View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF16208_low_11 (Length: 241)

Name: NF16208_low_11
Description: NF16208
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF16208_low_11
NF16208_low_11
[»] chr4 (52 HSPs)
chr4 (18-231)||(7151978-7152187)
chr4 (33-229)||(6864265-6864461)
chr4 (72-229)||(7703739-7703896)
chr4 (72-229)||(36493513-36493670)
chr4 (32-229)||(19440432-19440629)
chr4 (34-226)||(25184346-25184538)
chr4 (72-231)||(25700880-25701039)
chr4 (34-229)||(34361277-34361473)
chr4 (34-229)||(35020817-35021016)
chr4 (73-229)||(1815531-1815687)
chr4 (73-229)||(33341628-33341784)
chr4 (72-224)||(55240929-55241081)
chr4 (72-229)||(28002810-28002967)
chr4 (72-229)||(30002465-30002622)
chr4 (76-229)||(34947923-34948076)
chr4 (72-229)||(39400238-39400395)
chr4 (72-229)||(46887982-46888139)
chr4 (72-229)||(47253970-47254127)
chr4 (32-229)||(32579676-32579873)
chr4 (73-229)||(37775888-37776044)
chr4 (73-229)||(50764950-50765106)
chr4 (73-229)||(55477716-55477872)
chr4 (34-229)||(33816302-33816497)
chr4 (72-229)||(37287958-37288116)
chr4 (72-229)||(23761301-23761458)
chr4 (73-229)||(879373-879529)
chr4 (72-224)||(32592319-32592471)
chr4 (34-229)||(32912365-32912561)
chr4 (75-229)||(37663568-37663722)
chr4 (34-229)||(49376197-49376392)
chr4 (72-229)||(50697471-50697629)
chr4 (34-227)||(4205216-4205409)
chr4 (73-229)||(4598212-4598368)
chr4 (32-229)||(19089237-19089434)
chr4 (72-229)||(3042849-3043006)
chr4 (72-229)||(29584024-29584181)
chr4 (74-223)||(9139465-9139612)
chr4 (72-229)||(17167943-17168100)
chr4 (72-229)||(17173520-17173677)
chr4 (72-229)||(17272194-17272351)
chr4 (73-229)||(27396846-27397000)
chr4 (72-197)||(35025391-35025515)
chr4 (72-188)||(23431826-23431942)
chr4 (72-218)||(46883938-46884080)
chr4 (33-229)||(5047751-5047947)
chr4 (73-226)||(26896320-26896474)
chr4 (72-229)||(42199959-42200117)
chr4 (72-152)||(38012569-38012649)
chr4 (76-229)||(4934040-4934183)
chr4 (144-229)||(38012084-38012169)
chr4 (155-218)||(56050171-56050234)
chr4 (183-229)||(35025531-35025577)
[»] chr7 (50 HSPs)
chr7 (34-229)||(29173728-29173922)
chr7 (72-229)||(37703297-37703454)
chr7 (72-229)||(9355625-9355782)
chr7 (73-229)||(18797532-18797688)
chr7 (74-229)||(17842385-17842540)
chr7 (72-229)||(31520540-31520697)
chr7 (72-229)||(37347226-37347383)
chr7 (73-229)||(32820853-32821009)
chr7 (72-227)||(10359013-10359168)
chr7 (74-229)||(37110079-37110234)
chr7 (30-229)||(6546724-6546923)
chr7 (30-229)||(15612516-15612715)
chr7 (31-229)||(24211946-24212145)
chr7 (78-229)||(44411345-44411496)
chr7 (91-229)||(37704387-37704525)
chr7 (72-229)||(31578863-31579020)
chr7 (35-229)||(32432657-32432851)
chr7 (37-229)||(23111397-23111589)
chr7 (33-229)||(35353313-35353509)
chr7 (72-202)||(22687463-22687593)
chr7 (75-229)||(30055732-30055886)
chr7 (72-229)||(8861490-8861647)
chr7 (72-229)||(26980511-26980668)
chr7 (72-229)||(41764877-41765034)
chr7 (73-229)||(48928097-48928253)
chr7 (103-229)||(12165948-12166074)
chr7 (72-210)||(26587891-26588029)
chr7 (72-229)||(43925306-43925457)
chr7 (72-229)||(46480928-46481085)
chr7 (79-226)||(27283952-27284100)
chr7 (72-229)||(5657279-5657437)
chr7 (50-229)||(10481810-10481989)
chr7 (72-229)||(15672558-15672718)
chr7 (74-229)||(12390450-12390605)
chr7 (72-221)||(34361975-34362126)
chr7 (34-229)||(4583124-4583319)
chr7 (91-229)||(11071411-11071546)
chr7 (73-229)||(25691344-25691500)
chr7 (72-217)||(7335010-7335155)
chr7 (72-229)||(21991841-21991989)
chr7 (72-229)||(32593006-32593162)
chr7 (33-146)||(38258867-38258980)
chr7 (72-229)||(44598871-44599028)
chr7 (128-229)||(33688117-33688218)
chr7 (144-229)||(38053666-38053751)
chr7 (144-229)||(43686245-43686330)
chr7 (167-229)||(38258750-38258812)
chr7 (183-229)||(48928474-48928520)
chr7 (73-108)||(12166215-12166250)
chr7 (115-191)||(27421207-27421283)
[»] chr1 (54 HSPs)
chr1 (34-229)||(32216281-32216476)
chr1 (33-229)||(2959974-2960170)
chr1 (74-229)||(16415872-16416027)
chr1 (34-229)||(48353768-48353963)
chr1 (72-229)||(37451511-37451668)
chr1 (32-229)||(7078816-7079013)
chr1 (34-229)||(10922953-10923148)
chr1 (34-229)||(14758258-14758453)
chr1 (72-229)||(47279415-47279572)
chr1 (73-229)||(3535149-3535305)
chr1 (29-229)||(8222354-8222554)
chr1 (32-229)||(34012135-34012332)
chr1 (74-229)||(27266995-27267150)
chr1 (74-229)||(27227280-27227435)
chr1 (73-227)||(30254651-30254805)
chr1 (72-229)||(11742161-11742318)
chr1 (72-229)||(15168322-15168479)
chr1 (31-229)||(27532734-27532931)
chr1 (72-229)||(28564576-28564733)
chr1 (28-229)||(46931635-46931837)
chr1 (72-229)||(3309379-3309537)
chr1 (74-228)||(27563700-27563854)
chr1 (34-229)||(32267260-32267455)
chr1 (72-229)||(238306-238463)
chr1 (73-229)||(23999573-23999730)
chr1 (72-229)||(28769879-28770036)
chr1 (72-226)||(27763103-27763258)
chr1 (29-229)||(47682244-47682444)
chr1 (74-229)||(19899563-19899719)
chr1 (73-229)||(38823440-38823596)
chr1 (72-229)||(51129085-51129240)
chr1 (72-229)||(9902847-9903004)
chr1 (73-229)||(25160858-25161015)
chr1 (74-229)||(4330507-4330662)
chr1 (34-229)||(15383159-15383355)
chr1 (73-224)||(39393615-39393766)
chr1 (72-210)||(1547516-1547654)
chr1 (30-229)||(22170937-22171136)
chr1 (88-229)||(1359744-1359885)
chr1 (74-226)||(21289829-21289981)
chr1 (74-229)||(10181802-10181958)
chr1 (32-229)||(15752255-15752452)
chr1 (74-229)||(41926383-41926537)
chr1 (79-229)||(30326751-30326902)
chr1 (107-229)||(37618729-37618851)
chr1 (72-218)||(31962853-31963000)
chr1 (72-209)||(31621341-31621479)
chr1 (73-229)||(42721265-42721418)
chr1 (90-229)||(40885039-40885178)
chr1 (93-229)||(18422877-18423006)
chr1 (34-229)||(33725366-33725550)
chr1 (34-128)||(48620916-48621010)
chr1 (142-229)||(38759759-38759846)
chr1 (177-229)||(48620854-48620906)
[»] chr8 (43 HSPs)
chr8 (72-231)||(1953792-1953951)
chr8 (34-229)||(16446641-16446836)
chr8 (72-228)||(12587812-12587968)
chr8 (34-226)||(43643361-43643553)
chr8 (76-229)||(466061-466214)
chr8 (72-229)||(23854235-23854392)
chr8 (34-226)||(1149398-1149590)
chr8 (74-229)||(4132492-4132647)
chr8 (29-229)||(35859163-35859363)
chr8 (72-229)||(7890761-7890918)
chr8 (72-229)||(27082642-27082799)
chr8 (72-229)||(37970323-37970480)
chr8 (73-229)||(11727253-11727409)
chr8 (73-229)||(34895191-34895347)
chr8 (73-229)||(39098924-39099080)
chr8 (33-229)||(38644207-38644403)
chr8 (72-229)||(34951861-34952018)
chr8 (73-229)||(1205156-1205312)
chr8 (72-218)||(5299750-5299896)
chr8 (72-229)||(8803620-8803778)
chr8 (73-210)||(24823199-24823336)
chr8 (72-229)||(35459515-35459672)
chr8 (72-229)||(44869726-44869883)
chr8 (73-229)||(16223092-16223248)
chr8 (34-229)||(33906441-33906634)
chr8 (75-229)||(6098320-6098479)
chr8 (72-229)||(36694770-36694927)
chr8 (72-202)||(33198058-33198188)
chr8 (104-229)||(1149756-1149881)
chr8 (33-229)||(12876339-12876535)
chr8 (72-226)||(40862651-40862806)
chr8 (73-229)||(10555010-10555165)
chr8 (72-229)||(31933690-31933847)
chr8 (34-229)||(30654349-30654544)
chr8 (97-229)||(9864377-9864509)
chr8 (72-216)||(18259321-18259465)
chr8 (72-157)||(41362723-41362808)
chr8 (73-158)||(43025974-43026059)
chr8 (144-229)||(13307852-13307936)
chr8 (137-228)||(34463704-34463792)
chr8 (174-229)||(41910895-41910949)
chr8 (72-106)||(13307931-13307965)
chr8 (188-229)||(43025931-43025972)
[»] chr5 (52 HSPs)
chr5 (29-229)||(22255412-22255612)
chr5 (73-229)||(35826275-35826431)
chr5 (74-229)||(699380-699535)
chr5 (73-229)||(22981023-22981179)
chr5 (72-223)||(15992328-15992479)
chr5 (29-229)||(42342951-42343151)
chr5 (72-229)||(24886317-24886474)
chr5 (72-229)||(31786434-31786591)
chr5 (38-229)||(2888199-2888390)
chr5 (34-229)||(35511232-35511427)
chr5 (72-229)||(25669806-25669963)
chr5 (72-229)||(31705400-31705557)
chr5 (74-229)||(5830122-5830278)
chr5 (74-229)||(25889600-25889755)
chr5 (34-229)||(38527987-38528182)
chr5 (72-229)||(9200454-9200611)
chr5 (73-226)||(22973871-22974024)
chr5 (72-224)||(8741673-8741825)
chr5 (72-226)||(8437198-8437352)
chr5 (34-225)||(33908467-33908657)
chr5 (72-210)||(39573060-39573198)
chr5 (34-229)||(40133615-40133810)
chr5 (72-229)||(19120089-19120246)
chr5 (72-229)||(22019853-22020010)
chr5 (73-225)||(7208653-7208805)
chr5 (73-224)||(7693456-7693607)
chr5 (72-229)||(5837785-5837942)
chr5 (34-229)||(14409091-14409286)
chr5 (28-211)||(25500670-25500853)
chr5 (72-226)||(35504598-35504752)
chr5 (34-229)||(36866992-36867187)
chr5 (32-226)||(17157779-17157973)
chr5 (72-229)||(27330534-27330691)
chr5 (73-229)||(36860654-36860810)
chr5 (74-229)||(12910585-12910740)
chr5 (72-202)||(28416339-28416469)
chr5 (72-229)||(15724718-15724875)
chr5 (72-229)||(32563370-32563527)
chr5 (72-229)||(35934126-35934283)
chr5 (36-229)||(13956116-13956307)
chr5 (72-229)||(43308448-43308605)
chr5 (72-229)||(23116018-23116167)
chr5 (73-229)||(30969113-30969269)
chr5 (73-229)||(27318277-27318432)
chr5 (73-229)||(21088558-21088711)
chr5 (73-197)||(8466988-8467112)
chr5 (108-229)||(1428983-1429107)
chr5 (74-160)||(43254154-43254240)
chr5 (72-199)||(26269069-26269196)
chr5 (34-229)||(23954552-23954734)
chr5 (72-229)||(14919327-14919473)
chr5 (132-224)||(6824329-6824420)
[»] chr2 (45 HSPs)
chr2 (33-229)||(41961070-41961266)
chr2 (72-229)||(7006754-7006911)
chr2 (29-229)||(44913894-44914097)
chr2 (34-222)||(18494059-18494247)
chr2 (34-229)||(33660155-33660350)
chr2 (73-218)||(26357818-26357963)
chr2 (34-229)||(11366158-11366354)
chr2 (72-229)||(33709048-33709205)
chr2 (72-229)||(43770664-43770821)
chr2 (73-229)||(4763861-4764017)
chr2 (34-229)||(2325156-2325351)
chr2 (34-229)||(4167152-4167347)
chr2 (72-218)||(5881770-5881916)
chr2 (34-229)||(41465731-41465926)
chr2 (72-229)||(19289139-19289296)
chr2 (97-223)||(27349789-27349915)
chr2 (72-229)||(43648061-43648218)
chr2 (73-229)||(31570551-31570707)
chr2 (72-229)||(35959126-35959279)
chr2 (72-229)||(39167185-39167342)
chr2 (80-226)||(19500739-19500885)
chr2 (72-229)||(13711689-13711846)
chr2 (72-229)||(31862082-31862239)
chr2 (36-229)||(3177169-3177362)
chr2 (31-188)||(19424417-19424574)
chr2 (107-229)||(4478595-4478717)
chr2 (72-217)||(41051116-41051260)
chr2 (73-229)||(33550800-33550960)
chr2 (72-229)||(37905940-37906098)
chr2 (125-229)||(44286179-44286283)
chr2 (74-229)||(29241963-29242111)
chr2 (106-229)||(4263926-4264049)
chr2 (73-178)||(41463407-41463512)
chr2 (73-152)||(33902321-33902400)
chr2 (120-229)||(19314074-19314186)
chr2 (72-171)||(18257354-18257453)
chr2 (151-224)||(36642223-36642296)
chr2 (154-229)||(45327950-45328025)
chr2 (34-121)||(45328028-45328114)
chr2 (167-229)||(17071648-17071710)
chr2 (166-229)||(18258197-18258260)
chr2 (88-130)||(17053963-17054005)
chr2 (167-229)||(17054007-17054069)
chr2 (88-130)||(17071604-17071646)
chr2 (185-229)||(41463779-41463823)
[»] chr3 (56 HSPs)
chr3 (34-229)||(46297522-46297717)
chr3 (74-229)||(11357181-11357336)
chr3 (34-229)||(26941020-26941215)
chr3 (73-231)||(1089913-1090070)
chr3 (34-229)||(40552019-40552214)
chr3 (33-218)||(4015691-4015876)
chr3 (74-229)||(53228952-53229107)
chr3 (34-229)||(22622478-22622673)
chr3 (33-228)||(33378544-33378739)
chr3 (72-229)||(48355162-48355319)
chr3 (72-224)||(33698379-33698531)
chr3 (72-229)||(24707913-24708070)
chr3 (72-229)||(29099567-29099724)
chr3 (72-229)||(44186315-44186472)
chr3 (74-229)||(52040722-52040877)
chr3 (35-229)||(39282873-39283067)
chr3 (73-229)||(7327281-7327437)
chr3 (34-218)||(43975652-43975836)
chr3 (75-229)||(42505876-42506030)
chr3 (74-231)||(3362474-3362631)
chr3 (72-229)||(14586478-14586634)
chr3 (72-229)||(22451189-22451346)
chr3 (32-229)||(21193828-21194025)
chr3 (73-229)||(24488761-24488917)
chr3 (73-229)||(44891718-44891874)
chr3 (33-229)||(51212536-51212726)
chr3 (31-229)||(21009558-21009757)
chr3 (72-229)||(54506028-54506186)
chr3 (36-229)||(47481743-47481937)
chr3 (34-218)||(37157940-37158124)
chr3 (34-218)||(37203300-37203484)
chr3 (72-229)||(2008153-2008317)
chr3 (72-224)||(40936199-40936351)
chr3 (74-229)||(22445865-22446020)
chr3 (34-229)||(11356918-11357105)
chr3 (73-229)||(25579960-25580116)
chr3 (97-229)||(34133156-34133288)
chr3 (34-218)||(36012371-36012556)
chr3 (73-229)||(29164030-29164179)
chr3 (34-229)||(32373691-32373885)
chr3 (73-229)||(4761447-4761603)
chr3 (97-229)||(38591919-38592051)
chr3 (103-229)||(46994490-46994616)
chr3 (72-229)||(50475032-50475196)
chr3 (72-229)||(3654997-3655157)
chr3 (72-151)||(20373061-20373140)
chr3 (135-229)||(45174727-45174821)
chr3 (119-229)||(54828546-54828656)
chr3 (80-218)||(27480164-27480306)
chr3 (34-229)||(11467045-11467226)
chr3 (135-197)||(11835494-11835556)
chr3 (167-229)||(20373137-20373199)
chr3 (144-229)||(43348478-43348563)
chr3 (137-216)||(53811597-53811676)
chr3 (72-120)||(35844577-35844625)
chr3 (72-108)||(43348556-43348592)
[»] chr6 (16 HSPs)
chr6 (34-229)||(3879698-3879893)
chr6 (34-229)||(6090941-6091136)
chr6 (73-229)||(1946064-1946221)
chr6 (31-229)||(20768312-20768510)
chr6 (72-229)||(33892809-33892966)
chr6 (72-229)||(7234829-7234989)
chr6 (34-229)||(5627621-5627817)
chr6 (79-229)||(4318626-4318776)
chr6 (73-229)||(21016916-21017066)
chr6 (72-229)||(8513458-8513608)
chr6 (72-229)||(29182394-29182548)
chr6 (73-229)||(33619055-33619219)
chr6 (72-199)||(7054569-7054697)
chr6 (72-229)||(6089133-6089283)
chr6 (78-133)||(33724062-33724117)
chr6 (173-229)||(30353256-30353312)
[»] scaffold0002 (3 HSPs)
scaffold0002 (72-229)||(408227-408384)
scaffold0002 (72-229)||(364-515)
scaffold0002 (73-229)||(93900-94055)
[»] scaffold0318 (1 HSPs)
scaffold0318 (73-229)||(12139-12294)
[»] scaffold0291 (1 HSPs)
scaffold0291 (75-229)||(8117-8271)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (28-229)||(145769-145971)
[»] scaffold0061 (1 HSPs)
scaffold0061 (72-229)||(44186-44343)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (72-229)||(154444-154601)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (72-229)||(267515-267663)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (114-180)||(100994-101058)
scaffold0009 (192-229)||(100957-100994)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 156; Significance: 5e-83; HSPs: 52)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 18 - 231
Target Start/End: Original strand, 7151978 - 7152187
Alignment:
Q  18 gttagaattctaaaatgggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||    ||||||||       |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7151978 gttagaattctaaaatgggagcttatacagtgcag----aaaactgacttttttgaaaaagttatttttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgt 7152073  T
Q  118 tgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaac 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7152074 tgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacaggtactattttatcgttgacatatttaacatgcaaac 7152173  T
Q  218 agagttgatgatgt 231  Q
    ||||||||||||||    
T  7152174 agagttgatgatgt 7152187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 33 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 6864461 - 6864265
Alignment:
Q  33 tgggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaat 132  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6864461 tgggagcttctacggtgcagtcagaaaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaat 6864362  T
Q  133 gatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  6864361 gatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttacaaatattattttatcgttgtaatctttaacatgcaaacaaagttgatgat 6864265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 7703896 - 7703739
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 171  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  7703896 gaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgataaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 7703797  T
Q  172 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||    
T  7703796 cgacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacgtgcaaacagagttgctgat 7703739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Original strand, 36493513 - 36493670
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 171  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||    
T  36493513 gaaaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttaattacggattaatgatcaatagtaattcatcgagtaatgcttgcaatatctt 36493612  T
Q  172 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36493613 agacttacagatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgat 36493670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 32 - 229
Target Start/End: Original strand, 19440432 - 19440629
Alignment:
Q  32 atgggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaa 131  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| |||||||        |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||    
T  19440432 atgggagcttctacggtgcagtcaggaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattaatttttaaattattgattactgattaa 19440531  T
Q  132 tgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  19440532 tgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcattggaatctttaacatgcaaacagagttgatgat 19440629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 34 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 25184538 - 25184346
Alignment:
Q  34 gggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatg 133  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||       ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  25184538 gggagcttctatggtgcagtcagaaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgtcgattactgattaatg 25184439  T
Q  134 atcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgat 226  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| || || || |||||||||||||||||||||||    
T  25184438 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatttttaacatgcaaacagagttgat 25184346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 72 - 231
Target Start/End: Original strand, 25700880 - 25701039
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 171  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25700880 gaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgtacattattgattaatgatcaatagtaattcatctaacaatgcttgcaaaatctt 25700979  T
Q  172 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgatgt 231  Q
     || |||| |||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25700980 agatttacggatactattttatcgttgacttctttaacatgcaaacaaagttgatgatgt 25701039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 34 - 229
Target Start/End: Original strand, 34361277 - 34361473
Alignment:
Q  34 gggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatg 133  Q
    |||||||| |||||| ||||||| |||||||       ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34361277 gggagcttctacggtgcagtcaggaaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatg 34361376  T
Q  134 atcaatagta-attcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||    
T  34361377 atcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttataggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttgatgat 34361473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 34 - 229
Target Start/End: Original strand, 35020817 - 35021016
Alignment:
Q  34 gggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatg 133  Q
    |||||||| ||||||  ||||||||||||||        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  35020817 gggagcttctacggtgtagtcagaaaactgactcttttaaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattaccgattaatg 35020916  T
Q  134 atcaata----gtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |||||||    |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  35020917 atcaatatatagtaattcatctagtaatgtttgcaatatcttggacttacagatactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgat 35021016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 1815687 - 1815531
Alignment:
Q  73 aaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttg 172  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  1815687 aaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaattgtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttg 1815588  T
Q  173 gacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||    
T  1815587 gatttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttgatgat 1815531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 33341784 - 33341628
Alignment:
Q  73 aaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttg 172  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||    
T  33341784 aaaaaattaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaacatcttg 33341685  T
Q  173 gacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  33341684 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgctgat 33341628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 72 - 224
Target Start/End: Original strand, 55240929 - 55241081
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 171  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||    
T  55240929 gaaaaatttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgattaatagtaatttatctagtaatgtttgcaacatctt 55241028  T
Q  172 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttg 224  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  55241029 ggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttg 55241081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Original strand, 28002810 - 28002967
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 171  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||    
T  28002810 gaaaaagttaattttgatcttaatgttcgattcatttttaaattgttgattgttgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttagcaacatctt 28002909  T
Q  172 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  28002910 ggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgat 28002967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Original strand, 30002465 - 30002622
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 171  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  30002465 gaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgtttattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 30002564  T
Q  172 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
     |||||| |  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  30002565 agacttaaatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgctgat 30002622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 76 - 229
Target Start/End: Original strand, 34947923 - 34948076
Alignment:
Q  76 aagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggac 175  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  34947923 aagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaacgatcaatagtatttcatctagtaatgcttgcaacatcttggac 34948022  T
Q  176 ttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  34948023 ttacatgtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgttgat 34948076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 39400395 - 39400238
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 171  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||    
T  39400395 gaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtcattcatctagtaatgcttgcaacatctt 39400296  T
Q  172 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    | ||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  39400295 gaacttaaaggtaccattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgat 39400238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Original strand, 46887982 - 46888139
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 171  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||    
T  46887982 gaaaaagttaattttgattttaatatttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgtaacatctt 46888081  T
Q  172 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  46888082 ggatttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaaccgatttgatgat 46888139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 47254127 - 47253970
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 171  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  47254127 gaaaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 47254028  T
Q  172 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
     ||||| ||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  47254027 agacttgcatgtactattttattgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgat 47253970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 32 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 32579873 - 32579676
Alignment:
Q  32 atgggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaa 131  Q
    ||||||| || |||||| |||| ||||||||||       |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||    
T  32579873 atgggagtttctacggtgcagttagaaaactgacttttttgaaaaaattaattttgatcttaatgtttgatttatttttaaattgttgattgctgattaa 32579774  T
Q  132 tgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  32579773 tgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatttttaacatgcaaacatagttgatgat 32579676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 37776044 - 37775888
Alignment:
Q  73 aaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttg 172  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||     
T  37776044 aaaaagttaatttcaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctta 37775945  T
Q  173 gacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  37775944 gacttacatgtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacaaagttgctgat 37775888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 50765106 - 50764950
Alignment:
Q  73 aaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttg 172  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||     
T  50765106 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctta 50765007  T
Q  173 gacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||| ||||    
T  50765006 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacttgcaaacatagttgctgat 50764950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Original strand, 55477716 - 55477872
Alignment:
Q  73 aaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttg 172  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  55477716 aaaaaattaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttaattactgattaatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 55477815  T
Q  173 gacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |||||| |  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  55477816 gacttaaatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgat 55477872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 34 - 229
Target Start/End: Original strand, 33816302 - 33816497
Alignment:
Q  34 gggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatg 133  Q
    |||||||| |||| | ||||||| |||||||       ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  33816302 gggagcttctacgatgcagtcaggaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttcgattcatttttaaattgttgattgctgattaatg 33816401  T
Q  134 atcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  33816402 atcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgaactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgat 33816497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 37288116 - 37287958
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttca-tcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatct 170  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37288116 gaaaaagttaattttaaatcttaatgtttgattcatttttaaattattgattactgattaatgctcaatagtaattcatctaataatgcttgcaacatct 37288017  T
Q  171 tggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||    
T  37288016 tggacttacatgtactattttatcgttggcatcttcaacatgcaaacaaagttgctgat 37287958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 23761458 - 23761301
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 171  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  23761458 gaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattattgattactgattaatgatcaataataattcatctagtaatgcttgcaacatctt 23761359  T
Q  172 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    ||||||| || ||| ||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| ||||    
T  23761358 ggacttataggtacaattttatcgttggtatctttaacgtgcaaacagagttgctgat 23761301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Original strand, 879373 - 879529
Alignment:
Q  73 aaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttg 172  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  879373 aaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattacttattaatgatcaataataattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 879472  T
Q  173 gacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||  | || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  879473 gacttacaggtactattttattgtcagaatctttaacatgcaaacaaagttgatgat 879529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 72 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 32592471 - 32592319
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 171  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||    
T  32592471 gaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaacgatcaatagtaattcatttagtaatgctttcaacatctt 32592372  T
Q  172 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttg 224  Q
    | |||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||    
T  32592371 gaacttacaggtactattttatcgtagacatctttaacatgcaaacaaagttg 32592319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 34 - 229
Target Start/End: Original strand, 32912365 - 32912561
Alignment:
Q  34 gggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatg 133  Q
    |||||||| |||||| ||||||| |||||||       |||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32912365 gggagcttttacggtgcagtcaggaaactgacttttttgaaaaaattcattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatg 32912464  T
Q  134 atcaatagta-attcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||| |||| ||||||||||||    
T  32912465 atcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatacaaatagagttgatgat 32912561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 75 - 229
Target Start/End: Original strand, 37663568 - 37663722
Alignment:
Q  75 aaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttgga 174  Q
    |||||||||||| || |||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  37663568 aaagttaattttgattttaacgattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgga 37663667  T
Q  175 cttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||  |||||||||    
T  37663668 cttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcgaacaacgttgatgat 37663722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 34 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 49376392 - 49376197
Alignment:
Q  34 gggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatg 133  Q
    |||||||| |||||| ||||||| |||||||       ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  49376392 gggagcttctacggtgcagtcaggaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttaattcatttttaaattcttgattactgattaatg 49376293  T
Q  134 atcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| |||  |||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| ||||||||||    
T  49376292 atcaatagtaattcatttagtaatgctttcaacttcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatccaaacaaagttgatgat 49376197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 50697629 - 50697471
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 171  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||    
T  50697629 gaaaaaattaatttttattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactaattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaacatctt 50697530  T
Q  172 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaaca-tgcaaacagagttgatgat 229  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||    
T  50697529 ggaattacaggtactattttatcgttggaatctttaacattgcaaacagagttgatgat 50697471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 34 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 4205409 - 4205216
Alignment:
Q  34 gggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatg 133  Q
    |||||||| |||||| ||||||  |||||||       |||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| |||    
T  4205409 gggagcttctacggtgcagtcaagaaactgacttttttgaaaaagttacttttaattttaatgtttgattcatttttaaattattgattacttattcatg 4205310  T
Q  134 atcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatg 227  Q
    || |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4205309 ataaatagtaattcatctagtgatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatg 4205216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 4598368 - 4598212
Alignment:
Q  73 aaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttg 172  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  4598368 aaaatgttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtaattaatctaataatgcttgcaacatcttg 4598269  T
Q  173 gacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    || ||| |  || ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  4598268 gatttaaatgtattattttatcgttggcatctttaacatgaaaacagagttgctgat 4598212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 32 - 229
Target Start/End: Original strand, 19089237 - 19089434
Alignment:
Q  32 atgggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaa 131  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| ||| |||       || |||||||||||| || |||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19089237 atgggagcttctacggtgcagtcaggaaattgacttttttgataaagttaattttgattttaacgattgattcatttttaaattgttgattactgattaa 19089336  T
Q  132 tgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||| ||||  |||||||||    
T  19089337 tgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcgaacaacgttgatgat 19089434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 3043006 - 3042849
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 171  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||    
T  3043006 gaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaataatcaatactaattcatctagtaatgcttgcaacatgtt 3042907  T
Q  172 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||  || ||||||| ||||||| ||||||||||    
T  3042906 ggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacaagcaaacaaagttgatgat 3042849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Original strand, 29584024 - 29584181
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 171  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  29584024 gaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaatcgttcattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 29584123  T
Q  172 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |||||||||  ||| ||||||| ||||  || ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  29584124 ggacttacatgtaccattttattgttgaaatctttaacatgcaaatagagttgctgat 29584181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 74 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 9139612 - 9139465
Alignment:
Q  74 aaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttgg 173  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||    
T  9139612 aaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatttttaaatta--gattattgattaatgatcaatagtaattcgtctagtaatgcttgcaacatcttgg 9139515  T
Q  174 acttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagtt 223  Q
    |||||||  |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9139514 acttacatgtactacgttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagtt 9139465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 17168100 - 17167943
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 171  Q
    |||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||||    
T  17168100 gaaaaaattacttttaattttaatgtttgattcatttttaaattattgattactaattaatgataaatagtaattcatctagtgatgcttgcaacatctt 17168001  T
Q  172 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
     ||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  17168000 agacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaatagagttgatgat 17167943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 17173677 - 17173520
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 171  Q
    |||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||||    
T  17173677 gaaaaaattacttttaattttaatgtttgattcatttttaaattattgattacttattcatgataaatagtaattcatctagtgatgcttgcaacatctt 17173578  T
Q  172 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
     ||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17173577 agacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgat 17173520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 17272351 - 17272194
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 171  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  17272351 gaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaatcgttcattaccgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 17272252  T
Q  172 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |||||||||  ||||||||||| ||||  || ||||| ||||||| ||||||| ||||    
T  17272251 ggacttacatgtactattttattgttgaaatctttaatatgcaaatagagttgctgat 17272194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 27397000 - 27396846
Alignment:
Q  73 aaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttg 172  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||    
T  27397000 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattac--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacattttg 27396903  T
Q  173 gacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |||||| || ||| | |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||    
T  27396902 gacttataggtaccactttatcgttgacatctttaacatgcaaacagcgttgctgat 27396846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 72 - 197
Target Start/End: Original strand, 35025391 - 35025515
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 171  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  35025391 gaaaaagttaattttgat-ttaatgtttgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 35025489  T
Q  172 ggacttacagatactattttatcgtt 197  Q
    |||||||||  |||||||||||||||    
T  35025490 ggacttacatgtactattttatcgtt 35025515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 72 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 23431942 - 23431826
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 171  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  23431942 gaaaaagttaattttaattttaatgtttgatgcatttttaaattgttgattactaattaatgatcaatagtaattcatctactaatgcttgcaacatctt 23431843  T
Q  172 ggacttacagatactat 188  Q
    |||||||||| ||||||    
T  23431842 ggacttacaggtactat 23431826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 72 - 218
Target Start/End: Original strand, 46883938 - 46884080
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 171  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||      
T  46883938 gaaaaaattaatttttattttaatgtttgatttatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatc-- 46884035  T
Q  172 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaaca 218  Q
    ||||||||  ||||||||||||| |||| || |||||||||||||||    
T  46884036 ggacttac--atactattttatctttggaatttttaacatgcaaaca 46884080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 33 - 229
Target Start/End: Original strand, 5047751 - 5047947
Alignment:
Q  33 tgggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaat 132  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| |||| ||       |||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |    
T  5047751 tgggagcttttacggtgcagtcaggaaacagacttttttgaaaaaattaattttgattttaatgttcgattcatttttaaattgtttattgttgattact 5047850  T
Q  133 gatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||  ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  5047851 gatcaataataatttatctagtaaaacttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgttggcatctttaacatgcaaacatagtttatgat 5047947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 73 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 26896474 - 26896320
Alignment:
Q  73 aaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagta-attcatctaataatgcttgcaaaatctt 171  Q
    |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| || ||    
T  26896474 aaaaagttaattttgattttaatgttcgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgtttgcaacatttt 26896375  T
Q  172 -ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgat 226  Q
     |||||||||  ||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||| |||||    
T  26896374 cggacttacaagtactattttatcgttgaaat-tttaacatgcaaatagacttgat 26896320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 42200117 - 42199959
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagta-attcatctaataatgcttgcaaaatct 170  Q
    ||||||||||||||  || || |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||    
T  42200117 gaaaaagttaatttg-attttgatgtttgattaatttttaaattattgattactgattaatgaacagtagtatattcatctagtaatgcttgcaacatct 42200019  T
Q  171 tggacttac-agatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||    
T  42200018 tggacttacaaggtattattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagtttatgat 42199959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 72 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 38012649 - 38012569
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatcta 152  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38012649 gaaaaagttaattttgatcttaatgttcgatttatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtaattcatcta 38012569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 76 - 229
Target Start/End: Original strand, 4934040 - 4934183
Alignment:
Q  76 aagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaa-ttgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttgga 174  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||| ||          
T  4934040 aagttaattttgatcttaatgtttaatttatttttaaaatttttgattactgattaatgattaatagaaattcatctattaatgcgtgcaacat------ 4934133  T
Q  175 cttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
         || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  4934134 -----aggtactattttatcgttgtcatctttaacatgcaaacatagttgatgat 4934183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 144 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 38012169 - 38012084
Alignment:
Q  144 attcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    ||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||    
T  38012169 attcatctagtaatatttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgttggcatttttaacgtgcaaacatagttgatgat 38012084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 155 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 56050234 - 56050171
Alignment:
Q  155 aatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaaca 218  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||   | |||||||||||||||    
T  56050234 aatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaagtctttaacatgcaaaca 56050171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 229
Target Start/End: Original strand, 35025531 - 35025577
Alignment:
Q  183 tactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  35025531 tactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgat 35025577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 50)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 34 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 29173922 - 29173728
Alignment:
Q  34 gggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatg 133  Q
    |||||||| |||| | |||||||||||||||       ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  29173922 gggagcttctacgatgcagtcagaaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattcatg 29173823  T
Q  134 atcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29173822 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacagatactattttatcgttggcat-tttaacatgcaaacagagttgatgat 29173728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Original strand, 37703297 - 37703454
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 171  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  37703297 gaaaaagttaattttgatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatctt 37703396  T
Q  172 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  37703397 ggacttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgat 37703454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Original strand, 9355625 - 9355782
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 171  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||    
T  9355625 gaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagcaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 9355724  T
Q  172 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  9355725 ggacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgat 9355782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 18797688 - 18797532
Alignment:
Q  73 aaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttg 172  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  18797688 aaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 18797589  T
Q  173 gacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    ||||||||| ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||    
T  18797588 gacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttgatgat 18797532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 74 - 229
Target Start/End: Original strand, 17842385 - 17842540
Alignment:
Q  74 aaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttgg 173  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17842385 aaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaacatcttgg 17842484  T
Q  174 acttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |||||||  ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  17842485 acttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgat 17842540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Original strand, 31520540 - 31520697
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 171  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||    
T  31520540 gaaaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttaattacggattaatgatcaatagtaattcatcgagtaatgcttgcaacatctt 31520639  T
Q  172 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  31520640 ggacttacagatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaatagagttgatgat 31520697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 37347383 - 37347226
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 171  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||    
T  37347383 gaaaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttaattacggattaatgatcaatagtaattcatcgagtaatgcttgcaatatctt 37347284  T
Q  172 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37347283 ggacttacagatactattttatcattggcatctttaacatgcaaacagagttgatgat 37347226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Original strand, 32820853 - 32821009
Alignment:
Q  73 aaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttg 172  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||     
T  32820853 aaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgatgaatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctta 32820952  T
Q  173 gacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  32820953 gacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgat 32821009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 72 - 227
Target Start/End: Original strand, 10359013 - 10359168
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 171  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  10359013 gaaaaagttaattttgatcataatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaaatcatttagtaatgcttgcaaaatctt 10359112  T
Q  172 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatg 227  Q
    |||||||||  ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10359113 ggacttacaagtactaatttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatg 10359168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 74 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 37110234 - 37110079
Alignment:
Q  74 aaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttgg 173  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  37110234 aaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgg 37110135  T
Q  174 acttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |||||||  ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  37110134 acttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgat 37110079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 30 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 6546923 - 6546724
Alignment:
Q  30 aaatgggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgatt 129  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||  |||||||       ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6546923 aaatgggagcttctacggtgcagtcatgaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgattactgatt 6546824  T
Q  130 aatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  6546823 aatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcctcatcttagacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatacaaacagagttgctgat 6546724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 30 - 229
Target Start/End: Original strand, 15612516 - 15612715
Alignment:
Q  30 aaatgggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgatt 129  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||  |||||||        |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15612516 aaatgggagcttctacggtgcagtcatgaaactgactttttttaaaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgattactgatt 15612615  T
Q  130 aatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  15612616 aatgatcaacaataattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaggtactattttatcattggcatctttaacatgcaaacagagttgctgat 15612715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 31 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 24212145 - 24211946
Alignment:
Q  31 aatgggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgatta 130  Q
    |||| |||||| |||||| ||||||| |||||||       ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24212145 aatgagagcttctacggtgcagtcaggaaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgatta 24212046  T
Q  131 atgatcaatagta-attcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||||    
T  24212045 atgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttataggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaataaagttgatgat 24211946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 78 - 229
Target Start/End: Original strand, 44411345 - 44411496
Alignment:
Q  78 gttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggactt 177  Q
    ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  44411345 gttaattatgatcttaatgtttcattcatttttaaattgttgattactgattaatggtcaatattaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggactt 44411444  T
Q  178 acagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  44411445 acagataatattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgatgat 44411496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 91 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 37704525 - 37704387
Alignment:
Q  91 ttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattt 190  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37704525 ttaatgtttgattcatttgtaaattgttgattactaattaatgatcaatagtaattcatctggtaatgcttgcaacatcttggacttacagatactattt 37704426  T
Q  191 tatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  37704425 tatcgttggcatctttaacatgcaaatagagttgatgat 37704387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Original strand, 31578863 - 31579020
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 171  Q
    ||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  31578863 gaaaaagttaattttgattttattgtttgattcatttttaaattattgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 31578962  T
Q  172 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |||||||||  || |||||||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||||    
T  31578963 ggacttacatgtattattttatcgttggaatctttaacatgcaaataaagttgatgat 31579020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 35 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 32432851 - 32432657
Alignment:
Q  35 ggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatga 134  Q
    ||||||| |||||| ||||||| |||||||        ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32432851 ggagcttctacggtgcagtcaggaaactgacttttttaaaaaagttacttttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattcatga 32432752  T
Q  135 tcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    | |||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||    
T  32432751 ttaataataattcatctagtaatgcttgcaacaccttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaatatgcaaacagtgttgatgat 32432657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 37 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 23111589 - 23111397
Alignment:
Q  37 agcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatc 136  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||        |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  23111589 agcttctacggtacagtcagaaaactgacttttttaaaaaagttaactttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgatttatgatc 23111490  T
Q  137 aatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| ||| ||||| || |||||  ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  23111489 aatagtaattcttctagtaatgctttcaacatctttgatttacatgtactattttatcgttgttatctttaacatgcaaacagagttgatgat 23111397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 33 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 35353509 - 35353313
Alignment:
Q  33 tgggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaat 132  Q
    ||||||||| || ||| ||||||| |||||||       ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  35353509 tgggagcttctaaggtgcagtcaggaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttcgattcatttttaaattgttgattgctgattaat 35353410  T
Q  133 gatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | ||||||||||    
T  35353409 gatcaatagtgattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaaatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaatatagttgatgat 35353313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 72 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 22687593 - 22687463
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 171  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  22687593 gaaaaagttaattttaatcttaatgtatgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctattaatgcttgcaacatctt 22687494  T
Q  172 ggacttacagatactattttatcgttggcat 202  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  22687493 ggacttacatgtactattttatcgttggcat 22687463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 75 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 30055886 - 30055732
Alignment:
Q  75 aaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttgga 174  Q
    |||||||||||| || |||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  30055886 aaagttaattttgattttaacgattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgga 30055787  T
Q  175 cttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||  |||||||||    
T  30055786 cttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcgaacaacgttgatgat 30055732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 8861647 - 8861490
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 171  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| |||||    
T  8861647 gaaaaagttaattttaatcttagtgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatttcatctagtaatgcatgcaacatctt 8861548  T
Q  172 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
     ||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  8861547 agacttacatgtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaagagagttgctgat 8861490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 26980668 - 26980511
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 171  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||| |||||    
T  26980668 gaaaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgattaccgattaatgatcaacaataattcatctagtaatacttgcaacatctt 26980569  T
Q  172 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  26980568 agacttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaatagagttgctgat 26980511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Original strand, 41764877 - 41765034
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 171  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  41764877 gaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaataataattcatccagtaatgcttgcaaaatctt 41764976  T
Q  172 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  41764977 ggacttacatgtactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgat 41765034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Original strand, 48928097 - 48928253
Alignment:
Q  73 aaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttg 172  Q
    ||||| |||||||| |||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  48928097 aaaaaattaattttgatctaaatgttcgatttatttttaaattgttgattgttgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttg 48928196  T
Q  173 gacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  48928197 gacttacatgtactatttcatcgttggcatttttaacatgcaaacatagttgatgat 48928253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 103 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 12166074 - 12165948
Alignment:
Q  103 tcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcat 202  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12166074 tcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacagatactattttatcgttgtcat 12165975  T
Q  203 atttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||    
T  12165974 ctttaacatgcaaacagagttgctgat 12165948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 72 - 210
Target Start/End: Original strand, 26587891 - 26588029
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 171  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  26587891 gaaaaagttaattttaatcttaatgtttgatttatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcctgcaacatctt 26587990  T
Q  172 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaaca 210  Q
    |||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||    
T  26587991 ggacttacatgtattattttatcgttggcatctttaaca 26588029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 43925457 - 43925306
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 171  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  43925457 gaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattcatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 43925358  T
Q  172 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    ||||       || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43925357 ggac------gtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgat 43925306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Original strand, 46480928 - 46481085
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 171  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  46480928 gaaaaagttaattatgatcttaatgttttatttatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatctt 46481027  T
Q  172 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
     ||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  46481028 agacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacaaagttaatgat 46481085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 79 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 27284100 - 27283952
Alignment:
Q  79 ttaattttcatcttaatgtttgattc-atttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggactt 177  Q
    |||||||| || |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  27284100 ttaattttgattttaatgtttgattttatttttaaattattgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggactt 27284001  T
Q  178 acagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgat 226  Q
    |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||    
T  27284000 acaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgat 27283952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Original strand, 5657279 - 5657437
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatctt-aatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatct 170  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| || ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  5657279 gaaaaagttaattttaatctttaatgatttattcatttttaaatttttgattactcattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatct 5657378  T
Q  171 tggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    | ||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  5657379 tagacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgctgat 5657437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 50 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 10481989 - 10481810
Alignment:
Q  50 cagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcat 149  Q
    |||||||||||||||       ||||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  10481989 cagtcagaaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatatttaatttatttttaaattgttaattactgattaacgatcaatagtaattcat 10481890  T
Q  150 ctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    ||| |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  10481889 ctagtaatacttgcaacatcttggacttacggatactattttattgttggaatctttgacatgcaaagagagttgatgat 10481810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Original strand, 15672558 - 15672718
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 171  Q
    |||||| |||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||    
T  15672558 gaaaaaattaattttaaccttaatgtttaattcatttttaaattgttgattattgatgcatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatttt 15672657  T
Q  172 ggacttacagatac---tattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |||||||||| |||   ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||    
T  15672658 ggacttacaggtactattattttatcgttggcatctttaacattcaaatagagttgatgat 15672718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 74 - 229
Target Start/End: Original strand, 12390450 - 12390605
Alignment:
Q  74 aaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttgg 173  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  12390450 aaaagttaattttgatcttaatgtttatttcatttttaaattgtcaattactgattaatgataaatagtaattcatctagtaatggttgcaacatcttgg 12390549  T
Q  174 acttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  12390550 acttacatgtactattttatcattggcatctttaacatgcaagctgagttgatgat 12390605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 72 - 221
Target Start/End: Original strand, 34361975 - 34362126
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttca-tctt-aatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatc 169  Q
    ||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||    
T  34361975 gaaaaagttaattttaaatctttaatgtttgattcatttttaaattgttaatgactgattaatgatcaaaagtaattcatctagtaatgtttgcaatatc 34362074  T
Q  170 ttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagag 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  34362075 ttggacttacagatactattttatcgttgatatttttaacatgcaaacagag 34362126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 34 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 4583319 - 4583124
Alignment:
Q  34 gggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatg 133  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||| |||       ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||    
T  4583319 gggagcttctacggtgcagccagaaaattgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgatgactgattcatg 4583220  T
Q  134 atcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    || |||||||||||||| | |||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||| ||||||| ||| |||||||| |||||| ||||||||||    
T  4583219 attaatagtaattcatccagtaatgcttgcaacatcttgaacttacaaatattatttgatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgatgat 4583124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 91 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 11071546 - 11071411
Alignment:
Q  91 ttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattt 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| || |||||    
T  11071546 ttaatgtttgattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaggtattattt 11071447  T
Q  191 tatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    ||||||||   | |||||||||| |||| ||||||||||    
T  11071446 tatcgttg---tctttaacatgcgaacaaagttgatgat 11071411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Original strand, 25691344 - 25691500
Alignment:
Q  73 aaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttg 172  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| || |||    
T  25691344 aaaaatttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacattttg 25691443  T
Q  173 gacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
     |||||||  |  ||||||||||||  ||| |||||| |||||||||||||| ||||    
T  25691444 aacttacatgtgttattttatcgttaacatctttaacgtgcaaacagagttgctgat 25691500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 72 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 7335155 - 7335010
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 171  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  7335155 gaaaaaattaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattattgatttctgattaatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 7335056  T
Q  172 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaac 217  Q
    ||| |||||| ||||||||||| || || || |||||||| |||||    
T  7335055 ggatttacaggtactattttattgtcggaatctttaacattcaaac 7335010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 21991989 - 21991841
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 171  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    |||||||||||||||||||     ||||||||| |||||    
T  21991989 gaaaaggttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattaatgat----gatcaatagtaattcatct-----tgcttgcaacatctt 21991899  T
Q  172 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  21991898 ggacttacaggtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacaaagttgctgat 21991841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Original strand, 32593006 - 32593162
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 171  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||  ||| || |||||    
T  32593006 gaaaaagttaattttgatcttaatgttcaattcatttt-aaattgttgattgctgattaatgatccatagtaatttatctagtaatatttgtaacatctt 32593104  T
Q  172 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |||||||||  |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  32593105 ggacttacatgtactattttaacgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgat 32593162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 33 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 38258980 - 38258867
Alignment:
Q  33 tgggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaat 132  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38258980 tgggagcttctacggtgcagtcagaaaactgatttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat 38258881  T
Q  133 gatcaatagtaatt 146  Q
    ||||||||||||||    
T  38258880 gatcaatagtaatt 38258867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 44599028 - 44598871
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattatt---gattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaat 168  Q
    |||||| |||||||| ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| || ||    
T  44599028 gaaaaaattaattttaatcttaacgattgattcatttt-aaattgttgattattattgattaatgatcaatagt--ttcatctagtaatgcttgtaacat 44598932  T
Q  169 cttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    ||| ||||||||  || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  44598931 cttagacttacatgtattattttatcgttgtcatctttaacatgcaaacagagttgttgat 44598871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 128 - 229
Target Start/End: Original strand, 33688117 - 33688218
Alignment:
Q  128 ttaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatg 227  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||| ||    
T  33688117 ttaatgatcaatagcaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcattgacatctttaacttgcaaacagagttgctg 33688216  T
Q  228 at 229  Q
    ||    
T  33688217 at 33688218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 144 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 38053751 - 38053666
Alignment:
Q  144 attcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| |||| ||||||||||||    
T  38053751 attcatcaaataatgtttgcaacatcttggacttacaggtactattttattgttggaatctttaacatccaaatagagttgatgat 38053666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 144 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 43686330 - 43686245
Alignment:
Q  144 attcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||| ||||||||||    
T  43686330 attcatccagtaatgcttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgatgat 43686245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 167 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 38258812 - 38258750
Alignment:
Q  167 atcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  38258812 atcttggacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgat 38258750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 229
Target Start/End: Original strand, 48928474 - 48928520
Alignment:
Q  183 tactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  48928474 tactattttatcgttggcatttttaacatgcaaacatagttgatgat 48928520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 73 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 12166250 - 12166215
Alignment:
Q  73 aaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcattt 108  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12166250 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcattt 12166215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 191
Target Start/End: Original strand, 27421207 - 27421283
Alignment:
Q  115 tgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactatttt 191  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||  |||   |||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  27421207 tgttgatcattaattaatgatcaatattatttcatcttgtaacatttgcaacatcttggacttacatgtactatttt 27421283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 131; Significance: 4e-68; HSPs: 54)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 34 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 32216476 - 32216281
Alignment:
Q  34 gggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatg 133  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||        |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32216476 gggagcttctacggtgcagtcagaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatg 32216377  T
Q  134 atcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||    
T  32216376 atcaatagtaattcatctaataatgcttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagtttatgat 32216281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 33 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 2960170 - 2959974
Alignment:
Q  33 tgggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaat 132  Q
    ||||| ||| |||||| ||||||| |||||||       ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2960170 tgggatcttctacggtgcagtcaggaaactgatttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat 2960071  T
Q  133 gatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||    
T  2960070 gatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacagatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatatttgatgat 2959974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 74 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 16416027 - 16415872
Alignment:
Q  74 aaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttgg 173  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16416027 aaaaattaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaacatcttgg 16415928  T
Q  174 acttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16415927 acttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgat 16415872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 34 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 48353963 - 48353768
Alignment:
Q  34 gggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatg 133  Q
    |||||||| |||||| ||||||  |||||||       ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  48353963 gggagcttctacggtgcagtcatgaaactgatttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatg 48353864  T
Q  134 atcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  48353863 atcaataataattcatctagtaatgcttgcaatatcttggacttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgctgat 48353768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 37451668 - 37451511
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 171  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  37451668 gaaaaagttaatttttattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatctt 37451569  T
Q  172 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  37451568 ggacttacagatactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgat 37451511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 32 - 229
Target Start/End: Original strand, 7078816 - 7079013
Alignment:
Q  32 atgggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaa 131  Q
    ||||||| || |||||||||||||  |||||||       ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7078816 atgggagtttttacggtacagtcatgaaactgatttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgattattgattaa 7078915  T
Q  132 tgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  7078916 tgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaatatcttagacttacatatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgttgat 7079013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 34 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 10923148 - 10922953
Alignment:
Q  34 gggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatg 133  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||       ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10923148 gggagcttctatggtgcagtcagaaaactgactcttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatg 10923049  T
Q  134 atcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||||||    
T  10923048 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacattttggacttacagatactattttattgtcagaatctttaacatgcaaacagagttgatgat 10922953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 34 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 14758453 - 14758258
Alignment:
Q  34 gggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatg 133  Q
    |||||||| |||||| ||||||  |||||||       ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14758453 gggagcttctacggtgcagtcacgaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttcgattcatttttaaattgttgattgttgattaatg 14758354  T
Q  134 atcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  14758353 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgat 14758258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 47279572 - 47279415
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 171  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  47279572 gaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactaattaatgatcaatagtaattcatctaataatgtttgcaacatctt 47279473  T
Q  172 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  47279472 ggacttacagatactattttattgttggcatctttaacatgcaaacatagttgttgat 47279415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 3535305 - 3535149
Alignment:
Q  73 aaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttg 172  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  3535305 aaaaagttagttttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattgttgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 3535206  T
Q  173 gacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  3535205 gacttaaaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgat 3535149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 29 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 8222554 - 8222354
Alignment:
Q  29 aaaatgggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgatt-catttttaaattgttgattattga 127  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  8222554 aaaaggggagcttctacggtacagtcagaaaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgatttcatttttaaattgttgattactga 8222455  T
Q  128 ttaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatg 227  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  8222454 ttaatgatcaata-taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatg 8222356  T
Q  228 at 229  Q
    ||    
T  8222355 at 8222354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 32 - 229
Target Start/End: Original strand, 34012135 - 34012332
Alignment:
Q  32 atgggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaa 131  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| |||||||        |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34012135 atgggagcttctacggtgcagtcaggaaactgacttttttaaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaa 34012234  T
Q  132 tgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  34012235 tgatcaatagtaattcatatagtaatgcttgcaacatcttgaacttacatatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgat 34012332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 74 - 229
Target Start/End: Original strand, 27266995 - 27267150
Alignment:
Q  74 aaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttgg 173  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  27266995 aaaagttaattttgatcttaatgtttaattcatttttaaattattgattattgattaattatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttag 27267094  T
Q  174 acttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27267095 acttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgat 27267150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 74 - 229
Target Start/End: Original strand, 27227280 - 27227435
Alignment:
Q  74 aaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttgg 173  Q
    ||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  27227280 aaaagttaattttgatattaatgtttaattcatttttaaatggttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgg 27227379  T
Q  174 acttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  27227380 acttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgat 27227435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 73 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 30254805 - 30254651
Alignment:
Q  73 aaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttg 172  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  30254805 aaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaataatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 30254706  T
Q  173 gacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatg 227  Q
    ||||||||  || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  30254705 gacttacatgtattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatg 30254651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Original strand, 11742161 - 11742318
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 171  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  11742161 gaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 11742260  T
Q  172 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||| |||| ||||||| ||||    
T  11742261 ggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatacaaagagagttgctgat 11742318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 15168479 - 15168322
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 171  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15168479 gaaaaagttaattttgatcttaatgttcgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaacatctt 15168380  T
Q  172 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    | |||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  15168379 gtacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgat 15168322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 31 - 229
Target Start/End: Original strand, 27532734 - 27532931
Alignment:
Q  31 aatgggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgatta 130  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||  |||||||       ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  27532734 aatgggagcttctacggtgcagtcatgaaactgatttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaa-ttgttgattactgatta 27532832  T
Q  131 atgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||    
T  27532833 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacttgcaaacagaattgctgat 27532931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Original strand, 28564576 - 28564733
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 171  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  28564576 gaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatctt 28564675  T
Q  172 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |||||||||  || |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  28564676 ggacttacatgtattattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgat 28564733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 28 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 46931837 - 46931635
Alignment:
Q  28 taaaatgggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattga 127  Q
    |||||||||||||| |||||| |||| || |||||||       ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  46931837 taaaatgggagcttctacggtgcagtaaggaaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactga 46931738  T
Q  128 ttaatgatcaatagta-attcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgat 226  Q
    ||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||    
T  46931737 ttaatgatcaataatatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaatagagttgat 46931638  T
Q  227 gat 229  Q
    |||    
T  46931637 gat 46931635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 3309537 - 3309379
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttca-tcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatct 170  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  3309537 gaaaaagttaattttaaatctaaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaatatct 3309438  T
Q  171 tggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  3309437 tggacttacgggtactattttatcgttggcatctttaacatacaaacagagttgctgat 3309379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 74 - 228
Target Start/End: Original strand, 27563700 - 27563854
Alignment:
Q  74 aaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttgg 173  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||||    
T  27563700 aaaagttaattatgatcttaatgtttgattcttttttaaattgttgattactgattaatgatcaatattaattcatctagtaatacttgcaacatcttgg 27563799  T
Q  174 acttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatga 228  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27563800 acttacatatactattttatcgtttgcatctttaacatgcaaacagagttgatga 27563854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 34 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 32267455 - 32267260
Alignment:
Q  34 gggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatg 133  Q
    |||||||| |||||| ||||||| ||| |||       |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32267455 gggagcttctacggtgcagtcaggaaattgacttttttgaaaaaattaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatg 32267356  T
Q  134 atcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32267355 ttcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacctacaggtactattttatagttggaatatttaacatgcaaacaaagttgatgat 32267260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Original strand, 238306 - 238463
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 171  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  238306 gaaaaagttgattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgtggattactgattcatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 238405  T
Q  172 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||    
T  238406 ggacttacagatattattttatcgttggcatctttaacatacaaacatagttgatgat 238463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 23999730 - 23999573
Alignment:
Q  73 aaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagta-attcatctaataatgcttgcaaaatctt 171  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||    
T  23999730 aaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatctt 23999631  T
Q  172 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||    
T  23999630 ggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaatagagttgatgat 23999573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 28770036 - 28769879
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 171  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||    
T  28770036 gaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattaattaatgatcaatagtaattcatctagcaatgtttgcaacatctt 28769937  T
Q  172 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| |||||||    
T  28769936 ggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagaggtgatgat 28769879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 72 - 226
Target Start/End: Original strand, 27763103 - 27763258
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagta-attcatctaataatgcttgcaaaatct 170  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  27763103 gaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatatttatctagtaatgcttgcaacatct 27763202  T
Q  171 tggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgat 226  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  27763203 tgaacttacagatactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttgat 27763258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 29 - 229
Target Start/End: Original strand, 47682244 - 47682444
Alignment:
Q  29 aaaatgggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgat 128  Q
    ||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||       ||| ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||| ||||    
T  47682244 aaaatgggagcttctatggtgcagtcagtaaactgacttttttgaacaagttaattttaatcttaatgtttaattcttttttaaattgttaattactgat 47682343  T
Q  129 taatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatga 228  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  47682344 taatgatcaatagtaattcatttagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatga 47682443  T
Q  229 t 229  Q
    |    
T  47682444 t 47682444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 74 - 229
Target Start/End: Original strand, 19899563 - 19899719
Alignment:
Q  74 aaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagta-attcatctaataatgcttgcaaaatcttg 172  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  19899563 aaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 19899662  T
Q  173 gacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  19899663 gacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttggtgat 19899719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 38823596 - 38823440
Alignment:
Q  73 aaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttg 172  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||     
T  38823596 aaaaagttaattttaatcttaatatttgtttcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatttta 38823497  T
Q  173 gacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    
T  38823496 gacttacaggtattattttatcgttggcatctctaacatgcaaacagagttgctgat 38823440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 51129240 - 51129085
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 171  Q
    ||||||||||||||  || |||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  51129240 gaaaaagttaattt--attttaatacttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 51129143  T
Q  172 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  51129142 ggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgat 51129085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Original strand, 9902847 - 9903004
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 171  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  |||||    
T  9902847 gaaaaagttaattttgattttaatatttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtagtgcttgcagcatctt 9902946  T
Q  172 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |||||||| | |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | ||||||||    
T  9902947 ggacttactggtactattttatcgttgtcatctttaacatgcaaacaaatttgatgat 9903004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 25161015 - 25160858
Alignment:
Q  73 aaaaagttaattttcatcttaatgtttgatt-catttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 171  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||    
T  25161015 aaaaggttaattttgattttaatgtttgatttcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatatagtaatgcttgcaacatctt 25160916  T
Q  172 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  25160915 ggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgat 25160858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 74 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 4330662 - 4330507
Alignment:
Q  74 aaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttgg 173  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || ||||    
T  4330662 aaaaattaattttgatcttaatgtttgattcatttttatattgttgattactgattaatgatcaattgtaattcatctagtaatgcttgcaacatattgg 4330563  T
Q  174 acttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |||||||  |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  4330562 acttacaagtactattttatctttgacatctttaacatgcaaaaagagttgatgat 4330507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 34 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 15383355 - 15383159
Alignment:
Q  34 gggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgatt-catttttaaattgttgattattgattaat 132  Q
    |||||||| |||||| ||||||| ||| |||       ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  15383355 gggagcttctacggttcagtcaggaaattgatttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgatttcatttttaaattgttgattgctgattaat 15383256  T
Q  133 gatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  15383255 aatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcatacatagttgatgat 15383159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 73 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 39393766 - 39393615
Alignment:
Q  73 aaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttg 172  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  39393766 aaaaagttaattttaattttaatgttttattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttg 39393667  T
Q  173 gacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttg 224  Q
    || |||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  39393666 gatttaccggtactattttatcattggcatctttaacatggaaacagagttg 39393615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 72 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 1547654 - 1547516
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 171  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  1547654 gaaaaaattaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatggtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 1547555  T
Q  172 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaaca 210  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||    
T  1547554 ggacttacatgtactattttatcgttggtatctttaaca 1547516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 30 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 22171136 - 22170937
Alignment:
Q  30 aaatgggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgatt 129  Q
    |||||||||||| |||||| || | ||||||||||       ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||    
T  22171136 aaatgggagcttctacggtgcaattagaaaactgatttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgatttatttttaaattgttgattactaatt 22171037  T
Q  130 aatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||   | ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  22171036 aatgatcaatagtaatttatctaataatgtttgcaacatcttagacttacaagaattattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagatttgatgat 22170937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 88 - 229
Target Start/End: Original strand, 1359744 - 1359885
Alignment:
Q  88 atcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatacta 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||| || ||| |||||||| |||||    
T  1359744 atcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcgatagtaattcatccagtaatgcttgcaacattttgaacttacaggtacta 1359843  T
Q  188 ttttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  1359844 ttttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgat 1359885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 74 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 21289981 - 21289829
Alignment:
Q  74 aaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttgg 173  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  21289981 aaaaattaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaataataattcatctagtaatgtttgcaacatcttgg 21289882  T
Q  174 acttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgat 226  Q
    ||||| |  |  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  21289881 acttataagtgttattttatcgttggcatctttaatatgcaaacagagttgat 21289829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 74 - 229
Target Start/End: Original strand, 10181802 - 10181958
Alignment:
Q  74 aaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttgg 173  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||    
T  10181802 aaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattgttgattaatgttcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacattttgg 10181901  T
Q  174 acttac-agatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |||||| || ||||||| ||| |||| ||| |||||||| ||| |||||||||||||    
T  10181902 acttacaaggtactattgtattgttgtcatctttaacatacaaccagagttgatgat 10181958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 32 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 15752452 - 15752255
Alignment:
Q  32 atgggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaa 131  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||| |||        ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15752452 atgggagcttctacggtgcagtcagaaaattgattttttaaaaaaaattaattttgatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactgattaa 15752353  T
Q  132 tgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    ||||||||||||||||||||| |||   ||||||  |||||||||||||  || |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||    
T  15752352 tgatcaatagtaattcatctagtaaaaattgcaacttcttggacttacatgtattattttgtcgttggaatttttaacatgcaaacagagttaatgat 15752255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 74 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 41926537 - 41926383
Alignment:
Q  74 aaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttgg 173  Q
    |||| |||||| | || ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||    
T  41926537 aaaaattaattatgattttaatgtttgattcaattttaaatcattgattattaattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttg-aatatcttgg 41926439  T
Q  174 acttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41926438 acttacaagtactattttattgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgat 41926383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 79 - 229
Target Start/End: Original strand, 30326751 - 30326902
Alignment:
Q  79 ttaattttcatcttaatgtttgatt-catttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggactt 177  Q
    |||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  30326751 ttaattttgattttaatatttgatttcatttttaaattgttgattactgattgatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggactt 30326850  T
Q  178 acagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    | |  || |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  30326851 aaatgtattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgat 30326902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 107 - 229
Target Start/End: Original strand, 37618729 - 37618851
Alignment:
Q  107 ttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatattt 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  || |||||||||||||| || |||    
T  37618729 ttttaaattgttgattattgattaatggtcaatactaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtattattttatcgttggaatcttt 37618828  T
Q  207 aacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  37618829 aacatgcaaacagagttgatgat 37618851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 72 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 31963000 - 31962853
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaa-ttgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatct 170  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  31963000 gaaaaagttaattttaatcttaatgtttgatttatttttaaaattgttgattaccgattaatgatcaatagtagttcatctaataatgcttgcaacatct 31962901  T
Q  171 tggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaaca 218  Q
    |  ||||||| ||| |||||||||||||   | |||||||||||||||    
T  31962900 taaacttacatatattattttatcgttgatttctttaacatgcaaaca 31962853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 72 - 209
Target Start/End: Original strand, 31621341 - 31621479
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttt-taaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatct 170  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || |    
T  31621341 gaaaaagttaattttgatcttaatgttcgattcattttttaaattgttgattgatgattaatgatcaatagtagttcatctactaatgcttgcaacatat 31621440  T
Q  171 tggacttacagatactattttatcgttggcatatttaac 209  Q
    || |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  31621441 tgaacttacatgtactattttatcgttggcatctttaac 31621479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 42721418 - 42721265
Alignment:
Q  73 aaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttg 172  Q
    |||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||| ||||||    
T  42721418 aaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattattgattactcattaatgatcaatagtaattaatctagtaataattgcaacatcttg 42721319  T
Q  173 gacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    ||||||||  || |||||||||||||   | ||||||||||||||| ||||||||||    
T  42721318 gacttacatgtaatattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgat 42721265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 90 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 40885178 - 40885039
Alignment:
Q  90 cttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactatt 189  Q
    |||||| || ||||||||||| |||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||    
T  40885178 cttaatattcgattcatttttgaattattgattgctaattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactatt 40885079  T
Q  190 ttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    ||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  40885078 ttatcatcggcatctttaacatgcaaacatagttgatgat 40885039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 93 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 18423006 - 18422877
Alignment:
Q  93 aatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactatttta 192  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||  | || |||||    
T  18423006 aatgtttgattcatttttaaattgttgatta-------atgatcaatagtaattcatctagcaatgcttgcaacatcttggacttacatgtgctttttta 18422914  T
Q  193 tcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    ||||||| || |||||||||||||| ||| |||||||    
T  18422913 tcgttggaatctttaacatgcaaacggaggtgatgat 18422877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 34 - 229
Target Start/End: Original strand, 33725366 - 33725550
Alignment:
Q  34 gggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcattttta-aattgttgattattgattaat 132  Q
    ||||||||||||| | ||||||| |||||||       ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||  ||||||||    
T  33725366 gggagcttatacgttgcagtcaggaaactgatttttttgaaaaagtttattttgatcttaatgttcgattcatttttttaattgttgattgctgattaat 33725465  T
Q  133 gatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |||||||||            ||||| |||||| || |||| ||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  33725466 gatcaatag------------taatgtttgcaacattttggtcttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgat 33725550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 34 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 48621010 - 48620916
Alignment:
Q  34 gggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgat 128  Q
    |||||||| |||||| ||||||  |||||||       ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  48621010 gggagcttctacggtgcagtcatgaaactgacttttctgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcattttaaaattgttgattaatgat 48620916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 142 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 38759846 - 38759759
Alignment:
Q  142 taattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||| |||| ||  ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  38759846 taattaatctagtaatgcttgcaacatcttggagttacatatattattttatagttgacacctttaacatgcaaacatagttggtgat 38759759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 177 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 48620906 - 48620854
Alignment:
Q  177 tacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  48620906 tacaggtactatttattcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgat 48620854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 43)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 72 - 231
Target Start/End: Original strand, 1953792 - 1953951
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 171  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1953792 gaaaaaattaattttgatcttaatgtttgattcattttaaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 1953891  T
Q  172 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgatgt 231  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1953892 ggatttacaggtactattttatcgttgacaactttaacatgcaaacagagttgatgatgt 1953951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 34 - 229
Target Start/End: Original strand, 16446641 - 16446836
Alignment:
Q  34 gggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatg 133  Q
    |||||||| |||||| ||||||| |||||||       ||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16446641 gggagcttctacggtgcagtcaggaaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgttagattcatttttaaattgttgattactgattaatg 16446740  T
Q  134 atcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  16446741 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcattggcatctttaacatgcaaacagatttgatgat 16446836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 72 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 12587968 - 12587812
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 171  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12587968 gaaaaaattaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttaattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaaaatctt 12587869  T
Q  172 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatga 228  Q
     ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  12587868 tgacttacaggtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaatagagttgatga 12587812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 34 - 226
Target Start/End: Original strand, 43643361 - 43643553
Alignment:
Q  34 gggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatg 133  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||       ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  43643361 gggagcttctatggtgcagtcagaaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgtcgattactgattaatg 43643460  T
Q  134 atcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgat 226  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| || || || |||||||||||||||||||||||    
T  43643461 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatttttaacatgcaaacagagttgat 43643553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 76 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 466214 - 466061
Alignment:
Q  76 aagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggac 175  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||    
T  466214 aagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagac 466115  T
Q  176 ttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |||||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  466114 ttacaggtattattttatcattggcatctttaacatgcaaacagagttgctgat 466061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Original strand, 23854235 - 23854392
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 171  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  23854235 gaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 23854334  T
Q  172 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |||||||||| ||||||||||| || || || |||||||||||| |||||||||||||    
T  23854335 ggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaagcagagttgatgat 23854392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 34 - 226
Target Start/End: Original strand, 1149398 - 1149590
Alignment:
Q  34 gggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatg 133  Q
    |||||||| |||||| ||||||| ||| |||       |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  1149398 gggagcttctacggtgcagtcaggaaattgacttttttgaaaaaattaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattaccgattaatg 1149497  T
Q  134 atcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgat 226  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||    
T  1149498 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgat 1149590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 74 - 229
Target Start/End: Original strand, 4132492 - 4132647
Alignment:
Q  74 aaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttgg 173  Q
    ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  4132492 aaaagttaattttgatcttaatgtgtaattcatttttaaattgttgattacaaattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgg 4132591  T
Q  174 acttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  4132592 acttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgat 4132647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 29 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 35859363 - 35859163
Alignment:
Q  29 aaaatgggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgat 128  Q
    |||| ||||| || |||||| ||||||| |||||||       ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35859363 aaaaagggagtttctacggtgcagtcaggaaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgat 35859264  T
Q  129 taatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatga 228  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| | |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  35859263 taatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaacatctcgaacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatga 35859164  T
Q  229 t 229  Q
    |    
T  35859163 t 35859163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Original strand, 7890761 - 7890918
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 171  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||    
T  7890761 gaaaaagttaattttgatcttaatatttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatttt 7890860  T
Q  172 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
     ||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||    
T  7890861 agacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaccagagttgatgat 7890918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Original strand, 27082642 - 27082799
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 171  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  27082642 gaaaaagttaattttgatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattattgattaatgataagtagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 27082741  T
Q  172 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  27082742 ggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagtttatgat 27082799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Original strand, 37970323 - 37970480
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 171  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  37970323 gaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgatttctgattaatgatcaacagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 37970422  T
Q  172 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||||||    
T  37970423 ggacttacaggtactattttattgtaaggatctttaacatgcaaacagagttgatgat 37970480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 11727409 - 11727253
Alignment:
Q  73 aaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttg 172  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||     
T  11727409 aaaaagttaattttaatcttaataattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctta 11727310  T
Q  173 gacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||    
T  11727309 gacttacatatactattttatcgttggcatctttaacattcaaacaaagttgttgat 11727253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 34895347 - 34895191
Alignment:
Q  73 aaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttg 172  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||    
T  34895347 aaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatatagtaatgcttgcaacatcttg 34895248  T
Q  173 gacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
     |||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  34895247 aacttacatgtactattttttcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgat 34895191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Original strand, 39098924 - 39099080
Alignment:
Q  73 aaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttg 172  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||    
T  39098924 aaaaaattaattttaattttaatgtttgatgcatttttaaattattgattattaattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacattttg 39099023  T
Q  173 gacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39099024 gacttacatatactattttatcgttgacatatttaacatgcaaacagagttgctgat 39099080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 33 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 38644403 - 38644207
Alignment:
Q  33 tgggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaat 132  Q
    ||||||||| |||||| ||||||  |||||||       ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  38644403 tgggagcttttacggtgcagtcatgaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgatttatttttaaatttttgattactgattaat 38644304  T
Q  133 gatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||    
T  38644303 gatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcattgacatctttaacttgcaaacagagttgctgat 38644207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Original strand, 34951861 - 34952018
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 171  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||| |||||    
T  34951861 gaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatgtagtaagacttgcaacatctt 34951960  T
Q  172 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
     ||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  34951961 agacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgctgat 34952018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 1205312 - 1205156
Alignment:
Q  73 aaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttg 172  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||    
T  1205312 aaaaagttaattttgatcttgttgtttgattcatttttaaattgctgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatacttgcaacatcttg 1205213  T
Q  173 gacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    ||||||||| |||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||    
T  1205212 gacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacagagttgatgat 1205156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 72 - 218
Target Start/End: Original strand, 5299750 - 5299896
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 171  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  5299750 gaaaaagttaattttaatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 5299849  T
Q  172 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaaca 218  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||  || |||||||||||||||    
T  5299850 ggacttacatgtactattttatcgttgttatctttaacatgcaaaca 5299896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Original strand, 8803620 - 8803778
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagta-attcatctaataatgcttgcaaaatct 170  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||    
T  8803620 gaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttcattactgattaatgatcaatagtatattcatctggtaatgcttgcaacatct 8803719  T
Q  171 tggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||    
T  8803720 tggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttgatgat 8803778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 73 - 210
Target Start/End: Original strand, 24823199 - 24823336
Alignment:
Q  73 aaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttg 172  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  24823199 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgatttatttttaaattgttgattactgattaatgaacaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 24823298  T
Q  173 gacttacagatactattttatcgttggcatatttaaca 210  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  24823299 gacttacatgtactattttatcgttggcatctttaaca 24823336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Original strand, 35459515 - 35459672
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 171  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| || ||    
T  35459515 gaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatttt 35459614  T
Q  172 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |||||||||||||||||||||| || |  || |||||||| |||||||| ||||||||    
T  35459615 ggacttacagatactattttattgtcgaaatctttaacatacaaacagaattgatgat 35459672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 44869883 - 44869726
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 171  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  44869883 gaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttggttactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaatatctt 44869784  T
Q  172 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |||||||  | |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  44869783 ggacttatcggtactattttatcgttgacatctttaacatggaaacaaagttgctgat 44869726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 16223248 - 16223092
Alignment:
Q  73 aaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttg 172  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||     
T  16223248 aaaaaattaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctta 16223149  T
Q  173 gacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||| || ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  16223148 gacttacatgtactattttatcattggaatctttaaaatgcaaacaaagttgatgat 16223092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 34 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 33906634 - 33906441
Alignment:
Q  34 gggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatg 133  Q
    |||||||| ||| || |||||||||||||||       ||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||  |||||  |||||||||    
T  33906634 gggagcttctacagtgcagtcagaaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttactattcgattcatttttaaatt--tgattgctgattaatg 33906537  T
Q  134 atcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  33906536 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgat 33906441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 75 - 229
Target Start/End: Original strand, 6098320 - 6098479
Alignment:
Q  75 aaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttgga 174  Q
    |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  6098320 aaagttaatcatgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactaattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgga 6098419  T
Q  175 cttacagatac-----tattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    ||||||  |||     |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6098420 cttacaagtactattgtattgtatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgat 6098479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Original strand, 36694770 - 36694927
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 171  Q
    |||||||||| |||| || ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||||    
T  36694770 gaaaaagttacttttaattttaatgtttgatttatttttaaattattgattacttattcatgataaatagtaattcatctagtgatgcttgcaacatctt 36694869  T
Q  172 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    ||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36694870 ggatttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgat 36694927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 72 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 33198188 - 33198058
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 171  Q
    |||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || ||    
T  33198188 gaaaaagttaatcttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtgatgcttgcaacatttt 33198089  T
Q  172 ggacttacagatactattttatcgttggcat 202  Q
     ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  33198088 agacttacatgtactattttatcgttggcat 33198058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 104 - 229
Target Start/End: Original strand, 1149756 - 1149881
Alignment:
Q  104 catttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcata 203  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||     
T  1149756 catttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaagtactattttatcgttggaatc 1149855  T
Q  204 tttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||    
T  1149856 tttaacatgcaaacaaagttgatgat 1149881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 33 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 12876535 - 12876339
Alignment:
Q  33 tgggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaat 132  Q
    ||||||||||||||||| | |||| |||||||        ||||||||| |||| || ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| | ||| ||    
T  12876535 tgggagcttatacggtataatcaggaaactgacttttttaaaaaagttacttttaattttaatgtttgatttattttcaaactgttgattacttattcat 12876436  T
Q  133 gatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12876435 gataaatagtaattcatctagtaatgcctgtaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgat 12876339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 72 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 40862806 - 40862651
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcattttt-aaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatct 170  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  40862806 gaaaaagttacttttaatcttaatgtttgattcattttttaaattgtcgattactgatttatgacaaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatct 40862707  T
Q  171 tggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgat 226  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| |||||||    
T  40862706 tggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgat 40862651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Original strand, 10555010 - 10555165
Alignment:
Q  73 aaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagt--aattcatctaataatgcttgcaaaatct 170  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |   ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  10555010 aaaaaattaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgtttattact---taatgatcaatagtgtaattcatctagtaatgcttgcaatatct 10555106  T
Q  171 tggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || || || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  10555107 tggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgat 10555165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Original strand, 31933690 - 31933847
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 171  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||||| |||||    
T  31933690 gaaaaaattaattttgatcttaatatttgattcatttttaaatcgttgattactgattaatgatcaataataattcatctagtaatgtctgcaatatctt 31933789  T
Q  172 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
     ||||||||  ||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  31933790 agacttacaagtactattttattgttggaatccttaacatgcaaacagacttgatgat 31933847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 34 - 229
Target Start/End: Original strand, 30654349 - 30654544
Alignment:
Q  34 gggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatg 133  Q
    ||||| || |||||| ||||||| |||||||       ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  30654349 gggagtttctacggtgcagtcaggaaactgatttttttgaaaaagttaattttgattttaatatttgattcatttt-aaattgttaattactgattaatg 30654447  T
Q  134 atcaatagta-attcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    ||||||| || |||||| || |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||| |||||| |||||    
T  30654448 atcaataatatattcatttagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatttttaacatgcaaatagagtttatgat 30654544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 97 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 9864509 - 9864377
Alignment:
Q  97 tttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgt 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| | |||| ||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  9864509 tttgattcatttttaaattgttgattaccgattcatgattactagttattcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttacaggtactattttatcgt 9864410  T
Q  197 tggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||||||||    
T  9864409 tggcatctttaacatgcaaacaaaattgatgat 9864377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 72 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 18259465 - 18259321
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 171  Q
    ||||| ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  18259465 gaaaaggttaattttaattttaatgattgattcatttttaaattgttgattactcattactgatcaacaataattcatctagtaatgcttgcaacatctt 18259366  T
Q  172 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaa 216  Q
     ||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  18259365 agacttacatgtactattttatcgttgacatttttaacatgcaaa 18259321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 72 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 41362808 - 41362723
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataat 157  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41362808 gaaaaaattaattttgatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactggttaatgatcaatagtaattcatctagtaat 41362723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 73 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 43026059 - 43025974
Alignment:
Q  73 aaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatg 158  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  43026059 aaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgatcactgattcatgatcaatagtaatttatctaataatg 43025974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 144 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 13307936 - 13307852
Alignment:
Q  144 attcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||||| |||||| | |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  13307936 attcatcttgtaatgcttgcaacatcttgaacttacgggtactattttatcgttgacat-tttaacatgcaaacagagttgttgat 13307852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 137 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 34463792 - 34463704
Alignment:
Q  137 aatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatga 228  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| ||   ||||||| || || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  34463792 aatagtaattcatttagtaatgcttgcaacat---ggacttataggtattattttatcgttgacatctttaacatgcaaacaaagttgatga 34463704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 174 - 229
Target Start/End: Original strand, 41910895 - 41910949
Alignment:
Q  174 acttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  41910895 acttacaggtaatattttatcgttg-catctttaacatgcaaacagagttggtgat 41910949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 13307965 - 13307931
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcat 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13307965 gaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcat 13307931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 188 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 43025972 - 43025931
Alignment:
Q  188 ttttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  43025972 ttttatcgttgacatctttaacatgcaatcagagttgatgat 43025931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 52)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 29 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 22255612 - 22255412
Alignment:
Q  29 aaaatgggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgat 128  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||        |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22255612 aaaaagggagcttctacggtacagtcaggaaactgactttttttaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgat 22255513  T
Q  129 taatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatga 228  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  22255512 taatgatcaatagtaattcatctagtaaggcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggaatatttaacatgcaaacatagttgatga 22255413  T
Q  229 t 229  Q
    |    
T  22255412 t 22255412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Original strand, 35826275 - 35826431
Alignment:
Q  73 aaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttg 172  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  35826275 aaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 35826374  T
Q  173 gacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  35826375 gacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgat 35826431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 74 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 699535 - 699380
Alignment:
Q  74 aaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttgg 173  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  699535 aaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttaattactgattaataatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgg 699436  T
Q  174 acttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  699435 acttacagatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgat 699380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 22981179 - 22981023
Alignment:
Q  73 aaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttg 172  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  22981179 aaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaataataattcatctagtaatgattgcaacatcttg 22981080  T
Q  173 gacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  22981079 gacttacatatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagtttatgat 22981023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 72 - 223
Target Start/End: Original strand, 15992328 - 15992479
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 171  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  15992328 gaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttaattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 15992427  T
Q  172 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagtt 223  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15992428 ggacttaccggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagtt 15992479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 29 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 42343151 - 42342951
Alignment:
Q  29 aaaatgggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgat 128  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||  |||||||       ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42343151 aaaatgggagcttctacggtgcagtcatgaaactgacttttctgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgat 42343052  T
Q  129 taatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatga 228  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||  | |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42343051 taatgatcaatggtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtcctattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatga 42342952  T
Q  229 t 229  Q
    |    
T  42342951 t 42342951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 24886474 - 24886317
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 171  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  24886474 gaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 24886375  T
Q  172 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |||||||||  ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  24886374 ggacttacatgtactattttattgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgat 24886317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Original strand, 31786434 - 31786591
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 171  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  31786434 gaaaaagttaattttgatattaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgaacaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 31786533  T
Q  172 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  31786534 ggatttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaatcagagttgatgat 31786591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 38 - 229
Target Start/End: Original strand, 2888199 - 2888390
Alignment:
Q  38 gcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatca 137  Q
    |||| |||||| ||||||||||| |||       ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2888199 gcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatca 2888298  T
Q  138 atagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | ||||||||    
T  2888299 atagtaattcatctagtaatgcttgtaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatatttgatgat 2888390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 34 - 229
Target Start/End: Original strand, 35511232 - 35511427
Alignment:
Q  34 gggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatg 133  Q
    |||||||| |||||| ||||||| |||||||        |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35511232 gggagcttctacggtgcagtcaggaaactgacttttttaaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatg 35511331  T
Q  134 atcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  35511332 atcaatagtaattcatatagtaatgcttgcaacatcttgaacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgat 35511427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 25669963 - 25669806
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 171  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||    
T  25669963 gaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatttt 25669864  T
Q  172 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
     ||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25669863 agacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgat 25669806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Original strand, 31705400 - 31705557
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 171  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  31705400 gaaaaagttaatttttattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 31705499  T
Q  172 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    ||||||| |  |||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  31705500 ggacttatatgtactattttatctttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgat 31705557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 74 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 5830278 - 5830122
Alignment:
Q  74 aaaagttaattttcatcttaatgtttgatt-catttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttg 172  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  5830278 aaaagttaattttgattttaatgtttgatttcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 5830179  T
Q  173 gacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  5830178 gacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgat 5830122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 74 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 25889755 - 25889600
Alignment:
Q  74 aaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttgg 173  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  25889755 aaaagttaattttgatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctttcaacatcttgg 25889656  T
Q  174 acttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    | |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  25889655 atttacaggtactattttattgttggtatctttaacatgcaaacagagttgatgat 25889600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 34 - 229
Target Start/End: Original strand, 38527987 - 38528182
Alignment:
Q  34 gggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatg 133  Q
    |||||||| |||||| ||||||| |||||||       ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38527987 gggagcttctacggtgcagtcaggaaactgatttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatg 38528086  T
Q  134 atcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||  || ||||||||| ||| ||| ||||||||    
T  38528087 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtactattttatcgttgatatctttaacatgtaaatagatttgatgat 38528182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 9200611 - 9200454
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 171  Q
    |||||| |||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  9200611 gaaaaaattaattttaattttaaattttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 9200512  T
Q  172 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  9200511 agacttatagatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgat 9200454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 73 - 226
Target Start/End: Original strand, 22973871 - 22974024
Alignment:
Q  73 aaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttg 172  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  22973871 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 22973970  T
Q  173 gacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgat 226  Q
    ||||||||  ||||||||||| || |  || |||||||||||||||||||||||    
T  22973971 gacttacatgtactattttattgtcgaaatctttaacatgcaaacagagttgat 22974024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 72 - 224
Target Start/End: Original strand, 8741673 - 8741825
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 171  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||| || ||    
T  8741673 gaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatttcatctagtgatgcttgcaacatttt 8741772  T
Q  172 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttg 224  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  8741773 ggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttg 8741825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 72 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 8437352 - 8437198
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 171  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||    
T  8437352 gaaaaagttaattttgattttaatatttaattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacatctt 8437253  T
Q  172 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgat 226  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  8437252 ggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacattcaaacagagttgat 8437198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 34 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 33908657 - 33908467
Alignment:
Q  34 gggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatg 133  Q
    |||||| | |||||| |||| ||||||||||       ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  33908657 gggagcatctacggtgcagttagaaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattgctgattaatg 33908558  T
Q  134 atcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttga 225  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  33908557 atcaatagtaatt-atctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatacaaacatagttga 33908467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 72 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 39573198 - 39573060
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 171  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  39573198 gaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 39573099  T
Q  172 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaaca 210  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||    
T  39573098 ggacttacatgtactattttatcattggcatctttaaca 39573060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 34 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 40133810 - 40133615
Alignment:
Q  34 gggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatg 133  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| |||       ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  40133810 gggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactgattcatg 40133711  T
Q  134 atcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    || |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||| ||||||||||    
T  40133710 attaatagtaattcatccagtaatgcttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgatgat 40133615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 19120246 - 19120089
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 171  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  19120246 gaaaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgatcactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 19120147  T
Q  172 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
     |||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||    
T  19120146 agactttgaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacggagttgctgat 19120089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 22020010 - 22019853
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 171  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||    
T  22020010 gaaaaagttaattttaatcttaatatttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaacatctt 22019911  T
Q  172 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
     ||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  22019910 agacttacaagtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaatagagttgctgat 22019853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 73 - 225
Target Start/End: Original strand, 7208653 - 7208805
Alignment:
Q  73 aaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttg 172  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||||    
T  7208653 aaaaagttaatttttattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaataataattcatctagtaatacttgcaacatcttg 7208752  T
Q  173 gacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttga 225  Q
     |||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  7208753 aacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttga 7208805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 73 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 7693607 - 7693456
Alignment:
Q  73 aaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttg 172  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||     
T  7693607 aaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgaacaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctta 7693508  T
Q  173 gacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttg 224  Q
    ||||||||  || ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  7693507 gacttacaagtattattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttg 7693456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 5837942 - 5837785
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 171  Q
    ||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  5837942 gaaaaggttaattttaattttaatgattgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaacagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 5837843  T
Q  172 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |||||| ||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  5837842 ggacttgcaggtactattttgtcgttgtcatctttaacatgcaaagagagttgctgat 5837785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 34 - 229
Target Start/End: Original strand, 14409091 - 14409286
Alignment:
Q  34 gggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatg 133  Q
    |||||||| |||||| ||||||| |||||||       |||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||||    
T  14409091 gggagcttctacggtgcagtcaggaaactgatttttttgaaaaatttaattttaattttaatgttcgattcatttttaaattgttgattgctgaataatg 14409190  T
Q  134 atcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  14409191 atcaatagtaattcatttagtaatgtttgcaacatcttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgat 14409286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 28 - 211
Target Start/End: Original strand, 25500670 - 25500853
Alignment:
Q  28 taaaatgggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattga 127  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||  |||||||       ||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  25500670 taaaatgggagcttctacggtgcagtcatgaaactgatttttttgaaaaagttaattttaatcttagtatttgattcatttttaaattgttaattactga 25500769  T
Q  128 ttaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacat 211  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25500770 ttaatgatcaacagtatttcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacat 25500853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 72 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 35504752 - 35504598
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 171  Q
    |||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||    
T  35504752 gaaaaagtcaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaataatcaatagtaattcatctagtaatacttgcaacatctt 35504653  T
Q  172 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgat 226  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||    
T  35504652 ggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagatttgat 35504598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 34 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 36867187 - 36866992
Alignment:
Q  34 gggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatg 133  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| |||        |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  36867187 gggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttaaaaaagttaattttaatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactgattcatg 36867088  T
Q  134 atcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    || |||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||| ||||||||||    
T  36867087 attaatagtaattcatccagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgatgat 36866992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 32 - 226
Target Start/End: Original strand, 17157779 - 17157973
Alignment:
Q  32 atgggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaa 131  Q
    |||||||||| |||||||||||||  ||| |||       |||||||| || ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17157779 atgggagcttctacggtacagtcaagaaattgacttttttgaaaaagtcaagtttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaa 17157878  T
Q  132 tgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgat 226  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||    
T  17157879 tgatcaataataattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaaaagtactattttatcgttgaaatctttatcatgcaaacagagttgat 17157973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 27330691 - 27330534
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 171  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  27330691 gaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaatcgttcattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 27330592  T
Q  172 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |||||||||  ||| ||||||| ||||  || ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  27330591 ggacttacatgtaccattttattgttgaaatctttaacatgcaaatagagttgctgat 27330534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 36860810 - 36860654
Alignment:
Q  73 aaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttg 172  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||    
T  36860810 aaaaagttaattttaatcttaatgcttgattcatttttaaattgttgattactaattcatgattaatagtaattcatttagtaatgcttgcaacatcttg 36860711  T
Q  173 gacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||| ||||||||||    
T  36860710 gacttacaaatattattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgatgat 36860654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 74 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 12910740 - 12910585
Alignment:
Q  74 aaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttgg 173  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  12910740 aaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgttcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgg 12910641  T
Q  174 acttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |||||||  || |||| ||| |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||    
T  12910640 acttacatgtattattgtattgttggcatctttaacatacaaccagagttgatgat 12910585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 72 - 202
Target Start/End: Original strand, 28416339 - 28416469
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 171  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||    
T  28416339 gaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcttttttaaattgttgattgttgattaatgatcaatagtaattcatcaagtaatgcttgcaacatctt 28416438  T
Q  172 ggacttacagatactattttatcgttggcat 202  Q
    ||||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  28416439 ggacttaaaagtactattttatcgttggcat 28416469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 15724875 - 15724718
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 171  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| || ||    
T  15724875 gaaaaagttaattttaactttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgattaatagtaattcatctagtaatgcttacaatatttt 15724776  T
Q  172 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |||||||||  ||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  15724775 ggacttacaagtactattttatagttgacatctttaacatgtaaacaaagttgttgat 15724718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 32563527 - 32563370
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 171  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||| |||||    
T  32563527 gaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttaattgctgattaatgatcaataataatttatctagtaattcttgcaacatctt 32563428  T
Q  172 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
     ||||||||  |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    
T  32563427 agacttacatgtactattttatcgttggcatctataacatgcaaacagagttgctgat 32563370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 35934283 - 35934126
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 171  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  35934283 gaaaaagttaattttaattttaatgtttgaatcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaataataattcaactagtaatgcttgcaacatctt 35934184  T
Q  172 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |||||||| | ||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  35934183 ggacttaccggtactattttattgttgacatctttaacatggaaacaaagttgctgat 35934126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 36 - 229
Target Start/End: Original strand, 13956116 - 13956307
Alignment:
Q  36 gagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgat 135  Q
    |||||| |||||| |||||||||| ||||       ||||| ||||||||| || |||||||||||   | ||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  13956116 gagcttctacggtgcagtcagaaagctgatttttttgaaaatgttaattttgattttaatgtttgaaaaagtt--aaattgttgattactgattaatgat 13956213  T
Q  136 caatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||    
T  13956214 caatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggactaacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaatttgatgat 13956307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Original strand, 43308448 - 43308605
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 171  Q
    ||||||||||||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  43308448 gaaaaagttaattttgattttagtatttgattcgtttttaaattgttgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 43308547  T
Q  172 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
     ||||||||| ||||||||||| || || || ||||||||||||  ||||||||||||    
T  43308548 cgacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaagaagagttgatgat 43308605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Original strand, 23116018 - 23116167
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 171  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||         | |||||||||||| |||||    
T  23116018 gaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagt--------cagtaatgcttgcaacatctt 23116109  T
Q  172 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  23116110 ggacttacaggtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagatttgatgat 23116167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Original strand, 30969113 - 30969269
Alignment:
Q  73 aaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttg 172  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||||||  ||||||    
T  30969113 aaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgtggattactgattaatgattaatagtaactcatctagtaatacttgcagcatcttg 30969212  T
Q  173 gacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
     ||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  30969213 aacttatagatactattttattgttgacatctttaacatgcaaacaaagttgctgat 30969269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Original strand, 27318277 - 27318432
Alignment:
Q  73 aaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaa-ttgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 171  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||    
T  27318277 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaaattgttgatttttgattaatgatcaatagtaattcatatagtaatgtttgcaacatctt 27318376  T
Q  172 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
      ||||  |  ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  27318377 aaactt--atgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgat 27318432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Original strand, 21088558 - 21088711
Alignment:
Q  73 aaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttg 172  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||    
T  21088558 aaaaaattaactttaatcttaatgtttgattcatttttaaattg---attatttattcatgattaatagtaattcatctagtaatgcttacaacatcttg 21088654  T
Q  173 gacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    || ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||    
T  21088655 gatttacagatgttattttatcgttggcatctttaacatacaaacatagttgatgat 21088711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 73 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 8467112 - 8466988
Alignment:
Q  73 aaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttg 172  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||    
T  8467112 aaaaagttaattttatttttaatgtttgattcatttttaaactgttgattactaattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacattttg 8467013  T
Q  173 gacttacagatactattttatcgtt 197  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||    
T  8467012 gacttacaaataatattttatcgtt 8466988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 108 - 229
Target Start/End: Original strand, 1428983 - 1429107
Alignment:
Q  108 tttaaattgttgattatt---gattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatat 204  Q
    ||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  1428983 tttaaattgttgaatattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggcatct 1429082  T
Q  205 ttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |||||||||||| | |||| |||||    
T  1429083 ttaacatgcaaataaagtttatgat 1429107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 74 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 43254240 - 43254154
Alignment:
Q  74 aaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgct 160  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43254240 aaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgct 43254154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 72 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 26269196 - 26269069
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 171  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||| |||||    
T  26269196 gaaaaagttaattttaatcttaatgattggttcatttttaaattgttgattactgattaatgatcagtagtaatttatctagtattgcttacaacatctt 26269097  T
Q  172 ggacttacagatactattttatcgttgg 199  Q
      |||||||| |||||||||||| ||||    
T  26269096 aaacttacaggtactattttatccttgg 26269069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 34 - 229
Target Start/End: Original strand, 23954552 - 23954734
Alignment:
Q  34 gggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatg 133  Q
    |||||||| || ||| ||||||| |||||||       ||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||       |||    
T  23954552 gggagcttctatggtgcagtcaggaaactgacttttttgaaaaagttaattatgatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgatta-------atg 23954644  T
Q  134 atcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| |      |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23954645 atcaatagtaattcatcaagtaatgttc-----atcttgcacttacaaatattattttatcgttggcat-tttaacatgcaaacagagttgatgat 23954734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Original strand, 14919327 - 14919473
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 171  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||| ||||||||||      || |||||| |||||    
T  14919327 gaaaaaattaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattttagatttctgattaatgatcaat-gtaattcatc------tgattgcaatatctt 14919419  T
Q  172 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    ||||||    |||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  14919420 ggactt----atacaattttattgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgat 14919473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 132 - 224
Target Start/End: Original strand, 6824329 - 6824420
Alignment:
Q  132 tgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttg 224  Q
    ||||||||||||  ||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||  || | ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  6824329 tgatcaatagtatctcatctagtgatgcttgcaacatcttagacttacatgtattgttttatc-ttgacatctttaacatgcaaacagagttg 6824420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 45)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 33 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 41961266 - 41961070
Alignment:
Q  33 tgggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaat 132  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| |||||||       ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41961266 tgggagcttctacggtgcagtcaggaaactgaattttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaat 41961167  T
Q  133 gatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  41961166 gatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaaccgatttgatgat 41961070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Original strand, 7006754 - 7006911
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 171  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||    
T  7006754 gaaaaagttaattttaatcataatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagaaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 7006853  T
Q  172 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  7006854 ggacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgat 7006911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 29 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 44914097 - 44913894
Alignment:
Q  29 aaaatgggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgat 128  Q
    |||||| |||||| |||||| ||||||| ||||||        ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44914097 aaaatgagagcttctacggtgcagtcagcaaactggtttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgat 44913998  T
Q  129 taatgatcaatagtaattcat---ctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttga 225  Q
    | ||||| |||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44913997 tcatgattaatagtaattcattttctaataatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttga 44913898  T
Q  226 tgat 229  Q
    ||||    
T  44913897 tgat 44913894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 34 - 222
Target Start/End: Original strand, 18494059 - 18494247
Alignment:
Q  34 gggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatg 133  Q
    |||||||||||||||  |||||  |||||||       ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18494059 gggagcttatacggtgtagtcatgaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatg 18494158  T
Q  134 atcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagt 222  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18494159 atcaatagcaattcatctagtaatgcttacaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagt 18494247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 34 - 229
Target Start/End: Original strand, 33660155 - 33660350
Alignment:
Q  34 gggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatg 133  Q
    |||||||| |||||| ||||||  |||||||       ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33660155 gggagcttctacggtgcagtcatgaaactgacttttctgaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatg 33660254  T
Q  134 atcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  33660255 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctcagacttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacaaagttgctgat 33660350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 73 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 26357963 - 26357818
Alignment:
Q  73 aaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttg 172  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  26357963 aaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 26357864  T
Q  173 gacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaaca 218  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26357863 gacttaaaaatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaaca 26357818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 34 - 229
Target Start/End: Original strand, 11366158 - 11366354
Alignment:
Q  34 gggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatg 133  Q
    |||||| | |||||| ||||||||||| |||       ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11366158 gggagcatctacggtgcagtcagaaaattgatttttttgaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatg 11366257  T
Q  134 atcaatagta-attcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||    
T  11366258 atcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaatagagttgatgat 11366354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Original strand, 33709048 - 33709205
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 171  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  33709048 gaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 33709147  T
Q  172 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    ||| |||||  |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  33709148 ggatttacaagtactattttatcattgacatctttaacatgcaaacagagttgctgat 33709205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Original strand, 43770664 - 43770821
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 171  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||    
T  43770664 gaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgatttctaattaatgatcaatagaaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 43770763  T
Q  172 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  43770764 gaacttaaagatactattttattgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgat 43770821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 4764017 - 4763861
Alignment:
Q  73 aaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttg 172  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||    
T  4764017 aaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattattgattactgattaatgatcaatagtaattcaactagtaatgcttgcaatatcttg 4763918  T
Q  173 gacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||    
T  4763917 gacttacaggtactattttatcgttagcatctttaacatgcaaaaagaattgatgat 4763861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 34 - 229
Target Start/End: Original strand, 2325156 - 2325351
Alignment:
Q  34 gggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatg 133  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| |||        |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||     
T  2325156 gggagcttctacggtgcagtcagaaaattgattttttttaaaaagttaattttgatcttaatgtttgatttatttttaaattgttgattactgattaata 2325255  T
Q  134 atcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||| | ||||||||    
T  2325256 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttgtaatctttaacatgcaaacaaatttgatgat 2325351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 34 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 4167347 - 4167152
Alignment:
Q  34 gggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatg 133  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| |||       ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  4167347 gggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactgattcatg 4167248  T
Q  134 atcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    || |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||| ||||||||||    
T  4167247 attaatagtaattcatccagtaatgcttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgatgat 4167152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 72 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 5881916 - 5881770
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 171  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  5881916 gaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgaataatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 5881817  T
Q  172 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaaca 218  Q
     ||||||||  ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||    
T  5881816 agacttacatgtactattttattgttgacatctttaacatgcaaaca 5881770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 34 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 41465926 - 41465731
Alignment:
Q  34 gggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatg 133  Q
    ||||| ||||| ||| |||| ||||||||||       ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  41465926 gggagtttatatggtgcagttagaaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttcgattcaattttaaattgttgattgctgattaatg 41465827  T
Q  134 atcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||    
T  41465826 atcaatagtaattcatatagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacataattgatgat 41465731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Original strand, 19289139 - 19289296
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 171  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  19289139 gaaaaagttaattttgatcttaatgtttaattcatttttaaattgttaatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaatatctt 19289238  T
Q  172 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |||||||||| || |||||||| || || || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  19289239 ggacttacaggtattattttattgtcggaatctttaacatgcacacagagttgatgat 19289296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 97 - 223
Target Start/End: Original strand, 27349789 - 27349915
Alignment:
Q  97 tttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgt 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27349789 tttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacagatactattttatcgt 27349888  T
Q  197 tggcatatttaacatgcaaacagagtt 223  Q
    ||| || |||||| |||||||||||||    
T  27349889 tggaatctttaacttgcaaacagagtt 27349915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Original strand, 43648061 - 43648218
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 171  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||    
T  43648061 gaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcgacatctt 43648160  T
Q  172 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |||||||||  | ||||||||||||||  || ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  43648161 ggacttacaagtgctattttatcgttgaaatctttaacatggaaacaaagttgatgat 43648218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Original strand, 31570551 - 31570707
Alignment:
Q  73 aaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttg 172  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||     
T  31570551 aaaaagttaattttcattttaatgattgattcatttttaaatatttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagcaatgcttgcaacatctta 31570650  T
Q  173 gacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
     |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  31570651 aacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacatgtaaacagagttgttgat 31570707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 35959279 - 35959126
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 171  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  35959279 gaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 35959180  T
Q  172 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    ||    |||  ||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  35959179 gg----acatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacatagttgatgat 35959126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Original strand, 39167185 - 39167342
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 171  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||| ||||||| |||| |  ||    
T  39167185 gaaaaagttaattttaatcttaatgttttattcatttttaaattgttgattactgattcataattaatagtaattcatctagtaatgctagcaacaattt 39167284  T
Q  172 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  39167285 ggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatacaaacagagttgatgat 39167342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 80 - 226
Target Start/End: Original strand, 19500739 - 19500885
Alignment:
Q  80 taattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttac 179  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||    
T  19500739 taattttgatcttaatatttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgaaattac 19500838  T
Q  180 agatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgat 226  Q
    |  |||||||||||||||  ||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  19500839 atgtactattttatcgttaacatctttaacatgtaaatagagttgat 19500885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 13711846 - 13711689
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 171  Q
    |||||| |||||||| || | |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||    
T  13711846 gaaaaaattaattttaatttaaatgattgattcatttttaaatcgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtattgtttgcaacatctt 13711747  T
Q  172 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
     ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  13711746 agacttacaggtactattttatcgctggcatctttaacatgcatacagagttgctgat 13711689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 31862239 - 31862082
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 171  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||| |||||    
T  31862239 gaaaaagttaattttgatcttaatatttgattcatttttaaatcgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtctacaatatctt 31862140  T
Q  172 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |||||||||  ||||||||||| || || ||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  31862139 ggacttacaagtactattttattgtcggaatccttaacatgcaaacagacttgatgat 31862082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 36 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 3177362 - 3177169
Alignment:
Q  36 gagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgat 135  Q
    |||||| |||||| ||||||| |||||||       |||||||||| |||| || ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| | ||| |||||    
T  3177362 gagcttctacggtgcagtcaggaaactgacttttttgaaaaagttacttttaattttaatgtttgatttattttcaaattgttgattacttattcatgat 3177263  T
Q  136 caatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
     |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  3177262 aaatagtaattcatctagtaatgcttgtaatatcttggacttacatgtactattttatagttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgat 3177169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 31 - 188
Target Start/End: Original strand, 19424417 - 19424574
Alignment:
Q  31 aatgggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgatta 130  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||  |||||||       ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19424417 aatgggagcttctacggtgcagtcatcaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgattactgatta 19424516  T
Q  131 atgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactat 188  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||    
T  19424517 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttgcaggtactat 19424574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 107 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 4478717 - 4478595
Alignment:
Q  107 ttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatattt 206  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||    
T  4478717 ttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagcaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaccgatactattttatcattggcatcttt 4478618  T
Q  207 aacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |||||| ||||||||||| ||||    
T  4478617 aacatggaaacagagttggtgat 4478595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 72 - 217
Target Start/End: Original strand, 41051116 - 41051260
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 171  Q
    |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||| ||| |||||    
T  41051116 gaaaaaattaattttaattttaatgtttgattcatttttgaattgttgattattgattaatgatcaataacaattcatctagcaatgcttacaacatctt 41051215  T
Q  172 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaac 217  Q
    | |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  41051216 gaacttacaggtactattttatccttggcat-tttaacatgcaaac 41051260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Original strand, 33550800 - 33550960
Alignment:
Q  73 aaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatga----tcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaat 168  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |    |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||    
T  33550800 aaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactggttaataaataatcaatagttattcatctagtaatgcttgcaacat 33550899  T
Q  169 cttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
     |||||||| ||  ||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  33550900 attggactttcaagtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacatagttgatgat 33550960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 37906098 - 37905940
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgatt-catttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatct 170  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||    
T  37906098 gaaaaaattaattttgattttaatgtttgatttcatttttaaattgttaattactgattaatgatcaatagtaattcatccagtaattcttgcaacatct 37905999  T
Q  171 tggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    ||||||||||  |  ||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| |||||    
T  37905998 tggacttacatgtgttattttatcattggaatctttaacatgcaaacagagttaatgat 37905940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 125 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 44286283 - 44286179
Alignment:
Q  125 tgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttg 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  44286283 tgattaatgatcaatagtaattcatctaacaatgcttgcaacatcttagacttacagatactattttatcgttagcatatttaacatgcaaacaaagttg 44286184  T
Q  225 atgat 229  Q
     ||||    
T  44286183 ttgat 44286179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 74 - 229
Target Start/End: Original strand, 29241963 - 29242111
Alignment:
Q  74 aaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttgg 173  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| |||| |       |||||||    
T  29241963 aaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgttcaatagtaattcatctagtaattc-------atcttgg 29242055  T
Q  174 acttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||| ||| |||||||||||||    
T  29242056 acttacaggtactattgtatcgttgacatctttaacatacaaccagagttgatgat 29242111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 106 - 229
Target Start/End: Original strand, 4263926 - 4264049
Alignment:
Q  106 tttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatt 205  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |  ||||||||||| |||||||| ||    
T  4263926 tttttaaattgttgattactgatcaatgatcaatattatttcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttatatgtactattttattgttggcatctt 4264025  T
Q  206 taacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    ||||||||||||||||||| ||||    
T  4264026 taacatgcaaacagagttgctgat 4264049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 73 - 178
Target Start/End: Original strand, 41463407 - 41463512
Alignment:
Q  73 aaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttg 172  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||| |||||     
T  41463407 aaaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattattaattattgattaatgatcaatagtaatttatctattaatgtttacaacatctta 41463506  T
Q  173 gactta 178  Q
    ||||||    
T  41463507 gactta 41463512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 73 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 33902400 - 33902321
Alignment:
Q  73 aaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatcta 152  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  33902400 aaaaagttaattttgatcttaatgtttgatttatttttaaattgttgattacagattaataatcaataataattcatcta 33902321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 120 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 19314186 - 19314074
Alignment:
Q  120 attattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggactt---acagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaa 216  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||   |||  ||||||||||||| || ||| |||||||||||||    
T  19314186 attactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttataacatgtactattttatcgctgacatctttaacatgcaaa 19314087  T
Q  217 cagagttgatgat 229  Q
    || ||||| ||||    
T  19314086 catagttgctgat 19314074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 72 - 171
Target Start/End: Original strand, 18257354 - 18257453
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 171  Q
    ||||||||||||||| || |||||  || ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  18257354 gaaaaagttaattttaatattaataatttattcattttaaaattgtcgattactgattaatgataaataataattcatctagtaatgcttgcaacatctt 18257453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 151 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 36642296 - 36642223
Alignment:
Q  151 taataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttg 224  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  36642296 taataatgcttgcaacatcttgaacttaccggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaacagagttg 36642223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 154 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 45328025 - 45327950
Alignment:
Q  154 taatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  45328025 taatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagtttatgat 45327950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 34 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 45328114 - 45328028
Alignment:
Q  34 gggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgat 121  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| ||||       ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45328114 gggagcttctacggtgcagtcagaaa-ctgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgat 45328028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 167 - 229
Target Start/End: Original strand, 17071648 - 17071710
Alignment:
Q  167 atcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||    
T  17071648 atcttggatttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaatttgatgat 17071710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 166 - 229
Target Start/End: Original strand, 18258197 - 18258260
Alignment:
Q  166 aatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  18258197 aatcttagacttgcagttactattttatcgttgggatctttaacatgcaaagagagttgctgat 18258260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 88 - 130
Target Start/End: Original strand, 17053963 - 17054005
Alignment:
Q  88 atcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgatta 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  17053963 atcttaatgtttgattcatttttacattgttgattactgatta 17054005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 167 - 229
Target Start/End: Original strand, 17054007 - 17054069
Alignment:
Q  167 atcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| | ||||||||    
T  17054007 atcttggatttacaggtactattttatcgttggaacctttaacatgcaaacaaatttgatgat 17054069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 88 - 130
Target Start/End: Original strand, 17071604 - 17071646
Alignment:
Q  88 atcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgatta 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  17071604 atcttaatgtttgattcatttttacattgttgattactgatta 17071646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 229
Target Start/End: Original strand, 41463779 - 41463823
Alignment:
Q  185 ctattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  41463779 ctattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgttgat 41463823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 56)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 34 - 229
Target Start/End: Original strand, 46297522 - 46297717
Alignment:
Q  34 gggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatg 133  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||||||||        |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  46297522 gggagcttctacggtgcagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactaattaatg 46297621  T
Q  134 atcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  46297622 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaaatactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgat 46297717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 74 - 229
Target Start/End: Original strand, 11357181 - 11357336
Alignment:
Q  74 aaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttgg 173  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  11357181 aaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgg 11357280  T
Q  174 acttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  11357281 acttacaagtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgatgat 11357336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 34 - 229
Target Start/End: Original strand, 26941020 - 26941215
Alignment:
Q  34 gggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatg 133  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||| || |||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26941020 gggagcttctacggtgcagtcagaaaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttaacgcttgattcatttttaaattgttgattactgattaatg 26941119  T
Q  134 atcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  26941120 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgat 26941215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 73 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 1090070 - 1089913
Alignment:
Q  73 aaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttg 172  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1090070 aaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttg 1089971  T
Q  173 gacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgatgt 231  Q
    || ||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  1089970 gattta-atgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaatagagttgttgatgt 1089913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 34 - 229
Target Start/End: Original strand, 40552019 - 40552214
Alignment:
Q  34 gggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatg 133  Q
    |||||||| |||||| ||||| | |||||||       ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  40552019 gggagcttctacggtgcagtctggaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaata 40552118  T
Q  134 atcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  40552119 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcatggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgat 40552214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 33 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 4015876 - 4015691
Alignment:
Q  33 tgggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaat 132  Q
    ||||||||| |||||| ||||||  |||||||       ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4015876 tgggagcttctacggtgcagtcatgaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat 4015777  T
Q  133 gatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaaca 218  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  4015776 gatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttaccgttggcatctttaacatgcaaaca 4015691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 74 - 229
Target Start/End: Original strand, 53228952 - 53229107
Alignment:
Q  74 aaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttgg 173  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||     
T  53228952 aaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatactaattcatctagtaatgcttgcaacatcttga 53229051  T
Q  174 acttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  53229052 acttacatgtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgatgat 53229107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 34 - 229
Target Start/End: Original strand, 22622478 - 22622673
Alignment:
Q  34 gggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatg 133  Q
    |||||||| |||||| ||||||| |||||||       ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  22622478 gggagcttttacggtgcagtcaggaaactgatttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaatagttgattactgattaatg 22622577  T
Q  134 atcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  22622578 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatccaaacagatttgatgat 22622673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 33 - 228
Target Start/End: Original strand, 33378544 - 33378739
Alignment:
Q  33 tgggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaat 132  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| |||||||       |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33378544 tgggagcttctacggtgcagtcaggaaactgacttttttgaaaaaattaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaatcgttgattattgattaat 33378643  T
Q  133 gatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatga 228  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  33378644 gatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttgaacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatga 33378739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 48355319 - 48355162
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 171  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||    
T  48355319 gaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgcttactgattaatgatcaataataattcatctagtaatacttgcaacatctt 48355220  T
Q  172 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||    
T  48355219 ggacttacagatactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttgatgat 48355162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 72 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 33698531 - 33698379
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 171  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  33698531 gaaaaagttaattttaatcttaatgactgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaatatctt 33698432  T
Q  172 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttg 224  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33698431 agacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttg 33698379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Original strand, 24707913 - 24708070
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 171  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||    
T  24707913 gaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtaatttatctaataatgcttgcaacttctt 24708012  T
Q  172 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||    
T  24708013 ggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaatttgatgat 24708070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 29099724 - 29099567
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 171  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  29099724 gaaaaagttaattttaatattaatgtttgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatggtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 29099625  T
Q  172 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    ||||||| || ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  29099624 ggacttaaaggtactattttatcgttagcatctttaacatgcaaacagagttgctgat 29099567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Original strand, 44186315 - 44186472
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 171  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  44186315 gaaaatgttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 44186414  T
Q  172 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
     |||||| || |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  44186415 agacttagaggtactattttatcattggcatctttaacatgcaaacagagttgttgat 44186472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 74 - 229
Target Start/End: Original strand, 52040722 - 52040877
Alignment:
Q  74 aaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttgg 173  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  52040722 aaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactcattaatgatcaataatcattcatctagtaatgtttgcaacatcttgg 52040821  T
Q  174 acttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  52040822 acttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgat 52040877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 35 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 39283067 - 39282873
Alignment:
Q  35 ggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatga 134  Q
    ||||||| |||||| ||||||| |||||||       ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39283067 ggagcttctacggtgcagtcaggaaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatga 39282968  T
Q  135 tcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||| | ||||||||    
T  39282967 ttaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacattttggatttacagatactattttattgttgacatctttaacaggcaaacatatttgatgat 39282873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Original strand, 7327281 - 7327437
Alignment:
Q  73 aaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttg 172  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||     
T  7327281 aaaaagttaattttaatcttaataattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctta 7327380  T
Q  173 gacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  7327381 gacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaatagagttgttgat 7327437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 34 - 218
Target Start/End: Original strand, 43975652 - 43975836
Alignment:
Q  34 gggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatg 133  Q
    ||||| || |||||| |||||||||||||||       |||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  43975652 gggagtttctacggtgcagtcagaaaactgactcttttgaaaaaattaatcttgatcttaatgttcgattcatttttaaattgttgattgctgattaatg 43975751  T
Q  134 atcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaaca 218  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  43975752 atcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacatgtaaaca 43975836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 75 - 229
Target Start/End: Original strand, 42505876 - 42506030
Alignment:
Q  75 aaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttgga 174  Q
    |||||||||||| || |||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  42505876 aaagttaattttgattttaacgattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgga 42505975  T
Q  175 cttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||  |||||||||    
T  42505976 cttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcgaacaacgttgatgat 42506030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 74 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 3362631 - 3362474
Alignment:
Q  74 aaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttgg 173  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||    
T  3362631 aaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatccagtaatgcttgcaacatattgg 3362532  T
Q  174 acttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgatgt 231  Q
    ||||  |  ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3362531 acttctaagtacaattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatgt 3362474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Original strand, 14586478 - 14586634
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 171  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  14586478 gaaaaaattaattttaatcttaatgtttgatttatttttaaattgttgattactgattaatgatcagtagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 14586577  T
Q  172 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  14586578 ggacttaccg-tactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgttgat 14586634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 22451346 - 22451189
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 171  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  22451346 gaaaaagttaattttgatcttaatgttcgattcatttttaaatttttgattgctgattaatgatcaataataattcatctagtaatgcttgcaacatctt 22451247  T
Q  172 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |||||||||  ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  22451246 ggacttacatgtactattttattgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgat 22451189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 32 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 21194025 - 21193828
Alignment:
Q  32 atgggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaa 131  Q
    |||||||||| |||||| ||||||  |||||||       ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21194025 atgggagcttctacggtgcagtcatgaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaa 21193926  T
Q  132 tgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    | |||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||| |||||| | ||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  21193925 taatcaatagtaattcatttagtaatggttgcaacatcttgaacttacggctactattttatcgtgagaatctttaacatgcaaacagagttgctgat 21193828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Original strand, 24488761 - 24488917
Alignment:
Q  73 aaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttg 172  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||    
T  24488761 aaaaagttaattttaatattaatgtttgattcatttttaaattattgattattgattcatgattaatagtaatgcatctagtaatgcttgcaacatcttg 24488860  T
Q  173 gacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
     |||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  24488861 aacttactgacactattttattgttggcatctttaacatgcaaatagagttgatgat 24488917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 44891874 - 44891718
Alignment:
Q  73 aaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttg 172  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||     
T  44891874 aaaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaacagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctta 44891775  T
Q  173 gacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |||||  || |||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  44891774 gacttgtaggtactattttatcgttgacatctttaacatacaaacagagttgctgat 44891718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 33 - 229
Target Start/End: Original strand, 51212536 - 51212726
Alignment:
Q  33 tgggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaat 132  Q
    ||||||||| || ||| |||||||||||||||       ||||||||||||||| ||||||||      ||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  51212536 tgggagcttctatggtgcagtcagaaaactgacatttttgaaaaagttaattttgatcttaat------ttcatttttaaattgttgatttttaattaat 51212629  T
Q  133 gatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||    
T  51212630 gatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttgatgat 51212726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 31 - 229
Target Start/End: Original strand, 21009558 - 21009757
Alignment:
Q  31 aatgggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgatta 130  Q
    |||||||| || |||||| ||||||| |||||||        ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21009558 aatgggagtttctacggtgcagtcaggaaactgacttttttaaaaaaattaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgatta 21009657  T
Q  131 atgatcaatagta-attcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||| |  |||||||||    
T  21009658 atgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatattgttgatgat 21009757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 54506186 - 54506028
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagta-attcatctaataatgcttgcaaaatct 170  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |    
T  54506186 gaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacattt 54506087  T
Q  171 tggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||||| | ||| ||||||    
T  54506086 tggacttataaatactattttatcgttggaatctttaacatgcaaataaagtagatgat 54506028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 36 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 47481937 - 47481743
Alignment:
Q  36 gagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgat 135  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| |||       ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  47481937 gagcttctacggtacagtcaggaaattgatttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgat 47481838  T
Q  136 caatagta-attcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||  || ||||| ||||||| |||||| |||||    
T  47481837 caatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttacaagtactattttatcgttgaaatctttaatatgcaaatagagtttatgat 47481743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 34 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 37158124 - 37157940
Alignment:
Q  34 gggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatg 133  Q
    |||||||| |||||| ||||||| |||||||       ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  37158124 gggagcttctacggtgcagtcaggaaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactcattaatg 37158025  T
Q  134 atcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaaca 218  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||| | || |||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  37158024 atcaatggtaattcatctagtaatgcttgcgacatattggacttacatgtactattttatcattggcatctttaacatacaaaca 37157940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 34 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 37203484 - 37203300
Alignment:
Q  34 gggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatg 133  Q
    |||||||| |||||| ||||||| |||||||       ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  37203484 gggagcttctacggtgcagtcaggaaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactcattaatg 37203385  T
Q  134 atcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaaca 218  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||| | || |||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||    
T  37203384 atcaatggtaattcatctagtaatgcttgcgatatattggacttacaggtactattttatcattgacatctttaacatacaaaca 37203300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 2008317 - 2008153
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgatta-------atgatcaatagtaattcatctaataatgcttgca 164  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||       |||||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  2008317 gaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattaatgattactgattaatgatcaatattatttcatctagtaatgcttgca 2008218  T
Q  165 aaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    | ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  2008217 acatcttggacttacaagtactattttatcgttgtcatctttaacatgcaaacagagttgctgat 2008153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 72 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 40936351 - 40936199
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 171  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  40936351 gaaaaagttaatttcaatcttaatgattgatttatttttaaattgttgattaccgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 40936252  T
Q  172 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttg 224  Q
     ||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  40936251 agacttgcatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacggagttg 40936199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 74 - 229
Target Start/End: Original strand, 22445865 - 22446020
Alignment:
Q  74 aaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttgg 173  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| || ||||    
T  22445865 aaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatatttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatccagtaatacttgcaacattttgg 22445964  T
Q  174 acttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || ||||| ||||||| | ||||||||||    
T  22445965 acttaaaggtactattttatcgttggtatctttaatatgcaaaaatagttgatgat 22446020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 34 - 229
Target Start/End: Original strand, 11356918 - 11357105
Alignment:
Q  34 gggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatg 133  Q
    |||||| | |||||| |||||||| ||||||       ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  11356918 gggagcatctacggtgcagtcagacaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttggattcatttttaaattgttgattactaattaatg 11357017  T
Q  134 atcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    || |||||||||        |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  11357018 atgaatagtaat--------taatgcttgcaacatcttggacttacaaatactattttatcattggcatatttaacatacaaccagagttgatgat 11357105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 25580116 - 25579960
Alignment:
Q  73 aaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttg 172  Q
    ||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||     
T  25580116 aaaaagttaatcttaatcttaatgattggttcatttttaaattgttgattgcggattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaatatctta 25580017  T
Q  173 gacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    || ||| || |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  25580016 gatttataggtacagttttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgat 25579960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 97 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 34133288 - 34133156
Alignment:
Q  97 tttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgt 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34133288 tttgattcatttttaaattgttgattaccgattcatgattactagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgt 34133189  T
Q  197 tggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||||||||    
T  34133188 tggcatctttaacatgcaaacaaaattgatgat 34133156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 34 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 36012556 - 36012371
Alignment:
Q  34 gggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaa-ttttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaat 132  Q
    |||||||| |||||| ||||||  |||||||       ||||||||||| |||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36012556 gggagcttctacggtgcagtcatgaaactgacttttttgaaaaagttaaattttaattttaatgtttgatttatttttaaattgttgattactgattaat 36012457  T
Q  133 gatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaaca 218  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  36012456 gatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcagcattttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaaca 36012371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 29164179 - 29164030
Alignment:
Q  73 aaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttg 172  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||     
T  29164179 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgatttatttttaaattgttgatta-------atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgtaacatctta 29164087  T
Q  173 gacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  29164086 gacttacaagtactattttatcgttagcatctttaacatgcaaacagagttgctgat 29164030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 34 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 32373885 - 32373691
Alignment:
Q  34 gggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatg 133  Q
    |||||||| ||||||||||||   |||||||       ||||||||||||||| |||||| || |  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  32373885 gggagcttctacggtacagtcgtgaaactgaattttttgaaaaagttaattttaatcttattgatgaattcatttt-aaattgttgattactgattaatg 32373787  T
Q  134 atcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  32373786 atcaatagaaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaagtactattttatcgttgacatctttaatatgcaaacagagttgctgat 32373691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Original strand, 4761447 - 4761603
Alignment:
Q  73 aaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttg 172  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||| || |||    
T  4761447 aaaaagttaattttgattttaatgtttgattcattttcaaattgttgatttctgattaatgattaatagtaattcatctggtaatgtttgcaacattttg 4761546  T
Q  173 gacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||| | ||||||||||    
T  4761547 gacttataggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaatatagttgatgat 4761603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 97 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 38592051 - 38591919
Alignment:
Q  97 tttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgt 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  38592051 tttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaatttgtttaataatgcttgcaacatcttggatttacaaatacttttttatcgt 38591952  T
Q  197 tggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    || ||| ||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  38591951 tgtcatctttgacatgcaaatagatttgatgat 38591919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 103 - 229
Target Start/End: Original strand, 46994490 - 46994616
Alignment:
Q  103 tcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcat 202  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || || ||    
T  46994490 tcatttttaaattgttgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaatatcttggacttacaggtactattttattgtcggaat 46994589  T
Q  203 atttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
     |||| |||||||||| | ||||||||    
T  46994590 ctttagcatgcaaacataattgatgat 46994616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 50475196 - 50475032
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgat-------caatagtaattcatctaataatgcttgca 164  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||       ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  50475196 gaaaaatttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattattgattactgattaatgattaatgatcaatactaattcatctagtaatgcttgca 50475097  T
Q  165 aaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    | ||||||||||||||  || ||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  50475096 acatcttggacttacaagtattattttatccttgacatctttaatatgcaaacagatttgatgat 50475032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Original strand, 3654997 - 3655157
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattc-atttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattc--atctaataatgcttgcaaaat 168  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||    
T  3654997 gaaaatgttaattttgattttaatgtttgattttatttttaaattgttgattactgattaataatcaatagtaattcatatctagtaatgcttgcaacat 3655096  T
Q  169 cttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |||||||||| |  |  |||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||    
T  3655097 cttggacttatatgtgttattttatcgatggaatctttaacatgcaaacagagctgatgat 3655157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 72 - 151
Target Start/End: Original strand, 20373061 - 20373140
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatct 151  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20373061 gaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatct 20373140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 135 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 45174821 - 45174727
Alignment:
Q  135 tcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  45174821 tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaccgttactattttatcgttggcatctttaacatggaaacagagttgctgat 45174727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 119 - 229
Target Start/End: Original strand, 54828546 - 54828656
Alignment:
Q  119 gattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaaca 218  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||    
T  54828546 gattactgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatagttggaatttttaacatacaaaca 54828645  T
Q  219 gagttgatgat 229  Q
     ||||||||||    
T  54828646 tagttgatgat 54828656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 80 - 218
Target Start/End: Original strand, 27480164 - 27480306
Alignment:
Q  80 taattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttg----caaaatcttggac 175  Q
    |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||     || || ||||||    
T  27480164 taattttgttcttaatgttcgattcatttttaaattgttgatcgctgattaataatcaatagtaattcatctagtaatgtttgtaattaacattttggac 27480263  T
Q  176 ttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaaca 218  Q
    |||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27480264 ttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaaca 27480306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 34 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 11467226 - 11467045
Alignment:
Q  34 gggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatg 133  Q
    |||||||| |||||| ||||||  |||||||       |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||       |||||||    
T  11467226 gggagcttctacggtgcagtcatcaaactgacttttttgaaaaagttaattttattcttaatgattgattcatttttaaattgttg-------attaatg 11467134  T
Q  134 atcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |||||||||||||||||||       |||||| ||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||| || || |||||||||||||||||| ||||    
T  11467133 atcaatagtaattcatcta-------ttgcaacatcttagacttgcaggtactattttgtcgttggtatcttaaacatgcaaacagagttgttgat 11467045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 197
Target Start/End: Original strand, 11835494 - 11835556
Alignment:
Q  135 tcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgtt 197  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11835494 tcaatagtaattcatttagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatactattttatcgtt 11835556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 229
Target Start/End: Original strand, 20373137 - 20373199
Alignment:
Q  167 atcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  20373137 atcttggacttatatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgat 20373199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 144 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 43348563 - 43348478
Alignment:
Q  144 attcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||  |||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  43348563 attcatttagtaatgcttgcaacatcttaaacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaatagagttgttgat 43348478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 137 - 216
Target Start/End: Original strand, 53811597 - 53811676
Alignment:
Q  137 aatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaa 216  Q
    ||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||   || |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  53811597 aatagtaattcatctaggaatgcctgcaacatcttggacttacgagtattattttatcgttggtatctttaacatgcaaa 53811676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 72 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 35844625 - 35844577
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttga 120  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35844625 gaaaaagttaattttaattttaatgtttgatttatttttaaattgttga 35844577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 72 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 43348592 - 43348556
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcattt 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  43348592 gaaaaagttaattttaatcttaatgattgattcattt 43348556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 16)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 34 - 229
Target Start/End: Original strand, 3879698 - 3879893
Alignment:
Q  34 gggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatg 133  Q
    |||| ||| |||||| ||||||| |||||||       ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  3879698 gggaccttctacggtgcagtcaggaaactgatttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattcatg 3879797  T
Q  134 atcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3879798 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgat 3879893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 34 - 229
Target Start/End: Original strand, 6090941 - 6091136
Alignment:
Q  34 gggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatg 133  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||| |        |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6090941 gggagcttctacggtgcagtcagaaaacttacttttttaaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatg 6091040  T
Q  134 atcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  6091041 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgtttgaatctttaatatgcaaacagagttgatgat 6091136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 1946221 - 1946064
Alignment:
Q  73 aaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagta-attcatctaataatgcttgcaaaatctt 171  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||    
T  1946221 aaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctaataatgcttgtaacatctt 1946122  T
Q  172 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||    
T  1946121 ggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttgatgat 1946064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 31 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 20768510 - 20768312
Alignment:
Q  31 aatgggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgatta 130  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||       ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20768510 aatgggagcttctacggtgcagtcaggaaattgatttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttcaattcatttttaaattgttgattactgatta 20768411  T
Q  131 atgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | ||||||||    
T  20768410 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacaccttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacataattgatgat 20768312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Original strand, 33892809 - 33892966
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 171  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||    
T  33892809 gaaaaagttaattttaaccttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatttagtaatgtttgcaacatctt 33892908  T
Q  172 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||    
T  33892909 ggacttacatgtactattttattgttggcatctttaacatgcaaactgagttgctgat 33892966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Original strand, 7234829 - 7234989
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattg---attaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaat 168  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||    
T  7234829 gaaaaagttaattttgatcttaatgttcgatttatttttaaattgttgattgttgttgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacat 7234928  T
Q  169 cttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  7234929 cttggacttacatgtactattttatcgttggcatttttaacatgcaaacatagttgatgat 7234989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 34 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 5627817 - 5627621
Alignment:
Q  34 gggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatg 133  Q
    |||||||| |||||| ||||||| |||||||        ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5627817 gggagcttctacggtgcagtcaggaaactgatttttttaaaaaaattaattttgattttaatatttgattcatttttaaattgttgattactgattaatg 5627718  T
Q  134 atcaatagta-attcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||    
T  5627717 atcaatagtatattcacctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaatagagttgatgat 5627621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 79 - 229
Target Start/End: Original strand, 4318626 - 4318776
Alignment:
Q  79 ttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggactta 178  Q
    |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||     
T  4318626 ttaattttaattttaatgtttgatttatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttt 4318725  T
Q  179 cagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |   |||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  4318726 cccgtactatttcatcgttgacatctttaacatgaaaacagagttgctgat 4318776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Original strand, 21016916 - 21017066
Alignment:
Q  73 aaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttg 172  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||     
T  21016916 aaaaagttaattttaatcttaatatttgattcatttataaattgttgattactgattcatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctta 21017015  T
Q  173 gacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |||       |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21017016 gac------gtactattttatcgttgacatatttaacatgcaaacagagttgatgat 21017066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 8513608 - 8513458
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 171  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||    
T  8513608 gaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgatta-------atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaagatttt 8513516  T
Q  172 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  8513515 ggacttaccggtactattttatcattggcatctttaacatggaaacagagttgctgat 8513458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 29182548 - 29182394
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 171  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||| |||| ||||||| |||||    
T  29182548 gaaaaagttaattttagtcttaatgattgattcatttttaaattgttgattgttgattaatgatca---gtaattcatctagtaatacttgcaacatctt 29182452  T
Q  172 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
     ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||    
T  29182451 agacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacctgcaaatagagttgctgat 29182394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 33619219 - 33619055
Alignment:
Q  73 aaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgat---taatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatc 169  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||     
T  33619219 aaaaagttaattttaatcttaatgttcgattcatttttaaattgttgattgctgatcattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacata 33619120  T
Q  170 ttggacttacagatactattttatcgttggcat-----atttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||     | |||||||||||||| ||||||||||    
T  33619119 ttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacttaacatgcaaacatagttgatgat 33619055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 72 - 199
Target Start/End: Original strand, 7054569 - 7054697
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagta-attcatctaataatgcttgcaaaatct 170  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||| ||||    
T  7054569 gaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatctttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatttagtaatgtttgcaacatct 7054668  T
Q  171 tggacttacagatactattttatcgttgg 199  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7054669 tggacttacagttactattttatcgttgg 7054697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 6089283 - 6089133
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 171  Q
    |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||| || |||||||||||| || ||    
T  6089283 gaaaaaattaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgatta-------atgatcaatagtaattcatatagtaatgcttgcaacatttt 6089191  T
Q  172 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  6089190 ggacttactggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaacagagttgctgat 6089133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 78 - 133
Target Start/End: Original strand, 33724062 - 33724117
Alignment:
Q  78 gttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatg 133  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  33724062 gttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgcttaatgattaatg 33724117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 173 - 229
Target Start/End: Original strand, 30353256 - 30353312
Alignment:
Q  173 gacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  30353256 gacttacatgtactattttatcgttgacatttttaacatgcaaacagagttgctgat 30353312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 118; Significance: 2e-60; HSPs: 3)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Original strand, 408227 - 408384
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 171  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  408227 gaaaaaattaatttttattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 408326  T
Q  172 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  408327 ggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgat 408384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 515 - 364
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 171  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  515 gaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattcatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 416  T
Q  172 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    ||||       |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  415 ggac------gtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgat 364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Original strand, 93900 - 94055
Alignment:
Q  73 aaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttg 172  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  93900 aaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttt-aaattgttgattagtgattaatgatcaatagcaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 93998  T
Q  173 gacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | ||||||||    
T  93999 gacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacaaatttgatgat 94055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0318 (Bit Score: 113; Significance: 2e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0318
Description:

Target: scaffold0318; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 12294 - 12139
Alignment:
Q  73 aaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttg 172  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||     
T  12294 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgatt-atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctta 12196  T
Q  173 gacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  12195 gacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgat 12139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0291 (Bit Score: 99; Significance: 5e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0291
Description:

Target: scaffold0291; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 75 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 8271 - 8117
Alignment:
Q  75 aaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttgga 174  Q
    |||||||||||| || |||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  8271 aaagttaattttgattttaacgattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgga 8172  T
Q  175 cttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    ||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||  |||||||||    
T  8171 cttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcgaacaacgttgatgat 8117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 28 - 229
Target Start/End: Original strand, 145769 - 145971
Alignment:
Q  28 taaaatgggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattga 127  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||||||| ||| |||       ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| || |||| |||    
T  145769 taaaaagggagcttctacggtgcagtcaggaaattgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttaattcatttttaaattttttattactga 145868  T
Q  128 ttaatgatcaatagta-attcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgat 226  Q
    |||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  145869 ttaatgatcaattgtatattcatttagtaatgcttgcaacatcttggacttacagacactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttgat 145968  T
Q  227 gat 229  Q
    |||    
T  145969 gat 145971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 44343 - 44186
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 171  Q
    ||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||| | |||    
T  44343 gaaaaagttgattttgattttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcattcagtaatgcttgcaacaactt 44244  T
Q  172 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  44243 ggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgat 44186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Original strand, 154444 - 154601
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 171  Q
    ||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||| | |||    
T  154444 gaaaaagttgattttgattttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcattcagtaatgcttgcaacaactt 154543  T
Q  172 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  154544 ggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgat 154601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 267663 - 267515
Alignment:
Q  72 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 171  Q
    |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  |         ||||||||||| |||| ||||||  |||||    
T  267663 gaaaaaattaattttgatcttaatatttgattcatttttaaattgttgattactgattggt---------taattcatctagtaattcttgcagcatctt 267573  T
Q  172 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  267572 ggacttacatgtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgatgat 267515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 101058 - 100994
Alignment:
Q  114 ttgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttaca 180  Q
    |||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||||    
T  101058 ttgttgattactgattaatgatc--tagtaatgcatttagtaatgcttgcaacatcttggacttaca 100994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 192 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 100994 - 100957
Alignment:
Q  192 atcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 229  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  100994 atcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgat 100957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University