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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF16190_high_1 (Length: 820)

Name: NF16190_high_1
Description: NF16190
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF16190_high_1
NF16190_high_1
[»] chr2 (1 HSPs)
chr2 (1-820)||(6696863-6697686)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 730; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 730; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 820
Target Start/End: Complemental strand, 6697686 - 6696863
Alignment:
Q  1 aaatcgtcatataattagag--tataagatggttgtagatataagatatcaaacaaaatttggtacgtagcattttagaagattataaagatcattttaa 98  Q
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T  6697686 aaatcgtcatataattagagagtataagatggttgtagatataagttatcaaacaaaatttggtacgtagcattttagaagattataaagatcattttaa 6697587  T
Q  99 attatttgcaaactatagtaataatctatagtagataattttaacatttgaatattaatnnnnnnnnttgcaaagttatacccaatgcatccccatgata 198  Q
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T  6697586 attatttgcaaactatagtaataatctatagtagataattttaacatttgaatattaataaaaaaaattgcaaagttatacccaatgcatccccatgata 6697487  T
Q  199 taagatattagttgttttaggaaaagtttatccaattttatatatgcattttataatataataacatactaattatttttccttgttacatctttattca 298  Q
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T  6697486 taagatacaagtcgttttaggaaaagtttatccaattttatatatgcattttataatataataaaatactaattatttttccttgttacatctttagtca 6697387  T
Q  299 ttattaatgtatcatcttcaattcttacggataacaaaataaacggtaatttatagagatacatgatgttttttatatttactaatttgtgtaccaaaaa 398  Q
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T  6697386 ttattaatgtatcatcttcaattcttacaaataacaaaataaacgataatttatagagatacatgatgttttttatatttactaatttgtgtaccaaaaa 6697287  T
Q  399 attgaactgcttatata--atacgagaccattcagtactttgtttgtgccaagagtttctactttctagttaaactatcattgtaacacaaaaatcagag 496  Q
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T  6697286 attgaactgcttatatataatacgagaccattcagtactttgtttgtgccaagagtttctactttctagttaaactatcattgtaacacaaaaatcagag 6697187  T
Q  497 tcatgtactaggaaggtgtttatgctaatcattgttttccctttgcttgaatgtggtacgaagataacttactaagttggtgggggaaaccaacattgga 596  Q
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T  6697186 tcatgtactaggaaggtgtttatgctaatcattgttttccctttgcttggatgtggtacgaagataacttactaagttggtgggggaaaccaacatcgga 6697087  T
Q  597 tcccatacacaccaaaccagttaatatgtagtactttatattatatttttggaacatgttttaatggttttaaattataaactataagttagaacattgc 696  Q
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T  6697086 tcccatacacaccaaaccagttaatatgtagtactttatattatatttttggaacatgttttaatggttttaaattataaactataagttagaacattgc 6696987  T
Q  697 tttcacgactaaaatgatattgttagttggtcaagatttatgattaaaataaggggaaaatatagcatgtactcaacagaaagcttatatagaaatgata 796  Q
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T  6696986 tttcacgactaaaatgatattgttagttggtaaagatttatgattaaaataaggggaaaatatagcatgtactcaacagaaagcttatatagaaatgata 6696887  T
Q  797 ttcaggggatggctagggtggaga 820  Q
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T  6696886 ttcaggggatggctagggtggaga 6696863  T

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