View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF16124_low_57 (Length: 224)

Name: NF16124_low_57
Description: NF16124
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF16124_low_57
NF16124_low_57
[»] chr2 (55 HSPs)
chr2 (36-194)||(43410412-43410570)
chr2 (36-194)||(39691476-39691634)
chr2 (36-184)||(8947031-8947179)
chr2 (39-194)||(17695319-17695474)
chr2 (36-194)||(37322414-37322573)
chr2 (51-184)||(45235582-45235715)
chr2 (36-184)||(14523351-14523499)
chr2 (39-177)||(16377642-16377784)
chr2 (36-184)||(34225576-34225724)
chr2 (36-184)||(43115781-43115929)
chr2 (54-184)||(16805885-16806015)
chr2 (54-184)||(16845166-16845296)
chr2 (39-173)||(35313876-35314010)
chr2 (36-173)||(15359077-15359214)
chr2 (51-184)||(5789627-5789760)
chr2 (51-184)||(16463690-16463823)
chr2 (36-184)||(34120418-34120564)
chr2 (51-194)||(31448662-31448805)
chr2 (104-194)||(19937731-19937821)
chr2 (36-173)||(39785571-39785711)
chr2 (36-184)||(25637467-25637614)
chr2 (39-151)||(35242309-35242421)
chr2 (51-129)||(17346396-17346474)
chr2 (36-166)||(36794270-36794400)
chr2 (50-152)||(41220957-41221059)
chr2 (51-136)||(39329691-39329775)
chr2 (36-128)||(26608178-26608270)
chr2 (51-135)||(32831203-32831287)
chr2 (36-184)||(36354422-36354570)
chr2 (51-144)||(28186215-28186308)
chr2 (75-173)||(27866517-27866614)
chr2 (51-184)||(11742508-11742640)
chr2 (51-177)||(18853186-18853313)
chr2 (36-101)||(19937371-19937436)
chr2 (68-158)||(19426473-19426564)
chr2 (36-102)||(9458327-9458393)
chr2 (36-134)||(19444132-19444230)
chr2 (51-157)||(34451341-34451447)
chr2 (84-157)||(1206709-1206782)
chr2 (39-100)||(3323335-3323396)
chr2 (42-134)||(43730608-43730697)
chr2 (39-98)||(7438917-7438976)
chr2 (36-98)||(5272204-5272266)
chr2 (36-92)||(7494909-7494965)
chr2 (39-178)||(28170568-28170707)
chr2 (36-109)||(17122970-17123043)
chr2 (123-184)||(26607947-26608008)
chr2 (51-100)||(26863421-26863470)
chr2 (90-130)||(10005157-10005197)
chr2 (90-173)||(32783404-32783487)
chr2 (51-134)||(43730433-43730514)
chr2 (122-184)||(3323265-3323327)
chr2 (39-167)||(43699595-43699720)
chr2 (39-79)||(1206775-1206815)
chr2 (39-75)||(25904777-25904813)
[»] chr5 (49 HSPs)
chr5 (36-194)||(6315746-6315904)
chr5 (36-184)||(8724988-8725136)
chr5 (36-184)||(27542781-27542929)
chr5 (36-177)||(1248590-1248731)
chr5 (39-184)||(31655042-31655187)
chr5 (36-185)||(27580586-27580736)
chr5 (36-184)||(6753638-6753785)
chr5 (36-184)||(7827905-7828053)
chr5 (39-184)||(4818540-4818685)
chr5 (39-184)||(8698298-8698443)
chr5 (39-184)||(40530203-40530348)
chr5 (36-184)||(40899904-40900052)
chr5 (39-177)||(29570381-29570519)
chr5 (39-184)||(42803599-42803744)
chr5 (36-184)||(21060616-21060764)
chr5 (39-166)||(29374331-29374458)
chr5 (51-157)||(4441022-4441128)
chr5 (39-184)||(9515725-9515880)
chr5 (59-177)||(29856056-29856172)
chr5 (39-177)||(6615866-6616003)
chr5 (42-151)||(11796179-11796288)
chr5 (89-178)||(32440180-32440269)
chr5 (36-173)||(19929932-19930069)
chr5 (39-152)||(22848395-22848508)
chr5 (39-184)||(2232052-2232193)
chr5 (42-178)||(6754021-6754156)
chr5 (39-178)||(41478816-41478955)
chr5 (51-183)||(41496081-41496213)
chr5 (60-135)||(38161440-38161515)
chr5 (51-157)||(37184085-37184191)
chr5 (51-178)||(30512670-30512798)
chr5 (51-178)||(30553010-30553138)
chr5 (39-178)||(41492291-41492430)
chr5 (69-177)||(15439305-15439413)
chr5 (51-184)||(15818459-15818594)
chr5 (72-184)||(11904227-11904340)
chr5 (37-134)||(5129261-5129358)
chr5 (36-133)||(41062190-41062287)
chr5 (85-177)||(38508173-38508265)
chr5 (51-134)||(18841480-18841563)
chr5 (51-129)||(26285512-26285590)
chr5 (90-184)||(843480-843571)
chr5 (92-157)||(5282384-5282449)
chr5 (59-152)||(8493849-8493942)
chr5 (85-157)||(14339338-14339410)
chr5 (51-126)||(39325864-39325939)
chr5 (85-167)||(5731811-5731893)
chr5 (55-95)||(843293-843333)
chr5 (119-151)||(24335307-24335339)
[»] chr4 (88 HSPs)
chr4 (40-194)||(52247405-52247559)
chr4 (36-194)||(38405079-38405237)
chr4 (36-194)||(49428319-49428477)
chr4 (39-184)||(16821318-16821463)
chr4 (39-184)||(7061651-7061796)
chr4 (36-194)||(42616880-42617038)
chr4 (39-184)||(6643647-6643792)
chr4 (54-173)||(52859797-52859916)
chr4 (39-184)||(17237283-17237428)
chr4 (39-184)||(34360644-34360789)
chr4 (39-184)||(47464352-47464497)
chr4 (36-184)||(6609747-6609895)
chr4 (36-194)||(5841404-5841563)
chr4 (39-177)||(53346748-53346886)
chr4 (51-184)||(35311210-35311343)
chr4 (39-184)||(43237232-43237377)
chr4 (39-184)||(49175921-49176066)
chr4 (36-184)||(30682183-30682331)
chr4 (36-184)||(33790718-33790866)
chr4 (36-184)||(28500878-28501018)
chr4 (36-171)||(35380333-35380468)
chr4 (51-173)||(11907597-11907719)
chr4 (51-194)||(11288607-11288749)
chr4 (36-167)||(21240708-21240839)
chr4 (36-184)||(22130029-22130181)
chr4 (36-166)||(47773024-47773154)
chr4 (36-166)||(54506774-54506904)
chr4 (36-157)||(461944-462065)
chr4 (51-184)||(32884802-32884935)
chr4 (36-149)||(50264102-50264215)
chr4 (36-183)||(42517626-42517776)
chr4 (36-176)||(49746947-49747086)
chr4 (40-159)||(36985776-36985895)
chr4 (53-191)||(19265811-19265949)
chr4 (52-168)||(2942648-2942763)
chr4 (36-177)||(2653406-2653545)
chr4 (51-129)||(18741516-18741594)
chr4 (36-166)||(38502487-38502617)
chr4 (51-177)||(40122848-40122974)
chr4 (51-184)||(47358936-47359069)
chr4 (36-184)||(2066775-2066923)
chr4 (72-184)||(30192227-30192339)
chr4 (51-166)||(17114441-17114556)
chr4 (39-184)||(44536183-44536327)
chr4 (39-136)||(53412097-53412194)
chr4 (36-151)||(26147635-26147751)
chr4 (84-184)||(46396870-46396970)
chr4 (41-159)||(48914155-48914278)
chr4 (38-184)||(39397332-39397478)
chr4 (51-184)||(35998813-35998945)
chr4 (51-184)||(41711443-41711576)
chr4 (84-184)||(52869106-52869206)
chr4 (39-134)||(7986963-7987058)
chr4 (52-184)||(5618549-5618676)
chr4 (51-170)||(43902252-43902374)
chr4 (106-194)||(51625139-51625227)
chr4 (51-158)||(25233182-25233289)
chr4 (51-120)||(25142430-25142499)
chr4 (84-177)||(29575142-29575235)
chr4 (89-157)||(3098757-3098825)
chr4 (36-184)||(3689548-3689696)
chr4 (40-100)||(10754363-10754423)
chr4 (40-100)||(10968132-10968192)
chr4 (95-157)||(35251934-35251996)
chr4 (51-117)||(44526380-44526446)
chr4 (40-101)||(10672643-10672704)
chr4 (40-101)||(10886283-10886344)
chr4 (56-136)||(13016666-13016746)
chr4 (36-129)||(20612213-20612306)
chr4 (51-100)||(51624787-51624836)
chr4 (36-98)||(31370373-31370435)
chr4 (83-157)||(32469962-32470036)
chr4 (89-131)||(37868638-37868680)
chr4 (51-184)||(49579165-49579298)
chr4 (72-157)||(16506248-16506332)
chr4 (51-184)||(18532180-18532313)
chr4 (51-136)||(38663482-38663567)
chr4 (85-177)||(4972595-4972687)
chr4 (104-176)||(8175575-8175647)
chr4 (51-126)||(2400779-2400854)
chr4 (86-129)||(17512381-17512424)
chr4 (45-116)||(23915485-23915555)
chr4 (42-101)||(30260996-30261055)
chr4 (36-78)||(28911249-28911291)
chr4 (41-134)||(54202187-54202283)
chr4 (83-148)||(27880264-27880329)
chr4 (119-151)||(28757610-28757642)
chr4 (102-134)||(54123668-54123700)
[»] chr3 (65 HSPs)
chr3 (36-177)||(37695654-37695795)
chr3 (39-184)||(36460397-36460542)
chr3 (37-184)||(37311937-37312084)
chr3 (36-184)||(1778629-1778776)
chr3 (49-173)||(24569092-24569216)
chr3 (36-184)||(30190641-30190789)
chr3 (39-194)||(51837930-51838085)
chr3 (39-184)||(43253844-43253989)
chr3 (51-191)||(11905823-11905963)
chr3 (36-184)||(37772945-37773093)
chr3 (51-184)||(28690763-28690896)
chr3 (39-184)||(44301551-44301696)
chr3 (36-184)||(19822997-19823145)
chr3 (37-184)||(36476571-36476718)
chr3 (36-157)||(3901157-3901278)
chr3 (39-194)||(8679025-8679180)
chr3 (39-184)||(12736553-12736698)
chr3 (36-147)||(39043772-39043886)
chr3 (60-151)||(54477473-54477564)
chr3 (36-184)||(5322920-5323066)
chr3 (51-184)||(19611910-19612042)
chr3 (39-184)||(30711062-30711207)
chr3 (36-184)||(29023947-29024094)
chr3 (52-184)||(38795346-38795478)
chr3 (36-184)||(10366623-10366778)
chr3 (36-173)||(37497478-37497615)
chr3 (36-173)||(54726471-54726608)
chr3 (51-167)||(23004380-23004496)
chr3 (56-184)||(48540981-48541109)
chr3 (36-184)||(3313240-3313384)
chr3 (37-159)||(30682072-30682194)
chr3 (51-184)||(34750497-34750630)
chr3 (36-184)||(14194542-14194689)
chr3 (39-177)||(11632070-11632207)
chr3 (51-177)||(27471336-27471462)
chr3 (37-178)||(17652739-17652876)
chr3 (39-157)||(12904853-12904972)
chr3 (51-129)||(45710851-45710929)
chr3 (85-194)||(49830164-49830274)
chr3 (51-173)||(53560218-53560340)
chr3 (36-157)||(19609285-19609406)
chr3 (51-184)||(34957504-34957637)
chr3 (55-183)||(43719272-43719399)
chr3 (51-177)||(30861395-30861521)
chr3 (39-184)||(49447775-49447917)
chr3 (51-166)||(52290894-52291009)
chr3 (38-120)||(38705163-38705244)
chr3 (51-157)||(26467110-26467217)
chr3 (51-134)||(36462977-36463060)
chr3 (51-136)||(25108554-25108639)
chr3 (69-134)||(38512044-38512109)
chr3 (51-100)||(41351629-41351678)
chr3 (51-110)||(41038448-41038507)
chr3 (39-116)||(33491408-33491486)
chr3 (51-113)||(38137498-38137560)
chr3 (59-120)||(33459056-33459117)
chr3 (123-184)||(33491064-33491125)
chr3 (91-136)||(52206876-52206921)
chr3 (74-118)||(27955906-27955950)
chr3 (54-113)||(37804839-37804898)
chr3 (85-184)||(50035198-50035297)
chr3 (42-116)||(1018908-1018982)
chr3 (36-102)||(23068184-23068250)
chr3 (61-98)||(37804796-37804833)
chr3 (114-178)||(7757591-7757655)
[»] chr1 (82 HSPs)
chr1 (39-194)||(39864100-39864255)
chr1 (36-194)||(31978626-31978784)
chr1 (39-184)||(6023633-6023778)
chr1 (36-173)||(7759201-7759338)
chr1 (51-184)||(9307628-9307761)
chr1 (36-177)||(26093380-26093521)
chr1 (36-184)||(34031511-34031659)
chr1 (39-184)||(12039071-12039216)
chr1 (36-176)||(6160451-6160591)
chr1 (37-157)||(44761542-44761662)
chr1 (36-194)||(917010-917168)
chr1 (51-184)||(31042798-31042931)
chr1 (36-184)||(52429330-52429478)
chr1 (36-194)||(2572455-2572612)
chr1 (36-194)||(33733237-33733394)
chr1 (36-166)||(40144849-40144979)
chr1 (36-178)||(24880859-24881004)
chr1 (36-159)||(36701907-36702030)
chr1 (36-159)||(36718011-36718134)
chr1 (51-157)||(8896343-8896449)
chr1 (39-184)||(23168977-23169122)
chr1 (51-184)||(24991637-24991770)
chr1 (36-173)||(37276447-37276584)
chr1 (36-184)||(38787327-38787475)
chr1 (51-157)||(15699123-15699229)
chr1 (39-177)||(28748980-28749118)
chr1 (36-194)||(30754915-30755073)
chr1 (36-173)||(37506110-37506250)
chr1 (36-149)||(7351622-7351735)
chr1 (51-184)||(16395031-16395163)
chr1 (36-129)||(20209879-20209972)
chr1 (39-136)||(22856269-22856366)
chr1 (36-157)||(49223997-49224118)
chr1 (68-184)||(12151194-12151310)
chr1 (37-184)||(13579605-13579752)
chr1 (51-172)||(45331339-45331463)
chr1 (36-184)||(11449872-11450017)
chr1 (39-152)||(14757610-14757723)
chr1 (84-157)||(35538677-35538750)
chr1 (51-184)||(44707744-44707877)
chr1 (51-157)||(10495840-10495945)
chr1 (51-157)||(29074885-29074991)
chr1 (52-170)||(32970565-32970683)
chr1 (39-117)||(35367791-35367869)
chr1 (51-134)||(9379232-9379316)
chr1 (51-178)||(27896956-27897083)
chr1 (52-134)||(32219695-32219777)
chr1 (36-116)||(25089137-25089218)
chr1 (41-184)||(5179383-5179526)
chr1 (82-173)||(22181368-22181459)
chr1 (39-109)||(6785245-6785315)
chr1 (51-141)||(29778423-29778513)
chr1 (36-173)||(32825987-32826126)
chr1 (51-157)||(42409995-42410101)
chr1 (36-134)||(52837266-52837364)
chr1 (71-184)||(6267840-6267953)
chr1 (51-116)||(15904752-15904817)
chr1 (74-152)||(17988574-17988654)
chr1 (74-159)||(41121834-41121919)
chr1 (36-184)||(21909990-21910136)
chr1 (51-134)||(9412837-9412920)
chr1 (76-158)||(3312137-3312219)
chr1 (69-157)||(6365650-6365738)
chr1 (39-178)||(35682795-35682923)
chr1 (58-136)||(24903979-24904057)
chr1 (39-97)||(26256159-26256217)
chr1 (51-157)||(41080601-41080705)
chr1 (106-184)||(43500768-43500846)
chr1 (37-166)||(4441605-4441734)
chr1 (107-184)||(27687298-27687375)
chr1 (51-111)||(4659777-4659837)
chr1 (37-129)||(26000823-26000915)
chr1 (51-102)||(3260592-3260643)
chr1 (51-118)||(37539128-37539195)
chr1 (79-157)||(978868-978946)
chr1 (76-118)||(13365999-13366041)
chr1 (39-153)||(27721521-27721635)
chr1 (51-100)||(2137437-2137486)
chr1 (39-100)||(37177825-37177886)
chr1 (73-118)||(49176940-49176985)
chr1 (83-152)||(51028509-51028578)
chr1 (51-107)||(39887836-39887892)
[»] scaffold0095 (2 HSPs)
scaffold0095 (39-184)||(50193-50338)
scaffold0095 (51-134)||(22348-22432)
[»] chr8 (64 HSPs)
chr8 (39-184)||(39405751-39405896)
chr8 (52-184)||(21216083-21216215)
chr8 (36-184)||(32476273-32476421)
chr8 (39-184)||(7172903-7173048)
chr8 (39-159)||(44761501-44761621)
chr8 (37-184)||(10179929-10180076)
chr8 (52-184)||(42972490-42972625)
chr8 (51-184)||(9300095-9300228)
chr8 (51-184)||(11976918-11977051)
chr8 (37-194)||(31271008-31271165)
chr8 (36-184)||(26626094-26626242)
chr8 (51-183)||(27294042-27294174)
chr8 (37-177)||(39482602-39482742)
chr8 (39-173)||(45425659-45425793)
chr8 (36-159)||(5053160-5053283)
chr8 (36-166)||(396611-396741)
chr8 (36-177)||(17719247-17719388)
chr8 (38-178)||(31082607-31082747)
chr8 (40-152)||(42886990-42887102)
chr8 (85-184)||(1875574-1875673)
chr8 (42-157)||(4924076-4924191)
chr8 (37-120)||(32678390-32678473)
chr8 (36-173)||(31231716-31231853)
chr8 (39-152)||(36006901-36007014)
chr8 (92-184)||(7703138-7703230)
chr8 (36-184)||(13335202-13335350)
chr8 (39-151)||(17823910-17824022)
chr8 (52-159)||(5356602-5356708)
chr8 (51-166)||(10097991-10098106)
chr8 (39-157)||(4428360-4428478)
chr8 (51-177)||(34948676-34948802)
chr8 (61-159)||(31331419-31331517)
chr8 (52-184)||(14854916-14855048)
chr8 (36-184)||(22771817-22771965)
chr8 (36-102)||(39301020-39301086)
chr8 (51-184)||(40996347-40996480)
chr8 (43-173)||(34393947-34394081)
chr8 (85-178)||(41092029-41092122)
chr8 (53-157)||(34057627-34057731)
chr8 (39-158)||(35504880-35504998)
chr8 (37-120)||(35732108-35732191)
chr8 (79-173)||(2767284-2767378)
chr8 (36-122)||(29226572-29226658)
chr8 (106-184)||(36967417-36967495)
chr8 (39-157)||(40028501-40028623)
chr8 (69-184)||(51132-51246)
chr8 (51-134)||(39466069-39466153)
chr8 (41-120)||(1739534-1739613)
chr8 (51-134)||(24199316-24199399)
chr8 (106-177)||(39300930-39301001)
chr8 (92-158)||(12559635-12559701)
chr8 (86-184)||(33765696-33765794)
chr8 (122-178)||(1739712-1739768)
chr8 (110-169)||(10953405-10953464)
chr8 (36-117)||(10953787-10953865)
chr8 (110-169)||(10961410-10961469)
chr8 (36-117)||(10961792-10961870)
chr8 (51-118)||(43719284-43719351)
chr8 (77-136)||(44648562-44648621)
chr8 (73-158)||(3117028-3117111)
chr8 (112-194)||(6796017-6796099)
chr8 (38-113)||(6796383-6796461)
chr8 (51-113)||(21649414-21649476)
chr8 (96-157)||(39329065-39329126)
[»] chr7 (69 HSPs)
chr7 (36-184)||(34947493-34947641)
chr7 (36-184)||(21390288-21390436)
chr7 (39-183)||(41506054-41506198)
chr7 (39-176)||(11373424-11373561)
chr7 (59-194)||(26974042-26974180)
chr7 (36-184)||(28202297-28202445)
chr7 (36-184)||(32346040-32346188)
chr7 (51-176)||(7463221-7463346)
chr7 (51-184)||(13961967-13962100)
chr7 (51-184)||(30865975-30866108)
chr7 (36-184)||(759079-759227)
chr7 (39-184)||(2459467-2459610)
chr7 (38-184)||(21759972-21760118)
chr7 (36-184)||(83378-83526)
chr7 (36-184)||(3178192-3178340)
chr7 (39-171)||(46478294-46478426)
chr7 (38-184)||(9785983-9786129)
chr7 (51-184)||(22738709-22738842)
chr7 (51-184)||(24516277-24516410)
chr7 (39-184)||(28103729-28103874)
chr7 (37-184)||(49101657-49101807)
chr7 (39-184)||(21350616-21350758)
chr7 (39-170)||(34100549-34100680)
chr7 (39-184)||(23670482-23670626)
chr7 (39-184)||(7457409-7457554)
chr7 (39-184)||(8592428-8592573)
chr7 (39-184)||(19271721-19271866)
chr7 (36-184)||(38391741-38391889)
chr7 (63-173)||(16560569-16560679)
chr7 (63-173)||(16604983-16605093)
chr7 (37-173)||(42935652-42935791)
chr7 (37-120)||(25571413-25571496)
chr7 (39-170)||(33819210-33819341)
chr7 (51-158)||(43873931-43874038)
chr7 (49-151)||(35333049-35333151)
chr7 (85-178)||(2850875-2850968)
chr7 (59-184)||(5524396-5524521)
chr7 (36-178)||(48608859-48608997)
chr7 (51-184)||(40076326-40076456)
chr7 (51-184)||(17828340-17828471)
chr7 (51-184)||(29835402-29835534)
chr7 (45-194)||(31930475-31930626)
chr7 (36-166)||(27920981-27921111)
chr7 (85-184)||(12631347-12631446)
chr7 (51-129)||(24166999-24167077)
chr7 (42-128)||(30546399-30546485)
chr7 (51-129)||(32018959-32019037)
chr7 (39-184)||(37245686-37245833)
chr7 (36-129)||(6494977-6495070)
chr7 (39-184)||(16904375-16904520)
chr7 (36-112)||(36790733-36790809)
chr7 (39-130)||(37850768-37850860)
chr7 (42-129)||(10042280-10042367)
chr7 (51-150)||(32018734-32018833)
chr7 (89-134)||(39452390-39452435)
chr7 (87-160)||(47045466-47045538)
chr7 (55-134)||(39005433-39005512)
chr7 (51-129)||(42796013-42796094)
chr7 (39-102)||(47045541-47045604)
chr7 (54-116)||(17610913-17610975)
chr7 (72-134)||(21937825-21937887)
chr7 (106-184)||(44180268-44180346)
chr7 (87-184)||(46211472-46211572)
chr7 (51-134)||(17610576-17610659)
chr7 (51-157)||(31665731-31665838)
chr7 (46-122)||(37490466-37490538)
chr7 (36-84)||(2851113-2851160)
chr7 (57-101)||(32769787-32769831)
chr7 (46-90)||(37490378-37490422)
[»] scaffold0583 (1 HSPs)
scaffold0583 (36-173)||(2011-2148)
[»] chr6 (47 HSPs)
chr6 (36-184)||(13909410-13909558)
chr6 (36-170)||(13087516-13087650)
chr6 (39-184)||(15058106-15058251)
chr6 (36-184)||(29363292-29363440)
chr6 (39-184)||(3720221-3720366)
chr6 (36-184)||(11655926-11656074)
chr6 (52-189)||(1781805-1781941)
chr6 (42-159)||(17828932-17829049)
chr6 (36-184)||(21010159-21010311)
chr6 (51-173)||(5302352-5302474)
chr6 (51-177)||(7920240-7920365)
chr6 (39-177)||(31894197-31894335)
chr6 (36-184)||(3291748-3291896)
chr6 (42-169)||(24983444-24983571)
chr6 (40-157)||(1063610-1063727)
chr6 (39-178)||(181545-181683)
chr6 (36-166)||(6801917-6802047)
chr6 (36-129)||(30716886-30716979)
chr6 (52-184)||(23142669-23142801)
chr6 (37-176)||(1225035-1225173)
chr6 (51-134)||(34299996-34300079)
chr6 (36-133)||(11143618-11143715)
chr6 (37-133)||(33510127-33510222)
chr6 (38-120)||(4367297-4367379)
chr6 (51-185)||(6834348-6834482)
chr6 (51-173)||(32440636-32440758)
chr6 (39-134)||(10923408-10923503)
chr6 (89-184)||(27448136-27448231)
chr6 (53-158)||(21804535-21804639)
chr6 (51-100)||(34657626-34657675)
chr6 (36-152)||(1955991-1956106)
chr6 (53-136)||(25417993-25418076)
chr6 (73-134)||(8115068-8115129)
chr6 (51-152)||(15582284-15582385)
chr6 (57-157)||(17835391-17835491)
chr6 (42-129)||(8695037-8695124)
chr6 (39-98)||(15046113-15046171)
chr6 (51-101)||(22398414-22398464)
chr6 (51-116)||(16205207-16205271)
chr6 (92-152)||(4590610-4590670)
chr6 (92-175)||(4581970-4582053)
chr6 (106-136)||(6255630-6255660)
chr6 (42-100)||(13206896-13206954)
chr6 (51-80)||(28106013-28106042)
chr6 (77-125)||(6245953-6246001)
chr6 (105-153)||(28101370-28101418)
chr6 (122-178)||(34639438-34639494)
[»] scaffold0330 (1 HSPs)
scaffold0330 (51-194)||(5391-5534)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (36-173)||(105670-105807)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (51-177)||(16099-16225)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (36-120)||(252850-252933)
scaffold0003 (89-184)||(39127-39222)
[»] scaffold0182 (1 HSPs)
scaffold0182 (38-185)||(20333-20480)
[»] scaffold0294 (1 HSPs)
scaffold0294 (51-184)||(17036-17169)
[»] scaffold0159 (1 HSPs)
scaffold0159 (51-184)||(34000-34133)
[»] scaffold0328 (1 HSPs)
scaffold0328 (36-173)||(7973-8110)
[»] scaffold1809 (1 HSPs)
scaffold1809 (39-152)||(697-810)
[»] scaffold0110 (1 HSPs)
scaffold0110 (36-171)||(1690-1825)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (51-173)||(136029-136151)
[»] scaffold0188 (1 HSPs)
scaffold0188 (53-184)||(6741-6871)
[»] scaffold1391 (1 HSPs)
scaffold1391 (85-185)||(1797-1897)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (51-100)||(14233-14282)
[»] scaffold0464 (1 HSPs)
scaffold0464 (104-184)||(6266-6346)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (39-83)||(76281-76325)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 55)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 36 - 194
Target Start/End: Original strand, 43410412 - 43410570
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattg 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43410412 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattg 43410511  T
Q  136 atattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaaggagtataat 194  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43410512 atatcaacacaattaataatttccttaataatcgtgcacaaacattaaaggactataat 43410570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 36 - 194
Target Start/End: Original strand, 39691476 - 39691634
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattg 135  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39691476 cattattatacccttatttattgaatttcattcaactttactactccactaactgcaattaataagagtattttagtaaatgatattaattttatcattg 39691575  T
Q  136 atattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaaggagtataat 194  Q
    | || |||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  39691576 aaatcaacacaattaatcattttcttaataatcgtgcacaaaccttaaacgattataat 39691634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 36 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 8947179 - 8947031
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattg 135  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||||    
T  8947179 cattattatacccttatttattgaatttcatccaacttaactactccactaactataattaataaggatgttttagtaaatattactaattttatcattg 8947080  T
Q  136 atattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    | || |||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||| |||||    
T  8947079 aaatcaacacaattaatcatttccttaataattatgcacaaactttaaa 8947031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 39 - 194
Target Start/End: Original strand, 17695319 - 17695474
Alignment:
Q  39 tattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgata 138  Q
    |||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |    
T  17695319 tattatacccttatttattgaatttcatccaacttaactactctactaactataattaataagaatatttttgtaaatgatatcaattttaccattgaaa 17695418  T
Q  139 ttaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaaggagtataat 194  Q
    | || ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  17695419 tcaatacaattaatcatttccttaataatcgtgcacaaaccttaaacgattataat 17695474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 36 - 194
Target Start/End: Original strand, 37322414 - 37322573
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattg 135  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  37322414 cattattatacccttatttattgaatttcatctaacttaactactccactaactacaattaataagggtattttaataaatgatattaattttaccattg 37322513  T
Q  136 atattaacacaattaat-aatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaaggagtataat 194  Q
    | || |||||||| ||| | ||||| ||||||||||||| |||| ||||| || ||||||    
T  37322514 aaatcaacacaatcaatcattttccttaataatcgtgcataaaccttaaacgactataat 37322573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 51 - 184
Target Start/End: Original strand, 45235582 - 45235715
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaatta 150  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| |    
T  45235582 atttattgaatttcatcaaacttaactatttcattaactacaattaataagggtgttttagtaaatgatattaattttaccattgaaatcaacacaatca 45235681  T
Q  151 ataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    || |||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  45235682 atcatttccttaataatcgtgcacaaaccttaaa 45235715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 36 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 14523499 - 14523351
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattg 135  Q
    ||||||||||  || ||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14523499 cattattatatccttattaattgaatttcatctaacttaactactccactaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttaccattg 14523400  T
Q  136 atattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    | || |||||||  ||| |||||| |||||| | |||| |||| |||||    
T  14523399 aaatcaacacaaaaaatcatttccttaataaccttgcataaactttaaa 14523351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 39 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 16377784 - 16377642
Alignment:
Q  39 tattatactctcatttattgaatttcattcaacttaa----ctactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcatt 134  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    |||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  16377784 tattatacttttatttattgaatttcatccaacttaattaactactccactaactacaattaataaggttattttggtaaatgatattaattttaccatt 16377685  T
Q  135 gatattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaa 177  Q
    |  || |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  16377684 gtaatcaacacaattaatcatttctttaataatcgtgcacaaa 16377642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 36 - 184
Target Start/End: Original strand, 34225576 - 34225724
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattg 135  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||| |||| ||||     
T  34225576 cattattatacccttatttattaaatttcattcaacttaaatactccattaactacaattaataagggtgttttagtaaataatactaagtttaccatta 34225675  T
Q  136 atattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    | || || | ||||| | |||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  34225676 aaatcaatataattattcatttccttaataatcgtgcacaaaccttaaa 34225724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 36 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 43115929 - 43115781
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattg 135  Q
    |||||||||||  | |||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  43115929 cattattataccattattcgttgaatttcattcaacttaactactccactaactacaataaataagagtattttagtaaatgctactaactttatcattg 43115830  T
Q  136 atattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    | || |||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||| |||||    
T  43115829 aaatcaacacaattaatcatttctttaataatcgcgcacaaactttaaa 43115781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 54 - 184
Target Start/End: Original strand, 16805885 - 16806015
Alignment:
Q  54 tattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaattaata 153  Q
    |||| ||||| || ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| | || ||||||||||||     
T  16805885 tattaaatttaatccaacttaacaactccactaactacaattaataaggatattttagtaaatgatactaattttactattaaaatcaacacaattaatc 16805984  T
Q  154 atttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    |||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  16805985 atttctttaataatcgtgcacaaaccttaaa 16806015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 54 - 184
Target Start/End: Original strand, 16845166 - 16845296
Alignment:
Q  54 tattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaattaata 153  Q
    |||| ||||| || ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| | || ||||||||||||     
T  16845166 tattaaatttaatccaacttaacaactccactaactacaattaataaggatattttagtaaatgatactaattttactattaaaatcaacacaattaatc 16845265  T
Q  154 atttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    |||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  16845266 atttctttaataatcgtgcacaaaccttaaa 16845296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 39 - 173
Target Start/End: Original strand, 35313876 - 35314010
Alignment:
Q  39 tattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgata 138  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  |||| |||||  || |||||||| |||||| |    
T  35313876 tattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataaggttgctttaataaatactactaattttaccattgaaa 35313975  T
Q  139 ttaacacaattaataatttccgtaataatcgtgca 173  Q
    | |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  35313976 tcaacacaattaatcatttccttaataatcgtgca 35314010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 36 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 15359214 - 15359077
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattg 135  Q
    |||||| |||| || |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||      
T  15359214 cattataatacccttatttattgaacttcatccaacttaactactccactaactacaattaataagggtgttttagtaaatgatattaattttatcatca 15359115  T
Q  136 atattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgca 173  Q
    | || |||||||||||| || | | |||||| ||||||    
T  15359114 aaatcaacacaattaatcatcttcttaataaccgtgca 15359077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 51 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 5789760 - 5789627
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaatta 150  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||| | ||||||||||||  | ||||||||  |||||  | || |||||||    
T  5789760 atttattgaatttcatccaacttaactatttcactaactacaattaataagggtgttttagtaaatgccactaattttactattgaattcaatacaatta 5789661  T
Q  151 ataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    || |||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  5789660 atcatttccttaataatcgtgcacaaaccttaaa 5789627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 51 - 184
Target Start/End: Original strand, 16463690 - 16463823
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaatta 150  Q
    ||||||| ||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||  | || ||||||||||    
T  16463690 atttattaaatttcatcaaactttactactccactaactacaattaataagggtgttttagtaaatgatactaattttaccatcaaaatcaacacaatta 16463789  T
Q  151 ataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    || |||||| |||||| |||||| |||| |||||    
T  16463790 atcatttccttaataaccgtgcataaaccttaaa 16463823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 36 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 34120564 - 34120418
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattg 135  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| || ||||| |||      
T  34120564 cattattatactcttacttattgaatttcatccaacttaactattccactaactacaattaataa--atattttagtaaataatactagttttaccatca 34120467  T
Q  136 atattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    | || |||||||||||| |||| | |||||||| |||| |||| |||||    
T  34120466 aaatcaacacaattaatcattttcttaataatcatgcataaactttaaa 34120418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 51 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 31448805 - 31448662
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaatta 150  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| | || ||||| |||||| ||||| | |||||||||||||   |||||||| |||  | || ||||||||||    
T  31448805 atttattgaatttcatccaacttaactatttcactaactgcaattagtaagggtgttttagtaaatgactctaattttaccatcaaaatcaacacaatta 31448706  T
Q  151 ataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaaggagtataat 194  Q
    || |||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  31448705 atcatttccttaataatcgtgcacaaaccttaaacgactataat 31448662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 104 - 194
Target Start/End: Original strand, 19937731 - 19937821
Alignment:
Q  104 tattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaaggagtataat 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  19937731 tattttagtaaatgatattaattttaccattgaaatcaacacaattaatcatttccttaataatcgtgcacaaaccttaaacgactataat 19937821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 36 - 173
Target Start/End: Original strand, 39785571 - 39785711
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatga---tattaattttatca 132  Q
    |||||| |||| || |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||   || |||||||| ||    
T  39785571 cattataatacccttatttattgaacttcatccaacttaactactccattaactacaattaataagagtgttttagtaaatgatagtactaattttacca 39785670  T
Q  133 ttgatattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgca 173  Q
    |  | || |||||||||||| |||||| |||||| ||||||    
T  39785671 tcaaaatcaacacaattaatcatttccttaataaccgtgca 39785711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 36 - 184
Target Start/End: Original strand, 25637467 - 25637614
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattg 135  Q
    |||||||| || || ||||||| |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| | | ||||||||||||| | |||||||| |||      
T  25637467 cattattacacccttatttattaaatttcatccaacttaactactcctataactacaattaataaaggtgttttagtaaatgacactaattttaccatca 25637566  T
Q  136 atattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    | || |||||||||||| |||||| | ||||||||||| |||| |||||    
T  25637567 aaatcaacacaattaatcatttcc-ttataatcgtgcataaaccttaaa 25637614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 39 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 35242421 - 35242309
Alignment:
Q  39 tattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgata 138  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||  |||||||| |||| | |    
T  35242421 tattatacttttatttattgaatttcatccaacttaactactcaactaactacaattaataaatatattctagtaaatgattctaattttaacattaaaa 35242322  T
Q  139 ttaacacaattaa 151  Q
    | |||||||||||    
T  35242321 tcaacacaattaa 35242309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 17346474 - 17346396
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaatttta 129  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  17346474 atttattgaatttcttccaacttaactactccactaactacaattaataaaaatattttaataaatgatattaatttta 17346396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 36 - 166
Target Start/End: Original strand, 36794270 - 36794400
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattg 135  Q
    |||||| |||| || |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||   |||||||||| |||| |||||||| |||      
T  36794270 cattataatacccttatttattgaacttcatccaacttaactactccactaactacagttaataagggcgttttagtaaaagatactaattttaccatca 36794369  T
Q  136 atattaacacaattaataatttccgtaataa 166  Q
    | || |||||||||||| |||||| ||||||    
T  36794370 aaatcaacacaattaatcatttccttaataa 36794400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 50 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 41221059 - 41220957
Alignment:
Q  50 catttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaatt 149  Q
    ||||||||||| |||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||    
T  41221059 catttattgaacttcatctgacttaactacttcattaactacaattaataaaaatattttaataaatgatactaattttataattgaaatcaacacaatt 41220960  T
Q  150 aat 152  Q
    |||    
T  41220959 aat 41220957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 51 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 39329775 - 39329691
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattga 136  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39329775 atttattgaatttcatccaatttaactactccat-aactacaattaataagagtgttttagtaaatgctattaattttatcattga 39329691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 36 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 26608270 - 26608178
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaatttt 128  Q
    ||||||||||| || ||||| | | |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  26608270 cattattatacccttatttaattattttcattcaacttaactaatccactaactataattaataagagtattttagtaaatgatattaatttt 26608178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 51 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 32831287 - 32831203
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattg 135  Q
    ||||||||||||||||   | |||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32831287 atttattgaatttcatctcatttaactactccaataactacaattaataaagatgttttagtaaatgatattaattttaccattg 32831203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 36 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 36354570 - 36354422
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattg 135  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||| | ||||| ||| |||||||| |||      
T  36354570 cattattataccattatttattgaatttcatccaacttaactactccactaactacaattaataagagtgtttcaataaataatactaattttaccatca 36354471  T
Q  136 atattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    | || ||||||| || | |||||| |||||||||| || |||| |||||    
T  36354470 aaatcaacacaactagtcatttccttaataatcgtacataaaccttaaa 36354422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 144
Target Start/End: Original strand, 28186215 - 28186308
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaaca 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||| |||| |||| ||||    
T  28186215 atttattgaatttcattcaacttaactactctgctaactaaaatgaataaggatattttaataaatgattataattttaccattaatatcaaca 28186308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 75 - 173
Target Start/End: Original strand, 27866517 - 27866614
Alignment:
Q  75 actactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgca 173  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| | || ||||  |||||| |||||| ||| |||||||||    
T  27866517 actacaccgttaactacaattaataaggatattttactaaa-gatattaattttatcattaaaatcaacattattaatcatttccttaaaaatcgtgca 27866614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 51 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 11742640 - 11742508
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaatta 150  Q
    |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||| |||| | |||  | || || |||||||    
T  11742640 atttattgaacttcatcaaacttaactactccattaactacaattaataagggtgttttaataaataatattgattt-accatcaaaatcaatacaatta 11742542  T
Q  151 ataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    | || || | ||||||||||||| |||| |||||    
T  11742541 aaaaatttcttaataatcgtgcataaacgttaaa 11742508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 51 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 18853313 - 18853186
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaatt--ttatcattgatattaacacaat 148  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| ||||| | ||||||||| |||||||  |||||| ||||||||||  ||||  |||||||||| || ||||||||    
T  18853313 atttattgaatttcatccaaattaattactctactaactacaactaataagagtattttggtaaatgata-caattaattatcattgaaatcaacacaat 18853215  T
Q  149 taataatttccgtaataatcgtgcacaaa 177  Q
    |||| |||||| |||  ||||||||||||    
T  18853214 taattatttccttaaagatcgtgcacaaa 18853186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 36 - 101
Target Start/End: Original strand, 19937371 - 19937436
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataag 101  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19937371 cattattatacctttatttattgaattttattcaacttaactactccactaactacaattaataag 19937436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 68 - 158
Target Start/End: Original strand, 19426473 - 19426564
Alignment:
Q  68 caacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattg-atattaacacaattaataatttc 158  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||| | || |||||||||||| |||||    
T  19426473 caacttaactactcgacttactacaattaataatgatattttagtaaatgttgctaattttatcattgaaaatcaacacaattaatcatttc 19426564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 9458393 - 9458327
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataagg 102  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9458393 cattattatacccttatttattaaatttcatccaactttactactccactaactacaattaataagg 9458327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 134
Target Start/End: Original strand, 19444132 - 19444230
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcatt 134  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||| || || || ||||||||||| | ||| ||||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19444132 cattattatacccttgtttattgaaatttatccatcttaactactcgactaattacaattaataataacattttagtaaataatattaattttatcatt 19444230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 34451447 - 34451341
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaatta 150  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| | || |||||| ||||||| |  |||||||||||||| ||| ||||||| |||| || || |||| |||||    
T  34451447 atttattgaatttcatccaactaaactatttcaataactagaattaatgaaaatattttagtaaataatactaattttctcatcgaaatcaacataatta 34451348  T
Q  151 ataattt 157  Q
    |||||||    
T  34451347 ataattt 34451341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 84 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 1206782 - 1206709
Alignment:
Q  84 ttaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaattaataattt 157  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||| || |||| ||||||| ||||    
T  1206782 ttaactacaattaataaggatattttagtaaatgttactaattttaccactgaaatcaacataattaatcattt 1206709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 39 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 3323396 - 3323335
Alignment:
Q  39 tattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataa 100  Q
    ||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3323396 tattacactcttacttattgaatttcatccaacttaactactccactaactacaattaataa 3323335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 42 - 134
Target Start/End: Original strand, 43730608 - 43730697
Alignment:
Q  42 tatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcatt 134  Q
    |||||| | |||||||||||||||  | |||||||||||| | ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43730608 tatacttttatttattgaatttcac-ctacttaactactctagtaactacaattaataagg--tttttagtaaatgatattaattttaccatt 43730697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 39 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 7438976 - 7438917
Alignment:
Q  39 tattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaat 98  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||    
T  7438976 tattatacccttatttattgaatttcattcaacttaactactccaataattataattaat 7438917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 36 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 5272266 - 5272204
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaat 98  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||    
T  5272266 cattattatacccttatttattgaatttcatccaatttaattactccactaactacaattaat 5272204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 36 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 7494965 - 7494909
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactaca 92  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  7494965 cattattatacccttatttattgaatttcatccaacttaactactccgctaactaca 7494909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 28170707 - 28170568
Alignment:
Q  39 tattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgata 138  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||| ||| |||| || || |||||||||||||||||| | | |  |||||||||  | |||||||| | |||| |    
T  28170707 tattatactcttatttatagaatttcatccaatttaattattctattaactacaattaataaagctgtactagtaaatgcaactaattttacccttgaaa 28170608  T
Q  139 ttaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaac 178  Q
    | |||| ||||||| ||||    |||| ||||||||||||    
T  28170607 tcaacataattaatcattttttaaatactcgtgcacaaac 28170568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 36 - 109
Target Start/End: Original strand, 17122970 - 17123043
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatatttt 109  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||  |||| |||| | ||| |||||||||||| ||||||||    
T  17122970 cattattatactcttatttattgaatttcatctaatctaacaactcaactaattacaattaataatgatatttt 17123043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 123 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 26608008 - 26607947
Alignment:
Q  123 aattttatcattgatattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    ||||||| |||||| || |||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  26608008 aattttaccattgaaatcaacacaattaatcattttcttaataatcgtgcacaaaccttaaa 26607947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 51 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 26863470 - 26863421
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataa 100  Q
    ||||| |||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26863470 atttaatgaatttcatccgacttaactactccactaactacaattaataa 26863421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 10005197 - 10005157
Alignment:
Q  90 acaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttat 130  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10005197 acaattaataaagatattttagtaaatgatactaattttat 10005157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 90 - 173
Target Start/End: Original strand, 32783404 - 32783487
Alignment:
Q  90 acaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgca 173  Q
    ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||  ||  | || |||||||||||| |||| | |||||| ||||||    
T  32783404 acaattaataaaggtgttttagtaaatgatattaattttactatcaaaataaacacaattaatcattttcttaataaccgtgca 32783487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 51 - 134
Target Start/End: Original strand, 43730433 - 43730514
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcatt 134  Q
    |||||||||||||||  | |||||||||||| | ||| ||||||||||||  | |||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  43730433 atttattgaatttcac-cgacttaactactctagtaaatacaattaataaaaaaattt-agtaaatgatattaattttaccatt 43730514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 3323327 - 3323265
Alignment:
Q  122 taattttatcattgatattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    |||||||| |||||| || |||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| |||||    
T  3323327 taattttaccattgaaatcaacacaattaatcatttttataataatcgtgcacaaaccttaaa 3323265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 43699720 - 43699595
Alignment:
Q  39 tattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgata 138  Q
    |||||||| ||  |||||||||||| || |||||||| ||||||| ||   | |||||||| |  ||||||| ||||||||| ||||||||  ||||| |    
T  43699720 tattatacccttgtttattgaattttatccaacttaattactccacta---aaaattaataggtgtattttaataaatgatactaattttactattgaaa 43699624  T
Q  139 ttaacacaattaataatttccgtaataat 167  Q
    | |||||| ||||| |||| | |||||||    
T  43699623 tcaacacagttaatcattttcttaataat 43699595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 1206815 - 1206775
Alignment:
Q  39 tattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactac 79  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1206815 tattatactcatatttattgaatttcatccaacttaactac 1206775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 75
Target Start/End: Original strand, 25904777 - 25904813
Alignment:
Q  39 tattatactctcatttattgaatttcattcaacttaa 75  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  25904777 tattataccctaatttattgaatttcattcaacttaa 25904813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 49)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 36 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 6315904 - 6315746
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattg 135  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6315904 cattattatacccttatttattgaatttcatccaacttaactacttcactaactacaattaataagggtattttagtaaatgatattaattttatcattg 6315805  T
Q  136 atattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaaggagtataat 194  Q
    | ||||||||||| ||| |||||| ||||||||| | |||| | ||||| || ||||||    
T  6315804 aaattaacacaatcaatcatttccttaataatcgagtacaacccttaaacgactataat 6315746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 36 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 8725136 - 8724988
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattg 135  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8725136 cattattatactattatttattgaatttcattcaagttaactactccactaactacaattaataagtgtgttttagtaaatgatattaattttaccattg 8725037  T
Q  136 atattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    | || |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  8725036 aaatcaacacaattaatcatttctttaataatcgtgcacaaaccttaaa 8724988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 36 - 184
Target Start/End: Original strand, 27542781 - 27542929
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattg 135  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  27542781 cattattatactcttatttattgaattttatccaacttaactactccactaactacaattaataagagtattttagtaaatggtattaattttaccattg 27542880  T
Q  136 atattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    | || |||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  27542881 aaatcaacacaatcaatcatttccttaataatcgtgcacaaaccttaaa 27542929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 36 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 1248731 - 1248590
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattg 135  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1248731 cattattatacccttattaattgaattttattcaacttaactacttcactaactacaattaataagggtattttagtaaatgatattaattttaccattg 1248632  T
Q  136 atattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaa 177  Q
    | || |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  1248631 aaatcaacataattaataatttccttaataaccgtgcacaaa 1248590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 39 - 184
Target Start/End: Original strand, 31655042 - 31655187
Alignment:
Q  39 tattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgata 138  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  31655042 tattatacccttatttattgaatttcattcaacataattactccactaactacaattaataaggatattatagtaaatgatattaattttaccattgaaa 31655141  T
Q  139 ttaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    | |||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||| |||||    
T  31655142 tcaacacaattaatcatttctttaataatcgtacacaaactttaaa 31655187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 36 - 185
Target Start/End: Original strand, 27580586 - 27580736
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattg 135  Q
    |||||||||||  | ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27580586 cattattatacatttatttaattaatttcattcaacttaactactccactaactacaattaataagggtattttagtaaatgatattaattttaccattg 27580685  T
Q  136 atattaacacaattaataatttccgtaa-taatcgtgcacaaacattaaag 185  Q
    | || |||||||||||| ||||||  || |||||||||| |||| ||||||    
T  27580686 aaatcaacacaattaatcatttcctaaattaatcgtgcagaaaccttaaag 27580736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 36 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 6753785 - 6753638
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattg 135  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  6753785 cattattatacccttatttattaaatttcatccaacttaactactccactaactacaattaataagggtattttagtaaatgatactaattttaccattg 6753686  T
Q  136 atattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    | ||||| | ||||||| |||| | ||||||||||||| |||| |||||    
T  6753685 aaattaata-aattaatcattttcttaataatcgtgcataaaccttaaa 6753638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 36 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 7828053 - 7827905
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattg 135  Q
    ||||||||||  || ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  7828053 cattattatatccttatttattaaatttcatccaacttaactactccactaactacaattaataagggtattttaataaatgatactaattttaccattg 7827954  T
Q  136 atattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    | || |||||||||||| |||| | ||||||||||| |||||| |||||    
T  7827953 aaatcaacacaattaattattttcttaataatcgtgtacaaaccttaaa 7827905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 39 - 184
Target Start/End: Original strand, 4818540 - 4818685
Alignment:
Q  39 tattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgata 138  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||  |||||||  |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||  ||||| |    
T  4818540 tattatacccttatttattgaatttcatctaacttaatcactccactaactacaattaataagggtgttttagtaaatgctactaattttacaattgaaa 4818639  T
Q  139 ttaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    | |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  4818640 tcaacacaattaattatttccttaataatcgtgcacaaaccttaaa 4818685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 39 - 184
Target Start/End: Original strand, 8698298 - 8698443
Alignment:
Q  39 tattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgata 138  Q
    |||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | |||| |||||||  | |||||||| |||||| |    
T  8698298 tattatacccttatttattgaatttcatccaacttaaccactccactaactacaattaataagggtgttttggtaaatgcaactaattttaccattgaaa 8698397  T
Q  139 ttaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    | |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  8698398 tcaacacaattaatcatttctttaataatcgtgcacaaaccttaaa 8698443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 39 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 40530348 - 40530203
Alignment:
Q  39 tattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgata 138  Q
    |||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||| |||||| |    
T  40530348 tattatacccttatttatttaatttcatccaacttaaccactccactaactacaattaataagggtgttttagtaaatgctactaattttaccattgaaa 40530249  T
Q  139 ttaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    | |||||||||||| |||| | ||||||||||||||| || |||||    
T  40530248 tcaacacaattaatcattttcttaataatcgtgcacagaccttaaa 40530203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 36 - 184
Target Start/End: Original strand, 40899904 - 40900052
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattg 135  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||  |||      
T  40899904 cattattatacccttatttattgaatttcatctaacttaactactccactaactacaattaataagggtgttttagtaaatgatactaattttgccatca 40900003  T
Q  136 atattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    | || |||||||||||| |||||| |||||| |||||| |||| |||||    
T  40900004 aaatcaacacaattaatcatttccttaataaccgtgcataaaccttaaa 40900052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 39 - 177
Target Start/End: Original strand, 29570381 - 29570519
Alignment:
Q  39 tattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgata 138  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||| ||||  || |||||||| |||| | |    
T  29570381 tattatactcttatttattgaatttcatccaacttaactattccattaactacaattaataaaggtgttttagcaaatactaataattttaacattaaaa 29570480  T
Q  139 ttaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaa 177  Q
    | |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  29570481 tcaacacaattaatcatttctttaataatcgtgcacaaa 29570519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 39 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 42803744 - 42803599
Alignment:
Q  39 tattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgata 138  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||  || ||||||||  ||||| |    
T  42803744 tattatactcttatttattgaatttcatccaacttaaccactccattaactacaattaataatggtgttttagtaaatactactaattttacaattgaaa 42803645  T
Q  139 ttaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    | |||||||||||| |||||  | ||||||||||| |||| |||||    
T  42803644 tgaacacaattaattatttctttgataatcgtgcataaaccttaaa 42803599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 36 - 184
Target Start/End: Original strand, 21060616 - 21060764
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattg 135  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||| |||      
T  21060616 cattattataccattatttattgaattttatccaacttaactactccactaactacaattaataagagtattttagtaaataatactaattttaccatca 21060715  T
Q  136 atattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    | || |||||||||||| |||||| |||||| |||||| |||| |||||    
T  21060716 aaataaacacaattaatcatttccctaataaccgtgcataaaccttaaa 21060764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 39 - 166
Target Start/End: Original strand, 29374331 - 29374458
Alignment:
Q  39 tattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgata 138  Q
    |||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| | | |||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  29374331 tattatacccttatttattgaattttattcaatttaactactccactaactacaattaataaaggtcttttagtaaatgctattaattttatcattgaaa 29374430  T
Q  139 ttaacacaattaataatttccgtaataa 166  Q
    | |||| ||||||| |||| | ||||||    
T  29374431 tcaacataattaatcattttcttaataa 29374458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 51 - 157
Target Start/End: Original strand, 4441022 - 4441128
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaatta 150  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||    
T  4441022 atttattgaatttcatccaatttaactactccactaactacaattaataaaaatattttagtaaataatattaattttatcattaaaatcaacacaatta 4441121  T
Q  151 ataattt 157  Q
    || ||||    
T  4441122 attattt 4441128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 39 - 184
Target Start/End: Original strand, 9515725 - 9515880
Alignment:
Q  39 tattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaat----------taataaggatattttagtaaatgatattaatttt 128  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||          |||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  9515725 tattatactcttatttaatgaatttcattcaacttaactactccactaactactatgacctactattaataaggatgttttagtaaatgatactaatttt 9515824  T
Q  129 atcattgatattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    | |||||| || |||||||||||| |||  | |||||||||||||||||| |||||    
T  9515825 accattgaaatcaacacaattaatcattatcttaataatcgtgcacaaaccttaaa 9515880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 59 - 177
Target Start/End: Original strand, 29856056 - 29856172
Alignment:
Q  59 aatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaattaataatttc 158  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||||||||||||| || ||| |||||  | |||||    
T  29856056 aattgcattcaacttaactactccactaactacaattaataagagtattttagcaagtgatattaattttatcattgaaatcaacgcaatt--ttatttc 29856153  T
Q  159 cgtaataatcgtgcacaaa 177  Q
    | |||||||||||||||||    
T  29856154 cttaataatcgtgcacaaa 29856172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 39 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 6616003 - 6615866
Alignment:
Q  39 tattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgata 138  Q
    |||||||| || |||||||||||| ||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| |||| ||||||| || |||||||| |||||| |    
T  6616003 tattatacccttatttattgaatt-catccaacttaaccactccactaactaaaattaataaggatgttttggtaaatgctactaattttaccattgaaa 6615905  T
Q  139 ttaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaa 177  Q
    | |||||||||||| ||||   |||||||||||||||||    
T  6615904 tcaacacaattaattatttatttaataatcgtgcacaaa 6615866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 42 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 11796288 - 11796179
Alignment:
Q  42 tatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatatta 141  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| | || |    
T  11796288 tatactcttatttattaaatttcatctaacttaactactacactaactacaattaataataatattttagtaaataatattaattttatcattaaaatca 11796189  T
Q  142 acacaattaa 151  Q
    ||||||||||    
T  11796188 acacaattaa 11796179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 89 - 178
Target Start/End: Original strand, 32440180 - 32440269
Alignment:
Q  89 tacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaac 178  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||| |||| |||||||||    
T  32440180 tacaattaataagggtattttagtaaatgatattaattttatcattgaaattaacacaattaatcatttctttaaaaatcatgcacaaac 32440269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 36 - 173
Target Start/End: Original strand, 19929932 - 19930069
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattg 135  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||| |||||||||||||   || ||||| |||      
T  19929932 cattattatacccttatttattgaatttcatccaacttaactatttcactaactacaattaataaggatgttttagtaaatgacgctagttttaccatca 19930031  T
Q  136 atattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgca 173  Q
    | || |||| ||||||| |||| | |||||||||||||    
T  19930032 aaatcaacaaaattaatcattttcttaataatcgtgca 19930069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 39 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 22848508 - 22848395
Alignment:
Q  39 tattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgata 138  Q
    |||||||| || |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||  |||||||||||  ||||| |    
T  22848508 tattatacccttatttattgaatttcatccaatctaactactccattaactacaattaataagggtgttttaataaatactattaattttactattgaaa 22848409  T
Q  139 ttaacacaattaat 152  Q
    | ||||||||||||    
T  22848408 tcaacacaattaat 22848395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 39 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 2232193 - 2232052
Alignment:
Q  39 tattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgata 138  Q
    |||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    ||||||||||  | ||||| |||||| || |||||||| |||||| |    
T  2232193 tattatacccttatttattgaatttcatccaacttaactactccactaa----aattaataagagttttttaataaatgctactaattttaccattgaaa 2232098  T
Q  139 ttaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    | |||||||||| | |||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  2232097 tcaacacaattattcattttcttaataatcgtgcacaaaccttaaa 2232052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 42 - 178
Target Start/End: Original strand, 6754021 - 6754156
Alignment:
Q  42 tatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatatta 141  Q
    ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||  ||||| || |    
T  6754021 tatacccttatttattgaatttcatccaacttaactactccactaactacaattaataagagtgttttagtaaatgacattaattttactattgaaatca 6754120  T
Q  142 acacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaac 178  Q
    ||| ||||||| |||| | || |||| ||||| ||||    
T  6754121 aca-aattaatcattttcttattaatagtgcataaac 6754156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 39 - 178
Target Start/End: Original strand, 41478816 - 41478955
Alignment:
Q  39 tattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataagg-atattttagtaaatgatattaattttatcattgat 137  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| | |||||||| ||||||     
T  41478816 tattatacccttatttattgaatttcatctaacttaacta-tccattaactgcaattaacaagggatattttagtaaatgacactaattttaccattgaa 41478914  T
Q  138 attaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaac 178  Q
    || | |||||||||| |||| | ||| ||||| ||||||||    
T  41478915 ataagcacaattaatcattttcttaaaaatcgcgcacaaac 41478955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 51 - 183
Target Start/End: Original strand, 41496081 - 41496213
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaatta 150  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||  | |||||||| |||||| || ||||||||||    
T  41496081 atttattgcatttcatccaatttaactactccactaactacaattaataatgatgttttactaaatgcaactaattttaccattgaaatcaacacaatta 41496180  T
Q  151 ataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaa 183  Q
    || ||||   ||||||||||| |||||| ||||    
T  41496181 attatttttttaataatcgtgtacaaaccttaa 41496213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 60 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 38161515 - 38161440
Alignment:
Q  60 atttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattg 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  38161515 atttcatccaacttaactactccactaactacgattaataaggatattttagtaaatgatatgaattttaccattg 38161440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 37184191 - 37184085
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaatta 150  Q
    ||||||||||||||||  |||||||  | || |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| ||||||    
T  37184191 atttattgaatttcatcaaacttaatcagtctattaactacaatgaataaagatattttagtaaatgatattaattttaccattgaaatcaactcaatta 37184092  T
Q  151 ataattt 157  Q
    || ||||    
T  37184091 atcattt 37184085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 51 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 30512798 - 30512670
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaa-ttaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaatt 149  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| | || ||||||||  ||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||| |||||| || || ||||||    
T  30512798 atttattaaatttcatccaacttaactatttcactaactacatgttaataagagtatcttagtaaatgatgttaattttaccattgaaatcaatacaatt 30512699  T
Q  150 aataatttccgtaataatcgtgcacaaac 178  Q
    ||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  30512698 aatcatttccttaataatcgtgcataaac 30512670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 51 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 30553138 - 30553010
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaa-ttaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaatt 149  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| | || ||||||||  ||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||| |||||| || || ||||||    
T  30553138 atttattaaatttcatccaacttaactatttcactaactacatgttaataagagtatcttagtaaatgatgttaattttaccattgaaatcaatacaatt 30553039  T
Q  150 aataatttccgtaataatcgtgcacaaac 178  Q
    ||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  30553038 aatcatttccttaataatcgtgcataaac 30553010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 39 - 178
Target Start/End: Original strand, 41492291 - 41492430
Alignment:
Q  39 tattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataagg-atattttagtaaatgatattaattttatcattgat 137  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||  | |||||||| ||||||     
T  41492291 tattatacccttatttattgaatttcatctaacttaacta-tccattaactacatttaacaagggatattttagtaaatgtcactaattttaccattgaa 41492389  T
Q  138 attaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaac 178  Q
    || | |||||||||| |||| | ||| ||||| ||||||||    
T  41492390 ataagcacaattaatcattttcttaaaaatcgcgcacaaac 41492430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 69 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 15439413 - 15439305
Alignment:
Q  69 aacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaattaataatttccgtaataatc 168  Q
    |||||||||||| |  ||| ||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||| |||||| |||  |||    
T  15439413 aacttaactactactctaaatacaattaataaaagtattttagtaaatgatactaattttaccattgaaattaatacaattaatcatttccttaaatatc 15439314  T
Q  169 gtgcacaaa 177  Q
    |||||||||    
T  15439313 gtgcacaaa 15439305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 51 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 15818594 - 15818459
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaat--gatattaattttatcattgatattaacacaat 148  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||||||||||| | | |||||||||||| | | |||||||||||  | || |||||||| |||||| || ||||||||    
T  15818594 atttattaaatttcatccaatttaactactccactgattacaattaataaaggtgttttagtaaatatgctactaattttaccattgaaatcaacacaat 15818495  T
Q  149 taataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    |||  |||||| ||||||||||||| |||| |||||    
T  15818494 taaacatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 15818459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 72 - 184
Target Start/End: Original strand, 11904227 - 11904340
Alignment:
Q  72 ttaactactccattaactacaattaa-taaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaattaataatttccgtaataatcgt 170  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||  | || ||||||||| | || | |||  |||||    
T  11904227 ttaactactccaccaactacaattaaataagagtattttagtaaatgatattaattttattattgaactcaatacaattaatcactttcttaaagatcgt 11904326  T
Q  171 gcacaaacattaaa 184  Q
    ||||||||||||||    
T  11904327 gcacaaacattaaa 11904340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 37 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 5129358 - 5129261
Alignment:
Q  37 attattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcatt 134  Q
    |||| |||| ||| ||||||| | ||| |||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  5129358 attaatatattcttatttattaatttttattcaatttaactactctaataactacaattaataagaatgttatagtaaattatattaattttaccatt 5129261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 36 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 41062287 - 41062190
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcat 133  Q
    |||||| |||| || |||||||||| | ||| || ||||| || || | |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41062287 cattataatacccttatttattgaactccatccagcttaattattctactaactacaattaataagggtgttttagtaaatgatactaattttatcat 41062190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 38508265 - 38508173
Alignment:
Q  85 taactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaa 177  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| | | ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| | ||| ||||| |||||||    
T  38508265 taactacaattaataagagtattttaatgagtgatactaattttaccattgaaattaacacaattaatcattttcttaaaaatcgagcacaaa 38508173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 51 - 134
Target Start/End: Original strand, 18841480 - 18841563
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcatt 134  Q
    |||||||||||||||  ||| |||| || | || |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  18841480 atttattgaatttcacccaatttaattatttcactaactacaattaataacggtattttattaaatgatattaattttaccatt 18841563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 51 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 26285590 - 26285512
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaatttta 129  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||| |  | ||||  ||||||||| ||||||||    
T  26285590 atttattgaattttatacaacttaactacttcattaactacaattaatacgtgtgttttcataaatgatactaatttta 26285512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 90 - 184
Target Start/End: Original strand, 843480 - 843571
Alignment:
Q  90 acaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    ||||||||||||   || |||||||||||||   ||||||||||||| || |||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  843480 acaattaataagagcatgttagtaaatgata---attttatcattgaaatcaacaaaattaatcattttcttaataatcgtgcacaaaccttaaa 843571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 92 - 157
Target Start/End: Original strand, 5282384 - 5282449
Alignment:
Q  92 aattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaattaataattt 157  Q
    ||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||| |||||||||| ||||    
T  5282384 aattaataaagaaattttagtaaattatatttattttatcattaaaattagcacaattaatcattt 5282449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 59 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 8493942 - 8493849
Alignment:
Q  59 aatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaattaat 152  Q
    |||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||| ||| ||||| ||| ||||||||  ||||| |||||| ||| ||||    
T  8493942 aatttcatttcacttaactactctattaactaaaattaataagagtatattaataaatcatactaattttacgattgaaattaacccaactaat 8493849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 157
Target Start/End: Original strand, 14339338 - 14339410
Alignment:
Q  85 taactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaattaataattt 157  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||| | |||||||||| ||| || |||||| ||| |||| ||||    
T  14339338 taactacaattaataaaaatattttagtaaataaaattaattttaacatagaaattaactcaactaatcattt 14339410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 51 - 126
Target Start/End: Original strand, 39325864 - 39325939
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaatt 126  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||| |  |||||| | ||| ||||||||| | |||||||    
T  39325864 atttattgaatttaatccaacttaactactccactaactatatgtaataaaggtatcttagtaaattacattaatt 39325939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 167
Target Start/End: Original strand, 5731811 - 5731893
Alignment:
Q  85 taactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaattaataatttccgtaataat 167  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||   ||||| | ||| | || |||||||||||| |||| | |||||||    
T  5731811 taactacgattaataaggatgttttagtaaatgatacacattttgttattaaaatgaacacaattaatcattttcttaataat 5731893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 55 - 95
Target Start/End: Original strand, 843293 - 843333
Alignment:
Q  55 attgaatttcattcaacttaactactccattaactacaatt 95  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  843293 attgaatttcattcaacttaattactttattaactacaatt 843333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 119 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 24335339 - 24335307
Alignment:
Q  119 tattaattttatcattgatattaacacaattaa 151  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24335339 tattaattttatcattgatatcaacacaattaa 24335307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 88)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 40 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 52247559 - 52247405
Alignment:
Q  40 attatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatat 139  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||    
T  52247559 attatacacttatttaatgaatttcattcaacttaactactccactaactacaattaataaggatattttagtaaattgtattaattttaccattgaaat 52247460  T
Q  140 taacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaaggagtataat 194  Q
    ||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| | ||||| || ||||||    
T  52247459 taacacaattaatcattttcttaataatcgtgcacaatccttaaacgactataat 52247405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 36 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 38405237 - 38405079
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattg 135  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  38405237 cattattatacctttatttattgaatttcatccaacttaactacaccactaactacaattaataagggtattttagtaaatgatattaattttaccattt 38405138  T
Q  136 atattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaaggagtataat 194  Q
    | || |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  38405137 aaatcaacagaattaatcatttccttaataatcgtgcacaaaccttaaacgactataat 38405079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 36 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 49428477 - 49428319
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattg 135  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  49428477 cattattatacccttatttattgaatttcatccaacttaattactccactaactacaattaataagggtattttagtaaattatattaattttaccattg 49428378  T
Q  136 atattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaaggagtataat 194  Q
    | || ||||||| |||| |||||| ||||||||||||| |||| ||||| || ||||||    
T  49428377 aaatcaacacaaataatcatttccttaataatcgtgcaaaaaccttaaacgactataat 49428319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 39 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 16821463 - 16821318
Alignment:
Q  39 tattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgata 138  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  16821463 tattatacccttatttattgaatttcattcaacttaaatactccactaactataattaataaggatattatagtaaatgatactaattttatcattgaaa 16821364  T
Q  139 ttaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    | |||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||| |||||    
T  16821363 tcaacacaattaatcattgcattaataatcgtgcacaaaccttaaa 16821318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 39 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 7061796 - 7061651
Alignment:
Q  39 tattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgata 138  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  7061796 tattatacccttatttattgaatttcattcaacttaattaatccactaactacaattaataaagatattatagtaaatgatactaattttaccattgaaa 7061697  T
Q  139 ttaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    | |||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||||    
T  7061696 tcaacacaattaatcatttccttaataatcgtgtacaaaccttaaa 7061651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 36 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 42617038 - 42616880
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattg 135  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42617038 cattattatacacttatttattgaatttcattcgacttaactactccacttactacaattaataaaaatattttagtaaatgatattaattttaccattg 42616939  T
Q  136 atattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaaggagtataat 194  Q
    | || |||||| ||||| |||||  |||||||| ||||||||  ||||| || ||||||    
T  42616938 aaatcaacacagttaatcatttctttaataatcatgcacaaaacttaaacgactataat 42616880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 39 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 6643792 - 6643647
Alignment:
Q  39 tattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgata 138  Q
    |||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||| |||||| |    
T  6643792 tattatacccttatttattgaatttcatccaacttaactataccactaactacaattaataaagatgttttagtaaatgctactaattttaccattgaaa 6643693  T
Q  139 ttaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    | |||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  6643692 tcaacacaattaatcatttccttaataatcgtgctcaaacattaaa 6643647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 54 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 52859916 - 52859797
Alignment:
Q  54 tattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaattaata 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||  | || ||||||||||||     
T  52859916 tattgaatttcattcaacttaactactccactaactacaattaataaggatgttttagtaaatgatactaattttaccatcaaaatcaacacaattaatc 52859817  T
Q  154 atttccgtaataatcgtgca 173  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  52859816 atttccttaataatcgtgca 52859797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 39 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 17237428 - 17237283
Alignment:
Q  39 tattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgata 138  Q
    |||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||| |||||  |    
T  17237428 tattatacccttatttattgaatttcatccaacttaactactccactaactacaattaataaggttgttttagtaaatgttactaattttaccattgcaa 17237329  T
Q  139 ttaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    | |||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||| |||||    
T  17237328 tcaacacaattaattattttcttaataatcatgcacaaaccttaaa 17237283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 39 - 184
Target Start/End: Original strand, 34360644 - 34360789
Alignment:
Q  39 tattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgata 138  Q
    |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||| || |||||||| |||||| |    
T  34360644 tattatacccttatttattgaattttattcaacttaactactccactaactacaattaataagagtgttttagtaaatgctactaattttaccattgaaa 34360743  T
Q  139 ttaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    | || ||||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  34360744 tcaatacaattaatcatttctttaataatcgtgcacaaactttaaa 34360789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 39 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 47464497 - 47464352
Alignment:
Q  39 tattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgata 138  Q
    |||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||| || |||||||| |||||| |    
T  47464497 tattatacccttatttattgaatttcatccaacttaactactccaccaactacaattaataagagttttttagtaaatgctactaattttaccattgaaa 47464398  T
Q  139 ttaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    | |||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||    
T  47464397 tcaacacaattaatcatttccttaataatcgtgctcaaaccttaaa 47464352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 36 - 184
Target Start/End: Original strand, 6609747 - 6609895
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattg 135  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| |||| |||||||||| |||||||| |||      
T  6609747 cattattatactcttatttattgagtttcatccaacttaactactccaataattacaattaataaagatgtttttgtaaatgatactaattttaccatca 6609846  T
Q  136 atattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    | || |||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| |||||    
T  6609847 aaatcaacacaattaatcatttccttaataatcgtgcataaactttaaa 6609895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 36 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 5841563 - 5841404
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaa-ctactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcatt 134  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5841563 cattattatacctttatttattgaatttcatccaacttaaactactccactaactacaattaataagggtattttagtaaatgatattaattttaccatt 5841464  T
Q  135 gatattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaaggagtataat 194  Q
     | || ||| |||| ||| |||||| ||||| | |||||||||| ||||| || ||||||    
T  5841463 aaaatcaacgcaatcaatcatttccttaatagttgtgcacaaaccttaaacgactataat 5841404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 39 - 177
Target Start/End: Original strand, 53346748 - 53346886
Alignment:
Q  39 tattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgata 138  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||| |    
T  53346748 tattatactcatatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactaaaattaataagggtgttttagtaaatgctattaattttaccattgaaa 53346847  T
Q  139 ttaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaa 177  Q
     ||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||    
T  53346848 ctaacacaatcaattattttcttaataatcgtgcacaaa 53346886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 51 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 35311343 - 35311210
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaatta 150  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||  | || |||||||||  |||||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  35311343 atttattgaatttcatccaacttaattactccactaactacaattaataagagtgttctagtaaatgcaattaattttaccattgaaattaacataatta 35311244  T
Q  151 ataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    || |||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  35311243 atcatttccttaataatcgtgcacaaaccttaaa 35311210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 39 - 184
Target Start/End: Original strand, 43237232 - 43237377
Alignment:
Q  39 tattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgata 138  Q
    |||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||| |||||||||||  || |||||||| |||||| |    
T  43237232 tattatacacttatttattgaatttcatccaacttaactacttcactaactataattaataatgattttttagtaaatattactaattttaccattgaaa 43237331  T
Q  139 ttaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    | |||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| |||||    
T  43237332 taaacacaattaatcatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 43237377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 39 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 49176066 - 49175921
Alignment:
Q  39 tattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgata 138  Q
    |||||||| || ||||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  49176066 tattatacccttatttattgaattttatccaacttaactactccgctaactacaattaataaggttattttagtaaatgatactaattttatcattgaaa 49175967  T
Q  139 ttaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    |   |||||||||| |||| | ||| |||| ||||||||| |||||    
T  49175966 tctccacaattaatcattttcttaaaaatcatgcacaaaccttaaa 49175921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 36 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 30682331 - 30682183
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattg 135  Q
    ||||||||| || | |||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |     
T  30682331 cattattatgcttttatttattgaatttcattcaaattaactactctactaactacaactaataaggatattatagtaaatgatattaattttaccaata 30682232  T
Q  136 atattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    | ||||||||||||||| ||||   ||||| ||||||| |||| |||||    
T  30682231 aaattaacacaattaatcatttttttaatagtcgtgcaaaaaccttaaa 30682183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 36 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 33790866 - 33790718
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattg 135  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||||| | |||||||| |||      
T  33790866 cattattatacccttatttattgaatttcatccaacttaactactccactaactacaattaataagggtgttttagcaaatgaaactaattttaccatca 33790767  T
Q  136 atattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    | || |||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||| |||||    
T  33790766 aaatcaacacaattaatcattttcttaataatcgtgcataaaccttaaa 33790718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 36 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 28501018 - 28500878
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattg 135  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||        ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28501018 cattattatacccttatttattgaatttcatcaaacttaacta--------actgcaattaataagggtattttagtaaatgatattaattttaccattg 28500927  T
Q  136 atattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    | || |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28500926 aaatcaacacaatcaatcatttccttaataatcgtgcacaaacattaaa 28500878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 36 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 35380468 - 35380333
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattg 135  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||| ||||     
T  35380468 cattattatactcttatttattgaatttcatccaacttaaccactccactaactacaattaataatgatgttttagtaaatgctactaattttaccatta 35380369  T
Q  136 atattaacacaattaataatttccgtaataatcgtg 171  Q
    | || |||| ||||||| |||| | |||||||||||    
T  35380368 aaatcaacataattaatcattttcttaataatcgtg 35380333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 51 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 11907719 - 11907597
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaatta 150  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||  | || ||||||||||    
T  11907719 atttattgaacttcatccaacttaactactccaataactacaattaataagggtgttttagtaaatgatactaattttaccatcaaaatcaacacaatta 11907620  T
Q  151 ataatttccgtaataatcgtgca 173  Q
    || |||||| |||||||||||||    
T  11907619 atcatttccttaataatcgtgca 11907597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 51 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 11288749 - 11288607
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaatta 150  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||| || || |||||||    
T  11288749 atttattgaattttatccaacttaactactccaccaactacaattaataag-atattttagtaaatgatattaattttgccattgaaatcaatacaatta 11288651  T
Q  151 ataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaaggagtataat 194  Q
    || |||| | |||||||||| || |||| ||||| || ||||||    
T  11288650 atcattttcttaataatcgtacataaaccttaaacgattataat 11288607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 36 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 21240839 - 21240708
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattg 135  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||      
T  21240839 cattattatacccttatttattgaatttcatccaacttaactactcaactaactacaattaataaggatgtgttagtaaatgatactaattttaccatca 21240740  T
Q  136 atattaacacaattaataatttccgtaataat 167  Q
    | || |||||| ||||| |||||| |||||||    
T  21240739 aaatcaacacagttaatcatttccttaataat 21240708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 36 - 184
Target Start/End: Original strand, 22130029 - 22130181
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattg 135  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| || |||||    
T  22130029 cattattatacctttatttattgaatttcatccaacttaattactccactaactacaattaataaggatgtttttgtaaatgatactaattataccattg 22130128  T
Q  136 atattaac----acaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    | || |||    ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  22130129 aaatcaacacatacaattaatcatttccttaataaccgtgcacaaaccttaaa 22130181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 36 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 47773154 - 47773024
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattg 135  Q
    |||||| |||| || |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||      
T  47773154 cattataatacccttatttattgaacttcatccaacttaactactccactaactacaattaataagggtgttttagtaaatgatactaattttaccatca 47773055  T
Q  136 atattaacacaattaataatttccgtaataa 166  Q
    | || |||||||||||| |||||| ||||||    
T  47773054 aaatcaacacaattaattatttccttaataa 47773024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 36 - 166
Target Start/End: Original strand, 54506774 - 54506904
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattg 135  Q
    |||||||||| ||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  54506774 cattattatattcttattaattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattgataatgatattttaataaatgatattaattttaccattg 54506873  T
Q  136 atattaacacaattaataatttccgtaataa 166  Q
    | || |||||| ||||| |||| | ||||||    
T  54506874 aaatcaacacagttaatcattttcttaataa 54506904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 36 - 157
Target Start/End: Original strand, 461944 - 462065
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattg 135  Q
    ||||||||||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  461944 cattattatacccttatttgttgaattttattcaacttaactactccgctaattacaattaataaggatattttagtaaataatattacttttaccattg 462043  T
Q  136 atattaacacaattaataattt 157  Q
    | || || ||||||||| ||||    
T  462044 aaatcaatacaattaatcattt 462065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 51 - 184
Target Start/End: Original strand, 32884802 - 32884935
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaatta 150  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||| |||||| || ||||| || |||||| || ||||||||||    
T  32884802 atttattgaattccatccaacttaactactccactaactacaattaataagagtgttttactaaatgctactaattctaccattgaaatcaacacaatta 32884901  T
Q  151 ataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    || |||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  32884902 atcattttcttaataatcgtgcacaaaccttaaa 32884935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 36 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 50264215 - 50264102
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattg 135  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| || | || |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  50264215 cattattatacccttatttattgaatttcattcaacttaaatatttcactaactacaattaataagagtattttagtaaatgatgttaattttaacattg 50264116  T
Q  136 atattaacacaatt 149  Q
    | || |||||||||    
T  50264115 aaatcaacacaatt 50264102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 36 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 42517776 - 42517626
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactc---cattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatca 132  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||  ||||| |||| |    || |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  42517776 cattattatactgttatttattgaatttcatctaactttactagtatttcactaactataattaataagggtattttagtaaatgatcttaattttacca 42517677  T
Q  133 ttgatattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaa 183  Q
    |||| || |||||||||||| |||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  42517676 ttgaaatcaacacaattaatcattttcttaataatcgtgtacaaacattaa 42517626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 36 - 176
Target Start/End: Original strand, 49746947 - 49747086
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattg 135  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||||| | | |||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  49746947 cattattatacccttatttattgaatttcatccaacttaactactcaactaactataattaatgaaggtattttagtaaatactactaattttatcattg 49747046  T
Q  136 atattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaa 176  Q
    | || |||||||||||| ||||   ||||||||||||||||    
T  49747047 aaatcaacacaattaattattt-tttaataatcgtgcacaa 49747086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 40 - 159
Target Start/End: Original strand, 36985776 - 36985895
Alignment:
Q  40 attatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatat 139  Q
    ||||||| || |||||||||||||||| |||||||| || || | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||    
T  36985776 attatacccttatttattgaatttcatccaacttaattattctactaactacaattaatacgggtattttagtaaatgatactaattttaccattgaaat 36985875  T
Q  140 taacacaattaataatttcc 159  Q
     |||||||||||| ||||||    
T  36985876 caacacaattaatcatttcc 36985895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 53 - 191
Target Start/End: Original strand, 19265811 - 19265949
Alignment:
Q  53 ttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaattaat 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| || || | |||||||    
T  19265811 ttattgaatttcattcaacttaactactccactaactataattaataaggttattttaataaataacattaattttattattgaaataaatataattaat 19265910  T
Q  153 aatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaaggagtat 191  Q
     |||| | |||||| |||||| |||  ||||| ||||||    
T  19265911 cattttcttaataaccgtgcagaaagtttaaacgagtat 19265949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 52 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 2942763 - 2942648
Alignment:
Q  52 tttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaattaa 151  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||| || || |||||||||||    
T  2942763 tttattgaaattcattcaacttaaccactccactaactacaattaataagg-tgttttagtaaatgctactaattttatcatcgaaatcaacacaattaa 2942665  T
Q  152 taatttccgtaataatc 168  Q
    | |||||  ||||||||    
T  2942664 tcatttctttaataatc 2942648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 36 - 177
Target Start/End: Original strand, 2653406 - 2653545
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattg 135  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||  ||||    
T  2653406 cattattatacctttatttattaaatttcatccaatttaactactcctttaactacaattaataagagtattttaataaatgatactaattttacaattg 2653505  T
Q  136 atattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaa 177  Q
    | || |||||||||||| ||||   |||||||| ||||||||    
T  2653506 aaatcaacacaattaatcattt--ttaataatcatgcacaaa 2653545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 51 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 18741594 - 18741516
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaatttta 129  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  18741594 atttattgaatttcatccaacttaactactccattaactacaattaataaagatattttaataaatgacactaatttta 18741516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 36 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 38502617 - 38502487
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattg 135  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||||||   ||||||| ||||||||| |||||||| |||      
T  38502617 cattataatactcttatttattgaattttatccaacttaactactacattaactataattaataaaagtattttaataaatgatactaattttaccatca 38502518  T
Q  136 atattaacacaattaataatttccgtaataa 166  Q
    | || |||||||||||| |||||| ||||||    
T  38502517 aaatcaacacaattaattatttccttaataa 38502487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 51 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 40122974 - 40122848
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaatta 150  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| | |||||||||||| || |||||||| |||| | || ||| ||||||    
T  40122974 atttattgaatttcgtcgaacttaactgctccactaactacaatcaataagggtgttttagtaaatgctactaattttaacattaaaatcaacgcaatta 40122875  T
Q  151 ataatttccgtaataatcgtgcacaaa 177  Q
    || |||||| |||||||||||||||||    
T  40122874 atcatttccttaataatcgtgcacaaa 40122848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 51 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 47359069 - 47358936
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaatta 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||   |||||||| |||| ||  ||||||||||||||| || |||||||| |    
T  47359069 atttattgaatttcattcaacttaattactccactgactacaattaataaaagtattttagaaaattattctaattttatcattgaaatcaacacaatca 47358970  T
Q  151 ataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    ||||||| | ||   ||| |||||||||||||||    
T  47358969 ataattttcttagacatcatgcacaaacattaaa 47358936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 36 - 184
Target Start/End: Original strand, 2066775 - 2066923
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattg 135  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| | ||||| ||||| ||| ||| |||| |||      
T  2066775 cattattatacctttatttattgaatttcatctaacttaactaccccactaactaaaattaataagggtgttttaataaataatactaactttaccatca 2066874  T
Q  136 atattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    | || |||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| |||||    
T  2066875 aaatcaacacaattaatcatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 2066923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 72 - 184
Target Start/End: Original strand, 30192227 - 30192339
Alignment:
Q  72 ttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaattaataatttccgtaataatcgtg 171  Q
    |||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||| | ||| |||||||    
T  30192227 ttaattactctactaactacaattaataagaatattttagcaaatgacattaattttataattgaaatcaacacaattaatcattttcttaaaaatcgtg 30192326  T
Q  172 cacaaacattaaa 184  Q
     ||||||||||||    
T  30192327 tacaaacattaaa 30192339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 166
Target Start/End: Original strand, 17114441 - 17114556
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaatta 150  Q
    |||||||||| ||| | ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||  | || ||||||||||    
T  17114441 atttattgaacttcctccaaattaactactccactaactacaattaataagggtgttttagtaaatgatactaattttaccatcaaaatcaacacaatta 17114540  T
Q  151 ataatttccgtaataa 166  Q
    || |||||| ||||||    
T  17114541 atcatttccttaataa 17114556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 39 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 44536327 - 44536183
Alignment:
Q  39 tattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgata 138  Q
    |||||||| || |||| |||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||  |  |||||||| |||| | |    
T  44536327 tattatacccttattt-ttgaatttcatctaacttagctactccactaactacaattaataagggtgttttaataaatcctgctaattttaccattaaaa 44536229  T
Q  139 ttaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    | |||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| |||||    
T  44536228 tcaacacaattaatcatttccttaataatcgtgcataaactttaaa 44536183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 39 - 136
Target Start/End: Original strand, 53412097 - 53412194
Alignment:
Q  39 tattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattga 136  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  53412097 tattatacttttatttattgaatttcatccaacttaactattccacaaactataattaataaaaatattttagtaaatgatactaattttaccattga 53412194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 36 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 26147751 - 26147635
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaat-ttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcatt 134  Q
    ||||||||||| || ||||||||||  ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| |||     
T  26147751 cattattatacccttatttattgaaaattcatccaacttaattactccactaactacaattaataagaatgttttagtaaatgatactaattttaccatc 26147652  T
Q  135 gatattaacacaattaa 151  Q
     | || |||||||||||    
T  26147651 aaaatcaacacaattaa 26147635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 84 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 46396970 - 46396870
Alignment:
Q  84 ttaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaa 183  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||||||||| ||||||||||| |||||| || |||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||| ||||    
T  46396970 ttaactacaattaataagagtgttttagtaaatgctattaattttaccattgaaatcaacacaattaatcatttacttaatgatcgtgcacaaaccttaa 46396871  T
Q  184 a 184  Q
    |    
T  46396870 a 46396870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 41 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 48914278 - 48914155
Alignment:
Q  41 ttatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatga-----tattaattttatcattg 135  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||     || |||||||| |||||    
T  48914278 ttataccctaatttattgaatttcattaaacttaattacttcactaactacaaataataaggatattttagtatatgatggagtactaattttaccattg 48914179  T
Q  136 atattaacacaattaataatttcc 159  Q
    | || |||||||||||| ||||||    
T  48914178 aaatgaacacaattaattatttcc 48914155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 38 - 184
Target Start/End: Original strand, 39397332 - 39397478
Alignment:
Q  38 ttattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgat 137  Q
    ||||||||| || ||||||| |||||||| ||  ||||||| || | ||||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||| |||| || |||     
T  39397332 ttattatacccttatttattaaatttcatccattttaactaatctagtaactacaattaatatggggattttagtaaatgacattaaatttaccaatgaa 39397431  T
Q  138 attaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    || |||| ||||||| |||||| |||  ||||||||||||| |||||    
T  39397432 atcaacataattaatcatttccttaaacatcgtgcacaaactttaaa 39397478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 184
Target Start/End: Original strand, 35998813 - 35998945
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaatta 150  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||   || | || |||| || ||    
T  35998813 atttattgaatt-catccaacttaactactccatcaactacaattaataatgatattttaataaatgttactaattttactgttaaaatcaacataaata 35998911  T
Q  151 ataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    |||||||   |||||||||| || ||||||||||    
T  35998912 ataatttttttaataatcgtacaaaaacattaaa 35998945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 41711576 - 41711443
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaatta 150  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| |||||  ||| || |||||| || |||||||||  ||||||||||||||||| |||| | || |||| |||||    
T  41711576 atttattgaatttcataaaacttaacaactccgctaaataaaattaaaaatgatattttaaaaaatgatattaattttaccattaaaatcaacataatta 41711477  T
Q  151 ataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    || |||||| ||| ||| |||||||||| |||||    
T  41711476 atcatttccataaaaattgtgcacaaaccttaaa 41711443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 84 - 184
Target Start/End: Original strand, 52869106 - 52869206
Alignment:
Q  84 ttaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaa 183  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| |||| ||||||||| |||  ||||| || |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||||    
T  52869106 ttaactacaattaataaaggtattttaataaacgatattaatcttactattgaaatcaacacaattaattatttccttaataattgtgcacaaaccttaa 52869205  T
Q  184 a 184  Q
    |    
T  52869206 a 52869206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 39 - 134
Target Start/End: Original strand, 7986963 - 7987058
Alignment:
Q  39 tattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcatt 134  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||| | |||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  7986963 tattatacttttatttatttaatttcattaaacttaactactctactaacaataattaataataatattttagtagatgatactaattttatcatt 7987058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 52 - 184
Target Start/End: Original strand, 5618549 - 5618676
Alignment:
Q  52 tttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaattaa 151  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||     || ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| | || ||||||| | |    
T  5618549 tttattgaatttcattcaactttaccactc-----acaacaattaataaggatattttaataaataattttaattttaccattaaaatcaacacaactca 5618643  T
Q  152 taatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    | ||||   ||||||||| ||||||||||||||    
T  5618644 tcatttttttaataatcgagcacaaacattaaa 5618676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 51 - 170
Target Start/End: Original strand, 43902252 - 43902374
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagta---aatgatattaattttatcattgatattaacacaa 147  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||  ||||||||| |||||||| ||   ||| ||||||||||||||||| | || |||| ||    
T  43902252 atttattgaatttcatgcaacttaattactccactaactatgattaataagaatattttaataaataataatattaattttatcattaaaatcaacataa 43902351  T
Q  148 ttaataatttccgtaataatcgt 170  Q
    ||||| ||| || |||| |||||    
T  43902352 ttaatcattgccttaatgatcgt 43902374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 106 - 194
Target Start/End: Original strand, 51625139 - 51625227
Alignment:
Q  106 ttttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaaggagtataat 194  Q
    |||||||||||| || |||||||| |||||| || |||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  51625139 ttttagtaaatgttactaattttaccattgaaatcaacacaattaatcattttcttaataatcgtgcacaaactttaaacgactataat 51625227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 51 - 158
Target Start/End: Original strand, 25233182 - 25233289
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaatta 150  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||    | ||||||||||||||| |||||||| |||  | |||||||||||||    
T  25233182 atttattgaacttcatccaacttaactacttcactaactataattaatactagtgttttagtaaatgatactaattttaccatcaaaattaacacaatta 25233281  T
Q  151 ataatttc 158  Q
    || |||||    
T  25233282 attatttc 25233289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 51 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 25142499 - 25142430
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgata 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||  || ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  25142499 atttattgaatttcatccaacttaactacatcactaactgcaatcaataaggatattttagtacatgata 25142430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 84 - 177
Target Start/End: Original strand, 29575142 - 29575235
Alignment:
Q  84 ttaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaa 177  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||| |||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||||| |||| | || |||||||| |||||    
T  29575142 ttaactacaattaacaagagtattttaataaatgttattaattttatcatttaaattaacataattaatcattttcttagtaatcgtgtacaaa 29575235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 157
Target Start/End: Original strand, 3098757 - 3098825
Alignment:
Q  89 tacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaattaataattt 157  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||||||| ||||    
T  3098757 tacaattaataaagatattttagtaaatgatatcaattttatcattgaaatcaatataattaatcattt 3098825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 184
Target Start/End: Original strand, 3689548 - 3689696
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattg 135  Q
    ||||||||||| || ||| ||| ||||||||  |||||||| |||| | |||||| ||||||||||  | ||||||||||||||| |||||||| |||      
T  3689548 cattattatacccttattaatttaatttcatctaacttaacaactcaactaactataattaataagagtgttttagtaaatgatactaattttaccatca 3689647  T
Q  136 atattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    | || || ||||||||| |||||  |||||| ||| || |||| |||||    
T  3689648 aaatcaatacaattaatcatttctttaataaccgtacataaaccttaaa 3689696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 100
Target Start/End: Original strand, 10754363 - 10754423
Alignment:
Q  40 attatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataa 100  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||    
T  10754363 attatactcttatttattaaatttcattcaacttaattattccactaactacaattaataa 10754423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 100
Target Start/End: Original strand, 10968132 - 10968192
Alignment:
Q  40 attatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataa 100  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||    
T  10968132 attatactcttatttattaaatttcattcaacttaattattccactaactacaattaataa 10968192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 157
Target Start/End: Original strand, 35251934 - 35251996
Alignment:
Q  95 taataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaattaataattt 157  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||    
T  35251934 taataatggtattttagtaaatgatattaattttatcattgaaataaccacaattaattattt 35251996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 51 - 117
Target Start/End: Original strand, 44526380 - 44526446
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatg 117  Q
    ||||||| |||||||| |||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  44526380 atttattaaatttcatccaacttcactattccactaactacaattaataaggatgttttaataaatg 44526446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 40 - 101
Target Start/End: Original strand, 10672643 - 10672704
Alignment:
Q  40 attatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataag 101  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | |||| |||| ||||||||||    
T  10672643 attatactcttatttattgaatttcatccaacttaactatttcattgactaaaattaataag 10672704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 40 - 101
Target Start/End: Original strand, 10886283 - 10886344
Alignment:
Q  40 attatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataag 101  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | |||| |||| ||||||||||    
T  10886283 attatactcttatttattgaatttcatccaacttaactatttcattgactaaaattaataag 10886344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 13016746 - 13016666
Alignment:
Q  56 ttgaatttcattcaacttaactac-tccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattga 136  Q
    |||||||||| |||||| |||||| |||| |||||||| ||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13016746 ttgaatttcactcaactcaactacctccactaactaca-ttactatggatattatagcaaatgatattaattttatcattga 13016666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 20612306 - 20612213
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaatttta 129  Q
    ||||| |||||| | ||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||| ||||||||||||| | | ||||||||||| ||| ||| ||||    
T  20612306 cattaatatactattatttattgaatttcaattcacttaactacttcattatctacaattaataatggtgttttagtaaattatactaacttta 20612213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 100
Target Start/End: Original strand, 51624787 - 51624836
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataa 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  51624787 atttattgaatttcatccaacttaactactccactaactacaaataataa 51624836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 36 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 31370435 - 31370373
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaat 98  Q
    |||||||||||  | ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  31370435 cattattatacatttatttattgattttcatccaacttaactactccactaactataattaat 31370373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 83 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 32470036 - 32469962
Alignment:
Q  83 attaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaattaataattt 157  Q
    |||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||| |||||||| |||| | || |||||||||||| ||||    
T  32470036 attaactacagttaataagaatgttttaataaatgatactaattttaccattaaaatcaacacaattaatcattt 32469962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 89 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 37868680 - 37868638
Alignment:
Q  89 tacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatc 131  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37868680 tacaattaataaaaatattttagtaaatgatattaattttatc 37868638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 51 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 49579298 - 49579165
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcatt-gatattaacacaatt 149  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| | | || ||||||||||||||||   | ||||||| ||| ||| |||||||||||||  | || |||||||||    
T  49579298 atttattgaatttcatccaacttaacaatttcaataactacaattaataaaagtgttttagt-aataataataattttatcattaaaaatcaacacaatt 49579200  T
Q  150 aataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    ||| ||||   ||| |||| ||||||||| |||||    
T  49579199 aatcatttatttaaaaatcatgcacaaactttaaa 49579165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 72 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 16506332 - 16506248
Alignment:
Q  72 ttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaattaataattt 157  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||| || | |||  |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  16506332 ttaattactccattaactacaattaataaatgtgttttagtaaatgttact-attgcatcattgaaattaacataattaataattt 16506248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 51 - 184
Target Start/End: Original strand, 18532180 - 18532313
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaatta 150  Q
    |||||||||||||||| | | ||||| |||||| | |||| |||||||||   ||||||| ||||| ||| |||||||| |||| | ||| | | |||||    
T  18532180 atttattgaatttcatcctagttaaccactccacttactataattaataaaactattttaataaatcatactaattttaccattaaaatttatataatta 18532279  T
Q  151 ataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    || ||||  |||| |||| ||||||||| |||||    
T  18532280 atcatttatgtaaaaatcatgcacaaaccttaaa 18532313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 51 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 38663567 - 38663482
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattga 136  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||  | ||||||| ||||||||   | |||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  38663567 atttattaaatttcatccaacttaactactttactaactacgattaataaaagtgttttagtaaatgctactaattttaccattga 38663482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 177
Target Start/End: Original strand, 4972595 - 4972687
Alignment:
Q  85 taactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaa 177  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||||||||  |  ||||||   ||||| || |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  4972595 taactacaattaataagagtgttttagtaaatgtcaccaatttttcaattgaaatcaacacaattaatcatttcattaataatcgtgcacaaa 4972687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 104 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 8175647 - 8175575
Alignment:
Q  104 tattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaa 176  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||| || |||||||||| | ||||   |||||||| |||||||    
T  8175647 tattttaataaatgatattaattttaccattgaaatcaacacaattattcatttttttaataatcatgcacaa 8175575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 51 - 126
Target Start/End: Original strand, 2400779 - 2400854
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaatt 126  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||||||  ||||||||| ||| ||| | ||||||||||| || ||||||    
T  2400779 atttattgaattttattatacttaactactccacaaactacaatcaatgagggtgttttagtaaataatgttaatt 2400854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 86 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 17512424 - 17512381
Alignment:
Q  86 aactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaatttta 129  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||    
T  17512424 aactacaattaataatggtattttagtaaattatattaatttta 17512381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 45 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 23915555 - 23915485
Alignment:
Q  45 actctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaat 116  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||| || |||||||||| |||||| ||||||||| ||| |||||||||||    
T  23915555 actcttatttattgtatttcaatcacct-aactactccactaactataattaataatgatgttttagtaaat 23915485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 42 - 101
Target Start/End: Original strand, 30260996 - 30261055
Alignment:
Q  42 tatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataag 101  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||||||||||||    
T  30260996 tatagtcttatttattgaatttcactctacttaactactctactaattacaattaataag 30261055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 28911291 - 28911249
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaacta 78  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  28911291 cattattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaacta 28911249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 134
Target Start/End: Original strand, 54202187 - 54202283
Alignment:
Q  41 ttatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaat---aaggatattttagtaaatgatattaattttatcatt 134  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| | ||| || |||| || ||| ||||||||||   ||  |||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  54202187 ttatattcttatttattgaatttcatcccactcaattacttcactaattacaattaataaaaataatattttaataaatgatattaattttaccatt 54202283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 83 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 27880329 - 27880264
Alignment:
Q  83 attaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaat 148  Q
    ||||| ||||||| |||||  |||| |||||||||||| |||||||| |||||| || ||||||||    
T  27880329 attaagtacaattgataagagtattctagtaaatgatactaattttaccattgaaatcaacacaat 27880264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 119 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 28757642 - 28757610
Alignment:
Q  119 tattaattttatcattgatattaacacaattaa 151  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28757642 tattaattttatcattgatatcaacacaattaa 28757610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 134
Target Start/End: Original strand, 54123668 - 54123700
Alignment:
Q  102 gatattttagtaaatgatattaattttatcatt 134  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  54123668 gatattttagtaaatgatactaattttatcatt 54123700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 65)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 36 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 37695795 - 37695654
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattg 135  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37695795 cattattatacccttatttattgaatttcatctaacttaactactccactaactacaattaataagggtgttttagtaaatgatattaattttaccattg 37695696  T
Q  136 atattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaa 177  Q
    | || |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  37695695 aaatcaacacaattaatcatttccttaataatcgtgcacaaa 37695654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 39 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 36460542 - 36460397
Alignment:
Q  39 tattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgata 138  Q
    |||||||| || |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| || ||||||||  ||||| |    
T  36460542 tattatacccttatttattgaatttcatccaacttaattactccattaactacaattaataagaatattttaataaatgttactaattttactattgaaa 36460443  T
Q  139 ttaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  36460442 ttaacacaattaataattttcttaataatcgtgcacaaactttaaa 36460397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 37 - 184
Target Start/End: Original strand, 37311937 - 37312084
Alignment:
Q  37 attattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattga 136  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  37311937 attattatactcttatttattgaatttcattaaatttaactactccactaactacaattaataagggttttttagtaaatgctactaattttaccattga 37312036  T
Q  137 tattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
     || |||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| |||||    
T  37312037 aatcaacacaattaatcatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 37312084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 36 - 184
Target Start/End: Original strand, 1778629 - 1778776
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattg 135  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  1778629 cattattatacccttatttattgaatttcatccaacttatctactccactaactacaat-aataaggatgttttagtaaatgtcattaattttatcattg 1778727  T
Q  136 atattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    | || |||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  1778728 aaatcaacacaattaatcatttccttaataatcatgcacaaaccttaaa 1778776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 49 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 24569216 - 24569092
Alignment:
Q  49 tcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaat 148  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  24569216 tcatttaatgaatttcattcaacttaactactccactaactacaattaataagggtattttagtaaataatattaattttaccattgaaatcaacacaat 24569117  T
Q  149 taataatttccgtaataatcgtgca 173  Q
    |||| |||| | |||||||||||||    
T  24569116 taatcattttcttaataatcgtgca 24569092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 36 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 30190789 - 30190641
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattg 135  Q
    ||||||| ||| || ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  30190789 cattattttacccttattaattgaatttcatccaacttaactactccactaactacaattaataagggtattttagtaaatgatactaattttaccattg 30190690  T
Q  136 atattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    | || |||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||| |||||    
T  30190689 aaatcaacacaattaatcatttccttcataaccgtgcacaaaccttaaa 30190641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 39 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 51838085 - 51837930
Alignment:
Q  39 tattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgata 138  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  51838085 tattatacccttatttaatgaatttcattcaacgtaactactccactagctacaactaataagggtattttagtaaatgatattaattttatcattgaaa 51837986  T
Q  139 ttaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaaggagtataat 194  Q
    | |||||||||||| |||| | ||||| || ||||||||| ||||| || ||||||    
T  51837985 tcaacacaattaatcatttacttaatactcatgcacaaaccttaaatgactataat 51837930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 39 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 43253989 - 43253844
Alignment:
Q  39 tattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgata 138  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||| |||||| |    
T  43253989 tattatacccttatttaatgaatttcatcccacttaactactccactaactacaattaataagggtgttttagtaaatgctactaattttaccattgaaa 43253890  T
Q  139 ttaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    | |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  43253889 tcaacacaattaatcatttccttaataatcgtgcacaaaccttaaa 43253844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 51 - 191
Target Start/End: Original strand, 11905823 - 11905963
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaatta 150  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||    
T  11905823 atttattgaatttcatccaacttaacaactccattaactacaattaataagggtgctttagtaaatgatactaattttatcatcaaaattaacacaatta 11905922  T
Q  151 ataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaaggagtat 191  Q
    || |||| | ||||||||||||| |||| ||||| ||||||    
T  11905923 atcattttcttaataatcgtgcataaactttaaacgagtat 11905963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 36 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 37773093 - 37772945
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattg 135  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37773093 cattattatacccttatttaatgaatttcattcaacttaactattccactgactataattaataagggtattttagtaaatgatattaattttaccattg 37772994  T
Q  136 atattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
      || || ||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  37772993 taatcaatacaattaatcatttccttaataatcatgcacaaaccttaaa 37772945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 51 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 28690896 - 28690763
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaatta 150  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||   || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||    
T  28690896 atttattgaatttcatccaacttaactatctcactaactacaattaataaagatattttagtaaatgatattaattttaccgttgaaatcaacacaatta 28690797  T
Q  151 ataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    || |||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  28690796 atcatttctttaataatcgtgcacaaaccttaaa 28690763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 39 - 184
Target Start/End: Original strand, 44301551 - 44301696
Alignment:
Q  39 tattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgata 138  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  44301551 tattatactcttatttattgaatttcatccaacttaactactccactaattacaattgataagggtattttagtaaatgatactaattttatcattgaaa 44301650  T
Q  139 ttaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    | |||| ||||||  |||||| ||| | ||| |||||||| |||||    
T  44301651 tcaacataattaaatatttccttaaaagtcgggcacaaaccttaaa 44301696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 36 - 184
Target Start/End: Original strand, 19822997 - 19823145
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattg 135  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| || |||      
T  19822997 cattaatatacccttatttattgaatttcatccaacttaactattccactaactacaattaataagggtgttttagtaaatgatactaattctaccatca 19823096  T
Q  136 atattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    | || |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  19823097 aaatcaacacaattaatcatttccttaataatcgtgcacaaaccttaaa 19823145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 37 - 184
Target Start/End: Original strand, 36476571 - 36476718
Alignment:
Q  37 attattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattga 136  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  36476571 attattatacccttatttattgaatttcatcaaacttaactactctactaactacaattaataagggtattttagtaaatgatattaattttaccattgc 36476670  T
Q  137 tattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
     || |||||||| ||| |||| | |||||| |||| |||||| |||||    
T  36476671 aatcaacacaatcaattattttcttaataaccgtgaacaaaccttaaa 36476718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 36 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 3901278 - 3901157
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattg 135  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3901278 cattattatacccttatttattgaatttcatccaacttaagtaccccactaactacaactaataagaatgttttagtaaatgatattaattttatcattg 3901179  T
Q  136 atattaacacaattaataattt 157  Q
    | ||||| ||||||||| ||||    
T  3901178 aaattaatacaattaatcattt 3901157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 39 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 8679180 - 8679025
Alignment:
Q  39 tattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgata 138  Q
    |||||||| || |||||||||||||||| |||||||| || | || |||||| ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||| |    
T  8679180 tattatacccttatttattgaatttcatccaacttaattaattcactaactataattaataaggatcttttagtaaatgctactaattttaccattgaaa 8679081  T
Q  139 ttaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaaggagtataat 194  Q
    | |||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||  ||||| || ||||||    
T  8679080 tcaacacaattaatcatttccttaataatcgtgcataaatcttaaacgactataat 8679025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 39 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 12736698 - 12736553
Alignment:
Q  39 tattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgata 138  Q
    |||||||| || ||||||||||||| || ||| ||||||||| || ||| |||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||   |    
T  12736698 tattatacccttatttattgaattttatccaaattaactactacactaagtacaattaataagggtattgtagtaaatgatactaattttatcattagaa 12736599  T
Q  139 ttaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    | |||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  12736598 tcaacacaattaatcatttccttaaaaatcgtgcacaaactttaaa 12736553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 36 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 39043886 - 39043772
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatga---tattaattttatca 132  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||   ||||||||||| ||    
T  39043886 cattattatacccttatttattgaatttcattcaacttaactactccactaactacaattaataaaggtattttagtaaatgatactattaattttacca 39043787  T
Q  133 ttgatattaacacaa 147  Q
    |||| || |||||||    
T  39043786 ttgaaatcaacacaa 39043772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 60 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 54477564 - 54477473
Alignment:
Q  60 atttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaattaa 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| | || |||||||||||    
T  54477564 atttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaaaatattttagtaaatgatattaattttaccattaaaatcaacacaattaa 54477473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 36 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 5323066 - 5322920
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattg 135  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||||  | ||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5323066 cattattatacccttatttattgaatttcatcaaacttaactactttactaattataattaataagtgtattttagtaaatgatattaattttatcactg 5322967  T
Q  136 atattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    | || |||| ||||||| ||||   |||||||||||||||||| |||||    
T  5322966 aaatcaacataattaatcattt--ttaataatcgtgcacaaaccttaaa 5322920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 51 - 184
Target Start/End: Original strand, 19611910 - 19612042
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaatta 150  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| || ||||||||||    
T  19611910 atttattgaatttcatcaaacttaactactccactaacaacaattaataaggatattttagtaaattata-taattttaacattgaaatcaacacaatta 19612008  T
Q  151 ataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    || | || | ||| |||||| ||||||| |||||    
T  19612009 atcactttcttaaaaatcgtacacaaactttaaa 19612042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 39 - 184
Target Start/End: Original strand, 30711062 - 30711207
Alignment:
Q  39 tattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgata 138  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  30711062 tattataatcttatttattgaatttcatctaacttaattgctccattaactacaattaataatggtgttttagtaaatgatattaattttatcattaaaa 30711161  T
Q  139 ttaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    | |||| ||||||| |||||  ||||||   ||||||||| |||||    
T  30711162 tcaacataattaattatttctttaataacaatgcacaaaccttaaa 30711207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 36 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 29024094 - 29023947
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattg 135  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |||      
T  29024094 cattattataccattatttattgaatttcatccaacttaattactccactaactacaattaataa-gatgttttagtaaatgatactaattttaccatca 29023996  T
Q  136 atattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    | || |||||||||||| ||||   ||||||||||||| |||| |||||    
T  29023995 aaatcaacacaattaatcatttttttaataatcgtgcataaaccttaaa 29023947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 52 - 184
Target Start/End: Original strand, 38795346 - 38795478
Alignment:
Q  52 tttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaattaa 151  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||  ||||  |||||||||| |||||||| |||||| || |||||||||||    
T  38795346 tttattaaatttcatccaacttaacaactccaccaactacaattaataagggcatttgggtaaatgatactaattttaccattgaaataaacacaattaa 38795445  T
Q  152 taatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    | |||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  38795446 tcatttccttaaatatcgtgcacaaacattaaa 38795478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 36 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 10366778 - 10366623
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataagga-------tattttagtaaatgatattaatttt 128  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||  |       | ||||| ||||||||| |||||||    
T  10366778 cattattatacccttatttattgaatttcatccaacttaactacttcactaactacaattaataattaataagagtgttttaataaatgatactaatttt 10366679  T
Q  129 atcattgatattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    | |||||| || |||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  10366678 accattgaaatcaacacaattaatcattttcttaataatcgtgcacaaaccttaaa 10366623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 36 - 173
Target Start/End: Original strand, 37497478 - 37497615
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattg 135  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| || | | ||||||||||||||| |||||||| |||      
T  37497478 cattattatacgtttatttattgaatttcatccaacttaactactccactaactacagttaacaacggtgttttagtaaatgatactaattttaccatca 37497577  T
Q  136 atattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgca 173  Q
    | || |||||||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  37497578 aaatcaacacaataaatcatttccttaataatcgtgca 37497615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 36 - 173
Target Start/End: Original strand, 54726471 - 54726608
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattg 135  Q
    |||||| |||| || ||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||      
T  54726471 cattataatacccttatttattaaacttcatctaacttaactactccattaactacaattaataaagatgttttagtaaatgatattaattttaccatca 54726570  T
Q  136 atattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgca 173  Q
    | || |||||| ||||| |||| | |||||| ||||||    
T  54726571 aaatcaacacatttaatcattttcttaataaccgtgca 54726608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 51 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 23004496 - 23004380
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaatta 150  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||  || |||||||| |||||| ||  |||||||||    
T  23004496 atttattgaatttcatacaacttaactactccactaactacaattaataagggtgttttagtatatactactaattttaccattgaaatcgacacaatta 23004397  T
Q  151 ataatttccgtaataat 167  Q
    || |||||| |||||||    
T  23004396 atcatttccttaataat 23004380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 56 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 48541109 - 48540981
Alignment:
Q  56 ttgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaattaataat 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || || ||| ||| ||||| | ||    
T  48541109 ttgaatttcattcaacttaactactcaactaattacaattaataagaatattttaataaatgatattaattttattatagaaattgacataattagtcat 48541010  T
Q  156 ttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    |||| |||  || |||||||||| |||||    
T  48541009 ttccttaaacattgtgcacaaactttaaa 48540981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 36 - 184
Target Start/End: Original strand, 3313240 - 3313384
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattg 135  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||  || |||||||| |||||    
T  3313240 cattattataatcttatttattgaatttcatccaacttaaatactccattaactacaattaataagggtgttttagttaattctactaattttaccattg 3313339  T
Q  136 atattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    | ||  |||    |||| |||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  3313340 aaatcgaca----taatcattttcttaataatcgtgcacaaaccttaaa 3313384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 37 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 30682194 - 30682072
Alignment:
Q  37 attattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattga 136  Q
    ||||| ||||| | |||||||||||||| | |||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||| |||| |    
T  30682194 attatcatactattatttattgaatttcgtccaacttaattattccattaactacaattaataagattattttagtaaatgatactcattttaacattaa 30682095  T
Q  137 tattaacacaattaataatttcc 159  Q
     ||||| ||||||||| ||||||    
T  30682094 aattaaaacaattaatcatttcc 30682072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 51 - 184
Target Start/End: Original strand, 34750497 - 34750630
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaatta 150  Q
    ||||||| | |||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| | || |||||||| |    
T  34750497 atttattaattttcatccaagttaactactccaccaactacaattaataaggatgttttagtaaatgatactaattttaccattaaaatcaacacaatca 34750596  T
Q  151 ataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    || |||||   || |||||||||||||| |||||    
T  34750597 atcatttcatcaaaaatcgtgcacaaaccttaaa 34750630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 36 - 184
Target Start/End: Original strand, 14194542 - 14194689
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattg 135  Q
    |||||||||||  | ||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |||| |||||| ||||   |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  14194542 cattattatacctttattaattgaatttcatccaacttaattactccactaac-acaattcataaaagtattttagtaaatggtactaattttatcattg 14194640  T
Q  136 atattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    | || ||||||||| || |||||  ||| |||||||||||||| |||||    
T  14194641 aaatcaacacaattgatcatttctttaaaaatcgtgcacaaaccttaaa 14194689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 39 - 177
Target Start/End: Original strand, 11632070 - 11632207
Alignment:
Q  39 tattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgata 138  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||| | | |||||||||||  || |||||||| | |||| |    
T  11632070 tattatacttttatttattgaatttcatccaacttaacttttccactaactacaattaataaaggtgttttagtaaatactactaattttaccgttgaaa 11632169  T
Q  139 ttaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaa 177  Q
    | |||||||||||| ||||   |||||||||||||||||    
T  11632170 tcaacacaattaatcattt-tttaataatcgtgcacaaa 11632207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 177
Target Start/End: Original strand, 27471336 - 27471462
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaatta 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||  | ||||||||||||  | |||||| | |||||| || |||| |||||    
T  27471336 atttattgaatttcattcaacttaactactccactacttataattaataagagtgttttagtaaatgcaactaatttcaccattgaaatcaacataatta 27471435  T
Q  151 ataatttccgtaataatcgtgcacaaa 177  Q
    || |||| | |||||||||||||||||    
T  27471436 atcattttcttaataatcgtgcacaaa 27471462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 37 - 178
Target Start/End: Original strand, 17652739 - 17652876
Alignment:
Q  37 attattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattga 136  Q
    |||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||    ||| || ||||| |||  |    
T  17652739 attattatacccttatttattaaatttcatccaacttaactacctcactaactacaattaataaggatgttttagta----atactagttttaccatcaa 17652834  T
Q  137 tattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaac 178  Q
     || |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  17652835 aatcaacacaattaatcatttccttaataatcgtgcataaac 17652876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 39 - 157
Target Start/End: Original strand, 12904853 - 12904972
Alignment:
Q  39 tattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaat-aaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgat 137  Q
    |||||||| || |||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||||  ||||| ||| ||||||||| |||||     
T  12904853 tattatacccttatttattgaatttcatccaacttaattactccactaactacaattaataaaagatattttgataaatcatactaattttataattgaa 12904952  T
Q  138 attaacacaattaataattt 157  Q
    || |||| ||||||| ||||    
T  12904953 atcaacataattaattattt 12904972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 129
Target Start/End: Original strand, 45710851 - 45710929
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaatttta 129  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||    
T  45710851 atttattgaacttcatccaacttaactactccactaactacaattaataaaagtgttttagtaaatgatattaatttta 45710929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 85 - 194
Target Start/End: Original strand, 49830164 - 49830274
Alignment:
Q  85 taactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaattaat-aatttccgtaataatcgtgcacaaacattaa 183  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||| | |||   |||||||||||||||||| ||||    
T  49830164 taactacaattaataatggtattttagtaaatgatattaattttactattgaaatcaacacaattaatcattttttttaataatcgtgcacaaacgttaa 49830263  T
Q  184 aggagtataat 194  Q
    | || ||||||    
T  49830264 acgactataat 49830274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 173
Target Start/End: Original strand, 53560218 - 53560340
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaatta 150  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| | ||||||||| | |||||||||||||||  ||||||| |||  | || |||| |||||    
T  53560218 atttattgaacttcattcaacttaactactctactaactatatttaataagggtgttttagtaaatgatacaaattttaccatcaaaatcaacataatta 53560317  T
Q  151 ataatttccgtaataatcgtgca 173  Q
    || |||||| |||| ||||||||    
T  53560318 atcatttccttaatcatcgtgca 53560340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 36 - 157
Target Start/End: Original strand, 19609285 - 19609406
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattg 135  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||| ||  |||||| |||||||| |||| |||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  ||||    
T  19609285 cattattatacatttatttattgaattttatcaaacttatctactccactaacaacaagtaataagaatatttttgtaaatgatattaattttacgattg 19609384  T
Q  136 atattaacacaattaataattt 157  Q
    | || ||||||| |||| ||||    
T  19609385 aaatcaacacaaataatcattt 19609406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 184
Target Start/End: Original strand, 34957504 - 34957637
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaatta 150  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||| |||  |  | ||||||||||    
T  34957504 atttattgaatttcatttaactgaactactccactaactataattaataaggatatttaagtaaattatacaaattttaccatcaaattcaacacaatta 34957603  T
Q  151 ataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    || |||||| || |||| || || |||| |||||    
T  34957604 atcatttccttagtaattgtccataaaccttaaa 34957637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 55 - 183
Target Start/End: Original strand, 43719272 - 43719399
Alignment:
Q  55 attgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaattaataa 154  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| |||||||| |||| | || |||||||||||| |    
T  43719272 attgaattccatccaatttaactactccactaactacaattaataaggatgtttcagtgaatgata-taattttaccattaaaatcaacacaattaatca 43719370  T
Q  155 tttccgtaataatcgtgcacaaacattaa 183  Q
    |||   |||| |||||| |||||| ||||    
T  43719371 ttttattaatgatcgtgtacaaactttaa 43719399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 177
Target Start/End: Original strand, 30861395 - 30861521
Alignment:
Q  51 atttattgaattt-cattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaatt 149  Q
    ||||||||||||| |||| || |||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||||  |||| | || | |||||||||||| || |||||||||    
T  30861395 atttattgaattttcattaaatttaattactctactaactataattaataaggatattttaacaaattaaataatttttatcattgaaatcaacacaatt 30861494  T
Q  150 aataatttccgtaataatcgtgcacaaa 177  Q
    |||||||||| ||| |||| ||||||||    
T  30861495 aataatttcc-taaaaatcatgcacaaa 30861521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 39 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 49447917 - 49447775
Alignment:
Q  39 tattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgata 138  Q
    |||||||| || ||||||| ||||||||  || ||||||| || | |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||   || || |||| |    
T  49447917 tattatacccttatttattaaatttcatcaaatttaactattctactaactacaattaataagggtattttggtaaataatatta---ttttcgttgaaa 49447821  T
Q  139 ttaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    | |||||||||||| |||||  |||| ||||| |||||||||||||    
T  49447820 tcaacacaattaatcatttcgttaattatcgtacacaaacattaaa 49447775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 51 - 166
Target Start/End: Original strand, 52290894 - 52291009
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaatta 150  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||| |||||| || |||||||| |||  | || || |||||||    
T  52290894 atttattgaactttattcaacttaactactccactaactataattaataaggctgttttaataaatggtactaattttaccatcaaaatcaatacaatta 52290993  T
Q  151 ataatttccgtaataa 166  Q
    || |||| | ||||||    
T  52290994 atcattttcttaataa 52291009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 120
Target Start/End: Original strand, 38705163 - 38705244
Alignment:
Q  38 ttattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgata 120  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  38705163 ttataatactcttatttattgaatttcatctaacttaattactcaactaactacaattaataagaata-tttagtaaatgata 38705244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 51 - 157
Target Start/End: Original strand, 26467110 - 26467217
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaactactccatta--actacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaat 148  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||  ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||  |||||||| | || ||||||||    
T  26467110 atttattgaatttcatctaacttaactacttcattataactacaattaataaacatattttaataaatgatattaa-cttatcattaaaatcaacacaat 26467208  T
Q  149 taataattt 157  Q
     ||| ||||    
T  26467209 caatcattt 26467217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 51 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 36463060 - 36462977
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcatt 134  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| |||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||| ||||    
T  36463060 atttatttaatttcatccaacttaattactccacaaacaacaattaataaggttattttagtaaatgctaccaattttaacatt 36462977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 25108639 - 25108554
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattga 136  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| |||| ||   || |||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  25108639 atttattgaatttcattctatttaactacttcattaactacgattagtacttatgttttagaagatgatattaattttaccattga 25108554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 134
Target Start/End: Original strand, 38512044 - 38512109
Alignment:
Q  69 aacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcatt 134  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| |||||  |||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  38512044 aacttaactactccaataattacaatcaataaatatattttaataaatgatatcaattttatcatt 38512109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 41351678 - 41351629
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  41351678 atttattgaatttcattcaacttaactactccactaactatcattaataa 41351629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 51 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 41038507 - 41038448
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatatttta 110  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  41038507 atttattgaacttcaaccaacttaactacttcattaactacaattaataagagtatttta 41038448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 39 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 33491486 - 33491408
Alignment:
Q  39 tattatactctcatttattgaa-tttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaat 116  Q
    |||||||| || ||||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||  | |||||||||||    
T  33491486 tattatacccttatttattaaaatttcatacaacttaactactccactaactataattaataagagtgttttagtaaat 33491408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 51 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 38137560 - 38137498
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagta 113  Q
    ||||||||||||||||  || |||||||| ||| |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  38137560 atttattgaatttcatcgaatttaactaccccactaactacagttaataagaatattttagta 38137498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 59 - 120
Target Start/End: Original strand, 33459056 - 33459117
Alignment:
Q  59 aatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgata 120  Q
    |||||||||||| |||| || || | |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  33459056 aatttcattcaatttaagtattctactaactacaattaataaagatattttaataaatgata 33459117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 123 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 33491125 - 33491064
Alignment:
Q  123 aattttatcattgatattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    |||||||  ||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  33491125 aattttactattgaaatcaacacaattaatcatttccttaataatcgtgcacaaaccttaaa 33491064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 52206921 - 52206876
Alignment:
Q  91 caattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattga 136  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  52206921 caattaataaatatattttagtaaatgatattaattttaccattga 52206876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 74 - 118
Target Start/End: Original strand, 27955906 - 27955950
Alignment:
Q  74 aactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatga 118  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  27955906 aactactcgattaactactattaataatgatattttagtaaatga 27955950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 113
Target Start/End: Original strand, 37804839 - 37804898
Alignment:
Q  54 tattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagta 113  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||||||    
T  37804839 tatttaatttcataaaacttaactactccactaaccataattaataagggtattttagta 37804898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 85 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 50035297 - 50035198
Alignment:
Q  85 taactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    ||||||||||||| || | | |||| ||||||| || ||||||||| ||||| || |||| ||||| | |||| | |||||||| ||||||||| |||||    
T  50035297 taactacaattaacaacggtgttttggtaaatgctactaattttattattgaaatcaacataattattcattttcttaataatcatgcacaaaccttaaa 50035198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 1018982 - 1018908
Alignment:
Q  42 tatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaat 116  Q
    |||||| | |||||||| || |||  |||| ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  1018982 tatacttttatttattgtatctcaagcaacctaactactccactaactgcaattaataatgatatattagtaaat 1018908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 102
Target Start/End: Original strand, 23068184 - 23068250
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataagg 102  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||| || | ||  |||||||||||||||||    
T  23068184 cattattatacttttatttattgaatttcatctaacttaaatatttcacaaactacaattaataagg 23068250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 61 - 98
Target Start/End: Original strand, 37804796 - 37804833
Alignment:
Q  61 tttcattcaacttaactactccattaactacaattaat 98  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  37804796 tttcattcaacttaactacttcactaactacaattaat 37804833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 178
Target Start/End: Original strand, 7757591 - 7757655
Alignment:
Q  114 aatgatattaattttatcattgatattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaac 178  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||| ||| || |||||| ||||    
T  7757591 aatgataataattttatcattgaaatcaacacaattaatcttttccttaacaaacgtgcataaac 7757655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 92; Significance: 8e-45; HSPs: 82)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 39 - 194
Target Start/End: Original strand, 39864100 - 39864255
Alignment:
Q  39 tattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgata 138  Q
    |||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||||||| |||||| |    
T  39864100 tattatacccttatttattgaatttcatccaacttaactactccactaactacaattaataagagtattttagtaaatgctactaattttaccattgaaa 39864199  T
Q  139 ttaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaaggagtataat 194  Q
    | |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  39864200 tcaacacaattaatcatttccttaataatcgtgcacaaactttaaacgactataat 39864255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 36 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 31978784 - 31978626
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattg 135  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||||    
T  31978784 cattattatacccttatttaatgaatttaattcaacttaactactccattaactataattaataagaatagtttagtaagtgatattaattttaccattg 31978685  T
Q  136 atattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaaggagtataat 194  Q
    | || ||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  31978684 aaatcaacacaattaatctttttcttaataatcgtgcacaaactttaaacgactataat 31978626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 39 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 6023778 - 6023633
Alignment:
Q  39 tattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgata 138  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| | || ||| |||| |||||| |    
T  6023778 tattatactctcatgtattgaatttcatccaacttaactactccaataactacaattaataaaggtattttagtaaaagctactaaatttaccattgaaa 6023679  T
Q  139 ttaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    | |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6023678 tcaacacaattaaacatttccgtaataatcgcgcacaaacattaaa 6023633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 36 - 173
Target Start/End: Original strand, 7759201 - 7759338
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattg 135  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  7759201 cattattatacccttatttattgaatttcattcaacttaactattccactaactacaattaataagagtattttagtaaatgatattaatttcaccattg 7759300  T
Q  136 atattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgca 173  Q
    | || |||||||||||| ||||   |||||||||||||    
T  7759301 aaatcaacacaattaattatttttttaataatcgtgca 7759338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 51 - 184
Target Start/End: Original strand, 9307628 - 9307761
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaatta 150  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||| |||    
T  9307628 atttattgaatttcatccaacttaactactccactaactacaattaacaagggtgttttagtaaatgctattaattttatcattgaaatcaacacagtta 9307727  T
Q  151 ataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    || |||||| ||||||||||| |||||| |||||    
T  9307728 atcatttccttaataatcgtgtacaaaccttaaa 9307761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 36 - 177
Target Start/End: Original strand, 26093380 - 26093521
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattg 135  Q
    ||||||||||| || |||||||||| |||||  ||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  26093380 cattattatacccttatttattgaacttcatctaacttaattacttcactaactacaattaataaggatattttaataaatgatattaattttaccattg 26093479  T
Q  136 atattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaa 177  Q
    | || |||||||||||| |||| | |||||||||||||||||    
T  26093480 aaatcaacacaattaatcattttcttaataatcgtgcacaaa 26093521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 36 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 34031659 - 34031511
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattg 135  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| | || |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34031659 cattattatactcttatttattgaatttcattcaaccttactattacactaactacaattaataacggtattttagtaaatgatattaattttaccattg 34031560  T
Q  136 atattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
      || ||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  34031559 gaatcaacacaagtaatcatttccttaataatcatgcacaaaccttaaa 34031511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 39 - 184
Target Start/End: Original strand, 12039071 - 12039216
Alignment:
Q  39 tattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgata 138  Q
    |||||||| || |||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||| || |||||||| |||||| |    
T  12039071 tattatacccttatttattgaattacatccaacttaaatactccattaactacaattaataagagtgtattagtaaatgttactaattttaccattgaaa 12039170  T
Q  139 ttaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    | |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  12039171 tcaacacaattaatcatttccttaataatcgtgcacaaaccttaaa 12039216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 36 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 6160591 - 6160451
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattg 135  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  6160591 cattattatacccttgtttattgaattacattcaacttaactattccattaactacaattaataagagtattttagtaaataatactaattttatcattg 6160492  T
Q  136 atattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaa 176  Q
    | || |||||||||||| |||| | ||| |||||| |||||    
T  6160491 aaatcaacacaattaatcattttcttaaaaatcgtacacaa 6160451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 37 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 44761662 - 44761542
Alignment:
Q  37 attattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattga 136  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  44761662 attattatacccttatttattgaatttcattcaacttaaccattccactaactataattaataaagatattttagtaaatgatattaattttatcattaa 44761563  T
Q  137 tattaacacaattaataattt 157  Q
     ||||||| ||||||| ||||    
T  44761562 aattaacataattaatcattt 44761542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 36 - 194
Target Start/End: Original strand, 917010 - 917168
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattg 135  Q
    ||||||| ||| || ||||||| |||||||| ||||||||||| || | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  917010 cattattttacccttatttattaaatttcatgcaacttaactaatctactaactacaattaataagggtattttagtaaatgatattaattttaccattt 917109  T
Q  136 atattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaaggagtataat 194  Q
    | || |||| ||||||| ||||   |||||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  917110 aaatcaacataattaatcatttatttaataatcgtgcacaaaccttaaacgactataat 917168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 51 - 184
Target Start/End: Original strand, 31042798 - 31042931
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaatta 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||| |||||| || ||||||||||    
T  31042798 atttattgaatttcattcaacttaattacttcactacctacaattaataagggtattacagtaaatgatactaattttaccattgaaatcaacacaatta 31042897  T
Q  151 ataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    || |||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  31042898 atcatttccttaataatcatgcacaaaccttaaa 31042931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 36 - 184
Target Start/End: Original strand, 52429330 - 52429478
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattg 135  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| |||| ||| |    
T  52429330 cattattatacccttatttaatgaatttcattcaacttaactactccactaactacaattaataagggtattttaataaatgacattaaatttaccatcg 52429429  T
Q  136 atattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
      || |||  ||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||    
T  52429430 taatcaaccaaattaatcatttccttcataatcgtgcacaaaccttaaa 52429478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 36 - 194
Target Start/End: Original strand, 2572455 - 2572612
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattg 135  Q
    |||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2572455 cattattatatttttatttattgaatttcattcaacttaactactccactaactacaattaataattgta-tttagtaaatgatattaattttaccattg 2572553  T
Q  136 atattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaaggagtataat 194  Q
    | || || ||||||||| |||    |||||||||| ||||||| ||||| || ||||||    
T  2572554 aaatcaatacaattaatcattattttaataatcgtacacaaactttaaacgactataat 2572612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 36 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 33733394 - 33733237
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattg 135  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||| || |||| |||| | ||||||||||||||||   |||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  33733394 cattattatacccttatttattgaatttcattctacctaaccactctactaactacaattaataaaagtattttagtaaatgttaataattttaccattg 33733295  T
Q  136 atattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaaggagtataat 194  Q
    | || ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  33733294 aaatcaacacaa-taatcatttccttaataatcgtgcacaaactttaaacgactataat 33733237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 36 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 40144979 - 40144849
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattg 135  Q
    |||||| |||| || |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||      
T  40144979 cattataatacccttatttattgaacttcatccaacttaactactccattaactacaattaataagggtgttttagtaaatgatattaattttaccatca 40144880  T
Q  136 atattaacacaattaataatttccgtaataa 166  Q
    | || |||||||||||| |||| | ||||||    
T  40144879 aaatcaacacaattaatcattttcttaataa 40144849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 36 - 178
Target Start/End: Original strand, 24880859 - 24881004
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaactta---actactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatca 132  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||   ||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24880859 cattattatatcctaatttattgaatttcatccaacttactaactactccactaactacaattaataaaagtattttagtaaatgatattaattttacca 24880958  T
Q  133 ttgatattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaac 178  Q
    |||| || |||| ||| ||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  24880959 ttgaaatcaacataatcaatcatttccgtaataattatgcacaaac 24881004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 36 - 159
Target Start/End: Original strand, 36701907 - 36702030
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattg 135  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| | |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  36701907 cattattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaacgattccactaactacaattaataagggcattttagtaaatgatactaattttaccattg 36702006  T
Q  136 atattaacacaattaataatttcc 159  Q
    | || |||| ||||||| ||||||    
T  36702007 aaatcaacataattaatcatttcc 36702030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 36 - 159
Target Start/End: Original strand, 36718011 - 36718134
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattg 135  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| | |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  36718011 cattattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaacgattccactaactacaattaataagggcattttagtaaatgatactaattttaccattg 36718110  T
Q  136 atattaacacaattaataatttcc 159  Q
    | || |||| ||||||| ||||||    
T  36718111 aaatcaacataattaatcatttcc 36718134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 51 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 8896449 - 8896343
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaatta 150  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| |    
T  8896449 atttattgaatttcatccaacttaaccactccactaactacaattaataaatatattttagtaaatgatattaattttaccattgaaatcaacacaatca 8896350  T
Q  151 ataattt 157  Q
    || ||||    
T  8896349 atcattt 8896343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 39 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 23169122 - 23168977
Alignment:
Q  39 tattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgata 138  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||    ||||||||| |  | |||||| ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||| |    
T  23169122 tattatactcttatttattgaatttcacctcacttaactatttaactaactataattaataaggatgttttagtaaatgctactaattttaccattgaaa 23169023  T
Q  139 ttaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    | |||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  23169022 tcaacacaattaattattttcttaataatcgtgcacaaactttaaa 23168977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 51 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 24991770 - 24991637
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaatta 150  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| | | || ||||||||  ||||||||||| | |||| || ||||||||||    
T  24991770 atttattgaatttcatccaacttaactattccactaactacaattaataaaggtgttgtagtaaatactattaattttaccgttgaaatcaacacaatta 24991671  T
Q  151 ataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    || |||||| ||||||||||| |||||| |||||    
T  24991670 atcatttccttaataatcgtgtacaaaccttaaa 24991637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 36 - 173
Target Start/End: Original strand, 37276447 - 37276584
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattg 135  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||| |||      
T  37276447 cattattatacccttatttattgaatttcatccaatttaactattccactaactacaattaataagggtgttttagtaaacgatactaattttaccatca 37276546  T
Q  136 atattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgca 173  Q
    | || |||||| ||||| |||||| |||||||||||||    
T  37276547 aaatcaacacagttaatcatttccttaataatcgtgca 37276584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 36 - 184
Target Start/End: Original strand, 38787327 - 38787475
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattg 135  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| | |||||||| || ||||| |||      
T  38787327 cattattatacccttatttattgaatttcatccaatttaactactccactaactataattaataaggatgttttggcaaatgatactagttttaccatca 38787426  T
Q  136 atattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    | || |||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||| |||||    
T  38787427 aaatcaacacaatcaatcatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 38787475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 51 - 157
Target Start/End: Original strand, 15699123 - 15699229
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaatta 150  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||  | || ||||||||||    
T  15699123 atttattgaacttcatccaacttaactactccactaactacaattaataagggtgttttagtaaatgatattaattttaccatcaaaatcaacacaatta 15699222  T
Q  151 ataattt 157  Q
    || ||||    
T  15699223 atcattt 15699229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 39 - 177
Target Start/End: Original strand, 28748980 - 28749118
Alignment:
Q  39 tattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgata 138  Q
    |||||||| || ||||||  |||||||| ||||||||| | || | ||| |||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||| |||||| |    
T  28748980 tattatacccttatttataaaatttcatccaacttaacaattctactaattacaattaataagggtgttttagtaaatgctactaattttaccattgaaa 28749079  T
Q  139 ttaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaa 177  Q
    | |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  28749080 tcaacacaattaatcatttccttaataatcgtgcacaaa 28749118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 36 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 30755073 - 30754915
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattg 135  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||||  |||||||||| | || |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| | ||     
T  30755073 cattattatacctttatttattgaatttcatctaacttaactatttcactaactataattaataatgatattttagtaaataatataaattttaccctta 30754974  T
Q  136 atattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaaggagtataat 194  Q
    | || |||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||  ||||| || ||||||    
T  30754973 aaatcaacacaattaatcatttccttaataatcgtgcataaatcttaaacgactataat 30754915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 36 - 173
Target Start/End: Original strand, 37506110 - 37506250
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatga---tattaattttatca 132  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   | |||||||||||||   || |||||||||||    
T  37506110 cattataatacccttatttattgaatttcattcaacttaactactccactaactacaattaataaaagtgttttagtaaatgatagtactaattttatca 37506209  T
Q  133 ttgatattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgca 173  Q
    |  | || |||||||||||| |||||| |||||| ||||||    
T  37506210 tcaaaatcaacacaattaatcatttccttaataaccgtgca 37506250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 36 - 149
Target Start/End: Original strand, 7351622 - 7351735
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattg 135  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  | |||||||| || |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  7351622 cattattatactcttatttattgaattttgtccaacttaattattccactaactagaattaataaggttattttagtaaataatattaattttatcatta 7351721  T
Q  136 atattaacacaatt 149  Q
    | || |||||||||    
T  7351722 aaatcaacacaatt 7351735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 51 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 16395163 - 16395031
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaatta 150  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||  | || ||||||||||    
T  16395163 atttattgaatttcatctaacttaactactccactaactacaattaaaaagg-tattttagtaaatgatactaattttactatcaaaatcaacacaatta 16395065  T
Q  151 ataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    || |||| | ||||||||||||| |||| |||||    
T  16395064 atcattttcttaataatcgtgcataaaccttaaa 16395031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 36 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 20209972 - 20209879
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaatttta 129  Q
    |||||| |||| || |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  20209972 cattataatacccttatttattgaacttcatccaacttaactactccactaactacaattaataaggatgttttagtaaatgatactaatttta 20209879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 39 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 22856366 - 22856269
Alignment:
Q  39 tattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattga 136  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  22856366 tattatacttttatttattgaatttcatccagcttaactactccactaactacaattaattagggtattttagtaaatggtattaattttatgattga 22856269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 36 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 49224118 - 49223997
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattg 135  Q
    |||||| |||| || |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||      
T  49224118 cattataatacccttatttattgaacttcatccaacttaactactccactaactacaattaataagggtgttttagtaaatgatactaattttaccatca 49224019  T
Q  136 atattaacacaattaataattt 157  Q
    | || |||||||||||| ||||    
T  49224018 aaatcaacacaattaatcattt 49223997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 68 - 184
Target Start/End: Original strand, 12151194 - 12151310
Alignment:
Q  68 caacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaattaataatttccgtaataat 167  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||| |||||||||| ||| |||||||    
T  12151194 caacttaactgctccactaactacaattaattacaatattttagtaaatgatactaattttatcattgaaatcaacataattaataatctccttaataat 12151293  T
Q  168 cgtgcacaaacattaaa 184  Q
    | | ||||||| |||||    
T  12151294 catacacaaaccttaaa 12151310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 37 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 13579752 - 13579605
Alignment:
Q  37 attattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattga 136  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||| || ||||  |    
T  13579752 attattatacccttatttattgaatttcatcaaacttaaatactccactaactacaattaatatgggtgtttttgtaaatgatattaatattgtcatcaa 13579653  T
Q  137 tattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
     || |||||||||||| |||||  |||||||| |||| |||| |||||    
T  13579652 aatcaacacaattaatcatttctttaataatcatgcataaaccttaaa 13579605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 172
Target Start/End: Original strand, 45331339 - 45331463
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaacta---ctccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaa 147  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||  | || |||| ||    
T  45331339 atttattgaacttcatccaacttaactattcctccattaactacaattaataagggtgttttagtaaatgatattaattttaccatcaaaatcaacataa 45331438  T
Q  148 ttaataatttccgtaataatcgtgc 172  Q
    ||||| |||| | |||||| |||||    
T  45331439 ttaattattttcttaataaccgtgc 45331463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 36 - 184
Target Start/End: Original strand, 11449872 - 11450017
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattg 135  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||   | || ||| ||||  ||||||||||| |||||    
T  11449872 cattattatac-cttatttattgaatttcatccaattttactactctattaactacaattaataaatgtgttatagaaaat--tattaattttaccattg 11449968  T
Q  136 atattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    | || |||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  11449969 aaatcaacataattaaccatttccttaataatcgtgcacaaaccttaaa 11450017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 39 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 14757723 - 14757610
Alignment:
Q  39 tattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgata 138  Q
    |||||||| || ||||||| ||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||||||  | |||||||||||| || |||||||||| |||| |    
T  14757723 tattatacccttatttattaaatttcatcgaacttaactacttcactaactacaattaataagagtgttttagtaaatgttactaattttatcgttgaaa 14757624  T
Q  139 ttaacacaattaat 152  Q
    | ||||||||||||    
T  14757623 tcaacacaattaat 14757610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 84 - 157
Target Start/End: Original strand, 35538677 - 35538750
Alignment:
Q  84 ttaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaattaataattt 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  35538677 ttaactacaattaataaggatattttagtaaataatatccattttatcattgaaatcaacacaattaataattt 35538750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 51 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 44707877 - 44707744
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaatta 150  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| || || ||||||||||||||||   | |||||||||||  || ||||||||||||||| || || | |||||    
T  44707877 atttattgaatttcatccaacttaactgcttcactaactacaattaataaatgtgttttagtaaatactactaattttatcattgaaatcaatataatta 44707778  T
Q  151 ataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    || |||||  ||||||||||||| |||| |||||    
T  44707777 atcatttctataataatcgtgcaaaaactttaaa 44707744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 157
Target Start/End: Original strand, 10495840 - 10495945
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaatta 150  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| | | ||||||||||||||| |||||||| |||  | || |||| |||||    
T  10495840 atttattgaatttcatccaacttaactactccactaattacaattaataaag-tgttttagtaaatgatactaattttaccatcaaaatcaacaaaatta 10495938  T
Q  151 ataattt 157  Q
    |||||||    
T  10495939 ataattt 10495945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 157
Target Start/End: Original strand, 29074885 - 29074991
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaatta 150  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| | | ||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| |||| | || ||||||| ||    
T  29074885 atttattgaatttcatccaacttaactattacgttaacaacaattaatatggatgttttaataaatgatattaattttaccattaaaatcaacacaacta 29074984  T
Q  151 ataattt 157  Q
    || ||||    
T  29074985 atcattt 29074991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 52 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 32970683 - 32970565
Alignment:
Q  52 tttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaattaa 151  Q
    |||||||||||| || |||||||| || |  | |||| |||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  32970683 tttattgaattttatccaacttaattattttactaacaacaattaatacgagtattttagtaaataatattaattttatcattgaaatcaacacaattaa 32970584  T
Q  152 taatttccgtaataatcgt 170  Q
    | |||| | ||||||||||    
T  32970583 tcattttcttaataatcgt 32970565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 39 - 117
Target Start/End: Original strand, 35367791 - 35367869
Alignment:
Q  39 tattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatg 117  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  35367791 tattatacccttatttattgaatttcatctaacttaactactccactaactacaattaataagggtgttttagtaaatg 35367869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 51 - 134
Target Start/End: Original strand, 9379232 - 9379316
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaactactcc-attaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcatt 134  Q
    ||||||| ||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9379232 atttattaaatttcatcaaacttaactactcccactaactacaattaataaatatattttaataaatgatattaattttatcatt 9379316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 178
Target Start/End: Original strand, 27896956 - 27897083
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaatta 150  Q
    ||||||| |||||||| ||||| || ||||||| |||||| |||||||||| |||||||  ||||| ||| ||||||||||||| | || |||||  |||    
T  27896956 atttattaaatttcatccaactaaattactccactaactataattaataagaatattttgataaattatactaattttatcattaaaatcaacacgttta 27897055  T
Q  151 ataatttccgtaataatcgtgcacaaac 178  Q
    || |||||| ||| |||| |||||||||    
T  27897056 attatttccttaaaaatcatgcacaaac 27897083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 52 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 32219777 - 32219695
Alignment:
Q  52 tttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcatt 134  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  32219777 tttattgaatttcatccaacttaaccactccacaaactataattaataagagtattttaataaatgatattaattttaccatt 32219695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 36 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 25089218 - 25089137
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaat-aaggatattttagtaaat 116  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  25089218 cattagtatacccttatttattgaatttcatccaacttaactacttcactaactacaattaataaaggatgttttagtaaat 25089137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 41 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 5179526 - 5179383
Alignment:
Q  41 ttatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatatt 140  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||| | | | |||||||||||||| | |||||   ||||| ||     
T  5179526 ttatactcttatttcctgaatttcatccaatttatctactccactaactacaattaatatgaaaactttagtaaatgatactcattttgctattgaaatc 5179427  T
Q  141 aacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    |||||||||||| ||||   ||| ||||||| |||||| |||||    
T  5179426 aacacaattaatcattttgttaagaatcgtgtacaaaccttaaa 5179383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 173
Target Start/End: Original strand, 22181368 - 22181459
Alignment:
Q  82 cattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgca 173  Q
    ||||||||||||| | ||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| ||| |||| |||||| |||||| ||||||    
T  22181368 cattaactacaataactaagggtgttttagtaaatgatattaattttaccattgaaatgaactcaactaatcatttccttaataaccgtgca 22181459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 109
Target Start/End: Original strand, 6785245 - 6785315
Alignment:
Q  39 tattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatatttt 109  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  6785245 tattatacccttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaatgaagatatttt 6785315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 29778513 - 29778423
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatatta 141  Q
    ||||||||||||| || |||||||  | ||  | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  29778513 atttattgaattttatccaacttaggttcttaactaactacaattaataatgatattttagtaaatgatactaattttaccattgaaatta 29778423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 32826126 - 32825987
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactcc---attaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatca 132  Q
    |||||| |||| || |||||||||| ||||| |||||||||||||||   | ||| |||||||||||| | | ||||||||||||||| |||||||| ||    
T  32826126 cattataatacccttatttattgaacttcatccaacttaactactcctccactaattacaattaataaaggtgttttagtaaatgatactaattttacca 32826027  T
Q  133 ttgatattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgca 173  Q
    |  | || ||||| |||||| |||||| |||||| ||||||    
T  32826026 tcaaaatcaacac-attaatcatttccttaataaccgtgca 32825987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 157
Target Start/End: Original strand, 42409995 - 42410101
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaatta 150  Q
    |||||||||| ||||| | |||||||||  | | |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||  | || ||||||||||    
T  42409995 atttattgaacttcatcctacttaactatccaactaactacaattaataagggtgctttagtaaatgatattaattttaccatcaaaatcaacacaatta 42410094  T
Q  151 ataattt 157  Q
    || ||||    
T  42410095 atcattt 42410101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 134
Target Start/End: Original strand, 52837266 - 52837364
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcatt 134  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||  ||||||||||  ||| |||||||||| ||||    
T  52837266 cattattatacctttaattattgaatttcattcatattaactactccactagctacaattaataagagtattttagtagttgaaattaattttaccatt 52837364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 71 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 6267953 - 6267840
Alignment:
Q  71 cttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaattaataatttccgtaataatcgt 170  Q
    ||||||||||||||| |||||||  | |||  ||||||||||| |||||| || |||||||||| | || |||||||||||| |||||  ||| ||| ||    
T  6267953 cttaactactccattgactacaaccattaaaaatattttagtacatgatactagttttatcattaaaatcaacacaattaatcatttctttaaaaatagt 6267854  T
Q  171 gcacaaacattaaa 184  Q
    |||||||| |||||    
T  6267853 gcacaaaccttaaa 6267840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 51 - 116
Target Start/End: Original strand, 15904752 - 15904817
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaat 116  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15904752 atttattgaatttcacttcacttaactacttcactaactacaattaataaggatattttaataaat 15904817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 74 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 17988654 - 17988574
Alignment:
Q  74 aactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatat--taattttatcattgatattaacacaattaat 152  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||  |||||||| |||||| || ||||||||||||    
T  17988654 aactacttcattaactacaattaataagagtattttagtaaataatatactaattttaacattgaaatcaacacaattaat 17988574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 74 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 41121919 - 41121834
Alignment:
Q  74 aactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaattaataatttcc 159  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||| |||  | || |||||||||||| ||||||    
T  41121919 aactactccactaactacaattaataagggtattttagtaaattatgctaattttaccatcaaaatcaacacaattaatcatttcc 41121834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 21910136 - 21909990
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattg 135  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| |||  ||||||||||||||   ||||| | ||||||||| | |||||| ||| |||| |||||||| |||      
T  21910136 cattattatac-cttatttattgaattccatcaaacttaactactcctcaaactatagttaataagg-tgttttagcaaacgatactaattttaccatca 21910039  T
Q  136 atattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    | || |||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||| |||||    
T  21910038 aaatcaacacaattaatcatttccttaataattgtgcataaaccttaaa 21909990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 51 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 9412920 - 9412837
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcatt 134  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| |  |||||||| ||||    
T  9412920 atttattgaatttcatccaacccaactattccattaactacaattaatcagaatattttattaaatgcttctaattttaccatt 9412837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 76 - 158
Target Start/End: Original strand, 3312137 - 3312219
Alignment:
Q  76 ctactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaattaataatttc 158  Q
    |||||||| |||||||||||||||   ||||| |||||||||||| |||||| |||||| | || |||||||||||| |||||    
T  3312137 ctactccactaactacaattaatatcaatattatagtaaatgatactaatttaatcattaaaatcaacacaattaatcatttc 3312219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 69 - 157
Target Start/End: Original strand, 6365650 - 6365738
Alignment:
Q  69 aacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaattaataattt 157  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||| || ||||||||| ||||| ||| |||||| || ||||| || |||||||||||| ||||    
T  6365650 aacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttgattattgaaatcaacacaattaatcattt 6365738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 39 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 35682923 - 35682795
Alignment:
Q  39 tattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgata 138  Q
    |||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||          |||| ||||||||| |||| |||||||||| |    
T  35682923 tattatacccttatttattgaatttcatccaacttaactactccagtaa-taaaatta----------tttaataaatgatactaatgttatcattgaaa 35682835  T
Q  139 ttaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaac 178  Q
    | ||||||||||||  ||||  ||| ||||||||||||||    
T  35682834 tcaacacaattaatcttttcgttaaaaatcgtgcacaaac 35682795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 58 - 136
Target Start/End: Original strand, 24903979 - 24904057
Alignment:
Q  58 gaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattga 136  Q
    ||||||||||||||||||||||   | ||| || |||||||||  ||||||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  24903979 gaatttcattcaacttaactacctaactaattataattaataaaaatattttagtaaatgatacaaattttctcattga 24904057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 39 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 26256217 - 26256159
Alignment:
Q  39 tattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaa 97  Q
    ||||||| |||  |||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26256217 tattatattcttctttattgactttcatccaacttaactactctattaactacaattaa 26256159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 51 - 157
Target Start/End: Original strand, 41080601 - 41080705
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaatta 150  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| || ||||| ||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||| |||||||  ||| | || ||||||||||    
T  41080601 atttattgaatt-catccaacttacct-ctccactaattacaattaataaagatatttcaataaatgatataaattttactattaaaatcaacacaatta 41080698  T
Q  151 ataattt 157  Q
    || ||||    
T  41080699 atcattt 41080705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 43500846 - 43500768
Alignment:
Q  106 ttttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    ||||||||||||| | ||||| || |||  | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||    
T  43500846 ttttagtaaatgaaactaattataccatcaaaatcaacacaattaataatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 43500768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 37 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 4441734 - 4441605
Alignment:
Q  37 attattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattga 136  Q
    ||||||||||  | ||||||| ||||||||  || |||| ||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||||||    |||||||||| |||| |    
T  4441734 attattatacctttatttattaaatttcatctaatttaattactccactaactacaattaacaagggtgttttagtaaagacgattaattttaccattaa 4441635  T
Q  137 tattaacacaattaataatttccgtaataa 166  Q
     || | |||||||||| |||| | ||||||    
T  4441634 aatcaccacaattaattattttcttaataa 4441605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 184
Target Start/End: Original strand, 27687298 - 27687375
Alignment:
Q  107 tttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||| || ||||||| |||| ||||   ||||||| |||||||||| |||||    
T  27687298 tttagtaaataatattaattttaccattgaaatcaacacaactaatcatttttttaataattgtgcacaaaccttaaa 27687375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 111
Target Start/End: Original strand, 4659777 - 4659837
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttag 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||| | | ||||||||    
T  4659777 atttattgaatttcattcaacttaattactccactaactatcattaatgatggtattttag 4659837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 26000915 - 26000823
Alignment:
Q  37 attattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaatttta 129  Q
    ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||| ||||||| || || || ||  ||| ||||  |||||||||||||||||| ||||||||    
T  26000915 attattatattcgtatttattgaatttcgttcaatttaactattctatcaattatgattgataaaaatattttagtaaatgataataatttta 26000823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 51 - 102
Target Start/End: Original strand, 3260592 - 3260643
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataagg 102  Q
    ||||||| ||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  3260592 atttattcaatttcatcaaacttaacttctccactaactacaattaataagg 3260643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 51 - 118
Target Start/End: Original strand, 37539128 - 37539195
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatga 118  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||| |||  | || ||||||||||    
T  37539128 atttattgaatttcatcaaacttaactactctactaactacaattaacaagagtgttgtagtaaatga 37539195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 978946 - 978868
Alignment:
Q  79 ctccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaattaataattt 157  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||||| |   ||||||||||||| || ||||||| |||| ||||    
T  978946 ctccactaactactattaataaggatatttcattaaatgaaacacattttatcattgaaatcaacacaactaatcattt 978868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 13366041 - 13365999
Alignment:
Q  76 ctactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatga 118  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  13366041 ctactccactaactactattaataagggtattttagtaaatga 13365999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 153
Target Start/End: Original strand, 27721521 - 27721635
Alignment:
Q  39 tattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgata 138  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| || ||| ||||||| || | |||||||||||||||  | || |||| ||||| | | |||||||| |||| | |    
T  27721521 tattatacttttatttattgaattttatccaatttaactattctactaactacaattaatattggtactttaataaataaaaataattttaccattaaaa 27721620  T
Q  139 ttaacacaattaata 153  Q
    | |||||| ||||||    
T  27721621 tcaacacatttaata 27721635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 51 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 2137486 - 2137437
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataa 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||| |||||||||||    
T  2137486 atttattgaattttatccaacttaaatactccaataacaacaattaataa 2137437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 39 - 100
Target Start/End: Original strand, 37177825 - 37177886
Alignment:
Q  39 tattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataa 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||  | ||||||| ||||||||    
T  37177825 tattatactcttatttatttaattttatccaacttaactactatactaactaccattaataa 37177886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 73 - 118
Target Start/End: Original strand, 49176940 - 49176985
Alignment:
Q  73 taactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatga 118  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  49176940 taactactctattaactataattaataagagtattttagtaaatga 49176985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 83 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 51028578 - 51028509
Alignment:
Q  83 attaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaattaat 152  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||| |||||| || ||| ||||| ||| | || ||||||||||||    
T  51028578 attaactacaattaataaaaatattttaataaatgctactaactttattattaaaatcaacacaattaat 51028509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 51 - 107
Target Start/End: Original strand, 39887836 - 39887892
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatatt 107  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| ||||| | ||||||| |||||||| ||||||    
T  39887836 atttattgaatttcatcaaacttaattactcaactaactactattaataaagatatt 39887892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0095
Description:

Target: scaffold0095; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 39 - 184
Target Start/End: Original strand, 50193 - 50338
Alignment:
Q  39 tattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgata 138  Q
    |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  50193 tattatacccttatttatttaatttcattcaacttaattactccactaactgtaattaataaagatattatagtaaatgatactaattttatcattgaaa 50292  T
Q  139 ttaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  50293 ttaacacaattaatcatttccttaataatcgtgcacaaaccttaaa 50338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 51 - 134
Target Start/End: Original strand, 22348 - 22432
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaactt-aactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcatt 134  Q
    ||||||||||||| || ||| || ||||||| || |||| || |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  22348 atttattgaattttatccaattttaactactgcactaaccacgattaataaagatattttagtaaatgatactaattttagcatt 22432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 64)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 39 - 184
Target Start/End: Original strand, 39405751 - 39405896
Alignment:
Q  39 tattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgata 138  Q
    |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  39405751 tattatacccttatttatttaatttcattcaacttaattactccactaactgtaattaataaagatattatagtaaatgatactaattttatcattgaaa 39405850  T
Q  139 ttaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  39405851 ttaacacaattaatcatttccttaataatcgtgcacaaaccttaaa 39405896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 52 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 21216215 - 21216083
Alignment:
Q  52 tttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaattaa 151  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  | |||||||| |||||| || |||||||||||    
T  21216215 tttattgaatttcatccaacttaactactccactaactacaattaataaggatgttttagtaaatgcaactaattttaccattgaaatcaacacaattaa 21216116  T
Q  152 taatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    | |||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  21216115 tcatttccttaataatcatgcacaaaccttaaa 21216083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 36 - 184
Target Start/End: Original strand, 32476273 - 32476421
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattg 135  Q
    |||| |||||| || ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32476273 cattgttatacccttatttattgaatttcatcaaacttaactacttcattaactacaattaataagggtattttaataaatgatattaattttatcattg 32476372  T
Q  136 atattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    | || |||| ||| ||| |||| | |||||| ||||||||||| |||||    
T  32476373 aaatcaacagaatcaatcattttcttaataaccgtgcacaaaccttaaa 32476421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 39 - 184
Target Start/End: Original strand, 7172903 - 7173048
Alignment:
Q  39 tattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgata 138  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  || |||||||||||| || ||||||||||||||| |    
T  7172903 tattatacccttatttattgaatttcattcaacttaactacttcattaactacaattaataaatatgttttagtaaatgctactaattttatcattgaaa 7173002  T
Q  139 ttaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    | |||||||||||| |||||  |||||||  | ||||||| |||||    
T  7173003 tcaacacaattaatcatttctttaataatgatacacaaaccttaaa 7173048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 39 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 44761621 - 44761501
Alignment:
Q  39 tattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgata 138  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||| |||||| |    
T  44761621 tattataccctcatttattgaatttcatccaacttaactactccactaactacaattaataagggtgttttagtaaatgctactaattttaccattgaaa 44761522  T
Q  139 ttaacacaattaataatttcc 159  Q
    | |||||||||||| ||||||    
T  44761521 tcaacacaattaatcatttcc 44761501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 37 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 10180076 - 10179929
Alignment:
Q  37 attattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattga 136  Q
    |||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||    
T  10180076 attattatacacttattaattgaatttcattcaacttaactactccactaactacaattaataagtgtattttagtaaattatactaattttaccattga 10179977  T
Q  137 tattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
     || || |||| || | |||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  10179976 aatcaatacaactactcattttcttaataatcgtgcacaaaccttaaa 10179929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 52 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 42972625 - 42972490
Alignment:
Q  52 tttattgaatttcattcaacttaactac---tccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaat 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||| || || |||||    
T  42972625 tttattgaatttcattcaacttaactacgtctccactaactataattaataagggtattttagtaaacgatattaattttaccattgaaatcaaaacaat 42972526  T
Q  149 taataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    |||| |||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  42972525 taatcattttcttaataatcgtgcacaaaccttaaa 42972490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 51 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 9300228 - 9300095
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaatta 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||| | || |||||||  |    
T  9300228 atttattgaatttcattcaacttaactactccactaactaaaattaataagggtgttttagtaaatgctattaattttaccattaaaatcaacacaaaca 9300129  T
Q  151 ataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    || |||| | ||||||||||||| |||| |||||    
T  9300128 atcattttcttaataatcgtgcataaaccttaaa 9300095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 51 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 11977051 - 11976918
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaatta 150  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||| || |||||| || ||||||||||    
T  11977051 atttattgaatttcatctaacttaactactctactaactacaattaataagggtattttagtaaatgctactgattataccattgaaatcaacacaatta 11976952  T
Q  151 ataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    || |||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  11976951 atgatttccataataatcatgcacaaaccttaaa 11976918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 37 - 194
Target Start/End: Original strand, 31271008 - 31271165
Alignment:
Q  37 attattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattga 136  Q
    |||| ||||| || ||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||| |    
T  31271008 attactatacccttatttattgaattttatccaacttaactactccactaactataattaataagagtattttagtatatgatattaattttaccattaa 31271107  T
Q  137 tattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaaggagtataat 194  Q
     || |||||||| ||| |||| | |||||||||| ||||||| ||||| || ||||||    
T  31271108 aatcaacacaatcaatcattttcttaataatcgtacacaaaccttaaacgactataat 31271165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 36 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 26626242 - 26626094
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattg 135  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||| |||      
T  26626242 cattattatacccttatttattgaatttcattcaaccggactactccactaactacaattaataaggatattttaataaattatacaaattttaccatca 26626143  T
Q  136 atattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    |  | |||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| |||||    
T  26626142 aattcaacacaattaatcatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 26626094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 51 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 27294174 - 27294042
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaatta 150  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||| | || ||||||||||    
T  27294174 atttattgaatttcatccaacttaattactccactaactgcaattaataaatatattttagtaaaagatactaattttatcattcaaatgaacacaatta 27294075  T
Q  151 ataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaa 183  Q
    |||| |||  ||| |||||||||||||| ||||    
T  27294074 ataacttctttaaaaatcgtgcacaaaccttaa 27294042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Original strand, 39482602 - 39482742
Alignment:
Q  37 attattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattga 136  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||||| | |||||||||||  || |||||||| | ||||    
T  39482602 attattatacccttatttattgaatttcattccacttaactagtccactaactataattaataagggtgttttagtaaattctactaattttacccttga 39482701  T
Q  137 tattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaa 177  Q
     || |||||||||||| |||| | |||||||||||||||||    
T  39482702 aatcaacacaattaatcattttcttaataatcgtgcacaaa 39482742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 39 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 45425793 - 45425659
Alignment:
Q  39 tattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgata 138  Q
    |||||||| || |||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||||| |||| | |    
T  45425793 tattatacccttatttattgaatttcatacaacttaattactccactaactacaattaataagaatgttttaataaatgttattaattttaccattaaaa 45425694  T
Q  139 ttaacacaattaataatttccgtaataatcgtgca 173  Q
    | |||||||||||| |||| | |||||||| ||||    
T  45425693 tcaacacaattaatcattttcttaataatcatgca 45425659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 36 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 5053283 - 5053160
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattg 135  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||      
T  5053283 cattattatactcttatttattgaatctcatccaatttaactactccgctaactacaattaataagactgttttagtaaatgatattaattttaccatca 5053184  T
Q  136 atattaacacaattaataatttcc 159  Q
    | || |||||||||||| ||||||    
T  5053183 aaatcaacacaattaatcatttcc 5053160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 36 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 396741 - 396611
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattg 135  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||| || |||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | |||    
T  396741 cattattatacccttattaattgaattttatccaatataactacttcattaactacaattaataaggatattgtagtaaatgatactaattttaccgttg 396642  T
Q  136 atattaacacaattaataatttccgtaataa 166  Q
    | || |||| ||||||| |||||| ||||||    
T  396641 aaatcaacataattaatcatttccttaataa 396611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 36 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 17719388 - 17719247
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattg 135  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||     
T  17719388 cattattatacctttatttattaaatttcatccaacttaactactccactaactataattaataaggatattttagtaaataatactaactttaccatta 17719289  T
Q  136 atattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaa 177  Q
    | || |  ||||||||| ||||   |||||||||||||||||    
T  17719288 aaatcattacaattaatcatttttttaataatcgtgcacaaa 17719247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 38 - 178
Target Start/End: Original strand, 31082607 - 31082747
Alignment:
Q  38 ttattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgat 137  Q
    |||||||||  | ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||||||   | ||||||||||||| |     
T  31082607 ttattatacctttatttattaaatttcatccaacttaactactccactaactataattaataagggtgttttagtaaataccactaattttatcattaaa 31082706  T
Q  138 attaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaac 178  Q
    || || ||||||||| |||||| |||| |||||||||||||    
T  31082707 atcaagacaattaatcatttccttaattatcgtgcacaaac 31082747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 40 - 152
Target Start/End: Original strand, 42886990 - 42887102
Alignment:
Q  40 attatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatat 139  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||   ||||| ||    
T  42886990 attatactcttatttattgaattttatccaacttaactacgccactaactacaattaataaaggtattttagtaaatgatactaattttgctattgaaat 42887089  T
Q  140 taacacaattaat 152  Q
     ||||||||||||    
T  42887090 caacacaattaat 42887102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 85 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 1875673 - 1875574
Alignment:
Q  85 taactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||| |||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  1875673 taactacaattaataagggtgttttagtaaatgctactaattttaccattgaaatcaacacaattaatcatttccttaataatcgtgcacaaaccttaaa 1875574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 42 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 4924191 - 4924076
Alignment:
Q  42 tatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatatta 141  Q
    ||||| || ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| |||| | ||      
T  4924191 tatacccttatttattaagtttcattcaacttaactactctattaactacaattaataaagatattttagtaaataatactaattttaccattaaaatat 4924092  T
Q  142 acacaattaataattt 157  Q
    |||||| |||||||||    
T  4924091 acacaactaataattt 4924076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 37 - 120
Target Start/End: Original strand, 32678390 - 32678473
Alignment:
Q  37 attattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgata 120  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32678390 attattatattcttatttatttaatttcatccaacttaactactccactaactacaattaataaggatgttttagtaaatgata 32678473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 36 - 173
Target Start/End: Original strand, 31231716 - 31231853
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattg 135  Q
    |||||| |||| || |||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||      
T  31231716 cattataatacccttatttattgaactttatccaacttaactactccactaactacaattaataagggtgtttcagtaaatgatattaattttaccatca 31231815  T
Q  136 atattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgca 173  Q
    | ||  |||||||| || |||||| |||||| ||||||    
T  31231816 aaatcgacacaattcatcatttccttaataaccgtgca 31231853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 39 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 36007014 - 36006901
Alignment:
Q  39 tattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgata 138  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | |    
T  36007014 tattatgctcttatttattgaatttcatcaaacttaattaccccactaactacaattaatagggatattttagtcaataatattaattttatcattaaaa 36006915  T
Q  139 ttaacacaattaat 152  Q
    | ||||||| ||||    
T  36006914 tcaacacaactaat 36006901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 92 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 7703230 - 7703138
Alignment:
Q  92 aattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| |||||| |||||||| | ||||||| |||||    
T  7703230 aattaataagggtattttagtaaatgatattaattttaccattgaaatcaacacaattaattatttccttaataatcttacacaaactttaaa 7703138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 36 - 184
Target Start/End: Original strand, 13335202 - 13335350
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattg 135  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||| ||||||||||   | ||||| ||||||||| |||||||| |||      
T  13335202 cattattataccctgatttattgaatttcatcaaacttaactactctactaactgcaattaataaatgtgttttactaaatgatactaattttaccatca 13335301  T
Q  136 atattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    | || |||||||||||  |||||| ||||||||||||| |||| |||||    
T  13335302 aaatcaacacaattaaccatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 13335350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 39 - 151
Target Start/End: Original strand, 17823910 - 17824022
Alignment:
Q  39 tattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgata 138  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||| | |||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |    
T  17823910 tattatactattatttatttaatttcatccaacttaactacttcactaactacaattaataaaggtattctagtaaaagatactaattttatcattgaaa 17824009  T
Q  139 ttaacacaattaa 151  Q
    | ||||| |||||    
T  17824010 tcaacacgattaa 17824022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 52 - 159
Target Start/End: Original strand, 5356602 - 5356708
Alignment:
Q  52 tttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaattaa 151  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| |||    
T  5356602 tttattgaatttcatccaacttaattattccattaactacaattaataaag-tacattagtaaatgatattaattttatcattaaaatcaacacaactaa 5356700  T
Q  152 taatttcc 159  Q
    | ||||||    
T  5356701 tcatttcc 5356708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 10098106 - 10097991
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaatta 150  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| |||  | || || |||||||    
T  10098106 atttattgaacttcatccaacttaactactccactaactacaattaataagggtgttatagtaaatgatattaattttaccatcaaaatcaatacaatta 10098007  T
Q  151 ataatttccgtaataa 166  Q
    || |||| | ||||||    
T  10098006 atcattttcttaataa 10097991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 39 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 4428478 - 4428360
Alignment:
Q  39 tattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgata 138  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||  |||||||||| | || ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |    
T  4428478 tattatacttttatttattgaatttcatctaacttaactaattcactaactacaattaataattgtattttagtaaatgataataattttatcattaaaa 4428379  T
Q  139 ttaacacaattaataattt 157  Q
    | ||||||| |||| ||||    
T  4428378 tcaacacaaataatcattt 4428360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 34948802 - 34948676
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaatta 150  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||   | |||  |||||||||| ||||||||  ||| | || ||||||||||    
T  34948802 atttattgaatttcatccaacttaactactccactaactacaattaataaatgtgtttctgtaaatgatactaattttactatttaaatcaacacaatta 34948703  T
Q  151 ataatttccgtaataatcgtgcacaaa 177  Q
    || |||||| ||||||| ||| |||||    
T  34948702 atcatttccttaataattgtgtacaaa 34948676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 61 - 159
Target Start/End: Original strand, 31331419 - 31331517
Alignment:
Q  61 tttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaattaataatttcc 159  Q
    |||||| |||||||| |||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| || || ||||||||| ||||||    
T  31331419 tttcatccaacttaattacttcactaactacaattaataatgatattttagtaaataataataattttataattgaaatcaatacaattaatcatttcc 31331517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 52 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 14855048 - 14854916
Alignment:
Q  52 tttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaattaa 151  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| | | |||||| |||||  |||||||||| |||| | || |||||||| |     
T  14855048 tttattgaatttcattcagcctaactactccactaactacaattaataaaggtgttttagcaaatgcaattaattttaccattaaaatcaacacaatgat 14854949  T
Q  152 taatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    | |||| | | ||||||||| |||||| |||||    
T  14854948 tcattttcttgataatcgtgtacaaaccttaaa 14854916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 36 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 22771965 - 22771817
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattg 135  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||| |||| ||| |||| || |||||||||||||||||| | ||||| ||||||| | |||||||| |||      
T  22771965 cattattatacccttatttattgaatttcatccaacataattacttcactaactacaattaataagggtgttttaataaatgacactaattttaccatca 22771866  T
Q  136 atattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    | || ||| |||||||| | |||| ||||||  ||||| |||| |||||    
T  22771865 aaatcaacccaattaatcaattccttaataactgtgcataaaccttaaa 22771817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 36 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 39301086 - 39301020
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataagg 102  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||    
T  39301086 cattattatacttttatttattgaatttcattcaactgaactacttcactaactacaattaataagg 39301020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 40996480 - 40996347
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcatt-gatattaacacaatt 149  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| | | || |||||||||||||||||| | ||||||||||||| | |||||||| ||||  | || |||||||||    
T  40996480 atttattgaatttcatccaacttaaccatttcactaactacaattaataagggtgttttagtaaatgaaactaatttta-cattcaaaatcaacacaatt 40996382  T
Q  150 aataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    ||| |||||| ||| ||| ||||| |||| |||||    
T  40996381 aatcatttccttaacaattgtgcataaaccttaaa 40996347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 43 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 34394081 - 34393947
Alignment:
Q  43 atactctcatttattgaatttcattcaacttaactactcca----ttaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgata 138  Q
    ||||||| |||||||||| || || ||||||||||||||||    ||||||| ||||||||| | | ||||||||||| ||| |||||||| |||  | |    
T  34394081 atactcttatttattgaactttatccaacttaactactccactagttaactataattaataaaggtgttttagtaaattatactaattttaccatcaaaa 34393982  T
Q  139 ttaacacaattaataatttccgtaataatcgtgca 173  Q
    | |||||||||||| |||||| |||||| ||||||    
T  34393981 tcaacacaattaatcatttccttaataaccgtgca 34393947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 85 - 178
Target Start/End: Original strand, 41092029 - 41092122
Alignment:
Q  85 taactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaac 178  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||  ||||  ||| |||||| |||||||    
T  41092029 taactacaattaataagagtattttaataaatgatattaattttaccattgaaatcaacacaattaatcgtttctttaaaaatcgttcacaaac 41092122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 53 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 34057731 - 34057627
Alignment:
Q  53 ttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaattaat 152  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | || ||||||||| ||| || ||||||||||||||| ||| || |||||| ||||| || |||| |||||||    
T  34057731 ttattgaatttcatccaacttaactatttcactaactacaaataacaacgatattttagtaaataatactagttttattattgaaatcaacataattaat 34057632  T
Q  153 aattt 157  Q
     ||||    
T  34057631 tattt 34057627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 39 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 35504998 - 35504880
Alignment:
Q  39 tattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgata 138  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||  || ||||||| || ||||||||||||||||||  |||||||| | ||||| || ||||||| |||| | |    
T  35504998 tattatactcttatttattgaattttatcgaatttaactattctattaactacaattaataaaaatattttaat-aatgaaataaattttaacattaaaa 35504900  T
Q  139 ttaacacaattaataatttc 158  Q
    |||| ||||||||| |||||    
T  35504899 ttaatacaattaatcatttc 35504880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 37 - 120
Target Start/End: Original strand, 35732108 - 35732191
Alignment:
Q  37 attattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgata 120  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||  ||||| ||||||||| ||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  35732108 attattatactcttatatattgaatttcatctaactttactactccactaattacaattaataggagtattttagtaaatgata 35732191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 2767378 - 2767284
Alignment:
Q  79 ctccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgca 173  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||  | || |||||||||||| |||||| |||||| ||||||    
T  2767378 ctccactaactacaaataataaggatgttttaataaatgatactaattttaccatcaaaatcaacacaattaattatttccttaataaccgtgca 2767284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 29226658 - 29226572
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatatt 122  Q
    ||||||| ||| || ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||| ||||| |||||    
T  29226658 cattattgtacccttatttattgaatttcatctaacttaactactccactaactacaattaataagagtgttttaataaataatatt 29226572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 184
Target Start/End: Original strand, 36967417 - 36967495
Alignment:
Q  106 ttttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  | || |||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| |||||    
T  36967417 ttttagtaaatgatattaattttaccatcaaaatcaacacaattaatcatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 36967495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 39 - 157
Target Start/End: Original strand, 40028501 - 40028623
Alignment:
Q  39 tattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaacta----caattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcatt 134  Q
    ||||||| |||  |||||||||||||||  ||||||| |||| || ||||||    |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  40028501 tattatattcttgtttattgaatttcatctaacttaattacttcactaactaaatacaattaataatgatattttaataaatgctattaattttaccatt 40028600  T
Q  135 gatattaacacaattaataattt 157  Q
    || || |||| ||||||| ||||    
T  40028601 gaaatcaacataattaatcattt 40028623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 69 - 184
Target Start/End: Original strand, 51132 - 51246
Alignment:
Q  69 aacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaattaataatttccgtaataatc 168  Q
    ||||||| || |||| ||||||||||||||||   | |||| |||||||||| | |||||| |||| | || |||||||||||| |||| | ||||||||    
T  51132 aacttaattaatccactaactacaattaataaatgtgtttttgtaaatgatacttatttta-cattaaaatcaacacaattaatcattttcttaataatc 51230  T
Q  169 gtgcacaaacattaaa 184  Q
    |||||||||| |||||    
T  51231 gtgcacaaaccttaaa 51246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 51 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 39466153 - 39466069
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaactt-aactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcatt 134  Q
    ||||||||||||| || ||| || ||||||| || |||| || |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  39466153 atttattgaattttatccaattttaactactgcactaaccacgattaataaagatattttagtaaatgatactaattttagcatt 39466069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 120
Target Start/End: Original strand, 1739534 - 1739613
Alignment:
Q  41 ttatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgata 120  Q
    |||||| || ||||||| ||||||||  || |||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  1739534 ttatacccttatttattaaatttcatcaaaattaactacttaactaactacaattaataagaatattttggtaaatgata 1739613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 51 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 24199399 - 24199316
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcatt 134  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||  || |||||||||||||| |||| ||||| |  ||| || ||||||||||||||||    
T  24199399 atttattgaatttcactccacttaactgatctattaactacaattattaagaatattatgataactggtattaattttatcatt 24199316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 39301001 - 39300930
Alignment:
Q  106 ttttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaa 177  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || || |||| ||||||| |||||  |||||||||| ||||||    
T  39301001 ttttagtaaatgatattaattttaccatcgaaatcaacataattaatcatttctttaataatcgtacacaaa 39300930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 92 - 158
Target Start/End: Original strand, 12559635 - 12559701
Alignment:
Q  92 aattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaattaataatttc 158  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||| | || |||||||||||| |||||    
T  12559635 aattaataaaaatattttagtaaatggtattaattttattattaaaatcaacacaattaatcatttc 12559701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 184
Target Start/End: Original strand, 33765696 - 33765794
Alignment:
Q  86 aactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    |||||||||||||||   ||| ||||||||||||| ||||||||  ||| | || |||| ||||||| |||||| ||| ||| |||||||||| |||||    
T  33765696 aactacaattaataaaagtatattagtaaatgatagtaattttagtattaaaatcaacataattaatcatttccttaaaaattgtgcacaaaccttaaa 33765794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 178
Target Start/End: Original strand, 1739712 - 1739768
Alignment:
Q  122 taattttatcattgatattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaac 178  Q
    |||||||| |||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  1739712 taattttaccattgaaatcaacacaattaattatttccttaataatcgtacacaaac 1739768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 110 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 10953464 - 10953405
Alignment:
Q  110 agtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaattaataatttccgtaataatcg 169  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| | || |||||||||||| |||||| |||||||||    
T  10953464 agtaaatgctattaattatatcattaaaatcaacacaattaatcatttccttaataatcg 10953405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 36 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 10953865 - 10953787
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatg 117  Q
    ||||||||||| || || |||||||||| ||  ||||||||||||||| ||   ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  10953865 cattattatacccttatatattgaatttgatctaacttaactactccacta---acaattaataagggtgttttagtaaatg 10953787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 110 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 10961469 - 10961410
Alignment:
Q  110 agtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaattaataatttccgtaataatcg 169  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| | || |||||||||||| |||||| |||||||||    
T  10961469 agtaaatgctattaattatatcattaaaatcaacacaattaatcatttccttaataatcg 10961410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 36 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 10961870 - 10961792
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatg 117  Q
    ||||||||||| || || |||||||||| ||  ||||||||||||||| ||   ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  10961870 cattattatacccttatatattgaatttgatctaacttaactactccacta---acaattaataagggtgttttagtaaatg 10961792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 51 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 43719351 - 43719284
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatga 118  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || || | |||||| ||||||||| | ||||||| |||||||    
T  43719351 atttattgaatttcatccaacttaattattcaactaactataattaataatgttattttaataaatga 43719284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 77 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 44648621 - 44648562
Alignment:
Q  77 tactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattga 136  Q
    ||||||| ||| |||||||| |||| || ||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  44648621 tactccactaattacaattagtaagtatgttttagtaaatgatactaattttaccattga 44648562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 3117111 - 3117028
Alignment:
Q  73 taactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaattaataatttc 158  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||| | ||||||||||||| |   |||||| |||||| || ||||| |||||| |||||    
T  3117111 taactactccattaactataattaacaagggtgttttagtaaatgaca--cattttaccattgaaatcaacactattaatcatttc 3117028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 6796099 - 6796017
Alignment:
Q  112 taaatgatattaattttatcattgatattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaaggagtataat 194  Q
    |||||||||||||||||| |||| | || ||| |  ||||| ||||   |||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  6796099 taaatgatattaattttaccattaaaatcaacgctgttaatcattttattaataatcgtgcacaaacattaaacgactataat 6796017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 6796461 - 6796383
Alignment:
Q  38 ttattatactctcatttattgaatttcattcaacttaa----ctactccattaactacaattaataaggatattttagta 113  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||    |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  6796461 ttattatacccttatttaatgaattttattcaacttaattaactactccactaactacaattaataa-tatattttagta 6796383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 51 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 21649476 - 21649414
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagta 113  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||  ||||||||   ||||||||||    
T  21649476 atttattgaatttcattcaatttaactactcaactaactatgattaataaatgtattttagta 21649414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 96 - 157
Target Start/End: Original strand, 39329065 - 39329126
Alignment:
Q  96 aataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaattaataattt 157  Q
    ||||||| |||||||  ||| |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  39329065 aataagggtattttaaaaaacgatactaattttatcattaaaattaacacaattaatcattt 39329126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 69)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 36 - 184
Target Start/End: Original strand, 34947493 - 34947641
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattg 135  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  34947493 cattattataccctcatttattgaatttcatccaacttaactactccactaactacaattaataagggtgttttagtaaatgataataattttaccattg 34947592  T
Q  136 atattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    | || |||||||||||| |||||  |||||| | ||||||||| |||||    
T  34947593 aaatcaacacaattaatcatttctttaataaacatgcacaaaccttaaa 34947641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 36 - 184
Target Start/End: Original strand, 21390288 - 21390436
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattg 135  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||      
T  21390288 cattattatacccttatttattgaatttcatctaacttaactactccactaactacaatcaataaggatgttttagtaaatgatattagttttaccatca 21390387  T
Q  136 atattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    | ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| |||||    
T  21390388 aaattaacacaattaatcatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 21390436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 39 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 41506198 - 41506054
Alignment:
Q  39 tattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgata 138  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||| || |||||||| |||| | |    
T  41506198 tattatactcttatttattgaatttcatccaacttaactactccactaactacaattaataagagtgttttagtaaatgctactaattttaccattaaaa 41506099  T
Q  139 ttaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaa 183  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| ||||    
T  41506098 ttaacacaattaatcatttccttaataatcgtgcataaaccttaa 41506054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 39 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 11373561 - 11373424
Alignment:
Q  39 tattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgata 138  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||| ||| || |    
T  11373561 tattatactcttatttattgaatttcatccaacttaactactccactaactacaattaataagggtgttttagtaaatgctactaattttaccatcgaaa 11373462  T
Q  139 ttaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaa 176  Q
    | |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  11373461 tcaacacaattaaacatttccttaataatcgtgcacaa 11373424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 59 - 194
Target Start/End: Original strand, 26974042 - 26974180
Alignment:
Q  59 aatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaa---atgatattaattttatcattgatattaacacaattaataat 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||   ||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| ||    
T  26974042 aatttcattcaacttaactactccactaactacaattaataagagtattttagtaaatgatgatattaattttaccattgaaatcaacacaattaatcat 26974141  T
Q  156 ttccgtaataatcgtgcacaaacattaaaggagtataat 194  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  26974142 ttccttaataatcgtgcacaaaccttaaacgactataat 26974180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 36 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 28202445 - 28202297
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattg 135  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||      
T  28202445 cattattatactcttatttattgaatttcatccaactttactactccactaactacaattaataaggatgttttagtaaatgacattaattttaccatca 28202346  T
Q  136 atattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    | || |||||||||||| |||| | |||||| |||||| |||| |||||    
T  28202345 aaatcaacacaattaattattttcttaataaccgtgcataaaccttaaa 28202297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 36 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 32346188 - 32346040
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattg 135  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  32346188 cattattatacccttatttattgaatttcattcaacttaactactccactaattataattaataagagtattttagtagatgatattaattttaccattg 32346089  T
Q  136 atattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    | || |||||||| ||| |||||| |||||| ||| ||||||| |||||    
T  32346088 aaatcaacacaatcaattatttccttaataaccgtacacaaaccttaaa 32346040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 51 - 176
Target Start/End: Original strand, 7463221 - 7463346
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaatta 150  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||| || ||||||||||    
T  7463221 atttattgaatttcatccaacttaactactccactaactacaattaatgagggtatttaagtaaatgctactaattttatcattgaaatcaacacaatta 7463320  T
Q  151 ataatttccgtaataatcgtgcacaa 176  Q
    || |||||| |||||| |||||||||    
T  7463321 atcatttccttaataaccgtgcacaa 7463346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 51 - 184
Target Start/End: Original strand, 13961967 - 13962100
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaatta 150  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||||    
T  13961967 atttattaaatttcatccaacttaactactccactaactacacttaataaggatattttattaagtgatattaattttatcattaaaatcaacacaatta 13962066  T
Q  151 ataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    || |||||| |||||| |||||| |||| |||||    
T  13962067 atcatttccttaataaacgtgcataaaccttaaa 13962100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 51 - 184
Target Start/End: Original strand, 30865975 - 30866108
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaatta 150  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||    
T  30865975 atttattgaatttcatctaacttaactactccactaattataattaataagagtattttagtaaatgatattaattataccattgaaattaacacaatta 30866074  T
Q  151 ataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    || |||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  30866075 atcatttctttaataatcgtgcacaaaccttaaa 30866108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 36 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 759227 - 759079
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattg 135  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||      
T  759227 cattattatacccttatttattgaatttcatccaacttaactactccgctaactacaattaataaggatgttttagtaaatgatactagttttaccatca 759128  T
Q  136 atattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    | || |||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||| |||||    
T  759127 aaatcaacacaattaatcatttccttaataattgtgcataaaccttaaa 759079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 39 - 184
Target Start/End: Original strand, 2459467 - 2459610
Alignment:
Q  39 tattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgata 138  Q
    |||||||| || |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||| | || |||||||||  | |||||||| | |||| |    
T  2459467 tattatacccttatttattgaatttcatcctacttaactactccactaactacaattaataagggtgttgtagtaaatg--actaattttaccgttgaaa 2459564  T
Q  139 ttaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    | |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2459565 tcaacacaattaatcatttccttaataatcgtgcacaaacattaaa 2459610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 38 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 21760118 - 21759972
Alignment:
Q  38 ttattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgat 137  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||| |||  |     
T  21760118 ttattataccctcaattattgaatttcatccaacttaactactccattaactacaattagtaagggtgttttattaaatgatactaattttaccatcaaa 21760019  T
Q  138 attaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    || |||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||| |||||    
T  21760018 atcaacacaattaatcattttcttaataatcatgcacaaaccttaaa 21759972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 36 - 184
Target Start/End: Original strand, 83378 - 83526
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattg 135  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| |||      
T  83378 cattatcatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccgctaactacaattaataagaatgttttagtaaatgatactaattttaccatca 83477  T
Q  136 atattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    | || |||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||| |||||    
T  83478 aaatcaacacaattaatcatttccttaataattgtgcataaaccttaaa 83526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 36 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 3178340 - 3178192
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattg 135  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||| |||      
T  3178340 cattaatatacccttatttattgaatttcatccaacttaactactccactaactacaattaataaaggtgttttagtaaatgatattaattttaccatca 3178241  T
Q  136 atattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    | || |||||||| ||| |||| | |||||||| ||||||||| |||||    
T  3178240 aaatcaacacaatcaatcatttacttaataatcatgcacaaaccttaaa 3178192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 39 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 46478426 - 46478294
Alignment:
Q  39 tattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgata 138  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| ||||  ||| | |    
T  46478426 tattatactcttatttattgaatttcatccaacttaactactcaattaactacaattaataagggtattttagtaaatgctactaactttactattaaaa 46478327  T
Q  139 ttaacacaattaataatttccgtaataatcgtg 171  Q
    |||||||||||||| ||||   |||||||||||    
T  46478326 ttaacacaattaatcatttaattaataatcgtg 46478294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 38 - 184
Target Start/End: Original strand, 9785983 - 9786129
Alignment:
Q  38 ttattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgat 137  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| || ||||||||||||| || |||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||||| |||  |     
T  9785983 ttattatacccttatttattgaattttatccaacttaactacttcactaactacaattaataagcgtgttttagtaaatgaaattaattttaccatcaaa 9786082  T
Q  138 attaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    || |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || |||||    
T  9786083 atcaacacaattaatcatttccttaataatcgtgcacagaccttaaa 9786129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 51 - 184
Target Start/End: Original strand, 22738709 - 22738842
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaatta 150  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||  |||||||||    
T  22738709 atttattaaatttcatccaacttaactaatctactaactacaattaatgaggatattttagtaaatgatactaattttaccattgaaatctacacaatta 22738808  T
Q  151 ataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    || |||||  ||||||||||||| |||| |||||    
T  22738809 atcatttctttaataatcgtgcataaaccttaaa 22738842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 51 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 24516410 - 24516277
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaatta 150  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||| |||||| || ||||||||||    
T  24516410 atttattgaatttcatccaacttaactactccactaactacaattaataaggtttttttagtaaatgttactaattttaccattgaaatcaacacaatta 24516311  T
Q  151 ataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    || ||||   ||||||||||| | |||| |||||    
T  24516310 atcattttattaataatcgtgtataaaccttaaa 24516277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 39 - 184
Target Start/End: Original strand, 28103729 - 28103874
Alignment:
Q  39 tattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgata 138  Q
    |||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||| | |||| ||||||| |  |||||||| |||||| |    
T  28103729 tattatacgcttatttattgaatttcatccaacttaaccacttcactaactacaattaataagggtgttttggtaaatgctgctaattttaccattgaaa 28103828  T
Q  139 ttaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    | |||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  28103829 tcaacacaattaatcattttcttaataatcgtgcacaaaccttaaa 28103874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 37 - 184
Target Start/End: Original strand, 49101657 - 49101807
Alignment:
Q  37 attattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattt---tagtaaatgatattaattttatcat 133  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  |||||   ||||||||||||||||||||||| |    
T  49101657 attattatacttttatttattgaatttcattcaacttaactactccactaactacaattaatatgagtattttaatagtaaatgatattaattttatcct 49101756  T
Q  134 tgatattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    | | || |||||||||||| |||| | ||| ||||||  |||||| |||||    
T  49101757 taaaataaacacaattaatcattttcttaaaaatcgtaaacaaaccttaaa 49101807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 39 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 21350758 - 21350616
Alignment:
Q  39 tattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgata 138  Q
    |||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||   | || ||||| |||||| |    
T  21350758 tattatacccttatttattgaatttcatccaacttaactactccactaactacaattaataagggtgttttagtaaatacaactatttttaccattgaaa 21350659  T
Q  139 ttaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    | ||||||||   |||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  21350658 tcaacacaat---taatttccttaataatcgtgcacaaaccttaaa 21350616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 39 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 34100680 - 34100549
Alignment:
Q  39 tattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgata 138  Q
    |||||||| || ||||||||||| |||| ||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||  ||||| |    
T  34100680 tattatacccttatttattgaatgtcatccaacttaactacttcagtaactacaattaataaagatattttagtaaatgctactaattttactattgaaa 34100581  T
Q  139 ttaacacaattaataatttccgtaataatcgt 170  Q
    | |||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  34100580 tcaacacaattaatcattttcttaataatcgt 34100549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 39 - 184
Target Start/End: Original strand, 23670482 - 23670626
Alignment:
Q  39 tattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgata 138  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||||  | |||||||||||| ||||||||||| ||| || |    
T  23670482 tattatactcttatttattaaatttcatcaaacttaactactccactaactaccattaataagagtgttttagtaaatgctattaattttaccatggaaa 23670581  T
Q  139 ttaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    | |||||||||||| ||| || ||||||| |||||||||| |||||    
T  23670582 tcaacacaattaat-attcccttaataattgtgcacaaaccttaaa 23670626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 39 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 7457554 - 7457409
Alignment:
Q  39 tattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgata 138  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| || |||  |||||||| ||||||||| | ||||||||||||  | |||||||| |||||| |    
T  7457554 tattatactcttatttattgaatttaatttaacttaattattccgctaactacatttaataagggtcttttagtaaatgtaactaattttaccattgaaa 7457455  T
Q  139 ttaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    | |||| ||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  7457454 tcaacataattaatcatttttttaataatcgtgcacaaacattaaa 7457409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 39 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 8592573 - 8592428
Alignment:
Q  39 tattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgata 138  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||  || |||||| | |||||| |    
T  8592573 tattatactcttatttattaaatttcatctaactttactactccactaactacaattaataagggtgttttattaaatactactaatttaaccattgaaa 8592474  T
Q  139 ttaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    | |||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||| |||||    
T  8592473 tcaacacaattaatcatttctttaataatcatgcacaaaccttaaa 8592428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 39 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 19271866 - 19271721
Alignment:
Q  39 tattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgata 138  Q
    |||||||| || ||||||| | |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| ||||  | |||||| |||||||| |    
T  19271866 tattatacccttatttattaattttcatccaacttaactactccactaactacaattaataaaagtattttagtcaatgccactaatttgatcattgaaa 19271767  T
Q  139 ttaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    | |||||||||||| ||||   |||||||||||||||| |||||||    
T  19271766 tcaacacaattaatcatttttttaataatcgtgcacaagcattaaa 19271721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 36 - 184
Target Start/End: Original strand, 38391741 - 38391889
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattg 135  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||| |||  | ||||||||||||||| |||||||| |||      
T  38391741 cattattatacttttatttattgaatttcatccaacttaattattccactaactacaattaacaagagtgttttagtaaatgatactaattttaccatca 38391840  T
Q  136 atattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    | || |||||||||||| |||| | ||||||| ||||| |||| |||||    
T  38391841 aaatcaacacaattaatcattttcttaataattgtgcataaaccttaaa 38391889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 63 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 16560679 - 16560569
Alignment:
Q  63 tcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaattaataatttccgta 162  Q
    |||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||  | || |||||||||||| |||||| ||    
T  16560679 tcatccaacttaactaccccactaactacaattaataaggatgttttagtaaatgatactagttttaccatcaaaataaacacaattaatcatttcctta 16560580  T
Q  163 ataatcgtgca 173  Q
    |||||||||||    
T  16560579 ataatcgtgca 16560569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 63 - 173
Target Start/End: Original strand, 16604983 - 16605093
Alignment:
Q  63 tcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaattaataatttccgta 162  Q
    |||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||  | || |||||||||||| |||||| ||    
T  16604983 tcatccaacttaactaccccactaactacaattaataaggatgttttagtaaatgatactagttttaccatcaaaataaacacaattaatcatttcctta 16605082  T
Q  163 ataatcgtgca 173  Q
    |||||||||||    
T  16605083 ataatcgtgca 16605093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 37 - 173
Target Start/End: Original strand, 42935652 - 42935791
Alignment:
Q  37 attattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactcc---attaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcat 133  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||   | |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||    
T  42935652 attataatactcttatttattgaacttcatccaacttaactcctcctccactaactacaattaataagggtgttttagtaaatgatattaattttaccat 42935751  T
Q  134 tgatattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgca 173  Q
      | || |||||||||||| |||| | |||||| ||||||    
T  42935752 caaaatcaacacaattaatcattttcttaataaccgtgca 42935791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 37 - 120
Target Start/End: Original strand, 25571413 - 25571496
Alignment:
Q  37 attattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgata 120  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  25571413 attattatacccttatttattgaatttcatccaacttaactattccactaactacaactaataagggtattttagtaaatgata 25571496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 39 - 170
Target Start/End: Original strand, 33819210 - 33819341
Alignment:
Q  39 tattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgata 138  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||  |  ||| ||||||| || |||||||| |||||| |    
T  33819210 tattatacccttatttaatgaatttcattcaacttcactactccacaaacaacaattaataagagtgattttgtaaatgctactaattttaccattgaaa 33819309  T
Q  139 ttaacacaattaataatttccgtaataatcgt 170  Q
    | |||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  33819310 tcaacacaattaatcatttccttaataatcgt 33819341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 158
Target Start/End: Original strand, 43873931 - 43874038
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaatta 150  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||  | || ||||||||||    
T  43873931 atttattaaacttcatccaacttaactactccactaactacatttaataagggtgttttagtaaatgatattaattttaccatcaaaatcaacacaatta 43874030  T
Q  151 ataatttc 158  Q
    || |||||    
T  43874031 atcatttc 43874038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 49 - 151
Target Start/End: Original strand, 35333049 - 35333151
Alignment:
Q  49 tcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaat 148  Q
    |||||| |||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||| || ||||||||    
T  35333049 tcatttgttgaatttcatctaacttaactactccactaactacaattaataataatattttaataaataatattaattatataattgaaatcaacacaat 35333148  T
Q  149 taa 151  Q
    |||    
T  35333149 taa 35333151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 85 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 2850968 - 2850875
Alignment:
Q  85 taactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaac 178  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||||    
T  2850968 taactataattaatgagggtattttagtaaataatattaattttatcattgaaatcaacataattaatcatttccttaataatcatgcacaaac 2850875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 59 - 184
Target Start/End: Original strand, 5524396 - 5524521
Alignment:
Q  59 aatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaattaataatttc 158  Q
    |||||||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||   | ||||| |||||| || |||||||| |||||| || |||||||||||| ||||     
T  5524396 aatttcatccaacttaactactcaactaactataattaataaaagtgttttattaaatgttactaattttaccattgaaatcaacacaattaatcatttt 5524495  T
Q  159 cgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    | |||||||||||||||||| |||||    
T  5524496 cttaataatcgtgcacaaactttaaa 5524521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 36 - 178
Target Start/End: Original strand, 48608859 - 48608997
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattg 135  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||| |||||||||||| ||||||||    ||| || ||||| |||      
T  48608859 cattattatactcttatttattgaatttcatccaacttaactacatcactaactacgattaataaggatgttttagta----atactagttttaccatca 48608954  T
Q  136 atattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaac 178  Q
    | || |||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||    
T  48608955 aaatcaacacaattaatcatttccttaataatcatgcataaac 48608997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 51 - 184
Target Start/End: Original strand, 40076326 - 40076456
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaatta 150  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||   ||| ||||||||||||   | ||||||||||||||| |||||||| |||  | |||||||||||||    
T  40076326 atttattgaatttcatccaacttaactaatc---taagtacaattaataatagtgttttagtaaatgatactaattttaccatcaaaattaacacaatta 40076422  T
Q  151 ataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    || |||||  ||||||||||||| |||| |||||    
T  40076423 atcatttctttaataatcgtgcataaaccttaaa 40076456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 17828471 - 17828340
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaatta 150  Q
    |||||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||  || ||| ||||||||||||||||||| |||||| || |||| || ||    
T  17828471 atttattgaatt-catccaacttaattactccactaactacaattgataagagtaattttgtaaatgatattaattttaccattgaaatcaacaaaaata 17828373  T
Q  151 ataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    ||  ||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  17828372 atcgtttccttaat-atcgtgcacaaactttaaa 17828340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 29835534 - 29835402
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaatta 150  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||| |||||||||||  | |||||||||||| || |||||||| |||| | || |||| |||||    
T  29835534 atttattgaattacatccaact-aactactccgttaactgcaattaataagagtgttttagtaaatgctactaattttaccatttaaatcaacataatta 29835436  T
Q  151 ataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    || |||||| |||||| || |||||||| |||||    
T  29835435 atcatttccttaataagcgcgcacaaaccttaaa 29835402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 45 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 31930626 - 31930475
Alignment:
Q  45 actctcatttattgaatttcattcaacttaacta--ctccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaa 142  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||  |||| | |||| ||||| |||| | || ||    
T  31930626 actcttatttattgaatttcatcaaacttaactatactccactaactacaattaataagggtattttaaaaaattagattagttttaccattaaaatcaa 31930527  T
Q  143 cacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaaggagtataat 194  Q
    |||| | ||| |||||  ||||||||||||| |||| ||||| || ||||||    
T  31930526 cacagtcaatcatttctttaataatcgtgcataaactttaaacgactataat 31930475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 36 - 166
Target Start/End: Original strand, 27920981 - 27921111
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattg 135  Q
    |||||| ||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||  | ||||| ||||||||| |||||||| ||||     
T  27920981 cattataatactcttattgattgaacttcatccaacttaactaatgcactaactacaattaataagagtgttttaataaatgatactaattttaccatta 27921080  T
Q  136 atattaacacaattaataatttccgtaataa 166  Q
    | || |||| ||||||| |||| | ||||||    
T  27921081 aaatcaacataattaatcattttcttaataa 27921111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 184
Target Start/End: Original strand, 12631347 - 12631446
Alignment:
Q  85 taactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  |||||  || ||||||||  ||||| || || ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  12631347 taactacaattaataaggatgttttgataaatactactaattttactattgaaatcaatacaattaattatttccttaataatcgtgcacaaaccttaaa 12631446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 129
Target Start/End: Original strand, 24166999 - 24167077
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaatttta 129  Q
    |||| |||||||||||||||  |||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||    
T  24166999 atttcttgaatttcattcaatgtaactactgcactaactactattaataagggtattttagtaaataacattaatttta 24167077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 30546485 - 30546399
Alignment:
Q  42 tatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaatttt 128  Q
    ||||| || ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| | | ||||||||| ||| || ||||||    
T  30546485 tatacccttatttattgaatttcactccacttaactactccaataactacaattaataaaggtgttttagtaagtgaaatcaatttt 30546399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 32019037 - 32018959
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaatttta 129  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||    
T  32019037 atttattaaatttcatccaacttaattactccactaacaacaattaataagagtattttagtaaatgatagaaatttta 32018959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 184
Target Start/End: Original strand, 37245686 - 37245833
Alignment:
Q  39 tattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgata 138  Q
    |||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| |||||| | | |||||||||||||  | |||||||||||| || ||| |||| |||||| |    
T  37245686 tattatacccttatttattgaatttcatccaacttaaccactccacttattacaattaataagagtgttttagtaaatgctactaa-tttaccattgaaa 37245784  T
Q  139 ttaacacaattaataatttccgt---aataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    | |||| |||||||  ||| | |   ||||||||||||||||| |||||    
T  37245785 tcaacagaattaatctttttcttataaataatcgtgcacaaaccttaaa 37245833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 36 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 6495070 - 6494977
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaatttta 129  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||   | ||||||||||| | | ||||||||    
T  6495070 cattattatacccttatttattaaatttcatccaactttactactccactaactacaattaataaaagtgttttagtaaataacactaatttta 6494977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 39 - 184
Target Start/End: Original strand, 16904375 - 16904520
Alignment:
Q  39 tattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgata 138  Q
    |||||||| || ||||||||||||| || |||||||| || | || |||||| |||||||| |  |||||||| || ||||| ||||||||  ||||| |    
T  16904375 tattatacccttatttattgaatttgatccaacttaattatttcactaactataattaatacgagtattttagaaagtgataataattttactattgaaa 16904474  T
Q  139 ttaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    | |||||||||||| |||| | ||| |||  ||||||||| |||||    
T  16904475 tcaacacaattaatcattttcttaaaaattttgcacaaaccttaaa 16904520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 112
Target Start/End: Original strand, 36790733 - 36790809
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagt 112  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||| | || ||||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||    
T  36790733 cattattatacccttatttattgaatttcatccgacataactactcaactaactacaattaataagggtgttttagt 36790809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 37850860 - 37850768
Alignment:
Q  39 tattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggat-attttagtaaatgatattaattttat 130  Q
    ||||||| ||| ||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||| ||| |||||||||    
T  37850860 tattatattcttatttattgattttcatctaacttaacaactccattaactacagtttataaggatctttttagtaaatcatactaattttat 37850768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 42 - 129
Target Start/End: Original strand, 10042280 - 10042367
Alignment:
Q  42 tatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaatttta 129  Q
    |||||||| ||||||||| ||  |||  |||||||||||||| ||| || |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  10042280 tatactcttatttattgagttctattttacttaactactccaataattataattaataagaatattttaataaatgatattaagttta 10042367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 51 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 32018833 - 32018734
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaatta 150  Q
    ||||||| ||||| || |||||||| ||||| | |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||  ||||| || ||||||||||    
T  32018833 atttattaaatttaatccaacttaattactctactaacgacaattaataagagtattttagtaaatgatagaaattttactattgaaatcaacacaatta 32018734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 134
Target Start/End: Original strand, 39452390 - 39452435
Alignment:
Q  89 tacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcatt 134  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39452390 tacaattaataagggtattttagtaaatgatattaattttaccatt 39452435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 87 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 47045538 - 47045466
Alignment:
Q  87 actacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaattaataatttccg 160  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||| || ||| |||||||| |||||||    
T  47045538 actacaattaataagggtattttaggaaatgatactaatttta-cattgaaatcaactcaattaatcatttccg 47045466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 134
Target Start/End: Original strand, 39005433 - 39005512
Alignment:
Q  55 attgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcatt 134  Q
    ||||||||||| | ||||||| || || | |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  39005433 attgaatttcacttaacttaattaatctactaactacaattattaaaggtattttagtaaatgatactaattttaccatt 39005512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 51 - 129
Target Start/End: Original strand, 42796013 - 42796094
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaac---tactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaatttta 129  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||   ||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||| || ||||||||    
T  42796013 atttaatgaatttcatccaacttaacaactactccactaactacaattaataagggtgttttaataaatgttactaatttta 42796094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 47045604 - 47045541
Alignment:
Q  39 tattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataagg 102  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| || |||| |||||||| ||||    
T  47045604 tattatactcttatttgttgaatttcatccaacttaactactacactaaccacaattaacaagg 47045541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 54 - 116
Target Start/End: Original strand, 17610913 - 17610975
Alignment:
Q  54 tattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaat 116  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  17610913 tattgaatttcatccaacttaactatttcaataactacaattaatacaaatattttagtaaat 17610975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 72 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 21937887 - 21937825
Alignment:
Q  72 ttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcatt 134  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  |  |||||||||||| | |||||||||||||    
T  21937887 ttaactactccactaactacaattaataagagtgctttagtaaatgacactaattttatcatt 21937825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 184
Target Start/End: Original strand, 44180268 - 44180346
Alignment:
Q  106 ttttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| |||||| || |||||||||||| |||| | ||||||||||| | |||| |||||    
T  44180268 ttttagtaaattatactaattttaccattgaaatcaacacaattaatcattttcttaataatcgtgtataaaccttaaa 44180346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 87 - 184
Target Start/End: Original strand, 46211472 - 46211572
Alignment:
Q  87 actacaattaataaggatattttagtaaatga---tattaattttatcattgatattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaa 183  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||   || || ||||| |||  | || |||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||| ||||    
T  46211472 actacaattaataaggatgttttagtaaatgatagtactagttttaccatcaaaatcaacacaattaatcatttccttaataattgtgcataaaccttaa 46211571  T
Q  184 a 184  Q
    |    
T  46211572 a 46211572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 51 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 17610659 - 17610576
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcatt 134  Q
    ||||||||||||||| || | ||||||| | || ||| || |||||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||| ||||    
T  17610659 atttattgaatttcactctaattaactatttcactaattaaaattaataagaatattttaataaattatactaattttaccatt 17610576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 51 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 31665838 - 31665731
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatg-atattaattttatcattgatattaacacaatt 149  Q
    |||||||||| || ||  || |||||||||| | ||||||| ||||||||  ||||||||||||||| | |||||||||| |||| | || ||||||| |    
T  31665838 atttattgaaatttatctaatttaactactctactaactactattaataaatatattttagtaaatgaaaattaattttaccattaaaatcaacacaact 31665739  T
Q  150 aataattt 157  Q
    ||| ||||    
T  31665738 aattattt 31665731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 46 - 122
Target Start/End: Original strand, 37490466 - 37490538
Alignment:
Q  46 ctctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatatt 122  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||    ||||| |  |||||||||||||||||||    
T  37490466 ctcttatttattgaatttcattcaatttaattactccactaacta----taatatgagtattttagtaaatgatatt 37490538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 36 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 2851160 - 2851113
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccat 84  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2851160 cattattatac-cttatttaatgaatttaattcaacttaactactccat 2851113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 57 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 32769831 - 32769787
Alignment:
Q  57 tgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataag 101  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32769831 tgaatttcatttcatttaactactccatcaactacaattaataag 32769787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 46 - 90
Target Start/End: Original strand, 37490378 - 37490422
Alignment:
Q  46 ctctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaacta 90  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||    
T  37490378 ctcttatttattgaatttcattcaatttaattactccactaacta 37490422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0583 (Bit Score: 82; Significance: 7e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0583
Description:

Target: scaffold0583; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 36 - 173
Target Start/End: Original strand, 2011 - 2148
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattg 135  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||  ||  ||| || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2011 cattattatacccttatttattgaatttcatcgaatgtaattaatccactaactacaattaataaggatgttttagtaaatgatattaattttatcattg 2110  T
Q  136 atattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgca 173  Q
    | ||||||||||||||| | |||| |||||||||||||    
T  2111 aaattaacacaattaatcacttccttaataatcgtgca 2148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 47)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 36 - 184
Target Start/End: Original strand, 13909410 - 13909558
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattg 135  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||| |||||    
T  13909410 cattattatactcttatttattcaatttcatctaacttaattactccactaactacaattaataagggtattttagtaaatgtcactaattttaccattg 13909509  T
Q  136 atattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    | || |||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  13909510 aaatcaacacatttaatcatttccttaataatcgtgcacaaactttaaa 13909558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 36 - 170
Target Start/End: Original strand, 13087516 - 13087650
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattg 135  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| |||| || |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13087516 cattattatattcttatttattgaatttcatccaacttaattacttcactaactataattaataaggatgttttagtaaatgatattaattttaccattg 13087615  T
Q  136 atattaacacaattaataatttccgtaataatcgt 170  Q
    | || |||||||||||| | || | ||||||||||    
T  13087616 aaatcaacacaattaatcactttcttaataatcgt 13087650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 39 - 184
Target Start/End: Original strand, 15058106 - 15058251
Alignment:
Q  39 tattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgata 138  Q
    |||||||| || |||||||||||||||| |||||||| |||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||| |||||| |    
T  15058106 tattatacccttatttattgaatttcatccaacttaaatacttcactaactacaattaataagggtattttagtaaatgccactaattttaccattgaaa 15058205  T
Q  139 ttaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    |||||  ||||||| |||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  15058206 ttaacttaattaatcattttcttaataatcgtgcacaaaccttaaa 15058251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 36 - 184
Target Start/End: Original strand, 29363292 - 29363440
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattg 135  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||      
T  29363292 cattattatactcttatttattgaatttcatccaacttaactaatccgctaactacaattaataaggatgttttagtaaatgatactagttttaccatca 29363391  T
Q  136 atattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    | || |||||||||||| |||| | ||||||| ||||| |||| |||||    
T  29363392 aaatcaacacaattaatcattttcttaataattgtgcataaaccttaaa 29363440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 39 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 3720366 - 3720221
Alignment:
Q  39 tattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgata 138  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  | |||| ||||||  ||  |||||||| ||||| |    
T  3720366 tattatactcttatttactgaatttcattcaacttaactattccactaactacaattaataagagtgtttttgtaaatactacaaattttataattgaaa 3720267  T
Q  139 ttaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    | |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  3720266 tcaacacaattaatcatttcattaataatcgtgcacaaaccttaaa 3720221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 36 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 11656074 - 11655926
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattg 135  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||| | |||||||| |||      
T  11656074 cattattatacccttatttattgaatttcatccaactttactactccactaactacaattaataagggtgttttagtaaatgacactaattttaccatca 11655975  T
Q  136 atattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    | || |||||||||||| |||| | |||||| |||||| |||| |||||    
T  11655974 aaatcaacacaattaatcattttcttaataaccgtgcataaaccttaaa 11655926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 52 - 189
Target Start/End: Original strand, 1781805 - 1781941
Alignment:
Q  52 tttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaattaa 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||| |||||| || |||| ||||||    
T  1781805 tttattgaatttcattcaacttaac-actccactaactacaattaataagggtgttttagtaaatgctactaattttaccattgagatcaacataattaa 1781903  T
Q  152 taatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaaggagt 189  Q
    | |||| | ||| ||||||||| |||| ||||| ||||    
T  1781904 tcattttcttaacaatcgtgcataaaccttaaacgagt 1781941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 42 - 159
Target Start/End: Original strand, 17828932 - 17829049
Alignment:
Q  42 tatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatatta 141  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||| |||||||| |||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||    
T  17828932 tatactcttattaattaaatttcatccaacttaattacttcactaactacaattaataaagatattttagtaaatgatattaattttactgttgaaatta 17829031  T
Q  142 acacaattaataatttcc 159  Q
    |||| |||||||||||||    
T  17829032 acactattaataatttcc 17829049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 36 - 184
Target Start/End: Original strand, 21010159 - 21010311
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactcca----ttaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatc 131  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||    |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||  |    
T  21010159 cattattatactgttatttattgaatttcatccaacttaactactccactaattaactacaatttataagggtgttttagtaaatgatactaatttttcc 21010258  T
Q  132 attgatattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    ||  | ||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||| |||| |||||    
T  21010259 atcaaaattaacacaattaatcattttcttaataattgtgcataaaccttaaa 21010311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 51 - 173
Target Start/End: Original strand, 5302352 - 5302474
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaatta 150  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||| |||  | || |||||| |||    
T  5302352 atttattgaacttcatccaacttaactactccattaactacaattaataaggatgttttggtaaattatattaattttaccatcaaaatcaacacattta 5302451  T
Q  151 ataatttccgtaataatcgtgca 173  Q
    || |||| | |||||| ||||||    
T  5302452 atcattttcttaataaccgtgca 5302474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 51 - 177
Target Start/End: Original strand, 7920240 - 7920365
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaatta 150  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| |||||| || |||| |||||    
T  7920240 atttattgaatttcattcaaattaaatacttcactaactacaattaataag-atattttagtaaatggttttaattttaccattgaaatcaacaaaatta 7920338  T
Q  151 ataatttccgtaataatcgtgcacaaa 177  Q
    || |||||  ||| |||||||||||||    
T  7920339 atcatttctttaaaaatcgtgcacaaa 7920365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 39 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 31894335 - 31894197
Alignment:
Q  39 tattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgata 138  Q
    |||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||| ||  |||||||||||| || |||||||| |||||| |    
T  31894335 tattatacccttatttattaaatttcatccaacttaactacttcactaactacaattaataatgacgttttagtaaatgctactaattttaccattgaaa 31894236  T
Q  139 ttaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaa 177  Q
    | |||||||||||| |||| | |||||||| | ||||||    
T  31894235 tcaacacaattaatcattttcttaataatcatacacaaa 31894197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 36 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 3291896 - 3291748
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattg 135  Q
    |||| |||||| || ||||||||||||| || ||||||||||||| || |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| |||| ||| ||||     
T  3291896 cattgttatacacttatttattgaattttatccaacttaactacttcactaactacaattaataaaggtattttagtaaataatactaatattaccatta 3291797  T
Q  136 atattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    | ||  | ||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| |||||    
T  3291796 aaatcgatacaattaatcatttccttaataatcgtgcaaaaaccttaaa 3291748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 42 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 24983571 - 24983444
Alignment:
Q  42 tatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatatta 141  Q
    ||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||| | |||||||| |||||| || |    
T  24983571 tatacccttatttattgaatttcacccaacttaactactccactaactacaattaataagggtgttttagtaaatgacactaattttaccattgaaatca 24983472  T
Q  142 acacaattaataatttccgtaataatcg 169  Q
    || ||| |||| |||||| ||| |||||    
T  24983471 actcaactaatcatttccttaagaatcg 24983444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 40 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 1063727 - 1063610
Alignment:
Q  40 attatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatat 139  Q
    ||||||| || | ||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | ||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||    
T  1063727 attatacccttacttattaaatttcatttaacttaactactccactaactacaattactcagagtattttagtaaataatactaattttatcattgaaat 1063628  T
Q  140 taacacaattaataattt 157  Q
     |||||||||||| ||||    
T  1063627 caacacaattaatcattt 1063610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 39 - 178
Target Start/End: Original strand, 181545 - 181683
Alignment:
Q  39 tattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgata 138  Q
    |||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| |||||||||||  || ||||||||  ||||| |    
T  181545 tattatacccttatttattgaatttcatccaacttaactactccactaactataattaataatgatgttttagtaaatactactaattttactattgaaa 181644  T
Q  139 ttaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaac 178  Q
    | || ||||||||| ||||   |||||||||||| |||||    
T  181645 tcaatacaattaat-atttttttaataatcgtgctcaaac 181683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 36 - 166
Target Start/End: Original strand, 6801917 - 6802047
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattg 135  Q
    |||||| |||| || |||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||      
T  6801917 cattataatacccttatttatcgaacttcatccaacttaactactccactaactacaattaataagggcgttttagtaaatgatattaattttaccatca 6802016  T
Q  136 atattaacacaattaataatttccgtaataa 166  Q
    | || |||| ||||||| |||| | ||||||    
T  6802017 aaatcaacataattaatcattttcttaataa 6802047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 36 - 129
Target Start/End: Original strand, 30716886 - 30716979
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaatttta 129  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||    
T  30716886 cattataatactcttatttattgaattttatccaactttactactccactaactacaattaataagggtgtttaagtaaatgatactaatttta 30716979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 52 - 184
Target Start/End: Original strand, 23142669 - 23142801
Alignment:
Q  52 tttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaattaa 151  Q
    |||||||||||||||  | ||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||  | || ||||| |||||| || |||||||||||    
T  23142669 tttattgaatttcatctagcttaactactccactacctacaattaataagggtgttttagtaaatgccactatttttaccattgaaatcaacacaattaa 23142768  T
Q  152 taatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    | |||| | ||||||||||| | |||| |||||    
T  23142769 tcattttcttaataatcgtggataaaccttaaa 23142801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 37 - 176
Target Start/End: Original strand, 1225035 - 1225173
Alignment:
Q  37 attattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattga 136  Q
    |||||||||| || ||||||| ||||| || |||||||||| || || |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  ||| |    
T  1225035 attattatacccttatttattcaattt-atccaacttaacttcttcactaactaaaattaataagaatattttagtaaataatattaattttactattta 1225133  T
Q  137 tattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaa 176  Q
     || |||||||||||| |||||  ||| | ||||||||||    
T  1225134 aatcaacacaattaatcatttctttaaaactcgtgcacaa 1225173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 51 - 134
Target Start/End: Original strand, 34299996 - 34300079
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcatt 134  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  34299996 atttattgaataccatccaacttaactacttcactaaccacaattaataaggatattttagtaaataatactaattttatcatt 34300079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 36 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 11143715 - 11143618
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcat 133  Q
    |||||| |||| || |||||||||| ||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  11143715 cattataatacccttatttattgaacttcatccaacttaactacttcactaactataattaataagggtgatttagtaaatgatactaattttatcat 11143618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 37 - 133
Target Start/End: Original strand, 33510127 - 33510222
Alignment:
Q  37 attattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcat 133  Q
    |||||||||| || ||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  33510127 attattatacccttatttaataaatttcatccaacttaactactcaattaattacaattaataaaaatattttagtaaat-atactaattttatcat 33510222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 38 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 4367379 - 4367297
Alignment:
Q  38 ttattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgata 120  Q
    ||||||| | || ||||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  4367379 ttattattcccttatttattaaatttcatgcaacttaactacttcactaactacagttaataaggatattttagaaaatgata 4367297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 6834482 - 6834348
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaatta 150  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| ||| || | |||||| ||||||||| | | |||||||||||||||||||||| |  ||  | || ||||||||||    
T  6834482 atttattgaatctcattcaatttatctattctactaactataattaataaaggtgttttagtaaatgatattaatttgactatcaaaatcaacacaatta 6834383  T
Q  151 ataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaag 185  Q
    || |||| | ||||||||||||| |||| ||||||    
T  6834382 attattttcttaataatcgtgcataaactttaaag 6834348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 32440758 - 32440636
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaatta 150  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||||||||| | ||||||||||| ||| |||||||| |||  | || ||||||||||    
T  32440758 atttattacatttcatccaacttaactactctactaattacaattaataagggtgttttagtaaataatactaattttaccatcaaaatcaacacaatta 32440659  T
Q  151 ataatttccgtaataatcgtgca 173  Q
    || ||||||  ||||| ||||||    
T  32440658 atcatttcctaaataaccgtgca 32440636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 39 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 10923503 - 10923408
Alignment:
Q  39 tattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcatt 134  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||  || |||| || |||| || |||||||||| || | ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10923503 tattatattcttatttattgaatttcatctaatttaattattccactagctacaattaacaacggtattttagtaaataatattaattttatcatt 10923408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 89 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 27448231 - 27448136
Alignment:
Q  89 tacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| |||||  | || |||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||| |||||    
T  27448231 tacaattaataatgatgttttagtaaatgatactaatttcatcatcaaaatcaacacaattaatcatttccttaataattgtgcaaaaaccttaaa 27448136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 53 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 21804639 - 21804535
Alignment:
Q  53 ttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaattaat 152  Q
    ||||| |||||| | |||||||| |  |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||  ||||| ||||| |||||||||    
T  21804639 ttattaaatttcttccaacttaatttttccactaactacaattaataag-atatttaagtaaatgatactaattttacaattgaaattaatacaattaat 21804541  T
Q  153 aatttc 158  Q
     |||||    
T  21804540 catttc 21804535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 51 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 34657675 - 34657626
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataa 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34657675 atttattgaatttcatccaacttaactactccactaactacaattaataa 34657626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 1956106 - 1955991
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattg 135  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||| ||  |||  | ||||| || |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  1956106 cattattatac-cttatttattgaattttatcgaacacagctacttcactaactacaattaataagagtatattagtaaatgatactaattttaccattg 1956008  T
Q  136 atattaacacaattaat 152  Q
    | || || |||||||||    
T  1956007 aaatcaatacaattaat 1955991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 53 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 25418076 - 25417993
Alignment:
Q  53 ttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattga 136  Q
    ||||||||||||| || | ||||||||| ||||||| || ||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||    
T  25418076 ttattgaatttcactcgatttaactacttcattaacaacgattaataaaaatattttactaaataatattaattttaacattga 25417993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 8115129 - 8115068
Alignment:
Q  73 taactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcatt 134  Q
    |||||| |||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8115129 taactaatccactaactaaaattaataagagtattttagtaaatgatactaattttatcatt 8115068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 152
Target Start/End: Original strand, 15582284 - 15582385
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaatta 150  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||| || |||||||||  | |||   ||||||| ||||||||| | |||||| |||||| || ||||||||||    
T  15582284 atttattgaatttcattaaacttaaccacttcactaactacaacaagtaaatgtattttaataaatgatactgattttaccattgaaatcaacacaatta 15582383  T
Q  151 at 152  Q
    ||    
T  15582384 at 15582385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 57 - 157
Target Start/End: Original strand, 17835391 - 17835491
Alignment:
Q  57 tgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaattaataatt 156  Q
    ||||| |||| |||||||||||||  |  |||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||| ||| | || || ||||||||| |||    
T  17835391 tgaatatcatccaacttaactactaaacaaactacaattaataaatgtattttagtaaatgagattaattttattattaaaatcaatacaattaattatt 17835490  T
Q  157 t 157  Q
    |    
T  17835491 t 17835491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 129
Target Start/End: Original strand, 8695037 - 8695124
Alignment:
Q  42 tatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaatttta 129  Q
    |||| ||| |||||| |||||||| |  | ||||| ||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||    
T  8695037 tatattcttatttatagaatttcacttcatttaaccacttcactaactacaattaataagaatgttttagtaaatgctattaatttta 8695124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 98
Target Start/End: Original strand, 15046113 - 15046171
Alignment:
Q  39 tattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaat 98  Q
    |||||||| || |||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  15046113 tattatacccttatttattgaatttcatccaac-taactactccactaactacaattaat 15046171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 51 - 101
Target Start/End: Original strand, 22398414 - 22398464
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataag 101  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  22398414 atttattgaatttcatctaacttaactacttcaataactacaattaataag 22398464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 51 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 16205271 - 16205207
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaat 116  Q
    ||||||||| ||||||  ||||||| || |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16205271 atttattgagtttcatctaacttaaatattccactaactacaattaataa-gatattttagtaaat 16205207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 92 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 4590670 - 4590610
Alignment:
Q  92 aattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaattaat 152  Q
    |||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||  ||||| || ||||||||||||    
T  4590670 aattaatatgaatattttagtaaacgatattaattttactattgaaatcaacacaattaat 4590610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 92 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 4582053 - 4581970
Alignment:
Q  92 aattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcaca 175  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| | || ||||||  |||| |||| | ||| |||||| ||||    
T  4582053 aattaatatgaatattttagtaaatgatattaattttaccattaaaatcaacacagctaattattttcataagaatcgtacaca 4581970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 6255660 - 6255630
Alignment:
Q  106 ttttagtaaatgatattaattttatcattga 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6255660 ttttagtaaatgatattaattttatcattga 6255630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 13206954 - 13206896
Alignment:
Q  42 tatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataa 100  Q
    ||||| || |||||||||||| || |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  13206954 tatacccttatttattgaattacactcaatttaacaactccactaactacaattaataa 13206896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 51 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 28106042 - 28106013
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaactact 80  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28106042 atttattgaatttcattcaacttaactact 28106013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 77 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 6246001 - 6245953
Alignment:
Q  77 tactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaat 125  Q
    |||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  6246001 tactccacaaactataattaataatgatattttagtaaatgatactaat 6245953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 28101418 - 28101370
Alignment:
Q  105 attttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaattaata 153  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||| ||| ||||    
T  28101418 attttagtaaatgatactaattttatcattgaaatcaacataataaata 28101370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 122 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 34639494 - 34639438
Alignment:
Q  122 taattttatcattgatattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaac 178  Q
    |||||| | |||||| ||||||||||||||| |||||| || |||||||| ||||||    
T  34639494 taatttcaccattgaaattaacacaattaattatttccttattaatcgtgtacaaac 34639438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0330 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0330
Description:

Target: scaffold0330; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 51 - 194
Target Start/End: Original strand, 5391 - 5534
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaatta 150  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||| |||    
T  5391 atttattgaatttcatccaacttaactactccactaactaaaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttaccattgaattcaacacagtta 5490  T
Q  151 ataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaaggagtataat 194  Q
    || |||| | |||||||| || |||||| ||||| || ||||||    
T  5491 atcattttcttaataatcatgtacaaaccttaaacgattataat 5534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 74; Significance: 4e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 36 - 173
Target Start/End: Original strand, 105670 - 105807
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattg 135  Q
    ||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | |||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  105670 cattattatacccttatttatcgaatttcattcaacttaactacttcactaactacaattaataagggtgttttagtaaacgctattaattttaccattg 105769  T
Q  136 atattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgca 173  Q
    | || |||||||||||| |||| | |||||||| ||||    
T  105770 aaataaacacaattaatcatttacttaataatcatgca 105807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 51 - 177
Target Start/End: Original strand, 16099 - 16225
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaatta 150  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||| | || ||||||||||    
T  16099 atttattgaatttcatccatcttaactgcttcattaactacaattaataagtgtgttttagtaaatgctattaattttatcattaaaatcaacacaatta 16198  T
Q  151 ataatttccgtaataatcgtgcacaaa 177  Q
    || |||||| ||||||||||| |||||    
T  16199 atcatttccttaataatcgtgaacaaa 16225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 36 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 252933 - 252850
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgata 120  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  252933 cattattatactcttatttattgaatttcattcaacttaactactccaat-actacaattaataacgatattttagtaaatgata 252850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 89 - 184
Target Start/End: Original strand, 39127 - 39222
Alignment:
Q  89 tacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| |||||  | || |||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||| |||||    
T  39127 tacaattaataatgatgttttagtaaatgatactaatttcatcatcaaaatcaacacaattaatcatttccttaataattgtgcaaaaaccttaaa 39222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0182 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0182
Description:

Target: scaffold0182; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 38 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 20480 - 20333
Alignment:
Q  38 ttattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgat 137  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||  ||  |     
T  20480 ttattataccctcatttattgaatttcatccaacttaactacttcactaactgcaattaataagggtattttactaaatgatactaattttacaatcaaa 20381  T
Q  138 attaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaag 185  Q
    || |||||||||||| ||||   |||||||| ||||||| | ||||||    
T  20380 atcaacacaattaatcatttaattaataatcttgcacaacccttaaag 20333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0294 (Bit Score: 62; Significance: 6e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0294
Description:

Target: scaffold0294; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 51 - 184
Target Start/End: Original strand, 17036 - 17169
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaatta 150  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| ||||||||||| | || || |||||| || |||||||| |||||| || ||||||||||    
T  17036 atttattgaatttcattcaacgtaattacgccattaactataattaataagggtgttctaataaatgctactaattttaccattgaaatcaacacaatta 17135  T
Q  151 ataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    || |||| | |||||||| ||||||||| |||||    
T  17136 atcattttcttaataatcatgcacaaaccttaaa 17169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 62; Significance: 6e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 51 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 34133 - 34000
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaatta 150  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||| | ||||||||||||  | ||||||||  |||||  | || |||||||    
T  34133 atttattgaatttcatccaacttaactatttcactaactacaattaataagggtgttttagtaaatgccactaattttactattgaattcaatacaatta 34034  T
Q  151 ataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    || |||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  34033 atcatttccttaataatcgtgcacaaaccttaaa 34000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0328 (Bit Score: 58; Significance: 1e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0328
Description:

Target: scaffold0328; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 36 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 8110 - 7973
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattg 135  Q
    |||||| |||| || |||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||| |||||| |||||||||||| |||      
T  8110 cattataatacccttatttattgaacttcatccaacttaattactccactaactacaattaataagggtgttttggtaaataatattaattttaccatcc 8011  T
Q  136 atattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgca 173  Q
    | || |||| ||||||| |||||| |||||| ||||||    
T  8010 aaatcaacaaaattaatcatttccttaataaccgtgca 7973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1809 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold1809
Description:

Target: scaffold1809; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 39 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 810 - 697
Alignment:
Q  39 tattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgata 138  Q
    |||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||  |||||| |||||||||| ||||| | | |||||||||||| ||||||||||| |||||| |    
T  810 tattatacccttatttattgaatttcatccaatttaaacactccactaactacaatcaataaaggtgttttagtaaatgctattaattttaccattgaaa 711  T
Q  139 ttaacacaattaat 152  Q
    | ||||||||||||    
T  710 tcaacacaattaat 697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0110 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0110
Description:

Target: scaffold0110; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 36 - 171
Target Start/End: Original strand, 1690 - 1825
Alignment:
Q  36 cattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattg 135  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||| || |||||||||||||||| | ||||||||||||| || | ||| ||||||||||| |||||||| |||      
T  1690 cattattatacccttatttattgaatttaatccaacttaactactccactgactacaattaatacgggtgtttaagtaaatgatactaattttaccatca 1789  T
Q  136 atattaacacaattaataatttccgtaataatcgtg 171  Q
    | || |||| ||||||| |||| | |||||| ||||    
T  1790 aaatcaacataattaatcattttcttaataaccgtg 1825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 136151 - 136029
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaatta 150  Q
    ||||||| ||||||||  |||||||||||| || |||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||| || ||||  ||||    
T  136151 atttatttaatttcatcaaacttaactacttcactaactataattaataagggtgttttagtaaatgctattaattttaccattgaaatcaacattatta 136052  T
Q  151 ataatttccgtaataatcgtgca 173  Q
    || ||||   |||||||||||||    
T  136051 atcatttatttaataatcgtgca 136029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 53 - 184
Target Start/End: Original strand, 6741 - 6871
Alignment:
Q  53 ttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaattaat 152  Q
    ||||| ||||||||   ||||||||| || | |||||| ||||||||| || |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  6741 ttattaaatttcatcatacttaactattctagtaacta-aattaataaagacattttagtaaataatactaattttatcattgaaattaaaacaattaat 6839  T
Q  153 aatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
     |||||| ||| ||||  |||||||| |||||    
T  6840 catttccttaaaaatcacgcacaaaccttaaa 6871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1391 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1391
Description:

Target: scaffold1391; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 85 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 1897 - 1797
Alignment:
Q  85 taactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    |||||| ||||||||| | | |||||||||||||||||||||| |  ||  | || |||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||| |||||    
T  1897 taactataattaataaaggtgttttagtaaatgatattaatttgactatcaaaatcaacacaattaattattttcttaataatcgtgcataaactttaaa 1798  T
Q  185 g 185  Q
    |    
T  1797 g 1797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 51 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 14282 - 14233
Alignment:
Q  51 atttattgaatttcattcaacttaactactccattaactacaattaataa 100  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14282 atttattgaatttcatcaaatttaactactccattaactataattaataa 14233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0464 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0464
Description:

Target: scaffold0464; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 104 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 6346 - 6266
Alignment:
Q  104 tattttagtaaatgatattaattttatcattgatattaacacaattaataatttccgtaataatcgtgcacaaacattaaa 184  Q
    |||| |||| ||||||| |||||||||||||   || |||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||| |||||    
T  6346 tattgtagtgaatgatactaattttatcattagaatcaacacaattaatcatttcgttaaaaatcgtgcacaaactttaaa 6266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 83
Target Start/End: Original strand, 76281 - 76325
Alignment:
Q  39 tattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactcca 83  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  76281 tattatacccttatttattgaatttcatctaacttaactactcca 76325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University