View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF16218_low_2 (Length: 531)

Name: NF16218_low_2
Description: NF16218
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF16218_low_2
NF16218_low_2
[»] chr8 (11 HSPs)
chr8 (149-512)||(20171812-20172171)
chr8 (289-496)||(11428184-11428391)
chr8 (180-430)||(8150449-8150698)
chr8 (149-496)||(10186224-10186569)
chr8 (149-430)||(4138252-4138533)
chr8 (149-264)||(11428069-11428184)
chr8 (216-286)||(918949-919019)
chr8 (420-490)||(9083125-9083194)
chr8 (420-491)||(32663981-32664051)
chr8 (447-508)||(31686143-31686202)
chr8 (447-496)||(12274210-12274259)
[»] chr7 (11 HSPs)
chr7 (149-512)||(44393522-44393881)
chr7 (149-430)||(47233745-47234029)
chr7 (149-365)||(5767987-5768206)
chr7 (149-365)||(25419498-25419717)
chr7 (180-365)||(39066825-39067012)
chr7 (182-236)||(47932920-47932974)
chr7 (453-494)||(39063960-39064001)
chr7 (447-496)||(39073323-39073372)
chr7 (453-511)||(14755767-14755823)
chr7 (447-496)||(5768330-5768379)
chr7 (447-496)||(25419827-25419876)
[»] chr4 (15 HSPs)
chr4 (150-482)||(5430592-5430927)
chr4 (149-512)||(34737725-34738085)
chr4 (149-430)||(53830428-53830716)
chr4 (149-511)||(21802753-21803111)
chr4 (149-511)||(21632695-21633061)
chr4 (149-365)||(2504924-2505143)
chr4 (149-417)||(2500570-2500838)
chr4 (149-355)||(46092312-46092522)
chr4 (149-355)||(46134837-46135047)
chr4 (180-397)||(20036251-20036467)
chr4 (182-219)||(43943567-43943604)
chr4 (447-511)||(2505253-2505317)
chr4 (447-505)||(43942118-43942174)
chr4 (455-511)||(5874249-5874303)
chr4 (452-492)||(51868294-51868334)
[»] chr3 (13 HSPs)
chr3 (229-494)||(26215155-26215420)
chr3 (149-419)||(48266211-48266483)
chr3 (149-430)||(35870278-35870562)
chr3 (149-365)||(52349726-52349945)
chr3 (149-246)||(26215432-26215529)
chr3 (453-511)||(346592-346648)
chr3 (182-236)||(54945722-54945776)
chr3 (464-511)||(10179403-10179448)
chr3 (447-494)||(3744474-3744521)
chr3 (453-496)||(33519233-33519276)
chr3 (182-236)||(5884368-5884422)
chr3 (447-496)||(52349555-52349604)
chr3 (464-511)||(34209855-34209900)
[»] scaffold0516 (2 HSPs)
scaffold0516 (181-485)||(3127-3430)
scaffold0516 (392-493)||(1404-1504)
[»] chr5 (6 HSPs)
chr5 (164-502)||(37301929-37302266)
chr5 (149-430)||(21604992-21605274)
chr5 (149-365)||(36991043-36991262)
chr5 (447-496)||(10180436-10180485)
chr5 (455-496)||(11381255-11381296)
chr5 (395-488)||(11386776-11386869)
[»] chr2 (14 HSPs)
chr2 (152-430)||(41646633-41646912)
chr2 (149-365)||(7574014-7574233)
chr2 (149-365)||(16668609-16668828)
chr2 (221-286)||(43564237-43564302)
chr2 (228-286)||(29455447-29455505)
chr2 (420-490)||(6414329-6414398)
chr2 (447-496)||(22990032-22990081)
chr2 (149-185)||(29455521-29455557)
chr2 (149-185)||(43564311-43564347)
chr2 (447-502)||(37904098-37904153)
chr2 (447-496)||(7574355-7574404)
chr2 (447-496)||(16668938-16668987)
chr2 (441-494)||(29455077-29455130)
chr2 (441-494)||(31618575-31618628)
[»] chr1 (8 HSPs)
chr1 (150-430)||(22912455-22912735)
chr1 (149-365)||(13786229-13786448)
chr1 (149-365)||(25807694-25807914)
chr1 (181-477)||(23725986-23726278)
chr1 (447-511)||(29679029-29679095)
chr1 (447-494)||(39621645-39621692)
chr1 (447-496)||(13786058-13786107)
chr1 (464-511)||(42332478-42332523)
[»] chr6 (6 HSPs)
chr6 (149-365)||(13433376-13433595)
chr6 (149-268)||(16712037-16712155)
chr6 (452-502)||(18877355-18877405)
chr6 (447-496)||(8643585-8643634)
chr6 (447-496)||(13433717-13433766)
chr6 (455-511)||(18882289-18882343)
[»] scaffold0713 (1 HSPs)
scaffold0713 (447-502)||(7356-7411)
[»] scaffold0182 (1 HSPs)
scaffold0182 (182-236)||(10116-10170)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (455-496)||(1381-1422)
[»] scaffold0316 (1 HSPs)
scaffold0316 (452-496)||(5503-5547)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 310; Significance: 1e-174; HSPs: 11)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 149 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 20172171 - 20171812
Alignment:
Q  149 gataacataagcaacatatatatgagcttagaaaaaatgaggagctttatagtaaacttgtgtgtgtaagatgattgactaagaatatgaataattttaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20172171 gataacataagcaacatatatatgagcttagaaaa--tgaggagctttatagtaaacttgtgtgtgtaagatgattgactaagaatatgaataattttaa 20172074  T
Q  249 aatgtaacccctcactattaataaaatggattataatacattcattgtgtaacttccatgaagtgaagtgaatggagagtttttccaattgatgggaaat 348  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20172073 aatgaaacccctcactattaataaaatggattataatacattcattgtgtaacttccatgaagtgaagtaaatagagagtttttccaattgatgggaaat 20171974  T
Q  349 gaaagattagatagtaaggaatggctagtaaagaatcaagaacaaaagagagccacatgacataagtatgaaaaattagttacaaaaagaaaatattagt 448  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20171973 gaaagattagatagtaagaaatgactagtaaagaatcaagaacaaaagagagccacatgacataagtataaaaaattagttacaaaaagaaaatattagt 20171874  T
Q  449 gaagtgacacataaacaaaatgtagtttagaatacatgtatatatagagatagagatagagatg 512  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  20171873 gaagtgacacataagcaaaatgtagtttaaaataca--tatatatagagatagagatagagatg 20171812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 289 - 496
Target Start/End: Original strand, 11428184 - 11428391
Alignment:
Q  289 ttcattgtgtaacttccatgaagtgaagtgaatggagagtttttccaattgatgggaaatgaaagattagatagtaaggaatggctagtaaagaatcaag 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11428184 ttcattgtgtaacttccatgaagtgaagtaaatggatagtttttccaattgatggaaaatgaaagattagatagtaaggaatggctagtaaagaatcaag 11428283  T
Q  389 aacaaaagagagccacatgacataagtatgaaaaattagttacaaaaagaaaatattagtgaagtgacacataaacaaaatgtagtttagaatacatgta 488  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  11428284 aacaaaagagagccacaaggcataagtatgaaaaattagttacaaaagggaaatattagtgaggtgacacataagcaaaatgtagcttagaatacatgta 11428383  T
Q  489 tatataga 496  Q
    ||||||||    
T  11428384 tatataga 11428391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 180 - 430
Target Start/End: Original strand, 8150449 - 8150698
Alignment:
Q  180 aaaaaatgaggagctttatagtaaacttgtgtgtgtaagatgattgactaagaatatgaataattttaaaatgtaacccctcactattaataaaatggat 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  8150449 aaaaaatgaggagctttatagtaaacttgtgtgtgtaagaggactgattaagaatatgaataattttaaaatgtaacccctcaatattaataaaattgat 8150548  T
Q  280 tataatacattcattgtgtaacttccatgaagtgaagtgaatggagagtttttccaattgatgggaaatgaaagattagatagtaaggaatggctagtaa 379  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  8150549 tataatgcattcattgtgtaactcgcataaagtgaagtaaatggagtgtttttgcaactgatgggaaatgaaaga-tagatagtaagaaatggctagtaa 8150647  T
Q  380 agaatcaagaacaaaagagagccacatgacataagtatgaaaaattagtta 430  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  8150648 agaatcaagaacaaaagtgagtcacatggcataagtatgagagattagtta 8150698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 149 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 10186569 - 10186224
Alignment:
Q  149 gataacataagcaacatatatatgagcttagaaaaaa-tgaggagctttatagtaaacttgtgtgtgtaagatgattgactaagaatatgaataatttta 247  Q
    |||||||||||||||| ||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||    
T  10186569 gataacataagcaacacata-ataagcttggaaaaaaatgaggagctttatagtaaacttgtgtgtgtaagaggattgattaagaatatgaacaatttta 10186471  T
Q  248 aaatgtaacccctcactattaataaaatggattataatacattcattgtgtaacttccatgaagtgaagtgaatggagagtttttccaattgatgggaaa 347  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| || |||| |  |||||| ||| |||| |||||    
T  10186470 aaatgtaacccctcaatattaataaaatggattataatgcattcattgtgtaacttgcaagaagtgaggtaaatgaaatgtttttgcaactgataggaaa 10186371  T
Q  348 tgaaagattagatagtaaggaatggctagtaaagaatcaagaacaaaagagagccacatgacataagtatgaaaaattagttacaaaaagaaaatattag 447  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| || | ||||||||  ||| |     ||| |    
T  10186370 tgaaaga-tagatagtaaggaatgactagtaaagaatcaagaacaaaagagagtcacttggcataagtaagagatattagtta-gaaaggggggcattgg 10186273  T
Q  448 tgaagtgacacataaacaaaatgtagtttagaatacatgtatatataga 496  Q
    | | ||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10186272 taaggtgacacataggcgaaatgtagcttagaatacatgtatatataga 10186224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 149 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 4138533 - 4138252
Alignment:
Q  149 gataacataagcaacatatatatgagcttagaaaaaa-tgaggagctttatagtaaacttgtgtgtgtaagatgattgactaagaatatgaataatttta 247  Q
    |||||||||||||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||      ||||||||||||||||||||   |||| |||||||||||| |||||||    
T  4138533 gataacataagcaacacata-ataagcttagaaaaaaatgaggagc------gtaaacttgtgtgtgtaagagtcttgattaagaatatgaacaatttta 4138441  T
Q  248 aaatgtaacccctcactattaataaaatggattataatacattcattgtgtaacttccatgaagtgaagtgaatggagagtttttccaattgatgggaaa 347  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| |||| |  |||||| |||  ||| |||||    
T  4138440 aaacgtaacccctcaatattaataaaatagattataatgcattcattgtgtaacttgcaagaagtgaagtaaatgaaatgtttttgcaacggataggaaa 4138341  T
Q  348 tgaaagat------tagatagtaaggaatggctagtaaagaatcaagaacaaaagagagccacatgacataagtatgaaaaattagtta 430  Q
    ||||||||      |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||||    
T  4138340 tgaaagatgaaagatagatagtagagaatggctagtaaagaatcaagaacaaaagagagccacttggcataagtatgagagattagtta 4138252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 149 - 264
Target Start/End: Original strand, 11428069 - 11428184
Alignment:
Q  149 gataacataagcaacatatatatgagcttagaaaaaatgaggagctttatagtaaacttgtgtgtgtaagatgattgactaagaatatgaataattttaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11428069 gataacataagcaacatatatatgagcttagaaaaaatgaggagctttatcgtaaacttctgtgtgtaagatgattgactaagaatatgaataattttaa 11428168  T
Q  249 aatgtaacccctcact 264  Q
    ||||||||||||||||    
T  11428169 aatgtaacccctcact 11428184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 216 - 286
Target Start/End: Original strand, 918949 - 919019
Alignment:
Q  216 aagatgattgactaagaatatgaataattttaaaatgtaacccctcactattaataaaatggattataata 286  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  918949 aagaggattgattaagaatatgaataattttaaaatgtaacccctcaatattaataaaatggattataata 919019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 420 - 490
Target Start/End: Original strand, 9083125 - 9083194
Alignment:
Q  420 aaaattagttacaaaaagaaaatattagtgaagtgacacataaacaaaatgtagtttagaatacatgtata 490  Q
    ||||||||||| ||| | |||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  9083125 aaaattagttaaaaagaaaaaa-attagtgaggtgacacataagcaaagtgtagtttagaatacatgtata 9083194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 420 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 32664051 - 32663981
Alignment:
Q  420 aaaattagttacaaaaagaaaatattagtgaagtgacacataaacaaaatgtagtttagaatacatgtatat 491  Q
    ||||||||||| |||  ||||| ||| |||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  32664051 aaaattagttagaaagggaaaa-attggtgaggtgacacataagcaaagtgtagtttagaatacatgtatat 32663981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 447 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 31686202 - 31686143
Alignment:
Q  447 gtgaagtgacacataaacaaaatgtagtttagaatacatgtatatatagagatagagataga 508  Q
    |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||    
T  31686202 gtgaggtgacacataagcaatatgtagtttagaatacatg--tatacagagatagagataga 31686143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 447 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 12274259 - 12274210
Alignment:
Q  447 gtgaagtgacacataaacaaaatgtagtttagaatacatgtatatataga 496  Q
    |||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  12274259 gtgaggtgacacataaacaaaatgtaacttagcatacatgtatatataga 12274210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 310; Significance: 1e-174; HSPs: 11)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 149 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 44393881 - 44393522
Alignment:
Q  149 gataacataagcaacatatatatgagcttagaaaaaatgaggagctttatagtaaacttgtgtgtgtaagatgattgactaagaatatgaataattttaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44393881 gataacataagcaacatatatatgagcttagaaaa--tgaggagctttatagtaaacttgtgtgtgtaagatgattgactaagaatatgaataattttaa 44393784  T
Q  249 aatgtaacccctcactattaataaaatggattataatacattcattgtgtaacttccatgaagtgaagtgaatggagagtttttccaattgatgggaaat 348  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44393783 aatgaaacccctcactattaataaaatggattataatacattcattgtgtaacttccatgaagtgaagtaaatagagagtttttccaattgatgggaaat 44393684  T
Q  349 gaaagattagatagtaaggaatggctagtaaagaatcaagaacaaaagagagccacatgacataagtatgaaaaattagttacaaaaagaaaatattagt 448  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44393683 gaaagattagatagtaagaaatgactagtaaagaatcaagaacaaaagagagccacatgacataagtataaaaaattagttacaaaaagaaaatattagt 44393584  T
Q  449 gaagtgacacataaacaaaatgtagtttagaatacatgtatatatagagatagagatagagatg 512  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  44393583 gaagtgacacataagcaaaatgtagtttaaaataca--tatatatagagatagagatagagatg 44393522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 149 - 430
Target Start/End: Original strand, 47233745 - 47234029
Alignment:
Q  149 gataacataagcaacatatatatgagcttagaaaaaa-tgaggagctttatagtaa---acttgtgtgtgtaagatgattgactaagaatatgaataatt 244  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  47233745 gataatataagcaacatatatataagcttataaaaaaatgaggagctttatagtaataaacttgtgtgtgtaagaggattgattaagaatatgaataatt 47233844  T
Q  245 ttaaaatgtaacccctcactattaataaaatggattataatacattcattgtgtaacttccatgaagtgaagtgaatggagagtttttccaattgatggg 344  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || |||||| ||| ||||||     
T  47233845 ttaaaatgtaaccccttaatattaataaaatggattataatgcattcattgtgtaacttgcatgaagtgaagtaaatgaagtgtttttgcaactgatgga 47233944  T
Q  345 aaatgaaagattagatagtaaggaatggctagtaaagaatcaagaacaaaagagagccacatgacataagtatgaaaaattagtta 430  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  47233945 aaatgaaaga-tagatagtaaggaatgactagtaaagaatcaagaacaaaagatagccacatgacataagtatgagagattagtta 47234029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 149 - 365
Target Start/End: Original strand, 5767987 - 5768206
Alignment:
Q  149 gataacataagcaacatatatatgagcttagaaaaaa-tgaggagctttatagtaa---acttgtgtgtgtaagatgattgactaagaatatgaataatt 244  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  5767987 gataacataagcaacatatatataagcttagaaaaaaatgaggagctttatagtaataaacttgtgtgtgtaagaggattgattaagaatatgaataatt 5768086  T
Q  245 ttaaaatgtaacccctcactattaataaaatggattataatacattcattgtgtaacttccatgaagtgaagtgaatggagagtttttccaattgatggg 344  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||||     
T  5768087 ttaaaatgtaacccctcaatattaataaaattgattataatgcattcattgtgtaacttgcatgaagtgaagtaaatggagagtttttgtaactgatgga 5768186  T
Q  345 aaatgaaagattagatagtaa 365  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  5768187 aaatgaaaga-tagatagtaa 5768206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 149 - 365
Target Start/End: Original strand, 25419498 - 25419717
Alignment:
Q  149 gataacataagcaacatatatatgagcttagaaaaaa-tgaggagctttatagtaa---acttgtgtgtgtaagatgattgactaagaatatgaataatt 244  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||   | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  25419498 gataacataagcaacatatatataagcttagaaaaaaatgaggagctttatagtaataaatttgtgtgtgtaagaggattgattaagaatatgaataatt 25419597  T
Q  245 ttaaaatgtaacccctcactattaataaaatggattataatacattcattgtgtaacttccatgaagtgaagtgaatggagagtttttccaattgatggg 344  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||||     
T  25419598 ttaaaatgtaacccctcaatattaataaaatggattataatgcattcattgtgtaacttgcatgaagtgaagtaaatggagagtttttgtaactgatgga 25419697  T
Q  345 aaatgaaagattagatagtaa 365  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  25419698 aaatgaaaga-tagatagtaa 25419717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 180 - 365
Target Start/End: Original strand, 39066825 - 39067012
Alignment:
Q  180 aaaaaatgaggagctttatagtaa---acttgtgtgtgtaagatgattgactaagaatatgaataattttaaaatgtaacccctcactattaataaaatg 276  Q
    |||||||||||||| |||||||||   |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39066825 aaaaaatgaggagccttatagtaataaacttgtatgtgtaagaggattgattaagaatatgaataattttaaaatgtaacccctcaatattaataaaatg 39066924  T
Q  277 gattataatacattcattgtgtaacttccatgaagtgaagtgaatggagagtttttccaattgatgggaaatgaaagattagatagtaa 365  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  || |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  39066925 gattataatgcattcattgtgtaacttgcatgaagtgaagtaaatggagagtttttgtaactgatggaaaatgaaaga-tagatagtaa 39067012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 182 - 236
Target Start/End: Original strand, 47932920 - 47932974
Alignment:
Q  182 aaaatgaggagctttatagtaaacttgtgtgtgtaagatgattgactaagaatat 236  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| || ||| |||||    
T  47932920 aaaatgaggagctttgtagtaaacttgtgtgtgtaagaggatagaataaaaatat 47932974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 453 - 494
Target Start/End: Original strand, 39063960 - 39064001
Alignment:
Q  453 tgacacataaacaaaatgtagtttagaatacatgtatatata 494  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39063960 tgacacataagcaaaatgtaggttagaatacatgtatatata 39064001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 447 - 496
Target Start/End: Original strand, 39073323 - 39073372
Alignment:
Q  447 gtgaagtgacacataaacaaaatgtagtttagaatacatgtatatataga 496  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39073323 gtgaggtgacacataagcaaagtgtaggttagaatacatgtatatataga 39073372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 453 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 14755823 - 14755767
Alignment:
Q  453 tgacacataaacaaaatgtagtttagaatacatgtatatatagagatagagatagagat 511  Q
    |||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  14755823 tgacacatcagcaaagtgtagcttagaatacatgta--tatagagatagagatagagat 14755767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 447 - 496
Target Start/End: Original strand, 5768330 - 5768379
Alignment:
Q  447 gtgaagtgacacataaacaaaatgtagtttagaatacatgtatatataga 496  Q
    |||| ||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5768330 gtgaggtgacacataggaaaaatgtaggttagaatacatgtatatataga 5768379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 447 - 496
Target Start/End: Original strand, 25419827 - 25419876
Alignment:
Q  447 gtgaagtgacacataaacaaaatgtagtttagaatacatgtatatataga 496  Q
    |||| ||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25419827 gtgaggtgacacataggaaaaatgtaggttagaatacatgtatatataga 25419876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 302; Significance: 1e-170; HSPs: 15)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 150 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 5430927 - 5430592
Alignment:
Q  150 ataacataagcaacatatatatgagcttagaaaaaatgaggagctttatagtaaacttgtgtgtgtaagatgattgactaagaatatgaataattttaaa 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5430927 ataacataagcaacatatatatgagcttagaaaaaatgaggagttttatagtaaacttgtgtgtgtaagatgattgactaagaatatgaataattttaaa 5430828  T
Q  250 atgtaacccctcactatta---ataaaatggattataatacattcattgtgtaacttccatgaagtgaagtgaatggagagtttttccaattgatgggaa 346  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5430827 atgtaacccctcactattattaataaaatggattataatacattcattgtgtaacttccatgaagtgaagtaaatggagagtttttccaattgatgggaa 5430728  T
Q  347 atgaaagattagatagtaaggaatggctagtaaagaatcaagaacaaaagagagccacatgacataagtatgaaaaattagttacaaaaagaaaatatta 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5430727 atgaaagattagatagtaaggaatggctagtaaagaatcaagaacaaaagagagccacatggcataagtatgaaaaattagttacaaaaagaaaatatta 5430628  T
Q  447 gtgaagtgacacataaacaaaatgtagtttagaata 482  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  5430627 gtgaagtgacacataagcaaaatgtagtttataata 5430592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 149 - 512
Target Start/End: Original strand, 34737725 - 34738085
Alignment:
Q  149 gataacataagcaacatatatatgagcttagaaaa-aatgaggagctttatagtaaacttgtgtgtgtaagatgattgactaagaatatgaataatttta 247  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  34737725 gataacataagcaacatatatataagcttagaaaaaaatgaggagctttatagtaaacttgtgtgtgtaagaggattgatcaagaatatgaataatttta 34737824  T
Q  248 aaatgtaacccctcactattaataaaatggattataatacattcattgtgtaacttccatgaagtgaagtgaatggagagtttttccaattgatgggaaa 347  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||| ||| |||||| |||    
T  34737825 aaatgtaacccctcattgttaataaaatggattataatgcattcattgtgtaacttgcatgaagtgaagtagatggagtgtttttgcaactgatggaaaa 34737924  T
Q  348 tgaaagattagatagtaaggaatggctagtaaagaatcaagaacaaaagagagccacatgacataagtatgaaaaattagttacaaaaagaaaatattag 447  Q
    ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||  ||| | |   ||| |    
T  34737925 tgaaaga-tagattgtacggaatggctagtaaagaatcaagaacaaaagagatccacatggcataagtatgagagattagtta-gaaagggaggcattgg 34738022  T
Q  448 tgaagtgacacataaacaaaatgtagtttagaatacatgtatatatagagatagagatagagatg 512  Q
    | | ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  34738023 taaggtgacacatatgcaaaatgtaggttagaatacatg--tatatagagatagagatagagatg 34738085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 149 - 430
Target Start/End: Original strand, 53830428 - 53830716
Alignment:
Q  149 gataacataagcaacatatatatgagcttagaaaaaa-tgaggagctttatagtaa---acttgtgtgtgtaagatgattgactaagaatatgaataatt 244  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  53830428 gataacataagcaacatatatataagcttagaaaaaaatgaggagctttatagtaataaacttgtgtgtgtaagaggattgattaagaatatgaataatt 53830527  T
Q  245 ttaaaatgtaacccctcactattaataaaatggattataatacattcattgtgtaacttccatgaagtgaagtgaatggagagtttttccaattgatggg 344  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| |||||| |||  |||||     
T  53830528 ttaaaatgtaacccctcaatattaataaaatggattataatgcattcattgtgtaacttgcatgaagtgaagtaaatagagtgtttttgcaaccgatgga 53830627  T
Q  345 aaatgaaagat---tagatagtaaggaatggctagtaaagaatcaagaacaaaagagagccacatgacataagtatgaaaaattagtta 430  Q
    |||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  53830628 aaatgaaagatagatagatagtaaggaacggctagtaaagaatcaagaacaaaagatagccacatggcataagtatgagagattagtta 53830716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 149 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 21803111 - 21802753
Alignment:
Q  149 gataacataagcaacatatatatgagcttagaaaaaa-tgaggagctttatagtaaacttgtgtgtgtaagatgattgactaagaatatgaataatttta 247  Q
    |||||||||||||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||    
T  21803111 gataacataagcaacacata-ataagcttagaaaaaaatgaggagctttatagtaaacttgtgtgtgtaagattattgattaagaatatgaacaatttta 21803013  T
Q  248 aaatgtaacccctcactattaataaaatggattataatacattcattgtgtaacttccatgaagtgaagtgaatggagagtttttccaattgatgggaaa 347  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| |||| |  |||||| ||| |||| |||||    
T  21803012 aaacgtaacccctcaatattaataaaatggattataatgcattcattgtgtaacttgcaagaagtgaagtaaatgaaatgtttttgcaactgataggaaa 21802913  T
Q  348 tgaaagattagatagtaaggaatggctagtaaagaatcaagaacaaaagagagccacatgacataagtatgaaaaattagttacaaaaagaaaatattag 447  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||||  ||| |     ||| |    
T  21802912 tgaaaga-tagatagtaatgaatggctagtaaagaatcaagaacaaaagagagccacttggcataagtatgagagattagtta-gaaaggggggcattgg 21802815  T
Q  448 tgaagtgacacataaacaaaatgtagtttagaatacatgtatatatagagatagagatagagat 511  Q
    | | ||||||||||  | |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  21802814 taaggtgacacataggcgaaatgtagcttagaatacatg--tatatagagatagagatagagat 21802753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 149 - 511
Target Start/End: Original strand, 21632695 - 21633061
Alignment:
Q  149 gataacataagcaacatatatatgagcttagaaaa--aatgaggagctttatagtaaacttgtgtgtgtaagatgattgactaagaatatgaataatttt 246  Q
    |||||||||||||||| ||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||    
T  21632695 gataacataagcaacacata-ataagcttagaaaaaaaatgaggagctttatagtaaacttgtgtgtgtaagaagattgattaagaatatgaacaatttt 21632793  T
Q  247 aaaatgtaacccctcactattaataaaatggattataatacattcattgtgtaacttccatgaagtgaagtgaatggagag-tttttccaattgatggga 345  Q
    ||||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||| |||| |  | ||||| ||| |||| | |    
T  21632794 aaaacataacccctcaatattaataaaatggatcataatgcattcatcgtgtaacttgcaagaagtgaagtaaatgaaatgttttttgcaactgatagaa 21632893  T
Q  346 aatgaaagattagatagtaaggaatggctagtaaagaatcaagaacaaaagagagccacatgacataagtatgaaaaattagttacaaaaagaaaatatt 445  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| | ||||||||  ||| |    ||||    
T  21632894 aatgaaaga-tagatagtaaggaatggctagtaaagaatcaagaacaaaagagcgccacttggcataagtatgagagattagtta-gaaaggggggtatt 21632991  T
Q  446 agtgaagtgacacataaacaaaatgtagtttagaatacatgtat----atatagagatagagatagagat 511  Q
     || | ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||    
T  21632992 ggtaaggtgacacataggcaaaatgtagcttagaatacatgtataataatatagagatagagatagagat 21633061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 149 - 365
Target Start/End: Original strand, 2504924 - 2505143
Alignment:
Q  149 gataacataagcaacatatatatgagcttagaaaaaa-tgaggagctttatagtaa---acttgtgtgtgtaagatgattgactaagaatatgaataatt 244  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||   | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  2504924 gataacataagcaacatatatataagcttagaaaaaaatgaggagctttatagtaataaatttgtgtgtgtaagaggattgattaagaatatgaataatt 2505023  T
Q  245 ttaaaatgtaacccctcactattaataaaatggattataatacattcattgtgtaacttccatgaagtgaagtgaatggagagtttttccaattgatggg 344  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||||     
T  2505024 ttaaaatgtaacccctcaatattaataaaatggattataatgcattcattgtgtaacttgcatgaagtgaagtaaatggagagtttttgtaactgatgga 2505123  T
Q  345 aaatgaaagattagatagtaa 365  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  2505124 aaatgaaaga-tagatagtaa 2505143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 149 - 417
Target Start/End: Original strand, 2500570 - 2500838
Alignment:
Q  149 gataacataagcaacatatatatgagcttagaaaaaa-tgaggagctttatagtaaacttgtgtgtgtaagatgattgactaagaatatgaataatttta 247  Q
    ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||  ||||||||||    
T  2500570 gataatataagcaacatatatgtaagcttagaaaaaaatgagtagatttatagtaaacttgtgtgtgtaagaggattgatcaagaatacaaataatttta 2500669  T
Q  248 aaatgtaacccctcactattaataaaatggattataatacattcattgtgtaacttccatgaagtgaagtgaatggagagtttttccaattgatgggaaa 347  Q
    |||||||||| | || |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| |  ||||| |||  |||||||||    
T  2500670 aaatgtaaccgcacaatattaataaaatggattataatgcattcattgtgcaacttgcatgaagtgaagtaaatggtgtatttttgcaacggatgggaaa 2500769  T
Q  348 tgaaagattagatagtaaggaatggctagtaaagaatcaagaacaaaagagagccacatgacataagtat 417  Q
    ||||||| || |||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2500770 tgaaaga-taaatagtaaggaatgattagtagggaatcaagaacaaaagagagccacatggcataagtat 2500838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 149 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 46092522 - 46092312
Alignment:
Q  149 gataacataagcaacatatatatgagcttagaaaaaa-tgaggagctttatagtaa---acttgtgtgtgtaagatgattgactaagaatatgaataatt 244  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  46092522 gataacataagcaacatatatataagcttagaaaaaaatgaggagctttatagtaataaacttgtgtgtgtaagaggattgattaagaatatgaataatt 46092423  T
Q  245 ttaaaatgtaacccctcactattaataaaatggattataatacattcattgtgtaacttccatgaagtgaagtgaatggagagtttttccaattgatggg 344  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||  ||  |||||     
T  46092422 ttaaaatgtaacccctcaatattaataaaatggattataatgcattcattgtgtaacttgcatgaagtgaagtaaatggcaagtttttgtaaccgatgga 46092323  T
Q  345 aaatgaaagat 355  Q
    |||||||||||    
T  46092322 aaatgaaagat 46092312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 149 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 46135047 - 46134837
Alignment:
Q  149 gataacataagcaacatatatatgagcttagaaaaaa-tgaggagctttatagtaa---acttgtgtgtgtaagatgattgactaagaatatgaataatt 244  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  46135047 gataacataagcaacatatatataagcttagaaaaaaatgaggagctttatagtaataaacttgtgtgtgtaagaggattgattaagaatatgaataatt 46134948  T
Q  245 ttaaaatgtaacccctcactattaataaaatggattataatacattcattgtgtaacttccatgaagtgaagtgaatggagagtttttccaattgatggg 344  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||  ||  |||||     
T  46134947 ttaaaatgtaacccctcaatattaataaaatggattataatgcattcattgtgtaacttgcatgaagtgaagtaaatggcaagtttttgtaaccgatgga 46134848  T
Q  345 aaatgaaagat 355  Q
    |||||||||||    
T  46134847 aaatgaaagat 46134837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 180 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 20036467 - 20036251
Alignment:
Q  180 aaaaaatgaggagctttatagtaaacttgtgtgtgtaagatgattgactaagaatatgaataattttaaaatgtaacccctcactattaataaaatggat 279  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| ||    
T  20036467 aaaaaatgaggaactttatagtaaacttgtgagtgtaagaggattgattaagaatatgattaattttaaaatgtaactgctcaatattaataaaatgaat 20036368  T
Q  280 tataatacattcattgtgtaacttccatgaagtgaagtgaatggagag-tttttccaattgatgggaaatgaaagattagatagtaaggaatggctagta 378  Q
    |||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||| | || || | ||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  20036367 tataatgcattcattatgcaacttgcatgaagtgaagtaactgaagtgttttttacatctgatgggaaatgaaaga-tagatagtaatgaatgactagta 20036269  T
Q  379 aagaatcaagaacaaaaga 397  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  20036268 aagaat-aagaacaaaaga 20036251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 182 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 43943604 - 43943567
Alignment:
Q  182 aaaatgaggagctttatagtaaacttgtgtgtgtaaga 219  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43943604 aaaatgaggagctttgtagtaaacttgtgtgtgtaaga 43943567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 447 - 511
Target Start/End: Original strand, 2505253 - 2505317
Alignment:
Q  447 gtgaagtgacacataaacaaaatgtagtttagaatacatgtatatatagagatagagatagagat 511  Q
    |||| ||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  2505253 gtgaggtgacacataggaaaaatgtaggttagaatacatgtatatatatagatatagatatagat 2505317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 447 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 43942174 - 43942118
Alignment:
Q  447 gtgaagtgacacataaacaaaatgtagtttagaatacatgtatatatagagatagagat 505  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  43942174 gtgaagtgacatgtaagcaaaatgtagattagaatacatgta--tatagagatagagat 43942118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 455 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 5874303 - 5874249
Alignment:
Q  455 acacataaacaaaatgtagtttagaatacatgtatatatagagatagagatagagat 511  Q
    |||||| | |||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  5874303 acacatgagcaaagtgtagcttagaatacatgtatata--gagatagagatagagat 5874249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 452 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 51868334 - 51868294
Alignment:
Q  452 gtgacacataaacaaaatgtagtttagaatacatgtatata 492  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  51868334 gtgacacataagcaaaatgtatgttagaatacatgtatata 51868294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 13)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 229 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 26215420 - 26215155
Alignment:
Q  229 aagaatatgaataattttaaaatgtaacccctcactattaataaaatggattataatacattcattgtgtaacttccatgaagtgaagtgaatggagagt 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26215420 aagaatatgaataattttaaaatgtaacccctcgctattaataaaatggattataacacattcattgtgtaacttccatgaagtgaagtaaatggagagt 26215321  T
Q  329 ttttccaattgatgggaaatgaaagattagatagtaaggaatggctagtaaagaatcaagaacaaaagagagccacatgacataagtatgaaaaattagt 428  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||    
T  26215320 ttttccaattgatggaaaatgaaagattagatagtaaggaatggctagcaaagaatcaagaacaaaagagagccacatggcataagtatgagagattagt 26215221  T
Q  429 tacaaaaagaaaatattagtgaagtgacacataaacaaaatgtagtttagaatacatgtatatata 494  Q
    ||||||| | ||| ||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26215220 tacaaaagggaaacattggtgaagtaacacataagtaaaatgtagtttagaatacatgtatatata 26215155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 149 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 48266483 - 48266211
Alignment:
Q  149 gataacataagcaacatatatatgagcttagaaaaaa-tgaggagctttatagtaa---acttgtgtgtgtaagatgattgactaagaatatgaataatt 244  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  48266483 gataacataagcaacatatatataagcttagaaaaaaatgaggagctttatagtaataaacttgtgtgtgtaagaggattgattaagaatatgaataatt 48266384  T
Q  245 ttaaaatgtaacccctcactattaataaaatggattataatacattcattgtgtaacttccatgaagtgaagtgaatggagagtttttccaattgatggg 344  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||     
T  48266383 ttaaaatgtaacccctcaatattaataaaatggattataatgcattcattgtgtaacttgcatgaagt-aagtaaatggagagtttttgcaactgatgga 48266285  T
Q  345 aaatgaaagattagatagtaaggaatggctagtaaagaatcaagaacaaaagagagccacatgacataagtatga 419  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  48266284 aaatgaaaga-tagatagtaaggaatgactagtaaagaatcaagaagaaaagatagccacatgacataagtatga 48266211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 149 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 35870562 - 35870278
Alignment:
Q  149 gataacataagcaacatatatatgagcttagaaaaaa-tgaggagctttatagtaa---acttgtgtgtgtaagatgattgactaagaatatgaataatt 244  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||||||||||   |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  35870562 gataacataagcaacatatatataagtttagaaaaaaatgaggacctttatagtaataaacttgtgtgtgtaagaggattgattaagaatatgaataatt 35870463  T
Q  245 ttaaaatgtaacccctcactattaataaaatggattataatacattcattgtgtaacttccatgaagtgaagtgaatggagagtttttccaattgatggg 344  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||     
T  35870462 ttaaaatgtaacctctcaatattaataaaatggattataatgcattcattgtgtaacttgcatgaagtgaagtaaatggagagttttcgcaactgatgga 35870363  T
Q  345 aaatgaaagattagatagtaaggaatggctagtaaagaatcaagaacaaaagagagccacatgacataagtatgaaaaattagtta 430  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  35870362 aaatgaaaga-tagatagtaaggaatgactagtaaagaatcaagaagaaaagatagccacatggcataagtatgagagattagtta 35870278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 149 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 52349945 - 52349726
Alignment:
Q  149 gataacataagcaacatatatatgagcttagaaaaaa-tgaggagctttatagtaa---acttgtgtgtgtaagatgattgactaagaatatgaataatt 244  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||   | |||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  52349945 gataacataagcaacatatatataagcttagaaaaaaatgaggagctttatagtaataaatttgtgtgtgtaagaggattgattaagaatataaataatt 52349846  T
Q  245 ttaaaatgtaacccctcactattaataaaatggattataatacattcattgtgtaacttccatgaagtgaagtgaatggagagtttttccaattgatggg 344  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||||     
T  52349845 ttaaaatgtaacccctcaatattaataaaatggattataatgcattcattgtgtaacttgcatgaagtgaagtaaatggagagtttttgtaactgatgga 52349746  T
Q  345 aaatgaaagattagatagtaa 365  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  52349745 aaatgaaaga-tagatagtaa 52349726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 149 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 26215529 - 26215432
Alignment:
Q  149 gataacataagcaacatatatatgagcttagaaaaaatgaggagctttatagtaaacttgtgtgtgtaagatgattgactaagaatatgaataatttt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26215529 gataacataagcaacatatatatgagcttagaaaaaatgaggagctttatagtaaacttgtgtgtgtaagatgattgactaagaatatgaataatttt 26215432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 453 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 346648 - 346592
Alignment:
Q  453 tgacacataaacaaaatgtagtttagaatacatgtatatatagagatagagatagagat 511  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  346648 tgacacataagcaaaatgtagtttagaatacatgta--tatagagatagagatagagat 346592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 182 - 236
Target Start/End: Original strand, 54945722 - 54945776
Alignment:
Q  182 aaaatgaggagctttatagtaaacttgtgtgtgtaagatgattgactaagaatat 236  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| || ||| |||||    
T  54945722 aaaatgaggagctttgtagtaaacttgtgtgtgtaagaggatagaataaaaatat 54945776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 464 - 511
Target Start/End: Original strand, 10179403 - 10179448
Alignment:
Q  464 caaaatgtagtttagaatacatgtatatatagagatagagatagagat 511  Q
    |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  10179403 caaagtgtagtttagaatacatg--tatatagagatagagatagagat 10179448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 447 - 494
Target Start/End: Original strand, 3744474 - 3744521
Alignment:
Q  447 gtgaagtgacacataaacaaaatgtagtttagaatacatgtatatata 494  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  3744474 gtgaggtgacacataagcaaagtgtaggttagaatacatgtatatata 3744521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 453 - 496
Target Start/End: Original strand, 33519233 - 33519276
Alignment:
Q  453 tgacacataaacaaaatgtagtttagaatacatgtatatataga 496  Q
    |||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33519233 tgacacataagcaatatgtaggttagaatacatgtatatataga 33519276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 182 - 236
Target Start/End: Original strand, 5884368 - 5884422
Alignment:
Q  182 aaaatgaggagctttatagtaaacttgtgtgtgtaagatgattgactaagaatat 236  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||| || ||| |||||    
T  5884368 aaaatgagaagctttgtagtaaacttgtgtgtgtaagaggatagaataaaaatat 5884422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 447 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 52349604 - 52349555
Alignment:
Q  447 gtgaagtgacacataaacaaaatgtagtttagaatacatgtatatataga 496  Q
    |||| ||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  52349604 gtgaggtgacacataggaaaaatgtaggttagaatacatgtatatataga 52349555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 464 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 34209900 - 34209855
Alignment:
Q  464 caaaatgtagtttagaatacatgtatatatagagatagagatagagat 511  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  34209900 caaagtgtaatttagaatacatgtatata--gagatagagatagagat 34209855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0516 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 2)
Name: scaffold0516
Description:

Target: scaffold0516; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 181 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 3430 - 3127
Alignment:
Q  181 aaaaatgaggagctttatagtaaacttgtgtgtgtaagatgattgactaagaatatgaataattttaaaatgtaacccctcactattaataaaatggatt 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||    
T  3430 aaaaatgaggagctttatagtaaacttgtgtgtgtaagaggattgattaagaatatgaataattttaaaatgtaaccgcttaatattaataaaatggatt 3331  T
Q  281 ataatacattcattgtgtaacttccatgaagtgaagtgaatggagagtttttccaattgatgggaaatgaaagattagatagtaaggaatggctagtaaa 380  Q
    ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||| || |||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  3330 ataattcaatcattgtgcaacttgcatgaagtgaagtaaatgaagtgtttttgcaactgatgggaaatgaaaga-taaatagtaaagaatggctagtaaa 3232  T
Q  381 gaatcaagaacaaaagagagccacatgacataagtatgaaaaattagttacaaaaagaaaatattagtgaagtgacacataaacaaaatgtagtttagaa 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| | | |  || ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||    
T  3231 gaatcaagaacaaaagagagccacatgacataagtatgagagattagttacaaaagggagacgttggtgaagtgacacataagtaaaatgtagtttaaaa 3132  T
Q  481 tacat 485  Q
    |||||    
T  3131 tacat 3127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0516; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 392 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 1504 - 1404
Alignment:
Q  392 aaaagagagccacatgacataagtatgaaaaattagttacaaaaagaaaatattagtgaagtgacacataaacaaaatgtagtttagaatacatgtatat 491  Q
    ||||||||||||  || ||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||  || |||| |||||| || | ||||||| |  |||||||||||||||||    
T  1504 aaaagagagccatttggcataagtatgaaagattggtta-aaaaagagaactttggtgaggtgacaaatcatcaaaatgcaccttagaatacatgtatat 1406  T
Q  492 at 493  Q
    ||    
T  1405 at 1404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 184; Significance: 2e-99; HSPs: 6)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 164 - 502
Target Start/End: Original strand, 37301929 - 37302266
Alignment:
Q  164 atatatatgagcttagaaaa-aatgaggagctttatagtaaacttgtgtgtgtaagatgattgactaagaatatgaataattttaaaatgtaacccctca 262  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  37301929 atatatataagcttagaaaaaaatgaggagttttatagtaaacttgtgtgtgtaagtggattgattaagaatatgaataattttaaaatgtaaccctcca 37302028  T
Q  263 ctattaataaaatggattataatacattcattgtgtaacttccatgaagtgaagtgaatggagagtttttccaattgatgggaaatgaaagattagatag 362  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |    
T  37302029 ttattaataaaatggattataatgcattcattgtgtaacttgcatgaagtgaagtaaatggagtgtttttgcaaatgatgggaaatgaaaga-tagattg 37302127  T
Q  363 taaggaatggctagtaaagaatcaagaacaaaagagagccacatgacataagtatgaaaaattagttacaaaaagaaaatattagtgaagtgacacataa 462  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | | ||||||||  ||| |||   ||| || | ||||||||||     
T  37302128 tacggaatggctagtaaagaatcaagaacaaaagagatccacatggcataagtataagagattagtta-gaaaggaagtcattggtaaggtgacacatat 37302226  T
Q  463 acaaaatgtagtttagaatacatgtatatatagagataga 502  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  37302227 gcaaaatgtaggttagaatacatgtatatatatagataga 37302266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 149 - 430
Target Start/End: Original strand, 21604992 - 21605274
Alignment:
Q  149 gataacataagcaacatatatatgagcttagaaaaaa-tgaggagctttatagtaa---acttgtgtgtgtaagatgattgactaagaatatgaataatt 244  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  21604992 gataacataagcaacatatata--agcttagaaaaaaatgaggagctttatagtaataaacttgtgtgtgtaagaggattgattaagaatatgaataatt 21605089  T
Q  245 ttaaaatgtaacccctcactattaataaaatggattataatacattcattgtgtaacttccatgaagtgaagtgaatggagagtttttccaattgatggg 344  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || |||||| ||    ||||     
T  21605090 ttaaaatttaacccctcaatattaataaaatggattataatgcattcattgtgtaacttgcatgaagtgaagtaaatgaagtgtttttgcagccaatgga 21605189  T
Q  345 aaatgaaagattagatagtaaggaatggctagtaaagaatcaagaacaaaagagagccacatgacataagtatgaaaaattagtta 430  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  21605190 aaatgaaaga-tagatagtaaggaatgactaataaagaatcaagaacaaaagatagccacatgacataagtatgagagattagtta 21605274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 149 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 36991262 - 36991043
Alignment:
Q  149 gataacataagcaacatatatatgagcttagaaaaaa-tgaggagctttatagtaa---acttgtgtgtgtaagatgattgactaagaatatgaataatt 244  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  36991262 gataacataagcaacatatatataagcttagaaaaaaatgaggagctttatagtaataaacttgtgtgtgtaagaggattgattaagaatatgaataatt 36991163  T
Q  245 ttaaaatgtaacccctcactattaataaaatggattataatacattcattgtgtaacttccatgaagtgaagtgaatggagagtttttccaattgatggg 344  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||||     
T  36991162 ttaaaatgtaacccctcaatattaataaaatagattataatgcattcattgtgtaacttgcatgaagtgaagtaaatggagagtttttgtaactgatgga 36991063  T
Q  345 aaatgaaagattagatagtaa 365  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  36991062 aaatgaaaga-tagatagtaa 36991043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 447 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 10180485 - 10180436
Alignment:
Q  447 gtgaagtgacacataaacaaaatgtagtttagaatacatgtatatataga 496  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10180485 gtgaggtgacacataagcaaaatgtaggttagaatacatgtatatataga 10180436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 455 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 11381296 - 11381255
Alignment:
Q  455 acacataaacaaaatgtagtttagaatacatgtatatataga 496  Q
    |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11381296 acacataggcaaaatgtaggttagaatacatgtatatataga 11381255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 395 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 11386869 - 11386776
Alignment:
Q  395 agagagccacatgacataagtatgaaaaattagttacaaaaagaaaatattagtgaagtgacacataaacaaaatgtagtttagaatacatgta 488  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||  || | | || |||| ||||||  |||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  11386869 agagagccacatggcataagtatgagagattggttacaaagggagagttttggtgaggtgacatgtaaggaaaatgtagcttagaatacatgta 11386776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 170; Significance: 5e-91; HSPs: 14)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 152 - 430
Target Start/End: Original strand, 41646633 - 41646912
Alignment:
Q  152 aacataagcaacatatatatgagcttagaaaaaa--tgaggagctttatagtaa---acttgtgtgtgtaagatgattgactaagaatatgaataatttt 246  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  41646633 aacataagcaacatatatataagcttagaaaaaaaatgaggagctttatagtaataaacttgtgtgtgtaagaggattgattaagaatatgaataatttt 41646732  T
Q  247 aaaatgtaacccctcactattaataaaatggattataatacattcattgtgtaacttccatgaagtgaagtgaatggagagtttttccaattgatgggaa 346  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| |||||| |||  ||||| ||    
T  41646733 aaaatgtaacccctcaatattaataaaatggattaaaatacattcattgtgtaacttgcatgaaatgaagtaaatggagtgtttttgcaaccgatggaaa 41646832  T
Q  347 atgaaagattagatagtaaggaatggctagtaaagaatcaagaacaaaagagagccacatgacataagtatgaaaaattagtta 430  Q
    |||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  41646833 atgaaagat----aagtaaggaatggctagtaaagaatcaagaacaaaagatagccacatggcataagtatgagagattagtta 41646912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 149 - 365
Target Start/End: Original strand, 7574014 - 7574233
Alignment:
Q  149 gataacataagcaacatatatatgagcttagaaaaaa-tgaggagctttatagtaa---acttgtgtgtgtaagatgattgactaagaatatgaataatt 244  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||   | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  7574014 gataacataagcaacatatatataagcttagaaaaaaatgaggagctttatagtaataaatttgtgtgtgtaagaggattgattaagaatatgaataatt 7574113  T
Q  245 ttaaaatgtaacccctcactattaataaaatggattataatacattcattgtgtaacttccatgaagtgaagtgaatggagagtttttccaattgatggg 344  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||||     
T  7574114 ttaaaatgtaacccctcaatattaataaaatggattataatgcattcattgtgtaacttgcatgaagtgaagtaaatggagagtttttgtaactgatgga 7574213  T
Q  345 aaatgaaagattagatagtaa 365  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  7574214 aaatgaaaga-tagatagtaa 7574233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 149 - 365
Target Start/End: Original strand, 16668609 - 16668828
Alignment:
Q  149 gataacataagcaacatatatatgagcttagaaaaaa-tgaggagctttatagtaa---acttgtgtgtgtaagatgattgactaagaatatgaataatt 244  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||   | |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  16668609 gataacataagcaacatatatataagcttagaaaaaaatgaggagctttatagtaataaatttgtgtgtgtaagaggattgatcaagaatatgaataatt 16668708  T
Q  245 ttaaaatgtaacccctcactattaataaaatggattataatacattcattgtgtaacttccatgaagtgaagtgaatggagagtttttccaattgatggg 344  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||||     
T  16668709 ttaaaatgtaacccctcaatattaataaaatggattataatgcattcattatgtaacttgcatgaagtgaagtaaatggagagtttttgtaactgatgga 16668808  T
Q  345 aaatgaaagattagatagtaa 365  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  16668809 aaatgaaaga-tagatagtaa 16668828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 221 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 43564302 - 43564237
Alignment:
Q  221 gattgactaagaatatgaataattttaaaatgtaacccctcactattaataaaatggattataata 286  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43564302 gattgattaagaatatgaataattttaaaatgtaacccctcaatattaataaaatggattataata 43564237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 228 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 29455505 - 29455447
Alignment:
Q  228 taagaatatgaataattttaaaatgtaacccctcactattaataaaatggattataata 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  29455505 taagaatatgaataattttaaaatgtaacccctcgatattaataaaatggattataata 29455447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 420 - 490
Target Start/End: Original strand, 6414329 - 6414398
Alignment:
Q  420 aaaattagttacaaaaagaaaatattagtgaagtgacacataaacaaaatgtagtttagaatacatgtata 490  Q
    ||||||||||| ||| | |||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  6414329 aaaattagttaaaaagaaaaaa-attagtgaggtgacacataagcaaagtgtagtttagaatacatgtata 6414398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 447 - 496
Target Start/End: Original strand, 22990032 - 22990081
Alignment:
Q  447 gtgaagtgacacataaacaaaatgtagtttagaatacatgtatatataga 496  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  22990032 gtgaggtgacacataagcaaaatgtacgttagaatacatgtatatataga 22990081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 149 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 29455557 - 29455521
Alignment:
Q  149 gataacataagcaacatatatatgagcttagaaaaaa 185  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29455557 gataacataagcaacatatatataagcttagaaaaaa 29455521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 149 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 43564347 - 43564311
Alignment:
Q  149 gataacataagcaacatatatatgagcttagaaaaaa 185  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43564347 gataacataagcaacatatatataagcttagaaaaaa 43564311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 447 - 502
Target Start/End: Original strand, 37904098 - 37904153
Alignment:
Q  447 gtgaagtgacacataaacaaaatgtagtttagaatacatgtatatatagagataga 502  Q
    |||| ||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  37904098 gtgaggtgacacataggaaaaatgtagcttagaatacatgtatatatagatataga 37904153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 447 - 496
Target Start/End: Original strand, 7574355 - 7574404
Alignment:
Q  447 gtgaagtgacacataaacaaaatgtagtttagaatacatgtatatataga 496  Q
    |||| ||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7574355 gtgaggtgacacataggaaaaatgtaggttagaatacatgtatatataga 7574404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 447 - 496
Target Start/End: Original strand, 16668938 - 16668987
Alignment:
Q  447 gtgaagtgacacataaacaaaatgtagtttagaatacatgtatatataga 496  Q
    |||| ||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16668938 gtgaggtgacacataggaaaaatgtaggttagaatacatgtatatataga 16668987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 441 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 29455130 - 29455077
Alignment:
Q  441 atattagtgaagtgacacataaacaaaatgtagtttagaatacatgtatatata 494  Q
    ||||| |||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  29455130 atattggtgaagtgacacataggaaaaatgtagcttagaatacatatatatata 29455077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 441 - 494
Target Start/End: Original strand, 31618575 - 31618628
Alignment:
Q  441 atattagtgaagtgacacataaacaaaatgtagtttagaatacatgtatatata 494  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||    
T  31618575 atattggtgaggtgacacataaacaaagtgtagcttagaatatatatatatata 31618628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 159; Significance: 2e-84; HSPs: 8)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 150 - 430
Target Start/End: Original strand, 22912455 - 22912735
Alignment:
Q  150 ataacataagcaacatatatatgagcttagaaaa-aatgaggagctttatagtaaacttgtgtgtgtaagatgattgactaagaatatgaataattttaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  22912455 ataacataagcaacatatatataagcttagaaaaaaatgaggagcttaatagtaaattcgtgtgtgtaagaggattgattaagaatatgaataattttaa 22912554  T
Q  249 aatgtaacccctcactattaataaaatggattataatacattcattgtgtaacttccatgaagtgaagtgaatggagagtttttccaa-ttgatgggaaa 347  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| | || |||||||||| ||||||| |||| | |||  ||||||||||    
T  22912555 aatgtaactcctca-tattaataaaatggtttataatgcattcattttgtaacatgcaagaagtgaagtaaatggagtgtttctgcaacctgatgggaaa 22912653  T
Q  348 tgaaagattagatagtaaggaatggctagtaaagaatcaagaacaaaagagagccacatgacataagtatgaaaaattagtta 430  Q
    ||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  22912654 tgaaaga-taaataataaggaatggctagtaaagaatcaagaacaaaagagagccacatggcataagtatgagagattagtta 22912735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 149 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 13786448 - 13786229
Alignment:
Q  149 gataacataagcaacatatatatgagcttagaaaaaa-tgaggagctttatagtaa---acttgtgtgtgtaagatgattgactaagaatatgaataatt 244  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||   | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  13786448 gataacataagcaacatatatataagcttagaaaaaaatgaggagctttatagtaataaatttgtgtgtgtaagaggattgattaagaatatgaataatt 13786349  T
Q  245 ttaaaatgtaacccctcactattaataaaatggattataatacattcattgtgtaacttccatgaagtgaagtgaatggagagtttttccaattgatggg 344  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||||     
T  13786348 ttaaaatgtaacccctcaatattaataaaatggattataatgcattcattgtgtaacttgcatgaagtgaagtaaatggagagtttttgtaactgatgga 13786249  T
Q  345 aaatgaaagattagatagtaa 365  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  13786248 aaatgaaaga-tagatagtaa 13786229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 149 - 365
Target Start/End: Original strand, 25807694 - 25807914
Alignment:
Q  149 gataacataagcaacatatatatgagcttagaaaaaa--tgaggagctttatagtaa---acttgtgtgtgtaagatgattgactaagaatatgaataat 243  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  25807694 gataacataagaaacatatatataagcttagaaaaaaaatgaggagctttatagtaataaacttgtgtgtgtaagaggattgattaagaatatgaataat 25807793  T
Q  244 tttaaaatgtaacccctcactattaataaaatggattataatacattcattgtgtaacttccatgaagtgaagtgaatggagagtttttccaattgatgg 343  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||    
T  25807794 tttaaaatgtaacccctcaatattaataaaatggattataatgcattcattgtgtaacttgcatgaagtgaagtaaatggaaagtttttgtaattgatgg 25807893  T
Q  344 gaaatgaaagattagatagtaa 365  Q
     |||||||||| ||||||||||    
T  25807894 aaaatgaaaga-tagatagtaa 25807914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 181 - 477
Target Start/End: Original strand, 23725986 - 23726278
Alignment:
Q  181 aaaaatgaggagctttatagtaaacttgtgtgtgtaagatgattgactaagaatatgaataattttaaaatgtaacccctcactattaataaaatggatt 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  | | |||||||||||||||||    
T  23725986 aaaaatgaggagctttatagtaaacttgtgtgc--aagaggattgattaagaatatgaataattt-aaaatgtaaccgtttaatattaataaaatggatt 23726082  T
Q  281 ataatacattcattgtgtaacttccatgaagtgaagtgaatggagagtttttccaattgatgggaaatgaaagattagatagtaaggaatggctagtaaa 380  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||| || |||||| |||  ||||  ||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||    
T  23726083 ataattcattcattgtgcaacttgcatgaaatgaagtaaatgaagtgtttttgcaacagatgaaaaatgaaagat-agatagtaaagaatgaccagtaaa 23726181  T
Q  381 gaatcaagaacaaaagagagccacatgacataagtatgaaaaattagttacaaaaagaaaatattagtgaagtgacacataaacaaaatgtagttta 477  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||| | | |   | |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23726182 gaatcaagaacaaaagagagccatataacataagtatgagagattagttacaaaagggagacgctggtgaagtgacacataaacaaaatgtaattta 23726278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 447 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 29679095 - 29679029
Alignment:
Q  447 gtgaagtgacacataaacaaaatgtagtttagaatacatgtatat--atagagatagagatagagat 511  Q
    |||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  29679095 gtgaggtgacacataagcaaagtgtagtttagaatacatgtatatagagagagatagagatagagat 29679029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 447 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 39621692 - 39621645
Alignment:
Q  447 gtgaagtgacacataaacaaaatgtagtttagaatacatgtatatata 494  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39621692 gtgaggtgacacataagcaaagtgtagtttagaatacatgtatatata 39621645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 447 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 13786107 - 13786058
Alignment:
Q  447 gtgaagtgacacataaacaaaatgtagtttagaatacatgtatatataga 496  Q
    |||| ||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13786107 gtgaggtgacacataggaaaaatgtaggttagaatacatgtatatataga 13786058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 464 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 42332523 - 42332478
Alignment:
Q  464 caaaatgtagtttagaatacatgtatatatagagatagagatagagat 511  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  42332523 caaagtgtagtttataatacatgtatata--gagatagagatagagat 42332478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 143; Significance: 7e-75; HSPs: 6)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 149 - 365
Target Start/End: Original strand, 13433376 - 13433595
Alignment:
Q  149 gataacataagcaacatatatatgagcttagaaaaaa-tgaggagctttatagtaa---acttgtgtgtgtaagatgattgactaagaatatgaataatt 244  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||   | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  13433376 gataacataagcaacatatatataagcttagaaaaaaatgaggagctttatagtaataaatttgtgtgtgtaagaggattgattaagaatatgaataatt 13433475  T
Q  245 ttaaaatgtaacccctcactattaataaaatggattataatacattcattgtgtaacttccatgaagtgaagtgaatggagagtttttccaattgatggg 344  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||||     
T  13433476 ttaaaatgtaacccctcaatattaataaaatggattataatgcattcattgtgtaacttgcatgaagtgaagtaaatggagagtttttgtaactgatgga 13433575  T
Q  345 aaatgaaagattagatagtaa 365  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  13433576 aaatgaaaga-tagatagtaa 13433595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 149 - 268
Target Start/End: Original strand, 16712037 - 16712155
Alignment:
Q  149 gataacataagcaacatatatatgagcttagaaaaaa-tgaggagctttatagtaaacttgtgtgtgtaagatgattgactaagaatatgaataatttta 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16712037 gataacataagcaacatatatatgagcttagaaaaaaatgaggagttttatggtgaac--gtgtgtgtaagatgattgattaagaatatgaataatttta 16712134  T
Q  248 aaatgtaacccctcactatta 268  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  16712135 aaatgtaacccctcactatta 16712155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 452 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 18877405 - 18877355
Alignment:
Q  452 gtgacacataaacaaaatgtagtttagaatacatgtatatatagagataga 502  Q
    ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  18877405 gtgacacctaagcaaaatgtaggttagaatacatgtatatagatagataga 18877355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 447 - 496
Target Start/End: Original strand, 8643585 - 8643634
Alignment:
Q  447 gtgaagtgacacataaacaaaatgtagtttagaatacatgtatatataga 496  Q
    |||| ||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8643585 gtgaggtgacatgtaagcaaaatgtagcttagaatacatgtatatataga 8643634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 447 - 496
Target Start/End: Original strand, 13433717 - 13433766
Alignment:
Q  447 gtgaagtgacacataaacaaaatgtagtttagaatacatgtatatataga 496  Q
    |||| ||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13433717 gtgaggtgacacataggaaaaatgtaggttagaatacatgtatatataga 13433766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 455 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 18882343 - 18882289
Alignment:
Q  455 acacataaacaaaatgtagtttagaatacatgtatatatagagatagagatagagat 511  Q
    |||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  18882343 acacctaagcaaagtgtagcttagaatacatgtatata--gagatagagatagagat 18882289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0713 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0713
Description:

Target: scaffold0713; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 447 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 7411 - 7356
Alignment:
Q  447 gtgaagtgacacataaacaaaatgtagtttagaatacatgtatatatagagataga 502  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||    
T  7411 gtgaagtgacatgtaagcaaaatgtagcttaaaatacatgtatatatatagataga 7356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0182 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0182
Description:

Target: scaffold0182; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 182 - 236
Target Start/End: Original strand, 10116 - 10170
Alignment:
Q  182 aaaatgaggagctttatagtaaacttgtgtgtgtaagatgattgactaagaatat 236  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||| || ||| |||||    
T  10116 aaaatgagaagctttgtagtaaacttgtgtgtgtaagaggatagaataaaaatat 10170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 455 - 496
Target Start/End: Original strand, 1381 - 1422
Alignment:
Q  455 acacataaacaaaatgtagtttagaatacatgtatatataga 496  Q
    |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1381 acacataggcaaaatgtaggttagaatacatgtatatataga 1422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0316 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0316
Description:

Target: scaffold0316; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 452 - 496
Target Start/End: Original strand, 5503 - 5547
Alignment:
Q  452 gtgacacataaacaaaatgtagtttagaatacatgtatatataga 496  Q
    ||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5503 gtgacacataggaaaaatgtaggttagaatacatgtatatataga 5547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University