View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF16227_high_2 (Length: 429)

Name: NF16227_high_2
Description: NF16227
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF16227_high_2
NF16227_high_2
[»] chr6 (44 HSPs)
chr6 (11-416)||(27623522-27623927)
chr6 (56-417)||(8899561-8899918)
chr6 (11-417)||(27355926-27356330)
chr6 (11-417)||(34458323-34458725)
chr6 (11-417)||(33370246-33370650)
chr6 (11-417)||(27284177-27284581)
chr6 (56-400)||(13518056-13518396)
chr6 (56-401)||(27491128-27491469)
chr6 (70-417)||(4539634-4539978)
chr6 (70-417)||(26110287-26110629)
chr6 (70-417)||(26772505-26772847)
chr6 (70-417)||(28213433-28213777)
chr6 (56-399)||(4763760-4764099)
chr6 (57-417)||(27200165-27200522)
chr6 (57-417)||(27248711-27249068)
chr6 (56-399)||(16755817-16756157)
chr6 (56-399)||(27063479-27063817)
chr6 (70-399)||(26791813-26792138)
chr6 (56-417)||(29555537-29555894)
chr6 (70-406)||(30551876-30552208)
chr6 (11-417)||(22928696-22929102)
chr6 (70-393)||(29579018-29579336)
chr6 (56-399)||(28166491-28166831)
chr6 (69-417)||(4531267-4531610)
chr6 (56-399)||(29507413-29507754)
chr6 (56-400)||(16680135-16680476)
chr6 (86-399)||(26926765-26927073)
chr6 (70-416)||(16937901-16938243)
chr6 (74-393)||(13292831-13293140)
chr6 (69-399)||(4778877-4779204)
chr6 (14-399)||(14139218-14139595)
chr6 (56-399)||(27013730-27014062)
chr6 (70-315)||(26666534-26666774)
chr6 (69-399)||(27031020-27031343)
chr6 (11-399)||(27208901-27209283)
chr6 (11-399)||(27239945-27240327)
chr6 (69-399)||(24869707-24870027)
chr6 (73-399)||(27025142-27025460)
chr6 (69-399)||(24299635-24299956)
chr6 (64-399)||(15406403-15406730)
chr6 (64-399)||(15418190-15418517)
chr6 (69-356)||(20174589-20174882)
chr6 (69-356)||(22161109-22161402)
chr6 (320-417)||(23851450-23851547)
[»] chr4 (28 HSPs)
chr4 (11-417)||(39856630-39857032)
chr4 (70-417)||(18794546-18794889)
chr4 (11-399)||(20332290-20332677)
chr4 (11-399)||(40099504-40099891)
chr4 (11-399)||(27157180-27157568)
chr4 (56-399)||(24586276-24586616)
chr4 (11-400)||(14104553-14104939)
chr4 (56-400)||(30759774-30760112)
chr4 (56-400)||(33667718-33668056)
chr4 (56-399)||(54839402-54839740)
chr4 (11-399)||(14753362-14753747)
chr4 (70-406)||(21975708-21976040)
chr4 (56-399)||(5700551-5700890)
chr4 (69-399)||(34182892-34183216)
chr4 (70-406)||(31120439-31120772)
chr4 (70-417)||(5011870-5012214)
chr4 (69-399)||(24118674-24118999)
chr4 (11-393)||(1673877-1674258)
chr4 (11-417)||(1906245-1906654)
chr4 (11-417)||(15233809-15234217)
chr4 (69-399)||(36338454-36338772)
chr4 (69-393)||(6575879-6576191)
chr4 (11-417)||(15276497-15276904)
chr4 (11-417)||(15380106-15380510)
chr4 (69-399)||(14671027-14671350)
chr4 (69-399)||(17019063-17019385)
chr4 (69-320)||(36324245-36324484)
chr4 (347-406)||(18311379-18311439)
[»] chr7 (32 HSPs)
chr7 (56-417)||(5141135-5141493)
chr7 (70-411)||(26441238-26441576)
chr7 (56-398)||(4139046-4139386)
chr7 (70-417)||(11446867-11447210)
chr7 (70-417)||(3451297-3451641)
chr7 (11-399)||(26678858-26679245)
chr7 (75-417)||(16745340-16745679)
chr7 (56-399)||(26663713-26664053)
chr7 (53-403)||(45393212-45393558)
chr7 (70-399)||(39206954-39207279)
chr7 (56-417)||(26268886-26269247)
chr7 (11-406)||(24586289-24586682)
chr7 (11-399)||(16443757-16444144)
chr7 (56-399)||(26509496-26509837)
chr7 (11-399)||(5154081-5154466)
chr7 (11-393)||(5164387-5164767)
chr7 (56-399)||(31558195-31558534)
chr7 (56-399)||(26518790-26519127)
chr7 (70-417)||(4205368-4205711)
chr7 (70-417)||(26313664-26314006)
chr7 (56-393)||(11418580-11418913)
chr7 (70-399)||(45737298-45737625)
chr7 (11-417)||(16047294-16047695)
chr7 (11-399)||(2160567-2160955)
chr7 (70-417)||(31084437-31084781)
chr7 (11-417)||(10847562-10847968)
chr7 (11-314)||(26595750-26596053)
chr7 (14-399)||(2779249-2779626)
chr7 (56-399)||(31129902-31130235)
chr7 (69-399)||(16512254-16512574)
chr7 (64-399)||(10910735-10911060)
chr7 (315-399)||(26531926-26532010)
[»] chr3 (57 HSPs)
chr3 (69-417)||(4629730-4630073)
chr3 (69-417)||(21680646-21680989)
chr3 (11-417)||(29658879-29659283)
chr3 (11-417)||(32296574-32296979)
chr3 (69-417)||(29142725-29143072)
chr3 (11-399)||(5727941-5728328)
chr3 (11-399)||(47029416-47029803)
chr3 (11-399)||(5717031-5717418)
chr3 (11-399)||(5764040-5764427)
chr3 (56-406)||(4340634-4340980)
chr3 (56-417)||(18248683-18249040)
chr3 (64-417)||(20570812-20571161)
chr3 (11-417)||(28027236-28027638)
chr3 (11-399)||(10649034-10649420)
chr3 (56-398)||(31958413-31958753)
chr3 (70-417)||(28109923-28110271)
chr3 (56-398)||(5603271-5603611)
chr3 (56-398)||(24334137-24334477)
chr3 (56-399)||(5472951-5473289)
chr3 (14-406)||(5590275-5590665)
chr3 (56-399)||(8217595-8217936)
chr3 (70-399)||(51787985-51788310)
chr3 (56-399)||(4422881-4423220)
chr3 (11-417)||(16422128-16422532)
chr3 (69-399)||(22381552-22381877)
chr3 (11-417)||(16618400-16618808)
chr3 (70-399)||(18231156-18231481)
chr3 (11-399)||(4790544-4790931)
chr3 (56-406)||(17978908-17979255)
chr3 (56-399)||(17970824-17971161)
chr3 (70-399)||(22864820-22865143)
chr3 (70-399)||(22879879-22880202)
chr3 (56-399)||(10402112-10402450)
chr3 (70-398)||(28345135-28345458)
chr3 (56-399)||(5019676-5020014)
chr3 (11-393)||(18286266-18286645)
chr3 (11-393)||(18301567-18301946)
chr3 (56-399)||(20071996-20072337)
chr3 (56-399)||(6536701-6537040)
chr3 (56-391)||(11104319-11104651)
chr3 (56-399)||(7079185-7079529)
chr3 (56-399)||(48471890-48472233)
chr3 (11-399)||(18057223-18057612)
chr3 (69-399)||(31030216-31030535)
chr3 (69-401)||(18336589-18336911)
chr3 (11-393)||(6207869-6208245)
chr3 (11-394)||(19700454-19700847)
chr3 (11-393)||(4727602-4727976)
chr3 (69-394)||(32445122-32445434)
chr3 (69-399)||(15735071-15735392)
chr3 (69-393)||(35886733-35887049)
chr3 (64-399)||(4689614-4689939)
chr3 (64-399)||(5658097-5658425)
chr3 (70-399)||(8283430-8283766)
chr3 (291-399)||(15886894-15887004)
chr3 (315-399)||(8002523-8002607)
chr3 (64-219)||(15886707-15886857)
[»] chr2 (41 HSPs)
chr2 (69-417)||(40239489-40239832)
chr2 (11-399)||(27809699-27810087)
chr2 (70-417)||(12710520-12710863)
chr2 (64-417)||(27782212-27782561)
chr2 (11-399)||(254510-254896)
chr2 (11-399)||(37945723-37946110)
chr2 (11-399)||(16167476-16167862)
chr2 (11-399)||(3788492-3788877)
chr2 (11-399)||(12592808-12593198)
chr2 (56-398)||(22922048-22922388)
chr2 (56-393)||(12661543-12661875)
chr2 (70-399)||(37931370-37931702)
chr2 (70-399)||(13930463-13930790)
chr2 (56-398)||(19410389-19410729)
chr2 (11-417)||(39896048-39896452)
chr2 (56-399)||(27122523-27122860)
chr2 (56-400)||(34867680-34868019)
chr2 (11-399)||(37383675-37384061)
chr2 (11-417)||(37679749-37680155)
chr2 (11-417)||(37695014-37695420)
chr2 (70-406)||(16823256-16823588)
chr2 (70-406)||(16897892-16898224)
chr2 (56-399)||(9343892-9344231)
chr2 (69-417)||(11629103-11629446)
chr2 (56-399)||(34160842-34161183)
chr2 (11-417)||(21671028-21671435)
chr2 (56-399)||(39045727-39046066)
chr2 (11-406)||(21697031-21697427)
chr2 (70-399)||(32055800-32056124)
chr2 (64-399)||(31882285-31882615)
chr2 (70-349)||(31868705-31868979)
chr2 (56-399)||(34297154-34297486)
chr2 (11-417)||(27396303-27396717)
chr2 (11-417)||(19450276-19450689)
chr2 (69-399)||(28888277-28888598)
chr2 (64-399)||(34268839-34269165)
chr2 (69-399)||(23122496-23122817)
chr2 (64-399)||(27428366-27428690)
chr2 (70-399)||(20843910-20844235)
chr2 (11-196)||(23116993-23117180)
chr2 (344-399)||(31887682-31887737)
[»] chr5 (49 HSPs)
chr5 (56-405)||(3795539-3795885)
chr5 (69-417)||(33298522-33298870)
chr5 (11-399)||(30174472-30174859)
chr5 (56-400)||(33881132-33881472)
chr5 (11-417)||(28953548-28953952)
chr5 (11-400)||(18369300-18369687)
chr5 (70-417)||(31820239-31820580)
chr5 (56-393)||(11555367-11555699)
chr5 (11-417)||(22894405-22894808)
chr5 (56-417)||(32590091-32590447)
chr5 (11-399)||(41680711-41681098)
chr5 (64-403)||(30158037-30158372)
chr5 (70-417)||(37352473-37352816)
chr5 (11-417)||(2517054-2517459)
chr5 (56-399)||(37760989-37761329)
chr5 (70-399)||(37746157-37746482)
chr5 (11-394)||(43084270-43084651)
chr5 (69-406)||(6880303-6880637)
chr5 (70-417)||(9323466-9323808)
chr5 (70-403)||(8659301-8659629)
chr5 (70-399)||(13318657-13318981)
chr5 (70-400)||(24729976-24730302)
chr5 (70-417)||(12138165-12138507)
chr5 (56-394)||(18494583-18494916)
chr5 (14-399)||(9544478-9544862)
chr5 (56-399)||(28655249-28655589)
chr5 (56-399)||(40467368-40467707)
chr5 (70-406)||(33522382-33522715)
chr5 (70-399)||(15752687-15753006)
chr5 (70-399)||(30035433-30035757)
chr5 (56-393)||(23631982-23632317)
chr5 (56-400)||(11329643-11329985)
chr5 (70-417)||(26486385-26486717)
chr5 (70-399)||(5643807-5644130)
chr5 (56-399)||(13180608-13180943)
chr5 (56-399)||(13436489-13436834)
chr5 (69-399)||(18122244-18122570)
chr5 (69-399)||(37665314-37665640)
chr5 (56-399)||(34622525-34622865)
chr5 (14-399)||(31437471-31437847)
chr5 (69-399)||(15652588-15652912)
chr5 (56-394)||(25206289-25206630)
chr5 (56-394)||(25270445-25270786)
chr5 (69-399)||(22992952-22993270)
chr5 (64-394)||(23897886-23898206)
chr5 (69-399)||(33783494-33783815)
chr5 (69-394)||(24975861-24976176)
chr5 (73-399)||(24608252-24608570)
chr5 (64-399)||(30940643-30940968)
[»] scaffold0418 (1 HSPs)
scaffold0418 (56-399)||(12036-12374)
[»] chr8 (24 HSPs)
chr8 (11-406)||(28355780-28356176)
chr8 (56-399)||(9360622-9360960)
chr8 (11-399)||(31360528-31360914)
chr8 (70-399)||(33248366-33248690)
chr8 (56-398)||(31483747-31484087)
chr8 (70-417)||(12086614-12086958)
chr8 (70-405)||(29835317-29835647)
chr8 (56-417)||(19680430-19680786)
chr8 (11-399)||(18796706-18797093)
chr8 (70-399)||(33264731-33265055)
chr8 (56-399)||(15773574-15773913)
chr8 (70-399)||(18715480-18715807)
chr8 (70-417)||(19202266-19202598)
chr8 (56-393)||(21342047-21342381)
chr8 (56-399)||(44566980-44567322)
chr8 (137-417)||(16260205-16260480)
chr8 (56-393)||(19911039-19911374)
chr8 (11-417)||(27602744-27603141)
chr8 (11-417)||(22074759-22075164)
chr8 (14-399)||(19655180-19655560)
chr8 (69-399)||(19694095-19694417)
chr8 (69-399)||(2131158-2131478)
chr8 (64-399)||(22138906-22139231)
chr8 (69-361)||(14569194-14569480)
[»] chr1 (11 HSPs)
chr1 (56-399)||(3647148-3647487)
chr1 (56-399)||(10968667-10969007)
chr1 (70-417)||(51644204-51644549)
chr1 (70-392)||(10951100-10951419)
chr1 (70-400)||(28591084-28591409)
chr1 (11-417)||(20334283-20334689)
chr1 (56-399)||(28155728-28156069)
chr1 (56-399)||(41787224-41787565)
chr1 (11-417)||(20466761-20467173)
chr1 (11-417)||(16201895-16202307)
chr1 (69-417)||(21891690-21892020)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (56-417)||(3094-3453)
scaffold0159 (56-223)||(17980-18147)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (56-417)||(15551-15915)
[»] scaffold0547 (1 HSPs)
scaffold0547 (56-399)||(9557-9895)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (70-417)||(13931-14275)
[»] scaffold0322 (2 HSPs)
scaffold0322 (70-417)||(1639-1982)
scaffold0322 (11-417)||(12028-12443)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (56-399)||(8844-9182)
[»] scaffold0792 (1 HSPs)
scaffold0792 (11-399)||(4471-4860)
[»] scaffold0143 (2 HSPs)
scaffold0143 (56-399)||(9914-10252)
scaffold0143 (69-399)||(33297-33620)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (56-399)||(18585-18926)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (11-417)||(25097-25509)
[»] scaffold0288 (1 HSPs)
scaffold0288 (239-417)||(359-537)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (69-399)||(6066-6389)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (69-393)||(24834-25150)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (11-181)||(1-173)
[»] scaffold0241 (1 HSPs)
scaffold0241 (255-417)||(26243-26405)
[»] scaffold0099 (2 HSPs)
scaffold0099 (261-393)||(40759-40898)
scaffold0099 (69-116)||(40558-40606)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 326; Significance: 0; HSPs: 44)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 416
Target Start/End: Original strand, 27623522 - 27623927
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgctggtatcacaa--tgagatggacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||   ||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27623522 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 27623621  T
Q  109 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaa-tgttttgtatata 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27623622 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaatttttaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaaatgttttgtatata 27623721  T
Q  208 gctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgg 307  Q
    ||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27623722 gctttgaaagtagaag---aaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgg 27623818  T
Q  308 attcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaaa 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27623819 attcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaag 27623918  T
Q  408 cttctgatg 416  Q
    |||||||||    
T  27623919 cttctgatg 27623927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 56 - 417
Target Start/End: Original strand, 8899561 - 8899918
Alignment:
Q  56 gacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 155  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8899561 gacatcaacataccctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 8899660  T
Q  156 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaa 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||    
T  8899661 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtatataactttgaaagtagaag-----aaaatagagttttcaaacaaaagcaa 8899755  T
Q  255 aggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacatt 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8899756 aggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacatt 8899855  T
Q  355 gaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaaacttctgatga 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  8899856 gaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatga 8899918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 11 - 417
Target Start/End: Original strand, 27355926 - 27356330
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgctggtatcacaa--tgagatggacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 108  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||| ||| ||||   ||| || ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27355926 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 27356025  T
Q  109 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 207  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27356026 caggtttgcttttcaaaatagaccaaaggttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 27356125  T
Q  208 gctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgg 307  Q
    ||||||||||||||||         |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27356126 gctttgaaagtagaag----aaaaatagagttt-caaacaaaagcaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgg 27356220  T
Q  308 attcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaaa 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27356221 attcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaag 27356320  T
Q  408 cttctgatga 417  Q
    ||| ||||||    
T  27356321 cttttgatga 27356330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 11 - 417
Target Start/End: Original strand, 34458323 - 34458725
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgctggtatcacaa--tgagatggacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 108  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||| ||| ||||   ||| || ||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34458323 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 34458422  T
Q  109 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34458423 caggtttgcttttcaaaatagacaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaaccattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 34458521  T
Q  209 ctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 308  Q
    ||| |||| ||||||         |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34458522 cttagaaaatagaag-----aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 34458616  T
Q  309 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaaac 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34458617 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagc 34458716  T
Q  409 ttctgatga 417  Q
    || ||||||    
T  34458717 ttttgatga 34458725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 11 - 417
Target Start/End: Original strand, 33370246 - 33370650
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgctggtatcacaa--tgagatggacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 108  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| ||| || |   ||| || ||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33370246 cacagactatcctggaggagagcctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 33370345  T
Q  109 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 207  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  33370346 caggttcgcttttcaaaatagacaaaaaaatttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaagagaaagaaaatgctttgtatata 33370445  T
Q  208 gctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgg 307  Q
    ||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33370446 gctttgaaagtagaag-----aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgg 33370540  T
Q  308 attcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaaa 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  33370541 attcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaag 33370640  T
Q  408 cttctgatga 417  Q
    ||| ||||||    
T  33370641 cttttgatga 33370650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 11 - 417
Target Start/End: Original strand, 27284177 - 27284581
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgctggtatcacaa--tgagatggacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||   ||| || ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27284177 cacagactatcctggggaagagcctgtttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 27284276  T
Q  109 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27284277 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 27284376  T
Q  209 ctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 308  Q
    |||||||||||||||         ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  27284377 ctttgaaagtagaag---aaaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 27284472  T
Q  309 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaaac 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | |||| |||||||||||||| |||||| |    
T  27284473 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaagc 27284572  T
Q  409 ttctgatga 417  Q
    ||| |||||    
T  27284573 ttcagatga 27284581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 56 - 400
Target Start/End: Original strand, 13518056 - 13518396
Alignment:
Q  56 gacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 155  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13518056 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 13518155  T
Q  156 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaa 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||          |||||||||||||||||||||||    
T  13518156 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtggaa----aaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaa 13518251  T
Q  256 ggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattg 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13518252 ggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattg 13518351  T
Q  356 aacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagt 400  Q
    |||||||||| || |||| ||| | |||||||||||||| |||||    
T  13518352 aacacagtaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagt 13518396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 56 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 27491469 - 27491128
Alignment:
Q  56 gacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-t 154  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  27491469 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagaccaaaggttttcaattttcaaaaat 27491370  T
Q  155 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaa 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||         |||||||| ||||||||||||     
T  27491369 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatacagctttgaaagtagaag----aaaaatagagttt-caaacaaaagcac 27491275  T
Q  255 aggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacatt 354  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27491274 aagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacatt 27491175  T
Q  355 gaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagta 401  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27491174 gaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagta 27491128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 70 - 417
Target Start/End: Original strand, 4539634 - 4539978
Alignment:
Q  70 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4539634 ctcgctcatgcatgtttcatttgaacgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaacagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 4539733  T
Q  170 tgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatg 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |        ||||| |||||||||| |||| | |||||| ||||||    
T  4539734 tgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtaaaaag---aaaaatagag-tttcaaacaacagcacaagctcaatttgatg 4539829  T
Q  270 tataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaacca 368  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4539830 tataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacggtaacca 4539929  T
Q  369 ctacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaaacttctgatga 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  4539930 ctacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttttgatga 4539978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 70 - 417
Target Start/End: Original strand, 26110287 - 26110629
Alignment:
Q  70 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26110287 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaacagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 26110386  T
Q  170 tgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatg 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |         |||| ||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  26110387 tgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtaaaaagaaagc----agag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatg 26110481  T
Q  270 tataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccac 369  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26110482 tataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcac 26110581  T
Q  370 tacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaaacttctgatga 417  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||    
T  26110582 tacatttcttagaaactttgaatccacaagtgcagaagcttttgatga 26110629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 70 - 417
Target Start/End: Original strand, 26772505 - 26772847
Alignment:
Q  70 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagca 168  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  26772505 ctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgctcaggtttgtttttcaaaatagacaaaaagttttcaatcttcaaaaatgtttgtttcaagca 26772604  T
Q  169 ttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgat 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||    
T  26772605 ttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaag-----aaaatagaattt-caaacaaaagcacaagctcaaattgat 26772698  T
Q  269 gtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaacca 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26772699 gtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatca 26772798  T
Q  369 ctacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaaacttctgatga 417  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||    
T  26772799 ctacatttcttagaaactttgaatccacaagtgcagaagcttttgatga 26772847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 70 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 28213777 - 28213433
Alignment:
Q  70 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagca 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28213777 ctcgctcatgcatgtttcatttgaacgtaccctgttgctcaggcttgcttttcaaaacacacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagca 28213678  T
Q  169 ttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgat 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||         |||||||| ||||||| |||| | |||||| |||||    
T  28213677 ttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatacagctttgaaagtagaag----aaaaatagagttt-caaacaacagcacaagctcaatttgat 28213583  T
Q  269 gtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaacc 367  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28213582 gtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacggtaacc 28213483  T
Q  368 actacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaaacttctgatga 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  28213482 actacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttttgatga 28213433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 56 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 4764099 - 4763760
Alignment:
Q  56 gacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaat 154  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4764099 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaat 4764000  T
Q  155 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaa 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||    
T  4763999 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatatagctttgaaagtagaag-----aaaatagagttttcaaacaaaagcaa 4763905  T
Q  255 aggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacatt 354  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4763904 aggctcaaatagatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacatt 4763805  T
Q  355 gaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
    ||||||||||| ||  |||  || |||||||||||||||| ||||    
T  4763804 gaacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaag 4763760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 57 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 27200522 - 27200165
Alignment:
Q  57 acatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaa-aatg 155  Q
    |||||| ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27200522 acatcaacatactctcgttcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaagaatg 27200423  T
Q  156 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaa 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||         ||||||||| || ||||||||     
T  27200422 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtacatagctttgaaagtagaag-----aaaatagagtttt-aatcaaaagcac 27200329  T
Q  255 aggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacat 353  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27200328 aagctcaaatagatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacat 27200229  T
Q  354 tgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaaacttctgatga 417  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||    
T  27200228 tgaacacagtaatcactacatttcttagaaactttgaatccacaagtacagaagcttttgatga 27200165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 57 - 417
Target Start/End: Original strand, 27248711 - 27249068
Alignment:
Q  57 acatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaa-aatg 155  Q
    |||||| ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27248711 acatcaacatactctcgttcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaagaatg 27248810  T
Q  156 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaa 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||         ||||||||| || ||||||||     
T  27248811 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtacatagctttgaaagtagaag-----aaaatagagtttt-aatcaaaagcac 27248904  T
Q  255 aggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacat 353  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27248905 aagctcaaatagatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacat 27249004  T
Q  354 tgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaaacttctgatga 417  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||    
T  27249005 tgaacacagtaatcactacatttcttagaaactttgaatccacaagtacagaagcttttgatga 27249068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 56 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 16756157 - 16755817
Alignment:
Q  56 gacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaa--a 153  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |    
T  16756157 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattgtcaaaata 16756058  T
Q  154 tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagca 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||| |||||||||||||||    
T  16756057 tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaag----aaaaatagag-tttcaaacaaaagca 16755963  T
Q  254 aaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacat 353  Q
     | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16755962 caagctcaaattgatgtataagagcggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacat 16755863  T
Q  354 tgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
    |||||||||||| ||  ||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  16755862 tgaacacagtaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaag 16755817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 56 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 27063817 - 27063479
Alignment:
Q  56 gacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaat 154  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27063817 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaat 27063718  T
Q  155 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaa 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||         ||||||||| |||||||||||     
T  27063717 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatatagctttgaaagtagaag-----aaaatagagtttt-aaacaaaagcac 27063624  T
Q  255 aggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacatt 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27063623 aggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattagttggtggtacatt 27063524  T
Q  355 gaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
    ||||||||||| ||  ||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  27063523 gaacacagtaatcatgacatttcccagaaactttgaattcacaag 27063479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 70 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 26792138 - 26791813
Alignment:
Q  70 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagca 168  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26792138 ctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagca 26792039  T
Q  169 ttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgat 268  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||| | |||||||||||     
T  26792038 ttgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatatagctttgaaagtagaag-----aaaatagagttttcaaacaaaagcacaagctcaaattgac 26791944  T
Q  269 gtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaacca 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26791943 gtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgattccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatca 26791844  T
Q  369 ctacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
      ||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  26791843 tgacatttcctagaaactttgaattcgcaag 26791813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 56 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 29555894 - 29555537
Alignment:
Q  56 gacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaat 154  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  29555894 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgttcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagcttttaattttctaaaat 29555795  T
Q  155 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaa 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |         |||| ||||| |||||||||     
T  29555794 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtaaaaagaaaac----agag-tttcagacaaaagcac 29555700  T
Q  255 aggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacatt 354  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29555699 aagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgcgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacatt 29555600  T
Q  355 gaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaaacttctgatga 417  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| | |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29555599 gaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatga 29555537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 70 - 406
Target Start/End: Original strand, 30551876 - 30552208
Alignment:
Q  70 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 169  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30551876 ctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgctcgggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 30551975  T
Q  170 tgtcattatcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgat 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |         |||| ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  30551976 tgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatatagctttgaaagtaaaaagaaaac----agag-tttcaaacaaaagcacagtctcaaattgat 30552070  T
Q  269 gtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaacca 368  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  30552071 gtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatca 30552170  T
Q  369 ctacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaa 406  Q
     |||| ||| | | |||||||||| |||||||||||||    
T  30552171 ttacatttcctgggaactttgaatccacaagtacagaa 30552208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 11 - 417
Target Start/End: Original strand, 22928696 - 22929102
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgctggtatcacaa--tgagatggacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||   ||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  22928696 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctattgct 22928795  T
Q  109 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagtttt-caattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg--ttttgtata 205  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |    
T  22928796 caggtttgctttcaaaaatagacaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttttgtaca 22928895  T
Q  206 tagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccac 305  Q
    ||||||||||||||||| |        ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  22928896 tagctttgaaagtagaaag----aaagtagag-tttcaaacaaaagcataggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccat 22928990  T
Q  306 ggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacaga 405  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | |||| ||||||||| |||| |||||    
T  22928991 ggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcgcaagcacaga 22929090  T
Q  406 aacttctgatga 417  Q
    | |||| |||||    
T  22929091 agcttcagatga 22929102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 70 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 29579336 - 29579018
Alignment:
Q  70 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaa-ttttcaaaatgtttgtttcaagca 168  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29579336 ctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaatttttcaaaatgtttgtttcaagca 29579237  T
Q  169 ttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgat 268  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||         ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29579236 ttgtcattatcaagatagaaggaaaatgatttgtatatagctttgaaaatagaag-----aaaatagag-tttcaaacaaaagcacaggctcaaattgat 29579143  T
Q  269 gtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaacca 368  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  29579142 gtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatca 29579043  T
Q  369 ctacagttcttagaaactttgaatt 393  Q
     |||| ||| | |||||||||||||    
T  29579042 ttacatttcctggaaactttgaatt 29579018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 56 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 28166831 - 28166491
Alignment:
Q  56 gacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc--aaaa 153  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  28166831 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaa 28166732  T
Q  154 tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagca 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||         ||||| |||||||||||||||    
T  28166731 tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaataaattgtatatagctttgaaagtagaag----aaaaatagag-tttcaaacaaaagca 28166637  T
Q  254 aaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacat 353  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28166636 aaggctcaaattgatgtatgagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacat 28166537  T
Q  354 tgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
    ||||||||| || || |||| ||| | ||||||||| |||| ||||    
T  28166536 tgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttggattcgcaag 28166491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 69 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 4531610 - 4531267
Alignment:
Q  69 actcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagc 167  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4531610 actcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcgggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagc 4531512  T
Q  168 attgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattga 267  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||         ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||    
T  4531511 attgtcattatcaaaatggaaagagaatgttttgtatacagctttgaaagtagaag----aaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattga 4531417  T
Q  268 tgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaacc 367  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4531416 tgtataagagtggtgatcagccgaaggcacgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatc 4531317  T
Q  368 actacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaaacttctgatga 417  Q
    |  ||| |||  |||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  4531316 atgacatttcccagaaacttcgaattcacaagtacagaagcttttgatga 4531267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 56 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 29507754 - 29507413
Alignment:
Q  56 gacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaat 154  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29507754 gacatcaacatactctcgctcatgcatgttccatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaat 29507655  T
Q  155 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaa 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||           |||| |||||||||||||||     
T  29507654 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaagagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtaaaa--aaagaaagcagag-tttcaaacaaaagcac 29507558  T
Q  255 aggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacatt 354  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29507557 aagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacatt 29507458  T
Q  355 gaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
    ||||||||||| ||  |||  || |||||||||||||||| ||||    
T  29507457 gaacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaag 29507413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 56 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 16680476 - 16680135
Alignment:
Q  56 gacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 155  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16680476 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgtcgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 16680377  T
Q  156 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaat-gttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaa 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||         ||||| |||||||||||||||     
T  16680376 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtatataactttgaaagtagaag---aaaaaatagag-tttcaaacaaaagcac 16680281  T
Q  255 aggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacatt 354  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16680280 aagctcaaattgacgtataagagtggtggtcagccgacggcgtgactccacggattttcaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacatt 16680181  T
Q  355 gaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagt 400  Q
    |||||||| || || |||| ||| | |||||||||||||| |||||    
T  16680180 gaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagt 16680135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 86 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 26927073 - 26926765
Alignment:
Q  86 tcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaat 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26927073 tcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaat 26926974  T
Q  185 agaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggt 284  Q
    |||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||         ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26926973 agaaggaaaataaattgtatatagctttgaaagtagaag-----aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggt 26926880  T
Q  285 cagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaa 384  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||| ||||||    
T  26926879 cagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcctagaaa 26926780  T
Q  385 ctttgaattcacaag 399  Q
    |||||||||| ||||    
T  26926779 ctttgaattcgcaag 26926765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 70 - 416
Target Start/End: Original strand, 16937901 - 16938243
Alignment:
Q  70 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagca 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  16937901 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaataaacaaaaagttttcagttttcaaaaatgtttgtttcaagca 16938000  T
Q  169 ttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgat 268  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||         ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  16938001 ttgccattatcaaaatagaaggaaaataatttgtatatagctttgaaaatagaag-----aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgat 16938094  T
Q  269 gtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaacca 368  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16938095 gtataagagtggtggtcggccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatca 16938194  T
Q  369 ctacagtt-cttagaaactttgaattcacaagtacagaaacttctgatg 416  Q
     |||| || |  | ||||||||||||| |||||||| || |||| ||||    
T  16938195 ttacatttcccaaaaaactttgaattcgcaagtacaaaagcttcagatg 16938243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 74 - 393
Target Start/End: Original strand, 13292831 - 13293140
Alignment:
Q  74 ctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtc 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||    
T  13292831 ctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa-----aaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcattatc 13292925  T
Q  174 attatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtata 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  13292926 attatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaag----aaaaatagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtata 13293020  T
Q  274 agagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactaca 373  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||    
T  13293021 agagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacggtaatcattaca 13293120  T
Q  374 gttcttagaaactttgaatt 393  Q
     ||| |||||||||||||||    
T  13293121 tttcctagaaactttgaatt 13293140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 69 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 4779204 - 4778877
Alignment:
Q  69 actcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagc 167  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4779204 actcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagc 4779106  T
Q  168 attgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagc-tttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattg 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||         ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||    
T  4779105 attgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttcgtatacagcttttgaaagtagaag----aaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattg 4779011  T
Q  267 atgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaa 365  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4779010 atgtataagagtggtggtcagccggaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaa 4778911  T
Q  366 ccactacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
     || |||| ||| |  ||||||||||||| ||||    
T  4778910 tcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaag 4778877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 14 - 399
Target Start/End: Original strand, 14139218 - 14139595
Alignment:
Q  14 agactatcctggggaagagcctgctggtatcacaa--tgagatggacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcag 111  Q
    |||||||||||| | ||| |||||| ||| ||||   ||| || ||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  14139218 agactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtctcatttgaatgtaccatgttgctcag 14139317  T
Q  112 gtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctt 211  Q
    |||||||||||||||     ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14139318 gtttgcttttcaaaa-----aaaactttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctt 14139412  T
Q  212 tgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 311  Q
    |||||||| || |         ||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  14139413 tgaaagtaaaaagaaagc----agagttt-caaacaaaagcacaagctcaaatagatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattt 14139507  T
Q  312 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||  || |||||||||||||||| ||||    
T  14139508 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaag 14139595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 56 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 27014062 - 27013730
Alignment:
Q  56 gacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 155  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||  ||||||||||||||||||    
T  27014062 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtctcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa------aaactttttcaattttcaaaatg 27013969  T
Q  156 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaa 255  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |         ||||||| |||||||||||| |    
T  27013968 tttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtaaaaagaaagc----agagttt-caaacaaaagcaca 27013874  T
Q  256 ggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattg 355  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27013873 agctcaaatagatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattg 27013774  T
Q  356 aacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
    |||||||||| ||  |||  || |||||||||||||||| ||||    
T  27013773 aacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaag 27013730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 70 - 315
Target Start/End: Original strand, 26666534 - 26666774
Alignment:
Q  70 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagca 168  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  26666534 ctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgctcaggtttgtttttcaaaatagacaaaaagttttcaatcttcaaaaatgtttgtttcaagca 26666633  T
Q  169 ttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgat 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  26666634 ttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaag-----aaaataga-atttcaaacaaaagcacaagctcaaattgat 26666727  T
Q  269 gtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaa 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26666728 gtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggattcacaa 26666774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 69 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 27031343 - 27031020
Alignment:
Q  69 actcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagca 168  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    |||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  27031343 actcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaaaa----aaactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagca 27031249  T
Q  169 tt-gtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt--gtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaatt 265  Q
    || |||||||| ||||||||| |||||||||||  ||| ||| ||||||||||| || |         ||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  27031248 tttgtcattattaaaatagaaggaaaatgttttttgtacataactttgaaagtaaaaagaaaac----agagttt-caaacaaaagcacaggctcaaatt 27031154  T
Q  266 gatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaa 365  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  27031153 gatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaatacagcaa 27031054  T
Q  366 ccactacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
     || |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  27031053 tcattacatttcctagaaactttgaattcacaag 27031020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 27209283 - 27208901
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgctggtatcacaa--tgagatggacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |   ||| || ||||||| ||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  27209283 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcacgtt-catttgaatgtaccctgttgct 27209185  T
Q  109 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa---tagaaagaaaatgtttt-gta 203  Q
    || |||||||||||||||       ||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||   ||||| ||||||||||| |||    
T  27209184 caagtttgcttttcaaaa-------aactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaaaatagaaggaaaatgtttttgta 27209092  T
Q  204 tatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactcc 303  Q
     ||| ||||||||||| || |        |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  27209091 cataactttgaaagtaaaaagaaaa----tagagttt-caaacaaaagcacacgctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactcc 27208997  T
Q  304 acggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  27208996 acggatttacaaagcttggaaaatggtaattttatgggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaag 27208901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 399
Target Start/End: Original strand, 27239945 - 27240327
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgctggtatcacaa--tgagatggacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |   ||| || ||||||| ||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  27239945 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcacgtt-catttgaatgtaccctgttgct 27240043  T
Q  109 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa---tagaaagaaaatgtttt-gta 203  Q
    || |||||||||||||||       ||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||   ||||| ||||||||||| |||    
T  27240044 caagtttgcttttcaaaa-------aactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaaaatagaaggaaaatgtttttgta 27240136  T
Q  204 tatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactcc 303  Q
     ||| ||||||||||| || |        |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  27240137 cataactttgaaagtaaaaagaaaa----tagagttt-caaacaaaagcacacgctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactcc 27240231  T
Q  304 acggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  27240232 acggatttacaaagcttggaaaatggtaattttatgggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaag 27240327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 69 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 24870027 - 24869707
Alignment:
Q  69 actcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagca 168  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  24870027 actcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa-------aactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagca 24869936  T
Q  169 tt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaatt 265  Q
    || |||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| || |        |||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  24869935 tttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtacataactttgaaagtaaaaagaaag----tagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaatt 24869841  T
Q  266 gatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaa 365  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24869840 gatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaa 24869741  T
Q  366 ccactacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
     ||  ||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  24869740 tcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaag 24869707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 73 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 27025460 - 27025142
Alignment:
Q  73 gctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-g 171  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||  |||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |    
T  27025460 gctcatgcatgtctcgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa-------aactttttcaattttcaagatgcttgtttcgagcatttg 27025368  T
Q  172 tcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt--gtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgat 268  Q
    ||||||| |||| ||||| |||||||||||  ||| ||| ||||||||||| || |         ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  27025367 tcattattaaaaatagaaggaaaatgttttttgtacataactttgaaagtaaaaagaaagc----agagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgat 27025273  T
Q  269 gtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaacca 368  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27025272 gtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatca 27025173  T
Q  369 ctacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
     |||| ||| |||| ||||||||||| ||||    
T  27025172 ttacatttcctagagactttgaattcgcaag 27025142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 69 - 399
Target Start/End: Original strand, 24299635 - 24299956
Alignment:
Q  69 actcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagca 168  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     ||||  |||||||||||||| ||||||||| | ||||    
T  24299635 actcgcttatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttactcaggtttgcttttcaaaa-----aaaactttttcaattttcaagatgtttgttccgagca 24299728  T
Q  169 tt-gtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattg 266  Q
    || |||||||| |||| |||| | ||| ||||| ||| ||| |||||| |||| || |         ||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  24299729 tttgtcattattaaaaaagaagggaaacgtttttgtacataactttgagagtaaaaagaaagc----agagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattg 24299823  T
Q  267 atgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaac 366  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||     
T  24299824 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttatgggttggtgatacattgaacacaacaat 24299923  T
Q  367 cactacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
    || |||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  24299924 cattacatttcctagaaactttgaattcgcaag 24299956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 64 - 399
Target Start/End: Original strand, 15406403 - 15406730
Alignment:
Q  64 catatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttc 163  Q
    |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||   ||| |||||||| | |||||||||||    
T  15406403 catacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa------aactttttccaattttccagatgtttgtttc 15406495  T
Q  164 aagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctc 260  Q
     |||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| || |         ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  15406496 gagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtacatatctttgaaagtaaaaagaaagc----agagttt-caaacaaaagcacaggctc 15406590  T
Q  261 aaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaaca 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  15406591 aaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtgatacattgaaca 15406690  T
Q  360 cagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
    ||| || ||  ||| ||| ||| |||||||||||| ||||    
T  15406691 cagcaatcatgacatttcctaggaactttgaattcgcaag 15406730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 64 - 399
Target Start/End: Original strand, 15418190 - 15418517
Alignment:
Q  64 catatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttc 163  Q
    |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||   ||| |||||||| | |||||||||||    
T  15418190 catacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa------aactttttccaattttccagatgtttgtttc 15418282  T
Q  164 aagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctc 260  Q
     |||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| || |         ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  15418283 gagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtacatatctttgaaagtaaaaagaaagc----agagttt-caaacaaaagcacaggctc 15418377  T
Q  261 aaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaaca 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  15418378 aaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtgatacattgaaca 15418477  T
Q  360 cagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
    ||| || ||  ||| ||| ||| |||||||||||| ||||    
T  15418478 cagcaatcatgacatttcctaggaactttgaattcgcaag 15418517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 69 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 20174882 - 20174589
Alignment:
Q  69 actcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagaca-aaaagttttcaat------tttcaaaatgtttgtt 161  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || |  ||      ||| | ||||||||||    
T  20174882 actcgctcatgcatgtttcacttgaaagtaccttgttgctaaggtttgcttttcaaaatagacagaaaacttcttgatatttttttttagaatgtttgtt 20174783  T
Q  162 t-caagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggct 259  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||| |  |        |||||||| |||||||||||| || ||    
T  20174782 ttcaagcattgtcatcatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtacataactttggaagtaaa--gagaaaaaatagagttt-caaacaaaagcacagact 20174686  T
Q  260 caaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20174685 caaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgggactccatggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 20174589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 69 - 356
Target Start/End: Original strand, 22161109 - 22161402
Alignment:
Q  69 actcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagaca-aaaagttttcaat------tttcaaaatgtttgtt 161  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || |  ||      ||| | ||||||||||    
T  22161109 actcgctcatgcatgtttcacttgaaagtaccttgttgctaaggtttgcttttcaaaatagacagaaaacttcttgatatttttttttagaatgtttgtt 22161208  T
Q  162 t-caagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggct 259  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||| |  |        |||||||| |||||||||||| || ||    
T  22161209 ttcaagcattgtcatcatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtacataactttggaagtaaa--gagaaaaaatagagttt-caaacaaaagcacagact 22161305  T
Q  260 caaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22161306 caaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgggactccatggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 22161402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 320 - 417
Target Start/End: Original strand, 23851450 - 23851547
Alignment:
Q  320 tggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaaacttctgatga 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | |||| ||||||||| |||| |||||| |||| |||||    
T  23851450 tggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcgcaagcacagaagcttcagatga 23851547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 302; Significance: 1e-170; HSPs: 28)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 11 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 39857032 - 39856630
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgctggtatcacaa--tgagatggacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 108  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||| ||| ||||   ||| || ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39857032 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 39856933  T
Q  109 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39856932 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 39856833  T
Q  209 ctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 308  Q
    |||||||||||||||          |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39856832 ctttgaaagtagaagaaaaa-----agagtttt-aaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 39856739  T
Q  309 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaaac 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  39856738 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagc 39856639  T
Q  409 ttctgatga 417  Q
    ||| |||||    
T  39856638 ttcagatga 39856630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 70 - 417
Target Start/End: Original strand, 18794546 - 18794889
Alignment:
Q  70 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaa-aatgtttgtttcaagca 168  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18794546 ctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaataaacaaaaagttttcaattttcaagaatgtttgtttcaagca 18794645  T
Q  169 ttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgat 268  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18794646 ttgtcattatcaaaatggaaggaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaag-----aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaatttgat 18794740  T
Q  269 gtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaacca 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18794741 gtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacggtaacca 18794840  T
Q  369 ctacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaaacttctgatga 417  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  18794841 ctacagtttttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttttgatga 18794889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 11 - 399
Target Start/End: Original strand, 20332290 - 20332677
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgctggtatcacaa--tgagatggacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 108  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||| ||| ||||   ||| || ||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20332290 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 20332389  T
Q  109 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20332390 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatattttgtatatag 20332489  T
Q  209 ctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 308  Q
    |||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20332490 ctttgaaagtagaag---aaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 20332586  T
Q  309 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||| ||| | |||||||||||||| ||||    
T  20332587 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaag 20332677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 11 - 399
Target Start/End: Original strand, 40099504 - 40099891
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgctggtatcacaa--tgagatggacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 108  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||| ||| ||||   ||| || ||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40099504 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 40099603  T
Q  109 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40099604 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 40099703  T
Q  209 ctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 308  Q
    |||||||||||||||         ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40099704 ctttgaaagtagaag---aaaaaatagagttttcaaacaaaagtaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 40099800  T
Q  309 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||| ||| | |||||||||||||| ||||    
T  40099801 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaag 40099891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 11 - 399
Target Start/End: Original strand, 27157180 - 27157568
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgctggtatcacaa--tgagatggacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 108  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||| ||| ||||   ||| || ||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27157180 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 27157279  T
Q  109 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaat-gttttgtatata 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  27157280 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtatata 27157379  T
Q  208 gctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgg 307  Q
    ||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27157380 gctttgaaagtagaag---aaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgg 27157476  T
Q  308 attcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||| ||| | |||||||||||||| ||||    
T  27157477 attcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaag 27157568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 56 - 399
Target Start/End: Original strand, 24586276 - 24586616
Alignment:
Q  56 gacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 155  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24586276 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctattgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 24586375  T
Q  156 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaa 255  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         | |||||||||||||||||||||    
T  24586376 tttgtttcgagcattgtccttatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaag----aaaaatggagttttcaaacaaaagcaaa 24586471  T
Q  256 ggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacatt 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24586472 ggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacatt 24586571  T
Q  355 gaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
    |||||||  || || |||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  24586572 gaacacatcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaag 24586616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 11 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 14104939 - 14104553
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgctggtatcacaa--tgagatggacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 108  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||| ||| ||||   ||| || ||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14104939 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 14104840  T
Q  109 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14104839 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattaccaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 14104740  T
Q  209 ctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 308  Q
    |||||||||||||| |         |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14104739 ctttgaaagtagaaagaaaac----agagtttt-aaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacgga 14104645  T
Q  309 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagt 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||| ||| | |||||||||||||| |||||    
T  14104644 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagt 14104553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 56 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 30760112 - 30759774
Alignment:
Q  56 gacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 155  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30760112 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaaagtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatg 30760013  T
Q  156 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaa 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||         ||||||||| ||||||||||| |    
T  30760012 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatatagctttgaaaatagaag-----aaaatagagtttt-aaacaaaagcaca 30759919  T
Q  256 ggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattg 355  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30759918 ggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattg 30759819  T
Q  356 aacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagt 400  Q
    |||||||||| || |||| ||| | |||||||||||||| |||||    
T  30759818 aacacagtaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagt 30759774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 56 - 400
Target Start/End: Original strand, 33667718 - 33668056
Alignment:
Q  56 gacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 155  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33667718 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaaagtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatg 33667817  T
Q  156 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaa 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||         ||||||||| ||||||||||| |    
T  33667818 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatatagctttgaaaatagaag-----aaaatagagtttt-aaacaaaagcaca 33667911  T
Q  256 ggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattg 355  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33667912 ggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattg 33668011  T
Q  356 aacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagt 400  Q
    |||||||||| || |||| ||| | |||||||||||||| |||||    
T  33668012 aacacagtaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagt 33668056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 56 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 54839740 - 54839402
Alignment:
Q  56 gacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaat 154  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  54839740 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaagtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaat 54839641  T
Q  155 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaa 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||         ||||| |||||| ||||||||     
T  54839640 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatatagctttgaaagtagaag-----aaaatagag-tttcaagcaaaagcac 54839547  T
Q  255 aggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacatt 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54839546 aggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacatt 54839447  T
Q  355 gaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
    ||||||||||| ||  ||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  54839446 gaacacagtaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaag 54839402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 11 - 399
Target Start/End: Original strand, 14753362 - 14753747
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgctggtatcacaa--tgagatggacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 108  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||| ||| ||||   ||| || |||| || || | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14753362 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 14753460  T
Q  109 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa--tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 206  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14753461 cagatttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 14753560  T
Q  207 agctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacg 306  Q
    |||||||||||||||||         ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  14753561 agctttgaaagtagaag-----aaaatagagtttt-aatcaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacg 14753654  T
Q  307 gattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||  ||||||||||||||| ||||    
T  14753655 gatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcccagaaactttgaattcgcaag 14753747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 70 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 21976040 - 21975708
Alignment:
Q  70 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 169  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21976040 ctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgctcgggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 21975941  T
Q  170 tgtcattatcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgat 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |         |||| ||||||||||||||  || |||||||||||    
T  21975940 tgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatatagctttgaaagtaaaaagaaaac----agag-tttcaaacaaaagcgcagtctcaaattgat 21975846  T
Q  269 gtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaacca 368  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  21975845 gtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatca 21975746  T
Q  369 ctacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaa 406  Q
     |||| ||| | | |||||||||| |||||||||||||    
T  21975745 ttacatttcctgggaactttgaatccacaagtacagaa 21975708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 56 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 5700890 - 5700551
Alignment:
Q  56 gacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaat 154  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  5700890 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaagtttgcttttcaaaatagacaaaaagtttttaattttcaaaaat 5700791  T
Q  155 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaa 254  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||  |||||||||||||||     
T  5700790 gttcgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaag-----aaaataga-atttcaaacaaaagcac 5700697  T
Q  255 aggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacat 353  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5700696 aagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacat 5700597  T
Q  354 tgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
    |||||||||||| ||  ||| |||  | ||||||||||||| ||||    
T  5700596 tgaacacagtaatcatgacatttcccaaaaactttgaattcgcaag 5700551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 69 - 399
Target Start/End: Original strand, 34182892 - 34183216
Alignment:
Q  69 actcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagc 167  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34182892 actcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaa-gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagc 34182989  T
Q  168 attgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattga 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||    
T  34182990 attgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaag----aaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattga 34183084  T
Q  268 tgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaacc 367  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34183085 tgtataagagcggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatc 34183184  T
Q  368 actacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
    |  ||| |||  ||||||||||||||| ||||    
T  34183185 atgacatttcccagaaactttgaattcgcaag 34183216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 70 - 406
Target Start/End: Original strand, 31120439 - 31120772
Alignment:
Q  70 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa-tagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagca 168  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31120439 ctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgctcgggtttgcttttcaaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagca 31120538  T
Q  169 ttgtcattatcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattga 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |         |||| ||||||||||||||| || ||||||||||    
T  31120539 ttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatatagctttgaaagtaaaaagaaaac----agag-tttcaaacaaaagcacagtctcaaattga 31120633  T
Q  268 tgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaacc 367  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  31120634 tgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattcacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatc 31120733  T
Q  368 actacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaa 406  Q
    | |||| ||| | | ||||| |||| |||||||||||||    
T  31120734 attacatttcctgggaacttcgaatccacaagtacagaa 31120772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 70 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 5012214 - 5011870
Alignment:
Q  70 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagca 168  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  5012214 ctcgcttatgcatgtttcgtttgaatgtgccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagtttttaattttcaaaaatgtttgtttcaagca 5012115  T
Q  169 ttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgat 268  Q
    ||| ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||         ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  5012114 ttgccattatccaagtagaaagaaaatgatttgtatatagctttgaaagtagaag----aaaagtagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgat 5012020  T
Q  269 gtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaacc 367  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  5012019 gtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatc 5011920  T
Q  368 actacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaaacttctgatga 417  Q
    | |||| |||  | ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  5011919 attacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatga 5011870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 69 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 24118999 - 24118674
Alignment:
Q  69 actcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagc 167  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  24118999 actcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctccggtttgcttttcaaaatagacaaaaagtttttaattttcaaaaatgtttgtttcaagc 24118901  T
Q  168 attgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattga 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |         |||| ||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  24118900 attgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtaaaaagaaaac----agag-tttcagacaaaagcacaagctcaaattga 24118806  T
Q  268 tgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaacc 367  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24118805 tgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatc 24118706  T
Q  368 actacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
    |  ||| |||  ||||||||||||||| ||||    
T  24118705 atgacatttcccagaaactttgaattcgcaag 24118674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 11 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 1674258 - 1673877
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgctggtatcacaatgagatggacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctca 110  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||| ||| || ||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1674258 cacagactatcctagggaagaacctgcttgtaacacattgaaatagacatcaacacacactcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgctca 1674159  T
Q  111 ggtttgcttttcaaaatagacaaaaag--ttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt--gtata 205  Q
     ||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |    
T  1674158 agtttgcttt-caaaatagacaaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcatttgtcattatcaaaatagaaagaaaatattttttgtaca 1674060  T
Q  206 tagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccac 305  Q
    | ||||||||||||||| |        |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||    
T  1674059 tggctttgaaagtagaaagatag----tagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggagtgacaccac 1673965  T
Q  306 ggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaatt 393  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  1673964 ggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtatattgaacacagtaaccactacatttcctagaaactttgaatt 1673877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 11 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 1906654 - 1906245
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgctggtatcacaa--tgagatggacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 108  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||   ||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1906654 cacagactatcctggggaagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 1906555  T
Q  109 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaag--ttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaatagaaagaaaatgttt----tg 201  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    ||    
T  1906554 caggtttgcttt-caaaatagacaaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcatttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttcttttg 1906456  T
Q  202 tatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgact 301  Q
    || || ||||||||||||||| |        |||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  1906455 tacatggctttgaaagtagaaagatag----tagagttt-caaacaaaagcacagactcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgact 1906361  T
Q  302 ccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagta 401  Q
    |||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||| |||| |    
T  1906360 ccacagatatacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagca 1906261  T
Q  402 cagaaacttctgatga 417  Q
    ||  | ||||||||||    
T  1906260 catgagcttctgatga 1906245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 11 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 15234217 - 15233809
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgctggtatcacaa--tgagatggacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 108  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||   ||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  15234217 cacagactatcctggggaagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgcc 15234118  T
Q  109 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaag------ttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgt 202  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||       ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||    
T  15234117 caggtttgcttt-caaaatagacaaaaaaaaaactttttcaagtttcaagatgtttgcttcaagcattgtcattatcaagataaaaagaaatttttttgt 15234019  T
Q  203 atatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactc 302  Q
    | |||||||||||||||||| |        |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||    
T  15234018 acatagctttgaaagtagaaagaaag----tagagttt-caaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggttagccgaaggcgtgactc 15233924  T
Q  303 cacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtac 402  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| || ||||||||||||| |||| ||    
T  15233923 tacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattggacatagtaaccactacatttcctataaactttgaattcgcaagcac 15233824  T
Q  403 agaaacttctgatga 417  Q
    | || ||| ||||||    
T  15233823 aaaagcttatgatga 15233809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 69 - 399
Target Start/End: Original strand, 36338454 - 36338772
Alignment:
Q  69 actcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagca 168  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36338454 actcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa------aaactttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagca 36338546  T
Q  169 ttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgat 268  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||    
T  36338547 ttatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaag----aaaaatagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgat 36338641  T
Q  269 gtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaacca 368  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  36338642 gtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggcggtacattgaacacagtaatca 36338741  T
Q  369 ctacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
      |||  || |||||||||||||||| ||||    
T  36338742 tgacatctcctagaaactttgaattcgcaag 36338772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 69 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 6576191 - 6575879
Alignment:
Q  69 actcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagca 168  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6576191 actcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaag------aaactttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagca 6576099  T
Q  169 ttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgat 268  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |         ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||    
T  6576098 ttatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtaaaaagaaagc----agagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgat 6576004  T
Q  269 gtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaacca 368  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6576003 gtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatca 6575904  T
Q  369 ctacagttcttagaaactttgaatt 393  Q
      ||| ||| |||||||||||||||    
T  6575903 tcacatttcctagaaactttgaatt 6575879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 11 - 417
Target Start/End: Original strand, 15276497 - 15276904
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgctggtatcacaa--tgagatggacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||   ||| || ||||||  ||||  ||| |||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||    
T  15276497 cacagactatcctggggaagagcctgtttgtaacacatattgaaatagacatcgacatacgctcactcatgcacgtttcgtttgaacgtaccttgttgct 15276596  T
Q  109 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagtttt---caattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt--gta 203  Q
    || |||| |||| ||||| ||||||||| ||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||    
T  15276597 caagtttacttt-caaaacagacaaaaactttttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaagatagaaagaaaatgttttttgta 15276695  T
Q  204 tatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactcc 303  Q
     |||||||||||||||||  |        |||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  15276696 catagctttgaaagtagagagaaaa----tagagttt-caaacaaaagcacaggctcgaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactcc 15276790  T
Q  304 acggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtaca 403  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||    
T  15276791 acggatttacaaagcttggaaaatggcaattttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacatttcctagaaactttgaattcgcaagcaca 15276890  T
Q  404 gaaacttctgatga 417  Q
    ||| ||||||||||    
T  15276891 gaagcttctgatga 15276904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 11 - 417
Target Start/End: Original strand, 15380106 - 15380510
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgctggtatcacaa--tgagatggacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||   ||| |  ||||||  ||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||    
T  15380106 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaaaagacatcgacatacgctcgctcatgcacgtttcgtttgaatgtaccttgttgct 15380205  T
Q  109 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt--gtatat 206  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||    
T  15380206 caggcttgcttt-caaaacagacaaaaacttttttaatttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaagatagaaagaaaatgttttttgtacat 15380304  T
Q  207 agctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacg 306  Q
    |||||||||||||||| |        |||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  15380305 agctttgaaagtagaaagaaag----tagagttt-caaacaaaagcacaggctcgaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacg 15380399  T
Q  307 gattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaa 406  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||| ||| ||    
T  15380400 gatttacaaagcttggaaaatggcaattttattggttggtggtacattgaacacgataaccactacatttccttgaaactttgaattcgcaagcacaaaa 15380499  T
Q  407 acttctgatga 417  Q
     |||| |||||    
T  15380500 gcttcggatga 15380510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 69 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 14671350 - 14671027
Alignment:
Q  69 actcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagca 168  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  14671350 actcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa------aaactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagca 14671257  T
Q  169 tt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtt-ttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaatt 265  Q
    || |||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||||||| || |         ||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  14671256 tttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgttcttgtacataactttgaaagtaaaaagaaagc----agagttt-caaacaaaagcacgggctcaaatt 14671162  T
Q  266 gatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagta 364  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14671161 gatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagca 14671062  T
Q  365 accactacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
    | || |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  14671061 atcattacatttcctagaaactttgaattcacaag 14671027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 69 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 17019385 - 17019063
Alignment:
Q  69 actcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagca 168  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||  ||||||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  17019385 actcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa------aaactttttcaattctcaagatgtttgtttcgagca 17019293  T
Q  169 tt-gtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatatagcttt-gaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaatt 265  Q
    || |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||| || |         ||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  17019292 tttgtcattattaaaatagaaggaaaatgtttttgtacatagcttttgaaagtaaaaagaaagc----agagttt-caaacaaaagcataggctcaaatt 17019198  T
Q  266 gatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagta 364  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17019197 gatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtgatacattgaacacagta 17019098  T
Q  365 accactacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
    | || |||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  17019097 atcattacatttcctagaaactttgaattcgcaag 17019063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 69 - 320
Target Start/End: Original strand, 36324245 - 36324484
Alignment:
Q  69 actcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagca 168  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36324245 actcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa------aaactttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagca 36324337  T
Q  169 ttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgat 268  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  36324338 ttatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaag----aaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgat 36324432  T
Q  269 gtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagctt 320  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36324433 gtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagctt 36324484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 347 - 406
Target Start/End: Original strand, 18311379 - 18311439
Alignment:
Q  347 ggtacattgaaca-cagtaac-cactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaa 406  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18311379 ggtacattgaacaacagtaatacactaca-ttcttagaaactttgaatccacaagtacagaa 18311439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 288; Significance: 1e-161; HSPs: 32)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 56 - 417
Target Start/End: Original strand, 5141135 - 5141493
Alignment:
Q  56 gacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgctttt-caaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaat 154  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5141135 gacatcaacataccctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgctttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaat 5141234  T
Q  155 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagca 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||         |||||||||||||||||||||    
T  5141235 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtatataactttgaaagtagaag-----aaaatagagttttcaaacaaaagca 5141329  T
Q  254 aaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacat 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5141330 aaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacat 5141429  T
Q  354 tgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaaacttctgatga 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  5141430 tgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatga 5141493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 70 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 26441576 - 26441238
Alignment:
Q  70 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26441576 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 26441477  T
Q  170 tgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatg 269  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||         | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26441476 tgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatatagctttgaaagtaaaag---aaaaaatggagtttttaaacaaaagcaaaggctcaaattgatg 26441380  T
Q  270 tataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccac 369  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26441379 tataagagtggcggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccac 26441280  T
Q  370 tacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaaacttc 411  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26441279 tacagttcatagaaactttgaattcacaagtacagaagcttc 26441238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 56 - 398
Target Start/End: Original strand, 4139046 - 4139386
Alignment:
Q  56 gacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 155  Q
    ||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4139046 gacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 4139145  T
Q  156 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaa 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||| ||||||||||||||||||    
T  4139146 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaag--aacaaaatagaattttcaaacaaaagcaaa 4139243  T
Q  256 ggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattg 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4139244 ggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattg 4139343  T
Q  356 aacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaa 398  Q
    |||||||||| || |||| |||  | ||||||||| |||||||    
T  4139344 aacacagtaatcattacatttcccaaaaactttgatttcacaa 4139386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 70 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 11447210 - 11446867
Alignment:
Q  70 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc--aaaatgtttgtttcaagc 167  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  11447210 ctcgctcatgcatgtttcacttgattgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaatttttcaaaaatgtttgtttcaagc 11447111  T
Q  168 attgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattga 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||| ||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  11447110 attgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaag-----aaaatagaattt-caaacaaaagcacaagctcaaattga 11447017  T
Q  268 tgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaacc 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11447016 tgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatc 11446917  T
Q  368 actacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaaacttctgatga 417  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  11446916 actacatttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttttgatga 11446867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 70 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 3451641 - 3451297
Alignment:
Q  70 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa---tgtttgtttcaag 166  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  3451641 ctcgctcatgcatgttccatttgattgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaaatgtttgtttcaag 3451542  T
Q  167 cattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattg 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||| ||| ||||||||||||   ||||||||||    
T  3451541 cattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaag-----aaaatagaattt-caaacaaaagcaccagctcaaattg 3451448  T
Q  267 atgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaac 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  3451447 atgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaaacttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtgat 3451348  T
Q  367 cactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaaacttctgatga 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  3451347 cactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatga 3451297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 11 - 399
Target Start/End: Original strand, 26678858 - 26679245
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgctggtatcacaa--tgagatggacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 108  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||| ||| ||||   ||| || ||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26678858 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccccgttgct 26678957  T
Q  109 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26678958 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcattgtcgttatcaaaatataaagaaaatgttttgtatatag 26679057  T
Q  209 ctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 308  Q
    |||||||||||||||         ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26679058 ctttgaaagtagaag---aaaaaatagagttttcaaacaaaagtaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 26679154  T
Q  309 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||| ||| | |||||||||||||| ||||    
T  26679155 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaag 26679245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 75 - 417
Target Start/End: Original strand, 16745340 - 16745679
Alignment:
Q  75 tcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa--tgtttgtttcaagcattgt 172  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  16745340 tcatgcatgtttcgtttgaatataccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaatgtttgtttcaagcattgt 16745439  T
Q  173 cattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtat 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16745440 cattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaag-----aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaacttgatgtat 16745534  T
Q  273 aagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactac 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  16745535 aagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattac 16745634  T
Q  373 agttcttagaaactttgaattcacaagtacagaaacttctgatga 417  Q
    | |||  | ||||||||||||| |||| |||||| |||| |||||    
T  16745635 atttcccaaaaactttgaattcgcaagcacagaagcttcagatga 16745679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 56 - 399
Target Start/End: Original strand, 26663713 - 26664053
Alignment:
Q  56 gacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 155  Q
    ||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26663713 gacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccccgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 26663812  T
Q  156 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaa 255  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||| |||    
T  26663813 tttgtttcgagcattgtcgttatcaaaatataaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaag---aaaaaatagagttttcaaacaaaagtaaa 26663909  T
Q  256 ggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattg 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26663910 ggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattg 26664009  T
Q  356 aacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
    ||||||| || || |||| ||| | |||||||||||||| ||||    
T  26664010 aacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaag 26664053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 53 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 45393558 - 45393212
Alignment:
Q  53 atggacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aa 151  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  45393558 atggacatcaccatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaa 45393459  T
Q  152 aatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaag 251  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||         ||||||||| |||||||||    
T  45393458 aatgtttgtttcaggcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtgtatagctttgaaagtagaag----aaaagtagagtttt-aaacaaaag 45393364  T
Q  252 caaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtac 351  Q
    || | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45393363 cacaagctcaaattgatgtgtaagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtac 45393264  T
Q  352 attgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtaca 403  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45393263 attgaacacagtaatcactacatttcttagaaactttgaatccacaagtaca 45393212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 70 - 399
Target Start/End: Original strand, 39206954 - 39207279
Alignment:
Q  70 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagca 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39206954 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaataaacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagca 39207053  T
Q  169 ttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgat 268  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39207054 ttgtcattatcaaaatagaaggaaaatattttgtatatagctttgaaagtagaag-----aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaacttgat 39207148  T
Q  269 gtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaacca 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||    
T  39207149 gtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttatcggttggtggtacattgaacacagcaatca 39207248  T
Q  369 ctacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
     |||| ||| | |||||||||||||| ||||    
T  39207249 ttacacttcctggaaactttgaattcgcaag 39207279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 56 - 417
Target Start/End: Original strand, 26268886 - 26269247
Alignment:
Q  56 gacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-- 153  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  26268886 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaa 26268985  T
Q  154 --tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaa 250  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || |         ||||||| |||||||||    
T  26268986 aatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtacatagctttgaaagtaaaaagaaaac----agagttt-caaacaaaa 26269080  T
Q  251 gcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggta 350  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26269081 gcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggta 26269180  T
Q  351 cattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaaacttctgatga 417  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  26269181 cattgaacacagtaatcatgacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttttgatga 26269247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 11 - 406
Target Start/End: Original strand, 24586289 - 24586682
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgctggtatcacaa--tgagatggacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 108  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||| ||| ||||   ||| || ||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24586289 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 24586388  T
Q  109 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24586389 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaataggaagaaaatgttttgtatatag 24586488  T
Q  209 ctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 308  Q
    |||||||||||||||         |||||| || |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  24586489 ctttgaaagtagaag----aaaaatagagtctt-aaacgaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 24586583  T
Q  309 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagtt-cttagaaactttgaattcacaagtacagaa 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |  | |||||||||||||||||||||||||    
T  24586584 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaaactttgaattcacaagtacagaa 24586682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 11 - 399
Target Start/End: Original strand, 16443757 - 16444144
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgctggtatcacaa--tgagatggacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||   ||| || ||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16443757 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatgctcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 16443856  T
Q  109 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagtttt-caattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg--ttttgtata 205  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |    
T  16443857 caggtttgcttt-caaaatagacaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaagatagaaagaaaatgttttttgtaca 16443955  T
Q  206 tagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccac 305  Q
    ||||||||||||||||| |        ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  16443956 tagctttgaaagtagaaag----aaagtagagtttt-aaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcaggcgaaggcgtgactccac 16444050  T
Q  306 ggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  16444051 ggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaacgactacatttcttagaaactttgaattcgcaag 16444144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 56 - 399
Target Start/End: Original strand, 26509496 - 26509837
Alignment:
Q  56 gacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaag-ttttcaattttcaaaat 154  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26509496 gacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaaggttttcaattttcaaaat 26509595  T
Q  155 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaa 254  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         | |||||||||||||||||||     
T  26509596 gtttgtttcgagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaag----aaaaatggagttttcaaacaaaagcac 26509691  T
Q  255 aggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacat 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26509692 aggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacat 26509791  T
Q  354 tgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
    ||||||||| || ||  ||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  26509792 tgaacacagcaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaag 26509837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 11 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 5154466 - 5154081
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgctggtatcacaa--tgagatggacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 108  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||| ||| ||||   ||| || ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5154466 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttggatgtaccctgttgct 5154367  T
Q  109 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5154366 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 5154267  T
Q  209 ctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 308  Q
    ||||||||||| || |         |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  5154266 ctttgaaagtaaaaagaaagc----agag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 5154172  T
Q  309 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  5154171 tttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaag 5154081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 11 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 5164767 - 5164387
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgctggtatcacaa--tgagatggacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 108  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||| ||| ||||   ||| || ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5164767 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttggatgtaccctgttgct 5164668  T
Q  109 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata- 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5164667 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgttattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 5164568  T
Q  208 gctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgg 307  Q
    ||||||||||||||||         ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  5164567 gctttgaaagtagaag----aaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaagcgtgactccacgg 5164473  T
Q  308 attcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaatt 393  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||||    
T  5164472 attcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcctagaaactttgaatt 5164387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 56 - 399
Target Start/End: Original strand, 31558195 - 31558534
Alignment:
Q  56 gacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaat 154  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31558195 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaat 31558294  T
Q  155 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaa 254  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||    
T  31558295 gtttgtttcaagtattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatatagctttgaaagtagaag-----aaaatagagttttcaaacaaaagcaa 31558389  T
Q  255 aggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacatt 354  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31558390 aggctcaacttgatgtataaaagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacatt 31558489  T
Q  355 gaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
    ||||||||| | || |||| ||| | |||||||||||||| ||||    
T  31558490 gaacacagtgatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaag 31558534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 56 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 26519127 - 26518790
Alignment:
Q  56 gacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 155  Q
    ||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26519127 gacatcaacatactctcgctcgtgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatg 26519028  T
Q  156 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaa 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||         ||||||||| ||||||||||| |    
T  26519027 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatatagctttgaaaatagaag-----aaaatagagtttt-aaacaaaagcaca 26518934  T
Q  256 ggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattg 355  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26518933 ggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattg 26518834  T
Q  356 aacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
    |||||||||| || |||| ||| | |||||||||||||| ||||    
T  26518833 aacacagtaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaag 26518790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 70 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 4205711 - 4205368
Alignment:
Q  70 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaa-ttttcaaaatgtttgtttcaagca 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4205711 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaatttttcaaaatgtttgtttcaagca 4205612  T
Q  169 ttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgat 268  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||         ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  4205611 ttgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatatagctttgaaaatagaag-----aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgat 4205518  T
Q  269 gtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaacca 368  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4205517 gtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatca 4205418  T
Q  369 ctacagtt-cttagaaactttgaattcacaagtacagaaacttctgatga 417  Q
     |||| || |  | ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  4205417 ttacatttcccaaaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatga 4205368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 70 - 417
Target Start/End: Original strand, 26313664 - 26314006
Alignment:
Q  70 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 169  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26313664 ctcgcttatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 26313763  T
Q  170 tgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatg 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||         ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  26313764 tgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatatagctttgaaaatagaag-----aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatg 26313857  T
Q  270 tataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccac 369  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  26313858 tataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcat 26313957  T
Q  370 tacagtt-cttagaaactttgaattcacaagtacagaaacttctgatga 417  Q
    |||| || |  | |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  26313958 tacatttcccaaaaaactttgaattcataagtacagaaacttcagatga 26314006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 56 - 393
Target Start/End: Original strand, 11418580 - 11418913
Alignment:
Q  56 gacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaat 154  Q
    ||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||    
T  11418580 gacatcaacatactctcgctcgtgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaacagacagaaagttttcaattttcaaaaat 11418679  T
Q  155 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaa 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |        ||||| |||||||||||||||     
T  11418680 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatatagctttgaaagtaaaaag----aaagtagag-tttcaaacaaaagcac 11418774  T
Q  255 aggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacatt 354  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11418775 aggctcaaatcgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacatt 11418874  T
Q  355 gaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaatt 393  Q
    ||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||||    
T  11418875 gaacacagtaatcattacatttcctagaaactttgaatt 11418913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 70 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 45737625 - 45737298
Alignment:
Q  70 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc----aaaatgtttgtttcaa 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||    
T  45737625 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaaaatgtttgtttcaa 45737526  T
Q  166 gcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaatt 265  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  45737525 gcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaag-----aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaattt 45737432  T
Q  266 gatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaa 365  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  45737431 gatgtataagaggggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtga 45737332  T
Q  366 ccactacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
     ||  ||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  45737331 tcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaag 45737298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 11 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 16047695 - 16047294
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgctggtatcacaa--tgagatggacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 108  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||| ||| ||||   ||| || ||||||  ||||  |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  16047695 cacagactatcccggggaagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcgacatacgctcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtatcctgttgct 16047596  T
Q  109 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 208  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  16047595 caggcttgcttt-caaaatagacaaaaacttttcaattttcaggatgtttgtttcaagcattgtcattatcaagatagaaagaaaat-ttttgtacatag 16047498  T
Q  209 ctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 308  Q
    |||||| ||||||| |        |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  16047497 ctttgacagtagaaagaaag----tagagttt-caaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 16047403  T
Q  309 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaaac 408  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| | |||||||||||||| |||| |||||| |    
T  16047402 tttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacatagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacagaagc 16047303  T
Q  409 ttctgatga 417  Q
    |||||||||    
T  16047302 ttctgatga 16047294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 11 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 2160955 - 2160567
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgctggtatcacaa--tgagatggacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||   ||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2160955 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 2160856  T
Q  109 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg--ttttgtata 205  Q
    ||| ||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |    
T  2160855 cagatttgctttcaaaaatagacaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttttgtaca 2160756  T
Q  206 tagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccac 305  Q
    |||||||||||||| || |        ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  2160755 tagctttgaaagtaaaaag----gaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccac 2160661  T
Q  306 ggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||| ||| | |||||||||||||| ||||    
T  2160660 ggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgatacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaag 2160567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 70 - 417
Target Start/End: Original strand, 31084437 - 31084781
Alignment:
Q  70 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagca 168  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31084437 ctcgcttatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaaaatttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagca 31084536  T
Q  169 ttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgat 268  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  31084537 ttgccattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaag----aaaaataga-atttcaaacaaaagcacaagctcaaattgat 31084631  T
Q  269 gtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaacc 367  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  31084632 gtataagagtggtggtcaaccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatc 31084731  T
Q  368 actacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaaacttctgatga 417  Q
    | |||| |||  | ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  31084732 attacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatga 31084781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 11 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 10847968 - 10847562
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgctggtatcacaatgagatggacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| || ||||||  ||||  ||| |||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  10847968 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacattgaaatagacatcgacatacgctcactcatgcacgtttcgtttgaacgtaccttgttgctca 10847869  T
Q  111 ggtttgcttttcaaaatagacaaaaag---ttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt---gtat 204  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||||    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||     
T  10847868 ggtttacttt-caaaacagacaaaaaacttttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaagatagaaagaaaatgtttttttgtac 10847770  T
Q  205 atagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactcca 304  Q
    |||||||||||||||||  |        |||||||| || ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  10847769 atagctttgaaagtagagagaaaa----tagagttt-cagacaaaagcacaggctcgaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactcca 10847675  T
Q  305 cggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacag 404  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||    
T  10847674 cggatttacaaagcttggaaaatggcaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacatttcctagaaactttgaattcgcaagcacag 10847575  T
Q  405 aaacttctgatga 417  Q
    || ||||||||||    
T  10847574 aagcttctgatga 10847562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 11 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 26596053 - 26595750
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgctggtatcacaa--tgagatggacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 108  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||| ||| ||||   ||| || ||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26596053 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 26595954  T
Q  109 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  26595953 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaataaaaagaaaatgtgttgtatata 26595854  T
Q  208 gctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgg 307  Q
    ||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26595853 gctttgaaagtagaag---aaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgg 26595757  T
Q  308 attcaca 314  Q
    |||||||    
T  26595756 attcaca 26595750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 14 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 2779626 - 2779249
Alignment:
Q  14 agactatcctggggaagagcctgctggtatcacaa--tgagatggacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcag 111  Q
    |||||||||||| | ||| |||||| ||| ||||   ||| || ||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2779626 agactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtctcatttgaatgtaccctgttgctcag 2779527  T
Q  112 gtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctt 211  Q
    |||||||||||||||     ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2779526 gtttgcttttcaaaa-----aaaactttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctt 2779432  T
Q  212 tgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 311  Q
    |||||||| || |         ||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  2779431 tgaaagtaaaaagaaagc----agagttt-caaacaaaagcacaagctcaaatagatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattt 2779337  T
Q  312 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||  || |||||||||||||||| ||||    
T  2779336 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaag 2779249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 56 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 31130235 - 31129902
Alignment:
Q  56 gacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 155  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||  ||||||||||||||||||    
T  31130235 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtctcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa-----aaaactttttcaattttcaaaatg 31130141  T
Q  156 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaa 255  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |         ||||||| |||||||||||| |    
T  31130140 tttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtaaaaagaaagc----agagttt-caaacaaaagcaca 31130046  T
Q  256 ggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattg 355  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31130045 agctcaaatagatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattg 31129946  T
Q  356 aacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
    |||||||||| ||  |||  || |||||||||||||||| ||||    
T  31129945 aacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaag 31129902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 69 - 399
Target Start/End: Original strand, 16512254 - 16512574
Alignment:
Q  69 actcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagca 168  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |  ||| ||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  16512254 actcgctcatgcatatttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa--------acttttccaattatcaagatgtttgtttcgagca 16512345  T
Q  169 tt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaatt 265  Q
    || |||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| || |         ||||||| |||||||||||| ||||| |||||    
T  16512346 tttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtacataactttgaaagtaaaaagaaagc----agagttt-caaacaaaagcacaggcttaaatt 16512440  T
Q  266 gatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaa 365  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16512441 gatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaa 16512540  T
Q  366 ccactacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
     || |||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  16512541 tcattacatttcctagaaactttgaattcgcaag 16512574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 64 - 399
Target Start/End: Original strand, 10910735 - 10911060
Alignment:
Q  64 catatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttc 163  Q
    |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||       ||  |||||||||||||| ||| |||||||    
T  10910735 catacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccatgttgctcaggtttgcttttcaaaa-------aactttttcaattttcaagatgcttgtttc 10910826  T
Q  164 aagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctc 260  Q
     |||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| || |        |||||||| |||||||||||| ||||||    
T  10910827 gagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtacataactttgaaagtaaaaagaaaa----tagagttt-caaacaaaagcacaggctc 10910921  T
Q  261 aaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacac 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  10910922 aaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttatgggttagtgatacattgaacac 10911021  T
Q  361 agtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
    || || || |||| ||| ||||||||||| |||| ||||    
T  10911022 agcaatcattacatttcctagaaactttgtattcgcaag 10911060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 315 - 399
Target Start/End: Original strand, 26531926 - 26532010
Alignment:
Q  315 aagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||| ||| | |||||||||||||| ||||    
T  26531926 aagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaag 26532010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 282; Significance: 1e-158; HSPs: 57)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 69 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 4630073 - 4629730
Alignment:
Q  69 actcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagca 168  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4630073 actcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagca 4629975  T
Q  169 ttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattga 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4629974 ttgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtatataactttgaaagtagaag-----aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattga 4629880  T
Q  268 tgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaacc 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4629879 tgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattaacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaacc 4629780  T
Q  368 actacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaaacttctgatga 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  4629779 actacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatga 4629730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 69 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 21680989 - 21680646
Alignment:
Q  69 actcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagca 168  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21680989 actcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagca 21680891  T
Q  169 ttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattga 267  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21680890 ttgtcattatcaaaatggaaagaaaatatttttgtatataactttgaaagtagaag-----aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattga 21680796  T
Q  268 tgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaacc 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21680795 tgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaacc 21680696  T
Q  368 actacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaaacttctgatga 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  21680695 actacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatga 21680646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 11 - 417
Target Start/End: Original strand, 29658879 - 29659283
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgctggtatcacaa--tgagatggacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 108  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||| ||| ||||   ||| || ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29658879 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 29658978  T
Q  109 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 207  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29658979 caggtttgcttttcaaaatagaccaaaggttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 29659078  T
Q  208 gctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgg 307  Q
     |||||||||||||||         |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29659079 actttgaaagtagaag----aaaaatagagttt-caaacaaaagcaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgg 29659173  T
Q  308 attcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaaa 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  29659174 attcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaag 29659273  T
Q  408 cttctgatga 417  Q
    ||| ||||||    
T  29659274 cttttgatga 29659283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 11 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 32296979 - 32296574
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgctggtatcacaa--tgagatggacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 108  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||| ||| ||||   ||| || ||||||| ||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32296979 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 32296880  T
Q  109 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32296879 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 32296780  T
Q  209 ctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 308  Q
    |||||||||||||||         |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32296779 ctttgaaagtagaag---aaaaaatagaattttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcacgactccacgga 32296683  T
Q  309 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaaac 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | |||| ||||||||||||||  |||||||    
T  32296682 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcgcagaaac 32296583  T
Q  409 ttctgatga 417  Q
    |||||||||    
T  32296582 ttctgatga 32296574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 69 - 417
Target Start/End: Original strand, 29142725 - 29143072
Alignment:
Q  69 actcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttc--aaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaag 166  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29142725 actcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccatgttgctcaggtttgttttttcaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaag 29142824  T
Q  167 cattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaatt 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||          | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29142825 cattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatatagctttgaaagtagaa----aaaaaatggagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaatt 29142920  T
Q  266 gatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaa 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29142921 gatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaa 29143020  T
Q  366 ccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaaacttctgatga 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  29143021 ccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatga 29143072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 11 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 5728328 - 5727941
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgctggtatcacaa--tgagatggacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 108  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||| ||| ||||   ||| || ||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5728328 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 5728229  T
Q  109 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5728228 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 5728129  T
Q  209 ctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 308  Q
    |||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5728128 ctttgaaagtagaag---aaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 5728032  T
Q  309 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||| ||| | |||||||||||||| ||||    
T  5728031 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaag 5727941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 11 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 47029803 - 47029416
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgctggtatcacaa--tgagatggacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 108  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||| ||| ||||   ||| || ||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47029803 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 47029704  T
Q  109 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47029703 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 47029604  T
Q  209 ctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 308  Q
    |||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47029603 ctttgaaagtagaag---aaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 47029507  T
Q  309 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||| ||| | |||||||||||||| ||||    
T  47029506 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaag 47029416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 11 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 5717418 - 5717031
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgctggtatcacaa--tgagatggacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 108  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||| ||| ||||   ||| || ||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5717418 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 5717319  T
Q  109 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5717318 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 5717219  T
Q  209 ctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 308  Q
    |||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5717218 ctttgaaagtagaag---aaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 5717122  T
Q  309 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||| ||| |  ||||||||||||| ||||    
T  5717121 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaag 5717031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 11 - 399
Target Start/End: Original strand, 5764040 - 5764427
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgctggtatcacaa--tgagatggacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 108  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||| ||| ||||   ||| || ||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5764040 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 5764139  T
Q  109 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5764140 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 5764239  T
Q  209 ctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 308  Q
    |||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5764240 ctttgaaagtagaag---aaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 5764336  T
Q  309 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||| ||| |  ||||||||||||| ||||    
T  5764337 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaag 5764427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 56 - 406
Target Start/End: Original strand, 4340634 - 4340980
Alignment:
Q  56 gacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-t 154  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  4340634 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaataaacaaaaagttttcaattttcaaaaat 4340733  T
Q  155 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaa 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||    
T  4340734 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatggaaggaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaag-----aaaatagagttttcaaacaaaagcaa 4340828  T
Q  255 aggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacatt 354  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4340829 aggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacatt 4340928  T
Q  355 gaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaa 406  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4340929 gaacacagtaatcactacatttcttagaaactttgaatccacaagtacagaa 4340980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 56 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 18249040 - 18248683
Alignment:
Q  56 gacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-t 154  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  18249040 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagaccaaaggttttcaattttcaaaaat 18248941  T
Q  155 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaa 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||         |||||||  |||||||||||||    
T  18248940 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatgtagctttgaaagtagaag----aaaaatagagttc-caaacaaaagcaa 18248846  T
Q  255 aggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacatt 354  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18248845 aggctcaacttgatgtataagagtgatggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagctcggaaaatggtaattttattggttggtggtacatt 18248746  T
Q  355 gaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaaacttctgatga 417  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  18248745 gaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttttgatga 18248683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 64 - 417
Target Start/End: Original strand, 20570812 - 20571161
Alignment:
Q  64 catatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgttt 162  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  20570812 catacacttgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaataaacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttattt 20570911  T
Q  163 caagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaa 262  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||         |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20570912 caagcattgtcattatcaaaatggaaggaaaatgttttgtatatagctttgaaaatagaag-----aaaatagagttttcaaacaaaagcaacggctcaa 20571006  T
Q  263 attgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacag 362  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20571007 cttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacgg 20571106  T
Q  363 taaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaaacttctgatga 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  20571107 taaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttttgatga 20571161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 11 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 28027638 - 28027236
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgctggtatca--caatgagatggacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 108  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||| ||| ||  || ||| || ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28027638 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatacattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 28027539  T
Q  109 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||    
T  28027538 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattatcattatcaaaatagaaggaaaataaattgtatatag 28027439  T
Q  209 ctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 308  Q
    |||||||||||||||         |||| |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28027438 ctttgaaagtagaag-----aaaatagaatttt-aaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcctgactccacgga 28027345  T
Q  309 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaaac 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  28027344 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatccacaagtacagaagc 28027245  T
Q  409 ttctgatga 417  Q
    || ||||||    
T  28027244 ttttgatga 28027236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 11 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 10649420 - 10649034
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgctggtatcacaa--tgagatggacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 108  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||| ||| ||||   ||| || ||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10649420 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 10649321  T
Q  109 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaat-gttttgtatata 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  10649320 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtatata 10649221  T
Q  208 gctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgg 307  Q
     |||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10649220 actttgaaagtagaag-----aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgg 10649126  T
Q  308 attcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||| ||| | |||||||||||||| ||||    
T  10649125 attcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacacttcctggaaactttgaattcgcaag 10649034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 56 - 398
Target Start/End: Original strand, 31958413 - 31958753
Alignment:
Q  56 gacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 155  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31958413 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaaggtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatg 31958512  T
Q  156 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaa 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||| ||||||||||||||||||    
T  31958513 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaag--aacaaaatagaattttcaaacaaaagcaaa 31958610  T
Q  256 ggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattg 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31958611 ggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattg 31958710  T
Q  356 aacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaa 398  Q
    |||||||||| || |||| |||  | ||||||||| |||||||    
T  31958711 aacacagtaatcattacatttcccaaaaactttgatttcacaa 31958753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 70 - 417
Target Start/End: Original strand, 28109923 - 28110271
Alignment:
Q  70 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaat----gtttgtttcaa 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||    
T  28109923 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaaaacgtttgtttcaa 28110022  T
Q  166 gcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaatt 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28110023 gcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaag----aaaaatggagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaatt 28110118  T
Q  266 gatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaa 365  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28110119 gatgtataagagtggtggtcagcccaaggcatgactccacggattcataaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaa 28110218  T
Q  366 ccactacagtt-cttagaaactttgaattcacaagtacagaaacttctgatga 417  Q
     || |||| || |  | ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  28110219 tcattacatttcccaaaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatga 28110271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 56 - 398
Target Start/End: Original strand, 5603271 - 5603611
Alignment:
Q  56 gacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 155  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5603271 gacatcaacatactctcgctcatgcatgttttatttgaaggtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatg 5603370  T
Q  156 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaa 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||| ||||||||||||||||||    
T  5603371 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaag--aacaaaatagaattttcaaacaaaagcaaa 5603468  T
Q  256 ggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattg 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5603469 ggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattg 5603568  T
Q  356 aacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaa 398  Q
    |||||||||| || |||| |||  | ||||||||| |||||||    
T  5603569 aacacagtaatcattacatttcccaaaaactttgatttcacaa 5603611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 56 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 24334477 - 24334137
Alignment:
Q  56 gacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 155  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24334477 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaaggtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatg 24334378  T
Q  156 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaa 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||         |||| ||||||||||||||||||    
T  24334377 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtgtatagctttgaaagtagaag--aacaaaatagaattttcaaacaaaagcaaa 24334280  T
Q  256 ggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattg 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24334279 ggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattg 24334180  T
Q  356 aacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaa 398  Q
    |||||||||| || |||| |||  | ||||||||| |||||||    
T  24334179 aacacagtaatcattacatttcccaaaaactttgatttcacaa 24334137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 56 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 5473289 - 5472951
Alignment:
Q  56 gacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-t 154  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  5473289 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaa-gttttcaattttcaaaaat 5473191  T
Q  155 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaa 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||    
T  5473190 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatggaaggaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaag-----aaaatagagttttcaaacaaaagcaa 5473096  T
Q  255 aggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacatt 354  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5473095 aggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacatt 5472996  T
Q  355 gaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
    ||||||||||| ||  |||  || |||||||||||||||| ||||    
T  5472995 gaacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaag 5472951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 14 - 406
Target Start/End: Original strand, 5590275 - 5590665
Alignment:
Q  14 agactatcctggggaagagcctgctggtatcac--aatgagatggacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcag 111  Q
    |||||||||||| | ||| |||||| ||| |||  | ||| || ||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5590275 agactatcctggaggagaacctgcttgtaacacctattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcag 5590374  T
Q  112 gtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtatatagct 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  5590375 gtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtacatagct 5590474  T
Q  211 ttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 310  Q
    ||||||||| || |         |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  5590475 ttgaaagtaaaaagaaaac----agag-tttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 5590569  T
Q  311 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaa 406  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5590570 tacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacagctcttagaaactttgaattcacaagtacagaa 5590665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 56 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 8217936 - 8217595
Alignment:
Q  56 gacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-- 153  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  8217936 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaa 8217837  T
Q  154 tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagc 252  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||         ||||||||||||||||||||    
T  8217836 tgtttgtttcgagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtatataactttgaaagtagaag-----aaaatagagttttcaaacaaaagc 8217742  T
Q  253 aaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtaca 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8217741 aaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatccacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtaca 8217642  T
Q  353 ttgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||| |  ||||||||||||| ||||    
T  8217641 ttgaacacagtaatcactacatttcctgaaaactttgaattcgcaag 8217595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 70 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 51788310 - 51787985
Alignment:
Q  70 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagca 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  51788310 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaataaacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagca 51788211  T
Q  169 ttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgat 268  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  51788210 ttgtcattatcaaaatagaaggaaaatattttgtatatagctttgaaagtagaag-----aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaacttgat 51788116  T
Q  269 gtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaacca 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||    
T  51788115 gtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttatcggttggtggtacattgaacacagcaatca 51788016  T
Q  369 ctacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
     |||| ||| | |||||||||||||| ||||    
T  51788015 ttacacttcctggaaactttgaattcgcaag 51787985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 56 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 4423220 - 4422881
Alignment:
Q  56 gacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaat 154  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4423220 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaat 4423121  T
Q  155 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaa 254  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||    
T  4423120 gtttatttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatatagctttgaaagtagaag-----aaaatagagttttcaaacaaaagcaa 4423026  T
Q  255 aggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacatt 354  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4423025 aggctcaacttgatgtataaaagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacatt 4422926  T
Q  355 gaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
    ||||||||||| || |||| ||| | |||||||||||||| ||||    
T  4422925 gaacacagtaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaag 4422881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 11 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 16422532 - 16422128
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgctggtatcacaa--tgagatggacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||   ||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16422532 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 16422433  T
Q  109 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagtttt-caattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg--ttttgtata 205  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |    
T  16422432 caggtttgcttt-caaaatacacaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttttgtaca 16422334  T
Q  206 tagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccac 305  Q
    ||||||||||||||||| |        ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  16422333 tagctttgaaagtagaaag----aaagtagag-tttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccac 16422239  T
Q  306 ggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacaga 405  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||   |||||||||||||| |||| |||||    
T  16422238 ggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttc-cggaaactttgaattcgcaagcacaga 16422140  T
Q  406 aacttctgatga 417  Q
    | |||| |||||    
T  16422139 agcttcagatga 16422128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 69 - 399
Target Start/End: Original strand, 22381552 - 22381877
Alignment:
Q  69 actcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagc 167  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22381552 actcgctcatgcatgtt-catttgaatgtacactgtcgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagc 22381650  T
Q  168 attgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattga 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||    
T  22381651 attgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaag----aaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattga 22381745  T
Q  268 tgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaacc 367  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22381746 tgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatc 22381845  T
Q  368 actacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
    |  ||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  22381846 atgacatttcctagaaactttgaattcgcaag 22381877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 11 - 417
Target Start/End: Original strand, 16618400 - 16618808
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgctggtatcacaa--tgagatggacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||   ||| || ||||||  ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16618400 cacagactatcctggggaagagcctccttgtaacacatattgaaatagacatcgacatacgctcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 16618499  T
Q  109 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagtttt---caattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt---gt 202  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||| ||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||    
T  16618500 caggtttgcttt-caaaatggacaaaaactttttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaagatagaaagaaaatgtttttttgt 16618598  T
Q  203 atatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactc 302  Q
    | |||||||||||||||||| |        |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  16618599 acatagctttgaaagtagaaagaaag----tagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactc 16618693  T
Q  303 cacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtac 402  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||    
T  16618694 cacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacatttcctagaaactttgaattcgcaagcac 16618793  T
Q  403 agaaacttctgatga 417  Q
    |||| ||||||||||    
T  16618794 agaagcttctgatga 16618808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 70 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 18231481 - 18231156
Alignment:
Q  70 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagca 168  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18231481 ctcgctcatgcatgtttcatttgactgtaccctgttgctcgggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagca 18231382  T
Q  169 ttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgat 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |         |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18231381 ttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaagaaaac----agagtttt-aaacaaaagcaaaggctcaaattgat 18231287  T
Q  269 gtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaacca 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  18231286 gtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcgcaaatcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatca 18231187  T
Q  369 ctacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
     |||| ||| |  ||||||||||||| ||||    
T  18231186 ttacatttcctgaaaactttgaattcgcaag 18231156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 11 - 399
Target Start/End: Original strand, 4790544 - 4790931
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgctggtatcacaa--tgagatggacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 108  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||| ||| ||||   ||| || ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4790544 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 4790643  T
Q  109 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtatata 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4790644 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatata 4790743  T
Q  208 gctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgg 307  Q
    ||||||||||||||||         ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  4790744 gctttgaaagtagaag----aaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgaatccacgg 4790838  T
Q  308 attcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| ||| |  ||||||||||||| ||||    
T  4790839 atttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacggtaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaag 4790931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 56 - 406
Target Start/End: Original strand, 17978908 - 17979255
Alignment:
Q  56 gacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgctttt-caaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaat 154  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17978908 gacatcaacataccctcgctcatgcatatttcctttgaatgtaccctgttgctcaggtttgctttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaat 17979007  T
Q  155 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagca 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |         |||| |||||||||||||||    
T  17979008 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatatagctttgaaagtaaaaagaaaac----agag-tttcaaacaaaagca 17979102  T
Q  254 aaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacat 353  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17979103 cagtctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacat 17979202  T
Q  354 tgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaa 406  Q
    ||||||||| || || |||| ||| | | |||||||||| |||||||||||||    
T  17979203 tgaacacagcaatcattacatttcctgggaactttgaatccacaagtacagaa 17979255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 56 - 399
Target Start/End: Original strand, 17970824 - 17971161
Alignment:
Q  56 gacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 155  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17970824 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 17970923  T
Q  156 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaa 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||| ||||||         ||||||||| ||||||||||| |    
T  17970924 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaataaattgtatatagctttgaaaatagaag-----aaaatagagtttt-aaacaaaagcaca 17971017  T
Q  256 ggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattg 355  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17971018 ggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacgttg 17971117  T
Q  356 aacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
    ||||||| || ||  ||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  17971118 aacacagcaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaag 17971161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 70 - 399
Target Start/End: Original strand, 22864820 - 22865143
Alignment:
Q  70 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22864820 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaacagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 22864919  T
Q  170 tgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatg 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||         |||   ||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  22864920 tgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatacagctttgaaagtagaag---aaagcatag---tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatg 22865013  T
Q  270 tataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccac 369  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  22865014 tataagagtggtgatcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcat 22865113  T
Q  370 tacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
     ||| |||  ||||||||||||||| ||||    
T  22865114 gacatttcccagaaactttgaattcgcaag 22865143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 70 - 399
Target Start/End: Original strand, 22879879 - 22880202
Alignment:
Q  70 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22879879 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaacagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 22879978  T
Q  170 tgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatg 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||         |||   ||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  22879979 tgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatacagctttgaaagtagaag---aaagcatag---tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatg 22880072  T
Q  270 tataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccac 369  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  22880073 tataagagtggtgatcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcat 22880172  T
Q  370 tacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
     ||| |||  ||||||||||||||| ||||    
T  22880173 gacatttcccagaaactttgaattcgcaag 22880202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 56 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 10402450 - 10402112
Alignment:
Q  56 gacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaat 154  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10402450 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaat 10402351  T
Q  155 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaa 254  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          |||| |||| || ||||||||     
T  10402350 gtttgtttcgagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaa-----aaaaatagaatttt-aatcaaaagcac 10402257  T
Q  255 aggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacatt 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10402256 aggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggtgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacatt 10402157  T
Q  355 gaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
    ||||||||||| || |||| ||| |  ||||||||||||| ||||    
T  10402156 gaacacagtaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaag 10402112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 70 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 28345458 - 28345135
Alignment:
Q  70 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaa-ttttcaaaatgtttgtttcaagca 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28345458 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaatttttcaaaatgtttgtttcaagca 28345359  T
Q  169 ttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgat 268  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||         ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  28345358 ttgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatatagctttgaaaatagaag-----aaaatagagtttt-aaacaaaagcataggctcaatttgat 28345265  T
Q  269 gtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaacca 368  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28345264 gtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatca 28345165  T
Q  369 ctacagttcttagaaactttgaattcacaa 398  Q
     |||| |||  | ||||||||| |||||||    
T  28345164 ttacatttcccaaaaactttgatttcacaa 28345135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 56 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 5020014 - 5019676
Alignment:
Q  56 gacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaat 154  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5020014 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaat 5019915  T
Q  155 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaa 254  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||         ||||||||| |||||||||||     
T  5019914 gttcgtttcaggcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatatagctttgaaagtagaag-----aaagtagagtttt-aaacaaaagcac 5019821  T
Q  255 aggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacatt 354  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5019820 aagctcaaattgatgtgtaagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacatt 5019721  T
Q  355 gaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
    ||||||||||| ||  ||| ||| | |||||||||||||| ||||    
T  5019720 gaacacagtaatcatgacatttcctggaaactttgaattcgcaag 5019676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 11 - 393
Target Start/End: Original strand, 18286266 - 18286645
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgctggtatcacaa--tgagatggacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 108  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||| ||| ||||   ||| || |||| || || | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18286266 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 18286364  T
Q  109 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa--tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 206  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18286365 cagatttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 18286464  T
Q  207 agctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacg 306  Q
    |||||||||||||||||         ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  18286465 agctttgaaagtagaag-----aaaatagagtttt-aatcaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacg 18286558  T
Q  307 gattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaatt 393  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||  ||||||||||||||    
T  18286559 gatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcccagaaactttgaatt 18286645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 11 - 393
Target Start/End: Original strand, 18301567 - 18301946
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgctggtatcacaa--tgagatggacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 108  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||| ||| ||||   ||| || |||| || || | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18301567 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 18301665  T
Q  109 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa--tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 206  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18301666 cagatttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 18301765  T
Q  207 agctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacg 306  Q
    |||||||||||||||||         ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  18301766 agctttgaaagtagaag-----aaaatagagtttt-aatcaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacg 18301859  T
Q  307 gattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaatt 393  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||  ||||||||||||||    
T  18301860 gatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcccagaaactttgaatt 18301946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 56 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 20072337 - 20071996
Alignment:
Q  56 gacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc----aa 151  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||    
T  20072337 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaa 20072238  T
Q  152 aatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaag 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||| |||||||||    
T  20072237 aatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaag-----aaaatagagtttt-aaacaaaag 20072144  T
Q  252 caaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtac 351  Q
    || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20072143 cacaggctcaatttgatgtataagaggggtggtcagccgaaggtgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtac 20072044  T
Q  352 attgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
    |||||||||||| | ||  ||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  20072043 attgaacacagtgatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaag 20071996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 56 - 399
Target Start/End: Original strand, 6536701 - 6537040
Alignment:
Q  56 gacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaat 154  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||    
T  6536701 gacatcaacatactctcgctcatgcatgcttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaacagacaaaaagtttttaattttcaaaaat 6536800  T
Q  155 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaa 254  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |         |||| |||||||||||||||     
T  6536801 gtttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtaaaaagaaagc----agag-tttcaaacaaaagcac 6536895  T
Q  255 aggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacatt 354  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6536896 aagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacatt 6536995  T
Q  355 gaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
    ||||||||||| ||  ||| |||  ||||||||||||||| ||||    
T  6536996 gaacacagtaatcatgacatttcccagaaactttgaattcgcaag 6537040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 56 - 391
Target Start/End: Original strand, 11104319 - 11104651
Alignment:
Q  56 gacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 155  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11104319 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 11104418  T
Q  156 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata--tagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagca 253  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||   |||||||  |||||||||||||| || |        ||||| |||||||||||||||    
T  11104419 tttgtttcaagcattatcattatcaaaatagaaggaaaataaattgtatatttagctttgaaagtaaaaag----aaaatagag-tttcaaacaaaagca 11104513  T
Q  254 aaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacat 353  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11104514 caggctcaaattgatgtataagagtggtagtcagccgaaggcgtggctccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacat 11104613  T
Q  354 tgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaa 391  Q
    ||||||||| || || |||| ||| | |||||||||||    
T  11104614 tgaacacagcaatcattacacttcctggaaactttgaa 11104651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 56 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 7079529 - 7079185
Alignment:
Q  56 gacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaag-ttttcaattttcaaaat 154  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  7079529 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttttaattttcaaaat 7079430  T
Q  155 gtttgtttcaagcattgtcattatcaa-aatagaaagaaaatgttttg----tatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaa 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||| || |         |||| ||||| |||||    
T  7079429 gtttgtttcaagcattgtcattatcaagaatagaaagaaaatgttttgtatatatatagctttgaaagtaaaaagaaaac----agag-tttcagacaaa 7079335  T
Q  250 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 349  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7079334 agcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 7079235  T
Q  350 acattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
    |||||||||||||||| ||  ||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  7079234 acattgaacacagtaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaag 7079185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 56 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 48472233 - 48471890
Alignment:
Q  56 gacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaatttt-----ca 150  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||      |    
T  48472233 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacagaaagttttcaatttttaaaaaa 48472134  T
Q  151 aaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaa 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||| ||||||||||||    
T  48472133 aaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaag----aaaaatagag-tttcaaacaaaa 48472039  T
Q  251 gcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggta 350  Q
    ||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48472038 gcacaagctcaaattgatgtatgagagtggtggtcagccgagggcgtgactccatggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggta 48471939  T
Q  351 cattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
    |||||||||||  || || |||| ||| | |||||||||||||| ||||    
T  48471938 cattgaacacatcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaag 48471890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 11 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 18057612 - 18057223
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgctggtatcacaa--tgagatggacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||   ||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18057612 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 18057513  T
Q  109 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatc-aaaatagaaagaaaatg-ttttgtata 205  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |    
T  18057512 caggtttgctttcaaaaatagacaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaaatagaaggaaaatgtttttgtaca 18057413  T
Q  206 tagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccac 305  Q
    || ||||||||||| || |         |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  18057412 taactttgaaagtaaaaagaaagc----agag-tttcaaacaaaagcacgggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccac 18057318  T
Q  306 ggattcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || |||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  18057317 ggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaag 18057223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 69 - 399
Target Start/End: Original strand, 31030216 - 31030535
Alignment:
Q  69 actcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagca 168  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31030216 actcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa-----aaaactttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagca 31030309  T
Q  169 ttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgat 268  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||| |||||||||||| |||||||||||||     
T  31030310 ttatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaag----aaaaatagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgac 31030404  T
Q  269 gtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaacca 368  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31030405 gtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatca 31030504  T
Q  369 ctacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
      |||  || |||||||||||||||| ||||    
T  31030505 tgacatctcctagaaactttgaattcgcaag 31030535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 69 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 18336911 - 18336589
Alignment:
Q  69 actcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagca 168  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  18336911 actcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa-----aaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagca 18336818  T
Q  169 ttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgat 268  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||| |||||||||||| | |||||||| |||    
T  18336817 ttatcattatcataatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaag----aaaaatagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaatcgat 18336723  T
Q  269 gtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaacc 367  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18336722 gtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagtaatc 18336623  T
Q  368 actacagttcttagaaactttgaattcacaagta 401  Q
    | |||| ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  18336622 attacatttcctagaaactttgaattcgcaagta 18336589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 11 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 6208245 - 6207869
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgctggtatcacaa--tgagatggacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 108  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| || |   ||| || |||| || || | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6208245 cacagaccatcctggggaagagcctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 6208147  T
Q  109 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgttttgtatat 206  Q
    ||||||||||||||||||      |||  |||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  6208146 caggtttgcttttcaaaa------aaactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcctttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgttttgtatat 6208053  T
Q  207 agctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacg 306  Q
    |||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  6208052 agctttgaaagtagaag----aaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgacgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacg 6207957  T
Q  307 gattcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaatt 393  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||||    
T  6207956 gatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcctagaaactttgaatt 6207869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 19700847 - 19700454
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgctggtatcacaa--tgagatggacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 108  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||   ||| || |||| || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19700847 cacagactatcctggggaagaatctgctcgtaacacatattgaaatagacaccaacatacactcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 19700748  T
Q  109 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaag--ttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt----- 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||         
T  19700747 caggtttgcttt-caaaatagacaaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcatttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttttttt 19700649  T
Q  201 ------gtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaagg 294  Q
          ||| ||||||||||||||| || |        |||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19700648 ttttttgtacatagctttgaaagtaaaaagaaaa----tagagttt-caaacaaaagcacaggcttaacttgatgtataagagtggtggtcagccgaagg 19700554  T
Q  295 catgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattc 394  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  19700553 cgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgatacattgaacacagtaatcactacatttcctagaaactttgaattc 19700454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 11 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 4727976 - 4727602
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgctggtatcacaa--tgagatggacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 108  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| || |   ||| || |||| || || | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4727976 cacagaccatcctggggaagagcctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 4727878  T
Q  109 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgttttgtatat 206  Q
    ||||||||||||||||||      |||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  4727877 caggtttgcttttcaaaa------aaactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 4727784  T
Q  207 agctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacg 306  Q
    ||||||||||||| || |         ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  4727783 agctttgaaagtaaaaagaaagc----agagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacg 4727689  T
Q  307 gattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaatt 393  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||| |||||||||||||||    
T  4727688 gatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatcacatttcctagaaactttgaatt 4727602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 69 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 32445434 - 32445122
Alignment:
Q  69 actcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagca 168  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32445434 actcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa-------aactttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagca 32445343  T
Q  169 ttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgat 268  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |         ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||    
T  32445342 ttatcattatcaaaacagaaagaaaatgttttgtatataactttgaaagtaaaaagaaagc----agagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgat 32445248  T
Q  269 gtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaacca 368  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  32445247 gtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatca 32445148  T
Q  369 ctacagttcttagaaactttgaattc 394  Q
      ||| |||  |||||||||||||||    
T  32445147 tgacatttcccagaaactttgaattc 32445122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 69 - 399
Target Start/End: Original strand, 15735071 - 15735392
Alignment:
Q  69 actcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagca 168  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||  |||||||||||||| ||| ||||||| ||||    
T  15735071 actcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa-----aaaactttttcaattttcaagatgcttgtttcgagca 15735164  T
Q  169 tt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaatt 265  Q
    || |||||||| |||| ||||| | ||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||          ||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  15735165 tttgtcattattaaaaatagaagggaaatgtttttgtacataactttgaaagtaaaagaaagc-----agagttt-caaacaaaagcacaggctcaaatt 15735258  T
Q  266 gatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaa 365  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15735259 gatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaa 15735358  T
Q  366 ccactacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
     || |||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  15735359 tcattacatttcctagaaactttgaattcgcaag 15735392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 69 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 35887049 - 35886733
Alignment:
Q  69 actcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagca 168  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||      |||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  35887049 actcgctcatgtatgtt-cgtttgaatgtaccctgttacacaggtttgcttttcaaaa------aaactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagca 35886957  T
Q  169 tt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaatt 265  Q
    || |||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| || |         ||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  35886956 tttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtacatagctttgaaagtaaaaagaaagc----agagttt-caaacaaaagcacaggctcaaatt 35886862  T
Q  266 gatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagta 364  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35886861 gatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtgatacattgaacacagta 35886762  T
Q  365 accactacagttcttagaaactttgaatt 393  Q
    | || |||| ||| |||||||||||||||    
T  35886761 atcattacatttcctagaaactttgaatt 35886733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 64 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 4689939 - 4689614
Alignment:
Q  64 catatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttc 163  Q
    |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  4689939 catacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa-------aactttttcaattttcaagatgtttgtttc 4689848  T
Q  164 aagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctc 260  Q
     |||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| ||| ||| ||||||| |||          ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  4689847 gagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtacataacttagaaagtaaaagaaagc-----agagttt-caaacaaaagcacaggctc 4689754  T
Q  261 aaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaaca 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  4689753 aaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacgaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacg 4689654  T
Q  360 cagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
    ||| || || |||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  4689653 cagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaag 4689614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 64 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 5658425 - 5658097
Alignment:
Q  64 catatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttc 163  Q
    |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||      |||  ||||||||||| || |||||||||||    
T  5658425 catacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgcttaggtttgcttttcaaaa------aaactttttcaatttttaagatgtttgtttc 5658333  T
Q  164 aagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctc 260  Q
    ||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| ||| | ||||||||| ||||        |||||||| |||||||||||| ||||||    
T  5658332 aagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtacataacgttgaaagtaaaaggaaaa----tagagttt-caaacaaaagcacaggctc 5658238  T
Q  261 aaattgat--gtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 358  Q
    ||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5658237 aaaatgatatgtataagagtggtggtcagccgaaggcctgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacgttgaac 5658138  T
Q  359 acagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
    |||| || ||  ||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  5658137 acagcaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaag 5658097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 70 - 399
Target Start/End: Original strand, 8283430 - 8283766
Alignment:
Q  70 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaag---------ttttcaattttcaaaatgtttgt 160  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | |||||          |||||||||||||| ||| ||||    
T  8283430 ctcgctcatgcatgttttgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgctttccaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaactttttcaattttcaagatgcttgt 8283529  T
Q  161 ttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaagg 257  Q
    ||| |||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| || |          |||||| ||||||||| || | |    
T  8283530 ttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtacataactttgaaagtaaaaagaaagcg----gagttt-caaacaaaaacacatg 8283624  T
Q  258 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8283625 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 8283724  T
Q  358 cacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
    ||||  || || |||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  8283725 cacatcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaag 8283766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 291 - 399
Target Start/End: Original strand, 15886894 - 15887004
Alignment:
Q  291 aaggcatgactccacggattc-acaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaacttt 388  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||| ||| ||||||||||    
T  15886894 aaggcgtgactccacggattttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaacttt 15886993  T
Q  389 gaattcacaag 399  Q
    |||||| ||||    
T  15886994 gaattcgcaag 15887004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 315 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 8002607 - 8002523
Alignment:
Q  315 aagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||| ||| | |||||||||||||| ||||    
T  8002607 aagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacacttcctggaaactttgaattcgcaag 8002523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 64 - 219
Target Start/End: Original strand, 15886707 - 15886857
Alignment:
Q  64 catatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttc 163  Q
    |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||  |||||||||||||| ||||||| |||    
T  15886707 catacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaa-------aaaactttttcaattttcaagatgtttgcttc 15886798  T
Q  164 aagca-ttgtcatta-tcaaaatagaaagaaaat-gttttgtatatagctttgaaagta 219  Q
     |||| ||||||||| | ||||||||| |||| |  ||||||| ||| |||||||||||    
T  15886799 gagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaagtatttttgtacataactttgaaagta 15886857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 282; Significance: 1e-158; HSPs: 41)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 69 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 40239832 - 40239489
Alignment:
Q  69 actcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagca 168  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40239832 actcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagca 40239734  T
Q  169 ttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattga 267  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40239733 ttgtcattatcaaaatggaaagaaaatatttttgtatataactttgaaagtagaag-----aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattga 40239639  T
Q  268 tgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaacc 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40239638 tgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaacc 40239539  T
Q  368 actacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaaacttctgatga 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  40239538 actacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatga 40239489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 11 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 27810087 - 27809699
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgctggtatcacaa--tgagatggacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 108  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||| ||| ||||   ||| || ||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27810087 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaacctgttgct 27809988  T
Q  109 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27809987 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 27809888  T
Q  209 ctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 308  Q
    |||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27809887 ctttgaaagtagaag--aaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 27809790  T
Q  309 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  27809789 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaag 27809699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 70 - 417
Target Start/End: Original strand, 12710520 - 12710863
Alignment:
Q  70 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa--tgtttgtttcaagc 167  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  12710520 ctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaatgtttgtttcaagc 12710619  T
Q  168 attgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattga 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||| ||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  12710620 attgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaag-----aaaatagaattt-caaacaaaagcacaagctcaaattga 12710713  T
Q  268 tgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaacc 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12710714 tgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatc 12710813  T
Q  368 actacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaaacttctgatga 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  12710814 actacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatga 12710863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 64 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 27782561 - 27782212
Alignment:
Q  64 catatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgttt 162  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27782561 catacactcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaataaacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgttt 27782462  T
Q  163 caagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaa 262  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||         |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27782461 caagcattgtcattatcaaaatggaaggaaaatgttttgtatatagctttgaaaatagaag-----aaaatagagttttcaaacaaaagcaacggctcaa 27782367  T
Q  263 attgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacag 362  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27782366 cttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacgg 27782267  T
Q  363 taaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaaacttctgatga 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  27782266 taaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttttgatga 27782212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 11 - 399
Target Start/End: Original strand, 254510 - 254896
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgctggtatcacaa--tgagatggacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 108  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||| ||| ||||   ||| || ||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  254510 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 254609  T
Q  109 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  254610 caggtttgcttttcaaaatagacaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 254708  T
Q  209 ctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 308  Q
    |||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  254709 ctttgaaagtagaag---aaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 254805  T
Q  309 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||| ||| | |||||||||||||| ||||    
T  254806 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaag 254896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 11 - 399
Target Start/End: Original strand, 37945723 - 37946110
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgctggtatcacaa--tgagatggacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 108  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||| ||| ||||   ||| || ||||||| ||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37945723 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactcttactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 37945822  T
Q  109 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37945823 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 37945922  T
Q  209 ctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 308  Q
    |||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37945923 ctttgaaagtagaag---aaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 37946019  T
Q  309 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||| ||| | |||||||||||||| ||||    
T  37946020 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtatattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaag 37946110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 11 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 16167862 - 16167476
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgctggtatcacaa--tgagatggacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 108  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||| ||| ||||   ||| || ||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16167862 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacataccctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 16167763  T
Q  109 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaat-gttttgtatata 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  16167762 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtatata 16167663  T
Q  208 gctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgg 307  Q
     |||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16167662 actttgaaagtagaag-----aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgg 16167568  T
Q  308 attcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||| ||| | |||||||||||||| ||||    
T  16167567 attcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaag 16167476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 11 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 3788877 - 3788492
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgctggtatca--caatgagatggacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 108  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||| ||| ||  || ||| || ||||||| ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3788877 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatacattgaaatagacatcaacatactctcgttcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 3788778  T
Q  109 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3788777 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 3788678  T
Q  209 ctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 308  Q
    |||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3788677 ctttgaaagtagaag-----aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccgcgga 3788583  T
Q  309 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||  || |||||||||||||||| ||||    
T  3788582 tttataaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaag 3788492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 11 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 12593198 - 12592808
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgctggtatcacaa--tgagatggacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 108  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||| ||| ||||   ||| || ||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12593198 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 12593099  T
Q  109 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa----tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtat 204  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12593098 caggtttgctttccaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtat 12592999  T
Q  205 atagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactcca 304  Q
    |||||||||||||||||||         | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12592998 atagctttgaaagtagaag----aaaaatggagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactcca 12592903  T
Q  305 cggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  12592902 cggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaag 12592808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 56 - 398
Target Start/End: Original strand, 22922048 - 22922388
Alignment:
Q  56 gacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 155  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22922048 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaaggtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatg 22922147  T
Q  156 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaa 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||| ||||||||||||||||||    
T  22922148 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaag--aacaaaatagaattttcaaacaaaagcaaa 22922245  T
Q  256 ggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattg 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22922246 ggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattg 22922345  T
Q  356 aacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaa 398  Q
    |||||||||| || |||| |||  | ||||||||| |||||||    
T  22922346 aacacagtaatcattacatttcccaaaaactttgatttcacaa 22922388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 56 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 12661875 - 12661543
Alignment:
Q  56 gacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 155  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12661875 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 12661776  T
Q  156 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaa 255  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||| ||||||||||||||| |    
T  12661775 tttgtttcaagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaag----aaaaatagag-tttcaaacaaaagcaca 12661681  T
Q  256 ggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattg 355  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12661680 agctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattg 12661581  T
Q  356 aacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaatt 393  Q
    |||||||||| || |||| ||| |||||||||||||||    
T  12661580 aacacagtaatcattacatttcctagaaactttgaatt 12661543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 70 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 37931702 - 37931370
Alignment:
Q  70 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagca 168  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37931702 ctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaataaacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagca 37931603  T
Q  169 ttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnn--tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattg 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37931602 ttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaaaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattg 37931503  T
Q  267 atgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaac 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  37931502 atgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaat 37931403  T
Q  367 cactacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
    || |||| ||| | |||||||||||||| ||||    
T  37931402 cattacatttcctggaaactttgaattcgcaag 37931370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 70 - 399
Target Start/End: Original strand, 13930463 - 13930790
Alignment:
Q  70 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagca 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13930463 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagca 13930562  T
Q  169 ttgtcattatcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattga 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||         | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13930563 ttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatatagctttgaaagtagaag----aaaaatggagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattga 13930658  T
Q  268 tgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaacc 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  13930659 tgtataagagtggtggtcagccaaaggcacgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatc 13930758  T
Q  368 actacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
    | |||| ||| | |||||||||||||| ||||    
T  13930759 attacatttcctggaaactttgaattcgcaag 13930790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 56 - 398
Target Start/End: Original strand, 19410389 - 19410729
Alignment:
Q  56 gacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 155  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19410389 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaaggtatcctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatg 19410488  T
Q  156 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaa 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||         |||| ||||||||||||||||||    
T  19410489 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtgtatagctttgaaagtagaag--aacaaaatagaattttcaaacaaaagcaaa 19410586  T
Q  256 ggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattg 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19410587 ggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattg 19410686  T
Q  356 aacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaa 398  Q
    |||||||||| || |||| |||  | ||||||||| |||||||    
T  19410687 aacacagtaatcattacatttcccaaaaactttgatttcacaa 19410729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 11 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 39896452 - 39896048
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgctggtatcacaa--tgagatggacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 108  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||| ||| ||||   ||| || ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39896452 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 39896353  T
Q  109 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39896352 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 39896253  T
Q  209 ctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 308  Q
    |||||||||||||||         ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  39896252 ctttgaaagtagaag----aaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccggaggcgtgactccacgga 39896158  T
Q  309 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagtt-cttagaaactttgaattcacaagtacagaaa 407  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |  | ||||||||||||| |||||||||||     
T  39896157 ttcacaaagctcggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttccccaaaaactttgaattctcaagtacagaag 39896058  T
Q  408 cttctgatga 417  Q
    |||| |||||    
T  39896057 cttcagatga 39896048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 56 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 27122860 - 27122523
Alignment:
Q  56 gacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 155  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27122860 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 27122761  T
Q  156 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaa 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||| |||||||||||||    
T  27122760 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaag-----aaaatagagtttt-aaacaaaagcaaa 27122667  T
Q  256 ggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattg 355  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27122666 ggctcaatttgatgtataagaggggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattg 27122567  T
Q  356 aacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
    |||||||||| ||  |||  || |||||||||||||||| ||||    
T  27122566 aacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaag 27122523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 56 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 34868019 - 34867680
Alignment:
Q  56 gacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaat 154  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34868019 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaat 34867920  T
Q  155 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaa 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||         ||||||||| |||||||||||     
T  34867919 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatatagctttgaaaatagaag-----aaaatagagtttt-aaacaaaagcac 34867826  T
Q  255 aggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacatt 354  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34867825 aggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactctacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacatt 34867726  T
Q  355 gaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagt 400  Q
    ||||||||||| || | || ||| | |||||||||||||| |||||    
T  34867725 gaacacagtaatcatttcatttcctggaaactttgaattcgcaagt 34867680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 11 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 37384061 - 37383675
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgctggtatcacaa--tgagatggacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 108  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||| ||| ||||   ||| || ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37384061 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttggatgtaccctgttgct 37383962  T
Q  109 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37383961 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 37383862  T
Q  209 ctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 308  Q
    |||||||||||||||         ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  37383861 ctttgaaagtagaag----aaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccggaggcgtgactccacgga 37383767  T
Q  309 ttcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || |||| ||| |  ||||||||||||| ||||    
T  37383766 ttcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaag 37383675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 11 - 417
Target Start/End: Original strand, 37679749 - 37680155
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgctggtatca--caatgagatggacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 108  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||| ||| ||  || ||| || ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37679749 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatacattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 37679848  T
Q  109 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc--aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtata 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37679849 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaaatttcaattttcaaaaaatgtttgtttcaagcattgtctttatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtata 37679948  T
Q  206 tagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccac 305  Q
    ||||||||||||||||||         ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37679949 tagctttgaaagtagaag-----aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccac 37680042  T
Q  306 ggattcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacag 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || |||| |||    |||||||||||||||||||||||    
T  37680043 ggattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcccgaaaactttgaattcacaagtacag 37680142  T
Q  405 aaacttctgatga 417  Q
    || |||| |||||    
T  37680143 aagcttcagatga 37680155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 11 - 417
Target Start/End: Original strand, 37695014 - 37695420
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgctggtatca--caatgagatggacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 108  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||| ||| ||  || ||| || ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37695014 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatacattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 37695113  T
Q  109 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc--aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtata 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37695114 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaaatttcaattttcaaaaaatgtttgtttcaagcattgtctttatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtata 37695213  T
Q  206 tagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccac 305  Q
    ||||||||||||||||||         ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37695214 tagctttgaaagtagaag-----aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccac 37695307  T
Q  306 ggattcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacag 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || |||| |||    |||||||||||||||||||||||    
T  37695308 ggattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcccgaaaactttgaattcacaagtacag 37695407  T
Q  405 aaacttctgatga 417  Q
    || |||| |||||    
T  37695408 aagcttcagatga 37695420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 70 - 406
Target Start/End: Original strand, 16823256 - 16823588
Alignment:
Q  70 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 169  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16823256 ctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgctcgggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 16823355  T
Q  170 tgtcattatcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgat 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |         |||| ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  16823356 tgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatatagctttgaaagtaaaaagaaaac----agag-tttcaaacaaaagcacagtctcaaattgat 16823450  T
Q  269 gtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaacca 368  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  16823451 gtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatca 16823550  T
Q  369 ctacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaa 406  Q
     |||| ||| | | |||||||||| |||||||||||||    
T  16823551 ttacatttcctgggaactttgaatccacaagtacagaa 16823588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 70 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 16898224 - 16897892
Alignment:
Q  70 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 169  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16898224 ctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgctcgggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 16898125  T
Q  170 tgtcattatcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgat 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |         |||| ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  16898124 tgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatatagctttgaaagtaaaaagaaaac----agag-tttcaaacaaaagcacagtctcaaattgat 16898030  T
Q  269 gtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaacca 368  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  16898029 gtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatca 16897930  T
Q  369 ctacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaa 406  Q
     |||| ||| | | |||||||||| |||||||||||||    
T  16897929 ttacatttcctgggaactttgaatccacaagtacagaa 16897892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 56 - 399
Target Start/End: Original strand, 9343892 - 9344231
Alignment:
Q  56 gacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaat 154  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  9343892 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatggacaaaaagttttcaattttcaaaaat 9343991  T
Q  155 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaa 254  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        ||||||||| |||||||||||     
T  9343992 gtttgtttcaagcattgtcattattaaaatggaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaag----aaaatagagtttt-aaacaaaagcac 9344086  T
Q  255 aggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacatt 354  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9344087 aagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacatt 9344186  T
Q  355 gaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
    |||||||| || || |||| ||| | |||||||||||||| ||||    
T  9344187 gaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaag 9344231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 69 - 417
Target Start/End: Original strand, 11629103 - 11629446
Alignment:
Q  69 actcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagc 167  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  11629103 actcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcaggtttgtttttcaaaatagacaaagagttttcaattttcaaaaatgtttatttcaagc 11629201  T
Q  168 attgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattg 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||         ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  11629202 attgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatatagctttgaaaataaaag-----aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaaattg 11629295  T
Q  267 atgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaac 366  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  11629296 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaat 11629395  T
Q  367 cactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaaacttctgatga 417  Q
    || |||| |||  | ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  11629396 cattacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatga 11629446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 56 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 34161183 - 34160842
Alignment:
Q  56 gacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc---aaa 152  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  34161183 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaa 34161084  T
Q  153 atgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagc 252  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |         |||| ||||||||||||||    
T  34161083 atgtttgtttcaagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtaaaaagaaagc----agag-tttcaaacaaaagc 34160989  T
Q  253 aaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtaca 352  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34160988 acaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtaca 34160889  T
Q  353 ttgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
    ||||||||||||| ||  ||| |||  ||||||||||||||| ||||    
T  34160888 ttgaacacagtaatcatgacatttcccagaaactttgaattcgcaag 34160842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 11 - 417
Target Start/End: Original strand, 21671028 - 21671435
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgctggtatca--caatgagatggacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 108  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||| ||| ||  || ||| || ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21671028 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatacattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 21671127  T
Q  109 caggtttgcttttcaaaatagac-aaaaagttttcaattttc--aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtat 204  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21671128 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaaaatttcaattttcaaaaaatgtttgtttcaagcattgtctttatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtat 21671227  T
Q  205 atagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactcca 304  Q
    |||||||||||||||||||         ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21671228 atagctttgaaagtagaag-----aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactcca 21671321  T
Q  305 cggattcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtaca 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || |||| |||    ||||||||||||||||||||||    
T  21671322 cggattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcccgaaaactttgaattcacaagtaca 21671421  T
Q  404 gaaacttctgatga 417  Q
    ||| |||| |||||    
T  21671422 gaagcttcagatga 21671435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 56 - 399
Target Start/End: Original strand, 39045727 - 39046066
Alignment:
Q  56 gacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaat 154  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39045727 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaat 39045826  T
Q  155 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaa 254  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        ||||||||| |||||||||||     
T  39045827 gtttgtttcaagtattgtcattattaaaatggaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaag----aaaatagagtttt-aaacaaaagcac 39045921  T
Q  255 aggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacatt 354  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39045922 aagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttagtggtacatt 39046021  T
Q  355 gaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
    ||||||||||| || |||| ||  | |||||||||||||| ||||    
T  39046022 gaacacagtaatcattacattttctggaaactttgaattcgcaag 39046066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 11 - 406
Target Start/End: Original strand, 21697031 - 21697427
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgctggtatcacaa--tgagatggacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 108  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||   ||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  21697031 cacagactatcctggggaagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccttgttgct 21697130  T
Q  109 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaag--ttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt--gta 203  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  21697131 caggtttgcttt-caaaatagacaaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcatttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttttgta 21697229  T
Q  204 tatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactcc 303  Q
     |||||||||||||||| | |        |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  21697230 catagctttgaaagtaggaagatag----tagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactcc 21697324  T
Q  304 acggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtaca 403  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||| |||| |||    
T  21697325 acggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcaca 21697424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 70 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 32056124 - 32055800
Alignment:
Q  70 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagca 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  32056124 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaataaacaaaaagttttcagttttcaaaaatgtttgtttcaagca 32056025  T
Q  169 ttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgat 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  32056024 ttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaag-----aaaatagaatttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgat 32055931  T
Q  269 gtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaacca 368  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  32055930 gtataagagtggtagtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgatacattgaacacagtaatca 32055831  T
Q  369 ctacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
      ||| ||| | |||||||||||||| ||||    
T  32055830 tgacatttcctggaaactttgaattcgcaag 32055800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 64 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 31882615 - 31882285
Alignment:
Q  64 catatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgttt 162  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  31882615 catattctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccccgttgctcaagtttgcttttcaaaatagaaaaaaagtttttaattttcaaaaatgtttgttt 31882516  T
Q  163 caagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaa 262  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||  ||||||||||||||| | ||||||    
T  31882515 caagcattgccattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaag-----aaaataga-atttcaaacaaaagcacaagctcaa 31882422  T
Q  263 attgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacag 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31882421 attgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgatacattgaacacag 31882322  T
Q  363 taaccactacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
     || || |||| ||| | |||||||||||||| ||||    
T  31882321 caatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaag 31882285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 70 - 349
Target Start/End: Original strand, 31868705 - 31868979
Alignment:
Q  70 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagca 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31868705 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagca 31868804  T
Q  169 ttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgat 268  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||         ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  31868805 ttgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatatagctttgaaagtagaag-----aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgat 31868898  T
Q  269 gtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 349  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31868899 gtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaatgcttgaaaaatggtaattttattggttggtggt 31868979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 56 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 34297486 - 34297154
Alignment:
Q  56 gacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 155  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||  |||||||||||| |||||    
T  34297486 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa------aaactttttcaattttcgaaatg 34297393  T
Q  156 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaa 255  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |         ||||||| |||||||||||| |    
T  34297392 tttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtaaaaagaaagc----agagttt-caaacaaaagcaca 34297298  T
Q  256 ggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattg 355  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34297297 agctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattg 34297198  T
Q  356 aacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
    |||||||||| ||  |||  || |||||||||||||||| ||||    
T  34297197 aacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaag 34297154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 11 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 27396717 - 27396303
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgctggtatcacaa--tgagatggacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||   ||| || ||||||  ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  27396717 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcgacatacgctcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccttgttgct 27396618  T
Q  109 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaag----------ttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtt 198  Q
     ||||||||||| |||||  ||||||||           |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  27396617 taggtttgcttt-caaaaaggacaaaaaactttttttttttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattataaagatagaaagaaaatgtt 27396519  T
Q  199 tt--gtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggca 296  Q
    ||  ||| |||||||||||||||||| |        |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  27396518 ttttgtacatagctttgaaagtagaaagaaag----tagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcg 27396424  T
Q  297 tgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcac 396  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  27396423 tgactccacggatttacaaagcttggaaaatggcaattttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacatttcctagaaactttgaattcgc 27396324  T
Q  397 aagtacagaaacttctgatga 417  Q
    ||| ||| || ||||||||||    
T  27396323 aagcacaaaagcttctgatga 27396303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 11 - 417
Target Start/End: Original strand, 19450276 - 19450689
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgctggtatcacaa--tgagatggacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||   ||| || ||||||  ||||  ||| ||||||||  |||| |||||| ||||| |||||||    
T  19450276 cacagactatcctggggaagagcctgcttataacacatattgaaatagacatcgacatacgctcactcatgcacatttcgtttgaacgtaccttgttgct 19450375  T
Q  109 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagtttt------caattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-- 200  Q
    ||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||      |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||      
T  19450376 caggtttacttt-caaaacagacaaaaacttttttttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaagatagaaagaaaatgtttttt 19450474  T
Q  201 ---gtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcat 297  Q
       ||| ||| |||||||||||||  |        |||||||| |||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  19450475 tttgtacatacctttgaaagtagagagaaaa----tagagttt-caaacaaaagcacatgctcgaattgatgtataaaagtggtggtcagccgaaggcgt 19450569  T
Q  298 gactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcaca 397  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||    
T  19450570 gattccacggatttacaaagcttggaaaatggcaattttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacatttcctagaaactttgaattcgca 19450669  T
Q  398 agtacagaaacttctgatga 417  Q
    || |||||| ||||||||||    
T  19450670 agcacagaagcttctgatga 19450689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 69 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 28888598 - 28888277
Alignment:
Q  69 actcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagca 168  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  28888598 actcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa------aaactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagca 28888506  T
Q  169 tt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaatt 265  Q
    || |||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| || |         ||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  28888505 tttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtacataactttgaaagtaaaaagaaagc----agagttt-caaacaaaagcacaggctcaaatt 28888411  T
Q  266 gatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaa 365  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28888410 gatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgcgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaa 28888311  T
Q  366 ccactacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
     ||  ||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  28888310 tcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaag 28888277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 64 - 399
Target Start/End: Original strand, 34268839 - 34269165
Alignment:
Q  64 catatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttc 163  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||  ||||||||||| || |||||||||||    
T  34268839 catacactcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa-------aactttttcaatttttaagatgtttgtttc 34268931  T
Q  164 aagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctc 260  Q
    ||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| || |        ||||||||| ||||||||||| | ||||    
T  34268932 aagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtacataactttgaaagtaaaaagaaaa----tagagtttt-aaacaaaagcacatgctc 34269026  T
Q  261 aaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacac 360  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34269027 aatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggagaatggtaattttattggttggtggtacattgaacac 34269126  T
Q  361 agtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
    |  || ||  ||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  34269127 aacaatcatgacatttcctagaaactttgaattcacaag 34269165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 69 - 399
Target Start/End: Original strand, 23122496 - 23122817
Alignment:
Q  69 actcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagca 168  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  23122496 actcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa------aaactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagca 23122588  T
Q  169 tt-gtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattg 266  Q
    || |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| || |         ||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  23122589 tttgtcattattaaaatagaaggaaaatgtttttgtacataactttgaaagtaaaaagaaaac----agagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattg 23122683  T
Q  267 atgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaa 365  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  23122684 atgtataagagtggtggtcagccgaaggtgtgactccacggatttgcaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtgatacattgaacacagcaa 23122783  T
Q  366 ccactacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
     || |||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  23122784 tcattacatttcctagaaactttgaattcgcaag 23122817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 64 - 399
Target Start/End: Original strand, 27428366 - 27428690
Alignment:
Q  64 catatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttc 163  Q
    |||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |  ||| |||||||||| |||||||||||    
T  27428366 catacactcgctcatgcacgtt-cgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa--------acttttgcaattttcaagatgtttgtttc 27428456  T
Q  164 aagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctc 260  Q
     | |||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| | | ||| ||||||||||| || |        ||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  27428457 gaacatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgcacataactttgaaagtaaaaagaaaa----tagagtttt-aaacaaaagcacaggctc 27428551  T
Q  261 aaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacac 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27428552 aaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacac 27428651  T
Q  361 agtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
    || || || |||| ||| ||||||||||||| |||||||    
T  27428652 agcaatcattacatttcctagaaactttgaactcacaag 27428690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 70 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 20844235 - 20843910
Alignment:
Q  70 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 169  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||  |||||||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  20844235 ctcgctcatgcatgttttgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa-----aaaactttttcaattttcaagatgcttgtttcgagcat 20844141  T
Q  170 t-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgttttgt--atatagcttt-gaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaat 264  Q
    | |||||||| |||| ||||| ||||||||||| |  | ||| |||| ||| ||| || |        |||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  20844140 ttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgttttttgaacataacttttgaaggtaaaaagaaag----tagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaat 20844046  T
Q  265 tgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagt 363  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20844045 tgatgtataagagtggtgtccagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagc 20843946  T
Q  364 aaccactacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
    || || |||| ||| ||| |||||||||||| ||||    
T  20843945 aatcattacatttcctaggaactttgaattcgcaag 20843910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 11 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 23117180 - 23116993
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgctggtatcacaa--tgagatggacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 108  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||| ||| ||||   ||| || ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23117180 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgcc 23117081  T
Q  109 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||   ||  ||||||||||||||| || || |||| | |||||||    
T  23117080 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaatggtcaaaaacgttagttcaagcattgtcatgatgaagataggaggaaaatg 23116993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 344 - 399
Target Start/End: Original strand, 31887682 - 31887737
Alignment:
Q  344 ggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  ||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  31887682 ggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaag 31887737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 274; Significance: 1e-153; HSPs: 49)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 56 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 3795885 - 3795539
Alignment:
Q  56 gacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 155  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3795885 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatg 3795786  T
Q  156 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaa 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||| ||||||||||||||||||    
T  3795785 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaag---aaaaaatagaattttcaaacaaaagcaaa 3795689  T
Q  256 ggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattg 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3795688 ggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattg 3795589  T
Q  356 aacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacaga 405  Q
    |||||||||| ||||||| ||| | |||| |||||||||||||| |||||    
T  3795588 aacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacaga 3795539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 69 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 33298870 - 33298522
Alignment:
Q  69 actcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttc--aaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaag 166  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33298870 actcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccatgttgctcaggtttgttttttcaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaag 33298771  T
Q  167 cattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaatt 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||          | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33298770 cattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatatagctttgaaagtagaa---aaaaaaatggagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaatt 33298674  T
Q  266 gatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaa 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33298673 gatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaa 33298574  T
Q  366 ccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaaacttctgatga 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  33298573 ccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatga 33298522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 11 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 30174859 - 30174472
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgctggtatcacaa--tgagatggacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 108  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||| ||| ||||   ||| || ||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30174859 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 30174760  T
Q  109 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30174759 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 30174660  T
Q  209 ctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 308  Q
    |||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30174659 ctttgaaagtagaag---aaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 30174563  T
Q  309 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||| ||| | |||||||||||||| ||||    
T  30174562 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaag 30174472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 56 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 33881472 - 33881132
Alignment:
Q  56 gacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 155  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33881472 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 33881373  T
Q  156 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaa 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||          |||||||||||||||||||||||    
T  33881372 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtggaa----aaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaa 33881277  T
Q  256 ggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattg 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33881276 ggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattg 33881177  T
Q  356 aacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagt 400  Q
    |||||||||| || |||| ||| | |||||||||||||| |||||    
T  33881176 aacacagtaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagt 33881132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 11 - 417
Target Start/End: Original strand, 28953548 - 28953952
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgctggtatcacaa--tgagatggacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 108  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||| ||| || ||  ||| || |||| || || | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28953548 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacataaattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 28953646  T
Q  109 caggtttgcttttcaaaa-tagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 206  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28953647 caggtttgcttttcaaaaatagacaaaaagttttcaattcccaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatat 28953746  T
Q  207 agctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacg 306  Q
    |||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28953747 agctttgaaagtagaag-----aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacg 28953841  T
Q  307 gattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaa 406  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28953842 gatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagctcttagaaactttgaattcacaagtacagaa 28953941  T
Q  407 acttctgatga 417  Q
     |||| |||||    
T  28953942 gcttcagatga 28953952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 11 - 400
Target Start/End: Original strand, 18369300 - 18369687
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgctggtatcacaa--tgagatggacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 108  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||| ||| ||||   ||| || ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18369300 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 18369399  T
Q  109 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18369400 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattaccaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 18369499  T
Q  209 ctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 308  Q
    |||||||||||||||         |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18369500 ctttgaaagtagaag----aaaaatagagttttcaaacaaaagcgaaggttcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacgga 18369595  T
Q  309 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagt 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||| ||| | |||||||||||||| |||||    
T  18369596 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagt 18369687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 70 - 417
Target Start/End: Original strand, 31820239 - 31820580
Alignment:
Q  70 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 169  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31820239 ctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccttgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 31820338  T
Q  170 tgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatg 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||         ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  31820339 tgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatatagctttgaaaatagaag-----aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatg 31820432  T
Q  270 tataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccac 369  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31820433 tataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacggtaaccac 31820532  T
Q  370 tacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaaacttctgatga 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  31820533 tacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttttgatga 31820580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 56 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 11555699 - 11555367
Alignment:
Q  56 gacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 155  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11555699 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaagaagttttcaattttcaaaatg 11555600  T
Q  156 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaa 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||| ||||||||||||||| |    
T  11555599 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaag----aaaaatagag-tttcaaacaaaagcaca 11555505  T
Q  256 ggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattg 355  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11555504 agctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattg 11555405  T
Q  356 aacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaatt 393  Q
    |||||||||| || |||| ||| |||||||||||||||    
T  11555404 aacacagtaatcattacatttcctagaaactttgaatt 11555367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 11 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 22894808 - 22894405
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgctggtatcaca-at-gagatggacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 108  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| || || || ||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22894808 cacagactatcctggggaagagtctgcttgtaacacatatcgaaatagacatcaacatacactcgcttatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 22894709  T
Q  109 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaag-ttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 207  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  22894708 caggtttgcttt-caaaatagacaaaaaccttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcatggtcattatcaaaatagaaagaaaatattttgtacata 22894610  T
Q  208 gctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgg 307  Q
    ||||||||||||||| |        |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  22894609 gctttgaaagtagaaagaaag----tagagttt-caaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgg 22894515  T
Q  308 attcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaaa 407  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||||     
T  22894514 atttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacatttcctagaaactttgaattcgcaagcacagaag 22894415  T
Q  408 cttctgatga 417  Q
    ||||||||||    
T  22894414 cttctgatga 22894405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 56 - 417
Target Start/End: Original strand, 32590091 - 32590447
Alignment:
Q  56 gacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaat 154  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32590091 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaat 32590190  T
Q  155 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaa 254  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||         ||||||||| |||||||||||     
T  32590191 gttcgtttcaggcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgatttgtatatagctttgaaagtagaag-----aaagtagagtttt-aaacaaaagcac 32590284  T
Q  255 aggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacatt 354  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32590285 aggctcaatttgatgtataagagtggtagtcggccaaaggcatgaccccacgaattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacatt 32590384  T
Q  355 gaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaaacttctgatga 417  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||    
T  32590385 gaacacagtaatcactacatttcttagaaactttgaatccacaagtacagaagcttttgatga 32590447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 11 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 41681098 - 41680711
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgctggtatcacaa--tgagatggacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 108  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||| ||| || ||  ||| || |||| || || | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41681098 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacataaattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 41681000  T
Q  109 caggtttgcttttcaaaa-tagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatat 206  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  41680999 caggtttgcttttcaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtatat 41680900  T
Q  207 agctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacg 306  Q
    |||||||||||||||||         | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  41680899 agctttgaaagtagaag----aaaaatggagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaagggcacgactccacg 41680804  T
Q  307 gattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  41680803 gattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccattacatttcctagaaactttgaattcgcaag 41680711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 64 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 30158372 - 30158037
Alignment:
Q  64 catatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgttt 162  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30158372 catattctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccccgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgttt 30158273  T
Q  163 caagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaa 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||| ||||||||||| | ||||||    
T  30158272 caagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaag----aaaggtagagtttt-aaacaaaagcacaagctcaa 30158178  T
Q  263 attgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacag 362  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30158177 attgatgtgtaagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacag 30158078  T
Q  363 taaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtaca 403  Q
     || ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  30158077 caatcactacatttcttagaaactttgaatccacgagtaca 30158037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 70 - 417
Target Start/End: Original strand, 37352473 - 37352816
Alignment:
Q  70 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37352473 ctcgctcatgcatgtttcatttgaacgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaataaacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 37352572  T
Q  170 tgtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgat 268  Q
    |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37352573 tgtcattatcaaaaatggaaggaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaag-----aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaacttgat 37352667  T
Q  269 gtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaacca 368  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37352668 gtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatca 37352767  T
Q  369 ctacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaaacttctgatga 417  Q
      ||| |||  ||||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||    
T  37352768 tgacatttcccagaaactttgaatccacaagtgcagaagcttttgatga 37352816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 11 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 2517459 - 2517054
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgctggtatcacaa--tgagatggacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 108  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||| ||| ||||   ||| || ||||||| ||||  |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2517459 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacacgttgaaatagacatcaacatactctcattcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 2517360  T
Q  109 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa---tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2517359 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaaatgtttgtttcaagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 2517260  T
Q  206 tagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccac 305  Q
    ||||||||||||||||||         |||| | | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  2517259 tagctttgaaagtagaag-----aaaatagaatct-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgagggcatgactccac 2517166  T
Q  306 ggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacaga 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2517165 ggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacagttcttagaaactttgaattcacaagtacaga 2517066  T
Q  406 aacttctgatga 417  Q
    | ||| ||||||    
T  2517065 agcttttgatga 2517054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 56 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 37761329 - 37760989
Alignment:
Q  56 gacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa-tagacaaaaagttttcaattttcaaaa- 153  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  37761329 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtgccctgttgctcaggtttgcttttcaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaa 37761230  T
Q  154 tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagca 253  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||    
T  37761229 tgtttgtttcaagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaag-----aaaatagagttttcaaacaaaagca 37761135  T
Q  254 aaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacat 353  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37761134 aaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccgcggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacat 37761035  T
Q  354 tgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
    |||||||||||| ||  |||  || |||||||||||||||| ||||    
T  37761034 tgaacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaag 37760989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 70 - 399
Target Start/End: Original strand, 37746157 - 37746482
Alignment:
Q  70 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 169  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37746157 ctcgctcatgcatgcttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaacagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcat 37746256  T
Q  170 tgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatg 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37746257 tgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtaaaaag----aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatg 37746352  T
Q  270 tataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccac 369  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  37746353 tataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcat 37746452  T
Q  370 tacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
     ||| |||  ||||||||||||||| ||||    
T  37746453 gacatttcccagaaactttgaattcgcaag 37746482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 11 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 43084651 - 43084270
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgctggtatca--caatgagatggacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 108  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||| ||| ||  || ||| || ||||||| ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43084651 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtagcatacattgaaatagacatcaacatactctcgttcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 43084552  T
Q  109 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaat-gttttgtatata 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  43084551 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaactttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtatata 43084452  T
Q  208 gctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgg 307  Q
     |||||||| ||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43084451 actttgaaaatagaag-----aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgcataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgg 43084357  T
Q  308 attcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattc 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||    |||||||||||||    
T  43084356 attcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccgaaaactttgaattc 43084270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 69 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 6880637 - 6880303
Alignment:
Q  69 actcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagc 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6880637 actcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagc 6880538  T
Q  168 attgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattga 267  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||| || ||||||||||| |||||||| ||||    
T  6880537 attgtcattatcaaaataggaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaag----aaaaatagagtctt-aaacaaaagcacaggctcaatttga 6880443  T
Q  268 tgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaacc 367  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6880442 tgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatc 6880343  T
Q  368 actacagtt-cttagaaactttgaattcacaagtacagaa 406  Q
    | |||| || |  | |||||||||||||||||||||||||    
T  6880342 attacatttcccaaaaaactttgaattcacaagtacagaa 6880303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 70 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 9323808 - 9323466
Alignment:
Q  70 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 169  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9323808 ctcgcttatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 9323709  T
Q  170 tgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatg 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||         ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  9323708 tgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatatagctttgaaaatagaag-----aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatg 9323615  T
Q  270 tataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccac 369  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  9323614 tataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcat 9323515  T
Q  370 tacagtt-cttagaaactttgaattcacaagtacagaaacttctgatga 417  Q
    |||| || |  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9323514 tacatttcccaaaaaactttgaattcacaagtacagaaacttcagatga 9323466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 70 - 403
Target Start/End: Original strand, 8659301 - 8659629
Alignment:
Q  70 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagca 168  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8659301 ctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaataaacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagca 8659400  T
Q  169 ttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgat 268  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  8659401 ttgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaag-----aaaatagagttttcaaacaaaaacaaaggctcaacttgat 8659495  T
Q  269 gtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaacca 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  8659496 gtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggcgaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatca 8659595  T
Q  369 ctacagttcttagaaactttgaattcacaagtaca 403  Q
     |||| |||   |||||||||||||||||||||||    
T  8659596 ttacatttc-ccgaaactttgaattcacaagtaca 8659629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 70 - 399
Target Start/End: Original strand, 13318657 - 13318981
Alignment:
Q  70 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13318657 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaacagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 13318756  T
Q  170 tgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatg 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |         |||| ||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  13318757 tgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtaaaaagaaagc----agag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatg 13318851  T
Q  270 tataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccac 369  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  13318852 tataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcat 13318951  T
Q  370 tacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
     ||| |||  ||||||||||||||| ||||    
T  13318952 aacatttcccagaaactttgaattcgcaag 13318981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 70 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 24730302 - 24729976
Alignment:
Q  70 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc--aaaatgtttgtttcaagc 167  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  24730302 ctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaatgtttgtttcaagc 24730203  T
Q  168 attgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattga 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||         ||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  24730202 attgtcattatcaaaatagaaagaaaatattttgtatatagctttgaaagtagaag-----aaaataga-atttcaaacaaaagcacaggctcaatttga 24730109  T
Q  268 tgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaacc 367  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24730108 tgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatc 24730009  T
Q  368 actacagttcttagaaactttgaattcacaagt 400  Q
    | |||| ||| | |||||||||||||| |||||    
T  24730008 attacatttcctggaaactttgaattcgcaagt 24729976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 70 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 12138507 - 12138165
Alignment:
Q  70 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 169  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12138507 ctcgcttatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 12138408  T
Q  170 tgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatg 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||         ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  12138407 tgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatatagctttgaaaatagaag-----aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatg 12138314  T
Q  270 tataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccac 369  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  12138313 tataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcat 12138214  T
Q  370 tacagtt-cttagaaactttgaattcacaagtacagaaacttctgatga 417  Q
    |||| || |  | |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  12138213 tacatttcccaaaaaactttgaattcataagtacagaaacttcagatga 12138165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 56 - 394
Target Start/End: Original strand, 18494583 - 18494916
Alignment:
Q  56 gacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 155  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18494583 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 18494682  T
Q  156 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaa 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |   |||||||||||||||||||||||||         | |||||||||||||||||||||    
T  18494683 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaataggaagaaagtaaattgtatatagctttgaaagtagaag-----aaaatggagttttcaaacaaaagcaaa 18494777  T
Q  256 ggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattg 355  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18494778 ggctcaaattgatgtatgagagtggtggtcggccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattg 18494877  T
Q  356 aacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattc 394  Q
    ||||||| || || |||| ||| | ||||||| ||||||    
T  18494878 aacacagcaatcattacatttcctggaaacttcgaattc 18494916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 14 - 399
Target Start/End: Original strand, 9544478 - 9544862
Alignment:
Q  14 agactatcctggggaagagcctgctggtatcacaa--tgagatggacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcag 111  Q
    |||||||||||| | ||| |||||| ||| ||||   ||| || ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9544478 agactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcag 9544577  T
Q  112 gtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc----aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 207  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9544578 gtttacttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatata 9544677  T
Q  208 gctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgg 307  Q
    ||||||||||||||||         ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  9544678 gctttgaaagtagaag-----aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgg 9544771  T
Q  308 attcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| | |||||||||||||| ||||    
T  9544772 atttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcct-gaaactttgaattcgcaag 9544862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 56 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 28655589 - 28655249
Alignment:
Q  56 gacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagaca-aaaagttttcaattttc--aaa 152  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||    
T  28655589 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaaa 28655490  T
Q  153 atgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagc 252  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||| ||||||||||    
T  28655489 atgtttgtttcgagcattgtcattattaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaag-----aaaatagagtttt-aaacaaaagc 28655396  T
Q  253 aaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtaca 352  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28655395 acaggctcaaattgatgtataagagtggtagtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtaca 28655296  T
Q  353 ttgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
    ||||||||||||| || |||| ||| |  ||||||||||||| ||||    
T  28655295 ttgaacacagtaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaag 28655249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 56 - 399
Target Start/End: Original strand, 40467368 - 40467707
Alignment:
Q  56 gacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaat 154  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40467368 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaat 40467467  T
Q  155 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaa 254  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        ||||||||| |||||||||||     
T  40467468 gtttgtttcaagcattgtcattattaaaatggaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaag----aaaatagagtttt-aaacaaaagcac 40467562  T
Q  255 aggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacatt 354  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40467563 aagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttataaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacatt 40467662  T
Q  355 gaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
    |||||||| || || |||| ||| | |||||||||||||| ||||    
T  40467663 gaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaag 40467707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 70 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 33522715 - 33522382
Alignment:
Q  70 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 169  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33522715 ctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgctcgggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 33522616  T
Q  170 tgtcattatcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgat 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||           |||| ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  33522615 tgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatatagctttgaaagtaaaa---aagaaaacagag-tttcaaacaaaagcacagtctcaaattgat 33522520  T
Q  269 gtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaacca 368  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  33522519 gtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatca 33522420  T
Q  369 ctacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaa 406  Q
     |||| ||| | | |||||||||| |||||||||||||    
T  33522419 ttacatttcctgggaactttgaatccacaagtacagaa 33522382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 70 - 399
Target Start/End: Original strand, 15752687 - 15753006
Alignment:
Q  70 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15752687 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagtat 15752786  T
Q  170 tgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatg 269  Q
    |||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||  ||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  15752787 tgtcattatca----agaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaag-----aaaataga-atttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatg 15752876  T
Q  270 tataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccac 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||     
T  15752877 tataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgatacattgaacacagtaatcat 15752976  T
Q  370 tacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
     ||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  15752977 gacatttcctagaaactttgaattcgcaag 15753006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 70 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 30035757 - 30035433
Alignment:
Q  70 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagca 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  30035757 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaataaacaaaaagttttcagttttcaaaaatgtttgtttcaagca 30035658  T
Q  169 ttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgat 268  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  30035657 ttgccattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaag-----aaaatagaatttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgat 30035564  T
Q  269 gtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaacca 368  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  30035563 gtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgatacattgaacacagtaatca 30035464  T
Q  369 ctacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
      ||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  30035463 tgacatttcctagaaactttgaattcgcaag 30035433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 56 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 23632317 - 23631982
Alignment:
Q  56 gacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa-tagacaaaaag--ttttcaattttcaaa 152  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||     
T  23632317 gacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaagtttgcttttcaaaaatagacaaaaagctttttcaattttcaag 23632218  T
Q  153 atgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagc 252  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||| ||||||||||||||    
T  23632217 atgtttatttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaag----aaaaatagag-tttcaaacaaaagc 23632123  T
Q  253 aaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtaca 352  Q
    | | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23632122 acaagctcaaattgatgcataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacgaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtaca 23632023  T
Q  353 ttgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaatt 393  Q
    |||||||| |||| || |||| ||| |||||||||||||||    
T  23632022 ttgaacacggtaatcattacatttcctagaaactttgaatt 23631982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 56 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 11329985 - 11329643
Alignment:
Q  56 gacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-t 154  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  11329985 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaatttttaaaaat 11329886  T
Q  155 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat--agctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagc 252  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||   ||||||||  |||||||||||||||||         ||||||||| ||||||||||    
T  11329885 gtttgtttcaagcattatcattatcaaaatagaaggaaaataaattgtatatttagctttgaaagtagaag-----aaaatagagttttaaaacaaaagc 11329791  T
Q  253 aaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtaca 352  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11329790 aaaggctcaaattgatgtatgagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtaca 11329691  T
Q  353 ttgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagt 400  Q
    |||||||||| || || |||| ||| | |||||||||||||| |||||    
T  11329690 ttgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagt 11329643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 70 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 26486717 - 26486385
Alignment:
Q  70 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 169  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26486717 ctcgcttatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 26486618  T
Q  170 tgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatg 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||                ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  26486617 tgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatatagctttgaaa---------------atagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatg 26486534  T
Q  270 tataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccac 369  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  26486533 tataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcat 26486434  T
Q  370 tacagtt-cttagaaactttgaattcacaagtacagaaacttctgatga 417  Q
    |||| || |  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26486433 tacatttcccaaaaaactttgaattcacaagtacagaaacttcagatga 26486385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 70 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 5644130 - 5643807
Alignment:
Q  70 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagca 168  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||    
T  5644130 ctcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcgattttcaaaaatgtttgtttcaggca 5644032  T
Q  169 ttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgat 268  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||         ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5644031 ttgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatatagctttgaaagtaaaag-----aaaatagag-tttcaaacaaaagcacaggctcaaattgat 5643938  T
Q  269 gtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaacca 368  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  5643937 gtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaaacttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtgatca 5643838  T
Q  369 ctacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
      ||| ||| ||| |||||||||||| ||||    
T  5643837 tgacatttcctaggaactttgaattcgcaag 5643807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 56 - 399
Target Start/End: Original strand, 13180608 - 13180943
Alignment:
Q  56 gacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 155  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||  |||||||||||||| |||    
T  13180608 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa-----aaaactttttcaattttcaagatg 13180702  T
Q  156 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaa 255  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         | |||||||||||||||||||||    
T  13180703 tttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaag----aaaaatggagttttcaaacaaaagcaaa 13180798  T
Q  256 ggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacatt 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13180799 ggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacatt 13180898  T
Q  355 gaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
    |||||||| || || |||| ||| | |||||||||||||| ||||    
T  13180899 gaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaag 13180943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 56 - 399
Target Start/End: Original strand, 13436489 - 13436834
Alignment:
Q  56 gacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc----aa 151  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||    
T  13436489 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaa 13436588  T
Q  152 aatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaag-aaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaa 250  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||| ||||||||||||    
T  13436589 aatgtttgtttcaagcgttgccattatcaaaatagaaagaaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaag---aaaaaatagag-tttcaaacaaaa 13436684  T
Q  251 gcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggt 349  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13436685 gcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggt 13436784  T
Q  350 acattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
    ||||||||||||| || || |||| ||| |  ||||||||||||| ||||    
T  13436785 acattgaacacagcaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaag 13436834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 69 - 399
Target Start/End: Original strand, 18122244 - 18122570
Alignment:
Q  69 actcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagc 167  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18122244 actcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttctcaattttcaaaaatgtttgtttcaagc 18122342  T
Q  168 attgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattga 267  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||          ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||    
T  18122343 attgtcattatcaaaatagaaggaaaataaattgtatatagctttgaaagtagaa---aaaaaaatagagtttt-aaacaaaagcacaagctcaaattga 18122438  T
Q  268 tgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaacc 367  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18122439 tgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatc 18122538  T
Q  368 actacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
    |  |||  || |||||||||||||||| ||||    
T  18122539 atgacatctcctagaaactttgaattcgcaag 18122570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 69 - 399
Target Start/End: Original strand, 37665314 - 37665640
Alignment:
Q  69 actcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa-tagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaag 166  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37665314 actcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcaggtttgctttttaaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaag 37665412  T
Q  167 cattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattg 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||         ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||    
T  37665413 cattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatacagctttgaaagtagaag----aaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattg 37665507  T
Q  267 atgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaac 366  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  37665508 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaat 37665607  T
Q  367 cactacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
    ||  ||| |||  ||||| ||||||||| ||||    
T  37665608 catgacatttcccagaaattttgaattcgcaag 37665640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 56 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 34622865 - 34622525
Alignment:
Q  56 gacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaat 154  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||    
T  34622865 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaacagacaaaaagtttttaattttcaaaaat 34622766  T
Q  155 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaa 254  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |         |||| |||||||||||||||     
T  34622765 gtttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtaaaaagaaagc----agag-tttcaaacaaaagcac 34622671  T
Q  255 aggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacat 353  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34622670 aagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccggaggcgtgactccacggattcacaaaacttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacat 34622571  T
Q  354 tgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
    ||||||||| || || |||| ||| |  ||||||||||||| ||||    
T  34622570 tgaacacagcaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaag 34622525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 14 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 31437847 - 31437471
Alignment:
Q  14 agactatcctggggaagagcctgctggtatcacaa--tgagatggacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcag 111  Q
    |||||||||||| | ||| |||||| ||| ||||   ||| || ||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31437847 agactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtctcatttgaatgtaccctgttgctcag 31437748  T
Q  112 gtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctt 211  Q
    |||||||||||||||      |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31437747 gtttgcttttcaaaa------aaactttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctt 31437654  T
Q  212 tgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 311  Q
    |||||||| || |         ||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  31437653 tgaaagtaaaaagaaagc----agagttt-caaacaaaagcacaagctcaaatagatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattt 31437559  T
Q  312 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||  || |||||||||||||||| ||||    
T  31437558 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaag 31437471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 69 - 399
Target Start/End: Original strand, 15652588 - 15652912
Alignment:
Q  69 actcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagca 168  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    | | | ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15652588 actcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttttttaaaaaaaaaactttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagca 15652686  T
Q  169 ttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgat 268  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |         ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||    
T  15652687 ttatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtaaaaagaaagc----agagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgat 15652781  T
Q  269 gtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaacca 368  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||    
T  15652782 gtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattagttggtggtacattgaacacagcaatca 15652881  T
Q  369 ctacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
      ||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  15652882 tgacatttcctagaaactttgaattcgcaag 15652912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 56 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 25206630 - 25206289
Alignment:
Q  56 gacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaag-----ttttcaattttca 150  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||      |||||||||||||    
T  25206630 gacatcaacatacgctcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgttcaggtttgcttt-caaaatagacaaaaaaaaactttttcaattttca 25206532  T
Q  151 aaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt--gtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaaca 247  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| || |        |||||||| ||||||    
T  25206531 agatgtttgtttcaagcatttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttttgtacatagctttgaaagtaaaaagaaaa----tagagttt-caaaca 25206437  T
Q  248 aaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggt 346  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25206436 aaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggt 25206337  T
Q  347 ggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattc 394  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| || ||||| |||||||    
T  25206336 ggtacattgaacacagcaatcactacatttcctataaactctgaattc 25206289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 56 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 25270786 - 25270445
Alignment:
Q  56 gacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaag-----ttttcaattttca 150  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||      |||||||||||||    
T  25270786 gacatcaacatacgctcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgttcaggtttgcttt-caaaatagacaaaaaaaaactttttcaattttca 25270688  T
Q  151 aaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt--gtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaaca 247  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| || |        |||||||| ||||||    
T  25270687 agatgtttgtttcaagcatttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttttgtacatagctttgaaagtaaaaagaaaa----tagagttt-caaaca 25270593  T
Q  248 aaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggt 346  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25270592 aaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggt 25270493  T
Q  347 ggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattc 394  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| || ||||| |||||||    
T  25270492 ggtacattgaacacagcaatcactacatttcctataaactctgaattc 25270445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 69 - 399
Target Start/End: Original strand, 22992952 - 22993270
Alignment:
Q  69 actcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagca 168  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  22992952 actcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa------aaactttttcaattttcaaaatgcttgtttcgagca 22993044  T
Q  169 ttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgat 268  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |         ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||    
T  22993045 tcatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtaaaaagaaagc----agagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgat 22993139  T
Q  269 gtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaacca 368  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |     
T  22993140 gtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcg 22993239  T
Q  369 ctacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
     |||| ||| |  ||||||||||||| ||||    
T  22993240 atacatttcctgaaaactttgaattcgcaag 22993270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 64 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 23898206 - 23897886
Alignment:
Q  64 catatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttc 163  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  23898206 catacactcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttt----------caaaactttttcaattttcaagatgtttgtttc 23898117  T
Q  164 aagcatt-gtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt----gtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggc 258  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    ||| ||||||||||||||| || |        ||||||||| ||||||||||| | ||    
T  23898116 aagcatttgtcattattaaaatagaaagaaaatgttttttttgtacatagctttgaaagtaaaaagaaaa----tagagtttt-aaacaaaagcacaagc 23898022  T
Q  259 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23898021 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatgaatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 23897922  T
Q  359 acagtaaccactacagttcttagaaactttgaattc 394  Q
    |||| || || |||| ||| ||||||||||||||||    
T  23897921 acagcaatcattacatttcctagaaactttgaattc 23897886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 69 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 33783815 - 33783494
Alignment:
Q  69 actcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagca 168  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||       ||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  33783815 actcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgctccggtttgcttttcaaaa-------aactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagca 33783724  T
Q  169 tt-gtcattatcaaaa--tagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaat 264  Q
    || |||||||| ||||  ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| || |        |||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  33783723 tttgtcattattaaaaaatagaaggaaaatgtttttgtacataactttgaaagtaaaaagaaaa----tagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaat 33783629  T
Q  265 tgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagta 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  33783628 tgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttatgggttggtggtacattgaacacagca 33783529  T
Q  365 accactacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
    | || |||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  33783528 atcattacatttcctagaaactttgaattcgcaag 33783494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 69 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 24976176 - 24975861
Alignment:
Q  69 actcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagca 168  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |  ||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  24976176 actcgctcatgcatatttcgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa--------acttttccaattttcaagatgtttgtttcgagca 24976085  T
Q  169 tt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaatt 265  Q
    || |||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| || |         ||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  24976084 tttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtacataactttgaaagtaaaaagaaagc----agagttt-caaacaaaagcacagactcaaatt 24975990  T
Q  266 gatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaa 365  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  24975989 gatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacaacaa 24975890  T
Q  366 ccactacagttcttagaaactttgaattc 394  Q
     || |||| ||| ||||||||||||||||    
T  24975889 tcattacatttcctagaaactttgaattc 24975861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 73 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 24608570 - 24608252
Alignment:
Q  73 gctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-g 171  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |    
T  24608570 gctcatgcatgttttgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa-------aactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttg 24608478  T
Q  172 tcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatg 269  Q
    ||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| || |          |||||| |||||||||||| | |||||||||||||    
T  24608477 tcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtacataactttgaaagtaaaaagaaagcg----gagttt-caaacaaaagcacatgctcaaattgatg 24608383  T
Q  270 tataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaacca 368  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || ||    
T  24608382 tataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacaacaatca 24608283  T
Q  369 ctacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
     |||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  24608282 ttacatttcctagaaactttgaattcgcaag 24608252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 64 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 30940968 - 30940643
Alignment:
Q  64 catatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttc 163  Q
    |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |  |||||||||||||| |||||||||||    
T  30940968 catacactcgctcatgcatgtt-cttttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa--------actttttcaattttcaagatgtttgtttc 30940878  T
Q  164 aagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctc 260  Q
     |||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| || |         ||| ||| |||||||||||| ||||||    
T  30940877 gagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtacataactttgaaagtaaaaagaaagc----agaattt-caaacaaaagcacaggctc 30940783  T
Q  261 aaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaaca 359  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30940782 aaatagatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacgaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaaca 30940683  T
Q  360 cagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
    ||| || || |||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  30940682 cagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaag 30940643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418 (Bit Score: 272; Significance: 1e-152; HSPs: 1)
Name: scaffold0418
Description:

Target: scaffold0418; HSP #1
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 56 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 12374 - 12036
Alignment:
Q  56 gacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 155  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12374 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 12275  T
Q  156 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaa 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||    
T  12274 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttatatatagctttgaaagtagaag-----aaaatagagttttcaaacaaaagcaaa 12180  T
Q  256 ggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattg 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12179 ggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattg 12080  T
Q  356 aacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
    |||||||||| ||||||| ||| | |||| ||||||||| ||||    
T  12079 aacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcgcaag 12036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 272; Significance: 1e-152; HSPs: 24)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 11 - 406
Target Start/End: Original strand, 28355780 - 28356176
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgctggtatcacaa--tgagatggacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 108  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||| ||| ||||   ||| || ||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28355780 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 28355879  T
Q  109 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28355880 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatag 28355979  T
Q  209 ctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 308  Q
    |||||||||||||||         |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28355980 ctttgaaagtagaag--aaaaaaatagaattttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 28356077  T
Q  309 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagtt-cttagaaactttgaattcacaagtacagaa 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |  | |||||||||||||||||||||||||    
T  28356078 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaaactttgaattcacaagtacagaa 28356176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 56 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 9360960 - 9360622
Alignment:
Q  56 gacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 155  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9360960 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 9360861  T
Q  156 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaa 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||    
T  9360860 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaag-----aaaatagagttttcaaacaaaagcaaa 9360766  T
Q  256 ggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattg 355  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9360765 ggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattg 9360666  T
Q  356 aacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
     ||||||||| ||  |||  || |||||||||||||||| ||||    
T  9360665 gacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaag 9360622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 11 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 31360914 - 31360528
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgctggtatcacaa--tgagatggacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 108  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||| ||| ||||   ||| || ||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31360914 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 31360815  T
Q  109 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaat-gttttgtatata 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  31360814 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtatata 31360715  T
Q  208 gctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgg 307  Q
     |||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31360714 actttgaaagtagaag-----aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgg 31360620  T
Q  308 attcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||| ||| | |||||||||||||| ||||    
T  31360619 attcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacacttcctggaaactttgaattcgcaag 31360528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 70 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 33248690 - 33248366
Alignment:
Q  70 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33248690 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 33248591  T
Q  170 tgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatg 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||    
T  33248590 tgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaag----aaaaatagagtttt-aaacaaaagcacaagctcaaattgatg 33248496  T
Q  270 tataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccac 369  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||     
T  33248495 tataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcat 33248396  T
Q  370 tacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  33248395 tacatttcctagaaactttgaattcgcaag 33248366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 56 - 398
Target Start/End: Original strand, 31483747 - 31484087
Alignment:
Q  56 gacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 155  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31483747 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaaggtaccttgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatg 31483846  T
Q  156 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaa 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||| ||||||||||||||||||    
T  31483847 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaag--aacaaaatagaattttcaaacaaaagcaaa 31483944  T
Q  256 ggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattg 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31483945 ggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattg 31484044  T
Q  356 aacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaa 398  Q
    |||||||||| || |||| |||  | ||||||||| |||||||    
T  31484045 aacacagtaatcattacatttcccaaaaactttgatttcacaa 31484087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 70 - 417
Target Start/End: Original strand, 12086614 - 12086958
Alignment:
Q  70 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagca 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12086614 ctcgctcatgcatgtttcatttgaacgtaccctgttgctcaggcttgcttttcaaaacagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagca 12086713  T
Q  169 ttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgat 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||         |||||||| ||||||| |||| | |||||| |||||    
T  12086714 ttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatacagctttgaaagtagaag----aaaaatagagttt-caaacaacagcacaagctcaatttgat 12086808  T
Q  269 gtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaacc 367  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12086809 gtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacggtaacc 12086908  T
Q  368 actacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaaacttctgatga 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  12086909 actacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttttgatga 12086958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 70 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 29835647 - 29835317
Alignment:
Q  70 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29835647 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 29835548  T
Q  170 tgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatg 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||         | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  29835547 tgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatatagctttgaaagtagaag-----aaaatggagttttcaaacaaaagcacaggctcaatttgatg 29835453  T
Q  270 tataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccac 369  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||     
T  29835452 tataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcat 29835353  T
Q  370 tacagttcttagaaactttgaattcacaagtacaga 405  Q
    |||| |||    ||||||||||||||||||||||||    
T  29835352 tacatttcccgaaaactttgaattcacaagtacaga 29835317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 56 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 19680786 - 19680430
Alignment:
Q  56 gacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 155  Q
    ||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19680786 gacatcaacatactctcgctcgtgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatg 19680687  T
Q  156 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaa 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||         ||||||||| ||||||||||| |    
T  19680686 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatatagctttgaaaatagaag-----aaaatagagtttt-aaacaaaagcaca 19680593  T
Q  256 ggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattg 355  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19680592 ggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattg 19680493  T
Q  356 aacacagtaaccactacagtt-cttagaaactttgaattcacaagtacagaaacttctgatga 417  Q
    |||||||||| || |||| || |  | ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  19680492 aacacagtaatcattacatttcccaaaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatga 19680430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 11 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 18797093 - 18796706
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgctggtatcacaa--tgagatggacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 108  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||| ||| ||||   ||| || ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18797093 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 18796994  T
Q  109 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtatata 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18796993 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatata 18796894  T
Q  208 gctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgg 307  Q
    ||||||||||||||||         ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  18796893 gctttgaaagtagaag----aaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgg 18796799  T
Q  308 attcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
    ||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| ||| |  ||||||||||||| ||||    
T  18796798 atttataaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacggtaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaag 18796706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 70 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 33265055 - 33264731
Alignment:
Q  70 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagca 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||    
T  33265055 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagtttttaattttcaaaaatgttcgtttcaagca 33264956  T
Q  169 ttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgat 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||         ||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  33264955 ttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttcgtatatagctttgaaagtagaag-----aaaataga-atttcaaacaaaagcacaagctcaaattgat 33264862  T
Q  269 gtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaacca 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  33264861 gtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatca 33264762  T
Q  369 ctacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
       || ||| ||| |||||||||||| ||||    
T  33264761 tggcatttcctaggaactttgaattcgcaag 33264731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 56 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 15773913 - 15773574
Alignment:
Q  56 gacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaat 154  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15773913 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaat 15773814  T
Q  155 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaa 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |         |||| |||||||||||||||     
T  15773813 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaagagaaagaaaatgttttgtatatagctctgaaagtaaaaagaaagc----agag-tttcaaacaaaagcac 15773719  T
Q  255 aggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacatt 354  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15773718 aagctcaaattgacgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacatt 15773619  T
Q  355 gaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
    ||||||||||| ||  |||  || |||||||||||||||| ||||    
T  15773618 gaacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaag 15773574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 70 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 18715807 - 18715480
Alignment:
Q  70 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaatttt----caaaatgtttgtttcaa 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||    
T  18715807 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaatttttcaaaaaaatgtttgtttcaa 18715708  T
Q  166 gcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaatt 265  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  18715707 gcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaag-----aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaattt 18715614  T
Q  266 gatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaa 365  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18715613 gatgtataagaggggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtga 18715514  T
Q  366 ccactacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
     ||  ||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  18715513 tcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaag 18715480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 70 - 417
Target Start/End: Original strand, 19202266 - 19202598
Alignment:
Q  70 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 169  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19202266 ctcgcttatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 19202365  T
Q  170 tgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatg 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||                ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  19202366 tgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatatagctttgaaa---------------atagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatg 19202449  T
Q  270 tataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccac 369  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  19202450 tataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcat 19202549  T
Q  370 tacagttcttagaa-actttgaattcacaagtacagaaacttctgatga 417  Q
    |||| |||  | || |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19202550 tacatttcccaaaagactttgaattcacaagtacagaaacttcagatga 19202598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 56 - 393
Target Start/End: Original strand, 21342047 - 21342381
Alignment:
Q  56 gacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaat 154  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21342047 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaat 21342146  T
Q  155 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaa 254  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |         |||| ||||||||| |||||     
T  21342147 gcttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatatagctttgaaagtaaaaagaaagc----agag-tttcaaacagaagcac 21342241  T
Q  255 aggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacat 353  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21342242 aggctcaaatcgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacat 21342341  T
Q  354 tgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaatt 393  Q
    |||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||||    
T  21342342 tgaacacagtaatcattacatttcctagaaactttgaatt 21342381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 56 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 44567322 - 44566980
Alignment:
Q  56 gacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc----aa 151  Q
    ||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||    
T  44567322 gacatcaacatactctcgcttatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaa 44567223  T
Q  152 aatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaag 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||| |||||||||    
T  44567222 aatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaag-----aaaatagagtttt-aaacaaaag 44567129  T
Q  252 caaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtac 351  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44567128 cacaggctcaaattgatgtatgagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtac 44567029  T
Q  352 attgaacacagtaaccactacagtt-cttagaaactttgaattcacaag 399  Q
    ||||||||||| || || |||| || ||  |||||||||||||| ||||    
T  44567028 attgaacacagcaatcattacatttcctgggaaactttgaattcgcaag 44566980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 137 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 16260480 - 16260205
Alignment:
Q  137 gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntaga 236  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||    
T  16260480 gttttcgattttcaaaatgtttgtttcaagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaag-----aaaataga 16260386  T
Q  237 gttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttt 336  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16260385 gttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccgcggatttacaaagcttggaaaatggtaatttt 16260286  T
Q  337 attggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaaacttctgatga 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||    
T  16260285 attggttggtggtacattgaacacagcaatcactacatttcttagaaactttgaatccacaagtacagaagcttttgatga 16260205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 56 - 393
Target Start/End: Original strand, 19911039 - 19911374
Alignment:
Q  56 gacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaat 154  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||| ||    
T  19911039 gacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgctttcaaaaatagacaaaaactttttcaattttcaagat 19911138  T
Q  155 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg--ttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagc 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| || |        ||||||||| ||||||||||    
T  19911139 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttttgtacatagctttgaaagtaaaaag----gaaatagagtttt-aaacaaaagc 19911233  T
Q  253 aaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtaca 352  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19911234 acaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaaaggtaattttattggttggtggtaca 19911333  T
Q  353 ttgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaatt 393  Q
    ||||||||||||| || ||||  || |||||||||||||||    
T  19911334 ttgaacacagtaatcattacatctcctagaaactttgaatt 19911374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 11 - 417
Target Start/End: Original strand, 27602744 - 27603141
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgctggtatcacaa--tgagatggacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 108  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||| ||| ||||   ||| || |||| || || | ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||     
T  27602744 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgca 27602842  T
Q  109 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtata 205  Q
    ||||||||||||||||||        || |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| |    
T  27602843 caggtttgcttttcaaaa--------aacttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtaca 27602934  T
Q  206 tagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccac 305  Q
    |||||||||||||| || |         ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27602935 tagctttgaaagtaaaaagaaagc----agagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtctaagagtggtggtcagccaaaggcatgactccac 27603029  T
Q  306 ggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacaga 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27603030 ggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacaga 27603129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 11 - 417
Target Start/End: Original strand, 22074759 - 22075164
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgctggtatcacaa--tgagatggacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 108  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||   ||| || ||||||  ||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||    
T  22074759 cacagactatcctagggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcgacatacgctcgctcatgcacgtttcgtttgaatgtaccttgttgct 22074858  T
Q  109 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt---gtata 205  Q
    || | ||||||| ||||| ||||||||| ||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |    
T  22074859 catgcttgcttt-caaaacagacaaaaacttttttattttcaagaagtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttttgtaca 22074957  T
Q  206 tagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccac 305  Q
    ||||||||||||||||| |        |||||||| |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  22074958 tagctttgaaagtagaaagaaag----tagagttt-caaacaaaagcctaggctcgaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccac 22075052  T
Q  306 ggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacaga 405  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||  ||| |    
T  22075053 ggatttacaaagcttggaaaatggcaattttattggttggtggtacattgaacacggcaaccactacatttcctagaaactttgaattcgcaaacacaaa 22075152  T
Q  406 aacttctgatga 417  Q
    | ||||||||||    
T  22075153 agcttctgatga 22075164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 399
Target Start/End: Original strand, 19655180 - 19655560
Alignment:
Q  14 agactatcctggggaagagcctgctggtatcacaa--tgagatggacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcag 111  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||| || |   ||| || |||| || |||| ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  19655180 agactatcctggggaagagtctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacatacactcgctcatgcacgttttgtttgaatgtaccctgttgctcag 19655279  T
Q  112 gtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtatatag 208  Q
    ||||||||| |||||      |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| |||     
T  19655280 gtttgcttt-caaaa------aaaacttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtacataa 19655372  T
Q  209 ctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 308  Q
    ||||||||||| || |        |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  19655373 ctttgaaagtaaaaagaaag----tagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgagactccacgga 19655467  T
Q  309 ttcacaaagcttggaaaatggtaa--ttttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
    || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || || |||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  19655468 tttacaaagcttggaaaatggtaattttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaag 19655560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 69 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 19694417 - 19694095
Alignment:
Q  69 actcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagca 168  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||  |||||||||||||| ||| ||||||| ||||    
T  19694417 actcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa------aaactttttcaattttcaagatgcttgtttcgagca 19694325  T
Q  169 tt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaatt 265  Q
    || |||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| || |          ||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  19694324 tttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtacataactttgaaagtaaaaagaaagcg----gagtttt-aaacaaaagcacaggctcaaatt 19694230  T
Q  266 gatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagta 364  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19694229 gatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagca 19694130  T
Q  365 accactacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
    | || |||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  19694129 atcattacatttcctagaaactttgaattcgcaag 19694095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 69 - 399
Target Start/End: Original strand, 2131158 - 2131478
Alignment:
Q  69 actcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagca 168  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  2131158 actcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaag-------aactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagca 2131249  T
Q  169 tt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaatt 265  Q
    || |||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| || |        |||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  2131250 tttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtacataactttgaaagtaaaaagaaag----tagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaatt 2131344  T
Q  266 gatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaa 365  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||    
T  2131345 gatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgcgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgatacattgaacacatcaa 2131444  T
Q  366 ccactacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
     || |||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  2131445 tcattacatttcctagaaactttgaattcgcaag 2131478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 64 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 22139231 - 22138906
Alignment:
Q  64 catatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttc 163  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||        |  |||||||||||||| | |||||||||    
T  22139231 catacactcgctcatgcacgtttcatttcaatgtaccctgttgctcaagtttgcttt-caaaa--------actttttcaattttcaagacgtttgtttc 22139141  T
Q  164 aagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctc 260  Q
    ||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| || |        |||||||| |||||||||||| | ||||    
T  22139140 aagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtacataactttgaaagtaaaaagaaaa----tagagttt-caaacaaaagcacaagctc 22139046  T
Q  261 aaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaaca 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22139045 aaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaaca 22138946  T
Q  360 cagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
    ||  || || |||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  22138945 caacaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaag 22138906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 69 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 14569480 - 14569194
Alignment:
Q  69 actcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagca 168  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||       ||  |||||||||||||| ||| ||||||| ||||    
T  14569480 actcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgtctttcaaaa-------aactttttcaattttcaagatgcttgtttcgagca 14569389  T
Q  169 tt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgttttgtat-----atagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctca 261  Q
    || |||||||| |||| ||||| ||||||||||| | |     ||| ||||||||||| || |         ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  14569388 tttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttttttgaacataactttgaaagtaaaaagaaagc----agagttt-caaacaaaagcacaggctca 14569294  T
Q  262 aattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacaca 361  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14569293 aattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacaca 14569194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 268; Significance: 1e-149; HSPs: 11)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 56 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 3647487 - 3647148
Alignment:
Q  56 gacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 155  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3647487 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 3647388  T
Q  156 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaa 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         | |||||||||||||||||||||    
T  3647387 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaag----aaaaatggagttttcaaacaaaagcaaa 3647292  T
Q  256 ggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattg 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3647291 ggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattg 3647192  T
Q  356 aacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
    ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  3647191 aacacagtaaccattacatttcctagaaactttgaattcgcaag 3647148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 56 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 10969007 - 10968667
Alignment:
Q  56 gacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 155  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10969007 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 10968908  T
Q  156 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaa 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||    
T  10968907 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatattttgtatatagctttgaaagtagaag---aaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaa 10968811  T
Q  256 ggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattg 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10968810 ggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattg 10968711  T
Q  356 aacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
    |||||||||| ||  |||  || |||||||||||||||| ||||    
T  10968710 aacacagtaatcaggacatctcctagaaactttgaattcgcaag 10968667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 70 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 51644549 - 51644204
Alignment:
Q  70 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagca 168  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51644549 ctcgcttatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagca 51644450  T
Q  169 ttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgat 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51644449 ttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaag---aaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgat 51644353  T
Q  269 gtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaacca 368  Q
    || |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  51644352 gtgtaagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatca 51644253  T
Q  369 ctacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaaacttctgatga 417  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  51644252 tgacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttttgatga 51644204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 70 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 10951419 - 10951100
Alignment:
Q  70 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 169  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10951419 ctcgcttatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttacttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 10951320  T
Q  170 tgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatg 269  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10951319 tgtcattatcaaaataaaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaag---aaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatg 10951223  T
Q  270 tataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccac 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||     
T  10951222 tataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcat 10951123  T
Q  370 tacagttcttagaaactttgaat 392  Q
    |||| ||| | ||||||||||||    
T  10951122 tacatttcctggaaactttgaat 10951100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 70 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 28591409 - 28591084
Alignment:
Q  70 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28591409 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 28591310  T
Q  170 tgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatg 269  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |         |||| ||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  28591309 tgtcattatcaaaatagaaagagaatgttttgtatatagctttgaaagtaaaaagaaagc----agag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatg 28591215  T
Q  270 tataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccac 369  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||     
T  28591214 tataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcat 28591115  T
Q  370 tacagttcttagaaactttgaattcacaagt 400  Q
    |||| ||| | |||||||||||||| |||||    
T  28591114 tacatttcctggaaactttgaattcgcaagt 28591084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 11 - 417
Target Start/End: Original strand, 20334283 - 20334689
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgctggtatcacaa--tgagatggacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||   ||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20334283 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 20334382  T
Q  109 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagtttt-caattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg---ttttgtat 204  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||     
T  20334383 caggtttgcttt-caaaatagacaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttttgtac 20334481  T
Q  205 atagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactcca 304  Q
    |||||||||||||||||| |        ||||| ||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  20334482 atagctttgaaagtagaaag----aaagtagag-tttcaaacaaaagcacaatttcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactcca 20334576  T
Q  305 cggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacag 404  Q
     ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||| |||| ||||    
T  20334577 tggatttacaaggcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacag 20334676  T
Q  405 aaacttctgatga 417  Q
    || |||| |||||    
T  20334677 aagcttcagatga 20334689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 56 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 28156069 - 28155728
Alignment:
Q  56 gacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc----aa 151  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||    
T  28156069 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaa 28155970  T
Q  152 aatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaag 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||| |||||||||    
T  28155969 aatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaag-----aaaatagagtttt-aaacaaaag 28155876  T
Q  252 caaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtac 351  Q
    || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28155875 cacaggctcaatttgatgtataagaggggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtac 28155776  T
Q  352 attgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
    |||||||||||| | ||  ||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  28155775 attgaacacagtgatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaag 28155728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 56 - 399
Target Start/End: Original strand, 41787224 - 41787565
Alignment:
Q  56 gacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc---aaa 152  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  41787224 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaa 41787323  T
Q  153 atgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagc 252  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||| ||||||||||    
T  41787324 atgtttgtttcgagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaag-----aaaatagagtttt-aaacaaaagc 41787417  T
Q  253 aaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtac 351  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41787418 acaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccggaggcgtgaccccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtac 41787517  T
Q  352 attgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
    ||||||||||| || || |||| ||| | |||||||||||||| ||||    
T  41787518 attgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaag 41787565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 11 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 20467173 - 20466761
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgctggtatcacaa--tgagatggacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 108  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||   ||| || ||||||| |||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||| || ||||    
T  20467173 cacagactatcatggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatacactcgctcacgcatgtttcgtttgaatgtaccttgctgct 20467074  T
Q  109 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttc--------aattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg--tt 198  Q
    |||||||||||| |||||||||||  || ||||         |||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||    
T  20467073 caggtttgcttt-caaaatagacaggaactttttttttttctaattttgaagatgtttgtttcaagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatggttt 20466975  T
Q  199 ttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatg 298  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| |        |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  20466974 ttgtacatagctttgaaagtggaaagaaag----tagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtg 20466880  T
Q  299 actccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaa 398  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||  |||    
T  20466879 actccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaacgactacatttcctagaaactttgaatttgcaa 20466780  T
Q  399 gtacagaaacttctgatga 417  Q
    | | |||| ||||||||||    
T  20466779 gcatagaagcttctgatga 20466761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 11 - 417
Target Start/End: Original strand, 16201895 - 16202307
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgctggtatcacaa--tgagatggacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 108  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| ||| || |   ||| || ||||||| ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16201895 cacagactatcctggagaagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatacgctcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 16201994  T
Q  109 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaag---ttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt--- 200  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||       
T  16201995 caggtttgcttt-caaaatagacgaaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcatttgtcattatcaaaaatagaaagaaaatgttttttt 16202093  T
Q  201 --gtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatg 298  Q
      ||| || |||||||||||| || |        |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  16202094 ttgtacatggctttgaaagtaaaaagaaaa----tagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtg 16202188  T
Q  299 actccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaa 398  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  || | |||||||||||||| |||    
T  16202189 actccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaattactacatgtcctggaaactttgaattcgcaa 16202288  T
Q  399 gtacagaaacttctgatga 417  Q
    | |||| | ||||||||||    
T  16202289 gcacaggagcttctgatga 16202307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 69 - 417
Target Start/End: Original strand, 21891690 - 21892020
Alignment:
Q  69 actcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagca 168  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||      |||||||||||||| ||| ||||||| ||||    
T  21891690 actcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaaaaaactt----ttttcaattttcaagatgcttgtttcgagca 21891784  T
Q  169 tt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtt-ttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaatt 265  Q
    || |||||||| |||| ||||| ||||||||| ||| | |||       ||  |||| |        |||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  21891785 tttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgaacata-------aaaaagaaag--------tagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaatt 21891868  T
Q  266 gatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaa 365  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21891869 gatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacatagtaa 21891968  T
Q  366 ccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaaacttctgatga 417  Q
     ||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  21891969 tcactacatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaagcttctgatga 21892020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 56 - 417
Target Start/End: Original strand, 3094 - 3453
Alignment:
Q  56 gacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 155  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3094 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaaggtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatg 3193  T
Q  156 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaa 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||         |||| ||||||||||||||||||    
T  3194 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagagaatgttttgtatatagctttgaaagtagaag--aacaaaatagaattttcaaacaaaagcaaa 3291  T
Q  256 ggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattg 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3292 ggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattg 3391  T
Q  356 aacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaaacttctgatga 417  Q
    |||||||||| ||||||| ||| | |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3392 aacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatga 3453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 56 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 18147 - 17980
Alignment:
Q  56 gacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 155  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18147 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaaggtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatg 18048  T
Q  156 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaag 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18047 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagagaatgttttgtatatagctttgaaagtagaag 17980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 251; Significance: 1e-139; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 56 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 15915 - 15551
Alignment:
Q  56 gacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgctttt-caaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa- 153  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15915 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgctttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaa 15816  T
Q  154 -----tgtttgtttcaagcattgtcattatc-aaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaaca 247  Q
         |||||||||| |||||||||||  |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||    
T  15815 aaaaatgtttgtttcgagcattgtcatcgtttaaaatagaaggaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaag-----aaaatagagttttcaaaca 15721  T
Q  248 aaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtg 347  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15720 aaagcaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtg 15621  T
Q  348 gtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaaacttctgatga 417  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  15620 gtacattgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttttgatga 15551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0547 (Bit Score: 244; Significance: 1e-135; HSPs: 1)
Name: scaffold0547
Description:

Target: scaffold0547; HSP #1
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 56 - 399
Target Start/End: Original strand, 9557 - 9895
Alignment:
Q  56 gacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 155  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9557 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 9656  T
Q  156 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaa 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||| ||||||||||||||| |    
T  9657 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaag----aaaaatagag-tttcaaacaaaagcaca 9751  T
Q  256 ggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattg 355  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9752 agctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaagcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgatacattg 9851  T
Q  356 aacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
    |||||||||| || |||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  9852 aacacagtaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaag 9895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 70 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 14275 - 13931
Alignment:
Q  70 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagca 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14275 ctcgctcatgcatgtttcatttgaacgtaccctgttgctcaggcttgcttttcaaaacacacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagca 14176  T
Q  169 ttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgat 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||         |||||||| ||||||| |||| | |||||| |||||    
T  14175 ttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatacagctttgaaagtagaag----aaaaatagagttt-caaacaacagcacaagctcaatttgat 14081  T
Q  269 gtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaacc 367  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14080 gtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacggtaacc 13981  T
Q  368 actacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaaacttctgatga 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  13980 actacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttttgatga 13931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 2)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 70 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 1982 - 1639
Alignment:
Q  70 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagca 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1982 ctcgctcatgcatgtttcatttgatcgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaagtaaacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagca 1883  T
Q  169 ttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgat 268  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  1882 ttgtcattatcaaaatggaaggaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaag-----aaaatagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgat 1789  T
Q  269 gtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaacc 367  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1788 gtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagtaatc 1689  T
Q  368 actacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaaacttctgatga 417  Q
    |||||| ||| | |||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  1688 actacatttcctggaaattttgaattcataagcacagaaacttctgatga 1639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 11 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 12443 - 12028
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgctggtatcacaa--tgagatggacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 108  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||   ||| || ||||||| ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12443 cacagactatcctggagaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacataccctcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 12344  T
Q  109 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagtttt-caattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtat--- 204  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |       
T  12343 caggtttgcttt-caaaatagacaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagcaaatgttttttttttt 12245  T
Q  205 --------atagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaa-ttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggc 295  Q
            |||||||||||||||||| |        |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12244 ttttttacatagctttgaaagtagaaagatag----tagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggc 12150  T
Q  296 atgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattca 395  Q
     |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| | |||||||||| |||     
T  12149 gtgactccatggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacatagtaatcactacatttcctggaaactttgagttcg 12050  T
Q  396 caagtacagaaacttctgatga 417  Q
    ||||||||||| ||||||||||    
T  12049 caagtacagaagcttctgatga 12028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 56 - 399
Target Start/End: Original strand, 8844 - 9182
Alignment:
Q  56 gacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaat 154  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  8844 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaagtttgcttttcaaaatagacaaaaagtttttaattttcaaaaat 8943  T
Q  155 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaa 254  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||  |||||||||||||||     
T  8944 gttcgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaag-----aaaataga-atttcaaacaaaagcac 9037  T
Q  255 aggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacatt 354  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9038 aagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacatt 9137  T
Q  355 gaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
    ||||||||||| ||  ||| |||  | ||||||||||||| ||||    
T  9138 gaacacagtaatcatgacatttcccaaaaactttgaattcgcaag 9182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0792 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 1)
Name: scaffold0792
Description:

Target: scaffold0792; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 11 - 399
Target Start/End: Original strand, 4471 - 4860
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgctggtatcacaa--tgagatggacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||   ||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4471 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 4570  T
Q  109 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtatat 206  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4571 caggtttgctttcaaaaatagacaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatat 4670  T
Q  207 agctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacg 306  Q
    |||||||||||||||||         ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  4671 agctttgaaagtagaag----aaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacg 4765  T
Q  307 gattcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattgg-ttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |  ||||||||||||| ||||    
T  4766 gattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggtttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaag 4860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 2)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 56 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 10252 - 9914
Alignment:
Q  56 gacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaat 154  Q
    ||||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10252 gacatcaacatactctcgcttatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaat 10153  T
Q  155 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaa 254  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||         ||||||||| |||||||||||     
T  10152 gtttgtttcaaacattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatatagctttgaaaatagaag-----aaaatagagtttt-aaacaaaagcac 10059  T
Q  255 aggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacatt 354  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10058 aggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgacttcatggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgatacatt 9959  T
Q  355 gaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
    ||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  9958 gaacacagtaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaag 9914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 69 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 33620 - 33297
Alignment:
Q  69 actcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgctttt-caaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagc 167  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     ||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  33620 actcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttacaaaa-----aaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagc 33527  T
Q  168 att-gtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaatt 265  Q
    ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| || |         ||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  33526 atttgtcattattaaaatagaaggaaaatgtttttgtacataactttgaaagtaaaaagaaaac----agagttt-caaacaaaagcacaggctcaaatt 33432  T
Q  266 gatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagta 364  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  33431 gatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtgatacattgaacacaaca 33332  T
Q  365 accactacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
    | || |||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  33331 atcattacatttcctagaaactttgaattcgcaag 33297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 218; Significance: 1e-119; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 56 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 18926 - 18585
Alignment:
Q  56 gacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc---aaa 152  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  18926 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaa 18827  T
Q  153 atgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagc 252  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||| ||||||||||    
T  18826 atgtttgtttcgagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaag-----aaaatagagtttt-aaacaaaagc 18733  T
Q  253 aaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtac 351  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18732 acaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccggaggcgtgaccccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtac 18633  T
Q  352 attgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
    ||||||||||| || || |||| ||| | |||||||||||||| ||||    
T  18632 attgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaag 18585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 11 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 25509 - 25097
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgctggtatcacaa--tgagatggacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||   ||| || ||||||  ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  25509 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcgacatacgctcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccttgttgct 25410  T
Q  109 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaag-------ttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt- 200  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||     
T  25409 caggtttgcttt-caaaacagacaaaaaacttttttttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaagatagaaagataatgttttt 25311  T
Q  201 --gtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatg 298  Q
      ||| |||||||||||||||||| |        |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||    
T  25310 tcgtacatagctttgaaagtagaaagaaag----tagagttt-caaacaaaagcgcaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggtgtg 25216  T
Q  299 actccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaa 398  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||    
T  25215 actccacggatttacaaagcttggaaaatggcaattttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacatttcctagaaactttgaatttgcaa 25116  T
Q  399 gtacagaaacttctgatga 417  Q
    | |||||| ||||||||||    
T  25115 gcacagaagcttctgatga 25097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0288 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0288
Description:

Target: scaffold0288; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 239 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 537 - 359
Alignment:
Q  239 tttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttat 338  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  537 tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtatgagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttat 438  T
Q  339 tggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaaacttctgatga 417  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  437 tggttggtggtacattgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttttgatga 359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 146; Significance: 9e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 69 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 6389 - 6066
Alignment:
Q  69 actcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagca 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||  |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6389 actcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa-------aactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagca 6297  T
Q  169 tt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgttttgt--atatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaat 264  Q
    || |||||||| |||| ||||| ||||||||||| |  | ||| ||||||||||| || |        |||||||| |||||||||||| ||||||||      
T  6296 tttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgttttttgaacataactttgaaagtaaaaagaaag----tagagttt-caaacaaaagcacaggctcaata 6202  T
Q  265 tgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagt 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  6201 tgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttactggttggtggtacattgaacacagc 6102  T
Q  364 aaccactacagttcttagaaactttgaattcacaag 399  Q
    || || |||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  6101 aatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaag 6066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 69 - 393
Target Start/End: Original strand, 24834 - 25150
Alignment:
Q  69 actcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagca 168  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||      |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  24834 actcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgctcaggttttcttttcaaaa------aaaaattttcaattttcaagatgtttgtttcgagca 24926  T
Q  169 tt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaaggnnnnnnnntagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaatt 265  Q
    || |||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| || |         ||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  24927 tttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtacataactttgaaagtaaaaagaaagc----agagttt-caaacaaaagcacaggctcaaatt 25021  T
Q  266 gatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagta 364  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  25022 gatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacccagca 25121  T
Q  365 accactacagttcttagaaactttgaatt 393  Q
    | || |||| ||| |||||||||||||||    
T  25122 atcattacatttcctagaaactttgaatt 25150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 11 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 173 - 1
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgctggtatcacaa--tgagatggacatcatcatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 108  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||   ||| || ||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  173 cacagactatcctagggaagagcctgcttgtagcacatattgaaatagacatcaacatacacttgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 74  T
Q  109 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaa 181  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  73 caggtttgc-tttcaaaatagacaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaa 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0241
Description:

Target: scaffold0241; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 255 - 417
Target Start/End: Original strand, 26243 - 26405
Alignment:
Q  255 aggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacatt 354  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  26243 aggctcgaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgacttcacagatttacaaagcttgaaaaatggaaattttatttgttggtggtacatt 26342  T
Q  355 gaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaaacttctgatga 417  Q
    || ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||| |||||| ||||||||||    
T  26343 gagcacggtaaccactacatttcctagaaactttgaattagcaagcacagaagcttctgatga 26405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 261 - 393
Target Start/End: Original strand, 40759 - 40898
Alignment:
Q  261 aaattgatgtataagagtggtggtc-agccaaaggcatgactcc-acggattcac-aaagcttgg-aaaatggtaa-ttttattggttggtggtac-att 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  40759 aaattgatgtataagagtggtggtcaagccgaaggcgtgactccaacggatttacaaaagcttggaaaaatggtaatttttattggttggtggtacaatt 40858  T
Q  355 g-aacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaatt 393  Q
    | ||||||  || || |||| ||| |||||||||||||||    
T  40859 gaaacacaacaatcattacatttcctagaaactttgaatt 40898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 116
Target Start/End: Original strand, 40558 - 40606
Alignment:
Q  69 actcgctcatgcatg-tttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttg 116  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40558 actcgctcatgcattatttcgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttg 40606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University