgttgttgttgctgagacatgttgttgt 18612449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 191 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 18619449 - 18619354
Alignment:
Q  191 aattttgcttaattgatgatttgtgataagttgt-gttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttgacaaaacatgttgttgt 285  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||  || |||| || ||| |||||||||||||   | ||||||||||||    
T  18619449 aattatgcttaattgatgaattgtgacatgttgttgttgaattgaggtggaaatcaagatttaattgatgttgttgttgctgagacatgttgttgt 18619354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 74; Significance: 7e-34; HSPs: 3)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 209
Target Start/End: Original strand, 153946 - 154143
Alignment:
Q  14 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttg-ttgtttc 112  Q
    ||||||||||  | ||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | || || |  ||||    
T  153946 atcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttc 154045  T
Q  113 ttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 209  Q
    || | |||||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||    
T  154046 ttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaagttacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 154143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 97
Target Start/End: Original strand, 169863 - 169930
Alignment:
Q  30 aattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 97  Q
    ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  169863 aattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 169930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 36394 - 36326
Alignment:
Q  30 aattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgt 98  Q
    ||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  36394 aattttgcatattctcatgttgtatgaaactgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgt 36326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0191 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0191
Description:

Target: scaffold0191; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 185
Target Start/End: Original strand, 7395 - 7567
Alignment:
Q  14 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-c 112  Q
    ||||||||||  ||| | ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |   ||||||||||||||||| || || | ||| |    
T  7395 atcataatcatgttccatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattattactaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttc 7494  T
Q  113 ttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaag 185  Q
    || | ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  7495 ttgtgcatgaattgaagattatggtatgtttgtggatgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgtcaag 7567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0191; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 276 - 329
Target Start/End: Original strand, 7659 - 7712
Alignment:
Q  276 atgttgttgtgagtgaataataacttgggtatatataattatggattgatgatg 329  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7659 atgttgttgtgagtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatg 7712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1500 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold1500
Description:

Target: scaffold1500; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 209
Target Start/End: Original strand, 1453 - 1650
Alignment:
Q  14 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-c 112  Q
    ||||||||||  | ||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||| |  || | ||| |    
T  1453 atcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtaatgctattttc 1552  T
Q  113 ttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 209  Q
    || | |||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| | ||||||||||||    
T  1553 ttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatga 1650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 209
Target Start/End: Original strand, 1514 - 1711
Alignment:
Q  14 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-c 112  Q
    ||||||||||  ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||  ||| |||||| |||| | || || | ||| |    
T  1514 atcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaaatcgtgcacttgctgtgatgctattttc 1613  T
Q  113 ttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 209  Q
    || | |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| | ||||||||||||    
T  1614 ttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatga 1711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 54193 - 54013
Alignment:
Q  12 tcatcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttg-tt 110  Q
    |||||||||||||||  || ||||| || |||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||  | || || || ||    
T  54193 tcatcataatcaattcaaatttttgcattttctcatgttttatgaaaatgggttgatgaacaattgatgctaaattcgtgctcttactgtgatgctgttt 54094  T
Q  111 tcttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaa 192  Q
    |||| | |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | |||||||| ||| ||||||||||    
T  54093 tcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacat-gttcaaagcatgtataattgttaagttgtgaa 54013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 69; Significance: 7e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 209
Target Start/End: Original strand, 10279 - 10475
Alignment:
Q  15 tcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttg-ttgtttct 113  Q
    |||||||||  ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||  ||||||||||||||| | || || |  |||||    
T  10279 tcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgatattttct 10378  T
Q  114 tatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 209  Q
    | | |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||| || |||| | ||||||||||||    
T  10379 tgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgctaagttatgaaattatacttaattgatga 10475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 41 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 31599 - 31429
Alignment:
Q  41 ttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-cttatacatgaattgattgttatggtat 139  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| | || || | ||| ||| | | |||||||||  |||||||||    
T  31599 ttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtat 31500  T
Q  140 gtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 209  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||    
T  31499 gtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 31429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 42 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 39935 - 39766
Alignment:
Q  42 tctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatg-ttgttgtttcttatacatgaattgattgttatggtatg 140  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | || || |  |||| | | |||||||||||  |||||||||     
T  39935 tctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgattctattttcctgtgcatgaattgatgattatggtatt 39836  T
Q  141 tttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 209  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| | ||||||||||||    
T  39835 tttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattattcttaattgatga 39766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 41 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 39393 - 39223
Alignment:
Q  41 ttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-cttatacatgaattgattgttatggtat 139  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| | || || | ||| ||| | | |||||||||  |||||||||    
T  39393 ttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtat 39294  T
Q  140 gtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 209  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||    
T  39293 gtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 39223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 41 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 43287 - 43231
Alignment:
Q  41 ttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 97  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43287 ttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgagcaattcatgtcaaattcgtgctcttg 43231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0892 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0892
Description:

Target: scaffold0892; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 12 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 3732 - 3552
Alignment:
Q  12 tcatcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttg-tt 110  Q
    |||||||||||||||  || ||||| || |||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||  | || ||||| ||    
T  3732 tcatcataatcaattcaaatttttgcattttctcatgttttatgaaaatgggttgatgaacaattgatgctaaattagtgctcttactgtgatgttgttt 3633  T
Q  111 tcttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaa 192  Q
    |||| | |||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| | |||||||| ||| ||||||||||    
T  3632 tcttgtccatgaattgatgattatggtatgattgtgggtgaaattacat-gttcaaagcatgtataattgttaagttgtgaa 3552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 32 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 2691 - 2536
Alignment:
Q  32 ttttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-cttatacatgaattgattg 130  Q
    ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||   ||||||||||||||   || || | ||| ||| | |||||||||||      
T  2691 ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctcaattcgtgctcttgccgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgc 2592  T
Q  131 ttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagt 186  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  2591 ttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagt 2536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 59; Significance: 6e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 41 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 29452 - 29282
Alignment:
Q  41 ttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttg-ttgtttcttatacatgaattgattgttatggtat 139  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| | || || |  |||||| | | ||||||| |  ||||| |||    
T  29452 ttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgttgattatgttat 29353  T
Q  140 gtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 209  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||    
T  29352 gtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtgtaaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 29282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 57; Significance: 9e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 209
Target Start/End: Original strand, 34095 - 34294
Alignment:
Q  12 tcatcataatcaatttcaaattttgaatcttctcat-gttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgtt 110  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||| || ||||||| |||||| |||| |||||||||||| ||||  ||  ||||||||||||||| | ||  | | ||    
T  34095 tcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcattgttgtatgaaa-tgggttgatgaaaaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgaagctatt 34193  T
Q  111 t-cttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaa-ttttgcttaattgatg 208  Q
    | ||| | |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||| || | |||||||||||    
T  34194 ttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaagttatacttaattgatg 34293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 30 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 3263 - 3056
Alignment:
Q  30 aattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgt-ttcttatacatgaattgat 128  Q
    ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| | || |||| | ||  ||| |||||||||||    
T  3263 aattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatccatgaattgat 3164  T
Q  129 tgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg--aattttgcttaattgatgatttgtgataagttg-tg 225  Q
      | || ||||| |||| | ||||||||||| ||||||| |||||| |||||| ||||||||  |||| |||| ||||| ||| || || ||||||| ||    
T  3163 gataattgtatgattgttggtgaaattacat-gttcaat-tatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttg 3066  T
Q  226 ttgaattgag 235  Q
    ||||||||||    
T  3065 ttgaattgag 3056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 43 - 97
Target Start/End: Original strand, 64487 - 64541
Alignment:
Q  43 ctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 97  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  64487 ctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 64541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 108066 - 108001
Alignment:
Q  11 atcatcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaatt 76  Q
    ||||| |||||||  ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  108066 atcattataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaatt 108001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0516 (Bit Score: 49; Significance: 6e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0516
Description:

Target: scaffold0516; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 14 - 97
Target Start/End: Original strand, 12066 - 12149
Alignment:
Q  14 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatg-ttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 97  Q
    ||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  12066 atcataatcaatttcaaatttttcat-ttctcatggttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgatgttaaattcgtgctcttg 12149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 4039 - 3892
Alignment:
Q  14 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttg-ttgtttc 112  Q
    ||||||||||  | ||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || || |  ||||    
T  4039 atcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttc 3940  T
Q  113 ttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatg 160  Q
    || | |||||||||||  | || ||||| |||| | ||||||||||||    
T  3939 ttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg 3892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 93
Target Start/End: Original strand, 9300 - 9363
Alignment:
Q  30 aattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgct 93  Q
    ||||||| || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9300 aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgct 9363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 93
Target Start/End: Original strand, 16198 - 16261
Alignment:
Q  30 aattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgct 93  Q
    ||||||| || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16198 aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgct 16261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 47; Significance: 9e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 43 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 323 - 269
Alignment:
Q  43 ctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 97  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  323 ctcatgttatatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 47; Significance: 9e-18; HSPs: 3)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 47 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 45314 - 45168
Alignment:
Q  47 tgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgtttct-tatacatgaattgattgttatggtatgtttgt 145  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||| |||||| || || | |||   | | |||||||||||  | || ||||| ||||    
T  45314 tgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgttaaattcgtgcccttgttgtgatgctattttgatgtgcatgaattgatgataattgtatgattgt 45215  T
Q  146 ggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaa 192  Q
    || |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  45214 gggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgtcaagttttgaa 45168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 47 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 54700 - 54416
Alignment:
Q  47 tgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-cttatacatgaattgattgttatggtatgtttgt 145  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||  |||| | || || | ||| ||| | |||||||||||  | || ||||| ||||    
T  54700 tgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgttaaattcgtgtccttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgt 54601  T
Q  146 ggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatgatttgtgataagttg-tgttgaattgaggtgagaaa 243  Q
    || ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||| | || ||||| ||| || ||||| |||| ||||||| |||| || ||      
T  54600 gggtgaaattgcatgtttcaaagtatgtataaatgtcaagttatgaaattgtactcaattggtgaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtgatt 54501  T
Q  244 caagtttcaatggatgttgttgttgacaaaacatgttgttgtgagtgaataataacttgggtatatataattatggattgatgatg 329  Q
    || | ||| || |||||||||| |   ||   ||||||||||| |||||| || | ||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  54500 catg-ttccattgatgttgttgctattaactgatgttgttgtgggtgaatcatgagttgggtatacatatttatggattgatgatg 54416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 276 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 45064 - 45011
Alignment:
Q  276 atgttgttgtgagtgaataataacttgggtatatataattatggattgatgatg 329  Q
    ||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  45064 atgttgttgtgggtgaatcatgacttgggtatacatatttatggattgatgatg 45011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1666 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold1666
Description:

Target: scaffold1666; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 109 - 209
Target Start/End: Original strand, 31 - 132
Alignment:
Q  109 tttcttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgat 207  Q
    |||||| | |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||| || |||| | ||||||||||    
T  31 tttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtgtaaatgttaagttatgaaattatacttaattgat 130  T
Q  208 ga 209  Q
    ||    
T  131 ga 132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 30 - 99
Target Start/End: Original strand, 21067 - 21136
Alignment:
Q  30 aattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgtt 99  Q
    ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  21067 aattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgtt 21136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 77
Target Start/End: Original strand, 14013 - 14060
Alignment:
Q  30 aattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattc 77  Q
    ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  14013 aattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgcacaattc 14060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 98
Target Start/End: Original strand, 31626 - 31694
Alignment:
Q  30 aattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgt 98  Q
    ||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  31626 aattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgt 31694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 97
Target Start/End: Original strand, 5151 - 5234
Alignment:
Q  14 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 97  Q
    ||||||||||  | ||| ||||| || |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  5151 atcataatcatgtacaatttttgcattttctcacgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgttaaattcgtgctcttg 5234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1711 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1711
Description:

Target: scaffold1711; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 97
Target Start/End: Original strand, 1268 - 1322
Alignment:
Q  43 ctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 97  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  1268 ctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 1322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 191 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 11882 - 11788
Alignment:
Q  191 aattttgcttaattgatgatttgtgataagttgtgttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttgacaaaacatgttgttgt 285  Q
    |||| |||||||||||||| |  ||| | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||   | ||||||||||||    
T  11882 aattatgcttaattgatgaatcatgacatgttttgttgaattgaggtgagaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagacatgttgttgt 11788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 14 - 99
Target Start/End: Original strand, 10687 - 10772
Alignment:
Q  14 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgtt 99  Q
    ||||||||||  | ||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||    
T  10687 atcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgtt 10772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 41 - 96
Target Start/End: Original strand, 13287 - 13342
Alignment:
Q  41 ttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctctt 96  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  13287 ttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgctctt 13342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 17836 - 17761
Alignment:
Q  191 aattttgcttaattgatgatttgtgataagttgt-gttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttg 265  Q
    |||| |||||||||||||| || ||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  17836 aattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagtttcaattgatgttgttg 17761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0173 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0173
Description:

Target: scaffold0173; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 5359 - 5264
Alignment:
Q  191 aattttgcttaattgatgatttgtgataagttgt-gttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttgacaaaacatgttgttgt 285  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||| |||| || ||| |||||||||||||   | ||||||||||||    
T  5359 aattatgcttaattgatgaattgtgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagatttaattgatgttgttgttgctgagacatgttgttgt 5264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 198 - 268
Target Start/End: Original strand, 49972 - 50043
Alignment:
Q  198 cttaattgatgatttgtgataagttgtg-ttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttg 268  Q
    |||||||||||| || ||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  49972 cttaattgatgaattatgacatgttgtggttgaattgaggtgagaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 50043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 191 - 268
Target Start/End: Original strand, 5698 - 5776
Alignment:
Q  191 aattttgcttaattgatgatttgtgataagttgt-gttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttg 268  Q
    |||| ||||||||| |||| || ||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  5698 aattatgcttaattaatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 5776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 191 - 268
Target Start/End: Original strand, 165083 - 165161
Alignment:
Q  191 aattttgcttaattgatgatttgtgataagttgt-gttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttg 268  Q
    |||| |||||||||||||| || ||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  165083 aattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgttgttgttg 165161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 191 - 267
Target Start/End: Original strand, 34530 - 34607
Alignment:
Q  191 aattttgcttaattgatgatttgtgataagttgt-gttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgtt 267  Q
    |||| |||||||||||||| || ||| | ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||    
T  34530 aattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgaaaatcaagtttcaattgatgttgttgtt 34607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 130694 - 130616
Alignment:
Q  191 aattttgcttaattgatgatttgtgataagttgt-gttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttg 268  Q
    |||| |||||||||||||| || ||| | ||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  130694 aattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 130616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 192
Target Start/End: Original strand, 56169 - 56225
Alignment:
Q  136 gtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaa 192  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||    
T  56169 gtatgattgtggctgaaattacatgttttaaagtatgtataaatgtcaagttatgaa 56225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 199 - 268
Target Start/End: Original strand, 13409 - 13479
Alignment:
Q  199 ttaattgatgatttgtgataagttgt-gttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttg 268  Q
    ||||||||||| || ||| | ||||| ||||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||||||    
T  13409 ttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtggaaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 13479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0615 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0615
Description:

Target: scaffold0615; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 265
Target Start/End: Original strand, 6339 - 6408
Alignment:
Q  197 gcttaattgatgatttgtgataagttgt-gttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttg 265  Q
    ||||||||||||| || ||| | ||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  6339 gcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttg 6408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University