View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF16233_low_12 (Length: 269)

Name: NF16233_low_12
Description: NF16233
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF16233_low_12
NF16233_low_12
[»] chr5 (81 HSPs)
chr5 (1-269)||(22759026-22759300)
chr5 (22-264)||(16256276-16256518)
chr5 (22-225)||(16259909-16260112)
chr5 (22-225)||(22593628-22593831)
chr5 (22-225)||(22597183-22597386)
chr5 (22-225)||(22590073-22590276)
chr5 (74-252)||(29325562-29325740)
chr5 (74-254)||(26495487-26495667)
chr5 (36-258)||(43120765-43120985)
chr5 (36-258)||(43124298-43124518)
chr5 (60-228)||(22469776-22469945)
chr5 (39-212)||(26361399-26361574)
chr5 (31-265)||(26495405-26495640)
chr5 (60-267)||(27869721-27869926)
chr5 (60-175)||(16259881-16259996)
chr5 (60-175)||(22590045-22590160)
chr5 (60-175)||(22593600-22593715)
chr5 (60-175)||(22597155-22597270)
chr5 (31-265)||(29325587-29325822)
chr5 (60-252)||(22758964-22759156)
chr5 (31-226)||(23671450-23671644)
chr5 (49-254)||(22357911-22358118)
chr5 (81-258)||(27869692-27869867)
chr5 (61-175)||(8953034-8953148)
chr5 (41-216)||(24277605-24277782)
chr5 (41-216)||(24384431-24384608)
chr5 (152-265)||(23671493-23671605)
chr5 (59-215)||(23693107-23693262)
chr5 (152-265)||(23693122-23693234)
chr5 (140-267)||(16256312-16256439)
chr5 (114-265)||(23671493-23671644)
chr5 (60-180)||(26495553-26495672)
chr5 (61-180)||(16256243-16256361)
chr5 (140-269)||(22469817-22469947)
chr5 (39-137)||(4397416-4397514)
chr5 (140-264)||(16259909-16260033)
chr5 (140-269)||(43120830-43120957)
chr5 (140-269)||(43124363-43124490)
chr5 (139-267)||(22469776-22469905)
chr5 (101-238)||(23693109-23693246)
chr5 (140-264)||(22593628-22593752)
chr5 (140-264)||(22597183-22597307)
chr5 (140-269)||(27869758-27869885)
chr5 (179-265)||(23693109-23693195)
chr5 (140-264)||(22590073-22590197)
chr5 (139-255)||(24277646-24277763)
chr5 (139-255)||(24384450-24384567)
chr5 (138-266)||(26361423-26361554)
chr5 (139-267)||(16259945-16260074)
chr5 (153-269)||(22357935-22358051)
chr5 (191-265)||(23671492-23671566)
chr5 (152-243)||(26361407-26361499)
chr5 (122-214)||(26706362-26706458)
chr5 (122-214)||(26976096-26976192)
chr5 (81-214)||(21559424-21559562)
chr5 (139-267)||(22593664-22593793)
chr5 (139-267)||(22597219-22597348)
chr5 (138-219)||(4397436-4397518)
chr5 (139-267)||(22590109-22590238)
chr5 (100-252)||(17022880-17023038)
chr5 (157-235)||(21559443-21559523)
chr5 (61-141)||(22357907-22357986)
chr5 (122-215)||(7785124-7785219)
chr5 (140-215)||(8953034-8953108)
chr5 (191-265)||(23693082-23693156)
chr5 (178-219)||(22469949-22469990)
chr5 (152-255)||(22469963-22470069)
chr5 (61-136)||(21981017-21981094)
chr5 (140-219)||(8953069-8953148)
chr5 (156-212)||(10035178-10035234)
chr5 (153-213)||(10035215-10035274)
chr5 (157-213)||(21494999-21495055)
chr5 (157-258)||(21559460-21559564)
chr5 (122-216)||(7785163-7785261)
chr5 (1-34)||(22759339-22759372)
chr5 (60-141)||(23693186-23693266)
chr5 (179-258)||(4397438-4397518)
chr5 (156-212)||(15194090-15194146)
chr5 (157-235)||(21981036-21981116)
chr5 (218-258)||(22469950-22469990)
chr5 (61-141)||(29325556-29325634)
[»] chr7 (122 HSPs)
chr7 (1-264)||(38827732-38828002)
chr7 (60-266)||(13395806-13396014)
chr7 (39-269)||(48784825-48785055)
chr7 (60-254)||(16006007-16006199)
chr7 (43-267)||(21743649-21743873)
chr7 (74-256)||(8775925-8776107)
chr7 (61-258)||(13849878-13850074)
chr7 (74-225)||(16005941-16006093)
chr7 (49-264)||(14189305-14189520)
chr7 (39-218)||(13733838-13734017)
chr7 (61-266)||(48784887-48785091)
chr7 (41-267)||(13849946-13850173)
chr7 (60-256)||(48784925-48785120)
chr7 (41-264)||(16573070-16573293)
chr7 (41-264)||(16592369-16592592)
chr7 (74-225)||(4993111-4993263)
chr7 (61-219)||(21743619-21743776)
chr7 (36-258)||(124483-124704)
chr7 (60-254)||(17506100-17506295)
chr7 (60-254)||(17546919-17547114)
chr7 (49-254)||(14192072-14192275)
chr7 (140-269)||(124511-124639)
chr7 (61-256)||(13395777-13395973)
chr7 (115-252)||(21065462-21065600)
chr7 (36-265)||(8775848-8776078)
chr7 (60-215)||(8775991-8776144)
chr7 (152-269)||(13395842-13395960)
chr7 (139-269)||(17506164-17506295)
chr7 (139-269)||(17546919-17547050)
chr7 (60-238)||(13255429-13255609)
chr7 (100-269)||(13255628-13255795)
chr7 (76-260)||(13255644-13255825)
chr7 (39-176)||(35365917-35366053)
chr7 (61-221)||(13255668-13255825)
chr7 (101-264)||(14192100-14192263)
chr7 (61-176)||(38827916-38828031)
chr7 (140-269)||(14189339-14189468)
chr7 (31-264)||(16005859-16006093)
chr7 (62-176)||(48743284-48743398)
chr7 (74-175)||(4993190-4993291)
chr7 (31-264)||(4993029-4993263)
chr7 (83-176)||(709609-709702)
chr7 (152-269)||(14192134-14192250)
chr7 (60-168)||(47976002-47976109)
chr7 (61-264)||(13849910-13850113)
chr7 (94-215)||(40555756-40555882)
chr7 (138-266)||(13733868-13733997)
chr7 (114-225)||(16458920-16459031)
chr7 (101-212)||(11660764-11660874)
chr7 (54-180)||(16573202-16573326)
chr7 (54-180)||(16592336-16592460)
chr7 (152-258)||(48743296-48743401)
chr7 (161-258)||(709606-709702)
chr7 (150-219)||(709710-709779)
chr7 (49-219)||(48743232-48743401)
chr7 (60-252)||(11660763-11660956)
chr7 (61-172)||(16458947-16459056)
chr7 (74-258)||(21743619-21743803)
chr7 (152-265)||(124553-124666)
chr7 (139-243)||(13255429-13255533)
chr7 (60-141)||(17506096-17506177)
chr7 (60-141)||(17547037-17547118)
chr7 (60-179)||(13255705-13255823)
chr7 (139-264)||(48743243-48743369)
chr7 (157-258)||(15725455-15725557)
chr7 (60-137)||(711021-711097)
chr7 (152-257)||(13733838-13733942)
chr7 (60-175)||(14189278-14189392)
chr7 (122-216)||(12202048-12202146)
chr7 (192-265)||(16006098-16006172)
chr7 (81-216)||(7507496-7507636)
chr7 (81-216)||(7507619-7507759)
chr7 (160-216)||(8757395-8757452)
chr7 (179-264)||(35365939-35366024)
chr7 (100-243)||(21519278-21519424)
chr7 (154-269)||(13255604-13255718)
chr7 (101-186)||(711010-711096)
chr7 (179-269)||(11660764-11660853)
chr7 (81-216)||(4324975-4325115)
chr7 (160-216)||(22122759-22122816)
chr7 (160-216)||(40555960-40556017)
chr7 (60-175)||(16458906-16459021)
chr7 (60-107)||(13407739-13407786)
chr7 (122-216)||(12208662-12208760)
chr7 (100-255)||(15689865-15690025)
chr7 (100-255)||(15697458-15697618)
chr7 (61-141)||(40555752-40555834)
chr7 (60-137)||(13395779-13395855)
chr7 (60-141)||(14192068-14192147)
chr7 (81-176)||(15731803-15731902)
chr7 (157-235)||(40555776-40555856)
chr7 (192-258)||(709710-709777)
chr7 (158-258)||(15731800-15731903)
chr7 (139-216)||(711020-711097)
chr7 (122-216)||(7529109-7529207)
chr7 (122-255)||(12202048-12202186)
chr7 (100-252)||(16668543-16668699)
chr7 (100-252)||(17642913-17643069)
chr7 (61-135)||(21065462-21065536)
chr7 (122-216)||(39995810-39995908)
chr7 (61-216)||(40555837-40555998)
chr7 (142-176)||(47975967-47976001)
chr7 (81-255)||(7507496-7507677)
chr7 (157-255)||(8757395-8757496)
chr7 (160-213)||(41783099-41783152)
chr7 (63-107)||(13865424-13865468)
chr7 (61-141)||(16006125-16006203)
chr7 (140-216)||(4324913-4324992)
chr7 (157-219)||(7507698-7507761)
chr7 (178-213)||(14038579-14038614)
chr7 (178-213)||(14348609-14348644)
chr7 (157-219)||(15731800-15731863)
chr7 (60-107)||(21735541-21735588)
chr7 (61-216)||(22122636-22122797)
chr7 (178-212)||(17065655-17065689)
chr7 (152-222)||(47976026-47976095)
chr7 (157-255)||(7507619-7507720)
chr7 (1-34)||(38827672-38827705)
chr7 (201-264)||(709638-709702)
chr7 (82-137)||(8757396-8757452)
chr7 (61-93)||(12757143-12757175)
chr7 (218-262)||(21519379-21519423)
[»] chr4 (125 HSPs)
chr4 (60-269)||(33848480-33848688)
chr4 (25-219)||(10313330-10313523)
chr4 (43-267)||(14698249-14698473)
chr4 (43-267)||(4170557-4170781)
chr4 (39-258)||(16359093-16359313)
chr4 (31-255)||(6511365-6511589)
chr4 (61-258)||(14942621-14942817)
chr4 (74-254)||(15989930-15990111)
chr4 (39-219)||(28382453-28382633)
chr4 (74-226)||(41791273-41791426)
chr4 (39-218)||(15280394-15280573)
chr4 (60-269)||(16278445-16278654)
chr4 (60-209)||(9388387-9388534)
chr4 (60-269)||(16278561-16278772)
chr4 (74-264)||(56116095-56116286)
chr4 (60-215)||(33848559-33848712)
chr4 (76-269)||(56115971-56116166)
chr4 (61-215)||(16278421-16278573)
chr4 (61-269)||(16278522-16278731)
chr4 (74-258)||(15242415-15242599)
chr4 (61-219)||(4170654-4170811)
chr4 (61-217)||(14698346-14698501)
chr4 (36-258)||(55503039-55503260)
chr4 (41-267)||(27027527-27027760)
chr4 (152-266)||(16359168-16359282)
chr4 (138-266)||(28382473-28382602)
chr4 (140-269)||(55503067-55503195)
chr4 (39-217)||(286718-286897)
chr4 (140-269)||(6511435-6511564)
chr4 (61-258)||(27027587-27027791)
chr4 (140-223)||(3336989-3337072)
chr4 (61-219)||(31117344-31117498)
chr4 (138-266)||(15280424-15280553)
chr4 (140-225)||(15448464-15448549)
chr4 (158-258)||(13881385-13881485)
chr4 (41-264)||(15242447-15242671)
chr4 (39-252)||(24047750-24047965)
chr4 (39-176)||(47127139-47127278)
chr4 (60-174)||(21190078-21190192)
chr4 (60-175)||(53388033-53388150)
chr4 (152-256)||(286793-286897)
chr4 (41-176)||(13881346-13881482)
chr4 (74-258)||(31117344-31117525)
chr4 (31-265)||(41791190-41791426)
chr4 (61-219)||(6511474-6511631)
chr4 (130-225)||(15449787-15449882)
chr4 (61-254)||(16278421-16278613)
chr4 (152-258)||(28382528-28382633)
chr4 (88-269)||(31117372-31117550)
chr4 (41-174)||(33684861-33684994)
chr4 (140-264)||(14942653-14942777)
chr4 (140-267)||(15242483-15242611)
chr4 (61-178)||(15449756-15449872)
chr4 (64-215)||(15989960-15990111)
chr4 (139-238)||(13877706-13877806)
chr4 (41-215)||(13877687-13877853)
chr4 (61-179)||(15448432-15448549)
chr4 (152-258)||(21190073-21190178)
chr4 (61-213)||(56115909-56116063)
chr4 (159-266)||(286760-286868)
chr4 (60-233)||(15989756-15989928)
chr4 (101-264)||(15989835-15990003)
chr4 (139-254)||(53388033-53388150)
chr4 (138-256)||(47127138-47127258)
chr4 (140-269)||(10313366-10313495)
chr4 (154-257)||(15280394-15280496)
chr4 (60-175)||(41791339-41791453)
chr4 (41-268)||(56116130-56116358)
chr4 (61-219)||(3336989-3337130)
chr4 (152-269)||(9388405-9388520)
chr4 (139-258)||(33684856-33684975)
chr4 (179-254)||(20899759-20899834)
chr4 (60-252)||(56115909-56116103)
chr4 (95-176)||(3337084-3337166)
chr4 (75-258)||(4170628-4170811)
chr4 (152-265)||(55503109-55503222)
chr4 (179-264)||(9388448-9388533)
chr4 (74-256)||(14698319-14698501)
chr4 (61-141)||(15990035-15990115)
chr4 (41-141)||(20899755-20899854)
chr4 (179-269)||(28382475-28382566)
chr4 (122-216)||(8710554-8710652)
chr4 (166-262)||(3336976-3337072)
chr4 (139-258)||(6511394-6511514)
chr4 (156-258)||(10313422-10313523)
chr4 (179-269)||(13877707-13877798)
chr4 (152-258)||(15989970-15990075)
chr4 (139-264)||(15989756-15989881)
chr4 (179-264)||(21190105-21190191)
chr4 (152-254)||(33848612-33848712)
chr4 (139-215)||(20899759-20899835)
chr4 (179-269)||(13881366-13881457)
chr4 (60-137)||(6511551-6511627)
chr4 (101-237)||(9388398-9388533)
chr4 (192-264)||(15448464-15448537)
chr4 (192-264)||(15449787-15449860)
chr4 (36-93)||(31131813-31131870)
chr4 (179-269)||(53388057-53388149)
chr4 (60-107)||(18221102-18221149)
chr4 (61-137)||(8710573-8710651)
chr4 (62-176)||(15448397-15448509)
chr4 (179-266)||(47127167-47127256)
chr4 (157-220)||(18079533-18079597)
chr4 (122-218)||(18079577-18079677)
chr4 (73-141)||(53388029-53388097)
chr4 (157-211)||(4616068-4616123)
chr4 (101-175)||(20899759-20899834)
chr4 (179-269)||(33684884-33684974)
chr4 (85-176)||(3336973-3337065)
chr4 (157-255)||(8710551-8710652)
chr4 (156-216)||(16371694-16371755)
chr4 (122-216)||(32489757-32489854)
chr4 (157-235)||(4616084-4616164)
chr4 (157-216)||(10704512-10704572)
chr4 (157-216)||(10918282-10918342)
chr4 (179-269)||(15989757-15989847)
chr4 (217-267)||(20899785-20899835)
chr4 (122-180)||(10704515-10704576)
chr4 (122-180)||(10918285-10918346)
chr4 (60-141)||(16278417-16278496)
chr4 (60-141)||(33848637-33848716)
chr4 (206-254)||(13877805-13877853)
chr4 (157-216)||(16371776-16371836)
chr4 (157-216)||(16371895-16371955)
chr4 (122-179)||(32489797-32489857)
[»] chr2 (85 HSPs)
chr2 (60-269)||(23339506-23339714)
chr2 (1-254)||(25035944-25036204)
chr2 (43-267)||(31503118-31503342)
chr2 (43-267)||(31505684-31505908)
chr2 (74-254)||(21239445-21239625)
chr2 (74-254)||(21241995-21242175)
chr2 (61-258)||(31503215-31503412)
chr2 (61-258)||(31505781-31505978)
chr2 (39-217)||(44620562-44620740)
chr2 (1-137)||(12628184-12628326)
chr2 (31-265)||(21239472-21239707)
chr2 (31-265)||(21242022-21242257)
chr2 (60-215)||(23339482-23339635)
chr2 (74-213)||(28348743-28348882)
chr2 (94-258)||(24274235-24274399)
chr2 (36-258)||(31755525-31755746)
chr2 (36-258)||(24504268-24504488)
chr2 (138-269)||(44620582-44620714)
chr2 (140-269)||(31755590-31755718)
chr2 (41-176)||(23374863-23374998)
chr2 (60-176)||(24274238-24274354)
chr2 (39-176)||(41685076-41685215)
chr2 (140-269)||(24504332-24504460)
chr2 (60-175)||(20591424-20591540)
chr2 (41-252)||(10040152-10040366)
chr2 (140-269)||(28348731-28348860)
chr2 (41-252)||(28348671-28348882)
chr2 (60-180)||(21239440-21239559)
chr2 (60-180)||(21241990-21242109)
chr2 (168-267)||(24274303-24274403)
chr2 (138-256)||(41685075-41685195)
chr2 (152-256)||(44620637-44620740)
chr2 (74-176)||(28352568-28352670)
chr2 (138-264)||(28348689-28348816)
chr2 (140-255)||(31518274-31518394)
chr2 (139-256)||(23374882-23374999)
chr2 (140-225)||(28352556-28352641)
chr2 (139-234)||(20591444-20591540)
chr2 (179-258)||(22109438-22109517)
chr2 (41-217)||(28352496-28352671)
chr2 (157-267)||(31518252-31518366)
chr2 (152-265)||(31755563-31755676)
chr2 (139-219)||(12628180-12628261)
chr2 (152-264)||(24274267-24274379)
chr2 (60-126)||(24275717-24275782)
chr2 (152-265)||(24504305-24504418)
chr2 (122-219)||(23085382-23085482)
chr2 (138-264)||(28352514-28352641)
chr2 (157-215)||(31518498-31518557)
chr2 (152-254)||(23339482-23339582)
chr2 (60-137)||(22109437-22109513)
chr2 (100-258)||(22840916-22841079)
chr2 (179-269)||(41685101-41685193)
chr2 (61-216)||(31518274-31518435)
chr2 (179-258)||(12628180-12628260)
chr2 (179-269)||(20591448-20591539)
chr2 (128-219)||(21903151-21903245)
chr2 (179-264)||(25036052-25036138)
chr2 (128-216)||(20353406-20353498)
chr2 (101-176)||(22109438-22109514)
chr2 (177-216)||(23148578-23148617)
chr2 (179-269)||(23374883-23374973)
chr2 (177-216)||(23560368-23560407)
chr2 (157-219)||(24160205-24160268)
chr2 (218-269)||(24274341-24274392)
chr2 (152-186)||(23148593-23148627)
chr2 (152-186)||(23560383-23560417)
chr2 (61-139)||(25035942-25036020)
chr2 (122-255)||(25651191-25651329)
chr2 (61-189)||(28348770-28348898)
chr2 (157-255)||(20353406-20353507)
chr2 (1-34)||(25040278-25040311)
chr2 (81-141)||(31518500-31518561)
chr2 (217-269)||(22109437-22109489)
chr2 (157-213)||(24528478-24528534)
chr2 (157-223)||(23085339-23085405)
chr2 (178-213)||(24682759-24682794)
chr2 (179-216)||(43708197-43708235)
chr2 (60-141)||(23339478-23339557)
chr2 (122-209)||(24160249-24160341)
chr2 (1-34)||(25036231-25036264)
chr2 (1-34)||(25040338-25040371)
chr2 (157-190)||(43708265-43708298)
chr2 (180-267)||(10040258-10040345)
chr2 (61-137)||(24274317-24274392)
[»] chr1 (82 HSPs)
chr1 (5-225)||(2333361-2333588)
chr1 (22-225)||(22900594-22900797)
chr1 (43-265)||(20586715-20586937)
chr1 (43-265)||(20579022-20579244)
chr1 (60-215)||(296177-296331)
chr1 (39-256)||(20630905-20631123)
chr1 (74-254)||(45306915-45307095)
chr1 (1-176)||(24087063-24087245)
chr1 (74-252)||(293834-294014)
chr1 (39-217)||(14432661-14432840)
chr1 (61-225)||(18823462-18823627)
chr1 (39-217)||(36181203-36181382)
chr1 (152-266)||(20630980-20631094)
chr1 (83-267)||(21181382-21181567)
chr1 (60-258)||(20901017-20901214)
chr1 (60-175)||(22900566-22900681)
chr1 (152-256)||(36181278-36181382)
chr1 (100-264)||(18823461-18823627)
chr1 (138-269)||(20630925-20631058)
chr1 (138-269)||(36181223-36181356)
chr1 (60-237)||(28312083-28312262)
chr1 (31-265)||(45306833-45307068)
chr1 (61-215)||(2333293-2333446)
chr1 (61-235)||(21181375-21181549)
chr1 (138-266)||(14432690-14432820)
chr1 (61-175)||(18823541-18823655)
chr1 (140-268)||(20586773-20586901)
chr1 (140-225)||(21181503-21181588)
chr1 (41-238)||(293762-293959)
chr1 (152-256)||(14432661-14432765)
chr1 (139-258)||(24087128-24087248)
chr1 (60-180)||(16400611-16400733)
chr1 (140-219)||(28204696-28204775)
chr1 (61-175)||(20579158-20579271)
chr1 (61-175)||(20586851-20586964)
chr1 (140-268)||(20579080-20579208)
chr1 (140-264)||(22900594-22900718)
chr1 (139-269)||(296177-296307)
chr1 (41-176)||(28204699-28204835)
chr1 (140-267)||(20901057-20901184)
chr1 (42-216)||(21181474-21181647)
chr1 (140-215)||(18270240-18270315)
chr1 (140-215)||(18274894-18274969)
chr1 (60-233)||(21181336-21181511)
chr1 (41-137)||(18270180-18270275)
chr1 (41-137)||(18274834-18274929)
chr1 (139-264)||(293781-293907)
chr1 (140-211)||(19209465-19209536)
chr1 (139-269)||(20901017-20901146)
chr1 (139-264)||(21181503-21181629)
chr1 (39-106)||(37358180-37358247)
chr1 (139-258)||(28204696-28204816)
chr1 (61-215)||(20579119-20579271)
chr1 (61-215)||(20586812-20586964)
chr1 (139-267)||(22900630-22900759)
chr1 (179-269)||(24087129-24087220)
chr1 (152-264)||(2333361-2333472)
chr1 (139-254)||(18270199-18270315)
chr1 (139-254)||(18274853-18274969)
chr1 (139-243)||(28312083-28312187)
chr1 (151-254)||(296230-296331)
chr1 (152-237)||(19209438-19209523)
chr1 (74-133)||(19209477-19209536)
chr1 (122-216)||(8683038-8683136)
chr1 (60-137)||(19209423-19209500)
chr1 (122-216)||(21528816-21528914)
chr1 (140-216)||(16400652-16400729)
chr1 (119-255)||(21528816-21528957)
chr1 (81-141)||(18270259-18270319)
chr1 (81-141)||(18274913-18274973)
chr1 (83-180)||(44823101-44823202)
chr1 (157-216)||(44823105-44823165)
chr1 (157-215)||(52983171-52983231)
chr1 (138-219)||(16400610-16400691)
chr1 (178-212)||(24959925-24959959)
chr1 (100-141)||(52983193-52983235)
chr1 (60-141)||(296256-296335)
chr1 (1-34)||(2333619-2333652)
chr1 (122-213)||(24959989-24960081)
chr1 (179-215)||(45918252-45918289)
chr1 (61-141)||(20579197-20579275)
chr1 (61-141)||(20586890-20586968)
[»] scaffold0525 (6 HSPs)
scaffold0525 (60-269)||(8681-8889)
scaffold0525 (43-267)||(11215-11440)
scaffold0525 (61-256)||(11187-11382)
scaffold0525 (61-269)||(8722-8928)
scaffold0525 (72-254)||(8771-8952)
scaffold0525 (139-269)||(11291-11423)
[»] chr8 (98 HSPs)
chr8 (60-269)||(17794970-17795178)
chr8 (31-269)||(28853495-28853732)
chr8 (1-186)||(44523193-44523385)
chr8 (22-225)||(17614493-17614696)
chr8 (39-256)||(22145694-22145913)
chr8 (60-265)||(7301399-7301603)
chr8 (74-254)||(45135245-45135425)
chr8 (63-267)||(6608618-6608822)
chr8 (39-258)||(22059686-22059905)
chr8 (74-267)||(7301475-7301668)
chr8 (60-215)||(17795049-17795202)
chr8 (74-264)||(44431543-44431734)
chr8 (61-254)||(19881845-19882038)
chr8 (61-237)||(44431648-44431825)
chr8 (61-219)||(6608588-6608745)
chr8 (60-175)||(17614609-17614724)
chr8 (61-225)||(19881766-19881930)
chr8 (36-265)||(45135272-45135502)
chr8 (60-215)||(20459874-20460028)
chr8 (60-264)||(19881725-19881930)
chr8 (61-176)||(32949583-32949697)
chr8 (152-266)||(22145723-22145838)
chr8 (140-258)||(32949583-32949700)
chr8 (140-225)||(43111949-43112034)
chr8 (41-213)||(363594-363767)
chr8 (101-254)||(21415544-21415698)
chr8 (138-266)||(22059756-22059885)
chr8 (49-172)||(38186102-38186226)
chr8 (139-258)||(44523200-44523320)
chr8 (122-269)||(44431512-44431660)
chr8 (43-264)||(7301517-7301738)
chr8 (140-267)||(7301553-7301680)
chr8 (101-243)||(20459875-20460017)
chr8 (42-215)||(21415544-21415717)
chr8 (61-176)||(43111949-43112063)
chr8 (140-258)||(362178-362296)
chr8 (61-175)||(7301372-7301485)
chr8 (41-225)||(43111889-43112072)
chr8 (140-264)||(17614572-17614696)
chr8 (61-258)||(19881805-19882002)
chr8 (139-269)||(20459874-20460004)
chr8 (60-252)||(21861565-21861759)
chr8 (152-266)||(22059717-22059830)
chr8 (139-264)||(43111908-43112034)
chr8 (101-252)||(363614-363767)
chr8 (62-252)||(44431492-44431682)
chr8 (152-264)||(44431504-44431616)
chr8 (41-219)||(362178-362356)
chr8 (53-258)||(6608588-6608792)
chr8 (139-264)||(32949542-32949668)
chr8 (60-219)||(32949542-32949700)
chr8 (60-215)||(7301372-7301525)
chr8 (100-258)||(15267117-15267280)
chr8 (100-258)||(22521882-22522045)
chr8 (61-175)||(43111988-43112100)
chr8 (139-214)||(15004830-15004906)
chr8 (60-136)||(15004830-15004906)
chr8 (61-141)||(19881962-19882042)
chr8 (61-180)||(28853643-28853761)
chr8 (139-238)||(38186116-38186215)
chr8 (81-219)||(22434636-22434778)
chr8 (179-269)||(44523228-44523319)
chr8 (192-269)||(7301434-7301512)
chr8 (166-267)||(17614559-17614660)
chr8 (179-269)||(22145799-22145891)
chr8 (191-258)||(15004072-15004139)
chr8 (61-254)||(17795011-17795202)
chr8 (60-147)||(20454262-20454348)
chr8 (179-269)||(22059792-22059883)
chr8 (157-252)||(23647586-23647681)
chr8 (152-255)||(28853656-28853757)
chr8 (81-214)||(20385147-20385284)
chr8 (39-97)||(24708161-24708219)
chr8 (113-213)||(44431738-44431840)
chr8 (61-135)||(44431766-44431840)
chr8 (153-269)||(362206-362322)
chr8 (152-219)||(15004072-15004138)
chr8 (179-258)||(24708118-24708197)
chr8 (122-215)||(22434599-22434696)
chr8 (101-176)||(24708121-24708197)
chr8 (154-213)||(21861525-21861584)
chr8 (157-223)||(22434713-22434780)
chr8 (139-228)||(20454262-20454351)
chr8 (60-141)||(20459952-20460032)
chr8 (152-213)||(23647586-23647646)
chr8 (192-252)||(44431739-44431800)
chr8 (61-157)||(44523183-44523279)
chr8 (61-141)||(7301368-7301446)
chr8 (61-141)||(21415540-21415620)
chr8 (61-141)||(45135241-45135319)
chr8 (179-253)||(15004830-15004905)
chr8 (178-213)||(20012323-20012358)
chr8 (179-269)||(21861668-21861758)
chr8 (157-212)||(33088878-33088933)
chr8 (122-216)||(22616617-22616715)
chr8 (61-98)||(17272816-17272853)
chr8 (60-141)||(17795127-17795206)
chr8 (140-201)||(38186114-38186174)
[»] chr3 (132 HSPs)
chr3 (1-219)||(15010446-15010670)
chr3 (39-269)||(2039024-2039255)
chr3 (39-269)||(2042765-2042996)
chr3 (41-225)||(179729-179914)
chr3 (74-269)||(54972935-54973132)
chr3 (74-269)||(54975545-54975742)
chr3 (74-269)||(54978155-54978352)
chr3 (61-269)||(2038985-2039193)
chr3 (61-269)||(2042726-2042934)
chr3 (1-176)||(603939-604121)
chr3 (39-256)||(2035296-2035514)
chr3 (60-269)||(2038868-2039076)
chr3 (60-269)||(2038907-2039115)
chr3 (60-269)||(2042609-2042817)
chr3 (60-269)||(2042648-2042856)
chr3 (60-266)||(2038832-2039037)
chr3 (60-266)||(2042573-2042778)
chr3 (82-264)||(52338992-52339175)
chr3 (60-269)||(16799368-16799580)
chr3 (31-254)||(14951778-14951988)
chr3 (60-215)||(23396058-23396214)
chr3 (39-219)||(14041273-14041454)
chr3 (60-256)||(2038803-2038998)
chr3 (60-256)||(2042544-2042739)
chr3 (39-217)||(14037805-14037984)
chr3 (1-137)||(7631868-7632010)
chr3 (100-265)||(10553994-10554160)
chr3 (81-252)||(10989875-10990047)
chr3 (61-254)||(16799409-16799604)
chr3 (152-266)||(2035325-2035439)
chr3 (61-219)||(10554073-10554230)
chr3 (24-215)||(18958508-18958701)
chr3 (101-258)||(6806015-6806172)
chr3 (61-180)||(52338959-52339078)
chr3 (1-137)||(54046398-54046540)
chr3 (41-216)||(23396136-23396311)
chr3 (60-175)||(179701-179816)
chr3 (139-269)||(15010474-15010605)
chr3 (138-266)||(14037825-14037955)
chr3 (138-266)||(14041293-14041423)
chr3 (152-258)||(14041348-14041454)
chr3 (39-176)||(39230409-39230546)
chr3 (113-265)||(54973013-54973167)
chr3 (113-265)||(54975623-54975777)
chr3 (113-265)||(54978233-54978387)
chr3 (138-269)||(2035361-2035494)
chr3 (140-256)||(14951841-14951958)
chr3 (152-256)||(14037880-14037984)
chr3 (61-176)||(6806018-6806132)
chr3 (139-267)||(179765-179895)
chr3 (139-258)||(603936-604056)
chr3 (81-215)||(3395001-3395140)
chr3 (152-269)||(18958558-18958677)
chr3 (113-269)||(10554045-10554202)
chr3 (43-267)||(54972865-54973091)
chr3 (43-267)||(54975475-54975701)
chr3 (43-267)||(54978085-54978311)
chr3 (39-253)||(10834381-10834597)
chr3 (41-219)||(6806015-6806192)
chr3 (154-254)||(18958602-18958701)
chr3 (140-269)||(10989937-10990066)
chr3 (114-269)||(54972896-54973053)
chr3 (61-175)||(54973081-54973194)
chr3 (114-269)||(54975506-54975663)
chr3 (61-175)||(54975691-54975804)
chr3 (114-269)||(54978116-54978273)
chr3 (61-175)||(54978301-54978414)
chr3 (42-267)||(52339028-52339254)
chr3 (60-258)||(10554033-10554230)
chr3 (138-256)||(39230429-39230547)
chr3 (152-258)||(15010446-15010551)
chr3 (152-264)||(179729-179841)
chr3 (81-216)||(6819033-6819170)
chr3 (42-252)||(10989915-10990125)
chr3 (139-219)||(30206554-30206635)
chr3 (179-266)||(39230431-39230518)
chr3 (61-215)||(54973041-54973194)
chr3 (61-215)||(54975651-54975804)
chr3 (61-215)||(54978261-54978414)
chr3 (60-137)||(30206558-30206635)
chr3 (60-252)||(1989281-1989476)
chr3 (139-264)||(6806047-6806173)
chr3 (140-211)||(6819014-6819085)
chr3 (139-219)||(54046463-54046544)
chr3 (138-264)||(10989981-10990108)
chr3 (41-137)||(17211118-17211213)
chr3 (179-269)||(14951867-14951958)
chr3 (139-215)||(7631933-7632010)
chr3 (179-269)||(603964-604055)
chr3 (179-268)||(179804-179894)
chr3 (60-141)||(18958625-18958705)
chr3 (157-235)||(3395021-3395101)
chr3 (157-216)||(3395082-3395142)
chr3 (179-258)||(30206554-30206634)
chr3 (60-243)||(6818901-6819078)
chr3 (152-254)||(23396058-23396160)
chr3 (61-141)||(3394997-3395079)
chr3 (163-216)||(43928388-43928442)
chr3 (152-235)||(6819066-6819149)
chr3 (61-141)||(16799528-16799608)
chr3 (61-141)||(23396054-23396133)
chr3 (140-235)||(23396156-23396251)
chr3 (159-243)||(23396188-23396271)
chr3 (157-196)||(18367772-18367811)
chr3 (179-258)||(55292739-55292818)
chr3 (180-269)||(18958546-18958638)
chr3 (60-137)||(55292743-55292819)
chr3 (179-254)||(7631934-7632010)
chr3 (100-258)||(12855944-12856106)
chr3 (157-235)||(18367772-18367852)
chr3 (157-216)||(52213454-52213514)
chr3 (179-258)||(54046464-54046544)
chr3 (178-213)||(9884-9919)
chr3 (81-214)||(15232141-15232278)
chr3 (81-214)||(15238009-15238146)
chr3 (61-135)||(10989875-10989949)
chr3 (61-219)||(12855944-12856105)
chr3 (157-220)||(15232139-15232203)
chr3 (157-220)||(15238007-15238071)
chr3 (138-217)||(17211136-17211215)
chr3 (177-213)||(35984717-35984753)
chr3 (61-141)||(54973120-54973198)
chr3 (61-141)||(54975730-54975808)
chr3 (61-141)||(54978340-54978418)
chr3 (157-212)||(42109183-42109238)
chr3 (100-252)||(9884-10040)
chr3 (88-137)||(43928391-43928441)
chr3 (72-141)||(14951774-14951842)
chr3 (61-141)||(179697-179775)
chr3 (157-213)||(14289029-14289085)
chr3 (140-176)||(15446424-15446460)
chr3 (101-176)||(55292742-55292818)
[»] scaffold0500 (4 HSPs)
scaffold0500 (41-254)||(11688-11903)
scaffold0500 (139-267)||(11754-11884)
scaffold0500 (101-269)||(11712-11883)
scaffold0500 (61-141)||(11684-11764)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (36-269)||(32715-32947)
scaffold0141 (152-258)||(32871-32975)
[»] scaffold0049 (3 HSPs)
scaffold0049 (36-269)||(81865-82097)
scaffold0049 (152-258)||(81837-81941)
scaffold0049 (157-213)||(42955-43011)
[»] chr6 (88 HSPs)
chr6 (74-254)||(8522533-8522713)
chr6 (60-268)||(13763958-13764165)
chr6 (60-269)||(15538831-15539044)
chr6 (39-215)||(15686428-15686604)
chr6 (61-255)||(23621200-23621394)
chr6 (39-219)||(16101971-16102152)
chr6 (31-265)||(8522451-8522686)
chr6 (81-269)||(13764134-13764322)
chr6 (100-268)||(13764231-13764399)
chr6 (60-215)||(2288238-2288394)
chr6 (60-258)||(13764270-13764466)
chr6 (43-176)||(16829470-16829604)
chr6 (140-269)||(23621264-23621394)
chr6 (43-176)||(29492427-29492561)
chr6 (39-219)||(12595586-12595766)
chr6 (43-174)||(16812450-16812582)
chr6 (138-266)||(12595606-12595735)
chr6 (82-243)||(13764057-13764217)
chr6 (138-266)||(16101991-16102121)
chr6 (152-258)||(16102046-16102152)
chr6 (138-266)||(15686455-15686584)
chr6 (138-258)||(16829486-16829607)
chr6 (61-175)||(24440865-24440978)
chr6 (61-215)||(13764349-13764502)
chr6 (43-163)||(16804631-16804752)
chr6 (60-172)||(23352131-23352243)
chr6 (139-269)||(2288262-2288394)
chr6 (61-254)||(15538872-15539068)
chr6 (152-258)||(29492458-29492564)
chr6 (138-258)||(16812466-16812587)
chr6 (152-258)||(12595661-12595766)
chr6 (39-173)||(221613-221747)
chr6 (152-254)||(15686428-15686529)
chr6 (101-269)||(23621225-23621394)
chr6 (138-238)||(16804647-16804748)
chr6 (60-175)||(29848499-29848614)
chr6 (73-264)||(13764244-13764434)
chr6 (100-258)||(9185933-9186096)
chr6 (139-237)||(23352131-23352229)
chr6 (160-254)||(29848499-29848592)
chr6 (81-216)||(1639059-1639199)
chr6 (152-243)||(2288249-2288340)
chr6 (157-216)||(12389543-12389603)
chr6 (179-269)||(12595608-12595699)
chr6 (179-269)||(16829488-16829579)
chr6 (140-215)||(29848499-29848573)
chr6 (100-213)||(29265486-29265602)
chr6 (60-180)||(23621196-23621316)
chr6 (179-266)||(16812468-16812556)
chr6 (140-212)||(23352172-23352243)
chr6 (60-147)||(24266675-24266762)
chr6 (122-213)||(21469789-21469879)
chr6 (157-235)||(13751352-13751433)
chr6 (180-269)||(29492446-29492536)
chr6 (81-215)||(13751332-13751472)
chr6 (157-255)||(25806900-25807001)
chr6 (140-255)||(12389483-12389603)
chr6 (73-141)||(15539004-15539072)
chr6 (179-266)||(16804649-16804737)
chr6 (157-252)||(21469786-21469879)
chr6 (100-231)||(17027230-17027366)
chr6 (139-243)||(221634-221738)
chr6 (60-141)||(2288234-2288315)
chr6 (100-252)||(25772614-25772770)
chr6 (81-176)||(1584259-1584358)
chr6 (157-235)||(1639098-1639178)
chr6 (143-215)||(24440907-24440978)
chr6 (158-258)||(1584258-1584361)
chr6 (81-180)||(12389545-12389648)
chr6 (61-141)||(13751328-13751411)
chr6 (179-269)||(23352132-23352222)
chr6 (157-218)||(12389461-12389523)
chr6 (140-213)||(221675-221747)
chr6 (157-225)||(1590641-1590710)
chr6 (60-141)||(15686424-15686504)
chr6 (156-216)||(17526327-17526388)
chr6 (122-209)||(22346655-22346743)
chr6 (61-141)||(8522639-8522717)
chr6 (61-141)||(29848495-29848573)
chr6 (157-219)||(1584298-1584361)
chr6 (152-203)||(16804702-16804752)
chr6 (178-213)||(18137479-18137514)
chr6 (159-238)||(24266697-24266775)
chr6 (154-212)||(18315999-18316056)
chr6 (152-252)||(29265500-29265602)
chr6 (152-213)||(17027209-17027269)
chr6 (152-185)||(18137493-18137526)
chr6 (157-216)||(610733-610793)
[»] scaffold0609 (3 HSPs)
scaffold0609 (60-269)||(4316-4525)
scaffold0609 (61-258)||(4357-4553)
scaffold0609 (60-174)||(4434-4548)
[»] scaffold0004 (11 HSPs)
scaffold0004 (41-267)||(59146-59371)
scaffold0004 (149-269)||(59214-59333)
scaffold0004 (74-254)||(59217-59397)
scaffold0004 (60-215)||(59242-59397)
scaffold0004 (81-216)||(205343-205483)
scaffold0004 (60-141)||(59320-59401)
scaffold0004 (157-255)||(205343-205444)
scaffold0004 (152-225)||(384104-384179)
scaffold0004 (61-137)||(205344-205422)
scaffold0004 (178-216)||(384090-384128)
scaffold0004 (157-216)||(205425-205485)
[»] scaffold0860 (3 HSPs)
scaffold0860 (60-258)||(151-349)
scaffold0860 (139-267)||(151-280)
scaffold0860 (101-269)||(152-321)
[»] scaffold0026 (13 HSPs)
scaffold0026 (61-225)||(20883-21048)
scaffold0026 (41-219)||(20783-20963)
scaffold0026 (139-267)||(20802-20933)
scaffold0026 (152-243)||(20856-20948)
scaffold0026 (61-264)||(20843-21048)
scaffold0026 (139-258)||(23880-24001)
scaffold0026 (61-176)||(20963-21076)
scaffold0026 (41-204)||(23861-24025)
scaffold0026 (61-165)||(23921-24026)
scaffold0026 (100-219)||(35577-35697)
scaffold0026 (178-213)||(24707-24742)
scaffold0026 (122-213)||(24771-24863)
scaffold0026 (197-238)||(35636-35677)
[»] scaffold0381 (4 HSPs)
scaffold0381 (41-215)||(13986-14162)
scaffold0381 (139-269)||(14010-14143)
scaffold0381 (101-254)||(13986-14142)
scaffold0381 (61-141)||(13982-14062)
[»] scaffold0151 (6 HSPs)
scaffold0151 (140-258)||(2161-2279)
scaffold0151 (140-258)||(9005-9123)
scaffold0151 (41-219)||(2101-2279)
scaffold0151 (41-219)||(8945-9123)
scaffold0151 (166-269)||(2148-2251)
scaffold0151 (166-269)||(8992-9095)
[»] scaffold0109 (5 HSPs)
scaffold0109 (75-252)||(2140-2318)
scaffold0109 (74-269)||(2061-2256)
scaffold0109 (41-264)||(1989-2212)
scaffold0109 (61-135)||(2244-2318)
scaffold0109 (60-135)||(2204-2278)
[»] scaffold0042 (6 HSPs)
scaffold0042 (60-219)||(50696-50855)
scaffold0042 (122-225)||(50878-50982)
scaffold0042 (60-264)||(50774-50982)
scaffold0042 (140-258)||(50737-50855)
scaffold0042 (104-175)||(50939-51010)
scaffold0042 (152-267)||(50710-50825)
[»] scaffold0003 (4 HSPs)
scaffold0003 (61-252)||(137562-137754)
scaffold0003 (62-269)||(137484-137692)
scaffold0003 (157-213)||(81269-81325)
scaffold0003 (154-213)||(81229-81288)
[»] scaffold0058 (4 HSPs)
scaffold0058 (61-258)||(40132-40328)
scaffold0058 (140-269)||(40199-40328)
scaffold0058 (60-269)||(40160-40369)
scaffold0058 (60-136)||(40137-40212)
[»] scaffold0008 (10 HSPs)
scaffold0008 (61-215)||(12508-12662)
scaffold0008 (68-258)||(13106-13296)
scaffold0008 (114-267)||(12534-12688)
scaffold0008 (61-253)||(13071-13263)
scaffold0008 (60-258)||(13026-13226)
scaffold0008 (72-254)||(12508-12690)
scaffold0008 (159-269)||(13174-13283)
scaffold0008 (61-141)||(12504-12583)
scaffold0008 (191-267)||(12613-12689)
scaffold0008 (178-213)||(125038-125073)
[»] scaffold0338 (4 HSPs)
scaffold0338 (61-215)||(3943-4096)
scaffold0338 (60-254)||(3943-4137)
scaffold0338 (139-264)||(4011-4137)
scaffold0338 (61-141)||(3939-4018)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (60-258)||(34873-35071)
scaffold0034 (140-269)||(34901-35030)
scaffold0034 (139-269)||(34940-35071)
[»] scaffold0021 (2 HSPs)
scaffold0021 (39-175)||(134263-134401)
scaffold0021 (138-254)||(134263-134381)
[»] scaffold0825 (4 HSPs)
scaffold0825 (75-219)||(1801-1945)
scaffold0825 (140-225)||(1873-1958)
scaffold0825 (41-258)||(1801-2018)
scaffold0825 (166-264)||(1873-1971)
[»] scaffold0395 (5 HSPs)
scaffold0395 (61-252)||(8921-9112)
scaffold0395 (74-252)||(8841-9021)
scaffold0395 (61-213)||(8801-8955)
scaffold0395 (114-269)||(8863-9021)
scaffold0395 (178-219)||(10061-10102)
[»] scaffold0413 (3 HSPs)
scaffold0413 (140-258)||(10609-10727)
scaffold0413 (41-219)||(10549-10727)
scaffold0413 (139-266)||(10568-10696)
[»] scaffold0635 (2 HSPs)
scaffold0635 (41-252)||(6704-6918)
scaffold0635 (180-267)||(6725-6812)
[»] scaffold0586 (3 HSPs)
scaffold0586 (101-254)||(1503-1657)
scaffold0586 (42-215)||(1484-1657)
scaffold0586 (61-141)||(1581-1661)
[»] scaffold0107 (4 HSPs)
scaffold0107 (74-175)||(2830-2931)
scaffold0107 (140-225)||(2818-2903)
scaffold0107 (41-215)||(2758-2931)
scaffold0107 (138-264)||(2776-2903)
[»] scaffold0126 (2 HSPs)
scaffold0126 (41-219)||(5680-5857)
scaffold0126 (143-258)||(5743-5857)
[»] scaffold0131 (4 HSPs)
scaffold0131 (163-254)||(1414-1505)
scaffold0131 (88-175)||(1417-1505)
scaffold0131 (206-269)||(1417-1481)
scaffold0131 (61-141)||(1430-1509)
[»] scaffold0044 (4 HSPs)
scaffold0044 (74-176)||(6088-6190)
scaffold0044 (140-224)||(6118-6202)
scaffold0044 (60-137)||(6167-6243)
scaffold0044 (138-263)||(6118-6244)
[»] scaffold0447 (2 HSPs)
scaffold0447 (41-215)||(13893-14068)
scaffold0447 (139-258)||(13912-14030)
[»] scaffold0383 (2 HSPs)
scaffold0383 (41-215)||(11888-12063)
scaffold0383 (139-258)||(11907-12025)
[»] scaffold1098 (5 HSPs)
scaffold1098 (139-258)||(1064-1185)
scaffold1098 (41-204)||(1045-1209)
scaffold1098 (61-165)||(1105-1210)
scaffold1098 (178-213)||(1891-1926)
scaffold1098 (122-213)||(1955-2047)
[»] scaffold0556 (4 HSPs)
scaffold0556 (158-258)||(9638-9738)
scaffold0556 (60-176)||(9618-9735)
scaffold0556 (179-269)||(9619-9710)
scaffold0556 (60-106)||(9562-9608)
[»] scaffold0491 (5 HSPs)
scaffold0491 (31-141)||(10437-10546)
scaffold0491 (179-254)||(10467-10542)
scaffold0491 (139-215)||(10466-10542)
scaffold0491 (101-175)||(10467-10542)
scaffold0491 (217-269)||(10466-10518)
[»] scaffold0012 (3 HSPs)
scaffold0012 (60-173)||(223630-223743)
scaffold0012 (140-213)||(223630-223702)
scaffold0012 (166-252)||(223630-223715)
[»] scaffold0007 (3 HSPs)
scaffold0007 (159-225)||(165648-165714)
scaffold0007 (81-166)||(165629-165714)
scaffold0007 (199-264)||(165648-165714)
[»] scaffold1276 (2 HSPs)
scaffold1276 (41-137)||(112-207)
scaffold1276 (139-219)||(131-211)
[»] scaffold0364 (2 HSPs)
scaffold0364 (157-255)||(7087-7187)
scaffold0364 (157-267)||(7046-7159)
[»] scaffold0180 (4 HSPs)
scaffold0180 (81-212)||(29323-29459)
scaffold0180 (157-235)||(29340-29420)
scaffold0180 (61-112)||(29346-29398)
scaffold0180 (157-216)||(29401-29461)
[»] scaffold0273 (2 HSPs)
scaffold0273 (122-235)||(6555-6674)
scaffold0273 (81-211)||(6554-6690)
[»] scaffold0106 (4 HSPs)
scaffold0106 (81-211)||(20683-20818)
scaffold0106 (157-235)||(20722-20802)
scaffold0106 (61-133)||(20744-20818)
scaffold0106 (157-216)||(20681-20741)
[»] scaffold0069 (3 HSPs)
scaffold0069 (152-258)||(34489-34597)
scaffold0069 (100-219)||(34475-34597)
scaffold0069 (157-219)||(29298-29359)
[»] scaffold0453 (2 HSPs)
scaffold0453 (158-216)||(3035-3094)
scaffold0453 (140-235)||(2974-3073)
[»] scaffold2046 (3 HSPs)
scaffold2046 (157-235)||(69-150)
scaffold2046 (81-215)||(30-170)
scaffold2046 (61-141)||(91-174)
[»] scaffold0962 (3 HSPs)
scaffold0962 (81-216)||(1528-1668)
scaffold0962 (157-235)||(1549-1629)
scaffold0962 (157-216)||(1610-1670)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (100-258)||(21764-21927)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (157-213)||(524712-524768)
scaffold0001 (81-135)||(524714-524768)
scaffold0001 (152-213)||(524747-524809)
[»] scaffold0117 (2 HSPs)
scaffold0117 (157-223)||(33623-33690)
scaffold0117 (81-216)||(33625-33764)
[»] scaffold0859 (2 HSPs)
scaffold0859 (140-207)||(153-223)
scaffold0859 (157-235)||(165-245)
[»] scaffold0335 (2 HSPs)
scaffold0335 (157-252)||(3625-3722)
scaffold0335 (157-213)||(8455-8510)
[»] scaffold0322 (2 HSPs)
scaffold0322 (100-231)||(19277-19413)
scaffold0322 (152-213)||(19374-19434)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (100-248)||(177909-178061)
[»] scaffold0016 (3 HSPs)
scaffold0016 (41-107)||(120016-120082)
scaffold0016 (101-141)||(174911-174952)
scaffold0016 (122-191)||(183041-183113)
[»] scaffold0388 (2 HSPs)
scaffold0388 (122-218)||(16071-16171)
scaffold0388 (157-220)||(16151-16215)
[»] scaffold0165 (2 HSPs)
scaffold0165 (100-213)||(17865-17983)
scaffold0165 (154-213)||(17964-18023)
[»] scaffold0192 (2 HSPs)
scaffold0192 (178-213)||(20775-20810)
scaffold0192 (100-243)||(20775-20922)
[»] scaffold0130 (2 HSPs)
scaffold0130 (122-179)||(2808-2867)
scaffold0130 (158-216)||(2811-2869)
[»] scaffold0216 (2 HSPs)
scaffold0216 (114-252)||(21263-21404)
scaffold0216 (191-235)||(21262-21306)
[»] scaffold0178 (1 HSPs)
scaffold0178 (157-213)||(25568-25624)
[»] scaffold1336 (2 HSPs)
scaffold1336 (100-209)||(848-958)
scaffold1336 (178-225)||(911-958)
[»] scaffold0865 (1 HSPs)
scaffold0865 (178-213)||(30-65)
[»] scaffold0490 (2 HSPs)
scaffold0490 (157-252)||(4806-4901)
scaffold0490 (154-213)||(4843-4901)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (178-213)||(27043-27078)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (154-213)||(41647-41706)
[»] scaffold0028 (2 HSPs)
scaffold0028 (152-252)||(92723-92826)
scaffold0028 (178-210)||(92808-92840)
[»] scaffold0371 (3 HSPs)
scaffold0371 (178-212)||(7227-7261)
scaffold0371 (122-212)||(5356-5449)
scaffold0371 (160-223)||(5316-5379)
[»] scaffold0244 (1 HSPs)
scaffold0244 (154-212)||(13698-13755)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (122-216)||(188733-188831)
[»] scaffold0149 (2 HSPs)
scaffold0149 (122-212)||(28026-28119)
scaffold0149 (160-223)||(28096-28159)
[»] scaffold0071 (1 HSPs)
scaffold0071 (140-176)||(15732-15768)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 81)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 22759300 - 22759026
Alignment:
Q  1 caacatcatcaacacgatccacaacaacatcaac------tacgacgtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagccccc 94  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22759300 caacatcatcaacacgatccacaacaacatcaacgacaactacgacgtggtactatttccaacatgttgaatgactaagcattccggggcataagccccc 22759201  T
Q  95 aacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcat 194  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  22759200 aacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaagcat 22759101  T
Q  195 tccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacag-ttgaatgacaaag 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  22759100 tccagggcataagccctcaacagttgaatgataa-acattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaag 22759026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 22 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 16256518 - 16256276
Alignment:
Q  22 caacaacatcaactacgacgtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaa 121  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||     
T  16256518 caacaacaacaactacaacgtggtactattttcaacgtgttgaatgactaagcattccggagcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattccag 16256420  T
Q  122 ggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  16256419 ggcataagccctcaacggttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacggttg 16256320  T
Q  221 aatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagttgaatga 264  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||| |||||| |||||||||    
T  16256319 aatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacggttgaatga 16256276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 22 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 16260112 - 16259909
Alignment:
Q  22 caacaacatcaactacgacgtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaa 121  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||     
T  16260112 caacaacaacaactacaacgtggtactattttcaacgtgttgaatgactaagcattccggagcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattccag 16260014  T
Q  122 ggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  16260013 ggcataagccctcaacggttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacggttg 16259914  T
Q  221 aatga 225  Q
    |||||    
T  16259913 aatga 16259909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 22 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22593831 - 22593628
Alignment:
Q  22 caacaacatcaactacgacgtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaa 121  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||     
T  22593831 caacaacaacaactacaacgtggtactattttcaacgtgttgaatgactaagcattccggagcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattccag 22593733  T
Q  122 ggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttg 220  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  22593732 ggcataagcccacaacggttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacggttg 22593633  T
Q  221 aatga 225  Q
    |||||    
T  22593632 aatga 22593628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 22 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22597386 - 22597183
Alignment:
Q  22 caacaacatcaactacgacgtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaa 121  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||     
T  22597386 caacaacaacaactacaacgtggtactattttcaacgtgttgaatgactaagcattccggagcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattccag 22597288  T
Q  122 ggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttg 220  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  22597287 ggcataagcccacaacggttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacggttg 22597188  T
Q  221 aatga 225  Q
    |||||    
T  22597187 aatga 22597183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 22 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22590276 - 22590073
Alignment:
Q  22 caacaacatcaactacgacgtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaa 121  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |     
T  22590276 caacaacaacaactacaacgtggtactattttcaacgtgttgaatgactaagcattccggagcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattctag 22590178  T
Q  122 ggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttg 220  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  22590177 ggcataagcccacaacggttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacggttg 22590078  T
Q  221 aatga 225  Q
    |||||    
T  22590077 aatga 22590073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 74 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 29325740 - 29325562
Alignment:
Q  74 cattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagaca-ttccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctc 172  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||  |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29325740 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcaattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctc 29325641  T
Q  173 aacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctca 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||| ||||    
T  29325640 aacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacga-gcattccagggcatgagccctca 29325562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 74 - 254
Target Start/End: Original strand, 26495487 - 26495667
Alignment:
Q  74 cattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagaca-ttccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctc 172  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||  |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26495487 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcaattccagggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctc 26495586  T
Q  173 aacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaac 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||| ||||||    
T  26495587 aacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacga-gcattccagggcatgagccctcaac 26495667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 36 - 258
Target Start/End: Original strand, 43120765 - 43120985
Alignment:
Q  36 acgacgtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctca 135  Q
    |||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||| ||||||||    
T  43120765 acgacggggtactattttcaactcattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggcatgagccctca 43120863  T
Q  136 ac-ggttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcatt 234  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||    
T  43120864 acagattgaatgattaacattccagggcataagccctcaac-ggttgaatgacga-gcattccagggcatgagccctcaacggttgaatgacaaagcatt 43120961  T
Q  235 ccagagcattagctctcaacagtt 258  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||    
T  43120962 ccagggcatgagccctcaacagtt 43120985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 36 - 258
Target Start/End: Original strand, 43124298 - 43124518
Alignment:
Q  36 acgacgtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctca 135  Q
    |||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||| ||||||||    
T  43124298 acgacggggtactattttcaactcattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggcatgagccctca 43124396  T
Q  136 ac-ggttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcatt 234  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||    
T  43124397 acagattgaatgattaacattccagggcataagccctcaac-ggttgaatgacga-gcattccagggcatgagccctcaacggttgaatgacaaagcatt 43124494  T
Q  235 ccagagcattagctctcaacagtt 258  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||    
T  43124495 ccagggcatgagccctcaacagtt 43124518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 60 - 228
Target Start/End: Original strand, 22469776 - 22469945
Alignment:
Q  60 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattcca 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||| |||||||||  || |||||||    
T  22469776 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataa-acatttcagggcataagccctcaacagttgaatgacaaagcattcca 22469874  T
Q  159 gggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaa 228  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  22469875 gggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggctttccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaa 22469945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 39 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 26361574 - 26361399
Alignment:
Q  39 acgtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacg 138  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  26361574 acgtggtactattttcaacgggttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttcaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacg 26361475  T
Q  139 -gttgaatga-ttaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctc 212  Q
      ||||||||  || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  26361474 atttgaatgacatagcatttcagggcatgagccctcaacgatttgaatgacatagcattccagggcatgagccctc 26361399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 31 - 265
Target Start/End: Original strand, 26495405 - 26495640
Alignment:
Q  31 caactacgacgtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagc 130  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||| |||    
T  26495405 caactacgacgtggtactattttcaacacattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggcatgagc 26495503  T
Q  131 cctcaac-ggttgaatgatta--acattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac-agttgaatgac 226  Q
    ||||||| | ||||||||  |    |||||||||||| ||||||||||   ||||||||  |  ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  26495504 cctcaacagattgaatgacaaggcaattccagggcataagccctcaac-ggttgaatgatta-acattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgac 26495601  T
Q  227 aaggcattccagagcattagctctcaacagttgaatgac 265  Q
    |||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||    
T  26495602 aaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgac 26495640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 60 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 27869926 - 27869721
Alignment:
Q  60 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaa-cattcc 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| || ||||| || ||||||| ||| ||||||  |  ||||||    
T  27869926 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataa--catttcagggcatgagtcctcaacagtttgaatgacaaggcattcc 27869829  T
Q  158 agggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagt 257  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| ||| |||||||||    
T  27869828 agggcatgagctctcaacaattagaatgataa--cattccagggcatgagccctcaacagttgaatgataaagcattccagggcatgagccctcaacagt 27869731  T
Q  258 tgaatgacaa 267  Q
    ||||||||||    
T  27869730 tgaatgacaa 27869721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 60 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 16259996 - 16259881
Alignment:
Q  60 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccag 159  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16259996 gttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacggttgaatgattaacattccag 16259897  T
Q  160 ggcatgagccctcaac 175  Q
    ||||||||||||||||    
T  16259896 ggcatgagccctcaac 16259881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 60 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 22590160 - 22590045
Alignment:
Q  60 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccag 159  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22590160 gttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacggttgaatgattaacattccag 22590061  T
Q  160 ggcatgagccctcaac 175  Q
    ||||||||||||||||    
T  22590060 ggcatgagccctcaac 22590045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 60 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 22593715 - 22593600
Alignment:
Q  60 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccag 159  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22593715 gttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacggttgaatgattaacattccag 22593616  T
Q  160 ggcatgagccctcaac 175  Q
    ||||||||||||||||    
T  22593615 ggcatgagccctcaac 22593600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 60 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 22597270 - 22597155
Alignment:
Q  60 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccag 159  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22597270 gttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacggttgaatgattaacattccag 22597171  T
Q  160 ggcatgagccctcaac 175  Q
    ||||||||||||||||    
T  22597170 ggcatgagccctcaac 22597155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 31 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 29325822 - 29325587
Alignment:
Q  31 caactacgacgtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagc 130  Q
    |||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||| |||    
T  29325822 caacgacggcgtggtactattttcaacacattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggcatgagc 29325724  T
Q  131 cctcaac-ggttgaatgatta--acattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac-agttgaatgac 226  Q
    ||||||| | ||||||||  |    |||||| ||||| ||||||||||   ||||||||  |  ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  29325723 cctcaacagattgaatgacaaggcaattccaaggcataagccctcaac-ggttgaatgatta-acattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgac 29325626  T
Q  227 aaggcattccagagcattagctctcaacagttgaatgac 265  Q
    |||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||    
T  29325625 aaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgac 29325587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 60 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 22759156 - 22758964
Alignment:
Q  60 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccag 159  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||| ||||| |||||  |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  22759156 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagttgaatgataaacattccag 22759058  T
Q  160 ggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac-agttgaatgacaaggcattccagagcattagctctca 252  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||  ||||||| | | ||||| |||||||| |||||| |||| ||| ||||    
T  22759057 ggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaagcattctagggcatgtgccctcaccaatttgaacgacaaggcgttccagggcatgagccctca 22758964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 226
Target Start/End: Original strand, 23671450 - 23671644
Alignment:
Q  31 caactacgacgtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagc 130  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||| | |||||||||||| ||||||| ||||| |||    
T  23671450 caactacgacgtggtaccattttcaacacattgaatggctaagcattccagggcatgagccctcaac-agttgaatgacaaggcattccagggcatgagc 23671548  T
Q  131 cctcaacggttgaatgatta-acattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgac 226  Q
    |||||||| ||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||   ||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  23671549 cctcaacgattgaatgacgaggcattccagggcatgagccctcaac-ggttgaatgacgaagcattccagggcatgagccctcaacggttgactgac 23671644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 49 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 22358118 - 22357911
Alignment:
Q  49 atttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatga-caagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatga 147  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||  || | |||||| ||||| |||||||||| |||||||||    
T  22358118 attttcaacatgttgaataactaagcattctagggcataagacctcaacaatttgaatgataaaaatattccagggcatgagccctcaacagttgaatga 22358019  T
Q  148 ttaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac-agttgaatgacaaggcattccagagcatta 245  Q
      || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||| |    
T  22358018 caaagcattccagggcataagccctcaacaatttgaatgataa-acattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaagcattccagggcatga 22357920  T
Q  246 gctctcaac 254  Q
    || ||||||    
T  22357919 gccctcaac 22357911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 81 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 27869867 - 27869692
Alignment:
Q  81 gggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatt 179  Q
    |||||| || || ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||  || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27869867 gggcatgagtcctcaacagtttgaatgacaaggcattccagggcatgagctctcaacaattagaatgat-aacattccagggcatgagccctcaacagtt 27869769  T
Q  180 tgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagtt 258  Q
     |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  27869768 -gaatgataaagcattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaa-gcattccagggcataagccctcaacagtt 27869692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 61 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 8953148 - 8953034
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttgaatgattaacattccag 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| ||    
T  8953148 ttgaatgactaagcattccggggcataagtccccaacaatttgaatgataa-acattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgattaacattcaag 8953050  T
Q  160 ggcatgagccctcaac 175  Q
    ||||||||||||||||    
T  8953049 ggcatgagccctcaac 8953034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 41 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 24277782 - 24277605
Alignment:
Q  41 gtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-gg 139  Q
    ||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||| |     
T  24277782 gtggtaccattttcaacgtgttgaatgaataagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataa-acattccagggcatgagccctcaacagt 24277684  T
Q  140 ttgaatgatta-acattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattc-cagggcataagccctcaaca 216  Q
    ||||||||  |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    |||||| |||||||| |||||||||||    
T  24277683 ttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacaatttgaatgaactagcattcacagggcatgagccctcaaca 24277605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 41 - 216
Target Start/End: Original strand, 24384431 - 24384608
Alignment:
Q  41 gtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-gg 139  Q
    ||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||| |     
T  24384431 gtggtaccattttcaacgtgttgaatgaataagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataa-acattccagggcatgagccctcaacagt 24384529  T
Q  140 ttgaatgatta-acattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattc-cagggcataagccctcaaca 216  Q
    ||||||||  |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    |||||| |||||||| |||||||||||    
T  24384530 ttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacaatttgaatgaactagcattcacagggcatgagccctcaaca 24384608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 152 - 265
Target Start/End: Original strand, 23671493 - 23671605
Alignment:
Q  152 cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctc 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||    
T  23671493 cattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacgattgaatgacgaggcattccagggcatgagccctc 23671591  T
Q  252 aacagttgaatgac 265  Q
    ||| ||||||||||    
T  23671592 aacggttgaatgac 23671605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 59 - 215
Target Start/End: Original strand, 23693107 - 23693262
Alignment:
Q  59 cgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattcc 157  Q
    ||||||||||| | ||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  || ||||||    
T  23693107 cgttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacaatt-gaatgacgaggcattccagggcatgagccctcaacggttgaatgacgaagcattcc 23693205  T
Q  158 agggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac 215  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||    
T  23693206 agggcatgagccctcaacggtt-gaatgacgaggcattccagggcaagagccctcaac 23693262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 152 - 265
Target Start/End: Original strand, 23693122 - 23693234
Alignment:
Q  152 cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctc 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||| |||| ||| |||    
T  23693122 cattccagggcatgagccctcaacaatt-gaatgacgaggcattccagggcatgagccctcaacggttgaatgacgaagcattccagggcatgagccctc 23693220  T
Q  252 aacagttgaatgac 265  Q
    ||| ||||||||||    
T  23693221 aacggttgaatgac 23693234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 140 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 16256439 - 16256312
Alignment:
Q  140 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaggcattccag 238  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  16256439 ttgaatgatgaacattccagggcataagccctcaacggtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccag 16256341  T
Q  239 agcattagctctcaacagttgaatgacaa 267  Q
     |||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  16256340 ggcatgagccctcaacggttgaatgacaa 16256312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 114 - 265
Target Start/End: Original strand, 23671493 - 23671644
Alignment:
Q  114 cattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctc 212  Q
    ||||||| ||||| |||||||||| |||||||||  |  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  23671493 cattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacgatt-gaatgacgaggcattccagggcatgagccctc 23671591  T
Q  213 aacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagttgaatgac 265  Q
    ||| |||||||||| | ||||||||| |||| ||| |||||| ||||| ||||    
T  23671592 aacggttgaatgacgaagcattccagggcatgagccctcaacggttgactgac 23671644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 60 - 180
Target Start/End: Original strand, 26495553 - 26495672
Alignment:
Q  60 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccag 159  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||  | ||||||||    
T  26495553 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacgagcattccag 26495651  T
Q  160 ggcatgagccctcaacaattt 180  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  26495652 ggcatgagccctcaacgattt 26495672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 61 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 16256361 - 16256243
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagg 160  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||| ||||| ||||  || |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16256361 ttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacggtt-gaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacggttgaatgattaacattccagg 16256263  T
Q  161 gcatgagccctcaacaattt 180  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  16256262 gcatgagccctcaacgattt 16256243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 140 - 269
Target Start/End: Original strand, 22469817 - 22469947
Alignment:
Q  140 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaggcattccag 238  Q
    ||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  22469817 ttgaatgataaacatttcagggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggctttccag 22469915  T
Q  239 agcattagctctcaacag-ttgaatgacaaag 269  Q
     |||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  22469916 ggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaag 22469947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 39 - 137
Target Start/End: Original strand, 4397416 - 4397514
Alignment:
Q  39 acgtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac 137  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||    
T  4397416 acgtggtactatttccaacgggttgaatgactaagcattctggggcataagcccccaataatttgaatgacaaggcatttcagggcatgagccctcaac 4397514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 140 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 16260033 - 16259909
Alignment:
Q  140 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaggcattccag 238  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  16260033 ttgaatgatgaacattccagggcataagccctcaacggtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccag 16259935  T
Q  239 agcattagctctcaacagttgaatga 264  Q
     |||| ||| |||||| |||||||||    
T  16259934 ggcatgagccctcaacggttgaatga 16259909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 140 - 269
Target Start/End: Original strand, 43120830 - 43120957
Alignment:
Q  140 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccaga 239  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||     
T  43120830 ttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattccagggcataagccctcaacggttgaatgacgag-cattccagg 43120927  T
Q  240 gcattagctctcaacagttgaatgacaaag 269  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||    
T  43120928 gcatgagccctcaacggttgaatgacaaag 43120957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 140 - 269
Target Start/End: Original strand, 43124363 - 43124490
Alignment:
Q  140 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccaga 239  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||     
T  43124363 ttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattccagggcataagccctcaacggttgaatgacgag-cattccagg 43124460  T
Q  240 gcattagctctcaacagttgaatgacaaag 269  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||    
T  43124461 gcatgagccctcaacggttgaatgacaaag 43124490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 139 - 267
Target Start/End: Original strand, 22469776 - 22469905
Alignment:
Q  139 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattcca 237  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22469776 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataaa-catttcagggcataagccctcaacagttgaatgacaaagcattcca 22469874  T
Q  238 gagcattagctctcaacag-ttgaatgacaa 267  Q
    | |||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  22469875 gggcatgagccctcaacagtttgaatgacaa 22469905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 101 - 238
Target Start/End: Original strand, 23693109 - 23693246
Alignment:
Q  101 ttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccag 199  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||  || ||||||| | |||||||||    
T  23693109 ttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacaattgaatgacgaggcattccagggcatgagccctcaacggtt-gaatgacgaagcattccag 23693207  T
Q  200 ggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccag 238  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  23693208 ggcatgagccctcaacggttgaatgacgaggcattccag 23693246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 140 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 22593752 - 22593628
Alignment:
Q  140 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaggcattccag 238  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||  || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  22593752 ttgaatgatgaacattccagggcataagcccacaacggtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccag 22593654  T
Q  239 agcattagctctcaacagttgaatga 264  Q
     |||| ||| |||||| |||||||||    
T  22593653 ggcatgagccctcaacggttgaatga 22593628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 140 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 22597307 - 22597183
Alignment:
Q  140 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaggcattccag 238  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||  || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  22597307 ttgaatgatgaacattccagggcataagcccacaacggtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccag 22597209  T
Q  239 agcattagctctcaacagttgaatga 264  Q
     |||| ||| |||||| |||||||||    
T  22597208 ggcatgagccctcaacggttgaatga 22597183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 140 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 27869885 - 27869758
Alignment:
Q  140 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaggcattccag 238  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||| ||  ||||||||    
T  27869885 ttgaatgat-aacatttcagggcatgagtcctcaacagtttgaatgacaaggcattccagggcatgagctctcaacaattagaatgataa--cattccag 27869789  T
Q  239 agcattagctctcaacagttgaatgacaaag 269  Q
     |||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  27869788 ggcatgagccctcaacagttgaatgataaag 27869758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 179 - 265
Target Start/End: Original strand, 23693109 - 23693195
Alignment:
Q  179 ttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagttgaatgac 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||| ||||||||||    
T  23693109 ttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacaattgaatgacgaggcattccagggcatgagccctcaacggttgaatgac 23693195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 140 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 22590197 - 22590073
Alignment:
Q  140 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaggcattccag 238  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| ||||| ||||  || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  22590197 ttgaatgatgaacattctagggcataagcccacaacggtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccag 22590099  T
Q  239 agcattagctctcaacagttgaatga 264  Q
     |||| ||| |||||| |||||||||    
T  22590098 ggcatgagccctcaacggttgaatga 22590073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 139 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 24277763 - 24277646
Alignment:
Q  139 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaggcattcc 236  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24277763 gttgaatgaataagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataaa-cattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattcc 24277665  T
Q  237 agagcattagctctcaaca 255  Q
    || |||| ||| |||||||    
T  24277664 agggcataagccctcaaca 24277646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 139 - 255
Target Start/End: Original strand, 24384450 - 24384567
Alignment:
Q  139 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaggcattcc 236  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24384450 gttgaatgaataagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataaa-cattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattcc 24384548  T
Q  237 agagcattagctctcaaca 255  Q
    || |||| ||| |||||||    
T  24384549 agggcataagccctcaaca 24384567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 138 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 26361554 - 26361423
Alignment:
Q  138 ggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac-agttgaatgacaaggcattc 235  Q
    |||||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||  |||||     
T  26361554 ggttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttcaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacgatttgaatgacatagcattt 26361455  T
Q  236 cagagcattagctctcaac-agttgaatgaca 266  Q
    ||| |||| ||| |||||| | ||||||||||    
T  26361454 cagggcatgagccctcaacgatttgaatgaca 26361423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 139 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 16260074 - 16259945
Alignment:
Q  139 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattcca 237  Q
    ||||||||| ||| |||||| | |||| ||||| |||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  16260074 gttgaatgactaagcattccggagcataagcccccaacaatttgaatgatgaa-cattccagggcataagccctcaacggttgaatgacaaagcattcca 16259976  T
Q  238 gagcattagctctcaac-agttgaatgacaa 267  Q
    | |||| ||| |||||| | |||||||||||    
T  16259975 gggcatgagccctcaacaatttgaatgacaa 16259945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 153 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 22358051 - 22357935
Alignment:
Q  153 attccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac-agttgaatgacaaggcattccagagcattagctctc 251  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||  |||||||| |||| ||| |||    
T  22358051 attccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacaatttgaatgataa-acattccagggcatgagccctc 22357954  T
Q  252 aac-agttgaatgacaaag 269  Q
    ||| | |||||||||||||    
T  22357953 aacaatttgaatgacaaag 22357935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 191 - 265
Target Start/End: Original strand, 23671492 - 23671566
Alignment:
Q  191 gcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagttgaatgac 265  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||  |||||||||    
T  23671492 gcattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacgattgaatgac 23671566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 152 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 26361499 - 26361407
Alignment:
Q  152 cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac-agttgaatgacaaggcattccagagcat 243  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||| | ||||||||||  ||||||||| ||||    
T  26361499 cattccagggcatgagccctcaacgatttgaatgacatagcatttcagggcatgagccctcaacgatttgaatgacatagcattccagggcat 26361407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 122 - 214
Target Start/End: Original strand, 26706362 - 26706458
Alignment:
Q  122 ggcataagccctcaacggttg-aatgattaa-cattcc-agggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattc-cagggcataagccctcaa 214  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  26706362 ggcataagccctcaacagttggaatgattaagcattcccagggcatgagccctcaacgatttgaacgacaaggcgttcacagggcataagccctcaa 26706458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 122 - 214
Target Start/End: Original strand, 26976096 - 26976192
Alignment:
Q  122 ggcataagccctcaacggttg-aatgattaa-cattcc-agggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattc-cagggcataagccctcaa 214  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  26976096 ggcataagccctcaacagttggaatgattaagcattcccagggcatgagccctcaacgatttgaacgacaaggcgttcacagggcataagccctcaa 26976192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 81 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 21559562 - 21559424
Alignment:
Q  81 gggcataagcccccaacaatttgaatga-caagacattc-caaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaa-cattc-cagggcatgagccctcaac 175  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||| || ||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  21559562 gggcataagccctcaacaatttgaatgaactag-cattcacagggcatgagccctcaacagtttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctcaac 21559464  T
Q  176 aatttgaatgacaaggcattc-cagggcataagccctcaa 214  Q
    | |||||| |||||||||||| || |||| ||||||||||    
T  21559463 agtttgaacgacaaggcattcacaaggcaaaagccctcaa 21559424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 139 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 22593793 - 22593664
Alignment:
Q  139 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattcca 237  Q
    ||||||||| ||| |||||| | |||| ||||| |||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||    
T  22593793 gttgaatgactaagcattccggagcataagcccccaacaatttgaatgatgaa-cattccagggcataagcccacaacggttgaatgacaaagcattcca 22593695  T
Q  238 gagcattagctctcaac-agttgaatgacaa 267  Q
    | |||| ||| |||||| | |||||||||||    
T  22593694 gggcatgagccctcaacaatttgaatgacaa 22593664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 139 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 22597348 - 22597219
Alignment:
Q  139 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattcca 237  Q
    ||||||||| ||| |||||| | |||| ||||| |||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||    
T  22597348 gttgaatgactaagcattccggagcataagcccccaacaatttgaatgatgaa-cattccagggcataagcccacaacggttgaatgacaaagcattcca 22597250  T
Q  238 gagcattagctctcaac-agttgaatgacaa 267  Q
    | |||| ||| |||||| | |||||||||||    
T  22597249 gggcatgagccctcaacaatttgaatgacaa 22597219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 219
Target Start/End: Original strand, 4397436 - 4397518
Alignment:
Q  138 ggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt 219  Q
    |||||||||| ||| |||||  |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  4397436 ggttgaatgactaagcattctggggcataagcccccaataatttgaatgacaaggcatttcagggcatgagccctcaacagtt 4397518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 22590238 - 22590109
Alignment:
Q  139 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattcca 237  Q
    ||||||||| ||| |||||| | |||| ||||| |||||||||||||||  |  ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||    
T  22590238 gttgaatgactaagcattccggagcataagcccccaacaatttgaatgatgaa-cattctagggcataagcccacaacggttgaatgacaaagcattcca 22590140  T
Q  238 gagcattagctctcaac-agttgaatgacaa 267  Q
    | |||| ||| |||||| | |||||||||||    
T  22590139 gggcatgagccctcaacaatttgaatgacaa 22590109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 17023038 - 17022880
Alignment:
Q  100 tttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacgg--ttgaatgattaa--cattc-cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcat 194  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||   ||||||| ||||  ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||    ||||    
T  17023038 tttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacgaatttgaatggttaaagcattcacaaggcataagccctcaccaatttgaatgaactagcat 17022939  T
Q  195 tc-cagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctca 252  Q
    || ||||||||| ||||||| || ||||| |||||||| |||||| |||| ||| ||||    
T  17022938 tcacagggcataggccctcaccaattgaacgacaaggcgttccagggcatgagccctca 17022880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 21559523 - 21559443
Alignment:
Q  157 cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattc-cagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaggcattc 235  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  | |||||| |||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  21559523 cagggcatgagccctcaacagtttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctcaacagtttgaacgacaaggcattc 21559443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 22357986 - 22357907
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt 141  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  22357986 ttgaatga-taaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtt 22357907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 215
Target Start/End: Original strand, 7785124 - 7785219
Alignment:
Q  122 ggcataagccctcaacggttgaatgattaacattc-cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcatt-ccagggcataagccctcaac 215  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |  ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||  | ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  7785124 ggcataagccctcaacgattgaatgacttgcattcacagggcataagccctcaacaattggaatgattaagcattcccagggcatgagccctcaac 7785219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 8953108 - 8953034
Alignment:
Q  140 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac 215  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |  ||||| ||||||| ||||||||||    
T  8953108 ttgaatgataaacattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgatta-acattcaagggcatgagccctcaac 8953034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 191 - 265
Target Start/End: Original strand, 23693082 - 23693156
Alignment:
Q  191 gcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagttgaatgac 265  Q
    |||||||||||||| | || ||| | |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| |||||||||    
T  23693082 gcattccagggcatcatccttcacccgttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacaattgaatgac 23693156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 219
Target Start/End: Original strand, 22469949 - 22469990
Alignment:
Q  178 tttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22469949 tttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagtt 22469990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 152 - 255
Target Start/End: Original strand, 22469963 - 22470069
Alignment:
Q  152 cattccagggcatgagccctcaacaatttgaat-gacaaggcattc-cagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattc-cagagcattagct 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  || |||||| |||||||||||||||||||  |||||  ||||||| ||| ||| |||| |||     
T  22469963 cattccagggcatgagccctcaacagtttgaatagttaaagcattcacagggcataagccctcaacgattgaacaacaaggcgttcacagggcataagcc 22470062  T
Q  249 ctcaaca 255  Q
    |||||||    
T  22470063 ctcaaca 22470069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 61 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 21981094 - 21981017
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattc-cggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattc-caaggcataagccctcaa 136  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||| ||| ||| | |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21981094 ttgaatgattaagcattcacagggcataaaccctcaatagtttgaacgacaagacattcacaaggcataagccctcaa 21981017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 8953148 - 8953069
Alignment:
Q  140 ttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt 219  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||| || || ||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8953148 ttgaatgactaagcattccggggcataagtccccaacaatttgaatgataaa-cattccagggcatgagccctcaacagtt 8953069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 212
Target Start/End: Original strand, 10035178 - 10035234
Alignment:
Q  156 ccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctc 212  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||| |||||||    
T  10035178 ccagggcataagccctcaccaatttgaacaacaaggtattccagggcatgagccctc 10035234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 153 - 213
Target Start/End: Original strand, 10035215 - 10035274
Alignment:
Q  153 attccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctca 213  Q
    ||||||||||||||||||||  |  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10035215 attccagggcatgagccctcc-cgctttgaacgacaaggcgttccagggcataagccctca 10035274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 213
Target Start/End: Original strand, 21494999 - 21495055
Alignment:
Q  157 cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctca 213  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||    
T  21494999 cagggcataagccctcaccaatttgaacgacaaggcgttccagggcatgatccctca 21495055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 21559564 - 21559460
Alignment:
Q  157 cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattc-cagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaggcattc-cagagcattagctctcaa 253  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||    |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||  | |||||| ||| |||| ||| |||||    
T  21559564 cagggcataagccctcaacaatttgaatgaactagcattcacagggcatgagccctcaacagtttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctcaa 21559465  T
Q  254 cagtt 258  Q
    |||||    
T  21559464 cagtt 21559460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 216
Target Start/End: Original strand, 7785163 - 7785261
Alignment:
Q  122 ggcataagccctcaacggttg-aatgattaa-cattcc-agggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattc-cagggcataagccctcaaca 216  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||| |  || |||||||| |||||||||||    
T  7785163 ggcataagccctcaacaattggaatgattaagcattcccagggcatgagccctcaacggtttgaacgacaagacgctcacagggcattagccctcaaca 7785261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 34
Target Start/End: Complemental strand, 22759372 - 22759339
Alignment:
Q  1 caacatcatcaacacgatccacaacaacatcaac 34  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22759372 caacatcatcaacacgatccacaagaacatcaac 22759339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 60 - 141
Target Start/End: Original strand, 23693186 - 23693266
Alignment:
Q  60 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt 141  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||  || ||||||| || ||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  23693186 gttgaatgacgaagcattccagggcatgagccctcaacggtt-gaatgacgaggcattccagggcaagagccctcaacggtt 23693266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 179 - 258
Target Start/End: Original strand, 4397438 - 4397518
Alignment:
Q  179 ttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagtt 258  Q
    ||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||| | || ||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||||||    
T  4397438 ttgaatgactaagcattctggggcataagcccccaataatttgaatgacaaggcatttcagggcatgagccctcaacagtt 4397518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 156 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 15194146 - 15194090
Alignment:
Q  156 ccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctc 212  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||  ||||||||||| |||||||    
T  15194146 ccagggcataagccctcaccaatttgaacaacaaggtgttccagggcatgagccctc 15194090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 157 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 21981116 - 21981036
Alignment:
Q  157 cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattc-cagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaggcattc 235  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||  | |||||| |||||||||| ||||||| || ||||| |||||| |||||    
T  21981116 cagggcatgagccctcaatagtttgaatgattaagcattcacagggcataaaccctcaatagtttgaacgacaagacattc 21981036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 218 - 258
Target Start/End: Original strand, 22469950 - 22469990
Alignment:
Q  218 ttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagtt 258  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  22469950 ttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagtt 22469990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 61 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 29325634 - 29325556
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt 141  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||| | ||||||||| || ||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  29325634 ttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac-agttgaatgacgag-cattccagggcatgagccctcagcggtt 29325556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 176; Significance: 7e-95; HSPs: 122)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 264
Target Start/End: Original strand, 38827732 - 38828002
Alignment:
Q  1 caacatcatcaacacgatccacaacaacatcaac------tacgacgtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagccccc 94  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38827732 caacatcatcaacacgatccacaacaacatcaacgacaactacgacgtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagccccc 38827831  T
Q  95 aacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcat 194  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |  |||    
T  38827832 aacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacgattgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacgaatcat 38827931  T
Q  195 tccagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagttgaatga 264  Q
    || ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||| |||||||||    
T  38827932 tctagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacggttgaatga 38828002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 60 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 13396014 - 13395806
Alignment:
Q  60 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaa-cattcc 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||  || ||||||    
T  13396014 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaagcattcc 13395915  T
Q  158 agggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagt 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||    
T  13395914 agggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagt 13395815  T
Q  258 tgaatgaca 266  Q
    |||||||||    
T  13395814 tgaatgaca 13395806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 39 - 269
Target Start/End: Original strand, 48784825 - 48785055
Alignment:
Q  39 acgtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacg 138  Q
    ||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||     
T  48784825 acgtggtactaatttcaacgggttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaaca 48784924  T
Q  139 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattcca 237  Q
    |||||||||  || ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  48784925 gttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaac-agttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaagcattcca 48785023  T
Q  238 gagcattagctctcaacagttgaatgacaaag 269  Q
    | |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  48785024 gggcataagccctcaacagttgaatgacaaag 48785055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 60 - 254
Target Start/End: Original strand, 16006007 - 16006199
Alignment:
Q  60 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccag 159  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16006007 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggtataagccctcaacggttgaatgattaacattccag 16006105  T
Q  160 ggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaac 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||| ||||||    
T  16006106 ggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacga-gcattccagggcatgagccctcaac 16006199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 43 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 21743873 - 21743649
Alignment:
Q  43 ggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacgg-tt 141  Q
    |||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||| |||||||||| | ||    
T  21743873 ggtactattttcaactcaatgaatgactaagcattccgaggcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggcatgagccctcaacagatt 21743775  T
Q  142 gaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagc 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||    
T  21743774 gaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacggttgaatgacga-gcattccagggc 21743676  T
Q  242 attagctctcaacag-ttgaatgacaa 267  Q
    || ||| |||||||| |||||||||||    
T  21743675 atgagccctcaacagattgaatgacaa 21743649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 74 - 256
Target Start/End: Original strand, 8775925 - 8776107
Alignment:
Q  74 cattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagaca-ttccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctc 172  Q
    |||||| |||||| ||||| ||| |  |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8775925 cattccagggcatgagccctcaatagattgaatgacaaggcagttccagggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctc 8776024  T
Q  173 aacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacag 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||| ||||||||    
T  8776025 aacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacga-gcattccagggcatgagccctcaacag 8776107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 61 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 13850074 - 13849878
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagg 160  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||| || || | |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  13850074 ttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcaatctagggcataagccctcaatagttgaatgattaacattccagg 13849975  T
Q  161 gcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagtt 258  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  13849974 gcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgatta-acattccagggcatgagccctcaacagtt 13849878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 74 - 225
Target Start/End: Original strand, 16005941 - 16006093
Alignment:
Q  74 cattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagaca-ttccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctc 172  Q
    |||||| |||||| |||||||||||  |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16005941 cattccagggcatgagcccccaacagattgaatgacaaggcaattccagggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctc 16006040  T
Q  173 aacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatga 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  16006041 aacaatttgaatgacaaggcattccagggtataagccctcaacggttgaatga 16006093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 49 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 14189520 - 14189305
Alignment:
Q  49 atttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgat 148  Q
    |||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| |||||||||||||||     
T  14189520 atttccaacgtgttgaatgactaggcgttccggggcataagcccccaacaatttgaatgataa-acattccagggcataagccttcaacggttgaatgac 14189422  T
Q  149 taa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaggcattccagagcattag 246  Q
     || ||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| |     
T  14189421 aaagcattccagggcataagccctcaa-aagttgaatgacaaggcattctagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaagcattccagggcataat 14189323  T
Q  247 ctctcaacagttgaatga 264  Q
    | ||||||| ||||||||    
T  14189322 ccctcaacaattgaatga 14189305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 39 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 13734017 - 13733838
Alignment:
Q  39 acgtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacg 138  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  13734017 acgtggtactattttcaacgggttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacg 13733918  T
Q  139 gttgaatga-ttaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagt 218  Q
     ||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||    
T  13733917 attgaatgacatagtattccagggcatgagccctcaacga-ttgaatgacatagcattccagggcatgagccctcaacagt 13733838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 61 - 266
Target Start/End: Original strand, 48784887 - 48785091
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattccag 159  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||| ||||| ||||| || |||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||    
T  48784887 ttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaagcattccag 48784985  T
Q  160 ggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagttg 259  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||    
T  48784986 ggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagttg 48785084  T
Q  260 aatgaca 266  Q
    |||||||    
T  48785085 aatgaca 48785091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 41 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 13850173 - 13849946
Alignment:
Q  41 gtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-gg 139  Q
    ||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||| |     
T  13850173 gtggtaccattttcaacgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataa-acattccagggcatgagccctcaacagt 13850075  T
Q  140 ttgaatgatta-acattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccag 238  Q
    ||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||  |  ||||||||    
T  13850074 ttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcaatctagggcataagccctcaatagttgaatgatta-acattccag 13849976  T
Q  239 agcattagctctcaacag-ttgaatgacaa 267  Q
     |||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  13849975 ggcatgagccctcaacagtttgaatgacaa 13849946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 60 - 256
Target Start/End: Original strand, 48784925 - 48785120
Alignment:
Q  60 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattcca 158  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||  || |||||||    
T  48784925 gttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaagcattcca 48785023  T
Q  159 gggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacag 256  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||| ||||||||    
T  48785024 gggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacatagcattccagggcataagccctcaacag 48785120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 41 - 264
Target Start/End: Original strand, 16573070 - 16573293
Alignment:
Q  41 gtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggt 140  Q
    ||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| | ||| |||| ||||||||    
T  16573070 gtggtaccattttcaacgtgttgaatgactaagcattcctgggcatgagcccccaacaatttgaatgataa-acattccaggacatgagccatcaacggt 16573168  T
Q  141 t-gaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccag 238  Q
    | ||||||  || ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||    
T  16573169 ttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacaggttgaatgacaagacattccagggcataagccctcaacagttgaatgatta-acattccag 16573267  T
Q  239 agcattagctctcaacagttgaatga 264  Q
     | || ||| ||||||||||||||||    
T  16573268 ggtataagccctcaacagttgaatga 16573293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 41 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 16592592 - 16592369
Alignment:
Q  41 gtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggt 140  Q
    ||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| | ||| |||| ||||||||    
T  16592592 gtggtaccattttcaacgtgttgaatgactaagcattcctgggcatgagcccccaacaatttgaatgataa-acattccaggacatgagccatcaacggt 16592494  T
Q  141 t-gaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccag 238  Q
    | ||||||  || ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||    
T  16592493 ttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacaggttgaatgacaagacattccagggcataagccctcaacagttgaatgatta-acattccag 16592395  T
Q  239 agcattagctctcaacagttgaatga 264  Q
     | || ||| ||||||||||||||||    
T  16592394 ggtataagccctcaacagttgaatga 16592369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 74 - 225
Target Start/End: Original strand, 4993111 - 4993263
Alignment:
Q  74 cattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagaca-ttccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctc 172  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||  |||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4993111 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcaattccagggcatgagccctcaacggttcaatgattaacattccagggcatgagccctc 4993210  T
Q  173 aacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatga 225  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  4993211 aacaatttgaatggcaaggcattccagggcataagccctcaatggttgaatga 4993263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 61 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 21743776 - 21743619
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagg 160  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||| ||||| |||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  21743776 ttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacggttgaatgacgagcattccagg 21743678  T
Q  161 gcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt 219  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21743677 gcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagtt 21743619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 36 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 124704 - 124483
Alignment:
Q  36 acgacgtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctca 135  Q
    |||||| |||||||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||| ||||||||    
T  124704 acgacggggtactattttcaactcaatgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggcatgagccctca 124606  T
Q  136 ac-ggttgaatgatta-acattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcat 233  Q
    || | ||||||||  |  ||||||||||||| ||||||||||   ||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  124605 acagattgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac-ggttgaatgacga-gcattccagggcatgagccctcaacggttgaatgacaaagcat 124508  T
Q  234 tccagagcattagctctcaacagtt 258  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||||    
T  124507 tccagggcatgagccctcaacagtt 124483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 60 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 17506295 - 17506100
Alignment:
Q  60 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattcca 158  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||  || |||||||    
T  17506295 gttgaatgactaagcattccgggacataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacaattgaatgacaaagcattcca 17506196  T
Q  159 gggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaaca-gttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaac 254  Q
    |||||| ||||||| ||   ||||||||||| ||||||| || | ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||    
T  17506195 gggcataagccctccac-ggttgaatgacaaagcattccgggacgtaagcccccaacattttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaac 17506100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 60 - 254
Target Start/End: Original strand, 17546919 - 17547114
Alignment:
Q  60 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattcca 158  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||  || |||||||    
T  17546919 gttgaatgactaagcattccgggacataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacaattgaatgacaaagcattcca 17547018  T
Q  159 gggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaaca-gttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaac 254  Q
    |||||| ||||||| ||   ||||||||||| ||||||| || | ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||    
T  17547019 gggcataagccctccac-ggttgaatgacaaagcattccgggacgtaagcccccaacattttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaac 17547114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 49 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 14192275 - 14192072
Alignment:
Q  49 atttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgat 148  Q
    |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  |||||||||||||| | |||||||||     
T  14192275 atttccaacgtgttgaatgactaggcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataa-acattccggggcataagccctcaccagttgaatgac 14192177  T
Q  149 ta-acattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagc 247  Q
     |  ||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||| |||| |||    
T  14192176 aaggcattccagggcataagccctcaac-ggttgaatgacaaagcattctagggcataagccctcaacaattgaatgataa-acattccagggcatgagc 14192079  T
Q  248 tctcaac 254  Q
     ||||||    
T  14192078 cctcaac 14192072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 140 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 124639 - 124511
Alignment:
Q  140 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccaga 239  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||     
T  124639 ttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacggttgaatgacga-gcattccagg 124541  T
Q  240 gcattagctctcaacagttgaatgacaaag 269  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||    
T  124540 gcatgagccctcaacggttgaatgacaaag 124511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 61 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 13395973 - 13395777
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaa-cattcca 158  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||  || ||||||  || |||||||    
T  13395973 ttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaagcattcca 13395874  T
Q  159 gggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacag 256  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||| ||||||||    
T  13395873 gggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacatagcattccagggcataagccctcaacag 13395777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 115 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 21065600 - 21065462
Alignment:
Q  115 attccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaa 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||     
T  21065600 attccatggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacagagcattccagggcataagccctcac 21065501  T
Q  215 c-agttgaatgacaaggcattccagagcattagctctca 252  Q
    | | ||||| |||||||| |||||| |||| ||| ||||    
T  21065500 caatttgaacgacaaggcgttccagggcatgagccctca 21065462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 36 - 265
Target Start/End: Original strand, 8775848 - 8776078
Alignment:
Q  36 acgacgtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctca 135  Q
    |||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||| ||||||||    
T  8775848 acgacggggtactattttcaactcattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatga-tggacattccagggcatgagccctca 8775946  T
Q  136 a-cggttgaatgatta-aca-ttccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac-agttgaatgacaaggc 231  Q
    |  | ||||||||  |  || ||||||||||| ||||||||||   ||||||||  |  ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||    
T  8775947 atagattgaatgacaaggcagttccagggcataagccctcaac-ggttgaatgatta-acattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggc 8776044  T
Q  232 attccagagcattagctctcaacagttgaatgac 265  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||    
T  8776045 attccagggcataagccctcaacagttgaatgac 8776078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 60 - 215
Target Start/End: Original strand, 8775991 - 8776144
Alignment:
Q  60 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccag 159  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||  | ||||||||    
T  8775991 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacgagcattccag 8776089  T
Q  160 ggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac 215  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| | | |||||||||||||| ||||||||||    
T  8776090 ggcatgagccctcaacagattgaatggcga-gcattccagggcatgagccctcaac 8776144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 152 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 13395960 - 13395842
Alignment:
Q  152 cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaggcattccagagcattagctct 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||||| |||| ||| ||    
T  13395960 cattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaagcattccagggcataagccct 13395861  T
Q  251 caacagttgaatgacaaag 269  Q
    |||||||||||||||||||    
T  13395860 caacagttgaatgacaaag 13395842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 139 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 17506295 - 17506164
Alignment:
Q  139 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattcca 237  Q
    ||||||||| ||| |||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  17506295 gttgaatgactaagcattccgggacataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacaattgaatgacaaagcattcca 17506196  T
Q  238 gagcattagctctcaacagttgaatgacaaag 269  Q
    | |||| ||| ||| || ||||||||||||||    
T  17506195 gggcataagccctccacggttgaatgacaaag 17506164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 139 - 269
Target Start/End: Original strand, 17546919 - 17547050
Alignment:
Q  139 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattcca 237  Q
    ||||||||| ||| |||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  17546919 gttgaatgactaagcattccgggacataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacaattgaatgacaaagcattcca 17547018  T
Q  238 gagcattagctctcaacagttgaatgacaaag 269  Q
    | |||| ||| ||| || ||||||||||||||    
T  17547019 gggcataagccctccacggttgaatgacaaag 17547050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 60 - 238
Target Start/End: Original strand, 13255429 - 13255609
Alignment:
Q  60 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattcca 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || || |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||  || |||||||    
T  13255429 gttgaatgactaagcattccggggcataagccctcaacaatttgaaagataa-acattccagggcataagccttcaacagttgaatgacaaagcattcca 13255527  T
Q  159 gggcatgagccctcaacaatttgaat-gacaaggcattc-cagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccag 238  Q
    ||||||||||||||    |||||||| |  || |||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||    
T  13255528 gggcatgagccctcccggatttgaatggttaaagcattcacagggcataagccctcaccaattgaacgacaaggcgttccag 13255609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 100 - 269
Target Start/End: Original strand, 13255628 - 13255795
Alignment:
Q  100 tttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccag 199  Q
    |||||| |||||| | ||||  ||||| |||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||| |||||||||    
T  13255628 tttgaacgacaaggcgttcccgggcatgagccctcaccaattgaatgataaacattccagggcataagccctcaac-agttgaatgccaaagcattccag 13255726  T
Q  200 ggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagttgaatgacaaag 269  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  13255727 ggcataagccctcaacaattgaatgataa-acattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaag 13255795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 76 - 260
Target Start/End: Original strand, 13255644 - 13255825
Alignment:
Q  76 ttccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaa 174  Q
    |||| |||||| ||||| || ||||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||   || ||||||||||||| |||||||||    
T  13255644 ttcccgggcatgagccctcaccaatt-gaatgataa-acattccagggcataagccctcaacagttgaatgccaaagcattccagggcataagccctcaa 13255741  T
Q  175 caatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagttga 260  Q
    ||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||| ||||    
T  13255742 caatt-gaatgataaa-cattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcataagcactcaacaattga 13255825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 39 - 176
Target Start/End: Original strand, 35365917 - 35366053
Alignment:
Q  39 acgtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacg 138  Q
    ||||| ||| ||||||| |  |||||||||||||||||| | | |||||||||| || || || |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  35365917 acgtgataccatttccatcgtgttgaatgactaagcattgcagagcataagccctcaccagtt-gaatgacaaggcattccagggcataacccctcaacg 35366015  T
Q  139 gttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaaca 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35366016 gttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaaca 35366053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 61 - 221
Target Start/End: Original strand, 13255668 - 13255825
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagg 160  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||||||||| |||| | ||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  13255668 ttgaatga-taaacattccagggcataagccctcaac-agttgaatgccaaagcattccagggcataagccctcaacaattgaatgataaacattccagg 13255765  T
Q  161 gcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttga 221  Q
    |||| |||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  13255766 gcataagccctcaac-agttgaatgacaaagcattccagggcataagcactcaacaattga 13255825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 101 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 14192263 - 14192100
Alignment:
Q  101 ttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccag 199  Q
    ||||||||| || ||||||  ||||||||||| ||||  || ||||||| |||||||| |||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  14192263 ttgaatgactaggcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataaacattccggggcataagccctcaccagtt-gaatgacaaggcattccag 14192165  T
Q  200 ggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagttgaatga 264  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| || |||| ||| ||||||| ||||||||    
T  14192164 ggcataagccctcaacggttgaatgacaaagcattctagggcataagccctcaacaattgaatga 14192100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 61 - 176
Target Start/End: Original strand, 38827916 - 38828031
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagg 160  Q
    ||||||||| || |||||  |||||| ||||| |||||  |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38827916 ttgaatgacgaatcattctagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagg 38828015  T
Q  161 gcatgagccctcaaca 176  Q
    ||||||||||||||||    
T  38828016 gcatgagccctcaaca 38828031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 140 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 14189468 - 14189339
Alignment:
Q  140 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccaga 239  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||     
T  14189468 ttgaatgataaacattccagggcataagccttcaacggtt-gaatgacaaagcattccagggcataagccctcaaaagttgaatgacaaggcattctagg 14189370  T
Q  240 gcattagctctcaacag-ttgaatgacaaag 269  Q
    |||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  14189369 gcatgagccctcaacagtttgaatgacaaag 14189339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 31 - 264
Target Start/End: Original strand, 16005859 - 16006093
Alignment:
Q  31 caactacgacgtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagc 130  Q
    |||| ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||| ||||| |||    
T  16005859 caacgacggcgtggtactattttcaacacattgaatgactaaacattccggggcataagctcccaacaatttgaatgatga-acattccagggcatgagc 16005957  T
Q  131 cctcaac-ggttgaatgatta--acattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac-agttgaatgac 226  Q
    || |||| | ||||||||  |    |||||||||||| ||||||||||   ||||||||  |  ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  16005958 ccccaacagattgaatgacaaggcaattccagggcataagccctcaac-ggttgaatgatta-acattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgac 16006055  T
Q  227 aaggcattccagagcattagctctcaacagttgaatga 264  Q
    |||||||||||| | || ||| |||||| |||||||||    
T  16006056 aaggcattccagggtataagccctcaacggttgaatga 16006093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 62 - 176
Target Start/End: Original strand, 48743284 - 48743398
Alignment:
Q  62 tgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccaggg 161  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| ||||| | ||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  48743284 tgaatgacaaagcattccagggcatgagccctccacagtttgaatgacaagggattccagggcataagccctcaacaattgaatgattaacattccaggg 48743383  T
Q  162 catgagccctcaaca 176  Q
    |||||||||||||||    
T  48743384 catgagccctcaaca 48743398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 74 - 175
Target Start/End: Original strand, 4993190 - 4993291
Alignment:
Q  74 cattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctca 173  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4993190 cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatggcaaggcattccagggcataagccctcaatggttgaatgattaatattccagggcatgagccctca 4993289  T
Q  174 ac 175  Q
    ||    
T  4993290 ac 4993291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 31 - 264
Target Start/End: Original strand, 4993029 - 4993263
Alignment:
Q  31 caactacgacgtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagc 130  Q
    |||| ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||  | |||||||| ||||| |||    
T  4993029 caacgacggcgtggtactattttcaacacattgaatgactaagcattccttggcataagccccctacaatttgaatgatga-acattccagggcatgagc 4993127  T
Q  131 cctcaac-ggttgaatgatta--acattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac-agttgaatgac 226  Q
    ||||||| | ||||||||  |    |||||||||||||||||||||||   || |||||  |  ||||||||||||| |||||||||| | ||||||| |    
T  4993128 cctcaacagattgaatgacaaggcaattccagggcatgagccctcaac-ggttcaatgatta-acattccagggcatgagccctcaacaatttgaatggc 4993225  T
Q  227 aaggcattccagagcattagctctcaacagttgaatga 264  Q
    |||||||||||| |||| ||| |||||  |||||||||    
T  4993226 aaggcattccagggcataagccctcaatggttgaatga 4993263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 83 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 709702 - 709609
Alignment:
Q  83 gcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaaca 176  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  709702 gcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggaattccagggcataagccctcaacaattgaatgattaacattccagggcatgagccctcaaca 709609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 152 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 14192250 - 14192134
Alignment:
Q  152 cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctc 251  Q
    |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  14192250 cattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataaa-cattccggggcataagccctcaccagttgaatgacaaggcattccagggcataagccctc 14192152  T
Q  252 aacagttgaatgacaaag 269  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  14192151 aacggttgaatgacaaag 14192134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 60 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 47976109 - 47976002
Alignment:
Q  60 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccag 159  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||| |||||| |||||||||| |||    
T  47976109 gttgaattactaatcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataa-acattccaaggcatgagtcctcaacagttgaacgattaacatttcag 47976011  T
Q  160 ggcatgagc 168  Q
    | |||||||    
T  47976010 gacatgagc 47976002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 61 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 13850113 - 13849910
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaa-cattcca 158  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||  |  || || |    
T  13850113 ttgaatga-taaacattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcaatcta 13850015  T
Q  159 gggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagt 257  Q
    |||||| ||||||||| | || ||||||  |  ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||    
T  13850014 gggcataagccctcaatagtt-gaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagt 13849917  T
Q  258 tgaatga 264  Q
    |||||||    
T  13849916 tgaatga 13849910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 94 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 40555882 - 40555756
Alignment:
Q  94 caacaatttgaatgacaagacattc-caaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaa-cattc-cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaa 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||  || |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40555882 caacaatttgaatgacaagacattcacagggcatgaaccctcaacaatttgaatgattaagcattcacaaggcatgagccctcaacaatttgaatgacaa 40555783  T
Q  190 ggcattc-cagggcataagccctcaac 215  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||    
T  40555782 ggcattcacagggcataagccctcaac 40555756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 138 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 13733997 - 13733868
Alignment:
Q  138 ggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattcc 236  Q
    |||||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||  | |||||    
T  13733997 ggttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacgattgaatgacatagtattcc 13733898  T
Q  237 agagcattagctctcaacagttgaatgaca 266  Q
    || |||| ||| ||||||  ||||||||||    
T  13733897 agggcatgagccctcaacgattgaatgaca 13733868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 114 - 225
Target Start/End: Original strand, 16458920 - 16459031
Alignment:
Q  114 cattccaaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctc 212  Q
    |||||||  ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  16458920 cattccagagcatacgccctcaacagtttgaatgattaacattccagggcatgagacctcaacagtttgaatgataa-ccattccagggcataagccctc 16459018  T
Q  213 aacagttgaatga 225  Q
    ||| |||||||||    
T  16459019 aacggttgaatga 16459031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 101 - 212
Target Start/End: Original strand, 11660764 - 11660874
Alignment:
Q  101 ttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagg 200  Q
    ||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  11660764 ttgaatgactaaacattccagggcataagccctaaacaattgaatgataaacattccagggcataagctctcaacaa-ttgaatgacaaagcattccagg 11660862  T
Q  201 gcataagccctc 212  Q
    |||| |||||||    
T  11660863 gcatgagccctc 11660874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 54 - 180
Target Start/End: Original strand, 16573202 - 16573326
Alignment:
Q  54 caacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaaca 153  Q
    ||||| |||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||||| || ||||||  | |||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16573202 caacaggttgaatgacaagacattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgatta-acattccagggtataagccctcaacagttgaatgattaaca 16573299  T
Q  154 ttccagggcatgagccctcaacaattt 180  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||    
T  16573300 ttccagggcatgagccatcaacaattt 16573326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 54 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 16592460 - 16592336
Alignment:
Q  54 caacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaaca 153  Q
    ||||| |||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||||| || ||||||  | |||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16592460 caacaggttgaatgacaagacattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgatta-acattccagggtataagccctcaacagttgaatgattaaca 16592363  T
Q  154 ttccagggcatgagccctcaacaattt 180  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||    
T  16592362 ttccagggcatgagccatcaacaattt 16592336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 152 - 258
Target Start/End: Original strand, 48743296 - 48743401
Alignment:
Q  152 cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctc 251  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  |  |||||||| |||| ||| |||    
T  48743296 cattccagggcatgagccctccacagtttgaatgacaagggattccagggcataagccctcaacaattgaatgatta-acattccagggcatgagccctc 48743394  T
Q  252 aacagtt 258  Q
    |||||||    
T  48743395 aacagtt 48743401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 161 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 709702 - 709606
Alignment:
Q  161 gcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagtt 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  |  |||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  709702 gcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggaattccagggcataagccctcaacaattgaatgatta-acattccagggcatgagccctcaacagtt 709606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 150 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 709779 - 709710
Alignment:
Q  150 aacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  709779 aacattccagggcatgagccctcaacagtttaaatgacaaggcattccagggcataagccatcaacagtt 709710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 49 - 219
Target Start/End: Original strand, 48743232 - 48743401
Alignment:
Q  49 atttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttgaatga 147  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||| ||||||| || | ||||||||    
T  48743232 attttcaacatgttgaatgactaagcattctggggcataag-ccccaacaatctgaatgacaaagcattccagggcatgagccctccacagtttgaatga 48743330  T
Q  148 tta-acattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt 219  Q
      |   |||||||||||| |||||||||||| ||||||||  |  ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  48743331 caagggattccagggcataagccctcaacaa-ttgaatgatta-acattccagggcatgagccctcaacagtt 48743401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 60 - 252
Target Start/End: Original strand, 11660763 - 11660956
Alignment:
Q  60 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattcca 158  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||| |||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||  || |||||||    
T  11660763 gttgaatgactaaacattccagggcataagccctaaacaa-ttgaatgataa-acattccagggcataagctctcaacaattgaatgacaaagcattcca 11660860  T
Q  159 gggcatgagccctcaacaatttgaat-gacaaggcattc-cagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctca 252  Q
    ||||||||||||||    |||||||| |  || |||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||| |||| ||| ||||    
T  11660861 gggcatgagccctcccggatttgaatggttaaagcattcacagggcataagccctcaccaattgaacgacaaggcgttccagggcatgagccctca 11660956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 61 - 172
Target Start/End: Original strand, 16458947 - 16459056
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagg 160  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||| || || ||||| ||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16458947 ttgaatgattaa-cattccagggcatgagacctcaacagtttgaatgataac-cattccagggcataagccctcaacggttgaatgattaacattctagg 16459044  T
Q  161 gcatgagccctc 172  Q
    ||||||||||||    
T  16459045 gcatgagccctc 16459056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 74 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 21743803 - 21743619
Alignment:
Q  74 cattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacgg-ttgaatgattaa-cattccagggcatgagccct 171  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||  ||||||||  | |||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||  |  ||||||||||||| ||||||    
T  21743803 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgatta-acattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcataagccct 21743705  T
Q  172 caacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagtt 258  Q
    ||||  || ||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  21743704 caacggtt-gaatgacgag-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagtt 21743619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 152 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 124666 - 124553
Alignment:
Q  152 cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaggcattccagagcattagctct 250  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||||||||||||  |  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||    
T  124666 cattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcataagccct 124568  T
Q  251 caacagttgaatgac 265  Q
    |||| ||||||||||    
T  124567 caacggttgaatgac 124553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 139 - 243
Target Start/End: Original strand, 13255429 - 13255533
Alignment:
Q  139 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattcca 237  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  13255429 gttgaatgactaagcattccggggcataagccctcaacaatttgaaagataaa-cattccagggcataagccttcaacagttgaatgacaaagcattcca 13255527  T
Q  238 gagcat 243  Q
    | ||||    
T  13255528 gggcat 13255533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 60 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 17506177 - 17506096
Alignment:
Q  60 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt 141  Q
    |||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  17506177 gttgaatgacaaagcattccgggacgtaagcccccaacattttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacggtt 17506096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 60 - 141
Target Start/End: Original strand, 17547037 - 17547118
Alignment:
Q  60 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt 141  Q
    |||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  17547037 gttgaatgacaaagcattccgggacgtaagcccccaacattttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacggtt 17547118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 60 - 179
Target Start/End: Original strand, 13255705 - 13255823
Alignment:
Q  60 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattcca 158  Q
    |||||||| | ||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||| |||||||||  || |||||||    
T  13255705 gttgaatgccaaagcattccagggcataagccctcaacaa-ttgaatgataa-acattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaagcattcca 13255802  T
Q  159 gggcatgagccctcaacaatt 179  Q
    |||||| ||| ||||||||||    
T  13255803 gggcataagcactcaacaatt 13255823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 139 - 264
Target Start/End: Original strand, 48743243 - 48743369
Alignment:
Q  139 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaggcattcc 236  Q
    ||||||||| ||| |||||  |||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  48743243 gttgaatgactaagcattctggggcataagccc-caacaatctgaatgacaaagcattccagggcatgagccctccacagtttgaatgacaagggattcc 48743341  T
Q  237 agagcattagctctcaacagttgaatga 264  Q
    || |||| ||| ||||||| ||||||||    
T  48743342 agggcataagccctcaacaattgaatga 48743369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 157 - 258
Target Start/End: Original strand, 15725455 - 15725557
Alignment:
Q  157 cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattc-cagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaaca 255  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||    |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||||    
T  15725455 cagggcataagccctcaacaatttgaatgaactagcattcacagggcatgagccctcaaaagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaaca 15725554  T
Q  256 gtt 258  Q
    |||    
T  15725555 gtt 15725557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 60 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 711097 - 711021
Alignment:
Q  60 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac 137  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  |||| ||||||||||    
T  711097 gttgaatgactaagcattccagggcataagcccccaacaatttgaatgataa-acattccagtgcatgagccctcaac 711021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 152 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 13733942 - 13733838
Alignment:
Q  152 cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctc 251  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  | |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||  ||||||||| |||| ||| |||    
T  13733942 cattccagggcatgagccctcaacgatt-gaatgacatagtattccagggcatgagccctcaacgattgaatgacatagcattccagggcatgagccctc 13733844  T
Q  252 aacagt 257  Q
    ||||||    
T  13733843 aacagt 13733838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 60 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 14189392 - 14189278
Alignment:
Q  60 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccag 159  Q
    |||||||||| | ||||||  |||||| ||||| ||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||| ||    
T  14189392 gttgaatgacaaggcattctagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaagcattccagggcataatccctcaacaattgaatgataaacattctag 14189293  T
Q  160 ggcatgagccctcaac 175  Q
    |||||| |||||||||    
T  14189292 ggcatg-gccctcaac 14189278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 122 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 12202146 - 12202048
Alignment:
Q  122 ggcataagccctcaacggttg-aatgattaa-cattcc-agggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattc-cagggcataagccctcaaca 216  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  12202146 ggcataagccctcaacagttggaatgattaagcattcccagggcatgagccctcaacggtttgaacgacaaggcgttcacagggcataagccctcaaca 12202048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 192 - 265
Target Start/End: Original strand, 16006098 - 16006172
Alignment:
Q  192 cattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagttgaatgac 265  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||    
T  16006098 cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgac 16006172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 81 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 7507636 - 7507496
Alignment:
Q  81 gggcataagcccccaacaatttgaatga-caagacattc-caaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaac-attc-cagggcatgagccctcaac 175  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||| || ||||| |||||||||| ||| |||| |||||  |||| |||||||||| ||||||||    
T  7507636 gggcataagccctcaacaatttgaatgaactag-cattcacagggcatgagccctcaacagtttgaataattaagtattcacagggcatgaaccctcaac 7507538  T
Q  176 aatttgaatgacaaggcattc-cagggcataagccctcaaca 216  Q
    | |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7507537 agtttgaacgacaaggcattcacagggcataagccctcaaca 7507496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 81 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 7507759 - 7507619
Alignment:
Q  81 gggcataagcccccaacaatttgaatga-caagacattc-caaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaac-attc-cagggcatgagccctcaac 175  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||| || ||||| |||||||||| ||| |||| |||||  |||| |||||||||| ||||||||    
T  7507759 gggcataagccctcaacaatttgaatgaactag-cattcacagggcatgagccctcaacagtttgaataattaagtattcacagggcatgaaccctcaac 7507661  T
Q  176 aatttgaatgacaaggcattc-cagggcataagccctcaaca 216  Q
    | |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7507660 agtttgaacgacaaggcattcacagggcataagccctcaaca 7507619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 160 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 8757452 - 8757395
Alignment:
Q  160 ggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattc-cagggcataagccctcaaca 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  8757452 ggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattcacagtgcataagccctcaaca 8757395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 179 - 264
Target Start/End: Original strand, 35365939 - 35366024
Alignment:
Q  179 ttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagttgaatga 264  Q
    ||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||| |||||||||    
T  35365939 ttgaatgactaagcattgcagagcataagccctcaccagttgaatgacaaggcattccagggcataacccctcaacggttgaatga 35366024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 21519424 - 21519278
Alignment:
Q  100 tttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa--cattc-cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattc 196  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||  | ||  ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||    ||||||    
T  21519424 tttgaatgacaagacattccagggcatgagccctcaacagttgaatagtcaaagcattcacagggcatgagccctcaccaa-ttgaatgaactagcattc 21519326  T
Q  197 -cagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcat 243  Q
     ||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| ||||    
T  21519325 acagggcataagccctctccaattgaacgacaaggcgttccagggcat 21519278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 154 - 269
Target Start/End: Original strand, 13255604 - 13255718
Alignment:
Q  154 ttccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaa 253  Q
    ||||||| |||||||||||| |  |||||| |||||||| |||| |||||| |||||||| || |||||||| ||  |||||||| |||| ||| |||||    
T  13255604 ttccaggtcatgagccctcaccgctttgaacgacaaggcgttcccgggcatgagccctcaccaattgaatgataa-acattccagggcataagccctcaa 13255702  T
Q  254 cagttgaatgacaaag 269  Q
    |||||||||| |||||    
T  13255703 cagttgaatgccaaag 13255718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 101 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 711096 - 711010
Alignment:
Q  101 ttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatga 186  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||||||||| ||||  || ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  711096 ttgaatgactaagcattccagggcataagcccccaacaatttgaatgataaacattccagtgcatgagccctcaacaatttgaatga 711010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 269
Target Start/End: Original strand, 11660764 - 11660853
Alignment:
Q  179 ttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagttgaatgacaaag 269  Q
    ||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||  |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  11660764 ttgaatgactaaacattccagggcataagccctaaacaattgaatgataa-acattccagggcataagctctcaacaattgaatgacaaag 11660853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 81 - 216
Target Start/End: Original strand, 4324975 - 4325115
Alignment:
Q  81 gggcataagcccccaacaatttgaatga-caagacattc-caaggcataagccctcaacgg-ttgaatgattaa-cattc-cagggcatgagccctcaac 175  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||| || ||||||||||| ||||   |||||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||    
T  4324975 gggcataagccctcaacaatttgaatcaactag-cattcacagggcataagcccccaacaacttgaatgattaagcattcacagggtatgagccatcaac 4325073  T
Q  176 aatttgaatgacaaggcattc-cagggcataagccctcaaca 216  Q
    | |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  4325074 agtttgaatgacaatgcattcacagggcataagccctcaaca 4325115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 160 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 22122816 - 22122759
Alignment:
Q  160 ggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattc-cagggcataagccctcaaca 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||    
T  22122816 ggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattcacagggcataaacccccaaca 22122759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 160 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 40556017 - 40555960
Alignment:
Q  160 ggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattc-cagggcataagccctcaaca 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||    
T  40556017 ggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattcacagggcataaacccccaaca 40555960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 175
Target Start/End: Original strand, 16458906 - 16459021
Alignment:
Q  60 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttgaatgattaacattcca 158  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||||| |||| ||||| |||||||||  | |||||||| ||||| || ||||||| | ||||||||| | |||||||    
T  16458906 gttgaataactaagcattccagagcatacgccctcaacagtttgaatgatta-acattccagggcatgagacctcaacagtttgaatgataaccattcca 16459004  T
Q  159 gggcatgagccctcaac 175  Q
    |||||| ||||||||||    
T  16459005 gggcataagccctcaac 16459021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 107
Target Start/End: Original strand, 13407739 - 13407786
Alignment:
Q  60 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatg 107  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13407739 gttgaatgactgagcattccggggcatgagcccccaacaatttgaatg 13407786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 122 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 12208760 - 12208662
Alignment:
Q  122 ggcataagccctcaacggttg-aatgattaa-cattcc-agggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattc-cagggcataagccctcaaca 216  Q
    |||||||||||||||| |||| || |||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||    
T  12208760 ggcataagccctcaacagttggaacgattaagcattcccagggcatgagccctcaacggtttgaacgacaaggcgttcacagggcataagccttcaaca 12208662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 100 - 255
Target Start/End: Original strand, 15689865 - 15690025
Alignment:
Q  100 tttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttgaatgattaa--cattc-cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcatt 195  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| | ||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||   ||||||||    |||||    
T  15689865 tttgaatgacaagacattcaagggcatgagccctcaacagtttgaatggttaaagcattcacagggcatgagccctcaac-ggttgaatgaactagcatt 15689963  T
Q  196 c-cagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattc-cagagcattagctctcaaca 255  Q
    | |||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||| ||| |||| ||| |||||||    
T  15689964 cacagggcataagccctcaacgattgaacgacaaggcgttcacagggcataagccctcaaca 15690025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 100 - 255
Target Start/End: Original strand, 15697458 - 15697618
Alignment:
Q  100 tttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttgaatgattaa--cattc-cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcatt 195  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| | ||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||   ||||||||    |||||    
T  15697458 tttgaatgacaagacattcaagggcatgagccctcaacagtttgaatggttaaagcattcacagggcatgagccctcaac-ggttgaatgaactagcatt 15697556  T
Q  196 c-cagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattc-cagagcattagctctcaaca 255  Q
    | |||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||| ||| |||| ||| |||||||    
T  15697557 cacagggcataagccctcaacgattgaacgacaaggcgttcacagggcataagccctcaaca 15697618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 61 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 40555834 - 40555752
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattc-cggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattc-caaggcataagccctcaacggtt 141  Q
    |||||||| ||||||||| |  ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  40555834 ttgaatgattaagcattcacaaggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattcacagggcataagccctcaacggtt 40555752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 13395855 - 13395779
Alignment:
Q  60 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac 137  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||||   ||||||| ||||||||||||||||    
T  13395855 gttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacatagcattccagggcataagccctcaac 13395779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 14192147 - 14192068
Alignment:
Q  60 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt 141  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||| |||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  14192147 gttgaatgacaaagcattctagggcataagccctcaacaatt-gaatgataa-acattccagggcatgagccctcaacggtt 14192068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 81 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 15731902 - 15731803
Alignment:
Q  81 gggcataagcccccaacaatttgaatga-caagacattc-caaggcataagccctcaac-ggttgaatgattaa-cattc-cagggcatgagccctcaac 175  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  15731902 gggcataagccctcaacaatttgaatgaactag-cattcacagggcataagccctcaacagtttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctcaac 15731804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 157 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 40555856 - 40555776
Alignment:
Q  157 cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattc-cagggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaggcattc 235  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||  | |||||| || ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  40555856 cagggcatgaaccctcaacaatttgaatgattaagcattcacaaggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattc 40555776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 709777 - 709710
Alignment:
Q  192 cattccagggcataagccctcaacagttgaa-tgacaaggcattccagagcattagctctcaacagtt 258  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| |||| |||  |||||||||    
T  709777 cattccagggcatgagccctcaacagtttaaatgacaaggcattccagggcataagccatcaacagtt 709710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 15731903 - 15731800
Alignment:
Q  158 agggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattc-cagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaggcattc-cagagcattagctctcaac 254  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||| ||| |||| ||| ||||||    
T  15731903 agggcataagccctcaacaatttgaatgaactagcattcacagggcataagccctcaacagtttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctcaac 15731804  T
Q  255 agtt 258  Q
    ||||    
T  15731803 agtt 15731800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 711097 - 711020
Alignment:
Q  139 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaaca 216  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||  |||||||| |||| |||||||||||    
T  711097 gttgaatgactaagcattccagggcataagcccccaacaatttgaatgataaa-cattccagtgcatgagccctcaaca 711020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 216
Target Start/End: Original strand, 7529109 - 7529207
Alignment:
Q  122 ggcataagccctcaacggttg-aatgattaa-cattcc-agggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattc-cagggcataagccctcaaca 216  Q
    ||||||||||||||||  ||| || |||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||||    
T  7529109 ggcataagccctcaacaattggaacgattaagcattcccagggcatgagccctcaacggtttgaacgacaatgcgttcgcagggcataagccctcaaca 7529207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 12202186 - 12202048
Alignment:
Q  122 ggcataagccctcaacggttgaatg-attaacattc-cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcatt-ccagggcataagccctcaacag- 217  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| | || ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||  | ||||| ||||||||| |||||||||| |     
T  12202186 ggcataagccctcaacgattgaatgaactagcattcacagggcataagccctcaacagttggaatgattaagcattcccagggcatgagccctcaacggt 12202087  T
Q  218 ttgaatgacaaggcattc-cagagcattagctctcaaca 255  Q
    ||||| |||||||| ||| ||| |||| ||| |||||||    
T  12202086 ttgaacgacaaggcgttcacagggcataagccctcaaca 12202048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 16668699 - 16668543
Alignment:
Q  100 tttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacg-gttgaatgattaa--cattc-cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcatt 195  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||  ||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||    |||||    
T  16668699 tttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaccgatttgaatggttaaagcattcacagggcatgagccctcaccaa-ttgaatgagctagcatt 16668601  T
Q  196 c-cagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctca 252  Q
    |  |||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |||| ||| ||||    
T  16668600 catagggcataagccctctccaattgaacgacaaggcgttccagggcatgagccctca 16668543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 17643069 - 17642913
Alignment:
Q  100 tttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacg-gttgaatgattaa--cattc-cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcatt 195  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||  ||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||    |||||    
T  17643069 tttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaccgatttgaatggttaaagcattcacagggcatgagccctcaccaa-ttgaatgagctagcatt 17642971  T
Q  196 c-cagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctca 252  Q
    |  |||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |||| ||| ||||    
T  17642970 catagggcataagccctctccaattgaacgacaaggcgttccagggcatgagccctca 17642913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 21065536 - 21065462
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctca 135  Q
    |||||||||  |||||||| |||||||||||| || ||||||||| |||||| | ||||| ||||| ||||||||    
T  21065536 ttgaatgacagagcattccagggcataagccctcaccaatttgaacgacaaggcgttccagggcatgagccctca 21065462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 39995908 - 39995810
Alignment:
Q  122 ggcataagccctcaacggttg-aatgattaa-cattcc-agggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattc-cagggcataagccctcaaca 216  Q
    |||||||||||||||| |||| || |||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||  ||| ||||||||||||| ||||||    
T  39995908 ggcataagccctcaacagttggaacgattaagcattcccagggcatgagccctcaacggtttgaacgacaaggtgttcacagggcataagccttcaaca 39995810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 40555998 - 40555837
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattc-cggggcataagcccccaacaatttgaatga-caagacattc-caaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaa-catt 155  Q
    ||||||||| | |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||| || ||||| | ||||||||  || |||||||||| ||||    
T  40555998 ttgaatgacaaggcattcacagggcataaacccccaacaatttgaatgaactag-cattcacagggcatgatccctcaacaatttgaatgattaagcatt 40555900  T
Q  156 c-cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattc-cagggcataagccctcaaca 216  Q
    | || ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||    
T  40555899 cacatggcatggaccctcaacaatttgaatgacaagacattcacagggcatgaaccctcaaca 40555837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 47976001 - 47975967
Alignment:
Q  142 gaatgattaacattccagggcatgagccctcaaca 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47976001 gaatgattaacattccagggcatgagccctcaaca 47975967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 81 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 7507677 - 7507496
Alignment:
Q  81 gggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattc-caaggcataagccctcaacggtt-gaatgat-taacattc-cagggcatgagccctcaaca 176  Q
    |||||| | ||| ||||| |||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||  || ||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  7507677 gggcatgaaccctcaacagtttgaacgacaaggcattcacagggcataagccctcaacaatttgaatgaactagcattcacagggcatgagccctcaaca 7507578  T
Q  177 atttgaatgacaaggcattc-cagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaggcattc-cagagcattagctctcaaca 255  Q
     ||||||| |  | | |||| |||||||| | |||||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||| ||| |||||||    
T  7507577 gtttgaataattaagtattcacagggcatgaaccctcaacagtttgaacgacaaggcattcacagggcataagccctcaaca 7507496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 157 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 8757496 - 8757395
Alignment:
Q  157 cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattc-cagggcataagccctcaac-agttgaatgacaaggcattc-cagagcattagctctcaa 253  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||    |||||| || ||||| |||||||||| | |||||||||||||||||| ||| |||| ||| |||||    
T  8757496 cagggcataagccctcaacaatttgaatgaactagcattcacaaggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattcacagtgcataagccctcaa 8757397  T
Q  254 ca 255  Q
    ||    
T  8757396 ca 8757395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 160 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 41783152 - 41783099
Alignment:
Q  160 ggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctca 213  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  41783152 ggcatgagccctcaccactttgaacgacaaggcgttccagggcatgagccctca 41783099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 13865468 - 13865424
Alignment:
Q  63 gaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatg 107  Q
    |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  13865468 gaatgactgagcattccggcgcatgagcccccaacaatttgaatg 13865424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 141
Target Start/End: Original strand, 16006125 - 16006203
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt 141  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16006125 ttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacgag-cattccagggcatgagccctcaacggtt 16006203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 140 - 216
Target Start/End: Original strand, 4324913 - 4324992
Alignment:
Q  140 ttgaatgattaa-cattc-cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattc-cagggcataagccctcaaca 216  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||    |||||| ||||||||||||||||||||    
T  4324913 ttgaatgattaagcattcacagggcataagacctcaacaatttgaatgaactagcattcacagggcataagccctcaaca 4324992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 157 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 7507761 - 7507698
Alignment:
Q  157 cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattc-cagggcataagccctcaacagtt 219  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||    |||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  7507761 cagggcataagccctcaacaatttgaatgaactagcattcacagggcatgagccctcaacagtt 7507698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 178 - 213
Target Start/End: Original strand, 14038579 - 14038614
Alignment:
Q  178 tttgaatgacaaggcattccagggcataagccctca 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14038579 tttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctca 14038614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 178 - 213
Target Start/End: Original strand, 14348609 - 14348644
Alignment:
Q  178 tttgaatgacaaggcattccagggcataagccctca 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14348609 tttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctca 14348644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 157 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 15731863 - 15731800
Alignment:
Q  157 cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattc-cagggcataagccctcaacagtt 219  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||  | |||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  15731863 cagggcataagccctcaacagtttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctcaacagtt 15731800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 60 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 21735588 - 21735541
Alignment:
Q  60 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatg 107  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| |||||||||    
T  21735588 gttgaatgactgagcattccagggcatgagcccccaacgatttgaatg 21735541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 61 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 22122797 - 22122636
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattc-cggggcataagcccccaacaatttgaatga-caagacattc-caaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaa-catt 155  Q
    ||||||||| | |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||| || ||||| | ||||||||  || |||||||||| ||||    
T  22122797 ttgaatgacaaggcattcacagggcataaacccccaacaatttgaatgaactag-cattcacagggcatgatccctcaacaatttgaatgattaagcatt 22122699  T
Q  156 c-cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattc-cagggcataagccctcaaca 216  Q
    | || ||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| | |||||||||    
T  22122698 cacatggcatggaccctcaacaatttgaatgacaanacattcacagggcatgaaccctcaaca 22122636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 212
Target Start/End: Original strand, 17065655 - 17065689
Alignment:
Q  178 tttgaatgacaaggcattccagggcataagccctc 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17065655 tttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctc 17065689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 47976095 - 47976026
Alignment:
Q  152 cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaa 222  Q
    |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  47976095 cattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataa-acattccaaggcatgagtcctcaacagttgaa 47976026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 157 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 7507720 - 7507619
Alignment:
Q  157 cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattc-cagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaggcattc-cagagcattagctctcaa 253  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |  | | |||| |||||||| | |||||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||| ||| |||||    
T  7507720 cagggcatgagccctcaacagtttgaataattaagtattcacagggcatgaaccctcaacagtttgaacgacaaggcattcacagggcataagccctcaa 7507621  T
Q  254 ca 255  Q
    ||    
T  7507620 ca 7507619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 34
Target Start/End: Original strand, 38827672 - 38827705
Alignment:
Q  1 caacatcatcaacacgatccacaacaacatcaac 34  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38827672 caacatcatcaacacgatccacaagaacatcaac 38827705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 201 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 709702 - 709638
Alignment:
Q  201 gcataagccctcaacagtt-gaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagttgaatga 264  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||    
T  709702 gcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggaattccagggcataagccctcaacaattgaatga 709638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 82 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 8757452 - 8757396
Alignment:
Q  82 ggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattc-caaggcataagccctcaac 137  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||    
T  8757452 ggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattcacagtgcataagccctcaac 8757396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 61 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 12757175 - 12757143
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccc 93  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12757175 ttgaatgactaagcatttcggggcataagcccc 12757143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 218 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 21519423 - 21519379
Alignment:
Q  218 ttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagttgaat 262  Q
    |||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  21519423 ttgaatgacaagacattccagggcatgagccctcaacagttgaat 21519379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 125)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 60 - 269
Target Start/End: Original strand, 33848480 - 33848688
Alignment:
Q  60 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccag 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33848480 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccagggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccag 33848579  T
Q  160 ggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagttg 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||| |||| ||| |||||||||||    
T  33848580 ggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgatta-acattccagggcatgagccctcaacagttg 33848678  T
Q  260 aatgacaaag 269  Q
    ||||||||||    
T  33848679 aatgacaaag 33848688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 25 - 219
Target Start/End: Original strand, 10313330 - 10313523
Alignment:
Q  25 caacatcaactacgacgtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggc 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||    
T  10313330 caacaacaactacgacgtggtactattttcaacacattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaag-catcccagggc 10313428  T
Q  125 ataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt 219  Q
    || ||||||||||||||||||||  | |||||||| |||  ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10313429 atgagccctcaacggttgaatgacaagcattccagagcacaagccctcaacagtttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtt 10313523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 43 - 267
Target Start/End: Original strand, 14698249 - 14698473
Alignment:
Q  43 ggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacgg-tt 141  Q
    |||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||| |||||||||| | ||    
T  14698249 ggtactattttcaactcaatgaatgactaagcattccgaggcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggcatgagccctcaacagatt 14698347  T
Q  142 gaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagc 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||    
T  14698348 gaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacggttgaatgacga-gcattccagggc 14698446  T
Q  242 attagctctcaacag-ttgaatgacaa 267  Q
    || ||| |||||||| |||||||||||    
T  14698447 atgagccctcaacagattgaatgacaa 14698473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 43 - 267
Target Start/End: Original strand, 4170557 - 4170781
Alignment:
Q  43 ggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacgg-tt 141  Q
    |||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | | |||||| ||||| |||||||||| | ||    
T  4170557 ggtactattttcaactcaatgaatgactaagcattccgaggcataagcccccaacaatttgaatgatgaaa-attccagggcatgagccctcaacagatt 4170655  T
Q  142 gaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagc 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||    
T  4170656 gaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacggttgaatgacga-gcattccagggc 4170754  T
Q  242 attagctctcaacag-ttgaatgacaa 267  Q
    || ||| |||||||| |||||||||||    
T  4170755 atgagccctcaacagattgaatgacaa 4170781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 39 - 258
Target Start/End: Original strand, 16359093 - 16359313
Alignment:
Q  39 acgtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac- 137  Q
    ||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||     
T  16359093 acgtggtactaatttcaacgggttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaaca 16359192  T
Q  138 ggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattcc 236  Q
    | ||||||||  || ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  16359193 gtttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaac-agttgaatgacatagcattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacatagcattcc 16359291  T
Q  237 agagcattagctctcaacagtt 258  Q
    || |||| ||| ||||||||||    
T  16359292 agggcatgagccctcaacagtt 16359313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 31 - 255
Target Start/End: Original strand, 6511365 - 6511589
Alignment:
Q  31 caactacgacgtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagc 130  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||  |||    
T  6511365 caacaacgacgtggtactattttcaacacgttgaatgactaagcattccggggcataatcccccaacaatttgaatgataa-acattccagggcacgagc 6511463  T
Q  131 cctcaac-ggttgaatgatta-acattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaa 228  Q
    ||||||| | ||||||||  |  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6511464 cctcaacagtttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtttgaatgataa-acattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaa 6511562  T
Q  229 ggcattccagagcattagctctcaaca 255  Q
     ||||||||| |||| ||| |||||||    
T  6511563 agcattccagggcataagccctcaaca 6511589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 61 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 14942817 - 14942621
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaacattccag 159  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||    
T  14942817 ttgaatgactaagcattcaggtgcataagcccccaacaatttgaatgataa-acattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgataaacattctag 14942719  T
Q  160 ggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagtt 258  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  14942718 ggcatgagccctcaatagtttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgatta-acattccagggcatgagccctcaacagtt 14942621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 74 - 254
Target Start/End: Original strand, 15989930 - 15990111
Alignment:
Q  74 cattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctca 173  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| ||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15989930 cattccagggcataaaccctcaacatttttaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagttgaatgataaacattccagggcatgagccctca 15990029  T
Q  174 acaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaac 254  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||    
T  15990030 acagtttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagtttgaatgacgaggcattccagggcataagccctcaac 15990111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 39 - 219
Target Start/End: Original strand, 28382453 - 28382633
Alignment:
Q  39 acgtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacg 138  Q
    ||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||     
T  28382453 acgtggtactaatttcaacgggttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaaca 28382552  T
Q  139 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt 219  Q
    |||||||||  || ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28382553 gttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaac-agttgaatgacatagcattccagggcataagccctcaacagtt 28382633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 74 - 226
Target Start/End: Original strand, 41791273 - 41791426
Alignment:
Q  74 cattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagaca-ttccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctc 172  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||  |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41791273 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcaattccagggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctc 41791372  T
Q  173 aacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgac 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  41791373 aacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcatcggttgaatgac 41791426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 39 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 15280573 - 15280394
Alignment:
Q  39 acgtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacg 138  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||     
T  15280573 acgtggtactattttcaacgggttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcgttccagggcatgagccctcaaca 15280474  T
Q  139 gttgaatga-ttaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagt 218  Q
    |||||||||  || |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||    
T  15280473 gttgaatgacatagcattccagggcatgagccctcaac-agttgaatgacatagcattccagggcatgagccctcaacagt 15280394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 60 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 16278654 - 16278445
Alignment:
Q  60 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaa-cattcc 157  Q
    |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||  || ||||||    
T  16278654 gttgaatgacaaagcattccggagcgtaagcccccaacattttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaagcattcc 16278555  T
Q  158 agggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagt 257  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |  |||||||| |||| ||| |||||||||    
T  16278554 agggcatgagccctcaacaatt-gaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagt 16278457  T
Q  258 tgaatgacaaag 269  Q
    ||||||||||||    
T  16278456 tgaatgacaaag 16278445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 60 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 9388534 - 9388387
Alignment:
Q  60 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccag 159  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9388534 gttgaatgactacgcattccggggcataagcccccaacagtt-gaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccag 9388436  T
Q  160 ggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagcc 209  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  9388435 ggcatgagccctcaac-agttgaatgacaaagcattccatggcataagcc 9388387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 60 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 16278772 - 16278561
Alignment:
Q  60 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattcca 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||  || |||||||    
T  16278772 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacaattgaatgacaaagcattcca 16278673  T
Q  159 gggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaaca-gttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacag- 256  Q
    |||||| ||||||| ||   ||||||||||| ||||||| | || ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||     
T  16278672 gggcataagccctccac-ggttgaatgacaaagcattccggagcgtaagcccccaacattttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagt 16278574  T
Q  257 ttgaatgacaaag 269  Q
    |||||||||||||    
T  16278573 ttgaatgacaaag 16278561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 74 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 56116286 - 56116095
Alignment:
Q  74 cattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctca 173  Q
    |||||| | |||| ||||| |||||  ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56116286 cattccagtgcatgagccctcaacagattgaacgacaaggcattccagggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctca 56116187  T
Q  174 acaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagttgaatga 264  Q
     ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  |||| ||| |||| ||| |||||| |||||||||    
T  56116186 ccaatttgaacgacaaggcgttccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaatcattacagggcataagccctcaacggttgaatga 56116095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 60 - 215
Target Start/End: Original strand, 33848559 - 33848712
Alignment:
Q  60 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccag 159  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33848559 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgattaacattccag 33848657  T
Q  160 ggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac 215  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  33848658 ggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 33848712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 76 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 56116166 - 56115971
Alignment:
Q  76 ttccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaac 175  Q
    |||| |||||| ||||| |||||  |||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  56116166 ttccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaatcattacagggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcataagccctcaac 56116067  T
Q  176 aatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac-agttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacag-ttgaatgacaaag 269  Q
    |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||||| |||||||| |||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  56116066 agattgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaccaatttgaacgacaaggcgttccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaag 56115971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 61 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 16278573 - 16278421
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagg 160  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16278573 ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacaatt-gaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagg 16278475  T
Q  161 gcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac 215  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  16278474 gcatgagccctcaac-agttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 16278421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 61 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 16278731 - 16278522
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattccag 159  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  || |||||| |    
T  16278731 ttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacaatt-gaatgacaaagcattccagggcataagccctccacggttgaatgacaaagcattccgg 16278633  T
Q  160 ggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagtt 258  Q
     || | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||| ||    
T  16278632 agcgtaagcccccaacattttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacaatt 16278533  T
Q  259 gaatgacaaag 269  Q
    |||||||||||    
T  16278532 gaatgacaaag 16278522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 74 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 15242599 - 15242415
Alignment:
Q  74 cattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagaca-ttccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctc 172  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||  |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15242599 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcaattccagggcataagccctcaacagttgaatgattaacattccagggcatgagccctc 15242500  T
Q  173 aacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagtt 258  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  |  |||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  15242499 aacagattgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacggttaaatgatta-acattccagggcatgagccctcaacagtt 15242415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 61 - 219
Target Start/End: Original strand, 4170654 - 4170811
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagg 160  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||| ||||| |||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  4170654 ttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacggttgaatgacgagcattccagg 4170752  T
Q  161 gcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt 219  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4170753 gcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagtt 4170811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 61 - 217
Target Start/End: Original strand, 14698346 - 14698501
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagg 160  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||| ||||| |||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  14698346 ttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacggttgaatgacgagcattccagg 14698444  T
Q  161 gcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacag 217  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14698445 gcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacag 14698501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 36 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 55503260 - 55503039
Alignment:
Q  36 acgacgtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctca 135  Q
    |||||| |||||||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||| ||||||||    
T  55503260 acgacggggtactattttcaactcaatgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggcatgagccctca 55503162  T
Q  136 ac-ggttgaatgatta-acattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcat 233  Q
    || | ||||||||  |  ||||||||||||| ||||||||||   ||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  55503161 acagattgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac-ggttgaatgacga-gcattccagggcatgagccctcaacggttgaatgacaaagcat 55503064  T
Q  234 tccagagcattagctctcaacagtt 258  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||||    
T  55503063 tccagggcatgagccctcaacagtt 55503039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 41 - 267
Target Start/End: Original strand, 27027527 - 27027760
Alignment:
Q  41 gtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-gg 139  Q
    ||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||| |     
T  27027527 gtggtaccattttcaacgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataa-acattccagggcatgagccctcaacagt 27027625  T
Q  140 ttgaatgatta-acattccag------ggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaggc 231  Q
    ||||||||  |  ||||||||      ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  27027626 ttgaatgacaaggcattccagggcataggcatgagccctcaacagtttgaatgacaa-acatttcagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggc 27027724  T
Q  232 attccagagcattagctctcaacagttgaatgacaa 267  Q
    ||||||| |||| ||| ||||||  ||||| |||||    
T  27027725 attccagggcataagccctcaacgattgaacgacaa 27027760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 152 - 266
Target Start/End: Original strand, 16359168 - 16359282
Alignment:
Q  152 cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctc 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||| |||    
T  16359168 cattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacatagcattccagggcatgagccctc 16359267  T
Q  252 aacagttgaatgaca 266  Q
    |||||||||||||||    
T  16359268 aacagttgaatgaca 16359282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 138 - 266
Target Start/End: Original strand, 28382473 - 28382602
Alignment:
Q  138 ggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattcc 236  Q
    |||||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28382473 ggttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattcc 28382572  T
Q  237 agagcattagctctcaacagttgaatgaca 266  Q
    || |||| ||| ||||||||||||||||||    
T  28382573 agggcataagccctcaacagttgaatgaca 28382602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 140 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 55503195 - 55503067
Alignment:
Q  140 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccaga 239  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||     
T  55503195 ttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacggttgaatgacga-gcattccagg 55503097  T
Q  240 gcattagctctcaacagttgaatgacaaag 269  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||    
T  55503096 gcatgagccctcaacggttgaatgacaaag 55503067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 39 - 217
Target Start/End: Original strand, 286718 - 286897
Alignment:
Q  39 acgtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaa-c 137  Q
    ||||||||||| || ||||  |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||      
T  286718 acgtggtactaatttcaacgggttgaatgactaagtatttcggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaata 286817  T
Q  138 ggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacag 217  Q
    | ||||||||  || ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  286818 gtttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaac-agttgaatgacatagcattccagggcataagccctcaacag 286897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 140 - 269
Target Start/End: Original strand, 6511435 - 6511564
Alignment:
Q  140 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaggcattccag 238  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||    
T  6511435 ttgaatgataaacattccagggcacgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtttgaatgataa-acattccag 6511533  T
Q  239 agcattagctctcaacagttgaatgacaaag 269  Q
     |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  6511534 ggcatgagccctcaacagttgaatgacaaag 6511564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 61 - 258
Target Start/End: Original strand, 27027587 - 27027791
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcata------agccctcaacggtt-gaatgattaaca 153  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||      |||||||||| ||| ||||||  ||||    
T  27027587 ttgaatga-taaacattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattccagggcataggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaaca 27027685  T
Q  154 ttccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattc-cagagcattagctctca 252  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||| ||| |||| ||| ||||    
T  27027686 tttcagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacgattgaacgacaaggcgttcacagggcataagccctca 27027785  T
Q  253 acagtt 258  Q
    ||||||    
T  27027786 acagtt 27027791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 140 - 223
Target Start/End: Original strand, 3336989 - 3337072
Alignment:
Q  140 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaat 223  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3336989 ttgaatgataaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaat 3337072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 61 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 31117498 - 31117344
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagg 160  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||  || ||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31117498 ttgaatgattaa-cattccagggcataagccctcaacggtt-gaatgacgag-cattccagggcatgagccctcaacggttgaatgattaacattccagg 31117402  T
Q  161 gcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt 219  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31117401 gcatgagccctcaac-ggttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtt 31117344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 138 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 15280553 - 15280424
Alignment:
Q  138 ggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattcc 236  Q
    |||||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  15280553 ggttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcgttccagggcatgagccctcaacagttgaatgacatagcattcc 15280454  T
Q  237 agagcattagctctcaacagttgaatgaca 266  Q
    || |||| ||| ||||||||||||||||||    
T  15280453 agggcatgagccctcaacagttgaatgaca 15280424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 140 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 15448549 - 15448464
Alignment:
Q  140 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatga 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15448549 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatctgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacacttgaatga 15448464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 158 - 258
Target Start/End: Original strand, 13881385 - 13881485
Alignment:
Q  158 agggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagt 257  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  13881385 agggcataagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaatggttgaatgacaaagcattccagagcatgagccctcaacagt 13881484  T
Q  258 t 258  Q
    |    
T  13881485 t 13881485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 41 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 15242671 - 15242447
Alignment:
Q  41 gtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-gg 139  Q
    ||||||| |||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||| |||||||||| |     
T  15242671 gtggtaccattttcaacgtgttaaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggcatgagccctcaacaga 15242573  T
Q  140 ttgaatgatta--acattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaggcattcc 236  Q
    ||||||||  |    |||||||||||| |||||||||| | ||||||||  |  ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15242572 ttgaatgacaaggcaattccagggcataagccctcaac-agttgaatgatta-acattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattcc 15242475  T
Q  237 agagcattagctctcaacagttgaatga 264  Q
    || |||| ||| |||||| ||| |||||    
T  15242474 agggcataagccctcaacggttaaatga 15242447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 39 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 24047965 - 24047750
Alignment:
Q  39 acgtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacg 138  Q
    |||||| || |||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||     
T  24047965 acgtggcaccattttcaacttgttgaatgactaagcattctggggcataagcccccaacaatttgaatgataa-acattccagggcataagccctcaaca 24047867  T
Q  139 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaat-gacaaggcattc-cagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattc 235  Q
     ||||||||  || |||||||||||||||||||||    |||||||| |  || |||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||||| |||    
T  24047866 attgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcctggatttgaatggttaaagcattcacatggcataagccctcaccaattgaacgacaaggcgttc 24047767  T
Q  236 cagagcattagctctca 252  Q
    ||| |||| ||| ||||    
T  24047766 cagggcatgagccctca 24047750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 39 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 47127278 - 47127139
Alignment:
Q  39 acgtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac- 137  Q
    ||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||     
T  47127278 acgtggtactaatttcaacgggttgaatgactaagcattccggggcataagcccccgacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaaca 47127179  T
Q  138 ggttgaatga-ttaacattccagggcatgagccctcaaca 176  Q
    | ||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||    
T  47127178 gtttgaatgacatagcattccagggcataagccctcaaca 47127139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 60 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 21190192 - 21190078
Alignment:
Q  60 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccag 159  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  21190192 gttgaatgaccaagcattctagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagttgaatgataaacattccag 21190093  T
Q  160 ggcatgagccctcaa 174  Q
    |||||||||||||||    
T  21190092 ggcatgagccctcaa 21190078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 60 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 53388150 - 53388033
Alignment:
Q  60 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttgaatgattaa-cattcc 157  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||  || ||||||    
T  53388150 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaacgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaagcattcc 53388051  T
Q  158 agggcatgagccctcaac 175  Q
    ||||||||||||||||||    
T  53388050 agggcatgagccctcaac 53388033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 152 - 256
Target Start/End: Original strand, 286793 - 286897
Alignment:
Q  152 cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctc 251  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||| |||    
T  286793 cattccagggcatgagccctcaatagtttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacatagcattccagggcataagccctc 286892  T
Q  252 aacag 256  Q
    |||||    
T  286893 aacag 286897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 41 - 176
Target Start/End: Original strand, 13881346 - 13881482
Alignment:
Q  41 gtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggt 140  Q
    ||||||| |||| ||||  |||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||    
T  13881346 gtggtacaattttcaacgtgttgaatgactaagcaatctagggcataagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaatggt 13881445  T
Q  141 tgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaaca 176  Q
    |||||||  || |||||||| ||||||||||||||||    
T  13881446 tgaatgacaaagcattccagagcatgagccctcaaca 13881482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 74 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 31117525 - 31117344
Alignment:
Q  74 cattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctca 173  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||  ||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  31117525 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgatta-acattccagggcataagccctcaacggttgaatgacgagcattccagggcatgagccctca 31117427  T
Q  174 acaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagtt 258  Q
    ||  || ||||||  |  ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  31117426 acggtt-gaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacggttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtt 31117344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 31 - 265
Target Start/End: Original strand, 41791190 - 41791426
Alignment:
Q  31 caactacgacgtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattcc-ggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataag 129  Q
    |||| |||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||| ||    
T  41791190 caacgacgatgtggtactgttttcaacacattgaatgactaagcattccgggggcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggcatgag 41791288  T
Q  130 ccctcaac-ggttgaatgatta--acattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac-agttgaatga 225  Q
    |||||||| | ||||||||  |    |||||||||||| ||||||||||   ||||||||  |  ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||    
T  41791289 ccctcaacagattgaatgacaaggcaattccagggcataagccctcaac-ggttgaatgatta-acattccagggcatgagccctcaacaatttgaatga 41791386  T
Q  226 caaggcattccagagcattagctctcaacagttgaatgac 265  Q
    ||||||||||||| |||| ||| |||| | ||||||||||    
T  41791387 caaggcattccagggcataagccctcatcggttgaatgac 41791426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 61 - 219
Target Start/End: Original strand, 6511474 - 6511631
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattccag 159  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||    
T  6511474 ttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtttgaatgataa-acattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccag 6511572  T
Q  160 ggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt 219  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6511573 ggcataagccctcaacaatttgaatgatta-acattccagggcatgagccctcaacagtt 6511631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 130 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 15449882 - 15449787
Alignment:
Q  130 ccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatga 225  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  15449882 ccctcaacaattgaatgataaacattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattccagggcataagtcctcaatagttgaatga 15449787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 61 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 16278613 - 16278421
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattccag 159  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||  || ||||||||    
T  16278613 ttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacaattgaatgacaaagcattccag 16278514  T
Q  160 ggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaac 254  Q
    ||||| ||||||||||  || ||||||  |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||    
T  16278513 ggcataagccctcaacggtt-gaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 16278421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 152 - 258
Target Start/End: Original strand, 28382528 - 28382633
Alignment:
Q  152 cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctc 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||| |||    
T  28382528 cattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacatagcattccagggcataagccctc 28382626  T
Q  252 aacagtt 258  Q
    |||||||    
T  28382627 aacagtt 28382633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 88 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 31117550 - 31117372
Alignment:
Q  88 agcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacgg-ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatga 186  Q
    |||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||    
T  31117550 agcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccagggcataagccctcaacggtt-gaatga 31117453  T
Q  187 caaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagttgaatgacaaag 269  Q
    | || ||||||||||||| |||||||||| |||||||||  |  |||||||| |||| ||| |||||| ||||||||||||||    
T  31117452 cgag-cattccagggcatgagccctcaacggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacggttgaatgacaaag 31117372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 41 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 33684994 - 33684861
Alignment:
Q  41 gtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggt 140  Q
    ||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||| ||    
T  33684994 gtggtaccattttcaacatgttgaatgactaagcattccatggcataagcccccaacaatttgaatgataa-acattccagggcatgagccctcaacagt 33684896  T
Q  141 tgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaa 174  Q
    |||||||  || ||||||||||||| |||||||||    
T  33684895 tgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaa 33684861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 140 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 14942777 - 14942653
Alignment:
Q  140 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaggcattccag 238  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  14942777 ttgaatgataaacattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgataaa-cattctagggcatgagccctcaatagtttgaatgacaaggcattccag 14942679  T
Q  239 agcattagctctcaacagttgaatga 264  Q
     |||| ||| ||||||||||||||||    
T  14942678 ggcataagccctcaacagttgaatga 14942653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 140 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 15242611 - 15242483
Alignment:
Q  140 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggc-attccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccag 238  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||    
T  15242611 ttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcaattccagggcataagccctcaacagttgaatgatta-acattccag 15242513  T
Q  239 agcattagctctcaacag-ttgaatgacaa 267  Q
     |||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  15242512 ggcatgagccctcaacagattgaatgacaa 15242483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 61 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 15449872 - 15449756
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagg 160  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  15449872 ttgaatga-taaacattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattccagggcataagtcctcaatagttgaatgattaacattccagg 15449774  T
Q  161 gcatgagccctcaacaat 178  Q
    ||||||||||||||||||    
T  15449773 gcatgagccctcaacaat 15449756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 64 - 215
Target Start/End: Original strand, 15989960 - 15990111
Alignment:
Q  64 aatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttgaatgattaa-cattccaggg 161  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||| |||| | |||||||| || |||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||  || ||||||||||    
T  15989960 aatgacaaagcattccagggcataagccctcaac-agttgaatgataa-acattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaagcattccaggg 15990057  T
Q  162 catgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac 215  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15990058 cataagccctcaacagtttgaatgacgaggcattccagggcataagccctcaac 15990111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 139 - 238
Target Start/End: Original strand, 13877706 - 13877806
Alignment:
Q  139 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattcca 237  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  13877706 gttgaatgactaagcattccagggcataagccctcaacaatttgagtgacaaggcattccagggcataagccttcaacggttgaatgacaaagcattcca 13877805  T
Q  238 g 238  Q
    |    
T  13877806 g 13877806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 41 - 215
Target Start/End: Original strand, 13877687 - 13877853
Alignment:
Q  41 gtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggt 140  Q
    ||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  13877687 gtggtacaattttcaacgtgttgaatgactaagcattccagggcataagccctcaacaatttgagtgacaaggcattccagggcataagccttcaacggt 13877786  T
Q  141 tgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac 215  Q
    |||||||  || ||||||||        ||||||||  || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  13877787 tgaatgacaaagcattccag--------ccctcaacggtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 13877853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 61 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 15448549 - 15448432
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagg 160  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||    
T  15448549 ttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatctgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacacttgaatgattaacattctagg 15448451  T
Q  161 gcatgagccctcaacaatt 179  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  15448450 gcatgtgccctcaacaatt 15448432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 152 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 21190178 - 21190073
Alignment:
Q  152 cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctc 251  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||| |||| ||| |||    
T  21190178 cattctagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagttgaatgataa-acattccagggcatgagccctc 21190080  T
Q  252 aacagtt 258  Q
    || ||||    
T  21190079 aatagtt 21190073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 61 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 56116063 - 56115909
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttgaatgattaa-cattcca 158  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||| || ||||||||| |||||| | ||||| ||||| |||||||||| | ||||||||  || |||||||    
T  56116063 ttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaccaatttgaacgacaaggcgttccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaagcattcca 56115964  T
Q  159 gggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctca 213  Q
    | |||| |||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  56115963 gagcataagccctcaccaatttgaacgacaaggcgttccagggcatgagccctca 56115909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 159 - 266
Target Start/End: Original strand, 286760 - 286868
Alignment:
Q  159 gggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagt 257  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||    
T  286760 gggcataagcccccaacaatttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaatagtttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagt 286859  T
Q  258 tgaatgaca 266  Q
    |||||||||    
T  286860 tgaatgaca 286868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 60 - 233
Target Start/End: Original strand, 15989756 - 15989928
Alignment:
Q  60 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattcca 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||| ||||  |||||||||  || ||||| |    
T  15989756 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataag-cattccagggcatgagccttcaatagttgaatgacaaagcattcta 15989854  T
Q  159 gggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaggcat 233  Q
    ||| || || ||||||||| |||||||| ||  |||| ||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  15989855 gggtataagtcctcaacaa-ttgaatgataa-acatttcagagcatgagccctcaacagtttgaatgacaaagcat 15989928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 101 - 264
Target Start/End: Original strand, 15989835 - 15990003
Alignment:
Q  101 ttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcat----tc 196  Q
    |||||||||||  ||||| | || ||||| |||||||  ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||    ||    
T  15989835 ttgaatgacaaagcattctagggtataagtcctcaacaattgaatgataaacatttcagagcatgagccctcaacagtttgaatgacaaagcatccattc 15989934  T
Q  197 cagggcataagccctcaacagttg-aatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagttgaatga 264  Q
    |||||||||| ||||||||| ||  |||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  15989935 cagggcataaaccctcaacatttttaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagttgaatga 15990003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 139 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 53388150 - 53388033
Alignment:
Q  139 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaggcattcc 236  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  53388150 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaacgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaagcattcc 53388051  T
Q  237 agagcattagctctcaac 254  Q
    || |||| ||| ||||||    
T  53388050 agggcatgagccctcaac 53388033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 138 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 47127258 - 47127138
Alignment:
Q  138 ggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaggcattc 235  Q
    |||||||||| ||| |||||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||    
T  47127258 ggttgaatgactaagcattccggggcataagcccccgacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacatagcattc 47127159  T
Q  236 cagagcattagctctcaacag 256  Q
    ||| |||| ||| ||||||||    
T  47127158 cagggcataagccctcaacag 47127138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 140 - 269
Target Start/End: Original strand, 10313366 - 10313495
Alignment:
Q  140 ttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccag 238  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  10313366 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaag-catcccagggcatgagccctcaacggttgaatgacaa-gcattccag 10313463  T
Q  239 agcattagctctcaacag-ttgaatgacaaag 269  Q
    ||||  ||| |||||||| |||||||||||||    
T  10313464 agcacaagccctcaacagtttgaatgacaaag 10313495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 154 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 15280496 - 15280394
Alignment:
Q  154 ttccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaa 253  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||| |||||    
T  15280496 ttccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacatagcattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacatagcattccagggcatgagccctcaa 15280398  T
Q  254 cagt 257  Q
    ||||    
T  15280397 cagt 15280394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 60 - 175
Target Start/End: Original strand, 41791339 - 41791453
Alignment:
Q  60 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccag 159  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||  | | |||||     
T  41791339 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcatcggttgaatgacgagcgttccaa 41791437  T
Q  160 ggcatgagccctcaac 175  Q
    ||||||||||||||||    
T  41791438 ggcatgagccctcaac 41791453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 41 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 56116358 - 56116130
Alignment:
Q  41 gtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-gg 139  Q
    ||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||  |||| |||||||||| |     
T  56116358 gtggtaccattttcaacgggttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatga-tcattccagtgcatgagccctcaacaga 56116260  T
Q  140 ttgaatgatta-acattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac-agttgaatgacaaggcattcca 237  Q
    ||||| ||  |  ||||||||||||| ||||||||||   ||||||||  |  ||||||||||||| |||||||| | | ||||| |||||||| |||||    
T  56116259 ttgaacgacaaggcattccagggcataagccctcaac-ggttgaatgatta-acattccagggcatgagccctcaccaatttgaacgacaaggcgttcca 56116162  T
Q  238 gagcattagctctcaacag-ttgaatgacaaa 268  Q
    | |||| ||| |||||||| ||||||||||||    
T  56116161 gggcatgagccctcaacagattgaatgacaaa 56116130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 61 - 219
Target Start/End: Original strand, 3336989 - 3337130
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagg 160  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||             
T  3336989 ttgaatga-taaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaataattaa--------- 3337078  T
Q  161 gcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt 219  Q
           |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3337079 -------cccttaacaatttgaatgacaaggcattctagggcataagccctcaacagtt 3337130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 152 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 9388520 - 9388405
Alignment:
Q  152 cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctc 251  Q
    |||||| |||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |  |||||||| |||| ||| |||    
T  9388520 cattccggggcataagcccccaacagtt-gaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctc 9388423  T
Q  252 aacagttgaatgacaaag 269  Q
    ||||||||||||||||||    
T  9388422 aacagttgaatgacaaag 9388405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 139 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 33684975 - 33684856
Alignment:
Q  139 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattcca 237  Q
    ||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33684975 gttgaatgactaagcattccatggcataagcccccaacaatttgaatgataaa-cattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattcca 33684877  T
Q  238 gagcattagctctcaacagtt 258  Q
    | |||| ||| ||||| ||||    
T  33684876 gggcataagccctcaatagtt 33684856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 179 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 20899834 - 20899759
Alignment:
Q  179 ttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaac 254  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||    
T  20899834 ttgaatgactaagcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaac 20899759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 60 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 56116103 - 56115909
Alignment:
Q  60 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaa-cattcc 157  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||||||||| |||||  |||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |  || ||| ||  |  | ||||    
T  56116103 gttgaatgattaa-cattccagggcataagccctcaacagattgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaccaatttgaacgacaaggcgttcc 56116005  T
Q  158 agggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac-agttgaatgacaaggcattccagagcattagctctca 252  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | | ||||| |||||||| |||||| |||| ||| ||||    
T  56116004 agggcatgagccctcaacagattgaatgacaaagcattccagagcataagccctcaccaatttgaacgacaaggcgttccagggcatgagccctca 56115909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 95 - 176
Target Start/End: Original strand, 3337084 - 3337166
Alignment:
Q  95 aacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaacattccagggcatgagccctcaaca 176  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3337084 aacaatttgaatgacaaggcattctagggcataagccctcaacagtttgaatgattaacattccagggtatgagccctcaaca 3337166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 75 - 258
Target Start/End: Original strand, 4170628 - 4170811
Alignment:
Q  75 attccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacgg-ttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctc 172  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||  ||||||||  | |||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||  |  ||||||||||||| |||||||    
T  4170628 attccagggcatgagccctcaacagattgaatgatta-acattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcataagccctc 4170726  T
Q  173 aacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagtt 258  Q
    |||  || ||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  4170727 aacggtt-gaatgacgag-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagtt 4170811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 152 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 55503222 - 55503109
Alignment:
Q  152 cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaggcattccagagcattagctct 250  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||||||||||||  |  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||    
T  55503222 cattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcataagccct 55503124  T
Q  251 caacagttgaatgac 265  Q
    |||| ||||||||||    
T  55503123 caacggttgaatgac 55503109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 179 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 9388533 - 9388448
Alignment:
Q  179 ttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagttgaatga 264  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||| |||||||||    
T  9388533 ttgaatgactacgcattccggggcataagcccccaacagttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacggttgaatga 9388448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 74 - 256
Target Start/End: Original strand, 14698319 - 14698501
Alignment:
Q  74 cattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacgg-ttgaatgattaa-cattccagggcatgagccct 171  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||  ||||||||  | |||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||  |  ||||||||||||| ||||||    
T  14698319 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgatta-acattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcataagccct 14698417  T
Q  172 caacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacag 256  Q
    ||||  || ||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||    
T  14698418 caacggtt-gaatgacgag-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacag 14698501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 61 - 141
Target Start/End: Original strand, 15990035 - 15990115
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt 141  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15990035 ttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagtttgaatgacgaggcattccagggcataagccctcaacggtt 15990115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 41 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 20899854 - 20899755
Alignment:
Q  41 gtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggt 140  Q
    ||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  20899854 gtggtaccattttcaacgtgttgaatgactaagcattccagggcataagccctcaac-agttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacggt 20899756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 179 - 269
Target Start/End: Original strand, 28382475 - 28382566
Alignment:
Q  179 ttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagttgaatgacaaag 269  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  28382475 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaag 28382566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 122 - 216
Target Start/End: Original strand, 8710554 - 8710652
Alignment:
Q  122 ggcataagccctcaacggtt-gaatgattaa-cattc-cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattc-cagggcataagccctcaaca 216  Q
    ||||||||||||||||  || |||||||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8710554 ggcataagccctcaacaatttgaatgattaagcattcacggggcatgagcccttaacaatttgaatgacaaggcattcacagggcataagccctcaaca 8710652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 166 - 262
Target Start/End: Original strand, 3336976 - 3337072
Alignment:
Q  166 agccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagttgaat 262  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  3336976 agcccccaacaatttgaatgataaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaat 3337072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 139 - 258
Target Start/End: Original strand, 6511394 - 6511514
Alignment:
Q  139 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaggcattcc 236  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||| | ||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6511394 gttgaatgactaagcattccggggcataatcccccaacaatttgaatgataa-acattccagggcacgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattcc 6511492  T
Q  237 agagcattagctctcaacagtt 258  Q
    || |||| ||| ||||||||||    
T  6511493 agggcataagccctcaacagtt 6511514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 156 - 258
Target Start/End: Original strand, 10313422 - 10313523
Alignment:
Q  156 ccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaggcattccagagcattagctctcaac 254  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||    
T  10313422 ccagggcatgagccctcaacggtt-gaatgacaag-cattccagagcacaagccctcaacagtttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 10313519  T
Q  255 agtt 258  Q
    ||||    
T  10313520 agtt 10313523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 179 - 269
Target Start/End: Original strand, 13877707 - 13877798
Alignment:
Q  179 ttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagttgaatgacaaag 269  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| |||| |||  ||||| ||||||||||||||    
T  13877707 ttgaatgactaagcattccagggcataagccctcaacaatttgagtgacaaggcattccagggcataagccttcaacggttgaatgacaaag 13877798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 152 - 258
Target Start/End: Original strand, 15989970 - 15990075
Alignment:
Q  152 cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaggcattccagagcattagctct 250  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || |||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| ||| ||    
T  15989970 cattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgataaa-cattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaagcattccagggcataagccct 15990067  T
Q  251 caacagtt 258  Q
    ||||||||    
T  15990068 caacagtt 15990075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 139 - 264
Target Start/End: Original strand, 15989756 - 15989881
Alignment:
Q  139 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattcca 237  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||| |    
T  15989756 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataag-cattccagggcatgagccttcaatagttgaatgacaaagcattcta 15989854  T
Q  238 gagcattagctctcaacagttgaatga 264  Q
    | | || ||  ||||||| ||||||||    
T  15989855 gggtataagtcctcaacaattgaatga 15989881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 179 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 21190191 - 21190105
Alignment:
Q  179 ttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagttgaatga 264  Q
    ||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  21190191 ttgaatgaccaagcattctagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagttgaatga 21190105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 152 - 254
Target Start/End: Original strand, 33848612 - 33848712
Alignment:
Q  152 cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctc 251  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||  |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| |||    
T  33848612 cattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctc 33848709  T
Q  252 aac 254  Q
    |||    
T  33848710 aac 33848712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 139 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 20899835 - 20899759
Alignment:
Q  139 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac 215  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20899835 gttgaatgactaagcattccagggcataagccctcaac-agttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaac 20899759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 179 - 269
Target Start/End: Original strand, 13881366 - 13881457
Alignment:
Q  179 ttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagttgaatgacaaag 269  Q
    ||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| ||| |||||  ||||||||||||||    
T  13881366 ttgaatgactaagcaatctagggcataagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaatggttgaatgacaaag 13881457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 60 - 137
Target Start/End: Original strand, 6511551 - 6511627
Alignment:
Q  60 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac 137  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||| ||||| ||||||||||    
T  6511551 gttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacaatttgaatgatta-acattccagggcatgagccctcaac 6511627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 101 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 9388533 - 9388398
Alignment:
Q  101 ttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccag 199  Q
    ||||||||| |  ||||||  ||||||||||| |||| |||||||||  |  ||||||||||||| ||||||||||  || ||||||  |  ||||||||    
T  9388533 ttgaatgactacgcattccggggcataagcccccaacagttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacggtt-gaatgattaa-cattccag 9388436  T
Q  200 ggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattcca 237  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9388435 ggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattcca 9388398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 192 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 15448537 - 15448464
Alignment:
Q  192 cattccagggcataagccctcaacagt-tgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagttgaatga 264  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||    
T  15448537 cattccagggcatgagccctcaacaatctgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacacttgaatga 15448464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 192 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 15449860 - 15449787
Alignment:
Q  192 cattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagttgaatga 264  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||||||    
T  15449860 cattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattccagggcataagtcctcaatagttgaatga 15449787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 36 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 31131870 - 31131813
Alignment:
Q  36 acgacgtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccc 93  Q
    |||||| |||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31131870 acgacggggtactattttcaactcattgaatgactaagcattccggggcataagcccc 31131813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 53388149 - 53388057
Alignment:
Q  179 ttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacag-ttgaatgacaaag 269  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  53388149 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaacgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaag 53388057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 107
Target Start/End: Original strand, 18221102 - 18221149
Alignment:
Q  60 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatg 107  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18221102 gttgaatgactgagcattccggggcatgagcccccaacaatttgaatg 18221149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 61 - 137
Target Start/End: Original strand, 8710573 - 8710651
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattc-cggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattc-caaggcataagccctcaac 137  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  8710573 ttgaatgattaagcattcacggggcatgagcccttaacaatttgaatgacaaggcattcacagggcataagccctcaac 8710651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 62 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 15448509 - 15448397
Alignment:
Q  62 tgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccaggg 161  Q
    |||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||  | |||||| | |||||  |||||||||  |||||||||||||||||||| |    
T  15448509 tgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacactt-gaatgatta-acattctagggcatgtgccctcaacaattgaatgattaacattccagag 15448412  T
Q  162 catgagccctcaaca 176  Q
    |||||||||| ||||    
T  15448411 catgagcccttaaca 15448397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 47127256 - 47127167
Alignment:
Q  179 ttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacag-ttgaatgaca 266  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  47127256 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccgacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgaca 47127167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 157 - 220
Target Start/End: Original strand, 18079533 - 18079597
Alignment:
Q  157 cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattc-cagggcataagccctcaacagttg 220  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||    |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18079533 cagggcatgagcactcaacaatttgaatgaactagcattcacagggcataagccctcaacagttg 18079597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 122 - 218
Target Start/End: Original strand, 18079577 - 18079677
Alignment:
Q  122 ggcataagccctcaacggttg-aatgattaa-cattcc-agggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattc-cagggcataagccctcaacag 217  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| | | ||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||    
T  18079577 ggcataagccctcaacagttggaatgattaagcattcccacgacatgagccctcaacagtttgaacgacagggcgttcacagggcatgagccctcaacag 18079676  T
Q  218 t 218  Q
    |    
T  18079677 t 18079677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 73 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 53388097 - 53388029
Alignment:
Q  73 gcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt 141  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  53388097 gcattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtt 53388029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 4616123 - 4616068
Alignment:
Q  157 cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattc-cagggcataagccct 211  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||    
T  4616123 cagggcatgagccctcaaaaatttgaatgataaggcattcacagggcataacccct 4616068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 101 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 20899834 - 20899759
Alignment:
Q  101 ttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgatta-acattccagggcatgagccctcaac 175  Q
    ||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||    
T  20899834 ttgaatgactaagcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaac 20899759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 33684974 - 33684884
Alignment:
Q  179 ttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagttgaatgacaaag 269  Q
    ||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||||| || |||||| ||  |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  33684974 ttgaatgactaagcattccatggcataagcccccaacaatttgaatgataaa-cattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaag 33684884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 85 - 176
Target Start/End: Original strand, 3336973 - 3337065
Alignment:
Q  85 ataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttgaatgatta-acattccagggcatgagccctcaaca 176  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||   ||||||||  |  ||||||||||||| |||||||||||    
T  3336973 ataagcccccaacaatttgaatgataa-acattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaaca 3337065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 157 - 255
Target Start/End: Original strand, 8710551 - 8710652
Alignment:
Q  157 cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattc-cagggcataagccctcaac-agttgaatgacaaggcattc-cagagcattagctctcaa 253  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| | |||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||| ||| |||| ||| |||||    
T  8710551 cagggcataagccctcaacaatttgaatgattaagcattcacggggcatgagcccttaacaatttgaatgacaaggcattcacagggcataagccctcaa 8710650  T
Q  254 ca 255  Q
    ||    
T  8710651 ca 8710652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 156 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 16371755 - 16371694
Alignment:
Q  156 ccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattc-cagggcataagccctcaaca 216  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  16371755 ccagggcatgagccctcaacggtttgaacgacaaggcgttcacagggtataagccctcaaca 16371694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 122 - 216
Target Start/End: Original strand, 32489757 - 32489854
Alignment:
Q  122 ggcataagccctcaacggttgaatgat-taacattc-cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattcc-agggcataagccctcaaca 216  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  || || || |||||||| ||||||||||| || ||||||  | ||||||| |||||||||||||||||||    
T  32489757 ggcataagccctcaacgattgaatgaactagcactcacagggcataagccctcaacagttggaatgattaagcattcccagggcataagccctcaaca 32489854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 4616164 - 4616084
Alignment:
Q  157 cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattc-cagggcataagccctc-aacagttgaatgacaaggcattc 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  | | |||| |||||||| ||||||| || | |||||||| |||||||||    
T  4616164 cagggcatgagccctcaacaatttgaatgattaagaattcacagggcatgagccctcaaaaatttgaatgataaggcattc 4616084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 216
Target Start/End: Original strand, 10704512 - 10704572
Alignment:
Q  157 cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattc-cagggcataagccctcaaca 216  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||| |||||||||||    
T  10704512 cagggcataagccctcaacaatttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctcaaca 10704572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 216
Target Start/End: Original strand, 10918282 - 10918342
Alignment:
Q  157 cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattc-cagggcataagccctcaaca 216  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||| |||||||||||    
T  10918282 cagggcataagccctcaacaatttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctcaaca 10918342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 179 - 269
Target Start/End: Original strand, 15989757 - 15989847
Alignment:
Q  179 ttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagttgaatgacaaag 269  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||| || |||||| ||| |||||||| |||| |||  |||| |||||||||||||||    
T  15989757 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataag-cattccagggcatgagccttcaatagttgaatgacaaag 15989847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 217 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 20899835 - 20899785
Alignment:
Q  217 gttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagttgaatgacaa 267  Q
    |||||||||| | ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  20899835 gttgaatgactaagcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaa 20899785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 122 - 180
Target Start/End: Original strand, 10704515 - 10704576
Alignment:
Q  122 ggcataagccctcaacggtt-gaatgattaa-cattc-cagggcatgagccctcaacaattt 180  Q
    ||||||||||||||||  || |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10704515 ggcataagccctcaacaatttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctcaacaattt 10704576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 122 - 180
Target Start/End: Original strand, 10918285 - 10918346
Alignment:
Q  122 ggcataagccctcaacggtt-gaatgattaa-cattc-cagggcatgagccctcaacaattt 180  Q
    ||||||||||||||||  || |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10918285 ggcataagccctcaacaatttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctcaacaattt 10918346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 60 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 16278496 - 16278417
Alignment:
Q  60 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt 141  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||| || |||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16278496 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtt 16278417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 60 - 141
Target Start/End: Original strand, 33848637 - 33848716
Alignment:
Q  60 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt 141  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||| || |||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  33848637 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtt 33848716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 206 - 254
Target Start/End: Original strand, 13877805 - 13877853
Alignment:
Q  206 agccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaac 254  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||    
T  13877805 agccctcaacggttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 13877853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 157 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 16371836 - 16371776
Alignment:
Q  157 cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattc-cagggcataagccctcaaca 216  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |  | |||| |||||||||||| |||||||    
T  16371836 cagggcataagccctcaacaatttgaatgaaattgaattcacagggcataagcgctcaaca 16371776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 157 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 16371955 - 16371895
Alignment:
Q  157 cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattc-cagggcataagccctcaaca 216  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |  | |||| |||||||||||| |||||||    
T  16371955 cagggcataagccctcaacaatttgaatgaaattgaattcacagggcataagcgctcaaca 16371895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 122 - 179
Target Start/End: Original strand, 32489797 - 32489857
Alignment:
Q  122 ggcataagccctcaacggttg-aatgattaa-cattcc-agggcatgagccctcaacaatt 179  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  32489797 ggcataagccctcaacagttggaatgattaagcattcccagggcataagccctcaacaatt 32489857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 170; Significance: 3e-91; HSPs: 85)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 60 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 23339714 - 23339506
Alignment:
Q  60 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccag 159  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23339714 gttgaatgactaagcattccgtggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccagggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccag 23339615  T
Q  160 ggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagttg 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||| |||| ||| |||||||||||    
T  23339614 ggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgatta-acattccagggcatgagccctcaacagttg 23339516  T
Q  260 aatgacaaag 269  Q
    ||||||||||    
T  23339515 aatgacaaag 23339506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 25036204 - 25035944
Alignment:
Q  1 caacatcatcaacacgatccacaacaacatcaac------tacgacgtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagccccc 94  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25036204 caacatcatcaacacgatccacaacaacatcaacgacaactacgacgtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagccccc 25036105  T
Q  95 aacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcat 194  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |  |||    
T  25036104 aacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacgattgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacgaatcat 25036005  T
Q  195 tccagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaac 254  Q
    || ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||    
T  25036004 tctagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaac 25035944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 43 - 267
Target Start/End: Original strand, 31503118 - 31503342
Alignment:
Q  43 ggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggtt 141  Q
    |||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||| |||||||||| | ||    
T  31503118 ggtactattttcaactcaatgaatgactaagcattccgaggcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggcatgagccctcaacagatt 31503216  T
Q  142 gaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagc 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||    
T  31503217 gaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacggttgaatgacga-gcattccagggc 31503315  T
Q  242 attagctctcaacag-ttgaatgacaa 267  Q
    || ||| |||||||| |||||||||||    
T  31503316 atgagccctcaacagattgaatgacaa 31503342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 43 - 267
Target Start/End: Original strand, 31505684 - 31505908
Alignment:
Q  43 ggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggtt 141  Q
    |||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||| |||||||||| | ||    
T  31505684 ggtactattttcaactcaatgaatgactaagcattccgaggcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggcatgagccctcaacagatt 31505782  T
Q  142 gaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagc 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||    
T  31505783 gaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccatggcataagccctcaacggttgaatgacga-gcattccagggc 31505881  T
Q  242 attagctctcaacag-ttgaatgacaa 267  Q
    || ||| |||||||| |||||||||||    
T  31505882 atgagccctcaacagattgaatgacaa 31505908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 74 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 21239625 - 21239445
Alignment:
Q  74 cattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagaca-ttccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctc 172  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||  |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21239625 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcaattccagggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctc 21239526  T
Q  173 aacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaac 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||| ||||||    
T  21239525 aacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacga-gcattccagggcatgagccctcaac 21239445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 74 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 21242175 - 21241995
Alignment:
Q  74 cattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagaca-ttccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctc 172  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||  |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21242175 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcaattccagggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctc 21242076  T
Q  173 aacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaac 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||| ||||||    
T  21242075 aacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacga-gcattccagggcatgagccctcaac 21241995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 61 - 258
Target Start/End: Original strand, 31503215 - 31503412
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagg 160  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||| ||||| |||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  31503215 ttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacggttgaatgacgagcattccagg 31503313  T
Q  161 gcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagtt 258  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  31503314 gcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt 31503412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 61 - 258
Target Start/End: Original strand, 31505781 - 31505978
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagg 160  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||| ||||| |||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  31505781 ttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccatggcataagccctcaacggttgaatgacgagcattccagg 31505879  T
Q  161 gcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagtt 258  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  31505880 gcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt 31505978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 39 - 217
Target Start/End: Original strand, 44620562 - 44620740
Alignment:
Q  39 acgtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacg 138  Q
    ||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||     
T  44620562 acgtggtactaatttcaacgggttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaaca 44620661  T
Q  139 gttgaatga-ttaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacag 217  Q
    |||||||||  || ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  44620662 gttgaatgacatagcattccagggcataagccctcaac-agttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacag 44620740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 12628326 - 12628184
Alignment:
Q  1 caacatcatcaacacgatccacaacaacatcaac------tacgacgtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagccccc 94  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12628326 caacatcatcaacacgatccacaacaacatcaacgacaactacgacgtggtactattttcaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagccccc 12628227  T
Q  95 aacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac 137  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  12628226 aacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaac 12628184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 31 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 21239707 - 21239472
Alignment:
Q  31 caactacgacgtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagc 130  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||| |||    
T  21239707 caactacgacgtggtactattttcaacacattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggcatgagc 21239609  T
Q  131 cctcaac-ggttgaatgatta--acattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac-agttgaatgac 226  Q
    ||||||| | ||||||||  |    |||||||||||| ||||||||||   ||||||||  |  ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  21239608 cctcaacagattgaatgacaaggcaattccagggcataagccctcaac-ggttgaatgatta-acattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgac 21239511  T
Q  227 aaggcattccagagcattagctctcaacagttgaatgac 265  Q
    |||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||    
T  21239510 aaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgac 21239472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 31 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 21242257 - 21242022
Alignment:
Q  31 caactacgacgtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagc 130  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||| |||    
T  21242257 caactacgacgtggtactattttcaacacattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggcatgagc 21242159  T
Q  131 cctcaac-ggttgaatgatta--acattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac-agttgaatgac 226  Q
    ||||||| | ||||||||  |    |||||||||||| ||||||||||   ||||||||  |  ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  21242158 cctcaacagattgaatgacaaggcaattccagggcataagccctcaac-ggttgaatgatta-acattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgac 21242061  T
Q  227 aaggcattccagagcattagctctcaacagttgaatgac 265  Q
    |||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||    
T  21242060 aaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgac 21242022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 60 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 23339635 - 23339482
Alignment:
Q  60 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccag 159  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23339635 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgattaacattccag 23339537  T
Q  160 ggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac 215  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  23339536 ggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 23339482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 74 - 213
Target Start/End: Original strand, 28348743 - 28348882
Alignment:
Q  74 cattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctca 173  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28348743 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgattaacattccagggcatgagccctca 28348842  T
Q  174 acaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctca 213  Q
    |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28348843 acagattgaatgacaaagcattccagggcataagccctca 28348882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 94 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 24274399 - 24274235
Alignment:
Q  94 caacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggc 192  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24274399 caacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaatagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggt 24274300  T
Q  193 attccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagtt 258  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  24274299 attcgagggcataagccctcaacagttgaatgatta-acattccagggcatgagccctcaacagtt 24274235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 36 - 258
Target Start/End: Original strand, 31755525 - 31755746
Alignment:
Q  36 acgacgtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctca 135  Q
    |||||| |||||||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||| ||||||||    
T  31755525 acgacggggtactattttcaactcaatgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggcatgagccctca 31755623  T
Q  136 ac-ggttgaatgatta-acattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcat 233  Q
    || | ||||||||  |  ||||||||||||| ||||||||||   ||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  31755624 acagattgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac-ggttgaatgacga-gcattccagggcatgagccctcaacggttgaatgacaaagcat 31755721  T
Q  234 tccagagcattagctctcaacagtt 258  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||||    
T  31755722 tccagggcatgagccctcaacagtt 31755746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 36 - 258
Target Start/End: Original strand, 24504268 - 24504488
Alignment:
Q  36 acgacgtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctca 135  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| || || ||||||||    
T  24504268 acgacggggtactatttc-aactcaatgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggtatgagccctca 24504365  T
Q  136 acgg-ttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcat 233  Q
    || | ||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||  || ||||||| || ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  24504366 acagattgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacggtt-gaatgacgag-cattccagggcatgagccctcaacggttgaatgacaaagcat 24504463  T
Q  234 tccagagcattagctctcaacagtt 258  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||||    
T  24504464 tccagggcatgagccctcaacagtt 24504488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 138 - 269
Target Start/End: Original strand, 44620582 - 44620714
Alignment:
Q  138 ggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattcc 236  Q
    |||||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  44620582 ggttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacatagcattcc 44620681  T
Q  237 agagcattagctctcaacagttgaatgacaaag 269  Q
    || |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  44620682 agggcataagccctcaacagttgaatgacaaag 44620714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 140 - 269
Target Start/End: Original strand, 31755590 - 31755718
Alignment:
Q  140 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccaga 239  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||     
T  31755590 ttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacggttgaatgacga-gcattccagg 31755688  T
Q  240 gcattagctctcaacagttgaatgacaaag 269  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||    
T  31755689 gcatgagccctcaacggttgaatgacaaag 31755718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 41 - 176
Target Start/End: Original strand, 23374863 - 23374998
Alignment:
Q  41 gtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggt 140  Q
    ||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||| ||    
T  23374863 gtggtaccattttcaacttgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataa-acattccagggcatgagccctcaacagt 23374961  T
Q  141 tgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaaca 176  Q
    |||||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  23374962 tgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaaca 23374998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 60 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 24274354 - 24274238
Alignment:
Q  60 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccag 159  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||  |||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24274354 gttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggtattcgagggcataagccctcaacagttgaatgattaacattccag 24274255  T
Q  160 ggcatgagccctcaaca 176  Q
    |||||||||||||||||    
T  24274254 ggcatgagccctcaaca 24274238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 39 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 41685215 - 41685076
Alignment:
Q  39 acgtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac- 137  Q
    ||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||     
T  41685215 acgtggtactaatttcaacgggttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaaca 41685116  T
Q  138 ggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaaca 176  Q
    | ||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||    
T  41685115 gtttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaaca 41685076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 140 - 269
Target Start/End: Original strand, 24504332 - 24504460
Alignment:
Q  140 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccaga 239  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||||     
T  24504332 ttgaatgatgaacattccagggtatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacggttgaatgacga-gcattccagg 24504430  T
Q  240 gcattagctctcaacagttgaatgacaaag 269  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||    
T  24504431 gcatgagccctcaacggttgaatgacaaag 24504460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 60 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 20591540 - 20591424
Alignment:
Q  60 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattcca 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  || |||| ||    
T  20591540 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacatggcattccagggcataagccctccacggttgaatgacaaagcatttca 20591441  T
Q  159 gggcatgagccctcaac 175  Q
    ||| |||||||||||||    
T  20591440 gggtatgagccctcaac 20591424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 41 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 10040366 - 10040152
Alignment:
Q  41 gtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggt 140  Q
    ||||||| |||| ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||| |||||||||| ||    
T  10040366 gtggtaccattttcaacgtgatgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataa-acattcctgggcatgagccctcaacagt 10040268  T
Q  141 tgaatgatta-acattccagggcatgagccctcaac-aatttgaat-gacaaggcattc-cagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattcc 236  Q
    |||||||  |  ||||||||||||| |||||||| | ||||||||| |  || |||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||    
T  10040267 tgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaccgaatttgaatggttaaagcattcacagggcataagccctcaccaattgaacgacaaggcgttcc 10040168  T
Q  237 agagcattagctctca 252  Q
    || |||| ||| ||||    
T  10040167 agggcatgagccctca 10040152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 140 - 269
Target Start/End: Original strand, 28348731 - 28348860
Alignment:
Q  140 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccaga 239  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||     
T  28348731 ttgaatgatgatcattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgatta-acattccagg 28348829  T
Q  240 gcattagctctcaacag-ttgaatgacaaag 269  Q
    |||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  28348830 gcatgagccctcaacagattgaatgacaaag 28348860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 41 - 252
Target Start/End: Original strand, 28348671 - 28348882
Alignment:
Q  41 gtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-gg 139  Q
    ||||||| |||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||| ||||| |||||||||| |     
T  28348671 gtggtaccattttcaacgggttgaatgactaatcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatga-tcattccagggcatgagccctcaacaga 28348769  T
Q  140 ttgaatgatta-acattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaggcattcca 237  Q
    ||||||||  |  ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||  |  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  28348770 ttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac-agttgaatgatta-acattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaagcattcca 28348867  T
Q  238 gagcattagctctca 252  Q
    | |||| ||| ||||    
T  28348868 gggcataagccctca 28348882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 60 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 21239559 - 21239440
Alignment:
Q  60 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccag 159  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||  | ||||||||    
T  21239559 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacgagcattccag 21239461  T
Q  160 ggcatgagccctcaacaattt 180  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  21239460 ggcatgagccctcaacgattt 21239440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 60 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 21242109 - 21241990
Alignment:
Q  60 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccag 159  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||  | ||||||||    
T  21242109 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacgagcattccag 21242011  T
Q  160 ggcatgagccctcaacaattt 180  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  21242010 ggcatgagccctcaacgattt 21241990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 168 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 24274403 - 24274303
Alignment:
Q  168 ccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaac-agttgaatgaca 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||| | ||||||||||    
T  24274403 ccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaatagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgaca 24274304  T
Q  267 a 267  Q
    |    
T  24274303 a 24274303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 138 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 41685195 - 41685075
Alignment:
Q  138 ggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaggcattc 235  Q
    |||||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  41685195 ggttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaagcattc 41685096  T
Q  236 cagagcattagctctcaacag 256  Q
    ||| |||| ||| ||||||||    
T  41685095 cagggcataagccctcaacag 41685075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 152 - 256
Target Start/End: Original strand, 44620637 - 44620740
Alignment:
Q  152 cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctc 251  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| |||    
T  44620637 cattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacatagcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcataagccctc 44620735  T
Q  252 aacag 256  Q
    |||||    
T  44620736 aacag 44620740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 74 - 176
Target Start/End: Original strand, 28352568 - 28352670
Alignment:
Q  74 cattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctca 173  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||  |||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28352568 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaagtcattccaggacataagccatcaacagttgaatgattaacattccagggcatgagccctca 28352667  T
Q  174 aca 176  Q
    |||    
T  28352668 aca 28352670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 138 - 264
Target Start/End: Original strand, 28348689 - 28348816
Alignment:
Q  138 ggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaggcattc 235  Q
    |||||||||| ||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||||||  |  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28348689 ggttgaatgactaatcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatga-tcattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattc 28348787  T
Q  236 cagagcattagctctcaacagttgaatga 264  Q
    ||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  28348788 cagggcataagccctcaacagttgaatga 28348816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 140 - 255
Target Start/End: Original strand, 31518274 - 31518394
Alignment:
Q  140 ttgaatgattaa-cattc-cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattc-cagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaggcattc 235  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31518274 ttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattcacagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattc 31518373  T
Q  236 -cagagcattagctctcaaca 255  Q
     ||| |||| ||| |||||||    
T  31518374 acagggcataagccctcaaca 31518394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 139 - 256
Target Start/End: Original strand, 23374882 - 23374999
Alignment:
Q  139 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattcca 237  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23374882 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataaa-cattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattcca 23374980  T
Q  238 gagcattagctctcaacag 256  Q
    | |||| ||| ||||||||    
T  23374981 gggcatgagccctcaacag 23374999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 140 - 225
Target Start/End: Original strand, 28352556 - 28352641
Alignment:
Q  140 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatga 225  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  28352556 ttgaatgatgatcattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaagtcattccaggacataagccatcaacagttgaatga 28352641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 139 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 20591540 - 20591444
Alignment:
Q  139 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcatt 234  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||    
T  20591540 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacatggcattccagggcataagccctccacggttgaatgacaaagcatt 20591444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 179 - 258
Target Start/End: Original strand, 22109438 - 22109517
Alignment:
Q  179 ttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagtt 258  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  22109438 ttgaatgactaagcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagtt 22109517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 41 - 217
Target Start/End: Original strand, 28352496 - 28352671
Alignment:
Q  41 gtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-gg 139  Q
    ||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||| ||||| |||||||||| |     
T  28352496 gtggtaccattttcaacgggttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatga-tcattccagggcatgagccctcaacaga 28352594  T
Q  140 ttgaatgatta-acattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacag 217  Q
    ||||||||  |  ||||||||| ||| |||| ||||| | ||||||||  |  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  28352595 ttgaatgacaagtcattccaggacataagccatcaac-agttgaatgatta-acattccagggcatgagccctcaacag 28352671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 157 - 267
Target Start/End: Original strand, 31518252 - 31518366
Alignment:
Q  157 cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattc-cagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaggcattc-cagagcattagctctcaa 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| ||| |||||    
T  31518252 cagggcatgagccctcaacaatttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattcacagggcatgagccctcaa 31518351  T
Q  254 cag-ttgaatgacaa 267  Q
    ||| |||||||||||    
T  31518352 cagtttgaatgacaa 31518366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 152 - 265
Target Start/End: Original strand, 31755563 - 31755676
Alignment:
Q  152 cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaggcattccagagcattagctct 250  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||||||||||||  |  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||    
T  31755563 cattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcataagccct 31755661  T
Q  251 caacagttgaatgac 265  Q
    |||| ||||||||||    
T  31755662 caacggttgaatgac 31755676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 139 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 12628261 - 12628180
Alignment:
Q  139 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt 219  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12628261 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagtt 12628180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 152 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 24274379 - 24274267
Alignment:
Q  152 cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaggcattccagagcattagctct 250  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||| || |||| ||| ||    
T  24274379 cattccagggcataagccctcaatagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggtattcgagggcataagccct 24274281  T
Q  251 caacagttgaatga 264  Q
    ||||||||||||||    
T  24274280 caacagttgaatga 24274267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 60 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 24275782 - 24275717
Alignment:
Q  60 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcat 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  24275782 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatga-tagacattccagggcat 24275717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 152 - 265
Target Start/End: Original strand, 24504305 - 24504418
Alignment:
Q  152 cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaggcattccagagcattagctct 250  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||||||||||||  |  |||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||    
T  24504305 cattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggtatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcatgagccct 24504403  T
Q  251 caacagttgaatgac 265  Q
    |||| ||||||||||    
T  24504404 caacggttgaatgac 24504418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 122 - 219
Target Start/End: Original strand, 23085382 - 23085482
Alignment:
Q  122 ggcataagccctcaacggttgaatgattaac-attc-cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattc-cagggcataagccctcaacagt 218  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| |||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23085382 ggcatgagccctcaacagttgaataattaagtattcacagggcatgagccctcaacagtttgaatgaaaaagcattcacagggcataagccctcaacagt 23085481  T
Q  219 t 219  Q
    |    
T  23085482 t 23085482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 138 - 264
Target Start/End: Original strand, 28352514 - 28352641
Alignment:
Q  138 ggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaggcattc 235  Q
    |||||||||| ||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||||||  |  ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  28352514 ggttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatga-tcattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaagtcattc 28352612  T
Q  236 cagagcattagctctcaacagttgaatga 264  Q
    |||  ||| |||  |||||||||||||||    
T  28352613 caggacataagccatcaacagttgaatga 28352641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 157 - 215
Target Start/End: Original strand, 31518498 - 31518557
Alignment:
Q  157 cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattc-cagggcataagccctcaac 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  31518498 cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattcacagggcaaaagccctcaac 31518557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 152 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 23339582 - 23339482
Alignment:
Q  152 cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctc 251  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||  |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| |||    
T  23339582 cattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctc 23339485  T
Q  252 aac 254  Q
    |||    
T  23339484 aac 23339482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 137
Target Start/End: Original strand, 22109437 - 22109513
Alignment:
Q  60 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac 137  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| | |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  22109437 gttgaatgactaagcattccagggcataagccctcaac-agttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaac 22109513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 100 - 258
Target Start/End: Original strand, 22840916 - 22841079
Alignment:
Q  100 tttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaa--cattc-cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcatt 195  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||| ||| ||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||  |  |||||||||    |||||    
T  22840916 tttgaatgacaaggcattacagggcatgagccctcaacagtttgaatggttaaagcattcacagggcatgagccctccgcggtttgaatgaactagcatt 22841015  T
Q  196 c-cagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagtt 258  Q
    | |||||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||||| |||| ||| ||||||||||    
T  22841016 cacagggcataagccctcaacgattgaacgacaaggcgttccagggcatgagccctcaacagtt 22841079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 179 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 41685193 - 41685101
Alignment:
Q  179 ttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacag-ttgaatgacaaag 269  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  41685193 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaag 41685101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 61 - 216
Target Start/End: Original strand, 31518274 - 31518435
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattc-cggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattc-caaggcataagccctcaac-ggttgaatgatta-acattc 156  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||| | ||||||||  |  |||||    
T  31518274 ttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattcacagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattc 31518373  T
Q  157 -cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattc-cagggcataagccctcaaca 216  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||    |||||| ||||||||||||||| ||||    
T  31518374 acagggcataagccctcaacaatttgaatgaactagcattcacagggcataagccctaaaca 31518435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 12628260 - 12628180
Alignment:
Q  179 ttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagtt 258  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  12628260 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagtt 12628180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 179 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 20591539 - 20591448
Alignment:
Q  179 ttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagttgaatgacaaag 269  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||| |||| ||| ||| || ||||||||||||||    
T  20591539 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacatggcattccagggcataagccctccacggttgaatgacaaag 20591448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 128 - 219
Target Start/End: Original strand, 21903151 - 21903245
Alignment:
Q  128 agccctcaacggttgaatgattaac-attc-cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattc-cagggcataagccctcaacagtt 219  Q
    |||||||||| ||||||| |||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  21903151 agccctcaacagttgaataattaagtattcacagggcatgagccctcaacagtttgaatgactaagcattcacatggcatgagccctcaacagtt 21903245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 179 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 25036138 - 25036052
Alignment:
Q  179 ttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagttgaatga 264  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||  ||||||||    
T  25036138 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacgattgaatga 25036052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 128 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 20353498 - 20353406
Alignment:
Q  128 agccctcaacggtt-gaatgattaa-cattcc-agggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattc-cagggcataagccctcaaca 216  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| |||||  ||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20353498 agccctcaacagtttgaatgattaagcattcatagggcataagcactcaacagtttgaacgacaaggcattcacagggcataagccctcaaca 20353406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 101 - 176
Target Start/End: Original strand, 22109438 - 22109514
Alignment:
Q  101 ttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaaca 176  Q
    ||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||    
T  22109438 ttgaatgactaagcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaaca 22109514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 177 - 216
Target Start/End: Original strand, 23148578 - 23148617
Alignment:
Q  177 atttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaaca 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23148578 atttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaaca 23148617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 269
Target Start/End: Original strand, 23374883 - 23374973
Alignment:
Q  179 ttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagttgaatgacaaag 269  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||| || |||||| ||  |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  23374883 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataaa-cattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaag 23374973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 177 - 216
Target Start/End: Original strand, 23560368 - 23560407
Alignment:
Q  177 atttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaaca 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23560368 atttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaaca 23560407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 219
Target Start/End: Original strand, 24160205 - 24160268
Alignment:
Q  157 cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattc-cagggcataagccctcaacagtt 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  24160205 cagggcatgagccctcaacaatttgaatgaactagcattcagagggcataagccctcaacagtt 24160268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 218 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 24274392 - 24274341
Alignment:
Q  218 ttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagttgaatgacaaag 269  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||    
T  24274392 ttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaatagttgaatgacaaag 24274341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 152 - 186
Target Start/End: Original strand, 23148593 - 23148627
Alignment:
Q  152 cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatga 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23148593 cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatga 23148627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 152 - 186
Target Start/End: Original strand, 23560383 - 23560417
Alignment:
Q  152 cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatga 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23560383 cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatga 23560417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 25036020 - 25035942
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacgg 139  Q
    ||||||||| || |||||  |||||| ||||| |||||  |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  25036020 ttgaatgacgaatcattctagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacgg 25035942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 255
Target Start/End: Original strand, 25651191 - 25651329
Alignment:
Q  122 ggcataagccctcaacggttgaatgat-taacattc-cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattcc-agggcataagccctcaac-ag 217  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  |  ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||  | ||||||| ||||||| ||||||||||  |    
T  25651191 ggcataagccctcaacgattgaatgaacttgcattcacagggcatgagccctcaacagttggaatgattaagcattcctagggcatgagccctcaacggg 25651290  T
Q  218 ttgaatgacaaggcattc-cagagcattagctctcaaca 255  Q
    ||||| |||||||| ||| ||| |||| ||| |||||||    
T  25651291 ttgaacgacaaggcgttcacagggcataagccctcaaca 25651329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 189
Target Start/End: Original strand, 28348770 - 28348898
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttgaatgattaa-cattcca 158  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||| | ||||||||  | |||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||  || |||||||    
T  28348770 ttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac-agttgaatgatta-acattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaagcattcca 28348867  T
Q  159 gggcatgagccctcaacaatttgaatgacaa 189  Q
    |||||| ||||||||  |||||||| |||||    
T  28348868 gggcataagccctcactaatttgaacgacaa 28348898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 157 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 20353507 - 20353406
Alignment:
Q  157 cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattc-cagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaggcattc-cagagcattagctctcaa 253  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||  | ||||||  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||| ||| |||||    
T  20353507 caggacatgagccctcaacagtttgaatgattaagcattcatagggcataagcactcaacagtttgaacgacaaggcattcacagggcataagccctcaa 20353408  T
Q  254 ca 255  Q
    ||    
T  20353407 ca 20353406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 34
Target Start/End: Complemental strand, 25040311 - 25040278
Alignment:
Q  1 caacatcatcaacacgatccacaacaacatcaac 34  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25040311 caacatcatcaacacgatccacaacaacatcaac 25040278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 81 - 141
Target Start/End: Original strand, 31518500 - 31518561
Alignment:
Q  81 gggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattc-caaggcataagccctcaacggtt 141  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||    
T  31518500 gggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattcacagggcaaaagccctcaacggtt 31518561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 217 - 269
Target Start/End: Original strand, 22109437 - 22109489
Alignment:
Q  217 gttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagttgaatgacaaag 269  Q
    |||||||||| | ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  22109437 gttgaatgactaagcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaag 22109489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 213
Target Start/End: Original strand, 24528478 - 24528534
Alignment:
Q  157 cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctca 213  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  24528478 cagggcataagccctcaccaatttgaacgacaagccgttccagggcatgagccctca 24528534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 157 - 223
Target Start/End: Original strand, 23085339 - 23085405
Alignment:
Q  157 cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattc-cagggcataagccctcaacagttgaat 223  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  23085339 cagggcatgagccctcaacaa-ttgaatgaactagcattcacagggcatgagccctcaacagttgaat 23085405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 178 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 24682794 - 24682759
Alignment:
Q  178 tttgaatgacaaggcattccagggcataagccctca 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24682794 tttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctca 24682759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 43708235 - 43708197
Alignment:
Q  179 ttgaatgacaaggcattc-cagggcataagccctcaaca 216  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43708235 ttgaatgacaaggcattcacagggcataagccctcaaca 43708197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 60 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 23339557 - 23339478
Alignment:
Q  60 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt 141  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||| || |||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  23339557 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtt 23339478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 122 - 209
Target Start/End: Original strand, 24160249 - 24160341
Alignment:
Q  122 ggcataagccctcaacggtt-gaatgattaa--cattcc-agggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattc-cagggcataagcc 209  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||| || ||||||||||    
T  24160249 ggcataagccctcaacagtttgaatgatttaagcattcccagggcatgagccctcaacggtttgaacgacaaggcgttcacatggcataagcc 24160341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 34
Target Start/End: Complemental strand, 25036264 - 25036231
Alignment:
Q  1 caacatcatcaacacgatccacaacaacatcaac 34  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25036264 caacatcatcaacacgatccacaagaacatcaac 25036231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 34
Target Start/End: Complemental strand, 25040371 - 25040338
Alignment:
Q  1 caacatcatcaacacgatccacaacaacatcaac 34  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25040371 caacatcatcaacacgatccacaagaacatcaac 25040338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 157 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 43708298 - 43708265
Alignment:
Q  157 cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaag 190  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43708298 cagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaag 43708265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 180 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 10040345 - 10040258
Alignment:
Q  180 tgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagttgaatgacaa 267  Q
    |||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||| || |||||| ||  |||||| | |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  10040345 tgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataaa-cattcctgggcatgagccctcaacagttgaatgacaa 10040258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 61 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 24274392 - 24274317
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac 137  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||  | |||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||    
T  24274392 ttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaa-tagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 24274317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 165; Significance: 3e-88; HSPs: 82)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 5 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 2333588 - 2333361
Alignment:
Q  5 atcatcaacacgatccacaacaacatcaac------tacgacgtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagccccc-aac 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2333588 atcatcaacacgatccacaacaacatcaacgacaactacgacgtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagccccccaac 2333489  T
Q  98 aatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattcc 197  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  2333488 aatttgaatgacaaggcattccaaggcatgagccctcaacgattgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaagcattcc 2333389  T
Q  198 agggcataagccctcaacagttgaatga 225  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  2333388 agggcatgagccctcaacggttgaatga 2333361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 22 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22900797 - 22900594
Alignment:
Q  22 caacaacatcaactacgacgtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaa 121  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||     
T  22900797 caacaacaacaactacaacgtggtactattttcaacgtgttgaatgactaagcattccggagcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattccag 22900699  T
Q  122 ggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  22900698 ggcataagccctcaacggttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacggttg 22900599  T
Q  221 aatga 225  Q
    |||||    
T  22900598 aatga 22900594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 43 - 265
Target Start/End: Original strand, 20586715 - 20586937
Alignment:
Q  43 ggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacgg-tt 141  Q
    |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||| |||||||||| | ||    
T  20586715 ggtactattttcaactcattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggcatgagccctcaacagatt 20586813  T
Q  142 gaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagc 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||    
T  20586814 gaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacaattgaatgacaaaacattccagggc 20586913  T
Q  242 attagctctcaacagttgaatgac 265  Q
    || ||| |||||| ||||||||||    
T  20586914 ataagccctcaacggttgaatgac 20586937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 43 - 265
Target Start/End: Original strand, 20579022 - 20579244
Alignment:
Q  43 ggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacgg-tt 141  Q
    |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || ||||| ||||| |||||||||| | ||    
T  20579022 ggtactattttcaactcattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatga-acgttccagggcatgagccctcaacagatt 20579120  T
Q  142 gaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagc 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||    
T  20579121 gaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacaattgaatgacaaaacattccagggc 20579220  T
Q  242 attagctctcaacagttgaatgac 265  Q
    || ||| |||||| ||||||||||    
T  20579221 ataagccctcaacggttgaatgac 20579244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 60 - 215
Target Start/End: Original strand, 296177 - 296331
Alignment:
Q  60 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccag 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  296177 gttgaatgactaagcattccggggcttaagcccccaacaatttgaatgacaagacattccagggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccag 296276  T
Q  160 ggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac 215  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  296277 ggcatgagccctcaac-agttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 296331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 39 - 256
Target Start/End: Original strand, 20630905 - 20631123
Alignment:
Q  39 acgtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac- 137  Q
    ||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||     
T  20630905 acgtggtactaatttcaacgggttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaaca 20631004  T
Q  138 ggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattcc 236  Q
    | ||||||||  || ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  20631005 gtttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaac-agttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacatagcattcc 20631103  T
Q  237 agagcattagctctcaacag 256  Q
    || |||| ||| ||||||||    
T  20631104 agggcataagccctcaacag 20631123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 74 - 254
Target Start/End: Original strand, 45306915 - 45307095
Alignment:
Q  74 cattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagaca-ttccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctc 172  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||  |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45306915 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcaattccagggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctc 45307014  T
Q  173 aacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaac 254  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| |||| ||| ||||||    
T  45307015 aacaatttgaatggcaaggcattccagggcataagccctcaacggttgaatgacga-gcattccagggcatgagccctcaac 45307095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 24087063 - 24087245
Alignment:
Q  1 caacatcatcaacacgatccacaacaacatcaac------tacgacgtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagccccc 94  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24087063 caacatcattaacacgatccacaacaacatcaacgacaactacgacgtggtactatttccaacatgttgaatgactaagcattccggggcataagccccc 24087162  T
Q  95 aacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaaca 176  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||    
T  24087163 aacaatttgaatgataaggcattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattctagggcatgagccctcaaca 24087245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 74 - 252
Target Start/End: Original strand, 293834 - 294014
Alignment:
Q  74 cattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctca 173  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  293834 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccaaggcataagccctcaacagttgaatgattaacattccagggcatgagccctca 293933  T
Q  174 acaatttgaatgacaaggcattcca-gggcataagccctcaac-agttgaatgacaaggcattccagagcattagctctca 252  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | | ||||| |||||||| |||||| |||| ||| ||||    
T  293934 acaaattgaatgacaaggcattccaggggcataagccatcaccaatttgaacgacaaggcgttccagggcatgagccctca 294014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 39 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 14432840 - 14432661
Alignment:
Q  39 acgtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac- 137  Q
    ||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||     
T  14432840 acgtggtactaatttcaacgggttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaaca 14432741  T
Q  138 ggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacag 217  Q
    | ||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  14432740 gtttgaatgacaaagcattccagggcatgagcccccaac-agttgaatgacatagcattccagggcataagccctcaacag 14432661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 61 - 225
Target Start/End: Original strand, 18823462 - 18823627
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttgaatgatta-acattcca 158  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | ||||| |||||||||| | ||||||||  |  |||||||    
T  18823462 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataa-acattctagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattcca 18823560  T
Q  159 gggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatga 225  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18823561 gggcatgaaccctcaacagtttgaatgaaaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatga 18823627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 39 - 217
Target Start/End: Original strand, 36181203 - 36181382
Alignment:
Q  39 acgtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac- 137  Q
    ||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||     
T  36181203 acgtggtactaatttcaacgggttgaatgactaagcatttcggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaaca 36181302  T
Q  138 ggttgaatgatta-acattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacag 217  Q
    | ||||||||  |  ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36181303 gtttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac-agttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacag 36181382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 152 - 266
Target Start/End: Original strand, 20630980 - 20631094
Alignment:
Q  152 cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctc 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| |||    
T  20630980 cattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcataagccctc 20631079  T
Q  252 aacagttgaatgaca 266  Q
    |||||||||||||||    
T  20631080 aacagttgaatgaca 20631094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 83 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 21181567 - 21181382
Alignment:
Q  83 gcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatttga 182  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  21181567 gcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgattaacattccatggcataagccctcaacaatttga 21181468  T
Q  183 atgacaaggcattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacag-ttgaatgacaa 267  Q
    || | ||  ||||| ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||| ||||| || |||||||||||    
T  21181467 atcataa-acattctagggcatgagccctcaacagtttcaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaatagtttgaatgacaa 21181382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 60 - 258
Target Start/End: Original strand, 20901017 - 20901214
Alignment:
Q  60 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattcca 158  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||  | || ||||||||||||| |||||||||  || |||||||    
T  20901017 gttgaatgactaagcattccggggcataag-ccccaacaatttgaatgataa-acattgaagggaataagccctcaacagttgaatgacaaagcattcca 20901114  T
Q  159 gggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagt 257  Q
     ||||| |||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| ||| |||| ||| |||||||||    
T  20901115 tggcataagccctcaac-agttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttgaatgacaaggcattacagggcatgagccctcaacagt 20901213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 60 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 22900681 - 22900566
Alignment:
Q  60 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccag 159  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22900681 gttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacggttgaatgattaacattccag 22900582  T
Q  160 ggcatgagccctcaac 175  Q
    ||||||||||||||||    
T  22900581 ggcatgagccctcaac 22900566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 152 - 256
Target Start/End: Original strand, 36181278 - 36181382
Alignment:
Q  152 cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctc 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| |||    
T  36181278 cattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcataagccctc 36181377  T
Q  252 aacag 256  Q
    |||||    
T  36181378 aacag 36181382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 100 - 264
Target Start/End: Original strand, 18823461 - 18823627
Alignment:
Q  100 tttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattcca 198  Q
    |||||||||| |  ||||||  ||||||||||| ||||  || ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18823461 tttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataaacattctagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattcca 18823560  T
Q  199 gggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagttgaatga 264  Q
    |||||| | |||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  18823561 gggcatgaaccctcaacagtttgaatgaaaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatga 18823627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 138 - 269
Target Start/End: Original strand, 20630925 - 20631058
Alignment:
Q  138 ggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaggcattc 235  Q
    |||||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  20630925 ggttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaagcattc 20631024  T
Q  236 cagagcattagctctcaacagttgaatgacaaag 269  Q
    ||| |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  20631025 cagggcataagccctcaacagttgaatgacaaag 20631058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 138 - 269
Target Start/End: Original strand, 36181223 - 36181356
Alignment:
Q  138 ggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaggcattc 235  Q
    |||||||||| ||| |||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36181223 ggttgaatgactaagcatttcggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattc 36181322  T
Q  236 cagagcattagctctcaacagttgaatgacaaag 269  Q
    ||| |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  36181323 cagggcataagccctcaacagttgaatgacaaag 36181356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 60 - 237
Target Start/End: Original strand, 28312083 - 28312262
Alignment:
Q  60 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattcca 158  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||| ||    
T  28312083 gttgaatgactaagcattccggggcaaaagcccccaacaatttgaatgataa-acattccaaggcataagccctcaacagttgaatgacaaagcatttca 28312181  T
Q  159 gggcatgagccctcaacaatttgaat-gacaaggcattc-cagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattcca 237  Q
    ||||||||||||||    |||||||| |  || |||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||    
T  28312182 gggcatgagccctcccggatttgaatggttaaagcattcacagggcataagccctcaccaattgaacgacaaggcgttcca 28312262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 31 - 265
Target Start/End: Original strand, 45306833 - 45307068
Alignment:
Q  31 caactacgacgtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagc 130  Q
    |||| ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | |||||||| ||||| |||    
T  45306833 caacaacggcgtggtactattttcaacacattgaatgactaagcattccggggcataagccccccacaatttgaatgatga-acattccagggcatgagc 45306931  T
Q  131 cctcaac-ggttgaatgatta--acattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac-agttgaatgac 226  Q
    ||||||| | ||||||||  |    |||||||||||| ||||||||||   ||||||||  |  ||||||||||||| |||||||||| | ||||||| |    
T  45306932 cctcaacagattgaatgacaaggcaattccagggcataagccctcaac-ggttgaatgatta-acattccagggcatgagccctcaacaatttgaatggc 45307029  T
Q  227 aaggcattccagagcattagctctcaacagttgaatgac 265  Q
    |||||||||||| |||| ||| |||||| ||||||||||    
T  45307030 aaggcattccagggcataagccctcaacggttgaatgac 45307068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 61 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 2333446 - 2333293
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagg 160  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||| ||||| |||||  |||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2333446 ttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggttgaatgattaacactccagg 2333348  T
Q  161 gcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac 215  Q
    ||| |||||||| |||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  2333347 gcacgagccctcgacagattgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 2333293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 61 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 21181549 - 21181375
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttgaatgattaacattccag 159  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||| | ||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||   |||||| || ||||||| ||    
T  21181549 ttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac-agttgaatgatta-acattccatggcataagccctcaacaatttgaatcataaacattctag 21181452  T
Q  160 ggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaggcattc 235  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  21181451 ggcatgagccctcaacagtttcaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaatagtttgaatgacaaggcattc 21181375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 138 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 14432820 - 14432690
Alignment:
Q  138 ggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaggcattc 235  Q
    |||||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  14432820 ggttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaagcattc 14432721  T
Q  236 cagagcattagctctcaacagttgaatgaca 266  Q
    ||| |||| ||| | ||||||||||||||||    
T  14432720 cagggcatgagcccccaacagttgaatgaca 14432690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 61 - 175
Target Start/End: Original strand, 18823541 - 18823655
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagg 160  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||| | ||| ||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18823541 ttgaatgacaaggcattccagggcatgaaccctcaacagtttgaatgaaaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgattaacattccagg 18823640  T
Q  161 gcatgagccctcaac 175  Q
    |||||||||||||||    
T  18823641 gcatgagccctcaac 18823655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 140 - 268
Target Start/End: Original strand, 20586773 - 20586901
Alignment:
Q  140 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaggcattccag 238  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |  ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20586773 ttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccag 20586871  T
Q  239 agcattagctctcaacagttgaatgacaaa 268  Q
     |||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  20586872 ggcatgagccctcaacaattgaatgacaaa 20586901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 140 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 21181588 - 21181503
Alignment:
Q  140 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatga 225  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21181588 ttgaatgataaaccttccagagcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatga 21181503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 41 - 238
Target Start/End: Original strand, 293762 - 293959
Alignment:
Q  41 gtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-gg 139  Q
    ||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||| ||||| |||||||||| |     
T  293762 gtggtaccattttcaacgagttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatga-tcattccagggcatgagccctcaacaga 293860  T
Q  140 ttgaatgatta-acattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac-agttgaatgacaaggcattcca 237  Q
    ||||||||  |  ||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||  |  ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  293861 ttgaatgacaaggcattccaaggcataagccctcaac-agttgaatgatta-acattccagggcatgagccctcaacaaattgaatgacaaggcattcca 293958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 152 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 14432765 - 14432661
Alignment:
Q  152 cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctc 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||| |||    
T  14432765 cattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaagcattccagggcatgagcccccaacagttgaatgacatagcattccagggcataagccctc 14432666  T
Q  252 aacag 256  Q
    |||||    
T  14432665 aacag 14432661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 139 - 258
Target Start/End: Original strand, 24087128 - 24087248
Alignment:
Q  139 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattcca 237  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  24087128 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataaggcattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattcta 24087227  T
Q  238 gagcattagctctcaacagtt 258  Q
    | |||| ||| ||||||||||    
T  24087228 gggcatgagccctcaacagtt 24087248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 60 - 180
Target Start/End: Original strand, 16400611 - 16400733
Alignment:
Q  60 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttgaatg-attaacattc- 156  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | || |||||     
T  16400611 gttgaatgactaagcattccggggaataagcccccaacaatttgaatgataa-acattccaaggcatgagccctcaacagtttgaatgaactagcattca 16400709  T
Q  157 cagggcatgagccctcaacaattt 180  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  16400710 cagggcatgagccctcaacaattt 16400733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 140 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 28204775 - 28204696
Alignment:
Q  140 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt 219  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28204775 ttgaatgataaacattctagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt 28204696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 61 - 175
Target Start/End: Original strand, 20579158 - 20579271
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagg 160  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  20579158 ttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacaatt-gaatgacaaaacattccagggcataagccctcaacggttgaatgacgagcattccagg 20579256  T
Q  161 gcatgagccctcaac 175  Q
    |||||||||||||||    
T  20579257 gcatgagccctcaac 20579271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 61 - 175
Target Start/End: Original strand, 20586851 - 20586964
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagg 160  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  20586851 ttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacaatt-gaatgacaaaacattccagggcataagccctcaacggttgaatgacgagcattccagg 20586949  T
Q  161 gcatgagccctcaac 175  Q
    |||||||||||||||    
T  20586950 gcatgagccctcaac 20586964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 140 - 268
Target Start/End: Original strand, 20579080 - 20579208
Alignment:
Q  140 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaggcattccag 238  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||  |  ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20579080 ttgaatgatgaacgttccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccag 20579178  T
Q  239 agcattagctctcaacagttgaatgacaaa 268  Q
     |||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  20579179 ggcatgagccctcaacaattgaatgacaaa 20579208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 140 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 22900718 - 22900594
Alignment:
Q  140 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaggcattccag 238  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  22900718 ttgaatgatgaacattccagggcataagccctcaacggtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccag 22900620  T
Q  239 agcattagctctcaacagttgaatga 264  Q
     |||| ||| |||||| |||||||||    
T  22900619 ggcatgagccctcaacggttgaatga 22900594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 139 - 269
Target Start/End: Original strand, 296177 - 296307
Alignment:
Q  139 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattcca 237  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |  |||||||    
T  296177 gttgaatgactaagcattccggggcttaagcccccaacaatttgaatgacaagacattccagggcataagccctcaacggttgaatgatta-acattcca 296275  T
Q  238 gagcattagctctcaacagttgaatgacaaag 269  Q
    | |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  296276 gggcatgagccctcaacagttgaatgacaaag 296307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 41 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 28204835 - 28204699
Alignment:
Q  41 gtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-gg 139  Q
    ||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | ||||| |||||||||| |     
T  28204835 gtggtaccattttcaacgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataa-acattctagggcatgagccctcaacagt 28204737  T
Q  140 ttgaatgatta-acattccagggcatgagccctcaaca 176  Q
    ||||||||  |  ||||||||||||| |||||||||||    
T  28204736 ttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaaca 28204699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 140 - 267
Target Start/End: Original strand, 20901057 - 20901184
Alignment:
Q  140 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccaga 239  Q
    ||||||||| ||||||  |||| || ||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  20901057 ttgaatgataaacattgaagggaataagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccatggcataagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagg 20901155  T
Q  240 gcattagctctcaacag-ttgaatgacaa 267  Q
    |||| ||| |||||| | |||||||||||    
T  20901156 gcatgagccctcaacggtttgaatgacaa 20901184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 42 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 21181647 - 21181474
Alignment:
Q  42 tggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggt 140  Q
    |||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||  |||| |||||||||| | |    
T  21181647 tggtaccattttcaacgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataa-accttccagagcatgagccctcaacagtt 21181549  T
Q  141 tgaatgatta-acattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaaca 216  Q
    |||||||  |  ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||  |  ||||||| |||||||||||||||||    
T  21181548 tgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac-agttgaatgatta-acattccatggcataagccctcaaca 21181474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 140 - 215
Target Start/End: Original strand, 18270240 - 18270315
Alignment:
Q  140 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac 215  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18270240 ttgaatgataaacactccagggcatgagccctcaacagtttgaaagacaaggcattccagggcataagccctcaac 18270315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 140 - 215
Target Start/End: Original strand, 18274894 - 18274969
Alignment:
Q  140 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac 215  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18274894 ttgaatgataaacactccagggcatgagccctcaacagtttgaaagacaaggcattccagggcataagccctcaac 18274969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 60 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 21181511 - 21181336
Alignment:
Q  60 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttg-aatgattaa-cattcc 157  Q
    ||||||||| ||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||| | || |||||| | ||||| |||||||||| |||  |||||  |  ||||||    
T  21181511 gttgaatgattaa-cattccatggcataagccctcaacaatttgaatcataa-acattctagggcatgagccctcaacagtttcaatgacaaggcattcc 21181414  T
Q  158 agggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattc-cagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaggcat 233  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  21181413 agggcatgagccctcaatagtttgaatgacaaggcattcacaaggcataagcccttaacagtttgaatgacaaggcat 21181336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 41 - 137
Target Start/End: Original strand, 18270180 - 18270275
Alignment:
Q  41 gtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac 137  Q
    |||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||| ||||||||||    
T  18270180 gtggcactattttcaacgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataa-acactccagggcatgagccctcaac 18270275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 41 - 137
Target Start/End: Original strand, 18274834 - 18274929
Alignment:
Q  41 gtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac 137  Q
    |||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||| ||||||||||    
T  18274834 gtggcactattttcaacgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataa-acactccagggcatgagccctcaac 18274929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 139 - 264
Target Start/End: Original strand, 293781 - 293907
Alignment:
Q  139 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaggcattcc 236  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||||||  |  ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  293781 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatgat-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattcc 293879  T
Q  237 agagcattagctctcaacagttgaatga 264  Q
    |  |||| ||| ||||||||||||||||    
T  293880 aaggcataagccctcaacagttgaatga 293907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 140 - 211
Target Start/End: Original strand, 19209465 - 19209536
Alignment:
Q  140 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccct 211  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19209465 ttgaataataaacattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattccaaggcataagccct 19209536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 139 - 269
Target Start/End: Original strand, 20901017 - 20901146
Alignment:
Q  139 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattcca 237  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||  ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20901017 gttgaatgactaagcattccggggcataagccc-caacaatttgaatgataaa-cattgaagggaataagccctcaacagttgaatgacaaagcattcca 20901114  T
Q  238 gagcattagctctcaacagttgaatgacaaag 269  Q
      |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  20901115 tggcataagccctcaacagttgaatgacaaag 20901146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 139 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 21181629 - 21181503
Alignment:
Q  139 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaggcattcc 236  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||  | |||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21181629 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataa-accttccagagcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattcc 21181531  T
Q  237 agagcattagctctcaacagttgaatga 264  Q
    || |||| ||| ||||||||||||||||    
T  21181530 agggcataagccctcaacagttgaatga 21181503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 39 - 106
Target Start/End: Original strand, 37358180 - 37358247
Alignment:
Q  39 acgtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaat 106  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37358180 acgtggtactattttcaacgggttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaat 37358247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 139 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 28204816 - 28204696
Alignment:
Q  139 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaggcattcc 236  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||  ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28204816 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataaa-cattctagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattcc 28204718  T
Q  237 agagcattagctctcaacagtt 258  Q
    || |||| ||| ||||||||||    
T  28204717 agggcataagccctcaacagtt 28204696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 61 - 215
Target Start/End: Original strand, 20579119 - 20579271
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattccag 159  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||| ||||| |||||  |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||  || ||||||||    
T  20579119 ttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacaattgaatgacaaaacattccag 20579217  T
Q  160 ggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac 215  Q
    ||||| ||||||||||  || ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||    
T  20579218 ggcataagccctcaacggtt-gaatgacgag-cattccagggcatgagccctcaac 20579271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 61 - 215
Target Start/End: Original strand, 20586812 - 20586964
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattccag 159  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||| ||||| |||||  |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||  || ||||||||    
T  20586812 ttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacaattgaatgacaaaacattccag 20586910  T
Q  160 ggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac 215  Q
    ||||| ||||||||||  || ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||    
T  20586911 ggcataagccctcaacggtt-gaatgacgag-cattccagggcatgagccctcaac 20586964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 139 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 22900759 - 22900630
Alignment:
Q  139 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattcca 237  Q
    ||||||||| ||| |||||| | |||| ||||| |||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  22900759 gttgaatgactaagcattccggagcataagcccccaacaatttgaatgatgaa-cattccagggcataagccctcaacggttgaatgacaaagcattcca 22900661  T
Q  238 gagcattagctctcaac-agttgaatgacaa 267  Q
    | |||| ||| |||||| | |||||||||||    
T  22900660 gggcatgagccctcaacaatttgaatgacaa 22900630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 179 - 269
Target Start/End: Original strand, 24087129 - 24087220
Alignment:
Q  179 ttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagttgaatgacaaag 269  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  24087129 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataaggcattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaag 24087220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 152 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 2333472 - 2333361
Alignment:
Q  152 cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaggcattccagagcattagctct 250  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||  |  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||    
T  2333472 cattccaaggcatgagccctcaacgatt-gaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaagcattccagggcatgagccct 2333375  T
Q  251 caacagttgaatga 264  Q
    |||| |||||||||    
T  2333374 caacggttgaatga 2333361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 139 - 254
Target Start/End: Original strand, 18270199 - 18270315
Alignment:
Q  139 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaggcattcc 236  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||  || |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  18270199 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataa-acactccagggcatgagccctcaacagtttgaaagacaaggcattcc 18270297  T
Q  237 agagcattagctctcaac 254  Q
    || |||| ||| ||||||    
T  18270298 agggcataagccctcaac 18270315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 139 - 254
Target Start/End: Original strand, 18274853 - 18274969
Alignment:
Q  139 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaggcattcc 236  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||  || |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  18274853 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataa-acactccagggcatgagccctcaacagtttgaaagacaaggcattcc 18274951  T
Q  237 agagcattagctctcaac 254  Q
    || |||| ||| ||||||    
T  18274952 agggcataagccctcaac 18274969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 139 - 243
Target Start/End: Original strand, 28312083 - 28312187
Alignment:
Q  139 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattcca 237  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||  ||||| ||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  28312083 gttgaatgactaagcattccggggcaaaagcccccaacaatttgaatgataaa-cattccaaggcataagccctcaacagttgaatgacaaagcatttca 28312181  T
Q  238 gagcat 243  Q
    | ||||    
T  28312182 gggcat 28312187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 151 - 254
Target Start/End: Original strand, 296230 - 296331
Alignment:
Q  151 acattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctct 250  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  || ||||||  |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||    
T  296230 acattccagggcataagccctcaacggtt-gaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccct 296327  T
Q  251 caac 254  Q
    ||||    
T  296328 caac 296331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 237
Target Start/End: Original strand, 19209438 - 19209523
Alignment:
Q  152 cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaggcattcca 237  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||||||||| | ||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19209438 cattccaggggataagcccccaacaatttgaataataaa-cattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattcca 19209523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 74 - 133
Target Start/End: Original strand, 19209477 - 19209536
Alignment:
Q  74 cattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccct 133  Q
    |||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19209477 cattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattccaaggcataagccct 19209536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 122 - 216
Target Start/End: Original strand, 8683038 - 8683136
Alignment:
Q  122 ggcataagccctcaacggttg-aatgattaa-cattcc-agggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattc-cagggcataagccctcaaca 216  Q
    |||||||||||||||| |||| || |||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||    
T  8683038 ggcataagccctcaacagttggaacgattaagcattcccagggcatgagccctcaacggtttgaacgacaaggcgttcacagggcataagccttcaaca 8683136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 60 - 137
Target Start/End: Original strand, 19209423 - 19209500
Alignment:
Q  60 gttgaatgact-aagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac 137  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||| ||||||||||    
T  19209423 gttgaatgacttaagcattccaggggataagcccccaacaatttgaataataa-acattccagggcatgagccctcaac 19209500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 122 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 21528914 - 21528816
Alignment:
Q  122 ggcataagccctcaacggttg-aatgattaa-cattcc-agggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattc-cagggcataagccctcaaca 216  Q
    |||||||| ||||||| |||| |||||| || |||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  21528914 ggcataagacctcaacagttggaatgataaagcattcccagggcatgagccctcaacggtttgaacgacaaggcgttcacagggcataagccctcaaca 21528816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 216
Target Start/End: Original strand, 16400652 - 16400729
Alignment:
Q  140 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattc-cagggcataagccctcaaca 216  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    |||||| |||||||| |||||||||||    
T  16400652 ttgaatgataaacattccaaggcatgagccctcaacagtttgaatgaactagcattcacagggcatgagccctcaaca 16400729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 119 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 21528957 - 21528816
Alignment:
Q  119 caaggcataagccctcaacggttgaatg-attaacattc-cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcatt-ccagggcataagccctcaac 215  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | || ||||| |||||||| || |||||||| || |||||| || ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  21528957 caaggcataagccctcaacgattgaatgaactagcattcacagggcataagacctcaacagttggaatgataaagcattcccagggcatgagccctcaac 21528858  T
Q  216 ag-ttgaatgacaaggcattc-cagagcattagctctcaaca 255  Q
     | ||||| |||||||| ||| ||| |||| ||| |||||||    
T  21528857 ggtttgaacgacaaggcgttcacagggcataagccctcaaca 21528816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 81 - 141
Target Start/End: Original strand, 18270259 - 18270319
Alignment:
Q  81 gggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt 141  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18270259 gggcatgagccctcaacagtttgaaagacaaggcattccagggcataagccctcaacggtt 18270319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 81 - 141
Target Start/End: Original strand, 18274913 - 18274973
Alignment:
Q  81 gggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt 141  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18274913 gggcatgagccctcaacagtttgaaagacaaggcattccagggcataagccctcaacggtt 18274973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 44823202 - 44823101
Alignment:
Q  83 gcataagcccccaacaatttgaatga-caagacattc-caaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaa-cattc-cagggcatgagccctcaacaa 177  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| | || ||||| || ||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  44823202 gcataagccctcaacaatttgaatgaactag-cattcacagggcatgagccctcaacagtttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctcaacaa 44823104  T
Q  178 ttt 180  Q
    |||    
T  44823103 ttt 44823101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 44823165 - 44823105
Alignment:
Q  157 cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattc-cagggcataagccctcaaca 216  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  | |||||| |||||||| |||||||||||    
T  44823165 cagggcatgagccctcaacagtttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctcaaca 44823105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 215
Target Start/End: Original strand, 52983171 - 52983231
Alignment:
Q  157 cagggcatgagccctcaacaa-tttgaatgacaaggcattc-cagggcataagccctcaac 215  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  52983171 cagggcatgagccctctacaattttgaatgacaagacattcacatggcataagccctcaac 52983231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 219
Target Start/End: Original strand, 16400610 - 16400691
Alignment:
Q  138 ggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt 219  Q
    |||||||||| ||| |||||| ||| || ||||| ||||||||||||||| ||  ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16400610 ggttgaatgactaagcattccggggaataagcccccaacaatttgaatgataaa-cattccaaggcatgagccctcaacagtt 16400691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 212
Target Start/End: Original strand, 24959925 - 24959959
Alignment:
Q  178 tttgaatgacaaggcattccagggcataagccctc 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24959925 tttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctc 24959959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 141
Target Start/End: Original strand, 52983193 - 52983235
Alignment:
Q  100 tttgaatgacaagacattc-caaggcataagccctcaacggtt 141  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  52983193 tttgaatgacaagacattcacatggcataagccctcaacggtt 52983235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 60 - 141
Target Start/End: Original strand, 296256 - 296335
Alignment:
Q  60 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt 141  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||| || |||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  296256 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtt 296335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 34
Target Start/End: Complemental strand, 2333652 - 2333619
Alignment:
Q  1 caacatcatcaacacgatccacaacaacatcaac 34  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2333652 caacatcatcaacacgatccacaagaacatcaac 2333619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 122 - 213
Target Start/End: Original strand, 24959989 - 24960081
Alignment:
Q  122 ggcataagccctcaacggttgaatg-attaacattc-cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctca 213  Q
    |||||||||||||| |  ||||||| | || ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  24959989 ggcataagccctcaccaattgaatgtactagcattcacagggcatcagccctcaccaatt-gaacgacaaggcgttccagggcatgagccctca 24960081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 179 - 215
Target Start/End: Original strand, 45918252 - 45918289
Alignment:
Q  179 ttgaatgacaaggcattc-cagggcataagccctcaac 215  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45918252 ttgaatgacaaggcattcacagggcataagccctcaac 45918289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 61 - 141
Target Start/End: Original strand, 20579197 - 20579275
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt 141  Q
    ||||||||| || |||||| |||||||||||| ||||  || ||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  20579197 ttgaatgacaaaacattccagggcataagccctcaacggtt-gaatgacgag-cattccagggcatgagccctcaacggtt 20579275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 61 - 141
Target Start/End: Original strand, 20586890 - 20586968
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt 141  Q
    ||||||||| || |||||| |||||||||||| ||||  || ||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  20586890 ttgaatgacaaaacattccagggcataagccctcaacggtt-gaatgacgag-cattccagggcatgagccctcaacggtt 20586968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 6)
Name: scaffold0525
Description:

Target: scaffold0525; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 60 - 269
Target Start/End: Original strand, 8681 - 8889
Alignment:
Q  60 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccag 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||    
T  8681 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacggttgaatgacgagcattccag 8780  T
Q  160 ggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagttg 259  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||| |||    
T  8781 ggcatgagccctcaacaa-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacaattgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacaattg 8879  T
Q  260 aatgacaaag 269  Q
    ||||||||||    
T  8880 aatgacaaag 8889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 43 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 11440 - 11215
Alignment:
Q  43 ggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggtt 141  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||    
T  11440 ggtactattttcaactcgttgaatgactaagcagtccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccaaggcatgagccctcaacagttt 11341  T
Q  142 gaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagag 240  Q
    ||||||  || ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11340 gaatgacaaagcattccagggcataagccctcaac-agttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccaggg 11242  T
Q  241 cattagctctcaacagttgaatgacaa 267  Q
    ||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  11241 cataagccctcaacggttgaatgacaa 11215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525; HSP #3
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 61 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 11382 - 11187
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattccag 159  Q
    ||||||||| | |||||||  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||    
T  11382 ttgaatgacaaggcattccaaggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaagcattccag 11283  T
Q  160 ggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacag 256  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||    
T  11282 ggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacggttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacag 11187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525; HSP #4
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 61 - 269
Target Start/End: Original strand, 8722 - 8928
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattccag 159  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||  || ||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||  || ||||||||    
T  8722 ttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacggtt-gaatgacgag-cattccagggcatgagccctcaacaattgaatgacaaagcattccag 8819  T
Q  160 ggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagttg 259  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||| || ||||    
T  8820 ggcatgagccctcaacaatt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacaattgaatgacaaagcattccagggcataagccctccacggttg 8918  T
Q  260 aatgacaaag 269  Q
    ||||||||||    
T  8919 aatgacaaag 8928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525; HSP #5
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 72 - 254
Target Start/End: Original strand, 8771 - 8952
Alignment:
Q  72 agcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccc 170  Q
    |||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  8771 agcattccagggcatgagccctcaacaatt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacaattgaatgacaaagcattccagggcatgagccc 8869  T
Q  171 tcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaac 254  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||    
T  8870 tcaacaatt-gaatgacaaagcattccagggcataagccctccacggttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 8952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525; HSP #6
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 139 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 11423 - 11291
Alignment:
Q  139 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaggcattcc 236  Q
    ||||||||| ||| || ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  11423 gttgaatgactaagcagtccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccaaggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaagcattcc 11324  T
Q  237 agagcattagctctcaacagttgaatgacaaag 269  Q
    || |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  11323 agggcataagccctcaacagttgaatgacaaag 11291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 98)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 60 - 269
Target Start/End: Original strand, 17794970 - 17795178
Alignment:
Q  60 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccag 159  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17794970 gttgaatgactaagcattccgaggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccag 17795069  T
Q  160 ggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagttg 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||  |  |||||||| |||| ||| |||||||||||    
T  17795070 ggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaaacattccagggcataagccctccacggttgaatgatta-acattccagggcatgagccctcaacagttg 17795168  T
Q  260 aatgacaaag 269  Q
    ||||||||||    
T  17795169 aatgacaaag 17795178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 31 - 269
Target Start/End: Original strand, 28853495 - 28853732
Alignment:
Q  31 caactacgacgtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagc 130  Q
    |||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||| |||    
T  28853495 caacgacgacggggtactattttcaacacattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatg-gacattccagggcatgagc 28853593  T
Q  131 cctcaacgg-ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaag 229  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |     
T  28853594 cctcaacagattgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaaattgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacggttgaatgacga- 28853692  T
Q  230 gcattccagagcattagctctcaacagttgaatgacaaag 269  Q
    ||||||||| |||| ||| |||||| |||||| |||||||    
T  28853693 gcattccagggcatgagccctcaacggttgaacgacaaag 28853732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 44523385 - 44523193
Alignment:
Q  1 caacatcatcaacacgatccacaacaacatcaac------tacgacgtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagccccc 94  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44523385 caacatcatcaacacgatccacagcaacatcaacgacaactacgacgtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagccccc 44523286  T
Q  95 aacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatga 186  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44523285 aacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacggttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttgaatga 44523193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 22 - 225
Target Start/End: Original strand, 17614493 - 17614696
Alignment:
Q  22 caacaacatcaactacgacgtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaa 121  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  | ||||||||     
T  17614493 caacaacaacaactacaacatggtactattttcaacgtgttgaatgactaagcattccggagcgtaagcccccaacaatttgaatgatga-acattccag 17614591  T
Q  122 ggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  17614592 ggcataagccctcaacggttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacggttg 17614691  T
Q  221 aatga 225  Q
    |||||    
T  17614692 aatga 17614696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 39 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 22145913 - 22145694
Alignment:
Q  39 acgtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac- 137  Q
    ||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||     
T  22145913 acgtggtactaatttcaacgggttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaaca 22145814  T
Q  138 ggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattcc 236  Q
    | ||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||    
T  22145813 gtttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagtttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagttaaatgacatagcattcc 22145714  T
Q  237 agagcattagctctcaacag 256  Q
    || |||| ||| ||||||||    
T  22145713 agggcataagccctcaacag 22145694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 60 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 7301603 - 7301399
Alignment:
Q  60 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccag 159  Q
    ||||||||| ||| |||||| | |||| ||||| |||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7301603 gttgaatgattaa-cattccagagcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccag 7301505  T
Q  160 ggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagttg 259  Q
     ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||| ||||    
T  7301504 agcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacatttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacggttg 7301405  T
Q  260 aatgac 265  Q
    ||||||    
T  7301404 aatgac 7301399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 74 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 45135425 - 45135245
Alignment:
Q  74 cattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagaca-ttccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctc 172  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||  |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45135425 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcagttccagggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctc 45135326  T
Q  173 aacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaac 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||| ||||||    
T  45135325 aacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacga-gcattccagggcatgagccctcaac 45135245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 63 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 6608822 - 6608618
Alignment:
Q  63 gaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacgg-ttgaatgattaacattccaggg 161  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  | |||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  6608822 gaatgactaagcattccgaggcataagcccccaacactttgaatgatga-acattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccaggg 6608724  T
Q  162 catgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacag-ttga 260  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| |||| ||| |||||||| ||||    
T  6608723 catgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacggttgaatgacga-gcattccagggcatgagccctcaacagattga 6608625  T
Q  261 atgacaa 267  Q
    |||||||    
T  6608624 atgacaa 6608618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 39 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 22059905 - 22059686
Alignment:
Q  39 acgtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacg 138  Q
    ||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||     
T  22059905 acgtggtactaatttcaacgggttgaatgactaagcatttcggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaaca 22059806  T
Q  139 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattcca 237  Q
    | |||||||  || ||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  22059805 gctgaatgacaaagcattccagggcataagccatcaac-agttgaatgacatagcatccctgggcataagccctcaacagttgaatgacatagcattcca 22059707  T
Q  238 gagcattagctctcaacagtt 258  Q
    | |||| ||| ||||||||||    
T  22059706 gggcataagccctcaacagtt 22059686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 74 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 7301668 - 7301475
Alignment:
Q  74 cattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctca 173  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||  |||||||||||| || | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7301668 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcaattcagggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagagcatgagccctca 7301569  T
Q  174 acaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacag-ttgaatgacaa 267  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |  ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  7301568 acagattgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacggttgaatgatta-acattccagagcatgagccctcaacagattgaatgacaa 7301475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 60 - 215
Target Start/End: Original strand, 17795049 - 17795202
Alignment:
Q  60 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccag 159  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17795049 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaaacattccagggcataagccctccacggttgaatgattaacattccag 17795147  T
Q  160 ggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac 215  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  17795148 ggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 17795202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 74 - 264
Target Start/End: Original strand, 44431543 - 44431734
Alignment:
Q  74 cattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctca 173  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44431543 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacggttgaatgattaacatttcagggcatgagccctca 44431642  T
Q  174 acaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac-agttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagttgaatga 264  Q
    |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||    
T  44431643 acagattgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaccgctttgaatgacaaggcgttacagggcataagccctcaatggttgaatga 44431734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 61 - 254
Target Start/End: Original strand, 19881845 - 19882038
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagg 160  Q
    |||||||| ||| ||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||| ||  ||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  19881845 ttgaatga-taaacattccatggcataagccctcaacagtttgaatgaaaaagcattccagggcataagcactcaacaattgaatgataaacattccagg 19881943  T
Q  161 gcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaac 254  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||| ||| ||||||    
T  19881944 gcatgagccctcgacaatttgaatgacaaggcattccggggcataagccctcaacagtttgaatgacgaggcattctagggcataagccctcaac 19882038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 61 - 237
Target Start/End: Original strand, 44431648 - 44431825
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagg 160  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |  ||||||||||||| | || || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44431648 ttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaccgctttgaatgacaaggcgttacagggcataagccctcaatggttgaatgattaacattccagg 44431747  T
Q  161 gcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac-agttgaatgacaaggcattcca 237  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||||| |||||||| |||||    
T  44431748 gcatgagccctcaacagattgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaccaatttgaacgacaaggcgttcca 44431825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 61 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 6608745 - 6608588
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagg 160  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||| ||||| |||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  6608745 ttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacggttgaatgacgagcattccagg 6608647  T
Q  161 gcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt 219  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6608646 gcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagtt 6608588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 60 - 175
Target Start/End: Original strand, 17614609 - 17614724
Alignment:
Q  60 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccag 159  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17614609 gttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacggttgaatgattaacattccag 17614708  T
Q  160 ggcatgagccctcaac 175  Q
    ||||||||||||||||    
T  17614709 ggcatgagccctcaac 17614724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 61 - 225
Target Start/End: Original strand, 19881766 - 19881930
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttgaatgattaacattccag 159  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||     
T  19881766 ttgaatga-taaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccgtcaacagtttgaatgataaacattccat 19881864  T
Q  160 ggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatga 225  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  19881865 ggcataagccctcaacagtttgaatgaaaaagcattccagggcataagcactcaacaattgaatga 19881930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 36 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 45135502 - 45135272
Alignment:
Q  36 acgacgtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctca 135  Q
    |||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||| ||||||||    
T  45135502 acgacggggtactattttcaactcattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatga-tggacattccagggcatgagccctca 45135404  T
Q  136 ac-ggttgaatgatta-aca-ttccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac-agttgaatgacaaggc 231  Q
    || | ||||||||  |  || ||||||||||| ||||||||||   ||||||||  |  ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||    
T  45135403 acagattgaatgacaaggcagttccagggcataagccctcaac-ggttgaatgatta-acattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggc 45135306  T
Q  232 attccagagcattagctctcaacagttgaatgac 265  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||    
T  45135305 attccagggcataagccctcaacagttgaatgac 45135272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 60 - 215
Target Start/End: Original strand, 20459874 - 20460028
Alignment:
Q  60 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattcca 158  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||| |||||||||  || ||||| |    
T  20459874 gttgaatgactaagcattccgaggcataagcccccaacaatttgaatgataa-acattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaagcattcta 20459972  T
Q  159 gggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac 215  Q
    |||||| |||| ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  20459973 gggcataagccgtcaac-agttgaatgacaaagcattccagggcataagtcctcaac 20460028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 60 - 264
Target Start/End: Original strand, 19881725 - 19881930
Alignment:
Q  60 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttgaatgatta-acattcc 157  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||   ||||||||  |  ||||||    
T  19881725 gttgaatgactaagcattccgtggcataagcccccaacaatttgaatgataa-acattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattcc 19881823  T
Q  158 agggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacag 256  Q
    ||||||| |||| |||||| ||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||| |||| ||| |||||||     
T  19881824 agggcataagccgtcaacagtttgaatgataa-acattccatggcataagccctcaacagtttgaatgaaaaagcattccagggcataagcactcaacaa 19881922  T
Q  257 ttgaatga 264  Q
    ||||||||    
T  19881923 ttgaatga 19881930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 61 - 176
Target Start/End: Original strand, 32949583 - 32949697
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagg 160  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32949583 ttgaatga-taaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccaaggcataagccctcaacagttgaatgattaacattccagg 32949681  T
Q  161 gcatgagccctcaaca 176  Q
    ||||||||||||||||    
T  32949682 gcatgagccctcaaca 32949697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 152 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 22145838 - 22145723
Alignment:
Q  152 cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaggcattccagagcattagctct 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| ||| ||    
T  22145838 cattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagtttgaatgacaaagcattccagggcataagccct 22145739  T
Q  251 caacagttgaatgaca 266  Q
    |||||||| |||||||    
T  22145738 caacagttaaatgaca 22145723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 140 - 258
Target Start/End: Original strand, 32949583 - 32949700
Alignment:
Q  140 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccaga 239  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||     
T  32949583 ttgaatgataaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccaaggcataagccctcaacagttgaatgatta-acattccagg 32949681  T
Q  240 gcattagctctcaacagtt 258  Q
    |||| ||| ||||||||||    
T  32949682 gcatgagccctcaacagtt 32949700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 140 - 225
Target Start/End: Original strand, 43111949 - 43112034
Alignment:
Q  140 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatga 225  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43111949 ttgaatgataaacattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatga 43112034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 41 - 213
Target Start/End: Original strand, 363594 - 363767
Alignment:
Q  41 gtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-gg 139  Q
    ||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||| ||||| |||||||||| |     
T  363594 gtggtaccattttcaacgggttgaatgactaagcattccagggcataagcccccaacaatttgaatgatga-tcattccagggcatgagccctcaacaga 363692  T
Q  140 ttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctca 213  Q
    ||||||||  || || |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  363693 ttgaatgacaaagcagtccagggcataagccctcaccaatttgaacgacaaggcgttccagggcatgagccctca 363767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 101 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 21415698 - 21415544
Alignment:
Q  101 ttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagg 200  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||||||||| || |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  21415698 ttgaatgactaagcattccagggcataagcccccagcaattgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagg 21415599  T
Q  201 gcataagccctcaacag-ttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaac 254  Q
    |||| |||||||||| | ||||||| ||| ||||||||| |||| ||| ||||||    
T  21415598 gcatgagccctcaacggtttgaatggcaaagcattccagggcatgagccctcaac 21415544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 138 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 22059885 - 22059756
Alignment:
Q  138 ggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattcc 236  Q
    |||||||||| ||| |||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  22059885 ggttgaatgactaagcatttcggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagctgaatgacaaagcattcc 22059786  T
Q  237 agagcattagctctcaacagttgaatgaca 266  Q
    || |||| |||  |||||||||||||||||    
T  22059785 agggcataagccatcaacagttgaatgaca 22059756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 49 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 38186226 - 38186102
Alignment:
Q  49 atttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgat 148  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| |||||||||||||||     
T  38186226 attttcaacatgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataa-acattccagggcataagccatcaacggttgaatgac 38186128  T
Q  149 taa-cattcca-gggcatgagccctc 172  Q
     || ||||||| ||||||||||||||    
T  38186127 aaagcattccaggggcatgagccctc 38186102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 139 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 44523320 - 44523200
Alignment:
Q  139 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattcca 237  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  44523320 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacggttgaatgacaaagcattcca 44523221  T
Q  238 gagcattagctctcaacagtt 258  Q
    | |||| ||| ||||||||||    
T  44523220 gggcatgagccctcaacagtt 44523200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 122 - 269
Target Start/End: Original strand, 44431512 - 44431660
Alignment:
Q  122 ggcataagccctcaacggtt-gaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttg 220  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||| | |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44431512 ggcataagccctcaacaatttgaatgatgatcattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacggttg 44431611  T
Q  221 aatgacaaggcattccagagcattagctctcaacag-ttgaatgacaaag 269  Q
    |||||  |  |||| ||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  44431612 aatgatta-acatttcagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaag 44431660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 43 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 7301738 - 7301517
Alignment:
Q  43 ggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggtt 141  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||  | |||||||| ||||| |||||||||| | ||    
T  7301738 ggtactattttcaactcgttgaatgactaagcattccggggcataagccccaacaaatttgaatgatga-acattccagggcatgagccctcaacagatt 7301640  T
Q  142 gaatgatta-acattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaggcattccaga 239  Q
    ||||||  |  || | |||||||| ||||||||||   ||||||||  |  |||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  7301639 gaatgacaaggcaattcagggcataagccctcaac-ggttgaatgatta-acattccagagcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagg 7301542  T
Q  240 gcattagctctcaacagttgaatga 264  Q
    |||| ||| |||||| |||||||||    
T  7301541 gcataagccctcaacggttgaatga 7301517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 140 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 7301680 - 7301553
Alignment:
Q  140 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccaga 239  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||  |  |||||||||    
T  7301680 ttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcaattcagggcataagccctcaacggttgaatgatta-acattccaga 7301582  T
Q  240 gcattagctctcaacag-ttgaatgacaa 267  Q
    |||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  7301581 gcatgagccctcaacagattgaatgacaa 7301553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 101 - 243
Target Start/End: Original strand, 20459875 - 20460017
Alignment:
Q  101 ttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccag 199  Q
    ||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||||  || ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| |||||| ||    
T  20459875 ttgaatgactaagcattccgaggcataagcccccaacaatttgaatgataaacattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattctag 20459973  T
Q  200 ggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcat 243  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  20459974 ggcataagccgtcaacagttgaatgacaaagcattccagggcat 20460017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 42 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 21415717 - 21415544
Alignment:
Q  42 tggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggt 140  Q
    |||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||  | |||||||| ||||| |||||||||| | |    
T  21415717 tggtaccattttcaacgtgttgaatgactaagcattccagggcataagcccccagcaa-ttgaatgatga-acattccagggcatgagccctcaacagat 21415620  T
Q  141 tgaatgatta-acattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac 215  Q
    |||||||  |  ||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  21415619 tgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacggtttgaatggcaaagcattccagggcatgagccctcaac 21415544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 61 - 176
Target Start/End: Original strand, 43111949 - 43112063
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagg 160  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |    
T  43111949 ttgaatga-taaacattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgattaatattccaag 43112047  T
Q  161 gcatgagccctcaaca 176  Q
    ||||||||||||||||    
T  43112048 gcatgagccctcaaca 43112063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 140 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 362296 - 362178
Alignment:
Q  140 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccaga 239  Q
    ||||||||| ||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||     
T  362296 ttgaatgataaacattctagggtataagccctcaacagtttgaatgacaaggtattatagggcataagccctcaatagttgaatgacaaagcattccagg 362197  T
Q  240 gcattagctctcaacagtt 258  Q
    |||| ||| ||||||||||    
T  362196 gcatgagccctcaacagtt 362178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 61 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 7301485 - 7301372
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagg 160  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  7301485 ttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaaca-tttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacggttgaatgacgagcattccagg 7301387  T
Q  161 gcatgagccctcaac 175  Q
    |||||||||||||||    
T  7301386 gcatgagccctcaac 7301372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 41 - 225
Target Start/End: Original strand, 43111889 - 43112072
Alignment:
Q  41 gtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-gg 139  Q
    ||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||| |     
T  43111889 gtggtaccattttcaacgtgttgaatgactaagcattccgggggataagcccccaacaatttgaatgataa-acattccagggcatgagccctcaacagt 43111987  T
Q  140 ttgaatgatta-acattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatga 225  Q
    ||||||||  |  ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||  |   |||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  43111988 ttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac-agttgaatgatta-atattccaaggcatgagccctcaacagttgaatga 43112072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 140 - 264
Target Start/End: Original strand, 17614572 - 17614696
Alignment:
Q  140 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaggcattccag 238  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  17614572 ttgaatgatgaacattccagggcataagccctcaacggtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccag 17614670  T
Q  239 agcattagctctcaacagttgaatga 264  Q
     |||| ||| |||||| |||||||||    
T  17614671 ggcatgagccctcaacggttgaatga 17614696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 61 - 258
Target Start/End: Original strand, 19881805 - 19882002
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaa-cattcca 158  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||  ||||| ||||||||| || |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||  || |||||||    
T  19881805 ttgaatgacaaggcattccagggcataagccgtcaacagtttgaatgataa-acattccatggcataagccctcaacagtttgaatgaaaaagcattcca 19881903  T
Q  159 gggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagt 257  Q
    |||||| ||| |||||||||| |||||| ||  ||||||||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||| | |||| ||| |||||||||    
T  19881904 gggcataagcactcaacaatt-gaatgataaa-cattccagggcatgagccctcgacaatttgaatgacaaggcattccggggcataagccctcaacagt 19882001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 139 - 269
Target Start/End: Original strand, 20459874 - 20460004
Alignment:
Q  139 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattcca 237  Q
    ||||||||| ||| ||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  20459874 gttgaatgactaagcattccgaggcataagcccccaacaatttgaatgataaa-cattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaagcattcta 20459972  T
Q  238 gagcattagctctcaacagttgaatgacaaag 269  Q
    | |||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  20459973 gggcataagccgtcaacagttgaatgacaaag 20460004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 60 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 21861759 - 21861565
Alignment:
Q  60 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattcca 158  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||   |||||||||  || ||||| |    
T  21861759 gttgaatgactaagcattccagggcataagcccccaacaatttgaatgataa-acattccagggcataagccctcagtagttgaatgacaaagcattcta 21861661  T
Q  159 gggcatgagccctcaacaatttgaat-gacaaggcattc-cagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctca 252  Q
    ||||||||||||||    |||||||| |  || ||||||  ||||| |||||||||| || ||||| |||||||| |||||| |||| ||| ||||    
T  21861660 gggcatgagccctcccggatttgaatggttaaagcattcaaagggcgtaagccctcaccaattgaacgacaaggcgttccagggcatgagccctca 21861565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 152 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 22059830 - 22059717
Alignment:
Q  152 cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctc 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||| || | |||| ||| |||    
T  22059830 cattccagggcatgagccctcaacagct-gaatgacaaagcattccagggcataagccatcaacagttgaatgacatagcatccctgggcataagccctc 22059732  T
Q  252 aacagttgaatgaca 266  Q
    |||||||||||||||    
T  22059731 aacagttgaatgaca 22059717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 139 - 264
Target Start/End: Original strand, 43111908 - 43112034
Alignment:
Q  139 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaggcattcc 236  Q
    ||||||||| ||| |||||| ||| || ||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43111908 gttgaatgactaagcattccgggggataagcccccaacaatttgaatgataaa-cattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattcc 43112006  T
Q  237 agagcattagctctcaacagttgaatga 264  Q
    || |||| ||| ||||||||||||||||    
T  43112007 agggcataagccctcaacagttgaatga 43112034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 101 - 252
Target Start/End: Original strand, 363614 - 363767
Alignment:
Q  101 ttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccag 199  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||||||||| ||||  || ||||||| | |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||    
T  363614 ttgaatgactaagcattccagggcataagcccccaacaatttgaatgatgatcattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaagcagtccag 363713  T
Q  200 ggcataagccctcaac-agttgaatgacaaggcattccagagcattagctctca 252  Q
    |||||||||||||| | | ||||| |||||||| |||||| |||| ||| ||||    
T  363714 ggcataagccctcaccaatttgaacgacaaggcgttccagggcatgagccctca 363767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 62 - 252
Target Start/End: Original strand, 44431492 - 44431682
Alignment:
Q  62 tgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttgaatgatta-acattccag 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |  ||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||  |  ||||||||    
T  44431492 tgaatgactaagcattccggggcataagccctcaacaatttgaatgatga-tcattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccag 44431590  T
Q  160 ggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaggcattccagagcattagctctca 252  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||||  |  |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||    
T  44431591 ggcataagccctcaac-ggttgaatgatta-acatttcagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaagcattccagggcataagccctca 44431682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 152 - 264
Target Start/End: Original strand, 44431504 - 44431616
Alignment:
Q  152 cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaggcattccagagcattagctct 250  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||    
T  44431504 cattccggggcataagccctcaacaatttgaatgatga-tcattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcataagccct 44431602  T
Q  251 caacagttgaatga 264  Q
    |||| |||||||||    
T  44431603 caacggttgaatga 44431616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 41 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 362356 - 362178
Alignment:
Q  41 gtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-gg 139  Q
    ||||||| |||| ||||  |||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| | || ||||||||||||| |     
T  362356 gtggtaccattttcaacgtgttgaatgactaggtattccggggcttaagcccccaacaatttgaatgataa-acattctagggtataagccctcaacagt 362258  T
Q  140 ttgaatgatta-acattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt 219  Q
    ||||||||  |   |||  ||||||| |||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  362257 ttgaatgacaaggtattatagggcataagccctcaa-tagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtt 362178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 53 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 6608792 - 6608588
Alignment:
Q  53 ccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacgg-ttgaatgattaa 151  Q
    ||||||| ||||||||  || |||||| |||||| ||||| |||||  ||||||||  | |||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||  |     
T  6608792 ccaacactttgaatgatgaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgatta-acattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaag 6608695  T
Q  152 -cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaggcattccagagcattagctc 249  Q
     ||||||||||||| ||||||||||  || ||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| |    
T  6608694 gcattccagggcataagccctcaacggtt-gaatgacgag-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcatgagccc 6608597  T
Q  250 tcaacagtt 258  Q
    |||||||||    
T  6608596 tcaacagtt 6608588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 139 - 264
Target Start/End: Original strand, 32949542 - 32949668
Alignment:
Q  139 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaggcattcc 236  Q
    ||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  32949542 gttgaatgactaagcattctagggcataagcccccaacaatttgaatgataaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattcc 32949640  T
Q  237 agagcattagctctcaacagttgaatga 264  Q
    |  |||| ||| ||||||||||||||||    
T  32949641 aaggcataagccctcaacagttgaatga 32949668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 60 - 219
Target Start/End: Original strand, 32949542 - 32949700
Alignment:
Q  60 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttgaatgatta-acattcc 157  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||   ||||||||  |  ||||||    
T  32949542 gttgaatgactaagcattctagggcataagcccccaacaatttgaatgataa-acattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattcc 32949640  T
Q  158 agggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt 219  Q
    | ||||| |||||||||| | ||||||||  |  ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32949641 aaggcataagccctcaac-agttgaatgatta-acattccagggcatgagccctcaacagtt 32949700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 60 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 7301525 - 7301372
Alignment:
Q  60 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattcca 158  Q
    ||||||||| ||| |||||| | |||| ||||| |||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||  || |||||||    
T  7301525 gttgaatgattaa-cattccagagcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacatttgaatgacaaagcattcca 7301427  T
Q  159 gggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac 215  Q
    |||||| ||||||||||  || ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||    
T  7301426 gggcataagccctcaacggtt-gaatgacgag-cattccagggcatgagccctcaac 7301372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 100 - 258
Target Start/End: Original strand, 15267117 - 15267280
Alignment:
Q  100 tttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaa--cattc-cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcatt 195  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||    |||||    
T  15267117 tttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagtttgaatggttaaagcattcacagggcatgagccctcaacggtttgaatgaactagcatt 15267216  T
Q  196 c-cagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagtt 258  Q
    | |||||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||||  |||| ||| ||||||||||    
T  15267217 cacagggcataagccctcaacgattgaacgacaaggcgttccaaggcatgagccctcaacagtt 15267280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 100 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 22522045 - 22521882
Alignment:
Q  100 tttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaa--cattc-cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcatt 195  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||    |||||    
T  22522045 tttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttgaatggttaaagcattcacagggcatgagccctcaacggtttgaatgatctagcatt 22521946  T
Q  196 c-cagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagtt 258  Q
    | |||||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||||| |||| ||| ||||||||||    
T  22521945 cacagggcataagccctcaacgattgaacgacaaggcgttccagggcatgagccctcaacagtt 22521882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 61 - 175
Target Start/End: Original strand, 43111988 - 43112100
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagg 160  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||  | | |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43111988 ttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgatta-atattccaaggcatgagccctcaacagttgaatgattaacattccagg 43112085  T
Q  161 gcatgagccctcaac 175  Q
     |||||| |||||||    
T  43112086 acatgagtcctcaac 43112100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 139 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 15004906 - 15004830
Alignment:
Q  139 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaa 214  Q
    ||||||||| ||| |||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15004906 gttgaatgactaagcattccagagcataaaccctcaacaatttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaa 15004830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 60 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 15004906 - 15004830
Alignment:
Q  60 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaa 136  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  15004906 gttgaatgactaagcattccagagcataaaccctcaacaatttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaa 15004830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 61 - 141
Target Start/End: Original strand, 19881962 - 19882042
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt 141  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  19881962 ttgaatgacaaggcattccggggcataagccctcaacagtttgaatgacgaggcattctagggcataagccctcaacggtt 19882042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 61 - 180
Target Start/End: Original strand, 28853643 - 28853761
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattccag 159  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||  || ||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||  || ||||||||    
T  28853643 ttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacggtt-gaatgacgag-cattccagggcatgagccctcaacggttgaacgacaaagcattccag 28853740  T
Q  160 ggcatgagccctcaacaattt 180  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  28853741 ggcatgagccctcaacaattt 28853761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 139 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 38186215 - 38186116
Alignment:
Q  139 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattcca 237  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  38186215 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataaa-cattccagggcataagccatcaacggttgaatgacaaagcattcca 38186117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 81 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 22434778 - 22434636
Alignment:
Q  81 gggcataagcccccaacaatttgaatga-caagacattc-caaggcataagccctcaacggttgaatgattaac-attc-cagggcatgagccctcaaca 176  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||| || ||||| |||||||||| ||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  22434778 gggcataagccctcaacaatttgaatgaactag-cattcacagggcatgagccctcaacagttgaataattaagtattcacagggcatgagccctcaaca 22434680  T
Q  177 atttgaatgacaaggcattc-cagggcataagccctcaacagtt 219  Q
     |||||||||  | |||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  22434679 gtttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctcaacagtt 22434636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 179 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 44523319 - 44523228
Alignment:
Q  179 ttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagttgaatgacaaag 269  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| |||| ||| |||||| ||||||||||||||    
T  44523319 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacggttgaatgacaaag 44523228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 192 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 7301512 - 7301434
Alignment:
Q  192 cattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagttgaatgacaaag 269  Q
    |||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  7301512 cattccagagcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacatttgaatgacaaag 7301434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 166 - 267
Target Start/End: Original strand, 17614559 - 17614660
Alignment:
Q  166 agccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaac-agttgaatga 264  Q
    ||||| |||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||| | ||||||||    
T  17614559 agcccccaacaatttgaatgatgaa-cattccagggcataagccctcaacggttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacaatttgaatga 17614657  T
Q  265 caa 267  Q
    |||    
T  17614658 caa 17614660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 179 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 22145891 - 22145799
Alignment:
Q  179 ttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacag-ttgaatgacaaag 269  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  22145891 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaag 22145799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 191 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 15004139 - 15004072
Alignment:
Q  191 gcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagtt 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||| ||| ||||||||||    
T  15004139 gcattccagggcataagccctcaacagttgaataacaaagcattctagggcataagccctcaacagtt 15004072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 61 - 254
Target Start/End: Original strand, 17795011 - 17795202
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaa-cattcca 158  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||  || ||||||  | |||||||| ||||| ||||||||||  || ||||||  || |||||||    
T  17795011 ttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacggtt-gaatgatta-acattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaaacattcca 17795108  T
Q  159 gggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaac 254  Q
    |||||| ||||||| ||  || ||||||  |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||    
T  17795109 gggcataagccctccacggtt-gaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 17795202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 60 - 147
Target Start/End: Original strand, 20454262 - 20454348
Alignment:
Q  60 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatga 147  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||  | ||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||| |||||||||    
T  20454262 gttgaatgactaagcatttcagggcataagcccctgataatttgaatgataa-acatttcagggcataagccctcaacagttgaatga 20454348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 179 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 22059883 - 22059792
Alignment:
Q  179 ttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagttgaatgacaaag 269  Q
    ||||||||| | ||||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||||||    
T  22059883 ttgaatgactaagcatttcggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagctgaatgacaaag 22059792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 157 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 23647681 - 23647586
Alignment:
Q  157 cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctca 252  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||    |||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||    
T  23647681 cagggcataagccctcaccaatttgaatgaactagcattccagggcatgagccctcaccaattgaacgacaaggcgttccagagcatgagccctca 23647586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 152 - 255
Target Start/End: Original strand, 28853656 - 28853757
Alignment:
Q  152 cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctc 251  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  || ||||||| || ||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||| |||| ||| |||    
T  28853656 cattccagggcataagccctcaacggtt-gaatgacgag-cattccagggcatgagccctcaacggttgaacgacaaagcattccagggcatgagccctc 28853753  T
Q  252 aaca 255  Q
    ||||    
T  28853754 aaca 28853757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 214
Target Start/End: Original strand, 20385147 - 20385284
Alignment:
Q  81 gggcataagcccccaacaatttgaatga-caagacattc-caaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaacattc-cagggcatgagccctcaaca 176  Q
    |||||||||||| |||||||||||| || | || ||||| || ||||| || ||||||| ||| ||||||||||||| | || |||||||||||||||||    
T  20385147 gggcataagccctcaacaatttgaacgaactag-cattcacagggcatgagtcctcaacagtttgaatgattaacatccacaaggcatgagccctcaaca 20385245  T
Q  177 atttgaatgacaaggcattc-cagggcataagccctcaa 214  Q
     |||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  20385246 gtttgaacgacaaggccttcacagggcataagccctcaa 20385284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 24708219 - 24708161
Alignment:
Q  39 acgtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaac 97  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24708219 acgtggtactattttcaacgggttgaatgactaagcattccggggcataagccctcaac 24708161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 213
Target Start/End: Original strand, 44431738 - 44431840
Alignment:
Q  113 acattccaaggcataagccctcaacgg-ttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccc 210  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||  || ||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  44431738 acattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaccaatttgaacgacaaggcgttccaaggcatgagccc 44431837  T
Q  211 tca 213  Q
    |||    
T  44431838 tca 44431840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 135
Target Start/End: Original strand, 44431766 - 44431840
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctca 135  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||| || ||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  44431766 ttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaccaatttgaacgacaaggcgttccaaggcatgagccctca 44431840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 153 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 362322 - 362206
Alignment:
Q  153 attccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaggcattccagagcattagctctc 251  Q
    ||||| |||| | ||||| ||||||||||||||| ||  ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||  || |||| ||| |||    
T  362322 attccggggcttaagcccccaacaatttgaatgataaa-cattctagggtataagccctcaacagtttgaatgacaaggtattatagggcataagccctc 362224  T
Q  252 aacagttgaatgacaaag 269  Q
    || |||||||||||||||    
T  362223 aatagttgaatgacaaag 362206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 152 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 15004138 - 15004072
Alignment:
Q  152 cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt 219  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || |||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15004138 cattccagggcataagccctcaacagtt-gaataacaaagcattctagggcataagccctcaacagtt 15004072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 179 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 24708197 - 24708118
Alignment:
Q  179 ttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagtt 258  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  |||||| || |||| ||| ||||||||||    
T  24708197 ttgaatgactaagcattccggggcataagccctcaacggttgaatgacatagcattctagggcatgagccctcaacagtt 24708118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 22434696 - 22434599
Alignment:
Q  122 ggcataagccctcaacggtt-gaatgattaa-cattc-cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattc-cagggcataagccctcaac 215  Q
    ||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  | |||||| |||||||| ||||||||||    
T  22434696 ggcatgagccctcaacagtttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctcaacagtttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctcaac 22434599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 101 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 24708197 - 24708121
Alignment:
Q  101 ttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatga-ttaacattccagggcatgagccctcaaca 176  Q
    ||||||||| |  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||    
T  24708197 ttgaatgactaagcattccggggcataagccctcaacggttgaatgacatagcattctagggcatgagccctcaaca 24708121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 21861584 - 21861525
Alignment:
Q  154 ttccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctca 213  Q
    |||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  21861584 ttccagggcatgagccctcaccgctttgaacgacaaggcgttccagggcatgagccctca 21861525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 22434780 - 22434713
Alignment:
Q  157 cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattc-cagggcataagccctcaacagttgaat 223  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  22434780 cagggcataagccctcaacaatttgaatgaactagcattcacagggcatgagccctcaacagttgaat 22434713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 228
Target Start/End: Original strand, 20454262 - 20454351
Alignment:
Q  139 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaa 228  Q
    ||||||||| ||| |||| |||||||| |||||   | ||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20454262 gttgaatgactaagcatttcagggcataagcccctgataatttgaatgataaa-catttcagggcataagccctcaacagttgaatgacaa 20454351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 60 - 141
Target Start/End: Original strand, 20459952 - 20460032
Alignment:
Q  60 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt 141  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||||||||  ||||| || |||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  20459952 gttgaatgacaaagcattctagggcataagccgtcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcataagtcctcaacggtt 20460032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 152 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 23647646 - 23647586
Alignment:
Q  152 cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctca 213  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  23647646 cattccagggcatgagccctcaccaa-ttgaacgacaaggcgttccagagcatgagccctca 23647586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 252
Target Start/End: Original strand, 44431739 - 44431800
Alignment:
Q  192 cattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaggcattccagagcattagctctca 252  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||    
T  44431739 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaagcattccagggcataagccctca 44431800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 61 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 44523279 - 44523183
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaacattcc 157  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||| ||||| ||||  || |||||||||  ||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  44523279 ttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacggtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgattaacattcc 44523183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 7301446 - 7301368
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt 141  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||  || ||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  7301446 ttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacggtt-gaatgacgag-cattccagggcatgagccctcaacggtt 7301368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 21415620 - 21415540
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt 141  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||| ||||| ||||  |||||||| |||  ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  21415620 ttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacggtttgaatggcaaagcattccagggcatgagccctcaacggtt 21415540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 45135319 - 45135241
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt 141  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||| | ||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  45135319 ttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac-agttgaatgacgag-cattccagggcatgagccctcaacggtt 45135241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 179 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 15004905 - 15004830
Alignment:
Q  179 ttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaggcattccagagcattagctctcaa 253  Q
    ||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||    
T  15004905 ttgaatgactaagcattccagagcataaaccctcaacaatttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaa 15004830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 178 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 20012358 - 20012323
Alignment:
Q  178 tttgaatgacaaggcattccagggcataagccctca 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20012358 tttgaatgacaaggcattccagggcttaagccctca 20012323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 179 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 21861758 - 21861668
Alignment:
Q  179 ttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagttgaatgacaaag 269  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||  |||||||| |||| ||| ||||  |||||||||||||||    
T  21861758 ttgaatgactaagcattccagggcataagcccccaacaatttgaatgataaa-cattccagggcataagccctcagtagttgaatgacaaag 21861668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 157 - 212
Target Start/End: Original strand, 33088878 - 33088933
Alignment:
Q  157 cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctc 212  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||    
T  33088878 cagggcataagccctcaccaatttgaacaacaaggtgttccagggcataagccctc 33088933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 216
Target Start/End: Original strand, 22616617 - 22616715
Alignment:
Q  122 ggcataagccctcaacggttg-aatgattaa-cattcc-agggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattc-cagggcataagccctcaaca 216  Q
    ||||||| ||||||||  ||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||| |||||||||||  |||||||    
T  22616617 ggcataacccctcaacaattggaatgattaagcattcccagggcatgagccctcaacggtttgaacgacaaggcgttcacagggcataagaactcaaca 22616715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 61 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 17272853 - 17272816
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaaca 98  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  17272853 ttgaatgactaagcattccggagcataaacccccaaca 17272816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 60 - 141
Target Start/End: Original strand, 17795127 - 17795206
Alignment:
Q  60 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt 141  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||| || |||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  17795127 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtt 17795206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 140 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 38186174 - 38186114
Alignment:
Q  140 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccaggg 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||  || ||||||||| |||||||||||    
T  38186174 ttgaatgataaacattccagggcataagccatcaacggtt-gaatgacaaagcattccaggg 38186114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 132)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 15010670 - 15010446
Alignment:
Q  1 caacatcatcaacacgatccacaacaacatcaac------tacgacgtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagccccc 94  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15010670 caacatcatcaacacgatccacaacaacatcaacgacaactacgacgtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagccccc 15010571  T
Q  95 aacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggca 193  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||    
T  15010570 aacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctgaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcagc-agttgaatgacaaagca 15010472  T
Q  194 ttccagggcataagccctcaacagtt 219  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  15010471 ttccagggcatgagccctcaacagtt 15010446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 39 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 2039255 - 2039024
Alignment:
Q  39 acgtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac- 137  Q
    ||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||     
T  2039255 acgtggtactaatttcaacgggttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaaca 2039156  T
Q  138 ggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattcc 236  Q
      ||||||||  || ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2039155 atttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaac-agttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaagcattcc 2039057  T
Q  237 agagcattagctctcaacagttgaatgacaaag 269  Q
    || |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  2039056 agggcataagccctcaacagttgaatgacaaag 2039024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 39 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 2042996 - 2042765
Alignment:
Q  39 acgtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac- 137  Q
    ||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||     
T  2042996 acgtggtactaatttcaacgggttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaaca 2042897  T
Q  138 ggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattcc 236  Q
      ||||||||  || ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2042896 atttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaac-agttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaagcattcc 2042798  T
Q  237 agagcattagctctcaacagttgaatgacaaag 269  Q
    || |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  2042797 agggcataagccctcaacagttgaatgacaaag 2042765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 41 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 179914 - 179729
Alignment:
Q  41 gtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggt 140  Q
    ||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||    
T  179914 gtggtaccattttcaacgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcgtaagccctcaacagt 179815  T
Q  141 tgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatga 225  Q
    |||||||  || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  179814 tgaatgacaaatcattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatga 179729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 74 - 269
Target Start/End: Original strand, 54972935 - 54973132
Alignment:
Q  74 cattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagaca-ttccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctc 172  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||  |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54972935 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcaattccagggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctc 54973034  T
Q  173 aacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagttgaatgacaaag 269  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  54973035 aacaatttgaatgacaaagcattccagagcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacatttgaatgacaaag 54973132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 74 - 269
Target Start/End: Original strand, 54975545 - 54975742
Alignment:
Q  74 cattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagaca-ttccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctc 172  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||  |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54975545 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcaattccagggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctc 54975644  T
Q  173 aacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagttgaatgacaaag 269  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  54975645 aacaatttgaatgacaaagcattccagagcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacatttgaatgacaaag 54975742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 74 - 269
Target Start/End: Original strand, 54978155 - 54978352
Alignment:
Q  74 cattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagaca-ttccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctc 172  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||  |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54978155 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcaattccagggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctc 54978254  T
Q  173 aacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagttgaatgacaaag 269  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  54978255 aacaatttgaatgacaaagcattccagagcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacatttgaatgacaaag 54978352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 61 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 2039193 - 2038985
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattccag 159  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||    
T  2039193 ttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaagcattccag 2039094  T
Q  160 ggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagttg 259  Q
    ||||| |||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||    
T  2039093 ggcataagccctcaac-agttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagttg 2038995  T
Q  260 aatgacaaag 269  Q
    ||||||||||    
T  2038994 aatgacaaag 2038985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 61 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 2042934 - 2042726
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattccag 159  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||    
T  2042934 ttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaagcattccag 2042835  T
Q  160 ggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagttg 259  Q
    ||||| |||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||    
T  2042834 ggcataagccctcaac-agttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagttg 2042736  T
Q  260 aatgacaaag 269  Q
    ||||||||||    
T  2042735 aatgacaaag 2042726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 604121 - 603939
Alignment:
Q  1 caacatcatcaacacgatccacaacaacatcaac------tacgacgtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagccccc 94  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  604121 caacatcatcaacacgatccataacaacatcaacgacaactacgacgtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattctggggcataagccccc 604022  T
Q  95 aacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaaca 176  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  604021 aacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaaca 603939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 39 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 2035514 - 2035296
Alignment:
Q  39 acgtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac- 137  Q
    ||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||     
T  2035514 acgtggtactaatttcaacgggttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaaca 2035415  T
Q  138 ggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattcc 236  Q
      ||||||||  || ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  2035414 atttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaac-agttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacatagcattcc 2035316  T
Q  237 agagcattagctctcaacag 256  Q
    || |||| ||| ||||||||    
T  2035315 agggcataagccctcaacag 2035296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 60 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 2039076 - 2038868
Alignment:
Q  60 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattcca 158  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||  || |||||||    
T  2039076 gttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaagcattcca 2038978  T
Q  159 gggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagtt 258  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  2038977 gggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagtt 2038879  T
Q  259 gaatgacaaag 269  Q
    |||||||||||    
T  2038878 gaatgacaaag 2038868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 60 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 2039115 - 2038907
Alignment:
Q  60 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattcca 158  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| | |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||  || |||||||    
T  2039115 gttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaac-agttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaagcattcca 2039017  T
Q  159 gggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagtt 258  Q
    |||||| |||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  2039016 gggcataagccctcaac-agttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagtt 2038918  T
Q  259 gaatgacaaag 269  Q
    |||||||||||    
T  2038917 gaatgacaaag 2038907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 60 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 2042817 - 2042609
Alignment:
Q  60 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattcca 158  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||  || |||||||    
T  2042817 gttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaagcattcca 2042719  T
Q  159 gggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagtt 258  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  2042718 gggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagtt 2042620  T
Q  259 gaatgacaaag 269  Q
    |||||||||||    
T  2042619 gaatgacaaag 2042609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 60 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 2042856 - 2042648
Alignment:
Q  60 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattcca 158  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| | |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||  || |||||||    
T  2042856 gttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaac-agttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaagcattcca 2042758  T
Q  159 gggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagtt 258  Q
    |||||| |||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  2042757 gggcataagccctcaac-agttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagtt 2042659  T
Q  259 gaatgacaaag 269  Q
    |||||||||||    
T  2042658 gaatgacaaag 2042648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 60 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 2039037 - 2038832
Alignment:
Q  60 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattcca 158  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||  || |||||||    
T  2039037 gttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaagcattcca 2038939  T
Q  159 gggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagtt 258  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  2038938 gggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagtt 2038840  T
Q  259 gaatgaca 266  Q
    ||||||||    
T  2038839 gaatgaca 2038832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 60 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 2042778 - 2042573
Alignment:
Q  60 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattcca 158  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||  || |||||||    
T  2042778 gttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaagcattcca 2042680  T
Q  159 gggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagtt 258  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  2042679 gggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagtt 2042581  T
Q  259 gaatgaca 266  Q
    ||||||||    
T  2042580 gaatgaca 2042573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 82 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 52339175 - 52338992
Alignment:
Q  82 ggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatttg 181  Q
    ||||| ||||| |||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  52339175 ggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcataagccatcaacagttgaatgattaacatttcagggcatgagctctcaacaatttg 52339076  T
Q  182 aatgacaaggcattccagggcataagccctcaac-agttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagttgaatga 264  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  52339075 aatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatga 52338992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 60 - 269
Target Start/End: Original strand, 16799368 - 16799580
Alignment:
Q  60 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttgaatgattaa-cattcc 157  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||  || ||||||    
T  16799368 gttgaatgactaagcattccagggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaagcattcc 16799467  T
Q  158 agggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac-agttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacag 256  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||    
T  16799468 agggcatgagccctcaac-agttgaatgacaaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacag 16799566  T
Q  257 -ttgaatgacaaag 269  Q
     |||||||||||||    
T  16799567 tttgaatgacaaag 16799580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 31 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 14951988 - 14951778
Alignment:
Q  31 caactacgacgtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagc 130  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  14951988 caacaacgacgtggtactattttcaacacattgaatgactaagcattccggggcataagccctcaacaatttgaatgacaaagcattccagggcataagc 14951889  T
Q  131 cctcaacggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaag 229  Q
    ||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||||||              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14951888 cctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaaca--------------gcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaa 14951803  T
Q  230 gcattccagagcattagctctcaac 254  Q
    |||||| || |||| ||| ||||||    
T  14951802 gcattcaagggcatgagccctcaac 14951778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 60 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 23396214 - 23396058
Alignment:
Q  60 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaacattcca 158  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||    
T  23396214 gttgaatgacaaagcattccagggcataatcccccaacaatttgaatgacaaggcattctagggcataagcccccaacaatttgaatgattaacattcca 23396115  T
Q  159 gggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac 215  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23396114 gggcatgagccctcaacattttgaatgacaaggcattccagggcataagcgctcaac 23396058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 39 - 219
Target Start/End: Original strand, 14041273 - 14041454
Alignment:
Q  39 acgtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac- 137  Q
    ||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||     
T  14041273 acgtggtactaatttcaacgggttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaaca 14041372  T
Q  138 ggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt 219  Q
    | ||||||||  || ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14041373 gtttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaac-agttgaatgacatagcattccagggcataagccctcaacagtt 14041454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 60 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 2038998 - 2038803
Alignment:
Q  60 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattcca 158  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||  || |||||||    
T  2038998 gttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaagcattcca 2038900  T
Q  159 gggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacag 256  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||| ||||||||    
T  2038899 gggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacatagcattccagggcataagccctcaacag 2038803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 60 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 2042739 - 2042544
Alignment:
Q  60 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattcca 158  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||  || |||||||    
T  2042739 gttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaagcattcca 2042641  T
Q  159 gggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacag 256  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||| ||||||||    
T  2042640 gggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacatagcattccagggcataagccctcaacag 2042544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 39 - 217
Target Start/End: Original strand, 14037805 - 14037984
Alignment:
Q  39 acgtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac- 137  Q
    ||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||     
T  14037805 acgtggtactaatttcaacgggttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaaca 14037904  T
Q  138 ggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacag 217  Q
    | ||||||||  || ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  14037905 gtttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaac-agttgaatgacatagcattccagggcataagccctcaacag 14037984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Original strand, 7631868 - 7632010
Alignment:
Q  1 caacatcatcaacacgatccacaacaacatcaac------tacgacgtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagccccc 94  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7631868 caacatcatcaacgcgatccacaacaacatcaacgacaactacgatgtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagccccc 7631967  T
Q  95 aacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac 137  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  7631968 aacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaac 7632010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 100 - 265
Target Start/End: Original strand, 10553994 - 10554160
Alignment:
Q  100 tttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccag 199  Q
    |||||| |||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  10553994 tttgaacgacaaggcgttccagggcatgagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaagcattccag 10554093  T
Q  200 ggcataagccctcaac-agttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagttgaatgac 265  Q
    ||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||| ||||||||||    
T  10554094 ggcataagcccccaacaatttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggttgaatgac 10554160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 81 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 10990047 - 10989875
Alignment:
Q  81 gggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaattt 180  Q
    |||||| ||||| |||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  10990047 gggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagatt 10989948  T
Q  181 gaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac-agttgaatgacaaggcattccagagcattagctctca 252  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | | ||||| |||||||| |||||| |||| ||| ||||    
T  10989947 gaatgacaaagcattacagggcataagccctcaccaatttgaacgacaaggcgttccagggcatgagccctca 10989875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 61 - 254
Target Start/End: Original strand, 16799409 - 16799604
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattccag 159  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||| |    
T  16799409 ttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccgg 16799508  T
Q  160 ggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaggcattccagagcattagctctcaac 254  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||    
T  16799509 ggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 16799604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 152 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 2035439 - 2035325
Alignment:
Q  152 cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctc 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| |||    
T  2035439 cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcataagccctc 2035340  T
Q  252 aacagttgaatgaca 266  Q
    |||||||||||||||    
T  2035339 aacagttgaatgaca 2035325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 61 - 219
Target Start/End: Original strand, 10554073 - 10554230
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagg 160  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  | ||||| |||    
T  10554073 ttgaatgacaaagcattccagggcataagcccccaacaatttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggttgaatgacgagcattctagg 10554172  T
Q  161 gcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt 219  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10554173 gcatgagccctcaac-ggttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtt 10554230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 24 - 215
Target Start/End: Original strand, 18958508 - 18958701
Alignment:
Q  24 acaacatcaactacgacgtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttg-aatgacaagaca-ttccaa 121  Q
    |||||| |||| || ||| |||||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||     
T  18958508 acaacaacaacaacaacggggtactattttcaacgggctgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaaatgacaaggcatttccag 18958607  T
Q  122 ggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac 215  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18958608 ggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaac-agttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaac 18958701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 101 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 6806172 - 6806015
Alignment:
Q  101 ttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccag 199  Q
    ||||||||| |  ||||||  ||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6806172 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacagtttgaatgataaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccag 6806073  T
Q  200 ggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagtt 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  6806072 ggcataagccctcaacagttgaatgatta-gcattccagggcatgagccctcaacagtt 6806015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 61 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 52339078 - 52338959
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagg 160  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  52339078 ttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgattaacattccagg 52338979  T
Q  161 gcatgagccctcaacaattt 180  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  52338978 gcatgagccctcaacaattt 52338959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Original strand, 54046398 - 54046540
Alignment:
Q  1 caacatcatcaacacgatccacaacaacatcaac------tacgacgtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagccccc 94  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||      |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  54046398 caacatcatcaacacgatccataacaacatcaacgacaactacgacgtggcactatttccgacacgttgaatgactaagcattccggggcatgagccccc 54046497  T
Q  95 aacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac 137  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  54046498 aacaattcgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaac 54046540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 41 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 23396311 - 23396136
Alignment:
Q  41 gtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggt 140  Q
    |||| ||||||| ||||  |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| | ||||  ||    
T  23396311 gtggcactattttcaacgtgttgaatgactaagtatatcggggcataagcccccaacaatttgaatgataa-acattccagggcataagtcatcaatagt 23396213  T
Q  141 tgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaaca 216  Q
    |||||||  || ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  23396212 tgaatgacaaagcattccagggcataatcccccaacaatttgaatgacaaggcattctagggcataagcccccaaca 23396136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 60 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 179816 - 179701
Alignment:
Q  60 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccag 159  Q
    |||||||||| || |||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  179816 gttgaatgacaaatcattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgattaacattccag 179717  T
Q  160 ggcatgagccctcaac 175  Q
    ||||||||||||||||    
T  179716 ggcatgagccctcaac 179701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 139 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 15010605 - 15010474
Alignment:
Q  139 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattcca 237  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  15010605 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctgaacagttgaatgacaaagcattcca 15010506  T
Q  238 gagcattagctctcaacagttgaatgacaaag 269  Q
    | |||| ||| |||| ||||||||||||||||    
T  15010505 gggcatgagccctcagcagttgaatgacaaag 15010474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 138 - 266
Target Start/End: Original strand, 14037825 - 14037955
Alignment:
Q  138 ggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaggcattc 235  Q
    |||||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  14037825 ggttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaagcattc 14037924  T
Q  236 cagagcattagctctcaacagttgaatgaca 266  Q
    ||| |||| ||| ||||||||||||||||||    
T  14037925 cagggcataagccctcaacagttgaatgaca 14037955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 138 - 266
Target Start/End: Original strand, 14041293 - 14041423
Alignment:
Q  138 ggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaggcattc 235  Q
    |||||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  14041293 ggttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaagcattc 14041392  T
Q  236 cagagcattagctctcaacagttgaatgaca 266  Q
    ||| |||| ||| ||||||||||||||||||    
T  14041393 cagggcataagccctcaacagttgaatgaca 14041423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 152 - 258
Target Start/End: Original strand, 14041348 - 14041454
Alignment:
Q  152 cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctc 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||| |||    
T  14041348 cattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacatagcattccagggcataagccctc 14041447  T
Q  252 aacagtt 258  Q
    |||||||    
T  14041448 aacagtt 14041454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 39 - 176
Target Start/End: Original strand, 39230409 - 39230546
Alignment:
Q  39 acgtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacg 138  Q
    ||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||     
T  39230409 acgtggtactaatttcaacgggttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaac-agttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaaca 39230507  T
Q  139 gttgaatga-ttaacattccagggcatgagccctcaaca 176  Q
    |||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||    
T  39230508 gttgaatgacatagcattccagggcataagccctcaaca 39230546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 113 - 265
Target Start/End: Original strand, 54973013 - 54973167
Alignment:
Q  113 acattccaaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccc 210  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||  || ||||||  || |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54973013 acattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaagcattccagagcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcataagccc 54973112  T
Q  211 tcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagttgaatgac 265  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||| ||||||||||    
T  54973113 tcaacatttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacggttgaatgac 54973167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 113 - 265
Target Start/End: Original strand, 54975623 - 54975777
Alignment:
Q  113 acattccaaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccc 210  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||  || ||||||  || |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54975623 acattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaagcattccagagcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcataagccc 54975722  T
Q  211 tcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagttgaatgac 265  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||| ||||||||||    
T  54975723 tcaacatttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacggttgaatgac 54975777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 113 - 265
Target Start/End: Original strand, 54978233 - 54978387
Alignment:
Q  113 acattccaaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccc 210  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||  || ||||||  || |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54978233 acattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaagcattccagagcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcataagccc 54978332  T
Q  211 tcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagttgaatgac 265  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||| ||||||||||    
T  54978333 tcaacatttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacggttgaatgac 54978387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 138 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 2035494 - 2035361
Alignment:
Q  138 ggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac-agttgaatgacaaggcattc 235  Q
    |||||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| ||||||    
T  2035494 ggttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaagcattc 2035395  T
Q  236 cagagcattagctctcaacagttgaatgacaaag 269  Q
    ||| |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  2035394 cagggcataagccctcaacagttgaatgacaaag 2035361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 140 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 14951958 - 14951841
Alignment:
Q  140 ttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccag 238  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14951958 ttgaatgactaagcattccggggcataagccctcaacaatttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaagcattccag 14951859  T
Q  239 agcattagctctcaacag 256  Q
     |||| ||| ||||||||    
T  14951858 ggcatgagccctcaacag 14951841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 152 - 256
Target Start/End: Original strand, 14037880 - 14037984
Alignment:
Q  152 cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctc 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||| |||    
T  14037880 cattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacatagcattccagggcataagccctc 14037979  T
Q  252 aacag 256  Q
    |||||    
T  14037980 aacag 14037984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 61 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 6806132 - 6806018
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagg 160  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  6806132 ttgaatga-taaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgattagcattccagg 6806034  T
Q  161 gcatgagccctcaaca 176  Q
    ||||||||||||||||    
T  6806033 gcatgagccctcaaca 6806018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 139 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 179895 - 179765
Alignment:
Q  139 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattcca 237  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  179895 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcgtaagccctcaacagttgaatgacaaatcattcca 179796  T
Q  238 gagcattagctctcaacag-ttgaatgacaa 267  Q
    | |||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  179795 gggcatgagccctcaacagtttgaatgacaa 179765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 139 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 604056 - 603936
Alignment:
Q  139 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattcca 237  Q
    ||||||||| ||| |||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  604056 gttgaatgactaagcattctggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattcca 603957  T
Q  238 gagcattagctctcaacagtt 258  Q
    | |||| ||| ||||||||||    
T  603956 gggcatgagccctcaacagtt 603936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 81 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 3395140 - 3395001
Alignment:
Q  81 gggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattc-caaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaa-cattc-cagggcatgagccctcaaca 176  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||  || |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  3395140 gggcatgagccctcaacaatttgaatgacaagtcattcacagggcatgagccctcaacaatttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctcaaca 3395041  T
Q  177 atttgaatgacaaggcattc-cagggcataagccctcaac 215  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3395040 atttgaatgacaaggcattcacagggcataagccctcaac 3395001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 152 - 269
Target Start/End: Original strand, 18958558 - 18958677
Alignment:
Q  152 cattccagggcatgagccctcaacaatttgaa-tgacaaggcatt-ccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctc 249  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| |    
T  18958558 cattccggggcataagcccccaacaatttgaaatgacaaggcatttccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcataagccc 18958657  T
Q  250 tcaacagttgaatgacaaag 269  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  18958658 tcaacagttgaatgacaaag 18958677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 113 - 269
Target Start/End: Original strand, 10554045 - 10554202
Alignment:
Q  113 acattccaaggcataagccctcaacgg-ttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccc 210  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||  || ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  10554045 acattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaagcattccagggcataagcccccaacaatttgaatgacaaagcattccagggcatgagccc 10554144  T
Q  211 tcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagttgaatgacaaag 269  Q
    ||||| |||||||||| || ||||| || |||| ||| |||||| ||||||||||||||    
T  10554145 tcaacggttgaatgacgag-cattctagggcatgagccctcaacggttgaatgacaaag 10554202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 43 - 267
Target Start/End: Original strand, 54972865 - 54973091
Alignment:
Q  43 ggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggtt 141  Q
    |||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||| |||||||||| | ||    
T  54972865 ggtactattttcaactcaatgaatgactaagcattccgaggcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggcatgagccctcaacagatt 54972963  T
Q  142 gaatgatta--acattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac-agttgaatgacaaggcattccag 238  Q
    ||||||  |    |||||||||||| ||||||||||   ||||||||  |  ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  54972964 gaatgacaaggcaattccagggcataagccctcaac-ggttgaatgatta-acattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaagcattccag 54973061  T
Q  239 agcattagctctcaacag-ttgaatgacaa 267  Q
    ||||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  54973062 agcatgagccctcaacagattgaatgacaa 54973091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 43 - 267
Target Start/End: Original strand, 54975475 - 54975701
Alignment:
Q  43 ggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggtt 141  Q
    |||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||| |||||||||| | ||    
T  54975475 ggtactattttcaactcaatgaatgactaagcattccgaggcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggcatgagccctcaacagatt 54975573  T
Q  142 gaatgatta--acattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac-agttgaatgacaaggcattccag 238  Q
    ||||||  |    |||||||||||| ||||||||||   ||||||||  |  ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  54975574 gaatgacaaggcaattccagggcataagccctcaac-ggttgaatgatta-acattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaagcattccag 54975671  T
Q  239 agcattagctctcaacag-ttgaatgacaa 267  Q
    ||||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  54975672 agcatgagccctcaacagattgaatgacaa 54975701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 43 - 267
Target Start/End: Original strand, 54978085 - 54978311
Alignment:
Q  43 ggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggtt 141  Q
    |||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||| |||||||||| | ||    
T  54978085 ggtactattttcaactcaatgaatgactaagcattccgaggcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggcatgagccctcaacagatt 54978183  T
Q  142 gaatgatta--acattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac-agttgaatgacaaggcattccag 238  Q
    ||||||  |    |||||||||||| ||||||||||   ||||||||  |  ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  54978184 gaatgacaaggcaattccagggcataagccctcaac-ggttgaatgatta-acattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaagcattccag 54978281  T
Q  239 agcattagctctcaacag-ttgaatgacaa 267  Q
    ||||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  54978282 agcatgagccctcaacagattgaatgacaa 54978311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 39 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 10834597 - 10834381
Alignment:
Q  39 acgtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacg 138  Q
    |||||| || |||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||||     
T  10834597 acgtggcaccattttcaacatgttgaatgactaagcattatggggcataagcccccaacaatttgaatgataa-acattctagggcataagccctcaaca 10834499  T
Q  139 gttgaatga-ttaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaat-gacaaggcattc-cagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattc 235  Q
     ||||||||   |||| |||||||||||||||||     |||||||| |  || |||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||    
T  10834498 attgaatgacaaaacactccagggcatgagcccttccggatttgaatggttaaagcattcacagggcataagccctcaccaattgaacgacaaggcgttc 10834399  T
Q  236 cagagcattagctctcaa 253  Q
    ||| |||| ||| |||||    
T  10834398 cagggcatgagccctcaa 10834381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 41 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 6806192 - 6806015
Alignment:
Q  41 gtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-gg 139  Q
    ||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||       
T  6806192 gtggtaccattttcaacgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacagtttgaatgataa-acattccagggcatgagccctcaacaat 6806094  T
Q  140 ttgaatgatta-acattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt 219  Q
    ||||||||  |  ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6806093 ttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac-agttgaatgatta-gcattccagggcatgagccctcaacagtt 6806015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 154 - 254
Target Start/End: Original strand, 18958602 - 18958701
Alignment:
Q  154 ttccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaa 253  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||    
T  18958602 ttccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaa 18958700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 140 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 10990066 - 10989937
Alignment:
Q  140 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccaga 239  Q
    ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |  ||||||||     
T  10990066 ttgaatgatgatcattctagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacggttgaatgatta-acattccagg 10989968  T
Q  240 gcattagctctcaacag-ttgaatgacaaag 269  Q
    |||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  10989967 gcatgagccctcaacagattgaatgacaaag 10989937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 114 - 269
Target Start/End: Original strand, 54972896 - 54973053
Alignment:
Q  114 cattccaaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggc-attccagggcataagccct 211  Q
    |||||| |||||||||||| ||||  || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  54972896 cattccgaggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcaattccagggcataagccct 54972995  T
Q  212 caacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaac-agttgaatgacaaag 269  Q
    |||| |||||||||  |  |||||||| |||| ||| |||||| | |||||||||||||    
T  54972996 caacggttgaatgatta-acattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaag 54973053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 61 - 175
Target Start/End: Original strand, 54973081 - 54973194
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagg 160  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  54973081 ttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaaca-tttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacggttgaatgacgagcattccagg 54973179  T
Q  161 gcatgagccctcaac 175  Q
    |||||||||||||||    
T  54973180 gcatgagccctcaac 54973194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 114 - 269
Target Start/End: Original strand, 54975506 - 54975663
Alignment:
Q  114 cattccaaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggc-attccagggcataagccct 211  Q
    |||||| |||||||||||| ||||  || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  54975506 cattccgaggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcaattccagggcataagccct 54975605  T
Q  212 caacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaac-agttgaatgacaaag 269  Q
    |||| |||||||||  |  |||||||| |||| ||| |||||| | |||||||||||||    
T  54975606 caacggttgaatgatta-acattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaag 54975663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 61 - 175
Target Start/End: Original strand, 54975691 - 54975804
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagg 160  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  54975691 ttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaaca-tttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacggttgaatgacgagcattccagg 54975789  T
Q  161 gcatgagccctcaac 175  Q
    |||||||||||||||    
T  54975790 gcatgagccctcaac 54975804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 114 - 269
Target Start/End: Original strand, 54978116 - 54978273
Alignment:
Q  114 cattccaaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggc-attccagggcataagccct 211  Q
    |||||| |||||||||||| ||||  || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  54978116 cattccgaggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcaattccagggcataagccct 54978215  T
Q  212 caacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaac-agttgaatgacaaag 269  Q
    |||| |||||||||  |  |||||||| |||| ||| |||||| | |||||||||||||    
T  54978216 caacggttgaatgatta-acattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaag 54978273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 61 - 175
Target Start/End: Original strand, 54978301 - 54978414
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagg 160  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  54978301 ttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaaca-tttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacggttgaatgacgagcattccagg 54978399  T
Q  161 gcatgagccctcaac 175  Q
    |||||||||||||||    
T  54978400 gcatgagccctcaac 54978414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 42 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 52339254 - 52339028
Alignment:
Q  42 tggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggt 140  Q
    |||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||| ||||| |||||||||| | |    
T  52339254 tggtaccattttcaacgggttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatga-tcattccatggcatgagccctcaacagat 52339156  T
Q  141 tgaatgatta-acattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac-agttgaatgacaaggcattccag 238  Q
    |||||||  |  ||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||  |  |||| |||||||| ||| |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  52339155 tgaatgacaaggcattccagggcataagccatcaac-agttgaatgatta-acatttcagggcatgagctctcaacaatttgaatgacaaggcattccag 52339058  T
Q  239 agcattagctctcaac-agttgaatgacaa 267  Q
     |||| ||| |||||| | |||||||||||    
T  52339057 ggcatgagccctcaacaatttgaatgacaa 52339028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 60 - 258
Target Start/End: Original strand, 10554033 - 10554230
Alignment:
Q  60 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaa-cattcc 157  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||| ||||| |||||  |||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||  || ||||||  || ||||||    
T  10554033 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaagcattccagggcataagcccccaacaatttgaatgacaaagcattcc 10554131  T
Q  158 agggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagt 257  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||| || ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||    
T  10554132 agggcatgagccctcaacggtt-gaatgacgag-cattctagggcatgagccctcaacggttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagt 10554229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 138 - 256
Target Start/End: Original strand, 39230429 - 39230547
Alignment:
Q  138 ggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattcc 236  Q
    |||||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  39230429 ggttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacagtt-gaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacatagcattcc 39230527  T
Q  237 agagcattagctctcaacag 256  Q
    || |||| ||| ||||||||    
T  39230528 agggcataagccctcaacag 39230547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 152 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 15010551 - 15010446
Alignment:
Q  152 cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctc 251  Q
    |||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| ||| |||    
T  15010551 cattccagggcatgagccctgaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcagcagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctc 15010453  T
Q  252 aacagtt 258  Q
    |||||||    
T  15010452 aacagtt 15010446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 152 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 179841 - 179729
Alignment:
Q  152 cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaggcattccagagcattagctct 250  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||    
T  179841 cattccagggcgtaagccctcaacagtt-gaatgacaaatcattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattccagggcataagccct 179743  T
Q  251 caacagttgaatga 264  Q
    ||||||||||||||    
T  179742 caacagttgaatga 179729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 81 - 216
Target Start/End: Original strand, 6819033 - 6819170
Alignment:
Q  81 gggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatt 179  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| ||  ||| ||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||    
T  6819033 gggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctaaatagtttgaatgataaacatttcatggcataagccctcaacagtt 6819132  T
Q  180 tgaatgacaaggcattc-cagggcataagccctcaaca 216  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  6819133 tgaatgacaaggcattcacagggcataatccctcaaca 6819170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 42 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 10990125 - 10989915
Alignment:
Q  42 tggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggt 140  Q
    |||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||| | ||||| |||||||||| | |    
T  10990125 tggtaccattttcaacgggttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatga-tcattctagggcatgagccctcaacagat 10990027  T
Q  141 tgaatgatta-acattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaggcattccag 238  Q
    |||||||  |  ||||||||||||| ||||||||||   ||||||||  |  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  10990026 tgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac-ggttgaatgatta-acattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaagcattacag 10989929  T
Q  239 agcattagctctca 252  Q
     |||| ||| ||||    
T  10989928 ggcataagccctca 10989915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 139 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 30206635 - 30206554
Alignment:
Q  139 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt 219  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30206635 gttgaatgactaagcattccagggcataagccctcaacaatttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagtt 30206554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 179 - 266
Target Start/End: Original strand, 39230431 - 39230518
Alignment:
Q  179 ttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagttgaatgaca 266  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||    
T  39230431 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacagttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgaca 39230518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 61 - 215
Target Start/End: Original strand, 54973041 - 54973194
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattccag 159  Q
    ||||||||| ||||||||| | |||| ||||| |||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||  || ||||||||    
T  54973041 ttgaatgacaaagcattccagagcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacatttgaatgacaaagcattccag 54973140  T
Q  160 ggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac 215  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||    
T  54973141 ggcataagccctcaac-ggttgaatgacga-gcattccagggcatgagccctcaac 54973194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 61 - 215
Target Start/End: Original strand, 54975651 - 54975804
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattccag 159  Q
    ||||||||| ||||||||| | |||| ||||| |||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||  || ||||||||    
T  54975651 ttgaatgacaaagcattccagagcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacatttgaatgacaaagcattccag 54975750  T
Q  160 ggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac 215  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||    
T  54975751 ggcataagccctcaac-ggttgaatgacga-gcattccagggcatgagccctcaac 54975804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 61 - 215
Target Start/End: Original strand, 54978261 - 54978414
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattccag 159  Q
    ||||||||| ||||||||| | |||| ||||| |||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||  || ||||||||    
T  54978261 ttgaatgacaaagcattccagagcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacatttgaatgacaaagcattccag 54978360  T
Q  160 ggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac 215  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||    
T  54978361 ggcataagccctcaac-ggttgaatgacga-gcattccagggcatgagccctcaac 54978414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 60 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 30206635 - 30206558
Alignment:
Q  60 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac 137  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  30206635 gttgaatgactaagcattccagggcataagccctcaacaatttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaac 30206558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 60 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 1989476 - 1989281
Alignment:
Q  60 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttgaatgatta-acattcc 157  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||| | |||||||| | ||||||||  | |||||||    
T  1989476 gttgaatgactaagcattccagggcataagcccccaacaatgtgaatgataa-acattctagggcatgaaccctcaacagtttgaatgacaagacattcc 1989378  T
Q  158 agggcatgagccctcaacaatttgaat-gacaaggcattc-cagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctca 252  Q
    |||||||| |||| || |||||||||| |  || |||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||| || |||||| |||| ||| ||||    
T  1989377 agggcatgcgcccccaccaatttgaatggttaaagcattcacagggcatgagccctcaccaattgaacgacaaagcgttccagggcatgagccctca 1989281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 139 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 6806173 - 6806047
Alignment:
Q  139 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaggcattcc 236  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  6806173 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacagtttgaatgataaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattcc 6806075  T
Q  237 agagcattagctctcaacagttgaatga 264  Q
    || |||| ||| ||||||||||||||||    
T  6806074 agggcataagccctcaacagttgaatga 6806047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 140 - 211
Target Start/End: Original strand, 6819014 - 6819085
Alignment:
Q  140 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccct 211  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6819014 ttgaatgataaacattctagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattccagggcatgagccct 6819085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 139 - 219
Target Start/End: Original strand, 54046463 - 54046544
Alignment:
Q  139 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt 219  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  54046463 gttgaatgactaagcattccggggcatgagcccccaacaattcgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagtt 54046544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 138 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 10990108 - 10989981
Alignment:
Q  138 ggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaggcattc 235  Q
    |||||||||| ||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||||||  |  ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10990108 ggttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatga-tcattctagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattc 10990010  T
Q  236 cagagcattagctctcaacagttgaatga 264  Q
    ||| |||| ||| |||||| |||||||||    
T  10990009 cagggcataagccctcaacggttgaatga 10989981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 41 - 137
Target Start/End: Original strand, 17211118 - 17211213
Alignment:
Q  41 gtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac 137  Q
    ||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||| ||||| ||||||||||    
T  17211118 gtggtaccattttcaacgggttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatga-tcattccagggcatgagccctcaac 17211213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 179 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 14951958 - 14951867
Alignment:
Q  179 ttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagttgaatgacaaag 269  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  14951958 ttgaatgactaagcattccggggcataagccctcaacaatttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaag 14951867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 139 - 215
Target Start/End: Original strand, 7631933 - 7632010
Alignment:
Q  139 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac 215  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7631933 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaac 7632010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 179 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 604055 - 603964
Alignment:
Q  179 ttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagttgaatgacaaag 269  Q
    ||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  604055 ttgaatgactaagcattctggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaag 603964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 179 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 179894 - 179804
Alignment:
Q  179 ttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagttgaatgacaaa 268  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||    
T  179894 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcgtaagccctcaacagttgaatgacaaa 179804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 141
Target Start/End: Original strand, 18958625 - 18958705
Alignment:
Q  60 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt 141  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18958625 gttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacggtt 18958705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 157 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 3395101 - 3395021
Alignment:
Q  157 cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattc-cagggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaggcattc 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  3395101 cagggcatgagccctcaacaatttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattc 3395021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 157 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 3395142 - 3395082
Alignment:
Q  157 cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattc-cagggcataagccctcaaca 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  3395142 cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaagtcattcacagggcatgagccctcaaca 3395082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 179 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 30206634 - 30206554
Alignment:
Q  179 ttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagtt 258  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  30206634 ttgaatgactaagcattccagggcataagccctcaacaatttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagtt 30206554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 60 - 243
Target Start/End: Original strand, 6818901 - 6819078
Alignment:
Q  60 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttgaatgatta-acattcc 157  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| | ||||||||  |  |||||     
T  6818901 gttgaatgactaagaattccgggt-ataagcccccaacaatttgaatgataa-acattacaggacataagccctcaacagtttgaatgacaatgcattct 6818998  T
Q  158 agggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaggcattccagagcat 243  Q
    |||      |||||| ||| ||||||||| ||  ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  6818999 agg------gccctctacagtttgaatgataa-acattctagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattccagggcat 6819078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 152 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 23396160 - 23396058
Alignment:
Q  152 cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaggcattccagagcattagctct 250  Q
    ||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||  |  ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||    
T  23396160 cattctagggcataagcccccaacaatttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacattttgaatgacaaggcattccagggcataagcgct 23396062  T
Q  251 caac 254  Q
    ||||    
T  23396061 caac 23396058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 3395079 - 3394997
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattc-cggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattc-caaggcataagccctcaacggtt 141  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  3395079 ttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattcacagggcataagccctcaacggtt 3394997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 216
Target Start/End: Original strand, 43928388 - 43928442
Alignment:
Q  163 atgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattc-cagggcataagccctcaaca 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  43928388 atgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattcacatggcataagccctcaaca 43928442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 235
Target Start/End: Original strand, 6819066 - 6819149
Alignment:
Q  152 cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaggcattc 235  Q
    |||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6819066 cattccagggcatgagccctaaatagtttgaatgataaa-catttcatggcataagccctcaacagtttgaatgacaaggcattc 6819149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 141
Target Start/End: Original strand, 16799528 - 16799608
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt 141  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16799528 ttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtt 16799608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 23396133 - 23396054
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt 141  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  23396133 ttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacattttgaatgacaaggcattccagggcataagcgctcaacggtt 23396054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 23396251 - 23396156
Alignment:
Q  140 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaggcattc 235  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || | |||| | || ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  23396251 ttgaatgataaacattccagggcataagtcatcaatagtt-gaatgacaaagcattccagggcataatcccccaacaatttgaatgacaaggcattc 23396156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 23396271 - 23396188
Alignment:
Q  159 gggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcat 243  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  23396271 gggcataagcccccaacaatttgaatgataaa-cattccagggcataagtcatcaatagttgaatgacaaagcattccagggcat 23396188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 18367811 - 18367772
Alignment:
Q  157 cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattc 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18367811 cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattc 18367772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 179 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 55292818 - 55292739
Alignment:
Q  179 ttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagtt 258  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||| |||| ||| ||||||||||    
T  55292818 ttgaatgactaagcattccggggcataagccctccacggttgaatgacaaagcatttcagggcataagccctcaacagtt 55292739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 269
Target Start/End: Original strand, 18958546 - 18958638
Alignment:
Q  180 tgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt--gaatgacaaggca-ttccagagcattagctctcaacagttgaatgacaaag 269  Q
    |||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||| ||   |||||||||||| |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  18958546 tgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaaatgacaaggcatttccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaag 18958638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 55292819 - 55292743
Alignment:
Q  60 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||   |||||||||||  |||| || ||||||||||||||||    
T  55292819 gttgaatgactaagcattccggggcataagccctccac-ggttgaatgacaaagcatttcagggcataagccctcaac 55292743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 179 - 254
Target Start/End: Original strand, 7631934 - 7632010
Alignment:
Q  179 ttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaggcattccagagcattagctctcaac 254  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||    
T  7631934 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaac 7632010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 100 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 12856106 - 12855944
Alignment:
Q  100 tttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaa--cattcc-agggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcatt 195  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||  || ||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||    |||||    
T  12856106 tttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacaatttgaatggttaaagcattcatagggcatgagccctcaccaatt-gaatgaactagcatt 12856008  T
Q  196 c-cagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagtt 258  Q
    | ||||||||||||||||  || ||||| | ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  12856007 cacagggcataagccctctccaattgaacggcaaggcattccagggcatgagccctcaacagtt 12855944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 157 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 18367852 - 18367772
Alignment:
Q  157 cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattc-cagggcataagccctcaac-agttgaatgacaaggcattc 235  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||    |||||| |||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  18367852 cagggcatgagcccgcaacaatttgaatgatttagcattcacagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattc 18367772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 157 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 52213514 - 52213454
Alignment:
Q  157 cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattc-cagggcataagccctcaaca 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||| |||||||    
T  52213514 cagggcatgagccctcaacaatttgaatgatcaagcattcacagggcataagcactcaaca 52213454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 179 - 258
Target Start/End: Original strand, 54046464 - 54046544
Alignment:
Q  179 ttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagtt 258  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  54046464 ttgaatgactaagcattccggggcatgagcccccaacaattcgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagtt 54046544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 213
Target Start/End: Original strand, 9884 - 9919
Alignment:
Q  178 tttgaatgacaaggcattccagggcataagccctca 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9884 tttgaatgacaaggcattccagggcataagccctca 9919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 214
Target Start/End: Original strand, 15232141 - 15232278
Alignment:
Q  81 gggcataagcccccaacaatttgaatga-caagacattc-caaggcataagccctcaacggttg-aatgattaa-cattcc-agggcatgagccctcaac 175  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||| | || ||||| || |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||    
T  15232141 gggcataagccctcaacaaattgaatgaactag-cattcacagggcataagccctcaacagttggaatgattaagcattcctaggtcatgagccctcaac 15232239  T
Q  176 aatttgaatgacaaggcattc-cagggcataagccctcaa 214  Q
      || ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  15232240 ggtt-gaacgacaaggcgttcacagggcataagccctcaa 15232278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 214
Target Start/End: Original strand, 15238009 - 15238146
Alignment:
Q  81 gggcataagcccccaacaatttgaatga-caagacattc-caaggcataagccctcaacggttg-aatgattaa-cattcc-agggcatgagccctcaac 175  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||| | || ||||| || |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||    
T  15238009 gggcataagccctcaacaaattgaatgaactag-cattcacagggcataagccctcaacagttggaatgattaagcattcctaggtcatgagccctcaac 15238107  T
Q  176 aatttgaatgacaaggcattc-cagggcataagccctcaa 214  Q
      || ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  15238108 ggtt-gaacgacaaggcgttcacagggcataagccctcaa 15238146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 10989949 - 10989875
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctca 135  Q
    ||||||||| ||||||| | |||||||||||| || ||||||||| |||||| | ||||| ||||| ||||||||    
T  10989949 ttgaatgacaaagcattacagggcataagccctcaccaatttgaacgacaaggcgttccagggcatgagccctca 10989875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 12856105 - 12855944
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaat-gacaagacattc-caaggcataagccctcaacggttgaatg-attaacattc- 156  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |  ||  |||||  | ||||| |||||||| |  ||||||| | || |||||     
T  12856105 ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacaatttgaatggttaaagcattcatagggcatgagccctcaccaattgaatgaactagcattca 12856006  T
Q  157 cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt 219  Q
    |||||||| |||||||  ||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12856005 cagggcataagccctctccaa-ttgaacggcaaggcattccagggcatgagccctcaacagtt 12855944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 220
Target Start/End: Original strand, 15232139 - 15232203
Alignment:
Q  157 cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattc-cagggcataagccctcaacagttg 220  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||    |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15232139 cagggcataagccctcaacaaattgaatgaactagcattcacagggcataagccctcaacagttg 15232203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 220
Target Start/End: Original strand, 15238007 - 15238071
Alignment:
Q  157 cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattc-cagggcataagccctcaacagttg 220  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||    |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15238007 cagggcataagccctcaacaaattgaatgaactagcattcacagggcataagccctcaacagttg 15238071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 217
Target Start/End: Original strand, 17211136 - 17211215
Alignment:
Q  138 ggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacag 217  Q
    |||||||||| ||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||||||  |  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  17211136 ggttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatga-tcattccagggcatgagccctcaacag 17211215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 177 - 213
Target Start/End: Original strand, 35984717 - 35984753
Alignment:
Q  177 atttgaatgacaaggcattccagggcataagccctca 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35984717 atttgaatgacaaggcattccagggcgtaagccctca 35984753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 141
Target Start/End: Original strand, 54973120 - 54973198
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt 141  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||  || ||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  54973120 ttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacggtt-gaatgacgag-cattccagggcatgagccctcaacggtt 54973198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 141
Target Start/End: Original strand, 54975730 - 54975808
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt 141  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||  || ||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  54975730 ttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacggtt-gaatgacgag-cattccagggcatgagccctcaacggtt 54975808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 141
Target Start/End: Original strand, 54978340 - 54978418
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt 141  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||  || ||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  54978340 ttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacggtt-gaatgacgag-cattccagggcatgagccctcaacggtt 54978418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 157 - 212
Target Start/End: Original strand, 42109183 - 42109238
Alignment:
Q  157 cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctc 212  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||    
T  42109183 cagggcataagccctcaccaatttgaacaacaaggtgttccagggcataagccctc 42109238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 252
Target Start/End: Original strand, 9884 - 10040
Alignment:
Q  100 tttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaa--cattc-cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcatt 195  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |  || ||| | ||||  | ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||    |||||    
T  9884 tttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaccaatttgaacggttaaagcgttcacagggcatgagccctcaccaatt-gaatgaactagcatt 9982  T
Q  196 c-cagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctca 252  Q
    | ||||||||||||||||| |  ||||| |||||||| |||||| |||| ||| ||||    
T  9983 cacagggcataagccctcaccgattgaacgacaaggcgttccagggcatgagccctca 10040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 88 - 137
Target Start/End: Original strand, 43928391 - 43928441
Alignment:
Q  88 agcccccaacaatttgaatgacaagacattc-caaggcataagccctcaac 137  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  43928391 agccctcaacaatttgaatgacaaggcattcacatggcataagccctcaac 43928441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 72 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 14951842 - 14951774
Alignment:
Q  72 agcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt 141  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||||  ||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  14951842 agcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattcaagggcatgagccctcaacggtt 14951774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 61 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 179775 - 179697
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt 141  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||  | |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  179775 ttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgatta-acattccagggcatgagccctcaacggtt 179697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 157 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 14289085 - 14289029
Alignment:
Q  157 cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctca 213  Q
    |||||||| |||||||| |  |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  14289085 cagggcataagccctcaccgctttgaacgacaaggcgttccagggcatgagccctca 14289029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 140 - 176
Target Start/End: Original strand, 15446424 - 15446460
Alignment:
Q  140 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaaca 176  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  15446424 ttgaatgatgatcattccagggcatgagccctcaaca 15446460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 101 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 55292818 - 55292742
Alignment:
Q  101 ttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaaca 176  Q
    ||||||||| |  ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||  || |||| |||||||| |||||||||||    
T  55292818 ttgaatgactaagcattccggggcataagccctccacggttgaatgacaaagcatttcagggcataagccctcaaca 55292742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0500 (Bit Score: 136; Significance: 5e-71; HSPs: 4)
Name: scaffold0500
Description:

Target: scaffold0500; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 41 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 11903 - 11688
Alignment:
Q  41 gtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggt 140  Q
    ||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||    
T  11903 gtggtacaattttcaacgtgttgaatgactaagcattccagggcataagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagt 11804  T
Q  141 tgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac-agttgaatgacaaggcattccag 238  Q
    |||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  11803 tgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacaatttgaatgacaaagcattccag 11704  T
Q  239 agcattagctctcaac 254  Q
     |||| ||| ||||||    
T  11703 ggcataagccctcaac 11688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0500; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 139 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 11884 - 11754
Alignment:
Q  139 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattcca 237  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11884 gttgaatgactaagcattccagggcataagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaagcattcca 11785  T
Q  238 gagcattagctctcaac-agttgaatgacaa 267  Q
    | |||| ||| |||||| | |||||||||||    
T  11784 gggcatgagccctcaacaatttgaatgacaa 11754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0500; HSP #3
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 101 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 11883 - 11712
Alignment:
Q  101 ttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattcca 198  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||  || ||||||  |  ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||||    
T  11883 ttgaatgactaagcattccagggcataagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattcca 11785  T
Q  199 gggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaggcattccagagcattagctctcaac-agttgaatgacaaag 269  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| ||| |||||| | |||||||||||||    
T  11784 gggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacaatttgaatgacaaag 11712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0500; HSP #4
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 61 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 11764 - 11684
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt 141  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11764 ttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacaatttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacggtt 11684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 36 - 269
Target Start/End: Original strand, 32715 - 32947
Alignment:
Q  36 acgacgtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctca 135  Q
    |||||| |||||||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||| ||||||||    
T  32715 acgacggggtactattttcaactcaatgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggcatgagccctca 32813  T
Q  136 acgg-ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcatt 234  Q
    || | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||    
T  32814 acagattgaatgattaacattctagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacggttgaatgacga-gcatt 32912  T
Q  235 ccagagcattagctctcaacagttgaatgacaaag 269  Q
    |||| |||| ||| |||||| ||||||||||||||    
T  32913 ccagggcatgagccctcaacggttgaatgacaaag 32947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 152 - 258
Target Start/End: Original strand, 32871 - 32975
Alignment:
Q  152 cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctc 251  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  || ||||||| || ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| ||| |||    
T  32871 cattccagggcataagccctcaacggtt-gaatgacgag-cattccagggcatgagccctcaacggttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctc 32968  T
Q  252 aacagtt 258  Q
    |||||||    
T  32969 aacagtt 32975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 3)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 36 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 82097 - 81865
Alignment:
Q  36 acgacgtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctca 135  Q
    |||||| |||||||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||| ||||||||    
T  82097 acgacggggtactattttcaactcaatgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggcatgagccctca 81999  T
Q  136 acgg-ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcatt 234  Q
    || | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||    
T  81998 acagattgaatgattaacattctagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacggttgaatgacga-gcatt 81900  T
Q  235 ccagagcattagctctcaacagttgaatgacaaag 269  Q
    |||| |||| ||| |||||| ||||||||||||||    
T  81899 ccagggcatgagccctcaacggttgaatgacaaag 81865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 152 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 81941 - 81837
Alignment:
Q  152 cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctc 251  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  || ||||||| || ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| ||| |||    
T  81941 cattccagggcataagccctcaacggtt-gaatgacgag-cattccagggcatgagccctcaacggttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctc 81844  T
Q  252 aacagtt 258  Q
    |||||||    
T  81843 aacagtt 81837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 157 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 43011 - 42955
Alignment:
Q  157 cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctca 213  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||  ||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  43011 cagggcataagccctcaccaatttgaacaacaaggtgttccagggcatgagccctca 42955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 88)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 74 - 254
Target Start/End: Original strand, 8522533 - 8522713
Alignment:
Q  74 cattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagaca-ttccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctc 172  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||  |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8522533 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcaattccagggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctc 8522632  T
Q  173 aacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaac 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||| ||||||    
T  8522633 aacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacga-gcattccagggcatgagccctcaac 8522713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 60 - 268
Target Start/End: Original strand, 13763958 - 13764165
Alignment:
Q  60 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccag 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| || ||||||     
T  13763958 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataa-acattccagggcataagccctcaacaattgaatgataaaaattccac 13764056  T
Q  160 ggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacag-tt 258  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||||| ||  || ||||| |||| ||| |||||||| ||    
T  13764057 ggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaagcataccagggcataagccatcaacaattgaatgataa-acaatccagggcatgagccctcaacagttt 13764155  T
Q  259 gaatgacaaa 268  Q
    ||||||||||    
T  13764156 gaatgacaaa 13764165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 60 - 269
Target Start/End: Original strand, 15538831 - 15539044
Alignment:
Q  60 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttgaatgattaa-cattcc 157  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||  || ||| ||    
T  15538831 gttgaatgactaagcattccagggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaagcatccc 15538930  T
Q  158 agggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac-agttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacag 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| | |||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||| |||| ||| ||||||||    
T  15538931 agggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaagctttccggagcataagcccccaacaatttgaatggcaaggcattccagggcatgagccctcaacag 15539030  T
Q  257 -ttgaatgacaaag 269  Q
     |||||||||||||    
T  15539031 tttgaatgacaaag 15539044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 39 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 15686604 - 15686428
Alignment:
Q  39 acgtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacg 138  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||     
T  15686604 acgtggtactatttccaacgggttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaaca 15686505  T
Q  139 gttgaatga-ttaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac 215  Q
    |||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  15686504 gttgaatgacatagcattccagggcataagccctcaac-tgttgaatgacatagcattccagggcataagccctcaac 15686428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 61 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 23621394 - 23621200
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattccag 159  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||    
T  23621394 ttgaatgactaagcattccagggcataagccctcaacaatttgaatgacaaggcattacagggcataagccctcaacagttgaatgacaaagcattccag 23621295  T
Q  160 ggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaaca 255  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| || ||||||||| |||| ||| |||||||    
T  23621294 ggcatgaaccctcaac-agttgaatgtcaaagcattccagggcatgagccctcaatagttgaatgaaaaagcattccagggcatgagccctcaaca 23621200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 39 - 219
Target Start/End: Original strand, 16101971 - 16102152
Alignment:
Q  39 acgtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac- 137  Q
    ||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||     
T  16101971 acgtggtactaatttcaacgggttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaaca 16102070  T
Q  138 ggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt 219  Q
    | ||||||||  || ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16102071 gtttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaac-agttgaatgacatagcattccagggcataagccctcaacagtt 16102152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 31 - 265
Target Start/End: Original strand, 8522451 - 8522686
Alignment:
Q  31 caactacgacgtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagc 130  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||| |||    
T  8522451 caactacgacgtggtactattttcaacacattgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggcatgagc 8522549  T
Q  131 cctcaac-ggttgaatgatta--acattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac-agttgaatgac 226  Q
    ||||||| | ||||||||  |    |||||||||||| ||||||||||   ||||||||  |  ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  8522550 cctcaacagattgaatgacaaggcaattccagggcataagccctcaac-ggttgaatgatta-acattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgac 8522647  T
Q  227 aaggcattccagagcattagctctcaacagttgaatgac 265  Q
    |||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||    
T  8522648 aaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgac 8522686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 81 - 269
Target Start/End: Original strand, 13764134 - 13764322
Alignment:
Q  81 gggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaattt 180  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||  || |||    
T  13764134 gggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaatcattccagggcataagccctcaacaattgaatgataaacattccagagcatgagccctcggcagttt 13764233  T
Q  181 gaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacag-ttgaatgacaaag 269  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  13764234 gaacgaccaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgataa-acattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaag 13764322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 100 - 268
Target Start/End: Original strand, 13764231 - 13764399
Alignment:
Q  100 tttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccag 199  Q
    |||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  13764231 tttgaacgaccaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgataaacattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaagcattccag 13764330  T
Q  200 ggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacag-ttgaatgacaaa 268  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| ||  |||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||||||    
T  13764331 ggcataagccatcaacaattgaatgataa-acattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaa 13764399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 60 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 2288394 - 2288238
Alignment:
Q  60 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgatta-acattcca 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| | |||||||  |||||||||  |  |||||||    
T  2288394 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaagcattccagggcatgaaccctcaatagttgaatgacaaggcattcca 2288295  T
Q  159 gggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac 215  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  2288294 gggcttgagccctcaacagtttgaatgacaaagcattccagggcataagccttcaac 2288238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 60 - 258
Target Start/End: Original strand, 13764270 - 13764466
Alignment:
Q  60 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccag 159  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||    
T  13764270 gttgaatga-taaacattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaagcattccagggcataagccatcaacaattgaatgataaacattccag 13764368  T
Q  160 ggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagtt 258  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||| || ||| |||| |||||    
T  13764369 ggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaatcattctagggcataagccctcaacaattgaatgataa-acattccagagaatgagccctcagcagtt 13764466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 43 - 176
Target Start/End: Original strand, 16829470 - 16829604
Alignment:
Q  43 ggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttg 142  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  16829470 ggtactattttcaacgggttgaatgactaagcaatccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagttg 16829569  T
Q  143 aatgattaa-cattccagggcatgagccctcaaca 176  Q
    |||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  16829570 aatgacaaagcattccagggcatgagccctcaaca 16829604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 140 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 23621394 - 23621264
Alignment:
Q  140 ttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccag 238  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23621394 ttgaatgactaagcattccagggcataagccctcaacaatttgaatgacaaggcattacagggcataagccctcaacagttgaatgacaaagcattccag 23621295  T
Q  239 agcattagctctcaacagttgaatgacaaag 269  Q
     |||| | | ||||||||||||||| |||||    
T  23621294 ggcatgaaccctcaacagttgaatgtcaaag 23621264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 43 - 176
Target Start/End: Original strand, 29492427 - 29492561
Alignment:
Q  43 ggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttg 142  Q
    |||||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  29492427 ggtactattttcaacgggctgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacgaggcattccagggcatgagccctcaacggttg 29492526  T
Q  143 aatgattaa-cattccagggcatgagccctcaaca 176  Q
    |||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  29492527 aatgacaaagcattccagggcatgagccctcaaca 29492561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 39 - 219
Target Start/End: Original strand, 12595586 - 12595766
Alignment:
Q  39 acgtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacg 138  Q
    ||||| ||||| || ||||  |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||     
T  12595586 acgtgatactaatttcaacgggttgaatgactaagcattctagggcataagtccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaaca 12595685  T
Q  139 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt 219  Q
    |||||||||  || ||||| || |||| |||||||||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12595686 gttgaatgacaaagcattctagagcataagccctcaac-agttgaatgacatagcattccagggcataagccctcaacagtt 12595766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 43 - 174
Target Start/End: Original strand, 16812450 - 16812582
Alignment:
Q  43 ggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttg 142  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  16812450 ggtactattttcaacgggttgaatgactaagcaatccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagttg 16812549  T
Q  143 aatga-ttaacattccagggcatgagccctcaa 174  Q
    |||||  || |||||||||||||||||||||||    
T  16812550 aatgacatagcattccagggcatgagccctcaa 16812582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 138 - 266
Target Start/End: Original strand, 12595606 - 12595735
Alignment:
Q  138 ggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattcc 236  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  12595606 ggttgaatgactaagcattctagggcataagtccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattct 12595705  T
Q  237 agagcattagctctcaacagttgaatgaca 266  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  12595706 agagcataagccctcaacagttgaatgaca 12595735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 82 - 243
Target Start/End: Original strand, 13764057 - 13764217
Alignment:
Q  82 ggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatttg 181  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||  ||| ||| |||||||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  13764057 ggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaagcataccagggcataagccatcaacaattgaatgataaacaatccagggcatgagccctcaacagtttg 13764156  T
Q  182 aatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcat 243  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||    
T  13764157 aatgacaaatcattccagggcataagccctcaacaattgaatgataa-acattccagagcat 13764217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 138 - 266
Target Start/End: Original strand, 16101991 - 16102121
Alignment:
Q  138 ggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaggcattc 235  Q
    |||||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  16101991 ggttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaagcattc 16102090  T
Q  236 cagagcattagctctcaacagttgaatgaca 266  Q
    ||| |||| ||| ||||||||||||||||||    
T  16102091 cagggcataagccctcaacagttgaatgaca 16102121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 152 - 258
Target Start/End: Original strand, 16102046 - 16102152
Alignment:
Q  152 cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctc 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||| |||    
T  16102046 cattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacatagcattccagggcataagccctc 16102145  T
Q  252 aacagtt 258  Q
    |||||||    
T  16102146 aacagtt 16102152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 138 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 15686584 - 15686455
Alignment:
Q  138 ggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattcc 236  Q
    |||||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  15686584 ggttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacatagcattcc 15686485  T
Q  237 agagcattagctctcaacagttgaatgaca 266  Q
    || |||| ||| |||||| |||||||||||    
T  15686484 agggcataagccctcaactgttgaatgaca 15686455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 138 - 258
Target Start/End: Original strand, 16829486 - 16829607
Alignment:
Q  138 ggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattcc 236  Q
    |||||||||| ||| || ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16829486 ggttgaatgactaagcaatccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattcc 16829585  T
Q  237 agagcattagctctcaacagtt 258  Q
    || |||| ||| ||||||||||    
T  16829586 agggcatgagccctcaacagtt 16829607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 61 - 175
Target Start/End: Original strand, 24440865 - 24440978
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaacattccag 159  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  24440865 ttgaatgactacgcattccggggcataagcccc-aacaatttcaatgataa-acattccaaggcatgagccctcaacagtttgaatgattaacattccag 24440962  T
Q  160 ggcatgagccctcaac 175  Q
    ||||||||||||||||    
T  24440963 ggcatgagccctcaac 24440978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 61 - 215
Target Start/End: Original strand, 13764349 - 13764502
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagg 160  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||  ||||| | ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||     
T  13764349 ttgaatga-taaacattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaatcattctagggcataagccctcaacaattgaatgataaacattccaga 13764447  T
Q  161 gcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac 215  Q
    | ||||||||||| || ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  13764448 gaatgagccctcagcagtttaaatgaccaggcattacagggcataagccctcaac 13764502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 43 - 163
Target Start/End: Original strand, 16804631 - 16804752
Alignment:
Q  43 ggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttg 142  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  16804631 ggtactattttcaacgggttgaatgactaagcaatccggggcataagaccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagttg 16804730  T
Q  143 aatga-ttaacattccagggca 163  Q
    |||||  || ||||||||||||    
T  16804731 aatgacatagcattccagggca 16804752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 60 - 172
Target Start/End: Original strand, 23352131 - 23352243
Alignment:
Q  60 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattcca 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||    
T  23352131 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataa-acattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattcca 23352229  T
Q  159 gggcatgagccctc 172  Q
     |||||||||||||    
T  23352230 aggcatgagccctc 23352243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 139 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 2288394 - 2288262
Alignment:
Q  139 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattcca 237  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2288394 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaagcattccagggcatgaaccctcaatagttgaatgacaaggcattcca 2288295  T
Q  238 gagcattagctctcaacag-ttgaatgacaaag 269  Q
    | || | ||| |||||||| |||||||||||||    
T  2288294 gggcttgagccctcaacagtttgaatgacaaag 2288262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 61 - 254
Target Start/End: Original strand, 15538872 - 15539068
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaa-cattcca 158  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||  ||| ||| ||||| ||||||||||  || ||||||  || | ||||     
T  15538872 ttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaagcatcccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaagctttccg 15538971  T
Q  159 gggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaggcattccagagcattagctctcaac 254  Q
    | |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||    
T  15538972 gagcataagcccccaacaatttgaatggcaaggcattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaac 15539068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 152 - 258
Target Start/End: Original strand, 29492458 - 29492564
Alignment:
Q  152 cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctc 251  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| ||| |||    
T  29492458 cattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacgaggcattccagggcatgagccctcaacggttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctc 29492557  T
Q  252 aacagtt 258  Q
    |||||||    
T  29492558 aacagtt 29492564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 138 - 258
Target Start/End: Original strand, 16812466 - 16812587
Alignment:
Q  138 ggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattcc 236  Q
    |||||||||| ||| || ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  16812466 ggttgaatgactaagcaatccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacatagcattcc 16812565  T
Q  237 agagcattagctctcaacagtt 258  Q
    || |||| ||| ||||| ||||    
T  16812566 agggcatgagccctcaatagtt 16812587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 152 - 258
Target Start/End: Original strand, 12595661 - 12595766
Alignment:
Q  152 cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctc 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||| |||    
T  12595661 cattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattctagagcataagccctcaacagttgaatgacatagcattccagggcataagccctc 12595759  T
Q  252 aacagtt 258  Q
    |||||||    
T  12595760 aacagtt 12595766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 39 - 173
Target Start/End: Original strand, 221613 - 221747
Alignment:
Q  39 acgtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacg 138  Q
    |||||| || |||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| |||||     
T  221613 acgtggcaccattttcaacgtgttgaatgactaagcattctggggcataagcccccaacaatttgaatgataa-acattccagggcataagccatcaaca 221711  T
Q  139 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctca 173  Q
     |||| |||  || ||||||||||||||| ||||||    
T  221712 attgagtgacgaagcattccagggcatgatccctca 221747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 152 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 15686529 - 15686428
Alignment:
Q  152 cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctc 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||| ||| |||    
T  15686529 cattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacatagcattccagggcataagccctcaactgttgaatgacatagcattccagggcataagccctc 15686431  T
Q  252 aac 254  Q
    |||    
T  15686430 aac 15686428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 101 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 23621394 - 23621225
Alignment:
Q  101 ttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattcca 198  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||  || ||||||  |  |||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||||    
T  23621394 ttgaatgactaagcattccagggcataagccctcaacaatttgaatgacaaggcattacagggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattcca 23621296  T
Q  199 gggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagttgaatgacaaag 269  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||| ||||| |||||||||| ||||    
T  23621295 gggcatgaaccctcaacagttgaatgtcaaagcattccagggcatgagccctcaatagttgaatgaaaaag 23621225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 138 - 238
Target Start/End: Original strand, 16804647 - 16804748
Alignment:
Q  138 ggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattcc 236  Q
    |||||||||| ||| || ||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  16804647 ggttgaatgactaagcaatccggggcataagaccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacatagcattcc 16804746  T
Q  237 ag 238  Q
    ||    
T  16804747 ag 16804748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 60 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 29848614 - 29848499
Alignment:
Q  60 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattcca 158  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||| |||||||||  || ||||| |    
T  29848614 gttgaatgactaagcatttcgaggcataagccctcaaaaatttgaatgataa-acattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaagcattcaa 29848516  T
Q  159 gggcatgagccctcaac 175  Q
    |||||| ||||||||||    
T  29848515 gggcataagccctcaac 29848499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 73 - 264
Target Start/End: Original strand, 13764244 - 13764434
Alignment:
Q  73 gcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaa-cattccagggcatgagccc 170  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| || |||||| || |||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||  || ||||||||||||| ||||     
T  13764244 gcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgataa-acattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaagcattccagggcataagcca 13764341  T
Q  171 tcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagttgaatga 264  Q
    ||||||||| |||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||| || |||| ||| ||||||| ||||||||    
T  13764342 tcaacaatt-gaatgataaa-cattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaatcattctagggcataagccctcaacaattgaatga 13764434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 100 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 9186096 - 9185933
Alignment:
Q  100 tttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaa--cattc-cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcatt 195  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||    |||||    
T  9186096 tttgaatgacaaggaatttcaaggcatgagccctcaacagtttgaatggttaaagcattcacagggcatgagccctcaacggtttgaatgaactagcatt 9185997  T
Q  196 c-cagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagtt 258  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||| ||| ||||| ||||    
T  9185996 cacagggcataagccctcaacaattgaacgacaaggcgttccagggcatgagccctcaatagtt 9185933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 139 - 237
Target Start/End: Original strand, 23352131 - 23352229
Alignment:
Q  139 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattcca 237  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23352131 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataaa-cattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattcca 23352229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 160 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 29848592 - 29848499
Alignment:
Q  160 ggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaac 254  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||| ||||||    
T  29848592 ggcataagccctcaaaaatttgaatgataaa-cattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaagcattcaagggcataagccctcaac 29848499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 81 - 216
Target Start/End: Original strand, 1639059 - 1639199
Alignment:
Q  81 gggcataagcccccaacaatttgaatga-caagacattc-caaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaa-cattc-cagggcatgagccctcaac 175  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||| || ||||| |||||||||  ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||     
T  1639059 gggcataagccctcaacaatttgaatgaactag-cattcacagggcatgagccctcaatagtttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctcaat 1639157  T
Q  176 aatttgaatgacaaggcattc-cagggcataagccctcaaca 216  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  1639158 agtttgaatgacaaggcattcacagggcataaaccctcaaca 1639199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 152 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 2288340 - 2288249
Alignment:
Q  152 cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaggcattccagagcat 243  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | || |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||    
T  2288340 cattccagggcatgaaccctcaatagtt-gaatgacaaggcattccagggcttgagccctcaacagtttgaatgacaaagcattccagggcat 2288249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 157 - 216
Target Start/End: Original strand, 12389543 - 12389603
Alignment:
Q  157 cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattc-cagggcataagccctcaaca 216  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12389543 cagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattcacagggcataagccctcaaca 12389603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 179 - 269
Target Start/End: Original strand, 12595608 - 12595699
Alignment:
Q  179 ttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagttgaatgacaaag 269  Q
    ||||||||| | |||||| |||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  12595608 ttgaatgactaagcattctagggcataagtccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaag 12595699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 179 - 269
Target Start/End: Original strand, 16829488 - 16829579
Alignment:
Q  179 ttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagttgaatgacaaag 269  Q
    ||||||||| | ||| ||| |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  16829488 ttgaatgactaagcaatccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaag 16829579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 140 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 29848573 - 29848499
Alignment:
Q  140 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac 215  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  29848573 ttgaatgataaacattccagggcataagccctcaac-agttgaatgacaaagcattcaagggcataagccctcaac 29848499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 100 - 213
Target Start/End: Original strand, 29265486 - 29265602
Alignment:
Q  100 tttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacg-gttgaatgattaa--cattc-cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcatt 195  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||  ||||| |||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||| ||    
T  29265486 tttgaatgacaaggcattccaaggcataagccctcaccgatttgaatggttaaagcattcacagggcataagccctcaccaa-ttgaacgacaaggcgtt 29265584  T
Q  196 ccagggcataagccctca 213  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  29265585 ccagggcatgagccctca 29265602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 23621316 - 23621196
Alignment:
Q  60 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattcca 158  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| | ||| ||||| || ||||| |||  ||||||| ||||| |||||||||  |||||||||  || |||||||    
T  23621316 gttgaatgacaaagcattccagggcatgaaccctcaacagtt-gaatgtcaaagcattccagggcatgagccctcaatagttgaatgaaaaagcattcca 23621218  T
Q  159 gggcatgagccctcaacaattt 180  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  23621217 gggcatgagccctcaacaattt 23621196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 179 - 266
Target Start/End: Original strand, 16812468 - 16812556
Alignment:
Q  179 ttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagttgaatgaca 266  Q
    ||||||||| | ||| ||| |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||    
T  16812468 ttgaatgactaagcaatccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagttgaatgaca 16812556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 140 - 212
Target Start/End: Original strand, 23352172 - 23352243
Alignment:
Q  140 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctc 212  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  23352172 ttgaatgataaacattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccaaggcatgagccctc 23352243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 60 - 147
Target Start/End: Original strand, 24266675 - 24266762
Alignment:
Q  60 gttgaatgact-aagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatga 147  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||| | |||||||||||||    
T  24266675 gttgaatgacttaagcattatggggcataagcccccaacaatttgaatgataa-acattccagggcatgagccgttaacggttgaatga 24266762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 122 - 213
Target Start/End: Original strand, 21469789 - 21469879
Alignment:
Q  122 ggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctca 213  Q
    ||||| |||||||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  21469789 ggcatgagccctcaccaattgaatgactagcattccagggcatgagccctcaccaa-ttgaacgacaaggcgttccagggcatgagccctca 21469879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 13751433 - 13751352
Alignment:
Q  157 cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattc-cagggcataagccctcaaca--gttgaatgacaaggcattc 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |  | |||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  13751433 cagggcatgagccctcaacaatttgaataattaagcattcacagggcataagccctcaacaattttgaatgacaaggcattc 13751352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 269
Target Start/End: Original strand, 29492446 - 29492536
Alignment:
Q  180 tgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagttgaatgacaaag 269  Q
    |||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||| ||||||||||||||    
T  29492446 tgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacgaggcattccagggcatgagccctcaacggttgaatgacaaag 29492536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 81 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 13751472 - 13751332
Alignment:
Q  81 gggcataagcccccaacaatttgaatga-caagacattc-caaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaa-cattc-cagggcatgagccctcaac 175  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||| || ||||| ||||||||||  || |||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  13751472 gggcataagccctcaacaatttgaatgaactagt-attcacagggcatgagccctcaacaatttgaataattaagcattcacagggcataagccctcaac 13751374  T
Q  176 aattt-gaatgacaaggcattc-cagggcataagccctcaac 215  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13751373 aattttgaatgacaaggcattcacagggcataagccctcaac 13751332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 157 - 255
Target Start/End: Original strand, 25806900 - 25807001
Alignment:
Q  157 cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattc-cagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaggcattc-cagagcattagctctcaa 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||| ||| |||| ||| |||||    
T  25806900 cagggcatgagccctcaacaatttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctcaatagtttgaacgacaaggcattcacagggcataagccctcaa 25806999  T
Q  254 ca 255  Q
    ||    
T  25807000 ca 25807001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 255
Target Start/End: Original strand, 12389483 - 12389603
Alignment:
Q  140 ttgaatgattaa-cattc-cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattc-cagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaggcattc 235  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| | |||||||    |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12389483 ttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctcaacagtctgaatgaactagcattcacagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattc 12389582  T
Q  236 -cagagcattagctctcaaca 255  Q
     ||| |||| ||| |||||||    
T  12389583 acagggcataagccctcaaca 12389603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 141
Target Start/End: Original strand, 15539004 - 15539072
Alignment:
Q  73 gcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt 141  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15539004 gcattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacggtt 15539072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 266
Target Start/End: Original strand, 16804649 - 16804737
Alignment:
Q  179 ttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagttgaatgaca 266  Q
    ||||||||| | ||| ||| ||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||    
T  16804649 ttgaatgactaagcaatccggggcataagaccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagttgaatgaca 16804737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 252
Target Start/End: Original strand, 21469786 - 21469879
Alignment:
Q  157 cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctca 252  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||| |||| ||| ||||    
T  21469786 cagggcatgagccctcaccaatt-gaatgactag-cattccagggcatgagccctcaccaattgaacgacaaggcgttccagggcatgagccctca 21469879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 100 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 17027366 - 17027230
Alignment:
Q  100 tttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacgg--ttgaatgattaa--cattc-cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcat 194  Q
    |||||||||||||  |||||| ||||| |||||||| ||   ||||||| ||||  ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||    ||||    
T  17027366 tttgaatgacaaggaattccagggcatgagccctcaccgaatttgaatggttaaagcattcacagggcataagccctcaccaatttgaatgaactagcat 17027267  T
Q  195 tccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggc 231  Q
    |||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  17027266 tccagggcatgagccctcaccaattgaacgacaaggc 17027230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 243
Target Start/End: Original strand, 221634 - 221738
Alignment:
Q  139 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattcca 237  Q
    ||||||||| ||| |||||  |||||| ||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||| |||| |||| | ||||||||    
T  221634 gttgaatgactaagcattctggggcataagcccccaacaatttgaatgataaa-cattccagggcataagccatcaacaattgagtgacgaagcattcca 221732  T
Q  238 gagcat 243  Q
    | ||||    
T  221733 gggcat 221738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 2288315 - 2288234
Alignment:
Q  60 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt 141  Q
    |||||||||| | ||||||| |||| | ||||| ||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  2288315 gttgaatgacaaggcattccagggcttgagccctcaacagtttgaatgacaaagcattccagggcataagccttcaacggtt 2288234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 252
Target Start/End: Original strand, 25772614 - 25772770
Alignment:
Q  100 tttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaa--cattc-cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcatt 195  Q
    ||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||  | ||| ||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    |||||    
T  25772614 tttgaatgaaaaggcattccagggcatgagccctctccagtttgaatggttaaagcattcacagggcatgagccctcaccaatttgaatgaactagcatt 25772713  T
Q  196 ccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctca 252  Q
    |||||| || |||||||| || ||||| ||||| || |||||| |||| ||| ||||    
T  25772714 ccagggaatgagccctcaccaattgaacgacaaagcgttccagggcatgagccctca 25772770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 81 - 176
Target Start/End: Original strand, 1584259 - 1584358
Alignment:
Q  81 gggcataagcccccaacaatttgaatga-caagacattc-caaggcataagccctcaac-ggttgaatgattaa-cattc-cagggcatgagccctcaac 175  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  1584259 gggcataagccctcaacaatttgaatgaactag-cattcacagggcataagccctcaacagtttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctcaac 1584357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 157 - 235
Target Start/End: Original strand, 1639098 - 1639178
Alignment:
Q  157 cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattc-cagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaggcattc 235  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||  | |||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  1639098 cagggcatgagccctcaatagtttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctcaatagtttgaatgacaaggcattc 1639178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 143 - 215
Target Start/End: Original strand, 24440907 - 24440978
Alignment:
Q  143 aatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac 215  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  |  ||||||||||||| ||||||||||    
T  24440907 aatgataaacattccaaggcatgagccctcaacagtttgaatgatta-acattccagggcatgagccctcaac 24440978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 258
Target Start/End: Original strand, 1584258 - 1584361
Alignment:
Q  158 agggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattc-cagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaggcattc-cagagcattagctctcaac 254  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||| ||| |||| ||| ||||||    
T  1584258 agggcataagccctcaacaatttgaatgaactagcattcacagggcataagccctcaacagtttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctcaac 1584357  T
Q  255 agtt 258  Q
    ||||    
T  1584358 agtt 1584361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 180
Target Start/End: Original strand, 12389545 - 12389648
Alignment:
Q  81 gggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattc-caaggcataagccctcaac-ggttgaatg-attaacattc-cagggcatgagccctcaaca 176  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||   ||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  12389545 gggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattcacagggcataagccctcaacactttgaatgaactagcattcacagggcatgagccctcaaca 12389644  T
Q  177 attt 180  Q
    ||||    
T  12389645 attt 12389648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 13751411 - 13751328
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattc-cggggcataagcccccaacaattt-gaatgacaagacattc-caaggcataagccctcaacggtt 141  Q
    |||||| | ||||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  13751411 ttgaataattaagcattcacagggcataagccctcaacaattttgaatgacaaggcattcacagggcataagccctcaacggtt 13751328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 269
Target Start/End: Original strand, 23352132 - 23352222
Alignment:
Q  179 ttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagttgaatgacaaag 269  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||| || |||||| ||  |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  23352132 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataaa-cattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaag 23352222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 218
Target Start/End: Original strand, 12389461 - 12389523
Alignment:
Q  157 cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattc-cagggcataagccctcaacagt 218  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  12389461 cagggcatgagcccttaacaatttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctcaacagt 12389523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 140 - 213
Target Start/End: Original strand, 221675 - 221747
Alignment:
Q  140 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctca 213  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||| | |||||||||||||| | ||||||    
T  221675 ttgaatgataaacattccagggcataagccatcaacaa-ttgagtgacgaagcattccagggcatgatccctca 221747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 157 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 1590710 - 1590641
Alignment:
Q  157 cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattc-cagggcataagccctcaacagttgaatga 225  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||    |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  1590710 cagggcataagccctcaacaatttgaatgaactagcattcacagggcatgagccctcaaaagttgaatga 1590641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 60 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 15686504 - 15686424
Alignment:
Q  60 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt 141  Q
    ||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||  || ||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15686504 gttgaatgacatagcattccagggcataagccctcaactgtt-gaatgacatagcattccagggcataagccctcaacggtt 15686424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 156 - 216
Target Start/End: Original strand, 17526327 - 17526388
Alignment:
Q  156 ccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattc-cagggcataagccctcaaca 216  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||||    
T  17526327 ccagggcatgagccctcaacggtttgaacgacaaggcgttcacagggcataacccctcaaca 17526388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 122 - 209
Target Start/End: Original strand, 22346655 - 22346743
Alignment:
Q  122 ggcataagccctcaacggttgaatgat-taacattc-cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagcc 209  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||  || ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  22346655 ggcataagccctcaccaattgaatgaactagcattcacagggcatgagccctcaccaatt-gaatgacaaggcgttccagggcatgagcc 22346743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 141
Target Start/End: Original strand, 8522639 - 8522717
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt 141  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||| | ||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  8522639 ttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac-agttgaatgacgag-cattccagggcatgagccctcaacggtt 8522717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 29848573 - 29848495
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt 141  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||| || |||||||||  ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  29848573 ttgaatga-taaacattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattcaagggcataagccctcaacggtt 29848495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 157 - 219
Target Start/End: Original strand, 1584298 - 1584361
Alignment:
Q  157 cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattc-cagggcataagccctcaacagtt 219  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||  | |||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  1584298 cagggcataagccctcaacagtttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctcaacagtt 1584361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 152 - 203
Target Start/End: Original strand, 16804702 - 16804752
Alignment:
Q  152 cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggca 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||    
T  16804702 cattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacatagcattccagggca 16804752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 178 - 213
Target Start/End: Original strand, 18137479 - 18137514
Alignment:
Q  178 tttgaatgacaaggcattccagggcataagccctca 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18137479 tttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctca 18137514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 159 - 238
Target Start/End: Original strand, 24266697 - 24266775
Alignment:
Q  159 gggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccag 238  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||| | ||| ||||||||||||  ||||||||    
T  24266697 gggcataagcccccaacaatttgaatgataaa-cattccagggcatgagccgttaacggttgaatgacaaaacattccag 24266775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 18316056 - 18315999
Alignment:
Q  154 ttccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctc 212  Q
    |||||||||||||||||||  |  |||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  18316056 ttccagggcatgagccctcc-cgctttgaacgacaaggcgttccagggcataagccctc 18315999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 252
Target Start/End: Original strand, 29265500 - 29265602
Alignment:
Q  152 cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgac-aaggcattc-cagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctc 249  Q
    ||||||| ||||| |||||||| | |||||||||   || |||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||| |||| ||| |    
T  29265500 cattccaaggcataagccctcaccgatttgaatggttaaagcattcacagggcataagccctcaccaattgaacgacaaggcgttccagggcatgagccc 29265599  T
Q  250 tca 252  Q
    |||    
T  29265600 tca 29265602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 152 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 17027269 - 17027209
Alignment:
Q  152 cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctca 213  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||  |||||| ||||||||    
T  17027269 cattccagggcatgagccctcaccaa-ttgaacgacaaggcgttcttgggcatgagccctca 17027209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 152 - 185
Target Start/End: Original strand, 18137493 - 18137526
Alignment:
Q  152 cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatg 185  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18137493 cattccagggcatgagccctcaccaatttgaatg 18137526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 157 - 216
Target Start/End: Original strand, 610733 - 610793
Alignment:
Q  157 cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattc-cagggcataagccctcaaca 216  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||    |||||| |||||||| |||||||||||    
T  610733 cagggcataagccctcaacaatttgaatgaactagcattcacagggcatgagccctcaaca 610793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0609 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 3)
Name: scaffold0609
Description:

Target: scaffold0609; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 60 - 269
Target Start/End: Original strand, 4316 - 4525
Alignment:
Q  60 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattcca 158  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||    
T  4316 gttgaatgactaagcattccagggcacaagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattcca 4415  T
Q  159 gggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagtt 258  Q
    |||||| |||||||||  | ||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  4416 gggcattagccctcaa-tagttggatgacaaggcatcccagggcataagcccgcaacagttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagtt 4514  T
Q  259 gaatgacaaag 269  Q
    | |||||||||    
T  4515 ggatgacaaag 4525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0609; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 61 - 258
Target Start/End: Original strand, 4357 - 4553
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattccag 159  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||| ||||| ||||| || |||||||||  ||||||| ||||| |||||||||  |||| ||||  |  ||| ||||    
T  4357 ttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcattagccctcaatagttggatgacaaggcatcccag 4455  T
Q  160 ggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagtt 258  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||| ||||| ||||    
T  4456 ggcataagcccgcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagttggatgacaaagcattccagggcatgagccctcaatagtt 4553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0609; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 60 - 174
Target Start/End: Original strand, 4434 - 4548
Alignment:
Q  60 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattcca 158  Q
    |||| ||||| | |||| || |||||||||||| ||||| || |||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||| ||||  || |||||||    
T  4434 gttggatgacaaggcatcccagggcataagcccgcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagttggatgacaaagcattcca 4532  T
Q  159 gggcatgagccctcaa 174  Q
    ||||||||||||||||    
T  4533 gggcatgagccctcaa 4548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 114; Significance: 7e-58; HSPs: 11)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 41 - 267
Target Start/End: Original strand, 59146 - 59371
Alignment:
Q  41 gtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggt 140  Q
    ||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||| ||||| |||||||||| ||    
T  59146 gtggtaccattttcaacgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaattttaatgataa--cattccagggcatgagccctcaacagt 59243  T
Q  141 tgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccaga 239  Q
    |||||||  || |||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  59244 tgaatgacaaaacattccagagcatgagccctcaacaggt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccaga 59342  T
Q  240 gcattagctctcaaca-gttgaatgacaa 267  Q
    |||| ||| ||||| | ||||||||||||    
T  59343 gcatgagccctcaataggttgaatgacaa 59371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 149 - 269
Target Start/End: Original strand, 59214 - 59333
Alignment:
Q  149 taacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagct 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  |||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| |||     
T  59214 taacattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaaacattccagagcatgagccctcaacaggtgaatgacaaagcattccagggcatgagcc 59312  T
Q  249 ctcaacagttgaatgacaaag 269  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  59313 ctcaacagttgaatgacaaag 59333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 74 - 254
Target Start/End: Original strand, 59217 - 59397
Alignment:
Q  74 cattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctc 172  Q
    |||||| |||||| ||||| ||||| || ||||||||| ||||||||  |||| |||||||||| | |||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  59217 cattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaaacattccagagcatgagccctcaacaggtgaatgacaaagcattccagggcatgagccctc 59315  T
Q  173 aacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaac 254  Q
    |||| || ||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||    
T  59316 aacagtt-gaatgacaaagcattccagagcatgagccctcaataggttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac 59397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 60 - 215
Target Start/End: Original strand, 59242 - 59397
Alignment:
Q  60 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattcca 158  Q
    |||||||||| || |||||| | |||| ||||| |||||  | |||||||||  ||||||| ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||    
T  59242 gttgaatgacaaaacattccagagcatgagccctcaacaggt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattcca 59340  T
Q  159 gggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac 215  Q
    | |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  59341 gagcatgagccctcaataggttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac 59397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #5
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 81 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 205483 - 205343
Alignment:
Q  81 gggcataagcccccaacaatttgaatga-caagacattc-caaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaa-cattc-cagggcatgagccctcaac 175  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||| || ||||| ||||||||||  || |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  205483 gggcataagccctcaacaatttgaatgaactag-cattcacagggcatgagccctcaacaatttgaatgattaaacattcacagggcatgagccctcaac 205385  T
Q  176 aatttgaatgacaaggcattc-cagggcataagccctcaaca 216  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  205384 aatttgaatgacaaggcattcacagggcataagccctcaaca 205343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #6
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 60 - 141
Target Start/End: Original strand, 59320 - 59401
Alignment:
Q  60 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt 141  Q
    |||||||||| ||||||||| | |||| ||||| ||| |  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  59320 gttgaatgacaaagcattccagagcatgagccctcaataggttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacggtt 59401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #7
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 157 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 205444 - 205343
Alignment:
Q  157 cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattc-cagggcataagccctcaac-agttgaatgacaaggcattc-cagagcattagctctcaa 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||| |||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||| ||| |||| ||| |||||    
T  205444 cagggcatgagccctcaacaatttgaatgattaaacattcacagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattcacagggcataagccctcaa 205345  T
Q  254 ca 255  Q
    ||    
T  205344 ca 205343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #8
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 225
Target Start/End: Original strand, 384104 - 384179
Alignment:
Q  152 cattccagggcatgagccctcaacaatttgaat-gacaaggcattc-cagggcataagccctcaacagttgaatga 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||||| |||||||| |||||||| || ||||||||    
T  384104 cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatggttaaagcattcacagggcatgagccctcaccaattgaatga 384179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #9
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 205422 - 205344
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattc-cggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattc-caaggcataagccctcaac 137  Q
    |||||||| ||| ||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  205422 ttgaatgattaaacattcacagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattcacagggcataagccctcaac 205344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #10
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 178 - 216
Target Start/End: Original strand, 384090 - 384128
Alignment:
Q  178 tttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaaca 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  384090 tttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaaca 384128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #11
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 157 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 205485 - 205425
Alignment:
Q  157 cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattc-cagggcataagccctcaaca 216  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||    |||||| |||||||| |||||||||||    
T  205485 cagggcataagccctcaacaatttgaatgaactagcattcacagggcatgagccctcaaca 205425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0860 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 3)
Name: scaffold0860
Description:

Target: scaffold0860; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 60 - 258
Target Start/End: Original strand, 151 - 349
Alignment:
Q  60 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattcca 158  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||  |||||||||  || |||||||    
T  151 gttgaatgactaagcattccagggcataagccctcaacaatttgaatgacaagacattccagggcatgatccctcaatagttgaatgacaaagcattcca 250  T
Q  159 gggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagtt 258  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || |||| ||| ||||||||||    
T  251 gggcatgagccctcaac-agttggatgacaaggcatcccagggcataagccctcaacagttggatgacaaagcattctagggcatgagccctcaacagtt 349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0860; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 139 - 267
Target Start/End: Original strand, 151 - 280
Alignment:
Q  139 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattcca 237  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  151 gttgaatgactaagcattccagggcataagccctcaacaatttgaatgacaagacattccagggcatgatccctcaatagttgaatgacaaagcattcca 250  T
Q  238 gagcattagctctcaacagttgaatgacaa 267  Q
    | |||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  251 gggcatgagccctcaacagttggatgacaa 280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0860; HSP #3
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 101 - 269
Target Start/End: Original strand, 152 - 321
Alignment:
Q  101 ttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt-gaatgatta-acattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattcca 198  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||  || ||||||  | |||||||||||||||| ||||||| | || ||||||||| ||||||||    
T  152 ttgaatgactaagcattccagggcataagccctcaacaatttgaatgacaagacattccagggcatgatccctcaatagtt-gaatgacaaagcattcca 250  T
Q  199 gggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagttgaatgacaaag 269  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
T  251 gggcatgagccctcaacagttggatgacaaggcatcccagggcataagccctcaacagttggatgacaaag 321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 13)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 61 - 225
Target Start/End: Original strand, 20883 - 21048
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaacattccag 159  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  20883 ttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataaatcctcaacagtttgaatgataaacattccag 20982  T
Q  160 ggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatga 225  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  20983 ggcatgaaccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataaaccctcaacagttaaatga 21048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 41 - 219
Target Start/End: Original strand, 20783 - 20963
Alignment:
Q  41 gtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-gg 139  Q
    ||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| |     
T  20783 gtggtaccattttcaacgtgttgaatgactaagcatttcggggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagt 20882  T
Q  140 ttgaatgatta-acattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt 219  Q
    ||||||||  |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  20883 ttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataaatcctcaacagtt 20963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 139 - 267
Target Start/End: Original strand, 20802 - 20933
Alignment:
Q  139 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaggcattcc 236  Q
    ||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20802 gttgaatgactaagcatttcggggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattcc 20901  T
Q  237 agagcattagctctcaac-agttgaatgacaa 267  Q
    || |||| ||| |||||| | |||||||||||    
T  20902 agggcataagccctcaacaatttgaatgacaa 20933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #4
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 152 - 243
Target Start/End: Original strand, 20856 - 20948
Alignment:
Q  152 cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac-agttgaatgacaaggcattccagagcat 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  20856 cattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcat 20948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #5
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 61 - 264
Target Start/End: Original strand, 20843 - 21048
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaa-cattcca 158  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  || ||||||  |  |||||||    
T  20843 ttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacaatttgaatgacaaggcattcca 20942  T
Q  159 gggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagt 257  Q
    |||||| |  |||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| | | |||||||||    
T  20943 gggcataaatcctcaacagtttgaatgataaa-cattccagggcatgaaccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataaaccctcaacagt 21041  T
Q  258 tgaatga 264  Q
    | |||||    
T  21042 taaatga 21048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #6
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 139 - 258
Target Start/End: Original strand, 23880 - 24001
Alignment:
Q  139 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaggcattcc 236  Q
    ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  23880 gttgaatgactaagcattctagggcatgagccctcaatagtttgaatgacaaggcattctagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattct 23979  T
Q  237 agagcattagctctcaacagtt 258  Q
    || |||| ||| ||||| ||||    
T  23980 agggcataagccctcaatagtt 24001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #7
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 61 - 176
Target Start/End: Original strand, 20963 - 21076
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagg 160  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  20963 ttgaatga-taaacattccagggcatgaaccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataaaccctcaacagttaaatgattaacattccagg 21061  T
Q  161 gcatgagccctcaaca 176  Q
    |||||| |||||||||    
T  21062 gcatga-ccctcaaca 21076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #8
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Original strand, 23861 - 24025
Alignment:
Q  41 gtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-gg 139  Q
    ||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||| | ||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||| |     
T  23861 gtggtaccattttcaacgtgttgaatgactaagcattctagggcatgagccctcaatagtttgaatgacaaggcattctagggcatgagccctcaacagt 23960  T
Q  140 ttgaatgatta-acattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcat 204  Q
    ||||||||  |  ||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||| ||  |||||||||||||    
T  23961 ttgaatgacaaggcattctagggcataagccctcaatagtttgaatgataa-acattccagggcat 24025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #9
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 61 - 165
Target Start/End: Original strand, 23921 - 24026
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaa-cggttgaatgattaacattccag 159  Q
    ||||||||| | ||||||  |||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||    
T  23921 ttgaatgacaaggcattctagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattctagggcataagccctcaatagtttgaatgataaacattccag 24020  T
Q  160 ggcatg 165  Q
    ||||||    
T  24021 ggcatg 24026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #10
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 100 - 219
Target Start/End: Original strand, 35577 - 35697
Alignment:
Q  100 tttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatga-ttaacattc-cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattcc 197  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| |  ||| || | ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  35577 tttgaatgacaaggcattccagggcgtaagccctcaccaattggataaattagcattcacagggcatgagccctcaccaatt-gaatgacaaggcattcc 35675  T
Q  198 agggcataagccctcaacagtt 219  Q
    ||| ||| |||||||| |||||    
T  35676 aggacatgagccctcaccagtt 35697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #11
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 178 - 213
Target Start/End: Original strand, 24707 - 24742
Alignment:
Q  178 tttgaatgacaaggcattccagggcataagccctca 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24707 tttgaatgacaaggcattccagggcgtaagccctca 24742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #12
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 122 - 213
Target Start/End: Original strand, 24771 - 24863
Alignment:
Q  122 ggcataagccctcaacggttgaatga-ttaacattc-cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctca 213  Q
    ||||| |||| ||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  24771 ggcatgagccgtcaccgattgaatgaattagcattcacagggcatgagccctcaccaatt-gaacaacaaggcgttccagggcatgagccctca 24863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #13
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 197 - 238
Target Start/End: Original strand, 35636 - 35677
Alignment:
Q  197 cagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccag 238  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  35636 cagggcatgagccctcaccaattgaatgacaaggcattccag 35677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0381 (Bit Score: 101; Significance: 4e-50; HSPs: 4)
Name: scaffold0381
Description:

Target: scaffold0381; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 41 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 14162 - 13986
Alignment:
Q  41 gtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-gg 139  Q
    ||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||       
T  14162 gtggtacaattttcaacgtgttgaatgactaagcattccagggcataagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacaat 14063  T
Q  140 ttgaatgatta-acattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac 215  Q
    ||||||||  |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14062 ttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacaatttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaac 13986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0381; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 139 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 14143 - 14010
Alignment:
Q  139 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac-agttgaatgacaaggcattcc 236  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  14143 gttgaatgactaagcattccagggcataagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacaatttgaatgacaaggcattcc 14044  T
Q  237 agagcattagctctcaac-agttgaatgacaaag 269  Q
    || |||| ||| |||||| | |||||||||||||    
T  14043 agggcataagccctcaacaatttgaatgacaaag 14010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0381; HSP #3
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 101 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 14142 - 13986
Alignment:
Q  101 ttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattcca 198  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||  || ||||||  |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14142 ttgaatgactaagcattccagggcataagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacaatttgaatgacaaggcattcca 14043  T
Q  199 gggcataagccctcaac-agttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaac 254  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||    
T  14042 gggcataagccctcaacaatttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaac 13986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0381; HSP #4
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 61 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 14062 - 13982
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt 141  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14062 ttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacaatttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacggtt 13982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 99; Significance: 6e-49; HSPs: 6)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 140 - 258
Target Start/End: Original strand, 2161 - 2279
Alignment:
Q  140 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccaga 239  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  2161 ttgaatgataaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagg 2260  T
Q  240 gcattagctctcaacagtt 258  Q
    |||| ||| ||||||||||    
T  2261 gcatgagccctcaacagtt 2279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 140 - 258
Target Start/End: Original strand, 9005 - 9123
Alignment:
Q  140 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccaga 239  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  9005 ttgaatgataaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagg 9104  T
Q  240 gcattagctctcaacagtt 258  Q
    |||| ||| ||||||||||    
T  9105 gcatgagccctcaacagtt 9123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151; HSP #3
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 41 - 219
Target Start/End: Original strand, 2101 - 2279
Alignment:
Q  41 gtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-gg 139  Q
    ||||||| |||| ||||  | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||       
T  2101 gtggtaccattttcaacgtgctgaatgactaagcattccgaggcttaagcccccaacaatttgaatgataa-acattccagggcatgagccctcaacaat 2199  T
Q  140 ttgaatgatta-acattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt 219  Q
    ||||||||  |  ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2200 ttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac-agttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtt 2279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151; HSP #4
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 41 - 219
Target Start/End: Original strand, 8945 - 9123
Alignment:
Q  41 gtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-gg 139  Q
    ||||||| |||| ||||  | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||       
T  8945 gtggtaccattttcaacgtgctgaatgactaagcattccgaggcttaagcccccaacaatttgaatgataa-acattccagggcatgagccctcaacaat 9043  T
Q  140 ttgaatgatta-acattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt 219  Q
    ||||||||  |  ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9044 ttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac-agttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtt 9123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151; HSP #5
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 166 - 269
Target Start/End: Original strand, 2148 - 2251
Alignment:
Q  166 agccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagttgaatga 264  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  2148 agcccccaacaatttgaatgataaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatga 2246  T
Q  265 caaag 269  Q
    |||||    
T  2247 caaag 2251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151; HSP #6
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 166 - 269
Target Start/End: Original strand, 8992 - 9095
Alignment:
Q  166 agccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagttgaatga 264  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  8992 agcccccaacaatttgaatgataaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatga 9090  T
Q  265 caaag 269  Q
    |||||    
T  9091 caaag 9095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 99; Significance: 6e-49; HSPs: 5)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 75 - 252
Target Start/End: Original strand, 2140 - 2318
Alignment:
Q  75 attccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaa 174  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||  |||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2140 attccagggcatgagccctcaacagattgaatgataaagcattccagggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaa 2239  T
Q  175 caatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac-agttgaatgacaaggcattccagagcattagctctca 252  Q
    ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||    
T  2240 cagattgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaccaatttgaacgacaaggcattccagggcatgagccctca 2318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 74 - 269
Target Start/End: Original strand, 2061 - 2256
Alignment:
Q  74 cattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctca 173  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||  |||||||||||| ||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2061 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattctagggcataatccctcaacggttgaatgattaatattccagggcatgagccctca 2160  T
Q  174 acaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacag-ttgaatgacaaag 269  Q
    |||  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |  |||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  2161 acagattgaatgataaagcattccagggcataagccctcaacggttgaatgatta-acattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaag 2256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #3
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 41 - 264
Target Start/End: Original strand, 1989 - 2212
Alignment:
Q  41 gtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-gg 139  Q
    ||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||| ||||| |||||||||| |     
T  1989 gtggtaccattttcaacgggttgaatgactaagcattctggggcataagcccccaacaatttgaatgatga-tcattccagggcatgagccctcaacaga 2087  T
Q  140 ttgaatgatta-acattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaggcattcca 237  Q
    ||||||||  |  ||||| ||||||| | ||||||||   ||||||||  |   |||||||||||| |||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  2088 ttgaatgacaaggcattctagggcataatccctcaac-ggttgaatgatta-atattccagggcatgagccctcaacagattgaatgataaagcattcca 2185  T
Q  238 gagcattagctctcaacagttgaatga 264  Q
    | |||| ||| |||||| |||||||||    
T  2186 gggcataagccctcaacggttgaatga 2212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 135
Target Start/End: Original strand, 2244 - 2318
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctca 135  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||| || ||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  2244 ttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaccaatttgaacgacaaggcattccagggcatgagccctca 2318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 60 - 135
Target Start/End: Original strand, 2204 - 2278
Alignment:
Q  60 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctca 135  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||| ||||| |||||  |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  2204 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaagcattccagggcataagccctca 2278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 6)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 60 - 219
Target Start/End: Original strand, 50696 - 50855
Alignment:
Q  60 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattcca 158  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||| |||||||||  || ||||| |    
T  50696 gttgaatgactgagcattccggggcataagccccaaacaatttgaatgataa-acattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaagcattcta 50794  T
Q  159 gggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt 219  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  50795 gggcataagccctcaacagtttgaatgacaaggcattcaagggcatgagccctcaacagtt 50855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 122 - 225
Target Start/End: Original strand, 50878 - 50982
Alignment:
Q  122 ggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaa-tgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttg 220  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50878 ggcataagccctcaacgattgaacgataaacatttcagggcatgagccctcaacagtttaaaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttg 50977  T
Q  221 aatga 225  Q
    |||||    
T  50978 aatga 50982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 60 - 264
Target Start/End: Original strand, 50774 - 50982
Alignment:
Q  60 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaa--cattc 156  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||| ||| ||||| ||||  |||||    
T  50774 gttgaatgacaaagcattctagggcataagccctcaacagtttgaatgacaaggcattcaagggcatgagccctcaacagtttgaatggttaaagcattc 50873  T
Q  157 -cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaa--tgacaaggcattccagagcattagctctcaa 253  Q
     |||||||| |||||||||| ||| ||| || ||  |||| |||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  50874 acagggcataagccctcaacgatt-gaacgataaa-catttcagggcatgagccctcaacagtttaaaatgacaaggcattccagggcataagccctcaa 50971  T
Q  254 cagttgaatga 264  Q
    |||||||||||    
T  50972 cagttgaatga 50982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #4
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 140 - 258
Target Start/End: Original strand, 50737 - 50855
Alignment:
Q  140 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaggcattccag 238  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  50737 ttgaatgataaacattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattctagggcataagccctcaacagtttgaatgacaaggcattcaag 50835  T
Q  239 agcattagctctcaacagtt 258  Q
     |||| ||| ||||||||||    
T  50836 ggcatgagccctcaacagtt 50855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #5
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 104 - 175
Target Start/End: Original strand, 50939 - 51010
Alignment:
Q  104 aatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaac 175  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50939 aatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaac 51010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #6
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 152 - 267
Target Start/End: Original strand, 50710 - 50825
Alignment:
Q  152 cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctc 251  Q
    |||||| |||||| |||||  |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||| |||    
T  50710 cattccggggcataagccccaaacaatttgaatgataaa-cattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaagcattctagggcataagccctc 50808  T
Q  252 aacag-ttgaatgacaa 267  Q
    ||||| |||||||||||    
T  50809 aacagtttgaatgacaa 50825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 4)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 61 - 252
Target Start/End: Original strand, 137562 - 137754
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagg 160  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||| || ||||||||| |||||| | ||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  137562 ttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaccaatttgaacgacaaggcgttctagggcataagccctcaactgttgaatgattaacattccaga 137661  T
Q  161 gcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac-agttgaatgacaaggcattccagagcattagctctca 252  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | | ||||| |||||||| |||||| |||| ||| ||||    
T  137662 gcatgagccctcaacagattgaatgacaaagcattccagggaataagccctcaccaatttgaacgacaaggcgttccagggcatgagccctca 137754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 62 - 269
Target Start/End: Original strand, 137484 - 137692
Alignment:
Q  62 tgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacgg-ttgaatgattaa-cattccag 159  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  |  ||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||  || ||||||||    
T  137484 tgaatgactaagcattccggagcataagcccccaacaatttgaataatgat-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaagcattccag 137582  T
Q  160 ggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacag-tt 258  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||  |  ||||||||||||| ||| |||||||| ||    
T  137583 ggcataagccctcaccaatttgaacgacaaggcgttctagggcataagccctcaactgttgaatgattaa-cattccagagcatgagccctcaacagatt 137681  T
Q  259 gaatgacaaag 269  Q
    |||||||||||    
T  137682 gaatgacaaag 137692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 157 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 81325 - 81269
Alignment:
Q  157 cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctca 213  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  81325 cagggcataagccctcaccaatttgaacgacaaggcgttccagggcatgagccctca 81269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 154 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 81288 - 81229
Alignment:
Q  154 ttccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctca 213  Q
    |||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  81288 ttccagggcatgagccctcaccgctttgaacgacaaggcgttctagggcatgagccctca 81229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 4)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 61 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 40328 - 40132
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattccag 159  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||| |||||  |||| ||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||| |||||||||  || ||||||||    
T  40328 ttgaatga-taaacattccagggcatgagcccttaacagtttgaatgacaaggcattccagggagtaagccctcaacagttgaatgacaaagcattccag 40230  T
Q  160 ggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagtt 258  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||| ||||    
T  40229 ggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaatagtt 40132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 140 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 40328 - 40199
Alignment:
Q  140 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccaga 239  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  40328 ttgaatgataaacattccagggcatgagcccttaacagtttgaatgacaaggcattccagggagtaagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagg 40229  T
Q  240 gcattagctctcaacagttgaatgacaaag 269  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  40228 gcatgagccctcaacagttgaatgacaaag 40199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #3
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 60 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 40369 - 40160
Alignment:
Q  60 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaa-cattcc 157  Q
    ||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||| ||| ||| ||||||  |  ||||||    
T  40369 gttgaatgacataacattctgggccttaagcccccaacaatttgaatgataa-acattccagggcatgagcccttaacagtttgaatgacaaggcattcc 40271  T
Q  158 agggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagt 257  Q
    ||||  | ||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||    
T  40270 agggagtaagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagt 40172  T
Q  258 tgaatgacaaag 269  Q
    ||||||||||||    
T  40171 tgaatgacaaag 40160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 60 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 40212 - 40137
Alignment:
Q  60 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaa 136  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| | |||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||    
T  40212 gttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaac-agttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaa 40137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 92; Significance: 9e-45; HSPs: 10)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 61 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 12662 - 12508
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaacattccag 159  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||| || |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  12662 ttgaatga-taaacattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcatttcagggcataagccctcaacagtttgaatgataaacattccag 12564  T
Q  160 ggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac 215  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12563 ggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattccaaggcataagccctcaac 12508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 68 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 13296 - 13106
Alignment:
Q  68 actaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattccagggcatga 166  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||| |    
T  13296 actaagcattctggggcataagccccaaacaatttgaatgataa-acattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcataa 13198  T
Q  167 gccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagtt 258  Q
    ||| ||||| |  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  13197 gccgtcaac-agatgaatgacaaagcatttcagggcataagccctcagcggtttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt 13106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #3
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 114 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 12688 - 12534
Alignment:
Q  114 cattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctca 213  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12688 cattccagggcataagccctcaacaattgaatgataaacattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcatttcagggcataagccctca 12589  T
Q  214 acag-ttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacag-ttgaatgacaa 267  Q
    |||| |||||||| ||  |||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  12588 acagtttgaatgataa-acattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaa 12534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #4
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 61 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 13263 - 13071
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattccag 159  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||| || |||||||||  ||||||| |||||||||| ||||| | |||||||  || |||| |||    
T  13263 ttgaatga-taaacattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcataagccgtcaacagatgaatgacaaagcatttcag 13166  T
Q  160 ggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaa 253  Q
    ||||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| |||| ||| |||||    
T  13165 ggcataagccctcagcggtttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtttgaatcacgaggcattccagggcataagccctcaa 13071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #5
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 60 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 13226 - 13026
Alignment:
Q  60 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaa-cattcc 157  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||  |||||  | |||||||||  |||| || |||||||||||||| ||||| ||||||  |  ||||||    
T  13226 gttgaatgacaaagcattccagggcataagccgtcaacagat-gaatgacaaagcatttcagggcataagccctcagcggtttgaatgacaaggcattcc 13128  T
Q  158 agggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacag 256  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||  ||||  |||| ||| ||||||||    
T  13127 agggcataagccctcaacagtttgaatcacgaggcattccagggcataagccctcaatggtttgaatgacaaggctatccaaggcataagccctcaacag 13028  T
Q  257 tt 258  Q
    ||    
T  13027 tt 13026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #6
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 72 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 12690 - 12508
Alignment:
Q  72 agcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaa-cattccagggcatgagcc 169  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||| |||||| || |||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||  |  |||| |||||||| ||||    
T  12690 agcattccagggcataagccctcaacaatt-gaatgataa-acattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcatttcagggcataagcc 12593  T
Q  170 ctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaggcattccagagcattagctctcaac 254  Q
    ||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||    
T  12592 ctcaacagtttgaatgataaa-cattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattccaaggcataagccctcaac 12508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #7
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 159 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 13283 - 13174
Alignment:
Q  159 gggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagtt 258  Q
    |||||| |||||  |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||  ||||||| |    
T  13283 gggcataagccccaaacaatttgaatgataaa-cattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcataagccgtcaacagat 13185  T
Q  259 gaatgacaaag 269  Q
    |||||||||||    
T  13184 gaatgacaaag 13174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #8
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 61 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 12583 - 12504
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt 141  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12583 ttgaatga-taaacattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattccaaggcataagccctcaacggtt 12504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #9
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 191 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 12689 - 12613
Alignment:
Q  191 gcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacag-ttgaatgacaa 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  12689 gcattccagggcataagccctcaacaattgaatgataa-acattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaa 12613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #10
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 178 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 125073 - 125038
Alignment:
Q  178 tttgaatgacaaggcattccagggcataagccctca 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  125073 tttgaatgacaaggcattccagggcgtaagccctca 125038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 91; Significance: 4e-44; HSPs: 4)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 61 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 4096 - 3943
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagg 160  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  4096 ttgaatga-taaacattccagggcatgagccctcaacggtttgaatgacaaggcattccatggcataagccctcaacaattgaatgataaacattccagg 3998  T
Q  161 gcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac 215  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3997 gcatgagccctcaacggtttaaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac 3943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 60 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 4137 - 3943
Alignment:
Q  60 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaa-cattcc 157  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||  |  ||||||    
T  4137 gttgaatgactaagcatttcggggcataagcccccaacaatttgaatgataa-acattccagggcatgagccctcaacggtttgaatgacaaggcattcc 4039  T
Q  158 agggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaa-tgacaaggcattccagagcattagctctcaac 254  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||||||||||| |||| ||| ||||||    
T  4038 atggcataagccctcaacaatt-gaatgataaa-cattccagggcatgagccctcaacggtttaaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac 3943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 139 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 4137 - 4011
Alignment:
Q  139 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaggcattcc 236  Q
    ||||||||| ||| |||| | |||||| ||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  4137 gttgaatgactaagcatttcggggcataagcccccaacaatttgaatgataaa-cattccagggcatgagccctcaacggtttgaatgacaaggcattcc 4039  T
Q  237 agagcattagctctcaacagttgaatga 264  Q
    |  |||| ||| ||||||| ||||||||    
T  4038 atggcataagccctcaacaattgaatga 4011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 61 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 4018 - 3939
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt 141  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4018 ttgaatga-taaacattccagggcatgagccctcaacggtttaaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacggtt 3939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 89; Significance: 6e-43; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 60 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 35071 - 34873
Alignment:
Q  60 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaa-cattcc 157  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | ||||| |||||||||| ||| ||||||  |  |||||     
T  35071 gttgaatgactaagcatttcggggcataagcccccaacaatttgaatgataa-acattctagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattct 34973  T
Q  158 agggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagt 257  Q
    ||||||| | ||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||    
T  34972 agggcataatccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcataaaccctcaactgttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagt 34874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 140 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 35030 - 34901
Alignment:
Q  140 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccaga 239  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  35030 ttgaatgataaacattctagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattctagggcataatccctcaacagttgaatgacaaagcattccagg 34931  T
Q  240 gcattagctctcaacagttgaatgacaaag 269  Q
    |||| | | |||||| ||||||||||||||    
T  34930 gcataaaccctcaactgttgaatgacaaag 34901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 139 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 35071 - 34940
Alignment:
Q  139 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaggcattcc 236  Q
    ||||||||| ||| |||| | |||||| ||||| ||||||||||||||| ||  ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  35071 gttgaatgactaagcatttcggggcataagcccccaacaatttgaatgataa-acattctagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattct 34973  T
Q  237 agagcattagctctcaacagttgaatgacaaag 269  Q
    || |||| | | |||||||||||||||||||||    
T  34972 agggcataatccctcaacagttgaatgacaaag 34940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 87; Significance: 9e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 39 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 134401 - 134263
Alignment:
Q  39 acgtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacg 138  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  134401 acgtggtactattttcaacgggttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacg 134302  T
Q  139 -gttgaatga-ttaacattccagggcatgagccctcaac 175  Q
      ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  134301 atttgaatgacatagcattccagggcatgagccctcaac 134263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 138 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 134381 - 134263
Alignment:
Q  138 ggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac-agttgaatgacaaggcattc 235  Q
    |||||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||  ||||||    
T  134381 ggttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacgatttgaatgacatagcattc 134282  T
Q  236 cagagcattagctctcaac 254  Q
    ||| |||| ||| ||||||    
T  134281 cagggcatgagccctcaac 134263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0825 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 4)
Name: scaffold0825
Description:

Target: scaffold0825; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 75 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 1945 - 1801
Alignment:
Q  75 attccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaa 174  Q
    ||||| |||||| ||||  ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  1945 attccagggcatgagccatcaacagtttgaatgacaaggcattccagggcatcagtcctcaacagttgaatgattaacattctagggtatgagccctcaa 1846  T
Q  175 caatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt 219  Q
    || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  1845 cagtttgaatgacaaggcattccaacgcataagccctcaacagtt 1801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0825; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 140 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 1958 - 1873
Alignment:
Q  140 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatga 225  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  1958 ttgaatgataaatattccagggcatgagccatcaacagtttgaatgacaaggcattccagggcatcagtcctcaacagttgaatga 1873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0825; HSP #3
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 41 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 2018 - 1801
Alignment:
Q  41 gtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-gg 139  Q
    ||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||| |||| ||||| |     
T  2018 gtggtaccattttcaacgtgttgaatgactaagcattccggggtgtaagcccccaacaatttgaatgataa-atattccagggcatgagccatcaacagt 1920  T
Q  140 ttgaatgatta-acattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaggcattcca 237  Q
    ||||||||  |  ||||||||||||| || ||||||| | ||||||||  |  ||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1919 ttgaatgacaaggcattccagggcatcagtcctcaac-agttgaatgatta-acattctagggtatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattcca 1822  T
Q  238 gagcattagctctcaacagtt 258  Q
      |||| ||| ||||||||||    
T  1821 acgcataagccctcaacagtt 1801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0825; HSP #4
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 166 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 1971 - 1873
Alignment:
Q  166 agccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagttgaatga 264  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||   |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||    
T  1971 agcccccaacaatttgaatgataaat-attccagggcatgagccatcaacagtttgaatgacaaggcattccagggcatcagtcctcaacagttgaatga 1873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 82; Significance: 9e-39; HSPs: 5)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 61 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 9112 - 8921
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttgaatgattaacattccag 159  Q
    |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||| ||||||||||   ||||||||||  ||||||||    
T  9112 ttgaatgactgagctttccggggcttaagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggcatgagccctcaacattttgaatgattttcattccag 9014  T
Q  160 ggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac-agttgaatgacaaggcattccagagcattagctctca 252  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| ||||| ||| |||| ||| ||||    
T  9013 ggcatgagccctcaacagattgaatga-aaggcattccagggcataagccctcaccaatttgaatgacaaagcatttcagggcatgagccctca 8921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 74 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 9021 - 8841
Alignment:
Q  74 cattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaa-cattccagggcatgagccct 171  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||  |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| |  || ||||||  || |||| |||||||||||||||    
T  9021 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatga-aaggcattccagggcataagccctcaccaatttgaatgacaaagcatttcagggcatgagccct 8923  T
Q  172 caacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaggcattccagagcattagctctca 252  Q
    || |  |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||    
T  8922 caccgctttgaacgacaaggcgttccagggcataagccctcaccaatttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctca 8841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 61 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 8955 - 8801
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaa-cattcca 158  Q
    ||||||||| ||||||| | |||||| ||||| || |  |||||| |||||| | ||||| |||||||||||||| |  || ||||||  || |||||||    
T  8955 ttgaatgacaaagcatttcagggcatgagccctcaccgctttgaacgacaaggcgttccagggcataagccctcaccaatttgaatgacaaagcattcca 8856  T
Q  159 gggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctca 213  Q
    ||||||||||||||| |  |||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  8855 gggcatgagccctcaccgctttgaacgacaaggcgttctagggcataagccctca 8801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #4
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 114 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 9021 - 8863
Alignment:
Q  114 cattccaaggcataagccctcaacgg-ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctc 212  Q
    ||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  9021 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgaaaggcattccagggcataagccctcaccaatttgaatgacaaagcatttcagggcatgagccctc 8922  T
Q  213 aac-agttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaac-agttgaatgacaaag 269  Q
    | |   ||||| |||||||| |||||| |||| ||| |||| | | |||||||||||||    
T  8921 accgctttgaacgacaaggcgttccagggcataagccctcaccaatttgaatgacaaag 8863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 178 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 10102 - 10061
Alignment:
Q  178 tttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  10102 tttgaatgacaaggcattccagggcatgagcccccaacagtt 10061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 3)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 140 - 258
Target Start/End: Original strand, 10609 - 10727
Alignment:
Q  140 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccaga 239  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| ||     
T  10609 ttgaatgataaacattccagggcatgagccctcaatagtttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaatagttgaatgacagggtattctagg 10708  T
Q  240 gcattagctctcaacagtt 258  Q
    |||| ||| ||||||||||    
T  10709 gcataagccctcaacagtt 10727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 41 - 219
Target Start/End: Original strand, 10549 - 10727
Alignment:
Q  41 gtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaa-cgg 139  Q
    ||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||  |     
T  10549 gtggtaccattttcaacgtgttgaatgagtaagcattccggggcataagcccccaataatttgaatgataa-acattccagggcatgagccctcaatagt 10647  T
Q  140 ttgaatgatta-acattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt 219  Q
    ||||||||  |  ||||||||||||| |||||||||  | |||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||    
T  10648 ttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaa-tagttgaatgacagggtattctagggcataagccctcaacagtt 10727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 139 - 266
Target Start/End: Original strand, 10568 - 10696
Alignment:
Q  139 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaggcattcc 236  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||| ||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  10568 gttgaatgagtaagcattccggggcataagcccccaataatttgaatgataaa-cattccagggcatgagccctcaatagtttgaatgacaaggcattcc 10666  T
Q  237 agagcattagctctcaacagttgaatgaca 266  Q
    || |||| ||| ||||| ||||||||||||    
T  10667 agggcataagccctcaatagttgaatgaca 10696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0635 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0635
Description:

Target: scaffold0635; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 41 - 252
Target Start/End: Original strand, 6704 - 6918
Alignment:
Q  41 gtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggt 140  Q
    ||||||| |||| ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||| |||||||||| ||    
T  6704 gtggtaccattttcaacgtgatgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataa-acattcctgggcatgagccctcaacagt 6802  T
Q  141 tgaatgatta-acattccagggcatgagccctcaac-aatttgaat-gacaaggcattc-cagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattcc 236  Q
    |||||||  |  ||||||||||||| |||||||| | ||||||||| |  || |||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||    
T  6803 tgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaccgaatttgaatggttaaagcattcacagggcataagccctcaccaattgaacgacaaggcgttcc 6902  T
Q  237 agagcattagctctca 252  Q
    || |||| ||| ||||    
T  6903 agggcatgagccctca 6918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0635; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 180 - 267
Target Start/End: Original strand, 6725 - 6812
Alignment:
Q  180 tgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagttgaatgacaa 267  Q
    |||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||| || |||||| ||  |||||| | |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  6725 tgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataaa-cattcctgggcatgagccctcaacagttgaatgacaa 6812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0586 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 3)
Name: scaffold0586
Description:

Target: scaffold0586; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 101 - 254
Target Start/End: Original strand, 1503 - 1657
Alignment:
Q  101 ttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagg 200  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||||||||| || |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  1503 ttgaatgactaagcattccagggcataagcccccagcaattgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagg 1602  T
Q  201 gcataagccctcaacag-ttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaac 254  Q
    |||| |||||||||| | ||||||| ||| ||||||||| |||| ||| ||||||    
T  1603 gcatgagccctcaacggtttgaatggcaaagcattccagggcatgagccctcaac 1657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0586; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 42 - 215
Target Start/End: Original strand, 1484 - 1657
Alignment:
Q  42 tggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggt 140  Q
    |||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||  | |||||||| ||||| |||||||||| | |    
T  1484 tggtaccattttcaacgtgttgaatgactaagcattccagggcataagcccccagcaa-ttgaatgatga-acattccagggcatgagccctcaacagat 1581  T
Q  141 tgaatgatta-acattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac 215  Q
    |||||||  |  ||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  1582 tgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacggtttgaatggcaaagcattccagggcatgagccctcaac 1657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0586; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 141
Target Start/End: Original strand, 1581 - 1661
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt 141  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||| ||||| ||||  |||||||| |||  ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  1581 ttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacggtttgaatggcaaagcattccagggcatgagccctcaacggtt 1661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 4)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 74 - 175
Target Start/End: Original strand, 2830 - 2931
Alignment:
Q  74 cattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctca 173  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2830 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaagacattccagggcataagccctcaacagttgaatgattaacattccagggcatgagccctca 2929  T
Q  174 ac 175  Q
    ||    
T  2930 ac 2931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 140 - 225
Target Start/End: Original strand, 2818 - 2903
Alignment:
Q  140 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatga 225  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2818 ttgaatgatgatcattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaagacattccagggcataagccctcaacagttgaatga 2903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #3
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 41 - 215
Target Start/End: Original strand, 2758 - 2931
Alignment:
Q  41 gtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-gg 139  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  |  ||||||| ||||| |||||||||| |     
T  2758 gtggtactattttcaacgggttgaatgactaagcattccgcggcataagcccctaacaatttgaatgatga-tcattccagggcatgagccctcaacaga 2856  T
Q  140 ttgaatgatta-acattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac 215  Q
    ||||||||  | |||||||||||||| |||||||||| | ||||||||  |  ||||||||||||| ||||||||||    
T  2857 ttgaatgacaagacattccagggcataagccctcaac-agttgaatgatta-acattccagggcatgagccctcaac 2931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #4
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 138 - 264
Target Start/End: Original strand, 2776 - 2903
Alignment:
Q  138 ggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaggcattc 235  Q
    |||||||||| ||| ||||||  ||||| |||||  ||||||||||||||  |  ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  2776 ggttgaatgactaagcattccgcggcataagcccctaacaatttgaatgatgat-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaagacattc 2874  T
Q  236 cagagcattagctctcaacagttgaatga 264  Q
    ||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  2875 cagggcataagccctcaacagttgaatga 2903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 41 - 219
Target Start/End: Original strand, 5680 - 5857
Alignment:
Q  41 gtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-gg 139  Q
    ||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||| |     
T  5680 gtggtaccattttcaacgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttaaatgataa-acattccagggcatgagccctcaacagt 5778  T
Q  140 ttgaatgatta-acattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt 219  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||  |  ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5779 ttgaatgataagtcattccagggcataagccctcgacaa-ttgaatgatta-acattccagggcatgagccctcaacagtt 5857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 143 - 258
Target Start/End: Original strand, 5743 - 5857
Alignment:
Q  143 aatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagca 242  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  |  |||||||| |||    
T  5743 aatgataaacattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgataagtcattccagggcataagccctcgacaattgaatgatta-acattccagggca 5841  T
Q  243 ttagctctcaacagtt 258  Q
    | ||| ||||||||||    
T  5842 tgagccctcaacagtt 5857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 72; Significance: 8e-33; HSPs: 4)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 163 - 254
Target Start/End: Original strand, 1414 - 1505
Alignment:
Q  163 atgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaac 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||    
T  1414 atgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacggttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 1505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 88 - 175
Target Start/End: Original strand, 1417 - 1505
Alignment:
Q  88 agcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaac 175  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  1417 agccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacggttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 1505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 206 - 269
Target Start/End: Original strand, 1417 - 1481
Alignment:
Q  206 agccctcaacagtt-gaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagttgaatgacaaag 269  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| ||| |||||| ||||||||||||||    
T  1417 agccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacggttgaatgacaaag 1481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 141
Target Start/End: Original strand, 1430 - 1509
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt 141  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||  || |||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  1430 ttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacggtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtt 1509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 67; Significance: 8e-30; HSPs: 4)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 74 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 6190 - 6088
Alignment:
Q  74 cattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctca 173  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||  |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6190 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattctagggcataagccctcaacggttgaatgcttaacattccagggcatgagccctca 6091  T
Q  174 aca 176  Q
    |||    
T  6090 aca 6088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 140 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 6202 - 6118
Alignment:
Q  140 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatg 224  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  6202 ttgaaagatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattctagggcataagccctcaacggttgaatg 6118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 60 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 6243 - 6167
Alignment:
Q  60 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||| ||||| ||||||||||    
T  6243 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaaagatga-acattccagggcatgagccctcaac 6167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #4
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 138 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 6244 - 6118
Alignment:
Q  138 ggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaggcattc 235  Q
    |||||||||| ||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||| ||  |  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6244 ggttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaaagatgaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattc 6146  T
Q  236 cagagcattagctctcaacagttgaatg 263  Q
     || |||| ||| |||||| ||||||||    
T  6145 tagggcataagccctcaacggttgaatg 6118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 41 - 215
Target Start/End: Original strand, 13893 - 14068
Alignment:
Q  41 gtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggt 140  Q
    ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||| ||||| |||||||||| ||    
T  13893 gtggtaccattttcaacatgttgaatgactaagcatttcggggcataag-ccccaacaatttgaatgataa-atattccagggcatgagccctcaacagt 13990  T
Q  141 tgaatgatta-acattccagggcatgagccctcaacaatttgaat-gacaaggcattc-cagggcataagccctcaac 215  Q
    |||||||  |  ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |  || |||||| |||||||| ||||||||||    
T  13991 tgaatgacaatgcattccaaggcatgagccctcaacagtttgaatagttaaagcattcacagggcatgagccctcaac 14068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 139 - 258
Target Start/End: Original strand, 13912 - 14030
Alignment:
Q  139 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattcca 237  Q
    ||||||||| ||| |||| | |||||| ||||| ||||||||||||||| ||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13912 gttgaatgactaagcatttcggggcataagccc-caacaatttgaatgataaat-attccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaatgcattcca 14009  T
Q  238 gagcattagctctcaacagtt 258  Q
      |||| ||| ||||||||||    
T  14010 aggcatgagccctcaacagtt 14030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 41 - 215
Target Start/End: Original strand, 11888 - 12063
Alignment:
Q  41 gtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggt 140  Q
    ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||| ||||| |||||||||| ||    
T  11888 gtggtaccattttcaacatgttgaatgactaagcatttcggggcataag-ccccaacaatttgaatgataa-atattccagggcatgagccctcaacagt 11985  T
Q  141 tgaatgatta-acattccagggcatgagccctcaacaatttgaat-gacaaggcattc-cagggcataagccctcaac 215  Q
    |||||||  |  ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |  || |||||| |||||||| ||||||||||    
T  11986 tgaatgacaatgcattccaaggcatgagccctcaacagtttgaatagttaaagcattcacagggcatgagccctcaac 12063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 139 - 258
Target Start/End: Original strand, 11907 - 12025
Alignment:
Q  139 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattcca 237  Q
    ||||||||| ||| |||| | |||||| ||||| ||||||||||||||| ||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11907 gttgaatgactaagcatttcggggcataagccc-caacaatttgaatgataaat-attccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaatgcattcca 12004  T
Q  238 gagcattagctctcaacagtt 258  Q
      |||| ||| ||||||||||    
T  12005 aggcatgagccctcaacagtt 12025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1098 (Bit Score: 62; Significance: 7e-27; HSPs: 5)
Name: scaffold1098
Description:

Target: scaffold1098; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 139 - 258
Target Start/End: Original strand, 1064 - 1185
Alignment:
Q  139 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaggcattcc 236  Q
    ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  1064 gttgaatgactaagcattctagggcatgagccctcaaaagtttgaatgacaaggcattctagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattct 1163  T
Q  237 agagcattagctctcaacagtt 258  Q
    || |||| ||| ||||| ||||    
T  1164 agggcataagccctcaatagtt 1185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1098; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Original strand, 1045 - 1209
Alignment:
Q  41 gtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-gg 139  Q
    ||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||| | ||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||| |     
T  1045 gtggtaccattttcaacgtgttgaatgactaagcattctagggcatgagccctcaaaagtttgaatgacaaggcattctagggcatgagccctcaacagt 1144  T
Q  140 ttgaatgatta-acattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcat 204  Q
    ||||||||  |  ||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||| ||  |||||||||||||    
T  1145 ttgaatgacaaggcattctagggcataagccctcaatagtttgaatgataa-acattccagggcat 1209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1098; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 61 - 165
Target Start/End: Original strand, 1105 - 1210
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaa-cggttgaatgattaacattccag 159  Q
    ||||||||| | ||||||  |||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||    
T  1105 ttgaatgacaaggcattctagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattctagggcataagccctcaatagtttgaatgataaacattccag 1204  T
Q  160 ggcatg 165  Q
    ||||||    
T  1205 ggcatg 1210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1098; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 178 - 213
Target Start/End: Original strand, 1891 - 1926
Alignment:
Q  178 tttgaatgacaaggcattccagggcataagccctca 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1891 tttgaatgacaaggcattccagggcgtaagccctca 1926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1098; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 122 - 213
Target Start/End: Original strand, 1955 - 2047
Alignment:
Q  122 ggcataagccctcaacggttgaatga-ttaacattc-cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctca 213  Q
    ||||| |||| ||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  1955 ggcatgagccgtcaccgattgaatgaattagcattcacagggcatgagccctcaccaatt-gaacaacaaggcgttccagggcatgagccctca 2047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 4)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 158 - 258
Target Start/End: Original strand, 9638 - 9738
Alignment:
Q  158 agggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagt 257  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||| |||  ||||||||    
T  9638 agggcatgagccctcaacggtttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacggtttaatgacaaagcattccagggcatgagccgtcaacagt 9737  T
Q  258 t 258  Q
    |    
T  9738 t 9738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 60 - 176
Target Start/End: Original strand, 9618 - 9735
Alignment:
Q  60 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattcca 158  Q
    |||||||||| |||||| |  |||||| ||||| ||||  ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||  || |||||||    
T  9618 gttgaatgacaaagcatacaagggcatgagccctcaacggtttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacggtttaatgacaaagcattcca 9717  T
Q  159 gggcatgagccctcaaca 176  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  9718 gggcatgagccgtcaaca 9735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 179 - 269
Target Start/End: Original strand, 9619 - 9710
Alignment:
Q  179 ttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagttgaatgacaaag 269  Q
    ||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||| |||||| ||| ||||||||||    
T  9619 ttgaatgacaaagcatacaagggcatgagccctcaacggtttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacggtttaatgacaaag 9710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 60 - 106
Target Start/End: Original strand, 9562 - 9608
Alignment:
Q  60 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaat 106  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9562 gttgaatgactaggcattctggggcataagcccccaacaatttgaat 9608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 5)
Name: scaffold0491
Description:

Target: scaffold0491; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 31 - 141
Target Start/End: Original strand, 10437 - 10546
Alignment:
Q  31 caactacgacgtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagc 130  Q
    |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||  ||||||| ||||| |||    
T  10437 caacaacgacgtggtcttattttcaacacgttgaatgactaagcattccggggcatgagccctcaac-agttgaatgacaaagcattccagggcatgagc 10535  T
Q  131 cctcaacggtt 141  Q
    |||||||||||    
T  10536 cctcaacggtt 10546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 179 - 254
Target Start/End: Original strand, 10467 - 10542
Alignment:
Q  179 ttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaac 254  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||    
T  10467 ttgaatgactaagcattccggggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 10542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 139 - 215
Target Start/End: Original strand, 10466 - 10542
Alignment:
Q  139 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac 215  Q
    ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  10466 gttgaatgactaagcattccggggcatgagccctcaac-agttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 10542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 101 - 175
Target Start/End: Original strand, 10467 - 10542
Alignment:
Q  101 ttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaac 175  Q
    ||||||||| |  ||||||  ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  10467 ttgaatgactaagcattccggggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 10542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 217 - 269
Target Start/End: Original strand, 10466 - 10518
Alignment:
Q  217 gttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagttgaatgacaaag 269  Q
    |||||||||| | ||||||| | |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  10466 gttgaatgactaagcattccggggcatgagccctcaacagttgaatgacaaag 10518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 3)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 60 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 223743 - 223630
Alignment:
Q  60 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattcca 158  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||  || |||||||    
T  223743 gttgaatgactaagcattctgggacacaagcccccaacaatttgaatgataa-acattccatggcataacccctcaacaattgaatgacaaagcattcca 223645  T
Q  159 gggcatgagccctca 173  Q
    |||||||||||||||    
T  223644 gggcatgagccctca 223630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 140 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 223702 - 223630
Alignment:
Q  140 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctca 213  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  223702 ttgaatgataaacattccatggcataacccctcaacaa-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctca 223630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 166 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 223715 - 223630
Alignment:
Q  166 agccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctca 252  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||    
T  223715 agcccccaacaatttgaatgataaa-cattccatggcataacccctcaacaattgaatgacaaagcattccagggcatgagccctca 223630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 3)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 159 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 165714 - 165648
Alignment:
Q  159 gggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatga 225  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  165714 gggcatgagccctcaacagtttgaatgacaatgcattccagggcataagccctcaacagttgaatga 165648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 81 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 165714 - 165629
Alignment:
Q  81 gggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatga 166  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  165714 gggcatgagccctcaacagtttgaatgacaatgcattccagggcataagccctcaacagttgaatgattaacattccagggcatga 165629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 165714 - 165648
Alignment:
Q  199 gggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagttgaatga 264  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  165714 gggcatgagccctcaacagtttgaatgacaatgcattccagggcataagccctcaacagttgaatga 165648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1276 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold1276
Description:

Target: scaffold1276; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 41 - 137
Target Start/End: Original strand, 112 - 207
Alignment:
Q  41 gtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac 137  Q
    |||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||| ||||||||||    
T  112 gtggtactgttttcaacgtgttgaatgactaagcattccggggcatgagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggcatgagccctcaac 207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1276; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 219
Target Start/End: Original strand, 131 - 211
Alignment:
Q  139 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt 219  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||  |  ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  131 gttgaatgactaagcattccggggcatgagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggcatgagccctcaacagtt 211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0364 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0364
Description:

Target: scaffold0364; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 157 - 255
Target Start/End: Original strand, 7087 - 7187
Alignment:
Q  157 cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattc-cagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattc-cagagcattagctctcaac 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| ||| ||||||    
T  7087 cagggcatgagccctcaacaatttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctcaacagttgaacgacaaggcattcacagggcataagccctcaac 7186  T
Q  255 a 255  Q
    |    
T  7187 a 7187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0364; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 157 - 267
Target Start/End: Original strand, 7046 - 7159
Alignment:
Q  157 cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattc-cagggcataagccctcaac-agttgaatgacaaggcattc-cagagcattagctctcaa 253  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||| | |  |||||| |||||||| |||||||||| | ||||||||  | |||||| ||| |||| ||| |||||    
T  7046 cagggcataagccctcaacaatttaaataaaatagcattcacagggcatgagccctcaacaatttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctcaa 7145  T
Q  254 cagttgaatgacaa 267  Q
    |||||||| |||||    
T  7146 cagttgaacgacaa 7159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 4)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 81 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 29459 - 29323
Alignment:
Q  81 gggcataagcccccaacaatttgaatga-caagacattc-caaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaa-cattc-cagggcatgagccctcaac 175  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||| || ||||| ||||||||||  || |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  29459 gggcataagccctcaacaatttgaatgaactag-cattcacagggcatgagccctcaacaatttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctcaac 29361  T
Q  176 aatttgaatgacaaggcattc-cagggcataagccctc 212  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  29360 aatttgaatgacaaggaattcatagggcataagccctc 29323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 29420 - 29340
Alignment:
Q  157 cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattc-cagggcataagccctcaac-agttgaatgacaaggcattc 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  29420 cagggcatgagccctcaacaatttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggaattc 29340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 61 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 29398 - 29346
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattc-cggggcataagcccccaacaatttgaatgacaag 112  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  29398 ttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaag 29346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 157 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 29461 - 29401
Alignment:
Q  157 cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattc-cagggcataagccctcaaca 216  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||    |||||| |||||||| |||||||||||    
T  29461 cagggcataagccctcaacaatttgaatgaactagcattcacagggcatgagccctcaaca 29401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 122 - 235
Target Start/End: Original strand, 6555 - 6674
Alignment:
Q  122 ggcataagccctcaacggtt-gaatgat-taacattc-cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattc-cagggcataagccctcaaca- 216  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||     
T  6555 ggcataagccctcaacaatttgaatgaactaacattcacagggcatgagccctcaacaatttgaatgattaagcattcacagggcataagccctcaacaa 6654  T
Q  217 -gttgaatgacaaggcattc 235  Q
      ||||||||||||||||||    
T  6655 ttttgaatgacaaggcattc 6674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 81 - 211
Target Start/End: Original strand, 6554 - 6690
Alignment:
Q  81 gggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattc-caaggcataagccctcaac-ggttgaatgattaa-cattc-cagggcatgagccctcaaca 176  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||    |||||| || ||||| ||||||||||   |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  6554 gggcataagccctcaacaatttgaatgaactaacattcacagggcatgagccctcaacaatttgaatgattaagcattcacagggcataagccctcaaca 6653  T
Q  177 a-tttgaatgacaaggcattc-cagggcataagccct 211  Q
    | ||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  6654 attttgaatgacaaggcattcacggggcataagccct 6690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 4)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 81 - 211
Target Start/End: Original strand, 20683 - 20818
Alignment:
Q  81 gggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattc-caaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaa-cattc-cagggcatgagccctcaaca 176  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |   ||||| || || || ||||||||||  || |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  20683 gggcataagccctcaacaatttgaatgaaatagcattcgcagggaatgagccctcaacaatttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctcaaca 20782  T
Q  177 atttgaatgacaaggcattc-cagggcataagccct 211  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  20783 atttgaatgacgaggcattcacaaggcataagccct 20818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 157 - 235
Target Start/End: Original strand, 20722 - 20802
Alignment:
Q  157 cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattc-cagggcataagccctcaac-agttgaatgacaaggcattc 235  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||| |||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  20722 cagggaatgagccctcaacaatttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctcaacaatttgaatgacgaggcattc 20802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 133
Target Start/End: Original strand, 20744 - 20818
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattc-cggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattc-caaggcataagccct 133  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  20744 ttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctcaacaatttgaatgacgaggcattcacaaggcataagccct 20818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 157 - 216
Target Start/End: Original strand, 20681 - 20741
Alignment:
Q  157 cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattc-cagggcataagccctcaaca 216  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||| || |||||||||||    
T  20681 cagggcataagccctcaacaatttgaatgaaatagcattcgcagggaatgagccctcaaca 20741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 3)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 152 - 258
Target Start/End: Original strand, 34489 - 34597
Alignment:
Q  152 cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgac-aaggcattc-cagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctc 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||   || ||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||| |||| ||| |    
T  34489 cattccagggcatgagccctcaacagtttgaatggttaaagcagtcacagggcataagccctcaacaattaaatgacaaggtgttccagggcatgagccc 34588  T
Q  250 tcaacagtt 258  Q
    |||||||||    
T  34589 tcaacagtt 34597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 219
Target Start/End: Original strand, 34475 - 34597
Alignment:
Q  100 tttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaa--cattc-cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcatt 195  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||| ||||  || || |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||  ||    
T  34475 tttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttgaatggttaaagcagtcacagggcataagccctcaacaatta-aatgacaaggtgtt 34573  T
Q  196 ccagggcataagccctcaacagtt 219  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  34574 ccagggcatgagccctcaacagtt 34597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 219
Target Start/End: Original strand, 29298 - 29359
Alignment:
Q  157 cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt 219  Q
    |||||||| | |||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  29298 cagggcataacccctcaacaatt-gaacgacaaggcgttccagggcatgagccctcaacagtt 29359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0453 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0453
Description:

Target: scaffold0453; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 158 - 216
Target Start/End: Original strand, 3035 - 3094
Alignment:
Q  158 agggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattc-cagggcataagccctcaaca 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  3035 agggcatgagccctcaacaatttgaaggacaaggcattcacagggcataacccctcaaca 3094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0453; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 140 - 235
Target Start/End: Original strand, 2974 - 3073
Alignment:
Q  140 ttgaatgattaa-cattc-cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattc-cagggcataagccctcaac-agttgaatgacaaggcattc 235  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |  | ||||||  ||||||| |||||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  2974 ttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctaaacaatttgaatcattaagcattcatagggcatgagccctcaacaatttgaaggacaaggcattc 3073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2046 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 3)
Name: scaffold2046
Description:

Target: scaffold2046; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 235
Target Start/End: Original strand, 69 - 150
Alignment:
Q  157 cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattc-cagggcataagccctcaaca--gttgaatgacaaggcattc 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |  | |||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  69 cagggcatgagccctcaacaatttgaataattaagcattcacagggcataagccctcaacaattttgaatgacaaggcattc 150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2046; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 81 - 215
Target Start/End: Original strand, 30 - 170
Alignment:
Q  81 gggcataagcccccaacaatttgaatga-caagacattc-caaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaa-cattc-cagggcatgagccctcaac 175  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||| || ||||| ||||||||||  || |||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  30 gggcataagccctcaacaatttgaatgaactagt-attcacagggcatgagccctcaacaatttgaataattaagcattcacagggcataagccctcaac 128  T
Q  176 aattt-gaatgacaaggcattc-cagggcataagccctcaac 215  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  129 aattttgaatgacaaggcattcacagggcataagccctcaac 170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2046; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 141
Target Start/End: Original strand, 91 - 174
Alignment:
Q  61 ttgaatgactaagcattc-cggggcataagcccccaacaattt-gaatgacaagacattc-caaggcataagccctcaacggtt 141  Q
    |||||| | ||||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  91 ttgaataattaagcattcacagggcataagccctcaacaattttgaatgacaaggcattcacagggcataagccctcaacggtt 174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0962 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 3)
Name: scaffold0962
Description:

Target: scaffold0962; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 81 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 1668 - 1528
Alignment:
Q  81 gggcataagcccccaacaatttgaatga-caagacattc-caaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaa-cattc-cagggcatgagccctcaac 175  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||| || ||||| ||||||||||  || |||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||    
T  1668 gggcataagccctcaacaatttgaatgaactag-cattcacagggcatgagccctcaacaatttgaatgattaagcattcacaaggcatgatccctcaac 1570  T
Q  176 aatttgaatgacaaggcattc-cagggcataagccctcaaca 216  Q
    | |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  1569 agtttgaacgacaaggcattcacagggcacaagccctcaaca 1528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0962; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 157 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 1629 - 1549
Alignment:
Q  157 cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattc-cagggcataagccctcaacag-ttgaatgacaaggcattc 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| || ||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  1629 cagggcatgagccctcaacaatttgaatgattaagcattcacaaggcatgatccctcaacagtttgaacgacaaggcattc 1549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0962; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 157 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 1670 - 1610
Alignment:
Q  157 cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattc-cagggcataagccctcaaca 216  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||    |||||| |||||||| |||||||||||    
T  1670 cagggcataagccctcaacaatttgaatgaactagcattcacagggcatgagccctcaaca 1610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 21927 - 21764
Alignment:
Q  100 tttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaa--cattc-cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcatt 195  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||    |||||    
T  21927 tttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttgaatggttaaagcattcacagggcatgagccctcaacggtttgaatgaactagcatt 21828  T
Q  196 -ccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctcaacagtt 258  Q
      |||||||||||||||||||  || || |||||||| |||||| |||| ||| ||||| ||||    
T  21827 aacagggcataagccctcaacgattaaacgacaaggcgttccagggcatgagccctcaatagtt 21764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 213
Target Start/End: Original strand, 524712 - 524768
Alignment:
Q  157 cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctca 213  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  524712 cagggcataagccctcaccaatttgaacgacaaggcattccagggcatgagccctca 524768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 135
Target Start/End: Original strand, 524714 - 524768
Alignment:
Q  81 gggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctca 135  Q
    |||||||||||| || ||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  524714 gggcataagccctcaccaatttgaacgacaaggcattccagggcatgagccctca 524768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 213
Target Start/End: Original strand, 524747 - 524809
Alignment:
Q  152 cattccagggcatgagccctcaacaattt-gaatgacaaggcattccagggcataagccctca 213  Q
    |||||||||||||||||||||| |  ||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  524747 cattccagggcatgagccctcaccgcttttgaacgacaaggcgttccagggcatgagccctca 524809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 223
Target Start/End: Original strand, 33623 - 33690
Alignment:
Q  157 cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattc-cagggcataagccctcaacagttgaat 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  33623 cagggcatgagccctcaacaatttgaatgaactagcattcacagggcatgagccctcaacagttgaat 33690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 81 - 216
Target Start/End: Original strand, 33625 - 33764
Alignment:
Q  81 gggcataagcccccaacaatttgaatga-caagacattc-caaggcataagccctcaacggttgaatgattaac-attc-cagggcatgagccctcaaca 176  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||| | || ||||| || ||||| |||||||||| ||||||| |||||  |||| || |||||||||||||||||    
T  33625 gggcatgagccctcaacaatttgaatgaactag-cattcacagggcatgagccctcaacagttgaataattaagtattcacatggcatgagccctcaaca 33723  T
Q  177 atttgaatgacaaggcattc-cagggcataagccctcaaca 216  Q
     |||||||||| | |||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  33724 gtttgaatgactaagcattcacagtgcataagccctaaaca 33764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0859 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0859
Description:

Target: scaffold0859; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 140 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 223 - 153
Alignment:
Q  140 ttgaatgattaa-cattc-cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattc-cagggcataag 207  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  223 ttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctcaataatttgaatgccaaggcattcacagggcataag 153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0859; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 157 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 245 - 165
Alignment:
Q  157 cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattc-cagggcataagccctcaa-cagttgaatgacaaggcattc 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||| |||||||||  | ||||||| ||||||||||    
T  245 cagggcatgagccctcaacaatttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctcaataatttgaatgccaaggcattc 165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 157 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 3722 - 3625
Alignment:
Q  157 cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctca--acagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctca 252  Q
    |||||||| ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  ||  |||||  ||||||| ||||||||||| ||| ||||    
T  3722 cagggcataagctctcaccaatttgaacgacaaggcattccagggcatgagccctcacgacttttgaacaacaaggcgttccagagcatgagccctca 3625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 8510 - 8455
Alignment:
Q  157 cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctca 213  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  8510 cagggcatgagccctcaccaatt-gaacgacaaggcgttctagggcataagccctca 8455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 100 - 231
Target Start/End: Original strand, 19277 - 19413
Alignment:
Q  100 tttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacgg--ttgaatgattaa--cattc-cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcat 194  Q
    |||||||||||||  |||||| ||||| |||||||| ||   ||||||| ||||  ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||    ||||    
T  19277 tttgaatgacaaggaattccagggcatgagccctcaccgaatttgaatggttaaagcattcacagggcataagccctcaccaatttgaatgaactagcat 19376  T
Q  195 tccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggc 231  Q
    |||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  19377 tccagggcatgagccctcaccaattgaacgacaaggc 19413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 152 - 213
Target Start/End: Original strand, 19374 - 19434
Alignment:
Q  152 cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctca 213  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||  |||||| ||||||||    
T  19374 cattccagggcatgagccctcaccaa-ttgaacgacaaggcgttcttgggcatgagccctca 19434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 100 - 248
Target Start/End: Original strand, 177909 - 178061
Alignment:
Q  100 tttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacg-gttgaatgattaa--cattc-cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcatt 195  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||  ||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||    |||||    
T  177909 tttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaccgatttgaatggttaaagcattcacagggcatgagccctcaccaa-ttgaatgaactagcatt 178007  T
Q  196 c-cagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagct 248  Q
    | |||||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||| |||| ||||    
T  178008 cacagggcatgagccctcaccaattgaacgacaaggcgttccagggcatgagct 178061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 3)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 41 - 107
Target Start/End: Original strand, 120016 - 120082
Alignment:
Q  41 gtggtactatttccaacacgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatg 107  Q
    ||||||| |||| ||||  ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  120016 gtggtaccattttcaacgtgttgaatgactgagcattctggggcatgagcccccaacaatttgaatg 120082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 101 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 174952 - 174911
Alignment:
Q  101 ttgaatgacaagacattc-caaggcataagccctcaacggtt 141  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  174952 ttgaatgacaaggcattcacaaggcataagccctcaacggtt 174911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 122 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 183113 - 183041
Alignment:
Q  122 ggcataagccctcaacggttg-aatgattaa-cattcc-agggcatgagccctcaacaatttgaatgacaagg 191  Q
    ||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  183113 ggcatgagccctcaacagttggaatgattaagcattcccagggcatgagccctcaacggtttgaacgacaagg 183041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0388 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0388
Description:

Target: scaffold0388; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 122 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 16171 - 16071
Alignment:
Q  122 ggcataagccctcaacggttg-aatgattaa-cattcc-agggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattc-cagggcataagccctcaacag 217  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| | | ||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||    
T  16171 ggcataagccctcaacagttggaatgattaagcattcccacgacatgagccctcaacagtttgaacgacagggcgttcacagggcatgagccctcaacag 16072  T
Q  218 t 218  Q
    |    
T  16071 t 16071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0388; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 157 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 16215 - 16151
Alignment:
Q  157 cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattc-cagggcataagccctcaacagttg 220  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||    |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16215 cagggcatgagcactcaacaatttgaatgaactagcattcacagggcataagccctcaacagttg 16151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 100 - 213
Target Start/End: Original strand, 17865 - 17983
Alignment:
Q  100 tttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacgg--ttgaatgattaa--cattcc-agggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcat 194  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||   ||||||| |||   |||||  ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| |    
T  17865 tttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaccgaatttgaatggttagagcattcatagggcataagccctcaccaatttgaacgacaaggcgt 17964  T
Q  195 tccagggcataagccctca 213  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  17965 tccagggcatgagccctca 17983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 213
Target Start/End: Original strand, 17964 - 18023
Alignment:
Q  154 ttccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctca 213  Q
    |||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  17964 ttccagggcatgagccctcaccgctttgaacgacaaggcgttccagggcatgagccctca 18023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 213
Target Start/End: Original strand, 20775 - 20810
Alignment:
Q  178 tttgaatgacaaggcattccagggcataagccctca 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20775 tttgaatgacaaggcattccagggcataagccctca 20810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Original strand, 20775 - 20922
Alignment:
Q  100 tttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaa--cattc-cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcatt 195  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |  || ||| | ||||  | ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||    |||||    
T  20775 tttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaccaatttgaacggttaaagcgttcacagggcatgagccctcaccaatt-gaatgaactagcatt 20873  T
Q  196 c-cagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcat 243  Q
    | ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||| ||||    
T  20874 cacagggcataagccctcaccaattgaacgacaaggcgttccagggcat 20922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 2867 - 2808
Alignment:
Q  122 ggcataagccctcaacggttg-aatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatt 179  Q
    ||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2867 ggcatgagccctcaacagttggaatgattaagcattccagggcatgagccctcaacaatt 2808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 158 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 2869 - 2811
Alignment:
Q  158 agggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaaca 216  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||  | |||||||||||||| |||||||||||    
T  2869 agggcatgagccctcaacagttggaatgattaagcattccagggcatgagccctcaaca 2811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 114 - 252
Target Start/End: Original strand, 21263 - 21404
Alignment:
Q  114 cattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttg-aatgacaaggcattc-cagggcataagccc 210  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||  || ||||| |||||||||||||||    ||||| || |  || ||||||  | |||||||||||    
T  21263 cattccgaggcataagccctcaacagttgaatgaaaaagcattctagggcatgagccctcccggatttgaaaggttaaagcattcatacggcataagccc 21362  T
Q  211 tcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctca 252  Q
    ||| || ||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||    
T  21363 tcaccaattgaacgacaaggcattccagggcatgagccctca 21404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 191 - 235
Target Start/End: Original strand, 21262 - 21306
Alignment:
Q  191 gcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattc 235  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  21262 gcattccgaggcataagccctcaacagttgaatgaaaaagcattc 21306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0178 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0178
Description:

Target: scaffold0178; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 213
Target Start/End: Original strand, 25568 - 25624
Alignment:
Q  157 cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctca 213  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  25568 cagggcataagccctcactaatttgaacgacaaggcgttccagggcatgagccctca 25624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1336 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold1336
Description:

Target: scaffold1336; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 100 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 958 - 848
Alignment:
Q  100 tttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatg-attaacattc-cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattcc 197  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||| |  ||||||| | || ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||    
T  958 tttgaatgacaaggcattccagggcatgagtcctcaccaattgaatgaactaccattcacagggcatgagccctcaccaa-ttgaacgacaaggcgttcc 860  T
Q  198 agggcataagcc 209  Q
    | ||||| ||||    
T  859 aaggcatgagcc 848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1336; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 178 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 958 - 911
Alignment:
Q  178 tttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatga 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||    
T  958 tttgaatgacaaggcattccagggcatgagtcctcaccaattgaatga 911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0865 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0865
Description:

Target: scaffold0865; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 178 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 65 - 30
Alignment:
Q  178 tttgaatgacaaggcattccagggcataagccctca 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  65 tttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctca 30  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 157 - 252
Target Start/End: Original strand, 4806 - 4901
Alignment:
Q  157 cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagctctca 252  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||  ||||||  ||||||||||| ||||||||    ||||| |||||||| |||||| |||| ||| ||||    
T  4806 cagggcataagccctcaccaatttgaacaacaaggtgttccagggcatgagccctcacgctttgaacgacaaggcgttccagggcatgagccctca 4901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 154 - 213
Target Start/End: Original strand, 4843 - 4901
Alignment:
Q  154 ttccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctca 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  4843 ttccagggcatgagccctc-acgctttgaacgacaaggcgttccagggcatgagccctca 4901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 178 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 27078 - 27043
Alignment:
Q  178 tttgaatgacaaggcattccagggcataagccctca 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27078 tttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctca 27043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 154 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 41706 - 41647
Alignment:
Q  154 ttccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctca 213  Q
    ||||||||||||| |||||| |  |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  41706 ttccagggcatgaaccctcaccgctttgaacgacaaggcgttccagggcatgagccctca 41647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 152 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 92826 - 92723
Alignment:
Q  152 cattccagggcatgagccctcaac-aatttgaatgac-aaggcattc-cagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagagcattagct 248  Q
    ||||||||||||||||||| || | ||||||||||   || |||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||| |||| |||     
T  92826 cattccagggcatgagcccacaccgaatttgaatggttaaagcattcacagggcataagccctcaccaattgaacgacaaggcgttccagggcataagcc 92727  T
Q  249 ctca 252  Q
    ||||    
T  92726 ctca 92723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 178 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 92840 - 92808
Alignment:
Q  178 tttgaatgacaaggcattccagggcataagccc 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  92840 tttgaatgacaaggcattccagggcatgagccc 92808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 3)
Name: scaffold0371
Description:

Target: scaffold0371; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 7261 - 7227
Alignment:
Q  178 tttgaatgacaaggcattccagggcataagccctc 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7261 tttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctc 7227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 122 - 212
Target Start/End: Original strand, 5356 - 5449
Alignment:
Q  122 ggcataagccctcaacggttgaatgattaac-attc-cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattc-cagggcataagccctc 212  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| |||||  |||| || |||||||||||| |||| |||||||||  | |||||| ||||||||||||||||    
T  5356 ggcatgagccctcaacagttgaataattaagtattcacaaggcatgagccctaaacagtttgaatgattaagcattcacagggcataagccctc 5449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 160 - 223
Target Start/End: Original strand, 5316 - 5379
Alignment:
Q  160 ggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattc-cagggcataagccctcaacagttgaat 223  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  5316 ggcatgagccctcaacaatt-gaatgatctagcattcacagggcatgagccctcaacagttgaat 5379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 212
Target Start/End: Original strand, 13698 - 13755
Alignment:
Q  154 ttccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctc 212  Q
    |||||||||||||||||||  |  |||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  13698 ttccagggcatgagccctcc-cgctttgaacgacaaggcattccagggcatgagccctc 13755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 216
Target Start/End: Original strand, 188733 - 188831
Alignment:
Q  122 ggcataagccctcaacggttg-aatgattaa-cattcc-agggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattc-cagggcataagccctcaaca 216  Q
    |||||||||||||||| |||| || |||||| |||||| | ||| |||||||  ||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  188733 ggcataagccctcaacagttggaacgattaagcattcctaaggcttgagcccggaacgatttgaacgacaaggcgttcacagggcataagccctcaaca 188831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 122 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 28119 - 28026
Alignment:
Q  122 ggcataagccctcaacggttgaatgattaac-attc-cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattc-cagggcataagccctc 212  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| |||||  |||| || |||||||||||| |||| |||||||||  | |||||| ||||||||||||||||    
T  28119 ggcatgagccctcaacagttgaataattaagtattcacaaggcatgagccctaaacagtttgaatgattaagcattcacagggcataagccctc 28026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 160 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 28159 - 28096
Alignment:
Q  160 ggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattc-cagggcataagccctcaacagttgaat 223  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  28159 ggcatgagccctcaacaatt-gaatgatctagcattcacagggcatgagccctcaacagttgaat 28096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 140 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 15768 - 15732
Alignment:
Q  140 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaaca 176  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  15768 ttgaatgatgatcattccagggcatgagccctcaaca 15732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University