View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF16215_high_5 (Length: 307)

Name: NF16215_high_5
Description: NF16215
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF16215_high_5
NF16215_high_5
[»] chr3 (53 HSPs)
chr3 (2-201)||(6110064-6110263)
chr3 (2-201)||(10572600-10572799)
chr3 (2-201)||(15600892-15601091)
chr3 (2-201)||(15607437-15607636)
chr3 (2-198)||(13211305-13211501)
chr3 (2-201)||(13248607-13248806)
chr3 (2-199)||(16482491-16482688)
chr3 (2-195)||(17781126-17781319)
chr3 (2-195)||(10579363-10579556)
chr3 (2-199)||(18522665-18522862)
chr3 (2-201)||(15357594-15357793)
chr3 (15-201)||(8490488-8490674)
chr3 (2-199)||(18519980-18520174)
chr3 (2-195)||(19089753-19089946)
chr3 (2-199)||(17200192-17200389)
chr3 (2-182)||(15342227-15342407)
chr3 (2-199)||(13516813-13517010)
chr3 (40-201)||(18640792-18640953)
chr3 (2-195)||(32056908-32057101)
chr3 (9-195)||(1647536-1647726)
chr3 (13-199)||(16200128-16200313)
chr3 (9-201)||(29924971-29925163)
chr3 (9-201)||(29974124-29974316)
chr3 (13-199)||(16200434-16200619)
chr3 (2-194)||(24253396-24253589)
chr3 (2-95)||(17136465-17136558)
chr3 (137-199)||(18534758-18534820)
chr3 (237-293)||(6109972-6110028)
chr3 (237-293)||(8490396-8490452)
chr3 (237-293)||(13248515-13248571)
chr3 (237-293)||(13211211-13211267)
chr3 (237-293)||(18640989-18641045)
chr3 (237-293)||(17136137-17136193)
chr3 (243-293)||(10579603-10579653)
chr3 (237-293)||(15607672-15607729)
chr3 (154-199)||(18510924-18510969)
chr3 (237-293)||(15351237-15351293)
chr3 (237-293)||(15357829-15357885)
chr3 (237-293)||(16482727-16482782)
chr3 (237-293)||(17200427-17200483)
chr3 (237-293)||(18519885-18519941)
chr3 (243-293)||(10572840-10572890)
chr3 (237-294)||(1647768-1647825)
chr3 (237-293)||(15601127-15601184)
chr3 (237-293)||(13516719-13516775)
chr3 (237-293)||(17781358-17781414)
chr3 (237-293)||(19089985-19090041)
chr3 (237-293)||(32057144-32057200)
chr3 (237-293)||(18510829-18510885)
chr3 (237-293)||(18522570-18522626)
chr3 (237-285)||(18534671-18534719)
chr3 (237-293)||(29924879-29924935)
chr3 (237-293)||(29974032-29974088)
[»] scaffold0234 (4 HSPs)
scaffold0234 (2-201)||(2329-2528)
scaffold0234 (2-201)||(11220-11419)
scaffold0234 (237-293)||(2564-2620)
scaffold0234 (237-293)||(11455-11511)
[»] chr4 (47 HSPs)
chr4 (2-201)||(19926768-19926967)
chr4 (2-201)||(26970463-26970662)
chr4 (2-201)||(26963640-26963839)
chr4 (2-201)||(55612683-55612882)
chr4 (2-201)||(868597-868796)
chr4 (2-201)||(5707320-5707519)
chr4 (2-199)||(18262214-18262411)
chr4 (2-201)||(5713948-5714147)
chr4 (2-201)||(10621341-10621540)
chr4 (2-201)||(10628420-10628619)
chr4 (2-199)||(18269070-18269272)
chr4 (2-199)||(28393142-28393339)
chr4 (2-199)||(4426612-4426808)
chr4 (3-189)||(8845215-8845401)
chr4 (3-189)||(8858179-8858365)
chr4 (86-201)||(12357136-12357251)
chr4 (1-193)||(20311299-20311492)
chr4 (1-199)||(5616215-5616415)
chr4 (9-195)||(5668140-5668327)
chr4 (2-195)||(10677563-10677753)
chr4 (2-195)||(10891203-10891393)
chr4 (237-297)||(19927003-19927063)
chr4 (108-195)||(35223576-35223663)
chr4 (237-293)||(5713856-5713912)
chr4 (237-293)||(26963548-26963604)
chr4 (237-293)||(26970371-26970427)
chr4 (237-293)||(5707228-5707284)
chr4 (237-293)||(10621576-10621632)
chr4 (237-293)||(12357044-12357100)
chr4 (237-291)||(868507-868561)
chr4 (237-295)||(17142372-17142430)
chr4 (237-293)||(10628655-10628711)
chr4 (237-293)||(55612594-55612650)
chr4 (239-293)||(28393380-28393434)
chr4 (237-294)||(4426847-4426904)
chr4 (237-293)||(18268976-18269032)
chr4 (85-152)||(39074278-39074346)
chr4 (237-286)||(55992680-55992729)
chr4 (237-278)||(5668371-5668412)
chr4 (237-285)||(8845118-8845166)
chr4 (237-285)||(8858082-8858130)
chr4 (237-277)||(18262136-18262176)
chr4 (92-175)||(21454235-21454319)
chr4 (92-151)||(11161913-11161972)
chr4 (237-291)||(20311207-20311261)
chr4 (2-87)||(35223674-35223759)
chr4 (237-285)||(24699958-24700006)
[»] chr1 (26 HSPs)
chr1 (2-201)||(18252030-18252229)
chr1 (2-201)||(18532522-18532721)
chr1 (2-201)||(27131417-27131616)
chr1 (2-199)||(21171241-21171438)
chr1 (2-199)||(27310585-27310782)
chr1 (2-199)||(16359043-16359240)
chr1 (9-195)||(36816648-36816834)
chr1 (2-201)||(3855927-3856126)
chr1 (9-201)||(22657236-22657429)
chr1 (2-195)||(27277565-27277756)
chr1 (237-296)||(18532757-18532816)
chr1 (237-294)||(18251935-18251992)
chr1 (9-167)||(12006554-12006712)
chr1 (2-167)||(12014292-12014457)
chr1 (237-293)||(27310821-27310877)
chr1 (237-293)||(16359280-16359336)
chr1 (3-189)||(9917927-9918106)
chr1 (237-293)||(21171479-21171535)
chr1 (126-195)||(30720625-30720694)
chr1 (240-285)||(36816881-36816926)
chr1 (237-293)||(3856164-3856220)
chr1 (241-293)||(22657469-22657521)
chr1 (237-293)||(27131652-27131704)
chr1 (94-171)||(3403248-3403325)
chr1 (94-171)||(3443494-3443571)
chr1 (237-293)||(27277800-27277856)
[»] scaffold0220 (2 HSPs)
scaffold0220 (2-201)||(18288-18487)
scaffold0220 (237-293)||(18196-18252)
[»] chr7 (27 HSPs)
chr7 (2-201)||(29327784-29327983)
chr7 (2-201)||(11536070-11536269)
chr7 (2-201)||(11542988-11543187)
chr7 (2-199)||(15152445-15152642)
chr7 (2-199)||(15148144-15148341)
chr7 (2-199)||(18561009-18561206)
chr7 (9-199)||(12750828-12751018)
chr7 (2-195)||(12738542-12738735)
chr7 (9-199)||(18257857-18258047)
chr7 (13-195)||(13392157-13392338)
chr7 (237-295)||(12738441-12738499)
chr7 (237-294)||(2653275-2653332)
chr7 (237-293)||(11543223-11543279)
chr7 (108-195)||(39111819-39111905)
chr7 (9-179)||(2364917-2365086)
chr7 (237-293)||(11536305-11536361)
chr7 (237-293)||(12750733-12750789)
chr7 (237-293)||(15152350-15152406)
chr7 (238-293)||(29327690-29327745)
chr7 (9-168)||(7396221-7396381)
chr7 (237-293)||(15148049-15148105)
chr7 (84-127)||(3132748-3132791)
chr7 (238-293)||(13392030-13392085)
chr7 (86-151)||(10234179-10234244)
chr7 (237-293)||(18258087-18258143)
chr7 (169-201)||(2653207-2653239)
chr7 (237-293)||(18560913-18560969)
[»] chr6 (29 HSPs)
chr6 (2-201)||(27381260-27381459)
chr6 (2-201)||(27471643-27471842)
chr6 (2-199)||(17684477-17684674)
chr6 (2-201)||(29308890-29309089)
chr6 (2-201)||(29315850-29316049)
chr6 (2-199)||(16566328-16566525)
chr6 (2-201)||(17691448-17691647)
chr6 (2-199)||(188985-189182)
chr6 (2-199)||(25537167-25537364)
chr6 (2-199)||(11651725-11651922)
chr6 (11-199)||(13359286-13359474)
chr6 (2-162)||(20553595-20553755)
chr6 (237-291)||(17691683-17691737)
chr6 (237-293)||(27381495-27381551)
chr6 (237-293)||(27471878-27471934)
chr6 (237-293)||(29308798-29308854)
chr6 (237-293)||(29315758-29315814)
chr6 (237-293)||(17684712-17684768)
chr6 (239-293)||(11651630-11651684)
chr6 (237-293)||(25537405-25537461)
chr6 (9-182)||(8509941-8510115)
chr6 (9-178)||(27925772-27925946)
chr6 (139-194)||(31258065-31258120)
chr6 (2-163)||(17850503-17850663)
chr6 (237-285)||(13359512-13359560)
chr6 (237-285)||(16566563-16566611)
chr6 (237-294)||(189221-189281)
chr6 (237-279)||(16394484-16394526)
chr6 (120-185)||(22259925-22259990)
[»] chr2 (10 HSPs)
chr2 (5-201)||(21330259-21330455)
chr2 (2-201)||(18796506-18796705)
chr2 (3-199)||(18619807-18620002)
chr2 (56-195)||(19692598-19692737)
chr2 (9-136)||(20977957-20978084)
chr2 (237-295)||(21330493-21330551)
chr2 (2-167)||(36270199-36270365)
chr2 (9-167)||(18822115-18822275)
chr2 (237-293)||(19692773-19692829)
chr2 (10-165)||(36802664-36802820)
[»] scaffold0390 (4 HSPs)
scaffold0390 (2-201)||(6942-7141)
scaffold0390 (2-201)||(13958-14157)
scaffold0390 (237-293)||(7177-7233)
scaffold0390 (237-293)||(14193-14249)
[»] chr8 (18 HSPs)
chr8 (2-201)||(21940665-21940864)
chr8 (2-199)||(28554885-28555082)
chr8 (2-199)||(22171491-22171686)
chr8 (2-195)||(6094129-6094322)
chr8 (2-195)||(24642655-24642848)
chr8 (68-195)||(24636860-24636987)
chr8 (237-296)||(22070105-22070164)
chr8 (237-293)||(21940573-21940629)
chr8 (237-293)||(6094031-6094087)
chr8 (237-293)||(22171396-22171452)
chr8 (241-293)||(24642556-24642608)
chr8 (237-293)||(28554791-28554847)
chr8 (10-171)||(32872857-32873019)
chr8 (130-189)||(38232512-38232570)
chr8 (122-180)||(2375027-2375085)
chr8 (100-163)||(10920234-10920297)
chr8 (240-293)||(2374947-2375000)
chr8 (256-293)||(24636605-24636642)
[»] scaffold0433 (2 HSPs)
scaffold0433 (2-201)||(7107-7306)
scaffold0433 (237-293)||(7015-7071)
[»] chr5 (20 HSPs)
chr5 (2-201)||(24695474-24695673)
chr5 (2-201)||(18569871-18570070)
chr5 (2-199)||(19714506-19714703)
chr5 (2-195)||(19707226-19707419)
chr5 (13-196)||(27347497-27347679)
chr5 (9-195)||(22547031-22547217)
chr5 (92-201)||(39537962-39538071)
chr5 (16-197)||(17285754-17285935)
chr5 (237-293)||(24695709-24695765)
chr5 (92-195)||(31886537-31886640)
chr5 (237-293)||(19714742-19714798)
chr5 (16-197)||(17298907-17299088)
chr5 (237-293)||(19707462-19707518)
chr5 (237-293)||(27347722-27347778)
chr5 (10-135)||(18807050-18807175)
chr5 (2-88)||(39538701-39538787)
chr5 (85-175)||(33477389-33477479)
chr5 (237-285)||(18570108-18570156)
chr5 (238-293)||(39537870-39537925)
chr5 (83-151)||(11479420-11479489)
[»] scaffold0657 (2 HSPs)
scaffold0657 (2-201)||(993-1192)
scaffold0657 (237-294)||(900-957)
[»] scaffold0186 (2 HSPs)
scaffold0186 (2-201)||(25998-26197)
scaffold0186 (238-293)||(26231-26286)
[»] scaffold0063 (2 HSPs)
scaffold0063 (2-199)||(5531-5728)
scaffold0063 (237-285)||(5444-5492)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (18-199)||(230365-230545)
scaffold0008 (237-293)||(230584-230640)
[»] scaffold0176 (2 HSPs)
scaffold0176 (137-201)||(8446-8510)
scaffold0176 (237-293)||(8546-8602)
[»] scaffold0203 (1 HSPs)
scaffold0203 (237-293)||(23769-23825)
[»] scaffold0326 (2 HSPs)
scaffold0326 (237-293)||(16523-16579)
scaffold0326 (168-201)||(16615-16648)
[»] scaffold0705 (1 HSPs)
scaffold0705 (237-293)||(41-97)
[»] scaffold0637 (1 HSPs)
scaffold0637 (237-293)||(8944-9000)
[»] scaffold0565 (2 HSPs)
scaffold0565 (237-291)||(10202-10256)
scaffold0565 (151-182)||(10127-10158)
[»] scaffold0767 (1 HSPs)
scaffold0767 (257-293)||(1-37)
[»] scaffold0170 (1 HSPs)
scaffold0170 (241-293)||(5878-5930)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (100-172)||(92194-92267)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 196; Significance: 1e-107; HSPs: 53)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 2 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 6110263 - 6110064
Alignment:
Q  2 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaacttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6110263 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggt 6110164  T
Q  102 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6110163 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 6110064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 2 - 201
Target Start/End: Original strand, 10572600 - 10572799
Alignment:
Q  2 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaacttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10572600 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggt 10572699  T
Q  102 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10572700 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 10572799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 2 - 201
Target Start/End: Original strand, 15600892 - 15601091
Alignment:
Q  2 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaacttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15600892 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggt 15600991  T
Q  102 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15600992 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgtcttgt 15601091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 2 - 201
Target Start/End: Original strand, 15607437 - 15607636
Alignment:
Q  2 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaacttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15607437 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggt 15607536  T
Q  102 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15607537 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgtcttgt 15607636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 2 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 13211501 - 13211305
Alignment:
Q  2 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaacttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13211501 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggt 13211402  T
Q  102 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13211401 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 13211305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 2 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 13248806 - 13248607
Alignment:
Q  2 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaacttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13248806 tctacctacataatagtctctatgctttaatgttatcccacttctcaacaaagcttgactacgaatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggt 13248707  T
Q  102 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13248706 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 13248607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 199
Target Start/End: Original strand, 16482491 - 16482688
Alignment:
Q  2 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaacttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16482491 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagagtagtttccttatgtttaatggggt 16482590  T
Q  102 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16482591 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 16482688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 195
Target Start/End: Original strand, 17781126 - 17781319
Alignment:
Q  2 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaacttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17781126 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggt 17781225  T
Q  102 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17781226 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 17781319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 2 - 195
Target Start/End: Original strand, 10579363 - 10579556
Alignment:
Q  2 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaacttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10579363 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggt 10579462  T
Q  102 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10579463 ctcacaattaagttatacttaatgttccatttaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 10579556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 2 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 18522862 - 18522665
Alignment:
Q  2 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaacttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18522862 tctacctacataatagtctctatgcttaaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttaagaatagtttccttatgtttaatggggt 18522763  T
Q  102 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18522762 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 18522665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 2 - 201
Target Start/End: Original strand, 15357594 - 15357793
Alignment:
Q  2 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaacttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15357594 tctacctacataatagtctctatgttttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaataggttccttatgtttaatggggt 15357693  T
Q  102 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15357694 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactaatctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgtcttgt 15357793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 15 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 8490674 - 8490488
Alignment:
Q  15 tagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaacttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaattaagt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490674 tagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacagatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaattaagt 8490575  T
Q  115 tatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 201  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490574 tatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 8490488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 2 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 18520174 - 18519980
Alignment:
Q  2 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaacttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||   || |||||||||||||||||||||| |||||    
T  18520174 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggat---ttaagaatagtttccttatgtttaacggggt 18520078  T
Q  102 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18520077 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 18519980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 2 - 195
Target Start/End: Original strand, 19089753 - 19089946
Alignment:
Q  2 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaacttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||    
T  19089753 tctacctacataatagtctctatgatttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttaagaatagtttcattatgtttaaaggggt 19089852  T
Q  102 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19089853 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactaatctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 19089946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 2 - 199
Target Start/End: Original strand, 17200192 - 17200389
Alignment:
Q  2 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaacttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggt 101  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||    
T  17200192 tctacccacataatagtctctatgctttaatgatatcacacatctcaataaagcttaactacggatactttaagaatagtttcattatgtttaaaggggt 17200291  T
Q  102 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 199  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17200292 atcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 17200389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 2 - 182
Target Start/End: Original strand, 15342227 - 15342407
Alignment:
Q  2 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaacttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15342227 tctacctacataatagtctctatgttttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaataggttccttatgtttaatggggt 15342326  T
Q  102 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaat 182  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15342327 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacgaacaaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaat 15342407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 2 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 13517010 - 13516813
Alignment:
Q  2 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaacttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggt 101  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||    
T  13517010 tctacccacataatagtctctgtgctttaatgatatcctacttctcaataaagcttgactacagatactttaagaatcgtttccttatgtttaacggggt 13516911  T
Q  102 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13516910 ctcacaattaagttatacttaatgttccatgaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 13516813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 40 - 201
Target Start/End: Original strand, 18640792 - 18640953
Alignment:
Q  40 cacttctcaacaaaacttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacgga 139  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18640792 cacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaatgga 18640891  T
Q  140 ctaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18640892 ctaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 18640953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 2 - 195
Target Start/End: Original strand, 32056908 - 32057101
Alignment:
Q  2 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaacttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggt 101  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||    
T  32056908 tctacccacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagtttgactacggacactttaagaatagtttctttatgtttaacggggt 32057007  T
Q  102 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 195  Q
    || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32057008 cttacaataaagttatacttgatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 32057101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 9 - 195
Target Start/End: Original strand, 1647536 - 1647726
Alignment:
Q  9 acataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaacttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1647536 acataatagtctctatgctttaattatatcccttttctcaataaagcttgattacggatactttaaaaatagtttccttatgtttaacggggtctcacaa 1647635  T
Q  109 ttaagtta----tacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 195  Q
    ||||||||    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1647636 ttaagttaattatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 1647726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 13 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 16200313 - 16200128
Alignment:
Q  13 aatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaacttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaattaa 112  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16200313 aatagtctccatgctttaatgatatcccacttcacaataaatcttgactacgaatactttaagaataatgtccttatgtttaatggggtctcacaattaa 16200214  T
Q  113 gttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 199  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||    
T  16200213 gttatacataatgttccattaaacgaactaactattctaaggactttattattttgaaacaaaataaaa-caacgaagaaatgcctt 16200128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 9 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 29925163 - 29924971
Alignment:
Q  9 acataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaacttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaa 108  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||||  ||| ||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||    
T  29925163 acataatagcctccatgctttaatgatatctcacttcacaataaagcttgactacatatattttaagaataatgtccttatatttaatggggtctcacaa 29925064  T
Q  109 ttaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 201  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29925063 ttaaattatacttaataatccattaaacggactaactattttaggggctttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgtcttgt 29924971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 9 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 29974316 - 29974124
Alignment:
Q  9 acataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaacttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaa 108  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||||  ||| ||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||    
T  29974316 acataatagcctccatgctttaatgatatctcacttcacaataaagcttgactacatatattttaagaataatgtccttatatttaatggggtctcacaa 29974217  T
Q  109 ttaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 201  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29974216 ttaaattatacttaataatccattaaacggactaactattttaggggctttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgtcttgt 29974124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 13 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 16200619 - 16200434
Alignment:
Q  13 aatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaacttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaattaa 112  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  16200619 aatagtcttcatgctttaatgacatcccacttcacaataaatcttgactacgaatactttaagaataatgtccttatgtttattggagtctcacaattaa 16200520  T
Q  113 gttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 199  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||    
T  16200519 gttatacataatgttccattaaacggactaactattctaaggactttattattttgaaacaaaataaaa-caacgaagaaatgcctt 16200434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 194
Target Start/End: Original strand, 24253396 - 24253589
Alignment:
Q  2 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaacttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg- 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| || | |||||  ||| |||  ||||| ||  ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||     
T  24253396 tctaccgacataatagtctctatgctttaatgttacctcactttacaataaattttgaccacatatactttaagaatagtgtccttatgtttgatgggga 24253495  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaat 194  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| || | |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  24253496 tctcacgattaagtcatacttaatgttccatcaaacgaacgagctattctaaggactttattattttgaagtaaaacaaaatcaataaagaaat 24253589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 2 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 17136558 - 17136465
Alignment:
Q  2 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaacttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaa 95  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17136558 tctacccacataatagtctctatgttttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttaagaatagtttccttatgtttaa 17136465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 137 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 18534820 - 18534758
Alignment:
Q  137 ggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 199  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18534820 ggactaactattctatggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 18534758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 6110028 - 6109972
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6110028 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 6109972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 8490452 - 8490396
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490452 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 8490396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 13248571 - 13248515
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13248571 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 13248515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 13211267 - 13211211
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13211267 catgatacaaaaccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 13211211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 18640989 - 18641045
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18640989 catgatacaaagccaaacacaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 18641045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 17136193 - 17136137
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17136193 catgatacaaagccaaactcaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 17136137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 243 - 293
Target Start/End: Original strand, 10579603 - 10579653
Alignment:
Q  243 acaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10579603 acaaagtcaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 10579653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 15607672 - 15607729
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaa-tatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15607672 catgatacaaagccaaacccaataaaatatagattggctattagggcttattccaaca 15607729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 154 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 18510969 - 18510924
Alignment:
Q  154 gactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18510969 gactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 18510924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 15351237 - 15351293
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15351237 catgatacaaagccaaaatcaatcattatagattggctattagggcttattccaaca 15351293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 15357829 - 15357885
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15357829 catgatacaaagccaaaatcaatcattatagattggctattagggcttattccaaca 15357885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 16482727 - 16482782
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  16482727 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattgg-tattagggcttattctaaca 16482782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 17200427 - 17200483
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17200427 catgctacaaagccaaacccaatcaacatagattggctattagggcttactccaaca 17200483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 18519941 - 18519885
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  18519941 catgatacaaaaccaaacccaatcaatatagattggctattaggacttactccaaca 18519885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 243 - 293
Target Start/End: Original strand, 10572840 - 10572890
Alignment:
Q  243 acaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10572840 acaaagtcaaacccaatcaatataggttggctattagggcttattccaaca 10572890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 237 - 294
Target Start/End: Original strand, 1647768 - 1647825
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacat 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||    
T  1647768 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagaccagctattagggcttactccaacat 1647825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 15601127 - 15601184
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaa-tatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15601127 catgatacaaatccaaacccaataaaatatagattggctattagggcttattccaaca 15601184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 13516775 - 13516719
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13516775 catgatacacagccaaactcaatcaacatagattggctattagggcttactccaaca 13516719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 17781358 - 17781414
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17781358 catgatataaaaccaaactcaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 17781414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 19089985 - 19090041
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19089985 catgatataaaaccaaactcaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 19090041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 32057144 - 32057200
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  32057144 catgatacaaagtcaaacccaatcaacatagattggctattagagcttactccaaca 32057200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 18510885 - 18510829
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  18510885 catgatacaaaatcaaactcaatcaatatagattggatattagggcttactccaaca 18510829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 18522626 - 18522570
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  18522626 catgatacaaaatcaaactcaatcaatatagattggatattagggcttactccaaca 18522570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 237 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 18534719 - 18534671
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggctta 285  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18534719 catgatacaaaaccaaactcaatcaatatagattgactattagggctta 18534671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 29924935 - 29924879
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||||||| | ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||    
T  29924935 catgatacaatgtcaaactcaatcaatatagatcgactattagggcttactccaaca 29924879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 29974088 - 29974032
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||||||| | ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||    
T  29974088 catgatacaatgtcaaactcaatcaatatagatcgactattagggcttactccaaca 29974032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 4)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 2 - 201
Target Start/End: Original strand, 2329 - 2528
Alignment:
Q  2 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaacttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2329 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggt 2428  T
Q  102 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2429 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 2528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #2
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 2 - 201
Target Start/End: Original strand, 11220 - 11419
Alignment:
Q  2 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaacttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11220 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggt 11319  T
Q  102 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11320 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 11419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 2564 - 2620
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2564 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 2620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #4
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 11455 - 11511
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11455 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 11511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 47)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 2 - 201
Target Start/End: Original strand, 19926768 - 19926967
Alignment:
Q  2 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaacttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19926768 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggt 19926867  T
Q  102 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19926868 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 19926967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 2 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 26970662 - 26970463
Alignment:
Q  2 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaacttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26970662 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaatcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggt 26970563  T
Q  102 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26970562 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 26970463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 2 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 26963839 - 26963640
Alignment:
Q  2 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaacttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26963839 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaatcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggt 26963740  T
Q  102 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 201  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26963739 ctcacaattaagttatatttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 26963640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 2 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 55612882 - 55612683
Alignment:
Q  2 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaacttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  55612882 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagagtagtttccttatgtttaatggggt 55612783  T
Q  102 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55612782 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 55612683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 2 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 868796 - 868597
Alignment:
Q  2 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaacttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  868796 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaacggggt 868697  T
Q  102 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  868696 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaatggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgtcttgt 868597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 2 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 5707519 - 5707320
Alignment:
Q  2 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaacttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5707519 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggt 5707420  T
Q  102 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5707419 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaatggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 5707320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 2 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 18262411 - 18262214
Alignment:
Q  2 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaacttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18262411 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcatcaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaacggggt 18262312  T
Q  102 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18262311 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacgaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 18262214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 2 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 5714147 - 5713948
Alignment:
Q  2 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaacttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5714147 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggt 5714048  T
Q  102 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5714047 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaatgggctaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 5713948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 2 - 201
Target Start/End: Original strand, 10621341 - 10621540
Alignment:
Q  2 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaacttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10621341 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggct 10621440  T
Q  102 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621441 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattccagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 10621540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 2 - 201
Target Start/End: Original strand, 10628420 - 10628619
Alignment:
Q  2 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaacttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10628420 tctacctacataatagtctctatgctttaataatatcccacttctcaataaagcttgactacagatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggct 10628519  T
Q  102 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10628520 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattccagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 10628619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 2 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 18269272 - 18269070
Alignment:
Q  2 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaacttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18269272 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcatcaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaacggggt 18269173  T
Q  102 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaac-----aaaatcaataaagaaatgc 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||    
T  18269172 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgc 18269073  T
Q  197 ctt 199  Q
    |||    
T  18269072 ctt 18269070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 2 - 199
Target Start/End: Original strand, 28393142 - 28393339
Alignment:
Q  2 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaacttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggt 101  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28393142 tctacccacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatactttaagaatagtttccttatgtttaatggggt 28393241  T
Q  102 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28393242 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattttagggactttattattttgaaacaaatcaaaatcaataaagaaatgcctt 28393339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 2 - 199
Target Start/End: Original strand, 4426612 - 4426808
Alignment:
Q  2 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaacttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggt 101  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||    
T  4426612 tctacccacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttaagaatagtt-ccttatgtttaacggggt 4426710  T
Q  102 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4426711 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaaggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 4426808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 8845401 - 8845215
Alignment:
Q  3 ctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaacttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtc 102  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  8845401 ctacccacataatagtctctatgctttaatgatatccgacttctcaataaagcttgactacggatactttaagaatagtttccttatgtttaacgggatc 8845302  T
Q  103 tcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaa 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8845301 tcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaa 8845215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 8858365 - 8858179
Alignment:
Q  3 ctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaacttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtc 102  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  8858365 ctacccacataatagtctctatgctttaatgatatccgacttctcaataaagcttgactacggatactttaagaatagtttccttatgtttaacgggatc 8858266  T
Q  103 tcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaa 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8858265 tcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaa 8858179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 86 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 12357251 - 12357136
Alignment:
Q  86 ttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaa 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12357251 ttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaa 12357152  T
Q  186 taaagaaatgccttgt 201  Q
    ||||||||||||||||    
T  12357151 taaagaaatgccttgt 12357136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 20311492 - 20311299
Alignment:
Q  1 atctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaacttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| |||||| ||  ||||||| | || ||| ||||||||||||||||||    
T  20311492 atctacccacaaaatagtctctatgctttaatgatatctcacttcacaataaagcttgacaacaaatactttaaaaacagtgtccttatgtttaatgggg 20311393  T
Q  101 tctcacaattaagttata-cttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 193  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||  | |||||||| || | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20311392 tctcacaattaagttataccttaatgctccattgaacatattaactattataagtactttattattttaaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 20311299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 5616415 - 5616215
Alignment:
Q  1 atctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaac--ttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgg 98  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||| |||  || |||||  ||||| ||||||||||| |||||| | ||||   |||||| ||    
T  5616415 atctacatacataatagtctcaatgctttattaatatcccaattcataataaaacctttgacaacggatactttaagaataatgtcctctagtttaacgg 5616316  T
Q  99 ggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 198  Q
    | |||||  ||| ||| | |||||||||||||  |||  |||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5616315 gatctcatgatttagtcagacttaatgttccaagaaatagactaattattttaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatgaataaagaaatgcct 5616216  T
Q  199 t 199  Q
    |    
T  5616215 t 5616215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 195
Target Start/End: Original strand, 5668140 - 5668327
Alignment:
Q  9 acataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaacttgactacggata--ctttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcac 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||| |  ||| ||| ||| |||||||||  |||  |||| |||||| | |||||   ||||||||| ||||||    
T  5668140 acataatagtctctatgatttaatgttatctcttttcacaataaagcttgactacaaatatactttaagaataatgtcctttcatttaatggg-tctcac 5668238  T
Q  107 aattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 195  Q
     ||||| | | |||||||| |||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5668239 gattaaatcacacttaatgctccattaaatagactaattattctagagactttattattttgaaacaaaacaaaatcaacaaagaaatg 5668327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 2 - 195
Target Start/End: Original strand, 10677563 - 10677753
Alignment:
Q  2 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaacttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggt 101  Q
    |||||| |||||||||||| ||| |||||||| |||| || ||| | |  || |||||||||||||||||| |||||| | || ||  |||||||||| |    
T  10677563 tctacccacataatagtctatatactttaatgttatctcatttcacta--aagcttgactacggatactttaagaataatatcatttcgtttaatggg-t 10677659  T
Q  102 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 195  Q
    ||| | ||||||| |||||||||| ||||||| || |||||| |||| ||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  10677660 ctcgcgattaagtcatacttaatgctccattatacagactaattattttaggggctttattttattgaaacaaaagaaaatcaataaaaaaatg 10677753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 2 - 195
Target Start/End: Original strand, 10891203 - 10891393
Alignment:
Q  2 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaacttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggt 101  Q
    |||||| |||||||||||| ||| |||||||| |||| || ||| | |  || |||||||||||||||||| |||||| | || ||  |||||||||| |    
T  10891203 tctacccacataatagtctatatactttaatgttatctcatttcacta--aagcttgactacggatactttaagaataatatcatttcgtttaatggg-t 10891299  T
Q  102 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 195  Q
    ||| | ||||||| |||||||||| ||||||| || |||||| |||| ||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  10891300 ctcgcgattaagtcatacttaatgctccattatacagactaattattttaggggctttattttattgaaacaaaagaaaatcaataaaaaaatg 10891393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 237 - 297
Target Start/End: Original strand, 19927003 - 19927063
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacatatt 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19927003 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacatatt 19927063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 108 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 35223663 - 35223576
Alignment:
Q  108 attaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 195  Q
    ||||||| | |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  35223663 attaagtcacacttaatgctccattaaacagactaattattctagggactttattattttaaaacaaaacaaaatcaacaaagaaatg 35223576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 5713912 - 5713856
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5713912 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 5713856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 26963604 - 26963548
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26963604 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 26963548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 26970427 - 26970371
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26970427 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 26970371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 5707284 - 5707228
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5707284 catgatacaaagccaaacacaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 5707228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 10621576 - 10621632
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621576 catgatacaaagccaaaaccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 10621632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 12357100 - 12357044
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12357100 catgatacaaagccaaatccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 12357044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 237 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 868561 - 868507
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaa 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  868561 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggtttattccaa 868507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 237 - 295
Target Start/End: Original strand, 17142372 - 17142430
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacata 295  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17142372 catgatacaaagtcaaacccaatcaatatagattggctattagggctttttccaacata 17142430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 10628655 - 10628711
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10628655 catgatacaaagtcaaaaccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 10628711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 55612650 - 55612594
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  55612650 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggttattagggcttattctaaca 55612594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 239 - 293
Target Start/End: Original strand, 28393380 - 28393434
Alignment:
Q  239 tgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28393380 tgatacaaagtcaaacccaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 28393434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 237 - 294
Target Start/End: Original strand, 4426847 - 4426904
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacat 294  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  4426847 catgatacagagccaaacccaatcaatatagattggctattaggacttactccaacat 4426904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 18269032 - 18268976
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18269032 catgatacaaagccaaacccattcaacatagattggctatttgggcttattccaaca 18268976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 152
Target Start/End: Original strand, 39074278 - 39074346
Alignment:
Q  85 cttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttcca-ttaaacggactaactattctag 152  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||    
T  39074278 cttatgtttaatggggtctcatgattaagtcatacttaatgttcaatttaaacggactaattattctag 39074346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 55992729 - 55992680
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttat 286  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  55992729 catgatacaaagtcaaacccaatcaatacaaattggctattagggcttat 55992680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Original strand, 5668371 - 5668412
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctatta 278  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5668371 catgatacaaaaccaaacacaatcaatatagattggctatta 5668412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 8845166 - 8845118
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggctta 285  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  8845166 catgatacaaagtcaaactcaatcaacatagattggctattaggactta 8845118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 8858130 - 8858082
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggctta 285  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  8858130 catgatacaaagtcaaactcaatcaacatagattggctattaggactta 8858082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 18262176 - 18262136
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctatt 277  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  18262176 catgatacaaagccaaacccattcaacatagattggctatt 18262136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 175
Target Start/End: Original strand, 21454235 - 21454319
Alignment:
Q  92 ttaatggggtctcacaattaagttatactt-aatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaa 175  Q
    ||||||||||||||  ||||||| | | || ||||||||||||| |  ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  21454235 ttaatggggtctcaatattaagtcacattttaatgttccattaatcaaactaactattctaagaactttattactttgaaacaaa 21454319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 92 - 151
Target Start/End: Original strand, 11161913 - 11161972
Alignment:
Q  92 ttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattcta 151  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||| || |||||||||||    
T  11161913 ttaatggagtctcacaattaagtcacactttgtgttccattaaactgattaactattcta 11161972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 237 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 20311261 - 20311207
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaa 291  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||  ||||| |||||    
T  20311261 catgatacaaagccaaatccaatgaatacagattggctattacagcttactccaa 20311207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 35223759 - 35223674
Alignment:
Q  2 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaacttgactacggatactttgagaatagtttcctt 87  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||   ||  ||| ||| |||||||||| ||||||| |||||| | |||||    
T  35223759 tctacccacataatagtctatatgctttaatgttatccttttttacaataaagcttgactacgaatactttaagaataatgtcctt 35223674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 24700006 - 24699958
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggctta 285  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  24700006 catgatacaaaaccaaattcaatcaatatagattggttattcgggctta 24699958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 26)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 2 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 18252229 - 18252030
Alignment:
Q  2 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaacttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18252229 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggt 18252130  T
Q  102 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18252129 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 18252030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 2 - 201
Target Start/End: Original strand, 18532522 - 18532721
Alignment:
Q  2 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaacttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggt 101  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18532522 tctatctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggt 18532621  T
Q  102 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18532622 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacgaactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 18532721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 2 - 201
Target Start/End: Original strand, 27131417 - 27131616
Alignment:
Q  2 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaacttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggt 101  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27131417 tctacctacataatagtctttatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacaaatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggt 27131516  T
Q  102 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27131517 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 27131616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 2 - 199
Target Start/End: Original strand, 21171241 - 21171438
Alignment:
Q  2 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaacttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggt 101  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||    
T  21171241 tctacccacataatagtctttatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttaagaatagtttccttatgttcaacggggt 21171340  T
Q  102 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 199  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21171341 ctcacaattaagttatatttaatgttccatgaaacggactaactattctaaggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 21171438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 2 - 199
Target Start/End: Original strand, 27310585 - 27310782
Alignment:
Q  2 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaacttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggt 101  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || | |||    
T  27310585 tctacccacataatagtctctatgctttaatgatattccacttctcaataaagcttgactactgatactttaagaatagtttccttatgttcaacgtggt 27310684  T
Q  102 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27310685 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaaggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 27310782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 2 - 199
Target Start/End: Original strand, 16359043 - 16359240
Alignment:
Q  2 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaacttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggt 101  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  16359043 tctacccacataatagtctctatgctttaatgatattccatttctcaataaagcttgactagggttactttaagaatagtttccttatgtttaacggggt 16359142  T
Q  102 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 199  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16359143 ctcacaattaagttattcttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 16359240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 9 - 195
Target Start/End: Original strand, 36816648 - 36816834
Alignment:
Q  9 acataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaacttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||| | ||||||||||||| || |||||||||    
T  36816648 acataatagtctctatgctttaatggtatcccacttctcaataaagcttgactatggatactttaagaataatgtccttatgtttaacggagtctcacaa 36816747  T
Q  109 ttaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 195  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36816748 ttaatttatacttaatgttccattaaacagacgaactattctagggacttcattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 36816834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 2 - 201
Target Start/End: Original strand, 3855927 - 3856126
Alignment:
Q  2 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaacttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggt 101  Q
    |||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||  ||||||||  ||| ||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  3855927 tctacccacgtaatagtctccatgctttaataatatcccacttcacaataaagtttgactacaaatattttaagaataatgtccttatgtttaatggggt 3856026  T
Q  102 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  3856027 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacgggctaactattctagggactttgttattttgaaacaaaacaaaataaacaaagaaatgccttgt 3856126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 9 - 201
Target Start/End: Original strand, 22657236 - 22657429
Alignment:
Q  9 acataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaacttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaa 108  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||  || ||| ||||||||  || ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||    
T  22657236 acatgatagtctctatgctttaatgatatctcatttcagaataaagcttgactagagacactttaagaattgtgtccttatgtttaaaggggtctcacaa 22657335  T
Q  109 ttaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaac-aaaatcaataaagaaatgccttgt 201  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  22657336 ttaagttatatttaatgttccattaaacagactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaaatcaataaagaaatgtcttgt 22657429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 2 - 195
Target Start/End: Original strand, 27277565 - 27277756
Alignment:
Q  2 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaacttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggt 101  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||| ||| | |||||||||||||||| |||||| | || ||  | ||||  || |    
T  27277565 tctacccacataatagtctctatgctttaatgttatcccttttcacaataaagcctgactacggatactttaagaataatgtcatttcggttaaaagg-t 27277663  T
Q  102 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 195  Q
    ||| | ||||||| | ||| |||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  27277664 ctcgcgattaagtcacact-aatgctccgttaaatggactaattattctagggacgttattattttgaaacaaaacaaaaacaacaaagaaatg 27277756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 237 - 296
Target Start/End: Original strand, 18532757 - 18532816
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacatat 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18532757 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacatat 18532816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 237 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 18251992 - 18251935
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacat 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18251992 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacat 18251935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 167
Target Start/End: Original strand, 12006554 - 12006712
Alignment:
Q  9 acataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaacttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaa 108  Q
    |||||| | |||||| | ||||||| |||||| |||| ||  ||  |||||||||| ||  ||| | |||| | ||||||||||| |||||||||||| |    
T  12006554 acataacaatctctaagttttaatgttatccctcttcacactaaggcttgactacgaatgttttaataataatgtccttatgtttcatggggtctcacga 12006653  T
Q  109 ttaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattatttt 167  Q
    |||||  | ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12006654 ttaaggcacacttaatattccattaaatagactaactattctagggactttattatttt 12006712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 167
Target Start/End: Original strand, 12014292 - 12014457
Alignment:
Q  2 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaacttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggt 101  Q
    |||||| ||||||| |||| || ||||||||  |||||| |||| ||  ||| ||| |||||||||  ||| ||||||   || |||||||||||||| |    
T  12014292 tctacccacataatggtctttacgctttaatcgtatccctcttcacactaaagcttaactacggatgttttaagaataacatcattatgtttaatgggat 12014391  T
Q  102 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattatttt 167  Q
    || || ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  12014392 ctaacgattaatttacacttaatattccattaaacggactatgtattctagtgactttattatttt 12014457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 27310821 - 27310877
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27310821 catgatacaaagccaaactcaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 27310877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 16359280 - 16359336
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16359280 catgatacaaatcctaacccaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 16359336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Original strand, 9917927 - 9918106
Alignment:
Q  3 ctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaacttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtc 102  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| |||| ||||||||||  ||| ||| ||| ||||  |||| ||| |||||| | ||||||| ||||||||  ||    
T  9917927 ctaccgacatagtattctctatgcttcaatgctatcccacttaacaataaagcttaactatagatattttaagaataatgtccttatatttaatgga-tc 9918025  T
Q  103 tcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaa 189  Q
    ||   || |||||||||||||||||| |||||||  |||||       || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9918026 tcgtgatcaagttatacttaatgttcgattaaacaaactaa------aagtgactttattattttgtaacaaaacaaaatcaataaa 9918106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 21171479 - 21171535
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  21171479 catgatacaaagccaaactcaatccatatagattggctattagagcttactccaaca 21171535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 195
Target Start/End: Original strand, 30720625 - 30720694
Alignment:
Q  126 ttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 195  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||    
T  30720625 ttccattaaacgaactaattattccaggaactttattattttaaaacaaaataaaaccaataaaaaaatg 30720694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 240 - 285
Target Start/End: Original strand, 36816881 - 36816926
Alignment:
Q  240 gatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggctta 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  36816881 gatacaaagccaaacccaatcaatatagattgaatattagggctta 36816926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 3856164 - 3856220
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||| || |||||||    
T  3856164 catgatacaaagtcaaacccaatcaagatggattggctattagggcctactccaaca 3856220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 241 - 293
Target Start/End: Original strand, 22657469 - 22657521
Alignment:
Q  241 atacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||    
T  22657469 atacaaagccaaactcaatcaatatatattggctattaaggcttactccaaca 22657521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 27131652 - 27131704
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    ||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27131652 catgatacaaagccaaacccaac----atagattggctattagggcttattccaaca 27131704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 94 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 3403325 - 3403248
Alignment:
Q  94 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaa 171  Q
    |||| ||||||||| |||||| | ||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||  |||||||||| |||||||    
T  3403325 aatgtggtctcacatttaagtcacacttaatattccattaatcagactaactattttatagactttattactttgaaa 3403248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 94 - 171
Target Start/End: Original strand, 3443494 - 3443571
Alignment:
Q  94 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaa 171  Q
    |||| ||||||||| |||||| | ||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||  |||||||||| |||||||    
T  3443494 aatgtggtctcacatttaagtcacacttaatattccattaatcagactaactattttatagactttattactttgaaa 3443571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 27277800 - 27277856
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27277800 catgatacaaagtcaaacataattaacatagattggctattagggcttactccaaca 27277856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 2)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 2 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 18487 - 18288
Alignment:
Q  2 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaacttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18487 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggt 18388  T
Q  102 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18387 ctcacaattaagttatacttaatgttcaattaaatggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 18288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 18252 - 18196
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18252 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 18196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 27)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 2 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 29327983 - 29327784
Alignment:
Q  2 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaacttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29327983 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggt 29327884  T
Q  102 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29327883 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaactgactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 29327784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 2 - 201
Target Start/End: Original strand, 11536070 - 11536269
Alignment:
Q  2 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaacttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11536070 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaataggttccttatgtttaatggggt 11536169  T
Q  102 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 201  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11536170 ctcacaattaagttgtacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 11536269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 2 - 201
Target Start/End: Original strand, 11542988 - 11543187
Alignment:
Q  2 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaacttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11542988 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaataggttccttatgtttaatggggt 11543087  T
Q  102 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 201  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11543088 ctgacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcattgt 11543187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 2 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 15152642 - 15152445
Alignment:
Q  2 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaacttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||    
T  15152642 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttaagaatagtttccgtatgtttaacggggt 15152543  T
Q  102 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15152542 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaactcaataaagaaatgcctt 15152445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 2 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 15148341 - 15148144
Alignment:
Q  2 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaacttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  15148341 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatactttaagaatagtttccttatgtttaacggggt 15148242  T
Q  102 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15148241 ctcacaattaagttatacttaatgttcaatcaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaactcaataaagaaatgcctt 15148144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 2 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 18561206 - 18561009
Alignment:
Q  2 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaacttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggt 101  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  18561206 tctacccacataatagtctctatgctttaatgatatcccacctctcaataaagcttgactacagatactttaagaatagtttcctaatgtttaacggggt 18561107  T
Q  102 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 199  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18561106 ctcacagttaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 18561009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 9 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 12751018 - 12750828
Alignment:
Q  9 acataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaacttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  12751018 acataatagtctctatgctttaatgatatccaacttctcaataaagcttgactacggatactttaagaatagtttctttatgtttaacgaggtctcacaa 12750919  T
Q  109 ttaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 199  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12750918 ttaagttatacttaatgtttcattaaacggactaactattctagggactttattactttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 12750828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 12738735 - 12738542
Alignment:
Q  2 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaacttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggt 101  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||   |||    
T  12738735 tctacccacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatactttaagaatagtttccttatgtttaacaaggt 12738636  T
Q  102 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 195  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12738635 ctcacaattaagttataattaatgtttcattaaacaaactaactattctagggactttattattttgaaacaaaataaaatcaataaagaaatg 12738542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 9 - 199
Target Start/End: Original strand, 18257857 - 18258047
Alignment:
Q  9 acataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaacttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaa 108  Q
    |||||||||||| ||||| ||| || ||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  18257857 acataatagtctttatgcattattgttatcctacttaacaaaaaaacttgactacggatactttaagaataatgtccttgtgtttaatggggtctcacaa 18257956  T
Q  109 ttaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 199  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18257957 ttaagtcatacttaatgttccattaaacagactaattattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 18258047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 13392338 - 13392157
Alignment:
Q  13 aatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaacttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaattaa 112  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||  ||| ||| |||  |||||||  |||||||| |||||| | |||||   ||||||||| |||||| |||||    
T  13392338 aatagtctctatgttttaatgttatcccttttcacaataaagtttgactattgatactttaagaataatgtcctttcatttaatggg-tctcacgattaa 13392240  T
Q  113 gttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 195  Q
    || | |||||||| |||||||| | |||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  13392239 gtcacacttaatgctccattaagcagactaattgttctaggaactttattattttgaaacaaaacaaagtcaacaaagaaatg 13392157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 237 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 12738499 - 12738441
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacata 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12738499 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttactccaacata 12738441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 237 - 294
Target Start/End: Original strand, 2653275 - 2653332
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacat 294  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2653275 catgatacaaagccaatcccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacat 2653332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 11543223 - 11543279
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11543223 catgatacaaagccaaaaccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 11543279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 108 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 39111905 - 39111819
Alignment:
Q  108 attaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 195  Q
    |||||||  ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  39111905 attaagtcgtacttaatgtttcattaaacggactcgctattctagggactttatt-ttttgaaataaaacaaaattaataaagaaatg 39111819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 9 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 2365086 - 2364917
Alignment:
Q  9 acataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaacttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaa 108  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| |||| || ||| ||| ||   ||||||||| ||| ||| |||||| | || ||  |||||||||| |||||| |    
T  2365086 acatgatagtctctatgttttaatgttatctcatttcacaataagg-ttgactacgaatattttaagaataatgtcatttagtttaatgggttctcacga 2364988  T
Q  109 ttaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 179  Q
    |||||  | |||||||||||||||| |  |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  2364987 ttaagccacacttaatgttccattagaaagactaattattctagagactttattattttgaaacataacaa 2364917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 11536305 - 11536361
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11536305 catgatacaaagccaaaaccaatcaatatagagtggctattagggcttattccaaca 11536361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 12750789 - 12750733
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  12750789 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattagctattagggcttactccaaca 12750733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 15152406 - 15152350
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15152406 catgatacaaaaccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 15152350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 238 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 29327745 - 29327690
Alignment:
Q  238 atgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29327745 atgatacaaaaccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 29327690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 7396381 - 7396221
Alignment:
Q  9 acataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaacttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||  | ||| ||  ||  |||||||||  ||  ||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||  |    
T  7396381 acataatagtctctatgctttaatatcatcgtatttcacactaaggcttgactacatatgttttaagaataattttcttatgtttaatagggtctcaaga 7396282  T
Q  109 ttaagttatacttaatgttcca-ttaaacggactaactattctagggactttattattttg 168  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||| || ||||||||    
T  7396281 ttaagtcatacttaatgttccatttaaatgaactaactattctagcgacatttttattttg 7396221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 15148105 - 15148049
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15148105 catgatacaaaaccaaacccaattaatatagattggctattagggcttactccaaca 15148049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 84 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 3132791 - 3132748
Alignment:
Q  84 ccttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgtt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3132791 ccttatgtttaatggggtctcacaattaagttacacttaatgtt 3132748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 238 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 13392085 - 13392030
Alignment:
Q  238 atgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  13392085 atgatacaaagtcaaacacaatcaatatagattggatattagggcttactccaaca 13392030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 10234244 - 10234179
Alignment:
Q  86 ttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattcta 151  Q
    |||||||||||||  |||||  ||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  10234244 ttatgtttaatggaatctcatgattaagttatatttaatggttcattaaacggactaactattcta 10234179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 18258087 - 18258143
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  18258087 catgatacaaggccaaaaccaatcaatctagattggctatcagggcttactccaaca 18258143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 201
Target Start/End: Original strand, 2653207 - 2653239
Alignment:
Q  169 aaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2653207 aaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 2653239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 18560969 - 18560913
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || | |||||||| |||||||    
T  18560969 catgatacaaagccaagcccaatcaacatagattgcctttaagggcttactccaaca 18560913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 29)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 2 - 201
Target Start/End: Original strand, 27381260 - 27381459
Alignment:
Q  2 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaacttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27381260 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactatggatactttgagaatagtttccatatgtttaatggggt 27381359  T
Q  102 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27381360 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 27381459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 2 - 201
Target Start/End: Original strand, 27471643 - 27471842
Alignment:
Q  2 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaacttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27471643 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactatggatactttgagaatagtttccatatgtttaatggggt 27471742  T
Q  102 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471743 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 27471842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 199
Target Start/End: Original strand, 17684477 - 17684674
Alignment:
Q  2 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaacttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17684477 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcatcaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaacggggt 17684576  T
Q  102 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17684577 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 17684674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 2 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 29309089 - 29308890
Alignment:
Q  2 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaacttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29309089 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggct 29308990  T
Q  102 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29308989 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaatggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 29308890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 2 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 29316049 - 29315850
Alignment:
Q  2 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaacttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29316049 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggct 29315950  T
Q  102 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29315949 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaatggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 29315850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 2 - 199
Target Start/End: Original strand, 16566328 - 16566525
Alignment:
Q  2 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaacttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  16566328 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttaagaatagtttccttatgtttaacggggt 16566427  T
Q  102 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16566428 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 16566525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 2 - 201
Target Start/End: Original strand, 17691448 - 17691647
Alignment:
Q  2 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaacttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggt 101  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17691448 tctacctacataatagtctttatgctttaatgatatcccacttctcactaaagcttgactacggatactttaagaatagtttccttatgtttaatggggt 17691547  T
Q  102 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17691548 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaagaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 17691647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 2 - 199
Target Start/End: Original strand, 188985 - 189182
Alignment:
Q  2 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaacttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggt 101  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  188985 tctacccacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaataaagcttgactacaaatactttaagaatagtttccttatgtttaatggggt 189084  T
Q  102 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  189085 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaaggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 189182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 2 - 199
Target Start/End: Original strand, 25537167 - 25537364
Alignment:
Q  2 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaacttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggt 101  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  25537167 tctacctacataatagtctttatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaatagtttccttatgtttaacggggt 25537266  T
Q  102 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 199  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25537267 ctcacaataaagttatacttaatgttccattaaacggactaattattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 25537364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 2 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 11651922 - 11651725
Alignment:
Q  2 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaacttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggt 101  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  11651922 tctacccacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaataaagcttgactactgatacttttagaatagtttccttatttttaatggggt 11651823  T
Q  102 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11651822 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattttagggactttattattttgaaacaaatcaaaatcaataaagaaatgcctt 11651725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 11 - 199
Target Start/End: Original strand, 13359286 - 13359474
Alignment:
Q  11 ataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaacttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaatt 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||| ||| |||  ||||||||||||||||| | |||| | |  ||||||||||||| || |||| |||    
T  13359286 ataatagtctctacgctttaatgttgtcccatttcacaataaaggttgactacggatactttaaaaataatgtttttatgtttaatggagtttcacgatt 13359385  T
Q  111 aagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 199  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  13359386 aagttatacttaatgctccattaagcgaactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaataaataaataaatgcctt 13359474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 2 - 162
Target Start/End: Original strand, 20553595 - 20553755
Alignment:
Q  2 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaacttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggt 101  Q
    |||||| |||||| | ||| |||||||||||  |||| |||||| ||| |||| || ||||||||| |||| |||||| | | ||||| ||||||||| |    
T  20553595 tctaccaacataaaaatctttatgctttaattttatctcacttcacaataaaaattcactacggatgctttaagaataatattcttatatttaatgggat 20553694  T
Q  102 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttatt 162  Q
    ||||| |||||||  |||||||| || |||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  20553695 ctcacgattaagtcgtacttaatatttcattaaacggactagctatcctagagactttatt 20553755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 237 - 291
Target Start/End: Original strand, 17691683 - 17691737
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaa 291  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17691683 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaa 17691737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 27381495 - 27381551
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27381495 catgaaacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 27381551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 27471878 - 27471934
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471878 catgaaacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 27471934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 29308854 - 29308798
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29308854 catgatacaaagccaaaaccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 29308798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 29315814 - 29315758
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29315814 catgatacaaagccaaaaccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 29315758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 17684712 - 17684768
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17684712 catgatacaaagccaaacccattcaacatagattggctattagggcttattccaaca 17684768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 239 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 11651684 - 11651630
Alignment:
Q  239 tgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11651684 tgatacaaagccaaactcaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 11651630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 25537405 - 25537461
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25537405 catgatacaaagccaaactcagtcaatatagattggctattagggcttaatccaaca 25537461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 8510115 - 8509941
Alignment:
Q  9 acataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaacttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg-tctcaca 107  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| |||| || |||  || ||| ||| |||||  ||||||| | ||||   |||| || |||||||||| ||||| |    
T  8510115 acataatagtctttatgttttaatgctatctcatttcataataaagcttaactacatatactttaataatatcatcctcatatttaatgggggtctcata 8510016  T
Q  108 attaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaat 182  Q
    |||||||  ||| ||||||||||| |||  |||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  8510015 attaagtcgtacataatgttccatcaaatagactaattattctatagactttattattttaaaacaaaataaaat 8509941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 9 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 27925946 - 27925772
Alignment:
Q  9 acataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaacttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaa 108  Q
    |||||||||||| | ||||| |||| ||| |||||||  || |||  |||||||  |||||||| |||||| ||| |||  ||||||||| ||||||| |    
T  27925946 acataatagtctttgtgcttcaatgctataccacttccaaataaagtttgactagagatactttaagaataattttctttagtttaatggagtctcacga 27925847  T
Q  109 ttaagttatac--ttaat---gttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaaca 178  Q
    |||||| | ||  |||||   ||||| ||||||  ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27925846 ttaagtcacacacttaattatgttccgttaaacatactagttattctaaggactttattattttgaaacaaaaca 27925772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 194
Target Start/End: Original strand, 31258065 - 31258120
Alignment:
Q  139 actaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaat 194  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31258065 actaattattttagagactttattattttgaaacaaaacaaaagcaataaagaaat 31258120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 163
Target Start/End: Original strand, 17850503 - 17850663
Alignment:
Q  2 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaacttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggt 101  Q
    |||||| | |||||||||| ||| ||| |||| |||   ||||| ||| ||| |||||||| ||||| ||| |||||||| ||||| | |||||| || |    
T  17850503 tctacccatataatagtctatatacttgaatgttatttgacttcacaa-aaagcttgactatggataatttaagaatagtgtccttgtttttaattggat 17850601  T
Q  102 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttatta 163  Q
     ||||||||||||  ||| ||||||||||  ||||  |||| ||||| ||||||||||||||    
T  17850602 atcacaattaagtcttacataatgttccaacaaacaaactagctattatagggactttatta 17850663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 237 - 285
Target Start/End: Original strand, 13359512 - 13359560
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggctta 285  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  13359512 catgatacaaagtcaaacccaatgaatatagattggctattaggactta 13359560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 237 - 285
Target Start/End: Original strand, 16566563 - 16566611
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggctta 285  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16566563 catgatacaaagtcaaactcaatcaacatagattggctattagggctta 16566611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 237 - 294
Target Start/End: Original strand, 189221 - 189281
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaata---tagattggctattagggcttattccaacat 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  189221 catgatacaaagccaaacccaatcaatatactagattgattattagggcttactccaacat 189281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 237 - 279
Target Start/End: Original strand, 16394484 - 16394526
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattag 279  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  16394484 catgatacaaagtcaaactcaatcaatatagattgtctattag 16394526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 185
Target Start/End: Original strand, 22259925 - 22259990
Alignment:
Q  120 ttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaa 185  Q
    ||||||||  |||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  22259925 ttaatgttatattaaatggactagttattttagggagtttattattttgcaacataacaaaatcaa 22259990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 10)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 5 - 201
Target Start/End: Original strand, 21330259 - 21330455
Alignment:
Q  5 acctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaacttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctc 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21330259 acctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctc 21330358  T
Q  105 acaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21330359 acaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgtcttgt 21330455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 2 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 18796705 - 18796506
Alignment:
Q  2 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaacttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggt 101  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||| |||| ||| |||||| | |||||||||| || | |||    
T  18796705 tctacccacataatagtctcaatgctttaatgatataccacttcacaataaagcttgactacagataatttaagaataatatccttatgttaaaagaggt 18796606  T
Q  102 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||    
T  18796605 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttgttattttgaaacaaaacaaaataaacaaataaattccttgt 18796506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 3 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 18620002 - 18619807
Alignment:
Q  3 ctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaacttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtc 102  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||  ||| ||| |||  ||||| || |||||||| |||||| | ||||| ||||||||||| ||    
T  18620002 ctacccacataatagtctatatgctttaatattatcccttttcacaataaagtttgaccacagatactttaagaataatatccttttgtttaatggg-tc 18619904  T
Q  103 tcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 199  Q
    ||| |||||||| | |||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  18619903 tcataattaagtcacacttaatgctccattaaacagactaattattatagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaacaaagaaattcctt 18619807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 56 - 195
Target Start/End: Original strand, 19692598 - 19692737
Alignment:
Q  56 ttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggga 155  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| |||||||  |||||||| | |||||  ||||||| |  |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  19692598 ttgactaaggatactttaagaataatttcctttagtttaatgagatctcatgattaagtcaggcttaatgttccattaaacagactaattattctaggga 19692697  T
Q  156 ctttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 195  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19692698 cttcattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 19692737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 9 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 20978084 - 20977957
Alignment:
Q  9 acataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaacttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||  ||| |||||||||||||  ||| |||||| ||||||||| ||||||||| |||||  |    
T  20978084 acataatagtctctatgctttagtgatatctcacttcacattaaagcttgactacggatgttttaagaataatttccttatttttaatgggatctcatga 20977985  T
Q  109 ttaagttatacttaatgttccattaaac 136  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||    
T  20977984 ttaaattattcttaatgttccattaaac 20977957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 237 - 295
Target Start/End: Original strand, 21330493 - 21330551
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacata 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21330493 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacata 21330551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 36270365 - 36270199
Alignment:
Q  2 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaacttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggt 101  Q
    |||||| ||| |||||||| ||| |||||||| |||||| |||| ||  ||| ||||| |||||||  ||| |||||||| || || |||||||||  ||    
T  36270365 tctacccacacaatagtctttatactttaatgttatccctcttcacactaaagcttgattacggatgttttaagaatagtgtcattgtgtttaatgatgt 36270266  T
Q  102 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacgga-ctaactattctagggactttattatttt 167  Q
    ||||| ||||||| | ||||||  || |||| ||   | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36270265 ctcacgattaagtcacacttaacatttcatttaagtaaactaactattctagggactttattatttt 36270199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 18822275 - 18822115
Alignment:
Q  9 acataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaacttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaa 108  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||  |  ||| ||||| |||  ||  ||| |||||||| ||||| |||||||||| ||||||| |    
T  18822275 acataataatctatctgctttaatgatatcccacttcaaactaaagcttgattacatatgttttaagaatagtgtccttgtgtttaatggtgtctcacga 18822176  T
Q  109 ttaagttatacttaatgtt-ccatt-aaacggactaactattctagggactttattatttt 167  Q
    |||||  | ||||||| || ||||| ||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||    
T  18822175 ttaagccacacttaatttttccatttaaacgaactaacaattctatagactttattatttt 18822115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 19692773 - 19692829
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||||| |||||||    
T  19692773 catgatacaaaaccaaacctaataaatacagattggctattaaggcttactccaaca 19692829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 10 - 165
Target Start/End: Original strand, 36802664 - 36802820
Alignment:
Q  10 cataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaacttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaat 109  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||  ||   || ||||| |||||||  ||| |||||| | || || |||||||||   |||  ||||    
T  36802664 cataataatctatatgctttaatgttatcccactttacactgaatcttgattacggatgttttaagaataatgtcattgtgtttaatgatatcttgcaat 36802763  T
Q  110 taagttatacttaatgttcca-ttaaacggactaactattctagggactttattatt 165  Q
    ||||| | | ||||| ||||| ||||||| | ||||||||| | |||||||||||||    
T  36802764 taagtaacatttaatattccatttaaacgaattaactattcaaaggactttattatt 36802820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 4)
Name: scaffold0390
Description:

Target: scaffold0390; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 2 - 201
Target Start/End: Original strand, 6942 - 7141
Alignment:
Q  2 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaacttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6942 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatagggt 7041  T
Q  102 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 201  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7042 ctcacagttaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 7141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 2 - 201
Target Start/End: Original strand, 13958 - 14157
Alignment:
Q  2 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaacttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggt 101  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13958 tctacctacataatagtctttatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggt 14057  T
Q  102 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 201  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14058 ctcacagttaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattgtagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 14157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 7177 - 7233
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7177 catgatacaaaaccaaactcaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 7233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390; HSP #4
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 14193 - 14249
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14193 catgatacaaaaccaaactcaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 14249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 18)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 2 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 21940864 - 21940665
Alignment:
Q  2 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaacttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21940864 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggt 21940765  T
Q  102 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21940764 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcattgt 21940665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 2 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 28555082 - 28554885
Alignment:
Q  2 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaacttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28555082 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatacttttagaatagtttcattatgtttaatggggt 28554983  T
Q  102 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28554982 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattttaggtattttattattttgaaactaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 28554885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 2 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 22171686 - 22171491
Alignment:
Q  2 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaacttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  22171686 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatattccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttc--tatgtttaatggggt 22171589  T
Q  102 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  22171588 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaataaaacaaaatcaataaggaaatgcctt 22171491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 2 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 6094322 - 6094129
Alignment:
Q  2 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaacttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggt 101  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||    
T  6094322 tctacccatataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatactttaaaaatagtttccttatgtttaacggggt 6094223  T
Q  102 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6094222 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 6094129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 2 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 24642848 - 24642655
Alignment:
Q  2 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaacttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggt 101  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  24642848 tctacccacataatagtctctatactttaatgatatctcacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaatagtttccttatgtttaacggggt 24642749  T
Q  102 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24642748 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaacaattctagggactttatgattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 24642655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 68 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 24636987 - 24636860
Alignment:
Q  68 actttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattatttt 167  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24636987 actttaagaatagtttccttatgtttaacggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaaaggactaactattctagggactttattatttt 24636888  T
Q  168 gaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 195  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||    
T  24636887 gaaacaaaacaaaatcaagaaagaaatg 24636860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 237 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 22070164 - 22070105
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacatat 296  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22070164 catgatacaaaaccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacatat 22070105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 21940629 - 21940573
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21940629 catgatacaaagccaaaaccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 21940573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 6094087 - 6094031
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6094087 catgatacaaagccaaactcaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 6094031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 22171452 - 22171396
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22171452 catgatacaaaatcaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 22171396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 241 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 24642608 - 24642556
Alignment:
Q  241 atacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24642608 atacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 24642556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 28554847 - 28554791
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||    
T  28554847 catgatacaaagccaaacccaatcaacaaagattggctattagggcttactccaaca 28554791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 171
Target Start/End: Original strand, 32872857 - 32873019
Alignment:
Q  10 cataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaacttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaat 109  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||| ||| |||||  ||| ||| | | || | ||  | | || |||| | |||||||||    
T  32872857 cataatagtctctatgctttgatgttatcccacttcacaataaatcttaactacaaatattttaatagtattgtcactcttttcaatgagatctcacaat 32872956  T
Q  110 taagttatacttaatgttccat-taaacggactaactattctagggactttattattttgaaa 171  Q
    ||||| ||||||||||||| || |||| |||  ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  32872957 taagtcatacttaatgttctatataaatggatgaactattataaggactttattattttgaaa 32873019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 189
Target Start/End: Original strand, 38232512 - 38232570
Alignment:
Q  130 attaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaa 189  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38232512 attaaacagactaactattctagaga-tttattattttgaaataaaacaaaatcaataaa 38232570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 122 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 2375085 - 2375027
Alignment:
Q  122 aatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaa 180  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2375085 aatgttccattaaattgactaattattatagggagtttattattttgaaacaaaacaaa 2375027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 100 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 10920297 - 10920234
Alignment:
Q  100 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttatta 163  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | |||||||    
T  10920297 gtctcacgattaactcatacttaatgttccattaaacagactaattattctaggaattttatta 10920234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 240 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 2375000 - 2374947
Alignment:
Q  240 gatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||||||||||| |||||||||| | |||   ||||||||||||||||||||    
T  2375000 gatacaaagccaaatccaatcaatacatatttattattagggcttattccaaca 2374947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 256 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 24636642 - 24636605
Alignment:
Q  256 caatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  24636642 caatcaatatagattggctattatggcttactccaaca 24636605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0433 (Bit Score: 176; Significance: 8e-95; HSPs: 2)
Name: scaffold0433
Description:

Target: scaffold0433; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 2 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 7306 - 7107
Alignment:
Q  2 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaacttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7306 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatacttttagaatagtttcattatgtttaatggggt 7207  T
Q  102 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7206 ctcacaattaagttatacttaatgttctattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaataccttgt 7107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0433; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 7071 - 7015
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7071 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 7015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 176; Significance: 8e-95; HSPs: 20)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 2 - 201
Target Start/End: Original strand, 24695474 - 24695673
Alignment:
Q  2 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaacttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24695474 tctacctacataatagtctctatgctttattgatatctcacttctcaataaagcttgactacggatacttttagaatagtttcattatgtttaatggggt 24695573  T
Q  102 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24695574 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 24695673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 2 - 201
Target Start/End: Original strand, 18569871 - 18570070
Alignment:
Q  2 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaacttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggt 101  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||    
T  18569871 tctaccaacataatagtctttatgctttaatgatattccacttctcaataaagcttgactacggatactttaagagtagtttccttatgtttaacggggt 18569970  T
Q  102 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18569971 ctcacaattaagttatacttaatgttcaattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgtcttgt 18570070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 2 - 199
Target Start/End: Original strand, 19714506 - 19714703
Alignment:
Q  2 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaacttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggt 101  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||| |||||    
T  19714506 tctacccacataatagtctctatgctttaatgatatcctacttctcaataaagcttgacttcggatattttaagaatagattccttatgtttaacggggt 19714605  T
Q  102 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19714606 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattactttgaaataaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 19714703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 2 - 195
Target Start/End: Original strand, 19707226 - 19707419
Alignment:
Q  2 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaacttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggt 101  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||| |||||    
T  19707226 tctacccacataatagtctctatgctttaatgatatcctacttctcaataaagcttgacttcggatattttaagaatagattccttatgtttaacggggt 19707325  T
Q  102 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19707326 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaactgactaactattctagggactttattactttgaaataaaacaaaatcaataaagaaatg 19707419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 13 - 196
Target Start/End: Original strand, 27347497 - 27347679
Alignment:
Q  13 aatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaacttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaattaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||| ||| |||||||||  ||||||| |||||| | |||||  |||||||||| |||||| |||||    
T  27347497 aatagtctctatgctttaatgttatcccttttcacaataaagcttgactacatatactttaagaataatgtcctttcgtttaatggg-tctcacgattaa 27347595  T
Q  113 gttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgc 196  Q
    || | |||||||| |||||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  27347596 gtcacacttaatgctccattaaacagattaattattctaaggactttattattttgaatcaaaacaaaatcaacaaagaaatgc 27347679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 195
Target Start/End: Original strand, 22547031 - 22547217
Alignment:
Q  9 acataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaacttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaa 108  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||| ||| |||  |||||| || ||||||| | |||| | ||| ||| ||||||| | |||||| |    
T  22547031 acataatagtctctatattttaatgttatctcacttcacaataaagtttgactgcgaatactttaaaaataatgtccatatatttaatgagatctcacga 22547130  T
Q  109 ttaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |  ||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||    
T  22547131 ttaagttatacttaatgttccattaaaccgactaactattatagcggttttattattttaaaataaaacaaaatgaataaataaatg 22547217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 92 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 39538071 - 39537962
Alignment:
Q  92 ttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaaga 191  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39538071 ttaatgaggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacgaaccaactattctaaggacttaaccattttgaaacaaaacaaaatcattaaaga 39537972  T
Q  192 aatgccttgt 201  Q
    |||| |||||    
T  39537971 aatggcttgt 39537962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 16 - 197
Target Start/End: Original strand, 17285754 - 17285935
Alignment:
Q  16 agtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaacttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaattaagtt 115  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||| ||| ||| |||  | ||||| | ||||||| |||||| | || ||  ||||| | |||| |||| |||||||     
T  17285754 agtctatatgctttaatactatcccaattcacaataaagatcgactatgaatactttaagaataatgtcatttagtttactagggtttcacgattaagtc 17285853  T
Q  116 atacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcc 197  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  17285854 acacttaatgttccattaaacagactaactattctctggagattattattttgaaacataacaaaatcaataaataaatgcc 17285935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 24695709 - 24695765
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24695709 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 24695765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 92 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 31886640 - 31886537
Alignment:
Q  92 ttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaaga 191  Q
    ||||||| ||||||| |||||||  ||||| |||||| |||||| | ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  31886640 ttaatggagtctcacgattaagtcgtacttgatgttcaattaaatgaactaattattctaaggactttattaatttgaaacaaaacaaaatcactaaaga 31886541  T
Q  192 aatg 195  Q
    ||||    
T  31886540 aatg 31886537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 19714742 - 19714798
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19714742 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 19714798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 16 - 197
Target Start/End: Original strand, 17298907 - 17299088
Alignment:
Q  16 agtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaacttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaattaagtt 115  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||||  ||| |||  | ||||| | ||||||| |||||| | || ||  ||||| | |||| |||| |||||||     
T  17298907 agtctatatgctttaatactatcccacttaacaataaagatcgactatgaatactttaagaataatgtcatttagtttactagggtttcacgattaagtc 17299006  T
Q  116 atacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcc 197  Q
      ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||  |||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  17299007 gcacttaatgttccattaatcggactaactattctctggatattattatttataaacataacaaaatcaataaataaatgcc 17299088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 19707462 - 19707518
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19707462 catgatacaaagccaaactcaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 19707518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 27347722 - 27347778
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27347722 catgatacaaagccaaacgcaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 27347778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 135
Target Start/End: Original strand, 18807050 - 18807175
Alignment:
Q  10 cataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaacttgactacggatactttgagaatagtttcc-ttatgtttaatggggtctcacaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| ||| ||  ||||||||  |||||||| |||||| | ||| |||| |||||||| ||||||| |    
T  18807050 cataatagtctctatgctttattgttatcttacttcacaataacgcttgactatagatactttaagaataatgtccattat-tttaatggtgtctcacga 18807148  T
Q  109 ttaagttatacttaatgttccattaaa 135  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||    
T  18807149 ttaagtcacacttaatgttccattaaa 18807175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 39538787 - 39538701
Alignment:
Q  2 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaacttgactacggatactttgagaatagtttcctta 88  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||| ||||| ||| |||||||| ||||||    
T  39538787 tctacccacataatagtcttcatgctttaatgatatcccacttcacaataaagcttaactatggatattttaagaatagtgtcctta 39538701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 85 - 175
Target Start/End: Original strand, 33477389 - 33477479
Alignment:
Q  85 cttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaa 175  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||||  | | |||||||| |||||||| | | ||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  33477389 cttatgattaatgaggtctcacgattagatcacacttaatgatccattaatcagcctaactattgtaaggactttattattttgaaacaaa 33477479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 237 - 285
Target Start/End: Original strand, 18570108 - 18570156
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggctta 285  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||    
T  18570108 catgatacaaagccaaacccaattaatatagattagctattagagctta 18570156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 39537925 - 39537870
Alignment:
Q  238 atgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||||||||| |||| || |||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39537925 atgatacaaagctaaactcagtcaacatagattggctattagggcttaatccaaca 39537870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 11479489 - 11479420
Alignment:
Q  83 tccttatgtttaatg-gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattcta 151  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||| | ||||||| || ||||||||  ||||| |||||||    
T  11479489 tccttatgtttaatgagggtctcacaatcaagtcacacttaatatttcattaaacacactaattattcta 11479420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0657 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 2)
Name: scaffold0657
Description:

Target: scaffold0657; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 2 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 1192 - 993
Alignment:
Q  2 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaacttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1192 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatactttgagaatagtttctttatgtttaatggggt 1093  T
Q  102 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1092 ctcacaattaagttatacttaatgtttcattaaacggactaactattttagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgtcttgt 993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0657; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 237 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 957 - 900
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacat 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  957 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacat 900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0186 (Bit Score: 168; Significance: 5e-90; HSPs: 2)
Name: scaffold0186
Description:

Target: scaffold0186; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 2 - 201
Target Start/End: Original strand, 25998 - 26197
Alignment:
Q  2 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaacttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggt 101  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25998 tctacctacataatagtcgctatgctttaatgatatcccacttttcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggt 26097  T
Q  102 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 201  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26098 ctcacaattaagttatatttaatgttccattaaatggactaactattctaaggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgtcttgt 26197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0186; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 238 - 293
Target Start/End: Original strand, 26231 - 26286
Alignment:
Q  238 atgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26231 atgatacaaagccaaacccaatcaatatagattgactattagggcttattccaaca 26286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 2)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 2 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 5728 - 5531
Alignment:
Q  2 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaacttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggt 101  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||    
T  5728 tctacccacataatagtctttatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacatatactttaagaataatttccttatgtttaacggggt 5629  T
Q  102 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  5628 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaaataaatcaataaagaaatgcctt 5531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 237 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 5492 - 5444
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggctta 285  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5492 catgatacaaagccaaacccaaacaatatagattggctattagggctta 5444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 138; Significance: 4e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 18 - 199
Target Start/End: Original strand, 230365 - 230545
Alignment:
Q  18 tctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaaacttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaattaagttat 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  230365 tctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaatcttgactacaaatactttaagaatggtttccttatgtttaa-ggggtctcacaattaagttat 230463  T
Q  118 acttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  230464 acttaatgttccattaaacggactaactattataagaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 230545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 230584 - 230640
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  230584 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattattgcttactccaaca 230640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 137 - 201
Target Start/End: Original strand, 8446 - 8510
Alignment:
Q  137 ggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8446 ggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgtcttgt 8510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 8546 - 8602
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8546 catgatacaaagccgaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 8602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 23769 - 23825
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23769 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 23825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0326
Description:

Target: scaffold0326; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 16579 - 16523
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16579 catgatataaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 16523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 16648 - 16615
Alignment:
Q  168 gaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 201  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16648 gaancaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 16615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0705 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0705
Description:

Target: scaffold0705; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 41 - 97
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41 catgatacaaagccaaaatcaatcattatagattggctattagggcttattccaaca 97  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0637 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0637
Description:

Target: scaffold0637; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 9000 - 8944
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9000 catgatacaaagccaaacccattcaacatagattggctatttgggcttattccaaca 8944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0565 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0565
Description:

Target: scaffold0565; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 291
Target Start/End: Original strand, 10202 - 10256
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaa 291  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  10202 catgatacaaagtcaaactcaatcaatatagattggctattagagcttactccaa 10256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0565; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 151 - 182
Target Start/End: Original strand, 10127 - 10158
Alignment:
Q  151 agggactttattattttgaaacaaaacaaaat 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10127 agggactttattattttgaaacaaaacaaaat 10158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0767 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0767
Description:

Target: scaffold0767; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 257 - 293
Target Start/End: Original strand, 1 - 37
Alignment:
Q  257 aatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1 aatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 37  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0170 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0170
Description:

Target: scaffold0170; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 241 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 5930 - 5878
Alignment:
Q  241 atacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  5930 atacaaagtcaaactcaatcaatatagattggctattatgacttactccaaca 5878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 92267 - 92194
Alignment:
Q  100 gtctcacaattaagttatacttaatgttcca-ttaaacggactaactattctagggactttattattttgaaac 172  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||   ||||  |||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  92267 gtctcacgattaagttatacttaatgttccatttaaaataactagatattctagagactttattactttaaaac 92194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University