View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF16232_low_1 (Length: 1475)

Name: NF16232_low_1
Description: NF16232
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF16232_low_1
NF16232_low_1
[»] chr7 (35 HSPs)
chr7 (148-834)||(20299909-20300590)
chr7 (830-1325)||(20296610-20297105)
chr7 (887-1317)||(20292192-20292622)
chr7 (885-1325)||(20301386-20301826)
chr7 (891-1324)||(20261809-20262242)
chr7 (885-1302)||(20170124-20170535)
chr7 (885-1302)||(20172117-20172528)
chr7 (146-581)||(20293031-20293466)
chr7 (887-1254)||(20281762-20282129)
chr7 (891-1313)||(20229237-20229659)
chr7 (891-1243)||(20092152-20092506)
chr7 (885-1228)||(20271474-20271817)
chr7 (183-578)||(20302236-20302631)
chr7 (895-1217)||(20241283-20241605)
chr7 (851-1318)||(20064535-20065013)
chr7 (995-1308)||(20286830-20287143)
chr7 (147-627)||(20272178-20272658)
chr7 (148-567)||(20287674-20288096)
chr7 (155-627)||(20169288-20169760)
chr7 (179-581)||(20230072-20230474)
chr7 (179-580)||(20242023-20242424)
chr7 (152-610)||(20063759-20064202)
chr7 (181-578)||(20277971-20278368)
chr7 (273-404)||(20090414-20090545)
chr7 (183-365)||(20262856-20263038)
chr7 (151-581)||(20282546-20282977)
chr7 (1130-1259)||(19936641-19936770)
chr7 (1130-1259)||(19967780-19967909)
chr7 (18-81)||(20300665-20300727)
chr7 (666-722)||(20064290-20064346)
chr7 (213-292)||(19937726-19937805)
chr7 (213-292)||(19968865-19968944)
chr7 (666-806)||(20301968-20302116)
chr7 (184-254)||(20006627-20006697)
chr7 (429-475)||(47602086-47602132)
[»] chr4 (5 HSPs)
chr4 (887-1318)||(40821220-40821637)
chr4 (995-1314)||(40825998-40826317)
chr4 (179-577)||(40820408-40820806)
chr4 (147-567)||(40825043-40825464)
chr4 (1325-1458)||(55216247-55216380)
[»] scaffold0027 (1 HSPs)
scaffold0027 (980-1215)||(135267-135502)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 602; Significance: 0; HSPs: 35)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 602; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 148 - 834
Target Start/End: Complemental strand, 20300590 - 20299909
Alignment:
Q  148 tagagcataccaggttcttcatgggctatgtgaacatatagatcaagtcctccactctccagttgttgtatatcaattagattcctagtccaagacatac 247  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||||| || ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20300590 tagagcataccaggttctgcatgggctactcgaacatatagatcaagtcctccactttctagttgt---atatcaattagattcctagtccaagacatac 20300494  T
Q  248 aaccaattccagcatcatgaaaattcgcaacgcatgagcaattctacaagcataagcttctgcatatgtctggtgcaacagctacaccttctgcaaaatc 347  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20300493 aaccaattccagcatcatgagaattcgcaacgcatgagcaattctacaagcataagcttctgcatatgtctggtgcaacagctacaccttctgcaaattc 20300394  T
Q  348 aggaactttaaccatctgcaatatcaaaaatccatcctcctttgtactggtggttttatggttgaccctttaacactgaaaaggtgtcctcctgacacac 447  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20300393 aggaactttaaccatctgcaatatcaaaaatccatcttcctttgtactggtggttttattgttgaccctttaacactgaaaagctgtcctcctgacacac 20300294  T
Q  448 ccaccagtccaattgtttctattccattcttgtatcgacttgggttcaaattctttcaaacaggtgcaaaatggtgaacttagtgaactacagcttgcaa 547  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20300293 ccaccagtccaattgtttctattccattcttgtatcgacttgggttcaaattctttcaaacaggtgcaaattggtgaacttagtgaactacagcttgcaa 20300194  T
Q  548 ataccccacatataccataaccatcacactctgaaacccgactagtccatgtaacttgcacttaattcctctcataatcctaggatataggtaacaaatt 647  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  20300193 ataccccgcatataccataaccatcacactctgaaacccgactagtccatgtaacttgcacttaattcctctc--aatcctaggatataggtaataaatt 20300096  T
Q  648 cctcgttaatttggattataaaatatacatttatattcccttctctatcatttccaccttgaaaaccgtaaaaatgtgcatttgttgtagtcagtattcc 747  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20300095 ccttgttaatttggattataaaatatacatttatattcccttctctatcatttccaccttgaaaaccgtaaaaatgtgcatttgttgtagtcagtattcc 20299996  T
Q  748 tgtaaaacctccaccattccaggggccagtacggccgagtttcattcaaaataaacactacatctgaaggtttttccatgatgtgag 834  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20299995 tgtaaaacctccaccattccaggggccagtacggccgagtttcattcaaaataaacactacatctgaaggtttttccatgatgtgag 20299909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 472; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 830 - 1325
Target Start/End: Complemental strand, 20297105 - 20296610
Alignment:
Q  830 gtgagaattaatttatctccagttcttttgttagtagaaagtttcataccaggcagtaggttgctgaatactctcccataacatatttctagttgtgctc 929  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20297105 gtgagaattaatttatctctagttcttttgtcaatagaaagtttcataccaggcagtaggttgctgaatactctcccataacatatttctagttgtgctc 20297006  T
Q  930 tccaaaaggacaaggttaccaaagtctgaaaattgaaaacttgtaattgttgctatgttgaaaacatttgatgaccaaatgacttgtttctatccattta 1029  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20297005 tccaaaaggacaaggttaccaaagtctgaaaattgaaaacttgtaattgttgctatgttggaaacatttgatgaccaaatgacttgtttctatccattta 20296906  T
Q  1030 ataccacaagatttccattttcagatattgtgacaatcccattagaatcattcagtgattggtttttcttagccacccatacgactgtagtgcgagactt 1129  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20296905 ataccacaagatttccatcttcagatattgtgacaatcccattagaatcattcagtgattggtttttgttagccacccatacgactgtagtgcgagactt 20296806  T
Q  1130 ccaccaaattccaacatagcgatttgtagagtttataggactaaagcatccaaaggtgaagttaccatcttttgagattagagtttcagggtccttgatg 1229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20296805 ccaccaaattccaacatagcgatttgtagagtttataggactaaagcatccaaaggtgaagttaccatcttttgagattagagtttcagggtccttgatg 20296706  T
Q  1230 aattgggaagatgttatagtgtctatggcaatactcatgtgtaacaaattgcaaaacagaatggataaaacagaaaacagatttgaacagcagctg 1325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20296705 aattgggaagatgttatagtgtctatggcaatactcatgtgtaacaaattgcaaaacagaatggataaaacagaaaacagatttgaacagcagctg 20296610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 887 - 1317
Target Start/End: Complemental strand, 20292622 - 20292192
Alignment:
Q  887 aggttgctgaatactctcccataacatatttctagttgtgctctccaaaaggacaaggttaccaaagtctgaaaattgaaaacttgtaattgttgctatg 986  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| | |||||||||    
T  20292622 aggttgctgaatactctgccataaaatggttccagttgtgctctccaaaaggacaaggttaccaaagtcggaaaactgagaacttgtattggttgctatg 20292523  T
Q  987 ttgaaaacatttgatgaccaaatgacttgtttctatccatttaataccacaagatttccattttcagatattgtgacaatcccattagaatcattcagtg 1086  Q
    ||| | |||||||||| |||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||   || |||||||||||||||||||||    
T  20292522 ttggagacatttgatgtccaaatgacttgcttctgtccgtttaataccacaagatttccatcttcagatattgccgcagtcccattagaatcattcagtg 20292423  T
Q  1087 attggtttttcttagccacccatacgactgtagtgcgagacttccaccaaattccaacatagcgatttgtagagtttataggactaaagcatccaaaggt 1186  Q
     ||||||| | || |||||||||| || |||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  20292422 gttggtttctgttcgccacccatatgattgtagactgagacttccaccaaattccaacgtagcgatttgtagagtttttaggactaaagaatccaaaggt 20292323  T
Q  1187 gaagttaccatcttttgagattagagtttcagggtccttgatgaattgggaagatgttatagtgtctatggcaatactcatgtgtaacaaattgcaaaac 1286  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||| |||||||||| | |  |||||||||| |||||||    
T  20292322 gaagttaccatctttggagataagagtttcagcgtccttgatgaattgggatgatgtgatggtgtttatggcaatattaacttgtaacaaatagcaaaac 20292223  T
Q  1287 agaatggataaaacagaaaacagatttgaac 1317  Q
    | |||| | | |||||| | || ||||||||    
T  20292222 aaaatgaacagaacagagagcatatttgaac 20292192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 885 - 1325
Target Start/End: Complemental strand, 20301826 - 20301386
Alignment:
Q  885 gtaggttgctgaatactctcccataacatatttctagttgtgctctccaaaaggacaaggttaccaaagtctgaaaattgaaaacttgtaattgttgcta 984  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| |  |||| ||||| | ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  20301826 gtaggttgttgaatactctgccataatacgtttccagttgcgttctccaaaaggacaaggttgccatagtctgaaaactgagaacttgtatttgttgcta 20301727  T
Q  985 tgttgaaaacatttgatgaccaaatgacttgtttctatccatttaataccacaagatttccattttcagatattgtgacaatcccattagaatcattcag 1084  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20301726 tgttggaaacatttgatgaccaaatgactcgtttctgtccatttaatacctcaatatttccatcttcggatattgtgacaatcccattagaatcattcag 20301627  T
Q  1085 tgattggtttttcttagccacccatacgactgtagtgcgagacttccaccaaattccaacatagcgatttgtagagtttataggactaaagcatccaaag 1184  Q
    || ||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  ||| |||||| ||||||||    
T  20301626 tggttggtttctgttagccacccatacgactgtagaacgagaattccaccaaattccaacgtagcgatttgtagaattttcagggctaaagaatccaaag 20301527  T
Q  1185 gtgaagttaccatcttttgagattagagtttcagggtccttgatgaattgggaagatgttatagtgtctatggcaatactcatgtgtaacaaattgcaaa 1284  Q
    |   ||  ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  | ||||| |   ||||||||| | |||    
T  20301526 gcataggaaccatctttggaaagtagagtttcagggtccttgatgaattgggatgatgtgatggtgtctataccgatactaacacgtaacaaataggaaa 20301427  T
Q  1285 acagaatggataaaacagaaaacagatttgaacagcagctg 1325  Q
    |||||||| | |||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  20301426 acagaatgaacaaaacaaagaacagatttgaacagctgctg 20301386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 190; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 891 - 1324
Target Start/End: Complemental strand, 20262242 - 20261809
Alignment:
Q  891 tgctgaatactctcccataacatatttctagttgtgctctccaaaaggacaaggttaccaaagtctgaaaattgaaaacttgtaattgttgctatgttga 990  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||||  |||||| |||||| ||| ||||||||||| ||  | ||||| ||| |||||||| |||||| |||||||     
T  20262242 tgctgaatactctgccataaaatgtttccggttgtgttctccagaagcacaaggttaccgaaacccgaaaagtgagaacttgtatttgttgttatgttgg 20262143  T
Q  991 aaacatttgatgaccaaatgacttgtttctatccatttaataccacaagatttccattttcagatattgtgacaatcccattagaatcattcagtgattg 1090  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||     
T  20262142 aaacatttgatgaccaaacaacttgtttctgtccatttaataccacaagatttccatgttcagatattgtgacaatcccattagaatcattcagtagttt 20262043  T
Q  1091 gtttttcttagccacccatacgactgtagtgcgagacttccaccaaattccaacatagcgatttgtagagtttataggactaaagcatccaaaggtgaag 1190  Q
    |||| | || || ||||||| || |||||   |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||| |||||| ||||||||||||||    
T  20262042 gtttctgtttgcaacccatatgattgtagattgagacttccaccaaattccaacgtagcggtttgtagaatttttagggctaaagaatccaaaggtgaag 20261943  T
Q  1191 ttaccatcttttgagattagagtttcagggtccttgatgaattgggaagatgttatagtgtctatggcaatactcatgtgtaacaaattgcaaaacagaa 1290  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||||||  ||| ||| |  |||| ||||| |||| ||| ||    
T  20261942 ttaccatctttggagattagagtttcagggtctttgataaattgagatgatgtgatggtgtctataccaacactaacatgtaccaaatagcaacacaaaa 20261843  T
Q  1291 tggataaaacagaaaacagatttgaacagcagct 1324  Q
    || ||| |||||||||||||| || |||| ||||    
T  20261842 tgaatacaacagaaaacagatatgcacagtagct 20261809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 885 - 1302
Target Start/End: Original strand, 20170124 - 20170535
Alignment:
Q  885 gtaggttgctgaatactctcccataacatatttctagttgtgctctccaaaaggacaaggttaccaaagtctgaaaat-tgaaaacttgtaattgttgct 983  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| || |||| ||||||       |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||    
T  20170124 gtaggttgctgaatactttgccataaaatgtttccagttgt-------aaaaggacaaggttaccaaagtctgaaaagctgagaacttgtatttgttgct 20170216  T
Q  984 atgttgaaaacatttgatgaccaaatgacttgtttctatccatttaataccacaagatttccattttcagatattgtgacaatcccattagaatcattca 1083  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20170217 atgttggaaacacttgatgaccaaatgactcgtttctgtccattcaataccacaagatttccatcttcaaatattgtgacaatcccattagaatcattca 20170316  T
Q  1084 gtgattggtttttcttagccacccatacgactgtagtgcgagacttccaccaaattccaacatagcgatttgtagagtttataggactaaagcatccaaa 1183  Q
    ||| || |||| | ||||||||||||| || |||||   |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||| |||||| |||||||    
T  20170317 gtggttagtttctgttagccacccatatgattgtagattgagacttccaccaaattccaacgtagcggtttgtagaatttttagggctaaagaatccaaa 20170416  T
Q  1184 ggtgaagttaccatcttttgagattagagtttcagggtccttgatgaattgggaagatgttatagtgtctatggcaatactcatgtgtaacaaattgcaa 1283  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||||||  ||| ||| |  |||| ||||| ||||    
T  20170417 ggtgaagttaccgtctttggagattagagtttcagggtctttgataaattgagatgatgtgatggtgtctataccaacactaacatgtagcaaatagcaa 20170516  T
Q  1284 aacagaatggataaaacag 1302  Q
     ||| |||| |||||||||    
T  20170517 cacaaaatgaataaaacag 20170535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 885 - 1302
Target Start/End: Original strand, 20172117 - 20172528
Alignment:
Q  885 gtaggttgctgaatactctcccataacatatttctagttgtgctctccaaaaggacaaggttaccaaagtctgaaaat-tgaaaacttgtaattgttgct 983  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| || |||| ||||||       |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||    
T  20172117 gtaggttgctgaatactttgccataaaatgtttccagttgt-------aaaaggacaaggttaccaaagtctgaaaagctgagaacttgtatttgttgct 20172209  T
Q  984 atgttgaaaacatttgatgaccaaatgacttgtttctatccatttaataccacaagatttccattttcagatattgtgacaatcccattagaatcattca 1083  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20172210 atgttggaaacacttgatgaccaaatgactcgtttctgtccattcaataccacaagatttccatcttcaaatattgtgacaatcccattagaatcattca 20172309  T
Q  1084 gtgattggtttttcttagccacccatacgactgtagtgcgagacttccaccaaattccaacatagcgatttgtagagtttataggactaaagcatccaaa 1183  Q
    ||| || |||| | ||||||||||||| || |||||   |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||| |||||| |||||||    
T  20172310 gtggttagtttctgttagccacccatatgattgtagattgagacttccaccaaattccaacgtagcggtttgtagaatttttagggctaaagaatccaaa 20172409  T
Q  1184 ggtgaagttaccatcttttgagattagagtttcagggtccttgatgaattgggaagatgttatagtgtctatggcaatactcatgtgtaacaaattgcaa 1283  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||||||  ||| ||| |  |||| ||||| ||||    
T  20172410 ggtgaagttaccgtctttggagattagagtttcagggtctttgataaattgagatgatgtgatggtgtctataccaacactaacatgtagcaaatagcaa 20172509  T
Q  1284 aacagaatggataaaacag 1302  Q
     ||| |||| |||||||||    
T  20172510 cacaaaatgaataaaacag 20172528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 184; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 146 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 20293466 - 20293031
Alignment:
Q  146 gctagagcataccaggttcttcatgggctatgtgaacatatagatcaagtcctccactctccagttgttgtatatcaattagattcctagtccaagacat 245  Q
    |||||| ||||||| ||||| | | |||||   ||||||||||||| ||||||||||| |  ||||| ||||| |||| |||||| | ||||||||||||    
T  20293466 gctagaacataccaagttctgcgtaggctacacgaacatatagatcgagtcctccactttggagttgatgtatgtcaagtagatttccagtccaagacat 20293367  T
Q  246 acaaccaattccagcatcatgaaaattcgcaacgcatgagcaattctacaagcataagcttctgcatatgtctggtgcaacagctacaccttctgcaaaa 345  Q
    ||| ||||| |||| ||||||| ||| ||||| ||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20293366 acagccaatcccagaatcatgagaatacgcaatgcaggagcaattatgcaaacataagcttctgcatatttctggtgtaacagctacaccttctgcaaaa 20293267  T
Q  346 tcaggaactttaaccatctgcaatatcaaaaatccatcctcctttgtactggtggttttatggttgaccctttaacactgaaaaggtgtcctcctgacac 445  Q
    || |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||    
T  20293266 tctggaactttaaccatcttcaatttcaaaaacccatcttcctttgtactggtggttttattgttgaccctttcacactccaaaggtgtcctcctaacac 20293167  T
Q  446 acccaccagtccaattgtttctattccattcttgtatcgacttgggttcaaattctttcaaacaggtgcaaaatggtgaacttagtgaactacagcttgc 545  Q
    ||||||| |||||||| | | || ||||||||| |||     ||||| ||||| || |||||||| | || | |||||| || | |||||||||||||||    
T  20293166 acccaccggtccaattatgtttactccattcttctatgtttctgggtacaaatcctctcaaacagctacatattggtgagctcaatgaactacagcttgc 20293067  T
Q  546 aaataccccacatataccataaccatcacactctga 581  Q
    |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20293066 aaaggccccacatataccataaacatcacactctga 20293031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 180; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 887 - 1254
Target Start/End: Complemental strand, 20282129 - 20281762
Alignment:
Q  887 aggttgctgaatactctcccataacatatttctagttgtgctctccaaaaggacaaggttaccaaagtctgaaaattgaaaacttgtaattgttgctatg 986  Q
    ||||||||||||| | | |||||| || |||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  20282129 aggttgctgaataatttgccataaaatgtttccagttgtaatatccaaaaggacaaggttaccaaagtctgaaaactgagaacttgtatttgttgctatg 20282030  T
Q  987 ttgaaaacatttgatgaccaaatgacttgtttctatccatttaataccacaagatttccattttcagatattgtgacaatcccattagaatcattcagtg 1086  Q
    ||| ||||||| |||||||| |||||| |||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  20282029 ttggaaacattcgatgaccatatgactcgtttctgtccatttaatatcgcaagatttccatcttcggatattgtgaaattcccattagaatcattcagtg 20281930  T
Q  1087 attggtttttcttagccacccatacgactgtagtgcgagacttccaccaaattccaacatagcgatttgtagagtttataggactaaagcatccaaaggt 1186  Q
      |||||| | ||  ||||||| | || |||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || | |||||| |||| |||||    
T  20281929 gctggtttctgttttccacccacatgattgtagattgagacttccaccaaattccaacattgcgatttgtagaatttctacggctaaagaatcccaaggt 20281830  T
Q  1187 gaagttaccatcttttgagattagagtttcagggtccttgatgaattgggaagatgttatagtgtcta 1254  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  20281829 gaagttaccatctttggagattagagtttcagggtctttgataaattgagatgatgttatagtgtcta 20281762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 175; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 891 - 1313
Target Start/End: Complemental strand, 20229659 - 20229237
Alignment:
Q  891 tgctgaatactctcccataacatatttctagttgtgctctccaaaaggacaaggttaccaaagtctgaaaattgaaaacttgtaattgttgctatgttga 990  Q
    ||||||| ||||| ||||||  | |||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| || | |||  |  | ||| | | | ||||||||     
T  20229659 tgctgaaaactctgccataagttgtttccagttgtgctctccagaagcacaaggttaccagagtcagacatttgggaggtggtattggatactatgttgg 20229560  T
Q  991 aaacatttgatgaccaaatgacttgtttctatccatttaataccacaagatttccattttcagatattgtgacaatcccattagaatcattcagtgattg 1090  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  20229559 aaacatacgatgaccaaatgacttgtttctgtccatttaataccacgagatttccatgttcagatattgtgacaatcccattagaatcattcagtggttt 20229460  T
Q  1091 gtttttcttagccacccatacgactgtagtgcgagacttccaccaaattccaacatagcgatttgtagagtttataggactaaagcatccaaaggtgaag 1190  Q
    |||| | || || ||||||| || |||||   |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||| |||||| ||||||||||||||    
T  20229459 gtttctgtttgcaacccatatgattgtagattgagacttccaccaaattccaacgtagcggtttgtagaatttttagggctaaagaatccaaaggtgaag 20229360  T
Q  1191 ttaccatcttttgagattagagtttcagggtccttgatgaattgggaagatgttatagtgtctatggcaatactcatgtgtaacaaattgcaaaacagaa 1290  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||||||  ||| ||| |  |||| ||||| |||| ||| ||    
T  20229359 ttaccatctttggagattagagtttcagggtctttgataaattgagatgatgtgatggtgtctataccaacactaacatgtaccaaatagcaacacaaaa 20229260  T
Q  1291 tggataaaacagaaaacagattt 1313  Q
    || ||||||||||||||||||||    
T  20229259 tgaataaaacagaaaacagattt 20229237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 168; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 891 - 1243
Target Start/End: Original strand, 20092152 - 20092506
Alignment:
Q  891 tgctgaatactctcccataacatatttctagttgtgctctccaaaaggacaaggttaccaaagtctgaaaattgaaaacttgtaattgttgctatgttga 990  Q
    ||||||||||||| |||||   | |||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||| | |  || | ||| | | ||||||||||     
T  20092152 tgctgaatactctgccatatgttgtttccagttgtgctctcctgaagcacaaggttaccaaagtcagaaattcgggaagtggtattggatgctatgttgg 20092251  T
Q  991 aaacatttgatgaccaaatgacttgtttctatccatttaataccacaagatttccattttcagatattgtgacaatcccattagaatcattcagtgattg 1090  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20092252 aaacatttgatgaccaaatgacttgtttctttccatttaataccacaagatttccatcttcaaatattatgacaatcccattagaatcattcagtggttg 20092351  T
Q  1091 gtttttcttagccacccatacgactgtagtgcgagacttccaccaaattccaacatagcgatttgtagagtttataggactaaagcatccaaaggtgaag 1190  Q
    |||| | || |||||||||| || | |||   |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||    
T  20092352 gtttctgtttgccacccatatgaatctagattgagacttccaccaaattccaacgtagcgacttgtagagtttgtagggctaaagaatccaaaggtgaag 20092451  T
Q  1191 ttaccatcttttgagattagagtttcagggtcc--ttgatgaattgggaagatgt 1243  Q
    |||||| |||| ||||||||| |||||||||||   ||||||||||||| |||||    
T  20092452 ttaccacctttggagattagattttcagggtccgtgtgatgaattgggatgatgt 20092506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 164; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 885 - 1228
Target Start/End: Complemental strand, 20271817 - 20271474
Alignment:
Q  885 gtaggttgctgaatactctcccataacatatttctagttgtgctctccaaaaggacaaggttaccaaagtctgaaaattgaaaacttgtaattgttgcta 984  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  | ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||  || | ||| | | |||||    
T  20271817 gtaggttgctgaatactctgccataaggtgtttccggttgtgctctccaaaaggacaaggttgccatagtctgaaaactgcgaagtggtattggatgcta 20271718  T
Q  985 tgttgaaaacatttgatgaccaaatgacttgtttctatccatttaataccacaagatttccattttcagatattgtgacaatcccattagaatcattcag 1084  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  20271717 tgttggaaacatttgatgaccaatagactcgtttctgtccattcaataccacaagatttccatcttcagatattgtgacaatcccattagtatcattcaa 20271618  T
Q  1085 tgattggtttttcttagccacccatacgactgtagtgcgagacttccaccaaattccaacatagcgatttgtagagtttataggactaaagcatccaaag 1184  Q
    || ||||||| | || |||||||||| ||  ||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||| |||| |||    
T  20271617 tggttggtttctgtttgccacccatatgatagtagattgagacttccaccaaattccaacatagcggtttgtagaatttttagcactaaagaatcccaag 20271518  T
Q  1185 gtgaagttaccatcttttgagattagagtttcagggtccttgat 1228  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| |||||    
T  20271517 gtgaagttaccatctttggaggttagagcttcagggtctttgat 20271474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 156; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 183 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 20302631 - 20302236
Alignment:
Q  183 atatagatcaagtcctccactctccagttgttgtatatcaattagattcctagtccaagacatacaaccaattccagcatcatgaaaattcgcaacgcat 282  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||| || ||||| |||||||| |   | |  |||  |||     
T  20302631 atatagatcaagtcctccactttcgagttgttgtatgtcaagtaaattcccagtccaagacatgcagccaatcccagcatcgttggagtatgcagtgcaa 20302532  T
Q  283 gagcaattctacaagcataagcttctgcatatgtctggtgcaacagctacaccttctgcaaaatcaggaactttaaccatctgcaatatcaaaaatccat 382  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  20302531 gagcaattctccaagcataagcttctgcatatatctggtgtaacagctacaccttctgcaaaatcgggaactttaaccatctgcaatttcaaaaacccat 20302432  T
Q  383 cctcctttgtactggtggttttatggttgaccctttaacactgaaaaggtgtcctcctgacacacccaccagtccaattgtttctattccattcttgtat 482  Q
    | || |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| |||| | | ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20302431 cttcttttgtacttgtggttttattgttgaccctttcacactgcaaagatcttctcctaacacacccactagtccaattgtttctattccattcctgtat 20302332  T
Q  483 cgacttgggttcaaattctttcaaacaggtgcaaaatggtgaacttagtgaactacagcttgcaaataccccacatataccataaccatcacactc 578  Q
         | || |||||  ||||||||||| |||||| ||| |  || | |||| ||||  |||||||| |||| || ||||||||| ||||||||||    
T  20302331 gttgattggatcaaaccctttcaaacagctgcaaattggcgtgctcaatgaattacaaattgcaaatgccccgcaaataccataaacatcacactc 20302236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 155; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 895 - 1217
Target Start/End: Complemental strand, 20241605 - 20241283
Alignment:
Q  895 gaatactctcccataacatatttctagttgtgctctccaaaaggacaaggttaccaaagtctgaaaattgaaaacttgtaattgttgctatgttgaaaac 994  Q
    ||||||||| ||||||  | ||||  |||||| |||||| ||| ||||||||||| ||  | |||||   | |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  20241605 gaatactctgccataagttttttccggttgtgttctccagaagcacaaggttaccgaaacccgaaaagcaagaacttgtatttgttgctatgttggaaac 20241506  T
Q  995 atttgatgaccaaatgacttgtttctatccatttaataccacaagatttccattttcagatattgtgacaatcccattagaatcattcagtgattggttt 1094  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  20241505 atttgatgaccaaatgactcgtttctgtccatttaataccacaagatttccatcttcagatatcgtgacaatcccattagagtcattcagtggttggttt 20241406  T
Q  1095 ttcttagccacccatacgactgtagtgcgagacttccaccaaattccaacatagcgatttgtagagtttataggactaaagcatccaaaggtgaagttac 1194  Q
     | || |||||||||| || |||||   |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  20241405 ctgtttgccacccatatgattgtagattgagacttccaccaaattccaacgtagcggtttgtagaatttttagggctaaagaatccaaaagtgaagttac 20241306  T
Q  1195 catcttttgagattagagtttca 1217  Q
    | ||||| |||||||||||||||    
T  20241305 cgtctttggagattagagtttca 20241283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 153; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 851 - 1318
Target Start/End: Original strand, 20064535 - 20065013
Alignment:
Q  851 gttcttttgttagtagaaagtttcataccaggcagta-----------ggttgctgaatactctcccataacatatttctagttgtgctctccaaaagga 939  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||           |||| ||||||||||| |||||| || ||||  |||||||| ||||||||||    
T  20064535 gttcttttgttgatagaaagtttcataccaggcagtaatgaatcagaaggttcctgaatactctgccataagatgtttcctgttgtgctatccaaaagga 20064634  T
Q  940 caaggttaccaaagtctgaaaattgaaaacttgtaattgttgctatgttgaaaacatttgatgaccaaatgacttgtttctatccatttaataccacaag 1039  Q
    ||||||| |||  ||| ||||| ||  || | ||| | | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20064635 caaggtttccatggtccgaaaactgggaagtggtattggattctatgttggaaacatttgatgaccaaatgacttgtttctgtccatttaataccacaag 20064734  T
Q  1040 atttccattttcagatattgtgacaatcccattagaatcattcagtgattggtttttcttagccacccatacgactgtagtgcgagacttccaccaaatt 1139  Q
    |||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||| | || ||||||| | || |||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||    
T  20064735 atttccatcttcagatatggtgatagtcccattagaatcatttattggttggtttctgtttgccacccatatgactgtagaacgagaattccaccaaatt 20064834  T
Q  1140 ccaacatagcgatttgtagagtttataggactaaagcatccaaaggtgaagttaccatcttttgagattagagtttcagggtccttgatgaattgggaag 1239  Q
    ||| | ||||||||| |||| |||  ||| |||||| |||||||||   ||  ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  20064835 ccagcgtagcgatttatagaatttccagggctaaagaatccaaaggcataggaaccatctttggagagtagtgtttcagggtccttgatgaattgggatg 20064934  T
Q  1240 atgttatagtgtctatggcaatactcatgtgtaacaaattgcaaaacagaatggataaaacagaaaacagatttgaaca 1318  Q
    |||| || ||||||||  | ||||| |  ||||||||||   |||||| |||| | |||||  | ||||||||||||||    
T  20064935 atgtgatggtgtctataccgatactaacatgtaacaaatacaaaaacacaatgaacaaaactaacaacagatttgaaca 20065013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 138; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 995 - 1308
Target Start/End: Complemental strand, 20287143 - 20286830
Alignment:
Q  995 atttgatgaccaaatgacttgtttctatccatttaataccacaagatttccattttcagatattgtgacaatcccattagaatcattcagtgattggttt 1094  Q
    ||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||    
T  20287143 atttgatgaccaaattacttgtttttgtccattcaataccacaagatttccatcctcagatattgtgacaatcccattagaatcacttagtggtttgttt 20287044  T
Q  1095 ttcttagccacccatacgactgtagtgcgagacttccaccaaattccaacatagcgatttgtagagtttataggactaaagcatccaaaggtgaagttac 1194  Q
     | || |||||||||| || || ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  20287043 ctgtttgccacccatatgattgaagattgagacttccaccaaattccaacatagcgatttgtagagtttttagggctaaagaatccaaaggtgaaattac 20286944  T
Q  1195 catcttttgagattagagtttcagggtccttgatgaattgggaagatgttatagtgtctatggcaatactcatgtgtaacaaattgcaaaacagaatgga 1294  Q
    ||||||| |||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| || |  || ||||||||||  |  |||| ||||| |||| ||||||   |    
T  20286943 catctttggagagtagagttccagggtctttgatgaattgggatgatgtgatggcttcgatggcaataccgacttgtagcaaatagcaacacagaagaaa 20286844  T
Q  1295 taaaacagaaaaca 1308  Q
     |||||||||||||    
T  20286843 caaaacagaaaaca 20286830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 137; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 147 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 20272658 - 20272178
Alignment:
Q  147 ctagagcataccaggttcttcatgggctatgtgaacatatagatcaagtcctccactctccagttgttgtatatcaattagattcctagtccaagacata 246  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||  | || || |||||||| |||| ||||||   ||||||   ||||    
T  20272658 ctagagcataccaggtttttcatgggctatacgaacatatagatcgagtcctcccatttcaagctgttgtatgtcaagtagatttgcagtccacagcata 20272559  T
Q  247 caaccaattccagcatcatgaaaattcgcaacgcatgagcaattctacaagcataagcttctgcatatgtctggtgcaacagctacaccttctgcaaaat 346  Q
    || ||||| ||| |||||||| |||  |||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| |||   || |||||| |||||||    
T  20272558 cagccaatcccatcatcatgagaatatgcaaggcaagagcaattctccaagcataggcttctgcatatgtcaggtgtaacgattaaaccttcagcaaaat 20272459  T
Q  347 caggaactttaaccatctgcaatatcaaaaatccatcctcctttgtactggtggttttatggttgaccctttaacactgaaaaggtgtcctcctgacaca 446  Q
    | |||||||||| | |||| | | ||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||||  ||||| ||||||||| |||| |||||    
T  20272458 ctggaactttaatcgtctgtagtttcaaaatcccatcttcctttgtacttgtggttttattgtggaccctttcgcactgcaaaggtgtcttcctaacaca 20272359  T
Q  447 cccaccagtccaattgtttctattccattcttgtatcgacttgggttcaaattctttcaaacaggtgcaaaatggtgaacttagtgaactacagcttgca 546  Q
    |||||||| ||| |||||| | ||||||||  ||||    || ||||||||| |||||| |||| |||| | ||||||  |   |||||||||| |||||    
T  20272358 cccaccagaccagttgtttattttccattcacgtatatttttaggttcaaatcctttcagacagctgcatattggtgaggtcgatgaactacagattgca 20272259  T
Q  547 aataccccacatataccataaccatcacactctgaaacccgactagtccatgtaacttgcacttaattcctctcataatcc 627  Q
    ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| | || || ||||||||||| || ||||  ||| |||||| ||||    
T  20272258 aatgcgccacatataccataaacatcacactctgaatctcggcttgtccatgtaacatgaacttctttcttctcatcatcc 20272178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 130; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 148 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 20288096 - 20287674
Alignment:
Q  148 tagagcataccaggttcttcatgggctatgtgaacatatagatcaagtcctccactctccagttgttgtatatcaattagattcctagtccaagacatac 247  Q
    |||||||||||| ||||| ||| |||||   ||||||||| |||||| |||||| | |  | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20288096 tagagcataccaagttctgcataggctacacgaacatataaatcaagccctccatttttgaattgttgtatatcaattagattcccagtccaagacatac 20287997  T
Q  248 aaccaattccagcatcatgaaaattcgcaacgcatgagcaattctacaagcataagcttctgcatatgtctggtgcaacagctacaccttctgcaaaatc 347  Q
    ||||||| |||||    ||| |||  |||| ||| ||||||||||  ||||||  |||||| ||||||||||||| ||  |||  ||||| |||||||||    
T  20287996 aaccaatcccagcggtgtgagaatatgcaatgcaagagcaattctctaagcatcggcttctacatatgtctggtgtaagtgctgaaccttgtgcaaaatc 20287897  T
Q  348 aggaactttaaccatctgcaatatcaaaaatcca---tcctcctttgtactggtggttttatggttgaccctttaacactgaaaaggtgtcctcctgaca 444  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||   |||| ||||||||| ||||| ||||  |||||||||| |||||| ||| || |||| || |||    
T  20287896 aggaactttaaccatcttcaatttcaaaaatccatcttccttctttgtacttgtggtgttattattgaccctttcacactgcaaaagtatccttctaaca 20287797  T
Q  445 cacccaccagtccaattgtttctattccattcttgtatcgacttgggttcaaattctttcaaacaggtgcaaaatggtgaactt-agtgaactacagctt 543  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||| || ||| |   | ||||||||||| || |||||||  |||| | |||| ||||| | |||||||||||||    
T  20287796 cacccaccagtccagttgtgtctattccactcctgtttgttcctgggttcaaatcctctcaaacaactgcatattggt-aacttcaatgaactacagctt 20287698  T
Q  544 gcaaataccccacatataccataa 567  Q
    || ||| |||||||||||||||||    
T  20287697 gcgaatgccccacatataccataa 20287674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 125; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 155 - 627
Target Start/End: Original strand, 20169288 - 20169760
Alignment:
Q  155 taccaggttcttcatgggctatgtgaacatatagatcaagtcctccactctccagttgttgtatatcaattagattcctagtccaagacatacaaccaat 254  Q
    ||||| ||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||||| || |  | ||||||||| |||  |||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  20169288 taccaagttctccattggctacgcgaacatatagatcaagtcctcctctttgaaattgttgtatgtcacgtagattgccggtccaagacatacaaccaat 20169387  T
Q  255 tccagcatcatgaaaattcgcaacgcatgagcaattctacaagcataagcttctgcatatgtctggtgcaacagctacaccttctgcaaaatcaggaact 354  Q
     ||| |||||||| |||  |||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||  | |||||| |||||||| ||||||    
T  20169388 cccatcatcatgagaatatgcaaggcaagagcaattctccaagcataggcttctgcatatgtctgatgtaacagtcaaaccttcagcaaaatctggaact 20169487  T
Q  355 ttaaccatctgcaatatcaaaaatccatcctcctttgtactggtggttttatggttgaccctttaacactgaaaaggtgtcctcctgacacacccaccag 454  Q
    |||| ||| || | | ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| |  ||||||||||| |    
T  20169488 ttaatcatttgtagtttcaaaaacccatcttcctttgtacttgtggttttattgttgaccctttcacactgcaaaggtgtccttcgaacacacccaccgg 20169587  T
Q  455 tccaattgtttctattccattcttgtatcgacttgggttcaaattctttcaaacaggtgcaaaatggtgaacttagtgaactacagcttgcaaatacccc 554  Q
    |||| || | | ||||||||| || |||     ||||||||||  || |||||||| | ||   |||||| || | |||| |||| ||||||||| ||||    
T  20169588 tccagttatgtatattccattgttctatgtttctgggttcaaaccctctcaaacagctacatgttggtgagctcaatgaattacaacttgcaaatgcccc 20169687  T
Q  555 acatataccataaccatcacactctgaaacccgactagtccatgtaacttgcacttaattcctctcataatcc 627  Q
    |||||   | ||| ||||||||| |||  ||||||| ||||||  |||||||||||  ||| |||||| ||||    
T  20169688 acataagtcgtaaacatcacactttgattcccgacttgtccatagaacttgcacttctttcttctcatcatcc 20169760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 179 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 20230474 - 20230072
Alignment:
Q  179 gaacatatagatcaagtcctccactctccagttgttgtatatcaattagattcctagtccaagacatacaaccaattccagcatcatgaaaattcgcaac 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |  | ||||||||| |||| |||||| |  |||||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||| ||||||    
T  20230474 gaacatataggtcaagtcctccactttggaattgttgtatgtcaagtagattgccggtccaagacatacagccaatcccatcatcatgagaatacgcaac 20230375  T
Q  279 gcatgagcaattctacaagcataagcttctgcatatgtctggtgcaacagctacaccttctgcaaaatcaggaactttaaccatctgcaatatcaaaaat 378  Q
     || |||||||||| ||| |||||| |||||||| |||| ||||   |  ||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| | | |||||||     
T  20230374 acaagagcaattctccaaacataagattctgcatctgtcaggtgtcccttctaaaccttcagcaaaatctggaactttaaccatctgtagtttcaaaaac 20230275  T
Q  379 ccatcctcctttgtactggtggttttatggttgaccctttaacactgaaaaggtgtcctcctgacacacccaccagtccaattgtttctattccattctt 478  Q
    || || |||||| |||  |||||||||| |  || ||||| |||||| || ||| ||| ||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |    
T  20230274 ccgtcttcctttctacctgtggttttattgccgatccttttacactgcaatggtttccgcctaacacacccgccagtccagttgtttctattccattcct 20230175  T
Q  479 gtatcgacttgggttcaaattctttcaaacaggtgcaaaatggtgaacttagtgaactacagcttgcaaataccccacatataccataaccatcacactc 578  Q
    ||||   |   || |||||  ||||||||||| |||||| ||| |  || | |||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  20230174 gtatgttcaccggatcaaaccctttcaaacagctgcaaattggcgtgctcaatgaattacagcttgtaaatgccccacatagaccataaacatcacactc 20230075  T
Q  579 tga 581  Q
    |||    
T  20230074 tga 20230072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 102; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 179 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 20242424 - 20242023
Alignment:
Q  179 gaacatatagatcaagtcctccactctccagttgttgtatatcaattagattcctagtccaagacatacaaccaattccagcatcatgaaaattcgcaac 278  Q
    |||||||||| |||||||||||| | || | ||||| ||| |||| |||||| |  |||||||||||||| |||||  || ||| |||| ||| ||||||    
T  20242424 gaacatataggtcaagtcctccaatttcgaattgttctatgtcaagtagattgccggtccaagacatacagccaatcacatcatgatgagaatacgcaac 20242325  T
Q  279 gcatgagcaattctacaagcataagcttctgcatatgtctggtgcaacagctacaccttctgcaaaatcaggaactttaaccatctgcaatatcaaaaat 378  Q
     || ||||||||||  || |||||| |||||||| |||| |||| ||| |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| | | ||| |||     
T  20242324 acaagagcaattctctaaacataagattctgcatgtgtcaggtgtaactgctaaaccttcagcaaaatctggaactttaaccatctgtagtttcagaaac 20242225  T
Q  379 ccatcctcctttgtactggtggttttatggttgaccctttaacactgaaaaggtgtcctcctgacacacccaccagtccaattgtttctattccattctt 478  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||||| | ||||||||| |||| | |||||| ||  ||| |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||      
T  20242224 ccatcttcctttctacttgtggttttattggtgacccttttacacagcaaaggtctctgcctaacacacccgccagtccagttgtttctactccattcac 20242125  T
Q  479 gtatcgacttgggttcaaattctttcaaacaggtgcaaaatggtgaacttagtgaactacagcttgcaaataccccacatataccataaccatcacactc 578  Q
    |  |     ||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||| || | |||| ||||||||| |||  | ||||||| ||||||| ||||||| ||    
T  20242124 gagtatttctgggttcaaatcctttcaaacaactgcaaactggtgagctcaatgaattacagcttgtaaaatctccacatagaccataaacatcacattc 20242025  T
Q  579 tg 580  Q
    ||    
T  20242024 tg 20242023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 100; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 152 - 610
Target Start/End: Original strand, 20063759 - 20064202
Alignment:
Q  152 gcataccaggttcttcatgggctatgtgaacatatagatcaagtcctccactctccagttgttgtatatcaattagattcctagtccaagacatacaacc 251  Q
    |||||||| | ||| ||||||||| | ||| ||||||||||||||||||  | |  ||||||||||| |||| ||  |||| |||||||| |||||||||    
T  20063759 gcataccaagctctgcatgggctacgcgaaaatatagatcaagtcctcccatttggagttgttgtatgtcaagtaagttcccagtccaagtcatacaacc 20063858  T
Q  252 aattccagcatcatgaaaattcgcaacgcatgagcaattctacaagcataagcttctgcatatgtctggtgcaacagctacaccttctgcaaaatcagga 351  Q
    ||| |||||||| | | | | ||||  ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||   ||||||  ||   |||||||||||||    
T  20063859 aatcccagcatcgttagagtacgcagtgcaagagcaattctccaagcataaccttctgcatatgtccggtgtctcagctattccacttgcaaaatcagga 20063958  T
Q  352 actttaaccatctgcaatatcaaaaatccatcctcctttgtactggtggttttatggttgaccctttaacactgaaaaggtgtcctcctgacacacccac 451  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| ||||| || ||||||||       || ||        ||| ||| |  || | ||||||||| ||||||||||    
T  20063959 actttaaccatcttcaatttcaaaaacccatcttcttttgtact-------ttttg--------tttcacatttcaatgatgtcctcctaacacacccac 20064043  T
Q  452 cagtccaattgtttctattccattcttgtatcgacttgggttcaaattctttcaaacaggtgcaaaatggtgaacttagtgaactacagcttgcaaatac 551  Q
    | ||||| ||||||||||||||||| |||||   | | ||||||||| ||||||||||| |||| | |||||   | | ||||||||||||||||||| |    
T  20064044 ctgtccagttgtttctattccattcctgtatgctcctaggttcaaatcctttcaaacagctgcatattggtgtgttcaatgaactacagcttgcaaatgc 20064143  T
Q  552 cccacatataccataaccatcacactctgaaacccgactagtccatgtaacttgcactt 610  Q
    ||||||| |||||||  |||||||||||||    || ||||||||||||||||||||||    
T  20064144 cccacatgtaccatatacatcacactctgattttcggctagtccatgtaacttgcactt 20064202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 86; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 181 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 20278368 - 20277971
Alignment:
Q  181 acatatagatcaagtcctccactctccagttgttgtatatcaattagattcctagtccaagacatacaaccaattccagcatcatgaaaattcgcaacgc 280  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| ||| ||||  ||||| |||||||| |||||  | | ||||||  |||  |||| ||    
T  20278368 acatatagatcaagtcctccactttcgagttgttgtatgtcaagtagtttccctgtccacgacatacagccaatcacggaatcatgggaatatgcaaggc 20278269  T
Q  281 atgagcaattctacaagcataagcttctgcatatgtctggtgcaacagctacaccttctgcaaaatcaggaactttaaccatctgcaatatcaaaaatcc 380  Q
    | || ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| | |||| |||||| | || ||||| ||| |||| ||| |||||||  |    
T  20278268 aagaacaattctccaagcataggcttctgcaaatgtctggtgtaacagctaaagcttcagcaaaagctggtactttcaccgtctgtaatttcaaaaacgc 20278169  T
Q  381 atcctcctttgtactggtggttttatggttgaccctttaacactgaaaaggtgtcctcctgacacacccaccagtccaattgtttctattccattcttgt 480  Q
    ||| |||||| | |  |||||||||| |||  ||||   |||||| ||||  || ||||| ||||||||||| ||||| || | || |||||||||||||    
T  20278168 atcttcctttctccgtgtggttttattgttatccctactacactgcaaagtggttctcctaacacacccaccggtccagttatgtccattccattcttgt 20278069  T
Q  481 atcgacttgggttcaaattctttcaaacaggtgcaaaatggtgaacttagtgaactacagcttgcaaataccccacatataccataaccatcacactc 578  Q
    ||     | ||||||||| || ||| |||| | || | ||||||    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  20278068 atgtttctaggttcaaatcctctcagacagatacatattggtgagaacaatgaactacagcttgcaaatgccccacatataccgtaaacatcacactc 20277971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 80; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 273 - 404
Target Start/End: Original strand, 20090414 - 20090545
Alignment:
Q  273 cgcaacgcatgagcaattctacaagcataagcttctgcatatgtctggtgcaacagctacaccttctgcaaaatcaggaactttaaccatctgcaatatc 372  Q
    ||||||||| |||||||| | ||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||    
T  20090414 cgcaacgcaggagcaattatgcaaacataagctgctgcatatttctggtgcaacagctacaccttctgcaaaatctggaactttaaccatcttcaatttc 20090513  T
Q  373 aaaaatccatcctcctttgtactggtggtttt 404  Q
    ||||| ||||| ||||||||| | ||||||||    
T  20090514 aaaaacccatcttcctttgtatttgtggtttt 20090545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 67; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 183 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 20263038 - 20262856
Alignment:
Q  183 atatagatcaagtcctccactctccagttgttgtatatcaattagattcctagtccaagacatacaaccaattccagcatcatgaaaattcgcaacgcat 282  Q
    |||||| |||||||||||||| |  | ||||||||| |||| |||||| |  |||||||||||||| |||||  || ||| |||| ||| |||||| ||     
T  20263038 atataggtcaagtcctccactttggaattgttgtatgtcaagtagatttcgggtccaagacatacagccaatcacatcatgatgagaatacgcaacacaa 20262939  T
Q  283 gagcaattctacaagcataagcttctgcatatgtctggtgcaacagctacaccttctgcaaaatcaggaactttaaccatctg 365  Q
    |||||||||| ||| |||||| || ||||| |||| |||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  20262938 gagcaattctccaaacataagattttgcatttgtcaggtgcaactgctaaaccttcagcaaaatctggaactttaaccatctg 20262856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 63; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 151 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 20282977 - 20282546
Alignment:
Q  151 agcataccaggttcttcatgggctatgtgaacatatagatcaagtcctccactctccagttgttgtatatcaattagattcctagtccaagacatacaac 250  Q
    ||||||||| ||||| |||  ||| || | ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||| ||| ||||  ||||| |||||||| |    
T  20282977 agcataccaagttctgcatacgctgtgcggacatatagatcaagtcctccactttggagttgttgtatgtcaagtagtttccctgtccacgacatacagc 20282878  T
Q  251 caattccagcatcatgaaaattcgcaacgcatgagcaattctacaagcataagcttctgcatatgtctggtgcaacagctacaccttctgcaaaatcagg 350  Q
    ||||  | | ||||||  |||  |||| ||| || ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| | |||| |||||| | ||    
T  20282877 caatcacggaatcatgggaatatgcaaggcaagaacaattctccaagcataggcttctgcaaatgtctggtgtaacagctaaagcttcagcaaaagccgg 20282778  T
Q  351 aactttaaccatctgcaatatcaaaaatccatcctcctttgtactg-gtggttttatggttgaccctttaacactgaaaaggtgtcctcctgacacaccc 449  Q
     ||||| |||||||| | | | |||||  |||  |||||| | ||| |||||||||| |||  || |   |||||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  20282777 tactttcaccatctgtagtttgaaaaa-gcatattcctttct-ctgtgtggttttattgttagccttgccacactgcaaaggggttctcctaacacaccc 20282680  T
Q  450 accagtccaattgtttctattccattcttgtatcgacttgggttcaaattctttcaaac--aggtgcaaaatggtgaacttagtgaactacagcttgcaa 547  Q
    ||| ||||| || | | ||||||||||||||||     | ||||||||| || ||| ||  || | || | ||||||    | |||| ||||||||||||    
T  20282679 accggtccagttatgtatattccattcttgtatgtttctaggttcaaatcctctcagacagagatacatattggtgagaccaatgaattacagcttgcaa 20282580  T
Q  548 ataccccacatataccataaccatcacactctga 581  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20282579 atgccccacatataccataagcatcacactctga 20282546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 1130 - 1259
Target Start/End: Complemental strand, 19936770 - 19936641
Alignment:
Q  1130 ccaccaaattccaacatagcgatttgtagagtttataggactaaagcatccaaaggtgaagttaccatcttttgagattagagtttcagggtccttgatg 1229  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||  |||||||||  | || |||||||||||||||   || ||| ||||||||||||||||||||||     
T  19936770 ccaccaaattccaacataacgattcgtagaattttcaggactaaaaaagcctaaggtgaagttaccactcttggagcttagagtttcagggtccttgata 19936671  T
Q  1230 aattgggaagatgttatagtgtctatggca 1259  Q
    || || |  ||||| || ||||||||||||    
T  19936670 aactgagttgatgtaatggtgtctatggca 19936641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 1130 - 1259
Target Start/End: Complemental strand, 19967909 - 19967780
Alignment:
Q  1130 ccaccaaattccaacatagcgatttgtagagtttataggactaaagcatccaaaggtgaagttaccatcttttgagattagagtttcagggtccttgatg 1229  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||  |||||||||  | || |||||||||||||||   || ||| ||||||||||||||||||||||     
T  19967909 ccaccaaattccaacataacgattcgtagaattttcaggactaaaaaagcctaaggtgaagttaccactcttggagcttagagtttcagggtccttgata 19967810  T
Q  1230 aattgggaagatgttatagtgtctatggca 1259  Q
    || || |  ||||| || ||||||||||||    
T  19967809 aactgagttgatgtaatggtgtctatggca 19967780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 20300727 - 20300665
Alignment:
Q  18 tatcactgctattgtaatgatgattgttttatttctccctctatcctgtatatagggaaaattt 81  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  20300727 tatcacttctattgtaatgatgattgttttgtttctccctctat-ctgtaaatagggaaaattt 20300665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 666 - 722
Target Start/End: Original strand, 20064290 - 20064346
Alignment:
Q  666 taaaatatacatttatattcccttctctatcatttccaccttgaaaaccgtaaaaat 722  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  20064290 taaaatatatattaatattcccttctccatcatctccaccttggaaaccgttaaaat 20064346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 213 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 19937805 - 19937726
Alignment:
Q  213 ttgtatatcaattagattcctagtccaagacatacaaccaattccagcatcatgaaaattcgcaacgcatgagcaattct 292  Q
    |||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| | |||  ||||| || ||||||||||    
T  19937805 ttgtatgtcaactaggttcccagtccaagacatacaaccaatgtcagcatcataagaatatgcaacacaagagcaattct 19937726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 213 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 19968944 - 19968865
Alignment:
Q  213 ttgtatatcaattagattcctagtccaagacatacaaccaattccagcatcatgaaaattcgcaacgcatgagcaattct 292  Q
    |||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| | |||  ||||| || ||||||||||    
T  19968944 ttgtatgtcaactaggttcccagtccaagacatacaaccaatgtcagcatcataagaatatgcaacacaagagcaattct 19968865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 666 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 20302116 - 20301968
Alignment:
Q  666 taaaatatacatttatattcccttctctatcatttccaccttgaaaaccgtaaaaatgtgcatttgttgtagtcagtattcctgtaaaacctccaccatt 765  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||| | ||||| |||| ||||  ||||   ||| ||||||||  | || |||||    
T  20302116 taaaatatatatttatattcccttgtccgtcatctccaccttgaaaaccattaaaatatgcagttgtcatagtatctatccctgtaaagaccccgccatt 20302017  T
Q  766 ccaggg--------gccagtacggccgagtttcattcaaaataaacact 806  Q
    ||||||        ||||||| || |||||||||||| |||||||||||    
T  20302016 ccagggaccgctgcgccagtatggtcgagtttcattccaaataaacact 20301968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 254
Target Start/End: Original strand, 20006627 - 20006697
Alignment:
Q  184 tatagatcaagtcctccactctccagttgttgtatatcaattagattcctagtccaagacatacaaccaat 254  Q
    |||||||||  ||||||| | || | |||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  20006627 tatagatcagttcctccagtttcgaattgttgaatatcgattagatttctattccaagacatacaaccaat 20006697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 429 - 475
Target Start/End: Original strand, 47602086 - 47602132
Alignment:
Q  429 aggtgtcctcctgacacacccaccagtccaattgtttctattccatt 475  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  47602086 aggtgtcctcctaacacacccaccagtccatttttgtctattccatt 47602132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 151; Significance: 3e-79; HSPs: 5)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 887 - 1318
Target Start/End: Original strand, 40821220 - 40821637
Alignment:
Q  887 aggttgctgaatactctcccataacatatttctagttgtgctctccaaaaggacaaggttaccaaagtctgaaaattgaaaacttgtaattgttgctatg 986  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| | | |||||||    
T  40821220 aggttgctgaatactctaccataaaatgtttccagttgtactctccaaaaggacaaggttaccaaagtttgaaaactgagaacttgtattggatgctatg 40821319  T
Q  987 ttgaaaacatttgatgaccaaatgacttgtttctatccatttaataccacaagatttccattttcagatattgtgacaatcccattagaatcattcagtg 1086  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  40821320 ttggaaacatttgatgtccaaatgacttgtttatgtccattcaataccacaagatttccatcttcagatattgtgacagtcccattagaatcgttcagtg 40821419  T
Q  1087 attggttt-ttcttagccacccatacgactgtagtgcgagacttccaccaaattccaacatagcgatttgtagagtttataggactaaagcatccaaagg 1185  Q
     ||||||| |  || |||||||||| || |||||   ||||||| |||||||||||||               | ||| |||| |||||| |||||||||    
T  40821420 gttggtttctgttttgccacccatatgattgtaggctgagacttgcaccaaattccaa---------------aatttttagggctaaagaatccaaagg 40821504  T
Q  1186 tgaagttaccatcttttgagattagagtttcagggtccttgatgaattgggaagatgttatagtgtctatggcaatactcatgtgtaacaaattgcaaaa 1285  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||| | ||||| ||||| ||  ||  |||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  40821505 tgaagttaccatctttggagataagagtttcagtgtcctttatgtactgggatgatgtgatgttggttatggcaatactaacttgtaacaaagtgcaaaa 40821604  T
Q  1286 cagaatggataaaacagaaaacagatttgaaca 1318  Q
    || |||| | | |||||| | || |||||||||    
T  40821605 caaaatgaacagaacagagagcatatttgaaca 40821637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 995 - 1314
Target Start/End: Original strand, 40825998 - 40826317
Alignment:
Q  995 atttgatgaccaaatgacttgtttctatccatttaataccacaagatttccattttcagatattgtgacaatcccattagaatcattcagtgattggttt 1094  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||| ||||||| ||||  |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40825998 atttgatgaccaaatgacttgtttttgtccattcaataccgcaagattgccatcctcagatatagtaataatcccattagaatcattcagtgatcggttt 40826097  T
Q  1095 ttcttagccacccatacgactgtagtgcgagacttccaccaaattccaacatagcgatttgtagagtttataggactaaagcatccaaaggtgaagttac 1194  Q
     | || |||||||||| || |||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||| |||||| |||| |||||||||||||    
T  40826098 ctgtttgccacccatatgattgtagactgagacttccaccaaattccaacgtagcgatttgtagaattcttagggctaaagaatcccaaggtgaagttac 40826197  T
Q  1195 catcttttgagattagagtttcagggtccttgatgaattgggaagatgttatagtgtctatggcaatactcatgtgtaacaaattgcaaaacagaatgga 1294  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| |||||||| |  ||||   ||| |||| |||||||  |    
T  40826198 catctttggagagtagagtttcagggtccttgatgaattgagatgatgtgatggtgtctattgcaatactaaattgtagggaatagcaacacagaataaa 40826297  T
Q  1295 taaaacagaaaacagatttg 1314  Q
     ||||||||||||| |||||    
T  40826298 caaaacagaaaacaaatttg 40826317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 179 - 577
Target Start/End: Original strand, 40820408 - 40820806
Alignment:
Q  179 gaacatatagatcaagtcctccactctccagttgttgtatatcaattagattcctagtccaagacatacaaccaattccagcatcatgaaaattcgcaac 278  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |  ||||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||| ||||||    
T  40820408 gaacatatagatcgagtcctccactttggagttgatgtatgtcaagtagattcccagtccaagacatacagccaatcccagaatcatgagaatacgcaac 40820507  T
Q  279 gcatgagcaattctacaagcataagcttctgcatatgtctggtgcaacagctacaccttctgcaaaatcaggaactttaaccatctgcaatatcaaaaat 378  Q
    ||| |||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || | ||||| ||||   |||||| |||||||     
T  40820508 gcaggagcaattgtgcagacataagcttctgcatatgtctggtgtaacagctacaccttctgcaaattctgaaacttcaaccgcatgcaatttcaaaaac 40820607  T
Q  379 ccatcctcctttgtactggtggttttatggttgaccctttaacactgaaaaggtgtcctcctgacacacccaccagtccaattgtttctattccattctt 478  Q
    ||||  ||||||||||| |||||||||| | ||| ||||| |||||  |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| | | || |||||||||    
T  40820608 ccattttcctttgtactcgtggttttattgctgatcctttcacactccaaaggtgtcctcctaacacaccgacccgtccaattatgtatactccattctt 40820707  T
Q  479 gtatcgacttgggttcaaattctttcaaacaggtgcaaaatggtgaacttagtgaactacagcttgcaaataccccacatataccataaccatcacact 577  Q
     |||     ||||| ||||| || | |||||| | || | ||| || || | | ||||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||    
T  40820708 ctatgtttctgggtacaaatcctctaaaacagctacatattggcgagctcaataaactacagcttgcaaatgctgcacatataccataaacatcacact 40820806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 115; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 147 - 567
Target Start/End: Original strand, 40825043 - 40825464
Alignment:
Q  147 ctagagcataccaggttcttcatgggctatgtgaacatatagatcaagtcctccactctccagtt-gttgtatatcaattagattcctagtccaagacat 245  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| |||||   ||||||||||||||||||||||| | |  | || ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  40825043 ctagagcataccaagttctgcataggctacacgaacatatagatcaagtcctccattttagaatttgttgtatatcaattagattgccagtccaagacat 40825142  T
Q  246 acaaccaattccagcatcatgaaaattcgcaacgcatgagcaattctacaagcataagcttctgcatatgtctggtgcaacagctacaccttctgcaaaa 345  Q
    ||||||||| ||||     ||| |||  |||| ||| ||||||||||  | ||||  |||| | ||||||||||||| ||| |||  || || |||||||    
T  40825143 acaaccaatcccagtggtgtgagaatatgcaatgcaagagcaattctctatgcattggcttttacatatgtctggtgtaactgctgaactttgtgcaaaa 40825242  T
Q  346 tcaggaactttaaccatctgcaatatcaaaaatccatcctcctttgtactggtggttttatggttgaccctttaacactgaaaaggtgtcctcctgacac 445  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||  |||||| ||| |||||| ||| ||||||| || ||||    
T  40825243 tcaggaactttaaccatctgcaatttcaaaaacccatcttcctttgtacttgttgtcttattattgaccttttcacactgcaaaagtgtccttctaacac 40825342  T
Q  446 acccaccagtccaattgtttctattccattcttgtatcgacttgggttcaaattctttcaaacaggtgcaaaatggtgaactt-agtgaactacagcttg 544  Q
    ||||||| ||||| |||| ||||||||| || ||| |   | ||||||||||| || |||||||  |||| |  ||| ||||| | ||||||||||||||    
T  40825343 acccacctgtccagttgtgtctattccactcctgtttgttcctgggttcaaatcctctcaaacaactgcatatcggt-aacttcaatgaactacagcttg 40825441  T
Q  545 caaataccccacatataccataa 567  Q
     |||| |||||||||||||||||    
T  40825442 aaaatgccccacatataccataa 40825464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 110; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 1325 - 1458
Target Start/End: Original strand, 55216247 - 55216380
Alignment:
Q  1325 gcccttcctcaccggaacagcccgagcaaacaaagcaacgctccactgcaggggagattcttctttctggagccaaagggctagcgcttcgagttcaggt 1424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  55216247 gcccttcctcaccggaacagcccgagcaaacaaagcaacgttccgctgcaggggagactcttctttctggagccaaagggctagcacttcgagttcaggt 55216346  T
Q  1425 gcgacttcgtgattaaaggaaactggcgatctat 1458  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  55216347 gcgacttcgtgattaaaggaaactcgagatctat 55216380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 36; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 980 - 1215
Target Start/End: Original strand, 135267 - 135502
Alignment:
Q  980 tgctatgttgaaaacatttgatgaccaaatgacttgtttctatccatttaataccacaagatttccattttcagatattgtgacaatcccattagaatca 1079  Q
    |||||||||  ||| ||||||||||| ||||  | | |||| |||| ||| ||||| || |||||||| |||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  135267 tgctatgttcgaaatatttgatgacccaatgcttcgcttctgtccaattattaccataatatttccatcttcaaatattgtgacaatctcattcgaatca 135366  T
Q  1080 ttcagtgattggtttttcttagccacccatacgactgtagtgcgagacttccaccaaattccaacatagcgatttgtagagtttataggactaaagcatc 1179  Q
    |  | || ||| ||| | ||  |||| |||| || |||||    ||||||||  ||| ||||||  ||||||||||||||  || ||   ||| || |||    
T  135367 tcaaatggttgatttatgttttccactcatatgattgtagaataagacttccgtcaagttccaatgtagcgatttgtagatcttttaaagctagagaatc 135466  T
Q  1180 caaaggtgaagttaccatcttttgagattagagttt 1215  Q
    ||||| || | ||||||||||| |||||||||||||    
T  135467 caaagttggatttaccatctttcgagattagagttt 135502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University