View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1616-INSERTION-7 (Length: 300)

Name: NF1616-INSERTION-7
Description: NF1616
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1616-INSERTION-7
NF1616-INSERTION-7
[»] chr3 (95 HSPs)
chr3 (70-300)||(10506165-10506395)
chr3 (70-300)||(42591787-42592017)
chr3 (70-293)||(47669262-47669485)
chr3 (70-300)||(54108119-54108349)
chr3 (70-299)||(26318400-26318629)
chr3 (70-298)||(5900642-5900870)
chr3 (70-300)||(8474063-8474293)
chr3 (70-300)||(32633282-32633512)
chr3 (70-300)||(39241361-39241591)
chr3 (70-300)||(29818180-29818410)
chr3 (70-300)||(44893743-44893973)
chr3 (70-299)||(22201619-22201848)
chr3 (70-300)||(21969632-21969862)
chr3 (70-300)||(21992068-21992298)
chr3 (70-300)||(27801492-27801722)
chr3 (70-299)||(21568749-21568977)
chr3 (92-300)||(51509336-51509543)
chr3 (65-300)||(18464454-18464689)
chr3 (65-300)||(53716293-53716526)
chr3 (79-293)||(1994393-1994606)
chr3 (70-300)||(15986238-15986467)
chr3 (70-300)||(54752166-54752396)
chr3 (64-300)||(46152612-46152846)
chr3 (70-300)||(39664401-39664631)
chr3 (79-298)||(4757713-4757931)
chr3 (65-300)||(24428565-24428800)
chr3 (70-300)||(22151848-22152078)
chr3 (58-300)||(39951348-39951590)
chr3 (65-293)||(16931604-16931832)
chr3 (56-300)||(11256092-11256336)
chr3 (64-300)||(12203768-12204004)
chr3 (53-300)||(41835143-41835390)
chr3 (64-266)||(28986393-28986594)
chr3 (72-300)||(4773248-4773475)
chr3 (79-300)||(47303236-47303454)
chr3 (72-226)||(27801780-27801934)
chr3 (72-226)||(39664189-39664343)
chr3 (73-226)||(21569036-21569189)
chr3 (73-226)||(54107908-54108061)
chr3 (70-212)||(45306835-45306977)
chr3 (72-226)||(47669550-47669704)
chr3 (72-220)||(10505953-10506101)
chr3 (70-220)||(12791473-12791623)
chr3 (72-226)||(22201907-22202061)
chr3 (72-226)||(24428858-24429012)
chr3 (72-226)||(29818468-29818622)
chr3 (72-226)||(26318187-26318341)
chr3 (72-226)||(44894031-44894185)
chr3 (72-226)||(51509124-51509278)
chr3 (72-225)||(15986526-15986679)
chr3 (79-223)||(1994181-1994325)
chr3 (79-223)||(1999340-1999484)
chr3 (79-223)||(5900435-5900579)
chr3 (79-226)||(42592075-42592222)
chr3 (72-226)||(11256394-11256548)
chr3 (72-226)||(12203556-12203710)
chr3 (72-226)||(18464747-18464901)
chr3 (72-226)||(54752454-54752608)
chr3 (89-226)||(8473868-8474005)
chr3 (72-220)||(16931903-16932051)
chr3 (79-226)||(4757506-4757653)
chr3 (76-226)||(4773533-4773683)
chr3 (79-226)||(47303031-47303178)
chr3 (72-223)||(22152139-22152292)
chr3 (72-218)||(45306991-45307137)
chr3 (64-226)||(19883531-19883692)
chr3 (79-226)||(21969920-21970069)
chr3 (79-226)||(21992356-21992505)
chr3 (72-218)||(44317514-44317660)
chr3 (72-226)||(53716584-53716738)
chr3 (102-226)||(41834961-41835085)
chr3 (72-218)||(13866025-13866171)
chr3 (72-218)||(49528154-49528300)
chr3 (80-193)||(7681447-7681561)
chr3 (134-226)||(39241649-39241741)
chr3 (70-184)||(15790682-15790796)
chr3 (80-185)||(7163463-7163568)
chr3 (95-226)||(46152904-46153032)
chr3 (187-300)||(19883359-19883472)
chr3 (64-189)||(15791434-15791557)
chr3 (80-178)||(28985522-28985620)
chr3 (72-182)||(30681752-30681862)
chr3 (78-218)||(20963525-20963664)
chr3 (145-226)||(32633143-32633224)
chr3 (79-186)||(30681041-30681148)
chr3 (91-197)||(44316651-44316756)
chr3 (91-197)||(49529076-49529182)
chr3 (64-153)||(42853243-42853331)
chr3 (70-160)||(43844392-43844482)
chr3 (91-197)||(13866920-13867026)
chr3 (172-226)||(28986265-28986319)
chr3 (91-148)||(43839984-43840041)
chr3 (122-226)||(39951648-39951748)
chr3 (91-212)||(8327680-8327801)
chr3 (64-140)||(40639430-40639506)
[»] chr5 (40 HSPs)
chr5 (70-300)||(36440417-36440647)
chr5 (65-291)||(9989321-9989547)
chr5 (70-299)||(2182946-2183175)
chr5 (52-293)||(32288301-32288541)
chr5 (70-300)||(37424479-37424711)
chr5 (70-300)||(24040302-24040534)
chr5 (79-300)||(35569997-35570218)
chr5 (72-300)||(38958941-38959168)
chr5 (79-293)||(27185886-27186099)
chr5 (70-300)||(34264565-34264799)
chr5 (63-262)||(11315955-11316153)
chr5 (70-299)||(25567206-25567435)
chr5 (72-226)||(25182944-25183098)
chr5 (72-226)||(35569780-35569934)
chr5 (72-226)||(39325417-39325571)
chr5 (70-223)||(27186167-27186320)
chr5 (70-229)||(16860306-16860465)
chr5 (72-226)||(24040090-24040244)
chr5 (72-226)||(38958729-38958883)
chr5 (72-223)||(37424267-37424418)
chr5 (70-236)||(39325636-39325802)
chr5 (89-226)||(9989614-9989751)
chr5 (95-226)||(11316245-11316376)
chr5 (72-226)||(36440205-36440359)
chr5 (72-226)||(32288083-32288236)
chr5 (89-226)||(2183234-2183371)
chr5 (72-218)||(19184602-19184748)
chr5 (78-213)||(1140077-1140204)
chr5 (89-224)||(29198974-29199109)
chr5 (72-189)||(31756630-31756747)
chr5 (101-184)||(34264396-34264479)
chr5 (8-66)||(37173727-37173785)
chr5 (70-197)||(19185504-19185631)
chr5 (232-300)||(16860637-16860705)
chr5 (70-142)||(33817659-33817731)
chr5 (232-300)||(16860520-16860588)
chr5 (72-136)||(19128434-19128498)
chr5 (232-300)||(29199169-29199237)
chr5 (70-160)||(2597377-2597467)
chr5 (196-226)||(34264477-34264507)
[»] chr4 (85 HSPs)
chr4 (57-300)||(19088558-19088801)
chr4 (70-298)||(46849888-46850116)
chr4 (70-299)||(30683746-30683975)
chr4 (70-298)||(8591972-8592200)
chr4 (70-299)||(15477863-15478092)
chr4 (64-300)||(42855556-42855792)
chr4 (65-300)||(44957387-44957622)
chr4 (65-300)||(44991495-44991730)
chr4 (65-290)||(16038021-16038246)
chr4 (70-299)||(53751120-53751349)
chr4 (65-300)||(21763398-21763633)
chr4 (70-297)||(53259358-53259585)
chr4 (70-300)||(14985334-14985564)
chr4 (72-298)||(38339497-38339723)
chr4 (65-300)||(53995151-53995387)
chr4 (64-298)||(12817803-12818037)
chr4 (65-299)||(24898187-24898421)
chr4 (65-298)||(623898-624131)
chr4 (64-300)||(6711960-6712196)
chr4 (70-298)||(25182031-25182259)
chr4 (70-298)||(39448707-39448935)
chr4 (80-300)||(41752033-41752253)
chr4 (65-300)||(1433488-1433723)
chr4 (70-293)||(52557311-52557534)
chr4 (72-300)||(50768826-50769054)
chr4 (56-300)||(23756017-23756263)
chr4 (70-300)||(43734503-43734733)
chr4 (65-299)||(50508675-50508909)
chr4 (70-293)||(37206651-37206874)
chr4 (65-300)||(41878076-41878310)
chr4 (70-300)||(33091670-33091900)
chr4 (65-293)||(36122657-36122884)
chr4 (99-300)||(19508630-19508831)
chr4 (103-293)||(43566602-43566792)
chr4 (72-225)||(53750907-53751060)
chr4 (72-226)||(43566383-43566537)
chr4 (72-226)||(44991284-44991438)
chr4 (72-226)||(46849674-46849828)
chr4 (72-226)||(38339783-38339937)
chr4 (72-226)||(42855344-42855498)
chr4 (72-226)||(43734291-43734445)
chr4 (74-226)||(12818097-12818249)
chr4 (79-226)||(6505549-6505695)
chr4 (72-226)||(14985622-14985776)
chr4 (72-226)||(52557092-52557246)
chr4 (72-229)||(50769109-50769266)
chr4 (79-223)||(8592263-8592407)
chr4 (79-223)||(16037806-16037950)
chr4 (79-226)||(24898480-24898627)
chr4 (79-210)||(25269307-25269438)
chr4 (72-226)||(1433276-1433430)
chr4 (72-226)||(15477650-15477804)
chr4 (72-226)||(19088346-19088500)
chr4 (70-226)||(20888146-20888302)
chr4 (72-226)||(39448493-39448647)
chr4 (78-225)||(41877871-41878017)
chr4 (72-226)||(8398036-8398190)
chr4 (72-226)||(53994939-53995093)
chr4 (78-226)||(19508423-19508572)
chr4 (65-213)||(44125774-44125922)
chr4 (72-226)||(30683531-30683686)
chr4 (72-226)||(6712254-6712406)
chr4 (72-226)||(36122438-36122592)
chr4 (80-226)||(37206440-37206586)
chr4 (70-211)||(55022287-55022427)
chr4 (79-223)||(25181824-25181968)
chr4 (72-223)||(623684-623835)
chr4 (72-226)||(21763185-21763340)
chr4 (91-226)||(41751841-41751975)
chr4 (72-226)||(33091458-33091612)
chr4 (116-226)||(53259187-53259297)
chr4 (65-212)||(47602941-47603088)
chr4 (72-222)||(23755423-23755573)
chr4 (72-206)||(44957668-44957802)
chr4 (122-225)||(50508512-50508615)
chr4 (64-181)||(4513252-4513369)
chr4 (89-222)||(49135928-49136065)
chr4 (72-200)||(44125627-44125755)
chr4 (64-168)||(47603710-47603814)
chr4 (70-162)||(52692027-52692119)
chr4 (70-218)||(52692740-52692886)
chr4 (72-153)||(55022424-55022504)
chr4 (228-300)||(23755635-23755707)
chr4 (231-300)||(6505753-6505822)
chr4 (70-155)||(31214165-31214250)
[»] chr8 (58 HSPs)
chr8 (70-300)||(45276813-45277043)
chr8 (64-300)||(33295901-33296137)
chr8 (70-297)||(15048402-15048629)
chr8 (70-300)||(27473288-27473518)
chr8 (57-300)||(7949402-7949645)
chr8 (70-300)||(7535050-7535280)
chr8 (65-300)||(45077420-45077655)
chr8 (80-300)||(38588600-38588820)
chr8 (91-300)||(27669440-27669649)
chr8 (72-300)||(1651789-1652016)
chr8 (72-300)||(1740165-1740392)
chr8 (70-298)||(5435119-5435347)
chr8 (70-300)||(1432134-1432364)
chr8 (70-300)||(15871838-15872068)
chr8 (72-300)||(1646724-1646951)
chr8 (70-300)||(44594818-44595047)
chr8 (70-298)||(5152753-5152980)
chr8 (70-293)||(11173858-11174081)
chr8 (70-300)||(1869937-1870168)
chr8 (70-291)||(37569541-37569762)
chr8 (70-226)||(33819788-33819944)
chr8 (72-226)||(1646506-1646660)
chr8 (72-226)||(1739953-1740107)
chr8 (72-226)||(15048690-15048844)
chr8 (89-300)||(40048089-40048288)
chr8 (70-226)||(40659986-40660142)
chr8 (72-226)||(5434905-5435059)
chr8 (72-226)||(45276602-45276756)
chr8 (73-226)||(37569320-37569473)
chr8 (72-224)||(40660179-40660331)
chr8 (72-226)||(5152540-5152693)
chr8 (72-226)||(15871626-15871780)
chr8 (72-226)||(34470835-34470989)
chr8 (72-226)||(38588878-38589032)
chr8 (79-226)||(1870226-1870373)
chr8 (72-226)||(11707755-11707909)
chr8 (72-226)||(27473077-27473230)
chr8 (135-258)||(18298488-18298611)
chr8 (64-218)||(22763232-22763386)
chr8 (72-226)||(27669712-27669864)
chr8 (72-226)||(40048345-40048499)
chr8 (67-226)||(7534842-7534992)
chr8 (65-153)||(11920136-11920224)
chr8 (70-168)||(22762516-22762614)
chr8 (72-189)||(24666006-24666123)
chr8 (72-226)||(45077226-45077361)
chr8 (78-193)||(33295747-33295862)
chr8 (79-226)||(44594613-44594760)
chr8 (200-300)||(11707967-11708067)
chr8 (237-298)||(34470714-34470775)
chr8 (72-142)||(12643891-12643961)
chr8 (79-149)||(24652835-24652905)
chr8 (234-300)||(24659413-24659479)
chr8 (89-155)||(33819975-33820041)
chr8 (78-189)||(15740624-15740735)
chr8 (72-142)||(15741607-15741677)
chr8 (116-189)||(24652901-24652974)
chr8 (70-148)||(29769366-29769444)
[»] chr2 (52 HSPs)
chr2 (70-300)||(34735560-34735790)
chr2 (70-298)||(15744460-15744688)
chr2 (65-299)||(13192986-13193220)
chr2 (70-293)||(7469169-7469392)
chr2 (70-300)||(26181917-26182147)
chr2 (72-300)||(29472247-29472475)
chr2 (64-300)||(8174102-8174338)
chr2 (70-300)||(19815921-19816151)
chr2 (70-300)||(38332707-38332937)
chr2 (64-292)||(24372192-24372420)
chr2 (70-300)||(15405973-15406202)
chr2 (79-298)||(19847538-19847756)
chr2 (72-300)||(24138723-24138952)
chr2 (80-293)||(16305037-16305251)
chr2 (79-298)||(7496199-7496417)
chr2 (91-300)||(2148103-2148312)
chr2 (116-298)||(12860586-12860768)
chr2 (70-300)||(41474085-41474315)
chr2 (70-298)||(10991854-10992082)
chr2 (70-290)||(36713591-36713809)
chr2 (72-245)||(33470195-33470368)
chr2 (72-226)||(41474373-41474527)
chr2 (62-229)||(24138063-24138230)
chr2 (79-223)||(7495992-7496136)
chr2 (72-223)||(38332974-38333125)
chr2 (79-223)||(12860392-12860536)
chr2 (79-226)||(15405768-15405915)
chr2 (72-226)||(8173890-8174044)
chr2 (72-226)||(24371972-24372126)
chr2 (76-226)||(34735352-34735502)
chr2 (79-226)||(19815716-19815863)
chr2 (72-226)||(13193279-13193433)
chr2 (72-229)||(26181705-26181862)
chr2 (97-226)||(42834452-42834581)
chr2 (78-226)||(29472533-29472681)
chr2 (79-223)||(30898595-30898739)
chr2 (72-226)||(2147890-2148045)
chr2 (72-226)||(16305316-16305470)
chr2 (81-226)||(17052345-17052490)
chr2 (54-177)||(17032580-17032703)
chr2 (116-226)||(10992142-10992252)
chr2 (54-177)||(17050916-17051039)
chr2 (72-196)||(8444827-8444951)
chr2 (77-226)||(36713876-36714025)
chr2 (66-218)||(8962359-8962510)
chr2 (174-300)||(17052164-17052287)
chr2 (79-223)||(15744751-15744885)
chr2 (70-179)||(8445127-8445236)
chr2 (72-225)||(7469458-7469603)
chr2 (70-168)||(8963166-8963264)
chr2 (70-197)||(23992162-23992289)
chr2 (91-218)||(23991290-23991417)
[»] chr1 (78 HSPs)
chr1 (64-298)||(12481278-12481512)
chr1 (70-300)||(49140360-49140589)
chr1 (64-299)||(37304025-37304260)
chr1 (70-299)||(6798025-6798254)
chr1 (70-300)||(35612299-35612529)
chr1 (70-300)||(45052906-45053136)
chr1 (70-299)||(16023900-16024129)
chr1 (72-300)||(20306007-20306235)
chr1 (70-298)||(37576184-37576412)
chr1 (70-300)||(1762891-1763121)
chr1 (70-293)||(23476565-23476788)
chr1 (71-293)||(4330061-4330283)
chr1 (89-293)||(12127277-12127484)
chr1 (72-293)||(38127714-38127935)
chr1 (64-300)||(9006408-9006643)
chr1 (64-299)||(2064429-2064664)
chr1 (70-300)||(3089345-3089575)
chr1 (70-300)||(27547886-27548116)
chr1 (70-293)||(8762623-8762846)
chr1 (70-293)||(25995787-25996010)
chr1 (57-293)||(49643895-49644130)
chr1 (116-298)||(31703663-31703845)
chr1 (70-300)||(37284945-37285174)
chr1 (70-300)||(37585910-37586140)
chr1 (70-262)||(45843372-45843564)
chr1 (79-226)||(49643683-49643830)
chr1 (126-300)||(27400641-27400815)
chr1 (72-226)||(44322951-44323105)
chr1 (70-226)||(4696885-4697041)
chr1 (72-226)||(27547674-27547828)
chr1 (72-229)||(35612087-35612244)
chr1 (65-226)||(37304319-37304480)
chr1 (79-223)||(12481071-12481215)
chr1 (79-226)||(16024188-16024335)
chr1 (72-226)||(9006196-9006350)
chr1 (72-226)||(37576472-37576626)
chr1 (72-226)||(49140148-49140302)
chr1 (72-223)||(38000494-38000645)
chr1 (72-226)||(12127062-12127216)
chr1 (79-226)||(1762686-1762833)
chr1 (89-262)||(39486448-39486620)
chr1 (78-226)||(26707207-26707355)
chr1 (65-229)||(26723089-26723253)
chr1 (79-226)||(23476353-23476500)
chr1 (64-226)||(39486199-39486361)
chr1 (72-226)||(45052695-45052848)
chr1 (79-223)||(31703907-31704051)
chr1 (72-226)||(8760277-8760431)
chr1 (72-226)||(20306293-20306447)
chr1 (79-225)||(37585705-37585851)
chr1 (79-225)||(37284740-37284886)
chr1 (64-206)||(23598069-23598213)
chr1 (79-226)||(6797819-6797966)
chr1 (64-189)||(46593559-46593683)
chr1 (65-189)||(5537132-5537256)
chr1 (64-189)||(34967050-34967175)
chr1 (70-218)||(10831134-10831281)
chr1 (68-189)||(34966304-34966425)
chr1 (70-183)||(37467554-37467667)
chr1 (70-153)||(13109191-13109274)
chr1 (222-300)||(26707413-26707491)
chr1 (70-168)||(10831935-10832033)
chr1 (79-189)||(28884751-28884861)
chr1 (72-189)||(32047748-32047865)
chr1 (70-215)||(46592815-46592959)
chr1 (70-189)||(5536401-5536520)
chr1 (70-153)||(13183769-13183852)
chr1 (72-189)||(28884022-28884139)
chr1 (223-292)||(44322816-44322885)
chr1 (228-300)||(4697099-4697171)
chr1 (94-153)||(4697163-4697222)
chr1 (96-210)||(37466831-37466943)
chr1 (172-226)||(25996075-25996129)
chr1 (79-189)||(32048510-32048620)
chr1 (116-189)||(49837420-49837493)
chr1 (72-140)||(46289329-46289397)
chr1 (70-147)||(49838756-49838832)
chr1 (173-216)||(46015766-46015809)
[»] scaffold0037 (3 HSPs)
scaffold0037 (80-300)||(45769-45989)
scaffold0037 (72-226)||(56427-56581)
scaffold0037 (72-226)||(63552-63706)
[»] chr6 (68 HSPs)
chr6 (70-298)||(26600360-26600588)
chr6 (70-300)||(5310829-5311059)
chr6 (56-300)||(34890633-34890877)
chr6 (65-300)||(32993232-32993467)
chr6 (64-300)||(2516999-2517235)
chr6 (70-300)||(5639390-5639620)
chr6 (70-300)||(5938030-5938260)
chr6 (70-300)||(24744332-24744561)
chr6 (64-300)||(18052953-18053189)
chr6 (70-298)||(31247119-31247347)
chr6 (70-298)||(31237749-31237977)
chr6 (64-291)||(21856781-21857008)
chr6 (70-300)||(34994597-34994827)
chr6 (70-300)||(9046089-9046319)
chr6 (72-293)||(6137602-6137822)
chr6 (89-300)||(7269973-7270186)
chr6 (79-293)||(21540201-21540415)
chr6 (79-298)||(6236140-6236359)
chr6 (110-300)||(7270672-7270862)
chr6 (70-300)||(32753180-32753406)
chr6 (72-252)||(6532197-6532377)
chr6 (116-298)||(3423389-3423571)
chr6 (64-226)||(6235918-6236080)
chr6 (72-226)||(32753464-32753618)
chr6 (142-298)||(25176876-25177032)
chr6 (120-300)||(26957015-26957195)
chr6 (78-226)||(34890935-34891083)
chr6 (80-226)||(3423183-3423329)
chr6 (72-226)||(5937818-5937972)
chr6 (72-222)||(10412796-10412946)
chr6 (72-226)||(34994385-34994539)
chr6 (72-226)||(35167495-35167649)
chr6 (79-223)||(15932850-15932994)
chr6 (72-226)||(9046377-9046531)
chr6 (78-226)||(7270920-7271068)
chr6 (79-223)||(21856567-21856711)
chr6 (79-223)||(25176675-25176819)
chr6 (79-226)||(978427-978574)
chr6 (79-226)||(26600638-26600785)
chr6 (72-226)||(6137384-6137537)
chr6 (72-220)||(26957258-26957406)
chr6 (72-226)||(2517293-2517447)
chr6 (78-223)||(18053247-18053392)
chr6 (78-226)||(5311117-5311265)
chr6 (72-226)||(31238037-31238191)
chr6 (72-225)||(32993020-32993173)
chr6 (72-226)||(24744612-24744765)
chr6 (72-226)||(31247407-31247561)
chr6 (172-300)||(35167707-35167837)
chr6 (72-218)||(17244669-17244815)
chr6 (72-226)||(7270244-7270398)
chr6 (72-202)||(14276404-14276534)
chr6 (70-218)||(34517991-34518139)
chr6 (70-184)||(7438807-7438921)
chr6 (70-189)||(29261279-29261398)
chr6 (72-218)||(6228735-6228880)
chr6 (70-168)||(34517275-34517373)
chr6 (120-211)||(3035933-3036025)
chr6 (70-161)||(15932733-15932824)
chr6 (70-215)||(15286348-15286492)
chr6 (70-189)||(29260534-29260652)
chr6 (70-146)||(25180219-25180295)
chr6 (59-139)||(35167833-35167913)
chr6 (80-185)||(27829297-27829402)
chr6 (78-197)||(6229643-6229761)
chr6 (95-216)||(17245561-17245682)
chr6 (70-170)||(34251557-34251655)
chr6 (188-226)||(5639294-5639332)
[»] chr7 (75 HSPs)
chr7 (70-300)||(41191902-41192132)
chr7 (70-300)||(48626280-48626510)
chr7 (70-300)||(33716591-33716821)
chr7 (65-298)||(41453224-41453457)
chr7 (70-293)||(7579096-7579319)
chr7 (65-300)||(10526309-10526543)
chr7 (70-300)||(44332736-44332966)
chr7 (70-291)||(6356768-6356989)
chr7 (65-298)||(8542497-8542730)
chr7 (78-300)||(17359193-17359414)
chr7 (70-300)||(19681712-19681942)
chr7 (70-293)||(8937073-8937296)
chr7 (70-300)||(21391407-21391637)
chr7 (70-300)||(31638160-31638390)
chr7 (89-300)||(28297841-28298052)
chr7 (70-300)||(34037128-34037358)
chr7 (70-298)||(28286336-28286564)
chr7 (70-300)||(35146915-35147136)
chr7 (70-300)||(41751653-41751883)
chr7 (70-270)||(1114057-1114257)
chr7 (72-300)||(43247420-43247648)
chr7 (72-300)||(6356291-6356518)
chr7 (89-300)||(36423391-36423602)
chr7 (72-226)||(35146704-35146858)
chr7 (72-226)||(6356576-6356730)
chr7 (72-226)||(10526601-10526755)
chr7 (54-226)||(7578859-7579031)
chr7 (72-226)||(8936854-8937008)
chr7 (72-226)||(21391195-21391349)
chr7 (72-226)||(28286122-28286276)
chr7 (72-226)||(48626068-48626222)
chr7 (72-225)||(31075485-31075638)
chr7 (70-234)||(4931556-4931720)
chr7 (89-226)||(36423660-36423797)
chr7 (79-223)||(41453017-41453161)
chr7 (79-223)||(1114339-1114483)
chr7 (78-242)||(7909297-7909461)
chr7 (79-226)||(6357056-6357203)
chr7 (72-223)||(17363532-17363681)
chr7 (91-247)||(27738935-27739090)
chr7 (72-223)||(17749940-17750091)
chr7 (72-226)||(19681500-19681654)
chr7 (72-222)||(31637948-31638098)
chr7 (144-300)||(40673224-40673378)
chr7 (89-226)||(41191704-41191841)
chr7 (79-223)||(8542793-8542936)
chr7 (89-223)||(7909460-7909594)
chr7 (70-200)||(16867710-16867840)
chr7 (89-226)||(41751941-41752078)
chr7 (89-226)||(28298110-28298247)
chr7 (59-195)||(4155590-4155726)
chr7 (72-190)||(36673980-36674098)
chr7 (70-212)||(41891969-41892111)
chr7 (70-218)||(8416488-8416635)
chr7 (72-189)||(29277671-29277788)
chr7 (95-226)||(33716875-33717005)
chr7 (70-189)||(36282789-36282908)
chr7 (70-168)||(8417285-8417383)
chr7 (89-210)||(36283512-36283634)
chr7 (100-189)||(32946669-32946758)
chr7 (70-153)||(36674095-36674176)
chr7 (164-223)||(17359479-17359538)
chr7 (80-226)||(40673024-40673166)
chr7 (91-218)||(28264587-28264714)
chr7 (79-153)||(29276887-29276961)
chr7 (64-127)||(36423790-36423853)
chr7 (70-189)||(41893403-41893522)
chr7 (91-197)||(28263520-28263626)
chr7 (268-300)||(17750152-17750184)
chr7 (70-146)||(36507116-36507192)
chr7 (164-244)||(38447603-38447682)
chr7 (72-161)||(38447691-38447776)
chr7 (78-197)||(4156509-4156628)
chr7 (64-142)||(38677053-38677131)
chr7 (116-168)||(46540017-46540069)
[»] scaffold0134 (2 HSPs)
scaffold0134 (64-298)||(14354-14588)
scaffold0134 (72-226)||(14140-14294)
[»] scaffold0340 (2 HSPs)
scaffold0340 (59-300)||(18265-18506)
scaffold0340 (79-226)||(18564-18711)
[»] scaffold0182 (2 HSPs)
scaffold0182 (70-298)||(19711-19939)
scaffold0182 (79-223)||(20002-20146)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (72-298)||(72767-72992)
scaffold0029 (79-223)||(73055-73199)
[»] scaffold0220 (2 HSPs)
scaffold0220 (79-298)||(20763-20981)
scaffold0220 (179-223)||(21044-21088)
[»] scaffold0019 (2 HSPs)
scaffold0019 (70-300)||(50693-50924)
scaffold0019 (72-226)||(50481-50635)
[»] scaffold0003 (5 HSPs)
scaffold0003 (79-300)||(349085-349306)
scaffold0003 (78-226)||(349364-349511)
scaffold0003 (79-226)||(113657-113804)
scaffold0003 (79-196)||(113405-113522)
scaffold0003 (220-300)||(113519-113599)
[»] scaffold0115 (2 HSPs)
scaffold0115 (72-300)||(21517-21744)
scaffold0115 (72-219)||(22451-22598)
[»] scaffold0221 (2 HSPs)
scaffold0221 (64-300)||(8426-8661)
scaffold0221 (79-224)||(8721-8866)
[»] scaffold0186 (2 HSPs)
scaffold0186 (65-298)||(24160-24393)
scaffold0186 (79-223)||(24456-24600)
[»] scaffold0246 (2 HSPs)
scaffold0246 (116-300)||(6047-6228)
scaffold0246 (91-226)||(6286-6420)
[»] scaffold0032 (3 HSPs)
scaffold0032 (72-220)||(81863-82011)
scaffold0032 (144-300)||(82075-82231)
scaffold0032 (57-170)||(90785-90898)
[»] scaffold0072 (2 HSPs)
scaffold0072 (65-300)||(15451-15681)
scaffold0072 (79-226)||(15739-15886)
[»] scaffold0260 (1 HSPs)
scaffold0260 (106-226)||(14231-14350)
[»] scaffold0225 (2 HSPs)
scaffold0225 (78-218)||(9793-9932)
scaffold0225 (72-214)||(10860-11001)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (116-224)||(147133-147241)
scaffold0001 (89-214)||(144042-144166)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 95)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 70 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 10506395 - 10506165
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10506395 taaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 10506296  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcc 269  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10506295 acatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgcc 10506196  T
Q  270 ttgttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10506195 ttgttaaggtattatgattaaatagtgactg 10506165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 70 - 300
Target Start/End: Original strand, 42591787 - 42592017
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42591787 taaattacctttttggtcctctaactatttaatcggtatcggatttgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcttctaagtttctcactgttact 42591886  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcc 269  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42591887 acatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcc 42591986  T
Q  270 ttgttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42591987 ttgttaaggtattatgattaaatagtgactg 42592017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 70 - 293
Target Start/End: Original strand, 47669262 - 47669485
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  47669262 taaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattaatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttact 47669361  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcc 269  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47669362 acatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcc 47669461  T
Q  270 ttgttaaggtattatgattaaata 293  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
T  47669462 ttgttaagatattatgattaaata 47669485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 70 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 54108349 - 54108119
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  54108349 taaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcagtgttatt 54108250  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcc 269  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  54108249 acatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgtc 54108150  T
Q  270 ttgttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  54108149 ttgttaaggtattatgattaaatagtgactg 54108119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 70 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 26318629 - 26318400
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  26318629 taaattacctttttggtcatctaactatttaattggtatcggattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctgaccgttact 26318530  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcc 269  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  26318529 acatttagtcttttctgttagttttattcaaataaacgttagtgtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattct 26318430  T
Q  270 ttgttaaggtattatgattaaataatgact 299  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26318429 ttgttaaggtattatgattaaatagtgact 26318400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 70 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 5900870 - 5900642
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    |||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5900870 taaattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttact 5900771  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcc 269  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  5900770 acatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagcatcattttggtcctattcc 5900671  T
Q  270 ttgttaaggtattatgattaaataatgac 298  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5900670 ttgttaaggtattatgattaaatagtgac 5900642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 70 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 8474293 - 8474063
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||    
T  8474293 taaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcgaattagtcctctaattaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatgaccgttact 8474194  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcc 269  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  8474193 acatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagtgtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattct 8474094  T
Q  270 ttgttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8474093 ttgttaaggtattatgattaaatagtgactg 8474063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 70 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 32633512 - 32633282
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32633512 taaattatctttttggtcctctaactatttaattgttatcggattggtcctttaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttact 32633413  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcc 269  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  32633412 acatttagtcctttatgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatttc 32633313  T
Q  270 ttgttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  32633312 ttgttaagatattatgattaaatagtgactg 32633282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 70 - 300
Target Start/End: Original strand, 39241361 - 39241591
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39241361 taaattacatttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 39241460  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcc 269  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |    
T  39241461 acatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttaatgtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgtc 39241560  T
Q  270 ttgttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39241561 ttgttaaggtattatgattaaatagtgactg 39241591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 70 - 300
Target Start/End: Original strand, 29818180 - 29818410
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29818180 taaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattagtcctctaaataaaaattgatttatttcgatcctctaagtttctcactgttact 29818279  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcc 269  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  29818280 acatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatatggatcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgtt 29818379  T
Q  270 ttgttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29818380 ttattaaggtattatgattaaatagtgactg 29818410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 70 - 300
Target Start/End: Original strand, 44893743 - 44893973
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44893743 taaattatctttttggttctctaactatttaattggtatcggattggtcttctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttact 44893842  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcc 269  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  44893843 acatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgtc 44893942  T
Q  270 ttgttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  44893943 ttgttaagatattatgatcaaatagtgactg 44893973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 70 - 299
Target Start/End: Original strand, 22201619 - 22201848
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  22201619 taaattacatttttggtcctctaactatttaattggtatcggattgatcctctaaataaaaattgatttatttctgtcctctaagtttctcaccgttact 22201718  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcc 269  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22201719 acatttagtcctttctgttaggtttattcaaataaacgttaaggtttgtgttatgtgagtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgcc 22201818  T
Q  270 ttgttaaggtattatgattaaataatgact 299  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22201819 ttgttaaggtattatgattaaatagtgact 22201848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 70 - 300
Target Start/End: Original strand, 21969632 - 21969862
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  21969632 taaattacctttttggtcctctaactatttaattggtaacagattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcttctaagtttctcaccgttact 21969731  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcc 269  Q
    | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  21969732 acatttagtcctttttgttacttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcgttttggtcttattcc 21969831  T
Q  270 ttgttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  21969832 ttgttaaggtattatgtttaaatagtgactg 21969862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 70 - 300
Target Start/End: Original strand, 21992068 - 21992298
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  21992068 taaattacctttttggtcctctaactatttaattggtaacagattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcttctaagtttctcaccgttact 21992167  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcc 269  Q
    | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  21992168 acatttagtcctttttgttacttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcgttttggtcttattcc 21992267  T
Q  270 ttgttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  21992268 ttgttaaggtattatgtttaaatagtgactg 21992298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 70 - 300
Target Start/End: Original strand, 27801492 - 27801722
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27801492 taaattatatttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 27801591  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcc 269  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||    
T  27801592 agatttattcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttctgttatgtggatcctctaactttatttattaatatcattttggttctatgcc 27801691  T
Q  270 ttgttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  27801692 ttgttaaagtattatgattaaatagtgactg 27801722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 70 - 299
Target Start/End: Original strand, 21568749 - 21568977
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21568749 taaattatctttttgatcctctaactatttaattggtatcggattgatcctctaattaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttact 21568848  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcc 269  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21568849 acatttagtcatttctgttagttttattcaaataaatgttagggtttgtgttatgtg-gtcctctaaccttatttattagtatcattttggtcatatgcc 21568947  T
Q  270 ttgttaaggtattatgattaaataatgact 299  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  21568948 ttgttaagatattatgattaaatagtgact 21568977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 92 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 51509543 - 51509336
Alignment:
Q  92 aactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagtcctttctgttagt 191  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  51509543 aactatttaattggtattggattagtc-tctaactaaaaattgatttatttcggtcatctaagtttctcactgttactacatttagtcttttctgttagt 51509445  T
Q  192 tttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattccttgttaaggtattatgattaaa 291  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51509444 tttattcaaataaatgttagggtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattccttgttaaggtattatgattaaa 51509345  T
Q  292 taatgactg 300  Q
    || ||||||    
T  51509344 tagtgactg 51509336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 65 - 300
Target Start/End: Original strand, 18464454 - 18464689
Alignment:
Q  65 tagggtaaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 164  Q
    |||| |||||||  |||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18464454 taggctaaattacatttttgctcctctaactatttaattggtattggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 18464553  T
Q  165 ttactatatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcat 264  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18464554 ttactacatttagtcctttatgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtaggtcctatagctttatttattagtatcattttggtcat 18464653  T
Q  265 attccttgttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
    || | |||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  18464654 atgcattgttaaggtattatggttaaatagtgactg 18464689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 65 - 300
Target Start/End: Original strand, 53716293 - 53716526
Alignment:
Q  65 tagggtaaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 164  Q
    |||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  53716293 taggctaaatta-cttttttgtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg 53716391  T
Q  165 ttactatatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcat 264  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  53716392 ttactatatttggtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttacgtg-ggcctctaactttatttattagtatcattttggtcct 53716490  T
Q  265 attccttgttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  53716491 atgtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactg 53716526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 79 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 1994606 - 1994393
Alignment:
Q  79 tttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagt 178  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1994606 tttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagt 1994507  T
Q  179 cctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattccttgttaagg 278  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |    
T  1994506 cctttctgttatttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaa-g 1994408  T
Q  279 tattatgattaaata 293  Q
     ||||||||||||||    
T  1994407 aattatgattaaata 1994393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 70 - 300
Target Start/End: Original strand, 15986238 - 15986467
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15986238 taaattatctttttgatcctctaactatttaattggtatcggattagtcccctagctaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttact 15986337  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcc 269  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  15986338 gcatttagtcctttctgttagttttattcaaataaatgttagagtttgtgttatgtgggttctctaactttatttattagtatcattttggtcctatt-c 15986436  T
Q  270 ttgttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15986437 gtgttaaggtattatgattaaatagtgactg 15986467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 70 - 300
Target Start/End: Original strand, 54752166 - 54752396
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  54752166 taaattatctttttggtcctctaactatttaattggtataagattggtcctgtaactaaaaattgatttatttcggtcatataagtttctcaccgttact 54752265  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcc 269  Q
    | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  54752266 acatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacattatggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattct 54752365  T
Q  270 ttgttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  54752366 ttgttaaggtattatgattaaatagtgactg 54752396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 64 - 300
Target Start/End: Original strand, 46152612 - 46152846
Alignment:
Q  64 ttagggtaaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcact 163  Q
    ||||| |||||||  | ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  46152612 ttaggctaaattacatctttggtcctctaactatttaattggcatcgaattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcacc 46152711  T
Q  164 gttactatatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtca 263  Q
     | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46152712 atcactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgtta--tctggcatctaactttatttattagtatcattttggtca 46152809  T
Q  264 tattccttgttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  46152810 tattccttgttaaggtattatgattaaatagtgactg 46152846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 70 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 39664631 - 39664401
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39664631 taaattacatttttggtcctctaactatttaattggtatcagattgatcctctaactaaaaattaatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttact 39664532  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcc 269  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||    
T  39664531 acatttagtcttttctgttagttttattcaaataaatgttagagtttctgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggttctatgcc 39664432  T
Q  270 ttgttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39664431 ttgttaaggtattatgattaaataatgactg 39664401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 79 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 4757931 - 4757713
Alignment:
Q  79 tttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagt 178  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  4757931 tttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactacatttagt 4757832  T
Q  179 cctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattccttgttaagg 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| ||| |    
T  4757831 cctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagcatcattttggttctattccttgataa-g 4757733  T
Q  279 tattatgattaaataatgac 298  Q
     |||||||| ||||| ||||    
T  4757732 aattatgatcaaatagtgac 4757713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 65 - 300
Target Start/End: Original strand, 24428565 - 24428800
Alignment:
Q  65 tagggtaaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 164  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24428565 taggctaaattatctttttggtcctctaactattcaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaagtttctcactg 24428664  T
Q  165 ttactatatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcat 264  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| || |    
T  24428665 ttactacatttagtcatttctattagttttattcaaataaacgttgggatttgtgttatgtggatcctctaacttaatttattagtatcattttgctcct 24428764  T
Q  265 attccttgttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24428765 atgccttcttaaggtattatgattaaatagtgactg 24428800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 70 - 300
Target Start/End: Original strand, 22151848 - 22152078
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    |||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  22151848 taaattacatttttggtcctataactatttaattggtaacagattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggttttctaagtttctcaccgttact 22151947  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcc 269  Q
    | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  22151948 acatttagtcctttttgttaattttattcaaataaacgatagagtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctattca 22152047  T
Q  270 ttgttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22152048 ttgttaaggtattatgattaaatagtgactg 22152078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 58 - 300
Target Start/End: Original strand, 39951348 - 39951590
Alignment:
Q  58 taaaagttagggtaaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagttt 157  Q
    ||||| ||||| ||||||| | ||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  39951348 taaaacttaggctaaattacccttttgatcatctgactatttaattggtatcggattagtcctctaattaaaaattgatttatttcgatcctttaagttt 39951447  T
Q  158 ctcactgttactatatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattt 257  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39951448 ctcatcgttactatatttagttctttatgttagttttattcaaataaatgttagagtttgtgttatgtgggtcctttaactttatttattagtatcattt 39951547  T
Q  258 tggtcatattccttgttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  39951548 tggtcatatgccttgttaagatattatgattaaatagtgactg 39951590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 65 - 293
Target Start/End: Original strand, 16931604 - 16931832
Alignment:
Q  65 tagggtaaattatctttttggtcttctaactatttaa-ttggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcact 163  Q
    |||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16931604 taggctaaattacatttttggtcctctaactatttaatttggta-cggattggtgctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcacc 16931702  T
Q  164 gttactatatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtca 263  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16931703 gttactacatttagtcctttctgttagttttatacaaatatacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtca 16931802  T
Q  264 tattccttgttaaggtattatgattaaata 293  Q
    |||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  16931803 tatgtcttgttaaggtattaagattaaata 16931832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 56 - 300
Target Start/End: Original strand, 11256092 - 11256336
Alignment:
Q  56 aataaaagttagggtaaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagt 155  Q
    ||||||| ||||| | ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||    
T  11256092 aataaaaattaggcttaattacctttttagtcctctaactatttaattggtatcggattgatcctctaactaaaaaataatttatttcgatcctttaagt 11256191  T
Q  156 ttctcactgttactatatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcat 255  Q
    ||||||  ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11256192 ttctcatcgttactacatttagtcctttttgatagttttattcaaataaacgttagagtttctgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcat 11256291  T
Q  256 tttggtcatattccttgttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11256292 tttggtcctatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactg 11256336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 64 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 12204004 - 12203768
Alignment:
Q  64 ttagggtaaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcact 163  Q
    ||||| ||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12204004 ttaggttaaattaccgttttggtcccctaactatttaattggtatcggattgatcctctaattaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcacc 12203905  T
Q  164 gttactatatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtca 263  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12203904 gttactacatttagtcctttctgatagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggacctctaactttatttattagtatcattttggtaa 12203805  T
Q  264 tattccttgttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
    |||   |||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  12203804 tatgttttgttaaggtattatgattaaacagtgactg 12203768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 53 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 41835390 - 41835143
Alignment:
Q  53 tataataaaagttagggtaaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctcta 152  Q
    |||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| | |||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41835390 tataattaaatttaggttaaattacctttttggtcctctaactatttaattgatattgaattagttctttaattaaaaattgatttatttcggtcctcta 41835291  T
Q  153 agtttctcactgttactatatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtat 252  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||||    
T  41835290 agtttctcaccgttactacatttagtcctttctattagttttatttaaataaacgttagtgtttgtgttacatgggtcatctaactttatttattagtat 41835191  T
Q  253 cattttggtcatattccttgttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  41835190 cattttggtcatattccttgttaatgtattttgattaaatagtgactg 41835143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 64 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 28986594 - 28986393
Alignment:
Q  64 ttagggtaaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcact 163  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28986594 ttaggctaaattacctttttggtcctctaattatttaattggtatcggattggtcctttaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcact 28986495  T
Q  164 gttactatatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtca 263  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28986494 gttacta-atttagtcatttctattagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatatgagtcctctaactttatttattagtatcattttggtca 28986396  T
Q  264 tat 266  Q
    |||    
T  28986395 tat 28986393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 72 - 300
Target Start/End: Original strand, 4773248 - 4773475
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4773248 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattgatcctctaattaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactat 4773347  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcctt 271  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||     
T  4773348 atttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttttgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatatctc 4773446  T
Q  272 gttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  4773447 gttaagatattatgattaaatagtgactg 4773475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 79 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 47303454 - 47303236
Alignment:
Q  79 tttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagt 178  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| |||||||    
T  47303454 tttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaagtaaaaattgatttattttggtcctttaagtttctcaccgttactacatttagt 47303355  T
Q  179 cctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattccttgttaagg 278  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||    
T  47303354 catttctgttagttttattcaaataaacgttagagtt--tgttatgtgggtcctctaactttatttatta-tatcattttgatcatatgccttattaagg 47303258  T
Q  279 tattatgattaaataatgactg 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  47303257 tattatgattaaatagtgactg 47303236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 72 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 27801934 - 27801780
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27801934 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcgaattggtcctctaattaaaaaatgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactac 27801835  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27801834 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 27801780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 72 - 226
Target Start/End: Original strand, 39664189 - 39664343
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  39664189 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaaatgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactac 39664288  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39664289 atttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 39664343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 73 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 21569189 - 21569036
Alignment:
Q  73 attatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactata 172  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |    
T  21569189 attacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaagtttctcaccgttactaca 21569090  T
Q  173 tttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21569089 tttagtcttttctgttagttttattcaaataaatgttagggtttgtgttatgtg 21569036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 73 - 226
Target Start/End: Original strand, 54107908 - 54108061
Alignment:
Q  73 attatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactata 172  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  54107908 attacctttttggtcatctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactaca 54108007  T
Q  173 tttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  54108008 tttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtg 54108061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 70 - 212
Target Start/End: Original strand, 45306835 - 45306977
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    ||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45306835 taaattacctttttgatcctctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaatttgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 45306934  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagg 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45306935 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaatgttagg 45306977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 72 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 47669704 - 47669550
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  47669704 aattatctttttggtcctctaactatttatttggtatcggattggttctctaactaaaaattaatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactac 47669605  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47669604 atttagtccttactgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 47669550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 72 - 220
Target Start/End: Original strand, 10505953 - 10506101
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||     
T  10505953 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattagtcctttaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccattactac 10506052  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgt 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10506053 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgt 10506101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 70 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 12791623 - 12791473
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  12791623 taaattatctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaattaaaaattgatttatttcggtcctctaaatttctcaccgttact 12791524  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgt 220  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12791523 acatttagtcttttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgt 12791473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 72 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 22202061 - 22201907
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  22202061 aattatctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcacggttactac 22201962  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  22201961 atttaatcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttatgctatgtg 22201907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 72 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 24429012 - 24428858
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||     
T  24429012 aattacctttttggtcatctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcttctaagtttctcaccgttactac 24428913  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24428912 atttagtcttttatgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 24428858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 72 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 29818622 - 29818468
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    ||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||     
T  29818622 aattacctttttgatcttctaattatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctttaagtttctcaccgttactac 29818523  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29818522 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggattgtgttatgtg 29818468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 72 - 226
Target Start/End: Original strand, 26318187 - 26318341
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    ||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  26318187 aattacctttttagtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactac 26318286  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  26318287 atttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttatgatttgtgttatgtg 26318341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 72 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 44894185 - 44894031
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  44894185 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggacctctaagtttctcaccgttactac 44894086  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  44894085 atttagtcttttatgttagttttattcaaataaacattagagtttgtgttatgtg 44894031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 72 - 226
Target Start/End: Original strand, 51509124 - 51509278
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||     
T  51509124 aattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaagtttctcaccgttcctac 51509223  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  51509224 atttagtcctttatgttagttttattcaaataaacgttaggatttgtgttatgtg 51509278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 72 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 15986679 - 15986526
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    ||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  15986679 aattaactttttggtcctctaattatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactac 15986580  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgt 225  Q
    |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15986579 atttagtcctttcaataagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgt 15986526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 79 - 223
Target Start/End: Original strand, 1994181 - 1994325
Alignment:
Q  79 tttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagt 178  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||    
T  1994181 tttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcaccgttgctacatttagt 1994280  T
Q  179 cctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttat 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1994281 cctttctgttagttttattcaaataaacgttcgggtttgtgttat 1994325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 79 - 223
Target Start/End: Original strand, 1999340 - 1999484
Alignment:
Q  79 tttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagt 178  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||    
T  1999340 tttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcaccgttgctacatttagt 1999439  T
Q  179 cctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttat 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1999440 cctttctgttagttttattcaaataaacgttcgggtttgtgttat 1999484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 79 - 223
Target Start/End: Original strand, 5900435 - 5900579
Alignment:
Q  79 tttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagt 178  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  5900435 tttttggtcatctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcaccgttactacatttagt 5900534  T
Q  179 cctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttat 223  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5900535 catttctattagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttat 5900579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 79 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 42592222 - 42592075
Alignment:
Q  79 tttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagt 178  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  42592222 tttttggtcctctaactatttagttggtatcaaattggtcctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaagtttctcaccgttactacatttagt 42592123  T
Q  179 cctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42592122 cctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgttttatgtg 42592075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 72 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 11256548 - 11256394
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||     
T  11256548 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaaatgatttatttcggtcctttaagtttctcaccgttactaa 11256449  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  11256448 atttagtcctttttgttagttttattcaaataaacgttagggtttatgctatgtg 11256394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 72 - 226
Target Start/End: Original strand, 12203556 - 12203710
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    ||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12203556 aattaccttttttatcctctaactatttaattggtatcggattggtcatctaactaaaaattggtatatttcggtcctctaagtttctcactgttactac 12203655  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12203656 atttagtcttttctgttaattttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 12203710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 72 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 18464901 - 18464747
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||     
T  18464901 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcgaattggtcttctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 18464802  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18464801 atttagtcatttctattagttttattcaaataaacattagggtttgtgttatgtg 18464747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 72 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 54752608 - 54752454
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||     
T  54752608 aattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggttctctaactaaaaattgatttatttcggtgctctaagtttctcatcgttactac 54752509  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  54752508 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtg 54752454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 89 - 226
Target Start/End: Original strand, 8473868 - 8474005
Alignment:
Q  89 tctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagtcctttctgtt 188  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  8473868 tctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtactctaagtttctcactgttactacatttagtcatttctgtt 8473967  T
Q  189 agttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  8473968 agttttattcaaataaacgttatgatttgtgttatgtg 8474005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 72 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 16932051 - 16931903
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||     
T  16932051 aattacctttttggtcctctaactttttaattggtatcggatttgtcctctaactaaaaattgatttatttctgtcctctaagtttctcaccgttactac 16931952  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgt 220  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16931951 atttagtcttttctgttagtcttattcaaataaacgttagagtttgtgt 16931903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 79 - 226
Target Start/End: Original strand, 4757506 - 4757653
Alignment:
Q  79 tttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagt 178  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||||| |    
T  4757506 tttttggtcctctaactatttagttggaatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcaccattactacatttatt 4757605  T
Q  179 cctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4757606 cttttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 4757653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 76 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 4773683 - 4773533
Alignment:
Q  76 atctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatattt 175  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  4773683 atctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattgatcctctaactaaaaattgatttattttggtcttctaagtttctcactgttactacattt 4773584  T
Q  176 agtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  4773583 agtcctttatgttagttttattcaaataaacgtcaaggtttgtgctatgtg 4773533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 79 - 226
Target Start/End: Original strand, 47303031 - 47303178
Alignment:
Q  79 tttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagt 178  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  47303031 tttttgatcatctaactatttaattggtattgaatcagtcctctaattaaaaattaatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactacatttagt 47303130  T
Q  179 cctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47303131 catttctgttagttttattcaaataaatgttagggtttgtgttatgtg 47303178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 72 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 22152292 - 22152139
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactat--ttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||  ||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  22152292 aattacctttttggtcctctaactatatttagttggtatcagattgatcctctaactaaaaattgatttatttcagtcctctgagtttctcactgttact 22152193  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttat 223  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22152192 acatttagtcgtttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttat 22152139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 72 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 45307137 - 45306991
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  45307137 aattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactac 45307038  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgt 218  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45307037 atttagtcatttttgttagttttattcaaataaatgttagggtttgt 45306991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 64 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 19883692 - 19883531
Alignment:
Q  64 ttagggtaaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcact 163  Q
    ||||||| ||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  19883692 ttagggttaattaccttttta-tcctctaactatttaattggtatcggattggttctctaactaaaaaatgatttatttcggtcctctaagtttctcaca 19883594  T
Q  164 gttactatatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    ||||||| ||||| || ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19883593 gttactacatttaatcgtttttattaattttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 19883531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 79 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 21970069 - 21969920
Alignment:
Q  79 tttttggtcttctaactat--ttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatattta 176  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  21970069 tttttggtcctctaactatatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattcatttatttcagtcctctgagtttctcactgttactacattta 21969970  T
Q  177 gtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21969969 gtcatttctgttagttttatttaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 21969920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 79 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 21992505 - 21992356
Alignment:
Q  79 tttttggtcttctaactat--ttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatattta 176  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  21992505 tttttggtcctctaactatatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattcatttatttcagtcctctgagtttctcactgttactacattta 21992406  T
Q  177 gtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21992405 gtcatttctgttagttttatttaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 21992356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 72 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 44317660 - 44317514
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||    
T  44317660 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggtttggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttatcaccgttactat 44317561  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgt 218  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||    
T  44317560 atttcgtcctttctgttagttttaatagaagaaacgttagggtttgt 44317514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 72 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 53716738 - 53716584
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||   ||||||     
T  53716738 aattacctttttggtcatctaactatttaattggtatcagattggtcttctaactaaaaattgatttatttcggtcctttaagtttatcatcattactac 53716639  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  53716638 atttagtcatttatgttagttttattcaaattaacgttagggtttgtgttatgtg 53716584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 102 - 226
Target Start/End: Original strand, 41834961 - 41835085
Alignment:
Q  102 ttggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagtcctttctgttagttttattcaaa 201  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||    
T  41834961 ttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactacatttaatcctttctgttagttgtatttaaa 41835060  T
Q  202 taaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  41835061 taaacgttagggtttgtgttatgtg 41835085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 72 - 218
Target Start/End: Original strand, 13866025 - 13866171
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||    
T  13866025 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggtttggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctttaagtttatcaccgttactat 13866124  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgt 218  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||    
T  13866125 atttcgtcctttctgttagttttaatagaagaaacgttagggtttgt 13866171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 72 - 218
Target Start/End: Original strand, 49528154 - 49528300
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||    
T  49528154 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggtttggtcctctagctaaaaattgatttattttggtcctctaagtttatcaccgttactat 49528253  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgt 218  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||    
T  49528254 atttcgtcctttctgttagttttaatagaagaaacgttagggtttgt 49528300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 80 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 7681561 - 7681447
Alignment:
Q  80 ttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcc-tctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagt 178  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||    
T  7681561 ttttggtcctctaattatttaattggtatcggattagtccctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactacattcagt 7681462  T
Q  179 cctttctgttagttt 193  Q
    |||||||||||||||    
T  7681461 cctttctgttagttt 7681447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 134 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 39241741 - 39241649
Alignment:
Q  134 gatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  39241741 gatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagaatttgtgttatgtg 39241649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 70 - 184
Target Start/End: Original strand, 15790682 - 15790796
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||| ||||||    
T  15790682 taaattatctttttggtcatctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttccatcccttaagtttctcaccgttact 15790781  T
Q  170 atatttagtcctttc 184  Q
    | |||||||||||||    
T  15790782 acatttagtcctttc 15790796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 80 - 185
Target Start/End: Original strand, 7163463 - 7163568
Alignment:
Q  80 ttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagtc 179  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  7163463 ttttggtcctctaactatttaattggtattggattggtcatctaactaaaaattaatttatttcggtcctctaagtttctcacagttactacatttagtc 7163562  T
Q  180 ctttct 185  Q
    ||||||    
T  7163563 ctttct 7163568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 95 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 46153032 - 46152904
Alignment:
Q  95 tatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagtcctttctgttagtttt 194  Q
    |||||| ||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  46153032 tatttagttggtatcgaattggttctctaactaaaaattgatttatttcggtcctataagtttctcac---tactacatttagtcatttatgttagtttt 46152936  T
Q  195 attcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  46152935 attcaaataaacgttgaggtttgtgttatgtg 46152904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 187 - 300
Target Start/End: Original strand, 19883359 - 19883472
Alignment:
Q  187 ttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattccttgttaaggtattatga 286  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||  ||   ||||||||||||||||||    
T  19883359 ttagttttatttaaataaacgttagggtttgtgttatgtgagtaccttaactttatttattagtatcattttggttctaagtcttgttaaggtattatga 19883458  T
Q  287 ttaaataatgactg 300  Q
    ||||||| ||||||    
T  19883459 ttaaatagtgactg 19883472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 64 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 15791557 - 15791434
Alignment:
Q  64 ttagggtaaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcact 163  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||     
T  15791557 ttaggctaaattatatttttggtcctctaactatttaattggtatcggat-----ctctaactaaaaattgatttatttcggtcccttaagtttctcacc 15791463  T
Q  164 gttact---atatttagtcctttctgtta 189  Q
    ||||||   ||||||||||||||| ||||    
T  15791462 gttactacaatatttagtcctttccgtta 15791434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 80 - 178
Target Start/End: Original strand, 28985522 - 28985620
Alignment:
Q  80 ttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagt 178  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || |||||||    
T  28985522 ttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaatttgatttatttcggtcctataagtttctcaccgttattacatttagt 28985620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 72 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 30681862 - 30681752
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | || |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||| ||    
T  30681862 aattatctttttggtcctctaactatttaattggtaacagtttggtcctctaactaaaaaatgatttattttggtcctctaactttatcaccgttaccat 30681763  T
Q  172 atttagtcctt 182  Q
    |||| ||||||    
T  30681762 atttcgtcctt 30681752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 78 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 20963664 - 20963525
Alignment:
Q  78 ctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttag 177  Q
    ||||||||||   ||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||   |||||    
T  20963664 ctttttggtcccttaactatttaattagtatcggtttgatcctctaactaaaatttgatttattttggtcctttaagtttctctctgttacttcttttag 20963565  T
Q  178 tcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgt 218  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||| |||||    
T  20963564 tcctttccgttagttttatt-aaaaaaaagttaggatttgt 20963525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 145 - 226
Target Start/End: Original strand, 32633143 - 32633224
Alignment:
Q  145 gtcctctaagtttctcactgttactatatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  32633143 gtcctttaagtttctcaccgttactacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttatgatatgtg 32633224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 79 - 186
Target Start/End: Original strand, 30681041 - 30681148
Alignment:
Q  79 tttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagt 178  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || || |||||||||||||   |||||||| |||||||||| ||| |||| ||||| |||||| ||    
T  30681041 tttttggtcatctaactatttaattggtaacggtttggttctctaactaaaaaaatatttattttggtcctctaactttatcaccgttaccatatttcgt 30681140  T
Q  179 cctttctg 186  Q
    ||||||||    
T  30681141 cctttctg 30681148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 91 - 197
Target Start/End: Original strand, 44316651 - 44316756
Alignment:
Q  91 taactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagtcctttctgttag 190  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||  ||| |||||| |||||||||  |||||||||||| ||||     
T  44316651 taactatttaattagtatcggtttagtcccctaactaaaatttgatttattt-ggtcccttaaatttctctctgttactacttttagtcctttccgttaa 44316749  T
Q  191 ttttatt 197  Q
    |||||||    
T  44316750 ttttatt 44316756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 91 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 49529182 - 49529076
Alignment:
Q  91 taactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagtcctttctgttag 190  Q
    ||||||||||||| ||||||| || |||| |||||||||| ||||||||||| |||||  ||| |||||| |||||||||  |||||||||||| ||||     
T  49529182 taactatttaattagtatcggtttggtcccctaactaaaatttgatttattttggtcccttaaatttctctctgttactacttttagtcctttccgttaa 49529083  T
Q  191 ttttatt 197  Q
    |||||||    
T  49529082 ttttatt 49529076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 64 - 153
Target Start/End: Original strand, 42853243 - 42853331
Alignment:
Q  64 ttagggtaaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaa 153  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  42853243 ttaggctaaattacctttttggtct-ctatctatttagttggtatcggattggttctctaactaaaaattgatttatgtgggtcctctaa 42853331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 70 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 43844482 - 43844392
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctc 160  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||    
T  43844482 taaattatttttttggtcctttaactatttaattagtatcggtttggtcccctaactaaaaattgatttatttttgtcctttaaatttctc 43844392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 13867026 - 13866920
Alignment:
Q  91 taactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagtcctttctgttag 190  Q
    ||||||||||||| ||||||| || |||| |||||||||| ||||||||||| |||||  ||| |||||| | |||||||  |||| ||||||| ||||     
T  13867026 taactatttaattagtatcggtttggtcccctaactaaaatttgatttattttggtcccttaaatttctctcagttactacttttaatcctttccgttaa 13866927  T
Q  191 ttttatt 197  Q
    |||||||    
T  13866926 ttttatt 13866920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 172 - 226
Target Start/End: Original strand, 28986265 - 28986319
Alignment:
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  28986265 atttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtg 28986319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 148
Target Start/End: Original strand, 43839984 - 43840041
Alignment:
Q  91 taactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcc 148  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43839984 taactatttaattagtatcggtttgatcctctaactaaaaattgatttattttggtcc 43840041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 122 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 39951748 - 39951648
Alignment:
Q  122 taactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgtt 221  Q
    ||||||||||||||||||||||  | |||||||||| |||  |||| || |||||||| |||||    |||| |||| ||||||| ||||| |||| |||    
T  39951748 taactaaaaattgatttatttcaattctctaagtttttcaacgttattacatttagtcatttct----gtttcattcgaataaacattaggttttgagtt 39951653  T
Q  222 atgtg 226  Q
    |||||    
T  39951652 atgtg 39951648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 8327801 - 8327680
Alignment:
Q  91 taactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagtcctttctgttag 190  Q
    |||||||||| |||||||||| || ||||  |||||| |  ||||||||||| |||||| ||| ||| ||  |||||| | |||||||  ||||| ||||    
T  8327801 taactatttatttggtatcggtttggtcccttaactatattttgatttattttggtcctttaaatttatctttgttaccacatttagttatttctattag 8327702  T
Q  191 ttttattcaaataaacgttagg 212  Q
    ||||| |  || ||||||||||    
T  8327701 ttttaatagaagaaacgttagg 8327680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 64 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 40639506 - 40639430
Alignment:
Q  64 ttagggtaaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttat 140  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||||||  || ||||  ||| ||||| |||||||||    
T  40639506 ttaggctaaattatgtttttggtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttat 40639430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 40)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 70 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 36440647 - 36440417
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  36440647 taaattatctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactataact 36440548  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcc 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  36440547 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttggggtttgtgttatatgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattca 36440448  T
Q  270 ttgttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36440447 ttgttaaggtattatgattaaatagtgactg 36440417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 65 - 291
Target Start/End: Original strand, 9989321 - 9989547
Alignment:
Q  65 tagggtaaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 164  Q
    |||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9989321 taggctaaattacttttttggtcatctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg 9989420  T
Q  165 ttactatatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcat 264  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9989421 ttactacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcct 9989520  T
Q  265 attccttgttaaggtattatgattaaa 291  Q
    ||  ||| |||||||||||||||||||    
T  9989521 atgtcttattaaggtattatgattaaa 9989547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 70 - 299
Target Start/End: Original strand, 2182946 - 2183175
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||    
T  2182946 taaattaattttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttatgtcgtctaagtttctcaccgttact 2183045  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcc 269  Q
    | |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  2183046 acatttagtcctttatgttagctttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatatc 2183145  T
Q  270 ttgttaaggtattatgattaaataatgact 299  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  2183146 ttgttaaagtattatgattaaatagtgact 2183175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 52 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 32288541 - 32288301
Alignment:
Q  52 atataataaaagttagggtaaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctct 151  Q
    |||||| |||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32288541 atataaaaaaaattagggtaaattacctttttgatcctctaactatttaattgatattagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctct 32288442  T
Q  152 aagtttctcactgttactatatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagta 251  Q
    |||||| ||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32288441 aagtttatcactgttaatacatttagtcatttctgttagttttattcaaat-aatgttagagtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagta 32288343  T
Q  252 tcattttggtcatattccttgttaaggtattatgattaaata 293  Q
    | ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  32288342 ttattttggtcatatgccttgttaaagtattatgattaaata 32288301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 70 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 37424711 - 37424479
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  37424711 taaattacctttttggtcctctaactatttaattg-tattggattagtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcaccgttact 37424613  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtg---tcctctaactttatttattagtatcattttggtcatat 266  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |   |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  37424612 acatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtcctcctctaactttatttattaatatcattttggtcctat 37424513  T
Q  267 tccttgttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
    |  |||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  37424512 tttttgttaagatattatgattaaatagtgactg 37424479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 70 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 24040534 - 24040302
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    |||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||| ||    
T  24040534 taaattacttttttggtcctctaactatttaattagtatcggattgatcctctaactaaaaattgacttatttcagtcctttaagtttctcaccgttcct 24040435  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatc--attttggtcatatt 267  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||     
T  24040434 acatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcttctaactttatttattagtatcatattttggtcatatg 24040335  T
Q  268 ccttgttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24040334 ccttgttaaggtattatgattaaatagtgactg 24040302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 79 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 35570218 - 35569997
Alignment:
Q  79 tttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagt 178  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  35570218 ttttttgtcctctaactatttaattggtatttgattactcctctaactaaaaattgatttattttagtcttctaagtttctcaccgttactacatttagt 35570119  T
Q  179 cctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattccttgttaagg 278  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||     
T  35570118 cacttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgagtcctctaactttatttattagtatcatttcggtcttattccttgttaagt 35570019  T
Q  279 tattatgattaaataatgactg 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  35570018 tattatgattaaatagtgactg 35569997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 72 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 38959168 - 38958941
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  38959168 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactac 38959069  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcctt 271  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||     
T  38959068 atttagtcctttttgttaattttattcaaataaa-gttagattttgtgttatgtgagtcctctaactttatttataagtatcattttggtcttatatctc 38958970  T
Q  272 gttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  38958969 gttaagatattatgattaaatagtgactg 38958941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 79 - 293
Target Start/End: Original strand, 27185886 - 27186099
Alignment:
Q  79 tttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagt 178  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  27185886 tttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcttctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcacttttactacatttagt 27185985  T
Q  179 cctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattccttgttaagg 278  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  27185986 ccttcctgt-agttttattcaaataaatgttagggtttgttttatgtgggtcctctaattttattaattagtatcattttggtcttatgccttgttaagg 27186084  T
Q  279 tattatgattaaata 293  Q
    |||||||||||||||    
T  27186085 tattatgattaaata 27186099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 70 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 34264799 - 34264565
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgattta----tttcggtcctctaagtttctcactgt 165  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||| |||    
T  34264799 taaattatatttttggtcctccaactatttaattggtattgaattggtcctctaactaaaaattgatttaattatttcggtcctctaagtttctcattgt 34264700  T
Q  166 tactatatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcata 265  Q
    || || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||    
T  34264699 tattacatttagtcatttctgttggttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattaatatcattttggttcta 34264600  T
Q  266 ttccttgttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  34264599 tgccttgttaagatattatgattaaatagtgactg 34264565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 63 - 262
Target Start/End: Original strand, 11315955 - 11316153
Alignment:
Q  63 gttagggtaaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcac 162  Q
    |||||| |||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  11315955 gttaggttaaattatttttttgtcctt-taactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaagtttcttac 11316053  T
Q  163 tgttactatatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtc 262  Q
    | |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11316054 tattactacatttagtcatttctgttagttttattccaataaacgttagggtttgtgttatgtaggtcctctaactttatttattagtatcattttggtc 11316153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 70 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 25567435 - 25567206
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    |||||||  ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| |||| ||||||    
T  25567435 taaattacttttttagtcctttaactatttaattggtatcggattggttctttaactaaaaattgatttattttgatcctttaagtttttcaccgttact 25567336  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcc 269  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||    
T  25567335 acatttagtcttttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttttgttatgtgagtcctctaactttatttattagtattattttagtcatatgcc 25567236  T
Q  270 ttgttaaggtattatgattaaataatgact 299  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  25567235 ttgttaaagtattatgattaaatagtgact 25567206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 72 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 25183098 - 25182944
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  25183098 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagcttctcaatgttgctat 25182999  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25182998 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 25182944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 72 - 226
Target Start/End: Original strand, 35569780 - 35569934
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  35569780 aattacctttttggtcttctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactac 35569879  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35569880 atttaatcttttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 35569934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 72 - 226
Target Start/End: Original strand, 39325417 - 39325571
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  39325417 aattacctttttggtcctctgactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactac 39325516  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39325517 atttaatcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttctgttatgtg 39325571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 70 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 27186320 - 27186167
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27186320 taaattacatttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcagtcctctaagtttctcactgttact 27186221  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttat 223  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27186220 acatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttat 27186167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 70 - 229
Target Start/End: Original strand, 16860306 - 16860465
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  16860306 taaattatctttttggtcctctaactatttaatcggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctttaagtttctcaccgttact 16860405  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgt 229  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16860406 acatttagtcttttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgtgt 16860465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 72 - 226
Target Start/End: Original strand, 24040090 - 24040244
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||     
T  24040090 aattatctttttggtcctttaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtccactaagtttctcaccgttactac 24040189  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24040190 atttagtcctttctattagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtg 24040244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 72 - 226
Target Start/End: Original strand, 38958729 - 38958883
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  38958729 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactac 38958828  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  38958829 atttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgtcaaggtttgtgctatgtg 38958883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 72 - 223
Target Start/End: Original strand, 37424267 - 37424418
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  37424267 aattatctttttgatcctctaactatttatttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcttctaagtttctcactgttactac 37424366  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttat 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37424367 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttat 37424418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 70 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 39325802 - 39325636
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    |||||||  ||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  39325802 taaattacatttttagtcctctaattatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcattgttatt 39325703  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaa 236  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  39325702 acatttagtactttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtggctcctctaa 39325636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 89 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 9989751 - 9989614
Alignment:
Q  89 tctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagtcctttctgtt 188  Q
    |||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9989751 tctacctatttaattggtatcggattgatcttctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagtcctttctgtt 9989652  T
Q  189 agttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9989651 agttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtg 9989614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 95 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 11316376 - 11316245
Alignment:
Q  95 tatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagtcctttctgttagtttt 194  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||    
T  11316376 tatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagtcctttctattaatttt 11316277  T
Q  195 attcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11316276 attcgaataaacgttagggtttgtgttatgtg 11316245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 72 - 226
Target Start/End: Original strand, 36440205 - 36440359
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    ||||| ||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  36440205 aattacctttttgatcctctaactatttagttggtatcagattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttattac 36440304  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36440305 atttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtg 36440359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 72 - 226
Target Start/End: Original strand, 32288083 - 32288236
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  32288083 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtattagattggtcatctaactaaaaattgatttatttcggtcatctaagtttctcactgttactac 32288182  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32288183 atttagtcatttctattagttttattcaaataaacgtta-ggtttgtgttatgtg 32288236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 89 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 2183371 - 2183234
Alignment:
Q  89 tctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagtcctttctgtt 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||    
T  2183371 tctaactatttaattggtatcggattgatcctttaactaaaaattgatttatttcggttctgtaagtttctcaccgttactacatttagtcctttctatt 2183272  T
Q  189 agttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  2183271 agttttattcaaataaacattaaggtttgtcttatgtg 2183234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 72 - 218
Target Start/End: Original strand, 19184602 - 19184748
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||    
T  19184602 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggtttggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctttaagtttatcaccgttactat 19184701  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgt 218  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |  || || |||||||||||||    
T  19184702 atttcgtcctttctgttagttttaatagaagaaccgttagggtttgt 19184748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 78 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 1140204 - 1140077
Alignment:
Q  78 ctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttag 177  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||     
T  1140204 ctttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactacattta- 1140106  T
Q  178 tcctttctgttagttttattcaaataaacgttaggg 213  Q
           |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1140105 -------tgttagttttattcaaataaacgttaggg 1140077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 89 - 224
Target Start/End: Original strand, 29198974 - 29199109
Alignment:
Q  89 tctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagtcctttctgtt 188  Q
    |||||||||||||||| |||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||    
T  29198974 tctaactatttaattgatattaaattagtcctctaattaaaaattgatttatttcgattctttaagtttctcaccgttactacatttagtcatttctgtt 29199073  T
Q  189 agttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatg 224  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  29199074 agttttattcaaataaagtttagggtttgtgttatg 29199109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 72 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 31756747 - 31756630
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||    
T  31756747 aattacctttttggtctcctaactatttaattggtaacggtttagtcctctaactaaaaaatgatttattttggtcctctaactttatcactgttaccat 31756648  T
Q  172 atttagtcctttctgtta 189  Q
    |||| ||| |||||||||    
T  31756647 attttgtcatttctgtta 31756630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 101 - 184
Target Start/End: Original strand, 34264396 - 34264479
Alignment:
Q  101 attggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagtcctttc 184  Q
    |||||| | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  34264396 attggtgttggattggccctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaagtttctcaccgttactacatttagtcctttc 34264479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 8 - 66
Target Start/End: Original strand, 37173727 - 37173785
Alignment:
Q  8 aaaatttgatctaaatcgcatattataattgacaaacatcatctatataataaaagtta 66  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37173727 aaaatttgatctaaatcgcatattatatttgacaaacatcatctatataataaaagtta 37173785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 70 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 19185631 - 19185504
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    ||||||| ||||||||||   ||||||||||||| |||| || || |||| |||||||||| ||||||||||| |||||  ||| |||||| ||||||||    
T  19185631 taaattacctttttggtcccttaactatttaattagtattggtttggtcccctaactaaaatttgatttattttggtcccttaaatttctctctgttact 19185532  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttatt 197  Q
    |  |||||||||||| |||| |||||||    
T  19185531 acttttagtcctttccgttaattttatt 19185504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 232 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 16860705 - 16860637
Alignment:
Q  232 tctaactttatttattagtatcattttggtcatattccttgttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  16860705 tctaactttatttattagtatcattttggtcttatgtcttgttaatgtattatgattaattagtgactg 16860637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 70 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 33817731 - 33817659
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttattt 142  Q
    ||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  33817731 taaattacctttttgattctctaactatttaattggtatcggattgatcctctaactaaaaatttatttattt 33817659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 232 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 16860588 - 16860520
Alignment:
Q  232 tctaactttatttattagtatcattttggtcatattccttgttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   ||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  16860588 tctaactttatttattagtatcattttggttccatgtcttgttaagatattatgattaaatagtgactg 16860520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 72 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 19128498 - 19128434
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgat 136  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  19128498 aattacctttttggtcctctaactatttaattagtatcagattgatcctctaactaaaaattgat 19128434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 232 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 29199237 - 29199169
Alignment:
Q  232 tctaactttatttattagtatcattttggtcatattccttgttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  |  ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29199237 tctaacattatttattagtatcattttaattctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactg 29199169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 70 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 2597467 - 2597377
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctc 160  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||||| | || || |||   ||||||||  ||||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  2597467 taaattatctttttggtcccttaactatttaattggttttggtttggtctcttaactaaattttgatttattttggtcctttaactttctc 2597377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 196 - 226
Target Start/End: Original strand, 34264477 - 34264507
Alignment:
Q  196 ttcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34264477 ttcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 34264507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 196; Significance: 1e-107; HSPs: 85)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 57 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 19088801 - 19088558
Alignment:
Q  57 ataaaagttagggtaaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtt 156  Q
    |||||| | ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19088801 ataaaaataaggctaaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtt 19088702  T
Q  157 tctcactgttactatatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcatt 256  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19088701 tctcactgttactatatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcatt 19088602  T
Q  257 ttggtcatattccttgttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19088601 ttgatcttattccttgttaaggtattatgattaaatagtgactg 19088558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 70 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 46850116 - 46849888
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  46850116 taaattatctttttggtcatctaactattaaattggtatcagattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 46850017  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcc 269  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  46850016 acatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttattcc 46849917  T
Q  270 ttgttaaggtattatgattaaataatgac 298  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  46849916 ttgttaagatattatgattaaatagtgac 46849888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 70 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 30683975 - 30683746
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |    
T  30683975 taaattatatttttggtcctctaaatatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttcgcaccgttatt 30683876  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcc 269  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30683875 acatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgcc 30683776  T
Q  270 ttgttaaggtattatgattaaataatgact 299  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30683775 ttgttaaggtattatgattaaatagtgact 30683746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 70 - 298
Target Start/End: Original strand, 8591972 - 8592200
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    ||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8591972 taaattacctttttagtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttact 8592071  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcc 269  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  8592072 acatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagcatcattttggtcctattcc 8592171  T
Q  270 ttgttaaggtattatgattaaataatgac 298  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8592172 ttgttaaggtattatgattaaatagtgac 8592200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 70 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 15478092 - 15477863
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15478092 taaattacctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgattaatttcggtcctctaagtttctcaccgttact 15477993  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcc 269  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15477992 acatttagtcttttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttacgtgggtcctctaactttgtttattagtatcattttggtcatatgcc 15477893  T
Q  270 ttgttaaggtattatgattaaataatgact 299  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15477892 ttgttaaggtattatgattaaatagtgact 15477863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 64 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 42855792 - 42855556
Alignment:
Q  64 ttagggtaaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcact 163  Q
    ||||| ||||||| |||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  42855792 ttaggctaaattacctttttagtcatttaactatttaattagtatcggattggtcctccaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcacc 42855693  T
Q  164 gttactatatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtca 263  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  42855692 gttactacatttagtcttttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcc 42855593  T
Q  264 tattccttgttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42855592 tattcctcgttaaggtattatgattaaataatgactg 42855556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 65 - 300
Target Start/End: Original strand, 44957387 - 44957622
Alignment:
Q  65 tagggtaaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 164  Q
    |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44957387 taggctaaattatatttttggtcctctaactattttattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 44957486  T
Q  165 ttactatatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcat 264  Q
    |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44957487 ttactgcatttagtcctttatgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtggatcctctaactttatttattagtatcattttggtcat 44957586  T
Q  265 attccttgttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
    || ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  44957587 atgccttgataatgtattatgattaaatagtgactg 44957622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 65 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 44991730 - 44991495
Alignment:
Q  65 tagggtaaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 164  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44991730 taggctaaattatctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattgatcctctaactgaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 44991631  T
Q  165 ttactatatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcat 264  Q
    ||| || |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  44991630 ttattacatttagtcttttttgttagttttgttcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtctt 44991531  T
Q  265 attccttgttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44991530 atgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactg 44991495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 65 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 16038246 - 16038021
Alignment:
Q  65 tagggtaaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 164  Q
    |||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16038246 taggctaaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg 16038147  T
Q  165 ttactatatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcat 264  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  16038146 ttactacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagcatcattttggtcct 16038047  T
Q  265 attccttgttaaggtattatgattaa 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  16038046 attccttgttaaggtattatgattaa 16038021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 70 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 53751349 - 53751120
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53751349 taaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 53751250  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcc 269  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||    
T  53751249 acatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttatgatttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtataattttggtcttatgcc 53751150  T
Q  270 ttgttaaggtattatgattaaataatgact 299  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  53751149 ttgttaaggtattatgattaaatagtgact 53751120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 65 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 21763633 - 21763398
Alignment:
Q  65 tagggtaaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 164  Q
    |||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21763633 taggctaaattacatttttggtcctctaactatttaattggtataagattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 21763534  T
Q  165 ttactatatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcat 264  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  |    
T  21763533 ttactacatttaatcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgttttt 21763434  T
Q  265 attccttgttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21763433 atttcttgttaaggtattatgattaaatagtgactg 21763398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 70 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 53259585 - 53259358
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  53259585 taaattatctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttact 53259486  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcc 269  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  53259485 acatttagtcatttctgttagttttattcaaatacacgttagagtttgtgttatgtgagtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgcc 53259386  T
Q  270 ttgttaaggtattatgattaaataatga 297  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||    
T  53259385 ttgttaaggtattatgattaaacaatga 53259358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 70 - 300
Target Start/End: Original strand, 14985334 - 14985564
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  14985334 taaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccattact 14985433  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcc 269  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  14985434 acatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggttcgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatgcc 14985533  T
Q  270 ttgttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  14985534 ttgttaaagtattatgattaaatagtgactg 14985564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 72 - 298
Target Start/End: Original strand, 38339497 - 38339723
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||     
T  38339497 aattacctttttggtcctctaactatttaactggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttaggtcctctaagtttctcaccgttgctac 38339596  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcctt 271  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38339597 atttagtcctttcggttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgcctt 38339696  T
Q  272 gttaaggtattatgattaaataatgac 298  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||    
T  38339697 gttaaggtattatgattaaatagtgac 38339723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 65 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 53995387 - 53995151
Alignment:
Q  65 tagggtaaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 164  Q
    |||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  53995387 taggctaaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcgcattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg 53995288  T
Q  165 ttactatatttagtcc--tttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtc 262  Q
    |||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  53995287 ttactacatttagtcctttttatgttagttttattcaaat-aacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattaatatcattttggtc 53995189  T
Q  263 atattccttgttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  53995188 ctattccttgttaaggtattatgattaaatagtgactg 53995151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 64 - 298
Target Start/End: Original strand, 12817803 - 12818037
Alignment:
Q  64 ttagggtaaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcact 163  Q
    ||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  12817803 ttaggctaaattacctttttggttctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctttaagtttatcact 12817902  T
Q  164 gttactatatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtca 263  Q
    ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12817903 gttactacatttagccctttctattagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtcctgtaactttatttatcagtatcattttggtca 12818002  T
Q  264 tattccttgttaaggtattatgattaaataatgac 298  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12818003 tatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgac 12818037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 65 - 299
Target Start/End: Original strand, 24898187 - 24898421
Alignment:
Q  65 tagggtaaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 164  Q
    |||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24898187 taggttaaattacatttttggtcctctaactatttaattggtatcggattgatcctctaattaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg 24898286  T
Q  165 ttactatatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcat 264  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24898287 ttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgcgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcac 24898386  T
Q  265 attccttgttaaggtattatgattaaataatgact 299  Q
    ||  |||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  24898387 atgtcttgttaatgtattatgattaaatagtgact 24898421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 65 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 624131 - 623898
Alignment:
Q  65 tagggtaaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 164  Q
    |||| |||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  624131 taggctaaattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcattg 624032  T
Q  165 ttactatatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcat 264  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  624031 ttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaatgttagagtttgtgttatgtggatcctctaactttatttattagcatcattttggtctt 623932  T
Q  265 attccttgttaaggtattatgattaaataatgac 298  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  623931 attccttgttaagatattatgattaaatagtgac 623898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 64 - 300
Target Start/End: Original strand, 6711960 - 6712196
Alignment:
Q  64 ttagggtaaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcact 163  Q
    ||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  6711960 ttaggctaaattatatttttggccctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcacc 6712059  T
Q  164 gttactatatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtca 263  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  6712060 gttactacatttagtcctttatgttagttttattcaaataaacgttagggtttctgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcc 6712159  T
Q  264 tattccttgttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
    | | |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  6712160 tgtgccttattaagatattatgattaaatagtgactg 6712196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 70 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 25182259 - 25182031
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25182259 taaattatctttttggtcttctaactatttagttggtatcagattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttact 25182160  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcc 269  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||    
T  25182159 acatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgtttgagtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattaacatcattttggtcctattcc 25182060  T
Q  270 ttgttaaggtattatgattaaataatgac 298  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  25182059 ttgttaagatattatgattaaatagtgac 25182031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 70 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 39448935 - 39448707
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39448935 taaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttact 39448836  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcc 269  Q
    | |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||    
T  39448835 acatttagtcatttttgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatctgggtcctctaactttatttattagcatcattttggtcttatgcc 39448736  T
Q  270 ttgttaaggtattatgattaaataatgac 298  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39448735 ttgttaaggtattatgattaaatagtgac 39448707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 80 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 41752253 - 41752033
Alignment:
Q  80 ttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagtc 179  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  41752253 ttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattcatttattttggtcctctaagtttctcactgttactacatgtagtc 41752154  T
Q  180 ctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattccttgttaaggt 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||    
T  41752153 ctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaattttatttattaatatcattttgatcatatgccttgctaaggt 41752054  T
Q  280 attatgattaaataatgactg 300  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  41752053 attatgattaaatagtgactg 41752033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 65 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 1433723 - 1433488
Alignment:
Q  65 tagggtaaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 164  Q
    |||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  1433723 taggctaaattacatttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaattttctcactg 1433624  T
Q  165 ttactatatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcat 264  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1433623 ttactacatttagtcttttctattagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtctt 1433524  T
Q  265 attccttgttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  1433523 atgccttgttatggtattatgattaaatagtgactg 1433488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 70 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 52557534 - 52557311
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  52557534 taaattatctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcttctaactaaaaattgatttattttggtcctctaaatttctcaccgttact 52557435  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcc 269  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  52557434 acatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtggatcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgtc 52557335  T
Q  270 ttgttaaggtattatgattaaata 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  52557334 ttgttaaggtattatgattaaata 52557311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 72 - 300
Target Start/End: Original strand, 50768826 - 50769054
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    ||||| ||||||| || | |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  50768826 aattacctttttgatcctttaactatttaattggtatcgaattggtcatctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactac 50768925  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcctt 271  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  50768926 atttagtactttctattagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtggatcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgcctt 50769025  T
Q  272 gttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  50769026 gttaaggtattatgattaaatagtgactg 50769054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 56 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 23756263 - 23756017
Alignment:
Q  56 aataaaagtt--agggtaaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaa 153  Q
    ||||||||||  ||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  23756263 aataaaagtttaaggttaaattacatttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctttaactaaaaattaatttattttggtcctctaa 23756164  T
Q  154 gtttctcactgttactatatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatc 253  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  23756163 gtttctcaccgttactatatttagtcatttctgttagttttattcaaataaatgttagggtttgcgttatgtggatcctctaactttatttattagtatc 23756064  T
Q  254 attttggtcatattccttgttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23756063 attttggtcatatgttttgttaaggtattatgattaaatagtgactg 23756017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 70 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 43734733 - 43734503
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |    
T  43734733 taaatcatttttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctataagtttctcaccgttatt 43734634  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcc 269  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  43734633 acatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttaagatttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgcc 43734534  T
Q  270 ttgttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
    |||||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  43734533 ttgttaaaatattatgattaaatagtgactg 43734503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 65 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 50508909 - 50508675
Alignment:
Q  65 tagggtaaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 164  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |    
T  50508909 taggctaaattatctttttggttttctaattatttaattggtatcagattggtcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttttcaccg 50508810  T
Q  165 ttactatatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcat 264  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  50508809 ttactgcatttagtcttttctgttagttttattcaaataaacgttatggtttatgttatgtgggtcctctaactttatttattagtattattttggtcat 50508710  T
Q  265 attccttgttaaggtattatgattaaataatgact 299  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  50508709 atgccttgttaaggtattatgattaaatagtgact 50508675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 70 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 37206874 - 37206651
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    ||||||| |||||| ||  |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||    
T  37206874 taaattaccttttttgttctctaactatttaattgatatcagattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggttctctaagtttttcatcgttact 37206775  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcc 269  Q
    | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  37206774 acatttaatcttttctgttagttttattcaaataaacgttaggatttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattct 37206675  T
Q  270 ttgttaaggtattatgattaaata 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  37206674 ttgttaaggtattatgattaaata 37206651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 65 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 41878310 - 41878076
Alignment:
Q  65 tagggtaaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 164  Q
    |||| |||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41878310 taggctaaattacttttttggtcctctaactatataattggaatcagattagtcctctaactaaaaattgatttattgcggtcctctaagtttctcactg 41878211  T
Q  165 ttactatatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcat 264  Q
    |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41878210 ttactacatt-agtcctttctgctagttttattcaaataaatgttagggtttatgttatgtgggtcctccaactttatttattagtatcattttggtcat 41878112  T
Q  265 attccttgttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41878111 attatttgttaaggtattatgattaaatattgactg 41878076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 70 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 33091900 - 33091670
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    |||||||  ||||| ||| ||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||    
T  33091900 taaattacatttttagtcctctaactatttaattagtattagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcagtcatctaagtttctcaccgttact 33091801  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcc 269  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |     
T  33091800 acatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatgct 33091701  T
Q  270 ttgttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33091700 ttgttaaggtattatgattaaatagtgactg 33091670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 65 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 36122884 - 36122657
Alignment:
Q  65 tagggtaaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 164  Q
    |||| |||||||  |||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36122884 taggctaaattacatttttgatcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatt-atttcggtcctctaagtttctcactg 36122786  T
Q  165 ttactatatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcat 264  Q
    ||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36122785 ttattacatttagtcatttctattagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatataggtcctctaactatatttattagtatcattttggtcat 36122686  T
Q  265 attccttgttaaggtattatgattaaata 293  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||    
T  36122685 atgccttgttaaggtattatgactaaata 36122657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 99 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 19508831 - 19508630
Alignment:
Q  99 taattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagtcctttctgttagttttattc 198  Q
    |||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19508831 taattgatatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctccaagtttctcacccttactacatttagtcctttctgttagttttattc 19508732  T
Q  199 aaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattccttgttaaggtattatgattaaataatgac 298  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  19508731 aaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatgattttggtcatatgccttgttaaggtattatgattaaacagtgac 19508632  T
Q  299 tg 300  Q
    ||    
T  19508631 tg 19508630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 103 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 43566792 - 43566602
Alignment:
Q  103 tggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagtcctttctgttagttttattcaaat 202  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  43566792 tggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcagtcttttaagtttctcaccgttactacatttagtcatttctgttagttttatttaaat 43566693  T
Q  203 aaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattccttgttaaggtattatgattaaata 293  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  43566692 aaacgttaggatttgtgttatgtgggtcctcaaactttatttattagtatcattttggtcctatgtcttgttaaggtattatgattaaata 43566602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 72 - 225
Target Start/End: Original strand, 53750907 - 53751060
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    ||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  53750907 aattacctttttagtcctctaactattaaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactac 53751006  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgt 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53751007 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgt 53751060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 72 - 226
Target Start/End: Original strand, 43566383 - 43566537
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  43566383 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactac 43566482  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    | |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43566483 aattagtcatttctattagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 43566537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 72 - 226
Target Start/End: Original strand, 44991284 - 44991438
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  44991284 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactac 44991383  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44991384 atttagtcatttctgttagttttattcaaataaatgttagggtttgtgttatgtg 44991438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 72 - 226
Target Start/End: Original strand, 46849674 - 46849828
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    ||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  46849674 aattacctttttcgtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaagtttctcactgttactat 46849773  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46849774 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 46849828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 72 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 38339937 - 38339783
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||     
T  38339937 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattgatcctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaagtttcacactgttactac 38339838  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38339837 atttaatcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 38339783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 72 - 226
Target Start/End: Original strand, 42855344 - 42855498
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  42855344 aattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcggagtggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactac 42855443  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42855444 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaaggttagggtttgtgttatgtg 42855498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 72 - 226
Target Start/End: Original strand, 43734291 - 43734445
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  43734291 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaatagatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactac 43734390  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43734391 atttagtcctttatgttagttttattcaaataaacgttaggatttgtgttatgtg 43734445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 74 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 12818249 - 12818097
Alignment:
Q  74 ttatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatat 173  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  12818249 ttatctttttggtcctctaattatttaattggtatcggattggtgctctaactaaaacttgatttatttcggtcctctaagtttctcattgttactacat 12818150  T
Q  174 ttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12818149 ttagtcctttttgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 12818097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 79 - 226
Target Start/End: Original strand, 6505549 - 6505695
Alignment:
Q  79 tttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagt 178  Q
    |||||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6505549 tttttgatcctctaactatttaattgatatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagt 6505648  T
Q  179 cctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6505649 cctttctgttagttttattcaaataaa-gttagggtttgtgttatgtg 6505695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 72 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 14985776 - 14985622
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||     
T  14985776 aattacctttttggtcctctaactatttaatttgtatcagattggtcatctaactaaaaattgatttattttgatcctctaagtttctcactgttactac 14985677  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14985676 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 14985622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 72 - 226
Target Start/End: Original strand, 52557092 - 52557246
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||     
T  52557092 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcgaattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctataagtttcttactgttactac 52557191  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  52557192 atttagtcttttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtg 52557246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 50769266 - 50769109
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||     
T  50769266 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattgatcctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaagtttctcaccgttactac 50769167  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgt 229  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  50769166 atttagtcatttcttttagttttattcaaataaacgttagggtttttgttatgtgtgt 50769109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 79 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 8592407 - 8592263
Alignment:
Q  79 tttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagt 178  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  8592407 tttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcaccgttactacatttagt 8592308  T
Q  179 cctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttat 223  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8592307 cctttctgtttgttttattcaaataaacgttagggtttgtgttat 8592263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 79 - 223
Target Start/End: Original strand, 16037806 - 16037950
Alignment:
Q  79 tttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagt 178  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16037806 tttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcactgttactacatttagt 16037905  T
Q  179 cctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttat 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16037906 cctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttat 16037950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 79 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 24898627 - 24898480
Alignment:
Q  79 tttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagt 178  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  24898627 ttttttgtcctctaactatttaattggtattggattggtcctctaactaaaaattgatttattttgatcctctaagtttctcaccgttactacatttagt 24898528  T
Q  179 cctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24898527 cctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 24898480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 79 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 25269438 - 25269307
Alignment:
Q  79 tttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagt 178  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25269438 tttttggtcctctaactatttaattggtatcggattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagt 25269339  T
Q  179 cctttctgttagttttattcaaataaacgtta 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25269338 cctttctgttagttttattcaaataaacgtta 25269307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 72 - 226
Target Start/End: Original strand, 1433276 - 1433430
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||| ||     
T  1433276 aattatctttttggtcctctaactatttcattggtattggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggttctctaagtttctcatcgttattac 1433375  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1433376 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 1433430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 72 - 226
Target Start/End: Original strand, 15477650 - 15477804
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||     
T  15477650 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaacattgatttatttcggtcctctaagtttctcatcgttactac 15477749  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15477750 atttagtccattctgttagttttattaaaataaacgttagtgtttgtgttatgtg 15477804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 72 - 226
Target Start/End: Original strand, 19088346 - 19088500
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||     
T  19088346 aattatctttttggtcctctaactatttagttggtatcggaatgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttaataccgttactac 19088445  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19088446 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 19088500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 70 - 226
Target Start/End: Original strand, 20888146 - 20888302
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    ||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20888146 taaattaccttttaggtactctaactatttaattggtatcggattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 20888245  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
      |||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  20888246 gcatttagtcatttctgttagttttattcaaatgaatgttagggtttgtgttatgtg 20888302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 72 - 226
Target Start/End: Original strand, 39448493 - 39448647
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||     
T  39448493 aattatctgtttggtcctctaactatttaattggtatcgaattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctttaagtttctcaccgttactac 39448592  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||    
T  39448593 atttagtcctttttgttagttttatttaaataagcgttagagtttgtgttatgtg 39448647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 78 - 225
Target Start/End: Original strand, 41877871 - 41878017
Alignment:
Q  78 ctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttag 177  Q
    |||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  41877871 ctttttggtcatctaattatttagttggtatcagattggtcatctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtt-ctcactgttactacatttag 41877969  T
Q  178 tcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgt 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41877970 tcctttctgttagttttattcaaataaatgttagggtttgtgttatgt 41878017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 72 - 226
Target Start/End: Original strand, 8398036 - 8398190
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||     
T  8398036 aattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaactttctcattgttactac 8398135  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8398136 atttagtcatttctattagttttattcaaataaatgttagggtttgtgttatgtg 8398190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 72 - 226
Target Start/End: Original strand, 53994939 - 53995093
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||     
T  53994939 aattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctttaactaaaaattgatttatttcggtcctttaagtttctcaccgttactac 53995038  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  53995039 atttagtcttttctattagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtg 53995093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 78 - 226
Target Start/End: Original strand, 19508423 - 19508572
Alignment:
Q  78 ctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttag 177  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  19508423 ctttttgatcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaacaattgatttatgtcggccctctaagtttctcactgtgactacatttag 19508522  T
Q  178 tcctttctgttagttttattcaaataaacgtta-gggtttgtgttatgtg 226  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19508523 tcatttctgttagttttattcaaataaacgttaggggtttgtgttatgtg 19508572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 65 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 44125922 - 44125774
Alignment:
Q  65 tagggtaaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 164  Q
    |||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44125922 taggctaaattacatttttggtcatctaactatttaattggtgtcggattggtcttctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcactg 44125823  T
Q  165 ttactatatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttaggg 213  Q
    ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44125822 ttattacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttaggg 44125774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 72 - 226
Target Start/End: Original strand, 30683531 - 30683686
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  30683531 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattgatcctccaattaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactac 30683630  T
Q  172 atttagtcctttctgttag-ttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30683631 atttagtcatttctgttagtttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtg 30683686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 72 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 6712406 - 6712254
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||     
T  6712406 aattacctttttggtct-ctaactatttaattggtaatggattgatcctctaactacaaattgatttatttcggtcctctaaattt-tcactgttactac 6712309  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6712308 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttaggatttgtgttatgtg 6712254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 72 - 226
Target Start/End: Original strand, 36122438 - 36122592
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||     
T  36122438 aattacctttttggtcctctgactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttttgtcatctaagtttttcactgttactac 36122537  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36122538 atttaatcctttatgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtg 36122592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 80 - 226
Target Start/End: Original strand, 37206440 - 37206586
Alignment:
Q  80 ttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagtc 179  Q
    ||||| || |||||||||| | ||| |||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  37206440 ttttgatcctctaactattcagttgatatcagattaatcctctagttaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcactgttactacatttagtc 37206539  T
Q  180 ctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37206540 ctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 37206586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 70 - 211
Target Start/End: Original strand, 55022287 - 55022427
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  55022287 taaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattgatcctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaagtttctcactgttact 55022386  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttag 211  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  55022387 acattta-tcctttctgttagttttattaaaataaacgttag 55022427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 79 - 223
Target Start/End: Original strand, 25181824 - 25181968
Alignment:
Q  79 tttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagt 178  Q
    ||||||||| |||||||||||| || |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || |||||||    
T  25181824 tttttggtcctctaactatttagtttgtatcggattggtcctttaactaaaaattgatttattttggtcttctaagtttctcactgttattacatttagt 25181923  T
Q  179 cctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttat 223  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25181924 catttctgttagttttattcaaataaatgttagggtttgtgttat 25181968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 72 - 223
Target Start/End: Original strand, 623684 - 623835
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| || |||||||     
T  623684 aattatatttttggtcctttaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgttttattttggtcctataagtttcttaccgttactac 623783  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttat 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  623784 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaggtttatgttat 623835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 72 - 226
Target Start/End: Original strand, 21763185 - 21763340
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||     
T  21763185 aattatctttttggtcctctaattatttaattggtatcggattggtcctccaactaaaaattgatttatttcggtcctccaggtttttcaccgttactac 21763284  T
Q  172 atttagtcctttctgttag-ttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21763285 atttagtcatttctgtttgtttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtg 21763340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 91 - 226
Target Start/End: Original strand, 41751841 - 41751975
Alignment:
Q  91 taactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagtcctttctgttag 190  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  41751841 taactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtctt-taagtttctcactgttactacatttagtctttactgttag 41751939  T
Q  191 ttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41751940 ttttattcaaataaatgttagggtttgtgttatgtg 41751975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 72 - 226
Target Start/End: Original strand, 33091458 - 33091612
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||      
T  33091458 aattacctttttggtcctctaactatttaatcagtattagattggtcctctaactaaaaattgatttattttgatcctctaagtttctcaccattactgc 33091557  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33091558 atttagtcttttctgttagttttattcaaataaacattagggtttgtgttatgtg 33091612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 116 - 226
Target Start/End: Original strand, 53259187 - 53259297
Alignment:
Q  116 gtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtt 215  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53259187 gtcctctaactaaaaattaattaatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtt 53259286  T
Q  216 tgtgttatgtg 226  Q
    |||||||||||    
T  53259287 tgtgttatgtg 53259297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 65 - 212
Target Start/End: Original strand, 47602941 - 47603088
Alignment:
Q  65 tagggtaaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 164  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  47602941 taggctaaattatctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaattaaaaattgatttattttggtcccttaagtttctcactg 47603040  T
Q  165 ttactatatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagg 212  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||  |||| | ||| ||||||||||    
T  47603041 ttactacatttagtcctttccgttaaatttaattaaaaaaacgttagg 47603088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 72 - 222
Target Start/End: Original strand, 23755423 - 23755573
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    ||||| ||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |  |||||||     
T  23755423 aattaacttattcgtcctctaactatttaattggtattggattggtcctctaactaaaaattaatttatttcggttctctaagtttcttatcgttactac 23755522  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgtta 222  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  23755523 atttagtcctttatgttagttttattcaaataaacgttaaagtttgtgtta 23755573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 72 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 44957802 - 44957668
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||     
T  44957802 aattacctttttggtcctctaactatttaattgatatcaaattggtcctttaactaaaaattgatttatttcgatcctctaagtttctcacatttactac 44957703  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaac 206  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44957702 atttagtcctttctattagttttattcaaataaac 44957668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 122 - 225
Target Start/End: Original strand, 50508512 - 50508615
Alignment:
Q  122 taactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgtt 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50508512 taactaaaaattgatttatttcggtcctttaagtttctcaccgttactacatttagtcatttttgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgtt 50508611  T
Q  222 atgt 225  Q
    ||||    
T  50508612 atgt 50508615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 64 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 4513369 - 4513252
Alignment:
Q  64 ttagggtaaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcact 163  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  4513369 ttaggctaaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcggattgatcctctaactaaaaattaatttatttcggtcctctaagtttctcacc 4513270  T
Q  164 gttactatatttagtcct 181  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  4513269 gttactacatttagtcct 4513252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 89 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 49136065 - 49135928
Alignment:
Q  89 tctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttag----tcctttc 184  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||    | ||||     
T  49136065 tctaactatttaattggtatcagattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctttaagtttctcaccgttactacatttagttatttcttta 49135966  T
Q  185 tgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgtta 222  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  49135965 tgtcaattttattcaaataaacgttaggatttgtgtta 49135928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 72 - 200
Target Start/End: Original strand, 44125627 - 44125755
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||   ||| || |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||     
T  44125627 aattatctttttggtcctttaactatttaattggtattaaattggttctctaactaaaaattgatttttttcggttttctaagtttctcaccgttactac 44125726  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaa 200  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  44125727 atttaatcatttctgttagttttattcaa 44125755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 64 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 47603814 - 47603710
Alignment:
Q  64 ttagggtaaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcact 163  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||     
T  47603814 ttaggctaaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattaatttatttcggtcccttaagtttctcacc 47603715  T
Q  164 gttac 168  Q
    |||||    
T  47603714 gttac 47603710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 70 - 162
Target Start/End: Original strand, 52692027 - 52692119
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcac 162  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  52692027 taaattatctttttgatcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcccttaagtttctcac 52692119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 70 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 52692886 - 52692740
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    ||||||| |||||||||| | || ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||||||    
T  52692886 taaattacctttttggtcctttagctatttaattgctatcg-attggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcccttaagtttctcaccgttact 52692788  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgt 218  Q
    | |||||||| |||| ||||  |||| |  || ||||||||||||||||    
T  52692787 acatttagtcatttccgttaaatttaatttaa-aaacgttagggtttgt 52692740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 72 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 55022504 - 55022424
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaa 153  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  55022504 aattatctttttg-tcctctaactatttaattggtatcggattaatcctctaattaaaaattgatttatttcgatcctctaa 55022424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 228 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 23755707 - 23755635
Alignment:
Q  228 gtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattccttgttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  23755707 gtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgctttgttaatgtattatgattaaatagtgactg 23755635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 231 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 6505822 - 6505753
Alignment:
Q  231 ctctaactttatttattagtatcattttggtcatattccttgttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6505822 ctctaattttatttattagtatcattttggtcctatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactg 6505753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 70 - 155
Target Start/End: Original strand, 31214165 - 31214250
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagt 155  Q
    |||||||  |||||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  31214165 taaattacatttttgatcatctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattaatttatttcggtcctcaaagt 31214250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 58)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 70 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 45277043 - 45276813
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45277043 taaattatctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaatttatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttact 45276944  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcc 269  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45276943 acatttagtcttttctgttagttttattcaaataaacgttagggattgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcc 45276844  T
Q  270 ttgttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  45276843 ttgttaaagtattatgattaaatagtgactg 45276813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 64 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 33296137 - 33295901
Alignment:
Q  64 ttagggtaaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcact 163  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  33296137 ttaggctaaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattagtcctctaactaaaaattaatttatttcggtcctctaagtttctcacc 33296038  T
Q  164 gttactatatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtca 263  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  33296037 gttactacatttagtcttttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgagtcctctaactttatttattagtatcattttgatca 33295938  T
Q  264 tattccttgttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33295937 tattccttgttaaggtattatgattaaatagtgactg 33295901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 70 - 297
Target Start/End: Original strand, 15048402 - 15048629
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  15048402 taaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctgaccgttact 15048501  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcc 269  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  15048502 acatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttttgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattat 15048601  T
Q  270 ttgttaaggtattatgattaaataatga 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15048602 ttgttaaggtattatgattaaataatga 15048629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 70 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 27473518 - 27473288
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27473518 taaattacctttttggtcctctaacaatttaattggtatcagattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttact 27473419  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcc 269  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27473418 acatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtaggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttattcc 27473319  T
Q  270 ttgttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27473318 ttgttaaggtattatgattaaatagtgactg 27473288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 57 - 300
Target Start/End: Original strand, 7949402 - 7949645
Alignment:
Q  57 ataaaagttagggtaaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtt 156  Q
    |||||| | ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7949402 ataaaaataaggttaaattatctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcttttaattaaaaattgatttatttcggtcctctaagtt 7949501  T
Q  157 tctcactgttactatatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcatt 256  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7949502 tctcaccgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcatt 7949601  T
Q  257 ttggtcatattccttgttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7949602 ttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactg 7949645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 70 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 7535280 - 7535050
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  7535280 taaattatctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcatcgttact 7535181  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcc 269  Q
    | ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7535180 acatttaatcctttatgttagttttattcaaataaacgttatagtttgtgttatgtgagtcctctagctttatttattagtatcattttggtcttattcc 7535081  T
Q  270 ttgttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7535080 tcgttaacgtattatgattaaataatgactg 7535050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 65 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 45077655 - 45077420
Alignment:
Q  65 tagggtaaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 164  Q
    |||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45077655 taggctaaattacctttttggtcctctaactatttgattagtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcactg 45077556  T
Q  165 ttactatatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcat 264  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  45077555 ttactacatttagtcatttctattagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtctt 45077456  T
Q  265 attccttgttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45077455 atgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactg 45077420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 80 - 300
Target Start/End: Original strand, 38588600 - 38588820
Alignment:
Q  80 ttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagtc 179  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  38588600 ttttcgtcctctaactatttaattggtattagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactacatttagtc 38588699  T
Q  180 ctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattccttgttaaggt 279  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  38588700 atttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatgccttgttaaggt 38588799  T
Q  280 attatgattaaataatgactg 300  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  38588800 attatgattaaatagtgactg 38588820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 91 - 300
Target Start/End: Original strand, 27669440 - 27669649
Alignment:
Q  91 taactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagtcctttctgttag 190  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  27669440 taactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaaatttctcactgttagtacatttagtcctttctgttag 27669539  T
Q  191 ttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattccttgttaaggtattatgattaa 290  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  27669540 ttttattgaaataaacgttagggtttatgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatataccttgttaaattattatgattaa 27669639  T
Q  291 ataatgactg 300  Q
    ||| ||||||    
T  27669640 atagtgactg 27669649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 72 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 1652016 - 1651789
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  1652016 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactac 1651917  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcctt 271  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  1651916 atttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttgttagtatcattttggtcatatatctc 1651818  T
Q  272 gttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  1651817 gttaagatattatgattaaatagtgactg 1651789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 72 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 1740392 - 1740165
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  1740392 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactac 1740293  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcctt 271  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  1740292 atttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttgttagtatcattttggtcatatatctc 1740194  T
Q  272 gttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  1740193 gttaagatattatgattaaatagtgactg 1740165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 70 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 5435347 - 5435119
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  5435347 taaattatctttttggtcctctaactatataattggtatcggattggtgctctaactaaaaattgatttatttcggtcctttaagtttctcaccgttact 5435248  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcc 269  Q
    | ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5435247 acatttagtcacttttgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtcatctaactttatttattagtatcattttggtcatatgcc 5435148  T
Q  270 ttgttaaggtattatgattaaataatgac 298  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||    
T  5435147 tagttaaggtattataattaaataatgac 5435119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 70 - 300
Target Start/End: Original strand, 1432134 - 1432364
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1432134 taaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttact 1432233  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcc 269  Q
    | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||    
T  1432234 acatttaatcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatttgggtcctctaactttatttattaatatcattttgatcatatgcc 1432333  T
Q  270 ttgttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  1432334 ttgttaatgtattatgtttaaatagtgactg 1432364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 70 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 15872068 - 15871838
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    |||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15872068 taaattacatttttggtcctctaactatttaatttgtatcagattggtcctctaaataaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 15871969  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcc 269  Q
    | |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |    
T  15871968 acatttagtcttttttgttagttttattcaaataaacgttagagcttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatgtc 15871869  T
Q  270 ttgttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15871868 ttgttaaggtattatgattaaatagtgactg 15871838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 72 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 1646951 - 1646724
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  1646951 aattacctttttcgtcctctaactatttaattggtatcggattggtcatctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactac 1646852  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcctt 271  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||     
T  1646851 atttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttatgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatatctc 1646753  T
Q  272 gttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  1646752 gttaagatattatgattaaatagtgactg 1646724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 70 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 44595047 - 44594818
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  44595047 taaattatctttttg-tcctctaactatttaattgatattggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctaaccgttact 44594949  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcc 269  Q
    | |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||  |    
T  44594948 acatttagtcatttcggttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtggatcctctaactttatttattagtattattttggttctatgtc 44594849  T
Q  270 ttgttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44594848 ttgttaaggtattatgattaaatagtgactg 44594818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 70 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 5152980 - 5152753
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    ||||||| ||||||| || ||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  5152980 taaattacctttttg-tcctctgactgtttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttatt 5152882  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcc 269  Q
    | |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  5152881 acatttagttttttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatatgggtcctctaactttatttactagtatcattttggtcatatgcc 5152782  T
Q  270 ttgttaaggtattatgattaaataatgac 298  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  5152781 ttcttaaggtattatgattaaatagtgac 5152753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 70 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 11174081 - 11173858
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11174081 taaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatctgattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttact 11173982  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcc 269  Q
    | |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |     
T  11173981 acatttagtcttttatgttagttttattcaaataaatgttagagtttagattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcatttgggttctatgct 11173882  T
Q  270 ttgttaaggtattatgattaaata 293  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  11173881 ttgttaaggtattatgaataaata 11173858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 70 - 300
Target Start/End: Original strand, 1869937 - 1870168
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    ||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  1869937 taaattacctttttg-tcctctaactatttaattggtatcagattgatcctctaactaaaaattaatttatttcggttctctaagtttctcaccgttact 1870035  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcc 269  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  1870036 acatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgaattgtgggtcccctaactttatttattagtatcattttggtcttatgcc 1870135  T
Q  270 ttgttaaggtat--tatgattaaataatgactg 300  Q
    || |||| ||||  |||||||||||| ||||||    
T  1870136 ttattaatgtattatatgattaaatagtgactg 1870168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 70 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 37569762 - 37569541
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||  || ||||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||  |||||||    
T  37569762 taaattatccttttgatcttctaagtatttaattgatatcggattgatcatctaattaaaaatttatttattttggtcctctaaatttctcgttgttact 37569663  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcc 269  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| || || ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  37569662 atatttagtcttttcagttagttttattcaaataaacgttagagtttatgctacgtgggttctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgtc 37569563  T
Q  270 ttgttaaggtattatgattaaa 291  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  37569562 ttgttaaggtattatgattaaa 37569541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 70 - 226
Target Start/End: Original strand, 33819788 - 33819944
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33819788 taaattacctttttggtcctctaattatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttact 33819887  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33819888 acatttagtcatttctattagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtg 33819944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 72 - 226
Target Start/End: Original strand, 1646506 - 1646660
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1646506 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggttctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 1646605  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  1646606 atttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgtcaaggtttgtgctatgtg 1646660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 72 - 226
Target Start/End: Original strand, 1739953 - 1740107
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  1739953 aattacctttttggtcctctaactatttaatcggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttattac 1740052  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| ||||||    
T  1740053 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgtcaagatttgtgctatgtg 1740107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 72 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 15048844 - 15048690
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  15048844 aattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactac 15048745  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  15048744 atttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttatgatttgtgttatgtg 15048690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 89 - 300
Target Start/End: Original strand, 40048089 - 40048288
Alignment:
Q  89 tctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagtcctttctgtt 188  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | | ||||||        ||||||||| |||||||| ||||||||    
T  40048089 tctaactatttaattgatattggattagtcctctaactaaaaattaatttattttgattctctaa--------ctgttactacatttagtcatttctgtt 40048180  T
Q  189 agttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattccttgttaaggtattatgatt 288  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40048181 agttttattcaaataaacgttaaagtttgtgttatgt----cctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcattgttaaggtattatgatt 40048276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 70 - 226
Target Start/End: Original strand, 40659986 - 40660142
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40659986 taaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcgaattagtcatctaactaaaaattgatttatttcagtcctctaagtttctcactgttact 40660085  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    | |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40660086 acatttagtcttttctaatagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 40660142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 72 - 226
Target Start/End: Original strand, 5434905 - 5435059
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||     
T  5434905 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattgatcctctacctaaaatttgatttatttcggttttctaagtttctcaccgttactac 5435004  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5435005 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 5435059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 72 - 226
Target Start/End: Original strand, 45276602 - 45276756
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||     
T  45276602 aattatctttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcatcgttactac 45276701  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45276702 atttagtcatttatattagttttattcaaataaatgttagggtttgtgttatgtg 45276756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 73 - 226
Target Start/End: Original strand, 37569320 - 37569473
Alignment:
Q  73 attatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactata 172  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  37569320 attacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactaca 37569419  T
Q  173 tttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  37569420 tttagtcatttctgttagttttattcgaataaacgttatggtttttgttatgtg 37569473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 72 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 40660331 - 40660179
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40660331 aattacctttttggtcctctaactatttagttgttatcgaattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactat 40660232  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatg 224  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  40660231 atttagtcttttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatg 40660179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 72 - 226
Target Start/End: Original strand, 5152540 - 5152693
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    ||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||     
T  5152540 aattacctttttgatcctctaactgtttaattggtatcagattggtcctctgactaaaaattgatttattt-ggtcctctaagtttctcattgttactac 5152638  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5152639 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 5152693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 72 - 226
Target Start/End: Original strand, 15871626 - 15871780
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    ||||| |||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||     
T  15871626 aattacctttttggtcctttaactatttaattgatatcggattggtcctctaactaaaaattaatttattttggtcctctaaatttctcactgttactac 15871725  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15871726 atttagtcatttatgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 15871780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 72 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 34470989 - 34470835
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||     
T  34470989 aattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttttcaccgttgctac 34470890  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34470889 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaggtttgtgttatgtg 34470835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 72 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 38589032 - 38588878
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  38589032 aattatttttttggttctctaactatttaattggtattggattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactag 38588933  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38588932 atttagtcctttatgttaattttattcaaataaacgttagggtttgtattatgtg 38588878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 79 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 1870373 - 1870226
Alignment:
Q  79 tttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagt 178  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  1870373 tttttggtcctctaactatttaattggtataagatagatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaaagttactacatttagt 1870274  T
Q  179 cctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1870273 catttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 1870226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 72 - 226
Target Start/End: Original strand, 11707755 - 11707909
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||     
T  11707755 aattatctttttgatcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttgtttcgatcctctaagtttctcactgttaatac 11707854  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11707855 atttagtcatttctcttagttttattcaaataaatgttagggtttgtgttatgtg 11707909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 72 - 226
Target Start/End: Original strand, 27473077 - 27473230
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  27473077 aattatctttttggtcctctaactatttagttgatatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcac-gttactac 27473175  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||    
T  27473176 atttaatcatttctgttagttttattcaaataaacattatgatttgtgttatgtg 27473230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 135 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 18298611 - 18298488
Alignment:
Q  135 atttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctct 234  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  18298611 atttattttggtcctctaagtttctcacaattactacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgagtcctct 18298512  T
Q  235 aactttatttattagtatcatttt 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  18298511 aactttatttattagtatcatttt 18298488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 64 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 22763386 - 22763232
Alignment:
Q  64 ttagggtaaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcact 163  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||     
T  22763386 ttaggctaaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcccttaagtttctcacc 22763287  T
Q  164 gttactatatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgt 218  Q
    ||||||| |||||||| |||| ||||  |||| | ||| ||||||||||||||||    
T  22763286 gttactacatttagtcttttccgttaaatttaattaaaaaaacgttagggtttgt 22763232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 72 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 27669864 - 27669712
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    ||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||||||     
T  27669864 aattatcttttta-tcctctaactatttaattggtatcagattggtcttctaactaaaaattgatttatttcgatctt-taagtttcacactgttactac 27669767  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  27669766 atttagtcatttctgttagttttattcaaataatcattagggtttgtgttatgtg 27669712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 72 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 40048499 - 40048345
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    ||||| ||||||| || ||||  |||||| ||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| |||||||     
T  40048499 aattacctttttgatcctctagttatttagttggtatcgtattgatcctctaactaaaaattgttttattttgatcctctaagtttctcaccgttactac 40048400  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40048399 atttagtcttttctgttagttttattcaaataaacgttaaggtttgtgttatgtg 40048345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 67 - 226
Target Start/End: Original strand, 7534842 - 7534992
Alignment:
Q  67 gggtaaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 166  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |      
T  7534842 gggttaattacctttttggtcttctaattatttagttgatatcggattagtcctttaattaaaaattgatttatttcggtcatttaagtttctcaccg-- 7534939  T
Q  167 actatatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7534940 -------ttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttaggatttgtgttatgtg 7534992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 65 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 11920224 - 11920136
Alignment:
Q  65 tagggtaaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaa 153  Q
    |||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11920224 taggctaaattacctttttggtcatctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttgggtcctctaa 11920136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 70 - 168
Target Start/End: Original strand, 22762516 - 22762614
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttac 168  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| |||||    
T  22762516 taaattatatttttggtcatctaactatttaattggtatcggattaatcctctaattaaaaattgatttatttcgatcccttaagtttctcaccgttac 22762614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 72 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 24666123 - 24666006
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||| ||    
T  24666123 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtaacggtttggtcctttaactaaaaaatgatttattttggtcctctaactttatcaccgttaccat 24666024  T
Q  172 atttagtcctttctgtta 189  Q
    |||| |||||||||||||    
T  24666023 atttcgtcctttctgtta 24666006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 72 - 226
Target Start/End: Original strand, 45077226 - 45077361
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||                       
T  45077226 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctcta------------------- 45077306  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45077307 atttagtcctttatgttagttttattcaaataaacgttatggtttgtgttatgtg 45077361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 78 - 193
Target Start/End: Original strand, 33295747 - 33295862
Alignment:
Q  78 ctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttag 177  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||| || ||||||    
T  33295747 ctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcttctaattaaaaattgatttatttcggtattctaagtttgtcaccgttattacatttag 33295846  T
Q  178 tcctttctgttagttt 193  Q
    || |||||||||||||    
T  33295847 tcatttctgttagttt 33295862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 79 - 226
Target Start/End: Original strand, 44594613 - 44594760
Alignment:
Q  79 tttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagt 178  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| |||  |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |    ||||||| |||||||    
T  44594613 tttttggtcctctaattatttaattgctattagattggtcctttaactaaaaattgatttatttcggtcctttaaatttatattcgttactacatttagt 44594712  T
Q  179 cctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
      ||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||    
T  44594713 tatttctgttagttttattcatataaacattagagtttgtgctatgtg 44594760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 200 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 11708067 - 11707967
Alignment:
Q  200 aataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattccttgttaaggtattatgattaaataatgact 299  Q
    |||||||||||||| || | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11708067 aataaacgttagggcttatattatgtgggtcatctaactttatttattagtatcattttgatcttatgttttgttaaggtattatgattaaataatgact 11707968  T
Q  300 g 300  Q
    |    
T  11707967 g 11707967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 237 - 298
Target Start/End: Original strand, 34470714 - 34470775
Alignment:
Q  237 ctttatttattagtatcattttggtcatattccttgttaaggtattatgattaaataatgac 298  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34470714 ctttatttattagtatcattttgatcatattccttgttaaggtattatgattaaatagtgac 34470775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 72 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 12643961 - 12643891
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttattt 142  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  12643961 aattatctttttggtcctctaactatttaatttgtatcgatttggtcctctaactaaatattgatttattt 12643891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 79 - 149
Target Start/End: Original strand, 24652835 - 24652905
Alignment:
Q  79 tttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcct 149  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  24652835 tttttggtcctctaactatttaattggtaacggtttggtcctctaactaaaaaatgatttattttggtcct 24652905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 234 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 24659479 - 24659413
Alignment:
Q  234 taactttatttattagtatcattttggtcatattccttgttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  24659479 taactttatttattagtatcattttggtcctctgccttattaaggtattctgattaaatagtgactg 24659413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 33820041 - 33819975
Alignment:
Q  89 tctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagt 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||    
T  33820041 tctaactatttaattggtatcggattgatcatctaactaaaaattaatttatttcagtcttctaagt 33819975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 78 - 189
Target Start/End: Original strand, 15740624 - 15740735
Alignment:
Q  78 ctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttag 177  Q
    ||||||||||   ||||||||||||| ||||||| || |||| |||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||  | ||||| |  |||||    
T  15740624 ctttttggtccattaactatttaattagtatcggtttggtcccctaactaaaatttgatttattttggtcccttaagtttctttccgttaccacttttag 15740723  T
Q  178 tcctttctgtta 189  Q
    ||||||| ||||    
T  15740724 tcctttccgtta 15740735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 72 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 15741677 - 15741607
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttattt 142  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||    
T  15741677 aattacctttttggtcccttaactatttaattggtatcggtttggtcctctaactaaattttgatttattt 15741607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 116 - 189
Target Start/End: Original strand, 24652901 - 24652974
Alignment:
Q  116 gtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagtcctttctgtta 189  Q
    ||||| |||||||||| | |||||||| |||||||||| ||| |||| ||||| |||||| |||||||||||||    
T  24652901 gtcctttaactaaaaaataatttattttggtcctctaactttatcaccgttaccatatttcgtcctttctgtta 24652974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 70 - 148
Target Start/End: Original strand, 29769366 - 29769444
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcc 148  Q
    ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||| || || |  ||||||||  ||||||||||| |||||    
T  29769366 taaattacctttttggtctcttaactatttaattggtttcggtttggttccttaactaaattttgatttattttggtcc 29769444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 52)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 70 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 34735790 - 34735560
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34735790 taaattacatttttggtcctctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctttaagtttctcactgttact 34735691  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcc 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34735690 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctattcc 34735591  T
Q  270 ttgttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  34735590 ttgttaaggtattaggattaaatagtgactg 34735560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 70 - 298
Target Start/End: Original strand, 15744460 - 15744688
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15744460 taaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctaactgttact 15744559  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcc 269  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15744560 acatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagcatcattttggtcatattcc 15744659  T
Q  270 ttgttaaggtattatgattaaataatgac 298  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15744660 ttgttaaggtattatgattaaatagtgac 15744688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 65 - 299
Target Start/End: Original strand, 13192986 - 13193220
Alignment:
Q  65 tagggtaaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 164  Q
    |||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13192986 taggctaaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 13193085  T
Q  165 ttactatatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcat 264  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13193086 ttactacatttagtcttttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgttggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcat 13193185  T
Q  265 attccttgttaaggtattatgattaaataatgact 299  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13193186 atgccttgttaaggtattatgattaaataatgact 13193220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 70 - 293
Target Start/End: Original strand, 7469169 - 7469392
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7469169 taaattacctttttggccctctaactatttaattggtatcagattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttact 7469268  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcc 269  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  7469269 acatttagtcttttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttactagtatcattttggtcctattcc 7469368  T
Q  270 ttgttaaggtattatgattaaata 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  7469369 ttgttaaggtattatgattaaata 7469392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 70 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 26182147 - 26181917
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    |||||||  ||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26182147 taaattacatttttggtcctttaattatttaattgatatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggccctctaagtttctcactgttact 26182048  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcc 269  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26182047 acatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgcc 26181948  T
Q  270 ttgttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26181947 ttgttaaggtattatgattaaatagtgactg 26181917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 72 - 300
Target Start/End: Original strand, 29472247 - 29472475
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||     
T  29472247 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaatagatttattttggtcctctaagtttctcaccgttcctac 29472346  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcctt 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29472347 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaggtttgtgttatgtgagtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgcctt 29472446  T
Q  272 gttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29472447 gttaaggtattatgattaaatagtgactg 29472475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 64 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 8174338 - 8174102
Alignment:
Q  64 ttagggtaaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcact 163  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||     
T  8174338 ttaggctaaattatctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattaatttatttcggtcctttaaatttctcacc 8174239  T
Q  164 gttactatatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtca 263  Q
    ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |      
T  8174238 gtttctacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgtttt 8174139  T
Q  264 tattccttgttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8174138 tattccttgttaaggtattatgattaaatagtgactg 8174102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 70 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 19816151 - 19815921
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    ||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||    
T  19816151 taaattacctttttggtcctcaaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttcagaccattact 19816052  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcc 269  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19816051 acatttagtcctttctgctagttttattcaaataaacgttagagtctgtgttatgtgggtcctctgactttatttattagtatcattttgctcatattcc 19815952  T
Q  270 ttgttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19815951 ttgttaaggtattatgattaaatagtgactg 19815921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 70 - 300
Target Start/End: Original strand, 38332707 - 38332937
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    |||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38332707 taaattacatttttggttctctaactatttaattggtattggattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttact 38332806  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcc 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  38332807 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaatgttagggtttgttttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatgcc 38332906  T
Q  270 ttgttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  38332907 ttgttaagatattatgattaaatagtgactg 38332937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 64 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 24372420 - 24372192
Alignment:
Q  64 ttagggtaaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcact 163  Q
    ||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  24372420 ttaggctaaattacatttttggtcctctaactatttaattggtatcagattagtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcacc 24372321  T
Q  164 gttactatatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtca 263  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24372320 gttactacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacattaggatttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcc 24372221  T
Q  264 tattccttgttaaggtattatgattaaat 292  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||    
T  24372220 tattcctttttaaagtattatgattaaat 24372192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 70 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 15406202 - 15405973
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    ||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15406202 taaattacctttttg-tcctctaactatttaattggtattggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttcttactgttact 15406104  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcc 269  Q
    | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  15406103 acatttaatcttttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgagtcctctaactttatttattagtattattttggtcatatgtc 15406004  T
Q  270 ttgttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  15406003 ttgttaaggtattatgattaaacagtgactg 15405973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 79 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 19847756 - 19847538
Alignment:
Q  79 tttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagt 178  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  19847756 tttttggtcatctaactatttagttggtattggattggtcctctaactaaaaattaatttatttcggtcttctaagtttctcaccgttactacatttagt 19847657  T
Q  179 cctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattccttgttaagg 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  19847656 cctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagcatcattttggtcatattccttgttaa-g 19847558  T
Q  279 tattatgattaaataatgac 298  Q
     |||||||||||||| ||||    
T  19847557 aattatgattaaatagtgac 19847538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 72 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 24138952 - 24138723
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| || ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  24138952 aattacctttttggtattctaactatttaattggtatcaaattagtactttaattaaaaattgatttatttcggtcttctaagtttctcactgttactac 24138853  T
Q  172 atttagtccttt-ctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcct 270  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  24138852 atttagtctttttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatgcct 24138753  T
Q  271 tgttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  24138752 tgttaagatattatgattaaatagtgactg 24138723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 80 - 293
Target Start/End: Original strand, 16305037 - 16305251
Alignment:
Q  80 ttttggtcttctaactatttaattggtatcggattag-tcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagt 178  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  16305037 tttttgtcctctaactatttaattggtatcggatttggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcacaattactacatttagt 16305136  T
Q  179 cctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattccttgttaagg 278  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||     
T  16305137 tctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgtcttgttaaga 16305236  T
Q  279 tattatgattaaata 293  Q
    |||||||||||||||    
T  16305237 tattatgattaaata 16305251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 79 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 7496417 - 7496199
Alignment:
Q  79 tttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagt 178  Q
    ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||    
T  7496417 tttttagtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctttaagtttctcaccgttactacatttagt 7496318  T
Q  179 cctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattccttgttaagg 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |    
T  7496317 cctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggttctctaactttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaa-g 7496219  T
Q  279 tattatgattaaataatgac 298  Q
     ||||||| |||||| ||||    
T  7496218 aattatgagtaaatagtgac 7496199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 91 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 2148312 - 2148103
Alignment:
Q  91 taactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagtcctttctgttag 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||    
T  2148312 taactatttaattggtatcggattgatcctctaactaaaaattgatttattttggtcctttaagtttctcatcgttactacatttagtcatttctgttag 2148213  T
Q  191 ttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattccttgttaaggtattatgattaa 290  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  2148212 ttttattcaaataaacgttagagtttctgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgtcttgttaaggtattatgattaa 2148113  T
Q  291 ataatgactg 300  Q
    ||| ||||||    
T  2148112 atagtgactg 2148103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 116 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 12860768 - 12860586
Alignment:
Q  116 gtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtt 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12860768 gtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttacggtt 12860669  T
Q  216 tgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattccttgttaaggtattatgattaaataatgac 298  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12860668 tgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaaggtattatgattaaatagtgac 12860586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 70 - 300
Target Start/End: Original strand, 41474085 - 41474315
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41474085 taaattacatttttggtcttctaactatttaattggtatcggatcggtcctgtaattaaaaatttatttatttcggtcctctaagtttctcactgttatt 41474184  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcc 269  Q
    | |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||    
T  41474185 acatttagtcttttatgttagttttatttaaataaacgttagtgtttgtgttatgtgggtcatctaactttatttattagtatcattttgatcctatgcc 41474284  T
Q  270 ttgttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  41474285 ttgttaaggtattataattaaatagtgactg 41474315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 70 - 298
Target Start/End: Original strand, 10991854 - 10992082
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||    
T  10991854 taaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaaatttttcaccgttact 10991953  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcc 269  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  |    
T  10991954 acatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttacagtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagcatcattttggtcctatgtc 10992053  T
Q  270 ttgttaaggtattatgattaaataatgac 298  Q
    ||| |||| ||||||||||||||| ||||    
T  10992054 ttgctaagatattatgattaaatagtgac 10992082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 70 - 290
Target Start/End: Original strand, 36713591 - 36713809
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    ||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||    
T  36713591 taaattacctttttgatcctctaactatttaattggtatcggattgatcttctaactaaaaattgatttatttatgtcctctaaatttctcagtgttact 36713690  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcc 269  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||| ||    
T  36713691 acatttagtcttttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattag--tcattttggttctatgcc 36713788  T
Q  270 ttgttaaggtattatgattaa 290  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  36713789 ttgttaaggtattatgattaa 36713809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 72 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 33470368 - 33470195
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  33470368 aattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattgatcctctgactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactac 33470269  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttattta 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33470268 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttattta 33470195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 72 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 41474527 - 41474373
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  41474527 aattatctttttggtcctctaattatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctgagtttctcactgttactac 41474428  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41474427 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtg 41474373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 62 - 229
Target Start/End: Original strand, 24138063 - 24138230
Alignment:
Q  62 agttagggtaaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctca 161  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24138063 agttaggctaaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtccactaagtttctca 24138162  T
Q  162 ctgttactatatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgt 229  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24138163 ccgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaatgttagggtttgtgttatgtgtgt 24138230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 79 - 223
Target Start/End: Original strand, 7495992 - 7496136
Alignment:
Q  79 tttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagt 178  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7495992 tttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagt 7496091  T
Q  179 cctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttat 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7496092 cctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttat 7496136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 72 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 38333125 - 38332974
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  38333125 aattatctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactac 38333026  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttat 223  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38333025 atttagtcatttctattagttttattcaaataaacgttaggatttgtgttat 38332974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 79 - 223
Target Start/End: Original strand, 12860392 - 12860536
Alignment:
Q  79 tttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagt 178  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  12860392 tttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcaccgttactacatttagt 12860491  T
Q  179 cctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttat 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12860492 cctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttat 12860536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 79 - 226
Target Start/End: Original strand, 15405768 - 15405915
Alignment:
Q  79 tttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagt 178  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  15405768 tttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcttctaagtttctcaccgttactacatttagt 15405867  T
Q  179 cctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15405868 catttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtg 15405915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 72 - 226
Target Start/End: Original strand, 8173890 - 8174044
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  8173890 aattacctttttggtcctctaactatttaattgatatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactac 8173989  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8173990 atttagtcctttctgttaattttattcaaatgaacgttagggtttgtgttatgtg 8174044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 72 - 226
Target Start/End: Original strand, 24371972 - 24372126
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  24371972 aattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactac 24372071  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24372072 atttagttctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtattatgtg 24372126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 76 - 226
Target Start/End: Original strand, 34735352 - 34735502
Alignment:
Q  76 atctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatattt 175  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  34735352 atctttttggtcctctaactatttagttggtatcgaattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactacattt 34735451  T
Q  176 agtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34735452 agtcctttctattagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 34735502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 79 - 226
Target Start/End: Original strand, 19815716 - 19815863
Alignment:
Q  79 tttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagt 178  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  19815716 tttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggttctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactacatttagt 19815815  T
Q  179 cctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  19815816 cctttctgttagttttattcaaataaacgttatgatttgtgttatgtg 19815863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 72 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 13193433 - 13193279
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  13193433 aattatatttttggtcctctaactatttaattggtatcagattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactac 13193334  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13193333 atttagtcttttctattagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtg 13193279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Original strand, 26181705 - 26181862
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  26181705 aattacctttttggtcctctaactatttaattggaattggattggtccactaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactac 26181804  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgt 229  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  26181805 atatattcctttctgttagttttattcaaataaaccttaaggtttgtgttatgtgtgt 26181862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 97 - 226
Target Start/End: Original strand, 42834452 - 42834581
Alignment:
Q  97 tttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagtcctttctgttagttttat 196  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  42834452 tttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggttctctaagtttctcactattactacatttagtcttttctgttagttttat 42834551  T
Q  197 tcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42834552 tcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 42834581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 78 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 29472681 - 29472533
Alignment:
Q  78 ctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttag 177  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  29472681 ctttttggtcctctaactatttaattggtattggattgatcctctaacaaaaaattgatttattttggtcctctaaatttctcaccgttactacatttag 29472582  T
Q  178 tcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29472581 tcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 29472533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 79 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 30898739 - 30898595
Alignment:
Q  79 tttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagt 178  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  30898739 tttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttgttcctctaagtttctcaccgttactacatttagt 30898640  T
Q  179 cctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttat 223  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30898639 catttctgttagttttattcaaataaacgttcgggtttgtgttat 30898595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 72 - 226
Target Start/End: Original strand, 2147890 - 2148045
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaat-tgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttacta 170  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  2147890 aattacctttttggtcctctaactatttaattagtatcagattggtcctctaactaaaaaaatgatttatttcgggcctctaagtttctcaccgttacta 2147989  T
Q  171 tatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2147990 catttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtg 2148045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 72 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 16305470 - 16305316
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||     
T  16305470 aattatctttttgatcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcaatcctctaagtttctcaccgttactac 16305371  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||    
T  16305370 atttagtcttttttgttagttttattcaaataagagttatggtttgtgttatgtg 16305316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 81 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 17052490 - 17052345
Alignment:
Q  81 tttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagtcc 180  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||||||||     
T  17052490 tttggtcctctaactatttaattggtattagattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcaccnttactacatttagtca 17052391  T
Q  181 tttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17052390 tttctgttagtttcattcaaataaacgttagtgtttgtgttatgtg 17052345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 54 - 177
Target Start/End: Original strand, 17032580 - 17032703
Alignment:
Q  54 ataataaaagttagggtaaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaa 153  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17032580 ataataaaacttaggctaaattatctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctcgaa 17032679  T
Q  154 gtttctcactgttactatatttag 177  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||    
T  17032680 gtttctcaccgttactacatttag 17032703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 116 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 10992252 - 10992142
Alignment:
Q  116 gtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtt 215  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10992252 gtcctctaattaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtt 10992153  T
Q  216 tgtgttatgtg 226  Q
    |||||||||||    
T  10992152 tgtgttatgtg 10992142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 54 - 177
Target Start/End: Original strand, 17050916 - 17051039
Alignment:
Q  54 ataataaaagttagggtaaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaa 153  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17050916 ataataaaatttaggctaaattatctttttggtcctctaactatttaattggtattggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctcgaa 17051015  T
Q  154 gtttctcactgttactatatttag 177  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||    
T  17051016 gtttctcaccgttactacatttag 17051039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 72 - 196
Target Start/End: Original strand, 8444827 - 8444951
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  8444827 aattacctttttggtcttctaactatttagttgatatcggattggttatctaactaaaaattaatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactac 8444926  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttat 196  Q
    |||||||| ||||||||||||||||    
T  8444927 atttagtcatttctgttagttttat 8444951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 77 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 36714025 - 36713876
Alignment:
Q  77 tctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatattta 176  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||| ||||| | | |||    
T  36714025 tctttttggttctctaactatttaattggtattgaattggtcctcaaactaaaaattgatttattttcgtcatctaggtttctcaccgttaccacactta 36713926  T
Q  177 gtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36713925 gtcatttctgtttgttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtg 36713876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 66 - 218
Target Start/End: Original strand, 8962359 - 8962510
Alignment:
Q  66 agggtaaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgt 165  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||    
T  8962359 agggtaaattatctttttggtcctctaactatttaattagtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtccctcaagtttctcaccgt 8962458  T
Q  166 tactatatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgt 218  Q
    ||||| |||||||| ||||  |||  |||| | ||| ||||||||||||||||    
T  8962459 tactacatttagtcttttccattaaatttaattaaa-aaacgttagggtttgt 8962510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 174 - 300
Target Start/End: Original strand, 17052164 - 17052287
Alignment:
Q  174 ttagtcctttctgttagttttattcaaataaa-cgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattccttg 272  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      |    
T  17052164 ttagtctttgctgttagttttattcaaataaaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtctta----acg 17052259  T
Q  273 ttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17052260 ttaaggtattatgattaaataatgactg 17052287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 79 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 15744885 - 15744751
Alignment:
Q  79 tttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagt 178  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  15744885 tttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcaccgttactacatttagt 15744786  T
Q  179 cctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttat 223  Q
    |          |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15744785 c----------gttttatttaaataaacgttagggtttgtgttat 15744751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 70 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 8445236 - 8445127
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  8445236 taaattaccttttttgtcctctaactatttaattggtatcggattagcactctaattaaaaattgatttacttcggtcctctaagtttatcacagttact 8445137  T
Q  170 atatttagtc 179  Q
    | ||||||||    
T  8445136 acatttagtc 8445127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 72 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 7469603 - 7469458
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  |           
T  7469603 aattacctttttggttctctaactatttagttggtatcagattggttctctaactaaaaattgatttatttcagtcgtctaagtttctcatcg------- 7469511  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgt 225  Q
     ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7469510 -tttagtcatttatgttagttttattcaaataaacgttatggtttgtgttatgt 7469458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 70 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 8963264 - 8963166
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttac 168  Q
    |||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| |||||    
T  8963264 taaattacttttttggttctctaactatttaattggtatcggattggttctctaactaaaaattgatttattttggtcccttaagtttctcaccgttac 8963166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 70 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 23992289 - 23992162
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    |||||| |||||||||||    |||||||||||| ||||||| || |||| |||||||||| ||||||||||| |||||  ||| ||||||  |||||||    
T  23992289 taaattgtctttttggtccctgaactatttaattagtatcggtttggtcccctaactaaaatttgatttattttggtcccttaaatttctctttgttact 23992190  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttatt 197  Q
    |  ||||| | |||| |||| |||||||    
T  23992189 aattttagacatttccgttaattttatt 23992162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 91 - 218
Target Start/End: Original strand, 23991290 - 23991417
Alignment:
Q  91 taactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagtcctttctgttag 190  Q
    |||||||||| |||||||||| || || |  |||||| |  || |||||||| |||||  ||| ||| || ||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  23991290 taactatttatttggtatcggtttggttccttaactatattttaatttattttggtcccttaaatttatctctgttatcatatttagtcttttctgttag 23991389  T
Q  191 ttttattcaaataaacgttagggtttgt 218  Q
    ||||| |  || |||| |||||||||||    
T  23991390 ttttaatagaagaaaccttagggtttgt 23991417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 78)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 64 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 12481512 - 12481278
Alignment:
Q  64 ttagggtaaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcact 163  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12481512 ttaggctaaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcact 12481413  T
Q  164 gttactatatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtca 263  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  12481412 gttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagcatcattttggtcc 12481313  T
Q  264 tattccttgttaaggtattatgattaaataatgac 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12481312 tattccttgttaaggtattatgattaaatagtgac 12481278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 70 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 49140589 - 49140360
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  49140589 taaattatctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattagtcctctaactaaaa-ttgatttatttcggtcctataagtttctcactgttact 49140491  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcc 269  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  49140490 acatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggttatattcc 49140391  T
Q  270 ttgttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  49140390 ttgttaaggtattatgattaaatagtgactg 49140360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 64 - 299
Target Start/End: Original strand, 37304025 - 37304260
Alignment:
Q  64 ttagggtaaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcact 163  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  37304025 ttaggctaaattacctttttggtcctctaaccatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcagtcctctaagtttctcacc 37304124  T
Q  164 gttactatatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtca 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37304125 gttactatatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgagggtcctctaactttatttattagtatcattttggtca 37304224  T
Q  264 tattccttgttaaggtattatgattaaataatgact 299  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37304225 tatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgact 37304260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 70 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 6798254 - 6798025
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  6798254 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaaatttctcaccgttact 6798155  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcc 269  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6798154 acatttagtcctttatgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgagggtcctctaattttatttattagtatcattttggtcatatgcc 6798055  T
Q  270 ttgttaaggtattatgattaaataatgact 299  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6798054 ttgttaaggtattatgattaaatagtgact 6798025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 70 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 35612529 - 35612299
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  35612529 taaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcagtcctctaagtttatcactgttact 35612430  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcc 269  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  35612429 acatttattcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtctgtgttatgttggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgtc 35612330  T
Q  270 ttgttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35612329 ttgttaaggtattatgattaaatagtgactg 35612299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 70 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 45053136 - 45052906
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  45053136 taaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcatctaagtttctcagtgttact 45053037  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcc 269  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  45053036 acatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatgcc 45052937  T
Q  270 ttgttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45052936 ttgttaaggtattatgattaaatagtgactg 45052906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 70 - 299
Target Start/End: Original strand, 16023900 - 16024129
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16023900 taaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttact 16023999  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcc 269  Q
    | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16024000 acatttagtcttttctgttagtcttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgagggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgcc 16024099  T
Q  270 ttgttaaggtattatgattaaataatgact 299  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  16024100 ttgttgaggtattatgattaaatagtgact 16024129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 72 - 300
Target Start/End: Original strand, 20306007 - 20306235
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||     
T  20306007 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggttctctaagtttcccaccgttattac 20306106  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcctt 271  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20306107 atttagtcatttctgttggttttattcaaataaacgttaggatttgtgttatgtgagtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgcctt 20306206  T
Q  272 gttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20306207 gttaaggtattatgattaaatagtgactg 20306235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 70 - 298
Target Start/End: Original strand, 37576184 - 37576412
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    ||||||| |||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||    
T  37576184 taaattacctttttggtcctttaactattaaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaaatttatcaaagttact 37576283  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcc 269  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  37576284 aaatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttataagtatcattttggtcctattcc 37576383  T
Q  270 ttgttaaggtattatgattaaataatgac 298  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  37576384 ttgttaaggtattaggattaaatagtgac 37576412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 70 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 1763121 - 1762891
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  1763121 taaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcaaattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcatcgttact 1763022  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcc 269  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1763021 acatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgcc 1762922  T
Q  270 ttgttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
    ||||||| || || |||||||||| ||||||    
T  1762921 ttgttaaagtgttctgattaaatagtgactg 1762891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 70 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 23476788 - 23476565
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23476788 taaattacatttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcattgttact 23476689  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcc 269  Q
      |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |    
T  23476688 tcatttagtcttttctgttagttttattcaaataaacgttaatgtttgtgttatgtgagtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatgtc 23476589  T
Q  270 ttgttaaggtattatgattaaata 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  23476588 ttgttaaggtattatgattaaata 23476565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 71 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 4330283 - 4330061
Alignment:
Q  71 aaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttacta 170  Q
    |||||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4330283 aaattaccttttttgtcctctaattatttaattggtatcggattaaccctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttcttactgttacta 4330184  T
Q  171 tatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcct 270  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  4330183 catttagtcctttctcttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcttctaactttatttattagtatcattttaatcatattcct 4330084  T
Q  271 tgttaaggtattatgattaaata 293  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  4330083 tgttaaggtattatggttaaata 4330061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 89 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 12127484 - 12127277
Alignment:
Q  89 tctaactatttaattggtatcggattagt---cctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagtcctttct 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| |||||    
T  12127484 tctaactatttaattggtatcggattagttctcctctaattaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctgaccgttactacatttagtcatttct 12127385  T
Q  186 gttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattccttgttaaggtattatg 285  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12127384 gttagttttgttcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattccttgttaaggtattatg 12127285  T
Q  286 attaaata 293  Q
    ||||||||    
T  12127284 attaaata 12127277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 72 - 293
Target Start/End: Original strand, 38127714 - 38127935
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38127714 aattacctttttggttctctaactatttaattggtttcggattggtcatctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcactgttactat 38127813  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcctt 271  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  38127814 atttagtccttgctgttagttttattcaaataaacgttatggtttgttttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgcctt 38127913  T
Q  272 gttaaggtattatgattaaata 293  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  38127914 attaaggtattatgattaaata 38127935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 64 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 9006643 - 9006408
Alignment:
Q  64 ttagggtaaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcact 163  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||     
T  9006643 ttaggctaaattatctttttggtcttctaactatttaatcgttatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttggatcctccaagtttctcacc 9006544  T
Q  164 gttactatatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtca 263  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  9006543 -ttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcc 9006445  T
Q  264 tattccttgttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  9006444 tatgccttgttaatgtattatgattaaatagtgactg 9006408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 64 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 2064664 - 2064429
Alignment:
Q  64 ttagggtaaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcact 163  Q
    ||||| |||||||  |||||| || ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2064664 ttaggctaaattacatttttgatcctctaactatttaattggtatcggattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggttctctaagtttctcact 2064565  T
Q  164 gttactatatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtca 263  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  2064564 gttactacatttaatcatttctgttagttttattcaaataaatgttagagtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtct 2064465  T
Q  264 tattccttgttaaggtattatgattaaataatgact 299  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2064464 tatgtcttgttaaggtattatgattaaatagtgact 2064429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 70 - 300
Target Start/End: Original strand, 3089345 - 3089575
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  3089345 taaattaccttttgggtcctctaactatttaattggcatcggattggtactctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttatt 3089444  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcc 269  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  3089445 acatttagtcctttctgttagtttaattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtggatcctataactttatttattagtatcattttggtcatatgtc 3089544  T
Q  270 ttgttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  3089545 ttgttaaagtattatgattaaatagtgactg 3089575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 70 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 27548116 - 27547886
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27548116 taaattaccttttttgtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttact 27548017  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcc 269  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |     
T  27548016 acatttaatcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttatggtatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtactatgct 27547917  T
Q  270 ttgttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  27547916 ttgttaaagtattatgattaaatagtgactg 27547886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 70 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 8762846 - 8762623
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||    
T  8762846 taaattacatttttggtcatctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcatcggtact 8762747  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcc 269  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  8762746 acatttagtcctttctgttagctttattcaaataaacgttaagagttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgtc 8762647  T
Q  270 ttgttaaggtattatgattaaata 293  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  8762646 ttgttaaggtattatgaataaata 8762623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 70 - 293
Target Start/End: Original strand, 25995787 - 25996010
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25995787 taaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctttaattaaaaattgatttatttcggtcctttaagtttctcactgttact 25995886  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcc 269  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  25995887 acatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttgagatttgtgttatgtggatcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatgcc 25995986  T
Q  270 ttgttaaggtattatgattaaata 293  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    
T  25995987 ttgttaaggtaatatgattaaata 25996010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 57 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 49644130 - 49643895
Alignment:
Q  57 ataaaagttagggtaaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtt 156  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  49644130 ataaatgttaggctaaattatctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaattaaaaattgatttaattcggtcctctaagtt 49644031  T
Q  157 tctcactgttactatatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcatt 256  Q
    ||   |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  49644030 tccatccattactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgtta-ggtttgtgttatgtgggttctctaactttatttattagtatcatt 49643932  T
Q  257 ttggtcatattccttgttaaggtattatgattaaata 293  Q
    ||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  49643931 ttgatcctatgccttgttaaggtattatgattaaata 49643895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 116 - 298
Target Start/End: Original strand, 31703663 - 31703845
Alignment:
Q  116 gtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtt 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31703663 gtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctttaagtttctcaccgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttggggtt 31703762  T
Q  216 tgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattccttgttaaggtattatgattaaataatgac 298  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31703763 tgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagcatcattttggttctattccttgttaaggtattatgattaaatagtgac 31703845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 70 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 37285174 - 37284945
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    |||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||  |||||    
T  37285174 taaattacatttttggtcctttaactatttaattggtattagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcgattctctaaatttctcacaattact 37285075  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcc 269  Q
    | |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37285074 acatttagtcctta-tgttagttttatttaaataaatgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgcc 37284976  T
Q  270 ttgttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37284975 ttgttaaggtattatgattaaatagtgactg 37284945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 70 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 37586140 - 37585910
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||    
T  37586140 taaattatcttttttgtcatctaactacttaattggtatcggattgatcctctaattaaaaattaatttatttcggtcttctaagtttttcaccgttact 37586041  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcc 269  Q
    | |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  37586040 acatttagtcatttatgttagttttattcaaataaacgttagagtttatattatgtgggtcctctaactttatttattagtattattttggtcatatgtc 37585941  T
Q  270 ttgttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  37585940 ttgttaagatattatgattaaatagtgactg 37585910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 70 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 45843564 - 45843372
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  45843564 taaattacatttttggtcctctaactatttaattggtattagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaagtttctcaccgttact 45843465  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtc 262  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  45843464 acatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctagctttttttattagtatcattttggtc 45843372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 79 - 226
Target Start/End: Original strand, 49643683 - 49643830
Alignment:
Q  79 tttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagt 178  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  49643683 tttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagt 49643782  T
Q  179 cctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  49643783 cctttctgttagttttattcaaataaacattagggtttgtgttatgtg 49643830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 126 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 27400815 - 27400641
Alignment:
Q  126 taaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgt 225  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27400815 taaaaattgatttattttgttcctctaaatttctcaccgttactacatttagtcttttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgt 27400716  T
Q  226 gtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattccttgttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  27400715 gggtcctctaactttatttattagtatcattttagtcttatgccttgttaatgtattatgattaaatagtgactg 27400641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 72 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 44323105 - 44322951
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  44323105 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactac 44323006  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44323005 atttagtcatttctgttagttttattcaaataaatgttagggtttgtgttatgtg 44322951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 70 - 226
Target Start/End: Original strand, 4696885 - 4697041
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4696885 taaattatctttttagtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctataactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcactgttact 4696984  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4696985 acatttagtcctttctgttagtttaattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtg 4697041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 72 - 226
Target Start/End: Original strand, 27547674 - 27547828
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||     
T  27547674 aattacctttttggtcttttaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttaatac 27547773  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27547774 atttagtcctttctgttggttttattcaaataaacgttagggtttgtgtcatgtg 27547828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Original strand, 35612087 - 35612244
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||     
T  35612087 aattacctttttggtcctctaagtatttaattggtatcggattgatcctctaactaaaaattgatttattttgttcctctaagtttctcactgttactac 35612186  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgt 229  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35612187 atttagtcctttcttttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgt 35612244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 65 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 37304480 - 37304319
Alignment:
Q  65 tagggtaaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 164  Q
    |||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  37304480 taggttaaattatttttttggccctctaactatttaattggtatcggattgatcctataactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg 37304381  T
Q  165 ttactatatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37304380 ttactacatttagtcctttatgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 37304319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 79 - 223
Target Start/End: Original strand, 12481071 - 12481215
Alignment:
Q  79 tttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagt 178  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  12481071 tttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcaccgttactacatttagt 12481170  T
Q  179 cctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttat 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12481171 cctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttat 12481215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 79 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 16024335 - 16024188
Alignment:
Q  79 tttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagt 178  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  16024335 tttttggtcctctaactatttaattggtatcggattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactacatttagt 16024236  T
Q  179 cctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16024235 cctttctggtagttttattcaaataaacgttagggtttatgttatgtg 16024188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 72 - 226
Target Start/End: Original strand, 9006196 - 9006350
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||     
T  9006196 aattatctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattgatcctttaactaaaaattgatttatttcggtcatctaagtttatcaccgttagtac 9006295  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9006296 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 9006350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 72 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 37576626 - 37576472
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  37576626 aattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggttctctaagtttctcactgttactac 37576527  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37576526 atttagtcttttctgttagttttattcaaataaacattagggtttgtgttatgtg 37576472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 72 - 226
Target Start/End: Original strand, 49140148 - 49140302
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  49140148 aattatctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactac 49140247  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  49140248 atttagtcatttctcttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtg 49140302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 72 - 223
Target Start/End: Original strand, 38000494 - 38000645
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  38000494 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcttctaattaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcattgttactac 38000593  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttat 223  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38000594 atttagtcctttctattagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttat 38000645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 72 - 226
Target Start/End: Original strand, 12127062 - 12127216
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||     
T  12127062 aattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggttctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtttctac 12127161  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  12127162 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttatgatttgtgttatgtg 12127216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 79 - 226
Target Start/End: Original strand, 1762686 - 1762833
Alignment:
Q  79 tttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagt 178  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |    
T  1762686 tttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttacaacatttaat 1762785  T
Q  179 cctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  1762786 catttatgttagttttattcaaataaacattagggtttgtattatgtg 1762833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 89 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 39486620 - 39486448
Alignment:
Q  89 tctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagtcctttctgtt 188  Q
    |||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| | || ||||||| ||||||||||||| |||    
T  39486620 tctaactatttaattggtattgaattgttcctctaactaaaaattgatttatttccgttttctaagttttttaccgttactacatttagtcctttcagtt 39486521  T
Q  189 agttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtc 262  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39486520 agttttattcaaa-aaacgttagggtttgtgttatatgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtc 39486448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 78 - 226
Target Start/End: Original strand, 26707207 - 26707355
Alignment:
Q  78 ctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttag 177  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||    
T  26707207 ctttttggtcctctaactatttaattggtatcagatcggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctccccgttactacatttag 26707306  T
Q  178 tcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  26707307 tcatttctgttagttttattcaaataaacgttggagtttgtgttatgtg 26707355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 65 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 26723253 - 26723089
Alignment:
Q  65 tagggtaaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 164  Q
    |||| ||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  26723253 taggctaaattacctttttgatcctctaactatttaattggtatcagattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcaccg 26723154  T
Q  165 ttactatatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgt 229  Q
    ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26723153 ttattacatttaatcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggttcgtgttatgtgtgt 26723089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 79 - 226
Target Start/End: Original strand, 23476353 - 23476500
Alignment:
Q  79 tttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagt 178  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  23476353 tttttggtcctctaactatttaattggtattagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtccactaagtttctcaccgttactacatttagt 23476452  T
Q  179 cctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  23476453 cctttctgttagttttattcaaataaacgttagaatctgtgttatgtg 23476500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 64 - 226
Target Start/End: Original strand, 39486199 - 39486361
Alignment:
Q  64 ttagggtaaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcact 163  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||     
T  39486199 ttagggtaaattatctttttggttctctaactatttaattggtattggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcgtttaagtttctcaca 39486298  T
Q  164 gttactatatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
     |||||  |||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39486299 tttactgcatttggtcttttctgttagttctattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtg 39486361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 72 - 226
Target Start/End: Original strand, 45052695 - 45052848
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  45052695 aattatctttttgatcttcaaactatttaattggtatcagattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctataagtttctcactgttactac 45052794  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  45052795 atttaatcatttctgttagttttattcaaataaacgttaaggttt-tgttatgtg 45052848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 79 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 31704051 - 31703907
Alignment:
Q  79 tttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagt 178  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  31704051 tttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggacctataagtttctcactgttactacatttagt 31703952  T
Q  179 cctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttat 223  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  31703951 cctttctgttaattttattcaaataaacgttaggctttatgttat 31703907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 72 - 226
Target Start/End: Original strand, 8760277 - 8760431
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||     
T  8760277 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattgaccctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaagtttttcagtgttactac 8760376  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8760377 atttagtcatttatgttagctttattcaaataaacattagggtttgtgttatgtg 8760431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 72 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 20306447 - 20306293
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    ||||| || ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||  ||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||     
T  20306447 aattacctctttggtcctctaactagttaattggtatcagattgatcctccaactaaagattgatttattttggtcctttaagtttctcactgttactac 20306348  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20306347 atttagtcctttctattagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 20306293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 79 - 225
Target Start/End: Original strand, 37585705 - 37585851
Alignment:
Q  79 tttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagt 178  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  37585705 tttttggtcctctaactatttaattggtattagattgatcctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaaatttctcaccgttattatatttagt 37585804  T
Q  179 cctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgt 225  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37585805 catttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgt 37585851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 79 - 225
Target Start/End: Original strand, 37284740 - 37284886
Alignment:
Q  79 tttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagt 178  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||    
T  37284740 tttttggtcctctaactatttaattgatatcggattggttctctaactaaaaattgatttatttcggtcatttaagtttctcaccgttactacatttagt 37284839  T
Q  179 cctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgt 225  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  37284840 cttttttgttagttttattcaaataagagttatggtttgtgttatgt 37284886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 64 - 206
Target Start/End: Original strand, 23598069 - 23598213
Alignment:
Q  64 ttagggtaaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcact 163  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||     
T  23598069 ttaggctaaattatctttttggtcctctaactatttaattggtatcgaattggtcctctaactaaaaattgatttatttcagtcctctaaatttctcacc 23598168  T
Q  164 gttactatatttagtcctttctgttagttt--tattcaaataaac 206  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||||||||  |||||||||||||    
T  23598169 gttactacatttagtcatttttgttagttttatattcaaataaac 23598213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 79 - 226
Target Start/End: Original strand, 6797819 - 6797966
Alignment:
Q  79 tttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagt 178  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  6797819 tttttggttctctaactatttaattgatatcagattgatcttctaattaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactccatttagt 6797918  T
Q  179 cctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6797919 catttctgttagttttgttcaaataaacgttagagtttgtgttatgtg 6797966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 64 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 46593683 - 46593559
Alignment:
Q  64 ttagggtaaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcact 163  Q
    ||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  46593683 ttaggctaaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcct-taagtttctcact 46593585  T
Q  164 gttactatatttagtcctttctgtta 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||    
T  46593584 gttactatatttagtcatttccgtta 46593559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 65 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 5537256 - 5537132
Alignment:
Q  65 tagggtaaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 164  Q
    |||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  5537256 taggttaaattatatttttggtcctctaactatttaatcggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcccttaagattctcactg 5537157  T
Q  165 ttactatatttagtcctttctgtta 189  Q
    |||||| |||||||| |||| ||||    
T  5537156 ttactacatttagtcatttccgtta 5537132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 64 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 34967175 - 34967050
Alignment:
Q  64 ttagggtaaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcact 163  Q
    ||||| |||||||  |||||| |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||     
T  34967175 ttaggctaaattacatttttgattctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtccattaagtttctcacc 34967076  T
Q  164 gttactatatttagtcctttctgtta 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||    
T  34967075 gttactatatttagtcatttccgtta 34967050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 70 - 218
Target Start/End: Original strand, 10831134 - 10831281
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||| ||||||    
T  10831134 taaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcgaattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggttccttaagtttttcaccgttact 10831233  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgt 218  Q
    | ||||||||||||  ||||  |||| | ||| ||||||||||||||||    
T  10831234 acatttagtccttttcgttaaatttaattaaa-aaacgttagggtttgt 10831281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 68 - 189
Target Start/End: Original strand, 34966304 - 34966425
Alignment:
Q  68 ggtaaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtta 167  Q
    ||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  34966304 ggtaaattacctttttggacctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaacttgatttatttcagtcccttaagtttctcactgtta 34966403  T
Q  168 ctatatttagtcctttctgtta 189  Q
    ||  |||||||| ||| |||||    
T  34966404 ctgcatttagtcttttatgtta 34966425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 70 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 37467667 - 37467554
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  37467667 taaattacctttttggtcatctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattaatttatttaggtcccttaagtttctcactgttact 37467568  T
Q  170 atatttagtccttt 183  Q
    | |||  |||||||    
T  37467567 acattcggtccttt 37467554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 70 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 13109274 - 13109191
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaa 153  Q
    ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13109274 taaattacctttttagtcctctaactatttaattggtatccgattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaa 13109191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 222 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 26707491 - 26707413
Alignment:
Q  222 atgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattccttgttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26707491 atgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactg 26707413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 70 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 10832033 - 10831935
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttac 168  Q
    |||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||    
T  10832033 taaattacttttttggtcctctaactatttaactggtattggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcccttaagtttctcaccgttac 10831935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 79 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 28884861 - 28884751
Alignment:
Q  79 tttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagt 178  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||    
T  28884861 tttttggtcctctaactatttaattggttacggtttggtcctctaactaaaaaatgatttattttagtcctctaactttatcactgttaccatatttcgt 28884762  T
Q  179 cctttctgtta 189  Q
    |||||||||||    
T  28884761 cctttctgtta 28884751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 72 - 189
Target Start/End: Original strand, 32047748 - 32047865
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||  |||| ||||| ||    
T  32047748 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtaacggtttggtcctctaactaaaaaatgatttattttggtcctctaacttcatcaccgttaccat 32047847  T
Q  172 atttagtcctttctgtta 189  Q
    |||| || ||||||||||    
T  32047848 atttcgttctttctgtta 32047865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 70 - 215
Target Start/End: Original strand, 46592815 - 46592959
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    ||||||| |||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  46592815 taaattacctttttggccctctaactatttaattgatatcagattgatcctctaactaaaaaatgatttatttcgatcccttaagtttctcactgttact 46592914  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtt 215  Q
      |||||||| |||| ||||  |||| | ||| |||||||||||||    
T  46592915 gcatttagtcatttccgttaaatttaattaaa-aaacgttagggtt 46592959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 70 - 189
Target Start/End: Original strand, 5536401 - 5536520
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    |||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||  ||||||    
T  5536401 taaattacatttttggccctctaactatttaattggtatcggattggtcctctacctaaaatttgatttatttgggtctcttaagtttctcatcgttact 5536500  T
Q  170 atatttagtcctttctgtta 189  Q
    | ||||||||||||| ||||    
T  5536501 acatttagtcctttccgtta 5536520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 70 - 153
Target Start/End: Original strand, 13183769 - 13183852
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaa 153  Q
    ||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13183769 taaattacctttttgatcctctaactatttaattggtattgaattagtcttctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaa 13183852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 72 - 189
Target Start/End: Original strand, 28884022 - 28884139
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||    
T  28884022 aattacctttttggtcctctaattatttaattggtaacggtttggtcctctaactaaaaaataatttattttggtcctctaactttatcactgttaccat 28884121  T
Q  172 atttagtcctttctgtta 189  Q
    ||||  || |||||||||    
T  28884122 atttcatcatttctgtta 28884139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 223 - 292
Target Start/End: Original strand, 44322816 - 44322885
Alignment:
Q  223 tgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattccttgttaaggtattatgattaaat 292  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44322816 tgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatgccttgttaaggtattatgattaaat 44322885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 228 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 4697171 - 4697099
Alignment:
Q  228 gtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattccttgttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4697171 gtcctctaactttatttattagtatcattttgatcctatgtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactg 4697099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 94 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 4697222 - 4697163
Alignment:
Q  94 ctatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaa 153  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4697222 ctatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaa 4697163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 96 - 210
Target Start/End: Original strand, 37466831 - 37466943
Alignment:
Q  96 atttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagtcctttctgttagtttta 195  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||  | |||||| ||| |||||||| |||||||| |||||||||  ||||    
T  37466831 atttaattggtatcggattactgctctaactaaaaattgatttatttccgtc--ccaagtttttcattgttactacatttagtcttttctgttaaattta 37466928  T
Q  196 ttcaaataaacgtta 210  Q
     | ||| ||||||||    
T  37466929 attaaaaaaacgtta 37466943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 172 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 25996129 - 25996075
Alignment:
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25996129 atttaatcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 25996075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 79 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 32048620 - 32048510
Alignment:
Q  79 tttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagt 178  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||| || ||| || |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||| |||| ||||| ||||||  |    
T  32048620 tttttggtcctctaactatttatttgataacggtttggtcctctaactaaaaaatgatttatttttgtcctctaactttatcacagttaccatatttcat 32048521  T
Q  179 cctttctgtta 189  Q
    |||||||||||    
T  32048520 cctttctgtta 32048510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 116 - 189
Target Start/End: Original strand, 49837420 - 49837493
Alignment:
Q  116 gtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagtcctttctgtta 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||    
T  49837420 gtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcccttaagtttctcaccgttactacatttagtcatttccgtta 49837493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 72 - 140
Target Start/End: Original strand, 46289329 - 46289397
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttat 140  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  46289329 aattatctttttgatcctctaactatttaattggtatcagattggtcatctaactaaaaattgatttat 46289397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 70 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 49838832 - 49838756
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtc 147  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  49838832 taaattacctttttggcctt-taattatttaattggtatcagattggtcttctaactaaaaattgatttatttcggtc 49838756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 173 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 46015809 - 46015766
Alignment:
Q  173 tttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggttt 216  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  46015809 tttagtcctttccgttaattttattcaaaaaaacgttagggttt 46015766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 3)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 80 - 300
Target Start/End: Original strand, 45769 - 45989
Alignment:
Q  80 ttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagtc 179  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  45769 ttttggtcctctaattatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcacggttactacatttagtc 45868  T
Q  180 ctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattccttgttaaggt 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  45869 ctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttacttattagtttcattttggtcatattccttgttaaggt 45968  T
Q  280 attatgattaaataatgactg 300  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  45969 attatgattaaatagtgactg 45989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 72 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 56581 - 56427
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    ||||||||||||  || |||||||||||| |||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  56581 aattatcttttttatcctctaactatttagttggtatttgattggtcatctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactac 56482  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  56481 atttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgttttatgtg 56427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 72 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 63706 - 63552
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    ||||||||||||  || |||||||||||| |||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  63706 aattatcttttttatcctctaactatttagttggtatttgattggtcatctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactac 63607  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  63606 atttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgttttatgtg 63552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 68)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 70 - 298
Target Start/End: Original strand, 26600360 - 26600588
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  26600360 taaattatctttttggtcctctaactattaaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattaatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 26600459  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcc 269  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26600460 acatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcc 26600559  T
Q  270 ttgttaaggtattatgattaaataatgac 298  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  26600560 ttattaaggtattatgattaaatagtgac 26600588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 70 - 300
Target Start/End: Original strand, 5310829 - 5311059
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5310829 taaattatctttttggtcctctaactatttaattgatatcagagtagtcctataactaaaaattgatttatttcggtcatctaagtttctcactgttact 5310928  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcc 269  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5310929 acatttagtcctttctgttagttttattcaaataaatgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattca 5311028  T
Q  270 ttgttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5311029 ttgttaaggtattatgattaaatagtgactg 5311059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 56 - 300
Target Start/End: Original strand, 34890633 - 34890877
Alignment:
Q  56 aataaaagttagggtaaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagt 155  Q
    ||||||| ||||| ||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  34890633 aataaaatttaggctaaattacctttttgttcctctaactatttaattggtattggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctcaaagt 34890732  T
Q  156 ttctcactgttactatatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcat 255  Q
    |||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34890733 ttctcactgttattacatttagtcttttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcat 34890832  T
Q  256 tttggtcatattccttgttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34890833 tttggtcatatgccttgttaaagtattatgattaaataatgactg 34890877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 65 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 32993467 - 32993232
Alignment:
Q  65 tagggtaaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 164  Q
    |||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  32993467 taggctaaattatatttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctataagtttctcaccg 32993368  T
Q  165 ttactatatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcat 264  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  32993367 tttctacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtctt 32993268  T
Q  265 attccttgttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32993267 atgccttgttaaggtgttatgattaaataatgactg 32993232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 64 - 300
Target Start/End: Original strand, 2516999 - 2517235
Alignment:
Q  64 ttagggtaaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcact 163  Q
    ||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2516999 ttaggttaaattacatttttggtcctctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctgact 2517098  T
Q  164 gttactatatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtca 263  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| || |||||||||||||    
T  2517099 gttactacatttagtcttttctgttagttttattcaaataaacgttagtgtttgtgttatgtgggtcctccaactttatttataagaatcattttggtca 2517198  T
Q  264 tattccttgttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2517199 tattctttgttaaggtattatgattaaatagtgactg 2517235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 70 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 5639620 - 5639390
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  5639620 taaattacatttttgatcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaatttatttatttcggtcctctaagtttcttaccgttact 5639521  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcc 269  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5639520 acatttagtcctttttgttagttttattcaaataaacattatggtttgtgttatgtgggttctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcc 5639421  T
Q  270 ttgttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5639420 ttgttaaggtattatgattaaatagtgactg 5639390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 70 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 5938260 - 5938030
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  5938260 taaattacctttttggtcatctaattatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcacaattact 5938161  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcc 269  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||    
T  5938160 acatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggttctatgcc 5938061  T
Q  270 ttgttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5938060 ttgttaaggtattatgattaaatagtgactg 5938030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 70 - 300
Target Start/End: Original strand, 24744332 - 24744561
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    ||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||    
T  24744332 taaattacctttttg-tcctctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaactttcacaccgttact 24744430  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcc 269  Q
      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  24744431 gcatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatttc 24744530  T
Q  270 ttgttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24744531 ttgttaaggtattatgattaaatagtgactg 24744561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 64 - 300
Target Start/End: Original strand, 18052953 - 18053189
Alignment:
Q  64 ttagggtaaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcact 163  Q
    ||||| |||||||  |||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18052953 ttaggctaaattacttttttgatcctttaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcact 18053052  T
Q  164 gttactatatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtca 263  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  18053053 gttactacatttagtcatttatgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggttc 18053152  T
Q  264 tattccttgttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18053153 tatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactg 18053189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 70 - 298
Target Start/End: Original strand, 31247119 - 31247347
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  31247119 taaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattagttctctaactaaaaattgatttatttcggtgttctaagtttctcaccgttact 31247218  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcc 269  Q
    | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31247219 acatttaatcttttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgttttatgtgagtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatattcc 31247318  T
Q  270 ttgttaaggtattatgattaaataatgac 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31247319 ttgttaaggtattatgattaaataatgac 31247347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 70 - 298
Target Start/End: Original strand, 31237749 - 31237977
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  31237749 taaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattagttctctaactaaaaattgatttatttcggtcttctaagtttctcaccgttact 31237848  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcc 269  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  31237849 acatttagtcatttctgttagttttattcaaataaatgttagagtttgttttatgtgggtcctctaactttatttattagtattattttgatcatgttcc 31237948  T
Q  270 ttgttaaggtattatgattaaataatgac 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31237949 ttgttaaggtattatgattaaataatgac 31237977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 64 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 21857008 - 21856781
Alignment:
Q  64 ttagggtaaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcact 163  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  21857008 ttaggctaaattacctttttggtcctctaagtatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcacc 21856909  T
Q  164 gttactatatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtca 263  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  21856908 gttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttatggtttttgttatatgggtcctctaactttatttattagcatcattttggtct 21856809  T
Q  264 tattccttgttaaggtattatgattaaa 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21856808 tattccttgttaaggtattatgattaaa 21856781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 70 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 34994827 - 34994597
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34994827 taaattacctttttagtcatctaactatttaattggtattagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaagtttctcactgttact 34994728  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcc 269  Q
      |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  34994727 gcatttagtcttttatgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgcgggtcctctaacttgatttattagtatcattttggtcttatgcc 34994628  T
Q  270 ttgttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34994627 ttgttaaggtattatgattaaatagtgactg 34994597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 70 - 300
Target Start/End: Original strand, 9046089 - 9046319
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  9046089 taaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaagtaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttgtcaccgttact 9046188  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcc 269  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  9046189 acatttagtcttttctgttagttttattcaaataaatgttagagtttgtgttatgtgggtcctctaaatttatttattagtatcattttggtcttatgcc 9046288  T
Q  270 ttgttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  9046289 ttgttaagctattatgattaaatagtgactg 9046319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 72 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 6137822 - 6137602
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  6137822 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctttaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactac 6137723  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcctt 271  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||     
T  6137722 atttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttagattttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatatctc 6137624  T
Q  272 gttaaggtattatgattaaata 293  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  6137623 gttaagatattatgattaaata 6137602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 89 - 300
Target Start/End: Original strand, 7269973 - 7270186
Alignment:
Q  89 tctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagtcctttctgtt 188  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||    
T  7269973 tctaactatttaattggtattggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggttctctaagtttctcaccgttactacatttagtcatttctgtt 7270072  T
Q  189 agtttt--attcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattccttgttaaggtattatga 286  Q
    ||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  7270073 agttttttatttaaataaatgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgccttgttaaagtattatga 7270172  T
Q  287 ttaaataatgactg 300  Q
    ||||||| ||||||    
T  7270173 ttaaatagtgactg 7270186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 79 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 21540415 - 21540201
Alignment:
Q  79 tttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagt 178  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |    
T  21540415 tttttggtcctttaactatttaattggtatcagattagtcctctaattaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcatcgttactacatttaat 21540316  T
Q  179 cctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattccttgttaagg 278  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||     
T  21540315 catttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgcgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcctatgccttgttaaga 21540216  T
Q  279 tattatgattaaata 293  Q
    |||||||||||||||    
T  21540215 tattatgattaaata 21540201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 79 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 6236359 - 6236140
Alignment:
Q  79 tttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagt 178  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| |    
T  6236359 tttttggtcccctaactatttaattgatatttgattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctaacagttactaaatttaat 6236260  T
Q  179 cctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattccttgttaagg 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||     
T  6236259 cctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgaatcctctaacttcatttattagtatcatcttggtcctatgccttgttaaga 6236160  T
Q  279 tattatgattaaataatgac 298  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  6236159 tattatgattaaatagtgac 6236140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 110 - 300
Target Start/End: Original strand, 7270672 - 7270862
Alignment:
Q  110 ggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgtt 209  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | || | ||||||||| || |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7270672 ggattggtcctctaattaaaaattgatttattttgatcttttaagtttcttaccgttactatatttagtcttttttgttagttttattcaaataaacgtt 7270771  T
Q  210 agggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattccttgttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7270772 agggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactg 7270862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 70 - 300
Target Start/End: Original strand, 32753180 - 32753406
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    |||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  32753180 taaattacatttttggtcctctaactatttaattagtatcagattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttatt 32753279  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcc 269  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |    |||| ||| ||    
T  32753280 acatttagtcatttctgttagttttattcaaataaatgttaaggtttgtgttatgtgggtcctctaactgtatttattagtataa----ggtcctatgcc 32753375  T
Q  270 ttgttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32753376 ttgttaaggtattatgattaaatagtgactg 32753406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 72 - 252
Target Start/End: Original strand, 6532197 - 6532377
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    ||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||     
T  6532197 aattaccttttttgtcctctaactatttaatttgtatcggattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggttctctaaatttctcaccgttactac 6532296  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtat 252  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6532297 atttagtgatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtat 6532377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 116 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 3423571 - 3423389
Alignment:
Q  116 gtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtt 215  Q
    |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3423571 gtccgctaattaaaaattggtttatttcggtcctctaattttctcaccgttactacatttagtcttttctgttagttttattcaaataaacgttagagtt 3423472  T
Q  216 tgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattccttgttaaggtattatgattaaataatgac 298  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  3423471 tgtgatatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattacgattaaatagtgac 3423389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 64 - 226
Target Start/End: Original strand, 6235918 - 6236080
Alignment:
Q  64 ttagggtaaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcact 163  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  6235918 ttaggctaaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattagtcctataattaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcacc 6236017  T
Q  164 gttactatatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6236018 gttactgcatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 6236080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 72 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 32753618 - 32753464
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  32753618 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactac 32753519  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  32753518 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgtcagagtttgtgttatgtg 32753464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 142 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 25177032 - 25176876
Alignment:
Q  142 tcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaacttta 241  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  25177032 tcggtcctctaagtttctcaccgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtggggcctctaacttta 25176933  T
Q  242 tttattagtatcattttggtcatattccttgttaaggtattatgattaaataatgac 298  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  25176932 tttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgac 25176876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 120 - 300
Target Start/End: Original strand, 26957015 - 26957195
Alignment:
Q  120 tctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtg 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  26957015 tctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttcttaccgttactacatttagtcctttatgttagttttattcaaataaacgttaaagtttatg 26957114  T
Q  220 ttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattccttgttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
    ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26957115 ttatgggggtcctctagctttatttattagtatcattttggtcctatgtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactg 26957195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 78 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 34891083 - 34890935
Alignment:
Q  78 ctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttag 177  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34891083 ctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttag 34890984  T
Q  178 tcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34890983 tcttttctgttagttttattcaaataaacgttaggatttgtgttatgtg 34890935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 80 - 226
Target Start/End: Original strand, 3423183 - 3423329
Alignment:
Q  80 ttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagtc 179  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3423183 ttttggttctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagtc 3423282  T
Q  180 ctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3423283 ttttctattagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 3423329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 72 - 226
Target Start/End: Original strand, 5937818 - 5937972
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5937818 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattgattctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactac 5937917  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5937918 atttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 5937972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 72 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 10412946 - 10412796
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10412946 aattatctttttggtcttttaactatttagttggtatcggattagttctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactat 10412847  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgtta 222  Q
    |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10412846 atttagtcatttctattaattttattcaaataaacgttagggtttgtgtta 10412796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 72 - 226
Target Start/End: Original strand, 34994385 - 34994539
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    ||||| |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34994385 aattacctttttggtcctttaactatttaattggtattggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactat 34994484  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  34994485 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagaatttgtgttatgtg 34994539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 72 - 226
Target Start/End: Original strand, 35167495 - 35167649
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  35167495 aattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcggattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactac 35167594  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35167595 atttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 35167649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 79 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 15932994 - 15932850
Alignment:
Q  79 tttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagt 178  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  15932994 tttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcaccgttactacatttagt 15932895  T
Q  179 cctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttat 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15932894 cctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttat 15932850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 72 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 9046531 - 9046377
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||     
T  9046531 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtattggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtccgctaagtttctcaccgctactac 9046432  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9046431 atttagtcctttctgttagttctattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 9046377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 78 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 7271068 - 7270920
Alignment:
Q  78 ctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttag 177  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  7271068 ctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattagtcctctaactaaaaattgatttatttcagtcctctaagtttctcatcgttactatatttag 7270969  T
Q  178 tcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7270968 tcctttctattagttttatttaaataaacgttggggtttgtgttatgtg 7270920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 79 - 223
Target Start/End: Original strand, 21856567 - 21856711
Alignment:
Q  79 tttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagt 178  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  21856567 tttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcaccgttactacatttagt 21856666  T
Q  179 cctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttat 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21856667 cctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttat 21856711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 79 - 223
Target Start/End: Original strand, 25176675 - 25176819
Alignment:
Q  79 tttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagt 178  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  25176675 tttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattatggtcctctaagtttctcaccgttactacatttagt 25176774  T
Q  179 cctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttat 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25176775 cctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttat 25176819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 79 - 226
Target Start/End: Original strand, 978427 - 978574
Alignment:
Q  79 tttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagt 178  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  978427 tttttggtcctctaactatttagttggtatcgtattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactacatttagt 978526  T
Q  179 cctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  978527 catttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 978574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 79 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 26600785 - 26600638
Alignment:
Q  79 tttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagt 178  Q
    ||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26600785 ttttttgtcctctaactatttagttggtattggattggtcttctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagt 26600686  T
Q  179 cctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26600685 catttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 26600638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 72 - 226
Target Start/End: Original strand, 6137384 - 6137537
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  6137384 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaattaaaaat-gatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactac 6137482  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  6137483 atttagtcttttctgttagttttattcaaataaacgtcaaggtttgtgttatgtg 6137537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 72 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 26957406 - 26957258
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||     
T  26957406 aattatctttttggtcatctaactatttaattggtattagattggtcctttaactaaaaattgatttatttcggtcctttaagtttttcaccgttactac 26957307  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgt 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26957306 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgt 26957258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 72 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 2517447 - 2517293
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  2517447 aattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactac 2517348  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| | | |||||||||||    
T  2517347 atttaatcctttctgttagttttatttaaataaacgttatgatctgtgttatgtg 2517293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 78 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 18053392 - 18053247
Alignment:
Q  78 ctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttag 177  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  18053392 ctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtactctaagtttctcaccgttactacatttag 18053293  T
Q  178 tcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttat 223  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  18053292 tcctttctattagttttattcaaataaacgttagagtttgttttat 18053247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 78 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 5311265 - 5311117
Alignment:
Q  78 ctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttag 177  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  5311265 ctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtgctctaagtttctcatcgttactacatttag 5311166  T
Q  178 tcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5311165 tcctttatgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtg 5311117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 72 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 31238191 - 31238037
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctct-aagtttctcactgttacta 170  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||    
T  31238191 aattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtc-tctaactaaaaattgatttatttcggtcctcttaagtttttcaccgttacta 31238093  T
Q  171 tatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31238092 catttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtg 31238037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 72 - 225
Target Start/End: Original strand, 32993020 - 32993173
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||     
T  32993020 aattaccttcttggtcctctaactatttaattggtattagattggtcatctaagtaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattgttactac 32993119  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgt 225  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32993120 atttggtcctttctgttagttttattcaaataaacgttaggatttgtgttatgt 32993173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 72 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 24744765 - 24744612
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||| ||     
T  24744765 aattatctttttggtcctctaactatttagttggtatta-attggtcctctaactaaaaattgatttatttccattctttaagtttctcactgttattac 24744667  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24744666 atttagtcttttctattagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 24744612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 72 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 31247561 - 31247407
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctc-taagtttctcactgttacta 170  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||    
T  31247561 aattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattaatttatttcagtcctcttaagtttttcaccgttacta 31247462  T
Q  171 tatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
     | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  31247461 ca-ttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttaaagtttgtgttatgtg 31247407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 172 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 35167837 - 35167707
Alignment:
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcctt 271  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||    
T  35167837 atttaatcctttctgttagttttattcaagtaaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttagtcctaatcctt 35167738  T
Q  272 gttaaggtat--tatgattaaataatgactg 300  Q
    ||||||||||  |||||||||||| ||||||    
T  35167737 gttaaggtattatatgattaaatagtgactg 35167707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 72 - 218
Target Start/End: Original strand, 17244669 - 17244815
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||| |||    
T  17244669 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggtttggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttatcaccgttattat 17244768  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgt 218  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||    
T  17244769 atttcgtcatttctgttagttttaatagaagaaacgttagggtttgt 17244815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 72 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 7270398 - 7270244
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||| |||||||  |||||||     
T  7270398 aattatctttttggtcctttaactatttaattggtatcgaattgatcctctaactaaaaattaattttttttggttctctaaatttctcatcgttactac 7270299  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  7270298 atttagtcttttctgttaattttattcaaataaacgttagagtttgtggtatgtg 7270244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 72 - 202
Target Start/End: Original strand, 14276404 - 14276534
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||     
T  14276404 aattacctttttggtcctctacctatttaattggtatcggattgatcctctaactaaaaattgatttacttcggtcctctaaatttctcaccgttactac 14276503  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaat 202  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  14276504 atttagtcctttgtattagttttattcaaat 14276534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 70 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 34518139 - 34517991
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||  ||||||    
T  34518139 taaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctcaaactaaaaattgatttatttcgatcccttaagtttctcatcgttact 34518040  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgt 218  Q
    | ||||||||||||| ||||  |||| | ||| ||||||||||||||||    
T  34518039 acatttagtcctttccgttaaatttaattaaaaaaacgttagggtttgt 34517991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 70 - 184
Target Start/End: Original strand, 7438807 - 7438921
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||    
T  7438807 taaattatctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcccttaagtttctcaccgttact 7438906  T
Q  170 atatttagtcctttc 184  Q
    | ||||||| |||||    
T  7438907 acatttagttctttc 7438921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 70 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 29261398 - 29261279
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  29261398 taaattatatttttagtcctctaactatttaattggtattagattggtcctctaactaaaaattgatttatgtcggtcccttaagtttctcactgttact 29261299  T
Q  170 atatttagtcctttctgtta 189  Q
    | ||||||||||||| ||||    
T  29261298 acatttagtcctttccgtta 29261279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 72 - 218
Target Start/End: Original strand, 6228735 - 6228880
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    ||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  6228735 aattacctttttagtcctctaattatttaattggtatcggtttggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcc-ctaagtttatcaccgttactat 6228833  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgt 218  Q
    |||| ||| |||||||| |||||| |  || ||| ||||||||||||    
T  6228834 atttcgtcatttctgtttgttttaatagaagaaatgttagggtttgt 6228880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 70 - 168
Target Start/End: Original strand, 34517275 - 34517373
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttac 168  Q
    |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  34517275 taaattacttttttggtcctctaactatttaattggtgtcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcccttaagtttctcactgttac 34517373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 120 - 211
Target Start/End: Original strand, 3035933 - 3036025
Alignment:
Q  120 tctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagtc-ctttctgttagttttattcaaataaacgttag 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3035933 tctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactcttactacatttagtcattttctgttaattttattcaaataaacgttag 3036025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 70 - 161
Target Start/End: Original strand, 15932733 - 15932824
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctca 161  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  15932733 taaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttgatcctctaagtttctca 15932824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 70 - 215
Target Start/End: Original strand, 15286348 - 15286492
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    ||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||| ||||||    
T  15286348 taaattacctttttgatcctctaactatttaattggtgtcggattggtcctctgactaaaaattgatttatttcaatcccttaagtttctcaccgttact 15286447  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtt 215  Q
      |||||||| |||| ||||  |||| | ||| |||||||||||||    
T  15286448 gcatttagtcatttccgttaaatttaattaaa-aaacgttagggtt 15286492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 70 - 189
Target Start/End: Original strand, 29260534 - 29260652
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    ||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||  |||||    
T  29260534 taaattacctttctggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctcaaactaaaaattaatttatttcggtcccttaagtttctcac-attact 29260632  T
Q  170 atatttagtcctttctgtta 189  Q
    | |||||||| |||| ||||    
T  29260633 acatttagtcatttccgtta 29260652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 70 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 25180295 - 25180219
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggt 146  Q
    ||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25180295 taaattacctttctggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggt 25180219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 59 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 35167913 - 35167833
Alignment:
Q  59 aaaagttagggtaaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgattta 139  Q
    |||| ||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35167913 aaaaattaggctaaattacatttttggtcctctaactatttaattggtatcagattagtcctctaactaaaaattgattta 35167833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 80 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 27829402 - 27829297
Alignment:
Q  80 ttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagtc 179  Q
    |||||||| || |||||||||||||||| | | || ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||    
T  27829402 ttttggtcctccaactatttaattggtaacagtttggtcctctaattaaaaaatgatttattttggtcctctaactttatcactgttaccatatttcgtc 27829303  T
Q  180 ctttct 185  Q
     |||||    
T  27829302 atttct 27829297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 78 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 6229761 - 6229643
Alignment:
Q  78 ctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttag 177  Q
    ||||||||||   ||||||||||||| ||||||| || |||| |||||||||| ||||||||||| |||||  ||| |||||| |||||||||  |||||    
T  6229761 ctttttggtcccttaactatttaattagtatcggtttggtcc-ctaactaaaatttgatttattttggtcccttaaatttctctctgttactacttttag 6229663  T
Q  178 tcctttctgttagttttatt 197  Q
    ||||||| |||| |||||||    
T  6229662 tcctttccgttaattttatt 6229643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 95 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 17245682 - 17245561
Alignment:
Q  95 tatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagtcctttctgttagtttt 194  Q
    ||||||||| ||||||| || |||| |||||||||| ||||||||||| |||||  ||| |||||| |||||||||  ||||||| |||| |||| ||||    
T  17245682 tatttaattagtatcggtttggtcccctaactaaaatttgatttattttggtcccttaaatttctctctgttactacttttagtcttttccgttaatttt 17245583  T
Q  195 attcaaataaacgttagggttt 216  Q
    ||| | | ||| ||||||||||    
T  17245582 attaataaaaaagttagggttt 17245561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 70 - 170
Target Start/End: Original strand, 34251557 - 34251655
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    ||||||| ||||||  || ||||| |||||| |||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||    
T  34251557 taaattacctttttaatcctctaattatttagttggtatcggattagtcctg--actaaaaattaatttatttcgatcctctaagtttctcatcgttact 34251654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 226
Target Start/End: Original strand, 5639294 - 5639332
Alignment:
Q  188 tagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  5639294 tagttttattcaaataaatgttagagtttgtgttatgtg 5639332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 75)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 70 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 41192132 - 41191902
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41192132 taaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattagtcctctaagtaaaaattgatttatttcggtcatctaagtttctcactgttact 41192033  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcc 269  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41192032 acatttagtcttttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatttc 41191933  T
Q  270 ttgttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41191932 ttattaaggtattatgattaaatagtgactg 41191902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 70 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 48626510 - 48626280
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || ||| ||    
T  48626510 taaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattagtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctttaagtttctgaccgttgct 48626411  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcc 269  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48626410 acatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttaggatttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcc 48626311  T
Q  270 ttgttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  48626310 ttgttaaggtattatgattaaatagtgactg 48626280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 70 - 300
Target Start/End: Original strand, 33716591 - 33716821
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33716591 taaattagttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttact 33716690  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcc 269  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |    
T  33716691 acatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatgtc 33716790  T
Q  270 ttgttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33716791 ttgttaaggtattatgattaaataatgactg 33716821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 65 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 41453457 - 41453224
Alignment:
Q  65 tagggtaaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 164  Q
    |||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  41453457 taggttaaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaagtttctcaccg 41453358  T
Q  165 ttactatatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcat 264  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  41453357 ttactacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaatgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagcatcattttggtcct 41453258  T
Q  265 attccttgttaaggtattatgattaaataatgac 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41453257 attccttgttaaggtattatgattaaatagtgac 41453224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 70 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 7579319 - 7579096
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||    
T  7579319 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcgatcatctaattttctcaccgttact 7579220  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcc 269  Q
    | |||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7579219 acatttagtcctttattttagttatattcaaataaacgttatggtttttgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttattcc 7579120  T
Q  270 ttgttaaggtattatgattaaata 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  7579119 ttgttaaggtattatgattaaata 7579096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 65 - 300
Target Start/End: Original strand, 10526309 - 10526543
Alignment:
Q  65 tagggtaaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 164  Q
    |||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10526309 taggctaaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg 10526408  T
Q  165 ttactatatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcat 264  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  10526409 ttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcca 10526508  T
Q  265 attccttgttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
    || || ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10526509 atgcc-tgttaaggtattatgattaaatattgactg 10526543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 70 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 44332966 - 44332736
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44332966 taaattacatttttggtcctctaactatttaattggtatcaaattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttact 44332867  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcc 269  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  44332866 acatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttctgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatgcc 44332767  T
Q  270 ttgttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44332766 ttgttaaggtattatgattaaatagtgactg 44332736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 70 - 291
Target Start/End: Original strand, 6356768 - 6356989
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  6356768 taaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttact 6356867  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcc 269  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  6356868 acatttagtcctttctgttagttttattcaaataaatgttagtgtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggttctattcc 6356967  T
Q  270 ttgttaaggtattatgattaaa 291  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  6356968 ttgttaaggtattatgattaaa 6356989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 65 - 298
Target Start/End: Original strand, 8542497 - 8542730
Alignment:
Q  65 tagggtaaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 164  Q
    |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  8542497 taggctaaattacctttttcgtcttctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcagtcctctaagtttctcaccg 8542596  T
Q  165 ttactatatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcat 264  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8542597 ttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgtcagagtttgtgttgtgtgggtcttctaactttatttattagcatcattttggtcat 8542696  T
Q  265 attccttgttaaggtattatgattaaataatgac 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8542697 attccttgttaaggtattatgattaaatattgac 8542730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 78 - 300
Target Start/End: Original strand, 17359193 - 17359414
Alignment:
Q  78 ctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttag 177  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  17359193 ctttttgttctt-taactatttaattggtattggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactacatttag 17359291  T
Q  178 tcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattccttgttaag 277  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  17359292 tcatttctgttagttttattcaaataaacattagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatttcttgttaag 17359391  T
Q  278 gtattatgattaaataatgactg 300  Q
    |||||||||||||||| ||||||    
T  17359392 gtattatgattaaatagtgactg 17359414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 70 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 19681942 - 19681712
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  19681942 taaattacctttttggtcctctgactatttaattggtatcagattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttact 19681843  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcc 269  Q
    | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19681842 acatttagtcatttctcttagttttattcaaataaatgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatttc 19681743  T
Q  270 ttgttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
    ||||||| | |||||||||||||| ||||||    
T  19681742 ttgttaatgcattatgattaaatattgactg 19681712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 70 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 8937296 - 8937073
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8937296 taaattatatttttggtcctctaactatttaattagtatcagatttgtcctctaattaaaagttgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 8937197  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcc 269  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  8937196 acatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttatggtttgtgttatgtgggttctctaactttatttattaatatcatgttggtcatattcc 8937097  T
Q  270 ttgttaaggtattatgattaaata 293  Q
    ||||||||||||| ||||||||||    
T  8937096 ttgttaaggtattgtgattaaata 8937073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 70 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 21391637 - 21391407
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21391637 taaattacatttttggtcatctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattaatttatttcggtcctctaagtttctcactcttact 21391538  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcc 269  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||    
T  21391537 acatttagtcctttctgttagttttattcaaataaatgttagtgtttgtgttatgtggatcatctaactttatttattagtatcattttgatcttatgcc 21391438  T
Q  270 ttgttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21391437 ttgttaaggtattatgattaaatagtgactg 21391407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 70 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 31638390 - 31638160
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||    
T  31638390 taaattacctttttggttctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctttaaatttctcatcgttact 31638291  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcc 269  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31638290 acatttagtcctttctattagttttattcaaataaacgttatggtttgtgtcatgtggatcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgcc 31638191  T
Q  270 ttgttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31638190 ttgttaaggtattatgattaaatagtgactg 31638160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 89 - 300
Target Start/End: Original strand, 28297841 - 28298052
Alignment:
Q  89 tctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagtcctttctgtt 188  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  28297841 tctaactatttaattggtattagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcagttctctaagtttctcaccgttactatatttagtcatttctgtt 28297940  T
Q  189 agttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattccttgttaaggtattatgatt 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  28297941 agttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgactagttaaggtattatgatt 28298040  T
Q  289 aaataatgactg 300  Q
    ||||| ||||||    
T  28298041 aaatagtgactg 28298052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 70 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 34037358 - 34037128
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||    
T  34037358 taaattatctttttggtcctctaactatttaattggtatatgattagtcctctgactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatctccgttact 34037259  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcc 269  Q
      |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||      
T  34037258 gcatttagtcctttttgttagttttattcaaataaacgttagagtttatgttatgtgggtcctctaactttatttattaatatcattttggtcatatttt 34037159  T
Q  270 ttgttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34037158 ttgttaaggtattatgattaaatagtgactg 34037128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 70 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 28286564 - 28286336
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    |||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28286564 taaattacatttttggtcctctaactttttaattggtatcggattagtcctttaactaaaaattgattgatttcggtcctctaagtttctcaccgttact 28286465  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcc 269  Q
    | ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||    
T  28286464 acatttagttctttatattagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggaactattcc 28286365  T
Q  270 ttgttaaggtattatgattaaataatgac 298  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  28286364 ttcttaaggtattatgattaaatagtgac 28286336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 70 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 35147136 - 35146915
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  35147136 taaattatctttttggtcctctaactatttaattggtattggattagtcctctaactaaaatttgatttatttcggtcctctaagtttcttaccgttact 35147037  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcc 269  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||         |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  35147036 acatttagtcctttctgttagttttattcaaataaatgttatggtttgtgtt---------ctctaactttatttatcaatatcattttggtcatattcc 35146946  T
Q  270 ttgttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35146945 ttgttaaggtattatgattaaatagtgactg 35146915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 70 - 300
Target Start/End: Original strand, 41751653 - 41751883
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  41751653 taaattatctttttggtcctttaactatttaattgatattggattagtcctctaactaaaaattgacttatttcggtcctctaagtttctaaccgttact 41751752  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcc 269  Q
    | ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  |    
T  41751753 acatttaatcctttttgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtggatcttctaactttatttattagtattattttggtcctatgtc 41751852  T
Q  270 ttgttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  41751853 ttgttaagttattatgattaaatagtgactg 41751883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 70 - 270
Target Start/End: Original strand, 1114057 - 1114257
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  1114057 taaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttcacacagttact 1114156  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcc 269  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||    
T  1114157 aaatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagcatcattgtggtcctattcc 1114256  T
Q  270 t 270  Q
    |    
T  1114257 t 1114257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 72 - 300
Target Start/End: Original strand, 43247420 - 43247648
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    |||||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||     
T  43247420 aattatattttttgtcctctaactatttaattgatatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaagtttctcaccgttactac 43247519  T
Q  172 atttagt-cctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcct 270  Q
    ||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |    
T  43247520 atttactccctttctattagttttattcaaataaacatta-ggtttatgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgcat 43247618  T
Q  271 tgttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43247619 tgttaaggtattatgattaaatagtgactg 43247648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 72 - 300
Target Start/End: Original strand, 6356291 - 6356518
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||     
T  6356291 aattacctttttggtcatctaactatttaattggtatcggattggtcctctaattaaaaattgatttatttcggtcctctaagttttttaccgttactac 6356390  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcctt 271  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||     
T  6356391 atttagtcatttttgttagttttattcaaataaa-gttagattttgtgttatatgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatatctc 6356489  T
Q  272 gttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  6356490 gttaagatattatgattaaatagtgactg 6356518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 89 - 300
Target Start/End: Original strand, 36423391 - 36423602
Alignment:
Q  89 tctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagtcctttctgtt 188  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | |  ||| || |||||||||    
T  36423391 tctaactatttaattggcattagattggtcctctaactaaaaattaatttattttggtcctctaagtttctcactgttgccacttttggttctttctgtt 36423490  T
Q  189 agttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattccttgttaaggtattatgatt 288  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||     
T  36423491 agttttattcaaataaacgttaggatttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatacctggttaaggtattatgatc 36423590  T
Q  289 aaataatgactg 300  Q
    ||||| ||||||    
T  36423591 aaatagtgactg 36423602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 72 - 226
Target Start/End: Original strand, 35146704 - 35146858
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  35146704 aattacctttttggtcctctaactatttagttagtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactac 35146803  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35146804 atttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 35146858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 72 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 6356730 - 6356576
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    ||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  6356730 aattacctttttggtcctataactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactac 6356631  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  6356630 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgtcaaggtttgtgctatgtg 6356576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 72 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 10526755 - 10526601
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  10526755 aattatcttttttgtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactac 10526656  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  10526655 atttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttaagttttgtgttatgtg 10526601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 54 - 226
Target Start/End: Original strand, 7578859 - 7579031
Alignment:
Q  54 ataataaaagttagggtaaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaa 153  Q
    ||||||||| || || | |||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7578859 ataataaaattttggcttaattacttttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaa 7578958  T
Q  154 gtttctcactgttactatatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    |||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7578959 gtttctcaatgttacttcatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 7579031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 72 - 226
Target Start/End: Original strand, 8936854 - 8937008
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||     
T  8936854 aattatctttttagtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcacttttactac 8936953  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8936954 atttagtcatttctgttagttttattcaaataaatgttagggtttgtgttatgtg 8937008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 72 - 226
Target Start/End: Original strand, 21391195 - 21391349
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||     
T  21391195 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgctactac 21391294  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21391295 atttagtcttttctgttaattttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtg 21391349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 72 - 226
Target Start/End: Original strand, 28286122 - 28286276
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||     
T  28286122 aattatatttttggtcttctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcatcgttactac 28286221  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28286222 atttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 28286276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 72 - 226
Target Start/End: Original strand, 48626068 - 48626222
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  48626068 aattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggttctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactac 48626167  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  48626168 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttatgatttgtgttatgtg 48626222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 72 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 31075638 - 31075485
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  31075638 aattatctttttggtcctctaactatttaattggtattggattggtcctccaattaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactac 31075539  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgt 225  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31075538 atttagtcctttctgtttgttttattcaaataaacgttaggatttgtgttatgt 31075485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 70 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 4931720 - 4931556
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4931720 taaattacatttttggtcctctaactatttaattggtatcgaattggtcctctaactaaaaattgaattatttcggtcctctaagtttctcaccgttact 4931621  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctct 234  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||    
T  4931620 atattcagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagaatttgtgttatgtaagtcctct 4931556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 89 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 36423797 - 36423660
Alignment:
Q  89 tctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagtcctttctgtt 188  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||    
T  36423797 tctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttattacatttagtcctttctgtt 36423698  T
Q  189 agttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36423697 agttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtg 36423660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 79 - 223
Target Start/End: Original strand, 41453017 - 41453161
Alignment:
Q  79 tttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagt 178  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  41453017 tttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcaccgttactacatttagt 41453116  T
Q  179 cctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttat 223  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41453117 catttctgttagttttattcaaataaacgttaggatttgtgttat 41453161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 79 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 1114483 - 1114339
Alignment:
Q  79 tttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagt 178  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |    
T  1114483 tttttggtcctctaactatttagttgttatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcaccgttactacatttact 1114384  T
Q  179 cctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttat 223  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1114383 cttttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttat 1114339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 78 - 242
Target Start/End: Original strand, 7909297 - 7909461
Alignment:
Q  78 ctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttag 177  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||    
T  7909297 cttttttgtcctttaactatttaattggtatcagattggttttctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactacatttag 7909396  T
Q  178 tcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttat 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  7909397 tcctttctgttagttttattcaaataaacgttatagtttgtgttatgtggatcctctaactttat 7909461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 79 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 6357203 - 6357056
Alignment:
Q  79 tttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagt 178  Q
    |||||| || ||||| |||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  6357203 tttttgatcctctaattatttagttagtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcacagttactacatttagt 6357104  T
Q  179 cctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6357103 catttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgctatgtg 6357056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 72 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 17363681 - 17363532
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||     
T  17363681 aattatatttttggttctctaactatttaattggtattggatttgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctttaagtt--tcaatgttactac 17363584  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttat 223  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17363583 atttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttat 17363532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 91 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 27739090 - 27738935
Alignment:
Q  91 taactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagtcctttctgttag 190  Q
    |||||||||| |||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||    
T  27739090 taactatttatttggtatcagattgatcccctaactaaaaattgatttatttcggtccttttagtttctcaccgttactatatttaatc-tttctgttag 27738992  T
Q  191 ttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttatt 247  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27738991 ttttattcaaataaacgttaaggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttatt 27738935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 72 - 223
Target Start/End: Original strand, 17749940 - 17750091
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  17749940 aattacctttttggtcctctaactatttaattgatatcagattggttctctaactaaaaattaatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactac 17750039  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttat 223  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17750040 atttagtcatttatgttagttttattcaaataaacgttatggtttgtgttat 17750091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 72 - 226
Target Start/End: Original strand, 19681500 - 19681654
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | |||||||     
T  19681500 aattacctttttggtcctctaactatttagttggtattggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagttttttgccgttactac 19681599  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  19681600 atttattcctttctgttagttttagtcgaataaacgttagggtttgtgttatgtg 19681654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 72 - 222
Target Start/End: Original strand, 31637948 - 31638098
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| |||||||     
T  31637948 aattacctttttagtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcgaaccactaagtttctcaccgttactac 31638047  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgtta 222  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31638048 atttagtcatttctgttagttttattcatataaacgttagggtttgtgtta 31638098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 144 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 40673378 - 40673224
Alignment:
Q  144 ggtcctctaagtttctcactgttactatatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatt 243  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40673378 ggtcctctaagtttctcaccgttactatatttagtcatttatgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtcctctaactttatt 40673279  T
Q  244 tattagtatcattttggtcatattccttgttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
    ||||||||  ||||| ||||||| ||||||||| ||||||  |||||||| ||||||    
T  40673278 tattagta--attttagtcatatgccttgttaaagtattagaattaaatagtgactg 40673224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 89 - 226
Target Start/End: Original strand, 41191704 - 41191841
Alignment:
Q  89 tctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagtcctttctgtt 188  Q
    |||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  41191704 tctaactatttagttgatattggattggtcctctaactaaaaattggtttatttcagttctctaagtttctcaccgttactacatttagtcctttctgtt 41191803  T
Q  189 agttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41191804 agttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 41191841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 79 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 8542936 - 8542793
Alignment:
Q  79 tttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagt 178  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |    
T  8542936 tttttggtcctctaactatttagttggtatcggattgatcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcactgtgactacatttaat 8542837  T
Q  179 cctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttat 223  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8542836 cctttctg-tagttttattcaaataaatgttagggtttgtgttat 8542793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 89 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 7909594 - 7909460
Alignment:
Q  89 tctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagtcctttctgtt 188  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||    
T  7909594 tctaactatttaattgatattggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcttctaagtttctcaccgttagtacatttagtcatttctgtt 7909495  T
Q  189 agttttattcaaataaacgttagggtttgtgttat 223  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7909494 agttttattcaaataaacgttaggatttgtgttat 7909460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 70 - 200
Target Start/End: Original strand, 16867710 - 16867840
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  16867710 taaattacctttttggtcctctaactatataattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcagtcctctaagtttcttactgttact 16867809  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaa 200  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16867810 acatttagtcatttctgttagttttattcaa 16867840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 89 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 41752078 - 41751941
Alignment:
Q  89 tctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagtcctttctgtt 188  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||    
T  41752078 tctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcagtcctctaagtttctatctgttaccatatttagttctttctgtt 41751979  T
Q  189 agttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||    
T  41751978 agttttaatcaaataaacattagggtttatgctatgtg 41751941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 89 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 28298247 - 28298110
Alignment:
Q  89 tctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagtcctttctgtt 188  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||   ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||    
T  28298247 tctaactatttaattggtatcagatttaccctctaattaaaaattgatttatttcgattctctaagtttctcaccgttactacatttagtcatttctgtt 28298148  T
Q  189 agttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28298147 aattttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtg 28298110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 59 - 195
Target Start/End: Original strand, 4155590 - 4155726
Alignment:
Q  59 aaaagttagggtaaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttc 158  Q
    |||| ||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  4155590 aaaaattaggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggtttgatcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagttta 4155689  T
Q  159 tcactgttactatatttagtcctttctgttagtttta 195  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4155690 tcaccgttactatatttcgtcctttctgttagtttta 4155726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 72 - 190
Target Start/End: Original strand, 36673980 - 36674098
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||     
T  36673980 aattacctttatggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactac 36674079  T
Q  172 atttagtcctttctgttag 190  Q
    |||||||||||||||||||    
T  36674080 atttagtcctttctgttag 36674098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 70 - 212
Target Start/End: Original strand, 41891969 - 41892111
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| | |||||||    
T  41891969 taaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttctttcggtcccttaagtttcttaatgttact 41892068  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagg 212  Q
    | ||||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||    
T  41892069 acatttagtcctttctgttaaatttatttaaaaaaacgttagg 41892111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 70 - 218
Target Start/End: Original strand, 8416488 - 8416635
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  8416488 taaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcccttaagtttctcactgttact 8416587  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgt 218  Q
    | |||||||| ||||  |||  |||| | ||| ||||||||||||||||    
T  8416588 acatttagtcatttccattaaatttaattaaa-aaacgttagggtttgt 8416635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 72 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 29277788 - 29277671
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||| || |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||    
T  29277788 aattacctttttggtcctctaactatttatttggtaacggtttggtcctctaactaaaaaatgatttattttggtcctctaactttatcactgttaccat 29277689  T
Q  172 atttagtcctttctgtta 189  Q
    |||| |||||||||||||    
T  29277688 atttcgtcctttctgtta 29277671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 95 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 33717005 - 33716875
Alignment:
Q  95 tatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagtcctttctgttagtttt 194  Q
    |||||||||| |||||||||  || |||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| | |||||| ||| ||||| ||||    
T  33717005 tatttaattgatatcggattgatcatctaactaaaaattaatttatttcggtcatttaagtttctcattgttactaca-ttagtcatttatgttaatttt 33716907  T
Q  195 attcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33716906 gttcaaataaacgttagggttggtgttatgtg 33716875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 70 - 189
Target Start/End: Original strand, 36282789 - 36282908
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    |||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||    
T  36282789 taaattacatttttagtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctttaactaaaaattgatttatttcggtcccttaagtttctcaccgttact 36282888  T
Q  170 atatttagtcctttctgtta 189  Q
    | |||| ||| |||| ||||    
T  36282889 acatttggtcttttccgtta 36282908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 70 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 8417383 - 8417285
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttac 168  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||| |||||    
T  8417383 taaattatctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctttaactaaaaattaatttattttggtcccttaagtttctcaccgttac 8417285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 89 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 36283634 - 36283512
Alignment:
Q  89 tctaactatttaattggtatcggattag-tcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagtcctttctgt 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||| |||||||| ||| |||    
T  36283634 tctaactatttaattggtatcggatttgatcctctaactaaaaattgatttatttccgtcccttaaatttctcactgttactacatttagtcatttttgt 36283535  T
Q  188 tagttttattcaaataaacgtta 210  Q
    ||  |||| | ||| ||||||||    
T  36283534 taaatttaattaaaaaaacgtta 36283512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 100 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 32946758 - 32946669
Alignment:
Q  100 aattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagtcctttctgtta 189  Q
    |||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  32946758 aattggtatcagattggtactctaactaaaaattgatttatttcggttttctaagtttttcactgttagtacatttagtcctttctgtta 32946669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 70 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 36674176 - 36674095
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaa 153  Q
    ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36674176 taaattacctttttggtcctctgactatttaattggtatcgggttagtc--ttaactaaaaattgatttatttcggtcctctaa 36674095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 164 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 17359538 - 17359479
Alignment:
Q  164 gttactatatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttat 223  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17359538 gttactacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttat 17359479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 80 - 226
Target Start/End: Original strand, 40673024 - 40673166
Alignment:
Q  80 ttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagtc 179  Q
    |||| ||| |||| ||||||||||||||||   ||  |||||||||||||| || ||||||||  || || ||||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  40673024 tttttgtcctctatctatttaattggtatc---ttgatcctctaactaaaatttaatttatttgagttctgtaagtttttcattgttactacatttagtc 40673120  T
Q  180 ctttctgttagttttattcaaataa--acgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    |||||||||||||   |||||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  40673121 ctttctgttagtt---ttcaaataaacacgttaggatttgtgttatgtg 40673166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 91 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 28264714 - 28264587
Alignment:
Q  91 taactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagtcctttctgttag 190  Q
    ||||||||||||| |||||   || ||| | ||||||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||  ||||||||  |||| |||||||  ||||    
T  28264714 taactatttaattagtatcaatttggtcttttaactaaaatttgatttattttggtcccttaagtttctctatgttactacttttaatcctttccattag 28264615  T
Q  191 ttttattcaaataaacgttagggtttgt 218  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  28264614 ttttatttaaaaaaacgttagggtttgt 28264587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 79 - 153
Target Start/End: Original strand, 29276887 - 29276961
Alignment:
Q  79 tttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaa 153  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  29276887 tttttggtcctctaactatttaattggtaacggtttggtcctctaattaaaaaatgatttattttggtcctctaa 29276961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 64 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 36423853 - 36423790
Alignment:
Q  64 ttagggtaaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaacta 127  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  36423853 ttaggctaaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattggatttgtcctctaacta 36423790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 70 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 41893522 - 41893403
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    |||||||| ||||| ||| | |||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| | |  ||||||| |||| ||||||    
T  41893522 taaattattttttttgtcctttaactatttaattaatatcggattggtcatctaactaaaaatttatttatttcgattccttaagtttttcaccgttact 41893423  T
Q  170 atatttagtcctttctgtta 189  Q
    | ||||| || |||| ||||    
T  41893422 acatttaatcttttccgtta 41893403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 197
Target Start/End: Original strand, 28263520 - 28263626
Alignment:
Q  91 taactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagtcctttctgttag 190  Q
    ||||||||||||| ||||||| || |||| |||||||||| ||||||||||| ||| |  ||| |||||  | ||||| |  ||||||| |||| |||||    
T  28263520 taactatttaattagtatcggtttggtcccctaactaaaatttgatttattttggtaccttaaatttcttcccgttaccacctttagtcgtttccgttag 28263619  T
Q  191 ttttatt 197  Q
    |||||||    
T  28263620 ttttatt 28263626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 268 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 17750184 - 17750152
Alignment:
Q  268 ccttgttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17750184 ccttgttaaggtattatgattaaataatgactg 17750152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 36507192 - 36507116
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggt 146  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||||  || ||||  ||| ||||| |||||||||||||||    
T  36507192 taaattatgtttttggtctcttaactatttaattagtatcgatttggtcccttaattaaaatttgatttatttcggt 36507116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 244
Target Start/End: Original strand, 38447603 - 38447682
Alignment:
Q  164 gttactatatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttattt 244  Q
    ||||||| ||||| || ||||| | | |||||||||||||||  || ||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  38447603 gttactacatttaatcatttctttaaattttattcaaataaatatt-gggtttgtgttatgtggatcctctaactttattt 38447682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 38447776 - 38447691
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctca 161  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||  |||    | |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  38447776 aattatctttttggtcctctaactatttaattgatattagattgatcc----attaaaaattgatttatttcagtcccttaagtttctca 38447691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 78 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 4156628 - 4156509
Alignment:
Q  78 ctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttag 177  Q
    ||||||||||   ||||||||||||| ||||| | || || | |||||||||| ||||||||||| ||||   ||| |||||| |||||||||  |||||    
T  4156628 ctttttggtcccttaactatttaattagtatctgtttggtaccctaactaaaatttgatttattttggtctcttaaatttctctctgttactacttttag 4156529  T
Q  178 tcctttctgttagttttatt 197  Q
    || |||  |||| |||||||    
T  4156528 tctttttcgttaattttatt 4156509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 38677131 - 38677053
Alignment:
Q  64 ttagggtaaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttattt 142  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||   |||||||||||||||| |||| || ||||  ||||||||  |||||||||||    
T  38677131 ttaggctaaattacctttttggtcccttaactatttaattggtttcggtttggtcccttaactaaattttgatttattt 38677053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 116 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 46540069 - 46540017
Alignment:
Q  116 gtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttac 168  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  |||  |||||||||||| |||||    
T  46540069 gtcctctaactaaaaattgattcatttcaatcccttaagtttctcaccgttac 46540017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 175; Significance: 3e-94; HSPs: 2)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 64 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 14588 - 14354
Alignment:
Q  64 ttagggtaaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcact 163  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  14588 ttaggctaaattacctttttggtcctctaactatttaattgatatcggattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctatgtttctcacc 14489  T
Q  164 gttactatatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtca 263  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14488 gttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatctgggtcctctaactttatttattagcatcattttggtca 14389  T
Q  264 tattccttgttaaggtattatgattaaataatgac 298  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14388 tatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgac 14354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 72 - 226
Target Start/End: Original strand, 14140 - 14294
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||     
T  14140 aattacctgtttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctttaagtttctcaccgttactac 14239  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14240 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtg 14294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0340 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 2)
Name: scaffold0340
Description:

Target: scaffold0340; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 59 - 300
Target Start/End: Original strand, 18265 - 18506
Alignment:
Q  59 aaaagttagggtaaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttc 158  Q
    |||||||| | |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  18265 aaaagttatgctaaattatatttttggtcctctaactatttaattggtattagattggtcctctaactaaaaattgatttatttaggtcttctaagtttc 18364  T
Q  159 tcactgttactatatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcatttt 258  Q
    |||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18365 tcaccgctactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaattttatttattagtatcatttt 18464  T
Q  259 ggtcatattccttgttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18465 ggtcatatgtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactg 18506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0340; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 79 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 18711 - 18564
Alignment:
Q  79 tttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagt 178  Q
    ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  18711 tttttggtcctttaattatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttttcactgttactacatttagt 18612  T
Q  179 cctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18611 cttttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 18564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0182 (Bit Score: 173; Significance: 5e-93; HSPs: 2)
Name: scaffold0182
Description:

Target: scaffold0182; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 70 - 298
Target Start/End: Original strand, 19711 - 19939
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 169  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  19711 taaattacctttttggtcctctaactatttagttggtattggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttcttaccgttact 19810  T
Q  170 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcc 269  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19811 acatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagcatcattttggtcatattcc 19910  T
Q  270 ttgttaaggtattatgattaaataatgac 298  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  19911 ttgttaaggttttatgattaaatagtgac 19939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0182; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 79 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 20146 - 20002
Alignment:
Q  79 tttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagt 178  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  20146 tttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgattattttttgtcctctaagtttctcaccgttactacatttagt 20047  T
Q  179 cctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttat 223  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20046 catttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttat 20002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 171; Significance: 7e-92; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 72 - 298
Target Start/End: Original strand, 72767 - 72992
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  72767 aattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactac 72866  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcctt 271  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  72867 atttattcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagcatcattttggtcttattcctt 72966  T
Q  272 gttaaggtattatgattaaataatgac 298  Q
    ||||| | |||||||||||||| ||||    
T  72967 gttaa-gaattatgattaaatagtgac 72992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 79 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 73199 - 73055
Alignment:
Q  79 tttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagt 178  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  73199 tttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcaccgttactacatttagt 73100  T
Q  179 cctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttat 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  73099 cctttctgttagttttattcaaataaacgttcgggtttgtgttat 73055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 168; Significance: 5e-90; HSPs: 2)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 79 - 298
Target Start/End: Original strand, 20763 - 20981
Alignment:
Q  79 tttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagt 178  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  20763 tttttggtcatctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttcacactgttactacatttagt 20862  T
Q  179 cctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattccttgttaagg 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |    
T  20863 cctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaa-g 20961  T
Q  279 tattatgattaaataatgac 298  Q
     |||||||||||||| ||||    
T  20962 aattatgattaaatagtgac 20981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 179 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 21088 - 21044
Alignment:
Q  179 cctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttat 223  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21088 cctttctattagttttattcaaataaacgttcgggtttgtgttat 21044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 168; Significance: 5e-90; HSPs: 2)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 70 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 50924 - 50693
Alignment:
Q  70 taaattatctttttggtcttctaactattt-aattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttac 168  Q
    |||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  50924 taaattacatttttggtcctctaactattttaattggtatcagattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcttctaagtttctcaccgttac 50825  T
Q  169 tatatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattc 268  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  50824 tacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatgc 50725  T
Q  269 cttgttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  50724 cttgttaaggtattatgattaaatagtgactg 50693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 72 - 226
Target Start/End: Original strand, 50481 - 50635
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||     
T  50481 aattatctttttggtcctctacctatttaattggtatctgattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctttaagtttctcaccgttactac 50580  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50581 atttagtcctttctgttatttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 50635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 5)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 79 - 300
Target Start/End: Original strand, 349085 - 349306
Alignment:
Q  79 tttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagt 178  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  || |||||||    
T  349085 ttttttgtcctctaactatttaattagtattagattagtcctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaagtttctcaccgtttttacatttagt 349184  T
Q  179 cctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattccttgttaagg 278  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  349185 catttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgcgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattccttgttaagg 349284  T
Q  279 tattatgattaaataatgactg 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  349285 tattatgattaaatattgactg 349306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 78 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 349511 - 349364
Alignment:
Q  78 ctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttag 177  Q
    ||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  349511 ctttttggtcccctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaag-ttctcacttttactacatttag 349413  T
Q  178 tcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  349412 tcctttctgttaattttattcaaataaatgttagggtttgtgttatgtg 349364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 79 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 113804 - 113657
Alignment:
Q  79 tttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagt 178  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || |||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  113804 tttttggtcctctaactatttaagtgctatcagattggtcctgtaactaaaaattgatttctttcggtcatctaaatttctcactgttactacatttagt 113705  T
Q  179 cctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  113704 catttctgttagttttattcaaataaacgttaaggttagtgttatgtg 113657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #4
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 79 - 196
Target Start/End: Original strand, 113405 - 113522
Alignment:
Q  79 tttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagt 178  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| || ||||| |    
T  113405 tttttggtcctctaactgtttaattggtatccgattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcatcgttagtaaatttatt 113504  T
Q  179 cctttctgttagttttat 196  Q
    |||||| |||||||||||    
T  113505 cctttccgttagttttat 113522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #5
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 220 - 300
Target Start/End: Original strand, 113519 - 113599
Alignment:
Q  220 ttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattccttgttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  113519 ttatgtggctcctctaactttatttattagtatcattttggttctatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactg 113599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0115 (Bit Score: 161; Significance: 7e-86; HSPs: 2)
Name: scaffold0115
Description:

Target: scaffold0115; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 72 - 300
Target Start/End: Original strand, 21517 - 21744
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  21517 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactac 21616  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcctt 271  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||     
T  21617 atttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatatctc 21715  T
Q  272 gttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
    |||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  21716 gttaaaatattatgattaaatagtgactg 21744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0115; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 72 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 22598 - 22451
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  22598 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactattactac 22499  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtg 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  22498 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgtcaaggtttgtg 22451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0221 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 2)
Name: scaffold0221
Description:

Target: scaffold0221; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 64 - 300
Target Start/End: Original strand, 8426 - 8661
Alignment:
Q  64 ttagggtaaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcact 163  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  || | ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  8426 ttaggctaaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattgatctt-taactaaaaattgatttatttcgatcctttaagtttctcact 8524  T
Q  164 gttactatatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtca 263  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  8525 gttacaatatttagtattttctgttagttttattcaaataaacgttgaggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcc 8624  T
Q  264 tattccttgttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8625 tatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactg 8661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0221; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 79 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 8866 - 8721
Alignment:
Q  79 tttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagt 178  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  8866 tttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttatgttctctaagtttctcaccgttactacatttagt 8767  T
Q  179 cctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatg 224  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8766 cttttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatg 8721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0186 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 2)
Name: scaffold0186
Description:

Target: scaffold0186; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 65 - 298
Target Start/End: Original strand, 24160 - 24393
Alignment:
Q  65 tagggtaaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 164  Q
    |||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  24160 taggctaaattacctttttggtcctctaactatttagttggtattgaattggtcctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaagtttctcaccg 24259  T
Q  165 ttactatatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcat 264  Q
    ||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||| |    
T  24260 ttattacatttagtcatttctgttagtttttttcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattaacatcattttggtcct 24359  T
Q  265 attccttgttaaggtattatgattaaataatgac 298  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  24360 gttccttgttaagatattatgattaaatagtgac 24393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0186; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 79 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 24600 - 24456
Alignment:
Q  79 tttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagt 178  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24600 tttttggtactctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcactgttactacatttagt 24501  T
Q  179 cctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttat 223  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24500 catttctgttaattttattcaaataaacgttagggtttgtgttat 24456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0246 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0246
Description:

Target: scaffold0246; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 116 - 300
Target Start/End: Original strand, 6047 - 6228
Alignment:
Q  116 gtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtt 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  6047 gtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcttctaagtttctcattgttactatatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacattagagtt 6146  T
Q  216 tgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattccttgttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6147 tgtgttatgtggatcctctaactttatttat---tatcattttgatcatatgtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactg 6228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0246; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 91 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 6420 - 6286
Alignment:
Q  91 taactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagtcctttctgttag 190  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||    
T  6420 taactaattaattggtatcgtattggtcctctaactaaaaattgatt-atttcggtcctctaagtttctcaccgttactacatttagtcatttctgttag 6322  T
Q  191 ttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6321 ttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtg 6286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 3)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 72 - 220
Target Start/End: Original strand, 81863 - 82011
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  81863 aattatctttttgatcctctaactatttatttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactac 81962  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgt 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  81963 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgt 82011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 144 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 82231 - 82075
Alignment:
Q  144 ggtcctctaagtttctcactgttactatatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatt 243  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  82231 ggtcctctaagtttctcaccgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtcctctaactttatt 82132  T
Q  244 tattagtatcattttggtcatattccttgttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  82131 tattaatatcattttggtcctatttcttgttaagatattatgattaaatagtgactg 82075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #3
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 57 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 90898 - 90785
Alignment:
Q  57 ataaaagttagggtaaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtt 156  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  90898 ataaatgttaggttaaattatatttttcgtcctctaactatttagttggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtt 90799  T
Q  157 tctcactgttacta 170  Q
    |||||| |||||||    
T  90798 tctcaccgttacta 90785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 124; Significance: 8e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 65 - 300
Target Start/End: Original strand, 15451 - 15681
Alignment:
Q  65 tagggtaaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 164  Q
    |||| ||||||| ||||||  || |||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  15451 taggataaattaccttttttatcctctaactattcaattggtatcggattgatcctctaattaaaaattgatttattttggtcatttaagtttctcactg 15550  T
Q  165 ttactatatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcat 264  Q
    |||||| |||||||| |||||||||     ||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  15551 ttactacatttagtcatttctgtta-----attcaaataaatgtttgagtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcatttttgtcct 15645  T
Q  265 attccttgttaaggtattatgattaaataatgactg 300  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  15646 atgccttgttaagatattatgattaaatagtgactg 15681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 79 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 15886 - 15739
Alignment:
Q  79 tttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagt 178  Q
    |||||| || ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| ||||| |    
T  15886 tttttgatcctctaactatttaactggtatcggattggtcatctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccatgactacatttaat 15787  T
Q  179 cctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15786 cccttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 15739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 106 - 226
Target Start/End: Original strand, 14231 - 14350
Alignment:
Q  106 tatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagtcctttctgttagttttattcaaataaa 205  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14231 tatcggattggtc-tctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttgctatatttagtcatttctgttagttttattcaaataaa 14329  T
Q  206 cgttagggtttgtgttatgtg 226  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  14330 cgttagagtttgtgttatgtg 14350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 78 - 218
Target Start/End: Original strand, 9793 - 9932
Alignment:
Q  78 ctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttag 177  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||  | |||||||  |||||    
T  9793 ctttttggtcccttaactatttaattggtatcggtttgctcctctaactaaaatttgatttattttggtcctttaagtttctatccgttactacttttag 9892  T
Q  178 tcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgt 218  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  9893 tcctttccgttagttttatt-aaaaaaacgttagggtttgt 9932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 72 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 11001 - 10860
Alignment:
Q  72 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactat 171  Q
    |||| |||||||||||   ||||||||||||| ||||||| || |||| |||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||  ||||||| |     
T  11001 aattgtctttttggtcccttaactatttaattagtatcggtttggtcccctaactaaaatttgatttattttggtcccttaagtttctttctgttaccac 10902  T
Q  172 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggt 214  Q
     |||||| ||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||    
T  10901 ttttagttctttccgttaattttatt-aaaaaaacgttagggt 10860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 116 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 147241 - 147133
Alignment:
Q  116 gtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtt 215  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||| |||||||| ||||||||||||| ||    
T  147241 gtcctcgaactaaaaattgatttatttcggtccgttaagtttctcatcgttactatatttagtcatttccgttaattttattcgaataaacgttaggatt 147142  T
Q  216 tgtgttatg 224  Q
    | |||||||    
T  147141 tatgttatg 147133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 89 - 214
Target Start/End: Original strand, 144042 - 144166
Alignment:
Q  89 tctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactatatttagtcctttctgtt 188  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||  ||||||| ||||  ||    
T  144042 tctaactatttaattggtatcatattggttctctaactaaaaattgatttatttcggtcccttaaatttctcaccgttactacttttagtcttttccatt 144141  T
Q  189 agttttattcaaataaacgttagggt 214  Q
     |||||||| ||| ||||||||||||    
T  144142 ggttttatt-aaaaaaacgttagggt 144166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University